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gi|15 : tgcaaAAAGTAGTG----TTAT--------A----AAT--AATGGT---CA----TG-CAACTA---ATTGT--T--TTCCTA----TACAAAGA-GGTGTTCGACAAAGCTATTCACT-AT--C--GCC----T-TATCTC--TT---TAT----T--ATATGCA-T-TGA---GTTGTTGT--T---G---T----------------TGT---T-----CG---A-A-----AGTGT--AA----------A-TA---A---CA----AAA--ATAT--T-A-----------A-T-G------TC--------AT--A-CACATGGC---A---GGTTTA--GATA----T---A-AAA-AAAACA---C--TT--TT-TTTGCAGATGATGCGACATTCGTCACCGATGGATC----A---A---A---A-C-A-A-----TTATTTGAAAA-CT-TA-ATT--AA--TAC---AC---T--TGATTCA--TT------T---A----GTT-----------A------TGTA--TCTTGGT----TAAAACT---C-AA--T-CC--ttaaatggtgcaatgatagtgcaaaagcattaggtgtcactttccacac
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gi|25 : atataagtagttcattacttaacaacggacatatgactatttttccctattcaccgatgtgttaACAAGGATGCCCACT-TT--C--TCC----A-TATTTG--TT---TAT----A--CTAGCAA-T-AGA---A--ATT-C--T---A---T-A--T---AA---AGCTGT--------------A-A-----A---T--AACGA--TAACAA-TA---T---TG----AAG--GTG---T-A-----------C---A------A---------AT--A-CGCATAA----A---C----A--TTT-----T---C-AAATA---CA---C--AG--CT-TTTGCAGACGATGCCACATTTTTGTTAAATGGAAT----T---A---A---A-T-CTT-----CT-TTTGAAAC-TC-TA-ATATTAT--TAATT-GA---T--AGA------TT------T---A----GCT-----------C------AATT--TC-TGGT----TTAAAGT---TAAA--T-TC--TAAAA--AA---ATCT---A--TTC-TC-C------GTG-----T-AGG-CTC-T-TT--AAAAACATCTATTGACATA--TTTTGTAAAAAAT----AAAATAT----TTGT-TTGGAT----T----AA------T--G-AAAAA----G--CATCttaacaatcaaaagcacttggaatagttttct
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14 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-960 ) : CAAAGTTGTGTAGT-------------NAATAACGGNCACATGTCNGAN-TTCT-TT----AAAAT-AGAAAGN-GGN-GTACGACAAGGATGCCCNCTN-T--CNCCN----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAA-----NT--TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---ATA-------TNA---AAG-GTATN-A--C-TA------T---------AT-AC----G-ATAG----A---GAAA---T--NA---A-AA-ACA--CN--GCT-T----------T-T-GCAGATGATGC-AACNTTTATG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGNA-AC-CTT--AATA--A-A--T-AA--NN--T--AG---ACGAT---TT------TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGTCTTAA-ACT---T-AA--CNCT-AAT-AAATCTATAATTTTAC--GNTC-AGGNTC--T-TTAAAA-A--A--C-TCAAAT--GAAACATTTAG-T-AC-N----A-A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
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gi|10 : aCAAAGTTGTGTAAT-------------AAATAATGGCCACATGTCGGAA-TTCT-TT----AAAGT-AGAAAGG-GGA-GTACGACAAGGATGCCCACTA-T--CGCCT----TAT-T-TA--TT---TAT----TTT--AGT-TATT-GAG-----GT--TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TG-AC---TCTTATA-------TTA---AAG-GTATT-A--C-TA------T---------AT-AC----G-ATAG----A---GAGA---T--TA---A-AA-ACA--CT--GCT-T----------T-T-GCAGATGACGC-CACTTTTATG---ATTGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TTACA-AC-CTT--AATA--A-A--T-AA--AA--T--AG---ACAAT---TT------CAGCA-----------A--AATA--------TC-G-----GGTCTTAA-ACT---T-AA--TTCT-AGT-AAATCCATAATTTTAC--GCTC-AGGGTC--T-TTAAAA-T--A--T-TCAAAT--AAAACATTTAA-T-AT-T----A-A-T-A-AA--A-A--A---TACATC--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACTCTGGGAATTACATTTGC
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gi|15 : cAAAGTAGTGTTAT-------------AAATAATGGTCATGCAACTAAT-TGTT-TT----CCTAT-ACAAAGA-GGT-GTTCGACAAAGCTATTCACTA-T--CGCCT----TAT-C-TC--TT---TAT----TAT--ATG-CATT-GAG-----TT--GTT--------G-------T-----T--G----TTG--TT--CG---A------A-----AGTG--TA-A--------ATA-------ACA---AAA-ATATT-A--A-TG------TC--------AT-ACACATG-GCAGGTTTA---GATA---TAAAA---A-AA-ACA--CT--TTT-T----------T-T-GCAGATGATGC-GACATTCGTC---ACCGATGGATC----A---AA---A-C-A-A-----TTAT---TTGAA-AA-CTT--AATT--A-A--T-AC--AC--T--------TGATTCATT------TAGTT-----------A--TGTA--------TCTT-----GGT-TAAA-ACT---C-AAT-CCCT-CG--AAATGTAACATATTAA--AAGC-CGGTTT--A-TTGAAA-AT-A--C-ACGTAT--ACAA----TAA-T-CC-G----A-A-G-A-AATGA-A--A---TTC-TGT-TGG-TCATCA--GAT-AAG----GC-AA-AGGCATTGGGAAtcttcac
gi|16 : aAAATTTGTGTAGT-------------TAATAACGTATACATGTCAGATATTTT-TC----AAAAT-AGAAAAT-GGA-GTAAGACAAGGATGCCCATTA-T--CGCCT----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-TATC-GAG-----TT--ATT--------A-------T--A--T--AA-AT-------------------------------------C---G---GTA-------CAA---AAG-GTATT-A--C-AT------T---------TT-AC----A-ATAG----AT--TAAT---T--AA---A-AA-ACA--CA--GCA-T----------T-C-GCAGATGATGC-AACATTTATG---ATGGATGGACA----A---AA---A-A-C-A-----TG-T---T--TA-AC-CTT--AATA--A-A--G-AA--AA--T--CG---ATAAT---TT------T-GTA-----------A--AATA--------TT-T-----GGGCTTAA-GCT---T-AA--TTCT-AAA-AAATCTATAATTTTAC--GATC-GGGTTC--A-TTAAAA-A--A--CTTCAAAT--GAAATTCTAAG-T-AA-A----G-ATT-A-AA--A-A--A---TT-ATA--TGG-ACAACT--GA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAGTTGTCTTTGC
gi|17 : tT-------------TAATAATGGTTACATGTCTGAT-TTTT-TA----AAAAT-AGGACGT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCTC-TTTCTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAA-----AT--TTT--------A-------TT-A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---ATA-------TAA---AAG-ATATA-AAAC-T-------T---------A--AT----G-AAAA----A---GAAA---T--TA---A-AA-AAG--C----CTGT----------T-T-GCTGATGACAC-AACATTTGTT---ACTGATGGGTCGGA-A---AA---A-----A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--ATTA--A-A----AC--TA--T--AG---ACGAA---TT------TAGTA-----------A--ATTA--------TC-C-----GGCCTTAA-ATT---G-AA--CCTA-AAC-AAATCCACAGTATTAA--GAGC-AGGATC--C-CTAAAA-A--A--T-ACAGAC--AAA--ATTTAT-T-GCAA----A-A-TGA-AA--A-A--A---T--ACA--TGG-ACATCT--AA---------GC-AG-CCACTTTAGGAATCAaaatt
gi|18 : tttTTGTGTGTC-------------AAATAGTGGTTACTCCGCAGAC-TTGT-TT----ATTAT-AAAAAAAAGGA-ATAAGGCAA-----TCCATTT-T-------------T-T-TG--TT---T-T----TAT--AAGCTAAA-TGA-----AT--TTT--------A-------T--A--T--AA-GACGG--T--------A------A-----A-----TA-AT---G---ATAACATTA-TTG---AAA-GCGCA-A-----A------G---------AT-AC----G--CAA----A---AACA---T--GATCTA-AA-ATT--CT--GTT-T----------T-T-GCGAACGATGCCAAAATTT-TG---TTGAATGG-----------AA---A-T-C-A------------------AT-CTT--TATA-------TGAA--TT--T--AG---A--AT---AT------TATTA-----------ATTGATAGGTTTAGCTC-CATTTTGGT-TTAATAAT---A-AA--TTCC-AA--AAATCGATTATTTT-C--GTGA-AGGCTC--T-TTAACA-A--A--A-TCCATT--AAAATATTTTG-TAAA-G----A-A-T-A-AA--A-A--A---tcttcacaaa
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gi|25 : ACAAGGATGCCCACTT-T--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TAT----ACT--AGC-AATA-GAA-----AT--TCT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG--T----A---A------ATAACGA-----TA-AC---A---ATA-------TTG---AAG-GTGT--A--C--A------A---------AT-AC----GCATAA----A---CATT---T--TC---A-AATACA--CA--GCT-T----------T-T-GCAGACGATGC-CACATTTTTG---TTAAATGGAAT----T---AA---A-T-CTT-----CT-T---TTGAA-AC-TCT--AATATTA-T--T-AATTGA--T--AG---A-------TT------TAGCT-----------C--AATT--------TC-T-----GGT-TTAA-AGT---TAAA--TTCTAAAA-AAATCT---ATTCTCC--GTGT-AGGCTC--T-TTAAAA-A--C--A-TCTATT--GACATATTTTG-TAAA-A----A-A-T-A-AA--A-T--A---TTTGTT--TGG-ATTAAT--GA--AAAA---GC-AT-CAACACTAGGAAT--CGTTTaggcagtgtagataggttcaaggaaaatagtaatattaagttatgtgaagaatattatct
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Reference ( family-960 ) : CAAAGTTGTGTANTTA-------------AT-AACGGNCACA----TGTCNG-AN-T-TTT-T----C--A--ANATAGAAA-GA-GGN-GTACGACAAGGATGCCCACTN-T--CNCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAANT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------AA---T-NA---A-AA-A--TA--C--NGCT-TTT-GCAGATGATG-CAA-CNTTTATG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGAA-AC-CTT--A-A-TA--A-AN--AA--NNTAG---ACGAT---TT------TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--CNCT----AANAAATCTATNATT-TTACGNNC-AGGNT--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACATT-TAGT--AC---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
gi|1 : AAAGTTGTGTAGTTATATGTTAAATGTAAT-AGCTGACACA----TGTCA--AT-T-TTTGT----C--A--CATTAGAAA-GA-GAA-GTAAGTAAAAGATGTCCATTA-T--CGCCT----TAT-C-TG--TT---TAT----TAT--AAA-TATC-GAATT-----ATT--------A-------T--G--T--AA-ATCGG--TA--CA---A------A-----AG----TATAC---A---AAT----A-------TA--A---AAG--TAT--C-A--C----TG------T---------TT--ACT-GCAG----A----AA------GG---T-TA---A-AA----CA--T--CGCT-TTT-GTAGATGATG-GAA-CGTTTATT---TTGGATGTATC----A---AA---AGT-A-A-----AT-T---TC--A-AC-ATT--A-AATA--T-GA--AA--TTCA----ACAAT---TT------TAGTAAATTTTAGTATA--AATA--------T--------GGTCT-TGA-GCT---T-AA--CTTG----AATGAATCTTTAATT-TTACGATT-AGGTA--C-T-TTAAAA-A--CT-T----CAAAT--GAAAC-TT-TCAT--AC---A-A--A-G-A-AA--G-AATA---TTCATT--TGG-ACATCT--AA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAATCATCTCTGC
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gi|11 : AAAGTTGTGTAATAA-------------CT-AATGGACACA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----T--A--AAGTAGATA-GG-GGA-GTAAGACAAGGATGCACATTA-T--TACCA----CAT-T-T--------TGT----TTT--AGC-TATT-GAAGT-----TTT--------A-------T--A--A--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----CG-AT---GCTAA-T----ACT-----TA--AGTTAAG-GTAT--T-A--C----CA------T---------AT--ACA-ATAA----A----GA------GA---T-TA---A-AA-A--CA--C--TGCT-TTT-GCAGATGATG-CCA-CCTTTATGTTAACAAA--------------AA---A-T---A-----CT-T---TTATA-AC-CTT--G-A-TA--A-AG--AA--AATTG---ACAAA---TT------CAGTA-----------A--AATA--------TC-G-----GGTCA-TAA-ACT---T-AA--TTAT----AGCAAATCAATGATT-TTACGTTC-AGAGG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CTAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---G-A--A-A-ACAA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTATCCTGGGAATCACATTTAC
gi|12 : TGTGTGTCTA-------------AT-AATGGTTATT----TTTCAG-AG-T-GTT-T----T--A--ACATAAAAA-GA-GAG-TTA-GACAAGGATGCCCACTT-T--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AGC-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---A---A-T----AACAACATTG--A---AAGCGTAC--A-A-------------------------GT--ACG--CAA----A----AA------TA---T-CAT--C-AA-A--TA--TCATGCT-TTT-GCAGATGATG-CCA-CATTTTTG---TTCAATGG-----------AA---A-T-C-AGTTCTCT-T---TTGAA-TC-TTT--A-A-TATTA-TT--AATTGTTAG---A-------TT------TAGTA-----------C--TATT--------TC-C-----GGT-T-TAA-AGA---T-AA--ATTTC---AAGAAATCGATTATT-CTCCGCGT-AGGCT--C-T-TTAAAG-A--AA-T----CTACT--GAAATATT-TTGT--AA---A-G--A-C-A-AA--A-A--A---ATTGTT--TGG-AC------GA--AAAA---GC-AT-CAACACTGGGAA--ATGTTTaaa
gi|13 : ctcaattcAAGTTGTGTAAGTA-------------AT-AACGGACACA----TGTCCG-AG-T-TCT-T----C--A--ACATCAAAA-GA-GGA-GTACGACAAGGATGTCCTCTT-T--CACCA----TGT-T-TA--TT---TAT----ACT--AAT-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--A--C--AA-ATCCG--TG--AAAGCA------G-----A-----TA-CT---G---C-T----A-------TA--A---AAG-CCGT--A-A--A----CA------T---------AT--ATG-ATAG----A----GA------AA---T-AA---A-AC-A--TA--C--AGCA-TTT-GCAGATGATG-CAA-CGTTTATG---ATGGATTGGTCTTATA---AA---------A-----CT-T---TCACA-TC-TTT--T-A-TA--A-AA--AA--GCTTA---ATGAT---TT------TAGTA-----------C--AATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAAAAATCTGTTTTC-TTAAGATC-GGGAT--C-A-ATAAAA-C--AT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A-----------A--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-AT-CTACACTGGAAAT--TGTTTtcgcg
gi|14 : ttTGTGTTTTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----T--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCTC-T--CTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--AATT--AG---CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTATC-A-A--A----TT------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA---T-TA---A-AA-A--AAGCC--TG---TTT-GCTGATGACG-CAA-CATTTGTT---ACTGATGGGTC----AG--AA---A-A-A-A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TATAG---ACGAA---TT------TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AATAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---TTTACA--TGG-ACATCT--AATCAA-----GC-AG-CCACTTTAGGAATTAtttcaa
gi|15 : cAAAGTAGTGTTATAA-------------AT-AATGGTCATG----CAACTA-AT-TGTTT-T----C--C---TATACAAA-GA-GGT-GTTCGACAAAGCTATTCACTA-T--CGCCT----TAT-C-TC--TT---TAT----TAT--ATG-CATT-GAGTT-----GTT--------G-------T-----T--G----TTG--TT--CG---A------A-----AGTG--TA-A--------A-T----A-------AC--A---AAA-ATATT-A-A--TGTCATA------C---------AC--ATG-GCAGGTTTA----GA------TA---T-AA---A-AA-AAACA--C--TTTT-TTT-GCAGATGATG-CGA-CATTCGTC---ACCGATGGATC----A---AA---A-C-A-A-----TTAT---TTGAA-AA-CTT--A-A-TT--A-AT--AC--ACT------TGATTCATT------TAGTT-----------A--TGTA--------TCTT-----GGT-T-AAA-ACT---C-AA--TCCC----TCGAAATGTAACATA-TTAAAAGC-CGGTT--T-A-TTGAAA-AT-AC-A----CGTAT--ACAA-----TAAT--CC---G-A--A-G-A-AATGA-A--A---TTC-TGT-TGG-TCATCA--GAT-AAG----GC-AA-AGGCATTGGGAAtcttcac
gi|16 : aAAATTTGTGTAGTTA-------------AT-AACGTATACA----TGTCAG-ATAT-TTT-T----C--A--AAATAGAAA-AT-GGA-GTAAGACAAGGATGCCCATTA-T--CGCCT----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-TATC-GAGTT-----ATT--------A-------T--A--T--AA-ATC----------------------------------------G---G-T----A-------CA--A---AAG-GTAT--T-A--C----AT------T---------TT--ACA-ATAG----A----TT------AA---T-TA---A-AA-AA-CA--C--AGCA-TTC-GCAGATGATG-CAA-CATTTATG---ATGGATGGACA----A---AA---A-A-C-A-----TG-T---TT--A-AC-CTT--A-A-TA--A-AG--AA--AATCG---ATAAT---TT------T-GTA-----------A--AATA--------TT-T-----GGGCT-TAA-GCT---T-AA--TTCT----AAAAAATCTATAATT-TTACGATC-GGGTT--C-A-TTAAAA-A--ACTT----CAAAT--GAAATTCT-AAGT--AA---A-G--ATT-A-AA--A-A--A---TT-ATA--TGG-ACAACT--GA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAGTTGTCTTTGC
gi|17 : tTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----A--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCTC-TTTCTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------A-------TT-A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-ATATAAA-A--C----T-------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA---T-TA---A-AA-A--AG--C----CTGTTT-GCTGATGACA-CAA-CATTTGTT---ACTGATGGGTCGGA-A---AA---A-----A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TATAG---ACGAA---TT------TAGTA-----------A--ATTA--------TC-C-----GGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AACAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---T--ACA--TGG-ACATCT--AA---------GC-AG-CCACTTTAGGAATCAaaatt
gi|18 : tttTTGTGTGTCAA-------------AT-AGTGGTTACT----CCGCAG-AC-T-TGT-T----T--A--TTATAAAAA-AAAGGA-ATAAGGCAA-----TCCATTT-T-------------T-T-TG--TT---T-T----TAT--AAGCTAAA-TGAAT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-GACGG--T--------A------A-----A-----TA-AT---G---A-T----AACAT---TATTG---AAA-GCGC--A-A--------A------G---------AT--ACG--CAA----A----AA------CA---T-GATCTA-AA-A--TT--C--TGTT-TTT-GCGAACGATGCCAA-AATTT-TG---TTGAATGG-----------AA---A-T-C------------------A-AT-CTT--T-A-T---A-TG--AA--TTTAG---A--AT---AT------TATTA-----------ATTGATAGGTTTAGCTC-CATTTTGGT-T-TAATAAT---A-AA--TTCC----AA-AAATCGATTATT-TT-CGTGA-AGGCT--C-T-TTAACA-A--AA-T----CCATT--AAAATATT-TTGT--AA---AGA--A-T-A-AA--A-A--A---tcttcacaaa
gi|19 : acgcacacatTTA-------------AT-AATGGTTACAAG--TATCAATAA-T-TTT------------AAACAGGAC-GC-GGT-GTACGTCAAGAATACCCTCTCAC--CTCCA----TAA-A-TA--TT---TCT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----ATT--------A-------TC-A--T--AAGATGTG--AT--------------A-----T-----TA-AA---G---A-C----A-------CA--A---ATG-ATAT--A-A--A----T-------T---------A---ATG-AAAT----G----GA------AA---T--A---A-AA-A--TT--T--TG---TTT-GCTGATGATG-CAA-CTTTCGTT---ACTCATGGATCGG--A---AG---A-T---A-----CT-T---TC-----T-CTTTCA-A-TA--ATCT--AA--TTAAA---ACTAT---TTGCGAATCAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GCATT-TAA-ATT---A-AA--CAAA----AACAAATGCACAGTA-TTAAGAGC-AGCAT--C-C-CT-AAA-A--GC-A----CAGA----AAAGATT-TG------------------A-GA--A-A--C---CTCACA--TGG-ACAT-----A--AAATTAAGT-AC-CTAATATAGGAATCAaatgttaagactgtgaaaaaacatgggttatgttttcacgaac
gi|2 : ttttA-GA-GGA-GTTTGCTAAGAATGTCATTTA-T--CACCA----AAT-T-TG--TT---TAT----CGT--ATG-TAAT-GAATT-----TCT--------G-------TCAG--TTGAA-AT--A--CT--CA---ATTATACAT----G-----TA-AA---A---A-T----A-------TA--A---AAG-AAAT--G-A--------A------T---------CC--AC--ATGG----A----AA------AA---A-AA---ATAA-A--TA--C--GCTT-TTT-GCTGACGACG-CTA-CTTTTATA---ACCGAT-GGTT----A---GA---A-A-C-ATAC--CT-T---TGGAA-A--CTT--A-T-TT--A-AT--AT--TTTAA---ATAAT---TT------AAGCT-----------A--CATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CATA----AATAAATGCACTGTT-CTACTTGA-TGGCTCCC-T-TTAAGA-T--A-------CAAAT--G-----TC-CACT--ACCTGA-AACA-T-A-AA--A-A--AAATTTCAT---TGG-GATTCT--GAGCAA-----GC-AG-AAACGCTAGGAATtttcataaa
gi|20 : tgttttaaataatttcagttacatatcaggtttattttttttcctattcgcTACTTA-------------AC-AACGGACATA----TGACT---A-T-TTT-T----C--C--CTATTCACC-GA-TGT-GTTAGACAAGGCTGCCTTCTG-T--CCCTA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAC--TTG-TATT-GAACTGCTTTCTT--------A-------TG-A--G--AA-ATCAA--T--------A------A-----A-----TC-CT---A---A-T----A-------TA--A---AAG-GGAT--A-A--C----CA------T---------AG--CTG-GGAA----A----GA------AA---TAAA---A-AA-A--TA--C--TCTT-TTT-ACTGATGACG-TCA-CTTTTCTA---ACTGATGGTTCTAA-G---AA---A-T-C-G--------T---TCGAA-AC-CCT--T-A-TA--T-AT--AC--TTTGG---ATGAG---TA------TAGCA-----------A--CGTT--------TC-T-----GGTTTGTAA--------------------------------TGTT-TTAAGGGC-AGAAT--C-A-TTGAAA-AATAC-C----CAAGT--AAAATATA-TGG---A----A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTTAatacttctacactg
gi|21 : atataagtagttcatA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----A--A--ACATAGGGA-GA-GG---------AAAAATGCCCG-TT-T--CACCT----TAC-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-AATT-GAAAT-----ACT--------G-------A--A--C--AT-ATCCA--TT--CA---A------A-----A-----AG-AT---A---A-T----A-------CA--ATTAAAG-GTATTAA-A--A----TG------C---------AT--A---ATAG----G----GA------AA---T-AA---A-AA-A--CA--C--AGCT-TTT-GCTGATGATA-CC--CATTTATG---TTAAATAGTTC----A---AATAAA-A-C-A-----CT-T---TCTAG-TC---T--A-A-TA--A-AC--AA--AATAGGGTAC--T---TT------TAACC-----------A--AATA--------TA-A-----GGCCT-TAA-TCTATAT-AA--A-------AATAAATCTATAATT-CTTCGTGT-AGGGT--C-A-TTAAAA-T--AT-T----CAAAT--GAAATATA-TAGT--TG---T-G--A-T-A-GC--A-A--A---TTCATT--TGG-ACATCT--GA--AAAA---GC-CA-CAACACTTGGAATTGTTTTTGCacaatcaaaagcacttggaatagttttct
gi|22 : tAAAGCAGTGTTATAA-------------AT-AACGATTACG----TAACTG-A-----TT-T----C--ATTACATACAAA-GA-AGT-GTTCGACAAGGCTTTCCACAT-T--CGCCT----AAT-C-TA--TT---TAT----TAT--ATG-CATG-TAGTT-----GTC--------A-------T--A--TG-AA-ATTTC--TA--AA---A------A-----A-----CA-A----A---A-T----A-------TT--G---AAC-GCAT--A-A-------------------------AT--ACG-GAAGGTTTA----GA------CA---T-GA---A-AT-A--TA--C--ATAT-TT---CAGATTATG-TTT-CTTTTGTC---ACCGATGAATC----A---AA---A-C-G-AT----CG-T---TTGAA-AA-TCT--A-A-TT--A-AA--AC--TCTTG---ATTCT---TT------TAGCT-----------T--TGTA--------TC-T-----GGGTT-GAA-ACT---T-AA--TCCaaat
gi|23 : CAATGTTATGCAGTTA-------------AT-AACGGACACA----TATCCG-AA-T-TCT-T----C--A--ACATAAAAA-----------CGACAAGGTTGTCCACTG-C--CGCCA----TAC-T-TA--TT---TAT----ACTTAAAA-TAT---AAAT-----TTT--------A-------G--A-----AA-TTCTG--AG--AAGGCA------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGG-GCAT--A-A--C----TA------T---------AC--ATA-ATAG----A----GA------AA---T-GA---C-AA-A--TA--C--AGTA-TTT-GAAGATGATG-CAA-CTTTTGTG---A-TAATCGGAC----A---A-------------------T---TTAAA-AT-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GCTAA---ATGAT---TT------TAG-A-----------A--AATAG-------TT-C-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AACACATCTGTTATA-TTAAGATC-GGGAA--C-A-CTAAAG-A--CT-T----CTACT--GAAACATT-T-------------------------------------ATA--TGG-ACACCT--AA--AGTT---TC-AT-CTACAATGGGAATcttgaaatgtaatatagtaaaagcagattaattgaaacatacacacataaggtagaaaaaaatgtttgctggtcatcaaacaaggcaaag
gi|24 : gctGTGTAAT-A-------------GTCAATGGACACT----TGTCAG-AG-T-GGT-T----C--T--ACTTACAGA-GA-GGCTGTA-GACAAGGAGACCCATTA-T--CCCCA----TATATATA--TT---CAT----TAT--ATG-TGCA-GAGAT-----CCTCG------C-------T--G--T------TCTA--AT--CAG--A------A-----A-----TA-ACCCTA---A-T----A-------TA--A---AAG-GAAT--A---------CA------G---------ATTGACA-ATAA----A----AACTGTTTAAT--T-TC---A-CA-A--TA------------T-GCCGATGATA-CAA-CACTCATG---CTTGATGGTTCAGA-A---AA---A-T-C-A-----CT-T---GTAAACACACTT------CA--A-AC---A--CTCAA---AT--T---CTA-----TACTG-----------A--AAGC--------TC-C-----GGCCT-TAA-TAT---C-AA--TGTT----GATAAAACTAtgttg
gi|25 : ACAAGGATGCCCACTT-T--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TAT----ACT--AGC-AATA-GAAAT-----TCT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---G---A-TAACAA-------TATTG---AAG-GTGT--A---------CA------A---------AT--ACGCATAA----A----CA------TT---T-TC---A-AATA--CA--C--AGCT-TTT-GCAGACGATG-CCA-CATTTTTG---TTAAATGGAAT----T---AA---A-T-CTT-----CT-T---TTGAA-AC-TCT--A-A-TATTA-TT--AATTGATAG---A-------TT------TAGCT-----------C--AATT--------TC-T-----GGT-T-TAA-AGT---TAAA--TTCTA---AAAAAATCT---ATT-CTCCGTGT-AGGCT--C-T-TTAAAA-A--CA-T----CTATT--GACATATT-TTGTA-AA---A-A--A-T-A-AA--A-T--A---TTTGTT--TGG-ATTAAT--GA--AAAA---GC-AT-CAACACTAGGAAT--CGTTTaggcagtgtagataggttcaaggaaaatagtaatattaagttatgtgaagaatattatct
gi|26 : AA-GATGGG-GTACGGCAAG-ATTTCCGCTG-T--AGCCAAACGTGT-T-TAAATT---TAT----TAT--AGA-AATGTGTAGT-----TTG--------A-------G--A------A-AGC-------------A------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGA-GCAT--A-A--A----TA------T---------AC--ATA-TTAG----A----GA------AA---T-AT---A-AA-A--TA--C--AGCA-TTT-TCAGATGCTG-CAA-CTTTTATG---ATTAATGGGTC----ATTTAA---A-C-C-G-----TT-T---AC--A-AC-TTG--A-A-TA--A-A---AG--GCTAA---ATGAT---TT------TAATA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AAAAAA-CTGTTATA-TTAAGATCGAGAAA--C----TAAAA-T--A--T----CTACT--GAAACATT-TGGT--AC------------------A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCC--GA--AAGT---TT-AT-TTACATAGGGAATtcact
gi|27 : TG-AAAAC-----TGT--------A-------T--A--TG-AA-ATCCAAATT--GC---A------G-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GCAT--A-A--A----CA------T---------AT--ATA-ATAG----A----GA------AA---T-AA---A-AA-A--TA--C--GGTA-TTT-GCAGATGATG-CAA-CGTTTATG---ATGGATGGGTC----ATATAA---A-----A-----CT-T---TTACA-TC-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GCTAA---ATTAT---TT------TAGTA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTCT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAATAATCTGTTATC-TTAAGATC-AGGAT--C-A-TTAAAA-A--CT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-GT-CTACGCTGGAAAT--TGTTTtgttgt
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Reference ( family-960 ) : CAAAGTTGTGTANTTA-------------AT-AACGGNCACA----TGTCNG-AN-T-TTT-T----C--A--ANATAGAAA-GA-GGN-GTACGACAAGGATGCCCACT-NT--CNCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAANT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------AA-T-N---A---A-AA-A--TA--C--NGCT-TTT-GCAGATGATGC---AA-CNTTTNTG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGAA-AC-CTT--A-A-TA--A-AN--AA--NN--TAG---ACGAT---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--CNCT----AANAAATCTATNATT-TTACGNNC-AGGNT--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACATT-TAGT--AC---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
gi|1 : AAAGTTGTGTAGTTATATGTTAAATGTAAT-AGCTGACACA----TGTCA--AT-T-TTTGT----C--A--CATTAGAAA-GA-GAA-GTAAGTAAAAGATGTCCATT-AT--CGCCT----TAT-C-TG--TT---TAT----TAT--AAA-TATC-GAATT-----ATT--------A-------T--G--T--AA-ATCGG--TA--CA---A------A-----AG----TATAC---A---AAT----A-------TA--A---AAG--TAT--C-A--C----TG------T---------TT--ACT-GCAG----A----AA------GG-T-T---A---A-AA----CA--T--CGCT-TTT-GTAGATGATGG---AA-CGTTTATT---TTGGATGTATC----A---AA---AGT-A-A-----AT-T---TC--A-AC-ATT--A-AATA--T-GA--AA--TT--CA----ACAAT---T------T-TAGTAAATTTTAGTATA--AATA--------T--------GGTCT-TGA-GCT---T-AA--CTTG----AATGAATCTTTAATT-TTACGATT-AGGTA--C-T-TTAAAA-A--CT-T----CAAAT--GAAAC-TT-TCAT--AC---A-A--A-G-A-AA--G-AATA---TTCATT--TGG-ACATCT--AA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAATCATCTCTGC
gi|10 : aCAAAGTTGTGTAATAA-------------AT-AATGGCCACA----TGTCGG-AA-T-TCT-T----T--A--AAGTAGAAA-GG-GGA-GTACGACAAGGATGCCCACT-AT--CGCCT----TAT-T-TA--TT---TAT----TTT--AGT-TATT-GAGGT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TG-AC---TCTTA-T----A-------TT--A---AAG-GTAT--T-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------GA-T-T---A---A-AA-A--CA--C--TGCT-TTT-GCAGATGACGC---CA-CTTTTATG---ATTGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TTACA-AC-CTT--A-A-TA--A-AT--AA--AA--TAG---ACAAT---T------T-CAGCA-----------A--AATA--------TC-G-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCCATAATT-TTACGCTC-AGGGT--C-T-TTAAAA-T--AT-T----CAAAT--AAAACATT-TAAT--AT---T-A--A-T-A-AA--A-A--A---TACATC--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACTCTGGGAATTACATTTGC
gi|11 : AAAGTTGTGTAATAA-------------CT-AATGGACACA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----T--A--AAGTAGATA-GG-GGA-GTAAGACAAGGATGCACATT-AT--TACCA----CAT-T-T--------TGT----TTT--AGC-TATT-GAAGT-----TTT--------A-------T--A--A--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----CG-AT---GCTAA-T----ACT-----TA--AGTTAAG-GTAT--T-A--C----CA------T---------AT--ACA-ATAA----A----GA------GA-T-T---A---A-AA-A--CA--C--TGCT-TTT-GCAGATGATGC---CA-CCTTTATGTTAACAAA--------------AA---A-T---A-----CT-T---TTATA-AC-CTT--G-A-TA--A-AG--AA--AA--TTG---ACAAA---T------T-CAGTA-----------A--AATA--------TC-G-----GGTCA-TAA-ACT---T-AA--TTAT----AGCAAATCAATGATT-TTACGTTC-AGAGG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CTAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---G-A--A-A-ACAA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTATCCTGGGAATCACATTTAC
gi|12 : TGTGTGTCTA-------------AT-AATGGTTATT----TTTCAG-AG-T-GTT-T----T--A--ACATAAAAA-GA-GAG-TTA-GACAAGGATGCCCACT-TT--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AGC-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---A---A-T----AACAACATTG--A---AAGCGTAC--A-A-------------------------GT--ACG--CAA----A----AA------TA-T-C---AT--C-AA-A--TA--TCATGCT-TTT-GCAGATGATGC---CA-CATTTTTG---TTCAATGG-----------AA---A-T-C-AGTTCTCT-T---TTGAA-TC-TTT--A-A-TATTA-TT--AATTGT--TAG---A-------T------T-TAGTA-----------C--TATT--------TC-C-----GGT-T-TAA-AGA---T-AA--ATTTC---AAGAAATCGATTATT-CTCCGCGT-AGGCT--C-T-TTAAAG-A--AA-T----CTACT--GAAATATT-TTGT--AA---A-G--A-C-A-AA--A-A--A---ATTGTT--TGG-AC------GA--AAAA---GC-AT-CAACACTGGGAA--ATGTTTaaa
gi|13 : ctcaattcAAGTTGTGTAAGTA-------------AT-AACGGACACA----TGTCCG-AG-T-TCT-T----C--A--ACATCAAAA-GA-GGA-GTACGACAAGGATGTCCTCT-TT--CACCA----TGT-T-TA--TT---TAT----ACT--AAT-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--A--C--AA-ATCCG--TG--AAAGCA------G-----A-----TA-CT---G---C-T----A-------TA--A---AAG-CCGT--A-A--A----CA------T---------AT--ATG-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AC-A--TA--C--AGCA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CGTTTATG---ATGGATTGGTCTTATA---AA---------A-----CT-T---TCACA-TC-TTT--T-A-TA--A-AA--AA--GC--TTA---ATGAT---T------T-TAGTA-----------C--AATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAAAAATCTGTTTTC-TTAAGATC-GGGAT--C-A-ATAAAA-C--AT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A-----------A--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-AT-CTACACTGGAAAT--TGTTTtcgcg
gi|14 : ttTGTGTTTTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----T--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCT-CT--CTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--AATT--AG---CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTATC-A-A--A----TT------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AAGCC--TG---TTT-GCTGATGACGC---AA-CATTTGTT---ACTGATGGGTC----AG--AA---A-A-A-A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TA--TAG---ACGAA---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AATAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---TTTACA--TGG-ACATCT--AATCAA-----GC-AG-CCACTTTAGGAATTAtttcaa
gi|15 : cAAAGTAGTGTTATAA-------------AT-AATGGTCATG----CAACTA-AT-TGTTT-T----C--C---TATACAAA-GA-GGT-GTTCGACAAAGCTATTCACT-AT--CGCCT----TAT-C-TC--TT---TAT----TAT--ATG-CATT-GAGTT-----GTT--------G-------T-----T--G----TTG--TT--CG---A------A-----AGTG--TA-A--------A-T----A-------AC--A---AAA-ATATT-A-A--TGTCATA------C---------AC--ATG-GCAGGTTTA----GA------TA-T-A---A---A-AA-AAACA--C--TTTT-TTT-GCAGATGATGC---GA-CATTCGTC---ACCGATGGATC----A---AA---A-C-A-A-----TTAT---TTGAA-AA-CTT--A-A-TT--A-AT--AC--AC--T------TGATTCAT------T-TAGTT-----------A--TGTA--------TCTT-----GGT-T-AAA-ACT---C-AA--TCCC----TCGAAATGTAACATA-TTAAAAGC-CGGTT--T-A-TTGAAA-AT-AC-A----CGTAT--ACAA-----TAAT--CC---G-A--A-G-A-AATGA-A--A---TTC-TGT-TGG-TCATCA--GAT-AAG----GC-AA-AGGCATTGGGAAtcttcac
gi|16 : aAAATTTGTGTAGTTA-------------AT-AACGTATACA----TGTCAG-ATAT-TTT-T----C--A--AAATAGAAA-AT-GGA-GTAAGACAAGGATGCCCATT-AT--CGCCT----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-TATC-GAGTT-----ATT--------A-------T--A--T--AA-ATC----------------------------------------G---G-T----A-------CA--A---AAG-GTAT--T-A--C----AT------T---------TT--ACA-ATAG----A----TT------AA-T-T---A---A-AA-AA-CA--C--AGCA-TTC-GCAGATGATGC---AA-CATTTATG---ATGGATGGACA----A---AA---A-A-C-A-----TG-T---TT--A-AC-CTT--A-A-TA--A-AG--AA--AA--TCG---ATAAT---T------T-T-GTA-----------A--AATA--------TT-T-----GGGCT-TAA-GCT---T-AA--TTCT----AAAAAATCTATAATT-TTACGATC-GGGTT--C-A-TTAAAA-A--ACTT----CAAAT--GAAATTCT-AAGT--AA---A-G--ATT-A-AA--A-A--A---TT-ATA--TGG-ACAACT--GA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAGTTGTCTTTGC
gi|17 : tTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----A--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCT-CTTTCTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------A-------TT-A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-ATATAAA-A--C----T-------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AG--C----CTGTTT-GCTGATGACAC---AA-CATTTGTT---ACTGATGGGTCGGA-A---AA---A-----A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TA--TAG---ACGAA---T------T-TAGTA-----------A--ATTA--------TC-C-----GGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AACAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---T--ACA--TGG-ACATCT--AA---------GC-AG-CCACTTTAGGAATCAaaatt
gi|18 : tttTTGTGTGTCAA-------------AT-AGTGGTTACT----CCGCAG-AC-T-TGT-T----T--A--TTATAAAAA-AAAGGA-ATAAGGCAA-----TCCATT-TT-------------T-T-TG--TT---T-T----TAT--AAGCTAAA-TGAAT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-GACGG--T--------A------A-----A-----TA-AT---G---A-T----AACAT---TATTG---AAA-GCGC--A-A--------A------G---------AT--ACG--CAA----A----AA------CA-T-G---ATCTA-AA-A--TT--C--TGTT-TTT-GCGAACGATGCCAAAA-TTTTGTTG---A---ATGG-----------AA---A-T-C-A------------------AT-CTT--T-A-TA--T--G--AA--TT--TAG---A--AT---A------T-TATTA-----------ATTGATAGGTTTAGCTC-CATTTTGGT-T-TAATAAT---A-AA--TTCC----AA-AAATCGATTATT-TT-CGTGA-AGGCT--C-T-TTAACA-A--AA-T----CCATT--AAAATATT-TTGT--AA---AGA--A-T-A-AA--A-A--A---tcttcacaaa
gi|19 : acgcacacatTTA-------------AT-AATGGTTACAAG--TATCAATAA-T-TTT------------AAACAGGAC-GC-GGT-GTACGTCAAGAATACCCTCTCAC--CTCCA----TAA-A-TA--TT---TCT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----ATT--------A-------TC-A--T--AAGATGTG-------A---T------A-----T-----TA-AA---G---A-C----A-------CA--A---ATG-ATAT--A-A--A----T-------T---------A---ATG-AAAT----G----GA------AA-T-----A---A-AA-A--TT--T--TG---TTT-GCTGATGATGC---AA-CTTTCGTT---ACTCATGGATCGG--A---AG---A-T---A-----CT-T---TC-----T-CTTTCA-A-TA--ATCT--AA--TT--AAA---ACTAT---TTGCGAAT-CAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GCATT-TAA-ATT---A-AA--CAAA----AACAAATGCACAGTA-TTAAGAGC-AGCAT--C-C-CT-AAA-A--GC-A----CAGA----AAAGATT-TG------------------A-GA--A-A--C---CTCACA--TGG-ACAT-----A--AAATTAAGT-AC-CTAATATAGGAATCAaatgttaagactgtgaaaaaacatgggttatgttttcacgaac
gi|2 : ttttA-GA-GGA-GTTTGCTAAGAATGTCATTT-AT--CACCA----AAT-T-TG--TT---TAT----CGT--ATG-TAAT-GAATT-----TCT--------G-------TCAG--TTGAA-AT--A--CT--CA---ATTATACAT----G-----TA-AA---A---A-T----A-------TA--A---AAG-AAAT--G-A--------A------T---------CC--AC--ATGG----A----AA------AA-A-A---A---ATAA-A--TA--C--GCTT-TTT-GCTGACGACGC---TA-CTTTTATA---ACCGAT-GGTT----A---GA---A-A-C-ATAC--CT-T---TGGAA-A--CTT--A-T-TT--A-AT--AT--TT--TAA---ATAAT---T------T-AAGCT-----------A--CATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CATA----AATAAATGCACTGTT-CTACTTGA-TGGCTCCC-T-TTAAGA-T--A-------CAAAT--G-----TC-CACT--ACCTGA-AACA-T-A-AA--A-A--AAATTTCAT---TGG-GATTCT--GAGCAA-----GC-AG-AAACGCTAGGAATtttcataaa
gi|20 : tgttttaaataatttcagttacatatcaggtttattttttttcctattcgcTACTTA-------------AC-AACGGACATA----TGACT---A-T-TTT-T----C--C--CTATTCACC-GA-TGT-GTTAGACAAGGCTGCCTTCT-GT--CCCTA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAC--TTG-TATT-GAACTGCTTTCTT--------A-------TG-A--G--AA-ATCAA--T--------A------A-----A-----TC-CT---A---A-T----A-------TA--A---AAG-GGAT--A-A--C----CA------T---------AG--CTG-GGAA----A----GA------AA-TAA---A---A-AA-A--TA--C--TCTT-TTT-ACTGATGACGT---CA-CTTTTCTA---ACTGATGGTTCTAA-G---AA---A-T-C-G--------T---TCGAA-AC-CCT--T-A-TA--T-AT--AC--TT--TGG---ATGAG---T------A-TAGCA-----------A--CGTT--------TC-T-----GGTTTGTAA--------------------------------TGTT-TTAAGGGC-AGAAT--C-A-TTGAAA-AATAC-C----CAAGT--AAAATATA-TGG---A----A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTTAatacttctacactg
gi|21 : atataagtagttcatA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----A--A--ACATAGGGA-GA-GG---------AAAAATGCCCG-T-TT--CACCT----TAC-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-AATT-GAAAT-----ACT--------G-------A--A--C--AT-ATCCA--TT--CA---A------A-----A-----AG-AT---A---A-T----A-------CA--ATTAAAG-GTATTAA-A--A----TG------C---------AT--A---ATAG----G----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--CA--C--AGCT-TTT-GCTGATGATAC---C--CATTTATG---TTAAATAGTTC----A---AATAAA-A-C-A-----CT-T---TCTAG-TC---T--A-A-TA--A-AC--AA--AA--TAGGGTAC--T---T------T-TAACC-----------A--AATA--------TA-A-----GGCCT-TAA-TCTATAT-AA--A-------AATAAATCTATAATT-CTTCGTGT-AGGGT--C-A-TTAAAA-T--AT-T----CAAAT--GAAATATA-TAGT--TG---T-G--A-T-A-GC--A-A--A---TTCATT--TGG-ACATCT--GA--AAAA---GC-CA-CAACACTTGGAATTGTTTTTGCacaatcaaaagcacttggaatagttttct
gi|22 : tAAAGCAGTGTTATAA-------------AT-AACGATTACG----TAACTG-A-----TT-T----C--ATTACATACAAA-GA-AGT-GTTCGACAAGGCTTTCCACA-TT--CGCCT----AAT-C-TA--TT---TAT----TAT--ATG-CATG-TAGTT-----GTC--------A-------T--A--TG-AA-ATTTC--TA--AA---A------A-----A-----CA-A----A---A-T----A-------TT--G---AAC-GCAT--A-A-------------------------AT--ACG-GAAGGTTTA----GA------CA-T-G---A---A-AT-A--TA--C--ATAT-TT---CAGATTATGT---TT-CTTTTGTC---ACCGATGAATC----A---AA---A-C-G-AT----CG-T---TTGAA-AA-TCT--A-A-TT--A-AA--AC--TC--TTG---ATTCT---T------T-TAGCT-----------T--TGTA--------TC-T-----GGGTT-GAA-ACT---T-AA--TCCaaat
gi|23 : CAATGTTATGCAGTTA-------------AT-AACGGACACA----TATCCG-AA-T-TCT-T----C--A--ACATAAAAA-----------CGACAAGGTTGTCCACT-GC--CGCCA----TAC-T-TA--TT---TAT----ACTTAAAA-TAT---AAAT-----TTT--------A-------G--A-----AA-TTCTG--AG--AAGGCA------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGG-GCAT--A-A--C----TA------T---------AC--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-G---A---C-AA-A--TA--C--AGTA-TTT-GAAGATGATGC---AA-CTTTTGTG---A-TAATCGGAC----A---A-------------------T---TTAAA-AT-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAG-A-----------A--AATAG-------TT-C-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AACACATCTGTTATA-TTAAGATC-GGGAA--C-A-CTAAAG-A--CT-T----CTACT--GAAACATT-T-------------------------------------ATA--TGG-ACACCT--AA--AGTT---TC-AT-CTACAATGGGAATcttgaaatgtaatatagtaaaagcagattaattgaaacatacacacataaggtagaaaaaaatgtttgctggtcatcaaacaaggcaaag
gi|24 : gctGTGTAAT-A-------------GTCAATGGACACT----TGTCAG-AG-T-GGT-T----C--T--ACTTACAGA-GA-GGCTGTA-GACAAGGAGACCCATT-AT--CCCCA----TATATATA--TT---CAT----TAT--ATG-TGCA-GAGAT-----CCTCG------C-------T--G--T------TCTA--AT--CAG--A------A-----A-----TA-ACCCTA---A-T----A-------TA--A---AAG-GAAT--A---------CA------G---------ATTGACA-ATAA----A----AACTGTTTAATT-T---C---A-CA-A--TA------------T-GCCGATGATAC---AA-CACTCATG---CTTGATGGTTCAGA-A---AA---A-T-C-A-----CT-T---GTAAACACACTT------CA--A-AC---A--CT--CAA---AT--T---C------TATACTG-----------A--AAGC--------TC-C-----GGCCT-TAA-TAT---C-AA--TGTT----GATAAAACTAtgttg
gi|25 : ACAAGGATGCCCACT-TT--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TAT----ACT--AGC-AATA-GAAAT-----TCT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---G---A-TAACAA-------TATTG---AAG-GTGT--A---------CA------A---------AT--ACGCATAA----A----CA------TT-T-T---C---A-AATA--CA--C--AGCT-TTT-GCAGACGATGC---CA-CATTTTTG---TTAAATGGAAT----T---AA---A-T-CTT-----CT-T---TTGAA-AC-TCT--A-A-TATTA-TT--AATTGA--TAG---A-------T------T-TAGCT-----------C--AATT--------TC-T-----GGT-T-TAA-AGT---TAAA--TTCTA---AAAAAATCT---ATT-CTCCGTGT-AGGCT--C-T-TTAAAA-A--CA-T----CTATT--GACATATT-TTGTA-AA---A-A--A-T-A-AA--A-T--A---TTTGTT--TGG-ATTAAT--GA--AAAA---GC-AT-CAACACTAGGAAT--CGTTTaggcagtgtagataggttcaaggaaaatagtaatattaagttatgtgaagaatattatct
gi|26 : AA-GATGGG-GTACGGCAAG-ATTTCCGCT-GT--AGCCAAACGTGT-T-TAAATT---TAT----TAT--AGA-AATGTGTAGT-----TTG--------A-------G--A------A-AGC-------------A------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGA-GCAT--A-A--A----TA------T---------AC--ATA-TTAG----A----GA------AA-T-A---T---A-AA-A--TA--C--AGCA-TTT-TCAGATGCTGC---AA-CTTTTATG---ATTAATGGGTC----ATTTAA---A-C-C-G-----TT-T---AC--A-AC-TTG--A-A-TA--A-A---AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAATA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AAAAAA-CTGTTATA-TTAAGATCGAGAAA--C----TAAAA-T--A--T----CTACT--GAAACATT-TGGT--AC------------------A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCC--GA--AAGT---TT-AT-TTACATAGGGAATtcact
gi|27 : TG-AAAAC-----TGT--------A-------T--A--TG-AA-ATCCAAATT--GC---A------G-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GCAT--A-A--A----CA------T---------AT--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA--C--GGTA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CGTTTATG---ATGGATGGGTC----ATATAA---A-----A-----CT-T---TTACA-TC-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GC--TAA---ATTAT---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTCT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAATAATCTGTTATC-TTAAGATC-AGGAT--C-A-TTAAAA-A--CT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-GT-CTACGCTGGAAAT--TGTTTtgttgt
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Reference ( family-960 ) : CAAAGTTGTGTANTTA-------------AT-AACGGNCACA----TGTCNG-AN-T-TTT-T----C--A--ANATAGAAA-GA-GGN-GTACGACAAGGATGCCCACT-NT--CNCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAANT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------AA-T-N---A---A-AA-A--TA--C--NGCT-TTT-GCAGATGATGC---AA-CNTTTNTG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGAA-AC-CTT--A-A-TA--A-AN--AA--NN--TAG---ACGAT---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--CNCT----AANAAATCTATNATT-TTACGNNC-AGGNT--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACATT-TAGT--AC---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
gi|1 : AAAGTTGTGTAGTTATATGTTAAATGTAAT-AGCTGACACA----TGTCA--AT-T-TTTGT----C--A--CATTAGAAA-GA-GAA-GTAAGTAAAAGATGTCCATT-AT--CGCCT----TAT-C-TG--TT---TAT----TAT--AAA-TATC-GAATT-----ATT--------A-------T--G--T--AA-ATCGG--TA--CA---A------A-----AG----TATAC---A---AAT----A-------TA--A---AAG--TAT--C-A--C----TG------T---------TT--ACT-GCAG----A----AA------GG-T-T---A---A-AA----CA--T--CGCT-TTT-GTAGATGATGG---AA-CGTTTATT---TTGGATGTATC----A---AA---AGT-A-A-----AT-T---TC--A-AC-ATT--A-AATA--T-GA--AA--TT--CA----ACAAT---T------T-TAGTAAATTTTAGTATA--AATA--------T--------GGTCT-TGA-GCT---T-AA--CTTG----AATGAATCTTTAATT-TTACGATT-AGGTA--C-T-TTAAAA-A--CT-T----CAAAT--GAAAC-TT-TCAT--AC---A-A--A-G-A-AA--G-AATA---TTCATT--TGG-ACATCT--AA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAATCATCTCTGC
gi|10 : aCAAAGTTGTGTAATAA-------------AT-AATGGCCACA----TGTCGG-AA-T-TCT-T----T--A--AAGTAGAAA-GG-GGA-GTACGACAAGGATGCCCACT-AT--CGCCT----TAT-T-TA--TT---TAT----TTT--AGT-TATT-GAGGT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TG-AC---TCTTA-T----A-------TT--A---AAG-GTAT--T-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------GA-T-T---A---A-AA-A--CA--C--TGCT-TTT-GCAGATGACGC---CA-CTTTTATG---ATTGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TTACA-AC-CTT--A-A-TA--A-AT--AA--AA--TAG---ACAAT---T------T-CAGCA-----------A--AATA--------TC-G-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCCATAATT-TTACGCTC-AGGGT--C-T-TTAAAA-T--AT-T----CAAAT--AAAACATT-TAAT--AT---T-A--A-T-A-AA--A-A--A---TACATC--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACTCTGGGAATTACATTTGC
gi|11 : AAAGTTGTGTAATAA-------------CT-AATGGACACA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----T--A--AAGTAGATA-GG-GGA-GTAAGACAAGGATGCACATT-AT--TACCA----CAT-T-T--------TGT----TTT--AGC-TATT-GAAGT-----TTT--------A-------T--A--A--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----CG-AT---GCTAA-T----ACT-----TA--AGTTAAG-GTAT--T-A--C----CA------T---------AT--ACA-ATAA----A----GA------GA-T-T---A---A-AA-A--CA--C--TGCT-TTT-GCAGATGATGC---CA-CCTTTATGTTAACAAA--------------AA---A-T---A-----CT-T---TTATA-AC-CTT--G-A-TA--A-AG--AA--AA--TTG---ACAAA---T------T-CAGTA-----------A--AATA--------TC-G-----GGTCA-TAA-ACT---T-AA--TTAT----AGCAAATCAATGATT-TTACGTTC-AGAGG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CTAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---G-A--A-A-ACAA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTATCCTGGGAATCACATTTAC
gi|12 : TGTGTGTCTA-------------AT-AATGGTTATT----TTTCAG-AG-T-GTT-T----T--A--ACATAAAAA-GA-GAG-TTA-GACAAGGATGCCCACT-TT--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AGC-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---A---A-T----AACAACATTG--A---AAGCGTAC--A-A-------------------------GT--ACG--CAA----A----AA------TA-T-C---AT--C-AA-A--TA--TCATGCT-TTT-GCAGATGATGC---CA-CATTTTTG---TTCAATGG-----------AA---A-T-C-AGTTCTCT-T---TTGAA-TC-TTT--A-A-TATTA-TT--AATTGT--TAG---A-------T------T-TAGTA-----------C--TATT--------TC-C-----GGT-T-TAA-AGA---T-AA--ATTTC---AAGAAATCGATTATT-CTCCGCGT-AGGCT--C-T-TTAAAG-A--AA-T----CTACT--GAAATATT-TTGT--AA---A-G--A-C-A-AA--A-A--A---ATTGTT--TGG-AC------GA--AAAA---GC-AT-CAACACTGGGAA--ATGTTTaaa
gi|13 : ctcaattcAAGTTGTGTAAGTA-------------AT-AACGGACACA----TGTCCG-AG-T-TCT-T----C--A--ACATCAAAA-GA-GGA-GTACGACAAGGATGTCCTCT-TT--CACCA----TGT-T-TA--TT---TAT----ACT--AAT-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--A--C--AA-ATCCG--TG--AAAGCA------G-----A-----TA-CT---G---C-T----A-------TA--A---AAG-CCGT--A-A--A----CA------T---------AT--ATG-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AC-A--TA--C--AGCA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CGTTTATG---ATGGATTGGTCTTATA---AA---------A-----CT-T---TCACA-TC-TTT--T-A-TA--A-AA--AA--GC--TTA---ATGAT---T------T-TAGTA-----------C--AATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAAAAATCTGTTTTC-TTAAGATC-GGGAT--C-A-ATAAAA-C--AT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A-----------A--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-AT-CTACACTGGAAAT--TGTTTtcgcg
gi|14 : ttTGTGTTTTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----T--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCT-CT--CTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------A-------T--AATT--AG---CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTATC-A-A--A----TT------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AAGCC--TG---TTT-GCTGATGACGC---AA-CATTTGTT---ACTGATGGGTC----AG--AA---A-A-A-A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TA--TAG---ACGAA---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AATAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---TTTACA--TGG-ACATCT--AATCAA-----GC-AG-CCACTTTAGGAATTAtttcaa
gi|15 : cAAAGTAGTGTTATAA-------------AT-AATGGTCATG----CAACTA-AT-TGTTT-T----C--C---TATACAAA-GA-GGT-GTTCGACAAAGCTATTCACT-AT--CGCCT----TAT-C-TC--TT---TAT----TAT--ATG-CATT-GAGTT-----GTT--------G-------T-----T--G----TTG--TT--CG---A------A-----AGTG--TA-A--------A-T----A-------AC--A---AAA-ATATT-A-A--TGTCATA------C---------AC--ATG-GCAGGTTTA----GA------TA-T-A---A---A-AA-AAACA--C--TTTT-TTT-GCAGATGATGC---GA-CATTCGTC---ACCGATGGATC----A---AA---A-C-A-A-----TTAT---TTGAA-AA-CTT--A-A-TT--A-AT--AC--AC--T------TGATTCAT------T-TAGTT-----------A--TGTA--------TCTT-----GGT-T-AAA-ACT---C-AA--TCCC----TCGAAATGTAACATA-TTAAAAGC-CGGTT--T-A-TTGAAA-AT-AC-A----CGTAT--ACAA-----TAAT--CC---G-A--A-G-A-AATGA-A--A---TTC-TGT-TGG-TCATCA--GAT-AAG----GC-AA-AGGCATTGGGAAtcttcac
gi|16 : aAAATTTGTGTAGTTA-------------AT-AACGTATACA----TGTCAG-ATAT-TTT-T----C--A--AAATAGAAA-AT-GGA-GTAAGACAAGGATGCCCATT-AT--CGCCT----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-TATC-GAGTT-----ATT--------A-------T--A--T--AA-ATC----------------------------------------G---G-T----A-------CA--A---AAG-GTAT--T-A--C----AT------T---------TT--ACA-ATAG----A----TT------AA-T-T---A---A-AA-AA-CA--C--AGCA-TTC-GCAGATGATGC---AA-CATTTATG---ATGGATGGACA----A---AA---A-A-C-A-----TG-T---TT--A-AC-CTT--A-A-TA--A-AG--AA--AA--TCG---ATAAT---T------T-T-GTA-----------A--AATA--------TT-T-----GGGCT-TAA-GCT---T-AA--TTCT----AAAAAATCTATAATT-TTACGATC-GGGTT--C-A-TTAAAA-A--ACTT----CAAAT--GAAATTCT-AAGT--AA---A-G--ATT-A-AA--A-A--A---TT-ATA--TGG-ACAACT--GA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAGTTGTCTTTGC
gi|17 : tTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----A--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCT-CTTTCTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------A-------TT-A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-ATATAAA-A--C----T-------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AG--C----CTGTTT-GCTGATGACAC---AA-CATTTGTT---ACTGATGGGTCGGA-A---AA---A-----A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TA--TAG---ACGAA---T------T-TAGTA-----------A--ATTA--------TC-C-----GGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AACAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---T--ACA--TGG-ACATCT--AA---------GC-AG-CCACTTTAGGAATCAaaatt
gi|18 : tttTTGTGTGTCAA-------------AT-AGTGGTTACT----CCGCAG-AC-T-TGT-T----T--A--TTATAAAAA-AAAGGA-ATAAGGCAA-----TCCATT-TT-------------T-T-TG--TT---T-T----TAT--AAGCTAAA-TGAAT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-GACGG--T--------A------A-----A-----TA-AT---G---A-T----AACAT---TATTG---AAA-GCGC--A-A--------A------G---------AT--ACG--CAA----A----AA------CA-T-G---ATCTA-AA-A--TT--C--TGTT-TTT-GCGAACGATGCCAAAA-TTTTGTTG---A---ATGG-----------AA---A-T-C-A------------------AT-CTT--T-A-TA--T--G--AA--TT--TAG---A--AT---A------T-TATTA-----------ATTGATAGGTTTAGCTC-CATTTTGGT-T-TAATAAT---A-AA--TTCC----AA-AAATCGATTATT-TT-CGTGA-AGGCT--C-T-TTAACA-A--AA-T----CCATT--AAAATATT-TTGT--AA---AGA--A-T-A-AA--A-A--A---tcttcacaaa
gi|19 : acgcacacatTTA-------------AT-AATGGTTACAAG--TATCAATAA-T-TTT------------AAACAGGAC-GC-GGT-GTACGTCAAGAATACCCTCTCAC--CTCCA----TAA-A-TA--TT---TCT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----ATT--------A-------TC-A--T--AAGATGTG-------A---T------A-----T-----TA-AA---G---A-C----A-------CA--A---ATG-ATAT--A-A--A----T-------T---------A---ATG-AAAT----G----GA------AA-T-----A---A-AA-A--TT--T--TG---TTT-GCTGATGATGC---AA-CTTTCGTT---ACTCATGGATCGG--A---AG---A-T---A-----CT-T---TC-----T-CTTTCA-A-TA--ATCT--AA--TT--AAA---ACTAT---TTGCGAAT-CAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GCATT-TAA-ATT---A-AA--CAAA----AACAAATGCACAGTA-TTAAGAGC-AGCAT--C-C-CT-AAA-A--GC-A----CAGA----AAAGATT-TG------------------A-GA--A-A--C---CTCACA--TGG-ACAT-----A--AAATTAAGT-AC-CTAATATAGGAATCAaatgttaagactgtgaaaaaacatgggttatgttttcacgaac
gi|2 : ttttA-GA-GGA-GTTTGCTAAGAATGTCATTT-AT--CACCA----AAT-T-TG--TT---TAT----CGT--ATG-TAAT-GAATT-----TCT--------G-------TCAG--TTGAA-AT--A--CT--CA---ATTATACAT----G-----TA-AA---A---A-T----A-------TA--A---AAG-AAAT--G-A--------A------T---------CC--AC--ATGG----A----AA------AA-A-A---A---ATAA-A--TA--C--GCTT-TTT-GCTGACGACGC---TA-CTTTTATA---ACCGAT-GGTT----A---GA---A-A-C-ATAC--CT-T---TGGAA-A--CTT--A-T-TT--A-AT--AT--TT--TAA---ATAAT---T------T-AAGCT-----------A--CATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CATA----AATAAATGCACTGTT-CTACTTGA-TGGCTCCC-T-TTAAGA-T--A-------CAAAT--G-----TC-CACT--ACCTGA-AACA-T-A-AA--A-A--AAATTTCAT---TGG-GATTCT--GAGCAA-----GC-AG-AAACGCTAGGAATtttcataaa
gi|20 : tgttttaaataatttcagttacatatcaggtttattttttttcctattcgcTACTTA-------------AC-AACGGACATA----TGACT---A-T-TTT-T----C--C--CTATTCACC-GA-TGT-GTTAGACAAGGCTGCCTTCT-GT--CCCTA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAC--TTG-TATT-GAACTGCTTTCTT--------A-------TG-A--G--AA-ATCAA--T--------A------A-----A-----TC-CT---A---A-T----A-------TA--A---AAG-GGAT--A-A--C----CA------T---------AG--CTG-GGAA----A----GA------AA-TAA---A---A-AA-A--TA--C--TCTT-TTT-ACTGATGACGT---CA-CTTTTCTA---ACTGATGGTTCTAA-G---AA---A-T-C-G--------T---TCGAA-AC-CCT--T-A-TA--T-AT--AC--TT--TGG---ATGAG---T------A-TAGCA-----------A--CGTT--------TC-T-----GGTTTGTAA--------------------------------TGTT-TTAAGGGC-AGAAT--C-A-TTGAAA-AATAC-C----CAAGT--AAAATATA-TGG---A----A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTTAatacttctacactg
gi|21 : atataagtagttcatA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----A--A--ACATAGGGA-GA-GG---------AAAAATGCCCG-T-TT--CACCT----TAC-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-AATT-GAAAT-----ACT--------G-------A--A--C--AT-ATCCA--TT--CA---A------A-----A-----AG-AT---A---A-T----A-------CA--ATTAAAG-GTATTAA-A--A----TG------C---------AT--A---ATAG----G----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--CA--C--AGCT-TTT-GCTGATGATAC---C--CATTTATG---TTAAATAGTTC----A---AATAAA-A-C-A-----CT-T---TCTAG-TC---T--A-A-TA--A-AC--AA--AA--TAGGGTAC--T---T------T-TAACC-----------A--AATA--------TA-A-----GGCCT-TAA-TCTATAT-AA--A-------AATAAATCTATAATT-CTTCGTGT-AGGGT--C-A-TTAAAA-T--AT-T----CAAAT--GAAATATA-TAGT--TG---T-G--A-T-A-GC--A-A--A---TTCATT--TGG-ACATCT--GA--AAAA---GC-CA-CAACACTTGGAATTGTTTTTGCacaatcaaaagcacttggaatagttttct
gi|22 : tAAAGCAGTGTTATAA-------------AT-AACGATTACG----TAACTG-A-----TT-T----C--ATTACATACAAA-GA-AGT-GTTCGACAAGGCTTTCCACA-TT--CGCCT----AAT-C-TA--TT---TAT----TAT--ATG-CATG-TAGTT-----GTC--------A-------T--A--TG-AA-ATTTC--TA--AA---A------A-----A-----CA-A----A---A-T----A-------TT--G---AAC-GCAT--A-A-------------------------AT--ACG-GAAGGTTTA----GA------CA-T-G---A---A-AT-A--TA--C--ATAT-TT---CAGATTATGT---TT-CTTTTGTC---ACCGATGAATC----A---AA---A-C-G-AT----CG-T---TTGAA-AA-TCT--A-A-TT--A-AA--AC--TC--TTG---ATTCT---T------T-TAGCT-----------T--TGTA--------TC-T-----GGGTT-GAA-ACT---T-AA--TCCaaat
gi|23 : CAATGTTATGCAGTTA-------------AT-AACGGACACA----TATCCG-AA-T-TCT-T----C--A--ACATAAAAA-----------CGACAAGGTTGTCCACT-GC--CGCCA----TAC-T-TA--TT---TAT----ACTTAAAA-TAT---AAAT-----TTT--------A-------G--A-----AA-TTCTG--AG--AAGGCA------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGG-GCAT--A-A--C----TA------T---------AC--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-G---A---C-AA-A--TA--C--AGTA-TTT-GAAGATGATGC---AA-CTTTTGTG---A-TAATCGGAC----A---A-------------------T---TTAAA-AT-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAG-A-----------A--AATAG-------TT-C-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AACACATCTGTTATA-TTAAGATC-GGGAA--C-A-CTAAAG-A--CT-T----CTACT--GAAACATT-T-------------------------------------ATA--TGG-ACACCT--AA--AGTT---TC-AT-CTACAATGGGAATcttgaaatgtaatatagtaaaagcagattaattgaaacatacacacataaggtagaaaaaaatgtttgctggtcatcaaacaaggcaaag
gi|24 : gctGTGTAAT-A-------------GTCAATGGACACT----TGTCAG-AG-T-GGT-T----C--T--ACTTACAGA-GA-GGCTGTA-GACAAGGAGACCCATT-AT--CCCCA----TATATATA--TT---CAT----TAT--ATG-TGCA-GAGAT-----CCTCG------C-------T--G--T------TCTA--AT--CAG--A------A-----A-----TA-ACCCTA---A-T----A-------TA--A---AAG-GAAT--A---------CA------G---------ATTGACA-ATAA----A----AACTGTTTAATT-T---C---A-CA-A--TA------------T-GCCGATGATAC---AA-CACTCATG---CTTGATGGTTCAGA-A---AA---A-T-C-A-----CT-T---GTAAACACACTT------CA--A-AC---A--CT--CAA---AT--T---C------TATACTG-----------A--AAGC--------TC-C-----GGCCT-TAA-TAT---C-AA--TGTT----GATAAAACTAtgttg
gi|25 : ACAAGGATGCCCACT-TT--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TAT----ACT--AGC-AATA-GAAAT-----TCT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---G---A-TAACAA-------TATTG---AAG-GTGT--A---------CA------A---------AT--ACGCATAA----A----CA------TT-T-T---C---A-AATA--CA--C--AGCT-TTT-GCAGACGATGC---CA-CATTTTTG---TTAAATGGAAT----T---AA---A-T-CTT-----CT-T---TTGAA-AC-TCT--A-A-TATTA-TT--AATTGA--TAG---A-------T------T-TAGCT-----------C--AATT--------TC-T-----GGT-T-TAA-AGT---TAAA--TTCTA---AAAAAATCT---ATT-CTCCGTGT-AGGCT--C-T-TTAAAA-A--CA-T----CTATT--GACATATT-TTGTA-AA---A-A--A-T-A-AA--A-T--A---TTTGTT--TGG-ATTAAT--GA--AAAA---GC-AT-CAACACTAGGAAT--CGTTTaggcagtgtagataggttcaaggaaaatagtaatattaagttatgtgaagaatattatct
gi|26 : AA-GATGGG-GTACGGCAAG-ATTTCCGCT-GT--AGCCAAACGTGT-T-TAAATT---TAT----TAT--AGA-AATGTGTAGT-----TTG--------A-------G--A------A-AGC-------------A------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGA-GCAT--A-A--A----TA------T---------AC--ATA-TTAG----A----GA------AA-T-A---T---A-AA-A--TA--C--AGCA-TTT-TCAGATGCTGC---AA-CTTTTATG---ATTAATGGGTC----ATTTAA---A-C-C-G-----TT-T---AC--A-AC-TTG--A-A-TA--A-A---AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAATA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AAAAAA-CTGTTATA-TTAAGATCGAGAAA--C----TAAAA-T--A--T----CTACT--GAAACATT-TGGT--AC------------------A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCC--GA--AAGT---TT-AT-TTACATAGGGAATtcact
gi|27 : TG-AAAAC-----TGT--------A-------T--A--TG-AA-ATCCAAATT--GC---A------G-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GCAT--A-A--A----CA------T---------AT--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA--C--GGTA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CGTTTATG---ATGGATGGGTC----ATATAA---A-----A-----CT-T---TTACA-TC-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GC--TAA---ATTAT---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTCT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAATAATCTGTTATC-TTAAGATC-AGGAT--C-A-TTAAAA-A--CT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-GT-CTACGCTGGAAAT--TGTTTtgttgt
gi|28 : atagtTGTTTTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-G-TTT-T----T--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTATGTCAAGGATGCACTCT-CT--CTCAA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-AATA-GAAAT-----TTT--------A-------TC-A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---GC-----A-----A-----TA-CA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GAAT--A-A--A-----A------T---------TTA-ATG-AGAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AA--A--GCCTGTCT-GCTGATGACGC---AA-CAGTTGTT---ACTGATGGGTCGG--A---AA---A-A-A-A-----CG-T---TCAAT-ACTCTT--ATT-TA--A-AC--TA--A----AG---ACAAA---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGCCT-TAA-A-T---T-AA--ACCT----AAAAAtttcaa
gi|29 : gcttAAATCTGTGTAGTTA-------------AT-AACGGATACA----TGTCGG-AT-T-TTT-T----C--A--AAGTAAAAC-GA-GAA-GTAAGACAAGGATGCCCACT-AT--CGCCT----TAT-T-TG--TT---TAT----ATT--ACT-TATC-GATTT-----ACT--------G-------T--A--T--AA-ATca
gi|3 : gatgctaCAAAGTTGAATATCAA-------------AT-AATCGTTATT----CCTCAG-AT-T-ATT-T----C--A--ATATAAAAAAGA-GGA-GTTAGACAAGGATGTCCACT-TT--CTCCA----TAT-T-TG--TT---TAT----ACT--AGC-AATA-GAAAT-----TCT--------A-------T--A--T--AA-AGCTG------CA---A------ATAACGA-----TA-AC---A---A-T----A-------TT--G---AAG-GTGT--A-A--------A------G---------AT--ACG--CAA----A----AA------CA-T-TTTCA---A-AT-A--TA--C--AGCT-TTT-GCAGACGATGC---CA-CATTTTTG---TTAAATGG-----------AA---A-T-A-AACCTTCT-T---TTGAA-AC-TTT--A-A-TATTA-TT--AA--TTGATAG---A-------T------T-TAGCT-----------C--AATT--------TC-T-----GGT-T-TAA-AGT---T-AAA-TTCT----AAAAAATCTATTATT-CTCCGTGT-AGGCT--C-T-TTAAAA-A--CA-T----CCATT--GACATATT-TTGT--AA---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTTGTT--TGG-ACTAAT--GA--AAAA---GC-AT-CAACACAGGGAAT--TGTTTtggaacacttcagttgttatcagaatactacagtcatggccagctattaactcaaacaaaaatgttgaaaatataaacatagatgctatggaataattcaaatatatggaacaaatctttgacaatagacaaaaagcattttatactttacacaataaggaatctg
gi|30 : atgcaAT----TTT--ACA-TATT-----T-----TTT--------AATCGTGAC--A--T--AA-GTCGG--TT--CC---A------A-----A-----TG-ATACTG---A-T----A-------TT--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------TTCATAATTCAT--GCT-ATAG----A----GG-----------T---A---A-AA-A--GA--A--AGAT-TTT-TCAAATAATGC---AA-CATTAATG---ATAGGTGGATC----G---AA---A--------------------GGA-AC---T--C-A-TA--A-AG--AA--AA--TTG---ACAAT---T------T-TAGTA-----------C--AATA--------TC-T-----GGTCT-TAA-AAG---T-AA--CTCT----AATAAAGTTATTGTT-TTACG-AC-GTATT--T-T-CTGAAATA--AC-T----CCATT--TAAACGTG-TAGT--AA---A-G--A-T-A-Atcactaac
gi|31 : gtttctttaatac-GTGT--A-A--CAG--TA------T---------GT--A-G-A-AG----C----AT------AA-T-C---A---A-AT-A--CA--A--TGTT-TTT-GCAAACGATTT---CA-CTTTCTTG---TCAAATGG-----------AA---A-T-T-AAT---CT-TCATTTGAA-TC-TTT--A-A-TG--ACAT--TT--TT--TTG---ACAGT---T------T-TAGCT-----------T--CATT--------TT-C-----GGT-T-AAA-AGT---T-AAA-TTCC----AAGAAAACGTTTATT-CGCCATGT-AGGCT--C-T-TTAAAG-A--AA-T----CCATT--GAAATATT-TAAG--AT---G-A--A-C-A-AA--A-T--A---TTTAtaga
gi|32 : A------AA-T-A---A---A-AA-G--TA--G--TAGT-TAT-GCTGATGATGC---AACCATCTTTT---AC-GATGGTTA----A---AC---A-T-C-A--------T---TTGAA-ACGCTT----A-TC--A-AT--GT--TC--TAG---ATAGT---T------A-CGGTA-----------A--TATC--------TC-C-----GG-AT-TAA-AAT---CAAA--TACTTCAAAAAAAATGTACTATA-TTAAAAGC-TGGTT--C-G-TTGTAC-G--AC-T----CTAAT--ATTA-ATTCTAAT--TA---A-A--A-C-A-AA--A-T--A---TAAATC--TGG-AATTCT--GA--AAgaataatgaaaaaaaacatcaacatttggaattgttttcacgat
gi|33 : tG-GTAT----A----GA------AG-T-A---A---G-AA-A--TA--C---GCTGTTT-GCATATGATGC---AA-CTTTTGTC---ACGGATGGATCAAG-A---AA---A-T---A------T-T---TTGAA-AC-GTT--A-A-TA--G-AT-------------------AT---T------T-TAG-----------------ATA-------------------TTT-TAA-ACA---T-AA--GGC---------AAT-----GTG-TTAAGAGC-GGGTT--C-T-CTTAAA-C--AT-A----CAAATACAAAGCATT-TA----AC---A-C--A-T-A-AA--ATA--A---TTTA-G--TGG-A-ACTT--GG--AAaaacacgaaaactcttgaaatattgtttagcgc
gi|34 : GAT-ATGC---AA-CATTTATG---ATCGTTGAATC----A---AA---A-T-CGA-----TT-T---TTACA-AC-CTT--A-A-TA--A-AG--AA--AA--TTT---GCAAT---T------T-TAGTA-----------A--AGTA--------TC-T-----GGTCT-TGA-ACT---T-AA--CTGC----AATACAGCTATAGTT-TTACGCCC-AGGTT--T-TATAAAAA-A--AC-T----TAAAT--GAAACGTT-TAGT--GT---C-T--A-T-A-AC--A-A--A---TT-ATA--aaggtcaagacactcgga
gi|36 : agtatatacac--TGG---ATAAT---T------T-TAAAT-----------A--TATA--------TC-T-----GG-AT-TAA-GAT---T-AAATCATT----CA-AAATGTACAGCG-CTAAAAGT-AGGGT--C-T-CTGAAA-A--CC-T----CCAAG--GACACATA-TTGT--CA---A-A--A-T-A-AA--A-A--G---TTTAAA--TGGTGCA-AT--GA--TAGT---GC-A
gi|37 : aagctcttatcgatgtttTT--A-A-TA--A-GA--AA--TA--TTG---AACAT---T------T-TGGCA-----------T--ATTA--------TC-T-----GGTCT-AAA-ACT---A-AA--CAAG----AAAAAAACTACTATA-TTGCGTTG-TGGAT--CAC-TTAAAA-AT-AC------CGATT------TCTC-TTGTA-AT---A-A--A-G-A-AA--AGA--A---TTT-TAACTGG-ACTTCT--GA--TAAA---GC-TT-CTACGTTAGGGATaaagcgttaggtgtcactttcccacacc
gi|38 : atcaT--A-A-TA--A-AG--AA--AT--TTG---ACAAA---T------C-CAGTA-----------A--ACTA--------TC-A-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGTTC-AGGTG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTATCATGGGAATCATATTggtttttacaaata
gi|39 : --A-A-TA--A-AG--AA--AA--TTG---AAAAA---A------T-CAGTA-----------A--ACTA--------TC-A-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGTTC-AGGTG--T-T-TTAAAA-A--AC-T----CAATT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTACCCTGGGAATCACATTTaacaaa
gi|4 : CAAAGTTGTGTAGTTA-------------AT-AACTGACACA----TGTCCG-AG-T-TCT-TTCTTC--A--ACATCAAAA-GT-GGA-GTACGACATGGATGTCCACT-TT--CACCA----TAT-T-TA--TT---TAT----AGT--AAT-TATA-GAACT-----TTT--------A-------T--T--C--AA-GTCCG--T----A---A------A-----AGCAGATA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GCAT--ATA--CA---TAAAAAATT---------AT--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA--C--AGCA-TTT-GCATATGATGC---AA-CCTTTATG---ATGGATAGGTC----GTATAA---A-----A-----CT-T---TTACA-TC-TTT--A-A-CA--A-A---AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTCT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAAAAATCTCTTATC-TAAAGATC-AGGAT--C-A-TTAAAA-A--AT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A--A---TTCATA--TGG-CAATCA--GA--A--T---GCTAGTCTACACTGGGAAT--TGTTT
gi|40 : t-TA--A-AG--AA--AA--TTG---ACAAA---T------T-CAGGA-----------A--ACTA--------TT-A-----AGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGTTC-AGGTG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTACCCTGGGAATCACATTt
gi|41 : GTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGCTC-AGGGG--C-T-CTAAAA----AC-T----CAAAT--GAAAC-TG-TAATTGCC---A-A--A---A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ATATCC--GA--CAGT---GC-AG-CTACTCTGCGAATCACATTTAC
gi|43 : attataaagattgtaaaagcacac----AAAAAATCTATTATT-CTCCGTGT-AGGCT--C-A-TTAAAG-A--AA-T----CCATT--GACATATT-TTGT--AA---A-G--A-T-A-AA--A-AC-A---TT-ATT--TGG-ACaa
gi|45 : GCA-----------A--AATA--------TC-T-----GGTTT-TAG-ATT---A-AA--CTCG----AACACATCCA-CATTATTAAGAAT-AGGTT--C-A-TGAAAA-T--CC-TGGAAAAAAG--GAAA-A---TAAT--GC---A-A--A-T-A-GA--tgattgcttggactaatgaaaaatcattaacactgtgaattgtttttgcgaacg
gi|47 : CT-TAA-GGT---T-AA--CACG----AAAAATTCTATAATT-TAACAATC-GGCAT--C-T-GTCAAA-A--CT-T----CAAAG--GAAACTTT-AAGT--AC---A-G--A---A-AA--A-A--C---CT--TA--TGG-ACATCT--GA--GAAC---GC-AG-CTACTCTTGGGATTATGTTTGtttcgaatcaagcatctacttattttcacaaacacg
gi|49 : ------A-----A-----TA-AT---A---A-T----A-------TT--A---AAG-ATAT--T-A--T----AA------T---------TT--ACA-ATAG----A----GA------AG-C---------A-AA-C--CA--C--AGC------GCAAATGATAC---AA-CATTTATG---ATGGATGGATC----A---AA---A-TGA-A-----CT-T---TTACA-AC-CTT--A-A-TA--A-AG--Atcaa
gi|5 : AAAGTTGTACTACTG-------------AT-A-TGGAAATAATAATGTCCG-AT-TGTTT-T----C--C---TATAAAAA-GA-GCC-GTACGTCAAGGCTACCCATT-GT--CACCC----TAT-T-TA--TTATGTATGCAGTTT--CTG-TATT-GAGCT-----TTTATA-----A-------T--A--T--GA-AATAA--CA--CA---A------A-----A-----CG-AT---A---A-T----A-------TG--A---AGG-GTAT--A---------CA----------------AT--ACA-A-AA----ATCATGA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA-------CT-TTT-GCAGACGATGC---AA-CATTTGTA---ACTGATGA-------A---AA---G-T-C-A--------T---TCACA-AC-ATT--C-T-TA--T-CT--GT--TT--TAG---AAAAT---G------T-TAGCT-----------C--CAT---------TT-C-----TGTTT-TAA-ATA---A-AA--CACA----GTAAAATGTAAAATA-TTACGAGC-GGGTT--T-A-CTAAAA-
gi|51 : agattcgaTATTATT-TTGCGATC-AGGTT--C-C-TTAAAA-A--CT-T----CAAAT--GACACTCC-TAGT--AC---A-G--A-T-A-AA--A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCT--GA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAGTttatctaatataattatatgcgataataaaagtttgtttggagtttcgatcaagcaaaatgcactgaaaatagtattcaa
gi|52 : T-TGA-ACC---T-AA-----------ATAAATCCACAATT-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-TTAAAA-T--A-------CAAAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---ATCACA--TGG-ACAACTTAGA--AAtgtctttacaaa
gi|53 : ATT-TTACGTTC-AGGTG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTACCCTGGGAATCACATTTACtcaccttcacaaaa
gi|55 : ATT-TTACGTTC-AGGTG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--AAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTACCCTGGGAATCACATTTaaata
gi|56 : aATT-TTACGTTC-AGGAG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---CTTATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTACCCTGGGAATCACATT
gi|6 : aAGAGTTGTGTAATTA-------------AT-AATGGTCATT----TGTCGC-AG-T-TTT-T----C--C--CAATACAAT-GT-GGC-GTTAGACAAGGATGTCCCCT-GT--CTCCT----TAT-C-TG--TT---TAT----TTT--ATG-CATT-GAACT-----GTT--------ATCT----T--A--TG-AA-ATAT---CA--CA---C------A-----A-----CA-TT---A---A-T----A-------TA--A---AAG-GCAT--T-A--A----TA------T---------AT--ATG----G----ACAT-GA------AA-T-A---A---A-AG-A--AA--C--TTTA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CTTTTTTA---ACTGATGGCTC----C---AA---A---C-AAT---CT-T---TTGAA-TC-TCT--T-A-TC--G-AT--GT--TT--TGG---ATAAT---T------T-TAAAT-----------A--TATA--------TC-T-----GG-AT-TAA-GAT---T-AAACCATT----CA-AAATGTACAGCG-CTAAAAGT-AGGGT--C-T-CTGAAA-A--CC-T----CCAAG--GAAACATA-TTGT--CA---A-A--A-T-A-AA--A-A--G---TTTAAA--TGGTGCA-AT--GA--TAGT---GC-A
gi|7 : tgcaaGCTGTGCTTTTA-------------AT-GAAGATGTCA----TGTCTG-AC-T-TTT-T----TTTA--AAATAGGAC-GT-GGT-ATACGTCAAGGATGCCCTAT-CT--TTCCA----TAT-C-TA--TT---TAA----TAT--ATT-GATA-GAAAT-----TGT--------A-------TC-A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-A--------A-T----A-------TA--A---AAT-ATAT--A-AAAC----T------------------T--ATG-AAAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A---A--T--GTCT-TTTTGCTTTTGATGC---AA--ATTCGTT---ACTGATGTGTCGG--A---AA---A-A-A-A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-AACCAT--TA--TAG---ACGAT---T------T--AGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GACCT-TAA-ATG---G-AA--CCAA----AATAAATCCATAGTA-TCAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-G--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---TTCACA--TGA-ACATCT--AATCAA-----GC-AG-CCACTTAAGGAATCATCTTCGCaaagcattaggtgtcactttccacac
gi|8 : AGTTCAGTAATTA-------------AC-AACGGACATA----TGACTA-AT-T-TTT-T----C--C--CTATTTATC-GA-GGT-GTTAGACAAGGCTGCCCTCT-GT--CCCCC----TAT-T-TA--TT---TAT----TAC--TTG-TATT-GAACTGC---TTTCTTGTGAGA-------T--A--T--CA-AT--------------A------A-----A-----TC-CT---A---A-T----A-------TA--A---AAG-GGAT--A-A--C----CA------T---------AG--CTG-GGAA----A----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA--C--TCTT-TTT-GCTGATGACGC---CA-CTTCTCTA---ACTGATGGTTCTAA-G---AA---A-T-C-G--------T---TCGAA-AC-CCT--T-A-TA--T-AT--AC--TT--TGG---ATGAG---T------A-TAGCA-----------A--CGTT--------TC-T-----GGTTT-GAA-GCT---T-AA--CATC----TCTAAATGTAATGTT-TTAAGGGC-AGGAT--A-A-TTGAAA-AATAC-C----CAAGT--AAAATATA-TGG---A----A-A--A-T-A-AA--A-A--T---TTTAAC--TGG-TCCTCC--GA--Aaaataa
gi|9 : ataagtAAGTTGTGAAGTTA-------------AT-AACGGACACA----TGTCCG-AA-T-TCT-T----C--G--ACATAAATA-GA-GGA-GTACGACAAGGATGTCCACT-GT--CGCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----ACT--AAT-TATA-GACAT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-GTCTG--TG--AA---A------ACAG--A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-AACC----TA------T---------AT--A---ACAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA--C--AGCA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CATTTATG---TTGGATGGGTC----ATATAA---A-----A-----CG-T---TTACA-TC-TTT--G-A-TG--A-AA--AA--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAGTA-----------A--AGTA--------TC-T-----GG-CT-TAA-AAT---TAAA--CAAT----AAAAAATCTGTTATA-TTAAGATC-GGGAT--CAC-TAAAAA-A--AC-T----CTGCT--GAAACATT-TGGT--AC---T-A--A-C-A-AT--A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCA--AA--ATGT---TC-AT-CCACATTGGGAAT--CGTTTcaatcaaaagcacttggaatggttttct
blockSeqs : A . C C ATAA G T TA G . TCTTCAAC G A AA CT C A CA TT G AAACG A A AA ATG GCAGTT TA AGCT GT G GCTTT AATCGTGACATAAGTCGGTTCCAAATGATACTG . AACA ACAACAT TT GTT C AA T CTATTCATAATTC TG CGCAT GTTT TCAT CTGTTT T TTTC TCT T T AAC GC CATGCT T CAA C T A TTA TT GTTAGAAACATACC A CAT TAC C TC TCA . TT T TAATTGT A GGT CA TCA TGCGAA A . TT GGTTTAGC CATTTT C C ATAT TACTTCAA T A TA CT G CC TA AT CT GGAA A AC CA AA ACCTGA AC TG TG T C AAT C AC T TA TCA ATTAA T T T T A
blockSeqs : A . . A AG A . A G . CATTAC G . AT A A A A . A T . . . . TT . GTT T G GC GTCAGTTGAAATACTCAATTATACATGTAAAA . . ACAT TT TTA . TA . CATAAAAAATT A CGAT GTTT CAT . . AA T . . AC . GCCTG . . . C A . CA TTCAAATAAAACAC . . TAT . TC AT . TT C TAATTGA T . CA . . . . . G TT C C TA ATCATT C G T TT G . AC AT T . T . CT AA TGCCA . TT . G . . C T T . GCA GT . . C C A
blockSeqs : T . . T . A . A . . TTTAAA A . G A C A A . T A . . . . TT . GCT T A . ATATAAATCTGTTCAAAATGACTCTT . . CT . . . C . TGTCATAC . CAAT . . . . T . . . C . TGCT . . . A T . TC TTCAGAAAAATCAC . . TGA . AC A . TT . TAATTGA A . TG . . . . . . G T G CA ACCATT G T T CG C . AC T C . T . TA TG GCAA . TG . . . . T . . . TCA GT . . A T G
blockSeqs : A . . A . C . G . . TAAA A . G G C T T . A A . . . . AT . GCT A A . ATAAAAATCTGTTCAAAACGATGCTA . . . . . . T . CAGTAT . TGAT . . . . T . . . C . TGCT . . . G A . TG GTCATTTAAACCGT . . CAC . TC G . . . ACCATTA T . CG . . . . . . G C T TA ATTTC A T T AT A . T T A . T . CA GG GCAA . TG . . . . T . . . TA AA . . A T G
blockSeqs : T . . T . T . G . . TAAA G . A A C T T . T A . . . . AC . ATT A A . ATACAAATCCGTGAAAGCAGATACTG . . . . . . . . ACCTAT . TGAA . . . . C . . . T . AGCA . . . A G . CT TTCTAAGAAATCG . . CAA . GC A . . . TAAAA A . TG . . . . . . C C T T TTCTA T A C AG A . T . T . A . TT AT AAAG . TG . . . . C . . . A GC . . T C C
blockSeqs : A . . T . T . T . . TAAC C . A T A A C . G A . . . . TA . TCG A T . ATAATTAGCTGTTAGTAACAATAAAG . . . . . . . . CTAT . TGGC . . . . A . . . T . TTTT . . . A G . CC GTCGGAAAAAAAC . . TGA . TC T . . . GAAAA C . TA . . . . . . T C C T ATTCT G C A AG T . T . T . G . TA AA AAAA . T . . . . C . . . C GT . . A C T
blockSeqs : G . . A . A . T . . CAAC G . T T C A A . G T . . . . TA . TGC T T . ATTATTAGCTGTTAGTAACAATAAAG . . . . . . . . CCAT . CAAT . . . . T . . . A . AGCA . . . A A . TG GTCGGAAAAAAAC . . CAA . C A . . . AAAGC A . CG . . . . . . C T C T ATTCC A A A AT T . A . C . A . GA AG AATA . A . . . . C . . . A AA . . T T G
blockSeqs : T . . T . T . T . . TAAA G . A A A T A . T T . . . . AT . ACT C A . CGCTGTTCTAATCAGAAATAACCCTA . . . . . . . . ACAT . TGAA . . . . A . . . A . TGTT . . . A G . CT TTCTAAGAAATCG . . GGA . C A . . . TACAC A . CT . . . . . . T T T A TTCT C A T AG A . C . T . A . TA AT GCAA . C . . . . T . . . A TT . . T C G
blockSeqs : C . . T . A . C . . CAAA A . T T C A C . T A . . . . TA . TCG A A . ATATGAAATCCAAATTGCAGATAAAG . . . . . . . . ATTT . TGAA . . . . T . . . T . GCTT . . . T T . CT AAATCAGTTCTC . . CGA . T A . . . GAAAA A . TA . . . . . . C T A G TTAT C T A TG C . A . A . C . TA TG GCAA . T . . . . C . . . G AA . . T C G
blockSeqs : A . . T . A . A . . AAAA G . T A T T T . A A . . . . TA . TCG A A . ATCATTAGCTGTTAGTAGCAATACAG . . . . . . . . CATT . TGGG . . . . T . . . T . TCTT . . . T G . CC GTCTTATAAAAC . . CTA . T A . . . GAATT A . TG . . . . . . C C T C CGAT T A T AG A . A . C . A . CA AC ATT . G . . . . T . . . A GT . . G C A
blockSeqs : G . . A . T . A . . TATT C . C T A T A . C A . . . . TA . TGT A T . ATATAAAGCTGCAAATAACGATAACA . . . . . . . . CCAT . CGGA . . . . G . . . T . AGCT . . . T A . CT GTCAGAAAAAAC . . TGA . C T . . . TAATT G . TT . . . . . . T T T T CCTA T T A TG C . C . C . A . TA GG ACG . T . . . . T . . . A GC . . A C A
blockSeqs : A . . T . A . A . . CCCT G . A A C T G . A A . . . . CG . TGT T C . ATTCAAGTCCGTAAAAGCAGATAAAG . . . . . . . . ATGC . TAAT . . . . A . . . T . ATAT . . . T C . TA GTCGGAAAAAAC . . TAA . C A . . . TATTT A . TG . . . . . . T T C G TCCC C T T GG A . T . T . A . CA AG AAA . T . . . . C . . . A AA . . A T G
blockSeqs : T . . A . T . A . . AAAC C . A T C G T . G T . . . . TA . ACA T A . ATAATATGAAATAACACAAAACGATA . . . . . . . . CTAT . CAAT . . . . A . . . C . AGTA . . . A A . CC ATCGGAAGATAC . . TAA . C T . . . TACTT T . TG . . . . . . A C C A TTCT T A T TG G . C . T . A . CA TG ACA . T . . . . T . . . A GT . . A C A
blockSeqs : G . . A . C . G . . CAAC A . A T C A T . G T . . . . AT . TGC T T . ATCTTATGAAATATCACACAACATTA . . . . . . . . ATAT . TATT . . . . G . . . T . AGCT . . . T G . TT ATCAAAACGATC . . TGA . C A . . . CAAAA A . TT . . . . . . T T T A CCTA A T T AT A . T . A . T . TA GG CCG . T . . . . T . . . A AA . . A C A
blockSeqs : T . . T . A . T . . CTAC C . A G T A G . C A . . . . TA . AAT G A . ATATAAGTCTGTGAAAACAGATAAAG . . . . . . . . ACAT . TAAT . . . . G . . . T . AGCA . . . T G . TA AATTAAATCTTC . . TAC . C A . . . AACTC A . CA . . . . . . C C A A TTCC A T A TG C . A . T . T . CG GG AAA . T . . . . A . . . A GT . . G C G
blockSeqs : G . . A . T . T . . TAAA G . A T A A A . T A . . . . AC . TGT A A . AGAAATTCTGAGAAGGCAGATAACG . . . . . . . . TAAT . TGAG . . . . T . . . T . GGTA . . . A A . TT GTCATATAAAAC . . CAA . C A . . . AAGGC A . CA . . . . . . C C G T CAAA A T T AT A . A . A . T . TA TG TGT . T . . . . T . . . A GT . . A C A
blockSeqs : A . . T . G . T . . CAAA A . T A A A T . G A . . . . TA . GCA A A . ATCATTAGCTGTTAGTAACAATAA . . . . . . . . ATAT . CTAT . . . . T . . . C . AGCT . . . A T . TG AAATAAACCTTC . . TGA . T A . . . AAGGC A . CA . . . . . . T C T A CATA A T A AT A . A . C . T . CA AG ACA . T . . . . T . . . A GT . . G . A
blockSeqs : A . . A . A . G . . CAAT A . A A C G G . T A . . . . AC . GAA G G . CTTGTGAGATATCAATAAATCCTA . . . . . . . . AACT . TAAT . . . . A . . . T . AGAT . . . T A . CT ATCAAGAAAATA . . TGA . T A . . . GAAAA A . TA . . . . . . T A T C CAAT A T C TG C . T . A . C . CG AA AAA . T . . . . T . . . A GT . . C . A
blockSeqs : T . . A . C . T . . CCCA A . A A C T C . G T . . . . TA . TCA A A . GAACATATCCATTCAAAAAGATA . . . . . . . . CCAT . CAAT . . . . A . . . T . TGTT . . . G A . TA ATCAAAATCGAT . . TGA . T A . . . TTTTT A . CA . . . . . . T T G A TGTT T T T TG T . A . C . C . CA AA AAA . C . . . . T . . . T AC . . C . C
blockSeqs : A . . T . C . G . . CCCT A . T C A A A . T A . . . . TA . CTT C A . ATATGAAATTTCTAAAAAACAAA . . . . . . . . CTT . TGAA . . . . T . . . A . TAGT . . . A G . TA GTCGTATAAAAC . . TGA . T A . . . TGTTC A . TA . . . . . . C C A A CAAT G T T AG C . T . T . C . TC AG ATG . C . . . . C . . . T GT . . A . G
blockSeqs : G . . T . G . C . . CGAC C . A C C A T . A A . . . . AT . GCA A T . ATCATAAGATGTGATATTAAAG . . . . . . . . ATT . TGGG . . . . T . . . T . GCTG . . . A T . CA ATCAAAATGAAC . . TAC . T C . . . GAAAA T . AC . . . . . . T A G T CGAT A A T AG T . T . C . T . CT TG TAA . T . . . . C . . . C GT . . C .
blockSeqs : . . A . T . T . . CCT G . T T A A T . A C . . . . AC . CAT T A . ATGAGAAATCAATAAATCCTA . . . . . . . . CAG . CGC . . . . C . . . G . AGCA . . . A A . CG CTCCAAACAATC . . TAC . T A . . . AAATA T . CA . . . . . . T C A T ACCT T A A CC T . T . C . A . CT TG ACA . T . . . . C . . . C GT . . T .
blockSeqs : . . A . T . A . . CCT T . T T C A G . T T . . . . TT . ATT A C . ATATAAAGCTGTAAATAACA . . . . . . . . CAA . CGC . . . . A . . . C . TTTA . . . T T . TC GTCATATAAAAC . . TAC . T A . . . GAAAT A . AA . . . . . . C C C T CTCT A T G AG T . G . C . A . CA AA GTC . T . . . . C . . . A GT . . T .
blockSeqs : . C . . . . AA A . A A . C G . T A . . . . AG . TGT T C . GTTGTTGTTCGAAAGTGTAA . . . . . . . . AAT . CAT . . . . A . . . T . GTCT . . . A T . TG GTCAAAATCAC . . CAC . G A . . . GAAAA T . TG . . . . . . C C C T CTGC T A T TT G . T . C . C . CT AA CAA . G . . . . T . . . C GT . . T
blockSeqs : . A . . T C . C C . . . . TT . TGC T C . ATATAAGACGGTAAATAATG . . . . . . . . AG . CGC . . . . A . . . T . TCTT . . . T G . TG ATCAAAACAAT . . TGA . C A . . . GAAAA G . CA . . . . . . T C A T CAAG T A G TT A . T . C . G . TA GG ACC . A . . . . C . . . C GT . . C
blockSeqs : . . . . T G . G A . . . . TA . TTG A A . ATATAAAGCTGTAAATAACG . . . . . . . . AT . CAA . . . . A . . . T . AGCA . . . A A . CT ACAAAAAACAT . . CAA . T A . . . TGTTT T . AA . . . . . . T C C T TTCT A T A TT T . T . T . A . CT AA ACC . A . . . . C . . . G G . . C
blockSeqs : A G . . . . . . . TA . TGT T C . AGAAAGCAGATAACG . . . . . . . . AG . AT . . . . A . . . C . CTG . . . C A . CT TTAAACATCA . . CGA . C A . . . TGTTT T . TA . . . . . . T C C T TTCT T A T AT T . T . C . A . CT AA ACA . T . . . . C . . . G T . . C
blockSeqs : AC . ATT A A . ATATAAATCG . . . . . . . . CA . GA . . . . T . . . T . AGC . . . A A . CT AAATTAATC . . TAC . A A . . . TACTT T . CG . . . . . . A T C A CGAT T A T TT A . A . C . T . CT TG ACC . A . . . . T . . . A . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TG . . . . A . . . A . TG . . . A G . CT ATCGAAA . . GG . T A . . . AAAGC A . TG . . . . . . A C T T TTCT A T C CT T . T . A . A . CT AA AAA . T . . . . T . . . C . . . A
blockSeqs : . . . . . AC . . . . A . . . T . TG . . . T T . TG AAAGTCA . . T . C C . . . ACTA T . TG . . . . . . T T C T TTCT C C T TG G . T . C . A . CT AG GCA . T . . . . C . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . CT . . . A G . T AAATAC . . C . T T . . . ACTA A . C . . . . . . A A C A CTCG A A T AA C . A . T . C . CA AG ACA . T . . . . T . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T C . C AAATCA . . C . . A . . . CACT G . T . . . . . . T C T T CACG A A T AT T . A . T . A . TA AT ACA . A . . . . T . . . T
blockSeqs : . . A A . . GACAA . . . . . T . . . AGGC A . . . . . . . . C T G T CACA T T T AG A . T . C . A . CA AA ACC . A . . . . . . . . A
blockSeqs : G . . . CTAA G . . . . . . . . T C T A CCAA T A A AT T . A . C . A . A AA ACC . A . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . AGGC A . . . . . . . . C . C T CATC T A T AG T . C . C . A . A AA ACC . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . T . A A CAAT A A T TT A . C . C . A . A TG CAA . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . T T GGC . T T TT T . T . T . A . C AT ACT . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C T A . T T TT T . T . C . A . A GG AA . . . . . . .
blockSeqs : . A G . . . T AG A . T . C . C . A GG AC . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . G AG G . T . . . A . A G AA . . . . . .
blockSeqs : . . . A GG A . C . . . A . . A . . . .
blockSeqs : T AT A . A . . . T . . . . . .
blockSeqs : A A A . .
blockSeqCons : ************* CGA *********** T****** CA **
originalCons : CAAAGTTGTGTANTTA-------------AT-AACGGNCACA----TGTCNG-AN-T-TTT-T----C--A--ANATAGAAA-GA-GGN-GTACGACAAGGATGCCCACT-NT--CNCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAANT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------AA-T-N---A---A-AA-A--TA--C--NGCT-TTT-GCAGATGATGC---AA-CNTTTNTG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGAA-AC-CTT--A-A-TA--A-AN--AA--NN--TAG---ACGAT---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TC-C-----GGTCT-TAA-ACT---T-AA--CNCT----AANAAATCTATNATT-TTACGNNC-AGGNT--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACATT-TAGT--AC---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
finalCons : CAAAGTTGTGTANTTA-------------AT-AACGGNCACA----TGTCNG-AN-T-TTT-T----C--A--ANATAGAAA-GA-GGN-GTACGACAAGGATGCCCACT-NT--CNCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAANT-----TTT--------A-------T--A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------AA-T-N---A---A-AA-A--TA--C--NGCT-TTT-GCAGATGATGC---AA-CNTTTNTG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGAA-AC-CTT--A-A-TA--A-AN--AA--NN--TAG---ACGAT---T------T-TAGTA-----------A--AATA--------TCT------GGTCT-TAA-ACT---T-AA--CNCT----AANAAATCTATNATT-TTACGNNC-AGGNT--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACATT-TAGT--AC---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|35 ): TATTTTATCTATTGAACTTATATCATTTGAAATACTCAACAGTAAGAAAATCAATTAACCTACATGGAAAAGAAATTTTAAAAAAATCGCTTTTTGCAGATTTTGTTATTTTTATTGCAATTAAGAGATGGCTTTGAAAACTTAGCTAATGTTTAAAATAAGTTCAGCTATATATCTTGTTTAA
Unaligned ( gi|42 ): GAAAAATCGTTACGACACTCATATTAGTTTTAAGAAAATTTAAGCTTAATTTCTGGTCAGTGTCACTTTAGTTGTCCAACATAATATTACGCAAAAACAAAAAAGTTTATTTGGAGTTCCAATCAAGCAAAAACACTAGAAAGTAATAATAAAAGT
Unaligned ( gi|44 ): TAAATTCTTCAAAATGTACAATATTAAGAGCTGGTTTGTTGAAACACTCTAATATTACTTTTTGTCAAAATAAAAAGGACATATCTGGAATTCTGAAAAATAACGAAAAGGCTTGGAATAGTGTTTAGCACGAA
Unaligned ( gi|46 ): AATCTTCTTTTGAAACTTTAATTTATTGATTTTAACTCAAATTAAATTCTAAAGCAATCTATCAAAACATCAAAAACAAAATTGTTGGACTAATGAAAATATTTCAACACTGGGATTTGTTTTCGCAAACA
Unaligned ( gi|48 ): AACAAAAGTAAATGCCTTATTTTACGCGCTGAATCACCTTAATATACAAATGTACACTACCTGAAAAATAAAAAAACACTGGCATTCTGAGCGGGCAAAAGTACTAGGAATATACTTCTACACTGAT
Unaligned ( gi|50 ): GTGGTTTTAACACTCATTTGAAACGGTTACCAATATTATACATATTTATGATAACATATCTGGACTATGGTTAGATAATTCCGAATGTATTTTATTAAGATCGGATTCATTG
Unaligned ( gi|54 ): ACCTACATGGAAAAGACATAAAAAAATACGCTTTTATAACAGACGGCTCAAAAATACCTTTGGAAACTTAGTTAATGTTTTAAATAATTTCAGTTACATATCAGGTTTA
Unaligned ( gi|57 ): CATAAGTATATGCACTGTTCTACGAGTTAGCTCACTTAAATATACAAATGTCCACTACCTGAAAAACCAAAAGCGCTAGGAATATACTTCTACACTGAT
Unaligned ( gi|58 ): GCACACAGCTGTGTGTAAAATAATGGTTATTTCTCAGAGATTTTTTATATAAAAGAGAAGTTAGGCAAGAATGGCATCTTTCTCCGTATTTGTTTA
Unaligned ( gi|59 ): TTTTTGTTAAATGGAAATACATTTTCTTTTGAAACTTTAATATTATTAATTGATAGATTTAGCTCAATTTCTGGTTTAAAGTTA
Alignments
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lowQualScore : 1 9999999999999 1 1 5555 1 1 44 3 1 444444444444 1 1 33 44 4 0 22 1 22 1 44444 1 1 22 222 444444 11 3333 33 1 55555 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 2222 9999999 33 444 1 66 1 7777777777777777777777777 33 77777 5555 4444 333333 1 66666 333 1 1 333 11 9999999 1 0 222 1 1 1 222 33 55555555555555555555555555555 1 222 666 1 99 1111 1 44 2 22222222222 1 111 99 111 333333 1 3333333333 11 6666666666666 1 3 1 1 3 66666 3333333333 3 1 0 0 22 0 1 11 555 0 44 33 2222 1 0 11 33 1 1 888888888 11 777 1 11 2 22 111 3 22 1 11 777777777 1 1 1 6 1
lowQualScore : . ............. . . .... . . .. . . ............ . . .. .. . . .. . .. . ..... . . .. ... ...... .. .... .. . ..... ............................................................................ . .... ....... .. ... . .. . ......................... .. ..... .... .... ...... . ..... ... . . ... .. ....... . . ... . . . ... .. ............................. . ... ... . .. .... . .. . ........... . ... .. ... ...... . .......... .. ............. . . . . . ..... .......... . . . . .. . . .. ... . .. .. .... . . .. .. . . ......... .. ... . .. . .. ... . .. . .. ......... . . . . .
lowQualScore : 0 2222222222222 7 0 6666 0 6 22 2 6 555555555555 8 5 66 44 1 3 00 3 44 5 00000 4 4 00 555 444444 99 7777 66 5 22222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 8888 0000000 77 777 3 11 3 2222222222222222222222222 11 22222 3333 8888 555555 2 77777 333 2 2 333 77 7777777 2 1 111 2 0 0 111 00 66666666666666666666666666666 2 111 999 2 33 8888 1 33 1 33333333333 9 999 99 999 111111 1 5555555555 44 8888888888888 1 1 0 0 2 00000 9999999999 6 7 9 5 99 9 0 33 555 9 55 00 0000 3 8 33 33 0 3 222222222 33 333 0 33 0 44 888 8 66 1 66 333333333 3 3 0 9 6
consensus : CAAAGTTGTGTANTTA-------------AT-AACGGNCACA----TGTCNG-AN-T-TTT-T----C--A--ANATAGAAA-GA-GGN-GTACGACAAGGATGCC--CACT-NTCNCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAANT-----TTT--------A-------T---A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------AA-T-N---A---A-AA-A--TA--C--NGCT-TTT-GCAGATGATGC---AA-CNTTTNTG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGAA-AC-CTT--A-A-TA--A-AN--AA--NN--TAG---ACGAT---T------T-TAGTAA--A-------AT--A-------------TC-CGGTCT-TAA-ACT---T-AA--CNCT----AANAAATCTATNATT-TTACGNNC-AGGNT--C-N-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACATT-TAGT--AC---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
Reference ( family-960 ) : CAAAGTTGTGTANTTA-------------AT-AACGGNCACA----TGTCNG-AN-T-TTT-T----C--A--ANATAGAAA-GA-GGN-GTACGACAAGGATGCC--CACT-NTCNCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TNT--ANN-TATN-GAANT-----TTT--------A-------T---A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------AA-T-N---A---A-AA-A--TA--C--NGCT-TTT-GCAGATGATGC---AA-CNTTTNTG---ACNGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TCGAA-AC-CTT--A-A-TA--A-AN--AA--NN--TAG---ACGAT---T------T-TAGTAA--A-------AT--A-------------TC-TGGTCT-TAA-ACT---T-AA--CNCT----AANAAATCTATNATT-TTACGNNC-AGGNT--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACATT-TAGT--AC---A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACNCTGGGAATCACGTTTGC
gi|1 : AAAGTTGTGTAGTTATATGTTAAATGTAAT-AGCTGACACA----TGTCA--AT-T-TTTGT----C--A--CATTAGAAA-GA-GAA-GTAAGTAAAAGATGTC--CATT-ATCGCCT----TAT-C-TG--TT---TAT----TAT--AAA-TATC-GAATT-----ATT--------A-------T---G--T--AA-ATCGG--TA--CA---A------A-----AG----TATAC---A---AAT----A-------TA--A---AAG--TAT--C-A--C----TG------T---------TT--ACT-GCAG----A----AA------GG-T-T---A---A-AA----CA--T--CGCT-TTT-GTAGATGATGG---AA-CGTTTATT---TTGGATGTATC----A---AA---AGT-A-A-----AT-T---TC--A-AC-ATT--A-AATA--T-GA--AA--TT--CA----ACAAT---T------T-TAGTAA--ATTTTAGTATAAA-------------TA-TGGTCT-TGA-GCT---T-AA--CTTG----AATGAATCTTTAATT-TTACGATT-AGGTA--C-T-TTAAAA-A--CT-T----CAAAT--GAAAC-TT-TCAT--AC---A-A--A-G-A-AA--G-AATA---TTCATT--TGG-ACATCT--AA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAATCATCTCTGC
gi|10 : aCAAAGTTGTGTAATAA-------------AT-AATGGCCACA----TGTCGG-AA-T-TCT-T----T--A--AAGTAGAAA-GG-GGA-GTACGACAAGGATGCC--CACT-ATCGCCT----TAT-T-TA--TT---TAT----TTT--AGT-TATT-GAGGT-----TTT--------A-------T---A--T--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----TG-AC---TCTTA-T----A-------TT--A---AAG-GTAT--T-A--C----TA------T---------AT--ACG-ATAG----A----GA------GA-T-T---A---A-AA-A--CA--C--TGCT-TTT-GCAGATGACGC---CA-CTTTTATG---ATTGATGGGTC----A---AA---A-T-C-A-----CT-T---TTACA-AC-CTT--A-A-TA--A-AT--AA--AA--TAG---ACAAT---T------T-CAGCAA--A-------AT--A-------------TC-GGGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCCATAATT-TTACGCTC-AGGGT--C-T-TTAAAA-T--AT-T----CAAAT--AAAACATT-TAAT--AT---T-A--A-T-A-AA--A-A--A---TACATC--TGG-ACATCT--GA--AAGT---GC-AG-CTACTCTGGGAATTACATTTGC
gi|11 : AAAGTTGTGTAATAA-------------CT-AATGGACACA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----T--A--AAGTAGATA-GG-GGA-GTAAGACAAGGATGCA--CATT-ATTACCA----CAT-T-T--------TGT----TTT--AGC-TATT-GAAGT-----TTT--------A-------T---A--A--AA-ATCTG--TT--CA---A------A-----A-----CG-AT---GCTAA-T----ACT-----TA--AGTTAAG-GTAT--T-A--C----CA------T---------AT--ACA-ATAA----A----GA------GA-T-T---A---A-AA-A--CA--C--TGCT-TTT-GCAGATGATGC---CA-CCTTTATGTTAACAAA--------------AA---A-T---A-----CT-T---TTATA-AC-CTT--G-A-TA--A-AG--AA--AA--TTG---ACAAA---T------T-CAGTAA--A-------AT--A-------------TC-GGGTCA-TAA-ACT---T-AA--TTAT----AGCAAATCAATGATT-TTACGTTC-AGAGG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CTAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---G-A--A-A-ACAA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTATCCTGGGAATCACATTTAC
gi|12 : TGTGTGTCTA-------------AT-AATGGTTATT----TTTCAG-AG-T-GTT-T----T--A--ACATAAAAA-GA-GAG-TTA-GACAAGGATGCC--CACT-TTCTCCA----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AGC-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T---A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---A---A-T----AACAACATTG--A---AAGCGTAC--A-A-------------------------GT--ACG--CAA----A----AA------TA-T-C---AT--C-AA-A--TA--TCATGCT-TTT-GCAGATGATGC---CA-CATTTTTG---TTCAATGG-----------AA---A-T-C-AGTTCTCT-T---TTGAA-TC-TTT--A-A-TATTA-TT--AATTGT--TAG---A-------T------T-TAGTAC--T-------AT--T-------------TC-CGGT-T-TAA-AGA---T-AA--ATTTC---AAGAAATCGATTATT-CTCCGCGT-AGGCT--C-T-TTAAAG-A--AA-T----CTACT--GAAATATT-TTGT--AA---A-G--A-C-A-AA--A-A--A---ATTGTT--TGG-AC------GA--AAAA---GC-AT-CAACACTGGGAA--ATGTTTaaa
gi|13 : ctcaattcAAGTTGTGTAAGTA-------------AT-AACGGACACA----TGTCCG-AG-T-TCT-T----C--A--ACATCAAAA-GA-GGA-GTACGACAAGGATGTC--CTCT-TTCACCA----TGT-T-TA--TT---TAT----ACT--AAT-TATA-GAAAT-----TTT--------A-------T---A--C--AA-ATCCG--TG--AAAGCA------G-----A-----TA-CT---G---C-T----A-------TA--A---AAG-CCGT--A-A--A----CA------T---------AT--ATG-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AC-A--TA--C--AGCA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CGTTTATG---ATGGATTGGTCTTATA---AA---------A-----CT-T---TCACA-TC-TTT--T-A-TA--A-AA--AA--GC--TTA---ATGAT---T------T-TAGTAC--A-------AT--A-------------TC-TGGTTT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAAAAATCTGTTTTC-TTAAGATC-GGGAT--C-A-ATAAAA-C--AT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A-----------A--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-AT-CTACACTGGAAAT--TGTTTtcgcg
gi|14 : ttTGTGTTTTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----T--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCC--CTCT-CTCTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------A-------T---AATT--AG---CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GTATC-A-A--A----TT------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AAGCC--TG---TTT-GCTGATGACGC---AA-CATTTGTT---ACTGATGGGTC----AG--AA---A-A-A-A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TA--TAG---ACGAA---T------T-TAGTAA--A-------AT--A-------------TC-CGGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AATAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---TTTACA--TGG-ACATCT--AATCAA-----GC-AG-CCACTTTAGGAATTAtttcaa
gi|15 : cAAAGTAGTGTTATAA-------------AT-AATGGTCATG----CAACTA-AT-TGTTT-T----C--C---TATACAAA-GA-GGT-GTTCGACAAAGCTATT--CACT-ATCGCCT----TAT-C-TC--TT---TAT----TAT--ATG-CATT-GAGTT-----GTT--------G-------T------T--G----TTG--TT--CG---A------A-----AGTG--TA-A--------A-T----A-------AC--A---AAA-ATATT-A-A--TGTCATA------C---------AC--ATG-GCAGGTTTA----GA------TA-T-A---A---A-AA-AAACA--C--TTTT-TTT-GCAGATGATGC---GA-CATTCGTC---ACCGATGGATC----A---AA---A-C-A-A-----TTAT---TTGAA-AA-CTT--A-A-TT--A-AT--AC--AC--T------TGATTCAT------T-TAGTTA--T-------GT--A-------------TCTTGGT-T-AAA-ACT---C-AA--TCCC----TCGAAATGTAACATA-TTAAAAGC-CGGTT--T-A-TTGAAA-AT-AC-A----CGTAT--ACAA-----TAAT--CC---G-A--A-G-A-AATGA-A--A---TTC-TGT-TGG-TCATCA--GAT-AAG----GC-AA-AGGCATTGGGAAtcttcac
gi|16 : aAAATTTGTGTAGTTA-------------AT-AACGTATACA----TGTCAG-ATAT-TTT-T----C--A--AAATAGAAA-AT-GGA-GTAAGACAAGGATGCC--CATT-ATCGCCT----TAT-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-TATC-GAGTT-----ATT--------A-------T---A--T--AA-ATC----------------------------------------G---G-T----A-------CA--A---AAG-GTAT--T-A--C----AT------T---------TT--ACA-ATAG----A----TT------AA-T-T---A---A-AA-AA-CA--C--AGCA-TTC-GCAGATGATGC---AA-CATTTATG---ATGGATGGACA----A---AA---A-A-C-A-----TG-T---TT--A-AC-CTT--A-A-TA--A-AG--AA--AA--TCG---ATAAT---T------T-T-GTAA--A-------AT--A-------------TT-TGGGCT-TAA-GCT---T-AA--TTCT----AAAAAATCTATAATT-TTACGATC-GGGTT--C-A-TTAAAA-A--ACTT----CAAAT--GAAATTCT-AAGT--AA---A-G--ATT-A-AA--A-A--A---TT-ATA--TGG-ACAACT--GA--GAGT---GC-AG-CTACTCTTGGAGTTGTCTTTGC
gi|17 : tTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-T-TTT-T----A--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTACGTCAAGGATGCCCTCTCT-TTCTCCA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-GATA-GAAAT-----TTT--------AT------T---A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---AC-----A-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-ATATAAA-A--C----T-------T---------A---ATG-AAAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AG--C----CTGTTT-GCTGATGACAC---AA-CATTTGTT---ACTGATGGGTCGGA-A---AA---A-----A-----CT-T---TCAAT-ACTCTT--A-T-TA--A-A---AC--TA--TAG---ACGAA---T------T-TAGTAA--A-------TT--A-------------TC-CGGCCT-TAA-ATT---G-AA--CCTA----AACAAATCCACAGTA-TTAAGAGC-AGGAT--C-C-CTAAAA-A--AT-A----CAGAC--AAA--ATT-TATT--GCA--A-A--A-TGA-AA--A-A--A---T--ACA--TGG-ACATCT--AA---------GC-AG-CCACTTTAGGAATCAaaatt
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gi|2 : ttttA-GA-GGA-GTTTGCTAAGAATGTC--ATTT-ATCACCA----AAT-T-TG--TT---TAT----CGT--ATG-TAAT-GAATT-----TCT--------G-------TCA-G--TTGAA-AT--A--CT--CA---ATTATACAT----G-----TA-AA---A---A-T----A-------TA--A---AAG-AAAT--G-A--------A------T---------CC--AC--ATGG----A----AA------AA-A-A---A---ATAA-A--TA--C--GCTT-TTT-GCTGACGACGC---TA-CTTTTATA---ACCGATGG-TT----A---GA---A-A-C-ATAC--CT-T---TGGAA-AC--TT--A-T-TT--A-AT--AT--TT--TAA---ATAAT---T------T-AAGCTA--C-------AT--A-------------TC-TGGTTT-AAA-ATT---A-AA--CATA----AATAAATGCACTGTT-CTACTTGA-TGGCTCCC-T-TTAAGA-T--A-------CAAAT--G-----TC-CACT--ACCTGA-AACA-T-A-AA--A-A--AAATTTCAT---TGG-GATTCT--GAGCAA-----GC-AG-AAACGCTAGGAATtttcataaa
gi|20 : tgttttaaataatttcagttacatatcaggtttattttttttcctattcgcTACTTA-------------AC-AACGGACATA----TGACT---A-T-TTT-T----C--C--CTATTCACC-GA-TGT-GTTAGACAAGGCTGCC--TTCT-GTCCCTA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAC--TTG-TATT-GAACTGCTTTCTT--------A-------TG--A--G--AA-ATCAA--T--------A------A-----A-----TC-CT---A---A-T----A-------TA--A---AAG-GGAT--A-A--C----CA------T---------AG--CTG-GGAA----A----GA------AA-TAA---A---A-AA-A--TA--C--TCTT-TTT-ACTGATGACGT---CA-CTTTTCTA---ACTGATGGTTCTAA-G---AA---A-T-C-G--------T---TCGAA-AC-CCT--T-A-TA--T-AT--AC--TT--TGG---ATGAG---T------A-TAGCAA--C-------GT--T-------------TC-TGGTTTGTAA--------------------------------TGTT-TTAAGGGC-AGAAT--C-A-TTGAAA-AATAC-C----CAAGT--AAAATATA-TGG---A----A-A--A-T-A-AA--A-A--A---TTTAatacttctacactg
gi|21 : atataagtagttcatA----TGTCAG-AA-T-TCT-T----A--A--ACATAGGGA-GA-GG---------AAAAATGCC--CG-T-TTCACCT----TAC-T-TG--TT---TGT----ATT--AAC-AATT-GAAAT-----ACT--------G-------A---A--C--AT-ATCCA--TT--CA---A------A-----A-----AG-AT---A---A-T----A-------CA--ATTAAAG-GTATTAA-A--A----TG------C---------AT--A---ATAG----G----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--CA--C--AGCT-TTT-GCTGATGATAC---C--CATTTATG---TTAAATAGTTC----A---AATAAA-A-C-A-----CT-T---TCTAG-TC---T--A-A-TA--A-AC--AA--AA--TAGGGTAC--T---T------T-TAACCA--A-------AT--A-------------TA-AGGCCT-TAA-TCTATAT-AA--A-------AATAAATCTATAATT-CTTCGTGT-AGGGT--C-A-TTAAAA-T--AT-T----CAAAT--GAAATATA-TAGT--TG---T-G--A-T-A-GC--A-A--A---TTCATT--TGG-ACATCT--GA--AAAA---GC-CA-CAACACTTGGAATTGTTTTTGCacaatcaaaagcacttggaatagttttct
gi|22 : tAAAGCAGTGTTATAA-------------AT-AACGATTACG----TAACTG-A-----TT-T----C--ATTACATACAAA-GA-AGT-GTTCGACAAGGCTTTC--CACA-TTCGCCT----AAT-C-TA--TT---TAT----TAT--ATG-CATG-TAGTT-----GTC--------A-------T---A--TG-AA-ATTTC--TA--AA---A------A-----A-----CA-A----A---A-T----A-------TT--G---AAC-GCAT--A-A-------------------------AT--ACG-GAAGGTTTA----GA------CA-T-G---A---A-AT-A--TA--C--ATAT-TT---CAGATTATGT---TT-CTTTTGTC---ACCGATGAATC----A---AA---A-C-G-AT----CG-T---TTGAA-AA-TCT--A-A-TT--A-AA--AC--TC--TTG---ATTCT---T------T-TAGCTT--T-------GT--A-------------TC-TGGGTT-GAA-ACT---T-AA--TCCaaat
gi|23 : CAATGTTATGCAGTTA-------------AT-AACGGACACA----TATCCG-AA-T-TCT-T----C--A--ACATAAAAA-----------CGACAAGGTTGTC--CACT-GCCGCCA----TAC-T-TA--TT---TAT----ACTTAAAA-TAT---AAAT-----TTT--------A-------G---A-----AA-TTCTG--AG--AAGGCA------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGG-GCAT--A-A--C----TA------T---------AC--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-G---A---C-AA-A--TA--C--AGTA-TTT-GAAGATGATGC---AA-CTTTTGTG---A-TAATCGGAC----A---A-------------------T---TTAAA-AT-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAG-AA--A-------AT--AG------------TT-CGGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AACACATCTGTTATA-TTAAGATC-GGGAA--C-A-CTAAAG-A--CT-T----CTACT--GAAACATT-T-------------------------------------ATA--TGG-ACACCT--AA--AGTT---TC-AT-CTACAATGGGAATcttgaaatgtaatatagtaaaagcagattaattgaaacatacacacataaggtagaaaaaaatgtttgctggtcatcaaacaaggcaaag
gi|24 : gctGTGTAAT-A-------------GTCAATGGACACT----TGTCAG-AG-T-GGT-T----C--T--ACTTACAGA-GA-GGCTGTA-GACAAGGAGACC--CATT-ATCCCCA----TATATATA--TT---CAT----TAT--ATG-TGCA-GAGAT-----CCTCG------C-------T---G--T------TCTA--AT--CAG--A------A-----A-----TA-ACCCTA---A-T----A-------TA--A---AAG-GAAT--A---------CA------G---------ATTGACA-ATAA----A----AACTGTTTAATT-T---C---A-CA-A--TA------------T-GCCGATGATAC---AA-CACTCATG---CTTGATGGTTCAGA-A---AA---A-T-C-A-----CT-T---GTAAACACACTT------CA--A-AC---A--CT--CAA---AT--T---C------TATACTGA--A-------AG--C-------------TC-CGGCCT-TAA-TAT---C-AA--TGTT----GATAAAACTAtgttg
gi|25 : ACAAGGATGCC--CACT-TTCTCCA----TAT-T-TG--TT---TAT----ACT--AGC-AATA-GAAAT-----TCT--------A-------T---A--T--AA-AGCTG--T--------A------A-----A-----TA-AC---G---A-TAACAA-------TATTG---AAG-GTGT--A---------CA------A---------AT--ACGCATAA----A----CA------TT-T-T---C---A-AATA--CA--C--AGCT-TTT-GCAGACGATGC---CA-CATTTTTG---TTAAATGGAAT----T---AA---A-T-CTT-----CT-T---TTGAA-AC-TCT--A-A-TATTA-TT--AATTGA--TAG---A-------T------T-TAGCTC--A-------AT--T-------------TC-TGGT-T-TAA-AGT---TAAA--TTCTA---AAAAAATCT---ATT-CTCCGTGT-AGGCT--C-T-TTAAAA-A--CA-T----CTATT--GACATATT-TTGTA-AA---A-A--A-T-A-AA--A-T--A---TTTGTT--TGG-ATTAAT--GA--AAAA---GC-AT-CAACACTAGGAAT--CGTTTaggcagtgtagataggttcaaggaaaatagtaatattaagttatgtgaagaatattatct
gi|26 : AA-GATGGG-GTACGGCAAG-ATTTC--CGCT-GTAGCCAAACGTGT-T-TAAATT---TAT----TAT--AGA-AATGTGTAGT-----TTG--------A-------G---A------A-AGC-------------A------G-----A-----TA-AC---G---A-T----A-------TA--A---AGA-GCAT--A-A--A----TA------T---------AC--ATA-TTAG----A----GA------AA-T-A---T---A-AA-A--TA--C--AGCA-TTT-TCAGATGCTGC---AA-CTTTTATG---ATTAATGGGTC----ATTTAA---A-C-C-G-----TT-T---AC--A-AC-TTG--A-A-TA--A-A---AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAATAA--A-------AT--A-------------TC-TGGTTT-AAA-ATT---A-AA--CAAT----AAAAAA-CTGTTATA-TTAAGATCGAGAAA--C----TAAAA-T--A--T----CTACT--GAAACATT-TGGT--AC------------------A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCC--GA--AAGT---TT-AT-TTACATAGGGAATtcact
gi|27 : TG-AAAAC-----TGT--------A-------T---A--TG-AA-ATCCAAATT--GC---A------G-----A-----TA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GCAT--A-A--A----CA------T---------AT--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA--C--GGTA-TTT-GCAGATGATGC---AA-CGTTTATG---ATGGATGGGTC----ATATAA---A-----A-----CT-T---TTACA-TC-TTT--A-A-TA--A-AA--AG--GC--TAA---ATTAT---T------T-TAGTAA--A-------AT--A-------------TC-TGGTCT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAATAATCTGTTATC-TTAAGATC-AGGAT--C-A-TTAAAA-A--CT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCA--GA--ATGC---TC-GT-CTACGCTGGAAAT--TGTTTtgttgt
gi|28 : atagtTGTTTTTA-------------AT-AATGGTTACA----TGTCTG-AT-G-TTT-T----T--A--AAATAGGAC-GT-GGT-GTATGTCAAGGATGCA--CTCT-CTCTCAA----TAT-T-TA--TT---TAT----TAT--ATC-AATA-GAAAT-----TTT--------A-------TC--A--T--TA-G-CTG--TTAGTA---GC-----A-----A-----TA-CA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GAAT--A-A--A-----A------T---------TTA-ATG-AGAA----A----GA------AA-T-T---A---A-AA-A--AA--A--GCCTGTCT-GCTGATGACGC---AA-CAGTTGTT---ACTGATGGGTCGG--A---AA---A-A-A-A-----CG-T---TCAAT-ACTCTT--ATT-TA--A-AC--TA--A----AG---ACAAA---T------T-TAGTAA--A-------AT--A-------------TC-CGGCCT-TAA-A-T---T-AA--ACCT----AAAAAtttcaa
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gi|30 : atgcaAT----TTT--ACA-TATT-----T-----TTT--------AATCGTGAC---A--T--AA-GTCGG--TT--CC---A------A-----A-----TG-ATACTG---A-T----A-------TT--A---AAG-GTAT--A-A--C----TA------TTCATAATTCAT--GCT-ATAG----A----GG-----------T---A---A-AA-A--GA--A--AGAT-TTT-TCAAATAATGC---AA-CATTAATG---ATAGGTGGATC----G---AA---A--------------------GGA-AC---T--C-A-TA--A-AG--AA--AA--TTG---ACAAT---T------T-TAGTAC--A-------AT--A-------------TC-TGGTCT-TAA-AAG---T-AA--CTCT----AATAAAGTTATTGTT-TTACG-AC-GTATT--T-T-CTGAAATA--AC-T----CCATT--TAAACGTG-TAGT--AA---A-G--A-T-A-Atcactaac
gi|31 : gtttctttaatac-GTGT--A-A--CAG--TA------T---------GT--A-G-A-AG----C----AT------AA-T-C---A---A-AT-A--CA--A--TGTT-TTT-GCAAACGATTT---CA-CTTTCTTG---TCAAATGG-----------AA---A-T-T-AAT---CT-TCATTTGAA-TC-TTT--A-A-TG--ACAT--TT--TT--TTG---ACAGT---T------T-TAGCTT--C-------AT--T-------------TT-CGGT-T-AAA-AGT---T-AAA-TTCC----AAGAAAACGTTTATT-CGCCATGT-AGGCT--C-T-TTAAAG-A--AA-T----CCATT--GAAATATT-TAAG--AT---G-A--A-C-A-AA--A-T--A---TTTAtaga
gi|32 : A------AA-T-A---A---A-AA-G--TA--G--TAGT-TAT-GCTGATGATGC---AACCATCTTTT---AC-GATGGTTA----A---AC---A-T-C-A--------T---TTGAA-ACGCTT----A-TC--A-AT--GT--TC--TAG---ATAGT---T------A-CGGTAA--T-------AT--C-------------TC-CGG-AT-TAA-AAT---CAAA--TACTTCAAAAAAAATGTACTATA-TTAAAAGC-TGGTT--C-G-TTGTAC-G--AC-T----CTAAT--ATTA-ATTCTAAT--TA---A-A--A-C-A-AA--A-T--A---TAAATC--TGG-AATTCT--GA--AAgaataatgaaaaaaaacatcaacatttggaattgttttcacgat
gi|33 : tG-GTAT----A----GA------AG-T-A---A---G-AA-A--TA--C---GCTGTTT-GCATATGATGC---AA-CTTTTGTC---ACGGATGGATCAAG-A---AA---A-T---A------T-T---TTGAA-AC-GTT--A-A-TA--G-AT-------------------AT---T------T-TAG-------------AT--A-------------------TTT-TAA-ACA---T-AA--GGC---------AAT-----GTG-TTAAGAGC-GGGTT--C-T-CTTAAA-C--AT-A----CAAATACAAAGCATT-TA----AC---A-C--A-T-A-AA--ATA--A---TTTA-G--TGG-A-ACTT--GG--AAaaacacgaaaactcttgaaatattgtttagcgc
gi|34 : GAT-ATGC---AA-CATTTATG---ATCGTTGAATC----A---AA---A-T-CGA-----TT-T---TTACA-AC-CTT--A-A-TA--A-AG--AA--AA--TTT---GCAAT---T------T-TAGTAA--A-------GT--A-------------TC-TGGTCT-TGA-ACT---T-AA--CTGC----AATACAGCTATAGTT-TTACGCCC-AGGTT--T-TATAAAAA-A--AC-T----TAAAT--GAAACGTT-TAGT--GT---C-T--A-T-A-AC--A-A--A---TT-ATA--aaggtcaagacactcgga
gi|37 : agtatatacacTT--A-A-TA--A-GA--AA--TA--TTG---AACAT---T------T-TGGCAT--A-------TT--A-------------TC-TGGTCT-AAA-ACT---A-AA--CAAG----AAAAAAACTACTATA-TTGCGTTG-TGGAT--CAC-TTAAAA-AT-AC------CGATT------TCTC-TTGTA-AT---A-A--A-G-A-AA--AGA--A---TTT-TAACTGG-ACTTCT--GA--TAAA---GC-TT-CTACGTTAGGGAT
gi|38 : atcaT--A-A-TA--A-AG--AA--AT--TTG---ACAAA---T------C-CAGTAA--A-------CT--A-------------TC-AGGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGTTC-AGGTG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTTATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTATCATGGGAATCATATTggtttttacaaata
gi|39 : --A-A-TA--A-AG--AA--AA--TTG---AAAAA---A------T-CAGTAA--A-------CT--A-------------TC-AGGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGTTC-AGGTG--T-T-TTAAAA-A--AC-T----CAATT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTACCCTGGGAATCACATTTaacaaa
gi|4 : CAAAGTTGTGTAGTTA-------------AT-AACTGACACA----TGTCCG-AG-T-TCT-TTCTTC--A--ACATCAAAA-GT-GGA-GTACGACATGGATGTC--CACT-TTCACCA----TAT-T-TA--TT---TAT----AGT--AAT-TATA-GAACT-----TTT--------A-------T---T--C--AA-GTCCG--T----A---A------A-----AGCAGATA-AA---G---A-T----A-------TA--A---AAG-GCAT--ATA--CA---TAAAAAATT---------AT--ATA-ATAG----A----GA------AA-T-A---A---A-AA-A--TA--C--AGCA-TTT-GCATATGATGC---AA-CCTTTATG---ATGGATAGGTC----GTATAA---A-----A-----CT-T---TTACA-TC-TTT--A-A-CA--A-A---AG--GC--TAA---ATGAT---T------T-TAGTAA--A-------AT--A-------------TC-TGGTCT-AAA-ATT---A-AA--CGAT----AAAAAATCTCTTATC-TAAAGATC-AGGAT--C-A-TTAAAA-A--AT-T----CTATT--GAAACATT-TGGT--AC---A-A--A-T-A-AT--A-A--A---TTCATA--TGG-CAATCA--GA--A--T---GCTAGTCTACACTGGGAAT--TGTTT
gi|40 : t-TA--A-AG--AA--AA--TTG---ACAAA---T------T-CAGGAA--A-------CT--A-------------TT-AAGTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGTTC-AGGTG--C-T-TTAAAA-A--AC-T----CAAAT--GAAACTTT-TAAT--AC---C-A--A-A-A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ACATCT--GA--CAGT---GC-AG-CTACCCTGGGAATCACATTt
gi|41 : GTCT-TAA-ACT---T-AA--TTCT----AGTAAATCAATAATT-TTACGCTC-AGGGG--C-T-CTAAAA----AC-T----CAAAT--GAAAC-TG-TAATTGCC---A-A--A---A-CA--A-A--A---TTCATA--TGG-ATATCC--GA--CAGT---GC-AG-CTACTCTGCGAATCACATTTAC
gi|43 : attataaagattgtaaaagcacac----AAAAAATCTATTATT-CTCCGTGT-AGGCT--C-A-TTAAAG-A--AA-T----CCATT--GACATATT-TTGT--AA---A-G--A-T-A-AA--A-AC-A---TT-ATT--TGG-ACaa
gi|45 : GCAA--A-------AT--A-------------TC-TGGTTT-TAG-ATT---A-AA--CTCG----AACACATCCA-CATTATTAAGAAT-AGGTT--C-A-TGAAAA-T--CC-TGGAAAAAAG--GAAA-A---TAAT--GC---A-A--A-T-A-GA--tgattgcttggactaatgaaaaatcattaacactgtgaattgtttttgcgaacg
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