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Reference ( gi|10 )           :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACCAACTCTTTGATAACAGACATAGAT-TATTTCATAC---ATT--TCAATATATG---AAAACTA---TACATGCTTTAGACAACACGGATTTT---TTAAAATATCATAA----ACTTATTCAAAGTATACCTCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-A-TAT-----TATATC-AT--CA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AAC----TAGTAAAACAAATTAAGACTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACCAACTATTTGATAGCAGACATAAGT-T-TTTAATAC---CTT--TCAATATATG---AAAAATA---TACATGCTTTAGAAAACACA-ATTTTTTTTTAAAATATCATAA----ACTCATTCAAAGTATACCGCGTTCTTGGAAGGT-T-ATCTCAAGAATG-A-TAA-----GTTATT-AT--CA--AATACACAA--CAA------AATA-AAC----TAATAAATCAAATTAAAACTT
gi|6                          :                                                                                               atatcatgaaaataaaggggacatgtagtacatatacttaaaacaactagacaaattcggagctcaaaaaacttctaagttattttagacatagctgtatcatggtcaaatataaacttcaacgtaaaaatgcagataatatggaacaactatttcattaaaacaataacaacaaaacactcttctacaaaccatggtatgataaaggaataaaatatattGACCAACATTTTGATAGCAGACATAAAT-TATATTATAC---CTT--TCAATAAATG---AAAA--A---TTCATGCTTTAGACAACACAGATTCT---TTAAAATATCATAA----ACTTATTAAAAGTATTCCGCACTCTTGGCAGGT-TAAACTAAAACATG-A-TAA-----TATATT-AC--CA--AATACTCAA--CAA------AATA-AAC----TAGTAGATCAAACAGATACTTtaaag
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gi|7                          : ttaaaaggaaatggaaatacatatacttaaaacaactaaataaattatgataatttaaagttgaatataagaacaataggaacgacctaaataatgcagcttaaataacttctaagtttttataatatatagtactatcacggtcaaatataaactttagtgaacatattgaaaagtaataatcagaaattgattattgggatatgaagatatgaaacgcagataatattgaacaagtcctttattaaaaaaaacaacaaaaaaaaacacaactttcttctacaaaccatatacgataaagaaatagaatatattGACCAACTCTATGATAGCAGACATAAAT-TATTTTAAAC---CTT--TCATTATAT-----------------ATGCTTTACACAACACATATTTT---TTAAAATATCATAC----ACTTATTCAAAGTATGATACAGTCTTTATAAGT-TAAACTTAAGAGTGAA-AAA-----TATATT-TT--CA--AATATGTAA--CAA------AATA-AAC----TAGTTATTCAAATCAGTACTacaaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                         taatatggaacaactcctttttttaaaaaccacaacaaaacactcttctacaaaccatggtatgataaggaataaaatacattGAACAAATCTTTGACAATAGACAAAAAG-TATTTAATAC---TTT--TCAGCATATG---AAAATTG---TACACAAATTGAATAATTCAGACTTT---CTAAAATATTATAC----CCTTATTCAAAGTATATCACATTCATGGAAATC-TGAACTTAAAAATG-A-TAC-----T---------------ATACGCAA--TAATTATATACAA-AAC----
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAAATCATTGATTCTAAAGAAAAATGTATTTAATAC---ATT--TCAGCAAATGTACACAACTG---TACACAAATTGTATAATTCGGATTTT---CTAAGATATTATAC----TCTTATTCAAAGTATATCATATTTATGG-CGGTATGAACGTAAAAATT-A-TAG-----TAGACC-Acaaaca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                   aaaacattcgtctaaaaatttgattcgaataaaggaatagttacaatatatcgaacaaatctttgacaataaacaaaaataattttatatcagcattaaaaagctacacattTCTTTGACAATAGACA-AAATGCATT--ATAA---ACTACTCATCATATT---AAAATTG---TACTCAAATTAAATAA------TTTT---CTAAAATATTATACTGTTATTTATTTAAAGTATATCACATTCATGGAAATA-TAAACTTAACAATG-A-CAA-----TATACC-A----A--AA---ACAA--TAATGC---ACAA-AATAACTTAATGGAACAAATTAaacaattataaacacataacttaatggaacccgttat
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAATA---TACATACTATAGACATAACAGATTTT---TTAAAATATCATAA----ACTTATTCAAAGTATATTGCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAAATTG-A-TAA-----TATTTT-AT--TA--AATACGCAA--CAA------ACTA-AGC----TAATAAAACAAATTAAAACTTcaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TA---CACAT-CTTAAAAAAAT-CGGATTTT---CTAAAATATTATAC----TCTTATTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAA-AATG-A-AAA-----TATA-C-AGAACAATAATAC---A--CAA------A-AT-AACT---TAATAAAACAAATTtaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atacggA---CACATGCTTTAGACAACACAGATTTT---TTAAAACATCATAA----ACTTATTCAAAGTATACCTCTCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-A-TAT-----TATATT-AT--CA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AAC----TAGTAAAACAAATTAAGAC
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACACGCTTTAGACAACACAGATTTT---TTAAAATATCATAC----GTTTATTCAAAGTATAGCACGCTCTTGGAAAGT-TGAACTTAAGAGTA-A-TAC-----TATATT-AT--CC--AATGCACatcaaaca
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaCGGATTTT---CTAAAATATTATAC----TCTTATTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-A-GA-------ATAT--AC--CA--AATA-ATAA--TAC------ACAA-AAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CGGATTTT---CTAAAATATTATAC----TCTTATTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTG-TAAATTTAAGAATG-A-AAA-----TGTACCAAA--CAATAATAC---A--CAA------A-AT-AACT---TAATGGAACAAATTtaaatatgaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAGATTTT---CTAAAATATTATAC----TCGTATTCAAAGTATATAAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-A-GAA-----TATACCAAA--CAATAATAC---A--CAA------A-AT-AACT---TAATGGAACAAATTAgtaaa
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ATATAACTGTAATATAAAAATGACAGAAATAATGCATTCCAGATCAGATACACTTAAGATTTTTATCAGATCAGATTTATACAATCATGATCAAATTTTCATTTCAAAGAAAATATTAACAATGACATCTAAACTAATATGGTATATTTGTAACAGTAAAATAACAATAAAACATTATTCTATATTGTTTTATTGAACAAATCTTTAATTGTAGGCAAACATTTTTATTTTTATTTTTCAGCATATGAAAAATGTTCACACTTTACCTTTTTTAAAGTAATATACCTGTATTCAATGTATAT
Unaligned ( gi|21 ): AGGGACAGACCTAAACAATACAACTCAAATAACTTCTAAATTTTT
Unaligned ( gi|22 ): TACCAAACAAGAATATACAAAATAACTTAATGGAACAAATTG
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Reference ( family-961 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACCAACTCTTTGATAGCAGACANAA---AT-T---ATTTNATACNT--TT--CANTATATG---AAAACTA---TACACGCTTTAGACAACACAGA---TTTT---CTAAAATATCATACN----CTTA-TTCAAAGTATATCGCGTTCNTGGAAGGT-TAAACTTAAGAATG-ATANTA------T--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACTT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACCAACTATTTGATAGCAGACGGGA---AT-A---ATTTCATACTTGATTAGTAGTACATG---AAATGTA---TACATGCGGTAGA-AACACATA---TTTTGATTTTAAATATCATGCA----CTTA-TTCAAAGTATATTGCGTTCTTGAAAAAT-TAAACTCAAGAATG-ATTATATACATGT--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------AATA-AA----C-TAGTAAATCAAA
gi|10                         : ttaaaaggaaatggaaatacatatacttaaaacaactaaataaattatgataatttaaagttgaatataagaacaataggaacgacctaaataatgcagcttaaataacttctaagtttttataatatatagtactatcacggtcaaatataaactttagtgaacatattgaaaagtaataatcagaaattgattattgggatatgaagatatgaaacgcagataatattgaacaagtcctttattaaaaaaaacaacaaaaaaaaacacaactttcttctacaaaccatatacgataaagaaatagaatatattGACCAACTCTTTGATAACAGACATAG---AT-T---ATTTCATACAT--TT--CAATATATG---AAAACTA---TACATGCTTTAGACAACACGGA---TTTT---TTAAAATATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATACCTCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-ATATTA------T--------AT-CATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACTTacaaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAACAAATCTTTGACAATAGACAAAA---AG-C---ATTTTATACTT--TA--CACAATAAG---GAATCTG---TAC------------ACACAG-----TTT---CT-AAATATTATTTT----CTTACTTTAAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaatatatgACAT--TT--TA--ATATG---AAAACAACGGTACACAACTCAAATAATTCAGA---TTTT---CTAAAATATTATACT----CCTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTGAAAAATG-AGAATA------------------TACCA--AACA-ATAATGCAC------ACAATAA----CTTAATGGAACAAATTAaagatagtttacctaacaataatacacaaaataaattaatgaacaaattgtaaatgtgaaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caG---AAACCTA---TACATGCTTTAGACAACATAGA---TTTT---TTAAAATATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTGTACCTCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-GTATTA------T--------AT-TATCA--AATACGAAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACTTtaaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAATA---TACATACTATAGACATAACAGA---TTTT---TTAAAATATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATATTGCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAAATTG-ATAATA------T--------TT-TATTA--AATACGCAA--CAA------ACTA-AG----C-TAATAAAACAAATTAAAACTTcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A---CACATGCTTTAGACAACACAGA---TTTT---TTAAAACATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATACCTCTCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-ATATTA------T--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACtaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TACACATCTTAAAAAAATCGGA---TTTT---CTAAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAA-AATG-AAAATA------T--------ACAGAACAATAATAC---A--CAA------A-AT-AA----CTTAATAAAACAAATTatcaaaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atacggCGGA---TTTT---CTAAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTG-TAAATTTAAGAATG-AAAATG------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAGA---TTTT---CTAAAATATTATACT----CGTA-TTCAAAGTATATAAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATTAgtaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACACGCTTTAGACAACACAGA---TTTT---TTAAAATATCATACG----TTTA-TTCAAAGTATAGCACGCTCTTGGAAAGT-TGAACTTAAGAGTA-ATACTA------T--------AT-TATCC--AATGCACtaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaGAACAAATCTTTGACAATAGACAAAA---AG-T---ATTTAATACTT--TT--CAGCATATG---AAAATTG---TACACAAATTGAATAATTCAGA---CTTT---CTAAAATATTATACC----CTTA-TTCAAAGTATATCACATTCATGGAAATC-TGAACTTAAAAATG-ATACT---------------------------ATACGCAA--TAATTATATACAA-AA----C-t
gi|20                         :                                                                                                                                           attaaaaatggcaggggcataaaaagagaactagcaaaaataggaggacaattaatatttaaatgtaatattaataaaaatgacttaaacaatgcacttcagatagactcgaggtttttataagaaataatacaaccatgatctagtattaatttaagcgaaaatgttgaaaatatgaacaaacaaataatacgaaataattctaacattaaaaataacaataaaacattcacctataaatcttggttcgaaaaaggaattagatatataCGGA---TTTT---CTAAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AATA-ATAA--TAC------ACAA-AA----
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-Ataaatatgaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaGACCAACTATTTGATAGCAGACATAA---GT-T----TTTAATACCT--TT--CAATATATG---AAAAATA---TACATGCTTTAGAAAACACA-ATTTTTTT---TTAAAATATCATAAA----CTCA-TTCAAAGTATACCGCGTTCTTGGAAGGT-T-ATCTCAAGAATG-ATAAGT------T--------AT-TATCA--AATACACAA--CAA------AATA-AA----C-TAATAAATCAAATTAAAACTTg
gi|4                          :                                                                                                  atatcatgaaaataaaggggacatgtagtacatatacttaaaacaactagacaaattcggagctcaaaaaacttctaagttattttagacatagctgtatcatggtcaaatataaacttcaacgtaaaaatgcagataatatggaacaactatttcattaaaacaataacaacaaaacactcttctacaaaccatggtatgataaaggaataaaatatattCAAATCATTGATTCTAAAGAAAA---ATGT---ATTTAATACAT--TT--CAGCAAATGTACACAACTG---TACACAAATTGTATAATTCGGA---TTTT---CTAAGATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCATATTTATGG-CGGTATGAACGTAAAAATT-ATAGTA------GACCAAACAAT-TAT-A--AACACATAA--Ctaaag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                            aaaacattcgtctaaaaatttgattcgaataaaggaatagttacaatatatcgaacaaatctttgacaataaacaaaaataattttatatcagcattaaaaagctacacattGAACAAATCTTTAATTGTAGGCAAAC---AT-TTTTATTTT-TATTT--TT--CAGCATATG---AAAAATG---TTCACACTTT--AC--C--------TTTT---TTAAAGTAATATACC----TGTA-TTCAATGTATATttaatggaacccgttat
gi|6                          :                                                                                                                          atataactgtaatataaaaatgacagaaataatgcattccagatcagatacacttaagatttttatcagatcagatttatacaatcatgatcaaattttcatttcaaagaaaatattaacaatgacatctaaactaatatggtatatttgtaacagtaaaataacaataaaacattattctatattgttttattGACCAACATTTTGATAGCAGACATAA---AT-T---ATATTATACCT--TT--CAATAAATG---AAAA--A---TTCATGCTTTAGACAACACAGA---TTCT---TTAAAATATCATAAA----CTTA-TTAAAAGTATTCCGCACTCTTGGCAGGT-TAAACTAAAACATG-ATAATA------T--------AT-TACCA--AATACTCAA--CAA------AATA-AA----C-TAGTAGATCAAACAGATACTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             ttgaaaaaataaaaatgcagataatatagaacaactcctttattaaaaacaacaacaaaacactcttctacaaaccttgataaataagatgtattGACCAACTCTATGATAGCAGACATAA---AT-T---ATTTTAAACCT--TT--CATTATAT-----------------ATGCTTTACACAACACATA---TTTT---TTAAAATATCATACA----CTTA-TTCAAAGTATGATACAGTCTTTATAAGT-TAAACTTAAGAGTGAAAAATA------T--------AT-TTTCA--AATATGTAA--CAA------AATA-AA----C-TAGTTATTCAAATCAGTACTatataaca
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Reference ( family-961 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACCAACTCTTTGATAGCAGACANAA---AT-T---ATTTNATACNT--TT--CAGTATATG---AAAACTA---TACACGCTTTAGACAACACAGATTTT---CT---AAAATATCATACN----CTTA-TTCAAAGTATATCGCGTTCNTGGAAGGT-TAAACTTAAGAATG-ATAATA------T--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACTT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAATA---TACATACTATAGACATAACAGATTTT---TT---AAAATATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATATTGCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAAATTG-ATAATA------T--------TT-TATTA--AATACGCAA--CAA------ACTA-AG----C-TAATAAAACAAATTAAAACTTcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A---CACATGCTTTAGACAACACAGATTTT---TT---AAAACATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATACCTCTCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-ATATTA------T--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACtaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TACACATCTTAAAAAAATCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAA-AATG-AAAATA------T--------ACAGAACAATAATAC---A--CAA------A-AT-AA----CTTAATAAAACAAATTatcaaaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atacggCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTG-TAAATTTAAGAATG-AAAATG------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CGTA-TTCAAAGTATATAAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATTAgtaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACACGCTTTAGACAACACAGATTTT---TT---AAAATATCATACG----TTTA-TTCAAAGTATAGCACGCTCTTGGAAAGT-TGAACTTAAGAGTA-ATACTA------T--------AT-TATCC--AATGCACtaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaGAACAAATCTTTGACAATAGACAAAA---AG-T---ATTTAATACTT--TT--CAGCATATG---AAAATTG---TACACAAATTGAATAATTCAGACTTT---CT---AAAATATTATACC----CTTA-TTCAAAGTATATCACATTCATGGAAATC-TGAACTTAAAAATG-ATACT---------------------------ATACGCAA--TAATTATATACAA-AA----C-t
gi|20                         :                                                                                                                                           attaaaaatggcaggggcataaaaagagaactagcaaaaataggaggacaattaatatttaaatgtaatattaataaaaatgacttaaacaatgcacttcagatagactcgaggtttttataagaaataatacaaccatgatctagtattaatttaagcgaaaatgttgaaaatatgaacaaacaaataatacgaaataattctaacattaaaaataacaataaaacattcacctataaatcttggttcgaaaaaggaattagatatataCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AATA-ATAA--TAC------ACAA-AA----
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-Ataaatatgaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaGACCAACTATTTGATAGCAGACATAA---GT-T----TTTAATACCT--TT--CAATATATG---AAAAATA---TACATGCTTTAGAAAACACA-ATTTT---TTTTTAAAATATCATAAA----CTCA-TTCAAAGTATACCGCGTTCTTGGAAGGT-TAT-CTCAAGAATG-ATAAGT------T--------AT-TATCA--AATACACAA--CAA------AATA-AA----C-TAATAAATCAAATTAAAACTTg
gi|4                          :                                                                                                  atatcatgaaaataaaggggacatgtagtacatatacttaaaacaactagacaaattcggagctcaaaaaacttctaagttattttagacatagctgtatcatggtcaaatataaacttcaacgtaaaaatgcagataatatggaacaactatttcattaaaacaataacaacaaaacactcttctacaaaccatggtatgataaaggaataaaatatattCAAATCATTGATTCTAAAGAAAA---ATGT---ATTTAATACAT--TT--CAGCAAATGTACACAACTG---TACACAAATTGTATAATTCGGATTTT---CT---AAGATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCATATTTATGG-CGGTATGAACGTAAAAATT-ATAGTA------GACCAAACAAT-TAT-A--AACACATAA--Ctaaag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                            aaaacattcgtctaaaaatttgattcgaataaaggaatagttacaatatatcgaacaaatctttgacaataaacaaaaataattttatatcagcattaaaaagctacacattGAACAAATCTTTAATTGTAGGCAAAC---AT-TTTTATTTT-TATTT--TT--CAGCATATG---AAAAATG---TTCACACTTT--AC--C-----TTTT---TT---AAAGTAATATACC----TGTA-TTCAATGTATATttaatggaacccgttat
gi|6                          :                                                                                                                          atataactgtaatataaaaatgacagaaataatgcattccagatcagatacacttaagatttttatcagatcagatttatacaatcatgatcaaattttcatttcaaagaaaatattaacaatgacatctaaactaatatggtatatttgtaacagtaaaataacaataaaacattattctatattgttttattGACCAACATTTTGATAGCAGACATAA---AT-T---ATATTATACCT--TT--CAATAAATG---AAAA--A---TTCATGCTTTAGACAACACAGATTCT---TT---AAAATATCATAAA----CTTA-TTAAAAGTATTCCGCACTCTTGGCAGGT-TAAACTAAAACATG-ATAATA------T--------AT-TACCA--AATACTCAA--CAA------AATA-AA----C-TAGTAGATCAAACAGATACTT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-961 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GACCAACTCTTTGATAGCAGACANAA---AT-T---ATTTNATACNT--TT--CAGTATATG---AAAACTA---TACACGCTTTAGACAACACAGATTTT---CT---AAAATATCATACN----CTTA-TTCAAAGTATATCGCGTTCNTGGAAGGT-TAAACTTAAGAATG-ATAATA------T--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACTT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TACACATCTTAAAAAAATCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAA-AATG-AAAATA------T--------ACAGAACAATAATAC---A--CAA------A-AT-AA----CTTAATAAAACAAATTatcaaaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atacggCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTG-TAAATTTAAGAATG-AAAATG------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CGTA-TTCAAAGTATATAAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATTAgtaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACACGCTTTAGACAACACAGATTTT---TT---AAAATATCATACG----TTTA-TTCAAAGTATAGCACGCTCTTGGAAAGT-TGAACTTAAGAGTA-ATACTA------T--------AT-TATCC--AATGCACtaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaGAACAAATCTTTGACAATAGACAAAA---AG-T---ATTTAATACTT--TT--CAGCATATG---AAAATTG---TACACAAATTGAATAATTCAGACTTT---CT---AAAATATTATACC----CTTA-TTCAAAGTATATCACATTCATGGAAATC-TGAACTTAAAAATG-ATACT---------------------------ATACGCAA--TAATTATATACAA-AA----C-t
gi|20                         :                                                                                                                                           attaaaaatggcaggggcataaaaagagaactagcaaaaataggaggacaattaatatttaaatgtaatattaataaaaatgacttaaacaatgcacttcagatagactcgaggtttttataagaaataatacaaccatgatctagtattaatttaagcgaaaatgttgaaaatatgaacaaacaaataatacgaaataattctaacattaaaaataacaataaaacattcacctataaatcttggttcgaaaaaggaattagatatataCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AATA-ATAA--TAC------ACAA-AA----
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-Ataaatatgaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaGACCAACTATTTGATAGCAGACATAA---GT-T----TTTAATACCT--TT--CAATATATG---AAAAATA---TACATGCTTTAGAAAACACA-ATTTT---TTTTTAAAATATCATAAA----CTCA-TTCAAAGTATACCGCGTTCTTGGAAGGT-TAT-CTCAAGAATG-ATAAGT------T--------AT-TATCA--AATACACAA--CAA------AATA-AA----C-TAATAAATCAAATTAAAACTTg
gi|4                          :                                                                                                  atatcatgaaaataaaggggacatgtagtacatatacttaaaacaactagacaaattcggagctcaaaaaacttctaagttattttagacatagctgtatcatggtcaaatataaacttcaacgtaaaaatgcagataatatggaacaactatttcattaaaacaataacaacaaaacactcttctacaaaccatggtatgataaaggaataaaatatattCAAATCATTGATTCTAAAGAAAA---ATGT---ATTTAATACAT--TT--CAGCAAATGTACACAACTG---TACACAAATTGTATAATTCGGATTTT---CT---AAGATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCATATTTATGG-CGGTATGAACGTAAAAATT-ATAGTA------GACCAAACAAT-TAT-A--AACACATAA--Ctaaag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                            aaaacattcgtctaaaaatttgattcgaataaaggaatagttacaatatatcgaacaaatctttgacaataaacaaaaataattttatatcagcattaaaaagctacacattGAACAAATCTTTAATTGTAGGCAAAC---AT-TTTTATTTT-TATTT--TT--CAGCATATG---AAAAATG---TTCACACTTT--AC--C-----TTTT---TT---AAAGTAATATACC----TGTA-TTCAATGTATATttaatggaacccgttat
gi|6                          :                                                                                                                          atataactgtaatataaaaatgacagaaataatgcattccagatcagatacacttaagatttttatcagatcagatttatacaatcatgatcaaattttcatttcaaagaaaatattaacaatgacatctaaactaatatggtatatttgtaacagtaaaataacaataaaacattattctatattgttttattGACCAACATTTTGATAGCAGACATAA---AT-T---ATATTATACCT--TT--CAATAAATG---AAAA--A---TTCATGCTTTAGACAACACAGATTCT---TT---AAAATATCATAAA----CTTA-TTAAAAGTATTCCGCACTCTTGGCAGGT-TAAACTAAAACATG-ATAATA------T--------AT-TACCA--AATACTCAA--CAA------AATA-AA----C-TAGTAGATCAAACAGATACTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                             ttgaaaaaataaaaatgcagataatatagaacaactcctttattaaaaacaacaacaaaacactcttctacaaaccttgataaataagatgtattGACCAACTCTATGATAGCAGACATAA---AT-T---ATTTTAAACCT--TT--CATTATAT-----------------ATGCTTTACACAACACATATTTT---TT---AAAATATCATACA----CTTA-TTCAAAGTATGATACAGTCTTTATAAGT-TAAACTTAAGAGTGAAAAATA------T--------AT-TTTCA--AATATGTAA--CAA------AATA-AA----C-TAGTTATTCAAATCAGTACTatataaca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                taatatggaacaactcctttttttaaaaaccacaacaaaacactcttctacaaaccatggtatgataaggaataaaatacattTCTTTGACAATAGACAAAATGCAT-T---AT---AAACTA--CT--CATCATATT---AAAATTG---TACTCAAATTAAATAA------TTTT---CT---AAAATATTATACTGTTATTTA-TTTAAAGTATATCACATTCATGGAAATA-TAAACTTAACAATG-ACAATA------------------TACCA--AAAA--CAA--TAATGC---ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaacattcttctctaacccttggttcgacaaggggattaaatatattgaacacaCAACTCTTTGATAACAGACATAA---AT-T---ATGTCATACCT--TT--CAATATATG---AAG-CTA---TACATGCTAAAGACAACACAGATTTT---TT---AAAATATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATACCTCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-ATATTA------T--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACTTtaaatgt


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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T  .    . .      A    T .   .   AT     .     CC  .               C   A        .    .              T        .             G     T      G .              .      TAT                    .     CG   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A  .    . .      A    C .   .   GC     .     AA  .               C   A        .    .              A        .             T     T      G .              .      TTT                    .     CA   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A  .    . .      T    A .   .   GC     .     AT  .               A   A        .    .              A        .             A     A      T .              .      TAT                    .     CG   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T  .    . .      T    T .   .   AT     .     AA  .               C   T        .    .              A        .             A     A      T .              .      TAT                    .     CA   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T  .    . .      T    C .   .   TT     .     AC  .               T   A        .    .              T        .             A     A      T .              .      TAT                    .     CA   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A  .    . .      C    C .   .   TC     .     AA  .               A   T        .    .              T        .             A     T      G .              .      TAT                    .     CT   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T  .    . .      .    T .   .   AT     .     AT  .               T   A        .    .              T        .             A     A      T .              .      TAT                    .     TG   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         C .   .   .      .     A   .               C   T        .    .              G        .             A     A      T .              .      TAT                    .     CG   .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .     C   .               C   A        .    .              C        .             G     A      T .              .      .                      .     A    .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .   .               C   A        .    .              T        .             A     T      G .              .      .                      .     C    .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .               T   A        .    .              A        .             G     A      G .              .      .                      .     A    .    .         .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .               C   .        .    .              T        .             A     T      G .              .      .                      .     A    .    .         .  .     
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaatatatgACAT--TT--TA--ATATG---AAAACAACGGTACACAACTCAAATAATTCAGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CCTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTGAAAAATG-AGAATA------------------TACCA--AACA-ATAATGCAC------ACAATAA----CTTAATGGAACAAATTAaagatagtttacctaacaataatacacaaaataaattaatgaacaaattgtaaatgtgaaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caG---AAACCTA---TACATGCTTTAGACAACATAGATTTT---TT---AAAATATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTGTACCTCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-GTATTA------T--------AT-TATCA--AATACGAAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACTTtaaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAAATA---TACATACTATAGACATAACAGATTTT---TT---AAAATATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATATTGCGCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAAATTG-ATAATA------T--------TT-TATTA--AATACGCAA--CAA------ACTA-AG----C-TAATAAAACAAATTAAAACTTcaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A---CACATGCTTTAGACAACACAGATTTT---TT---AAAACATCATAAA----CTTA-TTCAAAGTATACCTCTCTCTTGGAAGGT-TAAACTCAAGAATG-ATATTA------T--------AT-TATCA--AATACGCAA--CAA------ACAA-AA----C-TAGTAAAACAAATTAAGACtaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---TACACATCTTAAAAAAATCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAA-AATG-AAAATA------T--------ACAGAACAATAATAC---A--CAA------A-AT-AA----CTTAATAAAACAAATTatcaaaca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atacggCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTG-TAAATTTAAGAATG-AAAATG------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CGTA-TTCAAAGTATATAAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AACA-ATAA--TAC------ACAA-AATAACT-TAATGGAACAAATTAgtaaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACACGCTTTAGACAACACAGATTTT---TT---AAAATATCATACG----TTTA-TTCAAAGTATAGCACGCTCTTGGAAAGT-TGAACTTAAGAGTA-ATACTA------T--------AT-TATCC--AATGCACtaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaGAACAAATCTTTGACAATAGACAAAA---AG-T---ATTTAATACTT--TT--CAGCATATG---AAAATTG---TACACAAATTGAATAATTCAGACTTT---CT---AAAATATTATACC----CTTA-TTCAAAGTATATCACATTCATGGAAATC-TGAACTTAAAAATG-ATACT---------------------------ATACGCAA--TAATTATATACAA-AA----C-t
gi|20                         :                                                                                                                                           attaaaaatggcaggggcataaaaagagaactagcaaaaataggaggacaattaatatttaaatgtaatattaataaaaatgacttaaacaatgcacttcagatagactcgaggtttttataagaaataatacaaccatgatctagtattaatttaagcgaaaatgttgaaaatatgaacaaacaaataatacgaaataattctaacattaaaaataacaataaaacattcacctataaatcttggttcgaaaaaggaattagatatataCGGATTTT---CT---AAAATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCAAATTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-AGAATA------------------TACCA--AATA-ATAA--TAC------ACAA-AA----
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCATGGAAGTC-TAAACTTAAGAATG-Ataaatatgaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaGACCAACTATTTGATAGCAGACATAA---GT-T----TTTAATACCT--TT--CAATATATG---AAAAATA---TACATGCTTTAGAAAACACA-ATTTT---TTTTTAAAATATCATAAA----CTCA-TTCAAAGTATACCGCGTTCTTGGAAGGT-TAT-CTCAAGAATG-ATAAGT------T--------AT-TATCA--AATACACAA--CAA------AATA-AA----C-TAATAAATCAAATTAAAACTTg
gi|4                          :                                                                                                  atatcatgaaaataaaggggacatgtagtacatatacttaaaacaactagacaaattcggagctcaaaaaacttctaagttattttagacatagctgtatcatggtcaaatataaacttcaacgtaaaaatgcagataatatggaacaactatttcattaaaacaataacaacaaaacactcttctacaaaccatggtatgataaaggaataaaatatattCAAATCATTGATTCTAAAGAAAA---ATGT---ATTTAATACAT--TT--CAGCAAATGTACACAACTG---TACACAAATTGTATAATTCGGATTTT---CT---AAGATATTATACT----CTTA-TTCAAAGTATATCATATTTATGG-CGGTATGAACGTAAAAATT-ATAGTA------GACCAAACAAT-TAT-A--AACACATAA--Ctaaag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                            aaaacattcgtctaaaaatttgattcgaataaaggaatagttacaatatatcgaacaaatctttgacaataaacaaaaataattttatatcagcattaaaaagctacacattGAACAAATCTTTAATTGTAGGCAAAC---AT-TTTTATTTT-TATTT--TT--CAGCATATG---AAAAATG---TTCACACTTT--AC--C-----TTTT---TT---AAAGTAATATACC----TGTA-TTCAATGTATATttaatggaacccgttat
gi|6                          :                                                                                                                          atataactgtaatataaaaatgacagaaataatgcattccagatcagatacacttaagatttttatcagatcagatttatacaatcatgatcaaattttcatttcaaagaaaatattaacaatgacatctaaactaatatggtatatttgtaacagtaaaataacaataaaacattattctatattgttttattGACCAACATTTTGATAGCAGACATAA---AT-T---ATATTATACCT--TT--CAATAAATG---AAAA--A---TTCATGCTTTAGACAACACAGATTCT---TT---AAAATATCATAAA----CTTA-TTAAAAGTATTCCGCACTCTTGGCAGGT-TAAACTAAAACATG-ATAATA------T--------AT-TACCA--AATACTCAA--CAA------AATA-AA----C-TAGTAGATCAAACAGATACTT
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