lowQualScore : 1 2 2222222 333333333
lowQualScore : 1 6 3 6 0 0 7 44 44 44 0 1111111 2 555 6 999999999 7777 3
lowQualScore : . . . . . . . .. .. .. . ....... . ... . ......... .... .
lowQualScore : 4 6 1 7 0 0 3 66 66 66 7 7777777 0 888 3 555555555 7777 6
consensus : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTT-TTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTG-----AAGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
Reference ( gi|6 ) : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTT-TT-CACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT-------ACGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|5 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTT-TT-CACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATT-AAAAAAAG--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT-------ACGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACATTTCATCAATCCTT
gi|3 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTTTATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTT-TTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTTCATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTAAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTTTTTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGAAACTTAGTACCTGTTTGTAACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT-------ACGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGTTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|4 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTT-TTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATACTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTG-----AAGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGCTACACTTCATCAATCCTT
gi|1 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTT-TTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAATGTTGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTATAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCACTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTATATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTG-----AAGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ACGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCT
gi|11 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTTTTT-CACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATAAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTTTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAAACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTACCTGTT----------------TGT----GACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAACAGAAATAACT-------ACGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|9 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTT-TTTCACTATAATTTTAA------AATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTTTTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTGTCGTTATGAAAACAAACCTTACCTGTTTT--TGACACTTATCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTATCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---------TGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGAAACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTG-----AAGTTATTT----TCCAGTATTGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGTTACACTTCATCAATCCTT
gi|10 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTT-TT-CACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAGCATCTGCGAAATT-AAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATT---------------ACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTACGTCTAATGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTG-----AAGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATTAATCCTT
gi|7 : ACTTATCGATTACCACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTTAGTTTTAG-TTTT-TTTCACTATGATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGAAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAATATGAAACTCTTTTTCTTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCATTATGAAAACAAACCTAA-CTGTTTT--TGAAACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGCATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC-----------TTATTT----TCCAGTATCGAGAAGAT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAAT
gi|2 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGAGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATAAGGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTAGTTTTTAGTTTTAG-TTTT-TTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA--AAA--TGTATTATATCATAATATGGAACTCTTTTTATAACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAAAGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAGGTATTCATTAAAGCGAAGTTACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCATAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGGTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC-----------TTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|8 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCACAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTTTTT-CACTATAATTTTAATTTTAAAATAACATAGATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAAATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTAAAATATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCAGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATG-------------TTGCTATATAAACAAATATGTGGTACATGTTGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTGTGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGACT-TATATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTG-----AAGTTATTT----TCCAGTATCGAGAAGCTAATGGTACTTTAACATGTATTTTAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|12 : aACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGAGTCATAAATCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTAATTTT-CAGTTTTAA-TTTT-T--CACAATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAA---TGTAGAAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTTGATAAATTAAAATATAAAAAGTATATATATTTTGTAACTGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTTTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAATTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTGTTTT--TGGCACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACGATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTTGTACA---------CGTTGTTAACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAA
gi|13 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTTATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAG-TTTTTTT-CACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAATTTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAATTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTAACCTTTTTT--TGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGTTTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTttaacaccttcctcaggtgacagtagccaatatct
gi|15 : ACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTAT-AAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTT
gi|13 : TTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT
gi|14 : acttatcaattcctacagtttagtttattggggttataaaactctagggtcataaaccaataggcttataaaaataggttatattttagagatcattgtgttttaaagttttgatggtttttatttttcagttttagtttttttcactataattttaattttaaaattacataaatatgtagtaaacatctacgaatttaaaaaaaaatgtattagatcatagtatgaaactctttttattactcgataaattaaaacataaaaagtatatatattgtaacagtttttattaatttggattacaaacaaataaacgtgtttgttgttgttaactgtcaagtatttattaaagcgaattaactgttttgttatcgttatgaaaacaaacctaaccttAAATTGATTGGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAATTTATTTTATTTAATTTCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATATCAGGGTTTCACATTTTTATCCTAATTACACATCATCAATCCTTttaattaccacctttgtcgggtgactatgtatagtgtctaatttgttaattggcattttgcaggtgttcttttagacgacaatgcagaataaacatattgctatataaacaaatatgtggtacatgttgttgttgt
gi|16 : ACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 2222222 11 111111111
lowQualScore : 0 2 2 444 44 6666 33 2222222222 0000000 555 0 33 3 333333333 3
lowQualScore : . . . ... .. .... .. .......... ....... ... . .. . ......... .
lowQualScore : 7 9 3 888 22 1111 99 5555555555 0000000 444 4 88 0 333333333 3
consensus : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
Reference ( family-2695 ) : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|1 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAATGTTGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTATAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCACTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTATATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ACGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCT
gi|10 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAGCATCTGCGAAATT-AAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATT---------------ACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTACGTCTAATGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATTAATCCTT
gi|11 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATAAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTTTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAAACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---T--------------------GTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAACAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|12 : ACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGAGTCATAAATCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTAATTTT-CAGTTTTAATTTTT--CACAATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAA---TGTAGAAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTTGATAAATTAAAATATAAAAAGTATATATATTTTGTAACTGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTTTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAATTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGGCACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACGATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTTGTACA---------CGTTGTTAACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAA
gi|12 : TATTGCTATATAAACAAATATGTTGTACA--CGTTGTTAACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAATTAACACCTTCCTCAGGTGACAGTAGCCAATATCTttaacaccttcctcaggtgacagtagccaatatct
gi|13 : acttatcgattcctacggtttagtttattggggtcataaaactctagagtcataaatcaataggcttataaaaataggttatattttagagatcattgtgttttatagttttgatggttttaattttcagttttaatttttcacaataattttaattttaaaattacataaatatgtagtaaacatctacgaaattaaaaaaaatgtagaagatcatagtatgaaactctttttattacttgataaattaaaatataaaaagtatatatattttgtaactgtttttattaatttggattacaaacaaataaacgtgtttgtttttgttaactgtcaagtatttattaaagcgaagtaattgttttgttatcgttatgaaaacaaacctaacctgtttttggcacttagcacttgtttttaacattgtgtttaattaccacctttgtcgggtgactatgtctagtgtcttatttgttaattggcattttacaggtgttcttttagacgacgatgcagaataaacaACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTTATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAATTTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAATTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TTTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGT
gi|14 : AAATTGATTGGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAATTTATTTTATTTAATTTCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATATCAGGGTTTCACATTTTTATCCTAATTACACATCATCAATCCTT
gi|15 : ACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTAT-AAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTT
gi|16 : ACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|2 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGAGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATAAGGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTAGTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA--AAA--TGTATTATATCATAATATGGAACTCTTTTTATAACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAAAGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAGGTATTCATTAAAGCGAAGTTACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCATAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGGTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC------TTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|3 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTTTATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTTCATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTAAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACCTTTTTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGAAACTTAGTACCTGTTTGTAACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGTTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|4 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATACTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGCTACACTTCATCAATCCTT
gi|5 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAG---TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACATTTCATCAATCCTT
gi|6 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTT-TTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|7 : ACTTATCGATTACCACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTCACTATGATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGAAGTAAACATCTACGAAATT-AAAAAAAA--TGTATTAGATCATAATATGAAACTCTTTTTCTTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCATTATGAAAACAAACCTA----A-C--TGTTTTTGAAACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGCATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC------TTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGAT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAAT
gi|8 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCACAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATAACATAGATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAAATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTAAAATATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCAGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATG-------------TTGCTATATAAACAAATATGTGGTACATGTTGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTGTGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGACT-TATATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCTAATGGTACTTTAACATGTATTTTAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|9 : aACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAA------AATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTTTTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTGTCGTTATGAAAACAAACCTT----ACC--TGTTTTTGACACTTATCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTATCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---------TGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGAAACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATTGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGTTACACTTCATCAATCCTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 2222222 11 111111111
lowQualScore : 0 2 2 444 44 6666 33 2222222222 0000000 555 0 33 3 333333333 3
lowQualScore : . . . ... .. .... .. .......... ....... ... . .. . ......... .
lowQualScore : 7 9 3 888 22 1111 99 5555555555 0000000 444 4 88 0 333333333 3
consensus : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
Reference ( family-2695 ) : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|1 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAATGTTGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTATAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCACTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTATATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ACGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCT
gi|10 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAGCATCTGCGAAATT-AAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATT---------------ACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTACGTCTAATGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATTAATCCTT
gi|11 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATAAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTTTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAAACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---T--------------------GTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAACAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|12 : ACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGAGTCATAAATCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTAATTTT-CAGTTTTAATTTTT--CACAATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAA---TGTAGAAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTTGATAAATTAAAATATAAAAAGTATATATATTTTGTAACTGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTTTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAATTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGGCACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACGATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTTGTACA---------CGTTGTTAACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAA
gi|12 : TATTGCTATATAAACAAATATGTTGTACA--CGTTGTTAACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAATTAACACCTTCCTCAGGTGACAGTAGCCAATATCTttaacaccttcctcaggtgacagtagccaatatct
gi|13 : acttatcgattcctacggtttagtttattggggtcataaaactctagagtcataaatcaataggcttataaaaataggttatattttagagatcattgtgttttatagttttgatggttttaattttcagttttaatttttcacaataattttaattttaaaattacataaatatgtagtaaacatctacgaaattaaaaaaaatgtagaagatcatagtatgaaactctttttattacttgataaattaaaatataaaaagtatatatattttgtaactgtttttattaatttggattacaaacaaataaacgtgtttgtttttgttaactgtcaagtatttattaaagcgaagtaattgttttgttatcgttatgaaaacaaacctaacctgtttttggcacttagcacttgtttttaacattgtgtttaattaccacctttgtcgggtgactatgtctagtgtcttatttgttaattggcattttacaggtgttcttttagacgacgatgcagaataaacaACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTTATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAATTTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAATTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TTTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGT
gi|14 : AAATTGATTGGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAATTTATTTTATTTAATTTCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATATCAGGGTTTCACATTTTTATCCTAATTACACATCATCAATCCTT
gi|15 : ACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTAT-AAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTT
gi|16 : ACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|2 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGAGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATAAGGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTAGTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA--AAA--TGTATTATATCATAATATGGAACTCTTTTTATAACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAAAGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAGGTATTCATTAAAGCGAAGTTACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCATAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGGTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC------TTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|3 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTTTATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTTCATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTAAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACCTTTTTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGAAACTTAGTACCTGTTTGTAACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGTTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|4 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATACTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGCTACACTTCATCAATCCTT
gi|5 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAG---TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACATTTCATCAATCCTT
gi|6 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTT-TTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|7 : ACTTATCGATTACCACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTCACTATGATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGAAGTAAACATCTACGAAATT-AAAAAAAA--TGTATTAGATCATAATATGAAACTCTTTTTCTTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCATTATGAAAACAAACCTA----A-C--TGTTTTTGAAACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGCATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC------TTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGAT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAAT
gi|8 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCACAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATAACATAGATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAAATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTAAAATATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCAGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATG-------------TTGCTATATAAACAAATATGTGGTACATGTTGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTGTGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGACT-TATATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCTAATGGTACTTTAACATGTATTTTAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|9 : aACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAA------AATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTTTTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTGTCGTTATGAAAACAAACCTT----ACC--TGTTTTTGACACTTATCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTATCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---------TGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGAAACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATTGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGTTACACTTCATCAATCCTT
blockSeqs : A A A TT TTGT TT GCTCAAAATG TTTAGAC TGT TG A ATTTAATTT A
blockSeqs : . A A . . . . TTTAGAC . TG C . .
blockSeqs : . A A . . . . . . TG A . .
blockSeqs : . A A . . . . . . TG C . .
blockSeqs : . A A . . . . . . TG A . .
blockSeqs : . A A . . . . . . . C . .
blockSeqs : . A A . . . . . . . C . .
blockSeqs : . A A . . . . . . . A . .
blockSeqs : . A A . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : A** **
originalCons : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
finalCons : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--AAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 2222222 22 111111111
lowQualScore : 0 2 2 444 44 6666 33 2222222222 0000000 555 0 77 3 333333333 3
lowQualScore : . . . ... .. .... .. .......... ....... ... . .. . ......... .
lowQualScore : 7 9 3 888 22 1111 99 5555555555 0000000 444 4 55 0 333333333 3
consensus : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
Reference ( family-2695 ) : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--AAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|1 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAATGTTGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTATAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCACTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTATATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ACGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCT
gi|10 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAGCATCTGCGAAATT-AAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATT---------------ACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTACGTCTAATGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATTAATCCTT
gi|11 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATAAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTTTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAAACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---T--------------------GTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAACAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|12 : ACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGAGTCATAAATCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTAATTTT-CAGTTTTAATTTTT--CACAATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAA---TGTAGAAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTTGATAAATTAAAATATAAAAAGTATATATATTTTGTAACTGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTTTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAATTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGGCACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACGATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTTGTACA---------CGTTGTTAACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAA
gi|12 : TATTGCTATATAAACAAATATGTTGTACA--CGTTGTTAACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAATTAACACCTTCCTCAGGTGACAGTAGCCAATATCTttaacaccttcctcaggtgacagtagccaatatct
gi|13 : acttatcgattcctacggtttagtttattggggtcataaaactctagagtcataaatcaataggcttataaaaataggttatattttagagatcattgtgttttatagttttgatggttttaattttcagttttaatttttcacaataattttaattttaaaattacataaatatgtagtaaacatctacgaaattaaaaaaaatgtagaagatcatagtatgaaactctttttattacttgataaattaaaatataaaaagtatatatattttgtaactgtttttattaatttggattacaaacaaataaacgtgtttgtttttgttaactgtcaagtatttattaaagcgaagtaattgttttgttatcgttatgaaaacaaacctaacctgtttttggcacttagcacttgtttttaacattgtgtttaattaccacctttgtcgggtgactatgtctagtgtcttatttgttaattggcattttacaggtgttcttttagacgacgatgcagaataaacaACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTTATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAATTTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAATTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TTTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGT
gi|14 : AAATTGATTGGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAATTTATTTTATTTAATTTCCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATATCAGGGTTTCACATTTTTATCCTAATTACACATCATCAATCCTT
gi|15 : ACTTATCGATTCCTACGGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTAT-AAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTT
gi|16 : ACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|2 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGAGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATAAGGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTAGTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA--AAA--TGTATTATATCATAATATGGAACTCTTTTTATAACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAAAGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAGGTATTCATTAAAGCGAAGTTACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCATAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGGTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC------TTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|3 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTTTATTTTAGAGATCATTGTGTTTTAAAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTTCATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTAAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACCTTTTTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTATAGTGTCTAATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGAAACTTAGTACCTGTTTGTAACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGTTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|4 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATCTGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTATTTTGTTATTGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACTCTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAGATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATACTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATAAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGCTACACTTCATCAATCCTT
gi|5 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAG---TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACATTTCATCAATCCTT
gi|6 : ACTTATCAATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGGGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTT-TTCACTATAATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTGCAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTGTATAAACAAATATGTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAAAATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACT--ACGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|7 : ACTTATCGATTACCACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTTAGTTTTAGTTTTTTTCACTATGATTTTAATTTTAAAATTACATAAATATGAAGTAAACATCTACGAAATT-AAAAAAAA--TGTATTAGATCATAATATGAAACTCTTTTTCTTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCATTATGAAAACAAACCTA----A-C--TGTTTTTGAAACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTTGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCTTTTAGACTTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATTTGGTACA---TGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGCATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAAC------TTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGAT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAAT
gi|8 : ACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCACAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAATTTTAAAATAACATAGATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAAAAAAA--TGTATTAAATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTATTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTAAAATATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTATCGTTATGAAAACAAACCTA----ACC--TGTTTTTGACACTTAGCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTACCACCTTTGTCAGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATG-------------TTGCTATATAAACAAATATGTGGTACATGTTGTTGTTGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGACACTGTGTGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGACT-TATATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATCGAGAAGCTAATGGTACTTTAACATGTATTTTAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGATTACACTTCATCAATCCTT
gi|9 : aACTTATCGATTCCTACAGTTTAGTTTATTGGGGTCATAAAACTCTAGCGTCATAAACCAATA-GGCTTATAAAAATAGGTTATATTTTAGAGATCATTGTGTTTTATAGTTTTGATGGTTTTTATTTTTCAGTTTTAGTTTTTTTCACTATAATTTTAA------AATTACATAAATATGTAGTAAACATCTACGAAATTAAAA-AAAA--TGTATTAGATCATAGTATGAAACTCTTTTTATTACTCGATAAATTAAAACATAAAAAGTATATATATT--GTAACAGTTTTTTTTAATTTGGATTACAAACAAATAAACGTGTTTGTTGTTGTTAACTGTCAAGTATTTATTAAAGCGAAGTAACTGTTTTGTTGTCGTTATGAAAACAAACCTT----ACC--TGTTTTTGACACTTATCACTTGTTTTTAACATTGTGT----------TTAATTATCACCTTTGTCGGGTGACTATGTCTAGTGTCTTATTTGTTAATTGGCATTTTACAGGTGTTCT-------TTTAGACGACAATGCAGAATAAACATATTGCTATATAAACAAATATGTGGTACA---------TGTTGTTGACACTTAGTACCTGTTTGTGAAACTGTATGCTCAACATGCCAAATTGATTTGGTACAATCGGCTGTGTATGAACCTAGATATCGAAGAGAAATAACTTGAAGTTATTTT---------CCAGTATTGAGAAGCT-ATGGTACTTTAACATGTATTTCAGGGTTTCCAATTTTTATGCCGGTTACACTTCATCAATCCTT