lowQualScore : 1 1 3333333333333 11111 11
lowQualScore : 6 2 5 3 55 9 55 9999999999999 9999 3 77777 33 3 55555 0 22 77 8
lowQualScore : . . . . .. . .. ............. .... . ..... .. . ..... . .. .. .
lowQualScore : 0 5 0 4 55 9 00 0000000000000 8888 1 77777 66 1 55555 9 22 99 3
consensus : ATATNTCATATACAC--TGCGGTCCC-GAT--AT--AACGC-GGT--CCCC-G--GGAG-CCA-----AAGAGCC-GGACC-GCG-ATATAGACGGAAC--CG--TTATAAATA
Reference ( gi|10 ) : ATGTGTCATATGCAC--TGCGGTCCCTGAT--AT-TACCGT-GGT--TCCC-G--GGAG-CCA-----AAGAATC-AGACT-ACA-ATATAGATGGAAC--CA--TTATTAATA
gi|5 : ATATTTCATA--CAC--TGCAG-CCCTGATGAAA-TA-----AGA--CCCT-G--GGAG-CCA-----AAGAATC-AGATTGAGATATATAGACAGAACAACG--TTAT
gi|8 : atacactgcagccctggtgtaTGT-ACATACAC--TGCGGT-CCTGAT--AT-AA--GTCTGT--CCCC-C--AGAG-CCAATTTTAAGAGCC-AGACA-TTG-ATATAGAaagtgtcg
gi|11 : ctttacatacATATGCAC--TGTGGTCA-TGAT--AT-AACACT-G----TCCCAG--GGAG-TCA-----GAGAGCC-AGACT-ACA-ATACAGACGGcaagaaggtgtt
gi|2 : aataaaacaaatgaaaataaatATACACAC--TGGGGTCCC-GAT--AT--AACGA-GGCCCTCCC-ACAGGAA-CCA-----AAGAACC-AGACC-ACA-ATATAATCGGAAC--
gi|7 : cagttttgattattatatgtatttttaacattataactcttggattatatATATACAC--TGTGGTCCC-AAT--AT--AACGT-GGT--CCAA-G--AGAG-ACA-----AAGAAAT-GGACC-GCG-TTATAAAatcaggtacaaatgcagcagcta
gi|4 : taaaatataggtgtaaacttcttactaatattagTATACAC--CGCGATCCC-GAT--AC--AGCGC-AGT--CCCT-G--AGAG-CCA-----AAGAGCT-GGATT-GTGTTTATAGATGGAAatcacgc
gi|9 : tgttgtatatttcaatagtacttatataatgTACAC--TGCTGTCC---AT--ATATAATGC-GGT--TTCC-A--GGAG-CCA-----AAGAGTC-TGACC-ATG-ATATAGATGAAAC--ttgcggtataaatattgc
gi|1 : gctttagTACAC--TGATGTCTC-GAT--AT--AATGG-GAA--CCCC-T--AAAG-CCA-----AAGAGCT-GGACT-CTG-ATATAGATGGAAC--CATGTTATAAATAtgtattgtaaacagag
gi|14 : aattttgcattgaaattgcatgttttttataccatagactgagccaaaattttggacgtttaacatttacagTGCACAGTGCTTTTCC-GAT---T-TAAGGC-AGT--CCCCCG--GGAG-CGG-----AAAAGTCGAAACT--CA-ATATAGATGGAACTGCA--TTATtcgcag
gi|3 : AC--TGCGGTCCC-GTT--AT-AACACT-G-T--CTCC-A--GGAA-CCA-----AACAGCC-AGACC-ATC-ATATAGATGGAAA--CA--T
gi|6 : ccattttgattgctgagtaaaacacatatttcagccaagatgactttgatatatccaaatTGAT--AT--AATGT-GGT--TCCC-G--GGAG-CCA-----AAGAATT-GGATT-TAA-ATATAGA--------CA--TTATTgttt
gi|16 : tattttgacattaatataatagttatccctatg--TCCC-T--GGAG-CCA-----AAGAGCC-AGACC-ATG-ACATAGACG------TG--TTATAAATAgcgttataaacatcgcggtt
gi|12 : tataacattgCC-G--GGAGTCCA-----AACAGCT-GGGCC-ATG-ATATAGGTGGAAC--CA--Ttcacgt
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): CATTGATGCAGATATAGTCCCCAGGAGTCAAAGAGCTGGACAATGATGCGGATGAAGCTGCGTTATATAAACATTATACAGCTA
Unaligned ( gi|15 ): TAATATATACACACTGTGGCCCCAATGTAACGCAGTCCCCCTCCCCTCGAGACCTGGACCGCGATATAAATATCAC
Unaligned ( gi|17 ): CATTGATGCAGATATAATGCAGTCCCCAGGAGTCAAAGAGCTGGACATTGATGCAGAT
Alignments
lowQualScore : 1 22
lowQualScore : 1 0 0 2 444 2 2 3 444 2 2 2 55555 888888 55 55555
lowQualScore : . . . . ... . . . ... . . . ..... ...... .. .....
lowQualScore : 0 1 5 5 111 4 6 5 111 4 4 4 99999 111111 00 88888
consensus : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGACGGAAC-GC--G--TTATAAATA
Reference ( family-1134 ) : ATATNTCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGACGGAAC--C--G--TTATAAATA
gi|1 : TACACTGATGTCTC-GAT---AT-AATGGGA---ACCC-C-TAAAG-CCA-----AAGAGCTGGACTCTG--ATATAGATGGAAC--CATG--TTATAAATA
gi|10 : aattttgcattgaaattgcatgttttttataccatagactgagccaaaattttggacgtttaacatttacagATGTGTCATATGCACTGCGGTCCCTGAT---ATTACCGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGACTACA--ATATAGATGGAAC--C--A--TTATTAATAtcgcag
gi|11 : ATATGCACTGTGGTCAT-GAT---AT-AACACTG---TCCC-A-GGGAG-TCA-----GAGAGCCAGACTACA--ATACAGACGG
gi|12 : aataaaacaaatgaaaataaatTGTGATCCC-AAT---GT-AAAGCAG---CCAC-C-GGGAGTCCA-----AACAGCTGGGCCATG--ATATAGGTGGAAC--C--A--
gi|13 : tttaatcgacaaactg-GAT---AT-A-----G---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACAATG--ATGCGGATGAAGCTGC--G--TTATAgtt
gi|14 : cattgatgcaACAGTGCTTTTCC-GAT---TT-AAGGCAG---TCCC-CCGGGAG-CGG-----AAAAGTCGAAACTCA--ATATAGATGGAACTGC--A--TTATtaaacattatacagcta
gi|15 : tgcATAT-ATACACACTGTGGCCCC-AAT---GT-AACGCAG---TCCC-C-CTCCC-CTC-----GAGACCTGGACCGCG--ATATAAA
gi|16 : taT---AT-AACATTG---TCCC-T-GG-AG-CCA-----AAGAGCCAGACCATG--ACATAGACG------T--G--TTATAAATAtatcac
gi|17 : -GAT---AT-AATGCAG---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACATTG--ATGCAGAtcacgt
gi|2 : cattgatgcaTATAT-ATACACACTGGGGTCCC-GAT---AT-AACGAGGCCCTCCCAC-AGGAA-CCA-----AAGAACCAGACCACA--ATATAATCGGAAC--t
gi|3 : cagttttgattattatatgtatttttaacattataactcttggatATATATC-CAAATACTGCGGTCCC-GTT---AT-AACACTG---TCTC-C-AGGAA-CCA-----AACAGCCAGACCATC--ATATAGATGGAAatcaggtacaaatgcagcagcta
gi|4 : ccattttgattgctgagtaaaacacatatttcagccaagatgactttgATATAATGTATACACCGCGATCCC-GAT---AC-AGCGCAG---TCCC-T-GAGAG-CCA-----AAGAGCTGGATTGTGT-TTATAGATGGAATTGC--G--GTATAAATAacatgttt
gi|5 : tgttgtatatttcaatagtacttATATTTCATA--CACTGCAGCCCT-GATGAAAT-AA----G---ACCC-T-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGATTGAGATATATAGACAGAACAAC--G--TTATAAGTttgc
gi|6 : atacactgcagccctggtgta-GAT---AT-AATGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATTGGATTTAA--ATATAGACATTATTGC--G--TTATAAACAgtcg
gi|7 : tattttgacattaatataatagttatccctatgtATATTAGATATACACTGTGGTCCC-AAT---AT-AACGTGG---TCCA-A-GAGAG-ACA-----AAGAAATGGACCGCG--TTATAAAtcgcggtt
gi|8 : taaaatataggtgtaaacttcttactaACATACACTGCGGTCCT-GAT---AT-AAGTCTG---TCCC-C-CAGAG-CCAATTTTAAGAGCCAGACATTG--ATATAGACatcacgc
gi|9 : ctttacatactgtTACACTGCTGTCCA-TAT---AT-AATGCGG---TTTC-C-AGGAG-CCA-----AAGAGTCTGACCATG--ATATAGATGAAAC--T--GTATTGTAAACAaagaaggtgtt
Alignments
lowQualScore : 1 1111111
lowQualScore : 3 0 2 444 2 2 3 444 2 2 2 55555 888888 33 2 2 4444444
lowQualScore : . . . ... . . . ... . . . ..... ...... .. . . .......
lowQualScore : 7 5 5 111 4 6 5 111 4 4 4 99999 111111 88 9 9 9999999
consensus : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
Reference ( family-1134 ) : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
gi|1 : TACACTGATGTCTC-GAT---AT-AATGGGA---ACCC-C-TAAAG-CCA-----AAGAGCTGGACTCTG--ATATAGAT-G-G-AACC-AT--GTTATAAATA
gi|10 : aattttgcattgaaattgcatgttttttataccatagactgagccaaaattttggacgtttaacatttacagATGTGTCATATGCACTGCGGTCCCTGAT---ATTACCGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGACTACA--ATATAGAT-G-G-AA-C--C--ATTATTAATAtcgcag
gi|11 : ATAAAT-ATATGCACTGTGGTCAT-GAT---AT-AACACTG---TCCC-A-GGGAG-TCA-----GAGAGCCAGACTACA--ATACAGAC-G-G-
gi|12 : aataaaacaaatgaaaTGTGATCCC-AAT---GT-AAAGCAG---CCAC-C-GGGAGTCCA-----AACAGCTGGGCCATG--ATATAGGT-G-G-AA-C-
gi|13 : tttaatcgacaaactg-GAT---AT-A-----G---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACAATG--ATGCGGAT-G-A-AG-CTGC--GTTATAcatgtt
gi|14 : cattgatgcaACAGTGCTTTTCC-GAT---TT-AAGGCAG---TCCC-CCGGGAG-CGG-----AAAAGTCGAAACTCA--ATATAGAT-G-G-AA-CTGC--ATTATtaaacattatacagcta
gi|15 : tgcATAT-ATACACACTGTGGCCCC-AAT---GT-AACGCAG---TCCC-C-CTCCC-CTC-----GAGACCTGGACCGCG--ATATAAA
gi|16 : taT---AT-AACATTG---TCCC-T-GG-AG-CCA-----AAGAGCCAGACCATG--ACATAG--------A-C-GT--GTTATAAATAtatcac
gi|17 : -GAT---AT-AATGCAG---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACATTG--ATGCAGAtcacgt
gi|2 : cattgatgcaTATAT-ATACACACTGGGGTCCC-GAT---AT-AACGAGGCCCTCCCAC-AGGAA-CCA-----AAGAACCAGACCACA--ATATAATC-G-G-AA-C-ATCAGGTACAAATt
gi|3 : cagttttgattattatatgtatttttaacattataactcttggatATATATC-CAAATACTGCGGTCCC-GTT---AT-AACACTG---TCTC-C-AGGAA-CCA-----AACAGCCAGACCATC--ATATAGAT-G-GAAA-C-AT--GTTgcagcagcta
gi|4 : ccattttgattgctgagtaaaacacatatttcagccaagatgactttgATATAATGTATACACCGCGATCCC-GAT---AC-AGCGCAG---TCCC-T-GAGAG-CCA-----AAGAGCTGGATTGTGT-TTATAGAT-G-G-AATT-GC--GGTATAAATAt
gi|5 : tgttgtatatttcaatagtacttATATTTCATA--CACTGCAGCCCT-GATGAAAT-AA----G---ACCC-T-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGATTGAGATATATAGAC-A-G-AA-CAAC--GTTATAAGTttgc
gi|6 : atacactgcagccctggtgta-GAT---AT-AATGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATTGGATTTAA--ATATAGAC-ATT-AT-T-GC--GTTATAAACAgtcg
gi|7 : tattttgacattaatataatagttatccctatgtATATACACTGTGGTCCC-AAT---AT-AACGTGG---TCCA-A-GAGAG-ACA-----AAGAAATGGACCGCG--TTATAAAtcgcggtt
gi|8 : taaaatataggtgtaaacttcttactaatattagACATACACTGCGGTCCT-GAT---AT-AAGTCTG---TCCC-C-CAGAG-CCAATTTTAAGAGCCAGACATTG--ATATAGACAA-G-AA-G-GT--GTTatcacgc
gi|9 : ctttacatactgtTACACTGCTGTCCA-TAT---AT-AATGCGG---TTTC-C-AGGAG-CCA-----AAGAGTCTGACCATG--ATATAGAT-G-A-AA-CTGT--ATTGTAAACA
Alignments
lowQualScore : 1 1111111
lowQualScore : 3 0 2 444 2 2 3 444 2 2 2 55555 888888 33 2 2 4444444
lowQualScore : . . . ... . . . ... . . . ..... ...... .. . . .......
lowQualScore : 7 5 5 111 4 6 5 111 4 4 4 99999 111111 88 9 9 9999999
consensus : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
Reference ( family-1134 ) : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
gi|1 : TACACTGATGTCTC-GAT---AT-AATGGGA---ACCC-C-TAAAG-CCA-----AAGAGCTGGACTCTG--ATATAGAT-G-G-AACC-AT--GTTATAAATA
gi|10 : aattttgcattgaaattgcatgttttttataccatagactgagccaaaattttggacgtttaacatttacagATGTGTCATATGCACTGCGGTCCCTGAT---ATTACCGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGACTACA--ATATAGAT-G-G-AA-C--C--ATTATTAATAtcgcag
gi|11 : ATAAAT-ATATGCACTGTGGTCAT-GAT---AT-AACACTG---TCCC-A-GGGAG-TCA-----GAGAGCCAGACTACA--ATACAGAC-G-G-
gi|12 : aataaaacaaatgaaaTGTGATCCC-AAT---GT-AAAGCAG---CCAC-C-GGGAGTCCA-----AACAGCTGGGCCATG--ATATAGGT-G-G-AA-C-
gi|13 : tttaatcgacaaactg-GAT---AT-A-----G---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACAATG--ATGCGGAT-G-A-AG-CTGC--GTTATAcatgtt
gi|14 : cattgatgcaACAGTGCTTTTCC-GAT---TT-AAGGCAG---TCCC-CCGGGAG-CGG-----AAAAGTCGAAACTCA--ATATAGAT-G-G-AA-CTGC--ATTATtaaacattatacagcta
gi|15 : tgcATAT-ATACACACTGTGGCCCC-AAT---GT-AACGCAG---TCCC-C-CTCCC-CTC-----GAGACCTGGACCGCG--ATATAAA
gi|16 : taT---AT-AACATTG---TCCC-T-GG-AG-CCA-----AAGAGCCAGACCATG--ACATAG--------A-C-GT--GTTATAAATAtatcac
gi|17 : -GAT---AT-AATGCAG---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACATTG--ATGCAGAtcacgt
gi|2 : cattgatgcaTATAT-ATACACACTGGGGTCCC-GAT---AT-AACGAGGCCCTCCCAC-AGGAA-CCA-----AAGAACCAGACCACA--ATATAATC-G-G-AA-C-ATCAGGTACAAATt
gi|3 : cagttttgattattatatgtatttttaacattataactcttggatATATATC-CAAATACTGCGGTCCC-GTT---AT-AACACTG---TCTC-C-AGGAA-CCA-----AACAGCCAGACCATC--ATATAGAT-G-GAAA-C-AT--GTTgcagcagcta
gi|4 : ccattttgattgctgagtaaaacacatatttcagccaagatgactttgATATAATGTATACACCGCGATCCC-GAT---AC-AGCGCAG---TCCC-T-GAGAG-CCA-----AAGAGCTGGATTGTGT-TTATAGAT-G-G-AATT-GC--GGTATAAATAt
gi|5 : tgttgtatatttcaatagtacttATATTTCATA--CACTGCAGCCCT-GATGAAAT-AA----G---ACCC-T-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGATTGAGATATATAGAC-A-G-AA-CAAC--GTTATAAGTttgc
gi|6 : atacactgcagccctggtgta-GAT---AT-AATGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATTGGATTTAA--ATATAGAC-ATT-AT-T-GC--GTTATAAACAgtcg
gi|7 : tattttgacattaatataatagttatccctatgtATATACACTGTGGTCCC-AAT---AT-AACGTGG---TCCA-A-GAGAG-ACA-----AAGAAATGGACCGCG--TTATAAAtcgcggtt
gi|8 : taaaatataggtgtaaacttcttactaatattagACATACACTGCGGTCCT-GAT---AT-AAGTCTG---TCCC-C-CAGAG-CCAATTTTAAGAGCCAGACATTG--ATATAGACAA-G-AA-G-GT--GTTatcacgc
gi|9 : ctttacatactgtTACACTGCTGTCCA-TAT---AT-AATGCGG---TTTC-C-AGGAG-CCA-----AAGAGTCTGACCATG--ATATAGAT-G-A-AA-CTGT--ATTGTAAACA
blockSeqs : C T GAA T C G CCC A C T ATTTT TGAGAT CA T A CATCA
blockSeqs : T . . . C T . . . . . TGTGT T . . CTGC
blockSeqs : C . . . A A . . . . . TACA C . . CTGC
blockSeqs : . . . . G A . . . . . TACA T . . TTGC
blockSeqs : . . . . C A . . . . . CATG T . . CAAC
blockSeqs : . . . . C T . . . . . AATG T . . CTGT
blockSeqs : . . . T A . . . . . CTCA C . . CGT
blockSeqs : . . . C G . . . . . CGCG T . . CAT
blockSeqs : . . . C T . . . . . CATG T . . TGC
blockSeqs : . . . C A . . . . . ATTG C . . GGT
blockSeqs : . . . T G . . . . . CACA C . . CC
blockSeqs : . . . C G . . . . . CATC T . .
blockSeqs : . . . G T . . . . . TTAA . . .
blockSeqs : . . . T G . . . . . CGCG
blockSeqs : . . . . . . . . . . ATTG
blockSeqs : . . . . . . . . . CATG
blockSeqCons :
originalCons : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
finalCons : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
Alignments
lowQualScore : 1 1111111
lowQualScore : 3 0 2 444 2 2 3 444 2 2 2 55555 888888 33 2 2 4444444
lowQualScore : . . . ... . . . ... . . . ..... ...... .. . . .......
lowQualScore : 7 5 5 111 4 6 5 111 4 4 4 99999 111111 88 9 9 9999999
consensus : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
Reference ( family-1134 ) : ATATATCATATACACTGCGGTCCC-GAT---AT-AACGCGG---TCCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAGCCGGACCGCG--ATATAGAC-G-G-AA-C-GC--GTTATAAATA
gi|1 : TACACTGATGTCTC-GAT---AT-AATGGGA---ACCC-C-TAAAG-CCA-----AAGAGCTGGACTCTG--ATATAGAT-G-G-AACC-AT--GTTATAAATA
gi|10 : aattttgcattgaaattgcatgttttttataccatagactgagccaaaattttggacgtttaacatttacagATGTGTCATATGCACTGCGGTCCCTGAT---ATTACCGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGACTACA--ATATAGAT-G-G-AA-C--C--ATTATTAATAtcgcag
gi|11 : ATAAAT-ATATGCACTGTGGTCAT-GAT---AT-AACACTG---TCCC-A-GGGAG-TCA-----GAGAGCCAGACTACA--ATACAGAC-G-G-
gi|12 : aataaaacaaatgaaaTGTGATCCC-AAT---GT-AAAGCAG---CCAC-C-GGGAGTCCA-----AACAGCTGGGCCATG--ATATAGGT-G-G-AA-C-
gi|13 : tttaatcgacaaactg-GAT---AT-A-----G---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACAATG--ATGCGGAT-G-A-AG-CTGC--GTTATAcatgtt
gi|14 : cattgatgcaACAGTGCTTTTCC-GAT---TT-AAGGCAG---TCCC-CCGGGAG-CGG-----AAAAGTCGAAACTCA--ATATAGAT-G-G-AA-CTGC--ATTATtaaacattatacagcta
gi|15 : tgcATAT-ATACACACTGTGGCCCC-AAT---GT-AACGCAG---TCCC-C-CTCCC-CTC-----GAGACCTGGACCGCG--ATATAAA
gi|16 : taT---AT-AACATTG---TCCC-T-GG-AG-CCA-----AAGAGCCAGACCATG--ACATAG--------A-C-GT--GTTATAAATAtatcac
gi|17 : -GAT---AT-AATGCAG---TCCC-C-AGGAG-TCA-----AAGAGCTGGACATTG--ATGCAGAtcacgt
gi|2 : cattgatgcaTATAT-ATACACACTGGGGTCCC-GAT---AT-AACGAGGCCCTCCCAC-AGGAA-CCA-----AAGAACCAGACCACA--ATATAATC-G-G-AA-C-ATCAGGTACAAATt
gi|3 : cagttttgattattatatgtatttttaacattataactcttggatATATATC-CAAATACTGCGGTCCC-GTT---AT-AACACTG---TCTC-C-AGGAA-CCA-----AACAGCCAGACCATC--ATATAGAT-G-GAAA-C-AT--GTTgcagcagcta
gi|4 : ccattttgattgctgagtaaaacacatatttcagccaagatgactttgATATAATGTATACACCGCGATCCC-GAT---AC-AGCGCAG---TCCC-T-GAGAG-CCA-----AAGAGCTGGATTGTGT-TTATAGAT-G-G-AATT-GC--GGTATAAATAt
gi|5 : tgttgtatatttcaatagtacttATATTTCATA--CACTGCAGCCCT-GATGAAAT-AA----G---ACCC-T-GGGAG-CCA-----AAGAATCAGATTGAGATATATAGAC-A-G-AA-CAAC--GTTATAAGTttgc
gi|6 : atacactgcagccctggtgta-GAT---AT-AATGTGG---TTCC-C-GGGAG-CCA-----AAGAATTGGATTTAA--ATATAGAC-ATT-AT-T-GC--GTTATAAACAgtcg
gi|7 : tattttgacattaatataatagttatccctatgtATATACACTGTGGTCCC-AAT---AT-AACGTGG---TCCA-A-GAGAG-ACA-----AAGAAATGGACCGCG--TTATAAAtcgcggtt
gi|8 : taaaatataggtgtaaacttcttactaatattagACATACACTGCGGTCCT-GAT---AT-AAGTCTG---TCCC-C-CAGAG-CCAATTTTAAGAGCCAGACATTG--ATATAGACAA-G-AA-G-GT--GTTatcacgc
gi|9 : ctttacatactgtTACACTGCTGTCCA-TAT---AT-AATGCGG---TTTC-C-AGGAG-CCA-----AAGAGTCTGACCATG--ATATAGAT-G-A-AA-CTGT--ATTGTAAACA