lowQualScore : 555555555555555555555 111111 33333333 333333333333333333333333333333 88888888888888888888888888 1111 2222222 111 4444444444444 4444444 222222 2 555555555555
lowQualScore : 4 444444444444444444444 3 1 3 555 3 777777 55555555 7 000000000000000000000000000000 22222222222222222222222222 9999 9 77 0 6666666 99 6 5 888 9 8888888888888 5 4444444 666666 3 999999999999
lowQualScore : . ..................... . . . ... . ...... ........ . .............................. .......................... .... . .. . ....... .. . . ... . ............. . ....... ...... . ............
lowQualScore : 0 000000000000000000000 3 0 1 444 1 222222 11111111 4 666666666666666666666666666666 33333333333333333333333333 2222 8 33 7 3333333 22 7 3 333 0 2222222222222 0 2222222 000000 0 000000000000
consensus : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CCTC------TAATATA-ACGACT-CC---CT-GTCTTA-----TGCGACTG--T--A-TTTTTCCTCCCGAC-GATT-----TC--TG-CTATA--------TAATGGGT-CATGTATGT--ATAACGACATCCTGCCTTACGTGACAAGCGACCGTAAAATNCG-TT--C-CCGAAAT---CAATAGTC---G---NTN-A-ATCGGCCTGTATATAACGAC-TCTTGTTTT-T----ACGGCTTTCAAAATGATTACCGTATTGA
Reference ( gi|7 ) : AGTCTAGACTGGCTTAATGACCC------CCGC------CAATTTA-ACGACT-CC---CT-GTCTTG-----TGCGACTG--T--T-TTTTTCCTCCCGAC-AATT-----TC--TG-CTATA--------TAATGGGTACATGTATGTTAATAATGGCACCATGCCTTTCACGACAATTGACCGTGATATCCA-TT--C-CTGAAAT---CAGTAATC---A---ATC-A-ATTAGCCTGTATATAACGAC-TCGTGATTT-T----ACGACTTTCCTCATACTTGTGGTATTGA
gi|8 : AGTCTAGACTGGCTCAATAACTC------TCTC------T-ATATA-ACAACT-CC---CC-GTCTCGTTATATATGACTG--TAAT-TCTTTCCTACCAAA-GATT-----TT--TA-CT
gi|18 : tgcAGTCTAGACTGGTTTAATGACCC------CATC------TA---TA-AGAACT-CT---CTAGTCTTG-----TGCAACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgaattaactgctagatagcatctcttaatgaattaat
gi|16 : cAGTCCAGGCTGGCCTTATGACCC------CCTC------TG-TGAA-ACAACT-CC---CT-ATGTTA-----TGTGACTGTAT--T-TTTTTTCTCCtaatttt
gi|19 : cAGTTCAGACTGGCATAATGA-CC------CTAT------CTATATA-ACAACA-CC---CT-GT
gi|17 : atacAGTCTAGACTGGCTCAACAACCT------TCTC------T-ATATA-AAGACA-AA---CT-ATATTA-----TGTGACT
gi|12 : acGTCCAGACTGGCTGAATTACCC------CC-T------TAATAGA-ATGACT-CT---CA-A--CTGAA---TGCGACTA-----A-TTTTTCCTCCTTACAAATTTTGGGTC--TG-C-ATA--------TAATGtgaattcttc
gi|6 : TCTAGACTGGTTGAAAGACCC------TCTC------T-ATATA-AAGATG-CC---AT-GTTGTA-----TGCGACTG--TA-A-TTTTTCTTCCCAAC-AATT-----TT--TG-CTATATACATTTGTAATTGGT-C-TGTATGT--AT--CTACATCCTGACTTACATGACAGCTGTCTGTAAAATCTG-GT--CACCAAAATC--CACTAGGCGGTA---TTA-A-ATCAGTCAATATATAATGAC--CTTGTTTT-TTCAAACG-TTTTCAAAATGATTACCGTATTGA
gi|13 : CTAGACTAGTTCAAGAAACC------CCACATTTATTAAACTA-ACGACT-CC---CT-GTCTT------T----CTG---------TTTCCTCCCGAC-A--------CC--TGACAATA--------TAATGGGT--ATGCATtcttttacttggtcacagc
gi|5 : GACTGACTGAACAACCCAATCTCCCAT------CTATGTA-ATGACTACT---CT--TCTTG-----TGAGACTA--T--AATTTTTCATTTTGAT-GAGT-----TT--TG-CTATA--------TATTAGGT-C-TGTAT----ATAACAACATACTGCCTTATGTGACAAGCAACTGTGAAATCTGTTT--C-CCAAAATATACAATCGTT---T---ATA-A-ATCAACCTGCACATAATG
gi|2 : TGACCC------TCTC------TA---TATACAACT-CC---CT-ATCTTA-----TGCAACTG--T--A-ATTTTTCTCTC----------------------------------AATGGTTA-----ATGTTTATAATGGCATCCTTCCTTATGTGACAAGCGACAGTAAAGTTTGTTT--C-CCAAAAT---CAATAGTT---GTT-ATT-ATAACAGCCCGTATATAACAAC-cccttttttttaaaaaattttcgaaatagtaaataatattttatttgatcacaagaagtggtaatttc
gi|15 : atATATA-AAGTCT-CG---CT-GTGTTA-----TGCGACTA--C--A-ATTTTCATCCCAAC-AAGT-----TT--TA-CTATA--------TAATcttgtcttttcaaaataattatccatcttctgttggtcacaatataggtgataattgctcctaaattaaacattatgacacaagttaattttttaattgatttacaataagtgttgagaaatataacaaagcagacacataa
gi|4 : ATGTA-ACGACT-CC---CT-GTCTTT-----TGCGACaattggtctgaatatatc
gi|9 : gtctgtGACT-CTGAGCT-GTCTTA-----TGCAA-TG--T--T-ATTTTATTTTCAAC-CATG-----ACAATA-CTCTA--------TATTGG---CATG-ATAC--ATAA-----CCCTGTCTTACACGACAAGTGACTCTAAAATGCT-TTTCC-CAGAAAT---CAATAATC---aagtgaccataaaatctgtttcctaaaatcaatattctttatttaatcagcccattataacattacaaccttgttttcacattaaatgttaatcttttatttggtcacaatatgagaagaaaattgcaactgaattaaacatcaagacaggatttttattaccggtaattgatttacgtttgtttctgacaaagattacacataacaataattagtttgccacattgcattagcttttgtt
gi|1 : gctgtaattaaacccctttatatattTGCCTTGTGTGACAATTGA----GAAATTCT-TT--C-CTGAAAT---TATCAATC---ATTGTTT-A-ATGGGCCTATATATGACGAC-T----ATTT-T----gttatttaa
gi|14 : ccTGCCTTATATGAGAAATGACCATAATTTATA-TT--T-TCGAAAT---CAATAATCTT-A---TTC-T-CTCAGCCTGTATATAATTAC--CTTGTTTT-T----tcttctttttttgaatggataatgatctctctttttttttggtcacagcaatagatgctaatggcaccgatttaaaattaaacatgatagttactttttaagttgattgatgtttgactctgacaaaactgacacaataatcattttgccacacatttactaaaattattgctttttttttttttattagaagccatgcattttgtttacagatcattcaaaatcttttatccagactagctgaatttcacca
gi|3 : cc---ATCTA-ATTGGTCTGTATATAACGACATCCTGCTTTGC----ACGGC
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): TCCCCATCTTTTTTAACATATTTATTCCTCCCATTGGTGTTTACTTTAAAAAGGGTCTGTATGTAACGACTCCCTCCTGACAAGTGACTGTAAAATATGTTTCACAAAATCAATATTTGTTTTTGAATCAG
Unaligned ( gi|11 ): GTCTGCATGTAGTGACATCCTCTTGTATGCCACAAGGGACCATGGAATGTGTATCTTGAAATCAATTATTGTTCTGTTGTATTATCGGCCTGTT
Alignments
lowQualScore : 222 111111 222222222222222222222222222222222222222222 222 1111111 1111 111 3333333333333333333333333333333333 2222222 4444444444 1
lowQualScore : 1 4 888888 888 000 555 0 2 444 2 77777 1 2 333333 2 2 44 555555555555555555555555555555555555555555 777 222 0 2222222 0 2 444 55 55 2 1 4444 3 3 3 55 666 000 4444444444444444444444444444444444 55 2 5 66 0000000 3333333333 8 2 22 3
lowQualScore : . . ...... ... ... ... . . ... . ..... . . ...... . . .. .......................................... ... ... . ....... . . ... .. .. . . .... . . . .. ... ... .................................. .. . . .. ....... .......... . . .. .
lowQualScore : 0 6 888888 555 555 000 6 7 777 7 11111 7 9 333333 9 9 66 666666666666666666666666666666666666666666 000 666 5 1111111 1 0 000 00 00 5 8 6666 6 6 6 00 444 000 0000000000000000000000000000000000 55 8 0 99 2222222 6666666666 6 0 22 3
consensus : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA-ATA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TG-T-A--TTT-T-TCCTC--CC--GAC-GATT-----TTTG-CTA------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCTTACGCG--ACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT---CAA----------TA---ATC---G---TT------NA--ATCAGCCCGTA-TATAACG--AC--TCT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAAATAATTATCG-TATTGA
Reference ( family-1751 ) : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA-ATA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TG-T-A--TTT-T-TCCTC--CC--GAC-GATT-----TCTG-CTA------TA--------T--AATG---GGT-CATGTATGT--ATAACGACATCCTGCCTTACGTG--ACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT---CAA----------TA---GTC---G---NT------NA--ATCGGCCTGTA-TATAACG--AC--TCT--TGTTTTT----ACGGC-TTTCAAAATGATTACCG-TATTGA
gi|1 : CCTGCCTTGTGTG--ACA--ATTGA----GAAATTCT-T-TC-C-T--GAAATTAT---CAA----------TC---ATT---G---TT------TA--ATGGGCCTATA-TATGACG--AC--TAT--TTTTCTT----
gi|10 : T-CC---CC-ATCT-----TTTTTAAC--A-T-A--TTTAT-TCCTC--CC--ATT-GGTG-----TTTA-CTT------TA--------A--AAAG---GGT-C-TGTATGT--A--ACGAC-TCCCTCCT-----G--ACA--AGTGACTGTAAAATATG-T-TT-CAC--AAA---AT---CAA----------TATTTGTT---T---TT------GA--ATCAGctttttttgaatggataatgatctctctttttttttggtcacagcaatagatgctaatggcaccgatttaaaattaaacatgatagttactttttaagttgattgatgtttgactctgacaaaactgacacaataatcattttgccacacatttactaaaattattgctttttttttttttattagaagccatgcattttgtttacagatcattcaaaatcttttatccagactagctgaatttcacca
gi|11 : GT-C-TGCATGT--A--GTGACATCCT--CTTGTATGCCACA--AGGGACCATGGAATGTG-TATC-T-T--GAA---AT---CAA----------TT---ATT---G---TTCTGTTGTATTATCGGCCTGT
gi|12 : GTCCAGACTGGCTGAATTACCC------CC---T-TA-ATA---GAATGACT-CT---CA-ACTG-----AATGCGAC-TA---A--TTT-T-TCCTC--CT--TACAAATTTTGGGTCTG-C-A------TA--------T--AATG---t
gi|13 : CTAGACTAGTTCAAGAAACC------CCACATTTA-TTAAACTAACGACT-CC---CT-GTCT-----T-T----C-TG--------T-T-TCCTC--CC--GAC-A--------CCTGACAA------TA--------T--AATG---GGT--ATGCAT
gi|14 : CCTGCCTTATATG--AGA--AATGACCATAATTTATA-T-TT-T-C--GAA---AT---CAA----------TA---ATCTT-A---TT------CT--CTCAGCCTGTA-TATAATT--AC---CT--TGTTTTT----
gi|15 : -ATA---TAAAGTCT-CG---CT-GTGT-----TATGCGAC-TA-C-A--ATT-T-TCATC--CC--AAC-AAGT-----TTTA-CTA------TA--------T--AATAATTGGT-C-TGAATAT--AT
gi|16 : AGTCCAGGCTGGCCTTATGACCC------CC---TCTG--TG---AAACAACT-CC---CT-ATGT-----TATGTGAC-TG-T-A--TTT-T-TTTTC--TC--c
gi|17 : cAGTCTAGACTGGCTCAACAACCT------TC---TCT--ATA---TAAAGACA-AA---CT-ATAT-----TATGTGACTTG-A-A--TTC-T-TCc
gi|18 : acAGTCTAGACTGGTTTAATGACCC------CA---TC----TA---TAAGAACT-CT---CTAGTCT-----TGTGCAAC-TT-A-A--TTT-T-
gi|19 : cAGTTCAGACTGGCATAATGACCC------TA---TCT--ATA---TAACAACA-CC---CT-GT
gi|2 : atacGACCC------TC---TCTA--TA---TA-CAACT-CC---CT-ATCT-----TATGCAAC-TG-T-A--ATT-T-TTCTC--TC------------------------------------------AATG---GTT-AATGT-T-T--ATAATGGCATCCTTCCTTATGTG--ACA--AGCGACAGTAAAGTTTGTT-TC-C-C--AAA---AT---CAA----------TA---GTT---G---TTATTA--TA--A-CAGCCCGTA-TATAACA--AC---CT--TGTCT------------TTTCAAAATAATTATC
gi|3 : attC------CC---TCTACATA---TAACGATT-TG---CT-GACT-----AACG---------------T-T-TCCTA--CC--AAA-AAGT-----TTTA-CTACCTATATA--------TCTAATT---GGT-C-TGTAT----ATAACGACATCCTGCTTTGCACG--GCACTAGCAGCTGTAAAATATGTT-TC-C-C--GAA---AG---CAATTATTATAAGTA---ATT---T---AT------AA--ATCAGCCCGTATTATGACG--GC--T-TGACGTTTTA----AAAATATTTC-AAATAATTATTGTTATTcatcttctgttggtcacaatataggtgataattgctcctaaattaaacattatgacacaagttaattttttaattgatttacaataagtgttgagaaatataacaaagcagacacataa
gi|4 : GT-C-TGTATGT--A--ACGACTCCCTGTCTTTTGCG--ACA--AGTGACCATAAAATCTGTT-TC-C-T--AAA---AT---CAA----------TA---TTCTTTA---TT------TA--ATCAGCCCAT--TATAACATTACAACCT--TGTTTTC----ACttgtattgtcatagcacgagttaataaaatcatcaaaattaaacacaataagtgtgatgcaag
gi|5 : GACTGACTGAACAACCCAATCTCCCA--TCTA--TG---TAATGACTACT---CT--TCT-----TGTGAGAC-TA-T-AA-TTT-T-TCATT--TT--GAT-GAGT-----TTTG-CTA------TA--------T--ATTA---GGT-C-TGTAT----ATAACAACATACTGCCTTATGTG--ACA--AGCAACTGTGAAATCTGTT-TC-C-C--AAA---ATATACAA----------TC---GTT---T---AT------AA--ATCAACCTGCA-CATAATG---C--CCT--TTTTTTTAA--AAAAT-TTTCGAAATattaaatgttaatcttttatttggtcacaatatgagaagaaaattgcaactgaattaaacatcaagacaggatttttattaccggtaattgatttacgtttgtttctgacaaagattacacataacaataattagtttgccacattgcattagcttttgtt
gi|6 : TCTAGACTGGTTGAAAGACCC------TC---TCT--ATA---TAAAGATG-CC---AT-GTTG-----TATGCGAC-TG-TAA--TTT-T-TCTTC--CC--AAC-AATT-----TTTG-CTA------TATACATTTGT--AATT---GGT-C-TGTATGT--AT--CTACATCCTGACTTACATG--ACA--GCTGTCTGTAAAATCTG-G-TCAC-C--AAA---ATC--CAC----------TA---GGC---GGTATT------AA--ATCAGTCAATA-TATAATG--AC---CT--TGTTTTTTCAAAC-GT-TTTCAAAATGATTACCG-TATTGAagtaaataatattttatttgatcacaagaagtggtaatttc
gi|7 : AGTCTAGACTGGCTTAATGACCC------CC---GCCA-ATT---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TGTGCGAC-TG-T-T--TTT-T-TCCTC--CC--GAC-AATT-----TCTG-CTA------TA--------T--AATG---GGTACATGTATGTTAATAATGGCACCATGCCTTTCACG--ACA--ATTGACCGTGATATCCA-T-TC-C-T--GAA---AT---CAG----------TA---ATC---A---AT------CA--ATTAGCCTGTA-TATAACG--AC--TCG--TGATTTT----ACGAC-TTTCCTCATACTTGTGG-TATTGAtcttttacttggtcacagc
gi|8 : AGTCTAGACTGGCTCAATAACTC------TC---TCT--ATA---TAACAACT-CC---CC-GTCTCGTTATATATGAC-TG-T-AATTCT-T-TCCTA--CC--AAA-GATT-----TTTA-CT
gi|9 : tgcCC------CC---TTTA--TA---TATTGACT-CTGAGCT-GTCT-----TATGCAA--TGTT-A--TTT-TATTTTCAACCATGAC-AA---------TA-CTC------TA--------T--ATTG---G---CATG-ATAC--ATAAC-----CCTGTCTTACACG--ACA--AGTGACTCTAAAATGCT-T-TT-C-CCAGAA---AT---CAA----------TA---ATC---G---TT------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgaattaactgctagatagcatctcttaatgaattaat
Alignments
lowQualScore : 222 11111 1111 111111111 11111111111 1111 1111 333333333333333333 2222222 33333333 111 1
lowQualScore : 1 4 888888 888 000 555 0 2 444 2 77777 1 2 33333 2 2 44 555 0 2 0000 222222222 66666666666 777 3 7 2 3333 22 0 2 3 11 55 2 1 4444 3 3 3 55 666 3 555555555555555555 88888 1 5 66 0000000 33333333 5 7 111 3
lowQualScore : . . ...... ... ... ... . . ... . ..... . . ..... . . .. ... . . .... ......... ........... ... . . . .... .. . . . .. .. . . .... . . . .. ... . .................. ..... . . .. ....... ........ . . ... .
lowQualScore : 0 6 888888 555 222 000 6 7 777 7 11111 7 9 33333 9 9 66 666 2 1 4444 555555555 00000000000 000 6 3 7 4444 66 1 0 6 66 00 5 8 6666 6 6 6 00 444 6 555555555555555555 77777 1 0 99 2222222 66666666 7 8 777 3
consensus : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA-ATA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATAACG--AC--TCT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
Reference ( family-1751 ) : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA-ATA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATAACG--AC--TCT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
gi|1 : CCTGCCT-TGTGTGACA--ATTGA----GAAATTCT-T-TC-C-T--GAAATTAT-CAATCATT---G---T----------T----TAATGGGCCTATA-TATGACG--AC--TAT--TTTTCTT-----CTTT-TTTTGAATGGATAATGATC
gi|10 : T-CC---CC-ATCT-----TTTTTAAC--AT-A--TTTAT-TCCTC--CC--ATTGGTGTTTA---CT--T------TA--------A--AAAG---GGT-C-TGTATG----TAACGAC-TCCCTCCT------GACA--AGTGACTGTAAAATATG-T-TT-CAC--AAA---AT-CAATATTT---GTTTT----------T----GAATCAGtctctttttttttggtcacagcaatagatgctaatggcaccgatttaaaattaaacatgatagttactttttaagttgattgatgtttgactctgacaaaactgacacaataatcattttgccacacatttactaaaattattgctttttttttttttattagaagccatgcattttgtttacagatcattcaaaatcttttatccagactagctgaatttcacca
gi|11 : GT-C-TGCATGT--A--GTGACATCCT-CTTGTATGCCACA--AGGGACCATGGAATGTG-TATC-T-T--GAA---AT-CAATTATT---G---T----------T----
gi|12 : GTCCAGACTGGCTGAATTACCC------CC---T-TA-ATA---GAATGACT-CT---CA-ACTG-----AATGCGAC-TA--A--TTT-T-TCCTC--CT--TACAAATTTTGGGTCTGCA------TA--------T--AATG---ctgttgtattatcggcctgtt
gi|13 : CTAGACTAGTTCAAGAAACC------CCACATTTA-TTAAACTAACGACT-CC---CT-GTCT-----T-T----C-TG-------T-T-TCCTC--CC--GACA---CCTGA--CA--A------TA--------T--AATG---GGT-A-TGCAT
gi|14 : CCTGCCT-TATATGAGA--AATGACCATAATTTATA-T-TT-T-C--GAA---AT-CAATAATCTT-A---T----------T----CTCTCAGCCTGTA-TATAATT--AC---CT--TGTTTTT----
gi|15 : -ATA---TAAAGTCT-CG---CT-GTGT-----TATGCGAC-TAC-A--ATT-T-TCATC--CC--AACAAGTTTTA---CT--A------TA--------T--AATAATTGGT-C-TGAATAT--AT
gi|16 : AGTCCAGGCTGGCCTTATGACCC------CC---TCTG--TG---AAACAACT-CC---CT-ATGT-----TATGTGAC-TGT-A--TTT-T-TTTTC--TC--c
gi|17 : cAGTCTAGACTGGCTCAACAACCT------TC---TCT--ATA---TAAAGACA-AA---CT-ATAT-----TATGTGACTTGA-A--TTC-T-TCc
gi|18 : acAGTCTAGACTGGTTTAATGACCC------CA---TC----TA---TAAGAACT-CT---CTAGTCT-----TGTGCAAC-TTA-A--TTT-T-
gi|19 : cAGTTCAGACTGGCATAATGACCC------TA---TCT--ATA---TAACAACA-CC---CT-GT
gi|2 : atacGACCC------TC---TCTA--TA---TA-CAACT-CC---CT-ATCT-----TATGCAAC-TGT-A--ATT-T-TTCTC--TC--AATGGTT-------------------------------AATG-------------TTT--ATAATGGCATCCTTCCT-TATGTGACA--AGCGACAGTAAAGTTTGTT-TC-C-C--AAA---AT-CAATAGTT---G---T----------TATTATAA-CAGCCCGTA-TATAACA--AC---CT--TGTC-----------T-TTTCAAA---ATAATTATC
gi|3 : attC------CC---TCTACATA---TAACGATT-TG---CT-GACT-----AACG--------------T-T-TCCTA--CC--AAAAAGTTTTA---CT--ACCTATATA--------TCTAATT---GGT-C-TGTAT----ATAACGACATCCTGCTT-TGCACGGCACTAGCAGCTGTAAAATATGTT-TC-C-C--GAA---AG-CAATTATT---A---TAAGTAATTTAT----AAATCAGCCCGTATTATGACG--GC--T-TGACGTTTTA----AAAATATTTC-AA---ATAATTATTGTTATTcatcttctgttggtcacaatataggtgataattgctcctaaattaaacattatgacacaagttaattttttaattgatttacaataagtgttgagaaatataacaaagcagacacataa
gi|4 : GT-C-TGTATGT--A--ACGACTCCCTGTCT-TTTGCGACA--AGTGACCATAAAATCTGTT-TC-C-T--AAA---AT-CAATATTCTTTA---T----------T----TAATCAGCCCAT--TATAACATTACAACCT--TGTTTTC----AC-AT-Tttgtattgtcatagcacgagttaataaaatcatcaaaattaaacacaataagtgtgatgcaag
gi|5 : GACTGACTGAACAACCCAATCTCCCA--TCTA--TG---TAATGACTACT---CT--TCT-----TGTGAGAC-TAT-AA-TTT-T-TCATT--TT--GATGAGTTTTG---CT--A------TA--------T--ATTA---GGT-C-TGTAT----ATAACAACATACTGCCT-TATGTGACA--AGCAACTGTGAAATCTGTT-TC-C-C--AAA---AT-ATACAATC---G---TTTA-------T----AAATCAACCTGCA-CATAATG---C--CCT--TTTTTTTAA--AAAAT-TTTCGAA---ATAGTaaatgttaatcttttatttggtcacaatatgagaagaaaattgcaactgaattaaacatcaagacaggatttttattaccggtaattgatttacgtttgtttctgacaaagattacacataacaataattagtttgccacattgcattagcttttgtt
gi|6 : TCTAGACTGGTTGAAAGACCC------TC---TCTA--TA---TAAAGATG-CC---AT-GTTG-----TATGCGAC-TGT-AA-TTT-T-TCTTC--CC--AACAATTTTTG---CT--A------TATACATTTGT--AATT---GGT-C-TGTATGT--AT--CTACATCCTGACT-TACATGACA--GCTGTCTGTAAAATCTG-G-TCAC-C--AAA---ATCCACTAGGC---GGTAT----------T----AAATCAGTCAATA-TATAATG--AC---CT--TGTTTTTTCAAACG-T-TTTCAAA---ATGATTACCG-TATTGAaaataatattttatttgatcacaagaagtggtaatttc
gi|7 : AGTCTAGACTGGCTTAATGACCC------CC---GCCA-ATT---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TGTGCGAC-TGT-T--TTT-T-TCCTC--CC--GACAATTTCTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGTACATGTATGTTAATAATGGCACCATGCCT-TTCACGACA--ATTGACCGTGATATCCA-T-TC-C-T--GAA---AT-CAGTAATC---A---A----------T----CAATTAGCCTGTA-TATAACG--AC--TCG--TGATTTT----ACGAC-TTTCCTC---ATACTTGTGG-TATTGAtcttttacttggtcacagc
gi|8 : AGTCTAGACTGGCTCAATAACTC------TC---TCT--ATA---TAACAACT-CC---CC-GTCTCGTTATATATGAC-TGT-AATTCT-T-TCCTA--CC--AAAGATTTTTA---CT--
gi|9 : tgcCC------CC---TTTA--TA---TATTGACT-CTGAGCT-GTCT-----TATGCAA--TGTTA--TTT-TATTTTCAACCATGACAATACT-----CT--A------TA--------T----TG---G---CATG-ATAC--ATAAC-----CCTGTCT-TACACGACA--AGTGACTCTAAAATGCT-T-TT-C-CCAGAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgaattaactgctagatagcatctcttaatgaattaat
Alignments
lowQualScore : 222 11111 1111 111111111 11111111111 1111 1111 333333333333333333 2222222 33333333 111 1
lowQualScore : 1 4 888888 888 000 555 0 2 444 2 77777 1 2 33333 2 2 44 555 0 2 0000 222222222 66666666666 777 3 7 2 3333 22 0 2 3 11 55 2 1 4444 3 3 3 55 666 3 555555555555555555 88888 1 5 66 0000000 33333333 5 7 111 3
lowQualScore : . . ...... ... ... ... . . ... . ..... . . ..... . . .. ... . . .... ......... ........... ... . . . .... .. . . . .. .. . . .... . . . .. ... . .................. ..... . . .. ....... ........ . . ... .
lowQualScore : 0 6 888888 555 222 000 6 7 777 7 11111 7 9 33333 9 9 66 666 2 1 4444 555555555 00000000000 000 6 3 7 4444 66 1 0 6 66 00 5 8 6666 6 6 6 00 444 6 555555555555555555 77777 1 0 99 2222222 66666666 7 8 777 3
consensus : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA-ATA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATAACG--AC--TCT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
Reference ( family-1751 ) : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA-ATA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATAACG--AC--TCT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
gi|1 : CCTGCCT-TGTGTGACA--ATTGA----GAAATTCT-T-TC-C-T--GAAATTAT-CAATCATT---G---T----------T----TAATGGGCCTATA-TATGACG--AC--TAT--TTTTCTT-----CTTT-TTTTGAATGGATAATGATC
gi|10 : T-CC---CC-ATCT-----TTTTTAAC--AT-A--TTTAT-TCCTC--CC--ATTGGTGTTTA---CT--T------TA--------A--AAAG---GGT-C-TGTATG----TAACGAC-TCCCTCCT------GACA--AGTGACTGTAAAATATG-T-TT-CAC--AAA---AT-CAATATTT---GTTTT----------T----GAATCAGtctctttttttttggtcacagcaatagatgctaatggcaccgatttaaaattaaacatgatagttactttttaagttgattgatgtttgactctgacaaaactgacacaataatcattttgccacacatttactaaaattattgctttttttttttttattagaagccatgcattttgtttacagatcattcaaaatcttttatccagactagctgaatttcacca
gi|11 : GT-C-TGCATGT--A--GTGACATCCT-CTTGTATGCCACA--AGGGACCATGGAATGTG-TATC-T-T--GAA---AT-CAATTATT---G---T----------T----
gi|12 : GTCCAGACTGGCTGAATTACCC------CC---T-TA-ATA---GAATGACT-CT---CA-ACTG-----AATGCGAC-TA--A--TTT-T-TCCTC--CT--TACAAATTTTGGGTCTGCA------TA--------T--AATG---ctgttgtattatcggcctgtt
gi|13 : CTAGACTAGTTCAAGAAACC------CCACATTTA-TTAAACTAACGACT-CC---CT-GTCT-----T-T----C-TG-------T-T-TCCTC--CC--GACA---CCTGA--CA--A------TA--------T--AATG---GGT-A-TGCAT
gi|14 : CCTGCCT-TATATGAGA--AATGACCATAATTTATA-T-TT-T-C--GAA---AT-CAATAATCTT-A---T----------T----CTCTCAGCCTGTA-TATAATT--AC---CT--TGTTTTT----
gi|15 : -ATA---TAAAGTCT-CG---CT-GTGT-----TATGCGAC-TAC-A--ATT-T-TCATC--CC--AACAAGTTTTA---CT--A------TA--------T--AATAATTGGT-C-TGAATAT--AT
gi|16 : AGTCCAGGCTGGCCTTATGACCC------CC---TCTG--TG---AAACAACT-CC---CT-ATGT-----TATGTGAC-TGT-A--TTT-T-TTTTC--TC--c
gi|17 : cAGTCTAGACTGGCTCAACAACCT------TC---TCT--ATA---TAAAGACA-AA---CT-ATAT-----TATGTGACTTGA-A--TTC-T-TCc
gi|18 : acAGTCTAGACTGGTTTAATGACCC------CA---TC----TA---TAAGAACT-CT---CTAGTCT-----TGTGCAAC-TTA-A--TTT-T-
gi|19 : cAGTTCAGACTGGCATAATGACCC------TA---TCT--ATA---TAACAACA-CC---CT-GT
gi|2 : atacGACCC------TC---TCTA--TA---TA-CAACT-CC---CT-ATCT-----TATGCAAC-TGT-A--ATT-T-TTCTC--TC--AATGGTT-------------------------------AATG-------------TTT--ATAATGGCATCCTTCCT-TATGTGACA--AGCGACAGTAAAGTTTGTT-TC-C-C--AAA---AT-CAATAGTT---G---T----------TATTATAA-CAGCCCGTA-TATAACA--AC---CT--TGTC-----------T-TTTCAAA---ATAATTATC
gi|3 : attC------CC---TCTACATA---TAACGATT-TG---CT-GACT-----AACG--------------T-T-TCCTA--CC--AAAAAGTTTTA---CT--ACCTATATA--------TCTAATT---GGT-C-TGTAT----ATAACGACATCCTGCTT-TGCACGGCACTAGCAGCTGTAAAATATGTT-TC-C-C--GAA---AG-CAATTATT---A---TAAGTAATTTAT----AAATCAGCCCGTATTATGACG--GC--T-TGACGTTTTA----AAAATATTTC-AA---ATAATTATTGTTATTcatcttctgttggtcacaatataggtgataattgctcctaaattaaacattatgacacaagttaattttttaattgatttacaataagtgttgagaaatataacaaagcagacacataa
gi|4 : GT-C-TGTATGT--A--ACGACTCCCTGTCT-TTTGCGACA--AGTGACCATAAAATCTGTT-TC-C-T--AAA---AT-CAATATTCTTTA---T----------T----TAATCAGCCCAT--TATAACATTACAACCT--TGTTTTC----AC-AT-Tttgtattgtcatagcacgagttaataaaatcatcaaaattaaacacaataagtgtgatgcaag
gi|5 : GACTGACTGAACAACCCAATCTCCCA--TCTA--TG---TAATGACTACT---CT--TCT-----TGTGAGAC-TAT-AA-TTT-T-TCATT--TT--GATGAGTTTTG---CT--A------TA--------T--ATTA---GGT-C-TGTAT----ATAACAACATACTGCCT-TATGTGACA--AGCAACTGTGAAATCTGTT-TC-C-C--AAA---AT-ATACAATC---G---TTTA-------T----AAATCAACCTGCA-CATAATG---C--CCT--TTTTTTTAA--AAAAT-TTTCGAA---ATAGTaaatgttaatcttttatttggtcacaatatgagaagaaaattgcaactgaattaaacatcaagacaggatttttattaccggtaattgatttacgtttgtttctgacaaagattacacataacaataattagtttgccacattgcattagcttttgtt
gi|6 : TCTAGACTGGTTGAAAGACCC------TC---TCTA--TA---TAAAGATG-CC---AT-GTTG-----TATGCGAC-TGT-AA-TTT-T-TCTTC--CC--AACAATTTTTG---CT--A------TATACATTTGT--AATT---GGT-C-TGTATGT--AT--CTACATCCTGACT-TACATGACA--GCTGTCTGTAAAATCTG-G-TCAC-C--AAA---ATCCACTAGGC---GGTAT----------T----AAATCAGTCAATA-TATAATG--AC---CT--TGTTTTTTCAAACG-T-TTTCAAA---ATGATTACCG-TATTGAaaataatattttatttgatcacaagaagtggtaatttc
gi|7 : AGTCTAGACTGGCTTAATGACCC------CC---GCCA-ATT---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TGTGCGAC-TGT-T--TTT-T-TCCTC--CC--GACAATTTCTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGTACATGTATGTTAATAATGGCACCATGCCT-TTCACGACA--ATTGACCGTGATATCCA-T-TC-C-T--GAA---AT-CAGTAATC---A---A----------T----CAATTAGCCTGTA-TATAACG--AC--TCG--TGATTTT----ACGAC-TTTCCTC---ATACTTGTGG-TATTGAtcttttacttggtcacagc
gi|8 : AGTCTAGACTGGCTCAATAACTC------TC---TCT--ATA---TAACAACT-CC---CC-GTCTCGTTATATATGAC-TGT-AATTCT-T-TCCTA--CC--AAAGATTTTTA---CT--
gi|9 : tgcCC------CC---TTTA--TA---TATTGACT-CTGAGCT-GTCT-----TATGCAA--TGTTA--TTT-TATTTTCAACCATGACAATACT-----CT--A------TA--------T----TG---G---CATG-ATAC--ATAAC-----CCTGTCT-TACACGACA--AGTGACTCTAAAATGCT-T-TT-C-CCAGAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgaattaactgctagatagcatctcttaatgaattaat
blockSeqs : C G AATCTC ACA ACA AAC A GAG A CGTTA C T TAAT . A AA ATG A GGGT ACCTATA TACATTTGT ATT A A C GTTA TA A G AT CT T T TTGT A A A CA . C ATAAGTAATTTA ATTAT T T TT AACCT TCAAACG A A . .
blockSeqs : T T . A AT . . . . . C . TAA . . . T G GA GCA TCT . . A C GT TA A . AT . G C ATGT . . . . . . GTTTT G C . . TTGA AAAAAA . G . .
blockSeqs : C C . . AA . . . . . T . TAA . . . G T A A T . . . A AT TA A . AT . T C CTGT . . . . . . TTTAT C C . . CCT AAAA . A .
blockSeqs : T T . . G . . . . . T . TTA . . . A G A A T . . . T TT TA T . GC . C A CTGT . . . . . . GTTTA A C . . TCG ACGA . C .
blockSeqs : T T . . A . . . . . C . CA . . . A G G A T . . . T GT TA A . TT . C T ATG . . . . . . GGTAT T T . . CT ACA . . .
blockSeqs : G C . . A . . . . . C . TA . . . A T G A T . . . T GT T A . AT . T C GTG . . . . . . TTAT A A . . CT . .
blockSeqs : G A . . A . . . . . A . AA . . . G T G A T . . . T AC . A . AC . C T ATA . . . . . . GT A T . . CT
blockSeqs : T T . . A . . . . . C . AA . . . A T A A T . . . T . . . . TC . T T CTG . . . . . . GT C
blockSeqs : C T . . A . . . . . C . TA . . . G T . . . . . . . . . AC . T C CCA . . . . . . AA
blockSeqs : . . A . . . . . T . TT . . . A . . . . . . . . T T GCT . . . . . . GT
blockSeqs : . . A . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : A** GT** *** CT***** ACGA**** ***
originalCons : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA-ATA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATAACG--AC--TCT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
finalCons : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA--TA---TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-TC-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATAACG--ACCT-----TGTTTTTACGA----T-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
Alignments
lowQualScore : 11111 1111 111111111 11111111111 1111 1111 333333333333333333 11111 33333333 111 1
lowQualScore : 1 4 888888 888 66 555 2 0 2 444 2 77777 1 2 33333 2 2 44 555 0 2 0000 222222222 66666666666 777 3 7 2 3333 22 0 2 3 11 55 2 1 1111 3 3 3 3 55 666 3 555555555555555555 88888 1 5 22222 5 66 00000000 5 7 111 3
lowQualScore : . . ...... ... .. ... . . . ... . ..... . . ..... . . .. ... . . .... ......... ........... ... . . . .... .. . . . .. .. . . .... . . . . .. ... . .................. ..... . . ..... . .. ........ . . ... .
lowQualScore : 0 6 888888 555 88 000 9 6 7 777 7 11111 7 9 33333 9 9 66 666 2 1 4444 555555555 00000000000 000 6 3 7 4444 66 1 0 6 66 00 5 8 0000 6 6 6 6 00 444 6 555555555555555555 77777 1 0 55555 0 99 44444444 7 8 777 3
consensus : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA--T---A-TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-T-C-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATA-----ACGAC-CT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
Reference ( family-1751 ) : AGTCTAGACTGGCTNAACGACCC------CC---TCTA--T---A-TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TATGCGAC-TGT-A--TTT-T-TCCTC--CC--GACGATTTTTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGT-C-TGTATGT--ATAACGACATCCTGCCT-TACGCGACA--AGCGACCGTAAAATNCG-T-T-C-C-C--GAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----NAATCAGCCCGTA-TATA-----ACGAC-CT--TGTTTTT----ACGAT-TTTCGAA---ATAATTATCG-TATTGA
gi|1 : CCTGCCT-TGTGTGACA--ATTGA----GAAATTCT-T-T-C-C-T--GAAATTAT-CAATCATT---G---T----------T----TAATGGGCCTATA-TATG-----ACGAC-TA--TTTTTCT----TCTTT-TTTTGAATGGATAATGATC
gi|10 : T-CC---CC-ATCT-----TTTTTAAC--AT-A--TTTAT-TCCTC--CC--ATTGGTGTTTA---CT--T------TA--------A--AAAG---GGT-C-TGTATG----TAACGAC-TCCCTCCT------GACA--AGTGACTGTAAAATATG-T-T-T-CAC--AAA---AT-CAATATTT---GTTTT----------T----GAATCAGtctctttttttttggtcacagcaatagatgctaatggcaccgatttaaaattaaacatgatagttactttttaagttgattgatgtttgactctgacaaaactgacacaataatcattttgccacacatttactaaaattattgctttttttttttttattagaagccatgcattttgtttacagatcattcaaaatcttttatccagactagctgaatttcacca
gi|11 : GT-C-TGCATGT--A--GTGACATCCT-CTTGTATGCCACA--AGGGACCATGGAATGTG-TAT-C-T-T--GAA---AT-CAATTATT---G---T----------T----
gi|12 : GTCCAGACTGGCTGAATTACCC------CC---TTAA--T---A-GAATGACT-CT---CA-ACTG-----AATGCGAC-TA--A--TTT-T-TCCTC--CT--TACAAATTTTGGGTCTGCA------TA--------T--AATG---ctgttgtattatcggcctgtt
gi|13 : CTAGACTAGTTCAAGAAACC------CCACATTTA--TTAAACTAACGACT-CC---CT-GTCT-----T-T----C-TG-------T-T-TCCTC--CC--GACA---CCTGA--CA--A------TA--------T--AATG---GGT-A-TGCAT
gi|14 : CCTGCCT-TATATGAGA--AATGACCATAATTTATA-T-T-T-T-C--GAA---AT-CAATAATCTT-A---T----------T----CTCTCAGCCTGTA-TATA-----ATTAC-CT--TGTTTTT----
gi|15 : A--T---A-TAAAGTCT-CG---CT-GTGT-----TATGCGAC-TAC-A--ATT-T-TCATC--CC--AACAAGTTTTA---CT--A------TA--------T--AATAATTGGT-C-TGAATAT--AT
gi|16 : AGTCCAGGCTGGCCTTATGACCC------CC---TCTG--T---G-AAACAACT-CC---CT-ATGT-----TATGTGAC-TGT-A--TTT-T-TTTTC--TC--c
gi|17 : cAGTCTAGACTGGCTCAACAACCT------TC---TCTA--T---A-TAAAGACA-AA---CT-ATAT-----TATGTGACTTGA-A--TTC-T-TCc
gi|18 : acAGTCTAGACTGGTTTAATGACCC------CA---TC----T---A-TAAGAACT-CT---CTAGTCT-----TGTGCAAC-TTA-A--TTT-T-
gi|19 : cAGTTCAGACTGGCATAATGACCC------TA---TCTA--T---A-TAACAACA-CC---CT-GT
gi|2 : atacGACCC------TC---TCTA--T---A-TA-CAACT-CC---CT-ATCT-----TATGCAAC-TGT-A--ATT-T-TTCTC--TC--AATGGTT-------------------------------AATG-------------TTT--ATAATGGCATCCTTCCT-TATGTGACA--AGCGACAGTAAAGTTTGTT-T-C-C-C--AAA---AT-CAATAGTT---G---T----------TATTATAA-CAGCCCGTA-TATA-----ACAAC-CT--TGTC-----------T-TTTCAAA---ATAATTATC
gi|3 : attC------CC---TCTACAT---A-TAACGATT-TG---CT-GACT-----AACG--------------T-T-TCCTA--CC--AAAAAGTTTTA---CT--ACCTATATA--------TCTAATT---GGT-C-TGTAT----ATAACGACATCCTGCTT-TGCACGGCACTAGCAGCTGTAAAATATG-T-TTC-C-C--GAA---AG-CAATTATT---A---TAAGTAATTTAT----AAATCAGCCCGTATTATG-----ACGGC-TTGACGTTTTA----AAAATATTTC-AA---ATAATTATTGTTATTcatcttctgttggtcacaatataggtgataattgctcctaaattaaacattatgacacaagttaattttttaattgatttacaataagtgttgagaaatataacaaagcagacacataa
gi|4 : GT-C-TGTATGT--A--ACGACTCCCTGTCT-TTTGCGACA--AGTGACCATAAAATCTGTT-T-C-C-T--AAA---AT-CAATATTCTTTA---T----------T----TAATCAGCCCAT--TATAACATTACAAC-CT--TGTTTTC----AC-AT-Tttgtattgtcatagcacgagttaataaaatcatcaaaattaaacacaataagtgtgatgcaag
gi|5 : GACTGACTGAACAACCCAATCTCCCA--TCTA--T---G-TAATGACTACT---CT--TCT-----TGTGAGAC-TAT-AA-TTT-T-TCATT--TT--GATGAGTTTTG---CT--A------TA--------T--ATTA---GGT-C-TGTAT----ATAACAACATACTGCCT-TATGTGACA--AGCAACTGTGAAATCTGTT-T-C-C-C--AAA---AT-ATACAATC---G---TTTA-------T----AAATCAACCTGCA-CATA-----ATGCC-CT--TTTTTTTAA--AAAAT-TTTCGAA---ATAGTaaatgttaatcttttatttggtcacaatatgagaagaaaattgcaactgaattaaacatcaagacaggatttttattaccggtaattgatttacgtttgtttctgacaaagattacacataacaataattagtttgccacattgcattagcttttgtt
gi|6 : TCTAGACTGGTTGAAAGACCC------TC---TCTA--T---A-TAAAGATG-CC---AT-GTTG-----TATGCGAC-TGTAA--TTT-T-TCTTC--CC--AACAATTTTTG---CT--A------TATACATTTGT--AATT---GGT-C-TGTATGT--AT--CTACATCCTGACT-TACATGACA--GCTGTCTGTAAAATCTG-G-T-CAC-C--AAA---ATCCACTAGGC---GGTAT----------T----AAATCAGTCAATA-TATA-----ATGAC-CT--TGTTTTTTCAAACG-T-TTTCAAA---ATGATTACCG-TATTGAaaataatattttatttgatcacaagaagtggtaatttc
gi|7 : AGTCTAGACTGGCTTAATGACCC------CC---GCCAA-T---T-TAACGACT-CC---CT-GTCT-----TGTGCGAC-TGT-T--TTT-T-TCCTC--CC--GACAATTTCTG---CT--A------TA--------T--AATG---GGTACATGTATGTTAATAATGGCACCATGCCT-TTCACGACA--ATTGACCGTGATATCCA-T-T-C-C-T--GAA---AT-CAGTAATC---A---A----------T----CAATTAGCCTGTA-TATA-----ACGACTCG--TGATTTT----ACGAC-TTTCCTC---ATACTTGTGG-TATTGAtcttttacttggtcacagc
gi|8 : AGTCTAGACTGGCTCAATAACTC------TC---TCTA--T---A-TAACAACT-CC---CC-GTCTCGTTATATATGAC-TGT-AATTCT-T-TCCTA--CC--AAAGATTTTTA---CT--
gi|9 : tgcCC------CC---TTTA--T---A-TATTGACT-CTGAGCT-GTCT-----TATGCAA--TGTTA--TTT-TATTTTCAACCATGACAATACT-----CT--A------TA--------T----TG---G---CATG-ATAC--ATAAC-----CCTGTCT-TACACGACA--AGTGACTCTAAAATGCT-T-T-T-C-CCAGAA---AT-CAATAATC---G---T----------T----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgaattaactgctagatagcatctcttaatgaattaat