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Reference ( gi|1 ) : ACGTCACATCGAGACAACCCAACAATCACATCCTATGACAACCCCCATTTGATAAATATTAATTCTGCTAAGTTGATT--AATTCTGAGCAATTCCAAATTCCAGCGATATCACCTTCATTTGTTGAAAATCAACTACAGCTTCTCGA-CATAGCA-AAATCTACAGGATCAGATGGCCTGAGTGCCAAGTTTCTTAAAAG---GTTAGCCACGGTTATAGCTCCAATACTAACAAAAATATTTGATAGTAGTTT-AGACACCAATACATTTCCTTAATTATTTAAACAAGCAAAAATTGTCCCAATTCACAAAAA-GGGACCGAAAAAT-GATA-AATCAAATTATAGACCAATATCAATTCTTCCGATTATATCATTAATTCTAGAACGTC-ACGTTTGTATGCATCTTAGAAAATACATGGAGGAAAATAAACTGT-TCTATTTTTGTTAATCTGGTTTTAG-AGCACGAC-AT-TCTTGTCAAACGGCTCCCACAAAAATATTGGATGAC-TGCCTTACAGCTATAGATAAAAATGAAATAGTTGGTAC-ATTATAT-CTTGATTTGTCCAAGG----CTTTCGACTTAGTTGACCATGACGTACTTGTTCTAAAAT-TGAAAATATA-CAA-GTTAAGCA----G-AAATACGATAAAATGGGTTTCC--T-CATATTT-AG---AAA-ATAGAACTCATTATACTCAAGTTTCTGG---TATAACTTCAAGGTTCTGCAAAGTAAAAGCTGGTGTACCTCAG-GGCTCCGTCTTAG---------GCCAAC---TTTTATTT-TTAAT--ATTCATAAATG-------ATTTGC-CAT-TATCTGTTCA---AA-ATACTGTTGTTGATATGTTTGCAGACGATACTACCCTCTCAGTTTCAAATAATTCTC--TTCC----AAATGTTATTAAATGCTTAACAGTGGATCTCAATTATGT-----TGATGCATGGTGTGTAGCTA-ATCGCACGTCTATCCTAGCAGCGAAATCTAAAATAAAGTAT--AT-TTCTTC-CAA----AAGC--AAAGTTAACCGC---ATATGTAATGACTCTCACCTAATTCATTACAAAGATGAAGTTA
gi|4 : ATGTCACATCGAGACAAC-----AGTCACATCCTATGACAATCCCCATTTGATAAATATTAATTATGATAAGATAATT--AATTCTCAGCAATTCCAAATTCCAGCGATTTCACATTCATTTGTTGAAAATAAATTACAACTTCTCGA-CATACCA-AAATCTACAGGATCATACGGCCTGAGTGCCAAGTTTCTTAAAAT---GTCAGCCTCGGTTATAGCTCCAATACTAACAAAGATATTCAATATTAGTTT-AGACAC
gi|5 : tctgcaagtgatcattatcatatttgcattaccctcaaggtagttaattatcttgaaggtccagtgcataaaacaaaaattacaggtctatgaaatcattcaaagaagcacagtttattaatgatctctcagaacaacatggtcaatacttgaattatatgacaaaccaaatgagtcttttgacttattcaatgaaatgtttcaaaccgtattagatagacatgcccccaaaagaaagaaacgattaaaaaatataaatcaaccgaattggataaatattgaaattctggatgcaattaaacaacgaaattgttttcttaagaaaaaagatactgatagttacacatattggcgtcagaaggttaaaactcttatacttcaagctaaacacaagcattacaatgaaactattaattcgaacaaacgtaatccaaaacagttgtggaacagccttcatgatttatctggcttaaaattacaaaatcaaactcactattttgatgatgatgacggaaatgctataactcgtccggctcaaacagcaaatattttttacaattatttttcaacggtttatgaaACGTTAAAGCAAGAAAATCCGCTAATTACATCTTATGACAATTCTCATCTGATAAATATTAATTCTGAGAAGT--ATTTGAATACC-ATCAATCCCAACTTCCGGCGATATCACTTCAATTCTTTGAAAATAAACTAAACCTTCTCGA-C-TATCA-AAATCTACAGGGTCGGGCGGCCGTTGTGCAAAGTGTCTTAAATT---ATCAGTTTCTGTTATAGCTTC--------------------GTAGCCGTTTCAGG-ACC-ATACATTTCCTAAATTATTCAAAAGTGCAAAACATGTCTCAATACACAAAAA-GAGATC--ACAATCGACC-AATCAATATATAGGCCTATATTAATTCTTCCCAGTGCATCTTTATTTCTGGAATGTC-ACGTTAGCATACATCTTAGAAAATG------------------GC-TCGA-ATTCATAAATCTGGTTACCG-GGCAAATC-GT-TCTTGTCAAACGGCTTTCACAAAAA---TGACTGAT-TGGTTTACAGTCATAGGTAACAATGAAATCGTTGGTAC-ATTATGT-aa
gi|2 : ggataaattcagagattctggatgccataacaaatagttctcataagaaaacgatacagaaagttacatatttcggcgacagctggttaaattttgtatacttaaaaaaaaaataaaaaaaataaatatatcaaattctaacaaacgtaatccgaaacagttgcctacatgatttatctggattcaatcgcaaatccaaactcactatttggtgatgatgatggaaaacctacagcttgtccaactgaaacaaaaatgtttttaacaaatatttttgaacgattgatgaaTTGAAAATCAACTACAACTTCTCCA-CATAGCA-AAATCTACAGGAGCAGACGGCCTGAGTGCCAAGTTTCTGAAAAT---GTCAGCT-CTGTTATTGCTCCAATTTTAACAAAGATATTTAATAGTAGTTT-AGACACCAGTACATTTCTTAAATTATTTAAAAGAGCAAAAATTGCCCCAATTCACAAAA--GGGACCGAAAAAC-GATA-AATCAAATCATAGACCTATATCAAATCTTCCCTTTATATCATTAATTCTGGAACGTC-ACGTTAGTATACATCTTAGAAA-TACATGGAAGAAAATAAACTGT-TTTACTTCTGTAAATCTGGTTTTAA-AGCAAACC-AT-TCTTATCAAACGGGTCTCACAAAAATATTG----AC-TGGCTTACAGCTATAGATAAAAATGAAACTGTTGGTAC-ATTATAG-CTTGATTTGTCCAAAG----TATTTGACTTAGTTGACCATGACATATTTGTTCAAACAT-TGAAAATGTA-CAA-GTTAACCA----G-AAATACGATAAAATGGTTTTCC--T-CATATTT-AG---AAA-TT---ATTCATTATACTCAATTTTCTGG---TATAACTTCAGAGTTACGCGTAGTAAAAGCTGGTGTACTTCAG-GGCTGCGTCTTAA---------GCCCCC---ATTTAGTT-TTAGT--ATTCATAAATG-------ACTTGC-CAT-TATCTGTGCA---AA-ATAC---TGTCGATATTTTTCCAGACGGTACTACCCTCTTAGTTTCAAATATTTCTC--TCCC----AAATGTTGTTAAATGCTTAACAGCGGCTCTAAATAATGT-----TGATGCATGGTGTGTAGCTA-ATCGCATGTCTATCAATGCAGCTAAAGCTAAAATAATGTAT--AT-TTCTTC-CAAAAGCAAGC--AAAATTAACCGC---ATATGTTATGACTTTCACCTAATTCATTACAAAGATGATGCTA
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gi|10 : ctataagtgaccatttcccaatatgcatgacacggaaattaatacagaaaccagaaaaaggcaataaacctaatatcattaactacagatgcatgaaacattttaatgaagaagcatttcttcaagagcttcaaaatcaaccatggtctgttatagatatttttgatgacccagatgatgcacttcaatattttttagatatatttattagcattttaaataatcatgcccctaaaaagaaaaagtgtgtcaagcatcccaaacagccagcctggtttaatattgatatatctgaatccatgaaacttagagactatttcaaaaaaacagtagacacagaaaattacaaactcagtagaaatttaattaagactatgatccatgaagcaaaaaaatcctacttttcaaaaacaataaatgaaaataaaaaaaatcccaaacagttatggaagaacctaaaaaatgtctcgagccaaatgactaatcatcaaactcatttaataaatgatgaggaaggaaacccaattttagatccagaaattactgctaatacattttatgactattttgccaaactaccaaccttgtataaatgcttgaattcacaacaaaatcaagaaaatactgcactaaaagactatgttagtgctaatattggaaataacgaaaagtttagttttattacaattacagaagactatgtatatGTTACAGCTCCAATACTTTCAAAGATATTTAATGGCAATTT-AGACAACAAGATATTTCCTAAATTATTTAAAAATACAAATATAGCCCCAGGTCACAAAAAAGGGAATAAAAAAT-GATA-AATCAAATTATAGGCCTACATCAATTCTTTCCATTGTCTCATTAATTCTGGAACGTC-ACGTTAGTATGCATCTTAGAAAATACATAGAAGCAAATAAAGTGTATTTATTTTCGTCAATCTGGTTTCAG-GAGAAACC-AT-TCTTGTCAGACGGTTCTCGAAAATATATTGGATGGCTTG--TTACAGCTACAGATAACGATGGAATTGTTTGAAC-ATTTTAT-CTTAATTTGTCaa
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gi|7 : tGT-TATACTCTAGACAGTCCGGATTTAG-AACA-AAC-ATATCTTGTCAGACAGCTCTGACAAAAATGCTAGATAAT-TGGATATCAGCTATTGATAACAATGACATTGTTGGTAC-A-GATTTCCTTGATTTTTCAAAGG----CCTCGGATTTGGTAAATCATTCTAT-TTTGCTTTAAAAG-TCAAAAT
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gi|24 : ---TTTAATTT-CTGAT--ATC---AAA-G-------ATTTATACATGTATATA---A---AA-GTCCT--TGCTGATA------CAAACGATACTAACCTCTCGGTTTCAAATATTTCTC--TTCT----TAACGTTGTCAAATGCTTGAAAGTGGATTTTGAT
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gi|31 : AAGTAATGTAC--ATATTTTTC-CAA----AAGC--AAAGTTAACCGC------------------------GTTCATTACAAAGATGAAGTTA
gi|29 : --AT-TTCTTC-CAA----AAGC--AAAGTTAACCGC---AAATGTAATGACTCTCAACTAATTCATTACAAAGATGCAGTtt
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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