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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                  CATGGATAAACATTAATCGTGGAATTTACAAGT---T----A------A-------CAAT-----AAAAAA-GTGC-ATT--TCA-CTGCTATTTT----TATTGC----AC---AGAATTAAACTATA----TTTATTT--ATT--CATGTGCG---AAAATTATA-----TTCTAATGCTTATGTTTTGCCACAT-TTTGC-CTA---CTGT--TGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCTCATGAATACTT--TAGTTAAACTT--CAAAAG--------AGA-------TCTTCTTA-AATTATCCTGGACAAAGAT-TATGACACACCGT--TCAGTGA-ACTATTTT-CCGAATGGAAATGGATGAACCTTCCTGGTACAG-TTGAATAT----CAAAAAGCAATACTAATG--TACAAAGTAATAAAAGGAAT-TTCACCACCT--TCCAATCG-GGTTCATTTAA----------GTGCATATATGAAATAC
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gi|9                          :          taaagtcatgctcattgcttcaaaacaagcattagctaaaatattgcaggaaccaccatttatactagcgaatgtcgtttcaatacaaatgtctgaaaatgaaaaactcttacaaattacCATAGATAAACATTTATCATGGAATTTAAAAGT--------AGAAAATA-------CAAT-----AAAGAA-GTTA-AAT--TTA-CTGCTGTTTT----TATTAA----AC---AGAATTAAACCATA----TTAATCA--ATT--tcaatcgtcaa
gi|12                         :                                                                                          cctatataattgtcaaaaaaaaaaaacacttaggaattacCATATATTAA-ATTTATCATGGAATT-----AT---T----A--------------CAAT-----AAAACC-GT---------CA-TTGCTGTTTT----AATGAA----AC---AGAATCAAACCATA----TTTATT
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gi|8                          :                                                                                                                                    acGATAAACTTTAACCATTGATTTT-CAAG---------A------AGAAAATACAAT-----A-AAAA-GTAC-ATT--TCATTTGCTGTTTC----TATGAA----AC---ATAATCAAACCATA----TTCAT
gi|5                          :               gaatttatgttcatttcttcaaaaacaagcattggctaagatattgcaagatccattgattatatgggcgaatgacgttccaatataatcgtttaaaaatgatttttttttaaattaccaaaAAACATTTATCATGGGTTTTACAAGC---C----G------AAAATA--CAAT-----AAAAAAAGTTC-AAT--TCT-CTGCTATTTT----TATTAA----AC---AGATTTAAACCATATAACTTTATATCAATT--CATGc
gi|1                          : atgtcatgttcattgcttcaaaactaaatttgcttcaaaattttatttaaaaattgcaggaaccaccaattatatttgcgaatgacgctccaattaaagtgtctgaaaacgatgaactcttaggaattaccacagtaAACATTTATCATGAATTCTATAAATATAT----A------ATT-----CAAT-----AAAAA--GTGA-AAT--TCA-TTGCTTATTT----TATTTA----AC---ATGATTAAACCATA----TGTATTA--AGT--AGTGTGCG---CAAATTAC------TTTTAAGGTTTTAGTGCAGTCATAT-TTT----TAATTCTGT--TCTT------CAACTT-AGGC--A----AATTGTTCTCCTGTTTCCATCAATTCAA--TAGTTAAACTTGATAAAAAATACTAGTAGACAAAATGTTTGCTAG-AATTATCTTCGACAACGATATA-GACACGCCGTTCTCTGTGT-ATTG-TTT-CCG--TTGGGTTGAATGGATTTTCCTGATAGAG-TTAGATAT----CAGTAAGTAATTCTAATG--TACAAAATA
gi|4                          :                      cgtaaggtgtgttgcttgtttttaaatcaagcactgaaatatttcaagatccacataatatatttaacgttttatgcattccaatacaattattaaaaaaagtgaaaataatacaaattactattaactGAGTTTATCAGT---TGG--A------A-------AAAT-----ATAAAA--CGT-AGT--TCG-TTGCTGTCGTAGTATATTAA----ACGGCAGAATCGAACCATA----TTTATCA--ATCGGCATTCGC-------ATT-T------TTTTAAATCTTACGTTATGCCACAT-TTGGA-ATA---TTGTCTTGTTGCTCAACAATTC-AGGG--G----AAT-GTGCTTCTGAACTCAAGAA-ATCTAATAGTAAAACT--------------------------------TTA-AAC------------AG-T-T-TGACACACTGT--CAAGTGACAC--TTTT-CTGAATTAGATTGGATGGAATTTCCCGATAGAGATTGA
gi|6                          :                                                                                                                                                             ATAAGT---A----G------A-------AAAT-----ACAATA-GGGCGATTACTTA-CTGC-----------ATTGGTGAAAC---ATGATTAAATTGTA----TTGATCA--ATT--CATGTATT---TTAATTAT-------TTTAATGCTTGTGTTTTACTACAT-TT----CAA---CTAT--TTGT------AAATTT-GGAC--AACATAATCGTATTTCTGACAGCATGAATCCTA--TAGg
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcATA-----TT--GATGCTTACGTTTTGACACAT-TTT---------------TGTT------CAATTT-GGAG--A----AATTGTTCTTCTGa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---CCGT--TGAT------CA-TAT-GGGGTTA----AA--GTAATTCTGATCATATGAACATTA--TAGTGAAACTT--TGAAAA--------CGA-------TA-TGTTACAGTTATCTT------AGAT-TTCAACACAGCAT--CCA--GA----ATTTTAACGAAATAAAATGGATGGAATTGCCTGAT-C------GATAT----CAAGATCCTATTTTGATG--CA-AAAATAATA----------TCACCTCCTTATCC--TCGCGACTGATTTAAACAAGCACATGTACATATATGAAG
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): CCTAAAGTTATGTGGTTATTTTTCAAAACAAACAGTAACTAAAATATTGC






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Reference ( family-2134 )     :                                                                                                                                          CATAGATAAACATTTATCATGGANTTT--ACAAGT----N---AA-----CAAT-----AAAAAA-GTGCAATTCA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCGTAT---T---TATCAATTCGTGTGCGCAAATTAT-------TTTTAATGCTTACGTTTTGTCACA-T-TT-NG-NTACTG--TTGNT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCNCATGAATNCT-ATAGTNAAACTT--TGAAA---------A-GA-------T----TT----A-AATTATCTTAG----A----GATTTCGACACACCGT--CCAGTGAACTNTTTTNCGAATTGGATTGGATGGAATTTCCTGATANAGTTAGATAT----CAANAANCAATTCTAATGCACAAAATAATAAATGAGATGTTCACCTCCTTATCC--TCGCGACTGATTTAAACAAGCACATGTACATATATGAAGT
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Reference ( family-2134 )     :                                                                                                                                          CATAGATAAACATTTATCATGGANTTT--ANAAGTAG----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCAATTCA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---TATCAATTCGTGTGCGCAAATTAT-------TTTTAATGCTTACGTTTTGCCACA-TTT-CG--ATACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCNCATGAATNCT-ATAGTNAAACTT--TAAAA--G--------AGA-------TTT--TA-AATTATCTTAG----A----GATTTCGACACACCGT--CCAGTGAACTNTTTTCCGAATTGAATTGGATGGAATTTCCTGATANAGTTAGATAT----CAAAAAGCAATTCTAATGCACAAAATAAT-AAA-GGGAT-TTCACCNCCTTATCCAATCGCGGCTNATTTAAACAAGCACATGTGCATATATGAAGT
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gi|5                          :                                                                                                                                                 AAACATTTATCATGGGTTTT--ACAAGCCG----AAAATACAAT-----A-AAAAAAGTTCAATTCT-CT-GCTATTTT----TATTAAAC---AGATTTAAACCATATAACTTTATATCAATTCATGattgag
gi|6                          : atgtcatgttcattgcttcaaaactaaatttgcttcaaaattttatttaaaaattgcaggaaccaccaattatatttgcgaatgacgctccaattaaagtgtctgaaaacgatgaactcttaggaattaccacagtaCATATATAAAAAGT-GCCATGGAT-------AAGTAG----A-----AAAT-----A-CAATA-GGGCGATT-A-CTTACTGCATT----GGTGAAAC---ATGATTAAATTGTAT---T---GATCAATTCATGTATTTTAATTAT--------TTTAATGCTTGTGTTTTACTACA-TTT-CA----ACTA--TTTGT------AAATTT-GGAC--AACATAATCGTATTTCTGACAGCATGAATCCT-ATAGCAAAGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atatctgcaaacgaaaatctcttgatgaagattaacCCG--TTGAT------CA-TAT-GGGGTTA----AA--GTAATTCTGATCATATGAACATT-ATAGTGAAACTT--TGAAAACG--------ATA-------TGT--TACAGTTATCTTAG----A------TTTCAACACAGCAT--CCAG--AA--TTTTAACGAAATAAAATGGATGGAATTGCCTGATC------GATAT----CAAGATCCTATTTTGATGCA-AAAATAAT-A----------TCACCTCCTTATCC--TCGCGACTGATTTAAACAAGCACATGTACATATATGAAGTc
gi|8                          :                                                                                                                                          CAAAGATAAACTTTAACCATTGATTTTCAAGAAGAAA----ATA---CAAT-----A--AAAA-GTACATTTCATTT-GCTGTTTC----TATGAAAC---ATAATCAAACCATAT---T---CATCg
gi|9                          :                    gaatttatgttcatttcttcaaaaacaagcattggctaagatattgcaagatccattgattatatgggcgaatgacgttccaatataatcgtttaaaaatgatttttttttaaattacCATAGATAAACATTTATCATGGAATTT--AAAAGTAG----AAAATACAAT-----A-AAGAA-GTTAAATTTA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---AATCAATT
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Reference ( family-2134 )     :                                                                                                                                          CATAGATAAACATTTATCATGGANTTT--ANAAGTAG----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCAATTCA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---TATCAATTCGTGTGCGCAAATTAT-------TTTTAATGCTTACGTTTTGCCACA-TTT-CG--ATACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCNCATGAATNCT-ATAGTNAAACTT--TAAAAGAGA--C-TNTTA-----------------AATTATCTTAG----A----GATTTCGACACACCGT--CCAGTGAACTNTTTTCCGAATTGAATTGGATGGAATTTCCTGATANAGTTAGATAT----CAAAAAGCAATTCTAATGCACAAAATAAT-AAA-GGGAT-TTCACCNCCTTATCCAATCGCGGCTNATTTAAACAAGCACATGTGCATATATGAAGT
gi|1                          :                                                                                                                                                  AACATTTATCATGAATTCT--ATAAATAT----A-----TAATTCA--ATAAAAA-GTGAAATTCA-TT-GCTTATTT----TATTTAAC---ATGATTAAACCATAT---G---TATTAAGTAGTGTGCGCAAATTAC-------TTTTAAGGTTTTAGTGCAGTCATATTTT-TA--ATTCTG--TTCTT------CAACTT-AGGC--A----AATTGTTCTCCTGTTTCCATCAATTCA-ATAGTTAAACTTGATAAAAAATA--C-TAGTAGACAAAATGTTTGCTAGAATTATCTTCG----ACAACGATATAGACACGCCGTTCTCTGTGTATTG-TTTCCG--TTGGGTTGAATGGATTTTCCTGATAGAGTTAGATAT----CAGTAAGTAATTCTAATGTACAAAATA
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gi|12                         :                                                                                                                                          CATATATTAA-ATTTATCATGGAATT------ATTA-----------CAAT-----A-AAACC-GT------CA-TT-GCTGTTTT----AATGAAAC---AGAATCAAACCATAT---T---TATa
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                       acCATAT---T---TATCAATTCGTGTG-GCAAATAAT-------TTTAAATGCTTACGTTTTGTCACA-TAT-TGGAATACT---TAGTT------CGATTT-GGGG--G----AATT
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gi|4                          :                                       taaagtcatgctcattgcttcaaaacaagcattagctaaaatattgcaggaaccaccatttatactagcgaatgtcgtttcaatacaaatgtctgaaaatgaaaaactcttacaaattacGAGTTT--ATCAGTTGGA--A-----AAAT-----A-TAAAA--CGTAGTTCG-TT-GCTGTCGTAGTATATTAAACGGCAGAATCGAACCATAT---T---TATCAATCGGCATTCGC--ATT-T-------TTTTAAATCTTACGTTATGCCACA-TTT-GGA-ATATTGTCTTGTTGCTCAACAATTC-AGGG--G----AA-TGTGCTTCTGAACTCAAGAAATCTAATAGTAAAACTT--TAAA---------------------------------------CAG------------TTTGACACACTGT--CAAGTG-ACACTTTTCTGAATTAGATTGGATGGAATTTCCCGATAGAG
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gi|6                          : atgtcatgttcattgcttcaaaactaaatttgcttcaaaattttatttaaaaattgcaggaaccaccaattatatttgcgaatgacgctccaattaaagtgtctgaaaacgatgaactcttaggaattaccacagtaCATATATAAAAAGT-GCCATGGAT-------AAGTAG----A-----AAAT-----A-CAATA-GGGCGATT-A-CTTACTGCATT----GGTGAAAC---ATGATTAAATTGTAT---T---GATCAATTCATGTATTTTAATTAT--------TTTAATGCTTGTGTTTTACTACA-TTT-CA----ACTA--TTTGT------AAATTT-GGAC--AACATAATCGTATTTCTGACAGCATGAATCCT-ATAGCAAAGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atatctgcaaacgaaaatctcttgatgaagattaacCCG--TTGAT------CA-TAT-GGGGTTA----AA--GTAATTCTGATCATATGAACATT-ATAGTGAAACTT--TGAAAACGA--TATGTTAC----------------AGTTATCTTAG----A------TTTCAACACAGCAT--CCAG--AA--TTTTAACGAAATAAAATGGATGGAATTGCCTGATC------GATAT----CAAGATCCTATTTTGATGCA-AAAATAAT-A----------TCACCTCCTTATCC--TCGCGACTGATTTAAACAAGCACATGTACATATATGAAGTc
gi|8                          :                                                                                                                                          CAAAGATAAACTTTAACCATTGATTTTCAAGAAGAAA----ATA---CAAT-----A--AAAA-GTACATTTCATTT-GCTGTTTC----TATGAAAC---ATAATCAAACCATAT---T---CATCg
gi|9                          :                    gaatttatgttcatttcttcaaaaacaagcattggctaagatattgcaagatccattgattatatgggcgaatgacgttccaatataatcgtttaaaaatgatttttttttaaattacCATAGATAAACATTTATCATGGAATTT--AAAAGTAG----AAAATACAAT-----A-AAGAA-GTTAAATTTA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---AATCAATT
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Reference ( family-2134 )     :                                                                                                                                          CATAGATAAACATTTATCATGGANTTT--ANAAGTAG----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCAATTCA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---TATCAATTCGTGTGCGCAAATTAT-------TTTTAATGCTTACGTTTTGCCACA-TTT-CG--ATACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCNCATGAATNCT-ATAGTNAAACTT--TAAAAA--------AGA--------T-TNTTA-AATTATCTTAG----A----GATTTCGACACACCGT--CCAGTGAACTNTTTTCCGAATTGAATTGGATGGAATTTCCTGATANAGTTAGATAT----CAAAAAGCAATTCTAATGCACAAAATAAT-AAA-GGGAT-TTCACCNCCTTATCCAATCGCGGCTNATTTAAACAAGCACATGTGCATATATGAAGT
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gi|12                         :                                                                                                                                          CATATATTAA-ATTTATCATGGAATT------ATTA-----------CAAT-----A-AAACC-GT------CA-TT-GCTGTTTT----AATGAAAC---AGAATCAAACCATAT---T---TATa
gi|13                         :                                                                                                                         aaactctaagaatttgcCATAGATTAGCATGTATCGTGTAATTT--TAAAGTAGAAAAA-----CAAT-------AAAGA-GTGCAATTCA-C-------------------AAC---ATAATTAAACCATAT---A---TATCAATTCATt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                       acCATAT---T---TATCAATTCGTGTG-GCAAATAAT-------TTTAAATGCTTACGTTTTGTCACA-TAT-TGGAATACT---TAGTT------CGATTT-GGGG--G----AATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTGATGCTTACGTTTTGACACA-TTT-------------TTGTT------CAATTT-GGAG--A----AATTGTTCTTCTGa
gi|2                          :                                                                                                                                       ataCATGGATAAACATTAATCGTGGAATTT--ACAAGTTA----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCATTTCA-CT-GCTATTTT----TATTGCAC---AGAATTAAACTATAT---T---TATTTATTCATGTGCGAAAATTATA------TTCTAATGCTTATGTTTTGCCACA-TTT-TGC-CTACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCTCATGAATACT-TTAGTTAAACTT--CAAAAG--------AGATC------T-TCTTA-AATTATCCTGGACAAA----GATTATGACACACCGT--TCAGTGAACTATTTTCCGAATGGAAATGGATGAACCTTCCTGGTACAGTTGAATAT----CAAAAAGCAATACTAATGTACAAAGTAATAAAA-GGAAT-TTCACCACCT--TCCAATCG-GGTTCATTTAA----------GTGCATATATGAAAT
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gi|4                          :                                       taaagtcatgctcattgcttcaaaacaagcattagctaaaatattgcaggaaccaccatttatactagcgaatgtcgtttcaatacaaatgtctgaaaatgaaaaactcttacaaattacGAGTTT--ATCAGTTGGA--A-----AAAT-----A-TAAAA--CGTAGTTCG-TT-GCTGTCGTAGTATATTAAACGGCAGAATCGAACCATAT---T---TATCAATCGGCATTCGC--ATT-T-------TTTTAAATCTTACGTTATGCCACA-TTT-GGA-ATATTGTCTTGTTGCTCAACAATTC-AGGG--G----AA-TGTGCTTCTGAACTCAAGAAATCTAATAGTAAAACTT--TAAA-------------------------------------CAG------------TTTGACACACTGT--CAAGTG-ACACTTTTCTGAATTAGATTGGATGGAATTTCCCGATAGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                 AAACATTTATCATGGGTTTT--ACAAGCCG----AAAATACAAT-----A-AAAAAAGTTCAATTCT-CT-GCTATTTT----TATTAAAC---AGATTTAAACCATATAACTTTATATCAATTCATGattgag
gi|6                          : atgtcatgttcattgcttcaaaactaaatttgcttcaaaattttatttaaaaattgcaggaaccaccaattatatttgcgaatgacgctccaattaaagtgtctgaaaacgatgaactcttaggaattaccacagtaCATATATAAAAAGT-GCCATGGAT-------AAGTAG----A-----AAAT-----A-CAATA-GGGCGATT-A-CTTACTGCATT----GGTGAAAC---ATGATTAAATTGTAT---T---GATCAATTCATGTATTTTAATTAT--------TTTAATGCTTGTGTTTTACTACA-TTT-CA----ACTA--TTTGT------AAATTT-GGAC--AACATAATCGTATTTCTGACAGCATGAATCCT-ATAGCAAAGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atatctgcaaacgaaaatctcttgatgaagattaacCCG--TTGAT------CA-TAT-GGGGTTA----AA--GTAATTCTGATCATATGAACATT-ATAGTGAAACTT--TGAAAA--------CGA--------TATGTTACAGTTATCTTAG----A------TTTCAACACAGCAT--CCAG--AA--TTTTAACGAAATAAAATGGATGGAATTGCCTGATC------GATAT----CAAGATCCTATTTTGATGCA-AAAATAAT-A----------TCACCTCCTTATCC--TCGCGACTGATTTAAACAAGCACATGTACATATATGAAGTc
gi|8                          :                                                                                                                                          CAAAGATAAACTTTAACCATTGATTTTCAAGAAGAAA----ATA---CAAT-----A--AAAA-GTACATTTCATTT-GCTGTTTC----TATGAAAC---ATAATCAAACCATAT---T---CATCg
gi|9                          :                    gaatttatgttcatttcttcaaaaacaagcattggctaagatattgcaagatccattgattatatgggcgaatgacgttccaatataatcgtttaaaaatgatttttttttaaattacCATAGATAAACATTTATCATGGAATTT--AAAAGTAG----AAAATACAAT-----A-AAGAA-GTTAAATTTA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---AATCAATT
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Reference ( family-2134 )     :                                                                                                                                          CATAGATAAACATTTATCATGGANTTT--ANAAGTAG----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCAATTCA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---TATCAATTCGTGTGCGCAAATTAT-------TTTTAATGCTTACGTTTTGCCACA-TTT-CG--ATACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCNCATGAATNCT-ATAGTNAAACTT--TAAAAA--------AGA-C-------TTGTTA-AATTATCTTAG----A----GATTTCGACACACCGT--CCAGTGAACTNTTTTCCGAATTGAATTGGATGGAATTTCCTGATANAGTTAGATAT----CAAAAAGCAATTCTAATGCACAAAATAAT-AAA-GGGAT-TTCACCNCCTTATCCAATCGCGGCTNATTTAAACAAGCACATGTGCATATATGAAGT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                           caTTT----TATCAAGC---AGAAACATACTGTAT---T---TATTAATGTGTGTGAGCAAAAAAG-------TGTTTATGCTTGCATTTTGTCACA-TTTGCA--CTACTG--TTGAT------CAATTTGGGGG--A----AATTCTT
gi|12                         :                                                                                                                                          CATATATTAA-ATTTATCATGGAATT------ATTA-----------CAAT-----A-AAACC-GT------CA-TT-GCTGTTTT----AATGAAAC---AGAATCAAACCATAT---T---TATa
gi|13                         :                                                                                                                         aaactctaagaatttgcCATAGATTAGCATGTATCGTGTAATTT--TAAAGTAGAAAAA-----CAAT-------AAAGA-GTGCAATTCA-C-------------------AAC---ATAATTAAACCATAT---A---TATCAATTCATt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                       acCATAT---T---TATCAATTCGTGTG-GCAAATAAT-------TTTAAATGCTTACGTTTTGTCACA-TAT-TGGAATACT---TAGTT------CGATTT-GGGG--G----AATT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTGATGCTTACGTTTTGACACA-TTT-------------TTGTT------CAATTT-GGAG--A----AATTGTTCTTCTGa
gi|2                          :                                                                                                                                       ataCATGGATAAACATTAATCGTGGAATTT--ACAAGTTA----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCATTTCA-CT-GCTATTTT----TATTGCAC---AGAATTAAACTATAT---T---TATTTATTCATGTGCGAAAATTATA------TTCTAATGCTTATGTTTTGCCACA-TTT-TGC-CTACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCTCATGAATACT-TTAGTTAAACTT--CAAAAG--------AGATC-------TTCTTA-AATTATCCTGGACAAA----GATTATGACACACCGT--TCAGTGAACTATTTTCCGAATGGAAATGGATGAACCTTCCTGGTACAGTTGAATAT----CAAAAAGCAATACTAATGTACAAAGTAATAAAA-GGAAT-TTCACCACCT--TCCAATCG-GGTTCATTTAA----------GTGCATATATGAAAT
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gi|4                          :                                       taaagtcatgctcattgcttcaaaacaagcattagctaaaatattgcaggaaccaccatttatactagcgaatgtcgtttcaatacaaatgtctgaaaatgaaaaactcttacaaattacGAGTTT--ATCAGTTGGA--A-----AAAT-----A-TAAAA--CGTAGTTCG-TT-GCTGTCGTAGTATATTAAACGGCAGAATCGAACCATAT---T---TATCAATCGGCATTCGC--ATT-T-------TTTTAAATCTTACGTTATGCCACA-TTT-GGA-ATATTGTCTTGTTGCTCAACAATTC-AGGG--G----AA-TGTGCTTCTGAACTCAAGAAATCTAATAGTAAAACTT--TAAA-------------------------------------CAG------------TTTGACACACTGT--CAAGTG-ACACTTTTCTGAATTAGATTGGATGGAATTTCCCGATAGAG
gi|5                          :                                                                                                                                                 AAACATTTATCATGGGTTTT--ACAAGCCG----AAAATACAAT-----A-AAAAAAGTTCAATTCT-CT-GCTATTTT----TATTAAAC---AGATTTAAACCATATAACTTTATATCAATTCATGattgag
gi|6                          : atgtcatgttcattgcttcaaaactaaatttgcttcaaaattttatttaaaaattgcaggaaccaccaattatatttgcgaatgacgctccaattaaagtgtctgaaaacgatgaactcttaggaattaccacagtaCATATATAAAAAGT-GCCATGGAT-------AAGTAG----A-----AAAT-----A-CAATA-GGGCGATT-A-CTTACTGCATT----GGTGAAAC---ATGATTAAATTGTAT---T---GATCAATTCATGTATTTTAATTAT--------TTTAATGCTTGTGTTTTACTACA-TTT-CA----ACTA--TTTGT------AAATTT-GGAC--AACATAATCGTATTTCTGACAGCATGAATCCT-ATAGCAAAGC
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gi|8                          :                                                                                                                                          CAAAGATAAACTTTAACCATTGATTTTCAAGAAGAAA----ATA---CAAT-----A--AAAA-GTACATTTCATTT-GCTGTTTC----TATGAAAC---ATAATCAAACCATAT---T---CATCg
gi|9                          :                    gaatttatgttcatttcttcaaaaacaagcattggctaagatattgcaagatccattgattatatgggcgaatgacgttccaatataatcgtttaaaaatgatttttttttaaattacCATAGATAAACATTTATCATGGAATTT--AAAAGTAG----AAAATACAAT-----A-AAGAA-GTTAAATTTA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---AATCAATT
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Reference ( family-2134 )     :                                                                                                                                          CATAGATAAACATTTATCATGGANTTT--ANAAGTAG----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCAATTCA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---TATCAATTCGTGTGCGCAAATTAT-------TTTTAATGCTTACGTTTTGCCACA-TTT-CG--ATACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCNCATGAATNCT-ATAGTNAAACTT--TAAAAA--------AGA-C-------TTGTTA-AATTATCTTAG----A----GATTTCGACACACCGT--CCAGTGAACTNTTTTCCGAATTGAATTGGATGGAATTTCCTGATANAGTTAGATAT----CAAAAAGCAATTCTAATGCACAAAATAAT-AAA-GGGAT-TTCACCNCCTTATCCAATCGCGGCTNATTTAAACAAGCACATGTGCATATATGAAGT
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gi|5                          :                                                                                                                                                 AAACATTTATCATGGGTTTT--ACAAGCCG----AAAATACAAT-----A-AAAAAAGTTCAATTCT-CT-GCTATTTT----TATTAAAC---AGATTTAAACCATATAACTTTATATCAATTCATGattgag
gi|6                          : atgtcatgttcattgcttcaaaactaaatttgcttcaaaattttatttaaaaattgcaggaaccaccaattatatttgcgaatgacgctccaattaaagtgtctgaaaacgatgaactcttaggaattaccacagtaCATATATAAAAAGT-GCCATGGAT-------AAGTAG----A-----AAAT-----A-CAATA-GGGCGATT-A-CTTACTGCATT----GGTGAAAC---ATGATTAAATTGTAT---T---GATCAATTCATGTATTTTAATTAT--------TTTAATGCTTGTGTTTTACTACA-TTT-CA----ACTA--TTTGT------AAATTT-GGAC--AACATAATCGTATTTCTGACAGCATGAATCCT-ATAGCAAAGC
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gi|9                          :                    gaatttatgttcatttcttcaaaaacaagcattggctaagatattgcaagatccattgattatatgggcgaatgacgttccaatataatcgtttaaaaatgatttttttttaaattacCATAGATAAACATTTATCATGGAATTT--AAAAGTAG----AAAATACAAT-----A-AAGAA-GTTAAATTTA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---AATCAATT


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Reference ( family-2134 )     :                                                                                                                                          CATAGATAAACATTTATCATGGANTTT--ANAAGTAG----A-----CAAT-----A-AAAAA-GTGCAATTCA-CT-GCTGTTTT----TATTAAAC---AGAATTAAACCATAT---T---TATCAATTCGTGTGCGCAAATTAT-------TTTTAATGCTTACGTTTTGCCACA-T-TT-NG-NTACTG--TTGTT------CAATTT-GGGG--A----AATTGTTCTTCTGATCNCATGAATNCT-ATAGTNAAACTT--TAAAAA--------AGA-C-------TTGTTA-AATTATCTTAG----A----GATTTCGACACACCG---TCCAG-GA-A-C--T-TTTC--CGAATTGAATTGGATGGAATTTCCTGATANAGTTAGATAT----CAAAAAGCAATTCTAATGCACAAAATAAT-AAA-GGGAT-TTCACCNCCTTATCCAATCGCGGCTNATTTAAACAAGCACATGTGCATATATGAAGT
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gi|6                          : atgtcatgttcattgcttcaaaactaaatttgcttcaaaattttatttaaaaattgcaggaaccaccaattatatttgcgaatgacgctccaattaaagtgtctgaaaacgatgaactcttaggaattaccacagtaCATATATAAAAAGT-GCCATGGAT-------AAGTAG----A-----AAAT-----A-CAATA-GGGCGATT-A-CTTACTGCATT----GGTGAAAC---ATGATTAAATTGTAT---T---GATCAATTCATGTATTTTAATTAT--------TTTAATGCTTGTGTTTTACTACA-T-TT-CA---ACTA--TTTGT------AAATTT-GGAC--AACATAATCGTATTTCTGACAGCATGAATCCT-ATAGCAAAGC
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