lowQualScore : 2222222222222222 3333333333333333333333
lowQualScore : 0000000000000000 1 1 1 5555555555555555555555 1 22 1 1 1111 111 11111 111111 555555555555 11 22222222222222222 2222222 1 1111111 11111 2222 1 2222222222 111111 5555555555555555555555 1 111111 1 1 1 11111111111111 222222222222222222 1111 111 11111111111 1111111111 1111 1111111111111111111 11 1 111111111 111 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111 1111111111
lowQualScore : 6 9999999999999999 5 5 6 6 5 5555555555555555555555 5 6 6 11 5 6 7 6 6 6 6 1 8 6666 33 0 999 1 0 88 22222 66 5 0 2 999999 555 0 9 555555555555 8 44 7777 66666666666666666 66 777 88 22 777 4 4 4 99999999 0000000 4 9999 3 4 1 5555555 2 44 22 8 7 66 888 3 11111 3 3333 77 77 3 8888 4 1111111111 4 000000 6666666666666666666666 7777 1 2 111111 555 6 6 66666 3 33 66666 5 2 444 3 8 1 5555 33 33333333333333 444 2 2 222222222222222222 33 1111 2 888888888 22 0 9999999999 5 555 5555 33 2 33 22222222222 0 6 33 22 333 1 2 7 55 555 4444444444 7777 4444444444444444444 77 9999999 0 55 5 33 000000000 9 555 1 2 3 3 6 5 555 1 33333333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4444444444 4444444444 2 3 1 6
lowQualScore : . ................ . . . . . ...................... . . . .. . . . . . . . . . .... .. . ... . . .. ..... .. . . . ...... ... . . ............ . .. .... ................. .. ... .. .. ... . . . ........ ....... . .... . . . ....... . .. .. . . .. ... . ..... . .... .. .. . .... . .......... . ...... ...................... .... . . ...... ... . . ..... . .. ..... . . ... . . . .... .. .............. ... . . .................. .. .... . ......... .. . .......... . ... .... .. . .. ........... . . .. .. ... . . . .. ... .......... .... ................... .. ....... . .. . .. ......... . ... . . . . . . ... . ........ .............................................................. .......... .......... . . . .
lowQualScore : 0 0000000000000000 0 0 0 0 0 0000000000000000000000 0 0 0 00 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3333 55 8 222 4 3 33 55555 99 0 4 0 222222 444 7 0 777777777777 1 22 7777 33333333333333333 11 888 33 99 888 0 0 0 55555555 9999999 4 4444 0 4 2 7777777 0 11 11 0 6 11 888 7 11111 2 1111 00 99 3 5555 0 5555555555 0 555555 5555555555555555555555 1111 3 9 111111 444 0 8 77777 1 77 77777 8 7 777 9 3 1 7777 77 33333333333333 444 1 1 999999999999999999 11 6666 1 444444444 99 9 2222222222 9 666 0000 22 4 44 77777777777 9 6 44 99 555 7 8 3 00 222 4444444444 5555 1111111111111111111 55 5555555 4 77 3 44 000000000 5 444 7 5 1 1 2 6 444 0 22222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6666666666 6666666666 6 6 9 0
consensus : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCC---------ATTT---GGTGAGTTTGTTGGCCGATACCAACTTCACTTGGGTCTCCATGTAGGCTGCCTC----------------------ACGTAAAATTGCGGTGCCACTCGGGTCCTTGCGTTTAGCCTCTTGTGCCAGCCTGAAAATACATGATAAT-GCGATATTATTGTAAATCGTAATTGCAGTTAAAG-GATTAAAT-----AG--A-TCAATCACACTGTAAT-A----AT-TGCAATTAAAGGATA---------N--TCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AA-GGATATAG---ACCAATCACACTG-TAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTANAAG-TT-AATTAATT-----GTAAT-CA----ATCAATCACAC-GGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCANT-----TTGTTTCTTAATACTGNA--ATTAATTATTGACATN-TTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAA--TTACACCATGT----CAT-TTT----------T-C------ATTTTAATAT-----------CA--N------AGA----AATACCATAAA------ATAT--CGTTTTATT-----CTTC--TTT-----ATTCAT-CTTTAT---AAACCATTTACANAATATGTT----CAA--C----C---------GGTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-TTC--T-------T--TAT----T-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAATATGT--T----C--A-A--CC---------GGTTACGAAATGAC--CA--AAACTTACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAA-TATGTTCAA--CC---------GGTTACGAAATGAC--CAAAACTTACTCCATGTATGTCAT-T-TTT-CATTTTAATATGATT---ATATTAT--------CAT-----------AAAAC----AT-------TGTT----------------TT-----------ATTCAT----------CTT----------TATGAACCATTTACACANT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
Reference ( gi|1 ) : ATTCTTCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGATTTTGTTGGCCGATACAAACTTCACTTGGGTTTCCACGTATGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATGGTGGTGCCACCCGATTCCTGGCGCTAAGTCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATAAAAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAG-GATTAAAT-----AG--A-TCAATCACACTGTAAT-A----AT-TGCAATTAAAAGATA---------T--TCGGTAATTAATATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AA-GGATGTAG---ACCAATCACACTG-TAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTTAATAGTTAAAAG-TT-AATTAATT-----ATAAT-CA----ATCAATTACAC-GGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATAAGCAATCAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCT--ATTAATTATTGACATT-TTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAA--TAACACCATGT----CAT-TTT----------T-C------ATTTTAATAT-----------CA--A------AGA----AATATCCTAAA------ATAT--CGCTTTATT-----CATC--TTT-----ATTTAT-CTTTAT---AAACCATTTACAAAAAATGGT----CAA--C----C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--CC-TTC--C-------T--TAT----T-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAATATGG--T----C--A-A--CC---------GGTTACGAAATTAC--CA--AAACTTACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAA-AATGTACAA--CC---------GGTAACGAAATGAC--AAAAACTTACTCCATGTATGTCAT-T-TTT-CATTTTGATATGATT---ATATTAT--------CAT-----------AGAAC----AT-------TG-T----------------TT-----------ATTCAT----------CTT----------TATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACTCTTC
gi|2 : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCC---------ATTT---GGTGAGTTTGTTGGCCGATACCAACTTCACTTGGGTCTCCATGTAGGCTGCCTC----------------------ACGTAAAATTGCGGTGCCACTCGGGTCCTTGCGTTTAGCCTCTTGTGCCAGCCTGAAAATACATAAACA--G-AATACAAT--TAAAT--TAAT-----TTAAA---AATAAAT-----AA--A-TAAATCA-AC---AAT-A----AT-TAT-ATT-----ATA---------T--C--ATGATT--TATAATA-TT----ATT-----A-----A-----
gi|4 : ACATGATAATGGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAG-GATTAAAT-----AG--A-TCAATCACACTGTAAT-A----A----CAGTTA-------------------TTGG---TTA-----------------------A-----A-----CTAA--TTA---AA-GGATATAG---ACCAATCACACTG-TAATATTTT-ACTTACAATTAAAGAATAATCGGCAATTAGCTTTATAGTTAAAAG-TA-AATTAATT-----GTAAT-CA----ATCAATTACAT-GGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTGTAATTAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACCCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCA--ATTAATTATTGACATT-TTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAA--TTACACCATGT----CAA-TTA----------T-CAATATGATTTTAATAT-----------CA--A------AGA----AATATCATAAA------ATAT--CGTTTTATT-----CTTC--TTT-----ATTTAT-CTTTAT---AAACCATTTACAAAATATGGT----CAA--C----C---------GGTTACAAAATGACCAAAACTTACACCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-TTC--T-------T--TAT----T-CGT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAGTATGT--T----C--A-A--CC---------GGTAACGAAATGAC--CA--AAACTTACTCCAT---TTAT-ACCATTT-T--TC--ATTT-------TGATATGA--TTAT-------------------AT--TAATGGTTACGAAACGAC---CGAAA-AA-----AA--CT---------GGTTACGAAATGAC--tgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaatattattttattcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatatgttcagccggttacgaaatgaccaaaacttactgcatgtatgtcatttttcattttaatatgattatattatcataaaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|14 : ACATGGTAATTGTGAAATTATTATAAATTTTAATTGCAGTTAAAG-GATt
gi|13 : gaatgtatagatacaacaaATTATTGTGC-CCGGAATTGCAATTAAAG-GATTAAAT-----AG--A-TCAATCAT----TGAT-A----AT-----------------------------CGGCAATTAACATTATAGTT----ATTAGATAA-----A-----CTAA--TTA---AA-GGATAAAA---AACAATCACACTG-TAATATATT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATCAGCTTAATAGTTAAAAG-TT-AATTAATT-----aatcagcaattagcataacagttttaagttaaactaattaaatgcaagagatcaatcacactgtaatattttaattgacata
gi|3 : TAAAT---AATGACAGTTAAC---ATTAACC-----AGTGACTCAATCACACTGTAAT-AT---AT-TGCAATTAAAGGATAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----G-----TTAAACTTATTTAA-CGATATAG---ACCAATCACACTG-TAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTTATAAG-TT-AATTAATT-----GTAAT-CA----ATCAATTGCAT-GGGAAATACTTCA-CTTTTAATTGCAGTTATTTAGTATCTATAATTAGCAATTAACATAATAATTAATAATAGTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTATTTAATACTGAA--ATTAATTATTGACATA-TTAGCATGGAATAAAAA-TATAGGTCAAA--TAACACCATGT----CAT-TTT----------T-C------ATTTTAATAT-----------CA--T------GGA----AATATCATAAA------ATAT--TGTTTTATT-----CTTC--TTT-----ATCCAT-CTTTAT---AAACCATTTACATAA--------------------------------TT-TGAAATGACCGAAACTTACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-TTC--N-------N--NNN----N-NNN---------NN--NNN----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N----N--N-N--NN---------NNNNNNNNNNNNNN--NA--AAACTTACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--ATTT-------TAATATGA--TTAT-------------------ATTATCATA------AAACTA-CTATAAAACAATGT
gi|7 : aTTGCAGTTAAAG-GACCAAAT-----AG--A-TCAGTCACACTGTAAT-AT---AT-TGCATTTAAAGGATAGTTACAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----ATTAAACTAA--GTA---AA-CGATAAAG---ACCAATCACAATG-TAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTCA-------------------------T-CA----ATCAATGACAT-GGAAAATACTTCAATTTTTAATTGCAATTATCTA-TATCTATAATAAGCAATTAACATAATAATTAATA---GTTAAAATTACTCATT-----TTGTTTCTTAATTCTGAA--ACTAATTATTGACATA-TTAGCATGG---AAAAAATATAGGTCAAA--TTAAACCACAT----CAC-TTT----------T-C------ATTTTAATAT-----------tttattcatctttatgaaccatttacacattgttttcaacc
gi|2 : TGCAATTAAAG-GATTAAAT-----AG--A-TCAATCACTCCGTAATAA----AT-TGTAATTAAAGGATA---------A--TCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATTAGTTAA-----A-----CTAA--CTA---AA-GGATATAG---ACCAATCACACTG-TAATATTTT-AT-------------GTAAT-----AT----TTAATTGT----AA-TC-AATTAATT------------------------ACAT-GGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATGTAGTATCTATAATTAGCAATTAACAAAATAATAAATA---GTTAAAAGGACTC-AT--------TTTCATAATACTGAA--ATTAATTATTGACATT-TTAGGATGGAATAAAATATAGATGTCAAA--TTACATCATGT----CATGTTTGAATTTAATAT-G------ATTTTAATAT-----------CA--A------AGA----AATATCATAAA------ATAT--TATTTTATT-----CTTC--TTT-----ATTCAT-CTTTAT---AAACCATTTACAAAATATGTT----CAG--C----C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-ATT--T-------TAATATGA--T-TAT---------ATTATCA----------TAAAACATTgattttaatgtca
gi|20 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttaAATTAAAG-GAT---AT-----AG--A-CCAATCACACTGTAAT-ATTTTATGTACAATTAAAGGATA---------A--TCGGCAATTAGCTCAA---TT----ATT-----A-----gttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|14 : caattagcataatagttattagttaaactAGTTAAACTAATTAAATGCAAGAG--A-TCAATCACACTGTAAT------AT-TTTAATTGAcaa
gi|14 : gaatgtatagatacaacaaacatggtaattgtgaaattattataaattttaattgcagttaaaggataatcagcaattagcataacagttttaT-A----AT-TGCAGTTAAAGGATA---------A--TCAGCAATTAGCATAACAGTTTTAAGTT-----A-----AA----CTAA--TTA---AATGCAAG-AG---ATCAATCACACTG-TAATATTTTAATTGACAcata
gi|10 : gaatgtatagatacaacaaacatggtaattgtgaaattattataaatttAATTAAAGGATT---------A--TCGACAATTAGCATAATAGTT----ACT-----A-----G-----TTAA--TTA---AT----TGTAATCAATCAATCACACTGAAAATACTTT-ACTTTTAATT------------GCAATTA-TTTATTAGTTAAAAta
gi|20 : tgttgacatcttttaAATTAGCATAATAGTT----ATT-----AGTTAAA-----CTAA--TTA---AA-GGATATAG---ACCAATCACACTG-TAATATTTT-ATGTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTCAATTATTACAAtgactcattttgtttcttaacaccaaaattattgacatattagcatggaattaaaaatattagtcaaattacaccatgtcattttttcattttaatatcttaaaaataccataaagtattgttttattcttctttattcatctttataaaccatttacacaatatgttcaactggttatgaaatgttcaaaacttactccatcatgtcatttttc
gi|9 : cTGGTT----A-------A-----A-----CTAA--TCA---AA-TGCAGTAA---ATCAATCACACTG-AAATATTTT-AATTGCA
gi|14 : tATTA-TAA-ATTTT-AATTGCAGTTAAAGGATAATCAGCAATTAGCATAACAGTTTTAAG-TTAAACTAATT-----A-AATGCAAGAGATCAATCACAC-TGTA-ATA-------TTTTAATTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttcttaatacctaaattgattattgacagattagcatggaatttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactctatgtatgtcatttttcattttcatatgattttaata
gi|10 : gaatgtatagatacaacaaacatggtaattgtgaaattTTTA-AATTAAAGGATTATCGACAATTAGCATAATAGTTACTAG-TT-AATTAATT-----GTAAT-CA----ATCAATCACAC-TGAAAATACTTTA-CTTTTA------ATT------------------GCAAT--------TATTTATTA---GTTAAAATGACTCATT-----TTGTTTCTTAACAC--CA--A--AATTATTGACATA-TTAGCATGGAATTAAAAATATTAGTCAAA--TTACACCATGT----CAT-TTTT---------T-C------ATTTTAATAT-----------CT--T------AAA----AATACCATAAA------GTAT--TGTTTTATT-----CTTC--TTT-----ATTCAT-CTTTAT---AAACCATTTACACAATATGTT----CAA--C----T---------GGTTATGAAATGTTCAAAACTTACTCCAT----CAT-GTCATTT-T--TC-acata
gi|13 : tgttgacatctGATAATCGGCAATTAACATTATAGTTATTAGATA-AACTAATTAAAGGATAA--AA----AACAATCACACTGTAATATA---------TTATTTACAATTA--AAG----GATAATCGGCAATCAGC-------TTAATA---GTTAAAAG---TTAAT-----T
gi|9 : attattgtgcccggaattgcaattaaaggattaaatagatcaatcattTGGTTAAA---CT-AATCAAAT-----GCAGT-AA----ATCAATCACAC-TGAA-ATA-------TTTTAATTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTCTTAATAC--CTAAATTGATTATTGACAGA-TTAGCATGGAATaatt
gi|5 : tT-----GTAAT-CA----ATTAATTA-AT-GGGACATACTTTA--------------TTATCTAGTATCTATAATAAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTACAAGGACCCAAT-----TTTTTTCTTAATACTGCA--ATTAATTATTGACATT-TTAGCATGGAATAttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactctatgtatgtcatttttcattttcatatgattttaata
gi|6 : GGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAA--ATTAATTACTGATATT-TTAGCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|8 : CATTATTATCATGGAATGAAAAATATAAGACAAA--TTACATCATGT----CAT-TTT----------T-C------ATTTTAATATGATCT------TA--ATATTATAGA----AATACCATTAA------ATAT--TGTTTTTTTTCTTTCTTC--TTT-----ATTCAT-CTTTAT---AAACCATTTGCACAATATGTT----CAA--C----T---------GGTTACGAAATGACGAAAACTTACTCCAA---GTAT-GTCAT----------------------G--TATG---T-CA---------------------------------ATTT----AATATGATTT----T--A-A--C-----------ATCATTAAAATAC--TA--AAA---A--ACA------AT-GT--TTTAT--TC--ATCT-------T--TAT----TCAA-------------------CT--TTAT-------GAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|11 : atatcatttatctttttttacttaaatctctattaaaattattttttgccttacgacagatatatttataatcctgtttagcttAGACCAAAACTTACTCCATGTATATCAT-TTT----------T-C------ATTTTAATATGATTTTAACATCA--T------AAA----AATA--CTAAA------AAACAATGTTTTATT-----CATC--TTA-----ATTCAA-CTTTAT---AAACCATTTACACATTATTTT----CTA--C----C---------GATTATGAAATGACCAAAA
gi|12 : cacaatatgttcaactggttatgaaaCATGT----CAT-TTT----------T-C------ATTTTGATAT-----------GATTA------TGT------TATCATAGA------ACAT--TGTTTTATT-----CATC--TTT-----AT--------------GAACCATTTACAatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|5 : tactctatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatatgttcaaccggtaacgaaattaccaaaacttactccatgATGT----AAT-TTT----------T-C------ATTTTGATAT-----------------------GATTATATTATCATTGA------ACAT--TGTTTTATT-----C-----------------AT-CTTTAT---GAACCATTTACACATTATTTT----CGA--C----C---------GGTTACGAAATGACCGAAAcattattttcaac
gi|6 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttATGG----CAT-TTT----------TTC------ATTTTAATATGATTATATCATCA--T------AAA----ACTACTATAAA------ACAA--TGTTTTGTT-----CATCAATATGAACCATTTACACCTTATTTTCAACCGGTTACAAAA--TGAC----CAA--AAAAGT---------GGTTACAAAATGACCGACATTTAaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|16 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgt------ATGTTAATAT-----------CA--T------AAA----AATACTATAAA------ACAA--TGTTTTATT-----CATC--TTG-----TTTCAG-CTTTAT---AAACCATTTACACAATATTTT----CCA--C----C---------GATTACAAAATGACCAAAAaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|15 : tgAATAA-----------GA--A------AAA----AGTATA-TAAATTATACATAT--TGTTTTATT-----C-----------------AT-CTTCAT---AAAACATTTAT----AATGGTTATGCAATGC----CTAATAGTATGGTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAG---TTAT-Gatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|21 : tgaaGA----AATACTCCATGT-----ATGT--CATTTT--T-----CTTC--TTT-----ATTCAT-CTTTAT---AAACCATTTACAAAATATGTT----CAaaatgacaagataccgaaaaataat
gi|12 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgtct------ATGT--CATTTT--T-----CTTC--TTT-----ATTCAT-CTTTAT---AAACCATTTACAAAATATGTT----CAA--C----C---------GGTAACGAAATTACCAAAACTTACTCCAT---GCAT-GTCATTT-T--TC-
gi|6 : tactctatgt------ATGT--CATTTT--T-----CTTC--TTT-----ATTCAT-CTTTAT---AAACCATTTACAAAATGTGTT----CAA--C----C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTACAT---GTAT-GGCATTT-T-----------------------T----T-CAT---------TT--T--------------------------AATATGA--T----T--ATA--TC----------ATCATAAAACTACTATA--AAAC--A----AT---G---------TT-T--TG--TT--------------------CAT-------------------CA--ATAT-------GAACCATTTACACCT-TATTTTCAA--CC---------GGTTACAAAATGAC--CAAAAattttgatatgattatgttatcatagaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcaac
gi|5 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtTTT-TT-----CTTC--ATT-----ATTCGT-CTTTAT---AAACCATTTACAAAGTATGTT----CAA--T----C---------GGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT---TTAT-GTAATTT-T--TCATTT--TGATATGAT--TATATTAT-CATTGAACATTGTT--TTATTCATCTTTATGAACCATTTACACATTATTT--T----C--G-A--CC---------GGTTACGAAATGAC--CG--AAAaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|11 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcaCACAATATGTT----CAA--C----T---------GGTTATGAAAAGACCAAAACTTACTCCAT---GTAT-ATCATTT-------------------------T----T-CAT---------TT--T--------------------------AATATGATTT----T--A-A--C-----------ATCATAAAAATAC--TA--AAA---A--ACA------AT-GT--TTTAT--TC--ATCT-------T--AAT----TCAA-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACACAT-TATTTTCTA--CC---------GATTATGAAATGAC--CAAAAaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|18 : AA--C----T---------GGTTACGAAATGACCGAAAatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|5 : gttgcgaaatgaccgacatataaAAAACTTACTCCAT---GTGT-GTCATTT-T--TC-TTC--A-------T--TAT----T-CGT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAGTATGT--T----C--A-A--TC---------GGTAACGAAATGAC--CA--AAACTTACTCCAT---TTAT-GTAATTT-T--TCA-TTTTGATATGAT--TATATTATCATTGAACATTGTTTTATTCATCT--TTAT-------GAACCATTTACACAT-TATTTTCGA--CC---------GGTTACGAAATGACCGAAAAAaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaatcgaaatttaggttacgatatgacttagttacgaaatgacc
gi|6 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAACTTGCTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-TTC--T-------T--TAT----T-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAATGTGT--T----C--A-A--CC---------GGTTACGAAATGAC--CA--AAACTTACTACAT---GTAT-GGCATTT-T--TTCATTTTAATATGAT--TATA---TCAT-------------------C-----ATA------AAACTA-CTATAAAACAATGTgtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|9 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAAACTTACTCTAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-ATT--T-------T--CATA---T-GAT---------TT--TAA----------TAtttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|12 : ttggttaaactaatcaaatgcagtaaatcaatcacactgaaatattttaattgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttcttaatacctaaattgattattgacagattagcatggaatttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACTCTAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-TTC--T-------T--TAT----T-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAATATGT--T----C--A-A--CC---------GGTAACGAAATTAC--CA--AAACTTACTCCAT---GCAT-GTCATTT-T--TC--ATTT-------TGATATGA--TTAT-------------------GTTATCAT-------AGAACATT
gi|21 : TACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC-TTC--T-------T--TAT----T-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAATATGT--T----C--A-gttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcaac
gi|10 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgtctgaaaCCATAAAGTATTGT--TTTAT--TC-TTC--T-------T--TAT----T-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACACAATATGT--T----C--A-A--CT---------GGTTATGAAATGTT--CA--AAACTTACTCCAT----CAT-GTCATTT-T--TC--
gi|4 : tgttgacatcttttaaattaaaggattatcgacaattagcataatagttactagttaattaattgtaatcaatcaatcacactgaaaatactttacttttaattgcaattatttattagttaaaatgactcattttgtttcttaacaccaaaattattgacatattagcatggaattaaaaatattagtcaaattacaccatgtcattttttcattttaatatcttaaaaataAT-ATCGTTT-TATTC-TTC--T-------T--TAT----T-TAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAATATGG--T----C--A-A--CC---------GGTTACAAAATGAC--CA--AAACTTACACCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--TTCT-------T--TAT----TCGT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAG-TATGTTCAA--CC---------GGTAACGAAATGAC--CAAAACTTACTCCATTTATACCAT-T-TTT-CATTTTGATATGATT---ATATTA
gi|3 : acatgataatggcgatattattgtaaattgtaattgcaattaaaggattaaatagatcaatcacactgtaataacagttattggttaaactaattaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttacttacaattaaagaataatcggcaattagctttatagttaaaagtaaattaattgtaatcaatcaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatctagtatctgtaattagcaattaacaaaataattaatagttaaaaggacccaatttgtttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaataaaaaatataggtcaaattacaccatgtcaattatcaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaAT-ATTGTTT-TATTC-TTC--T-------T--TAT----C-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACATAAT--------------------------------TT--GAAATGAC--CG--AAACTTACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--TTCN-------N--NNN----NNNN-------------------NN--NNNN-------NNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNN--NN---------NNNNNNNNNNNNNN--NAAAACTTACTCCATGTATGTCAT-T-TTT-CATTTTAATATGATT---ATATTAT--------CAT-----------AAAACTACTATAAAACAATG-T----------------TTT----------ATTCAT----------CTT----------TATGAACCATTTACACATT-GTTTTCAACCatggttacgaaacgaccgaaaaaaactggttacgaaatgact
gi|2 : ataaataatgacagttaacattaaccagtgactcaatcacactgtaatatattgcaattaaaggataattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaacttatttaacgatatagaccaatcacactgtaatattttatttacaattaaaggataatcggcaattagcataatagttataagttaattaattgtaatcaatcaattgcatgggaaatacttcacttttaattgcagttatttagtatctataattagcaattaacataataattaataatagttaaaaggactcattttgttatttaatactgaaattaattattgacatattagcatggaataaaaatataggtcaaataacaccatgtcatttttcattttaatatcatggaaatatcataaaAT-ATTATTT-TATTC-TTC--T-------T--TAT----T-CAT---------CT--TTA----------TAAACCATTTACAAAATATGT--T----C--A-G--CC---------GGTTACGAAATGAC--CA--AAACTTACTGCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--ATTT-------TAATATGA--TTAT-------------------ATTATCAT-------AAAACATT
gi|16 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaTT-T--TA-TTCATC-------T--TGT----TTCAG---------CT--TTA----------TAAACCATTTACACAATATTT--T----C--C-A--CC---------GATTACAAAATGAC--CA--AAAgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|15 : tgatgttaatatcataaaaatactataaaacaatg-------T--TAT----T-CAT---------CT--TCA----------TAAAACATTTATA----ATGG--TTATGC--A-ATGCCTAATAGTATGGTAACGAAATGAC--C---AGACTTTC-CCAG---TTAT-Gatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|8 : tgaaaataagaaaaaagtatataaattatacatattgtt----T-CAT---------TT--TT----------------CATTTT---AATATGA--T----CTTA-A--T-----------ATTATAGAAATAC--CATTAAA--TATT-------GTTT-TTTTTCT-T--TC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTGCACAA-TATGTTCAA--CT---------GGTTACGAAATGAC--GAAAACTTACTCCAAGTATGTCATGTATGT-CAATTTAATATGATT---TTAACAT--------CATTAAAATACTAAAAAAC----AA-------TGTT----------------TT-----------ATTCAT----------CTT----------TATaaatgacaagataccgaaaaataat
gi|5 : atatcatttatctttttttacttaaatctctattaaaattattttttgccttacgacagatatatttataatcctgtttagcttcattattatcatggaatgaaaaatataagacaaattacatcatgA--AAACTTACTCCAT---GTGT-GTCATTT-T--TC--TTCA-------T--TAT----TCGT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAG-TATGTTCAA--TC---------GGTAACGAAATGAC--CAAAACTTACTCCATTTATGTAAT-T-TTT-CATTTTGATATGATT---ATATTAT--------CAT-----------TGAAC----AT-------TGTT----------------TT-----------ATTCAT----------CTT----------TATGAACCATTTACACATT-ATTTTCGACCtcaactttatgaa
gi|6 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--AAACTTGCTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAA-TGTGTTCAA--CC---------GGTTACGAAATGAC--CAAAACTTACTACATGTATGGCAT-T-TTTTCATTTTAATATGATT---ATATCAT--------CAT-----------AAAACTACTATAAAACAATG-T----------------TTT----------GTTCAT----------CAA----------TATGAACCATTTACACCTT-ATTTTCAACCggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|9 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--AAACTTACTCTAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--ATTT-------T--CATA---TGAT-------------------TT--TAAT-------Aggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|12 : ttggttaaactaatcaaatgcagtaaatcaatcacactgaaatattttaattgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttcttaatacctaaattgattattgacagattagcatggaatttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACTCTAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAA-TATGTTCAA--CC---------GGTAACGAAATTAC--CAAAACTTACTCCATGCATGTCAT-T-TTT-CATTTTGATATGATT---ATGTTAT--------CAT-----------AGAAC----AT-------TGTT----------------TT-----------ATTCAT----------CTT----------TATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAAC
gi|21 : TACTCCAT---GTAT-GTCATTT-T--TC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAA-TATGTTCA
gi|10 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgtctgaaaCCATAAAGTATTGT--TTTAT--TC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACACAA-TATGTTCAA--CT---------GGTTATGAAATGTT--CAAAACTTACTCCAT-CATGTCAT-T-TTT-C
gi|4 : tgttgacatcttttaaattaaaggattatcgacaattagcataatagttactagttaattaattgtaatcaatcaatcacactgaaaatactttacttttaattgcaattatttattagttaaaatgactcattttgtttcttaacaccaaaattattgacatattagcatggaattaaaaatattagtcaaattacaccatgtcattttttcattttaatatcttaaaaataAT-ATCGTTT-TATTC--TTCT-------T--TAT----TTAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAA-TATGGTCAA--CC---------GGTTACAAAATGAC--CAAAACTTACACCATGTATGTCAT-T-TTT-C-TTCT-------TT---AT-TCGT--------C----------------------------------T----------------TT-----------A------------------------------TAAACCATTTACAAAGT-ATGTTCAACC
gi|2 : acatgataatggcgatattattgtaaattgtaattgcaattaaaggattaaatagatcaatcacactgtaataacagttattggttaaactaattaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttacttacaattaaagaataatcggcaattagctttatagttaaaagtaaattaattgtaatcaatcaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatctagtatctgtaattagcaattaacaaaataattaatagttaaaaggacccaatttgtttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaataaaaaatataggtcaaattacaccatgtcaattatcaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaAT-ATTATTT-TATTC--TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACAAAA-TATGTTCAG--CC---------GGTTACGAAATGAC--CAAAACTTACTGCATGTATGTCAT-T-TTT-CATTTTAATATGATT---ATATTAT--------CAT-----------AAAAC----AT-------TGTT----------------TT-----------ATTCAT----------CTT----------TATGAACCATTTACACATTCATGTCCAACggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttataccatttttcattttgatatgattatattaatggttacgaaacgaccgaaaaaaactggttacgaaatgact
gi|16 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaAT-GT--TTTAT--TC--ATCT-------T--GTT----TCAG-------------------CT--TTAT-------AAACCATTTACACAA-TATTTTCCA--CC---------GATTACAAAATGAC--CAAAAtttcggtacctaataaaaa
gi|15 : tgatgttaatatcataaaaatactataaaacaT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TCAT-------AAAACATTTATAATG-GTTATGCAATGCCTAATAGTATGGTAACGAAATGAC---CAGACTTTC-CCAGTTATGatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|11 : tgaaaataagaaaaaagtatataaattatacatattgtCACAA-TATGTTCAA--CT---------GGTTATGAAAAGAC--CAAAACTTACTCCATGTATATCAT-T-TTT-CATTTTAATATGATT---TTAACAT--------CATAAAAATACTAAAAAAC----AA-------TGTT----------------TT-----------ATTCATCTTAATTCAACTT----------TATAAACCATTTACACATT-ATTTTCTACCaaatgacaagataccgaaaaataat
gi|8 : GAC--AAA---TTAC---AT-CATGTCAT-T-TTT-CATTTTAATATGATCTTAATATTATAGAAATACCAT-----------TAAAT----AT-------TG-TTTTTTTTCTTTCTTCTTT-----------ATTCAT----------CTT----------TATAAACCATTTGCACAAT-ATGTTCAACgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|9 : atatcatttatctttttttacttaaatctctattaaaattattttttgccttacgacagatatatttataatcctgtttagcttcattattatcatggaatgaaaaatataaAAAACTTACTCTATGTATGTCAT-T-TTT-CATTTTCATATGATT---TTAATAtggttacgaaatgacgaaaacttactccaagtatgtcatgtatgtcaatttaatatgattttaacatcattaaaatactaaaaaacaatgttttattcatctttattcaactttatgaa
gi|10 : ttggttaaactaatcaaatgcagtaaatcaatcacactgaaatattttaattgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttcttaatacctaaattgattattgacagattagcatggaatttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATTACACCATGT----CAT-T-TTTTCATTTTAATATCTTA---AAAATAC--------CAT-----------AAAGT----AT-------TG-T----------------TTTATTCTTCTTTATTCAT----------CTT----------TATAAACCATTTACACAAT-ATGTTCAAC
gi|16 : tgttgacatcttttaaattaaaggattatcgacaattagcataatagttactagttaattaattgtaatcaatcaatcacactgaaaatactttacttttaattgcaattatttattagttaaaatgactcattttgtttcttaacaccaaaattattgacatattagcatggaattaaaaatattagtcATGTTAATATCATA---AAAATAC--------TAT-----------AAAAC----AA-------TG-T----------------TTT----------ATTCAT----------CTTGTTTCAGCTTTATAAACCATTTACACAAT-ATTTTCCACCtggttatgaaatgttcaaaacttactccatcatgtcatttttc
gi|21 : tgT-------TC-T----------------TT-----------ATTCAT----------CTT----------TATAAACCATTTACAAAAT-ATGTTCAgattacaaaatgaccaaaaatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|5 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgtctgaaatactccatgtatgtcatttttcTTGGTTACGAAATGACCTCAACC
gi|19 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacTTGGTTACAAAATGACCTgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|18 : tggttacaaaatgaccgatatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaatagttatgaaacgactgaaacaaaaacggttacgaaatgacTGGTTACGAAATGACCgatc
gi|6 : gttgcgaaatgaccgacatataaaacGGTTACGAAATGACCTgaaaaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaatcgaaatttaggttacgatatgacttagttacgaaatgacc
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAACTTACTACATGTATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|22 ): AGCTGTTACGAAATGTCCGACATTTAAAAGTTGTTACGAAATGACCGAAAAAGTGGTTACGAAACGACCGGAAAAAAAAACGGTTAAGAAATGACTTG
Unaligned ( gi|23 ): AAAAGTGGTTACGGAACGACCGAAAAAAAAAGGTTACGAAATGACTTGGTTACGAAATGAC
Unaligned ( gi|24 ): AAAAAATGGTTACGAAACGACCGAAAAAAACCGGTTACGAAATGACTTGGTTACGAAAT
Unaligned ( gi|25 ): AAATGACCGAAAAATAGTTACCAAACAACTTAAATTAAGTGGTTTCAAAATGACCAGA
Unaligned ( gi|26 ): CTATTGACCACACTACGGCGAGAAAGTCGGCTA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 8888888888888888 7777777777777777777777 111 222 11 1 22222222222222222222222222222222 33333333333333333 11111 1111 2222222222 111111 33333333333 1111111 1111 33333333333333333333333 222222222222222 11 222222222 1111111 222222 33333333333 2222222222222 2222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 6666666666666666 2 2 2 7777777777777777777777 3 2 3 4 777 3 444 0 77 0 1 2 77 5 0 3 0 5 1 11 99999999999999999999999999999999 9999 22222222222222222 66 888 0 5 2 6 1 4 0 1 66 0 0 2 1 888 1 11111 1 1 0000 5 6666666666 222222 88888888888 1 3 3 99999 0 1 77777 0 555 66 999999999999999999 1 4 4 3333333 55 8888 55555555555555555555555 55 1 8888 1 333333333333333 0 2 2 000 666 55 8888 4 55 55 55 55 11 4 55 8888 000000000 6666666 222222 66 5 0 0 11111111111 2222222222222 9999999999 1 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : ................ . . . ...................... . . . . ... . ... . .. . . . .. . . . . . . .. ................................ .... ................. .. ... . . . . . . . . .. . . . . ... . ..... . . .... . .......... ...... ........... . . . ..... . . ..... . ... .. .................. . . . ....... .. .... ....................... .. . .... . ............... . . . ... ... .. .... . .. .. .. .. .. . .. .... ......... ....... ...... .. . . . ........... ............. .......... . . .................................................................................................................
lowQualScore : 5555555555555555 5 5 5 5555555555555555555555 0 5 0 0 555 5 000 8 22 1 1 5 99 7 7 6 0 0 4 11 00000000000000000000000000000000 4444 66666666666666666 99 888 5 0 8 9 4 2 2 0 44 1 8 8 8 888 0 11111 0 0 6666 0 9999999999 888888 00000000000 0 6 6 11111 1 0 77777 4 000 55 555555555555555555 1 0 0 0000000 55 0000 00000000000000000000000 55 3 3333 1 666666666666666 3 3 9 888 444 00 5555 0 55 55 55 55 00 0 55 5555 777777777 2222222 222222 11 0 8 8 77777777777 2222222222222 2222222222 0 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATG---ANAATTG-CGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATAAT-----------CGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
Reference ( family-1120 ) : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCC---------ATTT---GGTGAGTTTGTTGGCCGATACCAACTTCACTTGGGTCTCCATGTAGGCTGCCTC----------------------ACGTAAAATTGCGGTGCCACTCGGGTCCTTGCGTTTAGCCTCTTGTGCCAGCCTGAAAATACATG---ATAAT-G-CGATATTATTGTAAATCGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATANT-----------CGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTANAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATCACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCANT-----TTGTTTCTTAATACTGNAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTAATATGATTATATTATCAT-----------AAAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACANT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
gi|1 : ATTCTTCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGATTTTGTTGGCCGATACAAACTTCACTTGGGTTTCCACGTATGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATGGTGGTGCCACCCGATTCCTGGCGCTAAGTCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATA---AAAATTG-CGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAA-----------GATATT-----------CGGTAATTAATATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATGTAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTATAATCAATCAATTACACGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATAAGCAATCAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCTATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCCTAAAATAT-CGCTTTATT-----CATCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAA-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TCC-TTCC-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--GTCAA--C--C---------GGTTACGAAATTACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAA-----ATGTAC------AA--CCGGTAACGAAATGACAAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TG-TTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACTC
gi|10 : TTTA-AATTAAAGGATTATCGACAATTAGCATAATAGTTACTAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATCACACTGAAAATACTTTA-CTTTTAATT------------------------GCAATTA------T--TTATTA---GTTAAAATGACTCATT-----TTGTTTCTTAACAC--CAA--AATTATTGACATATTAGCATGGAATTAAAAATATTAGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTTT---------TC------ATTTTAATAT-----------CTTAAAAATACCATAAAGTAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTATGAAATGTTCAAAACTTACTCCAT-CATGTCATTT-TTC-ttc
gi|11 : tgttgacatctCACAAT-----ATGTTC------AA--CTGGTTATGAAAAGACCAAAACTTACTCCATGTATATCATTTTT-CATTTTAATATGATTTTAACATCATAAAAATACTAAAAAAC----AA-------TGTTTTATTCATCTTAATTCAACTTTATAAACCATTTACACATT-ATTTTCTACC
gi|11 : ATGT--TTTATTC-ATCT-------T--AAT----TCAA-------------------CT--TTATAAACCATTTACAC--ATTATT--TTCTA--C--C---------GATTATGAAATGACCAAAAgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaCAACTTTTTTAACCGGTTACGAAAT-----G---------A--CC---------GAAAATATGGTTACAAAATGACCGAAAatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgacTT---TAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAataacagggtacgaaatgacc
gi|12 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaactttTACTCTAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTAACGAAATTACCAAAACTTACTCCATGCATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATGTTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|13 : ATTATTGTGC-CCGGAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATC------------A-TT---------------------GATAAT-----------CGGCAATTAACATTATAGTT----ATTAGATAA-----A-----CTAA--TTA---AAGGATAAAAAACAATCACACTGTAATATATT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATCAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATT
gi|14 : ACATG---GTAATTG-TGAAATTATTATAAATTTTAATTGCAGTTAAAGGAT
gi|14 : gaatgtatagatacaacaaTA-A-TTGCAGTTAAAG-----------GATAAT-----------CAGCAATTAGCATAACAGTTTTAAGTTA----A-----A-----CTAA--TTA---AATGCAAGAGATCAATCACACTGTAATATTTTAATTGACAaatcagcaattagcataacagttttaagttaaactaattaaatgcaagagatcaatcacactgtaatattttaattgacata
gi|15 : gaatgtatagatacaacaaacatggtaattgtgaaattattataaatttAATAA-----------GAAAAAAGTAT-ATAAATTATACATATTGTT----------TTATTCATCTTCATAAAACATTTA--TAAT-----G-GTTATGCAATGCCTAATAGTATG--------GTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAGTTATGta
gi|15 : tgaaT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TCATAAAACATTTATAATGGTTATG----CAATGC--CTAATAGTATGGTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAG--TTATG--aaatgacaagataccgaaaaataat
gi|16 : tgaaaataagaaaaaagtatataaattatacatattgt------ATGTTAATAT-----------CATAAAAATACTATAAAACAA-TGTTTTATT-----CATCTTGTTTCAGCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATTTT---CCA--CC---------G--------ATTACAAAATGACCAAAAaaatgacaagataccgaaaaataat
gi|18 : tgAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|19 : gttgcgaaatgaccgacatataaTTACAAAATGACCGATATT---TAAAACT---------G--------GTTATGAAATGACCGAAAaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaatcgaaatttaggttacgatatgacttagttacgaaatgacc
gi|2 : tggATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCC---------ATTT---GGTGAGTTTGTTGGCCGATACCAACTTCACTTGGGTCTCCATGTAGGCTGCCTC----------------------ACGTAAAATTGCGGTGCCACTCGGGTCCTTGCGTTTAGCCTCTTGTGCCAGCCTGAAAATACATAAACAGAAT-A-CAAT-------TAAAT--TAAT-----TTAAA--AATAAATAA--A-TAAATCA-AC---AATA-A-TTAT-ATT----------------ATA-T-----------C-ATGATT--TATAATA-TT----ATT-----A-----A-----aaatagttatgaaacgactgaaacaaaaacggttacgaaatgacttggttacaaaatgacctgatc
gi|2 : TGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACTCCGTAATA-AATTGTAATTAAAG-----------GATAAT-----------CGGCAATTAGCATAATAGTT----ATTAGTTAA-----A-----CTAA--CTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-AT-------------GTAAT-----ATT----TAATTGT----AATCAATTAATT--------------ACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATGTAGTATCTATAATTAGCAATTAACAAAATAATAAATA---GTTAAAAGGACTCAT---------TTTCATAATACTGAAATTAATTATTGACATTTTAGGATGGAATAAAATATAGATGTCAAATTACATCATGT----CATGTTTGAATTTAATATG------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-TATTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGTT---CAG--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTT-TTC-ATTT-------TAATATGA--TTAT-------------------ATTATCATAAAACATTtgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaatattattttattcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatatgttcagccggttacgaaatgaccaaaacttactgcatgtatgtcatttttcattttaatatgattatattatcataaaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|2 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttaATA--TTAT----TT-TATT--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AG--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTTTT-CATTTTAATATGATTATATTATCAT-----------AAAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATTCATGTCCAACgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|20 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----AGTTAAA-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATGTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTCAATTATTACAAtttcggtacctaataaaaa
gi|21 : CTGAAA--TACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCA
gi|22 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgt--------GTTACGAAATGACCGAAA
gi|24 : agctgttacgaaatgtccgacatttaaaagttAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACaagtggttacgaaacgaccggaaaaaaaaacggttaagaaatgacttg
gi|3 : aaaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaTAAAT---AATGACAGTTAAC--ATTAACCAGTGACTCAATCACACTGTAATATA-TTGCAATTAAAGGATAATTAAAGGATAAT-----------CGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----G-----TTAAACTTATTTAACGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTTATAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTGCATGGGAAATACTTCA-CTTTTAATTGCAGTTATTTAGTATCTATAATTAGCAATTAACATAATAATTAATAATAGTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTATTTAATACTGAAATTAATTATTGACATATTAGCATGGAATAAAAA-TATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CATGGAAATATCATAAAATAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATCCATCTTTATAAACCATTTACATAAT---------------------------------------TT--GAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCN-------N--NNN----NNNN-------------------NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN--NNNNN--N--N---------NNNNNNNNNNNNNNNAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CATTTTAATATGATTATATTATCATAA--AA----CTA---------CTATAAAACA----ATGTTttggttacgaaat
gi|3 : aAACTTACTCCATGTATGTCAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATTATATTATCATAAAACTACTATAAAACAA-TGTTTTA---------------TTCATCTTTATGAACCATTTACACATT-----GTTTT---CAA--CC---------ttattcatctttatgaaccatttacacattgttttcaacc
gi|4 : ataaataatgacagttaacattaaccagtgactcaatcacactgtaatatattgcaattaaaggataattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaacttatttaacgatatagaccaatcacactgtaatattttatttacaattaaaggataatcggcaattagcataatagttataagttaattaattgtaatcaatcaattgcatgggaaatacttcacttttaattgcagttatttagtatctataattagcaattaacataataattaataatagttaaaaggactcattttgttatttaatactgaaattaattattgacatattagcatggaataaaaatataggtcaaataacaccatgtcatttttcattttaatatcatggaaatatcataaaatattgttttattcttctttatccatctttataaaccatttacataatttgaaatgaccgaaacttactccatgtatgtcatttttcttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaACATG---ATAAT-GGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A----CAGTTA-------------------T-----------TGG---------------TT----A-------A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ACTTACAATTAAAGAATAATCGGCAATTAGCTTTATAGTTAAAAGTAAATTAATTGTAATCAATCAATTACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTGTAATTAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACCCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAA-TTA----------TCAATATGATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACAAAATGACCAAAACTTACACCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCGT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AGTATG--TTCAA--C--C---------GGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--TTATA--CCAT----TT-T--T--CATTTT--GAT----ATGA--TTAT-ATTAA-----TG------G--TTACGAA-------ACGACCGAAAAAAA--CTGGTTACGAAATGAC
gi|5 : TGTAATCAATTAATTA-ATGGGACATACTTTA--------------TTATCTAGTATCTATAATAAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTACAAGGACCCAAT-----TTTTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAt
gi|5 : AAAACTTACTCCAT--GTGTG--TCAT----TT-T--T--CTTCAT--TAT--TCGTCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAGT-----ATGTTC------AA--TCGGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------TGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGT-CATTTT--T-----CTTCATTATTCGTCTTTATAAACCATTTACAAAGT-----ATGTT---CAA--TC---------G--------GTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTT-TTCATTTTGATATGAT--TATATTATCATTGAACATTGTTTTATTCATCT--TTATGAACCATTTACAC--ATTATT--TTCGA--C--C---------GGTTACGAAATGACCGAAA--------AA--GTG-G--TTACGAAANN-N--N--NNNNNN--CAT--T-ATTT--TC------GA----CCG------G--TTACGAA-------ATGACCGAAA--AA--GTGGTTACGAAACGACCGAAAggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgATAAACCGGTTACGA--AATGAC--TT------------------GGTTACGAAATGACCtaaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaTTGGTTACGAAATGACCTCAACCCtcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTACTGATATTTTAGCATgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : AAAACTTGCTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----GTGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTTTTTCATTTTAATATGATTATATCATCAT-----------AAAACTACTATAAAACAATGTTTTGTTCAT----------CAATATGAACCATTTACACCTT-ATTTTCAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-CATTTT--T-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----GTGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTT-T---TTCA-------T--T-T----TAAT-------------------ATGATTATA--TCATC-ATAA--AA--------CTA--C---------------TATAAAA----CAATGTTTTGTTCATCAATATGAACCAT----TT-A--CACCTTATT--T----TCAACCGGTTAC-A--AAATGACCAAAAAAGTGGTTACAAAATGACCGACATTT------AAAACTGGTTATGAAATGACCGAAAggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|7 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagTTGCAGTTAAAGGACCAAATAG--A-TCAGTCACACTGTAATATA-TTGCATTTAAAG-----------GATAGTTACAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----ATTAAACTAA--GTA---AACGATAAAGACCAATCACAATGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTCA------------------TCAATCAATGACATGGAAAATACTTCAATTTTTAATTGCAATTATCTA-TATCTATAATAAGCAATTAACATAATAATTAATA---GTTAAAATTACTCATT-----TTGTTTCTTAATTCTGAAACTAATTATTGACATATTAGCATGG---AAAAAATATAGGTCAAATTAAACCACAT----CAC-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------t
gi|7 : TCACTTTT-CATTTTAATATGATTTTAATGTCAgattttaatgtca
gi|8 : ttgcagttaaaggaccaaatagatcagtcacactgtaatatattgcatttaaaggatagttacaggataatcggcaattagcataatagttattaattaaactaagtaaacgataaagaccaatcacaatgtaatattttatttacaattaaaggataatcggcaattagcataatagtcatcaatcaatgacatggaaaatacttcaatttttaattgcaattatctatatctataataagcaattaacataataattaatagttaaaattactcattttgtttcttaattctgaaactaattattgacatattagcatggaaaaaatataggtcaaattaaaccacaTATTATCATGGAATGAAAAATATAAGACAAATTACATCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATCTTAATATTATAGAAATACCATTAAATAT-TGTTTTTTTTCTTTCTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTGCACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACGAAAACTTACTCCAAGTATGTCA-----------T-------G--TATG---TCA---------------------------------ATTT------AATATGATTTTAA--CATC----------ATTA--AAAT-ACTAAAA---A--ACA-----ATG--T--T----TTAT--T--CATCTT--TAT--TCAACT--TTAT-G--AA----
gi|9 : atatcatttatctttttttacttaaatctctattaaaattattttttgccttacgacagatatatttataatcctgtttagcttcatTGGTTAAA--CTAATCAAATGCAGTAAATCAATCACACTG-AAATA-------TTTTAATTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTCTTAATACCTAAATTGATTATTGACAGATTAGCATGGAAT
gi|9 : tAAAACTTACTCTATGTATGTCATTTTT-CATTTTCATATGATTTTAATAttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactctatgtatgtcatttttcattttcatatgattttaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAACTTACTACATGTATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|23 ): AAAAGTGGTTACGGAACGACCGAAAAAAAAAGGTTACGAAATGACTTGGTTACGAAATGAC
Unaligned ( gi|25 ): AAATGACCGAAAAATAGTTACCAAACAACTTAAATTAAGTGGTTTCAAAATGACCAGA
Unaligned ( gi|26 ): CTATTGACCACACTACGGCGAGAAAGTCGGCTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333 222 7777777777777777777777 11 1 22222222222222222222222222222 33333333333333333 11111 1111 2222222222 111111 33333333333 1111111 1111 33333333333333333333333 222222222222222 11 222222222 1111111 222222 33333333333 2222222222222 2222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 888888888 111 1 1 1 3333333333333333333333 1 1 1 1 1 66 6 0 22 0 1 2 77 5 0 3 0 5 1 11 99999999999999999999999999999 0 9999 22222222222222222 66 888 0 5 2 7 1 0 0 1 66 0 0 2 1 888 0 11111 1 0000 5 6666666666 222222 88888888888 1 3 3 99999 0 1 77777 0 555 66 999999999999999999 1 4 4 3333333 55 8888 55555555555555555555555 55 1 8888 1 333333333333333 0 2 2 000 666 55 8888 4 55 55 55 55 11 4 55 8888 000000000 6666666 222222 66 5 0 11111111111 2222222222222 9999999999 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : ......... ... . . . ...................... . . . . . .. . . .. . . . .. . . . . . . .. ............................. . .... ................. .. ... . . . . . . . . .. . . . . ... . ..... . .... . .......... ...... ........... . . . ..... . . ..... . ... .. .................. . . . ....... .. .... ....................... .. . .... . ............... . . . ... ... .. .... . .. .. .. .. .. . .. .... ......... ....... ...... .. . . ........... ............. .......... . .................................................................................................................
lowQualScore : 555555555 555 0 0 0 5555555555555555555555 0 0 0 0 0 22 5 8 33 1 1 5 99 7 7 6 0 0 4 11 44444444444444444444444444444 1 4444 66666666666666666 99 888 5 0 8 3 4 8 2 0 44 1 8 8 8 888 8 11111 0 6666 0 9999999999 888888 00000000000 0 6 6 11111 1 0 77777 4 000 55 555555555555555555 1 0 0 0000000 55 0000 00000000000000000000000 55 3 3333 1 666666666666666 3 3 9 888 444 00 5555 0 55 55 55 55 00 0 55 5555 777777777 2222222 222222 11 7 4 77777777777 2222222222222 2222222222 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
Reference ( family-1120 ) : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
gi|1 : ATTCTTCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGATTTTGTTGGCCGATACAAACTTCACTTGGGTTTCCACGTATGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATGGTGGTGCCACCCGATTCCTGGCGCTAAGTCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATAAAAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAA-----------GATA-----------TTCGGTAATTAATATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATGTAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTATAATCAATCAATTACACGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATAAGCAATCAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCTATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCCTAAAATAT-CGCTTTATT-----CATCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAA-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TCC-TTCC-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--GTCAA--C--C---------GGTTACGAAATTACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAA-----ATGTAC------AA--CCGGTAACGAAATGACAAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TG-TTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACTC
gi|10 : TTTA-AATTAAAGGATTATCGACAATTAGCATAATAGTTACTAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATCACACTGAAAATACTTTA-CTTTTAATT------------------------GCAATTA------T--TTATTA---GTTAAAATGACTCATT-----TTGTTTCTTAACACCAAAATTA----TTGACATATTAGCATGGAATTAAAAATATTAGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTTT---------TC------ATTTTAATAT-----------CTTAAAAATACCATAAAGTAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTATGAAATGTTCAAAACTTACTCCAT-CATGTCATTT-TTC-ttc
gi|11 : tgttgacatctCACAAT-----ATGTTC------AA--CTGGTTATGAAAAGACCAAAACTTACTCCATGTATATCATTTTT-CATTTTAATATGATTTTAACATCATAAAAATACTAAAAAAC----AA-------TGTTTTATTCATCTTAATTCAACTTTATAAACCATTTACACATT-ATTTTCTACC
gi|11 : ATGT--TTTATTC-ATCT-------T--AAT----TCAA-------------------CT--TTATAAACCATTTACAC--ATTATT--TTCTA--C--C---------GATTATGAAATGACCAAAAgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaCAACTTTTTTAACCGGTTACGAAAT-----G---------A--CC---------GAAAATATGGTTACAAAATGACCGAAAatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgacTT---TAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAataacagggtacgaaatgacc
gi|12 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaactttTACTCTAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTAACGAAATTACCAAAACTTACTCCATGCATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATGTTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|13 : ATTATTGTGC-CCGGAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATC------------A-TT---------------------GATA-----------ATCGGCAATTAACATTATAGTT----ATTAGATAA-----A-----CTAA--TTA---AAGGATAAAAAACAATCACACTGTAATATATT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATCAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATT
gi|14 : ACATGGTAATTGTGAAATTATTATAAATTTTAATTGCAGTTAAAGGAT
gi|14 : gaatgtatagatacaacaaTA-A-TTGCAGTTAAAG-----------GATA-----------ATCAGCAATTAGCATAACAGTTTTAAGTTA----A-----A-----CTAA--TTA---AATGCAAGAGATCAATCACACTGTAATATTTTAATTGACAaatcagcaattagcataacagttttaagttaaactaattaaatgcaagagatcaatcacactgtaatattttaattgacata
gi|15 : gaatgtatagatacaacaaacatggtaattgtgaaattattataaatttAATAA-----------GAAAAAAGTAT-ATAAATTATACATATTGTT----------TTATTCATCTTCATAAAACATTT--ATAAT-----G-GTTATGCAATGCCTAATAGTATG--------GTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAGTTATGta
gi|15 : tgaaT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TCATAAAACATTTATAATGGTTATG----CAATGC--CTAATAGTATGGTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAG--TTATG--aaatgacaagataccgaaaaataat
gi|16 : tgaaaataagaaaaaagtatataaattatacatattgt------ATGTTAATAT-----------CATAAAAATACTATAAAACAA-TGTTTTATT-----CATCTTGTTTCAGCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATTTT---CCA--CC---------G--------ATTACAAAATGACCAAAAaaatgacaagataccgaaaaataat
gi|18 : tgAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|19 : gttgcgaaatgaccgacatataaTTACAAAATGACCGATATT---TAAAACT---------G--------GTTATGAAATGACCGAAAaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaatcgaaatttaggttacgatatgacttagttacgaaatgacc
gi|2 : tggATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCC---------ATTT---GGTGAGTTTGTTGGCCGATACCAACTTCACTTGGGTCTCCATGTAGGCTGCCTCAC----------------------GTAAAATTGCGGTGCCACTCGGGTCCTTGCGTTTAGCCTCTTGTGCCAGCCTGAAAATACATAAACA--G-AATACAAT--TAAAT--TAAT-----TTAAA--AATAAATAA--A-TAAATCA-AC---AATA-A-TTAT-ATTATAT-----------CATG-----------AT------TT---ATAATA-TT----ATT-----A-----A-----aaatagttatgaaacgactgaaacaaaaacggttacgaaatgacttggttacaaaatgacctgatc
gi|2 : TGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACTCCGTAATA-AATTGTAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATTAGTTAA-----A-----CTAA--CTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-AT-------------GTAAT-----ATT----TAATTGT----AATCAATTAATT--------------ACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATGTAGTATCTATAATTAGCAATTAACAAAATAATAAATA---GTTAAAAGGACTCAT---------TTTCATAATACTGAAATTAATTATTGACATTTTAGGATGGAATAAAATATAGATGTCAAATTACATCATGT----CATGTTTGAATTTAATATG------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-TATTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGTT---CAG--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTT-TTC-ATTT-------TAATATGA--TTAT-------------------ATTATCATAAAACATTtgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaatattattttattcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatatgttcagccggttacgaaatgaccaaaacttactgcatgtatgtcatttttcattttaatatgattatattatcataaaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|2 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttaATA--TTAT----TT-TATT--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AG--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTTTT-CATTTTAATATGATTATATTATCAT-----------AAAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATTCATGTCCAACgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|20 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----AGTTAAA-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATGTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTCAATTATTACAAtttcggtacctaataaaaa
gi|21 : CTGAAA--TACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCA
gi|22 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgt--------GTTACGAAATGACCGAAA
gi|24 : agctgttacgaaatgtccgacatttaaaagttAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACaagtggttacgaaacgaccggaaaaaaaaacggttaagaaatgacttg
gi|3 : aaaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaTAAAT---AATGACAGTTAAC--ATTAACCAGTGACTCAATCACACTGTAATATA-TTGCAATTAAAGGATAATTAAAGGATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----G-----TTAAACTTATTTAACGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTTATAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTGCATGGGAAATACTTCA-CTTTTAATTGCAGTTATTTAGTATCTATAATTAGCAATTAACATAATAATTAATAATAGTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTATTTAATACTGAAATTAATTATTGACATATTAGCATGGAATAAAAA-TATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CATGGAAATATCATAAAATAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATCCATCTTTATAAACCATTTACATAAT---------------------------------------TT--GAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCN-------N--NNN----NNNN-------------------NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN--NNNNN--N--N---------NNNNNNNNNNNNNNNAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CATTTTAATATGATTATATTATCATAA--AA----CTA---------CTATAAAACA----ATGTTttggttacgaaat
gi|3 : aAACTTACTCCATGTATGTCAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATTATATTATCATAAAACTACTATAAAACAA-TGTTTTA---------------TTCATCTTTATGAACCATTTACACATT-----GTTTT---CAA--CC---------ttattcatctttatgaaccatttacacattgttttcaacc
gi|4 : ataaataatgacagttaacattaaccagtgactcaatcacactgtaatatattgcaattaaaggataattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaacttatttaacgatatagaccaatcacactgtaatattttatttacaattaaaggataatcggcaattagcataatagttataagttaattaattgtaatcaatcaattgcatgggaaatacttcacttttaattgcagttatttagtatctataattagcaattaacataataattaataatagttaaaaggactcattttgttatttaatactgaaattaattattgacatattagcatggaataaaaatataggtcaaataacaccatgtcatttttcattttaatatcatggaaatatcataaaatattgttttattcttctttatccatctttataaaccatttacataatttgaaatgaccgaaacttactccatgtatgtcatttttcttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaACATGATAATGGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A----CAGTTA------------------------------TTGG---------------TT----A-------A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ACTTACAATTAAAGAATAATCGGCAATTAGCTTTATAGTTAAAAGTAAATTAATTGTAATCAATCAATTACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTGTAATTAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACCCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAA-TTA----------TCAATATGATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACAAAATGACCAAAACTTACACCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCGT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AGTATG--TTCAA--C--C---------GGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--TTATA--CCAT----TT-T--T--CATTTT--GAT----ATGA--TTAT-ATTAA-----TG------G--TTACGAA-------ACGACCGAAAAAAA--CTGGTTACGAAATGAC
gi|5 : TGTAATCAATTAATTA-ATGGGACATACTTTA--------------TTATCTAGTATCTATAATAAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTACAAGGACCCAAT-----TTTTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAt
gi|5 : AAAACTTACTCCAT--GTGTG--TCAT----TT-T--T--CTTCAT--TAT--TCGTCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAGT-----ATGTTC------AA--TCGGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------TGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGT-CATTTT--T-----CTTCATTATTCGTCTTTATAAACCATTTACAAAGT-----ATGTT---CAA--TC---------G--------GTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTT-TTCATTTTGATATGAT--TATATTATCATTGAACATTGTTTTATTCATCT--TTATGAACCATTTACAC--ATTATT--TTCGA--C--C---------GGTTACGAAATGACCGAAA--------AA--GTG-G--TTACGAAANN-N--N--NNNNNN--CAT--T-ATTT--TC------GA----CCG------G--TTACGAA-------ATGACCGAAA--AA--GTGGTTACGAAACGACCGAAAggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgATAAACCGGTTACGA--AATGAC--TT------------------GGTTACGAAATGACCtaaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaTTGGTTACGAAATGACCTCAACCCtcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTACTGATATTTTAGCATgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : AAAACTTGCTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----GTGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTTTTTCATTTTAATATGATTATATCATCAT-----------AAAACTACTATAAAACAATGTTTTGTTCAT----------CAATATGAACCATTTACACCTT-ATTTTCAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-CATTTT--T-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----GTGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTT-T---TTCA-------T--T-T----TAAT-------------------ATGATTATA--TCATC-ATAA--AA--------CTA--C---------------TATAAAA----CAATGTTTTGTTCATCAATATGAACCAT----TT-A--CACCTTATT--T----TCAACCGGTTAC-A--AAATGACCAAAAAAGTGGTTACAAAATGACCGACATTT------AAAACTGGTTATGAAATGACCGAAAggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|7 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagTTGCAGTTAAAGGACCAAATAG--A-TCAGTCACACTGTAATATA-TTGCATTTAAAG-----------GATAGTTACAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----ATTAAACTAA--GTA---AACGATAAAGACCAATCACAATGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTCA------------------TCAATCAATGACATGGAAAATACTTCAATTTTTAATTGCAATTATCTA-TATCTATAATAAGCAATTAACATAATAATTAATA---GTTAAAATTACTCATT-----TTGTTTCTTAATTCTGAAACTAATTATTGACATATTAGCATGG---AAAAAATATAGGTCAAATTAAACCACAT----CAC-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------t
gi|8 : TATTATCATGGAATGAAAAATATAAGACAAATTACATCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATCTTAATATTATAGAAATACCATTAAATAT-TGTTTTTTTTCTTTCTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTGCACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACGAAAACTTACTCCAAGTATGTCA-----------T-------G--TATG---TCA---------------------------------ATTT------AATATGATTTTAA--CATC----------ATTA--AAAT-ACTAAAA---A--ACA-----ATG--T--T----TTAT--T--CATCTT--TAT--TCAACT--TTAT-G--AA----gattttaatgtca
gi|9 : atatcatttatctttttttacttaaatctctattaaaattattttttgccttacgacagatatatttataatcctgtttagcttcatTGGTTAAA--CTAATCAAATGCAGTAAATCAATCACACTG-AAATA-------TTTTAATTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTCTTAATACCTAAATTGATTATTGACAGATTAGCATGGAAT
gi|9 : tAAAACTTACTCTATGTATGTCATTTTT-CATTTTCATATGATTTTAATAttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactctatgtatgtcatttttcattttcatatgattttaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAACTTACTACATGTATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|23 ): AAAAGTGGTTACGGAACGACCGAAAAAAAAAGGTTACGAAATGACTTGGTTACGAAATGAC
Unaligned ( gi|25 ): AAATGACCGAAAAATAGTTACCAAACAACTTAAATTAAGTGGTTTCAAAATGACCAGA
Unaligned ( gi|26 ): CTATTGACCACACTACGGCGAGAAAGTCGGCTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333 222 7777777777777777777777 11 1 22222222222222222222222222222 33333333333333333 11111 1111 2222222222 111111 33333333333 1111111 1111 33333333333333333333333 222222222222222 11 222222222 1111111 222222 33333333333 2222222222222 2222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 888888888 111 1 1 1 3333333333333333333333 1 1 1 1 1 66 6 0 22 0 1 2 77 5 0 3 0 5 1 11 99999999999999999999999999999 0 9999 22222222222222222 66 888 0 5 2 7 1 0 0 1 66 0 0 2 1 888 0 11111 1 0000 5 6666666666 222222 88888888888 1 3 3 99999 0 1 77777 0 555 66 999999999999999999 1 4 4 3333333 55 8888 55555555555555555555555 55 1 8888 1 333333333333333 0 2 2 000 666 55 8888 4 55 55 55 55 11 4 55 8888 000000000 6666666 222222 66 5 0 11111111111 2222222222222 9999999999 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : ......... ... . . . ...................... . . . . . .. . . .. . . . .. . . . . . . .. ............................. . .... ................. .. ... . . . . . . . . .. . . . . ... . ..... . .... . .......... ...... ........... . . . ..... . . ..... . ... .. .................. . . . ....... .. .... ....................... .. . .... . ............... . . . ... ... .. .... . .. .. .. .. .. . .. .... ......... ....... ...... .. . . ........... ............. .......... . .................................................................................................................
lowQualScore : 555555555 555 0 0 0 5555555555555555555555 0 0 0 0 0 22 5 8 33 1 1 5 99 7 7 6 0 0 4 11 44444444444444444444444444444 1 4444 66666666666666666 99 888 5 0 8 3 4 8 2 0 44 1 8 8 8 888 8 11111 0 6666 0 9999999999 888888 00000000000 0 6 6 11111 1 0 77777 4 000 55 555555555555555555 1 0 0 0000000 55 0000 00000000000000000000000 55 3 3333 1 666666666666666 3 3 9 888 444 00 5555 0 55 55 55 55 00 0 55 5555 777777777 2222222 222222 11 7 4 77777777777 2222222222222 2222222222 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
Reference ( family-1120 ) : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
gi|1 : ATTCTTCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGATTTTGTTGGCCGATACAAACTTCACTTGGGTTTCCACGTATGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATGGTGGTGCCACCCGATTCCTGGCGCTAAGTCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATAAAAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAA-----------GATA-----------TTCGGTAATTAATATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATGTAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTATAATCAATCAATTACACGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATAAGCAATCAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCTATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCCTAAAATAT-CGCTTTATT-----CATCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAA-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TCC-TTCC-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--GTCAA--C--C---------GGTTACGAAATTACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAA-----ATGTAC------AA--CCGGTAACGAAATGACAAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TG-TTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACTC
gi|10 : TTTA-AATTAAAGGATTATCGACAATTAGCATAATAGTTACTAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATCACACTGAAAATACTTTA-CTTTTAATT------------------------GCAATTA------T--TTATTA---GTTAAAATGACTCATT-----TTGTTTCTTAACACCAAAATTA----TTGACATATTAGCATGGAATTAAAAATATTAGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTTT---------TC------ATTTTAATAT-----------CTTAAAAATACCATAAAGTAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTATGAAATGTTCAAAACTTACTCCAT-CATGTCATTT-TTC-ttc
gi|11 : tgttgacatctCACAAT-----ATGTTC------AA--CTGGTTATGAAAAGACCAAAACTTACTCCATGTATATCATTTTT-CATTTTAATATGATTTTAACATCATAAAAATACTAAAAAAC----AA-------TGTTTTATTCATCTTAATTCAACTTTATAAACCATTTACACATT-ATTTTCTACC
gi|11 : ATGT--TTTATTC-ATCT-------T--AAT----TCAA-------------------CT--TTATAAACCATTTACAC--ATTATT--TTCTA--C--C---------GATTATGAAATGACCAAAAgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaCAACTTTTTTAACCGGTTACGAAAT-----G---------A--CC---------GAAAATATGGTTACAAAATGACCGAAAatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgacTT---TAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAataacagggtacgaaatgacc
gi|12 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaactttTACTCTAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTAACGAAATTACCAAAACTTACTCCATGCATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATGTTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|13 : ATTATTGTGC-CCGGAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATC------------A-TT---------------------GATA-----------ATCGGCAATTAACATTATAGTT----ATTAGATAA-----A-----CTAA--TTA---AAGGATAAAAAACAATCACACTGTAATATATT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATCAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATT
gi|14 : ACATGGTAATTGTGAAATTATTATAAATTTTAATTGCAGTTAAAGGAT
gi|14 : gaatgtatagatacaacaaTA-A-TTGCAGTTAAAG-----------GATA-----------ATCAGCAATTAGCATAACAGTTTTAAGTTA----A-----A-----CTAA--TTA---AATGCAAGAGATCAATCACACTGTAATATTTTAATTGACAaatcagcaattagcataacagttttaagttaaactaattaaatgcaagagatcaatcacactgtaatattttaattgacata
gi|15 : gaatgtatagatacaacaaacatggtaattgtgaaattattataaatttAATAA-----------GAAAAAAGTAT-ATAAATTATACATATTGTT----------TTATTCATCTTCATAAAACATTT--ATAAT-----G-GTTATGCAATGCCTAATAGTATG--------GTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAGTTATGta
gi|15 : tgaaT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TCATAAAACATTTATAATGGTTATG----CAATGC--CTAATAGTATGGTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAG--TTATG--aaatgacaagataccgaaaaataat
gi|16 : tgaaaataagaaaaaagtatataaattatacatattgt------ATGTTAATAT-----------CATAAAAATACTATAAAACAA-TGTTTTATT-----CATCTTGTTTCAGCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATTTT---CCA--CC---------G--------ATTACAAAATGACCAAAAaaatgacaagataccgaaaaataat
gi|18 : tgAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|19 : gttgcgaaatgaccgacatataaTTACAAAATGACCGATATT---TAAAACT---------G--------GTTATGAAATGACCGAAAaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaatcgaaatttaggttacgatatgacttagttacgaaatgacc
gi|2 : tggATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCC---------ATTT---GGTGAGTTTGTTGGCCGATACCAACTTCACTTGGGTCTCCATGTAGGCTGCCTCAC----------------------GTAAAATTGCGGTGCCACTCGGGTCCTTGCGTTTAGCCTCTTGTGCCAGCCTGAAAATACATAAACA--G-AATACAAT--TAAAT--TAAT-----TTAAA--AATAAATAA--A-TAAATCA-AC---AATA-A-TTAT-ATTATAT-----------CATG-----------AT------TT---ATAATA-TT----ATT-----A-----A-----aaatagttatgaaacgactgaaacaaaaacggttacgaaatgacttggttacaaaatgacctgatc
gi|2 : TGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACTCCGTAATA-AATTGTAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATTAGTTAA-----A-----CTAA--CTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-AT-------------GTAAT-----ATT----TAATTGT----AATCAATTAATT--------------ACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATGTAGTATCTATAATTAGCAATTAACAAAATAATAAATA---GTTAAAAGGACTCAT---------TTTCATAATACTGAAATTAATTATTGACATTTTAGGATGGAATAAAATATAGATGTCAAATTACATCATGT----CATGTTTGAATTTAATATG------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-TATTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGTT---CAG--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTT-TTC-ATTT-------TAATATGA--TTAT-------------------ATTATCATAAAACATTtgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaatattattttattcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatatgttcagccggttacgaaatgaccaaaacttactgcatgtatgtcatttttcattttaatatgattatattatcataaaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|2 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttaATA--TTAT----TT-TATT--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AG--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTTTT-CATTTTAATATGATTATATTATCAT-----------AAAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATTCATGTCCAACgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|20 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----AGTTAAA-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATGTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTCAATTATTACAAtttcggtacctaataaaaa
gi|21 : CTGAAA--TACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCA
gi|22 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgt--------GTTACGAAATGACCGAAA
gi|24 : agctgttacgaaatgtccgacatttaaaagttAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACaagtggttacgaaacgaccggaaaaaaaaacggttaagaaatgacttg
gi|3 : aaaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaTAAAT---AATGACAGTTAAC--ATTAACCAGTGACTCAATCACACTGTAATATA-TTGCAATTAAAGGATAATTAAAGGATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----G-----TTAAACTTATTTAACGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTTATAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTGCATGGGAAATACTTCA-CTTTTAATTGCAGTTATTTAGTATCTATAATTAGCAATTAACATAATAATTAATAATAGTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTATTTAATACTGAAATTAATTATTGACATATTAGCATGGAATAAAAA-TATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CATGGAAATATCATAAAATAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATCCATCTTTATAAACCATTTACATAAT---------------------------------------TT--GAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCN-------N--NNN----NNNN-------------------NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN--NNNNN--N--N---------NNNNNNNNNNNNNNNAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CATTTTAATATGATTATATTATCATAA--AA----CTA---------CTATAAAACA----ATGTTttggttacgaaat
gi|3 : aAACTTACTCCATGTATGTCAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATTATATTATCATAAAACTACTATAAAACAA-TGTTTTA---------------TTCATCTTTATGAACCATTTACACATT-----GTTTT---CAA--CC---------ttattcatctttatgaaccatttacacattgttttcaacc
gi|4 : ataaataatgacagttaacattaaccagtgactcaatcacactgtaatatattgcaattaaaggataattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaacttatttaacgatatagaccaatcacactgtaatattttatttacaattaaaggataatcggcaattagcataatagttataagttaattaattgtaatcaatcaattgcatgggaaatacttcacttttaattgcagttatttagtatctataattagcaattaacataataattaataatagttaaaaggactcattttgttatttaatactgaaattaattattgacatattagcatggaataaaaatataggtcaaataacaccatgtcatttttcattttaatatcatggaaatatcataaaatattgttttattcttctttatccatctttataaaccatttacataatttgaaatgaccgaaacttactccatgtatgtcatttttcttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaACATGATAATGGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A----CAGTTA------------------------------TTGG---------------TT----A-------A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ACTTACAATTAAAGAATAATCGGCAATTAGCTTTATAGTTAAAAGTAAATTAATTGTAATCAATCAATTACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTGTAATTAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACCCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAA-TTA----------TCAATATGATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACAAAATGACCAAAACTTACACCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCGT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AGTATG--TTCAA--C--C---------GGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--TTATA--CCAT----TT-T--T--CATTTT--GAT----ATGA--TTAT-ATTAA-----TG------G--TTACGAA-------ACGACCGAAAAAAA--CTGGTTACGAAATGAC
gi|5 : TGTAATCAATTAATTA-ATGGGACATACTTTA--------------TTATCTAGTATCTATAATAAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTACAAGGACCCAAT-----TTTTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAt
gi|5 : AAAACTTACTCCAT--GTGTG--TCAT----TT-T--T--CTTCAT--TAT--TCGTCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAGT-----ATGTTC------AA--TCGGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------TGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGT-CATTTT--T-----CTTCATTATTCGTCTTTATAAACCATTTACAAAGT-----ATGTT---CAA--TC---------G--------GTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTT-TTCATTTTGATATGAT--TATATTATCATTGAACATTGTTTTATTCATCT--TTATGAACCATTTACAC--ATTATT--TTCGA--C--C---------GGTTACGAAATGACCGAAA--------AA--GTG-G--TTACGAAANN-N--N--NNNNNN--CAT--T-ATTT--TC------GA----CCG------G--TTACGAA-------ATGACCGAAA--AA--GTGGTTACGAAACGACCGAAAggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgATAAACCGGTTACGA--AATGAC--TT------------------GGTTACGAAATGACCtaaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaTTGGTTACGAAATGACCTCAACCCtcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTACTGATATTTTAGCATgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : AAAACTTGCTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----GTGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTTTTTCATTTTAATATGATTATATCATCAT-----------AAAACTACTATAAAACAATGTTTTGTTCAT----------CAATATGAACCATTTACACCTT-ATTTTCAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-CATTTT--T-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----GTGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTT-T---TTCA-------T--T-T----TAAT-------------------ATGATTATA--TCATC-ATAA--AA--------CTA--C---------------TATAAAA----CAATGTTTTGTTCATCAATATGAACCAT----TT-A--CACCTTATT--T----TCAACCGGTTAC-A--AAATGACCAAAAAAGTGGTTACAAAATGACCGACATTT------AAAACTGGTTATGAAATGACCGAAAggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|7 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagTTGCAGTTAAAGGACCAAATAG--A-TCAGTCACACTGTAATATA-TTGCATTTAAAG-----------GATAGTTACAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----ATTAAACTAA--GTA---AACGATAAAGACCAATCACAATGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTCA------------------TCAATCAATGACATGGAAAATACTTCAATTTTTAATTGCAATTATCTA-TATCTATAATAAGCAATTAACATAATAATTAATA---GTTAAAATTACTCATT-----TTGTTTCTTAATTCTGAAACTAATTATTGACATATTAGCATGG---AAAAAATATAGGTCAAATTAAACCACAT----CAC-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------t
gi|8 : TATTATCATGGAATGAAAAATATAAGACAAATTACATCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATCTTAATATTATAGAAATACCATTAAATAT-TGTTTTTTTTCTTTCTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTGCACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACGAAAACTTACTCCAAGTATGTCA-----------T-------G--TATG---TCA---------------------------------ATTT------AATATGATTTTAA--CATC----------ATTA--AAAT-ACTAAAA---A--ACA-----ATG--T--T----TTAT--T--CATCTT--TAT--TCAACT--TTAT-G--AA----gattttaatgtca
gi|9 : atatcatttatctttttttacttaaatctctattaaaattattttttgccttacgacagatatatttataatcctgtttagcttcatTGGTTAAA--CTAATCAAATGCAGTAAATCAATCACACTG-AAATA-------TTTTAATTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTCTTAATACCTAAATTGATTATTGACAGATTAGCATGGAAT
gi|9 : tAAAACTTACTCTATGTATGTCATTTTT-CATTTTCATATGATTTTAATAttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactctatgtatgtcatttttcattttcatatgattttaata
blockSeqs : . . G C G . T G T T T TT T CG A G TG C C T A G AG AAGGATAATTAAAGGATA TTAA AGATAAA AC TTT A A C G A AT T A ATA NNNNN A ATGT G GAATTTAATA AATATG GATTATATTAT T A A TCTTT C GACCG ATG TG TAATAGTATG A A A GATATGA AA ATTA TGAACATTGTTTTATTCATCT TG T GATT T TGCCTAATAGTAT G C TCA AA GAAA A AT AC AA GA TA A TT ATGA AAAAAGTGG ATGACCG GAAAAA AA T AAAAATACTAA TACTATAAAACAA CTTAATTCAA C
blockSeqs : A TG C TT G G . . T T . A AA AAGGATAGTTACAGGATA . AGTTAAA . . . T A G C C T T . . T . . T . GATCTTAATAT A . G . A . . AA GAAAATATG G . . . . GA ATTA . T TT A CATC G C T . . . . . . . GG . . . T ACA GAAA . . . AA . .
blockSeqs : T . . TG A G . . T . . G AA AAGGATA . AGTTAAA . . . T C G A C T A . . A . . . . . T . A . T . . . G G . . . . G ATGA . A GT A CC N C G . . . . . . . . . . . T AT . . . . AT . .
blockSeqs : . G G . . T . . G AG TATCATG . AATTAAA . . . A T G C C A A . . T . . . . . A . A . C . . . G A . . . . . CT . N NN N NN G C T . . . . . . . . . . . G AT . . . . AT . .
blockSeqs : . A G . . . . . G AT AAGGATA . AAA . . . T A G C C A T . . T . . . . . T . A . A . . . G G . . . . . CT . G GT A CC G C T . . . . . . . . . . . T AT . . . . AT . .
blockSeqs : G . . . . . . . A GATA . AA . . . A A . A . N N . . T . . . . . T . A . A . . . G G . . . . . CT . T TT G CC G T T . . . . . . . . . . . G GT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AG . . . . . . A . . . . . A . . . . . A . A . T . . . G A . . . . . NN . A CT T C . . A . . . . . . . . . . . T AT . .
blockSeqs : . AA . . A . . T . T . C . . . G G . . . . . CT . A G A . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . A . . . G G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . G G .
blockSeqs : A . . . G A
blockSeqs : C . . . G A
blockSeqs : . . G A
blockSeqs : . G A
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : AGTAAA***********
originalCons : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATT-----A-----A-----CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
finalCons : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTT----ATTAGTAAA-----------CTAA--TTA---AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAACTTACTACATGTATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|23 ): AAAAGTGGTTACGGAACGACCGAAAAAAAAAGGTTACGAAATGACTTGGTTACGAAATGAC
Unaligned ( gi|25 ): AAATGACCGAAAAATAGTTACCAAACAACTTAAATTAAGTGGTTTCAAAATGACCAGA
Unaligned ( gi|26 ): CTATTGACCACACTACGGCGAGAAAGTCGGCTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333 222 7777777777777777777777 11 1 222222222222222222222222222222 2222 11111 1111 2222222222 111111 33333333333 1111111 1111 33333333333333333333333 222222222222222 11 222222222 1111111 222222 33333333333 2222222222222 2222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 888888888 111 1 1 1 3333333333333333333333 1 1 1 1 1 66 6 0 22 0 1 2 77 5 4 3 0 55 11 999999999999999999999999999999 0 0 4444 0 5 2 7 1 0 0 1 66 0 0 2 1 888 0 11111 1 0000 5 6666666666 222222 88888888888 1 3 3 99999 0 1 77777 0 555 66 999999999999999999 1 4 4 3333333 55 8888 55555555555555555555555 55 1 8888 1 333333333333333 0 2 2 000 666 55 8888 4 55 55 55 55 11 4 55 8888 000000000 6666666 222222 66 5 0 11111111111 2222222222222 9999999999 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : ......... ... . . . ...................... . . . . . .. . . .. . . . .. . . . . .. .. .............................. . . .... . . . . . . . . .. . . . . ... . ..... . .... . .......... ...... ........... . . . ..... . . ..... . ... .. .................. . . . ....... .. .... ....................... .. . .... . ............... . . . ... ... .. .... . .. .. .. .. .. . .. .... ......... ....... ...... .. . . ........... ............. .......... . .................................................................................................................
lowQualScore : 555555555 555 0 0 0 5555555555555555555555 0 0 0 0 0 22 5 8 33 1 1 5 99 7 3 6 0 11 11 555555555555555555555555555555 1 1 9999 5 0 8 3 4 8 2 0 44 1 8 8 8 888 8 11111 0 6666 0 9999999999 888888 00000000000 0 6 6 11111 1 0 77777 4 000 55 555555555555555555 1 0 0 0000000 55 0000 00000000000000000000000 55 3 3333 1 666666666666666 3 3 9 888 444 00 5555 0 55 55 55 55 00 0 55 5555 777777777 2222222 222222 11 7 4 77777777777 2222222222222 2222222222 7 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
consensus : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTTATTAG-T-AAACTAATTAAAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
Reference ( family-1120 ) : ATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGANTTTGTTGGCCGATACNAACTTCACTTGGGTCTCCACGTANGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATNGCGGTGCCACCCGGNTCCTNGCGCTNAGCCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATGANAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAGTTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTTATTAG-T-AAACTAATTAAAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCNTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTACACGGGANATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATNAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTATTGACATNTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CANAGAAATACCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACANAAT-----ATGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCAA--C--C---------GGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACCC
gi|1 : ATTCTTCCTTCCATTTGCCGAGTCCTCTTCTTTTGTTTATTGGTGATTTTGTTGGCCGATACAAACTTCACTTGGGTTTCCACGTATGCTGCCTCACGGTTTAGTAGTTGAACCGTCACGTAAAATGGTGGTGCCACCCGATTCCTGGCGCTAAGTCTCCTGTGCCGGCCTGGAAATACATAAAAATTGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A-TTGCAATTAAAA-----------GATA-----------TTCGGTAATTAATATAATAGTTATTA------ACTAATTAAAGGATGTAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATTATAATCAATCAATTACACGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTATAATAAGCAATCAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACTCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCTATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCCTAAAATAT-CGCTTTATT-----CATCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAA-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TCC-TTCC-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--GTCAA--C--C---------GGTTACGAAATTACCAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAA-----ATGTAC------AA--CCGGTAACGAAATGACAAAAACTTACTCCATGTATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------AGAAC----AT-------TG-TTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTACGAAATGACCTCAACTC
gi|10 : TTTA-AATTAAAGGATTATCGACAATTAGCATAATAGTTACTAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATCACACTGAAAATACTTTA-CTTTTAATT------------------------GCAATTA------T--TTATTA---GTTAAAATGACTCATT-----TTGTTTCTTAACACCAAAATTA----TTGACATATTAGCATGGAATTAAAAATATTAGTCAAATTACACCATGT----CAT-TTTT---------TC------ATTTTAATAT-----------CTTAAAAATACCATAAAGTAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTATGAAATGTTCAAAACTTACTCCAT-CATGTCATTT-TTC-ttc
gi|11 : tgttgacatctCACAAT-----ATGTTC------AA--CTGGTTATGAAAAGACCAAAACTTACTCCATGTATATCATTTTT-CATTTTAATATGATTTTAACATCATAAAAATACTAAAAAAC----AA-------TGTTTTATTCATCTTAATTCAACTTTATAAACCATTTACACATT-ATTTTCTACC
gi|11 : ATGT--TTTATTC-ATCT-------T--AAT----TCAA-------------------CT--TTATAAACCATTTACAC--ATTATT--TTCTA--C--C---------GATTATGAAATGACCAAAAgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaCAACTTTTTTAACCGGTTACGAAAT-----G---------A--CC---------GAAAATATGGTTACAAAATGACCGAAAatatggtaatgaaatgaccaacttttttaaccggttacgaaatgaccgaaaatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|11 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgacTT---TAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAataacagggtacgaaatgacc
gi|12 : cacaatatgttcaactggttatgaaaagaccaaaacttactccatgtatatcatttttcattttaatatgattttaacatcataaaaatactaaaaaacaatgttttattcatcttaattcaactttataaaccatttacacattattttctaccgattatgaaatgaccaaaaatatggtaatgaaatgaccaactttTACTCTAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AA--CCGGTAACGAAATTACCAAAACTTACTCCATGCATGTCATTTTT-CATTTTGATATGATTATGTTATCAT-----------AGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCAACatatggttacaaaatgaccgaaaataacagggtacgaaatgacc
gi|13 : ATTATTGTGC-CCGGAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCA-------------------TT---------------GATA-----------ATCGGCAATTAACATTATAGTTATTAGAT-AAACTAATTAAAGGATAAAAAACAATCACACTGTAATATATT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATCAGCTTAATAGTTAAAAGTTAATTAATT
gi|14 : ACATGGTAATTGTGAAATTATTATAAATTTTAATTGCAGTTAAAGGAT
gi|14 : gaatgtatagatacaacaaTA-A-TTGCAGTTAAAG-----------GATA-----------ATCAGCAATTAGCATAACAGTTTTAAGTT-AAACTAATTAAATGCAAGAGATCAATCACACTGTAATATTTTAATTGACAaatcagcaattagcataacagttttaagttaaactaattaaatgcaagagatcaatcacactgtaatattttaattgacata
gi|15 : gaatgtatagatacaacaaacatggtaattgtgaaattattataaatttAATAA-----------GAAAAAAGTAT-ATAAATTATACATATTGTT----------TTATTCATCTTCATAAAACATTT--ATAAT-----G-GTTATGCAATGCCTAATAGTATG--------GTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAGTTATGta
gi|15 : tgaaT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TCATAAAACATTTATAATGGTTATG----CAATGC--CTAATAGTATGGTAACGAAATGACC-AGACTTTC-CCAG--TTATG--aaatgacaagataccgaaaaataat
gi|16 : tgaaaataagaaaaaagtatataaattatacatattgt------ATGTTAATAT-----------CATAAAAATACTATAAAACAA-TGTTTTATT-----CATCTTGTTTCAGCTTTATAAACCATTTACACAAT-----ATTTT---CCA--CC---------G--------ATTACAAAATGACCAAAAaaatgacaagataccgaaaaataat
gi|18 : tgAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACCGAAAatatggttattaaatgactaacattttaaac
gi|19 : gttgcgaaatgaccgacatataaTTACAAAATGACCGATATT---TAAAACT---------G--------GTTATGAAATGACCGAAAaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaatcgaaatttaggttacgatatgacttagttacgaaatgacc
gi|2 : tggATTCTCCCTTCCATTTGCCGAGTCC---------ATTT---GGTGAGTTTGTTGGCCGATACCAACTTCACTTGGGTCTCCATGTAGGCTGCCTCAC----------------------GTAAAATTGCGGTGCCACTCGGGTCCTTGCGTTTAGCCTCTTGTGCCAGCCTGAAAATACATAAACA--G-AATACAAT--TAAAT--TAAT-----TTAAA--AATAAATAA--A-TAAATCA-AC---AATA-A-TTAT-ATTATAT-----------CATG-----------AT------TT---ATAATA-TTATTAA-T-aaatagttatgaaacgactgaaacaaaaacggttacgaaatgacttggttacaaaatgacctgatc
gi|2 : TGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACTCCGTAATA-AATTGTAATTAAAG-----------GATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTTATTAGTT-AAACTAACTAAAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-AT-------------GTAAT-----ATT----TAATTGT----AATCAATTAATT--------------ACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATGTAGTATCTATAATTAGCAATTAACAAAATAATAAATA---GTTAAAAGGACTCAT---------TTTCATAATACTGAAATTAATTATTGACATTTTAGGATGGAATAAAATATAGATGTCAAATTACATCATGT----CATGTTTGAATTTAATATG------ATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-TATTTTATT-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGTT---CAG--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTT-TTC-ATTT-------TAATATGA--TTAT-------------------ATTATCATAAAACATTgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaatattattttattcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatatgttcagccggttacgaaatgaccaaaacttactgcatgtatgtcatttttcattttaatatgattatattatcataaaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|2 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttaATA--TTAT----TT-TATT--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----ATGTTC------AG--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTGCATGTATGTCATTTTT-CATTTTAATATGATTATATTATCAT-----------AAAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATTCATGTCCAACgttttattcatctttatgaaccatttacacattcatgtccaactttcggtacctaataaaaa
gi|20 : attctcccttccatttgccgagtccatttggtgagtttgttggccgataccaacttcacttgggtctccatgtaggctgcctcacgtaaaattgcggtgccactcgggtccttgcgtttagcctcttgtgccagcctgaaaatacataaacagaatacaattaaattaatttaaaaataaataaataaatcaacaataattatattatatcatgatttataatattattaatgttattatttttttacatattatactcatattatattaaaccatgatttatattattatgttttttacgtaccttcgcagtcttttttttatgcaattaaaggattaaatagatcaatcactccgtaataaattgtaattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaactaactaaaggatatagaccaatcacactgtaatattttatgtaatatttaattgtaatcaattaattacatgggacatacttcacttttaattgcaattatgtagtatctataattagcaattaacaaaataataaatagttaaaaggactcattttcataatactgaaattaattattgacattttaggatggaataaaatatagatgtcaaattacatcatgtcatgtttgaatttaatatgattttaatatcaaagaaatatcataaaCAATTAGCATAATAGTTATTAG-TTAAACTAATTAAAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATGTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCTCAATTATTACAAtttcggtacctaataaaaa
gi|21 : CTGAAA--TACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCAT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AATATG--TTCA
gi|22 : ccatattgtcaattggatgtatctatatctgaagtcgt--------GTTACGAAATGACCGAAA
gi|24 : agctgttacgaaatgtccgacatttaaaagttAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACaagtggttacgaaacgaccggaaaaaaaaacggttaagaaatgacttg
gi|3 : aaaaaatggttacgaaacgaccgaaaaaTAAAT---AATGACAGTTAAC--ATTAACCAGTGACTCAATCACACTGTAATATA-TTGCAATTAAAGGATAATTAAAGGATA-----------ATCGGCAATTAGCATAATAGTTATTAG-TTAAACTTATTTAACGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTTATAAGTTAATTAATTGTAATCAATCAATTGCATGGGAAATACTTCA-CTTTTAATTGCAGTTATTTAGTATCTATAATTAGCAATTAACATAATAATTAATAATAGTTAAAAGGACTCATT-----TTGTTATTTAATACTGAAATTAATTATTGACATATTAGCATGGAATAAAAA-TATAGGTCAAATAACACCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------CATGGAAATATCATAAAATAT-TGTTTTATT-----CTTCTTTATCCATCTTTATAAACCATTTACATAAT---------------------------------------TT--GAAATGACCGAAACTTACTCCATGTATGTCATTT-TTC-TTCN-------N--NNN----NNNN-------------------NN--NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNN--NNNNN--N--N---------NNNNNNNNNNNNNNNAAAACTTACTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CATTTTAATATGATTATATTATCATAA--AA----CTA---------CTATAAAACA----ATGTTttggttacgaaat
gi|3 : aAACTTACTCCATGTATGTCAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATTATATTATCATAAAACTACTATAAAACAA-TGTTTTA---------------TTCATCTTTATGAACCATTTACACATT-----GTTTT---CAA--CC---------ttattcatctttatgaaccatttacacattgttttcaacc
gi|4 : ataaataatgacagttaacattaaccagtgactcaatcacactgtaatatattgcaattaaaggataattaaaggataatcggcaattagcataatagttattagttaaacttatttaacgatatagaccaatcacactgtaatattttatttacaattaaaggataatcggcaattagcataatagttataagttaattaattgtaatcaatcaattgcatgggaaatacttcacttttaattgcagttatttagtatctataattagcaattaacataataattaataatagttaaaaggactcattttgttatttaatactgaaattaattattgacatattagcatggaataaaaatataggtcaaataacaccatgtcatttttcattttaatatcatggaaatatcataaaatattgttttattcttctttatccatctttataaaccatttacataatttgaaatgaccgaaacttactccatgtatgtcatttttcttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaACATGATAATGGCGATATTATTGTAAATTGTAATTGCAATTAAAGGATTAAATAG--A-TCAATCACACTGTAATA-A----CAGTT------------------------------ATTGG---TTAA---ACTAATTA-----------------AAGGATATAGACCAATCACACTGTAATATTTT-ACTTACAATTAAAGAATAATCGGCAATTAGCTTTATAGTTAAAAGTAAATTAATTGTAATCAATCAATTACATGGGACATACTTCA-CTTTTAATTGCAATTATCTAGTATCTGTAATTAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTAAAAGGACCCAAT-----TTGTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAAAAAATATAGGTCAAATTACACCATGT----CAA-TTA----------TCAATATGATTTTAATAT-----------CAAAGAAATATCATAAAATAT-CGTTTTATT-----CTTCTTTATTTATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----ATGGT---CAA--CC---------G--------GTTACAAAATGACCAAAACTTACACCATGTATGTCATTT-TTC-TTCT-------T--TAT----TCGT-------------------CT--TTATAAACCATTTACAA--AGTATG--TTCAA--C--C---------GGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCAT--TTATA--CCAT----TT-T--T--CATTTT--GAT----ATGA--TTAT-ATTAA-----TG------G--TTACGAA-------ACGACCGAAAAAAA--CTGGTTACGAAATGAC
gi|5 : TGTAATCAATTAATTA-ATGGGACATACTTTA--------------TTATCTAGTATCTATAATAAGCAATTAACAAAATAATTAATA---GTTACAAGGACCCAAT-----TTTTTTCTTAATACTGCAATTAATTATTGACATTTTAGCATGGAATAt
gi|5 : AAAACTTACTCCAT--GTGTG--TCAT----TT-T--T--CTTCAT--TAT--TCGTCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAGT-----ATGTTC------AA--TCGGTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTTTT-CATTTTGATATGATTATATTATCAT-----------TGAAC----AT-------TGTTTTATTCAT----------CTTTATGAACCATTTACACATT-ATTTTCGACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGT-CATTTT--T-----CTTCATTATTCGTCTTTATAAACCATTTACAAAGT-----ATGTT---CAA--TC---------G--------GTAACGAAATGACCAAAACTTACTCCATTTATGTAATTT-TTCATTTTGATATGAT--TATATTATCATTGAACATTGTTTTATTCATCT--TTATGAACCATTTACAC--ATTATT--TTCGA--C--C---------GGTTACGAAATGACCGAAA--------AA--GTG-G--TTACGAAANN-N--N--NNNNNN--CAT--T-ATTT--TC------GA----CCG------G--TTACGAA-------ATGACCGAAA--AA--GTGGTTACGAAACGACCGAAAggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgATAAACCGGTTACGA--AATGAC--TT------------------GGTTACGAAATGACCtaaaccggttacgaaatgacttggttacgaaatgacctcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|5 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaTTGGTTACGAAATGACCTCAACCCtcaacccgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : tgtaatcaattaattaatgggacatactttattatctagtatctataataagcaattaacaaaataattaatagttacaaggacccaatttttttcttaatactgcaattaattattgacattttagcatggaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactccatgtgtgtcatttttcttcattattcgtctttataaaccatttacaaagtatgttcaatcggtaacgaaatgaccaaaacttactccatttatgtaatttttcattttgatatgattatattatcattgaacattgttttattcatctttatgaaccatttacacattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaannnnnnnnnncattattttcgaccggttacgaaatgaccgaaaaagtggttacgaaacgaccgaaataaaccggttacgaaatgacGGACTCATT-----TTGTTTCTTAATACTGAAATTAATTACTGATATTTTAGCATgaaatgagcaggtcgtgctttgagaaagttggtta
gi|6 : AAAACTTGCTCCAT--GTATG--TCAT----TT-T--T--CTTCTT--TAT--TCATCT--TTAT-A--AA----CCA------T--TTACAAAAT-----GTGTTC------AA--CCGGTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTTTTTCATTTTAATATGATTATATCATCAT-----------AAAACTACTATAAAACAATGTTTTGTTCAT----------CAATATGAACCATTTACACCTT-ATTTTCAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGT-CATTTT--T-----CTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTACAAAAT-----GTGTT---CAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCAAAACTTACTACATGTATGGCATTT-T---TTCA-------T--T-T----TAAT-------------------ATGATTATA--TCATC-ATAA--AA--------CTA--C---------------TATAAAA----CAATGTTTTGTTCATCAATATGAACCAT----TT-A--CACCTTATT--T----TCAACCGGTTAC-A--AAATGACCAAAAAAGTGGTTACAAAATGACCGACATTT------AAAACTGGTTATGAAATGACCGAAAggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|6 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtAA--CC---------G--------GTTACGAAATGACCaaattgtaacgaaacaactgaaaagaaccggttacgaaatgacct
gi|7 : ggactcattttgtttcttaatactgaaattaattactgatattttagcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttgctccatgtatgtcatttttcttctttattcatctttataaaccatttacaaaatgtgttcaaccggttacgaaatgaccaaaacttactacatgtatggcattttttcattttaatatgattatatcatcataaaactactataaaacaatgttttgttcatcaatatgaaccatttacaccttattttcaaccggttacaaaatgaccaaaaaagtggttacaaaatgaccgacatttaaaactggttatgaaatgaccgaaaaaattgtaacgaaacaactgaaaagTTGCAGTTAAAGGACCAAATAG--A-TCAGTCACACTGTAATATA-TTGCATTTAAAG-----------GATAGTTACAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTTATTAA-TTAAACTAAGTAAACGATAAAGACCAATCACAATGTAATATTTT-ATTTACAATTAAAGGATAATCGGCAATTAGCATAATAGTCA------------------TCAATCAATGACATGGAAAATACTTCAATTTTTAATTGCAATTATCTA-TATCTATAATAAGCAATTAACATAATAATTAATA---GTTAAAATTACTCATT-----TTGTTTCTTAATTCTGAAACTAATTATTGACATATTAGCATGG---AAAAAATATAGGTCAAATTAAACCACAT----CAC-TTT----------TC------ATTTTAATAT-----------t
gi|8 : TATTATCATGGAATGAAAAATATAAGACAAATTACATCATGT----CAT-TTT----------TC------ATTTTAATATGATCTTAATATTATAGAAATACCATTAAATAT-TGTTTTTTTTCTTTCTTCTTTATTCATCTTTATAAACCATTTGCACAAT-----ATGTT---CAA--CT---------G--------GTTACGAAATGACGAAAACTTACTCCAAGTATGTCA-----------T-------G--TATG---TCA---------------------------------ATTT------AATATGATTTTAA--CATC----------ATTA--AAAT-ACTAAAA---A--ACA-----ATG--T--T----TTAT--T--CATCTT--TAT--TCAACT--TTAT-G--AA----gattttaatgtca
gi|9 : atatcatttatctttttttacttaaatctctattaaaattattttttgccttacgacagatatatttataatcctgtttagcttcatTGGTTAAA--CTAATCAAATGCAGTAAATCAATCACACTG-AAATA-------TTTTAATTGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTTTCTTAATACCTAAATTGATTATTGACAGATTAGCATGGAAT
gi|9 : tAAAACTTACTCTATGTATGTCATTTTT-CATTTTCATATGATTTTAATAttgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaacttactctatgtatgtcatttttcattttcatatgattttaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAACTTACTACATGTATGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
Unaligned ( gi|23 ): AAAAGTGGTTACGGAACGACCGAAAAAAAAAGGTTACGAAATGACTTGGTTACGAAATGAC
Unaligned ( gi|25 ): AAATGACCGAAAAATAGTTACCAAACAACTTAAATTAAGTGGTTTCAAAATGACCAGA
Unaligned ( gi|26 ): CTATTGACCACACTACGGCGAGAAAGTCGGCTA