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lowQualScore                  :                                                
lowQualScore                  :                                                
consensus                     :            CTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTTATAA
Reference ( gi|7 )            :            CTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTTATAA
gi|8                          :            CTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTTA
gi|10                         :          aaCTTTAACTAGTATTTCTAAGTAAAACATATTTATA
gi|13                         :            CTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTT
gi|6                          :            CTTTAACCAGTATTTTTAAGTAAAACATATTTAT
gi|15                         :         acaCTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATT
gi|9                          :           aCTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAATATATTTA
gi|5                          :          aaCTTTAACCAGTATTTCTTAGTAAAACATAATTATAA
gi|1                          :             TTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTCATAAaa
gi|11                         :             TTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTTAaaaaaaaaaa
gi|2                          :             TTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTTAa
gi|16                         : aaaataaaaaaaTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTT
gi|14                         :             TTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTT
gi|3                          :             TTTAACCAGTATTTCTAAGTTAAACATATTTATAAt
gi|4                          :             TTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATTCTTATAAaaaaaaca
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Alignments
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lowQualScore                  :                                                
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gi|12                         :              TTATCCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTTa
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gi|15                         :            CTTTAACCAGTATTTCTAAGTAAAACATATTt
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Alignments
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lowQualScore                  :                                                
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