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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTAACTTT-TAT-TAAGTT-C-ACGTAAGGATGTATG----------TAG--A-AGGATAGAAAAC---ATGCATCTCTCTGAC-AAATGTCGATAA----AAGAG-CTTGCGAAGAA-TAAAT--ATTTTGTCAATTTA-TCATTCAAATT-TCACAGGCATCTGATT-TAC-TT----------C---A-CATTAAATGTAAGGTTT-A----TGTCAC---CTTAGAT-GT-ATAATAATGTTTTAAG-CACGCATAATGTTATTG-ATT---T-TAAAATATTGCATTTTGAAGTAAGATTACAAGTA-CT-T--TCCTT-GATTTT-TT---ACTTGCAG-TA-TAC----ACATTTTATA---------ATCATAAGTACTTCAACAATTT--TAA-GCACAGTT-AGCTGAGAATGGTTTCAATTTG-TCGACAATAACATTGTTT-AAAGAAAGACTTTTGATTTGTATTTCTGAGATGAATGGAAGTTAG---GATATT--TGAAA--ACGT-GAT-TTCTTGAGATTTTGCTTGAATAGGCAAGC-GTTC-CTTACATCTCAATC--AGTTGCTTT-GCCTTTTCTTTATAAGTCCctttcactttcgagacaatttcattagtttaaacaatattttattcac
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cTCACTTA-TA-----------A-CCAATGACTTGTA----------TAG--A-AGGATAAGAAAC---TTGCAGCTC-CTGACTAAATGTTGATAA----AATAG-CACACAAATGATTAATA--ATTTG--TAAATTAGTCATTCAT----TAACAGGCAACCGATT-T-C-TTTCTTACTCTGATTTA-CATAACATGCAA-GTTG-TA---TGTAAT---CTTAGAT-GT-TTAAACATGTTCCGAT-CACGCATACTAATCTTG-AAT---T-AAAGATATTGTGGTTTG------AAGTA-----A-ATGTA-TCGTA-A----T-AT---GT-CG-----T-TA--------TTTT---------------AG-----CTGCAG--------TAA-ACACATTT-TGCTAGAAATGACATTGTTTTG-ATGAGAATTGCATTCTGC-AATGTAAGAATTGTGATTTGTTATCCTGAGATGAATGGGAGTAAA---TATAAT--TGAAA--A------------CGAGATTTTGCGTGTATACGCAAGC-GTACAC-AACATCTCAATC--AGTTGCATT-TCCTTCTCTTTATTAGTCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agcttgggtatagtatcaaatcaagatgaattggcttacactgtttttcaattttattctaacaatttcaACTTG-CATCTC---T-CTA-CCAAGGACTTACA----------TAG--A-AGGATAGGAAAC---TTGCATCTC-TCTACTTAACATTGATAA----AAAAG-TATGCGAAAAGTTAA-T--AATTGGCAAATTAA-TCATTCAAATT-TTACAGGCAACCGGTT-T-G-TTC---------A---A-CATAAAATGTAA-GGTGTATGTATGTAAT---CTTAGAT-GTCTTT--TATGTTTTAAA-CATGCAAAATGGTTTTG-AAT---T-TAAAATATTGTAATTTGAA-------TTTT--TA-------------------------GT-TGCAG-TA-TAC----AAATTTTGTACTGGTTATCATAAG---TACTTTAAAACTTT--TAA-ACACAATT-TGCAGGGAATGGTCTCGTTTTGTAC-AGAATTCCATTAAGC-CAAAAAATAATTTTCATTTGTATTTCTGAGATAAATGGAAGTTAT---GATATT--TAAAA--ATGA-GAT-ATTGCAAGATTCTGTGTGAATA
gi|15                         :                                                                                                                                                                     attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacacagaaggataggaaACTAA-TATGAA---T-T-A-CCAAATACTTGTA----------TAG--A-AAGATAAGAAAC---TTGCATCTC-GTGACAAAATGTTGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAATT--ATTTGATGAA--CAGGCATTCATAAT-TTACAGGCAACTGATTAT-T-TT----------A---A--------TGCAA-GTTG-TA---TGTAAG---CTTAAAT-GA-TAAAAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTT-AAT---T-AAgttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTA-T-TATA-------A-CCCAGGACTTGTA----------TAG--A-AGGATTGGAAAC---TTGCACCTC-CTGACTAAATGTTGATAA----TATAG-CACACGAGGCATTAATT--ATTTGGCAAATTAA-TCATTCATAAT-TTACAGACAACGGATT-T-C-TT----------G---TTCATAAACTGTAA-ATTGTAT---T-TAAT---CTTAAAT-GT-TAAAACATATTTCGAT-CACGCACAATAATCTTG-AAT---T-AAAGAATTTGAGGTTTGAAGGAAAATTTCTTGTA-ACTTG-TCGTT-A--TTT-TA---GC-TGCAG-TA-TAC----ACATTTTGCA---------ATAAAAAGTACTTGAACAATTTAAACACACACACATATG-TGGGAGTGGTATTGTTTTG-ATAAGAATCTCATTCTGG-AATGTAAGAATTTTGATTTGTGTTCCTGAGATGAATGGAAGTTAAGATGATAAT--TGAAA--ACGA-GAC-ATTGCCAGATTTTGCCTTAATACGCTAGC-GTTCACAAAA-TCTCAATC--AGTTGCCTT-TCCTTCTTGATATAATTCC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aataattagctgtaatgcttctgat-C-A-GCAAGGACTTATA----------TAG------GATACGAAAT---TTCCATCTC-TCCACTAAATGTTTATAA----AATAG-CATGTGAAGAATTAATA--ATTTTGCTAATTAA-ACATTCAAATT-TCACAGACAACTGATT-T-C-TTTTA-------A---A-CACAA--TGTAA-TGTG-TT---TGTAAC---CTTAAAT-GT-TGAATAATGTTACAAA-CATGCGAAATGATCTTG-AAC---T-AAA-ACATTGCAGT-------AAAATTTCAAGTA--CGC--TCTTTGA--TTT-TTTA-GT-TGCAG-TA-TAC----AAA-TTTGT----------ATGAGATT-ACT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcagaaaacaccatttacaacttgataaaaataattacagaaataactggatca-A-ACAATGACTTATA----------TAG--A-AGAA-----AAC---TTGCATATC-TCTACTAAAAGTTTATAA----AACAG-CATGCGAAGAGTAAATA--ATTTGGCAAATTAA-TCAT--------TTACAGGCAACTGATT-T-CTTT----------T---A-CATAAAATGTAA-GATG-TA---TGTAAC---CTTAAATAGT-TTGTACG-GTTTTAAA-CACGTAAAATA---TTGCAGTTTAT-AAAG----TAAAATCTGAAGT---AGTTTCCTTG-AT-------------TTT-ATA--GT-TGCAG-TA-TAC----AAAGTTTGTctagatattgcatgaatatgcgagtgttcataacatctcaatcagtttccttatctatacacgtccttggtcacagatattcatatttattcaaatgttgtagcttcatggtggat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              actttggattttacatacaaaatgacattgtaattcagttatgtgattatctgctataattg-A-GCAATGATTTATAATTTTATATGTAC--ATAGGATAGGAAAC---GTGCATATC-CCGGCTGAATGTCAGTGA----tctcatagagatttcgcgagattttgcgtgaatacgcgagctttaataacatctaaataggttgcttttccttccctatataagtcctttaattgaacaacaacattagtatggttcgtcatcaacataatcatcat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatCAATGATGTATA----------TAG--A-AGGATAGGAATC---TGGCGTCTG-CTGACTAAATGTTGTTAA----AATAG-CAAGC--AG-----ATT--ATTTGGCAAATTAA-TCATTCAGACT-TCATAGGCTTCTGCTT-T-C-TT----------GT--A-CATAAAt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGGTCTTATA----------TAG--A-AGTATAGGA--C---TTGTATCTC-TCTACTAAATGTTGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAATA--ATTTGGTAAATTAA-TCATTCATATT-TCAAAGATAACTGATT-C-C-TT----------AT--A-CATTAA-TGTAA-GCTGTAT---T-TAAC---CTTAGAT--T-TATA--ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTG-AAT---TCAAAAA----AAAATC--AAG---CACTTTTATTA-TTGTG-T--TT-AGGTTCAGT---G---GCAG-AA-TAC----AGATTTTGTA---------ATCACAAGTACTTCAATAATTT--TAA-ATGCAATT-TGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGC-AAAGAAATAAATTTGATTTGAATTGCTGAGATGAATGAAAAA----------------AAA--A--------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAAA-TCTCATTC--AGTTGC-------TTTTCC-TATAAGTCCTTG-tggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaatattctatagttgaatttactccattgAGAACTTATA----------TAG--A-AGGATAGGAAACGCTCCACATTT-------TAAATATTAATAATTTAAATAG-CACACAAAGGATTTATTTAATTTGGCAAATTAA-TCATTCAAAAT-TCACAGGCAAGTGATT-T-C-TT----------GC--A-CATAAAATGACA-GATG-AA---TGTAAT---CTTAGAT-GT-TTAAAAATGTTTTGAT-CACGAAAAATGAACTTG-AA----T-AAACATATTGAGGTTTGAAGTAAAATTTCTCATA-AAGTG-TTATC-A--TAT-A----GC-TGCAG-A---ACAAAGAAAGTTTGTA---------ATCAGAAGTACTTTAACtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              taagttatcaatccttaatttaatggccataaacaaaccaagacttgtttattaccatgaagttaaacattaagttgttttcacaagcttgttaataactgcttagttgaatttctagtaaaatacttgttaattattTATA----------TAG--A-AGGATAGGAAAC---TTGTATttta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aacatctcaacttgannnnnnnnnnA-TCATTCATAAT-ACACAGCCAACTGATT-T-C-TT----------GT--A-CATCAACTGTAA-GTTG-TA---TGTAAA---CTTAGAT-AT-TCAAACATGTTTCGAG-AACGCAAAATGATCTTG-AAT---T-AAAAATATTGAGATTTGAAGGAAACATTATCGTA-ATTTG-TTGCT-A--TTT-TA---GC-TGTA--ATATAC----AAATTTTGTA---------ATCAGATGTTCTTCAACAATTT--TAA-ACACAAAT-TTATGGGAATGGTATTGGTTTG-ATGACAATTTCAGTCTGC-AATGTAAGAATTTTGATTTGTGTTCCTGAGATGAAAGGAATTTGA---GATAAT--TGAA------------ATT--GAGATTTTGCAT--ATACGCGAGC-GTTCATAAAA-ACTCTATC--AGTTGCATT-TCCTTCTCTATATAATTCCTTG-ATG--AA-ATATACAAATaaggacttatatagaagg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aacaacaccgagttgtaggttacatactttttcataTGATT-T-C-TT----------AT--G-CATAAAATGTAA-GCTG-TA---TGTAATAACCTTAGAC-AT-TTTAGAATGTTTTAAAACATGCAAAATGATCTTG-AAT---C-AAAAACATTGTAGTTTGAAGAAAAATTTCAAGCA-CTTTCCTTGCT-T--TTT-TA---GT-CGCAG-TA-AAC----AAATTTTGTA---------ATTACAAGTACGTCAACAATTC--GAA-ACACAATT-TTATCAGTATGGTTTCATTTTG-TAGAGAATTCCATTGTGCAAATG-AAGAATTTTGATTGGTATACTTTAGATGAAAGGAAGTTAG---GATA------AAA--ACAA-GAT-TTTGCAAGACAGTGCTTGAATATTTGAGC-TTTCATAAAA-TCTCAACC--AGTTTCTTT-Tgatatctcttcatgaggattcacgtgaaccaaacttcccaaaattcaatttt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCTTGTACATAAA-TGGTT-G--TTT-CTTTAAT-TGCAG-TA-TAC----ACATTTTGTA---------ATCAGAAGTACATCACTAATTT--TAA-ACACAAAT-TGTTGTGAATGGTCTTGTTTTG-TTTAAAATTTCATTCTGC-AGCGTAAGtcgtc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctCAAAT-TTCTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGC-AATGTAAGAATTTTGATATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGTTGA---GATAAC--TGAAA--ACAA-GAT-ATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAAA-TATTGATC--AGTTGCCTT-TCCTTCTCTATATAATTCCTgccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattC-AATA-AAGTATTT-GGTTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGCCGA---GATAAT--TTCAA--ACGA-GAT-TTTGTAAGAtacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttagtagcagcaaaataataaggcattgtaaacgcttcgacaatttgaacagatgatcttattttctggggattgttttcctaaaA---GATGAT--TGAAA--GTAAAGAT-ATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAAcagtacgaat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttg--ATGA-GATTACT-CTAGATATTGCATGAATATGCGAGT-GTTCA-TAACATCTCAATC--AG-----TT-TCCTTATCTATACACGTCCTTG-GTCACAG-ATATatct
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcagaaaacaccatttacaacttgataaaaataattacagaaataactggatcacagcaaggacttatataggatacgaaatttccatctctccactaaatgtttataaaatagcatgtgaagaattaataattttgctaattaaacattcaaatttcacagacaactgatttcttttaaacacaatgtaatgtgtttgtaaccttaaatgttgaataatgttacaaacatgcgaaatgatcttgaactaaaacattgcagtaaaatttcaagtacgctctttgattttttagttgcagtatacaaatttgtGA-GAT-TTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC--TTTAATAACATCTAAATA--GGTTGCTTT-TCCTTCCCTATATAAGTCCTtcatatttattcaaatgttgtagcttcatggtggat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actttggattttacatacaaaatgacattgtaattcagttatgtgattatctgctataattgaacaatgacttatatagaagaaaacttgcatatctctactaaaagtttataaaacagcatgcgaagagtaaataatttggcaaattaatcatttacaggcaactgatttcttttacataaaatgtaagatgtatgtaaccttaaatagtttgtacggttttaaacacgtaaaatattgcagtttataaagtaaaatctgaagtagtttccttgattttatagttgcagtatacaaagtttgttctcataTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGTAAA--AAC-TATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCT-CTATATAATTCCTttaattgaacaacaacattagtatggttcgtcatcaacataatcatcat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAAGATAGTGTGTGAATACGCAAGC-TTTTACAAAA-CCCCAATC--ACTTGCTTT-TCTATCTCGGTATAATTCTTTG-GTA-AGGGATATAAAAAt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctttcttgtacataaatggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcaTAAA-TG--AATCTAAGTTGCATT-TCCTTCTCTATACAATTCCTTGAAAAT--GCATA-GGAAATATaaggaaaacataaatatagttatataattatta
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GAATAAGATAACTGAAAACAAAATTTTTCATATATACACATACATTAACATTCTCATCAGGTGGATTCAATATTTATCTTCATTTAAGTCTTT
Unaligned ( gi|20 ): TAAATCAGAACTGTCAATGTTATGAAAGATTTAAAATGGTTGTAATGTAACTAACTGTCATTGGTCATTCATTTTAATGATATTTTATACACA
Unaligned ( gi|24 ): TTGACTCGGTCAATACCAAATGGCATAAATCAGCCAAAAACATT






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Reference ( family-1981 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATATTCACTTA-TATATA---T-C-AN-CAAGGACTTATATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCC-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACGCGAAGAATTAATN--ATTTGGCAAATTAATCATTCANANTTCACAGGCAACTGATT-T-CTT----------AT--ACATAAAATGTAAG----NTGTATGTAA---CCTTAGAT-G--TTTAAANATGTTTCGAN-CACGCAAAATGATCTTGAATTAAA-AATATTGNAGTT--TGAA-G-AAAA-T-TTCNNGTA-----ATGTG-TCGTT-ATTTT-T--G--TTGCAG--TATACAAATTTTGTA------ATCAGAAGTACTTCAACAATTTTAAACACA-------ATTTGCTGGGAATGGTNTCGTTTTG-ACGAGAATTTCATTNTGCAANGNAAGAATTTTGATTTGTATTCCTGAGATGAATGGAAGTTAA---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATNTTGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-GTTCACAAANA-TCTCAATC--AGTTGCNTTTCCTTCTCTATATAANTCCTTGAT-AT-AG-AT--ATA-AAAATAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATTTA-T-TGTA-------AC-CAAGGACTTACATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAA
gi|1                          :                                                                                                                                             attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaaACTTG-CATCTC---T-CTAC-CAAGGACTTACACAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAAggacttacacagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|1                          :                                                                                                      attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaACTTG-CATCTC---T-CTAC-CAAGGACTTACATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TTAACAT---TGATAA----AAAAG-TATGCGAAAAGTTAATA--A-TTGGCAAATTAATCATTCAAATTTTACAGGCAACCGGTT-T-GTT----------CA--ACATAAAATGTAAGGTGTATGTATGTAA---TCTTAGAT-GTCTTT---TATGTTTTAAA-CATGCAAAATGGTTTTGAATTTAA-AATATTGTAATT--TGA------------------------------------ATTTT-TA-G--TTGCAG--TATACAAATTTTGTACTGGTTATCATAAGTACTTTAAAACTTTTAAACACA-------ATTTGCAGGGAATGGTCTCGTTTTGTAC-AGAATTCCATTAAGCCAAAAAATAATTTTCATTTGTATTTCTGAGATAAATGGAAGTTAT---GATATT--TAAAA--ATGA-GATATTGCAAGATTCTGTGTGAATA--------GTT-----------------------GCTTTTCCTTCTCTATATCAGTCCggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|10                         :                                                                            attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacacagaaggataggaa-C-AG-CAAGGACTTATATAG----GATACGAAATTTCCATCTCTC-CAC----TAAATGT---TTATAA----AATAG-CATGTGAAGAATTAATA--ATTTTGCTAATTAAACATTCAAATTTCACAGACAACTGATT-T-CTT----------TT--AAACACAATGTAAT----GTGTTTGTAA---CCTTAAAT-G--TTGAATAATGTTACAAA-CATGCGAAATGATCTTGAACT-AA-AACATTGCAGT----------AAAA-T-TTCAAGT------ACGC--TCTTTGATTTT-TTAG--TTGCAG--TATACAAA-TTTGTA------
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcagaaaacaccatttacaacttgataaaaataattacagaaataactggatca--ATGA-GATTACTCTAGATATTGCATGAATATGCGAGT-GTTCATAA-CA-TCTCAATC--AG-----TTTCCTTATCTATACACGTCCTTGGTCAC-AG-AT--ATtgagattactctagatattgcatgaatatgcgagtgttcataacatctcaatcagtttccttatctatacacgtccttggtcacagatattcatatttattcaaatgttgtagcttcatggtggat
gi|11                         : tcagaaaacaccatttacaacttgataaaaataattacagaaataactggatcacagcaaggacttatataggatacgaaatttccatctctccactaaatgtttataaaatagcatgtgaagaattaataattttgctaattaaacattcaaatttcacagacaactgatttcttttaaacacaatgtaatgtgtttgtaaccttaaatgttgaataatgttacaaacatgcgaaatgatcttgaactaaaacattgcagtaaaatttcaagtacgctctttgattttttagttgcagtatacaaatttgtAGAACTTATATAGA-AGGATAGGAAAC--GC---TCC---ACATTTTAAATAT---TAATAATTTAAATAG-CACACAAAGGATTTATTTAATTTGGCAAATTAATCATTCAAAATTCACAGGCAAGTGATT-T-CTT----------GC--ACATAAAATGACAG----ATGAATGTAA---TCTTAGAT-G--TTTAAAAATGTTTTGAT-CACGAAAAATGAACTTGAA-TAAA-CATATTGAGGTT--TGAA-GTAAAA-T-TTCTCATA-----AAGTG-TTATC-A-TAT-A--G--CTGCAGAACAAAGAAAGTTTGTA------ATCAGAAGTACTTTAAC---TTTAtcatatttattcaaatgttgtagcttcatggtggat
gi|12                         :                                                                                                                                                                            taagttatcaatccttaatttaatggccataaacaaaccaagacttgtttattaccatgaagttaaacattaagttgttttcacaagcttgttaataactgcttagttgaatttctagtaaaatacttgttaattatt-CAATGATGTATATAGA-AGGATAGGAATCTGGCGTCTGCT-GAC----TAAATGT---TGTTAA----AATAG-CAAGC--AG-----ATT--ATTTGGCAAATTAATCATTCAGACTTCATAGGCTTCTGCTT-T-CTT----------GT--ACATAAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T-TTCTTGTACATAAATG-G-TTGTT-TCTTT-A--A--TTGCAG--TATACACATTTTGTA------ATCAGAAGTACATCACTAATTTTAAACACA-------AATTGTTGTGAATGGTCTTGTTTTG-TTTAAAATTTCATTCTGCAGCGTAAGtggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgcCAAGATAGTGTGTGAATACGCAAGC-TTTTACAAA-A-CCCCAATC--ACTTGCTTTTCTATCTCGGTATAATTCTTTGGTAAG-GG-AT--ATA-AAAAgccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                        caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctttcttgtacataaatggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcaTGATT-T-CTT----------AT--GCATAAAATGTAAG----CTGTATGTAATAACCTTAGAC-A--TTTTAGAATGTTTTAAAACATGCAAAATGATCTTGAATCAAA-AACATTGTAGTT--TGAA-G-AAAAAT-TTCAAGCA-----CTTTCCTTGCT-TTTTT-A--G--TCGCAG--TAAACAAATTTTGTA------ATTACAAGTACGTCAACAATTCGAAACACA-------ATTTTATCAGTATGGTTTCATTTTG-TAGAGAATTCCATTGTGCAAATGAAGAATTTTGATTGGTATACTTTAGATGAAAGGAAGTTAG---GATA------AAA--ACAA-GATTTTGCAAGACAGTGCTTGAATATTTGAGC-TTTCATAAA-A-TCTCAACC--AGTTTCTTTTTCGTCaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-------ATTT-CTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGATATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGTTGA---GATAAC--TGAAA--ACAA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAA-A-TATTGATC--AGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAATTCCTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                           caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattcaACTAA-TATGAA---T-T-AC-CAAATACTTGTATAGA-AAGATAAGAAACTTGCATCTCGT-GAC----AAAATGT---TGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAATT--ATTTGATGAA-CAGGCATTCATAATTTACAGGCAACTGATTAT-TTT--------------------AATGCAAG----TTGTATGTAA---GCTTAAAT-G--ATAAAAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTTAATTAAacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTCGACAATTT-GAACAGATGATCTTATTTTCTGGGGATTGTTT--TCCTA-A--ACAAT----------AAAGTA-----TTTGGTTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGCCGA---GATAAT--TTCAA--ACGA-GATTTTGTAAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttagtagcagcaaaataataaggcattgtaaacgGGATAGGAAACTTGCATATCCC-GGT----TGAAcagtacgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATGTACACAGGATAAGAAACTTGCATATCCC-GAC----TAAATgtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttaTATGTACATAGGATAGGAAACGTGCATATCCC-GGC----TGAATGTCAGTGATagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttaAATCTAAGTTGCATTTCCTTCTCTATACAATTCCTTGA-----AA-ATGCATAGGAAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtgtttaaatg-C-AT-TGAGGTCTTATATAGA-AGTATAGGA--CTTGTATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAATA--ATTTGGTAAATTAATCATTCATATTTCAAAGATAACTGATT-C-CTT----------AT--ACAT-TAATGTAAG----CTGTATTTAA---CCTTAGA-----TTTATA-ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTGAATTCAA-AAAA---AAATC----AA-G---CA-C-TTTTATTA-----TTGTG-T--TT-AGGTT-CA-G--TGGCAG--AATACAGATTTTGTA------ATCACAAGTACTTCAATAATTTTAAATGCA-------ATTTGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGCAAAGAAATAAATTTGATTTGAATTGCTGAGATGAATGAAA---AA-------------AAA--A-------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAA-A-TCTCATTC--AGTTGCTTTTCC-------TATAAGTCCTTGgttcatttcaagcgtttggatttttgtgtacccaatttaaaatacatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaatattctatagttgaatttactcTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGT----AAAAACTATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCTCTATATAATTCCTTtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATATAGA-AGGATAGGAAACTTGTAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aacatctcaacttgannnnnnnnnnTTGA---GATGAT--TGAAA--GTAAAGATATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAA-A-TCTaaggacttatatagaagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGTAT---CAATTAATATAAA---TGC-AA-CAAGAGTTT---TAG----GATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AGTAG-CATGCAAAGAGTTAATA--ACTTGGCAAGTTAATCATTCAAACTTCAAAGATAACAGAAT-T-TCT----------A---ACATTAAATATAAG----GTGTATGTAA---CTTTAGAT-A--TTTTATGACGTTATAAA-CACGC-AACTGATCTTGAATTTAA-AATATTGCAGTT--TAAA-GTAAAC-T-TTCAAGTA-----CT-T--TTATTGATTTT-TTAG--TTTCAG--TATGTACTTTTTTTA------ATCATAAGTACTTCAACAATTATAAACACA-------ATTTGCTGGGAATAGTCTCGTTTGA-AC-AGAATTGCATTGCGCAAAGAAAGAAGTTTGA-TTGTAATTCTGAGATGAATGAAAATTAG---G--AATTCTGAAATTTTGA-GATTTCGCAAAATTTCGCGTGAATAAGCGAGC-GTTCAT-GACA-TCTCAATC--AGCAACTTTTCTTTCTCTATATAAGTCCTTGA--ATGAA-AT--ACA-ACAATA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1981 )     :                                                                                                                                                                                         NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATATTC---ACTTATATNTA--T--C-AC--CAAGGACTTATATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCC-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACGCGAAGAATTAAT--AATTTGGCAAATTAATCATTCANANTTCACAGGCAACTG-ATTTCTTN------------TACATAAAATGTAAG----NTGTATGTAA---CCTTAGAT-G--TTTA-AANATGTTTCGAN-CACGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-AATATTGCGGTT--TGAA-G-A---AAA-T-TTC-TNG-TA-----A-TGT-G-TCGTT-A---TTT--TNGTTGCAG--TATACAAAT---TTTGTA------ATCANAAGTACTTCAACAATTTTAAACACA-------ATTTGCTGGGAATGGTNTCGTTTTG-ACGAGAATTTCATTNTGCAANGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATNTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-GTTCACAAACATCTCAATC--AGTTGCNTTTCCTTCTCTATATAANTCCTTGAT-AT-AG-AT--ATA-AAAATAT
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gi|1                          :                                                                     attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACACAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAAggacttacacagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|1                          :                              attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TTAACAT---TGATAA----AAAAG-TATGCGAAAAGTTAAT--AA-TTGGCAAATTAATCATTCAAATTTTACAGGCAACCG-GTTTGTTC------------AACATAAAATGTAAGGTGTATGTATGTAA---TCTTAGAT-GTCTTT----TATGTTTTAAA-CATGCAAAATGGTTTTGAATT---TAA-AATATTGTAATT--TG----------AA-T-T---------------------------------TT--TAGTTGCAG--TATACAAAT---TTTGTACTGGTTATCATAAGTACTTTAAAACTTTTAAACACA-------ATTTGCAGGGAATGGTCTCGTTTTGTAC-AGAATTCCATTAAGCCAAAAAATAATTTTCA--------TTTGTATTTCTGAGATAAATGGAAGT-TA-T---GATATT--TAAAA--ATGA-GATATTGCAAGATTCTGTGTGAATA--------GTT----------------------GCTTTTCCTTCTCTATATCAGTCCggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|10                         : attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacacagaaggataggaaA--T--C-ACAGCAAGGACTTATATAG----GATACGAAATTTCCATCTCTC-CAC----TAAATGT---TTATAA----AATAG-CATGTGAAGAATTAAT--AATTTTGCTAATTAAACATTCAAATTTCACAGACAACTG-ATTTCTTT------------TAAACACAATGTAAT----GTGTTTGTAA---CCTTAAAT-G--TTGA-ATAATGTTACAAA-CATGCGAAATGATCTTGAACT----AA-AACATTGCAGT----------A---AAA-T-TTC-AAG-T------A-CGC---TCTTT-GATTTTT--TAGTTGCAG--TATACAAA----TTTGTA------
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gi|12                         :                                                                                                      taagttatcaatccttaatttaatggccataaacaaaccaagacttgtttattaccatgaagttaaacattaagttgttttcacaagcttgttaataactgcttagttgaatttctagtaaaatacttgttaattatt--CAATGATGTATATAGA-AGGATAGGAATCTGGCGTCTGCT-GAC----TAAATGT---TGTTAA----AATAG-CAAGC--AG-ATT------ATTTGGCAAATTAATCATTCAGACTTCATAGGCTTCTG-CTTTCTTG------------TACATAAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-TTC-TTG-TACATAAA-TG--G-TTGTT-T---CTT--TAATTGCAG--TATACACAT---TTTGTA------ATCAGAAGTACATCACTAATTTTAAACACA-------AATTGTTGTGAATGGTCTTGTTTTG-TTTAAAATTTCATTCTGCAGCGTAAGtggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgc-TA-A---GGCCAT--TAATA--AC-------TCACAAGATAGTGTGTGAATACGCAAGC-TTTTACAAA-ACCCCAATC--ACTTGCTTTTCTATCTCGGTATAATTCTTTGGTAAG-GG-AT--ATA-AAAAgccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|13                         :                                                                                                                                      caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctttcttgtacataaatggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgTG-ATTTCTTA------------TGCATAAAATGTAAG----CTGTATGTAATAACCTTAGAC-A--TTTT-AGAATGTTTTAAAACATGCAAAATGATCTTGAATC---AAA-AACATTGTAGTT--TGAA-G-A---AAAAT-TTC-AAG-CA-----C-TTT-CCTTGCT-T---TTT--TAGTCGCAG--TAAACAAAT---TTTGTA------ATTACAAGTACGTCAACAATTCGAAACACA-------ATTTTATCAGTATGGTTTCATTTTG-TAGAGAATTCCATTGTGCAAATGAAGAATTTTGA--------TTGGTATACTTTAGATGAAAGGAAGT-TA-G---GATA------AAA--ACAA-GATTTTGCAAGACAGTGCTTGAATATTTGAGC-TTTCATAAA-ATCTCAACC--AGTTTCTTTTTCGTCaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-------ATTT-CTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGT-TG-A---GATAAC--TGAAA--ACAA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAA-ATATTGATC--AGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAATTCCTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                   caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattca---ACTAATATGAA--T--T-AC--CAAATACTTGTATAGA-AAGATAAGAAACTTGCATCTCGT-GAC----AAAATGT---TGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAAT--TATTTGATGAA-CAGGCATTCATAATTTACAGGCAACTG-ATTATTTT-------------------AATGCAAG----TTGTATGTAA---GCTTAAAT-G--ATAA-AAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTTAATT---AAacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ------ATTGTAAACGCTTCGACAATTT-GAACAGATGATCTTATTTTCTGGGGATTGTTT--TCCTA-A--ACAAT----------AAAGTA-----TTTGG--------TTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGC-CG-A---GATAAT--TTCAA--ACGA-GATTTTGTAAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                           tttagtagcagcaaaataataaggcGGATAGGAAACTTGCATATCCC-GGT----TGAAcagtacgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATGTACACAGGATAAGAAACTTGCATATCCC-GAC----TAAATgtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttaTATGTACATAGGATAGGAAACGTGCATATCCC-GGC----TGAATGTCAGTGATagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttaAATCTAAGTTGCATTTCCTTCTCTATACAATTCCTTGA-----AA-ATGCATAGGAAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        gtgtttaaatgATATTCTATAGTTGAATTTA--CTCC-AT--TGAGGTCTTATATAGA-AGTATAGGA--CTTGTATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAAT--AATTTGGTAAATTAATCATTCATATTTCAAAGATAACTG-ATTCCTTA------------TACAT-TAATGTAAG----CTGTATTTAA---CCTTAGA-----TTTA-TA-ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTGAATTCAAAAA-AAAATC----------AA-G------CA-C-TTT-TAT-TA-----T-TGT-G-T--TT-AG--GTT--CAGTGGCAG--AATACAGAT---TTTGTA------ATCACAAGTACTTCAATAATTTTAAATGCA-------ATTTGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGCAAAGAAATAAATTTGA--------TTTGAATTGCTGAGATGAATGAAA----A-A-------------AAA--A-------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAA-ATCTCATTC--AGTTGCTTTTCC-------TATAAGTCCTTGgttcatttcaagcgtttggatttttgtgtacccaatttaaaatacatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGT--AAAAAC-TATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCTCTATATAATTCCTTtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aacatctcaacttgannnnnnnnnnT-TG-A---GATGAT--TGAAA--GTAAAGATATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAA-ATCTaaggacttatatagaagg
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                 tttggaaaatactgttttaacgTC---ACTTATA-----------AC--CAATGACTTGTATAGA-AGGATAAGAAACTTGCAGCTCCT-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACACAAATGATTAAT--AATTTG-TAAATTAGTCATTCA---TTAACAGGCAACCG-ATTTCTTTCTTACTCTGATTTACATAACATGCAAG----TTGTATGTAA---TCTTAGAT-G--TTTA-AACATGTTCCGAT-CACGCATACTAATCTTGAATT---AAA-GATATTGTGGTT--TGAA-G-T---AAA-T-GTA-TCG-TA-----A-TAT-G-TCGTT-A---TTT--TAGCTGCAG--TAAACACAT---TTTG---------CTAGAAAT-----GAC-ATTGT---------------TTTGATGAGAATTG---CATTCTG-----------CA--ATGTAA-----GAATTGTGA--------TTTGTTATCCTGAGATGAATGGGAGT-AA-A---TATAAT--TGAAA--A-----------CGAGATTTTGCGTGTATACGCAAGC-GTACAC-AACATCTCAATC--AGTTGCATTTCCTTCTCTTTATTAGTCCT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1981 )     :                                                                                                                                                                                         NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATATTC---ACTTATATNTA--T--C-AC--CAAGGACTTATATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCC-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACGCGAAGAATTAAT--AATTTGGCAAATTAATCATTCANANTTCACAGGCAACTG-ATTTCTTN------------TACATAAAATGTAAG----NTGTATGTAA---CCTTAGAT-G--TTTA-AANATGTTTCGAN-CACGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-AATATTGCGGTT--TGAA-G-A---AAA-T-TTCNNG--TA-----A-TGTG-TCGTT-NTTT--TAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTA------ATCANAAGTACTTCAACAATTTTAAACACA-------ATTTGCTGGGAATGGTNTCGTTTTG-ACGAGAATTTCATTNTGCAANGTAAGAATTTTGA--------TTTGTATTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATTTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-GTTCACAAACATCTCAATC--AGTTGCNTTTCCTTCTCTATATAANTCCTTGAT-AT-AG-AT--ATA-AAAATAT
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gi|1                          :                                                                     attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACACAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAAggacttacacagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgc-TA-A---GGCCAT--TAATA--AC-------TCACAAGATAGTGTGTGAATACGCAAGC-TTTTACAAA-ACCCCAATC--ACTTGCTTTTCTATCTCGGTATAATTCTTTGGTAAG-GG-AT--ATA-AAAAgccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|13                         :                                                                                                                                      caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctttcttgtacataaatggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgTG-ATTTCTTA------------TGCATAAAATGTAAG----CTGTATGTAATAACCTTAGAC-A--TTTT-AGAATGTTTTAAAACATGCAAAATGATCTTGAATC---AAA-AACATTGTAGTT--TGAA-G-A---AAAAT-TTCAAG--CA-----C-TTTCCTTGCT-TTTT--TAGTCGCAG--TAAACAAAT---TTT--GTA------ATTACAAGTACGTCAACAATTCGAAACACA-------ATTTTATCAGTATGGTTTCATTTTG-TAGAGAATTCCATTGTGCAAATGAAGAATTTTGA--------TTGGTATACTTTAGATGAAAGGAAGT-TA-G---GATA------AAA--ACAA-GATTTTGCAAGACAGTGCTTGAATATTTGAGC-TTTCATAAA-ATCTCAACC--AGTTTCTTTTTCGTCaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-------ATTT-CTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGT-TG-A---GATAAC--TGAAA--ACAA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAA-ATATTGATC--AGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAATTCCTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                   caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattca---ACTAATATGAA--T--T-AC--CAAATACTTGTATAGA-AAGATAAGAAACTTGCATCTCGT-GAC----AAAATGT---TGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAAT--TATTTGATGAA-CAGGCATTCATAATTTACAGGCAACTG-ATTATTTT-------------------AATGCAAG----TTGTATGTAA---GCTTAAAT-G--ATAA-AAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTTAATT---AAacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TT--TAGTAGCAG--CA---AAAT---AATAAGGC------ATTGTAAACGCTTCGACAATTT-GAACAGATGATCTTATTTTCTGGGGATTGTTT--TCCTA-A--ACAAT----------AAAGTA-----TTTGG--------TTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGC-CG-A---GATAAT--TTCAA--ACGA-GATTTTGTAAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    GGATAGGAAACTTGCATATCCC-GGT----TGAAcagtacgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATGTACACAGGATAAGAAACTTGCATATCCC-GAC----TAAATgtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttaTATGTACATAGGATAGGAAACGTGCATATCCC-GGC----TGAATGTCAGTGATagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttaAATCTAAGTTGCATTTCCTTCTCTATACAATTCCTTGA-----AA-ATGCATAGGAAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        gtgtttaaatgATATTCTATAGTTGAATTTA--CTCC-AT--TGAGGTCTTATATAGA-AGTATAGGA--CTTGTATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAAT--AATTTGGTAAATTAATCATTCATATTTCAAAGATAACTG-ATTCCTTA------------TACAT-TAATGTAAG----CTGTATTTAA---CCTTAGA-----TTTA-TA-ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTGAATTCAAAAA-AAAATC----------AA-G------CA-C-TTTTAT--TA-----T-TGTG-T--TTAGGTT--CAGTGGCAG--AATACAGAT---TTT--GTA------ATCACAAGTACTTCAATAATTTTAAATGCA-------ATTTGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGCAAAGAAATAAATTTGA--------TTTGAATTGCTGAGATGAATGAAA----A-A-------------AAA--A-------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAA-ATCTCATTC--AGTTGCTTTTCC-------TATAAGTCCTTGgttcatttcaagcgtttggatttttgtgtacccaatttaaaatacatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGT--AAAAAC-TATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCTCTATATAATTCCTTtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATATAGA-AGGATAGGAAACTTGTAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aacatctcaacttgannnnnnnnnnT-TG-A---GATGAT--TGAAA--GTAAAGATATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAA-ATCTaaggacttatatagaagg
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1981 )     :                                                                                                                                                                                         NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATATTC---ACTTATATNTA--T--C-AC--CAAGGACTTATATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCC-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACGCGAAGAATTAAT--AATTTGGCAAATTAATCATTCANANTTCACAGGCAACTG-ATTTCTTN------------TACATAAAATGTAAG----NTGTATGTAA---CCTTAGAT-G--TTTA-AANATGTTTCGAN-CACGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-AATATTGCGGTT--TGAA-G-A---AAA-T-TTCNCGTA-----A-TNT-G-TCGTT-NTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTA------ATCANAAGTACTTCAACAATTTTAAACACA-------ATTTGCTGGGAATGGTNTCGTTTTG-ACGAGAATTTCATTNTGCAANGTAAGAATTTTGA--------TTTGTATTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATTTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-GTTCACAAACATCTCAATC--AGTTGCNTTTCCTTCTCTATATAANTCCTTGAT-AT-AG-AT--ATA-AAAATAT
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gi|1                          :                                                                     attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACACAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAAggacttacacagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|1                          :                              attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TTAACAT---TGATAA----AAAAG-TATGCGAAAAGTTAAT--AA-TTGGCAAATTAATCATTCAAATTTTACAGGCAACCG-GTTTGTTC------------AACATAAAATGTAAGGTGTATGTATGTAA---TCTTAGAT-GTCTTT----TATGTTTTAAA-CATGCAAAATGGTTTTGAATT---TAA-AATATTGTAATT--TGAA----------------------------------------TTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTACTGGTTATCATAAGTACTTTAAAACTTTTAAACACA-------ATTTGCAGGGAATGGTCTCGTTTTGTAC-AGAATTCCATTAAGCCAAAAAATAATTTTCA--------TTTGTATTTCTGAGATAAATGGAAGT-TA-T---GATATT--TAAAA--ATGA-GATATTGCAAGATTCTGTGTGAATA--------GTT----------------------GCTTTTCCTTCTCTATATCAGTCCggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|10                         : attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacacagaaggataggaaA--T--C-ACAGCAAGGACTTATATAG----GATACGAAATTTCCATCTCTC-CAC----TAAATGT---TTATAA----AATAG-CATGTGAAGAATTAAT--AATTTTGCTAATTAAACATTCAAATTTCACAGACAACTG-ATTTCTTT------------TAAACACAATGTAAT----GTGTTTGTAA---CCTTAAAT-G--TTGA-ATAATGTTACAAA-CATGCGAAATGATCTTGAACT----AA-AACATTGCAGT----------A---AAA-T-TTCAAGTACG---C-TCT---TTGAT-TTTTTAGTTGCAG--TATACAAA----TTT--GTA------
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gi|12                         :                                                                                                      taagttatcaatccttaatttaatggccataaacaaaccaagacttgtttattaccatgaagttaaacattaagttgttttcacaagcttgttaataactgcttagttgaatttctagtaaaatacttgttaattatt--CAATGATGTATATAGA-AGGATAGGAATCTGGCGTCTGCT-GAC----TAAATGT---TGTTAA----AATAG-CAAGC--AG-ATT------ATTTGGCAAATTAATCATTCAGACTTCATAGGCTTCTG-CTTTCTTG------------TACATAAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-TTCTTGTACATAAA-TG--G-TTGTT-TCTTTAATTGCAG--TATACACAT---TTT--GTA------ATCAGAAGTACATCACTAATTTTAAACACA-------AATTGTTGTGAATGGTCTTGTTTTG-TTTAAAATTTCATTCTGCAGCGTAAGtggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgc-TA-A---GGCCAT--TAATA--AC-------TCACAAGATAGTGTGTGAATACGCAAGC-TTTTACAAA-ACCCCAATC--ACTTGCTTTTCTATCTCGGTATAATTCTTTGGTAAG-GG-AT--ATA-AAAAgccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|13                         :                                                                                                                                      caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctttcttgtacataaatggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgTG-ATTTCTTA------------TGCATAAAATGTAAG----CTGTATGTAATAACCTTAGAC-A--TTTT-AGAATGTTTTAAAACATGCAAAATGATCTTGAATC---AAA-AACATTGTAGTT--TGAA-G-A---AAAAT-TTCAAGCA-----C-TTT-CCTTGCT-TTTTTAGTCGCAG--TAAACAAAT---TTT--GTA------ATTACAAGTACGTCAACAATTCGAAACACA-------ATTTTATCAGTATGGTTTCATTTTG-TAGAGAATTCCATTGTGCAAATGAAGAATTTTGA--------TTGGTATACTTTAGATGAAAGGAAGT-TA-G---GATA------AAA--ACAA-GATTTTGCAAGACAGTGCTTGAATATTTGAGC-TTTCATAAA-ATCTCAACC--AGTTTCTTTTTCGTCaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-------ATTT-CTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGT-TG-A---GATAAC--TGAAA--ACAA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAA-ATATTGATC--AGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAATTCCTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                   caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattca---ACTAATATGAA--T--T-AC--CAAATACTTGTATAGA-AAGATAAGAAACTTGCATCTCGT-GAC----AAAATGT---TGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAAT--TATTTGATGAA-CAGGCATTCATAATTTACAGGCAACTG-ATTATTTT-------------------AATGCAAG----TTGTATGTAA---GCTTAAAT-G--ATAA-AAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTTAATT---AAacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTAGTAGCAG--CA---AAAT---AATAAGGC------ATTGTAAACGCTTCGACAATTT-GAACAGATGATCTTATTTTCTGGGGATTGTTT--TCCTA-A--ACAAT----------AAAGTA-----TTTGG--------TTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGC-CG-A---GATAAT--TTCAA--ACGA-GATTTTGTAAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    GGATAGGAAACTTGCATATCCC-GGT----TGAAcagtacgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATGTACACAGGATAAGAAACTTGCATATCCC-GAC----TAAATgtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttaTATGTACATAGGATAGGAAACGTGCATATCCC-GGC----TGAATGTCAGTGATagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttaAATCTAAGTTGCATTTCCTTCTCTATACAATTCCTTGA-----AA-ATGCATAGGAAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        gtgtttaaatgATATTCTATAGTTGAATTTA--CTCC-AT--TGAGGTCTTATATAGA-AGTATAGGA--CTTGTATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAAT--AATTTGGTAAATTAATCATTCATATTTCAAAGATAACTG-ATTCCTTA------------TACAT-TAATGTAAG----CTGTATTTAA---CCTTAGA-----TTTA-TA-ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTGAATTCAAAAA-AAAATC----------AA-G-C---ACT-T-TTAT--TA-----T-TGT-G-T--TTAGGTTCAGTGGCAG--AATACAGAT---TTT--GTA------ATCACAAGTACTTCAATAATTTTAAATGCA-------ATTTGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGCAAAGAAATAAATTTGA--------TTTGAATTGCTGAGATGAATGAAA----A-A-------------AAA--A-------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAA-ATCTCATTC--AGTTGCTTTTCC-------TATAAGTCCTTGgttcatttcaagcgtttggatttttgtgtacccaatttaaaatacatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGT--AAAAAC-TATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCTCTATATAATTCCTTtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATATAGA-AGGATAGGAAACTTGTAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacatctcaacttgannnnnnnnnnT-TG-A---GATGAT--TGAAA--GTAAAGATATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAA-ATCTaaggacttatatagaagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  -AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AGTAG-CATGCAAAGAGTTAAT--AACTTGGCAAGTTAATCATTCAAACTTCAAAGATAACAGAATTTCT--------------AACATTAAATATAAG----GTGTATGTAA---CTTTAGAT-A--TTTT-ATGACGTTATAAA-CACGC-AACTGATCTTGAATT---TAA-AATATTGCAGTT--TAAA-GTA---AAC-T-TTCAAGTA-----CTTTT-A-TTGAT-TTTTTAGTTTCAG--TATGTACTT---TTT--TTA------ATCATAAGTACTTCAACAATTATAAACACA-------ATTTGCTGGGAATAGTCTCGTTTGA-AC-AGAATTGCATTGCGCAAAGAAAGAAGTTTGA---------TTGTAATTCTGAGATGAATGAAAAT-TA-G---G--AATTCTGAAATTTTGA-GATTTCGCAAAATTTCGCGTGAATAAGCGAGC-GTTCAT-GACATCTCAATC--AGCAACTTTTCTTTCTCTATATAAGTCCTTGA--ATGAA-AT--ACA-ACAATA
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                 tttggaaaatactgttttaacgTC---ACTTATA-----------AC--CAATGACTTGTATAGA-AGGATAAGAAACTTGCAGCTCCT-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACACAAATGATTAAT--AATTTG-TAAATTAGTCATTCA---TTAACAGGCAACCG-ATTTCTTTCTTACTCTGATTTACATAACATGCAAG----TTGTATGTAA---TCTTAGAT-G--TTTA-AACATGTTCCGAT-CACGCATACTAATCTTGAATT---AAA-GATATTGTGGTT--TGAA-G-T---AAA-T-GTATCGTA-----A-TAT-G-TCGTT-ATTTTAGCTGCAG--TAAACACAT---TTT--G---------CTAGAAAT-----GAC-ATTGT---------------TTTGATGAGAATTG---CATTCTG-----------CA--ATGTAA-----GAATTGTGA--------TTTGTTATCCTGAGATGAATGGGAGT-AA-A---TATAAT--TGAAA--A-----------CGAGATTTTGCGTGTATACGCAAGC-GTACAC-AACATCTCAATC--AGTTGCATTTCCTTCTCTTTATTAGTCCT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1981 )     :                                                                                                                                                                                         NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATATTC---ACTTATATNTA--T--C-AC--CAAGGACTTATATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCC-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACGCGAAGAATTAAT--AATTTGGCAAATTAATCATTCANANTTCACAGGCAACTG-ATTTCTTN------------TACATAAAATGTAAG----NTGTATGTAA---CCTTAGAT-G--TTTA-AANATGTTTCGAN-CACGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-AATATTGCGGTT--TGAA-G-A---AAA-T-TTCNCGTA-----A-TNT-G-TTGTTNTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTA------ATCANAAGTACTTCAACAATTTTAAACACA-------ATTTGCTGGGAATGGTNTCGTTTTG-ACGAGAATTTCATTNTGCAANGTAAGAATTTTGA--------TTTGTATTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATTTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-GTTCACAAACATCTCAATC--AGTTGCNTTTCCTTCTCTATATAANTCCTTGAT-AT-AG-AT--ATA-AAAATAT
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gi|1                          :                                                                     attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACACAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAAggacttacacagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|1                          :                              attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TTAACAT---TGATAA----AAAAG-TATGCGAAAAGTTAAT--AA-TTGGCAAATTAATCATTCAAATTTTACAGGCAACCG-GTTTGTTC------------AACATAAAATGTAAGGTGTATGTATGTAA---TCTTAGAT-GTCTTT----TATGTTTTAAA-CATGCAAAATGGTTTTGAATT---TAA-AATATTGTAATT--TGAA---------------------------------------TTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTACTGGTTATCATAAGTACTTTAAAACTTTTAAACACA-------ATTTGCAGGGAATGGTCTCGTTTTGTAC-AGAATTCCATTAAGCCAAAAAATAATTTTCA--------TTTGTATTTCTGAGATAAATGGAAGT-TA-T---GATATT--TAAAA--ATGA-GATATTGCAAGATTCTGTGTGAATA--------GTT----------------------GCTTTTCCTTCTCTATATCAGTCCggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|10                         : attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacacagaaggataggaaA--T--C-ACAGCAAGGACTTATATAG----GATACGAAATTTCCATCTCTC-CAC----TAAATGT---TTATAA----AATAG-CATGTGAAGAATTAAT--AATTTTGCTAATTAAACATTCAAATTTCACAGACAACTG-ATTTCTTT------------TAAACACAATGTAAT----GTGTTTGTAA---CCTTAAAT-G--TTGA-ATAATGTTACAAA-CATGCGAAATGATCTTGAACT----AA-AACATTGCAGT----------A---AAA-T-TTCAAGTACG---C-TCT---TTGATTTTTTAGTTGCAG--TATACAAA----TTT--GTA------
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -T-TTCTTGTACATAAA-TG--G-TTGTTTCTTTAATTGCAG--TATACACAT---TTT--GTA------ATCAGAAGTACATCACTAATTTTAAACACA-------AATTGTTGTGAATGGTCTTGTTTTG-TTTAAAATTTCATTCTGCAGCGTAAGtggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-------ATTT-CTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGT-TG-A---GATAAC--TGAAA--ACAA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAA-ATATTGATC--AGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAATTCCTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                   caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattca---ACTAATATGAA--T--T-AC--CAAATACTTGTATAGA-AAGATAAGAAACTTGCATCTCGT-GAC----AAAATGT---TGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAAT--TATTTGATGAA-CAGGCATTCATAATTTACAGGCAACTG-ATTATTTT-------------------AATGCAAG----TTGTATGTAA---GCTTAAAT-G--ATAA-AAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTTAATT---AAacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAGTAGCAG--CA---AAAT---AATAAGGC------ATTGTAAACGCTTCGACAATTT-GAACAGATGATCTTATTTTCTGGGGATTGTTT--TCCTA-A--ACAAT----------AAAGTA-----TTTGG--------TTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGC-CG-A---GATAAT--TTCAA--ACGA-GATTTTGTAAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    GGATAGGAAACTTGCATATCCC-GGT----TGAAcagtacgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATGTACACAGGATAAGAAACTTGCATATCCC-GAC----TAAATgtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttaTATGTACATAGGATAGGAAACGTGCATATCCC-GGC----TGAATGTCAGTGATagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttaAATCTAAGTTGCATTTCCTTCTCTATACAATTCCTTGA-----AA-ATGCATAGGAAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        gtgtttaaatgATATTCTATAGTTGAATTTA--CTCC-AT--TGAGGTCTTATATAGA-AGTATAGGA--CTTGTATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAAT--AATTTGGTAAATTAATCATTCATATTTCAAAGATAACTG-ATTCCTTA------------TACAT-TAATGTAAG----CTGTATTTAA---CCTTAGA-----TTTA-TA-ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTGAATTCAAAAA-AAAATC----------AA-G-C---ACT-T-TTAT--TA-----T-TGT-G-TT-TAGGTTCAGTGGCAG--AATACAGAT---TTT--GTA------ATCACAAGTACTTCAATAATTTTAAATGCA-------ATTTGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGCAAAGAAATAAATTTGA--------TTTGAATTGCTGAGATGAATGAAA----A-A-------------AAA--A-------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAA-ATCTCATTC--AGTTGCTTTTCC-------TATAAGTCCTTGgttcatttcaagcgtttggatttttgtgtacccaatttaaaatacatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGT--AAAAAC-TATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCTCTATATAATTCCTTtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATATAGA-AGGATAGGAAACTTGTAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aacatctcaacttgannnnnnnnnnT-TG-A---GATGAT--TGAAA--GTAAAGATATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAA-ATCTaaggacttatatagaagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  -AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AGTAG-CATGCAAAGAGTTAAT--AACTTGGCAAGTTAATCATTCAAACTTCAAAGATAACAGAATTTCT--------------AACATTAAATATAAG----GTGTATGTAA---CTTTAGAT-A--TTTT-ATGACGTTATAAA-CACGC-AACTGATCTTGAATT---TAA-AATATTGCAGTT--TAAA-GTA---AAC-T-TTCAAGTA-----CTTTT-A-TTGATTTTTTAGTTTCAG--TATGTACTT---TTT--TTA------ATCATAAGTACTTCAACAATTATAAACACA-------ATTTGCTGGGAATAGTCTCGTTTGA-AC-AGAATTGCATTGCGCAAAGAAAGAAGTTTGA---------TTGTAATTCTGAGATGAATGAAAAT-TA-G---G--AATTCTGAAATTTTGA-GATTTCGCAAAATTTCGCGTGAATAAGCGAGC-GTTCAT-GACATCTCAATC--AGCAACTTTTCTTTCTCTATATAAGTCCTTGA--ATGAA-AT--ACA-ACAATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                              agtatcaattaatataaatgcaacaagagttttGAGTATATTC---ACTTATATATA--T--C-AG--CAAGGATTTGTATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCT-GGC----TAAATGT---TGATGA----AACAG-CACACGAAGAATTCAT--TATTTGGCCAATTTATCATTCATAACTCACAGTCAACTG-ATTTCTTA-------------ACATAAACTGTAAG----TTGATTGTAA---TCTTAGAT-G--TTTC-AACATGTTTCGAT-CATGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-GATTTTGAGGTT--TGAAGG-A---AAA-G-TTCTCGTA-----A-TGT-G-TCGTTATTTGTGCTGCAG--ATTACAAAT---TTT--GTA------ATGAGATTCACTTCAACGATTTTCAACACA-------AATTGTTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGAAAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGGTGAATGAAAGA-CA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGGATACACGAGC-GTTCACTAAC-TGTCAATC--AGTTGCATTTCATTTTCTATATAATTCCTCGAT-ATCAGCAT--ATA-AAAATATctttcactttcgagacaatttcattagtttaaacaatattttattcac
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gi|6                          :                                                                                                                                                       agcttgggtatagtatcaaatcaagatgaattggcttacactgtttttcaattttattctaacaatttcaCTTAT---TA--T--A-AC--CCAGGACTTGTATAGA-AGGATTGGAAACTTGCACCTCCT-GAC----TAAATGT---TGATAA----TATAG-CACACGAGGCATTAAT--TATTTGGCAAATTAATCATTCATAATTTACAGACAACGG-ATTTCTTG------------TTCATAAACTGTAAA----TTGTATTTAA---TCTTAAAT-G--TTAA-AACATATTTCGAT-CACGCACAATAATCTTGAATT---AAAGAAT-TTGAGGTT--TGAAGG-A---AAA-T-TTCTTGTA-----A-CTT-G-TCGTTATTTTAGCTGCAG--TATACACAT---TTT--GCA------ATAAAAAGTACTTGAACAA-TTTAAACACACACAC--ATATG-TGGGAGTGGTATTGTTTTG-ATAAGAATCTCATTCTGGAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-AGATGATAAT--TGAAA--ACGA-GACATTGCCAGATTTTGCCTTAATACGCTAGC-GTTCACAAA-ATCTCAATC--AGTTGCCTTTCCTTCTTGATATAATTCC
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1981 )     :                                                                                                                                                                                         NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATATTC---ACTTATATNTA--T--C-AC--CAAGGACTTATATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCC-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACGCGAAGAATTAAT--AATTTGGCAAATTAATCATTCANANTTCACAGGCAACTG-ATTTCTTN------------TACATAAAATGTAAG----NTGTATGTAA---CCTTAGAT-G--TTTA-AANATGTTTCGAN-CACGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-AATATTGCGGTT--TGAA-G-A---AAA-T-TTCNCGTA-----A-TNT-G-TTGTTNTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTA------ATCANAAGTACTTCAACAATTTTAAACACA-------ATTTGCTGGGAATGGTNTCGTTTTG-ACGAGAATTTCATTNTGCAANGTAAGAATTTTGA--------TTTGTATTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATTTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-GTTCACAAACATCTCAATC--AGTTGCNTTTCCTTCTCTATATAANTCCTTGAT-AT-AG-AT--ATA-AAAATAT
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gi|1                          :                                                                     attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACACAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAAggacttacacagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|1                          :                              attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TTAACAT---TGATAA----AAAAG-TATGCGAAAAGTTAAT--AA-TTGGCAAATTAATCATTCAAATTTTACAGGCAACCG-GTTTGTTC------------AACATAAAATGTAAGGTGTATGTATGTAA---TCTTAGAT-GTCTTT----TATGTTTTAAA-CATGCAAAATGGTTTTGAATT---TAA-AATATTGTAATT--TGAA---------------------------------------TTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTACTGGTTATCATAAGTACTTTAAAACTTTTAAACACA-------ATTTGCAGGGAATGGTCTCGTTTTGTAC-AGAATTCCATTAAGCCAAAAAATAATTTTCA--------TTTGTATTTCTGAGATAAATGGAAGT-TA-T---GATATT--TAAAA--ATGA-GATATTGCAAGATTCTGTGTGAATA--------GTT----------------------GCTTTTCCTTCTCTATATCAGTCCggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|10                         : attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacacagaaggataggaaA--T--C-ACAGCAAGGACTTATATAG----GATACGAAATTTCCATCTCTC-CAC----TAAATGT---TTATAA----AATAG-CATGTGAAGAATTAAT--AATTTTGCTAATTAAACATTCAAATTTCACAGACAACTG-ATTTCTTT------------TAAACACAATGTAAT----GTGTTTGTAA---CCTTAAAT-G--TTGA-ATAATGTTACAAA-CATGCGAAATGATCTTGAACT----AA-AACATTGCAGT----------A---AAA-T-TTCAAGTACG---C-TCT---TTGATTTTTTAGTTGCAG--TATACAAA----TTT--GTA------
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcagaaaacaccatttacaacttgataaaaataattacagaaataactggTAAAT-G--TTTATAAAAT------AG-CATGTGAA--------GAATT---AAT-AATTTTGCTAAT--TAAA-C-ATTCAAA-T-TTCACAGAC----A-ACT-G-AT-TTCTTTTAAACACAA--TGTA---ATGTGTTT--GTA------ACCTTAAATG-TTGAATAATGTTACAAACA----------TGC--GAAATGATCTTG----A-ACTAAAA---CATT--GCA--GTAA-AATTTCAAGTACGCTCTTTG-ATTTTTTAG-----TTGCAGTATACA---AAT--T--TGTA----TGA-GATTACTCTAGATATTGCATGAATATGCGAGT-GTTCATAA-CATCTCAATC--AG-----TTTCCTTATCTATACACGTCCTTGGTCAC-AG-AT--ATtgagattactctagatattgcatgaatatgcgagtgttcataacatctcaatcagtttccttatctatacacgtccttggtcacagatattcatatttattcaaatgttgtagcttcatggtggat
gi|11                         :                                                                                                                                                    tcagaaaacaccatttacaacttgataaaaataattacagaaataactggatcacagcaaggacttatataggatacgaaatttccatctctccacAGAACTTATATAGA-AGGATAGGAAAC--GC---TCC---ACATTTTAAATAT---TAATAATTTAAATAG-CACACAAAGGATTTATTTAATTTGGCAAATTAATCATTCAAAATTCACAGGCAAGTG-ATTTCTTG------------CACATAAAATGACAG----ATGAATGTAA---TCTTAGAT-G--TTTA-AAAATGTTTTGAT-CACGAAAAATGAACTTGAA-T---AAA-CATATTGAGGTT--TGAA-GTA---AAA-T-TTCTCATA-----A-AGT-G-TTATCA-TATAGCTGCAGAACAAAGAAAG---TTT--GTA------ATCAGAAGTACTTTAAC---TTTAtcatatttattcaaatgttgtagcttcatggtggat
gi|12                         :                                                                                                      taagttatcaatccttaatttaatggccataaacaaaccaagacttgtttattaccatgaagttaaacattaagttgttttcacaagcttgttaataactgcttagttgaatttctagtaaaatacttgttaattatt--CAATGATGTATATAGA-AGGATAGGAATCTGGCGTCTGCT-GAC----TAAATGT---TGTTAA----AATAG-CAAGC--AG-ATT------ATTTGGCAAATTAATCATTCAGACTTCATAGGCTTCTG-CTTTCTTG------------TACATAAA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgc-TA-A---GGCCAT--TAATA--AC-------TCACAAGATAGTGTGTGAATACGCAAGC-TTTTACAAA-ACCCCAATC--ACTTGCTTTTCTATCTCGGTATAATTCTTTGGTAAG-GG-AT--ATA-AAAAgccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|13                         :                                                                                                                                      caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctttcttgtacataaatggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgTG-ATTTCTTA------------TGCATAAAATGTAAG----CTGTATGTAATAACCTTAGAC-A--TTTT-AGAATGTTTTAAAACATGCAAAATGATCTTGAATC---AAA-AACATTGTAGTT--TGAA-G-A---AAAAT-TTCAAGCA-----C-TTT-CCTTGCTTTTTTAGTCGCAG--TAAACAAAT---TTT--GTA------ATTACAAGTACGTCAACAATTCGAAACACA-------ATTTTATCAGTATGGTTTCATTTTG-TAGAGAATTCCATTGTGCAAATGAAGAATTTTGA--------TTGGTATACTTTAGATGAAAGGAAGT-TA-G---GATA------AAA--ACAA-GATTTTGCAAGACAGTGCTTGAATATTTGAGC-TTTCATAAA-ATCTCAACC--AGTTTCTTTTTCGTCaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A-------ATTT-CTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGT-TG-A---GATAAC--TGAAA--ACAA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAA-ATATTGATC--AGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAATTCCTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                   caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattca---ACTAATATGAA--T--T-AC--CAAATACTTGTATAGA-AAGATAAGAAACTTGCATCTCGT-GAC----AAAATGT---TGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAAT--TATTTGATGAA-CAGGCATTCATAATTTACAGGCAACTG-ATTATTTT-------------------AATGCAAG----TTGTATGTAA---GCTTAAAT-G--ATAA-AAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTTAATT---AAacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTAGTAGCAG--CA---AAAT---AATAAGGC------ATTGTAAACGCTTCGACAATTT-GAACAGATGATCTTATTTTCTGGGGATTGTTT--TCCTA-A--ACAAT----------AAAGTA-----TTTGG--------TTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGC-CG-A---GATAAT--TTCAA--ACGA-GATTTTGTAAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    GGATAGGAAACTTGCATATCCC-GGT----TGAAcagtacgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATGTACACAGGATAAGAAACTTGCATATCCC-GAC----TAAATgtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttaTATGTACATAGGATAGGAAACGTGCATATCCC-GGC----TGAATGTCAGTGATagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttaAATCTAAGTTGCATTTCCTTCTCTATACAATTCCTTGA-----AA-ATGCATAGGAAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        gtgtttaaatgATATTCTATAGTTGAATTTA--CTCC-AT--TGAGGTCTTATATAGA-AGTATAGGA--CTTGTATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAAT--AATTTGGTAAATTAATCATTCATATTTCAAAGATAACTG-ATTCCTTA------------TACAT-TAATGTAAG----CTGTATTTAA---CCTTAGA-----TTTA-TA-ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTGAATTCAAAAA-AAAATC----------AA-G-C---ACT-T-TTAT--TA-----T-TGT-G-TT-TAGGTTCAGTGGCAG--AATACAGAT---TTT--GTA------ATCACAAGTACTTCAATAATTTTAAATGCA-------ATTTGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGCAAAGAAATAAATTTGA--------TTTGAATTGCTGAGATGAATGAAA----A-A-------------AAA--A-------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAA-ATCTCATTC--AGTTGCTTTTCC-------TATAAGTCCTTGgttcatttcaagcgtttggatttttgtgtacccaatttaaaatacatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGT--AAAAAC-TATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCTCTATATAATTCCTTtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATATAGA-AGGATAGGAAACTTGTAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aacatctcaacttgannnnnnnnnnT-TG-A---GATGAT--TGAAA--GTAAAGATATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAA-ATCTaaggacttatatagaagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  -AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AGTAG-CATGCAAAGAGTTAAT--AACTTGGCAAGTTAATCATTCAAACTTCAAAGATAACAGAATTTCT--------------AACATTAAATATAAG----GTGTATGTAA---CTTTAGAT-A--TTTT-ATGACGTTATAAA-CACGC-AACTGATCTTGAATT---TAA-AATATTGCAGTT--TAAA-GTA---AAC-T-TTCAAGTA-----CTTTT-A-TTGATTTTTTAGTTTCAG--TATGTACTT---TTT--TTA------ATCATAAGTACTTCAACAATTATAAACACA-------ATTTGCTGGGAATAGTCTCGTTTGA-AC-AGAATTGCATTGCGCAAAGAAAGAAGTTTGA---------TTGTAATTCTGAGATGAATGAAAAT-TA-G---G--AATTCTGAAATTTTGA-GATTTCGCAAAATTTCGCGTGAATAAGCGAGC-GTTCAT-GACATCTCAATC--AGCAACTTTTCTTTCTCTATATAAGTCCTTGA--ATGAA-AT--ACA-ACAATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                              agtatcaattaatataaatgcaacaagagttttGAGTATATTC---ACTTATATATA--T--C-AG--CAAGGATTTGTATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCT-GGC----TAAATGT---TGATGA----AACAG-CACACGAAGAATTCAT--TATTTGGCCAATTTATCATTCATAACTCACAGTCAACTG-ATTTCTTA-------------ACATAAACTGTAAG----TTGATTGTAA---TCTTAGAT-G--TTTC-AACATGTTTCGAT-CATGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-GATTTTGAGGTT--TGAAGG-A---AAA-G-TTCTCGTA-----A-TGT-G-TCGTTATTTGTGCTGCAG--ATTACAAAT---TTT--GTA------ATGAGATTCACTTCAACGATTTTCAACACA-------AATTGTTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGAAAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGGTGAATGAAAGA-CA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGGATACACGAGC-GTTCACTAAC-TGTCAATC--AGTTGCATTTCATTTTCTATATAATTCCTCGAT-ATCAGCAT--ATA-AAAATATctttcactttcgagacaatttcattagtttaaacaatattttattcac
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                 tttggaaaatactgttttaacgTC---ACTTATA-----------AC--CAATGACTTGTATAGA-AGGATAAGAAACTTGCAGCTCCT-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACACAAATGATTAAT--AATTTG-TAAATTAGTCATTCA---TTAACAGGCAACCG-ATTTCTTTCTTACTCTGATTTACATAACATGCAAG----TTGTATGTAA---TCTTAGAT-G--TTTA-AACATGTTCCGAT-CACGCATACTAATCTTGAATT---AAA-GATATTGTGGTT--TGAA-G-T---AAA-T-GTATCGTA-----A-TAT-G-TCGTTATTTTAGCTGCAG--TAAACACAT---TTT--G---------CTAGAAAT-----GAC-ATTGT---------------TTTGATGAGAATTG---CATTCTG-----------CA--ATGTAA-----GAATTGTGA--------TTTGTTATCCTGAGATGAATGGGAGT-AA-A---TATAAT--TGAAA--A-----------CGAGATTTTGCGTGTATACGCAAGC-GTACAC-AACATCTCAATC--AGTTGCATTTCCTTCTCTTTATTAGTCCT
gi|6                          :                                                                                                                                                       agcttgggtatagtatcaaatcaagatgaattggcttacactgtttttcaattttattctaacaatttcaCTTAT---TA--T--A-AC--CCAGGACTTGTATAGA-AGGATTGGAAACTTGCACCTCCT-GAC----TAAATGT---TGATAA----TATAG-CACACGAGGCATTAAT--TATTTGGCAAATTAATCATTCATAATTTACAGACAACGG-ATTTCTTG------------TTCATAAACTGTAAA----TTGTATTTAA---TCTTAAAT-G--TTAA-AACATATTTCGAT-CACGCACAATAATCTTGAATT---AAAGAAT-TTGAGGTT--TGAAGG-A---AAA-T-TTCTTGTA-----A-CTT-G-TCGTTATTTTAGCTGCAG--TATACACAT---TTT--GCA------ATAAAAAGTACTTGAACAA-TTTAAACACACACAC--ATATG-TGGGAGTGGTATTGTTTTG-ATAAGAATCTCATTCTGGAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-AGATGATAAT--TGAAA--ACGA-GACATTGCCAGATTTTGCCTTAATACGCTAGC-GTTCACAAA-ATCTCAATC--AGTTGCCTTTCCTTCTTGATATAATTCC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                            aataattagctgtaatgcttctgatATTA---ACTTTTATTAAGTT--C-ACG-TAAGGATGTATGTAGA-AGGATAGAAAACATGCATCTCTCTGAC-----AAATGT---CGATAA----AAGAG-CTTGCGAAGAATAAAT--ATTTTGTCAATTTA-TCATTCAAATTTCACAGGCATCTG-ATTTACTT------------CACATTAAATGTAAG----GTTTATGTCA---CCTTAGAT-G--TATA-ATAATGTTTTAAG-CACGCATAATGTTATTGATTT---TAA-AATATTGCATTT--TGAA-GTA---AGA-T-TACAAGTA-----C-TTT-CCTTGATTTTTTACTTGCAG--TATACACAT---TTT--ATA------ATCATAAGTACTTCAACAATTTTAAGCACA-------GTTAGCTGAGAATGGTTTCAATTTG-TCGACAATAACATTGTTTAAAGAAAGACTTTTGA--------TTTGTATTTCTGAGATGAATGGAAGT-TA-G---GATATT--TGAAA--ACGT-GATTTCTTGAGATTTTGCTTGAATAGGCAAGC-GTTC-CTTACATCTCAATC--AGTTGCTTTGCCTTTTCTTTATAAGTCC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cTAATCATTCATAATACACAGCCAACTG-ATTTCTTG------------TACATCAACTGTAAG----TTGTATGTAA---ACTTAGAT-A--TTCA-AACATGTTTCGAG-AACGCAAAATGATCTTGAATT---AAA-AATATTGAGATT--TGAA-G-G---AAA-CATTATCGTA-----A-TTT-G-TTGCTATTTTAGCTGTAA--TATACAAAT---TTT--GTA------ATCAGATGTTCTTCAACAATTTTAAACACA-------AATTTATGGGAATGGTATTGGTTTG-ATGACAATTTCAGTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGATGAAAGGAATT-TG-A---GATAAT--TGAA---------ATT----GAGATTTTGCAT--ATACGCGAGC-GTTCATAAAAA-CTCTATC--AGTTGCATTTCCTTCTCTATATAATTCCTTGAT-G--AA-AT--ATA-CAAAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                              aacaacaccgagttgtaggttacatactttttca--CAATGACTTATATAGA-AGAA-----AACTTGCATATCTC-TAC----TAAAAGT---TTATAA----AACAG-CATGCGAAGAGTAAAT--AATTTGGCAAATTAATCA-------TTTACAGGCAACTG-ATTTCTTT------------TACATAAAATGTAAG----ATGTATGTAA---CCTTAAATAG--TTTG-TACG-GTTTTAAA-CACGT--------------------AA-AATATTGCAGTTTATAAA-GTA---AAA-T-CTGAAGTA-----G-TTTCC-TTGATTTTATAGTTGCAG--TATACAAAG---TTT--GTT------CTCATAGAGATTTCgatatctcttcatgaggattcacgtgaaccaaacttcccaaaattcaatttt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   actttggattttacatacaaaatgacattgtaattcagttatgtgattatctgctataattgaaGA-GATTTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-TTTAAT-AACATCTAAATA--GGTTGCTTTTCCTTCCCTATATAAGTCCTTgcgagattttgcgtgaatacgcgagctttaataacatctaaataggttgcttttccttccctatataagtcctttaattgaacaacaacattagtatggttcgtcatcaacataatcatcat


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1981 )     :                                                                                                                                                                                         NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATATTC---ACTTATATNTA--T--C-AC--CAAGGACTTATATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCC-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACGCGAAGAATTAAT--AATTTGGCAAATTAATCATTCANANTTCACAGGCAACTG-ATTTCTTN------------TACATAAAATGTAAG----NTGTATGTAA---CCTTAGAT-G--TTTA-AANATGTTTCGAN-CACGCAAAATGATCTTGAATTAAA-AATATTGCGGTT--TGAAG--TAAA--ATTTCNNG--TA-N-T---TT-G-TT--GNTNTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTA------ATCANAAGTACTTCAACAATTTTAAACACA-------ATTTGCTGGGAATGGTNTCGTTTTG-ACGAGAATTTCATTNTGCAANGTAAGAATTTTGA--------TTTGTATTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATTTCGCGAGATTTTGCGTGAATACGCGAGC-GTTCACAAACATCTCAATC--AGTTGCNTTTCCTTCTCTATATAANTCCTTGAT-AT-AG-AT--ATA-AAAATAT
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gi|1                          :                                                                     attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACACAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----CAAggacttacacagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|1                          :                              attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaa---ACTTGCATCTC--T--CTAC--CAAGGACTTACATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TTAACAT---TGATAA----AAAAG-TATGCGAAAAGTTAAT--AA-TTGGCAAATTAATCATTCAAATTTTACAGGCAACCG-GTTTGTTC------------AACATAAAATGTAAGGTGTATGTATGTAA---TCTTAGAT-GTCTTT----TATGTTTTAAA-CATGCAAAATGGTTTTGAATTTAA-AATATTGTAATT--TGAA----------------------------------------TTTTTAGTTGCAG--TATACAAAT---TTT--GTACTGGTTATCATAAGTACTTTAAAACTTTTAAACACA-------ATTTGCAGGGAATGGTCTCGTTTTGTAC-AGAATTCCATTAAGCCAAAAAATAATTTTCA--------TTTGTATTTCTGAGATAAATGGAAGT-TA-T---GATATT--TAAAA--ATGA-GATATTGCAAGATTCTGTGTGAATA--------GTT----------------------GCTTTTCCTTCTCTATATCAGTCCggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctacttaacattgataaaaaagtatgcgaaaagttaataattggcaaattaatcattcaaattttacaggcaaccggtttgttcaacataaaatgtaaggtgtatgtatgtaatcttagatgtcttttatgttttaaacatgcaaaatggttttgaatttaaaatattgtaatttgaatttttagttgcagtatacaaattttgtactggttatcataagtactttaaaacttttaaacacaatttgcagggaatggtctcgttttgtacagaattccattaagccaaaaaataattttcatttgtatttctgagataaatggaagttatgatatttaaaaatgagatattgcaagattctgtgtgaatagttgcttttccttctctatatcagtcc
gi|10                         : attataagtattgactgtgataaccagtttttaaatatttcttacaactaaagaaatcttttatgggttcaaggattggacagataattccgtccctgagggataactgttttggtgggaacgagcctctgtgagattactgttaaaacatttattgtaaccaaggacttacatagaaggataggaaacttgcatctctctaccaaggacttacacagaaggataggaaA--T--C-ACAGCAAGGACTTATATAG----GATACGAAATTTCCATCTCTC-CAC----TAAATGT---TTATAA----AATAG-CATGTGAAGAATTAAT--AATTTTGCTAATTAAACATTCAAATTTCACAGACAACTG-ATTTCTTT------------TAAACACAATGTAAT----GTGTTTGTAA---CCTTAAAT-G--TTGA-ATAATGTTACAAA-CATGCGAAATGATCTTGAACT-AA-AACATTGC---------AG--TAAA--ATTTCAAG--TACG-C---TC-T-TT--GATTTTTTAGTTGCAG--TATACAAA----TTT--GTA------
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gi|11                         :                                                                                                                                                    tcagaaaacaccatttacaacttgataaaaataattacagaaataactggatcacagcaaggacttatataggatacgaaatttccatctctccacAGAACTTATATAGA-AGGATAGGAAAC--GC---TCC---ACATTTTAAATAT---TAATAATTTAAATAG-CACACAAAGGATTTATTTAATTTGGCAAATTAATCATTCAAAATTCACAGGCAAGTG-ATTTCTTG------------CACATAAAATGACAG----ATGAATGTAA---TCTTAGAT-G--TTTA-AAAATGTTTTGAT-CACGAAAAATGAACTTGAA-TAAA-CATATTGAGGTT--TGAAG--TAAA--ATTTCTCA--TA-A-A---GT-G-TT---ATCATATAGCTGCAGAACAAAGAAAG---TTT--GTA------ATCAGAAGTACTTTAAC---TTTAtcatatttattcaaatgttgtagcttcatggtggat
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCTTG--TA-CATAAATG-G-TT--GTTTCTTTAATTGCAG--TATACACAT---TTT--GTA------ATCAGAAGTACATCACTAATTTTAAACACA-------AATTGTTGTGAATGGTCTTGTTTTG-TTTAAAATTTCATTCTGCAGCGTAAGtggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgtaaggccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgc-TA-A---GGCCAT--TAATA--AC-------TCACAAGATAGTGTGTGAATACGCAAGC-TTTTACAAA-ACCCCAATC--ACTTGCTTTTCTATCTCGGTATAATTCTTTGGTAAG-GG-AT--ATA-AAAAgccattaataactcacaagatagtgtgtgaatacgcaagcttttacaaaaccccaatcacttgcttttctatctcggtataattctttggtaagggatataaaaaaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|13                         :                                                                                                                                      caatgatgtatatagaaggataggaatctggcgtctgctgactaaatgttgttaaaatagcaagcagattatttggcaaattaatcattcagacttcataggcttctgctttcttgtacataaatggttgtttctttaattgcagtatacacattttgtaatcagaagtacatcactaattttaaacacaaattgttgtgaatggtcttgttttgtttaaaatttcattctgcagcgTG-ATTTCTTA------------TGCATAAAATGTAAG----CTGTATGTAATAACCTTAGAC-A--TTTT-AGAATGTTTTAAAACATGCAAAATGATCTTGAATCAAA-AACATTGTAGTT--TGAAG--AAAA--ATTTCAAG--CA-C-T---TT-CCTT--GCTTTTTTAGTCGCAG--TAAACAAAT---TTT--GTA------ATTACAAGTACGTCAACAATTCGAAACACA-------ATTTTATCAGTATGGTTTCATTTTG-TAGAGAATTCCATTGTGCAAATGAAGAATTTTGA--------TTGGTATACTTTAGATGAAAGGAAGT-TA-G---GATA------AAA--ACAA-GATTTTGCAAGACAGTGCTTGAATATTTGAGC-TTTCATAAA-ATCTCAACC--AGTTTCTTTTTCGTCaaggaaaacataaatatagttatataattatta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A-------ATTT-CTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TATGTGTTCCTGAAATATATAGAAGT-TG-A---GATAAC--TGAAA--ACAA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGAATACGAGAGC-ATTCACAAA-ATATTGATC--AGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAATTCCTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                   caaaaaaatgcacaggggttacactttatccccattca---ACTAATATGAA--T--T-AC--CAAATACTTGTATAGA-AAGATAAGAAACTTGCATCTCGT-GAC----AAAATGT---TGATAA----AATAGTCA-ACAAAGGATTAAT--TATTTGATGAA-CAGGCATTCATAATTTACAGGCAACTG-ATTATTTT-------------------AATGCAAG----TTGTATGTAA---GCTTAAAT-G--ATAA-AAAATGTTTCGAT-CACGAAAAATTATCTTTAATTAAacatgaagttagaaactggttagagattcaacacttact
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTAGTAGCAG--CA---AAAT---AATAAGGC------ATTGTAAACGCTTCGACAATTT-GAACAGATGATCTTATTTTCTGGGGATTGTTT--TCCTA-A--ACAAT----------AAAGTA-----TTTGG--------TTTGTTTTCTTTTAATTAATGGAAGC-CG-A---GATAAT--TTCAA--ACGA-GATTTTGTAAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    GGATAGGAAACTTGCATATCCC-GGT----TGAAcagtacgaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATGTACACAGGATAAGAAACTTGCATATCCC-GAC----TAAATgtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                         ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttaTATGTACATAGGATAGGAAACGTGCATATCCC-GGC----TGAATGTCAGTGATagcaatgatttataattttatatgtacataggataggaaacgtgcatatcccggctgaatgtcagtgat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggataggaaacttgcatatcccggttgaagtcagtgatttataatgttatatgtacacaggataagaaacttgcatatcccgactaaatagcaatgatttataattttaAATCTAAGTTGCATTTCCTTCTCTATACAATTCCTTGA-----AA-ATGCATAGGAAATAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                        gtgtttaaatgATATTCTATAGTTGAATTTA--CTCC-AT--TGAGGTCTTATATAGA-AGTATAGGA--CTTGTATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AATGG-CATTCAAAGAATTAAT--AATTTGGTAAATTAATCATTCATATTTCAAAGATAACTG-ATTCCTTA------------TACAT-TAATGTAAG----CTGTATTTAA---CCTTAGA-----TTTA-TA-ATGATTCAAA-CATGCAAAATGATCTTGAATTCAA-AAAA------------AAA--TCAAGCACTTTTAT--TA-T-T---GT-G-TTTAGG---TTCAGTGGCAG--AATACAGAT---TTT--GTA------ATCACAAGTACTTCAATAATTTTAAATGCA-------ATTTGCAGGGAATAATTTTGT-----A-GAGAATATCATTGTGCAAAGAAATAAATTTGA--------TTTGAATTGCTGAGATGAATGAAA----A-A-------------AAA--A-------------AGATTTTGTATGAATATGCAAGC-ATTCATAAA-ATCTCATTC--AGTTGCTTTTCC-------TATAAGTCCTTGgttcatttcaagcgtttggatttttgtgtacccaatttaaaatacatttt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aattctgaactttcataaaaaacaaacattttgattaacctgttagggcaagaagtttaTTGCTAGATTTTGCGTGAATACGCGAGCTGT--AAAAAC-TATTAATC--AGTTGCCTTCTCATCTCTATATAATTCCTTtttattttaataactgcttaatacaggatttacttattttctgtaatgtttg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                          TATATAGA-AGGATAGGAAACTTGTAT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aacatctcaacttgannnnnnnnnnT-TG-A---GATGAT--TGAAA--GTAAAGATATTGCGAGATTTTGCATGAATACGCGAGC-GTTCACAAA-ATCTaaggacttatatagaagg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  -AGGATAGGAAACTTGCATCTCTC-TAC----TAAATGT---TGATAA----AGTAG-CATGCAAAGAGTTAAT--AACTTGGCAAGTTAATCATTCAAACTTCAAAGATAACAGAATTTCT--------------AACATTAAATATAAG----GTGTATGTAA---CTTTAGAT-A--TTTT-ATGACGTTATAAA-CACGC-AACTGATCTTGAATTTAA-AATATTGCAGTT--TAAAG--TAAA--CTTTCAAG--TACT-T---TT-A-TT--GATTTTTTAGTTTCAG--TATGTACTT---TTT--TTA------ATCATAAGTACTTCAACAATTATAAACACA-------ATTTGCTGGGAATAGTCTCGTTTGA-AC-AGAATTGCATTGCGCAAAGAAAGAAGTTTGA---------TTGTAATTCTGAGATGAATGAAAAT-TA-G---G--AATTCTGAAATTTTGA-GATTTCGCAAAATTTCGCGTGAATAAGCGAGC-GTTCAT-GACATCTCAATC--AGCAACTTTTCTTTCTCTATATAAGTCCTTGA--ATGAA-AT--ACA-ACAATA
gi|4                          :                                                                                                                                                                              agtatcaattaatataaatgcaacaagagttttGAGTATATTC---ACTTATATATA--T--C-AG--CAAGGATTTGTATAGA-AGGATAGGAAACTTGCATCTCCT-GGC----TAAATGT---TGATGA----AACAG-CACACGAAGAATTCAT--TATTTGGCCAATTTATCATTCATAACTCACAGTCAACTG-ATTTCTTA-------------ACATAAACTGTAAG----TTGATTGTAA---TCTTAGAT-G--TTTC-AACATGTTTCGAT-CATGCAAAATGATCTTGAATTAAA-GATTTTGAGGTT--TGAAG--GAAA--AGTTCTCG--TA-A-T---GT-G-TC--GTTATTTGTGCTGCAG--ATTACAAAT---TTT--GTA------ATGAGATTCACTTCAACGATTTTCAACACA-------AATTGTTGGGAATGGTATTGTTTTG-ATGAAAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGGTGAATGAAAGA-CA-A---GATAAT--TGAAA--ACGA-GATATTGCGAGATTTTGCGTGGATACACGAGC-GTTCACTAAC-TGTCAATC--AGTTGCATTTCATTTTCTATATAATTCCTCGAT-ATCAGCAT--ATA-AAAATATctttcactttcgagacaatttcattagtttaaacaatattttattcac
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                 tttggaaaatactgttttaacgTC---ACTTATA-----------AC--CAATGACTTGTATAGA-AGGATAAGAAACTTGCAGCTCCT-GAC----TAAATGT---TGATAA----AATAG-CACACAAATGATTAAT--AATTTG-TAAATTAGTCATTCA---TTAACAGGCAACCG-ATTTCTTTCTTACTCTGATTTACATAACATGCAAG----TTGTATGTAA---TCTTAGAT-G--TTTA-AACATGTTCCGAT-CACGCATACTAATCTTGAATTAAA-GATATTGTGGTT--TGAAG--T-AA--ATGTATCG--TA-A-T---AT-G-TC--GTTATTTTAGCTGCAG--TAAACACAT---TTT--G---------CTAGAAAT-----GAC-ATTGT---------------TTTGATGAGAATTG---CATTCTG-----------CA--ATGTAA-----GAATTGTGA--------TTTGTTATCCTGAGATGAATGGGAGT-AA-A---TATAAT--TGAAA--A-----------CGAGATTTTGCGTGTATACGCAAGC-GTACAC-AACATCTCAATC--AGTTGCATTTCCTTCTCTTTATTAGTCCT
gi|6                          :                                                                                                                                                       agcttgggtatagtatcaaatcaagatgaattggcttacactgtttttcaattttattctaacaatttcaCTTAT---TA--T--A-AC--CCAGGACTTGTATAGA-AGGATTGGAAACTTGCACCTCCT-GAC----TAAATGT---TGATAA----TATAG-CACACGAGGCATTAAT--TATTTGGCAAATTAATCATTCATAATTTACAGACAACGG-ATTTCTTG------------TTCATAAACTGTAAA----TTGTATTTAA---TCTTAAAT-G--TTAA-AACATATTTCGAT-CACGCACAATAATCTTGAATTAAAGAAT-TTGAGGTT--TGAAG--GAAA--ATTTCTTG--TA-A-C---TT-G-TC--GTTATTTTAGCTGCAG--TATACACAT---TTT--GCA------ATAAAAAGTACTTGAACAA-TTTAAACACACACAC--ATATG-TGGGAGTGGTATTGTTTTG-ATAAGAATCTCATTCTGGAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGATGAATGGAAGT-TA-AGATGATAAT--TGAAA--ACGA-GACATTGCCAGATTTTGCCTTAATACGCTAGC-GTTCACAAA-ATCTCAATC--AGTTGCCTTTCCTTCTTGATATAATTCC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                            aataattagctgtaatgcttctgatATTA---ACTTTTATTAAGTT--C-ACG-TAAGGATGTATGTAGA-AGGATAGAAAACATGCATCTCTCTGAC-----AAATGT---CGATAA----AAGAG-CTTGCGAAGAATAAAT--ATTTTGTCAATTTA-TCATTCAAATTTCACAGGCATCTG-ATTTACTT------------CACATTAAATGTAAG----GTTTATGTCA---CCTTAGAT-G--TATA-ATAATGTTTTAAG-CACGCATAATGTTATTGATTTTAA-AATATTGCATTT--TGAAG--TAAG--ATTACAAG--TA-C-T---TT-CCTT--GATTTTTTACTTGCAG--TATACACAT---TTT--ATA------ATCATAAGTACTTCAACAATTTTAAGCACA-------GTTAGCTGAGAATGGTTTCAATTTG-TCGACAATAACATTGTTTAAAGAAAGACTTTTGA--------TTTGTATTTCTGAGATGAATGGAAGT-TA-G---GATATT--TGAAA--ACGT-GATTTCTTGAGATTTTGCTTGAATAGGCAAGC-GTTC-CTTACATCTCAATC--AGTTGCTTTGCCTTTTCTTTATAAGTCC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cTAATCATTCATAATACACAGCCAACTG-ATTTCTTG------------TACATCAACTGTAAG----TTGTATGTAA---ACTTAGAT-A--TTCA-AACATGTTTCGAG-AACGCAAAATGATCTTGAATTAAA-AATATTGAGATT--TGAAG--GAAA--CATTATCG--TA-A-T---TT-G-TT--GCTATTTTAGCTGTAA--TATACAAAT---TTT--GTA------ATCAGATGTTCTTCAACAATTTTAAACACA-------AATTTATGGGAATGGTATTGGTTTG-ATGACAATTTCAGTCTGCAATGTAAGAATTTTGA--------TTTGTGTTCCTGAGATGAAAGGAATT-TG-A---GATAAT--TGAA---------ATT----GAGATTTTGCAT--ATACGCGAGC-GTTCATAAAAA-CTCTATC--AGTTGCATTTCCTTCTCTATATAATTCCTTGAT-G--AA-AT--ATA-CAAAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                              aacaacaccgagttgtaggttacatactttttca--CAATGACTTATATAGA-AGAA-----AACTTGCATATCTC-TAC----TAAAAGT---TTATAA----AACAG-CATGCGAAGAGTAAAT--AATTTGGCAAATTAATCATTTA-------CAGGCAACTG-ATTTCTTT------------TACATAAAATGTAAG----ATGTATGTAA---CCTTAAATAG--TTTG-TACG-GTTTTAAA-CACGT-----------------AA-AATATTGCAGTTTATAAAG--TAAA--ATCTGAAG--TA-G-T---TTCC-TT--GATTTTATAGTTGCAG--TATACAAAG---TTT--GTT------CTCATAGAGATTTCgatatctcttcatgaggattcacgtgaaccaaacttcccaaaattcaatttt
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): GAATAAGATAACTGAAAACAAAATTTTTCATATATACACATACATTAACATTCTCATCAGGTGGATTCAATATTTATCTTCATTTAAGTCTTT
Unaligned ( gi|20 ): TAAATCAGAACTGTCAATGTTATGAAAGATTTAAAATGGTTGTAATGTAACTAACTGTCATTGGTCATTCATTTTAATGATATTTTATACACA
Unaligned ( gi|24 ): TTGACTCGGTCAATACCAAATGGCATAAATCAGCCAAAAACATT