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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTTTAAT---ATATTCAATTTTAGATATA-TATTTTTCAATAAAACGTGCCATGAATAAAGGTCT--TATTTGATAAGGAGATAGTAACTTC--------TTATC-AATTCACATTCCTTCAATGTACCCTTCCACCAGACAGAGCCGCCGACGTCACACCATTTACAGTATGATACGACGGCGACAACACGAGATTACAACTTCAAATCAGGATAACGCGCACCACTCAACCTGACAACACGAGATCACAACTTCAAAACAGGTAAACGCACATCACTCAACTAGACAACACTT----GATTACAACT-TCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACGAGATAATATTTTCAACATAACAGCACCATCAATA--AAGGCCGAAAAACCCACACCAACAGAGACCAATAGACTTTTGTTTAACTGTGTATATATTTAATCTTTATCTCAGTCTCATCAATGTACAACATA-ATA--ATA-ATAA-----TAATAGCATGATGT--ATGATGATCCATTAATCAAATCTGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATA------TTTTTTCCAATGCTGAGCATTGTATTGTGAGCAGGGGAATTTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTACATAT-TATATTTTTCATGTTTTA-GGTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATA--ATAAATGACATGATAGCCATATTTGTTGAGATGTAAATAT-TAATTTT-TA-T-T--TT-------------------ATATA------TCATAAGATGG-----------AA--------------ACATTAC-A------------------C------------------GGAAGTACATGAACTGTTTA-TTAGTTTAATTTGTGCCTTAAGGA-CAA------TCAA-ACAAAGATCAAATAATTGAAATGACAACTGAGATA---AAC-G-TTTCCTGTAATTATATCCTGAAAGAGGTGTATATATA--GA--CTGATCT------C-G---CA-G---------TT------CA--GA-A---ATACACACTCTTT--GGGGTATATATCATTGCAGGTAAGCAAAATGTTTT-ATTTTCAAAT-ATTCTGTTTAAATTAAATTACCAT-AACTCAAACTTCTGGTTAAAATAT--TAAATTAACACTTGCCTCGATTGA---AT---TTTAACTTTAGAAATTATATTTAAAAACATATTGTTCATCGAACATTTAT---GATCATTATGTGATTAAGATATTAAGAATTAC-ATT-AA-GTTACTAG--ACTATAATTAATTTAAGTCACTATACCTTATGCCTTACACAATCTCTCATATAAGCGAGTAAT-TTCCCATCTATTAAA-ATCATGTTATAACGTTTATTGA-TAGTTGATT-CTATTTTGTAACATACGAGTATGTTAATATGTATTTGAA-TTCTGTTTGACAACATATATTTGACTTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATATT-ATATTTCATTTTGTATGTATTTGGTTTCTGTATGTAGATGTACATAA-AAGTCAGAGTTCAGAAATAAACACTCTTT--GAGATATTTATTATCGCAGTTATCATTTGCTCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTTTCATTTTATATTAAACTTTAGTAAAA-TATTTTTCAATAAAACGTACCATGAACAAAGGTCT--TATGTCAGATGGAAATAGTAACTTCGCCATATGTTATCGAATTCACATTCCTTCAATGCACCCTCCTACCAGACAGAGCCGCCGGCGTCACGCCATTTCCGGTATGATACGACAGAGACAACACGATATTACAACTTCAAAACAGGACAACGCGCACCACTTAACCAGACAACACGAGATTACACCTTC
gi|2                          :               cataaatcaagaccaagaagccaagttttttgtataatgtaaccgatgtattgcttaattaaataccgatatgtattaataacacgttcttgtccgacaaaaaaaaatttgctgtggtttaacccaccatttatataaaccatcatttttaccaaaattgcgtaattaagtaaagtttaattgatattctttgatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcacgctatctgcttggatatttgtatttgagtttgcaataaagctttagtatctttttatatcgcagggtcataactgtatggttatttgttgttaaagcaattatgatataaaaacgcaaaggacagtgtgagcaaaagttatactttagtacggtatttaaattattagattgaaatgatgcaataaaacgataatccctatattccgttgacaaatttatgtaaatgtgaatgaatgaaatacgacgtagaacaagtgaccttatgatagttagaccacccatacttaatttcttcgactcttaatataattatatcattgttggtaatattcagtataatatgcctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgccccccaccccccacctttgatgaaaaaacacaacaagatcttcagaaaagtgactaaatcaaatgggtaaaattattattaagcaaaataggtttcattTTTTTTAA----ATATTCAATTTTAGATAGAATATGTTTCAATAAAACGTGCCATGAATAAAGGTCTAATGTTAGAT--GGAAATAGTAACTTTGCTATATGTTATC-AATTCACATTCCGTCAATGCACCTTTCCACCAGACAGAGCCACCGACGTCACGCCAATTCCAGTGCGATACGACAGAGACAACACGAGATTTCAACTTCACAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAATA
gi|9                          : cataaatcaagaccaagtagccaagttttttttgcataatgttaccgatgtattgcttaataaaataccgatatgtactaataacacgttcttgtccgacaaaataacatgctgctgcggtataacccaccatttatataaaccattatttttaccaaaattgcgtaataaagtaaagtttaattgatattctttaatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcgcgctatctgcttggatatttgtagttgagtttgcaataaagctttagtatctttttacatcgcagggtcataactatatggttatttattgttatagcaattatatataaaaacgcaagggacagtttgagcaaaagttatattttagtacggtttttaaattattagattgaaataatttaagccagtaaatcactgcatatgaacgttggaagcatgcatatgcgataaaacaattatccctatattccgttgtcaaatttatgtaaatgtaaatgaatgaaatacgacgtaaaacaaatgcactaccttctgatagtctacagatagaccacccatacctaatttcttcttaatataattatatcattgttggtaatattcaatataacatacctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgcgcctccctccccctccccctctttgatgaaaaagaaaatacaagatcttcagaaaggtggcaaaaataaaatagatcaaattattattgacaaattaggtttcattACGTGCCATGAACAAACGTCT--AATGTCAGATGGAAATAGTAACTTCGCCTTATGTTATC-AATTCACATTCCTTCCATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGATGTCACGCCATTTCCAGTATGTTACGACAGAGAAAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATAttttcaacattaccaccatcaat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAAAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTT----tttccaacaatacaccacaaccaacagaaaagccgagaaatcaacaataacagagaactatatacttttgttttactgtgtatatatttagtctttatcgcagtctcatcaatgtacaacttaataataataatagcatgctgtatgatcatccatacatcaaacccgacaagaacctcgctcacgaaccatattttgtttttttccaatgcggaacattgtattgtgagcggaagaatttttcacaaaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acgtgccatgaacaaacgtctaatgtcagatggaaatagtaacttcgccttatgttatcaattcacattccttccatgcaccctcccaccagacagagccgccgatgtcacgccatttccagtatgttacgacagaGACAACACGATATTACAACTTCAAAACAGGACAACGCGCACCACTTAACCAGACAACACGA----GATTACACCT-TCccaacaatacaccacaaccaacagaaaagccgagaaatcaacaataacagagaactatatacttttgttttactgtgtatatatttagtctttatcgcagtctcatcaatgtacaacttaataataataatagcatgctgtatgatcatccatacatcaaacccgacaagaacctcgctcacgaaccatattttgtttttttccaatgcggaacattgtattgtgagcggaagaatttttcacaaaga
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gi|9                          :                                                               cataaatcaagaccaagtagccaagttttttttgcataatgttaccgatgtattgcttaataaaataccgatatgtactaataacacgttcttgtccgacaaaataacatgctgctgcggtataacccaccatttatataaaccattatttttaccaaaattgcgtaataaagtaaagtttaattgatattctttaatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcgcgctatctgcttggatatttgtagttgagtttgcaataaagctttagtatctttttacatcgcagggtcataactatatggttatttattgttatagcaattatatataaaaacgcaagggacagtttgagcaaaagttatattttagtacggtttttaaattattagattgaaataatttaagccagtaaatcactgcatatgaacgttggaagcatgcatatgcgataaaacaattatccctatattccgttgtcaaatttatgtaaatgtaaatgaatgaaatacgacgtaaaacaaatgcactaccttctgatagtctacagatagaccacccatacctaatttcttcttaatataattatatcattgttggtaatattcaatataacatacctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgcgcctccctccccctccccctctttgatgaaaaagaaaatacaagatcttcagaaaggtggcaaaaataaaatagatcaaattattattgacaaattaggtttcattttttttaaatattcaattttagatagaatatgtttcaataaaacgtgccatgaataaaggtctaatgttagatggaaatagtaactttgctatatgttatcaattcacattccgtcaatgcacctttccaccagacagagccaccgacgtcacgccaattccagtgcgatacgacagaAGAAAACACGA----GATTACAACT-TCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATACACCACAACCAACAGAAAAGCCGAGAAATCAACAATAACAGAGAACTATATACTTTTGTTTTACTGTGTATATATTTAGTCTTTATCGCAGTCTCATCAATGTACAAC-T---TA--ATA-ATAA-----TAATAGCATGCTGT--ATGATCATCCATACATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCGGAACATTGTATTGTGAGCGGAAGAATTTTTCACAAAGA--t
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gi|2                          :                                                                                                                        cataaatcaagaccaagaagccaagttttttgtataatgtaaccgatgtattgcttaattaaataccgatatgtattaataacacgttcttgtccgacaaaaaaaaatttgctgtggtttaacccaccatttatataaaccatcatttttaccaaaattgcgtaattaagtaaagtttaattgatattctttgatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcacgctatctgcttggatatttgtatttgagtttgcaataaagctttagtatctttttatatcgcagggtcataactgtatggttatttgttgttaaagcaattatgatataaaaacgcaaaggacagtgtgagcaaaagttatactttagtacggtatttaaattattagattgaaatgatgcaataaaacgataatccctatattccgttgacaaatttatgtaaatgtgaatgaatgaaatacgacgtagaacaagtgaccttatgatagttagaccacccatacttaatttcttcgactcttaatataattatatcattgttggtaatattcagtataatatgcctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgccccccaccccccacctttgatgaaaaaacacaacaagatcttcagaaaagtgactaaatcaaatgggtaaaattattattaagcaaaataggtttcattttttttcattttatattaaactttagtaaaatatttttcaataaaacgtaccatgaacaaaggtcttatgtcagatggaaatagtaacttcgccatatgttatcgaattcacattccttcaatgcaccctcctaccagacagagccgccggcgtcacgccatttccggtatgatacgacagAGACAACACGA----GATTTCAACT-TCACAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAATATTTTCAACATTAC--CACCATCAATcgagattacaccttc
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATGTTTCACAAAGA--TTTAATTT-GTGAAATTGTAAATAT-TATCT-----AT-TTTTA-TATATTATTTTAA-TGAA-TTGTTATTGAAATATTATAAA--ACA-GAT
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTCACCAAAA--TTTTATTTTGTGAAATTG-AAAAAT-TATA-TTTTGATGTTTTACGGTATCATTTCAA-TAAA-TTATTATTGAAATA--TTATATGATATATTATTCAAATTCGTGGAGTTGTAAAT-----ATTTC-TATT-T--TT-------------------ATATA------TTATAAGATGGTAGCACCATATAAAATCATTTTATTGCACATTGCAA------------------C------------------GGAAATGCATGATATG-TAA-TTAGTTTATTTTGTGCCTTACGGA-AAAACAGGGCCAA-GTAAAGG--AAAAAACTGAAATGTTAGCTAAGATA---GAC-ATTTTTCTGT-TTTGTGTCCTGGACGA-TTATGTAAAAA--AA--TTGATCT------
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATATGTA---A--TTGATTT------CTG---TATG---------TTGATGTGCA--TA-ATATATAAACAACCTTC--GGGATATATATTATTGCAGTTActa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatacaaaaaatattgatatttcatttA-G---------TT------CA-----A---ATATACACTCTTTTCGGGACATATAT-GTTACAGTTAtcatttgctccctaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacatgaaccaatgtgaaaattgatatatacatatgtgtgaacggtttgatccgtcttacaaagaccaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atgtatttgatttctgtatgttgatgtacataatatatataACACAATCGT---GGGATATAAAT--TTA-AGGTAAGCGAAATGTTTT-TATTTCAAATGATTTTGTTTAAATCAT-TTATGAA-AAGTCAAACTTCTTGTTAAAATTT--CAAGTTAAAACTTGTCTCGATTTAATGAT---TTTAACTTT--------TGTTCAAACATATATTGTTCTTCAAACA---ATACGGAGAACTATGTTAATGATAAATTAAGAATTTCTTTT-AA-ATGACTAG--ACCATAATTAATCTAAGTCACTATACTTGATACCTT-CACCATCTCTCACATAAGCGAGTAAT-TCCCCATCTTGTAAATATCGTGTTTGAACGATTATTTATTTTTTTATTCCTGTTTTGTAACtaaattgatccccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccagataataacaacataaagttcagaacgaggttaaaaagaaaaacgacccgtctgaaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatataagagattgagcgcaaacagtggtattcaatgattaaTATACAAAAAATATTGATATTTCATTTTATATGTAATTGATTTCTGTATGTTGATGTGCATAA----T----------ATATAAACAACCTTC--GGGATATATATTATTGCAGTTATCATTTGCTCC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAATATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGACATATA-TGTTACAGTTATAAATTGATCCctaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacatgaaccaatgtgaaaattgatatatacatatgtgtgaacggtttgatccgtcttacaaagaccaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): CCGCCAGTTTTGCAAGCCATTAAGCTGCGTAATAAAGTAAAGTTGAAGAGATATTATTTTTACAAATAAAGTATTATTTGAACAAATAAAGTATGAACATTGCGTAAAAGCTCTGTTCATGAAAGCTATGTTAAGGTGAAAAGTCACCAATCTGCTTAGATATTTTGAGTTGACAATGGTATTTTGCACCTTTTTATACCGATGGCCCATAACTGTATGGTTTATTTTTGTGTTAATATTTATATTCAAAATACACAATTGAGCAAAAGTTAACTTTTGGTACGGTATTCGAAACATAAGGCCAATTAAACATTGCTTCTGAATATTGGAAGCATACGTAGTCAATAAAA
Unaligned ( gi|13 ): TAGCAATTATATATAAAATACGCAAAGGACAGTTTGAGTAATAGTTATATTTTTTACGGTATTCAAATTATTAGATTTAATTGATTTAGGCCAGTAAATCACTGCATCTGAACATTGGAAGCATGCATATGCAACAAAAACGATTATCCCTATATTCCGTTGTCAAATGTATGCAAGTGTAAATGAATAAAATACGACGCAAAACAAATACACTACCTTATGAT






Alignments
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Reference ( family-1101 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTNATTTTATATTNAACTTTAGNNAGAATATNTTTCAATAAAACGTGCCATGAACAAAGGTCTTATGTCAGATGGAAATAGTAACTTCGCCATATGTTATC-AATTCACATTCCTTCAATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGACGTCACGCCATTTCCGGTACGATACGACAGAGACAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAACA----CGAGATTACAACT-TCAA--AACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAATATTTCCAACANTACACCACNACCAACAGAAAAGCCGAGAAATCAACAATAACAGAGAACTATATACTTTTGTTTTACTGTGTATATATNTAGTCNTTATCGCAGTCTCATCAATGTACAACGTATATATTATATATAATTCCTTGATAGCATGCTGTTAATNATCGTCCATACATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCGGAACATTGTATTGTGAGCGGAAGAATNTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTANATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTTA-GGTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTAAATGACATGTTATTCATATTCGTNGAGATGTAAATAT-TAATTTTT-A-TTTT--------------------ATATA------TTATAAGATGGTAGC------------------AT------------------TAC--------AC------------------GGAAGTACATGAAATGTTTAATTAGTTTAATTTGTGCCTTAAGGAACAA-----CCAAACGAAGGTCAAATAATTGAAATGACAGCTAANATAAACAGTTTCCTATAATTGTATCCTGGANGAGGTGTATATAN-A--GA--TTGATCT------CG---CAG---------T-----TCA--GA-AAT---ACACANTCTTCGGGATATATATNATTGCAGGTAAGCGAAATGTTTTTATTTCCAAAT-ATTTTGTTTAAATT-AAATTACTATAANTCGAACTTCTGGTTAAAATAT--CGAGTTAAAACTCGTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCATCGAACAATTATGAGAACTATGTTAATGATAAATTAAGAATTACNTT-AAGTGACTA--GACCATAATTAATTTAAGTCGCTATACTTCATACCTTTCACCATCTCTCACATAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTNTAAATATCGTGTNNNAATGTTTATTNA-TANTTGATTCCTGTTTTGTAACA------TATGTTAATATGTATTTGAATTCT-GTTTAACAACATCTATTTAA-TTC-TGTTAAACAACATAT-------ATGTATAAAATATTGATATTTCATTTTATATGTANTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAATATATATAAGTTC--ANATATACACTCTTCTCGGGATATATATTATTGCAGTTATCATTTGCTCC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATGTTTCACAAAGA--TTTAATTT-GTGAAATTGTAAATAT-TATCTATTTTT-AT--------ATATTATTTTAA-TGAA-TTGTTATTGAAATATTATAAAACAGATTAccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccagataataacaacataaagttcagaacgaggttaaaaagaaaaacgacccgtctgaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttaatagtttaattctccatatgatttaagatttatgcATATATGTAATCATTATTTCAGTCTCATCAATGTACAACGTATATATTATATATAATTCCTTGATAACATG-TGTTAATTATGGTCg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTAA----ATATTCAATTTTAGATAGAATATGTTTCAATAAAACGTGCCATGAATAAAGGTCTAATGTTAGATGGAAATAGTAACTTTGCTATATGTTATC-AATTCACATTCCGTCAATGCACCTTTCCACCAGACAGAGCCACCGACGTCACGCCAATTCCAGTGCGATACGACAGAGACAACACGAGATTTCAACTTCACAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAATATTTTCAACATTACCACCATCAA--
gi|3                          : cataaatcaagaccaagtagccaagttttttttgcataatgttaccgatgtattgcttaataaaataccgatatgtactaataacacgttcttgtccgacaaaataacatgctgctgcggtataacccaccatttatataaaccattatttttaccaaaattgcgtaataaagtaaagtttaattgatattctttaatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcgcgctatctgcttggatatttgtagttgagtttgcaataaagctttagtatctttttacatcgcagggtcataactatatggttatttattgttatagcaattatatataaaaacgcaagggacagtttgagcaaaagttatattttagtacggtttttaaattattagattgaaataatttaagccagtaaatcactgcatatgaacgttggaagcatgcatatgcgataaaacaattatccctatattccgttgtcaaatttatgtaaatgtaaatgaatgaaatacgacgtaaaacaaatgcactaccttctgatagtctacagatagaccacccatacctaatttcttcttaatataattatatcattgttggtaatattcaatataacatacctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgcgcctccctccccctccccctctttgatgaaaaagaaaatacaagatcttcagaaaggtggcaaaaataaaatagatcaaattattattgacaaattaggtttcattTTTTTTCATTTTATATTAAACTTTAGTAA-AATATTTTTCAATAAAACGTACCATGAACAAAGGTCTTATGTCAGATGGAAATAGTAACTTCGCCATATGTTATCGAATTCACATTCCTTCAATGCACCCTCCTACCAGACAGAGCCGCCGGCGTCACGCCATTTCCGGTATGATACGACAGAGACAACACGATATTACAACTTCAAAACAGGACAACGCGCACCACTTAACCAGACAACA----CGAGATTACACCT-TCt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cataaatcaagaccaagaagccaagttttttgtataatgtaaccgatgtattgcttaattaaataccgatatgtattaataacacgttcttgtccgacaaaaaaaaatttgctgtggtttaacccaccatttatataaaccatcatttttaccaaaattgcgtaattaagtaaagtttaattgatattctttgatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcacgctatctgcttggatatttgtatttgagtttgcaataaagctttagtatctttttatatcgcagggtcataactgtatggttatttgttgttaaagcaattatgatataaaaacgcaaaggacagtgtgagcaaaagttatactttagtacggtatttaaattattagattgaaatgatgcaataaaacgataatccctatattccgttgacaaatttatgtaaatgtgaatgaatgaaatacgacgtagaacaagtgaccttatgatagttagaccacccatacttaatttcttcgactcttaatataattatatcattgttggtaatattcagtataatatgcctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgccccccaccccccacctttgatgaaaaaacacaacaagatcttcagaaaagtgactaaatcaaatgggtaaaattattattaagcaaaataggtttcattTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTGCAAAT-TT--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTAAATAACATGTTAGCCATAGTTGTTGAAATGTAAATAT-TAATCTTT-A-TTTT---------------------T-TA------TCATAA-----T----------------------T------------------TAC--------A------------------------TACATGAAA-GTTTTATTGGTT-AATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAACGAAGATCAAATAATTGCATTGACAAATAAT-TAAACAGTTTCCTATAATTATCTCCTGAAGTAGGTGCATATAT-A--GA--ATGGGTT------CG---CAG---------T-----TCA--GA-TAA---ACTCTCTTTTCGGGATATATATGATTGCAGGTAAGAAAAAGGTTT--ATTTC-AAAT-ATTCTGTTTAAATT-AAATTACTATAACTAAAACTTCTG-TTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTCCAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCACCGAACAATTATGATCATTATGTTATTAAGAAATTAAGAATTACATT-TAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCTATATCTCATACTTTTCACAATATCTCACTTAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTTTAAA-ATCGTGTAGTATTGTTAATTGA-TAATTGATT-CTGTTTTGTAATA------TATGTAAATATGTGTTTGAATTCT-GTTTAACAACATCTAT-----TTC-TGTTAAACAACATAT-------ATGTATAAAATATTGATGTCTCATTTTACATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAGTATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGATATATATGATTGCAGTTATCATTTGTTCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAAT-GTACA-ATCTA--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AC-TTTTTATTGCAATATTAAATAACATGTTATCCATACTTGTTGAAATATAACTAT-TAATCTTT-A-TTTT--------------------TTATA------TCATA---TG------------------------T------------------TAC--------AC------------------GGATGCACATGAAATGTTTA-TTGGTTTAATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAAGTAAAATCAAATATCTGCAATGACAAATAAT-TAAATAGTTTCCTA--ATTATATCCTAAAAGAGGTGTATATAT-ATAGAGCTTGGTCT------CG---CAG---------T-----TCA--GA-TAT---ACACACTCTTCGGGATATATATTATTGCAGGTAAGCAAAAGGTTTT-ATTTC-AAAT-ATTCTTTTTAAATT-AAATTACTATAACTCAAACTTCTGGTTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAATTATGTTTAAAAATGTATTGTTCACAGAACAATTATGATCATTATGATATTAAGAAATTAATAATTACATT-AAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCAACACCTCATACCTTCCACAATCTCTCACATAAGCAAGTAAT--TCCCCAGCTATTAAA-ATCATGTAGTAATGTTTTTTGA-TAATTGA-----------TA----------ATGTTAATA--TATTTGAATTCT-GTTTAATAACATCTATTTAATTTC-TGTTAAACAACATAT-------ATGTATAAAATGTTGATATTTCATTTTATATGTAATTGATATCTGTATGTTGATGTACATATTATATA-AAGTTC--AAATATACACACTCTTCGGGATATATATTATTACATTTATCATTTGCTCCccgacaacaacaactactacaacaacaaaaacaacaacaaaaccggataataacaacataaagttcagaacgggatagaaaaccgacctgtctgaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gT-------ATACAAAAAATATTGATATTTCATTTTATATGTAATTGATTTCTGTATGTTGATGTGCATAATATATA-------------A-ACAACCTTC--GGGATATATATTATTGCAGTTATCATTTGCTCCt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTCACAAAAAATTTTTATTTTGTGAAATTGTAGATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTGAAGGTATTATTTCAA-T-AAATTATTATTGAAATATTGTACGATATATCATTCATATTCATGGAGTTGTTAATATATATTTTTTTA-TTTTTAAATATAATATAAAATATAATATAAAATAATTATAAGATGGTAGC------------------ATTACATAAGATCATTTTATTAC--------AC------------------GGAAGTACATGCAATGTTTAATTAGTTTA-TGTGTGCCTTAAGAAATAA-----CAAGACGAAGGT--AA-AATTGAAATACCAGCTAAGATGGACAATTTCCT-------------------GGTTTATATCC--------TTGATCT-----------------------------------G-AAT---ACACAATC---------------GTTTCAGGTACACGACATGTTTTTATTTCAAAAT-ATTTTGTTTAAGTTGAAATCATTA--AATTGAGTTT-----TAACTTATGACAAGTTAAAACTCA-----ATTTAATGATTTCAACTGAAGAAAGTATGTTTTAAA-TATATTGTTCTTTGAACAATTATGAGAACCATGTTAATGATAAATGAAGAAGTATTTTAAAGTGACTAGTGACAA-AATTAAATTAAGTAACTAAACTTTATACCTTTCACCATCTCTCACATAAGctaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacatgaaccaatgtgaaaattgatatatacatatgtgtgaacggtttgatccgtcttacaaagaccaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACGTGCCATGAACAAACGTCTAATGTCAGATGGAAATAGTAACTTCGCCTTATGTTATC-AATTCACATTCCTTCCATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGATGTCACGCCATTTCCAGTATGTTACGACAGAGAAAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATAC-ACC-ACAACCAACAGAAAAGC-CG-AGAAATCAAC--AATAACA-GAGAACTATATACTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGAAAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATACACCACAACCAACAGAAAAGCCGAGAAATCAACAATAACAGAGAACTATATACTTTTGTTTTACTGTGTATATATTTAGTCTTTATCGCAGTCTCATCAATGTACAACTTA-ATA------ATAA-----TAATAGCATGCTGT--ATGATCATCCATACATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCGGAACATTGTATTGTGAGCGGAAGAATTTTTCACAAAGA--ttgttttactgtgtatatatttagtctttatcgcagtctcatcaatgtacaacttaataataataatagcatgctgtatgatcatccatacatcaaacccgacaagaacctcgctcacgaaccatattttgtttttttccaatgcggaacattgtattgtgagcggaagaatttttcacaaaga
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): CCGCCAGTTTTGCAAGCCATTAAGCTGCGTAATAAAGTAAAGTTGAAGAGATATTATTTTTACAAATAAAGTATTATTTGAACAAATAAAGTATGAACATTGCGTAAAAGCTCTGTTCATGAAAGCTATGTTAAGGTGAAAAGTCACCAATCTGCTTAGATATTTTGAGTTGACAATGGTATTTTGCACCTTTTTATACCGATGGCCCATAACTGTATGGTTTATTTTTGTGTTAATATTTATATTCAAAATACACAATTGAGCAAAAGTTAACTTTTGGTACGGTATTCGAAACATAAGGCCAATTAAACATTGCTTCTGAATATTGGAAGCATACGTAGTCAATAAAA
Unaligned ( gi|13 ): TAGCAATTATATATAAAATACGCAAAGGACAGTTTGAGTAATAGTTATATTTTTTACGGTATTCAAATTATTAGATTTAATTGATTTAGGCCAGTAAATCACTGCATCTGAACATTGGAAGCATGCATATGCAACAAAAACGATTATCCCTATATTCCGTTGTCAAATGTATGCAAGTGTAAATGAATAAAATACGACGCAAAACAAATACACTACCTTATGAT






Alignments
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Reference ( family-1101 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTAAT---ATATTCAATTTTAGATA-AATATTTTTCAATAAAACGTGCCATGAACAAAGGTCTNATGTCAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CATATGT---TATC-AATT--CACATTCCTTCAATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGACGTCACGCCATTTCCAGTATGATACGACAGAGACAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAACATTTCCGANATTACAACC-TCAA--AACAGGNAAGCGCGCANNANTCAACTAGANAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACNAGACAATATTTCCAACANNACANCACNACCAACAGAAAGGCCGAGAAACCNACANCAACAGAGANCNATANACTTTTGTTTNACTGTGTATATATTTAATCTTTATCTCAGTCTCATCAATGTACAACGTA-ATA--ATA-ATAA-----TAATAGCATG-TGT--ATGATGATCCATNNATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCNGAGCATTGTATTGTGAGCGGGGGAATTTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTACATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTTA-GGTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTANATGACATGTTATCCATATTCGTNGAGATGTAAATAT-TAATTTTT-A-TTTT--------------------ATATA------TCATAAGATGGTAGC------------------A------------------TTAC--------AC------------------GGAAGTACATGAAATGTTTAATTAGTTTAATTTGTGCCTTAAGGAACAA-----CCAAACGAAGGTCAAATAATTGAAATGACAGCTAAGATAGACAGTTTCCTAT-A-TTATATCCTGAANGAGGTGTATATAN-A--GA--TTGATCT------CG---CAG---------T-----TCA--GANAT---A-CACANTCTTCGGGATATATATNATTNCAGGTAAGCGAAATGTTTTTATTTCAAA-T-ATTCTGTTTAAATT-AAATTACTATAANTCAAACTTCTGGTTAAAATAT--CGAGTTAAAACTCGTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCATCGAACAATTATGANNACTATGTTANTGANAAATTAAGAATTA-C-NTT-AAGTGACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCTATACCTTATACCTTTCACNATCTCTCACATAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTTTAAATATCGTGTTNTAACGTTTATTGA-TANTTGATTCCTGTTTTGTAACA------TATGTTAATATGTATTTGAA-TTCTGTTTGACAACATCTATTTAACTTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATATTGATATTTCATTTTATATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAATATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGATATATATTATTGCAGTTATCATTTGCTCC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGTTTCACAAAGA--TTTAATTT-GTGAAATTGTAAATAT-TATCTATTTTT-AT--------ATATTATTTTAA-TGAA-TTGTTATTGAAATATTATAAAACAGATTAccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccagataataacaacataaagttcagaacgaggttaaaaagaaaaacgacccgtctgaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaatagtttaattctccatatgatttaagatttatgcATATATGTAATCATTATTTCAGTCTCATCAATGTACAACGTATATATTATATATAATTCCTTGATAACATG-TGTTAATTATGGTCg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTAA----ATATTCAATTTTAGATAGAATATGTTTCAATAAAACGTGCCATGAATAAAGGTCTAATGTTAGATGGA---AATAGTAACTTTGC-TATATGT---TATC-AATT--CACATTCCGTCAATGCACCTTTCCACCAGACAGAGCCACCGACGTCACGCCAATTCCAGTGCGATACGACAGAGACAACACGAGATTTCAACTTCACAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAATATTTTCAACATTACCACCATCAA--
gi|3                          : cataaatcaagaccaagtagccaagttttttttgcataatgttaccgatgtattgcttaataaaataccgatatgtactaataacacgttcttgtccgacaaaataacatgctgctgcggtataacccaccatttatataaaccattatttttaccaaaattgcgtaataaagtaaagtttaattgatattctttaatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcgcgctatctgcttggatatttgtagttgagtttgcaataaagctttagtatctttttacatcgcagggtcataactatatggttatttattgttatagcaattatatataaaaacgcaagggacagtttgagcaaaagttatattttagtacggtttttaaattattagattgaaataatttaagccagtaaatcactgcatatgaacgttggaagcatgcatatgcgataaaacaattatccctatattccgttgtcaaatttatgtaaatgtaaatgaatgaaatacgacgtaaaacaaatgcactaccttctgatagtctacagatagaccacccatacctaatttcttcttaatataattatatcattgttggtaatattcaatataacatacctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgcgcctccctccccctccccctctttgatgaaaaagaaaatacaagatcttcagaaaggtggcaaaaataaaatagatcaaattattattgacaaattaggtttcattTTTTTTCATTTTATATTAAACTTTAGTAA-AATATTTTTCAATAAAACGTACCATGAACAAAGGTCTTATGTCAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CATATGT---TATCGAATT--CACATTCCTTCAATGCACCCTCCTACCAGACAGAGCCGCCGGCGTCACGCCATTTCCGGTATGATACGACAGAGACAACACGATATTACAACTTCAAAACAGGACAACGCGCACCACTTAACCAGACAACA----CGAGATTACACCT-TCt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cataaatcaagaccaagaagccaagttttttgtataatgtaaccgatgtattgcttaattaaataccgatatgtattaataacacgttcttgtccgacaaaaaaaaatttgctgtggtttaacccaccatttatataaaccatcatttttaccaaaattgcgtaattaagtaaagtttaattgatattctttgatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcacgctatctgcttggatatttgtatttgagtttgcaataaagctttagtatctttttatatcgcagggtcataactgtatggttatttgttgttaaagcaattatgatataaaaacgcaaaggacagtgtgagcaaaagttatactttagtacggtatttaaattattagattgaaatgatgcaataaaacgataatccctatattccgttgacaaatttatgtaaatgtgaatgaatgaaatacgacgtagaacaagtgaccttatgatagttagaccacccatacttaatttcttcgactcttaatataattatatcattgttggtaatattcagtataatatgcctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgccccccaccccccacctttgatgaaaaaacacaacaagatcttcagaaaagtgactaaatcaaatgggtaaaattattattaagcaaaataggtttcattTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTGCAAAT-TT--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTAAATAACATGTTAGCCATAGTTGTTGAAATGTAAATAT-TAATCTTT-A-TTTT---------------------T-TA------TCATAA-----T----------------------------------------TTAC--------A------------------------TACATGAAA-GTTTTATTGGTT-AATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAACGAAGATCAAATAATTGCATTGACAAATAAT-TAAACAGTTTCCTAT-AATTATCTCCTGAAGTAGGTGCATATAT-A--GA--ATGGGTT------CG---CAG---------T-----TCA--GATAA---A-CTCTCTTTTCGGGATATATATGATTGCAGGTAAGAAAAAGGTTT--ATTTCAAA-T-ATTCTGTTTAAATT-AAATTACTATAACTAAAACTTCTG-TTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTCCAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCACCGAACAATTATGATCATTATGTTATTAAGAAATTAAGAATTA-C-ATT-TAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCTATATCTCATACTTTTCACAATATCTCACTTAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTTTAAA-ATCGTGTAGTATTGTTAATTGA-TAATTGATT-CTGTTTTGTAATA------TATGTAAATATGTGTTTGAA-TTCTGTTTAACAACATCTAT-----TTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATATTGATGTCTCATTTTACATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAGTATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGATATATATGATTGCAGTTATCATTTGTTCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAAT-GTACA-ATCTA--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AC-TTTTTATTGCAATATTAAATAACATGTTATCCATACTTGTTGAAATATAACTAT-TAATCTTT-A-TTTT--------------------TTATA------TCATA---TG------------------------------------------TTAC--------AC------------------GGATGCACATGAAATGTTTA-TTGGTTTAATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAAGTAAAATCAAATATCTGCAATGACAAATAAT-TAAATAGTTTCCTA--A-TTATATCCTAAAAGAGGTGTATATAT-ATAGAGCTTGGTCT------CG---CAG---------T-----TCA--GATAT---A-CACACTCTTCGGGATATATATTATTGCAGGTAAGCAAAAGGTTTT-ATTTCAAA-T-ATTCTTTTTAAATT-AAATTACTATAACTCAAACTTCTGGTTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAATTATGTTTAAAAATGTATTGTTCACAGAACAATTATGATCATTATGATATTAAGAAATTAATAATTA-C-ATT-AAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCAACACCTCATACCTTCCACAATCTCTCACATAAGCAAGTAAT--TCCCCAGCTATTAAA-ATCATGTAGTAATGTTTTTTGA-TAATTGA-----------TA----------ATGTTAATA--TATTTGAA-TTCTGTTTAATAACATCTATTTAATTTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATGTTGATATTTCATTTTATATGTAATTGATATCTGTATGTTGATGTACATATTATATA-AAGTTC--AAATATACACACTCTTCGGGATATATATTATTACATTTATCATTTGCTCCccgacaacaacaactactacaacaacaaaaacaacaacaaaaccggataataacaacataaagttcagaacgggatagaaaaccgacctgtctgaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTCTT-TGTAAGACGGATCAAACCGT----TCACACATATGTATATATC-AATTTTCACATTGGTTCActaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacatgaaccaatgtgaaaattgatatatacatatgtgtgaacggtttgatccgtcttacaaagaccaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacaaaaaatattgatatttcattttatatgtaattgatttctgtatgttgatgtgcataatatataaacaaccttcgggatatatattattgcagttatcatttgctccctaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacaTTTCACAAAAAATTTTTATTTTGTGAAATTGTAGATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTGAAGGTATTATTTCAA-T-AAATTATTATTGAAATATTGTACGATATATCATTCATATTCATGGAGTTGTTAATATATATTTTTTTA-TTTTTAAATATAATATAAAATATAATATAAAATAATTATAAGATGGTAGC------------------ATTACATAAGATCATTTTATTAC--------AC------------------GGAAGTACATGCAATGTTTAATTAGTTTA-TGTGTGCCTTAAGAAATAA-----CAAGACGAAGGT--AA-AATTGAAATACCAGCTAAGATGGACAATTTCCT--------------------GGTTTATATCC--------TTGATCT----------------------------------GA-AT---A-CACAATC---------------GTTTCAGGTACACGACATGTTTTTATTTCAAAAT-ATTTTGTTTAAGTTGAAATCATTA-AATTGAG--TT----TTAACTTATGACAAGTTAAAACTCA-----ATTTAATGATTTCAACTGAAGAAAGTATGTTTTAAA-TATATTGTTCTTTGAACAATTATGAGAACCATGTTAATGATAAATGAAGAAGTA-T-TTTAAAGTGACTAGTGAC-AAAATTAAATTAAGTAACTAAACTTTATACCTTTCACCATCTCTCACATAAGaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACGTGCCATGAACAAACGTCTAATGTCAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CTTATGT---TATC-AATT--CACATTCCTTCCATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGATGTCACGCCATTTCCAGTATGTTACGACAGAGAAAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATAC-ACC-ACAACCAACAGAAAAGC-CG-AGAAATCAAC--AATAACA-GAGAACTATATACTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGAAAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATACACCACAACCAACAGAAAAGCCGAGAAATCAACAATAACAGAGAACTATATACTTTTGTTTTACTGTGTATATATTTAGTCTTTATCGCAGTCTCATCAATGTACAAC-T---TA--ATA-ATAA-----TAATAGCATGCTGT--ATGATCATCCATACATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCGGAACATTGTATTGTGAGCGGAAGAATTTTTCACAAAGA--ttgttttactgtgtatatatttagtctttatcgcagtctcatcaatgtacaacttaataataataatagcatgctgtatgatcatccatacatcaaacccgacaagaacctcgctcacgaaccatattttgtttttttccaatgcggaacattgtattgtgagcggaagaatttttcacaaaga
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): CCGCCAGTTTTGCAAGCCATTAAGCTGCGTAATAAAGTAAAGTTGAAGAGATATTATTTTTACAAATAAAGTATTATTTGAACAAATAAAGTATGAACATTGCGTAAAAGCTCTGTTCATGAAAGCTATGTTAAGGTGAAAAGTCACCAATCTGCTTAGATATTTTGAGTTGACAATGGTATTTTGCACCTTTTTATACCGATGGCCCATAACTGTATGGTTTATTTTTGTGTTAATATTTATATTCAAAATACACAATTGAGCAAAAGTTAACTTTTGGTACGGTATTCGAAACATAAGGCCAATTAAACATTGCTTCTGAATATTGGAAGCATACGTAGTCAATAAAA
Unaligned ( gi|13 ): TAGCAATTATATATAAAATACGCAAAGGACAGTTTGAGTAATAGTTATATTTTTTACGGTATTCAAATTATTAGATTTAATTGATTTAGGCCAGTAAATCACTGCATCTGAACATTGGAAGCATGCATATGCAACAAAAACGATTATCCCTATATTCCGTTGTCAAATGTATGCAAGTGTAAATGAATAAAATACGACGCAAAACAAATACACTACCTTATGAT






Alignments
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Reference ( family-1101 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTAAT---ATATTCAATTTTAGATA-AATATTTTTCAATAAAACGTGCCATGAACAAAGGTCTTATGTNAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CATATGT---TATC-AATT--CACATTCCTTCAATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGACGTCACGCCATTTCCAGTATGATACGACAGAGACAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAACATTTCCGANATTACAACC-TCAA--AACAGGNAAGCGCGCANNANTCAACTAGANAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACNAGACAATATTTCCAACANNACANCACNACCAACAGAAAGGCCGAGAAACCNACANCAACAGAGANCNATANACTTTTGTTTNACTGTGTATATATTTAATCTTTATCTCAGTCTCATCAATGTACAACGTA-ATA--ATA-ATAA-----TAATAGCATG-TGT--ATGATGATCCATNNATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCNGAGCATTGTATTGTGAGCGGGGGAATTTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTACATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTTA-GGTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTANATGACATGTTATCCATATTCGTNGAGATGTAAATAT-TAATTTTT-A-TTTT--------------------ATATA------TCATAAGATGGTAGC------------------A------------------TTAC--------AC------------------GGAAGTACATGAAATGTTTAATTAGTTTAATTTGTGCCTTAAGGAACAA-----CCAAACGAAGGTCAAATAATTGAAATGACAGCTAAGATAGACAGTTTCCTAT-A-TTATATCCTGAANGAGGTGTATATAN-A--GA--TTGATCT------CG---CAG---------T-----TCA--GANAT---A-CACANTCTTCGGGATATATATNATTNCAGGTAAGCGAAATGTTTTTATTTCAAA-T-ATTCTGTTTAAATT-AAATTACTATAACTCAAACTTCTGGTTAAAATAT--CGAGTTAAAACTCGTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCATCGAACAATTATGANNACTATGTTANTGANAAATTAAGAATTA-C-NTT-AAGTGACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCTATACCTTATACCTTTCACNATCTCTCACATAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTTTAAATATCGTGTTNTAACGTTTATTGA-TANTTGATTCCTGTTTTGTAACA------TATGTTAATATGTATTTGAA-TTCTGTTTGACAACATCTATTTAANTTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATATTGATATTTCATTTTATATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAATATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGATATATATTATTGCAGTTATCATTTGCTCC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGTTTCACAAAGA--TTTAATTT-GTGAAATTGTAAATAT-TATCTATTTTT-AT--------ATATTATTTTAA-TGAA-TTGTTATTGAAATATTATAAAACAGATTAccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccagataataacaacataaagttcagaacgaggttaaaaagaaaaacgacccgtctgaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaatagtttaattctccatatgatttaagatttatgcATATATGTAATCATTATTTCAGTCTCATCAATGTACAACGTATATATTATATATAATTCCTTGATAACATG-TGTTAATTATGGTCg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTAA----ATATTCAATTTTAGATAGAATATGTTTCAATAAAACGTGCCATGAATAAAGGTCTAATGTTAGATGGA---AATAGTAACTTTGC-TATATGT---TATC-AATT--CACATTCCGTCAATGCACCTTTCCACCAGACAGAGCCACCGACGTCACGCCAATTCCAGTGCGATACGACAGAGACAACACGAGATTTCAACTTCACAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAATATTTTCAACATTACCACCATCAA--
gi|3                          : cataaatcaagaccaagtagccaagttttttttgcataatgttaccgatgtattgcttaataaaataccgatatgtactaataacacgttcttgtccgacaaaataacatgctgctgcggtataacccaccatttatataaaccattatttttaccaaaattgcgtaataaagtaaagtttaattgatattctttaatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcgcgctatctgcttggatatttgtagttgagtttgcaataaagctttagtatctttttacatcgcagggtcataactatatggttatttattgttatagcaattatatataaaaacgcaagggacagtttgagcaaaagttatattttagtacggtttttaaattattagattgaaataatttaagccagtaaatcactgcatatgaacgttggaagcatgcatatgcgataaaacaattatccctatattccgttgtcaaatttatgtaaatgtaaatgaatgaaatacgacgtaaaacaaatgcactaccttctgatagtctacagatagaccacccatacctaatttcttcttaatataattatatcattgttggtaatattcaatataacatacctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgcgcctccctccccctccccctctttgatgaaaaagaaaatacaagatcttcagaaaggtggcaaaaataaaatagatcaaattattattgacaaattaggtttcattTTTTTTCATTTTATATTAAACTTTAGTAA-AATATTTTTCAATAAAACGTACCATGAACAAAGGTCTTATGTCAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CATATGT---TATCGAATT--CACATTCCTTCAATGCACCCTCCTACCAGACAGAGCCGCCGGCGTCACGCCATTTCCGGTATGATACGACAGAGACAACACGATATTACAACTTCAAAACAGGACAACGCGCACCACTTAACCAGACAACA----CGAGATTACACCT-TCt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cataaatcaagaccaagaagccaagttttttgtataatgtaaccgatgtattgcttaattaaataccgatatgtattaataacacgttcttgtccgacaaaaaaaaatttgctgtggtttaacccaccatttatataaaccatcatttttaccaaaattgcgtaattaagtaaagtttaattgatattctttgatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcacgctatctgcttggatatttgtatttgagtttgcaataaagctttagtatctttttatatcgcagggtcataactgtatggttatttgttgttaaagcaattatgatataaaaacgcaaaggacagtgtgagcaaaagttatactttagtacggtatttaaattattagattgaaatgatgcaataaaacgataatccctatattccgttgacaaatttatgtaaatgtgaatgaatgaaatacgacgtagaacaagtgaccttatgatagttagaccacccatacttaatttcttcgactcttaatataattatatcattgttggtaatattcagtataatatgcctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgccccccaccccccacctttgatgaaaaaacacaacaagatcttcagaaaagtgactaaatcaaatgggtaaaattattattaagcaaaataggtttcattTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTGCAAAT-TT--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTAAATAACATGTTAGCCATAGTTGTTGAAATGTAAATAT-TAATCTTT-A-TTTT---------------------T-TA------TCATAA-----T----------------------------------------TTAC--------A------------------------TACATGAAA-GTTTTATTGGTT-AATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAACGAAGATCAAATAATTGCATTGACAAATAAT-TAAACAGTTTCCTAT-AATTATCTCCTGAAGTAGGTGCATATAT-A--GA--ATGGGTT------CG---CAG---------T-----TCA--GATAA---A-CTCTCTTTTCGGGATATATATGATTGCAGGTAAGAAAAAGGTTT--ATTTCAAA-T-ATTCTGTTTAAATT-AAATTACTATAACTAAAACTTCTG-TTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTCCAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCACCGAACAATTATGATCATTATGTTATTAAGAAATTAAGAATTA-C-ATT-TAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCTATATCTCATACTTTTCACAATATCTCACTTAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTTTAAA-ATCGTGTAGTATTGTTAATTGA-TAATTGATT-CTGTTTTGTAATA------TATGTAAATATGTGTTTGAA-TTCTGTTTAACAACATCTAT-----TTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATATTGATGTCTCATTTTACATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAGTATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGATATATATGATTGCAGTTATCATTTGTTCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAAT-GTACA-ATCTA--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AC-TTTTTATTGCAATATTAAATAACATGTTATCCATACTTGTTGAAATATAACTAT-TAATCTTT-A-TTTT--------------------TTATA------TCATA---TG------------------------------------------TTAC--------AC------------------GGATGCACATGAAATGTTTA-TTGGTTTAATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAAGTAAAATCAAATATCTGCAATGACAAATAAT-TAAATAGTTTCCTA--A-TTATATCCTAAAAGAGGTGTATATAT-ATAGAGCTTGGTCT------CG---CAG---------T-----TCA--GATAT---A-CACACTCTTCGGGATATATATTATTGCAGGTAAGCAAAAGGTTTT-ATTTCAAA-T-ATTCTTTTTAAATT-AAATTACTATAACTCAAACTTCTGGTTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAATTATGTTTAAAAATGTATTGTTCACAGAACAATTATGATCATTATGATATTAAGAAATTAATAATTA-C-ATT-AAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCAACACCTCATACCTTCCACAATCTCTCACATAAGCAAGTAAT--TCCCCAGCTATTAAA-ATCATGTAGTAATGTTTTTTGA-TAATTGA-----------TA----------ATGTTAATA--TATTTGAA-TTCTGTTTAATAACATCTATTTAATTTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATGTTGATATTTCATTTTATATGTAATTGATATCTGTATGTTGATGTACATATTATATA-AAGTTC--AAATATACACACTCTTCGGGATATATATTATTACATTTATCATTTGCTCCccgacaacaacaactactacaacaacaaaaacaacaacaaaaccggataataacaacataaagttcagaacgggatagaaaaccgacctgtctgaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTCTT-TGTAAGACGGATCAAACCGT----TCACACATATGTATATATC-AATTTTCACATTGGTTCActaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacatgaaccaatgtgaaaattgatatatacatatgtgtgaacggtttgatccgtcttacaaagaccaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacaaaaaatattgatatttcattttatatgtaattgatttctgtatgttgatgtgcataatatataaacaaccttcgggatatatattattgcagttatcatttgctccctaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacaTTTCACAAAAAATTTTTATTTTGTGAAATTGTAGATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTGAAGGTATTATTTCAA-T-AAATTATTATTGAAATATTGTACGATATATCATTCATATTCATGGAGTTGTTAATATATATTTTTTTA-TTTTTAAATATAATATAAAATATAATATAAAATAATTATAAGATGGTAGC------------------ATTACATAAGATCATTTTATTAC--------AC------------------GGAAGTACATGCAATGTTTAATTAGTTTA-TGTGTGCCTTAAGAAATAA-----CAAGACGAAGGT--AA-AATTGAAATACCAGCTAAGATGGACAATTTCCT--------------------GGTTTATATCC--------TTGATCT----------------------------------GA-AT---A-CACAATC---------------GTTTCAGGTACACGACATGTTTTTATTTCAAAAT-ATTTTGTTTAAGTTGAAATCATTA-AATTGAG--TT----TTAACTTATGACAAGTTAAAACTCA-----ATTTAATGATTTCAACTGAAGAAAGTATGTTTTAAA-TATATTGTTCTTTGAACAATTATGAGAACCATGTTAATGATAAATGAAGAAGTA-T-TTTAAAGTGACTAGTGAC-AAAATTAAATTAAGTAACTAAACTTTATACCTTTCACCATCTCTCACATAAGaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACGTGCCATGAACAAACGTCTAATGTCAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CTTATGT---TATC-AATT--CACATTCCTTCCATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGATGTCACGCCATTTCCAGTATGTTACGACAGAGAAAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATAC-ACC-ACAACCAACAGAAAAGC-CG-AGAAATCAAC--AATAACA-GAGAACTATATACTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGAAAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATACACCACAACCAACAGAAAAGCCGAGAAATCAACAATAACAGAGAACTATATACTTTTGTTTTACTGTGTATATATTTAGTCTTTATCGCAGTCTCATCAATGTACAAC-T---TA--ATA-ATAA-----TAATAGCATGCTGT--ATGATCATCCATACATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCGGAACATTGTATTGTGAGCGGAAGAATTTTTCACAAAGA--ttgttttactgtgtatatatttagtctttatcgcagtctcatcaatgtacaacttaataataataatagcatgctgtatgatcatccatacatcaaacccgacaagaacctcgctcacgaaccatattttgtttttttccaatgcggaacattgtattgtgagcggaagaatttttcacaaaga


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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1101 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTAAT---ATATTCAATTTTAGATA-AATATTTTTCAATAAAACGTGCCATGAACAAAGGTCTTATGTNAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CATATGT---TATC-AATT--CACATTCCTTCAATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGACGTCACGCCATTTCCAGTATGATACGACAGAGACAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAACATTTCCGANATTACAACC-TCAA--AACAGGNAAGCGCGCANNANTCAACTAGANAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGCGCACCACTCAACNAGACAATATTTCCAACANNACANCACNACCAACAGAAAGGCCGAGAAACCNACANCAACAGAGANCNATANACTTTTGTTTNACTGTGTATATATTTAATCTTTATCTCAGTCTCATCAATGTACAACGTA-ATA--ATA-ATAA-----TAATAGCATG-TGT--ATGATGATCCATNNATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCNGAGCATTGTATTGTGAGCGGGGGAATTTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTACATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTTA-GGTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTANATGACATGTTATCCATATTCGTNGAGATGTAAATAT-TAATTTTT-A-TTTT--------------------ATATA------TCATAAGATGGTAGC------------------A------------------TTAC--------AC------------------GGAAGTACATGAAATGTTTAATTAGTTTAATTTGTGCCTTAAGGAACAA-----CCAAACGAAGGTCAAATAATTGAAATGACAGCTAAGATAGACAGTTTCCTATA-TTATATCCTGAANGAGGTGTATAT-A---AAAGATTGATCT------CG---CAG---------T-----TCA--GANAT---A-CACANTC--TTCGGGATATATATNATTNCAGGTAAGCGAAATGTTTTTATTTCAAAAGATTCTGTTTAAATT-AAATTACTATAACTCAAACTTCT-G-TTAAAATAT--CGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCATCGAACAATTATGANNACTATGTTANTGANAAATTAAGAATTA-CNTT-AAGTGACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCTATACCTTATACCTTTCACNATCTCTCACATAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTTTAAATATCGTGTTNTAACGTTTATTGA-TANTTGATTCCTGTTTTGTAACA------TATGTTAATATGTATTTGAA-TTCTGTTTGACAACATCTATTTAANTTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATATTGATATTTCATTTTATATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAATATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGATATATATTATTGCAGTTATCATTTGCTCC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGTTTCACAAAGA--TTTAATTT-GTGAAATTGTAAATAT-TATCTATTTTT-AT--------ATATTATTTTAA-TGAA-TTGTTATTGAAATATTATAAAACAGATTAccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccagataataacaacataaagttcagaacgaggttaaaaagaaaaacgacccgtctgaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaatagtttaattctccatatgatttaagatttatgcATATATGTAATCATTATTTCAGTCTCATCAATGTACAACGTATATATTATATATAATTCCTTGATAACATG-TGTTAATTATGGTCg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTAA----ATATTCAATTTTAGATAGAATATGTTTCAATAAAACGTGCCATGAATAAAGGTCTAATGTTAGATGGA---AATAGTAACTTTGC-TATATGT---TATC-AATT--CACATTCCGTCAATGCACCTTTCCACCAGACAGAGCCACCGACGTCACGCCAATTCCAGTGCGATACGACAGAGACAACACGAGATTTCAACTTCACAACAGGATAACGCGCACCACTCAACCAGACAATATTTTCAACATTACCACCATCAA--
gi|3                          : cataaatcaagaccaagtagccaagttttttttgcataatgttaccgatgtattgcttaataaaataccgatatgtactaataacacgttcttgtccgacaaaataacatgctgctgcggtataacccaccatttatataaaccattatttttaccaaaattgcgtaataaagtaaagtttaattgatattctttaatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcgcgctatctgcttggatatttgtagttgagtttgcaataaagctttagtatctttttacatcgcagggtcataactatatggttatttattgttatagcaattatatataaaaacgcaagggacagtttgagcaaaagttatattttagtacggtttttaaattattagattgaaataatttaagccagtaaatcactgcatatgaacgttggaagcatgcatatgcgataaaacaattatccctatattccgttgtcaaatttatgtaaatgtaaatgaatgaaatacgacgtaaaacaaatgcactaccttctgatagtctacagatagaccacccatacctaatttcttcttaatataattatatcattgttggtaatattcaatataacatacctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgcgcctccctccccctccccctctttgatgaaaaagaaaatacaagatcttcagaaaggtggcaaaaataaaatagatcaaattattattgacaaattaggtttcattTTTTTTCATTTTATATTAAACTTTAGTAA-AATATTTTTCAATAAAACGTACCATGAACAAAGGTCTTATGTCAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CATATGT---TATCGAATT--CACATTCCTTCAATGCACCCTCCTACCAGACAGAGCCGCCGGCGTCACGCCATTTCCGGTATGATACGACAGAGACAACACGATATTACAACTTCAAAACAGGACAACGCGCACCACTTAACCAGACAACA----CGAGATTACACCT-TCt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cataaatcaagaccaagaagccaagttttttgtataatgtaaccgatgtattgcttaattaaataccgatatgtattaataacacgttcttgtccgacaaaaaaaaatttgctgtggtttaacccaccatttatataaaccatcatttttaccaaaattgcgtaattaagtaaagtttaattgatattctttgatcttatattgagcagaataaagtaatgaaaattgtgtaaaaacttcgttcatgaaaaatgtgctaccagtgtgagacgtcacgctatctgcttggatatttgtatttgagtttgcaataaagctttagtatctttttatatcgcagggtcataactgtatggttatttgttgttaaagcaattatgatataaaaacgcaaaggacagtgtgagcaaaagttatactttagtacggtatttaaattattagattgaaatgatgcaataaaacgataatccctatattccgttgacaaatttatgtaaatgtgaatgaatgaaatacgacgtagaacaagtgaccttatgatagttagaccacccatacttaatttcttcgactcttaatataattatatcattgttggtaatattcagtataatatgcctacatctcctgaaaacagaacactgctcaataacccataaaaatatgccccccaccccccacctttgatgaaaaaacacaacaagatcttcagaaaagtgactaaatcaaatgggtaaaattattattaagcaaaataggtttcattTTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAATTGTGCAAAT-TT--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AA-TTATTATTGAAATATTAAATAACATGTTAGCCATAGTTGTTGAAATGTAAATAT-TAATCTTT-A-TTTT---------------------T-TA------TCATAA-----T----------------------------------------TTAC--------A------------------------TACATGAAA-GTTTTATTGGTT-AATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAACGAAGATCAAATAATTGCATTGACAAATAAT-TAAACAGTTTCCTATAATTATCTCCTGAAGTAGGTGCATAT-A---TAGAATGGGT-T------CG---CAG---------T-----TCA--GATAA---A-CTCTCTT--TTCGGGATATATATGATTGCAGGTAAGAAAAAGGTTT--ATTTCAAA-TATTCTGTTTAAATT-AAATTACTATAACTAAAACTTCT-G-TTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTCCAACTTAAGAAACTATGTTTAAAAATATATTGTTCACCGAACAATTATGATCATTATGTTATTAAGAAATTAAGAATTA-CATT-TAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCTATATCTCATACTTTTCACAATATCTCACTTAAGCGAGTAAT--TCCCCATCTTTTAAA-ATCGTGTAGTATTGTTAATTGA-TAATTGATT-CTGTTTTGTAATA------TATGTAAATATGTGTTTGAA-TTCTGTTTAACAACATCTAT-----TTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATATTGATGTCTCATTTTACATGTATTTGATTTCTGTATGTTGATGTACATAGTATATATAAGTTC--AAATATACACTCTTTTCGGGATATATATGATTGCAGTTATCATTTGTTCC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTTCACAAAGA--TTTTATTTTGTGAAAT-GTACA-ATCTA--TATTTTT-ATGTTTTA-GTTATTATTTCAA-C-AC-TTTTTATTGCAATATTAAATAACATGTTATCCATACTTGTTGAAATATAACTAT-TAATCTTT-A-TTTT--------------------TTATA------TCATA---TG------------------------------------------TTAC--------AC------------------GGATGCACATGAAATGTTTA-TTGGTTTAATTTGTGCCTTAAGGA-CAA-----TCAAAGTAAAATCAAATATCTGCAATGACAAATAAT-TAAATAGTTTCCTA-A-TTATATCCTAAAAGAGGTGTATAT-ATATAGAGCTTGGTCT------CG---CAG---------T-----TCA--GATAT---A-CACACTC--TTCGGGATATATATTATTGCAGGTAAGCAAAAGGTTTT-ATTTC-AAATATTCTTTTTAAATT-AAATTACTATAACTCAAACTTCTGG-TTAAAATAT--TGAGTTAAAACT-GTCTCGATTTAATGATTTTAACTTAAGAAATTATGTTTAAAAATGTATTGTTCACAGAACAATTATGATCATTATGATATTAAGAAATTAATAATTA-CATT-AAGTAACTA--GACTATAATTAATTTAAGTCGCAACACCTCATACCTTCCACAATCTCTCACATAAGCAAGTAAT--TCCCCAGCTATTAAA-ATCATGTAGTAATGTTTTTTGA-TAATTGA-----------TA----------ATGTTAATA--TATTTGAA-TTCTGTTTAATAACATCTATTTAATTTCTGTTAAACAACA-------TATATGTATAAAATGTTGATATTTCATTTTATATGTAATTGATATCTGTATGTTGATGTACATATTATATA-AAGTTC--AAATATACACACTCTTCGGGATATATATTATTACATTTATCATTTGCTCCccgacaacaacaactactacaacaacaaaaacaacaacaaaaccggataataacaacataaagttcagaacgggatagaaaaccgacctgtctgaaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTCTT-TGTAAGACGGATCAAACCGT----TCACACATATGTATATATC-AATTTTCACATTGGTTCActaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacatgaaccaatgtgaaaattgatatatacatatgtgtgaacggtttgatccgtcttacaaagaccaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacaaaaaatattgatatttcattttatatgtaattgatttctgtatgttgatgtgcataatatataaacaaccttcgggatatatattattgcagttatcatttgctccctaacaacaactacaacaataacaacaacaacaaatccaggtcataaacacacaagttcagagcgaggtagaaacaaccgaccattttgaaaagtggtggagaatccgggtaacgactagagataacgccaaatcaacctaatcgacgccgaaaacaactagaacaaccaaccaaagtttagcaacaTTTCACAAAAAATTTTTATTTTGTGAAATTGTAGATAT-TA--TATTTTT-ATGTTTGAAGGTATTATTTCAA-T-AAATTATTATTGAAATATTGTACGATATATCATTCATATTCATGGAGTTGTTAATATATATTTTTTTA-TTTTTAAATATAATATAAAATATAATATAAAATAATTATAAGATGGTAGC------------------ATTACATAAGATCATTTTATTAC--------AC------------------GGAAGTACATGCAATGTTTAATTAGTTT-ATGTGTGCCTTAAGAAATAA-----CAAGACGAAGGT-AA--AATTGAAATACCAGCTAAGATGGACAATTTCCTGGT-TTATATCC--------------------------TTGATCT----------------------------------GA-AT---A-CACAATCGTTTCAGG-----------TACA------CGACATGTTTTTATTTCAAAATATTTTGTTTAAGTTGAAATCATTA-AATT--GAGTT-----TTAACTTATGACAAGTTAAAA-----CTCAATTTAATGATTTCAACTGAAGAAAGTATGTTT-TAAATATATTGTTCTTTGAACAATTATGAGAACCATGTTAATGATAAATGAAGAAGTA-TTTTAAAGTGACTAGTGAC-AAAATTAAATTAAGTAACTAAACTTTATACCTTTCACCATCTCTCACATAAGaaaaaatcatggttaaaatttcattagttttatcataaacatactctagataacagtttttgtcacttaacataacataacaaattaaatcaaaaataggttttaaaaaaaatcatatcgaaaattattctaacattgaattaattgtcaatgtaagaaccaagtctatacaaatttctcatataaaatgatgtacaaatcgcttaaagcattatttttagatagtaattttatcattgtcaacaatctaagggtaaaataattaata
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACGTGCCATGAACAAACGTCTAATGTCAGATGGA---AATAGTAACTTCGC-CTTATGT---TATC-AATT--CACATTCCTTCCATGCACCCTCCCACCAGACAGAGCCGCCGATGTCACGCCATTTCCAGTATGTTACGACAGAGAAAACACGAGATTACAACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATAC-ACC-ACAACCAACAGAAAAGC-CG-AGAAATCAAC--AATAACA-GAGAACTATATACTT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGAAAACACGAG-ATTACA-ACTTCAAAACAGGATAACGTGCACCATTCAACCAGACAATATTTCCAACAATACACCACAACCAACAGAAAAGCCGAGAAATCAACAATAACAGAGAACTATATACTTTTGTTTTACTGTGTATATATTTAGTCTTTATCGCAGTCTCATCAATGTACAAC-T---TA--ATA-ATAA-----TAATAGCATGCTGT--ATGATCATCCATACATCAAACCCGACAAGAACCTCGCTCACGAACCATATTTTGTTTTTTTCCAATGCGGAACATTGTATTGTGAGCGGAAGAATTTTTCACAAAGA--ttgttttactgtgtatatatttagtctttatcgcagtctcatcaatgtacaacttaataataataatagcatgctgtatgatcatccatacatcaaacccgacaagaacctcgctcacgaaccatattttgtttttttccaatgcggaacattgtattgtgagcggaagaatttttcacaaaga
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): CCGCCAGTTTTGCAAGCCATTAAGCTGCGTAATAAAGTAAAGTTGAAGAGATATTATTTTTACAAATAAAGTATTATTTGAACAAATAAAGTATGAACATTGCGTAAAAGCTCTGTTCATGAAAGCTATGTTAAGGTGAAAAGTCACCAATCTGCTTAGATATTTTGAGTTGACAATGGTATTTTGCACCTTTTTATACCGATGGCCCATAACTGTATGGTTTATTTTTGTGTTAATATTTATATTCAAAATACACAATTGAGCAAAAGTTAACTTTTGGTACGGTATTCGAAACATAAGGCCAATTAAACATTGCTTCTGAATATTGGAAGCATACGTAGTCAATAAAA
Unaligned ( gi|13 ): TAGCAATTATATATAAAATACGCAAAGGACAGTTTGAGTAATAGTTATATTTTTTACGGTATTCAAATTATTAGATTTAATTGATTTAGGCCAGTAAATCACTGCATCTGAACATTGGAAGCATGCATATGCAACAAAAACGATTATCCCTATATTCCGTTGTCAAATGTATGCAAGTGTAAATGAATAAAATACGACGCAAAACAAATACACTACCTTATGAT