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Reference ( family-949 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAGATATTCGATACTGGAATTTTACCGGATAGCTGGCTTATTGGAATCATTAAACATATCTTT-AGGGGAAAAGGGTCTCCGCTTGACTCAGCAAATTATAGATCTATTACTATTCTAAGTTGTCTTGGTTAACTGTTTACTTCTATTTTAAATGAACGTATTACAATATTTCTCAATCAAAATTATATTCTTAAAGAAAACCAAGCTGGTTTTCGGGCAAAATATCCTACTACCGATCATG-TTTTTACTTTG--ATTTTTTTAATAGATACGTCAAGATCACAAAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAGATACGT-----CAAGATCACAAAAGCAAAAAACTGTTTTGCTCCTACANAGATTTCTCTGNAGCATTCGATAGTATTTGGNGGGTAGGTCTGTGNAGTAAATTAATTAAAAATGGCNTAAANGNTAANNTTTTNCAAGTNATGTTTAATATGTATTCCGACATTAAATNTTGTGNAGCTGCTAATGNTAATATNTCCCCCTTCTTCAAAAGTCACTGTGGGGTAAGACAAGNCGNGAATCTTTCACCGATCCTNTTTTTCAACCTACTTAAACGACCTNGAAACGGAACTCGAAAATAANAACCATACACCNGTATCGAATTTAACCAGCCNNTTGACAACTTAAATATNNACCTTAAACTATTTATGTGTGCTATATGCGGACGACGCAGTTATTNTAAGTGATAACCCTACCACACTTCAANATTTATTAA----ATGAC---TTTCATTTGTACTGCACAAAA-TGGAAATTATCAATTAATATGAGTAAA--ACAAAGGTGATT-GTTTTTGGTACAAATAAACCTAATAACTTNAGTTTT--AATATAAATNGCGA-AAGCATAGAAATTGT-------------T--A-------------T-CTAGGAATAT---TATTTTCTTCA--TCCGGCGGTTTCCTAAACACAAG---AAAACATTTAGCTAGTCAAGCAAATAAAGC-AATGCA-----TATACTTAATACACGA-ATCTCAA-------ATC-----TCGACTTG----------CCAATTG-------------A----TA-T------------------TCAA-----------C---AATTTT-------AAC-ATAT-----------------AACTGCGAGGTNTGGGGCTTCGAAAACTTAGATTTAAT-CGAAAAAAAAAGTACACA----CCGATTT-CCTTCGCAAAATTACGAACAGCAAGAAAAGTACCCCTTTATAC-------A-------C-------G-------GT-GAATTAGGGCGATAC----CCTCTTGAAATTACA-----ATTAAGTCTAGAATNATTAATTACTGGATCAAACTTATTTCAGG-AAACGAA-----GAAAAAAN-TGCGCGAATANGTTACAATATA-------ATGTTATAT--TCATCAACAAATTACAAGTGGATTAATTACGTGAANACTATTTTAGATAATACCGGTAATACATACATATGGATCAACCAAAAAACATTTCATCTCAAGAGCACAAGTAAACCGATAAAACAAAACCTCTTAGATCGATTTCACCAACATTGGTATGGTCAGCTTAACAATTCATCAAAAGGACTTAATTACAGATTAATCAAATCCGATATCAAACTAGA-ACCTTATTTGACAATTTTACCAGTTAATCTGCGACTGGAACTATTCCATTTCCGTACCACTAACCATAGATTACCAGTGGAACTGGGCAGATTTCAACAGTCATATTTACCGTATCACGAACGCAAATGCCGACACTGCCTTTTAAACGA-TATCGGCGATGAGCTACACTATGTCCTAAAATGTCCATTATTTCTTACTGAGAGATTGAGAT-ATATTCCCCTATACTATTACCGTCGGCCAAATATCATAAAATTTC--GTGAACTTATGTCCTCA--A------ACTCGTCCAAAATACTGAGAAATGTTAGTACATTTGCTCGCCGCACTAACAATTATTTTCGGTCAATTAACTTAACACAACAGACTTACCTTTAATTTAAGCTATGGTTATATCCAAAATAGTTATATTC-CCTCAAGTAATCCGCTAG---TTTT-T-ATGCACAGCCATGTGTTT-ACTATTAAATCNCAGTC-AATGACATTCCAATGCGACTAT---ACAATTTCCATGAATGAAAGCACGTTAAGCACGTGCAAATGAANAAACTCTCCCAACCTTGAGTAGACAGACAGTGAATTTAAACACGNCCATCTGCAAAGTTATGAATG------------AAA-CTTTGATCGGC----------------CAATCG------TGATTTTAATGCACAAGCCNTATTTGCACTGCATATCACAATTATGTTTATTTTTAT--TTATTCTTTTTATTCAT-TTTTTTTTTCACAATAC-AATTATAGTTGTTT-------TGTTTT-GTT--GATATAAACATTACAAGGTAATNTGTTT---AAAA-------A-A--GTCGTTGAAAGAATGTTCGGATTTCCTGTATTTCCCCCATTTTATT-ATTTCCT
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15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|9 : tTTAACA---ATATTTACCGTATCACTGTCACAAATGCCGACACTGCCTTTTAAACGA-TATCAGCGATGAGCTACACTATGTCCTAAAATGCCCATTATTTCTTACTGAAAGACTGAGAT-ATATTCTCTTGTACTATTACCCTCGGTCAAATATCA--AAAT-------G---TTATGTCCTCA--A------ACTCGTCCAAAATATTGAAAAAAATTGATATATTTGCTCGCCATACTAACAATTATTTTCGTTCAATTAATTTAACACAACAAACTTACCTTTTATTTAAGTTATGGTTATAT--AAAA-----ACATTC-CCTCAAGCAATCCACTAA---TTTT-T-ATGCACAGCCATGTGTTA-ACTATTAAATCACAGTC-AATGTCACTCCAATTCGACTAT---ATAATTTCCATGAATAAAATCATGTTAAGCACCTGCAAATGAATAAAATCTGCTAACCTTGGGTAGATAGGCAGTGAATTTAAACACACCCATCTGTATAGTTATGAATG------------AAA-GTTTGATCGGC----------------CAATCG------TGATTGTAATGCACAAGTTGCATTTGCATTGCATGATACAATTATG-TTGTTTTTAA--TTATCATTTCTTTTC-A--cgtcccttaagcatttcattaaatgcacagtcgccacattgacttctatgtgcagaacagagtgaaatttgaatgtaaatatgcatgcatataaaaataatgttctaatttaaatcagcaatgccaattatatatacttaataatataaattta
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): GTTAATATAAACTTAACGTATAACTAAATTTACCTGTGATTTGGCAAATGACACGAAATTTGAAAAATATATGGACACAAGTAAAACACCATAATGCAGTTTTCGTTAAATGTTGTTTTAGTATGTAAATGTTGACTAATGTGAAATCTATATATATTTCATTTATTTCTGTCCCCTGGATAAATACCCACATATATGTTAAACGAAATGAATCATACTGTAACCTTTGTGTAGCCTGATATTAATGAAAGTAAATGTTGT
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Unaligned ( gi|30 ): CATTCGTCTCCTGTTTGTTTCTCTTTTTATAGATTCCTTTGAAGCATCGACGTAGATTTATTGGGCGTTTCCTGTTGATTTCTGAAGAAAAAAATTAAA
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