lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     111111111111111111        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           2222                      1111    1                                        22222222                111111                            11111111                                                                        111          1111111              222    1         11111   111111111                                   22222                                                             1          88888888888888888888888          1                                           1      11111                  1      111111                                                                       11                                            1111111                           1111111   33333333333333333         1111111                            333                                             2222                     1                       111  111      2222222222222222222222                                 1      111                    1111    1                                              33333333             333333                             2222222             11111111                                                        111                                            111                            1                               111      555555555555                                 000000000000000000   1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           8888                      1111    0      6                 9999            55555555 88   5         777777                            55555555           1    888    5       22    8                                  111     555  0000000 3          3 111    1 666 3   88888   666666666                 5                 22222 3    6     0     88            5           6                6        8 66666666666666666666666          6 1           1             1       2       5  77  33333             4    8      666666    22             999       6         9     0      5           4      33  66      1  6             4  0 2           7777777           2          77   8888888   77777777777777777         8888888  5 99 0  9999      1       111  66 0          2    66  2  6    5 4      0  6666         2    4      2  4        8      3    222  222 3    9999999999999999999999        666                 3    2 44   111                    5555    2      8       8888        7777            6   66666666             333333            0  2  2     0  1 8888888 0           55555555   8   33 0        8          0 8              44       111     555   77     44       3   88888 44     444     8888                   4                 1  2   0   7  222      444444444444    4              6     2       777777777777777777   5    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ....                      ....    .      .                 ....            ........ ..   .         ......                            ........           .    ...    .       ..    .                                  ...     ...  ....... .          . ...    . ... .   .....   .........                 .                 ..... .    .     .     ..            .           .                .        . .......................          . .           .             .       .       .  ..  .....             .    .      ......    ..             ...       .         .     .      .           .      ..  ..      .  .             .  . .           .......           .          ..   .......   .................         .......  . .. .  ....      .       ...  .. .          .    ..  .  .    . .      .  ....         .    .      .  .        .      .    ...  ... .    ......................        ...                 .    . ..   ...                    ....    .      .       ....        ....            .   ........             ......            .  .  .     .  . ....... .           ........   .   .. .        .          . .              ..       ...     ...   ..     ..       .   ..... ..     ...     ....                   .                 .  .   .   .  ...      ............    .              .     .       ..................   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           4444                      3333    3      2                 6666            55555555 55   7         777777                            11111111           9    111    7       77    8                                  777     888  8888888 3          6 555    7 444 6   11111   000000000                 6                 44444 0    0     8     88            0           0                0        0 22222222222222222222222          0 4           4             4       8       7  99  44444             7    6      444444    44             111       0         5     2      0           0      33  77      7  0             7  7 8           1111111           7          99   6666666   77777777777777777         6666666  9 66 7  4444      7       111  11 6          6    11  6  0    8 3      1  2222         2    7      5  8        0      4    777  777 6    2222222222222222222222        444                 3    9 66   777                    9999    1      6       3333        8888            3   22222222             888888            6  0  2     9  4 1111111 3           11111111   3   11 8        8          4 3              66       777     888   99     66       3   33333 55     333     5555                   1                 2  5   2   3  333      222222222222    0              0     5       000000000000000000   0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA--ACAACTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGGGTCACAT-TGTGACCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TAAA--GCACATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAA-ANGTTT-TATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TA-------T-ATTGCAAATA-TT--CAAANA---A-TACNG---AAA------A--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGT-GG----------------------GGGGTAACAATATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCCGGCAACTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCGTCATGCTTCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGT-GTGAAGAGGCTNGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAAA------GGATCTCCACTGACCCGGCAACT--GAC-------CAA--A------CAT-----CGACGAGCT-------AANCGGTGAT----GCTTCCCGCAGAGC-AATT--GCGTATGTGCGGNGAGG--CTTGCGATAAGANCTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAA-CGCGCTATGAT---TT---T-CGTA----GNT-----A-T----T--ATTTATAA---ATCTTGCCAAGGGTTTG-AAAAAA--CAA---CTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGGGTCACAT-TGTGACC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTAAA--------GCACATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCAT-TATGCATTATTAGA-ACGACACACATGTGCCATAA-A-GTTNTAT--ACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATA--ATATCAA---TAACA---TAT--ATTGC--AAATATT-CAA-----AT-AATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAANGAAGAACTATGAATTATAGTTCTATCTT-CCCCACNTTTCGAGTGGAGAGGGGGAGNAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGAGA-AACCAATG
Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA--ATAACTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGGATCACAT-TGTGACCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TTTA--GCATATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTT-TATACATTGCATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TA-------T-ATTGCAAATA-TA--CAAACA---A-TACCG---AAA------A--GAAAAGAAATGTGAAGGATTCGATAGAATACGCCAACCCCATATATGTGTTAAATATCT-AAACGGAATTATGGACCATATACCCGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGT-GT----------------------GGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGAAAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTACCTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCGTCATGCTTTCAGCAGAGCTAATTGCGTATGT-GTGAAAAGGCTAGCGATAGTACC-TGTGCGGTCTGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--A------CAT-----TGACGAGCT-------AAACGGTGAT----GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCAATAAAAACTGATTATA----CAATACACGTTGCCCTTAGCTGGAGTTATAAAA-CGCGCTATGAT---TT---T-CATA----GAT-----A-T----T--ATTTATAA---ATCTTGCCAAGGGTTTG-AAAACA--CAA---CTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGGATCACAT-TGTGACC--AATTATTATT----ATGCAATATATGTAAA--------GCACATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCAT-TATGCATTATTAGA-ACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTATAT--ATATTACATCTTCAGAAGCAAGGTACACATGTGCCATA--ATATCAA---TAACA---TAT--ATTGC--AAATATT-CAA-----AT-AATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGATCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGACTTATAGTTCTACCTTCCCCCACATTTCGAGTGGAGAAAGAGAGCAGAAGGAAAC--TCT---AGGATATAACAAATG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA---CAACTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGGGCCACAT-TGTGAGCAGTTATTATT----AAGCAATATATG-----TAAA--GCACATATGTGTC------ATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTT-TATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TG-------T-ATTGCAAATA-TT--CAAATA---A-TACCG---AAA------AAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGGATTATGGACCATATATCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGG-GG----------------------GGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATTACTGAGATAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCTTCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGT-GTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atccatatctttatttataaATCTTGCCAAGTGTTTGAAAAAA---CAACTGAAC-GAGAATGTATTGA----ATGGATCATAT-TGTGACCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TAAA--GCACATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAAAACGACACACATGTGTCATAA-AAGTTT-TATACATTACATCGTCAG-AGCAAGG--CATTTTTGCCATAATATCAG---TAACA---TA-------T-ATTGCAAAGA-TT--CAAAGA---A-TACAGAA-AAA------A--GAAAAGAAATGTGAAGGATTCGGTAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTCAATATTTAAAACTGAATTATTGACCATATACCTTATCTGTGTGGAGCAGCGGGGTGGC-GG----------------------TGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCA-------------AATCA--GA-------------CATTCTTCCAACA---------ACATCTGT-GTGGAGA-GCTTGCGATAAGACC-TGcgcttcccgcagagcttgtgtaaatgcggtgaggcttgcgataaaaactcattatacaatacacgctgcccttagctcgagttataaaacgcactatgattttcatagctattattcataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggtcacattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattatatcttcagaagcaaggcacacatgtgccattatatcaataacatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgataaaatacgccataaatgaagaactatgaattatagttcta
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tagcattgcaatatagtgaattataatgtATCTTGCCAAGGGTTTGAAAA-A--ATAACTGTACTTAGGATGCAATGA----ATGGGTTACAT-TGTGACCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TAAA--GCACATATGTGTC------ATAAATCATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACATACGTGCCATAA-AAGTTT-TATACATTACATCGATAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TA-------T-ATTGCAAAAA-AAATCATAGA---A-TACAGAAAAAA------A--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCTAatttaggtttaccacagagttaagcgtctgtgtcgaaagactgcgataagacctgattaatcaatacacgctgccctttgctcgaattacaaaacacgctatgatttgcatagctattat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttataaATCTTGCCAGGGGTTTGAAAAAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATAA----ATGGGTCACAT-TGTGATCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TATA--GCACATATGTGTC------ATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAA-AAGTTG-TATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TA-------T-ATTGCAAATA-TT--CAAAGA---A-TACAG---AAtaaaggaagaactatgaatgctagttctatcttccccacatttcaagtggagaaggagagaagaaggaggcattctgtcaggagaaaccaatgaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|3                          : aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagtaattatatatccattttacattgttttggctcaattacaaaatcgtacttgatattttgaatcgtgaatctattattgtattcataaATCTTGCCAGGGGTTTGAAAAAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATCA----ATGGGTCACAT-TGTGATCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TATA--GCACATATGTGTC------ATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAA-AAGTTG-TATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TA-------T-ATTGCAAATA-TT--CAAAGA---A-TACAG---AAca
gi|11                         : aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagtaattatatatccattttacattgttttggctcaattacaaaatcgtacttgatattttgaatcgtgaatctattattgtattcataaATCTTGCAAAGGGGT-GGAAAAA--ACAACTGAACTAAGGATGCGTCGA----ATTGTTCACAT-TGTGACCAGTTATTATT----ACGCAATATATG-----TAAA--GCTCATATGTGCC------ATAAAACATGGTTATCAATATGCATTATT-------------------ATAA-ATACTT-TATACTTTGCATCGTCAGAAGCAAGGCAAACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TA-------T-TTTGCAATTG-T---TAAAAA---ATTACAG---AAAAAAAAGA--GAAAATAAATGTGAAGGGTTAGATAGAATACca
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttgtatagaatggttttataaATCTTGCATAGGGAT--AAACAA--GCACCTGAACAGTGGATGCATCGA----ATGGGTAAAAT-TGTAACAAATTATCATT----ATGCAATAAATG-----TAAA--GCATAAATTTGTC------AT-AAATA-GGTT---ACTATG---------------ACACTTTTGCTATAA---GTTT-TATACATTACAACCTCAAAAGCAATACACACATGTGCACCAATTTCAA---TAACATCGTA-------T-AATACAAATA-T---TGAACATTTG-TAGTA---TAA------A--TAGATGTATTGTTATTGGTTTGATAGAATACGCCAaactgtataaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtgcggcccagaattgatgcataggactaatgatcttcactgtcccaacaactgataaatctgcgacggacttatcaaagaggcttccaatagagtaaattaagtatgtggtgagagtctctcggtaagatacacaccgccttcagttcaaattataaagtacacttttatattcatagctagtatttgtaaATCTTGCCAAGGGTTTG-AAAAG--ACAACTGAACTAAGtgaatgaaaaaaatcttattgccacttttcgaatggagagggggagcaacaaaaggcatcatgtccggttgcaaaaaactgagtgtcaattatgttcgtgtttgttccactggtttcagatatattaatgataat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttagctcgagttataaaacgcgctatgattttcatagctattatttataaATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA--ACAACTGAACTGATGGTCCAATGA----ATGGGTCATAcgcaagcctcaccgcacttacacaagctctgcgggaagcgt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tattaaattattattaaaatatatataatatatttataaATCTTGTTAAGGGTTTGAAAAAA---CAACTGAACTGATGGTGCAATGA----ATGGGTCATAc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatataatatattcataaTCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA---CAACTGAACTAAGGATGCATTGG----ATGGGTCACAT-TGTGACCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TAAA--GCACATATGTGTC------AAAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTT-TATACATTACATCTTCAGAATCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TA-------T-ATTGCAAATA-TT--CAAATA---A-TACTG---AAA------AAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGAATGATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGT-G-----------------------GGGGTAACAA-ATAACTATGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCGTTATGCTTCCAGCAGAGCTAATTGAGTATGT-GAGAAAAGACTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGTCCGGTAACT--GAC-------CAA--A------CAT-----TGATGAGCT-------AAACGGTGAT----GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAAAACTTATTATA----CAATACACGCTGCCTTTAGCTCGAGTTATAAAA-CGCGCTATGAT---TT---T-C
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          attaaaaatgaataacatacattttgcataattctttttatatgCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA---CAACTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGTGTCACAT-TGTGATCAGTTATTATT----ATGCAATATATG-----TAAA--GCACATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTT-TATACATTACATCTTCAAAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAAAA---TA-------T-ATTGCAAATA-TT--CAAATA---A-TACCGAA-AAA------A--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTTCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGAACTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGGTAACAA-ATAAGTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACTAACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCTTCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGT-GTGAAAAGGCTAGCGATAAGAAT-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGGACGCATTGA----ATGGGTCACAA-TGTGACCAGCTAT---------------ATATG-----TACA--GCACATATGTGAT------ATAAAACATGGTTATCATTATGCATT-TTA--------------TGCCATTA-AAGTTT-CATACAAAACATCATCAGAAGAAA--------------AAAA----AA---TAACA---TA-------TAATTGCAAATA-TT--AAAATA---T-CATTG---AAA------A--------AAATGTGAAGGTTTCGcgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             catccttgttgctacttcgttttatatgtttgttatgtatttattatcTGCATTGA----ATGTGTCACAT-TGTGACTAGTTATCATT----ATGCAATATATG-----TTAA--GCAAATATGGTTC------CTATAAAATGGTTATCATTA-----------AAC--CACACATGTGCAATAA-AAAGTC-TATGAATGACATCGTCAGAAGTTGGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATAAATTGT-ATTGCAAATATTA--CAGA-A---A---------AAA------A--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTATATAGAATGCGCCACTCTAATATGTATGTTA-----C----ACAGAATTAT------------TGATCTGTGTGAAGCAGTGGAGTGAT-GG----------------------TGGGTAACAATAAAATTATGTGCGATCCGAAAGTGTCTAAAGTAATGATTAAGACAA--AGG----TTCTCTACTGACCCGGCAGTTGACCAAATTGAATCAGCGACGAGCTAATCGGACATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCAAATGT-ATAAAGAGGTTTGCGATAGGACC-TG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactatATTGATATTATGG--CACATGTGTG-CC--TTGCTTTTGAAGATGTAATGTATAAAACATTTATGGCACATGTGTGTCGTTCTAATAATGCATAATGATAACCATGTTTTAT------GACACATATGTGC---------TTTACATATATTGCATatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatactgcgataacacctgatttatcaatacacactgcccttagttggaaatataaatcaagctatgattttagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgtgtcacattgtgatcagttattattATTGATATTATGG--CACATGTGTGCCTTGCTTCTATCG---ATGTAATGTATAAAACTTTTATGGCACGTATGTGTCGTTCTAATAATGCATAATGATAACCATGATTTAT------GACACATATGTGC---------TTTACATATATTGCATaaaatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccacttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaataagtacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagaattgtgcggtccgagcgtgtctagattacgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttataaatcttgccaagggtttgaaaaaataactgtacttaggatgcaatgaatgggttacattgtgaccagttattattAACGCGGTTATTATCATGCAATTCTGGAA----GCACATGTGACATAACATATTT--ATATATAACAGTGCTATAGGCAATCCGCATATGCAGTGTTATATCAA---TAGCA---CA-------C-ACTGCAaacatatattgcaaaaaaaatcatagaatacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgctataaaggaagaactatgaatgctagttctatcttccccacatttcaagtggagaaggagagaagaaggaggcattctgtcaggagaaaccaatgaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGTGACTAAGATAA--AGG----ATCTCCACTGGCCCGGTAACTGACC------AAAC-TTGACGAGCTAAACGGTGATGCTTCCCACAGAGC---TTGTGTAAGT-GCGGTGAGGCTTGCGATAttttttttaatgaacacaacaaataacaaatcgaaacaatacgtcattaaggaataa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A--ATG----ATCTTCACTGTCCCAACAACTGATA------AATCTGCGACGGACTTATCAAAGAGGCTTCCAATAGAGTAAATTAAGTATGTGGTGAGAaaaactgattatacaatacacgctgcccttagctcaagttataaaacgcgctatgattttcat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtgcggcccagaattgatgcataggactACGCTTCCCGCAGAGC---TTGTGTAAGT-GCGGTGAGGCTTGCGgtctctcggtaagatacacaccgccttcagttcaaattataaagtacacttttatattcatagctagtatttgtaaatcttgcatagggataaacaagcacctgaacagtggatgcatcgaatgggtaaaattgtaacaaattatcattatgcaataaatgtaaagcataaatttgtcataaataggttactatgacacttttgctataagttttatacattacaacctcaaaagcaatacacacatgtgcaccaatttcaataacatcgtataatacaaatattgaacatttgtagtataaatagatgtattgttattggtttgatagaatacgccatgaatgaaaaaaatcttattgccacttttcgaatggagagggggagcaacaaaaggcatcatgtccggttgcaaaaaactgagtgtcaattatgttcgtgtttgttccactggtttcagatatattaatgataat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttagctcgagttataaaacgcgctatgattttcatagctattatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaagGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCCAACAA------CATCTGTGTGGAGAGCTTGCGATAAGACC-TGATTTAGGTTTACCACAGAG----TTAAGCGTCTGTGTCGAAAGA--CT-GCGATAAGACCTGATTAAT----CAATACACGCTGCCCTTTGCTCGAATTACAAAA-CACGCTATGAT---TT---G-CATA----GCT-----A-T----T--AT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tagcattgcaatatagtgaattataatgtatcttgccaagtgtttgaaaaaacaactgaacgagaatgtattgaatggatcatattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattaaaacgacacacatgtgtcataaaagttttatacattacatcgtcagagcaaggcatttttgccataatatcagtaacatatattgcaaagattcaaagaatacagaaaaaagaaaagaaatgtgaaggattcggtagaatacgccactccaacatatatgttcaatatttaaaactgaattattgaccatataccttatctgtgtggagcagcggggtggcggtAGTAC---GTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAAA------TTATCTCCACTGACCAGGTAACT--AAC-------CAA--T------CAG-----CGACGAGCT-------AATCCTTCAT----GCTCCCAGCAGAGCTAATT--GCGTATGTGTGAAAAGG--CTAGCGATAAGAATTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgtgtcacattgtgatcagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcaaaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataaaatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccacttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaata-TGTGCGATCCGAAAGTGTCTAAAGTAATGATTAAGACAAA------GGTTCTCTACTGACCCGGCAGTT--GAC-------CAA--ATTGAATCAG-----CGACGAGCT-------AATCGGACAT----GCTTCCAACAGAGCTAATT--GCAAATGTATAAAGAGG--TTTGCGATAGGACCTGATTtgcggtccgagcgtgtctagattacgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactattgcattgaatgtgtcacattgtgactagttatcattatgcaatatatgttaagcaaatatggttcctataaaatggttatcattaaaccacacatgtgcaataaaaagtctatgaatgacatcgtcagaagttgggcacacatgtgccataatatcaataacatataaattgtattgcaaatattacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttatatagaatgcgccactctaatatgtatgttacacagaattattgatctgtgtgaagcagtggagtgatggtgggtaacaataaaattaGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATTACTGAGATAAA------TTATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------CAA--T------CAG-----CGACGAGCT-------AATCCTTCAT----GCTCCCAGCAGAGCTAATT--GCGTATGTGTGAAAAGG--CTAGCGATAAGACCTGtaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatactgcgataacacctgatttatcaatacacactgcccttagttggaaatataaatcaagctatgattttagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atccatatctttatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggccacattgtgagcagttattattaagcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcagaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataacatgtattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacgggattatggaccatatatctgatctgtgtggagcagggggtgggggggggtaacaaataactacAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--A------C-T-----TGACGAGCT-------AAACGGTGAT----GCTTCCCACAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAAAACTGATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCAAGTTATAAAA-CGCGCTATGAT---TT---T-CATtgcggtccgagcgtgtctagattacgcttcccgcagagcttgtgtaaatgcggtgaggcttgcgataaaaactcattatacaatacacgctgcccttagctcgagttataaaacgcactatgattttcatagctattattcataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggtcacattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattatatcttcagaagcaaggcacacatgtgccattatatcaataacatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgataaaatacgccataaatgaagaactatgaattatagttcta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAGGACTAA------TGATCTTCACTGTCCCAACAACT--GAT--------AA--A------TCTG----CGACGGACT-------TATCAAAGAG----GCTTCCAATAGAGTAAATT--AAGTATGT--GGTGAGAGTCTCTCGGTAA-----------------GATACACACCGCCTTCAGTTCAAATTATAAAG-TACACTTTTAT---AT---T-CATA----GCT-----A-G----T--ATTTGTAA---ATCTTGCATAGGGAT----AAACAAGCAC---CTGAACAGTGGATGCATCGA----ATGGGTAAAAT-TGTAACA--AATTATCATT----ATGCAATAAATGTAAA--------GCATAAATTTGTC------AT-AAATA-GGTT---AC-TATG----------------ACACTTTTGCTATAA---GTTTTAT--ACATTACAACCTCAAAAGCAATACACACATGTGCACCA--ATTTCAA---TAACATCGTAT--AATAC--AAATATT-GAACATTTGT-AGTAT------AA----ATAGATGTATTGTTATTGGTTTGATAGAATACGCCATGAATGAAAAAA-AT--CTTATTG------------CCACTTTTCGAATGGAGAGGGGGAGCA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gtgcggcccagaattgatgcaAC----GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAATGCGGTGAGG--CTTGCGATAAAAACTCATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAAAA-CGCACTATGAT---TT---T-CATA----GCT-----A-T----T--ATTCATAA---ATCTTGCCAAGGGTTTG-AAAAGA--CAA---CTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGGGTCACAT-TGTGACC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTAAA--------GCACATATGTGTC------ATAAAACGTGGTTATCAT-TATGCATTATTAGA-ACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTTTAT--ACATTATATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATT--ATATCAA---TAACA---TAT--ATTGC--AAATATT-CAA-----AT-AATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAAAATACGCCATAAATGAAGAACTATGAATTATAGTTCTAacaaaaggcatcatgtccggttgcaaaaaactgagtgtcaattatgttcgtgtttgttccactggtttcagatatattaatgataat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atccatatctttatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggccacattgtgagcagttattattaagcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcagaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataacatgtattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacgggattatggaccatatatctgatctgtgtggagcagggggtgggggggggtaacaaataactacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaattactgagataaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagacctgtgcggtccgagcgtgtctagattAC----GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttagctcgagttataaaacgcgctatgattttcatagctattatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaagcTGCGATAACACCTGATT-TAT---CAATACACACTGCCCTTAGTTGGAAATATAAAT-CAAGCTATGAT---TT---T-AGTATTTGGAT-----AGTA---T--ATTTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactattgcattgaatgtgtcacattgtgactagttatcattatgcaatatatgttaagcaaatatggttcctataaaatggttatcattaaaccacacatgtgcaataaaaagtctatgaatgacatcgtcagaagttgggcacacatgtgccataatatcaataacatataaattgtattgcaaatattacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttatatagaatgcgccactctaatatgtatgttacacagaattattgatctgtgtgaagcagtggagtgatggtgggtaacaataaaattatgtgcgatccgaaagtgtctaaagtaatgattaagacaaaggttctctactgacccggcagttgaccaaattgaatcagcgacgagctaatcggacatgcttccaacagagctaattgcaaatgtataaagaggtttgcgataggacctgatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatacTAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAAAATCGTACT-TGATATTTTGAAT-CGTG----AATCTATTA-T----TGTATTCATAA---ATCTTGCCAGGGGTTTG-AAAAAA--TAAAAACTGAACTAAGGATGCAATAA----ATGGGTCACAT-TGTGATC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTATA--------GCACATATGTGTC------ATAAATCATGGTAATCAT-TATGCATTATTAGA-ATGCCACACATGGGCCATAA-AAGTTGTAT--ACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATA--ATAATAATATTAATA---TAT--ATTGC--AAATATT-CAA-----AG-AATACAG-AAttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagTAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAAAATCGTACT-TGATATTTTGAAT-CGTG----AATCTATTA-T----TGTATTCATAA---ATCTTGCCAGGGGTTTG-AAAAAA--TAAAAACTGAACTAAGGATGCAATCA----ATGGGTCACAT-TGTGATC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTATA--------GCACATATGTGTC------ATAAATCATGGTAATCAT-TATGCATTATTAGA-ATGCCACACATGGGCCATAA-AAGTTGTAT--ACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATA--ATAATAATATTAATA---TAT--ATTGC--AAATATT-CAA-----AG-AATACAG-AAca
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagCTTAGCTCGAGTTATAAAA-CGCACAATGAT---TT---T-CATA----GCT-----A-T----T--ca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAGCTCGAGTTATAAAA-CGCGCTATGAT---TT---T-CATA----GCT-----A-T----T--ATTTATAA---ATCTTGCCAAGGGTTTG-AAAAGA--CAA---CTGAACTAAG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tAT---TT---TGCATA----ATT-----C-T----T---TTTATAT---GTCTTGCCAAGGGTTTG-AAAAAA--CAA---CTGAACTAAGGATGCATTGG----ATGGGTCACAT-TGTGACC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTAAA--------GCACATATGTGTC------AAAAAACATGGTTATCAT-TATGCATTATTAGA-ACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTTTAT--ACATTACATCTTCAGAATCAAGGCACACATGTGCCATA--ATATCAA---TAACA---TAT--ATTGC--AAATATT-CAA-----AT-AATACTG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCAcgcaagcctcaccgcacttacacaagctctgcgggaagcgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  attaaaaatgaataacatacATA----TAT-----A-TAATAT--ATTTATAA---ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAAA--CAA---CTGAACTGATGGTCCAATGA----ATGGGTCATActccaacatatatgttaaatatctaaacggaatgatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtgggggtaacaaataactatgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccgttatgcttccagcagagctaattgagtatgtgagaaaagactagcgataagacctgtgcggtccgagagtgtctagattagtaactaagataaaggatctccactggtccggtaactgaccaaacattgatgagctaaacggtgatgcttccaacagagcttgtgtatgtgcggtgaggcttgcgataaaaacttattatacaatacacgctgcctttagctcgagttataaaacgcgctatgattttc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tattaaattattattaaaATA-----AT-----A-T-------ATTCATAA---ATCTTGTTAAGGGTTTG-AAAAAA--CAA---CTGAACTGATGGTGCAATGA----ATGGGTCATAc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tatTTTATAA---ATCTTGCCAAGGGTTTG-AAAAAA--TAA---CTGTACTTAGGATGCAATGA----ATGGGTTACAT-TGTGACC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTAAA--------GCACATATGTGTC------ATAAATCATGGTTATCAT-TATGCATTATTAGA-ACGACACATACGTGCCATAA-AAGTTTTAT--ACATTACATCGATAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATA--ATATCAA---TAACA---TAT--ATTGCAAAAAAAAT-CAT-----AG-AATACAGAAAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCTATAAAGGAAGAACTATGAATGCTAGTTCTATCTT-CCCCACATTTCAAGTGGAGAAGGAGAGAAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGAGA-AACCAATG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTATAA---ATCTTGCAAAGGGGTGG-AAAAAA--CAA---CTGAACTAAGGATGCGTCGA----ATTGTTCACAT-TGTGACC--AGTTATTATT----ACGCAATATATGTAAA--------GCTCATATGTGCC------ATAAAACATGGTTATCAA-TATGCATTATT--------------------ATAA-ATACTTTAT--ACTTTGCATCGTCAGAAGCAAGGCAAACATGTGCCATA--ATATCAA---TAACA---TAT--TTTGC--AATTGTT-AAA-----AA-ATTACAG-AAAAAAAAGAGAAAATAAATGTGAAGGGTTAGATAGAATACaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttgtatagaatggtTTATAATGTATCTTGCCAAGTGTTTG-AAAAAA--CAA---CTGAAC-GAGAATGTATTGA----ATGGATCATAT-TGTGACC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTAAA--------GCACATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCAT-TATGCATTATTAAA-ACGACACACATGTGTCATAA-AAGTTTTAT--ACATTACATCGTCAG-AGCAAGG--CATTTTTGCCATA--ATATCAG---TAACA---TAT--ATTGC--AAAGATT-CAA-----AG-AATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGATTCGGTAGAATACGCCAaactgtataaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tagcattgcaatatagtgaaCTTGCCAAGGGTTTG-AAAAGA--CAA---CTGAACTAAGGATGCATTGA----ATGTGTCACAT-TGTGATC--AGTTATTATT----ATGCAATATATGTAAA--------GCACATATGTGTC------ATAAAACATGGTTATCAT-TATGCATTATTAGA-ACGACACACATGTGCCATAA-ATGTTTTAT--ACATTACATCTTCAAAAGCAAGGCACACATGTGCCATA--ATATCAA---TAAAA---TAT--ATTGC--AAATATT-CAA-----AT-AATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCActccaacatatatgttcaatatttaaaactgaattattgaccatataccttatctgtgtggagcagcggggtggcggtgggtaacaataaaactatgtgcgatccaacagtgtctagagtaatgactaagacaaccgttgtggatctccactgacccggcaaatcagacattcttccaacaacatctgtgtggagagcttgcgataagacctgatttaggtttaccacagagttaagcgtctgtgtcgaaagactgcgataagacctgattaatcaatacacgctgccctttgctcgaattacaaaacacgctatgatttgcatagctattat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGGACGCATTGA----ATGGGTCACAA-TGTGACC--A---------------GCTATATATGTACA--------GCACATATGTGAT------ATAAAACATGGTTATCAT-TATGCATT-TTA---------------TGCCATTA-AAGTTTCAT--ACAAAACATCATCAGAAGAAA--------------AAA--A----AA---TAACA---TATA-ATTGC--AAATATT-AAA-----AT-ATCATTG-AAAA------------AAATGTGAAGGcttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaataagtacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagaattgtgcggtccgagcgtgtctagattacgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      catccttgttgctacttcgttttatatgtttgttatgtatttattatcTGCATTGA----ATGTGTCACAT-TGTGACT--AGTTATCATT----ATGCAATATATGTTAA--------GCAAATATGGTTC------CTATAAAATGGTTATCAT-TA-----------A-AC--CACACATGTGCAATAA-AAAGTCTAT--GAATGACATCGTCAGAAGTTGGGCACACATGTGCCATA--ATATCAA---TAACA---TATAAATTG------TATTGCAA-----AT-ATTACAGAAAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTATATAGAATGCGCCAtttcg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactatATTGATATTATGG--CACATGTGTG-CCTTGATTCTGAAG----ATGTAATGTATA-AAACATTTATGGCACATGTGTGTCGTTCTAATAATGCATAATGATAAC-CATGTTTT-TT------GACACATATGTGCT--------TTACAT--ATATTGCATctctaatatgtatgttacacagaattattgatctgtgtgaagcagtggagtgatggtgggtaacaataaaattatgtgcgatccgaaagtgtctaaagtaatgattaagacaaaggttctctactgacccggcagttgaccaaattgaatcagcgacgagctaatcggacatgcttccaacagagctaattgcaaatgtataaagaggtttgcgataggacctgatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatactgcgataacacctgatttatcaatacacactgcccttagttggaaatataaatcaagctatgattttagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attaaaaatgaataacatacattttgcataattctttttatatgtcttgccaagggtttgaaaaaacaactgaactaaggatgcattggatgggtcacattgtgaccagttattattATTGATATTATGG--CACATGTGTG-CC----TTGCTTTTGAAGATGTAATGTATA-AAACATTTATGGCACATGTGTGTCGTTCTAATAATGCATAATGATAAC-CATGTTTTAT-------GACACATATGTGCT--------TTACAT--ATATTGCATaacatatattgcaaatattcaaataatactgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacggaatgatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtgggggtaacaaataactatgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccgttatgcttccagcagagctaattgagtatgtgagaaaagactagcgataagacctgtgcggtccgagagtgtctagattagtaactaagataaaggatctccactggtccggtaactgaccaaacattgatgagctaaacggtgatgcttccaacagagcttgtgtatgtgcggtgaggcttgcgataaaaacttattatacaatacacgctgcctttagctcgagttataaaacgcgctatgattttc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgtgtcacattgtgatcagttattattATTGATATTATGG--CACATGTGTGCCT--TGCTTCTATCG---ATGTAATGTATA-AAACTTTTATGGCACGTATGTGTCGTTCTAATAATGCATAATGATAAC-CATGATTTAT-------GACACATATGTGCT--------TTACAT--ATATTGCATaaaatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccacttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaataagtacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagaattgtgcggtccgagcgtgtctagattacgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttataaatcttgccaagggtttgaaaaaataactgtacttaggatgcaatgaatgggttacattgtgaccagttattattTTATTATC----ATGCAAT-TCTG-GAA--------GCAC--ATGTGAC------AT--AACATATTTAT-ATATA-ACAGTGCTATAGGCAATCCGCATATGC----A-GTGTTATATCAATAGCACAaacatatattgcaaaaaaaatcatagaatacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgctataaaggaagaactatgaatgctagttctatcttccccacatttcaagtggagaaggagagaagaaggaggcattctgtcaggagaaaccaatgaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aacgcgg----ATGTAATGTATA-AAACATTTATGGCACATGTGTGTCGTTCTAATAATGCATAATGATAAC-CACGTTTTAT-------GACACATATGTGCT--------TTACAT--ATATTGCcactgcattttttttaatgaacacaacaaataacaaatcgaaacaatacgtcattaaggaataa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atccatatctttatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggccacattgtgagcagttattattaaCACATGTGTGTCGTTTTAATAATGCATAATGATAAC-CATGTTTTAT-------GACACATATGTGCT--------TTACAT--ATATTGCATcttcagaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataacatgtattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacgggattatggaccatatatctgatctgtgtggagcagggggtgggggggggtaacaaataactacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaattactgagataaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagacctgtgcggtccgagcgtgtctagattacgcttcccgcagagcttgtgtaaatgcggtgaggcttgcgataaaaactcattatacaatacacgctgcccttagctcgagttataaaacgcactatgattttcatagctattattcataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggtcacattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattatatcttcagaagcaaggcacacatgtgccattatatcaataacatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgataaaatacgccataaatgaagaactatgaattatagttcta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tagcattgcaatatagtgaattataatgtatcttgccaagtgtttgaaaaaacaactgaacgagaatgtattgaatggatcatattgtgaccagttattattAACGCGGTTATTAT-CATGCAATTCTGGA-A----GCACATGTGACATAACATATT-TAT--ATATAACAGTGCTATAGGCAA--TCCGCATATGCAGTGTTATATCAA---TAGCA---CAC--ACTGC--ATTTTTT-TTA-----ATGAACAC----------------AACAAAT---AACAAATCGAAACAATACGTCATTAAGGAATAAtcataaaagttttatacattacatcgtcagagcaaggcatttttgccataatatcagtaacatatattgcaaagattcaaagaatacagaaaaaagaaaagaaatgtgaaggattcggtagaatacgccactccaacatatatgttcaatatttaaaactgaattattgaccatataccttatctgtgtggagcagcggggtggcggtgggtaacaataaaactatgtgcgatccaacagtgtctagagtaatgactaagacaaccgttgtggatctccactgacccggcaaatcagacattcttccaacaacatctgtgtggagagcttgcgataagacctgatttaggtttaccacagagttaagcgtctgtgtcgaaagactgcgataagacctgattaatcaatacacgctgccctttgctcgaattacaaaacacgctatgatttgcatagctattat
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AAGTGCTATTTTCAGTTTAAGATGCACTGTAGACATTGCTTAGACGTATTAGCGTCAAGTAAGGAAATACTGAAAACTCAACAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTGCATCGTCTTCGCT
Unaligned ( gi|18 ): AATGTTATTTTCATGTCTGGAGGCACTACAACCGTTGCTAAGATATCAAACACTGAACCAATACTATAACATAAGATAATGCAAAACAAAAAAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   3                                                                                                                                                                                                    1111111                        22                                                                                                           1       666666666666666666666666            2                                                   1111                         111111                                                                                                   1                222222                       11   2222222   11    33333333        22222222          1111              4444                                            2222                                               111  111    1111111           11111                                 111                                                                                                              111              11111                                                     111                                            1111                                                                     1                                                    2        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   0         0                                     0                                                          3   1   2                  1           0     4                                          5 6666666           5    1  0  3 33    77                                                           6            2                            3       333333333333333333333333            3           0                       2          99   4444             6  0 5      999999                    2                                    0     1           5          1            0                333333            5          11   6666666   11  5 00000000  3     99999999  1 3     0000              6666   5   4      1              9999 5  0   0  7777              2         4      44  6      1    222  222  1 1111111 1  4 3    88888                      4   4      444                5                                                                 0                           222              66666  5 1       0     3                                  777     888        66          5 3       5     4444                                        1      2       44  2     4   3      1             0  0   1          7    6      2 0   2    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         .                                     .                                                          .   .   .                  .           .     .                                          . .......           .    .  .  . ..    ..                                                           .            .                            .       ........................            .           .                       .          ..   ....             .  . .      ......                    .                                    .     .           .          .            .                ......            .          ..   .......   ..  . ........  .     ........  . .     ....              ....   .   .      .              .... .  .   .  ....              .         .      ..  .      .    ...  ...  . ....... .  . .    .....                      .   .      ...                .                                                                 .                           ...              .....  . .       .     .                                  ...     ...        ..          . .       .     ....                                        .      .       ..  .     .   .      .             .  .   .          .    .      . .   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   2         8                                     1                                                          4   4   5                  0           5     5                                          0 2222222           7    0  1  0 66    99                                                           7            5                            3       333333333333333333333333            7           7                       2          22   2222             7  7 7      222222                    5                                    7     0           7          0            8                000000            2          00   0000000   00  6 66666666  2     00000000  0 2     6666              8888   1   0      0              9999 9  7   9  0000              0         4      66  7      3    777  777  2 4444444 0  4 6    22222                      0   0      000                4                                                                 8                           000              11111  0 0       8     4                                  555     888        99          0 2       0     2222                                        0      5       22  5     0   3      0             7  7   0          3    7      5 0   5    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCNTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT-A-------TTGCAAATATT-CAAATAATACCGAAAAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCGTCATGCTTCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCT--------AAACGGTGAC----GCTTCCCGCAGAGC----TTGTGTANGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCGT--A----GCTA-T-TATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAA-GT-TTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAA-ANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
Reference ( family-2395 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAAACAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT-A-------TTGCAAATATT-CAAANAATACNG--AAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAATATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATGACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCCGGCAACTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCGTCATGCTTCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAGAGGCTNGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAAA------GGATCTCCACTGACCCGGCAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCT--------AANCGGTGAT----GCTTCCCGCAGAGC-AA-TTGCGTATGTGCGGNGAGGCTTGCGATAAG---ANCTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCGT--A----GNTA-T-TATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCAT-AAA-GT-TNTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAA-ATAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAANGAAGAACTATGAATTATAGTTCTATCTT-CCCCACNTTTCGAGTGGAGAGGGGGAGNAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGAGA-AACCAATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAAATAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTTTAGCATATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTGCATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT-A-------TTGCAAATATA-CAAACAATACCG--AAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGATTCGATAGAATACGCCAACCCCATATATGTGTTAAATATCT-AAACGGAATTATGGACCATATACCCGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GTGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGAAAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTACCTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCGTCATGCTTTCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAGTACC-TGTGCGGTCTGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GACGAGCT--------AAACGGTGAT----GCTTCCAACAGAGC----TTGTGTATGTGCGGTGAGGCTTGCAATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGTTGCCCTTAGCTGGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--A----GATA-T-TATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-ACACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAATTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCAT-AAATGT-TATATATATTACATCTTCAGAAGCAAGGTACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAA-ATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGATCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGACTTATAGTTCTACCTTCCCCCACATTTCGAGTGGAGAAAGAGAGCAGAAGGAAAC--TCT---AGGATATAACAAATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAATAA---CTGTACTTAGGATGCAATGAATGGGTTACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACATACGTGCCATAAAA-GT-TTTATACATTACATCGATAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGCAAAAAAAATCAT-AGAATACAGAAAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCTATAAAGGAAGAACTATGAATGCTAGTTCTATCTT-CCCCACATTTCAAGTGGAGAAGGAGAGAAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGAGA-AACCAATG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TT-----TATAAATCTTGCAAAGGGGTGG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCGTCGAATTGTTCACATTGTGACCAGTTATTATTACGCAATATATGTAAAGCTCATATGTGCCATAAAACATGGTTATCAATATGCATTATTATAA--ATAC-------------------TTTATACTTTGCATCGTCAGAAGCAAGGCAAACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATTTTGC--AATTGTTAAA-AAATTACAG-AAAAAAAAGAGAAAATAAATGTGAAGGGTTAGATAGAATACaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttgtatagaatggtAAGGACGCATTGAATGGGTCACAATGTGACCAGCTAT-----------ATATGTACAGCACATATGTGATATAAAACATGGTTATCATTATGCATT-TTA--------------TGCCATTAAAGTTTCATACAAAACATCATCAGAAGAAA--------------AAAA----AATAACATATAA-------TTGCAAATATT-AAAATATCATTG--AAAA--------AAATGTGAAGGTTTCGaactgtataaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            catccttgttgctacttcgttttatatgtttgttatgtatttattatcAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--AC-T-T------GACGAGCT--------AAACGGTGAT----GCTTCCCACAGAGC----TTGTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCAAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACGCGGTTATTATCATGCAATTCTGGAA----GCACATGTGACATAACATATTTATATATAACAGTGCTATAGGCAATCCGCATATGCAGTGTTATATCAATAGCACAC-A-------CTGCA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AACGCGGTTATTATCATGCAATTCTGGAA----GCACATGTGACAT-AAC-ATATTTATATATAACAGTGCTATAGGCAATCCGCATATGCAGTGTTATATCAA---TAGCA---CACACTGC--ATTTTTTTTA-ATGA-ACAC-AACAA----ATAACAAA------------TCGAAACAATACGTCATTAAGGAATAAttttttttaatgaacacaacaaataacaaatcgaaacaatacgtcattaaggaataa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--A----GCTA-T-TATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tAC----GCTTCCCGCAGAGC----TTGTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCGCTTAGTTCAGTTG-TCTTTT---CAA--------ACCCTTGGCAAGATTTATAAATAA-TA-GCTATGAcgcaagcctcaccgcacttacacaagctctgcgggaagcgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttagctcgagttataaaacgcgctatgattt-TATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTGAAAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTCCAATGAATGGGTCATA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tattaaattattattaaaatatatataata-TATT-----CATAAATCTTGTTAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTGCAATGAATGGGTCATAc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatataataTAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAA----TCTA-T-TATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATAAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAA-GT-TGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAA-AGAATACAG-AA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACAATGAT---TT---TCAT--A----GCTA-T-Tca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAA----TCTA-T-TATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATCAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAA-GT-TGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAA-AGAATACAG-AA
gi|4                          : aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGCCACATTGTGAGCAGTTATTATTAAGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATGT-A-------TTGCAAATATT-CAAATAATACCGAAAAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGGATTATGGACCATATATCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------G-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATTACTGAGATAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCTTCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTAca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atccatatctttatttataaAC----GCTTCCCGCAGAGC----TTGTGTAAATGCGGTGAGGCTTGCGATAAA---AACTCATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACTATGAT---TT---TCAT--A----GCTA-T-TATT-----CATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCAT-AAATGT-TTTATACATTATATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATTATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAA-ATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAAAATACGCCATAAATGAAGAACTATGAATTATAGTTCTAcgcttcccgcagagcttgtgtaaatgcggtgaggcttgcgataaaaactcattatacaatacacgctgcccttagctcgagttataaaacgcactatgattttcatagctattattcataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggtcacattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattatatcttcagaagcaaggcacacatgtgccattatatcaataacatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgataaaatacgccataaatgaagaactatgaattatagttcta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                  atccatatctttatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggccacattgtgagcagttattattaagcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcagaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataacatgtattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacgggattatggaccatatatctgatctgtgtggagcagggggtgggggggggtaacaaataactacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaattactgagataaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagacctgtgcggtccgagcgtgtctagattTGCATTGAATGTGTCACATTGTGACTAGTTATCATTATGCAATATATGTTAAGCAAATATGGTTCCTATAAAATGGTTATCATTA-----------AAC--CACACATGTGCAATAAAAAGTCTATGAATGACATCGTCAGAAGTTGGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT-AAATTGTATTGCAAATATTACAGAAAA--------AAA--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTATATAGAATGCGCCACTCTAATATGTATGTTA-----C----ACAGAATTAT------------TGATCTGTGTGAAGCAGTGGAGTGA------------T-----------GGTGGGTAACAATAAAATTATGTGCGATCCGAAAGTGTCTAAAGTAATGATTAAGACAA--AGG----TTCTCTACTGACCCGGCAGTTGACCAAATTGAATCAGCGACGAGCTAATCGGACATGCTTCCAACAGAGCTAATTGCAAATGTATAAAGAGGTTTGCGATAGGACC-TG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactatTGCGATAAC---ACCTGATT-TAT---CAATACACACTGCCCTTAGTTGGAAATATAA--AT-CAAGCTATGAT---TT---TAGT--ATTTGGATAGTATATT-----TATatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatactgcgataacacctgatttatcaatacacactgcccttagttggaaatataaatcaagctatgattttagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|6                          :                                                                                  taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactattgcattgaatgtgtcacattgtgactagttatcattatgcaatatatgttaagcaaatatggttcctataaaatggttatcattaaaccacacatgtgcaataaaaagtctatgaatgacatcgtcagaagttgggcacacatgtgccataatatcaataacatataaattgtattgcaaatattacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttatatagaatgcgccactctaatatgtatgttacacagaattattgatctgtgtgaagcagtggagtgatggtgggtaacaataaaattatgtgcgatccgaaagtgtctaaagtaatgattaagacaaaggttctctactgacccggcagttgaccaaattgaatcagcgacgagctaatcggacatgcttccaacagagctaattgcaaatgtataaagaggtttgcgataggacctgatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatacTCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGGATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCAAAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAATCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT-A-------TTGCAAATATT-CAAATAATACTGAAAAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGAATGATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T------------GGGGGTAACAA-ATAACTATGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACTGACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCGTTATGCTTCCAGCAGAGCTAATTGAGTATGTGAGAAAAGACTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGTCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GATGAGCT--------AAACGGTGAT----GCTTCCAACAGAGC----TTGTGTATGTGCGGTGAGGCTTGCGATAAA---AACTTATTATA----CAATACACGCTGCCTTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attaaaaatgaataacatacattttgcataattctttttatatgATCTTGCCAAGTGTTTGAAAAAA-CAACTGAAC-GAGAATGTATTGAATGGATCATATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAAAACGACACACATGTGTCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAG-AGCAAGG--CATTTTTGCCATAATATCAGTAACATAT-A-------TTGCAAAGATT-CAAAGAATACAGAAAAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGATTCGGTAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTCAATATTTAAAACTGAATTATTGACCATATACCTTATCTGTGTGGAGCAGCGGGGTGG------------C-----------GGTGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCA-------------AATCA--GA-------------CATTCTTCCAACA---------ACATCTGTGTGGAGA-GCTTGCGATAAGACC-TG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tagcattgcaatatagtgaattataatgtGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCCAACAACAT-CTGTGTGGA-GAGCTTGCGATAAGACC--TGATTTAGGTTTACCACAGAGTTAA---GCGTCTGTGTCGAAAGACT-GCGATAAG---ACCTGATTA-AT---CAATACACGCTGCCCTTTGCTCGAATTACAA--AA-CACGCTATGAT---TT---GCAT--A----GCTA-T-TATatttaggtttaccacagagttaagcgtctgtgtcgaaagactgcgataagacctgattaatcaatacacgctgccctttgctcgaattacaaaacacgctatgatttgcatagctattat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagcattgcaatatagtgaattataatgtatcttgccaagtgtttgaaaaaacaactgaacgagaatgtattgaatggatcatattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattaaaacgacacacatgtgtcataaaagttttatacattacatcgtcagagcaaggcatttttgccataatatcagtaacatatattgcaaagattcaaagaatacagaaaaaagaaaagaaatgtgaaggattcggtagaatacgccactccaacatatatgttcaatatttaaaactgaattattgaccatataccttatctgtgtggagcagcggggtggcggtCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGTGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAAAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAAAATAT-A-------TTGCAAATATT-CAAATAATACCG--AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTTCAACATATATGTTAAATATCT-AAACGGAACTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGGTAACAA-ATAAGTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACTAACC------AATCAGCGACGAGCTAATCCTTCATGCTCCCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGAAT-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AC----GCTTCCCGCAGAGC----TTGTGTAAGTGCGGTGAGGCTTGCcgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgtgtcacattgtgatcagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcaaaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataaaatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccacttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaataagtacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagaattgtgcggtccgagcgtgtctagattGTGCGGCCC-AGAAT--------TGATGCATAGGACTAA------TGATCTTCACTGTCCCAACAACT--GAT--------AA--ATCTGC------GACGGACT--------TATCAAAGAG----GCTTCCAATAGAGT-AAATTAAGTATGTGGTGAGAGTCTCTCGGTAAG---A-----------------TACACACCGCCTTCAGTTCAAATTATAA--AG-TACACTTTTAT---AT---TCAT--A----GCTA-G-TATT-----TGTAAATCTTGCATAGGGAT---AAACAAGCAC---CTGAACAGTGGATGCATCGAATGGGTAAAATTGTAACAAATTATCATTATGCAATAAATGTAAAGCATAAATTTGTCAT-AAATA-GGTT---ACTATG---------------ACACTTTTGCTAT--AA-GT-TTTATACATTACAACCTCAAAAGCAATACACACATGTGCACCAATTTCAA---TAACATCGTATAATAC--AAATATTGAACAT-TTGTAG-TATAA----ATAGATGTATTGTTATTGGTTTGATAGAATACGCCATGAATGAAAAA-----AATCTTA---------T-TGCCACTTTTCGAATGGAGAGGGGGAGCAACAAAAGGCATCATGTCCGG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AAGTGCTATTTTCAGTTTAAGATGCACTGTAGACATTGCTTAGACGTATTAGCGTCAAGTAAGGAAATACTGAAAACTCAACAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTGCATCGTCTTCGCT
Unaligned ( gi|18 ): AATGTTATTTTCATGTCTGGAGGCACTACAACCGTTGCTAAGATATCAAACACTGAACCAATACTATAACATAAGATAATGCAAAACAAAAAAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      11                                                                                                                                     1       666666666666666666666666            1                                                   1111                          33333333333333       11111          22222222                                                                                                        222222                       11   2222222   11    33333333               11   222222222                                                                 2222                                               11111111    11           11111                                 111                                                                                                              111                                                                      111                                           1111                                                                     1                                                    1        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   8         0                                     0                                                          1   3   0                  1                 1                0                         33            5          1 5    5                                                               6         2                            3       333333333333333333333333            3           0                       0          99   4444                     99   00000000000000   99  66666          44444444      99        6   1                              1           5          1                             333333                       11   6666666   11  5 00000000  3     1 6    11   000000000              888  66     1           66          9999 5  0   0  7777              2         4      44  6      1    11111111  1 00   4       88888                      4   4      444                1                                                                 0                       2   111                 0   0       0     3                                  777     888        66           1       5     4444                                               2       11  2     3   3                                      7    6      1 5   1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         .                                     .                                                          .   .   .                  .                 .                .                         ..            .          . .    .                                                               .         .                            .       ........................            .           .                       .          ..   ....                     ..   ..............   ..  .....          ........      ..        .   .                              .           .          .                             ......                       ..   .......   ..  . ........  .     . .    ..   .........              ...  ..     .           ..          .... .  .   .  ....              .         .      ..  .      .    ........  . ..   .       .....                      .   .      ...                .                                                                 .                       .   ...                 .   .       .     .                                  ...     ...        ..           .       .     ....                                               .       ..  .     .   .                                      .    .      . .   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   0         8                                     1                                                          4   0   7                  0                 0                7                         66            7          7 7    0                                                               7         5                            3       333333333333333333333333            3           7                       3          22   2222                     22   88888888888888   22  77777          22222222      22        7   0                              7           7          0                             000000                       00   0000000   00  6 66666666  2     4 0    00   000000000              888  99     0           99          9999 0  7   9  0000              0         4      66  7      3    88888888  6 00   4       22222                      0   0      000                0                                                                 8                       0   999                 8   2       8     4                                  555     888        99           0       0     2222                                               5       88  5     7   3                                      3    7      0 5   0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
Reference ( family-2395 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCNTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCGT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAAATAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTTTAGCATATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTGCATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATA-CAAACAATACCG-AAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGATTCGATAGAATACGCCAACCCCATATATGTGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCCGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GTGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGAAAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTACCT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-TCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAGTACC-TGTGCGGTCTGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GACGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCAATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGTTGCCCTTAGCTGGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGA-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-ACACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAATTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTATATATATTACATCTTCAGAAGCAAGGTACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGATCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGACTTATAGTTCTACCTTCCCCCACATTTCGAGTGGAGAAAGAGAGCAGAAGGAAAC--TCT---AGGATATAACAAATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAATAA---CTGTACTTAGGATGCAATGAATGGGTTACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACATACGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGATAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGCAAAAAAAATCATAGAATACAGAAAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCTATAAAGGAAGAACTATGAATGCTAGTTCTATCTT-CCCCACATTTCAAGTGGAGAAGGAGAGAAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGAGA-AACCAATG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-----TATAAATCTTGCAAAGGGGTGG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCGTCGAATTGTTCACATTGTGACCAGTTATTATTACGCAATATATGTAAAGCTCATATGTGCCATAAAACATGGTTATCAATATGCATTATT-------------------ATAAATACTTTATACTTTGCATCGTCAGAAGCAAGGCAAACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATTTTGC--AATTGTTAAAAAATTACAG-AAAAAAAAGAGAAAATAAATGTGAAGGGTTAGATAGAATACaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttgtatagaatggtAAGGACGCATTGAATGGGTCACAATGTGACCAGCTAT-----------ATATGTACAGCACATATGTGATATAAAACATGGTTATCATTATGCATT-TTA--------------TGCCATTAAAGTTTCATACAAAACATCATCAGAAGAAA--------------AAAA----AATAACATATA-ATTGCAAATATT-AAAATATCATTG-AAAA--------AAATGTGAAGGTTTCGaactgtataaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                catccttgttgctacttcgttttatatgtttgttatgtatttattatcAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--AC-T-T------GACGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCCACAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCAAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACGCGGTTATTATCATGCAATTCTGGAA----GCACATGTGACATAACATATTTATATATAACAGTGCTATAGGCAATCCGCATATGCAGTGTTATATCAA---TAGCA---CACACTGC--ATTTTTTTTAATGA-ACAC-AACAA----ATAACAAA------------TCGAAACAATACGTCATTAAGGAATAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCGCTTAGTTCAGTTG-TCTTTT---CAA--------ACCCTTGGCAAGATTTATAAATAA-TA-GCTATGAA---AA---TCAT--AGCGCGT--TT-----TATAACTCcgcaagcctcaccgcacttacacaagctctgcgggaagcgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttagctcTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTGAAAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTCCAATGAATGGGTCATA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattaaattattattaaaatatatataataTATT-----CATAAATCTTGTTAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTGCAATGAATGGGTCATAc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatataataTAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAATC-TATTATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATAAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAAGTTGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAAAGAATACAG-AA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACAATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAATC-TATTATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATCAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAAGTTGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAAAGAATACAG-AA
gi|4                          : aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGCCACATTGTGAGCAGTTATTATTAAGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATGT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGGATTATGGACCATATATCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------G-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATTACTGAGATAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCT--TCATGCTC-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTAca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atccatatctttatttataaAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAATGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTCATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----CATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTATATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATTATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAAAATACGCCATAAATGAAGAACTATGAATTATAGTTCTAcgcttcccgcagagcttgtgtaaatgcggtgaggcttgcgataaaaactcattatacaatacacgctgcccttagctcgagttataaaacgcactatgattttcatagctattattcataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggtcacattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattatatcttcagaagcaaggcacacatgtgccattatatcaataacatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgataaaatacgccataaatgaagaactatgaattatagttcta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                  atccatatctttatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggccacattgtgagcagttattattaagcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcagaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataacatgtattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacgggattatggaccatatatctgatctgtgtggagcagggggtgggggggggtaacaaataactacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaattactgagataaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagacctgtgcggtccgagcgtgtctagattTGCATTGAATGTGTCACATTGTGACTAGTTATCATTATGCAATATATGTTAAGCAAATATGGTTCCTATAAAATGGTTATCATTA-----------AAC--CACACATGTGCAATAAAAAGTCTATGAATGACATCGTCAGAAGTTGGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATATAAATTG----TATTGCAAATATTACAGAAAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTATATAGAATGCGCCACTCTAATATGTATGTTA-----C---A-CAGAATTAT------------TGATCTGTGTGAAGCAGTGGAGTGA------------T-----------GGTGGGTAACAATAAAATTATGTGCGATCCGAAAGTGTCTAAAGTAATGATTAAGACAA--AGG----TTCTCTACTGACCCGGCAGTT--GAC-------CAAATTGAAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCGG--ACATGCTT-CCAACAGAGCTAATTGCAAATGTATAAAGAGGTTTGCGATAGGACC-TG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactatTGCGATAAC---ACCTGATT-TAT---CAATACACACTGCCCTTAGTTGGAAATATAA--AT-CAAGCTATGAT---TT---TAGT--Aatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatactgcgataacacctgatttatcaatacacactgcccttagttggaaatataaatcaagctatgattttagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|6                          :                                                                                  taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactattgcattgaatgtgtcacattgtgactagttatcattatgcaatatatgttaagcaaatatggttcctataaaatggttatcattaaaccacacatgtgcaataaaaagtctatgaatgacatcgtcagaagttgggcacacatgtgccataatatcaataacatataaattgtattgcaaatattacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttatatagaatgcgccactctaatatgtatgttacacagaattattgatctgtgtgaagcagtggagtgatggtgggtaacaataaaattatgtgcgatccgaaagtgtctaaagtaatgattaagacaaaggttctctactgacccggcagttgaccaaattgaatcagcgacgagctaatcggacatgcttccaacagagctaattgcaaatgtataaagaggtttgcgataggacctgatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatacTCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGGATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCAAAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAATCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACTG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATGATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T------------GGGGGTAACAA-ATAACTATGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TTATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGAGTATGTGAGAAAAGACTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGTCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GATGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTTATTATA----CAATACACGCTGCCTTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCtttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attaaaaatgaataacatacattttgcataattctttttatatgATCTTGCCAAGTGTTTGAAAAAA-CAACTGAAC-GAGAATGTATTGAATGGATCATATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAAAACGACACACATGTGTCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGA-GCAAGGCATT--TTTGCCATAATATCAGTAACATAT--ATTGCAAAGATT-CAAAGAATACAG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGATTCGGTAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTCAATATTTAAAACTGAATTATTGACCATATACCTTATCTGTGTGGAGCAGCGGGGTGG------------C-----------GGTGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCC------AACAACATCTGTGTGGAGAGCTTGCGATAAGACCTGATTTAGGTTTACCA-CAGAGTTAA--GCGTCTGTGTCGAAAGACT-GCGATAAGACC-TG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagcattgcaatatagtgaattataatgtGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCCAACAACAT-CTGTGTGGA-GAGCTTG-CGATAAGACCTGATTTAGGTTTACCACAGAG----TTAAGCGTCTGTGTCGAAAGA--CT-GCGATAAG---ACCTGATTA-AT---CAATACACGCTGCCCTTTGCTCGAATTACAA--AA-CACGCTATGAT---TT---GCAT--AGC-TATTATattaatcaatacacgctgccctttgctcgaattacaaaacacgctatgatttgcatagctattat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagcattgcaatatagtgaattataatgtatcttgccaagtgtttgaaaaaacaactgaacgagaatgtattgaatggatcatattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattaaaacgacacacatgtgtcataaaagttttatacattacatcgtcagagcaaggcatttttgccataatatcagtaacatatattgcaaagattcaaagaatacagaaaaaagaaaagaaatgtgaaggattcggtagaatacgccactccaacatatatgttcaatatttaaaactgaattattgaccatataccttatctgtgtggagcagcggggtggcggtCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGTGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAAAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAAAATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTTCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAACTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGGTAACAA-ATAAGTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--AAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCT--TCATGCTC-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGAAT-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCcgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgtgtcacattgtgatcagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcaaaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataaaatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccacttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaataagtacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagaattgtgcggtccgagcgtgtctagattGTGCGGCCC-AGA--------ATTGATGCATAGGACTAA------TGATCTTCACTGTCCCAACAACT--GAT--------AA--ATCTGC------GACGGACTTATCAAA--GAG---------GCTTCCAATAGAGTAAATT--AAGTATGTG--GTGAGAGTCTCTCGGTAAG---A-----------------TACACACCGCCTTCAGTTCAAATTATAA--AG-TACACTTTTAT---AT---TCAT--AGC-TAGTATT-----TGTAAATCTTGCATAGGGAT---AAACAAGCAC---CTGAACAGTGGATGCATCGAATGGGTAAAATTGTAACAAATTATCATTATGCAATAAATGTAAAGCATAAATTTGTCAT-AAATA-GGTT---ACTATG---------------ACACTTTTGCTAT--AAGTTTTATACATTACAACCTCAAAAGCAATACACACATGTGCACCAATTTCAA---TAACATCGTATAATAC--AAATATTGAACATTTGTAG-TATAA----ATAGATGTATTGTTATTGGTTTGATAGAATACGCCATGAATGAAAAA-----AATCTTA---------T-TGCCACTTTTCGAATGGAGAGGGGGAGCAACAAAAGGCATCATGTCCGG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AAGTGCTATTTTCAGTTTAAGATGCACTGTAGACATTGCTTAGACGTATTAGCGTCAAGTAAGGAAATACTGAAAACTCAACAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTGCATCGTCTTCGCT
Unaligned ( gi|18 ): AATGTTATTTTCATGTCTGGAGGCACTACAACCGTTGCTAAGATATCAAACACTGAACCAATACTATAACATAAGATAATGCAAAACAAAAAAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      11                                                                                                                                     1       666666666666666666666666            1                                                   1111                          33333333333333       11111          22222222                                                                                                        222222                       11   2222222   11    33333333               11   222222222                                                                 2222                                               11111111    11           11111                                 111                                                                                                              111                                                                      111                                           1111                                                                     1                                                    1        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   8         0                                     0                                                          1   3   0                  1                 1                0                         33            5          1 5    5                                                               6         2                            3       333333333333333333333333            3           0                       0          99   4444                     99   00000000000000   99  66666          44444444      99        6   1                              1           5          1                             333333                       11   6666666   11  5 00000000  3     1 6    11   000000000              888  66     1           66          9999 5  0   0  7777              2         4      44  6      1    11111111    11   4       88888                      4   4      444                1                                                                 0                       2   111                 0   0       0     3                                  777     888        66           1       5     4444                                               2       11  2     3   3                                      7    6      1 5   1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         .                                     .                                                          .   .   .                  .                 .                .                         ..            .          . .    .                                                               .         .                            .       ........................            .           .                       .          ..   ....                     ..   ..............   ..  .....          ........      ..        .   .                              .           .          .                             ......                       ..   .......   ..  . ........  .     . .    ..   .........              ...  ..     .           ..          .... .  .   .  ....              .         .      ..  .      .    ........    ..   .       .....                      .   .      ...                .                                                                 .                       .   ...                 .   .       .     .                                  ...     ...        ..           .       .     ....                                               .       ..  .     .   .                                      .    .      . .   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   0         8                                     1                                                          4   0   7                  0                 6                7                         66            7          7 7    0                                                               7         5                            3       333333333333333333333333            3           7                       3          22   2222                     22   88888888888888   22  77777          22222222      22        7   0                              7           7          0                             000000                       00   0000000   00  6 66666666  2     4 0    00   000000000              888  99     0           99          9999 0  7   9  0000              0         4      66  7      3    88888888    00   4       22222                      0   0      000                0                                                                 8                       0   999                 8   2       8     4                                  555     888        99           0       0     2222                                               5       88  5     7   3                                      3    7      0 5   0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
Reference ( family-2395 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAAATAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTTTAGCATATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTGCATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATA-CAAACAATACCG-AAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGATTCGATAGAATACGCCAACCCCATATATGTGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCCGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GTGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGAAAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTACCT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-TCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAGTACC-TGTGCGGTCTGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GACGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCAATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGTTGCCCTTAGCTGGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGA-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-ACACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAATTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTATATATATTACATCTTCAGAAGCAAGGTACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGATCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGACTTATAGTTCTACCTTCCCCCACATTTCGAGTGGAGAAAGAGAGCAGAAGGAAAC--TCT---AGGATATAACAAATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAATAA---CTGTACTTAGGATGCAATGAATGGGTTACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACATACGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGATAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGCAAAAAAAATCATAGAATACAGAAAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCTATAAAGGAAGAACTATGAATGCTAGTTCTATCTT-CCCCACATTTCAAGTGGAGAAGGAGAGAAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGAGA-AACCAATG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-----TATAAATCTTGCAAAGGGGTGG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCGTCGAATTGTTCACATTGTGACCAGTTATTATTACGCAATATATGTAAAGCTCATATGTGCCATAAAACATGGTTATCAATATGCATTATT-------------------ATAAATACTTTATACTTTGCATCGTCAGAAGCAAGGCAAACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATTTTGC--AATTGTTAAAAAATTACAG-AAAAAAAAGAGAAAATAAATGTGAAGGGTTAGATAGAATACaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttgtatagaatggtAAGGACGCATTGAATGGGTCACAATGTGACCAGCTAT-----------ATATGTACAGCACATATGTGATATAAAACATGGTTATCATTATGCATT-TTA--------------TGCCATTAAAGTTTCATACAAAACATCATCAGAAGAAA--------------AAAA----AATAACATATA-ATTGCAAATATT-AAAATATCATTG-AAAA--------AAATGTGAAGGTTTCGaactgtataaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                catccttgttgctacttcgttttatatgtttgttatgtatttattatcAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--AC-T-T------GACGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCCACAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCAAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACGCGGTTATTATCATGCAATTCTGGAA----GCACATGTGACATAACATATTTATATATAACAGTGCTATAGGCAATCCGCATATGCAGTGTTATATCAA---TAGCA---CACACTGC--ATTTTTTTTAATGA-ACAC-AACAA----ATAACAAA------------TCGAAACAATACGTCATTAAGGAATAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCGCTTAGTTCAGTTG-TCTTTT---CAA--------ACCCTTGGCAAGATTTATAAATAA-TA-GCTATGAA---AA---TCAT--AGCGCGT--TT-----TATAACTCcgcaagcctcaccgcacttacacaagctctgcgggaagcgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttagctcTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTGAAAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTCCAATGAATGGGTCATA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattaaattattattaaaatatatataataTATT-----CATAAATCTTGTTAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTGCAATGAATGGGTCATAc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatataataTAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAATC-TATTATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATAAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAAGTTGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAAAGAATACAG-AA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACAATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAATC-TATTATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATCAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAAGTTGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAAAGAATACAG-AA
gi|4                          : aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGCCACATTGTGAGCAGTTATTATTAAGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATGT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGGATTATGGACCATATATCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------G-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATTACTGAGATAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCT--TCATGCTC-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTAca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atccatatctttatttataaAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAATGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTCATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----CATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTATATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATTATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAAAATACGCCATAAATGAAGAACTATGAATTATAGTTCTAcgcttcccgcagagcttgtgtaaatgcggtgaggcttgcgataaaaactcattatacaatacacgctgcccttagctcgagttataaaacgcactatgattttcatagctattattcataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggtcacattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattatatcttcagaagcaaggcacacatgtgccattatatcaataacatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgataaaatacgccataaatgaagaactatgaattatagttcta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                  atccatatctttatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggccacattgtgagcagttattattaagcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcagaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataacatgtattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacgggattatggaccatatatctgatctgtgtggagcagggggtgggggggggtaacaaataactacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaattactgagataaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagacctgtgcggtccgagcgtgtctagattTGCATTGAATGTGTCACATTGTGACTAGTTATCATTATGCAATATATGTTAAGCAAATATGGTTCCTATAAAATGGTTATCATTA-----------AAC--CACACATGTGCAATAAAAAGTCTATGAATGACATCGTCAGAAGTTGGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATATAAATTG----TATTGCAAATATTACAGAAAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTATATAGAATGCGCCACTCTAATATGTATGTTA-----C---A-CAGAATTAT------------TGATCTGTGTGAAGCAGTGGAGTGA------------T-----------GGTGGGTAACAATAAAATTATGTGCGATCCGAAAGTGTCTAAAGTAATGATTAAGACAA--AGG----TTCTCTACTGACCCGGCAGTT--GAC-------CAAATTGAAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCGG--ACATGCTT-CCAACAGAGCTAATTGCAAATGTATAAAGAGGTTTGCGATAGGACC-TG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactatTGCGATAAC---ACCTGATT-TAT---CAATACACACTGCCCTTAGTTGGAAATATAA--AT-CAAGCTATGAT---TT---Tatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatactgcgataacacctgatttatcaatacacactgcccttagttggaaatataaatcaagctatgattttagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|6                          :                                                                                  taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactattgcattgaatgtgtcacattgtgactagttatcattatgcaatatatgttaagcaaatatggttcctataaaatggttatcattaaaccacacatgtgcaataaaaagtctatgaatgacatcgtcagaagttgggcacacatgtgccataatatcaataacatataaattgtattgcaaatattacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttatatagaatgcgccactctaatatgtatgttacacagaattattgatctgtgtgaagcagtggagtgatggtgggtaacaataaaattatgtgcgatccgaaagtgtctaaagtaatgattaagacaaaggttctctactgacccggcagttgaccaaattgaatcagcgacgagctaatcggacatgcttccaacagagctaattgcaaatgtataaagaggtttgcgataggacctgatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatacTCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGGATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCAAAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAATCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACTG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATGATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T------------GGGGGTAACAA-ATAACTATGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TTATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGAGTATGTGAGAAAAGACTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGTCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GATGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTTATTATA----CAATACACGCTGCCTTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attaaaaatgaataacatacattttgcataattctttttatatgATCTTGCCAAGTGTTTGAAAAAA-CAACTGAAC-GAGAATGTATTGAATGGATCATATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAAAACGACACACATGTGTCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGA-GCAAGGCATT--TTTGCCATAATATCAGTAACATAT--ATTGCAAAGATT-CAAAGAATACAG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGATTCGGTAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTCAATATTTAAAACTGAATTATTGACCATATACCTTATCTGTGTGGAGCAGCGGGGTGG------------C-----------GGTGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCC------AACAACATCTGTGTGGAGAGCTTGCGATAAGACCTGATTTAGGTTTACCA-CAGAGTTAA--GCGTCTGTGTCGAAAGACT-GCGATAAGACC-TG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagcattgcaatatagtgaattataatgtGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCCAACAACAT-CTGTGTGGA-GAGCTTG-CGATAAGACCTGATTTAGGTTTACCACAGAG----TTAAGCGTCTGTGTCGAAAGA--CT-GCGATAAG---ACCTGATTA-AT---CAATACACGCTGCCCTTTGCTCGAATTACAA--AA-CACGCTATGAT---TT---GCAT--AGC-TATTATattaatcaatacacgctgccctttgctcgaattacaaaacacgctatgatttgcatagctattat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagcattgcaatatagtgaattataatgtatcttgccaagtgtttgaaaaaacaactgaacgagaatgtattgaatggatcatattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattaaaacgacacacatgtgtcataaaagttttatacattacatcgtcagagcaaggcatttttgccataatatcagtaacatatattgcaaagattcaaagaatacagaaaaaagaaaagaaatgtgaaggattcggtagaatacgccactccaacatatatgttcaatatttaaaactgaattattgaccatataccttatctgtgtggagcagcggggtggcggtCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGTGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAAAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAAAATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTTCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAACTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGGTAACAA-ATAAGTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--AAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCT--TCATGCTC-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGAAT-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCcgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgtgtcacattgtgatcagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcaaaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataaaatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccacttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaataagtacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagaattgtgcggtccgagcgtgtctagattGTGCGGCCC-AGA--------ATTGATGCATAGGACTAA------TGATCTTCACTGTCCCAACAACT--GAT--------AA--ATCTGC------GACGGACTTATCAAA--GAG---------GCTTCCAATAGAGTAAATT--AAGTATGTG--GTGAGAGTCTCTCGGTAAG---A-----------------TACACACCGCCTTCAGTTCAAATTATAA--AG-TACACTTTTAT---AT---TCAT--AGC-TAGTATT-----TGTAAATCTTGCATAGGGAT---AAACAAGCAC---CTGAACAGTGGATGCATCGAATGGGTAAAATTGTAACAAATTATCATTATGCAATAAATGTAAAGCATAAATTTGTCAT-AAATA-GGTT---ACTATG---------------ACACTTTTGCTAT--AAGTTTTATACATTACAACCTCAAAAGCAATACACACATGTGCACCAATTTCAA---TAACATCGTATAATAC--AAATATTGAACATTTGTAG-TATAA----ATAGATGTATTGTTATTGGTTTGATAGAATACGCCATGAATGAAAAA-----AATCTTA---------T-TGCCACTTTTCGAATGGAGAGGGGGAGCAACAAAAGGCATCATGTCCGG


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .                                                                                                          A   G                      A                 A                                          AA            G          T A    A                                                               A         G                            T       TGGTGGTGGTGGTGGTGGGGGGGG            T                                              CC   GTGG                     CA   ATTCTTCC         AA  TCTGT          TGCGATAA      AT        A   G                              A           A          G                             CGTTGT                       CA   ATTCTTC   CA  A CTGTGTG   C     A A    AA   CTGATTTAG              AAA  AA     A           GT          GTTC A         TATC              C         G      AT  T      A    ATTTTGAA    GA   G       GTATT                      A   C      AAA                A                                                                                         A   CGA                                   G                                  TAT     TCG        AA           G       A     AAAG                                               C       GC  G     T   .                                      A    G      G .   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .                                                                                                          A   G                      T                 T                                          A             .          C .    A                                                               .         G                            C       G                                   T                                              .    .                        .    CAAATTG          .   .              .             .         .   A                              T           .          G                             .                            .    .         .   A GC        T     A A    .    .                      .    .      A           .           A    G         TATC              C         G      .   T      A    ATTTTGAA    GA   .       GTATT                      .   .      AAA                T                                                                                         G   TGC                                   G                                  TAT     .          .            A       .     .                                                  C       TA  G     .   .                                      A    G             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .                                                                                                          A   A                      A                 G                                          .             .          A .    A                                                               .         T                            .       T                                   .                                              .    .                        .    C                .   .              .             .         .   G                              A           .          A                             .                            .    .         .   C T         C     T T    .    .                      .    .      A           .           A    A         T                 C         T      .   .      A    TT          .    .       .                          .   .      .                  A                                                                                         A   TGC                                   G                                  .       .          .            T       .     .                                                  .       CT  .                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .                                                                                                          A   G                      T                 T                                          .             .          T .    A                                                               .         G                            .       T                                   .                                              .    .                        .    C                .   .              .             .         .   G                              A           .          G                             .                            .    .         .   . T         .     T .    .    .                      .    .      T           .           C    C         T                 C         G      .   .      A    TT          .    .       .                          .   .      .                  A                                                                                         A   CGA                                   A                                  .       .          .            G       .     .                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .                      A                 G                                          .             .          A .    A                                                               .         .                            .       C                                   .                                              .    .                        .    C                .   .              .             .         .   .                              A           .          .                                                                                                           .                      .    .      T           .           A    A         T                 C         G      .   .      A    AA          .    .       .                          .   .      .                  A                                                                                         A   .                                     A                                  .       .          .            G       .     .                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .                      T                 T                                          .             .          C .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .           .                                                                                                                      .                      .    .      A           .           G    C         .                 T         A      .   .      A    TT          .    .       .                          .   .      .                  A                                                                                         .   .                                     T                                  .       .          .            T       .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                      .    .      T           .           G    .         .                 C         G      .   .      A    TT          .    .       .                          .   .      .                  T                                                                                         .   .                                     C                                  .       .          .            A       .                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .                 T         A      .   .      A    TT          .    .       .                          .   .      .                  T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .                 .         A      .   .      T    TT          .            .                          .   .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .         .      .   .      .    TT                       .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .      .   .      .    AT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AAGTGCTATTTTCAGTTTAAGATGCACTGTAGACATTGCTTAGACGTATTAGCGTCAAGTAAGGAAATACTGAAAACTCAACAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTGCATCGTCTTCGCT
Unaligned ( gi|18 ): AATGTTATTTTCATGTCTGGAGGCACTACAACCGTTGCTAAGATATCAAACACTGAACCAATACTATAACATAAGATAATGCAAAACAAAAAAGA






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      11                                                                                                                                     1       666666666666666666666666            1                                                   1111                          33333333333333       11111          22222222                                                                                                        222222                       11   2222222   11    33333333               11   222222222                                                                 2222                                               11111111    11           11111                                 111                                                                                                              111                                                                      111                                           1111                                                                     1                                                    1        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   8         0                                     0                                                          1   3   0                  1                 1                0                         33            5          1 5    5                                                               6         2                            3       333333333333333333333333            3           0                       0          99   4444                     99   00000000000000   99  66666          44444444      99        6   1                              1           5          1                             333333                       11   6666666   11  5 00000000  3     1 6    11   000000000              888  66     1           66          9999 5  0   0  7777              2         4      44  6      1    11111111    11   4       88888                      4   4      444                1                                                                 0                       2   111                 0   0       0     3                                  777     888        66           1       5     4444                                               2       11  2     3   3                                      7    6      1 5   1    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         .                                     .                                                          .   .   .                  .                 .                .                         ..            .          . .    .                                                               .         .                            .       ........................            .           .                       .          ..   ....                     ..   ..............   ..  .....          ........      ..        .   .                              .           .          .                             ......                       ..   .......   ..  . ........  .     . .    ..   .........              ...  ..     .           ..          .... .  .   .  ....              .         .      ..  .      .    ........    ..   .       .....                      .   .      ...                .                                                                 .                       .   ...                 .   .       .     .                                  ...     ...        ..           .       .     ....                                               .       ..  .     .   .                                      .    .      . .   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   0         8                                     1                                                          4   0   7                  0                 6                7                         66            7          7 7    0                                                               7         5                            3       333333333333333333333333            3           7                       3          22   2222                     22   88888888888888   22  77777          22222222      22        7   0                              7           7          0                             000000                       00   0000000   00  6 66666666  2     4 0    00   000000000              888  99     0           99          9999 0  7   9  0000              0         4      66  7      3    88888888    00   4       22222                      0   0      000                0                                                                 8                       0   999                 8   2       8     4                                  555     888        99           0       0     2222                                               5       88  5     7   3                                      3    7      0 5   0    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
Reference ( family-2395 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAANGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGCGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-C------GACGAGCTAAACGGT--GAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTANGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAG---AACTGATTATAT---CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCANTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAANAATACAG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGAATTNTAGTTCTACCTT-CCCCACATTTCGAGTGGAGAAGGAGAGCAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGANATAACNAATG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAAATAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTTTAGCATATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTGCATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATA-CAAACAATACCG-AAAA--GAAAAGAAATGTGAAGGATTCGATAGAATACGCCAACCCCATATATGTGTTAAATATCTAAA-CGGAATTATGGACCATATACCCGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T-----------GTGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGAAAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTACCT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TCATGCTT-TCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAGTACC-TGTGCGGTCTGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GACGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCAATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGTTGCCCTTAGCTGGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGA-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-ACACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGATCACATTGTGACCAATTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTATATATATTACATCTTCAGAAGCAAGGTACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGATCGATAGAATACGCCATAAAGGAAGAACTATGACTTATAGTTCTACCTTCCCCCACATTTCGAGTGGAGAAAGAGAGCAGAAGGAAAC--TCT---AGGATATAACAAATG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AAATAA---CTGTACTTAGGATGCAATGAATGGGTTACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACATACGTGCCATAAAAGTTTTATACATTACATCGATAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATATTGCAAAAAAAATCATAGAATACAGAAAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCTATAAAGGAAGAACTATGAATGCTAGTTCTATCTT-CCCCACATTTCAAGTGGAGAAGGAGAGAAGAAGGAGGCATTCTGTCAGGAGA-AACCAATG
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TT-----TATAAATCTTGCAAAGGGGTGG-AAA-AAACAA---CTGAACTAAGGATGCGTCGAATTGTTCACATTGTGACCAGTTATTATTACGCAATATATGTAAAGCTCATATGTGCCATAAAACATGGTTATCAATATGCATTATT-------------------ATAAATACTTTATACTTTGCATCGTCAGAAGCAAGGCAAACATGTGCCATAATATCAA---TAACA---TATTTTGC--AATTGTTAAAAAATTACAG-AAAAAAAAGAGAAAATAAATGTGAAGGGTTAGATAGAATACaactgagaattattcaatcgcgtgtaattaaacattgattgcatattgaatgaaaa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttgtatagaatggtAAGGACGCATTGAATGGGTCACAATGTGACCAGCTAT-----------ATATGTACAGCACATATGTGATATAAAACATGGTTATCATTATGCATT-TTA--------------TGCCATTAAAGTTTCATACAAAACATCATCAGAAGAAA--------------AAAA----AATAACATATA-ATTGCAAATATT-AAAATATCATTG-AAAA--------AAATGTGAAGGTTTCGaactgtataaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                catccttgttgctacttcgttttatatgtttgttatgtatttattatcAGTGACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGCCCGGTAACT--GAC-------CAA--AC-T-T------GACGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCCACAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTGATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCAAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACGCGGTTATTATCATGCAATTCTGGAA----GCACATGTGACATAACATATTTATATATAACAGTGCTATAGGCAATCCGCATATGCAGTGTTATATCAA---TAGCA---CACACTGC--ATTTTTTTTAATGA-ACAC-AACAA----ATAACAAA------------TCGAAACAATACGTCATTAAGGAATAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCGCTTAGTTCAGTTG-TCTTTT---CAA--------ACCCTTGGCAAGATTTATAAATAA-TA-GCTATGAA---AA---TCAT--AGCGCGT--TT-----TATAACTCcgcaagcctcaccgcacttacacaagctctgcgggaagcgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttagctcTATT-----TATAAATCTTGCCAAGGGTTTGAAAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTCCAATGAATGGGTCATA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tattaaattattattaaaatatatataataTATT-----CATAAATCTTGTTAAGGGTTTG-AAA-AAACAA---CTGAACTGATGGTGCAATGAATGGGTCATAc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatataataTAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAATC-TATTATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATAAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAAGTTGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAAAGAATACAG-AA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACAATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAATTATATATCCATTTTACATTGTT-TTGGCTCAA-TTACAA--AATCGTACT-TGATATTTTGAATCGTGAATC-TATTATTGTATTCATAAATCTTGCCAGGGGTTTG-AAA-AAATAAAAACTGAACTAAGGATGCAATCAATGGGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTATAGCACATATGTGTCATAAATCATGGTAATCATTATGCATTATTAGAATGCCACACATGGGCCATAAAAGTTGTATACATAACATCATCAGAAGCAAGGCACACTTGTGCCATAATAATAATATTAATA---TATATTGC--AAATATTCAAAGAATACAG-AA
gi|4                          : aaatgctattgtcaagtttagatacactgttaccattgctaagatgtcgttctgcaaggaaacactgaaacaacaccaaacaaaagaacaaaaccaaaacgaatgttttcctcccacggactattaacggctatttacaaacagtggtcgtgtttggaggacaacacacaatcataatgacgtatgattaattatcaccataacaatgtcaaacagttattgtcccgttatcgattaaatagtctgatctgatgtttcatgagatgaaaatgccatttaagctttcatctttacactctgcttgtgtaacataactagaaccgctttgttatctttataaatacttaggttggtaaaaggaggtgagttgtacttctgagattaagattaccgttatttacttaaatgtcaaacaaccctttatacacaccatgaatgttaataatagatagacacacaaatagacacatgacatttatgaaatcggagaaaccttgaagttacattgacatttcagtagatagtctggcaaataatacattttaacagaaagatatgttgttttagtcgaaacctcgatagtctcatcgaacaaacgagacacgaacacaccattacaggatgataattctaaaccgtgagaaaaacaaagttaacacattagaatggaaggtttagatttgactatattgtttataaggttttatttttaacgacgtatattatcatagATCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGCCACATTGTGAGCAGTTATTATTAAGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATGT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGGATTATGGACCATATATCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------G-----------GGGGGGTAACAA-ATAACTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATTACTGAGATAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCT--TCATGCTC-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTAca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atccatatctttatttataaAC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAATGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTCATTATA----CAATACACGCTGCCCTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCACTATGAT---TT---TCAT--AGC-TATTATT-----CATAAATCTTGCCAAGGGTTTG-AAA-AGACAA---CTGAACTAAGGATGCATTGAATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACGTGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTATATCTTCAGAAGCAAGGCACACATGTGCCATTATATCAA---TAACA---TATATTGC--AAATATTCAAATAATACCG-AAAAA----AGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAAAATACGCCATAAATGAAGAACTATGAATTATAGTTCTAcgcttcccgcagagcttgtgtaaatgcggtgaggcttgcgataaaaactcattatacaatacacgctgcccttagctcgagttataaaacgcactatgattttcatagctattattcataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggtcacattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattatatcttcagaagcaaggcacacatgtgccattatatcaataacatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgataaaatacgccataaatgaagaactatgaattatagttcta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                  atccatatctttatttataaatcttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgggccacattgtgagcagttattattaagcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacgtggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcagaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataacatgtattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccactccaacatatatgttaaatatctaaacgggattatggaccatatatctgatctgtgtggagcagggggtgggggggggtaacaaataactacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaattactgagataaattatctccactgaccaggtaactgaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagacctgtgcggtccgagcgtgtctagattTGCATTGAATGTGTCACATTGTGACTAGTTATCATTATGCAATATATGTTAAGCAAATATGGTTCCTATAAAATGGTTATCATTA-----------AAC--CACACATGTGCAATAAAAAGTCTATGAATGACATCGTCAGAAGTTGGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATATAAATTG----TATTGCAAATATTACAGAAAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTATATAGAATGCGCCACTCTAATATGTATGTTA-----C---A-CAGAATTAT------------TGATCTGTGTGAAGCAGTGGAGTGA------------T-----------GGTGGGTAACAATAAAATTATGTGCGATCCGAAAGTGTCTAAAGTAATGATTAAGACAA--AGG----TTCTCTACTGACCCGGCAGTT--GAC-------CAAATTGAAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCGG--ACATGCTT-CCAACAGAGCTAATTGCAAATGTATAAAGAGGTTTGCGATAGGACC-TG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactatTGCGATAAC---ACCTGATT-TAT---CAATACACACTGCCCTTAGTTGGAAATATAA--AT-CAAGCTATGAT---TT---Tatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatactgcgataacacctgatttatcaatacacactgcccttagttggaaatataaatcaagctatgattttagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|6                          :                                                                                  taataatttcatgcatcgatttgttcctgttttggcttaatatcttactaatatttgaataaatgttaagtatatatatatatattcatctatccgcaataaatgagaaatttgaaaatttttatgaccaaatctagtataacctactattgcattgaatgtgtcacattgtgactagttatcattatgcaatatatgttaagcaaatatggttcctataaaatggttatcattaaaccacacatgtgcaataaaaagtctatgaatgacatcgtcagaagttgggcacacatgtgccataatatcaataacatataaattgtattgcaaatattacagaaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttatatagaatgcgccactctaatatgtatgttacacagaattattgatctgtgtgaagcagtggagtgatggtgggtaacaataaaattatgtgcgatccgaaagtgtctaaagtaatgattaagacaaaggttctctactgacccggcagttgaccaaattgaatcagcgacgagctaatcggacatgcttccaacagagctaattgcaaatgtataaagaggtttgcgataggacctgatttaggtttcttatagagttaagctaagcttcagagtggaaatacTCTTGCCAAGGGTTTGAAAAAA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGGATGGGTCACATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCAAAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAGAATCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAACATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACTG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAATGATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGG------------T------------GGGGGTAACAA-ATAACTATGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--GAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCG--TTATGCTT-CCAGCAGAGCTAATTGAGTATGTGAGAAAAGACTAGCGATAAGACC-TGTGCGGTCCGAGAGTGTCTAGATTAGTAACTAAGATAAA------GGATCTCCACTGGTCCGGTAACT--GAC-------CAA--ACAT-T------GATGAGCTAAACGGT--GAT---------GCTTCCAACAGAGC---TT--GTGTATGTGCGGTGAGG--CTTGCGATAAA---AACTTATTATA----CAATACACGCTGCCTTTAGCTCGAGTTATAA--AA-CGCGCTATGAT---TT---TCagtatttggatagtatatttatttgaaagtcaatatacatgtatgtgatctttaatgaaaatagtgaattagcaatatcgttacatgcgaaata
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                attaaaaatgaataacatacattttgcataattctttttatatgATCTTGCCAAGTGTTTGAAAAAA-CAACTGAAC-GAGAATGTATTGAATGGATCATATTGTGACCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAAAACGACACACATGTGTCATAAAAGTTTTATACATTACATCGTCAGA-GCAAGGCATT--TTTGCCATAATATCAGTAACATAT--ATTGCAAAGATT-CAAAGAATACAG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGATTCGGTAGAATACGCCACTCCAACATATATGTTCAATATTTAAAACTGAATTATTGACCATATACCTTATCTGTGTGGAGCAGCGGGGTGG------------C-----------GGTGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCC------AACAACATCTGTGTGGAGAGCTTGCGATAAGACCTGATTTAGGTTTACCA-CAGAGTTAA--GCGTCTGTGTCGAAAGACT-GCGATAAGACC-TG
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tagcattgcaatatagtgaattataatgtGGGTAACAATAAAACTATGTGCGATCCAACAGTGTCTAGAGTAATGACTAAGACAACCGTTGTGGATCTCCACTGACCCGGCAAATCAGACATTCTTCCAACAACAT-CTGTGTGGA-GAGCTTG-CGATAAGACCTGATTTAGGTTTACCACAGAG----TTAAGCGTCTGTGTCGAAAGA--CT-GCGATAAG---ACCTGATTA-AT---CAATACACGCTGCCCTTTGCTCGAATTACAA--AA-CACGCTATGAT---TT---GCAT--AGC-TATTATattaatcaatacacgctgccctttgctcgaattacaaaacacgctatgatttgcatagctattat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tagcattgcaatatagtgaattataatgtatcttgccaagtgtttgaaaaaacaactgaacgagaatgtattgaatggatcatattgtgaccagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattaaaacgacacacatgtgtcataaaagttttatacattacatcgtcagagcaaggcatttttgccataatatcagtaacatatattgcaaagattcaaagaatacagaaaaaagaaaagaaatgtgaaggattcggtagaatacgccactccaacatatatgttcaatatttaaaactgaattattgaccatataccttatctgtgtggagcagcggggtggcggtCTTGCCAAGGGTTTGAAAAGA-CAACTGAACTAAGGATGCATTGAATGTGTCACATTGTGATCAGTTATTATTATGCAATATATGTAAAGCACATATGTGTCATAAAACATGGTTATCATTATGCATTATTAGAACGACACACATGTGCCATAAATGTTTTATACATTACATCTTCAAAAGCAAGGCACACATGTGCCATAATATCAATAAAATAT--ATTGCAAATATT-CAAATAATACCG-AAAAAAGAAAAGAAATGTGAAGGGTTCGATAGAATACGCCACTTCAACATATATGTTAAATATCTAAA-CGGAACTATGGACCATATACCTGATCTGTGTGGAGCAG-GGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGGGGGGGGGGGTAACAA-ATAAGTACGTGTGTTCCGAGAGTGTCTTGAGTAATAACTGAGACAA--ATT----ATCTCCACTGACCAGGTAACT--AAC-------C------AAT--CA-----GCGACGAGCT--------AATCCT--TCATGCTC-CCAGCAGAGCTAATTGCGTATGTGTGAAAAGGCTAGCGATAAGAAT-TGTGCGGTCCGAGCGTGTCTAGATTA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AC---------GCTTCCCGCAGAGC---TT--GTGTAAGTGCGGTGAGG--CTTGCcgcttcccgcagagcttgtgtaagtgcggtgaggcttgc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cttgccaagggtttgaaaagacaactgaactaaggatgcattgaatgtgtcacattgtgatcagttattattatgcaatatatgtaaagcacatatgtgtcataaaacatggttatcattatgcattattagaacgacacacatgtgccataaatgttttatacattacatcttcaaaagcaaggcacacatgtgccataatatcaataaaatatattgcaaatattcaaataataccgaaaaaagaaaagaaatgtgaagggttcgatagaatacgccacttcaacatatatgttaaatatctaaacggaactatggaccatatacctgatctgtgtggagcagggggtggtggtggtggtggtggtggggggggggggggtaacaaataagtacgtgtgttccgagagtgtcttgagtaataactgagacaaattatctccactgaccaggtaactaaccaatcagcgacgagctaatccttcatgctcccagcagagctaattgcgtatgtgtgaaaaggctagcgataagaattgtgcggtccgagcgtgtctagattGTGCGGCCC-AGA--------ATTGATGCATAGGACTAA------TGATCTTCACTGTCCCAACAACT--GAT--------AA--ATCTGC------GACGGACTTATCAAA--GAG---------GCTTCCAATAGAGTAAATT--AAGTATGTG--GTGAGAGTCTCTCGGTAAG---A-----------------TACACACCGCCTTCAGTTCAAATTATAA--AG-TACACTTTTAT---AT---TCAT--AGC-TAGTATT-----TGTAAATCTTGCATAGGGAT---AAACAAGCAC---CTGAACAGTGGATGCATCGAATGGGTAAAATTGTAACAAATTATCATTATGCAATAAATGTAAAGCATAAATTTGTCAT-AAATA-GGTT---ACTATG---------------ACACTTTTGCTAT--AAGTTTTATACATTACAACCTCAAAAGCAATACACACATGTGCACCAATTTCAA---TAACATCGTATAATAC--AAATATTGAACATTTGTAG-TATAA----ATAGATGTATTGTTATTGGTTTGATAGAATACGCCATGAATGAAAAA-----AATCTTA---------T-TGCCACTTTTCGAATGGAGAGGGGGAGCAACAAAAGGCATCATGTCCGG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): AAGTGCTATTTTCAGTTTAAGATGCACTGTAGACATTGCTTAGACGTATTAGCGTCAAGTAAGGAAATACTGAAAACTCAACAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTGCATCGTCTTCGCT
Unaligned ( gi|18 ): AATGTTATTTTCATGTCTGGAGGCACTACAACCGTTGCTAAGATATCAAACACTGAACCAATACTATAACATAAGATAATGCAAAACAAAAAAGA