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Reference ( gi|1 )            :                                                              ACTTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATAA--ATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGCTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACA---TCAACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAACAATAAAATACGATTAAGTTATCAAACATAACAATAAATGGAGA--TTT-TTTCTCCAATAAAATGACATCTAC----TC--ATTT-C-AGG-----AAGG--------CTACATACTATTCCTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTTTATATTCTT----T-TC-TCCACGAAACTTGTCTTCTGTTCTCTAAAC--TCACCCTTTGTCTTCCTTTAATACATTTTT---TT-C-C-TCTTACAAAATATAAAC-GTTT------TCATCAAA---------------TAT-TATTTTATAGAGTACATTGTCTTA-----A-----TG-----AGTGTT--TGTG-CAACAT----------A----------ATT--AT---A---A---A-----A------CA----AATTTTATG---------------------G--A---AAAAAGTCAATCATTATGAATTGTC-TATA---ATTTTATG-TGCATAAACTT-ATAATAT-TAT-TGTAT---TATAT-TGTATTATGACCATG-TT---T-ATTGATATACTATGCTGATTTATGAAATAAAAAAAATA---AATTAT
gi|6                          :                                                                TTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATCA--ATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATATTAAACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTTATCAAACATAACAATAAATGGAGA--TTC-TTTCTCCAAT-AAATGCCATCTAC----TA--ATTT-C-AGG-----AAGG--------C----------------------TTTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTC
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gi|3                          :      tcactttagataatactactttggatgcaaactcgacggaagcagtcagttacataattTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATTG--ATAAATATCAAAATGTCACACCTATGTTTTTGCTTTTTAAACAGTACTTACA---TAAACAAATAGC-ATTG-----------------AAATACGATAAACTTATCAACCATAACAATAAATGGAGA--TTT-CTTCTACAATAAAATGCAATCTAA----TA--ATTT-T-ATG-----AAGA--------CTACATACTATTCCTTTTCAATTTCTTGGCCTTTACCTAGTTATACACTTGTATTTATATTCTTA---TGTC-TCCGAGTAATTTGTCTTGAGTTCTCTAAACTTTC-CCCTTTGTCTTCTTTCAAAAC--TTTT---TC-C-C-TCTTAC-AAATATAAAC-ATAT------GCTTTAAA----------------AT-TATc
gi|16                         :                    actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgCTTTGCAAAAT---ATTACATTTTCACCA--AAAAATGTCAAAATGTCACAC---TGTTTTCCCTTTTTAAACAATATTTACA---AAATCAAATATCAATCAAGGAACAAATAGCATTAAAATATGATAAACTTGTCTAACATAAatcgaaaccaattttatgatgaaaaagtttagcattatgagttgttgtatatgccatgttttatagctatactttcctgattaatgaaataaagaaataaattattata
gi|2                          :                                                              aatatacactatgcT---AGTATGTTTTTTGAAGGATAAATGCCAAATCGTCACACCTATAGTTTCCCCTTTTAAACAGTACTTACA---TAAACAAATAGCAATCGAGGAACAAAAAACATTGAAATATGATAATCTTTTCAAATATAACAACAAGTGGAGATTTTT-TTTCTCC----------TATCTAC----TA--ATTT-T-AAGAAACAAAGGTACTTTTTCTACAT----TTTCTTTTCCAATGTTTGTCCTTTGCCTATTCATACAC--GTGTGTGTATTTTT----T-TCTTTCATGTAACTTGTCTTCTGTTCCCAAAAC--TC-CCCCTTGCCTTCCCTCAAGAC-TTGTT---TT-C-CATCTTACAAAATATGAACTATTT------TCATTAAA---------------CAT-TATCTTATAGCTTACATTGTCTTAATATCA-----TG-----AGTGAT--GGCG-CAACAT----------ATG--------CTT--AT---A---A---A-----ATTATATCAGAACAATTTTATG---------------------AT-G---AAACAGTCGATTATTATTAATTGGT-TACA-------TATG-C-CGT-TACTT-ATTATAT-CATGTGTGT---TAAAT-TGTATTGTGACCA--------------AAATACTATGCTGATTTATGAAATATAA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TT----T-TA-TTCGTGTAACTTGTCTTCCAT-----AAAC--TT-CCTTTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTT---TTAC-C-TGCTATTAATTATAA----TTTCATTAATCATTAAAAAAAAAAAGAATTGTTATATATTTTATAGTGAACATGGTCTTG-----ATTTATTG-----AGTGTC--AGTGTTGATATATGCTTTTACA----------ATT--AT---A---ACAGA-----A------C-----AATTTTATG---------------------ATTA---AAAAAGTCGAGCATTATGAATTAAT-TATA-------TATG-T-CGTAA--TTAATCATGC-TATGTGTGT---TATAT-TGTATTGTGACAATG-TT---T-TTTGCTTTACTATGCTGATTT-----ATAAAAAAACTATTTAATTAat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T----T-TC-TTCATGTAACTTGTTTTCTGCTCTCTAAAC--TCACCCTTTGCATATCTTCAAGAC--TTTC---TT-C-TGTCTTACAAGATATAAAC-TATT------TCATCAAA---------------CAT-TATTTTGTAGCGAACATGGTCAAA-----ATATTTTG-----AATGTT--GGTT-CAACATATGCTTATACA----------ATT--ATATCA---G---A-----A------CA----AATTTTATG---------------------AT-G---AAAAAGT-A---ATTATAAATTGGT-TATA-------TATG-C-CGT-TATTT-ATTATAT-CATGTGTTT---TACAT-TGTATTGTGACCATG-TTTTCT-TTTGCTTTACTATGCTGATTTATGCAATAAAAATAAc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACTTGTCTTCTGTTCTCTAAAC--TCCCCCTTTGTCTTCCTTCAAGACTTTTTT---TC-C-C-TCTTACAAAATATAAAT-TTGT------TCATCAAA---------------CAT-T---------------------T------------TG-----AGTGTT--TGTG-CAACAT----------A----------GTT--AT---A---A---A-----A------CA----AATTTTATG---------------------A--A---AAAAAGTCAAGCATTATGCATTGTC-TATA---------TG-TGCATAAACTT-ATTATAT-TAC-TGTGT---TATAT-TGTATTGTGACCATG-TG---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAAT--AAAAAATA---AATTA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gCTTCCTTCATGACATTTTC---TTAC-C-TCC--CATAAT-TA------TT------ATATTAAA---------------CAT-TATTTTATAGCAAACATATTCTTG-----ATTTTTTG-----AGTGTA--GGTG-TGACATACGCTTATTCA----------ATC--AT---A---ACAGA-----A------CA----A--TTTAAA---------------------G--ATGCAAAAAGTCGAGCACCATAATTTGTT-TATA------TGACG-T-----AACTA-ATTATAT-TA--TATGT---TATAT-TGTAGTGTGACTATA-CT---T--TTGCTATACTA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATCAAA---------------TAT-TATTTTATAGCGAACATTGTTTTA-----ACAATTTG-----AGAGCT--GGTG-CAACAT----------ATC--------CTT--AT---A---A---A-----A------CA----GACATTATA---------------------GGAA---AAAAAGTCAAGCAT-ATAAATTGTC-TACA---------TG-TGCATTAACTT-ACTATAA-TAT-TGTGT---AATAT-TGTATTGTGACCATGTTT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAGT--AAAAAATA---AA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA---------------CAC-TATTTTATAGGGAACATGGTCTTT-----G-----CGTTTCAAGTGTTGATGTT-TCATAT----------A----------ATT--AT---AT--A---ATTATCA------CAGAACAATTTTATGTTAAAACATTGAAAAGCATATG--ATG-AAAAAGTCGAGCAC-ACAAATTAAT-TATAGATATCTTA----AC-TAAATCT-GC--TATGTAT-T---T---TTTAT-TATATTATGACTATG-TT---T--TTGCTATGATATGCTGATTTATGAAATAAAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tATTTTATAGTGAACATGGTCTTT-----A-----TATTTTCAGTGTT--AGTG-GAACAT----------ATGCTTATAAGATT--AT---ATCGG---A-----A------CA----AATTTTATG---------------------A--T---AAAAAGTCGAGCATTATCAATTGTT-TATA---------TA-TGCATTTATTT-ATAATAT-TAT-TTTGT---TATAT-TGTATTGTGACCATGTTT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAAT-AAAAAAATA---AATTATtatttaatt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ataagtaatgtttctttcttaattttgtgaatcattgtaaca----------A----------ATT--AT---ATCGA---A-----A------CC----AATTTTATG---------------------AT-G---AAAAAGTTTAGCATTATGAGTTGTTGTATA---aaaaaaaagtttcccatgttttatttt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgtctgtgcaaaatattatattttcattgataaatatcaaaatgtcacacctatgtttttgctttttaaacagtacttacataaacaaatagcattgaaatacgataaacttatcaaccataacaataaatggagatttcttctacaataaaatgcaatctaataattttatgaagactacatactattccttttcaatttcttggcctttacctagttatacacttgtatttatattcttatgtctccgagtaatttgtcttgagttctctaaactttcccctttgtcttctttcaaaactttttccctcttacaaatataaacatatgctttaaA---ATTTTATGATGAA-AAAGTT--TAGCAT-TAT--GAGT---TGT---TGTAT-ATG-CCATG-TT---TTATAGCTATACTTTCCTGATTAATGAAAT-AAAGAAATA---AATTATtgccatgttttatagctatactttcctgattaatgaaataaagaaataaattattata
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgtctgtgcaaaatattatattttcattgataaatatcaaaatgtcacacctatgtttttgctttttaaacagtacttacataaacaaatagcattgaaatacgataaacttatcaaccataacaataaatggagatttcttctacaataaaatgcaatctaataattttatgaagactacatactattccttttcaatttcttggcctttacctagttatacacttgtatttatattcttatgtctccgagtaatttgtcttgagttctctaaactttcccctttgtcttctttcaaaactttttccctcttacaaatataaacatatgctttaaaattatatcgaaaccT-TGTATGTTTA-ATATATATAATGACTATG-TT---T-A--GCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAATAATTA---ATTTtata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaattaatgaccttgctatatatatcacaaccgaatgtactTTGTCACCATG-TT---T-ATTGCTATACTTTGCTGATTTATGAAAT-AAAAAAATA---TATCAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttctctttagagaccattactttcggatcgataaactcgacgaaagtagtaaattatatcattttctgtgcaaaatattatattttcatcaataaatgtcaaaatgccacacctatgttttcctcttttaaacagtacttacatattaaacaaatagcaatcgaggaacaaatagcaatgaaatacgataaacttatcaaacataacaataaatggagattctttctccaataaatgccatctactaatttcaggaaggcttttgtcctttacctattcatacacttgtgtgtatattcttttctccatgaaacTATGCTGATTTATGAAATAAAACAAaa
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCATGCTCTCTCTCTGTACTCTGCTTCTATATGAATAAGAAAGTTAAGTAAAAAAATACCCAGTTTTCATTTTTGTTA
Unaligned ( gi|20 ): AAAAACCATTGAGAATTGCGAAAATGTGCTTATTTCGTAATGAACTGCTTATA






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataagtaatgtttctttcttaattttgtgaatcattgtACTTGTCTTCTGTTCTCTAAAC-TCCCCCTTTGTCTTCCTTCAAGACTTTTTT---TC-C-C-TCTTACAAAATATAAAT---T-TGTT--------CATC-AAA--CATT-----------------------------------------------------------T--T---GAG-TGTTTGTG---C-A-------ACAT----------A----------GTT--AT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------TAT--GA--A-AAAAAGTCAAGCATTATGCATTGTCTATA----T--GT----GCATAAACTTA-TTATATTAC-TGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TG---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAAT--AAAAAATA---AATTAaaaaaaaagtttcccatgttttatttt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gGATTT-TTTATCCAACAAAATGTCATCTGCCGGTTCTAATTTTC-AGG-----AAGG--------CTACATATTATTCTTTT------------CTTTTACCTCTTAATACACTTGC-----TAGTTTT----T-TC-TTCATATTACTCATCTTCTGTTAGTCATAC-TCCC--TTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTTACCTT-C-C-TTT-----------AAC---T-ATTT--------CTTCAAAA--CATT-----------------------ATTTCATGGCAAACATAATC---T
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATGCTGATTTATGAAATAAAACAAcgttatatgctgatttatgaaataaaacaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gattttttatccaacaaaatgtcatctgccggttctaattttcaggaaggctacatattattcttttcttttacctcttaatacacttgctagttttttcttcatattactcatcttctgttagtcatactccctttgtcttcctttaagacatttttaccttcctttaactatttcttcaaaacattatttcatggcaaacataatctcgtta-AAA--CACT-----------------------ATTTTATAGGGAACATGGTC---TTT--GCGTT---T--C---AAG-TGTTGATGTTTC-ATATAATTATAT----------A----------ATT--ATCACA---G---AA------CA----ATTTTATGTTAAAACATTGAAAAGCATAT--GAT-G-AAAAAGTCGAGCAC-ACAAATTAATTATA----GATATCTTAAC-TAAATCTG-CTATGT-AT-T-----TT--TTATTATATTATGACTATG-TT---T--TTGCTATGATATGCTGATTTATGAAATAAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tCTTCCTTCATGACATTTTC---TTAC-C-TCCCATAA--------T---T-ATTA--------TATT-AAA--CATT-----------------------ATTTTATAGCAAACATATTC---TTG--ATTTT---T--T---GAG-TGTAGGTG---T-G-------ACATACGCTTATTCA----------ATC--AT---A---ACAGAA------C-----AATTT---------------------AAA--GAT-GCAAAAAGTCGAGCACCATAATTTGTTTATA----TG-------ACGT-AACTAA-TTATATTA--TAT--GTT--ATATTGTAGTGTGACTATA-CT---T--TTGCTATACTAtatttaatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATC-AAA--TATT-----------------------ATTTTATAGCGAACATTGTT---TTA--ACAAT---T--T---GAG-AGCTGGTG---C-A-------ACAT----------ATC--------CTT--AT---A---A---AA------CA----GACAT---------------------TATAGGA--A-AAAAAGTCAAGCAT-ATAAATTGTCTACA----T--GT----GCATTAACTTA-CTATAATAT-TGT--GTA--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---TTATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAGT--AAAAAATA---AA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTGCAAAAT---ATTACATTTTCACCAAAAAATGTCAAAATGTCACAC---TGTTTTCCCTTTTTAAACAATATTTACAAA---ATCAAATATCAATCAAGGAACAAATAGCATTAAAATATGATAAACTTGTCTAACATAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatatacactatgcTTCTGT---AAATGAAAATATATTTTCATCATTAAATATCAAAATGTCACATCTATGTTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcactttagataatactactttggatgcaaactcgacggaagcagtcagttacataattTATA----TATAT-----CACAA-CCGA-ATGTACT-T-TGTATGTTTAATAT-ATATAATGACTATG-TT---T-A--GCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAATAATTA---ATTTc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaattaatgaccttgcATAAATGCCAAATCGTCACACCTATAGTTTCCCCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAGGAACAAAAAACATTGAAATATGATAATCTTTTCAAATATAACAACAAGTGGAGATTT-TTTTTC--------TCCTATCTAC------TAATTT-T-AAGAAACAAAGGTACTTTTTCTACAT----TTTCTTTTCCAATGTTTGTCCTTTGCCTATTCATACAC--GTGTGTGTATTTTT----T-TCTTTCATGTAACTTGTCTTCTGTTCCCAAAAC-TCCCCC-TTGCCTTCCCTCAAGAC-TTGTT---TT-C-CATCTTACAAAATATGAAC---TATTTT--------CATT-AAA--CATT-----------------------ATCTTATAGCTTACATTGTC---TTA--A---TA--TCAT---GAG-TGATGGCG---C-A-------ACAT----------ATG--------CTT--AT---A---A---AATTATATCAGAACAATTT---------------------TAT--GAT-G-AAACAGTCGATTATTATTAATTGGTTACA----TATGC-----CGT-TACTTA-TTATATCATGTGT--GTT--AAATTGTATTGTGACCAAA--------------ATACTATGCTGATTTATGAAATATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taatttcgttttagtatgttttttgaaggTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATTGATAAATATCAAAATGTCACACCTATGTTTTTGCTTTTTAAACAGTACTTACATA---AACA------------------AATAGCATTGAAATACGATAAACTTATCAACCATAACAATAAATGGAGATTT-CTTCTACAATAAAATGCAATCTAA------TAATTT-T-ATG-----AAGA--------CTACATACTATTCCTTTTCAATTTCTTGGCCTTTACCTAGTTATACACTTGTATTTATATTCTTA---TGTC-TCCGAGTAATTTGTCTTGAGTTCTCTAAACTTTCCCCTTTGTCTTCTTTCAAAAC--TTTT---TC-C-C-TCTTAC-AAATATAAACATAT-GCTTTAAAATTATATC-GAAACCA-------------------------ATTTTATGATGAAAA-AGT----TTAGCA---T---TA-T---GAGTTGTTGttgtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgATTAT--GA--GTT--GT--TGTAT-ATG-CCATG-TT---TTATAGCTATACTTTCCTGATTAATGAAAT-AAAGAAATA---AATTATtatatgccatgttttatagctatactttcctgattaatgaaataaagaaataaattattata
gi|4                          : actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgtctgtgcaaaatattatattttcattgataaatatcaaaatgtcacacctatgtttttgctttttaaacagtacttacataaacaaatagcattgaaatacgataaacttatcaaccataacaataaatggagatttcttctacaataaaatgcaatctaataattttatgaagactacatactattccttttcaatttcttggcctttacctagttatacacttgtatttatattcttatgtctccgagtaatttgtcttgagttctctaaactttcccctttgtcttctttcaaaactttttccctcttacaaatataaacatatgctttaaaattatatcgaaaccaattttatgatgaaaaagtttagcTTGTATTTTCATCAATGCATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAAGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTT--------------------GAGATTTCTTTTTCCAATAAAATGCCATCTAC------TAATTT-TTAGG-----AAGG--------CTACATACTATTCCTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGT---------T----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTCTGTTCTCTTAAC-TCCTCCTTTGTCATCCTTCAAG--ATTTT------------------ATATAAAAAC---A-ATTT--------CATC-AAA--CATT-----------------------ATTTTATAGCGAACATTGTC---TTA--A----------T---GA---------------A-------A-AT----------A----------ATTTAAT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------ATT--G---A-AAAAAGTCAAGCATAATGAATTGTC--TC----TATGT----GCATAAACTTA-TTATATTAT-TGT--CTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTTTTAAAT--AAAAAATG---AATTtata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTT-TTTCTCCAATAAAATGCAATCTAC------CAATTT-C-AGG-----AAGG--------CTACATATTATTCTTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTCTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTTTGTTCTCTAAAC-TCCCCCCTTGTCTTACTTCAAAAC-TTTTT---TT-CAG-TCTTATAAAATATAAAC---T-ATTT--------CATC-AAA--CATT-----------------------ATTTTATAGCGAACATTGTC---TTA--ATATT---T--T---AAA-TGTTTGTG---C-A-------ACAT----------A----------GTT--AT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------TAT--AA--A-AAAAAGTCGAACATTATGAATTGTC--TA----TATGT----GCATGAATTTA-TGATATTAT-AGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAAAAATTA---AA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATCAATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATATTAAACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTTATCAAACATAACAATAAATGGAGATTC-TTTCTCCAAT-AAATGCCATCTAC------TAATTT-C-AGG-----AAGG--------C----------------------TTTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTC
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttctctttagagaccattactttcggatcgataaactcgacgaaagtagtaaattatatcattttctgtgcaaaatattatattttcatcaataaatgtcaaaatgccacacctatgttttcctcttttaaacagtacttacatattaaacaaatagcaatcgaggaacaaatagcaatgaaatacgataaacttatcaaacataacaataaatggagattctttctccaataaatgccatctactaatttcaggaaggcttttgtcctttacctattcatacacttgtgtgtatattcttttctccatgaaacTT----T-TA-TTCGTGTAACTTGTCTTCCAT-----AAAC-TTCCT-TTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTT---TTAC-C-TGCTATTAATTATAA--------TTT--------CATT-AAT--CATTAAAAAAAAAAAGAATTGTTATATATTTTATAGTGAACATGGTC---TTG--A---T---T--TATTGAG-TGTCAGTG---TTG-------ATAT----------ATGCTTTTACAATT--AT---A---ACAGAA------CA----A-TTT---------------------TAT--GATTA-AAAAAGTCGAGCATTATGAATTAATTATA----TATGT-----CGTAA--TTAATCATGCTATGTGT--GTT--ATATTGTATTGTGACAATG-TT---T-TTTGCTTTACTATGCTGATTT-----ATAAAAAAACTATTTAATTAaa
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Reference ( family-853 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 NNTTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATCAATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCCCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAGCANTGAAATACGATAAACTTATCAAACATAACAATAAATGGAGATTT-TTTCTCCAATAAAATGCCATCTAC------TAATTT-C-AGG-----AAGG--------CTACATACTATTCCTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGNAACTTGTCTTCTGTTCTCTAAAC-TCCCCCTTTGTCTTCCTTCAAGACATTTTT---TT-C-C-TCTTACAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATNGTC---TTA--A---T---T--T---GAG-TGTTGGTG---C-A-------ACAT----------A----------ATT--AT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------TAT--GAT-A-AAAAAGTCGAGCATTATGAATTGTCTATA----TATGT----GCGTAAACTTA-TTATATTAT-TGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAAAAAATA---AATTAT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gattttttatccaacaaaatgtcatctgccggttctaattttcaggaaggctacatattattcttttcttttacctcttaatacacttgctagttttttcttcatattactcatcttctgttagtcatactccctttgtcttcctttaagacatttttaccttcctttaactatttcttcaaaacattatttcatggcaaacataatctcgtta-AAA---------------CAC-TATTTTATAGGGAACATGGTC---TTT--GCGTT---T--C---AAG-TGTTGATGTTTC-ATATAATTATAT----------A----------ATT--ATCACA---G---AA------CA----ATTTTATGTTAAAACATTGAAAAGCATAT--GAT-G-AAAAAGTCGAGCAC-ACAAATTAATTATA----GATATCTTAAC-TAAATCTG-CTATGT-AT-T-----TT--TTATTATATTATGACTATG-TT---T--TTGCTATGATATGCTGATTTATGAAATAAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tCTTCCTTCATGACATTTTC---TTAC-C-TCCCATAA--------T-T-A-T--T--A--------TATT-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCAAACATATTC---TTG--ATTTT---T--T---GAG-TGTAGGTG---T-G-------ACATACGCTTATTCA----------ATC--AT---A---ACAGAA------C-----AATTT---------------------AAA--GAT-GCAAAAAGTCGAGCACCATAATTTGTTTATA----TG-------ACGT-AACTAA-TTATATTA--TAT--GTT--ATATTGTAGTGTGACTATA-CT---T--TTGCTATACTAtatttaatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATC-AAA---------------TAT-TATTTTATAGCGAACATTGTT---TTA--ACAAT---T--T---GAG-AGCTGGTG---C-A-------ACAT----------ATC--------CTT--AT---A---A---AA------CA----GACAT---------------------TATAGGA--A-AAAAAGTCAAGCAT-ATAAATTGTCTACA----T--GT----GCATTAACTTA-CTATAATAT-TGT--GTA--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---TTATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAGT--AAAAAATA---AA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTGCAAAAT---ATTACATTTTCACCAAAAAATGTCAAAATGTCACAC---TGTTTTCCCTTTTTAAACAATATTTACAAA---ATCAAATATCAATCAAGGAACAAATAGCATTAAAATATGATAAACTTGTCTAACATAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatatacactatgcTTCTGT---AAATGAAAATATATTTTCATCATTAAATATCAAAATGTCACATCTATGTTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcactttagataatactactttggatgcaaactcgacggaagcagtcagttacataattTTG-CTATA----TATAT-----CACAA-CCGA-ATGTACT-T-TGTATGTTTAATAT-ATATAATGACTATG-TT---T-A--GCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAATAATTA---ATTTc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaattaatgaccATAAATGCCAAATCGTCACACCTATAGTTTCCCCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAGGAACAAAAAACATTGAAATATGATAATCTTTTCAAATATAACAACAAGTGGAGATTT-TTTTTC--------TCCTATCTAC------TAATTT-T-AAGAAACAAAGGTACTTTTTCTACAT----TTTCTTTTCCAATGTTTGTCCTTTGCCTATTCATACAC--GTGTGTGTATTTTT----T-TCTTTCATGTAACTTGTCTTCTGTTCCCAAAAC-TCCCCC-TTGCCTTCCCTCAAGAC-TTGTT---TT-C-CATCTTACAAAATATGAAC-T-ATT--T--T--------CATT-AAA---------------CAT-TATCTTATAGCTTACATTGTC---TTA--A---TA--TCAT---GAG-TGATGGCG---C-A-------ACAT----------ATG--------CTT--AT---A---A---AATTATATCAGAACAATTT---------------------TAT--GAT-G-AAACAGTCGATTATTATTAATTGGTTACA----TATGC-----CGT-TACTTA-TTATATCATGTGT--GTT--AAATTGTATTGTGACCAAA--------------ATACTATGCTGATTTATGAAATATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taatttcgttttagtatgttttttgaaggTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATTGATAAATATCAAAATGTCACACCTATGTTTTTGCTTTTTAAACAGTACTTACATA---AACA------------------AATAGCATTGAAATACGATAAACTTATCAACCATAACAATAAATGGAGATTT-CTTCTACAATAAAATGCAATCTAA------TAATTT-T-ATG-----AAGA--------CTACATACTATTCCTTTTCAATTTCTTGGCCTTTACCTAGTTATACACTTGTATTTATATTCTTA---TGTC-TCCGAGTAATTTGTCTTGAGTTCTCTAAACTTTCCCCTTTGTCTTCTTTCAAAAC--TTTT---TC-C-C-TCTTAC-AAATATAAACAT-A-TGCT--TTAAAATTATATC-GAAAC-------------CA---ATTTTATGATGAAAA-AGT----TTAGCA---T---TA-T---GAGTTGTTGttgtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgATTAT--GA--GTT--GT--TGTAT-ATG-CCATG-TT---TTATAGCTATACTTTCCTGATTAATGAAAT-AAAGAAATA---AATTATtatatgccatgttttatagctatactttcctgattaatgaaataaagaaataaattattata
gi|4                          : actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgtctgtgcaaaatattatattttcattgataaatatcaaaatgtcacacctatgtttttgctttttaaacagtacttacataaacaaatagcattgaaatacgataaacttatcaaccataacaataaatggagatttcttctacaataaaatgcaatctaataattttatgaagactacatactattccttttcaatttcttggcctttacctagttatacacttgtatttatattcttatgtctccgagtaatttgtcttgagttctctaaactttcccctttgtcttctttcaaaactttttccctcttacaaatataaacatatgctttaaaattatatcgaaaccaattttatgatgaaaaagtttagcTTGTATTTTCATCAATGCATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAAGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTT--------------------GAGATTTCTTTTTCCAATAAAATGCCATCTAC------TAATTT-TTAGG-----AAGG--------CTACATACTATTCCTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGT---------T----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTCTGTTCTCTTAAC-TCCTCCTTTGTCATCCTTCAAG--ATTTT------------------ATATAAAAAC-A-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATTGTC---TTA--A----------T---GA---------------A-------A-AT----------A----------ATTTAAT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------ATT--G---A-AAAAAGTCAAGCATAATGAATTGTC--TC----TATGT----GCATAAACTTA-TTATATTAT-TGT--CTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTTTTAAAT--AAAAAATG---AATTtata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTT-TTTCTCCAATAAAATGCAATCTAC------CAATTT-C-AGG-----AAGG--------CTACATATTATTCTTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTCTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTTTGTTCTCTAAAC-TCCCCCCTTGTCTTACTTCAAAAC-TTTTT---TT-CAG-TCTTATAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATTGTC---TTA--ATATT---T--T---AAA-TGTTTGTG---C-A-------ACAT----------A----------GTT--AT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------TAT--AA--A-AAAAAGTCGAACATTATGAATTGTC--TA----TATGT----GCATGAATTTA-TGATATTAT-AGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAAAAATTA---AA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATCAATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATATTAAACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTTATCAAACATAACAATAAATGGAGATTC-TTTCTCCAAT-AAATGCCATCTAC------TAATTT-C-AGG-----AAGG--------C----------------------TTTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttctctttagagaccattactttcggatcgataaactcgacgaaagtagtaaattatatcattTTGTCACCATG-TT---T-ATTGCTATACTTTGCTGATTTATGAAAT-AAAAAAATA---TATCATaccatgtttattgctatactttgctgatttatgaaataaaaaaatatatcataa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttctctttagagaccattactttcggatcgataaactcgacgaaagtagtaaattatatcattttctgtgcaaaatattatattttcatcaataaatgtcaaaatgccacacctatgttttcctcttttaaacagtacttacatattaaacaaatagcaatcgaggaacaaatagcaatgaaatacgataaacttatcaaacataacaataaatggagattctttctccaataaatgccatctactaatttcaggaaggcttttgtcctttacctattcatacacttgtgtgtatattcttttctccatgaaacTT----T-TA-TTCGTGTAACTTGTCTTCCAT-----AAAC-TTCCT-TTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTT---TTAC-C-TGCTATTAATTATAATT-TCA-T--TAAT--------CATT-AAAAAAAAAAAGAATTGTTATATATTTTATAGTGAACATGGTC---TTG--A---T---T--TATTGAG-TGTCAGTG---TTG-------ATAT----------ATGCTTTTACAATT--AT---A---ACAGAA------CA----A-TTT---------------------TAT--GATTA-AAAAAGTCGAGCATTATGAATTAATTATA----TATGT-----CGTAA--TTAATCATGCTATGTGT--GTT--ATATTGTATTGTGACAATG-TT---T-TTTGCTTTACTATGCTGATTT-----ATAAAAAAACTATTTAATTAaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAATGCCATCTAC------TTATTT-C-AGG-----AAGG--------CTTCATACTTTTACTTTTCCACTTCTTGTCCTTAACATATTCACACACTTGTGTATGTTTTTTTGTTCT-TC-TTCATGAAACTTGTTTTCTGTTCTCTTAAC-TTCCCCATGGTCTTCCTTCAAGACATTTTT---TC-C-C-TCTTACAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATT-AAA---------------TAG-TATTTTATTTCGGACATGGAA---TTA--ATAGT---T--T---TAG-TGTTGGTG---C-A-------ACATATGCTTATAAA----------ATT--AT---ATCGG---AA------CA----AATTT---------------------TCT--GAT-G-AAAAAGTCGAGCAATAAGAATc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                T----T-TC-TTCATGTAACTTGTTTTCTGCTCTCTAAAC-TCACCCTTTGCATATCTTCAAGAC--TTTC---TT-C-TGTCTTACAAGATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTGTAGCGAACATGGTCAAAATA--T---T---T--T---GAA-TGTTGGTT---C-A-------ACATATGCTTATACA----------ATT--ATATCA---G---AA------CA----AATTT---------------------TAT--GAT-G-AAAAAGT--A--ATTATAAATTGGTTATA----TATGC-----CGT-TATTTA-TTATATCATGTGT--TTT--ACATTGTATTGTGACCATG-TTTTCT-TTTGCTTTACTATGCTGATTTATGCAATAAAAATAAat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGTCATGCTCTCTCTCTGTACTCTGCTTCTATATGAATAAGAAAGTTAAGTAAAAAAATACCCAGTTTTCATTTTTGTTA
Unaligned ( gi|20 ): AAAAACCATTGAGAATTGCGAAAATGTGCTTATTTCGTAATGAACTGCTTATA






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataagtaatgtttctttcttaattttgtgaatcattgtACTTGTCTTCTGTTCTCTAAAC-TCCCCCTTTGTCTTCCTTCAAGACTTTTTT---TC-C-C-TCTTACAAAATATAAAT-T-T-G--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-T------------------------------------T--T---GAG-TGTTTGTG---C-A-------ACAT----------A----------GTT--AT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------TAT--GA--A-AAAAAGTCAAGCATTATGCATTGTCTATA----T--GT----GCATAAACTTA-TTATATTAC-TGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TG---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAAT--AAAAAATA---AATTAaaaaaaaagtttcccatgttttatttt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gGATTT-TTTATCCAACAAAATGTCATCTGCCGGTTCTAATTTTC-AGG-----AAGG--------CTACATATTATTCTTTT------------CTTTTACCTCTTAATACACTTGC-----TAGTTTT----T-TC-TTCATATTACTCATCTTCTGTTAGTCATAC-TCCC--TTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTTACCTT-C-C-TTT-----------AAC-T-A-T--T--T--------CTTCAAAA---------------CAT-TATTTCATGGCAAACATAATC---T
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATGCTGATTTATGAAATAAAACAAcgttatatgctgatttatgaaataaaacaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gattttttatccaacaaaatgtcatctgccggttctaattttcaggaaggctacatattattcttttcttttacctcttaatacacttgctagttttttcttcatattactcatcttctgttagtcatactccctttgtcttcctttaagacatttttaccttcctttaactatttcttcaaaacattatttcatggcaaacataatctcgtta-AAA---------------CAC-TATTTTATAGGGAACATGGTC---TTT--GCGTT---T--C---AAG-TGTTGATGTTTC-ATATAATTATAT----------A----------ATT--ATCACA---G---AA------CA----ATTTTATGTTAAAACATTGAAAAGCATAT--GAT-G-AAAAAGTCGAGCAC-ACAAATTAATTATA----GATATCTTAAC-TAAATCTG-CTATGT-AT-T-----TT--TTATTATATTATGACTATG-TT---T--TTGCTATGATATGCTGATTTATGAAATAAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tCTTCCTTCATGACATTTTC---TTAC-C-TCCCATAA--------T-T-A-T--T--A--------TATT-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCAAACATATTC---TTG--ATTTT---T--T---GAG-TGTAGGTG---T-G-------ACATACGCTTATTCA----------ATC--AT---A---ACAGAA------C-----AATTT---------------------AAA--GAT-GCAAAAAGTCGAGCACCATAATTTGTTTATA----TG-------ACGT-AACTAA-TTATATTA--TAT--GTT--ATATTGTAGTGTGACTATA-CT---T--TTGCTATACTAtatttaatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATC-AAA---------------TAT-TATTTTATAGCGAACATTGTT---TTA--ACAAT---T--T---GAG-AGCTGGTG---C-A-------ACAT----------ATC--------CTT--AT---A---A---AA------CA----GACAT---------------------TATAGGA--A-AAAAAGTCAAGCAT-ATAAATTGTCTACA----T--GT----GCATTAACTTA-CTATAATAT-TGT--GTA--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---TTATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAGT--AAAAAATA---AA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTTGCAAAAT---ATTACATTTTCACCAAAAAATGTCAAAATGTCACAC---TGTTTTCCCTTTTTAAACAATATTTACAAA---ATCAAATATCAATCAAGGAACAAATAGCATTAAAATATGATAAACTTGTCTAACATAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aatatacactatgcTTCTGT---AAATGAAAATATATTTTCATCATTAAATATCAAAATGTCACATCTATGTTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcactttagataatactactttggatgcaaactcgacggaagcagtcagttacataattTTG-CTATA----TATAT-----CACAA-CCGA-ATGTACT-T-TGTATGTTTAATAT-ATATAATGACTATG-TT---T-A--GCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAATAATTA---ATTTc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaattaatgaccATAAATGCCAAATCGTCACACCTATAGTTTCCCCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAGGAACAAAAAACATTGAAATATGATAATCTTTTCAAATATAACAACAAGTGGAGATTT-TTTTTC--------TCCTATCTAC------TAATTT-T-AAGAAACAAAGGTACTTTTTCTACAT----TTTCTTTTCCAATGTTTGTCCTTTGCCTATTCATACAC--GTGTGTGTATTTTT----T-TCTTTCATGTAACTTGTCTTCTGTTCCCAAAAC-TCCCCC-TTGCCTTCCCTCAAGAC-TTGTT---TT-C-CATCTTACAAAATATGAAC-T-ATT--T--T--------CATT-AAA---------------CAT-TATCTTATAGCTTACATTGTC---TTA--A---TA--TCAT---GAG-TGATGGCG---C-A-------ACAT----------ATG--------CTT--AT---A---A---AATTATATCAGAACAATTT---------------------TAT--GAT-G-AAACAGTCGATTATTATTAATTGGTTACA----TATGC-----CGT-TACTTA-TTATATCATGTGT--GTT--AAATTGTATTGTGACCAAA--------------ATACTATGCTGATTTATGAAATATAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taatttcgttttagtatgttttttgaaggTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATTGATAAATATCAAAATGTCACACCTATGTTTTTGCTTTTTAAACAGTACTTACATA---AACA------------------AATAGCATTGAAATACGATAAACTTATCAACCATAACAATAAATGGAGATTT-CTTCTACAATAAAATGCAATCTAA------TAATTT-T-ATG-----AAGA--------CTACATACTATTCCTTTTCAATTTCTTGGCCTTTACCTAGTTATACACTTGTATTTATATTCTTA---TGTC-TCCGAGTAATTTGTCTTGAGTTCTCTAAACTTTCCCCTTTGTCTTCTTTCAAAAC--TTTT---TC-C-C-TCTTAC-AAATATAAACAT-A-TGCT--TTAAAATTATATC-GAAAC-------------CA---ATTTTATGATGAAAA-AGT----TTAGCA---T---TA-T---GAGTTGTTGttgtt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgATTAT--GA--GTT--GT--TGTAT-ATG-CCATG-TT---TTATAGCTATACTTTCCTGATTAATGAAAT-AAAGAAATA---AATTATtatatgccatgttttatagctatactttcctgattaatgaaataaagaaataaattattata
gi|4                          : actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgtctgtgcaaaatattatattttcattgataaatatcaaaatgtcacacctatgtttttgctttttaaacagtacttacataaacaaatagcattgaaatacgataaacttatcaaccataacaataaatggagatttcttctacaataaaatgcaatctaataattttatgaagactacatactattccttttcaatttcttggcctttacctagttatacacttgtatttatattcttatgtctccgagtaatttgtcttgagttctctaaactttcccctttgtcttctttcaaaactttttccctcttacaaatataaacatatgctttaaaattatatcgaaaccaattttatgatgaaaaagtttagcTTGTATTTTCATCAATGCATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAAGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTT--------------------GAGATTTCTTTTTCCAATAAAATGCCATCTAC------TAATTT-TTAGG-----AAGG--------CTACATACTATTCCTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGT---------T----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTCTGTTCTCTTAAC-TCCTCCTTTGTCATCCTTCAAG--ATTTT------------------ATATAAAAAC-A-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATTGTC---TTA--A----------T---GA---------------A-------A-AT----------A----------ATTTAAT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------ATT--G---A-AAAAAGTCAAGCATAATGAATTGTC--TC----TATGT----GCATAAACTTA-TTATATTAT-TGT--CTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTTTTAAAT--AAAAAATG---AATTtata
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTT-TTTCTCCAATAAAATGCAATCTAC------CAATTT-C-AGG-----AAGG--------CTACATATTATTCTTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTCTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTTTGTTCTCTAAAC-TCCCCCCTTGTCTTACTTCAAAAC-TTTTT---TT-CAG-TCTTATAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATTGTC---TTA--ATATT---T--T---AAA-TGTTTGTG---C-A-------ACAT----------A----------GTT--AT---A---A---AA------CA----AATTT---------------------TAT--AA--A-AAAAAGTCGAACATTATGAATTGTC--TA----TATGT----GCATGAATTTA-TGATATTAT-AGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---T-ATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAAAAATTA---AA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATCAATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATATTAAACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTTATCAAACATAACAATAAATGGAGATTC-TTTCTCCAAT-AAATGCCATCTAC------TAATTT-C-AGG-----AAGG--------C----------------------TTTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTC
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttctctttagagaccattactttcggatcgataaactcgacgaaagtagtaaattatatcattTTGTCACCATG-TT---T-ATTGCTATACTTTGCTGATTTATGAAAT-AAAAAAATA---TATCATaccatgtttattgctatactttgctgatttatgaaataaaaaaatatatcataa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttctctttagagaccattactttcggatcgataaactcgacgaaagtagtaaattatatcattttctgtgcaaaatattatattttcatcaataaatgtcaaaatgccacacctatgttttcctcttttaaacagtacttacatattaaacaaatagcaatcgaggaacaaatagcaatgaaatacgataaacttatcaaacataacaataaatggagattctttctccaataaatgccatctactaatttcaggaaggcttttgtcctttacctattcatacacttgtgtgtatattcttttctccatgaaacTT----T-TA-TTCGTGTAACTTGTCTTCCAT-----AAAC-TTCCT-TTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTT---TTAC-C-TGCTATTAATTATAATT-TCA-T--TAAT--------CATT-AAAAAAAAAAAGAATTGTTATATATTTTATAGTGAACATGGTC---TTG--A---T---T--TATTGAG-TGTCAGTG---TTG-------ATAT----------ATGCTTTTACAATT--AT---A---ACAGAA------CA----A-TTT---------------------TAT--GATTA-AAAAAGTCGAGCATTATGAATTAATTATA----TATGT-----CGTAA--TTAATCATGCTATGTGT--GTT--ATATTGTATTGTGACAATG-TT---T-TTTGCTTTACTATGCTGATTT-----ATAAAAAAACTATTTAATTAaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAATGCCATCTAC------TTATTT-C-AGG-----AAGG--------CTTCATACTTTTACTTTTCCACTTCTTGTCCTTAACATATTCACACACTTGTGTATGTTTTTTTGTTCT-TC-TTCATGAAACTTGTTTTCTGTTCTCTTAAC-TTCCCCATGGTCTTCCTTCAAGACATTTTT---TC-C-C-TCTTACAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATT-AAA---------------TAG-TATTTTATTTCGGACATGGAA---TTA--ATAGT---T--T---TAG-TGTTGGTG---C-A-------ACATATGCTTATAAA----------ATT--AT---ATCGG---AA------CA----AATTT---------------------TCT--GAT-G-AAAAAGTCGAGCAATAAGAATc
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Reference ( family-853 )      :                             NNTTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATCAATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCCCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAGCANTGAAATACGATAAACTTATCAAACATAACAATAAATGGAGATTT-TTTCTCCAATAAAATGCCATCTAC------TAATTT-C-AGG-----AAGG--------CTACATACTATTCCTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGNAACTTGTCTTCTGTTCTCTAAAC-TCCCCCTTTGTCTTCCTTCAAGACATTTTT---TT-C-C-TCTTACAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATNGTCT--TAATATTTTGAG-TGTTGGTGC-AACATATGC---T---T---T---AA--TTATANCGGAACAAATTT---------------------TAT--GAT-G-AA-AAAGTCGAGCATTATGAATTGTCTATA----TATGT----GCGTAAACTTA-TTATATTAT-TGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---TATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAAAAAATA---AATTAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acAA---------------CA---ATTTTATAGTGAACATGGTCT--TTATATTTTCAG-TGTTAGTGG-AACATATGC---T---TA--T---AAGATTATATCGGAACAAATTT---------------------TAT--GAT---AA-AAAGTCGAGCATTATCAATTGTTTATA----TATG------CATTTATTTA-TAATATTAT-TTT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATGTTT---TATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAAT-AAAAAAATA---AATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ataagtaatgtttctttcttaattttgtgaatcattgtACTTGTCTTCTGTTCTCTAAAC-TCCCCCTTTGTCTTCCTTCAAGACTTTTTT---TC-C-C-TCTTACAAAATATAA-----A-T--T--T--------G-----------------------------TTCAT--CAAACAT-------------TTTGAG-TGTTTGTGC-AACATA-------------------G--TTATAA---AACAAATTT---------------------TAT--GA--A-AA-AAAGTCAAGCATTATGCATTGTCTATA----T--GT----GCATAAACTTA-TTATATTAC-TGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TG---TATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAAT--AAAAAATA---AATTAaaaaaaaagtttcccatgttttatttt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                           gGATTT-TTTATCCAACAAAATGTCATCTGCCGGTTCTAATTTTC-AGG-----AAGG--------CTACATATTATTCTTTT------------CTTTTACCTCTTAATACACTTGC-----TAGTTTT----T-TC-TTCATATTACTCATCTTCTGTTAGTCATAC-TCCC--TTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTTACCTT-C-C-TTT-----------AAC-T-A-T--T--T--------CTTCAAAA---------------CAT-TATTTCATGGCAAACATAATCTCGTTATATGCTGA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATGCTGATTTATGAAATAAAACAAtttatgaaataaaacaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                gattttttatccaacaaaatgtcatctgccggttctaattttcaggaaggctacatattattcttttcttttacctcttaatacacttgctagttttttcttcatattactcatcttctgttagtcatactccctttgtcttcctttaagacatttttaccttcctttaactatttcttcaaaacattatttcatggcaaacataatctcgtta-AAA---------------CAC-TATTTTATAGGGAACATGGTCT--TTGCGTTTCAAG-TGTTGATGT-TTCATATAA---T---TATAT---AA--TTATCACAGAACAATTTTATGTTAAAACATTGAAAAGCATAT--GAT-G-AA-AAAGTCGAGCAC-ACAAATTAATTATA----GATATCTTAAC-TAAATCTG-CTATGT-AT-T-----TT--TTATTATATTATGACTATG-TT---T-TTGCTATGATATGCTGATTTATGAAATAAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tCTTCCTTCATGACATTTTC---TTAC-C-TCCCATAA--------T-T-A-T--T--A--------TATT-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCAAACATATTCT--TGATTTTTTGAG-TGTAGGTGT-GACATACGCTTAT---T---C---AA--TCATAACAGAAC-AATTT---------------------AAA--GAT-GCAA-AAAGTCGAGCACCATAATTTGTTTATA----TG-------ACGT-AACTAA-TTATATTA--TAT--GTT--ATATTGTAGTGTGACTATA-CT---T-TTGCTATACTAtatttaatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATC-AAA---------------TAT-TATTTTATAGCGAACATTGTTT--TAACAATTTGAG-AGCTGGTGC-AACATATCC-------------------TTATAA---AACAGACAT---------------------TATAGGA--A-AA-AAAGTCAAGCA-TATAAATTGTC--TA----CATGT----GCATTAACTTA-CTATAATAT-TGT--GTA--ATATTGTATTGTGACCATGTTT---TATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAGT--AAAAAATA---AA
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gi|17                         :                 aatatacactatgcTTCTGT---AAATGAAAATATATTTTCATCATTAAATATCAAAATGTCACATCTATGTTT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcactttagataatactactttggatgcaaactcgacggaagcagtcagttacataattTTG-CTATA----TATAT-----CACAA-CCGA-ATGTACT-T-TGTATGTTTAATAT-ATATAATGACTATG-TT---TA--GCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAATAATTA---ATTTc
gi|2                          :                                                  aaattaatgaccATAAATGCCAAATCGTCACACCTATAGTTTCCCCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAGGAACAAAAAACATTGAAATATGATAATCTTTTCAAATATAACAACAAGTGGAGATTT-TTTTTC--------TCCTATCTAC------TAATTT-T-AAGAAACAAAGGTACTTTTTCTACAT----TTTCTTTTCCAATGTTTGTCCTTTGCCTATTCATACAC--GTGTGTGTATTTTT----T-TCTTTCATGTAACTTGTCTTCTGTTCCCAAAAC-TCCCCC-TTGCCTTCCCTCAAGAC-TTGTT---TT-C-CATCTTACAAAATATGAAC-T-ATT--T--T--------CATT-AAA---------------CAT-TATCTTATAGCTTACATTGTCT--TAATATCATGAG-TGATGGCGC-AACATATGC---T---TA--TAA-AA--TTATATCAGAAC-AATTT---------------------TAT--GAT-G-AA-ACAGTCGATTATTATTAATTGGTTACA----TATGC-----CGT-TACTTA-TTATATCATGTGT--GTT--AAATTGTATTGTGACCAAA-------------ATACTATGCTGATTTATGAAATATAA
gi|3                          :   taatttcgttttagtatgttttttgaaggTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATTGATAAATATCAAAATGTCACACCTATGTTTTTGCTTTTTAAACAGTACTTACATA---AACA------------------AATAGCATTGAAATACGATAAACTTATCAACCATAACAATAAATGGAGATTT-CTTCTACAATAAAATGCAATCTAA------TAATTT-T-ATG-----AAGA--------CTACATACTATTCCTTTTCAATTTCTTGGCCTTTACCTAGTTATACACTTGTATTTATATTCTTA---TGTC-TCCGAGTAATTTGTCTTGAGTTCTCTAAACTTTCCCCTTTGTCTTCTTTCAAAAC--TTTT---TC-C-C-TCTTAC-AAATATAAACAT-A-TGCT--TTAAAATTATATC-GAAAC-------------CA---ATTTTATGATGAAAA-AGT-T--TAGCATTATGAGTTGTTG-------TATATGC---CATGT---T-------TTATAGCTATAC---TTT---------------------CCT--GAT-T-AATGAAATAAAGAA--ATAAATTAT-TATA----ttgtt
gi|4                          :  actttcggatcgataaactcgatgaaggtagtaaattacattattgTTGTATTTTCATCAATGCATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATA---AACAAATAGCAATCGAAGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTT--------------------GAGATTTCTTTTTCCAATAAAATGCCATCTAC------TAATTT-TTAGG-----AAGG--------CTACATACTATTCCTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGT---------T----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTCTGTTCTCTTAAC-TCCTCCTTTGTCATCCTTCAAG--ATTTT------------------ATATAAAAAC-A-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATTGTCT--TAA-----TGA------------AA---ATAA---T---T---T---AA--TAA------AACAAATTT---------------------ATT--GA----AA-AAAGTCAAGCATAATGAATTGTC--TC----TATGT----GCATAAACTTA-TTATATTAT-TGT--CTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---TATTGCTATACTATGCTGATTTTTTAAAT--AAAAAATG---AATT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                              TTT-TTTCTCCAATAAAATGCAATCTAC------CAATTT-C-AGG-----AAGG--------CTACATATTATTCTTTTTCCACTTCTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTCTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTCTTTTGTTCTCTAAAC-TCCCCCCTTGTCTTACTTCAAAAC-TTTTT---TT-CAG-TCTTATAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATC-AAA---------------CAT-TATTTTATAGCGAACATTGTCT--TAATATTTTAAA-TGTTTGTGC-AACA----------------T---AG--TTATAA---AACAAATTT---------------------TAT--AA--A-AA-AAAGTCGAACATTATGAATTGTC--TA----TATGT----GCATGAATTTA-TGATATTAT-AGT--GTT--ATATTGTATTGTGACCATG-TT---TATTGCTATACTATGCTGATTTATGAAATAAAAAAATTA---AA
gi|6                          :                               TTCTGTGCAAAAT---ATTATATTTTCATCAATAAATGTCAAAATGCCACACCTATGTTTTCCTCTTTTAAACAGTACTTACATATTAAACAAATAGCAATCGAGGAACAAATAGCAATGAAATACGATAAACTTATCAAACATAACAATAAATGGAGATTC-TTTCTCCAAT-AAATGCCATCTAC------TAATTT-C-AGG-----AAGG--------C----------------------TTTTGTCCTTTACCTATTCATACACTTGTGTGTATATTCTT----T-TC-TCCATGAAACTTGTC
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gi|7                          : ttctctttagagaccattactttcggatcgataaactcgacgaaagtagtaaattatatcattttctgtgcaaaatattatattttcatcaataaatgtcaaaatgccacacctatgttttcctcttttaaacagtacttacatattaaacaaatagcaatcgaggaacaaatagcaatgaaatacgataaacttatcaaacataacaataaatggagattctttctccaataaatgccatctactaatttcaggaaggcttttgtcctttacctattcatacacttgtgtgtatattcttttctccatgaaacTT----T-TA-TTCGTGTAACTTGTCTTCCAT-----AAAC-TTCCT-TTTGTCTTCCTTTAAGACATTTTT---TTAC-C-TGCTATTAATTATAATT-TCA-T--TAAT--------CATT-AAAAAAAAAAAGAATTGTTATATATTTTATAGTGAACATGGTCT--TGATTTATTGAG-TGTCAGTGTTGATATATGC---T---T---TTACAA--TTATAACAGAACAA-TTT---------------------TAT--GATTA-AA-AAAGTCGAGCATTATGAATTAATTATA----TATGT-----CGTAA--TTAATCATGCTATGTGT--GTT--ATATTGTATTGTGACAATG-TT---TTTTGCTTTACTATGCTGATTT-----ATAAAAAAACTATTTAATTAaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                             AAATGCCATCTAC------TTATTT-C-AGG-----AAGG--------CTTCATACTTTTACTTTTCCACTTCTTGTCCTTAACATATTCACACACTTGTGTATGTTTTTTTGTTCT-TC-TTCATGAAACTTGTTTTCTGTTCTCTTAAC-TTCCCCATGGTCTTCCTTCAAGACATTTTT---TC-C-C-TCTTACAAAATATAAAC-T-A-T--T--T--------CATT-AAA---------------TAG-TATTTTATTTCGGACATGGAAT--TAATAGTTTTAG-TGTTGGTGC-AACATATGC---T---TA--TAA-AA--TTATATCGGAACAAATTT---------------------TCT--GAT-G-AA-AAAGTCGAGCAATAAGAATc
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