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consensus                     :                                        TCTGGAGGANCCCCGAATGTGAAAATGGTCACAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTGTN------AA--TAA-TTT----CAC-ACATATGTGAAA----TAA-A---------AATGTGA-------AACT--TC--------A-AAACGAC-ATGGTCACA----TATGTCATAAAAA---CG----T-----T---A--C----AAATGTAAAAACG-A--TTTTGGTC-----ACA-TAT-GT-----AAA-A-A--A------AAATATTCNTA---CAAATGTGAAAAC-G--A---TTTTTCCC-TTAGAAATATGAAA-CCGNATATTGGTTGAAAGTGTT---------TGTTGT--A-CAT--TCAGTATGTTGAAATGCTTAATCAAACTAGAACATAGATCAGAAACCTTTCATT-CTTGTTTCC-TAT---CTCAATTGTATC--------GAAANANAATATATTCGAATTTATNNTNTCAGCGTATTT-NTGANATCANGTATGGTTTT
Reference ( gi|4 )            :                                        TCTGTAGGACCGACAACTATGAAAATGGCCACAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTGTT------GA--T-A-TTT----CATTACATATGTAAAA----TAA-A---------AATATGA-------AACC--TC--------A-AAATGACTATGGCCACA----TATGTCATAAAAA---CG----T-----T---A--C----AAATGTAAAAACG-G--TTTTGGTC-----ATG-TAT-GT-----AAA-A-A--A------AAACATTCATA---CAAATGTGCAAAC-G--A---TTTCCCCCACTAGAGTTATGAAA-CCGAATATTGGTTGAATGTGTT---------TGTTGT--A-CAT--TCAGTGTGTTAAAATGCTTAATCAAACTAGAACATAGCTCAGAAACCTTTCATTTTTTGTTTCC-TAT---TTCAATTATATC--------GACATACAATATATTTTAATTCATTCTATCGACGTGTTTCTTGACATTAAGTAT--TTTTCGTGGTTAACAAAG
gi|5                          :                                        TCTGGAGGAACCCCAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTGCAA
gi|3                          :                                atttgttaaggtttGGACCCCCGAATGTGAAAATGGTCACAAATCTGAAAATGGTCACAAATG-GGA------AA--TAA-TTT----GACTACATGTGTA--------AA-A---------ACTGTGACCCCTACAACTA-TA--------A-AAACGATAACTGTCATA----TATATCATAAAAA---CG----T-----C---A--C----AAATGTTAACAT--A--TTTTGGTCGTCATATGTTAT-GG-----AAA-ATA--A------AAGTATTCTTA---CATATGTG-AAACTGATA---TTTTCCTC-TTATAA-TATGAAA-ATGAATATTGATTGAAAGTTTTGAGGGGGAGTGGGGTTAA-GAT--TTAATATGTTGAAATGTTTAATCAAACTTGAATATAGAACAGAAACTTTTCATTTTTTGTTTCCATATCAATTCAATTATATC--------GAAATAAATTATATCTtacttttaccgctacgtatggttgggactggtaaggcgccatttactaaatatttttattttttatttattattttagatatttgtaacaatttcataagtggctaacagtgtatgttcatttgctgttcacttgcagttacacattactaagagaaacttgggattccactaaaggaattaatatccgatagtgaaatatgccaaattgttttctaaattaacttcgtcattggatactgaattaattactaacactcattctctgttaaagaggttttg
gi|8                          :                                                    ACAAATGTGAAAATAGTAACAAATGTGAAAATGGTCATAAATGTG---------------------------ACAATTGTGAAACC--TAA-A---------AATGTAA-------AAAA------------A-AAATGA---TGGTCACACTTATATGCCATAAAAA---CA----TC----T---A-------AAATGTAAAAAC--A--TTTTGATC-----ACA-TAT-GT-----AAATA-T--A------AAAGATTCAAC---CAAATatagtcgtgatgagcaatgggtgacattgaaatattcatttaagtttgtaggtaacacacattattcct
gi|2                          : ttataacggacatggttttaatctgtatgacccttaaaatgtgaaaaatagttAAATGTGAAAATGGTAACAAATGTGAAAATGGTCACAAATAT-TTACCAAAAG--T-A-TTC----CA--AAA-ATGTTAAA----CGA-A---------AAAATG--------------TA--------A-AAA-------GGTCATA----GATTGCATAAAAA---AGGTTCT-----T---A--C----AAATGTGAAACCG-A--TTTTtttcccttagaccatctgaaaaaata
gi|9                          :                                                aagaccccaTGTGATAATGGCCACAAATGTGAAATTGGTTATGAACGTA-A------AA--CAA-TTT----CAC--CACATGTCAA------GG-A---------ATTA-GA-------TACC--TCTTCTTCT-A-TATTTCCT-TG--CACA----TGTGT-ATAAATATTTCA----TATTCCT---A--C----AAATGTGAAACCGAG--TTTTttctgttagaaatataaaatccggatattggatgtggttcattcattattttgaaatgcttaatcaaagtaaaacaacgataagaaattccccatctcaattgtattataagaaaaacatgcaaacttgaatttattctatcagtgtatttttgacatcatgtattacattgggtgacatttgttaagtttgaggaggctcacattaattcgtcatgtcatacattttctgagctgctcctggtgcgggtagattggcaacacaccatcgaccagccattttgattatttattaacttacccatatatttgtttcattttcattgcatgttcatctgctgttgcacaaagtgttttgttttcaaactcaaaagaaatacttgatccaccaaatgaaacagtatccgactatgatatgtgctaaaccgtagtctgagtaaacttcgtcagtgaatgttgaataaattactgcaacttattttatgtt
gi|5                          :                                                              ccaagaCCCCAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTG-C------AA--T-A-CTTTTACCGCTACGTATGccttccagaaatacgaaactgattttcggttgaagctgtagcataatcagtatgttgaaatgattaatcaaactagaacataaaaaaaat
gi|7                          :                                               atttgttaaggttttctggaggaaCAAATGTGAAAATGATCACAAAGGTATT------AAA-T-AATTT----TATAACGTGTGTA-AG----TA-------------ATTT---------------TC--------A--------------CAAA----TATG----AAAGT---TG----T-----TGCTA--C----AATTGTACAAG-G-A--TGATGGTC-----ACA-TAT-GTCGTGTAAA-A-A--GTCATGGAAACATTTTTTGGTCACATATGTAAAC-A--A---TGTCTC----TACAAATATGAAA-CTGCGTATTGTTTGAAAGTGTT---------TGATGT--A-CAT--TCGGTATGTAAAAATGCCTAATCGAACTGGTACATAGATCAAAAACGTTTCATgttgggactggtaaggcgccatttactaaatatttttattttttatttattattttagatatttgtaacaatttcataagtggctaacagtgtatgttcatttgctgttcacttgcagttacacattactaagagaaacttgggattccactaaaggaattaatatccgatagtgaaatatgccaaattgttttctaaattaacttcgtcattggatactgaattaattactaacactcattctctgttaaagaggttttg
gi|13                         :                                                                            gTGAAAATGGTCACAAAT---TT------GAAGTAA-TTT----TACCACATATGTGAAACC--TAA-A---------AGT--------------T--TA--------A-AAACGAAGATTGTCACA----TATGTC
gi|14                         :                                                                                                                            ACATATGTAAAA----AAA-ACTTTTCACAAATATGA-------AACC--TCCAATTGTAA-AAATGACGATGGTCACA----TATG--------A---C---------------A--C----ATATGTAAAAAAA-ATTTTTTGGTC-----tcttaataatcatgtgagcaaatatt
gi|2                          :                                                                                                                          tttacaATGTGAAAATGGTAACA---------AATGTGA-------AAATGGTC--------ACAAATATTTA---CCAAA----AGTATTCCAAAAA---TG----T-----T---AAACGAAAAAATGTAAAAA----------GGTC-----ATA-GATTGC-----ATA-A-A--A------AAG-GTTCTTA---CAAATGTGAAACC-G--A---TTTTTTCTGTTAGAAATATAAAATCCGGATATTGG----ATGTG------------GTT------CAT--TCATTATTTTGAAATGCTTAATCAAAGTAAAACAACGATAAGAAA--------------TTCCC-CAT---CTCAATTGTATTATAAGAAAAACATGCAA---ACTTGAATTTATTCTATCAGTGTATTT-TTGACATCATGTAT--c
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                 aagaccccaaa-GT-----AAA-A-ATGA------CAATGGTCACA---TAAGGG---AAAC-T--AATATTTCCCTC--TAGAAATATGAG--CCGTATTGTGGTTGAAGGTGTT---------TATTTT--A-CAT--TCAGTATGTT-------------GAACTATAACATAAATCAGAAATCTT--------------C-TAT---CTCAATTGTATC--------CAAAGACAATATATTCTAATTTATAATTTCAACGTATTT-GTGAGATCAAGTATGGTTTTacattgggtgacatttgttaagtttgaggaggctcacattaattcgtcatgtcatacattttctgagctgctcctggtgcgggtagattggcaacacaccatcgaccagccattttgattatttattaacttacccatatatttgtttcattttcattgcatgttcatctgctgttgcacaaagtgttttgttttcaaactcaaaagaaatacttgatccaccaaatgaaacagtatccgactatgatatgtgctaaaccgtagtctgagtaaacttcgtcagtgaatgttgaataaattactgcaacttattttatgtt
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                        ccaagatgtgataatggccacaaatgtgaaattggttatgaacgtaaaacaatttcaccacatgtcaaggaattagatacctcttcttctatatttccttgcacatgtgtataaatatttcTAGAAATGTAAAA-CCGGATATTGGTTGAAAGTGTT---------TGTTGT--A-CAT--TCAATATACCCACATGCTTAATCAAA-------------CAGAAA-CGTTCA-TACTTGTATTC-TAT---CTTAATAGTATT--------GAAAGAAAATATATTCAAATTTAaaaaaaat
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCTGT--AGCATAATCAGTATGTTGAAATGATTAATCAAACTAGAACATAA--AAAAAATCTCTCAat
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): ATATTCGTTTATTAATTAACTCTTCCATATGTTTGTTTAATTTTCTTCAGTGGCTAACATTCCATGCTGCTGCACATGTTTTAACCCAAAAAAGAAACATAAGGATCCACTAAAACGAAATAATACCCGACATTGAAATGTGCAAACCATTCTTCCAAATGAACTTCGTCAGTAAATGCTGAATGAATTAATGATCATCGTTCTCTGTTTAGGACAGTTTTAA
Unaligned ( gi|12 ): ATTAACTATTGCATATATAATTTTCATTTTATTTAGTGGCTAGCATTACGTGTTCATTTCCTGTTAAACATGTTGTTTTGCTTTCCACCCAAAAATAACTTTCAGATCCAACCAAATGAAA
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1687 )     :          TCTGTAGGACCCCCAA-A-TGTGAAAA-TGGTCACAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTG--A-AAT-------AATTTTA-C----A-CATATGTGAAA--TAA-------A---------AA-TATGA-------AACT-T-------C--------AA------AACG-AC-ATGGTCAC----ATATGTCATA-AAAACGTCACAAATGTAAAAACA---TTTT--GGTCA-CATAT-GT-----AAA-A-A--AA---AATATTCNTACAAATGTGAAAC----CGAT-TTTTCC-C-T-T-AGA-AATATGAAA-CCGNATATTGGTTGAAAGTGTT---------TGTTGT--A-CAT--TCAGTATGTTGAAATGCTTAATCAAACTAGAACATAGATCAGAAACCTTTCA-TTTTTGTTTCC-TATC---TCAATTGTATCG-AAANAAAATAT----ATTCGAATTTATTNTATCAACG-TATTT-TTGACATCAAGTATGGTTTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCTGT--AGCATAATCAGTATGTTGAAATGATTAATCAAACTAGAACATAAA--AAAAATCTCTCA-
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gi|4                          :          TCTGTAGGACCGACAA-C-TATGAAAA-TGGCCACAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTG--TTGAT-------A-TTTCA-TT---A-CATATGTAAAA--TAA-------A---------AA-TATGA-------AACC-T-------C--------AA------AATG-ACTATGGCCAC----ATATGTCATA-AAAACGTTACAAATGTAAAAACGG--TTTT--GGTCA-TGTAT-GT-----AAA-A-A--AA---AACATTCATACAAATGTGCAAA----CGAT-TTCCCC-CAC-T-AGA-GTTATGAAA-CCGAATATTGGTTGAATGTGTT---------TGTTGT--A-CAT--TCAGTGTGTTAAAATGCTTAATCAAACTAGAACATAGCTCAGAAACCTTTCATTTTTTGTTTCC-TATT---TCAATTATATCG-ACATACAATAT----ATTTTAATTCATTCTATCGACG-TGTTTCTTGACATTAAGTAT--TTTTctatagtcgtgatgagcaatgggtgacattgaaatattcatttaagtttgtaggtaacacacattattcct
gi|5                          :          TCTGGAGGAACCCCAA-A-TGTGAAAA-TGGTCACAAATGTGCAAcgtggttaacaaag
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                atttgttaaggttttctggaggaaccc-GT-----AAA-A-ATGAC---AATGGTCACATAA--GGGAAAC----TAAT-ATTTCC-C-TCT-AGA-AATATGAG--CCGTATTGTGGTTGAAGGTGTT---------TATTTT--A-CAT--TCAGTATGTTGAA-------------CTATAACATAAATCAGAAATCTT--------------C-TATC---TCAATTGTATCC-AAAGACAATAT----ATTCTAATTTATAATTTCAACG-TATTT-GTGAGATCAAGTATGGTTTTgttgggactggtaaggcgccatttactaaatatttttattttttatttattattttagatatttgtaacaatttcataagtggctaacagtgtatgttcatttgctgttcacttgcagttacacattactaagagaaacttgggattccactaaaggaattaatatccgatagtgaaatatgccaaattgttttctaaattaacttcgtcattggatactgaattaattactaacactcattctctgttaaagaggttttg
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                   CA-CATGT-GT-----ATA-A-A--TATTTCATATTCCTACAAATGTGAAAC----CGAG-TTTTCC-T-T-CCAGA-AATACGAAA-CTGATTTTCGGTTGAA----------------GCTGT--AGCATAATCAGTATGTTGAAATGATTAATCAAACTAGAACATAAAggaattagatacctcttcttctatatttccttgcacatgtgtataaatatttcatattcctacaaatgtgaaaccgagttttccttccagaaatacgaaactgattttcggttgaagctgtagcataatcagtatgttgaaatgattaatcaaactagaacataaaaaaaat
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): ATTAACTATTGCATATATAATTTTCATTTTATTTAGTGGCTAGCATTACGTGTTCATTTCCTGTTAAACATGTTGTTTTGCTTTCCACCCAAAAATAACTTTCAGATCCAACCAAATGAAA
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Reference ( family-1687 )     :          TCTGTAGGACCCCCAA-A-TGTGAAAA-TGGTCACAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTG--A-AAT-------AATTTTA-C----A-CATATGTGAAA--TAA-------A---------AA-TATGA-------AACT-T-------C--------AA------AACG-AC-ATGGTCAC----ATATGTCATA-AAAACGTCACAAATGTAAAAACA---TTTT--GGTCA-CATAT-GT-----AAA-A-A--AA---AATATTCNTACAAATGTGAAAC----CGAT-TTTTCC-C-T-T-AGA-AATATGAAA-CCGNATATTGGTTGAAAGTGTT---------TGTTGT--A-CAT--TCAGTATGTTGAAATGCTTAATCAAACTAGAACATAGATCAGAAACCTTTCA-TTTTTGTTTCC-TATC---TCAATTGTATCG-AAANAAAATAT----ATTCGAATTTATTNTATCAACG-TATTT-TTGACATCAAGTATGGTTTT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                atttgttaaggttttctggaggaaccc-GT-----AAA-A-ATGAC---AATGGTCACATAA--GGGAAAC----TAAT-ATTTCC-C-TCT-AGA-AATATGAG--CCGTATTGTGGTTGAAGGTGTT---------TATTTT--A-CAT--TCAGTATGTTGAA-------------CTATAACATAAATCAGAAATCTT--------------C-TATC---TCAATTGTATCC-AAAGACAATAT----ATTCTAATTTATAATTTCAACG-TATTT-GTGAGATCAAGTATGGTTTTgttgggactggtaaggcgccatttactaaatatttttattttttatttattattttagatatttgtaacaatttcataagtggctaacagtgtatgttcatttgctgttcacttgcagttacacattactaagagaaacttgggattccactaaaggaattaatatccgatagtgaaatatgccaaattgttttctaaattaacttcgtcattggatactgaattaattactaacactcattctctgttaaagaggttttg
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gi|8                          :         gTCTGTATGACCCTTAA-AATGTGAAAAATAGTTACAAATGTGAAAATAGTAACAAATGTGA-A-AATGGTCATAAATGTGA-C----A--AT-TGTGAAACCTAA-------A---------AA-TGTAA-------AAA----------A--------AA------AATG----ATGGTCACACTTATATGCCATA-AAAACATCTAAAATGTAAAAACA---TTTT--GATCA-CATAT-GT-----AAATA-T--AA---AAGATTC------------AAC----CAAA-TTTTCC-C-T-T-AGACCATCTGAAA-
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                   CA-CATGT-GT-----ATA-A-A--TATTTCATATTCCTACAAATGTGAAAC----CGAG-TTTTCC-T-T-CCAGA-AATACGAAA-CTGATTTTCGGTTGAA----------------GCTGT--AGCATAATCAGTATGTTGAAATGATTAATCAAACTAGAACATAAAggaattagatacctcttcttctatatttccttgcacatgtgtataaatatttcatattcctacaaatgtgaaaccgagttttccttccagaaatacgaaactgattttcggttgaagctgtagcataatcagtatgttgaaatgattaatcaaactagaacataaaaaaaat


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blockSeqs                     :                          A          .                                TTGAT          A     . TACATGTGTAAAAACTGTGACCCCTACAACTATAAAAACGATA                                                         .           TA       T  C           CA       .      .     .  AAAAATGACAAT              A     A        .      TT      CA  . .   .         .   A            T   T .              A      .                                       A      T   T  .       T   .    .              .   T       .       T      TAA   C    .     .  G G    A      
blockSeqs                     :                          C          .                                AAAT           A     . TACATATGTAAAATAAAAATATGAAACCTCAAAATGACT                                                             .           TA       T  A           CA       .      .     .  AAATATAAAAG               C     .        .      TA      C   . .   .         .   T            G   T .              T      .                                       T      C   T  .       .   .    .              .   G       .                                                
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1687 )     :          TCTGTAGGACCCCCAA-A-TGTGAAAA-TGGTCACAAATGTGAAAATGGTCACAAATGTG--A-AAT-------AATTTTA-C----A-CATATGTGAAA--TAA-------A---------AA-TATGA-------AACT-T-------C--------AA------AACG-AC-ATGGTCAC----ATATGTCATA-AAAACGTCACAAATGTAAAAAC-A---TTTT--GGTCA-CATAT-GT----AAAAATAAA-AATATTCNTACAAATGTGAAAC----CGAT-TTTTCC-C-T-T-AGA-AATATGAAA-CCGNATATTGGTTGAAAGTGTT---------TGTTGT--A-CAT--TCAGTATGTTGAAATGCTTAATCAAACTAGAACATAGATCAGAAACCTTTCA------GTTTCC-TATC---TCAATTGTATCG-AAANAAAATAT----ATTCGAATTTATTNTATCAACG-TATTT-TTGACATCAAGTATGGTTTT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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