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7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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lowQualScore : .... . .. .. .. . . . . . . . . . . . .. . . .......................... .... .. . . . ... . . ....... . . .. ..... ..... ..... . . . . ..... .. . . . .. . . . . . ..... ... ... . .... . .. . .
lowQualScore : 1111 3 66 66 55 0 5 0 5 8 0 5 5 9 4 7 00 7 6 77777777777777777777777777 4444 99 0 7 1 000 0 7 6666666 0 0 33 77777 33333 88888 0 7 7 7 00000 77 0 8 4 99 5 7 0 7 6 44444 000 444 4 6666 3 11 1 0
consensus : GGACTTGTATAGAAGGAT----AGGAAAC-TTGCA--TCTCCTG-ACTAAATGTT--GATAAA-ATAGCACGCGAAGGATTAATNATTTGGCAAATTAATCATTCATANTTCACAGGCAACTGATTTCTTGTACATAAACTGTAAGTTGTATGTAATCTTAGATGTTTAAACACGTTTCAATCACGCAAAA-TGA-TCTTGAATTA-----AAGATAT---TGAA-GTT--AA-AG-AAA--ATTTNTCGTAAT--TTNTCGT-------TNTTTNAGC-TGCAGT-----ATACA---A-ATTTTGTAA-T---CACAAGTACTTC-AACAATTTTAAACACAAATT---T-CTGGGAATGGTATTGTTTTGATGANAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGATTTGTGT--TCCTGAGATGAATGGAAGTTAAGATAATTGAAAACGAGATTTT---GCGAGA---TTTTGCGCGAATACGCGAGCGTTCACAAAATCTCAATCAGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAANTC
Reference ( family-1550 ) : GGACTTGTATAGAAGGAT----AGGAAAC-TTGCA--TCTCCTG-ACTAAATGTT--GATAAA-ATAGCACGCGAAGGATTAATNATTTGGCAAATTAATCATTCATANTTCACAGGCAACTGATTTCTTGTACATAAACTGTAAGTTGTATGTAATCTTAGATGTTTAAACACGTTTCAATCACGCAAAA-TGA-TCTTGAATTN-----AAGATAT---TGNA-GTT--AA-AG-AAA--ATTTNTCGTAAT--TTNTCGT-------TNTTTNAGC-TGCAGT-----ATACA---A-ATTTTGTAA-T---CACAAGTACTTC-AACAATTTTAAACACAAATT---T-CTGGGAATGGTATTGTTTTGATGANAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGATTTGTGT--TCCTGAGATGAATGGAAGTTAAGATAATTGAAAACGAGATTTT---GCGAGA---TTTTGCGCGAATACGCGAGCGTTCACAAAATCTCAATCAGTTGCCTTTCCTTCTCTATATAANTC
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gi|11 : atcaaaaaacctgaaattaaaccatatgaatcatttattgggatatcaacatcaagaaaGGACTTACAGAGAGGGTT----AAGAAAC-TTTAA--TCTCCTG-ATTAAATGTT--GATAAATATA-----------ATTAATTATAAGGTAAACTAGCCATTCATAATTTACAGGCAACTGATTTC--ATA---AAACTGtcgggcccgattagctcagttacgcgtctgactatcaatccaggagtcgtgagtttgaatccccgtctggcaacagtctctgtgatgactgatatacaacatcgtgtctcattatcgttcttctctcaccactgattcaagtgggaaaaatatcagttacttgcggagataaggtgtgctcgagtactggataaccttcaggatcccaggaaacagtggttaggttaactgatcgtctgttagccctcgatggtataaaaatgatgctaaatattcaatcaatcaatccttattatacataataattcattaccagcgaatacaatgttattgcatatcaatatatatatataaacatatgactttgacaagatgttcaaactgtcaactatattttttacaaaagtatgcacagtgttatggattat
gi|13 : ctcggcaaaatagtccgtattacaagaaaattacttttgacaaaaatatggaaaaatcatcaaTCATGTTACAAAG--AGAATATCACTGTGTGTACTCATGGTATGATTGGAAATTTAAGCAACTGAAAAC-AGAATTT---G-AAGAAATTTTTGCTCGAATATGCAAGCTTTCGCAAAATCTCAATCAGTCACTTTTCCTTCaa
gi|14 : cagcctcaGGACTTGTAAAGAAGGATTCTAAGGAAAC-TTGCA--TCTCCTG-ACTAAATGTT--G--AAA-ACAGCACACGGAGG
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gi|23 : GGACTTGTATAGAAGGAT----AGGAAACATTACA--
gi|24 : aaacaaGGACTTGTATAGAAGGAT----AAGAAAC-TTACA--TCTCa
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gi|4 : CTTGTATAGAAGGAT----AGGAAAC-TTGCA--TCTCCTG-ACTAAATGTTCGGATGAA-ACAGCACACGAAGGATTCATAATTTG-CAAATAAATCATTCATATTTCACA----ACTGATTTCTTATACATAAACTGTAAGTTGTATGTTATCTTAGATGTTTAAACATGTTTCAATCACGTAAAA-TGC-TCTTGAAATA-----AAGATAT---TGAA-GTTCGAA-GG-AAA--ATTTATCGTAAT--TTTTTGT-------TTTTTTAGC-TGCAGT-----ATACA---A-ATTTTGTAA-T---CACAAACACTTC-AACAATTTTAAACACAAATT---T-CTGGGAATGGTATTGTTTTGATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTAATTTGTAT--TCCTGAGATGGTTAGAAGTGAAGATAATTAAAAACGAGATTTC---GCGAGA---TTTTGCACGAATATGCGAGCGTTCACACAGTCTCACACAGTTGCCTTTCCTCCTCTATATAAT
gi|5 : CTTGTATAGAAGGAT----AGGAA-----GCA--ACTCCCG-ACTAAATGTT--GATAAA-ACAGCACACGAAGGGTTACTTATTTGGCAAATTGATCATTCAAAATTCACAGGCAACTGATTTCTT-TACATAAAATGTAAGTTGAATGTAATCTGAGATGTTTAAACATGTTTCGGTCATACAAAA-TGA-TC-------------------T---TGAA--TT--AA-AG-A------------TAAT-------GA-------GGTTGAAG------GA-----ATACA---C-ATTTAGTAA-T---CAGAAACACTTA-AACAATTTTAAACACAAATTGATC-CTGGGAATGGTATTGTTTTGATGACAATTTCATTCTGCAATGTAAGAATTTTGATTTATGT--TCCTGGGATGAATGGAAGTGAAGATAATTGAAAACGAGATATT---GCGAGA---TTTTACGTAAA-----------------------AATCAGTTGCGTTTCCTTCTCTATATAAATC
gi|6 : TTCATAACGTCCCAATCAGTTGCTTTTCCTTCTCTATATGAGTCa
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gi|8 : AATGAT----TAGAAAC-ATGCAACTCTCTT---CTTAATGTT--GATAAA-ATAGCAAGCAAAGTATTAATAATTTGGCAAATTTATAATTCAAATTCCACAGGCAACTGATTTCTCTCACATAAAATGTAAAGTGTAAGTAATGTTATATGTTTTATAATGTTTTAAACATGCAAAA-TGA-TCTTGAATTT-----AAAAT-T---TGCATGTT--AA-AATAAA--ATTTCAAGTA----TTTTCGT-------tgtacagatttccttggctaattcaatatcccgccactcttga
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TGTGTGGTTCCGGCTAAGAATAGAACCACTGTCGATCTCTGCAGAGAGTTAGGATAGAATTTGCTAAAACTCTGCAGTTCTGCAGGTATCAGGGTTCTAGGTTCATTCTGCAATATTCATTTGTTGATGTATTTGTTTTAATCTGTATGTTAATTTGTTATTTTTGTAGAGTGAACCTGGAATATCTTCCTGTTACTGTTGAATAATCTATAATGTGTTGG
Unaligned ( gi|10 ): CGTTAAATAATTCCTGTATGGTCCTGGGTATCACAAGAGTGATGGCAAGACTAGGATCACTGGAGCTCATGCATCTCGTAAAAGACGACAAAATAAATATTCCATTTAGAATTTGCTGAGATGGCACATCTGCAAGCATCAATGTTTTAATTCAATTTGCATTCATTTGAAAAAAGCTTCATAATCTGTATGTTAAT
Unaligned ( gi|12 ): ATAACATCACATTCATTTTATCTCGTTTTCGTTTGGTGTCATGATCCTTGGATTTATTGCTTGCATATAAAATGTCAGTTTCAGTGTGTTTTCAGGTTGCTCTATGAGTTATGGTAATTAACAGGATGCATACTGACACATCCAT
Unaligned ( gi|17 ): TTTCTATTGATTGACTGTATGTTGTATTGAGATTAAAACATTAACCCCCCACACTTGTTTCTAAGGTGCTACAGGAGTGATGGCAAGAATAAAA
Unaligned ( gi|19 ): CCGTGTGGTTCCGGCTAAGAATAGAATCACTGCCGATCTCTGCAGAGGGGTG
Unaligned ( gi|20 ): TTGAACTTCATTAATATGGTTAAATTACCAACATCTCTGTGGTTCAAGGG
Unaligned ( gi|21 ): CCGTGTGGTTCCGGCTAGGAATAGAATCACTGTTGATCTCTGCAGAG