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Reference ( gi|3 )            :                                                                                                                                                                                                                      AGGCCATAATAAATTGTTTGCTAGATT-ATCATCCC----CGCCC-ACCCCATAATTTTCATGCCACCCCA--AC-C--CT-TTTTATTTTCATA-AAAAA--AAAT-AA--------TC---GAAAAA---AGAAAAATTCC-----TAAAAAAATACAAAAAA---TTAAAAA-AAATAA-AAT-CCTCC--C----CT-CTC-----CCCC-TTTTTGAGACAAAATTTGG------ATGATAA-TCTAGCAGTTAATTTATAATGGCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                      AAGCCATAATAAATTAATTGCTAGATT-ATCATCCC----TGCCT-GCCCCGTAATTTTTATGGTGCCCCG--AC-C--GT-TTTTATTGTCTT----AAA--AAAT-TT--------T--------------------TTTT-----TAAAA----ATAAA-------TATAAA-AAATAA-AAT-CGTCCGAC----C--CTC-----CCTG-CTTTTAAA--AAAATTTCA------ATGATAA-TCTAGCAATTAATTCATAATGGCC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                     tAAGCCATTATAAATTAATTGCTAAATT-ATCAttgcccttttcaagaaaaatttcctgataatttagcaattaatttataatggctttatcttttttatatgggataaaaagtcatcagttatttgcggagatggggtgtgctcgagttctggttaacctttcagaatgccggggggggggggggggggggggggggagacagtggttagattaattgattgtctgttagcccagttgatggtataaaaatnnnnnnnnnnaaatggattcccacatgtctatgcaaacactggaaagaatttcaattataaatagatttctacatttctatgcaaacatt
gi|8                          :                                                                                                                                     taggccataataaattaattgctagaatatcattcatggtcacaccctaattttcatttgcccttttcaagaaaaatttccAGGCCATAATAAAGTAATTGCTACATT-ATTAT--------GCCC-ACC------------TGCC--CCCA--GA-CAATT-TTTTATTTTCAC--AAAAA--AAAT-AAATATATTTTT---GAAAAA-----AAATATACCGATTGTAAAAAATTAtatcttttttatatgggataaaaagtcatcagttatttgcggagatggggtgtgctcgagttctggttaacctttcagaatgccggggggggggggggggggggggggggagacagtggttagattaattgattgtctgttagcccagttgatggtataaaaatnnnnnnnnnnaaatggattcccacatgtctatgcaaacactggaaagaatttcaattataaatagatttctacatttctatgcaaacatt
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                      AGGCCATACTAAATTAATTGTTATATT--TCAT--------G-CT-GCCCCA-AATTTTtat
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gi|4                          :                                                              aagccataataaattaattgctagattatcatccctgcctgccccgtaatttttatggtgccccgaccgtttttattgtcttaaaaaatttttttttaaaaataaatataaaaaataaaatcgtccgaccctccctgcttttaaaaaaatttcaGCCATGATAAATTAATTGCTAGATT-ATCATCC
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gi|4                          :                                                                               taataaatatcatccccacctgccccctaattttcatgtcaacaggaccgtttttattttcataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagataataataaaaaaaatccttcccctcctccccatttttaaaacaaatttCCATAACAAATTAATTGCTAGGTTTATCATCTCTGCTCGCCC-GTCCCCTAATTTTCATGCCACCCGG--AC-C--CT-TTTTATTTTCATC-AAAAC--ATTT-TT--------TTTTTAAAAAC---ATCAACATTTT-----TAAAAA--TA---GAAA---T----AA-AAATAA-AAT-CCTTC--TG---CC-CTC-----CCCAATTTTTAAGA-AAAATTTGG------ATGATAA-TCTAGCAATTAATTTATCATGGC
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gi|11                         : aggtcataataaattaattgctaaattatcatccctgctggccccctaattttcatgctgccctgaccctttttattttcataaaaaaagaaaaaaaaaagaagaaaaaagaacaatttcatttttttatacttttttgttgtttttatataaaaaacatttaaaaataaagaataattcctccctgccccctcaccatcccctttttaagaaaacattTAGTTAATTAATTGCTAGATT-TTCACCCC----CA----ACTCCATTATTTTTAT-CCACTTTG--AC-A--------TATTTCAATGTAAAAA--AAAT-AG--------T
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                T-ATCATCCC----CACCT-GCCCCCTAATTTTCATGTCAACAGG--AC-C--GT-TTTTATTTTCATA-AAAAA--AAA------------------AAAAA---AAAAA------------AAAAAGATA-ATAA------TAAAAA-AAAT-----C-CTTCC--C----CTCCTC-----CCCA-TTTTTAAAAC-AAATTTGG------ATGAAAA-TCTAGCAATTAATTTATAATGGC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                               taataaaCCCA-AATTTTTATCCCATCT-G--AC-C--TT-TTTTATTTTCATA-AAAAATTAAATGAA--------T-----AAAAATATAGAAGAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCATGCTGCCCCA--A--A--TT-TTTTATTTTCATA-atatatttttttttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    actaaggccatactaaattaattgttataATATAAAAAACATTTAAAAATAAAGAATAATTCCTCC--CTGCCCC-CTCACCATCCCC-TTTTTAAGAAAACATT-GG------ATGACAA-TCTAGGAATTAATTTATAATGG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                      aggtcataataaattaattgctaaattatcatccctgctggccccctaattttcatgctgccctgaccctttttattttcataaaaaaagaaaaaaaaaagaagaaaaaagaacaatttcatttttttatacttttttgttgtttttCCC-TTTTCAAGA-AAAATTTCC-------TGATAA-TTTAGCAATTAATTTATAATGGC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taggccataataaattaattgctagaatatcattcatggtcacaccctaattttcatttgTTTTGAAACAAA-TTTGA------ACGAAAA-TCTAGGAATTAATATATTATGGTCtttatcttttttatatgggataaaaagtcatcagttatttgcggagatggggtgtgctcgagttctggttaacctttcagaatgccggggggggggggggggggggggggggagacagtggttagattaattgattgtctgttagcccagttgatggtataaaaatnnnnnnnnnnaaatggattcccacatgtctatgcaaacactggaaagaatttcaattataaatagatttctacatttctatgcaaacatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            caTTTTGA----AAAT--AA------GTGATAA-TCTAGCAATTCATTTATAAGGGCCt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttcAAAATTTGGGGCAGCATGA-AA-TATAACAATTAATTTAGTATGGCCt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actaaTTGG------ATAACAA-TCTAGAAATTAATTTATCATGGCCttattttcata
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGA------ATGATAT-TCTAGCAATTAATTTATTATGGCCta
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taGG------ATGATAA-TCTAGCAATTAATTTATTATGGCtggtcacaccctaattttcatttgcccttttcaagaaaaatttcctgataatttagcaattaatttataatggctttatcttttttatatgggataaaaagtcatcagttatttgcggagatggggtgtgctcgagttctggttaacctttcagaatgccggggggggggggggggggggggggggagacagtggttagattaattgattgtctgttagcccagttgatggtataaaaatnnnnnnnnnnaaatggattcccacatgtctatgcaaacactggaaagaatttcaattataaatagatttctacatttctatgcaaacatt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ------ATGAAAA-TCTAGCAACTAGTTTATTATGGTCttat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               a------ATGAAAA-TCTAGGTATTAATTTATCATGGCCacctgcccgactccatttttttaatccgccccatcacacatattttattgtaaaaaaaaac





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Reference ( family-1278 )     :             AGGCCATAATAAATTAATTGCTAGATT-ATCATCCC----CGCCCG-CCCCNTAATTTTCATGCCGCCCCG--AC-CNT-TTTTATTTTCATA-AAAA---------A---AAATA----NTT---AAAAAAA--AANA--------T-----TTTTAAAAAA-------------ATATAAAAAA---TTAAAAA-AAATAA-AAT-CCTCC-C----C-CCTC-----CCCN-TTTTTAA----GA-AAAATTTGGATGATAATCTAGCAATTAATTTATNATGGCC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   tCCC-TTTTCAA----GA-AAAATTTCC-TGATAATTTAGCAATTAATTTATAATGGCttttcaagaaaaatttcctgataatttagcaattaatttataatggctttatcttttttatatgggataaaaagtcatcagttatttgcggagatggggtgtgctcgagttctggttaacctttcagaatgccggggggggggggggggggggggggggagacagtggttagattaattgattgtctgttagcccagttgatggtataaaaatnnnnnnnnnnaaatggattcccacatgtctatgcaaacactggaaagaatttcaattataaatagatttctacatttctatgcaaacatt
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Reference ( family-1278 )     :                                                                                                                                               AGGCCATAATAAATTAATTGCTAGATT-ATCATCCC----CGCCCG-CCCCNTAATTTTCATGCCGCCCCG--AC-CCT-TTTTATTTTCATA-AAAAA---A---AATA----TTT--AAAAAAA--AANAT-----TTTTA---AAAAAATAT--AAAAA--TAAAAAA-AATAAAATCCTCC-C----C-CCTC-----CCC-NTTTTTAA----GA-AAAATTTGGATGANAATCTAGCAATTAATTTATAATGGCC
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Reference ( family-1278 )     :                                                                                                                                               AGGCCATAATAAATTAATTGCTAGATT-ATCATCCC----CGCCCG-CCCCNTAATTTTCATGCCGCCCCG--AC-CCT-TTTTATTTTCATA-AAAAA---A---AATA----TTT--AAAAAAA--AANAT-----TTTTA---AAAAAATAT--AAAAA--TAAAAAA-AATAAAATCCTCC-C----C-CCTC-----CCC-NTTTTTAA----GA-AAAATTTGGATGANAATCTAGCAATTAATTTATAATGGCC
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Reference ( family-1278 )     :                                                                                                                                               AGGCCATAATAAATTAATTGCTAGATT-ATCATCCC----CGCCCG-CCCCNTAATTTTCATGCCGCCCCG--AC-CCT-TTTTATTTTCATA-AAAAA--A-----AAT--TT----AAAAA----AAAATTTTT--A---AAAAAATAT--AAAAA---TAAAAAA-AATAAAATCCTCCC-GCCCTC-------CCC-NTTTTTAA----GA-AAAATTTGGATGANAATCTAGCAATTAATTTATAATGGCC
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gi|9                          :                                                                                                                                           aataAGACCATAATAAACTAGTTGCTAGATT-TTCATACC----TGCCCGACTCCATTTTTTTAAT-CCGCCCCATCACACATATTTTATT---GTA-AAAAA--A-----AAtta