lowQualScore : 11 2 33333 11 4444444444444444444444444 1 11 22222222222222 2 1 22222222222222222222 44444444444 1111 33333333333333333333333333333333333 11 444444444444 111111111111 1111111 1 1 555555555555555555555555555555 1 111 111
lowQualScore : 33 0 66666 5 5555 33 55 22 2 333 2 333 4 22 999 1 1 55555 0 3333 1 3333333333333333333333333 3 1 5 1 333 0 66 3333 55555555555555 1 22 55555 4 3 3 4 6 1 88888888888888888888 4 3333 1 5 1 99999999999 3 6666 22 88888888888888888888888888888888888 44444 22 00 1 3 22 55555 55555 5 2 333 333 6 9999999 111111111111 222222222222 22 666666 2 2 5 4444 6 0 6 2 2 22 44 2 555555 555555 7 22 9 1 22 333 2 4 55555 66 0000000 6666 0 0 0 4 2 2 2 333 33 666666666666666666666666666666 2 55555 666 5 2 4444 44 2 2 22 22 44444 1 777 1 1 3 6666 555 2
lowQualScore : .. . ..... . .... .. .. .. . ... . ... . .. ... . . ..... . .... . ......................... . . . . ... . .. .... .............. . .. ..... . . . . . . .................... . .... . . . ........... . .... .. ................................... ..... .. .. . . .. ..... ..... . . ... ... . ....... ............ ............ .. ...... . . . .... . . . . . .. .. . ...... ...... . .. . . .. ... . . ..... .. ....... .... . . . . . . . ... .. .............................. . ..... ... . . .... .. . . .. .. ..... . ... . . . .... ... .
lowQualScore : 66 0 22222 7 3333 44 33 77 1 777 1 555 7 66 777 8 7 88888 2 7777 7 1111111111111111111111111 5 7 8 7 000 5 33 7777 88888888888888 6 22 44444 6 1 1 5 8 5 11111111111111111111 9 5555 7 1 7 00000000000 2 1111 44 77777777777777777777777777777777777 33333 66 11 8 6 55 00000 00000 6 0 555 777 9 2222222 333333333333 666666666666 99 111111 1 1 7 2222 5 8 5 0 5 22 88 0 888888 555555 7 66 3 9 66 333 0 8 66666 66 3333333 9999 6 3 2 2 1 2 2 999 11 666666666666666666666666666666 2 66666 111 7 2 2222 88 0 4 66 55 55555 8 000 8 0 7 4444 666 2
consensus : GGGT-ATTTTATTTC--NT-TATATA-TATAT----A--TTTAATGT--TT-AATA-A---TAT-TTAAATGG---AAACA--CA--ATTATAT-TT-AA--A--ATTT----AA-AAA--------A-A-CAA-C-A-T--TGA-A-TCA-CAT---TGGAAA-TGGC----ATTAA--T--------AA-ACAT--CAACATAC-----TCGA-G-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--G-GAAA-AAA-AC--TCTC----AA-GCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAA---GGTTG--GTATGG-----A---G--TACAT-CA--CATA---CG-ATATGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAG-CAAC-TATGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-A---AAGTAC---TTCTGAT------ACTTTGATTATTTTG-----------TTTTN-----------TG--GT------TC-AGAAA-TTCCCATA----TAAAGATAACTTTGCAAG-ATTAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TATA------TGTATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAAC-----AT-CGAG-------AC----ATTCAAAATGTTAAC-TT-TTTT-GCACCTAGTGACCTTTGACCCCAA-T---TTT--TGCGTTTATAA-T-A---CA--AT--T--T---T-T-----CTT---GGCAACCGAT-G----AAAT-AT-GGTCAAGTATAGTCTAAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGC---GAT--GA-TTTTTGGA
Reference ( gi|4 ) : GGGA-ATTTGATTTC--TT-TATATA-TATAT----A--TTTAATGT--TA-AATA-A---TAT-TTAAATGG---AAATA--CA--GTTATAT-TT-AA--A--ATTT----AA-AAA------T-A-A-CAA-C-G-T--T-A-A-TTA-CAT---TAGAAC-TGGC----ATAAA--T--------AA-ACAT--CAACATAC-----TC-A-G-CCATTTATCAGTATTATTTCTAGTGAACAT-TTTAA--A--G-AAAA-AAACAC--TTTC----AA-GCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAT---GGTTG--GTATAG-----A---G--AATAT-TA--CAAA---CA-GTATGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAG-AAAC-TGTGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTTG-A---AAGTAC---TTTCGAT------GCTTTGATTATTTTG------A----TTTTT-----------TG--GT------TC-AGAAA-TCCCCATA----TAAAGACAACTTTGTAAG-ATTAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TATA------TGCATTCCA--TTGAAATGAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATCAGAAAC-----AC-CGAG-------AC----ATTAAAAATGTTTAC-TT-TTTT-GCACCTAGTGACCTTTGACCCCAA-T---TTT--TGCAATTATTA-A-A---CA--AT--T--TA-AT-T-----CTT---GGCAACTGAT-G----AAAT-GT-GGTCAAGTATAGTCTAAAGACA--CT--TT-----CT-ATA--ACAAC-AGACTTCCGTGAACATTCCGTACCTCATGC---AAT--TA-TTTTTGGA
gi|10 : GGGT-ATTTTATTTCACTT-TATATA-TATAT----A--TTTAATGT--TT-AATA-A---TAT-TTAGATGG---AAACA--CA---TAATAC-TT-AA--T--TTTTTAAAAA-AAA------A-G-A-CAA-G-A-T--TGA-A-TCT-CAT---TGAAAA-TGGC----ATAAAAAT--------AA-ACAT--CAACATAC-----TCGA-G-CCATTTATTGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--A-AACA-AAA-AC--TGTC----AA-GGCAACACTTATTT-GTATTTGTTACATTGCCCGATAA-----AA-----T-----TG-TTAA---GGTTG--GTATGG-----A---G--TACAT-CG--CATA---CA-GCATGAT-----TTGTTTTGTTTAA--ACCTTTCAGAG-AAAC-TGTGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCA-A---AAGTAC---TTCTGAT------ACTTTAATTATTTTG------T----TTGTT-----------TGTAGT------TC-AGAAA-TTCCCATATAGGTAAAGATAACTTTGCAAG-ATACT-GGTATTT--ATAATAATAA-AA------TATA------TGTATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CACATGCAGTC---TCTGGTG-TTTCAGTATGTCAGAAAC-----AC-TGAG-------AC----ATTCAACA--TTCAC-TT-TCT
gi|22 : taGGTA-ATGT-ATTTC--AC-AATATA-TATAT----G--TT-AATGT--TT-AATA-A---TAA-TTAAATGG---AAAGA---A--ACTACAT-TT-AA--A--ATTT----AA-AGA--------A-A--GA-C-A-T--TGA-A-TCA-CAT---TGGAAA-TGAC----ATTAA------------A-ACAT--CAATATAC-----TC-AAG-CTATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--AG-G-AAAA-AAACACAAACTCAAAAAA-GTCAACACTCATTTTGTATATGTTAAATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAA---GTTTG--GCATGA-----A---G--AACATACA--CATATTTTA-ATATGAT-----TATATTCGTTTAA--ACTCTTCATAG-CAAC-TATTTTGTTAAAAA--Tgttacaacagacttccatgaaccgtccatacctcaagcgatgattttttaaaaaaatttttaccagac
gi|26 : atagGGGT-ATTTTATTTCACTT-TATATA-TATAT----A--TTTAATGT--TT-AATA-A---TAT-TTAAATGG---AA-CA--CA--ATTATAT-TT-AA--A--ATT-----AA-AAA--------A-A-CA-----------------A-CAC---T-GAA--TCGC----AT-----T--------GA--------------C-----TCGA-G-CCATTTATCGCTATTGTTTCTAGTGTACAT-TTCAA--C--G-AAAA-CAAAAT--TCTC----AA-GCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAATTTAAAA-----T-----TG-TTAA---GGTTA--GTATGG-----A---G--
gi|24 : taGGGT-ATTTTATTTC------A-ATA-TATAT----A--TCTAATGG--TT-AGTA-A---TAT-TTAAATTG---AAATA--CACAATTATAT-TT-CA--A--ATTT----AA-AAG------A-A-A-TA------T--TGA-A-TCA-CCT---TGGAAA-CGGC----A---A--T--------AA-AAA----AACACAT-----TG-A-G-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TTTGA--G--G-AGCA-AGAC----TTTC----AA-ACCAACACCTGTTTTGTATGTGTTACCTTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----CG-TTAA---GTTTGACATGTAG-----A---G--CATA--AA--CATA---CA-CTATCAT-----TATTTTCGTTTt
gi|35 : aGGGT-ATTTCATTTC------AC-TG-TATAT----A--TTTAATGT--TA-AATA-A---TAT-TTAA-TGG---AATCA--CA--ATTATAT-TT-AA--A--ATTT----AA-AAA------G-A-A-CA------T--TGA-A-TCG-TAT---TGGAAA-TGTC----ATAAA--T--------AA-ACAT--CAACATACA----AA-A-G-CCATTTATCGGTACTA
gi|34 : taGGGT-ATTT--TTTCACTC-TATATA-TATGTGTGTA--TATATTGT--TT-AATT-A---TGT-TTAAATGG---AAACA--CA-----AAAT-TT-AA--A--A----------AAA------C-A-A-CAA-C-A-T--TGA-A-TCA-TAT---TGGAAA-TGGC----ATTAG--A--------AA-ACAT--CAACA--C-----TCGA-G-CTATTTATCAGTATTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--
gi|8 : ataGGATATTTTATTTC------ACAAAATGTAT----T--TTTAATGT--TT-AATA-A---TAT-TAAAATGC---AAACA--TA--ATTTAAT-TT-AA--A--ATTT----AA-AA---------A-A-CAA-T-G------A-A-TCA-TTT---TGGAAA-TGGC----ATTAA--A--------GA-ACAA--CAATACAC-----TC-A-ATCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAG-TTTTA--C--G--AGA-AAATAT--CTCC----AA--CCAACACTCGTTCTGTATGTGTTTCAATGGCAGATAG-TTAAAA-----TA----TGTTTATTAAGGTTG--GCATGG-----A---GTTCATA--CA--CATA---CG-ATACGAT-----TATTTTCATTTAAATACCATTCATAG-CAAC-TGCGTTGTTAAAAA--CTCATA----------------------------TG-A---AAATACACATTTAG-T------ACTTTGATTATTT--------G----TTTTG-----------TG--GT------TC-AGAAG-T-TGCATA----TAAAGATGACTTTGCAAG-ATTAT-TGTATTT--ATTATATGGA-AT------TATA------TAC--CCCA--ATGAAACGAATGC-C--TACATGCGGTA---TATAGTG-TTTAAATATATTGGACAT-----AT-CAAT-------AT----ATCAAAAATGTTAAC--A-TTGC-GCACCTAGTGACC----------A-T---TTT--TGTGCTTATAA-T-G---CA--AC--T--GT-TT-T-----CTT---GGCAAACGAT-G----AAAT-AG-GGTCAAGTATAGTCTAAAGACA--CT--TT-----CT-ATT--TCAAC-ACACTTCCGTcg
gi|6 : ca-ATTTTATTTT--AC-TATATA-T-TAT----A--TTAAATGT--AT-AATA-C---TAT-TTAAATGG---TATCA--AA--ATTATAT-CT-AA--A--ATTT----AA-AA-------------CGATC-A-T--TGA-A-TCA-CAT---TAAAAA-TTGC----ATTAA-----------AA-ACAT--CAACATAC-----TCGA-A-CCATTCATCAGTTTTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--G-TGAT-AAA-AC--TCTC----AA-GCCAACACTCATTTTTGATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAAATGT-C-----TG-TTAA---GATTA--GCATAG-----A---G--TACAT--A--CA-----TA-TTATGATAGTATTATTATCGTTTAA--ACTCTTCATAG-CAA----TAT-GTTAAAAA--TCCGTAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-G---AAGTAT---TTCTGAT------AATTTGATTATTTTG-----------TTTAG-----------TG--GT-----------ACA-TTCCAATA----AAAAGATAACTTTTCAAG-ATTAT-AGTATTT--ATGATAAGCA-AA------TACA------TGTGT---A--TT---------------------CAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATTCGAAAC-----AT-C-AC-------AA----ATTCAAAATG-TTAA-AT-TTTT-GCACCTAGTAACCTTTGAACCCAATT---TTT--TGT--TTATAA-T-A---CA--AC--T--TATTT-T-----CTT---GACAACGGAT-G----ACAT-AT-GGTCAAGTATAGTCTAAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--TCAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTATCTCATGC---GAT--GA-TTTTTTGAactggtgcgataattt
gi|9 : -ATTTCACTTC--ATATATATAATATAT----A--TTTAATGA--TT-AATA-A---TAT-TGAAATGG---AAACA--CA--ATTTTAT-TT-AA--A--ATTT----AAGAAA------T-A-A-CAA-C-A-C--T-G-ACTCA-CAT---TCGAAA-TGAC----ATTAA-----------AA-ACAT--CAGCATAC-----TCGA-G-CCATTGATCGATATTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--G-GAAA-TAACG---TCTC----AA-GCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTA-ATAGCTGGATAA-TT-ATG-----T-----TG-TTAttttccttaac
gi|19 : ctt-ATTTTATTTC--AA-TATGTA-TGTAT----A--TTTAATAT--TA-GATA-A---TAT-TTATATGA---AG-----CA--ATTATAT-TT-AA--A--ATTT----AA-AAAAAACCCC-A-A-CAA-C-A-T--T-G-A-TTGGCAT---TTGAAA-TGTC----ATTAA-----------AA-ACAT--CAACATAC-----TCGA-G-CCATTTATTGCTATTATTTTTTGTGTACAT-TTTAACGA--G-AAAA-AA------TCTG----AA-GCCAACACTGGTTAGGTATATGTTACATTGCCAGATAA-TCAAAA-----TATGTTTG-TTAT---GGTTG--GTATGGTC---C---G--TACATACA--CATA---CG-ATATGAT-----TATTATCTATTAA---CCCTTCATAA-CAAC-TATGTTGTCACGAA--TCCACAATATCT-----AAATCCAGT-----TT---------------------------------------ATTTTG-----------TTTTG-----------TG--GT------TC-AGATA-TTCCCGTA----TGAAGATAATTTTaaaaaatccataatatctaaatccagtcaaggtttcgaaagtacttttgattattttgttttgttttttgtttttttgtttaaaaatcctcatataaagataaatttgcaacattatggtatttatgataagcaaatatatgtgttcctttgaaataaatactcaaatgttgagtatatcagaaacactcaaaatgttaacttaatttgttgcacctggtgacctttgaccccatttttgcgtttataatatatttttttcttggcaaccgatgaaatatcgtcaagtacagtctaaaattacttttttattacaacagacttccatgaacattccgtacatcatgcgataattttttgattgttttaaccacatt
gi|14 : tttagagtATTTCACTT-TATATA-TATAT----A------ATGT--TT-AATA-A---TAT-TTAAATGATGAAAACA--CA--ATTATAA-T--AA--ATTATTT----AA-AAT------T-A-AACAA-C-A-A--C-A-A-CAA-CAT---T-GAAT-C---------AAG--TTGG-----AA-ACAT--CAACATAC-----TCGA-G-CCATTTATCTGTATAGTTTCTAGTTTACTT-TTTGA--C--G-GAAATAAAT-C--TCTC----AA-GCCAGCACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTATAA-----T-----TG-TTAA---GGTTG--GTATGG-----A---G--TATAT-CA--CATA---CG-GTATGAT-----TATTTTTATTTAA--ACCCTTCATAG-CAAC-TGTGTTGTTAAATA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-A---CA--------TTTGAT------GCTTTGATTATTTTT------A----ATTTT-----------TT--AT------TC-ATAAA-TCCCCATA----TAACGATAACTTTGCAAG-ATTAT-AGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TTTA------TGTATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAAC-----AT-CAAG-------AC----ATTCAAAATATTAAC-TT-TTTT-GCACCTAGTGACCTTTGACTCacagcatgtaaagcaagttcaattatccgcaagtatctagcaaacgtttg
gi|11 : TC--TT-TTT-TA-CA-AT----A--TTTAAAATA-TACAGTA-ACTTTAT-TCAAATGG---AAACA--CA--ATTATAT-TTGAA--A--ATTT----TT-AAA------T---------C-A-T--TGA-A-TCA-CAA---TGGCAA-TGAC----ATTGA--A--------AA-ACATTGTAACAAGC-----T--A-G-CCATTTATCGGTATTATTTTTAAT--ACAT-GTTaa
gi|3 : agggta-TATATA-TATAT----A--GTTAATGT--TT-AATA-A---TTA-ATAAATGG---AAACAAACA--GTC-T-T-TT-AA------CTT----AA-AAA------A-A-A-T---T-C-T--T-GCA-TCA-CAT---TGTAAA-TGAC----ATTAA-----------AA-ATAT--CAATATAC-----TC-AAG-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TTTTA--ACGG-AAAA-AAAT-C--TCTC----AA-GTCAACACTCGTTTTGTAAATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----TATGA-TGGTTAA---AGTTG--GTACA---------------TAT-CA-------------TACGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACTCTTCATAG-CAAC-TATTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTGG-A---AAGTAC---TTCTAAT------ACTTTGAGTATTTTG-----------TTTTG-----------TG--GT------TC-GGAAA-TTCCCACA----TAAAGACAACTTTGCAAG-ATTAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TATA------TGTATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CGAATGTAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAAC-----TT-CGAG--------C----ATTGAAAATGTTAAA-TT-TTTT-GCGCCTAGTGACCTTTGACCCCAA-T---TTT--TGCGTTTATAA-T-A---CA--AT--A--TT-TT-T-----CTT---GACAACCAAT-G----AAAT-AT-GGTAAAGTATAGTCTAAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAT-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGC---AAT--GA-TTTTTGAAtgttacggttgacatcgaatatatacacatacgatatgattattttcgtttaaacccaccttagcaaatatgttgttaaaatccataatatccaaatccagtttttgaaagtacttctaatactttgattattttattaagtgattcagaaatgccaataaaaagataatggtatttataattagcaaatatatgtacacaaatgtagtatctagtgtttgagtatattagaaacagaatatcaaaatatattcaaaatggcaactattttgcacctagtggtctttggctatttattttgcttttgtaatacaattttgtcttggcatccgataaaatagtgtccagtatagttactttctattacaacatattttcatgagcattccgtacctcatacgatgatttttgggttttgtttaccagact
gi|7 : gtactttatttcacaatataATA-TAAAT----AACGTTAAAGT--TT-AATA-A---TAA-TTAAATGG---AAACA---A--ACTGTAT-TA-AA--AT-ATTT----TA-AAA--------A-A-AAA-C-A-T--TCA-A-TCA-CAT---TGGAAA-TGAC----AT-----T--------AA-ACAT---ATCA-----------A-G-CCATTAATCAGTATTATTTCTAGCGTACAT-TTCAA--C--G-GGGG-AAA-------TC----AACGCTAA------TTTTGTAAATGTTACATTGCCGGATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAA---GGTTG--G-----------------AACATACA--CATA---TG-ATATGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACTTTTCATATCAAATATTTTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCTGT-----TTC-G-A---AAGTAC---TTCTTAT------ACTTGGATTATTTTG-----------TTTTG-----------TG--GT------TC-AGAAAATTCCCATA----TAAAGATATATTTACAAG-ATGAT-TGTATTT--ATGATAAGCA-AG------TATACATGTATGAATTCTA--T-GAAATAAATAC-T--TAAATGTAGTT---TCTACTG-TTCGAGTGTATCAGAAAC-----AT-CGAG-------ACCGTCATTAAAAATTTTAAT-TT-TTTT-GCA-------ACCTTTGACCCACA-T---TTT--TGCGTTTAATA-T-A---TACTGT--T--T---T-G-----CTT---GCCAACCGAC-G----AAAT-AT-AGACAAGTATAGTCTTAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAC-AAACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGC---attttttttttcc
gi|1 : agggtattctatttaacaTAT----A--TTCAATGGCATA-CATATA---TATGTTGTTTGT---AAATA--TA--TTTACGT-TT-AAGTA--A-------AA-AAA------T-ATA-CAC-CCG-TGAC-A-A-ATA-TATATGTCAAAC-TGACTTATATAAA--TGGCGTTAGAACACAT--CA-CATAT-----TCGA-G-TCCTTTATCCGTATTATTTC------------TTAA--C--G----A-AAATAC--TCTG----AC-GCCAACACTTATTTTGTATGTGATACATTGCCATATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAA---GGTTT--GTAT-G-----ATCCG--CACATACA--CATA---CG-ATATTAT-----TATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAG-CAAC-TATGCTGTTTAAAA--TACATACTATTT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAACAAGTAC---TTTTGAT------GCTTTGATTATTTTG------GGGTTTTTTT-----------TG--GT------TC-AGAAA-TCCCCATA----TAAAGATGACTTTGCAAG-ATAAT--GTATTC--GTGATAAGCA-AA------TATG------TGTATTCTG--TTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAAC-----AG-CAAG-------ACA---ACCAAAACTG--TAA-TT-TTTT-GCACTTAATGACCTTTGTCCCAAA-T---TTA--TGCGTTTATAA-T-A---CA--TT--T--TT-AT--------CT---GGCAACCGAT-A----CAAT-AT-AGTCAAGAATAGTGTAAAGACA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAC-ATATTTCCATTAACATTCTAGACCTCATGC---GAT--GATTTTTTGGAggtc
gi|18 : aaaaaatagtattaagaccacaactatggggcgccaaacgtgacT----A--TTTAATGT--TT-AATA-A---TAT-TTAAATGA---AAACA--CA--GTTATAT-CT-AA--A--ATTT----AA-AAA------C-A-A-CAA-T-AAT--G-A-A-TCA-CAT---TGGAAA-TGGC----ATGAA--T--------AA-ACAT--CAACATAC-----TCGA-G-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--TTAAAA-AGA-----TCTC----AA-GCCAACATTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAA---GGTTG--GTATGG-----A---G--TACAT-CA--CATT---CG-GTATGAT-----TATTTTCATTTTA--ACCCTTCACAG-AAAC-TGTGTTGTTAAA---------------------AAATCCTGT-----TTTCG-A---GGGTAC---TTTTGAT------GCTTTGATTATTTTGTGGGA-A----TGTTT-----------TT--AC------TC-AGAAA-TTCCCATA----TAAAGATAACTTTCCAAG-ATTAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TATA------TGAATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--TAAATGCAGTC---TCTAGTtattttaa
gi|5 : ATGT--TG-AATA-A---TGT-CTAAATGG---AAACA--CA--ATTATATCTT-TA--T--ATTA----AA-AAA-------------------------A-A-TAA-CAT---TGGAAA-TGGC----ATTTA--T--------AA-ACAT--CAACATACCATCATC-A-G-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--G-GAGA-T--CAC--TCTT----AA-GCAAACACTTATTCTGTATGTTTTACATTACCAGATAA-ATAAAA-----TATGATTG-TTAA---GGTTG--GTATTGTCCGCA---A--AA-----A--CATA---CG-ATATGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAG-CAAC-TATGTTGTTTAAAA--TTTATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-A---AAGTAC---TTTTGAT------ACTTAGATTATTTT-------A----TTTTTGGGTGAGAATATG--GTGTTTTGTCAAGAAA-TTCCCATA----TAAATATAACTTTGCAAG-ATTAT-GGTATTG--ATAATAAACA-AA------TATA------TGTATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CAAATAAAGTC---TCTGGTG-TTTGAGTATATCAGAAAC-----GT-CGAA-------AT----ATT-CAAATGTTAAC-TT-TTTT-GCACCAAGTAACCTTCGCCCCTAA-T---TT----------------------A--AT--T--T---T-T-----CTT---GGCAATCGAT-G----AAAT-AT-AGTCAAGTATAGTATAAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAC-AGACTTCCATGAACATTTCGTACCTCATAC---GAT--AA-TTTTTGGA
gi|2 : TGT--TT-TATA-A---TAT-TTAAATTG---AAACA--CC--ATTATAT----AAG-A--ATTT----TA-AAA--------A-A-AAA-C-A-T--T-GCA-TCA-AAT---TGGAAA-TGGC----ATTAA--T--------AG-ACAT--CAACATAC-----TC-G-GACCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TTTAA--T--G-AAAA-AAAATC--TCTG----AA-GCCAACACTC---------ATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAA---GGTCA--GTATGG-----T---C--CATACATACGCATA---CG-ATATGAT-----TATTTTTGTATAA--ACCATTCATAG-CAAC-TATGGTGTT-AAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCGAA---AAGTAC---TTTTGAT------ATTTTTATTATTTTC------CTT--TTTTT-----------TC--GT------TC-AGAAA-CTCCCATT----AAAAGATAACTTTGCAAT-ATCAT-GGTATTG--ATAAGAAACACAA------T-TA------TGTATTCCA--TT-AAATAAATGC-T--CATATGCATGC---TCTAATG-TTTGAGTATATCAGCAAC-----AT-CGAG-------GC----ATTCAAAATCTTAAT-TT-TTTT-CCGCCTAGTGACCTTTAATCCCAA-T---GTT--TAC-GTTCTTA-ATA---CA--TTGGT--T---T-T-----CTT---GGCAACCGAT-G----GAAC-AT-GTTCAAGTATATGCTAAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--GCAAC-AGACTTCAATAAACATTCCttctttaccagact
gi|23 : -AATA-A---TAT-TTCAATGA---AAACA--CA--GTTATAA-TT-TA--A--TTTT----A-----------T-A-A-AAA-T-G------A-A-TCA-CAT---TTGAAA-TGGC----ATTTA--T--------AA-ACAT--CAACATAC-----TCAA-G-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACA----TAA----------------AC--TCTC----TA-GCCAGCACTTATTCTGTACTTGTTACATTGCCAG-TAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTTA---GGTTG--GTACAGTCCGTA---A--AACAT--------G---CG-ATATGA------AATTTTCGTTTTA--ACTCTTCGTAA-AAAC-TATATTGTTTAAAA--TTCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-A---AAGTAG---TTTTGAT------AATTTGGTTATTTT------------TTTTtttattacattgcttatgaattttatatattttattacactcattctatttacagtattggcaacattagg
gi|27 : tgg---AAACA--GG--GTTATAT-TT-AA------TTT----AA-AAA----------A-TAG-C-A-T--TGA-A-TCA-CAT---TGGAAAATAGT----ATTTT--T--------AA-ACAT--CAACATAC-----TC-A------TTTATTGGTATAAATTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--G-GATA-AAA-AC--TCTC----AA-GCCA--TCTCATTTTGTATGT
gi|15 : AATG--TA--TTT-TAA-TT-AA--A--A--------A-AAA------C-A-A-CAA-C-A-T--TGA-A-TTA-CAT---TGGAAA-TTGC----AT-----T--------TA-ACAT--CAACGTAC-----TCGA-G-CCATTAATCGACAATATATCTGGTGTACAT-TTTAAC-A--G-AAAA------C--TCCC----AA-GCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATAACCAGATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAA---GGTTG--GCATGG-----A---G--TACATACA--CGTA---CG-ATATGAT-----TATGTTCCTTTAA--ACCCTTTATAG-CAAC-TATGTTGTTAAAAA--TCCATAACATCTAATAAAAATCAAGT-----TTTCA-A---AAGTAC---TTCTTAC------ACTTTGGTTATTTT-------A----TCTTA-----------TT--GT------TC-AGACA-TTCCCATA----TTAG------TTTACAAG-ATTGT-GGTATTT--ATAAGACGCA-AA------TTCA------TGTATTCCA--TTGAAAT-AACAC-T--CAAATTCAGTC---TCTAGTT-TTTGGGTATATCAATAAC-----AA-TGTG-------AC----ATTCAAAATATTAACTTT-TTTT-GCGCCTAGTGACCTTTGAACCCAT-T---TTT--TGCGTTTA-TA-A-A---TAT-AT--T--Tacaataatagcacacgtaaattttaattttacaatgataaaaaaatgtactcacatgagaataatatatttattt
gi|12 : tctgtatATAT-TT-AA--A--ATTT----AA-AAA------CCA-A-CAA-C-A-T--TGA-A-TCA-CAT---TTGAAA-TGGC----ATAAA--T--------AA-ACAT--CAAAATAC-----TTGA-G-CAATTTATCGGTACTATTTCAAGTGTACAA-TTTAACGA--G-AAAAAAAACAC--TCTT----AA-GCCAACACCCGTTTTGTATGTGCTACATTTCCAGATAA-TTACAT-----T-----TG-TTAA---GGTTG--GTATGG-----A---G--TATAT-CG--CAAA---CA-GTATAAT-----TA-TTTCGTTTAA--ACCCTTTATAG-AAAC-TGTGTTGTTAAAAA--TCAATAATATCT-----AAATTAAGT-----TTTCG-A---
gi|41 : -AA--A--A-------AA-AAA------C-A-A-CAA-C-A-T--TGA-A-TGA-CAA---TGGAAA-TGGC----ATTAA--T--------AA-ACAT--CAACATAC-----TCGA-G-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGttataattttttataatatgcaaaatttaatatatgtattccatttaaataaatactcaaatgcagtctctagagtttgagtatatcagaaacaccgagacattcaaaatggttactttttttgcacctagtgacctttgaccccaatttttgcgtttattatacattttttcttgacaactgatgaaatgtgatcaagtaaagtctaaaatcactttctattacaacagacttccatgaacattccgtacctcatgcgatgatttttggattttgtttgaccagact
gi|33 : aTAAA-----------AA-ACAT--AAACACGC-----TCGA-G-CCATTTATCAGTATTATTTCTACTGTACAT-TTTAA--T--G-GAAA-AAAC----TCTC----AA-ACCTACACTCGTTTTGTACGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----AT-TTAT---tagat
gi|47 : -ACAT--CAACATAC-----TCGA-G-CCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGtttcgtttaaacccttcatagtaactatgttgttaaaaatccttaat
gi|17 : AACATAC-----TCGA-G-CCATTTATCGGAATTATTTCAAATGTACAT-TTTAA--C--G-GGA-----TTT--TTTC----A-----------CATTTTTTATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAA-----TATGTCTG-TTAA---GGTTG--GCATGC-----A---G--TACA--TG--C--A---CATGCACAAC-----TATGTT-GTTAAA--AATC--CATA-----------------------------ATATAT-----AAATCTAG------TTTTG-A---AAGGTC---TTCTGAT------ACTTTGATTATTTTG-----------TTTTG-----------TG--GT------TC-AGAAA-TTCCAATA----TACAGACAACTTTGCAAGAAAAAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TATA------TGTATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTTGTG-TTTGAGAATATCAGAAAC-----AT-CACT-------AC----ATTCAAAATGCTAAT-TA-TTTT-GCGTTTA-TAA-----------------------TACAATTATT-----------------------T-T-----CAT---GGCAATCGAT-G----AAAT-AT-GGTCAAGTATGGTCTAAAGTCA--TT--TT-----TT-GTT--GCAAC-AGtagatcatacccaact
gi|13 : TTCTAGTGTACAT-TTTAA--C--G-GAAC-AAA-AC--TCTC----AA-GCTAACACACATTTTGTATGTGTTGCATTGTCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAA---GGTTG--GTCTGT-----A---G--TACAT-CG--CAAA---CG-ATGTGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACCCTTTATAG-CAAC-TATGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCG-A---AAGTAC---TTTTGAT------ACTTTGATTTTTTTGTGTTTTG----TTTTT-----------AG--GT------TC-AGAAA-TTCCCACA----TAAAGA------TGCAAG-ATTAT-AGTATTC--ATAACATGCA-AA------AATA------TGTATTCAATTTTGATAT--ATAC-T--CAACTGCAGTC---TC------TCTGAGTATATCAGAAAC-----AT-CGAG-------AT----ATTCAAAATGTTAAC-TTATTTT-GCACCTAGTGAACTTTGGCCCCAA-T---TTT--TGCGTTTATAA-T-A---CA--AT--T--GT-TT-T-----CTT---GTCAACCGAT-G----AAAT-AC-GGTCAACCTTAGTCTAAAGTCA--CT--TT-----CT-AAT--ACATCTA---TTCCATGAACATTCCGAACTTCATGC---GAT--GA-GTTTTGG
gi|38 : GTGTACAT-TCTAA--C--G-AAAA-AGAGAG--TCTC----AA-ACCAACACTCGTTTTGTATGTGTAACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAA---GGTTA--GTATGG-----A---G--TACAT-CG--CATA---CA-GTATGCT-----TATTTTgatttttgtttaccagac
gi|16 : ACATGTTTAG--C--G-GGAA-AAA-AC--TCTC----AA-GCCAACACTTATTTTGCATGTGTTACATTGGCAGATAA-GTAAAA-----TGTGTTTG-TTAA---GGTTG--GTATGGTC---C---G--TACAT--A--CAAATA-CG-ATATGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAG-AGAC-TATGTTGTTAAAAA--CCCATAACATCT-----AAATTCAGT-----TTTCG-A---AAGTAC---TTTTGAT------ACTTTGATTATTTT-------A----TGTTT-----------T
gi|20 : TGTATGTGCCACAT---CAGA-------------------------------GGTTA--GT---G-----A------AATAA-CA--CCAA---CA--TATATT-----TAATTTAGATTAA--GC-----ATA----AC-TAT-CTGTCAGACA--AC----ACGGCC-----AAAGTTGGC-----TTTT-------AGTAC---TTCTGAT------ACTTTGATTATTTT------------TTGTG-----------TG--GT------TC-AGAAA-TTCCCAAA----TAAAGATAACTCTGCAAG-ATTAT-AGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TATA------TATATTTCA--TTGAAATAAACAT-T--CAAATGCAATC---TCTAGTG-TTTGAGTAAATCAGAAAC-----AT-CGAG-------AC----ATTCAAAATGTTAAC-GT-TTTG-GCACCAAGTGTCCTTTGACCCCGA-T---TTT--TGCGTTTAT---A-A---TA--CT--T--T---T-T-----TTTCTAAGCAACCGAC-G----AAAT-AT-GACCAAGTATAGTCTAAAGTCA--C---TT-----CT-ATATTACAAC-AGACTTCCATGAACTTTCCGTACCTCATGC---GAT--GT-TTTTCGGAccattgaaataaatactcaaatgcagtctctaacgtttgagtatatcagaaacatcgagcatcgagacagtcaaaatgttcaccttttttacacctagtgacctttgaacccaatttatgcgttcataataataattcataattattttcttggcaaccgatgaactatggtcaagtatagtctaaaattactttctattacaacatacttccatgaacattccgtacctcatgcgaagattctttttaatttttttaccagact
gi|11 : -----T-----TG-TTAC---GGTTG--ACATCG-----A---A--TATATACA--CATA---CG-ATATGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACCCACCTTAG-CAAA-TATGTTGTTAAAA---TCCATAATATCC-----AAATCCAGT-----TTTTG-A---AAGTAC---TTCTAAT------ACTTTGATTATTTT-------A----TTAAG-----------TG--AT------TC-AGAAA-TGCCAATA----AAAAGATAA--------------T-GGTATTT--ATAATTAGCA-AA------TATA------TG-------------------TAC-A--CAAATGTAGTA---TCTAGTG-TTTGAGTATATTAGAAACAGAATAT-CAAAAT-----AT----ATTCAAAATGGCAAC-TA-TTTT-GCACCTAGTGGTCTTTGGCT---A-TTTATTT--TGCTTTTGTAA-T-A---CA--AT--T--T---TGT-----CTT---GGCATCCGAT-A----AAATAGT--GTCCAGTATAGT-------TA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAC-ATATTTTCATGAGCATTCCGTACCTCATAC---GAT--GA-TTTTTGG
gi|33 : agggtatcttttttacaatatttaaaatatacagtaactttattcaaatggaaacacaattatatttgaaaatttttaaatcattgaatcacaatggcaatgacattgaaaaacattgtaacaagctagccatttatcggtattatttttaatacatgtT-----TATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAG-TAAC-TATGTTGTTAAAAA--TCCTTAATgttttgtttaccagact
gi|9 : taaaaaacataaacacgctcgagccatttatcagtattatttctactgtacattttaatggaaaaaactctcaaacctacactcgttttgtacgtgttacattgccagataattaaaatatAAT-TATGTTGTTAAAAAAATCCATAATATCT-----AAATCCAGTCAAGGTTTCG-A---AAGTAC---TTTTGATTATTTTGTTTTG-TT-TTTTG-----------TTTTT-----------TT--GT------TT-AAAAA-TCCTCATA----TAAAGATAAATTTGCAAC-ATTAT-GGTATTT--ATGATAAGCA-AA------TATA------TGTGTTCCT--TTGAAATAAATAC-T--CAAATG-----------------TTGAGTATATCAGAAAC-----ACTCAAA-------AT----GTTAA-----CTTAA-TT-TGTT-GCACCTGGTGACCTTTGACCCCA--T---TTT--TGCGTTTAT---A-A---TAT-AT--T--TT-TT-T-----CTT---GGCAACCGAT-G----AAAT-AT-CGTCAAGTACAGTCTAAAATTA--CT--TT-----TTTATT--ACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACATCATGC---GAT--AA-TTTTTTGA
gi|30 : cttatttcacttcatatatataatatatatttaatgattaataatattgaaatggaaacacaattttatttaaaatttaagaaataacaacactgactcacattcgaaatgacattaaaaacatcagcatactcgagccattgatcgatattatttctagtgtacattttaacggaaataacgtctcaagccaacactcgttttgtatgtgttaatagctggatCTTTGATTATTT--------G----TTTTG-----------TG--GC------TT-AGACA-GTCCAATA----TAAAAATAA--TAGCAAG-ATAA---GTTTTTTAATAATAAGCA-AA------TATA------TGTATTCCG--TTGAAATAAATATATAACAAATATGGTCAAGTATAGT--TTTAAGTttgttttaaccacatt
gi|28 : aTT-----------TT--GT------AC-AGAAA-TTCCCATA----TAATTATAACTTTGCAAG-AA-ATAGGTATTG--ATAATAAGCA-AA------TATA------TGTATTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CGAGTGAAGTC---TGTAGTGATATGAGGATATcactttctattacaaaagacgtctgtacctcatgcgatgattttttgagagaaaaaaataccagtc
gi|25 : tgggtatcgtgA----TAAAGATAACTTTGCAAG-ATCAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-AA------TATA------TGTATTCCA--TTGAACTAAATAC-T--CAAATGTAGTC---CCTATTG-TTTGAG----TCAGAAAC-----AT-CGAA-------AC----ATTCAAAATGTT----------------------AACTTTGACCCCAA-T---TTT--TGC-GTTATAA-T-A---CT--TT--T--TT-TT-T-----CTT---GGCAACCGAT-G----AAAT-GT-TGTCAAGTATAGTCTTAAGTTC--TT--TT-----CT-A-A----AAC-AGTTTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGC---GAT--GA-TTTacttcatttaagaatacagatagacaaagaattgcactttcaaagatcatattaagatatttacgtcatatgac
gi|12 : G-ATTAT-AATTTTTT-ATAATATGCA-AAATTTAATATA------TGTATTCCA--TTTAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGAG-TTTGAGTATATCAGAAAC-----AC-CGAG-------AC----ATTCAAAATGGTTAC-TT-TTTTTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAA-T---TTT--TGCGTTTATTA-T-A---CA--TT--T--T---T-T-----CTT---GACAACTGAT-G----AAAT-GT-GATCAAGTAAAGTCTAAAATCA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGC---GAT--GA-TTTTTGGA
gi|16 : atatttaaaatttaaaaaccaacaacattgaatcacatttgaaatggcataaataaacatcaaaatacttgagcaatttatcggtactatttcaagtgtacaatttaacgagaaaaaaaacactcttaagccaacacccgttttgtatgtgctacatttccagataattacatttgttaaggttggtatggagtatatcgcaaacagtataattatttcgtttaaaccctttatagaaactgtgttgttaaaaatcaataatatctaaattaagttttcTA------TGTTTTCCA--TTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAACG-TTTGAGTATATCAGAAAC-----AT-CGAGCATCGAGAC----AGTCAAAATGTTCACCTT-TTTT-ACACCTAGTGACCTTTGAACCCAA-T---TTA--TGCGTTCATAATA-A---TA--AT--TCATA-AT-TATTTTCTT---GGCAACCGAT-G----AACT-AT-GGTCAAGTATAGTCTAAAATTA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAC-ATACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGAAGAT--TC-TTTTTttttgtttgaccagact
gi|31 : acatgtttagcgggaaaaaactctcaagccaacacttattttgcatgtgttacattggcagataagtaaaatgtgtttgttaaggttggtatggtccgtacatacaaatacgatatgattattttcgtttaaacccttcatagagactatgttgttaaaaacccataacatctaaattcagttttcgaaagtacttttgatactttgattatttAAAATATTTGC-TT-GTC---------GTGACCTTCGACC-----T---TTTAACGCGGTCA--A-A-AGGTCA--AA--T-----AT-T-----TTTA--GGCAACCGATTGTTTCAAAT-GTAGGT----TATAGTGCAGTGGCAAACTAATT------T-AGC--CCAGT-TGCCATCCATGAACACGCTGTACCTCATGC---ATC--GA-TTTCTAGaatttttttaccagact
gi|29 : ctcgtccagttCAA-T---TGT--TGTGCTTGTAA-T-A---CA--AC--T--T---T-T-----TCT---GACAACCGAT-G----ATAT-AT-GTTCAAGTATTGTTTAAAGTCA--CT--TTAAAAAAT-ATT--ACAAC-ATGCTTCCATGAACTTTAGATACCTCATGC---AATGATG-TTTTTccacatatatgagaaatttcaccaa
gi|37 : tttcaagatgtcggcccatgacaT-T-----CTT---GGCAACCGAT-G----AAAT-AT-TGTCATATAAAATCTAAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--TCAAC-ATACGTCCGTGAACATTCCGAGCCTCATGC---AAT--GA-TCTTTTGAaaaaatgtttaccaatttacaacatgcgatatttgattggaagaatcaa
gi|39 : taaatatct----AAAT-AT-AGTCAAGTATAGTCTGAATATA--CG--TT-----CC-ATT--GCAAC-ACACTTCCATGAACATTCCATACCTCTTGC---GAT--GA-TATTTGGttttatgaccag
gi|30 : ----AAAT-AT-GGTCAAGTATAGTTTTAAGTCA--CT--TT-----CT-ATT--ACAAA-AGA----CG-------TCTGTACCTCATGC---GAT--GA-TTTTTTGAtattcatctgtccaact
gi|10 : actttgattatttgttttgtggcttagacagtccaatataaaaataatagcaagataagttttttaataataagcaaatatatgtattccgttgaaataaatatataacCA--CT--TT-----CT-GTT--ACAAC-AGACTTCCATGAACCGTCCATACCTCAAGC---GAT--GA-TTTTTgagaaaaaaataccagtc
gi|46 : tagggtattttatttcactttatatatatatatttaatgtttaataatatttagatggaaacacataatacttaattttttaaaaaaaaagacaagattgaatctcattgaaaatggcataaaaataaacatcaacatactcgagccatttattggtattatttctagtgtacattttaacaaacaaaaactgtcaaggcaacacttatttgtatttgttacattgcccgataaaattgttaaggttggtatggagtacatcgcatacagcatgatttgttttgtttaaacctttcagagaaactgtgttgttaaaaatccataatatctaaatccagttttcaaaagtacttctgatactttaattattttgtttgtttgtagttcagaaattcccatataggtaaagataactttgcaagatactggtatttataataataaaatatatgtattccattgaaataaatactcacatgcagtctctggtgtttcagtatgtcagaaacactgagacattcaacattT--TT-----CT-ATT--ACAAC-AGACTTTAATGAACATTGTGTATGTCATAC---GAT--GA-TTTTTGGAtaaaaaaatttttaccagac
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATTATCTTTATTACACTCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGTAGTAAACATGACTTCAGTCAAATTAAAGAAAATAGAAAATACTCATATATTTTTTTTTAATTTCACACACTCGCATCCTCAAAGGCGCGCAAGCACGCACGCACAGACTCAACAACAACAAAAATTTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTATAGATTCAATAAACATTCATTTTCAGTATATATGAAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTTATATTTATATTCAAATGTTTAATTACTAGTAGTCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTCTAATTTAATATCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CAAAAAATTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTACAATTGTCATCAATTCAATAAACATTCATTTTTATATATATGACAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTGATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTTTTAATTCTAATCTTATATCCTTTGATTGCTTTCCTTA
Unaligned ( gi|36 ): ATATATCATATCCTTTTATTACGCTCAATCCATTTACAGTAAAGGCAACGTTAGATTATATTGTACAGTACAGTAGGTAATGTGACTTTTGTAAAATTGAAGAAAATAGAAAATGCTGATATTTGTTTAA
Unaligned ( gi|40 ): TATATAACGTGTTTATTTACACTAAATCCATTTTACAGCAATGGCAACACAGGACTATATAATACGGTAATTAATATGACTTCAGTCAAATGAAAGAAAAG
Unaligned ( gi|42 ): CCTTTAGTTAAACTCTAAATGGTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTTTAATTAAATACCCTTTAATTCCTTTCCTT
Unaligned ( gi|43 ): ATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGGTCACTAACACTATTTAATTGTATGAATTCTAATTTAGTATCCCTTGATTGCTTTCCTTAAA
Unaligned ( gi|44 ): TATATATATGTATATGATGTTTGATAATATTTAAATGGAAAACATTTAATCACATTTGAAATGCCATTAATAAACATCAA
Unaligned ( gi|45 ): TATAAGGTATTTTAGTTCACTATATATCTATATATCTAATAATATTTAAATGGAAACACAATTATCAAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|48 ): TTTTATTATCTTAATTATACCCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGT
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGTATTACTCTTATTCCATTTACGGCAATGTCAACATGAGGTAG
Unaligned ( gi|50 ): TGTTACTAGCGATAAATAACACTATATTTTTGTGTTAATTCTAATTT
Unaligned ( gi|51 ): ATTCTAATTTAATATCCCTTTATTGCTTTCCTTTAGTTA
Alignments
lowQualScore : 11111111 1111111111111111 111 1111111111 55555555555 11 1 111111111111 1111111111111111111
lowQualScore : 88888888 2 4444 22 22 1 333 333 22 44444 0 55555555 22 1 1 1 1 33333 8888888888888888 1 1 000 22 22 22 1 1 1 1 1 2222222222 3333 1 00000000000 1 33 1 9 1 1 333 22 44444 22 22 44444 44444 1 333 333 1 1 5555555 333 555 22 66666 9999999 000000000000 555555 2 2 4444 2 0 1 1 44 1 22 555555 3333 1 22 333 1 55555 666666666666 22 2 2 7777777 2 444444 0 2 2 22 5555555555555555555 22 22 2 333 2 4444 1 1 22 1 44 44444 1 1 2 2
lowQualScore : ........ . .... .. .. . ... ... .. ..... . ........ .. . . . . ..... ................ . . ... .. .. .. . . . . . .......... .... . ........... . .. . . . . ... .. ..... .. .. ..... ..... . ... ... . . ....... ... ... .. ..... ....... ............ ...... . . .... . . . . .. . .. ...... .... . .. ... . ..... ............ .. . . ....... . ...... . . . .. ................... .. .. . ... . .... . . .. . .. ..... . . . .
lowQualScore : 66666666 2 5555 99 66 8 222 000 44 33333 5 88888888 22 5 5 5 0 88888 1111111111111111 6 6 333 00 00 00 4 5 5 5 6 3333333333 4444 7 44444444444 7 88 7 1 7 7 000 55 33333 44 44 88888 88888 9 555 555 8 9 9999999 222 777 55 44444 1111111 555555555555 888888 0 0 0000 1 9 9 9 55 9 66 555555 9999 8 55 222 9 33333 999999999999 99 1 0 1111111 0 222222 3 1 1 99 6666666666666666666 99 99 1 777 1 0000 9 9 66 7 11 33333 7 7 7 0
consensus : GGGTATTTTATTTCA--C----TATATA-TATAT----AT--TTAA--TGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA-A---C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTA-CATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGAT-------TA---TTT---T--G-----T-------TTTG-----------TGGT------TCA-G-AAATTCCCATA----TAAAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
Reference ( family-950 ) : GGGTATTTTATTTCN--T----TATATA-TATAT----AT--TTAA--TGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA-A---C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTA-CAT-CA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGAT-------TA---TTT---T--G-----T-------TTTN-----------TGGT------TCA-G-AAATTCCCATA----TAAAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
gi|1 : TATGTTG--T----T-TGTA-AATAT----AT--TTA---CGTTTAAGTAA---AA---AAATAT---ACA--CCCGTGACAAATATA--------T----------ATGT-------------------------CAA--ACTGACTTATAT---AAA-TGGCGTTAG--AACACAT--CA-CATAT--TCG--AGTCCTTTATCCGTATTATTTCT-------------T-AACG---AA-AAT-A---C----TCTG----ACGCCAACACTTATTTTGTATGTGATACATTGCCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTTGTATGATCCGCA-CATACA-CA-TA---CGATATTATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGCTGTTTAAAA--TACATACTATTT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAACAAGTAC---TTTTGAT-GCTTTGAT-------TA---TTT---T--GGGGTTT-------TTTT-----------TGGT------TCA-G-AAATCCCCATA----TAAAGATGACTTTGCAAGATAA-T-G-TATTC--GTGATAAGCA-A--A------TATGTGT----ATTCTGTTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----GCAAG-------A----CAA--CCAAAACTG-T-AA--TT---TT-TTGCACTTAATGACCTTTGTCCCAAATTT---A--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-ATCT---GGCAACCGAT-A----CAATAT-AGTCA-AGAATAGT--GTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTCCATTAACATTCTAGACCTCATGCGATGATTTTTTGGA
gi|10 : aaaaaatagtattaagaccacaactatggggcgccaaacgtgactatattcaatggcatacatataGGGTATTTTATTTCACTT----TATATA-TATAT----AT--TTAA--TGTTTAA-TAA---TATTTAGATGG---AAA--C-----ACA-TAATA--------C--TT-AA-T-TTTTTAAAAAAAAA----G--A-------CAA-GATTGAATCTCATTGAAAA-TGGCATAAAAATAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACA-AACA-AAA-A---C----TGTC----AAGGCAACACTTATTT-GTATTTGTTACATTGCCCGATAA-----AA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTA-CAT-CG-CA-TA---CAGCATGATTTGTTTTGTTTAA--ACCTTTCAGAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTAAT-------TA---TTT---T--G-----TTTG----TTTG-----------TAGT------TCA-G-AAATTCCCATATAGGTAAAGATAACTTTGCAAGATAC-T-GGTATTT--ATAATAATAA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CACATGCAGTC---TCTGGTG-TTTCAGTATGTCAGAAACA-----CTGAG-------A----CAT--TCAACA----TTCAC-TT---TC-Ttattttaa
gi|10 : taTCAC-TT--T-----CTG-TTACAAC-AGACTTCCATGAACCGTCCATACCTCAAGCGATGA-TTTTTgttacaacagacttccatgaaccgtccatacctcaagcgatgattttttaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : tagggtattttatttcactttatatatatatatttaatgtttaataatatttagatggaaacacataatacttaattttttaaaaaaaaagacaagattgaatctcattgaaaatggcataaaaataaacatcaacatactcgagccatttattggtattatttctagtgtacattttaacaaacaaaaactgtcaaggcaacacttatttgtatttgttacattgcccgataaaattgttaaggttggtatggagtacatcgcatacagcatgatttgttttgtttaaacctttcagagaaactgtgttgttaaaaatccataatatctaaatccagttttcaaaagtacttctgatactttaattattttgtttgtttgtagttcagaaattcccatataggtaaagataactttgcaagatactggtatttataataataaaatatatgtattccattgaaataaatactcacatgcagtctctggtgtttcagtatgtcagaaacactgagacattcaacatGGGTATCTT--TT----T----TACA------AT----AT--TTAAAATATACAG-TAACTTTATTCAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TTGAA-A-ATTT-----TTAAA----T--------------CATTGAATCACAATGGCAA-TGACATTGA--AAAACATTGTAACAAGC--T----AGCCATTTATCGGTATTATTTTTAATACATGT-TTGT-TACG-Gtaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : a-----T-----TG-TTACGGTTGACATCG--AATA-TATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCACCTTAGC-----AAATA--TGTTGTTAAAA---TCCATAATATCC-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGAT-------TA---TTT---T--A-----T-------TAAG-----------TGAT------TCA-G-AAATGCCAATA----AAAAGATAA--------------T-GGTATTT--ATAATTAGCA-A--A------TATATGT----A---CA-----------------CAAATGTAGTA---TCTAGTG-TTTGAGTATATTAGAAACAGAATATCAAA-------A----TATATTCAAAA-TG-GCAAC-TA---TT-TTGCACCTAGTGGTCTTTGGCT---ATTTATTT--TGCTTTT-GTA-A--TA--------C--A--AT---T--T--TGTCTT---GGCATCCGAT-A----AAATAG-TGTCC-AGTATAGT--T-------AC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTTCATGAGCATTCCGTACCTCATACGATGA-TTTTTGGttgacatcgaatatatacacatacgatatgattattttcgtttaaacccaccttagcaaatatgttgttaaaatccataatatccaaatccagtttttgaaagtacttctaatactttgattattttattaagtgattcagaaatgccaataaaaagataatggtatttataattagcaaatatatgtacacaaatgtagtatctagtgtttgagtatattagaaacagaatatcaaaatatattcaaaatggcaactattttgcacctagtggtctttggctatttattttgcttttgtaatacaattttgtcttggcatccgataaaatagtgtccagtatagttactttctattacaacatattttcatgagcattccgtacctcatacgatgatttttgggttttgtttaccagact
gi|12 : agggtatcttttttacaatatttaaaatatacagtaactttattcaaatggaaacacaattatatttgaaaatttttaaatcattgaatcacaatggcaatgacattgaaaaacattgtaacaagctagccatttatcggtattatttttaatacatgtATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAACC--A--A-------CAA-CATTGAATCACATTTGAAA-TGGCATAAA--TAAACAT--CAAAATAC--TTG--AGCAATTTATCGGTACTATTTCAAGTGTACAA-TT-T-AACGAGAAA-AAA-AACAC----TCTT----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGCTACATTTCCAGATAA-TTACAT-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTA-TAT-CG-CA-AA---CAGTATAATTA-TTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCAATAATATCT-----AAATTAAGT-----TTTCG-Agttttgtttaccagact
gi|12 : TAAGTTTTC--GATTA-T-AATTTTTT-ATAATATGCA-A--AATTTAATATATGT----ATTCCATTTAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGAG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TGGTTACT-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATT-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-TCTT---GACAACTGAT-G----AAATGT-GATCA-AGTAAAGT--CTAAAATCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGAttataattttttataatatgcaaaatttaatatatgtattccatttaaataaatactcaaatgcagtctctagagtttgagtatatcagaaacaccgagacattcaaaatggttactttttttgcacctagtgacctttgaccccaatttttgcgtttattatacattttttcttgacaactgatgaaatgtgatcaagtaaagtctaaaatcactttctattacaacagacttccatgaacattccgtacctcatgcgatgatttttggattttgtttgaccagact
gi|13 : atatttaaaatttaaaaaccaacaacattgaatcacatttgaaatggcataaataaacatcaaaatacttgagcaatttatcggtactatttcaagtgtacaatttaacgagaaaaaaaacactcttaagccaacacccgttttgtatgtgctacatttccagataattacatttgttaaggttggtatggagtatatcgcaaacagtataattatttcgtttaaaccctttatagaaactgtgttgttaaaaatcaataatatctaaatTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAC-AAA-A---C----TCTC----AAGCTAACACACATTTTGTATGTGTTGCATTGTCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGTCTGT--AGTA-CAT-CG-CA-AA---CGATGTGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGATTTTTTTGTG---TTT---T--G-----T-------TTTT-----------AGGT------TCA-G-AAATTCCCACA----TAAAGA------TGCAAGATTA-T-AGTATTC--ATAACATGCA-A--A------AATATGT----ATTCAATTTTGATATATAC-T--CAACTGCAGTC---TC------TCTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----TAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TTA--TT-TTGCACCTAGTGAACTTTGGCCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ATTG-T--T--T-TCTT---GTCAACCGAT-G----AAATAC-GGTCA-ACCTTAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-ATACATCTA---TTCCATGAACATTCCGAACTTCATGCGATGA-GTTTTGGttttgtttgaccagact
gi|14 : ATTTCA--C----TTTATA-TATAT----AT----AA--TGTTTAA-TAA---TATTTAAATGATGAAAA--C-----ACAATTATAATAAATTAT--TT-AA-A-ATTA-----AACAACAACA--A-------CAA-CATTGAATCAAGTTGGAAA----------------CAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCTGTATAGTTTCTAGTTTACTT-TT-T-GACG-GAAA-TAA-AT--C----TCTC----AAGCCAGCACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTATAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTA-TAT-CA-CA-TA---CGGTATGATTATTTTTATTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTG--TGTTGTTAAATA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-ACA-----------TTTGAT-GCTTTGAT-------TA---TTT---TTAA-----T-------TTTT-----------TA-T------TCA-T-AAATCCCCATA----TAACGATAACTTTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TTTATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCAAG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACTCgatttttgtttaccagac
gi|15 : ATTTTA--------A--TT-AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATTACATTGGAAA-TTGCATT----TAA-CAT--CAACGTAC--TCG--AGCCATTAATCGACAATATATCTGGTGTACAT-TT-T-AACA-GAAA-A-------C----TCCC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATAACCAGATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGCATGG--AGTA-CATACA-CG-TA---CGATATGATTATGTTCCTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAACATCTAATAAAAATCAAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTTAC-ACTTTGGT-------TA---TTT---T--A-----T-------CTTA-----------TTGT------TCA-G-ACATTCCCATA----T-----TAG-TTTACAAGATTG-T-GGTATTT--ATAAGACGCA-A--A------TTCATGT----ATTCCATTGAAAT-AACAC-T--CAAATTCAGTC---TCTAGTT-TTTGGGTATATCAATAACA-----ATGTG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAACTTT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGAACCCATTTT---T--TGCGTTT-ATA-A--aa
gi|16 : tctgtataatgtACATGTT-T-AGCG-GGAA-AAA-A---C----TCTC----AAGCCAACACTTATTTTGCATGTGTTACATTGGCAGATAA-GTAAAA-----TGTGTTTG-TTAAGGTTGGTATGGTCCGTA-CATACA-AA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----GACTA--TGTTGTTAAAAA--CCCATAACATCT-----AAATTCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGAT-------TA---TTTTA-T--G-----T-------TTTatatattt
gi|16 : TATGT----TTTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAACG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAGCATCGAGA----CAG--TCAAAA-TG-TTCACCTT---TT-TTACACCTAGTGACCTTTGAACCCAATTT---A--TGCGTTC-ATA-A--TAATAATTCAT--A--AT---TATT--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AACTAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAATTAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGAAGA-TTCTTccattgaaataaatactcaaatgcagtctctaacgtttgagtatatcagaaacatcgagcatcgagacagtcaaaatgttcaccttttttacacctagtgacctttgaacccaatttatgcgttcataataataattcataattattttcttggcaaccgatgaactatggtcaagtatagtctaaaattactttctattacaacatacttccatgaacattccgtacctcatgcgaagattctttttaatttttttaccagact
gi|17 : acatgtttagcgggaaaaaactctcaagccaacacttattttgcatgtgttacattggcagataagtaaaatgtgtttgttaaggttggtatggtccgtacatacaaatacgatatgattattttcgtttaaacccttcatagagactatgttgttaaaaacccataacatctaaattcagttttcgaaagtacttttgatactttgattatttAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGAATTATTTCAAATGTACAT-TT-T-AACG-GGA----------T----TTTT-------TCA-----CATTTTTTATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAA-----TATGTCTG-TTAAGGTTGGCATGC--AGTA--------CA-TG---C-ACATG-----------------------CA---C-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATAT-----AAATCTAGT-----TTT-G-AAA---GGTC---TTCTGAT-ACTTTGAT-------TA---TTT---T--G-----T-------TTTG-----------TGGT------TCA-G-AAATTCCAATA----TACAGACAACTTTGCAAGAAAAAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTTGTG-TTTGAGAATATCAGAAACA-----TCACT-------A----CAT--TCAAAA-TG-CTAAT-TA---TT-TTGCGTTTA-TAA----TA----CAATT--------------------------------------AT---T-----T-TCAT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATGGT--CTAAAGTCAT-TT--T-----TTG-TTGCAAC-AGtttaatttttttaccagact
gi|18 : T----AT--TTAA--TGTTTAA-TAA---TATTTAAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAAAC---A--A-------CAA-TAATGAATCACATTGGAAA-TGGCATGAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACT-TAAA-AAG-A--------TCTC----AAGCCAACATTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTA-CAT-CA-CA-TT---CGGTATGATTATTTTCATTTTA--ACCCTTCACAGA-----AACTG--TGTTGTTAAA---------------------AAATCCTGT-----TTTCG-AGG---GTAC---TTTTGAT-GCTTTGAT-------TA---TTT---T--G-----TGGGAATGTTTT-----------T-AC------TCA-G-AAATTCCCATA----TAAAGATAACTTTCCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGA----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--TAAATGCAGTC---TCTAGT
gi|19 : GAGTATTTTATTTCA--A----TATGTA-TGTAT----AT--TTAA--TATTAGA-TAA---TATTTATATGA---AG----------CAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--AACCCCAACAA-CATTGATTGGCATTTGAAA-TGTCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGCTATTATTTTTTGTGTACAT-TT-T-AACG-AGAA-AAA-A--------TCTG----AAGCCAACACTGGTTAGGTATATGTTACATTGCCAGATAA-TCAAAATATGTT-----TG-TTATGGTTGGTATGGTCCGTA-CATACA-CA-TA---CGATATGATTATTATCTATT-A--ACCCTTCATAAC-----AACTA--TGTTGTCACGAA--TCCACAATATCT-----AAATCCAGT---------------------------------------T-------TA---TTT---T--G-----T-------TTTG-----------TGGT------TCA-G-ATATTCCCGTA----TGAAGATAATTTTACA
gi|2 : ttta--TGTTTTA-TAA---TATTTAAATTG---AAA--C-----ACCATTATA--------T-----AAGA-ATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTGCATCAAATTGGAAA-TGGCATTAA--TAGACAT--CAACATAC--TCG--GACCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-AATG-AAAA-AAA-AT--C----TCTG----AAGCCAACACTC---------ATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTCAGTATGGTCCATA-CATACG-CA-TA---CGATATGATTATTTTTGTATAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGGTGTT-AAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCGAAAA---GTAC---TTTTGAT-ATTTTTAT-------TA---TTTTCCT--T-----T-------TTTT-----------TCGT------TCA-G-AAACTCCCATT----AAAAGATAACTTTGCAATATCA-T-GGTATTG--ATAAGAAACACA--A------T-TATGT----ATTCCATT-AAATAAATGC-T--CATATGCATGC---TCTAATG-TTTGAGTATATCAGCAACA-----TCGAG-------G----CAT--TCAAAA-TC-TTAAT-TT---TT-TTCCGCCTAGTGACCTTTAATCCCAATGT---T--TACGTTC-TTA-A--TA--------C--A--TTGG-T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----GAACAT-GTTCA-AGTATATG--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTGCAAC-AGACTTCAATAAACATTCCgcatgtaaagcaagttcaattatccgcaagtatctagcaaacgtttg
gi|20 : AGGTTAGT--GA--AATAACAC-CAACA-TA------TAT--TTAATTTAGATTAA--GC-----ATA--------ACTA--T-CTGTCAGACA--AC----ACGGCC-----AAAGTTGGC-----TTTT----A---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGAT-------TA---TTT---T--------T-------TGTG-----------TGGT------TCA-G-AAATTCCCAAA----TAAAGATAACTCTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATAT----ATTTCATTGAAATAAACAT-T--CAAATGCAATC---TCTAGTG-TTTGAGTAAATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-GT---TT-TGGCACCAAGTGTCCTTTGACCCCGATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C------T---T--T--T-TTTTCTAAGCAACCGAC-G----AAATAT-GACCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TTC-T-----ATA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACTTTCCGTACCTCATGCGATGT-TTTTCGGAtttattacattgcttatgaattttatatattttattacactcattctatttacagtattggcaacattagg
gi|22 : tgtatgtgccacatcagGGGTAATGTATTTCA--C----AATATA-TATAT----GT--T-AA--TGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--G-----A-AACTACA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAGA----A--A--------GA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGACATTAA----AACAT--CAATATAC--TCA--AGCTATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AAAG-GAAA-AAA-A---CACAAACTCAAAAAAGTCAACACTCATTTTGTATATGTTAAATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGTTTGGCATGA--AGAA-CATACA-CA-TATTTTAATATGATTATATTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--T
gi|23 : ataAA-TAA---TATTTCAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------A--TT-TA-A-TTTT-----ATAAA----A--A--------------TGAATCACATTTGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-----------------AA-A---C----TCTC----TAGCCAGCACTTATTCTGTACTTGTTACATTGCCAG-TAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTTAGGTTGGTACAGTCCGTA-AA---A-CA-TG---CGATATGAA-ATTTTCGTTTTA--ACTCTTCGTAAA-----AACTA--TATTGTTTAAAA--TTCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAG---TTTTGAT-AATTTGGT-------TA---TTT---T--T-----T-------TT
gi|24 : tggGGGTATTTTATTTCA----------ATA-TATAT----AT--CTAA--TGGTTAG-TAA---TATTTAAATTG---AAATAC-----ACAATTATA--------T--TT-CA-A-ATTT-----AAAAG----A--A---------A-TATTGAATCACCTTGGAAA-CGGCA---A--TAAAAA----AACACAT--T-G--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-GA-G-GAGC-AAG-A---C----TTTC----AAACCAACACCTGTTTTGTATGTGTTACCTTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----CG-TTAAGTTTGACATGT--AGAG-CATAAA-CA-TA---CACTATCATTATTTTCGTTT
gi|25 : aA----TAAAGATAACTTTGCAAGATCA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAACTAAATAC-T--CAAATGTAGTC---CCTATTG-TTTGAG----TCAGAAACA-----TCGAA-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAA------------------------CTTTGACCCCAATTT---T--TGCG-TT-ATA-A--TA--------CTTT--TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATGT-TGTCA-AGTATAGT--CTTAAGTTCT-TT--T-----CTA---A-AAC-AGTTTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTT
gi|26 : GGGTATTTTATTTCACTT----TATATA-TATAT----AT--TTAA--TGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AA---C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATT------AAAAA----A--A-------CAA-CACTGAATCGCATTG-------------------------------AC--TCG--AGCCATTTATCGCTATTGTTTCTAGTGTACAT-TT-C-AACG-AAAACAAA-A---T----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAATTTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGT
gi|27 : ta---AAA--C-----AGGGTTATA--------T--TT-AA----TTT-----AAAAA----A----------TAG-CATTGAATCACATTGGAAAATAGTATTTT--TAAACAT--CAACATAC--TC-------ATTTATTGGTATAAATTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GATA-AAA-A---C----TCTC----AAGCCA--TCTCATTTTGTATGT
gi|28 : -------TA---TCG---T--G-----T-------TTTG-----------TA---------CA-G-AAATTCCCATA----TAATTATAACTTTGCAAGA-AA-TAGGTATTG--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAGTGAAGTC---TGTAGTGATATGAGGATATacaataatagcacacgtaaattttaattttacaatgataaaaaaatgtactcacatgagaataatatatttattt
gi|29 : tgggCAATTG---T--TGTGCTT-GTA-A--TA--------C--A--AC---T--T--T-TTCT---GACAACCGAT-G----ATATAT-GTTCA-AGTATTGT--TTAAAGTCAC-TT--TAAAAAATA-TTACAAC-ATGCTTCCATGAACTTTAGATACCTCATGCAATGA-TGTTTacttcatttaagaatacagatagacaaagaattgcactttcaaagatcatattaagatatttacgtcatatgac
gi|3 : tttcaagatgtcggcccatgacaGTACTTTATTTCA--CAATATATATA-TATAT----ATAGTTAA--TGTTTAA-TAA---TTAATAAATGG---AAA--C-----A-AACAGTC--------T--TT-TA-A--CTT-----AAAAA----A--A--------AT-TCTTGCATCACATTGTAAA-TGACATTAA---AAATAT--CAATATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-TTAACG-GAAA-AAA-AT--C----TCTC----AAGTCAACACTCGTTTTGTAAATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----TATGA-TGGTTAAAGTTGGTA-----------------CA-TA---TCATACGATTATTTTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTGG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGAG-------TA---TTT---T--G-----T-------TTTG-----------TGGT------TCG-G-AAATTCCCACA----TAAAGACAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAATGTAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACT-----TCGAG------------CAT--TGAAAA-TG-TTAAA-TT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--AATAT---T--T--T-TCTT---GACAACCAAT-G----AAATAT-GGTAA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAT-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCAATGA-TTTTTGAAttaaaaatgtttaccaatttacaacatgcgatatttgattggaagaatcaa
gi|30 : -ACTTTGAT-------TA---TTT------G-----T-------TTTG-----------TGGC------TTA-G-ACAGTCCAATA----TAAAAATAA--TAGCAAGATAA----GTTTTTTAATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCGTTGAAATAAATATATAACAAATATGGTCAAGTATAGT--TTTAAGTattttttttttcc
gi|30 : ----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--TTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAA-AGAC------G-----TCTGTACCTCATGCGATGA-TTTTTTGAcactttctattacaaaagacgtctgtacctcatgcgatgattttttgagagaaaaaaataccagtc
gi|31 : actttgattatttgttttgtggcttagacagtccaatataaaaataatagcaagataagttttttaataataagcaaatatatgtattccgttgaaataaatatataacG-TTAAA-AT---AT-TTGCTTGTCGTGACCTTCGACC----TTT---TAACGCGGTC-AAA-AGGTC--------A--A--AT---A--T--T-TTTA---GGCAACCGATTGTTTCAAATGTAGGTTATAGTGCAGTGGC-AAACTAAT-TTAGC-----CCAGTTGC--C-A----TCCATGAACACGCTGTACCTCATGCATCGA-TTTCTAGgagaaaaaaataccagtc
gi|33 : ctcgtccaTAA--AAAACAT--AAACACGC--TCG--AGCCATTTATCAGTATTATTTCTACTGTACAT-TT-T-AATG-GAAA-A-A-A---C----TCTC----AAACCTACACTCGTTTTGTACGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----ccacatatatgagaaatttcaccaa
gi|33 : ATAT--TTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGT-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCTTAATatttattttcgtttaaacccttcatagtaactatgttgttaaaaatccttaat
gi|34 : taaaaaacataaacacgctcgagccatttatcagtattatttctactgtacattttaatggaaaaaactctcaaacctacactcgttttgtacgtgttacattgccagataattaaaGGGTATTTTTTCACT--C----TATATA-TATGTGTGTAT--ATAT--TGTTTAA-TTA---TGTTTAAATGG---AAA--C-----ACAA--A-A--------T--TT-AA-A-A---------AAAC----A--A-------CAA-CATTGAATCATATTGGAAA-TGGCATTAG--AAAACAT--CAAC--AC--TCG--AGCTATTTATCAGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-
gi|35 : ataGGGTATTTCATTTCA--C----TGTATA-TAT----------TTAA--TGTTAAA-TAA---TATTTAA-TGG---AAT--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----G--A---------A-CATTGAATCGTATTGGAAA-TGTCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--AAA--AGCCATTTATCGGTACTA
gi|37 : ta--AT---C--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-TGTCA-TATAAAAT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ATACGTCCGTGAACATTCCGAGCCTCATGCAATGA-TCTTTTGA
gi|38 : taaatGTGTACAT-TC-T-AACG-AAAA-AGAGA---G----TCTC----AAACCAACACTCGTTTTGTATGTGTAACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGTA-CAT-CG-CA-TA---CAGTATGCTTATTTTttttatgaccag
gi|39 : ----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--CTGAATATAC-GT--T-----CCA-TTGCAAC-ACACTTCCATGAACATTCCATACCTCTTGCGATGA-TATTTGG
gi|4 : GGGAATTTGATTTCT--T----TATATA-TATAT----AT--TTAA--TGTTAAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--T-----ACAGTTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAAT---A--A-------CAA-CGTT-AATTACATTAGAAC-TGGCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--TC---AGCCATTTATCAGTATTATTTCTAGTGAACAT-TT-T-AAAG-AAAA-AAACA---C----TTTC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTATGGTTGGTATAG--AGAA-TAT-TA-CA-AA---CAGTATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTTCGAT-GCTTTGAT-------TA---TTT---T--GA----T-------TTTT-----------TGGT------TCA-G-AAATCCCCATA----TAAAGACAACTTTGTAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGC----ATTCCATTGAAATGAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TAAAAA-TG-TTTAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCAATT-ATT-A--AA--------C--A--AT---T--TAAT-TCTT---GGCAACTGAT-G----AAATGT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TAACAAC-AGACTTCCGTGAACATTCCGTACCTCATGCAATTA-TTTTTGGAtattcatctgtccaact
gi|41 : -AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATGACAATGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-
gi|44 : aa----TATATA-TATGT----AT--ATGA--TGTTTGA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--------------ACA--------T--TT--------------------------------------------AATCACATTTGAAA-TGCCATTAA--TAAACAT--CAA
gi|45 : GGTATTTTAGTTCA--C----TATATA-TCTAT----AT---------ATCTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTA-------------TC-AA-A-A--------AAAAA----A--
gi|46 : tataa-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTTAATGAACATTGTGTATGTCATACGATGA-TTTTTGGA
gi|47 : ACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-attttttttaccaga
gi|5 : A--TGTTGAA-TAA---TGTCTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------TCTTT-AT-A---TT-----AAAAA----A--A-----------------ATAACATTGGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATACCATCATCAGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAGA-TCA-----C----TCTT----AAGCAAACACTTATTCTGTATGTTTTACATTACCAGATAA-ATAAAA-----TATGATTG-TTAAGGTTGGTATTGTCCGCA-AA--AA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTTAAAA--TTTATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTAGAT-------TA---TTT---T--A-----T-------TTTTGGGTGAGAATATGGTGTTTTGTCAAG-AAATTCCCATA----TAAATATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTG--ATAATAAACA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATAAAGTC---TCTGGTG-TTTGAGTATATCAGAAACG-----TCGAA-------A----TAT--TC-AAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCAAGTAACCTTCGCCCCTAATTT----------------------------------A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--ATAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTTCGTACCTCATACGATAA-TTTTTGGAcatacccaact
gi|6 : ATTTTATTTTA--C----TATATA-T-TAT----AT--TAAA--TGTATAA-TAC---TATTTAAATGG---TAT--C-----AAAATTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAA----------------CGATCATTGAATCACATTAAAAA-TTGCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AACCATTCATCAGTTTTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-TGAT-AAA-A---C----TCTC----AAGCCAACACTCATTTTTGATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAAATGT-C-----TG-TTAAGATTAGCATAG--AGTA-CATACA-TATTA---TGATAGTATTATTATCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AA-TA-----TGTTAAAAA--TCCGTAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-GAA---GTAT---TTCTGAT-AATTTGAT-------TA---TTT---T--G-----T-------TTAG-----------TGGT------------ACATTCCAATA----AAAAGATAACTTTTCAAGATTA-T-AGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TACATGT----GT---ATT---------------------CAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATTCGAAACA-----TC-AC-------A----AAT--TCAAAA-TG-TTAAA--T---TT-TTGCACCTAGTAACCTTTGAACCCAATTT---T--T-TGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ACTTAT--T--T-TCTT---GACAACGGAT-G----ACATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTATCTCATGCGATGA-TTTTTTGAttctttaccagact
gi|7 : GGGTATTCTATTTAA--C----AATATA-AATAA----CG--TTAA--AGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--C-----A-AACTGTA--------T--TA-AA-ATATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTCAATCACATTGGAAA-TGACATTA-------------AACATA---TCA--AGCCATTAATCAGTATTATTTCTAGCGTACAT-TT-C-AACG-GGGG-AAA---------------------TCAACGCTAATTTTGTAAATGTTACATTGCCGGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTTGG-A--------A-CATACA-CA-TA---TGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACTTTTCATATC-----AAATATTTTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCTG------TTTCG-AAA---GTAC---TTCTTAT-ACTTGGAT-------TA---TTT---T--G-----T-------TTTG-----------TGGT------TCA-GAAAATTCCCATA----TAAAGATATATTTACAAGATGA-T-TGTATTT--ATGATAAGCA-AGTA------TACATGTATGAATTCTA-TGAAATAAATAC-T--TAAATGTAGTT---TCTACTG-TTCGAGTGTATCAGAAACA-----TCGAG-------ACCGTCAT--TAAAAA-TT-TTAAT-TT---TT-TTGCA-------ACCTTTGACCCACATTT---T--TGCGTTTAATATA--TA--------C--T--GT---T--T--T-GCTT---GCCAACCGAC-G----AAATAT-AGACA-AGTATAGT--CTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AAACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGGTttttccttaac
gi|8 : aGGATATTTTATTTCA--C----AAAATG-TAT-T-----T--TTAA--TGTTTAA-TAA---TATTAAAATGC---AAA--C-----ATAATTTAA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A----------CAA----TGAATCATTTTGGAAA-TGGCATTAA--AGAACAA--CAATACAC--TCA--ATCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAG-TT-T-TACG-AGAA-AAT-A--------TCTC----CAACCAACACTCGTTCTGTATGTGTTTCAATGGCAGATAG-TTAAAATATGTT-----TA-TTAAGGTTGGCATGG--AGTT-CATACA-CA-TA---CGATACGATTATTTTCATTTAAATACCATTCATAGC-----AACTG--CGTTGTTAAAAA--CTCATA----------------------------TG-AAA---ATACACATT-TAGT-ACTTTGAT-------TA----TT---T--G-----T-------TTTG-----------TGGT------TCA-G-AAGTT-GCATA----TAAAGATGACTTTGCAAGATTA-T-TGTATTT--ATTATATG-G-A--A------T-TATAT----ACCCCAATGAAACGAATGC-C--TACATGCGGTA---TATAGTG-TTTAAATATATTGGACATA-----TCAAT-------A----TAT--CAAAAA-TG-TTAAC--A---TT-GCGCACCTAGTGACC----------ATTT---T--TGTGCTT-ATA-A--TG--------C--A--ACTG-T--T--T-TCTT---GGCAAACGAT-G----AAATAG-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ACAC-----------TTCCGTA-CTGGTGCGATAA-TTTc
gi|9 : caTATTTCACTTCA--TA---TATATAATATAT----AT--TTAA--TGATTAA-TAA---TATTGAAATGG---AAA--C-----ACAATTTTA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAGAA----ATAA-------CAA-CACTGACTCACATTCGAAA-TGACATTAA---AAACAT--CAGCATAC--TCG--AGCCATTGATCGATATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-TAA-C---G----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTA-ATAGCTGGATAA-TT-ATG-----T-----TG-TTAA
gi|9 : ctTTAATAGCTGGATAATTA--TGTTGTTAAAAAAATCCATAATATCT-----AAATCCAGTCAAGGTTTCG-AAA---GTAC---TTTTGATTATTTTGTT-------TTGTTTTT---T--G-----T-------TTTT-----------TTGT------TTA-A-AAATCCTCATA----TAAAGATAAATTTGCAACATTA-T-GGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TATATGT----GTTCCTTTGAAATAAATAC-T--CAAATG-----------------TTGAGTATATCAGAAACA-----C---------------------TCAAAA-TG-TTAAC-TTAATTTGTTGCACCTGGTGACCTTTGACCCC-ATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------T--AT-TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-CGTCA-AGTACAGT--CTAAAATTACTTT--T-----TTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACATCATGCGATAA-TTTTTTGAaaaaatccataatatctaaatccagtcaaggtttcgaaagtacttttgattattttgttttgttttttgtttttttgtttaaaaatcctcatataaagataaatttgcaacattatggtatttatgataagcaaatatatgtgttcctttgaaataaatactcaaatgttgagtatatcagaaacactcaaaatgttaacttaatttgttgcacctggtgacctttgaccccatttttgcgtttataatatatttttttcttggcaaccgatgaaatatcgtcaagtacagtctaaaattacttttttattacaacagacttccatgaacattccgtacatcatgcgataattttttgattgttttaaccacatt
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATTATCTTTATTACACTCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGTAGTAAACATGACTTCAGTCAAATTAAAGAAAATAGAAAATACTCATATATTTTTTTTTAATTTCACACACTCGCATCCTCAAAGGCGCGCAAGCACGCACGCACAGACTCAACAACAACAAAAATTTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTATAGATTCAATAAACATTCATTTTCAGTATATATGAAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTTATATTTATATTCAAATGTTTAATTACTAGTAGTCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTCTAATTTAATATCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CAAAAAATTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTACAATTGTCATCAATTCAATAAACATTCATTTTTATATATATGACAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTGATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTTTTAATTCTAATCTTATATCCTTTGATTGCTTTCCTTA
Unaligned ( gi|36 ): ATATATCATATCCTTTTATTACGCTCAATCCATTTACAGTAAAGGCAACGTTAGATTATATTGTACAGTACAGTAGGTAATGTGACTTTTGTAAAATTGAAGAAAATAGAAAATGCTGATATTTGTTTAA
Unaligned ( gi|40 ): TATATAACGTGTTTATTTACACTAAATCCATTTTACAGCAATGGCAACACAGGACTATATAATACGGTAATTAATATGACTTCAGTCAAATGAAAGAAAAG
Unaligned ( gi|42 ): CCTTTAGTTAAACTCTAAATGGTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTTTAATTAAATACCCTTTAATTCCTTTCCTT
Unaligned ( gi|43 ): ATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGGTCACTAACACTATTTAATTGTATGAATTCTAATTTAGTATCCCTTGATTGCTTTCCTTAAA
Unaligned ( gi|48 ): TTTTATTATCTTAATTATACCCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGT
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGTATTACTCTTATTCCATTTACGGCAATGTCAACATGAGGTAG
Unaligned ( gi|50 ): TGTTACTAGCGATAAATAACACTATATTTTTGTGTTAATTCTAATTT
Unaligned ( gi|51 ): ATTCTAATTTAATATCCCTTTATTGCTTTCCTTTAGTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111111 111 1111111111 55555555555 1111111111111111 1111111111111111111
lowQualScore : 2222222 2 666666 333 1 333 333 22 44444 0 55555555 22 1 1 1 1 33333 8888888888888888 1 1 000 22 22 22 1 1 1 1 1 2222222222 3333 1 00000000000 1 99 7 1 1 333 22 44444 22 22 44444 44444 1 333 333 1 1 333 888 22 66666 5555555 333 333 1111111111111111 55555 2 4444 2 0 1 1 44 1 22 555555 3333 1 22 333 1 55555 666666666666 22 2 2 7777777 2 444444 0 2 2 22 5555555555555555555 22 22 2 333 2 4444 1 1 22 1 44 44444 1 1 2 2
lowQualScore : ....... . ...... ... . ... ... .. ..... . ........ .. . . . . ..... ................ . . ... .. .. .. . . . . . .......... .... . ........... . .. . . . ... .. ..... .. .. ..... ..... . ... ... . . ... ... .. ..... ....... ... ... ................ ..... . .... . . . . .. . .. ...... .... . .. ... . ..... ............ .. . . ....... . ...... . . . .. ................... .. .. . ... . .... . . .. . .. ..... . . . .
lowQualScore : 4444444 2 111111 888 8 222 000 44 33333 5 88888888 22 5 5 5 0 88888 1111111111111111 6 6 333 00 00 00 4 5 5 5 6 3333333333 4444 7 44444444444 7 22 0 7 7 000 55 33333 44 44 88888 88888 9 555 555 8 9 222 222 55 44444 9999999 222 333 2222222222222222 00000 0 0000 1 9 9 9 55 9 66 555555 9999 8 55 222 9 33333 999999999999 99 1 0 1111111 0 222222 3 1 1 99 6666666666666666666 99 99 1 777 1 0000 9 9 66 7 11 33333 7 7 7 0
consensus : GGGTATTTTATTTCAC----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
Reference ( family-950 ) : GGGTATTTTATTTCAC----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
gi|1 : TGTA-AATAT------AT--TTA-CGTTTAAGTAA---AA---AAATAT---ACA--CCCGTGACAAATATA--------T----------ATGT-------------------------CAA--ACTGACTTATAT---AAA-TGGCGTTAG--AACACAT--CA-CATAT--TCG--AGTCCTTTATCCGTATTATTTCT-------------T-AACG---AA-AAT---A-C----TCTG----ACGCCAACACTTATTTTGTATGTGATACATTGCCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTTGTATGATCCGCACATACA-CA-TA---CGATATTATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGCTGTTTAAAA--TACATACTATTT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAACAAGTAC---TTTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--GGGGTTT-------TT---T---TT-----G----------GTTC-----AG-AAATCCCCATATA----AAGATGACTTTGCAAGATAA-T-G-TATTC--GTGATAAGCA-A--A------TATGTGT----ATTCTGTTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----GCAAG-------A----CAA--CCAAAACTG-T-AA--TT---TT-TTGCACTTAATGACCTTTGTCCCAAATTT---A--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-ATCT---GGCAACCGAT-A----CAATAT-AGTCA-AGAATAGT--GTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTCCATTAACATTCTAGACCTCATGCGATGATTTTTTGGA
gi|10 : aaaaaatagtattaagaccacaactatggggcgccaaacgtgactatattcaatggcatacatatatatgttgttGGGTATTTTATTTCAC----TTTATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAGATGG---AAA--C-----ACA-TAATA--------C--TT-AA-T-TTTTTAAAAAAAAA----G--A-------CAA-GATTGAATCTCATTGAAAA-TGGCATAAAAATAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACA-AACA-AAA---A-C----TGTC----AAGGCAACACTTATTT-GTATTTGTTACATTGCCCGATAA-----AA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACAT-CG-CA-TA---CAGCATGATTTGTTTTGTTTAA--ACCTTTCAGAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTAATTA---TTT---T--G-----T-------TTGTTT---GT-----A----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATAGGTAAAGATAACTTTGCAAGATAC-T-GGTATTT--ATAATAATAA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CACATGCAGTC---TCTGGTG-TTTCAGTATGTCAGAAACA-----CTGAG-------A----CAT--TCAACA----TTCAC-TT---TC-Ttattttaa
gi|10 : taTCAC-TT--T-----CTG-TTACAAC-AGACTTCCATGAACCGTCCATACCTCAAGCGATGA-TTTTTgttacaacagacttccatgaaccgtccatacctcaagcgatgattttttaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : tagggtattttatttcactttatatatatatatttaatgtttaataatatttagatggaaacacataatacttaattttttaaaaaaaaagacaagattgaatctcattgaaaatggcataaaaataaacatcaacatactcgagccatttattggtattatttctagtgtacattttaacaaacaaaaactgtcaaggcaacacttatttgtatttgttacattgcccgataaaattgttaaggttggtatggagtacatcgcatacagcatgatttgttttgtttaaacctttcagagaaactgtgttgttaaaaatccataatatctaaatccagttttcaaaagtacttctgatactttaattattttgtttgtttgtagttcagaaattcccatataggtaaagataactttgcaagatactggtatttataataataaaatatatgtattccattgaaataaatactcacatgcagtctctggtgtttcagtatgtcagaaacactgagacattcaacatGGGTATCTT-TTTTAC----A--ATATT-TA---------A-----AATATACAG-TAACTTTATTCAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TTGAA-A-ATTT-----TTAAA----T--------------CATTGAATCACAATGGCAA-TGACATTGA--AAAACATTGTAACAAGC--T----AGCCATTTATCGGTATTATTTTTAATACATGT-TTGT-TACG-Gtaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : a-----T-----TG-TTACGGTTGACATCG--AATATATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCACCTTAGC-----AAATA--TGTTGTTAAAA---TCCATAATATCC-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGATTA---TTT---T--A-----T-------TA---A---GT-----G----------ATTC-----AG-AAATGCCAATAAA----AAGATAA--------------T-GGTATTT--ATAATTAGCA-A--A------TATATGT----A---CA-----------------CAAATGTAGTA---TCTAGTG-TTTGAGTATATTAGAAACAGAATATCAAA-------A----TATATTCAAAA-TG-GCAAC-TA---TT-TTGCACCTAGTGGTCTTTGGCT---ATTTATTT--TGCTTTT-GTA-A--TA--------C--A--AT---T--T--TGTCTT---GGCATCCGAT-A----AAATAG-TGTCC-AGTATAGT--T-------AC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTTCATGAGCATTCCGTACCTCATACGATGA-TTTTTGGttgacatcgaatatatacacatacgatatgattattttcgtttaaacccaccttagcaaatatgttgttaaaatccataatatccaaatccagtttttgaaagtacttctaatactttgattattttattaagtgattcagaaatgccaataaaaagataatggtatttataattagcaaatatatgtacacaaatgtagtatctagtgtttgagtatattagaaacagaatatcaaaatatattcaaaatggcaactattttgcacctagtggtctttggctatttattttgcttttgtaatacaattttgtcttggcatccgataaaatagtgtccagtatagttactttctattacaacatattttcatgagcattccgtacctcatacgatgatttttgggttttgtttaccagact
gi|12 : agggtatcttttttacaatatttaaaatatacagtaactttattcaaatggaaacacaattatatttgaaaatttttaaatcattgaatcacaatggcaatgacattgaaaaacattgtaacaagctagccatttatcggtattatttttaatacatgtATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAACC--A--A-------CAA-CATTGAATCACATTTGAAA-TGGCATAAA--TAAACAT--CAAAATAC--TTG--AGCAATTTATCGGTACTATTTCAAGTGTACAA-TT-T-AACGAGAAA-AAAAACA-C----TCTT----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGCTACATTTCCAGATAA-TTACAT-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTATAT-CG-CA-AA---CAGTATAATTA-TTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCAATAATATCT-----AAATTAAGT-----TTTCG-Agttttgtttaccagact
gi|12 : TAAGTTTTC--GATTA-T-AATTTTTT-ATAATATGCA-A--AATTTAATATATGT----ATTCCATTTAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGAG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TGGTTACT-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATT-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-TCTT---GACAACTGAT-G----AAATGT-GATCA-AGTAAAGT--CTAAAATCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGAttataattttttataatatgcaaaatttaatatatgtattccatttaaataaatactcaaatgcagtctctagagtttgagtatatcagaaacaccgagacattcaaaatggttactttttttgcacctagtgacctttgaccccaatttttgcgtttattatacattttttcttgacaactgatgaaatgtgatcaagtaaagtctaaaatcactttctattacaacagacttccatgaacattccgtacctcatgcgatgatttttggattttgtttgaccagact
gi|13 : atatttaaaatttaaaaaccaacaacattgaatcacatttgaaatggcataaataaacatcaaaatacttgagcaatttatcggtactatttcaagtgtacaatttaacgagaaaaaaaacactcttaagccaacacccgttttgtatgtgctacatttccagataattacatttgttaaggttggtatggagtatatcgcaaacagtataattatttcgtttaaaccctttatagaaactgtgttgttaaaaatcaataatatctaaatTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAC-AAA---A-C----TCTC----AAGCTAACACACATTTTGTATGTGTTGCATTGTCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGTCTGT--AGTACAT-CG-CA-AA---CGATGTGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGATTT---TTTTG-T--G-----T-------TT---T---GTTTTTAG----------GTTC-----AG-AAATTCCCACATA----AAGA------TGCAAGATTA-T-AGTATTC--ATAACATGCA-A--A------AATATGT----ATTCAATTTTGATATATAC-T--CAACTGCAGTC---TC------TCTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----TAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TTA--TT-TTGCACCTAGTGAACTTTGGCCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ATTG-T--T--T-TCTT---GTCAACCGAT-G----AAATAC-GGTCA-ACCTTAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-ATACATCTA---TTCCATGAACATTCCGAACTTCATGCGATGA-GTTTTGGttttgtttgaccagact
gi|14 : ATTTCAC----T--TTATA-TATAT------AT----AATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGATGAAAA--C-----ACAATTATAATAAATTAT--TT-AA-A-ATTA-----AACAACAACA--A-------CAA-CATTGAATCAAGTTGGAAA----------------CAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCTGTATAGTTTCTAGTTTACTT-TT-T-GACG-GAAA-TAA---ATC----TCTC----AAGCCAGCACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTATAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTATAT-CA-CA-TA---CGGTATGATTATTTTTATTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTG--TGTTGTTAAATA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-ACA-----------TTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---TTAA-----T-------TT---T---TT-----A-----------TTC-----AT-AAATCCCCATATA----ACGATAACTTTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TTTATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCAAG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACTCgatttttgtttaccagac
gi|15 : ATTTTA--------A--TT-AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATTACATTGGAAA-TTGCATT----TAA-CAT--CAACGTAC--TCG--AGCCATTAATCGACAATATATCTGGTGTACAT-TT-T-AACA-GAAA-A-------C----TCCC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATAACCAGATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGCATGG--AGTACATACA-CG-TA---CGATATGATTATGTTCCTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAACATCTAATAAAAATCAAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTTAC-ACTTTGGTTA---TTT---T--A-----T-------CT---T---AT-----T----------GTTC-----AG-ACATTCCCATAT---------TAG-TTTACAAGATTG-T-GGTATTT--ATAAGACGCA-A--A------TTCATGT----ATTCCATTGAAAT-AACAC-T--CAAATTCAGTC---TCTAGTT-TTTGGGTATATCAATAACA-----ATGTG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAACTTT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGAACCCATTTT---T--TGCGTTT-ATA-A--aa
gi|16 : tctgtataatgtACATGTT-T-AGCG-GGAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTTATTTTGCATGTGTTACATTGGCAGATAA-GTAAAA-----TGTGTTTG-TTAAGGTTGGTATGGTCCGTACATACA-AA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----GACTA--TGTTGTTAAAAA--CCCATAACATCT-----AAATTCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGATTA---TTTTA-T--G-----T-------TT---T---atatattt
gi|16 : TATGT----TTTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAACG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAGCATCGAGA----CAG--TCAAAA-TG-TTCACCTT---TT-TTACACCTAGTGACCTTTGAACCCAATTT---A--TGCGTTC-ATA-A--TAATAATTCAT--A--AT---TATT--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AACTAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAATTAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGAAGA-TTCTTccattgaaataaatactcaaatgcagtctctaacgtttgagtatatcagaaacatcgagcatcgagacagtcaaaatgttcaccttttttacacctagtgacctttgaacccaatttatgcgttcataataataattcataattattttcttggcaaccgatgaactatggtcaagtatagtctaaaattactttctattacaacatacttccatgaacattccgtacctcatgcgaagattctttttaatttttttaccagact
gi|17 : acatgtttagcgggaaaaaactctcaagccaacacttattttgcatgtgttacattggcagataagtaaaatgtgtttgttaaggttggtatggtccgtacatacaaatacgatatgattattttcgtttaaacccttcatagagactatgttgttaaaaacccataacatctaaattcagttttcgaaagtacttttgatactttgattatttAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGAATTATTTCAAATGTACAT-TT-T-AACG-GGA----------T----TTTT-------TCA-----CATTTTTTATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAA-----TATGTCTG-TTAAGGTTGGCATGC--AGT------A-CA-TG---C-ACATG-----------------------CA---C-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATAT-----AAATCTAGT-----TTT-G-AAA---GGTC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCAATATA----CAGACAACTTTGCAAGAAAAAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTTGTG-TTTGAGAATATCAGAAACA-----TCACT-------A----CAT--TCAAAA-TG-CTAAT-TA---TT-TTGCGTTTA-TAA----TA----CAATT--------------------------------------AT---T-----T-TCAT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATGGT--CTAAAGTCAT-TT--T-----TTG-TTGCAAC-AGtttaatttttttaccagact
gi|18 : T------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAAAC---A--A-------CAA-TAATGAATCACATTGGAAA-TGGCATGAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACT-TAAA-AAG---A------TCTC----AAGCCAACATTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACAT-CA-CA-TT---CGGTATGATTATTTTCATTTTA--ACCCTTCACAGA-----AACTG--TGTTGTTAAA---------------------AAATCCTGT-----TTTCG-AGG---GTAC---TTTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--G-----TGGGAATGTT---T----T-----T----------ACTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTCCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGA----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--TAAATGCAGTC---TCTAGT
gi|19 : GAGTATTTTATTTCAA----T--ATGTA-TGTAT------AT--TTAATATTAGA-TAA---TATTTATATGA---AG----------CAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--AACCCCAACAA-CATTGATTGGCATTTGAAA-TGTCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGCTATTATTTTTTGTGTACAT-TT-T-AACG-AGAA-AAA---A------TCTG----AAGCCAACACTGGTTAGGTATATGTTACATTGCCAGATAA-TCAAAATATGTT-----TG-TTATGGTTGGTATGGTCCGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTATCTATT-A--ACCCTTCATAAC-----AACTA--TGTTGTCACGAA--TCCACAATATCT-----AAATCCAGT---------------------------------------TTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-ATATTCCCGTATG----AAGATAATTTTACA
gi|2 : tttaTGTTTTA-TAA---TATTTAAATTG---AAA--C-----ACCATTATA--------T-----AAGA-ATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTGCATCAAATTGGAAA-TGGCATTAA--TAGACAT--CAACATAC--TCG--GACCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-AATG-AAAA-AAA---ATC----TCTG----AAGCCAACACTC---------ATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTCAGTATGGTCCATACATACG-CA-TA---CGATATGATTATTTTTGTATAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGGTGTT-AAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCGAAAA---GTAC---TTTTGAT-ATTTTTATTA---TTTTCCT--T-----T-------TT---T---TT-----C----------GTTC-----AG-AAACTCCCATTAA----AAGATAACTTTGCAATATCA-T-GGTATTG--ATAAGAAACACA--A------T-TATGT----ATTCCATT-AAATAAATGC-T--CATATGCATGC---TCTAATG-TTTGAGTATATCAGCAACA-----TCGAG-------G----CAT--TCAAAA-TC-TTAAT-TT---TT-TTCCGCCTAGTGACCTTTAATCCCAATGT---T--TACGTTC-TTA-A--TA--------C--A--TTGG-T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----GAACAT-GTTCA-AGTATATG--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTGCAAC-AGACTTCAATAAACATTCCgcatgtaaagcaagttcaattatccgcaagtatctagcaaacgtttg
gi|20 : AGGTTAGT--GA--AATA---ACA-CC-AA---C-ATATATTTAATTTAGATTAA--GC-----ATA--------ACTA--T-CTGTCAGACA--AC----ACGGCC-----AAAGTTGGC-----TTTT----A---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--------T-------TG---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCAAATA----AAGATAACTCTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATAT----ATTTCATTGAAATAAACAT-T--CAAATGCAATC---TCTAGTG-TTTGAGTAAATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-GT---TT-TGGCACCAAGTGTCCTTTGACCCCGATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C------T---T--T--T-TTTTCTAAGCAACCGAC-G----AAATAT-GACCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TTC-T-----ATA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACTTTCCGTACCTCATGCGATGT-TTTTCGGAtttattacattgcttatgaattttatatattttattacactcattctatttacagtattggcaacattagg
gi|22 : tgtatgtgccacatcagGGGTAATGTATTTCAC----A--ATATA-TATAT------GT--T-AATGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--G-----A-AACTACA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAGA----A--A--------GA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGACATTAA----AACAT--CAATATAC--TCA--AGCTATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AAAG-GAAA-AAA---A-CACAAACTCAAAAAAGTCAACACTCATTTTGTATATGTTAAATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGTTTGGCATGA--AGAACATACA-CA-TATTTTAATATGATTATATTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--T
gi|23 : ataAA-TAA---TATTTCAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------A--TT-TA-A-TTTT-----ATAAA----A--A--------------TGAATCACATTTGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-----------------AA---A-C----TCTC----TAGCCAGCACTTATTCTGTACTTGTTACATTGCCAG-TAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTTAGGTTGGTAC----AGTCCGTAAAACA-TG---CGATATGAA-ATTTTCGTTTTA--ACTCTTCGTAAA-----AACTA--TATTGTTTAAAA--TTCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAG---TTTTGAT-AATTTGGTTA---TTT---T--T-----T-------TT---
gi|24 : tggGGGTATTTTATTTCA----------ATA-TATAT------AT--CTAATGGTTAG-TAA---TATTTAAATTG---AAATAC-----ACAATTATA--------T--TT-CA-A-ATTT-----AAAAG----A--A---------A-TATTGAATCACCTTGGAAA-CGGCA---A--TAAAAA----AACACAT--T-G--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-GA-G-GAGC-AAG---A-C----TTTC----AAACCAACACCTGTTTTGTATGTGTTACCTTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----CG-TTAAGTTTGACATGT--AGAGCATAAA-CA-TA---CACTATCATTATTTTCGTTT
gi|25 : aATA----AAGATAACTTTGCAAGATCA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAACTAAATAC-T--CAAATGTAGTC---CCTATTG-TTTGAG----TCAGAAACA-----TCGAA-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAA------------------------CTTTGACCCCAATTT---T--TGCG-TT-ATA-A--TA--------CTTT--TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATGT-TGTCA-AGTATAGT--CTTAAGTTCT-TT--T-----CTA---A-AAC-AGTTTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTT
gi|26 : GGGTATTTTATTTCAC----TTTATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AA---C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATT------AAAAA----A--A-------CAA-CACTGAATCGCATTG-------------------------------AC--TCG--AGCCATTTATCGCTATTGTTTCTAGTGTACAT-TT-C-AACG-AAAACAAA---A-T----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAATTTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGT
gi|27 : ta---AAA--C-----AGGGTTATA--------T--TT-AA----TTT-----AAAAA----A----------TAG-CATTGAATCACATTGGAAAATAGTATTTT--TAAACAT--CAACATAC--TC-------ATTTATTGGTATAAATTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GATA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCA--TCTCATTTTGTATGT
gi|28 : TA---TCG---T--G-----T-------TT---T---GT-----A-------------C-----AG-AAATTCCCATATA----ATTATAACTTTGCAAGA-AA-TAGGTATTG--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAGTGAAGTC---TGTAGTGATATGAGGATATacaataatagcacacgtaaattttaattttacaatgataaaaaaatgtactcacatgagaataatatatttattt
gi|29 : tgggCAATTG---T--TGTGCTT-GTA-A--TA--------C--A--AC---T--T--T-TTCT---GACAACCGAT-G----ATATAT-GTTCA-AGTATTGT--TTAAAGTCAC-TT--TAAAAAATA-TTACAAC-ATGCTTCCATGAACTTTAGATACCTCATGCAATGA-TGTTTacttcatttaagaatacagatagacaaagaattgcactttcaaagatcatattaagatatttacgtcatatgac
gi|3 : tttcaagatgtcggcccatgacaGTACTTTATTTCACAATAT--ATATA-TATAT------ATAGTTAATGTTTAA-TAA---TTAATAAATGG---AAA--C-----A-AACAGTC--------T--TT-TA-A--CTT-----AAAAA----A--A--------AT-TCTTGCATCACATTGTAAA-TGACATTAA---AAATAT--CAATATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-TTAACG-GAAA-AAA---ATC----TCTC----AAGTCAACACTCGTTTTGTAAATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----TATGA-TGGTTAAAGTTGGTA---------CATAT--CA-TA---CGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTGG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGAGTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----GG-AAATTCCCACATA----AAGACAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAATGTAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACT-----TCGAG------------CAT--TGAAAA-TG-TTAAA-TT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--AATAT---T--T--T-TCTT---GACAACCAAT-G----AAATAT-GGTAA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAT-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCAATGA-TTTTTGAAttaaaaatgtttaccaatttacaacatgcgatatttgattggaagaatcaa
gi|30 : -ACTTTGATTA---TTT------G-----T-------TT---T---GT-----G----------GCTT-----AG-ACAGTCCAATATA----AAAATAA--TAGCAAGATAA----GTTTTTTAATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCGTTGAAATAAATATATAACAAATATGGTCAAGTATAGT--TTTAAGTattttttttttcc
gi|30 : ----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--TTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAA-AGAC------G-----TCTGTACCTCATGCGATGA-TTTTTTGAcactttctattacaaaagacgtctgtacctcatgcgatgattttttgagagaaaaaaataccagtc
gi|31 : actttgattatttgttttgtggcttagacagtccaatataaaaataatagcaagataagttttttaataataagcaaatatatgtattccgttgaaataaatatataacG-TTAAA-AT---AT-TTGCTTGTCGTGACCTTCGACC----TTT---TAACGCGGTC-AAA-AGGTC--------A--A--AT---A--T--T-TTTA---GGCAACCGATTGTTTCAAATGTAGGTTATAGTGCAGTGGC-AAACTAAT-TTAGC-----CCAGTTGC--C-A----TCCATGAACACGCTGTACCTCATGCATCGA-TTTCTAGgagaaaaaaataccagtc
gi|33 : ctcgtccaTAA--AAAACAT--AAACACGC--TCG--AGCCATTTATCAGTATTATTTCTACTGTACAT-TT-T-AATG-GAAA-A-A---A-C----TCTC----AAACCTACACTCGTTTTGTACGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----ccacatatatgagaaatttcaccaa
gi|33 : ATAT--TTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGT-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCTTAATatttattttcgtttaaacccttcatagtaactatgttgttaaaaatccttaat
gi|34 : taaaaaacataaacacgctcgagccatttatcagtattatttctactgtacattttaatggaaaaaactctcaaacctacactcgttttgtacgtgttacattgccagataattaaaGGGTATTTT--TTCAC----T--CTATA-TATATGTGTGTAT--ATATTGTTTAA-TTA---TGTTTAAATGG---AAA--C-----ACAA--A-A--------T--TT-AA-A-A---------AAAC----A--A-------CAA-CATTGAATCATATTGGAAA-TGGCATTAG--AAAACAT--CAAC--AC--TCG--AGCTATTTATCAGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-
gi|35 : ataGGGTATTTCATTTCAC----T--GTATA-TAT------------TTAATGTTAAA-TAA---TATTTAA-TGG---AAT--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----G--A---------A-CATTGAATCGTATTGGAAA-TGTCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--AAA--AGCCATTTATCGGTACTA
gi|37 : ta--AT---C--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-TGTCA-TATAAAAT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ATACGTCCGTGAACATTCCGAGCCTCATGCAATGA-TCTTTTGA
gi|38 : taaatGTGTACAT-TC-T-AACG-AAAA-AGAG--A-G----TCTC----AAACCAACACTCGTTTTGTATGTGTAACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGTACAT-CG-CA-TA---CAGTATGCTTATTTTttttatgaccag
gi|39 : ----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--CTGAATATAC-GT--T-----CCA-TTGCAAC-ACACTTCCATGAACATTCCATACCTCTTGCGATGA-TATTTGG
gi|4 : GGGAATTTGATTTCTT----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTAAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--T-----ACAGTTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAAT---A--A-------CAA-CGTT-AATTACATTAGAAC-TGGCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--TC---AGCCATTTATCAGTATTATTTCTAGTGAACAT-TT-T-AAAG-AAAA-AAAC--A-C----TTTC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTATGGTTGGTATAG--AGAATAT-TA-CA-AA---CAGTATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTTCGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--GA----T-------TT---T---TT-----G----------GTTC-----AG-AAATCCCCATATA----AAGACAACTTTGTAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGC----ATTCCATTGAAATGAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TAAAAA-TG-TTTAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCAATT-ATT-A--AA--------C--A--AT---T--TAAT-TCTT---GGCAACTGAT-G----AAATGT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TAACAAC-AGACTTCCGTGAACATTCCGTACCTCATGCAATTA-TTTTTGGAtattcatctgtccaact
gi|41 : -AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATGACAATGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-
gi|44 : aa----T--ATATA-TATGT------AT--ATGATGTTTGA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--------------ACA--------T--TT--------------------------------------------AATCACATTTGAAA-TGCCATTAA--TAAACAT--CAA
gi|45 : GGTATTTTAGTTCAC----T--ATATA-TCTAT------AT-------ATCTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTA-------------TC-AA-A-A--------AAAAA----A--
gi|46 : tataa-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTTAATGAACATTGTGTATGTCATACGATGA-TTTTTGGA
gi|47 : ACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-attttttttaccaga
gi|5 : ATGTTGAA-TAA---TGTCTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------TCTTT-AT-A---TT-----AAAAA----A--A-----------------ATAACATTGGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATACCATCATCAGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAGA-TCA-----C----TCTT----AAGCAAACACTTATTCTGTATGTTTTACATTACCAGATAA-ATAAAA-----TATGATTG-TTAAGGTTGGTATTG--TCCGCAAAAA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTTAAAA--TTTATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTAGATTA---TTT---T--A-----T-------TT---TTGGGT-----GAGAATATGGTGTTTTGTCAAG-AAATTCCCATATA----AATATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTG--ATAATAAACA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATAAAGTC---TCTGGTG-TTTGAGTATATCAGAAACG-----TCGAA-------A----TAT--TC-AAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCAAGTAACCTTCGCCCCTAATTT----------------------------------A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--ATAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTTCGTACCTCATACGATAA-TTTTTGGAcatacccaact
gi|6 : ATTTTATTTTAC----T--ATATA-T-TAT------AT--TAAATGTATAA-TAC---TATTTAAATGG---TAT--C-----AAAATTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAA----------------CGATCATTGAATCACATTAAAAA-TTGCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AACCATTCATCAGTTTTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-TGAT-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCATTTTTGATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAAATGT-C-----TG-TTAAGATTAGCATAG--AGTACATACA-TATTA---TGATAGTATTATTATCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AA-TA-----TGTTAAAAA--TCCGTAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-GAA---GTAT---TTCTGAT-AATTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---A---GT-----G----------GT----------ACATTCCAATAAA----AAGATAACTTTTCAAGATTA-T-AGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TACATGT----GT---ATT---------------------CAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATTCGAAACA-----TC-AC-------A----AAT--TCAAAA-TG-TTAAA--T---TT-TTGCACCTAGTAACCTTTGAACCCAATTT---T--T-TGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ACTTAT--T--T-TCTT---GACAACGGAT-G----ACATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTATCTCATGCGATGA-TTTTTTGAttctttaccagact
gi|7 : GGGTATTCTATTTAAC----A--ATATA-AATAA------CG--TTAAAGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--C-----A-AACTGTA--------T--TA-AA-ATATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTCAATCACATTGGAAA-TGACATTA-------------AACATA---TCA--AGCCATTAATCAGTATTATTTCTAGCGTACAT-TT-C-AACG-GGGG-AAA---------------------TCAACGCTAATTTTGTAAATGTTACATTGCCGGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTTGG-A--------ACATACA-CA-TA---TGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACTTTTCATATC-----AAATATTTTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCTG------TTTCG-AAA---GTAC---TTCTTAT-ACTTGGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AGAAAATTCCCATATA----AAGATATATTTACAAGATGA-T-TGTATTT--ATGATAAGCA-AGTA------TACATGTATGAATTCTA-TGAAATAAATAC-T--TAAATGTAGTT---TCTACTG-TTCGAGTGTATCAGAAACA-----TCGAG-------ACCGTCAT--TAAAAA-TT-TTAAT-TT---TT-TTGCA-------ACCTTTGACCCACATTT---T--TGCGTTTAATATA--TA--------C--T--GT---T--T--T-GCTT---GCCAACCGAC-G----AAATAT-AGACA-AGTATAGT--CTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AAACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGGTttttccttaac
gi|8 : aGGATATTTTATTTCAC----A--AAATG-TAT-T-------T--TTAATGTTTAA-TAA---TATTAAAATGC---AAA--C-----ATAATTTAA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A----------CAA----TGAATCATTTTGGAAA-TGGCATTAA--AGAACAA--CAATACAC--TCA--ATCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAG-TT-T-TACG-AGAA-AAT---A------TCTC----CAACCAACACTCGTTCTGTATGTGTTTCAATGGCAGATAG-TTAAAATATGTT-----TA-TTAAGGTTGGCATGG--AGTTCATACA-CA-TA---CGATACGATTATTTTCATTTAAATACCATTCATAGC-----AACTG--CGTTGTTAAAAA--CTCATA----------------------------TG-AAA---ATACACATT-TAGT-ACTTTGATTA----TT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAGTT-GCATATA----AAGATGACTTTGCAAGATTA-T-TGTATTT--ATTATATG-G-A--A------T-TATAT----ACCCCAATGAAACGAATGC-C--TACATGCGGTA---TATAGTG-TTTAAATATATTGGACATA-----TCAAT-------A----TAT--CAAAAA-TG-TTAAC--A---TT-GCGCACCTAGTGACC----------ATTT---T--TGTGCTT-ATA-A--TG--------C--A--ACTG-T--T--T-TCTT---GGCAAACGAT-G----AAATAG-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ACAC-----------TTCCGTA-CTGGTGCGATAA-TTTc
gi|9 : caTATTTCACTTCATA---T--ATATAATATAT------AT--TTAATGATTAA-TAA---TATTGAAATGG---AAA--C-----ACAATTTTA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAGAA----ATAA-------CAA-CACTGACTCACATTCGAAA-TGACATTAA---AAACAT--CAGCATAC--TCG--AGCCATTGATCGATATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-TAA---C-G----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTA-ATAGCTGGATAA-TT-ATG-----T-----TG-TTAA
gi|9 : ctTTAATAGCTGGATAATTA--TGTTGTTAAAAAAATCCATAATATCT-----AAATCCAGTCAAGGTTTCG-AAA---GTAC---TTTTGATTATTTTGTTTTGTTTTT---T--G-----T-------TT---T---TT-----T----------GTTT-----AA-AAATCCTCATATA----AAGATAAATTTGCAACATTA-T-GGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TATATGT----GTTCCTTTGAAATAAATAC-T--CAAATG-----------------TTGAGTATATCAGAAACA-----C---------------------TCAAAA-TG-TTAAC-TTAATTTGTTGCACCTGGTGACCTTTGACCCC-ATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------T--AT-TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-CGTCA-AGTACAGT--CTAAAATTACTTT--T-----TTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACATCATGCGATAA-TTTTTTGAaaaaatccataatatctaaatccagtcaaggtttcgaaagtacttttgattattttgttttgttttttgtttttttgtttaaaaatcctcatataaagataaatttgcaacattatggtatttatgataagcaaatatatgtgttcctttgaaataaatactcaaatgttgagtatatcagaaacactcaaaatgttaacttaatttgttgcacctggtgacctttgaccccatttttgcgtttataatatatttttttcttggcaaccgatgaaatatcgtcaagtacagtctaaaattacttttttattacaacagacttccatgaacattccgtacatcatgcgataattttttgattgttttaaccacatt
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATTATCTTTATTACACTCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGTAGTAAACATGACTTCAGTCAAATTAAAGAAAATAGAAAATACTCATATATTTTTTTTTAATTTCACACACTCGCATCCTCAAAGGCGCGCAAGCACGCACGCACAGACTCAACAACAACAAAAATTTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTATAGATTCAATAAACATTCATTTTCAGTATATATGAAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTTATATTTATATTCAAATGTTTAATTACTAGTAGTCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTCTAATTTAATATCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CAAAAAATTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTACAATTGTCATCAATTCAATAAACATTCATTTTTATATATATGACAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTGATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTTTTAATTCTAATCTTATATCCTTTGATTGCTTTCCTTA
Unaligned ( gi|36 ): ATATATCATATCCTTTTATTACGCTCAATCCATTTACAGTAAAGGCAACGTTAGATTATATTGTACAGTACAGTAGGTAATGTGACTTTTGTAAAATTGAAGAAAATAGAAAATGCTGATATTTGTTTAA
Unaligned ( gi|40 ): TATATAACGTGTTTATTTACACTAAATCCATTTTACAGCAATGGCAACACAGGACTATATAATACGGTAATTAATATGACTTCAGTCAAATGAAAGAAAAG
Unaligned ( gi|42 ): CCTTTAGTTAAACTCTAAATGGTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTTTAATTAAATACCCTTTAATTCCTTTCCTT
Unaligned ( gi|43 ): ATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGGTCACTAACACTATTTAATTGTATGAATTCTAATTTAGTATCCCTTGATTGCTTTCCTTAAA
Unaligned ( gi|48 ): TTTTATTATCTTAATTATACCCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGT
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGTATTACTCTTATTCCATTTACGGCAATGTCAACATGAGGTAG
Unaligned ( gi|50 ): TGTTACTAGCGATAAATAACACTATATTTTTGTGTTAATTCTAATTT
Unaligned ( gi|51 ): ATTCTAATTTAATATCCCTTTATTGCTTTCCTTTAGTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111111 111 1111111111 55555555555 1111111111111111 1111111111111111111
lowQualScore : 2222222 2 666666 333 1 333 333 22 44444 0 55555555 22 1 1 1 1 33333 8888888888888888 1 1 000 22 22 22 1 1 1 1 1 2222222222 3333 1 00000000000 1 99 7 1 1 333 22 44444 22 22 44444 44444 1 333 333 1 1 333 888 22 66666 5555555 333 333 1111111111111111 55555 2 4444 2 0 1 1 44 1 22 555555 3333 1 22 333 1 55555 666666666666 22 2 2 7777777 2 444444 0 2 2 22 5555555555555555555 22 22 2 333 2 4444 1 1 22 1 44 44444 1 1 2 2
lowQualScore : ....... . ...... ... . ... ... .. ..... . ........ .. . . . . ..... ................ . . ... .. .. .. . . . . . .......... .... . ........... . .. . . . ... .. ..... .. .. ..... ..... . ... ... . . ... ... .. ..... ....... ... ... ................ ..... . .... . . . . .. . .. ...... .... . .. ... . ..... ............ .. . . ....... . ...... . . . .. ................... .. .. . ... . .... . . .. . .. ..... . . . .
lowQualScore : 4444444 2 111111 888 8 222 000 44 33333 5 88888888 22 5 5 5 0 88888 1111111111111111 6 6 333 00 00 00 4 5 5 5 6 3333333333 4444 7 44444444444 7 22 0 7 7 000 55 33333 44 44 88888 88888 9 555 555 8 9 222 222 55 44444 9999999 222 333 2222222222222222 00000 0 0000 1 9 9 9 55 9 66 555555 9999 8 55 222 9 33333 999999999999 99 1 0 1111111 0 222222 3 1 1 99 6666666666666666666 99 99 1 777 1 0000 9 9 66 7 11 33333 7 7 7 0
consensus : GGGTATTTTATTTCAC----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
Reference ( family-950 ) : GGGTATTTTATTTCAC----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
gi|1 : TGTA-AATAT------AT--TTA-CGTTTAAGTAA---AA---AAATAT---ACA--CCCGTGACAAATATA--------T----------ATGT-------------------------CAA--ACTGACTTATAT---AAA-TGGCGTTAG--AACACAT--CA-CATAT--TCG--AGTCCTTTATCCGTATTATTTCT-------------T-AACG---AA-AAT---A-C----TCTG----ACGCCAACACTTATTTTGTATGTGATACATTGCCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTTGTATGATCCGCACATACA-CA-TA---CGATATTATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGCTGTTTAAAA--TACATACTATTT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAACAAGTAC---TTTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--GGGGTTT-------TT---T---TT-----G----------GTTC-----AG-AAATCCCCATATA----AAGATGACTTTGCAAGATAA-T-G-TATTC--GTGATAAGCA-A--A------TATGTGT----ATTCTGTTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----GCAAG-------A----CAA--CCAAAACTG-T-AA--TT---TT-TTGCACTTAATGACCTTTGTCCCAAATTT---A--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-ATCT---GGCAACCGAT-A----CAATAT-AGTCA-AGAATAGT--GTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTCCATTAACATTCTAGACCTCATGCGATGATTTTTTGGA
gi|10 : aaaaaatagtattaagaccacaactatggggcgccaaacgtgactatattcaatggcatacatatatatgttgttGGGTATTTTATTTCAC----TTTATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAGATGG---AAA--C-----ACA-TAATA--------C--TT-AA-T-TTTTTAAAAAAAAA----G--A-------CAA-GATTGAATCTCATTGAAAA-TGGCATAAAAATAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACA-AACA-AAA---A-C----TGTC----AAGGCAACACTTATTT-GTATTTGTTACATTGCCCGATAA-----AA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACAT-CG-CA-TA---CAGCATGATTTGTTTTGTTTAA--ACCTTTCAGAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTAATTA---TTT---T--G-----T-------TTGTTT---GT-----A----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATAGGTAAAGATAACTTTGCAAGATAC-T-GGTATTT--ATAATAATAA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CACATGCAGTC---TCTGGTG-TTTCAGTATGTCAGAAACA-----CTGAG-------A----CAT--TCAACA----TTCAC-TT---TC-Ttattttaa
gi|10 : taTCAC-TT--T-----CTG-TTACAAC-AGACTTCCATGAACCGTCCATACCTCAAGCGATGA-TTTTTgttacaacagacttccatgaaccgtccatacctcaagcgatgattttttaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : tagggtattttatttcactttatatatatatatttaatgtttaataatatttagatggaaacacataatacttaattttttaaaaaaaaagacaagattgaatctcattgaaaatggcataaaaataaacatcaacatactcgagccatttattggtattatttctagtgtacattttaacaaacaaaaactgtcaaggcaacacttatttgtatttgttacattgcccgataaaattgttaaggttggtatggagtacatcgcatacagcatgatttgttttgtttaaacctttcagagaaactgtgttgttaaaaatccataatatctaaatccagttttcaaaagtacttctgatactttaattattttgtttgtttgtagttcagaaattcccatataggtaaagataactttgcaagatactggtatttataataataaaatatatgtattccattgaaataaatactcacatgcagtctctggtgtttcagtatgtcagaaacactgagacattcaacatGGGTATCTT-TTTTAC----A--ATATT-TA---------A-----AATATACAG-TAACTTTATTCAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TTGAA-A-ATTT-----TTAAA----T--------------CATTGAATCACAATGGCAA-TGACATTGA--AAAACATTGTAACAAGC--T----AGCCATTTATCGGTATTATTTTTAATACATGT-TTGT-TACG-Gtaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : a-----T-----TG-TTACGGTTGACATCG--AATATATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCACCTTAGC-----AAATA--TGTTGTTAAAA---TCCATAATATCC-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGATTA---TTT---T--A-----T-------TA---A---GT-----G----------ATTC-----AG-AAATGCCAATAAA----AAGATAA--------------T-GGTATTT--ATAATTAGCA-A--A------TATATGT----A---CA-----------------CAAATGTAGTA---TCTAGTG-TTTGAGTATATTAGAAACAGAATATCAAA-------A----TATATTCAAAA-TG-GCAAC-TA---TT-TTGCACCTAGTGGTCTTTGGCT---ATTTATTT--TGCTTTT-GTA-A--TA--------C--A--AT---T--T--TGTCTT---GGCATCCGAT-A----AAATAG-TGTCC-AGTATAGT--T-------AC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTTCATGAGCATTCCGTACCTCATACGATGA-TTTTTGGttgacatcgaatatatacacatacgatatgattattttcgtttaaacccaccttagcaaatatgttgttaaaatccataatatccaaatccagtttttgaaagtacttctaatactttgattattttattaagtgattcagaaatgccaataaaaagataatggtatttataattagcaaatatatgtacacaaatgtagtatctagtgtttgagtatattagaaacagaatatcaaaatatattcaaaatggcaactattttgcacctagtggtctttggctatttattttgcttttgtaatacaattttgtcttggcatccgataaaatagtgtccagtatagttactttctattacaacatattttcatgagcattccgtacctcatacgatgatttttgggttttgtttaccagact
gi|12 : agggtatcttttttacaatatttaaaatatacagtaactttattcaaatggaaacacaattatatttgaaaatttttaaatcattgaatcacaatggcaatgacattgaaaaacattgtaacaagctagccatttatcggtattatttttaatacatgtATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAACC--A--A-------CAA-CATTGAATCACATTTGAAA-TGGCATAAA--TAAACAT--CAAAATAC--TTG--AGCAATTTATCGGTACTATTTCAAGTGTACAA-TT-T-AACGAGAAA-AAAAACA-C----TCTT----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGCTACATTTCCAGATAA-TTACAT-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTATAT-CG-CA-AA---CAGTATAATTA-TTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCAATAATATCT-----AAATTAAGT-----TTTCG-Agttttgtttaccagact
gi|12 : TAAGTTTTC--GATTA-T-AATTTTTT-ATAATATGCA-A--AATTTAATATATGT----ATTCCATTTAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGAG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TGGTTACT-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATT-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-TCTT---GACAACTGAT-G----AAATGT-GATCA-AGTAAAGT--CTAAAATCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGAttataattttttataatatgcaaaatttaatatatgtattccatttaaataaatactcaaatgcagtctctagagtttgagtatatcagaaacaccgagacattcaaaatggttactttttttgcacctagtgacctttgaccccaatttttgcgtttattatacattttttcttgacaactgatgaaatgtgatcaagtaaagtctaaaatcactttctattacaacagacttccatgaacattccgtacctcatgcgatgatttttggattttgtttgaccagact
gi|13 : atatttaaaatttaaaaaccaacaacattgaatcacatttgaaatggcataaataaacatcaaaatacttgagcaatttatcggtactatttcaagtgtacaatttaacgagaaaaaaaacactcttaagccaacacccgttttgtatgtgctacatttccagataattacatttgttaaggttggtatggagtatatcgcaaacagtataattatttcgtttaaaccctttatagaaactgtgttgttaaaaatcaataatatctaaatTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAC-AAA---A-C----TCTC----AAGCTAACACACATTTTGTATGTGTTGCATTGTCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGTCTGT--AGTACAT-CG-CA-AA---CGATGTGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGATTT---TTTTG-T--G-----T-------TT---T---GTTTTTAG----------GTTC-----AG-AAATTCCCACATA----AAGA------TGCAAGATTA-T-AGTATTC--ATAACATGCA-A--A------AATATGT----ATTCAATTTTGATATATAC-T--CAACTGCAGTC---TC------TCTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----TAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TTA--TT-TTGCACCTAGTGAACTTTGGCCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ATTG-T--T--T-TCTT---GTCAACCGAT-G----AAATAC-GGTCA-ACCTTAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-ATACATCTA---TTCCATGAACATTCCGAACTTCATGCGATGA-GTTTTGGttttgtttgaccagact
gi|14 : ATTTCAC----T--TTATA-TATAT------AT----AATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGATGAAAA--C-----ACAATTATAATAAATTAT--TT-AA-A-ATTA-----AACAACAACA--A-------CAA-CATTGAATCAAGTTGGAAA----------------CAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCTGTATAGTTTCTAGTTTACTT-TT-T-GACG-GAAA-TAA---ATC----TCTC----AAGCCAGCACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTATAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTATAT-CA-CA-TA---CGGTATGATTATTTTTATTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTG--TGTTGTTAAATA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-ACA-----------TTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---TTAA-----T-------TT---T---TT-----A-----------TTC-----AT-AAATCCCCATATA----ACGATAACTTTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TTTATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCAAG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACTCgatttttgtttaccagac
gi|15 : ATTTTA--------A--TT-AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATTACATTGGAAA-TTGCATT----TAA-CAT--CAACGTAC--TCG--AGCCATTAATCGACAATATATCTGGTGTACAT-TT-T-AACA-GAAA-A-------C----TCCC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATAACCAGATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGCATGG--AGTACATACA-CG-TA---CGATATGATTATGTTCCTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAACATCTAATAAAAATCAAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTTAC-ACTTTGGTTA---TTT---T--A-----T-------CT---T---AT-----T----------GTTC-----AG-ACATTCCCATAT---------TAG-TTTACAAGATTG-T-GGTATTT--ATAAGACGCA-A--A------TTCATGT----ATTCCATTGAAAT-AACAC-T--CAAATTCAGTC---TCTAGTT-TTTGGGTATATCAATAACA-----ATGTG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAACTTT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGAACCCATTTT---T--TGCGTTT-ATA-A--aa
gi|16 : tctgtataatgtACATGTT-T-AGCG-GGAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTTATTTTGCATGTGTTACATTGGCAGATAA-GTAAAA-----TGTGTTTG-TTAAGGTTGGTATGGTCCGTACATACA-AA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----GACTA--TGTTGTTAAAAA--CCCATAACATCT-----AAATTCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGATTA---TTTTA-T--G-----T-------TT---T---atatattt
gi|16 : TATGT----TTTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAACG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAGCATCGAGA----CAG--TCAAAA-TG-TTCACCTT---TT-TTACACCTAGTGACCTTTGAACCCAATTT---A--TGCGTTC-ATA-A--TAATAATTCAT--A--AT---TATT--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AACTAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAATTAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGAAGA-TTCTTccattgaaataaatactcaaatgcagtctctaacgtttgagtatatcagaaacatcgagcatcgagacagtcaaaatgttcaccttttttacacctagtgacctttgaacccaatttatgcgttcataataataattcataattattttcttggcaaccgatgaactatggtcaagtatagtctaaaattactttctattacaacatacttccatgaacattccgtacctcatgcgaagattctttttaatttttttaccagact
gi|17 : acatgtttagcgggaaaaaactctcaagccaacacttattttgcatgtgttacattggcagataagtaaaatgtgtttgttaaggttggtatggtccgtacatacaaatacgatatgattattttcgtttaaacccttcatagagactatgttgttaaaaacccataacatctaaattcagttttcgaaagtacttttgatactttgattatttAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGAATTATTTCAAATGTACAT-TT-T-AACG-GGA----------T----TTTT-------TCA-----CATTTTTTATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAA-----TATGTCTG-TTAAGGTTGGCATGC--AGT------A-CA-TG---C-ACATG-----------------------CA---C-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATAT-----AAATCTAGT-----TTT-G-AAA---GGTC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCAATATA----CAGACAACTTTGCAAGAAAAAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTTGTG-TTTGAGAATATCAGAAACA-----TCACT-------A----CAT--TCAAAA-TG-CTAAT-TA---TT-TTGCGTTTA-TAA----TA----CAATT--------------------------------------AT---T-----T-TCAT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATGGT--CTAAAGTCAT-TT--T-----TTG-TTGCAAC-AGtttaatttttttaccagact
gi|18 : T------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAAAC---A--A-------CAA-TAATGAATCACATTGGAAA-TGGCATGAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACT-TAAA-AAG---A------TCTC----AAGCCAACATTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACAT-CA-CA-TT---CGGTATGATTATTTTCATTTTA--ACCCTTCACAGA-----AACTG--TGTTGTTAAA---------------------AAATCCTGT-----TTTCG-AGG---GTAC---TTTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--G-----TGGGAATGTT---T----T-----T----------ACTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTCCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGA----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--TAAATGCAGTC---TCTAGT
gi|19 : GAGTATTTTATTTCAA----T--ATGTA-TGTAT------AT--TTAATATTAGA-TAA---TATTTATATGA---AG----------CAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--AACCCCAACAA-CATTGATTGGCATTTGAAA-TGTCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGCTATTATTTTTTGTGTACAT-TT-T-AACG-AGAA-AAA---A------TCTG----AAGCCAACACTGGTTAGGTATATGTTACATTGCCAGATAA-TCAAAATATGTT-----TG-TTATGGTTGGTATGGTCCGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTATCTATT-A--ACCCTTCATAAC-----AACTA--TGTTGTCACGAA--TCCACAATATCT-----AAATCCAGT---------------------------------------TTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-ATATTCCCGTATG----AAGATAATTTTACA
gi|2 : tttaTGTTTTA-TAA---TATTTAAATTG---AAA--C-----ACCATTATA--------T-----AAGA-ATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTGCATCAAATTGGAAA-TGGCATTAA--TAGACAT--CAACATAC--TCG--GACCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-AATG-AAAA-AAA---ATC----TCTG----AAGCCAACACTC---------ATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTCAGTATGGTCCATACATACG-CA-TA---CGATATGATTATTTTTGTATAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGGTGTT-AAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCGAAAA---GTAC---TTTTGAT-ATTTTTATTA---TTTTCCT--T-----T-------TT---T---TT-----C----------GTTC-----AG-AAACTCCCATTAA----AAGATAACTTTGCAATATCA-T-GGTATTG--ATAAGAAACACA--A------T-TATGT----ATTCCATT-AAATAAATGC-T--CATATGCATGC---TCTAATG-TTTGAGTATATCAGCAACA-----TCGAG-------G----CAT--TCAAAA-TC-TTAAT-TT---TT-TTCCGCCTAGTGACCTTTAATCCCAATGT---T--TACGTTC-TTA-A--TA--------C--A--TTGG-T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----GAACAT-GTTCA-AGTATATG--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTGCAAC-AGACTTCAATAAACATTCCgcatgtaaagcaagttcaattatccgcaagtatctagcaaacgtttg
gi|20 : AGGTTAGT--GA--AATA---ACA-CC-AA---C-ATATATTTAATTTAGATTAA--GC-----ATA--------ACTA--T-CTGTCAGACA--AC----ACGGCC-----AAAGTTGGC-----TTTT----A---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--------T-------TG---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCAAATA----AAGATAACTCTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATAT----ATTTCATTGAAATAAACAT-T--CAAATGCAATC---TCTAGTG-TTTGAGTAAATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-GT---TT-TGGCACCAAGTGTCCTTTGACCCCGATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C------T---T--T--T-TTTTCTAAGCAACCGAC-G----AAATAT-GACCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TTC-T-----ATA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACTTTCCGTACCTCATGCGATGT-TTTTCGGAtttattacattgcttatgaattttatatattttattacactcattctatttacagtattggcaacattagg
gi|22 : tgtatgtgccacatcagGGGTAATGTATTTCAC----A--ATATA-TATAT------GT--T-AATGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--G-----A-AACTACA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAGA----A--A--------GA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGACATTAA----AACAT--CAATATAC--TCA--AGCTATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AAAG-GAAA-AAA---A-CACAAACTCAAAAAAGTCAACACTCATTTTGTATATGTTAAATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGTTTGGCATGA--AGAACATACA-CA-TATTTTAATATGATTATATTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--T
gi|23 : ataAA-TAA---TATTTCAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------A--TT-TA-A-TTTT-----ATAAA----A--A--------------TGAATCACATTTGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-----------------AA---A-C----TCTC----TAGCCAGCACTTATTCTGTACTTGTTACATTGCCAG-TAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTTAGGTTGGTAC----AGTCCGTAAAACA-TG---CGATATGAA-ATTTTCGTTTTA--ACTCTTCGTAAA-----AACTA--TATTGTTTAAAA--TTCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAG---TTTTGAT-AATTTGGTTA---TTT---T--T-----T-------TT---
gi|24 : tggGGGTATTTTATTTCA----------ATA-TATAT------AT--CTAATGGTTAG-TAA---TATTTAAATTG---AAATAC-----ACAATTATA--------T--TT-CA-A-ATTT-----AAAAG----A--A---------A-TATTGAATCACCTTGGAAA-CGGCA---A--TAAAAA----AACACAT--T-G--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-GA-G-GAGC-AAG---A-C----TTTC----AAACCAACACCTGTTTTGTATGTGTTACCTTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----CG-TTAAGTTTGACATGT--AGAGCATAAA-CA-TA---CACTATCATTATTTTCGTTT
gi|25 : aATA----AAGATAACTTTGCAAGATCA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAACTAAATAC-T--CAAATGTAGTC---CCTATTG-TTTGAG----TCAGAAACA-----TCGAA-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAA------------------------CTTTGACCCCAATTT---T--TGCG-TT-ATA-A--TA--------CTTT--TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATGT-TGTCA-AGTATAGT--CTTAAGTTCT-TT--T-----CTA---A-AAC-AGTTTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTT
gi|26 : GGGTATTTTATTTCAC----TTTATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AA---C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATT------AAAAA----A--A-------CAA-CACTGAATCGCATTG-------------------------------AC--TCG--AGCCATTTATCGCTATTGTTTCTAGTGTACAT-TT-C-AACG-AAAACAAA---A-T----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAATTTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGT
gi|27 : ta---AAA--C-----AGGGTTATA--------T--TT-AA----TTT-----AAAAA----A----------TAG-CATTGAATCACATTGGAAAATAGTATTTT--TAAACAT--CAACATAC--TC-------ATTTATTGGTATAAATTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GATA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCA--TCTCATTTTGTATGT
gi|28 : TA---TCG---T--G-----T-------TT---T---GT-----A-------------C-----AG-AAATTCCCATATA----ATTATAACTTTGCAAGA-AA-TAGGTATTG--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAGTGAAGTC---TGTAGTGATATGAGGATATacaataatagcacacgtaaattttaattttacaatgataaaaaaatgtactcacatgagaataatatatttattt
gi|29 : tgggCAATTG---T--TGTGCTT-GTA-A--TA--------C--A--AC---T--T--T-TTCT---GACAACCGAT-G----ATATAT-GTTCA-AGTATTGT--TTAAAGTCAC-TT--TAAAAAATA-TTACAAC-ATGCTTCCATGAACTTTAGATACCTCATGCAATGA-TGTTTacttcatttaagaatacagatagacaaagaattgcactttcaaagatcatattaagatatttacgtcatatgac
gi|3 : tttcaagatgtcggcccatgacaGTACTTTATTTCACAATAT--ATATA-TATAT------ATAGTTAATGTTTAA-TAA---TTAATAAATGG---AAA--C-----A-AACAGTC--------T--TT-TA-A--CTT-----AAAAA----A--A--------AT-TCTTGCATCACATTGTAAA-TGACATTAA---AAATAT--CAATATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-TTAACG-GAAA-AAA---ATC----TCTC----AAGTCAACACTCGTTTTGTAAATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----TATGA-TGGTTAAAGTTGGTA---------CATAT--CA-TA---CGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTGG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGAGTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----GG-AAATTCCCACATA----AAGACAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAATGTAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACT-----TCGAG------------CAT--TGAAAA-TG-TTAAA-TT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--AATAT---T--T--T-TCTT---GACAACCAAT-G----AAATAT-GGTAA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAT-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCAATGA-TTTTTGAAttaaaaatgtttaccaatttacaacatgcgatatttgattggaagaatcaa
gi|30 : -ACTTTGATTA---TTT------G-----T-------TT---T---GT-----G----------GCTT-----AG-ACAGTCCAATATA----AAAATAA--TAGCAAGATAA----GTTTTTTAATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCGTTGAAATAAATATATAACAAATATGGTCAAGTATAGT--TTTAAGTattttttttttcc
gi|30 : ----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--TTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAA-AGAC------G-----TCTGTACCTCATGCGATGA-TTTTTTGAcactttctattacaaaagacgtctgtacctcatgcgatgattttttgagagaaaaaaataccagtc
gi|31 : actttgattatttgttttgtggcttagacagtccaatataaaaataatagcaagataagttttttaataataagcaaatatatgtattccgttgaaataaatatataacG-TTAAA-AT---AT-TTGCTTGTCGTGACCTTCGACC----TTT---TAACGCGGTC-AAA-AGGTC--------A--A--AT---A--T--T-TTTA---GGCAACCGATTGTTTCAAATGTAGGTTATAGTGCAGTGGC-AAACTAAT-TTAGC-----CCAGTTGC--C-A----TCCATGAACACGCTGTACCTCATGCATCGA-TTTCTAGgagaaaaaaataccagtc
gi|33 : ctcgtccaTAA--AAAACAT--AAACACGC--TCG--AGCCATTTATCAGTATTATTTCTACTGTACAT-TT-T-AATG-GAAA-A-A---A-C----TCTC----AAACCTACACTCGTTTTGTACGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----ccacatatatgagaaatttcaccaa
gi|33 : ATAT--TTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGT-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCTTAATatttattttcgtttaaacccttcatagtaactatgttgttaaaaatccttaat
gi|34 : taaaaaacataaacacgctcgagccatttatcagtattatttctactgtacattttaatggaaaaaactctcaaacctacactcgttttgtacgtgttacattgccagataattaaaGGGTATTTT--TTCAC----T--CTATA-TATATGTGTGTAT--ATATTGTTTAA-TTA---TGTTTAAATGG---AAA--C-----ACAA--A-A--------T--TT-AA-A-A---------AAAC----A--A-------CAA-CATTGAATCATATTGGAAA-TGGCATTAG--AAAACAT--CAAC--AC--TCG--AGCTATTTATCAGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-
gi|35 : ataGGGTATTTCATTTCAC----T--GTATA-TAT------------TTAATGTTAAA-TAA---TATTTAA-TGG---AAT--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----G--A---------A-CATTGAATCGTATTGGAAA-TGTCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--AAA--AGCCATTTATCGGTACTA
gi|37 : ta--AT---C--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-TGTCA-TATAAAAT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ATACGTCCGTGAACATTCCGAGCCTCATGCAATGA-TCTTTTGA
gi|38 : taaatGTGTACAT-TC-T-AACG-AAAA-AGAG--A-G----TCTC----AAACCAACACTCGTTTTGTATGTGTAACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGTACAT-CG-CA-TA---CAGTATGCTTATTTTttttatgaccag
gi|39 : ----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--CTGAATATAC-GT--T-----CCA-TTGCAAC-ACACTTCCATGAACATTCCATACCTCTTGCGATGA-TATTTGG
gi|4 : GGGAATTTGATTTCTT----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTAAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--T-----ACAGTTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAAT---A--A-------CAA-CGTT-AATTACATTAGAAC-TGGCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--TC---AGCCATTTATCAGTATTATTTCTAGTGAACAT-TT-T-AAAG-AAAA-AAAC--A-C----TTTC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTATGGTTGGTATAG--AGAATAT-TA-CA-AA---CAGTATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTTCGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--GA----T-------TT---T---TT-----G----------GTTC-----AG-AAATCCCCATATA----AAGACAACTTTGTAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGC----ATTCCATTGAAATGAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TAAAAA-TG-TTTAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCAATT-ATT-A--AA--------C--A--AT---T--TAAT-TCTT---GGCAACTGAT-G----AAATGT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TAACAAC-AGACTTCCGTGAACATTCCGTACCTCATGCAATTA-TTTTTGGAtattcatctgtccaact
gi|41 : -AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATGACAATGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-
gi|44 : aa----T--ATATA-TATGT------AT--ATGATGTTTGA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--------------ACA--------T--TT--------------------------------------------AATCACATTTGAAA-TGCCATTAA--TAAACAT--CAA
gi|45 : GGTATTTTAGTTCAC----T--ATATA-TCTAT------AT-------ATCTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTA-------------TC-AA-A-A--------AAAAA----A--
gi|46 : tataa-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTTAATGAACATTGTGTATGTCATACGATGA-TTTTTGGA
gi|47 : ACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-attttttttaccaga
gi|5 : ATGTTGAA-TAA---TGTCTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------TCTTT-AT-A---TT-----AAAAA----A--A-----------------ATAACATTGGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATACCATCATCAGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAGA-TCA-----C----TCTT----AAGCAAACACTTATTCTGTATGTTTTACATTACCAGATAA-ATAAAA-----TATGATTG-TTAAGGTTGGTATTG--TCCGCAAAAA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTTAAAA--TTTATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTAGATTA---TTT---T--A-----T-------TT---TTGGGT-----GAGAATATGGTGTTTTGTCAAG-AAATTCCCATATA----AATATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTG--ATAATAAACA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATAAAGTC---TCTGGTG-TTTGAGTATATCAGAAACG-----TCGAA-------A----TAT--TC-AAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCAAGTAACCTTCGCCCCTAATTT----------------------------------A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--ATAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTTCGTACCTCATACGATAA-TTTTTGGAcatacccaact
gi|6 : ATTTTATTTTAC----T--ATATA-T-TAT------AT--TAAATGTATAA-TAC---TATTTAAATGG---TAT--C-----AAAATTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAA----------------CGATCATTGAATCACATTAAAAA-TTGCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AACCATTCATCAGTTTTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-TGAT-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCATTTTTGATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAAATGT-C-----TG-TTAAGATTAGCATAG--AGTACATACA-TATTA---TGATAGTATTATTATCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AA-TA-----TGTTAAAAA--TCCGTAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-GAA---GTAT---TTCTGAT-AATTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---A---GT-----G----------GT----------ACATTCCAATAAA----AAGATAACTTTTCAAGATTA-T-AGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TACATGT----GT---ATT---------------------CAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATTCGAAACA-----TC-AC-------A----AAT--TCAAAA-TG-TTAAA--T---TT-TTGCACCTAGTAACCTTTGAACCCAATTT---T--T-TGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ACTTAT--T--T-TCTT---GACAACGGAT-G----ACATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTATCTCATGCGATGA-TTTTTTGAttctttaccagact
gi|7 : GGGTATTCTATTTAAC----A--ATATA-AATAA------CG--TTAAAGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--C-----A-AACTGTA--------T--TA-AA-ATATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTCAATCACATTGGAAA-TGACATTA-------------AACATA---TCA--AGCCATTAATCAGTATTATTTCTAGCGTACAT-TT-C-AACG-GGGG-AAA---------------------TCAACGCTAATTTTGTAAATGTTACATTGCCGGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTTGG-A--------ACATACA-CA-TA---TGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACTTTTCATATC-----AAATATTTTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCTG------TTTCG-AAA---GTAC---TTCTTAT-ACTTGGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AGAAAATTCCCATATA----AAGATATATTTACAAGATGA-T-TGTATTT--ATGATAAGCA-AGTA------TACATGTATGAATTCTA-TGAAATAAATAC-T--TAAATGTAGTT---TCTACTG-TTCGAGTGTATCAGAAACA-----TCGAG-------ACCGTCAT--TAAAAA-TT-TTAAT-TT---TT-TTGCA-------ACCTTTGACCCACATTT---T--TGCGTTTAATATA--TA--------C--T--GT---T--T--T-GCTT---GCCAACCGAC-G----AAATAT-AGACA-AGTATAGT--CTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AAACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGGTttttccttaac
gi|8 : aGGATATTTTATTTCAC----A--AAATG-TAT-T-------T--TTAATGTTTAA-TAA---TATTAAAATGC---AAA--C-----ATAATTTAA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A----------CAA----TGAATCATTTTGGAAA-TGGCATTAA--AGAACAA--CAATACAC--TCA--ATCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAG-TT-T-TACG-AGAA-AAT---A------TCTC----CAACCAACACTCGTTCTGTATGTGTTTCAATGGCAGATAG-TTAAAATATGTT-----TA-TTAAGGTTGGCATGG--AGTTCATACA-CA-TA---CGATACGATTATTTTCATTTAAATACCATTCATAGC-----AACTG--CGTTGTTAAAAA--CTCATA----------------------------TG-AAA---ATACACATT-TAGT-ACTTTGATTA----TT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAGTT-GCATATA----AAGATGACTTTGCAAGATTA-T-TGTATTT--ATTATATG-G-A--A------T-TATAT----ACCCCAATGAAACGAATGC-C--TACATGCGGTA---TATAGTG-TTTAAATATATTGGACATA-----TCAAT-------A----TAT--CAAAAA-TG-TTAAC--A---TT-GCGCACCTAGTGACC----------ATTT---T--TGTGCTT-ATA-A--TG--------C--A--ACTG-T--T--T-TCTT---GGCAAACGAT-G----AAATAG-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ACAC-----------TTCCGTA-CTGGTGCGATAA-TTTc
gi|9 : caTATTTCACTTCATA---T--ATATAATATAT------AT--TTAATGATTAA-TAA---TATTGAAATGG---AAA--C-----ACAATTTTA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAGAA----ATAA-------CAA-CACTGACTCACATTCGAAA-TGACATTAA---AAACAT--CAGCATAC--TCG--AGCCATTGATCGATATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-TAA---C-G----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTA-ATAGCTGGATAA-TT-ATG-----T-----TG-TTAA
gi|9 : ctTTAATAGCTGGATAATTA--TGTTGTTAAAAAAATCCATAATATCT-----AAATCCAGTCAAGGTTTCG-AAA---GTAC---TTTTGATTATTTTGTTTTGTTTTT---T--G-----T-------TT---T---TT-----T----------GTTT-----AA-AAATCCTCATATA----AAGATAAATTTGCAACATTA-T-GGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TATATGT----GTTCCTTTGAAATAAATAC-T--CAAATG-----------------TTGAGTATATCAGAAACA-----C---------------------TCAAAA-TG-TTAAC-TTAATTTGTTGCACCTGGTGACCTTTGACCCC-ATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------T--AT-TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-CGTCA-AGTACAGT--CTAAAATTACTTT--T-----TTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACATCATGCGATAA-TTTTTTGAaaaaatccataatatctaaatccagtcaaggtttcgaaagtacttttgattattttgttttgttttttgtttttttgtttaaaaatcctcatataaagataaatttgcaacattatggtatttatgataagcaaatatatgtgttcctttgaaataaatactcaaatgttgagtatatcagaaacactcaaaatgttaacttaatttgttgcacctggtgacctttgaccccatttttgcgtttataatatatttttttcttggcaaccgatgaaatatcgtcaagtacagtctaaaattacttttttattacaacagacttccatgaacattccgtacatcatgcgataattttttgattgttttaaccacatt
blockSeqs : AATAT A GTGTGT AGT . CTT TGA TA . ATAAATTA CT G G T TAAAA AAACCCCAAC T A AAT TG CA TC G G T A C ACACAA AAAA T TATGTT G TC A A T TTT AT TGGAT TT AA AATAA CAAGG A . ACA C T GTT TCC TA A GGGAATG GTT TGG GAGAATATGGT TGTCA A GGTA C A A TA C GT ATTTAA ATGA A AA AAG A GAATA CATCGAGA AT . G CTTAAT G ATTT A T GG ATAATTCATAAT AT AA G CTA T TTTC A T GG T AG AAAAA G T G .
blockSeqs : TTT . . T . . . . . . . . . . . CAACAAC . . A . . . . . . . . AACAC . . TATGTT . TC A . . . . . . . . . . . . C . . TG . . . . . TTTTAG . . . G . . T . . . . . . . . . ACCGT . . . CTTA . TAA . . . CAACTTA . . . . . . . . . . C . . . T .
blockSeqs : AT . . T . . . . . . . . . . . CCAAC . . T . . . . . . . . ATC . . TGTGTT . TC A . . . . . . . . . . . . T . . TA . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . CTTT . T . . . CAATTG . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : A . . T . . . . . . . . . . . ATAAC . . T . . . . . . . . ATC . . TATGTC . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . CCTT . T . . . CATTGG . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : T . . T . . . . . . . . . . . CAAC . . T . . . . . . . . ATC . . TATGTT . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . CTT . T . . . CTTTTT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : T . . C . . . . . . . . . . . TAAC . . T . . . . . . . . GAG . . TATGTT . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . CTA . A . . . CAATAT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : A . . T . . . . . . . . . . . GAC . . T . . . . . . . . CAC . . TATGTT . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . TTT . T . . . CAACTG . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : T . . A . . . . . . . . . . . AAC . . T . . . . . . . . AC . . TATGTT . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . CTT . T . . . TATTT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : T . . T . . . . . . . . . . . AAA . . T . . . . . . . . AC . . TATGTT . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . TTA . T . . . CAAT . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : T . . T . . . . . . . . . . . AAC . . A . . . . . . . . AC . . TATGAT . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . . . . . G . . . TTT . T . . . CATT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : T . . A . . . . . . . . . . . AAC . . A . . . . . . . . AC . . TATGTT . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . CGT . T . . . CAAC . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : T . . T . . . . . . . . . . . AAC . . T . . . . . . . . AC . . TATGTT . . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . ATT . T . . . AAAT . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : T . . T . . . . . . . . . . . AAA . . T . . . . . . . . AT . . TATGA . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . AAT . T . . . CAAT . . . . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : A . . T . . . . . . . . . . . AA . . T . . . . . . . . AC . . ATGTC . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . CTT . T . . . CTGT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : A . . T . . . . . . . . . . . AA . . T . . . . . . . . AC . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . CTT . T . . . AAT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AA . . T . . . . . . . . AC . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . C . . . . . . . . . . . . A . . . TTT . T . . . AT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . AT . . A . . . . . . . . CG . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons : T****** ***** AAC************* ** *** ***** CTT****
originalCons : GGGTATTTTATTTCAC----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
finalCons : GGGTATTTTATTTCACT------ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAAAAC-------------AA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAACTT----TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATTATCTTTATTACACTCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGTAGTAAACATGACTTCAGTCAAATTAAAGAAAATAGAAAATACTCATATATTTTTTTTTAATTTCACACACTCGCATCCTCAAAGGCGCGCAAGCACGCACGCACAGACTCAACAACAACAAAAATTTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTATAGATTCAATAAACATTCATTTTCAGTATATATGAAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTTATATTTATATTCAAATGTTTAATTACTAGTAGTCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTCTAATTTAATATCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CAAAAAATTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTACAATTGTCATCAATTCAATAAACATTCATTTTTATATATATGACAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTGATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTTTTAATTCTAATCTTATATCCTTTGATTGCTTTCCTTA
Unaligned ( gi|36 ): ATATATCATATCCTTTTATTACGCTCAATCCATTTACAGTAAAGGCAACGTTAGATTATATTGTACAGTACAGTAGGTAATGTGACTTTTGTAAAATTGAAGAAAATAGAAAATGCTGATATTTGTTTAA
Unaligned ( gi|40 ): TATATAACGTGTTTATTTACACTAAATCCATTTTACAGCAATGGCAACACAGGACTATATAATACGGTAATTAATATGACTTCAGTCAAATGAAAGAAAAG
Unaligned ( gi|42 ): CCTTTAGTTAAACTCTAAATGGTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTTTAATTAAATACCCTTTAATTCCTTTCCTT
Unaligned ( gi|43 ): ATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGGTCACTAACACTATTTAATTGTATGAATTCTAATTTAGTATCCCTTGATTGCTTTCCTTAAA
Unaligned ( gi|48 ): TTTTATTATCTTAATTATACCCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGT
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGTATTACTCTTATTCCATTTACGGCAATGTCAACATGAGGTAG
Unaligned ( gi|50 ): TGTTACTAGCGATAAATAACACTATATTTTTGTGTTAATTCTAATTT
Unaligned ( gi|51 ): ATTCTAATTTAATATCCCTTTATTGCTTTCCTTTAGTTA
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111111 111 1111111111 55555555555 1111111111111111 1111111111111111111
lowQualScore : 2222222 2 666666 333 1 333 333 22 44444 0 55555555 22 1 1 1 1 33333 8888888888888888 1 1 000 22 22 22 1 1 1 1 1 2222222222 3333 1 00000000000 1 99 7 1 1 333 22 44444 22 22 44444 44444 1 333 333 1 1 333 888 22 66666 5555555 333 333 1111111111111111 55555 2 4444 2 0 1 1 44 1 22 555555 3333 1 22 333 1 55555 666666666666 22 2 2 7777777 2 444444 0 2 2 22 5555555555555555555 22 22 2 333 2 4444 1 1 22 1 44 44444 1 1 2 2
lowQualScore : ....... . ...... ... . ... ... .. ..... . ........ .. . . . . ..... ................ . . ... .. .. .. . . . . . .......... .... . ........... . .. . . . ... .. ..... .. .. ..... ..... . ... ... . . ... ... .. ..... ....... ... ... ................ ..... . .... . . . . .. . .. ...... .... . .. ... . ..... ............ .. . . ....... . ...... . . . .. ................... .. .. . ... . .... . . .. . .. ..... . . . .
lowQualScore : 4444444 2 111111 888 8 222 000 44 33333 5 88888888 22 5 5 5 0 88888 1111111111111111 6 6 333 00 00 00 4 5 5 5 6 3333333333 4444 7 44444444444 7 22 0 7 7 000 55 33333 44 44 88888 88888 9 555 555 8 9 222 222 55 44444 9999999 222 333 2222222222222222 00000 0 0000 1 9 9 9 55 9 66 555555 9999 8 55 222 9 33333 999999999999 99 1 0 1111111 0 222222 3 1 1 99 6666666666666666666 99 99 1 777 1 0000 9 9 66 7 11 33333 7 7 7 0
consensus : GGGTATTTTATTTCAC----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
Reference ( family-950 ) : GGGTATTTTATTTCAC----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--A-------CAA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGA
gi|1 : TGTA-AATAT------AT--TTA-CGTTTAAGTAA---AA---AAATAT---ACA--CCCGTGACAAATATA--------T----------ATGT-------------------------CAA--ACTGACTTATAT---AAA-TGGCGTTAG--AACACAT--CA-CATAT--TCG--AGTCCTTTATCCGTATTATTTCT-------------T-AACG---AA-AAT---A-C----TCTG----ACGCCAACACTTATTTTGTATGTGATACATTGCCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTTGTATGATCCGCACATACA-CA-TA---CGATATTATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGCTGTTTAAAA--TACATACTATTT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAACAAGTAC---TTTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--GGGGTTT-------TT---T---TT-----G----------GTTC-----AG-AAATCCCCATATA----AAGATGACTTTGCAAGATAA-T-G-TATTC--GTGATAAGCA-A--A------TATGTGT----ATTCTGTTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----GCAAG-------A----CAA--CCAAAACTG-T-AA--TT---TT-TTGCACTTAATGACCTTTGTCCCAAATTT---A--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-ATCT---GGCAACCGAT-A----CAATAT-AGTCA-AGAATAGT--GTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTCCATTAACATTCTAGACCTCATGCGATGATTTTTTGGA
gi|10 : aaaaaatagtattaagaccacaactatggggcgccaaacgtgactatattcaatggcatacatatatatgttgttGGGTATTTTATTTCAC----TTTATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAGATGG---AAA--C-----ACA-TAATA--------C--TT-AA-T-TTTTTAAAAAAAAA----G--A-------CAA-GATTGAATCTCATTGAAAA-TGGCATAAAAATAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACA-AACA-AAA---A-C----TGTC----AAGGCAACACTTATTT-GTATTTGTTACATTGCCCGATAA-----AA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACAT-CG-CA-TA---CAGCATGATTTGTTTTGTTTAA--ACCTTTCAGAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTGAT-ACTTTAATTA---TTT---T--G-----T-------TTGTTT---GT-----A----------GTTC-----AG-AAATTCCCATATAGGTAAAGATAACTTTGCAAGATAC-T-GGTATTT--ATAATAATAA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CACATGCAGTC---TCTGGTG-TTTCAGTATGTCAGAAACA-----CTGAG-------A----CAT--TCAACA----TTCAC-TT---TC-Ttattttaa
gi|10 : taTCAC-TT--T-----CTG-TTACAAC-AGACTTCCATGAACCGTCCATACCTCAAGCGATGA-TTTTTgttacaacagacttccatgaaccgtccatacctcaagcgatgattttttaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : tagggtattttatttcactttatatatatatatttaatgtttaataatatttagatggaaacacataatacttaattttttaaaaaaaaagacaagattgaatctcattgaaaatggcataaaaataaacatcaacatactcgagccatttattggtattatttctagtgtacattttaacaaacaaaaactgtcaaggcaacacttatttgtatttgttacattgcccgataaaattgttaaggttggtatggagtacatcgcatacagcatgatttgttttgtttaaacctttcagagaaactgtgttgttaaaaatccataatatctaaatccagttttcaaaagtacttctgatactttaattattttgtttgtttgtagttcagaaattcccatataggtaaagataactttgcaagatactggtatttataataataaaatatatgtattccattgaaataaatactcacatgcagtctctggtgtttcagtatgtcagaaacactgagacattcaacatGGGTATCTT-TTTTAC----A--ATATT-TA---------A-----AATATACAG-TAACTTTATTCAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------T--TTGAA-A-ATTT-----TTAAA----T--------------CATTGAATCACAATGGCAA-TGACATTGA--AAAACATTGTAACAAGC--T----AGCCATTTATCGGTATTATTTTTAATACATGT-TTGT-TACG-Gtaaaaaaatttttaccagac
gi|11 : a-----T-----TG-TTACGGTTGACATCG--AATATATACA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCACCTTAGC-----AAATA--TGTTGTTAAAA---TCCATAATATCC-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGATTA---TTT---T--A-----T-------TA---A---GT-----G----------ATTC-----AG-AAATGCCAATAAA----AAGATAA--------------T-GGTATTT--ATAATTAGCA-A--A------TATATGT----A---CA-----------------CAAATGTAGTA---TCTAGTG-TTTGAGTATATTAGAAACAGAATATCAAA-------A----TATATTCAAAA-TG-GCAAC-TA---TT-TTGCACCTAGTGGTCTTTGGCT---ATTTATTT--TGCTTTT-GTA-A--TA--------C--A--AT---T--T--TGTCTT---GGCATCCGAT-A----AAATAG-TGTCC-AGTATAGT--T-------AC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATATTTTCATGAGCATTCCGTACCTCATACGATGA-TTTTTGGttgacatcgaatatatacacatacgatatgattattttcgtttaaacccaccttagcaaatatgttgttaaaatccataatatccaaatccagtttttgaaagtacttctaatactttgattattttattaagtgattcagaaatgccaataaaaagataatggtatttataattagcaaatatatgtacacaaatgtagtatctagtgtttgagtatattagaaacagaatatcaaaatatattcaaaatggcaactattttgcacctagtggtctttggctatttattttgcttttgtaatacaattttgtcttggcatccgataaaatagtgtccagtatagttactttctattacaacatattttcatgagcattccgtacctcatacgatgatttttgggttttgtttaccagact
gi|12 : agggtatcttttttacaatatttaaaatatacagtaactttattcaaatggaaacacaattatatttgaaaatttttaaatcattgaatcacaatggcaatgacattgaaaaacattgtaacaagctagccatttatcggtattatttttaatacatgtATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAACC--A--A-------CAA-CATTGAATCACATTTGAAA-TGGCATAAA--TAAACAT--CAAAATAC--TTG--AGCAATTTATCGGTACTATTTCAAGTGTACAA-TT-T-AACGAGAAA-AAAAACA-C----TCTT----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGCTACATTTCCAGATAA-TTACAT-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTATAT-CG-CA-AA---CAGTATAATTA-TTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCAATAATATCT-----AAATTAAGT-----TTTCG-Agttttgtttaccagact
gi|12 : TAAGTTTTC--GATTA-T-AATTTTTT-ATAATATGCA-A--AATTTAATATATGT----ATTCCATTTAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGAG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TGGTTACT-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATT-A--TA--------C--A--TT---T--T--T-TCTT---GACAACTGAT-G----AAATGT-GATCA-AGTAAAGT--CTAAAATCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTTTTGGAttataattttttataatatgcaaaatttaatatatgtattccatttaaataaatactcaaatgcagtctctagagtttgagtatatcagaaacaccgagacattcaaaatggttactttttttgcacctagtgacctttgaccccaatttttgcgtttattatacattttttcttgacaactgatgaaatgtgatcaagtaaagtctaaaatcactttctattacaacagacttccatgaacattccgtacctcatgcgatgatttttggattttgtttgaccagact
gi|13 : atatttaaaatttaaaaaccaacaacattgaatcacatttgaaatggcataaataaacatcaaaatacttgagcaatttatcggtactatttcaagtgtacaatttaacgagaaaaaaaacactcttaagccaacacccgttttgtatgtgctacatttccagataattacatttgttaaggttggtatggagtatatcgcaaacagtataattatttcgtttaaaccctttatagaaactgtgttgttaaaaatcaataatatctaaatTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAC-AAA---A-C----TCTC----AAGCTAACACACATTTTGTATGTGTTGCATTGTCATATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGTCTGT--AGTACAT-CG-CA-AA---CGATGTGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGATTT---TTTTG-T--G-----T-------TT---T---GTTTTTAG----------GTTC-----AG-AAATTCCCACATA----AAGA------TGCAAGATTA-T-AGTATTC--ATAACATGCA-A--A------AATATGT----ATTCAATTTTGATATATAC-T--CAACTGCAGTC---TC------TCTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAG-------A----TAT--TCAAAA-TG-TTAAC-TTA--TT-TTGCACCTAGTGAACTTTGGCCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ATTG-T--T--T-TCTT---GTCAACCGAT-G----AAATAC-GGTCA-ACCTTAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-ATACATCTA---TTCCATGAACATTCCGAACTTCATGCGATGA-GTTTTGGttttgtttgaccagact
gi|14 : ATTTCAC----T--TTATA-TATAT------AT----AATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGATGAAAA--C-----ACAATTATAATAAATTAT--TT-AA-A-ATTA-----AACAACAACA--A-------CAA-CATTGAATCAAGTTGGAAA----------------CAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCTGTATAGTTTCTAGTTTACTT-TT-T-GACG-GAAA-TAA---ATC----TCTC----AAGCCAGCACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTATAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTATAT-CA-CA-TA---CGGTATGATTATTTTTATTTAA--ACCCTTCATAGC-----AACTG--TGTTGTTAAATA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-ACA-----------TTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---TTAA-----T-------TT---T---TT-----A-----------TTC-----AT-AAATCCCCATATA----ACGATAACTTTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TTTATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCAAG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACTCgatttttgtttaccagac
gi|15 : ATTTTA--------A--TT-AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATTACATTGGAAA-TTGCATT----TAA-CAT--CAACGTAC--TCG--AGCCATTAATCGACAATATATCTGGTGTACAT-TT-T-AACA-GAAA-A-------C----TCCC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATAACCAGATAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTAAGGTTGGCATGG--AGTACATACA-CG-TA---CGATATGATTATGTTCCTTTAA--ACCCTTTATAGC-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAACATCTAATAAAAATCAAGT-----TTTCA-AAA---GTAC---TTCTTAC-ACTTTGGTTA---TTT---T--A-----T-------CT---T---AT-----T----------GTTC-----AG-ACATTCCCATAT---------TAG-TTTACAAGATTG-T-GGTATTT--ATAAGACGCA-A--A------TTCATGT----ATTCCATTGAAAT-AACAC-T--CAAATTCAGTC---TCTAGTT-TTTGGGTATATCAATAACA-----ATGTG-------A----CAT--TCAAAA-TA-TTAACTTT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGAACCCATTTT---T--TGCGTTT-ATA-A--aa
gi|16 : tctgtataatgtACATGTT-T-AGCG-GGAA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTTATTTTGCATGTGTTACATTGGCAGATAA-GTAAAA-----TGTGTTTG-TTAAGGTTGGTATGGTCCGTACATACA-AA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----GACTA--TGTTGTTAAAAA--CCCATAACATCT-----AAATTCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTTGATTA---TTTTA-T--G-----T-------TT---T---atatattt
gi|16 : TATGT----TTTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAACG-TTTGAGTATATCAGAAACA-----TCGAGCATCGAGA----CAG--TCAAAA-TG-TTCACCTT---TT-TTACACCTAGTGACCTTTGAACCCAATTT---A--TGCGTTC-ATA-A--TAATAATTCAT--A--AT---TATT--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AACTAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAATTAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-ATACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGAAGA-TTCTTccattgaaataaatactcaaatgcagtctctaacgtttgagtatatcagaaacatcgagcatcgagacagtcaaaatgttcaccttttttacacctagtgacctttgaacccaatttatgcgttcataataataattcataattattttcttggcaaccgatgaactatggtcaagtatagtctaaaattactttctattacaacatacttccatgaacattccgtacctcatgcgaagattctttttaatttttttaccagact
gi|17 : acatgtttagcgggaaaaaactctcaagccaacacttattttgcatgtgttacattggcagataagtaaaatgtgtttgttaaggttggtatggtccgtacatacaaatacgatatgattattttcgtttaaacccttcatagagactatgttgttaaaaacccataacatctaaattcagttttcgaaagtacttttgatactttgattatttAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGAATTATTTCAAATGTACAT-TT-T-AACG-GGA----------T----TTTT-------TCA-----CATTTTTTATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAA-----TATGTCTG-TTAAGGTTGGCATGC--AGT------A-CA-TG---C-ACATG-----------------------CA---C-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATAT-----AAATCTAGT-----TTT-G-AAA---GGTC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCAATATA----CAGACAACTTTGCAAGAAAAAT-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTTGTG-TTTGAGAATATCAGAAACA-----TCACT-------A----CAT--TCAAAA-TG-CTAAT-TA---TT-TTGCGTTTA-TAA----TA----CAATT--------------------------------------AT---T-----T-TCAT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-GGTCA-AGTATGGT--CTAAAGTCAT-TT--T-----TTG-TTGCAAC-AGtttaatttttttaccagact
gi|18 : T------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAAAC---A--A-------CAA-TAATGAATCACATTGGAAA-TGGCATGAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACT-TAAA-AAG---A------TCTC----AAGCCAACATTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTGGTATGG--AGTACAT-CA-CA-TT---CGGTATGATTATTTTCATTTTA--ACCCTTCACAGA-----AACTG--TGTTGTTAAA---------------------AAATCCTGT-----TTTCG-AGG---GTAC---TTTTGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--G-----TGGGAATGTT---T----T-----T----------ACTC-----AG-AAATTCCCATATA----AAGATAACTTTCCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGA----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--TAAATGCAGTC---TCTAGT
gi|19 : GAGTATTTTATTTCAA----T--ATGTA-TGTAT------AT--TTAATATTAGA-TAA---TATTTATATGA---AG----------CAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A--AACCCCAACAA-CATTGATTGGCATTTGAAA-TGTCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATTGCTATTATTTTTTGTGTACAT-TT-T-AACG-AGAA-AAA---A------TCTG----AAGCCAACACTGGTTAGGTATATGTTACATTGCCAGATAA-TCAAAATATGTT-----TG-TTATGGTTGGTATGGTCCGTACATACA-CA-TA---CGATATGATTATTATCTATT-A--ACCCTTCATAAC-----AACTA--TGTTGTCACGAA--TCCACAATATCT-----AAATCCAGT---------------------------------------TTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-ATATTCCCGTATG----AAGATAATTTTACA
gi|2 : tttaTGTTTTA-TAA---TATTTAAATTG---AAA--C-----ACCATTATA--------T-----AAGA-ATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTGCATCAAATTGGAAA-TGGCATTAA--TAGACAT--CAACATAC--TCG--GACCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-AATG-AAAA-AAA---ATC----TCTG----AAGCCAACACTC---------ATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTCAGTATGGTCCATACATACG-CA-TA---CGATATGATTATTTTTGTATAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGGTGTT-AAAA--TCCATAATATCT-----TAATCCAGT-----TTTCGAAAA---GTAC---TTTTGAT-ATTTTTATTA---TTTTCCT--T-----T-------TT---T---TT-----C----------GTTC-----AG-AAACTCCCATTAA----AAGATAACTTTGCAATATCA-T-GGTATTG--ATAAGAAACACA--A------T-TATGT----ATTCCATT-AAATAAATGC-T--CATATGCATGC---TCTAATG-TTTGAGTATATCAGCAACA-----TCGAG-------G----CAT--TCAAAA-TC-TTAAT-TT---TT-TTCCGCCTAGTGACCTTTAATCCCAATGT---T--TACGTTC-TTA-A--TA--------C--A--TTGG-T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----GAACAT-GTTCA-AGTATATG--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTGCAAC-AGACTTCAATAAACATTCCgcatgtaaagcaagttcaattatccgcaagtatctagcaaacgtttg
gi|20 : AGGTTAGT--GA--AATA---ACA-CC-AA---C-ATATATTTAATTTAGATTAA--GC-----ATA--------ACTA--T-CTGTCAGACA--AC----ACGGCC-----AAAGTTGGC-----TTTT----A---GTAC---TTCTGAT-ACTTTGATTA---TTT---T--------T-------TG---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAATTCCCAAATA----AAGATAACTCTGCAAGATTA-T-AGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATAT----ATTTCATTGAAATAAACAT-T--CAAATGCAATC---TCTAGTG-TTTGAGTAAATCAGAAACA-----TCGAG-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAAC-GT---TT-TGGCACCAAGTGTCCTTTGACCCCGATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C------T---T--T--T-TTTTCTAAGCAACCGAC-G----AAATAT-GACCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TTC-T-----ATA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACTTTCCGTACCTCATGCGATGT-TTTTCGGAtttattacattgcttatgaattttatatattttattacactcattctatttacagtattggcaacattagg
gi|22 : tgtatgtgccacatcagGGGTAATGTATTTCAC----A--ATATA-TATAT------GT--T-AATGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--G-----A-AACTACA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAGA----A--A--------GA-CATTGAATCACATTGGAAA-TGACATTAA----AACAT--CAATATAC--TCA--AGCTATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AAAG-GAAA-AAA---A-CACAAACTCAAAAAAGTCAACACTCATTTTGTATATGTTAAATTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGTTTGGCATGA--AGAACATACA-CA-TATTTTAATATGATTATATTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--T
gi|23 : ataAA-TAA---TATTTCAATGA---AAA--C-----ACAGTTATA--------A--TT-TA-A-TTTT-----ATAAA----A--A--------------TGAATCACATTTGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-----------------AA---A-C----TCTC----TAGCCAGCACTTATTCTGTACTTGTTACATTGCCAG-TAA-TTAAAA-----TATGTTTG-TTTAGGTTGGTAC----AGTCCGTAAAACA-TG---CGATATGAA-ATTTTCGTTTTA--ACTCTTCGTAAA-----AACTA--TATTGTTTAAAA--TTCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAG---TTTTGAT-AATTTGGTTA---TTT---T--T-----T-------TT---
gi|24 : tggGGGTATTTTATTTCA----------ATA-TATAT------AT--CTAATGGTTAG-TAA---TATTTAAATTG---AAATAC-----ACAATTATA--------T--TT-CA-A-ATTT-----AAAAG----A--A---------A-TATTGAATCACCTTGGAAA-CGGCA---A--TAAAAA----AACACAT--T-G--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTATACAT-TT-T-GA-G-GAGC-AAG---A-C----TTTC----AAACCAACACCTGTTTTGTATGTGTTACCTTGCCAGATAA-TTAAAATATGTT-----CG-TTAAGTTTGACATGT--AGAGCATAAA-CA-TA---CACTATCATTATTTTCGTTT
gi|25 : aATA----AAGATAACTTTGCAAGATCA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAACTAAATAC-T--CAAATGTAGTC---CCTATTG-TTTGAG----TCAGAAACA-----TCGAA-------A----CAT--TCAAAA-TG-TTAA------------------------CTTTGACCCCAATTT---T--TGCG-TT-ATA-A--TA--------CTTT--TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATGT-TGTCA-AGTATAGT--CTTAAGTTCT-TT--T-----CTA---A-AAC-AGTTTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGATGA-TTT
gi|26 : GGGTATTTTATTTCAC----TTTATATA-TATAT------AT--TTAATGTTTAA-TAA---TATTTAAATGG---AA---C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATT------AAAAA----A--A-------CAA-CACTGAATCGCATTG-------------------------------AC--TCG--AGCCATTTATCGCTATTGTTTCTAGTGTACAT-TT-C-AACG-AAAACAAA---A-T----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAATTTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGT
gi|27 : ta---AAA--C-----AGGGTTATA--------T--TT-AA----TTT-----AAAAA----A----------TAG-CATTGAATCACATTGGAAAATAGTATTTT--TAAACAT--CAACATAC--TC-------ATTTATTGGTATAAATTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GATA-AAA---A-C----TCTC----AAGCCA--TCTCATTTTGTATGT
gi|28 : TA---TCG---T--G-----T-------TT---T---GT-----A-------------C-----AG-AAATTCCCATATA----ATTATAACTTTGCAAGA-AA-TAGGTATTG--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAGTGAAGTC---TGTAGTGATATGAGGATATacaataatagcacacgtaaattttaattttacaatgataaaaaaatgtactcacatgagaataatatatttattt
gi|29 : tgggCAATTG---T--TGTGCTT-GTA-A--TA--------C--A--AC---T--T--T-TTCT---GACAACCGAT-G----ATATAT-GTTCA-AGTATTGT--TTAAAGTCAC-TT--TAAAAAATA-TTACAAC-ATGCTTCCATGAACTTTAGATACCTCATGCAATGA-TGTTTacttcatttaagaatacagatagacaaagaattgcactttcaaagatcatattaagatatttacgtcatatgac
gi|3 : tttcaagatgtcggcccatgacaGTACTTTATTTCACAATAT--ATATA-TATAT------ATAGTTAATGTTTAA-TAA---TTAATAAATGG---AAA--C-----A-AACAGTC--------T--TT-TA-A--CTT-----AAAAA----A--A--------AT-TCTTGCATCACATTGTAAA-TGACATTAA---AAATAT--CAATATAC--TCA--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-TTAACG-GAAA-AAA---ATC----TCTC----AAGTCAACACTCGTTTTGTAAATGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----TATGA-TGGTTAAAGTTGGTA---------CATAT--CA-TA---CGAT-----TATTTTCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AACTA--TTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTGG-AAA---GTAC---TTCTAAT-ACTTTGAGTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----GG-AAATTCCCACATA----AAGACAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CGAATGTAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTATATCAGAAACT-----TCGAG------------CAT--TGAAAA-TG-TTAAA-TT---TT-TTGCGCCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------C--AATAT---T--T--T-TCTT---GACAACCAAT-G----AAATAT-GGTAA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAT-AGACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCAATGA-TTTTTGAAttaaaaatgtttaccaatttacaacatgcgatatttgattggaagaatcaa
gi|30 : -ACTTTGATTA---TTT------G-----T-------TT---T---GT-----G----------GCTT-----AG-ACAGTCCAATATA----AAAATAA--TAGCAAGATAA----GTTTTTTAATAATAAGCA-A--A------TATATGT----ATTCCGTTGAAATAAATATATAACAAATATGGTCAAGTATAGT--TTTAAGTattttttttttcc
gi|30 : ----AAATAT-GGTCA-AGTATAGT--TTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAA-AGAC------G-----TCTGTACCTCATGCGATGA-TTTTTTGAcactttctattacaaaagacgtctgtacctcatgcgatgattttttgagagaaaaaaataccagtc
gi|31 : actttgattatttgttttgtggcttagacagtccaatataaaaataatagcaagataagttttttaataataagcaaatatatgtattccgttgaaataaatatataacG-TTAAA-AT---AT-TTGCTTGTCGTGACCTTCGACC----TTT---TAACGCGGTC-AAA-AGGTC--------A--A--AT---A--T--T-TTTA---GGCAACCGATTGTTTCAAATGTAGGTTATAGTGCAGTGGC-AAACTAAT-TTAGC-----CCAGTTGC--C-A----TCCATGAACACGCTGTACCTCATGCATCGA-TTTCTAGgagaaaaaaataccagtc
gi|33 : ctcgtccaTAA--AAAACAT--AAACACGC--TCG--AGCCATTTATCAGTATTATTTCTACTGTACAT-TT-T-AATG-GAAA-A-A---A-C----TCTC----AAACCTACACTCGTTTTGTACGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----ccacatatatgagaaatttcaccaa
gi|33 : ATAT--TTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGT-----AACTA--TGTTGTTAAAAA--TCCTTAATatttattttcgtttaaacccttcatagtaactatgttgttaaaaatccttaat
gi|34 : taaaaaacataaacacgctcgagccatttatcagtattatttctactgtacattttaatggaaaaaactctcaaacctacactcgttttgtacgtgttacattgccagataattaaaGGGTATTTT--TTCAC----T--CTATA-TATATGTGTGTAT--ATATTGTTTAA-TTA---TGTTTAAATGG---AAA--C-----ACAA--A-A--------T--TT-AA-A-A---------AAAC----A--A-------CAA-CATTGAATCATATTGGAAA-TGGCATTAG--AAAACAT--CAAC--AC--TCG--AGCTATTTATCAGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-
gi|35 : ataGGGTATTTCATTTCAC----T--GTATA-TAT------------TTAATGTTAAA-TAA---TATTTAA-TGG---AAT--C-----ACAATTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----G--A---------A-CATTGAATCGTATTGGAAA-TGTCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--AAA--AGCCATTTATCGGTACTA
gi|37 : ta--AT---C--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-TGTCA-TATAAAAT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ATACGTCCGTGAACATTCCGAGCCTCATGCAATGA-TCTTTTGA
gi|38 : taaatGTGTACAT-TC-T-AACG-AAAA-AGAG--A-G----TCTC----AAACCAACACTCGTTTTGTATGTGTAACATTGCTAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTAAGGTTAGTATGG--AGTACAT-CG-CA-TA---CAGTATGCTTATTTTttttatgaccag
gi|39 : ----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--CTGAATATAC-GT--T-----CCA-TTGCAAC-ACACTTCCATGAACATTCCATACCTCTTGCGATGA-TATTTGG
gi|4 : GGGAATTTGATTTCTT----T--ATATA-TATAT------AT--TTAATGTTAAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--T-----ACAGTTATA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAAT---A--A-------CAA-CGTT-AATTACATTAGAAC-TGGCATAAA--TAAACAT--CAACATAC--TC---AGCCATTTATCAGTATTATTTCTAGTGAACAT-TT-T-AAAG-AAAA-AAAC--A-C----TTTC----AAGCCAACACCCGTTTTGTATGTGTTACATTGCCAGATAA-TTAAAA-----T-----TG-TTATGGTTGGTATAG--AGAATAT-TA-CA-AA---CAGTATGATTATTTTCGTTTAA--ACCCTTCATAGA-----AACTG--TGTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTTG-AAA---GTAC---TTTCGAT-GCTTTGATTA---TTT---T--GA----T-------TT---T---TT-----G----------GTTC-----AG-AAATCCCCATATA----AAGACAACTTTGTAAGATTA-T-GGTATTT--ATAATAAGCA-A--A------TATATGC----ATTCCATTGAAATGAATAC-T--CAAATGCAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATCAGAAACA-----CCGAG-------A----CAT--TAAAAA-TG-TTTAC-TT---TT-TTGCACCTAGTGACCTTTGACCCCAATTT---T--TGCAATT-ATT-A--AA--------C--A--AT---T--TAAT-TCTT---GGCAACTGAT-G----AAATGT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TAACAAC-AGACTTCCGTGAACATTCCGTACCTCATGCAATTA-TTTTTGGAtattcatctgtccaact
gi|41 : -AA-A-A--------AAAAC----A--A-------CAA-CATTGAATGACAATGGAAA-TGGCATTAA--TAAACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-
gi|44 : aa----T--ATATA-TATGT------AT--ATGATGTTTGA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--------------ACA--------T--TT--------------------------------------------AATCACATTTGAAA-TGCCATTAA--TAAACAT--CAA
gi|45 : GGTATTTTAGTTCAC----T--ATATA-TCTAT------AT-------ATCTAA-TAA---TATTTAAATGG---AAA--C-----ACAATTA-------------TC-AA-A-A--------AAAAA----A--
gi|46 : tataa-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTTAATGAACATTGTGTATGTCATACGATGA-TTTTTGGA
gi|47 : ACAT--CAACATAC--TCG--AGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTAGAT-attttttttaccaga
gi|5 : ATGTTGAA-TAA---TGTCTAAATGG---AAA--C-----ACAATTATA--------TCTTT-AT-A---TT-----AAAAA----A--A-----------------ATAACATTGGAAA-TGGCATTTA--TAAACAT--CAACATACCATCATCAGCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAGA-TCA-----C----TCTT----AAGCAAACACTTATTCTGTATGTTTTACATTACCAGATAA-ATAAAA-----TATGATTG-TTAAGGTTGGTATTG--TCCGCAAAAA-CA-TA---CGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACCATTCATAGC-----AACTA--TGTTGTTTAAAA--TTTATAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-AAA---GTAC---TTTTGAT-ACTTAGATTA---TTT---T--A-----T-------TT---TTGGGT-----GAGAATATGGTGTTTTGTCAAG-AAATTCCCATATA----AATATAACTTTGCAAGATTA-T-GGTATTG--ATAATAAACA-A--A------TATATGT----ATTCCATTGAAATAAATAC-T--CAAATAAAGTC---TCTGGTG-TTTGAGTATATCAGAAACG-----TCGAA-------A----TAT--TC-AAA-TG-TTAAC-TT---TT-TTGCACCAAGTAACCTTCGCCCCTAATTT----------------------------------A--AT---T--T--T-TCTT---GGCAATCGAT-G----AAATAT-AGTCA-AGTATAGT--ATAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTTCGTACCTCATACGATAA-TTTTTGGAcatacccaact
gi|6 : ATTTTATTTTAC----T--ATATA-T-TAT------AT--TAAATGTATAA-TAC---TATTTAAATGG---TAT--C-----AAAATTATA--------T--CT-AA-A-ATTT-----AAAA----------------CGATCATTGAATCACATTAAAAA-TTGCATTAA---AAACAT--CAACATAC--TCG--AACCATTCATCAGTTTTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-TGAT-AAA---A-C----TCTC----AAGCCAACACTCATTTTTGATGTGTTACATTGCCAGCTAA-TTAAAAATGT-C-----TG-TTAAGATTAGCATAG--AGTACATACA-TATTA---TGATAGTATTATTATCGTTTAA--ACTCTTCATAGC-----AA-TA-----TGTTAAAAA--TCCGTAATATCT-----AAATCCAGT-----TTTCG-GAA---GTAT---TTCTGAT-AATTTGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---A---GT-----G----------GT----------ACATTCCAATAAA----AAGATAACTTTTCAAGATTA-T-AGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TACATGT----GT---ATT---------------------CAGTC---TCTAGTG-TTTGAGTGTATTCGAAACA-----TC-AC-------A----AAT--TCAAAA-TG-TTAAA--T---TT-TTGCACCTAGTAACCTTTGAACCCAATTT---T--T-TGTTT-ATA-A--TA--------C--A--ACTTAT--T--T-TCTT---GACAACGGAT-G----ACATAT-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTATCTCATGCGATGA-TTTTTTGAttctttaccagact
gi|7 : GGGTATTCTATTTAAC----A--ATATA-AATAA------CG--TTAAAGTTTAA-TAA---TAATTAAATGG---AAA--C-----A-AACTGTA--------T--TA-AA-ATATTT-----TAAAA----A--A-------AAA-CATTCAATCACATTGGAAA-TGACATTA-------------AACATA---TCA--AGCCATTAATCAGTATTATTTCTAGCGTACAT-TT-C-AACG-GGGG-AAA---------------------TCAACGCTAATTTTGTAAATGTTACATTGCCGGATAA-TTAAAATATGTT-----TG-TTAAGGTTGG-A--------ACATACA-CA-TA---TGATATGATTATTTTCGTTTAA--ACTTTTCATATC-----AAATATTTTTTGTTAAAAA--TCCATAATATCT-----AAATCCTG------TTTCG-AAA---GTAC---TTCTTAT-ACTTGGATTA---TTT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AGAAAATTCCCATATA----AAGATATATTTACAAGATGA-T-TGTATTT--ATGATAAGCA-AGTA------TACATGTATGAATTCTA-TGAAATAAATAC-T--TAAATGTAGTT---TCTACTG-TTCGAGTGTATCAGAAACA-----TCGAG-------ACCGTCAT--TAAAAA-TT-TTAAT-TT---TT-TTGCA-------ACCTTTGACCCACATTT---T--TGCGTTTAATATA--TA--------C--T--GT---T--T--T-GCTT---GCCAACCGAC-G----AAATAT-AGACA-AGTATAGT--CTTAAGTCAC-TT--T-----CTA-TTACAAC-AAACTTCCATGAACATTCCGTACCTCATGCGGTttttccttaac
gi|8 : aGGATATTTTATTTCAC----A--AAATG-TAT-T-------T--TTAATGTTTAA-TAA---TATTAAAATGC---AAA--C-----ATAATTTAA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAAAA----A----------CAA----TGAATCATTTTGGAAA-TGGCATTAA--AGAACAA--CAATACAC--TCA--ATCCATTTATCGGTATTATTTCTAGTGTACAG-TT-T-TACG-AGAA-AAT---A------TCTC----CAACCAACACTCGTTCTGTATGTGTTTCAATGGCAGATAG-TTAAAATATGTT-----TA-TTAAGGTTGGCATGG--AGTTCATACA-CA-TA---CGATACGATTATTTTCATTTAAATACCATTCATAGC-----AACTG--CGTTGTTAAAAA--CTCATA----------------------------TG-AAA---ATACACATT-TAGT-ACTTTGATTA----TT---T--G-----T-------TT---T---GT-----G----------GTTC-----AG-AAGTT-GCATATA----AAGATGACTTTGCAAGATTA-T-TGTATTT--ATTATATG-G-A--A------T-TATAT----ACCCCAATGAAACGAATGC-C--TACATGCGGTA---TATAGTG-TTTAAATATATTGGACATA-----TCAAT-------A----TAT--CAAAAA-TG-TTAAC--A---TT-GCGCACCTAGTGACC----------ATTT---T--TGTGCTT-ATA-A--TG--------C--A--ACTG-T--T--T-TCTT---GGCAAACGAT-G----AAATAG-GGTCA-AGTATAGT--CTAAAGACAC-TT--T-----CTA-TTTCAAC-ACAC-----------TTCCGTA-CTGGTGCGATAA-TTTc
gi|9 : caTATTTCACTTCATA---T--ATATAATATAT------AT--TTAATGATTAA-TAA---TATTGAAATGG---AAA--C-----ACAATTTTA--------T--TT-AA-A-ATTT-----AAGAA----ATAA-------CAA-CACTGACTCACATTCGAAA-TGACATTAA---AAACAT--CAGCATAC--TCG--AGCCATTGATCGATATTATTTCTAGTGTACAT-TT-T-AACG-GAAA-TAA---C-G----TCTC----AAGCCAACACTCGTTTTGTATGTGTTA-ATAGCTGGATAA-TT-ATG-----T-----TG-TTAA
gi|9 : ctTTAATAGCTGGATAATTA--TGTTGTTAAAAAAATCCATAATATCT-----AAATCCAGTCAAGGTTTCG-AAA---GTAC---TTTTGATTATTTTGTTTTGTTTTT---T--G-----T-------TT---T---TT-----T----------GTTT-----AA-AAATCCTCATATA----AAGATAAATTTGCAACATTA-T-GGTATTT--ATGATAAGCA-A--A------TATATGT----GTTCCTTTGAAATAAATAC-T--CAAATG-----------------TTGAGTATATCAGAAACA-----C---------------------TCAAAA-TG-TTAAC-TTAATTTGTTGCACCTGGTGACCTTTGACCCC-ATTT---T--TGCGTTT-ATA-A--TA--------T--AT-TT---T--T--T-TCTT---GGCAACCGAT-G----AAATAT-CGTCA-AGTACAGT--CTAAAATTACTTT--T-----TTA-TTACAAC-AGACTTCCATGAACATTCCGTACATCATGCGATAA-TTTTTTGAaaaaatccataatatctaaatccagtcaaggtttcgaaagtacttttgattattttgttttgttttttgtttttttgtttaaaaatcctcatataaagataaatttgcaacattatggtatttatgataagcaaatatatgtgttcctttgaaataaatactcaaatgttgagtatatcagaaacactcaaaatgttaacttaatttgttgcacctggtgacctttgaccccatttttgcgtttataatatatttttttcttggcaaccgatgaaatatcgtcaagtacagtctaaaattacttttttattacaacagacttccatgaacattccgtacatcatgcgataattttttgattgttttaaccacatt
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): ATTATCTTTATTACACTCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGTAGTAAACATGACTTCAGTCAAATTAAAGAAAATAGAAAATACTCATATATTTTTTTTTAATTTCACACACTCGCATCCTCAAAGGCGCGCAAGCACGCACGCACAGACTCAACAACAACAAAAATTTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTATAGATTCAATAAACATTCATTTTCAGTATATATGAAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTTATATTTATATTCAAATGTTTAATTACTAGTAGTCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTCTAATTTAATATCCCT
Unaligned ( gi|32 ): CAAAAAATTTAATATGCATTGTGAACAACAAATATTACAATTGTCATCAATTCAATAAACATTCATTTTTATATATATGACAGTATGTGGTTGGTTTTGCTTGATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTTTTAATTCTAATCTTATATCCTTTGATTGCTTTCCTTA
Unaligned ( gi|36 ): ATATATCATATCCTTTTATTACGCTCAATCCATTTACAGTAAAGGCAACGTTAGATTATATTGTACAGTACAGTAGGTAATGTGACTTTTGTAAAATTGAAGAAAATAGAAAATGCTGATATTTGTTTAA
Unaligned ( gi|40 ): TATATAACGTGTTTATTTACACTAAATCCATTTTACAGCAATGGCAACACAGGACTATATAATACGGTAATTAATATGACTTCAGTCAAATGAAAGAAAAG
Unaligned ( gi|42 ): CCTTTAGTTAAACTCTAAATGGTACTAGCGATCAATAACACTATATATTTGTGTTAATTTTAATTAAATACCCTTTAATTCCTTTCCTT
Unaligned ( gi|43 ): ATATTTACATTCAAATGTTTACTAGCGGTCACTAACACTATTTAATTGTATGAATTCTAATTTAGTATCCCTTGATTGCTTTCCTTAAA
Unaligned ( gi|48 ): TTTTATTATCTTAATTATACCCAATCCATTTACAGTAATGGCAACATGAGGT
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGTATTACTCTTATTCCATTTACGGCAATGTCAACATGAGGTAG
Unaligned ( gi|50 ): TGTTACTAGCGATAAATAACACTATATTTTTGTGTTAATTCTAATTT
Unaligned ( gi|51 ): ATTCTAATTTAATATCCCTTTATTGCTTTCCTTTAGTTA