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gi|6 : aattatatctttgttacctccagtaagaagattacaacatgatagcatacagtttatacaagtgtgcaagaaagaaatcacacatgcgcaaatataaacatatatacaaaaaacataacaaataatcaagtgtaaattacaatgagcatatgcacttgcatgcattaacaagcatgcaaacggaagcgtaaattatattaaataactccaagtatgtgaatgtttaatatgtgattagcactgacaaagatttacattgcattattatcttcgctatcgttctattgtattattatgagtttctcattataacatgtattattcaaatggcaaattcgctacatatgatttttatcgttacgaaATAATATCCTTATTTCCTCCAATAAGAAGATTACAACA---TGAAAGCATACAGTTTATACAAGTGTGCAAGAAAGAAATCACATATGCGC-AA-TATTAACATATA--TACAAGAA-CAT-A---ATATG-TATACAATTGTAAGTTATTATGACAATAT--GCACCTGCATGCATTAACAAGCATGTATATGGAAACGTATAT-AATATTAGA---TAA-CCATAAGTGTGTGAACGTT-AATTAT----------TGCTAACAATGGGTTGC----AG--TG---C-A---TT---ATCTTCGCAATCTCTCTATTG--CAT--TAATATGAATTTCTCATTATAA-CATGTATTATTC-AA-AATGCAAATTCGCTACAGAAAACTCTTAC-CGAAACGAAACA-TAAGAATCAAGCAACGAA-AAAAAG---AACTATTAATGCATGACTTGGTAAACTGCTAGA-TGACTAATGTTTATTGAGACACATATTTTGCCCATGCCCAGTGGTTATGGGATA------------------CATCAGATCTAGAGATTAACACAGTTACAAGTGTCGGGCTTTTAATACCCTAAGCCACATTCACCACTGAATTTCTGTCCATATTGGCGATACACGTGACTGCATCTTGACCAAATGTAAGTCTCATTTTTCTCAACActca
gi|7 : aGAA-AAT-ATTTACACT-TATACAAGTGCTAGTGACAATAAC--TATTCGCATTTACATGTATT--------------------CGTA-AT-TATAATAAC---GAA-CTATAATTATGAGAACATTTAA--ATGTGCCTTTGGTACATACAATGCGTTAC----AGAATG---TTG---TT---ATTTTCGCTATCGCTCTATTG--TATGACAATACA--TTTCTCATTATAA-CATGTAGTATAC-AATATTGCAATTGCGCTACAAACGACTCTTAT-CAAAAC-AAACAATAAGCATCACACAATTAATAAATAAGGCAACCACTTATGCATGTCTTAATAATTTTTTAATGCGACTAGCATTCGCCGAGATACATGTTCTACTAGTGCCCAGTGAGTATGGGTAAATATAA
gi|7 : ATATTGGTGATGCACGTGACTGCATCTCCACAAAAGGTAAGCAATAGTTTTGTCATTAACTTCTGATGTatagtgtatgacgcccaatattggtgatgcacgtgactgcatctccacaaaaggtaagcaatagttttgtcattaacttctgatgt
gi|8 : gaaaatatttacacttatacaagtgctagtgacaataactattcgcatttacatgtattcgtaattataataacgaactataattatgagaacatttaaatgtgcctttggtacatacaatgcgttacagaatgttgttattttcgctatcgctctattgtatgacaatacatttctcattataacatgtagtatacaatattgcaattgcgctacaaacgactcttatcaaaacaaacaataagcatcacacaattaataaataaggcaaccacttatgcatgtcttaataattttttaatgcgactagcattcgccgagatacatgttctactagtgcccagtgagtatgggtaaatataaatagtgtatgacgcccaATAATATCTTTATTTCCTCCAATAAGAATATTACAACA---TGAAAGCATACAGTTTATACAAGTGTGCAAGAAAGAAATCACATATGCGC-AA-TATTAACATTTA--TACAAGAA-CAT-A---ACATG-TATACAATTGTAAGTTATTATGACCATAT--GCACTTGCATGCATTAACAAGTATGCATACGGAAACGTATAT-CATATTAGA---TAA-CCGTAAGTATGTGAACG-----TTATGTGA--TTAGCACTTACAATGGTTTGC----AG--TG---T-A---TT---ATCTTCACCATCACTCTATTG--CAT--TAATATGAGTTTCTCATTATAA-CATGTATTTTTC-AA-ATTGCAAATTCGCTATAGA
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Alignments
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Reference ( family-2249 ) : ATAATATCTTTATTTCCTCCAATAAGAAGATTACAACA---TGANAGCATACAGTTTATACAAGTGTGCAAGAAAGAAATCACATATGCGC-AA-TATTAACATATA--TACAAGAA-CAT-A---ACATN-TATACAATTGTAAGTTACAATGACCATATGC-CACTTGCATGCATTAACAAGCATGCATACGGAAACGTATAT-TATATTAGA---TAA-CCATAAGTATGTGAACGTT-AATTATGTGA--TTAGCGCTNACAATGGTTTGC----AG--TG---T-A---TT---ATCTTCGCCATCGCTCTATTG--CAT--TAATATGAGTTTCTCATTATAA-CATGTATTATTC-AA-ATTGCAAATTCGCTACAGACGACTCTTAC-CGAAACGAAACA-TAAGAATCAAGCAACGAA-AAANAGAGCAACTATTAATGCATGACTTGGTAAACTACTAGNGTAACTAATGTTTATTGAGACACATATTTTGCCCATGCCCAGTGGGTATGGGANAATATAAGCCCAACAAAGTCATCATACCTAGAGTTTAACACAGTTACAAGTGTCGGGCTTTTAATACCCAAGACCACATTCACCGCTGAATTTCTGTCCATATTGGCGATGCACGTGACTGCATCTTGACCAAATGTAAGTCTCATTTTTCTCAACAACACCTGACGTGAC------GTATGCATTTCGACACAATCTATTAGAAAACGATCTGTCAGGCAA-----ACATTACCAAAANATGTTTTGCATTTTATACAGA---TTTCATCGANACGTGTCAAATTGGCAA----TGAGTTTTA----CAATAGTT----TTACA-AAATATTAAATGCTTCGGATATTTAAAGGCATACTGCCAAATTTCGCCCACTTGATATTCGCAATGTACAGATCTGAAACGGTCAAATTCTGCTGATGCTATGCGTATCTGCCAATCATCGGTAACCTGTTGACAAATNCGATTTCTC
gi|1 : ATAATATCTTTATTTCCTCCAATAAGAAGATTACAACA---TGAAAGCATACAGTTTATACAAATGTGCAAGAAAGAAATCACATATGCGC-AA-TATTAACATTTA--TACAAAAA-CAC-A---ACATG-TATACAATTGTAAGTTATTATGACCATATACACACTTGCATGCATTAACAAGCATGCATGCGGAAACGTATAT-TATATTAGA---TAA-CCATAAGTATGTCAGCGTT-AATTATTTGA--TTAGCGCTAACAATGATTTGC----AG--TG---T-A---TT---ATCTTCGCCATCACTCTATTG--CAT--TAATATGAGTTTCTCATTATAA-CATGTATTATTC-GA-ATTGCAAATTCGCTACAGATAACTCTTAC-CGAAACGAAACA-TAAGAATCAAGCAGCGAA-AAAAAGAGCAACTATTAATGCATGACTTGGTAAACTACTAGAGTAACTAATGTTTATTGACACACATATGTTGCCCATGCCCAGTGGGTATGGGATAATATAAGCCCAACAACGTCATCATATCTAGAGTTTAACACAGTTACAAGTGTCGGGCTTTTAATACCCAAGACCACATTCACCACTGAATTTCTGTCCATTTTGGCGATACACGTGACTGCATCGTGACCAAATGTAAGTCTCATTTTTCTCAACAACACCTGACGTGAT------ATATGCATTTCGACACAATCTATTAGAAAATGATCTGTCAGGCAA-----ACATTACCAGTAAATGTTTTGCATTTTATACAGA---TTTCATTAAAACGTGTCAAATTGGCAA----TGAGTTTTA----CAATAGTT----TTACA-AAATATTAAATGCTTCGGATATTTAAAGGCATACTGCCAAATTTCGCCCACTTGAAATTCGCAATGTACAGATCTGAAACGGTCAAATTCTGCTGATGCTATGCGTATCTGCCAATCATTGGTAACCTGTTGACAAATTCTATTTCTC
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gi|13 : AAATATTAATGCATGGTTTGGTGAATTACTAGTTTATCTAATGTTTAGTGAGACCCATATTTTGGCCATGCCCAGTGAGTATGGGAACATGCAAGCCGAGCAAAATCATCAAACCCAGTATTTAACACAGTTATAGGTGTCCGTCTTTTAATGCCCAAAACCATATTTACCACTGATTTTCTGTTCATAATGGCGATGTACGTGACTGCATCTacttttgataagatggaaaaatgttataaacatagtattcatcaaggttaaatttgttcaatatattgatatcat
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gi|3 : ATACTATCTTTATTTCCTCCAATAAGAAGATTACAACA---TGAAAGCATACAGTTTATACAAATGTGCAAGAAAGAAATCACATATGCGC-AA-TATTAACATTTA--TACAAGAA-CAT-A---ACATG-TATACAATTGTAAGTTATTATGACCATATACACACTTACATACATTAACAAGCATGCATACGGAAACGTATAT-TATATTAGA---TAA-CCATAAGTATGTGAGCGTT-AATTATTTGA--TTAGCGCTAACAATGCTTTGC----AG--TG---T-A---TT---ATCTTCGCCATCACTCTATTG--CAT--TTATATGAGTTTCTCATTATAA-CATGTATTATTC-AA-ATTGCAAATTCGCTACAGATAACTCTTAC-CGAAACGAAACA-TAAGAATCAAGCAGCGAA-AAATAGAGCAACTATTAATGCATGACTTGGTAAACTACTAGAGTAACTAATGTTTATTGAGACACATATGTTGCCCATGCCCAGTGGGTATGGGATAATATAAACCCAACAAAGTCATCATATCTAGAGTTTAACACAGTTACAAGTGTCta
gi|3 : taCCGCTGAATTTCTGTCCATTTTGGCGATACACGTGACTGCATCGTGACCAAATGTAAGTCTCATTTTTCTCAACAACACCTGACGTGAC------GTATGCATTTCGACACAATCTATTAGAAAATGATCTGTCAGGCAA-----ACATTACCAAAACATGTTTTcgctgaatttctgtccattttggcgatacacgtgactgcatcgtgaccaaatgtaagtctcatttttctcaacaacacctgacgtgacgtatgcatttcgacacaatctattagaaaatgatctgtcaggcaaacattaccaaaacatgtttt
gi|4 : taatactatctttatttcctccaataagaagattacaacatgaaagcatacagtttatacaaatgtgcaagaaagaaatcacatatgcgcaatattaacatttatacaagaacataacatgtatacaattgtaagttattatgaccatatacacacttacatacattaacaagcatgcatacggaaacgtatattatattagataaccataagtatgtgagcgttaattatttgattagcgctaacaatgctttgcagtgtattatcttcgccatcactctattgcatttatatgagtttctcattataacatgtattattcaaattgcaaattcgctacagataactcttaccgaaacgaaacataagaatcaagcagcgaaaaatagagcaactattaatgcatgacttggtaaactactagagtaactaatgtttattgagacacatatgttgcccatgcccagtgggtatgggataatataaacccaacaaagtcatcatatctagagtttaacacagttacaagtgtTACATACCTTTATAAATTACTAGTTTGTCTAATGTTCACTGAGACACATATTCCGCCCATGCCCATTGCGTA-----CAACAAAAGTCCAACAAATTCATCATGCATAT-GTTGAACACAGTTACGA-TGTCGGGCTTTTAATGCCCAAGACCA---TCACCG---GGTGTCTATTTATATTGGCGATGCATGTGAATGCATCTAGACCAAAGGTAAGCCTTATTTTTATCATCAACAGCCGACTTCACATACATGTATGTATTACAACACAATCTGTT----AACAATTTATCCGACAAAAAATACATTGGCAAAGTGTGTTTTGCATTTTATACAAACAGTAACATCGAGACG----AAA--GGTAAGCCTTATTTTTTATCATCAATAGCTGACCTTACATAAATGT
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