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Reference ( gi|5 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CATTTT-TCAAAGAGTAGATCCGCTATTTACACAGGCTT-ACACGTAGTTAAAATTGTTT-CATCTTAGA--------AA-G-ATTCTGAATG---ATG-------------TCACGC--AGTAT--TTTAAGTGGTG--TCTATTTTTAAAATGGGAGATTTCGTTTCAAGATTACTGTTCCAATTTAAATATTGATTTT----GTCACGTTTTTGTGGA---TTTGAC--ATTCGAAACCATTCGAATT-------T------T-------A------AGT----ATT-------A-------TGAGATGCTTTT-TATCCATTTT-AA-AAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTAAAAGCGTTTTTT-CCTGA--TA----CATTTCC-TTTAA-G-------AATTAAAAGGTAGAGGCCTCACCTATATTG---CCGATA--TTTTTTCTATCTTAGCAGTAAAA-------CT-GCACATCTATATCAAACAT---CG---TA-CA------TC---A-TGGATATTCCGT-----T-T-AA-T-A--TTGTAT-ATTGTA-TTCC--ATCTCTCTAGTATAAAATTCTTTA--------ATTTTGTTGACCAAATATT-AAATA----AATCGCAGCCCGTGATAAA----GTCACTCATT-GGTCAGTATT-GGGTTATGCTAAAAC-TTTGACGAATAAAACAGATAA--T--GCCAACCTGTGTATTAATGAATTTCTCATAAATAAGATAAA-CTA--CAAGGAAGGAATCAACCACTG-TCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                        aatagttttcaattattttaaaataaagaaaagcagtgactcttggtaattaaccatcctttaaaagttaatacttccttaaagggaatgtattaggttttccaatacatcatgcttatatatactcactgaccccttattgccaaaagtatatctatttaaccatgccaatataataaattaaaaagggatttcctaacttgggctactcaccttagactaaaatatggGATCCGTTGT----ACAGGTTT-GCATGTAGT-AAAATTGTTT-CATTATAGA--------AA-G-AGTCTGAATGACAATGTGAAGGGCA----TCAAGC--AATA---TTGAAGAGCCG--TTTA-TCTTAAGAAGGGA-ATTTGGCTTCAGATTTACCACACCAATTTAAATTTCGATTTT----GTATTATTTGGGTGGA---TTTGAC--ACACTATACCATTCGGATTATATTTAT------T-------A------AATAATGATA-------A-------CGAGATGCTTTT-TATCCATTTT-AA-AAAT-ATTT-CTATAT-TTTTTTAGACATTTATAGCGTTTATT-CCTGC--TA----TACTGCC-TTTAA-A-------Attcttatttact
gi|8                          :                                                                                                                                                 taatttggatgacactcacttgaagattaattttaataacggaaataatatcaggatttatcttcaaatttatacaatttttcccaatatatatttcctatatatactcaatgtcccctatttgccaaaaggatatatatttaaatatgccaaaataatatattgaaaacggatttcctaactttagctacgcgcctagatcagactaaaatagagtcgcttaaaattgaaacatattttgtgacgtattaaaaaagtcacgtggtttcattttgatatatatttGATCTGTCAT----ACAGGTTT-ACACGTTGTAGAATTTGTTT-CATCTGAGA--------AA-ACAATCCGAATG---GCGACGAGAAGGTCG-TCAAAC--AATAT--TA-AAGTGCGG--TCTTATTGTAGAATTG-AGATTTCGTTTCAAGTTT-CCACTCCGATTGCAACATTGATTTA----GTCACGTTCCAGTGGG---TTTAAT--AAAACAAACCATTAGA-----------------T-------G------A-T----ACT----------------GAGATGTTTTT-TATCCATTTTAAA-AAAA-AGTT-A--TAT-TTTTTAA-ACATTTATAGCGTTTTTTCCCTGA--CA----GACTCCCTTTTAATG-------AAATAAAA---------CTGCCCTGTTGTG---GAGAAA--TCTTATCAAT----ACATTAAAA-------CTAACATATGTGTGTAAATCTT---TG---TCTCA------TTTAAA-TG--TACTACAT-----T-T-AACT-AG-TTATATGATTGCACTTCC--GTcaacagtattgacgaattaatcgttcaaggaatacgcctctactt
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaaattaataagttttccagtcctttattaacttaccagtagcTTATGCAGGGAT-GCGCGTAGTAAAAATTGTTTTCATCTTAGA--------A-------------G---A-G-------------TCAGAC--AGTAT--TA-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGG-AGATTTTGTTTCAAGTTTACCACTCCAATTTACATATCGATTTT----G----------GTGGA---TTTGAC--ATACTAAACTATACGGTTTATCTTTAT------T-------A------ATG----ATA-------A-------TGAGATACTTTT-TATCCATATT-GA-TAAT-TATT-T--TAT-TTT------CAT----AGCATTTTAT-CCAGA--TA----TACTCCC-TTTAA-AGTCATACATTTAAAAAATA------------ATATTGTTATCATTA--CTTTTTCTCTTTTAcaccccatagaaatagaaatgg
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gi|3                          : cgaacaacctttaacttgaactcattgaagttctactgtattaatttatttgggcttgattgagaagacatctctccgcttgataatttatgaatcactctcaagtttgtttcctgggtagaaccagtactgagatgtgttcaaagacatcaggtcgagcatgggatcagaccataatatctggtgagatatgtcaacactctaactacttcactgtcagatccatatatagtgtgttgtttaaagaaggtatatctgagtttttttaattggcttaaaacatgtgtttctaatatatcatacttatatatactcactgacatttattgccgtaaggatatctatttaaacatgccaataatatattgattagagaacttggcctacacacaaaggtaacttagactaaaatagatttcccttttagaattacaacaaattttgtgacatgtaaaatgtgttacatgatttcattttgataaccgttttatctgtcattTGAAGG---CCG-------------TCAAGC--GGTAT--CT-AAGTACT---TCTATTCTTAGAATGGG-GATTTTGTTTTAAGTTTACCATTCCGATTGAAATATCAATTTT----TTT-CGCTTAT-TGGAATATTTGAT--ATACGAAACAATTCGGAAT-------T------T-------A------TTT----ATTTATGAAAA-------TGAGATGCTTAG-TATCCATTTT-GC-AAAT-A-AT-T--TA--TTTTTAAGACTTTTATCGCG-TTTTT-CTTTA--TA----TACAACC-TTTAA-aagacacttattgtctatttttgtttctggataaatcatatgatatactactaaattgttttgttgattcatttctttc
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatact----ATA-------A-------TGAGATG-TTTT-TATCCTTTTT-GATAATT-ATTT-G--AAT-TTTTT-AGACATTTATAGCG-TTTTT-CCTGA--TA----CATTCTC-TTTAA-tttggttatacgttattacttaaatttt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              g-G-------AGTTAAA-----GAGGCCTCACCTATATCG---CCGATA--TTTTTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CA-GCCCATTTGTATCAAACA----------A--------------A-TGGATATTATGT-----T-C-AA-T-A----GC----TTTTT-TTCT--GTCTATGTAGTGTAAAATTATTTAAACATTGTATTCCGTTGAGC-ATTGTT-GAATA----tgtaccaacacacgcttgata
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAGGCCTCACCCATAT----------A--TTT---CGATCTTAGCAGTTAAA-------CT-GCACATTTATATCAAATAT---CA---TA-TA------TT---A-TGGATATTCTAT-----T-C-AA-T-A--ACTTAT-ATTGTA-TTTT--GCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTA--------ATTTTGTTGACCAAATAC-----TA----AATCGTGGCCCGCGATACA----GTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAAC-ATCGACGAATTAAACGGAAAA--T--GCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAGAC----------------GGAATCAACCCTCA-TCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGtttgaaaacgtg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaAGAGGCCTCACCCATAT----------A--TTT---CGATCTTAGCAGTTAAA-------CT-GCACATTTATATCAAATAT---CA---TA-TA------TT---A-TGGATATTCTAT-----T-C-AA-T-A--ACTTAT-ATTGTA-TTTT--GCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTA--------ATTTTGTTGACCAAATAC-----TA----AATCGTGGCCCGCGATACA----GTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAAC-ATCGACGAATTAAACGGAAAA--T--GCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAGAC----------------GGAATCAACCCTCA-TCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGgttcaatacattttccgccactcattgaatagaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttaaAGAGGCCTCGTCTGTGGCG---CCGATA--TCTTTTTGATCTTAACAGTAAAA-------CT-GCACATTTATATCAAACAT---CA---TA-TA------TT---A-TGGATATTCTGT-----T-C-AT-TCA--CT-TAT-ATTTTA-TTTT--GTCTCTGTTGTGTAAACTTCATTA--------ATTTTGTTGACCAAATACT-AAAT---------------CGT---------------TCATT-GGTCAATATC-GGGTTATGCTAAAACATTTG-CGAATAAAACGGAAAA--T--GTCGACCTGTGTATTAACGGATTCCTCATAAATAAGAT-AA-CTA--CATGGATGGAATTCGCTATCA-TCTTCGAAAGGGTCATTGCTCTTTGTGgttcaatacattttccaccactcattgaataaaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGGGGCATCATCTATATTG---CCGATA--GTCTTCCGATCTTAGAAGTAAAA-------CT-GCGTATTTATATCAAACACTACCGGTATG-TA------TT---T-TGGATATTCTGT-----A-A-AA-A-A--AATTAT-ATTGTA-TTTT--GTCTCTTTAGTTTAAAAATCTTCA--------ATT------AC------------TA----AATCGTGGCCCGCAATAAA----GTCAACCATT-GGCCAGTATT-GAGTCATGCTAAAAC-ATTGAAGAATAAAACTGAAAA--T--GGCGACCTGTGTATTAACCAA-CACCCATCAAAAAGGTAAA-CTA--CAAGAGTGGAACCAACCAATA-TCTTCGAATGGAACCTTCCACTTTGTGattcaataaacttgccattatttactgaacagaaagttaaaggtgaagatgcat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAGAGCACTCATATATCTTG---CAGATA--TTTTTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CT-GCATATAAATATCAAACAT---CA---TA-TA------CT---A-TGGATTTTCTGT-----T-C-AA-TGA--TT-TAT-ATTGTA-TCTT--GTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTA--------ATTTTATTGGCCAAATAC-----TA----AATCGCAGCCCTTAATAAA----GTCACTCATT-GGTCAGTATC-GAGTTATGCTAGATT-ATTGACGAATAGAAAAAAACA--T--GCCAACCTGCATATTAatttaatatacttgccatcatttactgaacagaaagttataggtcatgtctctttaatgctataaatagacaatat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                taaAGAAACCTCGCCTATATCG---CCGAAA--TATTTTCGATTGTATCAGTAAAA-------CT-GCACATTTATATCAAGCAT---T--------A------TT---A-TGGATGTTCTGT-----T-C-AA-T-A--ACTTAT-ATTGTA-T-----GTTTGTGTAGTGTACAATTCTTAA--------ATT------ACCAAAT----------------CGTGGCCCACGATAAA----GTTACTCATT-GGC-------------ATACTAAAAT-ATTGACGAATAAAACGGAAAA--TATGCCGACCTGTATATTAACACATTTCTCATAAATAAGATAA--CTA--CAAGGACGGAATTAACCATTT-TCTTCGAATGGAAAATTCTTCTTTGTGg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAGAGGCCTCGCCTTTATCA---CTGATA--TATTCTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CT-GCACATTTATACCAAACAT---CA---TT-CA------TT---A-TAGATATTCTGTACAACT-T--A-T-A--TTGTTT-GTTG-A---------CTCTGTAGCGTAAAATTCTTTG--------ATTTTGTTAA-CAAATACT-AAAT------------GCC--------A----GT-----ATC-GG-----------GTTAGGCTAAAAC-ATTTACAAA-AAAGGGGAAAA--T--GCCGACTTTCGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAAATAAA-CTA--CAAGT-CGGAATCAAC--------------TGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaacttgcaatcatttgctgaacagaaatataaaggtaatgc
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aAGAGGCCTCATCTATATTG---CTGATA--TTTTATTAATCTTattaaacatttgctgaacagaaagttataggtt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaGAGGTCTCACCTATATCT---CTGATA--TTTATTTTGTCTTAGAAGTAAAA-------CT-GCACATTTATCTCAAATAT---CA---TA-TA------TT---A-TGGATATTCTGT-----T-C-AA-T-A--ACTTAT-ATTGTA-TTTTGTATCTGTCTC-TATA---TTTTTTC--------ATTTTGTTTTCCAAATATCCAAATATTTTAATCGTGGCTAGTGATAAA----GTCACTCATTTGGCCTGCATA-CGGTTATACTAAAAC-ATTATCGAATAAAACAGAAAA--T--GCTGACCTGTATTTTAACGAATTTCTCATAAATGAGATAAT-CCA--CAAGGACAGAAACAAACATTA-TCTTCGAATGGGACCTTCTTCTTTGTG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAGTCTCACCTATATTG---CTGATT--TTTTTTCGGTCTTAGCAGTTTAA-------CT-GCTTATTTATATCAAACAT---CA---TA-AAATTATTTT---A-TAGATATTCTGT-----T-C-AA-T-AACTTGTAT---TGTA-TTAT--ATCTCTGTAGTGTTGAATTCTTTA--------ATTTTGTTGACCAAATACT-AAATG----A----CAGCTTGCCATAAA----GTCACACATT-AGCCAGTATC-AGGTTATTATAAAAC-ATTGACAATTAAA----ATAC--T--G---ACCTGTCTGTTAACGAATTTCTCTAAAATAAAATAAAGCTA--CAAGT-TGGAATCAACCATTA-TCTTCGAATGGTGCCTTCattcaataaactttccatcatttactgaacagaaagttattgataatgcatcttt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGTCTCATTTATATCG---ACGATA--TTTTGCTGATCTTAGCAGTAAAA-------CT-GCAAGTTCATATCAAACTT---CA---TA-TA------TT---A-TGAATATT--AT-----TAT-AAAT-AACTTGTAT---TGTC-TGTT--GTCTCTGTGGTG--AAATTCTTTA--------ATTTTGTTGACCAAACACT-AAA--------TCGCAGCCCGTGATAAA----ATCACTCATT-CGCCATTTCC-GGGTTATGCTAAATC-ATTGACGAATAAAACGAAAGA--C--GCCGACCCATGTATTAA---------CA-AGAT-ATATATA-CTA--CAAGGACGGAACCCAGTATTA-TCT-----TGGGACCT---TCTTTGTtatgtggttcaataaactctccatcatttattaaacagagagttatatatgtgatgcatc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aatACCTATATCG---CCGATAGCTTATTTTTATTTTATCAGTAAAAGTTAACACT-GTACATTTATATCAAACAT---CA---TA--------------------TATTCTGT-----T-C-AA-T-A--ACTTAG-ATTGTA-TTTT--GTCTCTGTAATATAAAATTCTTTA--------ATTTTGTTGACCAAAAACT-C--TA----AATTGTGTCCCGCGATAAATGAAGTCACCCATT-GGCCAATATC-GGGTTCTGCTAAAAC-ATTGGCGAATAAAACAAAAAA--T--GCCGACTTGTGT-TTAACGACTTTCTCATAAATAAGATGAA-CTA--CAAGGACGGAATCAATC-CTGACCTTCGTATGGGACCTTTTTCTTTATGaattcgattaacgttccatcatttactgaacagaaagttataggtcacgcatcttgaaattaataacgataatatgt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTCTTAGCAGTAAAA-------CT-GCATGTTTATACCAAACAT---CA---TA-TT------TT---AATCGATATTCTGT-----T-TCAA-T-A--TTCTTT-ATTTTA-ATTT--GTCTCTGCCGTATAAATATCGTTA--------ATTTTGTTCAC-AAATACT----TA----A-TCGCGG-------TTAG----GTCACTCATT-GGCAAGTATC-GAGTTATGCTGAAAC-TTTGACGATTATT-CAGAAAT--T--GCCGATCTGTGTATAAACGATTTTTTTATAAATAAGATAAA-CTA--CAAGGACAGAATCTACCATTA-TCTTCGAGT-GGACCTT-ATCCTTGTGattcaattactattccatcatttactgaacagaaaggtatagatgatgtatatttgaatagtgtatgtaatactaatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGCAGTAAAA-------CT-GCAT-TTTATATCAAACAC---CA---TA-TA------TT---A-TGGATATTCCAT-----T-C-AA-T-A--ACTTAT-ATTGTA-TTTT--GTATCTGTAGTGTAAACTTTTTTA--------ATTTTGTTGACC------------A----AATC------C----TAAA-----TCAC------AGCCTGC----GGGTTGTGCTAAAAC-CTTGACGAATAAAACAGAAAAATT--GCCAACCTGTGAATTAACGAATTTCTCATAGATAAGATAAA-CTA--CAAGGACAGAATCAACCATTA-TCTTTGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcataactgaacagaaaagtataggggatacatcttt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TA----AATCGCGGTCC-CGATACA----ATCATCCATT-GGCCAGTGCCAGGGTTATGTTAAAAT-ATTTACGAATAAAACGGAAAA--A--GCTGATCTGTGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAGAAAAA-AAAAACAAGAACTGAATCAACCGTTA-TCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaattttctgtcacttactgaacagaaacttgtaggtaatgtatctttaaaaatgcatgatcatacttcagt
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ac-CTA--CAATGACAAAATCAACCATTA-TCTCCGAATGTGACCTTCACCCTTGTGatgcaatgaacgccccatcatttactaaacagaaagttataggtgatgcatct
18 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TTGAAAATCTTAAATGAAATTCAACGGTAAATACTCTTAGAAAAACTCTAAATTAATTTATGTCTAAAAGGGAATATAGCAAGATTTTTTCAATATATCATGCCTATATTTACTCAATGATCCCATTTTGCCCAAAGGATAAACATTTAAACATGCCAAGTCTTTGTCTACATAG
Unaligned ( gi|30 ): TATTGAAAAGTTTGCGAATTCTCAAATTCATTTTCTGAGTAATGTCAGTTCTTGGTGCTGTTAATAAGAGGCCAATGGGTTGGTTGAGCCTAGGATAAAACCATGACCTGTTATACTGTCAACACCCGAACTACTACAC
Unaligned ( gi|31 ): AACAGAAGATAACGTTTTATAATGTTCTTCTCCATGACATATAACTGATTTGTCCATATTTACAGAACAGAAAGTTATAGGTGATGCATCTTTAAATATGTTGATTGA
Unaligned ( gi|32 ): TGGCAAGGTCAATGTCATCTTATGGCAAGGTCAAGATCATCAAGCAGTGCATGCATAATATTTATTTCTAAAATTGAAATTCACTTTCAATTTCACTTCTCCGATTAA
Unaligned ( gi|34 ): TTAAAGGAAGTAAATCAGGATTATTAATTTTTTTAAAGTTGACAAAAACAAACTACATTTTTTCTCAATAAGTGATGCTTATCTATGCCCACATGATAACATT
Unaligned ( gi|36 ): AGTAGAGATGAGGATTATTTTTGGCTTATGAGTATTTGTAAGTAATACAAAACCATTTGTATTATGTTTCTGGTGAAATCTTATGTTTTTTTGA
Unaligned ( gi|37 ): TTCAGTAACAAATTGTGACCCACAATTAAAGGCTCAAATAGTGTCCACACTATTTAAAAGCTATACTAAAACATTAAGAAATAAAATGGAAAA
Unaligned ( gi|38 ): TAACAGTTACAGTATATTTATATAAAACTGTTGTTTTTTTTGTAGTGACTCTATTCAATAGCCTGTGTTGAATTATGTCTCTGTAATGTAGA
Unaligned ( gi|39 ): CTCTCAGTACAAGGAAGTTTAATATAACCGTGTGTTCATAAAAGGGAATATATCAGGATTTTTTCCCAATGCATCATGCCTGTATATA
Unaligned ( gi|40 ): CTTAAAGGGCTAAAATCAGGATTTCTTTTTTTAATTAACTAAAAACTTTTATTTCCAATGTAGCACCCCTATATATA
Unaligned ( gi|41 ): GTTTTCAAGCACAACATGCTTAGCTATACTCACTGAGCCTTTTATTGCAATAAGAATATATGTTAAACCTGCCATT
Unaligned ( gi|42 ): TAAATTCTTANNNNNNNNNNGGCTTTGTGTGTCAGTTACACCTATATTATTACATACCACCATATCTTCTTATAT
Unaligned ( gi|43 ): CCAGATCATTCACTTTTTATTTATAAAAATTAAGATGCCTTGTATTCATTTTAGAAATGATTTAATTTT
Unaligned ( gi|44 ): ATATATTAGCCTAAATACAGCATGCTTATATATACTCACTGTCCCAGTACTGCCAA
Unaligned ( gi|45 ): GATACTAAAACCCGGTCATGTCCCGGTAACATTCCGGCATATGTAAAT
Unaligned ( gi|47 ): TCTTAGAAGCAGTATTGAAGTGCTGTCTATTTTTAG
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Unaligned ( gi|49 ): TAAAGGACATTGAGGATAAGTTATAGATTATT






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Reference ( family-1439 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGTTTTATTAAAGAGTTGATCCGTCGTTTATAC-AGGTT-T-ACACGTAGTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATG---ACGA------GA-------------------GT--TCA---AGCAGTATTN-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGGGAGATTTCGTTTCAAGTTTACCACTCCGATTNAAATATCGA-TTTT----GTCACGTTTCGGTGGATTTGACATACNAAACCATTCGG-----ATT-------T------TA-------ANT----AT-------NA-------TGAGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTTATAGCG-TTTTTT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--A-ATTAAAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATANCTTATATTGTATTTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATA----AATCGCGGCCCGCGATA----AAGTCACTCATT-GGCCAGTATC-GGGTTATGCTAAAACATTGACGAATAAAACGGAAA--A--TGCCGACCTGTGTATTAACGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T-CCTGATA----TATTTCCTTTAAG--T-ATTGAGA---A
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatTTTTATTGCA-ACTCAATCTGTCGT--------GGTT-TCACACGTAGTAAAA-TTGTTT-CATCTTAGTAAG---TCCGAATG---ATGATATAA-AA-------------------GTCGTCA---AGCAGTATTT-AAGTGCTGGCTTTATTTTTGGAATCGG-GATTTCTCTTTAAGTCGACTACTCCAATTAAAATATTGA-TTTT----GTCAAGTTTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTCGA-----ATTTA-----T------TA-------ATG----AT-------AA-------TGAGATGCTTTT-TATTCATTTT-AAAAATGATAT-T--TA--TTTTTAAGACATCTATAGCG-ATTTAT-CTTGTTA----TATTCCCTTTAAA--A-ATgttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattttttattgcaactcaatctgtcgtggtttcacacgtagtaaaattgtttcatcttagtaagtccgaatgatgatataaaagtcgtcaagcagtatttaagtgctggctttatttttggaatcgggatttctctttaagtcgactactccaattaaaatattgattttgtcaagttttggtggatttgacataccaaaccattcgaatttattaatgataatgagatgctttttattcattttaaaaatgatatttatttttaagacatctatagcgatttatcttgttatattccctttaaaaatagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                           ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatttctcaatacttaaaggaaatatatcaggagttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattTTGTTCCGT----TATAT-AGGCT-T-ACACGTAATAACAATAGTCT-CATTATAGA-----GTCCGAACA---ACGATGC---GAAG-----------------GTCGTCA---AACAGTATTG-AAGTGCTT--TCTATTTTTAGAGTGGG-GATTTTGTTTCAAGTTAACTAATCCAATTCAAACATCGA-TTTT----GTCAGGTTTTGGTGGATTTGACATAAGAAACC-TTCGG-----ATT-------TTATTTATA-------AATG---AT-------AA-------TGAGATGCTTTT-TATCCATTTT----AGT-ATGTAT--TATATTTTTAAGATATATGTAGCG-TTTTTT-TATGAAT----TACTCCCTTTAAA--A-Aagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aaaaggatatttatttaatttttacttaaacatgccaaaacaatatattaaaaaaaggatttgctaacttgggctacgtgcttgtgttagattaaagtagattccccgcttaaaaatgcaacatattttgtaacgtgttaaatgagtcatgcgattttattttgatttcattACCTATATC--GCCGATAGCTTA-TTTTTATTTTATCAGTAAAAGTTAACACTGTACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TAT--------------TCTGTT-CAATAACTTAGATTGTATTTTGTCTCTGTAATATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAAAA-CT--CTA----AATTGTGTCCCGCGATAAATGAAGTCACCCATT-GGCCAATATC-GGGTTCTGCTAAAACATTGGCGAATAAAACAAAAA--A--TGCCGACTTGTGT-TTAACGACTTTCTCATAAATAAG--ATGAA-CTACAAGGACGGAATCAATCCTGACCTTCGTATGGGACCTTTTTCTTTATGaagcacattagactactcggtcacggatattcctccac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tA---AGGGGCATCATCTATATT--GCCGATA--GTC-TTCCGATCTTAGAAGTAAAA-------CTGCGTATTTATATCAAAC-ACTACCGGTATG----TATT--T-TGGA-T-ATTCTGTA-AAAAAAATTATATTGTATTTTGTCTCTTTAGTTTAAAAATCTTCAATT-------------A-CTAAAT--------CGTGGCCCGCAATA----AAGTCAACCATT-GGCCAGTATT-GAGTCATGCTAAAACATTGAAGAATAAAACTGAAA--A--TGGCGACCTGTGTATTAACCAA-CACCCATCAAAAAG--GTAAA-CTACAAGAGTGGAACCAACCAATATCTTCGAATGGAACCTTCCACTTTGTGattcaattactattccatcatttactgaacagaaaggtatagatgatgtatatttgaatagtgtatgtaatactaatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAGGTCTCACCTATATC--TCTGATA--TTTATTTTG-TCTTAGAAGTAAAA-------CTGCACATTTATCTCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTC-TCTATA-TTTTTTCATTTTGTTTTCCAAATATCCAAATATTTTAATCGTGGCTAGTGATA----AAGTCACTCATTTGGCCTGCATA-CGGTTATACTAAAACATTATCGAATAAAACAGAAA--A--TGCTGACCTGTATTTTAACGAATTTCTCATAAATGAG--ATAAT-CCACAAGGACAGAAACAAACATTATCTTCGAATGGGACCTTCTTCTTTGTGatttaatatacttgccatcatttactgaacagaaagttataggtcatgtctctttaatgctataaatagacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcatttactgaacagaaagttattgataatgcatcttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttAA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGgttcaatacattttccaccactcattgaataaaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttA---ATAGGTCTCATTTATATC--GACGATA--TTT-TGCTGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCAAGTTCATATCAAAC-TTCA------TA----TATT--A-TGAA-T-ATTATTAT-AAATAACTTGTATTGTCTGTTGTCTCTGTGGTG--AAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAACA-C----TA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAATCACTCATT-CGCCATTTCC-GGGTTATGCTAAATCATTGACGAATAAAACGAAAG--A--CGCCGACCCATGTATTAACAAG------AT--AT-----ATATA-CTACAAGGACGGAACCCAGTATTATCT-----TGGGACCT---TCTTTGTgttcaatacattttccgccactcattgaatagaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAGTCTCACCTATATT--GCTGATT--TTT-TTTCGGTCTTAGCAGTTTAA-------CTGCTTATTTATATCAAAC-ATCA------TAAAATTATTTTA-TAGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTGTATTGTATTATATCTCTGTAGTGTTGAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATG----A----CAGCTTGCCATA----AAGTCACACATT-AGCCAGTATC-AGGTTATTATAAAACATTGACAATT-------AAA--A--TACTGACCTGTCTGTTAACGAATTTCTCTAAAATAAA--ATAAAGCTACAAGT-TGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGTGCCTTCaattcgattaacgttccatcatttactgaacagaaagttataggtcacgcatcttgaaattaataacgataatatgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---AGAGGCCTCGTCTGTGGC--GCCGATA--TCT-TTTTGATCTTAACAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CATTCACTTATATTTTATTTTGTCTCTGTTGTGTAAACTTCATTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAA------------------------------TCGTTCATT-GGTCAATATC-GGGTTATGCTAAAACATTTGCGAATAAAACGGAAA--A--TGTCGACCTGTGTATTAACGGATTCCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACATGGATGGAATTCGCTATCATCTTCGAAAGGGTCATTGCTCTTTGTGtatgtggttcaataaactctccatcatttattaaacagagagttatatatgtgatgcatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTGAAATGTGA--TTCCGTTTCAATTTCAACACTTTGATTAATATATTGT-TTTT----GTCCTGTTTTGGTTGATTTTAAATCTGAAATAA-TCGGT----ATG-------T------TT-------GTT----ATA------AA-------TAAATTGATTTG-TATTAACTTT-CAACTT-ATTattcaataaacttgccattatttactgaacagaaagttaaaggtgaagatgcat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttttcagtaagatcatacttagatatacccactgagtccttattgccaatgtaatatctgtagcatacatatcatgtaagactaaaacatttttcgcgtttaaatttcaatatatgttatatagcagcaaataatccacgtggtttcaatttatttaatgttgtttatatattgttgactttggtacatctaagaaagacggcgtgtaatttctcTTTATCTGTCATT-------GGTT-T-ACATATTGCAGAATTTGTTT-CATATTAAAATG---TCCAAATG---ATGATGT---GATGGT---------------GT--TTC---AGCAGTATTT-GAGGTCTG--TCTAGTTTTAGAA-GAGTAATTTCCTTTCAAGTT----ACTC-----TAAACATAG--TTTT----ATC
gi|20                         : cgaacaacctttaacttgaactcattgaagttctactgtattaatttatttgggcttgattgagaagacatctctccgcttgataatttatgaatcactctcaagtttgtttcctgggtagaaccagtactgagatgtgttcaaagacatcaggtcgagcatgggatcagaccataatatctggtgagatatgtcaacactctaactacttcactgtcagatccatatatagtgtgttgtttaaagaaggtatatctgagtttttttaattggcttaaaacatgtgtttctaatatatcatacttatatatactcactgacatttattgccgtaaggatatctatttaaacatgccaataatatattgattagagaacttggcctacacacaaaggtaacttagactaaaatagatttcccttttagaattacaacaaattttgtgacatgtaaaatgtgttacatgatttcattttgataaccgtTTTATTAA----CTTACCAGTAGCTCACAA-AGTTT-T-ACATATACTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATA---ATGAATCGAAGA-------------------TTG-TCA---AACAGTATTA-AAGTGCTG--TTTATT-----AATAG-AGATTTTGTTTCAAATTTAACACTCCAATTTACATATTGA-TTTT----TTCACGTTTTAGTAGATTTGACTAACTAAACTATTCAGTTTATATTTA-----T------TA-------ATA----AT-------AA-------TGACAAGATTTT-TATCTATTTT-GATA---ATTA-T--CAT-TTTTTAAGACATTTATA-TG-TTTTAT-CGTGATA----CATTCCCTATAAC--A-Atttttaagacacttattgtctatttttgtttctggataaatcatatgatatactactaaattgttttgttgattcatttctttc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaaattaataagttttccagtccA---AGAAACCTCGCCTATATC--GCCGAAA--TAT-TTTCGATTGTATCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAGC-AT--------------TATT--A-TGGA-T-GTTCTGTT-CAATAACTTATATTGTA---TGTTTGTGTAGTGTACAATTCTTAAATT------ACC------------A----AATCGTGGCCCACGATA----AAGTTACTCATT-GGC-------------ATACTAAAATATTGACGAATAAAACGGAAAATA--TGCCGACCTGTATATTAACACATTTCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACAAGGACGGAATTAACCATTTTCTTCGAATGGAAAATTCTTCTTTGTGcaccccatagaaatagaaatgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGCAGTAAAA-------CTGCAT-TTTATATCAAAC-ACCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCCATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTAGTGTAAACTTTTTTAATTTTGTTGACCAAATC-CTAAAT--------CACAGCCTGCG--------------------------------GGTTGTGCTAAAACCTTGACGAATAAAACAGAAA--AATTGCCAACCTGTGAATTAACGAATTTCTCATAGATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCAACCATTATCTTTGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaacttgcaatcatttgctgaacagaaatataaaggtaatgc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATGTTTATACCAAAC-ATCA------TA----TTTT--AATCGA-T-ATTCTGTTTCAATATTCTTTATTTTAATTTGTCTCTGCCGTATAAATATCGTTAATTTTGTTCAC-AAATA-CT---TA----A-TCGCGG-------TT----AGGTCACTCATT-GGCAAGTATC-GAGTTATGCTGAAACTTTGACGATTATT-CAGAAA--T--TGCCGATCTGTGTATAAACGATTTTTTTATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCTACCATTATCTTCGAGT-GGACCTT-ATCCTTGTGattcaataaattttctgtcacttactgaacagaaacttgtaggtaatgtatctttaaaaatgcatgatcatacttcagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A---AGAGGCCTCGCCTTTATC--ACTGATA--TAT-TCTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATACCAAAC-ATCA------TT----CATT--A-TAGA-T-ATTCTGT----ACAACTTATATTGTTTGTTGACTCTGTAGCGTAAAATTCTTTGATTTTGTTAA-CAAATA-CTAAAT------------GCC------------AGT-----ATC-GG-----------GTTAGGCTAAAACATTTACAAA-AAAGGGGAAA--A--TGCCGACTTTCGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAA--ATAAA-CTACAAGT-CGGAATCAAC-------------TGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcataactgaacagaaaagtataggggatacatcttt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AA---AGAGCACTCA--TATATCTTGCAGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATATAAATATCAAAC-ATCA------TA----TACT--A-TGGA-T-TTTCTGTT-CAATGATTTATATTGTATCTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTATTGGCCAAATA-C----TA----AATCGCAGCCCTTAATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATC-GAGTTATGCTAGATTATTGACGAATAGAAAAAAAC--A--TGCCAACCTGCATATTAattaaacatttgctgaacagaaagttataggtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tTA----AATCGCGGTCC-CGATA----CAATCATCCATT-GGCCAGTGCCAGGGTTATGTTAAAATATTTACGAATAAAACGGAAA--A--AGCTGATCTGTGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAGAAAAAAA-AAACAAGAACTGAATCAACCGTTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CAGCCCATTTGTATCAAAC-A--A------------------A-TGGA-T-ATTATGTT-CAATAGCTT-T-TT---TTCTGTCTATGTAGTGTAAAATTATTTAAatgcaatgaacgccccatcatttactaaacagaaagttataggtgatgcatct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gagttATACTAACCCATTCGG-----ATT-------T------TATTAATT-AATG---AT-------AA-------TTAGTTGTATTT-TAACCGTTTT-AGAAAT-AATT-T--TAT-TTTTTAAGACATTCAT-GCT-TTTTTT-TCAAATATATGTATTCCCTTTAAacattgtattccgttgagcattgttgaatatttgaaaacgtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tGATTTGATGCGTC----ATACTGGGTT-T---------TAATTATTTTTT-AAAC---GAAAG-AGGTTGAATG---ACGATGT---GAAG-----------------GCCGTCA---AGCGGTATCT-AAGTACT---TCTATTCTTAGAATGGG-GATTTTGTTTTAAGTTTACCATTCCGATTGAAATATCAATTTTT----TTCGCTTATTGGAATATTTGATATACGAAACAATTCGG-----AAT-------T------TA-------TTT----ATTTATGAAAA-------TGAGATGCTTAG-TATCCATTTT-GCAAAT-A-AT-T--TA--TTTTTAAGACTTTTATCGCG--TTTTT-CTTTATA----TACAACCTTTAAtttggttatacgttattacttaaatttt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gatagtttccagctaatattccattaaacaaccaatttgaaaacaaaacatgttcttgattattccatgagaatatatttctaagaatttaccctttaaaggtagtgtatcaggctttttcaaaattttaaaagtgtctaaaatagttattatcaaaagctcatatatattcactaaccccgttttgccataagaatatatacatgatcatgtcatgggctagactaaaatagattgcccgcttaaaattgcatcgtcttgtctgatgtttcaaatgagtcacgtgatctcattttgattcc----AT-------AA-------TGAGATG-TTTT-TATCCTTTTT-GATAATTATTT-G--AAT-TTTTTA-GACATTTATAGCG--TTTTT-CCTGATA----CATTCTCTTTAAccgtgtcttcaaataaaacatattggcatgctataccattcgattcgatttatagtattaacaaatattaaaaagtgcttgatactgctacagtcatttatttagaggctaaacttccattgtatct
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          g-CTACAATGACAAAATCAACCATTATCTCCGAATGTGACCTTCACCCTTGTGtgtaccaacacacgcttgata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAACAGTTACA---------GTATATTTATATAAAACTGTTG------TT----TTTT--T-TGTAGTGACTCTATT-CAATAGCCTGTGTTGAATTATGTCTCTGTAATGTAGAattcaataaactgcactggtgcatctgtaccgcactgacagtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCGATCCATCAT--ATTC-AAGTTCT-ATAT-TGATGAAT-TTATTC-CATCCTAG------GTCTGAATA---ACAA------GGTGAATGTCACCTCGGTGATGT--TCGCCTAGCATCATGT-GCGTGATA--TTTATTTTCAAAATAGAA-ATTTTCTTTCAATTTCATCATTCAGATTAAAATATTGT-TTTTTTTGGTCATGTTT----GGA----AAGT-CCAGATCATTTGT-----ATT-------T------TATTGATGAAAT----GT-------CAA------TCAGATGCTTTTGTATTCATTTT-AAAAATGA--C-T--AAC-TTTTTAGG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atttcaacaatctttaaaggatgtatttcagaaaactttcaaaattgataagacacagtttttcccaatatatcatgtctatatatacgaatatttactaggccttttattgccgcacggaaacccatttaaacatgtcaaaataaaatattgaaaagggattaacttacttagattacggaactataatagattccacagtttaaaactgcaacatattttatgacacatcatCCAGATCATTCAC-----TTT-------T------TA-------TTT----AT-------AAAAAT---TAAGATGCCTTG-TATTCATTTT-AGAAAT-GATT-T--AAT-TTTcagtctatttctgaaatttgtatatccgtgtgatatgttttaatgtcatcacttgatttattattgatacaattaacaaaaagtttaagaaaataccagtttgtaattttaaagattcttttattaactgtacattgtattttcaaa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AA---AGAGGCCTCATCTATATT--GCTGATA--TTT-TATTAATCTT
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gA---AGCAGTATTG-AAGTGCTG--TCTATTTTTAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tcttagCATTTT-TCAAAGAGTAGATCCGCTATTTACAC-AGGCT-T-ACACGTAGTTAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-ATTCTGAATG---ATG--------------------------------TCA---CGCAGTATTTTAAGTGGTG--TCTATTTTTAAAATGGGAGATTTCGTTTCAAGATTACTGTTCCAATTTAAATATTGA-TTTT----GTCACGTTTTTGTGGATTTGACATTCGAAACCATTCGA-----ATT-------T------TA-------AGT----AT-------TA-------TGAGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTAAAAGCG-TTTTTT-CCTGATA----CATTTCCTTTAAG--A-ATTAAAAGGTAGAGGCCTCACCTATATT--GCCGATA--TTT-TTTCTATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATCTATATCAAAC-ATCG------TA----CATC--A-TGGA-T-ATTCCGTT-TAATATTGTATATTGTATTCCATCTCTCTAGTATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-TTAAATA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATT-GGGTTATGCTAAAACTTTGACGAATAAAACAGATA--A--TGCCAACCTGTGTATTAATGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGAAGGAATCAACCACTGTCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CATTTTGATATATATTTGATCCGTTGT----AC-AGGTT-T-GCATGTAGTAAAA-TTGTTT-CATTATAGAAAG-AGTCTGAATG---ACAATGTGAAGG-------------------GCA-TCA---AGCAATATTG-AAGAGCCG--TTTATCTTAAGAA-GGGA-ATTTGGCTTCAGATTTACCACACCAATTTAAATTTCGA-TTTT----GTATTATTTGGGTGGATTTGACACACTATACCATTCGG-----ATTATATTTAT------TA-------AATAATGAT-------AA-------CGAGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-CTATAT-TTTTTTAGACATTTATAGCG-TTTATT-CCTGCTA----TACTGCCTTTAAA--A-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taatttggatgacactcacttgaagattaattttaataacggaaataatatcaggatttatcttcaaatttatacaatttttcccaatatatatttcctatatatactcaatgtcccctatttgccaaaaggatatatatttaaatatgccaaaataatatattgaaaacggatttcctaactttagctacgcgcctagatcagactaaaatagagtcgcttaaaattgaaacatattttgtgacgtattaaaaaagtcacgtggtttT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--ATATTAAcaacagtattgacgaattaatcgttcaaggaatacgcctctactt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gattaaacaaattatcatctggaatatattataataTTGAGCCGT----TATGC-AGGGA-T-GCGCGTAGTAAAAATTGTTTTCATCTTAGAA-G-AGTC------------A------GA-------------------------------CAGTATTA-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGG-AGATTTTGTTTCAAGTTTACCACTCCAATTTACATATCGA-TTTT--------------GGTGGATTTGACATACTAAACTATACGG-----TTTATCTTTAT------TA-------ATG----AT-------AA-------TGAGATACTTTT-TATCCATATT-GATAAT-TATT-T--TAT-T----------TTCATAGCA-TTTTAT-CCAGATA----TACTCCCTTTAAA--catatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttcattttgattccaatttgagccgttatgcagggatgcgcgtagtaaaaattgttttcatcttagaagagtcagacagtattaaagtgctgtctatttttagaatggagattttgtttcaagtttaccactccaatttacatatcgattttggtggatttgacatactaaactatacggtttatctttattaatgataatgagatactttttatccatattgataattattttattttcatagcattttatccagatatactccctttaaagtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                            gattaaacaaattatcatctggaatatattataatattaatattttaaagggagtatatcaggacatatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttcattttgattccaatTTTTATTTCA-ATTTGATCTGTC----ATAC-AGGTT-T-ACACGTTGTAGAATTTGTTT-CATCTGAGAAAACAATCCGAATGGCGACGA------GAAG-----------------GTCGTCA---AACAATATTA-AAGTGCGG--TCTTATTGTAGAATTG-AGATTTCGTTTCAAGTTT-CCACTCCGATTGCAACATTGA-TTTA----GTCACGTTCCAGTGGGTTTAATAAAACAAACCATTAG--------------------------------ATG----AT-------AC-------TGAGATGTTTTT-TATCCATTTTAAAAAAA-AGTT-A--TAT-TTTTTAA-ACATTTATAGCG-TTTTTTCCCTGACA----GACTCCCTTTTAATGA-AATAAAA---gtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gcaaaatgtttaaatgaagctcagaatttttcaaaaaatttaattggctaaaaacatttttaaccaatatatcttgcctatatatatatatatatatattatgacgcattaaatgagtcacgtgatttcttCGTTTTATTAAAGAGTTGATCCGCCATTGATGC-AGGTT-T-ACACTTACTAAAAATTGTTT-TATCTTCGATAG-AGTCCGAATA---ACG--------------------------------TCA---ATTAGTTTTT-AAGTGTTG--TTTATTTTTAGAATTGG-GATGGCGTTTCAAGTGTATCACTCCAACTGAAAGAGCGT-TTTT----GTCACATTTCGGTTGATTCGACATACTAAGCATTTCGG-----AAT-------T------TA-------TTT----AT-------CAATGATATTGATATGTATTT-TAACAATTTT-AGAATT-ATTT------T-TTTTAAAGACATTTATAGCATTTTTTT-TCTTATT----TACTctgccctgttgtggagaaatcttatcaatacattaaaactaacatatgtgtgtaaatctttgtctcatttaaatgtactacatttaactagttatatgattgcacttccgt
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TTGAAAATCTTAAATGAAATTCAACGGTAAATACTCTTAGAAAAACTCTAAATTAATTTATGTCTAAAAGGGAATATAGCAAGATTTTTTCAATATATCATGCCTATATTTACTCAATGATCCCATTTTGCCCAAAGGATAAACATTTAAACATGCCAAGTCTTTGTCTACATAG
Unaligned ( gi|30 ): TATTGAAAAGTTTGCGAATTCTCAAATTCATTTTCTGAGTAATGTCAGTTCTTGGTGCTGTTAATAAGAGGCCAATGGGTTGGTTGAGCCTAGGATAAAACCATGACCTGTTATACTGTCAACACCCGAACTACTACAC
Unaligned ( gi|31 ): AACAGAAGATAACGTTTTATAATGTTCTTCTCCATGACATATAACTGATTTGTCCATATTTACAGAACAGAAAGTTATAGGTGATGCATCTTTAAATATGTTGATTGA
Unaligned ( gi|32 ): TGGCAAGGTCAATGTCATCTTATGGCAAGGTCAAGATCATCAAGCAGTGCATGCATAATATTTATTTCTAAAATTGAAATTCACTTTCAATTTCACTTCTCCGATTAA
Unaligned ( gi|34 ): TTAAAGGAAGTAAATCAGGATTATTAATTTTTTTAAAGTTGACAAAAACAAACTACATTTTTTCTCAATAAGTGATGCTTATCTATGCCCACATGATAACATT
Unaligned ( gi|36 ): AGTAGAGATGAGGATTATTTTTGGCTTATGAGTATTTGTAAGTAATACAAAACCATTTGTATTATGTTTCTGGTGAAATCTTATGTTTTTTTGA
Unaligned ( gi|37 ): TTCAGTAACAAATTGTGACCCACAATTAAAGGCTCAAATAGTGTCCACACTATTTAAAAGCTATACTAAAACATTAAGAAATAAAATGGAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CTCTCAGTACAAGGAAGTTTAATATAACCGTGTGTTCATAAAAGGGAATATATCAGGATTTTTTCCCAATGCATCATGCCTGTATATA
Unaligned ( gi|40 ): CTTAAAGGGCTAAAATCAGGATTTCTTTTTTTAATTAACTAAAAACTTTTATTTCCAATGTAGCACCCCTATATATA
Unaligned ( gi|41 ): GTTTTCAAGCACAACATGCTTAGCTATACTCACTGAGCCTTTTATTGCAATAAGAATATATGTTAAACCTGCCATT
Unaligned ( gi|42 ): TAAATTCTTANNNNNNNNNNGGCTTTGTGTGTCAGTTACACCTATATTATTACATACCACCATATCTTCTTATAT
Unaligned ( gi|44 ): ATATATTAGCCTAAATACAGCATGCTTATATATACTCACTGTCCCAGTACTGCCAA
Unaligned ( gi|45 ): GATACTAAAACCCGGTCATGTCCCGGTAACATTCCGGCATATGTAAAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAATATATGTATTAGCAAACAATGTTATAGTAA
Unaligned ( gi|49 ): TAAAGGACATTGAGGATAAGTTATAGATTATT






Alignments
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Reference ( family-1439 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CGTTTT-ATTANAGAT---TTGATCCGTCGT--ATAC-AGGTT-T-ACACGTAGTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATGACGATG-C-G-A----------GG-T------CGTCAAGCAGT--ATTN-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGGGAGATTTCGTTTCAAGTTTACCACTCCGATTNAAATATCGA-TTTT----GTCACGTTTTGGTGGATTTGACATACNAAACCATTCGG-----ATT-------T----------T-------A---ATTA----T-------AA----TG------A----G--ATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTTATAGCG-TTTTTT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--A-ATTAAAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATA----AATCGCGGCCCGCGATA----AAGTCACTCATT-GGCCAGTATC-GGGTTATGCTAAAACATTGACGAATAAAACGGAAA--A--TGCCGACCTGTGTATTAACGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatTTTT-ATTGCA-AC---TCAATCTGTCGT--------GGTT-TCACACGTAGTAAAA-TTGTTT-CATCTTAGTA---AGTCCGAATGATGATA-TAA-A----------AG-T------CGTCAAGCAGT--ATTT-AAGTGCTGGCTTTATTTTTGGAATCGG-GATTTCTCTTTAAGTCGACTACTCCAATTAAAATATTGA-TTTT----GTCAAGTTTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTCGA-----ATTTA-----T----------T-------A---ATGA----T-------AA----TG------A----G--ATGCTTTT-TATTCATTTT-AAAAATGATAT-T--TA--TTTTTAAGACATCTATAGCG-ATTTAT-CTTGTTA----TATTCCCTTTAAA--A-ATgttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattttttattgcaactcaatctgtcgtggtttcacacgtagtaaaattgtttcatcttagtaagtccgaatgatgatataaaagtcgtcaagcagtatttaagtgctggctttatttttggaatcgggatttctctttaagtcgactactccaattaaaatattgattttgtcaagttttggtggatttgacataccaaaccattcgaatttattaatgataatgagatgctttttattcattttaaaaatgatatttatttttaagacatctatagcgatttatcttgttatattccctttaaaaatagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                        ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatttctcaatacttaaaggaaatatatcaggagttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattT---TTGTTCCGT--T--ATAT-AGGCT-T-ACACGTAATAACAATAGTCT-CATTATAGA-----GTCCGAACAACGATG-C-G-AA---------GG-T------CGTCAAACAGT--ATTG-AAGTGCTT--TCTATTTTTAGAGTGGG-GATTTTGTTTCAAGTTAACTAATCCAATTCAAACATCGA-TTTT----GTCAGGTTTTGGTGGATTTGACATAAGAAACC-TTCGG-----ATT-------T----------TATTTATAA---ATGA----T-------AA----TG------A----G--ATGCTTTT-TATCCATTTT----AGT-ATGTAT--TATATTTTTAAGATATATGTAGCG-TTTTTT-TATGAAT----TACTCCCTTTAAA--A-Aagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaggatatttatttaatttttacttaaacatgccaaaacaatatattaaaaaaaggatttgctaacttgggctacgtgcttgtgttagattaaagtagattccccgcttaaaaatgcaacatattttgtaacgtgttaaatgagtcatgcgattttattttgatttcatACCTATATC--GCCGATAGCTTA-TTTTTATTTTATCAGTAAAAGTTAACACTGTACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TAT--------------TCTGTT-CAATAACTTAGATTGTATTTTGTCTCTGTAATATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAAAA-CT--CTA----AATTGTGTCCCGCGATAAATGAAGTCACCCATT-GGCCAATATC-GGGTTCTGCTAAAACATTGGCGAATAAAACAAAAA--A--TGCCGACTTGTGT-TTAACGACTTTCTCATAAATAAG--ATGAA-CTACAAGGACGGAATCAATCCTGACCTTCGTATGGGACCTTTTTCTTTATGaagcacattagactactcggtcacggatattcctccac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tA---AGGGGCATCATCTATATT--GCCGATA--GTC-TTCCGATCTTAGAAGTAAAA-------CTGCGTATTTATATCAAAC-ACTACCGGTATG----TATT--T-TGGA-T-ATTCTGTA-AAAAAAATTATATTGTATTTTGTCTCTTTAGTTTAAAAATCTTCAATT-------------A-CTAAAT--------CGTGGCCCGCAATA----AAGTCAACCATT-GGCCAGTATT-GAGTCATGCTAAAACATTGAAGAATAAAACTGAAA--A--TGGCGACCTGTGTATTAACCAA-CACCCATCAAAAAG--GTAAA-CTACAAGAGTGGAACCAACCAATATCTTCGAATGGAACCTTCCACTTTGTGattcaattactattccatcatttactgaacagaaaggtatagatgatgtatatttgaatagtgtatgtaatactaatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAGGTCTCACCTATATC--TCTGATA--TTTATTTTG-TCTTAGAAGTAAAA-------CTGCACATTTATCTCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTC-TCTATA-TTTTTTCATTTTGTTTTCCAAATATCCAAATATTTTAATCGTGGCTAGTGATA----AAGTCACTCATTTGGCCTGCATA-CGGTTATACTAAAACATTATCGAATAAAACAGAAA--A--TGCTGACCTGTATTTTAACGAATTTCTCATAAATGAG--ATAAT-CCACAAGGACAGAAACAAACATTATCTTCGAATGGGACCTTCTTCTTTGTGatttaatatacttgccatcatttactgaacagaaagttataggtcatgtctctttaatgctataaatagacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcatttactgaacagaaagttattgataatgcatcttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttAA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGgttcaatacattttccaccactcattgaataaaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttA---ATAGGTCTCATTTATATC--GACGATA--TTT-TGCTGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCAAGTTCATATCAAAC-TTCA------TA----TATT--A-TGAA-T-ATTATTAT-AAATAACTTGTATTGTCTGTTGTCTCTGTGGTG--AAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAACA-C----TA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAATCACTCATT-CGCCATTTCC-GGGTTATGCTAAATCATTGACGAATAAAACGAAAG--A--CGCCGACCCATGTATTAACAAG------AT--AT-----ATATA-CTACAAGGACGGAACCCAGTATTATCT-----TGGGACCT---TCTTTGTgttcaatacattttccgccactcattgaatagaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGTCTCACCTATATT--GCTGATT--TTT-TTTCGGTCTTAGCAGTTTAA-------CTGCTTATTTATATCAAAC-ATCA------TAAAATTATTTTA-TAGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTGTATTGTATTATATCTCTGTAGTGTTGAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATG----A----CAGCTTGCCATA----AAGTCACACATT-AGCCAGTATC-AGGTTATTATAAAACATTGACAATT-------AAA--A--TACTGACCTGTCTGTTAACGAATTTCTCTAAAATAAA--ATAAAGCTACAAGT-TGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGTGCCTTCaattcgattaacgttccatcatttactgaacagaaagttataggtcacgcatcttgaaattaataacgataatatgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---AGAGGCCTCGTCTGTGGC--GCCGATA--TCT-TTTTGATCTTAACAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CATTCACTTATATTTTATTTTGTCTCTGTTGTGTAAACTTCATTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAA------------------------------TCGTTCATT-GGTCAATATC-GGGTTATGCTAAAACATTTGCGAATAAAACGGAAA--A--TGTCGACCTGTGTATTAACGGATTCCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACATGGATGGAATTCGCTATCATCTTCGAAAGGGTCATTGCTCTTTGTGtatgtggttcaataaactctccatcatttattaaacagagagttatatatgtgatgcatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTGAAATGTGA--TTCCGTTTCAATTTCAACACTTTGATTAATATATTGT-TTTT----GTCCTGTTTTGGTTGATTTTAAATCTGAAATAA-TCGGT----ATG-------T----------T-------T---GTTA----TA------AA----TA------A----A--TTGATTTG-TATTAACTTT-CAACTT-ATTattcaataaacttgccattatttactgaacagaaagttaaaggtgaagatgcat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                         ttttcagtaagatcatacttagatatacccactgagtccttattgccaatgtaatatctgtagcatacatatcatgtaagactaaaacatttttcgcgtttaaatttcaatatatgttatatagcagcaaataatccacgtggtttcaatttatttaatgttgtttatatattgttgactttggtacatctaagaaagacggcgtgtaatttctcT---TTTATCTGTCAT---T----GGTT-T-ACATATTGCAGAATTTGTTT-CATATTAAAATG---TCCAAATGATGATG-T-G-AT---------GG-T------GTTTCAGCAGT--ATTT-GAGGTCTG--TCTAGTTTTAGAA-GAGTAATTTCCTTTCAAGTT----ACTC-----TAAACATAG--TTTT----ATC---TTTT
gi|20                         : cgaacaacctttaacttgaactcattgaagttctactgtattaatttatttgggcttgattgagaagacatctctccgcttgataatttatgaatcactctcaagtttgtttcctgggtagaaccagtactgagatgtgttcaaagacatcaggtcgagcatgggatcagaccataatatctggtgagatatgtcaacactctaactacttcactgtcagatccatatatagtgtgttgtttaaagaaggtatatctgagtttttttaattggcttaaaacatgtgtttctaatatatcatacttatatatactcactgacatttattgccgtaaggatatctatttaaacatgccaataatatattgattagagaacttggcctacacacaaaggtaacttagactaaaatagatttcccttttagaattacaacaaattttgtgacatgtaaaatgtgttacatgatttcattttgataaccg-AGTTT-T-ACATATACTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATAATGAAT-C-G-A----------AGAT------TGTCAAACAGT--ATTA-AAGTGCTG--TTTATT-----AATAG-AGATTTTGTTTCAAATTTAACACTCCAATTTACATATTGA-TTTT----TTCACGTTTTAGTAGATTTGACTAACTAAACTATTCAGTTTATATTTA-----T----------T-------A---ATAA----T-------AA----TG------A----C--AAGATTTT-TATCTATTTT-GATA---ATTA-T--CAT-TTTTTAAGACATTTATA-TG-TTTTAT-CGTGATA----CATTCCCTATAAC--A-Ataagacacttattgtctatttttgtttctggataaatcatatgatatactactaaattgttttgttgattcatttctttc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttaaattaataagttttccagtcctttattaacttaccagtagctcacaaA---AGAAACCTCGCCTATATC--GCCGAAA--TAT-TTTCGATTGTATCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAGC-AT--------------TATT--A-TGGA-T-GTTCTGTT-CAATAACTTATATTGTA---TGTTTGTGTAGTGTACAATTCTTAAATT------ACC------------A----AATCGTGGCCCACGATA----AAGTTACTCATT-GGC-------------ATACTAAAATATTGACGAATAAAACGGAAAATA--TGCCGACCTGTATATTAACACATTTCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACAAGGACGGAATTAACCATTTTCTTCGAATGGAAAATTCTTCTTTGTGcaccccatagaaatagaaatgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAGCAGTAAAA-------CTGCAT-TTTATATCAAAC-ACCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCCATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTAGTGTAAACTTTTTTAATTTTGTTGACCAAATC-CTAAAT--------CACAGCCTGCG--------------------------------GGTTGTGCTAAAACCTTGACGAATAAAACAGAAA--AATTGCCAACCTGTGAATTAACGAATTTCTCATAGATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCAACCATTATCTTTGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaacttgcaatcatttgctgaacagaaatataaaggtaatgc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATGTTTATACCAAAC-ATCA------TA----TTTT--AATCGA-T-ATTCTGTTTCAATATTCTTTATTTTAATTTGTCTCTGCCGTATAAATATCGTTAATTTTGTTCAC-AAATA-CT---TA----A-TCGCGG-------TT----AGGTCACTCATT-GGCAAGTATC-GAGTTATGCTGAAACTTTGACGATTATT-CAGAAA--T--TGCCGATCTGTGTATAAACGATTTTTTTATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCTACCATTATCTTCGAGT-GGACCTT-ATCCTTGTGattcaataaattttctgtcacttactgaacagaaacttgtaggtaatgtatctttaaaaatgcatgatcatacttcagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A---AGAGGCCTCGCCTTTATC--ACTGATA--TAT-TCTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATACCAAAC-ATCA------TT----CATT--A-TAGA-T-ATTCTGT----ACAACTTATATTGTTTGTTGACTCTGTAGCGTAAAATTCTTTGATTTTGTTAA-CAAATA-CTAAAT------------GCC------------AGT-----ATC-GG-----------GTTAGGCTAAAACATTTACAAA-AAAGGGGAAA--A--TGCCGACTTTCGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAA--ATAAA-CTACAAGT-CGGAATCAAC-------------TGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcataactgaacagaaaagtataggggatacatcttt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AA---AGAGCACTCA--TATATCTTGCAGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATATAAATATCAAAC-ATCA------TA----TACT--A-TGGA-T-TTTCTGTT-CAATGATTTATATTGTATCTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTATTGGCCAAATA-C----TA----AATCGCAGCCCTTAATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATC-GAGTTATGCTAGATTATTGACGAATAGAAAAAAAC--A--TGCCAACCTGCATATTAattaaacatttgctgaacagaaagttataggtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTA----AATCGCGGTCC-CGATA----CAATCATCCATT-GGCCAGTGCCAGGGTTATGTTAAAATATTTACGAATAAAACGGAAA--A--AGCTGATCTGTGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAGAAAAAAA-AAACAAGAACTGAATCAACCGTTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CAGCCCATTTGTATCAAAC-A--A------------------A-TGGA-T-ATTATGTT-CAATAGCTT-T-TT---TTCTGTCTATGTAGTGTAAAATTATTTAAatgcaatgaacgccccatcatttactaaacagaaagttataggtgatgcatct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gagttATACTAACCCATTCGG-----ATT-------T----------T-------ATTAATTAATGAT-------AA----TT------A----G--TTGTATTT-TAACCGTTTT-AGAAAT-AATT-T--TAT-TTTTTAAGACATTCAT-GCT-TTTTTT-TCAAATATATGTATTCCCTTTAAacattgtattccgttgagcattgttgaatatttgaaaacgtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tCATTTTGATTCC-GAT---TTGATGCGTC----ATACTGGGTT-T---------TAATTATTTTTT-AAAC---GAAAG-AGGTTGAATGACGATG-T-GAA----------GG-C------CGTCAAGCGGT--ATCT-AAGTACT---TCTATTCTTAGAATGGG-GATTTTGTTTTAAGTTTACCATTCCGATTGAAATATCAATTTTT----TTCGCTTATTGGAATATTTGATATACGAAACAATTCGG-----AAT-------T----------T-------A---TTTA----TTTATGAAAA----TG------A----G--ATGCTTAG-TATCCATTTT-GCAAAT-A-AT-T--TA--TTTTTAAGACTTTTATCGCG--TTTTT-CTTTATA----TACAACCTTTAAtttggttatacgttattacttaaatttt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                      gatagtttccagctaatattccattaaacaaccaatttgaaaacaaaacatgttcttgattattccatgagaatatatttctaagaatttaccctttaaaggtagtgtatcaggctttttcaaaattttaaaagtgtctaaaatagttattatcaaaagctcatatatattcactaaccccgttttgccataagaatatatacatgatcatgtcatgggctagactaaaatagattgcccgcttaaaattgcatcgtcttgtctgatgtttcaaatgagtcacgtgatctATGGCAAGGTC-A-A----------GA-T------CATCAAGCAGTGCATGC-A--TAATA--TTTATTTCTAAAATTGAA-ATTCACTTTCAATTTCACTTCTCCGATTAAccgtgtcttcaaataaaacatattggcatgctataccattcgattcgatttatagtattaacaaatattaaaaagtgcttgatactgctacagtcatttatttagaggctaaacttccattgtatct
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tggcaaggtcaatgtcatcttA----T-------AA----TG------A----G--ATG-TTTT-TATCCTTTTT-GATAATTATTT-G--AAT-TTTTTA-GACATTTATAGCG--TTTTT-CCTGATA----CATTCTCTTTAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      g-CTACAATGACAAAATCAACCATTATCTCCGAATGTGACCTTCACCCTTGTGtgtaccaacacacgcttgata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAACAGTTACA---------GTATATTTATATAAAACTGTTG------TT----TTTT--T-TGTAGTGACTCTATT-CAATAGCCTGTGTTGAATTATGTCTCTGTAATGTAGAattcaataaactgcactggtgcatctgtaccgcactgacagtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTT-ATGACACATCATTCGATCCATCAT--ATTC-AAGTTCT-ATAT-TGATGAAT-TTATTC-CATCCTAG------GTCTGAATAACAAGG-T-G-AATGTCACCTCGG-TGATGTTCGCCTAGCATC--ATGT-GCGTGATA--TTTATTTTCAAAATAGAA-ATTTTCTTTCAATTTCATCATTCAGATTAAAATATTGT-TTTTTTTGGTCATGTTT----GGA----AAGT-CCAGATCATTTGT-----ATT-------T----------T-------A---TTGA----TGA-----AA----TGTCAATCA----G--ATGCTTTTGTATTCATTTT-AAAAATGA--C-T--AAC-TTTTTAGG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atttcaacaatctttaaaggatgtatttcagaaaactttcaaaattgataagacacagtttttcccaatatatcatgtctatatatacgaatatttactaggccttttattgccgcacggaaacccatttaaacatgtcaaaataaaatattgaaaagggattaacttacttagattacggaactataatagattccacagtttaaaactgcaacataCCAGATCATTCAC-----TTT-------T----------T-------A---TTTA----T-------AAAAATTA------A----G--ATGCCTTG-TATTCATTTT-AGAAAT-GATT-T--AAT-TTTcagtctatttctgaaatttgtatatccgtgtgatatgttttaatgtcatcacttgatttattattgatacaattaacaaaaagtttaagaaaataccagtttgtaattttaaagattcttttattaactgtacattgtattttcaaa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AA---AGAGGCCTCATCTATATT--GCTGATA--TTT-TATTAATCTT
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gAAGCAGT--ATTG-AAGTGCTG--TCTATTTTTAG
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CATTTT-GATATATAT---TTGATCCGTTGT--A--C-AGGTT-T-GCATGTAGTAAAA-TTGTTT-CATTATAGAAAG-AGTCTGAATGACAATG-T-G-AA---------GG-G------CATCAAGCAAT--ATTG-AAGAGCCG--TTTATCTTAAGAA-GGGA-ATTTGGCTTCAGATTTACCACACCAATTTAAATTTCGA-TTTT----GTATTATTTGGGTGGATTTGACACACTATACCATTCGG-----ATTA------TATTTATTAAAT-------A---ATGA----T-------AA----CG------A----G--ATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-CTATAT-TTTTTTAGACATTTATAGCG-TTTATT-CCTGCTA----TACTGCCTTTAAA--A-
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14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatTTTT-ATTGCA-AC---TCAATCTGTCGT--------GGTT-TCACACGTAGTAAAA-TTGTTT-CATCTTAGTA---AGTCCGAATGATGATA-TAA-A----------AG-T------CGTCAAGCAGT--ATTT-AAGTGCTGGCTTTATTTTTGGAATCGG-GATTTCTCTTTAAGTCGACTACTCCAATTAAAATATTGA-TTTT----GTCAAGTTTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTCGA-----ATTTA-----T----------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATGCTTTT-TATTCATTTT-AAAAATGATAT-T--TA--TTTTTAAGACATCTATAGCG-ATTTAT-CTTGTTA----TATTCCCTTTAAA--A-ATgttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattttttattgcaactcaatctgtcgtggtttcacacgtagtaaaattgtttcatcttagtaagtccgaatgatgatataaaagtcgtcaagcagtatttaagtgctggctttatttttggaatcgggatttctctttaagtcgactactccaattaaaatattgattttgtcaagttttggtggatttgacataccaaaccattcgaatttattaatgataatgagatgctttttattcattttaaaaatgatatttatttttaagacatctatagcgatttatcttgttatattccctttaaaaatagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|10                         :                                                                                                                                                            ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatttctcaatacttaaaggaaatatatcaggagttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattATTTTGATTTCAT-T---TTGTTCCGT--T--ATAT-AGGCT-T-ACACGTAATAACAATAGTCT-CATTATAGA-----GTCCGAACAACGATG-C-G-AA---------GG-T------CGTCAAACAGT--ATTG-AAGTGCTT--TCTATTTTTAGAGTGGG-GATTTTGTTTCAAGTTAACTAATCCAATTCAAACATCGA-TTTT----GTCAGGTTTTGGTGGATTTGACATAAGAAACC-TTCGG-----ATT-------T----------TATTTATAA-------ATGAT--AA----TG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT----AGT-ATGTAT--TATATTTTTAAGATATATGTAGCG-TTTTTT-TATGAAT----TACTCCCTTTAAA--A-Aagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaaggatatttatttaatttttacttaaacatgccaaaacaatatattaaaaaaaggatttgctaacttgggctacgtgcttgtgttagattaaagtagattccccgcttaaaaatgcaacatattttgtaacgtgttaaatgagtcatgcgattttACCTATATC--GCCGATAGCTTA-TTTTTATTTTATCAGTAAAAGTTAACACTGTACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TAT--------------TCTGTT-CAATAACTTAGATTGTATTTTGTCTCTGTAATATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAAAA-CT--CTA----AATTGTGTCCCGCGATAAATGAAGTCACCCATT-GGCCAATATC-GGGTTCTGCTAAAACATTGGCGAATAAAACAAAAA--A--TGCCGACTTGTGT-TTAACGACTTTCTCATAAATAAG--ATGAA-CTACAAGGACGGAATCAATCCTGACCTTCGTATGGGACCTTTTTCTTTATGaagcacattagactactcggtcacggatattcctccac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tA---AGGGGCATCATCTATATT--GCCGATA--GTC-TTCCGATCTTAGAAGTAAAA-------CTGCGTATTTATATCAAAC-ACTACCGGTATG----TATT--T-TGGA-T-ATTCTGTA-AAAAAAATTATATTGTATTTTGTCTCTTTAGTTTAAAAATCTTCAATT-------------A-CTAAAT--------CGTGGCCCGCAATA----AAGTCAACCATT-GGCCAGTATT-GAGTCATGCTAAAACATTGAAGAATAAAACTGAAA--A--TGGCGACCTGTGTATTAACCAA-CACCCATCAAAAAG--GTAAA-CTACAAGAGTGGAACCAACCAATATCTTCGAATGGAACCTTCCACTTTGTGattcaattactattccatcatttactgaacagaaaggtatagatgatgtatatttgaatagtgtatgtaatactaatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAGGTCTCACCTATATC--TCTGATA--TTTATTTTG-TCTTAGAAGTAAAA-------CTGCACATTTATCTCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTC-TCTATA-TTTTTTCATTTTGTTTTCCAAATATCCAAATATTTTAATCGTGGCTAGTGATA----AAGTCACTCATTTGGCCTGCATA-CGGTTATACTAAAACATTATCGAATAAAACAGAAA--A--TGCTGACCTGTATTTTAACGAATTTCTCATAAATGAG--ATAAT-CCACAAGGACAGAAACAAACATTATCTTCGAATGGGACCTTCTTCTTTGTGatttaatatacttgccatcatttactgaacagaaagttataggtcatgtctctttaatgctataaatagacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcatttactgaacagaaagttattgataatgcatcttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttAA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGgttcaatacattttccaccactcattgaataaaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttA---ATAGGTCTCATTTATATC--GACGATA--TTT-TGCTGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCAAGTTCATATCAAAC-TTCA------TA----TATT--A-TGAA-T-ATTATTAT-AAATAACTTGTATTGTCTGTTGTCTCTGTGGTG--AAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAACA-C----TA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAATCACTCATT-CGCCATTTCC-GGGTTATGCTAAATCATTGACGAATAAAACGAAAG--A--CGCCGACCCATGTATTAACAAG------AT--AT-----ATATA-CTACAAGGACGGAACCCAGTATTATCT-----TGGGACCT---TCTTTGTgttcaatacattttccgccactcattgaatagaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGTCTCACCTATATT--GCTGATT--TTT-TTTCGGTCTTAGCAGTTTAA-------CTGCTTATTTATATCAAAC-ATCA------TAAAATTATTTTA-TAGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTGTATTGTATTATATCTCTGTAGTGTTGAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATG----A----CAGCTTGCCATA----AAGTCACACATT-AGCCAGTATC-AGGTTATTATAAAACATTGACAATT-------AAA--A--TACTGACCTGTCTGTTAACGAATTTCTCTAAAATAAA--ATAAAGCTACAAGT-TGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGTGCCTTCaattcgattaacgttccatcatttactgaacagaaagttataggtcacgcatcttgaaattaataacgataatatgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---AGAGGCCTCGTCTGTGGC--GCCGATA--TCT-TTTTGATCTTAACAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CATTCACTTATATTTTATTTTGTCTCTGTTGTGTAAACTTCATTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAA------------------------------TCGTTCATT-GGTCAATATC-GGGTTATGCTAAAACATTTGCGAATAAAACGGAAA--A--TGTCGACCTGTGTATTAACGGATTCCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACATGGATGGAATTCGCTATCATCTTCGAAAGGGTCATTGCTCTTTGTGtatgtggttcaataaactctccatcatttattaaacagagagttatatatgtgatgcatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTGAAATGTGA--TTCCGTTTCAATTTCAACACTTTGATTAATATATTGT-TTTT----GTCCTGTTTTGGTTGATTTTAAATCTGAAATAA-TCGGT----ATG-------T----------T-------T-------GTTATA-AA----TA------AATTGATTTG-TATTAACTTT-CAACTT-ATTattcaataaacttgccattatttactgaacagaaagttaaaggtgaagatgcat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                            ttttcagtaagatcatacttagatatacccactgagtccttattgccaatgtaatatctgtagcatacatatcatgtaagactaaaacatttttcgcgtttaaatttcaatatatgttatatagcagcaaataatccacgtggtttcaatttatttaatgttgtttatatattgttgactttggtacatctaagaaagacggcgtgtaatttctcCATTTTGATAACCG-T---TTTATCTGTCAT---T----GGTT-T-ACATATTGCAGAATTTGTTT-CATATTAAAATG---TCCAAATGATGATG-T-G-AT---------GG-T------GTTTCAGCAGT--ATTT-GAGGTCTG--TCTAGTTTTAGAA-GAGTAATTTCCTTTCAAGTT----ACTC-----TAAACATAG--TTTT----ATC---TTTT
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaaattaataagttttccagtcctttattaacttaccagtagctcacaaA---AGAAACCTCGCCTATATC--GCCGAAA--TAT-TTTCGATTGTATCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAGC-AT--------------TATT--A-TGGA-T-GTTCTGTT-CAATAACTTATATTGTA---TGTTTGTGTAGTGTACAATTCTTAAATT------ACC------------A----AATCGTGGCCCACGATA----AAGTTACTCATT-GGC-------------ATACTAAAATATTGACGAATAAAACGGAAAATA--TGCCGACCTGTATATTAACACATTTCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACAAGGACGGAATTAACCATTTTCTTCGAATGGAAAATTCTTCTTTGTGcaccccatagaaatagaaatgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAGCAGTAAAA-------CTGCAT-TTTATATCAAAC-ACCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCCATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTAGTGTAAACTTTTTTAATTTTGTTGACCAAATC-CTAAAT--------CACAGCCTGCG--------------------------------GGTTGTGCTAAAACCTTGACGAATAAAACAGAAA--AATTGCCAACCTGTGAATTAACGAATTTCTCATAGATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCAACCATTATCTTTGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaacttgcaatcatttgctgaacagaaatataaaggtaatgc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATGTTTATACCAAAC-ATCA------TA----TTTT--AATCGA-T-ATTCTGTTTCAATATTCTTTATTTTAATTTGTCTCTGCCGTATAAATATCGTTAATTTTGTTCAC-AAATA-CT---TA----A-TCGCGG-------TT----AGGTCACTCATT-GGCAAGTATC-GAGTTATGCTGAAACTTTGACGATTATT-CAGAAA--T--TGCCGATCTGTGTATAAACGATTTTTTTATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCTACCATTATCTTCGAGT-GGACCTT-ATCCTTGTGattcaataaattttctgtcacttactgaacagaaacttgtaggtaatgtatctttaaaaatgcatgatcatacttcagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A---AGAGGCCTCGCCTTTATC--ACTGATA--TAT-TCTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATACCAAAC-ATCA------TT----CATT--A-TAGA-T-ATTCTGT----ACAACTTATATTGTTTGTTGACTCTGTAGCGTAAAATTCTTTGATTTTGTTAA-CAAATA-CTAAAT------------GCC------------AGT-----ATC-GG-----------GTTAGGCTAAAACATTTACAAA-AAAGGGGAAA--A--TGCCGACTTTCGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAA--ATAAA-CTACAAGT-CGGAATCAAC-------------TGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcataactgaacagaaaagtataggggatacatcttt
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tTA----AATCGCGGTCC-CGATA----CAATCATCCATT-GGCCAGTGCCAGGGTTATGTTAAAATATTTACGAATAAAACGGAAA--A--AGCTGATCTGTGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAGAAAAAAA-AAACAAGAACTGAATCAACCGTTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGg
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gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gagttATACTAACCCATTCGG-----ATT-------T----------T-------ATTAATTAATGAT--AA----TT------AGTTGTATTT-TAACCGTTTT-AGAAAT-AATT-T--TAT-TTTTTAAGACATTCAT-GCT-TTTTTT-TCAAATATATGTATTCCCTTTAAacattgtattccgttgagcattgttgaatatttgaaaacgtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tCATTTTGATTCC-GAT---TTGATGCGTC----ATACTGGGTT-T---------TAATTATTTTTT-AAAC---GAAAG-AGGTTGAATGACGATG-T-GAA----------GG-C------CGTCAAGCGGT--ATCT-AAGTACT---TCTATTCTTAGAATGGG-GATTTTGTTTTAAGTTTACCATTCCGATTGAAATATCAATTTTT----TTCGCTTATTGGAATATTTGATATACGAAACAATTCGG-----AAT-------T----------T-------ATTTATTTATGAA--AA----TG------AGATGCTTAG-TATCCATTTT-GCAAAT-A-AT-T--TA--TTTTTAAGACTTTTATCGCG--TTTTT-CTTTATA----TACAACCTTTAAtttggttatacgttattacttaaatttt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                        gatagtttccagctaatattccattaaacaaccaatttgaaaacaaaacatgttcttgattattccatgagaatatatttctaagaatttaccctttaaaggtagtgtatcaggctttttcaaaattttaaaagtgtctaaaatagttattatcaaaagctcatatatattcactaaccccgttttgccataagaatatatacatgatcatgtcatgggctagactaaaatagattgcccgcttaaaattgcatcgtcttgtctgatgtttcaaatgagtcacgtgatctATGGCAAGGTC-A-A----------GA-T------CATCAAGCAGTGCATGC-A--TAATA--TTTATTTCTAAAATTGAA-ATTCACTTTCAATTTCACTTCTCCGATTAAccgtgtcttcaaataaaacatattggcatgctataccattcgattcgatttatagtattaacaaatattaaaaagtgcttgatactgctacagtcatttatttagaggctaaacttccattgtatct
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tggcaaggtcaatgtcatcttAT--AA----TG------AGATG-TTTT-TATCCTTTTT-GATAATTATTT-G--AAT-TTTTTA-GACATTTATAGCG--TTTTT-CCTGATA----CATTCTCTTTAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             g-CTACAATGACAAAATCAACCATTATCTCCGAATGTGACCTTCACCCTTGTGtgtaccaacacacgcttgata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAACAGTTACA---------GTATATTTATATAAAACTGTTG------TT----TTTT--T-TGTAGTGACTCTATT-CAATAGCCTGTGTTGAATTATGTCTCTGTAATGTAGAattcaataaactgcactggtgcatctgtaccgcactgacagtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTTT-ATGACACATCATTCGATCCATCAT--ATTC-AAGTTCT-ATAT-TGATGAAT-TTATTC-CATCCTAG------GTCTGAATAACAAGG-T-G-AATGTCACCTCGG-TGATGTTCGCCTAGCATC--ATGT-GCGTGATA--TTTATTTTCAAAATAGAA-ATTTTCTTTCAATTTCATCATTCAGATTAAAATATTGT-TTTTTTTGGTCATGTTT----GGA----AAGT-CCAGATCATTTGT-----ATT-------T----------T-------A-------TTGATGAAA----TGTCAATCAGATGCTTTTGTATTCATTTT-AAAAATGA--C-T--AAC-TTTTTAGG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttcaacaatctttaaaggatgtatttcagaaaactttcaaaattgataagacacagtttttcccaatatatcatgtctatatatacgaatatttactaggccttttattgccgcacggaaacccatttaaacatgtcaaaataaaatattgaaaagggattaacttacttagattacggaactataatagattccacagtttaaaactgcaacatCCAGATCATTCAC-----TTT-------T----------T-------A-------TTTAT--AAAAATTA------AGATGCCTTG-TATTCATTTT-AGAAAT-GATT-T--AAT-TTTcagtctatttctgaaatttgtatatccgtgtgatatgttttaatgtcatcacttgatttattattgatacaattaacaaaaagtttaagaaaataccagtttgtaattttaaagattcttttattaactgtacattgtattttcaaa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGGCCTCATCTATATT--GCTGATA--TTT-TATTAATCTT
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gAAGCAGT--ATTG-AAGTGCTG--TCTATTTTTAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcttagCATTTT--TCAAAGAG---TAGATCCGCTATTTACAC-AGGCT-T-ACACGTAGTTAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-ATTCTGAATGATG-------------------------------TCACGCAGT--ATTTTAAGTGGTG--TCTATTTTTAAAATGGGAGATTTCGTTTCAAGATTACTGTTCCAATTTAAATATTGA-TTTT----GTCACGTTTTTGTGGATTTGACATTCGAAACCATTCGA-----ATT-------T----------T-------A-------AGTAT--TA----TG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTAAAAGCG-TTTTTT-CCTGATA----CATTTCCTTTAAG--A-ATTAAAAGGTAGAGGCCTCACCTATATT--GCCGATA--TTT-TTTCTATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATCTATATCAAAC-ATCG------TA----CATC--A-TGGA-T-ATTCCGTT-TAATATTGTATATTGTATTCCATCTCTCTAGTATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-TTAAATA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATT-GGGTTATGCTAAAACTTTGACGAATAAAACAGATA--A--TGCCAACCTGTGTATTAATGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGAAGGAATCAACCACTGTCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATTTT-GATATATAT---TTGATCCGTTGT--A--C-AGGTT-T-GCATGTAGTAAAA-TTGTTT-CATTATAGAAAG-AGTCTGAATGACAATG-T-G-AA---------GG-G------CATCAAGCAAT--ATTG-AAGAGCCG--TTTATCTTAAGAA-GGGA-ATTTGGCTTCAGATTTACCACACCAATTTAAATTTCGA-TTTT----GTATTATTTGGGTGGATTTGACACACTATACCATTCGG-----ATTA------TATTTATTAAAT-------A-------ATGAT--AA----CG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-CTATAT-TTTTTTAGACATTTATAGCG-TTTATT-CCTGCTA----TACTGCCTTTAAA--A-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taatttggatgacactcacttgaagattaattttaataacggaaataatatcaggatttatcttcaaatttatacaatttttcccaatatatatttcctatatatactcaatgtcccctatttgccaaaaggatatatatttaaatatgccaaaataatatattgaaaacggatttcctaactttagctacgcgcctagatcagactaaaatagagtcgcttaaaattgaaacatattttgtgacgtattaaaaaagtcacgtggtttT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--ATATTAAcaacagtattgacgaattaatcgttcaaggaatacgcctctactt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gattaaacaaattatcatctggaatatattataataCATTTTGATTCCA-AT---TTGAGCCGT--T--ATGC-AGGGA-T-GCGCGTAGTAAAAATTGTTTTCATCTTAGAA-G-AGTCAGA------------------------------------------CAGT--ATTA-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGG-AGATTTTGTTTCAAGTTTACCACTCCAATTTACATATCGA---------------TTTTGGTGGATTTGACATACTAAACTATACGG-----TTTATCTTTAT----------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATACTTTT-TATCCATATT-GATAAT-TATT-T--TAT-T----------TTCATAGCA-TTTTAT-CCAGATA----TACTCCCTTTAAA--catatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttcattttgattccaatttgagccgttatgcagggatgcgcgtagtaaaaattgttttcatcttagaagagtcagacagtattaaagtgctgtctatttttagaatggagattttgtttcaagtttaccactccaatttacatatcgattttggtggatttgacatactaaactatacggtttatctttattaatgataatgagatactttttatccatattgataattattttattttcatagcattttatccagatatactccctttaaagtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                          gattaaacaaattatcatctggaatatattataatattaatattttaaagggagtatatcaggacatatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttTTTT-ATTTCA-AT---TTGATCTGTC----ATAC-AGGTT-T-ACACGTTGTAGAATTTGTTT-CATCTGAGAAAACAATCCGAATGGCGACG-A-G-AA---------GG-T------CGTCAAACAAT--ATTA-AAGTGCGG--TCTTATTGTAGAATTG-AGATTTCGTTTCAAGTTT-CCACTCCGATTGCAACATTGA-TTTA----GTCACGTTCCAGTGGGTTTAATAAAACAAACCATTAG-------------------------------------------ATGAT--AC----TG------AGATGTTTTT-TATCCATTTTAAAAAAA-AGTT-A--TAT-TTTTTAA-ACATTTATAGCG-TTTTTTCCCTGACA----GACTCCCTTTTAATGA-AATAAAA---gtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gcaaaatgtttaaatgaagctcagaatttttcaaaaaatttaattggctaaaaacatttttaaccaatatatcttgcctatatatatatatatatatattatgacgcattaaatgagtcacgtgatttcttCGTTTT-ATTAAAGAG---TTGATCCGCCATTGATGC-AGGTT-T-ACACTTACTAAAAATTGTTT-TATCTTCGATAG-AGTCCGAATAACG-------------------------------TCAATTAGT--TTTT-AAGTGTTG--TTTATTTTTAGAATTGG-GATGGCGTTTCAAGTGTATCACTCCAACTGAAAGAGCGT-TTTT----GTCACATTTCGGTTGATTCGACATACTAAGCATTTCGG-----AAT-------T----------TATTTATCA-------ATGAT--AT----TG------ATATGTATTT-TAACAATTTT-AGAATT-ATTT------T-TTTTAAAGACATTTATAGCATTTTTTT-TCTTATT----TACTctgccctgttgtggagaaatcttatcaatacattaaaactaacatatgtgtgtaaatctttgtctcatttaaatgtactacatttaactagttatatgattgcacttccgt
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TTGAAAATCTTAAATGAAATTCAACGGTAAATACTCTTAGAAAAACTCTAAATTAATTTATGTCTAAAAGGGAATATAGCAAGATTTTTTCAATATATCATGCCTATATTTACTCAATGATCCCATTTTGCCCAAAGGATAAACATTTAAACATGCCAAGTCTTTGTCTACATAG
Unaligned ( gi|30 ): TATTGAAAAGTTTGCGAATTCTCAAATTCATTTTCTGAGTAATGTCAGTTCTTGGTGCTGTTAATAAGAGGCCAATGGGTTGGTTGAGCCTAGGATAAAACCATGACCTGTTATACTGTCAACACCCGAACTACTACAC
Unaligned ( gi|31 ): AACAGAAGATAACGTTTTATAATGTTCTTCTCCATGACATATAACTGATTTGTCCATATTTACAGAACAGAAAGTTATAGGTGATGCATCTTTAAATATGTTGATTGA
Unaligned ( gi|34 ): TTAAAGGAAGTAAATCAGGATTATTAATTTTTTTAAAGTTGACAAAAACAAACTACATTTTTTCTCAATAAGTGATGCTTATCTATGCCCACATGATAACATT
Unaligned ( gi|36 ): AGTAGAGATGAGGATTATTTTTGGCTTATGAGTATTTGTAAGTAATACAAAACCATTTGTATTATGTTTCTGGTGAAATCTTATGTTTTTTTGA
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Unaligned ( gi|41 ): GTTTTCAAGCACAACATGCTTAGCTATACTCACTGAGCCTTTTATTGCAATAAGAATATATGTTAAACCTGCCATT
Unaligned ( gi|42 ): TAAATTCTTANNNNNNNNNNGGCTTTGTGTGTCAGTTACACCTATATTATTACATACCACCATATCTTCTTATAT
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Reference ( family-1439 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTTTGATTNCAGATTTGATCCGTCGT--ATAC-AGGTT-T-ACACGTAGTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATGACGATG-CG-A----------G-G-T------CGTCAAGCAGT--ATTN-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGGGAGATTTCGTTTCAAGTTTACCACTCCGATTNAAATATCGA-TTTT----GTCACGTTTTGGTGGATTTGACATACNAAACCATTCGG-----ATT-------T----------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTTATAGCG-TTTTTT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--A-ATTAAAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATA----AATCGCGGCCCGCGATA----AAGTCACTCATT-GGCCAGTATC-GGGTTATGCTAAAACATTGACGAATAAAACGGAAA--A--TGCCGACCTGTGTATTAACGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatTTTTTATTGCA-ACTCAATCTGTCGT--------GGTT-TCACACGTAGTAAAA-TTGTTT-CATCTTAGTAAG---TCCGAATGATGATA-TA-A----------AAG-T------CGTCAAGCAGT--ATTT-AAGTGCTGGCTTTATTTTTGGAATCGG-GATTTCTCTTTAAGTCGACTACTCCAATTAAAATATTGA-TTTT----GTCAAGTTTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTCGA-----ATT-------TAT--------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATGCTTTT-TATTCATTTT-AAAAATGATAT-T--TA--TTTTTAAGACATCTATAGCG-ATTTAT-CTTGTTA----TATTCCCTTTAAA--A-ATgttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattttttattgcaactcaatctgtcgtggtttcacacgtagtaaaattgtttcatcttagtaagtccgaatgatgatataaaagtcgtcaagcagtatttaagtgctggctttatttttggaatcgggatttctctttaagtcgactactccaattaaaatattgattttgtcaagttttggtggatttgacataccaaaccattcgaatttattaatgataatgagatgctttttattcattttaaaaatgatatttatttttaagacatctatagcgatttatcttgttatattccctttaaaaatagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|10                         :                                                                                                                                                                ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatttctcaatacttaaaggaaatatatcaggagttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcatATTTTGATTTCAT-TTTGTTCCGT--T--ATAT-AGGCT-T-ACACGTAATAACAATAGTCT-CATTATAGA-----GTCCGAACAACGATG-CG-AA---------G-G-T------CGTCAAACAGT--ATTG-AAGTGCTT--TCTATTTTTAGAGTGGG-GATTTTGTTTCAAGTTAACTAATCCAATTCAAACATCGA-TTTT----GTCAGGTTTTGGTGGATTTGACATAAGAAACC-TTCGG-----ATT-------T----------TATTTATAA-------ATGAT--AA----TG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT----AGT-ATGTAT--TATATTTTTAAGATATATGTAGCG-TTTTTT-TATGAAT----TACTCCCTTTAAA--A-Aagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaaggatatttatttaatttttacttaaacatgccaaaacaatatattaaaaaaaggatttgctaacttgggctacgtgcttgtgttagattaaagtagattccccgcttaaaaatgcaacatattttgtaacgtgttaaatgagtcatgcgattttACCTATATC--GCCGATAGCTTA-TTTTTATTTTATCAGTAAAAGTTAACACTGTACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TAT--------------TCTGTT-CAATAACTTAGATTGTATTTTGTCTCTGTAATATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAAAA-CT--CTA----AATTGTGTCCCGCGATAAATGAAGTCACCCATT-GGCCAATATC-GGGTTCTGCTAAAACATTGGCGAATAAAACAAAAA--A--TGCCGACTTGTGT-TTAACGACTTTCTCATAAATAAG--ATGAA-CTACAAGGACGGAATCAATCCTGACCTTCGTATGGGACCTTTTTCTTTATGaagcacattagactactcggtcacggatattcctccac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tA---AGGGGCATCATCTATATT--GCCGATA--GTC-TTCCGATCTTAGAAGTAAAA-------CTGCGTATTTATATCAAAC-ACTACCGGTATG----TATT--T-TGGA-T-ATTCTGTA-AAAAAAATTATATTGTATTTTGTCTCTTTAGTTTAAAAATCTTCAATT-------------A-CTAAAT--------CGTGGCCCGCAATA----AAGTCAACCATT-GGCCAGTATT-GAGTCATGCTAAAACATTGAAGAATAAAACTGAAA--A--TGGCGACCTGTGTATTAACCAA-CACCCATCAAAAAG--GTAAA-CTACAAGAGTGGAACCAACCAATATCTTCGAATGGAACCTTCCACTTTGTGattcaattactattccatcatttactgaacagaaaggtatagatgatgtatatttgaatagtgtatgtaatactaatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAGGTCTCACCTATATC--TCTGATA--TTTATTTTG-TCTTAGAAGTAAAA-------CTGCACATTTATCTCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTC-TCTATA-TTTTTTCATTTTGTTTTCCAAATATCCAAATATTTTAATCGTGGCTAGTGATA----AAGTCACTCATTTGGCCTGCATA-CGGTTATACTAAAACATTATCGAATAAAACAGAAA--A--TGCTGACCTGTATTTTAACGAATTTCTCATAAATGAG--ATAAT-CCACAAGGACAGAAACAAACATTATCTTCGAATGGGACCTTCTTCTTTGTGatttaatatacttgccatcatttactgaacagaaagttataggtcatgtctctttaatgctataaatagacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcatttactgaacagaaagttattgataatgcatcttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttAA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGgttcaatacattttccaccactcattgaataaaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttA---ATAGGTCTCATTTATATC--GACGATA--TTT-TGCTGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCAAGTTCATATCAAAC-TTCA------TA----TATT--A-TGAA-T-ATTATTAT-AAATAACTTGTATTGTCTGTTGTCTCTGTGGTG--AAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAACA-C----TA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAATCACTCATT-CGCCATTTCC-GGGTTATGCTAAATCATTGACGAATAAAACGAAAG--A--CGCCGACCCATGTATTAACAAG------AT--AT-----ATATA-CTACAAGGACGGAACCCAGTATTATCT-----TGGGACCT---TCTTTGTgttcaatacattttccgccactcattgaatagaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGTCTCACCTATATT--GCTGATT--TTT-TTTCGGTCTTAGCAGTTTAA-------CTGCTTATTTATATCAAAC-ATCA------TAAAATTATTTTA-TAGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTGTATTGTATTATATCTCTGTAGTGTTGAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATG----A----CAGCTTGCCATA----AAGTCACACATT-AGCCAGTATC-AGGTTATTATAAAACATTGACAATT-------AAA--A--TACTGACCTGTCTGTTAACGAATTTCTCTAAAATAAA--ATAAAGCTACAAGT-TGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGTGCCTTCaattcgattaacgttccatcatttactgaacagaaagttataggtcacgcatcttgaaattaataacgataatatgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---AGAGGCCTCGTCTGTGGC--GCCGATA--TCT-TTTTGATCTTAACAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CATTCACTTATATTTTATTTTGTCTCTGTTGTGTAAACTTCATTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAA------------------------------TCGTTCATT-GGTCAATATC-GGGTTATGCTAAAACATTTGCGAATAAAACGGAAA--A--TGTCGACCTGTGTATTAACGGATTCCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACATGGATGGAATTCGCTATCATCTTCGAAAGGGTCATTGCTCTTTGTGtatgtggttcaataaactctccatcatttattaaacagagagttatatatgtgatgcatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTGAAATGTGA--TTCCGTTTCAATTTCAACACTTTGATTAATATATTGT-TTTT----GTCCTGTTTTGGTTGATTTTAAATCTGAAATAA-TCGGT----ATG-------T----------T-------T-------GTTATA-AA----TA------AATTGATTTG-TATTAACTTT-CAACTT-ATTattcaataaacttgccattatttactgaacagaaagttaaaggtgaagatgcat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                               ttttcagtaagatcatacttagatatacccactgagtccttattgccaatgtaatatctgtagcatacatatcatgtaagactaaaacatttttcgcgtttaaatttcaatatatgttatatagcagcaaataatccacgtggtttcaatttatttaatgttgtttatatattgttgactttggtacatctaagaaagacggcgtgtaatttctcCATTTTGATAACCG-TTTTATCTGTCAT---T----GGTT-T-ACATATTGCAGAATTTGTTT-CATATTAAAATG---TCCAAATGATGATG-TG-AT---------G-G-T------GTTTCAGCAGT--ATTT-GAGGTCTG--TCTAGTTTTAGAA-GAGTAATTTCCTTTCAAGTT----ACTC-----TAAACATAG--TTTT----ATC---TTTT
gi|20                         : cgaacaacctttaacttgaactcattgaagttctactgtattaatttatttgggcttgattgagaagacatctctccgcttgataatttatgaatcactctcaagtttgtttcctgggtagaaccagtactgagatgtgttcaaagacatcaggtcgagcatgggatcagaccataatatctggtgagatatgtcaacactctaactacttcactgtcagatccatatatagtgtgttgtttaaagaaggtatatctgagtttttttaattggcttaaaacatgtgtttctaatatatcatacttatatatactcactgacatttattgccgtaaggatatctatttaaacatgccaataatatattgattagagaacttggcctacacacaaaggtaacttagactaaaatagatttcccttttagaattacaacaaattttgtgacatgtaaaatgtgttacatgattt-AGTTT-T-ACATATACTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATAATGAAT-CG-A----------A-GAT------TGTCAAACAGT--ATTA-AAGTGCTG--TTTATT-----AATAG-AGATTTTGTTTCAAATTTAACACTCCAATTTACATATTGA-TTTT----TTCACGTTTTAGTAGATTTGACTAACTAAACTATTCAGTTTATATTTA-----T----------T-------A-------ATAAT--AA----TG------ACAAGATTTT-TATCTATTTT-GATA---ATTA-T--CAT-TTTTTAAGACATTTATA-TG-TTTTAT-CGTGATA----CATTCCCTATAAC--A-Ataagacacttattgtctatttttgtttctggataaatcatatgatatactactaaattgttttgttgattcatttctttc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaaattaataagttttccagtcctttattaacttaccagtagctcacaaA---AGAAACCTCGCCTATATC--GCCGAAA--TAT-TTTCGATTGTATCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAGC-AT--------------TATT--A-TGGA-T-GTTCTGTT-CAATAACTTATATTGTA---TGTTTGTGTAGTGTACAATTCTTAAATT------ACC------------A----AATCGTGGCCCACGATA----AAGTTACTCATT-GGC-------------ATACTAAAATATTGACGAATAAAACGGAAAATA--TGCCGACCTGTATATTAACACATTTCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACAAGGACGGAATTAACCATTTTCTTCGAATGGAAAATTCTTCTTTGTGcaccccatagaaatagaaatgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAGCAGTAAAA-------CTGCAT-TTTATATCAAAC-ACCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCCATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTAGTGTAAACTTTTTTAATTTTGTTGACCAAATC-CTAAAT--------CACAGCCTGCG--------------------------------GGTTGTGCTAAAACCTTGACGAATAAAACAGAAA--AATTGCCAACCTGTGAATTAACGAATTTCTCATAGATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCAACCATTATCTTTGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaacttgcaatcatttgctgaacagaaatataaaggtaatgc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATGTTTATACCAAAC-ATCA------TA----TTTT--AATCGA-T-ATTCTGTTTCAATATTCTTTATTTTAATTTGTCTCTGCCGTATAAATATCGTTAATTTTGTTCAC-AAATA-CT---TA----A-TCGCGG-------TT----AGGTCACTCATT-GGCAAGTATC-GAGTTATGCTGAAACTTTGACGATTATT-CAGAAA--T--TGCCGATCTGTGTATAAACGATTTTTTTATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCTACCATTATCTTCGAGT-GGACCTT-ATCCTTGTGattcaataaattttctgtcacttactgaacagaaacttgtaggtaatgtatctttaaaaatgcatgatcatacttcagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A---AGAGGCCTCGCCTTTATC--ACTGATA--TAT-TCTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATACCAAAC-ATCA------TT----CATT--A-TAGA-T-ATTCTGT----ACAACTTATATTGTTTGTTGACTCTGTAGCGTAAAATTCTTTGATTTTGTTAA-CAAATA-CTAAAT------------GCC------------AGT-----ATC-GG-----------GTTAGGCTAAAACATTTACAAA-AAAGGGGAAA--A--TGCCGACTTTCGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAA--ATAAA-CTACAAGT-CGGAATCAAC-------------TGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcataactgaacagaaaagtataggggatacatcttt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGCACTCA--TATATCTTGCAGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATATAAATATCAAAC-ATCA------TA----TACT--A-TGGA-T-TTTCTGTT-CAATGATTTATATTGTATCTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTATTGGCCAAATA-C----TA----AATCGCAGCCCTTAATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATC-GAGTTATGCTAGATTATTGACGAATAGAAAAAAAC--A--TGCCAACCTGCATATTAattaaacatttgctgaacagaaagttataggtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tTA----AATCGCGGTCC-CGATA----CAATCATCCATT-GGCCAGTGCCAGGGTTATGTTAAAATATTTACGAATAAAACGGAAA--A--AGCTGATCTGTGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAGAAAAAAA-AAACAAGAACTGAATCAACCGTTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CAGCCCATTTGTATCAAAC-A--A------------------A-TGGA-T-ATTATGTT-CAATAGCTT-T-TT---TTCTGTCTATGTAGTGTAAAATTATTTAAatgcaatgaacgccccatcatttactaaacagaaagttataggtgatgcatct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gagttATACTAACCCATTCGG-----ATT-------T----------T-------ATTAATTAATGAT--AA----TT------AGTTGTATTT-TAACCGTTTT-AGAAAT-AATT-T--TAT-TTTTTAAGACATTCAT-GCT-TTTTTT-TCAAATATATGTATTCCCTTTAAacattgtattccgttgagcattgttgaatatttgaaaacgtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tCATTTTGATTCC-GATTTGATGCGTC----ATACTGGGTT-T---------TAATTATTTTTT-AAAC---GAAAG-AGGTTGAATGACGATG-TGAA----------G-G-C------CGTCAAGCGGT--ATCT-AAGTACT---TCTATTCTTAGAATGGG-GATTTTGTTTTAAGTTTACCATTCCGATTGAAATATCAATTTTT----TTCGCTTATTGGAATATTTGATATACGAAACAATTCGG-----AAT-------T----------T-------ATTTATTTATGAA--AA----TG------AGATGCTTAG-TATCCATTTT-GCAAAT-A-AT-T--TA--TTTTTAAGACTTTTATCGCG--TTTTT-CTTTATA----TACAACCTTTAAtttggttatacgttattacttaaatttt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                        gatagtttccagctaatattccattaaacaaccaatttgaaaacaaaacatgttcttgattattccatgagaatatatttctaagaatttaccctttaaaggtagtgtatcaggctttttcaaaattttaaaagtgtctaaaatagttattatcaaaagctcatatatattcactaaccccgttttgccataagaatatatacatgatcatgtcatgggctagactaaaatagattgcccgcttaaaattgcatcgtcttgtctgatgtttcaaatgagtcacgtgatctATGGCAAGGTCA-A----------G-A-T------CATCAAGCAGTGCATGC-A--TAATA--TTTATTTCTAAAATTGAA-ATTCACTTTCAATTTCACTTCTCCGATTAAccgtgtcttcaaataaaacatattggcatgctataccattcgattcgatttatagtattaacaaatattaaaaagtgcttgatactgctacagtcatttatttagaggctaaacttccattgtatct
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tggcaaggtcaatgtcatcttGAT--AA----TG------AGATG-TTTT-TATCCTTTTT-GATAATTATTT-G--AAT-TTTTTA-GACATTTATAGCG--TTTTT-CCTGATA----CATTCTCTTTAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CTACAATGACAAAATCAACCATTATCTCCGAATGTGACCTTCACCCTTGTGtgtaccaacacacgcttgata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAACAGTTACA---------GTATATTTATATAAAACTGTTG------TT----TTTT--T-TGTAGTGACTCTATT-CAATAGCCTGTGTTGAATTATGTCTCTGTAATGTAGAattcaataaactgcactggtgcatctgtaccgcactgacagtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTCGATCCATCAT--ATTC-AAGTTCT-ATAT-TGATGAAT-TTATTC-CATCCTAG------GTCTGAATAACAAGG-TG-AATGTCACCTCG-G-TGATGTTCGCCTAGCATC--ATGT-GCGTGATA--TTTATTTTCAAAATAGAA-ATTTTCTTTCAATTTCATCATTCAGATTAAAATATTGT-TTTTTTTGGTCATGTTT----GGA----AAGT-CCAGATCATTTGT-----ATT-------T----------T-------A-------TTGATGAAA----TGTCAATCAGATGCTTTTGTATTCATTTT-AAAAATGA--C-T--AAC-TTTTTAGG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atttcaacaatctttaaaggatgtatttcagaaaactttcaaaattgataagacacagtttttcccaatatatcatgtctatatatacgaatatttactaggccttttattgccgcacggaaacccatttaaacatgtcaaaataaaatattgaaaagggattaacttacttagattacggaactataatagattccacagtttaaaactgcaacatattttatgacacatcCCAGATCATTCAC-----TTT-------T----------T-------A-------TTTAT--AAAAATTA------AGATGCCTTG-TATTCATTTT-AGAAAT-GATT-T--AAT-TTTcagtctatttctgaaatttgtatatccgtgtgatatgttttaatgtcatcacttgatttattattgatacaattaacaaaaagtttaagaaaataccagtttgtaattttaaagattcttttattaactgtacattgtattttcaaa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGGCCTCATCTATATT--GCTGATA--TTT-TATTAATCTT
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gAAGCAGT--ATTG-AAGTGCTG--TCTATTTTTAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcttagCATTTT--TCAAAGAGTAGATCCGCTATTTACAC-AGGCT-T-ACACGTAGTTAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-ATTCTGAATGATG-------------------------------TCACGCAGT--ATTTTAAGTGGTG--TCTATTTTTAAAATGGGAGATTTCGTTTCAAGATTACTGTTCCAATTTAAATATTGA-TTTT----GTCACGTTTTTGTGGATTTGACATTCGAAACCATTCGA-----ATT-------T----------T-------A-------AGTAT--TA----TG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTAAAAGCG-TTTTTT-CCTGATA----CATTTCCTTTAAG--A-ATTAAAAGGTAGAGGCCTCACCTATATT--GCCGATA--TTT-TTTCTATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATCTATATCAAAC-ATCG------TA----CATC--A-TGGA-T-ATTCCGTT-TAATATTGTATATTGTATTCCATCTCTCTAGTATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-TTAAATA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATT-GGGTTATGCTAAAACTTTGACGAATAAAACAGATA--A--TGCCAACCTGTGTATTAATGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGAAGGAATCAACCACTGTCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTTTGAT-ATATATTTGATCCGTTGT--A--C-AGGTT-T-GCATGTAGTAAAA-TTGTTT-CATTATAGAAAG-AGTCTGAATGACAATG-TG-AA---------G-G-G------CATCAAGCAAT--ATTG-AAGAGCCG--TTTATCTTAAGAA-GGGA-ATTTGGCTTCAGATTTACCACACCAATTTAAATTTCGA-TTTT----GTATTATTTGGGTGGATTTGACACACTATACCATTCGG-----ATTA------TATTTATTAAAT-------A-------ATGAT--AA----CG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-CTATAT-TTTTTTAGACATTTATAGCG-TTTATT-CCTGCTA----TACTGCCTTTAAA--A-
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gattaaacaaattatcatctggaatatattataataCATTTTGATTCCA-ATTTGAGCCGT--T--ATGC-AGGGA-T-GCGCGTAGTAAAAATTGTTTTCATCTTAGAA-G-AGTCAGA------------------------------------------CAGT--ATTA-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGG-AGATTTTGTTTCAAGTTTACCACTCCAATTTACATATCGA---------------TTTTGGTGGATTTGACATACTAAACTATACGG-----TTTATCTTTAT----------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATACTTTT-TATCCATATT-GATAAT-TATT-T--TAT-T----------TTCATAGCA-TTTTAT-CCAGATA----TACTCCCTTTAAA--catatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttcattttgattccaatttgagccgttatgcagggatgcgcgtagtaaaaattgttttcatcttagaagagtcagacagtattaaagtgctgtctatttttagaatggagattttgtttcaagtttaccactccaatttacatatcgattttggtggatttgacatactaaactatacggtttatctttattaatgataatgagatactttttatccatattgataattattttattttcatagcattttatccagatatactccctttaaagtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
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Reference ( family-1439 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTTTGATTNCAGATTTGATCCGTCGT--ATAC-AGGTT-T-ACACGTAGTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATGACGATG-CG-A----------G-G-T------CGTCAAGCAGT--ATTN-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGGGAGATTTCGTTTCAAGTTTACCACTCCGATTNAAATATCGA-TTTT----GTCACGTTTTGGTGGATTTGACATACNAAACCATTCGG-----ATT-------T----------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTTATAGCG-TTTTTT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--A-ATTAAAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATA----AATCGCGGCCCGCGATA----AAGTCACTCATT-GGCCAGTATC-GGGTTATGCTAAAACATTGACGAATAAAACGGAAA--A--TGCCGACCTGTGTATTAACGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatTTTTTATTGCA-ACTCAATCTGTCGT--------GGTT-TCACACGTAGTAAAA-TTGTTT-CATCTTAGTAAG---TCCGAATGATGATA-TA-A----------AAG-T------CGTCAAGCAGT--ATTT-AAGTGCTGGCTTTATTTTTGGAATCGG-GATTTCTCTTTAAGTCGACTACTCCAATTAAAATATTGA-TTTT----GTCAAGTTTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTCGA-----ATT-------TAT--------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATGCTTTT-TATTCATTTT-AAAAATGATAT-T--TA--TTTTTAAGACATCTATAGCG-ATTTAT-CTTGTTA----TATTCCCTTTAAA--A-ATgttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcattttttattgcaactcaatctgtcgtggtttcacacgtagtaaaattgtttcatcttagtaagtccgaatgatgatataaaagtcgtcaagcagtatttaagtgctggctttatttttggaatcgggatttctctttaagtcgactactccaattaaaatattgattttgtcaagttttggtggatttgacataccaaaccattcgaatttattaatgataatgagatgctttttattcattttaaaaatgatatttatttttaagacatctatagcgatttatcttgttatattccctttaaaaatagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaaggatatttatttaatttttacttaaacatgccaaaacaatatattaaaaaaaggatttgctaacttgggctacgtgcttgtgttagattaaagtagattccccgcttaaaaatgcaacatattttgtaacgtgttaaatgagtcatgcgattttACCTATATC--GCCGATAGCTTA-TTTTTATTTTATCAGTAAAAGTTAACACTGTACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TAT--------------TCTGTT-CAATAACTTAGATTGTATTTTGTCTCTGTAATATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAAAA-CT--CTA----AATTGTGTCCCGCGATAAATGAAGTCACCCATT-GGCCAATATC-GGGTTCTGCTAAAACATTGGCGAATAAAACAAAAA--A--TGCCGACTTGTGT-TTAACGACTTTCTCATAAATAAG--ATGAA-CTACAAGGACGGAATCAATCCTGACCTTCGTATGGGACCTTTTTCTTTATGaagcacattagactactcggtcacggatattcctccac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tA---AGGGGCATCATCTATATT--GCCGATA--GTC-TTCCGATCTTAGAAGTAAAA-------CTGCGTATTTATATCAAAC-ACTACCGGTATG----TATT--T-TGGA-T-ATTCTGTA-AAAAAAATTATATTGTATTTTGTCTCTTTAGTTTAAAAATCTTCAATT-------------A-CTAAAT--------CGTGGCCCGCAATA----AAGTCAACCATT-GGCCAGTATT-GAGTCATGCTAAAACATTGAAGAATAAAACTGAAA--A--TGGCGACCTGTGTATTAACCAA-CACCCATCAAAAAG--GTAAA-CTACAAGAGTGGAACCAACCAATATCTTCGAATGGAACCTTCCACTTTGTGattcaattactattccatcatttactgaacagaaaggtatagatgatgtatatttgaatagtgtatgtaatactaatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAGGTCTCACCTATATC--TCTGATA--TTTATTTTG-TCTTAGAAGTAAAA-------CTGCACATTTATCTCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTC-TCTATA-TTTTTTCATTTTGTTTTCCAAATATCCAAATATTTTAATCGTGGCTAGTGATA----AAGTCACTCATTTGGCCTGCATA-CGGTTATACTAAAACATTATCGAATAAAACAGAAA--A--TGCTGACCTGTATTTTAACGAATTTCTCATAAATGAG--ATAAT-CCACAAGGACAGAAACAAACATTATCTTCGAATGGGACCTTCTTCTTTGTGatttaatatacttgccatcatttactgaacagaaagttataggtcatgtctctttaatgctataaatagacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcatttactgaacagaaagttattgataatgcatcttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttAA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGgttcaatacattttccaccactcattgaataaaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttA---ATAGGTCTCATTTATATC--GACGATA--TTT-TGCTGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCAAGTTCATATCAAAC-TTCA------TA----TATT--A-TGAA-T-ATTATTAT-AAATAACTTGTATTGTCTGTTGTCTCTGTGGTG--AAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAACA-C----TA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAATCACTCATT-CGCCATTTCC-GGGTTATGCTAAATCATTGACGAATAAAACGAAAG--A--CGCCGACCCATGTATTAACAAG------AT--AT-----ATATA-CTACAAGGACGGAACCCAGTATTATCT-----TGGGACCT---TCTTTGTgttcaatacattttccgccactcattgaatagaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAGTCTCACCTATATT--GCTGATT--TTT-TTTCGGTCTTAGCAGTTTAA-------CTGCTTATTTATATCAAAC-ATCA------TAAAATTATTTTA-TAGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTGTATTGTATTATATCTCTGTAGTGTTGAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATG----A----CAGCTTGCCATA----AAGTCACACATT-AGCCAGTATC-AGGTTATTATAAAACATTGACAATT-------AAA--A--TACTGACCTGTCTGTTAACGAATTTCTCTAAAATAAA--ATAAAGCTACAAGT-TGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGTGCCTTCaattcgattaacgttccatcatttactgaacagaaagttataggtcacgcatcttgaaattaataacgataatatgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ---AGAGGCCTCGTCTGTGGC--GCCGATA--TCT-TTTTGATCTTAACAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CATTCACTTATATTTTATTTTGTCTCTGTTGTGTAAACTTCATTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAA------------------------------TCGTTCATT-GGTCAATATC-GGGTTATGCTAAAACATTTGCGAATAAAACGGAAA--A--TGTCGACCTGTGTATTAACGGATTCCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACATGGATGGAATTCGCTATCATCTTCGAAAGGGTCATTGCTCTTTGTGtatgtggttcaataaactctccatcatttattaaacagagagttatatatgtgatgcatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTGAAATGTGA--TTCCGTTTCAATTTCAACACTTTGATTAATATATTGT-TTTT----GTCCTGTTTTGGTTGATTTTAAATCTGAAATAA-TCGGT----ATG-------T----------T-------T-------GTTATA-AA----TA------AATTGATTTG-TATTAACTTT-CAACTT-ATTattcaataaacttgccattatttactgaacagaaagttaaaggtgaagatgcat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                               ttttcagtaagatcatacttagatatacccactgagtccttattgccaatgtaatatctgtagcatacatatcatgtaagactaaaacatttttcgcgtttaaatttcaatatatgttatatagcagcaaataatccacgtggtttcaatttatttaatgttgtttatatattgttgactttggtacatctaagaaagacggcgtgtaatttctcCATTTTGATAACCG-TTTTATCTGTCAT---T----GGTT-T-ACATATTGCAGAATTTGTTT-CATATTAAAATG---TCCAAATGATGATG-TG-AT---------G-G-T------GTTTCAGCAGT--ATTT-GAGGTCTG--TCTAGTTTTAGAA-GAGTAATTTCCTTTCAAGTT----ACTC-----TAAACATAG--TTTT----ATC---TTTT
gi|20                         : cgaacaacctttaacttgaactcattgaagttctactgtattaatttatttgggcttgattgagaagacatctctccgcttgataatttatgaatcactctcaagtttgtttcctgggtagaaccagtactgagatgtgttcaaagacatcaggtcgagcatgggatcagaccataatatctggtgagatatgtcaacactctaactacttcactgtcagatccatatatagtgtgttgtttaaagaaggtatatctgagtttttttaattggcttaaaacatgtgtttctaatatatcatacttatatatactcactgacatttattgccgtaaggatatctatttaaacatgccaataatatattgattagagaacttggcctacacacaaaggtaacttagactaaaatagatttcccttttagaattacaacaaattttgtgacatgtaaaatgtgttacatgattt-AGTTT-T-ACATATACTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATAATGAAT-CG-A----------A-GAT------TGTCAAACAGT--ATTA-AAGTGCTG--TTTATT-----AATAG-AGATTTTGTTTCAAATTTAACACTCCAATTTACATATTGA-TTTT----TTCACGTTTTAGTAGATTTGACTAACTAAACTATTCAGTTTATATTTA-----T----------T-------A-------ATAAT--AA----TG------ACAAGATTTT-TATCTATTTT-GATA---ATTA-T--CAT-TTTTTAAGACATTTATA-TG-TTTTAT-CGTGATA----CATTCCCTATAAC--A-Ataagacacttattgtctatttttgtttctggataaatcatatgatatactactaaattgttttgttgattcatttctttc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaaattaataagttttccagtcctttattaacttaccagtagctcacaaA---AGAAACCTCGCCTATATC--GCCGAAA--TAT-TTTCGATTGTATCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAGC-AT--------------TATT--A-TGGA-T-GTTCTGTT-CAATAACTTATATTGTA---TGTTTGTGTAGTGTACAATTCTTAAATT------ACC------------A----AATCGTGGCCCACGATA----AAGTTACTCATT-GGC-------------ATACTAAAATATTGACGAATAAAACGGAAAATA--TGCCGACCTGTATATTAACACATTTCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACAAGGACGGAATTAACCATTTTCTTCGAATGGAAAATTCTTCTTTGTGcaccccatagaaatagaaatgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAGCAGTAAAA-------CTGCAT-TTTATATCAAAC-ACCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCCATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTAGTGTAAACTTTTTTAATTTTGTTGACCAAATC-CTAAAT--------CACAGCCTGCG--------------------------------GGTTGTGCTAAAACCTTGACGAATAAAACAGAAA--AATTGCCAACCTGTGAATTAACGAATTTCTCATAGATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCAACCATTATCTTTGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaacttgcaatcatttgctgaacagaaatataaaggtaatgc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATGTTTATACCAAAC-ATCA------TA----TTTT--AATCGA-T-ATTCTGTTTCAATATTCTTTATTTTAATTTGTCTCTGCCGTATAAATATCGTTAATTTTGTTCAC-AAATA-CT---TA----A-TCGCGG-------TT----AGGTCACTCATT-GGCAAGTATC-GAGTTATGCTGAAACTTTGACGATTATT-CAGAAA--T--TGCCGATCTGTGTATAAACGATTTTTTTATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCTACCATTATCTTCGAGT-GGACCTT-ATCCTTGTGattcaataaattttctgtcacttactgaacagaaacttgtaggtaatgtatctttaaaaatgcatgatcatacttcagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A---AGAGGCCTCGCCTTTATC--ACTGATA--TAT-TCTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATACCAAAC-ATCA------TT----CATT--A-TAGA-T-ATTCTGT----ACAACTTATATTGTTTGTTGACTCTGTAGCGTAAAATTCTTTGATTTTGTTAA-CAAATA-CTAAAT------------GCC------------AGT-----ATC-GG-----------GTTAGGCTAAAACATTTACAAA-AAAGGGGAAA--A--TGCCGACTTTCGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAA--ATAAA-CTACAAGT-CGGAATCAAC-------------TGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcataactgaacagaaaagtataggggatacatcttt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGCACTCA--TATATCTTGCAGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATATAAATATCAAAC-ATCA------TA----TACT--A-TGGA-T-TTTCTGTT-CAATGATTTATATTGTATCTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTATTGGCCAAATA-C----TA----AATCGCAGCCCTTAATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATC-GAGTTATGCTAGATTATTGACGAATAGAAAAAAAC--A--TGCCAACCTGCATATTAattaaacatttgctgaacagaaagttataggtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tTA----AATCGCGGTCC-CGATA----CAATCATCCATT-GGCCAGTGCCAGGGTTATGTTAAAATATTTACGAATAAAACGGAAA--A--AGCTGATCTGTGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAGAAAAAAA-AAACAAGAACTGAATCAACCGTTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CAGCCCATTTGTATCAAAC-A--A------------------A-TGGA-T-ATTATGTT-CAATAGCTT-T-TT---TTCTGTCTATGTAGTGTAAAATTATTTAAatgcaatgaacgccccatcatttactaaacagaaagttataggtgatgcatct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gagttATACTAACCCATTCGG-----ATT-------T----------T-------ATTAATTAATGAT--AA----TT------AGTTGTATTT-TAACCGTTTT-AGAAAT-AATT-T--TAT-TTTTTAAGACATTCAT-GCT-TTTTTT-TCAAATATATGTATTCCCTTTAAacattgtattccgttgagcattgttgaatatttgaaaacgtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tCATTTTGATTCC-GATTTGATGCGTC----ATACTGGGTT-T---------TAATTATTTTTT-AAAC---GAAAG-AGGTTGAATGACGATG-TGAA----------G-G-C------CGTCAAGCGGT--ATCT-AAGTACT---TCTATTCTTAGAATGGG-GATTTTGTTTTAAGTTTACCATTCCGATTGAAATATCAATTTTT----TTCGCTTATTGGAATATTTGATATACGAAACAATTCGG-----AAT-------T----------T-------ATTTATTTATGAA--AA----TG------AGATGCTTAG-TATCCATTTT-GCAAAT-A-AT-T--TA--TTTTTAAGACTTTTATCGCG--TTTTT-CTTTATA----TACAACCTTTAAtttggttatacgttattacttaaatttt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                        gatagtttccagctaatattccattaaacaaccaatttgaaaacaaaacatgttcttgattattccatgagaatatatttctaagaatttaccctttaaaggtagtgtatcaggctttttcaaaattttaaaagtgtctaaaatagttattatcaaaagctcatatatattcactaaccccgttttgccataagaatatatacatgatcatgtcatgggctagactaaaatagattgcccgcttaaaattgcatcgtcttgtctgatgtttcaaatgagtcacgtgatctATGGCAAGGTCA-A----------G-A-T------CATCAAGCAGTGCATGC-A--TAATA--TTTATTTCTAAAATTGAA-ATTCACTTTCAATTTCACTTCTCCGATTAAccgtgtcttcaaataaaacatattggcatgctataccattcgattcgatttatagtattaacaaatattaaaaagtgcttgatactgctacagtcatttatttagaggctaaacttccattgtatct
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tggcaaggtcaatgtcatcttGAT--AA----TG------AGATG-TTTT-TATCCTTTTT-GATAATTATTT-G--AAT-TTTTTA-GACATTTATAGCG--TTTTT-CCTGATA----CATTCTCTTTAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CTACAATGACAAAATCAACCATTATCTCCGAATGTGACCTTCACCCTTGTGtgtaccaacacacgcttgata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAACAGTTACA---------GTATATTTATATAAAACTGTTG------TT----TTTT--T-TGTAGTGACTCTATT-CAATAGCCTGTGTTGAATTATGTCTCTGTAATGTAGAattcaataaactgcactggtgcatctgtaccgcactgacagtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTCGATCCATCAT--ATTC-AAGTTCT-ATAT-TGATGAAT-TTATTC-CATCCTAG------GTCTGAATAACAAGG-TG-AATGTCACCTCG-G-TGATGTTCGCCTAGCATC--ATGT-GCGTGATA--TTTATTTTCAAAATAGAA-ATTTTCTTTCAATTTCATCATTCAGATTAAAATATTGT-TTTTTTTGGTCATGTTT----GGA----AAGT-CCAGATCATTTGT-----ATT-------T----------T-------A-------TTGATGAAA----TGTCAATCAGATGCTTTTGTATTCATTTT-AAAAATGA--C-T--AAC-TTTTTAGG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atttcaacaatctttaaaggatgtatttcagaaaactttcaaaattgataagacacagtttttcccaatatatcatgtctatatatacgaatatttactaggccttttattgccgcacggaaacccatttaaacatgtcaaaataaaatattgaaaagggattaacttacttagattacggaactataatagattccacagtttaaaactgcaacatattttatgacacatcCCAGATCATTCAC-----TTT-------T----------T-------A-------TTTAT--AAAAATTA------AGATGCCTTG-TATTCATTTT-AGAAAT-GATT-T--AAT-TTTcagtctatttctgaaatttgtatatccgtgtgatatgttttaatgtcatcacttgatttattattgatacaattaacaaaaagtttaagaaaataccagtttgtaattttaaagattcttttattaactgtacattgtattttcaaa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AA---AGAGGCCTCATCTATATT--GCTGATA--TTT-TATTAATCTT
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gAAGCAGT--ATTG-AAGTGCTG--TCTATTTTTAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcttagCATTTT--TCAAAGAGTAGATCCGCTATTTACAC-AGGCT-T-ACACGTAGTTAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-ATTCTGAATGATG-------------------------------TCACGCAGT--ATTTTAAGTGGTG--TCTATTTTTAAAATGGGAGATTTCGTTTCAAGATTACTGTTCCAATTTAAATATTGA-TTTT----GTCACGTTTTTGTGGATTTGACATTCGAAACCATTCGA-----ATT-------T----------T-------A-------AGTAT--TA----TG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTAAAAGCG-TTTTTT-CCTGATA----CATTTCCTTTAAG--A-ATTAAAAGGTAGAGGCCTCACCTATATT--GCCGATA--TTT-TTTCTATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATCTATATCAAAC-ATCG------TA----CATC--A-TGGA-T-ATTCCGTT-TAATATTGTATATTGTATTCCATCTCTCTAGTATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-TTAAATA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATT-GGGTTATGCTAAAACTTTGACGAATAAAACAGATA--A--TGCCAACCTGTGTATTAATGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGAAGGAATCAACCACTGTCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTTTGAT-ATATATTTGATCCGTTGT--A--C-AGGTT-T-GCATGTAGTAAAA-TTGTTT-CATTATAGAAAG-AGTCTGAATGACAATG-TG-AA---------G-G-G------CATCAAGCAAT--ATTG-AAGAGCCG--TTTATCTTAAGAA-GGGA-ATTTGGCTTCAGATTTACCACACCAATTTAAATTTCGA-TTTT----GTATTATTTGGGTGGATTTGACACACTATACCATTCGG-----ATTA------TATTTATTAAAT-------A-------ATGAT--AA----CG------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-CTATAT-TTTTTTAGACATTTATAGCG-TTTATT-CCTGCTA----TACTGCCTTTAAA--A-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taatttggatgacactcacttgaagattaattttaataacggaaataatatcaggatttatcttcaaatttatacaatttttcccaatatatatttcctatatatactcaatgtcccctatttgccaaaaggatatatatttaaatatgccaaaataatatattgaaaacggatttcctaactttagctacgcgcctagatcagactaaaatagagtcgcttaaaattgaaacatattttgtgacgtattaaaaaagtcacgtggtttT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--ATATTAAcaacagtattgacgaattaatcgttcaaggaatacgcctctactt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gattaaacaaattatcatctggaatatattataataCATTTTGATTCCA-ATTTGAGCCGT--T--ATGC-AGGGA-T-GCGCGTAGTAAAAATTGTTTTCATCTTAGAA-G-AGTCAGA------------------------------------------CAGT--ATTA-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGG-AGATTTTGTTTCAAGTTTACCACTCCAATTTACATATCGA---------------TTTTGGTGGATTTGACATACTAAACTATACGG-----TTTATCTTTAT----------T-------A-------ATGAT--AA----TG------AGATACTTTT-TATCCATATT-GATAAT-TATT-T--TAT-T----------TTCATAGCA-TTTTAT-CCAGATA----TACTCCCTTTAAA--catatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttcattttgattccaatttgagccgttatgcagggatgcgcgtagtaaaaattgttttcatcttagaagagtcagacagtattaaagtgctgtctatttttagaatggagattttgtttcaagtttaccactccaatttacatatcgattttggtggatttgacatactaaactatacggtttatctttattaatgataatgagatactttttatccatattgataattattttattttcatagcattttatccagatatactccctttaaagtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                             gattaaacaaattatcatctggaatatattataatattaatattttaaagggagtatatcaggacatatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttTTTTTATTTCA-ATTTGATCTGTC----ATAC-AGGTT-T-ACACGTTGTAGAATTTGTTT-CATCTGAGAAAACAATCCGAATGGCGACG-AG-AA---------G-G-T------CGTCAAACAAT--ATTA-AAGTGCGG--TCTTATTGTAGAATTG-AGATTTCGTTTCAAGTTT-CCACTCCGATTGCAACATTGA-TTTA----GTCACGTTCCAGTGGGTTTAATAAAACAAACCATTAG-------------------------------------------ATGAT--AC----TG------AGATGTTTTT-TATCCATTTTAAAAAAA-AGTT-A--TAT-TTTTTAA-ACATTTATAGCG-TTTTTTCCCTGACA----GACTCCCTTTTAATGA-AATAAAA---gtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcaaaatgtttaaatgaagctcagaatttttcaaaaaatttaattggctaaaaacatttttaaccaatatatcttgcctatatatatatatatatatattatgacgcattaaatgagtcacgtgatttctCGTTTT-ATTAAAGAGTTGATCCGCCATTGATGC-AGGTT-T-ACACTTACTAAAAATTGTTT-TATCTTCGATAG-AGTCCGAATAACG-------------------------------TCAATTAGT--TTTT-AAGTGTTG--TTTATTTTTAGAATTGG-GATGGCGTTTCAAGTGTATCACTCCAACTGAAAGAGCGT-TTTT----GTCACATTTCGGTTGATTCGACATACTAAGCATTTCGG-----AAT-------T----------TATTTATCA-------ATGAT--AT----TG------ATATGTATTT-TAACAATTTT-AGAATT-ATTT------T-TTTTAAAGACATTTATAGCATTTTTTT-TCTTATT----TACTctgccctgttgtggagaaatcttatcaatacattaaaactaacatatgtgtgtaaatctttgtctcatttaaatgtactacatttaactagttatatgattgcacttccgt


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Reference ( family-1439 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATTTTGATTNCAGATTTGATCCGTCAT----A--C-AGGTT-T-ACACGTAGTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATGACGATG-CG-A----------G-G-T------CGTCAAGCAGT--ATTN-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGGGAGATTTCGTTTCAAGTTTACCACTCCGATTNAAATATCGA-TTTT----GTCACGTTTTGGTGGATTTGACATACNAAACCATTCGG---ATT-T---T-TTA-T----TAATGATAAT-G------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTTATAGCG-TTTTTT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--A-ATTAAAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATA----AATCGCGGCCCGCGATA----AAGTCACTCATT-GGCCAGTATC-GGGTTATGCTAAAACATTGACGAATAAAACGGAAA--A--TGCCGACCTGTGTATTAACGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
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gi|10                         :                                                                                                                                                                          ttgtctgattgaaatattcaacaatgcgctttcatattggatatcctcacaaaagcatttctcaatacttaaaggaaatatatcaggagttttcaatatttttaaatcggctaaaacatttgtttccaatatagtatgcctatatatactcactgaccacgtctatttaaacatgcaaatattatattaaaagggaacttcgtgcctaggttagattactataggtttcccgcgtaatatcgcatcatattttgtggcatattaaattagtgatttcatATTTTGATTTCAT-TTTGTTCCGTTAT----A--T-AGGCT-T-ACACGTAATAACAATAGTCT-CATTATAGA-----GTCCGAACAACGATG-CG-AA---------G-G-T------CGTCAAACAGT--ATTG-AAGTGCTT--TCTATTTTTAGAGTGGG-GATTTTGTTTCAAGTTAACTAATCCAATTCAAACATCGA-TTTT----GTCAGGTTTTGGTGGATTTGACATAAGAAACC-TTCGG---ATT-TTA-T-TTA-T----AAATGATAAT-G------AGATGCTTTT-TATCCATTTT----AGT-ATGTAT--TATATTTTTAAGATATATGTAGCG-TTTTTT-TATGAAT----TACTCCCTTTAAA--A-Aagcatacacatcacatgaattatttaaatatttggtggtacagttgaatatgaaaacaatgccatgctgtgtaattagtcttcaagccttcttaataacagtattttacaaatacttcacatatttatatataacttag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaaggatatttatttaatttttacttaaacatgccaaaacaatatattaaaaaaaggatttgctaacttgggctacgtgcttgtgttagattaaagtagattccccgcttaaaaatgcaacatattttgtaacgtgttaaatgagtcatgcgattttACCTATATC--GCCGATAGCTTA-TTTTTATTTTATCAGTAAAAGTTAACACTGTACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TAT--------------TCTGTT-CAATAACTTAGATTGTATTTTGTCTCTGTAATATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAAAA-CT--CTA----AATTGTGTCCCGCGATAAATGAAGTCACCCATT-GGCCAATATC-GGGTTCTGCTAAAACATTGGCGAATAAAACAAAAA--A--TGCCGACTTGTGT-TTAACGACTTTCTCATAAATAAG--ATGAA-CTACAAGGACGGAATCAATCCTGACCTTCGTATGGGACCTTTTTCTTTATGaagcacattagactactcggtcacggatattcctccac
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tA---AGGGGCATCATCTATATT--GCCGATA--GTC-TTCCGATCTTAGAAGTAAAA-------CTGCGTATTTATATCAAAC-ACTACCGGTATG----TATT--T-TGGA-T-ATTCTGTA-AAAAAAATTATATTGTATTTTGTCTCTTTAGTTTAAAAATCTTCAATT-------------A-CTAAAT--------CGTGGCCCGCAATA----AAGTCAACCATT-GGCCAGTATT-GAGTCATGCTAAAACATTGAAGAATAAAACTGAAA--A--TGGCGACCTGTGTATTAACCAA-CACCCATCAAAAAG--GTAAA-CTACAAGAGTGGAACCAACCAATATCTTCGAATGGAACCTTCCACTTTGTGattcaattactattccatcatttactgaacagaaaggtatagatgatgtatatttgaatagtgtatgtaatactaatgat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAGGTCTCACCTATATC--TCTGATA--TTTATTTTG-TCTTAGAAGTAAAA-------CTGCACATTTATCTCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTC-TCTATA-TTTTTTCATTTTGTTTTCCAAATATCCAAATATTTTAATCGTGGCTAGTGATA----AAGTCACTCATTTGGCCTGCATA-CGGTTATACTAAAACATTATCGAATAAAACAGAAA--A--TGCTGACCTGTATTTTAACGAATTTCTCATAAATGAG--ATAAT-CCACAAGGACAGAAACAAACATTATCTTCGAATGGGACCTTCTTCTTTGTGatttaatatacttgccatcatttactgaacagaaagttataggtcatgtctctttaatgctataaatagacaatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcatttactgaacagaaagttattgataatgcatcttt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttAA---AGAGGCCTCACCCATAT---------A--TTT----CGATCTTAGCAGTTAAA-------CTGCACATTTATATCAAAT-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGCCTCTGTATTGTAAATTTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAAT--------CGTGGCCCGCGATA----CAGTCACTCATT-TGCCAGTATC-AGGTTATGCTAAAACATCGACGAATTAAACGGAAA--A--TGCCGATATGAGTATTTACGACTTTCTCATAAATAAG--A--------------CGGAATCAACCCTCATCTCCGAATGAGACTTTCCTCTTTGTGgttcaatacattttccaccactcattgaataaaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttA---ATAGGTCTCATTTATATC--GACGATA--TTT-TGCTGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCAAGTTCATATCAAAC-TTCA------TA----TATT--A-TGAA-T-ATTATTAT-AAATAACTTGTATTGTCTGTTGTCTCTGTGGTG--AAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAACA-C----TA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAATCACTCATT-CGCCATTTCC-GGGTTATGCTAAATCATTGACGAATAAAACGAAAG--A--CGCCGACCCATGTATTAACAAG------AT--AT-----ATATA-CTACAAGGACGGAACCCAGTATTATCT-----TGGGACCT---TCTTTGTgttcaatacattttccgccactcattgaatagaacgttataggtgatgcatctttaaagtcacaataatattaatt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAGTCTCACCTATATT--GCTGATT--TTT-TTTCGGTCTTAGCAGTTTAA-------CTGCTTATTTATATCAAAC-ATCA------TAAAATTATTTTA-TAGA-T-ATTCTGTT-CAATAACTTGTATTGTATTATATCTCTGTAGTGTTGAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAATG----A----CAGCTTGCCATA----AAGTCACACATT-AGCCAGTATC-AGGTTATTATAAAACATTGACAATT-------AAA--A--TACTGACCTGTCTGTTAACGAATTTCTCTAAAATAAA--ATAAAGCTACAAGT-TGGAATCAACCATTATCTTCGAATGGTGCCTTCaattcgattaacgttccatcatttactgaacagaaagttataggtcacgcatcttgaaattaataacgataatatgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ---AGAGGCCTCGTCTGTGGC--GCCGATA--TCT-TTTTGATCTTAACAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAAC-ATCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCTGTT-CATTCACTTATATTTTATTTTGTCTCTGTTGTGTAAACTTCATTAATTTTGTTGACCAAATA-CTAAA------------------------------TCGTTCATT-GGTCAATATC-GGGTTATGCTAAAACATTTGCGAATAAAACGGAAA--A--TGTCGACCTGTGTATTAACGGATTCCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACATGGATGGAATTCGCTATCATCTTCGAAAGGGTCATTGCTCTTTGTGtatgtggttcaataaactctccatcatttattaaacagagagttatatatgtgatgcatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTGAAATGTGA--TTCCGTTTCAATTTCAACACTTTGATTAATATATTGT-TTTT----GTCCTGTTTTGGTTGATTTTAAATCTGAAATAA-TCGGTATGTT-T---G-TTA-T----AAATA--AAT-----------TGATTTG-TATTAACTTT-CAACTT-ATTattcaataaacttgccattatttactgaacagaaagttaaaggtgaagatgcat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                         ttttcagtaagatcatacttagatatacccactgagtccttattgccaatgtaatatctgtagcatacatatcatgtaagactaaaacatttttcgcgtttaaatttcaatatatgttatatagcagcaaataatccacgtggtttcaatttatttaatgttgtttatatattgttgactttggtacatctaagaaagacggcgtgtaatttctcCATTTTGATAACCG-TTTTATCTGTCAT----T-----GGTT-T-ACATATTGCAGAATTTGTTT-CATATTAAAATG---TCCAAATGATGATG-TG-AT---------G-G-T------GTTTCAGCAGT--ATTT-GAGGTCTG--TCTAGTTTTAGAA-GAGTAATTTCCTTTCAAGTT----ACTC-----TAAACATAG--TTTT----ATC---TTTT
gi|20                         : cgaacaacctttaacttgaactcattgaagttctactgtattaatttatttgggcttgattgagaagacatctctccgcttgataatttatgaatcactctcaagtttgtttcctgggtagaaccagtactgagatgtgttcaaagacatcaggtcgagcatgggatcagaccataatatctggtgagatatgtcaacactctaactacttcactgtcagatccatatatagtgtgttgtttaaagaaggtatatctgagtttttttaattggcttaaaacatgtgtttctaatatatcatacttatatatactcactgacatttattgccgtaaggatatctatttaaacatgccaataatatattgattagagaacttggcctacacacaaaggtaacttagactaaaatagatttcccttttagaattacaacaaattttgtgacatgtaaaatgtgttacatgatttTCAC----A--A-AGTTT-T-ACATATACTAAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-AGTCCGAATAATGAAT-CG-A----------A-GAT------TGTCAAACAGT--ATTA-AAGTGCTG--TTTATT-----AATAG-AGATTTTGTTTCAAATTTAACACTCCAATTTACATATTGA-TTTT----TTCACGTTTTAGTAGATTTGACTAACTAAACTATTCAG----TT-TATAT-TTA-T----TAATAATAAT-G------ACAAGATTTT-TATCTATTTT-GATAAT---TA-T--CAT-TTTTTAAGACATTTATA-TG-TTTTAT-CGTGATA----CATTCCCTATAAC--A-Ataagacacttattgtctatttttgtttctggataaatcatatgatatactactaaattgttttgttgattcatttctttc
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttaaattaataagttttccagtcctttattaacttaccagtagcA---AGAAACCTCGCCTATATC--GCCGAAA--TAT-TTTCGATTGTATCAGTAAAA-------CTGCACATTTATATCAAGC-AT--------------TATT--A-TGGA-T-GTTCTGTT-CAATAACTTATATTGTA---TGTTTGTGTAGTGTACAATTCTTAAATT------ACC------------A----AATCGTGGCCCACGATA----AAGTTACTCATT-GGC-------------ATACTAAAATATTGACGAATAAAACGGAAAATA--TGCCGACCTGTATATTAACACATTTCTCATAAATAAG--AT-AA-CTACAAGGACGGAATTAACCATTTTCTTCGAATGGAAAATTCTTCTTTGTGcaccccatagaaatagaaatgg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAGCAGTAAAA-------CTGCAT-TTTATATCAAAC-ACCA------TA----TATT--A-TGGA-T-ATTCCATT-CAATAACTTATATTGTATTTTGTATCTGTAGTGTAAACTTTTTTAATTTTGTTGACCAAATC-CTAAAT--------CACAGCCTGCG--------------------------------GGTTGTGCTAAAACCTTGACGAATAAAACAGAAA--AATTGCCAACCTGTGAATTAACGAATTTCTCATAGATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCAACCATTATCTTTGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaacttgcaatcatttgctgaacagaaatataaaggtaatgc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATGTTTATACCAAAC-ATCA------TA----TTTT--AATCGA-T-ATTCTGTTTCAATATTCTTTATTTTAATTTGTCTCTGCCGTATAAATATCGTTAATTTTGTTCAC-AAATA-CT---TA----A-TCGCGG-------TT----AGGTCACTCATT-GGCAAGTATC-GAGTTATGCTGAAACTTTGACGATTATT-CAGAAA--T--TGCCGATCTGTGTATAAACGATTTTTTTATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGACAGAATCTACCATTATCTTCGAGT-GGACCTT-ATCCTTGTGattcaataaattttctgtcacttactgaacagaaacttgtaggtaatgtatctttaaaaatgcatgatcatacttcagt
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A---AGAGGCCTCGCCTTTATC--ACTGATA--TAT-TCTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATTTATACCAAAC-ATCA------TT----CATT--A-TAGA-T-ATTCTGT----ACAACTTATATTGTTTGTTGACTCTGTAGCGTAAAATTCTTTGATTTTGTTAA-CAAATA-CTAAAT------------GCC------------AGT-----ATC-GG-----------GTTAGGCTAAAACATTTACAAA-AAAGGGGAAA--A--TGCCGACTTTCGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAA--ATAAA-CTACAAGT-CGGAATCAAC-------------TGGGACCTTCCTCTTTGTGattcaataaactttccatcataactgaacagaaaagtataggggatacatcttt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA---AGAGCACTCA--TATATCTTGCAGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCATATAAATATCAAAC-ATCA------TA----TACT--A-TGGA-T-TTTCTGTT-CAATGATTTATATTGTATCTTGTCTCTGTAGTGTAAAATTCTTTAATTTTATTGGCCAAATA-C----TA----AATCGCAGCCCTTAATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATC-GAGTTATGCTAGATTATTGACGAATAGAAAAAAAC--A--TGCCAACCTGCATATTAattaaacatttgctgaacagaaagttataggtt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tTA----AATCGCGGTCC-CGATA----CAATCATCCATT-GGCCAGTGCCAGGGTTATGTTAAAATATTTACGAATAAAACGGAAA--A--AGCTGATCTGTGTATTAACGAATTTCTCAAAAATAAGAAAAAAA-AAACAAGAACTGAATCAACCGTTATCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTGg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acAA---AGAGGCCTCACCTATATC--GCCGATA--TTT-TTTCGATCTTAGCAGTAAAA-------CAGCCCATTTGTATCAAAC-A--A------------------A-TGGA-T-ATTATGTT-CAATAGCTT-T-TT---TTCTGTCTATGTAGTGTAAAATTATTTAAatgcaatgaacgccccatcatttactaaacagaaagttataggtgatgcatct
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gagttATACTAACCCATTCGG---ATT-T---TATTAAT----TAATGATAAT-T------AGTTGTATTT-TAACCGTTTT-AGAAAT-AATT-T--TAT-TTTTTAAGACATTCAT-GCT-TTTTTT-TCAAATATATGTATTCCCTTTAAacattgtattccgttgagcattgttgaatatttgaaaacgtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tCATTTTGATTCC-GATTTGATGCGTCAT----A--CTGGGTT-T---------TAATTATTTTTT-AAAC---GAAAG-AGGTTGAATGACGATG-TGAA----------G-G-C------CGTCAAGCGGT--ATCT-AAGTACT---TCTATTCTTAGAATGGG-GATTTTGTTTTAAGTTTACCATTCCGATTGAAATATCAATTTTT----TTCGCTTATTGGAATATTTGATATACGAAACAATTCGGA--ATT-TA--T-TTA-T----TTATGAAAAT-G------AGATGCTTAG-TATCCATTTT-GCAAAT-A-AT-T--TA--TTTTTAAGACTTTTATCGCG--TTTTT-CTTTATA----TACAACCTTTAAtttggttatacgttattacttaaatttt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                    gatagtttccagctaatattccattaaacaaccaatttgaaaacaaaacatgttcttgattattccatgagaatatatttctaagaatttaccctttaaaggtagtgtatcaggctttttcaaaattttaaaagtgtctaaaatagttattatcaaaagctcatatatattcactaaccccgttttgccataagaatatatacatgatcatgtcatgggctagactaaaatagattgcccgcttaaaattgcatcgtcttgtctgatgtttcaaatgagtcacgtgatctATGGCAAGGTCA-A----------G-A-T------CATCAAGCAGTGCATGC-A--TAATA--TTTATTTCTAAAATTGAA-ATTCACTTTCAATTTCACTTCTCCGATTAAccgtgtcttcaaataaaacatattggcatgctataccattcgattcgatttatagtattaacaaatattaaaaagtgcttgatactgctacagtcatttatttagaggctaaacttccattgtatct
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tggcaaggtcaatgtcatcttGATAAT-G------AGATG-TTTT-TATCCTTTTT-GATAATTATTT-G--AAT-TTTTTA-GACATTTATAGCG--TTTTT-CCTGATA----CATTCTCTTTAA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CTACAATGACAAAATCAACCATTATCTCCGAATGTGACCTTCACCCTTGTGtgtaccaacacacgcttgata
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAACAGTTACA---------GTATATTTATATAAAACTGTTG------TT----TTTT--T-TGTAGTGACTCTATT-CAATAGCCTGTGTTGAATTATGTCTCTGTAATGTAGAattcaataaactgcactggtgcatctgtaccgcactgacagtt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTCGATCCATCAT----ATTC-AAGTTCT-ATAT-TGATGAAT-TTATTC-CATCCTAG------GTCTGAATAACAAGG-TG-AATGTCACCTCG-G-TGATGTTCGCCTAGCATC--ATGT-GCGTGATA--TTTATTTTCAAAATAGAA-ATTTTCTTTCAATTTCATCATTCAGATTAAAATATTGT-TTTTTTTGGTCATGTTT----GGA----AAGT-CCAGATCATTTGT---ATT-T---T---A-T----TGATGA-AAT-GTCAATCAGATGCTTTTGTATTCATTTT-AAAAATGA--C-T--AAC-TTTTTAGG
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atttcaacaatctttaaaggatgtatttcagaaaactttcaaaattgataagacacagtttttcccaatatatcatgtctatatatacgaatatttactaggccttttattgccgcacggaaacccatttaaacatgtcaaaataaaatattgaaaagggattaacttacttagattacggaactataatagattccacagtttaaaactgcaacatattttatgacacatcCCAGATCATTC-----ACT-T---T-TTA-T----TTATAAAAATTA------AGATGCCTTG-TATTCATTTT-AGAAAT-GATT-T--AAT-TTTcagtctatttctgaaatttgtatatccgtgtgatatgttttaatgtcatcacttgatttattattgatacaattaacaaaaagtttaagaaaataccagtttgtaattttaaagattcttttattaactgtacattgtattttcaaa
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA---AGAGGCCTCATCTATATT--GCTGATA--TTT-TATTAATCTT
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gAAGCAGT--ATTG-AAGTGCTG--TCTATTTTTAG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcttagCATTTT--TCAAAGAGTAGATCCGCTATTTACA--C-AGGCT-T-ACACGTAGTTAAAATTGTTT-CATCTTAGAAAG-ATTCTGAATGATG-------------------------------TCACGCAGT--ATTTTAAGTGGTG--TCTATTTTTAAAATGGGAGATTTCGTTTCAAGATTACTGTTCCAATTTAAATATTGA-TTTT----GTCACGTTTTTGTGGATTTGACATTCGAAACCATTCGA---ATT-T---T-----------AAGTATTAT-G------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-T--TAT-TTTTTAAGACATTAAAAGCG-TTTTTT-CCTGATA----CATTTCCTTTAAG--A-ATTAAAAGGTAGAGGCCTCACCTATATT--GCCGATA--TTT-TTTCTATCTTAGCAGTAAAA-------CTGCACATCTATATCAAAC-ATCG------TA----CATC--A-TGGA-T-ATTCCGTT-TAATATTGTATATTGTATTCCATCTCTCTAGTATAAAATTCTTTAATTTTGTTGACCAAATA-TTAAATA----AATCGCAGCCCGTGATA----AAGTCACTCATT-GGTCAGTATT-GGGTTATGCTAAAACTTTGACGAATAAAACAGATA--A--TGCCAACCTGTGTATTAATGAATTTCTCATAAATAAG--ATAAA-CTACAAGGAAGGAATCAACCACTGTCTTCGAATGGGACCTTCCTCTTTGTG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CATTTTGAT-ATATATTTGATCCGTTGT----A--C-AGGTT-T-GCATGTAGTAAAA-TTGTTT-CATTATAGAAAG-AGTCTGAATGACAATG-TG-AA---------G-G-G------CATCAAGCAAT--ATTG-AAGAGCCG--TTTATCTTAAGAA-GGGA-ATTTGGCTTCAGATTTACCACACCAATTTAAATTTCGA-TTTT----GTATTATTTGGGTGGATTTGACACACTATACCATTCGG---ATTATA--T-TTA-TTAAATAATGATAAC-G------AGATGCTTTT-TATCCATTTT-AAAAAT-ATTT-CTATAT-TTTTTTAGACATTTATAGCG-TTTATT-CCTGCTA----TACTGCCTTTAAA--A-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taatttggatgacactcacttgaagattaattttaataacggaaataatatcaggatttatcttcaaatttatacaatttttcccaatatatatttcctatatatactcaatgtcccctatttgccaaaaggatatatatttaaatatgccaaaataatatattgaaaacggatttcctaactttagctacgcgcctagatcagactaaaatagagtcgcttaaaattgaaacatattttgtgacgtattaaaaaagtcacgtggtttT-CCTGATA----TACTCCCTTTAAA--ATATTAAcaacagtattgacgaattaatcgttcaaggaatacgcctctactt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gattaaacaaattatcatctggaatatattataataCATTTTGATTCCA-ATTTGAGCCGTTAT----G--C-AGGGA-T-GCGCGTAGTAAAAATTGTTTTCATCTTAGAA-G-AGTCAGA------------------------------------------CAGT--ATTA-AAGTGCTG--TCTATTTTTAGAATGG-AGATTTTGTTTCAAGTTTACCACTCCAATTTACATATCGA---------------TTTTGGTGGATTTGACATACTAAACTATACGG----TT-TATCT-TTA-T----TAATGATAAT-G------AGATACTTTT-TATCCATATT-GATAAT-TATT-T--TAT-T----------TTCATAGCA-TTTTAT-CCAGATA----TACTCCCTTTAAA--catatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttcattttgattccaatttgagccgttatgcagggatgcgcgtagtaaaaattgttttcatcttagaagagtcagacagtattaaagtgctgtctatttttagaatggagattttgtttcaagtttaccactccaatttacatatcgattttggtggatttgacatactaaactatacggtttatctttattaatgataatgagatactttttatccatattgataattattttattttcatagcattttatccagatatactccctttaaagtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                       gattaaacaaattatcatctggaatatattataatattaatattttaaagggagtatatcaggacatatacaaatttgcctatatatacccactgtccccgtattgccaaaacgattatctatttaaacatatcgaaaagcgcttaccttacatgggctacgcgcctaggttagactaaaatagattacccgcttaaaatggtaacatgttttgtgacgtattgaatgagtcgagtaagagtgcgtaatttTTTTTATTTCA-ATTTGATCTGTCAT----A--C-AGGTT-T-ACACGTTGTAGAATTTGTTT-CATCTGAGAAAACAATCCGAATGGCGACG-AGAA----------G-G-T------CGTCAAACAAT--ATTA-AAGTGCGG--TCTTATTGTAGAAT-TGAGATTTCGTTTCAAGTTT-CCACTCCGATTGCAACATTGA-TTTA----GTCACGTTCCAGTGGGTTTAATAAAACAAACCATTAG-------------------------ATGATACT-G------AGATGTTTTT-TATCCATTTTAAAAAAA-AGTT-A--TAT-TTTTTAA-ACATTTATAGCG-TTTTTTCCCTGACA----GACTCCCTTTTAATGA-AATAAAA---gtcatacatttaaaaaataatattgttatcattactttttctctttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcaaaatgtttaaatgaagctcagaatttttcaaaaaatttaattggctaaaaacatttttaaccaatatatcttgcctatatatatatatatatatattatgacgcattaaatgagtcacgtgatttctCGTTTT-ATTAAAGAGTTGATCCGCCATTGATG--C-AGGTT-T-ACACTTACTAAAAATTGTTT-TATCTTCGATAG-AGTCCGAATAACG-------------------------------TCAATTAGT--TTTT-AAGTGTTG--TTTATTTTTAGAATTGG-GATGGCGTTTCAAGTGTATCACTCCAACTGAAAGAGCGT-TTTT----GTCACATTTCGGTTGATTCGACATACTAAGCATTTCGGA--ATT-TA--T-TTA-T----CAATGATATT-G------ATATGTATTT-TAACAATTTT-AGAATT-ATTT------T-TTTTAAAGACATTTATAGCATTTTTTT-TCTTATT----TACTctgccctgttgtggagaaatcttatcaatacattaaaactaacatatgtgtgtaaatctttgtctcatttaaatgtactacatttaactagttatatgattgcacttccgt
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): TTGAAAATCTTAAATGAAATTCAACGGTAAATACTCTTAGAAAAACTCTAAATTAATTTATGTCTAAAAGGGAATATAGCAAGATTTTTTCAATATATCATGCCTATATTTACTCAATGATCCCATTTTGCCCAAAGGATAAACATTTAAACATGCCAAGTCTTTGTCTACATAG
Unaligned ( gi|30 ): TATTGAAAAGTTTGCGAATTCTCAAATTCATTTTCTGAGTAATGTCAGTTCTTGGTGCTGTTAATAAGAGGCCAATGGGTTGGTTGAGCCTAGGATAAAACCATGACCTGTTATACTGTCAACACCCGAACTACTACAC
Unaligned ( gi|31 ): AACAGAAGATAACGTTTTATAATGTTCTTCTCCATGACATATAACTGATTTGTCCATATTTACAGAACAGAAAGTTATAGGTGATGCATCTTTAAATATGTTGATTGA
Unaligned ( gi|34 ): TTAAAGGAAGTAAATCAGGATTATTAATTTTTTTAAAGTTGACAAAAACAAACTACATTTTTTCTCAATAAGTGATGCTTATCTATGCCCACATGATAACATT
Unaligned ( gi|36 ): AGTAGAGATGAGGATTATTTTTGGCTTATGAGTATTTGTAAGTAATACAAAACCATTTGTATTATGTTTCTGGTGAAATCTTATGTTTTTTTGA
Unaligned ( gi|37 ): TTCAGTAACAAATTGTGACCCACAATTAAAGGCTCAAATAGTGTCCACACTATTTAAAAGCTATACTAAAACATTAAGAAATAAAATGGAAAA
Unaligned ( gi|39 ): CTCTCAGTACAAGGAAGTTTAATATAACCGTGTGTTCATAAAAGGGAATATATCAGGATTTTTTCCCAATGCATCATGCCTGTATATA
Unaligned ( gi|40 ): CTTAAAGGGCTAAAATCAGGATTTCTTTTTTTAATTAACTAAAAACTTTTATTTCCAATGTAGCACCCCTATATATA
Unaligned ( gi|41 ): GTTTTCAAGCACAACATGCTTAGCTATACTCACTGAGCCTTTTATTGCAATAAGAATATATGTTAAACCTGCCATT
Unaligned ( gi|42 ): TAAATTCTTANNNNNNNNNNGGCTTTGTGTGTCAGTTACACCTATATTATTACATACCACCATATCTTCTTATAT
Unaligned ( gi|44 ): ATATATTAGCCTAAATACAGCATGCTTATATATACTCACTGTCCCAGTACTGCCAA
Unaligned ( gi|45 ): GATACTAAAACCCGGTCATGTCCCGGTAACATTCCGGCATATGTAAAT
Unaligned ( gi|48 ): TTAATATATGTATTAGCAAACAATGTTATAGTAA
Unaligned ( gi|49 ): TAAAGGACATTGAGGATAAGTTATAGATTATT