lowQualScore : 1111111111
lowQualScore : 1111111111 1 111111 444444444444444444444444 1111111 222222 11111 999999999999
lowQualScore : 6 8888888888 99 555 6 111111 333333333333333333333333 6 444 0000000 3 77 3 44 0 666666 77777 222222222222
lowQualScore : . .......... .. ... . ...... ........................ . ... ....... . .. . .. . ...... ..... ............
lowQualScore : 0 0000000000 22 222 2 333333 777777777777777777777777 7 000 0000000 1 55 1 22 4 888888 55555 000000000000
consensus : NATAATTGGTT----GTTT--GTGCTATA--CCACAGGCGTCTCTATA--GA--ATAGAG----------AC--------AGAGACACCTATGGTATA-CATGATCAAAC-ACTA-------T-TCTAAAGGGAA-TA--TAGAACATATATC--GAACATAGAACTTCA--G--TCCGTATCTGAAGTTTATAATTT
Reference ( gi|3 ) : CATGATTGATTCACGGTTCACGTGCTATA--CCACAGACATATCTATA--AA--ATAGAG----------AC--------AAAGACACCTATGGTATA-CATGATCAAAC-ATTA-------T-TCTAAAGCGAA-TA--TAGAACATATGTA--GAACATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTACAGTTTATAATTTCCTAT
gi|5 : ATAATTGGTT----GTTT--GTGCTATA--CCATAGGTGTCTCTATA--GA--ATAGAG----------ACTCTCTTTTATAGAAAC-------ATA-AATGATCAAAA-ATTA-------T-TCTAAAGCGAA-TA--TAGAATATGTATC--AAATATAGAA
gi|4 : actgattctatattatctatattATTGATT----GTTT--GTGCCACA--CCATAGGTGTCTCTATA--GACGAT-TAT----------AT--------AGAGACACCTACAGTAAA-CGTGACCAAAC-CATA-------TATATAAACGGAA-TA--AAGAACATGTATga
gi|1 : gtagcgctggtgttgcatattcgacaggagcttgaaattctgttctgtGTGCTAAA--CCACAGGCGTCTC-------A--ATAGAAGT--------AT--------ATAGACAACTATAGTATT-CATGACCAAAC-ATTA-------T-TTTAAAACGAA-TG--TATAA
gi|7 : attgttcaaccacaggagcctgaagttcgatgttaatattataaatggttgtttCTATA--CCACAGATGTGTCTATA--GA--ACAGAG----------AC--------AA------CCATGGTGAA-CATACTAAAAC-ACTT-------T-TCTGCAGGGAA--A--T--AATATGTATA--CAACATAGAACTgttcctgatgtcccaaatagaaa
gi|2 : gtaccttgggctctgtatagcctgtaatagactgcttgtataaCTATAGACTACTGGCAT--CTATT--AT--ATAG-------------C-----------GACACATATGGTATT-AATGATCAAAT-ACCA-------T-TCTAAATGAAA-TA--TAGAACACAAATT--GAACATAGAA
gi|6 : tactcactgtatgttctatttttagcaactattgtcagtattggttgtatgattgtctTATA----ACATATGTGTCTATATAAA--ATAG-T----------AT--------ATAGAGACCTATCATATA-CATAATAAAAC-ACTA-------T-TCTACAGGGAA-TA--TAG---ATAT-T-----ACATAGAATTCCgattatt
gi|5 : gtgtctatagactatatgtagtctgtataggtcgtttgttttatTCTATA--AA--AGAGAGTCTCTATTCTAT--------AGAGACACCTATGGTATAGCACAAACAACCAATTA-------T-AATATAGATAA-TA--TAGAA
gi|9 : actga----------AT--------AAAGACACCTATGGTATG-CAGGAACAATC-ATTA-------T-TCTTAAGCGAA-TA--TAGAACATATATC--CTACATAGAaacataaatgatcaaaaattattctaaagcgaatatagaatatgtatcaaatatagaaga
gi|10 : acttgcaaactatgtttgtgctaaaccatcttat----------AC--------AGAGGCACATATGGTATA-CATGATC-AAC-ACTA-------T-TCTGAATGGAA-TACTTATAATATATAT
gi|8 : tagaacttcaggtctctgttgt--------AGAGACACCTATAGTATAGCA----CAAAC------------------AACCAAT-TA--TA----ATAT-T---GAACATAGAACTTCA--G--t
gi|11 : gataatgctgttattattcacaggagcATGGTATG-CATG-TCTAAC-CTTAGGTCAGAT-TCTAAAGAGAAGTA--TAGAACATATATATGAAACATGGAACTTCA--G--agaatgtttaatatacctgccaaaatgggactaaa
gi|12 : -CATTATCAAAC-CTTT-------T-TTTAAGCTGAA-TA--TAGAACATATATC--GAAC--AGAACTTCG--GGTTCTGTATC----GTTTAgg
gi|13 : -ACTA-------T-TCTAAAGGGAG-TA--TAGAATATATATT--GAAAATAGAACTTCACGG--TCC---TTTGAA---TATAATTT
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): AAAATGTTTGTTTATATTTGCACAGGAGCCTGAAGTTCTATTTCTATATCATAATTGGTTGGTTAT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACCTAAAGTTCTATGGTCTATATTATAATTGGTTGTTTGTACTATGTGATAGG
Unaligned ( gi|16 ): CACATGAGCCTGAAGTTCAATATGCTACATTATAATTGGTTGTTTG
Alignments
lowQualScore : 1111111 33333333333333333333333333333 3333333333
lowQualScore : 8888 8888 55 3333333 55 3 2 3 4 88888888888888888888888888888 1 777 0 2 2 99999999 2 444 44 2 33 555 3 99 99 1111111111
lowQualScore : .... .... .. ....... .. . . . . ............................. . ... . . . ........ . ... .. . .. ... . .. .. ..........
lowQualScore : 5555 5555 55 7777777 00 3 5 3 4 99999999999999999999999999999 8 333 4 7 0 77777777 7 777 33 7 77 444 6 22 22 0000000000
consensus : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGCGTCT-CTATAGA--ATAG-AG----------AC--------AGAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAA---AGGGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTG-AGTTTATAATTT
Reference ( family-1875 ) : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCACAGGCGTCT-CTATAGA--ATAG-AG----------AC--------AGAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAA---AGGGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCGTATCTGAAGTTTATAATTT
gi|1 : ATAAATGGTT----GT----TT--GT---G---CTAAA--CCACAGGCGTCT-CAATAGA-------AGT---------AT--------ATAGACAACTATAGTAT-T-CATGACCAAAC-ATT--------AT-TTTAA---AACGAA-TG--TATAA
gi|10 : attgttcaaccacaggagcctgaagttcgatgttaatattGTT----GA----TC--AT---G----TATA--CCATATGTGCCT-CTGTACA--ACAG-AG----------AC--------gttcctgatgtcccaaatagaaa
gi|10 : tagaacttcag----------AC--------AGAGGCACATATGGTAT-A-CATGATC-AAC-ACT--------AT-TCTGA---ATGGAA-TACTTATAATATATAT-actattctgaatggaatacttataatatatatt
gi|11 : tagaacttcaggtctctgttgtATGGTAT-G-CATG-TCTAAC--CTTAGGTCAGAT-TCTAA---AGAGAAGTA--TAGAACATATATATGAAACATGGAACTTCA--G--t
gi|12 : -CATTATCAAAC-CTT--------TT-TTTAA---GCTGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-C--AGAACTTCG--GGTTCTGTATC----GTTTAgg
gi|13 : -ACT--------AT-TCTAA---AGGGAG-TA--TAGAATATATAT-TGAA-AATAGAACTTCACGG--TCC---TTTGAA---TATAATTT
gi|2 : ATTGGTT----GTATGATT--GT---CT--CTATAGACTACTGGCATCTATTATA----------------------T--------AGCGACACATATGGTAT-T-AATGATCAAAT-ACC--------AT-TCTAA---ATGAAA-TA--TAGAACACAAAT-TGAA-CATAGAAtata
gi|3 : tactcactgtatgttctatttttagcaactattgtcagtATGATTGATTCACGGT----TCACGT---G---CTATA--CCACAGACATAT-CTATAAA--ATAG-AG----------AC--------AAAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ATT--------AT-TCTAA---AGCGAA-TA--TAGAACATATGT-AGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTACAGTTTATAATTTgattatt
gi|4 : cTA--CTGTAGGTGTCT-CTATATA--ATCGTCT----------AT--------AGAGACACCTATGGTGTGG-CACAAACAATC-AAT--------A---CAGA---ACAGAA-TT--TCAAGCTCCTGT-CGAA-TATGCAACACCA--G--cctat
gi|4 : gtagcgATTGATT----GT----TT--GT---G---CCACA--CCATAGGTGTCT-CTATAGACGAT-T-AT----------AT--------AGAGACACCTACAGTAA-A-CGTGACCAAAC-CAT--------ATATATAA---ACGGAA-TA--AAGAACATGTAT-aacgtgaccaaaccatatatataaacggaataaagaacatgtat
gi|5 : gtagcgctggtgttgcatattcgacaggagcttgaaattctgttctgtGTTT-CTATAAA--AGAG-AGTCTCTATTCTAT--------AGAGACACCTATGGTAT-AGCACAAACAACC-A----------AT-TATAATATAGATAA-TA--TAGAA
gi|5 : actgaATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGTGTCT-CTATAGA--ATAG-AG----------ACTCTCTTTTATAGAAAC-------AT-A-AATGATCAAAA-ATT--------AT-TCTAA---AGCGAA-TA--TAGAATATGTAT-CAAA-TATAGAAataaatgatcaaaaattattctaaagcgaatatagaatatgtatcaaatatagaaga
gi|6 : actgattctatattatctatattATAGGTC----GT----TT--GTTTTA---TTATA--ACATATGTGTCT-ATATAAA--ATAGTAT----------AT--------AGAGAC--CTATCATAT-A-CATAATAAAAC-ACT--------AT-TCTAC---AGGGAA-TA--TAG-----ATAT-T--A-CATAGAATTCCga
gi|7 : gtgtctatagactatatgtagtctgtTAATAGACT----GC----TT--GT---ATAACTATA--CCACAGATGTGT-CTATAGA--ACAG-AG----------AC--------A-----ACC-ATGGTGA-A-CATACTAAAAC-ACT--------TT-TCTGC---AGGGAA--A--T--AATATGTAT-ACAA-CATAGAACT
gi|8 : gtaccttgggctctgtatagcctg--------AGAGACACCTATAGTAT-AGCA----CAAACAACC--------A--------------AT-TA--TA------ATAT-TGAA-CATAGAACTTCA--G--
gi|8 : gataatgctgttattattcacaggagcATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CTATAGGTGTCT-C--TAGA--ATagaatgtttaatatacctgccaaaatgggactaaa
gi|9 : gataatgctgttattattcacaggagcctgaagttctatgttcaatattT----GT----TT--GT---G---CTAAA--CCA------TCT--TATATA--A----------------------------AGACACCTATGGTAT-G-CAGGAACAATC-ATT--------AT-TCTTA---AGCGAA-TA--TAGAACATATAT-CCTA-CATAGAgtttaatatacctgccaaaatgggactaaa
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): AAAATGTTTGTTTATATTTGCACAGGAGCCTGAAGTTCTATTTCTATATCATAATTGGTTGGTTAT
Unaligned ( gi|15 ): GGAACCTAAAGTTCTATGGTCTATATTATAATTGGTTGTTTGTACTATGTGATAGG
Unaligned ( gi|16 ): CACATGAGCCTGAAGTTCAATATGCTACATTATAATTGGTTGTTTG
Alignments
lowQualScore : 1111111 55555555555555555555555555555 33333333333
lowQualScore : 7777 7777 55 3333333 44 2 3 4 22222222222222222222222222222 777 0 2 2 99999999 2 444 44 2 33 555 3 99 99 11111111111
lowQualScore : .... .... .. ....... .. . . . ............................. ... . . . ........ . ... .. . .. ... . .. .. ...........
lowQualScore : 7777 7777 00 0000000 66 5 3 4 66666666666666666666666666666 333 4 7 0 77777777 7 777 33 7 77 444 6 22 22 33333333333
consensus : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGCGTCT-CTATAGA--ATAG-AG----------AC--------AGAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAA---AGGGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTG-AGTTTATAATTT
Reference ( family-1875 ) : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGCGTCT-CTATAGA--ATAG-AG----------AC--------AGAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAA---AGGGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTG-AGTTTATAATTT
gi|1 : ATAAATGGTT----GT----TT--GT---G---CTAAA--CCACAGGCGTCT-CAATAGA-------AGT---------AT--------ATAGACAACTATAGTAT-T-CATGACCAAAC-ATT--------AT-TTTAA---AACGAA-TG--TATAA
gi|10 : attgttcaaccacaggagcctgaagttcgatgttaatattGTT----GA----TC--AT---G----TATA--CCATATGTGCCT-CTGTACA--ACAG-AG----------AC--------gttcctgatgtcccaaatagaaa
gi|10 : tagaacttcag----------AC--------AGAGGCACATATGGTAT-A-CATGATC-AAC-ACT--------AT-TCTGA---ATGGAA-TACTTATAATATATAT-actattctgaatggaatacttataatatatatt
gi|11 : tagaacttcaggtctctgttgtATGGTAT-G-CATG-TCTAAC--CTTAGGTCAGAT-TCTAA---AGAGAAGTA--TAGAACATATATATGAAACATGGAACTTCA--G--t
gi|12 : -CATTATCAAAC-CTT--------TT-TTTAA---GCTGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-C--AGAACTTCG--GGTTCTGTATC----GTTTAgg
gi|13 : -ACT--------AT-TCTAA---AGGGAG-TA--TAGAATATATAT-TGAA-AATAGAACTTCACGG--TCC---TTTG-AA--TATAATTT
gi|15 : ATAATTGGTT----GT----TT--GT---A---CTATG--TGATAGGtata
gi|2 : ggaacctaaagttctatggtctatattATTGGTT----GTATGATT--GT---CT--CTATAGACTACTGGCATCTATTATA----------------------T--------AGCGACACATATGGTAT-T-AATGATCAAAT-ACC--------AT-TCTAA---ATGAAA-TA--TAGAACACAAAT-TGAA-CATAGAA
gi|3 : tactcactgtatgttctatttttagcaactattgtcagtATGATTGATTCACGGT----TCACGT---G---CTATA--CCACAGACATAT-CTATAAA--ATAG-AG----------AC--------AAAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ATT--------AT-TCTAA---AGCGAA-TA--TAGAACATATGT-AGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTACAGTTTATAATTTgattatt
gi|4 : cTA--CTGTAGGTGTCT-CTATATA--ATCGTCT----------AT--------AGAGACACCTATGGTGTGG-CACAAACAATC-AAT--------A---CAGA---ACAGAA-TT--TCAAGCTCCTGT-CGAA-TATGCAACACCA--G--cctat
gi|4 : gtagcgATTGATT----GT----TT--GT---G---CCACA--CCATAGGTGTCT-CTATAGACGAT-T-AT----------AT--------AGAGACACCTACAGTAA-A-CGTGACCAAAC-CAT--------ATATATAA---ACGGAA-TA--AAGAACATGTAT-aacgtgaccaaaccatatatataaacggaataaagaacatgtat
gi|5 : gtagcgctggtgttgcatattcgacaggagcttgaaattctgttctgtGTTT-CTATAAA--AGAG-AGTCTCTATTCTAT--------AGAGACACCTATGGTAT-AGCACAAACAACC-A----------AT-TATAATATAGATAA-TA--TAGAA
gi|5 : actgaATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGTGTCT-CTATAGA--ATAG-AG----------ACTCTCTTTTATAGAAAC-------AT-A-AATGATCAAAA-ATT--------AT-TCTAA---AGCGAA-TA--TAGAATATGTAT-CAAA-TATAGAAataaatgatcaaaaattattctaaagcgaatatagaatatgtatcaaatatagaaga
gi|6 : actgattctatattatctatattATAGGTC----GT----TT--GTTTTA---TTATA--ACATATGTGTCT-ATATAAA--ATAGTAT----------AT--------AGAGAC--CTATCATAT-A-CATAATAAAAC-ACT--------AT-TCTAC---AGGGAA-TA--TAG-----ATAT-T--A-CATAGAATTCCga
gi|7 : gtgtctatagactatatgtagtctgtTAATAGACT----GC----TT--GT---ATAACTATA--CCACAGATGTGT-CTATAGA--A-----------------C--------AGAGACAACCATGGTGA-A-CATACTAAAAC-ACT--------TT-TCTGC---AGGGAA--A--T--AATATGTAT-ACAA-CATAGAACT
gi|8 : gtaccttgggctctgtatagcctg--------AGAGACACCTATAGTAT-AGCA----CAAACAACC--------A--------------AT-TA--TA------ATAT-TGAA-CATAGAACTTCA--G--
gi|8 : gataatgctgttattattcacaggagcATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CTATAGGTGTCT-C--TAGA--ATagaatgtttaatatacctgccaaaatgggactaaa
gi|9 : gataatgctgttattattcacaggagcctgaagttctatgttcaatattT----GT----TT--GT---G---CTAAA--CCAT------CT--TATATA--A----------------------------AGACACCTATGGTAT-G-CAGGAACAATC-ATT--------AT-TCTTA---AGCGAA-TA--TAGAACATATAT-CCTA-CATAGAgtttaatatacctgccaaaatgggactaaa
blockSeqs : CACG ATGA AC TTTA GA T A C AGAGAGTCTCTATTCTAT GG A C TAGGTCAG A TAT TG G CT CG . CG GT GATCTACAGT
blockSeqs : . . . ATAA . C . A ATAGAGACTCTCTTTT AG . C . . . GA . . TG . . . TTTGAA
blockSeqs : . . . CT . C . T ATCGTCTAT AG . T . . . CT . . TG . . .
blockSeqs : . . . G . T . G CGATTATAT A . C . . . GG . . AG . . .
blockSeqs : . . . A . T . A ATAGTATAT G . C . . . TG . . CG . . .
blockSeqs : . . . G . T . G ACAGAGAC T . T . . . GC . . CA .
blockSeqs : . . . G . T . A ATAGAGAC A . A . . . CA . . AC .
blockSeqs : . . . G . T . G AC A . A . . . CG . . TG .
blockSeqs : . . . G . T . G T A . T . . . GA . . CC .
blockSeqs : . . . G . . . T A A . C . . . GC . . T .
blockSeqs : . . . A . C . . . GG . .
blockSeqs : G . C . . . GG . .
blockSeqs : . T . . . GC . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : AAGAAT*********************** CG*
originalCons : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGCGTCT-CTATAGA--ATAG-AG----------AC--------AGAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAA---AGGGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTG-AGTTTATAATTT
finalCons : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGCGTCT-CTATAGAAAGAAT-----------------------AGAGACACCTATGGTAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAA---AGGGAA-TA--TAGAACATATATCG-AA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTG-AGTTTATAATTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): AAAATGTTTGTTTATATTTGCACAGGAGCCTGAAGTTCTATTTCTATATCATAATTGGTTGGTTAT
Unaligned ( gi|16 ): CACATGAGCCTGAAGTTCAATATGCTACATTATAATTGGTTGTTTG
Alignments
lowQualScore : 1111111 666666666666 11111111 33333333333
lowQualScore : 7777 7777 55 3333333 44 2 3 111111111111 7777 555 555 2 00000000 2 44 2 33 0 555 3 99 99 11111111111
lowQualScore : .... .... .. ....... .. . . ............ .... ... ... . ........ . .. . .. . ... . .. .. ...........
lowQualScore : 7777 7777 00 0000000 66 5 6 333333333333 7777 888 555 9 44444444 9 99 9 99 1 444 6 22 22 33333333333
consensus : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGCGTCT-CTATAGAA-AGA----ATAGAGACAC----CTATGG---TAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAAAGGGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTG-AGTTTATAATTT
Reference ( family-1875 ) : NATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGCGTCT-CTATAGAA-AGA----ATAGAGACAC----CTATGG---TAT-A-CATGATCAAAC-ACT--------AT-TCTAAAGGGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTG-AGTTTATAATTT
gi|1 : ATAAATGGTT----GT----TT--GT---G---CTAAA--CCACAGGCGTCT-CAATAG-A-AGT----ATATAGACAA----CTATAG---TAT-T-CATGACCAAAC-ATT--------AT-TTTAAAACGAA-TG--TATAA
gi|10 : attgttcaaccacaggagcctgaagttcgatgttaatattGTT----GA----TC--AT---G----TATA--CCATATGTGCCT-CTGT-----ACA----ACAGAGACgttcctgatgtcccaaatagaaa
gi|10 : tagaacttcag----ACAGAGGCAC----ATATGG---TAT-A-CATGATC-AAC-ACT--------AT-TCTGAATGGAA-TACTTATAATATATAT-actattctgaatggaatacttataatatatatt
gi|11 : tagaacttcaggtctctgttgtATGG---TAT-G-CATG-TCTAAC--CTTAGGTCAGAT-TCTAAAGAGAAGTA--TAGAACATATATATGAAACATGGAACTTCA--G--t
gi|12 : -CATTATCAAAC-CTT--------TT-TTTAAGCTGAA-TA--TAGAACATATAT-CGAA-C--AGAACTTCG--GGTTCTGTATC----GTTTAgg
gi|13 : -ACT--------AT-TCTAAAGGGAG-TA--TAGAATATATAT-TGAA-AATAGAACTTCACGG--TCC---TTTG-AA--TATAATTT
gi|15 : ATAATTGGTT----GT----TT--GT---A---CTATG--TGATAGGtata
gi|2 : ggaacctaaagttctatggtctatattATTGGTT----GTATGATT--GT---CT--CTATAGACTACTGGCATCTATTATA------------TAGCGACAC----ATATGG---TAT-T-AATGATCAAAT-ACC--------AT-TCTAAATGAAA-TA--TAGAACACAAAT-TGAA-CATAGAA
gi|3 : tactcactgtatgttctatttttagcaactattgtcagtATGATTGATTCACGGT----TCACGT---G---CTATA--CCACAGACATAT-CTATAAAATAGAG---ACAAAGACAC----CTATGG---TAT-A-CATGATCAAAC-ATT--------AT-TCTAAAGCGAA-TA--TAGAACATATGT-AGAA-CATAGAACTTCA--G--TCCG-ATCTACAGTTTATAATTTgattatt
gi|4 : cTA--CTGTAGGTGTCT-CTATATAA-TCGTCT-ATAGAGACAC----CTATGG---TGTGG-CACAAACAATC-AAT--------A---CAGAACAGAA-TT--TCAAGCTCCTGT-CGAA-TATGCAACACCA--G--cctat
gi|4 : gtagcgATTGATT----GT----TT--GT---G---CCACA--CCATAGGTGTCT-CTATAG-A-CGATTATATAGAGACAC----CTACAG---TAA-A-CGTGACCAAAC-CAT--------ATATATAAACGGAA-TA--AAGAACATGTAT-aacgtgaccaaaccatatatataaacggaataaagaacatgtat
gi|5 : gtagcgctggtgttgcatattcgacaggagcttgaaattctgttctgtATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CCATAGGTGTCT-CTAT-----AGA----ATAGAGACTCTCTTTTATAGAAACAT-A-AATGATCAAAA-ATT--------AT-TCTAAAGCGAA-TA--TAGAATATGTAT-CAAA-TATAGAA
gi|6 : actgattctatattatctatattATAGGTC----GT----TT--GTTTTA---TTATA--ACATATGTGTCT-ATATAAAATAGT----ATATAGAGAC----CTATCA---TAT-A-CATAATAAAAC-ACT--------AT-TCTACAGGGAA-TA--TAG-----ATAT-T--A-CATAGAATTCCga
gi|7 : gtgtctatagactatatgtagtctgtTAATAGACT----GC----TT--GT---ATAACTATA--CCACAGATGTGT-CTATAGAA---------CAGAGACAA----CCATGG---TGA-A-CATACTAAAAC-ACT--------TT-TCTGCAGGGAA--A--T--AATATGTAT-ACAA-CATAGAACT
gi|8 : gtaccttgggctctgtatagcctgTAGAGACAC----CTATAG---TAT-AGCA----CAAACAACC--------A-----------AT-TA--TA------ATAT-TGAA-CATAGAACTTCA--G--
gi|8 : gataatgctgttattattcacaggagcATAATTGGTT----GT----TT--GT---G---CTATA--CTATAGGTGTCT-CTAgaatgtttaatatacctgccaaaatgggactaaa
gi|9 : gataatgctgttattattcacaggagcctgaagttctatgttcaatattT----GT----TT--GT---G---CTAAA--CCAT------CT--TATA------------TAAAGACAC----CTATGG---TAT-G-CAGGAACAATC-ATT--------AT-TCTTAAGCGAA-TA--TAGAACATATAT-CCTA-CATAGAgaatgtttaatatacctgccaaaatgggactaaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): AAAATGTTTGTTTATATTTGCACAGGAGCCTGAAGTTCTATTTCTATATCATAATTGGTTGGTTAT
Unaligned ( gi|16 ): CACATGAGCCTGAAGTTCAATATGCTACATTATAATTGGTTGTTTG