lowQualScore : 11 1111111 33333333333333 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 44444444 1111 44444444444444444444444444 1 1111 22222222 222222222222 1 55555555555555555555555555555555555555555 11 11 1111111 555555555555555555555 1111 111111111 1111 33333333333333 11 111 22222222222222 33333333333333333 1111 3333333333333333333 11 33333333333333 11 22222222 1111 11 1111 1 3333333333 1 1 5555
lowQualScore : 555 99 888 8888888 2 8888888 666 99 44444444444444 11 33 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 6666 666666 0 1 1 888888 33 1 2 5 44 44444444 8 3 55 777 9999 1 00000000000000000000000000 55 666 2 777777 7 3 3 0000 5 2 2 77777777 0 2 666666666666 6666 0 66 3 7777 3 55 44 3 00000000000000000000000000000000000000000 2 44 4 6 9 77 0 11 8888 44 444 3 6666666 1 777777777777777777777 3 4444 77 3 555 000000000 555 3 2 999 33 4 6666 77777777777777 11 0 555 55 7 00000000000000 7777 0 3 66666666666666666 0 5 1 8888 3 7777777777777777777 2 2 2 3 7 3 3 22 2 2 555 66666666666666 55 3 00 3 55 88888888 2222 1 00 6 1 8888 6 1 1111111111 999 8888 1 2 8888 8 8 777 4 1 0
lowQualScore : ... .. ... ....... . ....... ... .. .............. .. .. ............................................................................................................. . .... ...... . . . ...... .. . . . .. ........ . . .. ... .... . .......................... .. ... . ...... . . . .... . . . ........ . . ............ .... . .. . .... . .. .. . ......................................... . .. . . . .. . .. .... .. ... . ....... . ..................... . .... .. . ... ......... ... . . ... .. . .... .............. .. . ... .. . .............. .... . . ................. . . . .... . ................... . . . . . . . .. . . ... .............. .. . .. . .. ........ .... . .. . . .... . . .......... ... .... . . .... . . ... . . .
lowQualScore : 666 77 666 1111111 5 4444444 777 44 88888888888888 77 77 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 6666 222222 9 5 2 222222 00 3 1 7 22 33333333 2 5 00 000 4444 2 44444444444444444444444444 00 444 2 222222 8 3 3 2222 7 9 9 66666666 5 8 333333333333 5555 6 33 5 2222 9 00 77 4 77777777777777777777777777777777777777777 1 88 7 4 3 66 8 88 3333 66 888 3 1111111 3 444444444444444444444 3 3333 55 8 666 888888888 333 6 9 111 44 2 3333 11111111111111 44 3 000 00 2 44444444444444 1111 2 3 22222222222222222 7 7 8 4444 1 7777777777777777777 9 9 9 8 1 5 3 88 5 7 888 66666666666666 00 9 99 6 00 99999999 3333 0 55 4 9 2222 7 0 7777777777 444 5555 5 9 1111 3 4 000 3 7 1
consensus : CTATCTN--CCA-NTA-A-GT-------CAAAC-CCCT-C-N-CGGGGAC--NTA--GAC-T-----GACGCG-CGTCA-ACTGACA--A--AG--------------GTN-AA---A--A-G--AAT-----A------AAAGC--A---TA----AA---AGAGA-NAA-T-AT--AC-------AG-G--------TT-GT---ATTTAAA-A--GCAGGTTAAAAACAGAGCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGG--CACACTGCCTGTCTGAAC--TGAT---TGGGC-TCGAGAGAG-------AC----A--AT-ATT-TC-CAG--GG---AGCGAG----TTCCACTGGACAA-TAG-TG---CG-GG-GGA-GAAA-GAA-TACTTGTAAAAGTCAGAACTT--G-TTTG----GATTTGTCTGTAGGCCAGA--GAATG--GGATA-GACGAC----TT-----GTTCTTGTATTNGGGATNAGGTAANN----TTCNGGTGGGATNGCNAC-NAGGTTATGGGTGATGTTATA-AAGCATA--ACC--AG-TCN-----CTGGTCAATACGA-----CGC--A-----GG-TCAAGTCGTCTCC-AGTT--TAGAGTGG---TCA-G-CATNT-C-G-GTGACACTGGAAGTGCGNC-CATAG--TCGTGCNTT---GCCCAGC-GAGCAGCCCGTC--TCTGNAC-GG-----NC----TC----AATTT-GTCCGATGNCAG-CGCCGGTATGNGGNGACCAGACAN-NGGAGCAGTACTCNAGTT---GGGGN------CTGA-C-A-AGNGTCNTATA-TGCCGTNGACT---TT----AGT--TTNT-CT--GAATGNACTTTTATG--TTT-----CTTCTN---AGAAATC-CTAATGTTTGATTTGC-CTTTTTNGTGAT--GTTGTCGATGTG-TNTGTTCCAT----GTTAAGTCCTCTG-A--ANATTGTGA-CNCCNAGATATTTTGCT
Reference ( gi|2 ) : CTATCTT--CCA-ATA-A-GT-------CAAAC-CCAT-C-G-TGAGGAC--ATA--GAC-T---A-GATGCA-CGTCA-ACTGACA--A--AG-------------TGTG-AA---A--A-G--AAT-----A------AAAGC--A---TA----AA---AGGGA-GAA-A-AT--AC-------TG-A--------TT-GT---ATTTAAA-A--ACAGGTTAAAAACAGAGCAGGT------TTCTAG-GGAGACACATGTTCAA-CCTGG--CAGTCTACGTGGCTGAAC--TGAT---TGGCT-CCGAGAGAG-------GC----A--AT-ATT-CT-CAG--GG---AGTTAG----TCCCAGTGGACAA-TAG-TG---TG-GG-GGA-GAAATGAA-TACTTATAAAAATCTGAGCTT--G-TTTG----GATTTGTCTATATGCCATA--GAGTG--GGATA-GATGAC----CT-----GTCCTTTTATTTGGGATTAGATAGGG----TTCAGTTGGGATAGCAAC-TAGGTTATGGACGATGTTATA-AAGCATA--ACC--AG-TCT-----TTGGTCAATAGGA-----TGC--A-----GG-TCAAGTCATCTCT-AGTT--TAAAGTGG---TCA-A-CATAT-C-A-GTAACACTGGAGGTGCGGC-CATAG--ATGTGCATT---GCCCAGC-AAGCAGCCTTTC--TCTGCAC-AG-----AC----TC----AATTT-GTCCGATGCCAA-CGCTGGTGTGTGGTGACCAGACAT-AGGAGCAGTACTCTAGCT---TGGGT------CTCA-C-A-AGTGTCATGTA-TGCAGTAGATT---TT----AGT--TTGA-CT--GAGTGAGCTTTGATG--TTG-----TGTCTG---AGGAATC-TTAGTGTTTGATTTGT-TTTTTTTGTTAT--ATTATCTGTGTG-TTTGTTCCAT----GATAAGTCATCTG-ATTATATTGTGA-CACCAAGATATTTTGCT
gi|3 : CTATCTT--CCACATG---GC-------CAAAC-CCCT-C-G-CGAGGAC--ATA--GAC-T---TTGACATA-CGTCA-ACTGACA--A--A----------------TG-GA--------G--AAT-----A------AAAGC--A---TA----AA---AGAGA-TAA-T-AT--AC-------AA-G--------TT-GT---ATTTAAA-A--GCAGGTTAAGAACAGAGCAGGT------ATCTAA-GGGGTCACGTGTTTAA-CTTGGTGCA--CTGCCTGTCTGAAC--TAAT---TGGGC-TCAAGAGAG-------AC----A--AT-GTT-TC-CAG--AT---ATTGAG----TTCTGCTGAACAA-TAA-TT---CG-AG-GGA-AGAAAGAA--------AAAAGTAAGAATTT--G-TTTG----GATTTGTATGTAGGCCAGA--GAATG--GGATA-TACGAC----------------------TAGG-TCA---AGGAACTTTTCAAGTGGAGTTGCGAC-TAGTTTATGGGTGGTGTAATA-GAGCTTG--ACC--AG-TCG-----TTGGTCAACACGAC----TAC--------GG-TCAAGCCGCCTCC-AGTT--TAATATTG---TCA-A-CATAT-T-G-GTGACACTGAAAGTGTGTC-CATAG--TCGAGCATT---GCCAAGC-GAGCAGCCCGTC--TCTGTAT-AT-----AC----TC----AATTT-GTCCGATTCCAG-CATTCATGTTTGGGGACCAGCCAG-AGAATCAGTACTGAAGCT---GGGGT------CTCA-T-A-AGTGTCAGGTA-TGTCATGGATT---TG----AGT--TTAT-CT--GAGTGAACTTTTATA--TTT-----CCTCTG---AGCAATC-CTAGTGTTTGATTTGC-TTTCTTTGTGAT--G-------------TTGTTCCAT----GTTAAGTC-TATG-G--AGATTGGGA-TTCCAAAATATTTTGCT
gi|1 : CTAACTG--CCA-TTT-A-TT-------TAAAC-CCCT-G-C-TGGGGACCTATACTGAC-T-----GA-GCG-CGTCA--CTGACA--AG-AA-------------TGTT-AAT--ATCA-A--AAT-----ACAGTTGAAAG---G---TA----AA---AGGAT-GAC-T-GC--AC-------GG-GG-------TTAGT---TTTTAAA-A-----GATTAAAA--------------------TAG-AGA----CATGTTCAA-CTCGA--C---TTA--TGGCCGAGC--TGA------ACT-CTGGCAGAGTTGTGCCGCTACAG--AT-GGT-GC-CAG--GG---CATT--------TCAGCGGACGA-TGG-TTC--TC-GG-GAA-GAAA-AAG-TACTTATAATAATCAGTACTG--G-TCTG----AATTTGACAATAGG--ATAATGAATG--TGAC--GATCAG----CTAG---GTC--------TGGTGTTG---AGGG----TTATGT----A-ACCCAC-TAAATATTGGGTAATGCTGTA-AAACATT--ACT--AG-CTT-----CTTATCAATCC-------TTCTGA-----GC-TCAAG----CTCC-AATG--TAAGGAGT---TTA-G-CATGT-C-T-GAGACACTAGAAGTGCG-------------TTCTTT---AACCAACTGAGCAGCTCGTA--TCTGTA--AG-----TC----TC----ATATT-GGCAAATGAGTG-TGTCGGTATGGGAAGACCAGACAG-GGTGGCAGTATTCGAATT---AAGGC------TTAA-CTACAGTATTAT--A-TGCAGTAGCTT---TT----AGTGCTTG---T--GAATGAACATTTATG--TTT-----CTTCTC---AGGAATCCTTAA-GTTTGGTTTGC-CTTTTCAGTGCT--ATTGTCGATGTG-TGTGTTCCAT----GATAAG---TCTG----AGATTGTGA-TTCTGAAATGTGTTGCaatgagactgtttctaatgaa
gi|8 : tctatCTATCTG--CCA-TTA-A-GT-------CAAAC-CCCT-G-C-TGGGGAC--CTA--GAC-T-----GTCGCG-CGTCT--CTGACA--AGAAG--------------GTT-AA---T--A------C-----A------AAAAC--AGT-TG----AT---AGGG---------------------------------TTAGT----TTTCAA-A--ATA--TTGAAAATAGAACAGGT------TTCTAA-GGAGAGACGTGTTCAA-TTCGG--C----TA-ACGGC-GAAC--T------TAACT-CTGGCAGGG-------GC----T--GT-ACCACTACAGAAGG---TGCCGGGGCATTCCAGTGGACAA-TGGTTC---TG-GG-GAA-GAAG-GAG-TACTTATAATAATCAGTACTG--G-TCTG----AATTTGGCGATATGagatatgactgagtcttatttagtgttatggagaatgtaggcggcgttgatgttttttttacttgaatgatctggcatgtggatgggttgaagtgcatgtctcactttgtttcc
gi|27 : atCTTTCTG--CCA-TTT-A-GT-------CAAAC-CCCT-G-C-TGGGGAC--CTA--GAC-T-----GACACT-CATC--ACTGACAAGA--AG--------------GTT-AAT--AT-A-G--AA------A------ACAGTTGA---TATGTTAA---AAGGATGAC-T-GT--AC-------AG-GTT------TT-GT---TTTTAAA------AGATTAAAAATAGCCCAGGT------TTCTAA-GGGGAGACATGTTCAA-CTCGA--Cataatgattctggtggtatcgccacaaaatagtgggtaatgctgtaacacatgacaagcctctgatcaatccttctgagctcaagcggcctccaatgaagggcgtttagcatgtctgagacactgtaatcgcgtgcaaaattgtgtttggccc
gi|34 : tCTATCTG--CCA-TTA-A-GT-------CAAAC-CCCTGC-T-TGA-GAC--CTA--AAC-T-----GACATG-TGTC--ACTGACA--A----------------------GA---A--A-GTTAAT-----AT-----AAAAC--AGT-TG----AT---AGGTT-TAA-A--------------TG-G--------T--------TTTAA-------AGATTAAAAATAGAGCAGGT------TTCTAA-GGATTGACATGTCTAA-Cttacagccaagcttaactctgacaagtgttgtgccactacagatggtgcca
gi|4 : tatCTATCTT--ATG-TTA-ATGT-------CAAAC-CCCT-T-T-TGGGGAC--CTA--GGC--------ATGTGTCGCCATACCAACA--A--AGACTTAATTAGTTTTTTA-AA---A--A-A--TATATTAAA------AAAGA--AATTTA----AA---AG------A-A-AT--AG-------TG-ATGTTTCAGTT-GTTAGGTTTAAA-A--A-----TAAAAACATACTATGA------ATTTAT-GATGAGATATGTTCAATTCTGC--TGATTTCTGTATC-AAAC--TGTTCTATGGTTAATGATATAG-------G-----G--GT-A----T-CAG--AACCTAATGAA----TTCCAATGAAAAA-CTG-T----TC-AG-GGA-AAAACGAG-AATTTGTAAAAGTCAGTGGTG--G-TGTT----AATTAGTTGA-AAGCAAGT--GAATG--TGA----ATGTCGGGATT-----GTCTGTTTGTCAGTG-TTATGTAATC----TTCTATGGGGATAGCTAC-AAGGTCATTGGTGATTTTGTA-ACACAGA--GAG--AGAGAG-----TTGGCT----GTA-----TAC--ATCTTTGG-TCTAGTCTTTTCC-ACTGGAGAGAGTAC---TGA-AGCATCT-T-A-GTAATGCTACTGGTCTGTC-TATAG--TCTTGTCTT---GCCCAGT-GTGCTGCCCGGC--ATTGGAC-GT-----CT----TC----AACCT-GATTTATGGCAGTCTCT-GTATAAGGTGACCGTACAT-TTGAACGGTACTCCAATT---GAGAG------CAGA-C-A-AGAGTTTTATA-TGCCATGGACT---TTA---AGTC-TT---CT--GGATGTACCTATATGTATTT-----CTTCTT---ATAAATC-CTAATATTTGGTTTtct
gi|52 : atCCATCTT--CCATATATA-GC-------CAAAC-CCAT-C-T-CGAGGAC--ATA--GGC-T---
gi|38 : aCTATCTCTGCCA-TCT-A-GT-------CAAAG-CCCT-A-C-TGGGGAC--TTA--GACAT---A-CATG---CGTC--ACTGACA--A--ttga
gi|53 : atCTATCTG--CCA-TTT-A-GT-------CAAAC-TCCT-G-C-TGGGGAC--CTA--GAC-T---gacgattaatataaaaaaacaagtgataagttaaaaagatgtctgttcagggttagtttttaaat
gi|13 : TATCTC--TCACATA-A--C-------CAAAC-CGCT-T-T-TGAGGAC--ATA--GGC-T---TTGACGTG-CTTCA-ACTGAC-----------------------------------------------------------------------AA---AGAGA-GAA-A-ATGTAT-------AG-G--------TT-GT---ATTTAAA-A--GCAGGTTAAAAACAGAGAAGGTTTCTACTTCTAG-GGGGGCACATATTCAA-CCTGG--CACACTGCCTGTCTGAACAAAGAT---TGGGC-TAAAGAGAG-------AC----A--AT-ATT-TC-CAG--GG---AGTGGG----TTTTATTGGACAA-TTG-TG---TG-AG-GG--GATATT-T-TTTTTGTAAAAGTCAGAATTT--GATTTGTTTTGATTTGTCTGAAGGTCAGA--TACTG--GGATC-TATGAC----TT-----GTTCTTATATTAGCGATAAGA
gi|5 : TATCTT--CCA-ATA-A-GT-------CAAA---CAT-CTGCTGGAGAT--CTA--GAC-G---A--ACGCA-CGTC--ACTGACA--AT-AA-------------TGTT-GATTTA--A-G--AAC-----AGAGTTTAAATT--G---TA----AA---AGAAT-GAA-T-GTA-AA-------GG-G--------TT-AT---CGTTAAATATTATACGTC--ACACAGAGTAGGT------TTCCAA-GAAGAGACATGTTTAA-CTCGG--Ca
gi|44 : ctatcagtgTATCTT--CCACATA-C-GTGACATAGCAAACTCCAC-C-A-CAAGGAC--ATA--GGC-TTTGA-GGTGT---GTCA-ACTGACA--G--AG-------------AG-A-AA---A--A-G--AAA-----A------AAAGC--A---TA----AA---Ataatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggtggtatcgctacaagataatggatgatgctgtaaaacatgccaagtctgaccctttctccggaagtcaagcggtctacaacttagggagtttaggaaatctaggacactagaattgtggataattctgtatttaacctttcgagcagcttatctctgcatcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|7 : ATCTT--CCACATA---GC-------CAAAC-CACT-T-G-CAAGGAC--ATA--GGC-T---TTGACACA-CATCC-ACTGACA--A--AG-------------AGAC-AA---A--A-GT-AAT-----A------AAATC--A---TA----AA---AGAGA-TAA-T-AA--AC-------AG-G--------TT-GC---ATTT-------------TAAAAACAG--CAGGT------TTCTAGTGGGGATGCATGTTCAA-CTGGG--CACACTGCCTGTCTGAAA--TGAT---TGCAA-TCAAGAGAG-------AT----A--AT-ATT-TC-CAG--GG---AGTGAG----TTCCACTGGACAA-TAG-TG---TGAGG-GAA-GAAAGGAA--ACTTGTAGAAGTTAGACTTT--A-TTTG----GATTTGTCTGTAGGCCAGG--GAATG--GGATA-GATGAC----TT-----GTTCTTGTAATAGTGATAAGG-AAAT----TTCAGGTGGAATTGCAAC-TAGGTTAAAGGTGATGTTATA-GAGCATA--ACC--AG-TCG-----CTGGTTAATACAA-----CAA--A-----GA-GCAAGTCGTCTCC-ATTT--TAAGGTGG---TCA-A-CATCT-T-A-GTAaaa
gi|37 : CTT--CCA--TATA-GC-------CAAAC-CCCT-C-G-GGAGG-C--TTT--GAC--------ATGT---GTCC-ACTGACA--A--AG------------------AG---A--A-A--AAT-----A---------GC--A---TA----AA---AGAGA-TAA-T-AT--AC-------AG-G--------TT-GT---AATTA
gi|22 : -ATATA-GC-------CAAAC-TCCT-C-G-CAAGGAC--ATAA-GTT-T---T-GACGCG-TGTCA-TCTGACA--A--AG-------------AGGG-AA---A--AAG--AAC-----A------AAAGC--A---TA----AA---AGAGA-TGA-A-AT--ACAGGTTATTGTA--------TT-GT---ATTTATA-A--GCAGGTT-AAAACGGAGCAGAT------ATCTAG-G--GGTACATGTTCAA-TCTTG--CACATTGCCTGTCGGAAC--TGAT---TGGGC-TCAAGAGAG---------------------------AA--GG---AGTGAG----TTCCGCTGGACAA-TAG-TG---CG-AGTGAA-GAAA-GAA-AACTTtattgctgacattaaacaaggttttatagtcggtgcatgtt
gi|17 : cc-A-GT-------CAAAC-CC-T-T-G-CGAGGAT--ATATAGGC-T---TTGACACA-TGTCA-ACTGACA--A--GG-------------AGAGCAA---A--A-G--AAC-----A------AAAGT--A---TA----AA---AGAGA-TAATATAT--AC-------AG-G--------TT-GT---ATTTAAA-A--GCAGGTTAAAAACAAACCGGGT------TTATAG-GGGTACATATGACCAA-CCTAG--CACACTGTCTGTCTGAAC--TGAT---TGGGC-TCAAGAGAA-------AC----A--AT-ATT-TT-GAG--GG---AGTGAG----TTCCACTGG-TAATTAG-TG---TGAGG-GGA-GAAA-GAA-AAGTTGTAAAAGTC--------------A----GATTTGT---TAGACCAGA--GAATG--GGA
gi|29 : acat-GACGCA-CGTCA-ACCAATA--A--AG-------------AGAG-AA---A--A-T--ATT-----A------AAAGC--A---TA----AACCGAAGGA-GAT-C-ATTTAC-------AG-G--------TT-GT---ATTTAAA-A--GCAGGTTAAAA-CAGAGCAGGT------TTCTAT-GGGGACACACGTTCAG-CCTGG--CA---TAC-CGTCTG-TC--TAAT---CGGGC-TCAAGAGAG-------AT----A--CTAAAT-CC-C-G--GA---AGCGAG----TTCCACTGGAC
gi|31 : ttt-G--AAT-----A------AACGT--G---TT----AA---AGACA-AGA-T-AT--GT-------AG-A--------GT-GT---ATT--AA-A--ACAGGTTTAAA-CAGAACATGC------TTCTAG-GGAGACACGTGTTCTA-TCTGG--TAAACAGCCTGGTTGAAC--TGA
gi|43 : --AAT-----A------AAAGC--A---TA----AA---AGAGA-GAA-T-AT--AC-------AG-A--------TT-GT---ATTTAAA-A---CAGGTTAAAAACAGAGCAGGT------TTCTAG-GGAGACATATGTTCAagggcctctagtatctccatattaacggtttactgcactgttaata
gi|42 : taTCTAT-GGGGACACATGATCAAACCTGG--CACACTGCCAGTTTAAAG--TGAT---TGGGC-TCAAGAGAG-------AC----AATAT-ATT-TT-CAG--GG----GCAAG----TTTCACTGGACAT-TAG-TA---TG-AG-GGA-AGAATGAA-AACTTtggtgttccgctttgcgcatcccaactg
gi|24 : G--GG---AGTGAG----CTTCAAATTACAA-TGG-TG---CC-AG-CAA-GAAAT------CTTG--AAAAT---ACCT--------G----GATTTGACAGTAAACCATG--CAATG--TGATA-GTCAAC----TG-----GGTCTTCTATTGGGGATAAGATCATA----TTTAGGTGGGATGACAACATGGG-TATGCATGATATTATGTAAGT-TA--ACTGGAG-TC-------TGGTCAAGATGA-----TGG--A-----G----AA--------T-GGTG--GATA--GG---TCAGA-TA-AT-C-T-GTAACATTGGAAATATGGT-CATAG--TTATG
gi|21 : G----TTCCACTGGACAA-TAG-TG---CG-AG-GGAAGAAA--AA--------AAAAGTCAGAATTT--G-TTTG----GATTTGTCTGTAGGCCAGA--GAATG--GGATA-GACGAC----GT-----GCTCTTGTAga
gi|26 : taaaagatataatacaaaatgtagttattttaactacttttaccagtgaaggtcacacttgcaggttcacactcactctctcgtttattcgaagattgaacgaatgtgaatgataaattcactgattttagtttaaatccaatgagtgcatgac----TTCCAGTGGACA---AA-TGTCCTT-GG-GAA-GAAA-GAG-TACTTATAACAATCAGAACT
gi|16 : ctcgcaagggcggtgccgctacatctagagccagcgca---TG-AG-GGA-AGAATAAAATA-TTATAAAAGTCAGAACAT--G-TTTG----AATTTGTCTGTAGACCATC--GAGTG--GGATA-CA--GC----TT-----GTTCTTTTATTTGGGATAAAGTATGT----TTAAG----------------GTTTATAGATCACACTATG-A----TA--GCC--AG-TCG-----CTCGTCAATATGA-----CGG--A-----GC-TCAAGTTGCCTCC-AGTT--TAAATTAG---TCA-A-CATCT-T-G-TTGACAATGAAAGTGCGGC-AATAG---------------TCCTGA-GAGCAGCCCTTC--TTTGTAT-GG-----A--------------------------------CTGGAGTGTGGCGACCAGACAG-GGGAGCAGTACTCGAGC----TGGG--------------A-AGTGTgatatgacaaggtaggtgacgatctactatgtctagtattgcggattgtgtattttctggtggtacaacacgaacattctctgatcaatcctcccgagtttcacgcggtctccaatgtagagagttgttgcat
gi|14 : G-GG-GAA-GAAA-GAA-TGCTCATAATAAT--AAGCTCTGG-TCTG----AATTTA-------GCGATA--GGATAATGAATATGACGAT----CTACTAGGTC-TAGTGTTTAGGGTTATATAATC----TTCTGGTAGTATCGCCAC-GAGATAATGGGTAATACTGTA-AAACATG--CAT--AG-CCT-----CTGATCAA----ACCTTCTG---A-----GG-TCAAGCGGTCTCCAAATG--TAGGGAGGAGTTTA-G-CATTT-C-T-GAGACACTAGAAGTGCGTG-CAAAGTCATGTTCA-----ACCCAac
gi|48 : ggcaggggctgcgccactacagatggtgccagggcatttcagtgattgatggttccAAATAAAATAAT-ATAAAA---TAAG-------TTCG----GATTTGTCTGTAGGCCAGA--AAGCA--GGATA-GACGCC----TT-----GTTTTTGTAccg
gi|54 : agaGTTT--G-TTTG----GATTTGTCTGTGGGCCATA--GAaa
gi|5 : TGGTATCGCTAC-AAGATAATGGATGATGCTGTA-AAACATG--CCA--AG-TCTGACCCTTTCTC------------CGG--A-----AG-TCAAGCGGTCTAC-AACT--TAGGGAGT---TTA-G-GAAAT-CTA-G-GACACTAGAATTGTGG---ATAA--TTCTGTATTTA-ACCTTTC-GAGCAGCTTATC--TCTGCAcgacttgttct
gi|18 : ctatcagtgtatcttccaataagtcaaacatctgctggagatctagacgaacgcacgtcactgacaataatgttgatttaagaacagagtttaaattgtaaaagaatgaatgtaaagggttatcgttaaatattatacgtcacacagagtaggtttccaagaagagacatgtttaactcggctaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggGGATAGCTAC-ATGGTCATTTGTGATCTTGTA-A--CATAGGAAG--AG-TCT-----GCTGTCTATACGT-----CTC--T-----GG-TCTAGTCTTCTCC-A------AGACTG-----TA-G-CATCT-C-A-GTGACACTACTCGTTCATC-TGTAA--TCGTGTTTT---ACCCAGC------GTTTTGC--CTGGCACTGG-----ACGCCTTC----AACTTAGTTT-ATGGCA-------GTATAAGGTTACCAGACAC-TTGAGCTGTACTCCAGTT---GAGGA------CGGA-C-A-AGtcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|10 : catggagtgttcatccatttattaagcagttatattgatcatctataa-TAGGTTATGGGTGATGTTATA-GAGCATA--ACC--AG-TCA-----TTGATCAATACGA-----C-C--G-----GGTTCAAGTCGTCTCC-AGTT--TAATGTGG---TCA-A-CATAC-T-G-GTGACACTGGAAGTGCGTTACATAA--TCACGTATT---GTCCAGC-GAGCTGCCAGTC--TCTGCAT-GG-----AT----TC----AATTT-GTCCGATCCCAG-CACTAGTGTGTGAGGACCAGACAG-AGGAGTAGTACTCAAGTT---GAGGC------GTCA-C-A---TGCCATGGA-T----TAG------------AGT--TTAT-CT--GAGTGAACTTTTATG--TTC-----CGTCT------GAATC-CTAGTGTTTCTTTTGC-TTTGTTTG--AT--GTCGTCTATGTG-TTTGTTCCAT----GTTATGTTTTTTG----AGATTGTGATTACTTA-ATATTTTGag
gi|9 : TATGA--GATGTTATG-TAACATA--ACC--AA-TTT-----CTGGTCAGTGCAA-----AGG--A-----GG-TCAAGGAGTCTCC-AATT--TAGATTGT---TTA-G-CATAT-C-T-GCGACACTGGAAGTATAAC---TAG--TCATGCATA---GTCCAGC-AA-TAGCCCGAC--TCTGGAC-AT-----TT----TC----AATTT-GTCCAATACAAG-AAATTGCATTTAGAGACCAGACATGAGGAG-----CTCTATGT---GGAG---------CATT-A-AATGTCCTGTA-TGCTATTGATTCAGTTTTCCAGT--TT-A-CT----ATGCGCTATGATG--TTGTTTTTTGTATG---AGAAATC-CTA-TGTTTGGTTT-T-CTTTTAAGTAAG--GTAGTCAGTGTGATTAGTTCT-T----GTTGAGTCATCTG-A--A-ATGGTGA-TTCTAAGATATTCAGCTatgatgaggttatttctaatgtagtg
gi|36 : ATGTTA------CATA--ACC--AG-TCT-----CCGGTAAAT-----------C--A-----TG-TC---TCA------AATT--TAGATTGG---TCA-G-CATATAT-ATGTGACACTGAAAGTGCGAC-CATAG--TCACGTATC---GTCCTTC-GAGCAGCTCGTC--CCTgaagagacagattctaata
gi|12 : gggatgagagtaatttcTCT-AGTC--TAC--TGA-----A-G-CATCT-C-A-GTAACGCTACTGGTCCATC-TGTAG--TTATGGTTT---GCCCAGC-GTGTTGCATGGCAAT-TG-AC-AC-----CC----TC----CACCG-GTTTTATGGCAA-TCTTAATATAAGGTGACCAGACAC-TTGAACAGTACTCTAATT---GAGGT------TGGA-C-A-Aagataat
gi|20 : gtcagtggttgcgtcaattagtttgaaagcaagcgagtgtgaatgtagggattgcctgttcgtctgtgtcatttagtcttctagttgagtagctacaaggccatttgtgatcttgtaatataaggacagttggctgtctatacgtctttgg---TCA-G-CATGT-C-C-G-AGTACTAGAAGTGCGGA-CAAAG-----TCCTTTTAAACCCATC-GATCAGCTCGCC--TCTGTAC-AGCATCTAC----TTGGTAAATTT-GT---GTGT--A-CG----TACGGAGCGACCAAATAA-TGGAGCAGTATTCTAGTTGGATGGGTAGAGGGCTAG-C-C-AATGTCTTATG-TGCAGTTGAAT---TT----AGA--TTTT-CT--GAATGTACATATATG--TTT-----CTTCTG---AGGAATC-C---TGTTAGATTT-----------TTAT--CATGTCGATGTG-AGTGTTCCAT----GATaatcttctgaatgtacctttatagttcttcataaaaacactactgtttggtttg
gi|35 : aatCTGGAC-AG-----CC----TC----GATCT-GGTTTATGGCAG-TCTCAGTATGGGGTGACCAGACAC-TTGAGCAGTACTCTGG------GGG-------CTGA-C-A-AGAGTTTTATAGTTCA-TAGACT---TT----A------------------AATTTTGATA--TTT-----CTTCTT---AAAAACC-CCAATGTTTAATTT
gi|41 : agtgC----TC----AACCT-GGTTTATGGCAG-CCTCAGTATAAGGTGACCAGACAC-TTGAGCAGTGCTCCAGTT---TAGAG------CGGA-C-A-CGAGTTTTATA-GGCCATGGACT---TT----A
gi|56 : agacgcc----TC----AATTT-GTCCAATGCTAA-CACTGGGGTGTGGTGaatcttctgaaaatgtata
gi|30 : GACCAGACAG-AGTAGCAATACTATAGAA---TTGTT------CTTG-C-A-AAGGTCCTGTA-TGCTGTTGATT---TC----ATT--TTTTTCC--GAACGTACTTTGATG--TTA-----TGTGAG---AGAAAAC-CTCATGCTTG----------TTTTGTTAT--TTT----------TTTGTTCCGTATCGGATAA-TCAGATA-ATCATAATGTGC-CACTAAGAT-TTT
gi|23 : A-C-A-AGAGTTTTATA-GGCCATAGACT---TT----AAA--TCTC-CT--GAATGTACGTTTATA--TTT-----TTTCTT---AAAAATA-CTAATGTTTGATTTGC-TTATTTGGTAAT--GTTGTTGATGTG-TGTGTTCCAT----GTTCAGTCCTCT
gi|11 : agcgtgctgtccggtgcagA-C-A-AGAGTTGTATA-GACCATGAACT---TT----AAA--TCTT-CT--GAATGTATTCTGATA--TTT-----CCTCTT---AAAACCCCTTATTGTT-GATTT-T-CTTTATAGTAAT--GTTGTTGATGTG-TCTGTTCCAT----GTTAAATCCTCTGCA--ATAT--TGA-CACCTTGGTATTTTGCacaagagagatacctaggtacatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|33 : TCATATA-TGTGGTAACCT---TG----AGT----GA-TTCAGAATGGACTATGATA--ACA-----TTTCTGCTTAGGAATC-CTAGTTTTTGATTTGTGTTTTTTCGTAATGCATTTTTTATGTG---TGTTCCGT----G-TGAGTTTTCTagaggaggttgactctagtttagtgttaagaacgatatgtttctttgaccgtgcgatgtgtttaacattttgacaggttaagctccatgtcctactgtttcccctctgttcaagagtgcacaagtatgtctgtagtgcttgtgcttgttgttgttaaaatgattgcaaggtatatggcagtgtcgtctgcaaataagcggacctgagattttaccttggaggg
gi|15 : agtggactatagtttaagggaaagaGTGAT--GTTGTTGATGTG-TGTGTTCCAT----GTTCAGTCCTCTGCA--ATAC--TGA-CACCTAGGTATTTTGC
14 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): TCAAATTGTCAAACCCCTGCTGGGGACTCAGGCGTGCGTCCTCATGCCGACAAAGGTTGTTGAAGTAGTATTTAAAAATGTATTTTAATGTCAGGTTTAAACAAACATACTATGAATCTATGGTAAGATAAATGTATTCGACTCTGCTTCCATATTAAGCACTATAGGGATGTCAGGAGCTGGTGATAGTTAGCGGAATACTGTTCTGAGGGCGGGAGATAAGAATATTAATAGTGAGTGGTTGGGCCAATTAAATTGAAAGCTAGTGGGTGTGAATGTCGGCATCGACTGTTCGTCCATTCCATATAGTCTTCCAGAGGGACAGCTACAAGGTTATTTGTAATCTTGTAACATGGGAGAGCCAACACGTCTTTGAATCTAGTCTTCTCCAATGGAGAGACTGAAGAATCTCAATGACGCACCTGGTCTATCTGTTGTCATATTTTGCCCAACCTAT
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTGTCTTCCGTGAATGCCAAACTTTTATTGGTGATCTAGGCATGCATAGTATTTGAAAATATAGTAAAATAAAATTGAAAGAAACAAAGAAGTTTCGGTTATTAGGTTTAGAAAAGAAAACACTATGAAAATATGACAAGGGATTTTCTTGTTTATTCTGAGATGTGTTCAGTTCTTGTGATTGTAGAATTGAACTGTTCTGTGAGGTAATATAGGGATATCAGAGCTAATGAATTCCAGTCAAAGACTGTTATTGGGAAA
Unaligned ( gi|25 ): TATCTATCTTCCGTTAATACCAAACCCTCTGGGGACCTAGGCATGCGTAATCATACCGACAAAGACTGATAGTATTTAAAAATACATTAGAAACAATTTAAAAGAAACATTGAAGTTTTAAATGCTAGGTTTAAAAATAAAAACATGAATTTATGGCAAGATGTCCTGACTGCCCAGTGCTGGACAGCCTCGATCTGGTTTATGGCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAG
Unaligned ( gi|28 ): CATGTCTCTAAAATAATCTATCTATCGATGCAAAACCCCTTTTAGGGACCCAGGCATGCGTAGTCATACCGACAAAGACTGTTAGTTTTTAAAACTATATTAACAAGATGTTTAAAAGAAACAGTGATGTTTCGGTTGTTAGGTTTAAAAATAAAAACCTACTATAAATTTATGGTGAAATATGTTCAATTCTGCAGACTTCAGAATTGAACTGTT
Unaligned ( gi|32 ): TCTGCCTTAGTTCTAATTGAACTGTTCTGTGGTTGTAAACAGGGGATATATGAAGCTAATGAATTCCAGTGAAATACTGTTCTGGGGGAAGCGAGATTTGTTATAGTCACTGGTTGCATCAATTAATTTGAAAGTGAGTGTGATTGTCGGCA
Unaligned ( gi|39 ): AATGTGTTGTGTTGATGTGTGTGTTCCATGTAAAGTCCTCTGCAATAGTGATGCCTAGGTACATTTACATAGGAGGTAGTCTCTAGTTTAGCATTGTGTAAGCAATGTGTTGTGTTGATGTGTGT
Unaligned ( gi|40 ): AGTAATGTGTTGTGTTGATGTGTGTGTTCCATGTTAAGTTCTCTACAATAGTGATGCCTAGGTACATTTACAGAGGAGGTAGTCTCTNNNNNNNNNNGTAAGCAATGTGTTGTGTTGATGTGTGT
Unaligned ( gi|45 ): ATGTCTGTTCGTCAATGTCATGTACGTAGTCGTCTGGAGGCAGATAGCTACAAGATCATTTGTTATCTTGGAGCATGGGGAGTCGG
Unaligned ( gi|46 ): ATTTAGTCAAACCCCTGCTGGGGACCTAGACTCAACCACAAGTGTTTATATATTGAAATAATATGGAAGTAACAATTAAGATGTT
Unaligned ( gi|47 ): AATGTGTTGTGTTGATGTGTGTGTTCCATGTGAAATTCTCTACAATAGTGATGCCTAGGTACATTTACAGAGAAGTCTGTTT
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGAGACCTAGAATTCGCATTTTCGACTGACGTATCTATAAGCGTCATACTTGCTAAAACGGTGTCAGTATGA
Unaligned ( gi|50 ): TGTTGGGAATGGGACTGATTCTAATTTAGTGTTATGAAGAATGTATGAGGTGTTGATATTTTTTTACTT
Unaligned ( gi|51 ): ATATGTTGCGGATTTGACTGAATCTAATTTCGCGTTATGGAGAATGAAGGAGGTGTTGAT
Unaligned ( gi|55 ): GGTTTATCTGCCATTTAGTCAAACCCCTGCTGAGAACCT
Alignments
lowQualScore : 11111 111 111 111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 11111111 1111111 1111 1 111 1111 11 111111111 111111 111111111111 111 1111 22222 111111111 11111 11111 2222222222
lowQualScore : 1 22222 3 5555555 1 222 1 22 777 333 2 2 555 111 55 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 4444444 4444 55555 1 333 4 2 666 2 33 00000 88888888 999999 5555555 0 2 2 444 777777 22 1 2 2 2 2 33 99999999999 3 0 44 44 1 55 9999 0 44 0000 3 555 555 33 0 2 6 2 1 2 55 2 777 2 0 000 1 2 0 777777777 33 3 0 333 888 77777777777777777 2 33 1 33 1 1111 1 1 3 888 2 3 3 2 2 0 2 11 33 444 111111111 4 1 999999 666 22 2 6 3 33 444444444444 0 33 000 444 2 9999 6 55 888 3 2 0 1 222 2 0 2 2222 2 22222 1 1 666 4 44 222222222 2 55 1 4 22 2 2 55 33 2 555 33 2 2 999 3 6666 1 2 33333 4 0 33 66666 0 333 1 4444444444 22 1
lowQualScore : . ..... . ....... . ... . .. ... ... . . ... ... .. .................................................................. . ....... .... ..... . ... . . ... . .. ..... ........ ...... ....... . . . ... ...... .. . . . . . .. ........... . . .. .. . .. .... . .. .... . ... ... .. . . . . . . .. . ... . . ... . . . ......... .. . . ... ... ................. . .. . .. . .... . . . ... . . . . . . . .. .. ... ......... . . ...... ... .. . . . .. ............ . .. ... ... . .... . .. ... . . . . ... . . . .... . ..... . . ... . .. ......... . .. . . .. . . .. .. . ... .. . . ... . .... . . ..... . . .. ..... . ... . .......... .. .
lowQualScore : 0 22222 6 9999999 8 333 0 66 999 777 1 1 888 999 88 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 2222222 5555 33333 0 999 4 2 999 2 11 88888 99999999 333333 8888888 3 4 5 000 222222 99 5 2 5 4 9 99 11111111111 1 3 66 88 2 00 9999 2 22 2222 1 000 111 55 8 9 0 5 0 5 99 5 777 2 1 888 6 4 2 111111111 44 8 2 888 888 22222222222222222 7 77 7 77 1 4444 1 0 6 111 1 3 2 1 1 9 5 66 44 222 888888888 4 1 666666 444 22 5 4 0 44 222222222222 1 44 666 444 4 1111 4 55 333 0 9 4 0 666 7 3 7 8888 0 44444 0 0 555 0 22 333333333 2 22 0 8 11 0 9 33 00 9 000 99 1 1 666 1 5555 0 5 55555 9 4 99 66666 9 999 6 7777777777 66 0
consensus : CTATCTNCCAT-TA-A-GT-------CAAACCCC-TNCCGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGATA---A-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATACTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTC--TGTAGGCCAGNGAATG-G-GA---TA-GAC---G----A---C-T-TGTTC--TTGTATTNGG-GATNANGTAATC-TTCNGGTGGGATNGCNACAAGGTTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG-----TCT-CTGGTCAATACGNCTGAG-G-TCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGNC-CATAGTCGTGTNTT---GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTT-GTCCGATGNCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANAT-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
Reference ( family-863 ) : CTATCTNCCAN-TA-A-GT-------CAAACCCC-TCNCGGGGACNTA--GACT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACTGACA--A--A--G---G-------------TNA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGANA---A-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GGAGA-A--A-GAATACTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTC--TGTAGGCCAGAGAATG-G-GA---TA-GAC---G----A---C-T-TGTTC--TTGTATTNGG-GATNAGGTAANN-TTCNGGTGGGATNGCNACNAGGTTATGGGTGATGTTATA-AAGCATA--AC--CAG-----TCN-CTGGTCAATACGACGCAG-G-TCAAGTCGTCTCC-AGTTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCG--GTGACA---CTGGAAGTGCGNC-CATAGTCGTGCNTT---GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGNCTC-AATTT-GTCCGATGNCAGCGCCGGTATGNGGNGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGNGTCNTATATGCCGTNGACTTTAGTTTNT-C---TGA--ATGNACTTTTATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--CTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TNTGTTCCATGTTAAGTCCTCTG-A--ANATTGTGACNCCNAGATATTTTGCT
gi|1 : CTAACTGCCAT-TT-A-TT-------TAAACCCC-TGCTGGGGACCTA--TACT--GACTGAGCG-C-G---TCA--CTGACA--AGAA--T---G-------------TTA------AT--ATCAA-------A---A--T---ACAGTTGAAA-G---G---TA----AA-----AG-GATG---ACT-GCA---CG-G--GG----TTA-------GT---T--TTTAAA-A--G----A-TTAAAA----------------------TAG-AG----ACATGTTCAA-CTCGACTTATGGCCGAGCT-GAAC--TCTGGCAG----AGTTGTGC---C-GCTACAGATG--GTG-----CCAG--GG------CA-----TTTCA--GCGGACGAT-GGTTC-TCGG-GAAGA-A--A-AAGTACTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGAC--AATAGGATAATGAATG-T-GA---CG-ATC---A----G---C-T-AGGTC--TGGTGTTGAG-GGTTATGTAAC----------------CCACTAAATATTGGGTAATGCTGTA-AAACATT--AC--TAG-----CTT-CTTATCAATCCTTCTGAG-C-TCAAG----CTCC-AATGTAAGGAG-----T-----TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCG-----------TTCTTT---AACCAACTGAGCAGCTCGTATCTGTA-AGTCTC-ATATT-GGCAAATGAGTGTGTCGGTATGGGAAGACCAGACAGGGTGGCAGTATTCGAA--TTAA---------GGCTTAACTACAGTATTATATGCAGTAGCTTTTAGTGCTT-G---TGA--ATGAACATTTATG---TT-TCTTC----TCAGGAATCCTTAAGTTTGGTTTGC--CTTTTCAGTGCTA--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGATAAG---TCTG----AGATTGTGATTCTGAAATGTGTTGC
gi|10 : tctatAGGTTATGGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG-----TCA-TTGATCAATACGAC-CGG-GTTCAAGTCGTCTCC-AGTTTA--ATG-----TGG---TCAACAT-ACTG--GTGACA---CTGGAAGTGCGTTACATAATCACGTATT---GTCCAGC-GAGCTGCCAGTCTCTGCATGGATTC-AATTT-GTCCGATCCCAGCACTAGTGTGTGAGGACCAGACAGAGGAGTAGTACTCAAG--TTGA---------G---------GCGTC--ACATGCCATGGATTAGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATG---TT-CCGTC----TG---AATCCTAGTGTTTCTTTTGC--TTTGTT--TGATG--T----CGTCTATGTG-TTTGTTCCATGTTATGTTTTTTG----AGATTGTGATTACTTAATATTTTGagatatgactgagtcttatttagtgttatggagaatgtaggcggcgttgatgttttttttacttgaatgatctggcatgtggatgggttgaagtgcatgtctcactttgtttcc
gi|11 : tACAAGAGTTGTATAGACCATGAACTTTAAATCTT-C---TGA--ATGTATTCTGATA---TT-TCCTC----TTAAAACCCCTTATTGTTGATTT-T--CTTTATAGTAATG--T----TGTTGATGTG-TCTGTTCCATGTTAAATCCTCTGCA--ATAT--TGACACCTTGGTATTTTGCatgatgaggttatttctaatgtagtg
gi|12 : GTCAGTGGTTG-CGTC----A----ATTAGTT--TGAAAGCAAGCGAGTG-T-GAATGTA-GG----G----ATTGC-C-TGTTCGTCTGTGTC-----ATT---TAGTC-TTCTAGTTGAGTAGCTACAAGGCCATTTGTGATCTTGTA-A--TATA--AGGACAG-----TTGGCTG-TCTATACGTCTTTG-G-TCTAGTCTACT-----------GA--------------AGCAT-CTCA--GTAACG---CTACTGGTCCATC-TGTAGTTATGGTTT---GCCCAGC-GTGTTGCATGGCAATTGACACCCTC-CACCG-GTTTTATGGCAATCTTAATATAAGGTGACCAGACACTTGAACAGTACTCTAA--TTGA---------GGTTGGACAAAA------------------------TCTT-C---TGA--ATGTACCTTTATA---GT-TCTTC----ATAAAAACACTACTGTTTGGTTTGagaggaggttgactctagtttagtgttaagaacgatatgtttctttgaccgtgcgatgtgtttaacattttgacaggttaagctccatgtcctactgtttcccctctgttcaagagtgcacaagtatgtctgtagtgcttgtgcttgttgttgttaaaatgattgcaaggtatatggcagtgtcgtctgcaaataagcggacctgagattttaccttggaggg
gi|13 : TATCTCTCACATA-A--C-------CAAACCGC-TTTTGAGGACATA--GGCTTTGAC---GTG-C-T---TCA-ACTGACA--A--A--G-------------------------------------------------------------------------------------AGAGAAA---A-T-GTA---TA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GAAGGTTTCTACTTCTAG-GGGGGCACATATTCAA-CCTGGCACACTGCCTGTCT-GAACAAA------G----A-TTGGGCT--A-AAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGGG---TTTTA--TTGGACAAT-TGTGT-G-AG-GG-GA-T--A-TTTTTTTTGTAAAAGTCAGAATTTGATTTGTTTTG----ATTTGTC--TGAAGGTCAGATACTG-G-GA---TC-TAT---G----A---C-T-TGTTC--TTATATTAGC-GATAAG
gi|14 : C-G-GG-GAAGA-A--A-GAATGCTCATAATAATAAGCTCTGG-TCTG----A----ATTTAGC--GATAG----GATAAT--G-AA---TATGAC---GATCTA---C-T-AGGTC--TAGTGTTTAG-GGTTATATAATC-TTCTGGTAGTATCGCCACGAGATAATGGGTAATACTGTA-AAACATG--CA--TAG-----CCT-CTGATCAAACCTTCTGAG-G-TCAAGCGGTCTCCAAATGTA--GGG-----AGGAGTTTAGCAT-TTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTG-CAAAGTCATGTTCA---ACCCACC-Gaa
gi|15 : ggcaggggctgcgccactacagatggtgccagggcatttcagtgattgatggttcGTGATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTGCA--ATAC--TGACACCTAGGTATTTTGC
gi|16 : -GG-GAAGA-AT-A-AAATA-TTATAAAAGTCAGAACATG-TTTG----A----ATTTGTC--TGTAGACCATCGAGTG-G-GA---TA---C---A----G---C-T-TGTTC--TTTTATTTGG-GATAAAGTATGT-TTAAGGT---------------TTATAGATCACACTATG-A----TA--GC--CAG-----TCG-CTCGTCAATATGACGGAG-C-TCAAGTTGCCTCC-AGTTTA--AAT-----TAG---TCAACAT-CTTG--TTGACA---ATGAAAGTGCGGC-AATAGTCCTG-----------A---GAGCAGCCCTTCTTTGTATGGACT------------------------GGAGTGTGGCGACCAGACAGGGGAGCAGTACTCGAG--CTGG---------Gagagtaggctgacgctagtttagtgttatgcaagtaatatgtggtgttattatgtttctttgactgtgtggggtgtataatttgacattttgacaagttaaactccatgtcccgctgtttttcccaatgttcaagagtgcataagtctgtctgtagtgtgtgtgattgttgtacatttgtgataacaaaataaacagcagtgtcatctgcaaataaccggaccaataaattaacctggggagg
gi|17 : tga-A-GT-------CAAACCCT-T-GCGAGGATATATAGGCTTTGAC---ACA-T-G---TCA-ACTGACA--AGGA--G---A-------------GCA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GT--A---TA----AA-----AGAGATA---A-T-ATATA-CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAAA--CCGGGT------TTATAG-GGGTACATATGACCAA-CCTAGCACACTGTCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAAACA--ATAT--TTTGAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGG-TAATTAGTGT-GAGG-GGAGA-A--A-GAAAAGTTGTAAAAGTCAGA--------------------TTTGT-----TAGACCAGAGAATG-G-GA---aagtgtac
gi|18 : acatGGATAGCTACATGGTCATTTGTGATCTTGTA-A--CATAGGAA--GAG-----TCTGCTG-TCTATACGTCTCTG-G-TCTAGTCTTCTCC-A----A--GAC-----TG-----TAGCAT-CTCA--GTGACA---CTACTCGTTCATC-TGTAATCGTGTTTT---ACCCAGC-GTTTTGCCTGGCACTGGACGCCTTC-AACTTAGTTT-ATGGCAG------TATAAGGTTACCAGACACTTGAGCTGTACTCCAG--TTGA---------GGACGGACAAGAG
gi|2 : catggagtgttcatccatttattaagcagttatattgatcatctataaCTATCTTCCAA-TA-A-GT-------CAAACCCA-TCGTGAGGACATA--GACTA-GAT---GCA-C-G---TCA-ACTGACA--A--A--GT--G-------------TGA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGGGAGA---A-A-ATA---CT-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--AC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACACATGTTCAA-CCTGGCAGTCTACGTGGCT-GAAC--T------G----A-TTGGCTC--C-GAGAGAGGCA--ATAT--TCTCAG--GG---AG-TTAG---TCCCA--GTGGACAAT-AGTGT-G-GG-GGAGA-A--ATGAATACTTATAAAAATCTGAGCTTG-TTTG----G----ATTTGTC--TATATGCCATAGAGTG-G-GA---TA-GAT---G----A---C-C-TGTCC--TTTTATTTGG-GATTAGATAGGG-TTCAGTTGGGATAGCAACTAGGTTATGGACGATGTTATA-AAGCATA--AC--CAG-----TCT-TTGGTCAATAGGATGCAG-G-TCAAGTCATCTCT-AGTTTA--AAG-----TGG---TCAACAT-ATCA--GTAACA---CTGGAGGTGCGGC-CATAGATGTGCATT---GCCCAGC-AAGCAGCCTTTCTCTGCACAGACTC-AATTT-GTCCGATGCCAACGCTGGTGTGTGGTGACCAGACATAGGAGCAGTACTCTAG--CTTG---------GGTCTCACAAGTGTCATGTATGCAGTAGATTTTAGTTTGA-C---TGA--GTGAGCTTTGATG---TT-GTGTC----TGAGGAATCTTAGTGTTTGATTTGT--TTTTTTTGTTATA--T----TATCTGTGTG-TTTGTTCCATGATAAGTCATCTG-ATTATATTGTGACACCAAGATATTTTGCT
gi|20 : ---TCAGCAT-GTCC--GAG-TA---CTAGAAGTGCGGA-CAAAGTC---CTTTTAAACCCATC-GATCAGCTCGCCTCTGTACAGCATC-TACTT-GGTAAATTTGTGTGTACGTACGGAGCGACCAAATAATGGAGCAGTATTCTAG--TTGGATGGGTAGAGGGCTAGCCAATGTCTTATGTGCAGTTGAATTTAGATTTT-C---TGA--ATGTACATATATG---TT-TCTTC----TGAGGAATCC---TGTTAGA---------TTTTTATCA---------TGTCGATGTG-AGTGTTCCATG
gi|21 : aatG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-AG-GGAAG-A--A-AAA-------AAAAGTCAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTC--TGTAGGCCAGAGAATG-G-GA---TA-GAC---G----A---C-G-TGCTC--TTGTAat
gi|22 : taaaagatataatacaaaatgtagttattttaactacttttaccagtgaaggtcacacttgcaggttcacactcactctctcgtttattcgaagattgaacgaatgtgaatgataaattcactgattttagtttaaatccaatgagtgcatgac-A-GC-------CAAACTCC-TCGCAAGGACATA--AGTTTTGAC---GCG-T-G---TCA-TCTGACA--A--A--GAG-G-------------GAA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGATG---A-A-ATA---CA-G--G-----TTATTGTATTGT---A--TTTATA-A--GC-AGG-TTAAAA-CGGA--GCAGAT------ATCTAG-GGG--TACATGTTCAA-TCTTGCACATTGCCTGTCG-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAG---------------AA--GG---AG-TGAG---TTCCG--CTGGACAAT-AGTGC-G-AGTGAAGA-A--A-GAAAACTT
gi|23 : ccatatGACAAGAGTTTTATAGGCCATAGACTTTAAATCTC-C---TGA--ATGTACGTTTATA---TT-TTTTC----TTAAAAATACTAATGTTTGATTTGC--TTATTTGGTAATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTACA--AGA--GAGATACCTAGGTA
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcaGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTcatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|24 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagagatacctaggtacatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaaG--GG---AG-TGAG---CTTCAAATT--ACAAT-GGTGC-C-AG-CAAGA-A--A----T-CTTG-AAAA---------TA-CCTG----G----ATTTGAC--AGTAAACCATGCAATG-T-GA---TA-GTC---A----A---C-T-GGGTC--TTCTATTGGG-GATAAGATCATA-TTTAGGTGGGATGACAACATGGGTATGCATGATATTATGTAAGT-TA--AC--TGG-----AGT-CTGGTCAAGATGATGGAG------AATGG----------TG--GAT-----AGG---TCAG-ATAATCT--GTAACA---TTGGAAATATGGT-CATAGTTATGt
gi|25 : CTATCTTCCGT-TA-ATAC-------CAAACCC--TCT-GGGGACCTA--GGC----AT---GCG-T-AA--TCATACCGACA--A--A--G---A-------------CTG------A---T--AG-------T---ATTT---A------AAA-AT--A---CA----TT-----AGAAACA---A-T-TTA---AA-A--GAAACATT--------GA---AGTTTTAAA-T--GCTAGGTTTAAAAATAAA--ga
gi|25 : tatCTGGACAGCCTC-GATCT-GGTTTATGGCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgctggacagcctcgatctggtttatggcagtctcagtatggggtgaccag
gi|26 : tatctatcttccgttaataccaaaccctctggggacctaggcatgcgtaatcataccgacaaagactgatagtatttaaaaatacattagaaacaatttaaaagaaacattgaagttttaaatgctaggtttaaaaataaaaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgTCTAG--AGCC-AG-CGCA---TTCCA--GTGGACAAA-TGTCC-TTGG-GAAGA-A--A-GAGTACTTATAACAATCAGAACT-----------G----ATATGACAAGGTAGG--------TG-ACGA---T----C---T----A---C-TATG-TC--TAGTATTGCG-GATTGTGT-ATT-TTCTGGTGG
gi|27 : ctcgcaagggcggtgccgctacaCTTTCTGCCAT-TT-A-GT-------CAAACCCC-TGCTGGGGACCTA--GACT--GAC---ACT-C-A---TC--ACTGACAAGA--A--G---G-------------TTA------AT--AT-AG-------A---A------A------ACA-GTTGA---TATGTTAA-----AAGGATG---ACT-GTA---CA-G--GTT---TT--------GT---T--TTTAAA-------AGA-TTAAAAATAGC--CCAGGT------TTCTAA-GGGGAGACATGTTCAA-CTCGACTTACAGCCAAGCT-TAAC--T------tacaacacgaacattctctgatcaatcctcccgagtttcacgcggtctccaatgtagagagttgttgcat
gi|28 : tCTATCTATCGA-T----GC-------AAAACCCC-TTTTAGGGACCCA--GGC----AT---GCG-TAG---TCATACCGACA--A--A--GACTG-------------TTAGTTTTTA---A--AACTATATTA---A--C---A------AGATGT--T---TA----AA-----AGAAACAGTGA-T-GTT---TC-G--G-----TT--------GTTAGG--TTTAAA-A--A-------TAAAAACCTACTATAAAT------T--TAT-GGTGAAATATGTTCAA-TTCTGCAGACT-----TCA-GAAT--T------G----A-ctgacaagtgttgtgccactacagatggtgcca
gi|29 : catgtctctaaaataatT--GAC---GCA-C-G---TCA-ACCAATA--A--A--GA--G-------------AGA------A---A--AT-------A---T--T---A------AAA-GC--A---TA----AACCGAAGGAGATC---A-T-TTA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAA-CAGA--GCAGGT------TTCTAT-GGGGACACACGTTCAG-CCTGGCATACCGTCTGT------C--T------A----A-TCGGGCT--C-AAGAGAGATA--CTAA--ATCCCG--GA---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACactgtt
gi|3 : ttCTATCTTCCAC-AT-G-GC-------CAAACCCC-TCGCGAGGACATA--GACTTTGAC---ATA-C-G---TCA-ACTGACA--A--AT-G---G-----------------------------AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGATA---A-T-ATA---CA-A--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAGAACAGA--GCAGGT------ATCTAA-GGGGTCACGTGTTTAA-CTTGGTGCACTGCCTGTCT-GAAC--T------A----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACA--ATGT--TTCCAG--AT---AT-TGAG---TTCTG--CTGAACAAT-AATTC-GAGG-GAAGA-A--A-GAA-------AAAAGTAAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTA--TGTAGGCCAGAGAATG-G-GA---TA-TAC---G----A---C-T-AGGTC----------------AAGGAACTT-TTCAAGTGGAGTTGCGACTAGTTTATGGGTGGTGTAATA-GAGCTTG--AC--CAG-----TCG-TTGGTCAACACGACTACG-G-TCAAGCCGCCTCC-AGTTTA--ATA-----TTG---TCAACAT-ATTG--GTGACA---CTGAAAGTGTGTC-CATAGTCGAGCATT---GCCAAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGTATATACTC-AATTT-GTCCGATTCCAGCATTCATGTTTGGGGACCAGCCAGAGAATCAGTACTGAAG--CTGG---------GGTCTCATAAGTGTCAGGTATGTCATGGATTTGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATA---TT-TCCTC----TGAGCAATCCTAGTGTTTGATTTGC--TTTCTTTGTGATG--T-----------------TGTTCCATGTTAAGT-CTATG-G--AGATTGGGATTCCAAAATATTTTGCT
gi|30 : GACCAGACAGAGTAGCAATACTATAGAATTGT-----------TCTTGCAAAGGTCCTGTATGCTGTTGATTTCATTTTTTTC---CGA--ACGTACTTTGATG---TT-ATGTG----AGAGAAAACCTCATGCTTGTTTTGTTATTTTTTTGTaatgagactgtttctaatgaa
gi|31 : G-------A---A--T---A------AAC-GT--G---TT----AA-----AGACAAG---A-T-ATG---TA-G--A-----GT--------GT---A--TT--AA-A--AC-AGG-TTTAAA-CAGA--ACATGC------TTCTAG-GGAGACACGTGTTCTA-TCTGGTAAACAGCCTGGTT-GAAC--T------G----A-AGGGCCT--C-TAGtccgtatcggataatcagataatcataatgtgccactaagatttt
gi|33 : AAAGATCATATATGTGGTAACCTTGAGTGATT-C---AGA--ATGGACTATGATAACATT-TCTGC----TTAGGAATCCTAGTTTTTGATTTGTG-TTTTTTCGTAATGCAT----TTTTTATGTG---TGTTCCGTG-TGAGTTTTCTtatctccatattaacggtttactgcactgttaata
gi|34 : agtggactatagtttaagggCTATCTGCCAT-TA-A-GT-------CAAACCCC-TGCTTGAGACCTA--AACT--GAC---ATG-T-G---TCA--CTGACA--A--G-----------------------------A---A--AGTT-----A---A--T---A------------------TA----AA-----ACAGTTG---A-T-A--------G--G-----TTTAAATG--GT------TTTAAA--------GA-TTAAAAATAGA--GCAGGT------TTCTAA-GGATTGACATGTCTAA-CTC
gi|35 : tatCTGGACAGCCTC-GATCT-GGTTTATGGCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGACACTTGAGCAGTACTC------TGG---------GGGCTGACAAGAGTTTTATAGTTCATAGACTTTA-------------A--AT----TTTGATA---TT-TCTTC----TTAAAAACCCCAATGTTTAATTTt
gi|36 : agtgATGTTA------CATA--AC--CAG-----TCT-CCGGTAAAT-------------CA---TGTCTCA-AATTTA--GAT-----TGG---TCAGCAT-ATATATGTGACA---CTGAAAGTGCGAC-CATAGTCACGTATC---GTCCTTC-GAGCAGCTCGTCCCTAGA
gi|37 : gggatgagagtaatttcCTTCCA--TATA-GC-------CAAACCCC-TCG-GGAGGCTT------T--GAC---ATG-T-G---TCC-ACTGACA--A--A--G-------------------A------G---A--AA-------A---A--T---A----------GC--A---TA----AA-----AGAGATA---A-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--ATTAtaat
gi|38 : TCTGCCAT-CT-A-GT-------CAAAGCCC-TACTGGGGACTTA--GACA--TAC---ATG-C-G---TC--ACTGACA--A--GACG---A-------------TTA------A---T--AT-------A---A------A------AAA-AC--A---tattgctgacattaaacaaggttttatagtcggtgcatgtt
gi|39 : atctatcGTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTAAAGTCCTCTGCA--ATA--GTGATGCCTAGGTAagtgataagttaaaaagatgtctgttcagggttagtttttaaat
gi|4 : aatCTATCTTATGT-TA-ATGT-------CAAACCCC-TTTTGGGGACCTA--GGC----AT---GTGTC-G---CCATACCAACA--A--A--G---ACTTAATTAGTTTTTTA------A---A--AA-------ATATA--TTAAA------AAA-GA--AATTTA----AA-----AGAAATA---G-TGATGTTTCA-GTTG-----TT--------AG---G--TTTAAA-A--A-------TAAAAACATA--CTATGA------ATTTAT-GATGAGATATGTTCAA-TTCTGCTGATT-TCTGTATCAAAC--T------GTTCTA-T--GGTTAAT-GATATAGG-G--GTAT-----CAG--AACCTAA-TGAA---TTCCA--ATGAAAAAC-TGTTC-A-GG-GAAAA-ACGA-GAAT--TTGTAAAAGTCAGTGGTGG-TGTT----A----ATTAGT---TGAAAGCAAGTGAATGTG-AA---T--GTC---G----G---GAT-TGTCT--GTTTGTCAGT-G-TTATGTAATC-TTCTATGGGGATAGCTACAAGGTCATTGGTGATTTTGTA-ACACAGA--GA--GAGAGAGTTGG-CTG-T--ATACATCTTTG-G-TCTAGTCTTTTCC-ACTGGA--GAGAGTACTGA-----AGCAT-CTTA--GTAATG---CTACTGGTCTGTC-TATAGTCTTGTCTT---GCCCAGT-GTGCTGCCCGGCATTGGACGTCTTC-AACCT-GATTTATGGCAGTCTCTGTATAAGGTGACCGTACATTTGAACGGTACTCCAA--TTGA---------GAGCAGACAAGAGTTTTATATGCCATGGACTTTAAGTCTT-C---TGG--ATGTACCTATATGTA-TT-TCTTC----TTATAAATCCTAATATTTGGTTTcatttacataggaggtagtctctagtttagcattgtgtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|40 : atGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTTCTCT--A--CAATAGTGATGCCTAGGTA
gi|41 : aACGCCCTC-AACCT-GGTTTATGGCAGCCTCAGTATAAGGTGACCAGACACTTGAGCAGTGCTCCAG--TTTA---------GAGCGGACACGAGTTTTATAGGCCATGGACTTTAAATCTT-C---TGA--Acatttacagaggaggtagtctctnnnnnnnnnngtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|42 : agTCTAT-GGGGACACATGATCAAACCTGGCACACTGCCAGTTT-AAAG--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACAATATAT--TTTCAG--GG----G-CAAG---TTTCA--CTGGACATT-AGTAT-GAGG-GAAGA-A--T-GAAAACTTaatgtata
gi|43 : -------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGAGA---A-T-ATA---CA-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A---C-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACATATGTTCA
gi|44 : taTATCTTCCACATA-C-GTGACATAGCAAACTCCACCACAAGGACATA--GGCTTTGAG---GTG-T-G---TCA-ACTGACA--G--A--G---A-------------GAA------A---A--AG-------A---A--A---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AAAtggtgttccgctttgcgcatcccaactg
gi|46 : -A-GT-------CAAACCCC-TGCTGGGGACCTA--GACT--a
gi|47 : atttGTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTGAAATTCTCT--A--CAATAGTGATGCCTAGGTAcaaccacaagtgtttatatattgaaataatatggaagtaacaattaagatgtt
gi|48 : aatG-TTCG----G----ATTTGTC--TGTAGGCCAGAAAGCA-G-GA---TA-GAC---G----C---C-T-TGTTT--TTGTAcatttacagagaagtctgttt
gi|5 : agaaaataaaataatataaaataaTATCTTCCAA-TA-A-GT-------CAAACATC-TGCTGGAGATCTA--GACG--AAC---GCA-C-G---TC--ACTGACAATA--A--T---G-------------TTG------ATTTA--AG-------A---A--C---AGAGTTTAAA-TT--G---TA----AA-----AGAATGA---A-T-GTA---AAGG--G-----TT--------AT---C--GTTAAATATTAT-ACG-TC--ACACAGA--GTAGGT------TTCCAA-GAAGAGACATGTTTAA-CTCGGCaa
gi|5 : ctatcagtgTATTGCG-GGTTATATTATT-TGCTGGTGGTATCGCTACAAGATAATGGATGATGCTGTA-AAACATG--CC--AAG-----TC---TGACCCTTTCTCCGGAA-G-TCAAGCGGTCTAC-AACTTA--GGG-----AGT---TTAGGAA-ATCT--AGGACA---CTAGAATTGTGG---ATAATTCTGTATTTA-ACCTTTC-GAGCAGCTTATCTCTGCATCGCTTCTAACTG-GTTCtaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggtggtatcgctacaagataatggatgatgctgtaaaacatgccaagtctgaccctttctccggaagtcaagcggtctacaacttagggagtttaggaaatctaggacactagaattgtggataattctgtatttaacctttcgagcagcttatctctgcatcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|52 : ctatcagtgtatcttccaataagtcaaacatctgctggagatctagacgaacgcacgtcactgacaataatgttgatttaagaacagagtttaaattgtaaaagaatgaatgtaaagggttatcgttaaatattatacgtcacacagagtaggtttccaagaagagacatgtttaactcggctaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatcCCATCTTCCATATATA-GC-------CAAACCCA-TCTCGAGGACATA--GGCT--atttgtgtgccgg
gi|53 : aCTATCTGCCAT-TT-A-GT-------CAAACTCC-TGCTGGGGACCTA--GACT--ttga
gi|54 : TTG-TTTG----G----ATTTGTC--TGTGGGCC------------A---TA-GAC---G----A---C-T-TGTTC--T
gi|55 : gtTATCTGCCAT-TT-A-GT-------CAAACCCC-TGCTGAGAACCT
gi|56 : ggttTC-AATTT-GTCCAATGCTAACACTGGGGTGTGGTG
gi|6 : -GT-------CAAACCCC-TGCTGGGGACTCA--------GGC---GTG-C-GTCCTCATGCCGACA--A--A--G---G-------------T
gi|6 : tcaaattG-GGAGATA--A-GAATATT---AATAGTGAG----TG-GTTG----GGCCAATTAAAT--TGAAAGCTAGTGGGTG-T-GAATGTC-GGCATCG----A---C-T--GTTC--GTCCATTC------CATATAGTC-TTCCAGAGGGACAGCTACAAGGTTATTTGTAATCTTGTA-A--CATG--G---GAG-----------AGCCAACACGTCTTTGAA-TCTAGTCTTCTCC-AATGGA--GAGAC---TGA-----AGAAT-CTCA--ATGACGCACCTG---GTCTATC-TGTTGTCATATTTT---GCCCAAC-tgttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgagggcgggagataagaatattaatagtgagtggttgggccaattaaattgaaagctagtgggtgtgaatgtcggcatcgactgttcgtccattccatatagtcttccagagggacagctacaaggttatttgtaatcttgtaacatgggagagccaacacgtctttgaatctagtcttctccaatggagagactgaagaatctcaatgacgcacctggtctatctgttgtcatattttgcccaacctat
gi|7 : tcaaattgtcaaacccctgctggggactcaggcgtgcgtcctcatgccgacaaaggttgttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgagggcATCTTCCAC-AT-A-GC-------CAAACCAC-TTGCAAGGACATA--GGCTTTGAC---ACA-C-A---TCC-ACTGACA--A--A--GA--G-------------ACA------A---A--AGT------A---A--T---A------AAA-TC--A---TA----AA-----AGAGATA---A-T-AAA---CA-G--G-----TT--------GC---A--TTT---------------TAAAAACAG----CAGGT------TTCTAGTGGGGATGCATGTTCAA-CTGGGCACACTGCCTGTCT-GAAA--T------G----A-TTGCAAT--C-AAGAGAGATA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGT-GAGG-GAAGA-A--A-GGAAACTTGTAGAAGTTAGACTTTA-TTTG----G----ATTTGTC--TGTAGGCCAGGGAATG-G-GA---TA-GAT---G----A---C-T-TGTTC--TTGTAATAGT-GATAAGG-AAAT-TTCAGGTGGAATTGCAACTAGGTTAAAGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG-----TCG-CTGGTTAATACAACAAAG-A-GCAAGTCGTCTCC-ATTTTA--AGG-----TGG---TCAACAT-CTTA--GTctat
gi|8 : CTATCTGCCAT-TA-A-GT-------CAAACCCC-TGCTGGGGACCTA--GACT--GTC---GCG-C-G---TCT--CTGACA--AGAA--G---G-------------TTA------A----------------------T---A-----------C--A----A----AA-----ACAGTTG---A-T-A------G-G--G-----TTA-------GT------TTTCAA-A--AT-A---TTGAAAATAGA--ACAGGT------TTCTAA-GGAGAGACGTGTTCAA-TTCGGCTAACGGC-------GAAC--T------T----A-----ACT--CTGGCAGGGGCT--GTACCACTACAGAAGG---TGCCGGGGCATTCCA--GTGGACAAT-GGTTCTG-GG-GAAGA-A--G-GAGTACTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGa
gi|8 : atTGAATTTGGCGATATGATAATGATTCTGGTGGTATCGCCACAAAATAGTGGGTAATGCTGTA-ACACATG--AC--AAG-----CCT-CTGATCAATCCTTCTGAG-C-TCAAGCGGCCTCC-AATGAA--GGG-----CGT---TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTGTAATCGCGTG-CAAAATTGTGTTTG---GCCCgcgatatgataatgattctggtggtatcgccacaaaatagtgggtaatgctgtaacacatgacaagcctctgatcaatccttctgagctcaagcggcctccaatgaagggcgtttagcatgtctgagacactgtaatcgcgtgcaaaattgtgtttggccc
gi|9 : atctatctgccattaagtcaaacccctgctggggacctagactgtcgcgcgtctctgacaagaaggttaatacaaaaacagttgatagggttagttttcaaaatattgaaaatagaacaggtttctaaggagagacgtgttcaattcggctaacggcgaacttaactctggcaggggctgtaccactacagaaggtgccggggcattccagtggacaatggttctggggaagaaggagtacttataataatcagtactggtcTATGAG--ATGTTATG-TAACATA--AC--CAA-----TTT-CTGGTCAGTGCAAAGGAG-G-TCAAGGAGTCTCC-AATTTA--GAT-----TGT---TTAGCAT-ATCT--GCGACA---CTGGAAGTATAAC---TAGTCATGCATA---GTCCAGC--AATAGCCCGACTCTGGACATTTTC-AATTT-GTCCAATACAAGAAATTGCATTTAGAGACCAGACAT--GAGGAG--CTCTAT--GTGG---------AGCAT--TAAATGTCCTGTATGCTATTGA-TTCAGTTTTC-CAGTTTACTATGCGCTATGATG---TTGTTTTTTGTATGAGAAATCCT-ATGTTTGGTTT-T--CTTTTAAGTAAGG--T----AGTCAGTGTGATTAGTTCT-TGTTGAGTCATCTG-A--A-ATGGTGATTCTAAGATATTCAGCT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTGTCTTCCGTGAATGCCAAACTTTTATTGGTGATCTAGGCATGCATAGTATTTGAAAATATAGTAAAATAAAATTGAAAGAAACAAAGAAGTTTCGGTTATTAGGTTTAGAAAAGAAAACACTATGAAAATATGACAAGGGATTTTCTTGTTTATTCTGAGATGTGTTCAGTTCTTGTGATTGTAGAATTGAACTGTTCTGTGAGGTAATATAGGGATATCAGAGCTAATGAATTCCAGTCAAAGACTGTTATTGGGAAA
Unaligned ( gi|32 ): TCTGCCTTAGTTCTAATTGAACTGTTCTGTGGTTGTAAACAGGGGATATATGAAGCTAATGAATTCCAGTGAAATACTGTTCTGGGGGAAGCGAGATTTGTTATAGTCACTGGTTGCATCAATTAATTTGAAAGTGAGTGTGATTGTCGGCA
Unaligned ( gi|45 ): ATGTCTGTTCGTCAATGTCATGTACGTAGTCGTCTGGAGGCAGATAGCTACAAGATCATTTGTTATCTTGGAGCATGGGGAGTCGG
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGAGACCTAGAATTCGCATTTTCGACTGACGTATCTATAAGCGTCATACTTGCTAAAACGGTGTCAGTATGA
Unaligned ( gi|50 ): TGTTGGGAATGGGACTGATTCTAATTTAGTGTTATGAAGAATGTATGAGGTGTTGATATTTTTTTACTT
Unaligned ( gi|51 ): ATATGTTGCGGATTTGACTGAATCTAATTTCGCGTTATGGAGAATGAAGGAGGTGTTGAT
Alignments
lowQualScore : 1111 222 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 11111111 1111111 1111 1 11111111 111 1111111111 1111 111111111111 1111 11111 111111111 111 11111 2222222222
lowQualScore : 1 2 2222 3 5555555 6666 1 22 222 333 2 4 333 11 1 88 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 5555555 4444 55555 333 2 4 2 666 2 33 00000 88888888 999999 5555555 0 2 2 444 777777 22 1 2 2 2 2 33 99999999999 3 0 44 44 1 55 9999 0 44 0000 3 555 555 2 0 2 7 2 2 55 2 22222222 2 0 000 1 2 0 777777777 0 1 1 33 2222222222 444 666 1 1 4444 2 1 1 1 2 77 3 888 2 1 2 0 0 1 1111 33 3333 888888888888 2 1 33 44444 66 33 2 0 3 33 333333333333 0 33 444 444 2 4444 4 22 444 3 2 0 1 222 2 2 5555 2 77777 1 1 666 4 44 222222222 1 55 0 4 22 2 2 55 0 2 555 33 2 1 999 3 6666 1 2 444 4 0 33 66666 11 2 0 3333333333 1
lowQualScore : . . .... . ....... .... . .. ... ... . . ... .. . .. .................................................................. . ....... .... ..... ... . . . ... . .. ..... ........ ...... ....... . . . ... ...... .. . . . . . .. ........... . . .. .. . .. .... . .. .... . ... ... . . . . . . .. . ........ . . ... . . . ......... . . . .. .......... ... ... . . .... . . . . . .. . ... . . . . . . .... .. .... ............ . . .. ..... .. .. . . . .. ............ . .. ... ... . .... . .. ... . . . . ... . . .... . ..... . . ... . .. ......... . .. . . .. . . .. . . ... .. . . ... . .... . . ... . . .. ..... .. . . .......... .
lowQualScore : 0 0 5555 6 9999999 4444 7 66 666 555 0 0 555 22 2 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0000000 2222 00000 777 1 2 2 999 2 11 88888 99999999 333333 8888888 3 4 5 000 222222 99 5 2 5 4 9 99 11111111111 1 3 66 88 2 00 9999 2 22 2222 1 000 111 9 1 7 5 5 5 99 5 33333333 2 1 888 6 4 2 111111111 3 9 8 44 7777777777 777 555 7 1 0000 9 0 0 6 9 00 0 555 9 9 5 5 7 6 0000 22 7777 555555555555 4 9 55 77777 00 33 4 3 7 22 000000000000 1 44 222 444 4 6666 8 44 111 0 9 4 0 999 9 9 4444 1 00000 0 0 555 0 22 333333333 0 22 5 8 11 9 9 33 4 9 000 99 1 0 666 1 5555 0 5 222 9 4 99 66666 00 9 7 3333333333 0
consensus : CTATCTNCC-AT-TN-A-GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTT-GNTCGATGGCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
Reference ( family-863 ) : CTATCTNCC-AT-TA-A-GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCNGGTGG--GATNGCNACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGNC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTT-GTCCGATGNCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
gi|1 : CTAACTGCC-AT-TT-A-TT-------TAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--TACT--GACTGAGCG-C-G---TCA--CTGACA--AGAA--T---G-------------TTA------AT--ATCAA-------A---A--T---ACAGTTGAAA-G---G---TA----AA-----AG-GA---T-GACT-GCA---CG-G--GG----TTA-------GT---T--TTTAAA-A--G----A-TTAAAA----------------------TAG-AG----ACATGTTCAA-CTCGACTTATGGCCGAGCT-GAAC--TCTGGCAG----AGTTGTGC---C-GCTACAGATG--GTG-----CCAG--GG------CA-----TTTCA--GCGGACGAT-GGTTC-TCGG-GAAGA-A--A-AAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGACAATAGGATAATGAATG-TGA---CGAT---CAG---C-T-AGGTCTGGTGTTGAG-GGTTATGTAA-CC---------------CACTA-AATA-TT--GGGTAATGCTGTA-AAACATT--AC--TAG----C---TT-CTTATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAG----CTCC-AATGTAAGGAG-----T-----TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTT-C----------TTT--AACCAACTGAGCAGCTCGTATCTGTA-AGTCTC-ATATT-GGCAAATGAGTGTGTCGGTATGGGAAGACCAGACAGGGTGGCAGTATTCGAA--TTAA---------GGCTTAACTACAGTATTATATGCAGTAGCTTTTAGTGCTT-G---TGA--ATGAACATTTATG---TT-TCTTC----TCAGGAATCCTTAAGTTTGGTTTGC--CTTTTCAGTGCTA--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGATAAG---TCTG----AGATT-GTGATTCTGAAATGTGTTGC
gi|10 : tctatAGG-TTATGGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CA-TTGATCA-ATACGAC--CG-GG-TTCAAGTCGTCTCC-AGTTTA--ATG-----TGG---TCAACAT-ACTG--GTGACA---CTGGAAGTGCGTTACATAATCACGTATT--GTCCAGC-GAGCTGCCAGTCTCTGCATGGATTC-AATTT-GTCCGATCCCAGCACTAGTGTGTGAGGACCAGACAGAGGAGTAGTACTCAAG--TTGA---------GGC---------GTC--ACATGCCATGGATTAGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATG---TT-CCGTC----TG---AATCCTAGTGTTTCTTTTGC--TTTGTT--TGATG--T----CGTCTATGTG-TTTGTTCCATGTTATGTTTTTTG----AGATT-GTGATTACTTAATATTTTGagatatgactgagtcttatttagtgttatggagaatgtaggcggcgttgatgttttttttacttgaatgatctggcatgtggatgggttgaagtgcatgtctcactttgtttcc
gi|11 : tACAAGAGTTGTATAGACCATGAACTTTAAATCTT-C---TGA--ATGTATTCTGATA---TT-TCCTC----TTAAAACCCCTTATTGTTGATTTTC---TTTATAGTAATG--T----TGTTGATGTG-TCTGTTCCATGTTAAATCCTCTGCA--ATA-T--TGACACCTTGGTATTTTGCatgatgaggttatttctaatgtagtg
gi|12 : GTCAGTGGTTG-CGTC----A----ATTAGTTTGAAAGCAAGCGAGTG-TGAATGTAGG----GATTGC-C-TGTTC--GTCTGTG----TCATTTAG-TC-TTCTAGTTG--AGTAGCTACAAGG-CCATTTGTGATCTTGTA-A--TATA--AGGACAG----TTGGCT----GTCT-ATACGTC--TT-TG-GTCTAGTCTACT-----------GA--------------AGCAT-CTCA--GTAACG---CTACTGGTCCATC-TGTAGTTATGGTTT--GCCCAGC-GTGTTGCATGGCAATTGACACCCTC-CACCG-GTTTTATGGCAATCTTAATATAAGGTGACCAGACACTTGAACAGTACTCTAA--TTGA---------GGTTGGACAAAA------------------------TCTT-C---TGA--ATGTACCTTTATA---GT-TCTTC----ATAAAAACACTACTGTTTGGTTTGagaggaggttgactctagtttagtgttaagaacgatatgtttctttgaccgtgcgatgtgtttaacattttgacaggttaagctccatgtcctactgtttcccctctgttcaagagtgcacaagtatgtctgtagtgcttgtgcttgttgttgttaaaatgattgcaaggtatatggcagtgtcgtctgcaaataagcggacctgagattttaccttggaggg
gi|13 : TATCTCTC-ACATA-A--C-------CAAACCGCTTT-TGAGGACATA--GGCTTTGAC---GTG-C-T---TCA-ACTGACA--A--A--G-------------------------------------------------------------------------------------AGAGA---A-AA-T-GTA---TA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GAAGGTTTCTACTTCTAG-GGGGGCACATATTCAA-CCTGGCACACTGCCTGTCT-GAACAAA------G----A-TTGGGCT--A-AAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGGG---TTTTA--TTGGACAAT-TGTGT-G-AG-G----------GGATATTTTTTTTGTAAAAGTCAGAATTTGATTTGTTTTG----ATTTGTCTGAAGGTCAGATACTG-GGA---TCTA---TGA---C-T-TGTTCTTATATTAGC-GATAA
gi|14 : C-G-GG-GAAGA-A--A-GAATG-----CTCATAATAATAAGCTCTGG-TCTG----A----ATTTAGCGATAGGATAATGAATA-TGA---CGAT---CTA---C-T-AGGTCTAGTGTTTAG-GGTTATATAA-TC-TTCTGGTAG--TATCGCCACGAGA-TAATGGGTAATACTGTA-AAACATG--CA--TAG----C---CT-CTGATCA-AACCTTC--TG-AG-GTCAAGCGGTCTCCAAATGTA--GGG-----AGGAGTTTAGCAT-TTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTG-CAAAGTCATGTTCA--ACCCACC-Ggaa
gi|15 : ggcaggggctgcgccactacagatggtgccagggcatttcagtgattgatggttcGTGATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTGCA--ATA-C--TGACACCTAGGTATTTTGC
gi|16 : -GG-GAAGA-AT-A-AAATA------TTATAAAAGTCAGAACATG-TTTG----A----ATTTGTCTGTAGACCATCGAGTG-GGA---T--A---CAG---C-T-TGTTCTTTTATTTGG-GATAAAGT-A-TG-TT-----------------TAAGGTTTATAGATCACACTATG-----ATA--GC--CAG----T---CG-CTCGTCA-ATATGAC--GG-AG-CTCAAGTTGCCTCC-AGTTTA--AAT-----TAG---TCAACAT-CTTG--TTGACA---ATGAAAGTGCGGC-AATAGTCCTG----------A---GAGCAGCCCTTCTTTGTATGG------ACT------------------GGAGTGTGGCGACCAGACAGGGGAGCAGTACTCGAG--CTGG---------Gagagtaggctgacgctagtttagtgttatgcaagtaatatgtggtgttattatgtttctttgactgtgtggggtgtataatttgacattttgacaagttaaactccatgtcccgctgtttttcccaatgttcaagagtgcataagtctgtctgtagtgtgtgtgattgttgtacatttgtgataacaaaataaacagcagtgtcatctgcaaataaccggaccaataaattaacctggggagg
gi|17 : tga-A-GT-------CAAACCCTTGC--GAGGATATATAGGCTTTGAC---ACA-T-G---TCA-ACTGACA--AGGA--G---A-------------GCA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GT--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATATA-CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAAA--CCGGGT------TTATAG-GGGTACATATGACCAA-CCTAGCACACTGTCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAAACA--ATAT--TTTGAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGG-TAATTAGTGT-GAGG-GGAGA-A--A-GAAAA-----GTTGTAAAAGTCAGA--------------------TTTGT---TAGACCAGAGAATG-GGA---aagtgtac
gi|18 : acatG--GATAGCTACATGG-TCATTTGTGATCTTGTA-A--CATAGGAA--GAG----T---CTGCTG-TCT-ATACGTC--TC-TG-GTCTAGTCTTCTCC-AA------GAC-----TG-----TAGCAT-CTCA--GTGACA---CTACTCGTTCATC-TGTAATCGTGTTTT--ACCCAGC-GTTTTGCCTGGCACTGGACGCCTTC-AACTTAGTTT-ATGGCA------GTATAAGGTTACCAGACACTTGAGCTGTACTCCAG--TTGA---------GGACGGACAAGAG
gi|2 : catggagtgttcatccatttattaagcagttatattgatcatctataaCTATCTTCC-AA-TA-A-GT-------CAAACCCATCG-TGAGGACATA--GACTA-GAT---GCA-C-G---TCA-ACTGACA--A--A--GT--G-------------TGA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGGGA---G-AA-A-ATA---CT-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--AC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACACATGTTCAA-CCTGGCAGTCTACGTGGCT-GAAC--T------G----A-TTGGCTC--C-GAGAGAGGCA--ATAT--TCTCAG--GG---AG-TTAG---TCCCA--GTGGACAAT-AGTGT-G-GG-GGAGA-A--ATGAATA-----CTTATAAAAATCTGAGCTTG-TTTG----G----ATTTGTCTATATGCCATAGAGTG-GGA---TAGA---TGA---C-C-TGTCCTTTTATTTGG-GATTAGATAG-GG-TTCAGTTGG--GATAGCAACTAGG-TTATGGACGATGTTATA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-TTGGTCA-ATA-GGA--TGCAG-GTCAAGTCATCTCT-AGTTTA--AAG-----TGG---TCAACAT-ATCA--GTAACA---CTGGAGGTGCGGC-CATAGATGTGCATT--GCCCAGC-AAGCAGCCTTTCTCTGCACAGACTC-AATTT-GTCCGATGCCAACGCTGGTGTGTGGTGACCAGACATAGGAGCAGTACTCTAG--CTTG---------GGTCTCACAAGTGTCATGTATGCAGTAGATTTTAGTTTGA-C---TGA--GTGAGCTTTGATG---TT-GTGTC----TGAGGAATCTTAGTGTTTGATTTGT--TTTTTTTGTTATA--T----TATCTGTGTG-TTTGTTCCATGATAAGTCATCTG-ATTATATT-GTGACACCAAGATATTTTGCT
gi|20 : ---TCAGCAT-GTCC--GAG-TA---CTAGAAGTGCGGA-CAAAGTCCTTTTAA--ACCCATC-GATCAGCTCGCCTCTGTACAGCATC-TACTT-GGTAAATTTGTGTGTACGTACGGAGCGACCAAATAATGGAGCAGTATTCTAG--TTGGATGGGTAGAGGGCTAGCCAATGTCTTATGTGCAGTTGAATTTAGATTTT-C---TGA--ATGTACATATATG---TT-TCTTC----TGAGGAATCC---TGTTAGA---------TTTTTATCA---------TGTCGATGTG-AGTGTTCCATG
gi|21 : aatG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-GAGG-GAAGA-A--A-AAA-------------AAAGTCAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-G-TGCTCTTGTAat
gi|22 : taaaagatataatacaaaatgtagttattttaactacttttaccagtgaaggtcacacttgcaggttcacactcactctctcgtttattcgaagattgaacgaatgtgaatgataaattcactgattttagtttaaatccaatgagtgcatgacCC-AT-AT-A-GC-------CAAACTCCTCG-CAAGGACATA--AGTTTTGAC---GCG-T-G---TCA-TCTGACA--A--A--GAG-G-------------GAA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-GA-A-ATA---CA-G--G-----TTATTGTATTGT---A--TTTATA-A--GC-AGG-TTAAAA-CGGA--GCAGAT------ATCTAG-GGG--TACATGTTCAA-TCTTGCACATTGCCTGTCG-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAG---------------AA--GG---AG-TGAG---TTCCG--CTGGACAAT-AGTGC-G-AGTGAAGA-A--A-GAAAA-----CTT
gi|23 : GACAAGAGTTTTATAGGCCATAGACTTTAAATCTC-C---TGA--ATGTACGTTTATA---TT-TTTTC----TTAAAAATACTAATGTTTGATTTGC--TTATTTGGTAATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTACA--AGA---GAGATACCTAGGTA
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcaTAAATCCTCTGTA--A-A-T-G---TACCTAGGTATCTcatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTgtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|24 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagagatacctaggtacatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaaG--GG---AG-TGAG---CTTCAAATT--ACAAT-GGTGC-C-AG-CAAGA-A--A----T------CTTG-AAAA---------TA-CCTG----G----ATTTGACAGTAAACCATGCAATG-TGA---TAGT---CAA---C-T-GGGTCTTCTATTGGG-GATAAGATCA-TA-TTTAGGTGG--GATGACAACATGG-GTATGCATGATATTATGTAAGT-TA--AC--TGG----A---GT-CTGGTCA-AGATGAT--GG-AG-----AATGG----------TG--GAT-----AGG---TCAG-ATAATCT--GTAACA---TTGGAAATATGGT-CATAGTTATGt
gi|25 : CTATCTTCC-GT-TA-ATAC-------CAAACCC--TC-TGGGGACCTA--GGC----AT---GCG-TAA---TCATACCGACA--A--A--G---A-------------CTG------A---T--AG-------T---ATTT---A------AAA-AT--A---CA----TT-----AGAAA---C-AA-T-TTA---AA-A--GAAACATT--------GA---AGTTTTAAA-T--GCTAGGTTTAAAAATAAA--ga
gi|25 : tatCTGGACAGCCTC-GATCT-GGTTTATGGCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgctggacagcctcgatctggtttatggcagtctcagtatggggtgaccag
gi|26 : tatctatcttccgttaataccaaaccctctggggacctaggcatgcgtaatcataccgacaaagactgatagtatttaaaaatacattagaaacaatttaaaagaaacattgaagttttaaatgctaggtttaaaaataaaaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgTCTAG--AGCC-AG-CGCA---TTCCA--GTGGACAAA-TGTCC-TTGG-GAAGA-A--A-GAGTA-----CTTATAACAATCAGAACT-----------G----ATATGAC--AAGGTAGGTGA----CGA---T------CTA---C-TATG-TCTAGTATTGCG-GATTGTGT-A-TT-TTCTGGTGG--------TACAA------------------------CACG--AA--CAT----T---CT-CTGATCA-ATCCTCC--CG-AGTTTCACGCGGTCTCC-AATGTA--GAG-----
gi|27 : ctcgcaagggcggtgccgctacaCTTTCTGCC-AT-TT-A-GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GAC---ACT-C-A---TC--ACTGACAAGA--A--G---G-------------TTA------AT--AT-AG-------A---A------A------ACA-GTTGA---TATGTTAA-----AAGGA---T-GACT-GTA---CA-G--GTT---TT--------GT---T--TTTAAA-------AGA-TTAAAAATAGC--CCAGGT------TTCTAA-GGGGAGACATGTTCAA-CTCGACTTACAGCCAAGCT-TAAC--T------agttgttgcat
gi|28 : tCTATCTATCGAT------GC-------AAAACCCCTTT-TAGGGACCCA--GGC----AT---GCG-TAG---TCATACCGACA--A--A--GACTG-------------TTAGTTTTTA---A--AACTATATTA---A--C---A------AGATGT--T---TA----AA-----AGAAACAGT-GA-T-GTT---TC-G--G-----TT--------GTTAGG--TTTAAA-A--A-------TAAAAACCTACTATAAAT------T--TAT-GGTGAAATATGTTCAA-TTCTGCAGACT-----TCA-GAAT--T------G----A-ctgacaagtgttgtgccactacagatggtgcca
gi|29 : catgtctctaaaataatT--GAC---GCA-C-G---TCA-ACCAATA--A--A--GA--G-------------AGA------A---A--AT-------A---T--T---A------AAA-GC--A---TA----AACCGAAGGAGA---T-CA-T-TTA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAA-CAGA--GCAGGT------TTCTAT-GGGGACACACGTTCAG-CCTGGCATACCGTCTGT------C--T------A----A-TCGGGCT--C-AAGAGAGATA--CTAA--ATCCCG--GA---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACactgtt
gi|3 : ttCTATCTTCC-AC-AT-G-GC-------CAAACCCCTCG-CGAGGACATA--GACTTTGAC---ATA-C-G---TCA-ACTGACA--A--AT-G---G-----------------------------AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-A--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAGAACAGA--GCAGGT------ATCTAA-GGGGTCACGTGTTTAA-CTTGGTGCACTGCCTGTCT-GAAC--T------A----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACA--ATGT--TTCCAG--AT---AT-TGAG---TTCTG--CTGAACAAT-AATTC-GAGG-GAAGA-A--A-GAA------------AAAAGTAAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTATGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TATA---CGA---C--------------TAGG---TCAAGGAACTT-TTCAAGTGG--AGTTGCGACTAGT-TTATGGGTGGTGTAATA-GAGCTTG--AC--CAG----T---CG-TTGGTCA-ACACGAC--TA-CG-GTCAAGCCGCCTCC-AGTTTA--ATA-----TTG---TCAACAT-ATTG--GTGACA---CTGAAAGTGTGTC-CATAGTCGAGCATT--GCCAAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGTATATACTC-AATTT-GTCCGATTCCAGCATTCATGTTTGGGGACCAGCCAGAGAATCAGTACTGAAG--CTGG---------GGTCTCATAAGTGTCAGGTATGTCATGGATTTGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATA---TT-TCCTC----TGAGCAATCCTAGTGTTTGATTTGC--TTTCTTTGTGATG--T-----------------TGTTCCATGTTAAGT-CTATGGA--GAT-T-GGGATTCCAAAATATTTTGCT
gi|30 : GACCAGACAGAGTAGCAATACTATAGAATTGT-----------TCTTGCAAAGGTCCTGTATGCTGTTGATTTCATTTTTTTC---CGA--ACGTACTTTGATG---TT-ATGTG----AGAGAAAACCTCATGCTTGTTTTGTTATTTTTTTGTaatgagactgtttctaatgaa
gi|31 : G-------A---A--T---A------AAC-GT--G---TT----AA-----AGACA---A-GA-T-ATG---TA-G--A-----GT--------GT---A--TT--AA-A--AC-AGG-TTTAAA-CAGA--ACATGC------TTCTAG-GGAGACACGTGTTCTA-TCTGGTAAACAGCCTGGTT-GAAC--T------G----A-AGGGCCT--C-TAGtccgtatcggataatcagataatcataatgtgccactaagatttt
gi|33 : AAGA-TCATATATGTGGTAACCTTGAGTGATT-C---AGA--ATGGACTATGATAACATT-TCTGC----TTAGGAATCCTAGTTTTTGATTTGTG-TTTTTTCGTAATGCAT----TTTT--TATG-TGTGTTCCGTG-TGAGTTTTCTtatctccatattaacggtttactgcactgttaata
gi|34 : agtggactatagtttaagggaCTATCTGCC-AT-TA-A-GT-------CAAACCCCTGC-TTGAGACCTA--AACT--GAC---ATG-T-G---TCA--CTGACA--AGAA--A---G-------------TTA------A--------------------------------------T--A---TA----AA-----ACAGT---T-GA-T-A--------G--G-----TTTAAATG--GT------TTTAAA--------GA-TTAAAAATAGA--GCAGGT------TTCTAA-GGATTGACATGTCTAA-CTC
gi|35 : tatCTGGACAGCCTC-GATCT-GGTTTATGGCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGACACTTGAGCAGTACTC------TGG---------GGGCTGACAAGAGTTTTATAGTTCATAGACTTTA-------------A--AT----TTTGATA---TT-TCTTC----TTAAAAACCCCAATGTTTAATTTt
gi|36 : agtgCATA--AC--CAG----T---CT-CCGGTAA-AT---------------CA---TGTCTCA-AATTTA--GAT-----TGG---TCAGCAT-ATATATGTGACA---CTGAAAGTGCGAC-CATAGTCACGTATC--GTCCTTC-GAGCAGCTCGTCCCTAGA
gi|37 : gggatgagagtaatttcatgttaCTTCC-AT-AT-A-GC-------CAAACCCCT---CGGG-----A--GGCTTTGAC---ATG-T-G---TCC-ACTGACA--A--A--G-------------------A------G---A--AA-------A---A--T---A----------GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--ATTAtaat
gi|38 : TCTGCC-AT-CT-A-GT-------CAAAGCCCTAC-TGGGGACTTA--GACA--TAC---ATG-C-G---TC--ACTGACA--A--GACG---A-------------TTA------A---T--AT-------A---A------A------AAA-AC-------------A-----AGTGA---T-AA-tattgctgacattaaacaaggttttatagtcggtgcatgtt
gi|39 : atctatcGTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTAAAGTCCTCTGCA--ATA---GTGATGCCTAGGTAgttaaaaagatgtctgttcagggttagtttttaaat
gi|4 : aatCTATCTTAT-GT-TA-ATGT-------CAAACCCCTTT-TGGGGACCTA--GGC----AT---GTGTC-G---CCATACCAACA--A--A--G---ACTTAATTAGTTTTTTA------A---A--AA-------ATATA--TTAAA------AAA-GA--AATTTA----AA-----AGAAA---T-AG-TGATGTTTCA-GTTG-----TT--------AG---G--TTTAAA-A--A-------TAAAAACATA--CTATGA------ATTTAT-GATGAGATATGTTCAA-TTCTGCTGATT-TCTGTATCAAAC--T------GTTCTA-T--GGTTAAT-GATATAGG-G--GTAT-----CAG--AACCTAA-TGAA---TTCCA--ATGAAAAAC-TGTTC-A-GG-GAAAA-ACGA-GAAT-------TTGTAAAAGTCAGTGGTGG-TGTT----A----ATTAGT-TGAAAGCAAGTGAATGTGAA---T-GT---CGG---GAT-TGTCTGTTTGTCAGT-G-TTATGTAA-TC-TTCTATGGG--GATAGCTACAAGG-TCATTGGTGATTTTGTA-ACACAGA--GA--GAGAGAGT-------TGGCTGTATACATC--TT-TG-GTCTAGTCTTTTCC-ACTGGA--GAGAGTACTGA-----AGCAT-CTTA--GTAATG---CTACTGGTCTGTC-TATAGTCTTGTCTT--GCCCAGT-GTGCTGCCCGGCATTGGACGTCTTC-AACCT-GATTTATGGCAGTCTCTGTATAAGGTGACCGTACATTTGAACGGTACTCCAA--TTGA---------GAGCAGACAAGAGTTTTATATGCCATGGACTTTAAGTCTT-C---TGG--ATGTACCTATATGTA-TT-TCTTC----TTATAAATCCTAATATTTGGTTTcatttacataggaggtagtctctagtttagcattgtgtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|40 : atGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTA
gi|41 : aACGCCCTC-AACCT-GGTTTATGGCAGCCTCAGTATAAGGTGACCAGACACTTGAGCAGTGCTCCAG--TTTA---------GAGCGGACACGAGTTTTATAGGCCATGGACTTTAAATCTT-C---TGA--Acatttacagaggaggtagtctctnnnnnnnnnngtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|42 : agTCTAT-GGGGACACATGATCAAACCTGGCACACTGCCAGTTT-AAAG--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACAATATAT--TTTCAG--GG----G-CAAG---TTTCA--CTGGACATT-AGTAT-GAGG-GAAGA-A--T-GAAAA-----CTTaatgtata
gi|43 : -------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---G-AA-T-ATA---CA-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A---C-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACATATGTTCA
gi|44 : taTATCTTCC-ACATA-C-GTGACATAGCAAACTCCACCACAAGGACATA--GGCTTTGAG---GTG-T-G---TCA-ACTGACA--G--A--G---A-------------GAA------A---A--AG-------A---A--A---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AAAtggtgttccgctttgcgcatcccaactg
gi|45 : ACGTAG-TC-GTCTGGAGGCAGATAGCTACAAGA-TCATTTGTTATCTTG---GAGCATa
gi|46 : atgtctgttcgtcaatgtcatgt-AT-TT-A-GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GAC-------------------TCA-ACC-ACA--A--G--T---G-------------TTggggagtcgg
gi|47 : GTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTGAAATTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTAtatatattgaaataatatggaagtaacaattaagatgtt
gi|48 : aatG-TTCG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAAAGCA-GGA---TAGA---CGC---C-T-TGTTTTTGTAcatttacagagaagtctgttt
gi|5 : agaaaataaaataatataaaataaTATCTTCC-AA-TA-A-GT-------CAAACATCTGC-TGGAGATCTA--GACG--AAC---GCA-C-G---TC--ACTGACAATA--A--T---G-------------TTG------ATTTA--AG-------A---A--C---AGAGTTTAAA-TT--G---TA----AA-----AGA-A---TGAA-T-GTA---AAGG--G-----TT--------AT---C--GTTAAATATTAT-ACG-TC--ACACAGA--GTAGGT------TTCCAA-GAAGAGACATGTTTAA-CTCGGCaa
gi|5 : ctatcagtgTATTGCG-GGTTATATTA-TT-TGCTGGTGG--TATCGCTACAAGA-TAATGGATGATGCTGTA-AAACATG--CC--AAG----T---CT---GACCC-TTTCTCC--GG-AA-GTCAAGCGGTCTAC-AACTTA--GGG-----AGT---TTAGGAA-ATCT--AGGACA---CTAGAATTGTGG---ATAATTCTGTATTTAACCTTTC-GAGCAGCTTATCTCTGCATCGCTTCTAACTG-GTTCtaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggtggtatcgctacaagataatggatgatgctgtaaaacatgccaagtctgaccctttctccggaagtcaagcggtctacaacttagggagtttaggaaatctaggacactagaattgtggataattctgtatttaacctttcgagcagcttatctctgcatcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|52 : ctatcagtgtatcttccaataagtcaaacatctgctggagatctagacgaacgcacgtcactgacaataatgttgatttaagaacagagtttaaattgtaaaagaatgaatgtaaagggttatcgttaaatattatacgtcacacagagtaggtttccaagaagagacatgtttaactcggctaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatcCCATCTTCC-ATATATA-GC-------CAAACCCATCT-CGAGGACATA--GGCT--atttgtgtgccgg
gi|53 : aCTATCTGCC-AT-TT-A-GT-------CAAACTCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--ttga
gi|54 : TTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTGGGCC-----------A---TAGA---CGA---C-T-TGTTCT
gi|55 : gtTATCTGCC-AT-TT-A-GT-------CAAACCCCTGC-TGAGAACCT
gi|6 : ggtt-GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACTCA--GG------C---GTG-C-GTCCTCATGCCGACA--A--A--G---G-------------TT
gi|6 : tcaaatt-AGGGC-G-GG---AGATA--A-GAATA-----T---TAATAGTGAG----TG-GTTG----GGCCAATTAAATTGAAAGCTAGTGGGTG-TGAATGTCGGCATCGA---C---TGTTCGTCCATTC------CATATAG-TC-TTCCAGAGG--GACAGCTACAAGG-TTATTTGTAATCTTGTA-A--CATG--G---GAG-------------AGCCA-ACACGTCTTTG-A--ATCTAGTCTTCTCC-AATGGA--GAGAC---TGA-----AGAAT-CTCA--ATGACGCACCTG---GTCTATC-TGTTGTCATATTTT--GCCCAAC-gttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgagggcgggagataagaatattaatagtgagtggttgggccaattaaattgaaagctagtgggtgtgaatgtcggcatcgactgttcgtccattccatatagtcttccagagggacagctacaaggttatttgtaatcttgtaacatgggagagccaacacgtctttgaatctagtcttctccaatggagagactgaagaatctcaatgacgcacctggtctatctgttgtcatattttgcccaacctat
gi|7 : tcaaattgtcaaacccctgctggggactcaggcgtgcgtcctcatgccgacaaaggttgttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgATCTTCC-AC-AT-A-GC-------CAAACCACTTG-CAAGGACATA--GGCTTTGAC---ACA-C-A---TCC-ACTGACA--A--A--GA--G-------------ACA------A---A--AGT------A---A--T---A------AAA-TC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-AAA---CA-G--G-----TT--------GC---A--TTT---------------TAAAAACAG----CAGGT------TTCTAGTGGGGATGCATGTTCAA-CTGGGCACACTGCCTGTCT-GAAA--T------G----A-TTGCAAT--C-AAGAGAGATA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGT-GAGG-GAAGA-A--A-GGAAA-----CTTGTAGAAGTTAGACTTTA-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGGGAATG-GGA---TAGA---TGA---C-T-TGTTCTTGTAATAGT-GATAAGGAAA-T--TTCAGGTGG--AATTGCAACTAGG-TTAAAGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CG-CTGGTTA-ATACAAC--AA-AG-AGCAAGTCGTCTCC-ATTTTA--AGG-----TGG---TCAACAT-CTTA--GTctat
gi|8 : CTATCTGCC-AT-TA-A-GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GTC---GCG-C-G---TC--TCTGACAAGA--A--G---G-------------TT-----------------------A---A--T---A-----------C--A----A----AA-----ACAGT---T-GA-T-A------G-G--G-----TTA-------GT------TTTCAA-A--AT-A---TTGAAAATAGA--ACAGGT------TTCTAA-GGAGAGACGTGTTCAA-TTCGGCTAACGGC-------GAAC--T------T----A-----ACT--CTGGCAGGGGCT--GTACCACTACAGAAGG---TGCCGGGGCATTCCA--GTGGACAAT-GGTTCTG-GG-GAAGA-A--G-GAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGa
gi|8 : atTGAATTTGGCGATATGATAA-TGATTCTGGTGG--TATCGCCACAAAA-TAGTGGGTAATGCTGTA-ACACATG--AC--AAG----C---CT-CTGATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAGCGGCCTCC-AATGAA--GGG-----CGT---TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTGTAATCGCGTG-CAAAATTGTGTTTG--GCCCgcgatatgataatgattctggtggtatcgccacaaaatagtgggtaatgctgtaacacatgacaagcctctgatcaatccttctgagctcaagcggcctccaatgaagggcgtttagcatgtctgagacactgtaatcgcgtgcaaaattgtgtttggccc
gi|9 : atctatctgccattaagtcaaacccctgctggggacctagactgtcgcgcgtctctgacaagaaggttaatacaaaaacagttgatagggttagttttcaaaatattgaaaatagaacaggtttctaaggagagacgtgttcaattcggctaacggcgaacttaactctggcaggggctgtaccactacagaaggtgccggggcattccagtggacaatggttctggggaagaaggagtacttataataatcagtactggtcTATGAG--ATGTTATG-TAACATA--AC--CAA----T---TT-CTGGTCA-GTGCAAA--GG-AG-GTCAAGGAGTCTCC-AATTTA--GAT-----TGT---TTAGCAT-ATCT--GCGACA---CTGGAAGTATAAC---TAGTCATGCATA--GTCCAGC--AATAGCCCGACTCTGGACATTTTC-AATTT-GTCCAATACAAGAAATTGCATTTAGAGACCAGACAT--GAGGAG--CTCTAT--GTGG---------AGCAT--TAAATGTCCTGTATGCTATTGA-TTCAGTTTTC-CAGTTTACTATGCGCTATGATG---TTGTTTTTTGTATGAGAAATCCT-ATGTTTGGTTTTC---TTTTAAGTAAGG--T----AGTCAGTGTGATTAGTTCT-TGTTGAGTCATCTG----AAA-TGGTGATTCTAAGATATTCAGCT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTGTCTTCCGTGAATGCCAAACTTTTATTGGTGATCTAGGCATGCATAGTATTTGAAAATATAGTAAAATAAAATTGAAAGAAACAAAGAAGTTTCGGTTATTAGGTTTAGAAAAGAAAACACTATGAAAATATGACAAGGGATTTTCTTGTTTATTCTGAGATGTGTTCAGTTCTTGTGATTGTAGAATTGAACTGTTCTGTGAGGTAATATAGGGATATCAGAGCTAATGAATTCCAGTCAAAGACTGTTATTGGGAAA
Unaligned ( gi|32 ): TCTGCCTTAGTTCTAATTGAACTGTTCTGTGGTTGTAAACAGGGGATATATGAAGCTAATGAATTCCAGTGAAATACTGTTCTGGGGGAAGCGAGATTTGTTATAGTCACTGGTTGCATCAATTAATTTGAAAGTGAGTGTGATTGTCGGCA
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGAGACCTAGAATTCGCATTTTCGACTGACGTATCTATAAGCGTCATACTTGCTAAAACGGTGTCAGTATGA
Unaligned ( gi|50 ): TGTTGGGAATGGGACTGATTCTAATTTAGTGTTATGAAGAATGTATGAGGTGTTGATATTTTTTTACTT
Unaligned ( gi|51 ): ATATGTTGCGGATTTGACTGAATCTAATTTCGCGTTATGGAGAATGAAGGAGGTGTTGAT
Unaligned ( gi|56 ): TCAATTTGTCCAATGCTAACACTGGGGTGTGGTG
Alignments
lowQualScore : 222 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 11111111 1111111 1111 1 11111111 111 1111 111111111111 22222 111111111 111 11111 2222222222
lowQualScore : 1 2 5555 3 6666 1 22 222 333 2 4 333 11 1 88 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 5555555 4444 55555 333 2 4 2 666 2 33 00000 88888888 999999 5555555 0 2 2 444 777777 22 1 2 2 2 2 33 99999999999 3 0 44 44 1 55 9999 0 44 0000 3 555 555 2 0 2 7 2 2 55 2 22222222 2 0 000 1 2 0 777777777 0 1 1 33 99999999999 444 4444 1 1 4444 2 1 1 2 77 1 888 2 1 2 0 0 1 1111 33 3333 888888888888 2 1 33 44444 66 33 2 0 3 33 333333333333 0 33 444 444 2 5555 4 22 444 3 2 0 1 222 2 9999 3 22222 1 1 666 4 44 222222222 1 55 0 4 22 2 2 888 0 555 33 2 1 999 3 6666 1 2 444 4 0 33 66666 11 2 0 3333333333 1
lowQualScore : . . .... . .... . .. ... ... . . ... .. . .. .................................................................. . ....... .... ..... ... . . . ... . .. ..... ........ ...... ....... . . . ... ...... .. . . . . . .. ........... . . .. .. . .. .... . .. .... . ... ... . . . . . . .. . ........ . . ... . . . ......... . . . .. ........... ... .... . . .... . . . . .. . ... . . . . . . .... .. .... ............ . . .. ..... .. .. . . . .. ............ . .. ... ... . .... . .. ... . . . . ... . .... . ..... . . ... . .. ......... . .. . . .. . . ... . ... .. . . ... . .... . . ... . . .. ..... .. . . .......... .
lowQualScore : 0 1 0000 8 4444 7 66 666 555 0 0 555 22 2 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0000000 2222 00000 777 1 2 2 999 2 11 88888 99999999 333333 8888888 3 4 5 000 222222 99 5 2 5 4 9 99 11111111111 1 3 66 88 2 00 9999 2 22 2222 1 000 111 9 1 7 5 5 5 99 5 33333333 2 1 888 6 4 2 111111111 3 9 8 44 33333333333 777 1111 7 1 0000 9 0 0 9 00 2 555 9 4 5 5 7 6 0000 22 7777 555555555555 4 9 55 77777 00 33 4 3 7 22 000000000000 1 44 222 444 4 3333 8 44 111 0 9 4 0 999 9 4444 1 88888 0 0 555 0 22 333333333 0 22 5 8 11 9 9 111 4 000 99 1 0 666 1 5555 0 5 222 9 4 99 66666 00 9 7 3333333333 0
consensus : CTATCTNCC-AT-TT-A-GTCAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGAC---GA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTA-GTTCTTC---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
Reference ( family-863 ) : CTATCTNCC-AT-TN-A-GTCAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGAC---GA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTA-GTTCTTC---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
gi|1 : CTAACTGCC-AT-TT-A-TTTAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--TACT--GACTGAGCG-C-G---TCA--CTGACA--AGAA--T---G-------------TTA------AT--ATCAA-------A---A--T---ACAGTTGAAA-G---G---TA----AA-----AG-GA---T-GACT-GCA---CG-G--GG----TTA-------GT---T--TTTAAA-A--G----A-TTAAAA----------------------TAG-AG----ACATGTTCAA-CTCGACTTATGGCCGAGCT-GAAC--TCTGGCAG----AGTTGTGC---C-GCTACAGATG--GTG-----CCAG--GG------CA-----TTTCA--GCGGACGAT-GGTTC-TCGG-GAAGA-A--A-AAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGACAATAGGATAATGAATG-TGA---CGATC---AG---C-T-AGGTCTGGTGTTGAG-GGTTATGTAA-CC---------------CACTA-AATA-TT--GGGTAATGCTGTA-AAACATT--AC--TAG----C---TT-CTTATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAG----CTCC-AATGTAAGGAG-----T-----TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTT-C----------TTT--AACCAACTGAGCAGCTCGTATCTGTA-AGTCTC-ATATTGGCAAATG-AGTGTGTCGGTATGGGAAGACCAGACAGGGTGGCAGTATTCGAA--TTAA---------GGCTTAACTACAGTATTATATGCAGTAGCTTTTA-GTGCTTG---TGA--ATGAACATTTATG---TT-TCTTC----TCAGGAATCCTTAAGTTTGGTTTGC--CTTTTCAGTGCTA--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGATAAG---TCTG----AGATT-GTGATTCTGAAATGTGTTGC
gi|10 : tctatAGG-TTATGGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CA-TTGATCA-ATACGAC--CG-GG-TTCAAGTCGTCTCC-AGTTTA--ATG-----TGG---TCAACAT-ACTG--GTGACA---CTGGAAGTGCGTTACATAATCACGTATT--GTCCAGC-GAGCTGCCAGTCTCTGCATGGATTC-AATTTGTCCGATC-CCAGCACTAGTGTGTGAGGACCAGACAGAGGAGTAGTACTCAAG--TTGA---------GGC---------GTC--ACATGCCATGGATTAGA-GTTTATC---TGA--GTGAACTTTTATG---TT-CCGTC----TG---AATCCTAGTGTTTCTTTTGC--TTTGTT--TGATG--T----CGTCTATGTG-TTTGTTCCATGTTATGTTTTTTG----AGATT-GTGATTACTTAATATTTTGagatatgactgagtcttatttagtgttatggagaatgtaggcggcgttgatgttttttttacttgaatgatctggcatgtggatgggttgaagtgcatgtctcactttgtttcc
gi|11 : tACAAGAGTTGTATAGACCATGAACTTTA-AATCTTC---TGA--ATGTATTCTGATA---TT-TCCTC----TTAAAACCCCTTATTGTTGATTTTC---TTTATAGTAATG--T----TGTTGATGTG-TCTGTTCCATGTTAAATCCTCTGCA--ATA-T--TGACACCTTGGTATTTTGCatgatgaggttatttctaatgtagtg
gi|12 : GTCAGTGGTTG-CGTC----A----ATTAGTTTGAAAGCAAGCGAGTG-TGAATGTAGG----GATTGC-C-TGTTC--GTCTGTG----TCATTTAG-TC-TTCTAGTTG--AGTAGCTACAAGG-CCATTTGTGATCTTGTA-A--TATA--AGGACAG----TTGGCT----GTCT-ATACGTC--TT-TG-GTCTAGTCTACT-----------GA--------------AGCAT-CTCA--GTAACG---CTACTGGTCCATC-TGTAGTTATGGTTT--GCCCAGC-GTGTTGCATGGCAATTGACACCCTC-CACCGGTTTTATG-GCAATCTTAATATAAGGTGACCAGACACTTGAACAGTACTCTAA--TTGA---------GGTTGGACAAAA-------------------------TCTTC---TGA--ATGTACCTTTATA---GT-TCTTC----ATAAAAACACTACTGTTTGGTTTGagaggaggttgactctagtttagtgttaagaacgatatgtttctttgaccgtgcgatgtgtttaacattttgacaggttaagctccatgtcctactgtttcccctctgttcaagagtgcacaagtatgtctgtagtgcttgtgcttgttgttgttaaaatgattgcaaggtatatggcagtgtcgtctgcaaataagcggacctgagattttaccttggaggg
gi|13 : TATCTCTC-AC-AT-A-ACCAAACCGCTTT-TGAGGACATA--GGCTTTGAC---GTG-C-T---TCA-ACTGACA--A--A--G-------------------------------------------------------------------------------------AGAGA---A-AA-T-GTA---TA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GAAGGTTTCTACTTCTAG-GGGGGCACATATTCAA-CCTGGCACACTGCCTGTCT-GAACAAA------G----A-TTGGGCT--A-AAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGGG---TTTTA--TTGGACAAT-TGTGT-G-AG-G----------GGATATTTTTTTTGTAAAAGTCAGAATTTGATTTGTTTTG----ATTTGTCTGAAGGTCAGATACTG-GGA---TCTAT---GA---C-T-TGTTCTTATATTAGC-GATAA
gi|14 : C-G-GG-GAAGA-A--A-GAATG-----CTCATAATAATAAGCTCTGG-TCTG----A----ATTTAGCGATAGGATAATGAATA-TGA---CGATC---TA---C-T-AGGTCTAGTGTTTAG-GGTTATATAA-TC-TTCTGGTAG--TATCGCCACGAGA-TAATGGGTAATACTGTA-AAACATG--CA--TAG----C---CT-CTGATCA-AACCTTC--TG-AG-GTCAAGCGGTCTCCAAATGTA--GGG-----AGGAGTTTAGCAT-TTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTG-CAAAGTCATGTTCA--ACCCACC-Ggaa
gi|15 : ggcaggggctgcgccactacagatggtgccagggcatttcagtgattgatggttcGTGATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTGCA--ATA-C--TGACACCTAGGTATTTTGC
gi|16 : -GG-GAAGA-AT-A-AAATA------TTATAAAAGTCAGAACATG-TTTG----A----ATTTGTCTGTAGACCATCGAGTG-GGA---T--AC---AG---C-T-TGTTCTTTTATTTGG-GATAAAGTA--------TGTT------------TAAGGTTTATAGATCACACTATG-----ATA--GC--CAG----T---CG-CTCGTCA-ATATGAC--GG-AG-CTCAAGTTGCCTCC-AGTTTA--AAT-----TAG---TCAACAT-CTTG--TTGACA---ATGAAAGTGCGGC-AATAGTCCTG----------A---GAGCAGCCCTTCTTTGTATGG------AC--------TG-G-AG--------TGTGGCGACCAGACAGGGGAGCAGTACTCGAG--CTGG---------Gagagtaggctgacgctagtttagtgttatgcaagtaatatgtggtgttattatgtttctttgactgtgtggggtgtataatttgacattttgacaagttaaactccatgtcccgctgtttttcccaatgttcaagagtgcataagtctgtctgtagtgtgtgtgattgttgtacatttgtgataacaaaataaacagcagtgtcatctgcaaataaccggaccaataaattaacctggggagg
gi|17 : tga-A-GTCAAACCCTTGC--GAGGATATATAGGCTTTGAC---ACA-T-G---TCA-ACTGACA--AGGA--G---A-------------GCA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GT--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATATA-CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAAA--CCGGGT------TTATAG-GGGTACATATGACCAA-CCTAGCACACTGTCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAAACA--ATAT--TTTGAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGG-TAATTAGTGT-GAGG-GGAGA-A--A-GAAAA-----GTTGTAAAAGTCAGA--------------------TTTGT---TAGACCAGAGAATG-GGA---aagtgtac
gi|18 : acatG--GATAGCTACATGG-TCATTTGTGATCTTGTA-A--CATAGGAA--GAG----T---CTGCTG-TCT-ATACGTC--TC-TG-GTCTAGTCTTCTCC-AA------GAC-----TG-----TAGCAT-CTCA--GTGACA---CTACTCGTTCATC-TGTAATCGTGTTTT--ACCCAGC-GTTTTGCCTGGCACTGGACGCCTTC-AACTTAGTTTATG-GCAG------TATAAGGTTACCAGACACTTGAGCTGTACTCCAG--TTGA---------GGACGGACAAGAG
gi|2 : catggagtgttcatccatttattaagcagttatattgatcatctataaCTATCTTCC-AA-TA-A-GTCAAACCCATCG-TGAGGACATA--GACTA-GAT---GCA-C-G---TCA-ACTGACA--A--A--GT--G-------------TGA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGGGA---G-AA-A-ATA---CT-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--AC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACACATGTTCAA-CCTGGCAGTCTACGTGGCT-GAAC--T------G----A-TTGGCTC--C-GAGAGAGGCA--ATAT--TCTCAG--GG---AG-TTAG---TCCCA--GTGGACAAT-AGTGT-G-GG-GGAGA-A--ATGAATA-----CTTATAAAAATCTGAGCTTG-TTTG----G----ATTTGTCTATATGCCATAGAGTG-GGA---TAGAT---GA---C-C-TGTCCTTTTATTTGG-GATTAGATAG-GG-TTCAGTTGG--GATAGCAACTAGG-TTATGGACGATGTTATA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-TTGGTCA-ATA-GGA--TGCAG-GTCAAGTCATCTCT-AGTTTA--AAG-----TGG---TCAACAT-ATCA--GTAACA---CTGGAGGTGCGGC-CATAGATGTGCATT--GCCCAGC-AAGCAGCCTTTCTCTGCACAGACTC-AATTTGTCCGATG-CCAACGCTGGTGTGTGGTGACCAGACATAGGAGCAGTACTCTAG--CTTG---------GGTCTCACAAGTGTCATGTATGCAGTAGATTTTA-GTTTGAC---TGA--GTGAGCTTTGATG---TT-GTGTC----TGAGGAATCTTAGTGTTTGATTTGT--TTTTTTTGTTATA--T----TATCTGTGTG-TTTGTTCCATGATAAGTCATCTG-ATTATATT-GTGACACCAAGATATTTTGCT
gi|20 : ---TCAGCAT-GTCC--GAG-TA---CTAGAAGTGCGGA-CAAAGTCCTTTTAA--ACCCATC-GATCAGCTCGCCTCTGTACAGCATC-TACTTGGTAAATTTGT-GTGTACGTACGGAGCGACCAAATAATGGAGCAGTATTCTAG--TTGGATGGGTAGAGGGCTAGCCAATGTCTTATGTGCAGTTGAATTTA-GATTTTC---TGA--ATGTACATATATG---TT-TCTTC----TGAGGAATCC---TGTTAGA---------TTTTTATCA---------TGTCGATGTG-AGTGTTCCATG
gi|21 : aatG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-GAGG-GAAGA-A--A-AAA-------------AAAGTCAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TAGAC---GA---C-G-TGCTCTTGTAat
gi|22 : taaaagatataatacaaaatgtagttattttaactacttttaccagtgaaggtcacacttgcaggttcacactcactctctcgtttattcgaagattgaacgaatgtgaatgataaattcactgattttagtttaaatccaatgagtgcatgacCC-AT-AT-A-GCCAAACTCCTCG-CAAGGACATA--AGTTTTGAC---GCG-T-G---TCA-TCTGACA--A--A--GAG-G-------------GAA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-GA-A-ATA---CA-G--G-----TTATTGTATTGT---A--TTTATA-A--GC-AGG-TTAAAA-CGGA--GCAGAT------ATCTAG-GGG--TACATGTTCAA-TCTTGCACATTGCCTGTCG-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAG---------------AA--GG---AG-TGAG---TTCCG--CTGGACAAT-AGTGC-G-AGTGAAGA-A--A-GAAAA-----CTT
gi|23 : GACAAGAGTTTTATAGGCCATAGACTTTA-AATCTCC---TGA--ATGTACGTTTATA---TT-TTTTC----TTAAAAATACTAATGTTTGATTTGC--TTATTTGGTAATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTACA--AGA---GAGATACCTAGGTA
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcaTAAATCCTCTGTA--A-A-T-G---TACCTAGGTATCTcatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTgtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|24 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagagatacctaggtacatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaaG--GG---AG-TGAG---CTTCAAATT--ACAAT-GGTGC-C-AG-CAAGA-A--A----T------CTTG-AAAA---------TA-CCTG----G----ATTTGACAGTAAACCATGCAATG-TGA---TAGTC---AA---C-T-GGGTCTTCTATTGGG-GATAAGATCA-TA-TTTAGGTGG--GATGACAACATGG-GTATGCATGATATTATGTAAGT-TA--AC--TGG----A---GT-CTGGTCA-AGATGAT--GG-AG-----AATGG----------TG--GAT-----AGG---TCAG-ATAATCT--GTAACA---TTGGAAATATGGT-CATAGTTATGt
gi|25 : CTATCTTCC-GT-TA-ATACCAAACCC--TC-TGGGGACCTA--GGC----AT---GCG-TAA---TCATACCGACA--A--A--G---A-------------CTG------A---T--AG-------T---ATTT---A------AAA-AT--A---CA----TT-----AGAAA---C-AA-T-TTA---AA-A--GAAACATT--------GA---AGTTTTAAA-T--GCTAGGTTTAAAAATAAA--ga
gi|25 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgctggacagcctcgatctggtttatggcagtctcagtatggggtgaccag
gi|26 : tatctatcttccgttaataccaaaccctctggggacctaggcatgcgtaatcataccgacaaagactgatagtatttaaaaatacattagaaacaatttaaaagaaacattgaagttttaaatgctaggtttaaaaataaaaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgTCTAG--AGCC-AG-CGCA---TTCCA--GTGGACAAA-TGTCC-TTGG-GAAGA-A--A-GAGTA-----CTTATAACAATCAGAACT-----------G----ATATGAC--AAGGTAGGTGA----CGA---T---C---TA---C-TATG-TCTAGTATTGCG-GATTGTGT-A-TT-TTCTGGTGG--------TACAA------------------------CACG--AA--CAT----T---CT-CTGATCA-ATCCTCC--CG-AGTTTCACGCGGTCTCC-AATGTA--GAG-----
gi|27 : ctcgcaagggcggtgccgctacaCTTTCTGCC-AT-TT-A-GTCAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GAC---ACT-C-A---TC--ACTGACAAGA--A--G---G-------------TTA------AT--AT-AG-------A---A------A------ACA-GTTGA---TATGTTAA-----AAGGA---T-GACT-GTA---CA-G--GTT---TT--------GT---T--TTTAAA-------AGA-TTAAAAATAGC--CCAGGT------TTCTAA-GGGGAGACATGTTCAA-CTCGACTTACAGCCAAGCT-TAAC--T------agttgttgcat
gi|28 : tCTATCTATCGAT-GC-A----AAACCCCTTT-TAGGGACCCA--GGC----AT---GCG-TAG---TCATACCGACA--A--A--GACTG-------------TTAGTTTTTA---A--AACTATATTA---A--C---A------AGATGT--T---TA----AA-----AGAAACAGT-GA-T-GTT---TC-G--G-----TT--------GTTAGG--TTTAAA-A--A-------TAAAAACCTACTATAAAT------T--TAT-GGTGAAATATGTTCAA-TTCTGCAGACT-----TCA-GAAT--T------G----A-ctgacaagtgttgtgccactacagatggtgcca
gi|29 : catgtctctaaaataatT--GAC---GCA-C-G---TCA-ACCAATA--A--A--GA--G-------------AGA------A---A--AT-------A---T--T---A------AAA-GC--A---TA----AACCGAAGGAGA---T-CA-T-TTA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAA-CAGA--GCAGGT------TTCTAT-GGGGACACACGTTCAG-CCTGGCATACCGTCTGT------C--T------A----A-TCGGGCT--C-AAGAGAGATA--CTAA--ATCCCG--GA---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACactgtt
gi|3 : ttCTATCTTCC-AC-AT-G-GCCAAACCCCTCG-CGAGGACATA--GACTTTGAC---ATA-C-G---TCA-ACTGACA--A--AT-G---G-----------------------------AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-A--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAGAACAGA--GCAGGT------ATCTAA-GGGGTCACGTGTTTAA-CTTGGTGCACTGCCTGTCT-GAAC--T------A----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACA--ATGT--TTCCAG--AT---AT-TGAG---TTCTG--CTGAACAAT-AATTC-GAGG-GAAGA-A--A-GAA------------AAAAGTAAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTATGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TATAC---GA---C--------------TAGG---TCAAGGAACTT-TTCAAGTGG--AGTTGCGACTAGT-TTATGGGTGGTGTAATA-GAGCTTG--AC--CAG----T---CG-TTGGTCA-ACACGAC--TA-CG-GTCAAGCCGCCTCC-AGTTTA--ATA-----TTG---TCAACAT-ATTG--GTGACA---CTGAAAGTGTGTC-CATAGTCGAGCATT--GCCAAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGTATATACTC-AATTTGTCCGATT-CCAGCATTCATGTTTGGGGACCAGCCAGAGAATCAGTACTGAAG--CTGG---------GGTCTCATAAGTGTCAGGTATGTCATGGATTTGA-GTTTATC---TGA--GTGAACTTTTATA---TT-TCCTC----TGAGCAATCCTAGTGTTTGATTTGC--TTTCTTTGTGATG--T-----------------TGTTCCATGTTAAGT-CTATGGA--GAT-T-GGGATTCCAAAATATTTTGCT
gi|30 : GACCAGACAGAGTAGCAATACTATAGAATT-----------GTTCTTGCAAAGGTCCTGTATGCTGTTGATTTCATTTTTTTC---CGA--ACGTACTTTGATG---TT-ATGTG----AGAGAAAACCTCATGCTTGTTTTGTTATTTTTTTGTaatgagactgtttctaatgaa
gi|31 : G-------A---A--T---A------AAC-GT--G---TT----AA-----AGACA---A-GA-T-ATG---TA-G--A-----GT--------GT---A--TT--AA-A--AC-AGG-TTTAAA-CAGA--ACATGC------TTCTAG-GGAGACACGTGTTCTA-TCTGGTAAACAGCCTGGTT-GAAC--T------G----A-AGGGCCT--C-TAGtccgtatcggataatcagataatcataatgtgccactaagatttt
gi|33 : AAGA-TCATATATGTGGTAACCTTGA-GTGATTC---AGA--ATGGACTATGATAACATT-TCTGC----TTAGGAATCCTAGTTTTTGATTTGTG-TTTTTTCGTAATGCAT----TTTT--TATG-TGTGTTCCGTG-TGAGTTTTCTtatctccatattaacggtttactgcactgttaata
gi|34 : agtggactatagtttaagggaCTATCTGCC-AT-TA-A-GTCAAACCCCTGC-TTGAGACCTA--AACT--GAC---ATG-T-G---TCA--CTGACA--AGAA--A---G-------------TTA------A--------------------------------------T--A---TA----AA-----ACAGT---T-GA-T-A--------G--G-----TTTAAATG--GT------TTTAAA--------GA-TTAAAAATAGA--GCAGGT------TTCTAA-GGATTGACATGTCTAA-CTC
gi|35 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGACACTTGAGCAGTACTC------TGG---------GGGCTGACAAGAGTTTTATAGTTCATAGACTTTA-------------A--AT----TTTGATA---TT-TCTTC----TTAAAAACCCCAATGTTTAATTTt
gi|36 : agtgCATA--AC--CAG----T---CT-CCGGTAA-AT---------------CA---TGTCTCA-AATTTA--GAT-----TGG---TCAGCAT-ATATATGTGACA---CTGAAAGTGCGAC-CATAGTCACGTATC--GTCCTTC-GAGCAGCTCGTCCCTAGA
gi|37 : gggatgagagtaatttcatgttaCTTCC-AT-AT-A-GCCAAACCCCT---CGGG-----A--GGCTTTGAC---ATG-T-G---TCC-ACTGACA--A--A--G-------------------A------G---A--AA-------A---A--T---A----------GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--ATTAtaat
gi|38 : TCTGCC-AT-CT-A-GTCAAAGCCCTAC-TGGGGACTTA--GACA--TAC---ATG-C-G---TC--ACTGACA--A--GACG---A-------------TTA------A---T--AT-------A---A------A------AAA-AC-------------A-----AGTGA---T-AA-tattgctgacattaaacaaggttttatagtcggtgcatgtt
gi|39 : atctatcGTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTAAAGTCCTCTGCA--ATA---GTGATGCCTAGGTAgttaaaaagatgtctgttcagggttagtttttaaat
gi|4 : aatCTATCTTAT-GT-TA-ATGTCAAACCCCTTT-TGGGGACCTA--GGC----AT---GTGTC-G---CCATACCAACA--A--A--G---ACTTAATTAGTTTTTTA------A---A--AA-------ATATA--TTAAA------AAA-GA--AATTTA----AA-----AGAAA---T-AG-TGATGTTTCA-GTTG-----TT--------AG---G--TTTAAA-A--A-------TAAAAACATA--CTATGA------ATTTAT-GATGAGATATGTTCAA-TTCTGCTGATT-TCTGTATCAAAC--T------GTTCTA-T--GGTTAAT-GATATAGG-G--GTAT-----CAG--AACCTAA-TGAA---TTCCA--ATGAAAAAC-TGTTC-A-GG-GAAAA-ACGA-GAAT-------TTGTAAAAGTCAGTGGTGG-TGTT----A----ATTAGT-TGAAAGCAAGTGAATGTGAA---T-GTC---GG---GAT-TGTCTGTTTGTCAGT-G-TTATGTAA-TC-TTCTATGGG--GATAGCTACAAGG-TCATTGGTGATTTTGTA-ACACAGA--GA--GAGAGAGT-------TGGCTGTATACATC--TT-TG-GTCTAGTCTTTTCC-ACTGGA--GAGAGTACTGA-----AGCAT-CTTA--GTAATG---CTACTGGTCTGTC-TATAGTCTTGTCTT--GCCCAGT-GTGCTGCCCGGCATTGGACGTCTTC-AACCTGATTTATG-GCAGTCTCTGTATAAGGTGACCGTACATTTGAACGGTACTCCAA--TTGA---------GAGCAGACAAGAGTTTTATATGCCATGGACTTTA-AGTCTTC---TGG--ATGTACCTATATGTA-TT-TCTTC----TTATAAATCCTAATATTTGGTTTcatttacataggaggtagtctctagtttagcattgtgtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|40 : atGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTA
gi|41 : aACGCCCTC-AACCTGGTTTATG-GCAGCCTCAGTATAAGGTGACCAGACACTTGAGCAGTGCTCCAG--TTTA---------GAGCGGACACGAGTTTTATAGGCCATGGACTTTA-AATCTTC---TGA--Acatttacagaggaggtagtctctnnnnnnnnnngtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|42 : agTCTAT-GGGGACACATGATCAAACCTGGCACACTGCCAGTTT-AAAG--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACAATATAT--TTTCAG--GG----G-CAAG---TTTCA--CTGGACATT-AGTAT-GAGG-GAAGA-A--T-GAAAA-----CTTaatgtata
gi|43 : -------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---G-AA-T-ATA---CA-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A---C-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACATATGTTCA
gi|44 : taCAAACTCCACCACAAGGACATA--GGCTTTGAG---GTG-T-G---TCA-ACTGACA--G--A--G---A-------------GAA------A---A--AG-------A---A--A---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AAAtggtgttccgctttgcgcatcccaactg
gi|45 : tatcttccacatacgtgacatagACGTAG-TC-GTCTGGAGGCAGATAGCTACAAGA-TCATTTGTTATCTTG---GAGCATa
gi|46 : atgtctgttcgtcaatgtcatgt-AT-TT-A-GTCAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GAC-------------------TCA-ACC-ACA--A--G--T---G-------------TTggggagtcgg
gi|47 : GTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTGAAATTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTAtatatattgaaataatatggaagtaacaattaagatgtt
gi|48 : aatG-TTCG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAAAGCA-GGA---TAGAC---GC---C-T-TGTTTTTGTAcatttacagagaagtctgttt
gi|5 : agaaaataaaataatataaaataaTATCTTCC-AA-TA-A-GTCAAACATCTGC-TGGAGATCTA--GACG--AAC---GCA-C-G---TC--ACTGACAATA--A--T---G-------------TTG------ATTTA--AG-------A---A--C---AGAGTTTAAA-TT--G---TA----AA-----AGA-A---TGAA-T-GTA---AAGG--G-----TT--------AT---C--GTTAAATATTAT-ACG-TC--ACACAGA--GTAGGT------TTCCAA-GAAGAGACATGTTTAA-CTCGGCaa
gi|5 : ctatcagtgTATTGCG-GGTTATATTA-TT-TGCTGGTGG--TATCGCTACAAGA-TAATGGATGATGCTGTA-AAACATG--CC--AAG----T---CT---GACCC-TTTCTCC--GG-AA-GTCAAGCGGTCTAC-AACTTA--GGG-----AGT---TTAGGAA-ATCT--AGGACA---CTAGAATTGTGG---ATAATTCTGTATTTAACCTTTC-GAGCAGCTTATCTCTGCATCGCTTCTAACTGGTTCtaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggtggtatcgctacaagataatggatgatgctgtaaaacatgccaagtctgaccctttctccggaagtcaagcggtctacaacttagggagtttaggaaatctaggacactagaattgtggataattctgtatttaacctttcgagcagcttatctctgcatcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|52 : ctatcagtgtatcttccaataagtcaaacatctgctggagatctagacgaacgcacgtcactgacaataatgttgatttaagaacagagtttaaattgtaaaagaatgaatgtaaagggttatcgttaaatattatacgtcacacagagtaggtttccaagaagagacatgtttaactcggctaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatcCCATCTTCC-ATATATA-GCCAAACCCATCT-CGAGGACATA--GGCT--atttgtgtgccgg
gi|53 : aCTATCTGCC-AT-TT-A-GTCAAACTCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--ttga
gi|54 : TTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTGGGCC-----------A---TAGAC---GA---C-T-TGTTCT
gi|55 : gtTATCTGCC-AT-TT-A-GTCAAACCCCTGC-TGAGAACCT
gi|6 : ggtt-GTCAAACCCCTGC-TGGGGACTCA--GG------C---GTG-C-GTCCTCATGCCGACA--A--A--G---G-------------TT
gi|6 : tcaaatt-AGGGC-G-GG---AGATA--A-GAATA-----TT---AATAGTGAG----TG-GTTG----GGCCAATTAAATTGAAAGCTAGTGGGTG-TGAATGTCGGCATCGA---C-T--GTTCGTCCATTC------CATATAG-TC-TTCCAGAGG--GACAGCTACAAGG-TTATTTGTAATCTTGTA-A--CATG--G---GAG-------------AGCCA-ACACGTCTTTG-A--ATCTAGTCTTCTCC-AATGGA--GAGAC---TGA-----AGAAT-CTCA--ATGACGCACCTG---GTCTATC-TGTTGTCATATTTT--GCCCAAC-gttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgagggcgggagataagaatattaatagtgagtggttgggccaattaaattgaaagctagtgggtgtgaatgtcggcatcgactgttcgtccattccatatagtcttccagagggacagctacaaggttatttgtaatcttgtaacatgggagagccaacacgtctttgaatctagtcttctccaatggagagactgaagaatctcaatgacgcacctggtctatctgttgtcatattttgcccaacctat
gi|7 : tcaaattgtcaaacccctgctggggactcaggcgtgcgtcctcatgccgacaaaggttgttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgATCTTCC-AC-AT-A-GCCAAACCACTTG-CAAGGACATA--GGCTTTGAC---ACA-C-A---TCC-ACTGACA--A--A--GA--G-------------ACA------A---A--AGT------A---A--T---A------AAA-TC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-AAA---CA-G--G-----TT--------GC---A--TTT---------------TAAAAACAG----CAGGT------TTCTAGTGGGGATGCATGTTCAA-CTGGGCACACTGCCTGTCT-GAAA--T------G----A-TTGCAAT--C-AAGAGAGATA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGT-GAGG-GAAGA-A--A-GGAAA-----CTTGTAGAAGTTAGACTTTA-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGGGAATG-GGA---TAGAT---GA---C-T-TGTTCTTGTAATAGT-GATAAGGAAA-T--TTCAGGTGG--AATTGCAACTAGG-TTAAAGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CG-CTGGTTA-ATACAAC--AA-AG-AGCAAGTCGTCTCC-ATTTTA--AGG-----TGG---TCAACAT-CTTA--GTctat
gi|8 : CTATCTGCC-AT-TA-A-GTCAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GTC---GCG-C-G---TC--TCTGACAAGA--A--G---G-------------TT-----------------------A---A--T---A-----------C--A----A----AA-----ACAGT---T-GA-T-A------G-G--G-----TTA-------GT------TTTCAA-A--AT-A---TTGAAAATAGA--ACAGGT------TTCTAA-GGAGAGACGTGTTCAA-TTCGGCTAACGGC-------GAAC--T------T----A-----ACT--CTGGCAGGGGCT--GTACCACTACAGAAGG---TGCCGGGGCATTCCA--GTGGACAAT-GGTTCTG-GG-GAAGA-A--G-GAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGa
gi|8 : atTGAATTTGGCGATATGATAA-TGATTCTGGTGG--TATCGCCACAAAA-TAGTGGGTAATGCTGTA-ACACATG--AC--AAG----C---CT-CTGATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAGCGGCCTCC-AATGAA--GGG-----CGT---TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTGTAATCGCGTG-CAAAATTGTGTTTG--GCCCgcgatatgataatgattctggtggtatcgccacaaaatagtgggtaatgctgtaacacatgacaagcctctgatcaatccttctgagctcaagcggcctccaatgaagggcgtttagcatgtctgagacactgtaatcgcgtgcaaaattgtgtttggccc
gi|9 : atctatctgccattaagtcaaacccctgctggggacctagactgtcgcgcgtctctgacaagaaggttaatacaaaaacagttgatagggttagttttcaaaatattgaaaatagaacaggtttctaaggagagacgtgttcaattcggctaacggcgaacttaactctggcaggggctgtaccactacagaaggtgccggggcattccagtggacaatggttctggggaagaaggagtacttataataatcagtactggtcTATGAG--ATGTTATG-TAACATA--AC--CAA----T---TT-CTGGTCA-GTGCAAA--GG-AG-GTCAAGGAGTCTCC-AATTTA--GAT-----TGT---TTAGCAT-ATCT--GCGACA---CTGGAAGTATAAC---TAGTCATGCATA--GTCCAGC--AATAGCCCGACTCTGGACATTTTC-AATTTGTCCAATA-CAAGAAATTGCATTTAGAGACCAGACAT--GAGGAG--CTCTAT--GTGG---------AGCAT--TAAATGTCCTGTATGCTATTGA-TTCA-GTTTTCCAGTTTACTATGCGCTATGATG---TTGTTTTTTGTATGAGAAATCCT-ATGTTTGGTTTTC---TTTTAAGTAAGG--T----AGTCAGTGTGATTAGTTCT-TGTTGAGTCATCTG----AAA-TGGTGATTCTAAGATATTCAGCT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTGTCTTCCGTGAATGCCAAACTTTTATTGGTGATCTAGGCATGCATAGTATTTGAAAATATAGTAAAATAAAATTGAAAGAAACAAAGAAGTTTCGGTTATTAGGTTTAGAAAAGAAAACACTATGAAAATATGACAAGGGATTTTCTTGTTTATTCTGAGATGTGTTCAGTTCTTGTGATTGTAGAATTGAACTGTTCTGTGAGGTAATATAGGGATATCAGAGCTAATGAATTCCAGTCAAAGACTGTTATTGGGAAA
Unaligned ( gi|32 ): TCTGCCTTAGTTCTAATTGAACTGTTCTGTGGTTGTAAACAGGGGATATATGAAGCTAATGAATTCCAGTGAAATACTGTTCTGGGGGAAGCGAGATTTGTTATAGTCACTGGTTGCATCAATTAATTTGAAAGTGAGTGTGATTGTCGGCA
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGAGACCTAGAATTCGCATTTTCGACTGACGTATCTATAAGCGTCATACTTGCTAAAACGGTGTCAGTATGA
Unaligned ( gi|50 ): TGTTGGGAATGGGACTGATTCTAATTTAGTGTTATGAAGAATGTATGAGGTGTTGATATTTTTTTACTT
Unaligned ( gi|51 ): ATATGTTGCGGATTTGACTGAATCTAATTTCGCGTTATGGAGAATGAAGGAGGTGTTGAT
Unaligned ( gi|56 ): TCAATTTGTCCAATGCTAACACTGGGGTGTGGTG
Alignments
lowQualScore : 1111 222 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 11111111 1111111 1111 1 11111111 111 1111111111 1111 111111111111 22222 111111111 111 11111 2222222222
lowQualScore : 1 2 0000 44 5555555 6666 1 22 222 333 2 4 333 11 1 88 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 5555555 4444 55555 333 2 4 2 666 2 33 00000 88888888 999999 5555555 0 2 2 444 777777 22 1 2 2 2 2 33 99999999999 3 0 44 44 1 55 9999 0 44 0000 3 555 555 2 0 2 7 2 2 55 2 22222222 2 0 000 1 2 0 777777777 0 1 1 33 2222222222 444 666 1 1 4444 2 1 1 2 77 1 888 2 1 2 0 0 1 1111 33 3333 888888888888 2 1 33 44444 66 33 2 0 3 33 333333333333 0 33 444 444 2 5555 4 22 444 3 2 0 1 222 2 9999 3 00000 1 1 666 4 44 222222222 1 55 0 4 22 2 2 55 0 2 555 33 2 1 999 3 6666 1 2 444 4 0 33 66666 11 2 0 3333333333 1
lowQualScore : . . .... .. ....... .... . .. ... ... . . ... .. . .. .................................................................. . ....... .... ..... ... . . . ... . .. ..... ........ ...... ....... . . . ... ...... .. . . . . . .. ........... . . .. .. . .. .... . .. .... . ... ... . . . . . . .. . ........ . . ... . . . ......... . . . .. .......... ... ... . . .... . . . . .. . ... . . . . . . .... .. .... ............ . . .. ..... .. .. . . . .. ............ . .. ... ... . .... . .. ... . . . . ... . .... . ..... . . ... . .. ......... . .. . . .. . . .. . . ... .. . . ... . .... . . ... . . .. ..... .. . . .......... .
lowQualScore : 0 0 5555 33 9999999 4444 7 66 666 555 0 0 555 22 2 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0000000 2222 00000 777 1 2 2 999 2 11 88888 99999999 333333 8888888 3 4 5 000 222222 99 5 2 5 4 9 99 11111111111 1 3 66 88 2 00 9999 2 22 2222 1 000 111 9 1 7 5 5 5 99 5 33333333 2 1 888 6 4 2 111111111 3 9 8 44 7777777777 777 555 7 1 0000 9 0 0 9 00 2 555 9 4 5 5 7 6 0000 22 7777 555555555555 4 9 55 77777 00 33 4 3 7 22 000000000000 1 44 222 444 4 3333 8 44 111 0 9 4 0 999 9 4444 1 88888 0 0 555 0 22 333333333 0 22 5 8 11 9 9 33 4 9 000 99 1 0 666 1 5555 0 5 222 9 4 99 66666 00 9 7 3333333333 0
consensus : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
Reference ( family-863 ) : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
gi|1 : CTAACTGCC-AT-T--TA--TT-------TAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--TACT--GACTGAGCG-C-G---TCA--CTGACA--AGAA--T---G-------------TTA------AT--ATCAA-------A---A--T---ACAGTTGAAA-G---G---TA----AA-----AG-GA---T-GACT-GCA---CG-G--GG----TTA-------GT---T--TTTAAA-A--G----A-TTAAAA----------------------TAG-AG----ACATGTTCAA-CTCGACTTATGGCCGAGCT-GAAC--TCTGGCAG----AGTTGTGC---C-GCTACAGATG--GTG-----CCAG--GG------CA-----TTTCA--GCGGACGAT-GGTTC-TCGG-GAAGA-A--A-AAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGACAATAGGATAATGAATG-TGA---CGAT---CAG---C-T-AGGTCTGGTGTTGAG-GGTTATGTAA-CC---------------CACTA-AATA-TT--GGGTAATGCTGTA-AAACATT--AC--TAG----C---TT-CTTATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAG----CTCC-AATGTAAGGAG-----T-----TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTT-C----------TTT--AACCAACTGAGCAGCTCGTATCTGTA-AGTCTC-ATATTGGCAAATG-AGTGTGTCGGTATGGGAAGACCAGACAGGGTGGCAGTATTCGAA--TTAA---------GGCTTAACTACAGTATTATATGCAGTAGCTTTTAGTGCTT-G---TGA--ATGAACATTTATG---TT-TCTTC----TCAGGAATCCTTAAGTTTGGTTTGC--CTTTTCAGTGCTA--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGATAAG---TCTG----AGATT-GTGATTCTGAAATGTGTTGC
gi|10 : tctatAGG-TTATGGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CA-TTGATCA-ATACGAC--CG-GG-TTCAAGTCGTCTCC-AGTTTA--ATG-----TGG---TCAACAT-ACTG--GTGACA---CTGGAAGTGCGTTACATAATCACGTATT--GTCCAGC-GAGCTGCCAGTCTCTGCATGGATTC-AATTTGTCCGATC-CCAGCACTAGTGTGTGAGGACCAGACAGAGGAGTAGTACTCAAG--TTGA---------GGC---------GTC--ACATGCCATGGATTAGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATG---TT-CCGTC----TG---AATCCTAGTGTTTCTTTTGC--TTTGTT--TGATG--T----CGTCTATGTG-TTTGTTCCATGTTATGTTTTTTG----AGATT-GTGATTACTTAATATTTTGagatatgactgagtcttatttagtgttatggagaatgtaggcggcgttgatgttttttttacttgaatgatctggcatgtggatgggttgaagtgcatgtctcactttgtttcc
gi|11 : tACAAGAGTTGTATAGACCATGAACTTTAAATCTT-C---TGA--ATGTATTCTGATA---TT-TCCTC----TTAAAACCCCTTATTGTTGATTTTC---TTTATAGTAATG--T----TGTTGATGTG-TCTGTTCCATGTTAAATCCTCTGCA--ATA-T--TGACACCTTGGTATTTTGCatgatgaggttatttctaatgtagtg
gi|12 : GTCAGTGGTTG-CGTC----A----ATTAGTTTGAAAGCAAGCGAGTG-TGAATGTAGG----GATTGC-C-TGTTC--GTCTGTG----TCATTTAG-TC-TTCTAGTTG--AGTAGCTACAAGG-CCATTTGTGATCTTGTA-A--TATA--AGGACAG----TTGGCT----GTCT-ATACGTC--TT-TG-GTCTAGTCTACT-----------GA--------------AGCAT-CTCA--GTAACG---CTACTGGTCCATC-TGTAGTTATGGTTT--GCCCAGC-GTGTTGCATGGCAATTGACACCCTC-CACCGGTTTTATG-GCAATCTTAATATAAGGTGACCAGACACTTGAACAGTACTCTAA--TTGA---------GGTTGGACAAAA------------------------TCTT-C---TGA--ATGTACCTTTATA---GT-TCTTC----ATAAAAACACTACTGTTTGGTTTGagaggaggttgactctagtttagtgttaagaacgatatgtttctttgaccgtgcgatgtgtttaacattttgacaggttaagctccatgtcctactgtttcccctctgttcaagagtgcacaagtatgtctgtagtgcttgtgcttgttgttgttaaaatgattgcaaggtatatggcagtgtcgtctgcaaataagcggacctgagattttaccttggaggg
gi|13 : TATCTCTC-AC-A--TA--AC-------CAAACCGCTTT-TGAGGACATA--GGCTTTGAC---GTG-C-T---TCA-ACTGACA--A--A--G-------------------------------------------------------------------------------------AGAGA---A-AA-T-GTA---TA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GAAGGTTTCTACTTCTAG-GGGGGCACATATTCAA-CCTGGCACACTGCCTGTCT-GAACAAA------G----A-TTGGGCT--A-AAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGGG---TTTTA--TTGGACAAT-TGTGT-G-AG-G----------GGATATTTTTTTTGTAAAAGTCAGAATTTGATTTGTTTTG----ATTTGTCTGAAGGTCAGATACTG-GGA---TCTA---TGA---C-T-TGTTCTTATATTAGC-GATAA
gi|14 : C-G-GG-GAAGA-A--A-GAATG-----CTCATAATAATAAGCTCTGG-TCTG----A----ATTTAGCGATAGGATAATGAATA-TGA---CGAT---CTA---C-T-AGGTCTAGTGTTTAG-GGTTATATAA-TC-TTCTGGTAG--TATCGCCACGAGA-TAATGGGTAATACTGTA-AAACATG--CA--TAG----C---CT-CTGATCA-AACCTTC--TG-AG-GTCAAGCGGTCTCCAAATGTA--GGG-----AGGAGTTTAGCAT-TTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTG-CAAAGTCATGTTCA--ACCCACC-Ggaa
gi|15 : ggcaggggctgcgccactacagatggtgccagggcatttcagtgattgatggttcGTGATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTGCA--ATA-C--TGACACCTAGGTATTTTGC
gi|16 : -GG-GAAGA-AT-A-AAATA------TTATAAAAGTCAGAACATG-TTTG----A----ATTTGTCTGTAGACCATCGAGTG-GGA---T--A---CAG---C-T-TGTTCTTTTATTTGG-GATAAAGTA--------TGTT------------TAAGGTTTATAGATCACACTATG-----ATA--GC--CAG----T---CG-CTCGTCA-ATATGAC--GG-AG-CTCAAGTTGCCTCC-AGTTTA--AAT-----TAG---TCAACAT-CTTG--TTGACA---ATGAAAGTGCGGC-AATAGTCCTG----------A---GAGCAGCCCTTCTTTGTATGG------AC--------TG-G-AG--------TGTGGCGACCAGACAGGGGAGCAGTACTCGAG--CTGG---------Gagagtaggctgacgctagtttagtgttatgcaagtaatatgtggtgttattatgtttctttgactgtgtggggtgtataatttgacattttgacaagttaaactccatgtcccgctgtttttcccaatgttcaagagtgcataagtctgtctgtagtgtgtgtgattgttgtacatttgtgataacaaaataaacagcagtgtcatctgcaaataaccggaccaataaattaacctggggagg
gi|17 : tga--TA--GT-------CAAACCCTTGC--GAGGATATATAGGCTTTGAC---ACA-T-G---TCA-ACTGACA--AGGA--G---A-------------GCA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GT--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATATA-CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAAA--CCGGGT------TTATAG-GGGTACATATGACCAA-CCTAGCACACTGTCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAAACA--ATAT--TTTGAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGG-TAATTAGTGT-GAGG-GGAGA-A--A-GAAAA-----GTTGTAAAAGTCAGA--------------------TTTGT---TAGACCAGAGAATG-GGA---aagtgtac
gi|18 : acaG--GATAGCTACATGG-TCATTTGTGATCTTGTA-A--CATAGGAA--GAG----T---CTGCTG-TCT-ATACGTC--TC-TG-GTCTAGTCTTCTCC-AA------GAC-----TG-----TAGCAT-CTCA--GTGACA---CTACTCGTTCATC-TGTAATCGTGTTTT--ACCCAGC-GTTTTGCCTGGCACTGGACGCCTTC-AACTTAGTTTATG-GCA------GTATAAGGTTACCAGACACTTGAGCTGTACTCCAG--TTGA---------GGACGGACAAGAG
gi|2 : catggagtgttcatccatttattaagcagttatattgatcatctataaCTATCTTCC-AA-T--AA--GT-------CAAACCCATCG-TGAGGACATA--GACTA-GAT---GCA-C-G---TCA-ACTGACA--A--A--GT--G-------------TGA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGGGA---G-AA-A-ATA---CT-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--AC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACACATGTTCAA-CCTGGCAGTCTACGTGGCT-GAAC--T------G----A-TTGGCTC--C-GAGAGAGGCA--ATAT--TCTCAG--GG---AG-TTAG---TCCCA--GTGGACAAT-AGTGT-G-GG-GGAGA-A--ATGAATA-----CTTATAAAAATCTGAGCTTG-TTTG----G----ATTTGTCTATATGCCATAGAGTG-GGA---TAGA---TGA---C-C-TGTCCTTTTATTTGG-GATTAGATAG-GG-TTCAGTTGG--GATAGCAACTAGG-TTATGGACGATGTTATA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-TTGGTCA-ATA-GGA--TGCAG-GTCAAGTCATCTCT-AGTTTA--AAG-----TGG---TCAACAT-ATCA--GTAACA---CTGGAGGTGCGGC-CATAGATGTGCATT--GCCCAGC-AAGCAGCCTTTCTCTGCACAGACTC-AATTTGTCCGATG-CCAACGCTGGTGTGTGGTGACCAGACATAGGAGCAGTACTCTAG--CTTG---------GGTCTCACAAGTGTCATGTATGCAGTAGATTTTAGTTTGA-C---TGA--GTGAGCTTTGATG---TT-GTGTC----TGAGGAATCTTAGTGTTTGATTTGT--TTTTTTTGTTATA--T----TATCTGTGTG-TTTGTTCCATGATAAGTCATCTG-ATTATATT-GTGACACCAAGATATTTTGCT
gi|20 : ---TCAGCAT-GTCC--GAG-TA---CTAGAAGTGCGGA-CAAAGTCCTTTTAA--ACCCATC-GATCAGCTCGCCTCTGTACAGCATC-TACTTGGTAAATTTGT-GTGTACGTACGGAGCGACCAAATAATGGAGCAGTATTCTAG--TTGGATGGGTAGAGGGCTAGCCAATGTCTTATGTGCAGTTGAATTTAGATTTT-C---TGA--ATGTACATATATG---TT-TCTTC----TGAGGAATCC---TGTTAGA---------TTTTTATCA---------TGTCGATGTG-AGTGTTCCATG
gi|21 : aatG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-GAGG-GAAGA-A--A-AAA-------------AAAGTCAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-G-TGCTCTTGTAat
gi|22 : taaaagatataatacaaaatgtagttattttaactacttttaccagtgaaggtcacacttgcaggttcacactcactctctcgtttattcgaagattgaacgaatgtgaatgataaattcactgattttagtttaaatccaatgagtgcatgacCC-AT-A--TA--GC-------CAAACTCCTCG-CAAGGACATA--AGTTTTGAC---GCG-T-G---TCA-TCTGACA--A--A--GAG-G-------------GAA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-GA-A-ATA---CA-G--G-----TTATTGTATTGT---A--TTTATA-A--GC-AGG-TTAAAA-CGGA--GCAGAT------ATCTAG-GGG--TACATGTTCAA-TCTTGCACATTGCCTGTCG-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAG---------------AA--GG---AG-TGAG---TTCCG--CTGGACAAT-AGTGC-G-AGTGAAGA-A--A-GAAAA-----CTT
gi|23 : GACAAGAGTTTTATAGGCCATAGACTTTAAATCTC-C---TGA--ATGTACGTTTATA---TT-TTTTC----TTAAAAATACTAATGTTTGATTTGC--TTATTTGGTAATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTACA--AGA---GAGATACCTAGGTA
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcaTAAATCCTCTGTA--A-A-T-G---TACCTAGGTATCTcatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTgtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|24 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagagatacctaggtacatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaaG--GG---AG-TGAG---CTTCAAATT--ACAAT-GGTGC-C-AG-CAAGA-A--A----T------CTTG-AAAA---------TA-CCTG----G----ATTTGACAGTAAACCATGCAATG-TGA---TAGT---CAA---C-T-GGGTCTTCTATTGGG-GATAAGATCA-TA-TTTAGGTGG--GATGACAACATGG-GTATGCATGATATTATGTAAGT-TA--AC--TGG----A---GT-CTGGTCA-AGATGAT--GG-AG-----AATGG----------TG--GAT-----AGG---TCAG-ATAATCT--GTAACA---TTGGAAATATGGT-CATAGTTATGt
gi|25 : CTATCTTCC-GT-TAATA---C-------CAAACCC--TC-TGGGGACCTA--GGC----AT---GCG-TAA---TCATACCGACA--A--A--G---A-------------CTG------A---T--AG-------T---ATTT---A------AAA-AT--A---CA----TT-----AGAAA---C-AA-T-TTA---AA-A--GAAACATT--------GA---AGTTTTAAA-T--GCTAGGTTTAAAAATAAA--ga
gi|25 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgctggacagcctcgatctggtttatggcagtctcagtatggggtgaccag
gi|26 : tatctatcttccgttaataccaaaccctctggggacctaggcatgcgtaatcataccgacaaagactgatagtatttaaaaatacattagaaacaatttaaaagaaacattgaagttttaaatgctaggtttaaaaataaaaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgTCTAG--AGCC-AG-CGCA---TTCCA--GTGGACAAA-TGTCC-TTGG-GAAGA-A--A-GAGTA-----CTTATAACAATCAGAACT-----------G----ATATGAC--AAGGTAGGTGA----CGA---T------CTA---C-TATG-TCTAGTATTGCG-GATTGTGT-A-TT-TTCTGGTGG--------TACAA------------------------CACG--AA--CAT----T---CT-CTGATCA-ATCCTCC--CG-AGTTTCACGCGGTCTCC-AATGTA--GAG-----
gi|27 : ctcgcaagggcggtgccgctacaCTTTCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GAC---ACT-C-A---TC--ACTGACAAGA--A--G---G-------------TTA------AT--AT-AG-------A---A------A------ACA-GTTGA---TATGTTAA-----AAGGA---T-GACT-GTA---CA-G--GTT---TT--------GT---T--TTTAAA-------AGA-TTAAAAATAGC--CCAGGT------TTCTAA-GGGGAGACATGTTCAA-CTCGACTTACAGCCAAGCT-TAAC--T------agttgttgcat
gi|28 : tCTATCTATCGAT--------GC-------AAAACCCCTTT-TAGGGACCCA--GGC----AT---GCG-TAG---TCATACCGACA--A--A--GACTG-------------TTAGTTTTTA---A--AACTATATTA---A--C---A------AGATGT--T---TA----AA-----AGAAACAGT-GA-T-GTT---TC-G--G-----TT--------GTTAGG--TTTAAA-A--A-------TAAAAACCTACTATAAAT------T--TAT-GGTGAAATATGTTCAA-TTCTGCAGACT-----TCA-GAAT--T------G----A-ctgacaagtgttgtgccactacagatggtgcca
gi|29 : catgtctctaaaataatT--GAC---GCA-C-G---TCA-ACCAATA--A--A--GA--G-------------AGA------A---A--AT-------A---T--T---A------AAA-GC--A---TA----AACCGAAGGAGA---T-CA-T-TTA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAA-CAGA--GCAGGT------TTCTAT-GGGGACACACGTTCAG-CCTGGCATACCGTCTGT------C--T------A----A-TCGGGCT--C-AAGAGAGATA--CTAA--ATCCCG--GA---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACactgtt
gi|3 : ttCTATCTTCC-AC-A--TG--GC-------CAAACCCCTCG-CGAGGACATA--GACTTTGAC---ATA-C-G---TCA-ACTGACA--A--AT-G---G-----------------------------AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-A--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAGAACAGA--GCAGGT------ATCTAA-GGGGTCACGTGTTTAA-CTTGGTGCACTGCCTGTCT-GAAC--T------A----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACA--ATGT--TTCCAG--AT---AT-TGAG---TTCTG--CTGAACAAT-AATTC-GAGG-GAAGA-A--A-GAA------------AAAAGTAAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTATGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TATA---CGA---C--------------TAGG---TCAAGGAACTT-TTCAAGTGG--AGTTGCGACTAGT-TTATGGGTGGTGTAATA-GAGCTTG--AC--CAG----T---CG-TTGGTCA-ACACGAC--TA-CG-GTCAAGCCGCCTCC-AGTTTA--ATA-----TTG---TCAACAT-ATTG--GTGACA---CTGAAAGTGTGTC-CATAGTCGAGCATT--GCCAAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGTATATACTC-AATTTGTCCGATT-CCAGCATTCATGTTTGGGGACCAGCCAGAGAATCAGTACTGAAG--CTGG---------GGTCTCATAAGTGTCAGGTATGTCATGGATTTGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATA---TT-TCCTC----TGAGCAATCCTAGTGTTTGATTTGC--TTTCTTTGTGATG--T-----------------TGTTCCATGTTAAGT-CTATGGA--GAT-T-GGGATTCCAAAATATTTTGCT
gi|30 : GACCAGACAGAGTAGCAATACTATAGAATTGT-----------TCTTGCAAAGGTCCTGTATGCTGTTGATTTCATTTTTTTC---CGA--ACGTACTTTGATG---TT-ATGTG----AGAGAAAACCTCATGCTTGTTTTGTTATTTTTTTGTaatgagactgtttctaatgaa
gi|31 : G-------A---A--T---A------AAC-GT--G---TT----AA-----AGACA---A-GA-T-ATG---TA-G--A-----GT--------GT---A--TT--AA-A--AC-AGG-TTTAAA-CAGA--ACATGC------TTCTAG-GGAGACACGTGTTCTA-TCTGGTAAACAGCCTGGTT-GAAC--T------G----A-AGGGCCT--C-TAGtccgtatcggataatcagataatcataatgtgccactaagatttt
gi|33 : AAGA-TCATATATGTGGTAACCTTGAGTGATT-C---AGA--ATGGACTATGATAACATT-TCTGC----TTAGGAATCCTAGTTTTTGATTTGTG-TTTTTTCGTAATGCAT----TTTT--TATG-TGTGTTCCGTG-TGAGTTTTCTtatctccatattaacggtttactgcactgttaata
gi|34 : agtggactatagtttaagggaCTATCTGCC-AT-T--AA--GT-------CAAACCCCTGC-TTGAGACCTA--AACT--GAC---ATG-T-G---TCA--CTGACA--AGAA--A---G-------------TTA------A--------------------------------------T--A---TA----AA-----ACAGT---T-GA-T-A--------G--G-----TTTAAATG--GT------TTTAAA--------GA-TTAAAAATAGA--GCAGGT------TTCTAA-GGATTGACATGTCTAA-CTC
gi|35 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGACACTTGAGCAGTACTC------TGG---------GGGCTGACAAGAGTTTTATAGTTCATAGACTTTA-------------A--AT----TTTGATA---TT-TCTTC----TTAAAAACCCCAATGTTTAATTTt
gi|36 : agtgCATA--AC--CAG----T---CT-CCGGTAA-AT---------------CA---TGTCTCA-AATTTA--GAT-----TGG---TCAGCAT-ATATATGTGACA---CTGAAAGTGCGAC-CATAGTCACGTATC--GTCCTTC-GAGCAGCTCGTCCCTAGA
gi|37 : gggatgagagtaatttcatgttaCTTCC-AT-A--TA--GC-------CAAACCCCT---CGGG-----A--GGCTTTGAC---ATG-T-G---TCC-ACTGACA--A--A--G-------------------A------G---A--AA-------A---A--T---A----------GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--ATTAtaat
gi|38 : TCTGCC-AT-C--TA--GT-------CAAAGCCCTAC-TGGGGACTTA--GACA--TAC---ATG-C-G---TC--ACTGACA--A--GACG---A-------------TTA------A---T--AT-------A---A------A------AAA-AC-------------A-----AGTGA---T-AA-tattgctgacattaaacaaggttttatagtcggtgcatgtt
gi|39 : atctatcGTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTAAAGTCCTCTGCA--ATA---GTGATGCCTAGGTAgttaaaaagatgtctgttcagggttagtttttaaat
gi|4 : aatCTATCTT---ATGT--TAATGT-------CAAACCCCTTT-TGGGGACCTA--GGC----AT---GTGTC-G---CCATACCAACA--A--A--G---ACTTAATTAGTTTTTTA------A---A--AA-------ATATA--TTAAA------AAA-GA--AATTTA----AA-----AGAAA---T-AG-TGATGTTTCA-GTTG-----TT--------AG---G--TTTAAA-A--A-------TAAAAACATA--CTATGA------ATTTAT-GATGAGATATGTTCAA-TTCTGCTGATT-TCTGTATCAAAC--T------GTTCTA-T--GGTTAAT-GATATAGG-G--GTAT-----CAG--AACCTAA-TGAA---TTCCA--ATGAAAAAC-TGTTC-A-GG-GAAAA-ACGA-GAAT-------TTGTAAAAGTCAGTGGTGG-TGTT----A----ATTAGT-TGAAAGCAAGTGAATGTGAA---T-GT---CGG---GAT-TGTCTGTTTGTCAGT-G-TTATGTAA-TC-TTCTATGGG--GATAGCTACAAGG-TCATTGGTGATTTTGTA-ACACAGA--GA--GAGAGAGT-------TGGCTGTATACATC--TT-TG-GTCTAGTCTTTTCC-ACTGGA--GAGAGTACTGA-----AGCAT-CTTA--GTAATG---CTACTGGTCTGTC-TATAGTCTTGTCTT--GCCCAGT-GTGCTGCCCGGCATTGGACGTCTTC-AACCTGATTTATG-GCAGTCTCTGTATAAGGTGACCGTACATTTGAACGGTACTCCAA--TTGA---------GAGCAGACAAGAGTTTTATATGCCATGGACTTTAAGTCTT-C---TGG--ATGTACCTATATGTA-TT-TCTTC----TTATAAATCCTAATATTTGGTTTcatttacataggaggtagtctctagtttagcattgtgtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|40 : atGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTA
gi|41 : aACGCCCTC-AACCTGGTTTATG-GCAGCCTCAGTATAAGGTGACCAGACACTTGAGCAGTGCTCCAG--TTTA---------GAGCGGACACGAGTTTTATAGGCCATGGACTTTAAATCTT-C---TGA--Acatttacagaggaggtagtctctnnnnnnnnnngtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|42 : agTCTAT-GGGGACACATGATCAAACCTGGCACACTGCCAGTTT-AAAG--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACAATATAT--TTTCAG--GG----G-CAAG---TTTCA--CTGGACATT-AGTAT-GAGG-GAAGA-A--T-GAAAA-----CTTaatgtata
gi|43 : -------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---G-AA-T-ATA---CA-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A---C-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACATATGTTCA
gi|44 : taTATCTTCC-AC-A--TAC-GTGACATAGCAAACTCCACCACAAGGACATA--GGCTTTGAG---GTG-T-G---TCA-ACTGACA--G--A--G---A-------------GAA------A---A--AG-------A---A--A---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AAAtggtgttccgctttgcgcatcccaactg
gi|45 : ACGTAG-TC-GTCTGGAGGCAGATAGCTACAAGA-TCATTTGTTATCTTG---GAGCATa
gi|46 : atgtctgttcgtcaatgtcatgt-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GAC-------------------TCA-ACC-ACA--A--G--T---G-------------TTggggagtcgg
gi|47 : GTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTGAAATTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTAtatatattgaaataatatggaagtaacaattaagatgtt
gi|48 : aatG-TTCG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAAAGCA-GGA---TAGA---CGC---C-T-TGTTTTTGTAcatttacagagaagtctgttt
gi|5 : agaaaataaaataatataaaataaTATCTTCC-AA-T--AA--GT-------CAAACATCTGC-TGGAGATCTA--GACG--AAC---GCA-C-G---TC--ACTGACAATA--A--T---G-------------TTG------ATTTA--AG-------A---A--C---AGAGTTTAAA-TT--G---TA----AA-----AGA-A---TGAA-T-GTA---AAGG--G-----TT--------AT---C--GTTAAATATTAT-ACG-TC--ACACAGA--GTAGGT------TTCCAA-GAAGAGACATGTTTAA-CTCGGCaa
gi|5 : ctatcagtgTATTGCG-GGTTATATTA-TT-TGCTGGTGG--TATCGCTACAAGA-TAATGGATGATGCTGTA-AAACATG--CC--AAG----T---CT---GACCC-TTTCTCC--GG-AA-GTCAAGCGGTCTAC-AACTTA--GGG-----AGT---TTAGGAA-ATCT--AGGACA---CTAGAATTGTGG---ATAATTCTGTATTTAACCTTTC-GAGCAGCTTATCTCTGCATCGCTTCTAACTGGTTCtaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggtggtatcgctacaagataatggatgatgctgtaaaacatgccaagtctgaccctttctccggaagtcaagcggtctacaacttagggagtttaggaaatctaggacactagaattgtggataattctgtatttaacctttcgagcagcttatctctgcatcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|52 : ctatcagtgtatcttccaataagtcaaacatctgctggagatctagacgaacgcacgtcactgacaataatgttgatttaagaacagagtttaaattgtaaaagaatgaatgtaaagggttatcgttaaatattatacgtcacacagagtaggtttccaagaagagacatgtttaactcggctaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatcCCATCTTCC-ATATA-TA--GC-------CAAACCCATCT-CGAGGACATA--GGCT--atttgtgtgccgg
gi|53 : aCTATCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACTCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--ttga
gi|54 : TTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTGGGCC-----------A---TAGA---CGA---C-T-TGTTCT
gi|55 : gtTATCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGAGAACCT
gi|6 : ggtt--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACTCA--GG------C---GTG-C-GTCCTCATGCCGACA--A--A--G---G-------------TT
gi|6 : tcaaatt-AGGGC-G-GG---AGATA--A-GAATA-----T---TAATAGTGAG----TG-GTTG----GGCCAATTAAATTGAAAGCTAGTGGGTG-TGAATGTCGGCATCGA---C---TGTTCGTCCATTC------CATATAG-TC-TTCCAGAGG--GACAGCTACAAGG-TTATTTGTAATCTTGTA-A--CATG--G---GAG-------------AGCCA-ACACGTCTTTG-A--ATCTAGTCTTCTCC-AATGGA--GAGAC---TGA-----AGAAT-CTCA--ATGACGCACCTG---GTCTATC-TGTTGTCATATTTT--GCCCAAC-gttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgagggcgggagataagaatattaatagtgagtggttgggccaattaaattgaaagctagtgggtgtgaatgtcggcatcgactgttcgtccattccatatagtcttccagagggacagctacaaggttatttgtaatcttgtaacatgggagagccaacacgtctttgaatctagtcttctccaatggagagactgaagaatctcaatgacgcacctggtctatctgttgtcatattttgcccaacctat
gi|7 : tcaaattgtcaaacccctgctggggactcaggcgtgcgtcctcatgccgacaaaggttgttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgATCTTCC-AC-A--TA--GC-------CAAACCACTTG-CAAGGACATA--GGCTTTGAC---ACA-C-A---TCC-ACTGACA--A--A--GA--G-------------ACA------A---A--AGT------A---A--T---A------AAA-TC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-AAA---CA-G--G-----TT--------GC---A--TTT---------------TAAAAACAG----CAGGT------TTCTAGTGGGGATGCATGTTCAA-CTGGGCACACTGCCTGTCT-GAAA--T------G----A-TTGCAAT--C-AAGAGAGATA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGT-GAGG-GAAGA-A--A-GGAAA-----CTTGTAGAAGTTAGACTTTA-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGGGAATG-GGA---TAGA---TGA---C-T-TGTTCTTGTAATAGT-GATAAGGAAA-T--TTCAGGTGG--AATTGCAACTAGG-TTAAAGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CG-CTGGTTA-ATACAAC--AA-AG-AGCAAGTCGTCTCC-ATTTTA--AGG-----TGG---TCAACAT-CTTA--GTctat
gi|8 : CTATCTGCC-AT-T--AA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GTC---GCG-C-G---TC--TCTGACAAGA--A--G---G-------------TT-----------------------A---A--T---A-----------C--A----A----AA-----ACAGT---T-GA-T-A------G-G--G-----TTA-------GT------TTTCAA-A--AT-A---TTGAAAATAGA--ACAGGT------TTCTAA-GGAGAGACGTGTTCAA-TTCGGCTAACGGC-------GAAC--T------T----A-----ACT--CTGGCAGGGGCT--GTACCACTACAGAAGG---TGCCGGGGCATTCCA--GTGGACAAT-GGTTCTG-GG-GAAGA-A--G-GAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGa
gi|8 : atTGAATTTGGCGATATGATAA-TGATTCTGGTGG--TATCGCCACAAAA-TAGTGGGTAATGCTGTA-ACACATG--AC--AAG----C---CT-CTGATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAGCGGCCTCC-AATGAA--GGG-----CGT---TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTGTAATCGCGTG-CAAAATTGTGTTTG--GCCCgcgatatgataatgattctggtggtatcgccacaaaatagtgggtaatgctgtaacacatgacaagcctctgatcaatccttctgagctcaagcggcctccaatgaagggcgtttagcatgtctgagacactgtaatcgcgtgcaaaattgtgtttggccc
gi|9 : atctatctgccattaagtcaaacccctgctggggacctagactgtcgcgcgtctctgacaagaaggttaatacaaaaacagttgatagggttagttttcaaaatattgaaaatagaacaggtttctaaggagagacgtgttcaattcggctaacggcgaacttaactctggcaggggctgtaccactacagaaggtgccggggcattccagtggacaatggttctggggaagaaggagtacttataataatcagtactggtcTATGAG--ATGTTATG-TAACATA--AC--CAA----T---TT-CTGGTCA-GTGCAAA--GG-AG-GTCAAGGAGTCTCC-AATTTA--GAT-----TGT---TTAGCAT-ATCT--GCGACA---CTGGAAGTATAAC---TAGTCATGCATA--GTCCAGC--AATAGCCCGACTCTGGACATTTTC-AATTTGTCCAATA-CAAGAAATTGCATTTAGAGACCAGACAT--GAGGAG--CTCTAT--GTGG---------AGCAT--TAAATGTCCTGTATGCTATTGA-TTCAGTTTTC-CAGTTTACTATGCGCTATGATG---TTGTTTTTTGTATGAGAAATCCT-ATGTTTGGTTTTC---TTTTAAGTAAGG--T----AGTCAGTGTGATTAGTTCT-TGTTGAGTCATCTG----AAA-TGGTGATTCTAAGATATTCAGCT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTGTCTTCCGTGAATGCCAAACTTTTATTGGTGATCTAGGCATGCATAGTATTTGAAAATATAGTAAAATAAAATTGAAAGAAACAAAGAAGTTTCGGTTATTAGGTTTAGAAAAGAAAACACTATGAAAATATGACAAGGGATTTTCTTGTTTATTCTGAGATGTGTTCAGTTCTTGTGATTGTAGAATTGAACTGTTCTGTGAGGTAATATAGGGATATCAGAGCTAATGAATTCCAGTCAAAGACTGTTATTGGGAAA
Unaligned ( gi|32 ): TCTGCCTTAGTTCTAATTGAACTGTTCTGTGGTTGTAAACAGGGGATATATGAAGCTAATGAATTCCAGTGAAATACTGTTCTGGGGGAAGCGAGATTTGTTATAGTCACTGGTTGCATCAATTAATTTGAAAGTGAGTGTGATTGTCGGCA
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGAGACCTAGAATTCGCATTTTCGACTGACGTATCTATAAGCGTCATACTTGCTAAAACGGTGTCAGTATGA
Unaligned ( gi|50 ): TGTTGGGAATGGGACTGATTCTAATTTAGTGTTATGAAGAATGTATGAGGTGTTGATATTTTTTTACTT
Unaligned ( gi|51 ): ATATGTTGCGGATTTGACTGAATCTAATTTCGCGTTATGGAGAATGAAGGAGGTGTTGAT
Unaligned ( gi|56 ): TCAATTTGTCCAATGCTAACACTGGGGTGTGGTG
Alignments
lowQualScore : 1111 222 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 11111111 1111111 1111 1 11111111 111 1111111111 1111 111111111111 22222 111111111 111 11111 2222222222
lowQualScore : 1 2 0000 44 5555555 6666 1 22 222 333 2 4 333 11 1 88 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 5555555 4444 55555 333 2 4 2 666 2 33 00000 88888888 999999 5555555 0 2 2 444 777777 22 1 2 2 2 2 33 99999999999 3 0 44 44 1 55 9999 0 44 0000 3 555 555 2 0 2 7 2 2 55 2 22222222 2 0 000 1 2 0 777777777 0 1 1 33 2222222222 444 666 1 1 4444 2 1 1 2 77 1 888 2 1 2 0 0 1 1111 33 3333 888888888888 2 1 33 44444 66 33 2 0 3 33 333333333333 0 33 444 444 2 5555 4 22 444 3 2 0 1 222 2 9999 3 00000 1 1 666 4 44 222222222 1 55 0 4 22 2 2 55 0 2 555 33 2 1 999 3 6666 1 2 444 4 0 33 66666 11 2 0 3333333333 1
lowQualScore : . . .... .. ....... .... . .. ... ... . . ... .. . .. .................................................................. . ....... .... ..... ... . . . ... . .. ..... ........ ...... ....... . . . ... ...... .. . . . . . .. ........... . . .. .. . .. .... . .. .... . ... ... . . . . . . .. . ........ . . ... . . . ......... . . . .. .......... ... ... . . .... . . . . .. . ... . . . . . . .... .. .... ............ . . .. ..... .. .. . . . .. ............ . .. ... ... . .... . .. ... . . . . ... . .... . ..... . . ... . .. ......... . .. . . .. . . .. . . ... .. . . ... . .... . . ... . . .. ..... .. . . .......... .
lowQualScore : 0 0 5555 33 9999999 4444 7 66 666 555 0 0 555 22 2 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0000000 2222 00000 777 1 2 2 999 2 11 88888 99999999 333333 8888888 3 4 5 000 222222 99 5 2 5 4 9 99 11111111111 1 3 66 88 2 00 9999 2 22 2222 1 000 111 9 1 7 5 5 5 99 5 33333333 2 1 888 6 4 2 111111111 3 9 8 44 7777777777 777 555 7 1 0000 9 0 0 9 00 2 555 9 4 5 5 7 6 0000 22 7777 555555555555 4 9 55 77777 00 33 4 3 7 22 000000000000 1 44 222 444 4 3333 8 44 111 0 9 4 0 999 9 4444 1 88888 0 0 555 0 22 333333333 0 22 5 8 11 9 9 33 4 9 000 99 1 0 666 1 5555 0 5 222 9 4 99 66666 00 9 7 3333333333 0
consensus : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
Reference ( family-863 ) : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
gi|1 : CTAACTGCC-AT-T--TA--TT-------TAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--TACT--GACTGAGCG-C-G---TCA--CTGACA--AGAA--T---G-------------TTA------AT--ATCAA-------A---A--T---ACAGTTGAAA-G---G---TA----AA-----AG-GA---T-GACT-GCA---CG-G--GG----TTA-------GT---T--TTTAAA-A--G----A-TTAAAA----------------------TAG-AG----ACATGTTCAA-CTCGACTTATGGCCGAGCT-GAAC--TCTGGCAG----AGTTGTGC---C-GCTACAGATG--GTG-----CCAG--GG------CA-----TTTCA--GCGGACGAT-GGTTC-TCGG-GAAGA-A--A-AAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGACAATAGGATAATGAATG-TGA---CGAT---CAG---C-T-AGGTCTGGTGTTGAG-GGTTATGTAA-CC---------------CACTA-AATA-TT--GGGTAATGCTGTA-AAACATT--AC--TAG----C---TT-CTTATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAG----CTCC-AATGTAAGGAG-----T-----TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTT-C----------TTT--AACCAACTGAGCAGCTCGTATCTGTA-AGTCTC-ATATTGGCAAATG-AGTGTGTCGGTATGGGAAGACCAGACAGGGTGGCAGTATTCGAA--TTAA---------GGCTTAACTACAGTATTATATGCAGTAGCTTTTAGTGCTT-G---TGA--ATGAACATTTATG---TT-TCTTC----TCAGGAATCCTTAAGTTTGGTTTGC--CTTTTCAGTGCTA--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGATAAG---TCTG----AGATT-GTGATTCTGAAATGTGTTGC
gi|10 : tctatAGG-TTATGGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CA-TTGATCA-ATACGAC--CG-GG-TTCAAGTCGTCTCC-AGTTTA--ATG-----TGG---TCAACAT-ACTG--GTGACA---CTGGAAGTGCGTTACATAATCACGTATT--GTCCAGC-GAGCTGCCAGTCTCTGCATGGATTC-AATTTGTCCGATC-CCAGCACTAGTGTGTGAGGACCAGACAGAGGAGTAGTACTCAAG--TTGA---------GGC---------GTC--ACATGCCATGGATTAGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATG---TT-CCGTC----TG---AATCCTAGTGTTTCTTTTGC--TTTGTT--TGATG--T----CGTCTATGTG-TTTGTTCCATGTTATGTTTTTTG----AGATT-GTGATTACTTAATATTTTGagatatgactgagtcttatttagtgttatggagaatgtaggcggcgttgatgttttttttacttgaatgatctggcatgtggatgggttgaagtgcatgtctcactttgtttcc
gi|11 : tACAAGAGTTGTATAGACCATGAACTTTAAATCTT-C---TGA--ATGTATTCTGATA---TT-TCCTC----TTAAAACCCCTTATTGTTGATTTTC---TTTATAGTAATG--T----TGTTGATGTG-TCTGTTCCATGTTAAATCCTCTGCA--ATA-T--TGACACCTTGGTATTTTGCatgatgaggttatttctaatgtagtg
gi|12 : GTCAGTGGTTG-CGTC----A----ATTAGTTTGAAAGCAAGCGAGTG-TGAATGTAGG----GATTGC-C-TGTTC--GTCTGTG----TCATTTAG-TC-TTCTAGTTG--AGTAGCTACAAGG-CCATTTGTGATCTTGTA-A--TATA--AGGACAG----TTGGCT----GTCT-ATACGTC--TT-TG-GTCTAGTCTACT-----------GA--------------AGCAT-CTCA--GTAACG---CTACTGGTCCATC-TGTAGTTATGGTTT--GCCCAGC-GTGTTGCATGGCAATTGACACCCTC-CACCGGTTTTATG-GCAATCTTAATATAAGGTGACCAGACACTTGAACAGTACTCTAA--TTGA---------GGTTGGACAAAA------------------------TCTT-C---TGA--ATGTACCTTTATA---GT-TCTTC----ATAAAAACACTACTGTTTGGTTTGagaggaggttgactctagtttagtgttaagaacgatatgtttctttgaccgtgcgatgtgtttaacattttgacaggttaagctccatgtcctactgtttcccctctgttcaagagtgcacaagtatgtctgtagtgcttgtgcttgttgttgttaaaatgattgcaaggtatatggcagtgtcgtctgcaaataagcggacctgagattttaccttggaggg
gi|13 : TATCTCTC-AC-A--TA--AC-------CAAACCGCTTT-TGAGGACATA--GGCTTTGAC---GTG-C-T---TCA-ACTGACA--A--A--G-------------------------------------------------------------------------------------AGAGA---A-AA-T-GTA---TA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GAAGGTTTCTACTTCTAG-GGGGGCACATATTCAA-CCTGGCACACTGCCTGTCT-GAACAAA------G----A-TTGGGCT--A-AAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGGG---TTTTA--TTGGACAAT-TGTGT-G-AG-G----------GGATATTTTTTTTGTAAAAGTCAGAATTTGATTTGTTTTG----ATTTGTCTGAAGGTCAGATACTG-GGA---TCTA---TGA---C-T-TGTTCTTATATTAGC-GATAA
gi|14 : C-G-GG-GAAGA-A--A-GAATG-----CTCATAATAATAAGCTCTGG-TCTG----A----ATTTAGCGATAGGATAATGAATA-TGA---CGAT---CTA---C-T-AGGTCTAGTGTTTAG-GGTTATATAA-TC-TTCTGGTAG--TATCGCCACGAGA-TAATGGGTAATACTGTA-AAACATG--CA--TAG----C---CT-CTGATCA-AACCTTC--TG-AG-GTCAAGCGGTCTCCAAATGTA--GGG-----AGGAGTTTAGCAT-TTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTG-CAAAGTCATGTTCA--ACCCACC-Ggaa
gi|15 : ggcaggggctgcgccactacagatggtgccagggcatttcagtgattgatggttcGTGATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTGCA--ATA-C--TGACACCTAGGTATTTTGC
gi|16 : -GG-GAAGA-AT-A-AAATA------TTATAAAAGTCAGAACATG-TTTG----A----ATTTGTCTGTAGACCATCGAGTG-GGA---T--A---CAG---C-T-TGTTCTTTTATTTGG-GATAAAGTA--------TGTT------------TAAGGTTTATAGATCACACTATG-----ATA--GC--CAG----T---CG-CTCGTCA-ATATGAC--GG-AG-CTCAAGTTGCCTCC-AGTTTA--AAT-----TAG---TCAACAT-CTTG--TTGACA---ATGAAAGTGCGGC-AATAGTCCTG----------A---GAGCAGCCCTTCTTTGTATGG------AC--------TG-G-AG--------TGTGGCGACCAGACAGGGGAGCAGTACTCGAG--CTGG---------Gagagtaggctgacgctagtttagtgttatgcaagtaatatgtggtgttattatgtttctttgactgtgtggggtgtataatttgacattttgacaagttaaactccatgtcccgctgtttttcccaatgttcaagagtgcataagtctgtctgtagtgtgtgtgattgttgtacatttgtgataacaaaataaacagcagtgtcatctgcaaataaccggaccaataaattaacctggggagg
gi|17 : tga--TA--GT-------CAAACCCTTGC--GAGGATATATAGGCTTTGAC---ACA-T-G---TCA-ACTGACA--AGGA--G---A-------------GCA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GT--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATATA-CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAAA--CCGGGT------TTATAG-GGGTACATATGACCAA-CCTAGCACACTGTCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAAACA--ATAT--TTTGAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGG-TAATTAGTGT-GAGG-GGAGA-A--A-GAAAA-----GTTGTAAAAGTCAGA--------------------TTTGT---TAGACCAGAGAATG-GGA---aagtgtac
gi|18 : acaG--GATAGCTACATGG-TCATTTGTGATCTTGTA-A--CATAGGAA--GAG----T---CTGCTG-TCT-ATACGTC--TC-TG-GTCTAGTCTTCTCC-AA------GAC-----TG-----TAGCAT-CTCA--GTGACA---CTACTCGTTCATC-TGTAATCGTGTTTT--ACCCAGC-GTTTTGCCTGGCACTGGACGCCTTC-AACTTAGTTTATG-GCA------GTATAAGGTTACCAGACACTTGAGCTGTACTCCAG--TTGA---------GGACGGACAAGAG
gi|2 : catggagtgttcatccatttattaagcagttatattgatcatctataaCTATCTTCC-AA-T--AA--GT-------CAAACCCATCG-TGAGGACATA--GACTA-GAT---GCA-C-G---TCA-ACTGACA--A--A--GT--G-------------TGA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGGGA---G-AA-A-ATA---CT-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--AC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACACATGTTCAA-CCTGGCAGTCTACGTGGCT-GAAC--T------G----A-TTGGCTC--C-GAGAGAGGCA--ATAT--TCTCAG--GG---AG-TTAG---TCCCA--GTGGACAAT-AGTGT-G-GG-GGAGA-A--ATGAATA-----CTTATAAAAATCTGAGCTTG-TTTG----G----ATTTGTCTATATGCCATAGAGTG-GGA---TAGA---TGA---C-C-TGTCCTTTTATTTGG-GATTAGATAG-GG-TTCAGTTGG--GATAGCAACTAGG-TTATGGACGATGTTATA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-TTGGTCA-ATA-GGA--TGCAG-GTCAAGTCATCTCT-AGTTTA--AAG-----TGG---TCAACAT-ATCA--GTAACA---CTGGAGGTGCGGC-CATAGATGTGCATT--GCCCAGC-AAGCAGCCTTTCTCTGCACAGACTC-AATTTGTCCGATG-CCAACGCTGGTGTGTGGTGACCAGACATAGGAGCAGTACTCTAG--CTTG---------GGTCTCACAAGTGTCATGTATGCAGTAGATTTTAGTTTGA-C---TGA--GTGAGCTTTGATG---TT-GTGTC----TGAGGAATCTTAGTGTTTGATTTGT--TTTTTTTGTTATA--T----TATCTGTGTG-TTTGTTCCATGATAAGTCATCTG-ATTATATT-GTGACACCAAGATATTTTGCT
gi|20 : ---TCAGCAT-GTCC--GAG-TA---CTAGAAGTGCGGA-CAAAGTCCTTTTAA--ACCCATC-GATCAGCTCGCCTCTGTACAGCATC-TACTTGGTAAATTTGT-GTGTACGTACGGAGCGACCAAATAATGGAGCAGTATTCTAG--TTGGATGGGTAGAGGGCTAGCCAATGTCTTATGTGCAGTTGAATTTAGATTTT-C---TGA--ATGTACATATATG---TT-TCTTC----TGAGGAATCC---TGTTAGA---------TTTTTATCA---------TGTCGATGTG-AGTGTTCCATG
gi|21 : aatG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-GAGG-GAAGA-A--A-AAA-------------AAAGTCAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-G-TGCTCTTGTAat
gi|22 : taaaagatataatacaaaatgtagttattttaactacttttaccagtgaaggtcacacttgcaggttcacactcactctctcgtttattcgaagattgaacgaatgtgaatgataaattcactgattttagtttaaatccaatgagtgcatgacCC-AT-A--TA--GC-------CAAACTCCTCG-CAAGGACATA--AGTTTTGAC---GCG-T-G---TCA-TCTGACA--A--A--GAG-G-------------GAA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-GA-A-ATA---CA-G--G-----TTATTGTATTGT---A--TTTATA-A--GC-AGG-TTAAAA-CGGA--GCAGAT------ATCTAG-GGG--TACATGTTCAA-TCTTGCACATTGCCTGTCG-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAG---------------AA--GG---AG-TGAG---TTCCG--CTGGACAAT-AGTGC-G-AGTGAAGA-A--A-GAAAA-----CTT
gi|23 : GACAAGAGTTTTATAGGCCATAGACTTTAAATCTC-C---TGA--ATGTACGTTTATA---TT-TTTTC----TTAAAAATACTAATGTTTGATTTGC--TTATTTGGTAATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTACA--AGA---GAGATACCTAGGTA
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcaTAAATCCTCTGTA--A-A-T-G---TACCTAGGTATCTcatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTgtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|24 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagagatacctaggtacatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaaG--GG---AG-TGAG---CTTCAAATT--ACAAT-GGTGC-C-AG-CAAGA-A--A----T------CTTG-AAAA---------TA-CCTG----G----ATTTGACAGTAAACCATGCAATG-TGA---TAGT---CAA---C-T-GGGTCTTCTATTGGG-GATAAGATCA-TA-TTTAGGTGG--GATGACAACATGG-GTATGCATGATATTATGTAAGT-TA--AC--TGG----A---GT-CTGGTCA-AGATGAT--GG-AG-----AATGG----------TG--GAT-----AGG---TCAG-ATAATCT--GTAACA---TTGGAAATATGGT-CATAGTTATGt
gi|25 : CTATCTTCC-GT-TAATA---C-------CAAACCC--TC-TGGGGACCTA--GGC----AT---GCG-TAA---TCATACCGACA--A--A--G---A-------------CTG------A---T--AG-------T---ATTT---A------AAA-AT--A---CA----TT-----AGAAA---C-AA-T-TTA---AA-A--GAAACATT--------GA---AGTTTTAAA-T--GCTAGGTTTAAAAATAAA--ga
gi|25 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgctggacagcctcgatctggtttatggcagtctcagtatggggtgaccag
gi|26 : tatctatcttccgttaataccaaaccctctggggacctaggcatgcgtaatcataccgacaaagactgatagtatttaaaaatacattagaaacaatttaaaagaaacattgaagttttaaatgctaggtttaaaaataaaaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgTCTAG--AGCC-AG-CGCA---TTCCA--GTGGACAAA-TGTCC-TTGG-GAAGA-A--A-GAGTA-----CTTATAACAATCAGAACT-----------G----ATATGAC--AAGGTAGGTGA----CGA---T------CTA---C-TATG-TCTAGTATTGCG-GATTGTGT-A-TT-TTCTGGTGG--------TACAA------------------------CACG--AA--CAT----T---CT-CTGATCA-ATCCTCC--CG-AGTTTCACGCGGTCTCC-AATGTA--GAG-----
gi|27 : ctcgcaagggcggtgccgctacaCTTTCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GAC---ACT-C-A---TC--ACTGACAAGA--A--G---G-------------TTA------AT--AT-AG-------A---A------A------ACA-GTTGA---TATGTTAA-----AAGGA---T-GACT-GTA---CA-G--GTT---TT--------GT---T--TTTAAA-------AGA-TTAAAAATAGC--CCAGGT------TTCTAA-GGGGAGACATGTTCAA-CTCGACTTACAGCCAAGCT-TAAC--T------agttgttgcat
gi|28 : tCTATCTATCGAT--------GC-------AAAACCCCTTT-TAGGGACCCA--GGC----AT---GCG-TAG---TCATACCGACA--A--A--GACTG-------------TTAGTTTTTA---A--AACTATATTA---A--C---A------AGATGT--T---TA----AA-----AGAAACAGT-GA-T-GTT---TC-G--G-----TT--------GTTAGG--TTTAAA-A--A-------TAAAAACCTACTATAAAT------T--TAT-GGTGAAATATGTTCAA-TTCTGCAGACT-----TCA-GAAT--T------G----A-ctgacaagtgttgtgccactacagatggtgcca
gi|29 : catgtctctaaaataatT--GAC---GCA-C-G---TCA-ACCAATA--A--A--GA--G-------------AGA------A---A--AT-------A---T--T---A------AAA-GC--A---TA----AACCGAAGGAGA---T-CA-T-TTA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAA-CAGA--GCAGGT------TTCTAT-GGGGACACACGTTCAG-CCTGGCATACCGTCTGT------C--T------A----A-TCGGGCT--C-AAGAGAGATA--CTAA--ATCCCG--GA---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACactgtt
gi|3 : ttCTATCTTCC-AC-A--TG--GC-------CAAACCCCTCG-CGAGGACATA--GACTTTGAC---ATA-C-G---TCA-ACTGACA--A--AT-G---G-----------------------------AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-A--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAGAACAGA--GCAGGT------ATCTAA-GGGGTCACGTGTTTAA-CTTGGTGCACTGCCTGTCT-GAAC--T------A----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACA--ATGT--TTCCAG--AT---AT-TGAG---TTCTG--CTGAACAAT-AATTC-GAGG-GAAGA-A--A-GAA------------AAAAGTAAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTATGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TATA---CGA---C--------------TAGG---TCAAGGAACTT-TTCAAGTGG--AGTTGCGACTAGT-TTATGGGTGGTGTAATA-GAGCTTG--AC--CAG----T---CG-TTGGTCA-ACACGAC--TA-CG-GTCAAGCCGCCTCC-AGTTTA--ATA-----TTG---TCAACAT-ATTG--GTGACA---CTGAAAGTGTGTC-CATAGTCGAGCATT--GCCAAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGTATATACTC-AATTTGTCCGATT-CCAGCATTCATGTTTGGGGACCAGCCAGAGAATCAGTACTGAAG--CTGG---------GGTCTCATAAGTGTCAGGTATGTCATGGATTTGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATA---TT-TCCTC----TGAGCAATCCTAGTGTTTGATTTGC--TTTCTTTGTGATG--T-----------------TGTTCCATGTTAAGT-CTATGGA--GAT-T-GGGATTCCAAAATATTTTGCT
gi|30 : GACCAGACAGAGTAGCAATACTATAGAATTGT-----------TCTTGCAAAGGTCCTGTATGCTGTTGATTTCATTTTTTTC---CGA--ACGTACTTTGATG---TT-ATGTG----AGAGAAAACCTCATGCTTGTTTTGTTATTTTTTTGTaatgagactgtttctaatgaa
gi|31 : G-------A---A--T---A------AAC-GT--G---TT----AA-----AGACA---A-GA-T-ATG---TA-G--A-----GT--------GT---A--TT--AA-A--AC-AGG-TTTAAA-CAGA--ACATGC------TTCTAG-GGAGACACGTGTTCTA-TCTGGTAAACAGCCTGGTT-GAAC--T------G----A-AGGGCCT--C-TAGtccgtatcggataatcagataatcataatgtgccactaagatttt
gi|33 : AAGA-TCATATATGTGGTAACCTTGAGTGATT-C---AGA--ATGGACTATGATAACATT-TCTGC----TTAGGAATCCTAGTTTTTGATTTGTG-TTTTTTCGTAATGCAT----TTTT--TATG-TGTGTTCCGTG-TGAGTTTTCTtatctccatattaacggtttactgcactgttaata
gi|34 : agtggactatagtttaagggaCTATCTGCC-AT-T--AA--GT-------CAAACCCCTGC-TTGAGACCTA--AACT--GAC---ATG-T-G---TCA--CTGACA--AGAA--A---G-------------TTA------A--------------------------------------T--A---TA----AA-----ACAGT---T-GA-T-A--------G--G-----TTTAAATG--GT------TTTAAA--------GA-TTAAAAATAGA--GCAGGT------TTCTAA-GGATTGACATGTCTAA-CTC
gi|35 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGACACTTGAGCAGTACTC------TGG---------GGGCTGACAAGAGTTTTATAGTTCATAGACTTTA-------------A--AT----TTTGATA---TT-TCTTC----TTAAAAACCCCAATGTTTAATTTt
gi|36 : agtgCATA--AC--CAG----T---CT-CCGGTAA-AT---------------CA---TGTCTCA-AATTTA--GAT-----TGG---TCAGCAT-ATATATGTGACA---CTGAAAGTGCGAC-CATAGTCACGTATC--GTCCTTC-GAGCAGCTCGTCCCTAGA
gi|37 : gggatgagagtaatttcatgttaCTTCC-AT-A--TA--GC-------CAAACCCCT---CGGG-----A--GGCTTTGAC---ATG-T-G---TCC-ACTGACA--A--A--G-------------------A------G---A--AA-------A---A--T---A----------GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--ATTAtaat
gi|38 : TCTGCC-AT-C--TA--GT-------CAAAGCCCTAC-TGGGGACTTA--GACA--TAC---ATG-C-G---TC--ACTGACA--A--GACG---A-------------TTA------A---T--AT-------A---A------A------AAA-AC-------------A-----AGTGA---T-AA-tattgctgacattaaacaaggttttatagtcggtgcatgtt
gi|39 : atctatcGTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTAAAGTCCTCTGCA--ATA---GTGATGCCTAGGTAgttaaaaagatgtctgttcagggttagtttttaaat
gi|4 : aatCTATCTT---ATGT--TAATGT-------CAAACCCCTTT-TGGGGACCTA--GGC----AT---GTGTC-G---CCATACCAACA--A--A--G---ACTTAATTAGTTTTTTA------A---A--AA-------ATATA--TTAAA------AAA-GA--AATTTA----AA-----AGAAA---T-AG-TGATGTTTCA-GTTG-----TT--------AG---G--TTTAAA-A--A-------TAAAAACATA--CTATGA------ATTTAT-GATGAGATATGTTCAA-TTCTGCTGATT-TCTGTATCAAAC--T------GTTCTA-T--GGTTAAT-GATATAGG-G--GTAT-----CAG--AACCTAA-TGAA---TTCCA--ATGAAAAAC-TGTTC-A-GG-GAAAA-ACGA-GAAT-------TTGTAAAAGTCAGTGGTGG-TGTT----A----ATTAGT-TGAAAGCAAGTGAATGTGAA---T-GT---CGG---GAT-TGTCTGTTTGTCAGT-G-TTATGTAA-TC-TTCTATGGG--GATAGCTACAAGG-TCATTGGTGATTTTGTA-ACACAGA--GA--GAGAGAGT-------TGGCTGTATACATC--TT-TG-GTCTAGTCTTTTCC-ACTGGA--GAGAGTACTGA-----AGCAT-CTTA--GTAATG---CTACTGGTCTGTC-TATAGTCTTGTCTT--GCCCAGT-GTGCTGCCCGGCATTGGACGTCTTC-AACCTGATTTATG-GCAGTCTCTGTATAAGGTGACCGTACATTTGAACGGTACTCCAA--TTGA---------GAGCAGACAAGAGTTTTATATGCCATGGACTTTAAGTCTT-C---TGG--ATGTACCTATATGTA-TT-TCTTC----TTATAAATCCTAATATTTGGTTTcatttacataggaggtagtctctagtttagcattgtgtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|40 : atGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTA
gi|41 : aACGCCCTC-AACCTGGTTTATG-GCAGCCTCAGTATAAGGTGACCAGACACTTGAGCAGTGCTCCAG--TTTA---------GAGCGGACACGAGTTTTATAGGCCATGGACTTTAAATCTT-C---TGA--Acatttacagaggaggtagtctctnnnnnnnnnngtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|42 : agTCTAT-GGGGACACATGATCAAACCTGGCACACTGCCAGTTT-AAAG--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACAATATAT--TTTCAG--GG----G-CAAG---TTTCA--CTGGACATT-AGTAT-GAGG-GAAGA-A--T-GAAAA-----CTTaatgtata
gi|43 : -------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---G-AA-T-ATA---CA-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A---C-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACATATGTTCA
gi|44 : taTATCTTCC-AC-A--TAC-GTGACATAGCAAACTCCACCACAAGGACATA--GGCTTTGAG---GTG-T-G---TCA-ACTGACA--G--A--G---A-------------GAA------A---A--AG-------A---A--A---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AAAtggtgttccgctttgcgcatcccaactg
gi|45 : ACGTAG-TC-GTCTGGAGGCAGATAGCTACAAGA-TCATTTGTTATCTTG---GAGCATa
gi|46 : atgtctgttcgtcaatgtcatgt-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GAC-------------------TCA-ACC-ACA--A--G--T---G-------------TTggggagtcgg
gi|47 : GTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTGAAATTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTAtatatattgaaataatatggaagtaacaattaagatgtt
gi|48 : aatG-TTCG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAAAGCA-GGA---TAGA---CGC---C-T-TGTTTTTGTAcatttacagagaagtctgttt
gi|5 : agaaaataaaataatataaaataaTATCTTCC-AA-T--AA--GT-------CAAACATCTGC-TGGAGATCTA--GACG--AAC---GCA-C-G---TC--ACTGACAATA--A--T---G-------------TTG------ATTTA--AG-------A---A--C---AGAGTTTAAA-TT--G---TA----AA-----AGA-A---TGAA-T-GTA---AAGG--G-----TT--------AT---C--GTTAAATATTAT-ACG-TC--ACACAGA--GTAGGT------TTCCAA-GAAGAGACATGTTTAA-CTCGGCaa
gi|5 : ctatcagtgTATTGCG-GGTTATATTA-TT-TGCTGGTGG--TATCGCTACAAGA-TAATGGATGATGCTGTA-AAACATG--CC--AAG----T---CT---GACCC-TTTCTCC--GG-AA-GTCAAGCGGTCTAC-AACTTA--GGG-----AGT---TTAGGAA-ATCT--AGGACA---CTAGAATTGTGG---ATAATTCTGTATTTAACCTTTC-GAGCAGCTTATCTCTGCATCGCTTCTAACTGGTTCtaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggtggtatcgctacaagataatggatgatgctgtaaaacatgccaagtctgaccctttctccggaagtcaagcggtctacaacttagggagtttaggaaatctaggacactagaattgtggataattctgtatttaacctttcgagcagcttatctctgcatcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|52 : ctatcagtgtatcttccaataagtcaaacatctgctggagatctagacgaacgcacgtcactgacaataatgttgatttaagaacagagtttaaattgtaaaagaatgaatgtaaagggttatcgttaaatattatacgtcacacagagtaggtttccaagaagagacatgtttaactcggctaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatcCCATCTTCC-ATATA-TA--GC-------CAAACCCATCT-CGAGGACATA--GGCT--atttgtgtgccgg
gi|53 : aCTATCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACTCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--ttga
gi|54 : TTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTGGGCC-----------A---TAGA---CGA---C-T-TGTTCT
gi|55 : gtTATCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGAGAACCT
gi|6 : ggtt--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACTCA--GG------C---GTG-C-GTCCTCATGCCGACA--A--A--G---G-------------TT
gi|6 : tcaaatt-AGGGC-G-GG---AGATA--A-GAATA-----T---TAATAGTGAG----TG-GTTG----GGCCAATTAAATTGAAAGCTAGTGGGTG-TGAATGTCGGCATCGA---C---TGTTCGTCCATTC------CATATAG-TC-TTCCAGAGG--GACAGCTACAAGG-TTATTTGTAATCTTGTA-A--CATG--G---GAG-------------AGCCA-ACACGTCTTTG-A--ATCTAGTCTTCTCC-AATGGA--GAGAC---TGA-----AGAAT-CTCA--ATGACGCACCTG---GTCTATC-TGTTGTCATATTTT--GCCCAAC-gttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgagggcgggagataagaatattaatagtgagtggttgggccaattaaattgaaagctagtgggtgtgaatgtcggcatcgactgttcgtccattccatatagtcttccagagggacagctacaaggttatttgtaatcttgtaacatgggagagccaacacgtctttgaatctagtcttctccaatggagagactgaagaatctcaatgacgcacctggtctatctgttgtcatattttgcccaacctat
gi|7 : tcaaattgtcaaacccctgctggggactcaggcgtgcgtcctcatgccgacaaaggttgttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgATCTTCC-AC-A--TA--GC-------CAAACCACTTG-CAAGGACATA--GGCTTTGAC---ACA-C-A---TCC-ACTGACA--A--A--GA--G-------------ACA------A---A--AGT------A---A--T---A------AAA-TC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-AAA---CA-G--G-----TT--------GC---A--TTT---------------TAAAAACAG----CAGGT------TTCTAGTGGGGATGCATGTTCAA-CTGGGCACACTGCCTGTCT-GAAA--T------G----A-TTGCAAT--C-AAGAGAGATA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGT-GAGG-GAAGA-A--A-GGAAA-----CTTGTAGAAGTTAGACTTTA-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGGGAATG-GGA---TAGA---TGA---C-T-TGTTCTTGTAATAGT-GATAAGGAAA-T--TTCAGGTGG--AATTGCAACTAGG-TTAAAGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CG-CTGGTTA-ATACAAC--AA-AG-AGCAAGTCGTCTCC-ATTTTA--AGG-----TGG---TCAACAT-CTTA--GTctat
gi|8 : CTATCTGCC-AT-T--AA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GTC---GCG-C-G---TC--TCTGACAAGA--A--G---G-------------TT-----------------------A---A--T---A-----------C--A----A----AA-----ACAGT---T-GA-T-A------G-G--G-----TTA-------GT------TTTCAA-A--AT-A---TTGAAAATAGA--ACAGGT------TTCTAA-GGAGAGACGTGTTCAA-TTCGGCTAACGGC-------GAAC--T------T----A-----ACT--CTGGCAGGGGCT--GTACCACTACAGAAGG---TGCCGGGGCATTCCA--GTGGACAAT-GGTTCTG-GG-GAAGA-A--G-GAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGa
gi|8 : atTGAATTTGGCGATATGATAA-TGATTCTGGTGG--TATCGCCACAAAA-TAGTGGGTAATGCTGTA-ACACATG--AC--AAG----C---CT-CTGATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAGCGGCCTCC-AATGAA--GGG-----CGT---TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTGTAATCGCGTG-CAAAATTGTGTTTG--GCCCgcgatatgataatgattctggtggtatcgccacaaaatagtgggtaatgctgtaacacatgacaagcctctgatcaatccttctgagctcaagcggcctccaatgaagggcgtttagcatgtctgagacactgtaatcgcgtgcaaaattgtgtttggccc
gi|9 : atctatctgccattaagtcaaacccctgctggggacctagactgtcgcgcgtctctgacaagaaggttaatacaaaaacagttgatagggttagttttcaaaatattgaaaatagaacaggtttctaaggagagacgtgttcaattcggctaacggcgaacttaactctggcaggggctgtaccactacagaaggtgccggggcattccagtggacaatggttctggggaagaaggagtacttataataatcagtactggtcTATGAG--ATGTTATG-TAACATA--AC--CAA----T---TT-CTGGTCA-GTGCAAA--GG-AG-GTCAAGGAGTCTCC-AATTTA--GAT-----TGT---TTAGCAT-ATCT--GCGACA---CTGGAAGTATAAC---TAGTCATGCATA--GTCCAGC--AATAGCCCGACTCTGGACATTTTC-AATTTGTCCAATA-CAAGAAATTGCATTTAGAGACCAGACAT--GAGGAG--CTCTAT--GTGG---------AGCAT--TAAATGTCCTGTATGCTATTGA-TTCAGTTTTC-CAGTTTACTATGCGCTATGATG---TTGTTTTTTGTATGAGAAATCCT-ATGTTTGGTTTTC---TTTTAAGTAAGG--T----AGTCAGTGTGATTAGTTCT-TGTTGAGTCATCTG----AAA-TGGTGATTCTAAGATATTCAGCT
blockSeqs : C G TAA AT GACATAG CCAC A TA TTT . T A TCC AT T AG AGACTTAATTAGTTTTTTAAAAAATATATTAAA T AAATT TGTT CCGAA CAG G C G TTT G TT AAACA ATTGTATT TAGG TATTAT T A CTA TTCTAC GT G C A C C AA GTTCT . AA TG C AT CCAC AA CCTA C GCA AAT T T A T T CG T TATTTTTT G TGG T A TTTTG C G TG ATGTCGGCAT TTG TA T G TGGC A C T C GA T CAG A T T G TAAG GG GGAC TTGGCT T A GA TTTG TT TC A T . GAGTACTGA AA TAT CAC G TTAC A TA TTA G . C GGA T TCCG T CACTA T G GAG A AA ATGGGTAGA C GG G CA G T GT T AGT CT A T ACA G TGTA G A TAT A CA GTTGT CT A ATTATATT T
blockSeqs : T . ATA C . TTT A . TTT . . A . AT T AT AGACTGTTAGTTTTTAAAACTATATTAACA . TTGA . . . . . . TA . . TT TAAATG AGT TGCT . A G . G G C . C . . G . . A C . TT . CCA . . T . . A . . T . TGC A AAT T . GGCCA A C T ATGTAGG . AT T A AGC G A T . C T A C C . C GAG . CC TCTGC . A GT TGC T TC . G . GAGGAGT A G . C TCT A GT T G . G ACC . TTTT . TCTTA A T CTT T . . T GG A CA G C AA . . . T G TA . . T T GT T . GTTGT TG . CAATAT A
blockSeqs : T . GT . . CGT A . TTT . . . . AT T AG ATGTTGATTTAAGAACAGAGTTT . TA . . . . . . . . . . A A AGC . A C . G A C . G . . G . . A C . TT . A . . C . . T . . . . AAG A CTC G . A T A G TCTA . C G G TAG A T A . C T T A T . A AAA . AT AGAGT . C TT CG G CG . T . GACTGA C A . G TGC A TT T C . T GCC . GTTT . CGCTG T C GGG G . . A TC T AG A T GT . . . T T . . . T A T T . C TG . CAATAC A
blockSeqs : G . A . . CGC A . TTT . . . . AT T . GGAGAGCAAAAGAACA . CA . . . . . . . . . . . A AGC . A G . G G T . C . . G . . G T . TT . A . . G . . A . . . . TAC G AAC T . A C G T CGAT . T T T TGG A A G . G A G A A . A AAG . CC TCAT . A GA TT G TT . T . GTGG T T . A GCA C TT A G . G AGA . TCCG . TGTAC A T CTT C . . T TA T AG T A GA . . . A G . . . G A T G . T CT . GAGATT A
blockSeqs : A . T . . TCT C . TTT . . . . A C . AGAGGGAAAAAGAACA . CA . . . . . . . . . . . A AAC . A G . G G G . T . . G . . A C . AA . A . . C . . A . . . . AAC A AGC T . A A A G TAGA . T T T TGG A T G . A A G G A . C GAG . AG CCTC . A GT TG C TC . G . TTAG C G . C TCT G CA T G . C AGC . GTAA . TCTCA T T TAG T . . G TC A CA A C AA . . . T T . . . G A T T . T CG . AGATT A
blockSeqs : T . A . . GCT C . TTT . . . . A T . AGACTGATAGTATTTA . TA . . . . . . . . . . . A AGC . A C . A T A . G . . G . . A C . TT . A . . C . . A . . . . TAC G AAT T . G A G G TAGA . T C G GGG A A T . T T G T T . G ACA . CC TCGC . A GG GG G TC . T . GTGG C A . G GCC G TT T T . T AGC . GTTT . CATTC G C ATG T . . T TT C CA G T GT . . . T T . . . T A T T . T TG . CAAGA A
blockSeqs : G . T . . TTT C . TTT . . . . A C . AGAGACAAAAGTAATA . TT . . . . . . . . . . . T AGC . A G . T G C . T . . A . . A T . TT . A . . G . . . . . . . AAC A AAC T . G A A G TAGT . C G C GCG G T A . T A A A G . A GAG . CT TCTT . A GA TC G TG . T . TAGG A A . G GAC C CA A G . G ATA . TCCG . TCTCA G T GAG A . . T TG A TG T T TT . . . A T . . . G C . C . T TG . TAAAT T
blockSeqs : T . A . . CGC A . TA . . . . A C . AGTGTGAAAAGAATA . CA . . . . . . . . . . . A AGC . A G . T G C . C . . A . . T C . TT . A . . C . . . . . . . TAT G AAT T . G G A G TATA . G T G AGG A C T . C T G A T . G AAA . AC AGTC . C TC GG G CG . G . ATTG G C . G GTC A TA T T . T AGC . GTTT . TCTCT T G GAG T . . G AG T GG A C GT . . . T G . . . G A . A . T TG . CAATA G
blockSeqs : G . T . . GCT C . T . . . . A T . AGGTTAATATAGAAA . CA . . . . . . . . . . . A AAC . A A . A A C . A . . G . . G . . T . A . . C . . . . . . . AAC G TGG G . G T A T TAGA . T T T AGT A T C . C T T C T . T GAG . CC TCTC . A GA CG G CC . T . TTGG A T . A TCC G TC C G . G GTC . ATTT . CCTCA G T CTT C . . G GG T CA A C AG . . . G G . . . T A . . . T TG . CAATA G
blockSeqs : T . A . . ACT T . T . . . . A T . AGAGAGAAAATATTA . TG . . . . . . . . . . . A AAT . A G . G A G . G . . G . . A . . . . A . . A . . . . . . . TAC A ACT T . G A A C TAGA . T T G GCG . T T . T T G A T . C ACA . CC TCGT . A AT TA G TC . G . GAGT A G . A ACC A TA T T . G GCC . GTTT . AAATT A T TTT C . . G T T CA G C AA . . . T G . . . T A . A TG . CAATA G
blockSeqs : T . C . . TTT C . T . . . . A T . GACGATTAATATAAA . TA . . . . . . . . . . . A AA . A C . A T G . C . . G . . A . T . . C . . . . . . . TA . TAC T . A T G G TAGA . T T C AGT . C T . C C A T T . G TAA . AG TCTC . T TC TT A CG . T . GTGG C A . C TCT T TT T A . G CGC . TCCA . . A T CTT T . . C . C CA G C GT . . . C T . . . T . . . CA . AAATG T
blockSeqs : T . A . . GCT A . A . . . . C T . AGAGAAAAAGAAAA . CA . . . . . . . . . . . G AA . A G . T G C . C . . T . . . . . C . . . . . . . TC . A T . G A G G TGT . T T G TG . A G . . A T C A . C A . CA TCGC . A GT GG A TC . G . GCGT A T . G TCT C TT G G . C ATT . . . . T A T . . . . TA T . . . . . . G . . . G . . . T .
blockSeqs : T . T . . GCT C . G . . . . A C . AGAGAAAAATA . CA . . . . . . . . . . . A AC . A G . T A C . A . . . G . . . . . . . T . . G . G T A T TA . . . G C . A G . . T . . C . G A . CC CCTC . A AA AA C TC . T . TTGT C A . T TGC A CA A . . G GG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . T . . CTC C . T . . . . A T . ATGGAGAATA . CA . . . . . . . . . . . C . . . A . G A G . . . . . . . . . . . G G . G T . . . . . . . . G A . CA TTTC . C TT TG G CG . . . CTG C A . G AC G . .
blockSeqs : G . T . . GCT A . T . . . . C C . GAAAGTTAA . TG . . . . . . . . . . . A . . . . . A G T . . . . . . . . . A . . . . G . . CC TCT . G AA GG . GA . . . . G T . . G A
blockSeqs : T . T . . GCT C . T . . . . . T . AGGTTAATA . CA . . . . . . . . . . . . . . . A A G . . . . . G . . . . . . T . . . A T
blockSeqs : G . A . . GCT C . . . . . . . C . AG . CA . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . TGC T . . . . . . . T . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . GCT A . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . GC C . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqCons : *** CA***** ***** ******** AGC**** G** G********** TT** A*** G** TC ** GTGG******** TN
originalCons : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
finalCons : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GCA-----TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAAAGC----AGG-TTAAAAACAGAG--CAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--TG----------A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATATT--TCCAG--GGA---G-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGGG--ATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAGTGG--------TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTGTCTTCCGTGAATGCCAAACTTTTATTGGTGATCTAGGCATGCATAGTATTTGAAAATATAGTAAAATAAAATTGAAAGAAACAAAGAAGTTTCGGTTATTAGGTTTAGAAAAGAAAACACTATGAAAATATGACAAGGGATTTTCTTGTTTATTCTGAGATGTGTTCAGTTCTTGTGATTGTAGAATTGAACTGTTCTGTGAGGTAATATAGGGATATCAGAGCTAATGAATTCCAGTCAAAGACTGTTATTGGGAAA
Unaligned ( gi|32 ): TCTGCCTTAGTTCTAATTGAACTGTTCTGTGGTTGTAAACAGGGGATATATGAAGCTAATGAATTCCAGTGAAATACTGTTCTGGGGGAAGCGAGATTTGTTATAGTCACTGGTTGCATCAATTAATTTGAAAGTGAGTGTGATTGTCGGCA
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGAGACCTAGAATTCGCATTTTCGACTGACGTATCTATAAGCGTCATACTTGCTAAAACGGTGTCAGTATGA
Unaligned ( gi|50 ): TGTTGGGAATGGGACTGATTCTAATTTAGTGTTATGAAGAATGTATGAGGTGTTGATATTTTTTTACTT
Unaligned ( gi|51 ): ATATGTTGCGGATTTGACTGAATCTAATTTCGCGTTATGGAGAATGAAGGAGGTGTTGAT
Unaligned ( gi|56 ): TCAATTTGTCCAATGCTAACACTGGGGTGTGGTG
Alignments
lowQualScore : 1111 222 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 11111111 1111111 1111 1 11111111 111 1111111111 1111 111111111111 22222 111111111 111 11111 2222222222
lowQualScore : 1 2 0000 44 5555555 6666 1 22 222 333 2 4 333 11 1 88 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 5555555 4444 55555 333 2 4 2 666 2 33 00000 88888888 999999 5555555 0 2 2 444 777777 22 1 2 2 2 2 33 99999999999 3 0 44 44 1 55 9999 0 44 0000 3 555 555 2 0 2 7 2 2 55 2 22222222 2 0 000 1 2 0 777777777 0 1 1 33 2222222222 444 666 1 1 4444 2 1 1 2 77 1 888 2 1 2 0 0 1 1111 33 3333 888888888888 2 1 33 44444 66 33 2 0 3 33 333333333333 0 33 444 444 2 5555 4 22 444 3 2 0 1 222 2 9999 3 00000 1 1 666 4 44 222222222 1 55 0 4 22 2 2 55 0 2 555 33 2 1 999 3 6666 1 2 444 4 0 33 66666 11 2 0 3333333333 1
lowQualScore : . . .... .. ....... .... . .. ... ... . . ... .. . .. .................................................................. . ....... .... ..... ... . . . ... . .. ..... ........ ...... ....... . . . ... ...... .. . . . . . .. ........... . . .. .. . .. .... . .. .... . ... ... . . . . . . .. . ........ . . ... . . . ......... . . . .. .......... ... ... . . .... . . . . .. . ... . . . . . . .... .. .... ............ . . .. ..... .. .. . . . .. ............ . .. ... ... . .... . .. ... . . . . ... . .... . ..... . . ... . .. ......... . .. . . .. . . .. . . ... .. . . ... . .... . . ... . . .. ..... .. . . .......... .
lowQualScore : 0 0 5555 33 9999999 4444 7 66 666 555 0 0 555 22 2 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 0000000 2222 00000 777 1 2 2 999 2 11 88888 99999999 333333 8888888 3 4 5 000 222222 99 5 2 5 4 9 99 11111111111 1 3 66 88 2 00 9999 2 22 2222 1 000 111 9 1 7 5 5 5 99 5 33333333 2 1 888 6 4 2 111111111 3 9 8 44 7777777777 777 555 7 1 0000 9 0 0 9 00 2 555 9 4 5 5 7 6 0000 22 7777 555555555555 4 9 55 77777 00 33 4 3 7 22 000000000000 1 44 222 444 4 3333 8 44 111 0 9 4 0 999 9 4444 1 88888 0 0 555 0 22 333333333 0 22 5 8 11 9 9 33 4 9 000 99 1 0 666 1 5555 0 5 222 9 4 99 66666 00 9 7 3333333333 0
consensus : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
Reference ( family-863 ) : CTATCTNCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTNC-CGGGGACCTA--GGCT--GAC---GCG-C-G---TCA-ACCGACA--A--A--G---G-------------TTA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGGGACACATGTTCAA-CCCGGCACACTGCCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-GAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-G-GG-GAAGA-A--A-GAATA-----CTTGTAAAAGTCAGAACTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGNGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-T-TGTTCTTGTATTNGG-GATNANGTAA-TC-TTCTGGTGG--GATNGCTACAAGG-TTATGGGTGATGTTGTA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-CTGGTCA-ATACGNC--TG-AG-GTCAAGTCGTCTCC-AATTTA--GAG-----TGG---TCAGCAT-NTCN--GTGACA---CTGGAAGTGCGTC-CATAGTCGTGTNTT--GCCCAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGNACGGCCTC-AACTTGNTCGATG-GCAGCGTCGGTATGNGGTGACCAGACANNGGAGCAGTACTCNAG--TTGG---------GGNCTGACAAGAGTCNTATATGCCGTGGACTTTAGTTCTT-C---TGA--ATGNACTTTNATG---TT-TCTTC----TNAGAAATCCTAATGTTTGATTTGC--TTTTTTNGTGATG--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTCCTCTGCA--ANA-T-GTGATNCCTAGGTATTTTGCT
gi|1 : CTAACTGCC-AT-T--TA--TT-------TAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--TACT--GACTGAGCG-C-G---TCA--CTGACA--AGAA--T---G-------------TTA------AT--ATCAA-------A---A--T---ACAGTTGAAA-G---G---TA----AA-----AG-GA---T-GACT-GCA---CG-G--GG----TTA-------GT---T--TTTAAA-A--G----A-TTAAAA----------------------TAG-AG----ACATGTTCAA-CTCGACTTATGGCCGAGCT-GAAC--TCTGGCAG----AGTTGTGC---C-GCTACAGATG--GTG-----CCAG--GG------CA-----TTTCA--GCGGACGAT-GGTTC-TCGG-GAAGA-A--A-AAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGACAATAGGATAATGAATG-TGA---CGAT---CAG---C-T-AGGTCTGGTGTTGAG-GGTTATGTAA-CC---------------CACTA-AATA-TT--GGGTAATGCTGTA-AAACATT--AC--TAG----C---TT-CTTATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAG----CTCC-AATGTAAGGAG-----T-----TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTT-C----------TTT--AACCAACTGAGCAGCTCGTATCTGTA-AGTCTC-ATATTGGCAAATG-AGTGTGTCGGTATGGGAAGACCAGACAGGGTGGCAGTATTCGAA--TTAA---------GGCTTAACTACAGTATTATATGCAGTAGCTTTTAGTGCTT-G---TGA--ATGAACATTTATG---TT-TCTTC----TCAGGAATCCTTAAGTTTGGTTTGC--CTTTTCAGTGCTA--T----TGTCGATGTG-TGTGTTCCATGATAAG---TCTG----AGATT-GTGATTCTGAAATGTGTTGC
gi|10 : tctatAGG-TTATGGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CA-TTGATCA-ATACGAC--CG-GG-TTCAAGTCGTCTCC-AGTTTA--ATG-----TGG---TCAACAT-ACTG--GTGACA---CTGGAAGTGCGTTACATAATCACGTATT--GTCCAGC-GAGCTGCCAGTCTCTGCATGGATTC-AATTTGTCCGATC-CCAGCACTAGTGTGTGAGGACCAGACAGAGGAGTAGTACTCAAG--TTGA---------GGC---------GTC--ACATGCCATGGATTAGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATG---TT-CCGTC----TG---AATCCTAGTGTTTCTTTTGC--TTTGTT--TGATG--T----CGTCTATGTG-TTTGTTCCATGTTATGTTTTTTG----AGATT-GTGATTACTTAATATTTTGagatatgactgagtcttatttagtgttatggagaatgtaggcggcgttgatgttttttttacttgaatgatctggcatgtggatgggttgaagtgcatgtctcactttgtttcc
gi|11 : tACAAGAGTTGTATAGACCATGAACTTTAAATCTT-C---TGA--ATGTATTCTGATA---TT-TCCTC----TTAAAACCCCTTATTGTTGATTTTC---TTTATAGTAATG--T----TGTTGATGTG-TCTGTTCCATGTTAAATCCTCTGCA--ATA-T--TGACACCTTGGTATTTTGCatgatgaggttatttctaatgtagtg
gi|12 : GTCAGTGGTTG-CGTC----A----ATTAGTTTGAAAGCAAGCGAGTG-TGAATGTAGG----GATTGC-C-TGTTC--GTCTGTG----TCATTTAG-TC-TTCTAGTTG--AGTAGCTACAAGG-CCATTTGTGATCTTGTA-A--TATA--AGGACAG----TTGGCT----GTCT-ATACGTC--TT-TG-GTCTAGTCTACT-----------GA--------------AGCAT-CTCA--GTAACG---CTACTGGTCCATC-TGTAGTTATGGTTT--GCCCAGC-GTGTTGCATGGCAATTGACACCCTC-CACCGGTTTTATG-GCAATCTTAATATAAGGTGACCAGACACTTGAACAGTACTCTAA--TTGA---------GGTTGGACAAAA------------------------TCTT-C---TGA--ATGTACCTTTATA---GT-TCTTC----ATAAAAACACTACTGTTTGGTTTGagaggaggttgactctagtttagtgttaagaacgatatgtttctttgaccgtgcgatgtgtttaacattttgacaggttaagctccatgtcctactgtttcccctctgttcaagagtgcacaagtatgtctgtagtgcttgtgcttgttgttgttaaaatgattgcaaggtatatggcagtgtcgtctgcaaataagcggacctgagattttaccttggaggg
gi|13 : TATCTCTC-AC-A--TA--AC-------CAAACCGCTTT-TGAGGACATA--GGCTTTGAC---GTG-C-T---TCA-ACTGACA--A--A--G-------------------------------------------------------------------------------------AGAGA---A-AA-T-GTA---TA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAGA--GAAGGTTTCTACTTCTAG-GGGGGCACATATTCAA-CCTGGCACACTGCCTGTCT-GAACAAA------G----A-TTGGGCT--A-AAGAGAGACA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGGG---TTTTA--TTGGACAAT-TGTGT-G-AG-G----------GGATATTTTTTTTGTAAAAGTCAGAATTTGATTTGTTTTG----ATTTGTCTGAAGGTCAGATACTG-GGA---TCTA---TGA---C-T-TGTTCTTATATTAGC-GATAA
gi|14 : C-G-GG-GAAGA-A--A-GAATG-----CTCATAATAATAAGCTCTGG-TCTG----A----ATTTAGCGATAGGATAATGAATA-TGA---CGAT---CTA---C-T-AGGTCTAGTGTTTAG-GGTTATATAA-TC-TTCTGGTAG--TATCGCCACGAGA-TAATGGGTAATACTGTA-AAACATG--CA--TAG----C---CT-CTGATCA-AACCTTC--TG-AG-GTCAAGCGGTCTCCAAATGTA--GGG-----AGGAGTTTAGCAT-TTCT--GAGACA---CTAGAAGTGCGTG-CAAAGTCATGTTCA--ACCCACC-Ggaa
gi|15 : ggcaggggctgcgccactacagatggtgccagggcatttcagtgattgatggttcGTGATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTGCA--ATA-C--TGACACCTAGGTATTTTGC
gi|16 : -GG-GAAGA-AT-A-AAATA------TTATAAAAGTCAGAACATG-TTTG----A----ATTTGTCTGTAGACCATCGAGTG-GGA---T--A---CAG---C-T-TGTTCTTTTATTTGG-GATAAAGTA--------TGTT------------TAAGGTTTATAGATCACACTATG-----ATA--GC--CAG----T---CG-CTCGTCA-ATATGAC--GG-AG-CTCAAGTTGCCTCC-AGTTTA--AAT-----TAG---TCAACAT-CTTG--TTGACA---ATGAAAGTGCGGC-AATAGTCCTG----------A---GAGCAGCCCTTCTTTGTATGG------AC--------TG-G-AG--------TGTGGCGACCAGACAGGGGAGCAGTACTCGAG--CTGG---------Gagagtaggctgacgctagtttagtgttatgcaagtaatatgtggtgttattatgtttctttgactgtgtggggtgtataatttgacattttgacaagttaaactccatgtcccgctgtttttcccaatgttcaagagtgcataagtctgtctgtagtgtgtgtgattgttgtacatttgtgataacaaaataaacagcagtgtcatctgcaaataaccggaccaataaattaacctggggagg
gi|17 : tga--TA--GT-------CAAACCCTTGC--GAGGATATATAGGCTTTGAC---ACA-T-G---TCA-ACTGACA--AGGA--G---A-------------GCA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GT--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATATA-CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAAACAAA--CCGGGT------TTATAG-GGGTACATATGACCAA-CCTAGCACACTGTCTGTCT-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAAACA--ATAT--TTTGAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGG-TAATTAGTGT-GAGG-GGAGA-A--A-GAAAA-----GTTGTAAAAGTCAGA--------------------TTTGT---TAGACCAGAGAATG-GGA---aagtgtac
gi|18 : acaG--GATAGCTACATGG-TCATTTGTGATCTTGTA-A--CATAGGAA--GAG----T---CTGCTG-TCT-ATACGTC--TC-TG-GTCTAGTCTTCTCC-AA------GAC-----TG-----TAGCAT-CTCA--GTGACA---CTACTCGTTCATC-TGTAATCGTGTTTT--ACCCAGC-GTTTTGCCTGGCACTGGACGCCTTC-AACTTAGTTTATG-GCA------GTATAAGGTTACCAGACACTTGAGCTGTACTCCAG--TTGA---------GGACGGACAAGAG
gi|2 : catggagtgttcatccatttattaagcagttatattgatcatctataaCTATCTTCC-AA-T--AA--GT-------CAAACCCATCG-TGAGGACATA--GACTA-GAT---GCA-C-G---TCA-ACTGACA--A--A--GT--G-------------TGA------A---A--AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGGGA---G-AA-A-ATA---CT-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--AC-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACACATGTTCAA-CCTGGCAGTCTACGTGGCT-GAAC--T------G----A-TTGGCTC--C-GAGAGAGGCA--ATAT--TCTCAG--GG---AG-TTAG---TCCCA--GTGGACAAT-AGTGT-G-GG-GGAGA-A--ATGAATA-----CTTATAAAAATCTGAGCTTG-TTTG----G----ATTTGTCTATATGCCATAGAGTG-GGA---TAGA---TGA---C-C-TGTCCTTTTATTTGG-GATTAGATAG-GG-TTCAGTTGG--GATAGCAACTAGG-TTATGGACGATGTTATA-AAGCATA--AC--CAG----T---CT-TTGGTCA-ATA-GGA--TGCAG-GTCAAGTCATCTCT-AGTTTA--AAG-----TGG---TCAACAT-ATCA--GTAACA---CTGGAGGTGCGGC-CATAGATGTGCATT--GCCCAGC-AAGCAGCCTTTCTCTGCACAGACTC-AATTTGTCCGATG-CCAACGCTGGTGTGTGGTGACCAGACATAGGAGCAGTACTCTAG--CTTG---------GGTCTCACAAGTGTCATGTATGCAGTAGATTTTAGTTTGA-C---TGA--GTGAGCTTTGATG---TT-GTGTC----TGAGGAATCTTAGTGTTTGATTTGT--TTTTTTTGTTATA--T----TATCTGTGTG-TTTGTTCCATGATAAGTCATCTG-ATTATATT-GTGACACCAAGATATTTTGCT
gi|20 : ---TCAGCAT-GTCC--GAG-TA---CTAGAAGTGCGGA-CAAAGTCCTTTTAA--ACCCATC-GATCAGCTCGCCTCTGTACAGCATC-TACTTGGTAAATTTGT-GTGTACGTACGGAGCGACCAAATAATGGAGCAGTATTCTAG--TTGGATGGGTAGAGGGCTAGCCAATGTCTTATGTGCAGTTGAATTTAGATTTT-C---TGA--ATGTACATATATG---TT-TCTTC----TGAGGAATCC---TGTTAGA---------TTTTTATCA---------TGTCGATGTG-AGTGTTCCATG
gi|21 : aatG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGC-GAGG-GAAGA-A--A-AAA-------------AAAGTCAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TAGA---CGA---C-G-TGCTCTTGTAat
gi|22 : taaaagatataatacaaaatgtagttattttaactacttttaccagtgaaggtcacacttgcaggttcacactcactctctcgtttattcgaagattgaacgaatgtgaatgataaattcactgattttagtttaaatccaatgagtgcatgacCC-AT-A--TA--GC-------CAAACTCCTCG-CAAGGACATA--AGTTTTGAC---GCG-T-G---TCA-TCTGACA--A--A--GAG-G-------------GAA------A---A--AG-------A---A--C---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-GA-A-ATA---CA-G--G-----TTATTGTATTGT---A--TTTATA-A--GC-AGG-TTAAAA-CGGA--GCAGAT------ATCTAG-GGG--TACATGTTCAA-TCTTGCACATTGCCTGTCG-GAAC--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAG---------------AA--GG---AG-TGAG---TTCCG--CTGGACAAT-AGTGC-G-AGTGAAGA-A--A-GAAAA-----CTT
gi|23 : GACAAGAGTTTTATAGGCCATAGACTTTAAATCTC-C---TGA--ATGTACGTTTATA---TT-TTTTC----TTAAAAATACTAATGTTTGATTTGC--TTATTTGGTAATG--T----TGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTCAGTCCTCTACA--AGA---GAGATACCTAGGTA
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcaTAAATCCTCTGTA--A-A-T-G---TACCTAGGTATCTcatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|23 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTgtctctagtttagtgttgtgtaagtaatgtgttgtgttgatgtgtgtgttccatgttaagtt
gi|24 : agcgtgctgtccggtgcagacaagagttttataggccatagactttaaatctcctgaatgtacgtttatattttttcttaaaaatactaatgtttgatttgcttatttggtaatgttgttgatgtgtgtgttccatgttcagtcctctacaagagagatacctaggtacatttacagaggatttagtctctagtttagtgttgtgtaaG--GG---AG-TGAG---CTTCAAATT--ACAAT-GGTGC-C-AG-CAAGA-A--A----T------CTTG-AAAA---------TA-CCTG----G----ATTTGACAGTAAACCATGCAATG-TGA---TAGT---CAA---C-T-GGGTCTTCTATTGGG-GATAAGATCA-TA-TTTAGGTGG--GATGACAACATGG-GTATGCATGATATTATGTAAGT-TA--AC--TGG----A---GT-CTGGTCA-AGATGAT--GG-AG-----AATGG----------TG--GAT-----AGG---TCAG-ATAATCT--GTAACA---TTGGAAATATGGT-CATAGTTATGt
gi|25 : CTATCTTCC-GT-TAATA---C-------CAAACCC--TC-TGGGGACCTA--GGC----AT---GCG-TAA---TCATACCGACA--A--A--G---A-------------CTG------A---T--AG-------T---ATTT---A------AAA-AT--A---CA----TT-----AGAAA---C-AA-T-TTA---AA-A--GAAACATT--------GA---AGTTTTAAA-T--GCTAGGTTTAAAAATAAA--ga
gi|25 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgctggacagcctcgatctggtttatggcagtctcagtatggggtgaccag
gi|26 : tatctatcttccgttaataccaaaccctctggggacctaggcatgcgtaatcataccgacaaagactgatagtatttaaaaatacattagaaacaatttaaaagaaacattgaagttttaaatgctaggtttaaaaataaaaacatgaatttatggcaagatgtcctgactgcccagtgTCTAG--AGCC-AG-CGCA---TTCCA--GTGGACAAA-TGTCC-TTGG-GAAGA-A--A-GAGTA-----CTTATAACAATCAGAACT-----------G----ATATGAC--AAGGTAGGTGA----CGA---T------CTA---C-TATG-TCTAGTATTGCG-GATTGTGT-A-TT-TTCTGGTGG--------TACAA------------------------CACG--AA--CAT----T---CT-CTGATCA-ATCCTCC--CG-AGTTTCACGCGGTCTCC-AATGTA--GAG-----
gi|27 : ctcgcaagggcggtgccgctacaCTTTCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GAC---ACT-C-A---TC--ACTGACAAGA--A--G---G-------------TTA------AT--AT-AG-------A---A------A------ACA-GTTGA---TATGTTAA-----AAGGA---T-GACT-GTA---CA-G--GTT---TT--------GT---T--TTTAAA-------AGA-TTAAAAATAGC--CCAGGT------TTCTAA-GGGGAGACATGTTCAA-CTCGACTTACAGCCAAGCT-TAAC--T------agttgttgcat
gi|28 : tCTATCTATCGAT--------GC-------AAAACCCCTTT-TAGGGACCCA--GGC----AT---GCG-TAG---TCATACCGACA--A--A--GACTG-------------TTAGTTTTTA---A--AACTATATTA---A--C---A------AGATGT--T---TA----AA-----AGAAACAGT-GA-T-GTT---TC-G--G-----TT--------GTTAGG--TTTAAA-A--A-------TAAAAACCTACTATAAAT------T--TAT-GGTGAAATATGTTCAA-TTCTGCAGACT-----TCA-GAAT--T------G----A-ctgacaagtgttgtgccactacagatggtgcca
gi|29 : catgtctctaaaataatT--GAC---GCA-C-G---TCA-ACCAATA--A--A--GA--G-------------AGA------A---A--AT-------A---T--T---A------AAA-GC--A---TA----AACCGAAGGAGA---T-CA-T-TTA---CA-G--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAAA-CAGA--GCAGGT------TTCTAT-GGGGACACACGTTCAG-CCTGGCATACCGTCTGT------C--T------A----A-TCGGGCT--C-AAGAGAGATA--CTAA--ATCCCG--GA---AG-CGAG---TTCCA--CTGGACactgtt
gi|3 : ttCTATCTTCC-AC-A--TG--GC-------CAAACCCCTCG-CGAGGACATA--GACTTTGAC---ATA-C-G---TCA-ACTGACA--A--AT-G---G-----------------------------AG-------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-A--G-----TT--------GT---A--TTTAAA-A--GC-AGG-TTAAGAACAGA--GCAGGT------ATCTAA-GGGGTCACGTGTTTAA-CTTGGTGCACTGCCTGTCT-GAAC--T------A----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACA--ATGT--TTCCAG--AT---AT-TGAG---TTCTG--CTGAACAAT-AATTC-GAGG-GAAGA-A--A-GAA------------AAAAGTAAGAATTTG-TTTG----G----ATTTGTATGTAGGCCAGAGAATG-GGA---TATA---CGA---C--------------TAGG---TCAAGGAACTT-TTCAAGTGG--AGTTGCGACTAGT-TTATGGGTGGTGTAATA-GAGCTTG--AC--CAG----T---CG-TTGGTCA-ACACGAC--TA-CG-GTCAAGCCGCCTCC-AGTTTA--ATA-----TTG---TCAACAT-ATTG--GTGACA---CTGAAAGTGTGTC-CATAGTCGAGCATT--GCCAAGC-GAGCAGCCCGTCTCTGTATATACTC-AATTTGTCCGATT-CCAGCATTCATGTTTGGGGACCAGCCAGAGAATCAGTACTGAAG--CTGG---------GGTCTCATAAGTGTCAGGTATGTCATGGATTTGAGTTTAT-C---TGA--GTGAACTTTTATA---TT-TCCTC----TGAGCAATCCTAGTGTTTGATTTGC--TTTCTTTGTGATG--T-----------------TGTTCCATGTTAAGT-CTATGGA--GAT-T-GGGATTCCAAAATATTTTGCT
gi|30 : GACCAGACAGAGTAGCAATACTATAGAATTGT-----------TCTTGCAAAGGTCCTGTATGCTGTTGATTTCATTTTTTTC---CGA--ACGTACTTTGATG---TT-ATGTG----AGAGAAAACCTCATGCTTGTTTTGTTATTTTTTTGTaatgagactgtttctaatgaa
gi|31 : G-------A---A--T---A------AAC-GT--G---TT----AA-----AGACA---A-GA-T-ATG---TA-G--A-----GT--------GT---A--TT--AA-A--AC-AGG-TTTAAA-CAGA--ACATGC------TTCTAG-GGAGACACGTGTTCTA-TCTGGTAAACAGCCTGGTT-GAAC--T------G----A-AGGGCCT--C-TAGtccgtatcggataatcagataatcataatgtgccactaagatttt
gi|33 : AAGA-TCATATATGTGGTAACCTTGAGTGATT-C---AGA--ATGGACTATGATAACATT-TCTGC----TTAGGAATCCTAGTTTTTGATTTGTG-TTTTTTCGTAATGCAT----TTTT--TATG-TGTGTTCCGTG-TGAGTTTTCTtatctccatattaacggtttactgcactgttaata
gi|34 : agtggactatagtttaagggaCTATCTGCC-AT-T--AA--GT-------CAAACCCCTGC-TTGAGACCTA--AACT--GAC---ATG-T-G---TCA--CTGACA--AGAA--A---G-------------TTA------A--------------------------------------T--A---TA----AA-----ACAGT---T-GA-T-A--------G--G-----TTTAAATG--GT------TTTAAA--------GA-TTAAAAATAGA--GCAGGT------TTCTAA-GGATTGACATGTCTAA-CTC
gi|35 : tatCTGGACAGCCTC-GATCTGGTTTATG-GCAGTCTCAGTATGGGGTGACCAGACACTTGAGCAGTACTC------TGG---------GGGCTGACAAGAGTTTTATAGTTCATAGACTTTA-------------A--AT----TTTGATA---TT-TCTTC----TTAAAAACCCCAATGTTTAATTTt
gi|36 : agtgCATA--AC--CAG----T---CT-CCGGTAA-AT---------------CA---TGTCTCA-AATTTA--GAT-----TGG---TCAGCAT-ATATATGTGACA---CTGAAAGTGCGAC-CATAGTCACGTATC--GTCCTTC-GAGCAGCTCGTCCCTAGA
gi|37 : gggatgagagtaatttcatgttaCTTCC-AT-A--TA--GC-------CAAACCCCT---CGGG-----A--GGCTTTGAC---ATG-T-G---TCC-ACTGACA--A--A--G-------------------A------G---A--AA-------A---A--T---A----------GC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-ATA---CA-G--G-----TT--------GT---A--ATTAtaat
gi|38 : TCTGCC-AT-C--TA--GT-------CAAAGCCCTAC-TGGGGACTTA--GACA--TAC---ATG-C-G---TC--ACTGACA--A--GACG---A-------------TTA------A---T--AT-------A---A------A------AAA-AC-------------A-----AGTGA---T-AA-tattgctgacattaaacaaggttttatagtcggtgcatgtt
gi|39 : atctatcGTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTAAAGTCCTCTGCA--ATA---GTGATGCCTAGGTAgttaaaaagatgtctgttcagggttagtttttaaat
gi|4 : aatCTATCTT---ATGT--TAATGT-------CAAACCCCTTT-TGGGGACCTA--GGC----AT---GTGTC-G---CCATACCAACA--A--A--G---ACTTAATTAGTTTTTTA------A---A--AA-------ATATA--TTAAA------AAA-GA--AATTTA----AA-----AGAAA---T-AG-TGATGTTTCA-GTTG-----TT--------AG---G--TTTAAA-A--A-------TAAAAACATA--CTATGA------ATTTAT-GATGAGATATGTTCAA-TTCTGCTGATT-TCTGTATCAAAC--T------GTTCTA-T--GGTTAAT-GATATAGG-G--GTAT-----CAG--AACCTAA-TGAA---TTCCA--ATGAAAAAC-TGTTC-A-GG-GAAAA-ACGA-GAAT-------TTGTAAAAGTCAGTGGTGG-TGTT----A----ATTAGT-TGAAAGCAAGTGAATGTGAA---T-GT---CGG---GAT-TGTCTGTTTGTCAGT-G-TTATGTAA-TC-TTCTATGGG--GATAGCTACAAGG-TCATTGGTGATTTTGTA-ACACAGA--GA--GAGAGAGT-------TGGCTGTATACATC--TT-TG-GTCTAGTCTTTTCC-ACTGGA--GAGAGTACTGA-----AGCAT-CTTA--GTAATG---CTACTGGTCTGTC-TATAGTCTTGTCTT--GCCCAGT-GTGCTGCCCGGCATTGGACGTCTTC-AACCTGATTTATG-GCAGTCTCTGTATAAGGTGACCGTACATTTGAACGGTACTCCAA--TTGA---------GAGCAGACAAGAGTTTTATATGCCATGGACTTTAAGTCTT-C---TGG--ATGTACCTATATGTA-TT-TCTTC----TTATAAATCCTAATATTTGGTTTcatttacataggaggtagtctctagtttagcattgtgtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|40 : atGTAATG--TGTTGTGTTGATGTG-TGTGTTCCATGTTAAGTTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTA
gi|41 : aACGCCCTC-AACCTGGTTTATG-GCAGCCTCAGTATAAGGTGACCAGACACTTGAGCAGTGCTCCAG--TTTA---------GAGCGGACACGAGTTTTATAGGCCATGGACTTTAAATCTT-C---TGA--Acatttacagaggaggtagtctctnnnnnnnnnngtaagcaatgtgttgtgttgatgtgtgt
gi|42 : agTCTAT-GGGGACACATGATCAAACCTGGCACACTGCCAGTTT-AAAG--T------G----A-TTGGGCT--C-AAGAGAGACAATATAT--TTTCAG--GG----G-CAAG---TTTCA--CTGGACATT-AGTAT-GAGG-GAAGA-A--T-GAAAA-----CTTaatgtata
gi|43 : -------A---A--T---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AGAGA---G-AA-T-ATA---CA-G--A-----TT--------GT---A--TTTAAA-A---C-AGG-TTAAAAACAGA--GCAGGT------TTCTAG-GGAGACATATGTTCA
gi|44 : taTATCTTCC-AC-A--TAC-GTGACATAGCAAACTCCACCACAAGGACATA--GGCTTTGAG---GTG-T-G---TCA-ACTGACA--G--A--G---A-------------GAA------A---A--AG-------A---A--A---A------AAA-GC--A---TA----AA-----AAAtggtgttccgctttgcgcatcccaactg
gi|45 : ACGTAG-TC-GTCTGGAGGCAGATAGCTACAAGA-TCATTTGTTATCTTG---GAGCATa
gi|46 : atgtctgttcgtcaatgtcatgt-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GAC-------------------TCA-ACC-ACA--A--G--T---G-------------TTggggagtcgg
gi|47 : GTGTTG--T-----GTTGATGTG-TGTGTTCCATGTGAAATTCTCTACA--ATA---GTGATGCCTAGGTAtatatattgaaataatatggaagtaacaattaagatgtt
gi|48 : aatG-TTCG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGAAAGCA-GGA---TAGA---CGC---C-T-TGTTTTTGTAcatttacagagaagtctgttt
gi|5 : agaaaataaaataatataaaataaTATCTTCC-AA-T--AA--GT-------CAAACATCTGC-TGGAGATCTA--GACG--AAC---GCA-C-G---TC--ACTGACAATA--A--T---G-------------TTG------ATTTA--AG-------A---A--C---AGAGTTTAAA-TT--G---TA----AA-----AGA-A---TGAA-T-GTA---AAGG--G-----TT--------AT---C--GTTAAATATTAT-ACG-TC--ACACAGA--GTAGGT------TTCCAA-GAAGAGACATGTTTAA-CTCGGCaa
gi|5 : ctatcagtgTATTGCG-GGTTATATTA-TT-TGCTGGTGG--TATCGCTACAAGA-TAATGGATGATGCTGTA-AAACATG--CC--AAG----T---CT---GACCC-TTTCTCC--GG-AA-GTCAAGCGGTCTAC-AACTTA--GGG-----AGT---TTAGGAA-ATCT--AGGACA---CTAGAATTGTGG---ATAATTCTGTATTTAACCTTTC-GAGCAGCTTATCTCTGCATCGCTTCTAACTGGTTCtaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatctattgcgggttatattatttgctggtggtatcgctacaagataatggatgatgctgtaaaacatgccaagtctgaccctttctccggaagtcaagcggtctacaacttagggagtttaggaaatctaggacactagaattgtggataattctgtatttaacctttcgagcagcttatctctgcatcgcttctaactggttcatttgtgtgccgg
gi|52 : ctatcagtgtatcttccaataagtcaaacatctgctggagatctagacgaacgcacgtcactgacaataatgttgatttaagaacagagtttaaattgtaaaagaatgaatgtaaagggttatcgttaaatattatacgtcacacagagtaggtttccaagaagagacatgtttaactcggctaatagccggtgacatattttaattcatgatatattgaaataaaatatgttttaaacagtcggtgacaaatatttcagtggctaataaaattagggagtattgattacaaccagttctggtctgaatttgacaagaggacaaggtacgtgacgatctaataaatcCCATCTTCC-ATATA-TA--GC-------CAAACCCATCT-CGAGGACATA--GGCT--atttgtgtgccgg
gi|53 : aCTATCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACTCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--ttga
gi|54 : TTG-TTTG----G----ATTTGTCTGTGGGCC-----------A---TAGA---CGA---C-T-TGTTCT
gi|55 : gtTATCTGCC-AT-T--TA--GT-------CAAACCCCTGC-TGAGAACCT
gi|6 : ggtt--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACTCA--GG------C---GTG-C-GTCCTCATGCCGACA--A--A--G---G-------------TT
gi|6 : tcaaatt-AGGGC-G-GG---AGATA--A-GAATA-----T---TAATAGTGAG----TG-GTTG----GGCCAATTAAATTGAAAGCTAGTGGGTG-TGAATGTCGGCATCGA---C---TGTTCGTCCATTC------CATATAG-TC-TTCCAGAGG--GACAGCTACAAGG-TTATTTGTAATCTTGTA-A--CATG--G---GAG-------------AGCCA-ACACGTCTTTG-A--ATCTAGTCTTCTCC-AATGGA--GAGAC---TGA-----AGAAT-CTCA--ATGACGCACCTG---GTCTATC-TGTTGTCATATTTT--GCCCAAC-gttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgagggcgggagataagaatattaatagtgagtggttgggccaattaaattgaaagctagtgggtgtgaatgtcggcatcgactgttcgtccattccatatagtcttccagagggacagctacaaggttatttgtaatcttgtaacatgggagagccaacacgtctttgaatctagtcttctccaatggagagactgaagaatctcaatgacgcacctggtctatctgttgtcatattttgcccaacctat
gi|7 : tcaaattgtcaaacccctgctggggactcaggcgtgcgtcctcatgccgacaaaggttgttgaagtagtatttaaaaatgtattttaatgtcaggtttaaacaaacatactatgaatctatggtaagataaatgtattcgactctgcttccatattaagcactatagggatgtcaggagctggtgatagttagcggaatactgttctgATCTTCC-AC-A--TA--GC-------CAAACCACTTG-CAAGGACATA--GGCTTTGAC---ACA-C-A---TCC-ACTGACA--A--A--GA--G-------------ACA------A---A--AGT------A---A--T---A------AAA-TC--A---TA----AA-----AGAGA---T-AA-T-AAA---CA-G--G-----TT--------GC---A--TTT---------------TAAAAACAG----CAGGT------TTCTAGTGGGGATGCATGTTCAA-CTGGGCACACTGCCTGTCT-GAAA--T------G----A-TTGCAAT--C-AAGAGAGATA--ATAT--TTCCAG--GG---AG-TGAG---TTCCA--CTGGACAAT-AGTGT-GAGG-GAAGA-A--A-GGAAA-----CTTGTAGAAGTTAGACTTTA-TTTG----G----ATTTGTCTGTAGGCCAGGGAATG-GGA---TAGA---TGA---C-T-TGTTCTTGTAATAGT-GATAAGGAAA-T--TTCAGGTGG--AATTGCAACTAGG-TTAAAGGTGATGTTATA-GAGCATA--AC--CAG----T---CG-CTGGTTA-ATACAAC--AA-AG-AGCAAGTCGTCTCC-ATTTTA--AGG-----TGG---TCAACAT-CTTA--GTctat
gi|8 : CTATCTGCC-AT-T--AA--GT-------CAAACCCCTGC-TGGGGACCTA--GACT--GTC---GCG-C-G---TC--TCTGACAAGA--A--G---G-------------TT-----------------------A---A--T---A-----------C--A----A----AA-----ACAGT---T-GA-T-A------G-G--G-----TTA-------GT------TTTCAA-A--AT-A---TTGAAAATAGA--ACAGGT------TTCTAA-GGAGAGACGTGTTCAA-TTCGGCTAACGGC-------GAAC--T------T----A-----ACT--CTGGCAGGGGCT--GTACCACTACAGAAGG---TGCCGGGGCATTCCA--GTGGACAAT-GGTTCTG-GG-GAAGA-A--G-GAGTA-----CTTATAATAATCAGTACTGG-TCTG----A----ATTTGa
gi|8 : atTGAATTTGGCGATATGATAA-TGATTCTGGTGG--TATCGCCACAAAA-TAGTGGGTAATGCTGTA-ACACATG--AC--AAG----C---CT-CTGATCA-ATCCTTC--TG-AG-CTCAAGCGGCCTCC-AATGAA--GGG-----CGT---TTAGCAT-GTCT--GAGACA---CTGTAATCGCGTG-CAAAATTGTGTTTG--GCCCgcgatatgataatgattctggtggtatcgccacaaaatagtgggtaatgctgtaacacatgacaagcctctgatcaatccttctgagctcaagcggcctccaatgaagggcgtttagcatgtctgagacactgtaatcgcgtgcaaaattgtgtttggccc
gi|9 : atctatctgccattaagtcaaacccctgctggggacctagactgtcgcgcgtctctgacaagaaggttaatacaaaaacagttgatagggttagttttcaaaatattgaaaatagaacaggtttctaaggagagacgtgttcaattcggctaacggcgaacttaactctggcaggggctgtaccactacagaaggtgccggggcattccagtggacaatggttctggggaagaaggagtacttataataatcagtactggtcTATGAG--ATGTTATG-TAACATA--AC--CAA----T---TT-CTGGTCA-GTGCAAA--GG-AG-GTCAAGGAGTCTCC-AATTTA--GAT-----TGT---TTAGCAT-ATCT--GCGACA---CTGGAAGTATAAC---TAGTCATGCATA--GTCCAGC--AATAGCCCGACTCTGGACATTTTC-AATTTGTCCAATA-CAAGAAATTGCATTTAGAGACCAGACAT--GAGGAG--CTCTAT--GTGG---------AGCAT--TAAATGTCCTGTATGCTATTGA-TTCAGTTTTC-CAGTTTACTATGCGCTATGATG---TTGTTTTTTGTATGAGAAATCCT-ATGTTTGGTTTTC---TTTTAAGTAAGG--T----AGTCAGTGTGATTAGTTCT-TGTTGAGTCATCTG----AAA-TGGTGATTCTAAGATATTCAGCT
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCTGTCTTCCGTGAATGCCAAACTTTTATTGGTGATCTAGGCATGCATAGTATTTGAAAATATAGTAAAATAAAATTGAAAGAAACAAAGAAGTTTCGGTTATTAGGTTTAGAAAAGAAAACACTATGAAAATATGACAAGGGATTTTCTTGTTTATTCTGAGATGTGTTCAGTTCTTGTGATTGTAGAATTGAACTGTTCTGTGAGGTAATATAGGGATATCAGAGCTAATGAATTCCAGTCAAAGACTGTTATTGGGAAA
Unaligned ( gi|32 ): TCTGCCTTAGTTCTAATTGAACTGTTCTGTGGTTGTAAACAGGGGATATATGAAGCTAATGAATTCCAGTGAAATACTGTTCTGGGGGAAGCGAGATTTGTTATAGTCACTGGTTGCATCAATTAATTTGAAAGTGAGTGTGATTGTCGGCA
Unaligned ( gi|49 ): TATCTGAGACCTAGAATTCGCATTTTCGACTGACGTATCTATAAGCGTCATACTTGCTAAAACGGTGTCAGTATGA
Unaligned ( gi|50 ): TGTTGGGAATGGGACTGATTCTAATTTAGTGTTATGAAGAATGTATGAGGTGTTGATATTTTTTTACTT
Unaligned ( gi|51 ): ATATGTTGCGGATTTGACTGAATCTAATTTCGCGTTATGGAGAATGAAGGAGGTGTTGAT
Unaligned ( gi|56 ): TCAATTTGTCCAATGCTAACACTGGGGTGTGGTG