lowQualScore : 1 1 111 2222 222
lowQualScore : 6 8 6 0 0 4 6 8 6666 0 33 888 2 777777 6666 2 2 7 111 6 5
lowQualScore : . . . . . . . . .... . .. ... . ...... .... . . . ... . .
lowQualScore : 0 0 0 8 8 4 0 8 1111 1 99 666 9 777777 0000 7 7 9 111 0 4
consensus : AAAGTGTT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAATA-TTGG-ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
Reference ( gi|3 ) : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGGTTGCTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAATA-CGGG-ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTAACGACCCTTTTTCTCAAATTATTCCCTAATTTTAA
gi|1 : AAAGT-TTTAAGTGAAA-TTGATGAAAATGTTCAGAGTGAAATAAAGTATTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCAACCTTAACGTCTAACTTATT----AAGAAC--TA--A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCATTA-TTGG-ATAGAAG-AAAAACAT
gi|2 : tcagaaaaaAAAGT-TT-AAATGAAAAT-AATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTACTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGTCATTAACGTCTAACTTATT----AACTTT--TA--A-AAAATATCTTTTA------TAGTTATATACCCAATA-TTGG-ATAGAAG-AAAATCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaattatgccccaatttca
gi|12 : agaaaaAAAGTGTT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAGTGGTCAGTCTTGATTGTTTGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------CAGTTATATACTCAATT-GAAG-ATAGAAG-AAAAGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaagtatgccccaatttt
gi|4 : agaaaAAAAT-TT-AAGTGAAGTTTT-TGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTTGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----TACGAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TATTT-T-------------GG-ATAGAAG-AAAAACAT
gi|11 : taaaAAGGTGTT-GAGTGAAAATTAATGAAAATCTCCAGAATGAAATAAAGTAATTTCAGCGGTCAGTCGCGAGTGTTGGATCTTAATGCCTAACTTATT----AACTAC--TACAA-AAAATAGCTTCTATACATGTAGTTATATACTGAATT-GAGG-ATAGAAG-AAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaaaatttacgatacattttcttaaattatgccccaattttg
gi|7 : caaaaaTGAAAATGTCAAGAGTAAAATAAAGTAATTTCAATGGTCAGTAGTGATTGTTCAACCTTAACGTTTAACATATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAATA-TTGG-ATAGAAG-AAAAACATg
gi|6 : GAAAATGTCAAGAGTGAA-TAAAGTAATTTCAACGGTTAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCTAACTTATT----AA-TAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAATA-TTGG-ATTGAAG-AAAAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagttttttgctatgaacataaacgacacattttcttaaattattccttaattttaaa
gi|5 : GAAAATGTCCAGAGAGAAATAAAGTAATTTTAACAGTCAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCAAACTTATTATTAAACTAC--T---A-AAAATAGCTTATA------TAGTTATATACCCAATA-TTGG-ATAGAAG-AATAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacattaacgacacattttcttaaattattccttaattttaa
gi|8 : GAAAATGTCAAGAGTGATATAAAGTAATTTCAACGGCCAGTCGTGATTG-------------------TTAT-------------------AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAATA-TTGG-ATAGAAGAAAAAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacaacacattttcttaaattatgccccaatttta
gi|9 : CCAGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTCGTGATCGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----A---AC--T---A-AAAACAGTTTCTA------TCATTATATACCCAATA-TTGG-ATAGAAG-AATAACATgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacataaacgacacattttcttaaattataccttaatttaa
gi|14 : GAGTGAAATAAAGTAATTCCAATGGTCAGTCGTGATTGTTCGACATTAACGTCTAATTTATT----AACTAC--T-----AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAATATC--G-ATAGAAG-AAAAACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaa
gi|13 : tcaaGTGAAATAAAGTAATTTCAGCAGTCAGTCGTGATTGTTTGATCTATATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACTCAAT--TGAATATAGAAG-AAAAGCA
gi|16 : aaaatGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--T---ACAAAACATCTTCTG------TAGTTATATAATAAATT-GAGG-ATAGAAA-AAA
gi|15 : TAGCGTTTTATTGATT----AATGACAAC---A-AAAATAGTTTCTA------TATTTAAATACTCGATT-GAGG-ATAGAAG-AAAAGCATtca
gi|10 : tttaGCTTCTA------TAGTTATATACCCAATA-TTGG-ATATAAG-
gi|1 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgatcatcaacgacattttttcttaaattattccctaattttaa
gi|2 : tcagaaaaaaaagttttaagtgaaattgatgaaaatgttcagagtgaaataaagtattttaaacggtcagtcgtgattgttcaaccttaacgtctaacttattaagaactaaaaaatagcttctatagttatatacccattattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCTTGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAGTATGCCCCAATTTT
gi|7 : agaaaaaaagtttaaatgaaaataatgaaaatgtccagagtgaaataaagtactttaaacggtcagtcgtgattgttcgtcattaacgtctaacttattaacttttaaaaaatatcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaatcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCTAGTTTTTTGCTATGAACATAAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAA
gi|6 : tgaaaatgtcaagagtaaaataaagtaatttcaatggtcagtagtgattgttcaaccttaacgtttaacatattaactactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCTAGTTTGCTATTTTGAACATTAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAa
gi|5 : gaaaatgtcaagagtgaataaagtaatttcaacggttagtcgtgattgtttgaccttaacgtctaacttattaatactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggattgaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACAACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTA
gi|4 : gaaaatgtccagagagaaataaagtaattttaacagtcagtcgtgattgtttgaccttaacgtcaaacttattattaaactactaaaaatagcttatatagttatatacccaatattggatagaagaataacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTAGTTTGCTATTTTGAAAATTTACGATACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTT
gi|9 : taaaaaaatttaagtgaagtttttgaaaatgtcctgagtgaaataaagtaatttaaacggtcagttgtgattgttcgaccttaacgtctaacttatttacgactaaaaatagcttttatattttggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAg
gi|10 : ccagagtgaaataaagtaatttaaacggtcagtcgtgatcgttcgaccttaacgtctaacttattaactaaaaacagtttctatcattatatacccaatattggatagaagaataacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTAGTTTGCTATTTTGATCATCAACGACATTTTTTCTTAAATTATTCCCTAATTTTAA
gi|18 : gcttctatagttatatacccaatattggatataagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTAGTTTGCCATTTCGAACATTGACTATACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTT
gi|17 : CTAGTTTGCTATTGTGAAAATTGACTATACATTTTCTTAAATTATTCCCTTATTTTA
gi|19 : TAGTTTGCTATTTTGAACATTTACTATACATTTTCGTAAATTATGTCCTAATT
Alignments
lowQualScore : 1 111
lowQualScore : 9 3 5555 33 777 2 777777 0 33 33 33 33 2 1
lowQualScore : . . .... .. ... . ...... . .. .. .. .. . .
lowQualScore : 2 5 7777 77 333 7 222222 2 44 44 44 44 5 0
consensus : AAAGT-TTAAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
Reference ( family-1200 ) : AAAGTGTTAAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
gi|1 : AAAGTTTTAAGTGAAA-TTGATGAAAATGTTCAGAGTGAAATAAAGTATTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCAACCTTAACGTCTAACTTATT----AAGAAC--TA--A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCATT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|1 : tcagaaaaaCTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaattatgccccaatttca
gi|10 : tcagaaaaaaaagttttaagtgaaattgatgaaaatgttcagagtgaaataaagtattttaaacggtcagtcgtgattgttcaaccttaacgtctaacttattaagaactaaaaaatagcttctatagttatatacccattattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATATAAG-
gi|10 : CTAGTTTGCTATTTTGATCATCAACGACATTTTTTCTTAAATTATTCCCTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgatcatcaacgacattttttcttaaattattccctaattttaa
gi|11 : gcttctatagttatatacccaatattggatataagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGGTGTTGAGTGAAAATTAATGAAAATCTCCAGAATGAAATAAAGTAATTTCAGCGGTCAGTCGCGAGTGTTGGATCTTAATGCCTAACTTATT----AACTAC--TACAA-AAAATAGCTTCTATACATGTAGTTATATACTGAAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAA
gi|12 : caaaaaAAAGTGTTAAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAGTGGTCAGTCTTGATTGTTTGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------CAGTTATATACTCA----ATT--GAAG--ATAGAAG-AAAAGCAg
gi|13 : agaaaGTGAAATAAAGTAATTTCAGCAGTCAGTCGTGATTGTTTGATCTATATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACTCA----ATT--G--AATATAGAAG-AAAAGCA
gi|14 : aaaatTCAAGAGTGAAATAAAGTAATTCCAATGGTCAGTCGTGATTGTTCGACATTAACGTCTAATTTATT----AACTAC--T-----AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATC-----G--ATAGAAG-AAAAACA
gi|15 : TAGCGTTTTATTGATT----AATGACAAC---A-AAAATAGTTTCTA------TATTTAAATACTCGAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAAGCAT
gi|16 : tttaGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--T---ACAAAACATCTTCTG------TAGTTATAT----AATAAATTGAG--G--ATAGAAA-AAA
gi|17 : CTAGTTTGCTATTGTGAAAATTGACTATACATTTTCTTAAATTATTCCCTTATTTTAtca
gi|18 : CTAGTTTGCCATTTCGAACATTGACTATACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTT
gi|19 : TAGTTTGCTATTTTGAACATTTACTATACATTTTCGTAAATTATGTCCTAATT
gi|2 : AAAGT-TTAAATGAAAAT-AATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTACTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGTCATTAACGTCTAACTTATT----AACTTT--TA--A-AAAATATCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAATCAT
gi|2 : agaaaaCTTGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAGTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaagtatgccccaatttt
gi|3 : agaaaaaaagtttaaatgaaaataatgaaaatgtccagagtgaaataaagtactttaaacggtcagtcgtgattgttcgtcattaacgtctaacttattaacttttaaaaaatatcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaatcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAAGT-TTAAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGGTTGCTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ACG--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|4 : AAAAT-TTAAGTGAAGTTTT-TGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTTGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----TACGAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TA-TT--------------TT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacattaacgaccctttttctcaaattattccctaattttaa
gi|4 : taaaCTAGTTTGCTATTTTGAAAATTTACGATACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaaaatttacgatacattttcttaaattatgccccaattttg
gi|5 : taaaaaaatttaagtgaagtttttgaaaatgtcctgagtgaaataaagtaatttaaacggtcagttgtgattgttcgaccttaacgtctaacttatttacgactaaaaatagcttttatattttggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAAATGTCCAGAGAGAAATAAAGTAATTTTAACAGTCAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCAAACTTATTATTAAACTAC--T---A-AAAATAGCTTATA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATg
gi|5 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACAACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacaacacattttcttaaattatgccccaatttta
gi|6 : gaaaatgtccagagagaaataaagtaattttaacagtcagtcgtgattgtttgaccttaacgtcaaacttattattaaactactaaaaatagcttatatagttatatacccaatattggatagaagaataacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAAAATGTCAAGAGTGAA-TAAAGTAATTTCAACGGTTAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCTAACTTATT----AA-TAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATTGAAG-AAAAACAT
gi|6 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacattaacgacacattttcttaaattattccttaattttaa
gi|7 : gaaaatgtcaagagtgaataaagtaatttcaacggttagtcgtgattgtttgaccttaacgtctaacttattaatactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggattgaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTGAAAATGTCAAGAGTAAAATAAAGTAATTTCAATGGTCAGTAGTGATTGTTCAACCTTAACGTTTAACATATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|7 : CTAGTTTTTTGCTATGAACATAAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagttttttgctatgaacataaacgacacattttcttaaattattccttaattttaaa
gi|8 : tgaaaatgtcaagagtaaaataaagtaatttcaatggtcagtagtgattgttcaaccttaacgtttaacatattaactactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGAAAATGTCAAGAGTGATATAAAGTAATTTCAACGGCCAGTCGTGATTG-------------------TTAT-------------------AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAGAAAAAACATa
gi|9 : CCAGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTCGTGATCGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----A---AC--T---A-AAAACAGTTTCTA------TCATTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacataaacgacacattttcttaaattataccttaatttaa
gi|9 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaa
Alignments
lowQualScore : 1 111
lowQualScore : 3 6 3 5555 33 777 2 777777 0 33 33 33 33 2 1
lowQualScore : . . . .... .. ... . ...... . .. .. .. .. . .
lowQualScore : 3 7 5 7777 77 333 7 222222 2 44 44 44 44 5 0
consensus : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
Reference ( family-1200 ) : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
gi|1 : AAAGT-TTTAAGTGAAA-TTGATGAAAATGTTCAGAGTGAAATAAAGTATTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCAACCTTAACGTCTAACTTATT----AAGAAC--TA--A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCATT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|1 : tcagaaaaaCTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaattatgccccaatttca
gi|10 : tcagaaaaaaaagttttaagtgaaattgatgaaaatgttcagagtgaaataaagtattttaaacggtcagtcgtgattgttcaaccttaacgtctaacttattaagaactaaaaaatagcttctatagttatatacccattattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATATAAG-
gi|10 : CTAGTTTGCTATTTTGATCATCAACGACATTTTTTCTTAAATTATTCCCTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgatcatcaacgacattttttcttaaattattccctaattttaa
gi|11 : gcttctatagttatatacccaatattggatataagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGGTGTT-GAGTGAAAATTAATGAAAATCTCCAGAATGAAATAAAGTAATTTCAGCGGTCAGTCGCGAGTGTTGGATCTTAATGCCTAACTTATT----AACTAC--TACAA-AAAATAGCTTCTATACATGTAGTTATATACTGAAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAA
gi|12 : caaaaaAAAGTGTT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAGTGGTCAGTCTTGATTGTTTGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------CAGTTATATACTCA----ATT--GAAG--ATAGAAG-AAAAGCAg
gi|13 : agaaaGTGAAATAAAGTAATTTCAGCAGTCAGTCGTGATTGTTTGATCTATATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACTCA----ATT--G--AATATAGAAG-AAAAGCA
gi|14 : aaaatTCAAGAGTGAAATAAAGTAATTCCAATGGTCAGTCGTGATTGTTCGACATTAACGTCTAATTTATT----AACTAC--T-----AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATC-----G--ATAGAAG-AAAAACA
gi|15 : TAGCGTTTTATTGATT----AATGACAAC---A-AAAATAGTTTCTA------TATTTAAATACTCGAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAAGCAT
gi|16 : tttaGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--T---ACAAAACATCTTCTG------TAGTTATAT----AATAAATTGAG--G--ATAGAAA-AAA
gi|17 : CTAGTTTGCTATTGTGAAAATTGACTATACATTTTCTTAAATTATTCCCTTATTTTAtca
gi|18 : CTAGTTTGCCATTTCGAACATTGACTATACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTT
gi|19 : TAGTTTGCTATTTTGAACATTTACTATACATTTTCGTAAATTATGTCCTAATT
gi|2 : AAAGT-TT-AAATGAAAAT-AATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTACTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGTCATTAACGTCTAACTTATT----AACTTT--TA--A-AAAATATCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAATCAT
gi|2 : agaaaaCTTGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAGTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaagtatgccccaatttt
gi|3 : agaaaaaaagtttaaatgaaaataatgaaaatgtccagagtgaaataaagtactttaaacggtcagtcgtgattgttcgtcattaacgtctaacttattaacttttaaaaaatatcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaatcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGGTTGCTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ACG--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|4 : AAAAT-TT-AAGTGAAGTTTT-TGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTTGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----TACGAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TA-TT--------------TT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacattaacgaccctttttctcaaattattccctaattttaa
gi|4 : taaaCTAGTTTGCTATTTTGAAAATTTACGATACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaaaatttacgatacattttcttaaattatgccccaattttg
gi|5 : taaaaaaatttaagtgaagtttttgaaaatgtcctgagtgaaataaagtaatttaaacggtcagttgtgattgttcgaccttaacgtctaacttatttacgactaaaaatagcttttatattttggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAAATGTCCAGAGAGAAATAAAGTAATTTTAACAGTCAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCAAACTTATTATTAAACTAC--T---A-AAAATAGCTTATA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATg
gi|5 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACAACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacaacacattttcttaaattatgccccaatttta
gi|6 : gaaaatgtccagagagaaataaagtaattttaacagtcagtcgtgattgtttgaccttaacgtcaaacttattattaaactactaaaaatagcttatatagttatatacccaatattggatagaagaataacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAAAATGTCAAGAGTGAA-TAAAGTAATTTCAACGGTTAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCTAACTTATT----AA-TAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATTGAAG-AAAAACAT
gi|6 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacattaacgacacattttcttaaattattccttaattttaa
gi|7 : gaaaatgtcaagagtgaataaagtaatttcaacggttagtcgtgattgtttgaccttaacgtctaacttattaatactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggattgaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTGAAAATGTCAAGAGTAAAATAAAGTAATTTCAATGGTCAGTAGTGATTGTTCAACCTTAACGTTTAACATATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|7 : CTAGTTTTTTGCTATGAACATAAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagttttttgctatgaacataaacgacacattttcttaaattattccttaattttaaa
gi|8 : tgaaaatgtcaagagtaaaataaagtaatttcaatggtcagtagtgattgttcaaccttaacgtttaacatattaactactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGAAAATGTCAAGAGTGATATAAAGTAATTTCAACGGCCAGTCGTGATTG-------------------TTAT-------------------AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAGAAAAAACATa
gi|9 : CCAGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTCGTGATCGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----A---AC--T---A-AAAACAGTTTCTA------TCATTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacataaacgacacattttcttaaattataccttaatttaa
gi|9 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaa
Alignments
lowQualScore : 1 111
lowQualScore : 3 6 3 5555 33 777 2 777777 0 33 33 33 33 2 1
lowQualScore : . . . .... .. ... . ...... . .. .. .. .. . .
lowQualScore : 3 7 5 7777 77 333 7 222222 2 44 44 44 44 5 0
consensus : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
Reference ( family-1200 ) : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
gi|1 : AAAGT-TTTAAGTGAAA-TTGATGAAAATGTTCAGAGTGAAATAAAGTATTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCAACCTTAACGTCTAACTTATT----AAGAAC--TA--A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCATT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|1 : tcagaaaaaCTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaattatgccccaatttca
gi|10 : tcagaaaaaaaagttttaagtgaaattgatgaaaatgttcagagtgaaataaagtattttaaacggtcagtcgtgattgttcaaccttaacgtctaacttattaagaactaaaaaatagcttctatagttatatacccattattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATATAAG-
gi|10 : CTAGTTTGCTATTTTGATCATCAACGACATTTTTTCTTAAATTATTCCCTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgatcatcaacgacattttttcttaaattattccctaattttaa
gi|11 : gcttctatagttatatacccaatattggatataagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGGTGTT-GAGTGAAAATTAATGAAAATCTCCAGAATGAAATAAAGTAATTTCAGCGGTCAGTCGCGAGTGTTGGATCTTAATGCCTAACTTATT----AACTAC--TACAA-AAAATAGCTTCTATACATGTAGTTATATACTGAAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAA
gi|12 : caaaaaAAAGTGTT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAGTGGTCAGTCTTGATTGTTTGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------CAGTTATATACTCA----ATT--GAAG--ATAGAAG-AAAAGCAg
gi|13 : agaaaGTGAAATAAAGTAATTTCAGCAGTCAGTCGTGATTGTTTGATCTATATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACTCA----ATT--G--AATATAGAAG-AAAAGCA
gi|14 : aaaatTCAAGAGTGAAATAAAGTAATTCCAATGGTCAGTCGTGATTGTTCGACATTAACGTCTAATTTATT----AACTAC--T-----AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATC-----G--ATAGAAG-AAAAACA
gi|15 : TAGCGTTTTATTGATT----AATGACAAC---A-AAAATAGTTTCTA------TATTTAAATACTCGAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAAGCAT
gi|16 : tttaGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--T---ACAAAACATCTTCTG------TAGTTATAT----AATAAATTGAG--G--ATAGAAA-AAA
gi|17 : CTAGTTTGCTATTGTGAAAATTGACTATACATTTTCTTAAATTATTCCCTTATTTTAtca
gi|18 : CTAGTTTGCCATTTCGAACATTGACTATACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTT
gi|19 : TAGTTTGCTATTTTGAACATTTACTATACATTTTCGTAAATTATGTCCTAATT
gi|2 : AAAGT-TT-AAATGAAAAT-AATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTACTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGTCATTAACGTCTAACTTATT----AACTTT--TA--A-AAAATATCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAATCAT
gi|2 : agaaaaCTTGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAGTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaagtatgccccaatttt
gi|3 : agaaaaaaagtttaaatgaaaataatgaaaatgtccagagtgaaataaagtactttaaacggtcagtcgtgattgttcgtcattaacgtctaacttattaacttttaaaaaatatcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaatcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGGTTGCTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ACG--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|4 : AAAAT-TT-AAGTGAAGTTTT-TGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTTGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----TACGAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TA-TT--------------TT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacattaacgaccctttttctcaaattattccctaattttaa
gi|4 : taaaCTAGTTTGCTATTTTGAAAATTTACGATACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaaaatttacgatacattttcttaaattatgccccaattttg
gi|5 : taaaaaaatttaagtgaagtttttgaaaatgtcctgagtgaaataaagtaatttaaacggtcagttgtgattgttcgaccttaacgtctaacttatttacgactaaaaatagcttttatattttggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAAATGTCCAGAGAGAAATAAAGTAATTTTAACAGTCAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCAAACTTATTATTAAACTAC--T---A-AAAATAGCTTATA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATg
gi|5 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACAACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacaacacattttcttaaattatgccccaatttta
gi|6 : gaaaatgtccagagagaaataaagtaattttaacagtcagtcgtgattgtttgaccttaacgtcaaacttattattaaactactaaaaatagcttatatagttatatacccaatattggatagaagaataacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAAAATGTCAAGAGTGAA-TAAAGTAATTTCAACGGTTAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCTAACTTATT----AA-TAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATTGAAG-AAAAACAT
gi|6 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacattaacgacacattttcttaaattattccttaattttaa
gi|7 : gaaaatgtcaagagtgaataaagtaatttcaacggttagtcgtgattgtttgaccttaacgtctaacttattaatactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggattgaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTGAAAATGTCAAGAGTAAAATAAAGTAATTTCAATGGTCAGTAGTGATTGTTCAACCTTAACGTTTAACATATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|7 : CTAGTTTTTTGCTATGAACATAAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagttttttgctatgaacataaacgacacattttcttaaattattccttaattttaaa
gi|8 : tgaaaatgtcaagagtaaaataaagtaatttcaatggtcagtagtgattgttcaaccttaacgtttaacatattaactactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGAAAATGTCAAGAGTGATATAAAGTAATTTCAACGGCCAGTCGTGATTG-------------------TTAT-------------------AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAGAAAAAACATa
gi|9 : CCAGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTCGTGATCGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----A---AC--T---A-AAAACAGTTTCTA------TCATTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacataaacgacacattttcttaaattataccttaatttaa
gi|9 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaa
blockSeqs : G . A ATTA AA ACA C TACATG AA GA AA AT A A
blockSeqs : G . A . . AC . . . . . . . G
blockSeqs : . . A . . AC . . . . . . . G
blockSeqs : . . A . . A . . . . . . . T
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : ***
originalCons : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
finalCons : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
Alignments
lowQualScore : 1 111
lowQualScore : 3 6 3 5555 33 777 2 777777 0 33 33 33 33 2 1
lowQualScore : . . . .... .. ... . ...... . .. .. .. .. . .
lowQualScore : 3 7 5 7777 77 333 7 222222 2 44 44 44 44 5 0
consensus : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
Reference ( family-1200 ) : AAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTAGTTTGCTATTTTGAACATTNACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTTTAA
gi|1 : AAAGT-TTTAAGTGAAA-TTGATGAAAATGTTCAGAGTGAAATAAAGTATTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCAACCTTAACGTCTAACTTATT----AAGAAC--TA--A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCATT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|1 : tcagaaaaaCTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaattatgccccaatttca
gi|10 : tcagaaaaaaaagttttaagtgaaattgatgaaaatgttcagagtgaaataaagtattttaaacggtcagtcgtgattgttcaaccttaacgtctaacttattaagaactaaaaaatagcttctatagttatatacccattattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATATAAG-
gi|10 : CTAGTTTGCTATTTTGATCATCAACGACATTTTTTCTTAAATTATTCCCTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgatcatcaacgacattttttcttaaattattccctaattttaa
gi|11 : gcttctatagttatatacccaatattggatataagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGGTGTT-GAGTGAAAATTAATGAAAATCTCCAGAATGAAATAAAGTAATTTCAGCGGTCAGTCGCGAGTGTTGGATCTTAATGCCTAACTTATT----AACTAC--TACAA-AAAATAGCTTCTATACATGTAGTTATATACTGAAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAA
gi|12 : caaaaaAAAGTGTT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTAATTTCAGTGGTCAGTCTTGATTGTTTGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------CAGTTATATACTCA----ATT--GAAG--ATAGAAG-AAAAGCAg
gi|13 : agaaaGTGAAATAAAGTAATTTCAGCAGTCAGTCGTGATTGTTTGATCTATATGTCTAATTTATT----AACTAC--TAC-A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACTCA----ATT--G--AATATAGAAG-AAAAGCA
gi|14 : aaaatTCAAGAGTGAAATAAAGTAATTCCAATGGTCAGTCGTGATTGTTCGACATTAACGTCTAATTTATT----AACTAC--T-----AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATC-----G--ATAGAAG-AAAAACA
gi|15 : TAGCGTTTTATTGATT----AATGACAAC---A-AAAATAGTTTCTA------TATTTAAATACTCGAT--TGA--G--G--ATAGAAG-AAAAGCAT
gi|16 : tttaGATTTTAATGTCTAATTTATT----AACTAC--T---ACAAAACATCTTCTG------TAGTTATAT----AATAAATTGAG--G--ATAGAAA-AAA
gi|17 : CTAGTTTGCTATTGTGAAAATTGACTATACATTTTCTTAAATTATTCCCTTATTTTAtca
gi|18 : CTAGTTTGCCATTTCGAACATTGACTATACATTTTCTTAAATTATGCCCTAATTT
gi|19 : TAGTTTGCTATTTTGAACATTTACTATACATTTTCGTAAATTATGTCCTAATT
gi|2 : AAAGT-TT-AAATGAAAAT-AATGAAAATGTCCAGAGTGAAATAAAGTACTTTAAACGGTCAGTCGTGATTGTTCGTCATTAACGTCTAACTTATT----AACTTT--TA--A-AAAATATCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAATCAT
gi|2 : agaaaaCTTGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAGTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacttgtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaagtatgccccaatttt
gi|3 : agaaaaaaagtttaaatgaaaataatgaaaatgtccagagtgaaataaagtactttaaacggtcagtcgtgattgttcgtcattaacgtctaacttattaacttttaaaaaatatcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaatcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaAAAGT-TT-AAGTGAAAATTAATGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTCAACGGTCAGTCGTGGTTGCTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTCTA------TAGTTATATACCCAAT--ACG--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|4 : AAAAT-TT-AAGTGAAGTTTT-TGAAAATGTCCTGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTTGTGATTGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----TACGAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TA-TT--------------TT--G--G--ATAGAAG-AAAAACATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacattaacgaccctttttctcaaattattccctaattttaa
gi|4 : taaaCTAGTTTGCTATTTTGAAAATTTACGATACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactagtttgctattttgaaaatttacgatacattttcttaaattatgccccaattttg
gi|5 : taaaaaaatttaagtgaagtttttgaaaatgtcctgagtgaaataaagtaatttaaacggtcagttgtgattgttcgaccttaacgtctaacttatttacgactaaaaatagcttttatattttggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAAAATGTCCAGAGAGAAATAAAGTAATTTTAACAGTCAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCAAACTTATTATTAAACTAC--T---A-AAAATAGCTTATA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATg
gi|5 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACAACACATTTTCTTAAATTATGCCCCAATTTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacaacacattttcttaaattatgccccaatttta
gi|6 : gaaaatgtccagagagaaataaagtaattttaacagtcagtcgtgattgtttgaccttaacgtcaaacttattattaaactactaaaaatagcttatatagttatatacccaatattggatagaagaataacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAAAATGTCAAGAGTGAA-TAAAGTAATTTCAACGGTTAGTCGTGATTGTTTGACCTTAACGTCTAACTTATT----AA-TAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATTGAAG-AAAAACAT
gi|6 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacattaacgacacattttcttaaattattccttaattttaa
gi|7 : gaaaatgtcaagagtgaataaagtaatttcaacggttagtcgtgattgtttgaccttaacgtctaacttattaatactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggattgaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTGAAAATGTCAAGAGTAAAATAAAGTAATTTCAATGGTCAGTAGTGATTGTTCAACCTTAACGTTTAACATATT----AACTAC--T---A-AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AAAAACAT
gi|7 : CTAGTTTTTTGCTATGAACATAAACGACACATTTTCTTAAATTATTCCTTAATTTTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagttttttgctatgaacataaacgacacattttcttaaattattccttaattttaaa
gi|8 : tgaaaatgtcaagagtaaaataaagtaatttcaatggtcagtagtgattgttcaaccttaacgtttaacatattaactactaaaaatagcttttatagttatatacccaatattggatagaagaaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntGAAAATGTCAAGAGTGATATAAAGTAATTTCAACGGCCAGTCGTGATTG-------------------TTAT-------------------AAAATAGCTTTTA------TAGTTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAGAAAAAACATa
gi|9 : CCAGAGTGAAATAAAGTAATTTAAACGGTCAGTCGTGATCGTTCGACCTTAACGTCTAACTTATT----A---AC--T---A-AAAACAGTTTCTA------TCATTATATACCCAAT--ATT--G--G--ATAGAAG-AATAACATgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctagtttgctattttgaacataaacgacacattttcttaaattataccttaatttaa
gi|9 : CTAGTTTGCTATTTTGAACATTTACGACACATTTTCTTAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctagtttgctattttgaacatttacgacacattttcttaaa