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lowQualScore : .. .. . ..... . .......................... . . . . . . .. . . .. .... ... . .. . . . . . .......... . .. . . . . . . . ... . . ... ....... .. .... . ..... . . . . .... . . . . . . .. ..... ...... . ... .. .. .
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Reference ( gi|5 ) : AGTCACGTTT--A--CA-CGTGTAAACGGATCCGTGTCGTTTAAAAGCA-----ATACACGTTT-A-------------C-T-A-TTT--A-T-ATCCGTGCACACTACCTTGAC-CATAGA-CCTTAGTAAATTTAGTA-AATTAG--TATA----TAGG--TCGTTTGACGAA-G-AAACAGGCTGTTAT-TGAATATTGTCCAACTATCCTTGTGTGTTTCACGACAT-------C--ATTAATCATTATGAC-TGTTGAGTT-AGATTCACGAAACCAGGGTTATTTCAAAATT-GCAATGT-CATGAGCGACA---TGT-CAGCCTTTTGTT---TG--AATG-GTTATTT--AAAC----ATTTGC-----GGTATATACTAGTTATTAGCTGTAAATACAACTTCGATAATACAC----ATACAAAACACC-C-G-GTTTGAACAACGTGTAAACAGAG-GCGTGTCGTTTA-TTAGCGTTA-GTGTA------CACGTTTACTGA---A--A--TCTGTAAACGTG-ACAG
gi|7 : AGTTATGTTT--G--CA-CATGTTAACCGACCTGTGTCGTATAAAAGCA-----ATACATGTTA-A-------------C-T-AGTTT--AAT-ATCCGTGTACACTACCTTGAC-CCTTAA-CCCCAGTAAATTTGGTA-AATTAG--TTTA----CAGA--TCATTTGACGAA-G-TAACAGGCTATCAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCGCAGCATAGAGCAAT--ATTTATAATTATGAC-TGTAGAGTT-AAAT-------------------TCAAAACT-GCAATGT-CATGAGCTACA---TGT-CAGCCATTTGTT---TG--GCGA-GTTATTT--AAAC----ATTTAC-----AGTATATACCAGTAATTAGCTGTAAATACAACTTGGATAATGCAC----ATACAAAA-------G-GTTTGAACAACATGTAAATGGAG-GCGTGTTG-TTA-ATAACGGTT-GTGTG------CATGTTAACAGA---A--A--TCTGTAAACATG-ACAG
gi|6 : GTCACGTTT--A--CA-CGTGTAAATGGATCCTTGTTGTTTAAAAGCA-----ATAATCATTT-A-------------C-T-A-TT-----T-ATTCGTGTACACTACCTTGAC-CCTAGACCCCCAGTAAATTTGGTAGAATTAG--TATA----TAGA--TCGTTTGACAAA-G-TAACAGGCTGTTAT-TGAATAGTTTCCAACTATCCTTGTGTGTTTCACGACAT-------TAAATTAATCATTGTTACTTGTTA---T-GGATTCACAGAGCCAGAGTTATTTCAAAACT-GCAATGT-CGTGAGCGACA---TGT-CAGACGTTTGTT---TA--AAGG-GTTATTT--AAAC----ATTTAC-----TGTATTTACAAGTAATCAGCTGTAAATACAACTTAGATAATGCAC----GTACAAAACACC-CAG-GTTTGAACA---TGTAAACGGAG-GCATGTCATTTA-TTGGCATTC-ATGTA------CACGTTTACTCA---A--A--TCTGTGAACGTG-ACAG
gi|9 : GTCACATTT--A--CA-TGTGTTAATGGATCCATGTCATTTAAAAGCA-----ATACACGTAT-A------------------------A-T-ATCTGTGTACACTACCTAGGC-CCTAGA-CCGCAGTTAATTTGGTA-AATTAG--TATA----TAGA--TCGTTTGACGAA-G-TAACAGGCTGTTAT-TGAATATTTTCTAATCATCC-----------ACAGCAT-------A--AATAATCATTATGAC-TGCGTATTT-AGATCCACAGAACCA---TTATTTTAAAACT-GCAATGT-CATGAGCGACA---TGT-TAACCATTAAGT---TGGCAA---GTTATTT--AAAC----ATTTAC-----GATATATACAAGTTGTTAGCTGTAAATACAACTTTGATAATGCAC----ATACAAAACACC-CAG-GTTTGAACAACATGTAAACAGAG-GCATGTTGTTTA-TTAGCGTTC-GTGTA------CACGTTTACAGA---A--A--TCTGTGAc
gi|8 : tGTCACGTTT--A--CA-CATGTAAACAGATCCGTGTTATTTAAAAGCA-----ATACACGTTT-ATATACAAGCAATAC-T-AATTT--AAT-TTCCATGTACACTACTTTGAT-CGTAGA-CCCCAGTAAATT-AGTA-AAT--------------AGA--TCGTTTGACAAA-G-TAACAAGCTGTTAT-TTGATATATTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCACAGCAT-------T--ATTAATCTTTATGTC-TAT---------------AAAGCCAGAGTTATTTCAAAACT-GCAATGT-CATGAGTGATA---TGT-CAGTCATTTGTTTTGTG--A----GTTATTT--AAAC----ATTTAC-----GGTATATACTAGTAATTAGATGTAAATAC-------ACAATGCAC----ATACAAAACACC-CAG-GTTTGATCAACATGTAATTGGAT-ACATGTTGTTTA-TTAGCATTT-GTGTA------CAAGTTTACTGA---A--A--TCTGAAAACGTG-c
gi|14 : GTCATGTTT--A--CA-TGTGTAAACGGATCTGTGTCGTTTAAAAGCA-----ATACCTGTTT-A-------------C-TTA-TTT--A-TTATTCATGTACACTACCTTGACTCA-AGA-CCCCAGTGAATTTGGTA-AATTAG--AATA----TAGA--TCATTTGATGAA-TTAAAC-GGCTGC-AG-TGAATATCTTCCTACCATCCTTGTGTGTTTCACAGCAT-------A--ATTAATCATTATGAC-TGTGTAATA-AGATTCACGGAGCCAGAGTTATTTCAAAACT-GCAATGT-CATGAGCAACA---TGT-CAGCCATTTGTT---TG--GCGA-GTTATTT--AAAC----ATTTA------GGTATCTACAAGTAATTGGCTGTGAATACAATTTAGATAATGCAC----ATAAAAAACACC-C-ATGTCTGAACA---TGTAAAC
gi|2 : GTCACGTTT--A--CA-CATGTAAACGGATCCGTGTTGTTTAAAAGCA-----ATACACCTTT-A-------------C-T-A-ATTCAA-T-ATGCATGTACACTAACTTGAC-CCTTAA-CTCTAGTAAATTTGGTA-AATTAG--CATA----CAGA--TCATTTGACAAA-G-TAACAGGCTGTTAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTCCAAAGCAT-------T--ATTTATCATTATGAC-TGTGGAGTTAAGATTCACGGAGCCAGAGTTATTTCAAAACT-TCAATGA-CATGAGTGACA---TGT-CAGCTGTTTGTT---TG--GCGA-GTTATTT--AAAC----ATTTAC-----GGTATATACAAGTTATAAATTGTAAg
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gi|16 : GTCACGCTA--A--CA-CATGTAAATGGACCCATGTCGTTTAAAAGCA-----ATACACGTTT-A-------------CAA-A-TTTA-A-T-ATCCGTGTACACTACCTtccttgtgttttacggcattattaatcattaggactgtggagtaagattcatggaaccagagttatttcaaaactgcaatgtcacgagcaacatgtcattcatttgtttggtaagctatataaacatttacagtatatactagtaattagctgtacaacttagataatgcacatacaaaacacccaggtttgaacaatgtgtaaacagaggcgtgcacacatttacagaaatctgtaaacgcaacag
gi|3 : tTCACATTT--A--CA-CCTGTAAACAGATCTGTGTCGTTTAAAAGCA-----ATACGTGTTT-A-------------C-T-AATGT--AAT-ATTTGTGTATACTACCTTTAC-CCTTAA-CCCCAGAAAATTTGGTA-AATTAG--TATAATATTAAGGATCGTTTGATAAA-G-TAACAGGCGATTAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCACGGCAT-------T--ATTAACCATAATGAC-TGTGGAGTT-AGATTCACGGAGACAGAGTTATTTCAAAACT-GCAATGC-CATGAGTGACA---TGT-CAGCCATTTGTT---TG---GTGAGTTTTTT--AAAC----ATTTAC-----AGTATATAAGAGTAATTAGCTGT-AATACAACTTAGATAATGCAC----ATGCAAAACACC-CAG-GTTTGAACAACATGTAAACGGAG-GTGTGTCGTTTA-TTAGCATTT-GTGTA------CACA-----TGAC--A--ATTTCTGTAAACGTG-GCAGaagttagtgacatcctatgaaagatcgtttgtatagtttaaaaatatgtaataattctaaaacatcataagctatgacgttcagcttaatgatataatttgaaactatccgcaatgtcatagtagtatgacattgtagttgtacgacataatttaaaactataccatcaatcttttcatacatgtaaatcatcat
gi|19 : TCACGTTT--A--CA-CGTTTTAACGGATCCGTGTTGTTTAAAAGCA-----ATACACGTTT-G-------------C-TAA-TTTA-A-T-ATC--TGTACACTACCTTCAC-CCTAGA-CCcc
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gi|1 : CAGGTTTGAA--CAATGTGTAAATGGAGGCGTGTTGTTTATTAGCGTTCGTGTACACATTT-A-------------C-
gi|18 : aagtttgatgacaatattctaaaaatacaaatatttaccaaaatttctcattttttatgcaataattatttgtttgtattttgaaaactcaaatcttaataaaaatgtattgcatgtatagggctgtcatgtatacttgtttagtaatttaatatccttgtacactaccttgaccttagaccccagtaaatatagattatttgacaaaagaaatggctgttagtgcatatcttacaaccatccttgtgtgtttcacagaattattaatcattagacagtgtagttagattcacggagtcggggttatttcaaaactgcaatgtccttaatggtatctactagtaattagctgtaaatacaacttagataatgcacatacaaaacaccCAGGTTT--AAACATCATGTAAACGGAGGCGTGTCATTTAaaaagtctgtaaacatgacacc
gi|6 : gtaattagttgtaaataaaacttagaaaatgcacatataaaacatcCATTT--A--CA-CGTGTAAACGtttgtgttcatgtacatgtttacagaaatctgtaaacgtgacagg
gi|10 : gtcaCGTTT--A--CA-CATGTAAATGGATCTGTGCCGTTTAAAAGCA-----CAACACGTTT-A-------------C-TAA-TTTG-A-T-ATCCTTGTAC---------------AGA-CCCCAGTAAATTTAGTA-AATAAG--TATA----TAGA--TCATTTAACAAA-G-TAACTGGCTATTAG-TGAATATCTTCCAACCATTCTTGTGTGTTTCATGGCAT-------T--ATTAATCATTATGAC-CGTGAAGCT-AGATTCATGTAGCCAGATTTATTTCAAAACT-GCAGTGT-CATGAGCGACA---TGT-CAGCCATTTGTT---TG--GCAG-GTTATTT--AAAC----ATTTAT-----GGAATCTACTAATAATAAGCTGTAAATACAAATTAGATAATGCACATGTATACTAAACACCAA-G-GTTTGAACAAGGTGCAAACAGAG-GTGAGTCGTTTA-TAAGCATTC-ATGTA------AACGTTTACgatccttgttgtttaaaagcaataatcatttactatttattcgtgtacactaccttgaccctagacccccagtaaatttggtagaattagtatatagatcgtttgacaaagtaacaggctgttattgaatagtttccaactatccttgtgtgtttcacgacattaaattaatcattgttacttgttatggattcacagagccagagttatttcaaaactgcaatgtcgtgagcgacatgtcagacgtttgtttaaagggttatttaaacatttactgtatttacaagtaatcagctgtaaatacaacttagataatgcacgtacaaaacacccaggtttgaacatgtaaacggaggcatgtcatttattggcattcatgtacacgtttactcaaatctgtgaacgtgacagc
gi|2 : CGTTT--A--CA-TGTGTAAACGag
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): CCTGATTGGAACAGTGTAATTTATCAAGAGGCGGACAATATGAA
Alignments
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Reference ( family-2484 ) : AGTCACGTTTACACGTGTAAACGGATCCGTGTCGTTTAAAAGCAATACACGTTT-A-------------C-T-A-TTTAATATCCGTGTACACTACCTTGACCCTAGACCCC-AGTAAATTTGGTA-AATTAGTATA----TA--GATCGTTTGACGAAGTAACAGGCTGTTAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCACGGCAT-------T--ATTAATCATTATGACTGTGNAGTT-A--GATTCACGGAGCCAGAGTTATTTCAAAAC---TGCAATGT-CATGAGCGACA---TGT-CAGCCATTTGTTTGGAGGGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CGGTATATACNAGTAATTAGCTGTAAATACAACTTAGATAATGCAC----ATACAAAACACCCAGGTTTGAACAACGTGTAAACGGAG-GCGTGTCGTTTATTAGCGTTCGTGTA------CACGTTTACNGA-AA--TCTGTAAACGTGACAG
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10 : aagtttgatgacaatattctaaaaatacaaatatttaccaaaatttctcattttttatgcaataattatttgtttgtattttgaaaactcaaatcttaataaaaatgtattgcatgtatagggctgtcatgtatacttgtttagtaatttaatatccttgtacactaccttgaccttagaccccagtaaatatagattatttgacaaaagaaatggctgttagtgcatatcttacaaccatccttgtgtgtttcacagaattattaatcattagacagtgtagttagattcacggagtcgCGTTTACACATGTAAATGGATCTGTGCCGTTTAAAAGCACAACACGTTT-A-------------CTAATTTGATATCCTTGTAC--------------AGACCCC-AGTAAATTTAGTA-AATAAGTATA----TA--GATCATTTAACAAAGTAACTGGCTATTAG-TGAATATCTTCCAACCATTCTTGTGTGTTTCATGGCAT-------T--ATTAATCATTATGACCGTGAAGCT-A--GATTCATGTAGCCAGATTTATTTCAAAAC---TGCAGTGT-CATGAGCGACA---TGT-CAGCCATTTGTTTG-GCAGGTTATTT--AAAC----AT----TTA-TGGAATCTACTAATAATAAGCTGTAAATACAAATTAGATAATGCACATGTATACTAAACACCAAGGTTTGAACAAGGTGCAAACAGAG-GTGAGTCGTTTATAAGCATTCATGTA------AACGTTTACAGcc
gi|11 : ATACACATTTTA-------------CTAATGTAATATCCATGTACACTACCTTGACCCTAAACCCC-AGTAAATTTGGTA-AATTGGTATA----TA--GATCGCTTGATGAAGTAACAGGCTGTTATATTAATATTTTCCGACCGTCCTTGTGTGTTTCACGGCAT-------T--ATTAATCATTACGACTGTGGAGTT-A--GATTCACAGAGCCAGAGTTATTTCAAAAC---CACAATGT-CATGAGCGACA---TGT-GAGCCATTTGTTTG-GAGAGTTATTA--AAAC----AT----TTA-CGCTATATACTAGAAACTTGCTGTAAATACAACTTACATTAT--AC----ATACAAAACACCCAGGTTTG---AATGTGTTAATGGAG-ACGTGCTGTTTATTAGCGTTTGTGTA------CATGTTGACAGAAATCTGTAAATGCGA
gi|12 : GTCACGTTTACATGTGTAAACTGATCCGTGTCGTTTACAACCAAAACATGTTT---------------CTTATTTAATATCTGTGTACACTACCTTGACCCTAAACCCC-AG-----TTGAT----TTGGTAAA----T----------T-----AGTA------TAT-AT----ATATCGTTTGACGATCCTTGTGT--TTTACGGCAT-------T--ATTAATCATTAGGACTGTGGAGTA-A--GATTCATGGAACCAGAGTTATTTCAAAAC---TGCAATGT-CACGAGCAACA---TGT-CATTCATTTGTTTG-GTAAGCTATAT--AAAC----AT----TTA-CAGTATATACTAGTAATTAGCTG----TACAACTTAGATAATGCAC----ATACAAAACACCCAGGTTTGAACAATGTGTAAACAGAG-G-------------------CGTGCA------CACATTTACAGAAATCTGTAAACGCAACAG
gi|13 : ACACGTGTAAATGGATCCGTGTCATTTAAAAGCAACACACATTT-A-------------CTAATGTAATATT-GTGTACATTACCTTGACCCTAAACCCC-AGTAAATTTGGTA-AATAAGTATA----TA--GATCATTTGAAGAAGTTACAGACTGTTAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCATAGCAT-------T--ATTAACC---ATGACTATGAAGTT-A--GATTAGTGGAGCCAGAGTTATT------------CAGTAT-CAT---TTACA----GTACA-----TTGTATATACGAATTATT----AGC-----T----------GTAAATACAA--------CT-TAAATACA---TGTAT--TACAC----ATACAAAACACCCAGGTTTGAACAACAGGTAAACGGAG-GCGTGTCATTTATTAGCTTACGTGCA------AACGTTTACAGAAATCTG
gi|14 : GTCATGTTTACATGTGTAAACGGATCTGTGTCGTTTAAAAGCAATACCTGTTT-A-------------CTTATTTATTATTCATGTACACTACCTTGACTCAAGACCCC-AGTGAATTTGGTA-AATTAGAATA----TA--GATCATTTGATGAATTAAACGGCTGC-AG-TGAATATCTTCCTACCATCCTTGTGTGTTTCACAGCAT-------A--ATTAATCATTATGACTGTGTAATA-A--GATTCACGGAGCCAGAGTTATTTCAAAAC---TGCAATGT-CATGAGCAACA---TGT-CAGCCATTTGTTTG-GCGAGTTATTT--AAAC----AT----TTA--GGTATCTACAAGTAATTGGCTGTGAATACAATTTAGATAATGCAC----ATAAAAAACACCCATGTCTGAACA---TGTAAACG
gi|15 : CCCT-TGTTAATTTGGTA-AATTAGTTTA----AA--GATTGTTTGACGAAGTAACAGGCTGTTAT-TGAATATTTTCCAACCATCC--GTGTGTTTCATGGCAT-------T--AATAATCGCTATGACTGTGTAGTT-A--GATTCACAGAGCAAGAGTTATTTCAAAAT---TGCAATGT-CATCAGCGACA---TGT-CAGCCATTTGTTTG-GTGAGTT
gi|16 : aagtttgaaacaatatcaaaataagtaaaaaattcacaatattgtgtatattgtattttaaaaatgaaaacactcaatatcacattgggatatcagtaatttacccgcaacagttgGTCACGCTAACACATGTAAATGGACCCATGTCGTTTAAAAGCAATACACGTTT-A-------------CAAATTTAATATCCGTGTACACTACCT
gi|17 : tTTCACACAGTCAGAGTTATTTCAAAAC---TGCTATGT-CATGAGCAACA---TCT-CAGCCATTTGTTTG-GTGAGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CAGTGTAAAGTAGTAATTAGCTGTAAATACAACTCGGAAAATGCAC----ATACGAAACATCCAGGTTTGAATTTCATGTAAACGGTG-GCGTGTCATTAATTAGC-TTTGTGTA------CATGATTTCAGAAATCTGTAAATGTGACAGaagttagtgacatcctatgaaagatcgtttgtatagtttaaaaatatgtaataattctaaaacatcataagctatgacgttcagcttaatgatataatttgaaactatccgcaatgtcatagtagtatgacattgtagttgtacgacataatttaaaactataccatcaatcttttcatacatgtaaatcatcat
gi|18 : GTAATTAGTTGTAAATAAAACTTAGAAAATGCAC----ATATAAAACATCCAGGTTTAAACATCATGTAAACGGAG-GCGTGTCATTTATTTGTGTTCATGTA------CATGTTTACAGAAATCTGTAAACGTGACAGc
gi|19 : TCACGTTTACACGTTTTAACGGATCCGTGTTGTTTAAAAGCAATACACGTTT-G-------------CTAATTTAATATC--TGTACACTACCTTCACCCTAGACCCg
gi|2 : GTCACGTTTACACATGTAAACGGATCCGTGTTGTTTAAAAGCAATACACCTTT-A-------------CTAATTCAATATGCATGTACACTAACTTGACCCTTAACTCT-AGTAAATTTGGTA-AATTAGCATA----CA--GATCATTTGACAAAGTAACAGGCTGTTAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTCCAAAGCAT-------T--ATTTATCATTATGACTGTGGAGTTAA--GATTCACGGAGCCAGAGTTATTTCAAAAC---TTCAATGA-CATGAGTGACA---TGT-CAGCTGTTTGTTTG-GCGAGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CGGTATATACAAGTTATAAATTGTAAaga
gi|2 : tGAGTTATTT--AAACATTTACGGTATATACAAGTTATAAATTGT-AAGCTGTTTGTTTG-GTGAGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CATTATATACAAGTTATAAATTGTAAATATAACTTAGATAATGCAC----ATACAAAACACCCACGTTAGAACAACGTGTAAA---AGTGCATGTgctgtttgtttggtgagttatttaaacatttacattatatacaagttataaattgtaaatataacttagataatgcacatacaaaacacccacgttagaacaacgtgtaaaagtgcatgtgaaatttgtaaacatgacagc
gi|20 : tgtcacgtttacacatgtaaacggatccgtgttgtttaaaagcaatacacctttactaattcaatatgcatgtacactaacttgacccttaactctagtaaatttggtaaattagcatacagatcatttgacaaagtaacaggctgttattgaatattttccaaccatccttgtgtgttccaaagcattatttatcattatgactgtggagttaagattcacggagccagagttatttcaaaacttcaatgacatgagtgacatgtcagctgtttgtttggcCGTGTAAATGGAG-GCATGTTGTTTAATAGCGTTCGTGTA------CACATTTACgaaatttgtaaacatgacagc
gi|3 : tcacatttactTCACATTTACACCTGTAAACAGATCTGTGTCGTTTAAAAGCAATACGTGTTT-A-------------CTAATGTAATATTTGTGTATACTACCTTTACCCTTAACCCC-AGAAAATTTGGTA-AATTAGTATAATATTAAGGATCGTTTGATAAAGTAACAGGCGATTAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCACGGCAT-------T--ATTAACCATAATGACTGTGGAGTT-A--GATTCACGGAGACAGAGTTATTTCAAAAC---TGCAATGC-CATGAGTGACA---TGT-CAGCCATTTGTTTG-GTGAGTTTTTT--AAAC----AT----TTA-CAGTATATAAGAGTAATTAGCTGT-AATACAACTTAGATAATGCAC----ATGCAAAACACCCAGGTTTGAACAACATGTAAACGGAG-GTGTGTCGTTTATTAGCATTTGTGTA------CACA-TGACA-ATTTCTGTAAACGTGGCAG
gi|4 : CACATTTACATGTGTAAACAGATCCATGTTGTTTAAAAGCAATTCACGTTT-A-------------CTAATTCAATAACCATGTACACTACCTTGACTCTAAACCCC-AGTAAATTTGGTA-AATTAGTATA----TA--GGTCGTTTGATGAAGTAACAGGATGTTAT-TTAATATTTTCCAACTATCATTGTGTGTTTCATGGCAT-------T--AAAAATCATAATGACTATGAAATT-A--GATTCATGGAGCC--AGTTATTTCAAAAC---TGCAATGT-CATAAGCGATG---TCT-CAGCTATTTGTTTG-GCGAGATTTTT--AAAC----AT----TTA-CAGTGTATACTAGTAATTAGCTGTAAATACAACTTAGAAAATGCAC----ATACAAAACACCCAGGTTTGAACATCGTGTAAATAAAG-GCGTGTTGTTTATTAGTGTTCATATATACATGTACATTTACAGAAATGTGTAAAAGTGACAGcc
gi|5 : AGTCACGTTTACACGTGTAAACGGATCCGTGTCGTTTAAAAGCAATACACGTTT-A-------------CTA-TTTA-TATCCGTGCACACTACCTTGACCATAGACCTT-AGTAAATTTAGTA-AATTAGTATA----TA--GGTCGTTTGACGAAGAAACAGGCTGTTAT-TGAATATTGTCCAACTATCCTTGTGTGTTTCACGACAT-------C--ATTAATCATTATGACTGTTGAGTT-A--GATTCACGAAACCAGGGTTATTTCAAAAT---TGCAATGT-CATGAGCGACA---TGT-CAGCCTTTTGTTTG-AATGGTTATTT--AAAC----AT----TTG-CGGTATATACTAGTTATTAGCTGTAAATACAACTTCGATAATACAC----ATACAAAACACCC-GGTTTGAACAACGTGTAAACAGAG-GCGTGTCGTTTATTAGCGTTAGTGTA------CACGTTTACTGAAATCTGTAAACGTGACAG
gi|6 : GTCACGTTTACACGTGTAAATGGATCCTTGTTGTTTAAAAGCAATAATCATTT-A-------------CTA--TT--TATTCGTGTACACTACCTTGACCCTAGACCCCCAGTAAATTTGGTAGAATTAGTATA----TA--GATCGTTTGACAAAGTAACAGGCTGTTAT-TGAATAGTTTCCAACTATCCTTGTGTGTTTCACGACAT-------TAAATTAATCATTGTTACT-T---GTT-ATGGATTCACAGAGCCAGAGTTATTTCAAAAC---TGCAATGT-CGTGAGCGACA---TGT-CAGACGTTTGTTTA-AAGGGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CTGTATTTACAAGTAATCAGCTGTAAATACAACTTAGATAATGCAC----GTACAAAACACCCAGGTTTGAACA---TGTAAACGGAG-GCATGTCATTTATTGGCATTCATGTA------CACGTTTACTCAAATCTGTGAACGTGACAG
gi|7 : AGTTATGTTTGCACATGTTAACCGACCTGTGTCGTATAAAAGCAATACATGTTA-A-------------CTAGTTTAATATCCGTGTACACTACCTTGACCCTTAACCCC-AGTAAATTTGGTA-AATTAGTTTA----CA--GATCATTTGACGAAGTAACAGGCTATCAT-TGAATATTTTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCGCAGCATAGAGCAAT--ATTTATAATTATGACTGTAGAGTT-A--AA-------------------TTCAAAAC---TGCAATGT-CATGAGCTACA---TGT-CAGCCATTTGTTTG-GCGAGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CAGTATATACCAGTAATTAGCTGTAAATACAACTTGGATAATGCAC----ATACAAA------AGGTTTGAACAACATGTAAATGGAG-GCGTGTTG-TTAATAACGGTTGTGTG------CATGTTAACAGAAATCTGTAAACATGACAGc
gi|8 : GTCACGTTTACACATGTAAACAGATCCGTGTTATTTAAAAGCAATACACGTTT-ATATACAAGCAATACTAATTTAATTTCCATGTACACTACTTTGATCGTAGACCCC-AGTAAATT----------AGTAAA----TA--GATCGTTTGACAAAGTAACAAGCTGTTAT-TTGATATATTCCAACCATCCTTGTGTGTTTCACAGCAT-------T--ATTAATCTTTATGTCTATAAAG-----------------CCAGAGTTATTTCAAAAC---TGCAATGT-CATGAGTGATA---TGT-CAGTCATTTGTTTT-GTGAGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CGGTATATACTAGTAATTAGATGTAAATAC-------ACAATGCAC----ATACAAAACACCCAGGTTTGATCAACATGTAATTGGAT-ACATGTTGTTTATTAGCATTTGTGTA------CAAGTTTACTGAAATCTGAAAACGTG
gi|9 : GTCACATTTACATGTGTTAATGGATCCATGTCATTTAAAAGCAATACACGT--------------------AT--AATATCTGTGTACACTACCTAGGCCCTAGACCGC-AGTTAATTTGGTA-AATTAGTATA----TA--GATCGTTTGACGAAGTAACAGGCTGTTAT-TGAATATTTTCTAATCATCC-----------ACAGCAT-------A--AATAATCATTATGACTGCGTATTT-A--GATCCACAGAACCA---TTATTTTAAAAC---TGCAATGT-CATGAGCGACA---TGT-TAACCATTAAGTTG-GCAAGTTATTT--AAAC----AT----TTA-CGATATATACAAGTTGTTAGCTGTAAATACAACTTTGATAATGCAC----ATACAAAACACCCAGGTTTGAACAACATGTAAACAGAG-GCATGTTGTTTATTAGCGTTCGTGTA------CACGTTTACAGAAATCTGTGA
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Unaligned ( gi|21 ): CCTGATTGGAACAGTGTAATTTATCAAGAGGCGGACAATATGAA