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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                    AAATTCATGTCTATATTAATTGTATAA--GA--ATGTAATTATGCCGTACATTTGGCAAATTT---CATCTCACGGTTATTGTTGT-CCATCTACAATTATGGATAGTACATTTAA-TTTGATTAGTCG--AAGCTATTTGTTA-T-CTTGGCGCTGATTGGCCGAATT----TCAATCC---GATTTTCA---TATCAAGCTC--------AAT-GAATTGAAAAACGGCCAATCAGCAGTAAGTT-CCGTGAAACCCA-------CTG---ATTGGGTGGATTTCAATCTGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTT--TTGAA-ATGTACTAGATTCTGACATACACTAAACTTCAGA-TGCCTTCCATACGGTCGGCGCTCTGTATTGGAG---A--TGTCAGG--CTAGTAAATGT--AAATATTATGTTTGCAGAACC
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gi|14                         :                                                                                                ataaatgactgtataagttatatatgattttttagacgtataatcatataattaattaaaaacatgttAATTTCATGTTCATATCAATTGTATAA--AA--GTGTAATT
gi|10                         :                                                                                                                              ttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttAATTCATGTTTATATTAAGTGTAAAA--GA--GTGTA--------------TTGGCAATTTT---CATTTCACGGTTATTGTTTT-CCGTCTACAATCAt
gi|1                          :                                                                                                        tgattgtataagttatatatgatttttaaaagtatgatcatataaataattataaacatgttATACATGTTTATATTTAGTGTAAAA--AAGTATATAATT--GCCTTAAAATTGGCAA---TAAACATCTCACAGTTATTGTTTT-ACATATTCAATAATGGATAGTACAGTTAA-TTTAATTGGTGT--AAACTCTTACATA-T-CTTGTCACTGGTT----GATTT----TCAGTCC---GATTTTTG---CTTCAAGCTC--------AAC-AGA-TGAAACTCGACTAATTGG-----------------------------TTG---ATT--------TTAAATCCGGTATGTAAGTCT-AGCTTGACAA-TT--TTGAATATGTACTAGTTTTTGACAC-CAC--AACTACAGG-TGCCTCCCGTTCAGTCTGGGCTCTGCAGTGGAG---ATTTGTCAGG--TTGCAAAATGT--agcgg
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gi|5                          :                                                                                                   ataataataatgatgttaaaatcgcatatatgtccacaaagacacaataaataatcaaatatgatgcgaaCATGTTTATATTTAGTGTAAAA--GA--AAGTGTTGATGCCATACATTTGGCAATATA---GATTTCACTGTAATTGTTTTCCCATGTACATTCATGGATAGTACAGTTGA-TTTCATTAacggatttcaatccggtatataagcctagctcgacaattttggacatgtactagattctgacatacaccacaatacagatgccttcctttcggccggcgctctgcagtggagatgtcaggctagcaaatgaaaatagtgtatttacaaaacc
gi|9                          :                                                                              aacgcaagaagaagaataataattgtatgttgtgaactatttaagaaataagttgaatgtatatggtatatatgattataaaacatataatcatataaatgattatgaacttgtaaaaatcatatatatgtgcacaaagacacaataaataacaaagtatgatgcaaaTTGT-TAAGCTATACTTAT--ATACCAGATTGAAATTCAACTAATCGTTAA---ATTTAATAATACT----GCTGATTGGCTGAGTT----TCAATTCGTTGAGCTTGA----AGCAAA-----------AATCGGATTGAAAATCATCCAATCAGCcgtgtctgacaagaattttacatcttatatattagtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttatcctggcTTCTTA-T-CTTGGCGCTGATTGGCCGATTT----TCAATCA---GATTTTCG---CATCAAGCTC--------AAT-GAATTGAAAATCGGCCAATCAGCAGCAGGTA-CCGTGAAATTTA-------CTG---ATTGGACGGATTTCAATCCGGTGTATAAGCCT-AGCTCGACAATTT--TGGAC-ATGTACTAGATTCTGGCACACATCACAATACAGG-TGCCTTCCTTACGGTCGGCGCGCTGCAGTGGAA---A--TGTCAGG--GTAGCAAATGT--AAATAGTATATTTACAGAACCtttttgt
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttcttatCCGGATTGAAATCCGTCC---GATATTCAATTCATTGAGCTTGAAGCGAAAATCGGATTGAAAATCGTCCAATCAGCGCCAAGtaccgtgaaatttactgattggacggatttcaatccggtgtataagcctagctcgacaattttggacatgtactagattctggcacacatcacaatacaggtgccttccttacggtcggcgcgctgcagtggaaatgtcagggtagcaaatgtaaatagtatatttacagaacc
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GGATTGAAATCCGTCCAATCAG---TAAATT-TCACGGTACCTG-------CTGCTGATTGGCCGATTTTCAATT---CAT-TGAGCTT-GATGCGAAAATCTGATTGAA-Aggtcc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttcttatcttggcgctgattggccgat---ATCGGACGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAATTT--TGGAC-ATGTACTAGATTCTGACATACACCACAATACAGA-TGCCTTCCTTTCGGCCGGCGCTCTGCAGTGGAG---A--TGTCAGG--CTAGCAAATGA--AAATAGTGTATTTACAAAACCggtgtataagcctagctcgacaattttggacatgtactagattctggcacacatcacaatacaggtgccttccttacggtcggcgcgctgcagtggaaatgtcagggtagcaaatgtaaatagtatatttacagaacc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                 ataataataatgatgttaaaatcgcatatatgtccacaaagacacaataaataatcaaatatgatgcgaacatgtttatatttagagtaaaatagagtgtttatgccatacatttggcaattttcatctcattatattgttttccatgtacaatcatggatagtacctttaatttgatttgtctaagctattacttatcttggcgctgattggacgattttcaatccgattttcgcttcaagctcaatgaattgaatT--TGGAC-ATGTACTAGATTCTGACATACACCACAATACAGA-TGCCTTCCTTATGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAG---A--TGTCAGA--TTGGCAAATG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -ATTTGCTAG--CCTGACAT---CTCCACTGCAGAGCGCCGGCCGAAAGGAAGGCA-TCTGTATTGTGGTGTA--TGTCAGAATCTAGTACATGTCCAAA-ATTGTc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                               ataataataatgatgttaaaatcgcatatatgtccacaaagacacaataaataatcaaatatgatgcgaacatgtttatatttagagtaaaatagagtgtttatgccatacatttggcaattttcatctcattatattgttttccatgtacaatcatggatagtacctttaatttgatttgtctaagctattacttatcttggcgctgattggacgattttcaatccgattttcgcttcaagctcaatgaattgaatatcggacggatttcaatccggtatataagcctagctcgTCTGACAT---CTCCACTGCAGAGCGCCGACCATAAGGAAGGCA-TCTGTATTGTGGTGTA--TGTCAGAATCTAGTACATGT--gaaaatagtgtatttacaaaacc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttggGTCGGCGCTCTGCATTGGAG---A--TGTCAGG--CTAGTTAATGttggcaaatgc
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|7 ): AAACGCAAGAAGAATAATGATTATTGCGTATATGTTGTCAGCTATTAAGAACTAAGTTGAATGTATATGGTATATATGTTTGTTAGAAGTATAATCATATAAATGATTATAAACATGTTAAAATCGCATACATGTTCGCAAAGACACAATAAATAACTAAGTATGATGCGAACATGTTTATATTTAGTGTAAAAGAAAGTGCAAATGCCATAT
Unaligned ( gi|15 ): ATATATGATTTATTAGACGTATAATCATATAATTAATTATAAACATGTTAAATTCATGT






Alignments
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Reference ( family-153 )      :                                                                                                                                                                             AAATTCATGTTTATATTAANTGTANAAG--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAANTTTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATCATGGATAGTACANTTAATTTGATTNGTCNAAGCTATTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGATTTTCAATCCGATTTTCGCNTCAAGCTCAACGGATTGAAANTCGGCCAATCAGCGGCAAGTT-----CCG--TGAAATCTACTGATTGGNCGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTTGANATGTACTAGATTCTGACATACACCAC-ANTACAGACGCCTNCCNTACGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGTAAATAGTGTATTTACAGAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                               ATACATGTTTATATTTAGTGTAAAAA--AGTAT-ATAATTGCCTTAAAATTGGCAATAAACATCTCACAGTTATTGTTTT-ACATATTCAATAATGGATAGTACAGTTAATTTAATTGGTGTAAACTCTTACATATCTTGTCACTGGTT----GATTTTCAGTCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACAGA-TGAAACTCGACTAATTGG----------------------------TTGATT--------TTAAATCCGGTATGTAAGTCT-AGCTTGACAATTTTGAATATGTACTAGTTTTTG----ACACCACAACTACAGGTGCCTCCCGTTCAGTCTGGGCTCTGCAGTGGAGATTTGTCAGGTT-GCAAAATGT
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gi|11                         :                                                                                                               tgattgtataagttatatatgatttttaaaagtatgatcatataaataattataaacatgttAAATTCATGTCCATATTAATTGTATAAG--AATGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAATTTCATCagcgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataaatgactgtataagttatatatgattttttagacgtataatcatataattaattaaaaacatgttCAAGCTCA-CGGAATGAGATTCAGCCAATCGGAAGCCACTTATCAACCAATTG---TTTTCTGGTTGGCTGGAGTTCGATCCAGTAT-TAAGCCCGAGCTCGAAAGTTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCAC-AATACAGATGCCTTCCTTATGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGATTGGC-AAATGggtcc
gi|14                         :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGTAATTTc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttGTCGGCGCTCTGCATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-TAATG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGAGTAAAAT--AGAGT-GTTTATGCCATACATTTGGCAATTTTCATCTCATTAT-ATTGTTTT-CCATGTACAATCATGGATAGTACCTTTAATTTGATTTGTCTAAGCTATTACTTATCTTGGCGCTGATTG---GA---------CGATTTTC-----AATCC-----GATT----TTCG---------CTTCAAGCT-----CAA--TGAA-TTGAAT-ATCGGACGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCAC-AATACAGATGCCTTCCTTTCGGCCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGAAAATAGTGTATTTACAAAACC
gi|3                          :                                                                                                       ataataataatgatgttaaaatcgcatatatgtccacaaagacacaataaataatcaaatatgatgcgaaAAATTCATGTCTATATTAATTGTATAAG--AATGT-AATTATGCCGTACATTTGGCAAATTTCATCTCACGGTTATTGTTGT-CCATCTACAATTATGGATAGTACATTTAATTTGATTAGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGAATTTCAATCCGATTTTCATATCAAGCTCAATGAATTGAAAAACGGCCAATCAGCAGTAAGTT-----CCG--TGAAACCCACTGATTGGGTGGATTTCAATCTGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTTGAAATGTACTAGATTCTGACATACACTAA-ACTTCAGATGCCTTCCATACGGTCGGCGCTCTGTATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-AAATGTAAATATTATGTTTGCAGAACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAGATTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAACTATGGATAATACAATTATTTTGATTTGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCCAATCAGCAGCAAGTA-----CCG--TGAAATCCACTGATTGGATGGATTTCAATCCGGTATATAAGTCA-AGCTCGACAGTTTTTAAAATGTACTAGATTCTGACATA
gi|5                          :                                                                                                                                     atgattttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttCATGTTTATATTTAGTGTAAAAG--AAAGT-GTTGATGCCATACATTTGGCAATATAGATTTCACTGTAATTGTTTTCCCATGTACATTCATGGATAGTACAGTTGATTTCATT
gi|6                          :                                                                                                                                        aacgcaagaagaagaataataattgtatgttgtgaactatttaagaaataagttgaatgtatatggtatatatgattataaaacatataatcatataaatgattatgaacttgtaaaaatcatatatatgtgcacaaagacacaataaataacaaagtatgatgcaaaTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGATTTTCAATCAGATTTTCGCATCAAGCTCAATGAATTGAAAATCGGCCAATCAGCAGCAGGTA-----CCG--TGAAATTTACTGATTGGACGGATTTCAATCCGGTGTATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGGCACACATCAC-AATACAGGTGCCTTCCTTACGGTCGGCGCGCTGCAGTGGAAA--TGTCAGGGTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACCacgtgtctgacaagaattttacatcttatatattagtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGTGTAAAAGAAAGTGC-A--AATGCCATA
gi|8                          : aaacgcaagaagaataatgattattgcgtatatgttgtcagctattaagaactaagttgaatgtatatggtatatatgtttgttagaagtataatcatataaatgattataaacatgttaaaatcgcatacatgttcgcaaagacacaataaataactaagtatgatgcgaaAAATTCATGTCTATATTAATTGTATAAG--AATGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAATTTTATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATTACGGATAGTAt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgactgtataagttatatatgttttattagacgtataatcatataattgattataaacatgttTTATCCTGGCGCTGATTGGATGATTTTCAATCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACGAATTGAAACTCAGCCAATCAGCAGTA--TT-------A--TTAAATTTAACGATTAGTTGAATTTCAATCTGGTATATAAGTAT-AGCTTAACAATTTTTG
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Reference ( family-153 )      :                                                                                                                                                                                                                                               AAATTCATGTTTATATTAANTGTANAAG--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAANTTTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATCATGGATAGTACANTTAATTTGATTNGTCNAAGCTATTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGATTTTCAATCCGATTTTCGCNTCAAGCTCAACGGATTGAAANTCGGCCAATCGGCAGCAAGTT-----CCG--TGAAATTTACTGATTGGNCGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTACGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                 ATACATGTTTATATTTAGTGTAAAAA--AGTAT-ATAATTGCCTTAAAATTGGCAATAAACATCTCACAGTTATTGTTTT-ACATATTCAATAATGGATAGTACAGTTAATTTAATTGGTGTAAACTCTTACATATCTTGTCACTGGTT----GATTTTCAGTCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACAGA-TGAAACTCGACTAATTGG----------------------------TTGATT--------TTAAATCCGGTATGTAAGTCT-AGCTTGACAATTTTGAATATGTACTAGTTTTTG----ACACCACAACTACAGGTGCCTCCCGTTCAGTCTGGGCTCTGCAGTGGAGATTTGTCAGGTT-GCAAAATGT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ataaatgactgtataagttatatatgattttttagacgtataatcatataattaattaaaaacatgttCAAGCTCA-CGGAATGAGATTCAGCCAATCGGAAGCCACTTATCAACCAATTG---TTTTCTGGTTGGCTGGAGTTCGATCCAGTAT-TAAGCCCGAGCTCGAAAGTTT
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Reference ( family-153 )      :                                                                                                                                                                             AAATTCATGTTTATATTAANTGTANAAG--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAANTTTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATCATGGATAGTACANTTAATTTGATTNGTCNAAGCTATTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGNCGATTTTCAATCCGATTTTCGCTTCAAGCTCAACGAATTGAAANTCGGCCAATCGGCAGCAAGTT-----CCG--TGAAATTTACTGATTGGNCGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTACGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                               ATACATGTTTATATTTAGTGTAAAAA--AGTAT-ATAATTGCCTTAAAATTGGCAATAAACATCTCACAGTTATTGTTTT-ACATATTCAATAATGGATAGTACAGTTAATTTAATTGGTGTAAACTCTTACATATCTTGTCACTGGTT----GATTTTCAGTCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACAGA-TGAAACTCGACTAATTGG----------------------------TTGATT--------TTAAATCCGGTATGTAAGTCT-AGCTTGACAATTTTGAATATGTACTAGTTTTTG----ACACCACAACTACAGGTGCCTCCCGTTCAGTCTGGGCTCTGCAGTGGAGATTTGTCAGGTT-GCAAAATGT
gi|10                         :      attgtttattgcatacatgttctcaactattaaaaaatataagttgagtgtacttgttatatatgattattaattgtataatcatatacatgtaaatgattgtaaacatgttataaatgcatacctgtgtacaaaatcacattaaattactacctgtatgtataatgcAATTCATGTTTATATTAAGTGTAAAAG--AGTGT-A--------------TTGGCAATTTTCATTTCACGGTTATTGTTTT-CCGTCTACAATCA
gi|11                         :                                                                                                               tgattgtataagttatatatgatttttaaaagtatgatcatataaataattataaacatgttAAATTCATGTCCATATTAATTGTATAAG--AATGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAATTTCATCagcgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataaatgactgtataagttatatatgattttttagacgtataatcatataattaattaaaaacatgttCAAGCTCA-CGGAATGAGATTCAGCCAATCGGAAGCCACTTATCAACCAATTG---TTTTCTGGTTGGCTGGAGTTCGATCCAGTAT-TAAGCCCGAGCTCGAAAGTTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTATGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGATTGGC-AAATGggtcc
gi|14                         :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGTAATTTc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttGTCGGCGCTCTGCATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-TAATG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGAGTAAAAT--AGAGT-GTTTATGCCATACATTTGGCAATTTTCATCTCATTAT-ATTGTTTT-CCATGTACAATCATGGATAGTACCTTTAATTTGATTTGTCTAAGCTATTACTTATCTTGGCGCTGATTGGA------------CGATTTTC-----AA--TC--CGATTT-------------TCG-CTTCAAGCT-----CAA--TGAA-TTGAAT-ATCGGACGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTTCGGCCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGAAAATAGTGTATTTACAAAACC
gi|3                          :                                                                                                       ataataataatgatgttaaaatcgcatatatgtccacaaagacacaataaataatcaaatatgatgcgaaAAATTCATGTCTATATTAATTGTATAAG--AATGT-AATTATGCCGTACATTTGGCAAATTTCATCTCACGGTTATTGTTGT-CCATCTACAATTATGGATAGTACATTTAATTTGATTAGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGAATTTCAATCCGATTTTCATATCAAGCTCAATGAATTGAAAAACGGCCAATCAGCAGTAAGTT-----CCG--TGAAACCCACTGATTGGGTGGATTTCAATCTGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTTGAAATGTACTAGATTCTGACATACACTAAAC-TTCAGATGCCTTCCATACGGTCGGCGCTCTGTATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-AAATGTAAATATTATGTTTGCAGAACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAGATTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAACTATGGATAATACAATTATTTTGATTTGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCCAATCAGCAGCAAGTA-----CCG--TGAAATCCACTGATTGGATGGATTTCAATCCGGTATATAAGTCA-AGCTCGACAGTTTTTAAAATGTACTAGATTCTGACATA
gi|5                          :                                                                                                                                     atgattttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttCATGTTTATATTTAGTGTAAAAG--AAAGT-GTTGATGCCATACATTTGGCAATATAGATTTCACTGTAATTGTTTTCCCATGTACATTCATGGATAGTACAGTTGATTTCATT
gi|6                          :                                                                                                                                        aacgcaagaagaagaataataattgtatgttgtgaactatttaagaaataagttgaatgtatatggtatatatgattataaaacatataatcatataaatgattatgaacttgtaaaaatcatatatatgtgcacaaagacacaataaataacaaagtatgatgcaaaTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGATTTTCAATCAGATTTTCGCATCAAGCTCAATGAATTGAAAATCGGCCAATCAGCAGCAGGTA-----CCG--TGAAATTTACTGATTGGACGGATTTCAATCCGGTGTATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGGCACACATCACAA-TACAGGTGCCTTCCTTACGGTCGGCGCGCTGCAGTGGAAA--TGTCAGGGTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACCacgtgtctgacaagaattttacatcttatatattagtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGTGTAAAAGAAAGTGC-A--AATGCCATA
gi|8                          : aaacgcaagaagaataatgattattgcgtatatgttgtcagctattaagaactaagttgaatgtatatggtatatatgtttgttagaagtataatcatataaatgattataaacatgttaaaatcgcatacatgttcgcaaagacacaataaataactaagtatgatgcgaaAAATTCATGTCTATATTAATTGTATAAG--AATGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAATTTTATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATTACGGATAGTAt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgactgtataagttatatatgttttattagacgtataatcatataattgattataaacatgttTTATCCTGGCGCTGATTGGATGATTTTCAATCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACGAATTGAAACTCAGCCAATCAGCAGTA--TT-------A--TTAAATTTAACGATTAGTTGAATTTCAATCTGGTATATAAGTAT-AGCTTAACAATTTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATATATGATTTATTAGACGTATAATCATATAATTAATTATAAACATGTTAAATTCATGT






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Reference ( family-153 )      :                                                                                                                                                                             AAATTCATGTTTATATTAANTGTANAAG--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAANTTTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATCATGGATAGTACANTTAATTTGATTNGTCNAAGCTATTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGNCGATTTTCAATCCGATTTTCGCNTCAAGCTCAACGAATTGAAANTCGGCCAATCGGCAGCAAGTT-----CCG--TGAAATTTACTGATTGGNCGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTACGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                               ATACATGTTTATATTTAGTGTAAAAA--AGTAT-ATAATTGCCTTAAAATTGGCAATAAACATCTCACAGTTATTGTTTT-ACATATTCAATAATGGATAGTACAGTTAATTTAATTGGTGTAAACTCTTACATATCTTGTCACTGGTT----GATTTTCAGTCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACAGA-TGAAACTCGACTAATTGG----------------------------TTGATT--------TTAAATCCGGTATGTAAGTCT-AGCTTGACAATTTTGAATATGTACTAGTTTTTG----ACACCACAACTACAGGTGCCTCCCGTTCAGTCTGGGCTCTGCAGTGGAGATTTGTCAGGTT-GCAAAATGT
gi|10                         :      attgtttattgcatacatgttctcaactattaaaaaatataagttgagtgtacttgttatatatgattattaattgtataatcatatacatgtaaatgattgtaaacatgttataaatgcatacctgtgtacaaaatcacattaaattactacctgtatgtataatgcAATTCATGTTTATATTAAGTGTAAAAG--AGTGT-A--------------TTGGCAATTTTCATTTCACGGTTATTGTTTT-CCGTCTACAATCA
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataaatgactgtataagttatatatgattttttagacgtataatcatataattaattaaaaacatgttCAAGCTCA-CGGAATGAGATTCAGCCAATCGGAAGCCACTTATCAACCAATTG---TTTTCTGGTTGGCTGGAGTTCGATCCAGTAT-TAAGCCCGAGCTCGAAAGTTT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGTAATTTc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttGTCGGCGCTCTGCATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-TAATG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGAGTAAAAT--AGAGT-GTTTATGCCATACATTTGGCAATTTTCATCTCATTAT-ATTGTTTT-CCATGTACAATCATGGATAGTACCTTTAATTTGATTTGTCTAAGCTATTACTTATCTTGGCGCTGATTGGA------------CGATTTTC-----AA--TC--CGATTT-------------TCG-CTTCAAGCT-----CAA--TGAA-TTGAAT-ATCGGACGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTTCGGCCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGAAAATAGTGTATTTACAAAACC
gi|3                          :                                                                                                       ataataataatgatgttaaaatcgcatatatgtccacaaagacacaataaataatcaaatatgatgcgaaAAATTCATGTCTATATTAATTGTATAAG--AATGT-AATTATGCCGTACATTTGGCAAATTTCATCTCACGGTTATTGTTGT-CCATCTACAATTATGGATAGTACATTTAATTTGATTAGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGAATTTCAATCCGATTTTCATATCAAGCTCAATGAATTGAAAAACGGCCAATCAGCAGTAAGTT-----CCG--TGAAACCCACTGATTGGGTGGATTTCAATCTGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTTGAAATGTACTAGATTCTGACATACACTAAAC-TTCAGATGCCTTCCATACGGTCGGCGCTCTGTATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-AAATGTAAATATTATGTTTGCAGAACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAGATTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAACTATGGATAATACAATTATTTTGATTTGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCCAATCAGCAGCAAGTA-----CCG--TGAAATCCACTGATTGGATGGATTTCAATCCGGTATATAAGTCA-AGCTCGACAGTTTTTAAAATGTACTAGATTCTGACATA
gi|5                          :                                                                                                                                     atgattttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttCATGTTTATATTTAGTGTAAAAG--AAAGT-GTTGATGCCATACATTTGGCAATATAGATTTCACTGTAATTGTTTTCCCATGTACATTCATGGATAGTACAGTTGATTTCATT
gi|6                          :                                                                                                                                        aacgcaagaagaagaataataattgtatgttgtgaactatttaagaaataagttgaatgtatatggtatatatgattataaaacatataatcatataaatgattatgaacttgtaaaaatcatatatatgtgcacaaagacacaataaataacaaagtatgatgcaaaTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGATTTTCAATCAGATTTTCGCATCAAGCTCAATGAATTGAAAATCGGCCAATCAGCAGCAGGTA-----CCG--TGAAATTTACTGATTGGACGGATTTCAATCCGGTGTATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGGCACACATCACAA-TACAGGTGCCTTCCTTACGGTCGGCGCGCTGCAGTGGAAA--TGTCAGGGTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACCacgtgtctgacaagaattttacatcttatatattagtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGTGTAAAAGAAAGTGC-A--AATGCCATA
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Reference ( family-153 )      :                                                                                                                                                                             AAATTCATGTTTATATTAANTGTANAAG--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAANTTTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATCATGGATAGTACANTTAATTTGATTNGTCNAAGCTATTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGATTTTCAATCCGATTTTCGCNTCAAGCTCAACGAATTGAAANTCGGCCAATCGGCAGCAAGT-----NCCG--TGAAATTTACTGATTGGNTGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTACGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACC
gi|1                          :                                                                                                                                                                               ATACATGTTTATATTTAGTGTAAAAA--AGTAT-ATAATTGCCTTAAAATTGGCAATAAACATCTCACAGTTATTGTTTT-ACATATTCAATAATGGATAGTACAGTTAATTTAATTGGTGTAAACTCTTACATATCTTGTCACTGGTT----GATTTTCAGTCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACAGA-TGAAACTCGACTAATTGG----------------------------TTGATT--------TTAAATCCGGTATGTAAGTCT-AGCTTGACAATTTTGAATATGTACTAGTTTTTG----ACACCACAACTACAGGTGCCTCCCGTTCAGTCTGGGCTCTGCAGTGGAGATTTGTCAGGTT-GCAAAATGT
gi|10                         :      attgtttattgcatacatgttctcaactattaaaaaatataagttgagtgtacttgttatatatgattattaattgtataatcatatacatgtaaatgattgtaaacatgttataaatgcatacctgtgtacaaaatcacattaaattactacctgtatgtataatgcAATTCATGTTTATATTAAGTGTAAAAG--AGTGT-A--------------TTGGCAATTTTCATTTCACGGTTATTGTTTT-CCGTCTACAATCA
gi|11                         :                                                                                                               tgattgtataagttatatatgatttttaaaagtatgatcatataaataattataaacatgttAAATTCATGTCCATATTAATTGTATAAG--AATGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAATTTCATCagcgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataaatgactgtataagttatatatgattttttagacgtataatcatataattaattaaaaacatgttCAAGCTCA-CGGAATGAGATTCAGCCAATCGGAAGCCACTTATCAACCAATTG---TTTTCTGGTTGGCTGGAGTTCGATCCAGTAT-TAAGCCCGAGCTCGAAAGTTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTATGGTCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGATTGGC-AAATGggtcc
gi|14                         :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGTAATTTc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttGTCGGCGCTCTGCATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-TAATG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGAGTAAAAT--AGAGT-GTTTATGCCATACATTTGGCAATTTTCATCTCATTAT-ATTGTTTT-CCATGTACAATCATGGATAGTACCTTTAATTTGATTTGTCTAAGCTATTACTTATCTTGGCGCTGATTG---GA---------CGATTTTC-----AA--TC--CGATTT-------------TCG-CTTCAAGC-----TCAA--TGAA-TTGAAT-ATCGGACGGATTTCAATCCGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGACATACACCACAA-TACAGATGCCTTCCTTTCGGCCGGCGCTCTGCAGTGGAGA--TGTCAGGCTAGC-AAATGAAAATAGTGTATTTACAAAACC
gi|3                          :                                                                                                       ataataataatgatgttaaaatcgcatatatgtccacaaagacacaataaataatcaaatatgatgcgaaAAATTCATGTCTATATTAATTGTATAAG--AATGT-AATTATGCCGTACATTTGGCAAATTTCATCTCACGGTTATTGTTGT-CCATCTACAATTATGGATAGTACATTTAATTTGATTAGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGAATTTCAATCCGATTTTCATATCAAGCTCAATGAATTGAAAAACGGCCAATCAGCAGTAAGT-----TCCG--TGAAACCCACTGATTGGGTGGATTTCAATCTGGTATATAAGCCT-AGCTCGACAGTTTTTGAAATGTACTAGATTCTGACATACACTAAAC-TTCAGATGCCTTCCATACGGTCGGCGCTCTGTATTGGAGA--TGTCAGGCTAGT-AAATGTAAATATTATGTTTGCAGAACC
gi|4                          :                                                                                                                                                                             AATTTCATGTTCATATCAATTGTATAAA--AGTGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAGATTCATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAACTATGGATAATACAATTATTTTGATTTGTCGAAGCTATTTGTTATCTTGGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGCCAATCAGCAGCAAGT-----ACCG--TGAAATCCACTGATTGGATGGATTTCAATCCGGTATATAAGTCA-AGCTCGACAGTTTTTAAAATGTACTAGATTCTGACATA
gi|5                          :                                                                                                                                     atgattttttagatgtataatcatataattaattataaacatgttCATGTTTATATTTAGTGTAAAAG--AAAGT-GTTGATGCCATACATTTGGCAATATAGATTTCACTGTAATTGTTTTCCCATGTACATTCATGGATAGTACAGTTGATTTCATT
gi|6                          :                                                                                                                                        aacgcaagaagaagaataataattgtatgttgtgaactatttaagaaataagttgaatgtatatggtatatatgattataaaacatataatcatataaatgattatgaacttgtaaaaatcatatatatgtgcacaaagacacaataaataacaaagtatgatgcaaaTTCTTATCTTGGCGCTGATTGGCCGATTTTCAATCAGATTTTCGCATCAAGCTCAATGAATTGAAAATCGGCCAATCAGCAGCAGGT-----ACCG--TGAAATTTACTGATTGGACGGATTTCAATCCGGTGTATAAGCCT-AGCTCGACAATTTTGGACATGTACTAGATTCTGGCACACATCACAA-TACAGGTGCCTTCCTTACGGTCGGCGCGCTGCAGTGGAAA--TGTCAGGGTAGC-AAATGTAAATAGTATATTTACAGAACCacgtgtctgacaagaattttacatcttatatattagtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                  CATGTTTATATTTAGTGTAAAAGAAAGTGC-A--AATGCCATA
gi|8                          : aaacgcaagaagaataatgattattgcgtatatgttgtcagctattaagaactaagttgaatgtatatggtatatatgtttgttagaagtataatcatataaatgattataaacatgttaaaatcgcatacatgttcgcaaagacacaataaataactaagtatgatgcgaaAAATTCATGTCTATATTAATTGTATAAG--AATGT-ATTTATGCCATACATTTGGCAAATTTTATCTCACGGTTATTGTTTT-CCATCTACAATTACGGATAGTAt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                 aaatgactgtataagttatatatgttttattagacgtataatcatataattgattataaacatgttTTATCCTGGCGCTGATTGGATGATTTTCAATCCGATTTTTGCTTCAAGCTCAACGAATTGAAACTCAGCCAATCAGC----AGT-----ATTA--TTAAATTTAACGATTAGTTGAATTTCAATCTGGTATATAAGTAT-AGCTTAACAATTTT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): ATATATGATTTATTAGACGTATAATCATATAATTAATTATAAACATGTTAAATTCATGT