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Reference ( gi|2 )            : ATTGCAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACAAGGGTAGAATACAATCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTAC---GAATATACAAGTACAA--AATATATACAAATTAAAGATAATAACTCAACACAAAAAA-AAC-CAGCTGGTTAAAAAAAGTCATTTGGTGGTATTAACACTCTTATTTTCACACAGTTCTATCTCCTACACG-T-ACGTAACCTACATCGCGATCCAAACTGCTTTTATCATTCGAATGTTTATA--------A---------AAATGCACTATATAT----T----TT-------------CCGCGTCCGGAT-ATCG---TAGATTTAGCATCACTCGTCCCTTGTGGCGGTGGCTATA-GAACTGGGTT-ATCTCCCCCTAGAACTCT-----ATACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGAACCGACCATC---GACCGGATTCCGACGTCAGGAACGTCAAGTTGTCCATATGACGAATATGTGGGTTGCA-GTCC-T-ACGACTGTACTTCCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCTA--T-ACG----TCGT-TAACATAGCG--GACACAT--TCCACGCTAACGTCTAAAAAC---TATA-TATATAT----ACTCAGATTTACTAGTT---TAAATATGTAATGACATGGCGTCTATTACTTACCATCTATCA-A-TTACATGGTATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTTCTAACCATCTA--ATAGTTTTATGGTAGATTTATCATTATATTATAACAGTT------C-AT---TC-A--ATTT-TTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCA-------ATATATGATAACA-----T----TT-CAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTACATGGCAGTTT---------A-AACAACATCTCAT--AT-----ACGACCTTC-C--TCAA-T-CTCA--AAGT-GCAATTATA--T----CTCTACATAACTTCT-CATT-TATAATATGAACAATTAC-AGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGTGAATATC-C-GAATAAGCATC-A-ACAATATTTAATTACACATATCAATCAAT--ATT--AACATGGTGAATCTGAATATTTCATCGTAAACACAATATCAACAGCTCAAAATACTTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAAAGCTTCTCAATACCGTGGATGTG-G-ATTAAATT--ACATACATTACCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTTAGATCTGATTATGTCAAAAATATATATATCAGACAT-----TTA---AATAT-------------AACATAATACAAATTTCACATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGGACAGTAACATATTCAATCTTTCTCGTCG---CAACTAAACCC-AAAGATGA--TTCTGCTA-ACTTGACATTGTTT--CC--ATAACAGAGTCAG-CATTAATAGCAAAACCGTCCACATACCTTAGTGAATTTCGTGTAAATCATAAA--A--ACAA----------AC---CCTAAA----AC----ATCGTACGAAGTGTA--TTTTACGCTATGAGG-CC-AAT-GTAAACCTA-AATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATAATTAATGGAATTTGATAAACTAAACTTCAAAA----TGATTTATTCTTTAATCAAAGAATGAA-AATG--TAAAA-ATAA-CTTGAAA--ACG--T--T--GCTCCTATCGAG-----CTATCAATACGTTTTAACAATCCCACACTACCTGACCTAAATATA-GCCTATATCACTACACTCGACACG----T----AATAGCTGACAACACT-AAA--TT--AGGCCACCAAAACCTAACA-----ATTTTATTAC-AACAT
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gi|3                          :   TGTAGCATAATGACCAAGG-CCGACAACTCACGAGGATAGAATTCAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATTGACAATTTTAATTTTACATGAATAAAATTAC---GAATATACAATTATAC--AATTTATACAATTTAAAGCTAATTGCTCAACA------A-AACACAACTTGTTTAAAAAGGTCCTATGATGGAATTAACACT----TTCTTAATCA-TTC-ATCT-------G-T-ACGTTCCGTATAT----ATCCAAACTGCTAACATCACACGATTGCT-ATA--------ACTGTTTTTAAAATACACT-TATAT----TATATTTAAGATACTACTA-CCGCGCCCGGATTATCG---TAGATATAGCATCAATCGTTCCTCGTGGTGATGGCTATT-TAAACAGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCT-----GTACTGTG-TTA-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCAACTATCTTCGACTGTACTATGACGCCAGGATCTTCAAGTCGTCCATATAATGATTAAGTGGGTTGCT-GTCC-TTATGACGGTACTACCACCAGTTGACTTCCTGTCACGTCTA--C-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACAT--GCGTCGCATACGTTTTAAAAC----ATA-TATATAT-----------TGTAGCCGTT---TTAAGACGT-ATG---CGACGCATATT------TATATATAA-ACTCAGAT-TTACTTGTTACTCAATACGTA--ATGACATGG-CG-----T-CTGTTACTTACCATCTA--TCAATTTCATGGCATTTTTATCAAAATATGATAACAGTG------C-AT---AT-A--ATTA-TTACCTTCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTCATCAACATCTCATATATGATctatttttaacaagatggccctatat
gi|1                          :   TGTAACAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACTGAGATAGAATTTAACTATACTCATAATAAAATTTACAA----------GAAT---------ATAGAATTATACAAAATATACAAAT-CAACTCATAT-TTTAAATGAAAAATActccgtcaaccccaaagtagcaattgtatctctatctaatttctcatttaaaatataaacaatcacggaccaattctttatctattgacttggtaaatatcagaataagcatccaccaaatttaattacacatatcaatcaattctaacgtgatgagtttcaatacttcatcgtaaacacgttatcaacagctcaaaatacgttcttagattccacggcctatattctaacaaaacaattttcaataccgcggatgtgaaattaaattacagacattctcatcagaatgaatatgaacaatttatacaactttactcagatctgattatgttaaaatatatctagcagacgtttaaatatctcaaccatatacaacataatataaaattcgcatacccatatgccgttatgtaatggaacagttacatgctcaattcttctcgtcatgacaattccgaaagatgtttctgctagactggacggtgtttccataatacagtcagacatatatagtaaaacactccacgtactttagtgaatttcgtgcaaattataaaacaacaattatcaatatatcgtaagatatggtacgatgcagcttttacgatatttggcccaatgtaaatttaaaagagttttataaataataaacccgtttgattattctaactttctgaatacttaatggaatttcatgaaataaacttcaaaatgatttattctttaatcaaagaatatgtttaaagatattaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacgaacccatgctatctgctcccaatatagccaataccattttactagacacgtactacttgacactactaaattaggccacaacaacctattttttttgttacag
gi|16                         :   TGTAGCAAAATGACAAAGGACCGACAATTCACGAAGGTAGAATACAAGTAAACTCAAA-TAAAAtaccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcggactcataatatatcataacggtacatttttttcatttcttacagtctatcacatttcatggtagtctgatcagtatataataagagtacaatctatcatttcttaccatctatcacatttcatggtagttttatcagtttataataacaggtactatacattctatcatttcttaccatctatcacatttcatggtagctttatcagtttataataacaggtactgtacattcaatcatttcttaccatctatcacattccatggtagttttataagtatataacaacagtgcattaatttcttagcatcgtctattaaatctcgacttagcatatagctctctacatatttcaacattatacaatataaatatcgctggacaaattccgtatctgtatttatgtttcgcaaaatcacagaataaacttgacacaatagttatacttcaaaacgacgattttcaatacgttattataaacacaatataagcatctcaaaacacgttccaagatgattcctcctcggcctatatttaaataaacaacttaaaatactgtggatatgaattcaccacattttagtctgtatttttatctacaatttatacaaatatttacttagatctgcctatgtcgaaataaagttatctgacatataaattactaaactatagaaaacattatattaaaagtactcactcagataccacatgcagtggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                          CTGTACG-TTCCGTAATCTATATCGCAATCCAAACTGCTTACGTCATATGAATGTTAAAACTGTTTTTA---------AAATGCACT-TATAT----TGTA-TTGAAGATACTACTACCTCGTCCGGATTATCG---TAGATTTAGCATCATTCGTCCCTTGCGGAGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCT-TCCTTAGAACTCT-----ATACGGAC-T-T-TCTGGCTTTATGTCGCCTCGTACCGACTGTC---GATCGTACTCCGACGCCAGGATCGTCAATTCGTCCATATAACGATTATGTGGGTTGGT-GTCCTT-ATGACGTTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCTA--C-ACG----TCGC-TAACGTAGCG--GACACATG-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNTAGT---TACTCAA-ATATGAAATGACATGG-CG-----TCTTAAACGTA-CCATCTA--TCAATTTCATGGTATTTTTATCAATAAATGATAACAGTG------C-AT---TC-A--ACTC-TTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCA-------ACATATTATAGCA-----G----CG-CAT----TCAAT----TCTTACCATCTAA-CA-GTTTCATGGTAGATT---------T-ATCAATATATGAT--A------ACAG--TTCAT--TCAATT-CTTACTATCT-GCAGTTTCA--TGGTAGTTTAAACATTTTCT-CAT------ATATGAAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                          CTACACG-TTCCGTAATCTATATCGCGATCCAAACTGCTTATATCAT--GAATAT---TA--------A---------AAttccgtcagtcttaaaatagcaattatatagctacataactttttatttatgatataaacaattacagatcaattctgtatctattcactctgtgaatatcagaataagcatcaacaaaatttaattatacatatcaattaattctaacatggtgaatttcaatacttcatcgtaaacgatatcaacagctcaaaatacgtttttagataccttggctaatattctaacaaaacgcctatcaataccgcggatgtgatattaaattacagacattatcgtcgaaatggatatgaaaaatttataccactttacttagatctgattatgtcaaaatatatctatcaggcatttaaatacaacataaaataaaattcacatactcatctgccgttatgtactggaacagtaacatgctgaatccttctcgtcaagtcaactacaaagatattttttgctatactggacagtttccccataatacagtcagaatatatagcagtccatatcaaatttcgtgcaaatcataaaacaacaaactttcttatatggtactatagtcgtacgatgcggattttacgcttttaggccaaaggtaaacttaaattagttttatgacaaataaacctgtttaattattttaactttcttaatacttaatggaatttgatgaaatcaacttcaaaatgattcactctttaatcaaagaatgaacatttaaaaaagatcttaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacaatcccacgctacctgttctaaatatagcctatatcattacaatggacacgtactagctgacacttctaaattaactcacaacaacctaactattttgttacaatgtacagc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATATTTATACGTATT--A---------AAA--CACTACGT--------------------------CCGCGTCCAGAT-G-CGAGGTACATTT----CCAATCGTCCCTTATGGCGATGGATGTATCCACAGGGTTCATTTCCC----GTGTTCTATGTAATACTGAGCT-ACTATGGCCTTACGTCGCCTTTTGCCGATT--------CC--AATCTGACGTCAGGAATGTCAAGTCGTCCATATGACGATTATACTGGTTGCGCGTCC-T-ATGACGGTATTACCACCGGCTAAC-TCCTGTTACGTCGA--TAACGTCCTTCGTGTGACCTAACGTTG-CACATCGTCAATTC-AACGGCTACAAA----TATA-TATACAC----GCTCAGATTCACTTATTAC-TCAATATGTAATAGTATTACGTCCATCACTTACCATCTCTCT-A-TTTCATTGCGGAC-TCA-T-AATATATC--ATAACGGTA-CATTTTTT-TCATTTCTTACAGTCTATCACA-TTTCATGGTAGTCTGATCAGTATATAATAAGAGTA------CAATCTATC-A--TTTC-TTACCATCTATCACA-TTTCATGGTAGTTTTATCA-------GTTTATAATAACAGG---TACTATA-CATTCTATCATT----TCTTACCATCT-ATCACATTTCATGGTAGCTT---------ctatttttaa
gi|5                          :          tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaatTA--------A---------ACATGCACTA-ATATGGTCT----TTAAGATACTACTA-CCGCGTCCGGATTATCG---TAGATTTAGCATCACTCGTCCTTTGCAGCGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCT-----ATACTGAG-T-A-TCTGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTTAC---GAACGTACTCCGACGTCAGGACCGTAAAGTCGTCCATATGACGATAATGTGCGTTGCT-GTCC-TTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCGGTCACGTCTAGAT-ATG----TCGT-TGACGTAGCG--GACACAT--ACATCGCTTACGTCTAAAAACGGCTATAATATATATGTAAACTCAGATTAACTAGTTACTCAAATATGTAATGACATGACGTCTATTACTTATCATCTATCA-A-TTCCATAGTATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CA-----T-TCAATTCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAGTT------C-AT---TC-A--TTTC-TTACTATCT---GCAGTTTCATGGTAGTTTAAACA-------ACATCTCATAtatcagtttataataacaggtactgtacattcaatcatttcttaccatctatcacattccatggtagttttataagtatataacaacagtgcattaatttcttagcatcgtctattaaatctcgacttagcatatagctctctacatatttcaacattatacaatataaatatcgctggacaaattccgtatctgtatttatgtttcgcaaaatcacagaataaacttgacacaatagttatacttcaaaacgacgattttcaatacgttattataaacacaatataagcatctcaaaacacgttccaagatgattcctcctcggcctatatttaaataaacaacttaaaatactgtggatatgaattcaccacattttagtctgtatttttatctacaatttatacaaatatttacttagatctgcctatgtcgaaataaagttatctgacatataaattactaaactatagaaaacattatattaaaagtactcactcagataccacatgcagtggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
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gi|6                          :                                                                                                                                                                       tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcggactcataatatatcataacggtacatttttttcatttcttacagtctatcacatttcatggtagtctgatcagtatataataagagtacaatctatcatttcttaccatctatcacatttcatggtagttttatcagtttataataacaggtactatacattctatcatttcttaccatctatcacatttcatggtagctttatcagtttataataacaggtactgtacattcaatcatttcttaccatctatcacattccatggtagttttataagtatataacaacagtgcattaatttcttagcatcgtctattaaatctcgacttagcatatagctctctacatatttcaacattatacaatataaatatcgctggacaaattccgtatctgtatttatgtttcgcaaaatcacagaataaacttgacacaatagttatacttcaaaacgacgattttcaatacgttattataaacacaatataagcatctcaaaacacgttccaagatgattcctcctcggcctatatttaaataaacaacttaaaatactgtggatatgaattcaccacattttagtctgtatttttatctacaatttatacaaatatttacttagatctgcctatgtcgaaataaagttatctgacatataaattactaaactatagaaaacattatattaaaagtactcactcagataccacatgcagtggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatAGG-CT-AAAAGTAAAA-TATGATTAGCTTTACAATATACAATAATAAACC--TTTACTT-TTCTTAAAACACTCAT--TACTCAACGGATCTTTATGAATCAAACGTCAACA----TGACTTTTTCTTTAAACCAAAAATGAA-TATG--TAAAA-CTAT-CTTTAAA--ATG--TGTT--ATCCTTGTCTAT-----CTTGCGATAAGTTT-AACAAACCTACTCTACTTGACT--GATATACGTCTATA-CAATGTAC---ATACG----TTGTTATTAGCTG---ACACT-AAAATTC--AGGCCACTTAAAC---ACATTT--ATTTTGTTAC-tgatag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcatttcatgcatcgtcttttaattctcgtagtagcatatacatccctacatatttccacgttacacaatataaatatcgacggacaaattctgtaaatctttactttgcaaaaacacagaatacatttaacaccatttacttacatatgttacacttcaaaatgccgatttcaaatacttcattataaacattatataaacatctcaacatacgttcccagattcctcggcctatatcctaataaacaactctcaatactgcggatatgaaattaaattcgccacactctagtcagaatgtatatcaataatttctacaaaaatttacttagatctgcttctgtcgaaatatagctatcggacattcgacttacttaagaaaacagaatatgaaatctacttacacagaaatgccgcatgtaatggtaagtttatgtggaaatctctgccacaacgatctcgtatgcttgtatttgctaactgaccctgatttaagcttatactcctttattaatacaagaaatccacacaccacaggtttttattaagaaacttcgatgccatacgactataaatgtacgaaaATGAAATAAACGTCAAAATGAATGACTTATTATTT-AT-----ACTAAA-AATG----AAT-ATTA-C---AAA--ACG--T--TAAATCCCTATCTAC-----CTAGCAAAACG-TTTGACAAgttag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACCAAA-AATGAATAATA--TAAAACATA---TTTAAA--AGGCTT--T--ATTCCTATCATGTCTGCCTAGCAATAAGTTTAAACAATCaactgtgatgtatttgcactacatacccttgcgaagtctataacatttgaataacattgtacttgctgacggcgataattt
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): CTTTATACTAAAATTGAATACAAAAAAGATCTTTAAAATGCTTTATCCATATCTACCAAGTGATGCATGTAACCCAGCAGGTTCAATTTTGCCCTACATCTATACAATATCAGTAACCTTGATCTTGATGACTCCGATACCTTAATTAGGCCACTTAAACTATATATTTTTGTTACATAG
Unaligned ( gi|11 ): CTCTATTATATATCAATGATGTCGCGATACAAACTGCTCTGCAACGTTAATGAATGATTTAGATAAGGTTTATACTTAATAAAACGTCCGCGTCT
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGTACTTACCCAGAATGCCGCATGCAATGGTCAGTTTATGTGGAAATCTATGCCACAACGATCTCGCAATGTTGGTATTAGC
Unaligned ( gi|13 ): ATGCAAACTGCTCTGCAACGTTAATGCATGATTTAAATATAAATATCATACTTATTAAAACACTACGTCCGC
Unaligned ( gi|14 ): ATATACTTGTTATTATCTGACACTGATATTCAGGCCACTTAAACACACCTATTTTGTTACAGTTAGCA
Unaligned ( gi|17 ): CAAACTGCTCTGTAACGTTAATGAATGATTTAAATAA
Unaligned ( gi|18 ): CTCTGCAACGTTAATGAATGATTTACATAAGCTT






Alignments
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Reference ( family-1565 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTGTAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATNCAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAANTATACAATATATACAATTTAAAG-ATAATTGCTCAACAAAAAAAACAACANAGCTNGTTTAAAAGGGTCCTNTGANGGNATTA-----ACACT----TTC---TTANNCAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TACATCATACG--AATA--TT-ATA-A---------AAATGCACTATATAT-TGTATT-AAGATACTACTACCGCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCANTCGTCCCTTGCGGCGGTGGCTATATNAACCGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TNTGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTNTC---GACCGTACTCCGACGCCAGGATCGTCAAGTCGTCCATATGACGATTATGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGT-TGACGTAGCG--GACACATNCGTCGCNT--ACGTCTAAAAA---CTAT-ATATATATG----CTCAGATTNACTNGTTACTCN-AATATGTAATGACATGACGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTTCATGG--TANTT-TTA-TCAATATATG--ATGACAGTG-CG-----T-TCANTT---CTTACCATCTANCA-ATTTCATGGTAGTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGNTTTATCAATATATGATAACAG------TNCAT----TCAAT----TCTTACCATCT-A-CA-GTTTCATGGTAGNTT---------A-AACAACATCTCAT--ATAT----G-AT--C--TTCTGTCAA-T-CTCGAANTA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTCT-CATT-TACAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTCGCGAATATCA-AGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACATGGCGANTTTCAATACTTCATCGTAAACACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACACCTNTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTATCGTCGGAATGNATATGAANAATTTATACAAC--T--TTACTTAGATCTGATTATGTC-GAAATATANCTATCGGACATT-----TA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAAATTCACATACCCATN--TGCCGTTATGTANTGGAACAGTAA---CATGCTCAA-TCCTTCTCGTCACGACCAACTCC-AAAGAT-G--T-TT-TGCTATACTGGAC--G--GTTT----CC--ATAATACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACGTACCTTAGCGAATTTCGTGCAAATCATAAAACAACA------AACNT----------TACAACA-TCGTACGA-TGCGN-ATTTTACGCTATNAG-G-CC-AAN-GTAAANTTAAATTAGTTTTACGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATACTTAACGGAATTTNATGAAATAAACNTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAANA-TGT-AAAA-ATATCTTAAAA--ACGT--T--ACCCCTATCGAG-----CTAGCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGNTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTG-CANTGGACA-CG----T----ACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAACTTATTTTGTTAC-AACAT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcgg----------TACGATA-TCGAACGC-TGCAACAATGTACG--AAAAGTG-CTTAAG-GTAAAATACGATTAGCTTAACAATA------A-TAAACCCATTTACTT-TTTT---AAAAG-CTCATTACTCAACGGATTTTTATAAAATAAACGTCGA----AATGATTTAATCTTTA-AACCAAAAACGAATT-TGT-AAAA-ATATTTTAAAAATACTT--T--ATCCCTATCTAT-----ATAGAGATAAG-TTTAACAA----CGTATGCTACTTGACCGATATAT----------GTCTGTA-CAATGTCAAT----A-TGTTGTT----ATTAGCTGACTCTG--AGATTTCAGGCCAC---ATTAACA-AATTCATTTTGTTACAAACATtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----T----ATTATCTGACACTGATA--TTC-AGGCCACTTAAACA--C--ACCTATTTTGTTAC-tgtaatcgattttaactatctacacttatacaatat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatacttgtC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TATATCAT--G--AATA--TT-A-A-A---------Agttagca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCAAAATGACAAAGGACCGACAATTCACGAAGGTAGAATACAAGTAAACTC-AAATAAAActatttttaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTGCAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACAAGGGTAGAATACAATCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAAGTACAAAATATATACAAATTAAAG-ATAATAACTCAACACAAAAAA-AAC-CAGCTGGTTAAAAAAAGTCATTTGGTGGTATTA-----ACACTCTTATTT---TCACACAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGT-ACGTAACCTAC-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TTTATCATTCG--AATG--TTTATA-A---------AAATGCACTATATAT-T---TT-------------CCGCGTCCGGAT--ATCGTAGATTTAGCATCACTCGTCCCTTGTGGCGGTGGCTATA-GAACTGGGTT-ATCTCCCCCTAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGAACCGACCATC---GACCGGATTCCGACGTCAGGAACGTCAAGTTGTCCATATGACGAATATGTGGGTTGC-AGTCCT-ACGACTGTACTTCCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACATAGCG--GACACATTCCACGCTA--ACGTCTAAAAA---CTAT-ATATATATA----CTCAGATTTACTAGTT---TA-AATATGTAATGACATGGCGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTACATGG--TATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTAACCATCTAATA-GTTTTATGGTAGATTTA-TCATTATATTATAACAG------TTC-AT---TCAAT----TTTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAT------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTACATGGCAGTTT---------A-AACAACATCTCAT--ATAC----G-AC--C--TTCC-TCAA-T-CTCAAAGT----GCAATTATA--T----CTCTACATAACTTCT-CATT-TATAATATGAACAATT-AC-AGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGTGAATATCC--GAATAAGCATC-AACAATATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATATTAACATGGTGAATCTGAATATTTCATCGTAAACACAATATCAACAGCTCAAAATACTTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAAAGCTTCTCAATACCGTGGATGTG-GATTAAATTACATACATTACCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATACAAC--T--TTACTTAGATCTGATTATGTCAAAAATATATATATCAGACATT-----TA---A-------------A-TAT------------AACATAATA-CAAATTTCACATACCCATA--TGCCGTTATGTACTGGGACAGTAA---CATATTCAA-TCTTTCTCGTCGCAACTAAACCC-AAAGAT-GA-T-TC-TGCTA-ACTTGAC--ATTGTTT----CC--ATAACAGAGTCAGC-ATTA--ATAGCAAAACCGTCCACATACCTTAGTGAATTTCGTGTAAATCATAAA--AACA------AACCC----------TAAAACA-TCGTACGA-AGTGT-ATTTTACGCTATGAG-G-CC-AAT-GTAAACCTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATAATTAATGGAATTTGATAAACTAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAAAA-TGT-AAAA-ATAACTTGAAA--ACGT--T--GCTCCTATCGAG-----CTATCAATACGTTTTAACAA---TCCCACACTACCTGACCTAAATAT--------A-GCCTATATCACTA-CACTCGACA-CG----T----AATAGCTGACAACACTAAATT--AGGCCAC---CAAAACCTAAC-AATTTTATTAC-AACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCATAATGACCAAGG-CCGACAACTCACGAGGATAGAATTCAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATTGACAATTTTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATTTATACAATTTAAAG-CTAATTGCTCAACAAAA-------CACAACTTGTTTAAAAAGGTCCTATGATGGAATTA-----ACACT----TTC---TTAATCA--TTC-ATCT---------------GTA------CGTTCCGTA-----T-------AT----ATCCAAACTGCT-AACATCACACG--ATTG--CT-ATA-ACTGTTTTTAAAATACACT-TATAT-TATATTTAAGATACTACTACCGCGCCCGGAT-TATCGTAGATATAGCATCAATCGTTCCTCGTGGTGATGGCTAT-TTAAACAGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTGT-----ACTGTG-TTA-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCAACTATCTTCGACTGTACTATGACGCCAGGATCTTCAAGTCGTCCATATAATGATTAAGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGTTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACATGCGTCGCAT--ACGTTTTAAAA---C-AT-ATATAT------------ATTG--TAGCCGTTTT-AAGACGT-ATG---CGACGCAT-----ATT------TATATATAA-A-CTCA-GATTTACTTGTTACTCAATACGTA--ATGACATGG-CG-----T-CTGTTA---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGCATTTTTA-TCAAAATATGATAACAG------TGC-AT---ATAAT----TATTACCTTCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTCATCAACATCTCATA
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gi|4                          : tgtagcataatgaccaaggccgacaactcacgaggatagaattcaagtatactcaaaataaaatttacaattgacaattttaattttacatgaataaaattacgaatatacaattatacaatttatacaatttaaagctaattgctcaacaaaacacaacttgtttaaaaaggtcctatgatggaattaacactttcttaatcattcatctgtacgttccgtatatatccaaactgctaacatcacacgattgctataactgtttttaaaatacacttatattatatttaagatactactaccgcgcccggattatcgtagatatagcatcaatcgttcctcgtggtgatggctatttaaacaggttatcttccctagaactctgtactgtgttatatggctttacgtcgcctcgtaccaactatcttcgactgtactatgacgccaggatcttcaagtcgtccatataatgattaagtgggttgctgtccttatgacggtactaccaccagttgacttcctgtcacgtctacacgtcgttaacgtagcggacacatgcgtcgcatacgttttaaaacatatatatattgtagccgttttaagacgtatgcgacgcatatttatatataaactcagatttacttgC----TGTA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCAATCCAAACTGCT-TACGTCATATG--AATG--TT-AAA-ACTGTTTTTAAAATGCACT-TATAT-TGTATTGAAGATACTACTACCTCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCATTCGTCCCTTGCGGAGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCT-TAGAACTCTAT-----ACGGAC-T-T-TCTGGCTTTATGTCGCCTCGTACCGACTGTC---GATCGTACTCCGACGCCAGGATCGTCAATTCGTCCATATAACGATTATGTGGGTTGG-TGTCCTTATGACGTTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGC-TAACGTAGCG--GACACAT--GNNNNNN--NNNNNNNNNNN---NNNN-NNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--TAG---TTACTCAA-ATATGAAATGACATGG-CG-----T----CTTAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGGTATTTTTA-TCAATAAATGATAACAG------TGC-AT---TCAAC----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAACATATTATAGCAG------CGCAT----TCAAT----TCTTACCATCTAA-CA-GTTTCATGGTAGATT---------T-ATCA-------AT--ATAT----G-ATAACAGTTCATTCAA-T--TCTTACTATCTGCAGTTTCA--TGGTAGTTTAAACATTTTCT-CAT------ATATGAACg
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                              ctgtacgttccgtaatctatatcgcaatccaaactgcttacgtcatatgaatgttaaaactgtttttaaaatgcacttatattgtattgaagatactactacctcgtccggattatcgtagatttagcatcattcgtcccttgcggaggtggctatataaactgggttatcttccttagaactctatacggactttctggctttatgtcgcctcgtaccgactgtcgatcgtactccgacgccaggatcgtcaattcgtccatataacgattatgtgggttggtgtccttatgacgttactaccaccagctgacttcctgtcacgtctacacgtcgctaacgtagcggacacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTA-A---------ACATGCACTA-ATAT-GGTCTTTAAGATACTACTACCGCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCACTCGTCCTTTGCAGCGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TCTGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTTAC---GAACGTACTCCGACGTCAGGACCGTAAAGTCGTCCATATGACGATAATGTGCGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCGGTCACGTCTAGAT-ATG----TCGT-TGACGTAGCG--GACACATACATCGCTT--ACGTCTAAAAACGGCTATAATATATATGTAAACTCAGATTAACTAGTTACTCA-AATATGTAATGACATGACGTCT-----ATTACTTATCATCTATCA-ATTCCATAG--TATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CA-----T-TCAATT---CTTACCATCTAACA-GTTTCATGGTAGATTTA-TCAATATATGATAACAG------TTC-AT---TCATT----TCTTACTATCT---GCAGTTTCATGGTAGTTTAAACAACATCTCATAtgtacagc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATATGTA--ATGACA-TGACG-----T-CTATTA---CTTATCATCTATCA-ATTCCATAGTATTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAG------TTCAT----TCATT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTTCATGGTAGTTT---------A-AACAACATCTCAT--ATAT----G-AC--C--TTCTGTAAA-T-CTCAAAATA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTCT-CATT-TATAATATAAACAATT-AC-AGACCAAATCTTTATCT--ATTCAC--TT-GTTAATATCA-A-AATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACACCTATCAATCAATCAATTCTAACATGGTGAATTTCAATACTTCATCGTAAACACGATTTCAATAGCTCAAAATACGTTCTCGGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACACCTCTCAATACCGTGGATGTG----TA--TTACAGACATTATCGTCGGAATGGATATGAAAAATTGATACAAC--T--TTACTTAGATTTGATAACATC-AAAA-------------CATT-----TA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAAATTCACATACCCATC--TGCCGTTATGTACTGTAACAGTAA----ATGCTCAA-TCCTTCTCGTCACG-CCAACTCC-AAAGAT-G--T-TT-TGCTATACTGGAC--A--GTTT----CCCCATAACACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACATACCTTAATGAATTTCGTGCAAATCATAAAACAACA------AACAT----------TTCAATA-CCGTACAA-TGCGA-ATTTTATGCTATAAG-G-CT-AAT-GCAAACTTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---TACTTTCTTAATACTTAATGGAATTTGATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATAAAAA-TGT-AAAA-CGATCTTAAAA--GCGT--T--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACAA---TTCCACGCTACCTGTTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTG-CAATGGACG-CG----T----ACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAAC-TATTTTGTTAC-tatgaccttctgtaaatctcaaaatagcaattatatctctacataatttctcatttataatataaacaattacagaccaaatctttatctattcacttgttaatatcaaaataagcatcaacaaaatttaattacacctatcaatcaatcaattctaacatggtgaatttcaatacttcatcgtaaacacgatttcaatagctcaaaatacgttctcggattcctcggcctatattctaacaaaacacctctcaataccgtggatgtgtattacagacattatcgtcggaatggatatgaaaaattgatacaactttacttagatttgataacatcaaaacatttaaatacaacataatataaaattcacatacccatctgccgttatgtactgtaacagtaaatgctcaatccttctcgtcacgccaactccaaagatgttttgctatactggacagtttccccataacacagtcagaatatatagcaaaacagtccacataccttaatgaatttcgtgcaaatcataaaacaacaaacatttcaataccgtacaatgcgaattttatgctataaggctaatgcaaacttaaattagttttatgacaaataaacccgtttaattattcttactttcttaatacttaatggaatttgatgaaataaacttcaaaatgatttattctttaatcaaagaataaaaatgtaaaacgatcttaaaagcgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacaattccacgctacctgttctaaatatagcctatatcattgcaatggacgcgtactagctgacactactaaattaggccacaacaacctaactattttgttacagataca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taaacatgcactaatatggtctttaagatactactaccgcgtccggattatcgtagatttagcatcactcgtcctttgcagcggtggctatataaactgggttatcttccctagaactctatactgagtatctggctttacgtcgcctcgtaccgacttacgaacgtactccgacgtcaggaccgtaaagtcgtccatatgacgataatgtgcgttgctgtccttatgacggtactaccaccagctgacttccggtcacgtctagatatgtcgttgacgtagcggacacatacatcgcttacgtctaaaaacggctataatatatatgtaaactcagattaactagttactcaCATTTCAT--GCAT----C-GT--C--TTTT---AA-TTCTCGTAGTA---GCATATACA--T----CCCTACATATTTCCA-CGTTACACAATATAAATA-TCGAC-GGACAAATTCTGTAAAT--CTTTAC--TTTGCAAAAA-CACAGAATA--CATTTAACACCATTTACTTACAT--AT--GTTA--CACTTC-AAAATGCCGATTTCAAATACTTCATTATAAACATTATATAAACATCTCAACATACGTTCCCAGAT------TCCTCGGCCTATATCCTAATAAA-CAACTCTCAATACTGCGGATATGAAATTAAATTCGCCACACTCTAGTCAGAATGTATATCAATAATTTCTACAAAAAT--TTACTTAGATCTGCTTCTGTC-GAAATATAGCTATCGGACATTCGACTTACTTA-------------A-GAA------------AACAGAATA-TGAAATCTACTTACACAGAAATGCCGC-ATGT-----AATGGTAAGTTTATGTGGAAATC--TCT-GCCACAACGATCTCG-TATGCTTG--TATT-TGCTA-ACTGACCCTG--ATTTAAGCTT--ATACTCC--TT-----TATTAATA-CAAGA-AATCCACACACCACAG---GTTT--------TTAT----TAAGA------AACTT------------CGATG-CCATACGACTATAA-ATGT-ACG--AAAAG-G-CT-AAAAGTAAAATATGATTAGCTTTACAATATACAATAATAAACC--TTTACTT-TTCTTAAAACACTCAT--TACTCAACGGATCTTTATGAATCAAACGTCAA----CATGACTTTTTCTTTA-AACCAAAAATGAATA-TGT-AAAA-CTATCTTTAAA--ATGTGTT--ATCCTTGTCTAT-----CTTGCGATAAGTTT-AACAA---ACCTACTCTACTTGA-CTGA-TAT--------ACGTCTATA-CAATG-TAC---ATA-CG----TTGTTATTAGCTGACACTA--AAATTC-AGGCCACTTAAAC-AC---ATTTATTTTGTTAC-gataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tACTGTAGCAAAATGACCAATGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATACAAGCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAAT-AAATAACGAATATACAACTATACAACATATACAATTTAAAG-ATAATTACTCAACAAAAAAAACAACAGAGCTGGTTTAAAAGA--CCTTTGAAGGTATTA-----ACACT----TTT---TTACACAG-TTCTATTT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TATATCAT--G--AATA--TT-A-A-A---------Agttag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGAAATAAACGTCAAAATGAATGACTTATTATTTATACTAAA-AATGAATA-T---------TAC----AAA--ACGT--TAAATCCCTATCTAC-----CTAGCAAAACG-TTTGACAAAACTGTGATG-TATTTGCACTACATACCCTTGCGAA-GTCTATAACATTT-GAAT-AACATTG----T----ACTTGCTGACctatttttaacaagatggccctatat
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|11 ): CTCTATTATATATCAATGATGTCGCGATACAAACTGCTCTGCAACGTTAATGAATGATTTAGATAAGGTTTATACTTAATAAAACGTCCGCGTCT
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGTACTTACCCAGAATGCCGCATGCAATGGTCAGTTTATGTGGAAATCTATGCCACAACGATCTCGCAATGTTGGTATTAGC
Unaligned ( gi|13 ): ATGCAAACTGCTCTGCAACGTTAATGCATGATTTAAATATAAATATCATACTTATTAAAACACTACGTCCGC
Unaligned ( gi|17 ): CAAACTGCTCTGTAACGTTAATGAATGATTTAAATAA
Unaligned ( gi|18 ): CTCTGCAACGTTAATGAATGATTTACATAAGCTT






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Reference ( family-1565 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTGTAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATACAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATATATACAANTTAAAG-ATAATTACTCAACGAAAAAAACAACACAGCTGGTTTAAAAAAGTCCTNTGANGGNATTA-----ACACT----TTC---TTANNCAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TACATCAT--ACGAATGTT-ATA-A---------AAATGCACTATATAT-TGTATTTAAGATACTACTACCGCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCANTCGTCCCTTGCGGCGGTGGCTATATNAACCGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTATC---GACCGTACTCCGACGTCAGGANCGTCAAGTCGTCCATATGACGATTATGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACAT-CGTCGCTT--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATACGCTCAGATTNACTAGTTACTCA-AATATGTAATGACATGACGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTTCATGG--TANTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGTAGTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGNTTTATCAATATATGATAACAG------TNCAT----TCAAT----TCTTACCATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATATGAT--C--TT----CCGTC-----AAT-CTCGAAGTA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTCT-CATT-TATAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGCGAATATCA-AGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACATGGCGANTTTCAATACTTCATCGTAAACACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACGNCTCTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTNTCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTTAGATCTGATTATGTC-GAAATATATCTATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGAACAGTAACATGC-TCAATCCTTCTCGTCACGACCAACTCC-AAAGA-TG--T-TT-TGCTATACTGGAC-G-TGTTTCCATAA---TACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACATACCTTA-GCGAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACA------AACNT----------TACGATA-TCGTACGA-TGCGA-ATTTTACGCTATNAG-G-CC-AANGTAAACTTAAATTAGTTTTACGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATACTTAACGGAATTTNATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAATA-TGT-AAAA-ATATCTTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTANCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGNTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTG-CAAT-G---ACA-CG----TACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAACTTATTTTGTTAC-AACAT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcgg-ATAT--ATA-CAACACCA-CCTCATACCACAAGTGTATCTCACGACAAA-CATGGAATTA---------ATTTGTCA------TACGATA-TCGAACGC-TGCAACAATGTACG--AAAAGTG-CTTAAGGTAAAATACGATTAGCTTAACAATA------A-TAAACCCATTTACTT-TTTT---AAAAG-CTCATTACTCAACGGATTTTTATAAAATAAACGTCGA----AATGATTTAATCTTTA-AACCAAAAACGAATT-TGT-AAAA-ATATTTTAAAAATA--CTTT--ATCCCTATCTAT-----ATAGAGATAAG-TTTAACAA----CGTATGCTACTTGACCGATATAT----------GTCTGTA-CAATGTCAAT-------A-TGTTGTTATTAGCTGACTCTG--AGATTTCAGGCCAC---ATTAACA-AATTCATTTTGTTACAAACATggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcggactcataatatatcataacggtacatttttttcatttcttacagtctatcacatttcatggtagtctgatcagtatataataagagtacaatctatcatttcttaccatctatcacatttcatggtagttttatcagtttataataacaggtactatacattctatcatttcttaccatctatcacatttcatggtagctttatcagtttataataacaggtactgtacattcaatcatttcttaccatctatcacattccatggtagttttataagtatataacaacagtgcattaatttcttagcatcgtctattaaatctcgacttagcatatagctctctacatatttcaacattatacaatataaatatcgctggacaaattccgtatctgtatttatgtttcgcaaaatcacagaataaacttgacacaatagttatacttcaaaacgacgattttcaatacgttattataaacacaatataagcatctcaaaacacgttccaagatgattcctcctcggcctatatttaaataaacaacttaaaatactgtggatatgaattcaccacattttagtctgtatttttatctacaatttatacaaatatttacttagatctgcctatgtcgaaataaagttatctgacatataaattactaaactatagaaaacattatattaaaagtactcactcagataccacatgcagtggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttct-ACCAAA-AATGAATAATAT-AAAACATATTTAAAAG--G--CTTT--ATTCCTATCATGTCTGCCTAGCAATAAGTTTAAACAA---TCtgatag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-------GTCGCGATACAAACTGCTCTGCAACGTTAATGAATGtgtaatcgattttaactatctacacttatacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctctattatatatcaatg----TATTATCTGACACTGATA--TTC-AGGCCACTTAAACA--C--ACCTATTTTGTTAC-atttagataaggtttatacttaataaaacgtccgcgtct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatacttgtC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TATATCAT----GAATATT-A-A-A---------Agttagca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCAAAATGACAAAGGACCGACAATTCACGAAGGTAGAATACAAGTAAACTC-AAATAAAActatttttaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTGCAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACAAGGGTAGAATACAATCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAAGTACAAAATATATACAAATTAAAG-ATAATAACTCAACACAAAAAA-AAC-CAGCTGGTTAAAAAAAGTCATTTGGTGGTATTA-----ACACTCTTATTT---TCACACAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGT-ACGTAACCTAC-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TTTATCAT--TCGAATGTTTATA-A---------AAATGCACTATATAT-T----TT------------CCGCGTCCGGAT--ATCGTAGATTTAGCATCACTCGTCCCTTGTGGCGGTGGCTATA-GAACTGGGTT-ATCTCCCCCTAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGAACCGACCATC---GACCGGATTCCGACGTCAGGAACGTCAAGTTGTCCATATGACGAATATGTGGGTTGC-AGTCCT-ACGACTGTACTTCCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACATAGCG--GACACATTCCACGCTA--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATATACTCAGATTTACTAGTT---TA-AATATGTAATGACATGGCGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTACATGG--TATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTAACCATCTAATA-GTTTTATGGTAGATTTA-TCATTATATTATAACAG------TTC-AT---TCAAT----TTTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAT------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTACATGGCAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATACGAC--C--TT----CC-TC-----AAT-CTCAAAGT----GCAATTATA--T----CTCTACATAACTTCT-CATT-TATAATATGAACAATT-AC-AGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGTGAATATCC--GAATAAGCATC-AACAATATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATATTAACATGGTGAATCTGAATATTTCATCGTAAACACAATATCAACAGCTCAAAATACTTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAAAGCTTCTCAATACCGTGGATGTGGA-TTAAATTACATACATTACCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTTAGATCTGATTATGTCAAAAATATATATATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAT------------AACATAATA-CAAA---TTTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGGACAGTAACATAT-TCAATCTTTCTCGTCGCAACTAAACCC-AAAGA-TGA-T-TC-TGCTA-ACTTGAC-ATTGTTTCCATAA---CAGAGTCAGC-ATTA--ATAGCAAAACCGTCCACATACCTTA-GTGAATTTCGTG-TAAATCATAAA--AACA------AACCC----------TAAAACA-TCGTACGA-AGTGT-ATTTTACGCTATGAG-G-CC-AATGTAAACCTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATAATTAATGGAATTTGATAAACTAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAAAA-TGT-AAAA-ATAACTTGAAA--A--CGTT--GCTCCTATCGAG-----CTATCAATACGTTTTAACAA---TCCCACACTACCTGACCTAAATAT--------A-GCCTATATCACTA-CACTCG---ACA-CG----TAATAGCTGACAACACTAAATT--AGGCCAC---CAAAACCTAAC-AATTTTATTAC-AACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCATAATGACCAAGG-CCGACAACTCACGAGGATAGAATTCAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATTGACAATTTTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATTTATACAATTTAAAG-CTAATTGCTCAACAAAA-------CACAACTTGTTTAAAAAGGTCCTATGATGGAATTA-----ACACT----TTC---TTAATCA--TTC-ATCT---------------GTA------CGTTCCGTA-----T-------AT----ATCCAAACTGCT-AACATCAC--ACGATTGCT-ATA-ACTGTTTTTAAAATACACT-TATAT-TATATTTAAGATACTACTACCGCGCCCGGAT-TATCGTAGATATAGCATCAATCGTTCCTCGTGGTGATGGCTAT-TTAAACAGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTGT-----ACTGTG-TTA-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCAACTATCTTCGACTGTACTATGACGCCAGGATCTTCAAGTCGTCCATATAATGATTAAGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGTTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACATGCGTCGCAT--ACGTTTTAAAAC---------ATATATAT--------ATTG--TAGCCGTTTT-AAGACGT-ATG---CGACGCAT-----ATT------TATATATAA-A-CTCA-GATTTACTTGTTACTCAATACGTA--ATGACATGG-CG-----T-CTGTTA---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGCATTTTTA-TCAAAATATGATAACAG------TGC-AT---ATAAT----TATTACCTTCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTCATCAACATCTCATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTACTCAATACGTAATGACAT------GGC-GT---CTGTT----ACTTACCATCTA--TCAATTTCATGGCATTTTTATCAAAATATGATAACAG------TGCAT----ATAAT----TATTACCTTCT-AACA-GTTTCATGGTAG-ATT---------C-ATCAACATCTC-ATATATGAT--C--T-----CCGTC-----AAC-CCCAAAGTA---GCAATTGTA--T----CTCTATCTAATTTCT-CATT-TAAAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTTTATCT--ATTGAC--TTGGTAAATATCA--GAATAAGCATC-CACCAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACGTGATGAGTTTCAATACTTCATCGTAAACACGTTATCAACAGCTCAAAATACGTTCTTAGAT------TCCACGGCCTATATTCTAACAAAACAATTTTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTCTCATCAGAATGAATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTCAGATCTGATTATGTT-AAAATATATCTAGCAGACGT-----TTA---AATATCTCAACCATA-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCGC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTAATGGAACAGTTACATGC-TCAATTCTTCTCGTCATGA-CAATTCCGAAAGA-TG--T-TTCTGCTAGACTGGACGG-TGTTTCCATAA---TACAGTCAGACATAT--ATAGTAAAACACTCCACGTACTTTA-GTGAATTTCGTG-CAAATTATAAAACAACAATTATCAATATATCG------TAAGATA-TGGTACGA-TGCAG-CTTTTACGATATTTG-GCCC-AATGTAAATTTAAAAGAGTTTTATAAAT------AATAAACCCGTTTGATTATTCT---AACTTTCTGAATACTTAATGGAATTTCATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAAT--ATG-TTT-AAAG-ATA--TTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACGA---ACCCATGCTATCTGCTCCCAATAT--------A-GCCAATACCATTT-TACTAG---ACA-CG----TACTACTTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCT-ATTTTTTTTGTTAC-tatgatctccgtcaaccccaaagtagcaattgtatctctatctaatttctcatttaaaatataaacaatcacggaccaattctttatctattgacttggtaaatatcagaataagcatccaccaaatttaattacacatatcaatcaattctaacgtgatgagtttcaatacttcatcgtaaacacgttatcaacagctcaaaatacgttcttagattccacggcctatattctaacaaaacaattttcaataccgcggatgtgaaattaaattacagacattctcatcagaatgaatatgaacaatttatacaactttactcagatctgattatgttaaaatatatctagcagacgtttaaatatctcaaccatatacaacataatataaaattcgcatacccatatgccgttatgtaatggaacagttacatgctcaattcttctcgtcatgacaattccgaaagatgtttctgctagactggacggtgtttccataatacagtcagacatatatagtaaaacactccacgtactttagtgaatttcgtgcaaattataaaacaacaattatcaatatatcgtaagatatggtacgatgcagcttttacgatatttggcccaatgtaaatttaaaagagttttataaataataaacccgtttgattattctaactttctgaatacttaatggaatttcatgaaataaacttcaaaatgatttattctttaatcaaagaatatgtttaaagatattaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacgaacccatgctatctgctcccaatatagccaataccattttactagacacgtactacttgacactactaaattaggccacaacaacctattttttttgttacag
gi|4                          : tgtagcataatgaccaaggccgacaactcacgaggatagaattcaagtatactcaaaataaaatttacaattgacaattttaattttacatgaataaaattacgaatatacaattatacaatttatacaatttaaagctaattgctcaacaaaacacaacttgtttaaaaaggtcctatgatggaattaacactttcttaatcattcatctgtacgttccgtatatatccaaactgctaacatcacacgattgctataactgtttttaaaatacacttatattatatttaagatactactaccgcgcccggattatcgtagatatagcatcaatcgttcctcgtggtgatggctatttaaacaggttatcttccctagaactctgtactgtgttatatggctttacgtcgcctcgtaccaactatcttcgactgtactatgacgccaggatcttcaagtcgtccatataatgattaagtgggttgctgtccttatgacggtactaccaccagttgacttcctgtcacgtctacacgtcgttaacgtagcggacacatgcgtcgcatacgttttaaaacatatatatattgtagccgttttaagacgtatgcgacgcatatttatatataaactcagatttacttgC----TGTA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCAATCCAAACTGCT-TACGTCAT--ATGAATGTT-AAA-ACTGTTTTTAAAATGCACT-TATAT-TGTATTGAAGATACTACTACCTCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCATTCGTCCCTTGCGGAGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCT-TAGAACTCTAT-----ACGGAC-T-T-TCTGGCTTTATGTCGCCTCGTACCGACTGTC---GATCGTACTCCGACGCCAGGATCGTCAATTCGTCCATATAACGATTATGTGGGTTGG-TGTCCTTATGACGTTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGC-TAACGTAGCG--GACACAT--GNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--TAG---TTACTCAA-ATATGAAATGACATGG-CG-----T----CTTAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGGTATTTTTA-TCAATAAATGATAACAG------TGC-AT---TCAAC----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAACATATTATAGCAG------CGCAT----TCAAT----TCTTACCATCTAA-CA-GTTTCATGGTAGATTT---------A----------TCAATATATGATAACAGTT----CATTC-----AAT--TCTTACTATCTGCAGTTTCA--TGGTAGTTTAAACATTTTCT-CATA-TATGAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGTTACTCA-AATATGAAATGACATGGCGTCT-----TAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGG--TATTT-TTA-TCAATAAATG--ATAACAGTG-CA-----T-TCAACT---CTTACCATCTAACA-GTTTCATGGTAGATTTA-TCAACATATTATAGCAG------CGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAG------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACATTTTCTC-ATATATGAA--C--TT----CCGTC-----AGT-CTTAAAATA---GCAATTATA--T----AGCTACATAACTTTT-TATT-TATGATATAAACAATT-AC-AGATCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TCTGTGAATATC--AGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTATAC--AT--ATCAATTAATTCTAACATGGTGAATTTCAATACTTCATCGTAA--ACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTTTTAGAT------ACCTTGGCTAATATTCTAACAAAACGCCTATCAATACCGCGGATGTGATATTAAATTACAGACATTATCGTCGAAATGGATATGAAAAATTTATAC--CACT--TTACTTAGATCTGATTATGTC-AAAATATATCTATCAGGCAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAAAA-TAAA---ATTCAC----ATACTCAT--CTGCCGTTATGTACTGGAACAGTAACATGC-TGAATCCTTCTCGTCAAG-TCAACTAC-AAAGA-TATTT-TT-TGCTATACTGGACAG-TTTCCCCATAA---TACAGTCAGA-ATAT--ATAG-----CAGTCCATAT--------CAAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACA------AACTTTCTTATATGGTACTATAGTCGTACGA-TGCGG-ATTTTACGCTTTTAG-G-CCAAAGGTAAACTTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCTGTTTAATTATTTT---AACTTTCTTAATACTTAATGGAATTTGATGAAATCAACTTCAA----AATGATTCACTCTTTA-ATCAAAGAATGAACA-TTTAAAAA-AGATCTTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGTTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTA-CAATGG---ACA-CG----TACTAGCTGACACTTCTAAATT--AACTCAC---AACAACCTAAC-TATTTTGTTAC-AAacttccgtcagtcttaaaatagcaattatatagctacataactttttatttatgatataaacaattacagatcaattctgtatctattcactctgtgaatatcagaataagcatcaacaaaatttaattatacatatcaattaattctaacatggtgaatttcaatacttcatcgtaaacgatatcaacagctcaaaatacgtttttagataccttggctaatattctaacaaaacgcctatcaataccgcggatgtgatattaaattacagacattatcgtcgaaatggatatgaaaaatttataccactttacttagatctgattatgtcaaaatatatctatcaggcatttaaatacaacataaaataaaattcacatactcatctgccgttatgtactggaacagtaacatgctgaatccttctcgtcaagtcaactacaaagatattttttgctatactggacagtttccccataatacagtcagaatatatagcagtccatatcaaatttcgtgcaaatcataaaacaacaaactttcttatatggtactatagtcgtacgatgcggattttacgcttttaggccaaaggtaaacttaaattagttttatgacaaataaacctgtttaattattttaactttcttaatacttaatggaatttgatgaaatcaacttcaaaatgattcactctttaatcaaagaatgaacatttaaaaaagatcttaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacaatcccacgctacctgttctaaatatagcctatatcattacaatggacacgtactagctgacacttctaaattaactcacaacaacctaactattttgttacaatgtacagc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATATGTA--ATGACA-TGACG-----T-CTATTA---CTTATCATCTATCA-ATTCCATAGTATTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAG------TTCAT----TCATT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATATGAC--C--TT----CTGTA-----AAT-CTCAAAATA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTCT-CATT-TATAATATAAACAATT-AC-AGACCAAATCTTTATCT--ATTCAC--TT-GTTAATATCA-A-AATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACACCTATCAATCAATCAATTCTAACATGGTGAATTTCAATACTTCATCGTAAACACGATTTCAATAGCTCAAAATACGTTCTCGGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACACCTCTCAATACCGTGGATGTG----TA--TTACAGACATTATCGTCGGAATGGATATGAAAAATTGATAC--AACT--TTACTTAGATTTGATAACATC-AAAA-------------CAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCAC----ATACCCAT--CTGCCGTTATGTACTGTAACAGTAA-ATGC-TCAATCCTTCTCGTCACG-CCAACTCC-AAAGA-TG--T-TT-TGCTATACTGGACAG-TTTCCCCATAA---CACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACATACCTTA-ATGAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACA------AACAT----------TTCAATA-CCGTACAA-TGCGA-ATTTTATGCTATAAG-G-CT-AATGCAAACTTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---TACTTTCTTAATACTTAATGGAATTTGATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATAAAAA-TGT-AAAA-CGATCTTAAAA--G--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACAA---TTCCACGCTACCTGTTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTG-CAATGG---ACG-CG----TACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAAC-TATTTTGTTAC-tatgaccttctgtaaatctcaaaatagcaattatatctctacataatttctcatttataatataaacaattacagaccaaatctttatctattcacttgttaatatcaaaataagcatcaacaaaatttaattacacctatcaatcaatcaattctaacatggtgaatttcaatacttcatcgtaaacacgatttcaatagctcaaaatacgttctcggattcctcggcctatattctaacaaaacacctctcaataccgtggatgtgtattacagacattatcgtcggaatggatatgaaaaattgatacaactttacttagatttgataacatcaaaacatttaaatacaacataatataaaattcacatacccatctgccgttatgtactgtaacagtaaatgctcaatccttctcgtcacgccaactccaaagatgttttgctatactggacagtttccccataacacagtcagaatatatagcaaaacagtccacataccttaatgaatttcgtgcaaatcataaaacaacaaacatttcaataccgtacaatgcgaattttatgctataaggctaatgcaaacttaaattagttttatgacaaataaacccgtttaattattcttactttcttaatacttaatggaatttgatgaaataaacttcaaaatgatttattctttaatcaaagaataaaaatgtaaaacgatcttaaaagcgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacaattccacgctacctgttctaaatatagcctatatcattgcaatggacgcgtactagctgacactactaaattaggccacaacaacctaactattttgttacagataca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taaacatgcactaatatggtctttaagatactactaccgcgtccggattatcgtagatttagcatcactcgtcctttgcagcggtggctatataaactgggttatcttccctagaactctatactgagtatctggctttacgtcgcctcgtaccgacttacgaacgtactccgacgtcaggaccgtaaagtcgtccatatgacgataatgtgcgttgctgtccttatgacggtactaccaccagctgacttccggtcacgtctagatatgtcgttgacgtagcggacacatacatcgcttacgtctaaaaacggctataatatatatgtaaactcagattaactagttactcaCATTTC-ATGCATCGT--C--TT-------TT-----AATTCTCGTAGTA---GCATATACA--T----CCCTACATATTTCCA-CGTTACACAATATAAATA-TCGAC-GGACAAATTCTGTAAAT--CTTTAC--TTTGCAAAAA-CACAGAATA--CATTTAACACCATTTACTTACAT--AT--GTTA--CACTTC-AAAATGCCGATTTCAAATACTTCATTATAAACATTATATAAACATCTCAACATACGTTCCCAGAT------TCCTCGGCCTATATCCTAAT-AAACAACTCTCAATACTGCGGATATGAAATTAAATTCGCCACACTCTAGTCAGAATGTATATCAATAATTTCTACAAAAAT--TTACTTAGATCTGCTTCTGTC-GAAATATAGCTATCGGACATTCGACTTACTTA-------------A-GAA------------AACAGAATA-TGAA---ATCTAC----TTACACAGAAATGCCG-CATGTAATGGTA-AGT-TTATGTGGAAATC--TCT-GCCACAACGATCTCG-TATGCTTG--TATT-TGCTA-ACTGACC-C-TGATT---TAAGCTTATACTCCT--TTATTAATA-CAAGA-AATCCACACACCACA-G---GTTT---------TTAT----TAAGA------AACTT------------CGATG-CCATACGACTATAA-A-TGTACG--AAAAG-G-CTAAAAGTAAAATATGATTAGCTTTACAATATACAATAATAAACC--TTTACTT-TTCTTAAAAC--ACTCATTACTCAACGGATCTTTATGAATCAAACGTCAA----CATGACTTTTTCTTTA-AACCAAAAATGAATA-TGT-AAAA-CTATCTTTAAA--ATGTGTT--ATCCTTGTCTAT-----CTTGCGATAAG-TTTAACAA---ACCTACTCTACTTGA-CT-GATAT--------ACGTCTATA-------CAAT-GTACATA-CGTTGTTATTAGCTGACACTA--AAATTC-AGGCCACTTAAAC-AC---ATTTATTTTGTTAC-gataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tACTGTAGCAAAATGACCAATGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATACAAGCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAAT-AAATAACGAATATACAACTATACAACATATACAATTTAAAG-ATAATTACTCAACAAAAAAAACAACAGAGCTGGTTTAAAAGA--CCTTTGAAGGTATTA-----ACACT----TTT---TTACACAG-TTCTATTT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TATATCAT----GAATATT-A-A-A---------Agttag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGAAATAAACGTCAAAATGAATGACTTATTATTTATACTAAA-AATGAATA-T---------TAC----AAA--A--CGTTAAATCCCTATCTAC-----CTAGCAAAACG-TTTGACAAAACTGTGATG-TATTTGCACTACATACCCTTGCGAA-GTCTATAACATTT-GAAT-A---ACATTG----TACTTGCTGACctatttttaacaagatggccctatat
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGTACTTACCCAGAATGCCGCATGCAATGGTCAGTTTATGTGGAAATCTATGCCACAACGATCTCGCAATGTTGGTATTAGC
Unaligned ( gi|13 ): ATGCAAACTGCTCTGCAACGTTAATGCATGATTTAAATATAAATATCATACTTATTAAAACACTACGTCCGC
Unaligned ( gi|17 ): CAAACTGCTCTGTAACGTTAATGAATGATTTAAATAA
Unaligned ( gi|18 ): CTCTGCAACGTTAATGAATGATTTACATAAGCTT






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Reference ( family-1565 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTGTAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATACAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATATATACAANTTAAAG-ATAATTACTCAACGAAAAAAACAACACAGCTGGTTTAAAAAAGTCCTNTGANGGNATTA-----ACACT----TTC---TTANNCAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TACATCGT--ACGAATGTT-ATA-A---------AAATGCACTATATAT-TGTATTTAAGATACTACTACCGCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCANTCGTCCCTTGCGGCGGTGGCTATATNAACCGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTATC---GACCGTACTCCGACGTCAGGANCGTCAAGTCGTCCATATGACGATTATGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACAT-CGTCGCTT--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATANACTCAGATTNACTAGTTACTCA-AATATGTAATGACATGACGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTTCATGG--TANTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGTAGTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGNTTTATCAATATATGATAACAG------TNCAT----TCAAT----TCTTACCATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATATGAT--C--TT----CCGTC-----AAT-CTCGAAGTA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTCT-CATT-TATAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGCGAATATCA-AGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACATGGCGANTTTCAATACTTCATCGTAAACACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACGNCTCTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTNTCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTTAGATCTGATTATGTC-GAAATATATCTATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGAACAGTAACATGC-TCAATCCTTCTCGTCACGACCAACTCC-AAAGA-TG--T-TT-TGCTATACTGGACGGTGTTTCCATAA---TACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACATACCTTA-GTGAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACAA--------ACNT-TC--------TACGATA-TCGTACGA-TGCGA-ATTTTACGCTATNAG-G-CC-AANGTAAACTTAAATTAGTTTTACGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATACTTAACGGAATTTNATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAATA-TGT-AAAA-ATATCTTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTANCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGNTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTNCAAT-G---ACA-CG----TACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAACTTATTTTGTTAC-AACAT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcgg-ATAT--ATA-CAACACCA-CCTCATACCACAAGTGTATCTCACGACAAA-CATGGAATTA-----------ATTTGTCA-------TACGATA-TCGAACGC-TGCAACAATGTACG--AAAAGTG-CTTAAGGTAAAATACGATTAGCTTAACAATA------A-TAAACCCATTTACTT-TTTT---AAAAG-CTCATTACTCAACGGATTTTTATAAAATAAACGTCGA----AATGATTTAATCTTTA-AACCAAAAACGAATT-TGT-AAAA-ATATTTTAAAAATA--CTTT--ATCCCTATCTAT-----ATAGAGATAAG-TTTAACAA----CGTATGCTACTTGACCGATATAT----------GTCTGTACAATGTCAAT-------A-TGTTGTTATTAGCTGACTCTG--AGATTTCAGGCCAC---ATTAACA-AATTCATTTTGTTACAAACATggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-------GTCGCGATACAAACTGCTCTGCAACGTTAATGAATGtgtaatcgattttaactatctacacttatacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctctattatatatcaatg----TATTATCTGACACTGATA--TTC-AGGCCACTTAAACA--C--ACCTATTTTGTTAC-atttagataaggtttatacttaataaaacgtccgcgtct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatacttgtC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TATATC----ATGAATATT-A-A-A---------Agttagca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCAAAATGACAAAGGACCGACAATTCACGAAGGTAGAATACAAGTAAACTC-AAATAAAActatttttaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTGCAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACAAGGGTAGAATACAATCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAAGTACAAAATATATACAAATTAAAG-ATAATAACTCAACACAAAAAA-AAC-CAGCTGGTTAAAAAAAGTCATTTGGTGGTATTA-----ACACTCTTATTT---TCACACAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGT-ACGTAACCTAC-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TTTATCAT--TCGAATGTTTATA-A---------AAATGCACTATATAT-T----TT------------CCGCGTCCGGAT--ATCGTAGATTTAGCATCACTCGTCCCTTGTGGCGGTGGCTATA-GAACTGGGTT-ATCTCCCCCTAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGAACCGACCATC---GACCGGATTCCGACGTCAGGAACGTCAAGTTGTCCATATGACGAATATGTGGGTTGC-AGTCCT-ACGACTGTACTTCCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACATAGCG--GACACATTCCACGCTA--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATATACTCAGATTTACTAGTT---TA-AATATGTAATGACATGGCGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTACATGG--TATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTAACCATCTAATA-GTTTTATGGTAGATTTA-TCATTATATTATAACAG------TTC-AT---TCAAT----TTTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAT------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTACATGGCAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATACGAC--C--TT----CC-TC-----AAT-CTCAAAGT----GCAATTATA--T----CTCTACATAACTTCT-CATT-TATAATATGAACAATT-AC-AGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGTGAATATC--CGAATAAGCATC-AACAATATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATATTAACATGGTGAATCTGAATATTTCATCGTAAACACAATATCAACAGCTCAAAATACTTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAAAGCTTCTCAATACCGTGGATGTG-GATTAAATTACATACATTACCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTTAGATCTGATTATGTCAAAAATATATATATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAT------------AACATAATA-CAAA---TTTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGGACAGTAACATAT-TCAATCTTTCTCGTCGCAACTAAACCC-AAAGA-TGA-T-TC-TGCTA-ACTTGACATTGTTTCCATAA---CAGAGTCAGC-ATTA--ATAGCAAAACCGTCCACATACCTTA-GTGAATTTCGTG-TAAATCATAAA--AACAA--------ACC---C--------TAAAACA-TCGTACGA-AGTGT-ATTTTACGCTATGAG-G-CC-AATGTAAACCTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATAATTAATGGAATTTGATAAACTAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAAAA-TGT-AAAA-ATAACTTGAAA--A--CGTT--GCTCCTATCGAG-----CTATCAATACGTTTTAACAA---TCCCACACTACCTGACCTAAATAT--------A-GCCTATATCACTACACTCG---ACA-CG----TAATAGCTGACAACACTAAATT--AGGCCAC---CAAAACCTAAC-AATTTTATTAC-AACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCATAATGACCAAGG-CCGACAACTCACGAGGATAGAATTCAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATTGACAATTTTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATTTATACAATTTAAAG-CTAATTGCTCAACAAAA-------CACAACTTGTTTAAAAAGGTCCTATGATGGAATTA-----ACACT----TTC---TTAATCA--TTC-ATCT---------------GTA------CGTTCCGTA-----T-------AT----ATCCAAACTGCT-AACATCAC--ACGATTGCT-ATA-ACTGTTTTTAAAATACACT-TATAT-TATATTTAAGATACTACTACCGCGCCCGGAT-TATCGTAGATATAGCATCAATCGTTCCTCGTGGTGATGGCTAT-TTAAACAGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTGT-----ACTGTG-TTA-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCAACTATCTTCGACTGTACTATGACGCCAGGATCTTCAAGTCGTCCATATAATGATTAAGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGTTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACATGCGTCGCAT--ACGTTTTAAAAC---------ATATATAT--------ATTG--TAGCCGTTTT-AAGACGT-ATG---CGACGCAT-----ATT------TATATATAA-A-CTCA-GATTTACTTGTTACTCAATACGTA--ATGACATGG-CG-----T-CTGTTA---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGCATTTTTA-TCAAAATATGATAACAG------TGC-AT---ATAAT----TATTACCTTCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTCATCAACATCTCATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTACTCAATACGTAATGACAT------GGC-GT---CTGTT----ACTTACCATCTA--TCAATTTCATGGCATTTTTATCAAAATATGATAACAG------TGCAT----ATAAT----TATTACCTTCT-AACA-GTTTCATGGTAG-ATT---------C-ATCAACATCTC-ATATATGAT--C--T-----CCGTC-----AAC-CCCAAAGTA---GCAATTGTA--T----CTCTATCTAATTTCT-CATT-TAAAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTTTATCT--ATTGAC--TTGGTAAATATCA--GAATAAGCATC-CACCAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACGTGATGAGTTTCAATACTTCATCGTAAACACGTTATCAACAGCTCAAAATACGTTCTTAGAT------TCCACGGCCTATATTCTAACAAAACAATTTTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTCTCATCAGAATGAATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTCAGATCTGATTATGTT-AAAATATATCTAGCAGACGT-----TTA---AATATCTCAACCATA-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCGC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTAATGGAACAGTTACATGC-TCAATTCTTCTCGTCATGA-CAATTCCGAAAGA-TG--T-TTCTGCTAGACTGGACGGTGTTTCCATAA---TACAGTCAGACATAT--ATAGTAAAACACTCCACGTACTTTA-GTGAATTTCGTG-CAAATTATAAAACAACAATTATCAATATAT-CG--------TAAGATA-TGGTACGA-TGCAG-CTTTTACGATATTTG-GCCC-AATGTAAATTTAAAAGAGTTTTATAAAT------AATAAACCCGTTTGATTATTCT---AACTTTCTGAATACTTAATGGAATTTCATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAAT--ATG-TTT-AAAG-ATA--TTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACGA---ACCCATGCTATCTGCTCCCAATAT--------A-GCCAATACCATTTTACTAG---ACA-CG----TACTACTTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCT-ATTTTTTTTGTTAC-tatgatctccgtcaaccccaaagtagcaattgtatctctatctaatttctcatttaaaatataaacaatcacggaccaattctttatctattgacttggtaaatatcagaataagcatccaccaaatttaattacacatatcaatcaattctaacgtgatgagtttcaatacttcatcgtaaacacgttatcaacagctcaaaatacgttcttagattccacggcctatattctaacaaaacaattttcaataccgcggatgtgaaattaaattacagacattctcatcagaatgaatatgaacaatttatacaactttactcagatctgattatgttaaaatatatctagcagacgtttaaatatctcaaccatatacaacataatataaaattcgcatacccatatgccgttatgtaatggaacagttacatgctcaattcttctcgtcatgacaattccgaaagatgtttctgctagactggacggtgtttccataatacagtcagacatatatagtaaaacactccacgtactttagtgaatttcgtgcaaattataaaacaacaattatcaatatatcgtaagatatggtacgatgcagcttttacgatatttggcccaatgtaaatttaaaagagttttataaataataaacccgtttgattattctaactttctgaatacttaatggaatttcatgaaataaacttcaaaatgatttattctttaatcaaagaatatgtttaaagatattaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacgaacccatgctatctgctcccaatatagccaataccattttactagacacgtactacttgacactactaaattaggccacaacaacctattttttttgttacag
gi|4                          : tgtagcataatgaccaaggccgacaactcacgaggatagaattcaagtatactcaaaataaaatttacaattgacaattttaattttacatgaataaaattacgaatatacaattatacaatttatacaatttaaagctaattgctcaacaaaacacaacttgtttaaaaaggtcctatgatggaattaacactttcttaatcattcatctgtacgttccgtatatatccaaactgctaacatcacacgattgctataactgtttttaaaatacacttatattatatttaagatactactaccgcgcccggattatcgtagatatagcatcaatcgttcctcgtggtgatggctatttaaacaggttatcttccctagaactctgtactgtgttatatggctttacgtcgcctcgtaccaactatcttcgactgtactatgacgccaggatcttcaagtcgtccatataatgattaagtgggttgctgtccttatgacggtactaccaccagttgacttcctgtcacgtctacacgtcgttaacgtagcggacacatgcgtcgcatacgttttaaaacatatatatattgtagccgttttaagacgtatgcgacgcatatttatatataaactcagatttacttgC----TGTA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCAATCCAAACTGCT-TACGTCAT--ATGAATGTT-AAA-ACTGTTTTTAAAATGCACT-TATAT-TGTATTGAAGATACTACTACCTCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCATTCGTCCCTTGCGGAGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCT-TAGAACTCTAT-----ACGGAC-T-T-TCTGGCTTTATGTCGCCTCGTACCGACTGTC---GATCGTACTCCGACGCCAGGATCGTCAATTCGTCCATATAACGATTATGTGGGTTGG-TGTCCTTATGACGTTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGC-TAACGTAGCG--GACACAT--GNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--TAG---TTACTCAA-ATATGAAATGACATGG-CG-----T----CTTAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGGTATTTTTA-TCAATAAATGATAACAG------TGC-AT---TCAAC----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAACATATTATAGCAG------CGCAT----TCAAT----TCTTACCATCTAA-CA-GTTTCATGGTAGATTT---------A----------TCAATATATGATAACAGTT----CATTC-----AAT--TCTTACTATCTGCAGTTTCA--TGGTAGTTTAAACATTTTCT-CATA-TATGAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGTTACTCA-AATATGAAATGACATGGCGTCT-----TAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGG--TATTT-TTA-TCAATAAATG--ATAACAGTG-CA-----T-TCAACT---CTTACCATCTAACA-GTTTCATGGTAGATTTA-TCAACATATTATAGCAG------CGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAG------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACATTTTCTC-ATATATGAA--C--TT----CCGTC-----AGT-CTTAAAATA---GCAATTATA--T----AGCTACATAACTTTT-TATT-TATGATATAAACAATT-AC-AGATCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TCTGTGAATATC--AGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTATAC--AT--ATCAATTAATTCTAACATGGTGAATTTCAATACTTCATCGTAA--ACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTTTTAGAT------ACCTTGGCTAATATTCTAACAAAACGCCTATCAATACCGCGGATGTGATATTAAATTACAGACATTATCGTCGAAATGGATATGAAAAATTTATAC--CACT--TTACTTAGATCTGATTATGTC-AAAATATATCTATCAGGCAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAAAA-TAAA---ATTCAC----ATACTCAT--CTGCCGTTATGTACTGGAACAGTAACATGC-TGAATCCTTCTCGTCAAG-TCAACTAC-AAAGA-TATTT-TT-TGCTATACTGGACAGTTTCCCCATAA---TACAGTCAGA-ATAT--ATAG-----CAGTCCATAT--------CAAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACAA--------ACTT-TCTTATATGGTACTATAGTCGTACGA-TGCGG-ATTTTACGCTTTTAG-G-CCAAAGGTAAACTTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCTGTTTAATTATTTT---AACTTTCTTAATACTTAATGGAATTTGATGAAATCAACTTCAA----AATGATTCACTCTTTA-ATCAAAGAATGAACA-TTTAAAAA-AGATCTTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGTTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTACAATGG---ACA-CG----TACTAGCTGACACTTCTAAATT--AACTCAC---AACAACCTAAC-TATTTTGTTAC-AAacttccgtcagtcttaaaatagcaattatatagctacataactttttatttatgatataaacaattacagatcaattctgtatctattcactctgtgaatatcagaataagcatcaacaaaatttaattatacatatcaattaattctaacatggtgaatttcaatacttcatcgtaaacgatatcaacagctcaaaatacgtttttagataccttggctaatattctaacaaaacgcctatcaataccgcggatgtgatattaaattacagacattatcgtcgaaatggatatgaaaaatttataccactttacttagatctgattatgtcaaaatatatctatcaggcatttaaatacaacataaaataaaattcacatactcatctgccgttatgtactggaacagtaacatgctgaatccttctcgtcaagtcaactacaaagatattttttgctatactggacagtttccccataatacagtcagaatatatagcagtccatatcaaatttcgtgcaaatcataaaacaacaaactttcttatatggtactatagtcgtacgatgcggattttacgcttttaggccaaaggtaaacttaaattagttttatgacaaataaacctgtttaattattttaactttcttaatacttaatggaatttgatgaaatcaacttcaaaatgattcactctttaatcaaagaatgaacatttaaaaaagatcttaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacaatcccacgctacctgttctaaatatagcctatatcattacaatggacacgtactagctgacacttctaaattaactcacaacaacctaactattttgttacaatgtacagc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATATGTA--ATGACA-TGACG-----T-CTATTA---CTTATCATCTATCA-ATTCCATAGTATTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAG------TTCAT----TCATT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATATGAC--C--TT----CTGTA-----AAT-CTCAAAATA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTCT-CATT-TATAATATAAACAATT-AC-AGACCAAATCTTTATCT--ATTCAC---TTGTTAATATCA-A-AATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACACCTATCAATCAATCAATTCTAACATGGTGAATTTCAATACTTCATCGTAAACACGATTTCAATAGCTCAAAATACGTTCTCGGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACACCTCTCAATACCGTGGATGTG---T---ATTACAGACATTATCGTCGGAATGGATATGAAAAATTGATAC--AACT--TTACTTAGATTTGATAACATC-AAA-------------ACAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCAC----ATACCCAT--CTGCCGTTATGTACTGTAACAGTAA-ATGC-TCAATCCTTCTCGTCACG-CCAACTCC-AAAGA-TG--T-TT-TGCTATACTGGACAGTTTCCCCATAA---CACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACATACCTTA-ATGAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACAA--------ACAT-TT----------CAATA-CCGTACAA-TGCGA-ATTTTATGCTATAAG-G-CT-AATGCAAACTTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---TACTTTCTTAATACTTAATGGAATTTGATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATAAAAA-TGT-AAAA-CGATCTTAAAA--G--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACAA---TTCCACGCTACCTGTTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTGCAATGG---ACG-CG----TACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAAC-TATTTTGTTAC-tatgaccttctgtaaatctcaaaatagcaattatatctctacataatttctcatttataatataaacaattacagaccaaatctttatctattcacttgttaatatcaaaataagcatcaacaaaatttaattacacctatcaatcaatcaattctaacatggtgaatttcaatacttcatcgtaaacacgatttcaatagctcaaaatacgttctcggattcctcggcctatattctaacaaaacacctctcaataccgtggatgtgtattacagacattatcgtcggaatggatatgaaaaattgatacaactttacttagatttgataacatcaaaacatttaaatacaacataatataaaattcacatacccatctgccgttatgtactgtaacagtaaatgctcaatccttctcgtcacgccaactccaaagatgttttgctatactggacagtttccccataacacagtcagaatatatagcaaaacagtccacataccttaatgaatttcgtgcaaatcataaaacaacaaacatttcaataccgtacaatgcgaattttatgctataaggctaatgcaaacttaaattagttttatgacaaataaacccgtttaattattcttactttcttaatacttaatggaatttgatgaaataaacttcaaaatgatttattctttaatcaaagaataaaaatgtaaaacgatcttaaaagcgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacaattccacgctacctgttctaaatatagcctatatcattgcaatggacgcgtactagctgacactactaaattaggccacaacaacctaactattttgttacagataca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taaacatgcactaatatggtctttaagatactactaccgcgtccggattatcgtagatttagcatcactcgtcctttgcagcggtggctatataaactgggttatcttccctagaactctatactgagtatctggctttacgtcgcctcgtaccgacttacgaacgtactccgacgtcaggaccgtaaagtcgtccatatgacgataatgtgcgttgctgtccttatgacggtactaccaccagctgacttccggtcacgtctagatatgtcgttgacgtagcggacacatacatcgcttacgtctaaaaacggctataatatatatgtaaactcagattaactagttactcaCATTTC-ATGCATCGT--C--TT-------TT-----AATTCTCGTAGTA---GCATATACA--T----CCCTACATATTTCCA-CGTTACACAATATAAATA-TCGAC-GGACAAATTCTGTAAAT--CTTTAC--TTTGCAAAAA-CACAGAATA--CATTTAACACCATTTACTTACAT--AT--GTTA--CACTTC-AAAATGCCGATTTCAAATACTTCATTATAAACATTATATAAACATCTCAACATACGTTCCCAGAT------TCCTCGGCCTATATCCTAAT-AAACAACTCTCAATACTGCGGATATGAAATTAAATTCGCCACACTCTAGTCAGAATGTATATCAATAATTTCTACAAAAAT--TTACTTAGATCTGCTTCTGTC-GAAATATAGCTATCGGACATTCGACTTACTTA-------------A-GAA------------AACAGAATA-TGAA---ATCTAC----TTACACAGAAATGCCG-CATGTAATGGTA-AGT-TTATGTGGAAATC--TCT-GCCACAACGATCTCG-TATGCTTG--TATT-TGCTA-ACT-GACCCTGATT---TAAGCTTATACTCCT--TTATTAATA-CAAGA-AATCCACACACCACA-G---GTTT---------TTAT----TAAGAA--------ACTT-------------CGATG-CCATACGACTATAA-A-TGTACG--AAAAG-G-CTAAAAGTAAAATATGATTAGCTTTACAATATACAATAATAAACC--TTTACTT-TTCTTAAAAC--ACTCATTACTCAACGGATCTTTATGAATCAAACGTCAA----CATGACTTTTTCTTTA-AACCAAAAATGAATA-TGT-AAAA-CTATCTTTAAA--ATGTGTT--ATCCTTGTCTAT-----CTTGCGATAAG-TTTAACAA---ACCTACTCTACTTGA-CT-GATAT--------ACGTCTATA------CAAT-GTACATA-CGTTGTTATTAGCTGACACTA--AAATTC-AGGCCACTTAAAC-AC---ATTTATTTTGTTAC-gataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tACTGTAGCAAAATGACCAATGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATACAAGCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAAT-AAATAACGAATATACAACTATACAACATATACAATTTAAAG-ATAATTACTCAACAAAAAAAACAACAGAGCTGGTTTAAAAGA--CCTTTGAAGGTATTA-----ACACT----TTT---TTACACAG-TTCTATTT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TATATC----ATGAATATT-A-A-A---------Agttag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATGAAATAAACGTCAAAATGAATGACTTATTATTTATACTAAA-AATGAATA-T---------TAC----AAA--A--CGTTAAATCCCTATCTAC-----CTAGCAAAACG-TTTGACAAAACTGTGATG-TATTTGCACTACATACCCTTGCGAA-GTCTATAACATTTGAAT-A---ACATTG----TACTTGCTGACctatttttaacaagatggccctatat
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGTACTTACCCAGAATGCCGCATGCAATGGTCAGTTTATGTGGAAATCTATGCCACAACGATCTCGCAATGTTGGTATTAGC
Unaligned ( gi|13 ): ATGCAAACTGCTCTGCAACGTTAATGCATGATTTAAATATAAATATCATACTTATTAAAACACTACGTCCGC
Unaligned ( gi|17 ): CAAACTGCTCTGTAACGTTAATGAATGATTTAAATAA
Unaligned ( gi|18 ): CTCTGCAACGTTAATGAATGATTTACATAAGCTT






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Reference ( family-1565 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTGTAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATACAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATATATACAANTTAAAG-ATAATTACTCAACGAAAAAAACAACACAGCTGGTTTAAAAAAGTCCTNTGANGGNATTA-----ACACT----TTC---TTANNCAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TACATCGT--ATGAATGTT-ATA-A---------AAATGCACTATATAT-TGTATTTAAGATACTACTACCGCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCANTCGTCCCTTGCGGCGGTGGCTATATNAACCGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTATC---GACCGTACTCCGACGTCAGGANCGTCAAGTCGTCCATATGACGATTATGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACAT-CGTCGCTT--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATANACTCAGATTNACTAGTTACTCA-AATATGTAATGACATGACGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTTCATGG--TANTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGTAGTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGNTTTATCAATATATGATAACAG------TNCAT----TCAAT----TCTTACCATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATATGAT--C--TT----CCGTC-----AAT-CTCGAAGTA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTCT-CATT-TATAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGCGAATATCA-AGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACATGGCGANTTTCAATACTTCATCGTAAACACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACGNCTCTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTNTCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTTAGATCTGATTATGTC-GAAATATATCTATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGAACAGTAACATGC-TCAATCCTTCTCGTCACGACCAACTCC-AAAGA-TG--T-TT-TGCTATACTGGACAGTGTTTCCATAA---TACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACATACCTTA-GTGAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACAA--------ACNT-TC--------TACGATA-TCGTACGA-TGCGA-ATTTTACGCTATNAG-G-CC-AANGTAAACTTAAATTAGTTTTACGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATACTTAACGGAATTTNATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAATA-TGT-AAAA-ATATCTTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTANCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGNTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTNCAAT-G---ACA-CG----TACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAACTTATTTTGTTAC-AACAT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcgg-ATAT--ATA-CAACACCA-CCTCATACCACAAGTGTATCTCACGACAAA-CATGGAATTA-----------ATTTGTCA-------TACGATA-TCGAACGC-TGCAACAATGTACG--AAAAGTG-CTTAAGGTAAAATACGATTAGCTTAACAATA------A-TAAACCCATTTACTT-TTTT---AAAAG-CTCATTACTCAACGGATTTTTATAAAATAAACGTCGA----AATGATTTAATCTTTA-AACCAAAAACGAATT-TGT-AAAA-ATATTTTAAAAATA--CTTT--ATCCCTATCTAT-----ATAGAGATAAG-TTTAACAA----CGTATGCTACTTGACCGATATAT----------GTCTGTACAATGTCAAT-------A-TGTTGTTATTAGCTGACTCTG--AGATTTCAGGCCAC---ATTAACA-AATTCATTTTGTTACAAACATggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-------GTCGCGATACAAACTGCTCTGCAACGTTAATGAATGtgtaatcgattttaactatctacacttatacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctctattatatatcaatg----TATTATCTGACACTGATA--TTC-AGGCCACTTAAACA--C--ACCTATTTTGTTAC-atttagataaggtttatacttaataaaacgtccgcgtct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatacttgtC----TACA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TATATC----ATGAATATT-A-A-A---------Agttagca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCAAAATGACAAAGGACCGACAATTCACGAAGGTAGAATACAAGTAAACTC-AAATAAAActatttttaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTGCAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACAAGGGTAGAATACAATCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAAGTACAAAATATATACAAATTAAAG-ATAATAACTCAACACAAAAAA-AAC-CAGCTGGTTAAAAAAAGTCATTTGGTGGTATTA-----ACACTCTTATTT---TCACACAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGT-ACGTAACCTAC-------ATCGCGATCCAAACTGCT-TTTATCAT--TCGAATGTTTATA-A---------AAATGCACTATATAT-T----TT------------CCGCGTCCGGAT--ATCGTAGATTTAGCATCACTCGTCCCTTGTGGCGGTGGCTATA-GAACTGGGTT-ATCTCCCCCTAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGAACCGACCATC---GACCGGATTCCGACGTCAGGAACGTCAAGTTGTCCATATGACGAATATGTGGGTTGC-AGTCCT-ACGACTGTACTTCCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACATAGCG--GACACATTCCACGCTA--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATATACTCAGATTTACTAGTT---TA-AATATGTAATGACATGGCGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTACATGG--TATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTAACCATCTAATA-GTTTTATGGTAGATTTA-TCATTATATTATAACAG------TTC-AT---TCAAT----TTTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAT------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTACATGGCAG-TTT---------A-AACAACATCTC-ATATACGAC--C--TT----CC-TC-----AAT-CTCAAAGT----GCAATTATA--T----CTCTACATAACTTCT-CATT-TATAATATGAACAATT-AC-AGACCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TTTGTGAATATC--CGAATAAGCATC-AACAATATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATATTAACATGGTGAATCTGAATATTTCATCGTAAACACAATATCAACAGCTCAAAATACTTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAAAGCTTCTCAATACCGTGGATGTG-GATTAAATTACATACATTACCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTTAGATCTGATTATGTCAAAAATATATATATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAT------------AACATAATA-CAAA---TTTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGGACAGTAACATAT-TCAATCTTTCTCGTCGCAACTAAACCC-AAAGA-TGA-T-TC-TGCTA-ACTTGACATTGTTTCCATAA---CAGAGTCAGC-ATTA--ATAGCAAAACCGTCCACATACCTTA-GTGAATTTCGTG-TAAATCATAAA--AACAA--------ACC---C--------TAAAACA-TCGTACGA-AGTGT-ATTTTACGCTATGAG-G-CC-AATGTAAACCTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATAATTAATGGAATTTGATAAACTAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAAAA-TGT-AAAA-ATAACTTGAAA--A--CGTT--GCTCCTATCGAG-----CTATCAATACGTTTTAACAA---TCCCACACTACCTGACCTAAATAT--------A-GCCTATATCACTACACTCG---ACA-CG----TAATAGCTGACAACACTAAATT--AGGCCAC---CAAAACCTAAC-AATTTTATTAC-AACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCATAATGACCAAGG-CCGACAACTCACGAGGATAGAATTCAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATTGACAATTTTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATTTATACAATTTAAAG-CTAATTGCTCAACAAAA-------CACAACTTGTTTAAAAAGGTCCTATGATGGAATTA-----ACACT----TTC---TTAATCA--TTC-ATCT---------------GTA------CGTTCCGTA-----T-------AT----ATCCAAACTGCT-AACATCAC--ACGATTGCT-ATA-ACTGTTTTTAAAATACACT-TATAT-TATATTTAAGATACTACTACCGCGCCCGGAT-TATCGTAGATATAGCATCAATCGTTCCTCGTGGTGATGGCTAT-TTAAACAGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTGT-----ACTGTG-TTA-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCAACTATCTTCGACTGTACTATGACGCCAGGATCTTCAAGTCGTCCATATAATGATTAAGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGTTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACATGCGTCGCAT--ACGTTTTAAAAC---------ATATATAT--------ATTG--TAGCCGTTTT-AAGACGT-ATG---CGACGCAT-----ATT------TATATATAA-A-CTCA-GATTTACTTGTTACTCAATACGTA--ATGACATGG-CG-----T-CTGTTA---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGCATTTTTA-TCAAAATATGATAACAG------TGC-AT---ATAAT----TATTACCTTCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTCATCAACATCTCATA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTACTCAATACGTAATGACAT------GGC-GT---CTGTT----ACTTACCATCTA--TCAATTTCATGGCATTTTTATCAAAATATGATAACAG------TGCAT----ATAAT----TATTACCTTCT-AACA-GTTTCATGGTAG-ATT---------C-ATCAACATCTC-ATATATGAT--C--T-----CCGTC-----AAC-CCCAAAGTA---GCAATTGTA--T----CTCTATCTAATTTCT-CATT-TAAAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTTTATCT--ATTGAC--TTGGTAAATATCA--GAATAAGCATC-CACCAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACGTGATGAGTTTCAATACTTCATCGTAAACACGTTATCAACAGCTCAAAATACGTTCTTAGAT------TCCACGGCCTATATTCTAACAAAACAATTTTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTCTCATCAGAATGAATATGAACAATTTATAC--AACT--TTACTCAGATCTGATTATGTT-AAAATATATCTAGCAGACGT-----TTA---AATATCTCAACCATA-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCGC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTAATGGAACAGTTACATGC-TCAATTCTTCTCGTCATGA-CAATTCCGAAAGA-TG--T-TTCTGCTAGACTGGACGGTGTTTCCATAA---TACAGTCAGACATAT--ATAGTAAAACACTCCACGTACTTTA-GTGAATTTCGTG-CAAATTATAAAACAACAATTATCAATATAT-CG--------TAAGATA-TGGTACGA-TGCAG-CTTTTACGATATTTG-GCCC-AATGTAAATTTAAAAGAGTTTTATAAAT------AATAAACCCGTTTGATTATTCT---AACTTTCTGAATACTTAATGGAATTTCATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAAT--ATG-TTT-AAAG-ATA--TTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACGA---ACCCATGCTATCTGCTCCCAATAT--------A-GCCAATACCATTTTACTAG---ACA-CG----TACTACTTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCT-ATTTTTTTTGTTAC-tatgatctccgtcaaccccaaagtagcaattgtatctctatctaatttctcatttaaaatataaacaatcacggaccaattctttatctattgacttggtaaatatcagaataagcatccaccaaatttaattacacatatcaatcaattctaacgtgatgagtttcaatacttcatcgtaaacacgttatcaacagctcaaaatacgttcttagattccacggcctatattctaacaaaacaattttcaataccgcggatgtgaaattaaattacagacattctcatcagaatgaatatgaacaatttatacaactttactcagatctgattatgttaaaatatatctagcagacgtttaaatatctcaaccatatacaacataatataaaattcgcatacccatatgccgttatgtaatggaacagttacatgctcaattcttctcgtcatgacaattccgaaagatgtttctgctagactggacggtgtttccataatacagtcagacatatatagtaaaacactccacgtactttagtgaatttcgtgcaaattataaaacaacaattatcaatatatcgtaagatatggtacgatgcagcttttacgatatttggcccaatgtaaatttaaaagagttttataaataataaacccgtttgattattctaactttctgaatacttaatggaatttcatgaaataaacttcaaaatgatttattctttaatcaaagaatatgtttaaagatattaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacgaacccatgctatctgctcccaatatagccaataccattttactagacacgtactacttgacactactaaattaggccacaacaacctattttttttgttacag
gi|4                          : tgtagcataatgaccaaggccgacaactcacgaggatagaattcaagtatactcaaaataaaatttacaattgacaattttaattttacatgaataaaattacgaatatacaattatacaatttatacaatttaaagctaattgctcaacaaaacacaacttgtttaaaaaggtcctatgatggaattaacactttcttaatcattcatctgtacgttccgtatatatccaaactgctaacatcacacgattgctataactgtttttaaaatacacttatattatatttaagatactactaccgcgcccggattatcgtagatatagcatcaatcgttcctcgtggtgatggctatttaaacaggttatcttccctagaactctgtactgtgttatatggctttacgtcgcctcgtaccaactatcttcgactgtactatgacgccaggatcttcaagtcgtccatataatgattaagtgggttgctgtccttatgacggtactaccaccagttgacttcctgtcacgtctacacgtcgttaacgtagcggacacatgcgtcgcatacgttttaaaacatatatatattgtagccgttttaagacgtatgcgacgcatatttatatataaactcagatttacttgC----TGTA------CGTTCCGTAATCTAT-------ATCGCAATCCAAACTGCT-TACGTCAT--ATGAATGTT-AAA-ACTGTTTTTAAAATGCACT-TATAT-TGTATTGAAGATACTACTACCTCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCATTCGTCCCTTGCGGAGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCT-TAGAACTCTAT-----ACGGAC-T-T-TCTGGCTTTATGTCGCCTCGTACCGACTGTC---GATCGTACTCCGACGCCAGGATCGTCAATTCGTCCATATAACGATTATGTGGGTTGG-TGTCCTTATGACGTTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGC-TAACGTAGCG--GACACAT--GNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--TAG---TTACTCAA-ATATGAAATGACATGG-CG-----T----CTTAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGGTATTTTTA-TCAATAAATGATAACAG------TGC-AT---TCAAC----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAACATATTATAGCAG------CGCAT----TCAAT----TCTTACCATCTAA-CA-GTTTCATGGTAGATTT---------A----------TCAATATATGATAACAGTT----CATTC-----AAT--TCTTACTATCTGCAGTTTCA--TGGTAGTTTAAACATTTTCT-CATA-TATGAg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGTTACTCA-AATATGAAATGACATGGCGTCT-----TAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGG--TATTT-TTA-TCAATAAATG--ATAACAGTG-CA-----T-TCAACT---CTTACCATCTAACA-GTTTCATGGTAGATTTA-TCAACATATTATAGCAG------CGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAG------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-G-CA-GTTTCATGGTAG-TTT---------A-AACATTTTCTC-ATATATGAA--C--TT----CCGTC-----AGT-CTTAAAATA---GCAATTATA--T----AGCTACATAACTTTT-TATT-TATGATATAAACAATT-AC-AGATCAATTCTGTATCT--ATTCAC--TCTGTGAATATC--AGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTATAC--AT--ATCAATTAATTCTAACATGGTGAATTTCAATACTTCATCGTAA--ACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTTTTAGAT------ACCTTGGCTAATATTCTAACAAAACGCCTATCAATACCGCGGATGTGATATTAAATTACAGACATTATCGTCGAAATGGATATGAAAAATTTATAC--CACT--TTACTTAGATCTGATTATGTC-AAAATATATCTATCAGGCAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAAAA-TAAA---ATTCAC----ATACTCAT--CTGCCGTTATGTACTGGAACAGTAACATGC-TGAATCCTTCTCGTCAAG-TCAACTAC-AAAGA-TATTT-TT-TGCTATACTGGACAGTTTCCCCATAA---TACAGTCAGA-ATAT--ATAG-----CAGTCCATAT--------CAAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACAA--------ACTT-TCTTATATGGTACTATAGTCGTACGA-TGCGG-ATTTTACGCTTTTAG-G-CCAAAGGTAAACTTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCTGTTTAATTATTTT---AACTTTCTTAATACTTAATGGAATTTGATGAAATCAACTTCAA----AATGATTCACTCTTTA-ATCAAAGAATGAACA-TTTAAAAA-AGATCTTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTATCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGTTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTACAATGG---ACA-CG----TACTAGCTGACACTTCTAAATT--AACTCAC---AACAACCTAAC-TATTTTGTTAC-AAacttccgtcagtcttaaaatagcaattatatagctacataactttttatttatgatataaacaattacagatcaattctgtatctattcactctgtgaatatcagaataagcatcaacaaaatttaattatacatatcaattaattctaacatggtgaatttcaatacttcatcgtaaacgatatcaacagctcaaaatacgtttttagataccttggctaatattctaacaaaacgcctatcaataccgcggatgtgatattaaattacagacattatcgtcgaaatggatatgaaaaatttataccactttacttagatctgattatgtcaaaatatatctatcaggcatttaaatacaacataaaataaaattcacatactcatctgccgttatgtactggaacagtaacatgctgaatccttctcgtcaagtcaactacaaagatattttttgctatactggacagtttccccataatacagtcagaatatatagcagtccatatcaaatttcgtgcaaatcataaaacaacaaactttcttatatggtactatagtcgtacgatgcggattttacgcttttaggccaaaggtaaacttaaattagttttatgacaaataaacctgtttaattattttaactttcttaatacttaatggaatttgatgaaatcaacttcaaaatgattcactctttaatcaaagaatgaacatttaaaaaagatcttaaaaacgttactcctatcgagctatcgatacgttttaacaatcccacgctacctgttctaaatatagcctatatcattacaatggacacgtactagctgacacttctaaattaactcacaacaacctaactattttgttacaatgtacagc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                            ctgtacgttccgtaatctatatcgcaatccaaactgcttacgtcatatgaatgttaaaactgtttttaaaatgcacttatattgtattgaagatactactacctcgtccggattatcgtagatttagcatcattcgtcccttgcggaggtggctatataaactgggttatcttccttagaactctatacggactttctggctttatgtcgcctcgtaccgactgtcgatcgtactccgacgccaggatcgtcaattcgtccatataacgattatgtgggttggtgtccttatgacgttactaccaccagctgacttcctgtcacgtctacacgtcgctaacgtagcggacacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTA-A---------ACATGCACTA-ATAT-GGTCTTTAAGATACTACTACCGCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCACTCGTCCTTTGCAGCGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TCTGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTTAC---GAACGTACTCCGACGTCAGGACCGTAAAGTCGTCCATATGACGATAATGTGCGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCGGTCACGTCTAGAT-ATG----TCGT-TGACGTAGCG--GACACATACATCGCTT--ACGTCTAAAAACGGCTATAATATATATGTAAACTCAGATTAACTAGTTACTCA-AATATGTAATGACATGACGTCT-----ATTACTTATCATCTATCA-ATTCCATAG--TATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CA-----T-TCAATT---CTTACCATCTAACA-GTTTCATGGTAGATTTA-TCAATATATGATAACAG------TTC-AT---TCATT----TCTTACTATCT---GCAGTTTCATGGTAGTTTAAACAACATCTCATAtgtacagc
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGTACTTACCCAGAATGCCGCATGCAATGGTCAGTTTATGTGGAAATCTATGCCACAACGATCTCGCAATGTTGGTATTAGC
Unaligned ( gi|13 ): ATGCAAACTGCTCTGCAACGTTAATGCATGATTTAAATATAAATATCATACTTATTAAAACACTACGTCCGC
Unaligned ( gi|17 ): CAAACTGCTCTGTAACGTTAATGAATGATTTAAATAA
Unaligned ( gi|18 ): CTCTGCAACGTTAATGAATGATTTACATAAGCTT






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Reference ( family-1565 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACTGTAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACGAGGGTAGAATACAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATATATACAANTTAAAG-ATAATTACTCAACGAAAAAAACAACACAGCTGGTTTAAAAAAGTCCTNTGANGGNATTA-----ACACT----TTC---TTANNCAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGTTCCGTAATCTATATCGCGAT-CCAAACTGCT-TACATCAT--ATG-AATGTT-A-TAACTGTTTTT---AAA-ATG-CACT-TATATTGTATTTAAGATACTACTACCGCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCANTCGTCCCTTGCGGCGGTGGCTATATNAACCGGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCGACTNTC---GACCGTACTCCGACGTCAGGANCGTCAAGTCGTCCATATGACGATTATGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACAT-CGTCGCTT--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATANACTCAGATTNACTAGTTACTCA-AATATGTAATGACATGACGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTTCATGGT--ANTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGTAGTTTTA-TCAATATATGATAACAG------TGC-AT---TCAAT----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGNTTTATCAATATATGATAACAG------TNCAT----TCAAT----TCTTACCATCTAGCA-GTTTCATGGTAG-TTTA---------AACAACATCTC-ATATATGA--T--C--TT----CCGTC-----AAT-CTCGAAGTA---GCAATTATA--T----CTCTACATAATTTC-TCATT-TATAATATAAACAATC-AC-GGACCAATTCTGTATC--TATTCA--CTTTGCGAATAT--CAGAATAAGCATC-AACAAAATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATTCTAACATGGCGANTTTCAATACTTCATCGTAAACACGATATCAACAGCTCAAAATACGTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAACGNCTCTCAATACCGCGGATGTGAAATTAAATTACAGACATTNTCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AA--CTTTACTTAGATCTGATTATGTC-GAAATATATCTATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAC------------AACATAATA-TAAA---ATTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGAACAGTAACATGC-TCAATCCTTCTCGTCACGNC--AA-CTCC-AAAGA-TG--T-TT-TGCTATACTGGACAGTGTTTCCATAA---TACAGTCAGA-ATAT--ATAGCAAAACAGTCCACATACCTTA-GTGAATTTCGTG-CAAATCATAAAACAACAA----------ACTC----------TACGATA-TCGTACGA-TGCGG-ATTTTACGCTATNAG-G-CC-AANGTAAACTTAAATTAGTTTTACGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATACTTAACGGAATTTNATGAAATAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAATA-TGT-AAAA-ATATCTTAAAA--A--CGTT--ACTCCTATCGAG-----CTANCGATACGTTTTAACAA---TCCCACGCTACCTGNTCTAAATAT--------A-GCCTATATCATTNCAATGGAC--A-CG----TACTAGCTGACACTACTAAATT--AGGCCAC---AACAACCTAACTTATTTTGTTAC-AACAT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACTCATAATATATCATAACGGTACATTTTTTTCATTTCTTACAGTCTATCACATTTCATGGT--AGTC-TGA-TCAGTATATA--ATAAGAGTA-CAATC--TATCATTT---CTTACCATCTATCACATTTCATGGTAGTTTTA-TCAGTTTATAATAACAGGTACTATAC-AT---TCTATCATTTCTTACCATCTATCACA-TTTCATGGTAGCTTTATCAGTTTATAATAACAGGTACTGTACAT----TCAATCATTTCTTACCATCTATCACATTCCATGGTAGTTTTATAAGTATATAACAACAGTGC-AT---TAATTT--C--TTAGCATCGTCTATTAAAT-CTCGACTTA---GCA--TATAGCT----CTCTACAT-ATTTCAACATTATACAATATAAAT-ATC-GCTGGACAAATTCCGTATCTGTATTTATGTTTCGCAAA-ATCACAGAATAAAC-TT-GACACAA--TAGTTATAC---------------TTC-AAAACGACGATTTTCAATACGTTATTATAAACACAATATAAGCATCTCAAAACACGTTCCAAGATGATTCCTCCTCGGCCTATATT-TAAATAAACAACTTAAAATACTGTGGATATG-AAT----TCAC-CACATTTTAGTCTGTATTTTTATCTACAATTTATAC--AAATATTTACTTAGATCTGCCTATGTC-GAAATAAAGTTATCTGACAT-----ATA---A-------------ATTACTAAACTATAGAAAACATTATATTAAAAGTACTCACTCAGATA-CCAC--ATGCAGTtatcagtttataataacaggtactgtacattcaatcatttcttaccatctatcacattccatggtagttttataagtatataacaacagtgcattaatttcttagcatcgtctattaaatctcgacttagcatatagctctctacatatttcaacattatacaatataaatatcgctggacaaattccgtatctgtatttatgtttcgcaaaatcacagaataaacttgacacaatagttatacttcaaaacgacgattttcaatacgttattataaacacaatataagcatctcaaaacacgttccaagatgattcctcctcggcctatatttaaataaacaacttaaaatactgtggatatgaattcaccacattttagtctgtatttttatctacaatttatacaaatatttacttagatctgcctatgtcgaaataaagttatctgacatataaattactaaactatagaaaacattatattaaaagtactcactcagataccacatgcagtggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtaacaaaatgaccaagggccgacaactcactgagatagaatttaactatactcataataaaatttacaagaatatagaattatacaaaatatacaaatcaactcatattttaaatgaaaaatataccggtctaataatgttctaagtggtaactatgctggcactgttcactttaatcagcttttgtctaattggtgtcgcgatacaaactgctactccttagtttatttcagatgtcgcagtgcaaacatctctgcaacgttaataaattatttaaaataatatttatacgtattaaaacactacgtccgcgtccagatgcgaggtacatttccaatcgtcccttatggcgatggatgtatccacagggttcatttcccgtgttctatgtaatactgagctactatggccttacgtcgccttttgccgattccaatctgacgtcaggaatgtcaagtcgtccatatgacgattatactggttgcgcgtcctatgacggtattaccaccggctaactcctgttacgtcgataacgtccttcgtgtgacctaacgttgcacatcgtcaattcaacggctacaaatatatatacacgctcagattcacttattactcaatatgtaatagtattacgtccatcacttaccatctctctatttcattgcgg-ATAT--ATA-CAACACCA-CCTCATACCACAAGTGTATCTCACGACAAA-CATGGAATTA-------------ATTTGTCA------TACGATA-TCGAACGC-TGCAACAATGTACG--AAAAGTG-CTTAAGGTAAAATACGATTAGCTTAACAATA------A-TAAACCCATTTACTT-TTTT---AAAAG-CTCATTACTCAACGGATTTTTATAAAATAAACGTCGA----AATGATTTAATCTTTA-AACCAAAAACGAATT-TGT-AAAA-ATATTTTAAAAATA--CTTT--ATCCCTATCTAT-----ATAGAGATAAG-TTTAACAA----CGTATGCTACTTGACCGATATAT----------GTCTGTACAATGTCAAT------A-TGTTGTTATTAGCTGACTCTG--AGATTTCAGGCCAC---ATTAACA-AATTCATTTTGTTACAAACATggtcattttaaaggttgtactcggtcacaaagtttccgcctgatgggatttgctagctaactgacaagagattcgggtttcattttctatatatacaacaccacctcataccacaagtgtatctcacgacaaacatggaattaatttgtcatacgatatcgaacgctgcaacaatgtacgaaaagtgcttaaggtaaaatacgattagcttaacaataataaacccatttacttttttaaaagctcattactcaacggatttttataaaataaacgtcgaaatgatttaatctttaaaccaaaaacgaatttgtaaaaatattttaaaaatactttatccctatctatatagagataagtttaacaacgtatgctacttgaccgatatatgtctgtacaatgtcaatatgttgttattagctgactctgagatttcaggccacattaacaaattcattttgttacaaacattgatag
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGTCGCGAT-ACAAACTGCTCTGCAACGTTAATG-AATGtgtaatcgattttaactatctacacttatacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctctattatatatcaatg----TATTATCTGACACTGATA--TTC-AGGCCACTTAAACA--C--ACCTATTTTGTTAC-atttagataaggtttatacttaataaaacgtccgcgtct
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatacttgtC----TACA------CGTTCCGTAATCTATATCGCGAT-CCAAACTGCT-TATATC----ATG-AATATT-A-AAACTATTTTT---AAgttagca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCAAAATGACAAAGGACCGACAATTCACGAAGGTAGAATACAAGTAAACTC-AAATAAAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTGCAGCAAAATGACCAAGGGCCGACAACTCACAAGGGTAGAATACAATCATACACAAAGTAAAATTTACAATT-------TTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAAGTACAAAATATATACAAATTAAAG-ATAATAACTCAACACAAAAAA-AAC-CAGCTGGTTAAAAAAAGTCATTTGGTGGTATTA-----ACACTCTTATTT---TCACACAG-TTCTATCT--------CC----TACA------CGT-ACGTAACCTACATCGCGAT-CCAAACTGCT-TTTATCAT--TCG-AATGTTTA-TAA------------AA-ATG-CACTATATATT----TT------------CCGCGTCCGGAT--ATCGTAGATTTAGCATCACTCGTCCCTTGTGGCGGTGGCTATA-GAACTGGGTT-ATCTCCCCCTAGAACTCTAT-----ACTGAG-T-A-TATGGCTTTACGTCGCCTCGAACCGACCATC---GACCGGATTCCGACGTCAGGAACGTCAAGTTGTCCATATGACGAATATGTGGGTTGC-AGTCCT-ACGACTGTACTTCCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AT-ACG----TCGT-TAACATAGCG--GACACATTCCACGCTA--ACGTCTAAAAAC--------TATATATATATACTCAGATTTACTAGTT---TA-AATATGTAATGACATGGCGTCT-----ATTACTTACCATCTATCA-ATTACATGGT--ATTT-TTA-TCAATATATG--ATAACAGTG-CG-----T-TCATTT---CTAACCATCTAATA-GTTTTATGGTAGATTTA-TCATTATATTATAACAG------TTC-AT---TCAAT----TTTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAATATATGATAACAT------TTCAT----TCAAT----TCTTACTATCT-GCA-GTTACATGGCAG-TTTA---------AACAACATCTC-ATATACGA--C--C--TT----CC-TC-----AAT-CTCAAAGT----GCAATTATA--T----CTCTACATAACTTC-TCATT-TATAATATGAACAATT-AC-AGACCAATTCTGTATC--TATTCA--CTTTGTGAATAT--CCGAATAAGCATC-AACAATATTTAATTACAC--AT--ATCAATCAATATTAACATGGTGAATCTGAATATTTCATCGTAAACACAATATCAACAGCTCAAAATACTTTCTCAGAT------TCCTCGGCCTATATTCTAACAAAAAGCTTCTCAATACCGTGGATGTGGA-TTAAATTACATACATTACCGTCGGAATGGATATGAACAATTTATAC--AA--CTTTACTTAGATCTGATTATGTCAAAAATATATATATCAGACAT-----TTA---A-------------A-TAT------------AACATAATA-CAAA---TTTCAC----ATACCCAT--ATGCCGTTATGTACTGGGACAGTAACATAT-TCAATCTTTCTCGTCGCAACTAAA-C-CC-AAAGA-TGA-T-TC-TGCTA-ACTTGACATTGTTTCCATAA---CAGAGTCAGC-ATTA--ATAGCAAAACCGTCCACATACCTTA-GTGAATTTCGTG-TAAATCATAAA--AACAA----------ACCC----------TAAAACA-TCGTACGA-AGTGT-ATTTTACGCTATGAG-G-CC-AATGTAAACCTAAATTAGTTTTATGACA------AATAAACCCGTTTAATTATTCT---AACTTTCTTAATAATTAATGGAATTTGATAAACTAAACTTCAA----AATGATTTATTCTTTA-ATCAAAGAATGAAAA-TGT-AAAA-ATAACTTGAAA--A--CGTT--GCTCCTATCGAG-----CTATCAATACGTTTTAACAA---TCCCACACTACCTGACCTAAATAT--------A-GCCTATATCACTACACTCGAC--A-CG----TAATAGCTGACAACACTAAATT--AGGCCAC---CAAAACCTAAC-AATTTTATTAC-AACAT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTAGCATAATGACCAAGG-CCGACAACTCACGAGGATAGAATTCAAGTATACTCAAAATAAAATTTACAATTGACAATTTTAATTTTACATGAATAAAATTACGAATATACAATTATACAATTTATACAATTTAAAG-CTAATTGCTCAACAAAA-------CACAACTTGTTTAAAAAGGTCCTATGATGGAATTA-----ACACT----TTC---TTAATCA--TTC-ATCT---------------GTA------CGTTCCGTA-----TAT----AT-CCAAACTGCT-AACATCAC--ACG-ATTGCT-A-TAACTGTTTTT---AAA-ATA-CACT-TATATTATATTTAAGATACTACTACCGCGCCCGGAT-TATCGTAGATATAGCATCAATCGTTCCTCGTGGTGATGGCTAT-TTAAACAGGTT-ATCTTCCC-TAGAACTCTGT-----ACTGTG-TTA-TATGGCTTTACGTCGCCTCGTACCAACTATCTTCGACTGTACTATGACGCCAGGATCTTCAAGTCGTCCATATAATGATTAAGTGGGTTGC-TGTCCTTATGACGGTACTACCACCAGTTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGT-TAACGTAGCG--GACACATGCGTCGCAT--ACGTTTTAAAAC---------ATATATATA--------TTG--TAGCCGTTTT-AAGACGTA-TG---CGACGCAT-----ATT------TATATATAA-ACT-CA-GATTTACTTGTTACTCAATACGTA--ATGACATGG-CG-----T-CTGTTA---CTTACCATCTATCA-ATTTCATGGCATTTTTA-TCAAAATATGATAACAG------TGC-AT---ATAAT----TATTACCTTCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTCATCAACATCTCATA
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gi|4                          : tgtagcataatgaccaaggccgacaactcacgaggatagaattcaagtatactcaaaataaaatttacaattgacaattttaattttacatgaataaaattacgaatatacaattatacaatttatacaatttaaagctaattgctcaacaaaacacaacttgtttaaaaaggtcctatgatggaattaacactttcttaatcattcatctgtacgttccgtatatatccaaactgctaacatcacacgattgctataactgtttttaaaatacacttatattatatttaagatactactaccgcgcccggattatcgtagatatagcatcaatcgttcctcgtggtgatggctatttaaacaggttatcttccctagaactctgtactgtgttatatggctttacgtcgcctcgtaccaactatcttcgactgtactatgacgccaggatcttcaagtcgtccatataatgattaagtgggttgctgtccttatgacggtactaccaccagttgacttcctgtcacgtctacacgtcgttaacgtagcggacacatgcgtcgcatacgttttaaaacatatatatattgtagccgttttaagacgtatgcgacgcatatttatatataaactcagatttacttgC----TGTA------CGTTCCGTAATCTATATCGCAAT-CCAAACTGCT-TACGTCAT--ATG-AATGTT-A-AAACTGTTTTT---AAA-ATG-CACT-TATATTGTATTGAAGATACTACTACCTCGTCCGGAT-TATCGTAGATTTAGCATCATTCGTCCCTTGCGGAGGTGGCTATATAAACTGGGTT-ATCTTCCT-TAGAACTCTAT-----ACGGAC-T-T-TCTGGCTTTATGTCGCCTCGTACCGACTGTC---GATCGTACTCCGACGCCAGGATCGTCAATTCGTCCATATAACGATTATGTGGGTTGG-TGTCCTTATGACGTTACTACCACCAGCTGACTTCCTGTCACGTCT--AC-ACG----TCGC-TAACGTAGCG--GACACAT--GNNNNNN--NNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNT--AG---TTACTCAA-ATATGAAATGACATGG-CG-----T----CTTAAACGTACCATCTATCA-ATTTCATGGTATTTTTA-TCAATAAATGATAACAG------TGC-AT---TCAAC----TCTTACCATCTA--ACAGTTTCATGGTAGATTTATCAACATATTATAGCAG------CGCAT----TCAAT----TCTTACCATCTAACA-GTTTCATGGTAGATTTA------------------TCAATATATGA--TAACAGTT----CATTC-----AAT--TCTTACTATCTGCAGTTTCA--TGGTAGTTTAAACATTTTC-TCATA-TATGAg
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taaacatgcactaatatggtctttaagatactactaccgcgtccggattatcgtagatttagcatcactcgtcctttgcagcggtggctatataaactgggttatcttccctagaactctatactgagtatctggctttacgtcgcctcgtaccgacttacgaacgtactccgacgtcaggaccgtaaagtcgtccatatgacgataatgtgcgttgctgtccttatgacggtactaccaccagctgacttccggtcacgtctagatatgtcgttgacgtagcggacacatacatcgcttacgtctaaaaacggctataatatatatgtaaactcagattaactagttactcaCATTTC-ATGCATCG--T--C--TT-------TT-----AATTCTCGTAGTA---GCATATACA--T----CCCTACATATTTCC-ACGTTACACAATATAAATA-TCGAC-GGACAAATTCTGTAAA--TCTTTA--CTTTGCAAAAACA-CAGAATA--CATTTAACACCATTTACTTACAT--AT--GTTA--CACTTC-AAAATGCCGATTTCAAATACTTCATTATAAACATTATATAAACATCTCAACATACGTTCCCAGAT------TCCTCGGCCTATATCCTAAT-AAACAACTCTCAATACTGCGGATATGAAATTAAATTCGCCACACTCTAGTCAGAATGTATATCAATAATTTCTACAAAA--ATTTACTTAGATCTGCTTCTGTC-GAAATATAGCTATCGGACATTCGACTTACTTA-------------A-GAA------------AACAGAATA-TGAA---ATCTAC----TTACACAGAAATGCCG-CATGTAATGGTA-AGT-TTATGTGGAAATC--TCT-GCCACAAC--GATCTCG-TATGCTTG--TATT-TGCTA-ACT-GACCCTGATT---TAAGCTTATACTCCT--TTATTAATA-CAAGA-AATCCACACACCACA-G---GTTT---------TTAT----TAAGAA----------ACTT------------CGATG-CCATACGACTATAA-A-TGTACG--AAAAG-G-CTAAAAGTAAAATATGATTAGCTTTACAATATACAATAATAAACC--TTTACTT-TTCTTAAAAC--ACTCATTACTCAACGGATCTTTATGAATCAAACGTCAA----CATGACTTTTTCTTTA-AACCAAAAATGAATA-TGT-AAAA-CTATCTTTAAA--ATGTGTT--ATCCTTGTCTAT-----CTTGCGATAAG-TTTAACAA---ACCTACTCTACTTGA-CT-GATAT--------ACGTCTATA------CAATGTACATA-CGTTGTTATTAGCTGACACTA--AAATTC-AGGCCACTTAAAC-AC---ATTTATTTTGTTAC-gataca
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGAAATAAACGTCAAAATGAATGACTTATTATTTATACTAAA-AATGAATA-T---------TAC----AAA--A--CGTTAAATCCCTATCTAC-----CTAGCAAAACG-TTTGACAAAACTGTGATG-TATTTGCACTACATACCCTTGCGAA-GTCTATAACATTTGAAT-AAC--ATTG----TACTTGCTGAC
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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