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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAGTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAAATGCTTCCATTTAAAACGAAAA--TCGCTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAA--AGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GG---AA------------AAT-------------TG------------G--------GAGAA--CATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTAC--ATACATATTT---ATA---AATACTATTCAAGCTTCAATTGGAATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATG-GTTTTTTTTTAATGTTTTTCTTTGTTGTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTT-ATGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACCTAAGGAAATATATGTTGTTTGATAACCGTTGA--GGCGTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGT-GACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGA-ACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGATA------------------TGTCCCT------------------CTGATCTGCACAGGGCGTGATAATCGTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATGT--GAATAAT---TGTTGG---CCTGT-TTGGG---CAACTGAATAATATTTGTATA-CCTGTT--GGGGCAATTGAATAATAAC-TTAATG-CCTGTCGGGG-AAAC-T-AATAATAATTGTATACCTATAGGGGCAA-TT---AAACGATTG-TTGGTTGG--TTGGGGT-ATTTGAATATTAATCATAGC---------CGT-TGAC--TA---TTATGCACCAAAAATAAAAGTATAAAT-TCATT--ACGAAGCTGTTACTTTC--------------TTTAT----GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAATATT----AA-ATTACGAGTACAC-----A-AAA--CAT--GT--GG-ATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGTCCTTGGTAAATAC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTTCCTTAAACA--ATCAAA--TAATTATTATAGGTACGACTTATCAAAGTAGTGTACAAATATACACATTCATTATATAAGGCCAGAGACAGGATT-ACTTCGTACTTACGGTAAAA------------AGC-------------TG------------ATTTCACTAGAGAAACTATA-----TGTCCGTTAGGCTTGCATACTATCAATACAAGAACACATCGAAGCTGACAGTGTACAATTTACCAAGTTGGCAACAAATATATATTTTCCATA---GATACAAATCAAGCTTCATTTAAAACGATATTGTCGGAGAA------TGTC--TCATACAGAATAAAATATgattgatacaagagtaaaagaggaaataaatgttgtttggtaaccgttgatgcgtgcccttccccactttagcggtgaaggtccatgttgattaacaatcctcatgtcccttcatttggcggtaaacgcgaactccacaatatatatagaatatgaaagtcatcaatgcttagccactgattattagcacaggactaggtaattaactttgaacgtaactgttcctctgatctgcacattgcatggtaattattttgaattgaattgaacattgaatagtaaagtatacctgttacggcatgggaatagttaatggcctgttggggcaaatgaataataactctattcctgttagggcaactggataataacttaattcattttggggcaactgaacaataactgtatgcatgtttgcacagttgaat
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gggaaagtaatcaaaataggaatatatctctggtttcaggaaaatatggtttaagacagacgaaattagttaaaaaggagtatttattaaaatgtatatattttgatatactgtacattattaaatacattaattggggtatgttcattcttccttaaacaatcaaataattattataggtacgacttatcaaagtagtgtacaaatatacacattcattatataaggccagagacaggattacttcgtacttacggtaaaaagctgatttcactagagaaactatatgtccgttaggcttgcatactatcaatacaagaacacatcgaagctgacagtgtacaatttaccaagttggcaacaaatatatattttccatagatacaaatcaagcttcatttaaaacgatattgtcggagaatgtctcatacagaataaaatataaaagtgtttcaaagttctagttcgttcctgtaataactcAGGAAATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGA--TGCGTGCCCTTC--C--CCACTTTAG----CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAA-TCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATAT-ATAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGGTAATTAACTTTGAACGTAACTGTTCCT------------------CTGATCTGCACATTGCATGGTAATTATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATGG--GAATAGT---TAATGG---CCTGT-TGGGG---CAAATGAATAATAACTCTATT-CCTGTT--AGGGCAACTGGATAATAAC-TTAATT-CATTTTGGGG-CAAC-TGAACAATAACTGTATGCtggtacttttaataactttgaacgt
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttgatacTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGTAAGTTACCAATG--------CCTAGCCACTGATAATTAGCACAGAGCTGGGTAATTAATTTTGAACGTTACTGTTCCT------------------CTGATCTGCAAAAGGTGTG------GTTTCGAATTGATTCGAC-CAT-TAAATAAT---T-ATGTTTGCCTGTTGGGGCAAAA--TAATAAC---TGTTGG---TCTGT-T
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaTGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGATGTATGCCTGTTGGAGCATGT--GAATAAT---GATTGTAATCCTGT-T--GG--------GAAT------TGTATG-CCTGTT--GCGGGAACTCAATAATAAC-TTTATG-CCTGTTGGGG-CAAC-TGAAAAATGATTGTATGCCCGTTGGGGCAATTT---AAATGAaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gacTGAAGCATGT--GAATAATGAGTGTATG---CCTGT-Tatccgcccttgacaataatgtatgcctgttgaagcatgtgaataatgagtgtatgcctgttgagaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCATGG--TAATTAT---T-TTGA---ATTGAATTGAA---CA-TTGAATAGTAAA-GTATA-CCTGTT--ACGGCA--TGGG-AATAG--TTAATGGCCTGTTGGGGCAAAT-G-AATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAA-CT---GGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGC-AACTGAACAATAAgagaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtactaagaacaaacattaagaaatacattgatgacattagggaaattcttcataacacaaaaaaatgatttttttctaaaatattaccaagattgatgcatagacatgacttatcaggataatgtaccaactccttaattcaggccagagtcaggattaattcgtacatacgcaattatgtgattttaattgggggaacataaattgtattcgttaccttgatataagaccaacacagtaacacatcgagtatgacggtgtgcatttgaataagttggaaacaagcatattaataattaatactattcaagcttcaattgataagatagtttctgagaatgtatcggtctatcccccagaataaaaaaagtgtttttgttgattgatacaagagtaaaagaggaaataaatgttgtttggtaaccgttgatgcgtgcccttccccactttagcggtgaaggtccatgttgattaacaatcctcatgtcccttcatttggcggtaaacgcgaactccacaatatatatagaatatgaaagtcatcaatgcttagccactgattattagcacaggactaggtaattaactttgaacgtaactgttcctctgatctgcacattAATGAT----GTATG---CCTGT-TGGAG---CATGTGAATAATGATTGTAAT-CCTGTT--GGG--AATTG-----------TA-TG-CCTGTTGCGG-GAAC-TCAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAA-CTGAAAAATGATTG-TATGCCCG--TTGGGGCAATTTAAATG--AATC--CGC---------CCT-TGAC--AA---TAATGTActgtatgcatgtttgcacagttgaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gacTGA-TTCGA---CCATTAAATAAT-TATGTTTG-CCTGTT--GGGGCAA---AATAATAAC-Ttgcctgttgaagcatgtgaataatgagtgtatgcctgttgagaa
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttatggcggtaaacgcgaactcaacaatatacaattgaatatgtaagttaccaatgcctagccactgataattagcacagagctgggtaattaattttgaacgttactgttcctctgatctgcaaaaggtgtggtttcgaatATTGGATAATAAT-GTATT-CCTGTT--GGGGCAgttggtctgttat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                 attgacgcggtatcagttttctgctattctaaataaatccataagagcactaaaattagacactgttcgtgttaaatctgattatataaagatatctgaccggtggaaagcaaatgtattcaataaatacatcagaataccatccaataaacttgccattttatagtgaatgaggagcatgataaaacctgcataataagaggaaagttaggtgagattcgtgtcggtccatgaaagaaatggtagctaccaccatcaacttaatgtccagaatgatatcacacttttaaaggttttcagagagtcaaatgtcggtgtggatcgtcggatcatcattgatcaaattggttttcatcaccgccagaggtagaacatggggaagtaatctaggttagaaagaataggaatagatgtctggtggcagtgaaaatgtgatttcagttcgatggacttggtaaaaaatatgattaattgttgaatttcaatgaatcgcccaatatatatattatacgtttaatgtggcggtaatgatattggtgccgtccgactcaaagtactaagaacaaacatgaggaaatacatttatgaaatttgggaaattctccctaaaacgaaaatgtttttttctcaaatattaccaagattaaagtatagacatggcatatcaggacaatgaataaaatccttgaatcaagccagaccaagggtaaattcgtacataggaaaatatgtgatttcatttggggggacatacattcggtaccctgacatatcgagtcggacggtgtgcttttggcagagttgggcacaaatttattcataaatactattcaagcttcaatctgagagtgttggtctatccttcagaataaaatttaatatgtgttttgatagttgtattgattgatgcaagatgaaacttggtcgatggcgaaatatattttgattgataaccgttgatgcattcacttcccccactttgttggcggtgaagggccatgttgattaacaatcctcatgtcccttcatttggcggcaaacgcgaactcaacaatatacaattgaatatgaaagtcagcagtgcctagccactgaatatgagcacagggctgggtaattaactttgaacgctactgttcttcttatctgcacaaggcgtggtaatcgttttgaattcaataggac-CCCGTT--GGAGCAATTGAATATTAA---TCATA-GCCGTCGtgttcaaatagtt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggATTAAATAATTATGTT--TG-CCTGTTGGGG-CAA----AATAATAACTGTacaaattttcgccaacattaaaagtattaatcattacaaagctgttactttcattatgtatatttctttatgtatatgtttaatgaatatcaaatgggatcactatgttaattgtcaaattacaaaagaacaaaatccttaagaccatttaatcagttgtcttccaataacctgtcatttgtccttcgaaaattaaaggtctgagataaaact
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttatggcggtaaacgcgaactcaacaatatacaattgaatatgtaagttaccaatgcctagccactgataattagcacagagctgggtaattaattttgaacgttactgttcctctgatctgcaaaaggtgtggtttcgaattgattcgacc-TTGCCCGA--TTAGGCT-ATT-GAATATTAATCATATC---------CTT-GGACAAGA---TT-T-CGCCAACAATAAAAGTATAAAA-TCAGA--ACAAAGCTGTTACTGTC--------------TTTAT----GTATATGTTTAATGAATATAAAATGGGATCACTAGGT-CACTTGTC----GA-ATTGCGAGTATACACA--A-AAA--CCT---T--GGAATCATTTAATCAGTTGTCTTTATATATCCTGTCATTTGTCTTTCGTAAATtggtctgttat
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAATCATGGC---------CGT-GGAC--AA---GTTTTCGCCAACAATAAAACTGTTAAT-T-ATT--AAAACGTT-TTACTTTC--------------TTTCG----GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATTGTC----GA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AAA--CAT--TG--GG-ACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTT
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cA-ATTACGAGTACAC-----A-AAA---AC--GTTGGG-GTCATTTAGTCAGTTGtataggtctga
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TTGACTAGGTATAAGTTATCTGCAATTCTAAAAAAAATCATAAGAGCCCTAAAATTAGAAACTGATCGTTTAAATCACGTTCACGAAATGGAGCTGCCACAACTGCGTCTATGCCTGGCATGTCTGATGAAGATGTAAAGATATTTGGTCGTTGGAAATCAAATGCATTGTATAAATACAACAGAATACCATCTCATAATTTATAGTAAATTAGGCGCATCATAAAACCAAAACAAACCTAGCATAATAAGTGAAAGGTTAGGTGAGATTCGAGTTGTTCCATGGGAAAAAATGGTAGCTACCACCTGCAACCTAATGTCCAGACTGGATCAAGACTCGATTATAATTAACATCAAACTTATTGGCGTTTATAAGTTGTTCAGAGAGTCCAATGTCTGTGTGGATTGTTAAATCATCATTCATCGAAAAGGATTTCATCACTGCTATAGGTAG
Unaligned ( gi|8 ): AGAGTAAAAATGGTTGCTTATGACAGAAACATTACTGCATGACTGGCTATACAATAAATCAATAATTACATCAAAACTGAGGTTTTAGTTCAGAAATTCGAAGTCTTAAAAATTAAAGGACACACCAGGGAAAGTAATCAAAATAGGAATATATCTCTGGTTTCAGGAAAATATGGTTTAAGACAGACGAAATTAGTTAAAAAGGAGTATTTATTAAAATGTATATATTTTGATATACTGTACATTATTAAATACATTAATT
Unaligned ( gi|20 ): TCAGTTGTCTTGCTAAAACTCATTTGTAGTTTCGTAAAGTAAAGGTCTGG
Unaligned ( gi|21 ): GCCTTCCTATAACCTGTCAATCGAAAATTAAAGGTCTGAGATAATAC






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Reference ( family-2400 )     :                                                                                                                NNNTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTAGGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T-G-TTTTTTTCTCAAATATTACCAAGATTGAAGTATAGACATGACCTATCAGGNCAATGTAC-------CAAATCC-TTAAATCAGGCCAGAGCCAGGANT-AATTCGTACATA-GGAAAATA-----------TG------------GGGGAAC-ATA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGNAACACATCGAGTCTGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGAACAAGCNTAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTAA-AA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCTTCAGAATAAAATANG-------TTTAATGTNTNTN----TTNGTNGTT-GTNTTT-TTG---------------ATTGA---TGCAAGACGAAACTTGATCCACGGCGAAACCT-A-GGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGANGC-GTTCGCTTCC-C--CCACTTTGGTGGCGGTGAAGGGCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCANCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGGCTGGGTAAT-----TAACTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGGTAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTGTTGGGGCATG--NGAAT---------------------AATTGTNGGCCTGTTT--GGGCAATTGAATAATAANTGTATNCCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTNATGCCTGTTGGGGCAACT--AAT---------------AATAACTGTATGCCTGTTGGGGCAACTG---AATGAT---TGTTGGCCCG-TTGGGGC-ATTTGAATATTAATCATAGC---------CGTTGACAATTTTNC--GCCAACAATAAAAGT-ATAAANTCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTAGGT-CGATT-GTCAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CNT--NNGGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAT
gi|1                          :                                                                                                                    TAAGAACAAACATGAGGAAATACATTTATGAAATTTGGGAA-----ATTCTCCC---TAAAACGAAAA--T-G-TTTTTTTCTCAAATATTACCAAGATTAAAGTATAGACATGGCATATCAGGACAATGAAT-------AAAATCC-TTGAATCAAGCCAGACCAAGGGTA-AATTCGTACATA-GGAAAATA-----------TGTGATTTCATTTGGGGGGAC-ATA-----CATTCGGTACCCTGA-------------------CATATCGAGTCGGACGGTGTGCTTTTGGCAGAGTTGGGCACAAATTTAT---TC--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAAT---------------CTGAGAGTGT--TGGTCTATCCTTCAGAATAAAAT-----------TTAATATGTGTT----TTGATAGTT-GTATT----G---------------ATTGA---TGCAAGATGAAACTTGGTCGATGGCGAAA------------TATATTTTGATTGATAACCGTTGATGC-ATTCACTTCC-C--CCACTTTGTTGGCGGTGAAGGGCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGCAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCAGCAGTG--------CCTAGCCACTGAATATGAGCACAGGGCTGGGTAAT-----TAACTTTGAACGCTACTGTTCTTCTTATCTGCACAAGGCGTGGTAATC-GTTTTGAATTCAATAGGA-CAT-TGGAT----AATAATGTATTCCTGTTGGGGCATGTTCAAAT---------------------AGTT
gi|10                         :                                                                                           attgacgcggtatcagttttctgctattctaaataaatccataagagcactaaaattagacactgttcgtgttaaatctgattatataaagatatctgaccggtggaaagcaaatgtattcaataaatacatcagaataccatccaataaacttgccattttatagtgaatgaggagcatgataaaacctgcataataagaggaaagttaggtgagattcgtgtcggtccatgaaagaaatggtagctaccaccatcaacttaatgtccagaatgatatcacacttttaaaggttttcagagagtcaaatgtcggtgtggatcgtcggatcatcattgatcaaattggttttcatcaccgccagaggtagaacatggggaagtaatctaggttagaaagaataggaatagatgtctggtggcagtgaaaatgtgatttcagttcgatggacttggtaaaaaatatgattaattgttgaatttcaatgaatcgcccaatatatatattatacgtttaatgtggcggtaatgatattggtgccgtccgactcaaagtacTTGATACCGTTCCCTTCC-C--CCGCTTTGTTGGCGATAAATGGCTATGTTGATATACAATACTCATGTCCCTTAATTTGGCGGTAAACGCAAACTCAACAATATACAATTAAATATGAAAGTCATCAATGCTTAGTCACTTAGTCACTGATTATTAGCACAGGGCTGAGTAAT-----TAACTTTGAACGTTACTATTCCTCTGATTTGCACAGGGCGTGGTAATA-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCCCGATTAGGCT-ATT-GAATATTAATCATATC---------CTTGGACAAGATTTC--GCCAACAATAAAAGT-ATAAAATCAGA--ACAAAGCTGTTACTGTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATAAAATGGGATCACTAGGT-CACTT-GTCGA-ATTGCGAGTATACACA--A-AA-A-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTTATATATCCTGTCATTTGT-CTTTCGTAAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttC-ATTTAAATATTAAGCATAGC---------TGTTG-TAAGTTTTT--GCCAACAATAAAAGT-ATAAAACAATT--ACAAAGTT-TTACTCTCTTTAT--------------TTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCAGTAGGT-CAATT-GTCAA-ATTACGAGAACACA----A-AA-A-CCT--TGAGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATGACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAcaaaggtctgatataaga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAT---------------------GAT-GTATGCCTGTTG--GAGCATGTGAATAATGATTGTAATCCTGTTGGG--AATTG-----------TATGCCTGTTGCGGGAACTC-AAT---------------AATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAAAAATGAT---TGTATGCCCG-TTGGGGCAATTTAAATG--AATC--CGC---------CCTTGACAATgaaaaggtctgagat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gacAATGATGTATGCCTGTTGGAGCATG--TGAATAATGATTGTAATCCTGTTGGGAATTGTATGCCTGTTG--CGGGAACTCAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAAAAATGATTGTATGCCCGTTGGGGCAATTTAAATGAATCCGCCCTTGACAATAA-TGTATGCCTGTTGAAGCATGTG---AATAATGAGTGTATGCCTG-TTGAGaatgtatgcctgttgaagcatgtgaataatgagtgtatgcctgttgagaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gacTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGTAAGTTACCAATG--------CCTAGCCACTGATAATTAGCACAGAGCTGGGTAAT-----TAATTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCAAAAGGTGTG-------GTTTCGAATTGATTCGAC-CAT-TAAATAAT---T-ATGTTTGCCTGTTGGGGCAAA--ATAAT---------------------AACTGTTGGTCTGTTaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttaTAATCATGGC---------CGTGGACAAGTTTTC--GCCAACAATAAAACT-GTTAATT-ATT--AAAACGTT-TTACTTTCTTTCG--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATT-GTCGA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AA-A-CAT--TGGGACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTTat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGaaaggtctgagataaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAATAATATC---------CGTTGACAAGCTTTC--TCCAACAATAAAAGT-ATAAATTAATTTTACAAAGCAAT-ATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTAAATGAATATCAAATGGGATCACT--------TT--TCAA-ATTACGAGCACAC-----A-AAGG-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGACATTTTT-aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -ATTTGAATATT--TTATAGCATTTCTATACGT--ATAGTTTTTTTGGCCAACAATATAAGT-ATAAAGTCATT--ACAAAGCTGTTTCTTTC---ATAAAA----------ATATATGTTTAATGGATAGCAATTGGGGTCATTGTGT-T-ATTGGTCAATGTTGCGAGTAAACT----A-AC-A-CCT--TAGGGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGGTACGAGT-GTTAA-----CGAGTACAC-----ATAA-A-TAT--TGGGGTCACTTAGTCAGTTGTCTTCCTATGGACTGTCAACTGT-CCATCGTGAAT
gi|2                          :                                                                                                                   cTAAGAACAAACATTAAGAAATACATTGATGACATTAGGGAA-----ATTCTTCA---TAACACAAAAAAAT-GATTTTTTTCTAAAATATTACCAAGATTGATGCATAGACATGACTTATCAGGATAATGTAC-------CAACTCC-TTAATTCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-CGCAATTA-----------TGTGATTTTAATTGGGGGAAC-ATAAATTGTATTCGTTACCTTGATATAAGACCAACACAGTAACACATCGAGTATGACGGTGTGCATTTGAATAAGTTGGAAACAAGCATAT---TA--ATAATTAATACTATTCAAGCTTCAATTGATAA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCCCCAGAATAAAAAAAG-------T--------------------------GTTTTTGTTG---------------ATTGA---TACAAGA----------------GTAAAAG---A-GGAA-ATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGATGC-GTGCCCTTCC-C--C-ACTTTAG---CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATATA-TAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGGTAAT-----TAACTTTGAACGTAACTGTTCCTCTGATCTGCACATTGCATGGTAATT-ATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATG--GGAAT---------------------AGTTAATGGCCTGTTG--GGGCAAATGAATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAACTGGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGCAACTG-AAC---------------AATAACTGTATGCATGTTTGCACAGTTG---AATtataggtctga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTCAGTTGTCTTGCTAAAAC---TCATTTGTAGTTTCGTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCCTTCCTATAACCTGTCAgtaaaggtctgg
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gi|3                          :                                                                                                                 gtTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAA-----ATGCTTCCATTTAAAACGAAAA--TCG-CTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAAAGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GGAAAAT------------TG------------GGAGAAC-ATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTACATACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGG-AATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATGGTTTTTTTTTAATGTTTTTC----TTTGTTGTT-TTTTTT-TTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTTA---TGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACCT-AAGGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGAGGC-GTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGTGACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGAACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGATA-----------------------TGTCCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGATAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATG--TGAAT---------------------AATTGTTGGCCTGTTT--GGGCAACTGAATAATATTTGTATACCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTAATGCCTGTCGGGGAAACT--AAT---------------AATAATTGTATACCTATAGGGGCAATTA---AACGAT---TGTTGGTTGG-TTGGGGT-ATTTGAATATTAATCATAGC---------CGTTGACTATTATGC--ACCAAAAATAAAAGT-ATAAATTCATT--ACGAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAAT-ATTAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CAT--GTGGATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGT-CCTTGGTAAAT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|1                          :                                                                                                                    TAAGAACAAACATGAGGAAATACATTTATGAAATTTGGGAA-----ATTCTCCC---TAAAACGAAAA--T-G-TTTTTTTCTCAAATATTACCAAGATTAAAGTATAGACATGGCATATCAGGACAATGAAT-------AAAATCC-TTGAATCAAGCCAGACCAAGGGTA-AATTCGTACATA-GGAAAATATGTGATTTCATTTGGGGGGAC-ATA-----CATTCGGTACCCTGA-------------------CATATCGAGTCGGACGGTGTGCTTTTGGCAGAGTTGGGCACAAATTTAT-TC----ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAAT---------------CTGAGAGTGT--TGGTCTATCCTTCAGAATAAAAT-----------TTAATATGTGTT----TTGATAGTT-GTATT---G---------------ATTGA---TGCAAGATGAAACTTGGTCGATGGCGAAA------------TATATTTTGATTGATAACCGTTGATGC-ATTCACTTCC-C--CCACTTTGTTGGCGGTGAAGGGCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGCAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCAGCAGTG--------CCTAGCCACTGAATATGAGCACAGGGCTGGGTAAT-----TAACTTTGAACGCTACTGTTCTTCTTATCTGCACAAGGCGTGGTAATC-GTTTTGAATTCAATAGGA-CAT-TGGAT----AATAATGTATTCCTGTTGGGGCATGTTCAAATAGT-----------T
gi|10                         :                                                                               attgacgcggtatcagttttctgctattctaaataaatccataagagcactaaaattagacactgttcgtgttaaatctgattatataaagatatctgaccggtggaaagcaaatgtattcaataaatacatcagaataccatccaataaacttgccattttatagtgaatgaggagcatgataaaacctgcataataagaggaaagttaggtgagattcgtgtcggtccatgaaagaaatggtagctaccaccatcaacttaatgtccagaatgatatcacacttttaaaggttttcagagagtcaaatgtcggtgtggatcgtcggatcatcattgatcaaattggttttcatcaccgccagaggtagaacatggggaagtaatctaggttagaaagaataggaatagatgtctggtggcagtgaaaatgtgatttcagttcgatggacttggtaaaaaatatgattaattgttgaatttcaatgaatcgcccaatatatatattatacgtttaatgtggcggtaatgatattggtgccgtccgactcaaagtacTTGATACCGTTCCCTTCC-C--CCGCTTTGTTGGCGATAAATGGCTATGTTGATATACAATACTCATGTCCCTTAATTTGGCGGTAAACGCAAACTCAACAATATACAATTAAATATGAAAGTCATCAATGCTTAGTCACTTAGTCACTGATTATTAGCACAGGGCTGAGTAAT-----TAACTTTGAACGTTACTATTCCTCTGATTTGCACAGGGCGTGGTAATA-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCCCGATTAGGCTATT-GAATATTAATCATATCCTTG---GACA---AGATTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAATCAGA--ACAAAGCTGTTACTGTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATAAAATGGGATCACTAGGT-CACTTGTCGA-ATTGCGAGTATACACA--A-AA-A-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTTATATATCCTGTCATTTGT-CTTTCGTAAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttCATTTAAATATTAAGCATAGCTGTT---G-TA---AGTTTTT---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAACAATT--ACAAAGTT-TTACTCTCTTTAT--------------TTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCAGTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGAACACA----A-AA-A-CCT--TGAGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATGACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAcaaaggtctgatataaga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGATGTATGCCTGTTGGAGCATG--TGAATAATGATTGTAATCCTGTTGGGAATTGTATGCCTGTT--GCGGGAACTCAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAAAAATGATTGTATGCCCGTTGGGGCAATTTAAATGAATCCGCCCTTGACAATAA-TGTATGCCTGTTGAAGCATGTGAATAATGAGTGTATGCCTG-TTGAGgaaaaggtctgagat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gacTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGTAAGTTACCAATG--------CCTAGCCACTGATAATTAGCACAGAGCTGGGTAAT-----TAATTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCAAAAGGTGTG-------GTTTCGAATTGATTCGAC-CAT-TAAATAAT---T-ATGTTTGCCTGTTGGGGCAAA--ATAATAAC-----------TGTTGG----------TCTGTT--aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttaTAATCATGGCCGTG---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAACT-GTTAATT-ATT--AAAACGTT-TTACTTTCTTTCG--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATTGTCGA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AA-A-CAT--TGGGACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTTat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGaaaggtctgagataaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAATAATATCCGTT---GACA---AGCTTTC---TCCAACAATAAAAGT-ATAAATTAATTTTACAAAGCAAT-ATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTAAATGAATATCAAATGGGATCACT--------TT-TCAA-ATTACGAGCACAC-----A-AAGG-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGACATTTTT-aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATTTGAATATT--TTATAGCATTTCTATACGTATAGTTTTTTTGGCCAACAATATAAGT-ATAAAGTCATT--ACAAAGCTGTTTCTTTC---ATAAAA----------ATATATGTTTAATGGATAGCAATTGGGGTCATTGTGT-TATTGGTCAATGTTGCGAGTAAACT----A-AC-A-CCT--TAGGGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGGTACGAGTGTTAA-----CGAGTACAC-----ATAA-A-TAT--TGGGGTCACTTAGTCAGTTGTCTTCCTATGGACTGTCAACTGT-CCATCGTGAAT
gi|2                          :                                                                                                                   cTAAGAACAAACATTAAGAAATACATTGATGACATTAGGGAA-----ATTCTTCA---TAACACAAAAAAAT-GATTTTTTTCTAAAATATTACCAAGATTGATGCATAGACATGACTTATCAGGATAATGTAC-------CAACTCC-TTAATTCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-CGCAATTATGTGATTTTAATTGGGGGAAC-ATAAATTGTATTCGTTACCTTGATATAAGACCAACACAGTAACACATCGAGTATGACGGTGTGCATTTGAATAAGTTGGAAACAAGCATAT-TA----ATAATTAATACTATTCAAGCTTCAATTGATAA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCCCCAGAATAAAA--------------AAAGTGTTT------------TT-GTT-----G---------------ATTGA---TACAAGA----------------GTAAAAG---A-GGAA-ATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGATGC-GTGCCCTTCC-C--C-ACTTTAG---CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATATA-TAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGGTAAT-----TAACTTTGAACGTAACTGTTCCTCTGATCTGCACATTGCATGGTAATT-ATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATG--GGAATAGT-----------TAATGG----------CCTGTT--GGGGCAAATGAATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAACTGGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGCAACTG-AAC---------------AATAACTGTATGCATGTTTGCACAGTTGAATtataggtctga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTCAGTTGTCTTGCTAAAAC---TCATTTGTAGTTTCGTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCCTTCCTATAACCTGTCAgtaaaggtctgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-ATTACGAGTACAC-----A-AA-AACGT--TGGGGTCATTTAGTCAGTTGatcgaaaattaaaggtctgagataatac
gi|3                          :                                                                                                                 gtTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAA-----ATGCTTCCATTTAAAACGAAAA--TCG-CTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAAAGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GGAAAAT-------------TGGGAGAAC-ATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTACATACATAT-TT----ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGG-AATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATGGTTTTTTTTTAATGTTTTTC----TTTGTTGTT-TTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTTA---TGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACC-TAAGGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGAGGC-GTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGTGACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGAACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGATA-----------------------TGTCCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGATAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATG--TGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--TGGGCAACTGAATAATATTTGTATACCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTAATGCCTGTCGGGGAAACT--AAT---------------AATAATTGTATACCTATAGGGGCAATTAAACGAT---TGTTGGTTGG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACT---ATTATGC---ACCAAAAATAAAAGT-ATAAATTCATT--ACGAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAATATTAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CAT--GTGGATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGT-CCTTGGTAAAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                  tagATTGCAGTATAGACATGACCTATCAGGCCAATGTTC-------TTAATCC-TTAAATCAGGCCAAA-TCAGGAAT-AATTCGTACATA-AGACAATATGTTATTTCAATCAGGGGAAC-AAA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGAAACACATCGAATCTGACGGTTTGCATTTGACCGAATTGGGAACAAGCCTAT-TT----ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTAA-AA-GATAGTTTCTGAAAATGTACTGGTCTATCCTTAAGAATAAATTACG------------TGT-TTTA----TTTGTTGTT-GTTTTTTT--------------------A---TGCAAGACGAAACTTGACCCACAGCGAAATC-TA-AGAACAAATATGTTGCTTGATAACCGTTGA-GC-CTTTGCTTCC-C--CCACTTTGGTGTCGGTGAAGGGTCATGTTGATTAACAATCGTCATGTCCTTTCATTTGTCGGTAAACGCGATCTCAACAATATACAATTGACTATGAAAGTCATCAATG--------CATAGTCACTGAATATTAGCACAGAGCTGGGTAAG-----TACCTTAGAACGTTACTTTTCATCTGATCCGCACAGGGCGCAGTAATCTTTTTTTATTTGAATTGAA-CAT-TGAAC--T--ATAATGTATGCC--TTGGGGTTTA--TAAATAAT-----------TGTTAG----------TCTGTTCGGGGGCAATTGAGTAATAATGTTATGCATGTTGAGGCAACATAATAATAATTATATGCCTGTC-AGGCAATT--GAT---------------AAT-----------TGTTG-----------------------GCCCG-TTGGGGTATTTGAA-AATAATCATAGCCGTT---GACA---AGGTTTC---GCTAATAATAAAAATAAAAAAATCATT--ACAAAGCTGTTATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATACCAAATTGGATCACTAGAT-CAATTCTTAA-ATTACGATTACACTA---G-AA-A-CATAAAAAAATCATTTGATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGCCATTTGT-CCTTCGac
gi|5                          :                                                                                                            ttactcacaattatataACATTATTAAATACATT-----AATTGGGGTATGTTCATTCTTCC---TTAAACAA-----------------TCAAATA--------ATT--ATTATAGGTACGACTTATCAAAGTAGTGTACAAATATACACATTCATTATATAAGGCCAGAGACAGGATT-ACTTCGTACTTACGGTAAAAAGCTGATTTCACT-AGAGAAACTATA-----TGTCCGTTAGGCTTGCATACTATCAATACAAGAACACATCGAAGCTGACAGTGTACAATTTACCAAGTTGGCAACAAATATATATTTTCCATAG---ATACAAATCAAGCTTCATTTAA-AACGATATTGTCGGAGAATGTCTCA---TA-----CAGAATAAAATA----------TAAAAGTGTTTCAAAGTTC-TAGTTCGTTCCTGTA---------------A-TAACTCTGCAAAACGAAGTTTGATTCAATGTGAAACCTTA-GTAA-ATACGCGCTGTTTTATGATCGTCGATAG-GCTCACTCCTACTACCACTTTGGTTGAGGTGGATGGCCATGTTAATTATCAATACTT-TG-----TCATATGTCGGT--ACATGAACATAACAATAAGCAATTGAATATGACAGTAGACAGTG--------CCACGTCATTTATTATAAGCGCAG---T-GGTACTTTTAATAACTTTGAACGT
gi|7                          : gggaaagtaatcaaaataggaatatatctctggtttcaggaaaatatggtttaagacagacgaaattagttaaaaaggagtatttattaaaatgtatatattttgatatactgtTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTATGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T----TGTTTTCTCAAATATCACCAAGATTGAAGTATAGGCATGACCTATCAGGTCAATGTAT-------TTAATCC-TTAAATCAGGTCAGAGCCAGAATT-AATTCGTATATA-ACAAAATACATGATTTCGAT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tATTTAAATATTAAGCATAGCTGTT---G-TA---AGTTTTT---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAACAATT--ACAAAGTT-TTACTCTCTTTAT--------------TTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCAGTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGAACACA----A-AA-A-CCT--TGAGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATGACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAcaaaggtctgatataaga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAATGATGTATGCCTGTTGGAGCATG--TGAATAATGATTGTAATCCTGTTGGGAATTGTATGCCTGTT--GCGGGAACTCAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAAAAATGATTGTATGCCCGTTGGGGCAATTTAAATGAATCCGCCCTTGACAATAA-TGTATGCCTGTTGAAGCATGTGAATAATGAGTGTAT--GCCTG-TTGAGgaaaaggtctgagat
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaTAATCATGGCCGTG---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAACT-GTTAATT-ATT--AAAACGTT-TTACTTTCTTTCG--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATTGTCGA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AA-A-CAT--TGGGACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTTat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGaaaggtctgagataaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATAATATCCGTT---GACA---AGCTTTC---TCCAACAATAAAAGT-ATAAATTAATTTTACAAAGCAAT-ATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTAAATGAATATCAAATGGGATCACT--------TT-TCAA-ATTACGAGCACAC-----A-AAGG-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGACATTTTT-aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTGAATATT--TTATAGCATTTCTATACGTATAGTTTTTTTGGCCAACAATATAAGT-ATAAAGTCATT--ACAAAGCTGTTTCTTTC---ATAAAA----------ATATATGTTTAATGGATAGCAATTGGGGTCATTGTGT-TATTGGTCAATGTTGCGAGTAAACT----A-AC-A-CCT--TAGGGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGGTACGAGTGTTAA-----CGAGTACAC-----ATAA-A-TAT--TGGGGTCACTTAGTCAGTTGTCTTCCTATGGACTGTCAACTGT-CCATCGTGAAT
gi|2                          :                                                                                                                   cTAAGAACAAACATTAAGAAATACATTGATGACATTAGGGAA-----ATTCTTCA---TAACACAAAAAAAT-GATTTTTTTCTAAAATATTACCAAGATTGATGCATAGACATGACTTATCAGGATAATGTAC-------CAACTCC-TTAATTCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-CG-CAATTATGTGATTTTAATTGGGGGAAC-ATAAATTGTATTCGTTACCTTGATATAAGACCAACACAGTAACACATCGAGTATGACGGTGTGCATTTGAATAAGTTGGAAACAAGCATAT---TA--ATAATTAATACTATTCAAGCTTCAATTGATAA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCCCCAGAATAAAA--------------AAAGTGTTT------------TT-GTT-----G---------------ATTGA---TACAAGA----------------GTAAAAG---A-GGAA-ATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGATGC-GTGCCCTTCC-C--C-ACTTTAG---CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATATA-TAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGG-----TAATTAACTTTGAACGTAACTGTTCCTCTGATCTGCACATTGCATGGTAATT-ATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATG--GGAATAGT-----------TAATGG----------CCTGTT--GGGGCAAATGAATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAACTGGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGCAACTG-AAC---------------AATAACTGTATGCATGTTTGCACAGTTGAATtataggtctga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTCAGTTGTCTTGCTAAAAC---TCATTTGTAGTTTCGTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCCTTCCTATAACCTGTCAgtaaaggtctgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-ATTACGAGTACAC-----A-AA-AACGT--TGGGGTCATTTAGTCAGTTGatcgaaaattaaaggtctgagataatac
gi|3                          :                                                                                                                 gtTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAA-----ATGCTTCCATTTAAAACGAAAA--TCG-CTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAAAGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GG-AAAAT-------------TGGGAGAAC-ATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTACATACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGG-AATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATGGTTTTTTTTTAATGTTTTTC----TTTGTTGTT-TTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTTA---TGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACCT-AAGGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGAGGC-GTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGTGACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGAACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGA-----TA------------------TGTCCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGATAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATG--TGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--TGGGCAACTGAATAATATTTGTATACCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTAATGCCTGTCGGGGAAACT--AAT---------------AATAATTGTATACCTATAGGGGCAATTAAACGAT-----TGTTGGTTGG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACT---ATTATGC---ACCAAAAATAAAAGT-ATAAATTCATT--ACGAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAATATTAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CAT--GTGGATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGT-CCTTGGTAAAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                  tagATTGCAGTATAGACATGACCTATCAGGCCAATGTTC-------TTAATCC-TTAAATCAGGCCAAA-TCAGGAAT-AATTCGTACATA-AG-ACAATATGTTATTTCAATCAGGGGAAC-AAA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGAAACACATCGAATCTGACGGTTTGCATTTGACCGAATTGGGAACAAGCCTAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTAA-AA-GATAGTTTCTGAAAATGTACTGGTCTATCCTTAAGAATAAA------TT--------ACGTGTTTTA---TTTGTTGTT-GTTTTTTT--------------------A---TGCAAGACGAAACTTGACCCACAGCGAAATCT-A-AGAACAAATATGTTGCTTGATAACCGTTGA-GC-CTTTGCTTCC-C--CCACTTTGGTGTCGGTGAAGGGTCATGTTGATTAACAATCGTCATGTCCTTTCATTTGTCGGTAAACGCGATCTCAACAATATACAATTGACTATGAAAGTCATCAATG--------CATAGTCACTGAATATTAGCACAGAGCTGGG-----TAAGTACCTTAGAACGTTACTTTTCATCTGATCCGCACAGGGCGCAGTAATCTTTTTTTATTTGAATTGAA-CAT-TGAAC--T--ATAATGTATGCC--TTGGGGTTTA--TAAATAAT-----------TGTTAG----------TCTGTTCGGGGGCAATTGAGTAATAATGTTATGCATGTTGAGGCAACATAATAATAATTATATGCCTGTC-AGGCAATT--GAT---------------AAT-----------TGTTG-------------------------GCCCG-TTGGGGTATTTGAA-AATAATCATAGCCGTT---GACA---AGGTTTC---GCTAATAATAAAAATAAAAAAATCATT--ACAAAGCTGTTATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATACCAAATTGGATCACTAGAT-CAATTCTTAA-ATTACGATTACACTA---G-AA-A-CATAAAAAAATCATTTGATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGCCATTTGT-CCTTCGac
gi|5                          :                                                                                                            ttactcacaattatataACATTATTAAATACATT-----AATTGGGGTATGTTCATTCTTCC---TTAAACAA-----------------TCAAATA--------ATT--ATTATAGGTACGACTTATCAAAGTAGTGTACAAATATACACATTCATTATATAAGGCCAGAGACAGGATT-ACTTCGTACTTACGGTAAAAAGC-TGATTTCACT-AGAGAAACTATA-----TGTCCGTTAGGCTTGCATACTATCAATACAAGAACACATCGAAGCTGACAGTGTACAATTTACCAAGTTGGCAACAAATATATATTTTCCATAG---ATACAAATCAAGCTTCATTTAA-AACGATATTGTCGGAGAATGTCTCA---TA-----CAGAATAAAATA---TA-------AAAGTGTTTCAAAGTTC-TAGTTCGTTCCTGTA---------------AT-AACTCTGCAAAACGAAGTTTGATTCAATGTGAAACCTTA-GTAA-ATACGCGCTGTTTTATGATCGTCGATAG-GCTCACTCCTACTACCACTTTGGTTGAGGTGGATGGCCATGTTAATTATCAATACTT-TGTC-----ATATGTCGGTA--CATGAACATAACAATAAGCAATTGAATATGACAGTAGACAGTG--------CCACGTCATTTATTATAAGCGCAG---TGGTACTTTTAAT-AACTTTGAACGT
gi|7                          : gggaaagtaatcaaaataggaatatatctctggtttcaggaaaatatggtttaagacagacgaaattagttaaaaaggagtatttattaaaatgtatatattttgatatactgtTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTATGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T----TGTTTTCTCAAATATCACCAAGATTGAAGTATAGGCATGACCTATCAGGTCAATGTAT-------TTAATCC-TTAAATCAGGTCAGAGCCAGAATT-AATTCGTATATA-AC-AAAATACATGATTTCGAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acgataaacttggtcagaaaagtgaaatatttgttaaattttaatgaatcgcgcagtaaattgatacgtttattgtgatggaaatggtataaaagtccgtctaaaagta--GCCCG-TTGGAGCAATTGAATATTAATCATAGCCGTC---GACA---AATTTTC---GCCAACATTAAAAGT-ATTAA-TCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCATTATGTATATTTCTTTATGTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTATGT-TAATTGTCAA-ATTACAAAAGAAC-----A-AA-ATCCT--TAAGACCATTTAATCAGTTGTCTTCCAATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGAAAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TTGACTAGGTATAAGTTATCTGCAATTCTAAAAAAAATCATAAGAGCCCTAAAATTAGAAACTGATCGTTTAAATCACGTTCACGAAATGGAGCTGCCACAACTGCGTCTATGCCTGGCATGTCTGATGAAGATGTAAAGATATTTGGTCGTTGGAAATCAAATGCATTGTATAAATACAACAGAATACCATCTCATAATTTATAGTAAATTAGGCGCATCATAAAACCAAAACAAACCTAGCATAATAAGTGAAAGGTTAGGTGAGATTCGAGTTGTTCCATGGGAAAAAATGGTAGCTACCACCTGCAACCTAATGTCCAGACTGGATCAAGACTCGATTATAATTAACATCAAACTTATTGGCGTTTATAAGTTGTTCAGAGAGTCCAATGTCTGTGTGGATTGTTAAATCATCATTCATCGAAAAGGATTTCATCACTGCTATAGGTAG
Unaligned ( gi|8 ): AGAGTAAAAATGGTTGCTTATGACAGAAACATTACTGCATGACTGGCTATACAATAAATCAATAATTACATCAAAACTGAGGTTTTAGTTCAGAAATTCGAAGTCTTAAAAATTAAAGGACACACCAGGGAAAGTAATCAAAATAGGAATATATCTCTGGTTTCAGGAAAATATGGTTTAAGACAGACGAAATTAGTTAAAAAGGAGTATTTATTAAAATGTATATATTTTGATATACTGTACATTATTAAATACATTAATT






Alignments
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Reference ( family-2400 )     :                                                                                                                NNNTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTAGGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T-G-TTNTTTTCTCAAATATTACCAAGATTGAAGTATAGACATGACCTATCAGGNCAATGTAC-------CGAATCC-TTAAATCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-GG-AAAATACGTGATTTCAATCGGGGGAAC-ATA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGGAACACATCGAGTCTGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGAACAAACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGA-AA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCTTCAGAATAAAATAT----------TAANGTGTTTCA---TTCG-TNGTT-GTTTTTTTG---------------ATTGA---TGCAAGACGAAGCTTGGTCCANGGCGAAACCT-A-GGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGATGC-GTTCGCTTCC-C--CCACTTTGGTGGCGGTGAAGGGCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGGCTGGG-----TAATTAACTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGGTAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTGTTGGGGCATG--CGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--GGGGCAACTGAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAATAATAACTNNATGCCTGTCGGGGCAACT--AAT---------------AATAACTGTATGCCTGTTGGNGCANTTGAATGAT-----TGT--GCCCG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAANTCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CNT--TGGGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T--GCCCGATTAGGCTATT-GAATATTAATCATATCCTTG---GACA---AGATTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAATCAGA--ACAAAGCTGTTACTGTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATAAAATGGGATCACTAGGT-CACTTGTCGA-ATTGCGAGTATACACA--A-AA-A-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTTATATATCCTGTCATTTGT-CTTTCGTAAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tATTTAAATATTAAGCATAGCTGTT---G-TA---AGTTTTT---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAACAATT--ACAAAGTT-TTACTCTCTTTAT--------------TTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCAGTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGAACACA----A-AA-A-CCT--TGAGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATGACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAcaaaggtctgatataaga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cAATGATGTATGCCTGTTGGAGCATG--TGAATAATGATTGTAATCCTGTTGGGAATTGTATGCCTGTT--GCGGGAACTCAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAAAAATGATTGTATGCCCGTTGGGGCAATTTAAATGAATCCGCCCTTGACAATAA-TGTATGCCTGTTGAAGCATGTGAATAATGAGTGTAT--GCCTG-TTGAGgaaaaggtctgagat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gacTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGTAAGTTACCAATG--------CCTAGCCACTGATAATTAGCACAGAGCTGGG-----TAATTAATTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCAAAAGGTGTG-------GTTTCGAATTGATTCGAC-CAT-TAAATAAT---T-ATGTTTGCCTGTTGGGGCAAA--ATAATAAC-----------TGTTGG----------TCTGTT--aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cttaTAATCATGGCCGTG---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAACT-GTTAATT-ATT--AAAACGTT-TTACTTTCTTTCG--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATTGTCGA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AA-A-CAT--TGGGACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTTat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGaaaggtctgagataaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAATAATATCCGTT---GACA---AGCTTTC---TCCAACAATAAAAGT-ATAAATTAATTTTACAAAGCAAT-ATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTAAATGAATATCAAATGGGATCACT--------TT-TCAA-ATTACGAGCACAC-----A-AAGG-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGACATTTTT-aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTTGAATATT--TTATAGCATTTCTATACGTATAGTTTTTTTGGCCAACAATATAAGT-ATAAAGTCATT--ACAAAGCTGTTTCTTTC---ATAAAA----------ATATATGTTTAATGGATAGCAATTGGGGTCATTGTGT-TATTGGTCAATGTTGCGAGTAAACT----A-AC-A-CCT--TAGGGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGGTACGAGTGTTAA-----CGAGTACAC-----ATAA-A-TAT--TGGGGTCACTTAGTCAGTTGTCTTCCTATGGACTGTCAACTGT-CCATCGTGAAT
gi|2                          :                                                                                                                   cTAAGAACAAACATTAAGAAATACATTGATGACATTAGGGAA-----ATTCTTCA---TAACACAAAAAAAT-GATTTTTTTCTAAAATATTACCAAGATTGATGCATAGACATGACTTATCAGGATAATGTAC-------CAACTCC-TTAATTCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-CG-CAATTATGTGATTTTAATTGGGGGAAC-ATAAATTGTATTCGTTACCTTGATATAAGACCAACACAGTAACACATCGAGTATGACGGTGTGCATTTGAATAAGTTGGAAACAAGCATAT---TA--ATAATTAATACTATTCAAGCTTCAATTGATAA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCCCCAGAATAAAA--------------AAAGTGTTT-------------TT-GTT-----G---------------ATTGA---TACAAGA----------------GTAAAAG---A-GGAA-ATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGATGC-GTGCCCTTCC-C--C-ACTTTAG---CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATATA-TAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGG-----TAATTAACTTTGAACGTAACTGTTCCTCTGATCTGCACATTGCATGGTAATT-ATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATG--GGAATAGT-----------TAATGG----------CCTGTT--GGGGCAAATGAATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAACTGGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGCAACTG-AAC---------------AATAACTGTATGCATGTTTGCACAGTTGAATtataggtctga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTCAGTTGTCTTGCTAAAAC---TCATTTGTAGTTTCGTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCCTTCCTATAACCTGTCAgtaaaggtctgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-ATTACGAGTACAC-----A-AA-AACGT--TGGGGTCATTTAGTCAGTTGatcgaaaattaaaggtctgagataatac
gi|3                          :                                                                                                                 gtTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAA-----ATGCTTCCATTTAAAACGAAAA--TCG-CTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAAAGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GG-AAAAT-------------TGGGAGAAC-ATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTACATACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGG-AATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATGGTTTTTTTTTAATGTTTTTC----TTTG-TTGTT-TTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTTA---TGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACCT-AAGGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGAGGC-GTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGTGACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGAACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGA-----TA------------------TGTCCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGATAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATG--TGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--TGGGCAACTGAATAATATTTGTATACCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTAATGCCTGTCGGGGAAACT--AAT---------------AATAATTGTATACCTATAGGGGCAATTAAACGAT-----TGTTGGTTGG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACT---ATTATGC---ACCAAAAATAAAAGT-ATAAATTCATT--ACGAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAATATTAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CAT--GTGGATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGT-CCTTGGTAAAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                  tagATTGCAGTATAGACATGACCTATCAGGCCAATGTTC-------TTAATCC-TTAAATCAGGCCAAA-TCAGGAAT-AATTCGTACATA-AG-ACAATATGTTATTTCAATCAGGGGAAC-AAA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGAAACACATCGAATCTGACGGTTTGCATTTGACCGAATTGGGAACAAGCCTAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTAA-AA-GATAGTTTCTGAAAATGTACTGGTCTATCCTTAAGAATAA---AT----------T-ACGTGTTTTA---TTTG-TTGTT-GTTTTTTT--------------------A---TGCAAGACGAAACTTGACCCACAGCGAAATCT-A-AGAACAAATATGTTGCTTGATAACCGTTGA-GC-CTTTGCTTCC-C--CCACTTTGGTGTCGGTGAAGGGTCATGTTGATTAACAATCGTCATGTCCTTTCATTTGTCGGTAAACGCGATCTCAACAATATACAATTGACTATGAAAGTCATCAATG--------CATAGTCACTGAATATTAGCACAGAGCTGGG-----TAAGTACCTTAGAACGTTACTTTTCATCTGATCCGCACAGGGCGCAGTAATCTTTTTTTATTTGAATTGAA-CAT-TGAAC--T--ATAATGTATGCC--TTGGGGTTTA--TAAATAAT-----------TGTTAG----------TCTGTTCGGGGGCAATTGAGTAATAATGTTATGCATGTTGAGGCAACATAATAATAATTATATGCCTGTC-AGGCAATT--GAT---------------AAT-----------TGTTG-------------------------GCCCG-TTGGGGTATTTGAA-AATAATCATAGCCGTT---GACA---AGGTTTC---GCTAATAATAAAAATAAAAAAATCATT--ACAAAGCTGTTATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATACCAAATTGGATCACTAGAT-CAATTCTTAA-ATTACGATTACACTA---G-AA-A-CATAAAAAAATCATTTGATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGCCATTTGT-CCTTCGac
gi|5                          :                                                                                                            ttactcacaattatataACATTATTAAATACATT-----AATTGGGGTATGTTCATTCTTCC---TTAAACAA-----------------TCAAATA--------ATT--ATTATAGGTACGACTTATCAAAGTAGTGTACAAATATACACATTCATTATATAAGGCCAGAGACAGGATT-ACTTCGTACTTACGGTAAAAAGC-TGATTTCACT-AGAGAAACTATA-----TGTCCGTTAGGCTTGCATACTATCAATACAAGAACACATCGAAGCTGACAGTGTACAATTTACCAAGTTGGCAACAAATATATATTTTCCATAG---ATACAAATCAAGCTTCATTTAA-AACGATATTGTCGGAGAATGTCTCA---TA-----CAGAATAAAATAT----------AAAAGTGTTTCAAAGTTC--TAGTTCGTTCCTGTA---------------AT-AACTCTGCAAAACGAAGTTTGATTCAATGTGAAACCTTA-GTAA-ATACGCGCTGTTTTATGATCGTCGATAG-GCTCACTCCTACTACCACTTTGGTTGAGGTGGATGGCCATGTTAATTATCAATACTT-TGTC-----ATATGTCGGTA--CATGAACATAACAATAAGCAATTGAATATGACAGTAGACAGTG--------CCACGTCATTTATTATAAGCGCAG---TGGTACTTTTAAT-AACTTTGAACGT
gi|7                          : gggaaagtaatcaaaataggaatatatctctggtttcaggaaaatatggtttaagacagacgaaattagttaaaaaggagtatttattaaaatgtatatattttgatatactgtTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTATGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T----TGTTTTCTCAAATATCACCAAGATTGAAGTATAGGCATGACCTATCAGGTCAATGTAT-------TTAATCC-TTAAATCAGGTCAGAGCCAGAATT-AATTCGTATATA-AC-AAAATACATGATTTCGAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acgataaacttggtcagaaaagtgaaatatttgttaaattttaatgaatcgcgcagtaaattgatacgtttattgtgatggaaatggtataaaagtccgtctaaaagta--GCCCG-TTGGAGCAATTGAATATTAATCATAGCCGTC---GACA---AATTTTC---GCCAACATTAAAAGT-ATTAA-TCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCATTATGTATATTTCTTTATGTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTATGT-TAATTGTCAA-ATTACAAAAGAAC-----A-AA-ATCCT--TAAGACCATTTAATCAGTTGTCTTCCAATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGAAAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TTGACTAGGTATAAGTTATCTGCAATTCTAAAAAAAATCATAAGAGCCCTAAAATTAGAAACTGATCGTTTAAATCACGTTCACGAAATGGAGCTGCCACAACTGCGTCTATGCCTGGCATGTCTGATGAAGATGTAAAGATATTTGGTCGTTGGAAATCAAATGCATTGTATAAATACAACAGAATACCATCTCATAATTTATAGTAAATTAGGCGCATCATAAAACCAAAACAAACCTAGCATAATAAGTGAAAGGTTAGGTGAGATTCGAGTTGTTCCATGGGAAAAAATGGTAGCTACCACCTGCAACCTAATGTCCAGACTGGATCAAGACTCGATTATAATTAACATCAAACTTATTGGCGTTTATAAGTTGTTCAGAGAGTCCAATGTCTGTGTGGATTGTTAAATCATCATTCATCGAAAAGGATTTCATCACTGCTATAGGTAG
Unaligned ( gi|8 ): AGAGTAAAAATGGTTGCTTATGACAGAAACATTACTGCATGACTGGCTATACAATAAATCAATAATTACATCAAAACTGAGGTTTTAGTTCAGAAATTCGAAGTCTTAAAAATTAAAGGACACACCAGGGAAAGTAATCAAAATAGGAATATATCTCTGGTTTCAGGAAAATATGGTTTAAGACAGACGAAATTAGTTAAAAAGGAGTATTTATTAAAATGTATATATTTTGATATACTGTACATTATTAAATACATTAATT






Alignments
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Reference ( family-2400 )     :                                                                                                                NNNTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTAGGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T-G-TTNTTTTCTCAAATATTACCAAGATTGAAGTATAGACATGACCTATCAGGNCAATGTAC-------CGAATCC-TTAAATCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-GG-AAAATACGTGATTTCAATCGGGGGAAC-ATA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGGAACACATCGAGTCTGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGAACAAACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGA-AA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCTTCAGAATAAAATAT----------TAANGTGTTTCA--TTTG-TNGTT-GTTTTTTTG---------------ATTGA---TGCAAGACGAAGCTTGGTCCANGGCGAAACCT-A-GGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGATGC-GTTCGCTTCC-C--CCACTTTGGTGGCGGTGAAGGGCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGGCTGGG-----TAATTAACTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGGTAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTGTTGGGGCATG--CGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--GGGGCAACTGAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAATAATAACTNNATGCCTGTCGGGGCAACT--AAT---------------AATAACTGTATGCCTGTTGGNGCANTTGAATGAT-----TGT--GCCCG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAANTCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CNT--TGGGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--GCCCGATTAGGCTATT-GAATATTAATCATATCCTTG---GACA---AGATTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAATCAGA--ACAAAGCTGTTACTGTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATAAAATGGGATCACTAGGT-CACTTGTCGA-ATTGCGAGTATACACA--A-AA-A-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTTATATATCCTGTCATTTGT-CTTTCGTAAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tATTTAAATATTAAGCATAGCTGTT---G-TA---AGTTTTT---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAACAATT--ACAAAGTT-TTACTCTCTTTAT--------------TTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCAGTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGAACACA----A-AA-A-CCT--TGAGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATGACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAcaaaggtctgatataaga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAATGATGTATGCCTGTTGGAGCATG--TGAATAATGATTGTAATCCTGTTGGGAATTGTATGCCTGTT--GCGGGAACTCAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAAAAATGATTGTATGCCCGTTGGGGCAATTTAAATGAATCCGCCCTTGACAATAA-TGTATGCCTGTTGAAGCATGTGAATAATGAGTGTAT--GCCTG-TTGAGgaaaaggtctgagat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGTAAGTTACCAATG--------CCTAGCCACTGATAATTAGCACAGAGCTGGG-----TAATTAATTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCAAAAGGTGTG-------GTTTCGAATTGATTCGAC-CAT-TAAATAAT---T-ATGTTTGCCTGTTGGGGCAAA--ATAATAAC-----------TGTTGG----------TCTGTT--aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaTAATCATGGCCGTG---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAACT-GTTAATT-ATT--AAAACGTT-TTACTTTCTTTCG--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATTGTCGA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AA-A-CAT--TGGGACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTTat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGaaaggtctgagataaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATAATATCCGTT---GACA---AGCTTTC---TCCAACAATAAAAGT-ATAAATTAATTTTACAAAGCAAT-ATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTAAATGAATATCAAATGGGATCACT--------TT-TCAA-ATTACGAGCACAC-----A-AAGG-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGACATTTTT-aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTGAATATT--TTATAGCATTTCTATACGTATAGTTTTTTTGGCCAACAATATAAGT-ATAAAGTCATT--ACAAAGCTGTTTCTTTC---ATAAAA----------ATATATGTTTAATGGATAGCAATTGGGGTCATTGTGT-TATTGGTCAATGTTGCGAGTAAACT----A-AC-A-CCT--TAGGGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGGTACGAGTGTTAA-----CGAGTACAC-----ATAA-A-TAT--TGGGGTCACTTAGTCAGTTGTCTTCCTATGGACTGTCAACTGT-CCATCGTGAAT
gi|2                          :                                                                                                                   cTAAGAACAAACATTAAGAAATACATTGATGACATTAGGGAA-----ATTCTTCA---TAACACAAAAAAAT-GATTTTTTTCTAAAATATTACCAAGATTGATGCATAGACATGACTTATCAGGATAATGTAC-------CAACTCC-TTAATTCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-CG-CAATTATGTGATTTTAATTGGGGGAAC-ATAAATTGTATTCGTTACCTTGATATAAGACCAACACAGTAACACATCGAGTATGACGGTGTGCATTTGAATAAGTTGGAAACAAGCATAT---TA--ATAATTAATACTATTCAAGCTTCAATTGATAA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCCCCAGAATAAAA--------------AAAGTGTTT------------TT-GTT-----G---------------ATTGA---TACAAGA----------------GTAAAAG---A-GGAA-ATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGATGC-GTGCCCTTCC-C--C-ACTTTAG---CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATATA-TAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGG-----TAATTAACTTTGAACGTAACTGTTCCTCTGATCTGCACATTGCATGGTAATT-ATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATG--GGAATAGT-----------TAATGG----------CCTGTT--GGGGCAAATGAATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAACTGGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGCAACTG-AAC---------------AATAACTGTATGCATGTTTGCACAGTTGAATtataggtctga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTCAGTTGTCTTGCTAAAAC---TCATTTGTAGTTTCGTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCCTTCCTATAACCTGTCAgtaaaggtctgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-ATTACGAGTACAC-----A-AA-AACGT--TGGGGTCATTTAGTCAGTTGatcgaaaattaaaggtctgagataatac
gi|3                          :                                                                                                                 gtTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAA-----ATGCTTCCATTTAAAACGAAAA--TCG-CTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAAAGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GG-AAAAT-------------TGGGAGAAC-ATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTACATACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGG-AATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATGGTTTTTTTTTAATGTTTTTC---TTTG-TTGTT-TTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTTA---TGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACCT-AAGGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGAGGC-GTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGTGACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGAACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGA-----TA------------------TGTCCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGATAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATG--TGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--TGGGCAACTGAATAATATTTGTATACCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTAATGCCTGTCGGGGAAACT--AAT---------------AATAATTGTATACCTATAGGGGCAATTAAACGAT-----TGTTGGTTGG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACT---ATTATGC---ACCAAAAATAAAAGT-ATAAATTCATT--ACGAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAATATTAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CAT--GTGGATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGT-CCTTGGTAAAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                  tagATTGCAGTATAGACATGACCTATCAGGCCAATGTTC-------TTAATCC-TTAAATCAGGCCAAA-TCAGGAAT-AATTCGTACATA-AG-ACAATATGTTATTTCAATCAGGGGAAC-AAA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGAAACACATCGAATCTGACGGTTTGCATTTGACCGAATTGGGAACAAGCCTAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTAA-AA-GATAGTTTCTGAAAATGTACTGGTCTATCCTTAAGAATAA---AT----------T-ACGTGTTTTA--TTTG-TTGTT-GTTTTTTT--------------------A---TGCAAGACGAAACTTGACCCACAGCGAAATCT-A-AGAACAAATATGTTGCTTGATAACCGTTGA-GC-CTTTGCTTCC-C--CCACTTTGGTGTCGGTGAAGGGTCATGTTGATTAACAATCGTCATGTCCTTTCATTTGTCGGTAAACGCGATCTCAACAATATACAATTGACTATGAAAGTCATCAATG--------CATAGTCACTGAATATTAGCACAGAGCTGGG-----TAAGTACCTTAGAACGTTACTTTTCATCTGATCCGCACAGGGCGCAGTAATCTTTTTTTATTTGAATTGAA-CAT-TGAAC--T--ATAATGTATGCC--TTGGGGTTTA--TAAATAAT-----------TGTTAG----------TCTGTTCGGGGGCAATTGAGTAATAATGTTATGCATGTTGAGGCAACATAATAATAATTATATGCCTGTC-AGGCAATT--GAT---------------AAT-----------TGTTG-------------------------GCCCG-TTGGGGTATTTGAA-AATAATCATAGCCGTT---GACA---AGGTTTC---GCTAATAATAAAAATAAAAAAATCATT--ACAAAGCTGTTATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATACCAAATTGGATCACTAGAT-CAATTCTTAA-ATTACGATTACACTA---G-AA-A-CATAAAAAAATCATTTGATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGCCATTTGT-CCTTCGac
gi|5                          :                                                                                                            ttactcacaattatataACATTATTAAATACATT-----AATTGGGGTATGTTCATTCTTCC---TTAAACAA-----------------TCAAATA--------ATT--ATTATAGGTACGACTTATCAAAGTAGTGTACAAATATACACATTCATTATATAAGGCCAGAGACAGGATT-ACTTCGTACTTACGGTAAAAAGC-TGATTTCACT-AGAGAAACTATA-----TGTCCGTTAGGCTTGCATACTATCAATACAAGAACACATCGAAGCTGACAGTGTACAATTTACCAAGTTGGCAACAAATATATATTTTCCATAG---ATACAAATCAAGCTTCATTTAA-AACGATATTGTCGGAGAATGTCTCA---TA-----CAGAATAAAATAT----------AAAAGTGTTTCAAAGTTC-TAGTTCGTTCCTGTA---------------AT-AACTCTGCAAAACGAAGTTTGATTCAATGTGAAACCTTA-GTAA-ATACGCGCTGTTTTATGATCGTCGATAG-GCTCACTCCTACTACCACTTTGGTTGAGGTGGATGGCCATGTTAATTATCAATACTT-TGTC-----ATATGTCGGTA--CATGAACATAACAATAAGCAATTGAATATGACAGTAGACAGTG--------CCACGTCATTTATTATAAGCGCAG---TGGTACTTTTAAT-AACTTTGAACGT
gi|7                          : gggaaagtaatcaaaataggaatatatctctggtttcaggaaaatatggtttaagacagacgaaattagttaaaaaggagtatttattaaaatgtatatattttgatatactgtTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTATGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T----TGTTTTCTCAAATATCACCAAGATTGAAGTATAGGCATGACCTATCAGGTCAATGTAT-------TTAATCC-TTAAATCAGGTCAGAGCCAGAATT-AATTCGTATATA-AC-AAAATACATGATTTCGAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acgataaacttggtcagaaaagtgaaatatttgttaaattttaatgaatcgcgcagtaaattgatacgtttattgtgatggaaatggtataaaagtccgtctaaaagta--GCCCG-TTGGAGCAATTGAATATTAATCATAGCCGTC---GACA---AATTTTC---GCCAACATTAAAAGT-ATTAA-TCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCATTATGTATATTTCTTTATGTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTATGT-TAATTGTCAA-ATTACAAAAGAAC-----A-AA-ATCCT--TAAGACCATTTAATCAGTTGTCTTCCAATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGAAAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TTGACTAGGTATAAGTTATCTGCAATTCTAAAAAAAATCATAAGAGCCCTAAAATTAGAAACTGATCGTTTAAATCACGTTCACGAAATGGAGCTGCCACAACTGCGTCTATGCCTGGCATGTCTGATGAAGATGTAAAGATATTTGGTCGTTGGAAATCAAATGCATTGTATAAATACAACAGAATACCATCTCATAATTTATAGTAAATTAGGCGCATCATAAAACCAAAACAAACCTAGCATAATAAGTGAAAGGTTAGGTGAGATTCGAGTTGTTCCATGGGAAAAAATGGTAGCTACCACCTGCAACCTAATGTCCAGACTGGATCAAGACTCGATTATAATTAACATCAAACTTATTGGCGTTTATAAGTTGTTCAGAGAGTCCAATGTCTGTGTGGATTGTTAAATCATCATTCATCGAAAAGGATTTCATCACTGCTATAGGTAG
Unaligned ( gi|8 ): AGAGTAAAAATGGTTGCTTATGACAGAAACATTACTGCATGACTGGCTATACAATAAATCAATAATTACATCAAAACTGAGGTTTTAGTTCAGAAATTCGAAGTCTTAAAAATTAAAGGACACACCAGGGAAAGTAATCAAAATAGGAATATATCTCTGGTTTCAGGAAAATATGGTTTAAGACAGACGAAATTAGTTAAAAAGGAGTATTTATTAAAATGTATATATTTTGATATACTGTACATTATTAAATACATTAATT






Alignments
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Reference ( family-2400 )     :                                                                                                                NNNTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTAGGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T-G-TTNTTTTCTCAAATATTACCAAGATTGAAGTATAGACATGACCTATCAGGNCAATGTAC-------CGAATCC-TTAAATCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-GG-AAAATACGTGATTTCAATCGGGGGAAC-ATA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGGAACACATCGAGTCTGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGAACAAACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGA-AA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCTTCAGAATAAAATAT----------TAANGTGTTTCA--TTTG-TNGTT-GTTTTTTTG---------------ATTGA---TGCAAGACGAAGCTTGGTCCANGGCGAAACCT-A-GGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGATGC-GTTCGCTTCC-C--CCACTTTGGTGGCGGTGAAGGGCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGGCTGGG-----TAATTAACTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGGTAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTGTTGGGGCATG--CGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--GGGGCAACTGAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAATAATAACTNNATGCCTGTCGGGGCAACT--AAT---------------AATAACTGTATGCCTGTTGGNGCANTTGAATGAT-----TGT--GCCCG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAANTCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CNT--TGGGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           T--GCCCGATTAGGCTATT-GAATATTAATCATATCCTTG---GACA---AGATTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAATCAGA--ACAAAGCTGTTACTGTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATAAAATGGGATCACTAGGT-CACTTGTCGA-ATTGCGAGTATACACA--A-AA-A-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTTATATATCCTGTCATTTGT-CTTTCGTAAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tATTTAAATATTAAGCATAGCTGTT---G-TA---AGTTTTT---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAACAATT--ACAAAGTT-TTACTCTCTTTAT--------------TTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCAGTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGAACACA----A-AA-A-CCT--TGAGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATGACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAcaaaggtctgatataaga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cAATGATGTATGCCTGTTGGAGCATG--TGAATAATGATTGTAATCCTGTTGGGAATTGTATGCCTGTT--GCGGGAACTCAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAAAAATGATTGTATGCCCGTTGGGGCAATTTAAATGAATCCGCCCTTGACAATAA-TGTATGCCTGTTGAAGCATGTGAATAATGAGTGTAT--GCCTG-TTGAGgaaaaggtctgagat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGTAAGTTACCAATG--------CCTAGCCACTGATAATTAGCACAGAGCTGGG-----TAATTAATTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCAAAAGGTGTG-------GTTTCGAATTGATTCGAC-CAT-TAAATAAT---T-ATGTTTGCCTGTTGGGGCAAA--ATAATAAC-----------TGTTGG----------TCTGTT--aa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaTAATCATGGCCGTG---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAACT-GTTAATT-ATT--AAAACGTT-TTACTTTCTTTCG--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATTGTCGA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AA-A-CAT--TGGGACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTTat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGaaaggtctgagataaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAATAATATCCGTT---GACA---AGCTTTC---TCCAACAATAAAAGT-ATAAATTAATTTTACAAAGCAAT-ATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTAAATGAATATCAAATGGGATCACT--------TT-TCAA-ATTACGAGCACAC-----A-AAGG-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGACATTTTT-aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTGAATATT--TTATAGCATTTCTATACGTATAGTTTTTTTGGCCAACAATATAAGT-ATAAAGTCATT--ACAAAGCTGTTTCTTTC---ATAAAA----------ATATATGTTTAATGGATAGCAATTGGGGTCATTGTGT-TATTGGTCAATGTTGCGAGTAAACT----A-AC-A-CCT--TAGGGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGGTACGAGTGTTAA-----CGAGTACAC-----ATAA-A-TAT--TGGGGTCACTTAGTCAGTTGTCTTCCTATGGACTGTCAACTGT-CCATCGTGAAT
gi|2                          :                                                                                                                   cTAAGAACAAACATTAAGAAATACATTGATGACATTAGGGAA-----ATTCTTCA---TAACACAAAAAAAT-GATTTTTTTCTAAAATATTACCAAGATTGATGCATAGACATGACTTATCAGGATAATGTAC-------CAACTCC-TTAATTCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-CG-CAATTATGTGATTTTAATTGGGGGAAC-ATAAATTGTATTCGTTACCTTGATATAAGACCAACACAGTAACACATCGAGTATGACGGTGTGCATTTGAATAAGTTGGAAACAAGCATAT---TA--ATAATTAATACTATTCAAGCTTCAATTGATAA-GATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCCCCAGAATAAAA--------------AAAGTGTTT------------TT-GTT-----G---------------ATTGA---TACAAGA----------------GTAAAAG---A-GGAA-ATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGATGC-GTGCCCTTCC-C--C-ACTTTAG---CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATATA-TAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGG-----TAATTAACTTTGAACGTAACTGTTCCTCTGATCTGCACATTGCATGGTAATT-ATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATG--GGAATAGT-----------TAATGG----------CCTGTT--GGGGCAAATGAATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAACTGGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGCAACTG-AAC---------------AATAACTGTATGCATGTTTGCACAGTTGAATtataggtctga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTCAGTTGTCTTGCTAAAAC---TCATTTGTAGTTTCGTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCCTTCCTATAACCTGTCAgtaaaggtctgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-ATTACGAGTACAC-----A-AA-AACGT--TGGGGTCATTTAGTCAGTTGatcgaaaattaaaggtctgagataatac
gi|3                          :                                                                                                                 gtTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAA-----ATGCTTCCATTTAAAACGAAAA--TCG-CTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAAAGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GG-AAAAT-------------TGGGAGAAC-ATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTACATACATAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGG-AATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATGGTTTTTTTTTAATGTTTTTC---TTTG-TTGTT-TTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTTA---TGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACCT-AAGGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGAGGC-GTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGTGACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGAACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGA-----TA------------------TGTCCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGATAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATG--TGAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--TGGGCAACTGAATAATATTTGTATACCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTAATGCCTGTCGGGGAAACT--AAT---------------AATAATTGTATACCTATAGGGGCAATTAAACGAT-----TGTTGGTTGG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACT---ATTATGC---ACCAAAAATAAAAGT-ATAAATTCATT--ACGAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAATATTAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CAT--GTGGATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGT-CCTTGGTAAAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                  tagATTGCAGTATAGACATGACCTATCAGGCCAATGTTC-------TTAATCC-TTAAATCAGGCCAAA-TCAGGAAT-AATTCGTACATA-AG-ACAATATGTTATTTCAATCAGGGGAAC-AAA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGAAACACATCGAATCTGACGGTTTGCATTTGACCGAATTGGGAACAAGCCTAT---TT--ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTAA-AA-GATAGTTTCTGAAAATGTACTGGTCTATCCTTAAGAATAA---AT----------T-ACGTGTTTTA--TTTG-TTGTT-GTTTTTTT--------------------A---TGCAAGACGAAACTTGACCCACAGCGAAATCT-A-AGAACAAATATGTTGCTTGATAACCGTTGA-GC-CTTTGCTTCC-C--CCACTTTGGTGTCGGTGAAGGGTCATGTTGATTAACAATCGTCATGTCCTTTCATTTGTCGGTAAACGCGATCTCAACAATATACAATTGACTATGAAAGTCATCAATG--------CATAGTCACTGAATATTAGCACAGAGCTGGG-----TAAGTACCTTAGAACGTTACTTTTCATCTGATCCGCACAGGGCGCAGTAATCTTTTTTTATTTGAATTGAA-CAT-TGAAC--T--ATAATGTATGCC--TTGGGGTTTA--TAAATAAT-----------TGTTAG----------TCTGTTCGGGGGCAATTGAGTAATAATGTTATGCATGTTGAGGCAACATAATAATAATTATATGCCTGTC-AGGCAATT--GAT---------------AAT-----------TGTTG-------------------------GCCCG-TTGGGGTATTTGAA-AATAATCATAGCCGTT---GACA---AGGTTTC---GCTAATAATAAAAATAAAAAAATCATT--ACAAAGCTGTTATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATACCAAATTGGATCACTAGAT-CAATTCTTAA-ATTACGATTACACTA---G-AA-A-CATAAAAAAATCATTTGATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGCCATTTGT-CCTTCGac
gi|5                          :                                                                                                            ttactcacaattatataACATTATTAAATACATT-----AATTGGGGTATGTTCATTCTTCC---TTAAACAA-----------------TCAAATA--------ATT--ATTATAGGTACGACTTATCAAAGTAGTGTACAAATATACACATTCATTATATAAGGCCAGAGACAGGATT-ACTTCGTACTTACGGTAAAAAGC-TGATTTCACT-AGAGAAACTATA-----TGTCCGTTAGGCTTGCATACTATCAATACAAGAACACATCGAAGCTGACAGTGTACAATTTACCAAGTTGGCAACAAATATATATTTTCCATAG---ATACAAATCAAGCTTCATTTAA-AACGATATTGTCGGAGAATGTCTCA---TA-----CAGAATAAAATAT----------AAAAGTGTTTCAAAGTTC-TAGTTCGTTCCTGTA---------------AT-AACTCTGCAAAACGAAGTTTGATTCAATGTGAAACCTTA-GTAA-ATACGCGCTGTTTTATGATCGTCGATAG-GCTCACTCCTACTACCACTTTGGTTGAGGTGGATGGCCATGTTAATTATCAATACTT-TGTC-----ATATGTCGGTA--CATGAACATAACAATAAGCAATTGAATATGACAGTAGACAGTG--------CCACGTCATTTATTATAAGCGCAG---TGGTACTTTTAAT-AACTTTGAACGT
gi|7                          : gggaaagtaatcaaaataggaatatatctctggtttcaggaaaatatggtttaagacagacgaaattagttaaaaaggagtatttattaaaatgtatatattttgatatactgtTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTATGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA--T----TGTTTTCTCAAATATCACCAAGATTGAAGTATAGGCATGACCTATCAGGTCAATGTAT-------TTAATCC-TTAAATCAGGTCAGAGCCAGAATT-AATTCGTATATA-AC-AAAATACATGATTTCGAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acgataaacttggtcagaaaagtgaaatatttgttaaattttaatgaatcgcgcagtaaattgatacgtttattgtgatggaaatggtataaaagtccgtctaaaagta--GCCCG-TTGGAGCAATTGAATATTAATCATAGCCGTC---GACA---AATTTTC---GCCAACATTAAAAGT-ATTAA-TCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCATTATGTATATTTCTTTATGTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTATGT-TAATTGTCAA-ATTACAAAAGAAC-----A-AA-ATCCT--TAAGACCATTTAATCAGTTGTCTTCCAATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGAAAAT


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Reference ( family-2400 )     :                                                                                                                NNNTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTAGGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA-----T---TNTTTTCTCAAATATTACCAAGATTGAAGTATAGACATGACCTATCAGGNCAATGTAC-------CGAATCC-TTAAATCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-GG-AAAATACGTGATTTCAATCGGGGGAAC-ATA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGGAACACATCGAGTCTGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGAACAAACATAT-TT----ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGAAANGATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCTTCAGAATAAAA-AT-----------AANGTGTTTC----TT-GTT-G-TT-GT--TCCT-T---------------------A-------TGCAAGACGAAGCTTGGTCCANGGCGAAACC-TA-GGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGATGC-GTTCGCTTCC-C--CCACTTTGGTGGCGGTGAAGGGCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGGCTGGGTAAT-----TAACTTTGAACGTTACTGTTCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGGTAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTGTTGGGGCATGT--GAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--GGGGCAACTGAATAATAACTTTATGCCTGTTGGGGCAACTGAATAATAACTNNATGCCTGTCGGGGCAACT--AAT---------------AATAACTGTATGCCTGTTGGNGCANTTGAATGAT-----TGT--GCCCG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAANTCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTAGGT-CAATTGTCAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CNT--TGGGATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGTAAAT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T--GCCCGATTAGGCTATT-GAATATTAATCATATCCTTG---GACA---AGATTTC---GCCAACAATAAAAGT-ATAAAATCAGA--ACAAAGCTGTTACTGTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATAAAATGGGATCACTAGGT-CACTTGTCGA-ATTGCGAGTATACACA--A-AA-A-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTTATATATCCTGTCATTTGT-CTTTCGTAAAT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cttaTAATCATGGCCGTG---GACA---AGTTTTC---GCCAACAATAAAACT-GTTAATT-ATT--AAAACGTT-TTACTTTCTTTCG--------------GTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATTATTAGGT-CGATTGTCGA-ATTGCGAGTATACACAAAA-AA-A-CAT--TGGGACTATTTAATCCATTTTCTTCCTATAAACTGTCACTTat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGAAGCATGTGAATAATGAGT---GTATGCCTGTTGAGaaaggtctgagataaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAATAATATCCGTT---GACA---AGCTTTC---TCCAACAATAAAAGT-ATAAATTAATTTTACAAAGCAAT-ATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTAAATGAATATCAAATGGGATCACT--------TT-TCAA-ATTACGAGCACAC-----A-AAGG-CCT--TGGAATCATTTAATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGACATTTTT-aannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTGAATATT--TTATAGCATTTCTATACGTATAGTTTTTTTGGCCAACAATATAAGT-ATAAAGTCATT--ACAAAGCTGTTTCTTTC---ATAAAA----------ATATATGTTTAATGGATAGCAATTGGGGTCATTGTGT-TATTGGTCAATGTTGCGAGTAAACT----A-AC-A-CCT--TAGGGTCA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGGTACGAGTGTTAA-----CGAGTACAC-----ATAA-A-TAT--TGGGGTCACTTAGTCAGTTGTCTTCCTATGGACTGTCAACTGT-CCATCGTGAAT
gi|2                          :                                                                                                                   cTAAGAACAAACATTAAGAAATACATTGATGACATTAGGGAA-----ATTCTTCA---TAACACAAAAAAATGAT---TTTTTTCTAAAATATTACCAAGATTGATGCATAGACATGACTTATCAGGATAATGTAC-------CAACTCC-TTAATTCAGGCCAGAGTCAGGATT-AATTCGTACATA-CG-CAATTATGTGATTTTAATTGGGGGAAC-ATAAATTGTATTCGTTACCTTGATATAAGACCAACACAGTAACACATCGAGTATGACGGTGTGCATTTGAATAAGTTGGAAACAAGCATAT-TA----ATAATTAATACTATTCAAGCTTCAATTGATAAGATAGTTTCTGAGAATGTATCGGTCTATCCCCCAGAATAAAA-A-------------AAGTGTTT-----TT-GTT-GATT-G------------------------------A-------TACAAGA----------------GTAAAAG---A-GGAA-ATAAATGTTGTTTGGTAACCGTTGATGC-GTGCCCTTCC-C--C-ACTTTAG---CGGTGAAGGTCCATGTTGATTAACAATCCTCATGTCCCTTCATTTGGCGGTAAACGCGAACTCCACAATATATA-TAGAATATGAAAGTCATCAATG--------CTTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTAGGTAAT-----TAACTTTGAACGTAACTGTTCCTCTGATCTGCACATTGCATGGTAATT-ATTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAGTAAA----GTATACCTGTTACGGCATGG--GAATAGT-----------TAATGG----------CCTGTT--GGGGCAAATGAATAATAACTCTATTCCTGTTAGGGCAACTGGATAATAACTTAATTCATTTTGGGGCAACTG-AAC---------------AATAACTGTATGCATGTTTGCACAGTTGAATtataggtctga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgggaggaaatggtagcttgcgccagcaacctaatttccagactggatcgagattataattaacatcaaactgactggtgtttaaagtttttcagagaggttaatgtctgtgtggatcgttggaacatcattaataaaaagggatttcatcaccgacataggtagaccagggggaagtaatttaagttaagaaagaataggaatagatgtatggtggcaggaaaaatgtggtttaagatcgatgaaataggccagaaaagtgaaatatttgtttaatttcaataaatcgcccaatttactatacgttaattgttgttgaaatgatagtggtgccctccgtctaaaagtacTCAGTTGTCTTGCTAAAAC---TCATTTGTAGTTTCGTAAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCCTTCCTATAACCTGTCAgtaaaggtctgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-ATTACGAGTACAC-----A-AA-AACGT--TGGGGTCATTTAGTCAGTTGatcgaaaattaaaggtctgagataatac
gi|3                          :                                                                                                                 gtTTAAGAACAAACAATAGGAGACACATTGATGACATTAGAGAA-----ATGCTTCCATTTAAAACGAAAA-----TCGCTGTTTTCTCAAATATAACCAAGATTAAAGTATAGACATGACCTATCAGGACAATGTAC-------CGGATCC-TTAAATCAGGCC-GTGTCAGGATTTAATTCGTACATA-GG-AAAAT-------------TGGGAGAAC-ATA-----TGTCCGTTACCCTGATATAAGACCAACACTGGAACACATCGAGTCGGACGGTGTGCATTTGACCGAGTTGGGTACATACATAT-TT----ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATTGGAATGATAGTTTCTAAGAAAGTATCTGTCTATCCTTCAGAATAAAATATGGTTTTTTTTTAATGTTTTTC----TTTGTT-G-TT-TT--TTTT-TTGGGGGGGGGGGGGGGAAGTTA-------TGCAAGCCGAAGCTTAGTCCAGGACGAAACC-TAAGGAA-ATATATGTTGTTTGATAACCGTTGAGGC-GTTCGCTTCT-C--CCACTTTGGTGACGGTTAAGGGCCATATTGATTAACGAACCTCATGTCCCTTCAGTTGGCGGTAAACACAAACTCAACAATATACAATTGAATATGAAAGTCATCAATG--------CCTAGCCACTGATTATTAGCACAGGACTGGATA-----------------------TGTCCCTCTGATCTGCACAGGGCGTGATAATC-GTTTTGAATTGAATTGAA-CAT-TGAATAATGAATAATGTATGCCTTTTGAGGCATGT--GAATAAT-----------TGTTGG----------CCTGTT--TGGGCAACTGAATAATATTTGTATACCTGTTGGGGCAATTGAATAATAACTTAATGCCTGTCGGGGAAACT--AAT---------------AATAATTGTATACCTATAGGGGCAATTAAACGAT-----TGTTGGTTGG-TTGGGGTATTTGAATATTAATCATAGCCGTT---GACT---ATTATGC---ACCAAAAATAAAAGT-ATAAATTCATT--ACGAAGCTGTTACTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATATTATATGGGGTCACTAGGT-CAAATATTAA-ATTACGAGTACAC-----A-AA-A-CAT--GTGGATCATTTATTCAGTTGTCTTCTTATAATTTGTCATTTGT-CCTTGGTAAAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                    tagATTGCAGTATAGACATGACCTATCAGGCCAATGTTC-------TTAATCC-TTAAATCAGGCCAAA-TCAGGAAT-AATTCGTACATA-AG-ACAATATGTTATTTCAATCAGGGGAAC-AAA-----TGTTCGTTACCCTGATATAAGACCAACACAGAAACACATCGAATCTGACGGTTTGCATTTGACCGAATTGGGAACAAGCCTAT-TT----ATAA---ATACTATTCAAGCTTCAATT-AAAAGATAGTTTCTGAAAATGTACTGGTCTATCCTTAAGAATAAA---T-----------TACGTGTTTTAT--TT-GTT-G-TT-GT--TTTT-TT--------------------A-------TGCAAGACGAAACTTGACCCACAGCGAAATC-TA-AGAACAAATATGTTGCTTGATAACCGTTGA-GC-CTTTGCTTCC-C--CCACTTTGGTGTCGGTGAAGGGTCATGTTGATTAACAATCGTCATGTCCTTTCATTTGTCGGTAAACGCGATCTCAACAATATACAATTGACTATGAAAGTCATCAATG--------CATAGTCACTGAATATTAGCACAGAGCTGGGTAAG-----TACCTTAGAACGTTACTTTTCATCTGATCCGCACAGGGCGCAGTAATCTTTTTTTATTTGAATTGAA-CAT-TGAAC--T--ATAATGTATGCC--TTGGGGTTTAT--AAATAAT-----------TGTTAG----------TCTGTTCGGGGGCAATTGAGTAATAATGTTATGCATGTTGAGGCAACATAATAATAATTATATGCCTGTC-AGGCAATT--GAT---------------AAT-----------TGTTG-------------------------GCCCG-TTGGGGTATTTGAA-AATAATCATAGCCGTT---GACA---AGGTTTC---GCTAATAATAAAAATAAAAAAATCATT--ACAAAGCTGTTATTTTCTTTAT--------------GTATATGTTTAATGAATACCAAATTGGATCACTAGAT-CAATTCTTAA-ATTACGATTACACTA---G-AA-A-CATAAAAAAATCATTTGATCAGTTGTCTTCCTATAACCTGCCATTTGT-CCTTCGac
gi|5                          :                                                                                                            ttactcacaattatataACATTATTAAATACATT-----AATTGGGGTATGTTCATTCTTCC---TTAAACAA-------------------TCAAATA--------ATT--ATTATAGGTACGACTTATCAAAGTAGTGTACAAATATACACATTCATTATATAAGGCCAGAGACAGGATT-ACTTCGTACTTACGGTAAAAAGC-TGATTTCACT-AGAGAAACTATA-----TGTCCGTTAGGCTTGCATACTATCAATACAAGAACACATCGAAGCTGACAGTGTACAATTTACCAAGTTGGCAACAAATATATATTTTCCATAG---ATACAAATCAAGCTTCATTTAAAACGATATTGTCGGAGAATGTCTCA---TA-----CAGAATAAAATATA----------AAAGTGTTTCAAAGTT-CTA-G-TTCGT--TCCTGT---------------------AATAACTCTGCAAAACGAAGTTTGATTCAATGTGAAACCTTA-GTAA-ATACGCGCTGTTTTATGATCGTCGATAG-GCTCACTCCTACTACCACTTTGGTTGAGGTGGATGGCCATGTTAATTATCAATACTT-TG-----TCATATGTCGGT--ACATGAACATAACAATAAGCAATTGAATATGACAGTAGACAGTG--------CCACGTCATTTATTATAAGCGCAG---T-GGTACTTTTAATAACTTTGAACGT
gi|7                          : gggaaagtaatcaaaataggaatatatctctggtttcaggaaaatatggtttaagacagacgaaattagttaaaaaggagtatttattaaaatgtatatattttgatatactgtTTAAGAACAAACATTAGGAAATACATTGATGAAATTATGGAA-----ATTCTTCC---TAAAACGAAAA-----T---TGTTTTCTCAAATATCACCAAGATTGAAGTATAGGCATGACCTATCAGGTCAATGTAT-------TTAATCC-TTAAATCAGGTCAGAGCCAGAATT-AATTCGTATATA-AC-AAAATACATGATTTCGAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acgataaacttggtcagaaaagtgaaatatttgttaaattttaatgaatcgcgcagtaaattgatacgtttattgtgatggaaatggtataaaagtccgtctaaaagta--GCCCG-TTGGAGCAATTGAATATTAATCATAGCCGTC---GACA---AATTTTC---GCCAACATTAAAAGT-ATTAA-TCATT--ACAAAGCTGTTACTTTCATTATGTATATTTCTTTATGTATATGTTTAATGAATATCAAATGGGATCACTATGT-TAATTGTCAA-ATTACAAAAGAAC-----A-AA-ATCCT--TAAGACCATTTAATCAGTTGTCTTCCAATAACCTGTCATTTGT-CCTTCGAAAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TTGACTAGGTATAAGTTATCTGCAATTCTAAAAAAAATCATAAGAGCCCTAAAATTAGAAACTGATCGTTTAAATCACGTTCACGAAATGGAGCTGCCACAACTGCGTCTATGCCTGGCATGTCTGATGAAGATGTAAAGATATTTGGTCGTTGGAAATCAAATGCATTGTATAAATACAACAGAATACCATCTCATAATTTATAGTAAATTAGGCGCATCATAAAACCAAAACAAACCTAGCATAATAAGTGAAAGGTTAGGTGAGATTCGAGTTGTTCCATGGGAAAAAATGGTAGCTACCACCTGCAACCTAATGTCCAGACTGGATCAAGACTCGATTATAATTAACATCAAACTTATTGGCGTTTATAAGTTGTTCAGAGAGTCCAATGTCTGTGTGGATTGTTAAATCATCATTCATCGAAAAGGATTTCATCACTGCTATAGGTAG
Unaligned ( gi|8 ): AGAGTAAAAATGGTTGCTTATGACAGAAACATTACTGCATGACTGGCTATACAATAAATCAATAATTACATCAAAACTGAGGTTTTAGTTCAGAAATTCGAAGTCTTAAAAATTAAAGGACACACCAGGGAAAGTAATCAAAATAGGAATATATCTCTGGTTTCAGGAAAATATGGTTTAAGACAGACGAAATTAGTTAAAAAGGAGTATTTATTAAAATGTATATATTTTGATATACTGTACATTATTAAATACATTAATT