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lowQualScore                  :         .............   .  ........   .               .      ..  ................................................................ . .                   . .   .      ...  .       .        .         .........    .......              ..     ..  ....  .  ..............   ..  . .  .........    .  ..      .          .    .     .    . .        . .   .             .  .   .        .    .    .             ..........................................    ...         ..     .   ..                     .                    .                   .       
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consensus                     :   TATACA---AT---TGACTTTGACT------GAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAA-------A-GTGA------------AA-C-------GAA-------GTCCGAGGTCAAT-A-TCACTTTTCTCAGGTCCATAGAAC-TACATATTCACCG-AAG-CAAAGTCTATAATTAT-TATATCATA------TGTGTAAT-AGT--TATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---AT-TTTCATTAA-T---GGTTA--AA-AAAT--CGTT---TTTT-CT--TCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAAT---------AT--A-TT-C---C----A-A----------GACC-TCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
Reference ( gi|1 )            :   TATACA---AT---TG---TTGACT------AAGGTAAATATGTAGTTCTATAGACCTGGGAAG-------A-GTGA--------G---AA-C-------AAA-------GTCCGAGGTCAAT-A-TCACTTTTCTCAGGTCCATAGAAC-TTCATTTTCACCG-AAG-CAAAGTCTATAATTAT-TATATCATA------CGAGTAAA-AAT--TATAAAATAAGAAGTTTTTAA--GTA---AT-TTACATTAA-T---GGTTA--AA-AAAT--CGTG---TTTT-CT--TCTGTTCACTTTCCATCCTGCAGCAGACGACTGGTATGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTTCTTTTTAACAGCGTCATGAACATTAGACGCTTGTAAGAA---------------A-T-------------A----------GACC-CAAACAGCGGTTGATATCGCTTGAAGCGGACTTTTCATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTGCTGATTTGATATGGGCATATGATATTATTTG
gi|3                          :   TATACA---ATAATTAACTTTGACT------GAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGCGAA--------------------------------------AA-------GT--GATGTCA-----------------GGTCCCTAGAAC-TACATATTCACCG-CAG-CAAAATCTATATTTAT-GATAGCATA------TGTGTAAT-TGT--TATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATGCAGATCTTAAGTT---T---TTTTA--AAGAAAT--C-----------CT--TCTGTTTAC----CATCTTGCACCAGAC---TGTTGTGAATGACTTTCCTTTGTTTATAGCGGTGATATTTTACAGCATCGTGAAAATTACCCGCTTGTAAGAA---------------AGTTCATGCCAATAA-A----------GACT-TCAACAACTGTCAATATC---TG-AGCGGACGTTTCAT-TAA-CCATTTTGACCAATAATAATTGTGGGGTTGATATGGGTATATGCTATTAT
gi|6                          : acTATACATTTAC---TGACTTTGATT------GCGGTGAATGTATAGTCC-ATGGACCTGAGAAA-------A-GTG-----------------------------------TTCG---TC-------CTCTTTTCTCAGGAACATAGAAC-TACATGTTAACCG-AAG-CAAAGTCTATAATTAC-TATATCATA------TGTGTAGT-AGT--TATAAAAT---AAGTGTTT-A--GTC---AT-TTTCATT-A-T----------------T--CGTGTTTTTTT-CT--TCTGTTTAGTTTCAACCTTGCACCAGAAGACTGTTATAAATGAC-------TGTTTATAACGGTGCTGTTTTACCGTGTCGTAAAAATTACACGCATGTAAGAA---------------A-T-------------
gi|3                          :   aATATAG--AT---T----TTG-CT------GCGGTGAATATGTAGTTCTAGGGACCTG-------------------------------A-C-------A-----------------TCA--------CTTTTCGCAGGTCCATAGAAC-TACATATTCACCT-CAGTCAAAGT---TAATTAT-TGTAT
gi|10                         : actATACA---AT---TA---TTGACTTTGGCTGAGATGAATATGTAGTTTCATCGACCTGttatgatagcatatgtgtaattgttataaaataaggcgaatttaaatgcagatcttaagtttttttaaagaaatccttctgtttaccatcttgcaccagactgttgtgaatgactttcctttgtttatagcggtgatattttacagcatcgtgaaaattacccgcttgtaagaaagttcatgccaataaagacttcaacaactgtcaatatctgagcggacgtttcattaaccattttgaccaataataattgtggggttgatatgggtatatgctattat
gi|9                          :         ---AT---TGACTTTGACT------GAGGTGAAAATGCAATTGTATAGACCTGAGAAC-------A-GTGATATTTACCG---AAGC-------AAA-------GTCataaagggatattcacctaagcaaagtctataattattatatcataattttatgtgttataggtataaaataaggcgaatttaaat
gi|4                          :                               caattGGTGAATACATAGCTCTATGGACCTGAGAAA-------A-GTGA--------T---AATC-----------------GTCCTCGGTCAAT-A-TCATATCTTTCAGGTTCATAGAAC-TACATtataattattgtatcatatatgtaaatagttataaaataaggagtttttaagtaattttcattaagggttgaaatatctc
gi|6                          :                                    GGTTAACATGTAGTTCTATGTTCCTGAGAAA-------A-G--A--------G---GA-C-------GAA------------------------CACTTTTCTCAGGTCCAT-GGAC-TATACATTCACCGCAAT-CAAAGTCAGTAA--ATGTATATatagtataaaataagaggtgttcaagtaattttcattaatggttaaaacatttcgttgtttcttctgttgactttccatcttgcaccagactactgttgtgaatggctttgtttatagcggtgctattttgcagcgtcgtgataattacacgcttgtaagaaattgcatgcctattataaacctcaatggcggtcaatgtcactttgagcgtacttttcatgtgaccacttttgagcaataagaattgcggatttgatatgggcatatgatatattataat
gi|11                         :                                    GGTGAATATGTAGTTCTATTGACCTGgaagcaaagtctataattactatatcatatgtgtagtagttataaaataagtgtttagtcattttcattattcgtgtttttttcttctgtttagtttcaaccttgcaccagaagactgttataaatgactgtttataacggtgctgttttaccgtgtcgtaaaaattacacgcatgtaagaaat
gi|4                          :                                         ATATGTAGTTCTATGAACCTGA-AAG-------ATATGA--------T---AT-T-------GA----------CCGAGGACGATTA-TCACTTTTCTCAGGTCCATAGAGC-TATGTATTCACCgaagcaaaatctataattattatatcatatgtgtagtagttataaaataaggcgaatttaaacgttgatcttaagtttttaagga
gi|2                          :                                          TATGTAGTTCTATGGACCTTAAAAA-------A-GTGA--------TTTTAA-CCGACGAGGAA-------GTCTGAGGCCAAT-AATTAAATTTCTCAGGTCCATAGAAT-TACAGT------------CAAAGTATATAATTAT-TATATCATA------TGTGTAAT-AGT--TATAAAATAAGGAGAATTTAAACGTG---AT-CT----TAAGT---TCTTATTAA-AAAT--CGTT---TTTT-CT--TCTGTTTCCTTTCCATCTTGCACCAGATGGCTGTTGTAAATGACCTCCCTTTGTTTATAATGGTGCTATATTACAATGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAATTTCATGCCTAT--A-T-------------A----------GACC-TCAACAGTGGTCAATATCACTTTGAGCTGACTTTTCATGTGACCACTTTTGACCAATAAGAATTGTGGATTTGATATTGGCATATGGTATagtataaaataagaggtgttcaagtaattttcattaatggttaaaacatttcgttgtttcttctgttgactttccatcttgcaccagactactgttgtgaatggctttgtttatagcggtgctattttgcagcgtcgtgataattacacgcttgtaagaaattgcatgcctattataaacctcaatggcggtcaatgtcactttgagcgtacttttcatgtgaccacttttgagcaataagaattgcggatttgatatgggcatatgatatattataat
gi|2                          :                                            TGTAATTCTATGGACCTGAGAAATTTAATTA-TTGG--------C---CT-C-------AGACTTCCTCGTC---GGTTAAA-A-TCACTTTTTTAAGGTCCATAGAAC-TACAT
gi|10                         :                                                                                                                     tAGGTGAAT-A-TC-CCTTTATCAGGTCGATGAAAC-TACATATTCATCT-CAGCCAAAGTCAATAATTGT-gtcaaagtatataattattatatcatatgtgtaatagttataaaataaggagaatttaaacgtgatcttaagttcttattaaaaatcgttttttcttctgtttcctttccatcttgcaccagatggctgttgtaaatgacctccctttgtttataatggtgctatattacaatgtcgtgaaaattacacgcttgtaagaaatttcatgcctatatagacctcaacagtggtcaatatcactttgagctgacttttcatgtgaccacttttgaccaataagaattgtggatttgatattggcatatggtat
gi|9                          :                                                                                                                     atGGTAAAT-A-TCACTGTTCTCAGGTCTATACAAT-TGCATTTTCACCT-CAGTCAAAGTCAATAATTaagcaaagtctataattattatatcataattttatgtgttataggtataaaataaggcgaatttaaat
gi|11                         :                                                                                                                                          cCAGGTCAATAGAAC-TACATATTCACCG-AAG-CAAAATCTATAATTAT-TATATCATA------TGTGTAGT-AGT--TATAAAATAAGgaagcaaagtctataattattgtatcatatatgtaaatagttataaaataaggagtttttaagtaattttcattaagggttgaaatatctc
gi|9                          :                                                                                                                                                    AGAACAGTGATATTTACCG-AAG-CAAAGTCTATAATTAT-TGTATCATA------TATGTAAATAGT--TATAAAATAAGGAGTTTTTAA--GTA---AT-TTTCATTAA-G---GGTTG--AA-ATAT--Cgcgaatttaaacgttgatcttaagtttttaagga
gi|10                         :                                                                                                               caattattgactttgactgaggtgaaaatgcaattgtatagacctgATATTCACCT-AAG-CAAAGTCTATAATTAT-TATATCATAATTTTATGTGTTAT-AGG--TATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATtc
gi|4                          :                                                                                                                                        atacaattattgactttggctgagatgaatatgtagtttcatcgacctgataaagggTCATA------GAACTACA-TATAGTATAAAATAAGAGGTGTTCAA--GTA---AT-TTTCATTAA-T---GGTTA--AA-ACATTTCGTT---GTTT-CT--TCTGTTGACTTTCCATCTTGCACCAGACTACTGTTGTGAATGGCTT-----TGTTTATAGCGGTGCTATTTTGCAGCGTCGTGATAATTACACGCTTGTAAGAAATTGCATGCCTATT-A-T-------------A----------AACC-TCAATGGCGGTCAATGTCACTTTGAGCGTACTTTTCATGTGACCACTTTTGAGCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATA-TATT
gi|5                          :                                                                                                                                                               ggtgaatacatagctctatggacctgagaaaagtgataatcgtcctcggtcaatatcatatctttcaggtAAGTTTTAAA--ACC---AT-TTTCAT-AA-TTTGGGTTAG-AA-AAAT--CCTT---TTTTTCT--TCTGTTTACTTTCTATCTTGC-TTAGACGACTATTCTTAATTCCTTCCCTATGTT-ATACCTGTGCTATTTTACAGCGTCATGAAAATTACACGCTTGTAAGAAATATTTCATGCATATA-T-------------A----------GACC-ATAACAGCGATCAATATTATTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCTCTTTTGACCAATAAGAATTGGGGATTTGATACGGGCATATGATATataat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                ataaggctaatttaaatgttgatcttTTTAA--GTC---AT-TTTCATTAT-T---GGTTA--AA-AAAAA-CGAG---TTTT-TTATTCTGTTTACTTTGCATCTTACATCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCATAATAAATACACGCTTATAAGAA---------------A-TTTC----------ATGCCTATATTGACC-TCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGAATTTTCATGTGACTGCTTTTGACTAATAGGAATTGCAGATTTGATGTGGGCATATGACATTGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCTTTGTTTATAACGGTGCTGTTTTACGGCGCCAAGAACATAACACGCTTGTAAGAA---------------A-TTGCATGCCTATATA----------GACCTCAAA-AGCTGTTAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGAACCCTTTTGACAAATAAGAATTGCGGATTTGATACGGGCTTATGATAataa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTGA--GCATCGTGAAATTTACACTCTTGTAAGAA---------------A-TTGCATGCCTATATA----------GACC-GCAACAGCGGTCAAAATCACTTTGAGCGGACaaat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taaattgtgctaCAGCGGCCAAAATCACTTTGAGCGAACTTTTCATGTGACTCTATTTGACCAGTACAAATTGCAGATTTGATATAGGCATATGGTATAAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTGA-GCGGACTTTTTATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTCCGGATATTATATGGGCATATGATAatc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGACTTTCGGATTAGATATAGACATATGCTATTaacat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aTTTCATGCGACCCTTTTAGACCAATAAGAATTGCGGATTCTATAAGGGTATATGCTATTt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGAGTTTTATCAGTAAGTTTTCCTATATATTACCATATTTATTTTGTTCTCATGT






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consensus                     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT----AA-C-------GAAGTCCGAGGTCAATA-TCACNTTTCTCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-T---NC----ATGC---C----ATAT--A----GACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
Reference ( family-2090 )     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGA-----AA-C-------GAAGTCCGAGGTCAATA-TCACTTTTCTCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-T---AT----ATTC---C----A-----A----GACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
gi|1                          :                            TATACA---AT---T---G---TTGACTAAGGTAAATATGTAGTTCTATAGACCTGGGAAGAGTGAG----AA-C-------AAAGTCCGAGGTCAATA-TCACTTTTCTCAGGTCCATAGAACTTCATTTTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TACGAGTAA-AAATTATAAAATAAGAAGTTTTTAA--GTA---ATTTACA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TGTTTT-CTTCTGTTCACTTTCCATCCTGCAGCAGACGACTGGTATGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTTCTTTTTAACAGCGTCATGAACATTAGACGCTTGTAAGAAA-T---------------------------A----GACCCAAACAGCGGTTGATATCGCTTGAAGCGGACTTTTCATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTGCTGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
gi|10                         :                             ATACA---AT---TATTGACTTTGGCTGAGATGAATATGTAGTTTCATCGACCTGATAAAGGtg
gi|10                         :                                                                                                                                                           ATATTCACCTAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCATAATTTTATGTGTTA-TAGGTATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATgatattcacctaagcaaagtctataattattatatcataattttatgtgttataggtataaaataaggcgaatttaaat
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGCTATTTTTGAGCATCGTGAAATTTACACTCTTGTAAGAAATT---GC----ATGC---CT---ATAT--A----GACCGCAACAGCGGTCAAAATCACTTTGAGCGGACacgttgatcttaagtttttaagga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taaattCAGCGGCCAAAATCACTTTGAGCGAACTTTTCATGTGACTCTATTTGACCAGTACAAATTGCAGATTTGATATAGGCATATGGTATAAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTGAGCGGACTTTTTATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTCCGGATATTATATGGGCATATGATAatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCATGCGACCCTTTTAGACCAATAAGAATTGCGGATTCTATAAGGGTATATGCTATTaacat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGACTTTCGGATTAGATATAGACATATGCTATTtat
gi|2                          :                                                               aTATGTAGTTCTATGGACCTTAAAAAAGTGATTTT-AA-CCGACGAGGAAGTCTGAGGCCAATAATTAAATTTCTCAGGTCCATAGAATTACA-GT---------CAAAGTATATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGAATTTAAACGTG---ATCTTAA-GTTCT---TATTA-AA-A-AT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTCCTTTCCATCTTGCACCAGATGGCTGTTGTAAATGACCTCCCTTTGTTTATAATGGTGCTATATTACAATGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-T---TTC---ATGC---CT---ATAT--A----GACCTCAACAGTGGTCAATATCACTTTGAGCTGACTTTTCATGTGACCACTTTTGACCAATAAGAATTGTGGATTTGATATTGGCATATGGTATt
gi|3                          :                            TATACA---ATAATT---AACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGCGAA-----------------------AAGT--GATGTCA----------------GGTCCCTAGAACTACATATTCACCGCAGCAAAATCTATATTTATGATAGCA------TATGTGTAA-TTGTTATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATGCAGATCTTAAGTT--T---TTTTA-AAGAAAT--C----------CTTCTGTTTAC----CATCTTGCACCAGAC---TGTTGTGAATGACTTTCCTTTGTTTATAGCGGTGATATTTTACAGCATCGTGAAAATTACCCGCTTGTAAGAAAGT---TC----ATGC---CAATAA-----A----GACTTCAACAACTGTCAATATC----TGAGCGGACGTTTCAT-TAA-CCATTTTGACCAATAATAATTGTGGGGTTGATATGGGTATATGCTATTAT
gi|4                          :                                                        acGGTGAATACATAGCTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT----AATC----------GTCCTCGGTCAATA-TCATATCTTTCAGGTTCATAGAACTACATAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                             A-TAGT-ATAAAATAAGAGGTGTTCAA--GTA---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-ACATTTCG--TTGTTT-CTTCTGTTGACTTTCCATCTTGCACCAGACTACTGTTGTGAATGGCTT-----TGTTTATAGCGGTGCTATTTTGCAGCGTCGTGATAATTACACGCTTGTAAGAAA-TTGCATGCCTATTA---T----A-----A-----ACCTCAATGGCGGTCAATGTCACTTTGAGCGTACTTTTCATGTGACCACTTTTGAGCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATA-TATTagtataaaataagaggtgttcaagtaattttcattaatggttaaaacatttcgttgtttcttctgttgactttccatcttgcaccagactactgttgtgaatggctttgtttatagcggtgctattttgcagcgtcgtgataattacacgcttgtaagaaattgcatgcctattataaacctcaatggcggtcaatgtcactttgagcgtacttttcatgtgaccacttttgagcaataagaattgcggatttgatatgggcatatgatatattataat
gi|5                          :                                                                                                                                           ggtgaatacatagctctatggacctgagaaaagtgataatcgtcctcggtcaatatcatatctttcaggttcatagaactacatAGTTTTAAA--ACC---ATTTTCA-T-AATTTGGGTTAGAA-AAAT--CC--TTTTTTTCTTCTGTTTACTTTCTATCTTGC-TTAGACGACTATTCTTAATTCCTTCCCTATGTT-ATACCTGTGCTATTTTACAGCGTCATGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-T---AT-----TTCATGC----ATATATA----GACCATAACAGCGATCAATATTATTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCTCTTTTGACCAATAAGAATTGGGGATTTGATACGGGCATATGATATataat
gi|6                          : ataaggctaatttaaatgttgatcttaTATACATTTAC---T---GACTTTGATTGCGGTGAATGTATAGTCC-ATGGACCTGAGAAAAGTG---------------------TTCG---TC------CTCTTTTCTCAGGAACATAGAACTACATGTTAACCGAAGCAAAGTCTATAATTACTATATCA------TATGTGTAG-TAGTTATAAAATA---AGTGTTT-A--GTC---ATTTTCA-TTATT---CGT--------GT------TTTTTT-CTTCTGTTTAGTTTCAACCTTGCACCAGAAGACTGTTATAAATGAC-------TGTTTATAACGGTGCTGTTTTACCGTGTCGTAAAAATTACACGCATGTAAGAAA-T---
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                  aTTTAA--GTC---ATTTTCA-TTATT---GGTTA-AA-AAAAA-CGAGTTTTTT-ATTCTGTTTACTTTGCATCTTACATCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCATAATAAATACACGCTTATAAGAAA-T---TTC---ATGC---C----T-----ATATTGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGAATTTTCATGTGACTGCTTTTGACTAATAGGAATTGCAGATTTGATGTGGGCATATGACATTGT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus                     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---A-C-------GAAGTCCGAGGTCAATA-TCACNTTTCTCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGT-AATAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAA--T-CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-TT---CATGC-CTA-TATAGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
Reference ( family-2090 )     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---A-C-------GAAGTCCGAGGTCAATA-TCACNTTTCTCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGT-AATAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAA--T-CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-TN---CATGC-C-A-TATAGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
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gi|10                         :                             ATACA---AT---TATTGACTTTGGCTGAGATGAATATGTAGTTTCATCGACCTGATAAAGG-GAT---A---tg
gi|10                         :                                                                                                                                                             ATATTCACCTAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCATAATTTTATGTGT-TATAGGTATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATttcacctaagcaaagtctataattattatatcataattttatgtgttataggtataaaataaggcgaatttaaat
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTGAGCGGACTTTTTATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTCCGGATATTATATGGGCATATGATAatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCATGCGACCCTTTTAGACCAATAAGAATTGCGGATTCTATAAGGGTATATGCTATTaacat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGACTTTCGGATTAGATATAGACATATGCTATTtat
gi|2                          :                                                               aTATGTAGTTCTATGGACCTTAAAAAAGTGATTTTA---A-CCGACGAGGAAGTCTGAGGCCAATAATTAAATTTCTCAGGTCCATAGAATTACA-GT---------CAAAGTATATAATTATTATATCA------TATGTGT-AATAGTTATAAAATAAGGAGAATTTAAACGTG---ATCTTAA-GTTCT---TATTA-AA-A-A--T-CG--TTTTTT-CTTCTGTTTCCTTTCCATCTTGCACCAGATGGCTGTTGTAAATGACCTCCCTTTGTTTATAATGGTGCTATATTACAATGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAATTT---CATGC-CTA-TATAGACCTCAACAGTGGTCAATATCACTTTGAGCTGACTTTTCATGTGACCACTTTTGACCAATAAGAATTGTGGATTTGATATTGGCATATGGTATt
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gi|6                          : ataaggctaatttaaatgttgatcttaTATACATTTAC---T---GACTTTGATTGCGGTGAATGTATAGTCC-ATGGACCTGAGAAAAGTG-----------------------TTCG---TC------CTCTTTTCTCAGGAACATAGAACTACATGTTAACCGAAGCAAAGTCTATAATTACTATATCA------TATGTGT-AGTAGTTATAAAATA---AGTGTTT-A--GTC---ATTTTCA-TTATT---CGT--------G--T-----TTTTTT-CTTCTGTTTAGTTTCAACCTTGCACCAGAAGACTGTTATAAATGAC-------TGTTTATAACGGTGCTGTTTTACCGTGTCGTAAAAATTACACGCATGTAAGAAA-T
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gi|9                          :                                  ---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAAAATGCAATTGTATAGACCTGAGAACAGTGAT---ATTTACC-------GAAG--CAAAGTCTATA-aaat
gi|9                          :                                                                                                                                                        caattATATTTACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTGTATCA------TATATGTAAATAGTTATAAAATAAGGAGTTTTTAA--GTA---ATTTTCA-TTAAG---GGTTG-AA-ATA--T-Cattattgtatcatatatgtaaatagttataaaataaggagtttttaagtaattttcattaagggttgaaatatctc
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Reference ( family-2090 )     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---A-C-------GAAGTCCGAGGTCAATA-TCACNTTTCTCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-T---T-CATGCCTAT-ATAGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
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gi|10                         :                             ATACA---AT---TATTGACTTTGGCTGAGATGAATATGTAGTTTCATCGACCTGATAAAGG-GAT---A---tg
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTGAGCGGACTTTTTATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTCCGGATATTATATGGGCATATGATAatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTCATGCGACCCTTTTAGACCAATAAGAATTGCGGATTCTATAAGGGTATATGCTATTaacat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGACTTTCGGATTAGATATAGACATATGCTATTtat
gi|2                          :                                                               aTATGTAGTTCTATGGACCTTAAAAAAGTGATTTTA---A-CCGACGAGGAAGTCTGAGGCCAATAATTAAATTTCTCAGGTCCATAGAATTACA-GT---------CAAAGTATATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGAATTTAAACGTG---ATCTTAA-GTTCT---TATTA-AA-A-AT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTCCTTTCCATCTTGCACCAGATGGCTGTTGTAAATGACCTCCCTTTGTTTATAATGGTGCTATATTACAATGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAAATT---T-CATGCCTAT-ATAGACCTCAACAGTGGTCAATATCACTTTGAGCTGACTTTTCATGTGACCACTTTTGACCAATAAGAATTGTGGATTTGATATTGGCATATGGTATt
gi|3                          :                            TATACA---ATAATT---AACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGCGAA-------------------------AAGT--GATGTCA----------------GGTCCCTAGAACTACATATTCACCGCAGCAAAATCTATATTTATGATAGCA------TATGTGTAA-TTGTTATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATGCAGATCTTAAGTT--T---TTTTA-AAGAAAT--C----------CTTCTGTTTAC----CATCTTGCACCAGAC---TGTTGTGAATGACTTTCCTTTGTTTATAGCGGTGATATTTTACAGCATCGTGAAAATTACCCGCTTGTAAGAAAGT---T-CATGCCAAT-AAAGACTTCAACAACTGTCAATATC----TGAGCGGACGTTTCAT-TAA-CCATTTTGACCAATAATAATTGTGGGGTTGATATGGGTATATGCTATTAT
gi|4                          :                                                        acGGTGAATACATAGCTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---ATC----------GTCCTCGGTCAATA-TCATATCTTTCAGGTTCATAGAACTACATAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                               A-TAGT-ATAAAATAAGAGGTGTTCAA--GTA---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-ACATTTCG--TTGTTT-CTTCTGTTGACTTTCCATCTTGCACCAGACTACTGTTGTGAATGGCTT-----TGTTTATAGCGGTGCTATTTTGCAGCGTCGTGATAATTACACGCTTGTAAGAAA-T---TGCATGCCTATTATAAACCTCAATGGCGGTCAATGTCACTTTGAGCGTACTTTTCATGTGACCACTTTTGAGCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATA-TATTagtataaaataagaggtgttcaagtaattttcattaatggttaaaacatttcgttgtttcttctgttgactttccatcttgcaccagactactgttgtgaatggctttgtttatagcggtgctattttgcagcgtcgtgataattacacgcttgtaagaaattgcatgcctattataaacctcaatggcggtcaatgtcactttgagcgtacttttcatgtgaccacttttgagcaataagaattgcggatttgatatgggcatatgatatattataat
gi|5                          :                                                                                                                                             ggtgaatacatagctctatggacctgagaaaagtgataatcgtcctcggtcaatatcatatctttcaggttcatagaactacatAGTTTTAAA--ACC---ATTTTCA-T-AATTTGGGTTAGAA-AAAT--CC--TTTTTTTCTTCTGTTTACTTTCTATCTTGC-TTAGACGACTATTCTTAATTCCTTCCCTATGTT-ATACCTGTGCTATTTTACAGCGTCATGAAAATTACACGCTTGTAAGAAA-TATTT-CATGCATAT-ATAGACCATAACAGCGATCAATATTATTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCTCTTTTGACCAATAAGAATTGGGGATTTGATACGGGCATATGATATataat
gi|6                          : ataaggctaatttaaatgttgatcttaTATACATTTAC---T---GACTTTGATTGCGGTGAATGTATAGTCC-ATGGACCTGAGAAAAGTG-----------------------TTCG---TC------CTCTTTTCTCAGGAACATAGAACTACATGTTAACCGAAGCAAAGTCTATAATTACTATATCA------TATGTGTAG-TAGTTATAAAATA---AGTGTTT-A--GTC---ATTTTCA-TTATT---CGT--------GT------TTTTTT-CTTCTGTTTAGTTTCAACCTTGCACCAGAAGACTGTTATAAATGAC-------TGTTTATAACGGTGCTGTTTTACCGTGTCGTAAAAATTACACGCATGTAAGAAA-T---
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCTTTGTTTATAACGGTGCTGTTTTACGGCGCCAAGAACATAACACGCTTGTAAGAAA-T---TGCATGCCTAT-ATAGACCTCAAAAGCTGTTAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGAACCCTTTTGACAAATAAGAATTGCGGATTTGATACGGGCTTATGATAataa
gi|9                          :                                  ---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAAAATGCAATTGTATAGACCTGAGAACAGTGAT---ATTTACC-------GAAG--CAAAGTCTATA-aaat
gi|9                          :                                                                                                                                                        caattATATTTACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTGTATCA------TATATGTAAATAGTTATAAAATAAGGAGTTTTTAA--GTA---ATTTTCA-TTAAG---GGTTG-AA-ATAT--Cattattgtatcatatatgtaaatagttataaaataaggagtttttaagtaattttcattaagggttgaaatatctc
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Unaligned ( gi|17 ): TGAGTTTTATCAGTAAGTTTTCCTATATATTACCATATTTATTTTGTTCTCATGT






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Reference ( family-2090 )     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---A-C-------GAAGTCCGAGGTCAATA-TCACNTTTCTCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAA--ATTGCATGCCTAT-ATAGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
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Reference ( family-2090 )     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---A-C-------GAAGTCCGAGGTCAATA-TCACNTTTCTCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAA--ATTTCATGCCTAT-ATAGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTCATGCGACCCTTTTAGACCAATAAGAATTGCGGATTCTATAAGGGTATATGCTATTaacat
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gi|4                          :                                                        acGGTGAATACATAGCTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---ATC----------GTCCTCGGTCAATA-TCATATCTTTCAGGTTCATAGAACTACATAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                               A-TAGT-ATAAAATAAGAGGTGTTCAA--GTA---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-ACATTTCG--TTGTTT-CTTCTGTTGACTTTCCATCTTGCACCAGACTACTGTTGTGAATGGCTT-----TGTTTATAGCGGTGCTATTTTGCAGCGTCGTGATAATTACACGCTTGTAAGAA--ATTGCATGCCTATTATAAACCTCAATGGCGGTCAATGTCACTTTGAGCGTACTTTTCATGTGACCACTTTTGAGCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATA-TATTagtataaaataagaggtgttcaagtaattttcattaatggttaaaacatttcgttgtttcttctgttgactttccatcttgcaccagactactgttgtgaatggctttgtttatagcggtgctattttgcagcgtcgtgataattacacgcttgtaagaaattgcatgcctattataaacctcaatggcggtcaatgtcactttgagcgtacttttcatgtgaccacttttgagcaataagaattgcggatttgatatgggcatatgatatattataat
gi|5                          :                                                                                                                                             ggtgaatacatagctctatggacctgagaaaagtgataatcgtcctcggtcaatatcatatctttcaggttcatagaactacatAGTTTTAAA--ACC---ATTTTCA-T-AATTTGGGTTAGAA-AAAT--CC--TTTTTTTCTTCTGTTTACTTTCTATCTTGC-TTAGACGACTATTCTTAATTCCTTCCCTATG-TTATACCTGTGCTATTTTACAGCGTCATGAAAATTACACGCTTGTAAGAAATATTTCATGCATAT-ATAGACCATAACAGCGATCAATATTATTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCTCTTTTGACCAATAAGAATTGGGGATTTGATACGGGCATATGATATataat
gi|6                          : ataaggctaatttaaatgttgatcttaTATACATTTAC---T---GACTTTGATTGCGGTGAATGTATAGTCC-ATGGACCTGAGAAAAGTG-----------------------TTCG---TC------CTCTTTTCTCAGGAACATAGAACTACATGTTAACCGAAGCAAAGTCTATAATTACTATATCA------TATGTGTAG-TAGTTATAAAATA---AGTGTTT-A--GTC---ATTTTCA-TTATT---CGT--------GT------TTTTTT-CTTCTGTTTAGTTTCAACCTTGCACCAGAAGACTGTTATAAATGAC-------TGTTTATAACGGTGCTGTTTTACCGTGTCGTAAAAATTACACGCATGTAAGAA--AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                    aTTTAA--GTC---ATTTTCA-TTATT---GGTTA-AA-AAAAA-CGAGTTTTTT-ATTCTGTTTACTTTGCATCTTACATCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCATAATAAATACACGCTTATAAGAA--ATTTCATGCCTAT-ATTGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGAATTTTCATGTGACTGCTTTTGACTAATAGGAATTGCAGATTTGATGTGGGCATATGACATTGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCTTTGTTTATAACGGTGCTGTTTTACGGCGCCAAGAACATAACACGCTTGTAAGAA--ATTGCATGCCTAT-ATAGACCTCAAAAGCTGTTAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGAACCCTTTTGACAAATAAGAATTGCGGATTTGATACGGGCTTATGATAataa
gi|9                          :                                  ---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAAAATGCAATTGTATAGACCTGAGAACAGTGAT---ATTTACC-------GAAG--CAAAGTCTATA-aaat
gi|9                          :                                                                                                                                                        caattATATTTACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTGTATCA------TATATGTAAATAGTTATAAAATAAGGAGTTTTTAA--GTA---ATTTTCA-TTAAG---GGTTG-AA-ATAT--Cattattgtatcatatatgtaaatagttataaaataaggagtttttaagtaattttcattaagggttgaaatatctc


blockSeqs                     :                                  TTT  TATT                                             A  T ATTTTAACCGACGAGG        C  AG   AATAATTAAA                                                          TAATTT         A                  AA     AC  GCAG       G  TC TTG     G  G A  ACGAG       T                                                C                                                         AT   G         T
blockSeqs                     :                                  .    AATT                                             A  T ATATTTACCG              C  AT   AATATCATA                                                           .              .                  AA     .   G          .  AA .       .  . C  TTCG        .                                                T                                                         .    T         .
blockSeqs                     :                                  .    T                                                A  T ATAATC                  T  CG   CTCT                                                                .              .                  AA     .   A          .  AA .       .  . A  CG          .                                                C                                                         .    T         .
blockSeqs                     :                                  .    T                                                A  T .                       .  AA   A                                                                   .              .                  AA     .   C          .  AT .       .  . A  CC          .                                                C                                                         .    G         .
blockSeqs                     :                                                                                        C  . .                       .  .                                                                        .              .                  TG     .   C          .  AT .       .  . T  C           .                                                .                                                         .    T         .
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consensus                     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---ACC-A------AGTCCGAGGTCAATA-TCA--TTTC--TCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAA--ATTTCATGCCTAT-ATAGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
Reference ( family-2090 )     :                            TATACA---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---ACCGA------AGTCCGAGGTC-----TCA--TTTC--TCAGGTCCATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGNNTTTAA--GTN---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTACTTTCCATCTTGCACCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAA--ATTTCATGCCTAT-ATAGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
gi|1                          :                            TATACA---AT---T---G---TTGACTAAGGTAAATATGTAGTTCTATAGACCTGGGAAGAGTGAG---A---AC-AA------AGTCCGAGGTCAATA-TCACTTTTC--TCAGGTCCATAGAACTTCATTTTCACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCA------TACGAGTAA-AAATTATAAAATAAGAAGTTTTTAA--GTA---ATTTACA-TTAAT---GGTTA-AA-AAAT--CG--TGTTTT-CTTCTGTTCACTTTCCATCCTGCAGCAGACGACTGGTATGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTTCTTTTTAACAGCGTCATGAACATTAGACGCTTGTAAGAA----------------ATAGACCCAAACAGCGGTTGATATCGCTTGAAGCGGACTTTTCATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTGCTGATTTGATATGGGCATATGATATTATT
gi|10                         :                             ATACA---AT---TATTGACTTTGGCTGAGATGAATATGTAGTTTCATCGACCTGATAAAGG-GAT---ATTCACCTA------AG--CAAAGTC-----Ttg
gi|10                         :                                                                                                                                                              ATATTCACCTAAGCAAAGTCTATAATTATTATATCATAATTTTATGTGTTA-TAGGTATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATataattattatatcataattttatgtgttataggtataaaataaggcgaatttaaat
gi|11                         :                                                                                    atacaattattgactttggctgagatgaatatgtagtttcatcgacctgataaagggCAGGTCAATAGAACTACATATTCACCGAAGCAAAATCTATAATTATTATATCA------TATGTGTAG-TAGTTATAAAATAAGGCGAATTTAA--
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTGCTATTTTTGAGCATCGTGAAATTTACACTCTTGTAAGAA--ATTGCATGCCTAT-ATAGACCGCAACAGCGGTCAAAATCACTTTGAGCGGACacgttgatcttaagtttttaagga
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taaattCAGCGGCCAAAATCACTTTGAGCGAACTTTTCATGTGACTCTATTTGACCAGTACAAATTGCAGATTTGATATAGGCATATGGTATAAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTGAGCGGACTTTTTATGTGACCCATTTTGACCAATAAGAATTCCGGATATTATATGGGCATATGATAatc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCATGCGACCCTTTTAGACCAATAAGAATTGCGGATTCTATAAGGGTATATGCTATTaacat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCATGTGACCCCTTTTGACCAATAAGACTTTCGGATTAGATATAGACATATGCTATTtat
gi|2                          :                                                               aTATGTAGTTCTATGGACCTTAAAAAAGTGATTTTA---ACCGACGAGGAAGTCTGAGGCCAATAATTAAATTTC--TCAGGTCCATAGAATTACA-GT---------CAAAGTATATAATTATTATATCA------TATGTGTAA-TAGTTATAAAATAAGGAGAATTTAAACGTG---ATCTTAA-GTTCT---TATTA-AA-A-AT--CG--TTTTTT-CTTCTGTTTCCTTTCCATCTTGCACCAGATGGCTGTTGTAAATGACCTCCCTTTGTTTATAATGGTGCTATATTACAATGTCGTGAAAATTACACGCTTGTAAGAA--ATTTCATGCCTAT-ATAGACCTCAACAGTGGTCAATATCACTTTGAGCTGACTTTTCATGTGACCACTTTTGACCAATAAGAATTGTGGATTTGATATTGGCATATGGTATt
gi|3                          :                            TATACA---ATAATT---AACTTTGACTGAGGTGAATATGTAGTTCTATGGACCTGCGAAAAGTGAT---G-----------------------------------------TCAGGTCCCTAGAACTACATATTCACCGCAGCAAAATCTATATTTATGATAGCA------TATGTGTAA-TTGTTATAAAATAAGGCGAATTTAA--ATGCAGATCTTAAGTT--T---TTTTA-AAGAAAT--C----------CTTCTGTTTAC----CATCTTGCACCAGAC---TGTTGTGAATGACTTTCCTTTGTTTATAGCGGTGATATTTTACAGCATCGTGAAAATTACCCGCTTGTAAGAA--AGTTCATGCCAAT-AAAGACTTCAACAACTGTCAATATC----TGAGCGGACGTTTCAT-TAA-CCATTTTGACCAATAATAATTGTGGGGTTGATATGGGTATATGCTATTAT
gi|4                          :                                                        acGGTGAATACATAGCTCTATGGACCTGAGAAAAGTGAT---A---ATC---------GTCCTCGGTCAATA-TCA--TATCTTTCAGGTTCATAGAACTACATAT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                A-TAGT-ATAAAATAAGAGGTGTTCAA--GTA---ATTTTCA-TTAAT---GGTTA-AA-ACATTTCG--TTGTTT-CTTCTGTTGACTTTCCATCTTGCACCAGACTACTGTTGTGAATGGCTT-----TGTTTATAGCGGTGCTATTTTGCAGCGTCGTGATAATTACACGCTTGTAAGAA--ATTGCATGCCTATTATAAACCTCAATGGCGGTCAATGTCACTTTGAGCGTACTTTTCATGTGACCACTTTTGAGCAATAAGAATTGCGGATTTGATATGGGCATATGATA-TATTagtataaaataagaggtgttcaagtaattttcattaatggttaaaacatttcgttgtttcttctgttgactttccatcttgcaccagactactgttgtgaatggctttgtttatagcggtgctattttgcagcgtcgtgataattacacgcttgtaagaaattgcatgcctattataaacctcaatggcggtcaatgtcactttgagcgtacttttcatgtgaccacttttgagcaataagaattgcggatttgatatgggcatatgatatattataat
gi|5                          :                                                                                                                                              ggtgaatacatagctctatggacctgagaaaagtgataatcgtcctcggtcaatatcatatctttcaggttcatagaactacatAGTTTTAAA--ACC---ATTTTCA-T-AATTTGGGTTAGAA-AAAT--CC--TTTTTTTCTTCTGTTTACTTTCTATCTTGC-TTAGACGACTATTCTTAATTCCTTCCCTATG-TTATACCTGTGCTATTTTACAGCGTCATGAAAATTACACGCTTGTAAGAAATATTTCATGCATAT-ATAGACCATAACAGCGATCAATATTATTTTGAGCGGACTTTTCATGTGACCTCTTTTGACCAATAAGAATTGGGGATTTGATACGGGCATATGATATataat
gi|6                          : ataaggctaatttaaatgttgatcttaTATACATTTAC---T---GACTTTGATTGCGGTGAATGTATAG-TCCATGGACCTGAGAAAAGTGTT--------C----------GTCC----TC-----T----TTTC--TCAGGAACATAGAACTACATGTTAACCGAAGCAAAGTCTATAATTACTATATCA------TATGTGTAG-TAGTTATAAAATA---AGTGTTT-A--GTC---ATTTTCA-TTATT---CGT--------GT------TTTTTT-CTTCTGTTTAGTTTCAACCTTGCACCAGAAGACTGTTATAAATGAC-------TGTTTATAACGGTGCTGTTTTACCGTGTCGTAAAAATTACACGCATGTAAGAA--AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                     aTTTAA--GTC---ATTTTCA-TTATT---GGTTA-AA-AAAAA-CGAGTTTTTT-ATTCTGTTTACTTTGCATCTTACATCAGACGACTGTTGTGAATGACTTCCCTTTGTTTATAACGGTGCTATTTTACAGCGTCATAATAAATACACGCTTATAAGAA--ATTTCATGCCTAT-ATTGACCTCAACAGCGGTCAATATCACTTTGAGCGGAATTTTCATGTGACTGCTTTTGACTAATAGGAATTGCAGATTTGATGTGGGCATATGACATTGT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCTTTGTTTATAACGGTGCTGTTTTACGGCGCCAAGAACATAACACGCTTGTAAGAA--ATTGCATGCCTAT-ATAGACCTCAAAAGCTGTTAATATCACTTTGAGCGGACTTTTCATGTGAACCCTTTTGACAAATAAGAATTGCGGATTTGATACGGGCTTATGATAataa
gi|9                          :                                  ---AT---T---GACTTTGACTGAGGTGAAAATGCAATTGTATAGACCTGAGAACAGTGAT---ATTTACCGA------AG--CAAAGTC-----Taaat
gi|9                          :                                                                                                                                                         caattATATTTACCGAAGCAAAGTCTATAATTATTGTATCA------TATATGTAAATAGTTATAAAATAAGGAGTTTTTAA--GTA---ATTTTCA-TTAAG---GGTTG-AA-ATAT--Cataattattgtatcatatatgtaaatagttataaaataaggagtttttaagtaattttcattaagggttgaaatatctc
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Unaligned ( gi|17 ): TGAGTTTTATCAGTAAGTTTTCCTATATATTACCATATTTATTTTGTTCTCATGT