lowQualScore : 2 11 2222 1 11 2222 1 1 1 11 11 222222222 11 1 111111111 111 22222222222222 1 111 111 1 2222222222222222222222 222 22222222222222 11111111 33333333333 111 1111111111 33333333 1 11111111111 11111111111111 222 1111111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555 111 222222222222222222 1111111111111 1111111111 11111111 111111 11111111111 22222222222222 11111111 11111111111 111111111 1111 11 44444444444444444444 33333333 1 1111 222222 11 2222222
lowQualScore : 2 4 0 6 8 5 5 4 4 00 2222 4 1 3 44 2222 2 7 2 4 5 3 88 33 222222222 1 55 3 4 77 666666666 000 33333333333333 5 55 555 2 666 33 999999 2 1 2 33 55555 444 2 3 2 6 222 3 2 33 77 2 33 5 1 5555 2 4 555 2 555 2 1 55555 2222222222222222222222 6 000 11111111111111 3 2 55 555 1 3 6 33 2 7777 2 5555 33333 555 2 66666 33 77777777 0 33333333333 111 66 2 2 2 55 5 1 6666 1 6 555 4 33 444 2222222222 7 9 1 66666 777 55555555 1 5 99 4 0 66666 77 88888888888 999 555 88888888888888 3 5 44 44 555 2 1 9999 33 2 44 2 2 2 1 0 5 00 6 2 55 2 111 3333 1 1 1111111111 3333 1 9 99999999999 1 9 22 6666666666666666666666666666666666666666666666666 444 2 777777777 333 2 000000000000000000 2 22 77 1 1 55555 22 33 333 1 1 333 3333333333333 22 222 3333333333 3333 1 11111111 3333 1 22 888 22 111111 3 44 2 88888888888 88888888888888 3 8 44 555 1 6666 2 22222222 33 66666666666 2 4 0 4 0 33 2 111111111 33 77 22 2 333 4444 2 99 6666666 4444 9 666 2 2 11 2 6 1 44 66666666666666666666 0 44444444 0 0 3 0 7777 333333 11 1111111 3 7 7
lowQualScore : . . . . . . . . . .. .... . . . .. .... . . . . . . .. .. ......... . .. . . .. ......... ... .............. . .. ... . ... .. ...... . . . .. ..... ... . . . . ... . . .. .. . .. . . .... . . ... . ... . . ..... ...................... . ... .............. . . .. ... . . . .. . .... . .... ..... ... . ..... .. ........ . ........... ... .. . . . .. . . .... . . ... . .. ... .......... . . . ..... ... ........ . . .. . . ..... .. ........... ... ... .............. . . .. .. ... . . .... .. . .. . . . . . . .. . . .. . ... .... . . .......... .... . . ........... . . .. ................................................. ... . ......... ... . .................. . .. .. . . ..... .. .. ... . . ... ............. .. ... .......... .... . ........ .... . .. ... .. ...... . .. . ........... .............. . . .. ... . .... . ........ .. ........... . . . . . .. . ......... .. .. .. . ... .... . .. ....... .... . ... . . .. . . . .. .................... . ........ . . . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 5 0 0 0 3 7 7 9 9 44 1111 3 6 9 88 9999 5 0 5 0 0 3 33 88 999999999 1 77 8 0 11 999999999 000 55555555555555 0 00 444 2 222 77 333333 7 1 7 11 66666 444 7 1 7 2 000 1 4 66 77 4 33 3 5 3333 4 7 444 0 666 1 7 00000 6666666666666666666666 2 222 44444444444444 6 5 55 888 2 3 2 77 7 3333 7 7777 88888 000 5 22222 99 22222222 6 44444444444 111 33 7 7 7 55 7 2 1111 1 8 777 4 11 111 6666666666 6 4 5 22222 777 88888888 2 0 55 0 3 22222 77 55555555555 666 444 11111111111111 1 9 22 66 000 9 6 1111 22 4 55 4 4 4 0 9 4 66 1 5 99 5 999 9999 9 9 1111111111 7777 7 1 33333333333 6 3 33 7777777777777777777777777777777777777777777777777 999 4 888888888 777 1 666666666666666666 1 66 00 9 9 88888 66 99 333 9 8 555 4444444444444 88 000 0000000000 5555 7 66666666 4444 6 22 999 22 444444 3 55 2 22222222222 11111111111111 1 8 66 222 8 0000 7 00000000 11 66666666666 2 4 9 4 4 11 2 999999999 22 88 99 1 777 2222 1 22 8888888 7777 1 222 1 1 99 5 2 6 66 55555555555555555555 8 44444444 4 0 5 2 0000 000000 00 7777777 2 3 3
consensus : AAACTAGANCTATCACTGNAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATGGTTTACCATTGTATGAAG-T-TCGATTAAATTATATCC----AGTACTTTTAAAGTTATGCTCCGGACAAAAAAAAN-NNTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTNTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGNTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGCTTTCTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTCATTANACTGTTACCACTG-ATG--GCTT--TAAAA---------GTACTTTAAAAGTANTGCTCCGG-ACAAGGGAAATA-------TA--TCAAA--------------GGGCAA--TAACTCTGT---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-TCTTGTACACTG--CAC-----TTCC---TNTCATT-ATATTCT---ACCATTGTA-TGA-A-GT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GTACTTT-TNAA-GTTATGCTCCGGACA-----A--------AG--------A---AAATATA--NCAAA--------------GG-GCGA--TAACTCTGT---AATT-AG-CA--AG-AAT--AGAGTTA-TG----TTT--CT-T---GTACACTGCA-C-----T--TCC-----TC-TCATT-A-TATTCT--ACCA--TTGTA--TGAA-G-T-TT-GA-TGAA----ATTCCATC--CA-GT--A---CT----------TTTAAAGTNATGCTCCGGACA-----AG-GAAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTC-CATC--CA-GTACTTTTAAAGTTATGCTCCGGACA-----AGGAAAAT--A-------TA--NCAA---A--------------GG-GCGA--TAAC--TCTGT---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTCTTGTACACTGCACTTCCTCTCANT-AT-AT-T--CT--ACCATTGTA-TGA-AGT-TT-GA-CGAA----ATTC-CATC--CA-GT----AC-TTTTNGAG--TTATGCTCCGGACAAG---AA-A-AAATA--N---C--A--------A-AGGA--AAATATA-TNAAAGG-GCG-ATAAC--TCTG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CT-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TCTCA-T-ATNTTCT--ACCATTGTG-TGA-A-GT-TT-GA-CGAA----ATTC-CATC--CA-GT----AC-T--TTTC-GAG--TTATGCTCCGGACAAG---A--A-A--AA-AT-----A--T--CAAA--------------GG-GNGA--TAAT--TCTGT---A-ATT-A--G-CA--AG--A----AT--AGAGTTA-T-GTT-TCTTGTACACT--GCA-CTTCCTCTCATT-A--TNTTCT--A-CCA--TTGTA-T---G-A-NG-T--T-CGA-TGAA----ATTCCATT--CA-GTA-CTTTTNGAGTTATG-CTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCNCAGG----GCGAC------TCC--AGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( gi|1 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATGGTTAACCATTGTATGAAG-T-TTAATTAAATTATATCC----AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAAAGAAAT-TCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTG-ATG--GCTT--TAAAA---------GTACTTTAAAAGTACTGCACCAG-ACAAGGGAAATA-------TA--TCAAA--------------GGGCAA--TAACTCTGT---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-TCTTGTACACTG--CAC-----TTCC---TGTCATT-ATATTCT---ACCATTGTA-TGA-A-AT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GTACTTT-AAAA-GTAATGCTCCGGACA-----A--------AG--------G---AAGTATA--TCAAA--------------GG-GCAA--TAACTCTGT---AATT-AG-CA--AG-AAT--AGAGTTA-TG----TTT--CC-T---GTACACTGCA-C-----T--TCC-----TG-TCATT-A-TATTGT--ACCA--CTGTA--TGAA-G-T-TT-GA-TGAA----ATTCCATC--CA-GT--A---CT----------TTAAAAGTAATGCTCCGGACA-----AG-GGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTC-CATC--CA-GTACTTTAAAAGTTATGCTCCGGACA-----AAGAAAAC--A-------TA--TCAA---A--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTCCTGTACACTGCACTTTCTCTCATT-AT-AT-T--GT--ACCATTGTA-TGA-AGC-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CG-GT----AC-TTTTCAAG--TTATGCTCCGGACAAG---AA-A-AAATA--T---C--A--------A-AGGA--AAATATA-TTAAAGG-GCA-ATAAC--TCTG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CC-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TCTCATT-ATATTTT--ACCATTGTA-TGA-A-GC-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CG-GT----AC-T--TTTC-AAG--TTATGCTCCGGACAAG---A--A-A--AA-AT-----A--T--CAAA--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATT-A--G-CA--AG--A----AT--AGAGTTA-T-GTT-TCTTGTACACT--GCA-CTTCCTCTCATT-A--TATTCT--A-CCA--TTGTA-T---G-A-TG-T--T-CGA-TGAA----ATTCCATC--CA-GTA-CTTTTCAAGTTATG-CTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCAGG----GTGAC------TCC--AGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACTA
gi|3 : AAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATGGTTTACCATTGTATGAAG-T-TTTATTAAATTATATCC----AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAAAAAAAA-AATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCT
gi|6 : aatAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATGGTTAACCATTGTATGAAG-T-TTTATTAAATTATATCC----AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAAAAAAAA-TCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTG-ATG--GCTT--TAAAA---------GTACTTTAAAAGTACTGCAGCAG-Agtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|8 : TTTACCATTGTATGAAG-C-TTGATGAAATTCCATCC----GGTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAAA
gi|16 : tcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcctgtacactgcacttcctctcattatatACCATTGTATGATG-T-TTGATGAAATTCCATAC----AGTACTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGAAAAT-Tatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctctggacaaggaaaattgcggacagacggacagaccaacagaccgacctccgggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataacaag
gi|12 : tgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctATCATTGTGTGAAA-TATCAACTAAATC----CCTTG-AACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAA--------CATAATAAAAgcaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataataaa
gi|2 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcaatgtcatctCATTGTGTGAAGAT-TCAAT-AAA----ATCCCTTAAATAGTTTTAGAGTTATGATCCAGACAAAA-AAATAAATTAACAAGAGAtataacaagagg
gi|10 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtTGTATGCAG-T-TTGAATAAATTATCACA----AGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAt
gi|8 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctaTCATTATATT-TTACCATTGTATGAAGCTTGATGAAATTCCATCCGGTACTTTTCAAGTTATGCTCCGG-ACAAGAAAAA-A-------TA--TCAAA--------------GGGCAA--TAACTCTGT---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-TCTTGTACACTG--CAC-----TTCC---TCTCATT-ATATTCT---ACCATTGTA-TGA-C-GT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GTACTTT-TCAA-GTTATGCTCTGGACA-----A--------GG--------A---AAATgtcaatttaa
gi|2 : tcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcctgtacactgcacttcctcG-ATA--ACNN--NNNNN---------NNNTTTTAGAGTTA-TGC-CCAGGACAAGT-AAATT-------TA--ATAAA--------------GGGAGA--TAACACAAA---AAGTAAG-CA--AGG-----TAGAGTTA-TTGT-TCTTGTACACTG--CAC-----TTCC---TACCAAT-ATCATCT---GTCATTGTT-TGA-AGAT-TC-AA-CAAA----ATTC-C-TT--AA-ATAGTTT-TGGA-GTTATGTTCTGGATA-----A--------AA--------GGGTAAATATA--ATAAA--------------GG-GAGA--CAATTCAAA---AAGTAAG-CA--AG--GT--AGAGTTATTG----TTC--TT-T---GTATTCTGCA-C-----T--TCC-----TC-TCA---A-TGTTCTCAGTCA--TTGTG--TGAA-GAT-TC-AA-TAAA----ATCCC-TT--AA-AT--A---GT----------TTTAGAGTTATGATCCAGACA-----A--AAAAATA-------AATTAAtgcggacagacggacagaccaacagaccgacctccgggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataacaag
gi|12 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggaCTT--CAAAA---------CT--TTTCAAGGT-TTGCTCCAA-ACAAGGGAA-TA-------TA--ATAAA--------------GGGGAA--TAATTATGT---GA--A-GACAGAAGA----A-AGAGTTA-TGCA-TACTGCACACTG--TAC-----TTCC---TCTCAAT-GTCATCT---ATCATTGTG-TGA-A-ATATC-AA-CTAA----ATCC-C-TT--GA-ACACTTT-TTGA-GTTATGCTCCGGACAAACATA--------AT--------A---AAATATA--ACAAG--------------AG-Gcaagagat
gi|54 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcaAAAG---------GTACTTTAAAAGTACTGCACCAG-GCAAGGGAA
gi|3 : A---------GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGG-ACAAGGGAAATA-------TA--TCAAA--------------GGGCAA--TAACTCTGT---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-TCTTGTACACTG--CAC-----TTCC---TCTCATT-ATATTCT---ACCATTGTA-TGA-A-GC-TT-TA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GTACTTT-TCAA-GTTATGCTCCGGAC------A--------AG--------A---AAAAATA--TCAAA--------------GG-GCAA--TAACTCTGT---AATT-AG-CA--AG-AAT--AGAGTTA-TG----TTT--CT-T---GTACACTGCA-C-----T--TCC-----TC-TCATT-A-TATTCT--ACCA--TTGTA--TGAC-G-T-TT-GA-TGAA----ATTCCTTC--CA-GT--A---CT----------TTTCAAGTGATGCTCCAGACA-----AG-GAAAAT
gi|16 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatgttttctgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccA---------GTACTTTTCAAGTGATGCTCCGG-ACAAGGAAAATtgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|7 : tgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgatgtttgatgaaattccatacTTTGAAGATA-TGCTCCAG-AGAAGAAAAA-A-------TAACCCAAACTAAAATACAACAGGGGAGA--TAATTCTGT---CATTA-T-CT--GAA----ATAGAGTTA-TGGT-TCTTTTGCCCTA--CATTCATGTTCCAGGTGTCATT-GAATTtgcaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataataaa
gi|5 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaagacaagcaaaaataaccaaaaattaagtacaaaaaaggaagataatcaaggcagagttacgattctttttgtatcgccactttcaggttccaaatcacacaattgaattcacttccatattAAAAGTGTTACTTTAA-TTAAGGGAGATA--------A--TTAAA--------------AA--AA--TA---C------------G-CA--A-A----GTAGAGTTA-TGGT-TCTTGTGTACTT--CTC-----TTTC---T--CACG-ATGTCCTCG-GTAATTGTG-TGGTA-GT-TTCAA-CATA----ATTC-C-TG--AA-ATAGATT-GTA--GTTAGGCTCTGGACA-----A---------G--------T---AAATTTG--ATAAA--------------GG-GAGG--TA-CTTCGA---AA---AG-TA--AGCAATGTAGAGTTA-TG----GTT--TT-T---ATACACTGCACC-----T--TCC-----TT-TCAAT-G-TCCTCT--GTCA--TTGTG--TGAATA-T-TC-AA-CAAA----ATCGC-TT--GA-GT--A---CT----------TTtccttaagtatttttggagttatttccaggcaaggattcaaacagactggcagacaaagtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|37 : gttattgtacactacacttcttcttaatgtcttcagtcattgtatggtgattcaacataatgtctcaaatagttctggggttatgcttcggacG-ACAAG--AAACAAATTTTTTA--TCAAA--------------GGGCAA--TAACTCTGT---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-Ttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|13 : CAAAATAAAAA-------TA---CAAA--------------AGGCGAGATAGTTCTGTCATAATT----CA--AGA-----TAGAGTT---GTT-TTTTTCATTCTG--CAT-----TTCC---A--CACT-TT-TCCTTTGGCCATT-TACTGA-A-GT-TT-CACTGGATTTTATTC-CCTC--CA-GTATTTT-
gi|8 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataac--TCAAA--------------GGGCAA--TAACTCTGT---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-TCCTGTACACTG--CAC-----TTCC---TCTCATT-ATATTTT---ACCATTGTA-TGA-A-GC-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CG-GTACTTT-TCAA-GTTATGCTCCGGACA-----A---------G--------A---AAAAATA--TCAAA--------------GG-GCAA--TAACTCTGT---AATT-AG-CA--AG-AAT--AGAGTTA-TG----TTT--CT-T---GTACACTGCA-C-----T--TCC-----TC-TCATT-A-TATTCT--ACCA--TTGTA--TGAC-G-T-TT-GA-TGAA----ATTCCATC--CA-GT--A---CT----------TTTCAAGTTATGCTCTGGACA-----AG-GAAAAT
gi|10 : AAA--------------GGG-AA--TGATT-TGA---AA--A-A-TA--AGGCATGGTAGATTTA-TGATATCTTTTCTAATG-----------TCC---T----TT-AT---CT---A----TGTA-TGC-A-GT-TT-GA-ATAA----ATT---ATCA-CAAGCACTTC-TAAA-GTGATGCCCCGGACA-----A--------tgcggacagacggacagaccaacagaccgacctccgggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataacaag
gi|4 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgt--TAACTCTGT---CATTA-TTCA--AGA-----TAGAGTTACTGTT-ATTTA-GCTCTG--TAC-----TTC--------A---ATATTTT---ACCCTC-TA-CCC-A-----T-G--TG--------CC-CTTT--CA--TATTTT-TGAA-GCTATGCTCAGGACA-----AGCAAAACTAGCCAAAAATA---AAGTACA----AAA--------------GGAGAGA--TAATTATGT---CATT-ATTCA--AG-A-T--AGAGTTA-TGGTTATTTTGCCGT---GTACATTGC--C-----C--TC-------G-AC---------------CCA---TGTT--CAAT-G-C-TT-CT-TGAG----ATCCCGTC--CATATTAA---CT----------TCGAAGAT-ATGCTCAAGACA-----AGCAAAAATA--------ACCAAAgtcaatttaa
gi|16 : ctcagaacaagtaaattttttttttacaaaaatgggagtTGT---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-TCTTGTACACTG--CAC-----TTCC---TCTCATT-ATATTCT---ACCATTGTA-TGA-T-GT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATA--CA-GTACTTT-TCAA-GTGATGCTCCGGACA-----A--------GG--------A---AAATacaaatggggagatgatactgacattattcaagctaataaaggttctctcactcagaactaccatacataagctttctattcatgttctaagtgtcatctgattccattcagttctcctagagttacatttcggacaagaatcaagacggacacaaggatgcacgaacata
gi|53 : ---AATTA-G-CA--AGA----ATAGAGTTA-TGTT-TCTTGTACACTG--CAC-----tgcaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataataaa
gi|18 : A--AGA----A-AGAGTTA-TGCT-TCCAGCACACTG--AAC-----
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagA--AGA----A---AGTTA-TGGT-TCCTGCACTGTG--CAC-----TTCC---
gi|12 : atattaataaaaggaaaatTGTACTGTC--CAC-----TTCC---TGTC--T-ATGCTCTCT-ATCACTGAA-TGC-A-GT-TC-AA-AGCA-----TTC-ACTT--CA-AAACTTTTCAAG-GTT-TGCTCCAAACA-----A--------GG--------G---AA-TATA--ATAAA--------------GG-GGAA--TAATTATGT---GA---AGACAGAAG-AA---AGAGTTA-TG----CAT--AC-T---GCACACTGTA-C-----T--TCC-----TC-TCAAT-G-TCATCT--ATCA--TTGTG--TGAA-A-TATC-AA-CTAA----ATCCC-TT--GA-AC--A---CT----------TTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAA-TAAAATA-------TAACAAGAGGaactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|41 : ACTGGCCAC-----TTCC---TGCCAAT-CCTCTCT---ATCATTGTA-TGC-A-GT-TT-
gi|32 : tTG--TAC-----TCCC---TTTCATTGACAT-CT---A--ATTC-----A-A-GT-TT-GACTGAA-------C-TATCTTCA-GTACTTA-TGGA-GTTATGCTGTGGACA-----A--------GG--------caaagcattcacttca
gi|39 : --CAC-----TTCC---TGTCATT-GCTCTCC---ATCATTGTA-TGC-A-GT-TT-a
gi|6 : ctggc---ACCATTGTA-TGA-A-GT-TT-TA-TTAA----ATTA-TATC--CA-ATAGTTT-TAAA-GTTATGCTCCAGACA-----A--------AA--------A---AAcaaactattcatttcaaaa
gi|3 : aactagacctatcactgtagtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggttaACTGGA-TGG-A-AT-TT-CA-TAAA----GCTT-CATA--CA-ATGGT---AGAATATAATG----AGAGG-----A--------AGT-------G---CAGTGTA---CAAG--------------AA-ACA---TAACTCTAT---TCTT-GC-TA--AT-TAC--AGAGTTA-T-----TGC--CC-TTTGATATATTTCC-C-----TTGTCC-----GGAGCATT-ACTTTTAA--AGTA--CTGGA--TGGA-A-T-TT-CA-TCAA----ACTTCATA--CA-AT--aatcttaataaaagagaatgttatggattgagttgtttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacggtctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatactttttcgagttatgttgagggacaacaattttatggataagaaacaaacaagagcactaggaatacaatatcgaacctgctttgctcgaactccatgtattcatcaacttggttctttcatgaactttattaaactgttatcactgatggctttaaaagtactttaaaagtactgcagcaga
gi|42 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatgttttctgtacactgcacttcctgtcattatattctaccTTGTA-TGC-A-GG-TT-GA-T-AA----ATTT-CATT--CA-GCATTTT-TAGA-TTTGTGC-CCAG-CA-----A--------AA--------A---AAacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|7 : ctA----ATTCACTTC--CA--TATTTT-TGAA-GATATGCTCCAGA-G-----A--------AG--------A---AAAAATAACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGA--TAATTCTGT---CATT-AT-CT--GA-AAT--AGAGTTA-TG----GTT--CT-T---TTGCCCTACA-TTCATGT--TCCAGG--TG-TCATT-G-AATT
gi|24 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaagacaagcaaaaataaccaaaaattaagtacaaaaaaggaagataatcaaggcagagttacgattctttttgtatcgccactttcaggttccaaatcacacaattgTC-CATT--CA-GCACTTT-TAGA-GTAATGCCCATGACA-----A--------Atccttaagtatttttggagttatttccaggcaaggattcaaacagactggcagacaaagtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|48 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaaATT--CA-GCACTTT-AAGA-GTTATTCCCAGGACA-----A--------Ataaattt
gi|20 : --CA-GCACTTT-AAGA-GTTATGCTCAGGACA-----A--------cacaattaataacagaagataa
gi|54 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttg-GTACTTT-AAAA-GTACTGCACCAGGCA-----A--------GG--------G---AAgtaaattta
gi|13 : aaagCA-----A--------AA--------T---AAAAATA---CAAA--------------AG-GCGAGATAGTTCTGTCATAATT----CA--AG-A-T--AGAGTT---G----TTT--TT-T---TCATTCTGCA-T-----T--TCCACACTTT-TCCTT------TG---GCCA--TT-TAC-TGAA-G-T-TT-CACTGGATTTTATTCCCTC--CA-GT--A---TT----------TT
gi|37 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacTA--TCAAA--------------GG-GCAA--TAACTCTGT---AATT-AG-CA--AG-AAT--AGAGTTA-TG----TTT--
gi|16 : gacaagaaacaaatttttTGT---AATT-AG-CA--AG-AAT--AGAGTTA-TG----TTT--CT-T---GTACACTGCA-C-----T--TCC-----TC-TCATT-A-TATTCT--ACCA--TTGTA--TGAT-G-T-TT-GA-TGAA----ATTCCATA--CA-GT--A---CT----------TTTCAAGTGATGCTCCGGACA-----AG-GAAAAT
gi|53 : ---AATT-AG-CA--AG-AAT--AGAGTTA-TG----TTT--CT-T---GTACACTGCA-C-----tgcaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataataaa
gi|21 : -CA--AG-G-T--AGAGTTA-TA----ATT--AT-T---GTGCAGTTTA-C-----C--GCC-----TC-CCATT---TACAG----CCAATCTGCATTTCAA-G-T-TTCAA-TGAA----ATT-CGTT--CA-GT--AGGTCTGGAACAATTATCAAAAGAAAAG---TGAGCA-----AG-GGAGATA-------
gi|18 : aagacgtaacaA--AG-AA---AGAGTTA-TG----CTT--CC-A---GCACACTGAA-C-----a
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagA--AG-AA-----AGTTA-TG----GTT--CC-T---GCACTGTGCA-C-----T--TCC-----
gi|32 : atattaataaaaggaaaatTGTA-C-----T--CCC-----TT-TCATTGA-CAT------CTA--AT-----TCAA-G-T-TT-GACTGAA-------CTATCTTCA-GT--A---CT----------TATGGAGTTATGCTGTGGACA-----AG-Gaactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|39 : CA-C-----T--TCC-----TG-TCATT-G-CTCTCC--ATCA--TTGTA--TGCA-G-T-TT-a
gi|6 : ctggc--ACCA--TTGTA--TGAA-G-T-TT-TA-TTAA----ATTATATC--CA-AT--A---GT----------TTTAAAGTTATGCTCCAGACA-----AA-AAAAAcaaactattcatttcaaaa
gi|10 : aactagacctatcactgtagtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggttaTGTA--TGCA-G-T-TT-GA-ATAA----ATT--ATCA-CAAGC--A---CT----------TCTAAAGTGATGCCCCGGACA-----AG-atcttaataaaagagaatgttatggattgagttgtttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacggtctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatactttttcgagttatgttgagggacaacaattttatggataagaaacaaacaagagcactaggaatacaatatcgaacctgctttgctcgaactccatgtattcatcaacttggttctttcatgaactttattaaactgttatcactgatggctttaaaagtactttaaaagtactgcagcaga
gi|40 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctaA--TGTA-G-T-TT-AA-ATAA----ATTCCTTT--CA-GC--A---CTA---------TTAGAATTAAGTCCCAGAACA-----AG-tcaatttaa
gi|24 : TCCATT--CA-GC--A---CT----------TTTAGAGTAATGCCCATGACA-----Atacattt
gi|48 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaaATT--CA-GC--A---CT----------TTAAGAGTTATTCCCAGGACA-----Aataaattt
gi|20 : --CA-GC--A---CT----------TTAAGAGTTATGCTCAGGACA-----AG-acacaattaataacagaagataa
gi|54 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttg-GT--A---CT----------TTAAAAGTACTGCACCAGGCA-----AG-GGAAtaaattta
gi|37 : aaagGACA-----AG---AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATT
gi|3 : TGAAATTC-CATC--CA-GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACA-----AGGGAAAT--A-------TA--TCAA---A--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTCTTGTACACTGCACTTCCTCTCATT-AT-AT-T--CT--ACCATTGTA-TGA-AGC-TT-TA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GT----AC-TTTTCAAG--TTATGCTCCGGACAAG---AA-A-AAATA--T---C--A---------------------------AAGG-GCA-ATAAC--TCTG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CT-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TCTCATT-ATATTCT--ACCATTGTA-TGA-C-GT-TT-GA-TGAA----ATTC-CTTC--CA-GT----AC-T--TTTC-AAG--TGATGCTCCAGACAAG---G--A-A--AA-agcaagaatagagttatgttt
gi|8 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatgttttctgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgaTGAAATTC-CATC--CG-GTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACA-----A-GAAAAA--A-------TA--TCAA---A--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTCTTGTACACTGCACTTCCTCTCATT-AT-AT-T--CT--ACCATTGTA-TGA-CGT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GT----AC-TTTTCAAG--TTATGCTCTGGACAAG---GA-A-AAttgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|16 : tcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcctgtacactgcacttcctctcattatattttaccattgtatgaagcttgaTGAAATTC-CATA--CA-GTACTTTTCAAGTGATGCTCCGGACA-----AGGAAAAttgcggacagacggacagaccaacagaccgacctccgggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataacaag
gi|32 : tgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgatgtttgaTGAA---C-TATCTTCA-GTACTTATGGAGTTATGCTGTGGACA-----AGGAttgcaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataataaa
gi|6 : tgtactccctttcattgacatctaattcaagtttgacAAATTA-TATC--CA-ATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACA-----AAAAAAA
gi|12 : aactagacctatcactgtagtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggttaaccattgtatgaagttttattAAATCC-C-TT--GA-ACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAAT--A-------TA--ACAA---G--------------AG-Gatcttaataaaagagaatgttatggattgagttgtttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacggtctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatactttttcgagttatgttgagggacaacaattttatggataagaaacaaacaagagcactaggaatacaatatcgaacctgctttgctcgaactccatgtattcatcaacttggttctttcatgaactttattaaactgttatcactgatggctttaaaagtactttaaaagtactgcagcaga
gi|10 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcaatgtcatctatcattgtgtgaaatatcaactAAATT---ATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACA-----A
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctatgtatgcagtttgaatAATTCACTTC--CA--TATTTTTGAAGATATGCTCCAGA-G-----AAGAAAAA--A-------TAACCCAA---ACTAAAATACAACAGGG-GAGA--TAAT--TCTGT---C-ATTA-T-CT--GA-AATAGA-GTTA-T-GGTTCTTTTGCCCTACA--TTC--------AT-GT-T-------CCA-GGTG-TCA-----TT-G-----A----ATTT-CCTT--AA-GT----AT-TTTTGGAG--TTAT-TTCCAGGCAAG---GA-gtcaatttaa
gi|48 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaagacaagcaaaaataaccaaaaattaagtacaaaaaaggaagataatcaaggcagagttacgattctttttgtatcgccactttcaggttccaaatcacacaattgATT--CA-GCACTTTAAGAGTTATTCCCAGGACA-----AACACAATTAA-------TA--ACAG---A--------------AG-ATAA--ttcaaacagactggcagacaaagtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|20 : --CA-GCACTTTAAGAGTTATGCTCAGGACA-----AGTAAA
gi|2 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgTTTTAGAGTTATGCCCAGGACA-----A-GTAAAT--T-------TA--ATAA---A--------------GG-GAGA--TAAC--ACAAA---A-AGTAAG-CA--AG-G-TAGA-GTTA-T-TGTTCTTGTACACTGCACTTCCTACCAAT-ATCATCT--GT----CATTGTT-TGA-AGA-TTCAA-CAAA----ATTC-C-TT--AA-AT----AG-TTTTGGAG--TTATGTTCTGGATAA-----------------------A--------A-GGGT--AAATATA-ATAAAGG-GAG-ACAAT--TCAA--A---A-A----GTAA----------G-CA--AG-GTAGAGTTATT-G----TTC--TT-T---GTA-TTCTGCA-CTTCC---TCTCA---ATGTTCTCAGTCATTGTG-TGA-A-GA-TTCAA-TAAA----ATCC-C-TT--AA-AT----AG-T--TTTA-GAG--TTATGATCCAGACAAA---A--A-A--AT-AA-----A--T--TAAttta
gi|12 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnTTTCAAGGTT-TGCTCCAAACA-----AGGGAA-T--A-------TA--ATAA---A--------------GG-GGAA--TAAT--TATGT---G-A--A-GACAGAAG-AA-AGA-GTTA-T-GCATACTGCACACTGTACTTCCTCTCAAT-GT-CA-T--CT--ATCATTGTG-TGA-AATATC-AA-CTAA----ATCC-C-TT--GA-AC----AC-TTTTTGAG--TTATGCTCCGGACAAACATAATA-AAATA--TAA-C--A--------AGAGGcaagagat
gi|11 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaactAAGATATGCT--GGACA-----CGTAAAAT--G-------TA--TAAA---A--------------GGAGAGA--TAATCATCT-C---ATATT----CA--AG-A---GA-GTTC-TTGTTATTTTTACTCCGCA-TTTC---CACT-GT----T---T--ACCATT-TC-C-A-AGT-GT-CA-TTGA----ATTC-CCTT--TG-TA----AC-TTTTAGAG--TTATGTCTCAGAAATG---AA-
gi|5 : tggGTTATGCTTCGGACA-----AAAGTGTT--A-------CT--TTAATTAA--------------GG-GAGA--TAAT--TAAAA---A-AATACG-CA--A--AGTAGA-GTTA-T-GGTTCTTGTGTACTTCTCTTTCTCACGAT-GT-CC-TCGGT--A--ATTGTG-TGGTAGT-TTCAA-CATA----ATTC-C-TG--AA-AT----AGATTGT--AG--TTAGGCTCTGGACAAG---TA-A-ATTTG--A---T--A--------A-AGGG--AGGTACT-TCGAAAA-GTA-A---------G--C---A-A----T----------------------GTAGAGTTA-T-G----GTT--TT-T---ATA-CACTGCACCTTCC---TTTCAAT-GTCCTCT--GTCATTGTG-TGA-ATAT-TC-AA-CAAA----ATCG-C-TT--GA-GT----AC-T--TTTG-TAG--TTttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|37 : gttattgtacactacacttcttcttaatgtcttcagtcattgtatggtgattcaacataatgtctcaaatagttctgggGACA-----AG--AAAC--AAATTTTTTA--TCAA---A--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|13 : CA-----AAATAAAA--A-------TA---CAA---A--------------AG-GCGAGATAGT--TCTGTCATA-ATT----CA--AG-A-TAGA-GT---T-GTTTTTTTCATTCTGCATTTCCACACTTT-TC-CT-T--TG--GCCATT-TACTGA-AGT-TT-CACTGGATTTTATTC-CCTC--CA-GT----AT-TTT
gi|8 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataac--TCAA---A--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTCCTGTACACTGCACTTCCTCTCATT-AT-AT-T--TT--ACCATTGTA-TGA-AGC-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CG-GT----AC-TTTTCAAG--TTATGCTCCGGACAAG---AA-A-AAATA--T---C--A---------------------------AAGG-GCA-ATAAC--TCTG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CT-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TCTCATT-ATATTCT--ACCATTGTA-TGA-C-GT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GT----AC-T--TTTC-AAG--TTATGCTCTGGACAAG---G--A-A--AA-
gi|2 : CAA---A--------------GG-G-AA--TAAT--TATGT---A-A-------A--AA-AATAG---TTA-T-GGTTCTTGCACCCTGTACTTCCTCTCAAT-GT-CC-T--TT--ATAATTGTG-TGA-AATATC-AA-CAAA----ATCC-C-TT--GA-AC----AC-TTTTTGAG--TTATGTTCAGGACAAG-------------------C--A--------T-AATA--AAATATAGTTAAAAG-A-G-ATAAT--T-----T---A-AAAAATG-G----------G-CA--TGG-TAGAGCCA-T-A----ATT--TT-T---GGA-CAATGTA-TTTCC---TGGCAAT-GTCCTCC--ATCAGTGTG-TGA-A-AT-AT-GAACCAA----ATCC-C-TT--GA-AT----AG-T--TCTT-GAG--TAATCTTTTTGTCAAGTATACTA-A--AA-GT-----G--A--TAAA--------------TG-GGGA--TAAT--T--GA---A-AAT-GAGG-CA--AG--A------------TTA-TTGTT-CTTTG-AAACT--GCA-CTTCTCCTTAGT-G--CACTCT--G-TCT--TTGTA-T---G-C-AG-T--T-TGA-ATAA----ATTCCATT--TA-GCA-CTTTTAGAGTTATG-CCCAGGACAAGTA--AATTTttgcggacagacggacagaccaacagaccgacctccgggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataacaag
gi|4 : acattaaaaa--TAAC--TCTGT---C-ATTA-TTCA--AG-A-TAGA-GTTACT-GTTATTTA-GCTCTGTACTT-----CA---AT-AT-T--TT--ACCCTC-TA-C-----C-C---A-TG-------TGC-CCTT--TC-AT----AT-TTTTGAAG--CTATGCTCAGGACAAG---CA-A-AACTA--G---CCAA--------A-AATA--AAGTACA---AAAGGAGAG-ATAAT--TATG--T---C-A----TT-AT---------T-CA--AG-ATAGAGTTA-T-GGTTATTTTGCCGT---GTA-CATTGC-----CC---TC------------G--ACCCATGTT-CAA-T-GC-TT-CT-TGAG----ATCC-CGTC--C--AT----AT-TAACTTCGAAG--ATATGCTCAAGACAAG---C--A-A--AA-ATA----A--C--CAAAACAAATG-------GG-GAGA--TGAT--ACTGA---C-ATT-AT-T-CA--AGCTA----AT--AAAG------GTTCTCT----CACTCAGAA-CTACCATACATA-AGCT-TTCT--ATTCA--TGTTC-T---A-AGTG-TCAT-C---TG------ATTCCATT--CA-GTT-CTCCTAGAGTTACA-TTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|16 : ctcagaacaagtaaattttttttttacaaaaatgggagtTGT---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTCTTGTACACTGCACTTCCTCTCATT-AT-AT-T--CT--ACCATTGTA-TGA-TGT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATA--CA-GT----AC-TTTTCAAG--TGATGCTCCGGACAAG---GA-A-AAcaaggatgcacgaacata
gi|53 : ---A-ATTA-G-CA--AG-AATAGA-GTTA-T-GTTTCTTGTACACTGCACttgcaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataataaa
gi|3 : TG-G-CA--ATCAATAAATGTTA-T-GTTTTCTGTACACTGCACTTCCTGTCATT-AT-AT-T--CT--ACCATTGTA-TGA-AGT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GT----AC-TTTAAAAG--TAATGCTCCGGACAAG-----------------------------------GG--AAATATA-TCAAAGG-GCA-ATAAC--TCTG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CT-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TCTCATT-ATATTCT--ACCATTGTA-TGA-A-GC-TT-TA-TGAA----ATTC-CATC--CA-GT----AC-T--TTTC-AAG--TTATGCTCCGGACAAG---A--A-A--AA-AT-----A--T--CAAA--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATT-A--G-CA--AG--A----AT--AGAGTTA-T-GTT-TCTTGTACACT--GCA-CTTCCTCTCATT-A--TATTCT--A-CCA--TTGTA-T---G-A-CG-T--T-TGA-TGAA----ATTCCTTC--CA-GTA-CTTTTCAAGTGATG-CTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACATG----GCGAC------TCC--AATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAA
gi|18 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcaA--AG-AA-AGA-GTTA-T-GCTTCCAGCACACTGAACaaatat
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagA--AG-AA---A-GTTA-T-GGTTCCTGCACTGTGCACTTCC
gi|12 : atattaataaaaggaaaatTGTACTGTCCACTTCCTGTC--T-AT-GC-T--CTCTATCACTGAA-TGC-AGT-TC-AA-AGCA-----TTC-ACTT--CA-AA----AC-TTTTCAAG--GTTTGCTCCAAACAAG----------------------------------GGA--A--TATA-ATAAAGG-GGA-ATAAT--TATG--T---G-A-------A----------GACAGAAGAA-AGAGTTA-T-G----CAT--AC-T---GCA-CACTGTA-CTTCC---TCTCAAT-GTCATCT--ATCATTGTG-TGA-A-ATATC-AA-CTAA----ATCC-C-TT--GA-AC----AC-T--TTTT-GAG--TTATGCTCCGGACAAACATA--ATA--AA-AT-----A--TAACAAG--------------AG-Gaactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|5 : TGTACACTACACTTCTTCTTAAT-GT-CT-TCAGT----CATTGTA-TGG-TGA-TTCAA-CATA----ATGT-C-TC--AA-AT----AG-TTCTGGGG--TTATGCTTCGGACAA---------AAGTG--T---T--ACTTTAATTA-AGGG--AGATA-A-TTAAAAA---A-ATA-----C-----------------------------G-CA--A-AGTAGAGTTA-T-G----GTT--CT-T---GTG-TACTTCT-CTT-----TCTCACG-ATGTCCTCGGTAATTGTG-TGGTA-GT-TTCAA-CATA----ATTC-C-TG--AA-AT----AGAT--TGT---AG--TTAGGCTCTGGACAAG---T--A-A--AT-TT-----G--A--TAAA--------------GG-GAGG--TA-C--TTCGA---A-A---A--G-TA--AGC-A----ATGTAGAGTTA-T-GGT-TTTTATACACT--GCACCTTCCTTTCAAT-G--TCCTCT--G-TCA--TTGTG-T---GAA-TA-T--T-CAA-CAAA----ATCGC-TT--GA-GTA-CTTTTGTAGTT
gi|32 : gttatTGTACTCCCTTTCATTGAC-AT-C---T--A--ATTC-----A-AGT-TT-GACTGAA-------C-TATCTTCA-GT----AC-TTATGGAG--TTATGCTGTGGACAAG---GA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|6 : --ACCATTGTA-TGA-AGT-TT-TA-TTAA----ATTA-TATC--CA-AT----AG-TTTTAAAG--TTATGCTCCAGACAAA---AA-A-AAATC--TTAAT--A--------A-AAGA--GAATGT
gi|33 : aactagacctatcactgtagtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggttaATTGTG-TGA-AAT-----A-TCAA----CTTA--ATC--CG-TTTAACAC-TTTTTGAG--TTATGTTCCGAACAAtatggattgagttgtttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacggtctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatactttttcgagttatgttgagggacaacaattttatggataagaaacaaacaagagcactaggaatacaatatcgaacctgctttgctcgaactccatgtattcatcaacttggttctttcatgaactttattaaactgttatcactgatggctttaaaagtactttaaaagtactgcagcaga
gi|31 : tgccctccataATTGTG-TGA-AATATC-AA-CTAA----AT-C-CTTT--GA-AT----AC-TTTTTTAG--CTATGTTCCAGACAAGCATAATA-AAATccataacaaca
gi|42 : tgtcgtctataaTTGTA-TGC-AGG-TT-GA-T-AA----ATTT-CATT--CA-GC----AT-TTTTAGAT--TTGTGC-CCAG-CAAA---AA-A-A
gi|10 : ctTGTA-TGC-AGT-TT-GA-ATAA----ATT---ATCA-CAAGC----AC-TTCTAAAG--TGATGCCCCGGACAAG---
gi|47 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatcta-TT-GA-GTAA----ATCC-CACT--CA-GC----AC-ATT--AAGAATTGTGCCCAAGACAAG---AA-A-Atcaatttaa
gi|7 : tA----ATTCACTTC--CA--T----AT-TTTTGAAG--ATATGCTCCAGAGAAG---AA-A-AAATAACC---C--A--------A-ACTA--AAATACA---ACAGG-GGAGATAAT--TCTG--T---C-A----TT-A----------T-CT--GAAATAGAGTTA-T-G----GTT--CT-T---TTG-CCCTACA--TTC------------ATGTT-----CCA-GGTG-TCA------TT-G-----A----ATTT-CCTT--AA-GT----AT-T--TTTG-GAG--TTAT-TTCCAGGCAAG---G--A-ttta
gi|20 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaagacaagcaaaaataaccaaaaattaagtacaaaaaaggaagataatcaaggcagagttacgattctttttgtatcgccactttcaggttccaaatcacacaattg--CA-GC----AC-TTTAAGAG--TTATGCTCAGGACAAG---TA-A-Attcaaacagactggcagacaaagtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|2 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttg-TTTTAGAG--TTATGCCCAGGACAAG---TA-A-ATTTA--A---T--A--------A-AGGG--AGATA-----ACA----CA-AAAA------G--T---A-A------------------G-CA--AGG-TAGAGTTA-T-T----GTT--CT-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TACCAAT-ATCATCT--GTCATTGTT-TGA-A-GA-TTCAA-CAAA----ATTC-C-TT--AA-AT----AG-T--TTTG-GAG--TTATGTTCTGGATAAA---A--G-GGTAA-AT-----A--TAATAAA--------------GG-GAGA--CAAT--TCAAA---A-AGTAA--G-CA--AG-------GT--AGAGTTATT-GTT-CTTTGTATTCT--GCA-CTTCCTCTCA---A--TGTTCTCAG-TCA--TTGTG-T---G-A-AGAT--T-CAA-TAAA----ATCCC-TT--AA-ATA-GTTTTAGAGTTATG-ATCCAGACAAAAA--AAttta
gi|37 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnGACAAG---AA-ACAAATT--T--------------------------TTTA-TCAAAGG-GCA-ATAAC--TCTG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--taaattaacaagagat
gi|7 : GACAAG---CA-A-AAATA--A---C--C--------A-AAAATTAAGTACA-AAAAAGG---A-AGA----------T---A-A----T---------------CA--AGG-CAGAGTTA-C-G----ATT--CT-TTTTGTATCGC--CA-CTTTCAGGTTCCA---A-ATCAC--ACAATTG---------------------A----ATTCACTTC--CA--T----AT-T--TTTG-AAG--ATATGCTCCAGAGAAG---A--A-A--AA-AT-----AACC--CAAACTAAAATACAACAGGG-GAGA--TAAT--TCTGT---C-ATT-A--T-CT--GA--A----AT--AGAGTTA-T-GGT-TCTTTTGCCCT--ACA--TTC---------A--TGTTCC--A----------------G-G-TG----T-CAT-TGAA----TTTCC-TT--AA-GTA-TTTTTGGAGTTAT--TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|13 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaaA-A-AGATAA-C---C--A--------A-AATA--AAA-ATA-CAAAAGGCGAG-ATAGT--TCTG--TCATA-A----TT--------------CA--AGA-TAGAGT---T-G----TTT--TT-T---TCA-TTCTGCA-TTTCC---ACACTTT-TCCTTTG--GCCATT-TACTGA-A-GT-TT-CACTGGATTTTATTC-CCTC--CA-GT----AT-T--TTgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|11 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcA--AAATGTA-TAAAAGGAGAG-ATAATCATCT---C---ATA----TT--------------CA--AGA---GAGTTC-TTG----TTA--TT-T---TTA-CTCCGCA-TTTCC---ACTG--------TTT--ACCATT-TC-C-A-A-GT-GT-CA-TTGA----ATTC-CCTT--TG-TA----AC-T--TTTA-GAG--TTATGTCTCAGAAATG---A--A-
gi|19 : tggaagatatgctggacacgt--AAGTATA-CTAAAAG--TG-ATAAC--TTGGGGT---A-A----TT-GAAATAATGACG-CA--AAAA-AGTGTTA-T-A----GTA--AT-T---AAA-CACTGC--CTTCC---CCTTAAT-ATCCTTT--GTCTTTGTA-TGttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|8 : tttctgac-TCAAAGG-GCA-ATAAC--TCTG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CC-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TCTCATT-ATATTTT--ACCATTGTA-TGA-A-GC-TT-GA-TGAA----ATTC-CATC--CG-GT----AC-T--TTTC-AAG--TTATGCTCCGGACAAG---A--A-A--AA-AT-----A--T--CAAA--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATT-A--G-CA--AG--A----AT--AGAGTTA-T-GTT-TCTTGTACACT--GCA-CTTCCTCTCATT-A--TATTCT--A-CCA--TTGTA-T---G-A-CG-T--T-TGA-TGAA----ATTCCATC--CA-GTA-CTTTTCAAGTTATG-CTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCCGG----GTGAC------TCC--AGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACcacgtttatagttatgcccaggacaagttaatttaa
gi|16 : TG--T---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CT-T---GTA-CACTGCA-CTTCC---TCTCATT-ATATTCT--ACCATTGTA-TGA-T-GT-TT-GA-TGAA----ATTC-CATA--CA-GT----AC-T--TTTC-AAG--TGATGCTCCGGACAAG---G--A-A--AA-aag
gi|53 : ---A-A----TT-A----------G-CA--AGAATAGAGTTA-T-G----TTT--CT-T---GTA-CACTGCA-Cttgcaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagggtgactccagtataccccctcaaaacttcgtttgtcgggggtataataaa
gi|18 : A--AGAA-AGAGTTA-T-G----CTT--CC-A---GCA-CACTGAA-C
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagA--AGAA---AGTTA-T-G----GTT--CC-T---GCA-CTGTGCA-CTTCC---
gi|12 : atattaataaaaggaaaat-T---GTA-CTGTCCA-CTTCC---TGTC--T-ATGCTCTCTATCACTGAA-TGC-A-GT-TC-AA-AGCA-----TTC-ACTT--CA-AA----AC-T--TTTC-AAG--GTTTGCTCCAAACAAG---G--G-A--AT-AT-----A--A--TAAA--------------GG-GGAA--TAAT--TATGT---G-A---A--GACAGAAG--A----A---AGAGTTA-T-GCA-TACTGCACACT--GTA-CTTCCTCTCAAT-G--TCATCT--A-TCA--TTGTG-T---G-A-AA-TA-T-CAA-CTAA----ATCCC-TT--GA-ACA-CTTTTTGAGTTATG-CTCCGGACAAaactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|32 : TGTA-CTCCC---TTTCATTGACATCT---A--ATTC-----A-A-GT-TT-GACTGAA-------C-TATCTTCA-GT----AC-T--TATG-GAG--TTATGCTGTGGACAAG---G--A-acataataaaatataacaagagg
gi|6 : TTA--ACCATTGTA-TGA-A-GT-TT-TA-TTAA----ATTA-TATC--CA-AT----AG-T--TTTA-AAG--TTATGCTCCAGACAAA---A--A-A--AA-AT-----C--T--TAA
gi|10 : aactagacctatcactgtagtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggTTT--ATCTATGTA-TGC-A-GT-TT-GA-ATAA----ATT---ATCA-CAAGC----AC-T--TCTA-AAG--TGATGCCCCGGACAAG---taaaagagaatgttatggattgagttgtttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacggtctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatactttttcgagttatgttgagggacaacaattttatggataagaaacaaacaagagcactaggaatacaatatcgaacctgctttgctcgaactccatgtattcatcaacttggttctttcatgaactttattaaactgttatcactgatggctttaaaagtactttaaaagtactgcagcaga
gi|33 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtccATTGTG-TGA-A-AT-----A-TCAA----CTTA--ATC--CG-TTTAACAC-T--TTTT-GAG--TTATGTTCCGAACAAtcaatttaa
gi|31 : tgccctccataATTGTG-TGA-A-ATATC-AA-CTAA----AT-C-CTTT--GA-AT----AC-T--TTTT-TAG--CTATGTTCCAGACAAGCATA--ATA--AA-AT-----ccataacaaca
gi|42 : tgtcgtctataaTTGTA-TGC-A-GG-TT-GA-T-AA----ATTT-CATT--CA-GC----AT-T--TTTA-GAT--TTGTGC-CCAG-CAAA---A--A-A--A
gi|47 : ct-TT-GA-GTAA----ATCC-CACT--CA-GC----AC-A--TT---AAGAATTGTGCCCAAGACAAG---A--A-A--A
gi|20 : t--CA-GC----AC-T--TTAA-GAG--TTATGCTCAGGACAAG---T--A-A--Attta
gi|11 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttg-AAG--ATATGCT--GGACACG---T--A-A--AATGT-----A--T--AAAA--------------GGAGAGA--TAATCATCT-C---ATATT------CA--AG--A---------GAGTTC-TTGTT-ATTTTTACTCC--GCA-TTTCCACT---------GTT-T--A-CCA--TT-TC-C---A-AGTG-T--C---A-TTGA----ATTCCCTT--T--GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCttta
gi|37 : tggGACAAG---A--A-AC-AA-ATTTTTTA--T--CAAA--------------GG-GCAA--TAAC--TCTGT---A-ATT-A--G-CA--AG--A----AT--AGAGTTA-T-GTT-Tagaaatgaattttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|13 : CAAA---AT-A-A--AA-AT-----A-----CAAA--------------AG-GCGAGATAGT--TCTGTCATA-ATT------CA--AG--A-----T--AGAGTT----GTT-TTTTTCATTCT--GCA-TTTCCACACTTT-T--CCTTTG--G-CCA--TT-TACT---G-A-AG-T--TTCAC-TGGATTTTATTCCCTC--CA-GTA-TTTT
gi|10 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAAA--------------GG-G-AA--TGAT--T-TGA---A-A---A--A-TA--AG--GCATGGT--AGATTTA-T-GATATCTTTTCTAAT--G-----TCCT----TT-A--T---CT--A-------TGTA-T---G-C-AG-T--T-TGA-ATAA----ATT--ATCA-CAAGCA-CTTCTAAAGTGATG-CCCCGGACAAG
gi|16 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtTGT---A-ATT-A--G-CA--AG--A----AT--AGAGTTA-T-GTT-TCTTGTACACT--GCA-CTTCCTCTCATT-A--TATTCT--A-CCA--TTGTA-T---G-A-TG-T--T-TGA-TGAA----ATTCCATA--CA-GTA-CTTTTCAAGTGATG-CTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTAGG----GTGAC------TCC--AGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAtcaatttaa
gi|19 : T---A-ATG-AC-G-CA--AA--A----A---AGTGTTA-T-AGT-AATTAAACACT--GC--CTTCCCCTTAAT-A--TCCTTT--G-TCT--TTGTA-T---GCA-CG-T--T-taaa
gi|53 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaa---A-ATT-A--G-CA--AG--A----AT--AGAGTTA-T-GTT-TCTTGTACACT--GCA-Ctatagttatgcccaggacaagttaatttaa
gi|21 : -CA--AG--G-----T--AGAGTTA-T-AAT-TATTGTGCAGT--TTA-CCGCCTCCCATT----TA--CA--G-CCAATCTGCA-TTTCA-A-GT-T--T-CAA-TGAA----ATT-CGTT--CA-GTA-
gi|18 : aagacgtaacaA--AG--A----A---AGAGTTA-T-GCT-TCCAGCACACT--GAA-Cggtctggaacaattatcaaaagaaaagtgagcaagggagataa
gi|27 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagA--AG--A----A-----AGTTA-T-GGT-TCCTGCACTGT--GCA-CTTCC
gi|32 : atattaataaaaggaaaatT--GTA-CTCCCTTTCATTGA--CAT-CT--A---A--TTCAA----------G-T--T-TGACTGAA-------CTATCTTCA-GTA-CTTATGGAGTTATG-CTGTGGACAAGGA--aactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|33 : TCC--A-TAA--TTGTG-T---G-A-AA-TA-T-CAACTTAA------TCCGTT--TA-ACA-CTTTTTGAGTTATG-TTCCGAACAA
gi|6 : tgccc--A-CCA--TTGTA-T---G-A-AG-T--T-TTA-TTAA----ATTATATC--CA-ATA-GTTTTAAAGTTATG-CTCCAGACAAAAA--AAAccataacaaca
gi|31 : aactagacctatcactgtagtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggttaA--TTGTG-T---G-A-AA-TA-T-CAA-CTAA----AT-CCTTT--GA-ATA-CTTTTTTAGCTATG-TTCCAGACAAGCA--TAATatcttaataaaagagaatgttatggattgagttgtttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacggtctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatcaataaatgttatactttttcgagttatgttgagggacaacaattttatggataagaaacaaacaagagcactaggaatacaatatcgaacctgctttgctcgaactccatgtattcatcaacttggttctttcatgaactttattaaactgttatcactgatggctttaaaagtactttaaaagtactgcagcaga
gi|42 : tgtcgtctataa--TTGTA-T---GCA-GG-T--T--GA-T-AA----ATTTCATT--CA-GCA-TTTTTAGATTTGTG-CCCAG--CAAAAA--AAaaaat
gi|20 : ct--CA-GCA-CTTTAAGAGTTATG-CTCAGGACAAGTA--AATTT
gi|25 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttg---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAAa
gi|50 : aaaaactaaccaacG----GCGAC------TTC--AATATATACACACCCCTCTCAAG-CTTCATTTGT--GGGGTATAACtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|45 : TATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAAa
20 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GCTCTGCACTTCCGCAAATTGCCTCTTCCCGTATCCGCAGTCGCATCCTATTCCTTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTAAAATAACCTTAAAATAAAGTTTAGAAGAGGATATATGTTTAATTTGTTATTATTTAGGATTGAGTTACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACCAGCATAAATAAGAGAAAATAAGTACAAAAGAGGAGATAATTATGACATTAT
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|15 ): AAAAACACAAGATAATTCAGTAACTATTCAAGATATATTTATATATATTCTTTCACTTCATACTTCCACCCTCAATCTATGTTCCATGTTTCATTGGATTTCCTTTGGTATTTTTGTAGTAATGGTCTGGAAACTAATTTTGAAGGATAACTCAAAGATGGACAAATCACCAGCTAAATGCTCGCCATCCGTGGAGCACAAAAATGAGAGCAGCTGATATTGATCAGATTACATACAAATT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|23 ): TTTTAATGTATGCTCCAAATTATAATTTTGTGAAGACAGAAGAGTAACCTCGTGCTTCCTCCACGTCTCCATTGTGTGAAATATCAACTTAATCCCCTGAACACTTTTTAGTTATGTTCAAGACAAGCATAACAAA
Unaligned ( gi|26 ): CTCCTTTTCATACTGCTGAAGATATATTCTGGACAACCAAAAATAAGGTATAAAAGGAGAGATGGTTCTTGTTCTATCAAAGATGGAGTTAAATGGCACATTGCCTGCTATCCTTGTTCAAGT
Unaligned ( gi|28 ): ACAAAAACTAAAGTACAAAAAGGGAGATAAAACTATCATTATATAAGATAGAGTTATGGGTCTTTGGCCCTACATTTGCACACAATACCAGCTCAGTTCATTGAA
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|35 ): AAATAGTTATGGTGAAATATCAACTAAAACCCTTATATAGTTTTTTAGGTCTGTTCCGGACAAGCATGATAAAATA
Unaligned ( gi|36 ): ACATCACTATCATTGTATGCAGGTTCAAAGCCTTTACTTCAAAACTTTCACGGTCCAAACAAGGGAAAAT
Unaligned ( gi|38 ): ATGTCCTAAGTCATTGTGTGAAGATTAAATAAAGTCGCTTGAATAGTTTTGTAGTAATGCTACGG
Unaligned ( gi|43 ): ATATCAACTAAATCCTTTGAACACTTTTTGAGTTATGTTCCAGACTAGCATAATAAAAT
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|49 ): TTTCTTGTACAATGCTCTCTACCATTGTATGCAGTTTTAAAGCATTCACTTCCAA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Unaligned ( gi|52 ): TGTTATGTCCACTTCCTGACAATACTCTCCATCATTGTGTGC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2 11 11 111 111 111 1 6666666 222222 3333333333 1 11 1 2222222 2 2222 3333 3333333333 2 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 444444444444 1 111 1 555555555555555555555555555 111 22222222222222222 11 22222 111111111111 1 111 111111 22222222222222 1111111111111 1111111 1 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 1 1 3 33 1 3 6 22 77 000 0 1 0 111 666 1 1 0 0 6 1 6 1 7 6 6 5555555 6 6 3 222222 5 2 5 2 0 1 8 7777777777 6 1 5 8 66 66 3 0 1 0 8 55 4 8 1 7 6 8888888 4 0 2 3 2 3333 6666 7777777777 3 66 0 5 2 4 1 6 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 1 6 2 5 0 88 3 99 3 111111111111 5 2 77 5 3 3 55 2 5 3 66 3 55 6 3 333 0 0 55 1 44 555555555555555555555555555 0 555 000 22222222222222222 44 5 3 777 4 1 4 3 33333 2 666 3 333333333333 55 3 3 33 7 3 44 111 0 333333 3 77777 3 9999 88888888888888 9 2 44 444 5555555555555 33 0000000 6 555 3 2 44 33 2 33 0 77777777 55 33 44 44444444 2 9 5 1 5555 2 2 22 0 44 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . . . .. . . . .. .. ... . . . ... ... . . . . . . . . . . . ....... . . . ...... . . . . . . . .......... . . . . .. .. . . . . . .. . . . . . ....... . . . . . .... .... .......... . .. . . . . . . .................................................................................................... . . . . . . .. . .. . ............ . . .. . . . .. . . . .. . .. . . ... . . .. . .. ........................... . ... ... ................. .. . . ... . . . . ..... . ... . ............ .. . . .. . . .. ... . ...... . ..... . .... .............. . . .. ... ............. .. ....... . ... . . .. .. . .. . ........ .. .. .. ........ . . . . .... . . .. . .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 0 0 3 88 4 2 7 77 99 000 7 9 4 777 444 0 0 7 7 0 0 0 0 0 0 7 0000000 7 7 2 000000 0 4 0 3 7 4 8 6666666666 4 0 4 0 55 55 2 2 0 0 8 88 7 3 0 3 7 5555555 0 0 5 0 5 5555 0000 0000000000 0 55 0 5 5 0 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 7 5 0 8 88 5 22 2 666666666666 7 0 44 7 0 7 00 8 8 6 11 0 88 2 1 666 3 9 55 0 77 111111111111111111111111111 1 444 999 66666666666666666 00 0 5 888 4 1 0 3 66666 4 666 6 555555555555 00 6 8 22 8 3 66 777 8 333333 1 77777 1 2222 11111111111111 2 1 66 888 5555555555555 99 3333333 2 444 1 8 22 99 9 99 4 11111111 77 44 00 99999999 5 4 8 2 0000 4 2 11 8 22 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTAT--ATCC---AGCACTTTTAGAGTTATGCCCCGGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGA----ATAGAGTTAT-GNT-TCTTGTACACTGCACTTCCTNTCATTGTAC------TCTATCATTGTATGCAGTTT-GANNAAATT-CCATCCAGCACTTCTAGAGTAATGCCCCGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGTAATTANCAAGANTAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGCACGTTTANAGTTATGCCCAGGACAAGNAAAGTATAACAAAGGGAGATAACTC--TGTAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTA-TGNTTCTTGTACACTG--CACTTCCTCTCAAT-ATNTTCTACCATTGTATG-NAG-T-TTGAC-GAAATTCCATT--CAGTACTTTTGGAGTTATGCTCC-GGACAAG-AAAA-TA-CA--------AAGGA--AAATATA-TTAAAGG-GCGATAACTCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTA-TGNTTCTT---GTA-CACTGCAC-TTCCTCTC-A-T-GTNTTCT--ACCATTGTGTGA-AG-T-TC-GA-CGAA--ATTC-CNTCCAATAC-T--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--AAAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AAT--AGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--AC-TTC--CTCTCA--TTA-TNTTCTA-CCA--TTGTA-T---G-AA-G-T-TCGACGAA----ATTCCNTTCAGTA-CTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGANCTATCACTGNAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TCGATTAAATTAT--ATCC---AGTACTTTTAAAGTTATGCTCCGGACAAA---AAAAANNNTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTNTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGNTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGCTTTCTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTCATTANACTGTTACCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTANTGCTCCGGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGA----ATAGAGTTAT-GTT-TCTTGTACACTGCACTTCCTNTCATTATAT------TCTACCATTGTATGAAGTTT-GATGAAATT-CCATCCAGTACTTTTNAAGTTATGCTCCGGACAAAGAAAATATANCAAAGGGCGATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTT-TCTTGTACACTGCACTTCCTCTCATTATATTCTACCATTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTTAAAGTNATGCTCCGGACAAGGAAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTTAAAGTTATGCTCCGGACAAGGAAAATATANCAAAGGGCGATAACTC--TGTAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTA-TGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTCTCANT-ATATTCTACCATTGTATG-AAG-T-TTGAC-GAAATTCCATC--CAGTACTTTTNGAGTTATGCTCC-GGACAAGAAAAAATANCA--------AAGGA--AAATATA-TNAAAGG-GCGATAACTCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTA-TGTTTCTT---GTA-CACTGCAC-TTCCTCTC-A-T-ATNTTCT--ACCATTGTGTGA-AG-T-TT-GA-CGAA--ATTC-CATCCAGTAC-T--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--AAAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GNGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AAT--AGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--AC-TTC--CTCTCA--TTA-TNTTCTA-CCA--TTGTA-T---G-AN-G-T-TCGATGAA----ATTCCATTCAGTA-CTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCNCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTAT--ATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGA----ATAGAGTTAT-GTT-TCTTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATAT------TCTACCATTGTATGAAATTT-GATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATGCTCCGGACAAAGAAAACATATCAAAGGGCAATAACTC--TGTAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTA-TGTTTCCTGTACACTG--CACTTTCTCTCATT-ATATTGTACCATTGTATG-AAG-C-TTGAT-GAAATTCCATC--CGGTACTTTTCAAGTTATGCTCC-GGACAAGAAAAAATATCA--------AAGGA--AAATATA-TTAAAGG-GCAATAACTCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTA-TGTTTCCT---GTA-CACTGCAC-TTCCTCTC-ATT-ATATTTT--ACCATTGTATGA-AG-C-TT-GA-TGAA--ATTC-CATCCGGTAC-T--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--AAAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AAT--AGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--AC-TTC--CTCTCA--TTA-TATTCTA-CCA--TTGTA-T---G-AT-G-T-TCGATGAA----ATTCCATCCAGTA-CTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : AAAGGG-AATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTAT-GATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---------CTA----TGTATGCAGTTT-GAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGgtcaatttaa
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggTTTATCTATGTATGCAGT-TTGAATAAATTAT--CACA---AGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAtcaatttaa
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcc-AGATATGCT--GGACACG---T--AAAATG-----T-A--TAAAA--------------GGAGAGATAATCATC-TCAT---A-T-T-----CA--AG--A-----GAGTTCTTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--AT-TTC--CACT---------GTT-TA-CCA--TT-TC-C-----AA-G-TGTC-ATTGA----ATTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--Agtcaatttaa
gi|12 : tggaT---GTA-CTGTCCAC-TTCCTGTCTA-T-GCTCTCT--ATCACTGAATGC-AG-T-T-----CAAAGCATTC-ACTTCAAAAC-T--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G--GAAT-A-----T-A--ATAAA--------------GG-GGAATAAT--TA-T-GT---GA---A--GACAGAAG--AA---AGAGTTAT-GC---A-TACTGCACACT--GT--AC-TTC--CTCTCA--ATG-TCATCTA-TCA--TTGTG-T---G-AA-A-TATCAACTAA----ATCCC-TTGAACA-CTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC------CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcCAAA---AT-AAAA-A-----T-A--CAAAA--------------GGCGAGATAGT--TC-T-GTCATAAT-T-----CA--AG--A-T--AGAGT--T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--AT-TTC--CACACT--TTT-CCTTTGG-CCA--TT-TACT---G-AA-GTT-TCACTGGATTTTATTCCCTCCAGTA-TTTTg
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataac--AAAA-A-----C-A---CAA--------------------GATAAT--TC-A-GT---AAC-TAT-T-CA--AG---AT--ATATTTAT-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATAC-TTCCACCCTCAATCTA-TGTTCCA-------TGT-------------T-TCATTGGA----TTTCC-TTTGGTA-TTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : -T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AAT--AGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--AC-TTC--CTCTCA--TTA-TATTCTA-CCA--TTGTA-T---G-AT-G-T-TTGATGAA----ATTCCATACAGTA-CTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGA----A-AGAGTTAT-GCT-TCCAGCACACTGAACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagAAGTATACTAAAAG-TGATAACTTGGGGTAATTGAAATAATGACG-CAAA-AA-AGT-GTTA-TAGTAATTAAACACTG--C-CTTCCCCTTAAT-ATCCTTTGTCTTTGTATGCACG-T-TT
gi|19 : tttctgacGCACGTTTATAGTTATGCCCAGGACAAGatagttatgcccaggacaagttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGG-AATAATTA--TGTAA----------------AAA-AATAG---TTA-TGGTTCTTGCACCCTG--TACTTCCTCTCAAT-GTCCTTTATAATTGTGTG-AAA-TATCAAC-AAAATCCC-TT--GAACACTTTTTGAGTTATGTTCA-GGACAAG---------CA--------TAATA--AAATATAGTTAAAAG-A-GATAATT---TAAAAAATG-G-GCATGG-TAGAGCCA-TAATTTTT---GGA-CAATGTAT-TTCCTGGC-AAT-GTCCTCC--ATCAGTGTGTGA-AA-T-AT-GAACCAA--ATCC-C-TTGAATAG-T--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGTATACTAAAA-G-----T-G--ATAAA--------------TG-GGGATAAT--T----GA---AAA-TGAGG-CA--AG--A--------TTATTGT---T-CTTTG-AAACT--GC--AC-TTC--TCCTTA--GTG-CACTCTG-TCT--TTGTA-T---G-CA-G-T-TTGAATAA----ATTCCATTTAGCA-CTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTTttaatttaa
gi|2 : acattaaaGCAAGA----------TTATTGTT-CTTTG-AAACTGCACTTCTCCTTAGTGCAC------TCTGTCTTTGTATGCAGTTT-GAATAAATT-CCATTTAGCACTTTTAGAGTTATGCCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----TTAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTAAATT-TAATAAAGGGAGATAACAC--AAAAAGTAA---------G-CAAG-G-TAGA-GTTA-TTGTTCTTGTACACTG--CACTTCCTACCAAT-ATCATCTGTCATTGTTTG-AAGAT-TCAAC-AAAATTCC-TT--AAATAGTTTTGGAGTTATGTTCT-GGATAA-----------A--------AGGGT--AAATATA-ATAAAGG-GAGACAATTCAAAAA----GTAA-GCAAG-GTAGAGTTATTGTTCTTT---GTA-TTCTGCAC-TTCCTCTC-A---ATGTTCTCAGTCATTGTGTGA-AGAT-TC-AA-TAAA--ATCC-C-TTAAATAG-T--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A--AAAT-A-----A-A--TTAAC--------------AA-GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnCAGCA-CTTTAAGAGTTATGCTCAGGACAAGTA--AATTT
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttg-CA--AG--G-T--AGAGTTAT-AA---T-TATTGTGCAGT--TT--AC-CGC--CTCCCA--TT----TACAG-CCAATCTGCA-TTTCA-AG-T-T-TCAATGAA----ATT-CGTTCAGTA-a
gi|21 : aagacgtaacaCAAGG-----TAGAGTTAT-AAT-TATTGTGCAGTTTACCGCCTCCCATT-TACAGCCAATCTG-CATT---TCAAGTTTCAATGAAATT--CGTTCAGTAGGTCTGGAACAATTATC---A-AAAGAAAAGTGAGC-AAGGGAGATAAggtctggaacaattatcaaaagaaaagtgagcaagggagataa
gi|23 : aagacgtaacaC-TTCCTC-C-A-C-GTCT------CCATTGTGTGA-AA-TATC-AA-CTTA--ATCC-CCTG-AACAC-T--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG---
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTATG--GT-TC--TTAGACAATCCATTC---AGCACTTTTAGAGTAATGCCCATGACAAA---TAAAcataacaaa
gi|24 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagaTCCATTCAGCA-CTTTTAGAGTAATGCCCATGACAAATA--AATTTttt
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaa---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAA
gi|26 : aaaaactaaccaacTAC-T--GCTGA-AGATATATTCTGGACAAC---C--AAAA-ATAAGGT-A--TAAAA--------------GGAGAGATGGT--TCTT-GT-----TCTA--T-CA--AA--GAT--GGAGTTAtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : ctccttttcaAAGA----A---AGTTAT-GGT-TCCTGCACTGTGCACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|28 : atattaataaaaggaaaatAAAGTACAA-AAAGGGAGATAAAAC--TATCATTAT---------A-TAAG-A-TAGA-GTTA-TGGGTCTTTGGCCCTA--CATTTGCACACAAT-Aaactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|3 : acaaaaactAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTAT--ATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTccagctcagttcattgaa
gi|3 : aatTG----------G-CAATCAATAAATGTTA-TGTTTTCTGTACACTG--CACTTCCTGTCATT-ATATTCTACCATTGTATG-AAG-T-TTGAT-GAAATTCCATC--CAGTACTTTAAAAGTAATGCTCC-GGACAAG----------------------GG--AAATATA-TCAAAGG-GCAATAACTCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTA-TGTTTCTT---GTA-CACTGCAC-TTCCTCTC-A-TTATATTCT--ACCATTGTATGA-AG-C-TT-TA-TGAA--ATTC-CATCCAGTAC-T--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--AAAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AAT--AGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--AC-TTC--CTCTCA--TTA-TATTCTA-CCA--TTGTA-T---G-AC-G-T-TTGATGAA----ATTCCTTCCAGTA-CTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcaA--TTGTG-T---G-AA-A-TATCAACTAA----AT-CCTTTGAATA-CTTTTTTAGCTATGTTCCAGACAAGCA--TAATaaatat
gi|32 : tgtcgtctataaTG--TACTCCCTTTCATTGACAT-CTA--ATTC-----AAG-T-TTGACTGAA---CTATCTTCAGTACTTATGGAGTTATGCTGT-GGACAAGGAaaaat
gi|33 : TCC--ATAATTGTGTGA-AA-TATC-AA-CTTA--A-TC-CGTTTAACAC-T--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|36 : tgcccCTA-TCA--TTGTA-T---GCAG-G-T-TCAAAGCC----TTTAC-TTCAAAA-CTT------TCACGGTCCAAACAAGGG--AAAccataacaaca
gi|37 : acatcaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGA----ATAGAGTTAT-GTT-Tat
gi|39 : CACTTCCTGTCATTGCTC------TCCATCATTGTATGCAGTTT-
gi|39 : ctggcC--AC-TTC--CTGTCA--TTG-CTCTCCA-TCA--TTGTA-T---G-CA-G-T-T---TCAA----A--CTATTCAcaaactattcatttcaaaa
gi|4 : ctggcTACAAAAATGGGAGTTAACTC--TGTCATTA----------TTCAAG-A-TAGA-GTTACTGTTATTTA-GCTCTG--TACTTC-----A---ATATTTTACCCTC-TACC-CA--T-GTG--------CCCTTT--CA-TATTTTTGAAGCTATGCTCA-GGACAAGCAAAACTAGCC--------AAAAA--TAAAGTA-CAAAAGGAGAGATAATTATGTCA----TT-ATTCAAG-ATAGAGTTA-TGGTTATT---TTG-CCGTGTACATTGCCCTC-G------------ACCCATGTTCAA-TG-C-TT-CT-TGAG--ATCC-CGTCCA-TAT-TAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C--AAAA-A-----TAA--CCAAAACAAATG-------GG-GAGATGAT--AC-T-GA---CAT-TAT-T-CA--AGCTAAT--AAAG-----GT---TCTCT----CACTCAGA--AC-TAC--CATACA--TAAGCTTTCTATTCA---TGTT-C---T-AA-G-TGTC-ATCTG----ATTCCATTCAGTT-CTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAtttcaaaa
gi|40 : ctcagaacaagtaaatttttttttATG-TAG-T-TTAAA-TAAATTCCTTT--CAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAACAAGcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGCCAAT-CCTCTCTATCATTGTATG-CAG-T-TTtacattt
gi|42 : tTTGTATG-CAG-G-TTGAT--AAATTTCATT--CAGCATTTTTAGATTTGTGC-CC-AG-CAAAAAAAcaaagcattcacttca
gi|43 : ct-TCAACTAA----AT-CCTTTGAACA-CTTTTTGAGTTATGTTCCAGACTAGCA--TAAT
gi|45 : ataTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAAaaaat
gi|47 : -T-TTGAG-TAAATCCCACT--CAGCACATTAAGAATTGTGCCCA-AGACAAGAAAAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : --ATTC---AGCACTTTAAGAGTTATTCCCAGGACAAA---CACAA---TTAATAACAGAAGATttta
gi|49 : TTTCTTGTACAATG--C--------TC--------TCTACCATTGTATG-CAG-T-TTaa
gi|5 : TTATTGTACACTA--CACTTCTTCTTAAT-GTCTTCAGTCATTGTATG-GTGAT-TCAAC-ATAATGTC-TC--AAATAGTTCTGGGGTTATGCTTC-GGACAA----AAGTGTTACTTTAATTAAGGG--AGATA-A-TTAAA--------AA------AA----TA-C-GCAA-AGTAGAGTTA-TGGTTCTT---GTG-TACTTCTC-TTTCTCACGA-T-GTCCTCG--GTAATTGTGTGGTAG-T-TTCAA-CATA--ATTC-C-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T--AAAT-T-----T-G--ATAAA--------------GG-GAGGTACT--TC---GA---AA---A--G-TA--AGC-AATGTAGAGTTAT-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTCTG-TCA--TTGTG-T---G-AATA-T-TCAACAAA----ATCGC-TTGAGTA-CTTTTGTAGTTtaaagcattcacttccaa
gi|50 : gGGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|53 : AATTAGCAAGA----ATAGAGTTAT-GTT-TCTTGTACACTGCACa
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTAT--ATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGC
gi|7 : GACAAGCAAAAATAACC--------AAAAATTAAGTACA-AAAAAGG-AAGATAAT-----------------CAAGG-CAGAGTTA-CGATTCTTTTTGTATCGC--CAC-TTTC---------AGGTTCC--AA-ATCACACAA------TT-GA-------ATTCACTTCCA-TAT-T--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A--AAAA-A-----T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TC-T-GT---CAT-TA--T-CT--GA--AAT--AGAGTTAT-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCA----------------G-GT-G---TCATTGAA----TTTCC-TTAAGTA-TTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAAagcaga
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCAAAGG-GCAATAACTCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTA-TGTTTCCT---GTA-CACTGCAC-TTCCTCTC-A-TTATATTTT--ACCATTGTATGA-AG-C-TT-GA-TGAA--ATTC-CATCCGGTAC-T--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--AAAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AAT--AGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--AC-TTC--CTCTCA--TTA-TATTCTA-CCA--TTGTA-T---G-AC-G-T-TTGATGAA----ATTCCATCCAGTA-CTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
13 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GCTCTGCACTTCCGCAAATTGCCTCTTCCCGTATCCGCAGTCGCATCCTATTCCTTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTAAAATAACCTTAAAATAAAGTTTAGAAGAGGATATATGTTTAATTTGTTATTATTTAGGATTGAGTTACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACCAGCATAAATAAGAGAAAATAAGTACAAAAGAGGAGATAATTATGACATTAT
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|35 ): AAATAGTTATGGTGAAATATCAACTAAAACCCTTATATAGTTTTTTAGGTCTGTTCCGGACAAGCATGATAAAATA
Unaligned ( gi|38 ): ATGTCCTAAGTCATTGTGTGAAGATTAAATAAAGTCGCTTGAATAGTTTTGTAGTAATGCTACGG
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Unaligned ( gi|52 ): TGTTATGTCCACTTCCTGACAATACTCTCCATCATTGTGTGC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 111 111 111 3333333 11 111111111111 11 1 44444444444444 1 2222 2222 2222222222 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222222222 44444444444444 111 11111 1111 1 99999999999999999999999 22222222 111 11 1111111 1 11111 1111 1111111111 111 1111111111111 33333333333333 1 111111 1111 22222222222222 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 3 33 4 8 1 0 6 111 0 5 0 111 333 6 3333333 88 1 1 66 1 5 999999999999 77 2 66 22 5 0 1 3 4 44 55 1 1 3 6 0 3 77777777777777 1 5 1 1 1 3333 3333 7777777777 1 22 5 5 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 4 1 1 3 999999999 7 44 99 3 00000000000000 000 77 1 1 1 5 0 1 22222 0 99999 4 2222 2 9 99 1 3 77777777777777777777777 999 888 5 8 00000000 0 000 44 1 6666666 5 777 4 2 6 3 6 00000 0 33 0 3 7777 1111111111 8 2 3 88 2 33 333 0 8888888888888 2 77777 2 6666 00000000000000 0 44 3 3 444 22 222222 33 6666666 2 2 555 2 33 33 33 2 33 0 555 2 1 5555 66 33 0000 6 11111111111111 333 1 1 2 22 44 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . .. . . . . . ... . . . ... ... . ....... .. . . .. . . ............ .. . .. .. . . . . . .. .. . . . . . . .............. . . . . . .... .... .......... . .. . . . . .................................................................................................... . . . . . ......... . .. .. . .............. ... .. . . . . . . ..... . ..... . .... . . .. . . ....................... ... ... . . ........ . ... .. . ....... . ... . . . . . ..... . .. . . .... .......... . . . .. . .. ... . ............. . ..... . .... .............. . .. . . ... .. ...... .. ....... . . ... . .. .. .. . .. . ... . . .... .. .. .... . .............. ... . . . .. .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 3 88 0 0 0 8 0 777 7 2 7 777 000 7 5555555 77 0 8 99 0 7 000000000000 99 3 77 00 0 6 4 3 0 55 77 0 0 2 5 3 0 00000000000000 0 5 0 0 0 5555 5555 5555555555 0 00 5 5 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 0 0 2 888888888 8 22 22 2 33333333333333 999 44 0 4 4 0 2 0 55555 4 88888 4 3333 1 1 77 7 0 22222222222222222222222 666 888 0 8 55555555 2 999 00 0 2222222 0 888 4 4 0 3 7 11111 1 88 7 1 4444 5555555555 1 9 8 88 9 99 111 5 2222222222222 9 11111 9 3333 44444444444444 0 66 1 1 777 99 999999 77 8888888 7 9 000 9 22 77 44 5 77 8 777 7 0 3333 88 88 5555 7 77777777777777 999 8 5 4 11 66 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AACANTTTTAGAGTTATGCTCCGGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCTTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCNC------TCT--ATCATTGTATGCAGTTT-GAANAAATTC-CATTCAGCACTTTTAGAGTNATGCCCAGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGCACTTTNAGAGTTATGCTCAGGACAAGTAAANT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATATCCT-----CTACCATTGTATGNA-G-T-TCGACGAAATTCC-TTCAG-TACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---A-AA-TA--CAAAGG-A--AAATACA-TTAA---AGG-GAGATAATTCTGT----AATT-A-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCCTCTACCA-TTGTGTGA-AG-T-TC-A-ACGA---AATTC-CNTCCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-T--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TG-AA-GT-TC---GAC-GAA----A---TTCCNTTCAGTA-CTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AGCACTTTTAGAGTTATGCCCCGGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCTTGTACACTG--CACTTCCTNT-CATTGTAC------TCT--ATCATTGTATGCAGTTT-GANNAAATTC-CATCCAGCACTTCTAGAGTAATGCCCCGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGTAATTANCAAGAN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGCACGTTTANAGTTATGCCCAGGACAAGNAAAGT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGNTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATATNTT-----CTACCATTGTATGNA-G-T-TTGACGAAATTCCATTCAG-TACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG--AA-AA-TA--CAAAGG-A--AAATATA-TTAA---AGG-GCGATAACTCTGT----AATT-A-GCAAGAATAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTNTTCTACCA-TTGTGTGA-AG-T-TC-G-ACGA---AATTC-CNTCCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-T--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TG-AA-GT-TC---GAC-GAA----A---TTCCNTTCAGTA-CTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTGT-CATTATAT------TCT--ACCATTGTATGAAATTT-GATGAAATTC-CATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA----TAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATGCTCCGGACAAAGAAAAC--------ATATCAAAGGGCAATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGTTTCCTGTA-CACTGCACTTTCTCTCATTATATT-----GTACCATTGTATGAA-G-C-TTGATGAAATTCCATCCGG-TACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAA-AA-TAT-CAAAGG-A--AAATATA-TTAA---AGG-GCAATAACTCTGT----AATT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATT-ATATTTTACCA-TTGTATGA-AG-C-TT-G-ATGA---AATTC-CATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-T--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TG-AT-GT-TC---GAT-GAA----A---TTCCATCCAGTA-CTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : AAAGGGA-ATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGta
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgt-AGATATGCT--GGACACG---T----A----AAATG-----T-A--TAAAA--------------GGAGAGATAATCATC-TCAT---A-T-T------CA--AG--A-----GAGTTC-TTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--A-TTTC--CACT---------GTT-----TA-CCATT-TC-C--AA-GTGTC----AT-TGA----A---TTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--Atcaatttaa
gi|12 : tggaT---GTA-CTGTCCACTTCCTGTCTA-T-GCTCTCTATCA-CTGAATGC-AG-T-TC-A-AAGC---A-TTC-ACTTCAAAA-CT--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G----G----AAT-A-----T-A--ATAAA--------------GG-GGAATAAT--TA-T-GT---GA-----A-GACAGAAG--AA---AGAGTTA-T-GC---A-TACTGCACACT--GT--A-CTTC--CTCTCA--ATG-TCATC----TA-TCATTGTG-TG-AA-ATATC---AAC-TAA----A---T-CCCTTGAACA-CTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC----CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcCAAA---AT---A----AAA-A-----T-A--CAAAA--------------GGCGAGATAGT--TC-T-GTCATAAT-T------CA--AG--A---TAGAGT---T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--A-TTTC--CACACT--TTT-CCTTT----GG-CCATT-TACTG-AA-GT-TT---CACTGGATTTTA---TTCCCTCCAGTA-TTTTg
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAGATAAT--TC-A-GT---AAC-T--ATT-CA--AG---A--TATATTTA-T-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATA-CTTCCACCCTCAATCTA-TGTTC----CA-----TGT---------T-TC---ATT-GGA----T---TTCCTTT-GGTA-TTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : aaaaacaca-T-GT---AAT-T--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TG-AT-GT-TT---GAT-GAA----A---TTCCATACAGTA-CTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGAA-AGAGTTATGCTTCCAGCACACTG--AACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagAAGT--------ATACTAAAAGT-GATAACTTGGGGTAATT-GAAATAATGACG-CAAA-AA-AGT-GTTATAGTAATTAAA-CACTGC-CTTCCCCTTAATATCCT-----TTGTCTTTGTATGCACG-T-TT
gi|19 : tttctgacT---AAT-G--ACG-CA--AA--AA---AGTGTTA-T-AG---T-AATTAAACACT--GC----CTTC--CCCTTA--ATA-TCCTT----TG-TCTTTGTA-TG--------C----AC-G-------------------------TTTATAGTTATGCCCAGGACAAGatagttatgcccaggacaagttaatttaa
gi|19 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaaGCACGTTTATAGTTATGCCCAGGACAAGttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGGA-ATAATTATG--TAA-----------------AAA-AATAG---TTATGGTTCTTGCA-CCCTGTACTTCCTCTCAATGTCCT-----TTATAATTGTGTGAA-A-TATCAACAAAATCCC-TTGAA-CACTTTTTGAGTTATGTTCAGGACAAG--CATAA-T----------A--AAATATAGTTAA---AAG-A-GATAATT---TAAAAAATG-G-GCATG-GTAGAGCCATAATT-------T-TT---GGA-CAATGTATTTCCTGGCAA-T-GTCCTCCATCA-GTGTGTGA-AA-TATG-A-ACCA---AA-TC-CCTTGAATA-GT--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGT--ATACTA----AAA-G-----T-G--ATAAA--------------TG-GGGATAAT-----T-GA---AAA-TGAG-G-CA--AG--A--------TTATT-GT---T-CTTTG-AAACT--GC--A-CTTC--TCCTTA--GTG-CACTC----TG-TCTTTGTA-TG-CA-GT-TT---GAA-TAA----A---TTCCATTTAGCA-CTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTTttaatttaa
gi|2 : acattaaaGCAAGA------TTATTGTTCTTTGAAACTG--CACTTCTCCT-TAGTGCAC------TCT--GTCTTTGTATGCAGTTT-GAATAAATTC-CATTTAGCACTTTTAGAGTTATGCCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----T----TAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTAAATT---------TAATAAAGGGAGATAACACAA--AAAGTAA----------G-CAAG--GTAGA-GTTATTGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTACCAATATCAT-----CTGTCATTGTTTGAA-GAT-TCAACAAAATTCC-TTAAA-TAGTTTTGGAGTTATGTTCTGGATAA--------------AAGGG-T--AAATATA-ATAA---AGG-GAGACAATTCAAA----AAGTAA-GCAAG-GTAGAGTTATTGTT-------CTTT---GTA-TTCTGCACTTCCTCTCAA-T-GTTCTCAGTCA-TTGTGTGA-AGAT-TC-A-ATAA---AA-TC-CCTTAAATA-GT--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A----A----AAT-A-----A-A--TTAAC--------------AA-GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnntTATGCA-G-T-TTG-------------CAG-CACTTTAAGAGTTATGCTCAGGACAAG--TA-AA-T
gi|20 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGCACTTTAAGAGTTATGCTCAGGACAAGTAAAtta
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgCAAGG-TAGAGTTATAATTATTGTGCAGTT--TACCGCCTCC-CATT-TACAGCCAATCT--G-CATTTCA---AGTTTCAATGAAATT--CGTTCAGTAGGTCTGGAACAATTATC---A-AAAGAAAAGTGAGC-AAGGGAGATAAttta
gi|23 : aagacgtaacaCTTCCTC-C-A-C-GTCT----CCA-TTGTGTGA-AA-TATC-A-ACTT---AATCC-CCTG-AACA-CT--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG---
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTA-TG----GT-TCTTAGAC-AA----------TCCATTCAGCA-CTTTTAGAGTAATGCCCATGACAAATA--AATTTcataacaaa
gi|24 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagaTC-CATTCAGCACTTTTAGAGTAATGCCCATGACAAA-TAAATTT
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaa---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAA
gi|26 : aaaaactaaccaacTC-CTTTTCATA-CT--GCTGA-AGATATATTCTGGACAAC---C----A----AAA-ATAAGGT-A--TAAAA--------------GGAGAGATGGT--TCTT-GT-----TCT--A-T-CA--AA--GA--TGGAGTTA-taatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : cAAGAA---AGTTATGGTTCCTGCACTGTG--CACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|27 : atattaataaaaggaaaatTGTGC-AC-T-TCCA-ACTA---AAACC-CTTG-AATA-GT--TTTTT-AGTTCTGTTCCGGACAAA---C----ATACTAAA-A-----T-A--Taactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|28 : atattaataaaaggaaaataagaaagttatggttcctgcacAACTAAAGT--------ACAA-AAAGGGAGATAAAACTA--TCATT-AT---------A-TAAG--ATAGA-GTTATGGGTCTTTGG-CCCTACATTTGCACACAATA
gi|3 : acaaaAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTccagctcagttcattgaa
gi|3 : aatT-G----------G-CAATCAATAAATGTTATGTTTTCTGTA-CACTGCACTTCCTGTCATTATATT-----CTACCATTGTATGAA-G-T-TTGATGAAATTCCATCCAG-TACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAG-----------------G-G--AAATATA-TCAA---AGG-GCAATAACTCTGT----AATT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATATTCTACCA-TTGTATGA-AG-C-TT-T-ATGA---AATTC-CATCCAGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-T--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TG-AC-GT-TT---GAT-GAA----A---TTCCTTCCAGTA-CTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttca-T-GTCGTCTATAAATTGTGTGA-AA-TATC-A-ACTA---AA-TC-CTTTGAATA-CT--TTTTT-AGCTATGTTCCAGACAAGCATA----AT---AAA-A-----T-aaatat
gi|32 : T--GT--A-CTCC--CTTTCA--TTG-ACATC----TA---ATTC------AA-GT-TT---GAC-TGA----A---CTATCTTCAGTA-CTTATGGAGTTATGCTGTGGACAAGGA--
gi|33 : -T-GCCCTCCATAA-TTGTGTGA-AA-TATC-A-ACTT---AA-TC-CGTTTAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|36 : C----TA-TCATTGTA-TGCAG-GT-TC--------AA----AGCCTTTACTTCAAAA-CTT------TCACGGTCCAAACAAGGG--AAAccataacaaca
gi|37 : acatcaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTat
gi|39 : --CACTTCCTGT-CATTGCTC------TCC--ATCATTGTATGCAGTTT-
gi|39 : ctggcC--A-CTTC--CTGTCA--TTG-CTCTC----CA-TCATTGTA-TG-CA-GT-TT-----C-AAACT--A---TTCATTTCAcaaactattcatttcaaaa
gi|4 : ctggcCTCAGAACAAGTAAATTTTTTTTTTACAAAAATGGGAGTTAACTCTG--TCATT-A----------TTCAAG-A-TAGA-GTTACTGTTATT-TAGCTCTGTACTTC-----AATATTTTACCCTCTACC----CATG--------TG-------CCCTTTCA--TATTTTTGAAGCTATGCTCAGGACAAGC-AA-AACTAGCCAAAAATA--AAGTACA---AA---AGGAGAGATAATTATGT----CATT-ATTCAAG-ATAGAGTTATGGTTATTTTGCC-GT---GTA-CATTGC-CCTCGACCC-A-T-GTT------CA-ATGC--------T-TC-T--TGA---GATCC-CGTCC-ATA-TTAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C----A----AAA-A-----TAA--CCAAAACAAATG-------GG-GAGATGAT--AC-T-GA---CAT-T--ATT-CA--AGCTAA--TAAAG------GT---TCTCT----CACTCAGA--A-CTAC--CATACA--TAAGCTTTC----TATTCA-TGTT-CT-AA-GTGTC---ATCTG------A---TTCCATTCAGTT-CTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaaa
gi|40 : ATGTAGTTT-AAATAAATTC-CTTTCAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAACAAGTACATTTcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGC-CAATCCTC------TCT--ATCATTGTATGCAGTTT-CAAAGCATTC-
gi|42 : tTTGTATGCAGG-TTGAT-AAATTTCATTC---AGCATTTTTAGATTTGTGCCCAG--CAAA---AAAAacttca
gi|43 : ct-TC---AAC-TAA----A---T-CCTTTGAACA-CTTTTTGAGTTATGTTCCAGACTAGCA--TAAT
gi|45 : ataTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAAaaaat
gi|47 : TTT-GAGTAAATCC-CACTCAGCACATTAAGAATTGTGCCCAAGACAA-GAAAATTTAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : ATTC---AGCACTTTAAGAGTTATTCCCAGGACAAA---CACAA---TTAATAACAGAAGAT
gi|49 : TTCTTGTACAATGCTC------TCT--ACCATTGTATGCAGTTT-TAAAGCATTCACTTCCAaa
gi|49 : tCAATGCTCT-----CTACCATTGTATGCA-G-T-TTa
gi|5 : tttcttgtaTTATTGTA-CACTACACTTCTTCTTAATGTCTT-----CAGTCATTGTATGGT-GAT-TCAACATAATGTC--TCAAATAGTTCTGGGGTTATGCTTCGGACAA----A-AG-TG--T------------TACT-TTAATTAAGG-GAGATAATTAAAA----AAAT-ACGCAA-AGTAGAGTTATGGTT-------C-TT---GTG-TACTTCTCTTTCTCACGA-T-GTCCTCGGTAA-TTGTGTGGTAGTT-TC-A-ACAT---AATTC-C-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T----A----AAT-T-----T-G--ATAAA--------------GG-GAGGTACT--TC---GA---AA-----A-G-TA--AGC-AATGTAGAGTTA-T-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTC----TG-TCATTGTG-TG-AATAT-TC---AAC-AAA----A----TCGCTTGAGTA-CTTTTGTAGTTtaaagcattcacttccaa
gi|50 : gGGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|52 : --CACTTCCTGA-CA--ATAC------TCTCCATCATTGTGTGCa
gi|53 : tgttatgtc---AAT-T--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-C
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCAGCAGA
gi|7 : GACAAGCAAA-AA-TAACCAAAA--ATTAAGTACA-AAAA---AGG-AAGATAAT-----------------CAAGG-CAGAGTTACGATT-------C-TTTTTGTATCGC--CACTT----TC-A-G-GTT-----CCA--------A-A----TC-ACACAATTGAATTCACTTCCA-TA-TT--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A----A----AAA-A-----T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TC-T-GT---CAT-T--A-T-CT--GA--AA--TAGAGTTA-T-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCAGGTG-TCATTG-----------------------A----A---TTTCCTTAAGTA-TTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCAA---AGG-GCAATAACTCTGT----AATT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATATTTTACCA-TTGTATGA-AG-C-TT-G-ATGA---AATTC-CATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-T--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TG-AC-GT-TT---GAT-GAA----A---TTCCATCCAGTA-CTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): GCTCTGCACTTCCGCAAATTGCCTCTTCCCGTATCCGCAGTCGCATCCTATTCCTTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTAAAATAACCTTAAAATAAAGTTTAGAAGAGGATATATGTTTAATTTGTTATTATTTAGGATTGAGTTACCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACCAGCATAAATAAGAGAAAATAAGTACAAAAGAGGAGATAATTATGACATTAT
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|35 ): AAATAGTTATGGTGAAATATCAACTAAAACCCTTATATAGTTTTTTAGGTCTGTTCCGGACAAGCATGATAAAATA
Unaligned ( gi|38 ): ATGTCCTAAGTCATTGTGTGAAGATTAAATAAAGTCGCTTGAATAGTTTTGTAGTAATGCTACGG
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1 111 111 3333333 111 1 1 1 44444444444444 1 2222 2222 2222222222 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222222222 44444444444444 111 11111 333333333333333333333333333333 9999999999999999999999999999 2222222222222222222222 11 1 111 11 111 22222222222 22222222222222 1111 1111111 111111111 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 3 33 1 0 1 3 777 2 1 2 2 777 11 6 3333333 666 1 0 77 6 1 1 2 5555 3 2 5 5 11 5 1 1 2 0 1 22222222222222 1 5 1 1 1 3333 3333 7777777777 1 22 5 5 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 2 1 5 4 1 333333333 2 99 3 00000000000000 000 77 1 1 5 0 0 3 11111 6 66 999999999999999999999999999999 1 11 4 4444444444444444444444444444 1 66 777 4 0 4 2222222222222222222222 33 1 4 777 4 0 0 3 0 5 5 6666 33 3 2 2 2 777 2 5 4 2 3 22 33 33 333 0 44444444444 2 55555 2 5555 88888888888888 9 44 444 555 33 3333 33 777777 6 555 3 2 33 33 2 44 1 555 3 1 6666 66 0000000 000000000 6666 1 2 3 1 66 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . .. . . . . ... . . . . ... .. . ....... ... . . .. . . . . .... . . . . .. . . . . . . .............. . . . . . .... .... .......... . .. . . . . .................................................................................................... . . . . . . ......... . .. . .............. ... .. . . . . . . ..... . .. .............................. . .. . ............................ . .. ... . . . ...................... .. . . ... . . . . . . . .... .. . . . . ... . . . . . .. .. .. ... . ........... . ..... . .... .............. . .. ... ... .. .... .. ...... . ... . . .. .. . .. . ... . . .... .. ....... ......... .... . . . . .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 3 88 0 0 0 2 555 0 0 0 0 555 22 7 5555555 888 0 2 99 7 0 0 0 2222 4 6 9 0 66 5 0 0 0 3 0 00000000000000 0 5 0 0 0 5555 5555 5555555555 0 00 5 5 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 0 0 0 0 0 333333333 9 22 2 33333333333333 999 44 4 4 0 2 9 7 11111 5 99 222222222222222222222222222222 4 44 5 4444444444444444444444444444 1 77 888 4 7 4 1111111111111111111111 55 0 4 000 0 1 5 5 0 7 7 1111 99 9 7 9 5 111 4 1 1 2 2 00 77 11 111 6 44444444444 4 99999 4 9999 11111111111111 2 66 888 000 88 2222 99 888888 2 444 1 8 99 99 9 22 2 999 1 0 5555 99 1111111 333333333 5555 0 1 1 0 11 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CTCAGGACAAGTA-AATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTC--TGTAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----CCTCTGCCATTGTAT--GNAG-T-TCGACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCNGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTA---AAGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAGTAGAGTTATGNTTC-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GT----CC--TCNATCA-TTGTGTGA-AG-T-TC-AACNAAATTC-CNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCCTTCAGTA-CTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AACANTTTTAGAGTTATGCTCCGGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCTTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCNCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCATTCAGCACTTTTAGAGTNATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGCACTTTNAGAGTTATG-CTCAGGACAAGTA-AANT--------ATAACAAAGGGAGATAACTC--TGTAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----CCTCTACCATTGTAT--GNAG-T-TCGACGAA----ATTCC-TTCA-GTACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAGGA--AAATACA-TTA---AAGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAGTAGAGTTATGNTTC-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GT----CC--TCTACCA-TTGTGTGA-AG-T-TC-AACGAAATTC-CNTCCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCNTTCAGTA-CTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTGT-CATTATATTCTACCATTGTATGAAATTTGATGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTAATG-CTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA----TAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATG-CTCCGGACAAAGA-AAAC--------ATATCAAAGGGCAATAACTC--TGTAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGTTTCCTGTA-CACTGCACTTTCTCTCATTAT-----ATTGTACCATTGTAT--GAAG-C-TTGATGAA----ATTCCATCCG-GTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAAAATAT---C------AAAGGA--AAATATA-TTA---AAGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTTC-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATT-AT----AT--TTTACCA-TTGTATGA-AG-C-TT-GATGAAATTC-CATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TCGAT-GAA----ATTCCATCCAGTA-CTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : AAAGGGA-ATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGta
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgt-AGATATGCT--GGACACG---T--A----AAATG-----T-A--TAAAA--------------GGAGAGATAATCATC-TCAT---A-T-T-----CA--AG--A-----GAGTTCTTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--A-TTTC--CACT---------GTT-----TA-CCATT-TC-C-AA-GTGTC-AT-TGA----ATTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--Atcaatttaa
gi|11 : tggaAATTCCCTTTGTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAG---AAATG-AATT--------TTCACAAAGttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : tggaagatatgctggacacgtaaaatgtataaaaggagagataatcatctcatattcaagagagttcttgttatttttactccgcatttccactgtttaccatttccaagtgtcattgT---GTA-CTGTCCACTTCCTGTCTA-T-GC----TC--TCTATCA-CTGAATGC-AG-T-TC-AAAGCA-TTC-ACTTCAAAA-CT--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G--G----AAT-A-----T-A--ATAAA--------------GG-GGAATAAT--TA-T-GT---GA---A--GACAGAAG--AA---AGAGTTAT-GC---A-TACTGCACACT--GT--A-CTTC--CTCTCA--ATG-TCATC----TA-TCATTGTG-TGAA-ATATCAAC-TAA----AT-CCCTTGAACA-CTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC----CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcCAAA---AT-A----AAA-A-----T-A--CAAAA--------------GGCGAGATAGT--TC-T-GTCATAAT-T-----CA--AG--A---TAGAGT--T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--A-TTTC--CACACT--TTT-CCTTT----GG-CCATT-TACTGAA-GT-TTCACTGGATTTTATTCCCTCCAGTA-TTTTg
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAGATAAT--TC-A-GT---AAC-TAT-T-CA--AG---A--TATATTTAT-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATA-CTTCCACCCTCAATCTA-TGTTC----CA-----TGT--------T-TCATT-GGA----TTTCCTTT-GGTA-TTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : aaaaacaca-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATACAGTA-CTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGAA-AGAGTTATGCTTCCAGCACACTG--AACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagGACAAGTA-TACT--------A----AAAGT--GATAACTTGGGGTAATT-GAAATAATGACG-CAAA-AA-AGT-GTTATAGTAATTAAA-CACTGC-CTTCCCCTTAATAT-----CCTTTGTCTTTGTAT--GCA-----CG-------------------------TTTATAGTTATGCCCAGGACAAG---
gi|19 : tttctGCACGTTTATAGTTATG-CCCAGGACAAGTT-AATT---------TAAttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGGA-ATAATTA--TGTAA-----------------AAA-AATAG---TTATGGTTCTTGCA-CCCTGTACTTCCTCTCAATGT-----CCTTTATAATTGTGT--GAAA-TATCAACAAA----ATCCC-TTGA-ACACTTTTTGAGTTATGTTCAGGACAAG------------C------ATAATA--AAATATAGTTA---AAAG--AGATA-AT------T---TAAAAAATG-G-GCATG-GTAGAGCCATAATTT-TT---GGA-CAATGTATTTCCTGGC-AAT-GT----CC--TCCATCA-GTGTGTGA-AA-TATG-AACCAAATCC-CTTG-AATA-GT--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGTATACTA----AAA-G-----T-G--ATAAA--------------TG-GGGATAAT--T----GA---AAA-TGAGG-CA--AG--A--------TTATTGT---T-CTTTG-AAACT--GC--A-CTTC--TCCTTA--GTG-CACTC----TG-TCTTTGTA-TGCA-GT-TTGAA-TAA----ATTCCATTTAGCA-CTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTT
gi|2 : acattaaaGCAAGA------TTATTGTTCTTTGAAACTG--CACTTCTCCT-TAGTGCACTCTGTCTTTGTATGCAGTTTGAATAAATTCCATTTAGCACTTTTAGAGTTATG-CCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----T----TAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTTAGAGTTATG-CCCAGGACAAGTA-AATT---------TAATAAAGGGAGATAACAC--AAAAAGTAA----------G-CAAG--GTAGA-GTTATTGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTACCAATAT-----CATCTGTCATTGTTT--GAAGAT-TCAACAAA----ATTCC-TTAA-ATAGTTTTGGAGTTATGTTCTGGATAA--------------------AAGGGT--AAATATA-ATA---AAGG-GAGACA-AT------TCAAAAA----GTAA-GCAAG-GTAGAGTTATTGTTCTTT---GTA-TTCTGCACTTCCTCTCAA-T-GT----TC--TCAGTCA-TTGTGTGA-AGAT-TC-AATAAAA-TC-CCTTAAATA-GT--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A--A----AAT-A-----A-A--TTAAC--------------AA-GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnTATGCAGTTTG-------------CAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGAC-AAGTAAATTTA
gi|20 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGACAAGTA-AATT--------
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgCAAG-GTAGAGTTATAATTA-TT---GTG-CAGTTTACCGCCTCCC-A-T-TTACAGCCAATCTG-CA-TT---TCA-AGTT-TC-AATGAAATT--CGTTCAGTA-GG--TCTGG-AACAATTATC---AAAAG---A--A----AAG-T-----G-A--GC-AA--------------GG-GAGATAAta
gi|23 : aagacgtaacaCTTCCTC-C-A-C-GT----CT------CCA-TTGTGTGA-AA-TATC-AACTTAATCC-CCTG-AACA-CT--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG---
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTTAGACAA--TCCATTCAGCACTTTTAGAGTAATG-CCCATGACAAA-TAAATTTcataacaaa
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttc---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAA
gi|26 : aaaaactaaccaacTC-CTTTTCATA-CT--GCTGA-AGATATATTCTGGACAAC---C--A----AAA-ATAAGGT-A--TAAAA--------------GGAGAGATGGT--TCTT-GT-----TCTA--T-CA--AA--GA--TGGAGTTAtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : cAAGAA---AGTTATGGTTCCTGCACTGTG--CACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|27 : atattaataaaaggaaaatTGTGC-AC-T-TCCAACTAAAACC-CTTG-AATA-GT--TTTTT-AGTTCTGTTCCGGACAAA---C--ATACTAAA-A-----T-A--Taactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|28 : atattaataaaaggaaaataagaaagttatggttcctgcacAACTA-AAGT--------ACAA-AAAGGGAGATAAAAC--TATCATT-AT---------A-TAAG--ATAGA-GTTATGGGTCTTTGG-CCCTACATTTGCACACAATAC-----C
gi|3 : acaaaAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTagctcagttcattgaa
gi|3 : aatT-G----------G-CAATCAATAAATGTTATGTTTTCTGTA-CACTGCACTTCCTGTCATTAT-----ATTCTACCATTGTAT--GAAG-T-TTGATGAA----ATTCCATCCA-GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAG-----------------------GG--AAATATA-TCA---AAGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTTC-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTAT----AT--TCTACCA-TTGTATGA-AG-C-TT-TATGAAATTC-CATCCAGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCTTCCAGTA-CTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttca-T-GT----CG--TCTATAAATTGTGTGA-AA-TATC-AACTAAA-TC-CTTTGAATA-CT--TTTTT-AGCTATGTTCCAGACAAGCATA--AT---AAA-A-----T-aaatat
gi|32 : T--GT--A-CTCC--CTTTCA--TTG-ACATC----TA---ATTC-----AA-GT-TTGAC-TGA----ACTATCTTCAGTA-CTTATGGAGTTATGCTGTGGACAAGGA--
gi|33 : -T-GC----CC--TCCATAA-TTGTGTGA-AA-TATC-AACTTAA-TC-CGTTTAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|33 : TCCGTTTAACACTTTTTGAGTTATG-TTCCGAAC------AACC--------ATAACAAccataacaaca
gi|35 : tgccctccataattgtgtgaaatatcaacttaaGTGA-AA-TATC-AACTAAAACC-CTTATA-TA-GT--TTTTT-AGGTCTGTTCCGGACAAG---C--ATGATAAA-A-----T-A--ca
gi|36 : aaatagttatgCTATCATTGTATGCAGGTTCAAAGCCTTTACTTCAAAACTTTCACGGT------CCA-AACAAGGGAAA
gi|37 : acatcaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTat
gi|38 : -A-T-GT----CC--TAAGTCA-TTGTGTGA-AG-A-TT-AAATAAAGTC-GCTTGAATA-GT--TTTGT-AGTAATGCTACGG
gi|39 : --CACTTCCTGT-CATTGCTCTCCATCATTGTATGCAGTTTCAAACTATTCATTTCA
gi|4 : ctggc-CTCAGAACAAGTA-AATTTTTTTTTTACAAAAATGGGAGTTAACTC--TGTCATT-A----------TTCAAG-A-TAGA-GTTACTGTTATT-TAGCTCTGTACTTC-----AATATTTTACCCTCTACC----CAT--GT-------GCC----------CT-TTCA--TATTTTTGAAGCTATGCTCAGGACAAG---CAAAA----CTAGCCAAAAATA--AAGTACA---A---AAGGAGAGATA-AT------TATGTCA----TT-ATTCAAGA-TAGAGTTATGGTTA-TT---TTG-CCGTGTACAT---------T-GC----CC--TCGACCC-ATGTTCAA-TG-C-TT-CTTGAGATCC-CGTCC-ATA-TTAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C--A----AAA-A-----TAA--CCAAAACAAATG-------GG-GAGATGAT--AC-T-GA---CAT-TAT-T-CA--AGCTAA--TAAAG-----GT---TCTCT----CACTCAGA--A-CTAC--CATACA--TAAGCTTTC----TATTCA-TGTT-CTAA-GTGTCATCTG------ATTCCATTCAGTT-CTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaaa
gi|40 : ATGTAGTTTAAATAAATTCCTTTCAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAAC-AAGTACATTTcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGC-CAATCCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTCAAAGCATTCACTTCA
gi|42 : tTTGTATGCAGGTTGA-TAAATTTCATTCAGCATTTTTAGATTTGTG-CCCAG--CAAAAAAA
gi|43 : ct-TC-AACTAAAT-C-CTTTGAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCAGACTAGCATA--AT---AAA-A-----T-
gi|45 : ataTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAA
gi|47 : TTTGAGTAAATCCCACTCAGCACATTAAGAATTGTG-CCCAAGAC-AAGAAAATTTAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : ATTCAGCACTTTAAGAGTTATT-CCCAGGACAAACACAATTA-------ATAACA---GAAGATAA
gi|49 : TTCTTGTACAATGCTCTCTACCATTGTATGCAGTTTTAAAGCATTC
gi|5 : tGTTATTGTA-CACTACACTTCTTCTTAATGT-----CTTCAGTCATTGTAT--GGTGAT-TCAACATA----ATGTC-TCAA-ATAGTTCTGGGGTTATGCTTCGGACAA----AAGTG----T-----------------TACT-TTAATTAAGG-GAGATA-AT------TAAAAAA----AT-ACGCAA-AGTAGAGTTATGGTTC-TT---GTG-TACTTCTCTTTCTCACGA-T-GT----CC--TCGGTAA-TTGTGTGGTAGTT-TC-AACATAATTC-C-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T--A----AAT-T-----T-G--ATAAA--------------GG-GAGGTACT--TC---GA---AA---A--G-TA--AGC-AATGTAGAGTTAT-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTC----TG-TCATTGTG-TGAATAT-TCAAC-AAA----A-TCGCTTGAGTA-CTTTTGTAGTTacttccaa
gi|50 : GGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|52 : --CACTTCCTGA-CAATACTCTCCATCATTGTGTGCa
gi|53 : tgttatgtc---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-C
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCAGCAGA
gi|7 : GACAAGCAAAAATAAC--C------AAAA-ATTAAGTACA-AAA---AAGG-AAGATA-AT-----------------------CAAG-GCAGAGTTACGATTC-TTTTTGTATCGC--CACTT----TC-A-G-GT----TC--CAAATCA-C--------A-----C-AATTGAATTCACTTCCA-TA-TT--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A--A----AAA-A-----T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TC-T-GT---CAT-TA--T-CT--GA--AA--TAGAGTTAT-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCAGGTG-TCATTG-------------------A----ATTTCCTTAAGTA-TTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCA---AAGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTTC-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTAT----AT--TTTACCA-TTGTATGA-AG-C-TT-GATGAAATTC-CATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATCCAGTA-CTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|9 : CTGCACTTCCGC-AAATTG-----CCTCTTCC--CGTATCCGCAG-T-----CGCATCCTATTCC-TTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTA-AAATAACCTT------AAAATA--AAGT----TTA---GAAG-AGGATATATGTTTAATTTGTTA----TT-A-TTTAGGATTGAGTTAaag
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1 111 111 3333333 111 1 1 1 44444444444444 1 2222 2222 2222222222 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 222222222 44444444444444 111 11111111 3333333333333333333 111111 7777777777777777777777777777 2222222222222222222222 11 1111111 1 1111 111 22222222222 22222222222222 1111 1111111 11111111111111 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 3 33 1 0 1 3 777 777 11 6 3333333 666 1 0 77 6 1 2 5555 33 1 3 5 11 5 1 1 2 0 1 22222222222222 1 5 1 1 1 3333 3333 7777777777 1 22 5 5 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 1 4 0 88888 3 222222222 1 6 99 3 00000000000000 000 77 1 1 5 0 0 3 22222222 4 3 1 66 0000000000000000000 777777 2 44 1 6666666666666666666666666666 1 1 66 777 4 0 4 2222222222222222222222 33 1 4444444 4 777 4 2 0 5 5 8888 3 555 2 0 2 9999 44 0 3 88 33 33 222 1 00000000000 2 66666 2 6666 88888888888888 9 44 444 555 33 3333 33 777777 6 555 3 2 33 33 2 44 1 555 3 1 6666 66 0000000 33333333333333 0 3 1 66 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . .. . . . . ... ... .. . ....... ... . . .. . . . .... .. . . . .. . . . . . . .............. . . . . . .... .... .......... . .. . . . . .................................................................................................... . . . . ..... . ......... . . .. . .............. ... .. . . . . . . ........ . . . .. ................... ...... . .. . ............................ . . .. ... . . . ...................... .. . ....... . ... . . . . . .... . ... . . . .... .. . . .. .. .. ... . ........... . ..... . .... .............. . .. ... ... .. .... .. ...... . ... . . .. .. . .. . ... . . .... .. ....... .............. . . . .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 3 88 0 0 0 2 555 555 22 7 5555555 888 0 2 99 7 0 0 2222 66 0 6 0 66 5 0 0 0 3 0 00000000000000 0 5 0 0 0 5555 5555 5555555555 0 00 5 5 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 0 0 6 33333 3 111111111 6 6 22 2 33333333333333 999 44 4 4 0 2 9 7 88888888 0 4 0 11 0000000000000000000 888888 9 66 0 8888888888888888888888888888 1 1 77 888 4 7 4 1111111111111111111111 55 0 4444444 4 000 0 7 0 7 7 6666 8 000 9 9 7 8888 11 2 3 55 11 22 666 1 22222222222 5 22222 5 9999 11111111111111 2 66 888 000 88 2222 99 888888 2 444 1 8 99 99 9 22 2 999 1 0 5555 99 1111111 44444444444444 8 1 0 11 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTA-AATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--NCAAA--------------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTA-AATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCNGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTGT-CATTATATTCTACCATTGTATGAAATTTGATGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTAATG-CTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA----TAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATG-CTCCGGACA-----AAGA-AAAC--------ATATCAAAGGGCAATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGTTTCCTGTA-CACTGCACTTTCTCTCATTAT-----A--TTGTA-CCATTGTAT--GAAG-C-TT-GATGAA----ATTCCATCCG-GTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAAAATAT---C------AAAGGA--AAATATA-TTAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATT-ATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TCGAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : AAAGGGA-ATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtAGCACTTCTAAAGTGATG-CCCCGGACA-----AGTC-AATT---------TAAtcaatttaa
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctatgtatgcagtttgaataaattatcaca-AGATATGCT--GGACACG---T--A----AAATG-----T-A--TAAAA--------------GGAGAGATAATCATC-TCAT---A-T-T-----CA--AG--A-----GAGTTCTTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--A-TTTC--CACT---------GTT-----TA-CCATT-TC-C-AA-GTGTC-AT-TGA----ATTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--A
gi|11 : tggaAATTCCCTTTGTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAG---A-----AATG-AATT--------TTCACAAAGttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : tggaagatatgctggacacgtaaaatgtataaaaggagagataatcatctcatattcaagagagttcttgttatttttactccgcatttccactgtttaccatttccaagtgtcattgT---GTA-CTGTCCACTTCCTGTCTA-T-GCTC--TCTAT---CA-CTGAATGC-AG-T-TCAA-AGCATTCACTTCAAAA-CT--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G--G----AAT-A-----T-A--ATAAA--------------GG-GGAATAAT--TA-T-GT---GA---A--GACAGAAG--AA---AGAGTTAT-GC---A-TACTGCACACT--GT--A-CTTC--CTCTCA--ATG-TCATC----TA-TCATTGTG-TGAA-ATATCAAC-TAA----AT-CCCTTGAAC-ACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC----CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|12 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcAAATCCC-TTGAACACTTTTTGAGTTATG-CTCCGGACAAACATAATA-AAAT--------ATAACAAGAGGg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcaatgtcatctatcattgtgtgaaatatcaactCAAA---AT-A----AAA-A-----T-A--CAAAA--------------GGCGAGATAGT--TC-T-GTCATAAT-T-----CA--AG--A---TAGAGT--T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--A-TTTC--CACACT--TTT-CCTTT----GG-CCATT-TACTGAA-GT-TTCACTGGATTTTATTCCCTCCAGT-ATTTT
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAGATAAT--TC-A-GT---AAC-TAT-T-CA--AG---A--TATATTTAT-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATA-CTTCCACCCTCAATCTA-TGTTC----CA-----TGT--------T-TC-AT-TGG----ATTTCCTTTGGT-ATTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : aaaaacaca-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATACAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGAA-AGAGTTATGCTTCCAGCACACTG--AACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagGACA-----AGTA-TACT--------A----AAAGTGA--TAACTTGGGGTAATT-GAAATAATGACG-CAAA-AA-AGT-GTTATAGTAATTAAA-CACTGC-CTTCCCCTTAATAT-----C--CTTTG-TCTTTGTAT--GCA-----C-G-------------------------TTTATAGTTATGCCCAGGACAAG---
gi|19 : tttctGCACGTTTATAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTT-AATT---------TAAttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGGA-ATAATTATG--TAA-----------------AAA-AATAG---TTATGGTTCTTGCA-CCCTGTACTTCCTCTCAATGT-----C--CTTTA-TAATTGTGT--GAAA-TATC-AACAAA----ATCCC-TTGA-ACACTTTTTGAGTTATGTTCAGGACAAG------------C------ATAATA--AAATATAGTTAA---AAG--AGATA-AT------T---TAAAAAATG-G-GCATG-GTAGAGCCATAATT-------T-TT---GGA-CAATGTATTTCCTGGC-AAT-GTCC--TCCAT---CA-GTGTGTGA-AA-TATGAACCAAATCCCTTG-AATA-GT--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGTATACTA----AAA-G-----T-G--ATAAA--------------TG-GGGATAAT--T----GA---AAA-TGAGG-CA--AG--A--------TTATTGT---T-CTTTG-AAACT--GC--A-CTTC--TCCTTA--GTG-CACTC----TG-TCTTTGTA-TGCA-GT-TTGAA-TAA----ATTCCATTTAGC-ACTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTT
gi|2 : acattaaaGCAAGA------TTATTGTTCTTTGAAACTG--CACTTCTCCT-TAGTGCACTCTGTCTTTGTATGCAGTTTGAATAAATTCCATTTAGCACTTTTAGAGTTATG-CCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----T----TAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTTAGAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTA-AATT---------TAATAAAGGGAGATAACACAA--AAAGTAA----------G-CAAG--GTAGA-GTTATTGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTACCAATAT-----C--ATCTG-TCATTGTTT--GAAGAT-TC-AACAAA----ATTCC-TTAA-ATAGTTTTGGAGTTATGTTCTGGATAA--------------------AAGGGT--AAATATA-ATAA---AGG-GAGACA-AT------TCAAAAA----GTAA-GCAAG-GTAGAGTTATTGTT-------CTTT---GTA-TTCTGCACTTCCTCTCAA-T-GTTC--TCAGT---CA-TTGTGTGA-AGAT-TCAATAAAATCCCTTA-AATA-GT--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A--A----AAT-A-----A-A--TTAAC--------------AA-GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnTATGCAGTTTG-------------CAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGAC-AAGTAAATTTA
gi|20 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTA-AATT--------
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgCAAG-GTAGAGTTATAATT-------A-TT---GTG-CAGTTTACCGCCTCCC-A-T-TTACAGCCAATCTGCA-TT---TCA-AGTT-TCAATGAAATT-CGTTCAGTA-GG--TCTGG-AACAATTATC---AAAAG---A--A----AAG-T-----G-A--GC-AA--------------GG-GAGATAAta
gi|23 : aagacgtaacaCTTCCTC-C-A-C-GTC---TC------CA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAATCCCCTG-AACA-CT--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG---
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTTAGACAA--TCCATTCAGCACTTTTAGAGTAATG-CCCATGACAAA-TAAATTTcataacaaa
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttc---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAA
gi|26 : aaaaactaaccaacTCCTTTTCATA-CT--GCTGA-AGATATATTCTGGACAAC---C--A----AAA-ATAAGGT-A--TAAAA--------------GGAGAGATGGT--TCTT-GT-----TCTA--T-CA--AA--GA--TGGAGTTAtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : cAAGAA---AGTTATGGTTCCTGCACTGTG--CACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|27 : atattaataaaaggaaaatCTG-C-ACTGT----GCAC-T-TCCAACTAA----AACCC-TTGA-ATAGTTTTTTAGTTCTGTTCCGGACAA----ACATA----CT-----AAAATA--aactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|28 : atattaataaaaggaaaataagaaagttatggttcA-----ACTA-AAGT--------ACAA-AAAGGGAGATAAAACTA--TCATT-AT---------A-TAAG--ATAGA-GTTATGGGTCTTTGG-CCCTACATTTGCACACAATAC-----CAGCTCAGTTCATTGt
gi|3 : acaaaAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTaa
gi|3 : aatT-G----------G-CAATCAATAAATGTTATGTTTTCTGTA-CACTGCACTTCCTGTCATTAT-----A--TTCTA-CCATTGTAT--GAAG-T-TT-GATGAA----ATTCCATCCA-GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAG-----------------------GG--AAATATA-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TCTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTTATGAAATTCCATCCAGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCTTCCAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttca-T-GTCG--TCTAT---AAATTGTGTGA-AA-TATCAACTAAA-TCCTTTGAATA-CT--TTTTT-AGCTATGTTCCAGACAAGCATA--AT---AAA-A-----T-aaatat
gi|32 : T--GT--A-CTCC--CTTTCA--TTG-ACATC----TA---ATTC-----AA-GT-TTGAC-TGA----ACTATCTTCAGT-ACTTATGGAGTTATGCTGTGGACAAGGA--
gi|33 : -T-GCCC--TCCAT---AA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAA-TCCGTTTAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|33 : TCCGTTTAACACTTTTTGAGTTATG-TTCCGAAC-----------AACC--------ATAACAAccataacaaca
gi|35 : tgccctccataattgtgtgaaatatcaacttaaGTGA-AA-TATCAACTAAAACCCTTATA-TA-GT--TTTTT-AGGTCTGTTCCGGACAAG---C--ATGATAAA-A-----T-A--ca
gi|36 : aaatagttatgTCACTATCATTGTATGCAGGTTCAAAGCCTTTACTTCAAAACTTTCACGGT------CCA-AACAAGGGAAA
gi|37 : acaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTat
gi|38 : -A-T-GTCC--TAAGT---CA-TTGTGTGA-AG-A-TTAAATAAAGTCGCTTGAATA-GT--TTTGT-AGTAATGCTACGG
gi|39 : --CACTTCCTGT-CATTGCTCTCCATCATTGTATGCAGTTTCAAACTATTCATTTCA
gi|4 : ctggc-CTCAGAACA-----AGTA-AATTTTTTTTTTACAAAAATGGGAGTTAACTCTG--TCATT-A----------TTCAAG-A-TAGA-GTTACTGTTATT-TAGCTCTGTACTTC-----AATATTTTACC--CTCTA-CC----CAT--GT-G-C-CC------------TTTC------ATATTTTTGAAGCTATGCTCAGGACAAG---CAAAA----CTAGCCAAAAATA--AAGTACA---AA---AGGAGAGATA-AT------TATGTCA----TT-ATTCAAGA-TAGAGTTATGGTTATTTTGCC-GT---GTA-CATTGC-CCTCGACCC-A-T-GT----TCAAT---GC-TTCT-TG-------------AGATCCCGTCC-ATA-TTAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C--A----AAA-A-----TAA--CCAAAACAAATG-------GG-GAGATGAT--AC-T-GA---CAT-TAT-T-CA--AGCTAA--TAAAG-----GT---TCTCT----CACTCAGA--A-CTAC--CATACA--TAAGCTTTC----TATTCA-TGTT-CTAA-GTGTCATCTG------ATTCCATTCAGT-TCTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaaa
gi|40 : ATGTAGTTTAAATAAATTCCTTTCAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAAC-AAGTACATTTcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGC-CAATCCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTCAAAGCATTCACTTCA
gi|42 : tTTGTATGCAGGTTGA-TAAATTTCATTCAGCATTTTTAGATTTGTG-CCCAG--CAAAAAAA
gi|43 : ct-TCAACTAAAT-CCTTTGAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCAGACTAGCATA--AT---AAA-A-----T-
gi|45 : ataTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAA
gi|47 : TTTGAGTAAATCCCACTCAGCACATTAAGAATTGTG-CCCAAGAC-AAGAAAATTTAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : TTCAGCACTTTAAGAGTTATT-CCCAGGACA-----AACACAATTA-------ATAACA---GAAGATAA
gi|49 : aTTCTTGTACAATGCTCTCTACCATTGTATGCAGTTTTAAAGCATTCACTTC
gi|5 : tGTTATTGTA-CACTACACTTCTTCTTAATGT-----C--TTCAG-TCATTGTAT--GGTGAT-TC-AACATA----ATGTC-TCAA-ATAGTTCTGGGGTTATGCTTCGGACAA----AAGTG----T-----------------TACT-TTAATTAAGG-GAGATA-AT------TAAAAAA----AT-ACGCAA-AGTAGAGTTATGGTT-------C-TT---GTG-TACTTCTCTTTCTCACGA-T-GTCC--TCGGT---AA-TTGTGTGGTAGTT-TCAACATAATTCC-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T--A----AAT-T-----T-G--ATAAA--------------GG-GAGGTACT--TC---GA---AA---A--G-TA--AGC-AATGTAGAGTTAT-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTC----TG-TCATTGTG-TGAATAT-TCAAC-AAA----A-TCGCTTGAGT-ACTTTTGTAGTTcaa
gi|50 : GGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|52 : --CACTTCCTGA-CAATACTCTCCATCATTGTGTGCa
gi|53 : tgttatgtc---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-C
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCAGCAGA
gi|7 : GACAAGCAAAAATAA---C------CAAAAATTAAGTACA-AAAA---AGG-AAGATA-AT-----------------------CAAG-GCAGAGTTACGATT-------C-TTTTTGTATCGC--CACTT----TC-A-G-GTTC--CAAAT---CA-C--------A-----CAATTGAATTCACTTCCATA-TT--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A--A----AAA-A-----T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TC-T-GT---CAT-TA--T-CT--GA--AA--TAGAGTTAT-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCAGGTG-TCATTG-------------------A----ATTTCCTTAAGT-ATTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AAA-A-----T-A--TCAAA--------------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|9 : CTGCACTTCCGC-AAATTG-----C--CTCTT-CC--CGTATCCGCAG-T------CGCATCCTATTCC-TTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTA-AAATAACCTT------AAAATA--AAGT----TTAG---AAG-AGGATATATGTTTAATTTGTTA----TT-A-TTTAGGATTGAGTTAaag
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1 111 111 3333333 111 1 1 44444444444444 1 2222 2222 2222222222 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 222222222 44444444444444 111 11111111 3333333333333333333 111111 7777777777777777777777777777 2222222222222222222222 11 1111111 1 1111 111 22222222222 11111111 11111111 1111 1111111 11111111111111 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 3 33 1 0 1 3 777 777 11 6 3333333 666 1 0 77 6 1 1 8888 44 1 0 5 0 5 1 11 6 0 1 22222222222222 1 5 1 1 1 3333 3333 7777777777 1 22 5 5 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 4 0 88888 000000000 2 9 99 3 00000000000000 000 77 1 1 5 0 0 3 22222222 4 3 1 66 0000000000000000000 777777 2 44 2 6666666666666666666666666666 1 1 66 777 4 0 4 2222222222222222222222 33 1 4444444 4 777 4 2 0 5 5 8888 3 555 2 0 2 9999 44 0 3 88 33 33 222 1 33333333333 2 2 99999 2 1 00000000 99999999 9 44 444 555 33 3333 33 777777 6 555 3 2 33 33 2 44 1 555 3 1 6666 66 0000000 33333333333333 0 3 1 66 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . .. . . . . ... ... .. . ....... ... . . .. . . . .... .. . . . . . . .. . . . .............. . . . . . .... .... .......... . .. . . . . .................................................................................................... . . . ..... ......... . . .. . .............. ... .. . . . . . . ........ . . . .. ................... ...... . .. . ............................ . . .. ... . . . ...................... .. . ....... . ... . . . . . .... . ... . . . .... .. . . .. .. .. ... . ........... . . ..... . . ........ ........ . .. ... ... .. .... .. ...... . ... . . .. .. . .. . ... . . .... .. ....... .............. . . . .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 3 88 0 0 0 2 555 555 22 7 5555555 888 0 2 99 7 0 6 3333 99 0 4 0 2 5 0 77 5 3 0 00000000000000 0 5 0 0 0 5555 5555 5555555555 0 00 5 5 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 6 33333 444444444 9 3 22 2 33333333333333 999 44 4 4 0 2 9 7 88888888 0 4 0 11 0000000000000000000 888888 9 66 9 8888888888888888888888888888 1 1 77 888 4 7 4 1111111111111111111111 55 0 4444444 4 000 0 7 0 7 7 6666 8 000 9 9 7 8888 11 2 3 55 11 22 666 1 00000000000 4 4 11111 4 0 44444444 66666666 2 66 888 000 88 2222 99 888888 2 444 1 8 99 99 9 22 2 999 1 0 5555 99 1111111 44444444444444 8 1 0 11 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTANCAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTGT-CATTATATTCTACCATTGTATGAAATTTGATGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTAATG-CTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA----TAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATG-CTCCGGACA-----AAGAAAAC--------ATATCAAAGGGCAATAACTCTG--TAATT-A----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGTTTCCTGTA-CACTGCACTTTCTCTCATTAT-----A--TTGTA-CCATTGTAT--GAAG-C-TT-GATGAA----ATTCCATCCG-GTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAAAATAT---C------AAAGGA--AAATATA-TTAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATT-ATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TCGAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : AAAGGGA-ATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtAGCACTTCTAAAGTGATG-CCCCGGACA-----AGTCAATT---------TAAtcaatttaa
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctatgtatgcagtttgaataaattatcaca-AGATATGCT--GGACACG---T--A----AA-ATG-----T-ATA--------AAA--------GGAGAGATAATCATC-TCAT---A-T-T-----CA--AG--A-----GAGTTCTTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--A-TTTC--CACT---------GTT-----TA-CCATT-TC-C-AA-GTGTC-AT-TGA----ATTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--A
gi|11 : tggaAATTCCCTTTGTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAG---A-----AATGAATT--------TTCACAAAGttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : tggaagatatgctggacacgtaaaatgtataaaaggagagataatcatctcatattcaagagagttcttgttatttttactccgcatttccactgtttaccatttccaagtgtcattgT---GTA-CTGTCCACTTCCTGTCTA-T-GCTC--TCTAT---CA-CTGAATGC-AG-T-TCAA-AGCATTCACTTCAAAA-CT--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G--G----AA-T-A-----T-AAT--------AAA--------GG-GGAATAAT--TA-T-GT---GA---A--GACAGAAG--AA---AGAGTTAT-GC---A-TACTGCACACT--GT--A-CTTC--CTCTCA--ATG-TCATC----TA-TCATTGTG-TGAA-ATATCAAC-TAA----AT-CCCTTGAAC-ACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC----CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|12 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcAAATCCC-TTGAACACTTTTTGAGTTATG-CTCCGGACAAACATAATAAAAT--------ATAACAAGAGGg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcaatgtcatctatcattgtgtgaaatatcaactCAAA---AT-A----AA-A-A-----T-ACA--------AAA--------GGCGAGATAGT--TC-T-GTCATAAT-T-----CA--AG--A---TAGAGT--T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--A-TTTC--CACACT--TTT-CCTTT----GG-CCATT-TACTGAA-GT-TTCACTGGATTTTATTCCCTCCAGT-ATTTT
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAGATAAT--TC-A-GT---AAC-TAT-T-CA--AG---A--TATATTTAT-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATA-CTTCCACCCTCAATCTA-TGTTC----CA-----TGT--------T-TC-AT-TGG----ATTTCCTTTGGT-ATTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : aaaaacaca-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATACAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGAA-AGAGTTATGCTTCCAGCACACTG--AACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagGACA-----AGTATACT--------A----AAAGTGA--TAACTTGGGGTAATT-GAAATAATGACG-CAAA-AA-AGT-GTTATAGTAATTAAA-CACTGC-CTTCCCCTTAATAT-----C--CTTTG-TCTTTGTAT--GCA-----C-G-------------------------TTTATAGTTATGCCCAGGACAAG---
gi|19 : tttctGCACGTTTATAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTTAATT---------TAAttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGGA-ATAATTATG--TAA-----------------AAA-AATAG---TTATGGTTCTTGCA-CCCTGTACTTCCTCTCAATGT-----C--CTTTA-TAATTGTGT--GAAA-TATC-AACAAA----ATCCC-TTGA-ACACTTTTTGAGTTATGTTCAGGACAAG------------C------ATAATA--AAATATAGTTAA---AAG--AGATA-AT------T---TAAAAAATG-G-GCATG-GTAGAGCCATAATT-------T-TT---GGA-CAATGTATTTCCTGGC-AAT-GTCC--TCCAT---CA-GTGTGTGA-AA-TATGAACCAAATCCCTTG-AATA-GT--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGTATACTA----AA-A-G-----T-GAT--------AAA--------TG-GGGATAAT--T----GA---AAA-TGAGG-CA--AG--A--------TTATTGT---T-CTTTG-AAACT--GC--A-CTTC--TCCTTA--GTG-CACTC----TG-TCTTTGTA-TGCA-GT-TTGAA-TAA----ATTCCATTTAGC-ACTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTT
gi|2 : acattaaaGCAAGA------TTATTGTTCTTTGAAACTG--CACTTCTCCT-TAGTGCACTCTGTCTTTGTATGCAGTTTGAATAAATTCCATTTAGCACTTTTAGAGTTATG-CCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----T----TAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTTAGAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTAAATT---------TAATAAAGGGAGATAACACAA--AAAGTAA----------G-CAAG--GTAGA-GTTATTGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTACCAATAT-----C--ATCTG-TCATTGTTT--GAAGAT-TC-AACAAA----ATTCC-TTAA-ATAGTTTTGGAGTTATGTTCTGGATAA--------------------AAGGGT--AAATATA-ATAA---AGG-GAGACA-AT------TCAAAAA----GTAA-GCAAG-GTAGAGTTATTGTT-------CTTT---GTA-TTCTGCACTTCCTCTCAA-T-GTTC--TCAGT---CA-TTGTGTGA-AGAT-TCAATAAAATCCCTTA-AATA-GT--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A--A----AATA-AAT---T-AAC--------AA------------GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnTATGCAGTTTG-------------CAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGAC-AAGTAAATTTA
gi|20 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgCAAG-GTAGAGTTATAATT-------A-TT---GTG-CAGTTTACCGCCTCCC-A-T-TTACAGCCAATCTGCA-TT---TCA-AGTT-TCAATGAAATT-CGTTCAGTA-GG--TCTGG-AACAATTATC---AAAAG---A--A----AA-G-T-----G-AGC---------AA--------GG-GAGATAAta
gi|23 : aagacgtaacaCTTCCTC-C-A-C-GTC---TC------CA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAATCCCCTG-AACA-CT--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG--------------C-A-----T-AAC--------AAA--------
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTCCATTCAGCACTTTTAGAGTAATG-CCCATGACA-----AATAAATT--------
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaa---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAAt
gi|26 : aaaaactaaccaacTCCTTTTCATA-CT--GCTGA-AGATATATTCTGGACAAC---C--A----AA-A-ATAAGGT-ATA--------AAA--------GGAGAGATGGT--TCTT-GT-----TCTA--T-CA--AA--GA--TGGAGTTAtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : cAAGAA---AGTTATGGTTCCTGCACTGTG--CACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|27 : atattaataaaaggaaaatCTG-C-ACTGT----GCAC-T-TCCAACTAA----AACCC-TTGA-ATAGTTTTTTAGTTCTGTTCCGGACAA----ACATA----CT-----AAAATA--aactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|28 : atattaataaaaggaaaataagaaagttatggttcA-----ACTAAAGT--------ACAA-AAAGGGAGATAAAACTA--TCATT-AT---------A-TAAG--ATAGA-GTTATGGGTCTTTGG-CCCTACATTTGCACACAATAC-----CAGCTCAGTTCATTGt
gi|3 : acaaaAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTaa
gi|3 : aatT-G----------G-CAATCAATAAATGTTATGTTTTCTGTA-CACTGCACTTCCTGTCATTAT-----A--TTCTA-CCATTGTAT--GAAG-T-TT-GATGAA----ATTCCATCCA-GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAG-----------------------GG--AAATATA-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TCTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTTATGAAATTCCATCCAGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCTTCCAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttca-T-GTCG--TCTAT---AAATTGTGTGA-AA-TATCAACTAAA-TCCTTTGAATA-CT--TTTTT-AGCTATGTTCCAGACAAGCATA--AT---AA-A-A-----T-aaatat
gi|32 : T--GT--A-CTCC--CTTTCA--TTG-ACATC----TA---ATTC-----AA-GT-TTGAC-TGA----ACTATCTTCAGT-ACTTATGGAGTTATGCTGTGGACAAGGA--
gi|33 : -T-GCCC--TCCAT---AA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAA-TCCGTTTAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|33 : TCCGTTTAACACTTTTTGAGTTATG-TTCCGAAC----------AACC--------ATAACAAccataacaaca
gi|35 : tgccctccataattgtgtgaaatatcaacttaaGTGA-AA-TATCAACTAAAACCCTTATA-TA-GT--TTTTT-AGGTCTGTTCCGGACAAG---C--ATGATAA-A-A-----T-Aca
gi|36 : aaatagttatgTCACTATCATTGTATGCAGGTTCAAAGCCTTTACTTCAAAACTTTCACGGT------CCA-AACAAGGGAAA
gi|37 : acaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTat
gi|38 : -A-T-GTCC--TAAGT---CA-TTGTGTGA-AG-A-TTAAATAAAGTCGCTTGAATA-GT--TTTGT-AGTAATGCTACGG
gi|39 : --CACTTCCTGT-CATTGCTCTCCATCATTGTATGCAGTTTCAAACTATTCATTTCA
gi|4 : ctggc-CTCAGAACA-----AGTAAATTTTTTTTTTACAAAAATGGGAGTTAACTCTG--TCATT-A----------TTCAAG-A-TAGA-GTTACTGTTATT-TAGCTCTGTACTTC-----AATATTTTACC--CTCTA-CC----CAT--GT-G-C-CC------------TTTC------ATATTTTTGAAGCTATGCTCAGGACAAG---CAAAA----CTAGCCAAAAATA--AAGTACA---AA---AGGAGAGATA-AT------TATGTCA----TT-ATTCAAGA-TAGAGTTATGGTTATTTTGCC-GT---GTA-CATTGC-CCTCGACCC-A-T-GT----TCAAT---GC-TTCT-TG-------------AGATCCCGTCC-ATA-TTAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C--A----AA-A-A-----TAACC--------AAAACAAATG-GG-GAGATGAT--AC-T-GA---CAT-TAT-T-CA--AGCTAA--TAAAG-----GT---TCTCT----CACTCAGA--A-CTAC--CATACA--TAAGCTTTC----TATTCA-TGTT-CTAA-GTGTCATCTG------ATTCCATTCAGT-TCTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaaa
gi|40 : ATGTAGTTTAAATAAATTCCTTTCAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAAC-AAGTACATTTcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGC-CAATCCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTCAAAGCATTCACTTCA
gi|42 : tTTGTATGCAGGTTGA-TAAATTTCATTCAGCATTTTTAGATTTGTG-CCCAG--CAAAAAAA
gi|43 : ct-TCAACTAAAT-CCTTTGAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCAGACTAGCATA--AT---AA-A-A-----T-
gi|45 : ataTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAA
gi|47 : TTTGAGTAAATCCCACTCAGCACATTAAGAATTGTG-CCCAAGAC-AAGAAAATTTAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : TTCAGCACTTTAAGAGTTATT-CCCAGGACAAACACAA-TTAATAACAGAAGATAA
gi|49 : aTTCTTGTACAATGCTCTCTACCATTGTATGCAGTTTTAAAGCATTCACTTC
gi|5 : tGTTATTGTA-CACTACACTTCTTCTTAATGT-----C--TTCAG-TCATTGTAT--GGTGAT-TC-AACATA----ATGTC-TCAA-ATAGTTCTGGGGTTATGCTTCGGACAA----AAGTG----T-----------------TACT-TTAATTAAGG-GAGATA-AT------TAAAAAA----AT-ACGCAA-AGTAGAGTTATGGTT-------C-TT---GTG-TACTTCTCTTTCTCACGA-T-GTCC--TCGGT---AA-TTGTGTGGTAGTT-TCAACATAATTCC-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T--A----AA-T-T-----T-GAT--------AAA--------GG-GAGGTACT--TC---GA---AA---A--G-TA--AGC-AATGTAGAGTTAT-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTC----TG-TCATTGTG-TGAATAT-TCAAC-AAA----A-TCGCTTGAGT-ACTTTTGTAGTTcaa
gi|50 : GGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|52 : --CACTTCCTGA-CAATACTCTCCATCATTGTGTGCa
gi|53 : tgttatgtc---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-C
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCAGCAGA
gi|7 : GACAAGCAAAAATAA---C------CAAAAATTAAGTACA-AAAA---AGG-AAGATA-AT-----------------------CAAG-GCAGAGTTACGATT-------C-TTTTTGTATCGC--CACTT----TC-A-G-GTTC--CAAAT---CA-C--------A-----CAATTGAATTCACTTCCATA-TT--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A--A----AA-A-A-----T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TC-T-GT---CAT-TA--T-CT--GA--AA--TAGAGTTAT-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCAGGTG-TCATTG-------------------A----ATTTCCTTAAGT-ATTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TT-A-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|9 : CTGCACTTCCGC-AAATTG-----C--CTCTT-CC--CGTATCCGCAG-T------CGCATCCTATTCC-TTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTA-AAATAACCTT------AAAATA--AAGT----TTAG---AAG-AGGATATATGTTTAATTTGTTA----TT-A-TTTAGGATTGAGTTAaag
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1 111 111 3333333 111 1 1 44444444444444 1 2222 2222 2222222222 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 222222222 444444444444 111 11111111 3333333333333333333 111111 7777777777777777777777777777 222222222222222222222 11 1111111 111 1111 111 22222222222 11111111 11111111 1111 1111111 11111111111111 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 3 33 1 0 1 3 777 777 11 6 3333333 666 1 0 77 6 1 1 8888 44 1 0 5 0 5 1 6 0 1 22222222222222 1 5 1 1 1 3333 3333 7777777777 1 22 5 5 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 4 0 88888 000000000 2 9 99 3 111111111111 000 77 1 1 5 0 0 3 22222222 4 3 1 66 0000000000000000000 777777 2 44 2 6666666666666666666666666666 1 1 66 777 4 0 4 222222222222222222222 33 1 4444444 111 4 2 6 8 5 8888 3 555 2 0 2 9999 44 0 3 88 33 33 222 1 33333333333 2 2 99999 2 1 00000000 99999999 9 44 444 555 33 3333 33 777777 6 555 3 2 33 33 2 44 1 555 3 1 6666 66 1111111 8 66666666666666 1 2 1 55 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . .. . . . . ... ... .. . ....... ... . . .. . . . .... .. . . . . . . . . . .............. . . . . . .... .... .......... . .. . . . . .................................................................................................... . . . ..... ......... . . .. . ............ ... .. . . . . . . ........ . . . .. ................... ...... . .. . ............................ . . .. ... . . . ..................... .. . ....... ... . . . . . .... . ... . . . .... .. . . .. .. .. ... . ........... . . ..... . . ........ ........ . .. ... ... .. .... .. ...... . ... . . .. .. . .. . ... . . .... .. ....... . .............. . . . .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 3 88 0 0 0 2 555 555 22 7 5555555 888 0 2 99 7 0 6 3333 99 0 4 0 2 5 0 5 3 0 00000000000000 0 5 0 0 0 5555 5555 5555555555 0 00 5 5 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 6 33333 444444444 9 3 22 2 666666666666 999 44 4 4 0 2 9 7 88888888 0 4 0 11 0000000000000000000 888888 9 66 9 8888888888888888888888888888 1 1 77 888 4 7 4 111111111111111111111 55 0 4444444 000 0 7 7 6 7 6666 8 000 9 9 7 8888 11 2 3 55 11 22 666 1 00000000000 4 4 11111 4 0 44444444 66666666 2 66 888 000 88 2222 99 888888 2 444 1 8 99 99 9 22 2 999 1 0 5555 99 3333333 6 77777777777777 9 9 0 55 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TTA-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TC---GAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TTA-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TC---GAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTGT-CATTATATTCTACCATTGTATGAAATTTGATGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTAATG-CTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA----TAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATG-CTCCGGACA-----AAGAAAAC--------ATATCAAAGGGCAATAACTCTG--TAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGTTTCCTGTA-CACTGCACTTTCTCTCATTAT-----A--TTGTA-CCATTGTAT--GAAG-C-TT-GATGAA----ATTCCATCCG-GTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAAAATAT---C------AAAGGA--AAATATA-TTAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TTA-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------CCT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATT-ATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TC---GAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : TAAAGGGA-ATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgAGCACTTCTAAAGTGATG-CCCCGGACA-----AGTCAATT---------TAAtcaatttaa
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctatgtatgcagtttgaataaattatcaca-AGATATGCT--GGACACG---T--A----AA-ATG-----T-ATA--------AAA--------GGAGAGATAATCATC-TCAT---A-T-T-----CA--AG--A-----GAGTTCTTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--A-TTTC--CACT---------GTT-----TA-CCATT-TC-C-AA-GTGTC----AT-TGA----ATTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--A
gi|11 : tggaAATTCCCTTTGTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAG---A-----AATGAATT--------TTCACAAAGttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : tggaagatatgctggacacgtaaaatgtataaaaggagagataatcatctcatattcaagagagttcttgttatttttactccgcatttccactgtttaccatttccaagtgtcattgT---GTA-CTGTCCACTTCCTGTCTA-T-GCTC--TCTAT---CA-CTGAATGC-AG-T-TCAA-AGCATTCACTTCAAAA-CT--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G--G----AA-T-A-----T-AAT--------AAA--------GG-GGAATAAT--TA-T-GT---GA---A--GACAGAAG--AA---AGAGTTAT-GC---A-TACTGCACACT--GT--A-CTTC--CTCTCA--ATG-TCATC----TA-TCATTGTG-TGAA-ATATC---AAC-TAA----AT-CCCTTGAAC-ACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC----CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|12 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcAAATCCC-TTGAACACTTTTTGAGTTATG-CTCCGGACAAACATAATAAAAT--------ATAACAAGAGGg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcaatgtcatctatcattgtgtgaaatatcaactCAAA---AT-A----AA-A-A-----T-ACA--------AAA--------GGCGAGATAGT--TC-T-GTCATAAT-T-----CA--AG--A---TAGAGT--T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--A-TTTC--CACACT--TTT-CCTTT----GG-CCATT-TACTGAA-GT-TT---CACTGGATTTTATTCCCTCCAGT-ATTTT
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAGATAAT--TC-A-GT---AAC-TAT-T-CA--AG---A--TATATTTAT-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATA-CTTCCACCCTCAATCTA-TGTTC----CA-----TGT--------T-TC----AT-TGG----ATTTCCTTTGGT-ATTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : aaaaacaca-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TT---GAT-GAA----ATTCCATACAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGAA-AGAGTTATGCTTCCAGCACACTG--AACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagGACA-----AGTATACT--------A----AAAGTGA--TAACTTGGGGTAATTGAAATAATGACG-CAAA-AA-AGT-GTTATAGTAATTAAA-CACTGC-CTTCCCCTTAATAT-----C--CTTTG-TCTTTGTAT--GCA-----C-G-------------------------TTTATAGTTATGCCCAGGACAAG---
gi|19 : tttctGCACGTTTATAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTTAATT---------TAAttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGGA-ATAATTATG--TAA----------------AAA-AATAG---TTATGGTTCTTGCA-CCCTGTACTTCCTCTCAATGT-----C--CTTTA-TAATTGTGT--GAAA-TATC-AACAAA----ATCCC-TTGA-ACACTTTTTGAGTTATGTTCAGGACAAG------------C------ATAATA--AAATATAGTTAA---AAG--AGATA-AT------T---TAAAAAATGG-GCATG-GTAGAGCCATAATT-------TTT---GGA-CAATGTATTTCCTGGC-AAT-GTCC--TCCAT---CA-GTGTGTGA-AA-TATGAACCAAATCCCTTG-AATA-GT--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGTATACTA----AA-A-G-----T-GAT--------AAA--------TG-GGGATAAT--T----GA---AAA-TGAGG-CA--AG--A--------TTATTGT---T-CTTTG-AAACT--GC--A-CTTC--TCCTTA--GTG-CACTC----TG-TCTTTGTA-TGCA-GT-TT---GAA-TAA----ATTCCATTTAGC-ACTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTT
gi|2 : acattaaaGCAAGA------TTATTGTTCTTTGAAACTG--CACTTCTCCT-TAGTGCACTCTGTCTTTGTATGCAGTTTGAATAAATTCCATTTAGCACTTTTAGAGTTATG-CCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----T----TAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTTAGAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTAAATT---------TAATAAAGGGAGATAACACAA--AAAGTAA---------G-CAAG-G-TAGA-GTTATTGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTACCAATAT-----C--ATCTG-TCATTGTTT--GAAGAT-TC-AACAAA----ATTCC-TTAA-ATAGTTTTGGAGTTATGTTCTGGATAA--------------------AAGGGT--AAATATA-ATAA---AGG-GAGACA-AT------TCAAAAA----GTAAGCAAG-GTAGAGTTATTGTT-------CTTT--GTA-TTCTGCACTTCCTCTC-AAT-GTTC--TCAGT---CA-TTGTGTGA-AGAT-TCAATAAAATCCCTTA-AATA-GT--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A--A----AATA-AAT---T-AAC--------AA------------GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnTATGCAGTTTG-------------CAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGAC-AAGTAAATTTA
gi|20 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgCAAG-GTAGAGTTATAATT-------ATT---GTG-CAGTTTACCGCCTCCC-A-T-TTACAGCCAATCTGCA-TT---TCA-AGTT-TCAATGAAATT-CGTTCAGTA-GG--TCTGG-AACAATTATC---AAAAG---A--A----AA-G-T-----G-AGC---------AA--------GG-GAGATAAta
gi|23 : aagacgtaacaCTTCCTC-C-A-C-GTC---TC------CA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAATCCCCTG-AACA-CT--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG--------------C-A-----T-AAC--------AAA--------
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTA-TG---GT-TCTTAGAC-AA-------TCCATTCAGC-ACTTTTAGAGTAATGCCCATGACAAATA--AATTT
gi|24 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagaTCCATTCAGCACTTTTAGAGTAATG-CCCATGACA-----AATAAATT--------
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaa---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAAt
gi|26 : aaaaactaaccaacTCCTTTTCATA-CT--GCTGA-AGATATATTCTGGACAAC---C--A----AA-A-ATAAGGT-ATA--------AAA--------GGAGAGATGGT--TCTT-GT-----TCTA--T-CA--AA--GA--TGGAGTTAtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : cAAGAA---AGTTATGGTTCCTGCACTGTG--CACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|27 : atattaataaaaggaaaatCTG-C-ACTGT----GCAC-T-TCCAACTAA----AACCC-TTGA-ATAGTTTTTTAGTTCTGTTCCGGACAA----ACATA----CT-----AAAATA--aactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|28 : atattaataaaaggaaaataagaaagttatggttcA-----ACTAAAGT--------ACAA-AAAGGGAGATAAAACTA--TCATTAT---------A-TAAG--ATAGA-GTTATGGGTCTTTGG-CCCTACATTTGCACACAATAC-----CAGCTCAGTTCATTGt
gi|3 : acaaaAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTaa
gi|3 : aatTG----------G-CAATCAATAAATGTTATGTTTTCTGTA-CACTGCACTTCCTGTCATTAT-----A--TTCTA-CCATTGTAT--GAAG-T-TT-GATGAA----ATTCCATCCA-GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAG-----------------------GG--AAATATA-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TTA-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TCTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTTATGAAATTCCATCCAGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TT---GAT-GAA----ATTCCTTCCAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttca-T-GTCG--TCTAT---AAATTGTGTGA-AA-TATCAACTAAA-TCCTTTGAATA-CT--TTTTT-AGCTATGTTCCAGACAAGCATA--AT---AA-A-A-----T-aaatat
gi|32 : T--GT--A-CTCC--CTTTCA--TTG-ACATC----TA---ATTC-----AA-GT-TT---GAC-TGA----ACTATCTTCAGT-ACTTATGGAGTTATGCTGTGGACAAGGA--
gi|33 : -T-GCCC--TCCAT---AA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAA-TCCGTTTAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|33 : TCCGTTTAACACTTTTTGAGTTATG-TTCCGAAC----------AACC--------ATAACAAccataacaaca
gi|35 : tgccctccataattgtgtgaaatatcaacttaaGTGA-AA-TATCAACTAAAACCCTTATA-TA-GT--TTTTT-AGGTCTGTTCCGGACAAG---C--ATGATAA-A-A-----T-Aca
gi|36 : aaatagttatgTCACTATCATTGTATGCAGGTTCAAAGCCTTTACTTCAAAACTTTCACGGT------CCA-AACAAGGGAAA
gi|37 : acaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTat
gi|38 : -A-T-GTCC--TAAGT---CA-TTGTGTGA-AG-A-TTAAATAAAGTCGCTTGAATA-GT--TTTGT-AGTAATGCTACGG
gi|39 : --CACTTCCTGT-CATTGCTCTCCATCATTGTATGCAGTTTCAAACTATTCATTTCA
gi|4 : ctggc-CTCAGAACA-----AGTAAATTTTTTTTTTACAAAAATGGGAGTTAACTCTG--TCATTA----------TTCAAG-A-TAGA-GTTACTGTTATT-TAGCTCTGTACTTC-----AATATTTTACC--CTCTA-CC----CAT--GT-G-C-CC------------TTTC------ATATTTTTGAAGCTATGCTCAGGACAAG---CAAAA----CTAGCCAAAAATA--AAGTACA---AA---AGGAGAGATA-AT------TATGTCA----TTATTCAAGA-TAGAGTTATGGTTATTTTGCCGT---GTA-CATTGC-CCTCGACCC-A-T-GT----TCAAT---GC-TTCT-TG-------------AGATCCCGTCC-ATA-TTAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C--A----AA-A-A-----TAACC--------AAAACAAATG-GG-GAGATGAT--AC-T-GA---CAT-TAT-T-CA--AGCTAA--TAAAG-----GT---TCTCT----CACTCAGA--A-CTAC--CATACA--TAAGCTTTC----TATTCA-TGTT-CTAA-GTGTC---ATCTG------ATTCCATTCAGT-TCTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaaa
gi|40 : ATGTAGTTTAAATAAATTCCTTTCAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAAC-AAGTACATTTcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGC-CAATCCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTCAAAGCATTCACTTCA
gi|42 : tTTGTATGCAGGTTGA-TAAATTTCATTCAGCATTTTTAGATTTGTG-CCCAG--CAAAAAAA
gi|43 : ct-TCAACTAAAT-CCTTTGAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCAGACTAGCATA--AT---AA-A-A-----T-
gi|45 : ataTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAA
gi|47 : TTTGAGTAAATCCCACTCAGCACATTAAGAATTGTG-CCCAAGAC-AAGAAAATTTAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : TTCAGCACTTTAAGAGTTATT-CCCAGGACAAACACAA-TTAATAACAGAAGATAA
gi|49 : aTTCTTGTACAATGCTCTCTACCATTGTATGCAGTTTTAAAGCATTCACTTC
gi|5 : tGTTATTGTA-CACTACACTTCTTCTTAATGT-----C--TTCAG-TCATTGTAT--GGTGAT-TC-AACATA----ATGTC-TCAA-ATAGTTCTGGGGTTATGCTTCGGACAA----AAGTG----T-----------------TACT-TTAATTAAGG-GAGATA-AT------TAAAAAA----ATACGCAA-AGTAGAGTTATGGTT-------CTT---GTG-TACTTCTCTTTCTCACGA-T-GTCC--TCGGT---AA-TTGTGTGGTAGTT-TCAACATAATTCC-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T--A----AA-T-T-----T-GAT--------AAA--------GG-GAGGTACT--TC---GA---AA---A--G-TA--AGC-AATGTAGAGTTAT-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTC----TG-TCATTGTG-TGAATAT-TC---AAC-AAA----A-TCGCTTGAGT-ACTTTTGTAGTTcaa
gi|50 : GGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|52 : --CACTTCCTGA-CAATACTCTCCATCATTGTGTGCa
gi|53 : tgttatgtc---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-C
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCAGCAGA
gi|7 : GACAAGCAAAAATAA---C------CAAAAATTAAGTACA-AAAA---AGG-AAGATA-AT----------------------CAAG-GCAGAGTTACGATT-------CTTTTTGTATCGC--CACTT----TC-A-G-GTTC--CAAAT---CA-C--------A-----CAATTGAATTCACTTCCATA-TT--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A--A----AA-A-A-----T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TC-T-GT---CAT-TA--T-CT--GA--AA--TAGAGTTAT-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCAGGTG-TCATTG----------------------A----ATTTCCTTAAGT-ATTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TTA-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------CCT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TT---GAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|9 : CTGCACTTCCGC-AAATTG-----C--CTCTT-CC--CGTATCCGCAG-T------CGCATCCTATTCC-TTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTA-AAATAACCTT------AAAATA--AAGT----TTAG---AAG-AGGATATATGTTTAATTTGTTA----TTA-TTTAGGATTGAGTTAaag
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1 111 111 3333333 111 1 1 44444444444444 1 2222 2222 2222222222 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 222222222 444444444444 111 11111111 3333333333333333333 111111 7777777777777777777777777777 222222222222222222222 11 1111111 111 1111 111 22222222222 11111111 11111111 1111 1111111 11111111111111 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 3 33 1 0 1 3 777 777 11 6 3333333 666 1 0 77 6 1 1 8888 44 1 0 5 0 5 1 6 0 1 22222222222222 1 5 1 1 1 3333 3333 7777777777 1 22 5 5 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 4 0 88888 000000000 2 9 99 3 111111111111 000 77 1 1 5 0 0 3 22222222 4 3 1 66 0000000000000000000 777777 2 44 2 6666666666666666666666666666 1 1 66 777 4 0 4 222222222222222222222 33 1 4444444 111 4 2 6 8 5 8888 3 555 2 0 2 9999 44 0 3 88 33 33 222 1 33333333333 2 2 99999 2 1 00000000 99999999 9 44 444 555 33 3333 33 777777 6 555 3 2 33 33 2 44 1 555 3 1 6666 66 1111111 8 66666666666666 1 2 1 55 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . .. . . . . ... ... .. . ....... ... . . .. . . . .... .. . . . . . . . . . .............. . . . . . .... .... .......... . .. . . . . .................................................................................................... . . . ..... ......... . . .. . ............ ... .. . . . . . . ........ . . . .. ................... ...... . .. . ............................ . . .. ... . . . ..................... .. . ....... ... . . . . . .... . ... . . . .... .. . . .. .. .. ... . ........... . . ..... . . ........ ........ . .. ... ... .. .... .. ...... . ... . . .. .. . .. . ... . . .... .. ....... . .............. . . . .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 3 88 0 0 0 2 555 555 22 7 5555555 888 0 2 99 7 0 6 3333 99 0 4 0 2 5 0 5 3 0 00000000000000 0 5 0 0 0 5555 5555 5555555555 0 00 5 5 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 6 33333 444444444 9 3 22 2 666666666666 999 44 4 4 0 2 9 7 88888888 0 4 0 11 0000000000000000000 888888 9 66 9 8888888888888888888888888888 1 1 77 888 4 7 4 111111111111111111111 55 0 4444444 000 0 7 7 6 7 6666 8 000 9 9 7 8888 11 2 3 55 11 22 666 1 00000000000 4 4 11111 4 0 44444444 66666666 2 66 888 000 88 2222 99 888888 2 444 1 8 99 99 9 22 2 999 1 0 5555 99 3333333 6 77777777777777 9 9 0 55 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TTA-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TC---GAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TTA-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TC---GAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTGT-CATTATATTCTACCATTGTATGAAATTTGATGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTAATG-CTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA----TAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATG-CTCCGGACA-----AAGAAAAC--------ATATCAAAGGGCAATAACTCTG--TAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGTTTCCTGTA-CACTGCACTTTCTCTCATTAT-----A--TTGTA-CCATTGTAT--GAAG-C-TT-GATGAA----ATTCCATCCG-GTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAAAATAT---C------AAAGGA--AAATATA-TTAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TTA-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------CCT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATT-ATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TC---GAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : TAAAGGGA-ATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgAGCACTTCTAAAGTGATG-CCCCGGACA-----AGTCAATT---------TAAtcaatttaa
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctatgtatgcagtttgaataaattatcaca-AGATATGCT--GGACACG---T--A----AA-ATG-----T-ATA--------AAA--------GGAGAGATAATCATC-TCAT---A-T-T-----CA--AG--A-----GAGTTCTTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--A-TTTC--CACT---------GTT-----TA-CCATT-TC-C-AA-GTGTC----AT-TGA----ATTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--A
gi|11 : tggaAATTCCCTTTGTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAG---A-----AATGAATT--------TTCACAAAGttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : tggaagatatgctggacacgtaaaatgtataaaaggagagataatcatctcatattcaagagagttcttgttatttttactccgcatttccactgtttaccatttccaagtgtcattgT---GTA-CTGTCCACTTCCTGTCTA-T-GCTC--TCTAT---CA-CTGAATGC-AG-T-TCAA-AGCATTCACTTCAAAA-CT--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G--G----AA-T-A-----T-AAT--------AAA--------GG-GGAATAAT--TA-T-GT---GA---A--GACAGAAG--AA---AGAGTTAT-GC---A-TACTGCACACT--GT--A-CTTC--CTCTCA--ATG-TCATC----TA-TCATTGTG-TGAA-ATATC---AAC-TAA----AT-CCCTTGAAC-ACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC----CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|12 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcAAATCCC-TTGAACACTTTTTGAGTTATG-CTCCGGACAAACATAATAAAAT--------ATAACAAGAGGg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcaatgtcatctatcattgtgtgaaatatcaactCAAA---AT-A----AA-A-A-----T-ACA--------AAA--------GGCGAGATAGT--TC-T-GTCATAAT-T-----CA--AG--A---TAGAGT--T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--A-TTTC--CACACT--TTT-CCTTT----GG-CCATT-TACTGAA-GT-TT---CACTGGATTTTATTCCCTCCAGT-ATTTT
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAGATAAT--TC-A-GT---AAC-TAT-T-CA--AG---A--TATATTTAT-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATA-CTTCCACCCTCAATCTA-TGTTC----CA-----TGT--------T-TC----AT-TGG----ATTTCCTTTGGT-ATTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : aaaaacaca-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TT---GAT-GAA----ATTCCATACAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGAA-AGAGTTATGCTTCCAGCACACTG--AACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagGACA-----AGTATACT--------A----AAAGTGA--TAACTTGGGGTAATTGAAATAATGACG-CAAA-AA-AGT-GTTATAGTAATTAAA-CACTGC-CTTCCCCTTAATAT-----C--CTTTG-TCTTTGTAT--GCA-----C-G-------------------------TTTATAGTTATGCCCAGGACAAG---
gi|19 : tttctGCACGTTTATAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTTAATT---------TAAttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGGA-ATAATTATG--TAA----------------AAA-AATAG---TTATGGTTCTTGCA-CCCTGTACTTCCTCTCAATGT-----C--CTTTA-TAATTGTGT--GAAA-TATC-AACAAA----ATCCC-TTGA-ACACTTTTTGAGTTATGTTCAGGACAAG------------C------ATAATA--AAATATAGTTAA---AAG--AGATA-AT------T---TAAAAAATGG-GCATG-GTAGAGCCATAATT-------TTT---GGA-CAATGTATTTCCTGGC-AAT-GTCC--TCCAT---CA-GTGTGTGA-AA-TATGAACCAAATCCCTTG-AATA-GT--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGTATACTA----AA-A-G-----T-GAT--------AAA--------TG-GGGATAAT--T----GA---AAA-TGAGG-CA--AG--A--------TTATTGT---T-CTTTG-AAACT--GC--A-CTTC--TCCTTA--GTG-CACTC----TG-TCTTTGTA-TGCA-GT-TT---GAA-TAA----ATTCCATTTAGC-ACTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTT
gi|2 : acattaaaGCAAGA------TTATTGTTCTTTGAAACTG--CACTTCTCCT-TAGTGCACTCTGTCTTTGTATGCAGTTTGAATAAATTCCATTTAGCACTTTTAGAGTTATG-CCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----T----TAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTTAGAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTAAATT---------TAATAAAGGGAGATAACACAA--AAAGTAA---------G-CAAG-G-TAGA-GTTATTGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTACCAATAT-----C--ATCTG-TCATTGTTT--GAAGAT-TC-AACAAA----ATTCC-TTAA-ATAGTTTTGGAGTTATGTTCTGGATAA--------------------AAGGGT--AAATATA-ATAA---AGG-GAGACA-AT------TCAAAAA----GTAAGCAAG-GTAGAGTTATTGTT-------CTTT--GTA-TTCTGCACTTCCTCTC-AAT-GTTC--TCAGT---CA-TTGTGTGA-AGAT-TCAATAAAATCCCTTA-AATA-GT--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A--A----AATA-AAT---T-AAC--------AA------------GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnTATGCAGTTTG-------------CAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGAC-AAGTAAATTTA
gi|20 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgCAAG-GTAGAGTTATAATT-------ATT---GTG-CAGTTTACCGCCTCCC-A-T-TTACAGCCAATCTGCA-TT---TCA-AGTT-TCAATGAAATT-CGTTCAGTA-GG--TCTGG-AACAATTATC---AAAAG---A--A----AA-G-T-----G-AGC---------AA--------GG-GAGATAAta
gi|23 : aagacgtaacaCTTCCTC-C-A-C-GTC---TC------CA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAATCCCCTG-AACA-CT--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG--------------C-A-----T-AAC--------AAA--------
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTA-TG---GT-TCTTAGAC-AA-------TCCATTCAGC-ACTTTTAGAGTAATGCCCATGACAAATA--AATTT
gi|24 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagaTCCATTCAGCACTTTTAGAGTAATG-CCCATGACA-----AATAAATT--------
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaa---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAAt
gi|26 : aaaaactaaccaacTCCTTTTCATA-CT--GCTGA-AGATATATTCTGGACAAC---C--A----AA-A-ATAAGGT-ATA--------AAA--------GGAGAGATGGT--TCTT-GT-----TCTA--T-CA--AA--GA--TGGAGTTAtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : cAAGAA---AGTTATGGTTCCTGCACTGTG--CACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|27 : atattaataaaaggaaaatCTG-C-ACTGT----GCAC-T-TCCAACTAA----AACCC-TTGA-ATAGTTTTTTAGTTCTGTTCCGGACAA----ACATA----CT-----AAAATA--aactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|28 : atattaataaaaggaaaataagaaagttatggttcA-----ACTAAAGT--------ACAA-AAAGGGAGATAAAACTA--TCATTAT---------A-TAAG--ATAGA-GTTATGGGTCTTTGG-CCCTACATTTGCACACAATAC-----CAGCTCAGTTCATTGt
gi|3 : acaaaAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTaa
gi|3 : aatTG----------G-CAATCAATAAATGTTATGTTTTCTGTA-CACTGCACTTCCTGTCATTAT-----A--TTCTA-CCATTGTAT--GAAG-T-TT-GATGAA----ATTCCATCCA-GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAG-----------------------GG--AAATATA-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TTA-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TCTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTTATGAAATTCCATCCAGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TT---GAT-GAA----ATTCCTTCCAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttca-T-GTCG--TCTAT---AAATTGTGTGA-AA-TATCAACTAAA-TCCTTTGAATA-CT--TTTTT-AGCTATGTTCCAGACAAGCATA--AT---AA-A-A-----T-aaatat
gi|32 : T--GT--A-CTCC--CTTTCA--TTG-ACATC----TA---ATTC-----AA-GT-TT---GAC-TGA----ACTATCTTCAGT-ACTTATGGAGTTATGCTGTGGACAAGGA--
gi|33 : -T-GCCC--TCCAT---AA-TTGTGTGA-AA-TATCAACTTAA-TCCGTTTAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|33 : TCCGTTTAACACTTTTTGAGTTATG-TTCCGAAC----------AACC--------ATAACAAccataacaaca
gi|35 : tgccctccataattgtgtgaaatatcaacttaaGTGA-AA-TATCAACTAAAACCCTTATA-TA-GT--TTTTT-AGGTCTGTTCCGGACAAG---C--ATGATAA-A-A-----T-Aca
gi|36 : aaatagttatgTCACTATCATTGTATGCAGGTTCAAAGCCTTTACTTCAAAACTTTCACGGT------CCA-AACAAGGGAAA
gi|37 : acaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGTTTat
gi|38 : -A-T-GTCC--TAAGT---CA-TTGTGTGA-AG-A-TTAAATAAAGTCGCTTGAATA-GT--TTTGT-AGTAATGCTACGG
gi|39 : --CACTTCCTGT-CATTGCTCTCCATCATTGTATGCAGTTTCAAACTATTCATTTCA
gi|4 : ctggc-CTCAGAACA-----AGTAAATTTTTTTTTTACAAAAATGGGAGTTAACTCTG--TCATTA----------TTCAAG-A-TAGA-GTTACTGTTATT-TAGCTCTGTACTTC-----AATATTTTACC--CTCTA-CC----CAT--GT-G-C-CC------------TTTC------ATATTTTTGAAGCTATGCTCAGGACAAG---CAAAA----CTAGCCAAAAATA--AAGTACA---AA---AGGAGAGATA-AT------TATGTCA----TTATTCAAGA-TAGAGTTATGGTTATTTTGCCGT---GTA-CATTGC-CCTCGACCC-A-T-GT----TCAAT---GC-TTCT-TG-------------AGATCCCGTCC-ATA-TTAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C--A----AA-A-A-----TAACC--------AAAACAAATG-GG-GAGATGAT--AC-T-GA---CAT-TAT-T-CA--AGCTAA--TAAAG-----GT---TCTCT----CACTCAGA--A-CTAC--CATACA--TAAGCTTTC----TATTCA-TGTT-CTAA-GTGTC---ATCTG------ATTCCATTCAGT-TCTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaaa
gi|40 : ATGTAGTTTAAATAAATTCCTTTCAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAAC-AAGTACATTTcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGC-CAATCCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTCAAAGCATTCACTTCA
gi|42 : tTTGTATGCAGGTTGA-TAAATTTCATTCAGCATTTTTAGATTTGTG-CCCAG--CAAAAAAA
gi|43 : ct-TCAACTAAAT-CCTTTGAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCAGACTAGCATA--AT---AA-A-A-----T-
gi|45 : ataTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAA
gi|47 : TTTGAGTAAATCCCACTCAGCACATTAAGAATTGTG-CCCAAGAC-AAGAAAATTTAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : TTCAGCACTTTAAGAGTTATT-CCCAGGACAAACACAA-TTAATAACAGAAGATAA
gi|49 : aTTCTTGTACAATGCTCTCTACCATTGTATGCAGTTTTAAAGCATTCACTTC
gi|5 : tGTTATTGTA-CACTACACTTCTTCTTAATGT-----C--TTCAG-TCATTGTAT--GGTGAT-TC-AACATA----ATGTC-TCAA-ATAGTTCTGGGGTTATGCTTCGGACAA----AAGTG----T-----------------TACT-TTAATTAAGG-GAGATA-AT------TAAAAAA----ATACGCAA-AGTAGAGTTATGGTT-------CTT---GTG-TACTTCTCTTTCTCACGA-T-GTCC--TCGGT---AA-TTGTGTGGTAGTT-TCAACATAATTCC-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T--A----AA-T-T-----T-GAT--------AAA--------GG-GAGGTACT--TC---GA---AA---A--G-TA--AGC-AATGTAGAGTTAT-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTC----TG-TCATTGTG-TGAATAT-TC---AAC-AAA----A-TCGCTTGAGT-ACTTTTGTAGTTcaa
gi|50 : GGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|52 : --CACTTCCTGA-CAATACTCTCCATCATTGTGTGCa
gi|53 : tgttatgtc---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-C
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCAGCAGA
gi|7 : GACAAGCAAAAATAA---C------CAAAAATTAAGTACA-AAAA---AGG-AAGATA-AT----------------------CAAG-GCAGAGTTACGATT-------CTTTTTGTATCGC--CACTT----TC-A-G-GTTC--CAAAT---CA-C--------A-----CAATTGAATTCACTTCCATA-TT--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A--A----AA-A-A-----T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TC-T-GT---CAT-TA--T-CT--GA--AA--TAGAGTTAT-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCAGGTG-TCATTG----------------------A----ATTTCCTTAAGT-ATTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCAA---AGG-GCAATA-AC------TCTGTAA----TTA-GCAAGAATAGAGTTATGTTT-------CCT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TTATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-AG-C-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TT---GAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|9 : CTGCACTTCCGC-AAATTG-----C--CTCTT-CC--CGTATCCGCAG-T------CGCATCCTATTCC-TTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAGTA-AAATAACCTT------AAAATA--AAGT----TTAG---AAG-AGGATATATGTTTAATTTGTTA----TTA-TTTAGGATTGAGTTAaag
blockSeqs : G TC T A A A TTG CAT AT G AATTTTT ATA C GC A G G ATAA CA T T A T G N A AATAAGGCATGG A A T C A . . CTA C AT A . A T C T AACAT TTTTTTTTA C G GG T AAATAATGACG CAA AT A A G T TTTACC T T A CC AAATATCAACAAA ATCCA C AT A GCAAAACTAGCCAAAAATA A T GT TTA A T GTTTAATTTGTTATTA AA A ATTTTGC TTT T T T A T ACAG T CTG A T ATA CC C TC GA AA CGA A TATACTA T T TAAGG A T CCAAACTA TACAACAG A CA TC CAT TC AGG GA CAATG T ATA C T CA AT C CA A ATC G G CAGG TT ACTGAA G CACTGGATTTT C A A TC GCAACGNNNNNNNNNNN CGACT T T AACC ACATTG TG TACACAC A T
blockSeqs : . . T . T A . . AA . AA G . . T G AAGC AC A . A T G . N NNNTTT A . . T C G . G AG AA T C G . T CAG . A G . AAGATTCAACAAA TTGAT G TG A GCAAAAATAACCAAAAATT A T A . . . TTAAAAAATGG AG G . T . G G A T TC C . . . GAT TA T TC C . CA G CATAAT . . AT . A . ACAAATG C . TT . T GA . CTAA T . . G . . . . T A . C . C GTGAAT A TTAGACAA C . T . GCAAC GGACA . G . . . . C T
blockSeqs : . A . T . . . TC A G . . A C AACT AT C . A G . G . . A C G . T TA AA A C G . C C . A T . CACTTCCAACTAA TTGA G GG T GTAAAATAACCTTAAAATA A T T . . . TCAAAAAGTAA AA A . . . T . . . CC A . . . GTT TG T TT G . TG T CATGAT . . . . C . . A . T . T TT . AA . . . T . . . . A T . C . T GTGAA G AACTAA C . G . AC N . A . . . . A T
blockSeqs : . T . . A C ATAA CT T . . T . . . A T . . T TT G A C T . A C . A A . GTGATTCAACATA TTAA C TT C ACATACTAAAATA G C T . . . TATGTCATTAT GA T . . . C . . . TC A . . . ATA CT G CC G . AG T CATAAT . . . . A . . . . T . C TT . AA . . . G . . . . C T . G . C ATGAT . GATGAA C . C . GC C . T . . . . A T
blockSeqs : . . A A AAGC AC T . . A . . A C . . . G A A T G . T C . A A . AAGTTTGATGAA TTGA T AA C GCATAATA G C A . . . TAAAAAAATAC G G . . . T . . . AT T . . . ATA TG C TG G . GG C ATA . . . . A . . . . A . T G . GA . . . G . . . . T G . A . C ATGCA . GAATAA A . A . C T . . . . .
blockSeqs : . C GTAA CA A . . A . . A A . A . A G . T A . A A . CAGTCGCATCCT TCAA G GA A AAGGGT G C T . . . TCTGTAATTA G G . . . C . . . CG T . . . ATA CT T TT C . GA T TA . . . . G . . . . T . A T . AA . . . G . . . . C T . A . T ATGAC . GATGAA A . A . . . .
blockSeqs : G AAGC CA A . . A . . . . A . . . C . A A . TGCCC . C GG C AAGTGT . . T . . . TCTGTAATTA G A . . . A . . . CC C . . . ATA CT A AT C . CA A GG . . . . A . . . . T . T G . AA . . . A . . . . T T . A . C TCTAA . GACTGA A . C .
blockSeqs : G TAA AC . . . . . C . . . . CACG . . GA G GGG . . . . . A T . . . T . . . CC A . . . GTT CT T TG C . TT T AA . . . . T . . . . T . T G . AA . . . G . . . . T T . C . T ATGAC . AACAAA T . G .
blockSeqs : T . . . . . . . G . . T . . . CC A . . . GT AT G CC C . TG C AA . . . . T . . . . T . T G . AA . . . T . . . . A A . T . T CCAA . GATGAA C . A .
blockSeqs : . . . . . TC G . . . GC CT T TG C . TT T CA . . . . C . . . . T . T T . A . . . G . . . . T T . C . C ATG . ATTGA A . G
blockSeqs : . . . . AT A . . . GA CA C GA G . GT G AA . . . . A . . . . . . T G . A . . . . . . . . T . . G . . AA . ATTGG C . G
blockSeqs : . . C T . . . GC TT G TC G . TG T CA . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . ATCTG C . C
blockSeqs : . . . . . . . . TG T CC T . GA A TA . . . . T . . . . . . A . . . . . A A .
blockSeqs : . . A C G C . CA T AA . . . .
blockSeqs : . A A T . T T AA . . . .
blockSeqs : . G C . . A . . . . .
blockSeqs : T
blockSeqCons : A** TG********** AA* NAGATCCGACGAA****** TCGA** GCAATAAAAATA**************** TNTGTAATTA*********** G* ATA*
originalCons : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATAGAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATTA----------G-CAAG-AATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG-T-TC-GACGAA----ATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---AAATA----C------AAAANA--AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-AT------TCTGTAA----TTA-GCAAGAGTAGAGTTATGNTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AG-T-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TC---GAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
finalCons : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA--GAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACTCTG--TAATTATG----------CAAGAA-TAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAGATCCGACGAA------ATTCCTCGA--ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAGCAATAAAAATA----------------AAGTACA-TTAA---AGG-GAGATA-ATTNTGTAATTA-----------GCAAGG-TAGAGTTATGNTT-------CTT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-T-GTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-AATA-TCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A--A----AA-A-A-----T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TC-T-GT---AAT-TA--G-CA--AG--AA--TAGAGTTAT-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TC---GAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|29 ): CCTCACCCCTTCTGCTTTCCTTGCTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAACCAAAACTAATGAAAAATAAGAAACAAAAGCATAGGTGTTATTTTGTAATTATTCAA
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1 111 111 3333333 33333 1 1 44444444444444 1 2222 2222 2222222222 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 222222222 22222222 111 11 1 11111111 444444444444444 111111 777777777777777777777777 111 1111111 111 1111111 1 1111 111 1111111111111 11111111 22222222 111111 1111111 11111111111111 33333333333333333333 22222222 1111 111111 1111111
lowQualScore : 3 33 1 0 1 3 777 777 11 6 3333333 55555 1 0 77 6 1 1 8888 44 1 0 5 0 5 1 6 0 1 22222222222222 1 5 1 1 1 3333 3333 7777777777 1 22 5 5 1 1 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 4 0 88888 000000000 2 1 44444444 111 3 11 2 77 1 1 5 0 0 3 22222222 4 3 1 66 1 222222222222222 444444 33 1 333333333333333333333333 66 0 555 666 7 3 55 3 0000000 3 99 000 1 4444444 4 777 4 2 3 8 8888 3 555 2 0 2 6666 55 0 3 999 44 33 333 0 9999999999999 2 2 33 2 1 11111111 11111111 6 55 3 555 1 222222 44 888888 3 3 555 3 2 33 33 2 44 1 555 3 1 6666 66 0000000 33333333333333 0 3 1 66 66666666666666666666 77777777 8 1 7777 999999 99 8888888 8 0 5
lowQualScore : . .. . . . . ... ... .. . ....... ..... . . .. . . . .... .. . . . . . . . . . .............. . . . . . .... .... .......... . .. . . . . .................................................................................................... . . . ..... ......... . . ........ ... . .. . .. . . . . . . ........ . . . .. . ............... ...... .. . ........................ .. . ... ... . . .. . ....... . .. ... . ....... . ... . . . . .... . ... . . . .... .. . . ... .. .. ... . ............. . . .. . . ........ ........ . .. . ... . ...... .. ...... . . ... . . .. .. . .. . ... . . .... .. ....... .............. . . . .. .................... ........ . . .... ...... .. ....... . . .
lowQualScore : 3 88 0 0 0 2 555 555 22 7 5555555 88888 0 2 99 7 0 6 3333 99 0 4 0 2 5 0 5 3 0 00000000000000 0 5 0 0 0 5555 5555 5555555555 0 00 5 5 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 6 33333 444444444 9 0 22222222 777 2 00 0 44 4 4 0 2 9 7 88888888 0 4 0 11 0 111111111111111 777777 22 0 333333333333333333333333 33 5 444 444 3 6 00 6 4444444 6 11 000 0 4444444 4 000 0 7 3 6 6666 8 000 9 9 7 7777 00 9 6 333 88 77 222 8 5555555555555 7 7 77 7 0 22222222 22222222 7 00 3 444 7 888888 22 666666 1 1 444 1 8 99 99 9 22 2 999 1 0 5555 99 1111111 44444444444444 8 1 0 11 77777777777777777777 00000000 0 0 0000 222222 22 6666666 4 1 0
consensus : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATA-GAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACT--------CTG---TAATTA-GCAAGAATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG----AT-CCGACGAAATTCC-TCGA-ATACTTTTGAAGTTATGCTCCGGACAAG---C--AA-------T-A-----AAAATAAAG-TACA-TTA---AAGG-G-AGATA--A-TT-NTGT--AATT-A-GCAAG-G-TAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TGTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-A-GTATCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AA-A-A--T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TCT-GT---AATT--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
Reference ( family-943 ) : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTNACCATTGTATGAAGT-TTNATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAANCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGA--A-GAGTTATGNTTCCTGCACACTG--CACTTCCTGT-CANTGCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTGAANAAATTCCNTTCAGCACTTTNAGAGTTATG-CCCAGGACAAAGNAAATTTAATAAAGGGAGATAACTCTGNAATTANTAAGGN----TAGAGTTATGNTATCCTNTNCANTGCACTTCCTGTCATTATATTNTACCACTGTATGNAGTTTGANNAAATTACCATCNAGCACTTCNAAAGTGATGCCCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCGTTCAGCACTTTTAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------ATAACAAAGGGAGATAACT--------CTG---TAATTATGCAAGAATAGA-GTTATGGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTCTCAATAT-----C--CTCTG-CCATTGTAT--GNAG----AT-CCGACGAAATTCC-TCGA-ATACTTTTGGAGTTATGCTCCGGACAAG---C--AA-------T-A-----AAAATAAAG-TACA-TTA---AAGG-G-AGATA--A-TT-NTGT--AATT-A-GCAAG-G-TAGAGTTATGNTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-A-TGTCC--TCNAT---CA-TTGTGTGA-A-ATATCAACNAAATTCCNTNCAATA-CT--TTTCG-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AA-A-A--T-ANC--------AAA--------GG-GAGATAAT--TCT-GT---AATT--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TNTTC----TA-CCATTGTA-TGAA-GT-TCGAC-GAA----ATTCCCTTCAGT-ACTTTTNGAGTTATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGCGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|1 : AAACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCAAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTAATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTAATGCTCCAGACAAA---AGAAATTCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTAAGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGACAAGGGAAATA-------TATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATA-GAGTTATGTTTCTTGTACACTG--CACTTCCTGT-CATTATATTCTACCATTGTATGAAATTTGATGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTAATG-CTCCGGACAAAGGAAGTATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAA----TAGAGTTATGTT-TCCTGTACACTGCACTTCCTGTCATTATATTGTACCACTGTATGAAGTTTGATGAAATT-CCATCCAGTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAGGGAAATATATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAAATTCCATCCAGTACTTTAAAAGTTATG-CTCCGGACA-----AAGAAAAC--------ATATCAAAGGGCAATAACT--------CTG---TAATTA-GCAAGAATAGA-GTTATGTTTCCTGTA-CACTGCACTTTCTCTCATTAT-----A--TTGTA-CCATTGTAT--GAAG----CT--TGATGAAATTCCATCCG-GTACTTTTCAAGTTATGCTCCGGACAAGAAAA--AA-------T-ATC---AAAGGAAAA-TATA-TTA---AAGG-G-CAATA--A-CT-CTGT--AATT-A-GCAAGAA-TAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATTATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-A-GC-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AA-A-A--T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TCT-GT---AATT--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TCGAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGAC---C----GACCGACAGACCGA-CCTCA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAC
gi|10 : TAAAGGGA-ATGATT-TGAAA--AATAAGGCATGGTAGATTTATGATATCTTTTCTAATG----TCCT----TTAT---CTA----TGTATGCAGTTTGAATAAATTATCA-CAAGCACTTCTAAAGTGATGCCCCGGACAAGta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgAGCACTTCTAAAGTGATG-CCCCGGACA-----AGTCAATT---------TAAtcaatttaa
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttctgaccatgtaaagggaatgatttgaaaaataaggcatggtagatttatgatatcttttctaatgtcctttatctatgtatgcagtttgaataaattatcaca-AGATATGCT--GGACACG---T----A----AA-ATG--T-ATA--------AAA--------GGAGAGATAATCATCTCAT---A-TT------CA--AG--A-----GAGTTC-TTGT---T-ATTTTTACTCC--GC--A-TTTC--CACT---------GTT-----TA-CCATT-TC-C-AA-GTGTC-AT-TGA----ATTCCCTTT-GTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAGA-AATGA--A
gi|11 : tggaAATTCCCTTTGTAACTTTTAGAGTTATGTCTCAG---A-----AATGAATT--------TTCACAAAGttttcacaaagacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : tggaagatatgctggacacgtaaaatgtataaaaggagagataatcatctcatattcaagagagttcttgttatttttactccgcatttccactgtttaccatttccaagtgtcattgT---GTA-CTGTCCACTTCCTGTCTA-TGCTC--TCTAT---CA-CTGAATGC-A-GT-TCAA-AGCATTCACTTCAAAA-CT--TTTCA-AGGTTTGCTCCAAACAAG---G----G----AA-T-A--T-AAT--------AAA--------GG-GGAATAAT--TAT-GT---GA----A-GACAGAAG--AA---AGAGTTA-T-GC---A-TACTGCACACT--GT--A-CTTC--CTCTCA--ATG-TCATC----TA-TCATTGTG-TGAA-ATATCAAC-TAA----AT-CCCTTGAAC-ACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAacacacggatggacgcacaaagcagcaggtatatgctctcccttttggaacataaaaaatgtagatagaacactgcttgataacaaaaaattaaa
gi|12 : AATGTCATCTATCATTGTGTGAAATATCAACTAAATC----CCTTGAACACTTTTTGAGTTATGCTCCGGACAAACATAATAAAATATAACAAGAGacataataaaatataacaagagg
gi|12 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcAAATCCC-TTGAACACTTTTTGAGTTATG-CTCCGGACAAACATAATAAAAT--------ATAACAAGAGGg
gi|13 : tgtactgtccacttcctgtctatgctctctatcactgaatgcagttcaaagcattcacttcaaaacttttcaaggtttgctccaaacaagggaatataataaaggggaataattatgtgaagacagaagaaagagttatgcatactgcacactgtacttcctctcaatgtcatctatcattgtgtgaaatatcaactCAAA---AT---A----AA-A-A--T-ACA--------AAA--------GGCGAGATAGT--TCT-GTCATAATT------CA--AG--A---TAGAGT---T-GT---T-TTTTTCATTCT--GC--A-TTTC--CACACT--TTT-CCTTT----GG-CCATT-TACTGAA-GT-TTCACTGGATTTTATTCCCTCCAGT-ATTTT
gi|15 : agatagagttaccattatttcgctatataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattttctcgggtgtatcaaagataacAGATAAT--TCA-GT---AACT--ATT-CA--AG---A--TATATTTA-T-ATATAT-TCTT-T-CACT--TCATA-CTTCCACCCTCAATCTA-TGTTC----CA-----TGT--------T-TC-AT-TGG----ATTTCCTTTGGT-ATTTTTGTAGTAATGGTCTGGA
gi|16 : aaaaacacaT-GT---AATT--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAT-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATACAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCGGACAAGGA--AAATTG---CAACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N----NNNNNNNNNNNNNN-NCTTA----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAaactaattttgaaggataactcaaagatggacaaatcaccagctaaatgctcgccatccgtggagcacaaaaatgagagcagctgatattgatcagattacatacaaatt
gi|18 : AAGA--AAGAGTTATGCTTCCAGCACACTG--AACtaaa
gi|19 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaaaacagGACA-----AGTATACT--------A----AAAGT--GATAACTTGGGGTAATTGAAATAATGACGCAAAAA-AGT-GTTATAGTAATTAAA-CACTGC-CTTCCCCTTAATAT-----C--CTTTG-TCTTTGTAT--GCA---------CG---------------------TTTATAGTTATGCCCAGGACAAG---
gi|19 : tttctGCACGTTTATAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTTAATT---------TAAttaatttaa
gi|2 : tttctgacaagtatactaaaagtgataacttggggtaattgaaataatgacgcaaaaaagtgttatagtaattaaacactgccttccccttaatatcctttgtctttgtatAACAAAGGGA-ATAATT--------ATG---TAA------AAAAATAG---TTATGGTTCTTGCA-CCCTGTACTTCCTCTCAATGT-----C--CTTTA-TAATTGTGT--GAA-----ATATCAACAAAATCCC-TTGA-ACACTTTTTGAGTTATGTTCAGGACAAG---C---A-------T---------AATAAAA-TATAGTTA---AA-A-G-AGATA--ATTT-AAAA--AATG-G-GCATG-G-TAGAGCCATAATT-------T-TT---GGA-CAATGTATTTCCTGGCAA-TGTCC--TCCAT---CA-GTGTGTGA-A-ATATGAACCAAATCCCTTG-AATA-GT--TCTTG-AGTAATCTTTTTGTCAAGT--ATACTA----AA-A-G--T-GAT--------AAA--------TG-GGGATAAT----T-GA---AAATGAG-G-CA--AG--A--------TTATT-GT---T-CTTTG-AAACT--GC--A-CTTC--TCCTTA--GTG-CACTC----TG-TCTTTGTA-TGCA-GT-TTGAA-TAA----ATTCCATTTAGC-ACTTTTAGAGTTATGCCCAGGACAAGTA--AATTT
gi|2 : acattaaaGCAAGA-------TTATTGTTCTTTGAAACTG--CACTTCTCCT-TAGTGCACTCTGTCTTTGTATGCAGTTTGAATAAATTCCATTTAGCACTTTTAGAGTTATG-CCCAGGAC-AAGTAAATTTAATAAAGGGAGATAACNNNNNNNNNNTT----T----TAGAGTTATGaataaagggagataacnnnnnnnnnnttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|2 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgagTTTTAGAGTTATG-CCCAGGACA-----AGTAAATT---------TAATAAAGGGAGATAACA--------CAA---AAAGTAAGCAAGG-TAGA-GTTATTGTTCTTGTA-CACTGCACTTCCTACCAATAT-----C--ATCTG-TCATTGTTT--GAAG----AT-TCAACAAAATTCC-TTAA-ATAGTTTTGGAGTTATGTTCTGGATAA------------------A-----AGGGTAAA--TATA-ATA---AAGG-G-AGACA--A-TT-CAAA--AAGTAA-GCAAG-G-TAGAGTTATTGTT-------CTTT---GTA-TTCTGCACTTCCTCTCAA-TGTTC--TCAGT---CA-TTGTGTGA-AGAT-TCAATAAAATCCCTTA-AATA-GT--TTTAG-AGTTATGATCCAGACAAA---A----A----AATA-AATT-AAC--------AA------------GAGATcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacacaaaaagtaagcaaggtagagttattgttcttgtacactgcacttcctaccaatatcatctgtcattgtttgaagattcaacaaaattccttaaatagttttggagttatgttctggataaaagggtaaatataataaagggagacaattcaaaaagtaagcaaggtagagttattgttctttgtattctgcacttcctctcaatgttctcagtcattgtgtgaagattcaataaaatcccttaaatagttttagagttatgatccagacaaaaaaataaattaacaagagat
gi|20 : acattaaaaacaaagggaataattatgtaaaaaaatagttatggttcttgcaccctgtacttcctctcaatgtcctttataattgtgtgaaatatcaacaaaatcccttgaacactttttgagttatgttcaggacaagcataataaaatatagttaaaagagataatttaaaaaatgggcatggtagagccataatttttggacaatgtatttcctggcaatgtcctccatcagtgtgtgaaatatgaaccaaatcccttgaatagttcttgagtaatctttttgtcaagtatactaaaagtgataaatggggataattgaaaatgaggcaagattattgttctttgaaactgcacttctccttagtgcactctgtctttgtatgcagtttgaataaattccatttagcacttttagagttatgcccaggacaagtaaatttaataaagggagataacnnnnnnnnnnTATGCAGTTTG-------------CAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGAC-AAGTAAATTTA
gi|20 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAGCACTTTAAGAGTTATG-CTCAGGACA-----AGTAAATT--------
gi|21 : tttatgacaagtatactaaaagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgcagtttgCAAG-G-TAGAGTTATAATT-------A-TT---GTG-CAGTTTACCGCCTCCC-A-TTTACAGCCAATCTGCA-TT---TCA-A-GTTTCAATGAAATT-CGTTCAGTA-GG--TCTGG-AACAATTATC---AAAAG---A----A----AA-G-T--G-AGC---------AA--------GG-GAGATAAta
gi|23 : aagacgtaacaCTTCCTC-C-A-CGTC---TC------CA-TTGTGTGA-A-ATATCAACTTAATCCCCTG-AACA-CT--TTTT--AGTTATGTTCAAGACAAG----------------C-A--T-AAC--------AAA--------
gi|24 : ttttaatgtatgctccaaattataattttgtgaagacagaagagtaacctcgtgTCCATTCAGCACTTTTAGAGTAATG-CCCATGACA-----AATAAATT--------
gi|25 : taactttgatttgtggactagcatactaaaagtaataaatgggataatcaaaaaatgaagcaaggtaaaagatatggttcttagacaa---C---------------GG-CAAGC---C----GACTGACAGACCGATCCGCAAACCAAGCGACACATTGTCTGTAGTATA-------TCCCTGGCAAACCTCGTTTG-CGGGTGTATAAt
gi|26 : aaaaactaaccaac-ATACTGCTGAAGATATATTCTGGACAAC---C--AA----------------AAATAAGG-TATA---A---AAGGAG-AGATG--G-TTCTTGTTCTATC-A---AAG-A-TGGAGTTAtaatgtgggttcagtaaagccc
gi|27 : ctccttttcAAGA--A--AGTTATGGTTCCTGCACTGTG--CACTTCCaatggcacattgcctgctatccttgttcaagt
gi|27 : atattaataaaaggaaaatCTG-C-ACTGT----GCAC----TT-CCAACTAAAACCC-TTGA-ATAGTTTTTTAGTTCTGTTCCGGACAAA---C---A-------T-ACT---AAAATAaactaaaacccttgaatagttttttagttctgttccggacaaacatactaaaatat
gi|28 : atattaataaaaggaaaataagaaagttatggttcA-----ACTAAAGT--------ACAA-AAAGGGAGATAAAA--------CTA---TCATTATATAAGA-TAGA-GTTATGGGTCTTTGG-CCCTACATTTGCACACAATAC-----CAGCTCAGTTCATTGt
gi|29 : acaaaTTCC-TTG-----CTGTTGAAGTTATACTTCGGAAAAC---C--AAAACTAA-TGA-----AAAATAAGA-AACA---A---AAGC-ATAGGTGTTA-TT-TTGT--AATT-A-aa
gi|3 : cctcaccccttctgctAAACTAGAGCTATCACTGAAGGTGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTTACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAAAATTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTTTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGTTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATGTTTTCTttcaa
gi|3 : aatAATAAATGTTATGTTTTCTGTA-CACTGCACTTCCTGTCATTAT-----A--TTCTA-CCATTGTAT--GAAG-----T-TTGATGAAATTCCATCCA-GTACTTTAAAAGTAATGCTCCGGACAAG-----------------G-----GAAATA------TA-TCA---AAGG-G-CAATA--A-CT-CTGT--AATT-A-GCAAG-AATAGAGTTATGTTT-------C-TT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATTATAT--TCTAC---CA-TTGTATGA-A-GC-TTTATGAAATTCCATCCAGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AA-A-A--T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TCT-GT---AATT--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCTTCCAGT-ACTTTTCAAGTGATGCTCCAGACAAGGA--AAATTGCAAC---------------AGACAGAC---CGACTGACCGACAGACCAA-CCACA----TGGCGAC------TC--CAATATA-------CCCCCTC-AAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAAgtacactgcacttcctgtcattatattctaccattgtatgaagtttgatgaaattccatccagtactttaaaagtaatgctccggacaagggaaatatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgaagctttatgaaattccatccagtacttttcaagttatgctccggacaagaaaaaatatcaaagggcaataactctgtaattagcaagaatagagttatgtttcttgtacactgcacttcctctcattatattctaccattgtatgacgtttgatgaaattccttccagtacttttcaagtgatgctccagacaaggaaaattgcaacagacagaccgactgaccgacagaccaaccacatggcgactccaatataccccctcaaacttcgtttgtcgggggtataaaaatat
gi|31 : aataaactagagctatcactgaaggtgatgaatacccccgaacgccgccatgacagaaaatggtttaccattgtatgaagttttattaaattatatccaatagttttaaagttatgctccagacaaaaaaaaaaattaataaaagagaatgttatggattgagttttttgtattgttaatttttttatggttttgttaaaattaaaaacgttctttttaattattgtgcagtgtacaagctttcatggcaatc-TGTCG--TCTAT---AAATTGTGTGA-A-ATATCAACTAAA-TCCTTTGAATA-CT--TTTTT-AGCTATGTTCCAGACAAGCATA----AT---AA-A-A--T-aaatat
gi|32 : T--GT--A-CTCC--CTTTCA--TTG-ACATC----TA---ATTC-----AA-GT-TTGAC-TGA----ACTATCTTCAGT-ACTTATGGAGTTATGCTGTGGACAAGGA--
gi|33 : -TGCCC--TCCAT---AA-TTGTGTGA-A-ATATCAACTTAA-TCCGTTTAACA-CT--TTTTG-AGTTATGTTCCGAACAA
gi|33 : TCCGTTTAACACTTTTTGAGTTATG-TTCCGAAC----------AACC--------ATAACAAccataacaaca
gi|35 : tgccctccataattgtgtgaaatatcaacttaaGTGA-A-ATATCAACTAAAACCCTTAT-ATA-GT--TTTTT-AGGTCTGTTCCGGACAAG---C----ATGATAA-A-A--T-Aca
gi|36 : aaatagttatgTCACTATCATTGTATGCAGGTTCAAAGCCTTTACTTCAAAACTTTCACGGT------CCA-AACAAGGGAAA
gi|37 : acaGACAAG--AAACAAATTTTTTATCAAAGGGCAATAACTCTGTAATTAGCAAGAATA-GAGTTATGTTTat
gi|38 : -A-TGTCC--TAAGT---CA-TTGTGTGA-A-G-ATTAAATAAAGTCGCTTGAATA-GT--TTTGT-AGTAATGCTACGG
gi|39 : --CACTTCCTGT-CATTGCTCTCCATCATTGTATGCAGTTTCAAACTATTCATTTCA
gi|4 : ctggc-CTCAGAACA-----AGTAAATTTTTTTTTTACAAAAATGGGAGTTAACT--------CTG---TCATTATTCAAGA-TAGA-GTTACTGTTATT-TAGCTCTGTACTTC-----AATATTTTACC--CTCTA-CC----CAT--GTG------C-CC-------TTTC------ATATTTTTGAAGCTATGCTCAGGACAAG---C--AAAACTAGCC-A-----AAAATAAAG-TACA---A---AAGGAG-AGATA--A-TT-ATGT--CATT-ATTCAAG-A-TAGAGTTATGGTTATTTTGCC-GT---GTA-CATTGC-CCTCGACCC-A-TGT----TCAAT---GC-TTCT-TG-------------AGATCCCGTCC-ATA-TTAACTTCGAAGATATGCTCAAGACAAG---C----A----AA-A-A--TAACC--------AAAACAAATG-GG-GAGATGAT--ACT-GA---CATT--ATT-CA--AGCTAA--TAAAG------GT---TCTCT----CACTCAGA--A-CTAC--CATACA--TAAGCTTTC----TATTCA-TGTT-CTAA-GTGTCATCTG------ATTCCATTCAGT-TCTCCTAGAGTTACATTTCGGACAAGAATCAAG--A---C---------------GGACAaaa
gi|40 : ATGTAGTTTAAATAAATTCCTTTCAGCACTATTAGAATTAAGTCCCAGAAC-AAGTACATTTcaaggatgcacgaacata
gi|41 : ACTGGCCACTTCCTGC-CAATCCTCTCTATCATTGTATGCAGTTTCAAAGCATTCACTTCA
gi|42 : tTTGTATGCAGGTTGA-TAAATTTCATTCAGCATTTTTAGATTTGTG-CCCAG--CAAAAAAA
gi|43 : ctCAACTAAATCCT-TTGA-ACACTTTTTGAGTTATGTTCCAGACTAG---CATAA-------T-A-----AAA
gi|45 : atatTATA-------TCCTCTCAAA-TTTTGTTTG-CGGGGGTATAAt
gi|47 : TTTGAGTAAATCCCACTCAGCACATTAAGAATTGTG-CCCAAGAC-AAGAAAATTTAaaacttcagatatatctaaacta
gi|48 : TTCAGCACTTTAAGAGTTATT-CCCAGGACAAACACAA-TTAATAACAGAAGATAA
gi|49 : aTTCTTGTACAATGCTCTCTACCATTGTATGCAGTTTTAAAGCATTCACTTC
gi|5 : tGTTATTGTA-CACTACACTTCTTCTTAATGT-----C--TTCAG-TCATTGTAT--GGTG----AT-TCAACATAATGTC-TCAA-ATAGTTCTGGGGTTATGCTTCGGAC--------------------A-----AAAGT---GTTACT-TTAATTAAGG-G-AGATA--A-TT-AAAA--AAAT-ACGCAAA-G-TAGAGTTATGGTT-------C-TT---GTG-TACTTCTCTTTCTCACGA-TGTCC--TCGGT---AA-TTGTGTGGTA-GTTTCAACATAATTCC-TGAAATAGAT--TGT---AGTTAGGCTCTGGACAAG---T----A----AA-T-T--T-GAT--------AAA--------GG-GAGGTACT--TC--GA---AA----A-G-TA--AGC-AATGTAGAGTTA-T-GG---T-TTTTATACACT--GC--ACCTTC--CTTTCA--ATG-TCCTC----TG-TCATTGTG-TGAATAT-TCAAC-AAA----A-TCGCTTGAGT-ACTTTTGTAGTTcaa
gi|50 : GGCGAC------TT--CAATATATACACACCCCTCTC-AAGCTTCATTTGT--GGGGTATAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngcggagaccattaccatatccttcttcgccttcattggggggata
gi|52 : --CACTTCCTGA-CAATACTCTCCATCATTGTGTGCa
gi|53 : tgttatgtc---AATT--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-C
gi|54 : AAAGGTACTTTAAAAGTACTGCACCAGGCAAGGGAA
gi|6 : AACTAGACCTATCACTGTAG-TGATGAATACCCCCGAACGCCGCCATGACAGAAAATG--GTTAACCATTGTATGAAGT-TTTATTAAATTATATCC---AATAGTTTTAAAGTTATGCTCCAGACAAA---AAAAAATCTTAATAAAAGAGAATGTTATGGATTGAGTTGTTTGTATTGTTAATTTTTTTATGGTTTTGTTAAAATTAAAAACGGTCTTTTTAATTATTGTGCAGTGTACAAGCTTTCATGGCAATCAATAAATGTTATACTTTTTCGAGTTATGTTGAGGGACAACAATTTTATGGATAAGAAACAAACAAGAGCACTAGGAATACAATATCGAACCTGCTTTGCTCGAACTCCATGTATTCATCAACTTGGTTCTTTCATGAACTTTATTAAACTGTTATCACTGATGGCTTTAAAAGTACTTTAAAAGTACTGCAGCAGA
gi|7 : GACAAG---C--AAAAATAACC-A-----AAAATTAAG-TACA-AAA---AAGG-A-AGATA--A-T----------------CAAG-G-CAGAGTTACGATT-------C-TTTTTGTATCGC--CACTT----TC-A-GGTTC--CAAAT---CA-C------------A-CAATTGAATTCACTTCCATA-TT--TTTGA-AGATATGCTCCAGAGAAG---A----A----AA-A-A--T-AACCCAAACTAAAATACAACAGGG-GAGATAAT--TCT-GT---CATT--A-T-CT--GA--AA--TAGAGTTA-T-GG---T-TCTTTTGCCCT--AC--A--TTC------------A-TGTTCCAGGTG-TCATTG-------------------A----ATTTCCTTAAGT-ATTTTTGGAGTTAT-TTCCAGGCAAGG-----ATT----C---------------AAACAGAC---T----GGCAGACAAA
gi|8 : agacaagcatttaaataagtatagtcagacttttagcttaaa-TCA---AAGG-G-CAATA--A-CT-CTGT--AATT-A-GCAAG-AATAGAGTTATGTTT-------C-CT---GTA-CACTGCACTTCCTCTC-ATTATAT--TTTAC---CA-TTGTATGA-A-GC-TTGATGAAATTCCATCCGGTA-CT--TTTCA-AGTTATGCTCCGGACAAG---A----A----AA-A-A--T-ATC--------AAA--------GG-GCAATAAC--TCT-GT---AATT--A-G-CA--AG--AA--TAGAGTTA-T-GT---T-TCTTGTACACT--GC--A-CTTC--CTCTCA--TTA-TATTC----TA-CCATTGTA-TGAC-GT-TTGAT-GAA----ATTCCATCCAGT-ACTTTTCAAGTTATGCTCTGGACAAGGA--AAATTG---C---------------GGACAGACGGACA---GACCAACAGACCGA-CCTCC----GGGTGAC------TC--CAGTATA-------CCCCCTCAAAACTTCGTTTGTCGGGGGTATAACgtggcagctatttgctagcccttttgggagcataaacatctggtactgaatccagttaagaaaagaggtaataataggtaacaatt
gi|9 : CTGCACTTCCGC-AAATTG-----C--CTCTT-CC--CGTATCCGCAGTCGCAT-CCT-----ATTCC-TTGATATACTGGTGATGATATACTCGGGACAAG---TAAAA-------T-AACCTTAAAATAAAG-T----TTA---GAAG-A-GGATA--T-AT-GTTT--AATT-aag
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TATCAAATACCCATATCCCTTCAAAAAAATTTTGTAATGTTCAAGACAAGCATAACAAAATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTATGACAAAATTTATATACTAAAAGTGATAAATGGGGATAACTGAGAAATAAGGCAAGGT
Unaligned ( gi|17 ): ACAAAAGGGGAAATAATTTTTCATTATTCAAGATAGAATTATTATTATTTACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGACCCAAAGAAGTTGATATATAAAAATGTTTAGTGCAAAAAGGGAGATAAATATGTCATTATTGAATCTTATGTTTATTTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCACCAATGTACTGCCAATGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGACAGAAGAAAGAAAGAGTTACG
Unaligned ( gi|30 ): CAAAAGTATTACAGACGGACGAACGAACGGATGGACGGACGGACGGAGACTATTACTATACCCCTTTCGCCTGCGGCGGTGAGGATA
Unaligned ( gi|34 ): GAATAGTTCTTGAGTAATTAATCTTTATGACAAGTATAGTAAAAGTGATGAATGGGGATAACTGAAAAATGAGGCAA
Unaligned ( gi|44 ): CACGGATTCAGAAGGACGGACAAAGCAGTAGCTGTAAGCTCGCCCTTCTGGTAAAAAA
Unaligned ( gi|46 ): GGACGCATGACTGGACAGAGACAATTACCTTATTCCCTCTTGCCTTCGGCGGGAGGA
Unaligned ( gi|51 ): AGCTATTGAGTAATCTTTATGACAAGTATACTAAAAGTGATA