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Reference ( family-1628 ) : TTTTTA--TT-T-TTTATTTCAAAATTACCATA----TTACAGAATAAC-AA-TATAATGTTTATATCGGTTTATACAAAAAATACA------TTGTAAAAGAA-AA-AA-T-TATATAACAGTATGCAAT-A-TTACAACATATAGTAAAGTTGAGTTTGTATTGGTT--------GGTCGAAGGCTCACTTCGCATTAAGATTTAGAATTATACATACAT--ACACATTTAGA------T--A---ATTTT---TTTT---------AAAA---AA--G---A---A--CACCTGAATCAGTGATC-ATATC--TT-T-TTT--GTA-GATC--TATA---TATA-GAT-TATA-TAT-----NTATTTGAAACAACGATAGTTATTTGATC--C--ATATAT--GTAATCATCGCGAGACTTCGAACGACCAGTACTTAATATA-TAGT---G-TA--TATTCT--AGTA----G----T----T-------CTTC---ACATTTTTCTCTC--AATTACAA-CA-T---AG-TAT-----G-TT-ATTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTAAGTAATATTGTA---T-TTTAA-TATCAA---ACGATA------TGA--A----A-ATT---A-TAATTTCAAATA-T---TT---G-TACATA--ATTCTATT---TAATAACAG-AAAGAAAAG-G--TTTTAGTCTTTATTGCGATCGTGCT-----TT----AA----ACAT-TGAAGTNATGGCAC-TGGTGGGGATGGA------------------A------------------TTCA-T-TGCTAAAATATGTGT--A--------------CAT------------------A--------T--------------ACATA------CA--TACATAT---TTTATATGAATACACATGTAAACACGC--ATA---TGTATCT----TAC-AGATCCATT---AAN-AAAC---------ATTATAAATAATTCTCACTTCGGACATTGACAGTAAAATGAAGGTACA---AATAAATACACGTAGAC--T--A--GTTTAAATCA----------------AAT------ATTCGGAATAAGCACTTTGTATAAATTCCACTGGGTCTCGAATTCTCT
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gi|31 : ta--TT-T-TTTTCTTCAAAACTACCATA----TTACAGAATAAT-AA-TTTAATGTTAATATCGGTTTATACAAAAAGTACG------TTATGAAAGAA-AG-AA-A-TATATAATA--ATGCAAA-A-TAACAACATATAGTAAAGTTGAGTTTGTATTGGTT--------GGTCGAAAGCTCACTTTGCACTAAAATTTAGAggaactaaaattaattttggcaatatggtattcagtattgtataatactgttatgtattttttaaagtttactatattagggactcttttttgtaaccttgattaaatatgaattcttttgcg
gi|32 : tCATA---AAGTAAGC---------AGTATAATTAATTTTCCTTTCGGACATCGACAGTATAATGAATGTACA---ATTAAATAT-----------------TTTAAAGCAT---------------AATTATTTGATTAGTAATAAGTGCTTTGTATAA
gi|33 : a--------------ACGTA------CA--TACACAT---TT-ATATGAATACACATATAAACACGC--ATAATATATACTT----TAC-AAACACACT---AAT-AACC---------ACTATAAATAATTGTCACGTCGGACATTGACAGAAGAATGAAGGTACATTTAATA---ATGCTTAAA------A-----TAAATCG----------------AGT------ATTCGGAATAATCACCTTtctatactaagcttagattttttagaactgaaattaattttggcaatatgacattc
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gi|21 : tTGATATT-TA---T-TTTAG-TTTTAA---AGGATA------TCA--AGTTAA-GTT---AATAATTTCAAATA-T---TTT--A-TGCATA--ATTCTATT---TAATAACAA-AAGGAAttcaaaatttcatgtttagaccacgtatgacgtta
gi|21 : aAAATATGTGT--A--------------CAT------------------A--------TTATATACATGT---ACATA------CACATACATATACGTTTATATAATTACAAATGTAAACATGC--ATA---CATATTT----TAC-AAACACATT---AAT-AAGCCTTATAAGCATTATAAATAATTCTGCCTTCGGAAATTGACAGCAAAATGAAGGAACA---AATAAATACACGTACAT--T--GTTGTTTCAATTA----------------AAT------ATTCGGAATAGGCACTTTGTATAAATGCCACcgtacttttcttgtaaacaaatatgtgtacatattatatacatgtacatacacatacatatacgtttatataattacaaatgtaaacatgcatacatattttacaaacacattaataagccttataagcattataaataattctgccttcggaaattgacagcaaaatgaaggaacaaataaatacacgtacattgttgtttcaattaaatattcggaataggcactttgtataaatgccacgg
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gi|26 : ttAA-TAT---CGTAT-----G---CTTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTAGTGAGTAAaatgttagatattttagtgagtaacattgtatgcttaagaataatgttagatattttggtgagtaatattgtattttgatattgaacgataatttgaaatattgtatacatcttattacaaaaagaaaaggttttagtctttattgtgatcatgctttaaacattggagtaatggtactgttgttgatggaatttacttgcgtatgtacatttcttgtaaaaatatgtgt
gi|26 : ttgtatgcttaagtataatgttagatattttggtgagtAA-CAT---TGTAT-----G---CTTAAGAATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTGAGTAATATTGTA---T-TTTGA-TATTGA---ACGATA----------------------------ATTTGAAATA-T---T----G-TATACA---TCTTATT--------ACAA-AAAGAAAAG-G--TTTTAGTCTTTATTGTGATCATGCT-----TT----AA----ACAT-TGGAGTAATGGTAC-TGTTGTTGATGGA------------------A------------------TTTACT-TGC------GTATGT--A--------------CAT------------------cattgtatgcttaagaataatgttagatattttggtgagtaatattgtattttgatattgaacgataatttgaaatattgtatacatcttattacaaaaagaaaaggttttagtctttattgtgatcatgctttaaacattggagtaatggtactgttgttgatggaatttacttgcgtatgtacatttcttgtaaaaatatgtgt
gi|27 : ttgtatgcttaagtataatgttagatattttggtgagtaatatcgtatgcttaagtataatgttagatattttagtgagtTTTTTAAACT-T-TTTATTTCAGAATTACTATA----TTACAGAATAACAA-TCTAATGTTTTTA-----TTA---AGATAATAT-TTTTAAAA--------AA-ATA-AA-A--C-Attcttgtaaaaatatgtgt
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gi|28 : ttattaacttctctattttcttatgtcaacttttttttttttaaactttttatttcagaattactatattacagaataacaatctaatgttttt--------T--------------ACATA------TA--TACACAT---TTTATATGTATATACATGTTAATACGC--ATA---TTTATCT----TAC-AAATCTATT---AGT-AAAC---------ATTATAAATAGTTCTCACTTCGGACATTGACAGTTAAATGAATGTACA---AATCAATACACGTAGAT--TACA--GTTTAAAGCA----------------AAT------ATTCGGTATAAGCACTTTGTATCAACTCCACtt
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gi|18 : attttaaaaaaagcaacacctgaatcagtgatcacgtttttgtagatctatatagattatatatgttttgaaaccacaggagttatttgatccacatatgtaatcatcacaatacttcaaacggccagcacttagcatattagtgtacattctagtatgttttttttccttaacattttactcttaattacaacatgtatgttcttaagtataatgttagatattttggtgagtaatattgtatgttcttaagtataatgtaagatattttggtgagtaatattatgataatgttagatattttggtacgtaatattgtatgttcttaagcataatgttagatattttggtgagtaatattctatgttcttaagtatannnnnnnnnnaatgttagatattttggtgagt--TT-T-TTTACTTCAAAATTACCATA----TTACAGAATACCAA-TATGATAGTTAT------TTAC-TAAAAAGTACATTGTAAAA--------TA-A-A-------T-ATGTAACATTATGCAAT-AATTACAACATATAGTAAAGTTGTGTTTGAATTGGTT--------GGTCGAAAGCTAACTTTGCATTTAGATT--GA----TACATAAAT--ATACATTTA--------------------------------------AA---AA--G---A---A--CACCTGAATCAGTGATC------------------------------TA---TATA-GAT-TTTT-TATG-----TATTTGAAACAACGATAGTTATTTG
gi|19 : tttatttcgtattaaacagtatttatcatatacagtacttagttactgtataacatttataaaaaatcaaacattgatctgaactgcttaatgtataaatggattaatggcatcaaattttttttttttgtgtgtttttttgtgttTTTT---TT-T-TTTATTTCGAAATTACAATA----TTACAAAATAACAAATATAATGTTTATATTGGTTTATTC-AAAACTACATTGTAAAA--------GA-A-A-AC-AT-T-ATATTAGAGTATGCAGT-A-TTACAACATATAGTAAAGTTGAGTTTGTATTGGTT--------GATCGAAGGCTCACTTCGCCTTAAGATTTAGAATTATACATACAT--ACACATTTAGA------T--A---ATTTT---TAAA---------AAAA---AA--G---A---A--AACCTGGATCAGTGATC-ATATC--TT-T-TTT--GTA-GATC--TATA---TATA-GGT-TATA-TATT-----TATGTGAAACAACGATAGTTATTTGATC--CATATATAT--GTAATCATCGCGAGACTTCGAACGACCAGTACTTAATATA-TAGT---A-TA--TGTTCT--AGTA----T----T----T-------CTTT---ACTTTTTTCTCTC--AATTACAA-CAT---AGTAT-----G-TTATTAAGTTTA-----------CCGTTAGATAGTTTtgcatcaaattgttaattaccatttgtaaacatgatttacaatactgtacttaagttataaatgt
gi|2 : aTTAA--TTGT-TTTATTTCAAAATTACCATA----TAACAGAATAACAA-TACAATGTTTATATCTATTTATACAAAAAATAAGTTGTAAAA--------GA-A-A-AA----T-ATATAACTGTATGCAAT-AATTGCAACATGTAGTAAGGTTGCATTTGTATTGGTT--------GGTCGAAGGCTCACTTTGCATTAAGAT-----ATT-TACATAAA---AAACATTTAGA------T-------TTTTAGGTTTT---------TAAA---AA--G---A---A--CACCTGAATCAGTGATC-ATATT--AT-T-TTT--GTA-GATC--TATA---TA---GAT-TATT-TATG-----TATTTGAAACAACGATCGTTATTTGATC--C--ATGTGT--GAAATCATCGCGAGACTTCGAACGACCAGCACTTAGCGTACTAGA---A-TA--CATTCT--AGTA----G----T----TTTTT---CTTC---ACATGTTTCTCTC--ATTTACAA-CAC---AGTAT-----G-TTCTTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTAAGAAATATTGTA---T-TTTGA-TATCAA---ACGATA------TGA--A----A-TTG---A-TAATTTCAAATA-T---TT-----TACACATTATTCTATT---TAATAACAA-AGAGAAACG-G--GTTTCGTCTTTATTGCGATCATGCT-----TT----AA----ACAT-TGGAACAATGGCAC-TGGTGGGGATGGAATTTACTTGTGAACCTACA------------------TTCA-T-TGGGAAAATATGTGT--A--------------CAT------------------A--------T--------------ATAAA------CA--TGTATA----TATACATACATACACATTTTA-----T--ATA---TATATATAAAATATAAAATCCATT---GAT-AAAC---------ATTATAAATAATTCTCACTTTGGACATTGACAGTAAAATGAAGGTACA---AATAAATACACGTAGATTGT--A--GCTTAAATCA----------------AAT------ATTCGGAATAAGCACTTTGTATAAATTCCACAGGGTCTCGGATTCTCTa
gi|20 : TTTTTA--TT------ATTTCAAAATTACTATA----TTACAACATAATGT-TATAATGTTTATATCGGTTTATACGAGAAATACATTCTAAAA--------GATG-A-AA-A--T-ATAT--CATTATGCAAT-AGTTACAAC-TTCAATAAAGTTTTATTTATATTGGTT--------GGCCAAATGCTCGTTTTGCA-----------AATGATACATACA----------TAGA------T--AC--ACTTT---TATA---------AAAA---AA--A---ATACA--CATCGTAATCAGTGATC-A-ATT--TT-TATTT--GTA-GATC--TTTA---TAT---AT-TATATTATG-----TATTTGAAACAACGAGGGTTATTTGATC--C--GCGTAT--GTATTCATCACGAGACTTCGAACGATCAACGCCTAGCATA-T--T---G-TC--TATT-----GTA----G----T----T-------TTTC----------TTTCAC--AATT-CAATCAT---TTTAT-----GCTTTTTAAagaactgaaattaattttggcaatatgatattccttattgtacaatactgttatatatttttaagtttgatatattaggaattccggcttttttgtaatctttgattaa
gi|21 : tTGATATT-TA---T-TTTAG-TTTTAA---AGGATA------TCA--AGTTAA-GTT---AATAATTTCAAATA-T---TTT--A-TGCATA--ATTCTATT---TAATAACAA-AAGGAAttcaaaatttcatgtttagaccacgtatgacgtta
gi|21 : aAAATATGTGT--A--------------CAT------------------A--------TTATATACATGT---ACATA------CACATACATATACGTTTATATAATTACAAATGTAAACATGC--ATA---CATATTT----TAC-AAACACATT---AAT-AAGCCTTATAAGCATTATAAATAATTCTGCCTTCGGAAATTGACAGCAAAATGAAGGAACA---AATAAATACACGTACAT--T--GTTGTTTCAATTA----------------AAT------ATTCGGAATAGGCACTTTGTATAAATGCCACcgtacttttcttgtaaacaaatatgtgtacatattatatacatgtacatacacatacatatacgtttatataattacaaatgtaaacatgcatacatattttacaaacacattaataagccttataagcattataaataattctgccttcggaaattgacagcaaaatgaaggaacaaataaatacacgtacattgttgtttcaattaaatattcggaataggcactttgtataaatgccacgg
gi|22 : atgatatttattttagttttaaaggatatcaagttaagttaataatttcaaatattttatgcataattctatttaataacaaaaggaacgtacttttcttgtaaacAT--ACATATCAAGA------T--A---AATT------------------------AA--C---A---A--CAATT-AATCGGTTATCTATGTCGTTT-TGTTT--GTAAGATC--TATA---T--A-GAG-TATG-TATG-----TAATTGAAAGAACGGTCGTTATTGGATCCGC--GTGTAC--ATTATCATCGTGAGACTCCG-ACGGTCAGCACTTAACATACTAGT---ATTA--TATTCT--AGTA----G----TAGTAT-------CTT----ATATCTTTATGTC--AGT---AA-TAT---TGTA--------TTTTGATGTAAA-----------A----GGATA---TG--AAGT------------T-TATAA-TTTCAA------ATA------T-----------ATT---A--AAT----AATA---------------GTA--ATTCTATT---TAATAACAA-GAAGAAAAATG--TTGTAGTCTTTATTGgg
gi|23 : taCTGAATCAGTGATC-AT-----TT-T-TTT--GTA-TATC--TGTA---TA---AAT-TAGA-TATG-----TATTTGAAACCGCGAGAAGTATTTGATC--C--GTATAT--GCAATCAATGCGAGACCT-----G--CGGCACTTAACATACTAGT---A-TAATTAATCT--AG--------------------------------CATTTTTTTCTC--ATTT---------------T-----A-CTCTCGATTATA-----------GTGT----------GATAAGTAGTATTGTA---T-TTTAG-TTTTAA---AGGACA------TGA--A----G------------TTTCAAATA-TGTTTT---AATACATA--ATTCTGTT---AAATAACAA-AAAGAAAAG-G--TTTTAGTCTTTATTGCGATCGTGCT-----TT----AA----ACAC-TGGAGCAATGACAC-
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gi|26 : acGTAT-----G---CTTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTGAGTAATATCGTA---TGCTTAAGTATggaactgaaactaattttgacaatatgatattgtgtattgtattttactgttatacattttttaaaagtttctatataagggattatttttttactttctaacgttaatcttgaat
gi|26 : ttAA-TAT---CGTAT-----G---CTTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTAGTGAGTAAaatgttagatattttagtgagtaacattgtatgcttaagaataatgttagatattttggtgagtaatattgtattttgatattgaacgataatttgaaatattgtatacatcttattacaaaaagaaaaggttttagtctttattgtgatcatgctttaaacattggagtaatggtactgttgttgatggaatttacttgcgtatgtacatttcttgtaaaaatatgtgt
gi|26 : ttgtatgcttaagtataatgttagatattttggtgagtAA-CAT---TGTAT-----G---CTTAAGAATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTGAGTAATATTGTA---T-TTTGA-TATTGA---ACGATA----------------------------ATTTGAAATA-T---T----G-TATACA---TCTTATT--------ACAA-AAAGAAAAG-G--TTTTAGTCTTTATTGTGATCATGCT-----TT----AA----ACAT-TGGAGTAATGGTAC-TGTTGTTGATGGA------------------A------------------TTTACT-TGC------GTATGT--A--------------CAT------------------cattgtatgcttaagaataatgttagatattttggtgagtaatattgtattttgatattgaacgataatttgaaatattgtatacatcttattacaaaaagaaaaggttttagtctttattgtgatcatgctttaaacattggagtaatggtactgttgttgatggaatttacttgcgtatgtacatttcttgtaaaaatatgtgt
gi|27 : ttgtatgcttaagtataatgttagatattttggtgagtaatatcgtatgcttaagtataatgttagatattttagtgagtTTTTTAAACT-T-TTTATTTCAGAATTACTATA----TTACAGAATAACAA-TCTAATGTTTTTA-----TTA---AGATAATAT-TTTTAAAA--------AA-ATA-AA-A--C-Attcttgtaaaaatatgtgt
gi|27 : ttattaacttctctattttcttatgtcaactttttttATTAAGA------T--A---ATATT---TTTA---------AAAA---AATAA---A---A--CACCTGAATCAGTGATC-AT------T-T-CAA--GTA-GATT--TATA---CA---GAT-TACA-TATG-----TATTTGAAAAAA--AT--TTATTTGATC--C--GCGTAT--GTAATCATCGCGATACTTCAAACGACCAGCATTTAGCGTACCAGA---A-TAT-TAATCA--AGTA----G----T----T-------CCTcctgaatcagtgatcatttcaagtagatttatacagattacatatgtatttgaaaaaaatttatttgatccgcgtatgtaatcatcgcgatacttcaaacgaccagcatttagcgtaccagaatattaatcaagtagttccttt
gi|28 : ttattaacttctctattttcttatgtcaacttttttttttttaaactttttatttcagaattactatattacagaataacaatctaatgttttt--------T--------------ACATA------TA--TACACAT---TTTATATGTATATACATGTTAATACGC--ATA---TTTATCT----TAC-AAATCTATT---AGT-AAAC---------ATTATAAATAGTTCTCACTTCGGACATTGACAGTTAAATGAATGTACA---AATCAATACACGTAGAT--TACA--GTTTAAAGCA----------------AAT------ATTCGGTATAAGCACTTTGTATCAACTCCACtt
gi|3 : TTT---TT-T-TTTATTTCGAAATTACCATA----TTACAGAATAACAAATATAATGTTTATATCAGTTTATA-AAACAATACATTGTAAAA--------GA-A-T-AC-A--TTATATAACAGTATACAGT-A-TTACAATA-ATAGTAAAGTTGAGTTTGTATTGGTT--------GATCGAAGACTCACTTAGCCTTAA-ATTTAGAATTAAACATACAT--ACACAATTAGA------T--T---TTTTT---TTTTTAAAAAAAAAAAA---AA--G---A---A--CACCTGGATCAGTGATC-ATATC--TT-A-TTT--GTA-GATC--TATA---TATA-GAT-AATA-TATT-----TATTTGAAACAACGATAGTTATTTGATC--C--ATATATATGTAATCGTCGCGA--------ACGACCAGTACTTAATATA-TAGT---G-TA--TATTCT--AGTA----G----T----T-------CTTT---AC-TTTTT---TC--AATTACAA-AAT---AGTAT-----G-TTATTAAGTATA-----------CCGTTAGATATTTTGGTAAGTTATATTGAA---T-TTTTA-TATCAA---ACGATA------TGA--A---------------AATT----ATAAT---TT-------CA-A--AT---ATT---TG-TA-CA------------------TAGT-TTTATTGCGATCGTGCT-----TT----AATTAAACAT-TAAAGTTATGGTAC-TGGTGGGGATGGA------------------A------------------TTCA-T-TGCTAAAATATGTGT--A--------------CATATCAACATGTACAAATACA--------T--------------ACATA------CA--TACATAT---TTTATATGAATACACATGTAAACACGC--ATA---TGTATCT----TAC-AGATCCATT---AAA-AAAC---------ATTATAAATAATTCTCACTTCGGACATTGACAGTAAGATAAAGATACA---AATAAATACACGTAGAC--T--A--GTTTAAATCA----------------GAT------ATTCGGAATAAGCACTTTGTATAATTTCCACTGGATCTCAAATTCCCT
gi|31 : ta--TT-T-TTTTCTTCAAAACTACCATA----TTACAGAATAATAA-TTTAATGTTAATATCGGTTTATACAAAAAGTACGTTATGAAA--------GA-A-AGAA-A--T-ATATAATA--ATGCAAA-A-TAACAACATATAGTAAAGTTGAGTTTGTATTGGTT--------GGTCGAAAGCTCACTTTGCACTAAAATTTAGAggaactaaaattaattttggcaatatggtattcagtattgtataatactgttatgtattttttaaagtttactatattagggactcttttttgtaaccttgattaaatatgaattcttttgcg
gi|32 : tCATA---AAGTAAGC---------AGTATAATTAATTTTCCTTTCGGACATCGACAGTATAATGAATGTACA---ATTAAATAT-----------------TTTAAAGCAT---------------AATTATTTGATTAGTAATAAGTGCTTTGTATAA
gi|33 : a--------------ACGTA------CA--TACACAT---TT-ATATGAATACACATATAAACACGC--ATAATATATACTT----TAC-AAACACACT---AAT-AACC---------ACTATAAATAATTGTCACGTCGGACATTGACAGAAGAATGAAGGTACATTTAATA---ATGCTTAAA------A-----TAAATCG----------------AGT------ATTCGGAATAATCACCTTtctatactaagcttagattttttagaactgaaattaattttggcaatatgacattc
gi|36 : ACCA-A----TTACAGAATAACAA-TGTAATGTTTATATTGGTTTATACAAGA----------AAAA--------CA-G-A-AG-A--C-ATGTAATAAT-TACAAT-C-TT----------------TTTA-TCTGTATTGGTT--------GGTCGAAGGCT
gi|37 : aAATAACAA-TATAATGTTTATATCGGTTTATACAAAAAACA------AAAATATTTTGCGA-A-A-AA-A--A-ACAAAACATTTTGCAAT-G-CTA
gi|4 : TA--TT-T-TTTATTTCAAAATTACCATA----TTACAGAATAACAA-TATAACGTCTATATCGGTTTATAAAAAAATTACACTGTAAAA--------GA-A-A-AA-AAAT-ATATAACAGTATGCAAT-A-TTACAACATATACTAAAGCTGAGTTTGTAGTGGTT--------TGTCGAAGGCTCTCTTTGCATTAAGATTTAGAATTATACATGCAT--ACACATATAAA------T--A---GGTTT---AT-----------AAAA---AT--G---A---A--CACCTGAATCAGTGATC-ATATC--TT-T-TTTTTGTA-GATCAATATA---TAGA-GAT-TGTA-TATT-----TATTTGAAACAATGATAGTTATTTGAAC--A--ATATCT--TTAATCATCACGAAACTTCGAACGACCAGTACTTAATATA-TAAT---G-TT--TATTCT--AGTA----G----T----T-------CTTC---ACATTTTTCTCTC--AATCACAA-CAT---AGTAT-----G-TTTTTAAGTATA-----------ATGTTTGATA-TTTGGTAAGTAATATTGTA---T-TTTAA-TATCAA---ACG--------------------------------------ATA-T---TT---G-TACATA--ATTTTATT---TAATAACAG-AAAGAAAAG-G--TT----TCTTTATTGCGATCGTGCT-----TT----AA----ACAT-TGGAGTAATGGCAC-TGGTGGGGATGGA------------------A------------------TTCA-T-GGCTAAAATATGTGTTCATATTAACATGTC--CAT------------------A--------T--------------GCATA------CA--TATATAT---TTTATATGAATACAAATGTAAACACGT--ATA---TGTATCT----TAC-AGATCCATT---AA--AAAC---------AATATAAGTAATTCTCACTTCGGACATTGACAGTAAATTGAAGGT-TT---AATTAATACA-ATAAACTGT--A--GTTTAAATCAAATATATATTAAATCAAAT------ATTCGGATTAAGCACATTGTTTAAATAACACTTGGTCTCGAATT
gi|5 : ttcaTTTTTA--TT-T-TTTATTTAGAAATTACCATA----TTACAGAATAACAA-TATAATGTTTATATCGGTTTATACAAAAAATACATTGTAAAA--------GA-A-A-AC-A--TTATATAACAGTATGCAGT-A-TTACAACATATAGTAAAGTTGAGTTTGTATTGGTT--------GACCGAAGGCTCACTTCGCCTTAAGATTTAGAATTATACATACAT--ACACATTTAGA------T--A---ATTTT---TTTT---------AAAA---AA--G---A---A--CACCTGGATCAGTGATC-ATATC--TT-T-TTT--GTA-GATC--TATA---TATA-GAT-TATA-TATT-----TATTTGAAACAACGATAGTTATTTGATC--C--ATATAT--GTAATCATCGCGAGACTTCGAACGACCAGTACTT----TA-TAGT---G-TA--TATTCT--AGTA----G----T----T-------CTTT---ACATTTTTCTC--------ACAA-CAT---AGTAT-----G-TTATTAAGTATA-----------CTGTTAGATATTTTAGTAAGTAATATTGTA---T-TTTTA-TATCAA---ACGATG------TGA--A----A-ATT---A-TAATTTCAAATA-T---TT---G-TACATA--ATTCTATT---TAATAACAG-AAAGAAAAG-G--TTTTAGTCTTTATTGCGATCGTGCT-----TTAATAAA----ACAT-TAAAGTTATGGCAC-TGGTGGGGATGGA------------------A------------------TTCA-T-TGCTAAAATATGTGT--A--------------CAT------------------A--------T--------------ACATA------CA--TACATAT---TTTATATGAATACACATGTAAACACAC--ATA---TGTATCT----TAC-AGATTCATTAAAAAA-AAAC---------ATTATAAATAATTCTCACTTCGGACATTGACAGTAAGATAAAAATACA---AATAAATACACGTAGAC--T--A--GTTTAAATCA----------------GAT------ATTCGGAATAAGCACTTTGTATAATTTCCACTGGGTCTCAAATTCCCTgaaaaaagaaattat
gi|6 : TTATTTCGAAATTACCATA----TTACAGAATAACAA-TATAATGTTTATATCGGTTTATACAAAAAATACATTGTAAAA--------GA-A-A-AC-A--TTATATAACAGTATGCAGT-A-TTACAACATATAGTAAAGTTGAGTTTGTATTGGCT--------GATCGAAGGCTCACTTCGCCTTAAGATTTAGAATTATATATACAT--ACACATTTAG----------A---ATTTT---TTTT---------AAAA---AA--A---A---ACCCACCTGAATCAGTGATC-ATTTC--TT-T-TTT--GTA-GATC--TATA---TACT-GAT-TATA-TATT-----TATTTGAAACAACGATAGTTATTTGATC--C--ATATAT--GTAATCATTGTGAGACTTCCAACGACCAATACATAATATA-TAAT---G-TA--TACTCT--AGTA----G----T----T-------CTTT---ATATTTTTCTCTCCAAATTACAA-CAT---AGTAT-----G-TTATTAAGTATA-----------CTGTTAGATTGTGTGGTAAGTAATATTGTA---T-TTTTA-TATCAA---ACGATA------TGA--A----A-ATT---A-TAAATTCAAATA-T---TT---G-TACATT--ATTCTATT---TAATAACAGAAAAAAAAAG-G--TTTTAGTCTTTATTGCGATCATGCTTTAAATT----AA----ACAT-TAAAGTTATGGCAC-TGGTGGGGATGGA------------------A------------------TTCA-T-TGCTAAAATATCTGT--A--------------CAT------------------A--------TAAACATGTAC----ATATA------TA--TACATAT---TTTATATGAATACACATGCAAACATGC--ATA---TGTATCT----TAC-AGATCCATT---AAA-AAAC---------ATTATAAATAATTCTCACTTGGGACATTGACAGTAAGATAAATGTACA---AATAAATACACGTAGAC--T--A--GTTTTAATCA----------------GAT------ATTCAGAATAAGCACTTTGTATAAATTCCACCGGG
gi|7 : --TT-T-TTTATTTCAAAATTACCATA----TTA-----------------------TATCGGTTTATACAAAATGTAAATTGTAAAA---------A-A-A-AA-A--T-ATATAACAGTATGCAAT-A-TATCAA-ATATAGCAATGTTGAGTTTGTATTGGTT--------GGTCGAAGGCTCACTTCGCATTAGAATTTAAAATTATACATACAT--ACACATTTAGA------T--------------------------------------------------AC----ATTAGTGATC-ATATA--TT-T-TTT--G------------------TA-GATCTATA-TAT-----------------------------TGATC--C--ATAAAT--GTAATCATCGCGGGACTTCAAACGACCAGTACTTAATATA-TAGT---G-TA--TATTCT--TGTA----G----T----T-------CTTC---ACATTTTTCTCTT--AATTACAA-CAC---AGTAT-----G-CTATTAAGTATA-----------ATGTTAAATATTTTGGTAAGTAATATTGTA---T-TCTAA-TATCGA---ACGATA------TGA--A----A-ATT---A-TAATTTCAAATA-TAA-TT---G-TACATA--ATTCTATT---TAATAACAG-AATGAAAAG-G--TTTTAATCTTTATTGCGATCATGCT-----TT----AA----ACGT-TTATGTTAAGGCAC-TGGTGGGGAATGA------------------C------------------TTCA-T-TGTTGAAATATGTGT--ACATATTAACATGCACAT------------------A--------T--------------ACATA------CA--TGCATAT---TTTATATGAATACACATGTAAACACGC--ATA---TGTATCT----TAC-AGATCCA-T---AAA-AAAC---------ATTATAAATAATTCTCACCTCGGACATTGGCAGTAAAATGAACGTACA---AATATATACACGTAGACTGT--A--ATTTAAATCA----------------GAT------ATTTGGAACAAGCACTTTGTATAAATTCCACTGGGTCTCAAATTCCCT
gi|8 : tatTTTTTA--TT-T-TTT---TCAAAATTACCATA----TAACAGAATAACAT-TATAACGTTTATATCGGTTTATACGAAAAATATATTGCAAAA--------GA-A-A-AA-AAGT-ATGTTACAGTATGCAAT-A-TTACAACATATAGTAAAGTTAAGTTTGTATTGGTT--------GGTCGAAGGCTCACTTCGCATTAAGATTTAGAATTATACATACAT--ACACATTTAGA------A--A---GTTTT---TTTTTA-------AAAA---AA--G---A---A--CACCTGAAGCAGTGCTC-AAATC--TT-C-TTT--GTA-GATC--TATA---TATA-GAT-TATA-TATT-----TATTTGAAACAACGATAGTTATTTGATC--C--ATATAT--GTAATAATCGCGAGACTTCGAACGACCGGTACTTAATATA-TAGT---G-TA--TATTCT--AGTA----G----T----T-------CTTC---ACATTGTTCTGTC--AAGTACAA-CAT---AGTAT-----G-TTATTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTAAGTTATATTGTA---T-TTTAA-TATCAA---ACGATA------TGA--A----A-ATT---A-AAATTTCAGATA-T---TT---G-TACATA--ATTCTATT---TAATAACAG-AAAGAAAAG-G--TTTTAGTATTTACTACTATCGTGCT-----TT----AA----ACAT-TAAAGTAATGGCAC-TGGTTGGGATGGA------------------A------------------TTCA-T-TGCTAAAATATGTGT--A--------------CAT------------------ATTAACATGT--------------ACATATATATTCA--TACATAT---TTTATATGAATACACATGTAAGTACGC--ATA---AGTATCG----TAC-AGATCCATT---AAA-AAAC---------ATTATAAATAATTCTTA-TTCGGACATTGACAGTAAggaactaaatttaatttttgcaatatggtattctgtattgtttaataccgttatgtattttt
gi|9 : TAGGT--TATGGTA---T-TTTAC-TTTAAA---AGGATG------TGA--A----G-TTT---A-TAATTTCAAA-A-T---TTTTCA-TACAGA--ATGTTGTAGAATAATAACAA-AAAGAAA--------TTA-TCTTAATTGCGATTGTGCT-----TT----AA----ACATATG-TGCAACGACAC-TGGTGAGAATTTA------------------A------------------TTTA-CGTATT-ATATACAGGT--A--------------CAT------------------A--------C--------------ATATG------CA--TACATAT---TTTTTATAAATACACATTTCAATAAAA--ATA---TATATTT----TGC-AAGCACATA---AAT-AAGC---------ATCATTAATAATTTATATTTCGGTCATAAACAGTAAATTGAACGTTCT---GTTAAATAAACTTATAT--T--GTTGTTTAATTCA----------------AAT------ATTTGGAATAAGCACTTCAC---AGTTTGACTGTTTCTCGAATTCTC
blockSeqs : AA G A T ATTA A A TATTTTGC T T G T AAT G A A ACCCATTG AA TTTTTTTTTTTTAAAAAAAA AAA AAAT TAC CC T TA CGT A A TT A AA GAT TAT C AT AATAAC CG AT AT C ATA T AT TA GTATT AGTA TTTTTTC CGTT CA T AGAA TAGTA CT A NNNNNNNNNNA TGT G G TGT TTTTGG GT GTTAAG ATG TT A GTT TTCA TT GAA GA T TT TTAAA AATA TTAA A A T T ATTTACTTGTGAACCTACA C G TC CATATCAACATGTACAAATACAT TATATT CA ACG . ATA AAAA A AAA GT CTTATAAGC TTT TTGTA AATATATATTAAATCA TATTTG
blockSeqs : . . . A . A T . . . G . AGT T . A . . TAGGTAATTTTTTT . TAA . . . TA C . G . . . . TA . A T . . . T . . T . TAATG . TTTT T . . A . T C . . G G . . . ATA . AT . AA TGG . . G . . TTAAA . . . A A . A . . . CATATTAACATGCACATAT . . . . . . . . T . . TTGTT T .
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blockSeqs : . . . A . . A . . . . . TT T . . . . TTTTTAGGTTTT . G . . . TA T . . . . . . TA . G G . . . C . . . . TG . . C . . A . T G . . . G . . . AA . T . . AA . . G . . . . . . G A . A . . . CATATTATATACATGT . . . . . . . . T . . CTGTA . .
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blockSeqs : . . . A . . A . . . . . T G . . . . TAATATTTTTA . G . . . TG C . . . . . . TA . T G . . . . . . . . G . . T . . T . T C . . . . . . . NN . N . . G . . A . . . . . . A T . A . . . CATAT . . . . . . . . A . . CTA . .
blockSeqs : . . . A . . A . . . . . A G . . . . TAATTTTTTTT . T . . . TA T . . . . . . TA . A G . . . . . . . . T . . C . . T . T A . . . . . . . AT . T . . G . . A . . . . . . A T . C . . . CATAC . . . . . . . . A . . CTA . .
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|17 : attttaaaaaaagcaacacctgaatcagtgatcacgtttttgtagatctatatagattatatatgttttgaaaccacaggagttatttgatccacatatgtaatcatcacaatacttcaaacggccagcacttagcatattagtgtacattctagtatgttttttttccttaacattttactcttaattacaacatgtatgttcttaagtataatgttagatattttggtgagtaatattgtatgttcttaagtataatgtaagatattttggtgagtaatattatgataatgttagatattttgAA-TAT---TGTAT-----G-TTCTTAAGCATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTGAGTAATATTCTA---T-GT----TCTTAA---GT-ATA------NNN--N----N-NNN---N-NAATGTTAGATA-T---TT---aatgttagatattttggtgagtaatatcgtatgcttaagtat
gi|17 : attttaaaaaaagcaacacctgaatcagtgatcacgtttttgtagatctatatagattatatatgttttgaaaccacaggagttatttgatccacatatgtaatcatcacaatacttcaaacggccagcacttagcatattagtgtacattctagtatgttttttttccttaacattttactcttaattacaacatgtatgttcttaagtataatgttagatattttggtgagtaatattgtatgttcttaagtataatgtaagatattttggtgagtaatattatgataatgttagatattttggtacgtAA-TAT---TGTAT-----G---CTTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTGAGTAATATCGTA---TGCTTAAGTATtggtgagtaatattgtatgcttaagtataatgttagatattttggtgagtaatatcgtatgcttaagtat
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gi|2 : aTTAA--TTGT-TTTATTTCAAAATTACCATA----TAACAGAATAACAA-TACAATGTTTATATCTATTTATACAAAAAATAAGTTGTAAAA--------GA-A-A-AA----T-ATATAACTGTATGCAAT-AATTGCAACATGTAGTAAGGTTGCATTTGTATTGGTT--------GGTCGAAGGCTCACTTTGCATTAAGAT-----ATT-TACATAAA---AAACATTTAGA------T-------TTTTAGGTTTT---------TAAA---AA--G---A---A--CACCTGAATCAGTGATC-ATATT--AT-T-TTT--GTA-GATC--TATA---TA---GAT-TATT-TATG-----TATTTGAAACAACGATCGTTATTTGATC--C--ATGTGT--GAAATCATCGCGAGACTTCGAACGACCAGCACTTAGCGTACTAGA---A-TA--CATTCT--AGTA----G----T----TTTTT---CTTC---ACATGTTTCTCTC--ATTTACAA-CAC---AGTAT-----G-TTCTTAAGTATA-----------ATGTTAGATATTTTGGTAAGAAATATTGTA---T-TTTGA-TATCAA---ACGATA------TGA--A----A-TTG---A-TAATTTCAAATA-T---TT-----TACACATTATTCTATT---TAATAACAA-AGAGAAACG-G--GTTTCGTCTTTATTGCGATCATGCT-----TT----AA----ACAT-TGGAACAATGGCAC-TGGTGGGGATGGAATTTACTTGTGAACCTACA------------------TTCA-T-TGGGAAAATATGTGT--A--------------CAT------------------A--------T--------------ATAAA------CA--TGTATA----TATACATACATACACATTTTA-----T--ATA---TATATATAAAATATAAAATCCATT---GAT-AAAC---------ATTATAAATAATTCTCACTTTGGACATTGACAGTAAAATGAAGGTACA---AATAAATACACGTAGATTGT--A--GCTTAAATCA----------------AAT------ATTCGGAATAAGCACTTTGTATAAATTCCACAGGGTCTCGGATTCTCTa
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gi|27 : ttgtatgcttaagtataatgttagatattttggtgagtaatatcgtatgcttaagtataatgttagatattttagtgagtTTTTTAAACT-T-TTTATTTCAGAATTACTATA----TTACAGAATAACAA-TCTAATGTTTTTA-----TTA---AGATAATAT-TTTTAAAA--------AA-ATA-AA-A--C-Attcttgtaaaaatatgtgt
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gi|28 : ttattaacttctctattttcttatgtcaacttttttttttttaaactttttatttcagaattactatattacagaataacaatctaatgttttt--------T--------------ACATA------TA--TACACAT---TTTATATGTATATACATGTTAATACGC--ATA---TTTATCT----TAC-AAATCTATT---AGT-AAAC---------ATTATAAATAGTTCTCACTTCGGACATTGACAGTTAAATGAATGTACA---AATCAATACACGTAGAT--TACA--GTTTAAAGCA----------------AAT------ATTCGGTATAAGCACTTTGTATCAACTCCACtt
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gi|32 : tCATA---AAGTAAGC---------AGTATAATTAATTTTCCTTTCGGACATCGACAGTATAATGAATGTACA---ATTAAATAT-----------------TTTAAAGCAT---------------AATTATTTGATTAGTAATAAGTGCTTTGTATAA
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Unaligned ( gi|34 ): CAACTGTTATATATATTTTACAGTTTACCAAACTATGGATTCGTTTTTGCAATCTTAAATTAAAAATGATTATCTTTTAACTGCATATATTATTTTGTTTAGAACAAAGTCAAAATCATTTAAATTAA
Unaligned ( gi|35 ): TTTACTTTGGGTTAAAAACACTAATTTAGTACTGTTGTTTTAATTTTTGTAAACTGTTTATAATGCATTATTAACTTTCCACTTTTTTATGTATAATTAAACAGTTTTTAAACATTTTT
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