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lowQualScore : .. . . . .. . . . . .. . .. . . . .... ... ..... . .. ... . .. . .... ... .. . . .... . .. . . . . . . ........ . . ..... ...... .................... ... ... ... . .. ............... .. . . ... . .. . . . . ... ............ .... . . .... ....... ... .... . . . . . .. . . .. . . .. ...... . ...... ... . . .. . . . ..... . . .... . . ... . . . . ... . .
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consensus : TGTCACCGAACTCTGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTTGATT-CTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTT-TGNTTGATT-AATAACAATAAGT--TAAGATAGTTTA---TAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAG-TT-CTTAAGTAAGTAATCGTAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-AT-TCCTTCTCCTCT-A-TAT---TTT--AAAAACCTTTCTTTAT---ATCA--TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAG----ATTTTAAAATTTGATATTACATAGAAATG-AAAATTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAA-TACAGTTG-TTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGC-TTGTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACAC----CATTTTACAATAAACAT-AAGT-AAA-AATT-T---AGCTTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTT---ATTTTATTATTTTTATT-ATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
Reference ( gi|2 ) : TGTCACCGAACTCCAAATCGTGCCTAATTATTATCGGCCTTTTGGTT-CTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGAAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-TGATGACACACGTTCGGTCAGTGTAACTTCTAGCCGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTT-GGTTTGATT-AATAACAATAAAG--TAAGATAGTTTA---TAGGTTCC-GAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAG-TT-GTTAAGTAAGTAATCGTAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAATATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCAATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTATTACTTATCT-----AT------ATGTA-AT-TCCTTCCCCTCT-A-TAT---TTT--AAAAACCTTTCTTTAT---ATAA--TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATGAATTCTGATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGCTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATTATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATATCAACA----CA----TGTCAACTCTAAATCAGATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAG----ATTTCAAAATTTGATATTACATAGAAATG-AAAATTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAA-TACAGTTG-TATTTAACACCTCACGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGC-TTGTATAATGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTACTAA-CAAAGTTCTACAAAC-ATCAGATACATATAC----TATTTTACAGTAAACAT-AGAT-AAA-AATT-T---AGGTTTTACCTTTTTAAT-TAAAATTTATTATTTATATTT---ATTTCATTATTTTTATT-ATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
gi|7 : TATCACCGAACTCTGAATCATGCCTAATTATTGTTGGCCTTTTGATT-CTAACAAGTTAGCGTAAGCTTT-AG-C-AAAGTGGGAAATTAGCTGGTAGGCAGCCTATACACACCTGGTATTT-TGATGACAC--GTGGGGTCAGTCTAACTTCTAATAGTAGACTTA----ACT---CAA-----CGTCTAATACAGCACACAAGTCTTCTGGTGTT-AACACTTTTATTTT-TGAT-GATTTAATA-CAA---------AGATAGTTTA---CAGTTTCC-AAAAATATTAAATTAACACAGTTTGAATAAG-TT-CGTAAATAA--AA--GTAGTCCTTAGTGATAATTT-AAAATAA-TTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGTTATTGCAAATTATATAATGGCTAGTGTTATGCCACT--------TAAAA-TTCTAAGTTCTA
gi|13 : GCCACCAAACTCTGAATCGTACCTAATTATTGTCGGCCTTTTGATT-CTAACCAGTTGGTGTAAGCTTT-AG-C-AAAGTGGGGAATAAGCTGGTAGGCAGCCTACATGCAACTGGTATTT-CAATAACACTTGCGGGGTCAGTCTAACTTCTAATAGTAGACTTA----ACT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTCTGGTG-TTAACACTTTTATTTT-TG-ATGATT-AAATACAATAGGT--TAAGATAGTTTA---CAGGTTTCAAAAA-CATTAAATTAACACAGTTCGAATAAG-T---TCA--TAAATAATTGTAGTCCTTAGTAATAA-TTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTTACTATCGTAAGTTCTATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTGTCTTTCTCTATCTTACTTATCT-----AC------ATGT--AT-TC--TCTCTTCT-A-TAA---TTTGGAAAAACCTTTCTTTATATCATAATTTAAGTTCCTAAAATGAA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatctatatgtatccctccttaatatttaaaaacctttctttatatcataagttctgattgactaagattttaatatttgatattacatagaaatgaaaatttaaataccttctcttagtaagtaaaatacagttgttattcacacctcaagggtttcgtgttacaccatggcttgtataatgattactctaatgaaacttgtatatactgaatattattaataaaattctcacctaacaaagctctacaaacatcagacatatataccattttacaataaacacaactaaaaattgtaacttttacctttttaattgaaatttattatttttatttattttgttatttttattatttgataacagcaataaaattataacagtaatttaatacctgttacataaattatgtaat
gi|24 : GTCACTGAACTTGGAATCGTAGCTTACTGTTGTTGGCCTTTAGATT-CGAGCCAGTTGGTGTAAGCTTT-AGAA-AA-GTGGGGAATCAGCTG
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gi|1 : TCACCGAACTCTGAATTGTGCCTTATTATTGTCGGCCTTTTTGTTTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGGTGACACACGTGGGGTCAGTCTTACTTCTAGCAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTTTTTTTGGTTTGATT-AATAACAATAAAT--TAAGATTGTTTA---TAGGTTCC-AAAA-TATTCATTTAACACAGTTTGAATAAG-TT-G---AGTAAGTAATC------CTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AGAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-TTCTCCTTCC--------TAT---TTT--AAAAACCTTTCTTTAT---ATCA--TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAATTTTACGT-ATATTTTGACCTAAAGCTAATAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGTTTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAC----ATTTTAAAATCTGATATTACATAGAAATG-AAAATTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAA-TACAGTTG-TTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGC-TTGTATAATGCTTACTATAATGAAAC--TTGTACATGTAT-A------TATTGCA---TGTTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACAC----CATTTTACAATAAACAT-AAGTAAAA-AATT-T---AGCTTTTACCTTTTTAAT-TGAAAcc
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gi|22 : agtccttagcaataacttaataataagtgactaaaagatatagttccgtttctctctttcctattaggtTTCATAAAATA-------------------AGTCAATAAAA--ATAAC-TTTGAATATTTAGCCAATAACAATCCATTATAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTT
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gi|21 : CAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAGTAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTTAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTTATAATTATGATTTTCTTATCAAATGTGATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACATGTCCTGGAAATGAGCAATGA-TGTac
gi|18 : AAACAATCTATAACAATCAAACAAGCCCCGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACA----CAGTCATGTCAACTCAAAATCAAATGACTA----TT------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAAAACTTGAATTTTATAA---CTGATTGACTAAG----ATTTTAAAATTTGATATTACATAGAAATG-AAAATTTAAATAC-----CTCAT----------TACAGTTG-TTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGC-TTGTATATTGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAGCAAAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTTCAAACAATCAGATACATACAC----
gi|16 : aatatATCAAGCATGCCAAGGAAACGAGCAATTAATGACCTAAATCTCA----------------------AACTCCAAATCAGATGATTA----TTATATATATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAACTTTACTTGGATTTTATAA---CTGATTGATTTAGAATCACTT----ATGTTATATGACAAGGAAATGAAAAATTTAAATACCTTCTAATATTAACTCAAATTACAGTTG-TTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTTTTACAACAT--GGCTTTGTATAATCATTACTCTAATTGAAC--T------TGTAT-A------AACTACA---TATTAAT-CATATTCACACCTAATAATTAAAGTTATACAAAC-ATCAGACAAATATAC----CAGTTTTCAATAAACAT-c
gi|17 : ----CA----TGTCAACTCAAAATTAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTTGATTTTATAA---CTGATTGACTA---------------TTTGATATGGTATAAAACTG-AAAATTTAAATACCTTCTCTTATAAACTAAAA-TACAGTTG-TTAATAACACCTCAAGGGTTTCGTGTTACAATCT--GAC-TTGTATAATGATTACACTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTAA---ACTCA-CAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACACATATTT----CAATTTACAATAAACAT-A-----------T-T---AA--TTT---TTTTTAGC-T----TTTACCATTT-TATTTTAAATTT-ATTATTTTTATTTACT-----ACAGCAATAAAATTATAACtatcgaattaagcttatttttatttttt
gi|7 : ATATCATAAGTTCTGATTGACTAAG----ATTTTAATATTTGATATTACATAGAAATG-AAAATTTAAATACCTTCTCTTAGTAAGTAAAA-TACAGTTGTTATTC-ACACCTCAAGGGTTTCGTGTTACACCAT--GGC-TTGTATAATGATTACTCTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGAATATTATTAAT-AAAATTCTCAC---CTAA-CAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACATATATAC----CATTTTACAATAAACAC-AACT-AAA-AATTGT---AACTTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTT---ATTTTGTTATTTTTATT-ATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTAAT
gi|23 : tatcaccgaactctgaatcatgcctaattattgttggccttttgattctaacaagttagcgtaagctttagcaaagtgggaaattagctggtaggcagcctatacacacctggtattttgatgacacgtggggtcagtctaacttctaatagtagacttaactcaacgtctaatacagcacacaagtcttctggtgttaacacttttatttttgatgatttaatacaaagatagtttacagtttccaaaaatattaaattaacacagtttgaataagttcgtaaataaaagtagtccttagtgataatttaaaataattgactaaagatttagttctgtttggttattgcaaattatataatggctagtgttatgccacttaaaattctaagttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatctatatgtatccctccttaatatttaaaaacctttctttTT-T---AGCTTTTACCATTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTT---ATTTTATTATTTTTGTT-ATATGATAACAGCAATAAAATTGTAACAGTAATTTTATGacctgttacataaattatgtaat
gi|25 : tTT-T---AGCTTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATT----TTT---AT---A--ATTTTTATT-ATTTGCTAACAGCAGTAATTTTAT
Alignments
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lowQualScore : . .. . . . . . .... ... ..... .... . .. .. . . . .... . .. . . . . ........ . . ..... ...... ......... . . . ... .. ..... ............... .. . . ... . . . ... . ..... .... .... ....... ... ... . . . . .. . . .. ...... . ...... ... . ... . . ....... ... . ... .... . .
lowQualScore : 6 33 3 3 3 3 6 1111 888 33333 4444 5 55 55 6 7 7 8888 7 22 7 9 7 5 22222222 1 3 77777 888888 222222222 1 9 9 999 99 77777 777777777777777 77 7 7 000 1 9 5 444 5 44444 1111 1111 1111111 000 000 9 9 9 7 99 9 0 99 222222 9 222222 000 9 222 3 5 9999999 000 1 444 5555 3 6
consensus : TGTCACCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGNTT-GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTC-TAAGTAAGTAATCGTAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCTTCTCCTCTA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-T-A-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
Reference ( family-2657 ) : TGTCACCGAACTCTGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGNTT-GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTCTTAAGTAAGTAATCGTAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCTTCTCCTCTA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-T-A-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
gi|1 : TCACCGAACTCTGAATTGTGCCTTATTATTGTCGGCCTTTTTGTTTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGGTGACACACGTGGGGTCAGTCTTACTTCTAGCAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTTTTTTTGGTTTGATT-AATAACAATAAA-TT-AAGATTGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTCATTTAACACAGTTTGAATAAGTT---GAGTAAGTAATC------CTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AGAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA------TTCTCCTTCC-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAATTTTACGT-ATATTTTGACCTAAAGCTAATAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGTTTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAACATT---TTAAAATCTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGCTTACTATAATGAAAC--TTGTACATGTAT-A------TATTGCA---TGTTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-TAA-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAA
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gi|11 : AGTCCTTAGCAATAACTTAATAATAA-GTGACTAAAAGATATAGTTCCGTTTac
gi|11 : CTCTA-T-ATATATTA--AAAAATCTTCCTTTATATTA-----CAAGTCCCTAAAATAGA---------------TAAGCCAATAAAA--TTAAC-TTT--ATATTTAACCAATAAAAAT-TATTTTATC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTAGCAT-AAATTTTTATCTAAAGCTACTAA---------AATTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAAC-ATACCA-------------TGGAAATTAGCAATTT-TGTCAT---TCTC---T---------------TGTCAAATCAAAATCAAATGATTA----T-------ATTGACATCTGCAGGCTTTTCTCCAAAACA-TAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAATATTTGATATGGCATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACAACAT--GGCTT-GTATAATGATTACTGTAATTAAAC--T------TGTATAA------AACTGCG---TATTAAC-AAAATTCTCACctctctttcctattaggtctctatatatattaaaaaatcttcctttatattacaagtccctaaaatagataagccaataaaattaactttatatttaaccaataaaaattattttatcaattaaccaataaattctagtttagcataaatttttatctaaagctactaaaattaataattaagattttcttatcaaatgtaatcaacataatataatcaaacaaacataccatggaaattagcaattttgtcattctcttgtcaaatcaaaatcaaatgattatattgacatctgcaggcttttctccaaaacataatacttggattttataactgattgactaagattttaatatttgatatggcatagaaatgaaaatttaaataccttctcttattaactaaaatacagttgttattaacacctcaagggtttcttgttacaacatggcttgtataatgattactgtaattaaacttgtataaaactgcgtattaacaaaattctcac
gi|12 : agtccttagcaataacttaataataagtgactaaaagatatagttccgtttctctctttcctattaggtAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACAC-C-TGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTTA----ATT---CAG-----TGTCCATTACAGTTCACAAGTCTTTTGGTGTTTAATACTTTTATTTTGGTTT-GATT-AATAACAATAAT-GT-AAGACAGTTTATAGGTTCG-AAAA-TATAAAGTTAACACAGTTTAAATAAGTTCTTAAGTAAGTAATCGTAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACCAAGTCCTATCTCTCCTGCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA--TTC--TCTCTTCAA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----CAAGTTCCTAAAATAAAATTAACTTTGAATATTTAACCAATAAAA--ATCAT-TTTAA----TTAACCAATGA------------------------------ATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACATAAAGCTGTTAAGCTGCTTGAAGTTAACAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAATAT
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gi|23 : tgtttaaatattattaattaattattatttttcTT-T---AGC----TTTTACCATTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTGTTATATGATAACAGCAATAAAATTGTAACAGTAATTTTATGtta
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gi|5 : c-GGTTCTAACCAGTTGGTGTAAGATTA-AG-C-AA-GTGGGGGATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGATATTT-CCATGACACACCTGGGGTCAGTCTTATTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---TAA-----TGTCCAATGCAGTGCACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGAT--GATTGAATA-CAATAGG-TTTAAGATAG-------GTTCC-AAAA-TATTAAATTATCACCATTCGAATAAGTTT----GTAAAGGATAATAGTCCTTGGTAATAATTT-AAAATTA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATCGTAAATTATTTAATGGCTACCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTGTCTTTC--TCTCTTACTTATCT-----ATCTATATATGTA-AT-----CTCTTCAT-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAGC-TTTGAA-ATTTAACCAATAAAATT-CATTTTAAC---AACTAACCAATGAATTTTAGTTTAACAT-ATATTTTGGCCTAAAGCTGTTAAGCTGCTTGAAGTTAATACTTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACACACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTTGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGAGTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTTCATAAAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTCATTAACTAAAAA-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACAACAT--GGCTT-GCATAATGATTACTCTAATGAAAC--T------TGTAT-A------T------------TAAC-AAAATTCTCACCTA---A-CAAAGCT------ACAA------ACATATTTCATTTTACAATAAACATA---T-T-AA---ATTT-TTTTCGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTACTTTTATTTATTGTATTATTTCTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACc
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gi|7 : TATCACCGAACTCTGAATCATGCCTAATTATTGTTGGCCTTTT-GATTCTAACAAGTTAGCGTAAGCTTT-AG-C-AAAGTGGGAAATTAGCTGGTAGGCAGCCTATACACACCTGGTATTT-TGATGACAC--GTGGGGTCAGTCTAACTTCTAATAGTAGACTTA----ACT---CAA-----CGTCTAATACAGCACACAAGTCTTCTGGTGTT-AACACTTTTATTTTTGAT--GATTTAATA-CAA---------AGATAGTTTACAGTTTCC-AAAAATATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTCGTAAATAA--AA--GTAGTCCTTAGTGATAATTT-AAAATAA-TTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGTTATTGCAAATTATATAATGGCTAGTGTTATGCCACT--------TAAAA-TTCTAAGTTCTAattt
gi|7 : TATCT-----AT------ATGTA---TCC--CTCCTTAA-T-AT---TT---AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCT-------GA---------------TTGAC---TAAGATTTTAATATTTG-ATATT--AC--ATAGAAAT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatctatatgtatccctccttaatatttaaaaacctttctttatatcataagttctgattgactaagattttaatatttgatattacatagaaatgaaaatttaaataccttctcttagtaagtaaaatacagttgttattcacacctcaagggtttcgtgttacaccatggcttgtataatgattactctaatgaaacttgtatatactgaatattattaataaaattctcacctaacaaagctctacaaacatcagacatatataccattttacaataaacacaactaaaaattgtaacttttacctttttaattgaaatttattatttttatttattttgttatttttattatttgataacagcaataaaattataacagtaatttaatacctgttacataaattatgtaat
gi|7 : tatcaccgaactctgaatcatgcctaattattgttggccttttgattctaacaagttagcgtaagctttagcaaagtgggaaattagctggtaggcagcctatacacacctggtattttgatgacacgtggggtcagtctaacttctaatagtagacttaactcaacgtctaatacagcacacaagtcttctggtgttaacacttttatttttgatgatttaatacaaagatagtttacagtttccaaaaatattaaattaacacagtttgaataagttcgtaaataaaagtagtccttagtgataatttaaaataattgactaaagatttagttctgtttggttattgcaaattatataatggctagtgttatgccacttaaaattctaagttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATCATAAGTTCTGATTGACTAAGATT---TTAATATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTAGTAAGTAAAAT-ACAGTTGTTATTCACACCTCAAGGGTTTCGTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTCTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGAATATTATTAAT-AAAATTCTCACC---TAA-CAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACATATATACCATTTTACAATAAACACAAC-T-A-AA---AATTGT---AAC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTGTTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTAATgaaaatttaaataccttctcttagtaagtaaaatacagttgttattcacacctcaagggtttcgtgttacaccatggcttgtataatgattactctaatgaaacttgtatatactgaatattattaataaaattctcacctaacaaagctctacaaacatcagacatatataccattttacaataaacacaactaaaaattgtaacttttacctttttaattgaaatttattatttttatttattttgttatttttattatttgataacagcaataaaattataacagtaatttaatacctgttacataaattatgtaat
gi|8 : tatcaccgaactctgaatcatgcctaattattgttggccttttgattctaacaagttagcgtaagctttagcaaagtgggaaattagctggtaggcagcctatacacacctggtattttgatgacacgtggggtcagtctaacttctaatagtagacttaactcaacgtctaatacagcacacaagtcttctggtgttaacacttttatttttgatgatttaatacaaagatagtttacagtttccaaaaatattaaattaacacagtttgaataagttcgtaaataaaagtagtccttagtgataatttaaaataattgactaaagatttagttctgtttggttattgcaaattatataatggctagtgttatgccacttaaaattctaagttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatctatatgtatccctccttaatatttaaaaacctttctttGTTTGAATAAGTTCATAAGTAAGTAATCGTAGTCCTTAGTAATATTTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAACGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCT---CTTTTA-T--T---TTT--AAAAACACTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTGAAATGGA---------------TTAGCCAATAACA--TTAAC-TTTGAATATTAAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCAATTAAGCTGGTAGAAGTTAATAATTAAGATGTTCTTATCAAGTGTAATCAACATAATATAATTAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTTGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGATGATTTTTATCAAAACAATAATACTTTGATTTTATAA---CTGATTGATTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATTATGATTACTATAATGAAAC--T------TATAT-A------TACTGCA---TGTTAAT-AAAATTCTCACCTTTTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-CAA-AA---AAAT-T---AGC-------------TTTAATCTGAAAATTATTATTTTTATATATTTTGTTTATTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTAacctgttacataaattatgtaat
gi|9 : gGTCCTTAGTAATAATTC-AAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGCCATCATAAATTACATAATGGCTAGCGTTATGCCACT--------TAAAAATTCTAAGTCCTATCTCTCTCTCTCT--CTTATTT-----AT------ATGTATATCCCTTA------A-T-AT---TT---AAAGACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTTCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATGAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACATTAAGCTGTTCAGCTGCTAAAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAA----------TATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAAAAAGTCGTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAAC------------------TCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACA-TAATACTTGTATATCATAA---CAGATTAACTAAGATT---TTAATATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACAAAAAT-ACAGTTGTTATTGACACCTCAAGGGTTCTGTGTTACAAGAT--GGCTT-ATATAATGATTACTGTAATGCAAC--T------TGTAT-A------TAATGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACC---TAA-CAAAGTTCTACAAAT-ATCAGACATATACCCAATATTTCAATAAACATAAA-T-G-AAT--ATTT-T---TGC----TTTTACCTCTTTAAC-CTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTA
Alignments
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Reference ( family-2657 ) : TGTCACCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGNTT-GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTT-C-T-AAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCTTCTCCTCTA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-T-A-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
gi|1 : TCACCGAACTCTGAATTGTGCCTTATTATTGTCGGCCTTTTTGTTTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGGTGACACACGTGGGGTCAGTCTTACTTCTAGCAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTTTTTTTGGTTTGATT-AATAACAATAAA-TT-AAGATTGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTCATTTAACACAGTTTGAATAAGTT-----GAGTAAGTAATC-------CTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AGAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA------TTCTCCTTCC-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAATTTTACGT-ATATTTTGACCTAAAGCTAATAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGTTTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAACATT---TTAAAATCTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGCTTACTATAATGAAAC--TTGTACATGTAT-A------TATTGCA---TGTTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-TAA-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAA
gi|10 : TCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TATGAATATTTAACCAATAAAAAT-CTTTTTAAC---AATTAACCAATGACTTCTAGTTTTACATTATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTTATAATTAAGATCTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACCATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TTTCAT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTTACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAG-TTTAAATACCTTCTCTTATTAAATAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAACGGTTTCTTATTATACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTCTGATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCG---TATTTAT-AAAATTCTCACCTTTTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-TAA-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TAATATTTATTATTTTTATTTATTTTATTGTTTTTATCATTTGATAACAGAAATAAAATTATAACAGTAATTTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcctgtaacagatgtaattagcaaaactcgttgataaatatgtagt
gi|11 : AGTCCTTAGCAATAACTTAATAATAA-GTGACTAAAAGATATAGTTCCGTTTac
gi|11 : CTCTA-T-ATATATTA--AAAAATCTTCCTTTATATTA-----CAAGTCCCTAAAATAGA---------------TAAGCCAATAAAA--TTAAC-TTT--ATATTTAACCAATAAAAAT-TATTTTATC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTAGCAT-AAATTTTTATCTAAAGCTACTAA---------AATTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAAC-ATACCA-------------TGGAAATTAGCAATTT-TGTCAT---TCTC---T---------------TGTCAAATCAAAATCAAATGATTA----T-------ATTGACATCTGCAGGCTTTTCTCCAAAACA-TAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAATATTTGATATGGCATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACAACAT--GGCTT-GTATAATGATTACTGTAATTAAAC--T------TGTATAA------AACTGCG---TATTAAC-AAAATTCTCACctctctttcctattaggtctctatatatattaaaaaatcttcctttatattacaagtccctaaaatagataagccaataaaattaactttatatttaaccaataaaaattattttatcaattaaccaataaattctagtttagcataaatttttatctaaagctactaaaattaataattaagattttcttatcaaatgtaatcaacataatataatcaaacaaacataccatggaaattagcaattttgtcattctcttgtcaaatcaaaatcaaatgattatattgacatctgcaggcttttctccaaaacataatacttggattttataactgattgactaagattttaatatttgatatggcatagaaatgaaaatttaaataccttctcttattaactaaaatacagttgttattaacacctcaagggtttcttgttacaacatggcttgtataatgattactgtaattaaacttgtataaaactgcgtattaacaaaattctcac
gi|12 : agtccttagcaataacttaataataagtgactaaaagatatagttccgtttctctctttcctattaggtAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACAC-C-TGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTTA----ATT---CAG-----TGTCCATTACAGTTCACAAGTCTTTTGGTGTTTAATACTTTTATTTTGGTTT-GATT-AATAACAATAAT-GT-AAGACAGTTTATAGGTTCG-AAAA-TATAAAGTTAACACAGTTTAAATAAGTT-C-TTAAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACCAAGTCCTATCTCTCCTGCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA--TTC--TCTCTTCAA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----CAAGTTCCTAAAATAAAATTAACTTTGAATATTTAACCAATAAAA--ATCAT-TTTAA----TTAACCAATGA------------------------------ATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACATAAAGCTGTTAAGCTGCTTGAAGTTAACAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAATAT
gi|13 : GCCACCAAACTCTGAATCGTACCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTT-AG-C-AAAGTGGGGAATAAGCTGGTAGGCAGCCTACATGCAACTGGTATTT-CAATAACACTTGCGGGGTCAGTCTAACTTCTAATAGTAGACTTA----ACT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTCTGGTG-TTAACACTTTTATTTTTGA-T-GATT-AAATACAATAGG-TT-AAGATAGTTTACAGGTTTCAAAAA-CATTAAATTAACACAGTTCGAATAAGTT-C-----ATAAATAATTG-TAGTCCTTAGTAATAA-TTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTTACTATCGTAAGTTCTATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTGTCTTTCTCTATCTTACTTATCT-----AC------ATGT--ATTC--TCTCTTCTA-T-AA---TTTGGAAAAACCTTTCTTTATATCATAATTTAAGTTCCTAAAATGAA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGTATA
gi|14 : GTTTATAAGTTCC-ACAA-TATTAAATGAACACAGTTTGAATAAGTT-C-----GTAAAGAATAG-TAGTCCTTAGTAATAATTT-AAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCATTTGGCTATTGTTAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCACT--------CAAAA-TACTAAATCCTGCCTCTCTCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATCTA---TCCT----CTCTAAT-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATTTCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATGAAAAT-CATTTTAAT----------CAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAACATTTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAATCAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGAAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCT--------------CG----TGTTAACTCAAAATCAAACGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTT
gi|15 : TCACCCAACTCTGAATCGTGCCTAATTAT-GTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAATTGGTGTAAGCTTA-AG-C-CA-ATGGGGAATTAGCTGGTTTGTAGCCTACACACAACTGATATTT-CAATGACACACAAGGGGTCAGTCTTACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---TAA-----TGTCCAATGCAGTACACAAGTTTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGA-T-GATTGAAT-ACAATAGGTTT-AAGATAGTTTATAGGTTCA-AAAA-CA--A---CAACA---TTTGAATAAGTT-T-----GTAAAGAATAGTTAGTCCTTAGTAATAA-TTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGACTAGCATTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTTT--TTCTCTTACTTATCTATTTAAT------ATGTA------TTCTTTTCTC-T-AT---TTT--AAAA
gi|16 : ATCAAGCATGCCAAGGAAACGAGCAATTAATGACCTAAATCTCA----------------------AACTCCAAATCAGATGATTA----TTATATATATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAACTTTACTTGGATTTTATAA---CTGATTGATTTAGAATCACTTA---TGTTATATGACAAGGAAATGAAAAATTTAAATACCTTCTAATATTAACTCAAATTACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTTTTACAACAT--GGCTTTGTATAATCATTACTCTAATTGAAC--T------TGTAT-A------AACTACA---TATTAAT-CATATTCACACCTAATAATTAAAGTTATACAAAC-ATCAGACAAATATACCAGTTTTCAATAAACAT----T-ATCG---AATT-A---AGCTTATTTTTATTTTTT
gi|17 : ----CA----TGTCAACTCAAAATTAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTTGATTTTATAA---CTGATTGACTA--------------TTTGATATGGTATAAAACTGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATAAACTAAAAT-ACAGTTGTTAATAACACCTCAAGGGTTTCGTGTTACAATCT--GACTT-GTATAATGATTACACTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTAA---ACTCA-CAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACACATATTTCAATTTACAATAAACATA---T-T-AATTTTTTT-T---AGC----TTTTACCATTTTATT-TTAAATTTATTATTTTTATTTACT----------------------ACAGCAATAAAATTATAAC
gi|18 : AATATAA----ACAATCTATAACAATCAAACAAGCCCCGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACA----CAGTCATGTCAACTCAAAATCAAATGACTA----TT------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAAAACTTGAATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATAC-----CTCAT---------T-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATATTGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAGCAAAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTTCAAACAATCAGATACATACACC
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gi|21 : CAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAGTAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTTAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTTATAATTATGATTTTCTTATCAAATGTGATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACATGTCCTGGAAATGAGCAATGA-TGT
gi|22 : TTCATAAAATA-------------------AGTCAATAAAA--ATAAC-TTTGAATATTTAGCCAATAACAATCCATTATAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTT
gi|23 : tgtttaaatattattaattaattattatttttcTT-T---AGC----TTTTACCATTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTGTTATATGATAACAGCAATAAAATTGTAACAGTAATTTTATGtta
gi|24 : tGTCACTGAACTTGGAATCGTAGCTTACTGTTGTTGGCCTTTA-GATTCGAGCCAGTTGGTGTAAGCTTT-AGAA-AA-GTGGGGAATCAGCTG
gi|25 : TT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTA--TA-------ATTTTTATTATTTGCTAACAGCAGTAATTTTAT
gi|3 : TCACCGAACTCCAAATCGTGCCTAATTATTGTCGACCTTTT-GGTTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGTAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTTTTATTT-CGATGACACATGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTTA----ATT---CAA-----TATCCAATACAGTACACAAGTCTTT-GGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTTT-GATT-AATAACATTAAA-GT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTGT-T-AAGTAAGTAATCA-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CCGACT-TAATATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATATTGGCTAGCGTTATGCCATC--------TAAAA-TAC-AAGTCCTATCTCTCCCTCTATTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCTTCTCCTCTA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATAA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCATTAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATGAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATTATTTAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAGCTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---TTGATTGACTAAGATT---TCAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTTTTAACACCTCAAGAGTTTCTTGTTACACCACCAGGCTT-GTATAATGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AACATTCTCACCTATTAA-CAAAGTTCTACAAAC-ATCAGATACATATACCATTTTACAATAAACATAGA-T-A-AA---AATT-T---AAG----TTTTACCTTTTTAAT-TAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAACAGCAATAAAATTAT-ACAGTAATTTTATGgc
gi|4 : TGCCTAATTATTGTCGGCCATTT-GATTCTAACCAATTGGTGTAAGCATC-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTTGTAGGCAGCCTACACACAATTGGTATTT-CGATGACACACATGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCAGTAGACTTA----ATT---CAG-----TGTCCAATACAATACATAAATCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTCTGGTTT-GATT-AATAACAATAAA-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTT-CTT-AAGTAAGTAACAA-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AATGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCATAAATTATATAATGGCTAGCGTTGTGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCGTCTCTTATTTATCT-----AT------ATGT--ATTCTCTTTCC-----T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAT-TTTGAATAATTTACCAATAAAAAT-CATTATAACAATAATTAATCAATAAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTGGAAGTTAATAATTAAGGTTTTCTTATCAAATGTAATCAGCATAATATAATCAAACAAACTATAACAGTCAAACAAGTCCTGGAAATAAGCAATTA-TGTTGT---TCTTATGTCAACACTGTCA----TGTCAACTCAAAATCAATTGATTATAATT-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATGA---CTGAATGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-AGAGTTGTTAATAACACGTAAAGGGTTTCTTGTTACACCTT--AGCTT-GTATAACGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-ATATTGGTACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACACACAATCAGATATATACACCATTTTACAATAAACGTAAGTT-A-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTATATTTATTTTATTATTTTAATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATGcc
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gi|7 : tatcaccgaactctgaatcatgcctaattattgttggccttttgattctaacaagttagcgtaagctttagcaaagtgggaaattagctggtaggcagcctatacacacctggtattttgatgacacgtggggtcagtctaacttctaatagtagacttaactcaacgtctaatacagcacacaagtcttctggtgttaacacttttatttttgatgatttaatacaaagatagtttacagtttccaaaaatattaaattaacacagtttgaataagttcgtaaataaaagtagtccttagtgataatttaaaataattgactaaagatttagttctgtttggttattgcaaattatataatggctagtgttatgccacttaaaattctaagttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATCATAAGTTCTGATTGACTAAGATT---TTAATATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTAGTAAGTAAAAT-ACAGTTGTTATTCACACCTCAAGGGTTTCGTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTCTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGAATATTATTAAT-AAAATTCTCACC---TAA-CAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACATATATACCATTTTACAATAAACACAAC-T-A-AA---AATTGT---AAC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTGTTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTAATgaaaatttaaataccttctcttagtaagtaaaatacagttgttattcacacctcaagggtttcgtgttacaccatggcttgtataatgattactctaatgaaacttgtatatactgaatattattaataaaattctcacctaacaaagctctacaaacatcagacatatataccattttacaataaacacaactaaaaattgtaacttttacctttttaattgaaatttattatttttatttattttgttatttttattatttgataacagcaataaaattataacagtaatttaatacctgttacataaattatgtaat
gi|8 : tatcaccgaactctgaatcatgcctaattattgttggccttttgattctaacaagttagcgtaagctttagcaaagtgggaaattagctggtaggcagcctatacacacctggtattttgatgacacgtggggtcagtctaacttctaatagtagacttaactcaacgtctaatacagcacacaagtcttctggtgttaacacttttatttttgatgatttaatacaaagatagtttacagtttccaaaaatattaaattaacacagtttgaataagttcgtaaataaaagtagtccttagtgataatttaaaataattgactaaagatttagttctgtttggttattgcaaattatataatggctagtgttatgccacttaaaattctaagttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatctatatgtatccctccttaatatttaaaaacctttctttGTTTGAATAAGTT-CAT-AAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATATTTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAACGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCT---CTTTTA-T--T---TTT--AAAAACACTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTGAAATGGA---------------TTAGCCAATAACA--TTAAC-TTTGAATATTAAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCAATTAAGCTGGTAGAAGTTAATAATTAAGATGTTCTTATCAAGTGTAATCAACATAATATAATTAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTTGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGATGATTTTTATCAAAACAATAATACTTTGATTTTATAA---CTGATTGATTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATTATGATTACTATAATGAAAC--T------TATAT-A------TACTGCA---TGTTAAT-AAAATTCTCACCTTTTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-CAA-AA---AAAT-T---AGC-------------TTTAATCTGAAAATTATTATTTTTATATATTTTGTTTATTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTAacctgttacataaattatgtaat
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Reference ( family-2657 ) : TGTCACCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGNTT-GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTT-C-T-AAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCTTCTCCTCTA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-T-A-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
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gi|11 : AGTCCTTAGCAATAACTTAATAATAA-GTGACTAAAAGATATAGTTCCGTTTac
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gi|7 : TATCACCGAACTCTGAATCATGCCTAATTATTGTTGGCCTTTT-GATTCTAACAAGTTAGCGTAAGCTTT-AG-C-AAAGTGGGAAATTAGCTGGTAGGCAGCCTATACACACCTGGTATTT-TGATGACAC--GTGGGGTCAGTCTAACTTCTAATAGTAGACTTA----ACT---CAA-----CGTCTAATACAGCACACAAGTCTTCTGGTGTT-AACACTTTTATTTTTGAT--GATTTAATA-CAA---------AGATAGTTTACAGTTTCC-AAAAATATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTT-C-----GTAAATAAAAG-TAGTCCTTAGTGATAATTT-AAAATAA-TTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGTTATTGCAAATTATATAATGGCTAGTGTTATGCCACT--------TAAAA-TTCTAAGTTCTAattt
gi|7 : TATCT-----AT------ATGTA---TCC--CTCCTTAA-T-AT---TT---AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCT-------GA---------------TTGAC---TAAGATTTTAATATTTG-ATATT--AC--ATAGAAAT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatctatatgtatccctccttaatatttaaaaacctttctttatatcataagttctgattgactaagattttaatatttgatattacatagaaatgaaaatttaaataccttctcttagtaagtaaaatacagttgttattcacacctcaagggtttcgtgttacaccatggcttgtataatgattactctaatgaaacttgtatatactgaatattattaataaaattctcacctaacaaagctctacaaacatcagacatatataccattttacaataaacacaactaaaaattgtaacttttacctttttaattgaaatttattatttttatttattttgttatttttattatttgataacagcaataaaattataacagtaatttaatacctgttacataaattatgtaat
gi|7 : tatcaccgaactctgaatcatgcctaattattgttggccttttgattctaacaagttagcgtaagctttagcaaagtgggaaattagctggtaggcagcctatacacacctggtattttgatgacacgtggggtcagtctaacttctaatagtagacttaactcaacgtctaatacagcacacaagtcttctggtgttaacacttttatttttgatgatttaatacaaagatagtttacagtttccaaaaatattaaattaacacagtttgaataagttcgtaaataaaagtagtccttagtgataatttaaaataattgactaaagatttagttctgtttggttattgcaaattatataatggctagtgttatgccacttaaaattctaagttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATCATAAGTTCTGATTGACTAAGATT---TTAATATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTAGTAAGTAAAAT-ACAGTTGTTATTCACACCTCAAGGGTTTCGTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTCTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGAATATTATTAAT-AAAATTCTCACC---TAA-CAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACATATATACCATTTTACAATAAACACAAC-T-A-AA---AATTGT---AAC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTGTTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTAATgaaaatttaaataccttctcttagtaagtaaaatacagttgttattcacacctcaagggtttcgtgttacaccatggcttgtataatgattactctaatgaaacttgtatatactgaatattattaataaaattctcacctaacaaagctctacaaacatcagacatatataccattttacaataaacacaactaaaaattgtaacttttacctttttaattgaaatttattatttttatttattttgttatttttattatttgataacagcaataaaattataacagtaatttaatacctgttacataaattatgtaat
gi|8 : tatcaccgaactctgaatcatgcctaattattgttggccttttgattctaacaagttagcgtaagctttagcaaagtgggaaattagctggtaggcagcctatacacacctggtattttgatgacacgtggggtcagtctaacttctaatagtagacttaactcaacgtctaatacagcacacaagtcttctggtgttaacacttttatttttgatgatttaatacaaagatagtttacagtttccaaaaatattaaattaacacagtttgaataagttcgtaaataaaagtagtccttagtgataatttaaaataattgactaaagatttagttctgtttggttattgcaaattatataatggctagtgttatgccacttaaaattctaagttctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatctatatgtatccctccttaatatttaaaaacctttctttGTTTGAATAAGTT-CAT-AAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATATTTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAACGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCT---CTTTTA-T--T---TTT--AAAAACACTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTGAAATGGA---------------TTAGCCAATAACA--TTAAC-TTTGAATATTAAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCAATTAAGCTGGTAGAAGTTAATAATTAAGATGTTCTTATCAAGTGTAATCAACATAATATAATTAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTTGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGATGATTTTTATCAAAACAATAATACTTTGATTTTATAA---CTGATTGATTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATTATGATTACTATAATGAAAC--T------TATAT-A------TACTGCA---TGTTAAT-AAAATTCTCACCTTTTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-CAA-AA---AAAT-T---AGC-------------TTTAATCTGAAAATTATTATTTTTATATATTTTGTTTATTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTAacctgttacataaattatgtaat
gi|9 : gGTCCTTAGTAATAATTC-AAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGCCATCATAAATTACATAATGGCTAGCGTTATGCCACT--------TAAAAATTCTAAGTCCTATCTCTCTCTCTCT--CTTATTT-----AT------ATGTATATCCCTTA------A-T-AT---TT---AAAGACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTTCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATGAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACATTAAGCTGTTCAGCTGCTAAAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAA----------TATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAAAAAGTCGTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAAC------------------TCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACA-TAATACTTGTATATCATAA---CAGATTAACTAAGATT---TTAATATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACAAAAAT-ACAGTTGTTATTGACACCTCAAGGGTTCTGTGTTACAAGAT--GGCTT-ATATAATGATTACTGTAATGCAAC--T------TGTAT-A------TAATGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACC---TAA-CAAAGTTCTACAAAT-ATCAGACATATACCCAATATTTCAATAAACATAAA-T-G-AAT--ATTT-T---TGC----TTTTACCTCTTTAAC-CTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTA
blockSeqs : T . TT A A A A T ACAT GGA TTTGT TTT G AA GT T A A CTTAA AGT A A A TAAGATAC A C ATTTA CTATAT ATATCCCTT T A A ATA GG TAATT ATTAACTTTGAATAT TT A C AAT T A AAA ACTGT GTCA TAAT TATATAT GTT CAC A A T CA T C TT . A TATTGG TAT A TTT T A AGTAA TTT G TTT TTAT C T
blockSeqs : T . T . . A . A . . . TTT G TA T . A A GTTAA CG T . G . . T . . AATTCCTT A . . A . . . . . . . . . . A . . T . . T . . . . G . . . . . . TAA . A AGTTA T . . . . T
blockSeqs : C . A . . A . A . . . TTT T TA G . . . GTTAA TG T . . . . T . . AATTCCTT T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . C . . . . . . TAT . A AGCAA . . . . . N
blockSeqs : G . A . . A . A . . . TTT T AA G . . . CTTAA AG T . . . . C . . ATTCTCT T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . C . . . . . . TAC . A GATA . . . . . T
blockSeqs : G . T . . . . A . . . AT . AA A . . . CATAA CG T . . . . C . . AATTCCT T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . A . . . . . . TAT . A GATA . . . . . G
blockSeqs : C . T . . . . A . . . AT . AA A . . . C CA T . . . . C . . ATTCT T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . A . . . . . . TAT . . ACTA . . . . . T
blockSeqs : T . A . . . . A . . . AT . A A . . . C AA T . . . . C . . ATTCT T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . A . . . . . . TTT . . AATG . . . . . T
blockSeqs : T . C . . . . A . . . AT . A G . . . T AA A . . . . T . . ATCCT A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . A . . . . . . AC . . TAT . . . . . N
blockSeqs : . A . . . . G . . . AT . A A . . . T AG T . . . . . . . ATTCT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . TA . . TT . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . AT . A . . . . C AG . . . . . . . . ATCC A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . . . . . . . . TT . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . C CG . . . . . . . . ATT T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : AT** C****** CG* ATTCT**** ****** ANTA***
originalCons : TGTCACCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGNTT-GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTT-C-T-AAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTA-ATTCCTTCTCCTCTA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAAG-T-A-AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
finalCons : TGTCACCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGAT--GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTC------GTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATT--------TAAAA-TACTAAGTCCTATCTCTCCCTCTCTTACTTATCT-----AT------ATGTATTCT----CTCCTCTA-T-AT---TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAAC---AATTAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACA----CA----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTA----T-------ATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAANTA---AA---AATT-T---AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
Alignments
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lowQualScore : . . .. . . . . . .... ... ..... . .. . .. .. . . . ..... . . . . . . . . ........ . .. ... ..... . . ... . ... ... .. ..... ............... .. . . ... . . . ... . . ......... ....... .... ... ... . . . . .. . . .. ...... . ...... ... . ... . . .. .. . ..... . .. .... . .
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consensus : TGTCACCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGNTT-GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTC-TAAGTAAGTAATNG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTATCTCTCCCTCT--CTTACT---TATCT-----ATATGTA-T-TC--TCTCTTCTA-TA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAACAAT---TAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACAC----A----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAA-NT-AAA-AA-----TT-T--AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
Reference ( family-2657 ) : TGTCACCGAACTCCGAATCGTGCCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTN-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGAT--GATT-AATAACAATAAG-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTC----GTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTATCTCTCCCTCT--CTTACT---TATCT-----ATATGTA-T-TC--TCTCCTCTA-TA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAACAAT---TAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACAC----A----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTNTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAA-NT-AAA-AA-----TT-T--AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
gi|1 : TCACCGAACTCTGAATTGTGCCTTATTATTGTCGGCCTTTTTGTTTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGGTGACACACGTGGGGTCAGTCTTACTTCTAGCAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTTTTTTTGGTTTGATT-AATAACAATAAA-TT-AAGATTGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTCATTTAACACAGTTTGAATAAGTT-------GAGTAA--G-TAATCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AGAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTATCTCTCCCTCT--CTTACT---TATCT-----ATATGTA-T-TC--TC-CTTCC--TA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAACAAT---TAACCAATAAATTCTAATTTTACGT-ATATTTTGACCTAAAGCTAATAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGTTTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAACAC----A----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAACATT---TTAAAATCTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGCTTACTATAATGAAAC--TTGTACATGTAT-A------TATTGCA---TGTTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAA-GTAAAA-AA-----TT-T--AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAA
gi|10 : TCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TATGAATATTTAACCAATAAAAAT-CTTTTTAACAAT---TAACCAATGACTTCTAGTTTTACATTATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTTATAATTAAGATCTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAACCATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TTTCAT---TCTCATGTCAACAC----A----TGTCAACTCAAAATCAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTTACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAG-TTTAAATACCTTCTCTTATTAAATAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAACGGTTTCTTATTATACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTCTGATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCG---TATTTAT-AAAATTCTCACCTTTTAA-CAAAGCTCTACAAACAATCAGATACATACACCATTTTACAATAAACATAA-GTAAAA-AA-----TT-T--AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TAATATTTATTATTTTTATTTATTTTATTGTTTTTATCATTTGATAACAGAAATAAAATTATAACAGTAATTTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgcctgtaacagatgtaattagcaaaactcgttgataaatatgtagt
gi|11 : AGTCCTTAGCAATAACTTAATAATAA-GTGACTAAAAGATATAGTTCCGTTTac
gi|11 : TAAAA-GA-TATAG--------TTCCGTTTCTCTCTTT--CCTATTAGGTCTCT-----ATATATA-T-T--------------A--------AAAAATCTTCCTTTATATTA-----CAAGTCCCTAAAATAGA---------------TAAGCCAATAAAA--TTAAC-TTT--ATATTTAACCAATAAAAAT-TATTTTATCAAT---TAACCAATAAATTCTAGTTTAGCAT-AAATTTTTATCTAAAGCTACTAA---------AATTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACAAAC-ATACCA-------------TGGAAATTAGCAATTT-TGTCAT---TCTC---T---------------TGTCAAATCAAAATCAAATGATTAT-------A----TTGACATCTGCAGGCTTTTCTCCAAAACA-TAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAATATTTGATATGGCATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACAACAT--GGCTT-GTATAATGATTACTGTAATTAAAC--T------TGTATAA------AACTGCG---TATTAAC-AAAATTCTCACctctctttcctattaggtctctatatatattaaaaaatcttcctttatattacaagtccctaaaatagataagccaataaaattaactttatatttaaccaataaaaattattttatcaattaaccaataaattctagtttagcataaatttttatctaaagctactaaaattaataattaagattttcttatcaaatgtaatcaacataatataatcaaacaaacataccatggaaattagcaattttgtcattctcttgtcaaatcaaaatcaaatgattatattgacatctgcaggcttttctccaaaacataatacttggattttataactgattgactaagattttaatatttgatatggcatagaaatgaaaatttaaataccttctcttattaactaaaatacagttgttattaacacctcaagggtttcttgttacaacatggcttgtataatgattactgtaattaaacttgtataaaactgcgtattaacaaaattctcac
gi|12 : agtccttagcaataacttaataataagtgacAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-CGATGACAC-C-TGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTTA----ATT---CAG-----TGTCCATTACAGTTCACAAGTCTTTTGGTGTTTAATACTTTTATTTTGGTTT-GATT-AATAACAATAAT-GT-AAGACAGTTTATAGGTTCG-AAAA-TATAAAGTTAACACAGTTTAAATAAGTTCTTAAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAAA-TACCA-AG--------TCCTATCTCTCCTGCT--CTTACT---TATCT-----ATATGTA-T-TC--TCTCTTCAA-TA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----CAAGTTCCTAAAATAAAATTAACTTTGAATATTTAACCAATAAAA--ATCAT-TTTAA----TTAACCAATGA------------------------------ATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACATAAAGCTGTTAAGCTGCTTGAAGTTAACAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAATAT
gi|13 : GCCACCAAACTCTGAATCGTACCTAATTATTGTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTT-AG-C-AAAGTGGGGAATAAGCTGGTAGGCAGCCTACATGCAACTGGTATTT-CAATAACACTTGCGGGGTCAGTCTAACTTCTAATAGTAGACTTA----ACT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTCTGGTG-TTAACACTTTTATTTTTGAT--GATT-AAATACAATAGG-TT-AAGATAGTTTACAGGTTTCAAAAA-CATTAAATTAACACAGTTCGAATAAGTTC----ATAAATAATTG-TAGTCCTTAGTAATAA-TTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCGTTTTACTATCGTAAGTTCTATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTGTCTTTCTCTAT--CTTACT---TATCT-----ACATGTA-T-TC--TCTCTTCTA-TA-A-TTTGGAAAAACCTTTCTTTATATCATAATTTAAGTTCCTAAAATGAA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGTATA
gi|14 : GTTTATAAGTTCC-ACAA-TATTAAATGAACACAGTTTGAATAAGTTC----GTAAAGAATAG-TAGTCCTTAGTAATAATTT-AAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCCATTTGGCTATTGTTAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCACTCAAAA-TACTA-AA--------TCCTGCCTCTCTCTCT--CTTACT---TATCT-----ATATCTA-T-CC--TCTC---TAATA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATTTCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATGAAAAT-CATTTTAAT----------CAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAACATTTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAATCAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGAAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCT----------C----G----TGTTAACTCAAAATCAAACGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTT
gi|15 : TCACCCAACTCTGAATCGTGCCTAATTAT-GTCGGCCTTTT-GATTCTAACCAATTGGTGTAAGCTTA-AG-C-CA-ATGGGGAATTAGCTGGTTTGTAGCCTACACACAACTGATATTT-CAATGACACACAAGGGGTCAGTCTTACTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---TAA-----TGTCCAATGCAGTACACAAGTTTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGAT--GATTGAAT-ACAATAGGTTT-AAGATAGTTTATAGGTTCA-AAAA-CA--A---CAACA---TTTGAATAAGTTT----GTAAAGAATAGTTAGTCCTTAGTAATAA-TTTAAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATCGTAAATTATATAATGACTAGCATTATGCCATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTATCTTT--TTCT--CTTACT---TATCTATTTAATATGTA-T-TC--TTTTCTC---TA-T-TTT--AAAA
gi|16 : ATCAAGCATGCCAAGGAAACGAGCAATTAATGACCTAAATCTCA----------------------AACTCCAAATCAGATGATTATTATATATA----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAACTTTACTTGGATTTTATAA---CTGATTGATTTAGAATCACTTA---TGTTATATGACAAGGAAATGAAAAATTTAAATACCTTCTAATATTAACTCAAATTACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTTTTACAACAT--GGCTTTGTATAATCATTACTCTAATTGAAC--T------TGTAT-A------AACTACA---TATTAAT-CATATTCACACCTAATAATTAAAGTTATACAAAC-ATCAGACAAATATACCAGTTTTCAATAAACATTA-TC---G-AA-----TT-A--AGCTTATTTTTATTTTTT
gi|17 : C----A----TGTCAACTCAAAATTAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTTGATTTTATAA---CTGATTGACTA--------------TTTGATATGGTATAAAACTGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATAAACTAAAAT-ACAGTTGTTAATAACACCTCAAGGGTTTCGTGTTACAATCT--GACTT-GTATAATGATTACACTAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTAA---ACTCA-CAAAGCTCTACAAAC-ATCAGACACATATTTCAATTTACAATAAACAT-A-TT-----AATTTTTTT-T--AGC----TTTTACCATTTTATT-TTAAATTTATTATTTTTATTTACT----------------------ACAGCAATAAAATTATAAC
gi|18 : AATATAA----ACAATCTATAACAATCAAACAAGCCCCGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACAC----AGTCATGTCAACTCAAAATCAAATGACTATT------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAAAACTTGAATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATAC-----CTCAT---------T-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATATTGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAGCAAAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTTCAAACAATCAGATACATACACC
gi|19 : GTTGGTGTAAGCTTTTAG-C-AAAGTGGGGAACTAGCTGGTAGGTAGCCTACACACAACTGGTATTT-CTATGACACACGTGGGGTCAGTCTAACTT-TAATAGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGCACACAAGTCTTCAGGTG-TTAACACTTTTATTTTTGAT--GATT-AAATACAATAGG-TT-AAGATAGTTTACAGGTTCCAAAAA-TATTAAAATAACACAG
gi|2 : ctTGTCACCGAACTCCAAATCGTGCCTAATTATTATCGGCCTTTT-GGTTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTGGAAGGCAGCCTACACACAACTGGTATTT-TGATGACACACGTTCGGTCAGTGTAACTTCTAGCCGTAGACTTA----ATT---CAA-----TGTCCAATACAGTACACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTTT-GATT-AATAACAATAAA-GT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-GAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTGTTAAGTAAGTAATCG-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AAATATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATAATGGCTAGCGTTATGCAATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTATCTCTCCCTCT--ATTACT---TATCT-----ATATGTAAT-TCCTTCCCCTCTA-TA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATATAA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAACAAT---TAACCAATGAATTCTGATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGCTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATTATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATATCAACAC----A----TGTCAACTCTAAATCAGATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TCAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTATTTAACACCTCACGGGTTTCTTGTTACACCAT--GGCTT-GTATAATGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTACTAA-CAAAGTTCTACAAAC-ATCAGATACATATACTATTTTACAGTAAACATAG-AT-AAA-AA-----TT-T--AGG----TTTTACCTTTTTAAT-TAAAATTTATTATTTATATTTATTTCATTATTTTTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATG
gi|20 : CACCGAAAGCGAAATCGTGCCTAATTGTTGTCGGTCTTTA-GATTCGAACCAGTTGGTGTTAGCTTT-AG-CAAA-GTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCTTACACACAGCTGTTGTTTACGATGACGCACGTGGGATCTGTCTAACTT-TAATAGTAGACTTAACATATTGGACGATTTGTTGTCCAATACAGCACA
gi|21 : CAATAAAAAT-CATTTTAACAAT---TAACCAGTAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACCTTAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTTATAATTATGATTTTCTTATCAAATGTGATCAACATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAACATGTCCTGGAAATGAGCAATGA-TGT
gi|22 : TTCATAAAATA-------------------AGTCAATAAAA--ATAAC-TTTGAATATTTAGCCAATAACAATCCATTATAACAAT---TAACCAATAAATTCTAGTTTT
gi|23 : tgtttaaatattattaattaattattatttttc-----TT-T--AGC----TTTTACCATTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTATTTATTTTATTATTTTTGTTATATGATAACAGCAATAAAATTGTAACAGTAATTTTATGtta
gi|24 : tGTCACTGAACTTGGAATCGTAGCTTACTGTTGTTGGCCTTTA-GATTCGAGCCAGTTGGTGTAAGCTTT-AGAA-AA-GTGGGGAATCAGCTG
gi|25 : -----TT-T--AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTTTA--TA-------ATTTTTATTATTTGCTAACAGCAGTAATTTTAT
gi|3 : TCACCGAACTCCAAATCGTGCCTAATTATTGTCGACCTTTT-GGTTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTA-AG-C-AA-GTGGGTAATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTTTTATTT-CGATGACACATGTGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCCGTAGACTTA----ATT---CAA-----TATCCAATACAGTACACAAGTCTTT-GGTGTTTAACACTTTTATTTTGGTTT-GATT-AATAACATTAAA-GT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTGTTAAGTAAGTAATCA-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CCGACT-TAATATTTAGTTCCGTTTAGCTATTGTAAATTATATATTGGCTAGCGTTATGCCATCTAAAA-TAC-A-AG--------TCCTATCTCTCCCTCT--ATTACT---TATCT-----ATATGTAAT-TCCTTCTCCTCTA-TA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATATAA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCATTAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAACAAT---TAACCAATGAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATTATTTAATCAAACAAACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTCAT---TCTCATGTCAACAC----A----TGTCAGCTCAAAATCAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---TTGATTGACTAAGATT---TCAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTTTTAACACCTCAAGAGTTTCTTGTTACACCACCAGGCTT-GTATAATGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-A------TACTGCA---TATTAAC-AACATTCTCACCTATTAA-CAAAGTTCTACAAAC-ATCAGATACATATACCATTTTACAATAAACATAG-AT-AAA-AA-----TT-T--AAG----TTTTACCTTTTTAAT-TAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAACAGCAATAAAATTAT-ACAGTAATTTTATGgc
gi|4 : TGCCTAATTATTGTCGGCCATTT-GATTCTAACCAATTGGTGTAAGCATC-AG-C-AA-GTGGGGAATTAGCTTGTAGGCAGCCTACACACAATTGGTATTT-CGATGACACACATGGGGTCAGTCTAACTTCTAGCAGTAGACTTA----ATT---CAG-----TGTCCAATACAATACATAAATCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTCTGGTTT-GATT-AATAACAATAAA-TT-AAGATAGTTTATAGGTTCC-AAAA-TATTAAATTAACACAGTTTGAATAAGTTCTTAAGTAAGTAACAA-TAGTCCTTAGTAATAATTTTAAAATAA-CTGACT-AATGATTTAGTTCCGTTTGGCTATCATAAATTATATAATGGCTAGCGTTGTGCCATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTATCTCTCCGTCT--CTTATT---TATCT-----ATATGTA-T-TC--TCTTTCCTA-T----TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAT-TTTGAATAATTTACCAATAAAAAT-CATTATAACAATAATTAATCAATAAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAGCTGCTGGAAGTTAATAATTAAGGTTTTCTTATCAAATGTAATCAGCATAATATAATCAAACAAACTATAACAGTCAAACAAGTCCTGGAAATAAGCAATTA-TGTTGT---TCTTATGTCAACACTGTCA----TGTCAACTCAAAATCAATTGATTAT-------AATTATCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATGA---CTGAATGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACTAAAAT-AGAGTTGTTAATAACACGTAAAGGGTTTCTTGTTACACCTT--AGCTT-GTATAACGATTACTATAATGAAAC--T------TGTAT-ATATTGGTACTGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACCTATTAA-CAAAGCTCTACACACAATCAGATATATACACCATTTTACAATAAACGTAAGTT-AAA-AA-----TT-T--AGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTATTTATATTTATTTTATTATTTTAATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTATGcc
gi|5 : c-GGTTCTAACCAGTTGGTGTAAGATTA-AG-C-AA-GTGGGGGATTAGCTGGTAGGCAGCCTACACACAACTGATATTT-CCATGACACACCTGGGGTCAGTCTTATTTCTAACAGTAGACTTA----ATT---TAA-----TGTCCAATGCAGTGCACAAGTCTTTTGGTGTTTAACACTTTTATTTTTGAT--GATTGAATA-CAATAGG-TTTAAGATAG-------GTTCC-AAAA-TATTAAATTATCACCATTCGAATAAGTTT----GTAAAGGATAA-TAGTCCTTGGTAATAATTT-AAAATTA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGCTATCGTAAATTATTTAATGGCTACCGTTATGCCATTTAAAA-TACTA-AG--------TCCTGTCTTTCTCTCTTACTTATC---TATCT-----ATATATG-T-AA--TCTCTTCAT-TA-T-TTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAGC-TTTGAA-ATTTAACCAATAAAATT-CATTTTAACAAC---TAACCAATGAATTTTAGTTTAACAT-ATATTTTGGCCTAAAGCTGTTAAGCTGCTTGAAGTTAATACTTAAGATTTTCTTATCAAATGTAATCAACATAATATAATCAAACACACTATAACAATCAAACAAGTCCTGGAAATGAGCAATTA-TGTTGT---TCTCATGTCAACAC----A----TGTCAACTCAAAATCAAATGAGTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACTTGGATTTTATAA---CTGATTGACTAAGATT---TTAAAATTTGATATTTCATAAAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTCATTAACTAAAAA-ACAGTTGTTATTAACACCTCAAGGGTTTCTTGTTACAACAT--GGCTT-GCATAATGATTACTCTAATGAAAC--T------TGTAT-A------T------------TAAC-AAAATTCTCACCTA---A-CAAAGCT------ACAA------ACATATTTCATTTTACAATAAACATA--TT-AAA-TT-----TT-TTTCGC----TTTTACCTTTTTAAT-TGAAATTTATTACTTTTATTTATTGTATTATTTCTATTATTTGATAACAGCAATAAAATTATAACc
gi|6 : CAAACTCTGAATTGTACCTAATTATTGTCGTCCTTTT-GATTCTAACCAGTTGGTGTAAGCTTT-AG-C-AAAGTGGGGAATTAGCTGGTAGGCAGCTTACACACAGCTGGTATTT-CGATGACTCGCGTGGG-TCAGTCTAACTTCTAATAGTAGACTTA----ACT---CAA-----TGTCCAATACAGCACACAATTCTTCTGGTGTTTA-CACTTTTATTTTTGAT--GATTTAATA-TAA-AAA-TT-AAGATAGTTTACAGGTTCC-AAAAATATTAAATTAACATAGTTCGAATAAGTTC----GTAAATAATAG-TAGTCCTTAGTAATAATTTAAAAAAAAACTGACTGAAAGATTAAGTTCCGATTGGC--------ATTATATAATGGCTAGCGTTATGCCATTTAAGA-TACTA-AGATACTAAGTCCTATTTCTC----T--CTTACT---TATCT-----AT--GTA-T-TC--TGTCTTTTA-TAATATTT--AAAAACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTCCTTAAATGGA---------------T-AGCCAAAAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCTATAAAAAT-TATTTTAACAAT---TAATTAATAAATTCTAATTTTACAT-ATATTTTGACCTAAAGCTGTTAAACTGCTAGAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAAATGTTATCAACATAATATAATCAAATAAACTATAACAATCAAACATGTCTTGGAAATGAGAAATAA-TGTCAT---TCTCAAGTGAACAC----A----TGTCAACTCAATATCAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACAATAATACATGGAGTTTATAA---CTGATTGACTAAGATC---TGGATATTTAATATGACATAGAAGTGAAAT-TTTAAATACTTTTTCTTATTAACTAAAAT-ACAGTTGTTATTAACACCTCAA-GGTTTCAGGTTACAACAT--GGCTT-GTATAATGATTACTCTTATGGAACTTT------TATAT-A------TACAGCA---AATTAAC-AAAATTCctgt
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gi|9 : gGTCCTTAGTAATAATTC-AAAATAA-CTGACT-AAAGATTTAGTTCTGTTTGGCCATCATAAATTACATAATGGCTAGCGTTATGCCACTTAAAAATTCTA-AG--------TCCTATCTCTCTCTCT--CT--CT---TATTT-----ATATGTA-TATC-----CCTTAA-TA-T-TT---AAAGACCTTTCTTTATATCA-----TAAGTTTCTAAAATGGA---------------TTAGCCAATAAAA--TTAAC-TTTGAATATTTAACCAATAAAAAT-CATTTTAACAAT---GAACCAATAAATTCTAGTTTTACAT-ATATTTTGACATTAAGCTGTTCAGCTGCTAAAAGTTAATAATTAAGATTTTCTTATCAA----------TATAATATAATCAAACAAACTATAACAATCAAAAAAGTCGTGGAAATGAGCAATTA-TGTCGT---TCTCATGTCAAC------------------TCAAAATCAAATGATTAT-------A----TCAACATCTGGAGGCTTTTCTCCAAAACA-TAATACTTGTATATCATAA---CAGATTAACTAAGATT---TTAATATTTGATATTACATAGAAATGAAAA-TTTAAATACCTTCTCTTATTAACAAAAAT-ACAGTTGTTATTGACACCTCAAGGGTTCTGTGTTACAAGAT--GGCTT-ATATAATGATTACTGTAATGCAAC--T------TGTAT-A------TAATGCA---TATTAAC-AAAATTCTCACC---TAA-CAAAGTTCTACAAAT-ATCAGACATATACCCAATATTTCAATAAACATAA-AT-GAATAT-----TT-T--TGC----TTTTACCTCTTTAAC-CTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAACAGCAATAAAATTATAACAGTAATTTTA