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Reference ( gi|1 )            :   GTGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGCTTGAGTTTAT-TCTT----GCTTTATCTT-TAAAAATTGTCTTTGATAAAAAGATTTACCA-TACA---TTATTATTGACTTTTTTT--TTATTTTATTCGG--CAGATAAACG-----GTTATTCATA---------T---GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAAT-T-TGCGTTGATTCATATCACATTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATAATTAAGCTTTAAAAAATAATTTTCGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATGGGATCAAGAAGGCTATAAATATATAGATGTATCTCCTGTGTTTTGTATTAAAAGCGA--TATATAGCTGGGGAATTTTTCCAAAAAAAAAAACATCAGCATGCCAATCAT
gi|4                          :   GCGATATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CG-AAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT--CTT----GCTTTATCTT-AAAAAATTGTCTTTGATAAAA-GATTTACCA-TACAGTATTATTATTGACTTATTTTACTTATTTTATTTGG--CAGATAAACG-----GTTATTCATA---------C---GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAAT-G-TGCGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACCATAATAAAGCTTTAAAAAATAA
gi|8                          : cgGCGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CAGATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACATGCTAAAACTACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-TCTT----GATTTATCTT-AAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTTACCA-TACA---
gi|9                          :   GCGGCACGATTTACCCANNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-CGCAAACAAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-TCTT----GCTTTATCTT-TAAACATTGTCTTTGATAAA
gi|12                         :   GCGGCATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTAC-----AC--------------------------CAAACTAGCTGTAAATATTCTT
gi|7                          :    TGGCACAATTTACCCCA-ATTGAC-CCCATAATACTTAATACTACCCCACACTA----------TCCCCAAAC--AC-ATATTTA-ACTTAATCTAACTTT--TT---TTTGTGTATT----GCTTTGTCTCGTAA----TGCATTTGAT-AAAAGATTTACCATTAAA---TC-TTGTGTATTTTTTCC--CCACTTTTGTCAG--T-GAGAAACA-----GCTATGCA
gi|10                         :     GGCACGATTTACCCA------------ATGCTACCCAATACTACCACATAATA--------------------AACTATAAATACACTTAATATAATTTTATT----TTTAT-TTTTTAAAGCTTTA
gi|6                          :      GCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTAC
gi|5                          :      aCACGATTTACCCAATACT-ACTCA-ATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATAGACTTAATTTAAGTGTGTTTGTATTTAT-TCTT----GCTTTATCTC-AAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTAACCA-TACA---TTATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCGG--CAGATAAATG-----GTTATTCATA---------C---GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAAT-A-TACGTTGATCCAtgcaaactagctataaatacacttaatttaagtattttgtgtttatttttgctttatctcaataaattgtcattgataaaagatttactatacaatcttattgacttattttaattggtgcagattaacagatatgcataacaaatttataaagaaatacttaccagtgataatcacacggaaacaat
gi|2                          :       cACGGTTTACCCAATACT-AC-CACATA
gi|2                          :                                    TACCCAATACTACCACATAATA----------T-CACAAACTATCTATAAATACAATTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-TCTT----GCTTTATCTT-AAAAAATTGTCTATGGT-----------------------TATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCGG--CATATAAACG-----GTTATTCATA---------C---GAAATATTTATCGGTGATAATCATTCAATGTGTGCGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATATTAAAGCTTTAAAAAATAATTTTTGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATTGGATTAAGAAAGCTACAAATATATAAATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCGA--TATAC--CCGGGGAATTTTTTTAAAAAAAAatatcacaaactatctataaatacaattaatttaagtgtgtttgtgtttattcttgctttatcttaaaaaattgtctatggttattattgactttttttacttattttattcggcatataaacggttattcatacgaaatatttatcggtgataatcattcaatgtgtgcgttgatccatatctcactacatttgtgttccaaagtaacgatattaaagctttaaaaaataatttttgcatgaatagtataaataagaattggattaagaaagctacaaatatataaatgtatctcctgtattttgtattaaaagcgatatacccggggaatttttttaaaaaaaa
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-904 )      :                                                                                                                                                                                    GCGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGATAAAAAGATTTACCA-TACA---TTATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTANTCGG--CAGATAAACG-----GTTATNCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATNTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACNATAATAAAGCTTTAAAAAATAATTTTTGCATGAATTTTTATAGTTTATTTAAATAAGGATNGGNTTAAGGAGGCTACAAATATATAGATGTATCGCCTGTATTTTGTATTAAAAGCGATGTATACACCCGGGGAATTTTTTTAAAAAAAACAACA-CGGCA--CCAACCAT
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     TACCCAATACTACCACATAATA----------T-CACAAACTATCTATAAATACAATTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTATGGT-----------------------TATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCGG--CATATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATATTTATCGGTGATAATCATTCAATGTGTGCGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATATTAAAGCTTTAAAAAATAATTTTTGCATGA------ATAG--TA--TAAATAAGAATTGGATTAAGAAAGCTACAAATATATAAATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCG----ATATACCCGGGGAATTTTTTTAAAAAAAAatatcacaaactatctataaatacaattaatttaagtgtgtttgtgtttattcttgctttatcttaaaaaattgtctatggttattattgactttttttacttattttattcggcatataaacggttattcatacgaaatatttatcggtgataatcattcaatgtgtgcgttgatccatatctcactacatttgtgttccaaagtaacgatattaaagctttaaaaaataatttttgcatgaatagtataaataagaattggattaagaaagctacaaatatataaatgtatctcctgtattttgtattaaaagcgatatacccggggaatttttttaaaaaaaa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acaagAAAAATAATTT----ATGAATTTTTATAATTTATTTAAATAAGGATGGGTTTAAAGAGGCTACAA----ATAGATATATTGCCTATATTTTGTATTAAAAACGATGTATATACCTGGGG-----------AAAAAACAACA-CGGCA--CCAACCATtataattgaaatataaaaataatttatgaatttttataatttatttaaataaggatgggtttaaagaggctacaaatagatatattgcctatattttgtattaaaaacgatgtatatacctggggaaaaaacaacacggcaccaaccatg
gi|4                          : acaagtaatttaaatatttttgtgtttattcttgctttatctcaaataatggtctttgataaaagatttaccatacattcttattgacttattttacttatattaattggcacagataaacatcaccattatgcataagaaatacttatcagtgataatcacacatataattgaaatatGCGATATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CG-AAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-CTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTTTGATAAAA-GATTTACCA-TACAGTATTATTATTGACTTATTTTACTTATTTTATTTGG--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACCATAATAAAGCTTTAAAAAATAAg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                      cgCACGATTTACCCAATACT-ACTCA-ATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATAGACTTAATTTAAGTGTGTTTGTATTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTAACCA-TACA---TTATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCGG--CAGATAAATG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATATA--CGTTGATCCA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                      cGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTAC
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gi|7                          :                                                                                                                                                                             agcacgattGGCACAATTTACCCCA-ATTGAC-CCCATAATACTTAATACTACCCCACACTA----------TCCCCAAAC--AC-ATATTTA-ACTTAATCTAACT-TTTTTTTGTGTA---TT----GCTTTGTCTCGTAA---TGCATTTGAT-AAAAGATTTACCATTAAA---TC-TTGTGTA--TTTTTTCCCCACTTTTGTCAG--T-GAGAAACA-----GCTATGCAacggaaacaat
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                    GCGGCACGATTTACCCANNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-CGCAAACAAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTTTAAACATTGTCTTTGATAAA
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Reference ( family-904 )      :                                                                                                                                                                                    GCGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGATAAAAAGATTTACCA-TACA---TTATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCG-G--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATAATAAAGCTTTAAAAAATAATTTTCGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATGGGATTAAGAAGGCTACAAATATATAGATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCGA--TATATACCCGGGGAATTTTTCCAAAAAAAANAACATCGGCATGCCAACCAT
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                    GCGGCATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTAC-----AC--------------------------CAAACTAGCTGTAAATATTCTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                         ACGGTTTACCCAATACT-AC-CACATA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     TACCCAATACTACCACATAATA----------T-CACAAACTATCTATAAATACAATTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTATGGT-----------------------TATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCG-G--CATATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATATTTATCGGTGATAATCATTCAATGTGTGCGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATATTAAAGCTTTAAAAAATAATTTTTGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATTGGATTAAGAAAGCTACAAATATATAAATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCG----ATATACCCGGGGAATTTTTTTAAAAAAAAatatcacaaactatctataaatacaattaatttaagtgtgtttgtgtttattcttgctttatcttaaaaaattgtctatggttattattgactttttttacttattttattcggcatataaacggttattcatacgaaatatttatcggtgataatcattcaatgtgtgcgttgatccatatctcactacatttgtgttccaaagtaacgatattaaagctttaaaaaataatttttgcatgaatagtataaataagaattggattaagaaagctacaaatatataaatgtatctcctgtattttgtattaaaagcgatatacccggggaatttttttaaaaaaaa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acaagAAAAATAATTT----ATGAATTTTTATAATTTATTTAAATAAGGATGGGTTTAAAGAGGCTACAAATA----GATATATTGCCTATATTTTGTATTAAAAACGATGTATATACCTGGGG-----------AAAAAACAACA-CGGCA--CCAACCATtataattgaaatataaaaataatttatgaatttttataatttatttaaataaggatgggtttaaagaggctacaaatagatatattgcctatattttgtattaaaaacgatgtatatacctggggaaaaaacaacacggcaccaaccatg
gi|4                          : acaagtaatttaaatatttttgtgtttattcttgctttatctcaaataatggtctttgataaaagatttaccatacattcttattgacttattttacttatattaattggcacagataaacatcaccattatgcataagaaatacttatcagtgataatcacacatataattgaaatatGCGATATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CG-AAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-CTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTTTGATAAAA-GATTTACCA-TACAGTATTATTATTGACTTATTTTACTTATTTTATTTG-G--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACCATAATAAAGCTTTAAAAAATAAg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                      cgCACGATTTACCCAATACT-ACTCA-ATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATAGACTTAATTTAAGTGTGTTTGTATTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTAACCA-TACA---TTATTATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCG-G--CAGATAAATG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATATA--CGTTGATCCA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                      cGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                    aTACCCAATACTACCACATACTA----------C-TGCAAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTAT-TTTGTGTTTATTTTT----GCTTTATCTCAATAAATTGTCATTGATAAAA-GATTTACTA-TACA---ATCTTATTGACTTATTTTA--------ATTGGTG--CAGATTAACA-----GATATGCATAACAAATTTATAAAGAAATACTTACCAGTGATAATCACtgcaaactagctataaatacacttaatttaagtattttgtgtttatttttgctttatctcaataaattgtcattgataaaagatttactatacaatcttattgacttattttaattggtgcagattaacagatatgcataacaaatttataaagaaatacttaccagtgataatcacacggaaacaat
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Reference ( family-904 )      :                                                                                                                                                                                    GCGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGATAAAAAGATTTACCAT---ACA---TTAT-TATTGACTTNTTTTACTTATTTTATTCG-G--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATAATAAAGCTTTAAAAAATAATTTTCGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATGGGATTAAGAAGGCTACAAATATATAGATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCGA--TATATACCCGGGGAATTTTTCCAAAAAAAANAACATCGGCATGCCAACCAT
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     TACCCAATACTACCACATAATA----------T-CACAAACTATCTATAAATACAATTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTATGGT-------------------------TAT-TATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCG-G--CATATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATATTTATCGGTGATAATCATTCAATGTGTGCGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATATTAAAGCTTTAAAAAATAATTTTTGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATTGGATTAAGAAAGCTACAAATATATAAATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCG----ATATACCCGGGGAATTTTTTTAAAAAAAAatatcacaaactatctataaatacaattaatttaagtgtgtttgtgtttattcttgctttatcttaaaaaattgtctatggttattattgactttttttacttattttattcggcatataaacggttattcatacgaaatatttatcggtgataatcattcaatgtgtgcgttgatccatatctcactacatttgtgttccaaagtaacgatattaaagctttaaaaaataatttttgcatgaatagtataaataagaattggattaagaaagctacaaatatataaatgtatctcctgtattttgtattaaaagcgatatacccggggaatttttttaaaaaaaa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acaagAAAAATAATTT----ATGAATTTTTATAATTTATTTAAATAAGGATGGGTTTAAAGAGGCTACAAATA----GATATATTGCCTATATTTTGTATTAAAAACGATGTATATACCTGGGG-----------AAAAAACAACA-CGGCA--CCAACCATtataattgaaatataaaaataatttatgaatttttataatttatttaaataaggatgggtttaaagaggctacaaatagatatattgcctatattttgtattaaaaacgatgtatatacctggggaaaaaacaacacggcaccaaccatg
gi|4                          : acaagtaatttaaatatttttgtgtttattcttgctttatctcaaataatggtctttgataaaagatttaccatacattcttattgacttattttacttatattaattggcacagataaacatcaccattatgcataagaaatacttatcagtgataatcacacatataattgaaatatGCGATATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CG-AAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-CTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTTTGATAAAA-GATTTACCAT---ACAGTATTAT-TATTGACTTATTTTACTTATTTTATTTG-G--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACCATAATAAAGCTTTAAAAAATAAg
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                     TACCCAATACTACCACATAATA----------T-CACAAACTATCTATAAATACAATTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTATGGT-------------------------TAT-TATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCG-G--CATATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATATTTATCGGTGATAATCATTCAATGTGTGCGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATATTAAAGCTTTAAAAAATAATTTTTGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATTGGATTAAGAAAGCTACAAATATATAAATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCG----ATATACCCGGGGAATTTTTTTAAAAAAAAatatcacaaactatctataaatacaattaatttaagtgtgtttgtgtttattcttgctttatcttaaaaaattgtctatggttattattgactttttttacttattttattcggcatataaacggttattcatacgaaatatttatcggtgataatcattcaatgtgtgcgttgatccatatctcactacatttgtgttccaaagtaacgatattaaagctttaaaaaataatttttgcatgaatagtataaataagaattggattaagaaagctacaaatatataaatgtatctcctgtattttgtattaaaagcgatatacccggggaatttttttaaaaaaaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        acggttTAATTTAAATATTTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTCAAATAATGGTCTTTGAT-AAAAGATTTACCAT---ACA---TTCT-TATTGACTTATTTTACTTATATTAATTG-GCACAGATAAACATCACCATTATGCATA-A-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACACA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acaagAAAAATAATTT----ATGAATTTTTATAATTTATTTAAATAAGGATGGGTTTAAAGAGGCTACAAATA----GATATATTGCCTATATTTTGTATTAAAAACGATGTATATACCTGGGG-----------AAAAAACAACA-CGGCA--CCAACCATtataattgaaatataaaaataatttatgaatttttataatttatttaaataaggatgggtttaaagaggctacaaatagatatattgcctatattttgtattaaaaacgatgtatatacctggggaaaaaacaacacggcaccaaccatg
gi|4                          : acaagtaatttaaatatttttgtgtttattcttgctttatctcaaataatggtctttgataaaagatttaccatacattcttattgacttattttacttatattaattggcacagataaacatcaccattatgcataagaaatacttatcagtgataatcacacatataattgaaatatGCGATATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CG-AAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-CTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTTTGATAAAA-GATTTACCAT---ACAGTATTAT-TATTGACTTATTTTACTTATTTTATTTG-G--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACCATAATAAAGCTTTAAAAAATAAg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                      cgCACGATTTACCCAATACT-ACTCA-ATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATAGACTTAATTTAAGTGTGTTTGTATTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTAACCAT---ACA---TTAT-TATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCG-G--CAGATAAATG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATATA--CGTTGATCCA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                      cGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTAC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                    aTACCCAATACTACCACATACTA----------C-TGCAAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTAT-TTTGTGTTTATTTTT----GCTTTATCTCAATAAATTGTCATTGATAAAA-GATTTACTAT---ACA---ATCT-TATTGACTTATTTTA--------ATTGGTG--CAGATTAACA-----GATATGCATAACAAATTTATAAAGAAATACTTACCAGTGATAATCACtgcaaactagctataaatacacttaatttaagtattttgtgtttatttttgctttatctcaataaattgtcattgataaaagatttactatacaatcttattgacttattttaattggtgcagattaacagatatgcataacaaatttataaagaaatacttaccagtgataatcacacggaaacaat
gi|7                          :                                                                                                                                                                             agcacgattGGCACAATTTACCCCA-ATTGAC-CCCATAATACTTAATACTACCCCACACTA----------TCCCCAAAC--AC-ATATTTA-ACTTAATCTAACT-TTTTTTTGTGTA---TT----GCTTTGTCTCGTAA---TGCATTTGAT-AAAAGATTTACCATTAAATC---TTGTGTATT------TTTTCCCCACTTTTGTCA-G--T-GAGAAACA-----GCTATGCAacggaaacaat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                   tGCGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CAGATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACATGCTAAAACTACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GATTTATCTTAAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTTACCAT---ACA---
gi|9                          :                                                                                                                                                                                    GCGGCACGATTTACCCANNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-CGCAAACAAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTTTAAACATTGTCTTTGATAAA


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Reference ( family-904 )      :                                                                                                                                                                                    GCGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGATAAAAAGATTTACCAT---ACA---TTAT-TATTGACTTNTTTTACTTATTTTATTCG-G--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACGATAATAAAGCTTTAAAAAATAATTTTCGCATGAAT------AGT--AT--AAATAAGAATGGGATTAAGAAGGCTACAAATATATAGATGTATCTCCTGTATTTTGTATTAAAAGCGA--TATATACCCGGGGAATTTTTCCAAAAAAAANAACATCGGCATGCCAACCAT
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gi|4                          : acaagtaatttaaatatttttgtgtttattcttgctttatctcaaataatggtctttgataaaagatttaccatacattcttattgacttattttacttatattaattggcacagataaacatcaccattatgcataagaaatacttatcagtgataatcacacatataattgaaatatGCGATATGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CG-AAACTAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTAT-CTT----GCTTTATCTTAAAAAATTGTCTTTGATAAAA-GATTTACCAT---ACAGTATTAT-TATTGACTTATTTTACTTATTTTATTTG-G--CAGATAAACG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATGTG--CGTTGATCCATATCTCACTACATTTGTGTTCCAAAGTAACCATAATAAAGCTTTAAAAAATAAg
gi|5                          :                                                                                                                                                                                      cgCACGATTTACCCAATACT-ACTCA-ATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACTAGCTATAAATAGACTTAATTTAAGTGTGTTTGTATTTATTCTT----GCTTTATCTCAAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTAACCAT---ACA---TTAT-TATTGACTTTTTTTACTTATTTTATTCG-G--CAGATAAATG-----GTTATTCATA-C-----------GAAATACTTATCAGTGATAATCACTCAATATA--CGTTGATCCA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                      cGCACGATTTACCCAATACT-AC-CACATACTAC
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                   tGCGGCACGATTTACCCAATACT-AC-CAGATACTACCCAATACTACCACATACTA----------T-CGCAAACATGCTAAAACTACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GATTTATCTTAAAAAATTGTCTTTGAT-AAAAGATTTACCAT---ACA---
gi|9                          :                                                                                                                                                                                    GCGGCACGATTTACCCANNNNN-NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-CGCAAACAAGCTATAAATACACTTAATTTAAGTGTGTTTGTGTTTATTCTT----GCTTTATCTTTAAACATTGTCTTTGATAAA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TTGAAAAATACGGCCGCATTTTCCTTTCTATCAAATGTCATGATACTTTTTTGGACAACTTTCTGACATTTTTAAGTATATTAA
Unaligned ( gi|13 ): ATCTAAAAATCGGTTTTGCTTAGAATCTGGGATCAAGTATTCATCATTTTATCA
Unaligned ( gi|14 ): ATATGGAAAATTAACTGATGTATTTATTTTTTGTATTTGCTATATTTATAAT
Unaligned ( gi|15 ): TATATATATATATCGGGAAATTGATGTTTAATCTTGATTTGT
Unaligned ( gi|16 ): TTTGCTTCTTATATATAATATGATAAAGAAT