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Reference ( family-2062 ) : AAGGGATTAGTTAACTGGGTCTC----AAAAACTAAATATATGTTACAGTCAAATGGTTTTGGAGAGGTATGGGAGTTTCCTGACTCAGTACTGTTAA-ATGCG-TTTTTACCTGTGTTTAAACTGCGACTTAAAGACACCTATATAT--CAAACTGGAGAGAGGGTATGCAA--ATGTTTTCGTCGTTGTCATTA-----TATAGAAACATAAAGACAAACTTTGAATCTGAGCCTTACTTGGATAAAATACTGAAACTGAAGAATAGACAAGCTTT-AACAAAACTGAGACTAAATTCAC------A-AATNA---ANCAGGGT---AGACATTGT---AGTCCAGTGATTCCAAGGAACGAACGNTTTTGTATGTTATGTACATCCAGAGATATTGAAGACGAG-TT-CATTTCGTTTTAAAATGCGATGTTTATAAAGAAATAAGACTGCTATACA------TACCTACATACTA-----CACAAGAAATATAAGTATGTTTAAGTTTGTGGAACT-ATTAAATACACGAAACACAAGGTTACTCAGGAAACTA-GCA----------ACATATGTT----AAT---AAAGCCTTTTAAAAGAGACAAGCACTGTTTAATCAAAACACAGATTAATGTNTAACT-GTANA----T--ATAT-------ATGTCTTAAGTTCCTTCTACATTTGAACAAAATCCATTAAATTCTTG-TTTTCACTCTCAGTCTAAC----CATACANTGTATGTAAAGTA----TATAGA-TATATGTGTATNTA------CGTACGTTTACTTTGTAATTT--CA-CATATATGTTTT-T-CAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTTT-G--ATATGTTGATGATTA---GCTGTCATGTATGCTAAAGTCA---AATAAAATA-TCTGTA------TTCTGTATT-AAT--A--AACATCCGCGCGATAANCATT
gi|1 : AAGGGATTAGTTAACTGGGTCTC----AAAAACTAAATATAGGTTACAGTCAAATGGTTTTGGAGAGGTATGGGAGTGACCTGACTCAGTACTGTCAA-ATGCG-TTTTTATCTGTGTTTAAACTGCGACTTAAAGACACCTGGATAT--CAAACTGAAGAAGGGGTATGCAA--ATGTTTTCGTCATTGTCATTA-----TATAGAAACATAAAAACAAACTTTGAATCTGAGCCTTACTTGGATAAAATACTGAAACTCAAGAATAGACAAGCTTT-AACAAAATTGAGACTAAATTCAC------A-AATAA---AACAGGGT---AGACATTGT---AGTCCAGTGATTCCAAGGAACTTACGTTTTTGTATGTTATGTACATCCAGAGATATTGAAG-CGAGATT-CATTTCGTTTAAAAATGTGATGTTTATAGAGAAATAAGACTGCTATATA------TACCTACATACTT-----CACAAGAAATATAAGTATGTTTAAGTTTGTGGAACT-ATTAAATACACGAAACACAAGGTTACTCAGGAAACTA-GCA----------ACATATGTT----AAT---AAAGCCATTTTAAAGAGACAATCACTGTTTAATCAAAATACAGATTAATGTTTAATT-GTAAA----T--ATAT-------ATGTCTTAAGTTCCTTCTATATTTGAATAAAATCCATTAAATTCTTG-TTTTTACTCACAGCCTAAC----CATACAATGTATGTAAAGTA----TATAGA-TATATGTGTATTTA------CGTACGTTTACTTTGTAATTT--CA-TATGTTTGTTTT-T-CAGCACATGATTTGTTTACTTGTTTT-G--ATATGTTGATGATTA---GCTGTAATGTATGCAAACGTGA---AATAAAATA-TCTGTC------TTCTGTATT-CAT--A--AACATCCGCGTGATAAACATT
gi|10 : A------CATACGTTAACTTTGCTTTTT--CA-TATATATGTTTTTT-CAGCGCATGATTTGTTTATTTGTTTT-G--ATATGTTGATTATGA---GCTGTCATGTATGCTAAAGTCAAATAATAAAATA-TCTGTA------TTCTGTATTAAAT--AATAACATtggtaaagtcaagtttatataaaatta
gi|11 : cactgtcctaatatcattaaTAGTTAACTGAGTCTC----AAAAACGAAATATATGTTACATTCAAATGGTTTTGGAGAGGTATGGGAGTTTCCTGACCCAGTACTGTTAA-ATGCA-TTTTTACTTGTGTTTAAATTGCGACTT-AAGACACCTTTATAT--CAAACTGGAGAGAGGGTATGAAA--ATGTTTTCTCCATTGTCattggctgtacatgacgaggctttta
gi|12 : aAGTCTATC----CATACATTGTATGTAAAATAATTATATAAAGTATATACATACCAA------CATATGTTTACTTTGTAATTT--CA-CATATATGTTTT-TTCAGCGC-----TTGTTTATTGGTTTTAG--ATATGTTGATGATTA---GCTGTCATGTTTGCTTAAGTTA---AA-AAAAAA-TCTGTA------TTCTGTATT-AA
gi|13 : GAGATGTTGAAGATGAGATT-CATTTCGTTTTAAAATGCAATGTTTGTACTGAAATGAGAC----------------------ATGATA-----CACAAGATTTACACGTATGTTTAGGTTTGTTGAACT-CTGAAATACACGAAACACTTGGTTGCGTAAAAAACCCTGCT----------ACATATG-T----AGT---AAAACA-TTTAAAA
gi|14 : GTTTATATTGTAATTT--CA-CATGTA-ATTTA-T-CA-----------GTTTATTTGTTTA-A--AGAT----ACGATTA---ACTG-CATGTATGCTAAAGTCA---TATAAAA-------TA------TTCTGTATA-AATTCA--AACA
gi|15 : tacaccgTGCATTGTATGTAAAATA----TGCAGA-GATATGTGTATATGCACCATCATACATTTTCATTGTAAATA--CA-CAGATATGTTTT-C-CGG-GCATGGTTTGTTCGTTTG-ATT-G--ATGTGTcagaatgttgtaaatatacccacatgagcttaatttgattgcattgaatt
gi|16 : aaacATTTGTTTATCTGTTTT-G--ATATGTTGATG-------------ATGTATGCTAAAGTCA---AAT-AAATA-TCTGTA------TTCTGTGTT-gt
gi|17 : TAAC----CATGCATCGTATGTTAAGTA----TAAAGA-CATGTGTGTTTACA------CGTACGTTTACAATGTAATgttgatt
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gi|4 : aAGAAATAAAACTGCTATACA------TACCTACATACTAGTCTACACAAGACATATAAGTATGTTTAAGTTTGTA----T-ATTAAACACACGAAACACAAGGTTACTCAGGAAACTA-GCA----------ACATATGTT----AAT---AAAGCCTTTTAAAAGAGACAAGCACTGTTTAATCAAAATACAGATTAATGTTTAACT-GTAAA----T--ATAT-------ATGTCTTAAGTTCCTTCTATATTTGAATAAAATCCATTAAATTCTTG-TTTTCACTCTCAGTCTAAC----CATACAATGTATGTAAAGTA----TATAGA-TATATGTGTAATTT------CATACAATGACTTTATAATTT--CA-TATATATGTCTT-T-CAGTTCATGATTTGTTTATTTGTTTT-G--ATATGTGGATTACTAGCTGCTGTAATGTATGCTTAAGTCA---AATAAAATA-TCTGTA-------TCTGTATT-
gi|5 : TCTC----TAAAATTAA---TATGATACAATCAAATTATTTTGGAGAGGTATGGGAGTTTCCCAACTCAGTACAGTTTA-ATGC--CTTTTAC----------ACTGTGAC--------ACCTAACTAA--CACACTGGAGAGAGGGTATGCAC--ATATTTTCGTCATTGTCATTC-----TATAGGAACATAAAGATAAACTTTGAATATGAGctattctgtattaaacagttaaataggtatgttagaaaatt
gi|5 : aAGATAAACTTTGAATA----TGAG-TTAAATTCAC------A---TGA---TTTAAGGT---AGACATTGT---AGTCCAGTGATCCCAAGGAATGAACGATTTTGTATGTTATGTACATCCAAAGATATTGAAGACAAGTTT-CATTTCATTTTTAAATGTGATCTTTATAAAGAAAAAATACTACTATACATACATGTACCTACATACTA-----CACAAGAAATATAAGTATG-TTAAGTTTGTGGAAttaaattcacatgatttaaggtagacattgtagtccagtgatcccaaggaatgaacgattttgtatgttatgtacatccaaagatattgaagacaagtttcatttcatttttaaatgtgatctttataaagaaaaaatactactatacatacatgtacctacatactacacaagaaatataagtatgttaagtttgtggaa
gi|6 : atctctaaaattaatatgatacaatcaaattattttggagaggtatgggagtttcccaactcagtacagtttaatgccttttacactgtgacacctaactaacacactggagagagggtatgcacatattttcgtcattgtcattctataggaacataa---AGGCATTATTACAGTCCATTGATTCCAAGGAATTAAAGATTGTGTATGTAATGTGCACCCAAAGATATTGAAGATGAG-TTTCATTTAGTTTTAAAATGTGAGATTCATAAAGAAATAAGACTGCTATACA------TACCAACATACTA-----CATAAGGACTATAAATATGTTTAAGTTTGTGAAAATAATGAAATACACAAAACACAAACATACTCTGGCAACTA-GCATTATATATTTGTATATGTT----TAT---AATGCCTTTCAAAAGAGACATGCACTGTTTAATTAAAACTCATACTGGTGTGTGA-----ACAAGCTT--ATAT-------ATG-CT---ATT--TTCCACATATGAA
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gi|8 : AATAAAAACACAGATTAATG-AGAACAAGTATA----T--ATATTTATATAATGTTTTAAGTTCCTTGTACATTTTAACAAACTCCATT-----CTTG-TTT------TCACTCTA-------------TTTAT-----------------A-TCTGTGTATATATA------CATA---TTACTTTGTAATGT--TA-CATATATGTTTT-T-CAGTGAATGATTTGTTCACTTGTTTT-G--ATATGTTAATGATTA---GATGGCATGTATGCTAAAGTCA---AATAAAATA-TCTGTATCTGTTTTCTGTATctgtttacataataacaaaataatacacttacattaacataattgcactatattatattaaattttttaaatgatatacatacaattatacatatttaata
gi|9 : atatatgtgatagtaaacatgttgcattttatgtaaAGGGATTAGTCAACTGGGTCCCCAAAAAAAACTAAATATAGGTTACAGTCAAATAATTTTGGAGAGGTATGGGAGTTTCCTGGCTCAGTACTGTTAA-GTGCGTTTTTTACTTTTGTTAAAACTGCGACTTTAAGACACCTATATAA--CAAACTGGAGAGAGGGTATGCAATTATGTTT--GTCGTTGCCATTATAAATTATAGAAACATAAAGACAAACGTTGAATCTGAGgtatgttttg
blockSeqs : CAAA A T GT T G A AT TT T A TAAAT A C T G A A GTATTTAAATTATTGAG TGA TAC A C TG TGAGA T TACATG GTCTA T T AC AA G T TTATATATTT AAAA AAA T G CAA T AGCT TC TTATATA T T ATTA T A ATTA GT C CACCAT A T AG T T TC C A AT GCT AAT T TCTGTT A AAT . T
blockSeqs : . A . A C T A . . T G . T . . . A A ATAATTT . . G C AT CAAGT . . . C A AC C T . . . . T T AT A . . A T . . T A . G A . T T . . . C C . . . . . . . TCA
blockSeqs : . C . G C G T . . T A . T . . . ATGATT . . G A AT TGAG . . . A T AA G T . . . . T T TT A . . . A . . T G . C A . T A . . . C T . . . . . . . AT
blockSeqs : . A . . T T . . . . G . G . . T . . . . . . C A . A G . . . . T G CT C . . . A . . T A . T C . T A . . . C C . . . . . . .
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Alignments
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gi|2 : GATTGGTTAACTGGGTCTC----AAAAATTAGAAATATGCTACAGTCAAATGGTTTTGGAGATGTATGAGAGTTCCCTGACTCGGTACATTTAATATA----TTTAACCTTTGTTTAAACTGTTATTTAAAGACATATATATATATCAAATTGAA--GAG--------A--GTG--------------A--A-----TATAGAAACAAAAAGACACACATTGAAGCTGAATCATA-TTGGA----GTACTGAAACTGAAAAGTAGACAAGCTTT-AACAAAACGGAGACTAAACTCACGTATTTA-AATTATTGAGCAGGGT---AGACATTGT---ATTCCGGTGA---------ACAAA------TGTATGTTATGTACATAAAGAGTTGTCGAGGA-----TT-AATTTTTTTTCAAAATACAATGTTTATAAAGAAATAGGACTGCTATACA------TACCTTTATACTA-----TGCAAGGCATATAAA-ATGTCTATGTTTGAAGA-------AAATACATTGAACACGAGGTTACTTAGGAAACTA-GCG----------AAACATGTTAAAAAATAAAAAAGCCTTTAAAAAGAGTCAAGCAATGTTTAATCAAAACATGGAT--GTATGTAAAT-ATATA----TTCATATA------ATGTTTTAGGTTCCTTCTAC-TTTGAACGAAATCCATTTAATTCATC-TTTTCACTCACA----AACATTACATACATCGTATGTAACATA----TATAGG-TATATTTGTACCAA------TGCACGTTAAAGTTG---TTTAGCATTATATATGTTTT-T--AGTGCATGACTGGTTTATTTGTTTT-GATATATATTGATGATTA---TCTGTCTTGTATATTAGGGTTA---AATAAAATATTTTGTA------TTTTGTACT-AAT--AT-AAC-------CGATAATCATT
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