lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 77777777777777777777777777777777777777 4 22 333 22 333333333 22222222 1 4444444444444444444 3333333333333333333333 2222222222 11111111111111111111111111 111111 1111111111 2222222 11111 222222222222222222222222222222222222222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333 1111111 222222
lowQualScore : 44444444444444444444444444444444444444 0 77 4 1 6 000 5 2 77 8888 2 8888 666666666 44 7777 33333333 0 33 2 4 7777777777777777777 99 1 222 2222222222222222222222 444 22 222 22 6666666666 44 333 99999999999999999999999999 1 1 444444 3333 1 33 7777777777 1 1 0000000 222 7 222 44444 1 11 44444444 22 1 4444 11 1 1 2 1 777777777777777777777777777777777777777777 3 1 7 22 1 3333 4 555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333 1 1 666 44444 4 1 1 3 666 22 55555555 6666 999999999 22 555555 22 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 22222 2 33 11 1111111 44 6 9 333333 66
lowQualScore : ...................................... . .. . . . ... . . .. .... . .... ......... .. .... ........ . .. . . ................... .. . ... ...................... ... .. ... .. .......... .. ... .......................... . . ...... .... . .. .......... . . ....... ... . ... ..... . .. ........ .. . .... .. . . . . .......................................... . . . .. . .... . ... ........................................................................................................... .... . . ... ..... . . . . ... .. ........ .... ......... .. ...... .. .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ..... . .. .. ....... .. . . ...... ..
lowQualScore : 00000000000000000000000000000000000000 0 55 0 0 7 666 0 0 88 5555 7 5555 444444444 22 4444 33333333 9 44 4 3 8888888888888888888 44 9 999 5555555555555555555555 666 33 555 33 8888888888 44 666 44444444444444444444444444 7 7 999999 8888 6 88 0000000000 6 6 0000000 888 4 777 11111 0 99 00000000 00 4 3333 99 4 4 8 4 888888888888888888888888888888888888888888 3 4 1 00 2 3333 8 999 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4444 6 6 111 55555 1 7 7 2 444 33 44444444 1111 555555555 55 222222 55 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 99999 9 99 55 2222222 22 0 0 999999 99
consensus : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCANACACGTGTAANTATACT-AAGNAAAATAT----GTTNA----GCAA-NNCT-G--TTC--ATATNAATAT-GT-----TTACAATA--TAAA-TACAT----T--A--CAT---T-ACAAAATT-AATCT-CAT--GT-N---T------TTT-----GTA---TATT--TGC--C--AATAC-CTA--GGGAATCATT--T-CAA-----N---T--TNTG-GTTTCA-NTT-T-TTG-----C---ATTCT-C--A-----C--G-C-T-AAACA-G-TT-AT---TGCCCCT---TT--N--TGTAA--AACAG-----C--GT--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-ANTT-G-------TT----GT---TGTT----AAAAAATA-T-TTCTTT-CANA--TTGCATGAC----TGCA--GAGAAC-----TTT-----T-GC----------NAG--GA----A-ATAAA----A---G--GCCGCC---A-G-N---A--TG--T--N------T-C-C--GN-----A----A-A-TG--CATCAC----AGTTC-ATGCA-TTAGG-T-ATCT--GAAGT----TCGCAT----GTC---GG----T--AAA------T--T------A----CC-----------T------------A-N-AT--T-A------A--AA------C--A------TGT----TT-TG---A---G-TCGC-ATNA---NN------A-TCG-----GAA-T---TNA--------ACTCGTTTT--T---ATT-G---NTTT--T--TT---TANT--C---------A-A-NT-C-CGTT--TG-----T-TG-C------------G------------A-----------T----TTT--A-----A-GT--AA---T-GAC-ATTCG-TGAT-TT----ACATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-T---------G-----GA----TTGAATGTCCCGTA----T-G--TAATTTTACA----TG-T--ATTTTTGTTGCTAAAC----TTAT--TTTA
Reference ( gi|1 ) : AAACAAAATTTCCAACCATTAAAAATGGTGTACTGTGTATAAAAACTATATATATT--ATATATGTGTAAGCATACT-AGGTCAAATAT----GTTTA----GCAA-CACT-G--TTC--ATATTAATAT-GT-----TTACATTA--TAAA-TACATG---T--A--CAT---T-ACAAAATC-AATCT-CAT--AT-T---T------TTT-----ATA---TATT--TGC--C--AATAC-CTA--AGGAATCATT--T-TAA-----T---T--TTTG-ATTTCA-ATT-T-TTA-----C---ATTCT-C--A-----C--T-C-T-AAACA-G-TC-CT---TGCTCCT---TT--T--TGTAA--AACAG-----T--GT--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-ACTT-G-------TT----GT---TGTT----AAAAAATA-T-TTTTTT-CATA--TTGTATGAC----TGTA--AAGTAC-----ATT-----A-GC----------AAG--GA----A-ATAAA----A---G--GTTACC---A-G-T---A--TG--C--A------T-C-T--GT-----A----A-A-TA--CATCAC----AATTC-ATGCA-TTAGG-C-ATCT--GAAGT----TTGCAT----GTC---AA----T--AAA------T--T------A----CC-----------T------------A-A-AT--T-A------A--AA------C--A------TGT----TT-TG---A---G-TTGC-ATTA---CA------A-TCA-----GAA-T---TTA--------ACTCATTTT--T---ATT-G---TTTT--T--TT---TATT--C---------A-A-AT-C-TGTT--TG-----T-TG-C------------G------------A-----------T----TTT--A-----A-GT--AA---T-TAC-ATTCA-TAAT-TT----ACATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-T---------G-----GA----TTGAATGTCCCGT-----T-G--TAGTTTTACA----TA-T--ATTTTTGTTGCTGAAT----ATAT--TTTA
gi|3 : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCAAACATGAGAAAA---ACT-AAGAAAAAAAA----GTTAA----GCGG-GACT-G--TTCTGATATGAATATCG--------ACAACA--TAGA-TA-ATT---T--C--CAA---T-A---AATT-AATCT-CAT--AT-A---C------TTT------TA---TATT--TTT--C--AATAT-CTA--A-AAATCATA--T-GGA---------T--TATG-GTTTCA-TAT-T-CTG-----G---ATTTT-CG-A-----CTAT-T-T-ATCCA----C-TT---TTATCCG---TT--TA-TATAA--AACAC-----T--G---TT-T----GAAT-GAGAT-ACA-AC-T-G-------TT----TA---TGTT----TAAG-------TTATAC-CAAA--TT-CATGGC----TGCA--GAG-AA-----ATT-----GTGC----------CAG--AA----A-ATACA----A---G--GTCACA---A-T-TA--A--TG--T--T------T-C-A--GA-----A----A-A-AG--CATCCT----TACTC-ATTCA-TTGGG-T-ATCC--GAAGT----TCGTAT----ATC---TG----T--CAA------T--A------A----CC-----------T----------------------------------------C--C------TGT----TT------A---A-TTG--A-------A------A-TAA-----GAATT---TTA--------A---ATTTTAATAAAATT-G---TTAT--TGATT---TAT-------------A-A-AT-TATGTTTGTG-----T-TGCC------------G------------A-----------C----TCT--A-----A-TT--CAGTTT-TA--AGCTA-TGCT-TT----ACATGCCTAG--------C---------T----------A-----------G-
gi|43 : ttccctatcaggaatacttcctgtttgaagtgtcttgattgaagtactatatcaatataTT--ATATACATGTA--TATACT-AAGTAAAATGT----GTTAT----GCAAGTACT----TTT--ATATAAATAT-GT-----TTGCAATA--TAAA-TACAT----T--A--CA--------AAGAT--AATCT-CAC--GT-A---T------TTT-----G-G---TATT--TGC--C--AATAG-ATA--AGGCATCATT--T-TTA-----T---gt
gi|13 : attaataattatcaccagACATGT-TAATAATATT-AAG---AA-AC----GTTTT----GCGA-TTCT-T--TTC--ATATTAACAT--T-----TTATAATA--TTAA-TACA-----------------------------ATAT-CAT--GT-A---T------TTG-----GTA---G--T--TGG--C--AATAT-CCA--GGAAATCATA--T-TAAATTAGT---C--TTTGTATTT---ATT-TATTT-----T---ATTTT-C--A-----T--G-T-C-AAACA-A-TT-AC---TA-TCCT---TTAAT--T-CAA--AACAG-----T--TG--TT-T----G--C-GAGAT-A----CTT-T-------TT----TTAAATGTT----TAAAGAT-------TTG-CATT--TT-----------TGCA--GAGAAC-----AAT-----A-AC----------AA-------------AAA----A---G--ACCGCA---A-A-T---AACTT--T--A------C-C-----------A----A-A-AAG-CATCAC----AATTC-ATGCA-TCAGG-T-ATTC--GAAGT----TCGTAT----TTA---AG----T--AAA------T---------------------------T------------A-A-AT--T-A------A--AA------T--AAT----TAT----TT-TG---A-----TTG--ATTa
gi|59 : ataagGTATACC-AAGTAAAATGT----GTTGA----GCAAGTATT----TTT--ACATGAAAAT-GT-----TTACACTA--TAAA-TACAT----T--A--CAtgtaagacattatgtgtattgtctatacat
gi|4 : tatacttactgATACT-AATTGAAATAT----GCTAA----GCAA-C--C-GATTTC--ATATGCATGT-TC-----TTGCAATAGATAAC-TACAT----T--A--CA------ACAAAACT-AATCT-CAT--TT-G---T------TTT-----GAA----AGT--TGC--C--AGTA-----------ATTATT--T-CAA-----T---T--TTTTTATATCA-ATT-T-TTT-----C---ATTCT-C--A-----C--T-CAT-AAGCG-GATT-C-----GCCCCT---TT--A--TGTAA--AACAG-----C--AT--TA-T----G--T-GAGAC-A-A-AGTT-T-------TT----AT---TATT------AAAATG-T-TTTT----GTA--TTTTATGAC----TGTA--CAGAAC-----TTT-----T-GC----------AAG--AA----A-ATAAA----A---G--GCTA-C---A-A-T---A--AA--T--A------T-C-TCAGG-----A----A-A-TT--CATCCC----AGTTA-ATGCA-TTAGG-T-AACT--GAATT----CAACAT----ATT---AG----T--AAA------T--T------A----CT-----------TCTCTTTTTATC-A-ATAT--T-A------A--AA------C--A------TAT----TTGCA---A---G-TCGT-ATGA---AA------ACTCC-----AAA-T---TCT--------ATTCA-TGT--T---ATT-G----ATG--T--TT---TAAT--G---------A-A-TT-C-TGTT--TG-----T-TG-CTGACTTTAATTTA------------A-----------T----TTT--A-----A-GC--AA---T-GAC-ATTCA-TGCT---------AGG--TAT--------C---------C----------ATT---------G-G---------G-----GA----TTGAAAGTCCCGTA----T-G--TAATTTAACA----AG-T--AGTTTTATTGCTAAAC----TTAT--TTTA
gi|23 : ATACT-GAGGAAAATAT----GTTTA----GCAA-GTCT-G--ATC--A-----------------------TA--TCAA-TA--TG---T-------T---TCACAAAACT-AATCTTCAT--GG-C------------------ATG---TATT-------------------------A-CATT--T-T-------T---T--TTTA-ATCT----TTAT-TTA-----C---ATTCT-C--G-----C--T-C-T-AAACA-A-TC-AT---TGTCCCT---TT--A--TTTAA--ATCAA-----T--GT--TTAT----T--T-TAGAC-A-A-ATTT-GAGATTTATT----GT---TGTT----ATAA--TA-T-TTCTTT-TATA--TTGTATGAC----TGCA--GGGAAC-----TTT-----T-GA----------AAA--GC----A-ATAGA----A---T--GTC-------------------------------T-C-T--GT-----A----A-A-TATACATCGA----AGTTC-AAGCA-TTATG-T-ATCT--GAAGT----TGCCAT----GTC---AG----T--ATA------T--T------tt
gi|48 : tATACTGAGAAAAAATAT----GTTTA----GCAA-TTCT-A--A-C--ATATGAAATT-GT-----TTATAATA--TAAA-TACAT----------------T-AAAAAATT-AATAA-CAT--GT----------------------A---T-TT--TGC--C--AATAC-TTA--GGGAATCATTTCT-TCA-----T---T--TTT
gi|58 : gtaatatTACT-GGG-AAAATAT----GTTCA----GCAA-GTCTTG--TCC---------TGT-AT-----TTACAATA--GGAA-TACA-------------T---T-ACAAAATT-AATTC-CAT--GT-A---T------TTT-----
gi|28 : atgAAATAA----GTTTATCTAGCAA-AA------TAC--ATGTTAACAT-TT-----TCACAATA--TGAA-TAAAT----T--A--C-T---T-A----ATC-AATCT-CAT--ATAT---T------TTT-----G-A---TATT--TGT--C--AGTAC-CTA--GGGAATCTTT--TCTAA---------T--TATG-GTTTCA-ATT-A-TTG-----C---CTTTT-T--A-----T--G-T-T-AAAC------------CACACC--------T--TGTGA--AATAA-----A--AT--TC-T---------------------TT-G-------TT----GT---TGT-------AAGATA-T-CTTTGG-AAT---TAGCATGAC----TGCA--GGGAAC-----TTT-----T-TC----------CAG--GA----A-A-GAA----A---G--ATCAC
gi|35 : aaagAAATATATAGGTTTA----GGAT-AGCT-T--TTC--ATGTGAATAT-TA-----TTACAATA--TAAA-TACAT----------------T-CCACAATT-AATCT-AAC--GT-A---T------TTT-----A-A---TA---------C--AATTT-ATA--AGGA--CAC-------------------------ATTTCA-A-----------------ATTC--C--A-----G--C-C-T-AAACC-A-TT-ATAACTGATCCT---TT--T---GTAA--AACAG-----A--GT--TT-A----G--T-GAGAT-A-C-A-TT-G-------TT----TT---TATT------AAAATA-T-TCTTTT-CAAA--TTaaagaatatttctaaa
gi|17 : --TTC--ATATAAATAT-AT-----TT---TTA--CAA--TAAAGA---T--A--AAT---T-TCAGAATT-AATCT-CGT--GC-A---T------TTT-----G-A---TATT--TGC--C--AATAC-CTA--GGAAATAATT--T-CAA-----------------ATT--A-AGC-T-TC------C---ATTCT-CCAG-----C--TGT-T-AAACA-G-TT-AT---TGCTCAT---TT--A--TGTAA--AA-AT-----T--GT--TT-T----G--C-AAGAT-G-A-AATC-A-------TT-----T---T-TTAAAAAAAAAAAA-A-TCCTTT-CAAACTCTGCATTAC----TGCA--GAGAAC-----TTT-----T-GC----------CGA--GA----T-ATTAA----A---G--GTTAAC---A-G-----A--T-----------------T--GTTAATGA----A-A-TG--CGACAA----AGTGC-ATGTA---AGG-CTGTGT--ACAGT----TTG-------GTT---AAACGTT--GAA------T--T-----------CT-----------T------------A-A-AT--
gi|9 : ataaatttcaagagaaataagtc--TTT--AAATTA-CAT-GTGATTGTTACAATA--TAAA-TAGA------------AT-----ACAAAGT--AATGT-AAT--GT-T---T------T-------ATA---TATT--TGCTTC--ATTTT-C------GAATTATT--T-TCA-----T---T--TTTG------------T-TTG-----C---ATTTT-C--A-----T--G-T-T-AAACA-G-CT-GT---TGTAAGG---TT--A--TGTTA--AATAG-----T--GT--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-GCTTCT-------TT----AT---CATT----AAAAAG-G-T-TCCTTT-TAAA--TTACATGAA----TACA--AAAAAG-----TTT-----T-GCTAATAAATAAAAC--AA----A-ATACA----A---G--CTTA-A---A-G-T---A--TG--T--T------G-T-T--GA-----A----A-G-CA--CACCAC----AGTTC-GTTTA-TTAGA-T-ATCT---AAATCAAATTACAC----CTC---TT----T--ACA------T--T------A------------------------------A-A-AT--A-A------C--AA------C--G------TGT----TTAAA---A---G-CCGT-ATTAAATCG------A-TCG-----GAA-T---CAA--------ACTTGTTTT--T---ATA-GA--TTTTAAT--TC---TATT--
gi|29 : attgtC--ATATT----T-TC-----TTACATAA--CAAC-TAT------T--A---AT---T-ACAAA-TC-AATAT-TAT--GTAT---TAAGAAGTTC-----ATACAGTATC--TGA--C--AATAC-CAA--GAGAATCATT--C-AAA-----A---TGGTTTA-ATT----GTT-T-TT------C---ATTCT-T--A-----C--C-C-TGAAACA-G-GT-AT---TACCC--------------------ACAG-----T--GT--TT-T----G--C-AAGATCA-A-ATTT-A-------------AC---TGTT----AGAAGG-----TTTAAT-CAAA--TTGCATGGA----TGCA--GAAGAC-----TTT-----T-GA----------CAG--GA----A-ATTAA----A---G--GCTGCttaagaagtggtcagctttaggtga
gi|7 : TTAATAT-ATGATTTTTACAATA--TAAA---CATA---T--A--C--------CAAAAGT-TATCT-CAT--AT-A---A------TTT-----GC----TATT--TGT--C--AATAC-CTC--ATTA-TTGTT--T-CAA-----A---T--TATG-ATTTCA--TT-T-TTA-----T---AGACT-T--A-----C--A-C-T-AAA-A-T-GC-TT---TGCTCCT---TT--A--TGCAA--AACAA-----C--GT--CG-T----A--T-GAGCT-A-A-AATC-A-------TT----GT---C---------AAAATA-T-TTCTTTAAATG--TCGTA--GC----TCAA--CAGAAC------TT-----ATGC----------CAC--GA----A-ACAAC----A---G--ACCGCC---A-A-A---A--AG--C--GT-----T-C-TC-GG-----A----A-A-TC--CATTATGTAGAGTTT-ATGCA-TTATG-T-ATAA--GGAGT----TCATAT----GTC---GG----T--ATA------T--T------GACT-CCCA---------T------------A-C-AT--T-A------A--AGTAAAGCC--G------CAT----TT-TGA--A---G-TCGC-ATT----CT------A-CCG-----GAA-C---CAA--------ACCCATTTC--T---GTT-----TATT--T--CT---TA----C---------ATA-AT-G-CATTA-TG-----T-CGTC------------G------------ACTCCTATTAAGT----TTTA-A-----A-GT--TA---T-GAC-ATTCG-TGAT-TT----ATAaaagaatgatcccaaa
gi|37 : ATATAA--CAAA-AATATGAACT--A--CAT---A-ACAAAATT-GATGT-CATGAAT-A---G------T--------GA---TAAT--TGC--C--AGTA-------------CATT--T-CAA-----TAGCT--TTTG--TTTC--ATT-T-TTATTTTGC---ATTCT-C--A-----C--T-T-T-AACCA-G-TC-AT---TGCCCCT---TC--G--TTCAA--AACAT-----T--GT--TT-C----A--T-GAGAT-ACA-ACTG-G-------CT----CT---TATT-------AAATG-CATTCTTT-CAT
gi|18 : TA--TAAAATA-ATG---TCTG--CATGGTT-GCAACATT-AATTG-TAC--AT-T---T------CTTGAAGGATGG--CATT--TGT--TGAAATA---TA--A---AT-ATTGCT-TAA-----T---A--TTC--ATTT----TT-T-TCT-----CGGTATTCT-C--A-----G--G-C-C-AGACA-G-TA-AT---TGCTTCT---TT--G--TATAA--AACAGACTAAT--CT--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-G--------------------------------------A-T-TACTTT-CAAA--TTGCATGGC----TGCA--GAGAGT-----TTT-----T-AC----------CCG--GA----A-ATGGA----A---G----TACTTTAA-G-A---C--GG--T--T------T-C-C--GG-----A----T-A-TG--CATCAC----AGTTC-GTGAA-TTAAA-T-ACCA--GAAGT---------T----GTT---AT----T--AAA------T--TTTAC--A----CT-----------T------------A-C-TT--TCA------A--AA------C--ATT----TCT----TT-CA---A---A-TTAC-AT
gi|2 : aatgcattttgaAA-CACAT----------CAT---A-ACAAAAACTAAGTT-TTT--AT-T---T------TG--------A---TATC--TGC--C--AGTAC-CTA--AGGAAACATT--TCTAA-----C---T--TTTG-GTTTCA-----T-TT--------------------------------T-GAACA-G-AC-AT---TGTCAAT---TT--A--TGTAA--AACCA-----C--GT--TT-T----G--TAGAGAT-A-A-AATT-G-------TT---------TGTT----AAAAGCTG-T-CTTT---CACA--TTGTATGAC----TGCA--AAGAAC-----TTT-----T-AC----------AAT--------A-ATAAA----A---G--G---CC---A-G-T---G--T---C---------T-C-A--GT-----A----A-A-TA--CATCAC----AGTTT-ATAAA-T-ATG-CTATCT--GAAGT----TTGCATAT--GTC---AG----T--AAA------T--T------A----CC-----------T------------C-C-CT--T-T------AT-AG------T--A------TGT----TT-TG---A---AATTGC-GTAA---AA------A-TCA-----GAA-T---TCA--------ACTAATTTT--T---ATT-GATTTCTT--T--TT---TAAT--A---------A-A-TT-C-AGAA--TG-----T-TG-CCAACTTA-----A------------A-----------TTCAATTT--A-----A-GT--AG---T-GAC-ATTCA-TAGT-TT----ACATGACTGG--------CTCAGTATCAT----------A-----------G-T---------G-----AA----TTAAATGTCCCATAATCAT-G--TAATTTTACA----TG-T--ATTTTTGTTGCTTAAC----ATAT--TTTAaa
gi|62 : tctcaatgagagcaggtatgagaagagcaatactatacagaatatcattgtaaatgtgatgaaaatcatgaataacttttaacagtaagtaaaatatatatacacagtatcaccaacttCATG---T--ATACAT---T-ACAAAACT-GATCT-CGT--GT-A---T------TTT-----G-A---TATT--TGC--C--AATAC-Ct
gi|50 : AT---C-ACAAAATT-AATCT-CAT--GT-TGTTT------TTT-----TTA---TATT--TGC--C--AATAC-ATT--GGGAATCATT--T-CAA-----A---T--TATG-GTTTCA-TAT-T-TTG-----C---AGTCT-A--A-----G--T-C-T-AAACA-G-TA-AT---CAC-CCC---TT--T--TATAA--AA
gi|49 : tAT---T-ACAAAATT-AATCT-CA---GT-T---T------TTT------TA---TATT--TGC--C--AATGTATTAGTGGGAATCATT--T-CAA-----A---T--CATG-GTTTCA-TAT-T-TTG-----C---AGTCTAA--A-----G--G-C-T-AAACA-G-TT-AT---TGCCCCT---TT--T--TATAA--AAa
gi|31 : ttTT-AATCT--AT--AT-T---G----------------A---TATT--TGT--C--AATA------------TCATT--T-CAG-----A---T--TATA-GT-----GTT-T-TTT-----C----TTCT-C--A-----A--T-C-T-AAACA-G-TTATT---TGCTCTTATATG--TA-TGTAA--AGCAG-----C--AT--TT-TT---G--G-GAGAT-A-A-ACTA-GT------TT----AT---TGAT----AAACAACA-A-CTTTTC-GA-A--TTGCACGAC----TCTG--GAGCAC-----TTT-----A-TC------------T--CA----A-ACAGA----A---G--TTTGTG---A-GATAAAA--TG--CT-G------T-T-T--GT-----A----A-A-TA--CTTCa
gi|12 : ATCT-CGA--AG-T---G------TTT-----ATA---TTTT--TGT--C--AATA---------AAATTATT--T-CAA-----A---T--TATG-GTATCA-ATT-T-TTG-----C-------T-C--ATGAGAC--A-T-T-AGACA-------T---TGCCCTT---TT--A--TGACA--AATAG-----G--GT--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-AATT-GT------TT----AT---TGTT------AAGATA-----TTTT-CAAA--TTCCATGAA----TGCA--AAGAACTG---CTT-----T-GT----------AAA--AACACCA-ACAAA----GACTG--ATTTCA---A-A-A---A--TG--C--AAAGTTCT-C-T--G-------------------CATTTC----AGCTCAATGCA-TTAAG-T-ATTT--G-------------------------A----T--AAA------T--T------A----CCTCCCTT-----T------------ACA-AT--A-A------G--AA------T--A------CAT----TT-TGA--A---G-GTGC-A-AA---AA------A-TCA-----AAA-T---ATA--------GCTTGGTTT--T---A-------------T--TT---TAAT--T---------A-A-CT-C-TGTT--
gi|8 : tagcaagtataaaaaaaagtagattttAT--AT-A---T------TTT-----A-A---TATT--TCT--T--GATA--------GGAATCCTT--T-TAA-----A---T--CATG-GTTTCA-CTT-C-TTG-----C---ATTCA-C--A-----G--A-C-T-AAACA-G-TT-AT---TAC-CCA---AC--A--CATAA--CTCGG-----C--AC--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-AATT-G-------TT-----------TT----AAAGA-T--T-TTCTTT-AAAA--TTGCACGAC----TGCA--CAGAACTTTCAATT-----T-GT----------TAG--GA----A-ATGAATGT-A---T--GTTACC---A-A---------------A--------------------A----A-A-TG--CATCCC----AGTTC-ATGCA-GAAGG-T-ATCT--GAAGT----TTGTAT----TTT---GG----T--TCC------T--C------A----CT-----------T------------G-ATAT--T-A------A--AG------T--A------AGTATCATTATGA--A---G-TTGG-ATAA---T-------A-TTG-----GAA-T---GAA--------ACTGGCTGT--T---AAT-G---ATTT--T--TT---TAAT------------A-A-AC-T-TG--------------G-G------------G----------------------------------------A-GT--A------TA-----TA-TAAG-TT----AC--GACTAGTTGGGTA-C---------CCAT-------A-----------G-T---------G-----CT----TTAAATTTTCTCTA----T-G--TAAGTTTATA----TG-T--ATTTTTCTTTCTgagaactcaagttttaaggtgaattta
gi|27 : ---T------TTT-----ATA---TACA--TAT--C--AACAC-CTA--AAGATCCATT--T-TAA-----A---T--TATG-GTTTCA-TGT-A-TAA-----C---TTTCT-T--A-----G--G-C-T-AAATATA-TC-------GC--CT---TT--T--GAT--------G-----TTCGT--TT-T----G--T-GAGAT-T-ATAGTG-T-------TT----AC---TGTT----AAAAGAT-----TACTT-AAAA--CTGCATAAC----GGCA--GTGAAC-----AT---------------------AT--GA----A-AGAAA----A---G-----------A-A-A---A--TT--T--A------A-C-T--TT-----A----A-A-TT--CAACAA----AGTTC-ATGCA-TTAGGTC-GTCTTCAAAA------TGCTT----ATCTTTGG----T--AAA------T--T------A----CCTGCCT------T------------A-ACAT--T-A------A--Atcag
gi|44 : aag---T------TTT------TA---TATT--TGT--C--AGTTG-CTA--GGGAATCATT--T-CAA-----A---T--TATG-GTTTCA-CTT-T-TT------T---TTTTT-C--A-----T--T-C-T-
gi|25 : A---TATTACTAC--C--AAT-T-TTG--ATTAAT-ATT--T-TTA-----T---T--TTTA-ACT----ATT-T-T-G-----C---TTTAT-C--A-----G--G-C-T-TAGTA-G-TT-AT---TGTAATT---TT--A--TTCAA--AACGG-----T--GTGGTT-T----T--C-CAAAT-A-A-ATGT-G-------TT---------TATT----ATTCAATGGT-TTCTTT-CAGG--TTGCATTAC----TGTA--GAGCAC------TT-----ATGC----------CAG--AA----A-ATAAA----A---GCAGCCA-----A-G-A---A--TG--T--T------T-A-T--GT-----A----A-A-TG--AACCAT----AGT----TG-----AGG-C-ATCC--GAAGT----TCGTAT----GTC---ttcatagttatataattttatatttcattcgctgcagagaacttttgccaggaaataaaatgccacaaaattatacctaaa
gi|21 : ATCATT--C-CAA-----A---T--TTTG-TATTCATGTT-T-GTA-----C---ACTAG-A--A-----T--G-C-T-TAACA-G-TT-AT---AGCACTT---TT--A--TGGAA--AATAG-----C--GT--TT-T----G--T-GAAAT-A-A-AATT-GT------TT----GG---TGTT----AAAAGATC-T-T-------AAA--TTGCATGGCTGCATGCA--AAGAAA-----ATT-----A-GT----------TAT--GA----A-ATTAA----A---G--GCT--------G-T---A---------A------A-T-T--GT-----A----G-A---------AC----AGTTC-ATGCA-TT---------T--GA--T----TTCC--------C---GG----T--AGA------T--T------A----TCTCCCTT-----T------------A-C-AT--T-AACCTACA--AA------CCTA------CAT----TT-T---------------ATC----CT------A-TCG-----GAA-T---CAA--------ACCCATTAA--T---ATT-G---CTGT--T--TT---TTTT--C----------------C-T-TT--TT-----T-T----------------------------------------T----TTT--A-----A-----AA---T-Tggttcataatcgacagtaacttatcatcctttat
gi|10 : gATT--T-T-------T---T--TTT---TTTT---TT-T-TTG-----C---TTTTT-C--A-----A--A-A-T-GATCA-G-TC-AA---TG-TCCT---TT--T---ATAGGCAACAT-----T--CT--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-AATT-G-------TTT---GT---TGCT----AAAAAAGA-G-TTCTTT-CATA--GTGTATGAC----TG--------------------------C----------AGA--GA----A-ATAAA----A---T--GCCACT---AAG-A---A--TG--T--C------T-CAT--GC-----A----G---TA--CATCAC----AGTTC-ATGCA-TAAGG-C-ATCT--GAAGT----CCGCAT----GCC---AG----C--AAA------T--T------A----CC-----------CCCCTTTGTATTAA-A-AT--T-A------ATTAA------C--A------TGT----TT-TGA--A---G-CCCC-ATAA---AA------A-TCA-----GAA-T---TCA--------ACTCATTTT--T---ATT-G----ATT--T--TT---TAAT--A---------A-A-GT-A-TGTT--TC-----T-GA-C------------T------------AAATTTTAT---T----TTT--A-----A-AT--CA---T-GAC-ATTCA-TAAT-TT----GCATGGCAAG-----------------------------------------A-T---------G-----GA----TTGAATGTCCCGTA----T-A--TAACTTTAAA----TG-A--A--TTTGTTGCTAAAC----TTAT--TTTA
gi|5 : gt-----T---T--TTT---TTTC------T-TTG-----C---ATTCC-C--G-----C--T-C-T-AAACA-G-AC-AT---T-------------------AA--AACAG-----T--GC--TT-T----G--T-GAGAT-A-A-AATT-GA------TT----GT---ATTT----CAAGG----T-TCCTTT-CATG--TTGTATGTC----TTCA--GAGAAC-----TTT-----T-GC----------AAG--GA----A-ATGAA-------------------------------TG--T--C------T-C-G--G------A----A-A-TA--CACCAG----AGTTC-ATGCC-TGTGG-T-ATAT--GTAGT----TTGCAT----GTC---AT----T--TAA------T--T------ACTTTCC-----------T------------T-C-ATA-T-C------A--AA------C--A------TG-----------------G-TAGT-ATAA---AC------A-TCA-----GAA-C---TCA--------GTTCATCTT--C----TT-G---ATTG--T--TT---T---------------A-A-TT-C-GGCT--TC-----T-TG-C------------T------------G-----------T----CTC--AAATTCA-GT--AA---TGTAC---TCG-TAAT-TT----GTATGACTAGTTAGGTTAC---------CAT--------A-----------G-G---------G-----GA----TTGGATGCCGCATA----T-G--TTATTTTt
gi|11 : aatatgtttatgtttgcaatatgaatacattgtaaaataagtagtatgtgttttggatattttcctatggaatcatttgaatttttgtgtgtatgtgttgtagttgttgttgttgtttgtgt---ATACT-C--A-----C--G-C-T-AAACA-G-TTATT---TGCCGCT---TC--C--TGTAT--AAAAG-----C--GT--TT-T----G--T-GGGGT-A------T-G-------TT----GT---T---------AAATTA-T-TAGTTT-CAAA--TTGCATGAT----TGCA--TAGAGCT----TTT-----A-AC----------GGG--GA----AGATGAA----A---G--G---CC-----G-T---T--CG--CAAA------C-C-T--CC-----A----ACACTG--CATCAC----AGTTC-CTGCATTTAGG-T-ATCT--GAAGG----CTGTAA----GTC---GG----T--ACA------T--T------A----TA-----------TATTTAAAATA--A-A-AT--T-A------AG-AA------C--G------TAT----TC-TGA--A---G-TCGC--TTA---AT------A-TCA-----GAA-A---TAA--------ACTCGATTT--T---ATT-A----CTA--T--CT---TA--------------A-A-A-------T--TG-----T-TG-C-------------------------------------------TT--A-----C-G----------TAC-ATTCA--ATT-TT----AC
gi|6 : aattatagtttcctatttggaT---TGCCCCT---TT--TA-TGTTA--AACAG-----T--AT--TT-A----G--T-GAGA--A-A-ATGT-G-------TTAATTGT---TGTT----G----------TTTTTT-CAAA--TTGCACGTC----TGTA--GAGAAC-----ATT-----T-G------------AA--GA----A-ATAAA----A---AA-GCCGCA---A-A-A---A--TG--T--T------T-C-C--AA-----A----A-A-AG--CATCAC----AGTCC-ATGCA-TTACG-T-ATTC--AAAAT----CGTAAT----GCC---AA----TTGACA------T--TAA----A----AC-----------A------------A-G-ATTCT-A------G--AA------C--A------TAA----TT-TG---AT--A-TCGT--TTA---TC------A-TCT-----GAA-T---CAA--------ATTCCTTTT--A---ATT-T---ATTT--G--TT---TGTTACC---------G-ACATGC-CGAC--TGAAA--T-T--C-------------------------A-----------T----TTT--A-----A-GT--G-------AC-ATTTG-TGA--------ACA-GATTGT--------T---------C----------A-------------T---------A-----GAGCT-TTGAATGCCCAATA----T-G--TAGTTTTTCA----TG-T--ATTTTcttgtaggtaccttttggattgtcccctatatatatagtacaagtatcatgcttgattcactcatttt
gi|16 : catatgtatacttttacaacataaatggttatcatggagatataattgatgtttgttcatatccaggcaatcattcaaatcatggtttcatgtaT---TT--TCATGTTG--AACAG-----C--GT--AT-T----G--T-CAGAT-A-A-AATA-G-------TTT---AT---TTTT----AAAA--TA-T-TTCTTC-CAAA--TTACTTGAT----TGCA--GATAAT-----TTT-----T-GC----------AAG--GA----A-ATAAACATAA---G--G---CC---A-A-----A--CA--T--A------T-T-T---T-----ACGCTG-A-TG--CATCAC----AGTTC-AAGCA-TAAGG-C-ATCC--AAAGT----TCGTGT----ACC---GG----T--ATA------T--T------A----CCTCCCTTTGCATT------------A-A-AC--T-AT-----G--AA------C--A------TA------A-TA---A---G-TCG---------CA------A-TTA-----GA------TTA--------GCTTCTATT--A---ATT-G---TTTA--A--TA---AATT--C---------A-A-TT-T-CACT--TA-----TATT-C------------A------------G-----------T----TTTAAA-----A-GT--TA---T-GAC-ATTCG-TGAT-TT----Acctgacttaaaactttttgcaatcagtt
gi|14 : atgatatgtacattcttgtatactggtaaaaagaagtttagcaagtaTAA--AACAT-----T--GT--TT-T----G--T-TAGAT-A-A-CCTT-T-------GT----GT---TGTT----AAAATACA-T-CTTT---CATA--GTGTAAGAC----TGCA--GAGAAT-----GTA-----T-GC----------TAG--TA----A-TTAAA----A--------TGCC-----G-C---A--TGGAC--A------TTC-TTCGG-----A----A-A-TA--CATCAT----AGTTC-CTGCA-TTAGG-T-ATCT--GAATT----TCGCAT----GTC---AG----C--AAA------TTAT------A----TC-----------TTTTG--------A-T-AT--T-A------A--AA-----------------GT----TT-TT---A---A-TGTCAAATA---AA------A-TTA-----GAG-T---TCA--------ATACATTTT--G---AAT-G---ATTT--T--TT---AAAT--G---------A-A-TTGC-TACT--AGCTAAAT-TT-C------------A------------T-----------T----TTT--A-----T-GT--AA---T-GAC-AGTCA-TAATGTTTGCGACAAG-CTAGATA-----C---------CTAT-------A-----------G-C---------G-----GA----CTGAATGTATAGTA----T-G--GAATTGTACA----AT-T--ATTTTGGTTGCTTAAC----TTAC--TT
gi|19 : TAA--AGCAG-----T--GT--TT-TTTTTG--T-GCGAT-A-G-CATT-G-------TTT---GT---TGTT----TAGA--TA-T-TTATTT-CTTG--TTTTATGAC----TGCA--AAGAAC-----ATTTTTCAA-GA----------AAATAAA----A-ATAAA----A---G--GTCACC---AAG-A---A--TA--C--C------T-A-C--GG-----A----A-A-TA--CATCAG----AGTTC-ATGCT-TAAAG-G-ATCT--GAATT----TCTTAT----GTC---AA----T--AAA------G--TCCATCCA----TT-----------T------------A-C-AT--T-A------A--AA------------------------T-TA---A---G---------A---C-------A-TCA-----G---T---TTG--------ACTTATT---------TT-G---TTT-------------CC--CAAAAAAAAAA-A-AT-G-CGTT--TG-----T-TT-CT-----------G------------ACTTAAATTCAGT----TTA--A-----A-AC--AA---T-GGC-ACTCG-TAAT-TT----ACATGATTAa
gi|32 : ttatc--AACAT-----T--GT--TT-T----G--A-GAGAT-A-A-AATA-GC------TT----AT---TGTT----AAAA
gi|45 : T--TT-T----G--T-GAGAT-G-A-AATG-A-------TT-------------------AAAACA-T-TTCTTT-CTAA--TTGCATGAT----ATTAGCAAGC--------TT-----T-GC----------CAG--AA----A-ATAAA----T---A--TATGCA---A-A-T---AA-TG--T--T------T-C-C--AA-----G----A-A-TA--CATCA------GTTC-ATGCA-TAAGG-C-ATCT--GAAGtgtagaaagaatgtttccgaaagttttatcatggttcatgcattaggtatacgaatttcaataaattgcttccttacatcaaaatagtaacataacatattttgaagtcacattggaaattttattgaatttttaataagttctgtttgtttcaaactcaaatttcagtttttg
gi|15 : gca----G--C-GAGAT-A-A-AATT-G-------TTT---GT---TGTT----AAAA--CA-T-TTCTTT-CATA--TTGTAT-AT----TGCA--AAGatgtagttttacat
gi|20 : G--GA----A-ATAAA----A---T--GTTGCA---ATG-A---A--TG--T--T------T-T-C--AT-----A----A-T-TC--CATTAC----AATAC-ATGCA-TAAGG-C-ATCC---AAGT----TTGTATTTTTGTC---AA----G--AAA------T--T------A----TC-----------TCCTTTC------A-T-AT--T-T------A--AA------T--AA-----TGT----CA-TA---AAAAG-TCGC-AT-A---AA------A-TAACGTAGGCA-T---TGA--------ACCCCTTTT--C---ATT-G---ATTT--T--TT---AAAT--A---------A-A-TT-C-TGTT--TG-----A-TG-C------------GGACTCAGATTCAG-----------T----TTT--A-----A-GT--TA---T-GAC-ATT-G-TGAT-AA----ACCTGGCTAT--------C---------T----------AG----------G-TACACACA--G-----GATT--TTGAACAT---GT-----T------GTTTTACA----CA-TGAAGTTTTCTTGCTAAAaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaagtaatgacattcataatttacatgactggctgggtatccataggggattgaatgtcctgtatgtaagtttacatgtatatttgttattaaattaaaatatcatttattgt
gi|47 : tgcatg-----A----A-A-TG--CATCTA----AGTTC-ATGCA-TTACA-T-GTCT--GAAGT----TCATAT----TTC---AG----T--AAGAAACCTT--C------A----TT-----------T------------A-C-AT--T-A------A--AA------T--AAGAATGTAT----TT-TG---AA--G-TCGC--TTA---GT------A-TCA-----GAA-TCATTTATACTGCCAACTCATATT--T---ACT-T---TTctta
gi|34 : caga-----------T------------A-C-AT--T-A------A--TA------G--A------TGT----GT-CATAAA---G-TTAC-AC-A---CATGTCATA-TTG-----GAA-C---CAA--------ACCTGTTTT--T---ATTAG---TTTT--TA-TT---TA----C---------A-ATTT-C-CATT--TG-----T-TG-CT-----------G------------ACCTAAATTCAGT----TTT--A-----ACAT---A---T-GGC-ATTGA-TGAT-TT----ACTGGACTAA--------C---------C----------AG----------G-T---------GCCCGCAACACTTTGAATGTTCCTA-----T-G--TAG-TTTACA----CA-T--G-TTTTGTT
gi|33 : t-A-AT--T-A------A--AA------C--A------TAT----TT-TG---AA--G-TCGC-ATTA---CT------A-TCA-----GAA-T---TCA--------GTCCTTTTT--T---ATT-G---ATTT--T--ATAAATAT---------------A-TT-C-TGTG--TA-----T-TG-CT-----------G------------A-----------C----TCG--A-----A-CTC-AG---T-T----TTCAGTAAT-TA----ACATGCCTA---------C---------C----------AAGGTACCTATGG-T---------G-----GA----TTGAATCTCCTATA----T-G--TAATTTTACATGTTTG-T--ATTTTTGCTCCAAAAC----GTTT--TTTAt
gi|51 : -TGTT--AA-----T-TG-CT-----------G------------A-----------C----TC---A-----A-GTTCAG---T-TGCCATTTG-TTAT-TT----ACAAAGCCAG--------C---------T----------A-----------GATAGGG-----G-----GA----TTGAATGTCCGGTA----T-G--TAATTTTACA----TT-T--A-TTTTGTTACTAAAC----TTAT--TGTAttca
gi|54 : -----------T----TTT--A-----A-GT--AA---C-GAC-ATGTG-AGAT-TT----ACATGACTAG--------C---------ttcaa
gi|15 : ggaatcaaaaccaattttattgattctaaaaataattatatgtgctgccaacttagatattTT--A-----A-GT--AA---T-GAC-ATTCA-TAAT-TT----ACATGACTGG--------C---------TGGGTATCCATA-----------G-G---------G-----GA----TTGAATGTCCTGTA----T-G--TAAGTTTACA----TG-T--ATATTTGTTATTAAATTAAAATATCATTTA
gi|57 : gcgagataaaattgtttgttgttaaaacatttctttcatattgtatattgcaaagaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC-ATTCG-TAAT-TT----ACATACCTAA--------C---------T----------AT----------G-TACCTATACGG-----GA----ATGAATATCCTG------T-GATTAGTTTTACT----TATT--GTTTTTATttgt
gi|56 : tgaatattgg-----GA----TTGAATGTCCTGT-----TTG--TAACTTTTCA----TG-T--ATTTTTGTTGCTTAAC----TTAT--TTTA
16 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GCATTCTCAGGATAAACAGTGAATATTATTAGTAAAAAAAGTGCTTATTGTAAGAGTATGTATTTAAAATTGCTAGACAACACAGTTGCTTTGTCGGATATTAATTAAAATGAATCAAAAGAATAATTAAGACAATGCATCACAGATCATGCTGCTAGGTTATAGCCGGAGTCTGTTATTTACACCGTGCCCCCTTTACATTGAAATATGAACGTACTTTGAGATAATTTCTTTTGACATTCTAATAGATTCCATTTGTTACGGACTTAAATTCATTTTTGTAAATTGTAACATTCAT
Unaligned ( gi|24 ): TCCTTATATGGAATACCACCTCTGTGAAGTGTCTTGGTTGAACAATTATATCAGTTAAAAAAATACGTAAGAGGGTTGTACCAAAGCTATAATAACTCAAATATACTGAGATAATGAGTTTAGAGAGAATTTTCATATGCATAGTGTTTGATAGAAATAAACTGCAAATTAATATCATGTATTTTGATATTTTTCAATTATACTGTTACTAAATGAAATTATGATTTCATGTTTAGGATACTCAGGCTAAACTTGTATTGTCCGTTTATGTAAACATTGTTT
Unaligned ( gi|26 ): TTAAACCACTTATAATATTACTGTTATGATCTTTACCTATCAGATTGAAACCTGTGAATTATCTAAAAGAATGAAAATTAATTGTTATAGGGCTGTGTATTGCTTGACCAATGCTGATACAATATGTATCGCAATTCAGGTATCCAGATACAAGATACAATGCGATACAGATTATTATTGAAAATGTGATGGAATTCAAGAGTATCTTTAACATTAAGTAAAATATATACGGTGTTGCCCGCTTAACACATCATAACAAA
Unaligned ( gi|30 ): AGAAATAAAATGTTTCCAGAAATGTATAACAATTTATGTACTAGACACACTAACTAGGTCACTAAAATACGTCTCTGTGTATTAAAATCAGATCTTAATTTGGAGACGCATAATATTAGAATCAACTTCTTTTATATCAATTTTTCAATAAAGAATCCTTGTTTCAAACTCGATATTATGATATGACATTAACGTTTTACATAGTTGGTTAAGGTACCCATACATCTTACATAA
Unaligned ( gi|36 ): AATAAGGGTGTATAATATGAAGTTGCATACTAGTGGAAACAATCTGGCTTTTATTATCTGTTTAAAATAATTTAGTTTCTTGCAAACGCAAATTCAGTTTCATGTTATGGTACTCGTGACTTACTTGATTAACCAGGTACTCGTGGATCGTTAAACGTCTCACATGGGGTTTTACATGTATTGCCTAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTTATTTGGACTGTGCACAGTATTGCTTGACCAATGGTGATCTGATATGTATCATGGTATAGGTATCCCGATACGCCATACAATACAGATTATTATTGAAAATTTGATGAAATCCATGAGTAACTTTTAACATTAAGTAAAATGTATACACAGTATCACCCTCTTAACACATCATT
Unaligned ( gi|39 ): AGGGATGTGCATTGCTTGGCCAATGCTGATTCTATATGTCTCATGATACAGGTATCAGATCCTGATACACAATACAATATGATACAGATTTTTATTGAAAATGTGATGAAATGCATGTGTCACTATTAACATTAAGTAAAGTATATATACAGTATAACATTCTTCACACATCATAA
Unaligned ( gi|40 ): TAGGGTTGTGTATTGTTTGACCATTGGTGATACAATATGTACCACGATACATCATCCCGATACGCGATACAATACGATACAGACTATTATTGAAAATGTGATGAAATGTATGAGTACTTCTAACATTAAGTGAAATACAAACGGCACCACTCTCGTTATACATAACAT
Unaligned ( gi|41 ): AGGGCTTTGTATTGCTTGACCAATGGCGATACAATATGTATCATGATACAGATAATCTGACACGCGATACAATACAATATAAATTATTGTTCAAAATGTGAAATCCATGAGTAACTTTTAAAATAAAGTAAATATATATAAATATACGGCATCACACTCAAAA
Unaligned ( gi|42 ): GATTCAAGCTATTTTTATGGATTTTGTAATAAATCATCATTGCTACCAACTCAAATAATTTCATGTAATGACACTTGTGATTTACATGACTGGCTAGGTTTCCAAAGGGCTTTGAATGCCCTTTGTTTTACATGAATCTACTTACTAAACTTACTTTTATCG
Unaligned ( gi|46 ): TGGTTTCATTTCTTGCATTCTCAGACTAAACACAGCGTGTTGTAAAAATAAAAGTGTTTGTTTTAGAAGATTTCTATCACTTGAAACTGCATGCCTGCATATAGAAACTTTGCCAGAAAATAAAAAATATCACAAAGAATGT
Unaligned ( gi|52 ): TGATTGTTCATTAATGTGAAGGATGAATTGTTCTAGGACTGTGTACTGCTTGACCAATGACGATAAGATTTGTATCTAAATATAGTATCATAATACGCGATACAACATGATACAG
Unaligned ( gi|53 ): GTATAATACATCCCATTACACTTAACAGTATAATACAAACAGTTTTCAAAATTCATGAGTAAATTTTATGTAAAATATATATACGGTATCACCCTCTTACACATCATATCAAA
Unaligned ( gi|55 ): TGTGATTGAAAATGGGATGAAATCCAGGAGAAACTTTTAAAATTAAGTATAATATATATATGGTATCAATCTCTTAACACATCATATCAAAA
Unaligned ( gi|60 ): AAATATTCATTTCAATTTGCATTGCTGCAGAGATATTTTGCCAAGAACTAAACGTCTACAGA
Unaligned ( gi|61 ): TCAAATTACATAACTGCAGAGGACTTTGGCTAGGGAAATAGGCTGCAAAGGATGTTTCAGA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 4444444 1 111111111 333333333333333 11 22222222222222 11111111 222222222222222222222222222222 333333333333333333333333333 11111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111
lowQualScore : 8888 8 3333333 3 3 8888 1 6666 888 4 3 7777 1 7777 555555555 33 1 2 88888 33 22 333333333333333 111 0 111 7777 4444444 66 222 1 222 00000000000000 22 1 1 5555 44444 0 1 222 888 33 6666 33333 1 1 1 33333333 1 3333 1 222 1 333 66666666 0 0 3333333 1 11 1 2222 11 1 2 1 2 9999999 666666666666666666666666666666 33333 11 1 11 1 11 2222 11 1 55555 1 2 1 1 33333 2222 111111111111111111111111111 33 1 444444 33 1 66666 22 1 33333 1 1 1 1 1 1 22 1 11111111111111 3333 4444 22 444444 22 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 0 1 333 1 66666 22 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 22 44444 1 00000 333 22 1 2 1 1 3333 333 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 3333 333 2 55 6666 2 2 22 33 4444 1 1 444
lowQualScore : .... . ....... . . .... . .... ... . . .... . .... ......... .. . . ..... .. .. ............... ... . ... .... ....... .. ... . ... .............. .. . . .... ..... . . ... ... .. .... ..... . . . ........ . .... . ... . ... ........ . . ....... . .. . .... .. . . . . ....... .............................. ..... .. . .. . .. .... .. . ..... . . . . ..... .... ........................... .. . ...... .. . ..... .. . ..... . . . . . . .. . .............. .... .... .. ...... .. ....................................................................................................................................... . . . ... . ..... .. ........................................................................................................ .. ..... . ..... ... .. . . . . .... ... . ............................................................ ..... .... ... . .. .... . . .. .. .... . . ...
lowQualScore : 3333 3 3333333 3 7 1111 4 3333 888 9 3 1111 0 1111 888888888 77 9 5 22222 11 99 111111111111111 999 7 999 9999 8888888 88 777 0 777 44444444444444 11 5 6 3333 33333 8 3 333 666 22 5555 44444 6 4 4 11111111 4 3333 4 555 4 555 55555555 4 8 9999999 3 88 3 7777 88 3 6 3 7 4444444 222222222222222222222222222222 11111 77 9 77 2 88 7777 88 3 22222 4 9 3 3 33333 8888 444444444444444444444444444 33 4 000000 77 4 11111 00 5 55555 5 5 0 5 5 5 00 4 77777777777777 3333 8888 11 666666 22 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 6 999 7 00000 44 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 00000 6 55555 000 44 7 4 7 7 7777 222 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333 9999 777 1 11 6666 1 1 99 11 7777 0 4 111
consensus : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCAAGN-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-G---TTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT-C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AAA---TTA----TGGT-T---TCATT-T--TT----T-----GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----TA-TGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TA-AAATTG-------TT----G-T---TGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA--TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAAC-T-----TTT-GCCA-GGAA-ATA-----A----AA---------G-GCCG----C-A-A-GAA--T-G------TT-T-C-C-GNAA--ATGC-ATCAC----AGTTC-ATGCA-TTAGG-T-AT-CC--GAAGTTC-GC--A-T----GT----C---GGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------A------CA-T-T--A------A--------AA-----------C--A------TG--T----TT-T------G-A---GTCGCATNA---AN----A-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT--T----T--A------------AT--NA--AT-T-C--CGTT--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----A-GTAA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
Reference ( family-892 ) : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTNA----GCAANN-CT-G--TTC--ATATNAATA-T-G---TTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT-C-ATGTN---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AAN---TTN----TGGT-T---TCANT-T--TT----T-----GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----TN-TGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TA-AANTTG-------TT----G-T---TGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCANA--TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAAC-T-----TTT-GCNA-GGAA-ATA-----A----AA---------G-GCCG----C-C-A-GNA--T-G------TN-T-C-C-GNAA--ATGC-ATCAC----AGTTC-ATGCA-TTAGG-T-AT-CT--GAAGTTC-GC--A-T----GT----C---GGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------A------NA-T-T--A------A--------AA-----------C--A------TG--T----TT-T------G-A---GTCGCATNA---NN----A-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGNT---TTTT--T----T--A------------NT--CA--AN-T-C--CGTT--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----A-GTAA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|1 : AAACAAAATTTCCAACCATTAAAAATGGTGTACTGTGTATAAAAACTATATATATT--ATATATGTGTAAG-CATACTAGGTCAAA-TAT----GTTTA----GCAACA-CT-G--TTC--ATATTAATA-T-G---TTT--ACATTA--TAAATAC--ATGTA-CATTACAAAA-T-CAATCT-C-ATATT---TT-------TTATA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAA--GGA--ATCATTT-T-AAT---TTT----TGAT-T---TCAAT-T--TT----T-----ACATTCT-C-AC--TC---T-AAACAGT---CC-T---T-GCTC--CTT-----TT-TGTAAAACAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TA-AACTTG-------TT----G-T---TGTT----AAAAAATA-T-TTTT-----T--TCATA--TT-GTAT--GAC----TGTAAA--GTAC-A-----TTA-GCAA-GGAA-ATA-----A----AA---------G-GTTA----C-C-A-GTA--T-G------CA-T-C-T-GTAA--ATAC-ATCAC----AATTC-ATGCA-TTAGG-C-AT-CT--GAAGTTT-GC--A-T----GT----C---AAT--AAA------T--T------A----C------C------T------------A------AA-T-T--A------A--------AA-----------C--A------TG--T----TT-T------G-A---GTTGCATTA---CA----A-TCAGAATTTAACTCATTTT-TATTGTT---TTTT--T----T--A------------TT--CA--AA-T-C--TGTT--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----A-GTAA---TTACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT-----TGTA-GTTT-T--AC--A----TATATTTTTGTTGCT--GAATATATTTTA
gi|10 : AT---TTT----TTTT-T---TTTTT-T--TT----T-----GCTTTTT-C-AA--AA---T-GATCAGT---CA-A---T-GTCC--TTT-----TA-TAGGCAACAT------TC-T--TT-T----G--T-GAGA-TA-AAATTG-------TTT---G-T---TGCT----AAAAAAGA-G-TTCT-----T--TCATA--GT-GTAT--GAC----TGCAGA--GAA----------------------ATA-----A----AA---------T-GCCA----C-T-AAGAA--T-G------TC-T-C-A-TGCA--GTAC-ATCAC----AGTTC-ATGCA-TAAGG-C-AT-CT--GAAGTCC-GC--A-T----GC----C---AGC--AAA------T--T------A----C------CCCCCTTT------------G------TA-T-T--A------AAATTAATTAA-----------C--A------TG--T----TT-T------GAA---GCCCCATAA---AA----A-TCAGAATTCAACTCATTTT-TATTGA----TTTT--T----T--A------------AT--AA--AG-T-A--TGTT--TC-----T-G------A-C------------T------------AAATTTTAT----T----TTT--A-----A-ATCA---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----GC---ATGGCAAG-----------------------------------------A-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATATA-ACTT-T--AA--A----TGAA--TTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|11 : gtAA---TTA----TAGT-T---TCCTA-T--TT----G-----GAATACT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TATT---T-GCCG--CTT-----CC-TGTATAAAAG------CG-T--TT-T----G--T-GGGG-TA-----TG-------TT----G-T---T---------AAATTA-T-TAGT-----T--TCAAA--TT-GCAT--GAT----TGCATA--GAGC-T-----TTTAACGG-GGAAGATG-----A----AA---------G-GCCG----T-T-C-GCA--A-A------CC-T-C-C-AACA--CTGC-ATCAC----AGTTC-CTGCATTTAGG-T-AT-CT--GAAGGCT-GT--A-A----GT----C---GGT--ACA------T--T------A----T------A------TATTTAAAATA--A------AA-T-T--A------AG-------AA-----------C--G------TA--T----TC-T------GAA---GTCGC-TTA---AT----A-TCAGAAATAAACTCGATTT-TATTACT---ATCT--T----A--A-----------------A--A----------T--TG-----T-T------G-C--------------------------------------------TT--A-----C-GT-------ACA---TT--C---AATT-TT----ACCTTGTAGGTAC--------C---------T----------T-----------T-------T---------G-----GA----T-------TGT-CCCCT----ATATATATAG-T--AC--A----AGTATCATGCTTGAT--TCACTCATTTTt
gi|12 : -T-TTATCT-CGAAGTG---TT-------T-ATA---TTTTTGTCA---ATA-------------AA--ATTATTT-C-AAA---TTA----TGGT-A---TCAAT-T--TT----T-----GC----T-C-AT--G------AGACATTAGACA-T---T-GCCC--TTT-----TA-TGACAAATAG------GG-T--TT-T----G--T-GAGA-TA-AAATTGT------TT----A-T---TGTT------AAGATA-T----T-----T--TCAAA--TT-CCAT--GAA----TGCAAA--GAAC-TGC---TTT-GTAA---AA-ACACCAACA----AA---------G-ACTGATTTC-A-A-AAA--T-GCAAAGTTC-T-C----------TGC-ATTTC----AGCTCAATGCA-TTAAG-T-AT-TT--GA-----------------------------T--AAA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------A------CA-A-T--A------AG-------AA-----------T--A------CA--T----TT-T------GAA---GGTGCA-AA---AA----A-TCAAAATATAGCTTGGTTT-TA----------TT--T----T--A------------AT--TA--AC-T-C--------TG-----T-T------G-A------------G------------A------------A----CTC--A-----A-GT
gi|13 : tagcaagtataaaaaaaagtagatAGACATGT-TAAT-AATATTAAGAAA-----C----GTTTT----GCGATT-CT-T--TTC--ATATTAACA-T-----TTT--ATAATA--TTAATAC--A--------------------ATAT-C-ATGTA---TT-------TGGTA---G--TTGGCA---ATAT-----CCAG--GAA--ATCATAT-T-AAA---TTAGTCTTTGTAT---TTATT-T--AT----T-----TTATTTT-C-AT--GT---C-AAACAAT---TA-C---T-ATCC--TTT-----AA-TTCAAAACAG------TT-G--TT-T----G--C-GAGA-TA---CTTT-------TT----T-TAAATGTT----TAAAGAT-----------------------TT-GCAT--TTT----TGCAGA--GAAC-------------AA-TAAC-AAA-----A----AA---------G-ACCG----C-A-A-ATA--A-C------TT-TAC-C-AAAA--A-GC-ATCAC----AATTC-ATGCA-TCAGG-T-AT-TC--GAAGTTC-GT--A-T----TT----A---AGT--AAA------T----------------------------T------------A------AA-T-T--A------A--------AA-----------T--AAT----TA--T----TT-T------G-A---tttaaggtgaattta
gi|14 : ataTAAAACAT------TG-T--TT-T----G--T-TAGA-TA-ACCTTT-------GT----G-T---TGTT----AAAATACA-T---CT-----T--TCATA--GT-GTAA--GAC----TGCAGA--GAAT-G-----TAT-GCTA-GTAA-TTA-----A----AA---------T-GCCG----C-A-T-GGA--C-A------TTCT-T-C-GGAA--ATAC-ATCAT----AGTTC-CTGCA-TTAGG-T-AT-CT--GAATTTC-GC--A-T----GT----C---AGC--AAA------TTAT------A----T------C------TTTTG--------A------TA-T-T--A------A--------AA----------------------G--T----TT-T------T-AAT-GTCAAAT-A---AA----A-TTAGAGTTCAATACATTTT-GAATGAT---TTTT--T----A--A------------AT--GA--AT-TGC--TACT--AGCTAAAT-T------T-C------------A------------T------------T----TTT--A-----T-GTAA---TGACA---GT--C-ATAA-TGTTTGCGAC---AAG-CTAGATA-----C---------CTAT-------A-----------G-------C---------G-----GA----CTG---AATGT-ATAGT----ATGGA-ATTG-T--AC--A----ATTATTTTGGTTGCT--TAACTTACTTttgatttgtaagacattatgtgtattgtctatacat
gi|15 : ----G--C-GAGA-TA-AAATTG-------TTT---G-T---TGTT----AAAA--CA-T-TTCT-----T--TCATA--TT-GTAT---AT----TGCAAA--GAAa
gi|15 : TT--A-----A-GTAA---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------TGGGTATCCATA-----------G-------G---------G-----GA----TTG---AATGT-CCTGT----ATGTA-AGTT-T--AC--A----TGTATATTTGTTATT--AAATTatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaagtaatgacattcataatttacatgactggctgggtatccataggggattgaatgtcctgtatgtaagtttacatgtatatttgttattaaattaaaatatcatttattgt
gi|16 : gcgagataaaattgtttgttgttaaaacatttctttcatattgtatattgcaaagaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----CA-TGTTGAACAG------CG-T--AT-T----G--T-CAGA-TA-AAATAG-------TTT---A-T---TTTT----AAAA--TA-T-TTCT-----T--CCAAA--TT-ACTT--GAT----TGCAGA--TAAT-T-----TTT-GCAA-GGAA-ATA-----AACATAA---------G-GCCA--------A-ACA--T-A------TT-T-TAC-GCTG--ATGC-ATCAC----AGTTC-AAGCA-TAAGG-C-AT-CC--AAAGTTC-GT--G-T----AC----C---GGT--ATA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------G------CA-T-T--A------A--------AC-----------T--A------------------T------G-A------ACATAA---TA----AGTCGCAATTAGATTAGCTTC-TATTAAT---TGTT--TAA--TAAA------------TT--CA--AT-T-T--CACT--TA-----TAT------T-C------------A------------G------------T----TTTAAA-----A-GTTA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----Aaaaatatcatttattgt
gi|17 : atgatatgtacattcttgtatactggtaaaaagaagtttagcaagtatt--TTC--ATATAAATA-T-A---TTTTTACAATA--AAGATAA--AT-T-----T-CAGAA-T-TAATCT-C-GTGCA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GAA--ATAATTT-C-AAA---TTA-----AGC-T---TC--------------------CATTCT-C-CA--GCTGTT-AAACAGT---TA-T---T-GCTC--ATT-----TA-TGTAAAA-AT------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TG-AAATCA-------TT------T---T-TTAAAAAAAAAAAA-A-TCCT-----T--TCAAACTCT-GCAT--TAC----TGCAGA--GAAC-T-----TTT-GCCG-AGAT-ATT-----A----AA---------G-GTTA----A-C-A-GAT--T-G------TT-A-A-T-G-AA--ATGC-GACAA----AGTGC-ATGTA---AGGCT-GT-GT--ACAGTTT-G----------GTTAAAC---GTT--GAA------T--T-----------C------T------T------------A------AA-T-
gi|18 : ataaatttcaagagaaataagtc-T---TCATT-T--TT----TTCTCGGTATTCT-C-AG--GC---C-AGACAGT---AA-T---T-GCTT--CTT-----TG-TATAAAACAGACTAATC--T--TT-T----G--T-GAGA-TA-AGATTA----------------------------------------CT-----T--TCAAA--TT-GCAT--GGC----TGCAGA--GAGT-T-----TTT-ACCC-GGAA-ATG-----G----AA---------G-TACT----T-T-A-AGA--CGG------TT-T-C-C-GGAT--ATGC-ATCAC----AGTTC-GTGAA-TTAAA-T-AC-CA--GAAGT---------T----GT----T---ATT--AAA------T--TTTAC--A----C------T------T------------A------CT-T-TC-A------A--------AA-----------C--A------TT--T----CT-T------
gi|19 : aatgcattttgatataaaataatgtctgcatggttgcaacattaattgtacatttcttgaaggatggcatttgttgaaatataaatattgcttaataT-----TA-TCTAAAGCAG------TG-T--TT-TTTTTG--T-GCGA-TA-GCATTG-------TTT---G-T---TGTT----TAGA--TA-T-TTAT-----T--TCTTG--TT-TTAT--GAC----TGCAAA--GAACAT-----TTT-TCAA-GAAA-ATA-----A----AAATAAAA---G-GTCA----C-C-AAGAA--T-A------CC-T-A-C-GGAA--ATAC-ATCAG----AGTTC-ATGCT-TAAAG-G-AT-CT--GAATTTC-TT--A-T----GT----C---AAT--AAA------G--TCCATCCA----T------T------T------------A------CA-T-T--A------A--------AA-------------------------------T-T------A-A---G-----------AC----A-TCAG--TTTGACTTATTTT------GT---TTCC--CAAAAA--A------------AA--AA--AA-T-G--CGTT--TG-----T-T------T-CT-----------G------------ACTTAAATTCAG-T----TTA--A-----A-ACAA---TGGCA---CT--C-GTAA-T-TT----AC---ATGATTAtcaaattacataa
gi|2 : AACAC--AT----CATAACAAAAAC-TAAGTT----TTTA---TT-------TTG-A---TATCTGCCA---GTAC-----CTAA--GGA--AACATTT-CTAAC---TTT----TGGT-T---TCA---T--TT----T-----G---------------------AACAGA---CA-T---T-GTCA--ATT-----TA-TGTAAAACCA------CG-T--TT-T----G--TAGAGA-TA-AAATTG-------TT----------TGTT----AAAAGCTG-T---CT-----T--TCACA--TT-GTAT--GAC----TGCAAA--GAAC-T-----TTT-ACAA-T--A-ATA-----A----AA---------G-GCC---------A-G----T-G------TC-T-C-A-GTAA--ATAC-ATCAC----AGTTT-ATAAA-TATGC-T-AT-CT--GAAGTTT-GCATA-T----GT----C---AGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------C------CCTT-T--A------T--------AG-----------T--A------TG--T----TT-T------GAA---ATTGCGTAA---AA----A-TCAGAATTCAACTAATTTT-TATTGATTTCTTTT--T----T--A------------AT--AA--AT-T-C--AGAA--TG-----T-T------G-CCAACTTA-----A------------A------------TTCAATTT--A-----A-GTAG---TGACA---TT--C-ATAG-T-TT----AC---ATGACTGG--------CTCAGTATCAT----------A-----------G-------T---------G-----AA----TTA---AATGT-CCCATAATCATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACATATTTTA
gi|20 : tctcaatgagagcaggtatgagaagagcaatactatacagaatatcattgtaaatgtgatgaaaatcatgaataacttttaacagtaagtaaaatatatatacacagtatcaccaactt-GGAA-ATA-----A----AA---------T-GTTG----C-A-ATGAA--T-G------TT-T-T-C-ATAA--TTCC-ATTAC----AATAC-ATGCA-TAAGG-C-AT-CC---AAGTTT-GT--A-TTTTTGT----C---AAG--AAA------T--T------A----T------C------TCCTTTC------A------TA-T-T--T------A--------AA-----------T--AA-----TG--T----CA-T------A-AAAAGTCGCATAA---AATAACG-TAGGCATTGAACCCCTTTT-CATTGAT---TTTT--T----A--A------------AT--AA--AT-T-C--TGTT--TG-----A-T------G-C------------GGACTCAGATTCAG------------T----TTT--A-----A-GTTA---TGACA---TT----GTGA-T-AA----AC---CTGGCTAT--------C---------T----------AG----------G-------TACACACA--G-----GATT--TTG---AA--------C----ATGTT-GTTT-TACAC--A----TGAAGTTTTCTTGCT--AAACTTAt
gi|21 : tgcatg--ATCATTC-C-AAA---TTT----TGTA-T---TCATG-T--TTG---T-----ACACTAG-A-AT--GC---T-TAACAGT---TA-T---A-GCAC--TTT-----TA-TGGAAAATAG------CG-T--TT-T----G--T-GAAA-TA-AAATTGT------TT----G-G---TGTT----AAAAGA------TCT-----T----AAA--TT-GCAT--GGCTGCATGCAAA--GAAA-A-----TTA-GTTA-TGAA-ATT-----A----AA---------G-GC-----------------T-G------T---------AAA--TTGT-AGAAC----AGTTC-ATGCA-TTTGA-T------------TTC-------------C----C---GGT--AGA------T--T------A----T------CTCCCTTT------------A------CA-T-T--AACCTACA--------AA-----------CCTA------CA--T----TT-T-----------------ATC----CT----A-TCGGAATCAAACCCATTAA-TATTGCTG--TTTT--T----T------------------------T-T-C--CTTT--TT-----T-T-----------------------------------------------T----TTT--A-----A-
gi|23 : g-TATACTGAGGAAAA-TAT----GTTTA----GCAAGT-CT-G--ATC--ATATCAATA-T-G---TTT----------------------------CACAAAA-C-TAATCTTC-ATG----------------GCA---TGT---------AT--------TA----------CATTT-T---T---TTT----TAAT-C---T--TT-A--TT----T-----ACATTCT-C-GC--TC---T-AAACAAT---CA-T---T-GTCC--CTT-----TA-TTTAAATCAA------TG-T--TTAT----T--T-TAGA-CA-AATTTGAGATTTATT----G-T---TGTT----ATAA--TA-T-TTCT-----T--TTATA--TT-GTAT--GAC----TGCAGG--GAAC-T-----TTT-G-----------A-----A----AA---------G---CA----A-T-A-GAA--T-G------TC-T-C-T-GTAAATATAC-ATCGA----AGTTC-AAGCA-TTATG-T-AT-CT--GAAGTTG-CC--A-T----GT----C---AGT--ATA------T--T------aatt
gi|24 : AAA----AAAATACGTAAGAGGGTTGTACCAAAG-------CTATA-ATAACTC----------AAA-TATACTGAG-ATAA-TGA----GTTTA----GAGAGA-AT-T--TTC--ATATGCATAGT-G---TTT----GATA--GAAATAA--AC-TG-C------AAA-T-TAATAT-C-ATGTA---TT-------TTG-A---TATTTTTCAATTATACTGTTACTA-----A--A-----T-G-AAA---TTA----TGAT-T---TCATG-T--TT----A-----GGATACT-C-AG--GC---T-AAACTTG---TA-T---T-GTCC--GTT-----TA-TGT-AAACAT------TG-T--TT-
gi|25 : tccttatatggaataccacctctgtgaagtgtcttggttgaacaattatatcagttAT---TTT----TATT-T---TTAAC-TATTT----T-----GCTTTAT-C-AG--GC---T-TAGTAGT---TA-T---T-GTAA--TTT-----TA-TTCAAAACGG------TG-TGGTT-T----T--C-CAAA-TA-AATGTG-------TT----------TATT----ATTCAATGGT-TTCT-----T--TCAGG--TT-GCAT--TAC----TGTAGA--GCAC-T-----TAT-GCCA-GAAA-ATA-----A----AA-----------GCAG----C-CAA-GAA--T-G------TT-T-A-T-GTAA--ATGA-ACCAT----AGT----TG-----AGG-C-AT-CC--GAAGTTC-GT--A-T----GT----C---GGT--
gi|27 : atattactaccaattttgattaat---TT-------TTATA---TACATATCA---ACAC-----CTAA--AGA--TCCATTT-T-AAA---TTA----TGGT-T---TCATG-T--AT----A-----ACTTTCT-T-AG--GC---T-AAATA-----TA-T---C-GCCT--TTT-----GA-TGT------T------CG-T--TT-T----G--T-GAGATTA-TAGTGT-------TT----A-C---TGTT----AAAAGA-----TTAC-----T--TAAAA--CT-GCAT--AAC----GGCAGT--GAAC-A-----T------A-TGAA-AGA-----A----AA---------G-------------A-AAA--T-T------TA-A-C-T-TTAA--ATTC-AACAA----AGTTC-ATGCA-TTAGG-TCGT-CTTCAAAAT---GC--T-T----AT----CTTTGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------G------CC-T-T--A------A--------tcataatcgacagtaacttatcatcctttat
gi|28 : aagAAA-TAA----GTTTATCTAGCAAAA-------TAC--ATGTTAACA-T-T---TTC--ACAATA--TGAATAA--AT-TA-C-TTA----A-T-CAATCT-C-ATATA---TT-------TTTGA---TATTTGTCA---GTAC-----CTAG--GGA--ATCTTTT-C-TAA---TTA----TGGT-T---TCAAT-T----------------------------------------------A-T---T-GCCT--TTT-----TA-TGTTAAACCA------CA-C--CT-T----G--T-GAAA-TA-AAATTC-------TTT---G-T---TGTT----GTAAGATA-T---CT-----T--TGGAA--TTAGCAT--GAC----TGCAGG--GAAC-T-----TTT-TCCA-GGAA-A-G-----A----AA---------G-ATCA----CAA-A-GAA--T-A------TT-T-C-cattaaa
gi|29 : aaagACA--TAACAACT-AT-TA--ATTACAAA--T-CAATAT-T-ATGTA---TTAAGAAGTTCATACAGTATCTGACA---ATAC-----CAAG--AGA--ATCATT--C-AAA-----A----TGGT-T---TAATTGT--TT----T-----TCATTCT-T-AC--CC---TGAAACAGG---TA-T---T-ACCC-------------------ACAG------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TC-AAATT--------TA----A-C---TGTT----AGAAGGT-------T-----TAATCAAA--TT-GCAT--GGA----TGCAGA--AGAC-T-----TTT-GACA-GGAA-ATT-----A----AA---------G-GCTG----CAA-A-GAA--T-G-------A-T-C-C-CAAA--taaa
gi|3 : catattttcttAAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCAAACATGAGAAAA----ACTAAGAAAAA-AAA----GTTAA----GCGGGA-CT-G--TTCTGATATGAATA-TCG--------ACAACA--TAGATAA--TT-TC-CAAT---AAA-T-TAATCT-C-ATATA---CT-------TT-TA---TATTTTTCA---ATAT-----CTA---AAA--ATCATAT-G-GA----TTA----TGGT-T---TCATA-T--TC----T-----GGATTTT-CGACTATT---T-ATCCACT---T--T---T-ATCC--GTT-----TA-TATAAAACAC------TG----TT-T----GAAT-GAGA-TA-CAACTG-------TT----T-A---TGTT----TAAG-------TTAT-----A--CCAAA--TT--CAT--GGC----TGCAGA--GAAA-T-----TGT-GCCA-GAAA-ATA-----C----AA---------G-GTCA----C-A-ATTAA--T-G------TT-T-C-A-GAAA--AAGC-ATCCT----TACTC-ATTCA-TTGGG-T-AT-CC--GAAGTTC-GT--A-T----AT----C---TGT--CAA------T--A------A----C------C------T------------CCTGTTTAA-T-T--G------A--------AA-----------T--A------AGAAT----TT-T------A-A---ATT---TTA---AT----A----AAATTG---------T-TATTGAT---TT-------------------------AT--AA--AT-T-A--TGTTTGTG-----T-T------GCC------------G------------A------------C----TCT--A-----A-TTCAGTTTTA-A---GC--T-ATGC-T-TT----AC---ATGCCTAG--------C---------T----------A-----------G-------
gi|30 : ttccctatcaggaatacttcctgtttgaagtgtcttgattgaagtactatatcaatata-A-AAA--T-G------TT-T-C-C-AGAA--ATGT-ATAAC----AATTT-ATGTA-CTAGA-C-ACACT---AACT-------A-G----GT----C---ACT--AAA------A--T------A----CGT----CTCTG--T------------G------TA-T-T--A------A--------AAT----------C--A------GA--T----CT-TAATTTGG-A---GACGCAT-A---AT----A-TTAGAA-TCAACTTCTTTTATATCAA----TTTT--T----C--A------------AT--AAAGAA-T-C--C--T--TG-----T-TTCAAACT-C------------G------------A------------T----ATT--A-----T-GATA---TGACA---TTAAC-GT---T-TT----AC---AT-----------------------------------A-----------G-------T---------T-----GG----TT----AAGGTACCCAT----AC----ATCT-T--AC--A----Tgt
gi|31 : agaaat-T-TAATCT---ATAT--------------TG-A---TATTTGTCA---ATA------------------TCATTT-C-AGA---TTA----TAGT--------GT-T--TT----T-----TC-TTCT-C-AA--TC---T-AAACAGT---TA-T---T-TGCT--CTTATATGTA-TGTAAAGCAG------CATT--TT-T----G--G-GAGA-TA-AACTAGT------TT----A-T---TGAT----AAACAACA-A-CT-T-----T--TCGAA--TT-GCAC--GAC----TCTGGA--GCAC-T-----TTaa
gi|31 : --CTT-----TA-TCTCAAACAG------AA-G--TT-T----G--T-GAGA-TA-AAA-TG-------CT----GTT---TGT--------AAATA-C-TTCatctcaaacagaagtttgtgagataaaatgctgtttgtaaatacttc
gi|32 : ttaatctatattgatatttgtcaatatcatttcagattatagtgttttttcttctcaatctaaacagttatttgctcttatatgtatgtaaagcagcatttttgggagataaactagtttattgataaacaacaacttttcgaattgcacgactctggagca-A-GAA--T-G------TT-T-C-C-GAAA--GTTTTATCAT----GGTTC-ATGCA-TTAGG-T-AT-AC--GAA-TT--------------T----C---AAT--AAA------T--T------G----C------T------TCCTT--------A------CA-T-C--A------A--------AATAGTAACATAAC--A------TA--T----TT-T------G-AA--GTCACATT--------------GGAA----A-----TTT-TATTGAA---TTTT--T-------A------------AT--AA--GT-T-C--TGTT--TG-----T-T------
gi|33 : aacattgttttgagagataaaatagcttattgttaaaatgtagaaA-T-T--A------A--------AA-----------C--A------TA--T----TT-T------G-AA--GTCGCATTA---CT----A-TCAGAATTCAGTCCTTTTT-TATTGAT---TTTA--T----A--A------------AT--AT--AT-T-C--TGTG--TA-----T-T------G-CT-----------G------------A------------C----TCG--A-----A-CT--------CAGTTTT--CAGTAA-T-TA----AC---ATGCCTA---------C---------C----------AAGGTACCTATGG-------T---------G-----GA----TTG---AATCT-CCTAT----ATGTA-ATTT-T--AC--ATGTTTGTATTTTTGCTCCA--AAACGTTTTTTAtcaaactcaaatttcagtttttg
gi|34 : a----A-TTGGAACCAAACCTGTTTT-TATTAGT---TTTTATT----T--A----------------CA--AT-TTC--CATT--TG-----T-T------G-CT-----------G------------ACCTAAATTCAG-T----TTT--A-----ACATA----TGGCA---TT--G-ATGA-T-TT----AC---TGGACTAA--------C---------C----------AG----------G-------T---------GCCCGCAACACTTTG---AATGT-TCC-T----ATGTA-GTTTAC--AC--A----TG---TTTTGTTttca
gi|35 : ttacattaatagatgtgtcataaagttacacacatgtcatAAA-TATATAGGTTTA----GGATAG-CT-T--TTC--ATGTGAATA-T-T---ATT--ACAATA--TAAATAC--AT-TC-CAC-----AA-T-TAATCT-A-ACGTA---TT-------TTA-A---TA-----CA---ATTT-----ATAA--GGA--CACATTT-C-AAA---TTC--------------CA------------------GC-------------C---T-AAACCAT---TA-TAACT-GATC--CTT-----T--TGTAAAACAG------AG-T--TT-A----G--T-GAGA-TA-CA-TTG-------TT----T-T---TATT------AAAATA-T-TCTT-----T--TCAAA--TT-t
gi|36 : -A---GTTGCAT-A---CT----A-GTGGAAACAATCTGGCTTT-TATTATC---TGTT--T----A--A------------AA--TA--AT-T-T--AGTT--TC-----T-T------G-C------------A------------AACGCAAATTCAGT----TTC--A-----T-GTTA---TGGTA---CT--C-GTGA-C-TT----AC---TTGATTAA--------C---------C----------A-----------GGTACTCGT---------G-----GA----TCGTTAAACGT-CTCAC----ATGGG-GTTT-T--AC--A----TGTATT
gi|37 : aataagggtgtataatatgaT--ATAACA--AAAATATGAAC-TA-CATAACAAAA-T-TGATGT-C-ATGAA---TA-------GTG-A---TAATTGCCA---GTAC-------------------ATTT-C-AATAGCTTT----TG-T-T---TCATT-T--TTATTTT-----GCATTCT-C-AC--TT---T-AACCAGT---CA-T---T-GCCC--CTT-----CG-TTCAAAACAT------TG-T--TT-C----A--T-GAGA-TACAACTGG-------CT----C-T---TATT-------AAATG-CATTCT-----T--TCAgcctaa
gi|4 : aATACTAATTGAAA-TAT----GCTAA----GCAA---CC-GATTTC--ATATGCATG-T-T---CTT--GCAATAGATAACTAC--AT-TA-CA--ACAAAA-C-TAATCT-C-ATTTG---TT-------TTGAA----AGTTGCCA---GTA-----------------ATTATTT-C-AAT---TTT----T--T-TATATCAAT-T--TT----T-----TCATTCT-C-AC--TCA--T-AAGCGG-----A-T---TCGCCC--CTT-----TA-TGTAAAACAG------CA-T--TA-T----G--T-GAGA-CA-AAGTTT-------TT----A-T---TATT------AAAATG-T-TTTT-----G--T---A--TT-TTAT--GAC----TGTACA--GAAC-T-----TTT-GCAA-GAAA-ATA-----A----AA---------G-GCTA----C-A-ATAAA--T-A------TC-T-C-A-GGAA--ATTC-ATCCC----AGTTA-ATGCA-TTAGG-T-AA-CT--GAA-TTCAAC--A-T----AT----T---AGT--AAA------T--T------A----C------T------TCTCTTTTTATCAA------TA-T-T--A------A--------AA-----------C--A------TA--T----TTGC------A-A---GTCGTATGA---AA----ACTCCAAATTCTATTCA-TGT-TATTGA----TGTT--T----T--A------------AT--GA--AT-T-C--TGTT--TG-----T-T------G-CTGACTTTAATTTA------------A------------T----TTT--A-----A-GCAA---TGACA---TT--C-ATGC-T------------AGG--TAT--------C---------C----------ATT---------G-------G---------G-----GA----TTG---AAAGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-A--AC--A----AGTAGTTTTATTGCT--AAACTTATTTTAt
gi|42 : ATTCAAGCTATTTT-TATGGAT---TTTG--T-------A------------AT---A--AA-T-CATCATT---G-----C-T------A-CCAACTCAAAT--A------------A------------T----TTC--A-----T-GTAA---TGACA---CT--T-GTGA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------T----------A-----------GGTT----TCCAAA----G-----GGCT--TTG---AATGC-CC--T----TTGT----TT-T--AC--A----TGAATCTAC-TTACT--AAACTTACTTTtt
gi|43 : gTTATATACATGTA---TATACTAAGTAAAA-TGT----GTTAT----GCAAGTACT----TTT--ATATAAATA-T-G---TTT--GCAATA--TAAATAC--AT-TA-CA----AAGA---TAATCT-C-ACGTA---TT-------TTG-G---TATTTGCCA---ATAG-----ATAA--GGC--ATCATTT-tatcg
gi|44 : attaataattatcaccagT-------TTTTA---TATTTGTCA---GTTG-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AAA---TTA----TGGT-T---TCACT-T--TT----T-----ttata
gi|44 : T-----T--TTATA--TT-TCATTCG-C----TGCAGA--GAAC-T-----TTT-GCCA-GGAA-ATA-----A----AA---------T-GCCA----C-ttttttcattctttcatagttatataattttatatttcattcgctgcagagaacttttgccaggaaataaaatgccacaaaattatacctaaa
gi|45 : tttttatatttgtcagttgctagggaatcatttcaaattatggtttcactttttttttttcattctttcatagttatataaG------CA-T--TT-T----G--T-GAGA-TG-AAATGA-------TT--------------------AAAACA-T-TTCT-----T--TCTAA--TT-GCAT--GAT----ATTAGC--AAGC-T-----TT--GCCA-GAAA-ATA-----A----AT---------A-TATG----C-A-A-ATAA-T-G------TT-T-C-C-AAGA--ATAC-ATCA------GTTC-ATGCA-TAAGG-C-AT-CT--GAAGaaaattatacctaaa
gi|46 : ----TGGT-T---TCATT-T--CT----T-----GCATTCT-C-AG--AC---T-AAACA--------------------------------------CAG------CG-T--GT-T----G--T-AAAAATA-AAAGTG-------TTT---G-T---T-TT----AGAAGAT----TTCTATCACT--TGAAA--CT-GCAT--GCC----TGCATATAGAAA-C-----TTT-GCCA-GAAA-ATA-----A----AA---------atgtagttttacat
gi|47 : -GAAA--ATGC-ATCTA----AGTTC-ATGCA-TTACA-T-GT-CT--GAAGTTC-AT--A-T----TT----C---AGT--AAGAAACCTT--C------A----T------T------T------------A------CA-T-T--A------A--------AA-----------T--AAGAATGTA--T----TT-T------GAA---GTCGC-TTA---GT----A-TCAGAATaatatcacaaagaatgt
gi|48 : caGTAATATATACTGAGAAAAAATAT----GTTTA----GCAATT-CT-A--A-C--ATATGAAAT-T-G---TTT--ATAATA--TAAATAC--AT-TA-----A-AAAA-T-TAATAA-C-ATGTA---TT-------TTG-----------CCA---ATAC-----TTAG--GGA--ATCATTT-C-------------------T---TCATT-T--TT----catttatactgccaactcatatttactttt
gi|49 : ATTACAAAA-T-TAATCT-C-A-GTT---TT-------TT-TA---TATTTGCCA---ATGTA----TTAGTGGGA--ATCATTT-C-AAA---TCA----TGGT-T---TCATA-T--TT----T-----GCAGTCTAA-AG--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----TT-TATAAAA
gi|5 : tt--ATATGTTTA-T-G---TTT--GCAATA--TGAATAC---------ATTGTAAAA-T-AAGTAG-T-ATGTG---TT-------TTGGA---TATTT--------T-C-----CTAT--GGA--ATCATTT-G-AAT---TTT----TGa
gi|5 : a---TTG----TGTT-T---TTTTT-TC-TT----T-----GCATTCC-C-GC--TC---T-AAACAGA---CA-T---T---------------------AAAACAG------TG-C--TT-T----G--T-GAGA-TA-AAATTGA------TT----G-T---ATTT----CAAGG----T-TCCT-----T--TCATG--TT-GTAT--GTC----TTCAGA--GAAC-T-----TTT-GCAA-GGAA-AT--------------------------------------GAA--T-G------TC-T-C---GGAA--ATAC-ACCAG----AGTTC-ATGCC-TGTGG-T-AT-AT--GTAGTTT-GC--A-T----GT----C---ATT--TAA------T--T------ACTTTC------C------T------------T------CA-TAT--C------A--------AA-----------C--A------TG-----------------------GTAGTATAA---AC----A-TCAGAACTCAGTTCATCTT-C-TTGAT---TGTT--T----T--------------------A--AT-T-C--GGCT--TC-----T-T------G-C------------T------------G------------T----CTC--AAATTCA-GTAA---TG-TA---CT--C-GTAA-T-TT----GT---ATGACTAGTTAGGTTAC---------CAT--------A-----------G-------G---------G-----GA----TTG---GATGC-CGCAT----ATGTT-ATTT-T--tgtgtatgtgttgtagttgttgttgttgtttgtgtttttttttctttgcattcccgctctaaacagacattaaaacagtgctttgtgagataaaattgattgtatttcaaggttcctttcatgttgtatgtcttcagagaacttttgcaaggaaatgaatgtctcggaaatacaccagagttcatgcctgtggtatatgtagtttgcatgtcatttaattactttccttcatatcaaacatggtagtataaacatcagaactcagttcatcttcttgattgttttaattcggcttcttgctgtctcaaattcagtaatgtactcgtaatttgtatgactagttaggttaccataggggattggatgccgcatatgttatttt
gi|50 : aatatgtttatgtttgcaatatgaatacattgtaaaataagtagtatgtgttttggatattttcctatggaatcatttgaatttttgtgtgtatgtgttgtagttgttgttgttgtATCACAAAA-T-TAATCT-C-ATGTTGTTTT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATAC-----ATTG--GGA--ATCATTT-C-AAA---TTA----TGGT-T---TCATA-T--TT----T-----GCAGTCT-A-AG--TC---T-AAACAGT---AA-T---C-ACCC--CTT-----T--TATAAAA
gi|51 : tTT--C-----A-GT-----TGCCA---TT--T-GTTA-T-TT----AC---AAAGCCAG--------C---------T----------A-----------GA------TAGGG-----G-----GA----TTG---AATGT-CCGGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TTTA-TTTTGTTACT--AAACTTATTGTAa
gi|54 : tgttaattgctgactcaagGGAATCAAAACCAATTT-TATTGAT---TCTA--A----A--A------------AT---A--AT-T-A--TATG--TG-----C-T------G-CCAACTTA-----G------------A------------TATTTTTT--A-----A-GTAA---CGACA---TG--T-GAGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------ttcaa
gi|56 : -----GA----TTG---AATGT-CCTGT----TTGTA-ACTT-T--TC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACTTATTTTA
gi|57 : ttacaagaccagcttggtacctttgggtT--G-----A-ATAT---TGGCA---TT--C-GTAA-T-TT----AC---ATACCTAA--------C---------T----------AT----------G-------TACCTATACGG-----GA----ATG---AATAT-CCTGTG---AT-TA-GTTT-T--ACTTA----T-TGTTTTTATtttagtat
gi|58 : -TGTACTG-GGAAAA-TAT----GTTCA----GCAAGT-CTTG--TCC---------TG-T-A---TTT--ACAATA--GGAATAC--A-------TTACAAAA-T-TAATTC-C-ATGTA---TT-------TT
gi|59 : a-TATACCAAGTAAAA-TGT----GTTGA----GCAAGT-AT-T--TTT--ACATGAAAA-T-G---TTT--ACACTA--TAAATAC--AT-TA-CA
gi|6 : tatacttactggC--ATATGTATA-C-T---TTT--ACAACA--TAAATG---GT-TATCATGG--AGA-TATAAT-----------------------TG-A---TGTTTGTTC---ATAT-----CCAG--GCA--ATCATT--C-AAA---TCA----TGGT-T---TCA------------T-----G------------------------------TA-T---T-GCCC--CTT-----TTATGTTAAACAG------TA-T--TT-A----G--T-GAGA--A-AATGTG-------TTAATTG-T---TGTT----G----------TTTT-----T--TCAAA--TT-GCAC--GTC----TGTAGA--GAAC-A-----TTT-G--A-AGAA-ATA-----A----AA---------AAGCCG----C-A-A-AAA--T-G------TT-T-C-C-AAAA--AAGC-ATCAC----AGTCC-ATGCA-TTACG-T-AT-TC--AAAAT-C-GT--AAT----GC----C---AATTGACA------T--T------A----AAA----C------A------------A------GA-T-TCTA------G--------AA-----------C--A------TA--A----TT-T------G-AT--ATCGT-TTA---TC----A-TCTGAATCAAATTCCTTTT-AATTTAT---TTGT--T----T--G------------TTACCG--ACATGC--CGAC--TGAAA--T-T--------C-------------------------A------------T----TTT--A-----A-GT------GACA---TT--T-GTGA---------AC---A-GATTGT--------T---------C----------A-------------------T---------A-----GAGCT-TTG---AATGC-CCAAT----ATGTA-GTTT-T--TC--A----TGTATTTTCCTGACTTAAAACTT-TTT
gi|60 : AAATA-T-TCAT-----T--TCAAT--TT-GCAT--TGC----TGCAGA--GATA-T-----TTT-GCCA-AGAA-CTA-----A----Agcaatcagtt
gi|61 : --TCAAA--TT-ACAT--AAC----TGCAGA--GGAC-T-----TTG-GCTAGGGAA-AT------------A---------G-GCTG----CAA-A-GGA--T-G------TT-T-C-cgtctacaga
gi|62 : -TA-CATTACAAAA-C-TGATCT-C-GTGTA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----Caga
gi|7 : catgtaATA-T-GATTTTT--ACAATA--TAAACAT--AT--A-C----CAAAA-G-TTATCT-C-ATATA---AT-------TTGC----TATTTGTCA---ATAC-----CTC-----ATTATTGTTT-C-AAA---TTA----TGAT-T---TCA-T-T--TT----T-----ATAGACT-T-AC--AC---T-AAAATGC---T--T---T-GCTC--CTT-----TA-TGCAAAACAA------CG-T--CG-T----A--T-GAGC-TA-AAATCA-------TT----G-T---C---------AAAATA-T-TTCT-----T--T-AAA--TG-TCGT--AGC----TCAACA--GAAC-T-----TAT-GCCA-CGAA-ACA-----A----CA---------G-ACCG----C-C-A-AAAAGC-G------TT-C-T-C-GGAA--ATCC-ATTATGTAGAGTTT-ATGCA-TTATG-T-AT-AA--GGAGTTC-AT--A-T----GT----C---GGT--ATA------T--T------GACT-C------CCA----T------------A------CA-T-T--A------A--------AGTAAAGC-----C--G------CA--T----TT-T------GAA---GTCGCATT----CT----A-CCGGAACCAAACCCATTTC-TGTTTAT---TTCT--TACA-T--AATGCATTATGTCGT--CG--AC-T-C--C-----TA-----T-T------A-A------------G------------T------------T----TTA--A-----A-GTTA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AT---A
gi|8 : ttaat-ATATA---TT-------TTA-A---TATTTCTTG---ATA------------GGA--ATCCTTT-T-AAA---TCA----TGGT-T---TCACT-T--CT----T-----GCATTCA-C-AG--AC---T-AAACAGT---TA-T---T-ACCCAAC--------A-CATAACTCGG------CA-C--TT-T----G--T-GAGA-TA-AAATTG-------TT------------TT----AAAGA-T--T-TTCT-----T--TAAAA--TT-GCAC--GAC----TGCACA--GAAC-TTTCAATTT-GTTA-GGAA-ATG-----A----A------------------------T-GTA--T-G------TT-A-C-CAAAAA--ATGC-ATCCC----AGTTC-ATGCA-GAAGG-T-AT-CT--GAAGTTT-GT--A-T----TT----T---GGT--TCC------T--C------A----C------T------TG-----------A------TA-T-T--A------A--------AG-----------T--A------AG--TATCATTAT------GAA---GTTGGAT-A---AT----A-TTGGAATGAAACTGGCTGT-TAATGAT---TTTT--T----T--A------------AT--AA--AC---------T--TG-----G-G------G-A------------GT-----------A------------TA---TAT--A-----A-GTTA---CGAC-----T--A-GT-----------------TGGGTAC--------C---------CAT--------A-----------G-------T---------G-----CT----TTA---AATTT-TCTCT----ATGTA-AGTT-T--AT--A----TGTATTTTTCTTTCT--
gi|9 : TT--ACAATA--TAAATAG--AA-TA-CA------AA-G-TAATGT-A-ATGT-----T-------TTATA---TATTTGCT-------------------------TCATTTTC-GAA---TTA----T--T-T---TCATT-T--TTGTT-T-----GCATTTT-C-AT--GT---T-AAACAGC---TG-T---T-GTAA--GGT-----TA-TGTTAAATAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TA-AGCTTC-------TTT---A-T---CATT----AAAAAG-G-T-TCCT-----T--TTAAA--TT-ACAT--GAA----TACAAA--AAAG-T-----TTT-GCTA-ATAA-ATA-----A----AACAAAATACAA-GCTT----A-A-A-GTA--T-G------TT-G-T-T-GAAA--GCAC-ACCAC----AGTTC-GTTTA-TTAGA-T-AT-CT--AAA--TC---------------------------AAA------T--T------A----CACCTCTT------T------------A------CA-T-T--A------AAATAAC--AA-----------C--G------TG--T----TTAA------A-A---GCCGTATTAAATCG----A-TCGGAATCAAACTTGTTTT-TATAGAT---TTTtcag
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GCATTCTCAGGATAAACAGTGAATATTATTAGTAAAAAAAGTGCTTATTGTAAGAGTATGTATTTAAAATTGCTAGACAACACAGTTGCTTTGTCGGATATTAATTAAAATGAATCAAAAGAATAATTAAGACAATGCATCACAGATCATGCTGCTAGGTTATAGCCGGAGTCTGTTATTTACACCGTGCCCCCTTTACATTGAAATATGAACGTACTTTGAGATAATTTCTTTTGACATTCTAATAGATTCCATTTGTTACGGACTTAAATTCATTTTTGTAAATTGTAACATTCAT
Unaligned ( gi|26 ): TTAAACCACTTATAATATTACTGTTATGATCTTTACCTATCAGATTGAAACCTGTGAATTATCTAAAAGAATGAAAATTAATTGTTATAGGGCTGTGTATTGCTTGACCAATGCTGATACAATATGTATCGCAATTCAGGTATCCAGATACAAGATACAATGCGATACAGATTATTATTGAAAATGTGATGGAATTCAAGAGTATCTTTAACATTAAGTAAAATATATACGGTGTTGCCCGCTTAACACATCATAACAAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTTATTTGGACTGTGCACAGTATTGCTTGACCAATGGTGATCTGATATGTATCATGGTATAGGTATCCCGATACGCCATACAATACAGATTATTATTGAAAATTTGATGAAATCCATGAGTAACTTTTAACATTAAGTAAAATGTATACACAGTATCACCCTCTTAACACATCATT
Unaligned ( gi|39 ): AGGGATGTGCATTGCTTGGCCAATGCTGATTCTATATGTCTCATGATACAGGTATCAGATCCTGATACACAATACAATATGATACAGATTTTTATTGAAAATGTGATGAAATGCATGTGTCACTATTAACATTAAGTAAAGTATATATACAGTATAACATTCTTCACACATCATAA
Unaligned ( gi|40 ): TAGGGTTGTGTATTGTTTGACCATTGGTGATACAATATGTACCACGATACATCATCCCGATACGCGATACAATACGATACAGACTATTATTGAAAATGTGATGAAATGTATGAGTACTTCTAACATTAAGTGAAATACAAACGGCACCACTCTCGTTATACATAACAT
Unaligned ( gi|41 ): AGGGCTTTGTATTGCTTGACCAATGGCGATACAATATGTATCATGATACAGATAATCTGACACGCGATACAATACAATATAAATTATTGTTCAAAATGTGAAATCCATGAGTAACTTTTAAAATAAAGTAAATATATATAAATATACGGCATCACACTCAAAA
Unaligned ( gi|52 ): TGATTGTTCATTAATGTGAAGGATGAATTGTTCTAGGACTGTGTACTGCTTGACCAATGACGATAAGATTTGTATCTAAATATAGTATCATAATACGCGATACAACATGATACAG
Unaligned ( gi|53 ): GTATAATACATCCCATTACACTTAACAGTATAATACAAACAGTTTTCAAAATTCATGAGTAAATTTTATGTAAAATATATATACGGTATCACCCTCTTACACATCATATCAAA
Unaligned ( gi|55 ): TGTGATTGAAAATGGGATGAAATCCAGGAGAAACTTTTAAAATTAAGTATAATATATATATGGTATCAATCTCTTAACACATCATATCAAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 4444444 1 1111 333333333333333 11 22222222222222 11111111111111111111 1111111111111 11111111 1111111 2222222222222222222222222 22222222222222222222222222222222222 111111111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111111111111111111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111
lowQualScore : 8888 0 3333333 3 1 8888 1 6666 888 4 3 7777 0 7777 777 5555 33 2 44 33 22 333333333333333 111 0 55555555 222 4444444 77 222 1 222 11111111111111 22 1 1 22 55555555 3333 11111111111111111111 1 222 1 44444444 4444444444444 0 1 1 33333333 1 444 1 222 1 444 33333 1 3333333 1 11 1 2222 11 1 1 333333 0000000 0000000000000000000000000 33333 11 333 1 11 2222 11 555555 1 11 5555555 1 3333333 33333 2222 66666666666666666666666666666666666 33333 2 111 2 11 0 1 3333 1 1 1 0 1 1 22 222 1 111111111111 6666 22 444444 44 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 3 44 1 5555 1 44444444444444444444444444444444444444 22 77777 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 33333 1 00000 333 22 1 2 1 1 3333 333 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 3333 333 2 55 6666 2 2 22 33 4444 1 1 444
lowQualScore : .... . ....... . . .... . .... ... . . .... . .... ... .... .. . .. .. .. ............... ... . ........ ... ....... .. ... . ... .............. .. . . .. ........ .... .................... . ... . ........ ............. . . . ........ . ... . ... . ... ..... . ....... . .. . .... .. . . ...... ....... ......................... ..... .. ... . .. .... .. ...... . .. ....... . ....... ..... .... ................................... ..... . ... . .. . . .... . . . . . . .. ... . ............ .... .. ...... .. ................................................................................................................................................... . . . .. . .... . ...................................... .. ..... . .................................................... .. ..... . ..... ... .. . . . . .... ... . ............................................................ ..... .... ... . .. .... . . .. .. .... . . ...
lowQualScore : 3333 7 3333333 3 0 1111 4 3333 888 9 3 1111 8 1111 222 8888 22 4 55 11 99 111111111111111 999 7 00000000 777 8888888 11 777 0 777 44444444444444 11 5 6 11 66666666 1111 66666666666666666666 4 444 4 44444444 3333333333333 9 3 4 33333333 4 888 4 444 4 444 22222 3 9999999 3 88 3 7777 88 3 3 777777 6666666 3333333333333333333333333 00000 66 888 2 77 7777 77 111111 3 00 7777777 2 9999999 00000 6666 22222222222222222222222222222222222 11111 6 333 8 99 7 4 0000 4 4 4 1 5 5 00 222 4 999999999999 7777 11 444444 22 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 0 1 99 6 8888 6 99999999999999999999999999999999999999 22 11111 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 88888 5 55555 000 44 7 4 7 7 7777 222 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333 9999 777 1 11 6666 1 1 99 11 7777 0 4 111
consensus : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCAAGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATTG-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----A----AA---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATG-----TT-TC-C-GNAA--ATGC-ATCAC----AGTTCA-TGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-GTA-T----GTC---GGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--TN-A-A---N----A-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AA--TA-A-----ATT---CCGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----A-GTAA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
Reference ( family-892 ) : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCAAGN-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATTG-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----A----AA---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATG-----TT-TC-C-GNAA--ATGC-ATCAC----AGTTCA-TGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-GCA-T----GTC---GGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--TN-A-A---N----A-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AA--TN-A-----ATT---CCGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----A-GTAA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|1 : AAACAAAATTTCCAACCATTAAAAATGGTGTACTGTGTATAAAAACTATATATATT--ATATATGTGTAAG-CATACTAGGTCAAA-TAT----GTTTA----GCAACA-CT-G--TTC--ATATTAATA-T-GTTT--ACATTA--TAAATAC--ATGTA-CATTACAAAA-T-CAATCT------C-ATATT---TT-------TTATA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAA--GGA--ATCATTT-T-AA--TT--------TT----TG-------------------AT-T---T-CA-----AT-TTT----T-------ACATTCT-C-AC--TC---T-AAACAGT---CC-T---T-GCTC--CTT-----T-TTGTAAAACAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------ACTTG-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTTT-----T--TCATA---TT-GTAT--GAC----TGTAAA--GTACA-----TT-AGCAA-GG----AA-A-------TA-----A----AA---------G--G--TTA----C--C--A-G----TATG-----CA-TC-T-GTAA--ATAC-ATCAC----AATTCA-TGC-A-TTAGG-C-AT--C--TGAAGTTT-GCA-T----GTC---AAT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AA----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----TGCA--TT-A-C---A----A-TCAGAATTTAACTCATTTT-TATTGTT---TTTT-T---T-----AT--TC-A-----AAT---CTGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----A-GTAA---TTACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT-----TGTA-GTTT-T--AC--A----TATATTTTTGTTGCT--GAATATATTTTA
gi|10 : T-T---T-TT-----TT-TTT----T-------GCTTTTT-C-AA--AA---T-GATCAGT---CA-A---T-GTCC--TTT-----T-ATAGGCAACAT------TC-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATTG-------TTTGTTGCT----AAAAAAGA-G-TTCT-----T--TCATA---GT-GTAT--GAC----TGCAGA--GAA-------------------------A-------TA-----A----AA---------T--G--CCA----CT-A--A-G----AATG-----TC-TC-A-TGCA--GTAC-ATCAC----AGTTCA-TGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGTCC-GCA-T----GCC---AGC--AAA------T--T------A----C------CCCCCTTT------------GT----------AT-T--A------AAATTAATT---AA------C--A------TG--T----TT-T------GA--A---G-C----CCCA--TA-A-A---A----A-TCAGAATTCAACTCATTTT-TATTGA----TTTT-T---T-----AA--TA-A-----AGT---ATGT------T--TC-----T-G------A-C------------T------------AAATTTTAT----T----TTT--A-----A-ATCA---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----GC---ATGGCAAG-----------------------------------------A-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATATA-ACTT-T--AA--A----TGAA--TTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|11 : gtatttttttA--AT--------TA----TA-------------------GT-T---T-CC-----TA-TTT----G-------GAATACT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TATT---T-GCCG--CTT-----C-CTGTATAAAAG------CG-T--TT-T----G--T-GGGG-TA----------TG-------TT-GTT---------AAATTA-T-TAGT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAT----TGCATA--GAGCT-----TT-TAACG-GGGA--AG-A-------TG-----A----AA---------G--G--CCG----T--T--C-G----CAAA-----CC-TC-C-AACA--CTGC-ATCAC----AGTTCC-TGC-ATTTAGG-T-AT--C--TGAAGGCT-GTA-A----GTC---GGT--ACA------T--T------A----T------A------T------------ATTTAAAATAAAAT-T--A------AG----------AA------C--G------TA--T----TC-T------GA--A---G-T----CGC---TT-A-A---T----A-TCAGAAATAAACTCGATTT-TATT-AC---TATC-T---T-----AA-----A-----A---------------T--TG-----T-T------G-C--------------------------------------------TT--A-----C-GT-------ACA---TT--C---AATT-TT----ACCTTGTAGGTAC--------C---------T----------T-----------T-------T---------G-----GA----T-------TGT-CCCCT----ATATATATAG-T--AC--A----AGTATCATGCTTGAT--TCACTCATTTTt
gi|12 : -T-TTATCT------CGAAGTG---TT-------T-ATA---TTTTTGTCA---ATA-------------AA--ATTATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-A---T-CA-----AT-TTT----T-------GC----T-C-AT--G------AGACATTAGACA-T---T-GCCC--TTT-----T-ATGACAAATAG------GG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATTG-------TTTATTGTT----AAGA--TA-T-TT----------TCAAA---TT-CCAT--GAA----TGCAAA--GAACTGC---TT-TGTAA-------AA-A-------CACCAACA----AA---------G--A--CTGATTTC--A--A-A----AATGCAAAGTT-CT-C--------TGC-ATTTC----AGCTCAATGC-A-TTAAG-T-AT--T--TGA-----------------------T--AAA------T--T------A----C------C------TCCCTTT------AC----------AA-T--A------AG----------AA------T--A------CA--T----TT-T------G---AAG-G-T-----GCA---A-A-A---A----A-TCAAAATATAGCTTGGTTT-TA----------TT-T---T-----AA--TT-A-----ACT---C------------TG-----T-T------G-A------------G------------A------------A----CTC--A-----A-GT
gi|13 : tagcaagtataaaaaaaagtagatAGACATGT-TAAT-AATATTAAGAAA-----C----GTTTT----GCGATT-CT-T--TTC--ATATTAACA-T--TTT--ATAATA--TTAATAC--A--------------------ATAT------C-ATGTA---TT-------TGGTA---G--TTGGCA---ATAT-----CCAG--GAA--ATCATAT-T-AA--AT--------TAGTCTTT-------------------GTAT---T-TA-----TT-TAT----T-------TTATTTT-C-AT--GT---C-AAACAAT---TA-C---T-ATCC--TTT-----A-ATTCAAAACAG------TT-G--TT-T----G--C-GAGA-T---------ACTT-------TT-TTT----------AAATG-T-TT------------AAAGATTT-GCAT--TTT----TGCAGA--GAA-------------CA-AT----AACA-------AA-----A----AA---------G--A--CCG----C--A--A-AT---AACT-----TT-AC-C-AAAA--A-GC-ATCAC----AATTCA-TGC-A-TCAGG-T-AT--T--CGAAGTTC-GTA-T----TTA---AGT--AAA------T--T------A-------------------------------A-----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAT----TA--T----TT-T------G---A---tttaaggtgaattta
gi|14 : ataTAAAACAT------TG-T--TT-T----G--T-TAGA-TAA------CCTTT-------GT-GTTGTT----AAAATACA-T---CT-----T--TCATA---GT-GTAA--GAC----TGCAGA--GAATG-----TA-TGCTA-GT----AA-T-------TA-----A----AA---------T--G--CCG----C--A--T-G----GACA-----TTCTT-C-GGAA--ATAC-ATCAT----AGTTCC-TGC-A-TTAGG-T-AT--C--TGAATTTC-GCA-T----GTC---AGC--AAA------TTAT------A----T------C------TTTTG--------AT----------AT-T--A------A-----------AA-----------------G--T----TT-T------T---AAT-G-T----CAAA--T--A-A---A----A-TTAGAGTTCAATACATTTT-GAATGAT---TTTT-T---A-----AA--TG-A-----ATTG--CTAC------T--AGCTAAAT-T------T-C------------A------------T------------T----TTT--A-----T-GTAA---TGACA---GT--C-ATAA-TGTTTGCGAC---AAG-CTAGATA-----C---------CTAT-------A-----------G-------C---------G-----GA----CTG---AATGT-ATAGT----ATGGA-ATTG-T--AC--A----ATTATTTTGGTTGCT--TAACTTACTTttgatttgtaagacattatgtgtattgtctatacat
gi|15 : ----G--C-GAGA-TAA------AATTG-------TTTGTTGTT----AAAA--CA-T-TTCT-----T--TCATA---TT-GTAT---AT----TGCAAA--GAAa
gi|15 : TT--A-----A-GTAA---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------TGGGTATCCATA-----------G-------G---------G-----GA----TTG---AATGT-CCTGT----ATGTA-AGTT-T--AC--A----TGTATATTTGTTATT--AAATTatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaagtaatgacattcataatttacatgactggctgggtatccataggggattgaatgtcctgtatgtaagtttacatgtatatttgttattaaattaaaatatcatttattgt
gi|16 : gcgagataaaattgtttgttgttaaaacatttctttcatattgtatattgcaaagaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----C-ATGTTGAACAG------CG-T--AT-T----G--T-CAGA-TAA------AATAG-------TTTATTTTT----AAAA--TA-T-TTCT-----T--CCAAA---TT-ACTT--GAT----TGCAGA--TAATT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------TA-----AACATAA---------G--G--C------C--A--A-A----CATA-----TT-TTAC-GCTG--ATGC-ATCAC----AGTTCA-AGC-A-TAAGG-C-AT--C--CAAAGTTC-GTG-T----ACC---GGT--ATA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------GC----------AT-T--A------A-----------AC------T--A------------------T------G---A-----------ACA--TA-ATA---A----G-TCGCAATTAGATTAGCTTC-TATTAAT---TGTT-TAA-T-----AAATTC-A-----ATT---TCAC------T--TA-----TAT------T-C------------A------------G------------T----TTTAAA-----A-GTTA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----Aaaaatatcatttattgt
gi|17 : atgatatgtacattcttgtatactggtaaaaagaagtttagcaagtattAAGT-CT-----TC--ATATAAATA-T-ATTTTTACAATA--AAGATAA--AT-T-----T-CAGAA-T-TAATCT------C-GTGCA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GAA--ATAATTT-C-AA--AT--------TA-----A-------------------GC-T---T-C-------------------------CATTCT-C-CA--GCTGTT-AAACAGT---TA-T---T-GCTC--ATT-----T-ATGTAAAA-AT------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TGA------AATCA-------TT--TT-TTAAAAAAAAAAAA-A-TCCT-----T--TCAAACT-CT-GCAT--TAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCG-AG----AT-A-------TT-----A----AA---------G--G--TTA----A--C--A-G----ATTG-----TT-AA-T-G-AA--ATGC-GACAA----AGTGCA-TGT-A-
gi|18 : ataaatttcaagagaaat-T---T-CA-----TT-TTT----TTCTCG--GTATTCT-C-AG--GC---C-AGACAGT---AA-T---T-GCTT--CTT-----T-GTATAAAACAGACTAATC--T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GATTA---------------------------------CT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GGC----TGCAGA--GAGTT-----TT-TACCC-GG----AA-A-------TG-----G----AA---------GT-A--CTT----T--A--A-G----ACGG-----TT-TC-C-GGAT--ATGC-ATCAC----AGTTCG-TGA-A-TTAAA-T-AC--C--AGAAGT-------T----GTT---ATT--AAA------T--TTTAC--A----C------T------T------------AC----------TT-TC-A------A-----------AA------C--A------TT--T----CT-T------aggctgtgtacagtttggttaaacgttgaattcttaaat
gi|19 : aatgcattttgatataaaataatgtctgcatggttgcaacattaattgtacatttcttgaaggatggcatttgttgaaatataaatattgcttaataT-----T-ATCTAAAGCAG------TG-T--TT-TTTTTG--T-GCGA-TAG------CATTG-------TTTGTTGTT----TAGA--TA-T-TTAT-----T--TCTTG---TT-TTAT--GAC----TGCAAA--GAACA-----TT-TTTCA-AG----AA-AATAAAAATA-----A----AA---------G--G--TCA----CC-A--A-G----AATA-----CC-TA-C-GGAA--ATAC-ATCAG----AGTTCA-TGC-T-TAAAG-G-AT--C--TGAATTTC-TTA-T----GTC---AAT--AAA------G--TCCATCCA----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA--------------------------T-T------A---A---G-----------------A---C----A-TCAG--TTTGACTTATT-----TTG-----TTTC-C---CAAAAAAA--AA-A-----AAT---GCGT------T--TG-----T-T------T-CT-----------G------------ACTTAAATTCAG-T----TTA--A-----A-ACAA---TGGCA---CT--C-GTAA-T-TT----AC---ATGATTAtcaaattacataa
gi|2 : AACAC--AT----CATAACAAAAAC-TAAGTT---------TTTA---TT-------TTG-A---TATCTGCCA---GTAC-----CTAA--GGA--AACATTT-CTAA--CT--------TT----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TT----------------------------------GAACAGA---CA-T---T-GTCA--ATT-----T-ATGTAAAACCA------CG-T--TT-T----G--TAGAGA-TAA------AATTG-------TT---TGTT----AAAAGCTG-T---CT-----T--TCACA---TT-GTAT--GAC----TGCAAA--GAACT-----TT-TACAA-T------A-A-------TA-----A----AA---------G--G--CC------------------AGTG-----TC-TC-A-GTAA--ATAC-ATCAC----AGTTTA-TAA-A-TATGC-T-AT--C--TGAAGTTT-GCA-TAT--GTC---AGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------CC----------CT-T--T------AT----------AG------T--A------TG--T----TT-T------G---A---AAT----TGCG--TA-A-A---A----A-TCAGAATTCAACTAATTTT-TATTGATTTCTTTT-T---T-----AA--TA-A-----ATT---CAGA------A--TG-----T-T------G-CCAACTTA-----A------------A------------TTCAATTT--A-----A-GTAG---TGACA---TT--C-ATAG-T-TT----AC---ATGACTGG--------CTCAGTATCAT----------A-----------G-------T---------G-----AA----TTA---AATGT-CCCATAATCATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACATATTTTA
gi|20 : tctcaatgagagcaggtatgagaagagcaatactatacagaatatcattgtaaatgtgatgaaaatcatgaataacttttaacagtaagtaaaatatatatacacagtatcaccaactt-GG----AA-A-------TA-----A----AA---------T--G--TTG----C--A--ATG----AATG-----TT-TT-C-ATAA--TTCC-ATTAC----AATACA-TGC-A-TAAGG-C-AT--C--C-AAGTTT-GTA-TTTTTGTC---AAG--AAA------T--T------A----T------C------TCCTTTC------AT----------AT-T--T------A-----------AA------T--AA-----TG--T----CA-T------A---AAAAG-T----CGCA--TA-A-A---ATAACG-TAGGCATTGAACCCCTTTT-CATTGAT---TTTT-T---A-----AA--TA-A-----ATT---CTGT------T--TG-----A-T------G-C------------GGACTCAGATTCAG------------T----TTT--A-----A-GTTA---TGACA---TT----GTGA-T-AA----AC---CTGGCTAT--------C---------T----------AG----------G-------TACACACA--G-----GATT--TTG---AA--------C----ATGTT-GTTT-TACAC--A----TGAAGTTTTCTTGCT--AAACTTAt
gi|21 : tgcatg--ATCATTC-C-AA--AT--------TT----TG-------------------TA-T---T-CA-----TG-TTTG---T-------ACACTAG-A-AT--GC---T-TAACAGT---TA-T---A-GCAC--TTT-----T-ATGGAAAATAG------CG-T--TT-T----G--T-GAAA-TAA------AATTGT------TT-GGTGTT----AAAAGA------TCT-----T----AAA---TT-GCAT--GGCTGCATGCAAA--GAAAA-----TT-AGTTA-TG----AA-A-------TT-----A----AA---------G--G--CTG----T--A---------AAT------------T-GTAG--A-------AC----AGTTCA-TGC-A-TTTGA-T-TT--C--C-------------------C---GGT--AGA------T--T------A----T------CTCCCTTT------------AC----------AT-T--AACCTACA-----------AA------CCTA------CA--T----TT-T--------------A-T----C-C------------T----A-TCGGAATCAAACCCATTAA-TATTGCTG--TTTT-T---T-------------------TT---CCTT------T--TT-----T-T-----------------------------------------------T----TTT--A-----A-
gi|22 : g-------GCATTCT-C-AG--GA---T-AAACAGTGAATA-T---T-A-------T-----T-A-GTAAAA-----------------------------------A------AAGTGC------TT-ATTGT------AAGAGTA-T-GTAT-----T--TAAAA---TT-GCTA--GAC----AACACA--GTTGC-----TT-TGTCG-GATATTAA-T-------TA-----A----AA---------T--GAATCA----A--A--A-G----AATA-----AT-TA-A-GACA--ATGC-ATCAC----AGATCA-TGCTG-CTAGGTT-ATAGC--CGGAGTCT-GT--T----ATT-----T--ACA------CCGT------G----C------CCCCTT-T------------AC----------AT-T--G------A-----------AA------T--A------TG-----------------A---A----------CGTACTTT-G-A---G----A-T---AATT-------TCTT---TTGA----CATT-C---T-----AA--TA-G-----ATT---CCAT------T--TG-----T-T------A-C------------G------------G------------A----CTT--A-----A-ATaatt
gi|23 : -TATACTGAGGAAAA-TAT----GTTTA----GCAAGT-CT-G--ATC--ATATCAATA-T-GTTT----------------------------CACAAAA-C-TAATCTTCATGGC-ATGTA---TT-----------A---CATTT----------------------------TT-TTT-T-AA----------------------------------------------T-CT-----TT-ATT----T-------ACATTCT-C-GC--TC---T-AAACAAT---CA-T---T-GTCC--CTT-----T-ATTTAAATCAA------TG-T--TTAT----T--T-TAGA-CAA------ATTTGAGATTTATT-GTTGTT----ATAA--TA-T-TTCT-----T--TTATA---TT-GTAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TG----------------------A-----A----AA-----------------G----C--AATA-G----AATG-----TC-TC-T-GTAAATATAC-ATCGA----AGTTCA-AGC-A-TTATG-T-AT--C--TGAAGTTG-CCA-T----GTC---AGT--ATA------T--T------tcatttttgtaaattgtaacattcat
gi|24 : AAA----AAAATACGTAAGAGGGTTGTACCAAAG-------CTATA-ATAACTC----------AAA-TATACTGAG-ATAA-TGA----GTTTA----GAGAGA-AT-T--TTC--ATATGCATAGT-GTTT----GATA--GAAATAA--AC-TG-C------AAA-T-TAATAT------C-ATGTA---TT-------TTG-A---TATTTTTCAATTATACTGTTACTA-----A--A-----T-G-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TG-TTT----A-------GGATACT-C-AG--GC---T-AAACTTG---TA-T---T-GTCC--GTT-----T-ATGT-AAACAT------TG-T--TT-
gi|25 : tccttatatggaataccacctctgtgaagtgtcttggttgaacaattatatcagtt-TTT----T-------GCTTTAT-C-AG--GC---T-TAGTAGT---TA-T---T-GTAA--TTT-----T-ATTCAAAACGG------TG-TGGTT-T----T--C-CAAA-TAA------A--TG-------TG-TTTATT----ATTCAATGGT-TTCT-----T--TCAGG---TT-GCAT--TAC----TGTAGA--GCACT-----TA-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----A----AA---------GCAG--CC--------A--A-G----AATG-----TT-TA-T-GTAA--ATGA-ACCAT----AGT----TG------AGG-C-AT--C--CGAAGTTC-GTA-T----GTC---GGT--TCA------T--A------A----T------C------G------------AC----------AG-T--A------A-----------
gi|27 : atattactaccaattttgattaatatttttatttttaacta---TT-------TTATA---TACATATCA---ACAC-----CTAA--AGA--TCCATTT-T-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TG-TAT----A-------ACTTTCT-T-AG--GC---T-AAATA-----TA-T---C-GCCT--TTT-----G-ATGT------T------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TTA------TAGTGT------TT-ACTGTT----AAAAGA-----TTAC-----T--TAAAA---CT-GCAT--AAC----GGCAGT--GAACA-----T------A-TG----AA-A-------GA-----A----AA---------G------------------A-A----AATT-----TA-AC-T-TTAA--ATTC-AACAA----AGTTCA-TGC-A-TTAGG-TCGT--CTTCAAAAT---GCT-T----ATCTTTGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------GC----------CT-T--A------A-----------cttatcatcctttat
gi|28 : aagAAA-TAA----GTTTATCTAGCAAAA-------TAC--ATGTTAACA-T-TTTC--ACAATA--TGAATAA--AT-TA-C-TTA----A-T-CAATCT------C-ATATA---TT-------TTTGA---TATTTGTCA---GTAC-----CTAG--GGA--ATCTTTT-C-TA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-------------------------------------------------AT---TA-T---T-GCCT--TTT-----T-ATGTTAAACCA------CA-C--CT-T----G--T-GAAA-TAA------AATTC-------TTTGTTGTT----GTAAGATA-T---CT-----T--TGGAA---TTAGCAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TTCCA-GG----AA-A--------G-----A----AA---------G--A--TCA----CA-A--A-G----AATA-----TT-TC-cattaaa
gi|29 : aaagACA--TAACAACT-AT-TA--ATTACAAA--T-CAATAT------T-ATGTA---TTAAGAAGTTCATACAGTATCTGACA---ATAC-----CAAG--AGA--ATCATT--C-AA--A----------A----TG-------------------GT-T---T-AA-----TTGTTT----T-------TCATTCT-T-AC--CC---TGAAACAGG---TA-T---T-ACCC-------------------ACAG------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TCA------AATT--------TA-ACTGTT----AGAAGGT-------T-----TAATCAAA---TT-GCAT--GGA----TGCAGA--AGACT-----TT-TGACA-GG----AA-A-------TT-----A----AA---------G--G--CTG----CA-A--A-G----AATG-----AT-CC-C-AAAtaaa
gi|3 : catattttcttAAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCAAACATGAGAAAA----ACTAAGAAAAA-AAA----GTTAA----GCGGGA-CT-G--TTCTGATATGAATA-TCG-----ACAACA--TAGATAA--TT-TC-CAAT---AAA-T-TAATCT------C-ATATA---CT-------TT-TA---TATTTTTCA---ATAT-----CTA---AAA--ATCATAT---GG--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTC----T-------GGATTTT-CGACTATT---T-ATCCACT---T--T---T-ATCC--GTT-----T-ATATAAAACAC------TG----TT-T----GAAT-GAGA-TAC------AACTG-------TT-TATGTT----TAAG-------TTAT-----A--CCAAA---TT--CAT--GGC----TGCAGA--GAAAT-----TG-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----C----AA---------G--G--TCA----C--A--ATT----AATG-----TT-TC-A-GAAA--AAGC-ATCCT----TACTCA-TTC-A-TTGGG-T-AT--C--CGAAGTTC-GTA-T----ATC---TGT--CAA------T--A------A----C------C------T------------CCTGTTTA----AT-T--G------A-----------AA------T--A------AGAAT----TT-T------A---A---A-T----T-----TT-A-A---T----A----AAATTG---------T-TATTGAT---TT--------------A--TA-A-----ATT---ATGT------TTGTG-----T-T------GCC------------G------------A------------C----TCT--A-----A-TTCAGTTTTA-A---GC--T-ATGC-T-TT----AC---ATGCCTAG--------C---------T----------A-----------G-------
gi|30 : ttccctatcaggaatacttcctgtttgaagtgtcttgattgaagtactatatcaatata--A-A----AATG-----TT-TC-C-AGAA--ATGT-ATAAC----AATTTA-TGT-A-CTAGA-C-AC--A--CTAACT-----A-G----GTC---ACT--AAA------A--T------A----CGT----CTCTG--T------------GT----------AT-T--A------A-----------AAT-----C--A------GA--T----CT-TAATTTGG---A---G-A----CGCA--T--A-A---T----A-TTAGAA-TCAACTTCTTTTATATCAAT---TTTT-CAA-T-----AA--AG-A-----ATC---C---------T--TG-----T-TTCAAACT-C------------G------------A------------T----ATT--A-----T-GATA---TGACA---TTAAC-GT---T-TT----AC---AT-----------------------------------A-----------G-------T---------T-----GG----TT----AAGGTACCCAT----AC----ATCT-T--AC--A----Tgt
gi|31 : agaaat-T-TAATCT------------A---TA-------TTG-A---TATTTGTCA---ATA------------------TCATTT-C-AG--AT--------TA----TA-------------------GT--------G-----TT-TTT----T--------C-TTCT-C-AA--TC---T-AAACAGT---TA-T---T-TGCT--CTTATATGT-ATGTAAAGCAG------CATT--TT-T----G--G-GAGA-TAA------ACTAGT------TT-ATTGAT----AAACAACA-A-CT-T-----T--TCGAA---TT-GCAC--GAC----TCTGGA--GCACT-----TTATCTC--------AA-A-------CA-----G----AA---------G--T--TTG----T--G--A-GATAAAATG-----CTGTT-T-GTAA--ATAC-TTCaa
gi|32 : -------TA-----A----AA---------T--G--TAG----A--A--A-G----AATG-----TT-TC-C-GAAA--GTTTTATCAT----GGTTCA-TGC-A-TTAGG-T-AT--A--CGAA-TT------------TC---AAT--AAA------T--T------GCTTCC------T------T------------AC----------AT-C--A------AAATAGTAACATAA------C--A------TA--T----TT-T------GA--A---G-T----CACA--TT----------------GGAA---A------TTT-TATTGA----ATTT-T---T-----AA--TA-A-----GTT---CTGT------T--TG-----T-T------
gi|33 : aacattgttttgagagataaaatagcttattgt----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TT-T------G---AA--G-T----CGCA--TT-A-C---T----A-TCAGAATTCAGTCCTTTTT-TATTGAT---TTTA-T---A-----AA--TA-T-----ATT---CTGT------G--TA-----T-T------G-CT-----------G------------A------------C----TCG--A-----A-CT--------CAGTTTT--CAGTAA-T-TA----AC---ATGCCTA---------C---------C----------AAGGTACCTATGG-------T---------G-----GA----TTG---AATCT-CCTAT----ATGTA-ATTT-T--AC--ATGTTTGTATTTTTGCTCCA--AAACGTTTTTTAtcaaactcaaatttcagtttttg
gi|34 : a------T------------AC----------AT-T--A------A-----------TA------G--A------TG--T----GT-C------ATAAA---G-TTACACACA--TGTC-A---T----A-TTGGAACCAAACCTGTTTT-TATTAGT---TTTTAT---T-----TA--CA-A-----TTT---CCAT------T--TG-----T-T------G-CT-----------G------------ACCTAAATTCAG-T----TTT--A-----ACATA----TGGCA---TT--G-ATGA-T-TT----AC---TGGACTAA--------C---------C----------AG----------G-------T---------GCCCGCAACACTTTG---AATGT-TCC-T----ATGTA-GTTTAC--AC--A----TG---TTTTGTTttca
gi|35 : tAAA-TATATAGGTTTA----GGATAG-CT-T--TTC--ATGTGAATA-T-TATT--ACAATA--TAAATAC--AT-TC-CAC-----AA-T-TAATCT------A-ACGTA---TT-------TTA-A---TA-----CA---ATTT-----ATAA--GGA--CACATTT-C-AA--A-------------------------------------T-T---C-CA-----------------------GC-------------C---T-AAACCAT---TA-TAACT-GATC--CTT-----T--TGTAAAACAG------AG-T--TT-A----G--T-GAGA-T-A------CATTG-------TT-TTTATT------AAAATA-T-TCTT-----T--TCAAA---TT-t
gi|36 : ---A---G-T----TGCA--T--A-C---T----A-GTGGAAACAATCTGGCTTT-TATT-AT---CTGT-T---T-----AA--AATA-----ATT---TAGT------T--TC-----T-T------G-C------------A------------AACGCAAATTCAGT----TTC--A-----T-GTTA---TGGTA---CT--C-GTGA-C-TT----AC---TTGATTAA--------C---------C----------A-----------GGTACTCGT---------G-----GA----TCGTTAAACGT-CTCAC----ATGGG-GTTT-T--AC--A----TGTATT
gi|37 : aataagggtgtataatatgaT--ATAACA--AAAATATGAAC-TA-CATAACAAAA-T-TGATGT------C-ATGAA---TA-------GTG-A---TAATTGCCA---GTAC-------------------ATTT-C-AATAGC--------TT----TT-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTTATTTT-------GCATTCT-C-AC--TT---T-AACCAGT---CA-T---T-GCCC--CTT-----C-GTTCAAAACAT------TG-T--TT-C----A--T-GAGA-TAC------AACTG----------GCTCTT----ATTAAATG-CATTCT-----T--TCAgcctaa
gi|4 : aATACTAATTGAAA-TAT----GCTAA----GCAA---CC-GATTTC--ATATGCATG-T-TCTT--GCAATAGATAACTAC--AT-TA-CA--ACAAAA-C-TAATCT------C-ATTTG---TT-------TTGAA----AGTTGCCA---GTA-----------------ATTATTT-C-AA--TT--------TT----T---------------------T-TATAT-CA-----AT-TTT----T-------TCATTCT-C-AC--TCA--T-AAGCGG-----A-T---TCGCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CA-T--TA-T----G--T-GAGA-CAA------AGTTT-------TT-ATTATT------AAAATG-T-TTTT-----G--T---A---TT-TTAT--GAC----TGTACA--GAACT-----TT-TGCAA-GA----AA-A-------TA-----A----AA---------G--G--CTA----C--A--ATA----AATA-----TC-TC-A-GGAA--ATTC-ATCCC----AGTTAA-TGC-A-TTAGG-T-AA--C--TGAA-TTCAACA-T----ATT---AGT--AAA------T--T------A----C------T------TCTCTTTTTATCAAT----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TTGC------A---A---G-T----CGTA--TG-A-A---A----ACTCCAAATTCTATTCA-TGT-TATTGA----TGTT-T---T-----AA--TG-A-----ATT---CTGT------T--TG-----T-T------G-CTGACTTTAATTTA------------A------------T----TTT--A-----A-GCAA---TGACA---TT--C-ATGC-T------------AGG--TAT--------C---------C----------ATT---------G-------G---------G-----GA----TTG---AAAGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-A--AC--A----AGTAGTTTTATTGCT--AAACTTATTTTAt
gi|42 : ATTCAAGCTATTTT-TATGGAT---TTTG-T---------AA--TA-A-----AT-----CATCA----T--TG-----C-T------A-CCAACTCAAAT--A------------A------------T----TTC--A-----T-GTAA---TGACA---CT--T-GTGA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------T----------A-----------GGTT----TCCAAA----G-----GGCT--TTG---AATGC-CC--T----TTGT----TT-T--AC--A----TGAATCTAC-TTACT--AAACTTACTTTtt
gi|43 : gTTATATACATGTA---TATACTAAGTAAAA-TGT----GTTAT----GCAAGTACT----TTT--ATATAAATA-T-GTTT--GCAATA--TAAATAC--AT-TA-CA----AAGA---TAATCT------C-ACGTA---TT-------TTG-G---TATTTGCCA---ATAG-----ATAA--GGC--ATCATTT-tatcg
gi|44 : attaataattatcaccagT-------TTTTA---TATTTGTCA---GTTG-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CACTTTTTT-TTT----T-------TCATTCT-ttata
gi|44 : T-----T--TTATA---TT-TCATTCG-C----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----A----AA---------T--G--CCA----C--A--A-A----Attcatagttatataattttatatttcattcgctgcagagaacttttgccaggaaataaaatgccacaaaattatacctaaa
gi|45 : tttttatatttgtcagttgctagggaatcatttcaaattatggtttcactttttttttttcattctttcatagttatataaG------CA-T--TT-T----G--T-GAGA-TGA------AATGA-------TT-------------AAAACA-T-TTCT-----T--TCTAA---TT-GCAT--GAT----ATTAGC--AAGC------TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----A----AT---------A--T--ATG----C--A--A-AT---AATG-----TT-TC-C-AAGA--ATAC-AT--C----AGTTCA-TGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGttatacctaaa
gi|46 : ----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TCT----T-------GCATTCT-C-AG--AC---T-AAACA--------------------------------------CAG------CG-T--GT-T----G--T-AAAAATAA------AAGTG-------TTTGTT-TT----AGAAGAT----TTCTATCACT--TGAAA---CT-GCAT--GCC----TGCATATAGAAAC-----TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----A----AA---------AATA--TCA----CA-A--A-G----AATG-----Tatgtagttttacat
gi|47 : -GAAA--ATGC-ATCTA----AGTTCA-TGC-A-TTACA-T-GT--C--TGAAGTTC-ATA-T----TTC---AGT--AAGAAACCTT--C------A----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAGAATGTA--T----TT-T------GA--A---G-T----CGC---TT-A-G---T----A-TCAGAAT
gi|48 : caGTAATATATACTGAGAAAAAATAT----GTTTA----GCAATT-CT-A--A-C--ATATGAAAT-T-GTTT--ATAATA--TAAATAC--AT-TA-----A-AAAA-T-TAATAA------C-ATGTA---TT-------TTG-----------CCA---ATAC-----TTAG--GGA--ATCATTT-C---------------------------------------------T---T-CA-----TT-TTT----catttatactgccaactcatatttactttt
gi|49 : ATTACAAAA-T-TAATCT------C-A-GT----TT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATGTA----TTAGTGGGA--ATCATTT-C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCTAA-AG--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-TTATAAAA
gi|5 : tt--ATATGTTTA-T-GTTT--GCAATA--TGAATAC---------ATTGTAAAA-T-AAGTAG------T-ATGTG---TT-------TTGGA---TATTT--------T-C-----CTAT--GGA--ATCATTT-G-AA--TTTTTGTGTGTA----TGTGTTGTAGTTGTTGTTGTTGT-T---TGTG-----TT-TTT----TTTTCTTTGCATTCC-C-GC--TC---T-AAACAGA---CA-T------------------------TAAAACAG------TG-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATTGA------TT-GTATTT----CAAG---G-T-TCCT-----T--TCATG---TT-GTAT--GTC----TTCAGA--GAACT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------T-------------------------------------------G----AATG-----TC-T--C-GGAA--ATAC-ACCAG----AGTTCA-TGC-C-TGTGG-T-AT--A--TGTAGTTT-GCA-T----GTC---ATT--TAA------T--T------ACTTTC------C------T------------TC----------ATAT--C------A-----------AA------C--A------TG-------------------------G-T----AGTA--TA-A-A---C----A-TCAGAACTCAGTTCATCTT-C-TTGAT---TGTT-T---T------------A-----ATT---CGGC------T--TC-----T-T------G-C------------T------------G------------T----CTC--AAATTCA-GTAA---TG-TA---CT--C-GTAA-T-TT----GT---ATGACTAGTTAGGTTAC---------CAT--------A-----------G-------G---------G-----GA----TTG---GATGC-CGCAT----ATGTT-ATTT-T--a
gi|50 : aATCACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTTGTTTT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATAC-----ATTG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCT-A-AG--TC---T-AAACAGT---AA-T---C-ACCC--CTT-----T--TATAAAA
gi|51 : tTT--C-----A-GT-----TGCCA---TT--T-GTTA-T-TT----AC---AAAGCCAG--------C---------T----------A-----------GA------TAGGG-----G-----GA----TTG---AATGT-CCGGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TTTA-TTTTGTTACT--AAACTTATTGTAa
gi|54 : tgttaattgctgactcaagGGAATCAAAACCAATTT-TATTGAT---TCTA-A---A-----AA--T--A-----ATT---ATAT------G--TG-----C-T------G-CCAACTTA-----G------------ATATT--------T----TTT--A-----A-GTAA---CGACA---TG--T-GAGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------ttcaa
gi|56 : -----GA----TTG---AATGT-CCTGT----TTGTA-ACTT-T--TC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACTTATTTTA
gi|57 : ttacaagaccagcttggtacctttgggtT--G-----A-ATAT---TGGCA---TT--C-GTAA-T-TT----AC---ATACCTAA--------C---------T----------AT----------G-------TACCTATACGG-----GA----ATG---AATAT-CCTGTG---AT-TA-GTTT-T--ACTTA----T-TGTTTTTATtttagtat
gi|58 : -TGTACTG-GGAAAA-TAT----GTTCA----GCAAGT-CTTG--TCC---------TG-T-ATTT--ACAATA--GGAATAC--A-------TTACAAAA-T-TAATTC------C-ATGTA---TT-------TT
gi|59 : a-TATACCAAGTAAAA-TGT----GTTGA----GCAAGT-AT-T--TTT--ACATGAAAA-T-GTTT--ACACTA--TAAATAC--AT-TA-CA
gi|6 : tatacttactggC--ATATGTATA-C-TTTT--ACAACA--TAAATG---GT-TATCATGG--AGA-TATAAT----------------------------TG-A---TGTTTGTTC---ATAT-----CCAG--GCA--ATCATT--C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----T-------------------------------------------GT----A-T---T-GCCC--CTT-----TTATGTTAAACAG------TA-T--TT-A----G--T-GAGA-AAATGTGTTAATTG-------TT-GTTGTT-----------------TT-----T--TCAAA---TT-GCAC--GTC----TGTAGA--GAACA-----TT-TG--A-AG----AA-A-------TA-----A----AA---------AA-G--CCG----C--A--A-A----AATG-----TT-TC-C-AAAA--AAGC-ATCAC----AGTCCA-TGC-A-TTACG-T-AT--T--CAAAAT-C-GTAAT----GCC---AATTGACA------T--T------A----AAA----C------A------------AG----------AT-TCTA------G-----------AA------C--A------TA--A----TT-T------G---AT--A-T----CGT---TT-A-T---C----A-TCTGAATCAAATTCCTTTT-AATTTAT---TTGT-T---T-----G---TT-ACCGACATG---CCGA------C--TGAAA--T-T--------C-------------------------A------------T----TTT--A-----A-GT------GACA---TT--T-GTGA---------AC---A-GATTGT--------T---------C----------A-------------------T---------A-----GAGCT-TTG---AATGC-CCAAT----ATGTA-GTTT-T--TC--A----TGTATTTTCCTGACTTAAAACTT-TTT
gi|60 : AAATA-T-TCAT-----T--TCAAT---TT-GCAT--TGC----TGCAGA--GATAT-----TT-TGCCA-AG----AA-C-------TA-----A----Agcaatcagtt
gi|61 : --TCAAA---TT-ACAT--AAC----TGCAGA--GGACT-----TT-GGCTAGGG----AA-A-------T------------A---------G--G--CTG----CA-A--A-G----GATG-----TT-TC-cgtctacaga
gi|62 : -TA-CATTACAAAA-C-TGATCT------C-GTGTA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----Caga
gi|7 : catgta--ATATGA----T-TTTT--ACAATA--TAAACAT--AT--A-C----CAAAA-G-TTATCT------C-ATATA---AT-------TTGC----TATTTGTCA---ATAC-----CTC-----ATTATTGTTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TT-TTTA---T-------AGA--CT-T-AC--AC---T-AAAATGC---T--T---T-GCTC--CTT-----T-ATGCAAAACAA------CG-T--CG-T----A--T-GAGC-TAA------AATCA-------TT-GTC---------AAAATA-T-TTCT-----T--T-AAA---TG-TCGT--AGC----TCAACA--GAACT-----TA-TGCCA-CG----AA-A-------CA-----A----CA---------G--A--CCG----CCAA--A-A----AGCG-----TT-CT-C-GGAA--ATCC-ATTATGTAGAGTTTA-TGC-A-TTATG-T-AT--A--AGGAGTTC-ATA-T----GTC---GGT--ATA------T--T------GACT-C------CCA----T------------AC----------AT-T--A------A-----------AGTAAAGCC--G------CA--T----TT-T------GA--A---G-T----CGCA--TT---C---T----A-CCGGAACCAAACCCATTTC-TGTTTAT---TTCT-TACAT-----AA--TG-C-----ATTATGTCGTCGACTCC--TA-----T-T------A-A------------G------------T------------T----TTA--A-----A-GTTA---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AT---A
gi|8 : ttaat-ATATA---TT-------TTA-A---TATTTCTTG---ATA------------GGA--ATCCTTT-T-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----CT-TCT----T-------GCATTCA-C-AG--AC---T-AAACAGT---TA-T---T-ACCCAAC---------ACATAACTCGG------CA-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATTG-------TT--TT--------AAAGAT--T-TTCT-----T--TAAAA---TT-GCAC--GAC----TGCACA--GAACTTTCAATT-TGTTA-GG----AA-A-------TG-----A----AT---------G--T-----------------------ATG-----TT-AC-CAAAAA--ATGC-ATCCC----AGTTCA-TGC-A-GAAGG-T-AT--C--TGAAGTTT-GTA-T----TTT---GGT--TCC------T--C------A----C------T------TG-----------AT----------AT-T--A------A-----------AG------T--A------AG--TATCATTAT------GA--A---G-T----TGGA--T--A-A---T----A-TTGGAATGAAACTGGCTGT-TAATGAT---TTTT-T---T-----AA--TA-A-----A--------C------T--TG-----G-G------G-A------------GT-----------A------------TA---TAT--A-----A-GTTA---CGAC-----T--A-GT-----------------TGGGTAC--------C---------CAT--------A-----------G-------T---------G-----CT----TTA---AATTT-TCTCT----ATGTA-AGTT-T--AT--A----TGTATTTTTCTTTCT--
gi|9 : C--ATGTGA-T--T-GTT---ACAATA--TAAATAG--AA-TA-CA------AA-G-TAATGT------A-ATGT-----T-------TTATA---TATTTGCT-------------------------TCATTTTC-GA--AT--------TA----T---------------------T-T---T-CA-----TT-TTTGTT-T-------GCATTTT-C-AT--GT---T-AAACAGC---TG-T---T-GTAA--GGT-----T-ATGTTAAATAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GCTTC-------TTTATCATT----AAAAAG-G-T-TCCT-----T--TTAAA---TT-ACAT--GAA----TACAAA--AAAGT-----TT-TGCTA-AT----AA-A-------TA-----A----AACAAAATACAA--G--CTT----A--A--A-G----TATG-----TT-GT-T-GAAA--GCAC-ACCAC----AGTTCG-TTT-A-TTAGA-T-AT--C--TAAA--TC---------------------AAA------T--T------A----CACCTCTT------T------------AC----------AT-T--A------AAATAAC-----AA------C--G------TG--T----TTAA------A---A---G-C----CGTA--TT-A-AATCG----A-TCGGAATCAAACTTGTTTT-TATAGAT---TTT-------------------A-----ATT---CTAT------T--Ttcag
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTAAACCACTTATAATATTACTGTTATGATCTTTACCTATCAGATTGAAACCTGTGAATTATCTAAAAGAATGAAAATTAATTGTTATAGGGCTGTGTATTGCTTGACCAATGCTGATACAATATGTATCGCAATTCAGGTATCCAGATACAAGATACAATGCGATACAGATTATTATTGAAAATGTGATGGAATTCAAGAGTATCTTTAACATTAAGTAAAATATATACGGTGTTGCCCGCTTAACACATCATAACAAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTTATTTGGACTGTGCACAGTATTGCTTGACCAATGGTGATCTGATATGTATCATGGTATAGGTATCCCGATACGCCATACAATACAGATTATTATTGAAAATTTGATGAAATCCATGAGTAACTTTTAACATTAAGTAAAATGTATACACAGTATCACCCTCTTAACACATCATT
Unaligned ( gi|39 ): AGGGATGTGCATTGCTTGGCCAATGCTGATTCTATATGTCTCATGATACAGGTATCAGATCCTGATACACAATACAATATGATACAGATTTTTATTGAAAATGTGATGAAATGCATGTGTCACTATTAACATTAAGTAAAGTATATATACAGTATAACATTCTTCACACATCATAA
Unaligned ( gi|40 ): TAGGGTTGTGTATTGTTTGACCATTGGTGATACAATATGTACCACGATACATCATCCCGATACGCGATACAATACGATACAGACTATTATTGAAAATGTGATGAAATGTATGAGTACTTCTAACATTAAGTGAAATACAAACGGCACCACTCTCGTTATACATAACAT
Unaligned ( gi|41 ): AGGGCTTTGTATTGCTTGACCAATGGCGATACAATATGTATCATGATACAGATAATCTGACACGCGATACAATACAATATAAATTATTGTTCAAAATGTGAAATCCATGAGTAACTTTTAAAATAAAGTAAATATATATAAATATACGGCATCACACTCAAAA
Unaligned ( gi|52 ): TGATTGTTCATTAATGTGAAGGATGAATTGTTCTAGGACTGTGTACTGCTTGACCAATGACGATAAGATTTGTATCTAAATATAGTATCATAATACGCGATACAACATGATACAG
Unaligned ( gi|53 ): GTATAATACATCCCATTACACTTAACAGTATAATACAAACAGTTTTCAAAATTCATGAGTAAATTTTATGTAAAATATATATACGGTATCACCCTCTTACACATCATATCAAA
Unaligned ( gi|55 ): TGTGATTGAAAATGGGATGAAATCCAGGAGAAACTTTTAAAATTAAGTATAATATATATATGGTATCAATCTCTTAACACATCATATCAAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 4444444 1 111111111 333333333333333 11 22222222222222 11111111111111111111 1111111111111 11111111 2222222222222222222222222222222222 22222222222222222222222222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111
lowQualScore : 8888 0 3333333 3 1 8888 1 6666 888 4 3 7777 0 7777 3 555555555 33 2 44 33 22 333333333333333 111 0 55555555 222 4444444 77 222 1 222 11111111111111 22 1 1 22 55555555 3333 11111111111111111111 1 222 1 33333333 4444444444444 0 1 1 33333333 1 444 1 222 1 444 33333 1 3333333 1 11 1 2222 11 1 1 333333 1 0000000000000000000000000000000000 33333 11 333 1 11 2222 11 555555 1 11 5555555 1 3333333 33333 2222 66666666666666666666666666666666666 2 222 2 11 444444 0 1 3333 1 1 1 0 1 1 22 222 2 66666 1 66666 3 22 444444 44 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1 3 44 1 9999 1 777777777 444 1 22 555555555555555555 22 77777 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 33333 00 333 333 22 1 2 1 1 3333 333 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 3333 333 2 55 6666 2 2 22 33 4444 1 1 444
lowQualScore : .... . ....... . . .... . .... ... . . .... . .... . ......... .. . .. .. .. ............... ... . ........ ... ....... .. ... . ... .............. .. . . .. ........ .... .................... . ... . ........ ............. . . . ........ . ... . ... . ... ..... . ....... . .. . .... .. . . ...... . .................................. ..... .. ... . .. .... .. ...... . .. ....... . ....... ..... .... ................................... . ... . .. ...... . . .... . . . . . . .. ... . ..... . ..... . .. ...... .. ................................................................................................................................................. . . . .. . .... . ......... ... . .. .................. .. ..... . .................................................... .. ..... .. ... ... .. . . . . .... ... . ............................................................ ..... .... ... . .. .... . . .. .. .... . . ...
lowQualScore : 3333 7 3333333 3 0 1111 4 3333 888 9 3 1111 8 1111 1 222222222 22 4 55 11 99 111111111111111 999 7 00000000 777 8888888 11 777 0 777 44444444444444 11 5 6 11 66666666 1111 66666666666666666666 4 444 4 66666666 3333333333333 9 3 4 33333333 4 888 4 444 4 444 22222 3 9999999 3 88 3 7777 88 3 3 777777 3 3333333333333333333333333333333333 00000 66 888 2 77 7777 77 111111 3 00 7777777 2 9999999 00000 6666 22222222222222222222222222222222222 6 222 3 99 000000 7 4 0000 4 4 4 1 5 5 00 555 3 22222 5 99999 4 11 444444 22 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 0 1 99 6 7777 6 000000000 444 6 22 777777777777777777 22 11111 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 88888 11 000 000 44 7 4 7 7 7777 222 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333 9999 777 1 11 6666 1 1 99 11 7777 0 4 111
consensus : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G-A---G-T----CGCA--T-TA-A---N----A-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
Reference ( family-892 ) : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G-A---G-T----CGCA--T-NA-A---N----A-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|1 : AAACAAAATTTCCAACCATTAAAAATGGTGTACTGTGTATAAAAACTATATATATT--ATATATGTGTAAG-CATACTAGGTCAAA-TAT----GTTTA----GCA-ACA-CT-G--TTC--ATATTAATA-T-GTTT--ACATTA--TAAATAC--ATGTA-CATTACAAAA-T-CAATCT------C-ATATT---TT-------TTATA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAA--GGA--ATCATTT-T-AA--TT--------TT----TG-------------------AT-T---T-CA-----AT-TTT----T-------ACATTCT-C-AC--TC---T-AAACAGT---CC-T---T-GCTC--CTT-----T-TTGTAAAACAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------ACTT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTTT-----T--TCATA---TT-GTAT--GAC----TGTAAA--GTACA-----TT-AGCAA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--TTA----C--C--A-G----TATGCA-TC-T-GTAA--A------TAC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TTAGG-C-AT--C--TGAAGTTT-G--CA-T----GTCAAT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AA----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G-A---G-T----TGCA--T-TA-C---A----A-TCAGAATTTAACTCATTTT-TATTGTT---TTTT-T---T-----ATTC---A-AA--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TTACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT-----TGTA-GTTT-T--AC--A----TATATTTTTGTTGCT--GAATATATTTTA
gi|10 : T-T---T-TT-----TT-TTT----T-------GCTTTTT-C-AA--AA---T-GATCAGT---CA-A---T-GTCC--TTT-----T-ATAGGCAACAT------TC-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TTTGTTGCT----AAAAAAGA-G-TTCT-----T--TCATA---GT-GTAT--GAC----TGCAGA--GAA-------------------------A-------TA-----AA----A---------T--G--CCA----CT-A--A-G----AATGTC-TC-A-TGCA--G------TAC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGTCC-G--CA-T----GCCAGC--AAA------T--T------A----C------CCCCCTTT------------GT----------AT-T--A------AAATTAATT---AA------C--A------TG--T----TT-T------GAA---G-C----CCCA--T-AA-A---A----A-TCAGAATTCAACTCATTTT-TATTGA----TTTT-T---T-----AATA---A-AG--T---A-----TGT------T--TC-----T-G------A-C------------T------------AAATTTTAT----T----TTT--A-----AATC-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----GC---ATGGCAAG-----------------------------------------A-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATATA-ACTT-T--AA--A----TGAA--TTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|11 : gtatttttttA--AT--------TA----TA-------------------GT-T---T-CC-----TA-TTT----G-------GAATACT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TATT---T-GCCG--CTT-----C-CTGTATAAAAG------CG-T--TT-T----G--T-GGGG-TA----------T-G-------TT-GTT---------AAATTA-T-TAGT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAT----TGCATA--GAGCT-----TT-TAACG-GGGA--AG-A-------TG-----AA----A---------G--G--CCG----T--T--C-G----CAAACC-TC-C-AACA--C------TGC-ATCAC----AGTTC-CTGC-ATTTAGG-T-AT--C--TGAAGGCT-G--TA-A----GTCGGT--ACA------T--T------A----T------A------T------------ATTTAAAATAAAAT-T--A------AG----------AA------C--G------TA--T----TC-T------GAA---G-T----CGC---T-TA-A---T----A-TCAGAAATAAACTCGATTT-TATT-AC---TATC-T---T-----AA-A---A------------------------T--TG-----T-T------G-C--------------------------------------------TT--A-----CGT--------ACA---TT--C---AATT-TT----ACCTTGTAGGTAC--------C---------T----------T-----------T-------T---------G-----GA----T-------TGT-CCCCT----ATATATATAG-T--AC--A----AGTATCATGCTTGAT--TCACTCATTTTt
gi|12 : -T-TTATCT------CGAAGTG---TT-------T-ATA---TTTTTGTCA---ATA-------------AA--ATTATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-A---T-CA-----AT-TTT----T-------GC----T-C-AT--G------AGACATTAGACA-T---T-GCCC--TTT-----T-ATGACAAATAG------GG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-GT------TT-ATTGTT------AAGATA-T----T-----T--TCAAA---TT-CCAT--GAA----TGCAAA--GAACTGC---TT-TGTAA-------AA-A-------CACCAACAA----A---------G--A--CTGATTTC--A--A-A----AAT---------GCAA--AGTTCTCTGC-ATTTC----AGCTCAATGC-A-TTAAG-T-AT--------------------------TTGAT--AAA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------AC----------AA-T--A------AG----------AA------T--A------CA--T----TT-T------GAA---G-G----TGCA----AA-A---A----A-TCAAAATATAGCTTGGTTT-TA----------TT-T---T-----AATT---A-AC--T---C-----------------TG-----T-T------G-A------------G------------A------------A----CTC--A-----AGT
gi|13 : tagcaagtataaaaaaaagtagatAGACATGT-TAAT-AATATTAAGAAA-----C----GTTTT----GCG-ATT-CT-T--TTC--ATATTAACA-T--TTT--ATAATA--TTAATAC--A--------------------ATAT------C-ATGTA---TT-------TGGTA---G--TTGGCA---ATAT-----CCAG--GAA--ATCATAT-T-AA--AT--------TAGTCTTT-------------------GTAT---T-TA-----TT-TAT----T-------TTATTTT-C-AT--GT---C-AAACAAT---TA-C---T-ATCC--TTT-----A-ATTCAAAACAG------TT-G--TT-T----G--C-GAGA-T---------ACT-T-------TT-TTT----------AAATG-T-TT------------AAAGATTT-GCAT--TTT----TGCAGA--GAA-------------CA-AT----AACA-------AA-----AA----A---------G--A--CCG----C--A--A-AT---AACTTT-AC-C-AAAA--A-------GC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TCAGG-T-AT--T--CGAAGTTC-G--TA-T----TTAAGT--AAA------T--T------A-------------------------------A-----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAT----TA--T----TT-T------G-A---tttaaggtgaattta
gi|14 : ataTAAAACAT------TG-T--TT-T----G--T-TAGA-TAA------CCTT-T-------GT-GTTGTT----AAAATACA-T---CT-----T--TCATA---GT-GTAA--GAC----TGCAGA--GAATG-----TA-TGCTA-GT----AA-T-------TA-----AA----A---------T--G--CCG----C--A--T-G----GACATTCTT-C-GGAA--A------TAC-ATCAT----AGTTC-CTGC-A-TTAGG-T-AT--C--TGAATTTC-G--CA-T----GTCAGC--AAA------TTAT------A----T------C------TTTTG--------AT----------AT-T--A------A-----------AA-----------------G--T----TT-T------T-AAT-G-T----CAAA--T--A-A---A----A-TTAGAGTTCAATACATTTT-GAATGAT---TTTT-T---A-----AATG---A-AT--TG--C-----TAC------T--AGCTAAAT-T------T-C------------A------------T------------T----TTT--A-----TGTA-A---TGACA---GT--C-ATAA-TGTTTGCGAC---AAG-CTAGATA-----C---------CTAT-------A-----------G-------C---------G-----GA----CTG---AATGT-ATAGT----ATGGA-ATTG-T--AC--A----ATTATTTTGGTTGCT--TAACTTACTTttgatttgtaagacattatgtgtattgtctatacat
gi|15 : ----G--C-GAGA-TAA------AATT-G-------TTTGTTGTT----AAAA--CA-T-TTCT-----T--TCATA---TT-GTAT---AT----TGCAAA--GAAa
gi|15 : TT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------TGGGTATCCATA-----------G-------G---------G-----GA----TTG---AATGT-CCTGT----ATGTA-AGTT-T--AC--A----TGTATATTTGTTATT--AAATTatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaagtaatgacattcataatttacatgactggctgggtatccataggggattgaatgtcctgtatgtaagtttacatgtatatttgttattaaattaaaatatcatttattgt
gi|16 : gcgagataaaattgtttgttgttaaaacatttctttcatattgtatattgcaaagaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----C-ATGTTGAACAG------CG-T--AT-T----G--T-CAGA-TAA------AATA-G-------TTTATTTTT----AAAA--TA-T-TTCT-----T--CCAAA---TT-ACTT--GAT----TGCAGA--TAATT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------TA-----AACATAA---------G--G--CC--------A--A-A----CATATT-TTAC-GCTG--A------TGC-ATCAC----AGTTC-AAGC-A-TAAGG-C-AT--C--CAAAGTTC-G--TG-T----ACCGGT--ATA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------GC----------AT-T--A------A-----------AC------T--A------------------T------G-A-----------ACA--T-AATA---A----G-TCGCAATTAGATTAGCTTC-TATTAA----TTGT-T---T-----AATA---A-AT--T---CAATTTCAC------T--TA-----TAT------T-C------------A------------G------------T----TTTAAA-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----Aaaaatatcatttattgt
gi|17 : atgatatgtacattcttgtatactggtaaaaagaagtttagcaagtattA-AGT-CT-----TC--ATATAAATA-T-ATTTTTACAATA--AAGATAA--AT-T-----T-CAGAA-T-TAATCT------C-GTGCA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GAA--ATAATTT-C-AA--AT--------TA-----A-------------------GC-T---T-C-------------------------CATTCT-C-CA--GCTGTT-AAACAGT---TA-T---T-GCTC--ATT-----T-ATGTAAAA-AT------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TGA------AATC-A-------TT--TT-TTAAAAAAAAAAAA-A-TCCT-----T--TCAAACT-CT-GCAT--TAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCG-AG----AT-A-------TT-----AA----A---------G--G--TTA----A--C--A-G----ATTGTT-AA-T-G-AA--A------TGC-GACAA----AGTGC-ATGT-A-
gi|18 : ataaatttcaagagaaat-T---T-CA-----TT-TTT----TTCTCG--GTATTCT-C-AG--GC---C-AGACAGT---AA-T---T-GCTT--CTT-----T-GTATAAAACAGACTAATC--T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GATT-A---------------------------------CT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GGC----TGCAGA--GAGTT-----TT-TACCC-GG----AA-A-------TG-----GA----A---------GT-A--CTT----T--A--A-G----ACGGTT-TC-C-GGAT--A------TGC-ATCAC----AGTTC-GTGA-A-TTAAA-T-AC--C--AGAAGTTG-T--TA-T---------T--AAA------T--TTTAC--A----C------T------T------------AC----------TT-TC-A------A-----------AA------C--A------TT--T----CT-T------aggctgtgtacagtttggttaaacgttgaattcttaaat
gi|19 : aatgcattttgatataaaataatgtctgcatggttgcaacattaattgtacatttcttgaaggatggcatttgttgaaatataaatattgcttaataT-----T-ATCTAAAGCAG------TG-T--TT-TTTTTG--T-GCGA-TAG------CATT-G-------TTTGTTGTT----TAGA--TA-T-TTAT-----T--TCTTG---TT-TTAT--GAC----TGCAAA--GAACA-----TT-TTTCA-AG----AA-AATAAAAATA-----AA----A---------G--G--TCA----CC-A--A-G----AATACC-TA-C-GGAA--A------TAC-ATCAG----AGTTC-ATGC-T-TAAAG-G-AT--C--TGAATTTC-T--TA-T----GTCAAT--AAA------G--TCCATCCA----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA--------------------------T-T------A-A---G-----------------A---C----A-TCAG--TTTGACTTATT-----TTG-----TTTC-C---CAAAAAAAAA---A-AA--T---G-----CGT------T--TG-----T-T------T-CT-----------G------------ACTTAAATTCAG-T----TTA--A-----AACA-A---TGGCA---CT--C-GTAA-T-TT----AC---ATGATTAtcaaattacataa
gi|2 : AACAC--AT----CATAACAAAAAC-TAAGTT---------TTTA---TT-------TTG-A---TATCTGCCA---GTAC-----CTAA--GGA--AACATTT-CTAA--CT--------TT----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TT----------------------------------GAACAGA---CA-T---T-GTCA--ATT-----T-ATGTAAAACCA------CG-T--TT-T----G--TAGAGA-TAA------AATT-G-------TT---TGTT----AAAAGCTG-T---CT-----T--TCACA---TT-GTAT--GAC----TGCAAA--GAACT-----TT-TACAA-T------A-A-------TA-----AA----A---------G--G--CC------------------AGTGTC-TC-A-GTAA--A------TAC-ATCAC----AGTTT-ATAA-A-TATGC-T-AT--C--TGAAGTTT-GCATA-T----GTCAGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------CC----------CT-T--T------AT----------AG------T--A------TG--T----TT-T------G-A---AAT----TGCG--T-AA-A---A----A-TCAGAATTCAACTAATTTT-TATTGATTTCTTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----AGA------A--TG-----T-T------G-CCAACTTA-----A------------A------------TTCAATTT--A-----AGTA-G---TGACA---TT--C-ATAG-T-TT----AC---ATGACTGG--------CTCAGTATCAT----------A-----------G-------T---------G-----AA----TTA---AATGT-CCCATAATCATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACATATTTTA
gi|20 : tctcaatgagagcaggtatgagaagagcaatactatacagaatatcattgtaaatgtgatgaaaatcatgaataacttttaacagtaagtaaaatatatatacacagtatcaccaactt-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------T--G--TTG----C--A--ATG----AATGTT-TT-C-ATAA--T------TCC-ATTAC----AATAC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--C-AAGTTT-G--TA-TTTTTGTCAAG--AAA------T--T------A----T------C------TCCTTTC------AT----------AT-T--T------A-----------AA------T--AA-----TG--T----CA-T------A-AAAAG-T----CGCA--T-AA-A---ATAACG-TAGGCATTGAACCCCTTTT-CATTGAT---TTTT-T---A-----AATA---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----A-T------G-C------------GGACTCAGATTCAG------------T----TTT--A-----AGTT-A---TGACA---TT----GTGA-T-AA----AC---CTGGCTAT--------C---------T----------AG----------G-------TACACACA--G-----GATT--TTG---AA--------C----ATGTT-GTTT-TACAC--A----TGAAGTTTTCTTGCT--AAACTTAt
gi|21 : tgcatg--ATCATTC-C-AA--AT--------TT----TG-------------------TA-T---T-CA-----TG-TTTG---T-------ACACTAG-A-AT--GC---T-TAACAGT---TA-T---A-GCAC--TTT-----T-ATGGAAAATAG------CG-T--TT-T----G--T-GAAA-TAA------AATT-GT------TT-GGTGTT----AAAAGA------TCT-----T----AAA---TT-GCAT--GGCTGCATGCAAA--GAAAA-----TT-AGTTA-TG----AA-A-------TT-----AA----A---------G--G--CTG----T--A---------AAT-------T-GTAG--A-------------AC----AGTTC-ATGC-A-TTTGA-T-TT--C--C---------------------CGGT--AGA------T--T------A----T------CTCCCTTT------------AC----------AT-T--AACCTACA-----------AA------CCTA------CA--T----TT-T------------A-T----C-C------------T----A-TCGGAATCAAACCCATTAA-TATTGCTG--TTTT-T---T---------------T--T---C-----CTT------T--TT-----T-T-----------------------------------------------T----TTT--A-----A
gi|22 : g-------GCATTCT-C-AG--GA---T-AAACAGTGAATA-T---T-A-------T-----T-A-GTAAAA-----------------------------------A------AAGT-GC------TT-ATTGT------AAGAGTA-T-GTAT-----T--TAAAA---TT-GCTA--GAC----AACACA--GTTGC-----TT-TGTCG-GATATTAA-T-------TA-----AA----A---------T--GAATCA----A--A--A-G----AATAAT-TA-A-GACA--A------TGC-ATCAC----AGATC-ATGCTG-CTAGGTT-ATAGC--CGGAGTCT-G--T--T----ATT--T--ACA------CCGT------G----C------CCCCTT-T------------AC----------AT-T--G------A-----------AA------T--A------TG-----------------A-A----------CGTACTT-TG-A---G----A-T---AATT-------TCTT---TTGA----CATT-C---T-----AATA---G-AT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------A-C------------G------------G------------A----CTT--A-----AATaatt
gi|23 : -TATACTGAGGAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--ATC--ATATCAATA-T-GTTT----------------------------CACAAAA-C-TAATCTTCATGGC-ATGTA---TT-----------A---CATTT----------------------------TT-TTT-T-AA----------------------------------------------T-CT-----TT-ATT----T-------ACATTCT-C-GC--TC---T-AAACAAT---CA-T---T-GTCC--CTT-----T-ATTTAAATCAA------TG-T--TTAT----T--T-TAGA-CAA------ATTT-GAGATTTATT-GTTGTT----ATAA--TA-T-TTCT-----T--TTATA---TT-GTAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TG----------------------A-----AA----A-----------------G----C--AATA-G----AATGTC-TC-T-GTAAATA------TAC-ATCGA----AGTTC-AAGC-A-TTATG-T-AT--C--TGAAGTTG-C--CA-T----GTCAGT--ATA------T--T------tcatttttgtaaattgtaacattcat
gi|24 : AAA----AAAATACGTAAGAGGGTTGTACCAAAG-------CTATA-ATAACTC----------AAA-TATACTGAG-ATAA-TGA----GTTTA----GAG-AGA-AT-T--TTC--ATATGCATAGT-GTTT----GATA--GAAATAA--AC-TG-C------AAA-T-TAATAT------C-ATGTA---TT-------TTG-A---TATTTTTCAATTATACTGTTACTA-----A--A-----T-G-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TG-TTT----A-------GGATACT-C-AG--GC---T-AAACTTG---TA-T---T-GTCC--GTT-----T-ATGT-AAACAT------TG-T--TT-
gi|25 : tccttatatggaataccacctctgtgaagtgtcttggttgaacaattatatcagtt-TTT----T-------GCTTTAT-C-AG--GC---T-TAGTAGT---TA-T---T-GTAA--TTT-----T-ATTCAAAACGG------TG-TGGTT-T----T--C-CAAA-TAA------A--T-G-------TG-TTTATT----ATTCAATGGT-TTCT-----T--TCAGG---TT-GCAT--TAC----TGTAGA--GCACT-----TA-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------GCAG--CC--------A--A-G----AATGTT-TA-T-GTAA--A------TGA-ACCAT----AGT----TG------AGG-C-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--TCA------T--A------A----T------C------G------------AC----------AG-T--A------A-----------
gi|27 : atattactaccaattttgattaatatttttatttttaacta---TT-------TTATA---TACATATCA---ACAC-----CTAA--AGA--TCCATTT-T-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TG-TAT----A-------ACTTTCT-T-AG--GC---T-AAATA-----TA-T---C-GCCT--TTT-----G-ATGT------T------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TTA------TAGT-GT------TT-ACTGTT----AAAAGA-----TTAC-----T--TAAAA---CT-GCAT--AAC----GGCAGT--GAACA-----T------A-TG----AA-A-------GA-----AA----A---------G------------------A-A----AATTTA-AC-T-TTAA--A------TTC-AACAA----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-TCGT--CTTCAAAATGC-T--TA-TC---TTTGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------GC----------CT-T--A------A-----------cttatcatcctttat
gi|28 : aagAAA-TAA----GTTTATCTAGCA-AA-----A--TAC--ATGTTAACA-T-TTTC--ACAATA--TGAATAA--AT-TA-C-TTA----A-T-CAATCT------C-ATATA---TT-------TTTGA---TATTTGTCA---GTAC-----CTAG--GGA--ATCTTTT-C-TA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T--------------------------------------------------CAAT---TA-T---T-GCCT--TTT-----T-ATGTTAAACCA------CA-C--CT-T----G--T-GAAA-TAA------AATTCT-------TT-GTTGTT----GTAAGATA----TCT-----T--TGGAA---TTAGCAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TTCCA-GG----AA-A--------G-----AA----A---------G--A--TCA----CA-A--A-G----AATATT-TC-cattaaa
gi|29 : aaagACA--TAACAACT-AT-TA--ATTACAAA--T-CAATAT------T-ATGTA---TTAAGAAGTTCATACAGTATCTGACA---ATAC-----CAAG--AGA--ATCATT--C-AA--A----------A----TG-------------------GT-T---T-AA-----TTGTTT----T-------TCATTCT-T-AC--CC---TGAAACAGG---TA-T---T-ACCC-------------------ACAG------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TCA------AATT---------TA-ACTGTT----AGAAGGT-------T-----TAATCAAA---TT-GCAT--GGA----TGCAGA--AGACT-----TT-TGACA-GG----AA-A-------TT-----AA----A---------G--G--CTG----CA-A--A-G----AATGAT-CC-C-AAAtaaa
gi|3 : catattttcttAAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCAAACATGAGAAAA----ACTAAGAAAAA-AAA----GTTAA----GCG-GGA-CT-G--TTCTGATATGAATA-TCG-----ACAACA--TAGATAA--TT-TC-CAAT---AAA-T-TAATCT------C-ATATA---CT-------TT-TA---TATTTTTCA---ATAT-----CTA---AAA--ATCATAT---GG--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTC----T-------GGATTTT-CGACTATT---T-ATCCACT---T--T---T-ATCC--GTT-----T-ATATAAAACAC------TG----TT-T----GAAT-GAGA-TAC------AACT-G-------TT-TATGTT----TAAG-------TTAT-----A--CCAAA---TT--CAT--GGC----TGCAGA--GAAAT-----TG-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----CA----A---------G--G--TCA----C--A--ATT----AATGTT-TC-A-GAAA--A------AGC-ATCCT----TACTC-ATTC-A-TTGGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----ATCTGT--CAA------T--A------A----C------C------T------------CCTGTTTA----AT-T--G------A-----------AA------T--A------AGAAT----TT-T------A-A---A-T----T-----T-TA-A---T----A----AAATTG---------T-TATTGAT---TT--------------ATA---A-AT--T---A-----TGT------TTGTG-----T-T------GCC------------G------------A------------C----TCT--A-----ATTC-AGTTTTA-A---GC--T-ATGC-T-TT----AC---ATGCCTAG--------C---------T----------A-----------G-------
gi|30 : ttccctatcaggaatacttcctgtttgaagtgtcttgattgaagtactatatcaatata--A-A----AATGTT-TC-C-AGAA--A------TGT-ATAAC----AATTT-ATGT-A-CTAGA-C-AC--A--CTAA---C----TA-G----GTCACT--AAA------A--T------A----CGT----CTCTG--T------------GT----------AT-T--A------A-----------AAT-----C--A------GA--T----CT-TAATTTGG-A---G-A----CGCA--T--A-A---T----A-TTAGAA-TCAACTTCTTTTATATCAA----TTTT-T---C-----AATA---A-AGAAT---C-----C--------T--TG-----T-TTCAAACT-C------------G------------A------------T----ATT--A-----TGAT-A---TGACA---TTAAC-GT---T-TT----AC---AT-----------------------------------A-----------G-------T---------T-----GG----TT----AAGGTACCCAT----AC----ATCT-T--AC--A----Tgt
gi|31 : agaaat-T-TAATCT------------A---TA-------TTG-A---TATTTGTCA---ATA------------------TCATTT-C-AG--AT--------TA----TA-------------------GT--------G-----TT-TTT----T--------C-TTCT-C-AA--TC---T-AAACAGT---TA-T---T-TGCT--CTTATATGT-ATGTAAAGCAG------CATT--TT-T----G--G-GAGA-TAA------ACTA-GT------TT-ATTGAT----AAACAACA-A-CT-T-----T--TCGAA---TT-GCAC--GAC----TCTGGA--GCACT-----TTATCTC--------AA-A-------CA-----GA----A---------G--T--TTG----T--G--A-GATAAAATGCTGTT-T-GTAA--A------TAC-TTCaa
gi|32 : -------TA-----AA----A---------T--G--TAG----A--A--A-G----AATGTT-TC-C-GAAA--G------TTTTATCAT----GGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--A--CGAA-TT--------------TCAAT--AAA------T--T------GCTTCC------T------T------------AC----------AT-C--A------AAATAGTAACATAA------C--A------TA--T----TT-T------GAA---G-T----CACA--T-T---------------GGAA---A------TTT-TATTGA----ATTT-T---T-----AATA---A-GT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------
gi|33 : aacattgttttgagagataaaatagcttattgt----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TT-T------G-AA--G-T----CGCA--T-TA-C---T----A-TCAGAATTCAGTCCTTTTT-TATTGAT---TTTA-T---A-----AATA---T-AT--T---C-----TGT------G--TA-----T-T------G-CT-----------G------------A------------C----TCG--A-----ACT---------CAGTTTT--CAGTAA-T-TA----AC---ATGCCTA---------C---------C----------AAGGTACCTATGG-------T---------G-----GA----TTG---AATCT-CCTAT----ATGTA-ATTT-T--AC--ATGTTTGTATTTTTGCTCCA--AAACGTTTTTTAtcaaactcaaatttcagtttttg
gi|34 : a------T------------AC----------AT-T--A------A-----------TA------G--A------TG--T----GT-CATA---A-A---G-TTACACACA--TGTC-A---T----A-TTGGAACCAAACCTGTTTT-TATTAGT---TTTTAT---T-----TACA---A-TT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------G-CT-----------G------------ACCTAAATTCAG-T----TTT--A-----A-CATA---TGGCA---TT--G-ATGA-T-TT----AC---TGGACTAA--------C---------C----------AG----------G-------T---------GCCCGCAACACTTTG---AATGT-TCC-T----ATGTA-GTTTAC--AC--A----TG---TTTTGTTttca
gi|35 : tAAA-TATATAGGTTTA----GGATAG--CT-T--TTC--ATGTGAATA-T-TATT--ACAATA--TAAATAC--AT-TC-CAC-----AA-T-TAATCT------A-ACGTA---TT-------TTA-A---TA-----CA---ATTT-----ATAA--GGA--CACATTT-C-AA--A-------------------------------------T-T---C-CA-----------------------GC-------------C---T-AAACCAT---TA-TAACT-GATC--CTT-----T--TGTAAAACAG------AG-T--TT-A----G--T-GAGA-T-A------CATT-G-------TT-TTTATT------AAAATA-T-TCTT-----T--TCAAA---TT-t
gi|36 : -A---G-T----TGCA--T--A-C---T----A-GTGGAAACAATCTGGCTTT-TATT-AT---CTGT-T---T-----AAAAT--A-AT--T---T-----AGT------T--TC-----T-T------G-C------------A------------AACGCAAATTCAGT----TTC--A-----TGTT-A---TGGTA---CT--C-GTGA-C-TT----AC---TTGATTAA--------C---------C----------A-----------GGTACTCGT---------G-----GA----TCGTTAAACGT-CTCAC----ATGGG-GTTT-T--AC--A----TGTATT
gi|37 : aataagggtgtataatatgaT--ATAACA--AAAATATGAAC-TA-CATAACAAAA-T-TGATGT------C-ATGAA---TA-------GTG-A---TAATTGCCA---GTAC-------------------ATTT-C-AATAGC--------TT----TT-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTTATTTT-------GCATTCT-C-AC--TT---T-AACCAGT---CA-T---T-GCCC--CTT-----C-GTTCAAAACAT------TG-T--TT-C----A--T-GAGA-TAC------AACT-G----------GCTCTT----ATTAAATG-CATTCT-----T--TCAgcctaa
gi|4 : aATACTAATTGAAA-TAT----GCTAA----GCA-A---CC-GATTTC--ATATGCATG-T-TCTT--GCAATAGATAACTAC--AT-TA-CA--ACAAAA-C-TAATCT------C-ATTTG---TT-------TTGAA----AGTTGCCA---GTA-----------------ATTATTT-C-AA--TT--------TT----T---------------------T-TATAT-CA-----AT-TTT----T-------TCATTCT-C-AC--TCA--T-AAGCGG-----A-T---TCGCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CA-T--TA-T----G--T-GAGA-CAA------AGTT-T-------TT-ATTATT------AAAATG-T-TTTT-----G--T---A---TT-TTAT--GAC----TGTACA--GAACT-----TT-TGCAA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CTA----C--A--ATA----AATATC-TC-A-GGAA--A------TTC-ATCCC----AGTTA-ATGC-A-TTAGG-T-AA--C--TGAA-TTCAA--CA-T----ATTAGT--AAA------T--T------A----C------T------TCTCTTTTTATCAAT----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TTGC------A-A---G-T----CGTA--T-GA-A---A----ACTCCAAATTCTATTCA-TGT-TATTGA----TGTT-T---T-----AATG---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-CTGACTTTAATTTA------------A------------T----TTT--A-----AGCA-A---TGACA---TT--C-ATGC-T------------AGG--TAT--------C---------C----------ATT---------G-------G---------G-----GA----TTG---AAAGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-A--AC--A----AGTAGTTTTATTGCT--AAACTTATTTTAt
gi|42 : ATTCAAGCTATTTT-TATGGAT---TTTG-T---------AATA---A-AT------------CATCA----T--TG-----C-T------A-CCAACTCAAAT--A------------A------------T----TTC--A-----TGTA-A---TGACA---CT--T-GTGA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------T----------A-----------GGTT----TCCAAA----G-----GGCT--TTG---AATGC-CC--T----TTGT----TT-T--AC--A----TGAATCTAC-TTACT--AAACTTACTTTtt
gi|43 : gTTATATACATGTA---TATACTAAGTAAAA-TGT----GTTAT----GCA-AGTACT----TTT--ATATAAATA-T-GTTT--GCAATA--TAAATAC--AT-TA-CA----AAGA---TAATCT------C-ACGTA---TT-------TTG-G---TATTTGCCA---ATAG-----ATAA--GGC--ATCATTT-tatcg
gi|44 : attaataattatcaccagT-------TTTTA---TATTTGTCA---GTTG-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CACTTTTTT-TTT----T-------TCATTCT-ttata
gi|44 : T-----T--TTATA---TT-TCATTCG-C----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------T--G--CCA----C--A--A-A----Attcatagttatataattttatatttcattcgctgcagagaacttttgccaggaaataaaatgccacaaaattatacctaaa
gi|45 : tttttatatttgtcagttgctagggaatcatttcaaattatggtttcactttttttttttcattctttcatagttatataaG------CA-T--TT-T----G--T-GAGA-TGA------AATG-A-------TT-------------AAAACA-T-TTCT-----T--TCTAA---TT-GCAT--GAT----ATTAGC--AAGC------TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----T---------A--T--ATG----C--A--A-AT---AATGTT-TC-C-AAGA--A------TAC-AT--C----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGttatacctaaa
gi|46 : ----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TCT----T-------GCATTCT-C-AG--AC---T-AAACA--------------------------------------CAG------CG-T--GT-T----G--T-AAAAATAA------AAGT-G-------TTTGTT-TT----AGAAGAT----TTCTATCACT--TGAAA---CT-GCAT--GCC----TGCATATAGAAAC-----TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------AATA--TCA----CA-A--A-G----AATGTatgtagttttacat
gi|47 : -GAAA--A------TGC-ATCTA----AGTTC-ATGC-A-TTACA-T-GT--C--TGAAGTTC-A--TA-T----TTCAGT--AAGAAACCTT--C------A----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAGAATGTA--T----TT-T------GAA---G-T----CGC---T-TA-G---T----A-TCAGAAT
gi|48 : caGTAATATATACTGAGAAAAAATAT----GTTTA----GCA-ATT-CT-A--A-C--ATATGAAAT-T-GTTT--ATAATA--TAAATAC--AT-TA-----A-AAAA-T-TAATAA------C-ATGTA---TT-------TTG-----------CCA---ATAC-----TTAG--GGA--ATCATTT-C---------------------------------------------T---T-CA-----TT-TTT----catttatactgccaactcatatttactttt
gi|49 : ATTACAAAA-T-TAATCT------C-A-GT----TT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATGTA----TTAGTGGGA--ATCATTT-C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCTAA-AG--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-TTATAAAA
gi|5 : tt--ATATGTTTA-T-GTTT--GCAATA--TGAATAC---------ATTGTAAAA-T-AAGTAG------T-ATGTG---TT-------TTGGA---TATTT--------T-C-----CTAT--GGA--ATCATTT-G-AA--TTTTTGTGTGTA----TGTGTTGTAGTTGTTGTTGTTGT-T---TGTG-----TT-TTT----TTTTCTTTGCATTCC-C-GC--TC---T-AAACAGA---CA-T------------------------TAAAACAG------TG-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-GA------TT-GTATTT----CAAG---G-T-TCCT-----T--TCATG---TT-GTAT--GTC----TTCAGA--GAACT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------T-------------------------------------------G----AATGTC-T--C-GGAA--A------TAC-ACCAG----AGTTC-ATGC-C-TGTGG-T-AT--A--TGTAGTTT-G--CA-T----GTCATT--TAA------T--T------ACTTTC------C------T------------TC----------ATAT--C------A-----------AA------C--A------TG-----------------------G-T----AGTA--T-AA-A---C----A-TCAGAACTCAGTTCATCTT-C-TTGAT---TGTT-T---T------------A-AT--T---C-----GGC------T--TC-----T-T------G-C------------T------------G------------T----CTC--AAATTCAGTA-A---TG-TA---CT--C-GTAA-T-TT----GT---ATGACTAGTTAGGTTAC---------CAT--------A-----------G-------G---------G-----GA----TTG---GATGC-CGCAT----ATGTT-ATTT-T--a
gi|50 : aATCACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTTGTTTT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATAC-----ATTG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCT-A-AG--TC---T-AAACAGT---AA-T---C-ACCC--CTT-----T--TATAAAA
gi|51 : tTT--C-----AGT------TGCCA---TT--T-GTTA-T-TT----AC---AAAGCCAG--------C---------T----------A-----------GA------TAGGG-----G-----GA----TTG---AATGT-CCGGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TTTA-TTTTGTTACT--AAACTTATTGTAa
gi|54 : tgttaattgctgactcaagGGAATCAAAACCAATTT-TATTGAT---TCTA-A---A-----AAT----A-AT--T---A-----TAT------G--TG-----C-T------G-CCAACTTA-----G------------ATATT--------T----TTT--A-----AGTA-A---CGACA---TG--T-GAGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------ttcaa
gi|56 : -----GA----TTG---AATGT-CCTGT----TTGTA-ACTT-T--TC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACTTATTTTA
gi|57 : ttacaagaccagcttggtacctttgggtT--G-----AATA-T---TGGCA---TT--C-GTAA-T-TT----AC---ATACCTAA--------C---------T----------AT----------G-------TACCTATACGG-----GA----ATG---AATAT-CCTGTG---AT-TA-GTTT-T--ACTTA----T-TGTTTTTATtttagtat
gi|58 : -TGTACTG-GGAAAA-TAT----GTTCA----GCA-AGT-CTTG--TCC---------TG-T-ATTT--ACAATA--GGAATAC--A-------TTACAAAA-T-TAATTC------C-ATGTA---TT-------TT
gi|59 : a-TATACCAAGTAAAA-TGT----GTTGA----GCA-AGT-AT-T--TTT--ACATGAAAA-T-GTTT--ACACTA--TAAATAC--AT-TA-CA
gi|6 : tatacttactggC--ATATGTATA-C-TTTT--ACAACA--TAAATG---GT-TATCATGG--AGA-TATAAT----------------------------TG-A---TGTTTGTTC---ATAT-----CCAG--GCA--ATCATT--C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----T-------------------------------------------GT----A-T---T-GCCC--CTT-----TTATGTTAAACAG------TA-T--TT-A----G--T-GAGA-AAATGTGTTAATT-G-------TT-GTTGTT-----------------TT-----T--TCAAA---TT-GCAC--GTC----TGTAGA--GAACA-----TT-TG--A-AG----AA-A-------TA-----AA----A---------AA-G--CCG----C--A--A-A----AATGTT-TC-C-AAAA--A------AGC-ATCAC----AGTCC-ATGC-A-TTACG-T-AT--T--CAAAAT-C-G--TAAT----GCCAATTGACA------T--T------A----AAA----C------A------------AG----------AT-TCTA------G-----------AA------C--A------TA--A----TT-T------G-AT--A-T----CGT---T-TA-T---C----A-TCTGAATCAAATTCCTTTT-AATTTAT---TTGT-T---T-----GTTACCGACAT--G---C-----CGA------C--TGAAA--T-T--------C-------------------------A------------T----TTT--A-----AGT-------GACA---TT--T-GTGA---------AC---A-GATTGT--------T---------C----------A-------------------T---------A-----GAGCT-TTG---AATGC-CCAAT----ATGTA-GTTT-T--TC--A----TGTATTTTCCTGACTTAAAACTT-TTT
gi|60 : AAATA-T-TCAT-----T--TCAAT---TT-GCAT--TGC----TGCAGA--GATAT-----TT-TGCCA-AG----AA-C-------TA-----AA----gcaatcagtt
gi|61 : --TCAAA---TT-ACAT--AAC----TGCAGA--GGACT-----TT-GGCTAGGG----AA-A-------T------------A---------G--G--CTG----CA-A--A-G----GATGTT-TC-cgtctacaga
gi|62 : -TA-CATTACAAAA-C-TGATCT------C-GTGTA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----Caga
gi|7 : catgta--ATATGA----T-TTTT--ACAATA--TAAACAT--AT--A-C----CAAAA-G-TTATCT------C-ATATA---AT-------TTGC----TATTTGTCA---ATAC-----CTC-----ATTATTGTTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TT-TTTA---T-------AGA--CT-T-AC--AC---T-AAAATGC---T--T---T-GCTC--CTT-----T-ATGCAAAACAA------CG-T--CG-T----A--T-GAGC-TAA------AATC-A-------TT-GTC---------AAAATA-T-TTCT-----T--T-AAA---TG-TCGT--AGC----TCAACA--GAACT-----TA-TGCCA-CG----AA-A-------CA-----AC----A---------G--A--CCG----CCAA--A-A----AGCGTT-CT-C-GGAA--A------TCC-ATTATGTAGAGTTT-ATGC-A-TTATG-T-AT--A--AGGAGTTC-A--TA-T----GTCGGT--ATA------T--T------GACT-C------CCA----T------------AC----------AT-T--A------A-----------AGTAAAGCC--G------CA--T----TT-T------GAA---G-T----CGCA--T-T--C---T----A-CCGGAACCAAACCCATTTC-TGTTTAT---TTCT-TACAT-----AATG---C-AT--TATGT-----CGTCGACTCC--TA-----T-T------A-A------------G------------T------------T----TTA--A-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AT---A
gi|8 : ttaat-ATATA---TT-------TTA-A---TATTTCTTG---ATA------------GGA--ATCCTTT-T-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----CT-TCT----T-------GCATTCA-C-AG--AC---T-AAACAGT---TA-T---T-ACCCAAC---------ACATAACTCGG------CA-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT--TT--------AAAGAT--T-TTCT-----T--TAAAA---TT-GCAC--GAC----TGCACA--GAACTTTCAATT-TGTTA-GG----AA-A-------TG-----AA----T---------G--T-----------------------ATGTT-AC-CAAAAA--A------TGC-ATCCC----AGTTC-ATGC-A-GAAGG-T-AT--C--TGAAGTTT-G--TA-T----TTTGGT--TCC------T--C------A----C------T------TG-----------AT----------AT-T--A------A-----------AG------T--A------AG--TATCATTAT------GAA---G-T----TGGA--T--A-A---T----A-TTGGAATGAAACTGGCTGT-TAATGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-A---------------C------T--TG-----G-G------G-A------------GT-----------A------------TA---TAT--A-----AGTT-A---CGAC-----T--A-GT-----------------TGGGTAC--------C---------CAT--------A-----------G-------T---------G-----CT----TTA---AATTT-TCTCT----ATGTA-AGTT-T--AT--A----TGTATTTTTCTTTCT--
gi|9 : C--ATGTGA-T--T-GTT---ACAATA--TAAATAG--AA-TA-CA------AA-G-TAATGT------A-ATGT-----T-------TTATA---TATTTGCT-------------------------TCATTTTC-GA--AT--------TA----T---------------------T-T---T-CA-----TT-TTTGTT-T-------GCATTTT-C-AT--GT---T-AAACAGC---TG-T---T-GTAA--GGT-----T-ATGTTAAATAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GCTT-C-------TTTATCATT----AAAAAG-G-T-TCCT-----T--TTAAA---TT-ACAT--GAA----TACAAA--AAAGT-----TT-TGCTA-AT----AA-A-------TA-----AA----ACAAAATACAA--G--CTT----A--A--A-G----TATGTT-GT-T-GAAA--G------CAC-ACCAC----AGTTC-GTTT-A-TTAGA-T-AT--C--TAAA--TC--------------------AAA------T--T------A----CACCTCTT------T------------AC----------AT-T--A------AAATAAC-----AA------C--G------TG--T----TTAA------A-A---G-C----CGTA--T-TA-AATCG----A-TCGGAATCAAACTTGTTTT-TATAGAT---TTT-------------------A-AT--T---C-----TAT------T--Ttcag
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTAAACCACTTATAATATTACTGTTATGATCTTTACCTATCAGATTGAAACCTGTGAATTATCTAAAAGAATGAAAATTAATTGTTATAGGGCTGTGTATTGCTTGACCAATGCTGATACAATATGTATCGCAATTCAGGTATCCAGATACAAGATACAATGCGATACAGATTATTATTGAAAATGTGATGGAATTCAAGAGTATCTTTAACATTAAGTAAAATATATACGGTGTTGCCCGCTTAACACATCATAACAAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTTATTTGGACTGTGCACAGTATTGCTTGACCAATGGTGATCTGATATGTATCATGGTATAGGTATCCCGATACGCCATACAATACAGATTATTATTGAAAATTTGATGAAATCCATGAGTAACTTTTAACATTAAGTAAAATGTATACACAGTATCACCCTCTTAACACATCATT
Unaligned ( gi|39 ): AGGGATGTGCATTGCTTGGCCAATGCTGATTCTATATGTCTCATGATACAGGTATCAGATCCTGATACACAATACAATATGATACAGATTTTTATTGAAAATGTGATGAAATGCATGTGTCACTATTAACATTAAGTAAAGTATATATACAGTATAACATTCTTCACACATCATAA
Unaligned ( gi|40 ): TAGGGTTGTGTATTGTTTGACCATTGGTGATACAATATGTACCACGATACATCATCCCGATACGCGATACAATACGATACAGACTATTATTGAAAATGTGATGAAATGTATGAGTACTTCTAACATTAAGTGAAATACAAACGGCACCACTCTCGTTATACATAACAT
Unaligned ( gi|41 ): AGGGCTTTGTATTGCTTGACCAATGGCGATACAATATGTATCATGATACAGATAATCTGACACGCGATACAATACAATATAAATTATTGTTCAAAATGTGAAATCCATGAGTAACTTTTAAAATAAAGTAAATATATATAAATATACGGCATCACACTCAAAA
Unaligned ( gi|52 ): TGATTGTTCATTAATGTGAAGGATGAATTGTTCTAGGACTGTGTACTGCTTGACCAATGACGATAAGATTTGTATCTAAATATAGTATCATAATACGCGATACAACATGATACAG
Unaligned ( gi|53 ): GTATAATACATCCCATTACACTTAACAGTATAATACAAACAGTTTTCAAAATTCATGAGTAAATTTTATGTAAAATATATATACGGTATCACCCTCTTACACATCATATCAAA
Unaligned ( gi|55 ): TGTGATTGAAAATGGGATGAAATCCAGGAGAAACTTTTAAAATTAAGTATAATATATATATGGTATCAATCTCTTAACACATCATATCAAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 4444444 1 111111111 333333333333333 11 22222222222222 11111111111111111111 1111111111111 11111111 2222222222222222222222222222222222 22222222222222222222222222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111
lowQualScore : 8888 0 3333333 3 1 8888 1 6666 888 4 3 7777 0 7777 3 555555555 33 2 44 33 22 333333333333333 111 0 55555555 222 4444444 77 222 1 222 11111111111111 22 1 1 22 55555555 3333 11111111111111111111 1 222 1 33333333 4444444444444 0 1 1 33333333 1 444 1 222 1 444 33333 1 3333333 1 11 1 2222 11 1 1 333333 1 0000000000000000000000000000000000 33333 11 333 1 11 2222 11 555555 1 11 5555555 1 3333333 33333 2222 66666666666666666666666666666666666 2 222 2 11 444444 0 1 3333 1 1 1 0 1 1 22 222 2 66666 1 66666 3 22 444444 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 3 44 1 9999 1 777777777 444 1 22 555555555555555555 22 77777 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 33333 00 333 333 22 1 2 1 1 3333 333 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 3333 333 2 55 6666 2 2 22 33 4444 1 1 444
lowQualScore : .... . ....... . . .... . .... ... . . .... . .... . ......... .. . .. .. .. ............... ... . ........ ... ....... .. ... . ... .............. .. . . .. ........ .... .................... . ... . ........ ............. . . . ........ . ... . ... . ... ..... . ....... . .. . .... .. . . ...... . .................................. ..... .. ... . .. .... .. ...... . .. ....... . ....... ..... .... ................................... . ... . .. ...... . . .... . . . . . . .. ... . ..... . ..... . .. ...... .. ................................................................................................................................................. . . . .. . .... . ......... ... . .. .................. .. ..... . .................................................... .. ..... .. ... ... .. . . . . .... ... . ............................................................ ..... .... ... . .. .... . . .. .. .... . . ...
lowQualScore : 3333 7 3333333 3 0 1111 4 3333 888 9 3 1111 8 1111 1 222222222 22 4 55 11 99 111111111111111 999 7 00000000 777 8888888 11 777 0 777 44444444444444 11 5 6 11 66666666 1111 66666666666666666666 4 444 4 66666666 3333333333333 9 3 4 33333333 4 888 4 444 4 444 22222 3 9999999 3 88 3 7777 88 3 3 777777 3 3333333333333333333333333333333333 00000 66 888 2 77 7777 77 111111 3 00 7777777 2 9999999 00000 6666 22222222222222222222222222222222222 6 222 3 99 000000 7 4 0000 4 4 4 1 5 5 00 555 3 22222 5 99999 4 11 444444 22 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 1 99 6 7777 6 000000000 444 6 22 777777777777777777 22 11111 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 88888 11 000 000 44 7 4 7 7 7777 222 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333 9999 777 1 11 6666 1 1 99 11 7777 0 4 111
consensus : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
Reference ( family-892 ) : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|1 : AAACAAAATTTCCAACCATTAAAAATGGTGTACTGTGTATAAAAACTATATATATT--ATATATGTGTAAG-CATACTAGGTCAAA-TAT----GTTTA----GCA-ACA-CT-G--TTC--ATATTAATA-T-GTTT--ACATTA--TAAATAC--ATGTA-CATTACAAAA-T-CAATCT------C-ATATT---TT-------TTATA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAA--GGA--ATCATTT-T-AA--TT--------TT----TG-------------------AT-T---T-CA-----AT-TTT----T-------ACATTCT-C-AC--TC---T-AAACAGT---CC-T---T-GCTC--CTT-----T-TTGTAAAACAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------ACTT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTTT-----T--TCATA---TT-GTAT--GAC----TGTAAA--GTACA-----TT-AGCAA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--TTA----C--C--A-G----TATGCA-TC-T-GTAA--A------TAC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TTAGG-C-AT--C--TGAAGTTT-G--CA-T----GTCAAT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AA----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----TGCA--T----TAC---AA-TCAGAATTTAACTCATTTT-TATTGTT---TTTT-T---T-----ATTC---A-AA--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TTACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT-----TGTA-GTTT-T--AC--A----TATATTTTTGTTGCT--GAATATATTTTA
gi|10 : T-T---T-TT-----TT-TTT----T-------GCTTTTT-C-AA--AA---T-GATCAGT---CA-A---T-GTCC--TTT-----T-ATAGGCAACAT------TC-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TTTGTTGCT----AAAAAAGA-G-TTCT-----T--TCATA---GT-GTAT--GAC----TGCAGA--GAA-------------------------A-------TA-----AA----A---------T--G--CCA----CT-A--A-G----AATGTC-TC-A-TGCA--G------TAC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGTCC-G--CA-T----GCCAGC--AAA------T--T------A----C------CCCCCTTT------------GT----------AT-T--A------AAATTAATT---AA------C--A------TG--T----TT-T------GA--A---G-C----CCCA--T----AAA---AA-TCAGAATTCAACTCATTTT-TATTGA----TTTT-T---T-----AATA---A-AG--T---A-----TGT------T--TC-----T-G------A-C------------T------------AAATTTTAT----T----TTT--A-----AATC-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----GC---ATGGCAAG-----------------------------------------A-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATATA-ACTT-T--AA--A----TGAA--TTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|11 : gtatttttttA--AT--------TA----TA-------------------GT-T---T-CC-----TA-TTT----G-------GAATACT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TATT---T-GCCG--CTT-----C-CTGTATAAAAG------CG-T--TT-T----G--T-GGGG-TA----------T-G-------TT-GTT---------AAATTA-T-TAGT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAT----TGCATA--GAGCT-----TT-TAACG-GGGA--AG-A-------TG-----AA----A---------G--G--CCG----T--T--C-G----CAAACC-TC-C-AACA--C------TGC-ATCAC----AGTTC-CTGC-ATTTAGG-T-AT--C--TGAAGGCT-G--TA-A----GTCGGT--ACA------T--T------A----T------A------T------------ATTTAAAATAAAAT-T--A------AG----------AA------C--G------TA--T----TC-T------GA--A---G-T----CGC---T----TAA---TA-TCAGAAATAAACTCGATTT-TATT-AC---TATC-T---T-----AA-A---A------------------------T--TG-----T-T------G-C--------------------------------------------TT--A-----CGT--------ACA---TT--C---AATT-TT----ACCTTGTAGGTAC--------C---------T----------T-----------T-------T---------G-----GA----T-------TGT-CCCCT----ATATATATAG-T--AC--A----AGTATCATGCTTGAT--TCACTCATTTTt
gi|12 : -T-TTATCT------CGAAGTG---TT-------T-ATA---TTTTTGTCA---ATA-------------AA--ATTATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-A---T-CA-----AT-TTT----T-------GC----T-C-AT--G------AGACATTAGACA-T---T-GCCC--TTT-----T-ATGACAAATAG------GG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-GT------TT-ATTGTT------AAGATA-T----T-----T--TCAAA---TT-CCAT--GAA----TGCAAA--GAACTGC---TT-TGTAA-------AA-A-------CACCAACAA----A---------G--A--CTGATTTC--A--A-A----AAT---------GCAA--AGTTCTCTGC-ATTTC----AGCTCAATGC-A-TTAAG-T-AT--------------------------TTGAT--AAA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------AC----------AA-T--A------AG----------AA------T--A------CA--T----TT-T------GA--A---G-G----TGCA-------AAA---AA-TCAAAATATAGCTTGGTTT-TA----------TT-T---T-----AATT---A-AC--T---C-----------------TG-----T-T------G-A------------G------------A------------A----CTC--A-----AGT
gi|13 : tagcaagtataaaaaaaagtagatAGACATGT-TAAT-AATATTAAGAAA-----C----GTTTT----GCG-ATT-CT-T--TTC--ATATTAACA-T--TTT--ATAATA--TTAATAC--A--------------------ATAT------C-ATGTA---TT-------TGGTA---G--TTGGCA---ATAT-----CCAG--GAA--ATCATAT-T-AA--AT--------TAGTCTTT-------------------GTAT---T-TA-----TT-TAT----T-------TTATTTT-C-AT--GT---C-AAACAAT---TA-C---T-ATCC--TTT-----A-ATTCAAAACAG------TT-G--TT-T----G--C-GAGA-T---------ACT-T-------TT-TTT----------AAATG-T-TT------------AAAGATTT-GCAT--TTT----TGCAGA--GAA-------------CA-AT----AACA-------AA-----AA----A---------G--A--CCG----C--A--A-AT---AACTTT-AC-C-AAAA--A-------GC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TCAGG-T-AT--T--CGAAGTTC-G--TA-T----TTAAGT--AAA------T--T------A-------------------------------A-----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAT----TA--T----TT-T------G---A---tttaaggtgaattta
gi|14 : ataTAAAACAT------TG-T--TT-T----G--T-TAGA-TAA------CCTT-T-------GT-GTTGTT----AAAATACA-T---CT-----T--TCATA---GT-GTAA--GAC----TGCAGA--GAATG-----TA-TGCTA-GT----AA-T-------TA-----AA----A---------T--G--CCG----C--A--T-G----GACATTCTT-C-GGAA--A------TAC-ATCAT----AGTTC-CTGC-A-TTAGG-T-AT--C--TGAATTTC-G--CA-T----GTCAGC--AAA------TTAT------A----T------C------TTTTG--------AT----------AT-T--A------A-----------AA-----------------G--T----TT-T------T---AAT-G-T----CAAA-------TAA---AA-TTAGAGTTCAATACATTTT-GAATGAT---TTTT-T---A-----AATG---A-AT--TG--C-----TAC------T--AGCTAAAT-T------T-C------------A------------T------------T----TTT--A-----TGTA-A---TGACA---GT--C-ATAA-TGTTTGCGAC---AAG-CTAGATA-----C---------CTAT-------A-----------G-------C---------G-----GA----CTG---AATGT-ATAGT----ATGGA-ATTG-T--AC--A----ATTATTTTGGTTGCT--TAACTTACTTttgatttgtaagacattatgtgtattgtctatacat
gi|15 : ----G--C-GAGA-TAA------AATT-G-------TTTGTTGTT----AAAA--CA-T-TTCT-----T--TCATA---TT-GTAT---AT----TGCAAA--GAAa
gi|15 : TT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------TGGGTATCCATA-----------G-------G---------G-----GA----TTG---AATGT-CCTGT----ATGTA-AGTT-T--AC--A----TGTATATTTGTTATT--AAATTatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaagtaatgacattcataatttacatgactggctgggtatccataggggattgaatgtcctgtatgtaagtttacatgtatatttgttattaaattaaaatatcatttattgt
gi|16 : gcgagataaaattgtttgttgttaaaacatttctttcatattgtatattgcaaagaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----C-ATGTTGAACAG------CG-T--AT-T----G--T-CAGA-TAA------AATA-G-------TTTATTTTT----AAAA--TA-T-TTCT-----T--CCAAA---TT-ACTT--GAT----TGCAGA--TAATT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------TA-----AACATAA---------G--G--CC--------A--A-A----CATATT-TTAC-GCTG--A------TGC-ATCAC----AGTTC-AAGC-A-TAAGG-C-AT--C--CAAAGTTC-G--TG-T----ACCGGT--ATA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------GC----------AT-T--A------A-----------AC------T--A------TG-----------------A---A----------CATA--A----TAA---G--TCGCAATTAGATTAGCTTC-TATTAA----TTGT-T---T-----AATA---A-AT--T---CAATTTCAC------T--TA-----TAT------T-C------------A------------G------------T----TTTAAA-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----Aaaaatatcatttattgt
gi|17 : atgatatgtacattcttgtatactggtaaaaagaagtttagcaagtattA-AGT-CT-----TC--ATATAAATA-T-ATTTTTACAATA--AAGATAA--AT-T-----T-CAGAA-T-TAATCT------C-GTGCA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GAA--ATAATTT-C-AA--AT--------TA-----A-------------------GC-T---T-C-------------------------CATTCT-C-CA--GCTGTT-AAACAGT---TA-T---T-GCTC--ATT-----T-ATGTAAAA-AT------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TGA------AATC-A-------TT--TT-TTAAAAAAAAAAAA-A-TCCT-----T--TCAAACT-CT-GCAT--TAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCG-AG----AT-A-------TT-----AA----A---------G--G--TTA----A--C--A-G----ATTGTT-AA-T-G-AA--A------TGC-GACAA----AGTGC-ATGT-A-
gi|18 : ataaatttcaagagaaat-T---T-CA-----TT-TTT----TTCTCG--GTATTCT-C-AG--GC---C-AGACAGT---AA-T---T-GCTT--CTT-----T-GTATAAAACAGACTAATC--T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GATT-A---------------------------------CT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GGC----TGCAGA--GAGTT-----TT-TACCC-GG----AA-A-------TG-----GA----A---------GT-A--CTT----T--A--A-G----ACGGTT-TC-C-GGAT--A------TGC-ATCAC----AGTTC-GTGA-A-TTAAA-T-AC--C--AGAAGTTG-T--TA-T---------T--AAA------T--TTTAC--A----C------T------T------------AC----------TT-TC-A------A-----------AA------C--A------TT--T----CT-T------aggctgtgtacagtttggttaaacgttgaattcttaaat
gi|19 : aatgcattttgatataaaataatgtctgcatggttgcaacattaattgtacatttcttgaaggatggcatttgttgaaatataaatattgcttaataT-----T-ATCTAAAGCAG------TG-T--TT-TTTTTG--T-GCGA-TAG------CATT-G-------TTTGTTGTT----TAGA--TA-T-TTAT-----T--TCTTG---TT-TTAT--GAC----TGCAAA--GAACA-----TT-TTTCA-AG----AA-AATAAAAATA-----AA----A---------G--G--TCA----CC-A--A-G----AATACC-TA-C-GGAA--A------TAC-ATCAG----AGTTC-ATGC-T-TAAAG-G-AT--C--TGAATTTC-T--TA-T----GTCAAT--AAA------G--TCCATCCA----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA--------------------------T-T------A---A---G-------------------A---CA-TCAG--TTTGACTTATT-----TTG-----TTTC-C---CAAAAAAAAA---A-AA--T---G-----CGT------T--TG-----T-T------T-CT-----------G------------ACTTAAATTCAG-T----TTA--A-----AACA-A---TGGCA---CT--C-GTAA-T-TT----AC---ATGATTAtcaaattacataa
gi|2 : AACAC--AT----CATAACAAAAAC-TAAGTT---------TTTA---TT-------TTG-A---TATCTGCCA---GTAC-----CTAA--GGA--AACATTT-CTAA--CT--------TT----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TT----------------------------------GAACAGA---CA-T---T-GTCA--ATT-----T-ATGTAAAACCA------CG-T--TT-T----G--TAGAGA-TAA------AATT-G-------TT---TGTT----AAAAGCTG-T---CT-----T--TCACA---TT-GTAT--GAC----TGCAAA--GAACT-----TT-TACAA-T------A-A-------TA-----AA----A---------G--G--CC------------------AGTGTC-TC-A-GTAA--A------TAC-ATCAC----AGTTT-ATAA-A-TATGC-T-AT--C--TGAAGTTT-GCATA-T----GTCAGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------CC----------CT-T--T------AT----------AG------T--A------TG--T----TT-T------G---A---AAT----TGCG--T----AAA---AA-TCAGAATTCAACTAATTTT-TATTGATTTCTTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----AGA------A--TG-----T-T------G-CCAACTTA-----A------------A------------TTCAATTT--A-----AGTA-G---TGACA---TT--C-ATAG-T-TT----AC---ATGACTGG--------CTCAGTATCAT----------A-----------G-------T---------G-----AA----TTA---AATGT-CCCATAATCATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACATATTTTA
gi|20 : tctcaatgagagcaggtatgagaagagcaatactatacagaatatcattgtaaatgtgatgaaaatcatgaataacttttaacagtaagtaaaatatatatacacagtatcaccaactt-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------T--G--TTG----C--A--ATG----AATGTT-TT-C-ATAA--T------TCC-ATTAC----AATAC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--C-AAGTTT-G--TA-TTTTTGTCAAG--AAA------T--T------A----T------C------TCCTTTC------AT----------AT-T--T------A-----------AA------T--AA-----TG--T----CA-T------A---AAAAG-T----CGCA--TAAAATAA---CG-TAGGCATTGAACCCCTTTT-CATTGAT---TTTT-T---A-----AATA---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----A-T------G-C------------GGACTCAGATTCAG------------T----TTT--A-----AGTT-A---TGACA---TT----GTGA-T-AA----AC---CTGGCTAT--------C---------T----------AG----------G-------TACACACA--G-----GATT--TTG---AA--------C----ATGTT-GTTT-TACAC--A----TGAAGTTTTCTTGCT--AAACTTAt
gi|21 : tgcatg--ATCATTC-C-AA--AT--------TT----TG-------------------TA-T---T-CA-----TG-TTTG---T-------ACACTAG-A-AT--GC---T-TAACAGT---TA-T---A-GCAC--TTT-----T-ATGGAAAATAG------CG-T--TT-T----G--T-GAAA-TAA------AATT-GT------TT-GGTGTT----AAAAGA------TCT-----T----AAA---TT-GCAT--GGCTGCATGCAAA--GAAAA-----TT-AGTTA-TG----AA-A-------TT-----AA----A---------G--G--CTG----T--A---------AAT-------T-GTAG--A-------------AC----AGTTC-ATGC-A-TTTGA-T-TT--C--C---------------------CGGT--AGA------T--T------A----T------CTCCCTTT------------AC----------AT-T--AACCTACA-----------AA------CCTA------CA--T----TT-T--------------A-T----C-C--------------TA-TCGGAATCAAACCCATTAA-TATTGCTG--TTTT-T---T---------------T--T---C-----CTT------T--TT-----T-T-----------------------------------------------T----TTT--A-----A
gi|22 : g-------GCATTCT-C-AG--GA---T-AAACAGTGAATA-T---T-A-------T-----T-A-GTAAAA-----------------------------------A------AAGT-GC------TT-ATTGT------AAGAGTA-T-GTAT-----T--TAAAA---TT-GCTA--GAC----AACACA--GTTGC-----TT-TGTCG-GATATTAA-T-------TA-----AA----A---------T--GAATCA----A--A--A-G----AATAAT-TA-A-GACA--A------TGC-ATCAC----AGATC-ATGCTG-CTAGGTT-ATAGC--CGGAGTCT-G--T--T----ATT--T--ACA------CCGT------G----C------CCCCTT-T------------AC----------AT-T--G------A-----------AA------T--A------TG-----------------A---A----------CGTACTT----TGA---GA-T---AATT-------TCTT---TTGA----CATT-C---T-----AATA---G-AT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------A-C------------G------------G------------A----CTT--A-----AATaatt
gi|23 : -TATACTGAGGAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--ATC--ATATCAATA-T-GTTT----------------------------CACAAAA-C-TAATCTTCATGGC-ATGTA---TT-----------A---CATTT----------------------------TT-TTT-T-AA----------------------------------------------T-CT-----TT-ATT----T-------ACATTCT-C-GC--TC---T-AAACAAT---CA-T---T-GTCC--CTT-----T-ATTTAAATCAA------TG-T--TTAT----T--T-TAGA-CAA------ATTT-GAGATTTATT-GTTGTT----ATAA--TA-T-TTCT-----T--TTATA---TT-GTAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TG----------------------A-----AA----A-----------------G----C--AATA-G----AATGTC-TC-T-GTAAATA------TAC-ATCGA----AGTTC-AAGC-A-TTATG-T-AT--C--TGAAGTTG-C--CA-T----GTCAGT--ATA------T--T------tcatttttgtaaattgtaacattcat
gi|24 : AAA----AAAATACGTAAGAGGGTTGTACCAAAG-------CTATA-ATAACTC----------AAA-TATACTGAG-ATAA-TGA----GTTTA----GAG-AGA-AT-T--TTC--ATATGCATAGT-GTTT----GATA--GAAATAA--AC-TG-C------AAA-T-TAATAT------C-ATGTA---TT-------TTG-A---TATTTTTCAATTATACTGTTACTA-----A--A-----T-G-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TG-TTT----A-------GGATACT-C-AG--GC---T-AAACTTG---TA-T---T-GTCC--GTT-----T-ATGT-AAACAT------TG-T--TT-
gi|25 : tccttatatggaataccacctctgtgaagtgtcttggttgaacaattatatcagtt-TTT----T-------GCTTTAT-C-AG--GC---T-TAGTAGT---TA-T---T-GTAA--TTT-----T-ATTCAAAACGG------TG-TGGTT-T----T--C-CAAA-TAA------A--T-G-------TG-TTTATT----ATTCAATGGT-TTCT-----T--TCAGG---TT-GCAT--TAC----TGTAGA--GCACT-----TA-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------GCAG--CC--------A--A-G----AATGTT-TA-T-GTAA--A------TGA-ACCAT----AGT----TG------AGG-C-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--TCA------T--A------A----T------C------G------------AC----------AG-T--A------A-----------
gi|27 : atattactaccaattttgattaatatttttatttttaacta---TT-------TTATA---TACATATCA---ACAC-----CTAA--AGA--TCCATTT-T-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TG-TAT----A-------ACTTTCT-T-AG--GC---T-AAATA-----TA-T---C-GCCT--TTT-----G-ATGT------T------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TTA------TAGT-GT------TT-ACTGTT----AAAAGA-----TTAC-----T--TAAAA---CT-GCAT--AAC----GGCAGT--GAACA-----T------A-TG----AA-A-------GA-----AA----A---------G------------------A-A----AATTTA-AC-T-TTAA--A------TTC-AACAA----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-TCGT--CTTCAAAATGC-T--TA-TC---TTTGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------GC----------CT-T--A------A-----------cttatcatcctttat
gi|28 : aagAAA-TAA----GTTTATCTAGCA-AA-----A--TAC--ATGTTAACA-T-TTTC--ACAATA--TGAATAA--AT-TA-C-TTA----A-T-CAATCT------C-ATATA---TT-------TTTGA---TATTTGTCA---GTAC-----CTAG--GGA--ATCTTTT-C-TA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T--------------------------------------------------CAAT---TA-T---T-GCCT--TTT-----T-ATGTTAAACCA------CA-C--CT-T----G--T-GAAA-TAA------AATTCT-------TT-GTTGTT----GTAAGATA----TCT-----T--TGGAA---TTAGCAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TTCCA-GG----AA-A--------G-----AA----A---------G--A--TCA----CA-A--A-G----AATATT-TC-cattaaa
gi|29 : aaagACA--TAACAACT-AT-TA--ATTACAAA--T-CAATAT------T-ATGTA---TTAAGAAGTTCATACAGTATCTGACA---ATAC-----CAAG--AGA--ATCATT--C-AA--A----------A----TG-------------------GT-T---T-AA-----TTGTTT----T-------TCATTCT-T-AC--CC---TGAAACAGG---TA-T---T-ACCC-------------------ACAG------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TCA------AATT---------TA-ACTGTT----AGAAGGT-------T-----TAATCAAA---TT-GCAT--GGA----TGCAGA--AGACT-----TT-TGACA-GG----AA-A-------TT-----AA----A---------G--G--CTG----CA-A--A-G----AATGAT-CC-C-AAAtaaa
gi|3 : catattttcttAAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCAAACATGAGAAAA----ACTAAGAAAAA-AAA----GTTAA----GCG-GGA-CT-G--TTCTGATATGAATA-TCG-----ACAACA--TAGATAA--TT-TC-CAAT---AAA-T-TAATCT------C-ATATA---CT-------TT-TA---TATTTTTCA---ATAT-----CTA---AAA--ATCATAT---GG--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTC----T-------GGATTTT-CGACTATT---T-ATCCACT---T--T---T-ATCC--GTT-----T-ATATAAAACAC------TG----TT-T----GAAT-GAGA-TAC------AACT-G-------TT-TATGTT----TAAG-------TTAT-----A--CCAAA---TT--CAT--GGC----TGCAGA--GAAAT-----TG-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----CA----A---------G--G--TCA----C--A--ATT----AATGTT-TC-A-GAAA--A------AGC-ATCCT----TACTC-ATTC-A-TTGGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----ATCTGT--CAA------T--A------A----C------C------T------------CCTGTTTA----AT-T--G------A-----------AA------T--A------AGAAT----TT-T------A---A---A-T----T-----T----TAA---TA----AAATTG---------T-TATTGAT---TT--------------ATA---A-AT--T---A-----TGT------TTGTG-----T-T------GCC------------G------------A------------C----TCT--A-----ATTC-AGTTTTA-A---GC--T-ATGC-T-TT----AC---ATGCCTAG--------C---------T----------A-----------G-------
gi|30 : ttccctatcaggaatacttcctgtttgaagtgtcttgattgaagtactatatcaatata--A-A----AATGTT-TC-C-AGAA--A------TGT-ATAAC----AATTT-ATGT-A-CTAGA-C-AC--A--CTAA---C----TA-G----GTCACT--AAA------A--T------A----CGT----CTCTG--T------------GT----------AT-T--A------A-----------AAT-----C--A------GA--T----CT-TAATTTGG---A---G-A----CGCA-------TAA---TA-TTAGAA-TCAACTTCTTTTATATCAA----TTTT-T---C-----AATA---A-AGAAT---C-----C--------T--TG-----T-TTCAAACT-C------------G------------A------------T----ATT--A-----TGAT-A---TGACA---TTAAC-GT---T-TT----AC---AT-----------------------------------A-----------G-------T---------T-----GG----TT----AAGGTACCCAT----AC----ATCT-T--AC--A----Tgt
gi|31 : agaaat-T-TAATCT------------A---TA-------TTG-A---TATTTGTCA---ATA------------------TCATTT-C-AG--AT--------TA----TA-------------------GT--------G-----TT-TTT----T--------C-TTCT-C-AA--TC---T-AAACAGT---TA-T---T-TGCT--CTTATATGT-ATGTAAAGCAG------CATT--TT-T----G--G-GAGA-TAA------ACTA-GT------TT-ATTGAT----AAACAACA-A-CT-T-----T--TCGAA---TT-GCAC--GAC----TCTGGA--GCACT-----TTATCTC--------AA-A-------CA-----GA----A---------G--T--TTG----T--G--A-GATAAAATGCTGTT-T-GTAA--A------TAC-TTCaa
gi|32 : -------TA-----AA----A---------T--G--TAG----A--A--A-G----AATGTT-TC-C-GAAA--G------TTTTATCAT----GGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--A--CGAA-TT--------------TCAAT--AAA------T--T------GCTTCC------T------T------------AC----------AT-C--A------AAATAGTAACATAA------C--A------TA--T----TT-T------GA--A---G-T----CACA--T----T----------GGAA---A------TTT-TATTGA----ATTT-T---T-----AATA---A-GT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------
gi|33 : aacattgttttgagagataaaatagcttattgt----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TT-T------G---AA--G-T----CGCA--T----TAC---TA-TCAGAATTCAGTCCTTTTT-TATTGAT---TTTA-T---A-----AATA---T-AT--T---C-----TGT------G--TA-----T-T------G-CT-----------G------------A------------C----TCG--A-----ACT---------CAGTTTT--CAGTAA-T-TA----AC---ATGCCTA---------C---------C----------AAGGTACCTATGG-------T---------G-----GA----TTG---AATCT-CCTAT----ATGTA-ATTT-T--AC--ATGTTTGTATTTTTGCTCCA--AAACGTTTTTTAtcaaactcaaatttcagtttttg
gi|34 : a------T------------AC----------AT-T--A------A-----------TA------G--A------TG--T----GT-C------ATAAA---G-TTACACACA--TG---TCA---TA-TTGGAACCAAACCTGTTTT-TATTAGT---TTTTAT---T-----TACA---A-TT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------G-CT-----------G------------ACCTAAATTCAG-T----TTT--A-----A-CATA---TGGCA---TT--G-ATGA-T-TT----AC---TGGACTAA--------C---------C----------AG----------G-------T---------GCCCGCAACACTTTG---AATGT-TCC-T----ATGTA-GTTTAC--AC--A----TG---TTTTGTTttca
gi|35 : tAAA-TATATAGGTTTA----GGATAG--CT-T--TTC--ATGTGAATA-T-TATT--ACAATA--TAAATAC--AT-TC-CAC-----AA-T-TAATCT------A-ACGTA---TT-------TTA-A---TA-----CA---ATTT-----ATAA--GGA--CACATTT-C-AA--A-------------------------------------T-T---C-CA-----------------------GC-------------C---T-AAACCAT---TA-TAACT-GATC--CTT-----T--TGTAAAACAG------AG-T--TT-A----G--T-GAGA-T-A------CATT-G-------TT-TTTATT------AAAATA-T-TCTT-----T--TCAAA---TT-t
gi|36 : ---A---G-T----TGCA--T-----AC---TA-GTGGAAACAATCTGGCTTT-TATT-AT---CTGT-T---T-----AAAAT--A-AT--T---T-----AGT------T--TC-----T-T------G-C------------A------------AACGCAAATTCAGT----TTC--A-----TGTT-A---TGGTA---CT--C-GTGA-C-TT----AC---TTGATTAA--------C---------C----------A-----------GGTACTCGT---------G-----GA----TCGTTAAACGT-CTCAC----ATGGG-GTTT-T--AC--A----TGTATT
gi|37 : aataagggtgtataatatgaT--ATAACA--AAAATATGAAC-TA-CATAACAAAA-T-TGATGT------C-ATGAA---TA-------GTG-A---TAATTGCCA---GTAC-------------------ATTT-C-AATAGC--------TT----TT-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTTATTTT-------GCATTCT-C-AC--TT---T-AACCAGT---CA-T---T-GCCC--CTT-----C-GTTCAAAACAT------TG-T--TT-C----A--T-GAGA-TAC------AACT-G----------GCTCTT----ATTAAATG-CATTCT-----T--TCAgcctaa
gi|4 : aATACTAATTGAAA-TAT----GCTAA----GCA-A---CC-GATTTC--ATATGCATG-T-TCTT--GCAATAGATAACTAC--AT-TA-CA--ACAAAA-C-TAATCT------C-ATTTG---TT-------TTGAA----AGTTGCCA---GTA-----------------ATTATTT-C-AA--TT--------TT----T---------------------T-TATAT-CA-----AT-TTT----T-------TCATTCT-C-AC--TCA--T-AAGCGG-----A-T---TCGCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CA-T--TA-T----G--T-GAGA-CAA------AGTT-T-------TT-ATTATT------AAAATG-T-TTTT-----G--T---A---TT-TTAT--GAC----TGTACA--GAACT-----TT-TGCAA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CTA----C--A--ATA----AATATC-TC-A-GGAA--A------TTC-ATCCC----AGTTA-ATGC-A-TTAGG-T-AA--C--TGAA-TTCAA--CA-T----ATTAGT--AAA------T--T------A----C------T------TCTCTTTTTATCAAT----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TTGC------A---A---G-T----CGTA--T----GAA---AACTCCAAATTCTATTCA-TGT-TATTGA----TGTT-T---T-----AATG---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-CTGACTTTAATTTA------------A------------T----TTT--A-----AGCA-A---TGACA---TT--C-ATGC-T------------AGG--TAT--------C---------C----------ATT---------G-------G---------G-----GA----TTG---AAAGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-A--AC--A----AGTAGTTTTATTGCT--AAACTTATTTTAt
gi|42 : ATTCAAGCTATTTT-TATGGAT---TTTG-T---------AATA---A-AT------------CATCA----T--TG-----C-T------A-CCAACTCAAAT--A------------A------------T----TTC--A-----TGTA-A---TGACA---CT--T-GTGA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------T----------A-----------GGTT----TCCAAA----G-----GGCT--TTG---AATGC-CC--T----TTGT----TT-T--AC--A----TGAATCTAC-TTACT--AAACTTACTTTtt
gi|43 : gTTATATACATGTA---TATACTAAGTAAAA-TGT----GTTAT----GCA-AGTACT----TTT--ATATAAATA-T-GTTT--GCAATA--TAAATAC--AT-TA-CA----AAGA---TAATCT------C-ACGTA---TT-------TTG-G---TATTTGCCA---ATAG-----ATAA--GGC--ATCATTT-tatcg
gi|44 : attaataattatcaccagT-------TTTTA---TATTTGTCA---GTTG-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CACTTTTTT-TTT----T-------TCATTCT-ttata
gi|44 : T-----T--TTATA---TT-TCATTCG-C----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------T--G--CCA----C--A--A-A----Attcatagttatataattttatatttcattcgctgcagagaacttttgccaggaaataaaatgccacaaaattatacctaaa
gi|45 : tttttatatttgtcagttgctagggaatcatttcaaattatggtttcactttttttttttcattctttcatagttatataaG------CA-T--TT-T----G--T-GAGA-TGA------AATG-A-------TT-------------AAAACA-T-TTCT-----T--TCTAA---TT-GCAT--GAT----ATTAGC--AAGC------TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----T---------A--T--ATG----C--A--A-AT---AATGTT-TC-C-AAGA--A------TAC-AT--C----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGttatacctaaa
gi|46 : ----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TCT----T-------GCATTCT-C-AG--AC---T-AAACA--------------------------------------CAG------CG-T--GT-T----G--T-AAAAATAA------AAGT-G-------TTTGTT-TT----AGAAGAT----TTCTATCACT--TGAAA---CT-GCAT--GCC----TGCATATAGAAAC-----TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------AATA--TCA----CA-A--A-G----AATGTatgtagttttacat
gi|47 : -GAAA--A------TGC-ATCTA----AGTTC-ATGC-A-TTACA-T-GT--C--TGAAGTTC-A--TA-T----TTCAGT--AAGAAACCTT--C------A----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAGAATGTA--T----TT-T------GA--A---G-T----CGC---T----TAG---TA-TCAGAAT
gi|48 : caGTAATATATACTGAGAAAAAATAT----GTTTA----GCA-ATT-CT-A--A-C--ATATGAAAT-T-GTTT--ATAATA--TAAATAC--AT-TA-----A-AAAA-T-TAATAA------C-ATGTA---TT-------TTG-----------CCA---ATAC-----TTAG--GGA--ATCATTT-C---------------------------------------------T---T-CA-----TT-TTT----catttatactgccaactcatatttactttt
gi|49 : ATTACAAAA-T-TAATCT------C-A-GT----TT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATGTA----TTAGTGGGA--ATCATTT-C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCTAA-AG--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-TTATAAAA
gi|5 : tt--ATATGTTTA-T-GTTT--GCAATA--TGAATAC---------ATTGTAAAA-T-AAGTAG------T-ATGTG---TT-------TTGGA---TATTT--------T-C-----CTAT--GGA--ATCATTT-G-AA--TTTTTGTGTGTA----TGTGTTGTAGTTGTTGTTGTTGT-T---TGTG-----TT-TTT----TTTTCTTTGCATTCC-C-GC--TC---T-AAACAGA---CA-T------------------------TAAAACAG------TG-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-GA------TT-GTATTT----CAAG---G-T-TCCT-----T--TCATG---TT-GTAT--GTC----TTCAGA--GAACT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------T-------------------------------------------G----AATGTC-T--C-GGAA--A------TAC-ACCAG----AGTTC-ATGC-C-TGTGG-T-AT--A--TGTAGTTT-G--CA-T----GTCATT--TAA------T--T------ACTTTC------C------T------------TC----------ATAT--C------A-----------AA------C--A------TG-------------------------G-T----AGTA--T----AAA---CA-TCAGAACTCAGTTCATCTT-C-TTGAT---TGTT-T---T------------A-AT--T---C-----GGC------T--TC-----T-T------G-C------------T------------G------------T----CTC--AAATTCAGTA-A---TG-TA---CT--C-GTAA-T-TT----GT---ATGACTAGTTAGGTTAC---------CAT--------A-----------G-------G---------G-----GA----TTG---GATGC-CGCAT----ATGTT-ATTT-T--a
gi|50 : aATCACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTTGTTTT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATAC-----ATTG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCT-A-AG--TC---T-AAACAGT---AA-T---C-ACCC--CTT-----T--TATAAAA
gi|51 : tTT--C-----AGT------TGCCA---TT--T-GTTA-T-TT----AC---AAAGCCAG--------C---------T----------A-----------GA------TAGGG-----G-----GA----TTG---AATGT-CCGGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TTTA-TTTTGTTACT--AAACTTATTGTAa
gi|54 : tgttaattgctgactcaagGGAATCAAAACCAATTT-TATTGAT---TCTA-A---A-----AAT----A-AT--T---A-----TAT------G--TG-----C-T------G-CCAACTTA-----G------------ATATT--------T----TTT--A-----AGTA-A---CGACA---TG--T-GAGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------ttcaa
gi|56 : -----GA----TTG---AATGT-CCTGT----TTGTA-ACTT-T--TC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACTTATTTTA
gi|57 : ttacaagaccagcttggtacctttgggtT--G-----AATA-T---TGGCA---TT--C-GTAA-T-TT----AC---ATACCTAA--------C---------T----------AT----------G-------TACCTATACGG-----GA----ATG---AATAT-CCTGTG---AT-TA-GTTT-T--ACTTA----T-TGTTTTTATtttagtat
gi|58 : -TGTACTG-GGAAAA-TAT----GTTCA----GCA-AGT-CTTG--TCC---------TG-T-ATTT--ACAATA--GGAATAC--A-------TTACAAAA-T-TAATTC------C-ATGTA---TT-------TT
gi|59 : a-TATACCAAGTAAAA-TGT----GTTGA----GCA-AGT-AT-T--TTT--ACATGAAAA-T-GTTT--ACACTA--TAAATAC--AT-TA-CA
gi|6 : tatacttactggC--ATATGTATA-C-TTTT--ACAACA--TAAATG---GT-TATCATGG--AGA-TATAAT----------------------------TG-A---TGTTTGTTC---ATAT-----CCAG--GCA--ATCATT--C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----T-------------------------------------------GT----A-T---T-GCCC--CTT-----TTATGTTAAACAG------TA-T--TT-A----G--T-GAGA-AAATGTGTTAATT-G-------TT-GTTGTT-----------------TT-----T--TCAAA---TT-GCAC--GTC----TGTAGA--GAACA-----TT-TG--A-AG----AA-A-------TA-----AA----A---------AA-G--CCG----C--A--A-A----AATGTT-TC-C-AAAA--A------AGC-ATCAC----AGTCC-ATGC-A-TTACG-T-AT--T--CAAAAT-C-G--TAAT----GCCAATTGACA------T--T------A----AAA----C------A------------AG----------AT-TCTA------G-----------AA------C--A------TA--A----TT-T------G---AT--A-T----CGT---T----TAT---CA-TCTGAATCAAATTCCTTTT-AATTTAT---TTGT-T---T-----GTTACCGACAT--G---C-----CGA------C--TGAAA--T-T--------C-------------------------A------------T----TTT--A-----AGT-------GACA---TT--T-GTGA---------AC---A-GATTGT--------T---------C----------A-------------------T---------A-----GAGCT-TTG---AATGC-CCAAT----ATGTA-GTTT-T--TC--A----TGTATTTTCCTGACTTAAAACTT-TTT
gi|60 : AAATA-T-TCAT-----T--TCAAT---TT-GCAT--TGC----TGCAGA--GATAT-----TT-TGCCA-AG----AA-C-------TA-----AA----gcaatcagtt
gi|61 : --TCAAA---TT-ACAT--AAC----TGCAGA--GGACT-----TT-GGCTAGGG----AA-A-------T------------A---------G--G--CTG----CA-A--A-G----GATGTT-TC-cgtctacaga
gi|62 : -TA-CATTACAAAA-C-TGATCT------C-GTGTA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----Caga
gi|7 : catgta--ATATGA----T-TTTT--ACAATA--TAAACAT--AT--A-C----CAAAA-G-TTATCT------C-ATATA---AT-------TTGC----TATTTGTCA---ATAC-----CTC-----ATTATTGTTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TT-TTTA---T-------AGA--CT-T-AC--AC---T-AAAATGC---T--T---T-GCTC--CTT-----T-ATGCAAAACAA------CG-T--CG-T----A--T-GAGC-TAA------AATC-A-------TT-GTC---------AAAATA-T-TTCT-----T--T-AAA---TG-TCGT--AGC----TCAACA--GAACT-----TA-TGCCA-CG----AA-A-------CA-----AC----A---------G--A--CCG----CCAA--A-A----AGCGTT-CT-C-GGAA--A------TCC-ATTATGTAGAGTTT-ATGC-A-TTATG-T-AT--A--AGGAGTTC-A--TA-T----GTCGGT--ATA------T--T------GACT-C------CCA----T------------AC----------AT-T--A------A-----------AGTAAAGCC--G------CA--T----TT-T------GA--A---G-T----CGCA--T----T-C---TA-CCGGAACCAAACCCATTTC-TGTTTAT---TTCT-TACAT-----AATG---C-AT--TATGT-----CGTCGACTCC--TA-----T-T------A-A------------G------------T------------T----TTA--A-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AT---A
gi|8 : ttaat-ATATA---TT-------TTA-A---TATTTCTTG---ATA------------GGA--ATCCTTT-T-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----CT-TCT----T-------GCATTCA-C-AG--AC---T-AAACAGT---TA-T---T-ACCCAAC---------ACATAACTCGG------CA-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT--TT--------AAAGAT--T-TTCT-----T--TAAAA---TT-GCAC--GAC----TGCACA--GAACTTTCAATT-TGTTA-GG----AA-A-------TG-----AA----T---------G--T-----------------------ATGTT-AC-CAAAAA--A------TGC-ATCCC----AGTTC-ATGC-A-GAAGG-T-AT--C--TGAAGTTT-G--TA-T----TTTGGT--TCC------T--C------A----C------T------TG-----------AT----------AT-T--A------A-----------AG------T--A------AG--TATCATTAT------GA--A---G-T----TGGA-------TAA---TA-TTGGAATGAAACTGGCTGT-TAATGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-A---------------C------T--TG-----G-G------G-A------------GT-----------A------------TA---TAT--A-----AGTT-A---CGAC-----T--A-GT-----------------TGGGTAC--------C---------CAT--------A-----------G-------T---------G-----CT----TTA---AATTT-TCTCT----ATGTA-AGTT-T--AT--A----TGTATTTTTCTTTCT--
gi|9 : C--ATGTGA-T--T-GTT---ACAATA--TAAATAG--AA-TA-CA------AA-G-TAATGT------A-ATGT-----T-------TTATA---TATTTGCT-------------------------TCATTTTC-GA--AT--------TA----T---------------------T-T---T-CA-----TT-TTTGTT-T-------GCATTTT-C-AT--GT---T-AAACAGC---TG-T---T-GTAA--GGT-----T-ATGTTAAATAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GCTT-C-------TTTATCATT----AAAAAG-G-T-TCCT-----T--TTAAA---TT-ACAT--GAA----TACAAA--AAAGT-----TT-TGCTA-AT----AA-A-------TA-----AA----ACAAAATACAA--G--CTT----A--A--A-G----TATGTT-GT-T-GAAA--G------CAC-ACCAC----AGTTC-GTTT-A-TTAGA-T-AT--C--TAAA--TC--------------------AAA------T--T------A----CACCTCTT------T------------AC----------AT-T--A------AAATAAC-----AA------C--G------TG--T----TTAA------A---A---G-C----CGTA--T----TAAATCGA-TCGGAATCAAACTTGTTTT-TATAGAT---TTT-------------------A-AT--T---C-----TAT------T--Ttcag
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTAAACCACTTATAATATTACTGTTATGATCTTTACCTATCAGATTGAAACCTGTGAATTATCTAAAAGAATGAAAATTAATTGTTATAGGGCTGTGTATTGCTTGACCAATGCTGATACAATATGTATCGCAATTCAGGTATCCAGATACAAGATACAATGCGATACAGATTATTATTGAAAATGTGATGGAATTCAAGAGTATCTTTAACATTAAGTAAAATATATACGGTGTTGCCCGCTTAACACATCATAACAAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTTATTTGGACTGTGCACAGTATTGCTTGACCAATGGTGATCTGATATGTATCATGGTATAGGTATCCCGATACGCCATACAATACAGATTATTATTGAAAATTTGATGAAATCCATGAGTAACTTTTAACATTAAGTAAAATGTATACACAGTATCACCCTCTTAACACATCATT
Unaligned ( gi|39 ): AGGGATGTGCATTGCTTGGCCAATGCTGATTCTATATGTCTCATGATACAGGTATCAGATCCTGATACACAATACAATATGATACAGATTTTTATTGAAAATGTGATGAAATGCATGTGTCACTATTAACATTAAGTAAAGTATATATACAGTATAACATTCTTCACACATCATAA
Unaligned ( gi|40 ): TAGGGTTGTGTATTGTTTGACCATTGGTGATACAATATGTACCACGATACATCATCCCGATACGCGATACAATACGATACAGACTATTATTGAAAATGTGATGAAATGTATGAGTACTTCTAACATTAAGTGAAATACAAACGGCACCACTCTCGTTATACATAACAT
Unaligned ( gi|41 ): AGGGCTTTGTATTGCTTGACCAATGGCGATACAATATGTATCATGATACAGATAATCTGACACGCGATACAATACAATATAAATTATTGTTCAAAATGTGAAATCCATGAGTAACTTTTAAAATAAAGTAAATATATATAAATATACGGCATCACACTCAAAA
Unaligned ( gi|52 ): TGATTGTTCATTAATGTGAAGGATGAATTGTTCTAGGACTGTGTACTGCTTGACCAATGACGATAAGATTTGTATCTAAATATAGTATCATAATACGCGATACAACATGATACAG
Unaligned ( gi|53 ): GTATAATACATCCCATTACACTTAACAGTATAATACAAACAGTTTTCAAAATTCATGAGTAAATTTTATGTAAAATATATATACGGTATCACCCTCTTACACATCATATCAAA
Unaligned ( gi|55 ): TGTGATTGAAAATGGGATGAAATCCAGGAGAAACTTTTAAAATTAAGTATAATATATATATGGTATCAATCTCTTAACACATCATATCAAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 4444444 1 111111111 333333333333333 11 22222222222222 11111111111111111111 1111111111111 11111111 2222222222222222222222222222222222 22222222222222222222222222222222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111
lowQualScore : 8888 0 3333333 3 1 8888 1 6666 888 4 3 7777 0 7777 3 555555555 33 2 44 33 22 333333333333333 111 0 55555555 222 4444444 77 222 1 222 11111111111111 22 1 1 22 55555555 3333 11111111111111111111 1 222 1 33333333 4444444444444 0 1 1 33333333 1 444 1 222 1 444 33333 1 3333333 1 11 1 2222 11 1 1 333333 1 0000000000000000000000000000000000 33333 11 333 1 11 2222 11 555555 1 11 5555555 1 3333333 33333 2222 66666666666666666666666666666666666 2 222 2 11 444444 0 1 3333 1 1 1 0 1 1 22 222 2 66666 1 66666 3 22 444444 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 3 44 1 9999 1 777777777 444 1 22 555555555555555555 22 77777 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 33333 00 333 333 22 1 2 1 1 3333 333 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 3333 333 2 55 6666 2 2 22 33 4444 1 1 444
lowQualScore : .... . ....... . . .... . .... ... . . .... . .... . ......... .. . .. .. .. ............... ... . ........ ... ....... .. ... . ... .............. .. . . .. ........ .... .................... . ... . ........ ............. . . . ........ . ... . ... . ... ..... . ....... . .. . .... .. . . ...... . .................................. ..... .. ... . .. .... .. ...... . .. ....... . ....... ..... .... ................................... . ... . .. ...... . . .... . . . . . . .. ... . ..... . ..... . .. ...... .. ................................................................................................................................................. . . . .. . .... . ......... ... . .. .................. .. ..... . .................................................... .. ..... .. ... ... .. . . . . .... ... . ............................................................ ..... .... ... . .. .... . . .. .. .... . . ...
lowQualScore : 3333 7 3333333 3 0 1111 4 3333 888 9 3 1111 8 1111 1 222222222 22 4 55 11 99 111111111111111 999 7 00000000 777 8888888 11 777 0 777 44444444444444 11 5 6 11 66666666 1111 66666666666666666666 4 444 4 66666666 3333333333333 9 3 4 33333333 4 888 4 444 4 444 22222 3 9999999 3 88 3 7777 88 3 3 777777 3 3333333333333333333333333333333333 00000 66 888 2 77 7777 77 111111 3 00 7777777 2 9999999 00000 6666 22222222222222222222222222222222222 6 222 3 99 000000 7 4 0000 4 4 4 1 5 5 00 555 3 22222 5 99999 4 11 444444 22 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 1 99 6 7777 6 000000000 444 6 22 777777777777777777 22 11111 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 88888 11 000 000 44 7 4 7 7 7777 222 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333 9999 777 1 11 6666 1 1 99 11 7777 0 4 111
consensus : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
Reference ( family-892 ) : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|1 : AAACAAAATTTCCAACCATTAAAAATGGTGTACTGTGTATAAAAACTATATATATT--ATATATGTGTAAG-CATACTAGGTCAAA-TAT----GTTTA----GCA-ACA-CT-G--TTC--ATATTAATA-T-GTTT--ACATTA--TAAATAC--ATGTA-CATTACAAAA-T-CAATCT------C-ATATT---TT-------TTATA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAA--GGA--ATCATTT-T-AA--TT--------TT----TG-------------------AT-T---T-CA-----AT-TTT----T-------ACATTCT-C-AC--TC---T-AAACAGT---CC-T---T-GCTC--CTT-----T-TTGTAAAACAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------ACTT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTTT-----T--TCATA---TT-GTAT--GAC----TGTAAA--GTACA-----TT-AGCAA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--TTA----C--C--A-G----TATGCA-TC-T-GTAA--A------TAC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TTAGG-C-AT--C--TGAAGTTT-G--CA-T----GTCAAT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AA----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----TGCA--T----TAC---AA-TCAGAATTTAACTCATTTT-TATTGTT---TTTT-T---T-----ATTC---A-AA--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TTACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT-----TGTA-GTTT-T--AC--A----TATATTTTTGTTGCT--GAATATATTTTA
gi|10 : T-T---T-TT-----TT-TTT----T-------GCTTTTT-C-AA--AA---T-GATCAGT---CA-A---T-GTCC--TTT-----T-ATAGGCAACAT------TC-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TTTGTTGCT----AAAAAAGA-G-TTCT-----T--TCATA---GT-GTAT--GAC----TGCAGA--GAA-------------------------A-------TA-----AA----A---------T--G--CCA----CT-A--A-G----AATGTC-TC-A-TGCA--G------TAC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGTCC-G--CA-T----GCCAGC--AAA------T--T------A----C------CCCCCTTT------------GT----------AT-T--A------AAATTAATT---AA------C--A------TG--T----TT-T------GA--A---G-C----CCCA--T----AAA---AA-TCAGAATTCAACTCATTTT-TATTGA----TTTT-T---T-----AATA---A-AG--T---A-----TGT------T--TC-----T-G------A-C------------T------------AAATTTTAT----T----TTT--A-----AATC-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----GC---ATGGCAAG-----------------------------------------A-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATATA-ACTT-T--AA--A----TGAA--TTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|11 : gtatttttttA--AT--------TA----TA-------------------GT-T---T-CC-----TA-TTT----G-------GAATACT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TATT---T-GCCG--CTT-----C-CTGTATAAAAG------CG-T--TT-T----G--T-GGGG-TA----------T-G-------TT-GTT---------AAATTA-T-TAGT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAT----TGCATA--GAGCT-----TT-TAACG-GGGA--AG-A-------TG-----AA----A---------G--G--CCG----T--T--C-G----CAAACC-TC-C-AACA--C------TGC-ATCAC----AGTTC-CTGC-ATTTAGG-T-AT--C--TGAAGGCT-G--TA-A----GTCGGT--ACA------T--T------A----T------A------T------------ATTTAAAATAAAAT-T--A------AG----------AA------C--G------TA--T----TC-T------GA--A---G-T----CGC---T----TAA---TA-TCAGAAATAAACTCGATTT-TATT-AC---TATC-T---T-----AA-A---A------------------------T--TG-----T-T------G-C--------------------------------------------TT--A-----CGT--------ACA---TT--C---AATT-TT----ACCTTGTAGGTAC--------C---------T----------T-----------T-------T---------G-----GA----T-------TGT-CCCCT----ATATATATAG-T--AC--A----AGTATCATGCTTGAT--TCACTCATTTTt
gi|12 : -T-TTATCT------CGAAGTG---TT-------T-ATA---TTTTTGTCA---ATA-------------AA--ATTATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-A---T-CA-----AT-TTT----T-------GC----T-C-AT--G------AGACATTAGACA-T---T-GCCC--TTT-----T-ATGACAAATAG------GG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-GT------TT-ATTGTT------AAGATA-T----T-----T--TCAAA---TT-CCAT--GAA----TGCAAA--GAACTGC---TT-TGTAA-------AA-A-------CACCAACAA----A---------G--A--CTGATTTC--A--A-A----AAT---------GCAA--AGTTCTCTGC-ATTTC----AGCTCAATGC-A-TTAAG-T-AT--------------------------TTGAT--AAA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------AC----------AA-T--A------AG----------AA------T--A------CA--T----TT-T------GA--A---G-G----TGCA-------AAA---AA-TCAAAATATAGCTTGGTTT-TA----------TT-T---T-----AATT---A-AC--T---C-----------------TG-----T-T------G-A------------G------------A------------A----CTC--A-----AGT
gi|13 : tagcaagtataaaaaaaagtagatAGACATGT-TAAT-AATATTAAGAAA-----C----GTTTT----GCG-ATT-CT-T--TTC--ATATTAACA-T--TTT--ATAATA--TTAATAC--A--------------------ATAT------C-ATGTA---TT-------TGGTA---G--TTGGCA---ATAT-----CCAG--GAA--ATCATAT-T-AA--AT--------TAGTCTTT-------------------GTAT---T-TA-----TT-TAT----T-------TTATTTT-C-AT--GT---C-AAACAAT---TA-C---T-ATCC--TTT-----A-ATTCAAAACAG------TT-G--TT-T----G--C-GAGA-T---------ACT-T-------TT-TTT----------AAATG-T-TT------------AAAGATTT-GCAT--TTT----TGCAGA--GAA-------------CA-AT----AACA-------AA-----AA----A---------G--A--CCG----C--A--A-AT---AACTTT-AC-C-AAAA--A-------GC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TCAGG-T-AT--T--CGAAGTTC-G--TA-T----TTAAGT--AAA------T--T------A-------------------------------A-----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAT----TA--T----TT-T------G---A---tttaaggtgaattta
gi|14 : ataTAAAACAT------TG-T--TT-T----G--T-TAGA-TAA------CCTT-T-------GT-GTTGTT----AAAATACA-T---CT-----T--TCATA---GT-GTAA--GAC----TGCAGA--GAATG-----TA-TGCTA-GT----AA-T-------TA-----AA----A---------T--G--CCG----C--A--T-G----GACATTCTT-C-GGAA--A------TAC-ATCAT----AGTTC-CTGC-A-TTAGG-T-AT--C--TGAATTTC-G--CA-T----GTCAGC--AAA------TTAT------A----T------C------TTTTG--------AT----------AT-T--A------A-----------AA-----------------G--T----TT-T------T---AAT-G-T----CAAA-------TAA---AA-TTAGAGTTCAATACATTTT-GAATGAT---TTTT-T---A-----AATG---A-AT--TG--C-----TAC------T--AGCTAAAT-T------T-C------------A------------T------------T----TTT--A-----TGTA-A---TGACA---GT--C-ATAA-TGTTTGCGAC---AAG-CTAGATA-----C---------CTAT-------A-----------G-------C---------G-----GA----CTG---AATGT-ATAGT----ATGGA-ATTG-T--AC--A----ATTATTTTGGTTGCT--TAACTTACTTttgatttgtaagacattatgtgtattgtctatacat
gi|15 : ----G--C-GAGA-TAA------AATT-G-------TTTGTTGTT----AAAA--CA-T-TTCT-----T--TCATA---TT-GTAT---AT----TGCAAA--GAAa
gi|15 : TT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------TGGGTATCCATA-----------G-------G---------G-----GA----TTG---AATGT-CCTGT----ATGTA-AGTT-T--AC--A----TGTATATTTGTTATT--AAATTatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaagtaatgacattcataatttacatgactggctgggtatccataggggattgaatgtcctgtatgtaagtttacatgtatatttgttattaaattaaaatatcatttattgt
gi|16 : gcgagataaaattgtttgttgttaaaacatttctttcatattgtatattgcaaagaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----C-ATGTTGAACAG------CG-T--AT-T----G--T-CAGA-TAA------AATA-G-------TTTATTTTT----AAAA--TA-T-TTCT-----T--CCAAA---TT-ACTT--GAT----TGCAGA--TAATT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------TA-----AACATAA---------G--G--CC--------A--A-A----CATATT-TTAC-GCTG--A------TGC-ATCAC----AGTTC-AAGC-A-TAAGG-C-AT--C--CAAAGTTC-G--TG-T----ACCGGT--ATA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------GC----------AT-T--A------A-----------AC------T--A------TG-----------------A---A----------CATA--A----TAA---G--TCGCAATTAGATTAGCTTC-TATTAA----TTGT-T---T-----AATA---A-AT--T---CAATTTCAC------T--TA-----TAT------T-C------------A------------G------------T----TTTAAA-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----Aaaaatatcatttattgt
gi|17 : atgatatgtacattcttgtatactggtaaaaagaagtttagcaagtattA-AGT-CT-----TC--ATATAAATA-T-ATTTTTACAATA--AAGATAA--AT-T-----T-CAGAA-T-TAATCT------C-GTGCA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GAA--ATAATTT-C-AA--AT--------TA-----A-------------------GC-T---T-C-------------------------CATTCT-C-CA--GCTGTT-AAACAGT---TA-T---T-GCTC--ATT-----T-ATGTAAAA-AT------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TGA------AATC-A-------TT--TT-TTAAAAAAAAAAAA-A-TCCT-----T--TCAAACT-CT-GCAT--TAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCG-AG----AT-A-------TT-----AA----A---------G--G--TTA----A--C--A-G----ATTGTT-AA-T-G-AA--A------TGC-GACAA----AGTGC-ATGT-A-
gi|18 : ataaatttcaagagaaat-T---T-CA-----TT-TTT----TTCTCG--GTATTCT-C-AG--GC---C-AGACAGT---AA-T---T-GCTT--CTT-----T-GTATAAAACAGACTAATC--T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GATT-A---------------------------------CT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GGC----TGCAGA--GAGTT-----TT-TACCC-GG----AA-A-------TG-----GA----A---------GT-A--CTT----T--A--A-G----ACGGTT-TC-C-GGAT--A------TGC-ATCAC----AGTTC-GTGA-A-TTAAA-T-AC--C--AGAAGTTG-T--TA-T---------T--AAA------T--TTTAC--A----C------T------T------------AC----------TT-TC-A------A-----------AA------C--A------TT--T----CT-T------aggctgtgtacagtttggttaaacgttgaattcttaaat
gi|19 : aatgcattttgatataaaataatgtctgcatggttgcaacattaattgtacatttcttgaaggatggcatttgttgaaatataaatattgcttaataT-----T-ATCTAAAGCAG------TG-T--TT-TTTTTG--T-GCGA-TAG------CATT-G-------TTTGTTGTT----TAGA--TA-T-TTAT-----T--TCTTG---TT-TTAT--GAC----TGCAAA--GAACA-----TT-TTTCA-AG----AA-AATAAAAATA-----AA----A---------G--G--TCA----CC-A--A-G----AATACC-TA-C-GGAA--A------TAC-ATCAG----AGTTC-ATGC-T-TAAAG-G-AT--C--TGAATTTC-T--TA-T----GTCAAT--AAA------G--TCCATCCA----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA--------------------------T-T------A---A---G-------------------A---CA-TCAG--TTTGACTTATT-----TTG-----TTTC-C---CAAAAAAAAA---A-AA--T---G-----CGT------T--TG-----T-T------T-CT-----------G------------ACTTAAATTCAG-T----TTA--A-----AACA-A---TGGCA---CT--C-GTAA-T-TT----AC---ATGATTAtcaaattacataa
gi|2 : AACAC--AT----CATAACAAAAAC-TAAGTT---------TTTA---TT-------TTG-A---TATCTGCCA---GTAC-----CTAA--GGA--AACATTT-CTAA--CT--------TT----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TT----------------------------------GAACAGA---CA-T---T-GTCA--ATT-----T-ATGTAAAACCA------CG-T--TT-T----G--TAGAGA-TAA------AATT-G-------TT---TGTT----AAAAGCTG-T---CT-----T--TCACA---TT-GTAT--GAC----TGCAAA--GAACT-----TT-TACAA-T------A-A-------TA-----AA----A---------G--G--CC------------------AGTGTC-TC-A-GTAA--A------TAC-ATCAC----AGTTT-ATAA-A-TATGC-T-AT--C--TGAAGTTT-GCATA-T----GTCAGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------CC----------CT-T--T------AT----------AG------T--A------TG--T----TT-T------G---A---AAT----TGCG--T----AAA---AA-TCAGAATTCAACTAATTTT-TATTGATTTCTTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----AGA------A--TG-----T-T------G-CCAACTTA-----A------------A------------TTCAATTT--A-----AGTA-G---TGACA---TT--C-ATAG-T-TT----AC---ATGACTGG--------CTCAGTATCAT----------A-----------G-------T---------G-----AA----TTA---AATGT-CCCATAATCATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACATATTTTA
gi|20 : tctcaatgagagcaggtatgagaagagcaatactatacagaatatcattgtaaatgtgatgaaaatcatgaataacttttaacagtaagtaaaatatatatacacagtatcaccaactt-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------T--G--TTG----C--A--ATG----AATGTT-TT-C-ATAA--T------TCC-ATTAC----AATAC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--C-AAGTTT-G--TA-TTTTTGTCAAG--AAA------T--T------A----T------C------TCCTTTC------AT----------AT-T--T------A-----------AA------T--AA-----TG--T----CA-T------A---AAAAG-T----CGCA--TAAAATAA---CG-TAGGCATTGAACCCCTTTT-CATTGAT---TTTT-T---A-----AATA---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----A-T------G-C------------GGACTCAGATTCAG------------T----TTT--A-----AGTT-A---TGACA---TT----GTGA-T-AA----AC---CTGGCTAT--------C---------T----------AG----------G-------TACACACA--G-----GATT--TTG---AA--------C----ATGTT-GTTT-TACAC--A----TGAAGTTTTCTTGCT--AAACTTAt
gi|21 : tgcatg--ATCATTC-C-AA--AT--------TT----TG-------------------TA-T---T-CA-----TG-TTTG---T-------ACACTAG-A-AT--GC---T-TAACAGT---TA-T---A-GCAC--TTT-----T-ATGGAAAATAG------CG-T--TT-T----G--T-GAAA-TAA------AATT-GT------TT-GGTGTT----AAAAGA------TCT-----T----AAA---TT-GCAT--GGCTGCATGCAAA--GAAAA-----TT-AGTTA-TG----AA-A-------TT-----AA----A---------G--G--CTG----T--A---------AAT-------T-GTAG--A-------------AC----AGTTC-ATGC-A-TTTGA-T-TT--C--C---------------------CGGT--AGA------T--T------A----T------CTCCCTTT------------AC----------AT-T--AACCTACA-----------AA------CCTA------CA--T----TT-T--------------A-T----C-C--------------TA-TCGGAATCAAACCCATTAA-TATTGCTG--TTTT-T---T---------------T--T---C-----CTT------T--TT-----T-T-----------------------------------------------T----TTT--A-----A
gi|22 : g-------GCATTCT-C-AG--GA---T-AAACAGTGAATA-T---T-A-------T-----T-A-GTAAAA-----------------------------------A------AAGT-GC------TT-ATTGT------AAGAGTA-T-GTAT-----T--TAAAA---TT-GCTA--GAC----AACACA--GTTGC-----TT-TGTCG-GATATTAA-T-------TA-----AA----A---------T--GAATCA----A--A--A-G----AATAAT-TA-A-GACA--A------TGC-ATCAC----AGATC-ATGCTG-CTAGGTT-ATAGC--CGGAGTCT-G--T--T----ATT--T--ACA------CCGT------G----C------CCCCTT-T------------AC----------AT-T--G------A-----------AA------T--A------TG-----------------A---A----------CGTACTT----TGA---GA-T---AATT-------TCTT---TTGA----CATT-C---T-----AATA---G-AT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------A-C------------G------------G------------A----CTT--A-----AATaatt
gi|23 : -TATACTGAGGAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--ATC--ATATCAATA-T-GTTT----------------------------CACAAAA-C-TAATCTTCATGGC-ATGTA---TT-----------A---CATTT----------------------------TT-TTT-T-AA----------------------------------------------T-CT-----TT-ATT----T-------ACATTCT-C-GC--TC---T-AAACAAT---CA-T---T-GTCC--CTT-----T-ATTTAAATCAA------TG-T--TTAT----T--T-TAGA-CAA------ATTT-GAGATTTATT-GTTGTT----ATAA--TA-T-TTCT-----T--TTATA---TT-GTAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TG----------------------A-----AA----A-----------------G----C--AATA-G----AATGTC-TC-T-GTAAATA------TAC-ATCGA----AGTTC-AAGC-A-TTATG-T-AT--C--TGAAGTTG-C--CA-T----GTCAGT--ATA------T--T------tcatttttgtaaattgtaacattcat
gi|24 : AAA----AAAATACGTAAGAGGGTTGTACCAAAG-------CTATA-ATAACTC----------AAA-TATACTGAG-ATAA-TGA----GTTTA----GAG-AGA-AT-T--TTC--ATATGCATAGT-GTTT----GATA--GAAATAA--AC-TG-C------AAA-T-TAATAT------C-ATGTA---TT-------TTG-A---TATTTTTCAATTATACTGTTACTA-----A--A-----T-G-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TG-TTT----A-------GGATACT-C-AG--GC---T-AAACTTG---TA-T---T-GTCC--GTT-----T-ATGT-AAACAT------TG-T--TT-
gi|25 : tccttatatggaataccacctctgtgaagtgtcttggttgaacaattatatcagtt-TTT----T-------GCTTTAT-C-AG--GC---T-TAGTAGT---TA-T---T-GTAA--TTT-----T-ATTCAAAACGG------TG-TGGTT-T----T--C-CAAA-TAA------A--T-G-------TG-TTTATT----ATTCAATGGT-TTCT-----T--TCAGG---TT-GCAT--TAC----TGTAGA--GCACT-----TA-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------GCAG--CC--------A--A-G----AATGTT-TA-T-GTAA--A------TGA-ACCAT----AGT----TG------AGG-C-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--TCA------T--A------A----T------C------G------------AC----------AG-T--A------A-----------
gi|27 : atattactaccaattttgattaatatttttatttttaacta---TT-------TTATA---TACATATCA---ACAC-----CTAA--AGA--TCCATTT-T-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TG-TAT----A-------ACTTTCT-T-AG--GC---T-AAATA-----TA-T---C-GCCT--TTT-----G-ATGT------T------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TTA------TAGT-GT------TT-ACTGTT----AAAAGA-----TTAC-----T--TAAAA---CT-GCAT--AAC----GGCAGT--GAACA-----T------A-TG----AA-A-------GA-----AA----A---------G------------------A-A----AATTTA-AC-T-TTAA--A------TTC-AACAA----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-TCGT--CTTCAAAATGC-T--TA-TC---TTTGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------GC----------CT-T--A------A-----------cttatcatcctttat
gi|28 : aagAAA-TAA----GTTTATCTAGCA-AA-----A--TAC--ATGTTAACA-T-TTTC--ACAATA--TGAATAA--AT-TA-C-TTA----A-T-CAATCT------C-ATATA---TT-------TTTGA---TATTTGTCA---GTAC-----CTAG--GGA--ATCTTTT-C-TA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T--------------------------------------------------CAAT---TA-T---T-GCCT--TTT-----T-ATGTTAAACCA------CA-C--CT-T----G--T-GAAA-TAA------AATTCT-------TT-GTTGTT----GTAAGATA----TCT-----T--TGGAA---TTAGCAT--GAC----TGCAGG--GAACT-----TT-TTCCA-GG----AA-A--------G-----AA----A---------G--A--TCA----CA-A--A-G----AATATT-TC-cattaaa
gi|29 : aaagACA--TAACAACT-AT-TA--ATTACAAA--T-CAATAT------T-ATGTA---TTAAGAAGTTCATACAGTATCTGACA---ATAC-----CAAG--AGA--ATCATT--C-AA--A----------A----TG-------------------GT-T---T-AA-----TTGTTT----T-------TCATTCT-T-AC--CC---TGAAACAGG---TA-T---T-ACCC-------------------ACAG------TG-T--TT-T----G--C-AAGA-TCA------AATT---------TA-ACTGTT----AGAAGGT-------T-----TAATCAAA---TT-GCAT--GGA----TGCAGA--AGACT-----TT-TGACA-GG----AA-A-------TT-----AA----A---------G--G--CTG----CA-A--A-G----AATGAT-CC-C-AAAtaaa
gi|3 : catattttcttAAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCAAACATGAGAAAA----ACTAAGAAAAA-AAA----GTTAA----GCG-GGA-CT-G--TTCTGATATGAATA-TCG-----ACAACA--TAGATAA--TT-TC-CAAT---AAA-T-TAATCT------C-ATATA---CT-------TT-TA---TATTTTTCA---ATAT-----CTA---AAA--ATCATAT---GG--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTC----T-------GGATTTT-CGACTATT---T-ATCCACT---T--T---T-ATCC--GTT-----T-ATATAAAACAC------TG----TT-T----GAAT-GAGA-TAC------AACT-G-------TT-TATGTT----TAAG-------TTAT-----A--CCAAA---TT--CAT--GGC----TGCAGA--GAAAT-----TG-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----CA----A---------G--G--TCA----C--A--ATT----AATGTT-TC-A-GAAA--A------AGC-ATCCT----TACTC-ATTC-A-TTGGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----ATCTGT--CAA------T--A------A----C------C------T------------CCTGTTTA----AT-T--G------A-----------AA------T--A------AGAAT----TT-T------A---A---A-T----T-----T----TAA---TA----AAATTG---------T-TATTGAT---TT--------------ATA---A-AT--T---A-----TGT------TTGTG-----T-T------GCC------------G------------A------------C----TCT--A-----ATTC-AGTTTTA-A---GC--T-ATGC-T-TT----AC---ATGCCTAG--------C---------T----------A-----------G-------
gi|30 : ttccctatcaggaatacttcctgtttgaagtgtcttgattgaagtactatatcaatata--A-A----AATGTT-TC-C-AGAA--A------TGT-ATAAC----AATTT-ATGT-A-CTAGA-C-AC--A--CTAA---C----TA-G----GTCACT--AAA------A--T------A----CGT----CTCTG--T------------GT----------AT-T--A------A-----------AAT-----C--A------GA--T----CT-TAATTTGG---A---G-A----CGCA-------TAA---TA-TTAGAA-TCAACTTCTTTTATATCAA----TTTT-T---C-----AATA---A-AGAAT---C-----C--------T--TG-----T-TTCAAACT-C------------G------------A------------T----ATT--A-----TGAT-A---TGACA---TTAAC-GT---T-TT----AC---AT-----------------------------------A-----------G-------T---------T-----GG----TT----AAGGTACCCAT----AC----ATCT-T--AC--A----Tgt
gi|31 : agaaat-T-TAATCT------------A---TA-------TTG-A---TATTTGTCA---ATA------------------TCATTT-C-AG--AT--------TA----TA-------------------GT--------G-----TT-TTT----T--------C-TTCT-C-AA--TC---T-AAACAGT---TA-T---T-TGCT--CTTATATGT-ATGTAAAGCAG------CATT--TT-T----G--G-GAGA-TAA------ACTA-GT------TT-ATTGAT----AAACAACA-A-CT-T-----T--TCGAA---TT-GCAC--GAC----TCTGGA--GCACT-----TTATCTC--------AA-A-------CA-----GA----A---------G--T--TTG----T--G--A-GATAAAATGCTGTT-T-GTAA--A------TAC-TTCaa
gi|32 : -------TA-----AA----A---------T--G--TAG----A--A--A-G----AATGTT-TC-C-GAAA--G------TTTTATCAT----GGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--A--CGAA-TT--------------TCAAT--AAA------T--T------GCTTCC------T------T------------AC----------AT-C--A------AAATAGTAACATAA------C--A------TA--T----TT-T------GA--A---G-T----CACA--T----T----------GGAA---A------TTT-TATTGA----ATTT-T---T-----AATA---A-GT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------
gi|33 : aacattgttttgagagataaaatagcttattgt----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TT-T------G---AA--G-T----CGCA--T----TAC---TA-TCAGAATTCAGTCCTTTTT-TATTGAT---TTTA-T---A-----AATA---T-AT--T---C-----TGT------G--TA-----T-T------G-CT-----------G------------A------------C----TCG--A-----ACT---------CAGTTTT--CAGTAA-T-TA----AC---ATGCCTA---------C---------C----------AAGGTACCTATGG-------T---------G-----GA----TTG---AATCT-CCTAT----ATGTA-ATTT-T--AC--ATGTTTGTATTTTTGCTCCA--AAACGTTTTTTAtcaaactcaaatttcagtttttg
gi|34 : a------T------------AC----------AT-T--A------A-----------TA------G--A------TG--T----GT-C------ATAAA---G-TTACACACA--TG---TCA---TA-TTGGAACCAAACCTGTTTT-TATTAGT---TTTTAT---T-----TACA---A-TT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------G-CT-----------G------------ACCTAAATTCAG-T----TTT--A-----A-CATA---TGGCA---TT--G-ATGA-T-TT----AC---TGGACTAA--------C---------C----------AG----------G-------T---------GCCCGCAACACTTTG---AATGT-TCC-T----ATGTA-GTTTAC--AC--A----TG---TTTTGTTttca
gi|35 : tAAA-TATATAGGTTTA----GGATAG--CT-T--TTC--ATGTGAATA-T-TATT--ACAATA--TAAATAC--AT-TC-CAC-----AA-T-TAATCT------A-ACGTA---TT-------TTA-A---TA-----CA---ATTT-----ATAA--GGA--CACATTT-C-AA--A-------------------------------------T-T---C-CA-----------------------GC-------------C---T-AAACCAT---TA-TAACT-GATC--CTT-----T--TGTAAAACAG------AG-T--TT-A----G--T-GAGA-T-A------CATT-G-------TT-TTTATT------AAAATA-T-TCTT-----T--TCAAA---TT-t
gi|36 : ---A---G-T----TGCA--T-----AC---TA-GTGGAAACAATCTGGCTTT-TATT-AT---CTGT-T---T-----AAAAT--A-AT--T---T-----AGT------T--TC-----T-T------G-C------------A------------AACGCAAATTCAGT----TTC--A-----TGTT-A---TGGTA---CT--C-GTGA-C-TT----AC---TTGATTAA--------C---------C----------A-----------GGTACTCGT---------G-----GA----TCGTTAAACGT-CTCAC----ATGGG-GTTT-T--AC--A----TGTATT
gi|37 : aataagggtgtataatatgaT--ATAACA--AAAATATGAAC-TA-CATAACAAAA-T-TGATGT------C-ATGAA---TA-------GTG-A---TAATTGCCA---GTAC-------------------ATTT-C-AATAGC--------TT----TT-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTTATTTT-------GCATTCT-C-AC--TT---T-AACCAGT---CA-T---T-GCCC--CTT-----C-GTTCAAAACAT------TG-T--TT-C----A--T-GAGA-TAC------AACT-G----------GCTCTT----ATTAAATG-CATTCT-----T--TCAgcctaa
gi|4 : aATACTAATTGAAA-TAT----GCTAA----GCA-A---CC-GATTTC--ATATGCATG-T-TCTT--GCAATAGATAACTAC--AT-TA-CA--ACAAAA-C-TAATCT------C-ATTTG---TT-------TTGAA----AGTTGCCA---GTA-----------------ATTATTT-C-AA--TT--------TT----T---------------------T-TATAT-CA-----AT-TTT----T-------TCATTCT-C-AC--TCA--T-AAGCGG-----A-T---TCGCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CA-T--TA-T----G--T-GAGA-CAA------AGTT-T-------TT-ATTATT------AAAATG-T-TTTT-----G--T---A---TT-TTAT--GAC----TGTACA--GAACT-----TT-TGCAA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CTA----C--A--ATA----AATATC-TC-A-GGAA--A------TTC-ATCCC----AGTTA-ATGC-A-TTAGG-T-AA--C--TGAA-TTCAA--CA-T----ATTAGT--AAA------T--T------A----C------T------TCTCTTTTTATCAAT----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TTGC------A---A---G-T----CGTA--T----GAA---AACTCCAAATTCTATTCA-TGT-TATTGA----TGTT-T---T-----AATG---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-CTGACTTTAATTTA------------A------------T----TTT--A-----AGCA-A---TGACA---TT--C-ATGC-T------------AGG--TAT--------C---------C----------ATT---------G-------G---------G-----GA----TTG---AAAGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-A--AC--A----AGTAGTTTTATTGCT--AAACTTATTTTAt
gi|42 : ATTCAAGCTATTTT-TATGGAT---TTTG-T---------AATA---A-AT------------CATCA----T--TG-----C-T------A-CCAACTCAAAT--A------------A------------T----TTC--A-----TGTA-A---TGACA---CT--T-GTGA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------T----------A-----------GGTT----TCCAAA----G-----GGCT--TTG---AATGC-CC--T----TTGT----TT-T--AC--A----TGAATCTAC-TTACT--AAACTTACTTTtt
gi|43 : gTTATATACATGTA---TATACTAAGTAAAA-TGT----GTTAT----GCA-AGTACT----TTT--ATATAAATA-T-GTTT--GCAATA--TAAATAC--AT-TA-CA----AAGA---TAATCT------C-ACGTA---TT-------TTG-G---TATTTGCCA---ATAG-----ATAA--GGC--ATCATTT-tatcg
gi|44 : attaataattatcaccagT-------TTTTA---TATTTGTCA---GTTG-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CACTTTTTT-TTT----T-------TCATTCT-ttata
gi|44 : T-----T--TTATA---TT-TCATTCG-C----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------T--G--CCA----C--A--A-A----Attcatagttatataattttatatttcattcgctgcagagaacttttgccaggaaataaaatgccacaaaattatacctaaa
gi|45 : tttttatatttgtcagttgctagggaatcatttcaaattatggtttcactttttttttttcattctttcatagttatataaG------CA-T--TT-T----G--T-GAGA-TGA------AATG-A-------TT-------------AAAACA-T-TTCT-----T--TCTAA---TT-GCAT--GAT----ATTAGC--AAGC------TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----T---------A--T--ATG----C--A--A-AT---AATGTT-TC-C-AAGA--A------TAC-AT--C----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGttatacctaaa
gi|46 : ----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TCT----T-------GCATTCT-C-AG--AC---T-AAACA--------------------------------------CAG------CG-T--GT-T----G--T-AAAAATAA------AAGT-G-------TTTGTT-TT----AGAAGAT----TTCTATCACT--TGAAA---CT-GCAT--GCC----TGCATATAGAAAC-----TT-TGCCA-GA----AA-A-------TA-----AA----A---------AATA--TCA----CA-A--A-G----AATGTatgtagttttacat
gi|47 : -GAAA--A------TGC-ATCTA----AGTTC-ATGC-A-TTACA-T-GT--C--TGAAGTTC-A--TA-T----TTCAGT--AAGAAACCTT--C------A----T------T------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------T--AAGAATGTA--T----TT-T------GA--A---G-T----CGC---T----TAG---TA-TCAGAAT
gi|48 : caGTAATATATACTGAGAAAAAATAT----GTTTA----GCA-ATT-CT-A--A-C--ATATGAAAT-T-GTTT--ATAATA--TAAATAC--AT-TA-----A-AAAA-T-TAATAA------C-ATGTA---TT-------TTG-----------CCA---ATAC-----TTAG--GGA--ATCATTT-C---------------------------------------------T---T-CA-----TT-TTT----catttatactgccaactcatatttactttt
gi|49 : ATTACAAAA-T-TAATCT------C-A-GT----TT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATGTA----TTAGTGGGA--ATCATTT-C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCTAA-AG--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-TTATAAAA
gi|5 : tt--ATATGTTTA-T-GTTT--GCAATA--TGAATAC---------ATTGTAAAA-T-AAGTAG------T-ATGTG---TT-------TTGGA---TATTT--------T-C-----CTAT--GGA--ATCATTT-G-AA--TTTTTGTGTGTA----TGTGTTGTAGTTGTTGTTGTTGT-T---TGTG-----TT-TTT----TTTTCTTTGCATTCC-C-GC--TC---T-AAACAGA---CA-T------------------------TAAAACAG------TG-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-GA------TT-GTATTT----CAAG---G-T-TCCT-----T--TCATG---TT-GTAT--GTC----TTCAGA--GAACT-----TT-TGCAA-GG----AA-A-------T-------------------------------------------G----AATGTC-T--C-GGAA--A------TAC-ACCAG----AGTTC-ATGC-C-TGTGG-T-AT--A--TGTAGTTT-G--CA-T----GTCATT--TAA------T--T------ACTTTC------C------T------------TC----------ATAT--C------A-----------AA------C--A------TG-------------------------G-T----AGTA--T----AAA---CA-TCAGAACTCAGTTCATCTT-C-TTGAT---TGTT-T---T------------A-AT--T---C-----GGC------T--TC-----T-T------G-C------------T------------G------------T----CTC--AAATTCAGTA-A---TG-TA---CT--C-GTAA-T-TT----GT---ATGACTAGTTAGGTTAC---------CAT--------A-----------G-------G---------G-----GA----TTG---GATGC-CGCAT----ATGTT-ATTT-T--a
gi|50 : aATCACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTTGTTTT-------TTTTA---TATTTGCCA---ATAC-----ATTG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCT-A-AG--TC---T-AAACAGT---AA-T---C-ACCC--CTT-----T--TATAAAA
gi|51 : tTT--C-----AGT------TGCCA---TT--T-GTTA-T-TT----AC---AAAGCCAG--------C---------T----------A-----------GA------TAGGG-----G-----GA----TTG---AATGT-CCGGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TTTA-TTTTGTTACT--AAACTTATTGTAa
gi|54 : tgttaattgctgactcaagGGAATCAAAACCAATTT-TATTGAT---TCTA-A---A-----AAT----A-AT--T---A-----TAT------G--TG-----C-T------G-CCAACTTA-----G------------ATATT--------T----TTT--A-----AGTA-A---CGACA---TG--T-GAGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------ttcaa
gi|56 : -----GA----TTG---AATGT-CCTGT----TTGTA-ACTT-T--TC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACTTATTTTA
gi|57 : ttacaagaccagcttggtacctttgggtT--G-----AATA-T---TGGCA---TT--C-GTAA-T-TT----AC---ATACCTAA--------C---------T----------AT----------G-------TACCTATACGG-----GA----ATG---AATAT-CCTGTG---AT-TA-GTTT-T--ACTTA----T-TGTTTTTATtttagtat
gi|58 : -TGTACTG-GGAAAA-TAT----GTTCA----GCA-AGT-CTTG--TCC---------TG-T-ATTT--ACAATA--GGAATAC--A-------TTACAAAA-T-TAATTC------C-ATGTA---TT-------TT
gi|59 : a-TATACCAAGTAAAA-TGT----GTTGA----GCA-AGT-AT-T--TTT--ACATGAAAA-T-GTTT--ACACTA--TAAATAC--AT-TA-CA
gi|6 : tatacttactggC--ATATGTATA-C-TTTT--ACAACA--TAAATG---GT-TATCATGG--AGA-TATAAT----------------------------TG-A---TGTTTGTTC---ATAT-----CCAG--GCA--ATCATT--C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----T-------------------------------------------GT----A-T---T-GCCC--CTT-----TTATGTTAAACAG------TA-T--TT-A----G--T-GAGA-AAATGTGTTAATT-G-------TT-GTTGTT-----------------TT-----T--TCAAA---TT-GCAC--GTC----TGTAGA--GAACA-----TT-TG--A-AG----AA-A-------TA-----AA----A---------AA-G--CCG----C--A--A-A----AATGTT-TC-C-AAAA--A------AGC-ATCAC----AGTCC-ATGC-A-TTACG-T-AT--T--CAAAAT-C-G--TAAT----GCCAATTGACA------T--T------A----AAA----C------A------------AG----------AT-TCTA------G-----------AA------C--A------TA--A----TT-T------G---AT--A-T----CGT---T----TAT---CA-TCTGAATCAAATTCCTTTT-AATTTAT---TTGT-T---T-----GTTACCGACAT--G---C-----CGA------C--TGAAA--T-T--------C-------------------------A------------T----TTT--A-----AGT-------GACA---TT--T-GTGA---------AC---A-GATTGT--------T---------C----------A-------------------T---------A-----GAGCT-TTG---AATGC-CCAAT----ATGTA-GTTT-T--TC--A----TGTATTTTCCTGACTTAAAACTT-TTT
gi|60 : AAATA-T-TCAT-----T--TCAAT---TT-GCAT--TGC----TGCAGA--GATAT-----TT-TGCCA-AG----AA-C-------TA-----AA----gcaatcagtt
gi|61 : --TCAAA---TT-ACAT--AAC----TGCAGA--GGACT-----TT-GGCTAGGG----AA-A-------T------------A---------G--G--CTG----CA-A--A-G----GATGTT-TC-cgtctacaga
gi|62 : -TA-CATTACAAAA-C-TGATCT------C-GTGTA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----Caga
gi|7 : catgta--ATATGA----T-TTTT--ACAATA--TAAACAT--AT--A-C----CAAAA-G-TTATCT------C-ATATA---AT-------TTGC----TATTTGTCA---ATAC-----CTC-----ATTATTGTTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TT-TTTA---T-------AGA--CT-T-AC--AC---T-AAAATGC---T--T---T-GCTC--CTT-----T-ATGCAAAACAA------CG-T--CG-T----A--T-GAGC-TAA------AATC-A-------TT-GTC---------AAAATA-T-TTCT-----T--T-AAA---TG-TCGT--AGC----TCAACA--GAACT-----TA-TGCCA-CG----AA-A-------CA-----AC----A---------G--A--CCG----CCAA--A-A----AGCGTT-CT-C-GGAA--A------TCC-ATTATGTAGAGTTT-ATGC-A-TTATG-T-AT--A--AGGAGTTC-A--TA-T----GTCGGT--ATA------T--T------GACT-C------CCA----T------------AC----------AT-T--A------A-----------AGTAAAGCC--G------CA--T----TT-T------GA--A---G-T----CGCA--T----T-C---TA-CCGGAACCAAACCCATTTC-TGTTTAT---TTCT-TACAT-----AATG---C-AT--TATGT-----CGTCGACTCC--TA-----T-T------A-A------------G------------T------------T----TTA--A-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AT---A
gi|8 : ttaat-ATATA---TT-------TTA-A---TATTTCTTG---ATA------------GGA--ATCCTTT-T-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----CT-TCT----T-------GCATTCA-C-AG--AC---T-AAACAGT---TA-T---T-ACCCAAC---------ACATAACTCGG------CA-C--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT--TT--------AAAGAT--T-TTCT-----T--TAAAA---TT-GCAC--GAC----TGCACA--GAACTTTCAATT-TGTTA-GG----AA-A-------TG-----AA----T---------G--T-----------------------ATGTT-AC-CAAAAA--A------TGC-ATCCC----AGTTC-ATGC-A-GAAGG-T-AT--C--TGAAGTTT-G--TA-T----TTTGGT--TCC------T--C------A----C------T------TG-----------AT----------AT-T--A------A-----------AG------T--A------AG--TATCATTAT------GA--A---G-T----TGGA-------TAA---TA-TTGGAATGAAACTGGCTGT-TAATGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-A---------------C------T--TG-----G-G------G-A------------GT-----------A------------TA---TAT--A-----AGTT-A---CGAC-----T--A-GT-----------------TGGGTAC--------C---------CAT--------A-----------G-------T---------G-----CT----TTA---AATTT-TCTCT----ATGTA-AGTT-T--AT--A----TGTATTTTTCTTTCT--
gi|9 : C--ATGTGA-T--T-GTT---ACAATA--TAAATAG--AA-TA-CA------AA-G-TAATGT------A-ATGT-----T-------TTATA---TATTTGCT-------------------------TCATTTTC-GA--AT--------TA----T---------------------T-T---T-CA-----TT-TTTGTT-T-------GCATTTT-C-AT--GT---T-AAACAGC---TG-T---T-GTAA--GGT-----T-ATGTTAAATAG------TG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------GCTT-C-------TTTATCATT----AAAAAG-G-T-TCCT-----T--TTAAA---TT-ACAT--GAA----TACAAA--AAAGT-----TT-TGCTA-AT----AA-A-------TA-----AA----ACAAAATACAA--G--CTT----A--A--A-G----TATGTT-GT-T-GAAA--G------CAC-ACCAC----AGTTC-GTTT-A-TTAGA-T-AT--C--TAAA--TC--------------------AAA------T--T------A----CACCTCTT------T------------AC----------AT-T--A------AAATAAC-----AA------C--G------TG--T----TTAA------A---A---G-C----CGTA--T----TAAATCGA-TCGGAATCAAACTTGTTTT-TATAGAT---TTT-------------------A-AT--T---C-----TAT------T--Ttcag
blockSeqs : . . . A TCAA C TGAG TAT A A ATAG TCTA T GTCTTG TG G CG TT GA TGAACTACATAAC AC TCATGGC GTT AAGAAGT AT CAG ATT TATTAGTGGG TT T T TA TTTGTGTG GTCT GTGTTGTAGTTGTTGTTGTT A ATA G CTTTTTT TTTTCTTTG A G AGCTGT G AGA T AAC C AAC ATATG T ACTAATC T GG A TTTT AA A A TGTGTT C AGATTTATTGTTGTTATAATATTTC ATCAC AA GAT A TC TGCA TA TTTCAA A AC GATATT C ATAAAAA CCAAC CATA CAAAATACAAGCTTAAAG C AC G AT GTTCTC T GTAG A T T T C AG TTC G TGCA A TTTTG A TG AAACCT TA ACACCTCTTTACATTAAAATAACAACGTGTTTAAAAGCCGTATTAAATCG C A C CA A TTTC A CAAAAA CCG C AA ATGTCGTCGACTC TG CTAAA A TCTGACTTAAATTCAGT AA AATTC AT GTT GTT AA A A T G TGCG CTT G GCTGGGTATCCATAGG CCCGC CACT TTA A CG AATC T A AC TT TGTT T G TAA
blockSeqs : . . . C TTAT C CATG TA G . . . . TTCTT . . A . . CTATTAATTAC TA CG . . GT . . CTGTTACTA . . . . . . A . . . TTG TTCTCGG . . CTATT . GAA . . . T . . T . . . . . . . . . TTTTTTAAAAAAAAAAAAATCC . . CT . . . . TGC . TA GGGA . . . . GACTGATTTCAAA G CA A . . . . . . . . . . T G CAA . CT G . . CG ACCCCCCTTTGTATTAAAATTAATTAACATGTTTTGAAGCCCCATAAAA . A A CG . TG . ACAT T . . CAATTTCAC . AAA . GCGGACTCAGATTCAGT . . C . . . . A . . . . G CCAAGGTACCTATGGT . GCT . . CC G . . . . . T C A
blockSeqs : TC T TGT AT A . . . . GTCTG . . G . . GTTATCATGG T C . . AT . . TCCAGGA . . . . . . G . . . TT ATTTTG . . CTCA . . . . . C . . C . . . . . . . . . TTTGTTGCTAAAAAAGAGTTC . . . . . . . T . CT GGG . . . . GTTTGTGAGATAA . A C . . . . . . . . . . T G CG . G G . . . ATCTCCTTTCATATTTAAATAATGTCATAAAAAGTCGCATAAAATAAC . A T TG . C . T . . . GCTAC . . . GCTGACCTAAATTCAGT . . A . . . . A . . . . A GTTAGGTTACCATAGG . TT . . AG . . . . . . T G T
blockSeqs : . . A T . . . . GAATT . . G . . CATCATAAC T C . . TG . . CCTAGGA . . . . . . T . . . TA GTTTG . . AAA . . . . . T . . G . . . . . . . . . TGTTTATTATTCAATGGTTTC . . . . . . . G . CA AT . . . . AATATCACAAAG . C A . . . . . . . . . . C T TG . G A . . . GCTTCCTTACATCAAAATAGTAACATAACATATTTTGAAGTCACATT . A C CA . T . T . . . CATCA . . . GCAAACGCAAATTCAGT . . A . . . . A . . . . A ACTATGTACCTATACG . CT . . TG . . . . . . T G T
blockSeqs : T T . . . . GACTG . . T . . AATTACTTA C C . . AT . . CCTAAGG . . . . . . A . . . AT GTA . . CGC . . . . . T . . T . . . . . . . . . TTTATTGATAAACAACAACT . . . . . . . T . CC GT . . . . TGAATCAAAAG . C G . . . . . . . . . . T G CG . T A . . . ACTTCTCTTTTTATCAATATTAAAACATATTTGCAAGTCGTATGAAA . G A AG . T . T . . . ATGT . . . GCTGACTTTAATTTAAT . . T . . . . G . . . . A GCTCAGTATCATAGT . . . . CA . . . . . . G G A
blockSeqs : A . . . . CCGAT . . T . . ATTTCCAAT T C . . GA . . CCTAAAG . . . . . . G . . . TT ATA . . TGT . . . . . A . . T . . . . . . . . . TTTATCATTAAAAAGGTTCC . . . . . . . T . CC GG . . . . GACCGCCAAAA . C C . . . . . . . . . . C G CG . G G . . . ACGTCTCTGTGTATTAAAATCAGATCTTAATTTGGAGACGCATAAT . A T TA . T . A . . . GCGT . . . GCCAACTTAAATTCAA . . A . . . . A . . . . G TCTAGGTACACACA . . . . CA . . . . . . T C T
blockSeqs : G . . . . GTACT . . T . . CATTACAAC T T . . TT . . CCTAGGG . . . . . . G . . . TT TG . . GGC . . . . . C . . C . . . . . . . . . TTTGTTGTTAAAACATTTC . . . . . . . T . TC AG . . . . TGCCACTAAG . T G . . . . . . . . . . A T CG . A A . . . ATATATTTAAAATAAAATTAAGAACGTATTCTGAAGTCGCTTAAT . A C AA . T . T . . . CAGA . . . GCCAACTTAGATATTT . . A . . . . A . . . . C GCTAGGTTTCCAAA . . . . TA . . . . . . T G A
blockSeqs : T . . . . TTCTA . . G . . CATTCCAC T C . . TT . . CCAAGAG . . . . . . G . . . TT GG . . TGC . . . . . A . . T . . . . . . . . . TTTATTTTTAAAATATTTC . . . . . . . A . CA GG . . . . GACCGCAAAT . C G . . . . . . . . . . T G GT . G A . . . GACTCCCATACATTAAAGTAAAGCCGCATTTTGAAGTCGCATTCT . G G CC . T . T . . . CTGT . . . ACCAACTCAAATAAT . . T . . . . G . . . . C ACCAGGTACTCGT . . . . CA . . . . . . G G A
blockSeqs : . . . . . GTATT . . G . . CATTACA T A . . GG . . TATAAGG . . . . . . G . . . TG TG . . GGA . . . . . T . . T . . . . . . . . . TTTGTTGTTTAGATATTTA . . . . . . . T . TT AG . . . . GTACTTTAAG . C T . . . . . . . . . . T G CT . G A . . . ACCTCCCTTTACAATAAGAATACATTTTGAAGGTGCAAAAA . G A CA . T . A . . . CCTT . . . ACTAAATTTTATT . . C . . . . G . . . . A GATACCTATAGC . . . . CG . . . . . . T A A
blockSeqs : . . . . GTCT . . G . . GAATACA T C . . TT . . GATAAGG . . . . . . G . . . TT TT . . CTC . . . . . C . . C . . . . . . . . . CTTATTGTAAGAGTATGTA . . . . . . . A . TC GG . . . . GGTCACCAAG . A T . . . . . . . . . . C G TG . A G . . . ATCTCCCTTTACATTAACCTACAAACCTACATTTTATCCT . A G TC . T . T . . . CCAT . . . TCAAACTCGAT . . T . . . . A . . . . A GCTAGATAGGG . . . . CA . . . . . . T G A
blockSeqs : . . . . GCTT . . A . . AATTTC T C . . GC . . GCTAGGG . . . . . . G . . . TG TA . . GGC . . . . . G . . C . . . . . . . . . GCTCTTATTAAATGCATTC . . . . . . . C . CC TG . . . . TGTTGCAATG . C T . . . . . . . . . . C G TG . G A . . . ATTTACATTAAAATAAGAATGTATTTTGAAGTCGCTTAGT . G C CT . T . T . . . ATGT . . . GAGTATA . . T . . . . G . . . . A TCCATTGG . . . . GG . . . . . . T G A
blockSeqs : . AA . . G . . AACTGC T C . . AT . . CTTAGGG . . . . . . G . . . TG AG . . GGC . . . . . T . . T . . . . . . . . . GTGTTGTTAAAATACATC . . . . . . . T . CC GA . . . . GATCACAAAG . T A . . . . . . . . . . C G GC . G G . . . ACTTGATATTAAAGTAAGTATCATTATGAAGTTGGATAAT . A C TG . T . C . . . CTGT . . . GCCGAC . . A . . . . G . . . . A CCCATAGT . . . . TG . . . . . . T A T
blockSeqs : . . T . . CATTAA C C . . G . . CCTATGG . . . . . . A . . . TA TG . . GGC . . . . . T . . T . . . . . . . . . TTTACTGTTAAAAGATTA . . . . . . . T . AC TG . . . . GGCTGCAAAG . A T . . . . . . . . . . T A CG . A G . . . ACCTCCTGTTTAATTGAAATAAGAATTTTAAATTTTAAT . G A GG . T . T . . . CTGT . . . GCTGAC . . A . . . . G . . . . G ACCAGGT . . . . TG . . . . . . T C
blockSeqs : . . T . . CATTGT T C . . G . . CATTGGG . . . . . . T . . . TT AA . . CCC . . . . . T . . T . . . . . . . . . TTGTTGTTGTAAGATATC . . . . . . . A . CC GG . . . . GGTCACAATT . T T . . . . . . . . . . C G CT . G T . . . AAAACAAGATTCTAGAACATAATTTGATATCGTTTATC . G A CA . T . A . . . CCAT . . . GAGAA . . A . . . . G . . . . A CCTTTT . . . . AA . . . . . . . C
blockSeqs : . . G . . CATTAC T T . . G . . TCCAGGC . . . . . . G . . . TT TT . . ATC . . . . . G . . C . . . . . . . . . TTTTTATTAAAATATTCT . . . . . . . T . TC GG . . . . GGCTACAATA . T T . . . . . . . . . . C G CG . A A . . . ATCTTTTGATATTAAAAGTTTTTAATGTCAAATAAA . C C TA . T . T . . . TAGT . . . TCATT . . A . . . . A . . . . C TTCAT . . . . TC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TATACC T C . . T . . TCTAAA . . . . . . G . . . AT TG . . CTT . . . . . C . . C . . . . . . . . . TTATTATTAAAATGTTTT . . . . . . . T . CA GA . . . . ATATGCAAAT . T A . . . . . . . . . . C G CA . T A . . . ACCTCCCTTTATAGTATGTTTTGAAATTGCGTAAAA . A C CA . T . T . . . CTGT . . . TCAGT . . A . . . . T . . . . A GAT . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . CAC T C . . G . . CCTC . . . . . . G . . . TT TT . . GAC . . . . . C . . T . . . . . . . . . TTTGTTTTAGAAGATTTC . . . . . . . T . CC GA . . . . AAGCCGCAAA . C A . . . . . . . . . . C G TG . G A . . . GCCCCCTTTACATTGAAATATGAACGTACTTTGAG . A C CA . . . T . . . CGGC . . . ACGGA . . T . . . . G . . . . G AGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . CA T C . . A . . GG . . . . . . G . . . TT TT . . GGC . . . . . C . . T . . . . . . . . . ATTGTATTTCAAGGTTCC . . . . . . . T . CC GG . . . . GGCTGCAAAG . A G . . . . . . . . . . T A CG . G A . . . ACCTCCCTTTGCATTAAACTATGAACATAATAAG . G A CC . . . T . . . ATAT . . . GCTGT . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C C . . G . . A . . . . . . G . . . TA TG . . CTC . . . . . C . . C . . . . . . . . . TTTGGTGTTAAAAGATC . . . . . . . T . CC GA . . . . GGCCGTTCG . C T . . . . . . . . . . T G CA . G A . . . ACTTTCCTTCATATCAAACATGGTAGTATAAAC . T A CA . . . A . . . CCGA . . . AAGTT . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : G A . . G . . C . . . . . . G . . . TT TG . . GTC . . . . . C . . A . . . . . . . . . TTTATTGTTAAGATAT . . . . . . . T . CA GA . . . . TGCCGCATG . T A . . . . . . . . . . T G TG . T A . . . CCATCCATTTACATTAAAATTAAGAC . G A GG . . . T . . . CTAT . . . CAT . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : G . . . G . . . . . . . . . G . . . TA TG . . CAC . . . . . C . . T . . . . . . . . . TTTGTTAAAAGCTGTC . . . . . . . C . CC GG . . . . GGTTAACAG . C G . . . . . . . . . . T . C . . G . . . . G A TG . . . T . . . CC . . . GC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . TT TG . . GAC . . . . . C . . C . . . . . . . . . TTGTTAAATTATTAG . . . . . . . T . CT AG . . . . GCAGCCAAG . A A . . . . . . . . . . C . C . . G . . . . G A . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . CT T . . TGT . . . . . C . . C . . . . . . . . . TAACTGTTAGAAGGT . . . . . . . A . CC AG . . . . TGTAGAAAG . C A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . TT G . . TG . . . . . G . . C . . . . . . . . . TTTATGTTTAAGTTA . . . . . . . T . TT CG . . . . TGCCACAAA . C G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . TTGTCAAAATATTTC . . . . . . . T . CT GG . . . . GGCCAAA . C A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . TTTTAAAGATTTTC . . . . . . . T . C AT . . . . GGCTGTA . C G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . TTTTTAAATGTTT . . . . . . . T . . T . . . . GCAATAG . T A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . TTAAAACATTTC . . . . . . . . . . . . . . . GGCC . . A . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . TTGTTGTTT . . . . . . . . . . . . . . . GAA . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . GT .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : T** CATTAC********* G* TTTGTTGTTAAAANATTTC*************** GGCCGCAAAG*************************
originalCons : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAN-TATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATAC--AT-TA-CATTACAAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTGTA---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-G-------TT-GTTGTT----AAAAAATA-T-TTCT-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----A---------G--G--CCG----C--A--A-G----AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
finalCons : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAAT--ATACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAATACATTAC---------AAAA-T-TAATCT------C-ATGTA---TT-------TTG-A---TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-AC--GC---T-AAACAGT---TA-T---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CG-T--TT-T----G--T-GAGA-TAA------AATT-GTTTGTTGTTAAAANATTTC---------------T-----T--TCAAA---TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT-----TT-TGCCA-GG----AA-A-------TA-----AA----AGGCCGCAAAG-------------------------AATGTT-TC-C-GNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTTC-G--TA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------AT-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---G-T----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTAAACCACTTATAATATTACTGTTATGATCTTTACCTATCAGATTGAAACCTGTGAATTATCTAAAAGAATGAAAATTAATTGTTATAGGGCTGTGTATTGCTTGACCAATGCTGATACAATATGTATCGCAATTCAGGTATCCAGATACAAGATACAATGCGATACAGATTATTATTGAAAATGTGATGGAATTCAAGAGTATCTTTAACATTAAGTAAAATATATACGGTGTTGCCCGCTTAACACATCATAACAAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTTATTTGGACTGTGCACAGTATTGCTTGACCAATGGTGATCTGATATGTATCATGGTATAGGTATCCCGATACGCCATACAATACAGATTATTATTGAAAATTTGATGAAATCCATGAGTAACTTTTAACATTAAGTAAAATGTATACACAGTATCACCCTCTTAACACATCATT
Unaligned ( gi|39 ): AGGGATGTGCATTGCTTGGCCAATGCTGATTCTATATGTCTCATGATACAGGTATCAGATCCTGATACACAATACAATATGATACAGATTTTTATTGAAAATGTGATGAAATGCATGTGTCACTATTAACATTAAGTAAAGTATATATACAGTATAACATTCTTCACACATCATAA
Unaligned ( gi|40 ): TAGGGTTGTGTATTGTTTGACCATTGGTGATACAATATGTACCACGATACATCATCCCGATACGCGATACAATACGATACAGACTATTATTGAAAATGTGATGAAATGTATGAGTACTTCTAACATTAAGTGAAATACAAACGGCACCACTCTCGTTATACATAACAT
Unaligned ( gi|41 ): AGGGCTTTGTATTGCTTGACCAATGGCGATACAATATGTATCATGATACAGATAATCTGACACGCGATACAATACAATATAAATTATTGTTCAAAATGTGAAATCCATGAGTAACTTTTAAAATAAAGTAAATATATATAAATATACGGCATCACACTCAAAA
Unaligned ( gi|52 ): TGATTGTTCATTAATGTGAAGGATGAATTGTTCTAGGACTGTGTACTGCTTGACCAATGACGATAAGATTTGTATCTAAATATAGTATCATAATACGCGATACAACATGATACAG
Unaligned ( gi|53 ): GTATAATACATCCCATTACACTTAACAGTATAATACAAACAGTTTTCAAAATTCATGAGTAAATTTTATGTAAAATATATATACGGTATCACCCTCTTACACATCATATCAAA
Unaligned ( gi|55 ): TGTGATTGAAAATGGGATGAAATCCAGGAGAAACTTTTAAAATTAAGTATAATATATATATGGTATCAATCTCTTAACACATCATATCAAAA
Alignments
lowQualScore : 2222 4444444 1 111111111 111111111 22222222222222 11111111111111111111 1111111111111 11111111 1111111111111111111111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111111111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111
lowQualScore : 8888 0 3333333 3 1 33 111111111 4 4 4 3 7777 0 7777 3 555555555 33 2 44 33 33 2 0 555555 9999 444444 1 3333 3333 555555 777 33333 1 222 11111111111111 22 1 1 22 55555555 3333 11111111111111111111 1 222 1 44444444 4444444444444 0 1 1 33333333 1 444 222 2 444 33333 1 3333333 11 1 3333 11 1 1 1 3333333 222 2 222 222 11 22 3 1111 0 33333 11 1 11 2222 11 11 44444 6666666666 1 3333333 2222 9999999999999999999999999 333 1 2 1 1 44444444 2 11 555555 0 1 3333 1 1 1 0 1 1 22 222 2 66666 1 66666 3 22 444444 44 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 3 44 1 7777 1 999999999 444 1 22 555555555555555555 22 77777 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 22 33333 00 333 333 22 1 2 1 1 3333 333 3 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55555 3333 333 2 55 6666 2 2 22 33 4444 1 1 444
lowQualScore : .... . ....... . . .. ......... . . . . .... . .... . ......... .. . .. .. .. . . ...... .... ...... . .... .... ...... ... ..... . ... .............. .. . . .. ........ .... .................... . ... . ........ ............. . . . ........ . ... ... . ... ..... . ....... .. . .... .. . . . ....... ... . ... ... .. .. . .... . ..... .. . .. .... .. .. ..... .......... . ....... .... ......................... ... . . . . ........ . .. ...... . . .... . . . . . . .. ... . ..... . ..... . .. ...... .. ................................................................................................................................................. . . . .. . .... . ......... ... . .. .................. .. ..... . .................................................... .. ..... .. ... ... .. . . . . .... ... . ............................................................ ..... .... ... . .. .... . . .. .. .... . . ...
lowQualScore : 3333 7 3333333 3 0 55 666666666 4 0 9 3 1111 8 1111 1 222222222 22 4 55 22 11 0 8 000000 5555 888888 6 4444 1111 777777 222 88888 0 777 44444444444444 11 5 6 11 66666666 1111 66666666666666666666 4 444 4 44444444 3333333333333 9 3 4 33333333 4 888 444 8 444 22222 3 9999999 77 2 9999 77 2 2 2 2222222 222 2 222 222 77 99 0 8888 6 00000 77 2 77 7777 77 88 55555 5555555555 2 9999999 6666 7777777777777777777777777 333 4 5 2 3 00000000 3 99 333333 7 4 0000 4 4 4 1 5 5 00 555 3 22222 5 99999 4 11 444444 22 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 0 1 99 6 7777 6 000000000 444 6 22 777777777777777777 22 11111 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 88888 11 000 000 44 7 4 7 7 7777 222 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333 9999 777 1 11 6666 1 1 99 11 7777 0 4 111
consensus : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAA-TA-TACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAA-TACAT------TACAA----AATTAATCT------C-ATG----TA----TT------TT-G-A-----TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-ACG--C---T-AAACAGT---TAT---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CGT--TT-T----G--T-GAGA-TAAAAT-TG-----T-T---TGT---T---GTT--AAA--ANA-T--TTCT-----TTCAAA--TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT--TT-----TGCCA-GG----AA-A-------TAAA----A---------G--G--C----C-G-CAA---AGA-ATG-TT-T--C-----CGNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTT--C-GTA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------A-T-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---GT----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
Reference ( family-892 ) : AAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTACCGAGT-------CTATA-ATANTTCANACACGTGTAA-TA-TACTAAGNAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--TTC--ATATGAATA-T-GTTT--ACAATA--TAAA-TACAT------TACAA----AATTAATCT------C-ATG----TA----TT------TT-G-A-----TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTT----T-------GCATTCT-C-ACG--C---T-AAACAGT---TAT---T-GCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CGT--TT-T----G--T-GAGA-TAAAAT-TG-----T-T---TGT---T---GTT--AAA--ANA-T--TTCT-----TTCAAA--TT-GCAT--GAC----TGCAGA--GAACT--TT-----TGCCA-GG----AA-A-------TAAA----A---------G--G--C----C-G-CAA---AGA-ATG-TT-T--C-----CGNAA--A------TGC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--C--CGAAGTT--C-GTA-T----GTCGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AC----------A-T-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---GT----CGCA--T----TAA---NA-TCGGAATTNAACTCGTTTT-TATTGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----CGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|1 : AAACAAAATTTCCAACCATTAAAAATGGTGTACTGTGTATAAAAACTATATATATT--ATATATGTGTAAGCA-TACTAGGTCAAA-TAT----GTTTA----GCA-ACA-CT-G--TTC--ATATTAATA-T-GTTT--ACATTA--TAAA-TACATGTACATTACAA----AATCAATCT------C-ATA----TT----TT------TT-ATA-----TATTTGCCA---ATAC-----CTAA--GGA--ATCATTT-T-AA--TT--------TT----TG-------------------AT-T---T-CA-----AT-TTT----T-------ACATTCT-C-ACT--C---T-AAACAGT---CCT---T-GCTC--CTT-----T-TTGTAAAACAG------TGT--TT-T----G--T-GAGA-TAAACT-TG-------T---TGT---T---GTTAAAAA--ATA-T--TTTT-----TTCATA--TT-GTAT--GAC----TGTAAA--GTACA--TT-----AGCAA-GG----AA-A-------TAAA----A---------G--G--T----T-A-C-C---AGT-ATG-CA-T--C-----TGTAA--A------TAC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TTAGG-C-AT--C--TGAAGTT--T-GCA-T----GTCAAT--AAA------T--T------A----C------C------T------------AA----------A-T-T--A------A-----------AA------C--A------TG--T----TT-T------G---A---GT----TGCA--T----TAC---AA-TCAGAATTTAACTCATTTT-TATTGTT---TTTT-T---T-----ATTC---A-AA--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-C------------G------------A------------T----TTT--A-----AGTA-A---TTACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------C----------A-----------G-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT-----TGTA-GTTT-T--AC--A----TATATTTTTGTTGCT--GAATATATTTTA
gi|10 : T-T---T-TT-----TT-TTT----T-------GCTTTTT-C-AAA--A---T-GATCAGT---CAA---T-GTCC--TTT-----T-ATAGGCAACAT------TCT--TT-T----G--T-GAGA-TAAAAT-TG-----T-T---TGT---T---GCT--AAA--AAA-GAGTTCT-----TTCATA--GT-GTAT--GAC----TGCAGA--GAA--------------------------A-------TAAA----A---------T--G--C----C-A-CTA---AGA-ATG-TC-T--C-----ATGCA--G------TAC-ATCAC----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGTC--C-GCA-T----GCCAGC--AAA------T--T------A----C------CCCCCTTT------------GT----------A-T-T--A------AAATTAATT---AA------C--A------TG--T----TT-T------GA--A---GC----CCCA--T----AAA---AA-TCAGAATTCAACTCATTTT-TATTGA----TTTT-T---T-----AATA---A-AG--T---A-----TGT------T--TC-----T-G------A-C------------T------------AAATTTTAT----T----TTT--A-----AATC-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----GC---ATGGCAAG-----------------------------------------A-------T---------G-----GA----TTG---AATGT-CCCGT----ATATA-ACTT-T--AA--A----TGAA--TTTGTTGCT--AAACTTATTTTA
gi|11 : gtatttttttA--AT--------TA----TA-------------------GT-T---T-CC-----TA-TTT----G-------GAATACT-C-ACG--C---T-AAACAGT---TAT---TTGCCG--CTT-----C-CTGTATAAAAG------CGT--TT-T----G--T-GGGG-TA------------------TGT---T---GTT--AAA--TTA-T--TAGT-----TTCAAA--TT-GCAT--GAT----TGCATA--GAGCT--TT-----TAACG-GGGA--AG-A-------TGAA----A---------G--G--CCGTTC-G-CAA---A-------CC-T--C-----CAACA--C------TGC-ATCAC----AGTTC-CTGC-ATTTAGG-T-AT--C--TGAAGGC--T-GTA-A----GTCGGT--ACA------T--T------A----T------A------T------------ATTTAAAATAAAA-T-T--A------AG----------AA------C--G------TA--T----TC-T------GA--A---GT----CGC---T----TAA---TA-TCAGAAATAAACTCGATTT-TATT-AC---TATC-T---T-----AA-A---A------------------------T--TG-----T-T------G-C--------------------------------------------TT--A-----CGT--------ACA---TT--C---AATT-TT----ACCTTGTAGGTAC--------C---------T----------T-----------T-------T---------G-----GA----T-------TGT-CCCCT----ATATATATAG-T--AC--A----AGTATCATGCTTGAT--TCACTCATTTTt
gi|12 : TTTATCT------CGAAG----TG----TT------TA-T-A-----TTTTTGTCA---ATA-------------AA--ATTATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-A---T-CA-----AT-TTT----T-------GC----T-C-ATG--------AGACATTAGACAT---T-GCCC--TTT-----T-ATGACAAATAG------GGT--TT-T----G--T-GAGA-TAAAAT-TG-----T-T---TAT---T---GTT--AAG--ATA-T-----T-----TTCAAA--TT-CCAT--GAA----TGCAAA--GAACTGCTT-----TG---------------------TAAA----A---------AC-A--C----CAA-CAA---AGA-CTGATT-T--CAAAAATGCAA--AGTTCTCTGC-ATTTC----AGCTCAATGC-A-TTAAG-T-AT--------------------------TTGAT--AAA------T--T------A----C------CTCCCTTT------------AC----------A-A-T--A------AG----------AA------T--A------CA--T----TT-T------GA--A---GG----TGCA-------AAA---AA-TCAAAATATAGCTTGGTTT-TA----------TT-T---T-----AATT---A-AC--T---C-----------------TG-----T-T------G-A------------G------------A------------A----CTC--A-----AGT
gi|13 : tagcaagtataaaaaaaagtagatAGACATGT-TAA-TAATATTAAGAAA-----C----GTTTT----GCG-ATT-CT-T--TTC--ATATTAACA-T--TTT--ATAATA--TTAA-TACA---------------------ATAT------C-ATG----TA----TT------T--G-G-----TAGTTGGCA---ATAT-----CCAG--GAA--ATCATAT-T-AA--AT--------TAGTCTTT-------------------GTAT---T-TA-----TT-TAT----T-------TTATTTT-C-ATG--T---C-AAACAAT---TAC---T-ATCC--TTT-----A-ATTCAAAACAG------TTG--TT-T----G--C-GAGA-TA---C-TT-----T-T---TTTAAAT---GTT--TAA--AGA-T--TT------------------GCAT--TTT----TGCAGA--GAAC--------------A-AT----AACA-------AAAA----A---------G--A--C----C-G-CAA---ATA-ACT-TT-A--C-----CAAAA--A-------GC-ATCAC----AATTC-ATGC-A-TCAGG-T-AT--T--CGAAGTT--C-GTA-T----TTAAGT--AAA------T--T------A-------------------------------A-----------A-T-T--A------A-----------AA------T--AAT----TA--T----TT-T------G---A---tttaaggtgaattta
gi|14 : ataTAAAACAT------TGT--TT-T----G--T-TAGA-TAACCT-T------T-G---TGT---T---GTT--AAA--ATA-C--ATCT-----TTCATA--GT-GTAA--GAC----TGCAGA--GAATG--TA-----TGCTA-GT----AA-T-------TAAA----A---------T--G--C----C-G-CAT---GGACAT--TC-T--T-----CGGAA--A------TAC-ATCAT----AGTTC-CTGC-A-TTAGG-T-AT--C--TGAATTT--C-GCA-T----GTCAGC--AAA------TTAT------A----T------C------TTTTG--------AT----------A-T-T--A------A-----------AA-----------------G--T----TT-T------T---AAT-GT----CAAA-------TAA---AA-TTAGAGTTCAATACATTTT-GAATGAT---TTTT-T---A-----AATG---A-AT--TG--C-----TAC------T--AGCTAAAT-T------T-C------------A------------T------------T----TTT--A-----TGTA-A---TGACA---GT--C-ATAA-TGTTTGCGAC---AAG-CTAGATA-----C---------CTAT-------A-----------G-------C---------G-----GA----CTG---AATGT-ATAGT----ATGGA-ATTG-T--AC--A----ATTATTTTGGTTGCT--TAACTTACTTttgatttgtaagacattatgtgtattgtctatacat
gi|15 : ----G--C-GAGA-TAAAAT-TG-----T-T---TGT---T---GTT--AAA--ACA-T--TTCT-----TTCATA--TT-GTAT---AT----TGCAAA--GAAa
gi|15 : TT--A-----AGTA-A---TGACA---TT--C-ATAA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------TGGGTATCCATA-----------G-------G---------G-----GA----TTG---AATGT-CCTGT----ATGTA-AGTT-T--AC--A----TGTATATTTGTTATT--AAATTatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaagtaatgacattcataatttacatgactggctgggtatccataggggattgaatgtcctgtatgtaagtttacatgtatatttgttattaaattaaaatatcatttattgt
gi|16 : gcgagataaaattgtttgttgttaaaacatttctttcatattgtatattgcaaagaaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT-----C-ATGTTGAACAG------CGT--AT-T----G--T-CAGA-TAAAAT-AG-----T-T---TAT---T---TTT--AAA--ATA-T--TTCT-----TCCAAA--TT-ACTT--GAT----TGCAGA--TAATT--TT-----TGCAA-GG----AA-A-------TAAACATAA---------G--G--C----C----AA---ACATAT--TT-T--A-----CGCTG--A------TGC-ATCAC----AGTTC-AAGC-A-TAAGG-C-AT--C--CAAAGTT--C-GTG-T----ACCGGT--ATA------T--T------A----C------C------TCCCTTT------GC----------A-T-T--A------A-----------AC------T--A------TG---------------------A---A-----CATA--A----TAA---G--TCGCAATTAGATTAGCTTC-TATTAAT---TGTT-T---------AATA---A-AT--T---CAATTTCAC------T--TA-----TAT------T-C------------A------------G------------T----TTTAAA-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----Aaaaatatcatttattgt
gi|17 : atgatatgtacattcttgtatactggtaaaaagaagtttagcaagtattA-AGT-CT-----TC--ATATAAATA-T-ATTTTTACAATA--AAGA-TAAAT------TTCAG----AATTAATCT------C-GTG----CA----TT------TT-G-A-----TATTTGCCA---ATAC-----CTAG--GAA--ATAATTT-C-AA--AT--------TA-----A-------------------GC-T---T-C-------------------------CATTCT-C-CAG--CTGTT-AAACAGT---TAT---T-GCTC--ATT-----T-ATGTAAAA-AT------TGT--TT-T----G--C-AAGA-TGAAAT-CA-----T-T---TTT---TAAAAAA--AAA--AAA-A--TCCT-----TTCAAACTCT-GCAT--TAC----TGCAGA--GAACT--TT-----TGCCG-AG----AT-A-------TTAA----A---------G--G--T----T-A--AC---AGA-TTG-TT-A--A-----TG-AA--A------TGC-GACAA----AGTGC-ATGT-A-
gi|18 : ataaatttcaagagaaat-T---T-CA-----TT-TTT----TTCTCG--GTATTCT-C-AGG--C---C-AGACAGT---AAT---T-GCTT--CTT-----T-GTATAAAACAGACTAATC-T--TT-T----G--T-GAGA-TAAGAT-TA----------------------------------------CT-----TTCAAA--TT-GCAT--GGC----TGCAGA--GAGTT--TT-----TACCC-GG----AA-A-------TGGA----A---------G--T--A----C-T-TTA---AGA-CGG-TT-T--C-----CGGAT--A------TGC-ATCAC----AGTTC-GTGA-A-TTAAA-T-AC--C--AGAAGTT--G-TTA-T---------T--AAA------T--TTTAC--A----C------T------T------------AC----------T-T-TC-A------A-----------AA------C--A------TT--T----CT-T------aggctgtgtacagtttggttaaacgttgaattcttaaat
gi|19 : aatgcattttgatataaaataatgtctgcatggttgcaacattaattgtacatttcttgaaggatggcatttgttgaaatataaatattgcttaataT-----T-ATCTAAAGCAG------TGT--TT-TTTTTG--T-GCGA-TAGCAT-TG-----T-T---TGT---T---GTT--TAG--ATA-T--TTAT-----TTCTTG--TT-TTAT--GAC----TGCAAA--GAACA--TT-----TTTCA-AG----AA-AATAAAAATAAA----A---------G--G--T----C-A-CCA---AGA-ATA-CC-T--A-----CGGAA--A------TAC-ATCAG----AGTTC-ATGC-T-TAAAG-G-AT--C--TGAATTT--C-TTA-T----GTCAAT--AAA------G--TCCATCCA----T------T------T------------AC----------A-T-T--A------A-----------AA--------------------------T-T------A---A---G------------------A---CA-TCAG--TTTGACTTATT-----TTG-----TTTC-C---CAAAAAAAAA---A-AA--T---G-----CGT------T--TG-----T-T------T-CT-----------G------------ACTTAAATTCAG-T----TTA--A-----AACA-A---TGGCA---CT--C-GTAA-T-TT----AC---ATGATTAtcaaattacataa
gi|2 : AA-CACAT------CATAACAAAAACTAAGTT---------TT----TA----TT------TT-G-A-----TATCTGCCA---GTAC-----CTAA--GGA--AACATTT-CTAA--CT--------TT----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TT----------------------------------GAACAGA---CAT---T-GTCA--ATT-----T-ATGTAAAACCA------CGT--TT-T----G--TAGAGA-TAAAAT-TG-----T-T---TGT---T--------AAA--AGC-T--GTCT-----TTCACA--TT-GTAT--GAC----TGCAAA--GAACT--TT-----TACAA-T------A-A-------TAAA----A---------G--G--C----C-----------A-GTG-TC-T--C-----AGTAA--A------TAC-ATCAC----AGTTT-ATAA-A-TATGC-T-AT--C--TGAAGTTTGC-ATA-T----GTCAGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------CC----------CTT-T--A------T-----------AG------T--A------TG--T----TT-T------GA--A---AT----TGCG--T----AAA---AA-TCAGAATTCAACTAATTTT-TATTGATTTCTTTT-T---T-----AATA---A-AT--T---C-----AGA------A--TG-----T-T------G-CCAACTTA-----A------------A------------TTCAATTT--A-----AGTA-G---TGACA---TT--C-ATAG-T-TT----AC---ATGACTGG--------CTCAGTATCAT----------A-----------G-------T---------G-----AA----TTA---AATGT-CCCATAATCATGTA-ATTT-T--AC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACATATTTTA
gi|20 : tctcaatgagagcaggtatgagaagagcaatactatacagaatatcattgtaaatgtgatgaaaatcatgaataacttttaacagtaagtaaaatatatatacacagtatcaccaactt-GG----AA-A-------TAAA----A---------T--G--T----T-G-CAA---TGA-ATG-TT-T--T-----CATAA--T------TCC-ATTAC----AATAC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--C-AAGTT--T-GTA-TTTTTGTCAAG--AAA------T--T------A----T------C------TCCTTTC------AT----------A-T-T--T------A-----------AA------T--AA-----TG--T----CA-T------A---AAAAGT----CGCA--TAAAATAA---CG-TAGGCATTGAACCCCTTTT-CATTGAT---TTTT-T---A-----AATA---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----A-T------G-C------------GGACTCAGATTCAG------------T----TTT--A-----AGTT-A---TGACA---TT----GTGA-T-AA----AC---CTGGCTAT--------C---------T----------AG----------G-------TACACACA--G-----GATT--TTG---AA--------C----ATGTT-GTTT-TACAC--A----TGAAGTTTTCTTGCT--AAACTTAt
gi|21 : tgcatg--ATCATTC-C-AA--AT--------TT----TG-------------------TA-T---T-CA-----TG-TTTG---T-------ACACTAG-A-ATG--C---T-TAACAGT---TAT---A-GCAC--TTT-----T-ATGGAAAATAG------CGT--TT-T----G--T-GAAA-TAAAAT-TG-----T-T---TGG---T---GTT--AAA--AGA-----TCT-----T--AAA--TT-GCAT--GGCTGCATGCAAA--GAAAA--TT-----AGTTA-TG----AA-A-------TTAA----A---------G--G--C----T-G-TAA---A-------TT-----------GTAG--A-------------AC----AGTTC-ATGC-A-TTTGA-T-TT--C--C---------------------CGGT--AGA------T--T------A----T------CTCCCTTT------------AC----------A-T-T--AACCTACA-----------AA------CCTA------CA--T----TT-T--------------AT----C-C--------------TA-TCGGAATCAAACCCATTAA-TATTGCTG--TTTT-T---T---------------T--T---C-----CTT------T--TT-----T-T-----------------------------------------------T----TTT--A-----A
gi|22 : g-------GCATTCT-C-AGG--A---T-AAACAGTGAATAT---T-A-------T-----T-A-GTAAAA----------------------------------AAAG-TG-----C-T---TAT---T---GTA--AGA--GTA-T--GTAT-----TTAAAA--TT-GCTA--GAC----AACACA--GTTGC--TT-----TGTCG-GATATTAA-T-------TAAA----A---------T--GAAT----C-A--AA---AGA-ATA-AT-T--A-----AGACA--A------TGC-ATCAC----AGATC-ATGCTG-CTAGGTT-ATAGC--CGGAGTC--T-GT--T----ATT--T--ACA------CCGT------G----C------CCCCTT-T------------AC----------A-T-T--G------A-----------AA------T--A------TG-----------------A---A---------CGTACTT----TGA---GA-T---AATT-------TCTT---TTGA----CATT-C---T-----AATA---G-AT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------A-C------------G------------G------------A----CTT--A-----AATaatt
gi|23 : -TA-TACTGAGGAAAA-TAT----GTTTA----GCA-AGT-CT-G--ATC--ATATCAATA-T-GTTT--------------------------CACAA----AACTAATCTTCATGGC-ATG----TA----TT-----------A-----CATTT----------------------------TT-TTT-T-AA----------------------------------------------T-CT-----TT-ATT----T-------ACATTCT-C-GCT--C---T-AAACAAT---CAT---T-GTCC--CTT-----T-ATTTAAATCAA------TGT--TTAT----T--T-TAGA-CAAATT-TGAGATTTAT---TGT---T---GTT--ATA--ATA-T--TTCT-----TTTATA--TT-GTAT--GAC----TGCAGG--GAACT--TT-----TG----------------------AAA----A----------------------G-CAAT--AGA-ATG-TC-T--C-----TGTAAATA------TAC-ATCGA----AGTTC-AAGC-A-TTATG-T-AT--C--TGAAGTT--G-CCA-T----GTCAGT--ATA------T--T------tcatttttgtaaattgtaacattcat
gi|24 : AAA----AAAATACGTAAGAGGGTTGTACCAAAG-------CTATA-ATAACTCA---------AA-TA-TACTGAG-ATAA-TGA----GTTTA----GAG-AGA-AT-T--TTC--ATATGCATAGT-GTTT--G--ATA--GAAA-TAAAC------TGCAA----A-TTAATAT------C-ATG----TA----TT------TT-G-A-----TATTTTTCAATTATACTGTTACTA-----A--A-----T-G-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TG-TTT----A-------GGATACT-C-AGG--C---T-AAACTTG---TAT---T-GTCC--GTT-----T-ATGT-AAACAT------TGT--TT-
gi|25 : tccttatatggaataccacctctgtgaagtgtcttggttgaacaattatatcagtt-TTT----T-------GCTTTAT-C-AGG--C---T-TAGTAGT---TAT---T-GTAA--TTT-----T-ATTCAAAACGG------TGTGGTT-T----T--C-CAAA-TAAATG-TG-----T-T---TAT---T---ATT--CAA--TGG-T--TTCT-----TTCAGG--TT-GCAT--TAC----TGTAGA--GCACT--TA-----TGCCA-GA----AA-A-------TAAA----A------------G--C----A-G-CCA---AGA-ATG-TT-T--A-----TGTAA--A------TGA-ACCAT----AGT----TG------AGG-C-AT--C--CGAAGTT--C-GTA-T----GTCGGT--TCA------T--A------A----T------C------G------------AC----------A-G-T--A------A-----------
gi|27 : atattactaccaattttgattaatatttttatttttaacta----TT------TT-ATA-----TACATATCA---ACAC-----CTAA--AGA--TCCATTT-T-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TG-TAT----A-------ACTTTCT-T-AGG--C---T-AAATA-----TAT---C-GCCT--TTT-----G-ATGT------T------CGT--TT-T----G--T-GAGA-TTATAG-TG-----T-T---TAC---T---GTT--AAA--AGA-T--TACT-----T-AAAA--CT-GCAT--AAC----GGCAGT--GAACA--T---------------------A-------TGAA----A---------G--A------------AA---AGA-AAA-TT-TAAC-----TTTAA--A------TTC-AACAA----AGTTC-ATGC-A-TTAGG-TCGT--CTTCAAAATG--C-TTA-TC---TTTGGT--AAA------T--T------A----C------C------T------------GC----------C-T-T--A------A-----------cttatcatcctttat
gi|28 : aagAAA-TAA----GTTTATCTAGCA-AA-----A--TAC--ATGTTAACA-T-TTTC--ACAATA--TGAA-TAAAT------TACTT----AATCAATCT------C-ATA----TA----TT------TTTG-A-----TATTTGTCA---GTAC-----CTAG--GGA--ATCTTTT-C-TA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-------------------------------------------------AT---TAT---T-GCCT--TTT-----T-ATGTTAAACCA------CAC--CT-T----G--T-GAAA-TAAAAT-TC-----T-T---TGT---T---GTT--GTA--AGA-T--ATCT-----TTGGAA--TTAGCAT--GAC----TGCAGG--GAACT--TT-----TTCCA-GG----AA-A--------GAA----A---------G--A--T----C-A-CAA---AGA-ATA-TT-T--C-----cattaaa
gi|29 : aaagAT------TACAA----A-TCAATAT------T-ATG----TA----TTAAGAAGTT-C-ATACAGTATCTGACA---ATAC-----CAAG--AGA--ATCA-TT-C-AA--A----------A----TG-------------------GT-T---T-AA-----TTGTTT----T-------TCATTCT-T-ACC--C---TGAAACAGG---TAT---T-ACCC-------------------ACAG------TGT--TT-T----G--C-AAGA-TCAAAT--------T-T---AAC---T---GTT--AGA--AGG-T--TTA------ATCAAA--TT-GCAT--GGA----TGCAGA--AGACT--TT-----TGACA-GG----AA-A-------TTAA----A---------G--G--C----T-G-CAA---AGA-ATG-AT-C--C-----CAAAtaaa
gi|3 : catattttcttacataacaactattaAAACAAA----CAAATAAGTAAAAGGGGTGTTCCAAGT-------CTATA-ATACTTCAAACATGAGAAA--A--ACTAAGAAAAA-AAA----GTTAA----GCG-GGA-CT-G--TTCTGATATGAATA-TCG-----ACAACA--TAGA-TAATT------TCCAATA--AATTAATCT------C-ATA----TA----CT------TT-T-A-----TATTTTTCA---ATAT-----CTAA--A-A--ATCATAT---GG--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTC----T-------GGATTTT-CGACTATT---T-ATCCACT---T-T---T-ATCC--GTT-----T-ATATAAAACAC------TGT--TT------GAAT-GAGA-TACAAC-TG-----T-T---TAT-------GTT--TAA--G------TTAT-----ACCAAA--TT--CAT--GGC----TGCAGA--GAAAT--TG-----TGCCA-GA----AA-A-------TACA----A---------G--G--T----C-A-CAA---TTA-ATG-TT-T--C-----AGAAA--A------AGC-ATCCT----TACTC-ATTC-A-TTGGG-T-AT--C--CGAAGTT--C-GTA-T----ATCTGT--CAA------T--A------A----C------C------T------------CCTGTTTA----A-T-T--G------A-----------AA------T--A------AGAAT----TT-T------A---A---AT----T-----T----TAA---TA----AAATTG---------T-TATTGAT---TT--------------ATA---A-AT--T---A-----TGT------TTGTG-----T-T------GCC------------G------------A------------C----TCT--A-----ATTC-AGTTTTA-A---GC--T-ATGC-T-TT----AC---ATGCCTAG--------C---------T----------A-----------G-------
gi|30 : ttccctatcaggaatacttcctgtttgaagtgtcttgattgaagtactatatcaatata---AAA-ATG-TT-T--C-----CAGAA--A------TGT-ATAAC----AATTT-ATGT-A-CTAGA-C-AC--A--CTAA-----C--TA-G----GTCACT--AAA------A--T------A----CGT----CTCTG--T------------GT----------A-T-T--A------A-----------AAT-----C--A------GA--T----CT-TAATTTGG---A---GA----CGCA-------TAA---TA-TTAGAA-TCAACTTCTTTTATATCAA----TTTT-T---C-----AATA---A-AGAAT---C-----C--------T--TG-----T-TTCAAACT-C------------G------------A------------T----ATT--A-----TGAT-A---TGACA---TTAAC-GT---T-TT----AC---AT-----------------------------------A-----------G-------T---------T-----GG----TT----AAGGTACCCAT----AC----ATCT-T--AC--A----Tgt
gi|31 : agaaatTTAATCT----------------A----TA------TT-G-A-----TATTTGTCA---ATA------------------TCATTT-C-AG--AT--------TA----TA-------------------GT--------G-----TT-TTT----T--------C-TTCT-C-AAT--C---T-AAACAGT---TAT---T-TGCT--CTTATATGT-ATGTAAAGCAG------CAT--TT-TT---G--G-GAGA-TAAACT-AG-----T-T---TAT---T---GAT--AAACAACA-A--CT-T-----TTCGAA--TT-GCAC--GAC----TCTGGA--GCACT--TTA----TCTC--------AA-A-------CAGA----A---------G--T--T----T-G-TGAGATAAA-ATG-CTGT--T-----TGTAA--A------TAC-TTCaa
gi|32 : AACAT------TGT--TT-T----G--A-GAGA-TAAAAT-AG-----C-T---TAT---T---GTT--AAA--ATG-T--
gi|32 : -------TAAA----A---------T--G--T----A-G--AA---AGA-ATG-TT-T--C-----CGAAA--G------TTTTATCAT----GGTTC-ATGC-A-TTAGG-T-AT--A--CGAA-TT--------------TCAAT--AAA------T--T------GCTTCC------T------T------------AC----------A-T-C--A------AAATAGTAACATAA------C--A------TA--T----TT-T------GA--A---GT----CACA--T----T----------GGAA---A------TTT-TATTGA----ATTT-T---T-----AATA---A-GT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------agaaagaatgtttccgaaagttttatcatggttcatgcattaggtatacgaatttcaataaattgcttccttacatcaaaatagtaacataacatattttgaagtcacattggaaattttattgaatttttaataagttctgtttgtttcaaactcaaatttcagtttttg
gi|33 : aacattgttttgagagataaaatagcttattgt----------A-T-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TT-T------G---AA--GT----CGCA--T----TAC---TA-TCAGAATTCAGTCCTTTTT-TATTGAT---TTTA-T---A-----AATA---T-AT--T---C-----TGT------G--TA-----T-T------G-CT-----------G------------A------------C----TCG--A-----ACT---------CAGTTTT--CAGTAA-T-TA----AC---ATGCCTA---------C---------C----------AAGGTACCTATGG-------T---------G-----GA----TTG---AATCT-CCTAT----ATGTA-ATTT-T--AC--ATGTTTGTATTTTTGCTCCA--AAACGTTTTTTAtcaaactcaaatttcagtttttg
gi|34 : a------T------------AC----------A-T-T--A------A-----------TA------G--A------TG--T----GT-C------ATAAA---GTTACACACA--TG---TCA---TA-TTGGAACCAAACCTGTTTT-TATTAGT---TTTTAT---T-----TACA---A-TT--T---C-----CAT------T--TG-----T-T------G-CT-----------G------------ACCTAAATTCAG-T----TTT--A-----A-CATA---TGGCA---TT--G-ATGA-T-TT----AC---TGGACTAA--------C---------C----------AG----------G-------T---------GCCCGCAACACTTTG---AATGT-TCC-T----ATGTA-GTTTAC--AC--A----TG---TTTTGTTttca
gi|35 : tAAA-TATATAGGTTTA----GGATAG--CT-T--TTC--ATGTGAATA-T-TATT--ACAATA--TAAA-TACAT------TCCAC----AATTAATCT------A-ACG----TA----TT------TT-A-A-----TA-----CA---ATTT-----ATAA--GGA--CACATTT-C-AA--A-------------------------------------T-T---C-CA-----------------------GC-------------C---T-AAACCAT---TATAACT-GATC--CTT-----T--TGTAAAACAG------AGT--TT-A----G--T-GAGA-T-ACAT-TG-----T-T---T-T---T---ATT--AAA--ATA-T--TCTT-----TTCAAA--TT-t
gi|36 : ---A---GT----TGCA--T-----AC---TA-GTGGAAACAATCTGGCTTT-TATT-AT---CTGT-T---T-----AAAAT--A-AT--T---T-----AGT------T--TC-----T-T------G-C------------A------------AACGCAAATTCAGT----TTC--A-----TGTT-A---TGGTA---CT--C-GTGA-C-TT----AC---TTGATTAA--------C---------C----------A-----------GGTACTCGT---------G-----GA----TCGTTAAACGT-CTCAC----ATGGG-GTTT-T--AC--A----TGTATT
gi|37 : aataagggtgtataatatgaAATA--TGAACTACAT------AACAA----AATTGATGT------C-ATG----AA----TA------GT-G-A-----TAATTGCCA---GTAC-------------------ATTT-C-AATAGC--------TT----TT-------------------GT-T---T-CA-----TT-TTTATTTT-------GCATTCT-C-ACT--T---T-AACCAGT---CAT---T-GCCC--CTT-----C-GTTCAAAACAT------TGT--TT-C----A--T-GAGA-TACAAC-TG-----G-C---TCT---T---ATT--AAAT-GCA----TTCT-----TTCAgcctaa
gi|4 : atataacaaaA-TACTAATTGAAA-TAT----GCTAA----GCA-A---CC-GATTTC--ATATGCATG-T-TCTT--GCAATAGATAAC-TACAT------TACAACAA-AACTAATCT------C-ATT----TG----TT------TT-G-A-----AAGTTGCCA---GTA-----------------ATTATTT-C-AA--TT--------TT----T---------------------T-TATAT-CA-----AT-TTT----T-------TCATTCT-C-ACT--CA--T-AAGCGG-----AT---TCGCCC--CTT-----T-ATGTAAAACAG------CAT--TA-T----G--T-GAGA-CAAAGT-T------T-T---TAT---T---ATT--AAA--ATG-T--TTTT-----GT---A--TT-TTAT--GAC----TGTACA--GAACT--TT-----TGCAA-GA----AA-A-------TAAA----A---------G--G--C----T-A-CAA---TAA-ATA-TC-T--C-----AGGAA--A------TTC-ATCCC----AGTTA-ATGC-A-TTAGG-T-AA--C--TGAA-TT--CAACA-T----ATTAGT--AAA------T--T------A----C------T------TCTCTTTTTATCAAT----------A-T-T--A------A-----------AA------C--A------TA--T----TTGC------A---A---GT----CGTA--T----GAA---AACTCCAAATTCTATTCA-TGT-TATTGA----TGTT-T---T-----AATG---A-AT--T---C-----TGT------T--TG-----T-T------G-CTGACTTTAATTTA------------A------------T----TTT--A-----AGCA-A---TGACA---TT--C-ATGC-T------------AGG--TAT--------C---------C----------ATT---------G-------G---------G-----GA----TTG---AAAGT-CCCGT----ATGTA-ATTT-A--AC--A----AGTAGTTTTATTGCT--AAACTTATTTTAt
gi|42 : ATTCAAGCTATTTT-TATGGAT---TTTG-T---------AATA---A-AT------------CATCA----T--TG-----C-T------A-CCAACTCAAAT--A------------A------------T----TTC--A-----TGTA-A---TGACA---CT--T-GTGA-T-TT----AC---ATGACTGG--------C---------T----------A-----------GGTT----TCCAAA----G-----GGCT--TTG---AATGC-CC--T----TTGT----TT-T--AC--A----TGAATCTAC-TTACT--AAACTTACTTTtt
gi|43 : gTTATATACATGTA--TA-TACTAAGTAAAA-TGT----GTTAT----GCA-AGTACT----TTT--ATATAAATA-T-GTTT--GCAATA--TAAA-TACAT------TACAA----AGATAATCT------C-ACG----TA----TT------TT-G-G-----TATTTGCCA---ATAG-----ATAA--GGC--ATCATTT-tatcg
gi|44 : attaataattatcaccag----TT------TT-T-A-----TATTTGTCA---GTTG-----CTAG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CACTTTTTT-TTT----T-------TCATTCT-ttata
gi|44 : T-----TTTATA--TT-TCATTCG-C----TGCAGA--GAACT--TT-----TGCCA-GG----AA-A-------TAAA----A---------T--G--C----C-A-CAA---Attcatagttatataattttatatttcattcgctgcagagaacttttgccaggaaataaaatgccacaaaattatacctaaa
gi|45 : tttttatatttgtcagttgctagggaatcatttcaaattatggtttcactttttttttttcattctttcatagttatataaG------CAT--TT-T----G--T-GAGA-TGAAAT---------------G--------ATT--AAA--ACA-T--TTCT-----TTCTAA--TT-GCAT--GAT----ATTAGC--AAGCT--TT------GCCA-GA----AA-A-------TAAA----T---------A--T--A----T-G-CAA---ATA-ATG-TT-T--C-----CAAGA--A------TAC-AT--C----AGTTC-ATGC-A-TAAGG-C-AT--C--TGAAGattatacctaaa
gi|46 : ----TG-------------------GT-T---T-CA-----TT-TCT----T-------GCATTCT-C-AGA--C---T-AAACA-------------------------------------CAG------CGT--GT-T----G--T-AAAAATAAAAG-TG-----T-T---TGT---T----TT--AGA--AGA-T--TTCTATCACTTGAAA--CT-GCAT--GCC----TGCATATAGAAAC--TT-----TGCCA-GA----AA-A-------TAAA----A---------AATA--T----C-A-CAA---AGA-ATG-Tatgtagttttacat
gi|47 : GAAA--A------TGC-ATCTA----AGTTC-ATGC-A-TTACA-T-GT--C--TGAAGTT--C-ATA-T----TTCAGT--AAGAAACCTT--C------A----T------T------T------------AC----------A-T-T--A------A-----------AA------T--AAGAATGTA--T----TT-T------GA--A---GT----CGC---T----TAG---TA-TCAGAAT
gi|48 : caA-TA-TACTGAGAAAAAATAT----GTTTA----GCA-ATT-CT-A--A-C--ATATGAAAT-T-GTTT--ATAATA--TAAA-TACAT------TAAAA----AATTAATAA------C-ATG----TA----T--------------------TTTGCCA---ATAC-----TTAG--GGA--ATCATTT-C---------------------------------------------T---T-CA-----TT-TTT----catttatactgccaactcatatttactttt
gi|49 : gtaatAT------TACAA----AATTAATCT------C-A-G----TT----TT------TT-T-A-----TATTTGCCA---ATGTA----TTAGTGGGA--ATCATTT-C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCTAA-AGG--C---T-AAACAGT---TAT---T-GCCC--CTT-----T-TTATAAAA
gi|5 : tt--ATATGTTTA-T-GTTT--GCAATA--TGAA-TACAT------TGTAA----AATAAGTAG------T-ATG----TG----TT------TTGG-A-----TATTT--------T-C-----CTAT--GGA--ATCATTT-G-AA--TTTTTGTGTGTA----TGTGTTGTAGTTGTTGTTGTTGT-T---TGTG-----TT-TTT----TTTTCTTTGCATTCC-C-GCT--C---T-AAACAGA---CAT------------------------TAAAACAG------TGC--TT-T----G--T-GAGA-TAAAAT-TG-----A-T---TG----T---ATT--TCA--AGG-T--TCCT-----TTCATG--TT-GTAT--GTC----TTCAGA--GAACT--TT-----TGCAA-GG----AA-A-------T---------------------------------------GA-ATG-TC-T--------CGGAA--A------TAC-ACCAG----AGTTC-ATGC-C-TGTGG-T-AT--A--TGTAGTT--T-GCA-T----GTCATT--TAA------T--T------ACTTTC------C------T------------TC----------A-TAT--C------A-----------AA------C--A------TG-------------------------GT----AGTA--T----AAA---CA-TCAGAACTCAGTTCATCTT-C-TTGAT---TGTT-T---T------------A-AT--T---C-----GGC------T--TC-----T-T------G-C------------T------------G------------T----CTC--AAATTCAGTA-A---TG-TA---CT--C-GTAA-T-TT----GT---ATGACTAGTTAGGTTAC---------CAT--------A-----------G-------G---------G-----GA----TTG---GATGC-CGCAT----ATGTT-ATTT-T--a
gi|50 : aAT------CACAA----AATTAATCT------C-ATG----TTGTTTTT------TT-T-A-----TATTTGCCA---ATAC-----ATTG--GGA--ATCATTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------GT-T---T-CA-----TA-TTT----T-------GCAGTCT-A-AGT--C---T-AAACAGT---AAT---C-ACCC--CTT-----T--TATAAAA
gi|51 : tTT--C-----AGT------TGCCA---TT--T-GTTA-T-TT----AC---AAAGCCAG--------C---------T----------A-----------GA------TAGGG-----G-----GA----TTG---AATGT-CCGGT----ATGTA-ATTT-T--AC--A----TTTA-TTTTGTTACT--AAACTTATTGTAa
gi|54 : tgttaattgctgactcaagGGAATCAAAACCAATTT-TATTGAT---TCTA-A---A-----AAT----A-AT--T---A-----TAT------G--TG-----C-T------G-CCAACTTA-----G------------ATATT--------T----TTT--A-----AGTA-A---CGACA---TG--T-GAGA-T-TT----AC---ATGACTAG--------C---------ttcaa
gi|56 : -----GA----TTG---AATGT-CCTGT----TTGTA-ACTT-T--TC--A----TGTATTTTTGTTGCT--TAACTTATTTTA
gi|57 : ttacaagaccagcttggtacctttgggtT--G-----AATA-T---TGGCA---TT--C-GTAA-T-TT----AC---ATACCTAA--------C---------T----------AT----------G-------TACCTATACGG-----GA----ATG---AATAT-CCTGTG---AT-TA-GTTT-T--ACTTA----T-TGTTTTTATtttagtat
gi|58 : A-TG-TACTG-GGAAAA-TAT----GTTCA----GCA-AGT-CTTG--TCC---------TG-T-ATTT--ACAATA--GGAA-TACAT------TACAA----AATTAATTC------C-ATG----TA----TT------TT-
gi|59 : -TA-TACCAAGTAAAA-TGT----GTTGA----GCA-AGT-AT-T--TTT--ACATGAAAA-T-GTTT--ACACTA--TAAA-TACAT------TACA
gi|6 : tatacttactggC--ATATGTATA-C-TTTT--ACAACA--TAAA-TG-------------------GTTA---T------C-ATGGAGATA----TAA-----TT-G-A-----TGTTTGTTC---ATAT-----CCAG--GCA--ATCATT--C-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----T-------------------------------------------GT----AT---T-GCCC--CTT-----TTATGTTAAACAG------TAT--TT-A----G--T-GAGA---AAATGTG-----T-TAATTGT---T---GTT--G-----------TTTT-----TTCAAA--TT-GCAC--GTC----TGTAGA--GAACA--TT-----TG--A-AG----AA-A-------TAAA----A---------AA-G--C----C-G-CAA---A-A-ATG-TT-T--C-----CAAAA--A------AGC-ATCAC----AGTCC-ATGC-A-TTACG-T-AT--T--CAAAAT---C-GTAAT----GCCAATTGACA------T--T------A----AAA----C------A------------AG----------A-T-TCTA------G-----------AA------C--A------TA--A----TT-T------G---AT--AT----CGT---T----TAT---CA-TCTGAATCAAATTCCTTTT-AATTTAT---TTGT-T---T-----GTTACCGACAT--G---C-----CGA------C--TGAAA--T-T--------C-------------------------A------------T----TTT--A-----AGT-------GACA---TT--T-GTGA---------AC---A-GATTGT--------T---------C----------A-------------------T---------A-----GAGCT-TTG---AATGC-CCAAT----ATGTA-GTTT-T--TC--A----TGTATTTTCCTGACTTAAAACTT-TTT
gi|60 : AA--ATA-T--TCAT-----TTCAAT--TT-GCAT--TGC----TGCAGA--GATAT--TT-----TGCCA-AG----AA-C-------TAAA----gcaatcagtt
gi|61 : TCAAA--TT-ACAT--AAC----TGCAGA--GGACT--TT-----GGCTAGGG----AA-A-------T-------A---------G--G--C----T-G-CAA---AGG-ATG-TT-T--C-----cgtctacaga
gi|62 : A-TACAT------TACAA----AACTGATCT------C-GTG----TA----TT------TT-G-A-----TATTTGCCA---ATAC-----Caga
gi|7 : catgt--ATATGA----T-TTTT--ACAATA--TAAA-CATAT------ACCAA----AAGTTATCT------C-ATA----TA----AT------TT-G-C-----TATTTGTCA---ATAC-----CT-----CATTATTGTTT-C-AA--AT--------TA----TG-------------------AT-T---T-CA-----TT-TTTA---T-------AGA--CT-T-ACA--C---T-AAAATGC---T-T---T-GCTC--CTT-----T-ATGCAAAACAA------CGT--CG-T----A--T-GAGC-TAAAA-----------T---CAT---T---GTC--AAA--ATA-T--TTCT-----TT-AAA--TG-TCGT--AGC----TCAACA--GAACT--TA-----TGCCA-CG----AA-A-------CAAC----A---------G--A--C----C-GCCAA---AAA-GCG-TT-C--T-----CGGAA--A------TCC-ATTATGTAGAGTTT-ATGC-A-TTATG-T-AT--A--AGGAGTT--C-ATA-T----GTCGGT--ATA------T--T------GACT-C------CCA----T------------AC----------A-T-T--A------A-----------AGTAAAGCC--G------CA--T----TT-T------GA--A---GT----CGCA--T----T-C---TA-CCGGAACCAAACCCATTTC-TGTTTAT---TTCT-TACAT-----AATG---C-AT--TATGT-----CGTCGACTCC--TA-----T-T------A-A------------G------------T------------T----TTA--A-----AGTT-A---TGACA---TT--C-GTGA-T-TT----AT---A
gi|8 : ttaat-ATA----TA----TT------TT-A-A-----TATTTCTTG---ATA------------GGA--ATCCTTT-T-AA--AT--------CA----TG-------------------GT-T---T-CA-----CT-TCT----T-------GCATTCA-C-AGA--C---T-AAACAGT---TAT---T-ACCCAAC---------ACATAACTCGG------CAC--TT-T----G--T-GAGA-TAAAAT-TG-----T-T---T-----------T--AAA--GAT-T--TTCT-----TTAAAA--TT-GCAC--GAC----TGCACA--GAACT--TTCAATTTGTTA-GG----AA-A-------TGAA----T---------G--T---------------------ATG-TT-A--C-----CAAAA--AA-----TGC-ATCCC----AGTTC-ATGC-A-GAAGG-T-AT--C--TGAAGTT--T-GTA-T----TTTGGT--TCC------T--C------A----C------T------TG-----------AT----------A-T-T--A------A-----------AG------T--A------AG--TATCATTAT------GA--A---GT----TGGA-------TAA---TA-TTGGAATGAAACTGGCTGT-TAATGAT---TTTT-T---T-----AATA---A-A---------------C------T--TG-----G-G------G-A------------GT-----------A------------TA---TAT--A-----AGTT-A---CGAC-----T--A-GT-----------------TGGGTAC--------C---------CAT--------A-----------G-------T---------G-----CT----TTA---AATTT-TCTCT----ATGTA-AGTT-T--AT--A----TGTATTTTTCTTTCT--
gi|9 : C--ATGTGA-T--T-GTT---ACAATA--TAAA-TAGAA------TACAA----AGT-AATGT------A-ATG----T-----TT------TA-T-A-----TATTTGCT-------------------------TCATTTTC-GA--AT--------TA----T---------------------T-T---T-CA-----TT-TTTGTT-T-------GCATTTT-C-ATG--T---T-AAACAGC---TGT---T-GTAA--GGT-----T-ATGTTAAATAG------TGT--TT-T----G--T-GAGA-TAAGCT-TC-----T-T---TAT---C---ATT--AAA--AAGGT--TCCT-----TTTAAA--TT-ACAT--GAA----TACAAA--AAAGT--TT-----TGCTA-AT----AA-A-------TAAA----ACAAAATACAA--G--C----T---TAA---AGT-ATG-TT-G--T-----TGAAA--G------CAC-ACCAC----AGTTC-GTTT-A-TTAGA-T-AT--C--TAAA--T--C------------------AAA------T--T------A----CACCTCTT------T------------AC----------A-T-T--A------AAATAAC-----AA------C--G------TG--T----TTAA------A---A---GC----CGTA--T----TAAATCGA-TCGGAATCAAACTTGTTTT-TATAGAT---TTT-------------------A-AT--T---C-----TAT------T--Ttcag
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): TTAAACCACTTATAATATTACTGTTATGATCTTTACCTATCAGATTGAAACCTGTGAATTATCTAAAAGAATGAAAATTAATTGTTATAGGGCTGTGTATTGCTTGACCAATGCTGATACAATATGTATCGCAATTCAGGTATCCAGATACAAGATACAATGCGATACAGATTATTATTGAAAATGTGATGGAATTCAAGAGTATCTTTAACATTAAGTAAAATATATACGGTGTTGCCCGCTTAACACATCATAACAAA
Unaligned ( gi|38 ): TGTTATTTGGACTGTGCACAGTATTGCTTGACCAATGGTGATCTGATATGTATCATGGTATAGGTATCCCGATACGCCATACAATACAGATTATTATTGAAAATTTGATGAAATCCATGAGTAACTTTTAACATTAAGTAAAATGTATACACAGTATCACCCTCTTAACACATCATT
Unaligned ( gi|39 ): AGGGATGTGCATTGCTTGGCCAATGCTGATTCTATATGTCTCATGATACAGGTATCAGATCCTGATACACAATACAATATGATACAGATTTTTATTGAAAATGTGATGAAATGCATGTGTCACTATTAACATTAAGTAAAGTATATATACAGTATAACATTCTTCACACATCATAA
Unaligned ( gi|40 ): TAGGGTTGTGTATTGTTTGACCATTGGTGATACAATATGTACCACGATACATCATCCCGATACGCGATACAATACGATACAGACTATTATTGAAAATGTGATGAAATGTATGAGTACTTCTAACATTAAGTGAAATACAAACGGCACCACTCTCGTTATACATAACAT
Unaligned ( gi|41 ): AGGGCTTTGTATTGCTTGACCAATGGCGATACAATATGTATCATGATACAGATAATCTGACACGCGATACAATACAATATAAATTATTGTTCAAAATGTGAAATCCATGAGTAACTTTTAAAATAAAGTAAATATATATAAATATACGGCATCACACTCAAAA
Unaligned ( gi|52 ): TGATTGTTCATTAATGTGAAGGATGAATTGTTCTAGGACTGTGTACTGCTTGACCAATGACGATAAGATTTGTATCTAAATATAGTATCATAATACGCGATACAACATGATACAG
Unaligned ( gi|53 ): GTATAATACATCCCATTACACTTAACAGTATAATACAAACAGTTTTCAAAATTCATGAGTAAATTTTATGTAAAATATATATACGGTATCACCCTCTTACACATCATATCAAA
Unaligned ( gi|55 ): TGTGATTGAAAATGGGATGAAATCCAGGAGAAACTTTTAAAATTAAGTATAATATATATATGGTATCAATCTCTTAACACATCATATCAAAA