lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       1111111111111                                                                                                                  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   22                           1                                                                                                                                                                                                                                                                                         11                                     1          1               1    1                                  1                                                               1            22222222222                1                       3333333333333     11111                                                  1       1           1                                         111111                       11                                                                                                                1                                                                                                                                                                          1111             222                                      11111  66666666666     11111                                     1                            1                                        11                               4444444444444                        22               1          11                    1            2222222                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   99                  1        5           3                  4                  4       4                     4 8 0                  4        2                       3                               1   2         3        1                     5 0 2   7    3  1          6 4       22            4      9          66    3                  3     0 6     5    7777  8  4            5    7                     3            5    1         5                      3                55 8888  2  99    4   11111111111       1        7                       7777777777777     33333                                                  5       5           7         4   6 4               0         000000                       22     3                                  3                 4       3     666                                     1                   0                         3              6                                              66   777   7 1                                     2           0000       0     777                 66       4        66 11111  33333333333     11111  4  9999       1 8  0  777       4  2    6         2           3 5    7777  2 0    0                      88                   1           3333333333333     66                 11 6 2      6    5  3       44    7          3    0            2222222                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ..                  .        .           .                  .                  .       .                     . . .                  .        .                       .                               .   .         .        .                     . . .   .    .  .          . .       ..            .      .          ..    .                  .     . .     .    ....  .  .            .    .                     .            .    .         .                      .                .. ....  .  ..    .   ...........       .        .                       .............     .....                                                  .       .           .         .   . .               .         ......                       ..     .                                  .                 .       .     ...                                     .                   .                         .              .                                              ..   ...   . .                                     .           ....       .     ...                 ..       .        .. .....  ...........     .....  .  ....       . .  .  ...       .  .    .         .           . .    ....  . .    .                      ..                   .           .............     ..                 .. . .      .    .  .       ..    .          .    .            .......                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   00                  1        2           7                  5                  0       0                     0 2 9                  5        8                       6                               4   8         6        9                     6 5 5   3    6  6          1 1       88            7      6          99    3                  6     5 0     0    7777  9  2            0    3                     5            0    4         2                      0                55 5555  5  55    0   11111111111       0        0                       2222222222222     99999                                                  0       0           0         0   0 5               5         555555                       88     6                                  3                 1       6     444                                     7                   5                         6              8                                              11   888   3 0                                     0           6666       8     222                 11       4        11 11111  88888888888     11111  4  4444       3 2  9  888       0  0    0         5           6 0    7777  0 5    3                      11                   4           3333333333333     11                 22 2 8      0    0  1       11    8          6    9            2222222                    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAANCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAANTGGTACGAG-TTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAAAAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--A----AAAAA--CGTG-TTT---TCT-----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATT------------AAGTTTAAAAAGTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAACAAAGTTA-TAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTT-AAGGAATGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATGTTACAGAAAACA--AAA---AAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATGTA-TGTAGACG--T-----ATTACAGA-----TTACG-----CA-AA----TGTATTTAANTCGAT---CATACCA-TT-GACATGTGAGCTAANGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTA--CGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTT-GACGTTACACTT--A-TTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATGATGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTTAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGCCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAG-TTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGTCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACTAACACAGACGGAAGTGGTGTCCAAAAAAAAAAATTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTGTAATTGAAAA----CTTTATAAAACTATGAGATTTTTTGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTAGTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAAACTGTATGTACATTTT--A----AACAA--CGTG-TTT---TAT-----TGTTATTTATGAGTATATTCGTAAAATTGAAAAAGAAATT------------TAGTTTAAAAAGTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAAAGTGTATTTTTAATTACACTTCTAAGTTTC-TCACCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATGGTAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTTA-TAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTT-AAGGAATGTAAATACATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AAA---AAAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGAGAAATATTACTTTGTACGTT--ATATGTA-TGTAGACG--T-----AT-----A-----TTACG-----CA-AA----TGTATTTAAGTCGAT---CATACCA-TT-GACACGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TGTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-GTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTA--CGCACGTTATTTTTAAAGTTTAGTCAAAACTAACCTATGGTTGAGACTCGTGTTTTACGGCG-TTTT-GACGTTACACTT--C-TAGGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CGTCGCGTCAGAAGTTGAGACTTACGCCGATTTCAGGGTAATGCTGGG-AATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTACAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTTA-TTTTATT-TGTAATTGTAATATTTTTAAT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCA--GACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATTAGCAACTGGTATAAG-TTAATAAAAGATTTTAGGGTAAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGATATGGTGTCAAAAAAAAAAGATTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGCATAATATAAAA----CTATATAATACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCATTAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATCTTTAA----AAAAA--CGTG-TTT---TCT-----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAACTGAAAAAGAAATT---------------------AAGTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTCC-TCGTCGAATAAAATATTTTCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTTAATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTT-AAAGAATGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AAA---AAA-TCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTATTTTGTAGAGGATTTCGATACATTTTACTTTGTACGTT--ATATGTA-GGTAGACG--T-----ATCACAGA-----TCACG-----CA-AA----TGTATTTAAATCGAT---CATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTGCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TTGCTATAAAGTTATTATATAGTACAATAAAATATCAAATCAAGTGTTTA--TGCACGTTATTTTTAAAGTT-AATCAAAATTAGCGTATGGTTGAGGTTCGTTTTTTACGGCG-TTTT-GACGTTACACTT--A-TTAGCTTCAACTTCTGACGCGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gaCGTCGCGTCAGAAATTGAAACT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tccaataaaatgtttcctattaaacgtatatcaattttatttaaatcacataatagtgtttttataaagagcagcatgtggtaatattattgtaaatattcaacgcataacaaagttaaaacagtttatttatttatagtaaaaatgtcacaacgctaatttttaagtcgacctgacgtagcgtttatttgagaaaatacggtttcaaggaatgtatagcccttatcctagcagtatctattgtttttgttacagaaaacaaaataatcaaaacattcaatttgaatgtagacaaccatcttcaattttgaaagtaatagaggaactcgatattactttgtaaattgtatgtatatagacgtattacagattagcattatattttattttatatttatactatttgacatgtgagctagcgttaaccattattttttgttatggacatcagtgatatcggcttaatgtattgttataaacttattatattgtactataaaacatcaaatcaagtgttaaggcatgatatttttaaattgaatcgaatttaacgtagagctgaccttcgtattttacaacgtttttgacgttacacttcttCGTCGCGTCAGAAGTTGAAGCTt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gctaaagattaccgttatttattgcgaatgacttcaatagtatcggctcaatgtatttgttataaacttattatatagtacaataaaagtttacgcacgttatctttaaagttaatcaaaataaacgtatggttgaggttcgtattttacggcattttgaagttacacttattCGTCGCGTCAGAAGTTGAAGCT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acttattGTCGCGTCAGAAGTTGAAGCTtc
gi|14                         :                                                       cttacgccgatttcagggttatgcagggaataaaagacatattgttgaataatcatattatataaactcttttataccaaattaaagataatttcattttctttgtacttgtaatatttttactatgagacacgtacatcagggaaaacgttaccgcttttgcgtcaagagaaaaacacggtgaaagatgtaacagaaattatcaagtggtacgagttaataaaagattttagagtgaaaactcagccaaatcgttttaaaaacacgtatggcgttgagacttactcagacggaaatgatgtaaaagaaaaggatgcggcaacaaaagaaaagatataaaaaatataatttaaaactatagaaaactatgagagttttggggaaaaaggaatgaagaaaaccatgactaagtattaaattcattttactaatttatttttcaataaaacaagactatatgtacattttaaaaaatgtgctttcttgttatttgtgagtatttttgtaatattgaaaagaaattaagtttaaaaagttttaatggaaaagcaatttcacaaatagtaaaatacgtgtattgttaattacactactaagtttctcttcctataaaatgtttcctattaaacatatatcaattctattttcatcacataatagtgtttttataaaaaacaacatgtggtaatattattgcaaatctccaacgtataacaaagttataccagtttattgatttctagttaaaatgtcacaacgctatttttcgacctgacgtagcgtgtatttgagataatacggttttaacgaatgtaaatatatagcccttatcctagcataatatattctttatgttattgaaaaaaaatcaaaacattcaatttgaatgtagacgaccatctatcaattttgaaagtactagaggaactcgatgttactttgtaaattgtttgaaatatagacgtattacagattacgcaaatgtatttgattcattcatcccatttgacatgtgagctaatgcgtactgttatttattgttatagacttcagtgatatcggctcaatgtattgttataaacttatcatattgtacaataaaacatcaaatctggtgtaaacgcacgttatttttaaatttaatcaaaattaacgtagagttgacattcgtattttacaatgtttttgacgttatacttattGTCGCGTCAGAAGTTGAAGCTTAt
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtaaaaatgtacaacacttatttttaaatcgacctgacgtagcgtgtatttgagaaaatacggtttcaaggcatataaatatatagccctaatcccagcatcatctattcattatgttacagaaaacaacaaaaaaatcaaaacattcaatttgaatgtagacgactacactttacagattaccattataatttattcaatcataccatttgacatgtgagctaacgtgtaccgttattttttttttgtaattgacatcagtgatatcggcttattgtattgttataaacttatcatattgtacaataaaacatcaaatcaagtgttaacgcatgttatttttaaattcaatcaaaattaacgtagagctgaccttcgttttttacgaagtttttgacgttacacttaTCGCGTCAGAAGTTGAAGCT
gi|3                          : gacgtcgcgtcagaagttgagacttacgccgatttcagggtaatgctgggaataaaagactgttcatattgttgaataatcatattgtacaaattattttataccaaattaaagataattttattttatttgtaattgtaatatttttaattgatcatcgtgtaacacgtacgtcagggaaatcgttaacgcttttgcagacagaaaaacacggtgagagatgaaacagaaattagcaactggtataagttaataaaagattttagggtaaaaacggagcctaatcgttttgaaaacacgtatggcgttgagactaacacagacggatatggtgtcaaaaaaaaaagattgcggcaacaaaataaaagatagaaaagcataatataaaactatataatactatgagagttttgggaaaaagggaatgaagaaaaacatggctaagtattaaagtcatttcattaatttatctttcaacaaaacaagactgtatgtacatctttaaaaaaacgtgttttctagttatttatgagtattttcgtaaaactgaaaaagaaattaagttttaatggaaatacgatttctagtaaaaatgtcacaaatggtaaaaaacgtgtattgttaattacactactaagttcctcgtcgaataaaatattttcttttaaacgtatatcaattttattttaatcacataatagtgtttttataaagaacaacatgtggtaattttattgcaaatctccaacgcataaaaaagttaataacagtttattgatttctagtaaaaatgtcacaacgctaatatttaaatcgacctgacgtaacatgtatttgagaaaatacggttttaaagaatgtaaatatataaccctcaccctagcaccatctattctttatattacagaaaacaaaaaaatcaaaacattcaatttgaatgtagacgactatctatcaattttgaaagtattttgtagaggatttcgatacattttactttgtacgttatatgtaggtagacgtatcacagatcacgcaaatgtatttaaatcgatcataccattgacatgtgagctaaagtttaccgttattttttgcgaatgactgcaatagtatcggctcaatgtattgctataaagttattatatagtacaataaaatatcaaatcaagtgtttatgcacgttatttttaaagttaatcaaaattagcgtatggttgaggttcgttttttacggcgttttgacgttacacttattCGCGCCAGAAGTTGAAGCTTA
gi|13                         :                         ttgaggcttacgccgatttcagggtaataaggggaataaaagactgttcatattgttgaataatcatattgtataaattattctatactaaattaaagataatttcattttctttgtaattttaatatttttatttgattatcgtgttacacgtacgccaaggaaatcgttaacgcttttgcgtcaacagaaaaacacgatgagagatgtaatagaaattagcaactggtacgagttaataaacgattttagggtgaaaacggagcctagtcgttttgagaacacgtatgacattgagacaaacacagacggaagttgtgtccaaaaaaaaattgcagcaacaaaagaaaagataaaaaagtataatttaaaactatataaaactatgagagttttgggaaaaagggaataaagaaaaacatggctaagtattaaagtcatttcacaaatttatttttcaacaaaacataactgtatgtacattttaaaaaaacgtgttttcttgttatttatgagtattttcgtaaaattgaaaaagaaattaagtttaaaaagttttaatggaaatacgatttctagtaaaaatgtcacaaatggtaaaaaacgtgtattgttaattacactactaagtttctcatcaaataaaatgtttccttttaaacgtatatcaattttattttaatcacataatagtgtttttataaagaacaacatgtggtaatattattgtaaatctccaacgcataaaaaagttataacagtttattgatttaaagtaaaaatgtcacaacgctaatatttaaatcgacctgacgtaacatgtatttgagaaaatacgcttttaaggaatgtaaatatataacccctatcctagcgccatctattctttatataacagaaaacaaaaacaattaaaacattcaattgaatgtaggcgactatctatcaactttgaaactactttttagaggatctcgataaatattactttgtacgctataggtatgtagacgtattacagattacgtaaatgtatttaaatcgatcataccattgacatatgagctaaagtttaccgttattttttgcgaatgacttcaatagtatcggctcaatgtaattatataaacttattatatagtacaataaaattttacgcacgttatttttaaagttagtcaaaattaaagtatggttgaggttcgtattttacggcgttttgacgttacacttaCGCGTCAGATGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTGTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTTTTCTGTAATTGTAACATTTTTATT-TGATCATCGCGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAT-TTAATAAAAGATTTTAGTGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAAGAAAGACGGAAATGGTGTCC--AAATAGAAATTGCAGCAACAAAAGATCAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAATATGGCTAAGTTTTACAGTCGTTTCACA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCAAGTTTAAGGTAA-AACGAGGAATAAAAGACCGTTAATATTGTTGAATAATCATATAATATAA-CTATTTTATACCAAACTAAAGATAATTTAA-TTTTCTT-TGCAATTGCATT-TTTTTATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAGTTATCAAGTGGTACAAG-TTGATAAGCGA-TTTAAGGTGAAAACGGAACCAACTCGTTTTT-AAAAACACGTATGTCGTTGAGACTTGCACAGACGTAATTGATGT-CAAAACAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATCATTTAAAC----CTGTAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGGAGAAAGTCATGGTTAAGTATAAAATTCATTTCGCTGATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGCAAATTTT--A----------------TTT-----------------------GTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATT------------AAATTT-----TTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAGAACGTGAATTGTTAATTACACTACCAAGTT-----ATCCAATAAAATGTTTCCTATTTAACGTA------TATCAATGTTATTTTAATCACATCATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACCTGTTGTAATATTATTGCAAATCTCCAATGCATAACAAAGTTA-TAATAACTGTTTATTGATTGCTAGTAAAAATGTCACAACACTAATTTTTAAA-CGACCTGACGTAGCGTTTATTTGACAAAATACGGTTTT-AAGGAATGTAAATATATAGCCCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaCGTCAGAAATTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CGGGGAATAAAAGATTGTAAATATTGTTGAATAATCATATAATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTGCATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAACTCACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAAG-TTAATAAGCGATTTTAAGGTGCAAACGGAGACAAATCGTTTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACATGCACAGACGGAATTGATGT-CAAAACAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAAACGGCTATAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATGGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTGTTCAACTAAATAAGACTGTATGTACATTTA--AAAACAACAA--CGTG-TTTACATGT-----TGATA---ATGAGTCTTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAGGTTTTTTTGTTGTTT------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTACAAATGATGCAAATGATGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACAT---GTAATATTATTGCAAATCTCAACCGCATAACAAAGTTA-TAACA---GTTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acgcgaGTCAGAAGTTGAGGCTTACACTGATTTCAGAGTAAT-ACGAGGAATAAAACACTGTAAATATTGTTAAATAATCATAA-ATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-T-ACCATTGTGTAACACGTACATCATGGAAAACATTAACGATTTTGTGTCAACAG-AAAAACATGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAAT-TTAATAAACGATTTTATGGTGTAAACGGAGCCAAATCG-TTTTTAAAAACACGTATGACGTTGAGACTTGCACAGACAGAAAGGAT-TTCAAAAAAGAAGGTTGCGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CT--A-AAAATTTTGAGAGCTTTGGAAAAAAAGGAATGAACAAAGCCATGGCTTAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAATATAAGACCGTGTGTACATTTT--A----AAAAA---ATGAGTT---TACA----TGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATT------------AAGTTTAATTTTTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATAGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTTATCATACAATAAAATGTATCCTTTTAAACATACATGGATATCAATTTTATTTTA-TCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATCATTGCAAATCTCCAACGCATAACAAAGTTA-TAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAATTGACCCAACGTAGCATGTATTTGAGAAAATACGGTTTC-AAGGAATGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATCATCTATTCTTTATGTTACAG----------------AATCAAAACATTCAATTTAAATGTAGAC-ACCATCTATCAATTTTGAAAGAAC----TAGAGGAACTCG----ATATTACTTTGTAAATT--GTATGTA-TGTAGAC---------AT-----A-----TTACA-----GATAACCATTATATTTTATTCAAT---CATACCATTT-GGCTTGTGAGCTAATGTGTACCGTTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TTGTTATAAACTTATTATATTGTACAAct
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gacgcgatCAGAAGTTAAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CAGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTG-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATAAGCAACTGGTACGAG-TTAATAAAATGTTTTAGCGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGTCATTGAGACTAACACAGACGGAGGTAGTGTCCAAAATAAAAAAT-GCGACAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTG-GGGAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAATATGTATGTACATTTT--A----AAAAA--CGTG-TTT---TCT-----TGTCATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTTAAAAAGAAATT------------AAGTTTAAAAAGTTTTGATGGAAATACGATTTTTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGAATTGTTAATTACACTACTTAGTTTA-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAAAATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTTA-TAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAACTGTCACAACGCTACTATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAAGAAATGTAAATATATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTGATATTACAGAAAACA--AAA---ATAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGGT--ATATGTA-TGTAGACG--T-----ATTACAGA-----TTACG-----CA-AA----TGTATTTAAATCGAT---CATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAATTTTACCGTTA-TTTTTT----GCAAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTAA--CGCACGTTATTTTTAAAG-TTAGTGAAAATAAACGTA-------------TATTTTATTGCA-TTTT-GACGTTACACTT--A-TTGGCTTCAACTTCT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGTAGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATATAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAAGTTTA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTGTT-TGATCATCTTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTAAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTAAGAGATGTAACAGAAAATAGCAACTGGTACGAG-TTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAACCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACGCAGACGGAAATAGTGTCCAAAAATAAG--TTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGTATAATATAATA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGG-AATGAAGAAAAACATGGCTAATTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATTTATATTTA--A----AAAAAAACGTG-TTT---TCT-----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAGATT------------AAGTTTAAAAAGTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATATTGCCTTCTTAACGTA------TATCAATTTTATTTTATTCACATAATAGTG-ATTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATTAAAAAGTTA-TAACA---GTTTATTGATTTCTATAAAAAATGTCACAACGCCAATATTTAAATCGACCTGACGTTACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTT-AAGGAATGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AAA---AAG-TCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTGTAGAGGATCTCGATACATATTACTGTGTACGTT--ATATGTA-TGTAGACG--TTTTACAT-----A-----TTACG-----CA-AA----TGTATTTAAATCTAT---CATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGAGTGCAATAGTGTTGGCTCAATGTA-TTGCTTTAAACTTATTGTATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTA--CGCAGGTTATTTTTAAAGTT-AATCAAAATTAACGCATGGTTGAGGTTCGTATTTAACGGCG-TTTT-GACG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATAA-GGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTCTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTTTAATATTTTTATT-TGATTATCGTGTTACACGTACGCCAAGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGATGAGAGATGTAATAGAAATTAGCAACTGGTACGAG-TTAATAAACGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACAAACACAGACGGAAGTTGTGTCCAAAAAAAAA--TTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-AAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATAAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACATAACTGTATGTACATTTT--A----AAAAAA-CGTG-TTT---TCT-----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATT------------AAGTTTAAAAAGTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTTA-TAACA---GTTTATTGATTTAAAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGCTTTT-AAGGAATGTAAATATATAACCCCTATCCTAGCGCCATCTATTCTTTATATAACAGAAAACA--AAA---ACAATTAAAACATTCAA-TTGAATGTAGGCGACTATCTATCAACTTTGAAACTACTTTTTAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGCT--ATAGGTA-TGTAGACG--T-----ATTACAGA-----TTACG-----TA-AA----TGTATTTAAATCGAT---CATACCA-TT-GACATATGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-ATTATATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------TTTTA--CGCACGTTATTTTTAAAG-TTAGTCAAAATTAAAGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTT-GACGTTACACTT--A-TAAGCTTCAACTTCTGGCGCG
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CAGGGAATAAAAGAC-----ATATTGTTGAATAATCATATTATATAAACTCTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTACTTGTAATATTTTTACTATGA---------GACACGTACATCAGGGAAAACGTTACCGCTTTTGCGTCAAGAG-AAAAACACGGTGAAAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACGAG-TTAATAAAAGATTTTAGAGTGAAAACTCAGCCAAATCG-TTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACTTACTCAGACGGAAATGATGT--AAAAGAAAAGGATGCGGCAACAAAAGAAAAGATATAAAAAATATAATTTAAAA----CTATAGAAAACTATGAGAGTTTTGGGGAAAAAGGAATGAAGAAAACCATGACTAAGTATTAAATTCATTTTACTAATTTATTTTTCAATAAAACAAGACTATATGTACATTTT--A----AAAAA--TGTG-CTT---TCT-----TGTTATTTGTGAGTATTTTTGTAATATTGAAAA-GAAATT------------AAGTTTAAAAAGTTTTAATGGAAAAGCAATTTC-------------ACAAATAGTAAAATACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCTTCCTATAAAATGTTTCCTATTAAACATA------TATCAATTCTATTTTCATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAAAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGTATAACAAAGTTA-TACCA---GTTTATTGATTTCTAGTTAAAATGTCACAACGCTA-T-TTT---TCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGATAATACGGTTTT-AACGAATGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATAATATATTCTTTATGTTATTGAAAA----------AAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACCATCTATCAATTTTGAAAGTACT----AGAGGAACTCGA----TGTTACTTTGTAAATT--GTTTGAAATATAGACG--T-----ATTACAGA-----TTACG-----CA-AA----TGTATTTGATTCATT---CATCCCA-TTTGACATGTGAGCTAATGCGTACTGTTA-TTTATT----GTTATAGACTTCAGTGATATCGGCTCAATGTA-TTGTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCTG--GTGTAAACGCACGTTATTTTTAAA-TTTAATCAAAATTAACGTAGAGTTGACATTCGTATTTTACAATG-TTTTTGACGTTATACTT--A-TTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATATTGCTGAATAATCATATAGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCATTTTTCTT-TGTAACTGTGATATTTTTATT-T-ACCGTCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTAGCGTCAACAGAAAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAACG----GAGCCCAAT---CGTTTTTA-----AAAAC-AAGTAT-GACG---CT-GAG-ACATGCAC-------AGAC----------GAAAATGATGT-CAAAAAAGAAGGTTTGGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CTATAGAAAAATATGAAAGCTTCGGAAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATAGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGTACATTTT--A----AAAAA--CGTG--TT---TATTAAAATGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATT------------AAGTTT--ATTTTTTTGATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTATGGAACATA------TATCACTTTT------ATCACATAAAAGTGTTTTTTATTAAGAACAACTTGTGGTAATATTATTGCAAATCACCAACGCATAACAAAGTTA-TAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACCTTTATTTTCAAATCGACCTGACGTAGCATGTTTTCGAGAAAATACGGTTTC-AAGGAATGTAAATATATAt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actataaGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGAGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAATTGGTACGAT-TTAATAAAATATTTTAGGGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAAACGAAAATGGTTTCCAAAAAATGA--TTGTGGCAACAAAAGAACAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAG----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGATAAGCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACACATTTATTTTTCAACGAAACAAGACTGTATGTACATTTT--A----AAAAG--CGTG-TTT---TCT-----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAATTT------------AAGTTTAAACAGTTTTAATGGAAATATGATTTCTAGTAAAAATGTCGCAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTTCACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCGTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAACATGTGGTAATATAATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTAA-TAACA---GTTTAGTGATTTCTAGTATAAATGTCACAACGCTAAT------------CTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATATGGTTTT-AAGGAATGTAAATATATAACCCTCACTCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AAAAACAAAAATAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATGTA-TGTAGACG--T-----AT-----AACAGCTTGCG-----CA-AA----TGTATTTAAGTCGAT---CATACCA-TT-GACATCTGAGCTAAAGTTTACAGTTA-TTTTTT----GCGAATGACGTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTA--CGCACGTTATTTTTAAAA-TTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTT-GACGTTACACTT--A-TTAGCTTCAACTTCTGAg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTTATAGTAAAAATGTCACAAa
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tccaataaaatgtttcctattaaacgtatatcaattttatttaaatcacataatagtgtttttataaagagcagcatgtggtaatattattgtaaatattcaacgcataacaaagttaaaacagtttatttAATAAAATGTTTCCTATTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAGCATGTGGTAATATTATTGTAAATATTCAACGCATAACAAAGTTA-AAACA---GTTTATTTATTTATAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAGTCGACCTGACGTAGCGTTTATTTGAGAAAATACGGTTTC-AAGGAATGTA------TAGCCCTTATCCTAGCAGTATCTATTGTTTTTGTTACAGAAAACA--AAA---TAA-TCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACAACCATCT-TCAATTTTGAAAGTA----ATAGAGGAACTCGA----TATTACTTTGTAAATT--GTATGTA-TATAGACG--T-----ATTACAGA-----TTA-G-----CA-T-----TATATTTTATTTTATATTTATACTA-TTTGACATGTGAGCTAGCGTTAACCATTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TTGTTATAAACTTATTATATTGTACTATAAAACATCAAATCAAGTGTTAA--GGCATGATATTTTTAAA-TTGAATCGAATTTAACGTAGAGCTGACCTTCGTATTTTACAACG-TTTTTGACGTTACACTT--C-TTAGTTTCAATTTCTGACGCGACcgctaatttttaagtcgacctgacgtagcgtttatttgagaaaatacggtttcaaggaatgtatagcccttatcctagcagtatctattgtttttgttacagaaaacaaaataatcaaaacattcaatttgaatgtagacaaccatcttcaattttgaaagtaatagaggaactcgatattactttgtaaattgtatgtatatagacgtattacagattagcattatattttattttatatttatactatttgacatgtgagctagcgttaaccattattttttgttatggacatcagtgatatcggcttaatgtattgttataaacttattatattgtactataaaacatcaaatcaagtgttaaggcatgatatttttaaattgaatcgaatttaacgtagagctgaccttcgtattttacaacgtttttgacgttacacttcttagtttcaatttctgacgcgacgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tccGTAAAAATGT-ACAACACTTATTTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTC-AAGGCATATAAATATATAGCCCTAATCCCAGCATCATCTATTCATTATGTTACAGAAAACAACAAA---AAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTAgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACATTCAATTTGAA-TGTAGACGACT-----AC-----ACT---TTACAGATTACC-AT----TATAATTTATTCAAT---CATACCA-TTTGACATGTGAGCTAACGTGTACCGTTA-TTTTTTTTTTGTAATTGACATCAGTGATATCGGCTTATTGTA-TTGTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTAA--CGCATGTTATTTTTAAA-TTCAATCAAAATTAACGTAGAGCTGACCTTCGTTTTTTACGAAG-TTTTTGACGTTACACTT--A-TAAGCTTCAACTTCTGACGCGACcactttacagattaccattataatttattcaatcataccatttgacatgtgagctaacgtgtaccgttattttttttttgtaattgacatcagtgatatcggcttattgtattgttataaacttatcatattgtacaataaaacatcaaatcaagtgttaacgcatgttatttttaaattcaatcaaaattaacgtagagctgaccttcgttttttacgaagtttttgacgttacacttataagcttcaacttctgacgcgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtaaaaatgtacaacacttatttttaaatcgacctgacgtagcgtgtatttgagaaaatacggtttcaaggcatataaatatatagccctaatcccagcatcatctattcattatgttacagaaaacaacaaaaaaatcaaaACCA-TT-GACATGTGAGCTAATGTGTACCGTTATTTTTTT----GCTAACGACTCCAATAATATCGGC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCTAAAGATTACCGTTA-TTTATT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTATTTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTA--CGCACGTTATCTTTAAAG-TTAATCAAAATAAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCA-TTTT-GAAGTTACACTT--A-TTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATCAAAATTAACATATGGTTGAGGTTTGTATTTTACGACGTTTTT-GACGTTTCACg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtacaataaaacatcaaataaagtgtgtacggaCG-TTTT--ACCTTAAACTTGGCGTAAGCCTCAACTTCTGACG
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaACTT--A-TTAGCTTCAACTTCTGACGCGACaggaataaaagaccgttaatattgttgaataatcatataatataactattttataccaaactaaagataatttaattttctttgcaattgcatttttttatttaccatcgtgtaacacgtacatcagggaaaacgttaacgattttgcgtcaacagaaaaacacggtgagagatgtaacagaagttatcaagtggtacaagttgataagcgatttaaggtgaaaacggaaccaactcgtttttaaaaacacgtatgtcgttgagacttgcacagacgtaattgatgtcaaaacagaaggttgcggcaacaaaagaaaagacagaaaattatcatttaaacctgtagaaaattatgagagttttgggaaaaaaggaatggagaaagtcatggttaagtataaaattcatttcgctgatttatttttcaacaaaataagactgtatgcaaattttatttgtattttcgtaaaattgaaaaagaaattaaattttttttaatggaaatacgatttctagtaaaaatgtcacaaatggtgaagaacgtgaattgttaattacactaccaagttatccaataaaatgtttcctatttaacgtatatcaatgttattttaatcacatcatagtgtttttataaagaacaacctgttgtaatattattgcaaatctccaatgcataacaaagttataataactgtttattgattgctagtaaaaatgtcacaacactaatttttaaacgacctgacgtagcgtttatttgacaaaatacggttttaaggaatgtaaatatatagccct
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TAAGTCTCAACTTCTGACGCGACgtc





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                                                                                                                                                               1111                                                                    111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111                                                                              1111                                                                                    1                                                                                                          11111111111                        11                                           1                                        
lowQualScore                  :                                            4                                        2                                     3       3                     3 6 0                           1                       3                               0   1                                         0     3    0                        1                    2    3     55                       3                  7777     1                                       1                 0         1                                       55    2222  7       2  7777       0                                   99999   555555555555                                                                  1            3     1                         999999                              3                                                    2      3      555                                     4                                                   3                                                 0    333  8888  1                                                     8888            2222                 55     4          55  8888             0 1       0 1    777        0  3              1           3      7777  1                             3  3                  0           00000000000     0                  88 5                2                        4                                        
lowQualScore                  :                                            .                                        .                                     .       .                     . . .                           .                       .                               .   .                                         .     .    .                        .                    .    .     ..                       .                  ....     .                                       .                 .         .                                       ..    ....  .       .  ....       .                                   .....   ............                                                                  .            .     .                         ......                              .                                                    .      .      ...                                     .                                                   .                                                 .    ...  ....  .                                                     ....            ....                 ..     .          ..  ....             . .       . .    ...        .  .              .           .      ....  .                             .  .                  .           ...........     .                  .. .                .                        .                                        
lowQualScore                  :                                            0                                        5                                     6       6                     6 7 1                           0                       3                               4   0                                         9     3    0                        8                    5    3     44                       3                  1111     0                                       0                 4         0                                       00    7777  3       5  7777       3                                   11111   888888888888                                                                  6            6     0                         666666                              3                                                    5      3      888                                     2                                                   3                                                 8    666  5555  0                                                     0000            3333                 55     0          55  5555             8 1       3 0    000        9  6              0           3      1111  0                             6  6                  5           88888888888     5                  44 6                0                        5                                        
consensus                     : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAANAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
Reference ( family-113 )      : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAANCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAANTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATGTTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAANGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|1                          : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGACTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CTGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTACAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTTA-TTTTATT-TGTAATTGTAATATTTTTAAT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCA--GACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATTAGCAACTGGTATAAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTAAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGATATGGTGTCAAAAA-AAAAAGATTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGCATAATATAAAA----CTATATAATACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCATTAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATCTTTAAAAA----AA-CGTGTTTTCT----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAACTGAAAAAGAAATT--------------AAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTCC-TCGTCGAATAAAATATTTTCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTTAATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAAGAA-TGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAAC---AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTATTTTGTAGAGGATTTCGATACATTTTACTTTGTACGTT--ATATG-TAGGTAGACG--TA----TCACAGATCACGCAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTGCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GCTATAAAGTTATTATATAGTACAATAAAATATCAAATCAAGTGTTTATGCACGTTATTTTTAAAG-TTAATCAAAATTAGCGTATGGTTGAGGTTCGTTTTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGA
gi|10                         :    gaCGTCAGAAATTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CGGGGAATAAAAGATTGTAAATATTGTTGAATAATCATATAATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTGCATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAACTCACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAAGTTAATAAGCGATTTTAAGGTGCAAACGGAGACAAATCGTTTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACATGCACAGACGGAATTGATGT-CAAAA-CAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAAACGGCTATAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATGGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTGTTCAACTAAATAAGACTGTATGTACATTTA--AAAACAACAA-CGTGTTTACA----TGTTGATAATGAGTCTTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAGGTTTTTTT-----GTTGTTTTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTACAAATGATGCAAATGATGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACAT---GTAATATTATTGCAAATCTCAACCGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTT
gi|11                         :                                                           acgcgaATATTGCTGAATAATCATATAGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCATTTTTCTT-TGTAACTGTGATATTTTTATT-T-ACCGTCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTAGCGTCAACAGAAAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAACGGct
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              actataaAAACGGAGCCCAATCG-TTTTTAAAAACAAGTATGACGCTGAGACATGCACAGACGAAAATGATGTC-AAAA-AAGAAGGTTTGGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CTATAGAAAAATATGAAAGCTTCGGAAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATAGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTATTAAAATGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTT--ATTT------TTTTGATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTATGGAACATA------TATCACTTTT------ATCACATAAAAGTGTTTTTTATTAAGAACAACTTGTGGTAATATTATTGCAAATCACCAACGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACCTTTATTTTCAAATCGACCTGACGTAGCATGTTTTCGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TGTAAATATATAGagcccaatcgtttttaaaaacaagtatgacgctgagacatgcacagacgaaaatgatgtcaaaaaagaaggtttgggcaataaaagaaaagacagaaaattataatttaaaactatagaaaaatatgaaagcttcggaaaaaaaggaatgaagaaagccatagctaagtattaaattcatttcactaatttatttttcaacaaaataagactgtatgtacattttaaaaaacgtgtttattaaaatgttattaatgagtattttcgtaaaattgaaaaagaaattaagtttatttttttgatggaaatacgatttctagtaaaaatgtcacaaatggtgaaaaacgtgtattgttaattacgctactaagtttctcatccaataaaatgtttcctatggaacatatatcacttttatcacataaaagtgttttttattaagaacaacttgtggtaatattattgcaaatcaccaacgcataacaaagttataacagtttatttatttctagtaaaaatgtcacaacctttattttcaaatcgacctgacgtagcatgttttcgagaaaatacggtttcaaggaatgtaaatatatag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actataaatattgctgaataatcatatagtataaactattttataccaaattaaagataatttcatttttctttgtaactgtgatatttttatttaccgtcgtgtaacacgtacatcagggaaaacgttaacgatttagcgtcaacagaaaaaacacggtgagagatgtaacagaaattatcTCCAATAAAATGTTTCCTATTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAGCATGTGGTAATATTATTGTAAATATTCAACGCATAACAAAGTT-AAAACA---GTTTATTTATTTATAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAGTCGACCTGACGTAGCGTTTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TG------TATAGCCCTTATCCTAGCAGTATCTATTGTTTTTGTTACAGAAAAC---AA----AATAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACAACCATCT-TCAATTTTGAAAGTA----ATAGAGGAACTCG----ATATTACTTTGTAAATT--GTATG-TATATAGACG--TA----TTACAGATTA-GC-ATTATATTTTATTTTATATTTATACTATTT-GACATGTGAGCTAGCGTTAACCATTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATTGTACTATAAAACATCAAATCAAGTGTTAAGGCATGATATTTTTAAA-TTGAATCGAATTTAACGTAGAGCTGACCTTCGTATTTTACAACGTTTTTGACGTTACACTTCTTAGTTTCAATTTCTGACGCGAC
gi|13                         :    CGCGTCAGATGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTGTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTTTTCTGTAATTGTAACATTTTTATT-TGATCATCGCGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGATTTAATAAAAGATTTTAGTGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAAGAAAGACGGAAATGGTGTCCAAAT-AGAAA--TTGCAGCAACAAAAGATCAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAATATGGCTAAGTTTTACAGTCGTTTCACgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTAAAAATGT-ACAACACTTATTTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGCA-TATAAATATATAGCCCTAATCCCAGCATCATCTATTCATTATGTTACAGAAAACAACAA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTAa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATTCAATTTG-AATGTAGACGACTACACTTTACAGATTAC-CAT-TATAATTTATTCAA---TCATACCA-TTTGACATGTGAGCTAACGTGTACCGTTA-TTTTTTTTTTGTAATTGACATCAGTGATATCGGCTTATTGTA-TT-GTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTAACGCATGTTATTTTTAAA-TTCAATCAAAATTAACGTAGAGCTGACCTTCGTTTTTTACGAAGTTTTTGACGTTACACTTATAAGCTTCAACTTCTGACGCGACcactttacagattaccattataatttattcaatcataccatttgacatgtgagctaacgtgtaccgttattttttttttgtaattgacatcagtgatatcggcttattgtattgttataaacttatcatattgtacaataaaacatcaaatcaagtgttaacgcatgttatttttaaattcaatcaaaattaacgtagagctgaccttcgttttttacgaagtttttgacgttacacttataagcttcaacttctgacgcgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtaaaaatgtacaacacttatttttaaatcgacctgacgtagcgtgtatttgagaaaatacggtttcaaggcatataaatatatagccctaatcccagcatcatctattcattatgttacagaaaacaacaaaaaaatcaaaGCTAAAGATTACCGTTA-TTTATT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TTTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTACGCACGTTATCTTTAAAGTT-AATCAAAATAAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCA-TTTTGAAGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTACAATAAAACATCAAATAAAGTGTGTACGGA-----------------AATCAAAATTAACATATGGTTGAGGTTTGTATTTTACGACGTTTTTGACGTTTCACg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCA-TT-GACATGTGAGCTAATGTGTACCGTTATTTTTTT----GCTAACGACTCCAATAATATCGGC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|2                          : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATGATGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTTAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGCCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGTCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACTAACACAGACGGAAGTGGTGTCCAAAA-AAAAAAATTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTGTAATTGAAAA----CTTTATAAAACTATGAGATTTTTTGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTAGTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAAACTGTATGTACATTTT--AAAC----AA-CGTGTTTTAT----TGTTATTTATGAGTATATTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTTAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAAAGTGTATTTTTAATTACACTTCTAAGTTTC-TCACCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATGGTAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATACATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGAGAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----T-----ATTACGCAAATGTATTTAAGTCGA---TCATACCA-TT-GACACGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TGTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-GT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAGTCAAAACTAACCTATGGTTGAGACTCGTGTTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTCTAGGCTTCAACTTCTGACGCGACgtc
gi|3                          :               TTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATA-AGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTCTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTTTAATATTTTTATT-TGATTATCGTGTTACACGTACGCCAAGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGATGAGAGATGTAATAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAACGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACAAACACAGACGGAAGTTGTGTCCAAAA-AAAAA--TTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-AAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATAAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACATAACTGTATGTACATTTT--AAAA----AAACGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTAAAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGCTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCCTATCCTAGCGCCATCTATTCTTTATATAACAGAAAACA--AA----AACAATTAAAACATTCAATT-GAATGTAGGCGACTATCTATCAACTTTGAAACTACTTTTTAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGCT--ATAGG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGTAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATATGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTAATT-AT-ATAAACTTATTATATAGTACAATAAAAT-------------TTTACGCACGTTATTTTTAAAGTT-AGTCAAAATTAAAGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATAAGCTTCAACTTCTGGCGCG
gi|4                          :         CAGAAGTTAAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CAGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTG-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATAAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAATGTTTTAGCGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGTCATTGAGACTAACACAGACGGAGGTAGTGTCCAAAATAAAAAA--TGCGACAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTT-GGGGAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAATATGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTCATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTTAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTGATGGAAATACGATTTTTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGAATTGTTAATTACACTACTTAGTTTA-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAAAATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAACTGTCACAACGCTACTATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAAGAAATGTAAATATATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTGATATTACAGAAAACA--AA----AATAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGGT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAATTTTACCGTTA-TTTTTT----GCAAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTAACGCACGTTATTTTTAAAG-TTAGTGAAAATAAACGTA-------------TATTTTATTGCA-TTTTGACGTTACACTTATTGGCTTCAACTTCT
gi|5                          :            AAGTAGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATATAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAAGTTTA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTGTT-TGATCATCTTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTAAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTAAGAGATGTAACAGAAAATAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAACCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACGCAGACGGAAATAGTGTCCAAAA-ATAA--GTTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGTATAATATAATA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGG-AATGAAGAAAAACATGGCTAATTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATTTATATTTA--AAAAAA--AA-CGTGTTTTCT----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAGATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATATTGCCTTCTTAACGTA------TATCAATTTTATTTTATTCACATAATAGTG-ATTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATTAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTATAAAAAATGTCACAACGCCAATATTTAAATCGACCTGACGTTACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAAC---AA----AAAAGTCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTGTAGAGGATCTCGATACATATTACTGTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TT----TTACATATTACGCAAATGTATTTAAATCTA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGAGTGCAATAGTGTTGGCTCAATGTA-TT-GCTTTAAACTTATTGTATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCAGGTTATTTTTAAAG-TTAATCAAAATTAACGCATGGTTGAGGTTCGTATTTAACGGCG-TTTTGACG
gi|6                          :                     CTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CAGGGAATAAAAGAC-----ATATTGTTGAATAATCATATTATATAAACTCTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTACTTGTAATATTTTTACTATGA---------GACACGTACATCAGGGAAAACGTTACCGCTTTTGCGTCAAGAG-AAAAACACGGTGAAAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGAGTGAAAACTCAGCCAAATCG-TTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACTTACTCAGACGGAAATGATGT--AAAA-GAAAAGGATGCGGCAACAAAAGAAAAGATATAAAAAATATAATTTAAAA----CTATAGAAAACTATGAGAGTTTTGGGGAAAAAGGAATGAAGAAAACCATGACTAAGTATTAAATTCATTTTACTAATTTATTTTTCAATAAAACAAGACTATATGTACATTTT--AAAA----AA-TGTGCTTTCT----TGTTATTTGTGAGTATTTTTGTAATATTGAAAA-GAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAAAGCAATTTC-------------ACAAATAGTAAAATACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCTTCCTATAAAATGTTTCCTATTAAACATA------TATCAATTCTATTTTCATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAAAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGTATAACAAAGTT-ATACCA---GTTTATTGATTTCTAGTTAAAATGTCACAACGCT-ATTTT----TCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGATAATACGGTTTTAACGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATAATATATTCTTTATGTTATTG-----A--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACCATCTATCAATTTTGAAAGTAC----TAGAGGAACTCG----ATGTTACTTTGTAAATT--GTTTGAAATATAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTGATTCAT---TCATCCCATTT-GACATGTGAGCTAATGCGTACTGTTA-TTTATT----GTTATAGACTTCAGTGATATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCTGGTGTAAACGCACGTTATTTTTAAA-TTTAATCAAAATTAACGTAGAGTTGACATTCGTATTTTACAATGTTTTTGACGTTATACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|7                          :       GTCAGAAGTTGAGGCTTACACTGATTTCAGAGTAATA-CGAGGAATAAAACACTGTAAATATTGTTAAATAATCATAA-ATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-T-ACCATTGTGTAACACGTACATCATGGAAAACATTAACGATTTTGTGTCAACAG-AAAAACATGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAATTTAATAAACGATTTTATGGTGTAAACGGAGCCAAATCG-TTTTTAAAAACACGTATGACGTTGAGACTTGCACAGACAGAAAGGAT-TTCAAAA-AAGAAGGTTGCGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CTA---AAAATTTTGAGAGCTTTGGAAAAAAAGGAATGAACAAAGCCATGGCTTAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAATATAAGACCGTGTGTACATTTT--AAAA----AAATGAGTTTACA----TGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAATTTT------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATAGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTTATCATACAATAAAATGTATCCTTTTAAACATACATGGATATCAATTTTATTTTA-TCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATCATTGCAAATCTCCAACGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAATTGACCCAACGTAGCATGTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATCATCTATTCTTTATGTTACAG-----------------AATCAAAACATTCAATTTAAATGTAGAC-ACCATCTATCAATTTTGAAAGAAC----TAGAGGAACTCG----ATATTACTTTGTAAATT--GTATG-TATGTAGACA--TA----TTACAGATAAC-C-ATTATATTTTATTCAA---TCATACCATTT-GGCTTGTGAGCTAATGTGTACCGTTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATTGTACAAt
gi|8                          :                                                                                                                                                   gacgcgatGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGAGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAATTGGTACGATTTAATAAAATATTTTAGGGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAAACGAAAATGGTTTCCAAAA-AAT--GATTGTGGCAACAAAAGAACAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAG----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGATAAGCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACACATTTATTTTTCAACGAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AG-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAATTTAAG-----TTTAAACAG------TTTTAATGGAAATATGATTTCTAGTAAAAATGTCGCAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTTCACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCGTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAACATGTGGTAATATAATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTA-ATAACA---GTTTAGTGATTTCTAGTATAAATGTCACAACGCTAAT------------CTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATATGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCTCACTCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AAAAACAAAAAT-AAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TAACAGCTTGCGCAAATGTATTTAAGTCGA---TCATACCA-TT-GACATCTGAGCTAAAGTTTACAGTTA-TTTTTT----GCGAATGACGTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAA-TTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGA
gi|9                          :      CGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCAAGTTTAAGGTAAAA-CGAGGAATAAAAGACCGTTAATATTGTTGAATAATCATATAATATAA-CTATTTTATACCAAACTAAAGATAATTTAA-TTTTCTT-TGCAATTGCATT-TTTTTATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAGTTATCAAGTGGTACAAGTTGATAAGCGATTT-AAGGTGAAAACGGAACCAACTCG-TTTTTAAAAACACGTATGTCGTTGAGACTTGCACAGACGTAATTGATGTC-AAAA-CAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATCATTTAAAC----CTGTAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGGAGAAAGTCATGGTTAAGTATAAAATTCATTTCGCTGATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGCAAATTTT--A--------------TTT-------------------GTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAA-----TTT-----T------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAGAACGTGAATTGTTAATTACACTACCAAGTT-----ATCCAATAAAATGTTTCCTATTTAACGTA------TATCAATGTTATTTTAATCACATCATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACCTGTTGTAATATTATTGCAAATCTCCAATGCATAACAAAGTT-ATAATAACTGTTTATTGATTGCTAGTAAAAATGTCACAACACTAATTTTTAAA-CGACCTGACGTAGCGTTTATTTGACAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTa





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                                                                                                                                                               1111                                                                    111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111                                                                              1111                                                                                    1                                                                                                          11111111111                        11                                           1                                        
lowQualScore                  :                                            4                                        2                                     3       3                     3 6 0                           1                       3                               0   0                                         0     3    0                        1                    2    3     55                       3                  7777     1                                       1                 0         1                                       55    2222  7       2  7777       0                                   99999   555555555555                                                                               3     1                         999999                              3                                                    1      3      555                                     4                                                   3                                                 0    333  8888  1                                                     8888            2222                 55     4          55  8888             0 1       0 1    777        0  3              1           3      7777  1                             3  3                  0           00000000000     0                  88 5                2                        4                                        
lowQualScore                  :                                            .                                        .                                     .       .                     . . .                           .                       .                               .   .                                         .     .    .                        .                    .    .     ..                       .                  ....     .                                       .                 .         .                                       ..    ....  .       .  ....       .                                   .....   ............                                                                               .     .                         ......                              .                                                    .      .      ...                                     .                                                   .                                                 .    ...  ....  .                                                     ....            ....                 ..     .          ..  ....             . .       . .    ...        .  .              .           .      ....  .                             .  .                  .           ...........     .                  .. .                .                        .                                        
lowQualScore                  :                                            0                                        5                                     6       6                     6 7 1                           8                       3                               4   5                                         9     3    0                        8                    5    3     44                       3                  1111     0                                       0                 4         0                                       00    7777  3       5  7777       3                                   11111   888888888888                                                                               6     0                         666666                              3                                                    0      3      888                                     2                                                   3                                                 8    666  5555  0                                                     0000            3333                 55     0          55  5555             8 1       3 0    000        9  6              5           3      1111  0                             6  6                  5           88888888888     5                  44 6                0                        5                                        
consensus                     : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAANAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
Reference ( family-113 )      : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAANAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|1                          : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGACTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CTGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTACAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTTA-TTTTATT-TGTAATTGTAATATTTTTAAT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCA--GACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATTAGCAACTGGTATAAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTAAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGATATGGTGTCAAAAA-AAAAAGATTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGCATAATATAAAA----CTATATAATACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCATTAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATCTTTAAAAA----AA-CGTGTTTTCT----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAACTGAAAAAGAAATT--------------AAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTCC-TCGTCGAATAAAATATTTTCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTTAATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAAGAA-TGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAAC---AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTATTTTGTAGAGGATTTCGATACATTTTACTTTGTACGTT--ATATG-TAGGTAGACG--TA----TCACAGATCACGCAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTGCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GCTATAAAGTTATTATATAGTACAATAAAATATCAAATCAAGTGTTTATGCACGTTATTTTTAAAG-TTAATCAAAATTAGCGTATGGTTGAGGTTCGTTTTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGA
gi|10                         :    gaCGTCAGAAATTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CGGGGAATAAAAGATTGTAAATATTGTTGAATAATCATATAATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTGCATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAACTCACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAAGTTAATAAGCGATTTTAAGGTGCAAACGGAGACAAATCGTTTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACATGCACAGACGGAATTGATGT-CAAAA-CAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAAACGGCTATAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATGGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTGTTCAACTAAATAAGACTGTATGTACATTTA--AAAACAACAA-CGTGTTTACA----TGTTGATAATGAGTCTTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAGGTTTTTTT-----GTTGTTTTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTACAAATGATGCAAATGATGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACAT---GTAATATTATTGCAAATCTCAACCGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTT
gi|11                         :                                                           acgcgaATATTGCTGAATAATCATATAGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCATTTTTCTT-TGTAACTGTGATATTTTTATT-T-ACCGTCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTAGCGTCAACAGAAAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAct
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              actataaAAACGGAGCCCAATCG-TTTTTAAAAACAAGTATGACGCTGAGACATGCACAGACGAAAATGATGTC-AAAA-AAGAAGGTTTGGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CTATAGAAAAATATGAAAGCTTCGGAAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATAGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTATTAAAATGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTT--ATTT------TTTTGATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTATGGAACATA------TATCACTTTT------ATCACATAAAAGTGTTTTTTATTAAGAACAACTTGTGGTAATATTATTGCAAATCACCAACGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACCTTTATTTTCAAATCGACCTGACGTAGCATGTTTTCGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TGTAAATATATAGacggagcccaatcgtttttaaaaacaagtatgacgctgagacatgcacagacgaaaatgatgtcaaaaaagaaggtttgggcaataaaagaaaagacagaaaattataatttaaaactatagaaaaatatgaaagcttcggaaaaaaaggaatgaagaaagccatagctaagtattaaattcatttcactaatttatttttcaacaaaataagactgtatgtacattttaaaaaacgtgtttattaaaatgttattaatgagtattttcgtaaaattgaaaaagaaattaagtttatttttttgatggaaatacgatttctagtaaaaatgtcacaaatggtgaaaaacgtgtattgttaattacgctactaagtttctcatccaataaaatgtttcctatggaacatatatcacttttatcacataaaagtgttttttattaagaacaacttgtggtaatattattgcaaatcaccaacgcataacaaagttataacagtttatttatttctagtaaaaatgtcacaacctttattttcaaatcgacctgacgtagcatgttttcgagaaaatacggtttcaaggaatgtaaatatatag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actataaatattgctgaataatcatatagtataaactattttataccaaattaaagataatttcatttttctttgtaactgtgatatttttatttaccgtcgtgtaacacgtacatcagggaaaacgttaacgatttagcgtcaacagaaaaaacacggtgagagatgtaacagaaattatcTCCAATAAAATGTTTCCTATTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAGCATGTGGTAATATTATTGTAAATATTCAACGCATAACAAAGTT-AAAACA---GTTTATTTATTTATAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAGTCGACCTGACGTAGCGTTTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TG------TATAGCCCTTATCCTAGCAGTATCTATTGTTTTTGTTACAGAAAAC---AA----AATAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACAACCATCT-TCAATTTTGAAAGTA----ATAGAGGAACTCG----ATATTACTTTGTAAATT--GTATG-TATATAGACG--TA----TTACAGATTA-GC-ATTATATTTTATTTTATATTTATACTATTT-GACATGTGAGCTAGCGTTAACCATTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATTGTACTATAAAACATCAAATCAAGTGTTAAGGCATGATATTTTTAAA-TTGAATCGAATTTAACGTAGAGCTGACCTTCGTATTTTACAACGTTTTTGACGTTACACTTCTTAGTTTCAATTTCTGACGCGAC
gi|13                         :    CGCGTCAGATGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTGTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTTTTCTGTAATTGTAACATTTTTATT-TGATCATCGCGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGATTTAATAAAAGATTTTAGTGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAAGAAAGACGGAAATGGTGTCCAAAT-AGAAA--TTGCAGCAACAAAAGATCAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAATATGGCTAAGTTTTACAGTCGTTTCACgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTAAAAATGT-ACAACACTTATTTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGCA-TATAAATATATAGCCCTAATCCCAGCATCATCTATTCATTATGTTACAGAAAACAACAA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTAa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATTCAATTTG-AATGTAGACGACTACACTTTACAGATTAC-CAT-TATAATTTATTCAA---TCATACCA-TTTGACATGTGAGCTAACGTGTACCGTTA-TTTTTTTTTTGTAATTGACATCAGTGATATCGGCTTATTGTA-TT-GTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTAACGCATGTTATTTTTAAA-TTCAATCAAAATTAACGTAGAGCTGACCTTCGTTTTTTACGAAGTTTTTGACGTTACACTTATAAGCTTCAACTTCTGACGCGACcactttacagattaccattataatttattcaatcataccatttgacatgtgagctaacgtgtaccgttattttttttttgtaattgacatcagtgatatcggcttattgtattgttataaacttatcatattgtacaataaaacatcaaatcaagtgttaacgcatgttatttttaaattcaatcaaaattaacgtagagctgaccttcgttttttacgaagtttttgacgttacacttataagcttcaacttctgacgcgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtaaaaatgtacaacacttatttttaaatcgacctgacgtagcgtgtatttgagaaaatacggtttcaaggcatataaatatatagccctaatcccagcatcatctattcattatgttacagaaaacaacaaaaaaatcaaaGCTAAAGATTACCGTTA-TTTATT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TTTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTACGCACGTTATCTTTAAAGTT-AATCAAAATAAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCA-TTTTGAAGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTACAATAAAACATCAAATAAAGTGTGTACGGA-----------------AATCAAAATTAACATATGGTTGAGGTTTGTATTTTACGACGTTTTTGACGTTTCACg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCA-TT-GACATGTGAGCTAATGTGTACCGTTATTTTTTT----GCTAACGACTCCAATAATATCGGC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|2                          : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATGATGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTTAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGCCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGTCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACTAACACAGACGGAAGTGGTGTCCAAAA-AAAAAAATTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTGTAATTGAAAA----CTTTATAAAACTATGAGATTTTTTGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTAGTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAAACTGTATGTACATTTT--AAAC----AA-CGTGTTTTAT----TGTTATTTATGAGTATATTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTTAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAAAGTGTATTTTTAATTACACTTCTAAGTTTC-TCACCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATGGTAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATACATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGAGAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----T-----ATTACGCAAATGTATTTAAGTCGA---TCATACCA-TT-GACACGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TGTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-GT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAGTCAAAACTAACCTATGGTTGAGACTCGTGTTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTCTAGGCTTCAACTTCTGACGCGACgtc
gi|3                          :               TTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATA-AGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTCTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTTTAATATTTTTATT-TGATTATCGTGTTACACGTACGCCAAGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGATGAGAGATGTAATAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAACGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACAAACACAGACGGAAGTTGTGTCCAAAA-AAAAA--TTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-AAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATAAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACATAACTGTATGTACATTTT--AAAA----AAACGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTAAAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGCTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCCTATCCTAGCGCCATCTATTCTTTATATAACAGAAAACA--AA----AACAATTAAAACATTCAATT-GAATGTAGGCGACTATCTATCAACTTTGAAACTACTTTTTAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGCT--ATAGG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGTAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATATGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTAATT-AT-ATAAACTTATTATATAGTACAATAAAAT-------------TTTACGCACGTTATTTTTAAAGTT-AGTCAAAATTAAAGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATAAGCTTCAACTTCTGGCGCG
gi|4                          :         CAGAAGTTAAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CAGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTG-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATAAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAATGTTTTAGCGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGTCATTGAGACTAACACAGACGGAGGTAGTGTCCAAAATAAAAAA--TGCGACAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTT-GGGGAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAATATGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTCATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTTAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTGATGGAAATACGATTTTTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGAATTGTTAATTACACTACTTAGTTTA-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAAAATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAACTGTCACAACGCTACTATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAAGAAATGTAAATATATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTGATATTACAGAAAACA--AA----AATAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGGT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAATTTTACCGTTA-TTTTTT----GCAAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTAACGCACGTTATTTTTAAAG-TTAGTGAAAATAAACGTA-------------TATTTTATTGCA-TTTTGACGTTACACTTATTGGCTTCAACTTCT
gi|5                          :            AAGTAGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATATAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAAGTTTA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTGTT-TGATCATCTTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTAAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTAAGAGATGTAACAGAAAATAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAACCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACGCAGACGGAAATAGTGTCCAAAA-ATAA--GTTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGTATAATATAATA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGG-AATGAAGAAAAACATGGCTAATTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATTTATATTTA--AAAAAA--AA-CGTGTTTTCT----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAGATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATATTGCCTTCTTAACGTA------TATCAATTTTATTTTATTCACATAATAGTG-ATTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATTAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTATAAAAAATGTCACAACGCCAATATTTAAATCGACCTGACGTTACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAAC---AA----AAAAGTCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTGTAGAGGATCTCGATACATATTACTGTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TT----TTACATATTACGCAAATGTATTTAAATCTA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGAGTGCAATAGTGTTGGCTCAATGTA-TT-GCTTTAAACTTATTGTATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCAGGTTATTTTTAAAG-TTAATCAAAATTAACGCATGGTTGAGGTTCGTATTTAACGGCG-TTTTGACG
gi|6                          :                     CTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CAGGGAATAAAAGAC-----ATATTGTTGAATAATCATATTATATAAACTCTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTACTTGTAATATTTTTACTATGA---------GACACGTACATCAGGGAAAACGTTACCGCTTTTGCGTCAAGAG-AAAAACACGGTGAAAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGAGTGAAAACTCAGCCAAATCG-TTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACTTACTCAGACGGAAATGATGT--AAAA-GAAAAGGATGCGGCAACAAAAGAAAAGATATAAAAAATATAATTTAAAA----CTATAGAAAACTATGAGAGTTTTGGGGAAAAAGGAATGAAGAAAACCATGACTAAGTATTAAATTCATTTTACTAATTTATTTTTCAATAAAACAAGACTATATGTACATTTT--AAAA----AA-TGTGCTTTCT----TGTTATTTGTGAGTATTTTTGTAATATTGAAAA-GAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAAAGCAATTTC-------------ACAAATAGTAAAATACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCTTCCTATAAAATGTTTCCTATTAAACATA------TATCAATTCTATTTTCATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAAAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGTATAACAAAGTT-ATACCA---GTTTATTGATTTCTAGTTAAAATGTCACAACGCT-ATTTT----TCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGATAATACGGTTTTAACGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATAATATATTCTTTATGTTATTG-----A--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACCATCTATCAATTTTGAAAGTAC----TAGAGGAACTCG----ATGTTACTTTGTAAATT--GTTTGAAATATAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTGATTCAT---TCATCCCATTT-GACATGTGAGCTAATGCGTACTGTTA-TTTATT----GTTATAGACTTCAGTGATATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCTGGTGTAAACGCACGTTATTTTTAAA-TTTAATCAAAATTAACGTAGAGTTGACATTCGTATTTTACAATGTTTTTGACGTTATACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|7                          :       GTCAGAAGTTGAGGCTTACACTGATTTCAGAGTAATA-CGAGGAATAAAACACTGTAAATATTGTTAAATAATCATAA-ATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-T-ACCATTGTGTAACACGTACATCATGGAAAACATTAACGATTTTGTGTCAACAG-AAAAACATGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAATTTAATAAACGATTTTATGGTGTAAACGGAGCCAAATCG-TTTTTAAAAACACGTATGACGTTGAGACTTGCACAGACAGAAAGGAT-TTCAAAA-AAGAAGGTTGCGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CTA---AAAATTTTGAGAGCTTTGGAAAAAAAGGAATGAACAAAGCCATGGCTTAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAATATAAGACCGTGTGTACATTTT--AAAA----AAATGAGTTTACA----TGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAATTTT------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATAGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTTATCATACAATAAAATGTATCCTTTTAAACATACATGGATATCAATTTTATTTTA-TCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATCATTGCAAATCTCCAACGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAATTGACCCAACGTAGCATGTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATCATCTATTCTTTATGTTACAG-----------------AATCAAAACATTCAATTTAAATGTAGAC-ACCATCTATCAATTTTGAAAGAAC----TAGAGGAACTCG----ATATTACTTTGTAAATT--GTATG-TATGTAGACA--TA----TTACAGATAAC-C-ATTATATTTTATTCAA---TCATACCATTT-GGCTTGTGAGCTAATGTGTACCGTTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATTGTACAAt
gi|8                          :                                                                                                                                                   gacgcgatGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGAGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAATTGGTACGATTTAATAAAATATTTTAGGGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAAACGAAAATGGTTTCCAAAA-AAT--GATTGTGGCAACAAAAGAACAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAG----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGATAAGCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACACATTTATTTTTCAACGAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AG-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAATTTAAG-----TTTAAACAG------TTTTAATGGAAATATGATTTCTAGTAAAAATGTCGCAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTTCACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCGTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAACATGTGGTAATATAATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTA-ATAACA---GTTTAGTGATTTCTAGTATAAATGTCACAACGCTAAT------------CTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATATGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCTCACTCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AAAAACAAAAAT-AAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TAACAGCTTGCGCAAATGTATTTAAGTCGA---TCATACCA-TT-GACATCTGAGCTAAAGTTTACAGTTA-TTTTTT----GCGAATGACGTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAA-TTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGA
gi|9                          :      CGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCAAGTTTAAGGTAAAA-CGAGGAATAAAAGACCGTTAATATTGTTGAATAATCATATAATATAA-CTATTTTATACCAAACTAAAGATAATTTAA-TTTTCTT-TGCAATTGCATT-TTTTTATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAGTTATCAAGTGGTACAAGTTGATAAGCGATTT-AAGGTGAAAACGGAACCAACTCG-TTTTTAAAAACACGTATGTCGTTGAGACTTGCACAGACGTAATTGATGTC-AAAA-CAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATCATTTAAAC----CTGTAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGGAGAAAGTCATGGTTAAGTATAAAATTCATTTCGCTGATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGCAAATTTT--A--------------TTT-------------------GTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAA-----TTT-----T------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAGAACGTGAATTGTTAATTACACTACCAAGTT-----ATCCAATAAAATGTTTCCTATTTAACGTA------TATCAATGTTATTTTAATCACATCATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACCTGTTGTAATATTATTGCAAATCTCCAATGCATAACAAAGTT-ATAATAACTGTTTATTGATTGCTAGTAAAAATGTCACAACACTAATTTTTAAA-CGACCTGACGTAGCGTTTATTTGACAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTa


blockSeqs                     :                                            A                                        A                                     T       C                     A G                             A                       A                                                                                   T    T                        T                    C    T     GG                       T                  ACGG     G                                       C                           T                                       .     CAAC  A       A  AAAA                                           GTTTT   GTTGTTT                                                                                    A     C                         CATGGA                              T                                                    C      .      ACT                                     T                                                   A                                                      AAC  AAAC  T                                                     TCTA            AGAA                 CA     A          AC  CACT               T         T    TAT        T  T              C           T      TTTT  T                             A  T                              CATCAAATCAA                        GT G                G                        T
blockSeqs                     :                                            .                                        A                                     .       .                     . G                             A                       .                                                                                   .    T                        T                    C    .     GG                       .                  .        G                                       C                           T                                       .     AA    A       A  .                                              .       AAAAAG                                                                                     .     C                         .                                   .                                                    C      .      .                                       T                                                   .                                                      A    .     A                                                     TTTT            ATAA                 .      .          .   .                  A         T    .          T  .              C           .      .     A                             .  .                              CATCAAATCAA                        GT C                G                        T
blockSeqs                     :                                            .                                        T                                     .       .                     . G                             T                       .                                                                                   .    T                        A                    C    .     AA                       .                  .        T                                       A                           A                                       .     .     .       T  .                                              .       AAAAAG                                                                                     .     C                         .                                   .                                                    C      .      .                                       T                                                   .                                                      A    .     A                                                     TCTA            ATAA                 .      .          .   .                  A         G    .          T  .              A           .      .     G                             .  .                              CATCAAATAAA                        GT T                T                        T
blockSeqs                     :                                            .                                        T                                     .       .                     . G                             T                       .                                                                                   .    .                        A                    C    .     GG                       .                  .        T                                       A                           A                                       .     .     .       T  .                                              .       AAAAAG                                                                                     .     A                         .                                   .                                                    A      .      .                                       A                                                   .                                                      A    .     C                                                     TCTG            ATAC                 .      .          .   .                  A         A    .          .  .              T           .      .     T                             .  .                              CATCAAATCAA                        T  T                T                        T
blockSeqs                     :                                            .                                        T                                     .       .                     . G                             T                       .                                                                                   .    .                        A                    C    .     GG                       .                  .        T                                       A                           A                                       .     .     .       T  .                                              .       AAAAAG                                                                                     .     A                         .                                   .                                                    A      .      .                                       A                                                   .                                                      A    .     T                                                     TCTA            ATAA                 .      .          .   .                  A         A    .          .  .              A           .      .     G                             .  .                              CATCAAATCTG                        T  T                T                        .
blockSeqs                     :                                            .                                        T                                     .       .                     . G                             T                       .                                                                                   .    .                        A                    C    .     GA                       .                  .        T                                       A                           A                                       .     .     .       T  .                                              .       AAAAAG                                                                                     .     A                         .                                   .                                                    A      .      .                                       A                                                   .                                                      A    .     A                                                     A               .                    .      .          .   .                  A         A    .          .  .              A           .      .     G                             .  .                              CATCAAATCAA                        G  T                T                        .
blockSeqs                     :                                            .                                        T                                     .       .                     . G                             T                       .                                                                                   .    .                        A                    C    .     GG                       .                  .        T                                       A                           T                                       .     .     .       T  .                                              .       AATTTT                                                                                     .     A                         .                                   .                                                    A      .      .                                       A                                                   .                                                      .    .     A                                                     .               .                    .      .          .   .                  T         T    .          .  .              A           .      .     A                             .  .                              T                                  G  T                T                        .
blockSeqs                     :                                            .                                        T                                     .       .                     . .                             A                       .                                                                                   .    .                        T                    C    .     A                        .                  .        G                                       C                           T                                       .     .     .       A  .                                              .       AAACAG                                                                                     .     C                         .                                   .                                                    C      .      .                                       T                                                   .                                                      .    .     A                                                     .               .                    .      .          .   .                  A         T    .          .  .              A           .      .     G                             .  .                              .                                  T  .                G                        .
blockSeqs                     :                                            .                                        A                                     .       .                     . .                             A                       .                                                                                   .    .                        T                    .    .     G                        .                  .        T                                       C                           A                                       .     .     .       T  .                                              .       ATTT                                                                                       .     C                         .                                   .                                                    C      .      .                                       T                                                   .                                                      .    .     .                                                                                          .      .          .   .                  .         G    .          .  .              T           .      .     T                             .  .                              .                                  A  .                T                        .
blockSeqs                     :                                                                                     .                                     .       .                     . .                             T                       .                                                                                   .    .                        A                    .    .     .                        .                  .        G                                       G                           T                                       .     .     .       .  .                                              .       T                                                                                          .     A                         .                                   .                                                    A      .      .                                       T                                                   .                                                                                                                                                                                                                               .  .              T           .      .     T                             .  .                              .                                  .  .                .                        .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                           .                             A                       .                                                                                   .    .                        T                    .    .     .                        .                  .        .                                       T                                                                                                                                                                                                                                                  C                         .                                   .                                                    C      .      .                                       .                                                   .                                                                                                                                                                                                                                                 A           .      .     G                                                                                                                                                


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    **                                                                            AAAAAG******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A**
originalCons                  : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAANAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
finalCons                     : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAANAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1                                                                                                                                                                                                                               1111                                                                    111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         111                                                                              1111                                                                                    1                                                                                                          11111111111                        11                                           1                                        
lowQualScore                  :                                            4                                        2                                     3       3                     3 6 0                           1                       3                               0   0                                         0     3    0                        1                    2    3     55                       3                  7777     1                                       1                 0         1                                       55    2222  7       2  7777       0                                   99999   555555555555                                                                               3     1                         999999                              3                                                    1      3      555                                     4                                                   3                                                 0    333  8888  1                                                     8888            2222                 55     4          55  8888             0 1       0 1    777        0  3              1           3      7777  1                             3  3                  0           00000000000     0                  88 5                2                        4                                        
lowQualScore                  :                                            .                                        .                                     .       .                     . . .                           .                       .                               .   .                                         .     .    .                        .                    .    .     ..                       .                  ....     .                                       .                 .         .                                       ..    ....  .       .  ....       .                                   .....   ............                                                                               .     .                         ......                              .                                                    .      .      ...                                     .                                                   .                                                 .    ...  ....  .                                                     ....            ....                 ..     .          ..  ....             . .       . .    ...        .  .              .           .      ....  .                             .  .                  .           ...........     .                  .. .                .                        .                                        
lowQualScore                  :                                            0                                        5                                     6       6                     6 7 1                           8                       3                               4   5                                         9     3    0                        8                    5    3     44                       3                  1111     0                                       0                 4         0                                       00    7777  3       5  7777       3                                   11111   888888888888                                                                               6     0                         666666                              3                                                    0      3      888                                     2                                                   3                                                 8    666  5555  0                                                     0000            3333                 55     0          55  5555             8 1       3 0    000        9  6              5           3      1111  0                             6  6                  5           88888888888     5                  44 6                0                        5                                        
consensus                     : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAANAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
Reference ( family-113 )      : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGAAATGGTGTCCAAAA-AAAAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAANCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACNAATTTATTTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCNAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAANAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATNTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAANTCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|1                          : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGACTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CTGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTACAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTTA-TTTTATT-TGTAATTGTAATATTTTTAAT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCA--GACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATTAGCAACTGGTATAAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTAAAAACGGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAGACGGATATGGTGTCAAAAA-AAAAAGATTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGCATAATATAAAA----CTATATAATACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCATTAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATGTACATCTTTAAAAA----AA-CGTGTTTTCT----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAACTGAAAAAGAAATT--------------AAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTCC-TCGTCGAATAAAATATTTTCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTTAATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAAGAA-TGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAAC---AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTATTTTGTAGAGGATTTCGATACATTTTACTTTGTACGTT--ATATG-TAGGTAGACG--TA----TCACAGATCACGCAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTGCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GCTATAAAGTTATTATATAGTACAATAAAATATCAAATCAAGTGTTTATGCACGTTATTTTTAAAG-TTAATCAAAATTAGCGTATGGTTGAGGTTCGTTTTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGA
gi|10                         :    gaCGTCAGAAATTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CGGGGAATAAAAGATTGTAAATATTGTTGAATAATCATATAATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTGCATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAACTCACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAAGTTAATAAGCGATTTTAAGGTGCAAACGGAGACAAATCGTTTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACATGCACAGACGGAATTGATGT-CAAAA-CAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAAACGGCTATAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATGGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTGTTCAACTAAATAAGACTGTATGTACATTTA--AAAACAACAA-CGTGTTTACA----TGTTGATAATGAGTCTTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAGGTTTTTTT-----GTTGTTTTTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTACAAATGATGCAAATGATGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACAT---GTAATATTATTGCAAATCTCAACCGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTT
gi|11                         :                                                           acgcgaATATTGCTGAATAATCATATAGTATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCATTTTTCTT-TGTAACTGTGATATTTTTATT-T-ACCGTCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTAGCGTCAACAGAAAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAct
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              actataaAAACGGAGCCCAATCG-TTTTTAAAAACAAGTATGACGCTGAGACATGCACAGACGAAAATGATGTC-AAAA-AAGAAGGTTTGGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CTATAGAAAAATATGAAAGCTTCGGAAAAAAAGGAATGAAGAAAGCCATAGCTAAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTATTAAAATGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTT--ATTT------TTTTGATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTC-TCATCCAATAAAATGTTTCCTATGGAACATA------TATCACTTTT------ATCACATAAAAGTGTTTTTTATTAAGAACAACTTGTGGTAATATTATTGCAAATCACCAACGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACCTTTATTTTCAAATCGACCTGACGTAGCATGTTTTCGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TGTAAATATATAGacggagcccaatcgtttttaaaaacaagtatgacgctgagacatgcacagacgaaaatgatgtcaaaaaagaaggtttgggcaataaaagaaaagacagaaaattataatttaaaactatagaaaaatatgaaagcttcggaaaaaaaggaatgaagaaagccatagctaagtattaaattcatttcactaatttatttttcaacaaaataagactgtatgtacattttaaaaaacgtgtttattaaaatgttattaatgagtattttcgtaaaattgaaaaagaaattaagtttatttttttgatggaaatacgatttctagtaaaaatgtcacaaatggtgaaaaacgtgtattgttaattacgctactaagtttctcatccaataaaatgtttcctatggaacatatatcacttttatcacataaaagtgttttttattaagaacaacttgtggtaatattattgcaaatcaccaacgcataacaaagttataacagtttatttatttctagtaaaaatgtcacaacctttattttcaaatcgacctgacgtagcatgttttcgagaaaatacggtttcaaggaatgtaaatatatag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actataaatattgctgaataatcatatagtataaactattttataccaaattaaagataatttcatttttctttgtaactgtgatatttttatttaccgtcgtgtaacacgtacatcagggaaaacgttaacgatttagcgtcaacagaaaaaacacggtgagagatgtaacagaaattatcTCCAATAAAATGTTTCCTATTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAGCATGTGGTAATATTATTGTAAATATTCAACGCATAACAAAGTT-AAAACA---GTTTATTTATTTATAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAGTCGACCTGACGTAGCGTTTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TG------TATAGCCCTTATCCTAGCAGTATCTATTGTTTTTGTTACAGAAAAC---AA----AATAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACAACCATCT-TCAATTTTGAAAGTA----ATAGAGGAACTCG----ATATTACTTTGTAAATT--GTATG-TATATAGACG--TA----TTACAGATTA-GC-ATTATATTTTATTTTATATTTATACTATTT-GACATGTGAGCTAGCGTTAACCATTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATTGTACTATAAAACATCAAATCAAGTGTTAAGGCATGATATTTTTAAA-TTGAATCGAATTTAACGTAGAGCTGACCTTCGTATTTTACAACGTTTTTGACGTTACACTTCTTAGTTTCAATTTCTGACGCGAC
gi|13                         :    CGCGTCAGATGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTGTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTTTTCTGTAATTGTAACATTTTTATT-TGATCATCGCGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGATTTAATAAAAGATTTTAGTGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAAGAAAGACGGAAATGGTGTCCAAAT-AGAAA--TTGCAGCAACAAAAGATCAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAATATGGCTAAGTTTTACAGTCGTTTCACgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTAAAAATGT-ACAACACTTATTTTTAAATCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGCA-TATAAATATATAGCCCTAATCCCAGCATCATCTATTCATTATGTTACAGAAAACAACAA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTAa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATTCAATTTG-AATGTAGACGACTACACTTTACAGATTAC-CAT-TATAATTTATTCAA---TCATACCA-TTTGACATGTGAGCTAACGTGTACCGTTA-TTTTTTTTTTGTAATTGACATCAGTGATATCGGCTTATTGTA-TT-GTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTAACGCATGTTATTTTTAAA-TTCAATCAAAATTAACGTAGAGCTGACCTTCGTTTTTTACGAAGTTTTTGACGTTACACTTATAAGCTTCAACTTCTGACGCGACcactttacagattaccattataatttattcaatcataccatttgacatgtgagctaacgtgtaccgttattttttttttgtaattgacatcagtgatatcggcttattgtattgttataaacttatcatattgtacaataaaacatcaaatcaagtgttaacgcatgttatttttaaattcaatcaaaattaacgtagagctgaccttcgttttttacgaagtttttgacgttacacttataagcttcaacttctgacgcgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtaaaaatgtacaacacttatttttaaatcgacctgacgtagcgtgtatttgagaaaatacggtttcaaggcatataaatatatagccctaatcccagcatcatctattcattatgttacagaaaacaacaaaaaaatcaaaGCTAAAGATTACCGTTA-TTTATT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TTTGTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTACGCACGTTATCTTTAAAGTT-AATCAAAATAAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCA-TTTTGAAGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTACAATAAAACATCAAATAAAGTGTGTACGGA-----------------AATCAAAATTAACATATGGTTGAGGTTTGTATTTTACGACGTTTTTGACGTTTCACg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCA-TT-GACATGTGAGCTAATGTGTACCGTTATTTTTTT----GCTAACGACTCCAATAATATCGGC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|2                          : CGTCGCGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATGATGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTTAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGCCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAGTCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACTAACACAGACGGAAGTGGTGTCCAAAA-AAAAAAATTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTGTAATTGAAAA----CTTTATAAAACTATGAGATTTTTTGGAAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTAGTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAAACTGTATGTACATTTT--AAAC----AA-CGTGTTTTAT----TGTTATTTATGAGTATATTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTTAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAAAGTGTATTTTTAATTACACTTCTAAGTTTC-TCACCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATGGTAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATACATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AA----AAAAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGAGAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----T-----ATTACGCAAATGTATTTAAGTCGA---TCATACCA-TT-GACACGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TGTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-GT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTTACGCACGTTATTTTTAAAGTTTAGTCAAAACTAACCTATGGTTGAGACTCGTGTTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTCTAGGCTTCAACTTCTGACGCGACgtc
gi|3                          :               TTGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATA-AGGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTCTATACTAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTTTAATATTTTTATT-TGATTATCGTGTTACACGTACGCCAAGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGATGAGAGATGTAATAGAAATTAGCAACTGGTACGAGTTAATAAACGATTTTAGGGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGACATTGAGACAAACACAGACGGAAGTTGTGTCCAAAA-AAAAA--TTGCAGCAACAAAAGAAAAGATA-AAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATAAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACATAACTGTATGTACATTTT--AAAA----AAACGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATTATTGTAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTAAAGTAAAAATGTCACAACGCTAATATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGCTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCCTATCCTAGCGCCATCTATTCTTTATATAACAGAAAACA--AA----AACAATTAAAACATTCAATT-GAATGTAGGCGACTATCTATCAACTTTGAAACTACTTTTTAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGCT--ATAGG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGTAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATATGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTAATT-AT-ATAAACTTATTATATAGTACAATAAAAT-------------TTTACGCACGTTATTTTTAAAGTT-AGTCAAAATTAAAGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATAAGCTTCAACTTCTGGCGCG
gi|4                          :         CAGAAGTTAAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CAGGGAATAAAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTG-TGTAATTGTAATATTTTTATT-TGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGAAACAGAAATAAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAATGTTTTAGCGTGAAAACGGAGCCTAGTCG-TTTT-GAGAACACGTATGTCATTGAGACTAACACAGACGGAGGTAGTGTCCAAAATAAAAAA--TGCGACAACAAAAGAAAAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAA----CTATATAAAACTATGAGAGTTT-GGGGAAAAGGGAATGAAGAAAAACATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATTTTTCAACAAAACAAATATGTATGTACATTTT--AAAA----AA-CGTGTTTTCT----TGTCATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTTAAAAAGAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTGATGGAAATACGATTTTTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGAATTGTTAATTACACTACTTAGTTTA-TCATCAAATAAAATGTTTCCTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTTAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAAAATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTAGTAAAACTGTCACAACGCTACTATTTAAATCGACCTGACGTAACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAAGAAATGTAAATATATAACCCTTATCCTAGCACCATCTATTCTTGATATTACAGAAAACA--AA----AATAATTAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAACTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGGT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTAAATCGA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAATTTTACCGTTA-TTTTTT----GCAAATGACTTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAA-------------GTTAACGCACGTTATTTTTAAAG-TTAGTGAAAATAAACGTA-------------TATTTTATTGCA-TTTTGACGTTACACTTATTGGCTTCAACTTCT
gi|5                          :            AAGTAGAGGCTTACGCCGATTTCAGGGTAATG-CGGGGAATATAAGACTGTTCATATTGTTGAATAATCATATTGTATAAATTATTTTATACCAAATTAAAGATAAGTTTA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTGTT-TGATCATCTTGTAACACGTACGTCAGGGAAATCGTAAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTAAGAGATGTAACAGAAAATAGCAACTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGGGTGAAAACGGAACCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACGCAGACGGAAATAGTGTCCAAAA-ATAA--GTTGCGGCAACAAAATAAAAGATA-GAAAAGTATAATATAATA----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGG-AATGAAGAAAAACATGGCTAATTATTAAAGTCATTTCACAAATTTATCTTTCAACAAAACAAGACTGTATTTATATTTA--AAAAAA--AA-CGTGTTTTCT----AGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAGATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATATTGCCTTCTTAACGTA------TATCAATTTTATTTTATTCACATAATAGTG-ATTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATTTTATTGCAAATCTCCAACGCATTAAAAAGTT-ATAACA---GTTTATTGATTTCTATAAAAAATGTCACAACGCCAATATTTAAATCGACCTGACGTTACATGTATTTGAGAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCTCACCCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAAC---AA----AAAAGTCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTGTAGAGGATCTCGATACATATTACTGTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TT----TTACATATTACGCAAATGTATTTAAATCTA---TCATACCA-TT-GACATGTGAGCTAAAGTTTACCGTTA-TTTTTT----GCGAATGAGTGCAATAGTGTTGGCTCAATGTA-TT-GCTTTAAACTTATTGTATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCAGGTTATTTTTAAAG-TTAATCAAAATTAACGCATGGTTGAGGTTCGTATTTAACGGCG-TTTTGACG
gi|6                          :                     CTTACGCCGATTTCAGGGTTATG-CAGGGAATAAAAGAC-----ATATTGTTGAATAATCATATTATATAAACTCTTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTACTTGTAATATTTTTACTATGA---------GACACGTACATCAGGGAAAACGTTACCGCTTTTGCGTCAAGAG-AAAAACACGGTGAAAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACGAGTTAATAAAAGATTTTAGAGTGAAAACTCAGCCAAATCG-TTTT-AAAAACACGTATGGCGTTGAGACTTACTCAGACGGAAATGATGT--AAAA-GAAAAGGATGCGGCAACAAAAGAAAAGATATAAAAAATATAATTTAAAA----CTATAGAAAACTATGAGAGTTTTGGGGAAAAAGGAATGAAGAAAACCATGACTAAGTATTAAATTCATTTTACTAATTTATTTTTCAATAAAACAAGACTATATGTACATTTT--AAAA----AA-TGTGCTTTCT----TGTTATTTGTGAGTATTTTTGTAATATTGAAAA-GAAATTAAG-----TTTAAAAAG------TTTTAATGGAAAAGCAATTTC-------------ACAAATAGTAAAATACGTGTATTGTTAATTACACTACTAAGTTTC-TCTTCCTATAAAATGTTTCCTATTAAACATA------TATCAATTCTATTTTCATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAAAACAACATGTGGTAATATTATTGCAAATCTCCAACGTATAACAAAGTT-ATACCA---GTTTATTGATTTCTAGTTAAAATGTCACAACGCT-ATTTT----TCGACCTGACGTAGCGTGTATTTGAGATAATACGGTTTTAACGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATAATATATTCTTTATGTTATTG-----A--AA----AAAAATCAAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACCATCTATCAATTTTGAAAGTAC----TAGAGGAACTCG----ATGTTACTTTGTAAATT--GTTTGAAATATAGACG--TA----TTACAGATTACGCAAATGTATTTGATTCAT---TCATCCCATTT-GACATGTGAGCTAATGCGTACTGTTA-TTTATT----GTTATAGACTTCAGTGATATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATCATATTGTACAATAAAACATCAAATCTGGTGTAAACGCACGTTATTTTTAAA-TTTAATCAAAATTAACGTAGAGTTGACATTCGTATTTTACAATGTTTTTGACGTTATACTTATTAGCTTCAACTTCTGACGCGAC
gi|7                          :       GTCAGAAGTTGAGGCTTACACTGATTTCAGAGTAATA-CGAGGAATAAAACACTGTAAATATTGTTAAATAATCATAA-ATATAAACTATTTTATACCAAATTAAAGATAATTTCA-TTTTCTT-TGTAATTGTAATATTTTTATT-T-ACCATTGTGTAACACGTACATCATGGAAAACATTAACGATTTTGTGTCAACAG-AAAAACATGGTGAGAGATGTAACAGAAATTATCAAGTGGTACAATTTAATAAACGATTTTATGGTGTAAACGGAGCCAAATCG-TTTTTAAAAACACGTATGACGTTGAGACTTGCACAGACAGAAAGGAT-TTCAAAA-AAGAAGGTTGCGGCAATAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATAATTTAAAA----CTA---AAAATTTTGAGAGCTTTGGAAAAAAAGGAATGAACAAAGCCATGGCTTAGTATTAAATTCATTTCACTAATTTATTTTTCAACAATATAAGACCGTGTGTACATTTT--AAAA----AAATGAGTTTACA----TGTTATTAATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAG-----TTTAATTTT------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATAGTGAAAAACGTGTATTGTTAATTACGCTACTAAGTTTTATCATACAATAAAATGTATCCTTTTAAACATACATGGATATCAATTTTATTTTA-TCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACATGTGGTAATATCATTGCAAATCTCCAACGCATAACAAAGTT-ATAACA---GTTTATTTATTTCTAGTAAAAATGTCACAACGCTAATTTTTAAATTGACCCAACGTAGCATGTATTTGAGAAAATACGGTTTCAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTTATCCTAGCATCATCTATTCTTTATGTTACAG-----------------AATCAAAACATTCAATTTAAATGTAGAC-ACCATCTATCAATTTTGAAAGAAC----TAGAGGAACTCG----ATATTACTTTGTAAATT--GTATG-TATGTAGACA--TA----TTACAGATAAC-C-ATTATATTTTATTCAA---TCATACCATTT-GGCTTGTGAGCTAATGTGTACCGTTA-TTTTTT----GTTATGGACATCAGTGATATCGGCTTAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATTGTACAAt
gi|8                          :                                                                                                                                                   gacgcgatGATCATCGTGTAACACGTACGTCAGAGAAATCGTTAACGCTTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAATTAGCAATTGGTACGATTTAATAAAATATTTTAGGGTGAAAACAGAGCCTAATCG-TTTT-GAAAACACGTATGGCGTTGAGACTAACACAAACGAAAATGGTTTCCAAAA-AAT--GATTGTGGCAACAAAAGAACAGATA-GAAAAGTATAATTTAAAG----CTATATAAAACTATGAGAGTTTTGGGAAAAAGGGAATGAAGATAAGCATGGCTAAGTATTAAAGTCATTTCACACATTTATTTTTCAACGAAACAAGACTGTATGTACATTTT--AAAA----AG-CGTGTTTTCT----TGTTATTTATGAGTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAATTTAAG-----TTTAAACAG------TTTTAATGGAAATATGATTTCTAGTAAAAATGTCGCAAATGGTAAAAAACGTGTATTGTTAATTTCACTACTAAGTTTC-TCATCAAATAAAATGTTTCGTTTTAAACGTA------TATCAATTTTATTTAAATCACATAATAGTG-TTTTTATAAAGAGCAACATGTGGTAATATAATTGCAAATCTCCAACGCATAAAAAAGTA-ATAACA---GTTTAGTGATTTCTAGTATAAATGTCACAACGCTAAT------------CTGACGTAGCGTGTATTTGAGAAAATATGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAACCCTCACTCTAGCACCATCTATTCTTTATATTACAGAAAACA--AAAAACAAAAAT-AAAACATTCAATTTGAATGTAGACGACTATCTATCAATTTTGAAAGTACTCTATAGAGGATCTCGATAAATATTACTTTGTACGTT--ATATG-TATGTAGACG--TA----TAACAGCTTGCGCAAATGTATTTAAGTCGA---TCATACCA-TT-GACATCTGAGCTAAAGTTTACAGTTA-TTTTTT----GCGAATGACGTCAATAGTATCGGCTCAATGTA-TT-GTTATAAACTTATTATATAGTACAATAAAACATCAAATCAAGTGTTTACGCACGTTATTTTTAAAA-TTAATCAAAATTAACGTATGGTTGAGGTTCGTATTTTACGGCG-TTTTGACGTTACACTTATTAGCTTCAACTTCTGA
gi|9                          :      CGTCAGAAGTTGAGGCTTACGCCAAGTTTAAGGTAAAA-CGAGGAATAAAAGACCGTTAATATTGTTGAATAATCATATAATATAA-CTATTTTATACCAAACTAAAGATAATTTAA-TTTTCTT-TGCAATTGCATT-TTTTTATT-T-ACCATCGTGTAACACGTACATCAGGGAAAACGTTAACGATTTTGCGTCAACAG-AAAAACACGGTGAGAGATGTAACAGAAGTTATCAAGTGGTACAAGTTGATAAGCGATTT-AAGGTGAAAACGGAACCAACTCG-TTTTTAAAAACACGTATGTCGTTGAGACTTGCACAGACGTAATTGATGTC-AAAA-CAGAAGGTTGCGGCAACAAAAGAAAAGACA-GAAAATTATCATTTAAAC----CTGTAGAAAATTATGAGAGTTTTGGGAAAAAAGGAATGGAGAAAGTCATGGTTAAGTATAAAATTCATTTCGCTGATTTATTTTTCAACAAAATAAGACTGTATGCAAATTTT--A--------------TTT-------------------GTATTTTCGTAAAATTGAAAAAGAAATTAAA-----TTT-----T------TTTTAATGGAAATACGATTTCTAGTAAAAATGTCACAAATGGTGAAGAACGTGAATTGTTAATTACACTACCAAGTT-----ATCCAATAAAATGTTTCCTATTTAACGTA------TATCAATGTTATTTTAATCACATCATAGTG-TTTTTATAAAGAACAACCTGTTGTAATATTATTGCAAATCTCCAATGCATAACAAAGTT-ATAATAACTGTTTATTGATTGCTAGTAAAAATGTCACAACACTAATTTTTAAA-CGACCTGACGTAGCGTTTATTTGACAAAATACGGTTTTAAGGAA-TGTAAATATATAGCCCTa