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Unaligned ( gi|17 ): GGCTAATATTGCCGTAATATTAATTAATTCAGCATGACATATAGGC
Alignments
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Reference ( family-128 ) : TTTCATGAAAA---TGAAAAAAAAAAT--AAAT--AAAAAAAT----------A--AGTGAAAAATTATATCCGAGCTCCAGGCCTTCAACTTT-G-TA------G------------AAA------------AANA-T---AT-TT-------TTA--CCCTTTAGGGCG-GGC-AA-TTTTGCCCCC--AGGGTCATGGTTTTGAACAAATTTGAGAGAGGACCACAAACTGATCCTATTTGTAAAACATCTAAGCTCAAGGC------CTTGTACTACAAACTTTAACCTGCTAAAAA-C-GT--AC--AAATTTCTAAGCCTAAAAGGGNAATAATTCTGCCAAAATGCAATCAAGAGTTATGGTTCTTGTCTCTACGAGTTTNCTAGATGATGCTGAACACACATGTGAAGTTTCATTCATGTCCAATGATAGGATGATGAAATAAGTACCAAATCAAAAACTTTTAACCT-CTTAAAAACTCTAACAAAATACTAGTCCAAAAGGNCNATTATAAACTCTGTANAAACACAACCCAGAGTTATGGTTCTTGTCNCTGTNCGTTCCNTNGATGATGCTGAANACACATGTGAAGTTTNATTCATATCCAATGACTGNNTGAGTGGTTGNATATATATCTAACCTGATAAAAAACTTTAACC--CTNAAAAATT-------AAGTC--AAAA-GGGCCATAACTCTGTCAAATTCTACCCAGAGTTATGGCTCTTATCTCTGTGCATTCTGTTGATGATTCTGAACACATGGGAAGTTTCATTCACATCCAATGAGTGGTGTTGCATAGATATCTTACTTGATAAAAAAAACATTAAACTAAACAAGAAAGTCTCGGTGTATTCCATTGATGATGCTGATGCTGAAGTTTCTCTCATATCCAATGAGTGGTTGCATAGATAACTTACCTNATAAAAACTTATAAAAANCTCACCNGAAAAACNAACGCCAACACCCAAGCCCGGGCAAGTACAATAGCCC-C-CTATTCTACGAATAGTCGAGCTAAAANTT
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gi|3 : aattaattcaccaacactattcattttcattaccaatagtaatgttttttttaaaaacaataaagtgaatggattgctcgtattatatttaattcagcatgacataacttcacctcagagggcaatatatcagtaccattcataaaaatggatctaaagttgaaacaatcttagtacagtttatcacagctggataccctttcatgaaaaatacccTTTCATGAAAA---TGAAAAATAAAAT--AGA---AAAAAAA-----------A--AGTGAACAATTATATCCGAGCTTCAGGTCTTCAACTTT-GGTA------GAAAAATATTTTTAAATTTTCCCTATATAACACT---AT-TTAACAATCTGA--TCCTTAAGGATG-AGC-AAATTTTGCTGCC--AGGGCCATGGCTCTGAACAAATTTGAAAGAGGTCCACAA-----CCCTATTTGTAAAACAGCTAAGCTCAAGGC------CTTGAACTACAAACTTTAACCTGCTAAAAAGCAGT--ACCAAAATT---------AAAAGGGCAATTATTCTGCCAAAATGCAATCAAGAGACATAGTTTTTGTCTCTATGAGTTTCCTAGTTGATGCTGAACACACTTGAGAAGTTTCATTCATGTCCAATGATAGGTTGATGAAATATGAACGAACTCAAAAACTTTT
gi|3 : tgtattgattaatcatatatataatataggccactaacttcacatcagtgggcaatatttcggtaccagttcataaaaatggatctttagttgaaataatcttgtaccagcatgcacagtttatcgcagctggataccc-CTTTTCTACGAATAGTCGAGCTAAAActacgaatagtcgagctaaaa
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gi|6 : aataattctccaacacttttcattttcattatcaacagttatgtttttttgaaaacaacaaagtgaatggatggcttgcattgccttaatattattcaattcagcatgacatataggcctatgcactaacttcacctcaaagtgcaatatatcggtactagttcatgaaaatgaaactatagttgaaataatcttgtaccagtatgcacagtttatcacagctggatacccTTTCATGAAAA---TGAAAAAAAAAATGGAAATAAAAAAAAATAAAATTAAAGA--AGTGAATAATTTTATCTAAACTCCAGG-CTTTAACTTT-G-nnnnnnnnnnaccatggagaaaactacaa
gi|7 : TTACCTTATAAAAACTTATAAAAAACT-ACTAGAAAAACGAACGCCAAT------------GCAAGTACAATAACCC-C-CTATTCTACAAATAGTC-AACTAAAAgta
gi|8 : A---TGGAAAAAAAAAT--ACTT--CAAAAAAT----------AGAAGTCAAAAA----ATCTGAGCTCCAGGTCTTCAACTTTTG-TA------G------------AAA------------AATA-T---AT-TT-------TTa
gi|9 : tcTGTGAACTTCCATTCATGTCCAA--A-AGGATGATGAATTAAGTAGAAAATCAAAAAC-TTTAACCT-CTT-AAATCTCTAACAAAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GTACTAACTTCACATCAGAGGGCAATATATCGGTACCAGTTAATGAAAATGGATCTATAAATGAATTAATCTTGTACCAGCATGCACATTTTATCACAGCTGGCTACCCTTTCATGAAAATGAAGAAAATAAATCTAAAAAAAACAA
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Unaligned ( gi|17 ): GGCTAATATTGCCGTAATATTAATTAATTCAGCATGACATATAGGC