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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|15 : atT--CA---ATTA---------T----------C--AAA--------CAATTAT---------C------CCCC----C-----C-A---C---T--C---C-------------CC---C-------------TTT-GA--------GTGA-TGCATC--A--C-CC---TCAGGGGGGTTTattatcccccccactccccctttgagtgatgcatcaccctcaggggggttttttttttttaagagaatacagaataccagaagatat
gi|16 : atatttttttttatgtgttatcggataaaagaaacccaacaataacgttcatttgctatgaaTATTCTGCCCA----AT--A-AAC-A-----------C--C-C------CA-----C----C---CTTAGATAC-----C-AA-C-A-------------C----C----A------A---------G-A-----A-------------A--------------TGTTTTATTTATTCT---T----T------TT--------------TTT-TGTAAG-------TGAT--ATCAGTAAAA-G-GAACCTGCAA---------A--C---T-----------TTAAGGTAATTA-A-----------T-TGT--AAT----GTA-TATTAAATTTTG----TT---TG--TGAAA--C--AATTATCAAtttttttttaagagaatacagaataccagaagatat
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gi|28 : taaaaatatataatttttatataaaacaatg-TGT--AAT----CTG-TATTAAAA--CAT---TT---TG--TGAAA--C--AATTATCAA----AC---AAG------ATTA---TTTG-T-Attgggggaatatggtac
gi|29 : ---AGT------ATTG---TTTG-T-AAA-----A-------------A---A--A---------T----------T--AAA--------TTA--AT---------A--------------------A-A---C---A--C---T-------------CC---T-------------TTTTGG--------GAAA-TTCATC--A--C-CC---CCTGGGGTGTATAtttcatttaactttttttttaagacccaaataaatgga
gi|3 : CCCCGACCCAAC--C-AAC-A-----------T--C-T------G------C----C---T------AC-----CCAA-T-T-T-G-GG--T---C----C----A------A---------A-T-----T-------------A--------------T-------------T---T----T------TT--------------TGT-TA-AAG-------TGTT--TTTAATCAAA-A-AGA----------------A--C---C-----------T----------A-A-----------T-TAT--ATT----TGG-TATT------TG----TT---TG--TGAAA--C--AATTATCAAAC--AC---AAT------ATTATTCTTTG-T-AAA-----AC-----TCTTAGCAATTA--A---------T-------------AAA--------TAA--AT---------A------ACAC------------A---T---TG-T---T-------------CA---C-------------TTTTAA--------AAAA-TACATT--G--T-CC---CCAGGG----------GGTGTTGGTA-AAGATttcagaggaatatggtat
gi|30 : tcattaacatagttaccatggtccactgtataaatgctccccccagtaaagtccatcccccg-A-----A-------------A--------------T-------------TAATT----A------TT--------------TTT-----AT-------TGTT--ATCAGTCAAA-CTGTA----------------ATGC---G-----------T----------AGA-----------T-TTC--TGT----ATG-TATA------TGC---TT---T---TGAAG--C--AATTATCAAAC--AC---AAT------Aggaa
gi|31 : GTATTCCCCTGC----AT--A-A---G-----------C--A-A------C------C----C---C------AC-----C-AATT-T-T-G-G---T---C----T----G------------------A-----A-------------A--------------T-------------T---T----G----------------------TTT-TG-GA--------TGTT--ATCAGT-AAA-T-GAA----------------A--C---C-----------T----------T-A-----------T-
gi|32 : tacc----------C--AAA--------TAA--AT------------------TC----C-----A------------------------------CT---T-------------TTTTGC--------AGAA-TGCATC--G--C-CC---CAGGAGG
gi|33 : cTATTCCCTGGT----AT--A-AAT-A-----------C--T-T------C------C----C---CTAATAAAC-----C-AA-T-T-TGG-G---T---A----C----A------A---------A-A-----A-------------A--------------T-------------aattactcgggggtatacggtata
gi|36 : tatactagca-TAT--GAT----ATG-TATT------TGT---TT---AG--TGAAA--C--AATTATCAAAC--AC---aa
gi|4 : aGTATTACCCCAA----AT--A-AAC-A-----------C--C-C------
gi|4 : tatcTCTCCC-A----AT--A-ATT-A-----------C--C-C------C------C----TA--C------AC-----C-AA-T-T-T-CTG---T---C----G----G------AGCAAGAAATA-A-----A-------------A-----------------------------------------------------------------A-AAG-------TGTTTTATCAGTAAAA-A-GAA----------------A--CTCGC-----------A----------A-A-----------C-TGTCAAACTTAAATG-TACT------TGA----T---TG--TAAGA--G--AAGTATCAACC--AC---G--------ACTG---TTTG-T-GAC-----AC-----ACTT--CA---C--T---------T----------C--AAA--------AAA--CT---------GT-----TTTC----T-----A-ATTTC---T--T---C-------------CC---CCTCCCATCTGTATTTTTCA--------AAAA-TGCATCTAGATC-AC---CTGAGAGTGTTT-ATT-GTG--GGAA-Aatcatcctctcccaataattaccccctacaccaatttctgtcggagcaagaaataaaaaaagtgttttatcagtaaaaagaaactcgcaaactgtcaaacttaaatgtacttgattgtaagagaagtatcaaccacgactgtttgtgacacacttcacttcaaaaaactgttttctaatttcttccccctcccatctgtatttttcaaaaatgcatctagatcacctgagagtgtttattgtgggaaataagg
gi|5 : tatcgtattaccccaaataaacacccatcatccGTATTCCCCAAA----AT--A-CAC-C-----------C--C-CACCACCC------C----C---C------AA-----C-AA-T-T-T-G-GCTCT---C----C----AGAAATCA---------A-A-----A-------------ATATATATTT-----T-------------T---T----G------TT--------------TTTGTG-AAG-------TGTT--ATCAGTAAAA-T-GAA----------------A--C---C-----------TGCA-------A-A-----------C-TGTC-AA--------------------AC---TA---TG--T---A--C--AATTATCAAA--------AA---------TG---TTTG-T-AAA--------------T-----------A---------T----------C----A--------TAA--AT---------GCCACTTACCC----C-----ACAAC-C---T--C---CCAATCAGGTTAATCC---C-------------CTTTGA--------AAAA-TGCATC--A--C-CC---CCAGGTGTGTtaagg
gi|6 : ttaccGA----AT--A-AAC-G-----------T--C-C------C------CACA-C---C------AC-----C-CA-T-T-T-G-GG--T---C----TTGGAA------A---------A-A-----A-------------A--------------T-------------TAAAT----GATACATTT--------------TTT-T------------TTTC--ATCAGTAAAA-A-GAA----------------A--C---C-----------T----------T-A-----------T-TTT--AAA----GTG-TATTAAATTTTGC---TT---GA--AAAAA--C--AATTATCAAAC--AC---AAC------AATG---TTTG-T-AAGATACTAC-----CCTC--CT---ACCC---------T----------C--AAA--------TAA--------------------GCCC----C-----A---------T--C---C-------------CCAATC-------------TTTTGA--------AAAA-GGTA-C--G--G-CC---CTGGGGGAACTT-ATTTGTG--AGAATAAGATATaaattattccgaggaatacagtattccata
gi|7 : GTATTCCCCCAT----AT--A-AAT-G-----------C--T-C------C------C----C---C------GC-----C-AA-T-T-G-G-G---T---C----T----G------A---------G-A-----A-------------A--------------T-------------T---T----G------TT--------------TTT-TT-AAT-------TGTT--ATCAGTAAAA-A-GAA----------------A--C---C-----------T----------A-A-----------C-TGC--AAA----GTG-TATTA-----TACATGTA---TA--TGAAA--C--AATTATTAAAC--AC---AAG------A-------TTG-T-AAC-----AC-----ACTT--CA---A--A---------T----------C--TAA--------TAA--AT---------GC-----ACCC----C-----A-AC--C---T--C---C-------------CC---C-------------ATTT-A--------AAAA-TTTATT--G--T-CC---CTGGGGGCATTTAATTGGTGCTGGAA-AGGATATGGt
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blockSeqs : GA . . A . . . . CATGC . . . . . GGGTCTTGGAAAAAAATTAAATGATACATTTTTTT . A ATTCATTGATATGATAA . . . . AAAACATTTTG . . . . T . . . . T AAATGTTTGTAACACAAATAAATGCCCACCCTCAG . . AA . GG A GTG A
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blockSeqs : TA . . G . . . . TAC . . . . . TAGTCTGAAAGACAAAATTGATTTTTTA . A ACCTGCAAA . . . . AGAAAAA . . . . T . . . . C AAAAAGAAAACTGGACCCAAATAAATTCCCCT . . AC . TG A
blockSeqs : AA . . A . . . . AC . . . . . GGGTCTTAAAAAACAATTTTTTGGAAG . G ATCTAA . . . . TGCTTAG . . . . T . . . . T AGCAATTAATAAATAAATAACACATTGTTCAC . . TC . TG A
blockSeqs : AT . . C . . . . CC . . . . . TGGTCCAAAAAATTAAAATTAAAAAG . A ACAAAA . . . . TGCTCCA . . . . T . . . . T AAAAAAATTGTGACCCAAATAAATGGCCTCT . . AC . TG .
blockSeqs : GA . . A . . . . TC . . . . . GGGTCCAAATTATTTTTTTGTTAAAG . T ACCCAA . . . . TGTTTAG . . . . T . . . . T CAAATCTAATAAATGCACCCCAACCTCCCCC . . GT . AA .
blockSeqs : TA . . A . . . . CC . . . . . GTGTTGGAATTATTTATTTTTTGAAG . A ACCTAA . . . . TGTTTG . . . . G . . . . T AAAATGTTTTTACTCGAATAAAAGGTCCCC . . GC . CA .
blockSeqs : GC . . G . . . . CC . . . . . CTGTCGGAGCAAGAAATAAAAAAAG . A ACCTAA . . . . TGTTTG . . . . T . . . . T CTACCCTCAAATAAGCCCCATCCCCAATC . . AC . AG .
blockSeqs : GT . . A . . . . CC . . . . . GGTCTGAGAAATTTGTTTTTTTAAT . A ACCTAG . . . . TACTTG . . . . G . . . . A TATAAGAAAAAATATAAATTCAAT . . GG . CA
blockSeqs : AA . . A . . . . TC . . . . . CCCACCAATTTAGGCTTGTTAAAA . A ACGTAA . . . . TGTTTG . . . . T . . . . C CCACTCCCACAAATAAACGCCCCC . . GT . .
blockSeqs : AA . . A . . . . CC . . . . . GGGTCCGAATTATTTTTGGGGG . A ACCTAG . . . . TGCTTG . . . . T . . . . A AAATTAAATTAATAAACACTCCT . . GT .
blockSeqs : GA . . C . . . . CT . . . . . TCCCACCAAGTTTTGACCTTG . A ACCTTA . . . . TGCTTG . . . . T . . . . A CCAAATAACACACACCCAC . . . .
blockSeqs : AT . . G . . . . CC . . . . . GGTCTGAAATTTGTTTTGGA . T GCCTTA . . . . TGCTTG . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : TA . . G . . . . CC . . . . . TAGTCCAAAAATTGAAG . A ACCTAA . . . . TGTTTG . . . . G . . . . .
blockSeqs : A . . T . . . . CC . . . . . GGTACATGTTGTGTAG . T ACCTTA . . . . TGCTTT . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CC . . . . . CCAATTTGT . A ACCTTA . . . . TGATTG . . . . A . . .
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|1 : CCCCCA----AT--A-ACC-G-----------C--C-C------C------CA---T---C------A--------AA-T-TGT-G-A---A---CAAAAC----A------A---------A-A-----A-------------AATAATATAATCCATT-------------T---T----T------TT--------------TTT-T---AG-------TGTTTTATCAGTGAAA-T-GAT----------------T--C---T-----------T----------A-A-----------T-TGT--TAT----GTG-TTTT------TG----TT---TG--TGAAA--C--AATTATCAAACATAT---AATTGTTTCATTG---TTTGTT-AAA-----AC-----ATTC--AA---A--A---------T----------G--AAA--------AAA--ATATATTTGAGG------ACACAAATG-----A-A---C---T--C---C-------------CT---C-------------TTTTGA--------AAAA-TACATT--A----CC---CAAGGGGCGTTTATTC----TTGAAA-AAGA
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gi|16 : atatttttttttatgtgttatcggataaaagaaacccaacaataacgttcatttgctatgaaTATTCTGCCCA----AT--A-AAC-A-----------C--C-C------CA-----C----C---CTTAGATAC-----C-AA-C-A-------------C----C----A------A---------G-A-----A-------------A--------------TGTTTTATTTATTCT---T----T------TT--------------TTT-TGTAAG-------TGAT--ATCAGTAAAA-G-GAACCTGCAA---------A--C---T-----------TTAAGGTAATTA-A-----------T-TGT--AAT----GTA-TATTAAATTTTG----TT---TG--TGAAA--C--AATTATCAAtttttttttaagagaatacagaataccagaagatat
gi|17 : ataccaG-------TGTT--ATCAGTATAG-A-GAA----------------A--C---C-----------T----------A-A-----------T-TTT--GTT----GTG-TATT------TG----TT---TG--TAAAA--C--AATTAACAAAC--AC---AAT------ATCT---TTTG-TAAAA-----AC-----TCAT--AA---A--ATGTTTTTACT----------C--GAA--------TAA--A-------------------------------A-G---G---T--C---C-------------CC------------------TTTAA--------AAAA-
gi|18 : A----AT--A-AAT-G-----------C--TGC------C------C----T---C------AT-----C-AA-T-T-T-G-GG--T---C----T----T------A---------A-A-----A-------------A--------------A-------------C---A----A------TT--------------TTT-TGGAAG-------TGTT--ATGAGTAAAA-T-GAA----------------A--C---C-----------T----------A-A-----------A-TGT--AAT----GTG-TATaaatcctgggtgtttgttcagagaatacg
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