lowQualScore : 6 0
lowQualScore : . .
lowQualScore : 0 2
consensus : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
Reference ( gi|15 ) : GTTTGCGTTCGTTTAGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
gi|9 : GTTTGTGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACAGTCT
gi|7 : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACAGATTATGGTCTat
gi|13 : GTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTGAACGGATTACGGTCtt
gi|8 : GTTTGCGTTCATTTGGTGTACTGGAACTGATTACGGTCTa
gi|2 : GTTTGTGTTCGTTTGGTGTACTAAAACGGATGACGGTCTgt
gi|12 : GTTTGCTTTTGGTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCTgta
gi|4 : GTTTGGGTTCGTTTGGTGTACTAGAATGGACTATGGTCg
gi|6 : GTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTAAACTGATTACGGTCTcgta
gi|1 : GTTTGCGTTCATTTGGCGTTCTAGAACTTATTACGGTCTgt
gi|16 : GTTTGCATCCGTTTGGTGTACTTGAACTGATAACGGTgtaag
gi|11 : cTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGACTATGGTCT
gi|3 : TTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAATAGATTACGGTCTgt
gi|10 : aTTTGTGTTCGTTTGGTTTACTAGAACAGATTATGGTCTgta
gi|14 : TTTACGTTCGTTTGGTGCACTCGAACGGATTACAGTCgta
gi|5 : caTTTATGTTCGCTTGGAGTACTAGAATGGATTACGGTCT
gi|17 : TTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTTAACAGATTACgtaa
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
Reference ( family-2124 ) : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
gi|1 : GTTTGCGTTCATTTGGCGTTCTAGAACTTATTACGGTCT
gi|10 : TTTGTGTTCGTTTGGTTTACTAGAACAGATTATGGTCTgtaag
gi|11 : TTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGACTATGGTCTgta
gi|12 : GTTTGCTTTTGGTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCTgt
gi|13 : GTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTGAACGGATTACGGTCg
gi|14 : TTTACGTTCGTTTGGTGCACTCGAACGGATTACAGTCa
gi|15 : caGTTTGCGTTCGTTTAGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
gi|16 : GTTTGCATCCGTTTGGTGTACTTGAACTGATAACGGT
gi|17 : cTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTTAACAGATTAC
gi|2 : aGTTTGTGTTCGTTTGGTGTACTAAAACGGATGACGGTCT
gi|3 : TTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAATAGATTACGGTCTgta
gi|4 : aGTTTGGGTTCGTTTGGTGTACTAGAATGGACTATGGTCgta
gi|5 : TTTATGTTCGCTTGGAGTACTAGAATGGATTACGGTCTcgta
gi|6 : GTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTAAACTGATTACGGTCTgtaa
gi|7 : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACAGATTATGGTCTgt
gi|8 : GTTTGCGTTCATTTGGTGTACTGGAACTGATTACGGTCTtt
gi|9 : GTTTGTGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACAGTCTgt
blockSeqCons :
originalCons : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
finalCons : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
Reference ( family-2124 ) : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
gi|1 : GTTTGCGTTCATTTGGCGTTCTAGAACTTATTACGGTCT
gi|10 : TTTGTGTTCGTTTGGTTTACTAGAACAGATTATGGTCTgtaag
gi|11 : TTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGACTATGGTCTgta
gi|12 : GTTTGCTTTTGGTTGGTGTACTAGAACGGATTACGGTCTgt
gi|13 : GTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTGAACGGATTACGGTCg
gi|14 : TTTACGTTCGTTTGGTGCACTCGAACGGATTACAGTCa
gi|15 : caGTTTGCGTTCGTTTAGTGTACTAGAACGGATTACGGTCT
gi|16 : GTTTGCATCCGTTTGGTGTACTTGAACTGATAACGGT
gi|17 : cTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTTAACAGATTAC
gi|2 : aGTTTGTGTTCGTTTGGTGTACTAAAACGGATGACGGTCT
gi|3 : TTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAATAGATTACGGTCTgta
gi|4 : aGTTTGGGTTCGTTTGGTGTACTAGAATGGACTATGGTCgta
gi|5 : TTTATGTTCGCTTGGAGTACTAGAATGGATTACGGTCTcgta
gi|6 : GTTTGCGTCCGTTTGGTGTACTTAAACTGATTACGGTCTgtaa
gi|7 : GTTTGCGTTCGTTTGGTGTACTAGAACAGATTATGGTCTgt
gi|8 : GTTTGCGTTCATTTGGTGTACTGGAACTGATTACGGTCTtt
gi|9 : GTTTGTGTTCGTTTGGTGTACTAGAACGGATTACAGTCTgt