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gi|2                          :                                                     atAC------ATG---------TTTTAA-AACAAATATGTTGTTGCTAGAGTTA--CTGCCT----TTGTAAAAATCTATGAAGGCT--TTTAAGTCCAGAT----CAG---ACATTTTTG-------G-----AGGACAA-GGTAGTTT----ATTAACAATATTTGAAGCATCTATAGT-AAAAAAAAGACATTAACATGAATTGCTATTTTTTTAAGGATTATGGCAATTTTGATATTC---AATATTTAAAACTCCATTTG----CAT----GTCCACCTT-TATGAG----ATTTATAATCTAAC-TGCTTTAAATGTTGCCACAAACGTTTGGAGT----GTTTC-TATT-TTCAGATATTTGATC--AAAAATATGTG-AACTTT---GCCTTTCT--A---------ACATCTCTTTGAATAATATTTTTAAATTTACAA-------T-ACAATGAATTG-TCACCATGACTAT--CAT---G-CTTT-CTGAATT----TGTACAAATAAGAATC-CTTAAGGTTTATAA---AATT-TA--A-AATCTCACTTGA---C-A-TCCAAGGCTCAGTTCTCTG-TTTAA---G----TCTTTCACAGGGGCAATGGAATTCAAA-ACTGACATCAATATCT-----TT--ATAAGC-TAACCAAG-AACTATT-AACAT-TAT---CAG---AATAAAAACACTTA-CTCCAATCAGC-C--TGACCT-AGCTTGTCAATAAGCAACTCTTTTGTTT-------------TTTT-TTATAAATCTTTTATAATTCT----TAACACAACTTACTTTA-GAAAAAT-----AGTGCTTAATAAATGTCTGTTTAGC------AATCTTCCTTGTACAAAAGGTCA-T-A---AAATGATACCT---TAA-AC--CAATAG--AAATGGTACAAGATTGACTCAGTTTA--TCTTT-----AGAACTAGTG-ACA--ATATGATCAATAATACTAATTGAAG---TTTTAGTGAT-------TTTAGTTG----CTTCATTGATAATC--TGATGTAAATAAAAAATTCTCAAAATATTTAA-ATAAGAC-TTAAA-------GAG--TGAAC---TAATT-TTTAG--TTTAAAACAA---A-----TACTGACATCCCCT---G--GGAGAAAAATTTCATAGTCTGAT------CTAAGGTTTGTTAAA-ACACTT---TCAAGATGATCAATAAAGGTGGCCTATTTTGGAGGCCTAT-ACGTAGTATCTACAATAATGGG--TTGATTTTTGGTAAAAGAAGTTCAA--CAAAAATAAGTTCATCA-------TT-----CATCAGGTCTAGTAGT-AATGCAGTACCATTCCTCACATAGCAACATACTTCTCCATGTCTGTTTCTA--CCGCATC-----TTGC------TACACTGTAATT--G-TCAACGTG-TATTTCTGCATC----AT----TCATCATTCCATGTTTC--TGATAAAGTAATTATAGCTGCTCT--GCTCT-TCATGGCAACAATATTC-----ATTTCAGATATTTTTGGTAAAATA-G--A--TCTAACATGCATATGTATAAAGCTAAGTCCTTTCTT--TAAAAAGCAC-TA--GAAATGAT--CCTCTGACGCT-GTAGATGGTCGAGA-TG-TTGAAGAactaagtcatttgctta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                         agcattgagattgctacatacattattaacaaatgactctgac-CATTAAAATGATTTGCTATTTT---AATCACTTTGACAAGTTTGATCTTCAATAATATCTAAAACTACATTTG----CAT----TTCCACCTT-TATGAG----ATTTGAAACCTAAC-TGCTTTAAATGCTGCCACAGACCTTTTGGATTA-TTC-TA-TTTTCAGA---TATTTGATCAGAAAAACATGTA-AACTTTGTgggtcctgaagatgtgtctgtagaaaaagaagtgtcagcagtgtacagg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                           ctctgacacatgttttacaacaaatctgttgttgctagagtttctgcctttgaaaaaatctatcaaggttatccaggttaaacgatttacatggacaaggttgtttatcagcaaatttcgaagctactgtggttaactagcTGCCATAGACCTTTCACATtttctctttgtacaatatttctatatttacaatacaattaattgtcctcatgactaccacgctttctgaatttgtacaaataagaatcccaaagtttaataaatcttaaaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACCTTGTTTCGAAAGCAACAAAATTGCTT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT----AAT---G-TTTTCTTATAAT----TGTATAAGGCACTGTCTCTT---GCTT-TAAT-TAGTT-CA--AGAATTCCA---GAGGTgtcgagttaaaacatgtgctccagtccgcactcgtgagattatgaatgaaatcttgtttagtataatttttcattgaccttatttttaaggtttaatatgaattaaaataacatttcggtccttacttgaacaaaacgtcataaaatgatcgctaacacccatagggatagtaacagactggaaaattcggtctttattattgcataggatatggtctataagggtacttgaagtgtgcgatacaagctaggttcggttatgatttgatctaggttaataatgcgtaacaaattgacatatgcttgatacaatgaactttcttttttaaaacagcaaatattaaaatcacctaatataatagtttcactatcggatcgtagattaaatagattttactcaaacatatcggtaaaattagactgattaggcggcctataacacgtaccaaaagtaataggttttgttttcggtaacaatagctcgatccataaaaattcgtcagtatggtcacttatatctgtcctaatatcaaaagccaaatcgtttcggatataggtgcatacaccaccaccacttcgatttcgatccttacggacaatacaataaccttctattgatacctctacgtctgtaatagaatcatctaaccaagtttcagtaatagaaataacaggggccctagctttgtcagcaaagaaacgaatttcggacattttaggaaataaagagcgtgcattttgttgaacaaagtgcaatcctttcctggtaaaacattgaaaatggtcaaatttaacattagttggtaaattgtttggagaatcattttatgctcatttgttaaattaacaaattcagaattttcaaattcagagtcaccaggttataatttaaaagtatattgaacgcagtaaaacagattgtctttatcgttacatgaaaacagttcatagtgactgactgtgatgtagccggtacactttatatgcttctttgaatgacagggatcacaggttactgcttttcttgttg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTT-TCAT-TAATGGCATGAAAATATCT---GAA-TCGA-TCCATGGTTCTGTCCTATGCTTGATTCGT-ATCTGCTTGAAAGGAACGATATTG-TCAATGACCAACAT--AAATA-A---ATGTTT-AAACTTATCCAAAGCCTCATT-TAAAC-TAT---C-GCTCAG-CATAACA-GGA-CTCTAGTC----------TGT-AGAT----AAC-A--GA---T-TGGTTTGGAGCTCCTGTAGTTCT-TCATGGAACG-----TATT-G----TAACA------TTATTATGTGTACTGTTTGAG-----GAT-------T-TT--GT------AGTTTTTCTTGTACAAATATTTA-T-C---GTATGGTCACT---AAA-GC-----TAGTTCAATAGTACCAGACTGGG--AAA
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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                  tTTAGAACAA-TTTAATTTA--CATAGTTCTTTGTATACAAAA-GCTTCACTTACTGT---GCG-AAGTTTA-AATTTAAC----A--AAA---T-----CTGGA------TTTCTTTTTTTTATACAAATCTTTTAGAA--TAGT--------AG---CTTCAG--CA------------T-TGTACATTTTTT-----AGGGTAA---GGCAA-----TTTTTTAACTAACATA-GAAGCAACATTGGT-AAAAA-AA-T--TATTAAAATGATTGGCAATTTTCA-TAGGCTCA---AAACAATTTTCGTCGTC---AATTTTCAAAACAATATTAGTAGAAGA----TTTAGTCTTG--TTA---C-TGTACCCTAAC-TTTTTAATTTGAGACCAGAG-TTTT-TGAGGACAGTTCTTATTTTTTTTCTAGCTTATTGGAAAGATACTCA-GATTT----GGCTCTTTTAACCTCCCTCTGTAC-----TAAA-----TTTCTA----TATAAACAATATGCTTT-ATAAAAT-----TCCTTC-TTCT--T-T---GATTTC-TTAAAATGATACATATAAAA----ATCTCTCT---G-TT-TAATAAGTT---CTAAAATATTA---GAA----TCT-AA-CCAAGGCTCACTTCTTTGC-T-TAAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                 ttTTAGCAACA-TTTAACTTA--TTTAATTCCTTGAAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A--AGAGTGT-----CTGGAG--A--CTTCTTCGAATTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATGCAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTTAC-ATGATTTGCTGCGACTGTAAT-AAAAA-AA-T--CATTAAAATGGTTTGCGTTTGTCA-AAGGATCA---TTACAAACCTCATTATC---AATATTTCAGACAATATTCA----AAC----TTT-G-TTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-CTTTTCAACTGCTGCCATAGACCTT-TCACGTCA-TACTTA-TGTTCTTCTACTTTATCTGAGAAATAGTTA-GATTTTGTAGATTTTATTAA---------ATAT-----TGAACCTTGTTTCGAAAGCTATTA--AAT-TGC-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--TAT---GTTTTT-TTATAAT----TGTATAAGGCATTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAATT---CTTAAACTTCA---a
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tATAA---ACT-TTCGGT------A-CCTTCCTTGAACAAAACGTCAATGA---AAATGATCGCTT--AGCC-TCAA-AG--GGATAGTAACAGACTGGA-A---AATT-CGGTCTTT---A---TAATGGCATAAGATATGGTCTATAAGGGTACTTGAAG---TGT--G--CGAT--ACACGTAATGGTTCGGTT-ATGGTTGGATCTAGGTTAAAA-TGCG---T--AACATATTGACATATGCATTAT---ACAA--TGAAC---T--TTATTT-T--TTTAAAACAACAAAATTAATATTAGAATCACC--CA--GTATTAAAGTTTCAATATC--------------GA--------AAATAGATTTT-CCTCAAACCTTTCGGTGACATTAGACTGATTAGGCAGCCTATAACAC-GTACCAATAGTAATAGGCCTTG-TTTTCGGTAACAATAGCTCGATCCATAGAAATTCGTCAGT-ATGGTTACTTATATCTGTCCTAATATTAAACGCTAAAACGTTTCGGATATTGGTGCATACACCACCA---CC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                   TTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCTTTGAAAACAAAA-ATCTCAGTGAT------GTG-A---TTA-ATTCTAAA----A--ATAGTGT-----CCGGAG--A--CTTCTTCGCGTTATAAAAAT-TCTTAAAATTTTGTG--A----AA---ATGTAG--TAA---A--A---ATATGTA-------T-----ATGGTTC---GGCAG-----CTTATTAAC-ATTATTTGCCGCGACTGTAGT-AAAAA-AA-T--TATTAAAACGATTCGCGTTTGTCA-AAGAATCA---TGACAAACCTCATTATC---AATATTTAAAACAATATTCG----AAC----TTTTG-TTTGTCATATATT-TCTAACCCAGCTTTTTTCAACTGCTGCCATAGACCTT-TCACATa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTT-CACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCCGCA---C--T--CGTGAGATTATGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TATAATTTTT-CATTGACCTT-----ATT-TT----TAAG------GTTTAATATGAATT-----AA-----AATAA---CAT-TTCGGT------gtcgagttaaaacatgtgctccagtccgcactcgtgagattatgaatgaaatcttgtttagtataatttttcattgaccttatttttaaggtttaatatgaattaaaataacatttcggtc
gi|16                         : tttagcagcatttaacttatttaattctttgaaaacaaaaatctcagtgatgtgattaattctaaaaatagtgtccggagacttcttcgcgttataaaaattcttaaaattttgtgaaaatgtagtaaaaatatgtatatggttcggcagcttattaacattatttgccgcgactgtagtaaaaaaattattaaaacgattcgcgtttgtcaaagaatcatgacaaacctcattatcaatatttaaaacaatattcgaacttttgtttgtcatatatttctaacccagcttttttcaactgctgccatagaccAAAAATCTATC--A----AGGTTATCCAGGTTAA---ACGATTTACATGGA-------C-----AAGGTT--------G-----TTTATCAGC-AAATTTCGAAGCTACTGTGGT-TAACT-AG-C--CATTAAAATGATTTGCTATT-TTA-----ATCACTTTGACAAGTTTGATCTTCAATAATATCTAAAACTACATTTG----CAT----TTCCACCTT-TATGAGATT-TGAAACCTAAC-TGCTTTAAATGCTGCCACAGACCTT-TTGGATTA-TTC-TA-TTTTCAGATATTTGATCAGAAAAACATGTA-AACTTTGTc
gi|17                         :                                                                                                                               ctctgacacatgttttacaacaaatctgttgttgctagagtttctgcctttgaTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCATTGAAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A--AGAGTAT-----CTGGAG--A--CTTCTTCGAATTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATGTAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTTAC-AAGATTTGCTGCGACTGTAGTAAAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATTATC---AATATTTAAGACAATATTCA----AAC----TTTTG-TTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGTTGCCATAGACCTT-TCACGTCtttctctttgtacaatatttctatatttacaatacaattaattgtcctcatgactaccacgctttctgaatttgtacaaataagaatcccaaagtttaataaatcttaaaat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTT-TCATTAATGGCATGAAAATATCT---GAA-----TCGAT-CCATGGTTCTGTCCTATGCTT-GATTCGT-ATCTGCTTGAAAGGAACGATATTGT-CAATGACCAACATA--AATA-A---ATGTTTAAACTTATCCAAAGCCT-CATTTAAAC-TATC---GCTCAG-CATAACA---GGACTCTAGTC-------------TGT-AGAT----AAC-A--GA---T---TGG--TTTGGAGCTCCTGTAGTTCTT-CATGGAACGT-----ATT-GT----AACA------TTATTATGTGTACTGTTTGAG-----GAT-------T-TT--GT------AGTTTTTCTTGTACAAATATTTA-T-C---GTATGGTCACT---AAAG-C---TAGTTCAATAGTACCAGACTGGG-A---AA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     tAACAAAT-GACTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----ACAAATATGTTGTTGCTAGAGTTA--CTGCCT----TTGTAAAAAT-CTATGAAGGCTTTT---A----AG----TCCAGATCAG---A--C---ATTTTTG-------G-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATTAAC-AATATTTGAAGCATCTATAGT-AAAAA-AA-AGACATTAACATGAATTGCTATTTTTTTAAGGATTA---TGGCAATTTTGATATTC---AATATTTAAAACTCCATTTG----CAT----GTCCACCTT-TATGAGATT-TATAATCTAAC-TGCTTTAAATGTTGCCACAAACGTT-TGGAGT-G-TTTCTA-TTTTCAGATATTTGATC--AAAAATATGTG-AACTTTGC---CTTTCT--A---------ACATCTCTTTGAATAATATTTTTAAATTTACAA-----------T-ACAATGAATTG-TCACCATGACTATCAT---G-CTTT-CTGAATT----TGTACAAATAAGAATC-CT-TAAGGTTTATAA--AATT---TAA-AATCTCACTTGA-------C-AT-CCAAGGCTCAGTTCTCTG-TT-TAA---G----TCTTTCACAGGGGCAATGGAATTCAAA-AC--TGACATCAATATC---TTT--ATAAGCTAACC-AAGAAC-TATTAACAT-TATCA--G---AATAAAAACA--CTTACTCCAATCAGC----C--TGACCT-AGCTTGTCAATAAGCAACTCTT--TTG--TTT-------------TTTTT-TATAAATCTTTTATAATTCTT----AACACAACTTACTTTA-GAAAAAT-----AGTGCTTAATAAATGTCTGTTTAGC------AATCTTCCTTGTACAAAAGGTCA-T-A---AAATGATACCT---TAAA-CCAATAG--AAATGGTACAAGATTG---ACTCAGTT-TA-TCTTTAGAA---CTAGTG-ACA--ATATGATCAATAATACTAATTGAAG---TTTTAG--TGAT-TTTA-GTT--GCTTCATTG-ATAATCTGATGTAAATAAAAAATTC----TCAAA-ATATTTAAATAAGACTTAA---AGAG--TGAAC---TAATT-TTTAG--TTTAA---AACAAA-----TACTGACATCCCC--TG--GGAGAAAAATTTCATAGTCTGAT------C-T-AAGGTTTGTTAAA-ACACTT----TCAAGATGATCAATAAAGGTGGCCTATTTTGGAGGCCTAT-ACGTAGTATCTACAATAATGGG--TTGATTTTTGGTAAAAGAAGTTCA----ACAAAAA----TAAGT--TCATCATT--CATCAGGTCTAGTAGT-AATGCAGTACCATTCCTCACATAGCAACATACTTCTCCATGTCTGTTTCTA--CCGCAT-----CTTGC-TACACT---GTAATT--G-TCAACGTG-TATTTCTGCATC----AT----TCATCATTCCATGTTTC--TGATAAAGTAATTATAGCTGCTCT--GCTCT-TCATGGCAACAATATTC-----ATTTCAGATATTTTTGGTAAAATAG--ATCTAACATGCATA-TGTATAAAGCTAAGTCCTTTCTT--TAAAAAGCACTAGAAATGAT--CCTCTGACGCT-GTAGATGGTCGAGA-TG-TTGAAGA
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgcattatgattcctaagaACCTTGTTTCGAAAGCAACAA--AAT-TGC-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--AAT---G-TTTTCTTATAAT----TGTATAAGGCACTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAGTT---CAAGAATTCCA---GAG----GTg
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|23 ): TATCAAGGTACAGTGAAGTTGATATCAAATATATGTAATATATGTTGATATCTATAAAACAAAGCAGAATTATTTTCTTTAAAACATATG






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Reference ( family-1986 )     :                                                                                                                                                               TTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCCTTGNAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----GT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAGTTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATNCAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTAAC-AAGATTTGCNGCGACTGTAGT-AAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATCATC---AATATTTAAAACAATATTCG----AAC----TTTCGTTTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGCTGCCATAGACCTT-TCACGTCA-TNCTTA-TTTTCTTCCACTTTATCNGAGAAATANTTA-GATTTTGTAGACTTTNT-TA-A---------ATAT-----TGAACCT-TGTTTCGAAAGCTACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--TAT---G-TTTT-TTATAAT----TGTATAAGGCATTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAATT---CGAGAATTTCA---GAG----GTC-AT-CCANGGTTCNGTNCNCTGCTT-TAATCTG-ACCTCTTTNATAGGAGCNATANTGTTTAATACATTCATAAAAATATA---ATGA--AAACNTGACCAA-GCAT-CGTTTACACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCAGCA---C--T--CGTGAGATTGTGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TGTAATTTTT-CATTGACCTN-----ATT-TT----AACG------GTTTTATGTGAATT-----AG-----AATAA---CCT-TTCGGT------A-CCTTCCTTGNACAAAACGTCA-T-A---AAATGATCGCT---AACA-CCAAT--AGGGATAGTACCAGACTGGA-A---AATT-CG-TCTTT---A---TTATTGCATAGGATATGGTCTATAAGGGTACTTGAAG---TGT--GCGAT-CACGCGTN--GGTTCGGTT-ATGATCTGATCTAGGTTAAAAATGCGT--AA-A-TATTGANATATGCTTTAT---ACAA--TGAAC---T--TT-CTT-T--TTTAAAACAACAAA-----TATTAAAATCACC--TA--ATATAANAGTTTCACTATCNGAT------C----GTAGATT----AAATAGATTTT-C-TCAAACCTATCGGTAAAGTTAGACTGNTTAGGCGGCCTATAACAC-GTACCNACAGTAATAGGCTTTG-TTTTCGGTAACAATAGCTCGATCCATAAAAATTCGTCAGT-ATGGTCACTTATATCTGNCCTAATATTAAANGCNAAATCGTTTCGNATATAGGTGCATACACCACCA---CCGTTTCNATTTCG-ATC----CTTACGNACAATACAATAATC--T-TCTAT-TGATACCTCTACGTCTGTAATAGAATCATCTAGCCAAGTTTCAGTGATAGAGTAATAACAGCGGCCCT-AGCTTTGTCATGGCAAAGAAACGA-----ATTTCGGACATTTTAGGTAAAATAA-GAGCTTGCATTT-ATATGAACAAAGCGCAATCCTTTCCTGGTAAAA--CATTGAAAATGGTCACTTTTAACATTAGTAGGT-----AAATTGTTTGAAGAATCA-TTTTATGCTCATTTGCTAAATTATCAAATTCAGAATTTTCAAATTC-AGAGTCACCAGGTAATAATTTAAAAGTACATTGAACGC-AGTAAAACAGATTGT--CTTTATCGTTACATGAAAACAGTTCATAGTCATTGACTGTGATGTAGCCGGTACACTTTATATGCGTC--TTTGAATGACAGGAATCACAGGTTACTGCTTTGCTTGTTGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTTT-CACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCCGCA---C--T--CGTGAGATTATGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TATAATTTTT-CATTGACCTT-----ATT-TT----TAAG------GTTTAATATGAATT-----AA-----AATAA---CAT-TTCGGT------gtcgagttaaaacatgtgctccagtccgcactcgtgagattatgaatgaaatcttgtttagtataatttttcattgaccttatttttaaggtttaatatgaattaaaataacatttcggtc
gi|16                         : tttagcagcatttaacttatttaattctttgaaaacaaaaatctcagtgatgtgattaattctaaaaatagtgtccggagacttcttcgcgttataaaaattcttaaaattttgtgaaaatgtagtaaaaatatgtatatggttcggcagcttattaacattatttgccgcgactgtagtaaaaaaattattaaaacgattcgcgtttgtcaaagaatcatgacaaacctcattatcaatatttaaaacaatattcgaacttttgtttgtcatatatttctaacccagcttttttcaactgctgccatagaccAAAAATCTATC--A----AGGTTATCCAGGTTAA---ACGATTTACATGGA-------C-----AAGGTT--------G-----TTTATCAGC-AAATTTCGAAGCTACTGTGGT-TAACT-AG-C--CATTAAAATGATTTGCTATT-TTA-----ATCACTTTGACAAGTTTGATCTTCAATAATATCTAAAACTACATTTG----CAT----TTCCACCTT-TATGAGATT-TGAAACCTAAC-TGCTTTAAATGCTGCCACAGACCTT-TTGGATTA-TTC-TA-TTTTCAGATATTTGATCAGAAAAACATGTA-AACTTTGTTTTCTCTTTGTACA---------ATAT-----T---TCTATATTTACAA---TACAATTAAT-TGTCC-TC-ATGAc
gi|17                         :                                                                                                           ctctgacacatgttttacaacaaatctgttgttgctagagtttctgcctttgaTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCATTGAAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----AT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAATTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATGTAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTTAC-AAGATTTGCTGCGACTGTAGTAAAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATTATC---AATATTTAAGACAATATTCA----AAC----TTTTG-TTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGTTGCCATAGACCTT-TCACGTCctaccacgctttctgaatttgtacaaataagaatcccaaagtttaataaatcttaaaat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTT-TCATTAATGGCATGAAAATATCT---GAA-----TCGAT-CCATGGTTCTGTCCTATGCTT-GATTCGT-ATCTGCTTGAAAGGAACGATATTGTC-AATG-ACCAACATAAATA-A---ATGTTTAAACTTATCCAAAGCCT-CATTTAAAC-TATC---GCTCAGC-ATAACA--GG-ACTCTAGTC-------------TGT-AGAT----AAC-A--GA---T---TGG--TTTGGAGCTCCTGTAGTTCTT-CATGGAACGT-----ATT-GT----AACA------TTATTATGTGTACTGTTTGAG-----GAT-------T-TT--GT------AGTTTTTCTTGTACAAATATTTA-T-C---GTATGGTCACT---AAAG-CTAGTTCA---ATAGTACCAGACTGGG-A---AA
gi|19                         :                                                                                                                                                               TTAGAACAA-TTTAATTTA--CATAGTTCTTTGTATACAAAA-TCTTCACTTACT-----GTG-----CGA-AGTTTAAATTT-A----------------ACAGA-----AT-------CTGGA-----TTTCTTTT-TTTATAAAAATCTTTTAGAA--TAGT--------AG---ATTCAG--CATTGTA--A---ATTTTTG-------------AGGGTAAA--GGCAA-----TTTTTTAACTAACATA-GAAGCAACATTGGT-AAAAA-AA-T--TATTAAAATGATTGGCAATTTTCA-TAGGCTCA---AAACAGTTTTCATCGTC---AATTTTCAAAACAATATTAGGAGAAGA----TTTAGTCTTG--TTA---C-TGTACCCTAAC-TTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                   tAGCA-TTGAGATTG--CTACATACATTATTAACAAAT-GACTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAAT-----ATGTTGTTGCTAGAGTTA-CTGCCT----TTGTAAAAAT-CTATGAAGGCTTTT---A----AG----TCCAGATCAG---A--C---ATTTTTG-------G-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATTAAC-AATATTTGAAGCATCTATAGT-AAAAA-AA-AGACATTAACATGAATTGCTATTTTTTTAAGGATTA---TGGCAATTTTGATATTC---AATATTTAAAACTCCATTTG----CAT----GTCCACCTT-TATGAGATT-TATAATCTAAC-TGCTTTAAATGTTGCCACAAACGTT-TGGAGT-G-TTTCTA-TTTTCAGATATTTGATC--AAAAATATGTG-AACTTTGC---CTTTCT----A---------ACATCTCTTTGAATAA-TATTTTTAAATTTACAA-------------T-ACAATGAATTG-TCACCATGACTATCAT---G-CTTT-CTGAATT----TGTACAAATAAGAATC-CT-TAAGGTTTATAA--AATT---TAA-AATCTCACTTGA-------C-AT-CCAAGGCTCAGTTCTCTG-TT-TAA---G----TCTTTCACAGGGGCAATGGAATTCAAAAC--TGACATCAATATC---TTTA--TAAGCTAACCAA-GAAC-TATTAACAT-TATCA--G---AATAAAAACA--CTTACTCCAATCAGC----C--TGACCT-AGCTTGTCAATAAGCAACTCTT--TTG--TTT-------------TTTTT-TATAAATCTTTTATAATTCTT----AACACAACTTACTTTA-GAAAAAT-----AGTGCTTAATAAATGTCTGTTTAGC------AATCTTCCTTGTACAAAAGGTCA-T-A---AAATGATACCT---TAAA-CCAAT--AGAAATGGTACAAGATTG---ACTCAGTT-TA-TCTTTAGAA---CTAGTG-ACA--ATATGATCAATAATACTAATTGAAG---TTTTAGTGAT-TTTA-GTT--GCTTCATTG-ATAATCTGATGTAAATAAAAAATTC-TCAAA-A-TATTTAAATAAGACTTAA---AGAG--TGAAC---TAATT-TTTAG--TTTAA---AACAAA-----TACTGACATCCCC--TG--GGAGAAAAATTTCATAGTCTGAT------CTAAGGTTTGTT----AAA-ACACTT----TCAAGATGATCAATAAAGGTGGCCTATTTTGGAGGCCTAT-ACGTAGTATCTACAATAATGGG--TTGATTTTTGGTAAAAGAAGTTCA----ACAAAAA----TAAGT--TCATCATT--CATCAGGTCTAGTAGT-AATGCAGTACCATTCCTCACATAGCAACATACTTCTCCATGTCTGTTTCTA--CCGCAT-----CTTGC-TACACT---GTAATT--G-TCAACGTG-TATTTCTGCATC----AT----TCATCATTCCATGTTTC--TGATAAAGTAATTATAGCTGCTCT--GCTCT-TCATGGCAACAATATTC-----ATTTCAGATATTTTTGGTAAAAT-A-GATCTAACATGC-ATATGTATAAAGCTAAGTCCTTTCTT--TAAAAAGCACTAGAAATGAT--CCTCTGACGCT-GTAGATGGTCGAGA-TG-TTGAAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                          TCCTTGTACACAAAT-GTTTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAATCTGTTGTTG-----CTAGAG----TTTCTGCC-TTTGTAAAAAT-CTATCGAGGCTTTTG--AGTCGAG---AT------CAA---A--C---A-ATTTAC------T-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATCAAC-AAGATTTGAAGCTACTGTGGT-AAAAgggtcctgaagatgtgtctgtagaaaaagaagtgtcagcagtgtacagg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgcattatgattcctaagaACCT-TGTTTCGAAAGCAACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--AAT---G-TTTTCTTATAAT----TGTATAAGGCACTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAGTT---CAAGAATTCCA---GAG----GTg
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atTGCCATAGACCTT-TCACATta
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Reference ( family-1986 )     :                                                                                                                                                               TTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCCTTGNAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----GT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAGTTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATNCAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTAAC-AAGATTTGCNGCGACTGTAGT-AAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATCATC---AATATTTAAAACAATATTCG----AAC----TTTCGTTTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGCTGCCATAGACCTT-TCACGTCA-TNCTTA-TTTTCTTCCACTTTATCNGAGAAATANTTA-GATTTTGTAGACTTTNT-TA-A---------ATAT-----TGAACCT-TGTTTCGAAAGCTACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--TAT---G-TTTT-TTATAAT----TGTATAAGGCATTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAATT---CGAGAATTTCA---GAG----GTC-AT-CCANGGTTCNGTNCNCTGCTT-TAATCTG-ACCTCTTTNATAGGAGCNATANTGTTTAATACATTCATAAAAATATA---ATGA--AAACNTGACCAA-GCAT-CGTTTACACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCAGCA---C--T--CGTGAGATTGTGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TGTAATTTTT-CATTGACCTN-----ATT-TT----AACG------GTTTTATGTGAATT-----AG-----AATAA---CCT-TTCGGT------A-CCTTCCTTGNACAAAACGTC-AT-A---AAATGATCGC-T---AACA-CCAAT--AGGGATAGTACCAGACTGGA-A---AATT-C-G-TCTTT---A---TTATTGCATAGGATATGGTCTATAAGGGTACTTGAAG---TGT--GCGAT-CACGCGT--NGGTTCGGTT-ATGATCTGATCTAGGTTAAAAATGCGTAACATATTGANATATGCTTTAT---ACAA--TGAAC---T--TT-CTT-T--TTTAAAACAACA-----AATATTAAAATCACC--TA--ATATAANAGTTTCACTATCNGAT------C----GTAGATT----AAATAGATTTT-C-TCAAACCTATCGGTAAAGTTAGACTGNTTAGGCGGCCTATAACAC-GTACCNACAGTAATAGGCTTTG-TTTTCGGTAACAATAGCTCGATCCATAAAAATTCGTCAGT-ATGGTCACTTATATCTGNCCTAATATTAAANGCNAAATCGTTTCGNATATAGGTGCATACACCACCA---CCGTTTCNATTTCG-ATC----CTTACGNACAATACAATAATC--T-TCTAT-TGATACCTCTACGTCTGTAATAGAATCATCTAGCCAAGTTTCAGTGATAGAGTAATAACAGCGGCCCT-AGCTTTGTCATGGCAAAGAAACGA-----ATTTCGGACATTTTAGGTAAAATAA-GAGCTTGCATTT-ATATGAACAAAGCGCAATCCTTTCCTGGTAAAA--CATTGAAAATGGTCACTTTTAACATTAGTAGGT-----AAATTGTTTGAAGAATCA-TTTTATGCTCATTTGCTAAATTATCAAATTCAGAATTTTCAAATTC-AGAGTCACCAGGTAATAATTTAAAAGTACATTGAACGC-AGTAAAACAGATTGT--CTTTATCGTTACATGAAAACAGTTCATAGTCATTGACTGTGATGTAGCCGGTACACTTTATATGCGTC--TTTGAATGACAGGAATCACAGGTTACTGCTTTGCTTGTTGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTTT-CACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCCGCA---C--T--CGTGAGATTATGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TATAATTTTT-CATTGACCTT-----ATT-TT----TAAG------GTTTAATATGAATT-----AA-----AATAA---CAT-TTCGGT------gtcgagttaaaacatgtgctccagtccgcactcgtgagattatgaatgaaatcttgtttagtataatttttcattgaccttatttttaaggtttaatatgaattaaaataacatttcggtc
gi|16                         : tttagcagcatttaacttatttaattctttgaaaacaaaaatctcagtgatgtgattaattctaaaaatagtgtccggagacttcttcgcgttataaaaattcttaaaattttgtgaaaatgtagtaaaaatatgtatatggttcggcagcttattaacattatttgccgcgactgtagtaaaaaaattattaaaacgattcgcgtttgtcaaagaatcatgacaaacctcattatcaatatttaaaacaatattcgaacttttgtttgtcatatatttctaacccagcttttttcaactgctgccatagaccAAAAATCTATC--A----AGGTTATCCAGGTTAA---ACGATTTACATGGA-------C-----AAGGTT--------G-----TTTATCAGC-AAATTTCGAAGCTACTGTGGT-TAACT-AG-C--CATTAAAATGATTTGCTATT-TTA-----ATCACTTTGACAAGTTTGATCTTCAATAATATCTAAAACTACATTTG----CAT----TTCCACCTT-TATGAGATT-TGAAACCTAAC-TGCTTTAAATGCTGCCACAGACCTT-TTGGATTA-TTC-TA-TTTTCAGATATTTGATCAGAAAAACATGTA-AACTTTGTTTTCTCTTTGTACA---------ATAT-----T---TCTATATTTACAA---TACAATTAAT-TGTCC-TC-ATGAc
gi|17                         :                                                                                                           ctctgacacatgttttacaacaaatctgttgttgctagagtttctgcctttgaTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCATTGAAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----AT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAATTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATGTAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTTAC-AAGATTTGCTGCGACTGTAGTAAAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATTATC---AATATTTAAGACAATATTCA----AAC----TTTTG-TTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGTTGCCATAGACCTT-TCACGTCctaccacgctttctgaatttgtacaaataagaatcccaaagtttaataaatcttaaaat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTT-TCATTAATGGCATGAAAATATCT---GAA-----TCGAT-CCATGGTTCTGTCCTATGCTT-GATTCGT-ATCTGCTTGAAAGGAACGATATTGTC-AATG-ACCAACATAAATA-A---ATGTTTAAACTTATCCAAAGCCT-CATTTAAAC-TATC---GCTCAGC-ATAACA--GG-ACTCTAGTC-------------TGT-AGAT----AAC-A--GA---T---TGG--TTTGGAGCTCCTGTAGTTCTT-CATGGAACGT-----ATT-GT----AACA------TTATTATGTGTACTGTTTGAG-----GAT-------T-TT--GT------AGTTTTTCTTGTACAAATATTT-AT-C---GTATGGTCAC-T---AAAG-CTAGTTCA---ATAGTACCAGACTGGG-A---AA
gi|19                         :                                                                                                                                                               TTAGAACAA-TTTAATTTA--CATAGTTCTTTGTATACAAAA-TCTTCACTTACT-----GTG-----CGA-AGTTTAAATTT-A----------------ACAGA-----AT-------CTGGA-----TTTCTTTT-TTTATAAAAATCTTTTAGAA--TAGT--------AG---ATTCAG--CATTGTA--A---ATTTTTG-------------AGGGTAAA--GGCAA-----TTTTTTAACTAACATA-GAAGCAACATTGGT-AAAAA-AA-T--TATTAAAATGATTGGCAATTTTCA-TAGGCTCA---AAACAGTTTTCATCGTC---AATTTTCAAAACAATATTAGGAGAAGA----TTTAGTCTTG--TTA---C-TGTACCCTAAC-TTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                   tAGCA-TTGAGATTG--CTACATACATTATTAACAAAT-GACTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAAT-----ATGTTGTTGCTAGAGTTA-CTGCCT----TTGTAAAAAT-CTATGAAGGCTTTT---A----AG----TCCAGATCAG---A--C---ATTTTTG-------G-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATTAAC-AATATTTGAAGCATCTATAGT-AAAAA-AA-AGACATTAACATGAATTGCTATTTTTTTAAGGATTA---TGGCAATTTTGATATTC---AATATTTAAAACTCCATTTG----CAT----GTCCACCTT-TATGAGATT-TATAATCTAAC-TGCTTTAAATGTTGCCACAAACGTT-TGGAGT-G-TTTCTA-TTTTCAGATATTTGATC--AAAAATATGTG-AACTTTGC---CTTTCT----A---------ACATCTCTTTGAATAA-TATTTTTAAATTTACAA-------------T-ACAATGAATTG-TCACCATGACTATCAT---G-CTTT-CTGAATT----TGTACAAATAAGAATC-CT-TAAGGTTTATAA--AATT---TAA-AATCTCACTTGA-------C-AT-CCAAGGCTCAGTTCTCTG-TT-TAA---G----TCTTTCACAGGGGCAATGGAATTCAAAAC--TGACATCAATATC---TTTA--TAAGCTAACCAA-GAAC-TATTAACAT-TATCA--G---AATAAAAACA--CTTACTCCAATCAGC----C--TGACCT-AGCTTGTCAATAAGCAACTCTT--TTG--TTT-------------TTTTT-TATAAATCTTTTATAATTCTT----AACACAACTTACTTTA-GAAAAAT-----AGTGCTTAATAAATGTCTGTTTAGC------AATCTTCCTTGTACAAAAGGTC-AT-A---AAATGATACC-T---TAAA-CCAAT--AGAAATGGTACAAGATTG---ACTCAGTT-T-A-TCTTTAGAA---CTAGTG-ACA--ATATGATCAATAATACTAATTGAAG---TTTTAGTGAT-TTTA-GT--TGCTTCATTG-ATAATCTGATGTAAATAAAAAATTCTCAAAATATTTAAATAAGACTTAA---AGAG--TGAAC---TAATT-TTTAG--TTTAA---AACA-----AATACTGACATCCCC--TG--GGAGAAAAATTTCATAGTCTGAT------CTAAGGTTTGTT----AAA-ACACTT----TCAAGATGATCAATAAAGGTGGCCTATTTTGGAGGCCTAT-ACGTAGTATCTACAATAATGGG--TTGATTTTTGGTAAAAGAAGTTCA----ACAAAAA----TAAGT--TCATCATT--CATCAGGTCTAGTAGT-AATGCAGTACCATTCCTCACATAGCAACATACTTCTCCATGTCTGTTTCTA--CCGCAT-----CTTGC-TACACT---GTAATT--G-TCAACGTG-TATTTCTGCATC----AT----TCATCATTCCATGTTTC--TGATAAAGTAATTATAGCTGCTCT--GCTCT-TCATGGCAACAATATTC-----ATTTCAGATATTTTTGGTAAAAT-A-GATCTAACATGC-ATATGTATAAAGCTAAGTCCTTTCTT--TAAAAAGCACTAGAAATGAT--CCTCTGACGCT-GTAGATGGTCGAGA-TG-TTGAAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                          TCCTTGTACACAAAT-GTTTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAATCTGTTGTTG-----CTAGAG----TTTCTGCC-TTTGTAAAAAT-CTATCGAGGCTTTTG--AGTCGAG---AT------CAA---A--C---A-ATTTAC------T-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATCAAC-AAGATTTGAAGCTACTGTGGT-AAAAgggtcctgaagatgtgtctgtagaaaaagaagtgtcagcagtgtacagg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgcattatgattcctaagaACCT-TGTTTCGAAAGCAACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--AAT---G-TTTTCTTATAAT----TGTATAAGGCACTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAGTT---CAAGAATTCCA---GAG----GTg
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atTGCCATAGACCTT-TCACATta
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Reference ( family-1986 )     :                                                                                                                                                               TTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCCTTGNAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----GT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAGTTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATNCAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTAAC-AAGATTTGCNGCGACTGTAGT-AAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATCATC---AATATTTAAAACAATATTCG----AAC----TTTCGTTTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGCTGCCATAGACCTT-TCACGTCA-TNCTTA-TTTTCTTCCACTTTATCNGAGAAATANTTA-GATTTTGTAGACTTTNT-TA-A---------ATAT-----TGAACCT-TGTTTCGAAAGCTACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--TAT---G-TTTT-TTATAAT----TGTATAAGGCATTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAATT---CGAGAATTTCA---GAG----GTC-AT-CCANGGTTCNGTNCNCTGCTT-TAATCTG-ACCTCTTTNATAGGAGCNATANTGTTTAATACATTCATAAAAATATA---ATGA--AAACNTGACCAA-GCAT-CGTTTACACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCAGCA---C--T--CGTGAGATTGTGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TGTAATTTTT-CATTGACCTN-----ATT-TT----AACG------GTTTTATGTGAATT-----AG-----AATAA---CCT-TTCGGT------A-CCTTCCTTGNACAAAACGTC-AT-A---AAATGATCGC-T---AACA-CCAAT--AGGGATAGTACCAGACTGGA-A---AATT-C-G-TCTTT---A---TTATTGCATAGGATATGGTCTATAAGGGTACTTGAAG---TGT--GCGAT-CACGCGT--NGGTTCGGTT-ATGATCTGATCTAGGTTAAAAATGCGTAACATATTGANATATGCTTTAT---ACAA--TGAAC---T--TT-CTT-T--TTTAAAACAACA-----AATATTAAAATCACC--TA--ATATAANAGTTTCACTATCNGAT------C----GTAGATT----AAATAGATTTT-C-TCAAACCTATCGGTAAAGTTAGACTGNTTAGGCGGCCTATAACAC-GTACCNACAGTAATAGGCTTTG-TTTTCGGTAACAATAGCTCGATCCATAAAAATTCGTCAGT-ATGGTCACTTATATCTGNCCTAATATTAAANGCNAAATCGTTTCGNATATAGGTGCATACACCACCA---CCGTTTCNATTTCG-ATC----CTTACGNACAATACAATAATC--T-TCTAT-TGATACCTCTACGTCTGTAATAGAATCATCTAGCCAAGTTTCAGTGATAGAGTAATAACAGCGGCCCT-AGCTTTGTCATGGCAAAGAAACGA-----ATTTCGGACATTTTAGGTAAAATAA-GAGCTTGCATTT-ATATGAACAAAGCGCAATCCTTTCCTGGTAAAA--CATTGAAAATGGTCACTTTTAACATTAGTAGGT-----AAATTGTTTGAAGAATCA-TTTTATGCTCATTTGCTAAATTATCAAATTCAGAATTTTCAAATTC-AGAGTCACCAGGTAATAATTTAAAAGTACATTGAACGC-AGTAAAACAGATTGT--CTTTATCGTTACATGAAAACAGTTCATAGTCATTGACTGTGATGTAGCCGGTACACTTTATATGCGTC--TTTGAATGACAGGAATCACAGGTTACTGCTTTGCTTGTTGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTTT-CACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCCGCA---C--T--CGTGAGATTATGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TATAATTTTT-CATTGACCTT-----ATT-TT----TAAG------GTTTAATATGAATT-----AA-----AATAA---CAT-TTCGGT------gtcgagttaaaacatgtgctccagtccgcactcgtgagattatgaatgaaatcttgtttagtataatttttcattgaccttatttttaaggtttaatatgaattaaaataacatttcggtc
gi|16                         : tttagcagcatttaacttatttaattctttgaaaacaaaaatctcagtgatgtgattaattctaaaaatagtgtccggagacttcttcgcgttataaaaattcttaaaattttgtgaaaatgtagtaaaaatatgtatatggttcggcagcttattaacattatttgccgcgactgtagtaaaaaaattattaaaacgattcgcgtttgtcaaagaatcatgacaaacctcattatcaatatttaaaacaatattcgaacttttgtttgtcatatatttctaacccagcttttttcaactgctgccatagaccAAAAATCTATC--A----AGGTTATCCAGGTTAA---ACGATTTACATGGA-------C-----AAGGTT--------G-----TTTATCAGC-AAATTTCGAAGCTACTGTGGT-TAACT-AG-C--CATTAAAATGATTTGCTATT-TTA-----ATCACTTTGACAAGTTTGATCTTCAATAATATCTAAAACTACATTTG----CAT----TTCCACCTT-TATGAGATT-TGAAACCTAAC-TGCTTTAAATGCTGCCACAGACCTT-TTGGATTA-TTC-TA-TTTTCAGATATTTGATCAGAAAAACATGTA-AACTTTGTTTTCTCTTTGTACA---------ATAT-----T---TCTATATTTACAA---TACAATTAAT-TGTCC-TC-ATGAc
gi|17                         :                                                                                                           ctctgacacatgttttacaacaaatctgttgttgctagagtttctgcctttgaTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCATTGAAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----AT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAATTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATGTAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTTAC-AAGATTTGCTGCGACTGTAGTAAAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATTATC---AATATTTAAGACAATATTCA----AAC----TTTTG-TTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGTTGCCATAGACCTT-TCACGTCctaccacgctttctgaatttgtacaaataagaatcccaaagtttaataaatcttaaaat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTT-TCATTAATGGCATGAAAATATCT---GAA-----TCGAT-CCATGGTTCTGTCCTATGCTT-GATTCGT-ATCTGCTTGAAAGGAACGATATTGTC-AATG-ACCAACATAAATA-A---ATGTTTAAACTTATCCAAAGCCT-CATTTAAAC-TATC---GCTCAGC-ATAACA--GG-ACTCTAGTC-------------TGT-AGAT----AAC-A--GA---T---TGG--TTTGGAGCTCCTGTAGTTCTT-CATGGAACGT-----ATT-GT----AACA------TTATTATGTGTACTGTTTGAG-----GAT-------T-TT--GT------AGTTTTTCTTGTACAAATATTT-AT-C---GTATGGTCAC-T---AAAG-CTAGTTCA---ATAGTACCAGACTGGG-A---AA
gi|19                         :                                                                                                                                                               TTAGAACAA-TTTAATTTA--CATAGTTCTTTGTATACAAAA-TCTTCACTTACT-----GTG-----CGA-AGTTTAAATTT-A----------------ACAGA-----AT-------CTGGA-----TTTCTTTT-TTTATAAAAATCTTTTAGAA--TAGT--------AG---ATTCAG--CATTGTA--A---ATTTTTG-------------AGGGTAAA--GGCAA-----TTTTTTAACTAACATA-GAAGCAACATTGGT-AAAAA-AA-T--TATTAAAATGATTGGCAATTTTCA-TAGGCTCA---AAACAGTTTTCATCGTC---AATTTTCAAAACAATATTAGGAGAAGA----TTTAGTCTTG--TTA---C-TGTACCCTAAC-TTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                   tAGCA-TTGAGATTG--CTACATACATTATTAACAAAT-GACTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAAT-----ATGTTGTTGCTAGAGTTA-CTGCCT----TTGTAAAAAT-CTATGAAGGCTTTT---A----AG----TCCAGATCAG---A--C---ATTTTTG-------G-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATTAAC-AATATTTGAAGCATCTATAGT-AAAAA-AA-AGACATTAACATGAATTGCTATTTTTTTAAGGATTA---TGGCAATTTTGATATTC---AATATTTAAAACTCCATTTG----CAT----GTCCACCTT-TATGAGATT-TATAATCTAAC-TGCTTTAAATGTTGCCACAAACGTT-TGGAGT-G-TTTCTA-TTTTCAGATATTTGATC--AAAAATATGTG-AACTTTGC---CTTTCT----A---------ACATCTCTTTGAATAA-TATTTTTAAATTTACAA-------------T-ACAATGAATTG-TCACCATGACTATCAT---G-CTTT-CTGAATT----TGTACAAATAAGAATC-CT-TAAGGTTTATAA--AATT---TAA-AATCTCACTTGA-------C-AT-CCAAGGCTCAGTTCTCTG-TT-TAA---G----TCTTTCACAGGGGCAATGGAATTCAAAAC--TGACATCAATATC---TTTA--TAAGCTAACCAA-GAAC-TATTAACAT-TATCA--G---AATAAAAACA--CTTACTCCAATCAGC----C--TGACCT-AGCTTGTCAATAAGCAACTCTT--TTG--TTT-------------TTTTT-TATAAATCTTTTATAATTCTT----AACACAACTTACTTTA-GAAAAAT-----AGTGCTTAATAAATGTCTGTTTAGC------AATCTTCCTTGTACAAAAGGTC-AT-A---AAATGATACC-T---TAAA-CCAAT--AGAAATGGTACAAGATTG---ACTCAGTT-T-A-TCTTTAGAA---CTAGTG-ACA--ATATGATCAATAATACTAATTGAAG---TTTTAGTGAT-TTTA-GT--TGCTTCATTG-ATAATCTGATGTAAATAAAAAATTCTCAAAATATTTAAATAAGACTTAA---AGAG--TGAAC---TAATT-TTTAG--TTTAA---AACA-----AATACTGACATCCCC--TG--GGAGAAAAATTTCATAGTCTGAT------CTAAGGTTTGTT----AAA-ACACTT----TCAAGATGATCAATAAAGGTGGCCTATTTTGGAGGCCTAT-ACGTAGTATCTACAATAATGGG--TTGATTTTTGGTAAAAGAAGTTCA----ACAAAAA----TAAGT--TCATCATT--CATCAGGTCTAGTAGT-AATGCAGTACCATTCCTCACATAGCAACATACTTCTCCATGTCTGTTTCTA--CCGCAT-----CTTGC-TACACT---GTAATT--G-TCAACGTG-TATTTCTGCATC----AT----TCATCATTCCATGTTTC--TGATAAAGTAATTATAGCTGCTCT--GCTCT-TCATGGCAACAATATTC-----ATTTCAGATATTTTTGGTAAAAT-A-GATCTAACATGC-ATATGTATAAAGCTAAGTCCTTTCTT--TAAAAAGCACTAGAAATGAT--CCTCTGACGCT-GTAGATGGTCGAGA-TG-TTGAAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                          TCCTTGTACACAAAT-GTTTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAATCTGTTGTTG-----CTAGAG----TTTCTGCC-TTTGTAAAAAT-CTATCGAGGCTTTTG--AGTCGAG---AT------CAA---A--C---A-ATTTAC------T-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATCAAC-AAGATTTGAAGCTACTGTGGT-AAAAgggtcctgaagatgtgtctgtagaaaaagaagtgtcagcagtgtacagg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgcattatgattcctaagaACCT-TGTTTCGAAAGCAACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--AAT---G-TTTTCTTATAAT----TGTATAAGGCACTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAGTT---CAAGAATTCCA---GAG----GTg
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atTGCCATAGACCTT-TCACATta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAAAGCACTGGAAAAGATCCTCTTGAGCTGTAGATGGTAGAGATGTTGACGAGAGTCCTGGAGATGTGTCTGTAGAAGAAAAGTGTCAGCAGGGTACAGG
Unaligned ( gi|23 ): TATCAAGGTACAGTGAAGTTGATATCAAATATATGTAATATATGTTGATATCTATAAAACAAAGCAGAATTATTTTCTTTAAAACATATG






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Reference ( family-1986 )     :                                                                                                                                                               TTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCCTTGNAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----GT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAGTTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATNCAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTAAC-AAGATTTGCNGCGACTGTAGT-AAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATCATC---AATATTTAAAACAATATTCG----AAC----TTTCGTTTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGCTGCCATAGACCTT-TCACGTCA-TNCTTA-TTTTCTTCCACTTTATCNGAGAAATANTTA-GATTTTGTAGACTTTNT-TA-A---------ATAT-----TGAACCT-TGTTTCGAAAGCTACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--TAT---G-TTTT-TTATAAT----TGTATAAGGCATTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAATT---CGAGAATTTCA---GAG----GTC-AT-CCANGGTTCNGTNCNCTGCTT-TAATCTG-ACCTCTTTNATAGGAGCNATANTGTTTAATACATTCATAAAAATATA---ATGA--AAACNTGACCAA-GCAT-CGTTTACACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCAGCA---C--T--CGTGAGATTGTGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TGTAATTTTT-CATTGACCTN-----ATT-TT----AACG------GTTTTATGTGAATT-----AG-----AATAA---CCT-TTCGGT------A-CCTTCCTTGNACAAAACGTCA-T-A---AAATGATCGCT---AACA-CCAAT--AGGGATAGTACCAGACTGGAAAATTCGG----TCTTT---A---TTATTGCATAGGATATGGTCTATAAGGGTACTTGAAG---TGT--GCGAT-TAC--GCGTN--GGTTCGGTT-ATGATCTGATCTAGGTTAAAAATGCGTAACATATTGANATATGCTTTAT---ACAA--TGAAC---T--TT-CTT-T--TTTAAAACAACAAA-----TATTAAAATCACC--TA--ATATAANAGTTTCACTATCNGAT------C----GTAGATT----AAATAGATTTT-C-TCAAACCTATCGGTAAAGTTAGACTGNTTAGGCGGCCTATAACAC-GTACCNACAGTAATAGGCTTTG-TTTTCGGTAACAATAGCTCGATCCATAAAAATTCGTCAGT-ATGGTCACTTATATCTGNCCTAATATTAAANGCNAAATCGTTTCGNATATAGGTGCATACACCACCA---CCGTTTCNATTTCG-ATC----CTTACGNACAATACAATAATC--T-TCTAT-TGATACCTCTACGTCTGTAATAGAATCATCTAGCCAAGTTTCAGTGATAGAG-AATAACAGCGGCCCT-AGCTTTGTCATGGCAAAGAAACGA-----ATTTCGGACATTTTAGGTAAAATA--GAGCTTGCATTTATA-TGAACAAAGCGCAATCCTTTCCTGGTAAAA--CATTGAAAATGGTCACTTTTAACATTAGTAGGT-----AAATTGTTTGAAGAATCA-TTTTATGCTCATTTGCTAAATTATCAAATTCAGAATTTTCAAATTC-AGAGTCACCAGGTAATAATTTAAAAGTACATTGAACGC-AGTAAAACAGATTGT--CTTTATCGTTACATGAAAACAGTTCATAGTCATTGACTGTGATGTAGCCGGTACACTTTATATGCGTC--TTTGAATGACAGGAATCACAGGTTACTGCTTTGCTTGTTGAAA
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTTT-CACATGTC---G---AGTTAAAACA--TGTGCTCCAGTCCGCA---C--T--CGTGAGATTATGAATGA--AA---TC--TTG--TTTAG------TATAATTTTT-CATTGACCTT-----ATT-TT----TAAG------GTTTAATATGAATT-----AA-----AATAA---CAT-TTCGGT------gtcgagttaaaacatgtgctccagtccgcactcgtgagattatgaatgaaatcttgtttagtataatttttcattgaccttatttttaaggtttaatatgaattaaaataacatttcggtc
gi|16                         : tttagcagcatttaacttatttaattctttgaaaacaaaaatctcagtgatgtgattaattctaaaaatagtgtccggagacttcttcgcgttataaaaattcttaaaattttgtgaaaatgtagtaaaaatatgtatatggttcggcagcttattaacattatttgccgcgactgtagtaaaaaaattattaaaacgattcgcgtttgtcaaagaatcatgacaaacctcattatcaatatttaaaacaatattcgaacttttgtttgtcatatatttctaacccagcttttttcaactgctgccatagaccAAAAATCTATC--A----AGGTTATCCAGGTTAA---ACGATTTACATGGA-------C-----AAGGTT--------G-----TTTATCAGC-AAATTTCGAAGCTACTGTGGT-TAACT-AG-C--CATTAAAATGATTTGCTATT-TTA-----ATCACTTTGACAAGTTTGATCTTCAATAATATCTAAAACTACATTTG----CAT----TTCCACCTT-TATGAGATT-TGAAACCTAAC-TGCTTTAAATGCTGCCACAGACCTT-TTGGATTA-TTC-TA-TTTTCAGATATTTGATCAGAAAAACATGTA-AACTTTGTTTTCTCTTTGTACA---------ATAT-----T---TCTATATTTACAA---TACAATTAAT-TGTCC-TC-ATGAc
gi|17                         :                                                                                                           ctctgacacatgttttacaacaaatctgttgttgctagagtttctgcctttgaTAGCAGCA-TTTAACTTA--TTTAATTCATTGAAAACAAAA-TCCTCAGTGAC------ATG-A---TTA-ATTTTAAA----A----------------AGAGT-----AT-------CTGGAG--A-CTTCTTCGAATTATAAAAAT-TCTTAAAAATTTGTG--A----AG---ATGTAG--CAA---A--A---ATATGTA-------T-----AGGGTTC---GGCAG-----CTTATTTAC-AAGATTTGCTGCGACTGTAGTAAAAAA-AA-T--CATTAAAATGATTCGCGATTGTCA-AAGGATCA---TGACAAACCTCATTATC---AATATTTAAGACAATATTCA----AAC----TTTTG-TTTGTCTTATATT-TGTAACCCAGC-TTTTTCAACTGTTGCCATAGACCTT-TCACGTCctaccacgctttctgaatttgtacaaataagaatcccaaagtttaataaatcttaaaat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CTT-TCATTAATGGCATGAAAATATCT---GAA-----TCGAT-CCATGGTTCTGTCCTATGCTT-GATTCGT-ATCTGCTTGAAAGGAACGATATTGTC-AATG-ACCAACATAAATA-A---ATGTTTAAACTTATCCAAAGCCT-CATTTAAAC-TATC---GCTCAGC-ATAACA--GG-ACTCTAGTC-------------TGT-AGAT----AAC-A--GA---T---TGG--TTTGGAGCTCCTGTAGTTCTT-CATGGAACGT-----ATT-GT----AACA------TTATTATGTGTACTGTTTGAG-----GAT-------T-TT--GT------AGTTTTTCTTGTACAAATATTTA-T-C---GTATGGTCACT---AAAG-CTAGTTCA---ATAGTACCAGACTGGGAAA
gi|19                         :                                                                                                                                                               TTAGAACAA-TTTAATTTA--CATAGTTCTTTGTATACAAAA-TCTTCACTTACT-----GTG-----CGA-AGTTTAAATTT-A----------------ACAGA-----AT-------CTGGA-----TTTCTTTT-TTTATAAAAATCTTTTAGAA--TAGT--------AG---ATTCAG--CATTGTA--A---ATTTTTG-------------AGGGTAAA--GGCAA-----TTTTTTAACTAACATA-GAAGCAACATTGGT-AAAAA-AA-T--TATTAAAATGATTGGCAATTTTCA-TAGGCTCA---AAACAGTTTTCATCGTC---AATTTTCAAAACAATATTAGGAGAAGA----TTTAGTCTTG--TTA---C-TGTACCCTAAC-TTTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                   tAGCA-TTGAGATTG--CTACATACATTATTAACAAAT-GACTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAAT-----ATGTTGTTGCTAGAGTTA-CTGCCT----TTGTAAAAAT-CTATGAAGGCTTTT---A----AG----TCCAGATCAG---A--C---ATTTTTG-------G-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATTAAC-AATATTTGAAGCATCTATAGT-AAAAA-AA-AGACATTAACATGAATTGCTATTTTTTTAAGGATTA---TGGCAATTTTGATATTC---AATATTTAAAACTCCATTTG----CAT----GTCCACCTT-TATGAGATT-TATAATCTAAC-TGCTTTAAATGTTGCCACAAACGTT-TGGAGT-G-TTTCTA-TTTTCAGATATTTGATC--AAAAATATGTG-AACTTTGC---CTTTCT----A---------ACATCTCTTTGAATAA-TATTTTTAAATTTACAA-------------T-ACAATGAATTG-TCACCATGACTATCAT---G-CTTT-CTGAATT----TGTACAAATAAGAATC-CT-TAAGGTTTATAA--AATT---TAA-AATCTCACTTGA-------C-AT-CCAAGGCTCAGTTCTCTG-TT-TAA---G----TCTTTCACAGGGGCAATGGAATTCAAAAC--TGACATCAATATC---TTTA--TAAGCTAACCAA-GAAC-TATTAACAT-TATCA--G---AATAAAAACA--CTTACTCCAATCAGC----C--TGACCT-AGCTTGTCAATAAGCAACTCTT--TTG--TTT-------------TTTTT-TATAAATCTTTTATAATTCTT----AACACAACTTACTTTA-GAAAAAT-----AGTGCTTAATAAATGTCTGTTTAGC------AATCTTCCTTGTACAAAAGGTCA-T-A---AAATGATACCT---TAAA-CCAAT--AGAAATGGTACAAGATTG----ACTCAGTTTATCTTTAGAA---CTAGTG-ACA--ATATGATCAATAATACTAATTGAAG---TTTTAGTGAT-TTT--A-GTT--GCTTCATTG-ATAATCTGATGTAAATAAAAAATTCTCAAAATATTTAAATAAGACTTAA---AGAG--TGAAC---TAATT-TTTAG--TTTAA---AACAAA-----TACTGACATCCCC--TG--GGAGAAAAATTTCATAGTCTGAT------CTAAGGTTTGTT----AAA-ACACTT----TCAAGATGATCAATAAAGGTGGCCTATTTTGGAGGCCTAT-ACGTAGTATCTACAATAATGGG--TTGATTTTTGGTAAAAGAAGTTCA----ACAAAAA----TAAGT--TCATCATT--CATCAGGTCTAGTAGT-AATGCAGTACCATTCCTCACATAGCAACATACTTCTCCATGTCTGTTTCTA--CCGCAT-----CTTGC-TACACT---GTAATT--G-TCAACGTG-TATTTCTGCATC----AT----TCATCATTCCATGTTTC--TGATAAAGTAATTATAGCTGCTCT--GCTCT-TCATGGCAACAATATTC-----ATTTCAGATATTTTTGGTAAAATA--GATCTAACATGCATA-TGTATAAAGCTAAGTCCTTTCTT--TAAAAAGCACTAGAAATGAT--CCTCTGACGCT-GTAGATGGTCGAGA-TG-TTGAAGA
gi|20                         :                                                                                                                                                                                          TCCTTGTACACAAAT-GTTTC--TGAC------AC--A---T---GTTTTAAA----A----------------CAAATCTGTTGTTG-----CTAGAG----TTTCTGCC-TTTGTAAAAAT-CTATCGAGGCTTTTG--AGTCGAG---AT------CAA---A--C---A-ATTTAC------T-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATCAAC-AAGATTTGAAGCTACTGTGGT-AAAAgggtcctgaagatgtgtctgtagaaaaagaagtgtcagcagtgtacagg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatgcattatgattcctaagaACCT-TGTTTCGAAAGCAACAA--AAT-TG--C-TT-ATAATAA-----TCAGTA-GACT--AAT---G-TTTTCTTATAAT----TGTATAAGGCACTGTCTCT-T---GCTT-TAATTAGTT---CAAGAATTCCA---GAG----GTg
gi|3                          :                                                                                                                                                                     GCA-TTAAGATTC--CTAAGTTCCTTGTACACAAAT-GACTC--TGAC------AT--A---T---GTTTTAAA----ACAAATCTGTTGTTGCTAGAGT-----GT-------CTG---------CCTTTG-----TAATAAT-CTATCAAGGCTTTTG--A----G-----TCCAGATCAA---A--C---A-ATTTAC------T-----AGGACAA---GGTAG-----TTTATCAAC-AAGATTTGAAGCTACTGTAGT-AAAAA-GG-T--CATTAAAATGATGTGTTATTTTTA---GGACTA---TGGCAATTTTGCTCTTC---AACATTTAAAACTACATT------AACAT--TTTCATTGT-TATTAGAATATATAACT-AAC-TGCTTTAAATGATGCCATAAACTTT-TTGGATTA-TTTCTA-TTTTCAGACATGTGATCTGAAAAATATGTA-GACTTTGC---CTTTCT-TA-C---------ATCTCGC--TGCACAA-TAGTTCTATATTAACAA-------------T-ACAATAAATGGTTCTATA-AACTACCAT---G-CGTT-CTGAATT----TGTACAAATAAGAATCTCT-A---AGTT-TAATAAAAT---TTAAAATCTCA---GTG------C-ATTCCAAGGCTCAGTTCTCTGTTT-AAGTCTA-ACTTCTTTCACAGGGGCAATGAAATTCAAAACTGGCATAAAAATATC---TTTA--AAAGCTAACCAA-GAAC-TATTGACAT-TATCAGCG---A---AAAACAAAT-TACTCCAGTCAGC----C--TGACCT-AGCTTGTCAATAA--CA---AC--TCT--TTT-G------CATAATCTTAACAC--ATCTG-----ATT-TAGAAAAATA------GTGCTA-------------AG-----AA-AA---TAT-TT--GTTAAGCAA-TCTTCCTAGTATAAAAGGTCT-T-A---AAATGATCACTTAAAACAACCAAT--AGAAATGGTACCAGACTC---AATTTA-----TTTTC---AGAATTAGTG-ACA--ATATGATCAATACTACTACTTGAAG---TTTTAGTGAT-T-C--TAGTT--GCTTCACTG-ATAATCTGATGTAA-TAAAAAATTCTCAAAATATTTGAATAAGACTTAA---AGAG--TGAACAAAT--AT-TTT-G--TTTAAAACAAC--------TATTGACATCCCC--TAGGAGATAAA--CTTCACAGTCTATT------C----TAAGGTTTGTTAAA-ACACTTT-C---AAGATTATCAATAGAGGTAGCCTGTTTTGGAGGCCTAT-ACATAGTACCTGCAATAATGAGTTTGG-TTAATGTTAAAAGAAGTTCAACAAATATAAGTTCTTCATTCATAA-CATTTAATTCAGATCTAGTGGTAAAAGCAATATCATTCCTCACATA---ACA---ACCTCCT---CCATGTATGTTTCT-ATCACATCTTAC-TAAACTATAATTATCAATGTGTAT-TGCTGCA---ACAT---TCACAGAACTGTCTAACCATGTTTC--TGACAAAGTAATTACAGC--TTCTAAGCACT-TCATGGC-----AACAATTTTCATTTCAGACAATTGAGGTAAAACA--GATCTAACATTCATA-TGTATAAAACTAAGTCATTTGCT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atTGCCATAGACCTT-TCACATta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): AAAAAGCACTGGAAAAGATCCTCTTGAGCTGTAGATGGTAGAGATGTTGACGAGAGTCCTGGAGATGTGTCTGTAGAAGAAAAGTGTCAGCAGGGTACAGG
Unaligned ( gi|23 ): TATCAAGGTACAGTGAAGTTGATATCAAATATATGTAATATATGTTGATATCTATAAAACAAAGCAGAATTATTTTCTTTAAAACATATG