lowQualScore : 11111 1 111 444444444 2222222222222222222222 2222222222 1111111 33333333
lowQualScore : 1 4 1 44 1 44444 3 3333 555555 1 2 99999 6 22 3 2 2 2 2 1 888 0 111111111 2 7777 55555 2 7777777 2 5555 5555555555555555555555 333 4444444444 2 2 888888888888888 666 77 4444 2 2 0000000 33 7777777 88888888 333 33 3 0 1 1 5555 1 8888888888 1 1
lowQualScore : . . . .. . ..... . .... ...... . . ..... . .. . . . . . . ... . ......... . .... ..... . ....... . .... ...................... ... .......... . . ............... ... .. .... . . ....... .. ....... ........ ... .. . . . . .... . .......... . .
lowQualScore : 5 6 5 22 5 33333 7 4444 000000 9 0 22222 7 88 3 1 1 1 1 2 000 5 111111111 4 4444 99999 2 2222222 7 0000 1111111111111111111111 888 1111111111 4 4 333333333333333 666 11 5555 1 2 1111111 11 2222222 77777777 999 11 4 5 8 7 3333 5 2222222222 5 5
consensus : GCCATCC-TT-A-AAAA--A-TATAT-TGTTTGCCGTGCTCCTAC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--ACCCAAACTT-T-TTT-AT-TGACTTT-CAAAGCGTT--T-AA-T-TTTTTT-TT----CA-----TGATTTCTGTCCA-T-------TTTTCTT----TAAAATG-------ACT------A-----TG--CAAAA---T--C---A-A-A---T--TTG----GCAA---CAA--AA----A-AA-AAT---T-AGCTA--CC-------TACNTACCCGCA---TG--AAAAATACTG-GGTCG--GAGCACGGC-AAACAA---A--TAT-T-TT-TTTAAGGATGGCCTT
Reference ( gi|1 ) : GCCATCC-TT-A-AAAA--A-TATAT-CGTTTGGCGTGCTCCTAC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAACTGCAGCT--ATCCAAACTT-T-TTT-AT-TGACTTT-CTAAGCATT--T-CA-C-TTTTTT-TT----CA-----TGATTTCTGTCCA-T-------TTTTCTT----TAAAATG-------ACT------A-----TG--CAAAA---T--C---A-A-A---T--TTG----GCAA---CAA--AA----A-AA-AAT---T-AGCTA--CC-------TACATACATGCA---TG--AAAAATACTG-GGTCA--GAGCACAGC-AAACAA---A--TAT-T-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|4 : GCCATCC-TT-A-AAAA----TATAT-TGTT-ACCGTGCTCCTAC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAAGTGCAGCT--ACCCAAACTT-T-TTA-AT-TGACTTT-CTAAGCATT--G-AA-T-ATTTTG-TT----CA-----TGATTTCTGTCCA-G-------TTTACTT----TAAAATG-------ACT------A-----TT--CAAAA---T--CA--A-A-A---T--TTG----GCAA---CAAC-AA----A-AA-AAA---T-AGCTA--CC-------TA---AC-CACA---TG--AAAAATACTG-GGTCG--GAGCAAAGC-AAACAA---A--TA--T-TT-TTTAAGGATGGCCT
gi|4 : GCCATCC-TT-A-AAAA--A-TAT-T-TGTTTGCTTTGCTCCGAC----CCAGTATTTT-TC-ATGTGG-TTAG----GTAGCT--AT-----TTT-T-TTT-GT-TG--TTG-CCAA--ATT--T-TG-A-TTT-----------------TGAAT--AGT-CA-T-------TTTAAAG----TAAACTGGACAGAAATC------A-----TGAACAAAATATT--C---A-ATG---C--TTA----GAAAGT-CAATTAA----A-AA-GTT---T-GGGTA--GC-------TGCACTTTTGAG---TG--AG------TA-GGTAG--GAGCACGGT--AAC-A---A--TAT-A-TT-TTTAAGGATGGCa
gi|2 : GCTATCC-TTAA-AAAA--A-TA-AT-TGTTTGCTGTGCTCCGAC----cta
gi|3 : ccgtcctttaaaaatagattgtttgctgtgctcttacctactcactcaaaattacagctacccaaacttttttattgactttcaaagcttttaatattttttttcatgatttctgttcatttttctttacaatgactgcaaaatcaaaatgttgaagcaaaaacaaagaagctacctacctacccacatgaataatactgaGCCATCC-TT-A-AAAA--AGTGT-T-TGTTTGCTGTGCTCTGAC---------------------------------ACAG-T--AT-------T-T-TTT-ATGTGGGTAT-ATAGGAATC--T-GA-T-TTTTTT-TTGGGCCAGATTTTGATTT-TG--CA-TACAGTAGTTATTTTATAGTAAAATGGACAGAAATC------A-----TG--AAAAAAAAT--T---A-A-ACGCT--TTGAAAGGCAA---TAA--AA----A-AA-T-T---T-GGGTA--GC-------TGCAATTTTGAG---TG--AA------TA-GGTAA--GAGTACGGC-AAACAA---G--T-T-T-TT-TTTAActga
gi|6 : GCCATCC-TT-A-AAAA--A-TAATT-TGTTTGCCGTGCTCCTAC----CTA------C-TC-AT-----TCGAAATTGCAGCT--AGCCAAACTA-T-TT--AT-TGATTA----AAGCATT--C-AA----TTTTT-TT----CA-----TGATTTATGTCCA-T-------TTTTCTT----TAAAATG-------ACT------A-----TG--CAAAT---T--CA--A-A-A---T--TTG----GCCA---AAA--AA----A-TA-AAT---A-AGCTA--CC-------TAC-CACCCACA---TA--AAAAATACTG-GATCG--GAGCGCAGC-AAACAA---A--TAT-T-GT-TTAAAGGATGACcttat
gi|6 : GTCATCCTTT-A-AACA--A-TAT-T-TGTTTGCTGCGCTCCGAT----CCA------
gi|11 : gccatccttaaaaaataatttgtttgccgtgctcctacctactcattcgaaattgcagctagccaaactatttattgattaaagcattcaatttttttcatgatttatgtccatttttctttaaaatgactatgcaaattcaaaatttggccaaaaaaataaataagctacctaccacccacataaaaaatacGCCATCC-TT-A-AAAA--A----AT-TGTTTGCCATGCTCCTAC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--ACCTCAACTT-T-TTT-AT-TGAATTTAAAAAGCATT--T-AA-T-TTTTTTCTT----CA-----TGATTTCTGTCCA-T-------TTTTCTT----TAAAATG-------ACG------A-----TG--CAAAA---T--C---------------TG----G--------A--AA----T-AA-AAC-------CTA--CC-------TA--------CA---TG--AAAAATACAA-GGTCA--GAGCACAGC-AAACAA---A--CA----TT-TTTAAGGATGGCC
gi|11 : GCCATCC-TT-A--AAA--A-TGT-T-TGTTTGCTGTGCTCTGAC----CT
gi|13 : gccatccttaaaaaaattgtttgccatgctcctacctactcactcaaaattgcagctacctcaacttttttattgaatttaaaaagcatttaatttttttcttcatgatttctgtccatttttctttaaaatgacgatgcaaaatctggaaataaaacctacctacatgaaaaatacaGCCGTCC-TC-A-AAAA--A-TTTTT-TTTTTGCCATGCTGCTAC----CTA------C-AT-AT-----TCAAAATTGCTGTT--ACCCGCACTT-T-TT--AT-TAACTTT-CAAAGCATTAAT-T--T-TTTTTT-TT----CA-----TGATT----------------------TT----CAAAAT----------T------T-----GG--CAAAA----------A-A-A---------------AA---CCC--AC----A-AA-AAC---T-AGCTA--GC-------TACCTACCCACA---TG--AAAA----TG-AGTTG--GAACACAGC-AAACAA---A--TAT-T-TT-TTTAAc
gi|14 : gGCCATCC-TTCA-ACAA--A----AT-TGTTTGCTGTGCTCtggtt
gi|19 : cattcttacaaaaatatttgtttgccgtgcccttacatgcctacccaccaaaacggcagctacttttttttgttgagatacactaaaaaaataaaaataactatgcctacatactcataaaaaatactggatcaGTCATTC-TT---AAAA--A-TGT-T-CGTTTGTAGTGCTCctgaaa
gi|25 : cattctgttcttttgtttgttatcactgtcagattttcagatttaaatagaaataaaatccctacctaaaatattctggatccGCCGCTC-TT-A-AAAAAAA-TAAAT-TGTTTGCCATGCTCCTAT----CAA------C-Tct
gi|2 : gCCGTCC-TT-T-AAAA--A-TAGAT-TGTTTGCTGTGCTCTTAC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--ACCCAAACTT-T-TTT-AT-TGACTTT-CAAAGCTTT--T-AA-TATTTTTT-TT----CA-----TGATTTCTGTTCA-T-------TTTTCTT----TACAATG-------AC-------------TG--CAAAA---T--CA--A-A-A---T--GTT----GAAG---CAA--AA----A-CA-AAG---A-AGCTA--CC-------TACCTACCCACA---TG--AATAATACTG-AGTCG--GAGCACAGC-AAACAA---T--TAT-T-TT-TTTAAGGATAGCCTt
gi|8 : CCATCC-TT-A-AAAA--A-TATAT-TGTTTGTCGTGCTACTTC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--ACCCAAAATT-T-TTT-AT-TGACTTT-CAAAGTATT--TAAA-T-TTTTTT-TT----CA-----TGATTTCTGTCCA-T-------TTTTC-------A----------------------------------------------A-A-A---T--TTG----GCAA---AAA--AA----A-AA-AGT---T-AGCTA--CC-------TACCTACCCACA---TG--ACAAATACTG-GGCGATGGAGCACAGC-AAACAA---AGTTGT-T-TT-TTT-AGCATGGCCTTga
gi|7 : CCAGTC-TT-A-TAAA----TATAT-TGTTTGCCGTGCTCCTAC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--ACCCAAACTT-T-TTT-AT-TGACCTT-GAAAGCG-----------CTTTTT-TT----CA-----TGATTTCTGTCCA-T-------ATTTCTT----AAAATTG-------ACC------A-----TG--CAAAT---T--CA--A-A-A---T--TTG----GCAA---C-----A----A-AA-AAT---A-AGCTA--CC-------TAC--CCAT--A---TG--AATAATCCTG-GATCG--GAGCACACC-AAACTA---A--TAT-TGTT-TTTAATGATGGTC
gi|7 : CCATCA-TT-A-AAAACAA-TAT-T-AGTTTGGTGTGCTCCGAT----CCA------
gi|17 : ccagtcttataaatatattgtttgccgtgctcctacctactcactcaaaattacagctacccaaacttttttattgaccttgaaagcgctttttttcatgatttctgtccatatttcttaaaattgaccatgcaaattcaaaatttggcaacaaaaaataagctacctacccatatgaataatccCCGTCC-TT-A-AAA-----TGTAT-TGTTTGCTGTGCTCCTAC----CT--------------------CATAATTGTAGCT--TCCCAAACTT-T-TTT-AT-TGACTTT-CAATGCGTT--T-AA-T-TTTTTT-TTG---TG-----TGATTAATGTCCA-T-------TTTTCTT----TAAAATtc
gi|24 : CCGTCA-TTGA-AAAA--A-TAT-T-TGTTTGCCATGCTCCTAC----CTA------C-TC-AC-----TCTACCCTGAAGCT--
gi|26 : CCATCC-TT-A-AAAA--A-TCCTT-TGTTTGCTGTTTTCCgcc
gi|16 : tCTATTC-TT-C-AAAA--A-TATATGTGTTTCCCATATATCTAC----GTG------C-TC-ATGTAAATCGAAATCACAACTCTATCCAAACTTAT-TTT-AT-TTAATTT-A-AAGTTGT--T-GA-T-TTTTTtctgataga
gi|5 : CATAC-TT-A-AAAA--A--A-AC-TGTTTGCCATGCTCCTAC----CTA------C-TC-AC-----TCAATATTGCCGCT--ACCTAAAC-T-T-TTT-AT-TGCCTTT-TAAAGCTTT--T-AATT-TTTTTT-TT----CA-----TGATTTCAGTCCA-T-------TTTTCTG----TAAAATG-------ACA------A-----TG--CAAAA---T--C---A-A-A---T--CTG----GCAA---CAA--TG----A-AA-ATA---T-AGCTA--CC-------TACCTACCTACA---TA--AAAATTACTG-AATCG--GAGAAAAGC-AAACAA---A--CAT-T-TT-TTTAAGAATGGTCatatgtttgttgctcac
gi|14 : CATTC-TT-ACAAAA--A-TAT-T-TGTTTGCCGTGCCCTTACATGCCTA------C-CC-AC------CAAAACGGCAGCT--ACT----TTT-T-TTT-GT-TGAc
gi|9 : TTC-TT-A-AAA-----TATGT--GTTTGCCATGCTCCTGC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAGGTGCAGCT--ACCCAAA-TG-C-TTT-AT-TGAATTT-CAAAGCGTT--G-AA----TTTTG-CC----CT-----TAATTCCTTTCCA-A-------TTTC-----------ATG-------ACTTTTTCCA-----TG---AAAA---TA-C---A-A-A---------------AA---CAA--AATCCGG-AA-AATATAT-AGTTA--CC-------TGCCTAACTACA---TG---AAAACACTG-GGTCA--GAGCAAAGC-AAACAA---A--CA--T-GT-TTTAAGAAgatacactaaaaaaataaaaataactatgcctacatactcataaaaaatactggatcagagcacagcaaacaattttgttgaaggatggcctgaaa
gi|22 : TCC-TT-A-AAAA--T-TGAAT-TGTTTAATGTGCTCCTTC----CTA------C-TC-AC-----TCAAAATTGGTACT--TCCCAAACTT-TATTT-AT-T
gi|12 : tgCC-TT-A-AAAA--A-TAGAT-TGTTTGCCGTGCTCCTAC----CTA------C-CC-AC-----TCATAATTGCAGCT--ACCCTAACTT-T-TTTAAT-TGACTTT-CAAAGCATT---------TTCTTT-TT----CA-----TGATTTCTGTCCACT-------TTTTGTT----TAAAATG-------ATT------A-----TG--CAAAA---T--CA--A-A-A---T--TT------CAG---GGA--AA----A-AACAAT---T-AGCTA--CC-------TACTTACCCATA---TGAAAAAAATACTG-GGTTG--GAGCACAG
gi|3 : ccga-TT-A-AAAA--A-AAC-T-TGTTTGCCGTACTCTTAC----CTA------T-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--ACCCAAATTT-T-TTT-AT-TGCCTTT-CAAAGCGTT--T-AA---TTTTTT-TT----CA-----TGATTTCTGTCCA-T-------TTTACTA----TAAAATA-------ACT------ACTGTATG--CAAAA---T--CA--A-A-A---T--CTG----GC-C---CAA--AA----A-AA-AAT---C-AGATT--CC-------TATATACCCACA---TA--AAAAATACTG-TGTCA--GAGCACAGC-AAACAA---A--CAC-T-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|15 : GTACTCCTTC----CTA------TGTCTAC-----T--ACATTGCAGCT--ACCCAAACAT-T-TTA-AT-TGAATTC-AAAAGCA------------TTTTT-TT----CA-----CGAATTCTGTCAA-T-------TTTat
gi|18 : taagccggacttgaaaatgttaattttcaTGCTTCTAC----CTA------C-CC-AC-----TTA--------GCT---TGCAACATT-T-TTT--T-TG------------------------TCTTTT-TT----CA-----TAAATTTTGTCCC-T-------TTTAGTT----CAAAATG-------A--------A-----T----AAAA---T--TTCAA-A-A---T--CTG----GTAA---CAA--AA----A-Agttcaactggacccaattattcaa
gi|10 : aataaaattgttTTTC-CC----CA-----TAAATTCTGTCCA-T-------TTTTGTT----CAAAATG-------GCA------A-----TA--AAAGA---T--T---AGA-A---T--ATG----t
gi|19 : ggccatacagtacttaatataatatttgttagtcacgcttctacctatccactgatagctacatacccaatgtaacattattatgtttatatcgactttgatagtattgttattccaccccattcccctccccctatacTTCTGTTC----------TTTTGTT----TGTTATC-------ACT------G-----T---CAGAT---TTTC---A-G-A---T--TTA------AA---TAG--AA----ATAA-AAT---C-C-CTA--CC-------TA-----------------AAATATTCTG-GATCC--GAGCACTAC-AAACGA---A--CAT-T-TT-T--AAGAATGACCTtgaaatattgggttggagcatga
gi|11 : caAAAA---T--T---A-A-A---TGCTTT----TTAAATTCAAT-AA----A-AA-AGT---TGAGGTA--GC-------TGCAATTTTGAG---TG--AG------TA-GGTAG--GAGCATGGC-AAACAA--------T-T-TT-TTTAAGGATGGC
gi|14 : CAA---CAA--AA----A-AA-AGT-----AGCTG--CCGTTTTGGTGGGTAG--GCA---TG-------TA--------A--GGGCACGGC-AAACAA---A--TAT-T-TT-TGTAAGAATGtttcttcatgatttctgtccatttttctttaaaatgacgatgcaaaatctggaaataaaacctacctacatgaaaaatacaaggtcagagcacagcaaacaaacatttttaaggatggcc
gi|14 : AA---AAA--AA----T-AA-AAA---T-AACTATGCC-------TACATAC-T-CA---TA--AAAAATACTG-GATCA--GAGCACAGC-AAACA--------AT-T-TTGTTGAAGGATGGCCTagatacactaaaaaaataaaaataactatgcctacatactcataaaaaatactggatcagagcacagcaaacaattttgttgaaggatggcctgaaa
gi|21 : cattcttacaaaaatatttgtttgccgtgcccttacatgcctacccaccaaaacggcagctacttttttttgttgagatacactAA---CAA--AA----A-AA-A-----T-GTCTA--CC-------TACGTAC---CAAGTTG--TAAAAT-CTAAGGTCG--G-GCAAGGGGAAACAA---A--TA----TT-TTTAAATGTGACCTgaaa
gi|20 : tcaaaaCTT-GATCG--GAGGACAGT-AAACAC---A--CAT-T-TT-TTAAAG
gi|2 : tttttttctacgcgatttttgttaaaacagcccagattagttaaaatatggttaaaatgaacacttaccgacatttagatTA-GGTAA--GAGCACAGC-AAACAAT--C--TA--T-TT-TTAAAGGACGG
gi|6 : TA-GGTAG--GAGCACGGC-AAACAA---A--TTA-T-TT-TTTAAGGATGGCctcactcaaaattacagctacccaaacttttttattgactttcaaagcttttaatattttttttcatgatttctgttcatttttctttacaatgactgcaaaatcaaaatgttgaagcaaaaacaaagaagctacctacctacccacatgaataatactgagtcggagcacagcaaacaattatttttttaaggatagcctga
gi|7 : TA-GGTAG--GAGCACGGC-AAAC-A---A--TAT-A-TT-TATAAGACTGGctcattcgaaattgcagctagccaaactatttattgattaaagcattcaatttttttcatgatttatgtccatttttctttaaaatgactatgcaaattcaaaatttggccaaaaaaataaataagctacctaccacccacataaaaaatactggatcggagcgcagcaaacaaatattgtttaaaggatgac
gi|24 : TA-GGTAG--GAGCATGGC-AAACAA---A--TAT-T-TT-TTCAATGACGGctcactcaaaattacagctacccaaacttttttattgaccttgaaagcgctttttttcatgatttctgtccatatttcttaaaattgaccatgcaaattcaaaatttggcaacaaaaaataagctacctacccatatgaataatcctggatcggagcacaccaaactaatattgtttttaatgatggtc
gi|17 : -GGTAG--GAGCACAGC-AAACAAT--A--CA-----T-TTTAAGGACGGctcactctaccctgaagctgcc
gi|25 : --GAGCATGGC-AAACAATTTA--T-T-T-TT-TTTAAGAGCGGCCtcataattgtagcttcccaaacttttttattgactttcaatgcgtttaatttttttttgtgtgattaatgtccatttttctttaaaat
gi|8 : AGCACGAC-AAACAA------TATAT-TT-TTTAAGGATGGctatcaactt
gi|26 : ACAGC-AAACAA---A--GGA-T-TT-TTTAAGGATGGTCTacttcctactcactcaaaattgcagctacccaaaattttttattgactttcaaagtatttaaatttttttttcatgatttctgtccatttttcaaaatttggcaaaaaaaaaaagttagctacctacctacccacatgacaaatactgggcgatggagcacagcaaacaaagttgtttttttagcatggcctt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|23 ): GGCCGTTCTTCGAAAGTGATTGTTTGTCATACTCCTTTTTATATACCTAAATTGCAACTATCCCAA
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222 111111111111 222222
lowQualScore : 1 1 1 2 8888 1 1 3333 1 1 44444 22 1 4444 4444 555 2 333 55 1111111111111111111111111111111111111 2 55 2 0 777777777777 1 222222 2 2 0 2 5555 2 2 6666 33 2 0 8 33 1 2 33 5 2 33 5 2 2
lowQualScore : . . . . .... . . .... . . ..... .. . .... .... ... . ... .. ..................................... . .. . . ............ . ...... . . . . .... . . .... .. . . . .. . . .. . . .. . . .
lowQualScore : 9 9 9 2 4444 8 8 9999 8 9 88888 66 9 2222 5555 888 1 111 11 0000000000000000000000000000000000000 5 99 4 9 999999999999 1 555555 7 1 1 5 3333 5 7 7777 77 8 9 2 44 8 5 44 6 5 44 8 5 5
consensus : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAG--CTA-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA-TTTTTCTTTAAAATGAC-----T------ATGCAAAAT--CA--A-AATTTGGCAACAA-AA----A-AA-AAT---TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACTG-GGT--CGGAGCACAGC-AAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
Reference ( family-1526 ) : GCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAG--CTA-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA-TTTTTCTTTAAAATGAC-----T------ATGCAAAAT--C---A-AATTTGGCAACAA-AA----A-AA-AAT---TAGCTA--CCTACNTACCCGCATG--AAAAATACTG-GGT--CGGAGCACGGC-AAACAAA--TATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|1 : GCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-CG-TTTGGCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAACTGCAG--CTA-TCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CTAAGCATT--T-C---------A-C-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA-TTTTTCTTTAAAATGAC-----T------ATGCAAAAT--C---A-AATTTGGCAACAA-AA----A-AA-AAT---TAGCTA--CCTACATACATGCATG--AAAAATACTG-GGT--CAGAGCACAGC-AAACAAA--TATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|10 : CTT-A-ATATAATAT---T-TG-TTAGTCACGCTTCTA----CCTAT-CC-AC-----TGATAGCTACA----TA-CCCAATGTAACATTATTATGT-TTAT-ATCGACTTT-GATAGTATTGTT-ATTCCACCCCA-T-TCCCCTCCCCCTATACTTTC-CC--CATAAATTCTGTCCA-TTTTTGTTCAAAATGGC-----A------ATAAAAGAT--T---AGAATATG
gi|11 : ggccatacagtaGCCATCCTT-A-AAA-AA---A--T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAG--CTA-CCTCA----AC----TT---T-TT-T-ATTGAATTTAAAAAGCATT--T-A---------A-T-TT--------------TTTTCTT--CATGATTTCTGTCCA-TTTTTCTTTAAAATGAC-----G------ATGCAAAAT--C---------TGGAAATAA-A---------------------A--CCTACCTA----CATG--AAAAATACAA-GGT--CAGAGCACAGC-AAACAAA--CA---TT-TTTAAGGATGGCCtgaaatattgggttggagcatga
gi|12 : CCTT-A-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-CC-AC-----TCATAATTGCAG--CTA-CCCTA----AC----TT---T-TT-TAATTGACTTT-CAAAGCAT-----------------T-TT--------------CTTT-TT--CATGATTTCTGTCCACTTTTTGTTTAAAATGAT-----T------ATGCAAAAT--CA--A-AATTT--CAGGGA-AA----A-AACAAT---TAGCTA--CCTACTTACCCATATGAAAAAAATACTG-GGT--TGGAGCACAG
gi|13 : ccgaGCCGTCCTC-A-AAA-AATTTT--T-TT-TTTGCCATGCTGCTA----CCTAC-AT-AT-----TCAAAATTGCTG--TTA-CCCGC----AC----TT---T-TT---ATTAACTTT-CAAAGCATT----A---------A-T-TT--------------TTTT-TTTTCATGATT---------------TTCAAAAT--------T------TGGCAAAA-------A-AA------AACCC-AC----A-AA-AAC---TAGCTA--GCTACCTACCCACATG--AAAA----TG-AGT--TGGAACACAGC-AAACAAA--TATT-TT-TTTAA
gi|14 : gCATTCTT-ACAAA-AATAT---T-TG-TTTGCCGTGCCCTTACATGCCTAC-CC-AC------CAAAACGGCAG--CTA-CT--------T----TT---T-TT-T-GTTGAtggtt
gi|14 : AAAAA-AA----T-AA-AAA---TAACTATGCCTACATACTC--ATA--AAAAATACTG-GAT--CAGAGCACAGC-AAACA-----ATT-TTGTTGAAGGATGGCCTgatacactaaaaaaataaaaataactatgcctacatactcataaaaaatactggatcagagcacagcaaacaattttgttgaaggatggcctgaaa
gi|15 : cattcttacaaaaatatttgtttgccgtgcccttacatgcctacccaccaaaacggcagctacttttttttgttgagatacactCTT-G-AAA-A---TG--T-TAATTTTCAGTACTCCTT----CCTATGTCTAC-----T--ACATTGCAG--CTA-CCCAA----AC----AT---T-TT-A-ATTGAATTC-AAAAGCA---------------------T--------------TTTT-TT--CACGAATTCTGTCAA-TTTTgaaa
gi|16 : taagccggaCTATTCTT-C-AAA-AATATA--TGTG-TTTCCCATATATCTA----CGTGC-TC-ATGTAAATCGAAATCACAACTCTA-TCCAA----AC----TTA--T-TT-T-ATTTAATTT--AAAGTTGT--T-G---------A-T-TT--------------TTTgttcaactggacccaattattcaa
gi|17 : CCGTCCTT-A-AAA---TGTA--T-TG-TTTGCTGTGCTCCTA----CCT--------------CATAATTGTAG--CTT-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAATGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TTG-TGTGATTAATGTCCA-TTTTTCTTTAAAATatatgtttgttgctcac
gi|18 : A--T-TG-TTTGC-----TTCTA----CCTAC-CC-AC-----TTAGC-TTGCAA--C------------AT----TT---T-TT-T---TG---------------------------------TC--------------TTTT-TT--CATAAATTTTGTCCC-TTTTAGTTCAAAATGA-------------AT--AAAAT--TTCAA-AATCTGGTAACAA-AA----A-A
gi|19 : aataaaTTCTGTTC---TTTTGTTTGTTATCAC-----T------GT-CAGATTTTC---A-GATTTA--AATAG-AA----ATAA-AAT---C-------CCTACCTA----------AAATATTCTG-GAT--CCGAGCACTAC-AAACGAA--CATT-TT-T--AAGAATGACCTt
gi|2 : caCCGTCCTT-T-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCTGTGCTCTTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAG--CTA-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCTTT--T-A---------A-TATT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTTCA-TTTTTCTTTACAATGAC-------------TGCAAAAT--CA--A-AATGTTGAAGCAA-AA----A-CA-AAG---AAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AATAATACTG-AGT--CGGAGCACAGC-AAACAAT--TATT-TT-TTTAAGGATAGCCT
gi|20 : ACTTACCGACATT--TAGA-T-CTT-GAT--CGGAGGACAGT-AAACACA--CATT-TT-TTAAAGga
gi|21 : tttttttctacgcgatttttgttaaaacagcccagattagttaaaatatggttaaaatgaacAACAA-AA----A-AA-A-----TGTCTA--CCTACGTACCAAGTTG--TAAAAT-CTAAGGT--CGG-GCAAGGGGAAACAAA--TA---TT-TTTAAATGTGACCT
gi|22 : tcaaaaTCCTT-A-AAA-ATTGAA--T-TG-TTTAATGTGCTCCTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGGTA--CTT-CCCAA----AC----TT---TATT-T-ATT
gi|23 : tgGCCGTTCTT-C-GAA-AGTG-A--T-TG-TTTGTCATACTCCTT----TTTAT-AT-AC------CTAAATTGCAA--CTATCCCAA----
gi|24 : gCCGTCATTGA-AAA-AATAT---T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCTACCCTGAAG--CTG-CC
gi|25 : GCCGCTCTT-A-AAA-AAAATAAAT-TG-TTTGCCATGCTCCTA----TCAAC-T
gi|26 : gGGAAAACAGC-AAACAAA--GGAT-TT-TTTAAGGATGGTCTt
gi|3 : tTT-A-AAA-AAAAC---T-TG-TTTGCCGTACTCTTA----CCTAT-TC-AC-----TCAAAATTGCAG--CTA-CCCAA----AT----TT---T-TT-T-ATTGCCTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A---TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA-TTTTACTATAAAATAACTACTGT------ATGCAAAAT--CA--A-AATCTGGC-CCAA-AA----A-AA-AAT---CAGATT--CCTATATACCCACATA--AAAAATACTG-TGT--CAGAGCACAGC-AAACAAA--CACT-TT-TTTAAGGATGGCCTTgataga
gi|4 : GCCATCCTT-A-AAA-A-TATA--T-TG-TT-ACCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAAGTGCAG--CTA-CCCAA----AC----TT---T-TT-A-ATTGACTTT-CTAAGCATT--G-A---------A-T-AT--------------TTTG-TT--CATGATTTCTGTCCA-GTTTACTTTAAAATGAC-----T------ATTCAAAAT--CA--A-AATTTGGCAACAACAA----A-AA-AAA---TAGCTA--CCTA---A-CCACATG--AAAAATACTG-GGT--CGGAGCAAAGC-AAACAAA--TA-T-TT-TTTAAGGATGGCCTat
gi|5 : CATACTT-A-AAA-AA-A-A--C-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAATATTGCCG--CTA-CCTAA----AC-----T---T-TT-T-ATTGCCTTT-TAAAGCTTT--T-A---------ATT-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCAGTCCA-TTTTTCTGTAAAATGAC-----A------ATGCAAAAT--C---A-AATCTGGCAACAA-TG----A-AA-ATA---TAGCTA--CCTACCTACCTACATA--AAAATTACTG-AAT--CGGAGAAAAGC-AAACAAA--CATT-TT-TTTAAGAATGGTCa
gi|6 : GCCATCCTT-A-AAA-AATAAT--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AT-----TCGAAATTGCAG--CTA-GCCAA----AC----TA---T-TT---ATTGATT----AAAGCATT--C-A---------A-T-TT--------------T--T-TT--CATGATTTATGTCCA-TTTTTCTTTAAAATGAC-----T------ATGCAAATT--CA--A-AATTTGGCCAAAA-AA----A-TA-AAT---AAGCTA--CCTACC-ACCCACATA--AAAAATACTG-GAT--CGGAGCGCAGC-AAACAAA--TATT-GT-TTAAAGGATGACc
gi|7 : CCAGTCTT-A-TAA-A-TATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAG--CTA-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACCTT-GAAAGCG--------------------CT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA-TATTTCTTAAAATTGAC-----C------ATGCAAATT--CA--A-AATTTGGCAAC----A----A-AA-AAT---AAGCTA--CC----TACCCATATG--AATAATCCTG-GAT--CGGAGCACACC-AAACTAA--TATTGTT-TTTAATGATGGTC
gi|8 : CCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGTCGTGCTACTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAG--CTA-CCCAA----AA----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGTATT--TAA---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA-TTTTTC---A----------------------------------A-AATTTGGCAAAAA-AA----A-AA-AGT---TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--ACAAATACTG-GGCGATGGAGCACAGC-AAACAAAGTTGTT-TT-TTT-AGCATGGCCTT
gi|9 : TTCTT-A-AAA---TATG--T--G-TTTGCCATGCTCCTG----CCTAC-TC-AC-----TCAAAGGTGCAG--CTA-CCCAA----A-----TG---C-TT-T-ATTGAATTT-CAAAGCGTT--G-A---------A-T-TT--------------TGCC-CT----TAATTCCTTTCCA-ATTTC-------ATGAC-----TTTTTCCATG-AAAATA-C---A-AA------AACAA-AATCCGG-AA-AATATATAGTTA--CCTGCCTAACTACATG---AAAACACTG-GGT--CAGAGCAAAGC-AAACAAA--CA-T-GT-TTTAAGAA
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222 1111111111 111111
lowQualScore : 2 2 1 8888 1 1 3333 1 1 44444 22 1 4444 4444 555 2 333 55 1111111111111111111111111111111111111 2 55 2222222222 0 111111 2 33 33 0 2 2 2 2 2 666 33 33 1 2 33 2 444 5 2 2
lowQualScore : . . . .... . . .... . . ..... .. . .... .... ... . ... .. ..................................... . .. .......... . ...... . .. .. . . . . . . ... .. .. . . .. . ... . . .
lowQualScore : 0 0 9 4444 8 8 9999 8 9 88888 66 9 2222 5555 888 1 111 11 0000000000000000000000000000000000000 5 99 6666666666 4 888888 1 44 44 2 4 7 5 5 7 555 77 44 8 5 44 4 666 8 5 5
consensus : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
Reference ( family-1526 ) : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|1 : GCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-CG-TTTGGCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAACTGCAGCT--A-TCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CTAAGCATT--T-C---------A-C-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--C-AAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACATACATGCATG--AAAAATACT-GGGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--TATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|10 : GTACTT-A-ATATAATAT---T-TG-TTAGTCACGCTTCTA----CCTAT-CC-AC-----TGATAGCTACA--T--A-CCCAATGTAACATTATTATGT-TTAT-ATCGACTTT-GATAGTATTGTT-ATTCCACCCCA-T-TCCCCTCCCCCTATACTTTC-CC--CATAAATTCTGTCCA----------TTTTTGTTCAAAATGGC-----AATAAAAGA--T--TAGAATATG
gi|11 : ggccatacaGCCATCCTT-A-AAA-AA---A--T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCTCA----AC----TT---T-TT-T-ATTGAATTTAAAAAGCATT--T-A---------A-T-TT--------------TTTTCTT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----GATGCAAAA--T--C------TGGAAATAA-A---------------------ACCTACCTACATG--AAAAATACA-AGGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--CA---TT-TTTAAGGATGGCCtgaaatattgggttggagcatga
gi|12 : CCGACCTT-A-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-CC-AC-----TCATAATTGCAGCT--A-CCCTA----AC----TT---T-TT-TAATTGACTTT-CAAAGCAT-----------------T-TT--------------CTTT-TT--CATGATTTCTGTCCAC---------TTTTTGTTTAAAATGAT-----TATGCAAAA--T--CAAAATTT--CAGGGA-AAA-AACAAT-TAGCTA--CCTACTTACCCATATGAAAAAAATACT-GGGT--TGGAGC-ACAG
gi|13 : GCCGTCCTC-A-AAA-AATTTT--T-TT-TTTGCCATGCTGCTA----CCTAC-AT-AT-----TCAAAATTGCTGTT--A-CCCGC----AC----TT---T-TT---ATTAACTTT-CAAAGCATT----A---------A-T-TT--------------TTTT-TTTTCATGATT------------------------TTCAAAAT--------TTGGCAAAA------AAA-------AACCC-ACA-AA-AAC-TAGCTA--GCTACCTACCCACATG--AAAA----T-GAGT--TGGAAC-ACAGCAAACAAA--TATT-TT-TTTAA
gi|14 : gCATTCTT-ACAAA-AATAT---T-TG-TTTGCCGTGCCCTTACATGCCTAC-CC-AC------CAAAACGGCAGCT--A-CT--------T----TT---T-TT-T-GTTGAtggtt
gi|14 : AAAAA-AAT-AA-AAA-TAACTATGCCTACATACTCATA----AAAAATACT-GGAT--CAGAGC-ACAGCAAACA-----ATT-TTGTTGAAGGATGGCCTgatacactaaaaaaataaaaataactatgcctacatactcataaaaaatactggatcagagcacagcaaacaattttgttgaaggatggcctgaaa
gi|15 : cattcttacaaaaatatttgtttgccgtgcccttacatgcctacccaccaaaacggcagctacttttttttgttgagatacactGCCGGACTT-G-AAA-A---TG--T-TAATTTTCAGTACTCCTT----CCTATGTCTAC-----T--ACATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----AT---T-TT-A-ATTGAATTC-AAAAGCA---------------------T--------------TTTT-TT--CACGAATTCTGTCAA----------TTTTgaaa
gi|16 : taaTTCTT-C-AAA-AATATA--TGTG-TTTCCCATATATCTA----CGTGC-TC-ATGTAAATCGAAATCACAACTCTA-TCCAA----AC----TTA--T-TT-T-ATTTAATTT--AAAGTTGT--T-G---------A-T-TT--------------TTTgttcaactggacccaattattcaa
gi|17 : ctaCCGTCCTT-A-AAA---TGTA--T-TG-TTTGCTGTGCTCCTA----CCT--------------CATAATTGTAGCT--T-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAATGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TTG-TGTGATTAATGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATatatgtttgttgctcac
gi|18 : A--T-TG-TTTGC-----TTCTA----CCTAC-CC-AC-----TTAGC-TTGCAAC--------------AT----TT---T-TT-T---TG---------------------------------TC--------------TTTT-TT--CATAAATTTTGTCCC----------TTTTAGTTCAAAATGA-------AT--AAAATTT--CAAAATCTGGTAACAA-AAA-A
gi|19 : aataaaTTCTGTTC------------TTTTGTTTGTTATCAC-----TGT-CAGAT--TTTCAGA-TTTA--AATAG-AAATAA-AAT-C-------CCTACCTA----------AAATATTCT-GGAT--CCGAGC-ACTACAAACGAA--CATT----TTTAAGAATGACCTt
gi|2 : caCCGTCCTT-T-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCTGTGCTCTTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCTTT--T-A---------A-TATT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTTCA----------TTTTTCTTTACAATGAC-------TGCAAAA--T--CAAAATGTTGAAGCAA-AAA-CA-AAG-AAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AATAATACT-GAGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAT--TATT-TT-TTTAAGGATAGCCT
gi|20 : ACTTACCGACATT--TAGA-T-CT-TGAT--CGGAGG-ACAGTAAACACA--CATT-TT-TTAAAGga
gi|21 : tttttttctacgcgatttttgttaaaacagcccagattagttaaaatatggttaaaatgaac--T--CAAAA------AACAA-AAA-AA-A---TGTCTA--CCTACGTACCAAGTTG--TAAAAT-CTAAGGT--CGG-GCAAGGGGAAACAAA--TA---TT-TTTAAATGTGACCT
gi|22 : GTCCTT-A-AAA-ATTGAA--T-TG-TTTAATGTGCTCCTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGGTACT--T-CCCAA----AC----TT---TATT-T-ATT
gi|23 : tGCCGTTCTT-C-GAA-AGTG-A--T-TG-TTTGTCATACTCCTT----TTTAT-AT-AC------CTAAATTGCAACT--ATCCCAA----
gi|24 : gCCGTCATTGA-AAA-AATAT---T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCTACCCTGAAGCT--G-CC
gi|25 : GCCGCTCTT-A-AAA-AAAATAAAT-TG-TTTGCCATGCTCCTA----TCAAC-T
gi|26 : gGGAAA-ACAGCAAACAAA--GGAT-TT-TTTAAGGATGGTCTt
gi|3 : tTT-A-AAA-AAAAC---T-TG-TTTGCCGTACTCTTA----CCTAT-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AT----TT---T-TT-T-ATTGCCTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A---TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTACTATAAAATAACTACTGTATGCAAAA--T--CAAAATCTGGC-CCAA-AAA-AA-AAT-CAGATT--CCTATATACCCACATA--AAAAATACT-GTGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--CACT-TT-TTTAAGGATGGCCTTgataga
gi|4 : GCCATCCTT-A-AAA-A-TATA--T-TG-TT-ACCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAAGTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-A-ATTGACTTT-CTAAGCATT--G-A---------A-T-AT--------------TTTG-TT--CATGATTTCTGTCCA----------GTTTACTTTAAAATGAC-----TATTCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAACAAA-AA-AAA-TAGCTA--CCTA---A-CCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-AAAGCAAACAAA--TA-T-TT-TTTAAGGATGGCCTat
gi|5 : CTT-A-AAA-AA-A-A--C-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAATATTGCCGCT--A-CCTAA----AC-----T---T-TT-T-ATTGCCTTT-TAAAGCTTT--T-A---------ATT-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCAGTCCA----------TTTTTCTGTAAAATGAC-----AATGCAAAA--T--C-AAATCTGGCAACAA-TGA-AA-ATA-TAGCTA--CCTACCTACCTACATA--AAAATTACT-GAAT--CGGAGA-AAAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGAATGGTCa
gi|6 : cataGCCATCCTT-A-AAA-AATAAT--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AT-----TCGAAATTGCAGCT--A-GCCAA----AC----TA---T-TT---ATTGATT----AAAGCATT--C-A---------A-T-TT--------------T--T-TT--CATGATTTATGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAT--T--CAAAATTTGGCCAAAA-AAA-TA-AAT-AAGCTA--CCTACC-ACCCACATA--AAAAATACT-GGAT--CGGAGC-GCAGCAAACAAA--TATT-GT-TTAAAGGATGACc
gi|7 : A-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACCTT-GAAAGCG--------------------CT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TATTTCTTAAAATTGAC-----CATGCAAAT--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-A------TA---A--GCTACCTACCCATATG--AATAATCCT-GGAT--CGGAGC-ACACCAAACTAA--TATTGTT-TTTAATGATGGTC
gi|8 : ccagtcttatCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGTCGTGCTACTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AA----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGTATT--TAA---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTT-----------------------------T--CAAAATTTGGCAAAAA-AAA-AA-AGT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--ACAAATACT-GGGCGATGGAGC-ACAGCAAACAAAGTTGTT-TT-TTT-AGCATGGCCTT
gi|9 : TTCTT-A-AAA---TATG--T--G-TTTGCCATGCTCCTG----CCTAC-TC-AC-----TCAAAGGTGCAGCT--A-CCCAA----A-----TG---C-TT-T-ATTGAATTT-CAAAGCGTT--G-A---------A-T-TT--------------TGCC-CT----TAATTCCTTTCCAATTTCATGACTTTTTCCATGAAA----------ATACAAAA--A--CAAAATCCGG--------AA-AA-TATATAGTTA--CCTGCCTAACTACATG---AAAACACT-GGGT--CAGAGC-AAAGCAAACAAA--CA-T-GT-TTTAAGAA
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222 1111111111 111111
lowQualScore : 2 2 1 8888 1 1 3333 1 1 44444 22 1 4444 4444 555 2 333 55 1111111111111111111111111111111111111 2 55 2222222222 0 111111 2 33 33 0 2 2 2 2 2 666 33 33 1 2 33 2 444 5 2 2
lowQualScore : . . . .... . . .... . . ..... .. . .... .... ... . ... .. ..................................... . .. .......... . ...... . .. .. . . . . . . ... .. .. . . .. . ... . . .
lowQualScore : 0 0 9 4444 8 8 9999 8 9 88888 66 9 2222 5555 888 1 111 11 0000000000000000000000000000000000000 5 99 6666666666 4 888888 1 44 44 2 4 7 5 5 7 555 77 44 8 5 44 4 666 8 5 5
consensus : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
Reference ( family-1526 ) : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|1 : GCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-CG-TTTGGCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAACTGCAGCT--A-TCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CTAAGCATT--T-C---------A-C-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--C-AAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACATACATGCATG--AAAAATACT-GGGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--TATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|10 : GTACTT-A-ATATAATAT---T-TG-TTAGTCACGCTTCTA----CCTAT-CC-AC-----TGATAGCTACA--T--A-CCCAATGTAACATTATTATGT-TTAT-ATCGACTTT-GATAGTATTGTT-ATTCCACCCCA-T-TCCCCTCCCCCTATACTTTC-CC--CATAAATTCTGTCCA----------TTTTTGTTCAAAATGGC-----AATAAAAGA--T--TAGAATATG
gi|11 : ggccatacaGCCATCCTT-A-AAA-AA---A--T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCTCA----AC----TT---T-TT-T-ATTGAATTTAAAAAGCATT--T-A---------A-T-TT--------------TTTTCTT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----GATGCAAAA--T--C------TGGAAATAA-A---------------------ACCTACCTACATG--AAAAATACA-AGGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--CA---TT-TTTAAGGATGGCCtgaaatattgggttggagcatga
gi|12 : CCGACCTT-A-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-CC-AC-----TCATAATTGCAGCT--A-CCCTA----AC----TT---T-TT-TAATTGACTTT-CAAAGCAT-----------------T-TT--------------CTTT-TT--CATGATTTCTGTCCAC---------TTTTTGTTTAAAATGAT-----TATGCAAAA--T--CAAAATTT--CAGGGA-AAA-AACAAT-TAGCTA--CCTACTTACCCATATGAAAAAAATACT-GGGT--TGGAGC-ACAG
gi|13 : GCCGTCCTC-A-AAA-AATTTT--T-TT-TTTGCCATGCTGCTA----CCTAC-AT-AT-----TCAAAATTGCTGTT--A-CCCGC----AC----TT---T-TT---ATTAACTTT-CAAAGCATT----A---------A-T-TT--------------TTTT-TTTTCATGATT------------------------TTCAAAAT--------TTGGCAAAA------AAA-------AACCC-ACA-AA-AAC-TAGCTA--GCTACCTACCCACATG--AAAA----T-GAGT--TGGAAC-ACAGCAAACAAA--TATT-TT-TTTAA
gi|14 : gCATTCTT-ACAAA-AATAT---T-TG-TTTGCCGTGCCCTTACATGCCTAC-CC-AC------CAAAACGGCAGCT--A-CT--------T----TT---T-TT-T-GTTGAtggtt
gi|14 : AAAAA-AAT-AA-AAA-TAACTATGCCTACATACTCATA----AAAAATACT-GGAT--CAGAGC-ACAGCAAACA-----ATT-TTGTTGAAGGATGGCCTgatacactaaaaaaataaaaataactatgcctacatactcataaaaaatactggatcagagcacagcaaacaattttgttgaaggatggcctgaaa
gi|15 : cattcttacaaaaatatttgtttgccgtgcccttacatgcctacccaccaaaacggcagctacttttttttgttgagatacactGCCGGACTT-G-AAA-A---TG--T-TAATTTTCAGTACTCCTT----CCTATGTCTAC-----T--ACATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----AT---T-TT-A-ATTGAATTC-AAAAGCA---------------------T--------------TTTT-TT--CACGAATTCTGTCAA----------TTTTgaaa
gi|16 : taaTTCTT-C-AAA-AATATA--TGTG-TTTCCCATATATCTA----CGTGC-TC-ATGTAAATCGAAATCACAACTCTA-TCCAA----AC----TTA--T-TT-T-ATTTAATTT--AAAGTTGT--T-G---------A-T-TT--------------TTTgttcaactggacccaattattcaa
gi|17 : ctaCCGTCCTT-A-AAA---TGTA--T-TG-TTTGCTGTGCTCCTA----CCT--------------CATAATTGTAGCT--T-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAATGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TTG-TGTGATTAATGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATatatgtttgttgctcac
gi|18 : A--T-TG-TTTGC-----TTCTA----CCTAC-CC-AC-----TTAGC-TTGCAAC--------------AT----TT---T-TT-T---TG---------------------------------TC--------------TTTT-TT--CATAAATTTTGTCCC----------TTTTAGTTCAAAATGA-------AT--AAAATTT--CAAAATCTGGTAACAA-AAA-A
gi|19 : aataaaTTCTGTTC------------TTTTGTTTGTTATCAC-----TGT-CAGAT--TTTCAGA-TTTA--AATAG-AAATAA-AAT-C-------CCTACCTA----------AAATATTCT-GGAT--CCGAGC-ACTACAAACGAA--CATT----TTTAAGAATGACCTt
gi|2 : caCCGTCCTT-T-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCTGTGCTCTTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCTTT--T-A---------A-TATT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTTCA----------TTTTTCTTTACAATGAC-------TGCAAAA--T--CAAAATGTTGAAGCAA-AAA-CA-AAG-AAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AATAATACT-GAGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAT--TATT-TT-TTTAAGGATAGCCT
gi|20 : ACTTACCGACATT--TAGA-T-CT-TGAT--CGGAGG-ACAGTAAACACA--CATT-TT-TTAAAGga
gi|21 : tttttttctacgcgatttttgttaaaacagcccagattagttaaaatatggttaaaatgaac--T--CAAAA------AACAA-AAA-AA-A---TGTCTA--CCTACGTACCAAGTTG--TAAAAT-CTAAGGT--CGG-GCAAGGGGAAACAAA--TA---TT-TTTAAATGTGACCT
gi|22 : GTCCTT-A-AAA-ATTGAA--T-TG-TTTAATGTGCTCCTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGGTACT--T-CCCAA----AC----TT---TATT-T-ATT
gi|23 : tGCCGTTCTT-C-GAA-AGTG-A--T-TG-TTTGTCATACTCCTT----TTTAT-AT-AC------CTAAATTGCAACT--ATCCCAA----
gi|24 : gCCGTCATTGA-AAA-AATAT---T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCTACCCTGAAGCT--G-CC
gi|25 : GCCGCTCTT-A-AAA-AAAATAAAT-TG-TTTGCCATGCTCCTA----TCAAC-T
gi|26 : gGGAAA-ACAGCAAACAAA--GGAT-TT-TTTAAGGATGGTCTt
gi|3 : tTT-A-AAA-AAAAC---T-TG-TTTGCCGTACTCTTA----CCTAT-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AT----TT---T-TT-T-ATTGCCTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A---TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTACTATAAAATAACTACTGTATGCAAAA--T--CAAAATCTGGC-CCAA-AAA-AA-AAT-CAGATT--CCTATATACCCACATA--AAAAATACT-GTGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--CACT-TT-TTTAAGGATGGCCTTgataga
gi|4 : GCCATCCTT-A-AAA-A-TATA--T-TG-TT-ACCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAAGTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-A-ATTGACTTT-CTAAGCATT--G-A---------A-T-AT--------------TTTG-TT--CATGATTTCTGTCCA----------GTTTACTTTAAAATGAC-----TATTCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAACAAA-AA-AAA-TAGCTA--CCTA---A-CCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-AAAGCAAACAAA--TA-T-TT-TTTAAGGATGGCCTat
gi|5 : CTT-A-AAA-AA-A-A--C-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAATATTGCCGCT--A-CCTAA----AC-----T---T-TT-T-ATTGCCTTT-TAAAGCTTT--T-A---------ATT-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCAGTCCA----------TTTTTCTGTAAAATGAC-----AATGCAAAA--T--C-AAATCTGGCAACAA-TGA-AA-ATA-TAGCTA--CCTACCTACCTACATA--AAAATTACT-GAAT--CGGAGA-AAAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGAATGGTCa
gi|6 : cataGCCATCCTT-A-AAA-AATAAT--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AT-----TCGAAATTGCAGCT--A-GCCAA----AC----TA---T-TT---ATTGATT----AAAGCATT--C-A---------A-T-TT--------------T--T-TT--CATGATTTATGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAT--T--CAAAATTTGGCCAAAA-AAA-TA-AAT-AAGCTA--CCTACC-ACCCACATA--AAAAATACT-GGAT--CGGAGC-GCAGCAAACAAA--TATT-GT-TTAAAGGATGACc
gi|7 : A-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACCTT-GAAAGCG--------------------CT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TATTTCTTAAAATTGAC-----CATGCAAAT--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-A------TA---A--GCTACCTACCCATATG--AATAATCCT-GGAT--CGGAGC-ACACCAAACTAA--TATTGTT-TTTAATGATGGTC
gi|8 : ccagtcttatCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGTCGTGCTACTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AA----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGTATT--TAA---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTT-----------------------------T--CAAAATTTGGCAAAAA-AAA-AA-AGT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--ACAAATACT-GGGCGATGGAGC-ACAGCAAACAAAGTTGTT-TT-TTT-AGCATGGCCTT
gi|9 : TTCTT-A-AAA---TATG--T--G-TTTGCCATGCTCCTG----CCTAC-TC-AC-----TCAAAGGTGCAGCT--A-CCCAA----A-----TG---C-TT-T-ATTGAATTT-CAAAGCGTT--G-A---------A-T-TT--------------TGCC-CT----TAATTCCTTTCCAATTTCATGACTTTTTCCATGAAA----------ATACAAAA--A--CAAAATCCGG--------AA-AA-TATATAGTTA--CCTGCCTAACTACATG---AAAACACT-GGGT--CAGAGC-AAAGCAAACAAA--CA-T-GT-TTTAAGAA
blockSeqs : G C T TAAA G A CATG G T GTAAA CT T TGTA ATTA ATG A AT AA ATTGTTATTCCACCCCATTCCCCTCCCCCTATAC C TT ATTTCATGAC TACTGT A TT TT A A C T C ATA TG AA A A GA A GTT T G G
blockSeqs : . . . GA . . . . . . . . . . A . TA G TTTTAATATT . G C A G . . T C . . . AT . . A . . . C T . .
blockSeqs : . . . TT . . . . . . . . . . . . T C TTTTAATTTT . . . G G . . C T . . . AC . . A . . . T T . .
blockSeqs : . . . TG . . . . . . . . . . . . T C ATTTAAATTT . . . T G . . T A . . . AA . . T . . . C T . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . . . . . . . A A ATTTAATTT . . . T G . . G C . . . AT . . A . . . T T . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . . . . . . . T C TGTTGATTT . . . T G . . C C . . . AG . . A . . . C A . .
blockSeqs : . . . GA . . . . . . . . . . . . T C GTTTAATTT . . . T T . . T C . . . AT . . A . . . T C . .
blockSeqs : . . . AA . . . . . . . . . . . . T C ATTGAATAT . . . A G . . C C . . . AA . . A . . . G T . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . . . . . . . T C ATTCAATTT . . . T G . . T C . . . TA . . A . . . C T . .
blockSeqs : . . . AT . . . . . . . . . . . . T T GTTGAATTT . . . C G . . T C . . . AT . . C . . . T T . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . . . . . . . T G ATTAATTT . . . . A . . T . . . . GT . . A . . . C T . .
blockSeqs : . . . TA . . . . . . . . . . . . A C GTTTAATT . . . . . . . C . . . . . . . A . . . T . . .
blockSeqs : . . . TG . . . . . . . . . . . . T C ATTTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . T . GCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . T . AT . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . T . TC . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
finalCons : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222 1111111111 111111
lowQualScore : 2 2 1 8888 1 1 3333 1 1 44444 22 1 4444 4444 555 2 333 55 1111111111111111111111111111111111111 2 55 2222222222 0 111111 2 33 33 0 2 2 2 2 2 666 33 33 1 2 33 2 444 5 2 2
lowQualScore : . . . .... . . .... . . ..... .. . .... .... ... . ... .. ..................................... . .. .......... . ...... . .. .. . . . . . . ... .. .. . . .. . ... . . .
lowQualScore : 0 0 9 4444 8 8 9999 8 9 88888 66 9 2222 5555 888 1 111 11 0000000000000000000000000000000000000 5 99 6666666666 4 888888 1 44 44 2 4 7 5 5 7 555 77 44 8 5 44 4 666 8 5 5
consensus : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
Reference ( family-1526 ) : GCCGTCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|1 : GCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-CG-TTTGGCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAACTGCAGCT--A-TCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CTAAGCATT--T-C---------A-C-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAA--T--C-AAATTTGGCAACAA-AAA-AA-AAT-TAGCTA--CCTACATACATGCATG--AAAAATACT-GGGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--TATT-TT-TTTAAGGATGGCCTT
gi|10 : GTACTT-A-ATATAATAT---T-TG-TTAGTCACGCTTCTA----CCTAT-CC-AC-----TGATAGCTACA--T--A-CCCAATGTAACATTATTATGT-TTAT-ATCGACTTT-GATAGTATTGTT-ATTCCACCCCA-T-TCCCCTCCCCCTATACTTTC-CC--CATAAATTCTGTCCA----------TTTTTGTTCAAAATGGC-----AATAAAAGA--T--TAGAATATG
gi|11 : ggccatacaGCCATCCTT-A-AAA-AA---A--T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCTCA----AC----TT---T-TT-T-ATTGAATTTAAAAAGCATT--T-A---------A-T-TT--------------TTTTCTT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----GATGCAAAA--T--C------TGGAAATAA-A---------------------ACCTACCTACATG--AAAAATACA-AGGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--CA---TT-TTTAAGGATGGCCtgaaatattgggttggagcatga
gi|12 : CCGACCTT-A-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-CC-AC-----TCATAATTGCAGCT--A-CCCTA----AC----TT---T-TT-TAATTGACTTT-CAAAGCAT-----------------T-TT--------------CTTT-TT--CATGATTTCTGTCCAC---------TTTTTGTTTAAAATGAT-----TATGCAAAA--T--CAAAATTT--CAGGGA-AAA-AACAAT-TAGCTA--CCTACTTACCCATATGAAAAAAATACT-GGGT--TGGAGC-ACAG
gi|13 : GCCGTCCTC-A-AAA-AATTTT--T-TT-TTTGCCATGCTGCTA----CCTAC-AT-AT-----TCAAAATTGCTGTT--A-CCCGC----AC----TT---T-TT---ATTAACTTT-CAAAGCATT----A---------A-T-TT--------------TTTT-TTTTCATGATT------------------------TTCAAAAT--------TTGGCAAAA------AAA-------AACCC-ACA-AA-AAC-TAGCTA--GCTACCTACCCACATG--AAAA----T-GAGT--TGGAAC-ACAGCAAACAAA--TATT-TT-TTTAA
gi|14 : gCATTCTT-ACAAA-AATAT---T-TG-TTTGCCGTGCCCTTACATGCCTAC-CC-AC------CAAAACGGCAGCT--A-CT--------T----TT---T-TT-T-GTTGAtggtt
gi|14 : AAAAA-AAT-AA-AAA-TAACTATGCCTACATACTCATA----AAAAATACT-GGAT--CAGAGC-ACAGCAAACA-----ATT-TTGTTGAAGGATGGCCTgatacactaaaaaaataaaaataactatgcctacatactcataaaaaatactggatcagagcacagcaaacaattttgttgaaggatggcctgaaa
gi|15 : cattcttacaaaaatatttgtttgccgtgcccttacatgcctacccaccaaaacggcagctacttttttttgttgagatacactGCCGGACTT-G-AAA-A---TG--T-TAATTTTCAGTACTCCTT----CCTATGTCTAC-----T--ACATTGCAGCT--A-CCCAA----AC----AT---T-TT-A-ATTGAATTC-AAAAGCA---------------------T--------------TTTT-TT--CACGAATTCTGTCAA----------TTTTgaaa
gi|16 : taaTTCTT-C-AAA-AATATA--TGTG-TTTCCCATATATCTA----CGTGC-TC-ATGTAAATCGAAATCACAACTCTA-TCCAA----AC----TTA--T-TT-T-ATTTAATTT--AAAGTTGT--T-G---------A-T-TT--------------TTTgttcaactggacccaattattcaa
gi|17 : ctaCCGTCCTT-A-AAA---TGTA--T-TG-TTTGCTGTGCTCCTA----CCT--------------CATAATTGTAGCT--T-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAATGCGTT--T-A---------A-T-TT--------------TTTT-TTG-TGTGATTAATGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATatatgtttgttgctcac
gi|18 : A--T-TG-TTTGC-----TTCTA----CCTAC-CC-AC-----TTAGC-TTGCAAC--------------AT----TT---T-TT-T---TG---------------------------------TC--------------TTTT-TT--CATAAATTTTGTCCC----------TTTTAGTTCAAAATGA-------AT--AAAATTT--CAAAATCTGGTAACAA-AAA-A
gi|19 : aataaaTTCTGTTC------------TTTTGTTTGTTATCAC-----TGT-CAGAT--TTTCAGA-TTTA--AATAG-AAATAA-AAT-C-------CCTACCTA----------AAATATTCT-GGAT--CCGAGC-ACTACAAACGAA--CATT----TTTAAGAATGACCTt
gi|2 : caCCGTCCTT-T-AAA-AATAGA--T-TG-TTTGCTGTGCTCTTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGCTTT--T-A---------A-TATT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTTCA----------TTTTTCTTTACAATGAC-------TGCAAAA--T--CAAAATGTTGAAGCAA-AAA-CA-AAG-AAGCTA--CCTACCTACCCACATG--AATAATACT-GAGT--CGGAGC-ACAGCAAACAAT--TATT-TT-TTTAAGGATAGCCT
gi|20 : ACTTACCGACATT--TAGA-T-CT-TGAT--CGGAGG-ACAGTAAACACA--CATT-TT-TTAAAGga
gi|21 : tttttttctacgcgatttttgttaaaacagcccagattagttaaaatatggttaaaatgaac--T--CAAAA------AACAA-AAA-AA-A---TGTCTA--CCTACGTACCAAGTTG--TAAAAT-CTAAGGT--CGG-GCAAGGGGAAACAAA--TA---TT-TTTAAATGTGACCT
gi|22 : GTCCTT-A-AAA-ATTGAA--T-TG-TTTAATGTGCTCCTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGGTACT--T-CCCAA----AC----TT---TATT-T-ATT
gi|23 : tGCCGTTCTT-C-GAA-AGTG-A--T-TG-TTTGTCATACTCCTT----TTTAT-AT-AC------CTAAATTGCAACT--ATCCCAA----
gi|24 : gCCGTCATTGA-AAA-AATAT---T-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCTACCCTGAAGCT--G-CC
gi|25 : GCCGCTCTT-A-AAA-AAAATAAAT-TG-TTTGCCATGCTCCTA----TCAAC-T
gi|26 : gGGAAA-ACAGCAAACAAA--GGAT-TT-TTTAAGGATGGTCTt
gi|3 : tTT-A-AAA-AAAAC---T-TG-TTTGCCGTACTCTTA----CCTAT-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AT----TT---T-TT-T-ATTGCCTTT-CAAAGCGTT--T-A---------A---TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTTACTATAAAATAACTACTGTATGCAAAA--T--CAAAATCTGGC-CCAA-AAA-AA-AAT-CAGATT--CCTATATACCCACATA--AAAAATACT-GTGT--CAGAGC-ACAGCAAACAAA--CACT-TT-TTTAAGGATGGCCTTgataga
gi|4 : GCCATCCTT-A-AAA-A-TATA--T-TG-TT-ACCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAAGTGCAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-A-ATTGACTTT-CTAAGCATT--G-A---------A-T-AT--------------TTTG-TT--CATGATTTCTGTCCA----------GTTTACTTTAAAATGAC-----TATTCAAAA--T--CAAAATTTGGCAACAACAAA-AA-AAA-TAGCTA--CCTA---A-CCACATG--AAAAATACT-GGGT--CGGAGC-AAAGCAAACAAA--TA-T-TT-TTTAAGGATGGCCTat
gi|5 : CTT-A-AAA-AA-A-A--C-TG-TTTGCCATGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAATATTGCCGCT--A-CCTAA----AC-----T---T-TT-T-ATTGCCTTT-TAAAGCTTT--T-A---------ATT-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCAGTCCA----------TTTTTCTGTAAAATGAC-----AATGCAAAA--T--C-AAATCTGGCAACAA-TGA-AA-ATA-TAGCTA--CCTACCTACCTACATA--AAAATTACT-GAAT--CGGAGA-AAAGCAAACAAA--CATT-TT-TTTAAGAATGGTCa
gi|6 : cataGCCATCCTT-A-AAA-AATAAT--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AT-----TCGAAATTGCAGCT--A-GCCAA----AC----TA---T-TT---ATTGATT----AAAGCATT--C-A---------A-T-TT--------------T--T-TT--CATGATTTATGTCCA----------TTTTTCTTTAAAATGAC-----TATGCAAAT--T--CAAAATTTGGCCAAAA-AAA-TA-AAT-AAGCTA--CCTACC-ACCCACATA--AAAAATACT-GGAT--CGGAGC-GCAGCAAACAAA--TATT-GT-TTAAAGGATGACc
gi|7 : A-AATATA--T-TG-TTTGCCGTGCTCCTA----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTACAGCT--A-CCCAA----AC----TT---T-TT-T-ATTGACCTT-GAAAGCG--------------------CT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TATTTCTTAAAATTGAC-----CATGCAAAT--T--CAAAATTTGGCAACAA-AAA-A------TA---A--GCTACCTACCCATATG--AATAATCCT-GGAT--CGGAGC-ACACCAAACTAA--TATTGTT-TTTAATGATGGTC
gi|8 : ccagtcttatCCATCCTT-A-AAA-AATATA--T-TG-TTTGTCGTGCTACTT----CCTAC-TC-AC-----TCAAAATTGCAGCT--A-CCCAA----AA----TT---T-TT-T-ATTGACTTT-CAAAGTATT--TAA---------A-T-TT--------------TTTT-TT--CATGATTTCTGTCCA----------TTTT-----------------------------T--CAAAATTTGGCAAAAA-AAA-AA-AGT-TAGCTA--CCTACCTACCCACATG--ACAAATACT-GGGCGATGGAGC-ACAGCAAACAAAGTTGTT-TT-TTT-AGCATGGCCTT
gi|9 : TTCTT-A-AAA---TATG--T--G-TTTGCCATGCTCCTG----CCTAC-TC-AC-----TCAAAGGTGCAGCT--A-CCCAA----A-----TG---C-TT-T-ATTGAATTT-CAAAGCGTT--G-A---------A-T-TT--------------TGCC-CT----TAATTCCTTTCCAATTTCATGACTTTTTCCATGAAA----------ATACAAAA--A--CAAAATCCGG--------AA-AA-TATATAGTTA--CCTGCCTAACTACATG---AAAACACT-GGGT--CAGAGC-AAAGCAAACAAA--CA-T-GT-TTTAAGAA