lowQualScore : 2 5555 222 1 1 11111 555555555555555555 2 22222222222 22222222 11 1 1 1111 1 111111111 6666666666666666 111111 1111111 111111111111 11 11111 11111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 11111 111 333333333 11111111111 11 11 11111111111111 55555555555555555555555555555555555555555555 1 555555555555555555555555 22222 111111 2222222 6666666666666666666666666666666666666 11111111111 11111111111111 2222
lowQualScore : 2 0 1111 666 5 0 7 88 44 22222 1 777777777777777777 2 88888888888 5 4 00000000 6 5 22 4 666 0 5 6 1 0000 5 888888888 3333333333333333 222222 4 55 77777 666 4 777 9999999 4 88888 1 999999999999 33 0 11 88888 3 555 8888 555 33 3 66666666666666 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 3 3 6 88 1 7777 88888 3 1 222 55 66 8888 999999999 44 4 3 9999999 1 5 99999999999 88 2 555 00 3 2 11111111111111 888888 66 22 6 3 66666666666666666666666666666666666666666666 3 1 555 444 5555 22 7 2 0 555 4 3 2 7777 2 000000000000000000000000 2 5 0 00000 77777 4 555 444 9 55 333333 5 1111111 6 3 44 3 77777777 0 2222222222222222222222222222222222222 2 2 0 22 22 88888888888 1 44444444444444 3 6666 55 33 1 1 111 22222 444444 2 4
lowQualScore : . . .... ... . . . .. .. ..... . .................. . ........... . . ........ . . .. . ... . . . . .... . ......... ................ ...... . .. ..... ... . ... ....... . ..... . ............ .. . .. ..... . ... .... ... .. . .............. ......................................................... .... . . . .. . .... ..... . . ... .. .. .... ......... .. . . ....... . . ........... .. . ... .. . . .............. ...... .. .. . . ............................................ . . ... ... .... .. . . . ... . . . .... . ........................ . . . ..... ..... . ... ... . .. ...... . ....... . . .. . ........ . ..................................... . . . .. .. ........... . .............. . .... .. .. . . ... ..... ...... . .
lowQualScore : 2 0 0000 777 9 4 0 55 22 99999 1 666666666666666666 4 00000000000 0 4 77777777 0 1 55 1 000 0 0 9 9 6666 8 555555555 6666666666666666 000000 0 55 11111 999 0 000 9999999 1 33333 0 555555555555 55 4 22 33333 7 444 7777 444 99 6 22222222222222 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4444 1 1 2 22 2 5555 33333 6 3 777 55 11 5555 777777777 22 5 1 7777777 1 7 66666666666 11 9 555 77 4 9 99999999999999 888888 88 88 2 1 44444444444444444444444444444444444444444444 2 8 444 777 7777 66 5 4 6 666 4 8 4 4444 1 111111111111111111111111 5 0 4 00000 11111 9 000 555 1 88 999999 9 3333333 2 1 22 1 44444444 9 4444444444444444444444444444444444444 2 2 3 88 33 22222222222 7 22222222222222 1 9999 11 44 4 1 999 66666 222222 6 8
consensus : AGGAAGAGGAACCCTATCCTCACAAGCTAC-TACAACATCCATGGCCACGACCTAACCGTAGCCAAG---A-ACGG--CGA--G-TACCT-GGAG-GC-ACA--T-CTC-TCAG-A--ACC---TCTCCTGGAATGCC-CATGTAGCAG-CC-ACNGCCAAGAAAG----CCAACAATNC-------CCTAG---C-CTT-C----C-TCA--G-A-GAAA-CCT--G-GCAAGTT-GCCCA-C---AGN---ANACCAAGG-----CACAG--AG-----T-TACAAGACCCTTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGN--NCACAGCATGGG---ACCCG---TA---C--ACCG-C-------CA-C---GAACATCAG----------------CC---AGATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AAC-AAGCAGTACCAGCCAG--AT-GAT-ACATGAC-CTT--GGCTGGAAGACATTGCAA----GAA-GCCGC-GCGTCAAC--GCGA-AGCTCGCG---ATGGTG-TGTA----CAGAATCGTCCATGGG-C--TCATA--GATATCCCCT-CAA----C----AN--TC------T-TCCGAC-CA-GC-------N-----TC-CCTCAA--C-A---CN-AN-AGGCAACTCGCTGAAGTTCC---TGGTCC---CA----TTCTGCAGAGTT-GAC-ATC-TACCGGCACTCCTTCTTTC-CC----TCGGG---CNC-C-A--GACTG-TG----GAA-C-AGCCTTCC--AGAGC-----GCATCGCCACAG---CCGA--CACCNTAGAGGCNTTCAGGGG--AGGGCTGGTC--TCTGC-ACCG-T--AGA-GC----G---AGGGCATCG-N----TTTA------TC--G--TTTT---AA--T--T-TAA-TCTTGTA--C-ATAC--G-C------GCGCCTCAC-AA------------TCACC-TTG---TAT-CATACA--C-CAAAT-TGTA---CG-----ACGATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAACGGAAGAA
Reference ( gi|4 ) : AAGAAGAGAACTCCCAT----ACAGGCCACTTACAACATTCTTGGCTAAAACCTAACTTTCGTCAAG---A-ACGG--CAA--G-TACCTTGGAGTGC-ACA--T-CTC-CCAG-A--ACA---TATCCTGGAATGCC-CATATAGCAG-CC-ACAGCTAACAAAG----CCAAAAATTC-------CCTAGAATT-CTT-T----C-TCA--G-A-GAAA-CCT--G-GCAAGTT-ACCCA-C---AAT---ACATCAAGG-----CACAG--AG-----T-TACAAGACCCTTGTCAGGCCCATTTTTGAGTATGCAA--GCACAGTATGAG---ACCCA---TA---C--ACCG-C-------CA-C---GAACATCAG----------------CC---AGATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AAC-AGTCAGTACCATCCAG--TT-GAT-ACATGAA-CTT--GGCTGGAAAACATTGCAA----GAACGCCGCCGCGTCAAC--GCGA-AGCTGGCG---ATGGTG-TGTA----CAGCATCGTCCACTGG-C--TCATA--GATATTCCCT-CAG----C----AT--TC------T-TCCGAC-CA-GC-------T-----TC-CCGCAA--C-A---CA-AT-ATGAAACGCGCTGAAGTTCC---TGGTCC---CA----TTCTGCAGAATT-GAC-ATC-TACCGGCATTCCTTATTTC-CC----TCGGG---CTA-A-A--GACTG-AC----GAA-C-AGCTTTTA--AGAGC-----GCATCGCTACAG---CCGA--CACCGTAGAGGCTTTCAGAAG--AGAGCTTGTC--CCTGC-ACCA-T--AGA-GC----G---AGGGCATCG-A----TTTA------TC--G--TTTT---AA--TG-T-TAA-TCTTGTA--C-ATAC--G-C------GCGCCTCAC-AA------------CCACC-TT----TAT-CATACA--C-CAAAT-TGTA---CG-----ACGATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAACGGAAGGA
gi|1 : AGGGAGAGGAGCCCTATCCTCGCAAGCTAC---CAA-ATCCATGGGCACAACCTAATCATAGTCAAG---ACAGGA--CGA----TACCT--GAGGACGACG----CTC-TCGG-GCGATC---TCTCCTGGAA-GCCACATGTGG-AGTCC-ACTATCAAGAAAG----TCAACAACAG-------CCTGG-----CGT-T----CATAA--G-G-AGAG-TCT--GTGTA-TTT-GTCCA-C---AAA---AAACCAAGG-----CCCA---AG-----CATACAAGAACCTCGTTTGACCAACGGTCGAGTGCGCCT--CCACAGCATGGG---ATCCAACGTAGTTC--AACG-TGGGGCAGCA-C---G--CTTC-G----------------CC---A-AGG---GA-----G--------------------ACTACTGCAC-AACTAGT-AGGATCTCCCAG--AT-GAT-A-ACGGATCTT--GGTTGGT---CATTTCTC----CAACATAG--ACGACAGCATGCCA-AGCTGATT---ATGATG-TATA------GGATCATCTATTGC-C--ATATC--GATATCCCCG-CAA----C----ACCGTA------T-CTCGACACA-CC-------A-----CCACTGTAG--CGA---CC-AG-AGGTCACGCAACCAGATACG---TTGTAC---CA----TTTTGCAGAATG-GACTATC-T-TCGTCACTCCTTCTTCC-CC----TT-GG---CTACA-C--GGCTG-TG----GAACC-AGCT
gi|2 : aagatctggacaaacgccagcaatgggaacgtgactggatgatgtccttcaaccctttaaagtgcggcgaggtcctgcgcattaccAGGAAGAGGAACCCTATCCTCACAAGCTAT---CAA-ATCCATGGGCACAACCTAATCATAGCCAAG---ACAGGA--CGA----TACCT-GGGG----ACAACG-CTC-TCGG-ACGACC---TCTCCTGGAA-GCCACATGTC-CAGTCC-ACTACCAAGAAAC----CCAACAACACTGAACAGCCTGGCATT-C--------A-TAA--G-A-GAAA-CCT--G-TCTAGCT-GTCCA-C---AGG---AAACCAAGG-----CCCA---AG-----CATACAAGACCCTTGTTTGACCAACGCTCGAGTACGCCT--CCACAGTATGGG---ATCCA---TA---C--ACaccacagaacctggtcacagcgtccaacctggcggcattcaagttgggggaggggaggggggactggtgcagtatgaataacccacactgtacaaagttttatttctttttaaacctgcactactagtttgcgcctcactcggcatcattcttgtacagtcacacatgtacgacaatgcctcagagtgggccctgtacattattattagaagaa
gi|39 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactAAGAAGAAAA-TCCCAT----ACAGGCCACATACAACATTCACGGCCAAGACCTGACTTacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcatgccaagctgactatgatgtataggatcatctatggccatatcgacatccccgcacacatctacacacagccagaggtcacacaatcaaataccattttgttccattttgcataacggactatcttcatcactccttcttcccctcagctacactgctgtggaacctgctaccagagcacctgaccacagcgtccaacctggaggcattcaaggacttgtgcagtattaataacccacactgtacgttttatttctttttaaacctgcattactagtttgcacctcacatcattcttgtacagtcacaaatgtacaacaatgcctcagagtgagctctgtacattactggaaggaaaa
gi|46 : gaagacctggacagaattattaagtgggaaaaagacgggatgatgttattcaatcccagtaagtgcgagatgatctgcatcacaAGGAAGAGGAACCCTATCCTCACAAGCTAC---CAA-ATCCATGGGCACAACCTAATCGTAGCCAAG---A--CAG--GAT--GATACCT-GGGG----ACAACC-CTC-TCAG-A---CAATCTCTCCTGGAA
gi|6 : tccgcgcattaccAAATCCCCT----ACAGGCCACATACAATATTCATGGCCAAGACCTAACTTTTGTCAAG---A-A-GA---------------GGAGCGC-ACA--T-TTT-CAAA-A--ACC---TCTCCTGGAATGCC-CATGTAGCAG-C--ACAGCTAAGAAGG----CCAATAATTT-------TCTAG---C-CTT-C----C-ACA--G-AAGAAA-CCT--G-GAAAGTT-GCCCA-C---AGG---ATATCAAGT-----CACAG--AG-----T-TATCAGGCCCTTGTTGGGCCCATTTTTGAGTATGCGA--TAACAGCATGGG---ACCCG---TA---C--ACTG-C-------CA-A---GAATATCAG----------------CC---AGATT---GA-----G--------------------GC
gi|22 : TTACCAAATCCATGGTGACAACCTAGCTGTAGCCAAG---A-------CAATGA-TACTT--GAGGAC-A-A--TGTTC-TCAG-A--AGA---CCTCCTGGAATCTG-CATGTCG-AG-TCAACTACCAAGAGAG----CCAACAGCAG-------TCTGGCATT-CAT----------AAGG-A-GAAA--CT--G-----TTT-ATCTGTC---AATAGGAAACTAAAG-----CCCAAGCAG-----T-T--AAGATTCTCGCTAGACCAACACATGACTACTCCT--CCACAGTATGGG---ATCCA---TA---C--ACtgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttcaagacaacaagtagtaacagccagatgatcaatgactttggctggaagacattgcaagaatgccatgtcaatgcaaggcttgtgatggtgtacagaaacgtccatggactcataggtatcccctcacttatcattctttcgatcacatcctcaacactaggggcaactcactgaagttcttagtcccattttgcataattgacatctacctgcattttccctcaagcaccagaatgtggaacagccttcctgagcgcatcgccacagtcgacactctagagg
gi|7 : caaaTACAATATCCATGACCAATAGCTGA-----AACAAGCAAA-ACAGTCCAA--A-TACCTTGGGG--C-ACT--T-CTCACCAACA--ACC---TGTCCTGGAACGC---ATACAAT-G-TC-AT-GATCACGAAGAGGGCCAACAATAC-------CACAG---T-CTT-C----C-TCA--G--------CC-----GCAACCT-CTCAA-C---A-T---GCA-CGAGGGGAACTAAAG--AGGCCTGC-TACAAGACCTTCGTAAGGCCCAAGGTTGAGTATGCCG--CCACTGTTTGGG---ACCCT---CA---C--ACacagtttgaatacagcaactagagacattccaatatagagc
gi|10 : tcaagctcaacgcagacCAACATTCACAGCCAATACCTGACTTTCGTCAAG---A-ATGG--CAA--G-TACCTTGGAGTGC-ACA--T-CTC-CCAA-A--ACC---TAACCTGGAATGCC-CATGAAGCAG-TC-ACAGCTAAGAAAG----CCAATAATTC-------CCTAG---C-CTT-C----C-TCA--G-A-AAAAACCT--G-GCAAGTT-GCCCA-C---AGG---ACATCAAGG---------------------TACA-GA----TGT-------------GAG------A--GCACAGCATGGG---ACCCT---TA---C--ACTG-C-------CA-C---AAACATCAG----------------CC---AGACT---GA-----G--------------------GCCA--T-CC-AGC-AATGAG-------CAG--TGAGAT-TCATGAA---T--GGC-----GAC--TACAA---------CCA--GTACCAAC--CCGATAACTGATGTTCATAATGGTGCA----CAGAATCGTTCATGAG-G--TCATA--GATATCCCCT-CAG----T----AG--TC------T-TCAGAC-CA-GC-------T-----TC-ACTCAA--C-A---CT-AG-AAGAAACTCGCTGAAGTTCC---TGGTCC---CA----TTCTGCAGAGTT-CAC-ATC-TACTGGCACTCCTTCTTTC-CC----TCGGG---CAT-C-A--GACTG-TG----GAA-C-AGCCATCC--AGAGC-----ACATCACCACAG---CCGA--Ctcaagcctatatcaacaaagtagaagcggtgcaacacagagctgccagctttgtctctgggattacaactgaaaattcatcgtcaccgccacgcataacacactcggctgggagggtcttcaacaacagaagaaggaggccaaggctgtcataatctattagattaccaacaaccttgatatccctaatgtgccttacatacatccacagagagtttcaaccttaggtcactcgatgaggtacttggtaccatactgcaagatgtctgtattgaaagagtcattcttcccttccatcattgtattatgga
gi|50 : ttGAAGTGT-ACA--T-TTC-TCAA-A--ACC---TATCTTGGAATGCA-TATGTACCCG-CC-ACAGCAAAGAAGA----CCAATAATTC-------TCTAG---------T----C-TCA--GAA-GAAA-CCT--G-GCATGTT-AACCA-C---
gi|14 : -A--ACC---TATCCTGGAATGCC-CATGTAGCAG-CC-ACAGTTGAGAAGG----CCAACAATTC-------CTTAG---C-CTT-CAGACC-TCA--G-AAGAAA-CCT--G-GCAAGTT-GCCCA-C---AGC---ACATCAAGG-----CACAG--AG-----T-TACAAGACCCTTGTCAGGCCCATTCTTGAATATGTGA--GCACAGCATGGG---ACACA---TA---C--ATGG-C-------CA-C---GAACATCAG----------------CC---AGATT---GA-----G--------------------GCtgg
gi|3 : aATTGCCT-T----C-TTGACG-A-GAAA-TTC--A-ACCAGTTGACCCA-CTGAAGT---A----AAGG-----CCCAA--AC-----T-TACAAGACACTGGTTCGCCCAATCCTCGAGTATGCAT--CTCCAGTCTAGG---ACCCC---CA---C--ACCA-C-------AA-C---TAACATCAA-----------------C---AAATT---G------G--------------------A----------AAC-AGTCcgtccagcgatgagcagcgagaatcatgaagggcgattacaagacaacaagcagtatacatgaccttggctggaagacattgcaagaacgctgcatcaacgcgaagcttgcgatggtgtagagaatcgtctaggagctcatagatatctcctaagcctttttc
gi|32 : aacccgcaagaggagcccatcgccaagcagtacactttacacggacagacactcaatcttgccccaaatggtagttacctgggtgtgaccatcaatgaaaaactgctgtgagatagtcatgttgatgccatcacaaataaggtcagtaatatc-CTTAT----T-TCA--A-A-GAAA-TGTTCG-ATA--TT-GTCCA-G---AAG---AGATAAGGG-----CACA---AG-----CATATACCACCCTTGTCAGGCTCATATTTGAATATGCAGCTGCATTGTGTGAT---ACC-----TA---CCAACAG-C-------AA------AACATTAA----------------C------ATC--------------------------------CAA--G-AT-AA--AATGAGGA--ACCCAGAATT-GAG-ACcaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaacatgctaagcttgtaatggtctacaggatcagccacgacctgatagacagtccagcagtcgtgtacttccaccccactgcaccatttacaagaggacattccacatgatacatgcagcctttctgccggacggacaagtacagctttttcccatatggtacctgcctgtggaaccagctgccggatcgcatagccactgcccagaccaaagagggcttcaagtccggtctggtcgccctccagttgtcgacaccatccacgtttttatcggtttttaaattcttaatctgtacatttttgcacgtcaaagcggctttgtatatacaccaagtgcgtttatgcctcagagtgggccctgcactttatcaggaagaagaaga
gi|31 : GG-----TACAC--AG-----T-TACCGTCCCCTTGTCAGGCCCATTCATGAGTATACGA--GCACAGCATGGG---GCCCG---TA---C--ACGG-C-------AA-T---GAACATCAG----------------CC---AGATT---GC-----G--------------------GC----G-ACGAAC-AG
gi|8 : G-----CACAT--AG-----T-TATCAGACCCTTGTCAGGCCCATTCTTAAGTATGC-----C-CAGCACGGG---ACCCG---TA---C--ACCA-C-------AA-C---GAACATAAGAAAGAACGACGAGCATCCGCGAGATTCGTGAATAACG--------------------ACAT--G-AC-AAC-AAGCAGTACTAGCCAG--AG-GAT-ACAGGAC-TTT--GGCTGGAAAACATTGCAA----GAACGCCGC---GTCAAC--GCGA--GCT--CG----TGGTGATGTA----CAGAATCGTCCATGGG-C--GCATA--T-TATCCCCT-CAA----C----AT--TC------T-TCCGAC-TA-GC-------G-----TC-CCTCAA--C-A---CT-AG-AGGCAACTCACTGAAGTTCC---TAGTCC---CA----CTCTGCAGATTT-GAC-ATA-TACACGCACCCCTTCTTTC-CC----TCAGA---CAC-C-A--GATTG-TG----GAA-C-AGCCTTCC--AGAAT-----GCACCGCCACAA-----AATTTACTTTAGAGGCTTTCA----------CT------CCTGC-GCCG-T--AGA-TCGTCGG---AGGGCATCG-T----TTTGAAAAACTC--AT-TTTT---AA--TT-T-TAA-TCTTGTA--C-ATAC--G-C------GCGTCTTAC-GG------------TCACC-TTG---TAT-CATACA--C-CAAAT-TGCA---CA-----ACGATGCCACAGAATGAG------ATGTTGTGCAGTAATGGAAGcgagattagcgaatggcgactgcaagacaacaagcaataccagttgacaacagttactatcgg
gi|9 : -----CACAG--AG-----T-TACCACACTCTTGTCAGGCCCATTATTGAGTATACAA--GCACAGCATGGG---ACTCG---TA---C--ACCG-C-------CA-T---GAACATCAG----------------TC---AAATT---GC-----GGGATTCGTGAATGGGTGACTACAA--G-AC-AAC-AAGCAGTACCAGCCAG--AT-GAT-ACAT--A-CTTTTGGCTGGAAGACATTGCAA----GAACGCCGC---ATCAAC--GCAA-AGCTCGTA---ATGGTG-T--A----CAAAAACGTCCATGGG-C--TCATA--GATATCCCCT-AAT----C----AT--TC------T-ACCAAC-CA-GC-------T-----TC-CCCCAA--C-A----A-ATGAGGCAACTCGCTGAAGT-CC---GGGTCC---CA----TTCTGCAAAGTT-GAC-ATC-TACTGGCACTCCTTCTTCC-CC----TCGGG---CAC-C-A--AACTG-CG----GAA-A-AGCCTTCC--AGAGC-----GCATCGCCACAG---CCGA--CACCGTAGAGGCTTTCAGAAG--AGGGTTGATC--TCTGC-ACAA-T--AGC-GC----G---AGGGCATCGTT----TTTA------TT--G--CTTT---AA--TC-T-TAA-TCTTGTA--C-ATAC--G-C------GCGTTGCAC-AA------------TGACCGTG----TAT-CATACA--C-CAAAT-TGTA---CG-----CCGATGCTCTAGAGAAGG------ATTTTGTGCAGTAAa
gi|11 : CAA--GCA-AATGCGAGGTGATCCA--------C--ACCA-C--------A-CAGAGAA-ATC-------------------C---A-ATT--------------------------------CAT--G-AC-AAC-AAGCAGTACCAGCAAG--AT-GAC-CCACGAC-ATT--GGTTGAAAGACACTGCAA----GA---TCGTCACGTCAAC---CAA-AGCTTGTG---AT--TG-TGTA----CAGAATTGTCCACGGG-C--TGATAA-GATA----CTACAA----C----AA--CC------T-----AC-CA-GC-------A-----TC-CCTCAA--C-A---CT-AA-AGGTAATTCACAGGTGTTCC---TGGTCC---CA----TTTTGCACAGTT-GAC-ATC-AAACGGCACTCCTTTTTTT-CC----CTGGA----TACC-A--GACTG-TG----GAA-C-AGCCTTCC--AGAGC-----CCATCACCACAG---CTGA--CA-----------TTCTGGGC--AGGGCTAG----------ACTG-T--AAA-GT----G---AGGGCA-----------------------------T---AA--TG-T-TTA-T-TCCTAACC-ATAT--G-C------ACACCTCAC-AA------------TCACCATA----TGT-CATACA--C-C-AAT-TGTA---CA-----ATGGTGGCTCAGTGTGGG------ATTATGTACAGTAATGGAAGA
gi|24 : atgatgttgttcaacc--ACCGGC-------CAGC---GAAGAGCAG----------------CT---TGATTCGTGA-----ATGGCGATT------------ACAA--A-AC-AAC-AATCAGTATCAGCCAA--AT-GAT-ACATGGC-CTT--TGCTTCAAGACATGGCAT----GAA---CGCCGTGTCAAC--GCAA-AGCTCGTG---ATGGTG-TATAATTTTA--ATCGTCTATGGG-C--TCTTG--GACATTCCTT-CTA----C----GA--TC------T-TCCG-T-GG-GC-------A-----TC-CAG--G--C--------AT-GT------CGTTGAAGTTTC---TGGTCC---CA----TTCTGCAGAGTT-GAT-ATA-TACg
gi|14 : cctcaactaacatcagccagattgaaGATT-------------------------------ACAA--G-AC-AAC-AAGCAGTA---------------T-ACATGAC-CTT--GGCTGGAAGACATTGCAA----GAA---CGCTGCATCAAC--GCGA-AGCTTGCG---ATG--G-TGTA----GAGAATCGTCTAGGAG-C--TCATA--GATATCTCCT-AAG----C----CT--TT------T-TCa
gi|28 : aaacctatcctggaatgcccatgtagcagccacagttgagaaggccaacaattccttagccttcagacctcagaagaaacctggcaagttgcccacagcacatcaaggcacagagttacaagacccttgtcaggcccattcttgaatatgtgagcacagcatgggacacatacatggccacgaacatcagccagattgaggccgtccagcgatgagcagcgagaatcatgaagggc--------------------ACAG--A-AC-AACTAG-CAGCACCTCCCAG--AT-GGTGACA-GAC-CTT--GGTTGGCCATCTCTCCAAAATAGAAGGCAGTAG-ATCAA---------GCTGACC---ATGATG-T--A----CAGGATCATCTA-TGG-C---CATATTGACATCCCCT-CAA----CACCGAT--TC------T---CAAC-AATGA-------T-----TC-T--CAA--C-A---C
gi|6 : caagggagactCAA--G-AC-AAC-AAGTAGTAACAGCCAG--AT-GAT-CAATGAC-TTT--GGCTGGAAGACATTGCAA----GAATGCCAT---GTCAAT--GCAA-GGCTTGTG---ATGGTG-T--A----CAGAAACGTCCATGGA-C--TCATA--GGTATCCCCT-CACTTATC----AT--TC------T-TTCGAT-CA--C-------A-----TC-CT-CAA--C-A---CT-AG-GGGCAACTCACTGAAGTTCT---TAGTCC---CA----TTTTGCATAATT-GAC-ATC-TACCTGCAT------TTTC-CC----TCAAG---CAC-C-A--GAATG-TG----GAA-C-AGCCTTCC--TGAGC-----GCATCGCCACAG---TCGA--CACTCTAGAGGctctactgtagcgaccagaggtcatgcaatcagacac
gi|53 : aaatcccctacaggccacatacaatattcatggccaagacctaacttttgtcaagaagaggagcgcacattttcaaaaacctctcctggaatgcccatgtagcagcacagctaagaaggccaataattttctagccttccacagaagaaacctggaaagttgcccacaggatatcaagtcacagagttatcaggcccttgttgggcccatttttgagtatgcgataacagcatgggacccgtacactgccaagaatatcagccagattgaggctgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgactt-AC-ATC-AAGCAATACCAGCCAG--AT-GAT-ACATGAT-CTT--GGCTGGAGGACATTGCAG----AAA---TGTAACATCAAC--GTGA-GGCTTGTG---ATGG
gi|2 : AT--GCCA-AGCTGACT---ATGATG-TATA------GGATCATCTA-TGG-C---CATATCGACATCCCCG-CA-----C----ACA-TC------T-AC--ACACA-GC-------CAGAGGTC------A--C-A---CA-AT-C--AAATAC-C----ATT-----TTGTTC---CA----TTTTGCATAACG-GACTATC-T-TCATCACTCCTTCTTCC-CC----TCAG----CTA-C-ACTG-CTG-TG----GAA-C---CTGCTACCAGAGC-----ACCTGACCACAG---CGTC--CAACCTGGAGGCATTCA------AGGACTTGT------GC-AGTA-TTAATA-AC----CCACACTGTA-CG-T----TTTA------TT--T--CTTT----------T-TAA-ACCTGCA--T--TACTAG-TTT----GCACCTCAC-A-------------TCATT-CT----TGTACAGTCA--C--AAAT--GTA---CA-----ACAATGCCTCAGAGTGAG-------CTCTGTACATTACTGGAAGGggcctatatttaa
gi|3 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactaggaagaggaaccctatcctcacaagctatcaaatccatgggcacaacctaatcatagccaagacaggacgatacctggggacaacgctctcggacgacctctcctggaagccacatgtccagtccactaccaagaaacccaacaacactgaacagcctggcattcataagagaaacctgtctagctgtccacaggaaaccaaggcccaagcatacaagacccttgtttgaccaacgctcgagtacgcctccacagtatgggatccatacacacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcAT--GCTA-AGCTTGTA---ATGGTC-T--A----CAGGATCAGCCACGAC-C--TGATA--GACAGTCC----AG----C----AG--TCGTGTACT-TCC-AC-C--------------------CCACTG--C-A---CC-AT-TTACAA-GAG--GACATTCCACATGATACATGCAGCCTTTCTGCCGGACG-GAC-AAG-TACAG------CTT-TTTC-CCA---TATGGTACCT-------GCCTG-TG----GAA-CCAGCTGCCG---GATC-----GCATAGCCACTG---CCCA--GACCAAAGAGGGCTTCA--AGTCCGGTCTGGTCGCCCT----CCAGT--TG--TC----G---ACACCATCC-ACGTTTTTA------TC--GGTTTTT---AAATTC-T-TAA-TCT-GTA--C-ATTT--T-T------GCACGTCAA-AG------------CGGCT-TTG---TAT--ATACA--C-CAA----GTG---CG-----TTTATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTAT-CAGGAA--GAAGAaaa
gi|13 : aacccgcaagaggagcccatcgccaagcagtacactttacacggacagacactcaatcttgccccaaatggtagttacctgggtgtgaccatcaatgaaaaactgctgtgagatagtcatgttgatgccatcacaaataaggtcagtaatatcattgccttcttgacgagaaattcaaccagttgacccactgaagtaaaggcccaaacttacaagacactggttcgcccaatcctcgagtatgcatctccagtctaggacccccacaccacaactaacatcaacaaattggaaacagtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaac--GCCA-AACTGACC---ATGATG-TATA------GGATCATCT-TTGG-TCATTATG--GACATCCCTA-CAA----C----AC--CC------TCTCAAAC-CA-G---------------------AAGTC-A---CACAT--TTAAATACGCTGTA------------CC---CA----T-CTGCTGAACG-GACTGTC-TAT-GCCACTCCTACTTCC-CC----TCGGga
gi|21 : catagctagcagcacctcccggatggtgacaatcctaggttgtctgccacatagaaggcagcagG---ATGGTG-T--A----CAGAATCGTCCATGGG-C--TACTA--GATATCCCCT-CAG----C----AT--TC------T-TCCGAC-CA-GCAGGCATCT-----TC-CCTCAA--C-AGCTCA-AC-AT---------TATAGTTCC---TGGTCC---CA----GTCTGCAGAGTT-GAC-AC-----------TCCTTCTTTC-CC----TCGAG---CAC-C-A--GATTG-GG----GAA-C-ACACTCCC--AGAGC-----GCATCGCCATAG---CTGA--CACCATAGAGGCTTTCAAAGG--AGAGCTGATT--AGTGC-ACCA-T--AGA-GC----G---AGGGCAATGTA----TTTA------TC--G--TTTT---AA--TT-T-TAA-TCTTGTA--C-ATAT--G-G------GTGCCTCAC-AA------------ttacacagctgtggaaccagcaatcagagtgcctggcaccagggtccaacctggaagcactcaaaggggaacagttgcagtattaatatcccacactgtacaaagtttcttttctttttaaatgtctcgcatcattctccccagagtgggccatgtacattattgaaagaagaa
gi|82 : atG-TGTA----CAGAATTGTCCA-TGGTC--TCATA--GATA-TCCTT-CAA----C----t
gi|45 : gC-CT-GC-------A-----TC-CCTCAA--T-A---CT-AG-AGGCAGTTCACTGGTTTTCC---TGGTTC---CA----TTCTGGAGCATT-TAC-ATG-TACTAACACTCCTTCTTTC-CC----TCGGG----TA-------CCTG-ACTTTGGAA-T-AGCT
gi|23 : CACTGATGTTCC---TGGTTC---TA----TTCTGCAGAGTT-GAC-ATC-TACTGCCACTCC--A-TTC-CC----TCAGG---CAC-C-A--AACTG-TG----GAA-C-AGCCTTCT--AGAGT-----GCATTGCCACAG---CCGA--TAACCTAG-GGCACTCAGTGA--AAGGCTCATC--TTTGCGGTCA-T--ACA-GT----G---AGGGCATCG-GT---TTTG------TC--A--TTTT----------T-AAA-TCCTGTA--C-ATAT--G-T------GCG-CTCAC-AA------------TCCCC-TTG---TAT-TATAGA--C-CAAAT-TGTA---AG-----ACAAT------TAGCAGA------AATATGTGCATTATTGAAAGAgacacccgagag
gi|17 : gcaattGGTAC---CA----TTCGGCAG-----GAT-ATCCTACCTACACTCCTTCTCTT-CAGGTGTCAGG---CT---------CTG-------GAA-CCAGCTTCCA---GAACACCTAGCATTAATA-AG---CCAA--ATCCTTGGAGGACTTCAAGGG--AG-GTTTA-------GCGAATA-T--ACATGC----A---TGAATACAG-A----ACTG------T------TTTT---AACATC-T-TA---CCTGTA--C----T--G-TTTT---GCACCTCAC-AAAAGAAGACATATTCACT-TTG---TA--CATAAA--T-CACAT-TGTA---CA-----ACAATGCCAAAGAGTGAG-------CCATGTGCA
gi|16 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacagGTAC---CA----TTTTGCAGAATA-AAC-TTT-TTTCGCCATTCCTTCTTTC-CC----TC-GG---CTACA-C--GGCTGTGT----AAC-C-AGCTACC---AGAGC-----ACCTGGCCACAGTGTCCA----ACCTT-GAGGCATTCAAGGG--AGGACTtcactggacgttctaagaa
gi|26 : gacatccacgcaacactatatctccacaccaccactgtagcgaccagaagtcactcaatcatatacattAGAATTTGGC-ATC-TGCCAGCACTC----TTTC-CC----TTGGG---CAC-C-A--GACTG-TG----GAG-C-AGCCTTCC--AAAAC-----ACATTGCCACAG---TTGA--TACTTTAGAGGCATTCAGGAG--AGGACTGGTC--TCTTC-ACTG-T--AGA-GC----G---AGGGCATCG------TTT----------------------------T-TAA-TCCCGTA--A-ATAT--G--------GCACCTCAT-AA------------TCACA-TG----TAT-CATACA--C-CAAGC-TGTA---CG-----ATAATGCCCCAGAATGAG------ATTTAATGTAATAATGGAAGAgccatactgtacaaagttttatttctttttaaacctacaatattagtttgtgcctcacatcattcttgtacagtcacacatgtatgatcttgtacagtcacacttgtaccacaacgcctcagagtggacccgttacattattggaagaaga
gi|27 : C-TATCGGCACTCCTTCTTTC-CC----TCGAG----TA-CCA--GACTG-TG----GAA-C-AGCCTTCA--TGAGC-----GTATCGCCACAG---CTGA--CACCGTAGGGG--GTCAGGGG--AGGGGTGGTC--TCTGC-ATCG-T--GGA-GC----A---AGGGCATCG------TTT----------------------------T-TAA-TCTTGTA--C-ATAT--G-C------GCACCTTAC-AG------------TCACC-TTG---TAG-CATACA--C-CAAAG-TATA---CG-----ACGATGCCCCAGTGTGGA------ATTATGTGTAGTATTGGAAG
gi|47 : aTTTCTGACTCCTCC----TTGGG---CAC-C-A--GACTG-------GAA-A-AGCCTTCA--AGAGC-----GCATCGCCACAG---CATA--AACCATAAAAGTTTTCAGAGG--AGAGCTGGTC--TCTGC-TGCA-G--AGT-GC----A---AGGGCATCa
gi|33 : atcatGGCTTTCAGAGG--AGAGCTGGTC--TCTGC-ACTA-T--AGA-GC----G---AGGGCATCGTT----TTTA------TC--A--TTTT---AA--TT-T-TAA-TCTTGCA--C-ATAC--G-C------GCGCCGCAC-AA------------ATACC-TTG---TAT-CTTACA--C-CAAGT-TGTA---CG-----ACGATGCCCCAGAATGGG------A-TTTGTGAAGTAACGGAAGA
gi|38 : G--AAGGCTGGTC--TCTGT-CCCG-T--AGA-GC----A---AGGGCGTTG------------------------TTT---A--------TAA-TCCTGTA--C-ATAT--G-C------GCCACTCAC-AA------------TCACC-TTG---TAT-CATACA--C-T-AAT-TGTAAGCTG-----ATGATGACCCAGAGTGGG------ATTAAGGTAAGTAATGGAAGA
gi|37 : gg----G---AGGGCATCG-T----TTT-------TCTTG--TTTT---AC--TT-T-TAAATCTTGTA--C-ATAC--C-C------GCGCCTCAC-AA------------TCACC-TTG---TAT-CATACA--C-CAAAT-TGTA---TG-----GCAATGCCCCAGAGTGGG------AATTTGTGCAGGAGAAGAAGA
gi|1 : ttatacaaatgta----TTTA------TT--T--CTTT----------T-TAA-ACCTGCA--C--TACTAG-TTT----GCGCCTCACTCG------------GCATC-AT----TCT-TGTACAG-T-CACACATGTA---CG-----ACAATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACATTAgaaga
gi|40 : aagatctggacaaacgccagcaatgggaacgtgactggatgatgtccttcaaccctttaaagtgcggcgaggtcctgcgcattaccagggagaggagccctatcctcgcaagctaccaaatccatgggcacaacctaatcatagtcaagacaggacgatacctgaggacgacgctctcgggcgatctctcctggaagccacatgtggagtccactatcaagaaagtcaacaacagcctggcgttcataaggagagtctgtgtatttgtccacaaaaaaccaaggcccaagcatacaagaacctcgtttgaccaacggtcgagtgcgcctccacagcatgggatccaacgtagttcaacgtggggcagcacgcttcgccaagggagactactgcacaactagtaggatctcccagatgataacggatcttggttggtcatttctccaacatagacgacagcatgccaagctgattatgatgtataggatcatctattgccatatcgatatccccgcaacaccgtatctcgacacaccaccactgtagcgaccagaggtcacgcaaccagatacgttgtaccattttgcagaatggactatcttcgtcactccttcttccccttggctacacggctgtggaaccagctaccacagaacctggtcacagcgtccaacctggcggcattcaagttgggggaggggaggggggactggtgcagtatgaataacccacactgtacaaagt----TTTG------T---G--TTTC---AT--TG-TACAA-ACTTGCA--CTATTT--G-TTT----GTGCCTCAC-A----------------TC-TTG---TA--CAGTCA--C--AAAT--GTA---TG-----ACAATGCTTCAGAGT-GG------ACCCTGCACATTATTGGAAGAttattagaagaa
gi|49 : tatacaatgacctctat----TTTA------TC--G--TTTT----------T-TAA-CTTTTTA--T-GTGT--G-CATTAATGTATCTCAC-AA------------C-GCC-AT----TGTACATACA------AAT----A---T-------CGATGCCTCAGAGTGGG------ggagaa
gi|30 : attcatgttTTA------TC--G--TTTTTTAAA--TTCT-TAA-TCT-GTA--C-ATTC--T-T------GCACCTCAC-AA------------CGGCT-TTG---TAT--GTACA--T-CAA----GTG---CA-----TTTATGCCTCAGAGTGGG------tcagaaaaaaaagaaga
gi|18 : aatggcttcaagtctggcgtggctgcccacctgtagtcaacgccatccacgtta--TTTT---AAATTC-T-TAA-TCT-GTA--C-AT-T--GTT------GCACCTAAC-AA------------CGGCT-TTG---TAT--ATACA----CAAAG-TGTG---TT-----A--ATGCTTTGGAGTAGG------ccctgtactttaccaggaagaagaag
gi|56 : acatgctaagcttgtcatggtctacaggatcagccacaacctgatagacacctgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacatggctgtccaccagtagtcaatgtcatccatgtttcaatccgtCTTGTA--C-ATAC--A-C------GTGTCTCAC-AA------------TCACC-TTG---TAT-CATTCA--C-CAAAT-TGTA---CA-----ATGATGCCCCAGAGTTGG------ATTTTGTGCAGTAATGGAAGccctgcactttactaggaagaagaa
gi|59 : GTA--C-CTGT--T-C------GCGCCTCGT-A-------------------TT----T-T-TGTACAATCACAAAT--GTA---AG-----ACAATGCTCCAGAGTGGG------a
gi|63 : gtttctgtttaaacctgcaTAC--G-A------GTGCAATAC-AA------------TCACC-TTG---TAT-CATACA--C-CAAAT-TGTA---CA-----ATGA-----------GGG------ATTTTGTGCAGTAACAGA
gi|35 : tt-C------ACACTTCAC-AT------------TCAC---T----TAG-AATATG--T-CATAG-TGTA---CA-----ACAATGCCCCAGAGTGGA------A
gi|19 : accagctcccagaagcaaagtgctttgagggcctcaatgggggtttggggagtctacatgcaggttttgaactatttgccttcacttgttc------GTGCTTCAC-AT------------TCACT-TTG---TA--CATAAG--T-CAAAT-TGTA---TGACACTACAATGCCTCAGAGTGGG------cgtat
gi|64 : cttccatacttccactgtcactaccatagtacatgcatacacaatgccattctgcaggacaggttctcctgcctacactcttttgtaccttcagatgtcaggctctgaaccagcttacagaacacctagagcattagccagaattttagaagatttcaagtgtgtatggaagtggggggagggtagcgagtctacatgtatgaatatagagctgtttttatctctaccttttt-AA------------TCACC-TTG---TAT-CATACA--C-CTAAT-TGTA---CA-----ATGATGCCCCAAAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAACGGAAccatgtctgtcactggaa
gi|43 : ------------CCACC-TTACATTGTACATACA--C-TA--T-TGTA---CA-----ACAATGTCCCAGGGT-GG------ACCTAGTACAAAATTGGAAG
gi|68 : ataatatacatatccaaactgttttcatttttacctgctcttgctttgtttcCACC-TTG---TAT-CATACA--C-CAAAT-TGTA---CG-----ACGATGCTCTAGAGTGAG------ATTTTATGCAGTAAatgaaga
gi|70 : C-TT----TGT--ATATG--T-CACAT-TGTA---CA-----ACAATGCCCCAGAGTGGG------Ag
gi|71 : ----TAT-TATACA--C-CAAAG-TGTA---CG-----AGGATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGTAACcatatgcctcacaggaag
gi|51 : ttgATACT--C-CAAAT-TGTA---CG-----ACGATGCCCCAGATTGGG------ATTTGATGCAATAACGGAAGA
gi|75 : gttaactcttgtgttatattaacgcccacgcaatagaaacattacaactAAAT-TGTA---CG-----ACGATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAATGGAAG
gi|73 : AAT-TATA---CG-----ACGATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGCGCAGTAACAGAAGA
gi|74 : AT-TGTA---TG-----ACAATGCCCCACAGTGAG------ATTTTATGATGTAATGAAAGA
gi|16 : T-TGTA---CC-----ACAACGCCTCAGAGTGG
gi|77 : gacatccacgcaacactatatctccacaccaccactgtagcgaccagaagtcactcaatcatatacattgtaccattttgcagaataaacttttttcgccattccttctttccctcggctacacggctgtgtaaccagctaccagagcacctggccacagtgtccaaccttgaggcattcaagggaggactgccatactgtacaaagttttatttctttttaaacctacaatattagtttgtgcctcacatcattcttgtacagtcacacatgtatgatcttgtacagtcacac-TGTA---CG-----ACGATACCCCAGAGTGAG------ATTTTGGGCAATAACGGAAGacccgttacattattggaagaaga
gi|84 : -TGTA---CG-----ACGATGACCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAa
gi|72 : -TGTA---CG-----ACAATGCTCCAGAGTGGGC-----A--CTGTACATTATTGGAAGA
gi|66 : tataGTA---CG-----GCGATGCCCCAGTGTGGG------ATTTCGTGCAGTAATTGAAGcaagaa
gi|83 : tgtaggtcatatagaga---CG-----ATGATGCCCCAGAGTGGG------ACTTTGTGCAGTAATTGAAtaga
gi|81 : gG-----ACGATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGAAACGGAAG
28 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): CTCAACCTTGTCCCAAATGGAAGATACCTGGGTGTGGCCATCAACAAAAAACTGCTATAGAACAGCCATGTTGATGCCATTAGAAAAGAGGCCAACAACAGCCTCACCTTCTTCACGAGGAACATTGCCAGCTATCCCATCATTAGTGTAGGCCCAAACCTAGAAGACACTGGTTTGTCAAATCCTTGATTATGTGTCTATGTCCTGGGAGCCCTGCACCACAATGTGAACAAACATCAAGAAACTGATGACAGTTCAAAGAATGGCAGCGTGATTCGCGCATTTAGCGACATGTTAAACAGACTTCTCTGGCCATCTCTACAACAGAGAAGAGATCATGCCAAGCTTGTCAGGGTCTACAGGATCAGCAATGACCTAATAGACATACCAGCAGTCATGTATCTCCACCCCACTGCACCATTAACCACAGGACATTCCTTAACATACATTCAGCCTTTCTACTGGACGGACATTTACCTGCACACTTTTTTTCCATCTGGCATCCTCTGTAGAACCAGCTGCCATATCACATAGCTGCCTGGATCATAGAGGGCTTCAGGTCCGGACTGGCCCCAAAACATTAGTCAACGCCATTCACGTTTTTATCTGTTTTTAATTTTAACTGGTGCATTATTGAGCTTCAAAAGGATACTGTACATAATACAAATGCGTTAATGTGGGCGCTTCTCTTTATTAAGAA
Unaligned ( gi|12 ): AATATGAAAACACTTCCGACCCGAGACCGCCACACCACAGCCAACATCAAGAAACCGGTACTCCAAAGAAAGTAAGTGCAATTCGCTTATGGGGATTACAGAACCACTTGCAAAGCAGCATCTGCAACATGTCATGGTCTATAGAATCAGCCACGACCTGATAGACATCCCAGCAGTCATGTATCTCCACCACCCCAATCCACCATCAACCTGAGGACATTTCTCCAGCCTTTCTGCAGGACAGACATTTACATGCACAAACGTTTTGGAACCAGTTGCCAATTTGCATAGCCGCTGCCCAGATCATAGAGAACTTCAGGTTCAGACTGGCCATCCACCACTAGTCGACGCAATTCATGTGTGTTTTTTTAATAGGTTTTTAACTTTTAAGCTATGCATCATTGCATCTCACGACATCGTACAGAGTGGTCTTTTACTTTAGCAGGAAGAAAAA
Unaligned ( gi|15 ): ACAACTAGTAGCACCTCCCAAAAGATGACCATCTTTCCAACATAGACGACAGCAGGCCAAGCTGACCATGATGTATAGGATCACCTATGGCCATATCAACATCCCCGCAACACCGTATCTCCACACAACAGATTATCTTCACCATTCCTTTTTGTCAGCTACGTGGCTGTGGAACCAGCTACCGGAGCACCTGGCCATTGCATCCAACCTGGAGGCATTCATAGGAGACTGGTGCAGTATTAATACCCTACACTGTACAGTTTTATTTCTTTTTAAACCTGCACTACTAGTTTGTAACTCACATCATTCTTGTTATGCCCCAGAATGGGCCCTGTACATTATTGAAAGAAGAA
Unaligned ( gi|20 ): CAGAGGTCACATTGTACCCTTCCGCTGAACGGATTGTCTTCGACACTCTTCTTCCTCTAGGCTACACGGCTGTGCAACCAGCTACCAGAGCATCTGGCCACGGCGTCTAACCTGGAGGCATTCGAGGGGTGGGATGGGGTGGGGGAGGGGAGGTGCTGGGGCAGTAGTTATACCCTACACTGCACACAGTTGTATTTCTTTTTAAACCTGCATTACATGTTTGCGCCTCATATCATTCGTGTATAGTCACAAATGCACGACAATGACTCAAATGGACCCTGTACATAAT
Unaligned ( gi|25 ): GATTGGATCATGTCCTTCAACCATTTGAAGTGCGGAGTCCTCTGCATTATGAACTAGGAAGAGAAACCCAATCCTCACACATGACCAGATCCATGGGCACAACATAGCTTTAGCCAAAATAGGACGATGTCTGGAGACAATGCTTTCAGAAGACCTCTCCTGAAAGCCGTATACCGAGTCAATTAGCAAGAGAGCCAACAACAGAAAAGTATGGCATTCATAAGAGAGGTCGTTTGAAGGAGTTGTCCCCAGGTATTACCAA
Unaligned ( gi|29 ): GTCAGACTTTGGAACCAGCTTCCAGAATAACTAGCATTAGGCAGTCCTTAGAGGGCTACAAGGGGGGTTTGGTAAGACAATATCCATGAATCTAAGGCTGTTTTTAACCTTTTATATTCACATGGTTGGCACCTCATATTCCCTTTGTACATGAGTCACATTGTATGACAATGTCCAAGACGGGACCATTCACATCACTGCAA
Unaligned ( gi|34 ): CCTGGACAATGGAGCATCAGGTTTTGACACCCACCATTAGTCGACACCATTCATGTTTTATAGGCTTTAACTTATAATCTGTGCATTGATTGTTGCACATAACAACTACATTGTACATACACCCTCCGAGTGGACCCTGCATTTTATCAGGAAGA
Unaligned ( gi|36 ): TGCAGTATTAATACCCTACACAGTACAAAGTTTTATAAATTTTCTTTTTAAAACATGTAACTACTTGTTCATGCCTCATATCGTTCTTGTACAGTCACAAATGTACTACACGCCTCCAGAGTTGACCCTGTACATTACTGGAACAAG
Unaligned ( gi|41 ): ATATAACGTACCTGGTCTGTGACCCCAACACTACAACTAACAACAATTTGGAGGCAGTCCAAAGAAGGGCAGCACAGTTTGTAGATTTGTGTAGATTACAGAACTTTGAGCAGCACCAGCAACATGATGG
Unaligned ( gi|42 ): GGTGCAGTATTATCACCCCAAACTGTACAAATTTTGTCACTTTTTAACCTGCTATTACGTCATTCCTGTTCAGTAACAAATGTATGACAATGCTTCAGAGTAGACCTTGTACATCAAACGAAGAAAAA
Unaligned ( gi|44 ): AAATACACATTTCGAGTAAACAGTTGCATTTCTTTTTAAACCTGCATTACTTGTTCGCGCCTTACATCACTCTTGTACAGTTGCACATGCAAAACAATGTTCCTGAGTGGGCCCTGTATATTATG
Unaligned ( gi|48 ): AGACCTTGGTTGGCCATTTTTCTAACAAAGATGGTAGAGGACCAAGCTGACCATGATATATAGGATCATCTATGGCCATAATGACACCCAGGCAACACCCAGGTACATCG
Unaligned ( gi|52 ): TTTGGAACGTTTCGAGAACCACTAGCAATAGCAATAACCTTAAGGGCTTCAAGGGAGTGTGACGAGTCTACATGCAATATTATGCAAAATTTGTTTCACCTTA
Unaligned ( gi|54 ): TAACCTATACATTCTCATGCCTCACATGTGTACATATTCAACATAATATAATGATACTTCAGAGTTGGCCATGTACTATATTGGGAGAAGAAATA
Unaligned ( gi|55 ): AAAGACGGGACGATTTACCTGGGGACAAACTGTCCTGGAAGCTGTATGTCAGGTCAGCTACAAAGAGAGCCAACAACAGCCTGGCATTCATAG
Unaligned ( gi|57 ): ACAGCCTGGCATTCATAGGCTGTTGGGCAGCATGTTTCATCAAGGGAGAGTACGGCACAACTGGCAGCATCTCCCATATTGCCACAATCT
Unaligned ( gi|58 ): CCATCCATTGCCAATAGCTGAAACAACCAAAACTGTCCAAATATCTTGAGTCACTTCTTACCAGTAGCCTGTCTTGGAATGCACGCA
Unaligned ( gi|60 ): CCTATCCTGGTAAATTACCAAACCCATGAGCACAACCTTATTTTAGCCAAGACAGGACAATAATTATATGTGTACAATGCT
Unaligned ( gi|61 ): TGAATGGATAATGCCTTTTAACCCTTCGAAGTGTTTAACCACGAAGAGGACCGCTATCCTATCAAATTACCAAATCCA
Unaligned ( gi|62 ): ATAACCCGCAAGAGGAGCCCATCGCCAAGCAGTACCCTGTACATTGACAGACACCCGAATGGTAGATACCCGGATG
Unaligned ( gi|65 ): AGTCACATACATAAACCATTCTCCAGAGTGGGTCCTATGTATTACAGTACTTAGAAGAAGAGGAGA
Unaligned ( gi|67 ): ACGTGCAGTAAGTATTGTACGACAATGTTCCAGTACCTAGTACACAATTGGAAGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|69 ): ATATTACTCAAAGCGCGTCGAAGCCTTAGAGTGGCCCTGAACCTTACCAGGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|76 ): TTATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTACCAGGAAGAAGAAAGAA
Unaligned ( gi|78 ): TTTGTATTTCAAAGTGGACCCAGCACATTATCAGGAAAAAGAAGA
Unaligned ( gi|79 ): CTCTCCTGGAAGCCACATGTCAAATCAACTACCAAGAGAGCCA
Unaligned ( gi|80 ): AATGCCACAGAGTGGGCCCTGTACATTATTGGAAGAAGAAGAA
Unaligned ( gi|85 ): CAACAGCTGAAACAAGCAAAACAGTCCAAATACC
Alignments
lowQualScore : 111111 222 1 11 11 22222222222 1111 11 1 1111111 111111111 111 1111111 111 222222222222222222222222222222222 3333333333333333333333333333333 111111 11111111 22222222222222222222 11111 4444444444444 1111 1 22222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111111
lowQualScore : 1 4 000000 0 1 333 1 2 99 3 00 00 1 33333333333 3 6 5555 99 2 3333 2 33 66 44 2 2 8 444 0 5555555 5 2 33 9999 222222222 0 555 0 7777 555 3 2 0000000 0 6 7777 2 44 2 1 333 555 8 6666 6666 2 22 999 444 2 444 33 555 2 555555555555555555555555555555555 2 2 8888888888888888888888888888888 111111 2 5 88888 5555 44444444 66 22 66666666666666666666 7777777777777 33 33 00000 6666 3 4444444444444 3 0 4 0000 4 2 4 444 2 2 1 2 333 66666 666 55555555555555555555555555555555555555 8888 2 2 2 55555 2 3 222 44444 1 2 444 1 333 4444 222 7 555555 1 1 333 1 0 4 222 77 2 22 7 8 5 0 44444 66666 1 333 1 333 888888 1 1 3 9999999999999999999999 666666 0 1 777777777 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4444 33 77777777777 11 777 222 0 22 999999999999 2222 777777777777 222 5 111 999999 11 77777777777777 22222 111 22222 333333 0 33
lowQualScore : . . ...... . . ... . . .. . .. .. . ........... . . .... .. . .... . .. .. .. . . . ... . ....... . . .. .... ......... . ... . .... ... . . ....... . . .... . .. . . ... ... . .... .... . .. ... ... . ... .. ... . ................................. . . ............................... ...... . . ..... .... ........ .. .. .................... ............. .. .. ..... .... . ............. . . . .... . . . ... . . . . ... ..... ... ...................................... .... . . . ..... . . ... ..... . . ... . ... .... ... . ...... . . ... . . . ... .. . .. . . . . ..... ..... . ... . ... ...... . . . ...................... ...... . . ......... ............................................................................................................................ .... .. ........... .. ... ... . .. ............ .... ............ ... . ... ...... .. .............. ..... ... ..... ...... . ..
lowQualScore : 7 1 111111 4 9 333 0 8 88 1 44 88 2 66666666666 1 2 6666 55 9 4444 9 99 33 77 5 4 2 444 7 4444444 7 9 99 7777 888888888 2 888 4 1111 555 3 3 1111111 4 7 1111 3 66 6 3 444 000 6 1111 1111 9 66 333 777 6 777 44 000 9 222222222222222222222222222222222 7 9 5555555555555555555555555555555 666666 7 2 33333 7777 33333333 11 99 33333333333333333333 4444444444444 99 99 11111 1111 1 5555555555555 1 4 9 0000 7 9 2 111 7 4 1 2 777 66666 555 66666666666666666666666666666666666666 1111 4 8 8 99999 4 0 999 55555 5 4 111 5 222 2222 777 6 555555 8 3 444 1 2 7 777 66 3 44 0 7 5 9 55555 33333 8 222 8 222 555555 8 7 5 5555555555555555555555 111111 1 8 333333333 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4444 55 00000000000 66 888 666 3 00 555555555555 8888 999999999999 333 0 777 666666 77 99999999999999 99999 777 33333 666666 2 44
consensus : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCNTAGCCAAGA-ACGG--CGA-T-ACCT-GGG---G-AC-ACAT-CTC-TC--AG--A--ACCTNTCCTG-GAATGC---C-CATGT-NG--C-AG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAATAC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAACCT--G-GCAAGTTG-CCCA----CAGGAN-ACCAAGGCACAG--A---GT-T----ACAAGACCC----TTGTCA-GGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTACA---GAATCGTCCATGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TCCG-AC-CAGCN-------TC-CC-T-CAA--C-A-CCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATTGAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGGGCAC-CA--GAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----GGGGAGG-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTGC-A-CC-G-TA-GA--GC----GA--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------T---C--G--TTTT---AA---T-T--T--A-----------A-TCTTG---T---ACAT--AC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
Reference ( family-845 ) : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAC-T-ACAACATCCATGGCCACGAC-CT--AACCGTAGCCAAGA-ACGG--CGAGT-ACCT-GGA---G-GC-ACAT-CTC-TC--AG--A--ACCTCTCCTG-GAATGC---C-CATGT-AG--C-AG-CC-A--CNGCCAAGAAAGCCAACAATNC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAACCT--G-GCAAGTTG-CCCA----CAGNAN-ACCAAGGCACAG--A---GT-T----ACAAGACCC----TTGTCA-GGCCCATNCTTGAGTATGCGNNCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTACA---GAATCGTCCATGGGC-TCATA-GATATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TCCG-AC-CAGCN-------TC-CC-T-CAA--C-A-CNANAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTTGAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGGGCNC-CA--GAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----GGGGAGG-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTGC-A-CC-G-TA-GA--GC----GA--------GGGCAT---C---G-N-T-TT-A------T---C--G--TTTT---AA---T-T--T--A-----------A-TCTTG---T---ACAT--AC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
gi|1 : AGGGAGAGGAGCCCTATC-CTC-GCAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGTCAAGACAGGA--CGA-T-ACCT-GAG---G-ACGACG--CTC-TC--GG--GCGATCTCTCCTG-GAA-GC---CACATGT-GG----AGTCC-A--CTATCAAGAAAGTCAACAACAG-------CCTGG---CGTTC----ATAA-G-G-AGAGTCT--GTGT-ATTTG-TCCA----CAAAAA-ACCAAGGCCCA---A---GCAT----ACAAGAACC----TCGTTT-GACCAACGGTCGAGTGCGCCTCCACAGCATGGGATCCAACGTAGTTC--AAC---G-TGGGGCAGCA-CG---------------------CTTC--GCCA--AGG---GA-----G--------------------ACTACTGCAC-AACTAGTAG---G-ATCTCCCAG----ATGA--------T-AAC-GGAT-------------------CTTGGTT-----G-------G--T--CA-TTTCTCCAA----CATA-G--ACG---ACAG-C-ATGCCAAGCT---GATTATGATGTATA---GGATCATCTATTGCC-ATATC-GATATCCCCG-CA---A-CACCGTA------T---CTCG-ACACACCA-------CC-AC-TGTAG--CGA-CCAGAGGTCACG-CAACCAGA-T-ACG---TT--------GTA--CCA----TTTTGCAGAATGGACTA------TC-T-TCGTCACTCCTTCTTCCCCTT-GGCTA-CAC-GGC--TGTGGAACC-AG-CTACCACAGA-----ACCT--G--GT-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGCGGCATTC----------------------AAGTTGGGGGAGG-GGAGGGGGGACTGG--------------------------------------TGC-A----G-TATGA--AT----AACCCACACTGTACAA---A---G-T-T-TT-A------T---T-----TCTT--------T-T--T--A-----------A-ACCTG---C---AC-T--ACTAGTTT------GCGCCTCACTCGGCA------------TC---ATT-C-TTGTACAGTC-A--CACA------------------------TGTA---CGACA-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACATTA
gi|10 : aagatctggacaaacgccagcaatgggaacgtgactggatgatgtccttcaaccctttaaagtgcggcgaggtcctgcgcattaccCAACATTCACAGCCAATAC-CT--GACTTTCGTCAAGA-ATGG--CAAGT-ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CC--AA--A--ACCTAACCTG-GAATGC---C-CATGA-AG--C-AG-TC-A--CAGCTAAGAAAGCCAATAATTC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-----GAAA----------------------------AA-ACCT-GGCA-----A---GT-TGCCCACAGGAC--------ATCAAGGTACA-----GA-TGTGAGAGCACAGCATGGGACC---CTTA---C--ACT---G-C-------CA-CAAA-------------------CATC-AGCCAG-ACT---GA-----G--------------------GC-------C-ATCCAGCAA---TGAGCAGTGAG----AT----------T--CA-TGAA---------------------TGGC--------------G--A--C------TACAA----CC-A-GTACCAAC-CCGA-TAAC-TGATGTTCATAATGGTG-C--ACA---GAATCGTTCATGAGG-TCATA-GATATCCCCT-CA---G-TA--GTC------T---TCAG-AC-CAGCT-------TC-AC-T-CAA--C-A-CTAGAA-----G-AAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTTCAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTTCCCTCGGGCAT-CA--GAC--TGTGGAA-C-AGCCATCCAGAGC-----ACAT--C--AC-CA---C-AG---CCGA--C-ttattagaagaa
gi|11 : ttCAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCAAG----ATGA--------C-CCA-CGAC-------------------ATTGGTT-----GAA----AG--A--CA-C---TGCAA----GA------TCGTC-ACGT-CAAC-CAAAGCTTGTGAT--TG-TGTACA---GAATTGTCCACGGGC-TGATAAGATA----CTACA---A-CA--ACC------T--------AC-CAGCA-------TC-CC-T-CAA--C-A-CTAAAG-----G-TAATTCAC-AGGTG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTTTGCACAGTTGAC-A------TC-AAACGGCACTCCTTTTTTTCCCTGGATAC-CA--GAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----CCAT--C--AC-CA---C-AG---CTGA--C-A-----------TTC----------------------T-----GGGCAGG-G---------CTAG------------------------------------------A-CT-G-TA-AA--GT----GA--------GGGCAT---A---ATG-T-TT-A------T---------TCCT---AA---C----------------------------------CAT--AT--G--C------ACACCTCAC----AA------------TC---A-C-C-ATATG---TC-A--TACAC-------------C------AATTGTA---CAATG-----GTGGCTCAGTGTGGG------ATTATGTACAGTAAT-GGAAGAA
gi|12 : atgatgttgttcaacccaagcaaatgcgaggtgatccacaccacacagagaaatccaattGACC---CG-A---G--ACC---G-C-------CA-C-AC-------------------CA-C-AGCCAACAT---------------------------------CAA--G-A--AAC---CGG---T-ACT--CCAA----A-GAAAG-----T-AAG-TGCA-------------------ATTCGCTTATGGGGATTACAG--AACCACT---TGCAA-------A-G--CAG-C-ATCTGCAACATG----TC---ATGGTC-TATA-----GAATCAGCCACGACC-TGATA-GACATCCC----A---G-CA--GTCATGTATC---TCC--AC-CA-------------CC-C-CAATCC-A-CCAT---------CAAC---C-TGAGGACATTT-C---T------CCAGCCTTTCTGCAGGACAGAC-A------TT-TACATGCAC----------------------A--AACGTTTTGGAA-CCAGT-TGCCAATTT-----GCAT--A--GC-CG---C-TG---CCCA--G-ATCATAGAGAACTTC----------------------A-----GGTTCAG-A---------CTGG-----------C------------CA----------TC--C-A-CC-ACTA-G---TC----GA--------CG-------C---A-A-T-TC-A------TGTGT--G--TTTT--------T-T--T--A-----------A-Tg
gi|13 : aatatgaaaacacttccAGCAG---C-ACCTCCCGG----ATGG--------TGACAAT--C-------------------CTAGGTT-----GTC----TGCCA--CA-T-------A----GA-A-G--------GCAG-CAG-GCCAAACTGACCATGATG-TATA-----GGATCATCTTTGGTCATTATG-GACATCCCTA-CA---A-CA--CCC------T---------------------------C-T-CAA----A-CCAGAA-----G-TCACACAT-TTAAA---TACGC---TGTAC--CCA----T-CTGCTGAACGGACTG------TC-TAT-GCCACTCCTACTTCCCCTCGGTTACACA--G-C--TGTGGAACC-AGCAAT-CAGAGT-----GCCTGGC--AC-CA---G-GG---TC----C-AACCTGGAAGCACTCAA--------------------A-----GGGGAaggtttttaacttttaagctatgcatcattgcatctcacgacatcgtacagagtggtcttttactttagcaggaagaaaaa
gi|14 : catagct--A--ACCTATCCTG-GAATGC---C-CATGT-AG--C-AG-CC-A--CAGTTGAGAAGGCCAACAATTC-------CTTAG---CCTTCAGACCTCA-G-AAGAAACCT--G-GCAAGTTG-CCCA----CAGCAC-ATCAAGGCACAG--A---GT-T----ACAAGACCC----TTGTCA-GGCCCATTCTTGAATATGTGAGCACAGCATGGGACA---CATA---C--ATG---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC-------C-GTCCAGCGA---TGAGCAGCGAGAATCATGAAGGGCGATT-ACA-AGACAACAAGCAGTATACATGACCTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-----CG-CTGCAT-CAACGCGAAGCTTGCGATG--G-TGTAGA---GAATCGTCTAGGAGC-TCATA-GATATCTCCT-AA---G-CC--TTT------T---TCacagttgcagtattaatatcccacactgtacaaagtttcttttctttttaaatgtctcgcatcattctccccagagtgggccatgtacattattgaaagaagaa
gi|15 : aCATTCCTTTTTG---TCAGCTAC-GT--GGC--TGTGGAACC-AG-CTACCGGAGC-----ACCT--G--GC-CATTGC-AT---CCAA------CCTGGAGGCATTC----------------------A-----TAGGA-G-A---------CTGG-----------TGCAGTATTAATAC-----------CCTAC-A-CT-G-TA------------------------CA--------G-T-T-TT-A------T---T-----TCTT--------T-T--T--A-----------A-ACCTG---C---AC-T--AC--T--A------G---TTTGT----AAC-----------TC---A-C-------A---TC-A--TTC------------------------TTGT--------T-----ATGCCCCAGAATGGG-------CCCTGTACATTATT-GAAAGAA
gi|16 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcaggccaagctgaccatgatgtataggatcacctatggccatatcaacatccccgcaacaccgtatctccacacaacagattatcttcac-GACATCCACG-CA---A-CA--CTA------TATCTCCACAC-CACCA-----------C-TGTAG--CGA-CCAGAA-----G-TCACTCAA-TCATA---TAC-A---TTGTA--CCA----TTTTGCAGAATAAAC-T------TT-TTTCGCCATTCCTTCTTTCCCTC-GGCTA-CAC-GGC--TGTGTAACC-AG-CTACCAGAGC-----ACCT--G--GC-CA---C-AGTGTCCA-----ACCTT-GAGGCATTC----------------------A-----AGGGAGG-A---------CTG--------------------------------------CCAT-A-CT-G-TA------------------------CAA---A---G-T-T-TT-A------T---T-----TCTT--------T-T--T--A-----------A-ACCTA---C---A-AT--ATTAGTTT------GTGCCTCAC-----A------------TC---ATT-C-TTGTACAGTC-A--CACATGTATGATCTTGTACAGTCACACTTGTA---CCACA-----ACGCCTCAGAGT-GG------ACCCGTTACATTATT-GGAAGAAgaa
gi|17 : GGTA--CCA----TTCGGCAG----GAT-A------TCCTACCTACACTCCTTCT---CTTCAGGTGT-CA--GGC--TCTGGAA-CCAGC-TTCCAGAACACCTAGCAT--T--AA-TA-----AG---CCAA--A-TCCTTGGAGGACTTC----------------------A---------AGG-G---------A-GG-----------T------------T-----------TA-GCGA-AT-A-TA-CAT-GC----AT--------GAATAC---A---G-A-A-CT-G------T---------TTTT---AA---C-------------------A-TCTTA---C---CTGT--ACT-G--TTTT---GCACCTCAC----AAAAGAAGACATATTC---A-C-T-TTGTA----C-A--TAAAT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCAAAGAGTGAG-------CCATGTGCAga
gi|18 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacagG-G---------CTG-------------------------------------TC--C-A-CCAG-TA-G---TC----AA--------TGTCAT---CCATG-T-T-TC-AAT----C---C--G--TTTTTA-AA---T-TCTT--A-----------A-TCT-G---T---ACAT---T--GT-T------GCACCTAAC----AA------------CG---G-C-T-TTGTA---T--A--TACA--------------CA-----AAGTGTG---TTA-------ATGCTTTGGAGTAGG------tcactggacgttctaagaa
gi|19 : acatgctaagcttgtcatggtctacaggatcagccacaacctgatagacacctgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacat--CCA----TTCTGCAG----GAC-AGGTTCTCC-TGCCTACACTCTTTTGTACCTTCAGATGT-CA--GGC--TCTGAAC-C-AGC-TTACAGAAC-----ACCT--A--GAGCA---TTAG---CCAG--A-ATTTTAGAAGATTTC----------------------A-----AGTG---------------TG-------------------------------------TATGG-A-A--G-TG-GG--GG----GA--------GGGTAG---C---G-AGT-CT-A------CA--T--G--TATG---AA---T-A--T--AGAGCTGTTTTTA-TCTC----T---ACCT--TT--T--T------GTGCTTCAC----AT------------TC---A-C-T-TTGTA----C-A--TAAGT-------------CA-----AATTGTA---TGACACTACAATGCCTCAGAGTGGG------ccctgcactttactaggaagaagaa
gi|2 : cttccatacttccactgtcactaccatagtacatgcatacacaatgAGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAT----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGCCAAGACAGGA--CGA-T-ACCT-GGG---G-AC-AACG-CTC-TC--GG--ACGACCTCTCCTG-GAA-GC---CACATGT-C---C-AGTCC-A--CTACCAAGAAACCCAACAACACTGAACAGCCTGG---CATTC----ATAA-G-A-GAAACCT--G-TCTAGCTG-TCCA----CAGGAA-ACCAAGGCCCA---A---GCAT----ACAAGACCC----TTGTTT-GACCAACGCTCGAGTACGCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--ACccatgtctgtcactggaa
gi|2 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactATGCCAAGCTGACTATGATG-TATA-----GGATCATCTATGGCC-ATATC-GACATCCCCG-CAC--A-CA---TC------T---AC---ACACAGCC--------------------------AGAG-----G-TCACACAA-TCAAA---TAC-CATTTTGTT--CCA----TTTTGCATAACGGACTA------TC-T-TCATCACTCCTTCTTCCCCTC-AGCTA-CACTG-C--TGTGGAA-C-CTGCTACCAGAGC-----ACCT--G--AC-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGAGGCATTC----------------------A---------AGG-A---------CTTG-----------TG-----------CAGTATTAATAACCCAC-A-CT-G-TA------------------------------C---G-T-T-TT-A------T---T-----TCTT--------T-T--T--A-----------A-ACCTG---C---AT-T--ACTAGTTT------GCACCTCAC-----A------------TC---ATT-C-TTGTA----C-A--GTCA--------------CA-----AA-TGTA---CAACA-----ATGCCTCAGAGTGAG-------CTCTGTACATTACT-GGAAGGAacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcatgccaagctgactatgatgtataggatcatctatggccatatcgacatccccgcacacatctacacacagccagaggtcacacaatcaaataccattttgttccattttgcataacggactatcttcatcactccttcttcccctcagctacactgctgtggaacctgctaccagagcacctgaccacagcgtccaacctggaggcattcaaggacttgtgcagtattaataacccacactgtacgttttatttctttttaaacctgcattactagtttgcacctcacatcattcttgtacagtcacaaatgtacaacaatgcctcagagtgagctctgtacattactggaaggaaaa
gi|20 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactaggaagaggaaccctatcctcacaagctatcaaatccatgggcacaacctaatcatagccaagacaggacgatacctggggacaacgctctcggacgacctctcctggaagccacatgtccagtccactaccaagaaacccaacaacactgaacagcctggcattcataagagaaacctgtctagctgtccacaggaaaccaaggcccaagcatacaagacccttgtttgaccaacgctcgagtacgcctccacagtatgggatccatacacacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcGTA--CCC----TTCCGCTGAACGGATTG------TC-T-TCGACACTC-TTCTTCCTCT-AGGCTA-CAC-GGC--TGTGCAA-CCAGC-TACCAGAGC-------AT--CTGGC-CA---C-GG---C-GT--CTAACCTGGAGGCATTCGAGGGGTGGGATGGGGTGGGGGA-----GGGGAGGTG---------CTGGGGCAGTAGTTATA-----------C-----------CCTAC-A-CT-G-CA------------------------CAC---A---G-T-T-GT-A------T---T-----TCTT--------T-T--T--A-----------A-ACCTGCATT---ACAT--GT--T--T------GCGCCTCAT-----A------------TC---ATT-C-GTGTA---TA-G--T-CA--------------CA-----AA-TGCA---CGACA-----ATGACTCA-AAT-GG------ACCCTGTACA-TAAaaa
gi|21 : cagaggtcacattGATGGTG-T--ACA---GAATCGTCCATGGGC-TACTA-GATATCCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TCCG-AC-CAGCAGGCATCTTC-CC-T-CAA--C-AGCT-----------CAAC--AT-TATAG---TTC-C---TGGTC--CCA----GTCTGCAGAGTTGAC-A-----------------CTCCTTCTTTCCCTCGAGCAC-CA--GAT--TGGGGAA-C-ACACTCCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---T-AG---CTGA--C-ACCATAGAGGCTTTC----------------------A-----AAGGAGA-G---------CTGA-----------T------------T-----------AGTGC-A-CC-A-TA-GA--GC----GA--------GGGCAA---T---GTA-T-TT-A------T---C--G--TTTT---AAT--T-T--T--A-----------A-TCTTG---T---ACAT--AT--G--G------GTGCCTCAC----AA------------Tt
gi|22 : atCAAATTAC----CAA-ATCCATGGTGACAAC-CT--AGCTGTAGCCAAGA--CAA--TGA-T-ACTT-GAG---G-AC-A-ATGTTC-TC--AG--A--AGACCTCCTG-GAATCT---G-CATGT-CG----AG-TCAA--CTACCAAGAGAGCCAACAGCAG-------TCTGG---CATTC----ATAAGG-A-GAAA-CT--G-TTTATCTG-TCAA----TAGGAA-ACTAAAGCCCAAGCA---GT-T------AAGATTC----TCGCTA-GACCAACACATGACTACTCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--AC
gi|23 : -----G-CAATTCAC-TGATG---TTC-C---TGGTT--CTA----TTCTGCAGAGTTGAC-A------TC-TACTGCCACTCCAT---TCCCTCAGGCAC-CA--AAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCTAGAGT-----GCAT--T--GC-CA---C-AG---CCGA--T-AACCTAG-GGCACTC----------------------A-----GTGAAAG-G---------CTCA-----------T------------C-----------TTTGCGG-TC-A-TA-CA--GT----GA--------GGGCAT---CG--G-T-T-TT-G------T---C--A--TTT---------T-T--A--A-----------A-TCCTG---T---ACAT--AT--G--T------GCG-CTCAC----AA------------TC---C-C-C-TTGTA---TT-A--TAGAC-------------CA-----AATTGTA---AGACA-----AT------TAGCAGA------AATATGTGCATTATT-GAAAGAAacagtttgaatacagcaactagagacattccaatatagagc
gi|24 : A-CTAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----A--------------------ACCG--G-CC-AGCGAAGAG-------CAGCT-------TGA--------T-TCG-TGA
gi|24 : cctca--ACC---GGC-------CAGCGAA-------------------GAGC-AGCTTG-ATTCGTGA-----ATGGCGATT------------ACAA--A-AC-AACAATCAG---T-ATCAGCCAA----ATGA--------T-ACA-TGGC-------------------CTTTGCT-----TCA----AG--A--CA-T---GGCAT----GA-A-----CGCC-GTGT-CAACGCAAAGCTCGTGATGGTG-TATA-ATTTTAATCGTCTATGGGC-TCTTG-GACATTCCTT-CT---A-CG--ATC------T---TCCG--T-GGGCA-------TC-C-----------------AG-----G-CATGTCGT-TGAAG---TTT-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTTGAT-A------TA-TACatggcgattacaaaacaacaatcagtatcagccaaatgatacatggcctttgcttcaagacatggcatgaacgccgtgtcaacgcaaagctcgtgatggtgtataattttaatcgtctatgggctcttggacattccttctacgatcttccgtgggcatccaggcatgtcgttgaagtttctggtcccattctgcagagttgatatataca
gi|25 : cctcaactaacatcagccagattgaaAGGAAGAGAAACCCAATC-CTC-ACA---CAT-G-ACCAGATCCATGGGCACAAC-AT--AGCTTTAGCCAAAATAGGA--CGA-T-GTCT-GGA---G-AC-A-ATGCTT-TC--AG--AAGACCTCTCCTG-AAA-G----C-CGTAT-AC--CGAG-TC-AATTAG-CAAGAGAGCCAACAAa
gi|25 : gattggatcatgtccttcaaccatttgaagtgcggagtcctctgcattatgaactAAT-ACCT-GGG---G-AC-AACT-CCT-TC--AA--ACGACCTCTCTTATGAATGC---C-cagaaaagtatggcattcataagagaggtcgtttgaaggagttgtccccaggtattaccaa
gi|26 : gattggatcatgtccttcaaccatttgaagtgcggagtcctctgcattatgaactaggaagagaaacccaatcctcacacatgaccagatccatgggcacaacatagctttagccaaaataggacgatgtctggagacaatgctttcagaagacctctcctgaaagccgtataccgagtcaattagcaagagagccaacaacagaaaagtatTTGGC-A------TC-TGCCAGCACTC----TTTCCCTTGGGCAC-CA--GAC--TGTGGAG-C-AGCCTTCCAAAAC-----ACAT--T--GC-CA---C-AG---TTGA--T-ACTTTAGAGGCATTC----------------------A-----GGAGAGG-A---------CTGG-----------T------------C-----------TCTTC-A-CT-G-TA-GA--GC----GA--------GGGCAT---C---G-T-T---------------------------------T-T--T--A-----------A-TCCCG---T---AAAT--AT--G---------GCACCTCAT----AA------------TC---A-C-A--TGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AGCTGTA---CGATA-----ATGCCCCAGAATGAG------ATTTAATGTAATAAT-GGAAGAAaccaa
gi|27 : agaatC-TATCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGAGTAC-CA--GAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCATGAGC-----GTAT--C--GC-CA---C-AG---CTGA--C-ACCGTAGGGGG--TC----------------------A-----GGGGAGG-G---------GTGG-----------T------------C-----------TCTGC-A-TC-G-TG-GA--GC----AA--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-----------------------------------T--A-----------A-TCTTG---T---ACAT--AT--G--C------GCACCTTAC----AG------------TC---A-C-C-TTGTA---GC-A--TACAC-------------CA-----AAGTATA---CGACG-----ATGCCCCAGTGTGGA------ATTATGTGTAGTATT-GGAAGA
gi|28 : a--------------------ACAG--A-AC-AACTAGCAG---C-ACCTCCCAG----ATGG--------TGACA--GAC-------------------CTTGGTT-----GGC-----------CA-TCTCTCCAAAATAGA-A-G----G-C-A-GT-AGAT-C-AAGCTGACCATGATG-T--ACA---GGATCATCTATGGCC-ATATT-GACATCCCCT-CA---A-CA--C-CGA----T---TCTC-AA-CAATG-------AT-TC-T-CAA--C-A-C
gi|3 : caagggagactAAGAGGAGCCC-ATCGC----CAAGC-AG-T-ACACTTTACACGGACA-GACACTC-AATCTT-GCCCCAA-ATGG--TAGTT-ACCT-GGGTGTG-AC--CAT-CAA-TG--AA--A--AACTGCTGTG-AGATAG---T-CATGT-TG--A-TG-CC-A--TCACAAATAAGGTCAGTAATAT-------CATTG---CCTTC----TTGACG-A-GAAATTC--A-ACCAGTTGACCCA----CTGAAGTA--AAGGCCCAA--A---CT-T----ACAAGACAC----TGGTTC-GCCCAATCCTCGAGTATGCATCTCCAGTCTAGGACC---CCCA---C--ACC---A-C-------AA-CTAA-------------------CATC-AA-CAA-ATTG--GA-----A--------------------ACActctactgtagcgaccagaggtcatgcaatcagacac
gi|3 : aacccgcATGCTAAGCTTGTAATGGTC-T--ACA---GGATCAGCCACGACC-TGATA-GACAGTCC----A---G-CA--GTCGTGTACT---TCCA-CC-CCACT-------GC-AC---CAT--TTA-CAAGAG-----GACATTCCACATGA-----TAC-A---TGCAG--CCT----TTCTGCCGGACGGAC-A------AG-TACAG------CTTTTTCCCATATGGTAC-CT--GCC--TGTGGAA-CCAGC-TGCCGGATC-----GCAT--A--GC-CA---C-TG---CCCA--G-ACCAAAGAGGGCTTC----------------------A-----AGTCCGG-T---------CTGG-----------T------------CGC---------CCTCC-AGTT-G-T-------C----GA--------CACCAT---CCACG-T-T-TTTA------T---C--GGTTTTT---AAATTC-T--T--A-----------A-TCT-G---T---ACAT--TT--T--T------GCACGTCAA----AG------------CG---G-C-T-TTGTA---T--A--TACAC-------------CA-----A---GTG---CGTTT-----ATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTAT-CAGGAA---GAAGAAgtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaacatgctaagcttgtaatggtctacaggatcagccacgacctgatagacagtccagcagtcgtgtacttccaccccactgcaccatttacaagaggacattccacatgatacatgcagcctttctgccggacggacaagtacagctttttcccatatggtacctgcctgtggaaccagctgccggatcgcatagccactgcccagaccaaagagggcttcaagtccggtctggtcgccctccagttgtcgacaccatccacgtttttatcggtttttaaattcttaatctgtacatttttgcacgtcaaagcggctttgtatatacaccaagtgcgtttatgcctcagagtgggccctgcactttatcaggaagaagaaga
gi|30 : aacccgcaagaggagcccatcgccaagcagtacactttacacggacagacactcaatcttgccccaaatggtagttacctgggtgtgaccatcaatgaaaaactgctgtgagatagtcatgttgatgccatcacaaataaggtcagtaatatcattgccttcttgacgagaaattcaaccagttgacccactgaagtaaaggcccaaacttacaagacactggttcgcccaatcctcgagtatgcatctccagtctaggacccccacaccacaactaacatcaacaaattggaaacagtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaac---C---G-T-TATT-A------T---C--G--TTTTTTAAA---T-TCTT--A-----------A-TCT-G---T---ACAT--TC--T--T------GCACCTCAC----AA------------CG---G-C-T-TTGTA---T--G--TACAT-------------CA-----A---GTG---CATTT-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACTTTACCAGGAAGAAga
gi|31 : aatggcttcaagtctggcgtggctgcccacctgtagtcaacgccatccaGGTACAC--A---GT-T----ACCGTCCCC----TTGTCA-GGCCCATTCATGAGTATACGAGCACAGCATGGGGCC---CGTA---C--ACG---G-C-------AA-TGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GC-----G--------------------GC----G-ACGAAC-AGCGA---G-ATTAGC--G----A---------------A-TGGC----------------------GACT-----GCA----AG--A--CA------ACAA----Ggaag
gi|32 : TCA-A-A-GAAATGTTCG-ATA--TTG-TCCA----GAAGAG-ATAAGGGCACA---A---GCAT----ATACCACCC----TTGTCA-GGCTCATATTTGAATATGCAGCTGCATTGTGTGATA---CCTA---CCAACA---G-C-------AA---AA-------------------CATT-AACcaataccagttgacaacagttactatcgg
gi|33 : cttattGGCTTTC----------------------A-----GAGGAGA-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTGC-A-CT-A-TA-GA--GC----GA--------GGGCAT---C---G-T-T-TTTA------T---C--A--TTTT---AA---T-T--TT-A-----------A-TCTTG---C---ACAT--AC--G--C------GCGCCGCAC----AA------------AT---A-C-C-TTGTA---TC-T--TACAC-------------CA-----AGTTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAATGGG------A-TTTGTGAAGTAAC-GGAAGAAatccaagataaaatgaggaacccagaattgagac
gi|35 : --C------ACACTTCAC----AT------------TC---A-C---TTAGA------A--TATGT-------------CA-----TAGTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGA------A
gi|37 : accagctcccagaagcaaagtgctttgagggcctcaatgggggtttggggagtctacatgcaggttttgaactatttgccttcacttgttc----GA--------GGGCAT---C---G-T-T-TT--------T---CTTG--TTTT---AC---T-T--TTAA-----------A-TCTTG---T---ACAT--AC--C--C------GCGCCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---TGGCA-----ATGCCCCAGAGTGGG------AATTTGTGCAGGAGA-AGAAGAAcgtat
gi|38 : ttatacaaatgtaGGGAAG-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTGT-C-CC-G-TA-GA--GC----AA--------GGGCGT---T---G--------------------------TTT---A---------T--A-----------A-TCCTG---T---ACAT--AT--G--C------GCCACTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------T------AATTGTAAGCTGATG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTAAGGTAAGTAAT-GGAAGAAgaaga
gi|39 : AAGAAGAA-AATCCCAT------ACAGGCCACAT-ACAACATTCACGGCCAAGAC-CT--GAC
gi|4 : gaagacctggacagaattattaagtgggaaaaagacgggatgatgttattcaatcccagtaagtgcgagatgatctgcatcacaAAGAAGAGAACTCCCAT------ACAGGCCAC-TTACAACATTCTTGGCTAAAAC-CT--AACTTTCGTCAAGA-ACGG--CAAGT-ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CC--AG--A--ACATATCCTG-GAATGC---C-CATAT-AG--C-AG-CC-A--CAGCTAACAAAGCCAAAAATTC-------CCTAGAATTCTTT----CTCA-G-A-GAAACCT--G-GCAAGTTA-CCCA----CAATAC-ATCAAGGCACAG--A---GT-T----ACAAGACCC----TTGTCA-GGCCCATTTTTGAGTATGCAAGCACAGTATGAGACC---CATA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAGTCAG---T-ACCATCCAG----TTGA--------T-ACA-TGAA-------------------CTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-CCGCGT-CAACGCGAAGCTGGCGATGGTG-TGTACA---GCATCGTCCACTGGC-TCATA-GATATTCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TCCG-AC-CAGCT-------TC-CC-G-CAA--C-A-CAATAT-----G-AAACGCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATTGAC-A------TC-TACCGGCATTCCTTATTTCCCTCGGGCTA-AA--GAC--TGACGAA-C-AGCTTTTAAGAGC-----GCAT--C--GC-TA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----GAAGAGA-G---------CTTG-----------T------------C-----------CCTGC-A-CC-A-TA-GA--GC----GA--------GGGCAT---C---G-A-T-TT-A------T---C--G--TTTT---AA---TGT--T--A-----------A-TCTTG---T---ACAT--AC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------CC---A-C-C-TT-TA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGGAtt
gi|40 : ------GTGCCTCAC----A--------------------T-C-TTGTA----C-A--GTCAC--------------A-----AAT-GTA---TGACA-----ATGCTTCAGAGT-GG------ACCCTGCACATTATT-GGAAGAA
gi|43 : tatacaatgacctctattttgtgtttcattgtacaaacttgcactatttgttt------------TT---A-C-A-TTGTA----C-A--TACAC-------------TA-------TTGTA---CAACA-----ATGTCCCAGGGT-GG------ACCTAGTACAAAATT-GGAAGAggagaa
gi|44 : ataatatacatatccaaactgttttcatttttacctgctcttgctttgtttcccacc---T-T--T--A-----------A-ACCTGCATT---ACTT--GT--T--C------GCGCCTTAC----A-------------TC---A-CTC-TTGTA----C-AGTTGCAC---------------------AT-GCA---AAACA-----ATGTTCCTGAGTGGG------tgaaga
gi|45 : aaatacacatttcgagtaaacagttgcatttcttC-CTGCA-------TC-CC-T-CAA--T-A-CTAGAG-----G-CAGTTCAC-TGGTT---TTC-C---TGGTT--CCA----TTCTGGAGCATTTAC-A------TG-TACTAACACTCCTTCTTTCCCTCGGGTAC-CT--GAC--TTTGGAA-T-AGCccctgtatattatg
gi|46 : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCGTAGCCAAGACAGGA--TGA-T-ACCT-GGG---G-AC-AACC-CTC-TC--AGACA--ATCTCTCCTG-GAAtgacacccgagag
gi|47 : tccgcgcattaccACTCCT------CCTTGGGCAC-CA--GAC--TG--GAA-A-AGCCTTCAAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CATA--A-ACCATAAAAGTTTTC----------------------A-----GAGGAGA-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTG----CT-G-CA-GAGTGC----AA--------GGGCAT---C---
gi|49 : atcattttctg-T-TT-A------T---C--G--TTTT----------T--T--A-----------A-CTTTT---T---ATGT--GT--G--CATTAATGTATCTCAC----AA-------------C---G-C-CATTGTA----C-A--TACA---------------------AAT---A---T--CG-----ATGCCTCAGAGTGGG------
gi|5 : attcatgttTA-GAACAG---C-CATGT-TG--A-TG-CC-A--TTAGAAAAGAGGCCAACAACAG-------CCTCA---CCTTC----TTCACG-A-GGAACAT--T-GCCAGCTATCCCATCATTAGTGT-----AGGCCCAA--A---CC-T----AGAAGACACTGGTTTGTCA-A----ATCCTTGATTATGTGTCTATGTCCTGGGAGC---CCTG---C--ACC---A-CAATGTG-AA-CAAA-------------------CATCAAG--AA-ACT---GAT----G--------------------ACAtcagaaaaaaaagaaga
gi|5 : ctcaaccttgtcccaaatggaagatacctgggtgtggccatcaacaaaaaactgctaATGCCAAGCTTGTCA-GG-G-TCTACA---GGATCAGCAATGACC-TAATA-GACATACC----A---G-CA--GTCATGTATC---TCCA-CC-CCACT-------GCACCAT-TAA--C----CACAG-----G-ACATTCCT-TAACA---TAC-A---T--TCAGCCT----TTCTACTGGACGGAC-A------TT-TACCTGCACACTTTTTTTCCATCTGGCAT-CC--T-C--TGTAGAA-CCAGC-TGCCATATC-----ACAT--A--GC-T-------G---CCTG--G-ATCATAGAGGGCTTC----------------------A-----GGTCCGG-A---------CTGG-----------C------------C-----------CCAAA-A-CA-T-TA-G---TC----AA--------CGCCATTCAC---GTT-T-TT-A------T---CT-GT-TTTT---AA---T-T--T--T-----------A-ACTGG---T---GCAT--gttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatcatgccaagcttgtcagggtctacaggatcagcaatgacctaatagacataccagcagtcatgtatctccaccccactgcaccattaaccacaggacattccttaacatacattcagcctttctactggacggacatttacctgcacactttttttccatctggcatcctctgtagaaccagctgccatatcacatagctgcctggatcatagagggcttcaggtccggactggccccaaaacattagtcaacgccattcacgtttttatctgtttttaattttaactggtgcattattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|50 : ctcaaccttgtcccaaatggaagatacctgggtgtggccatcaacaaaaaactgctatagaacagccatgttgatgccattagaaaagaggccaacaacagcctcaccttcttcacgaggaacattgccagctatcccatcattagtgtaggcccaaacctagaagacactggtttgtcaaatccttgattatgtgtctatgtcctgggagccctgcaccacaatgtgaacaaacatcaagaaactgatgacagttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatc-GT-ACAT-TTC-TC--AA--A--ACCTATCTTG-GAATGC---A-TATGT-AC--C-CG-CC-A--CAGCAAAGAAGACCAATAATTC-------TCTAG-------T----CTCA-GAA-GAAACCT--G-GCATGTTA-ACCA----Ctattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|51 : gaagt-T--T--A-----------ACTCTTG---TGTTATATTAAC--G--C---------CCACGC----AA------------TAGAAA-C-A-TTACA---ACTA--TACTC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGATTGGG------ATTTGATGCAATAAC-GGAAGAAtgg
gi|53 : g-AC-ATCAAGCAA---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAT-------------------CTTGGCT-----GGA----GG--A--CA-T---TGCAG----AA-A-----TG-TAACAT-CAACGTGAGGCTTGTGATGG
gi|55 : AAAG-ACGGGACGATTTACCT-GGG---G-AC-A----------------A--AC-TGTCCTG-GAA-GC---TGTATGTCAGGTC-AG-CT-A--CA---AAGAGAGCCAACAACAG-------CCTGG---CATTC----ggcctatatttaa
gi|56 : CTTG---T---ACAT--AC--A--C------GTGTCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TTCAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAGAGTTGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAGAatag
gi|58 : CATCCATTGCCAATAG-CTGAAAC---AACCAA-A-ACTGTCCAAAT-ATCT-TGA---G-TC-ACTT-CTTACC--AGT-A--GCCTGTCTTG-GAATGC---
gi|59 : c--G--TTTC---TG---T-T--T--A-----------A-ACCTGCAGT---ACCT--GT--T--C------GCGCCTCGT----AT------------TT---------TTGTA---CA-A--T-CAC--------------A-----AAT-GTA---AGACA-----ATGCTCCAGAGTGGG------acgca
gi|6 : ATC-CCCTACAGGCCACAT-ACAATATTCATGGCCAAGAC-CT--AACTTTTGTCAAGA-A------GAG--------GA---GCGC-ACAT-TTT-CA--AA--A--ACCTCTCCTG-GAATGC---C-CATGT-AG--C-AG--C-A--CAGCTAAGAAGGCCAATAATTT-------TCTAG---CCTTC----CACA-GAA-GAAACCT--G-GAAAGTTG-CCCA----CAGGAT-ATCAAGTCACAG--A---GT-T----ATCAGGCCC----TTGTTG-GGCCCATTTTTGAGTATGCGATAACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACT---G-C-------CA-AGAA-------------------TATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC
gi|6 : aaCAA--G-AC-AACAAGTAG---T-AACAGCCAG----ATGA--------T-CAA-TGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ATG--CCA-T-G--T-CAATGCAAGGCTTGTGATGGTG-T--ACA---GAAACGTCCATGGAC-TCATA-GGTATCCCCT-CACTTATCA--TTC------T---TTCG-AT-CA-CA-------TC-C--T-CAA--C-A-CTAGGG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-T---TAGTC--CCA----TTTTGCATAATTGAC-A------TC-TACCTGCATT------TTCCCTCAAGCAC-CA--GAA--TGTGGAA-C-AGCCTTCCTGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---TCGA--C-ACTCTAGAGGtgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttcaagacaacaagtagtaacagccagatgatcaatgactttggctggaagacattgcaagaatgccatgtcaatgcaaggcttgtgatggtgtacagaaacgtccatggactcataggtatcccctcacttatcattctttcgatcacatcctcaacactaggggcaactcactgaagttcttagtcccattttgcataattgacatctacctgcattttccctcaagcaccagaatgtggaacagccttcctgagcgcatcgccacagtcgacactctagagg
gi|60 : aaatcccctacaggccacatacaatattcatggccaagacctaacttttgtcaagaagaggagcgcacattttcaaaaacctctcctggaatgcccatgtagcagcacagctaagaaggccaataattttctagccttccacagaagaaacctggaaagttgcccacaggatatcaagtcacagagttatcaggcccttgttgggcccatttttgagtatgcgataacagcatgggacccgtacactgccaagaatatcagccagattgaggctgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttCCTATC-CTG-GTAAATTAC-C-A-AAC--CCATGAGCACAAC-CT--TATTTTAGCCAAGA-
gi|63 : T--AC--G--A------GTGCAATAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----A-----------GGG------ATTTTGTGCAGTAAC-AGAcaggacaataattatatgtgtacaatgct
gi|64 : tt----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CT-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAAAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAA
gi|66 : GTA---CGGCG-----ATGCCCCAGTGTGGG------ATTTCGTGCAGTAAT-TGAAG
gi|68 : tgtaggtcatatagagaC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCTCTAGAGTGAG------ATTTTATGCAGTAAtaga
gi|7 : AC-T-ACAATATCCATGACCAATAG-CTG-AAACA-AGC--AAA-ACAGTCCAAAT-ACCT-TGG---G-GC-ACTT-CTC-ACCAAC--A--ACCTGTCCTG-GAACGCATAC-AATGT-CA--T-GA-TC-A--CG---AAGAGGGCCAACAATAC-------CACAG---TCTTC----CTCA-GCC-GCAACCT--C-TCAACATG-CACG----AGGGGA-ACTAAAG---AG--GCCTGC-T----ACAAGACCT----TCGTAA-GGCCCAAGGTTGAGTATGCCGCCACTGTTTGGGACC---CTCA---C--ACTCAAG-C-------C----TA-------------------TATC-AACAAA-GTA---GA-----A--------------------GCGG--T-GC-AACA--CAGAGCT-GCCAGCg
gi|70 : tcaagctcaacgcag-C-T-TTGTA---T------ATGT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGG------Atttgtctctgggattacaactgaaaattcatcgtcaccgccacgcataacacactcggctgggagggtcttcaacaacagaagaaggaggccaaggctgtcataatctattagattaccaacaaccttgatatccctaatgtgccttacatacatccacagagagtttcaaccttaggtcactcgatgaggtacttggtaccatactgcaagatgtctgtattgaaagagtcattcttcccttccatcattgtattatgga
gi|71 : -TTGTA---TT-A--TACAC-------------CA-----AAGTGTA---CGAGG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGTAAC-catatgcctcacaggaag
gi|72 : TGTA---CGACA-----ATGCTCCAGAGTGGGC-----A--CTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|73 : tata-----AATTATA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGCGCAGTAAC-AGAAGAAcaagaa
gi|74 : ATTGTA---TGACA-----ATGCCCCACAGTGAG------ATTTTATGATGTAAT-GAAAGAA
gi|75 : A-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAG
gi|77 : TGTA---CGACG-----ATACCCCAGAGTGAG------ATTTTGGGCAATAAC-GGAAGA
gi|79 : CTCTCCTG-GAA-GC---CACATGT-CA--A-AT-CA-A--CTACCAAGAGAGCCA
gi|8 : GCACAT--A---GT-T----ATCAGACCC----TTGTCA-GGCCCATTCTTAAGTATGC---C-CAGCACGGGACC---CGTA---C--ACC---A-C-------AA-CGAACATAAGAAAGAACGACGAGCATC-CGCGAG-ATTCGTGAATAACG--------------------ACAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACTAGCCAG----AGGA--------T-ACA-GGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-G--T-CAACGCGA-GCTCG---TGGTGATGTACA---GAATCGTCCATGGGC-GCATA-T-TATCCCCT-CA---A-CA--TTC------T---TCCG-AC-TAGCG-------TC-CC-T-CAA--C-A-CTAGAG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-C---TAGTC--CCA----CTCTGCAGATTTGAC-A------TA-TACACGCACCCCTTCTTTCCCTCAGACAC-CA--GAT--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAAT-----GCAC--C--GC-CA---C-AA-----AATTT-ACTTTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------------CT--------------------------------------CCTGC-G-CC-G-TA-GA--TCGTCGGA--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-GAAAAACT---C--AT-TTTT---AAT--T-T--T--A-----------A-TCTTG---T---ACAT--AC--G--C------GCGTCTTAC----GG------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGCA---CAACG-----ATGCCACAGAATGAG------ATGTTGTGCAGTAAT-GGAAGA
gi|80 : -----ATGCCACAGAGTGGG-------CCCTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|81 : aGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGAAAC-GGAAGAgaagaa
gi|82 : tG-TGTACA---GAATTGTCCATGGTC-TCATA-GATAT-CCTT-CA---A-C
gi|83 : g---CGATG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ACTTTGTGCAGTAAT-TGAA
gi|84 : gTGTA---CGACG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAA
gi|9 : CACAG--A---GT-T----ACCACACTC----TTGTCA-GGCCCATTATTGAGTATACAAGCACAGCATGGGACT---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-TGAA-------------------CATC-AGTCAA-ATT---GC-----GGGATTCGTGAATGGGTGACTACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TACT-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-A--T-CAACGCAAAGCTCGTAATGGTG-T--ACA---AAAACGTCCATGGGC-TCATA-GATATCCCCT-AA---T-CA--TTC------T---ACCA-AC-CAGCT-------TC-CC-C-CAA--C-A-AATGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---T-C-C---GGGTC--CCA----TTCTGCAAAGTTGAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTCCCCTCGGGCAC-CA--AAC--TGCGGAA-A-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----GAAGAGG-G---------TTGA-----------T------------C-----------TCTGC-A-CA-A-TA-GC--GC----GA--------GGGCAT---C---GTT-T-TT-A------T---T--G--CTTT---AA---TCT--T--A-----------A-TCTTG---T---ACAT--AC--G--C------GCGTTGCAC----AA------------TG---A-C-C-GTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGCCG-----ATGCTCTAGAGAAGG------ATTTTGTGCAGTAA
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GTCAGACTTTGGAACCAGCTTCCAGAATAACTAGCATTAGGCAGTCCTTAGAGGGCTACAAGGGGGGTTTGGTAAGACAATATCCATGAATCTAAGGCTGTTTTTAACCTTTTATATTCACATGGTTGGCACCTCATATTCCCTTTGTACATGAGTCACATTGTATGACAATGTCCAAGACGGGACCATTCACATCACTGCAA
Unaligned ( gi|34 ): CCTGGACAATGGAGCATCAGGTTTTGACACCCACCATTAGTCGACACCATTCATGTTTTATAGGCTTTAACTTATAATCTGTGCATTGATTGTTGCACATAACAACTACATTGTACATACACCCTCCGAGTGGACCCTGCATTTTATCAGGAAGA
Unaligned ( gi|36 ): TGCAGTATTAATACCCTACACAGTACAAAGTTTTATAAATTTTCTTTTTAAAACATGTAACTACTTGTTCATGCCTCATATCGTTCTTGTACAGTCACAAATGTACTACACGCCTCCAGAGTTGACCCTGTACATTACTGGAACAAG
Unaligned ( gi|41 ): ATATAACGTACCTGGTCTGTGACCCCAACACTACAACTAACAACAATTTGGAGGCAGTCCAAAGAAGGGCAGCACAGTTTGTAGATTTGTGTAGATTACAGAACTTTGAGCAGCACCAGCAACATGATGG
Unaligned ( gi|42 ): GGTGCAGTATTATCACCCCAAACTGTACAAATTTTGTCACTTTTTAACCTGCTATTACGTCATTCCTGTTCAGTAACAAATGTATGACAATGCTTCAGAGTAGACCTTGTACATCAAACGAAGAAAAA
Unaligned ( gi|48 ): AGACCTTGGTTGGCCATTTTTCTAACAAAGATGGTAGAGGACCAAGCTGACCATGATATATAGGATCATCTATGGCCATAATGACACCCAGGCAACACCCAGGTACATCG
Unaligned ( gi|52 ): TTTGGAACGTTTCGAGAACCACTAGCAATAGCAATAACCTTAAGGGCTTCAAGGGAGTGTGACGAGTCTACATGCAATATTATGCAAAATTTGTTTCACCTTA
Unaligned ( gi|54 ): TAACCTATACATTCTCATGCCTCACATGTGTACATATTCAACATAATATAATGATACTTCAGAGTTGGCCATGTACTATATTGGGAGAAGAAATA
Unaligned ( gi|57 ): ACAGCCTGGCATTCATAGGCTGTTGGGCAGCATGTTTCATCAAGGGAGAGTACGGCACAACTGGCAGCATCTCCCATATTGCCACAATCT
Unaligned ( gi|61 ): TGAATGGATAATGCCTTTTAACCCTTCGAAGTGTTTAACCACGAAGAGGACCGCTATCCTATCAAATTACCAAATCCA
Unaligned ( gi|62 ): ATAACCCGCAAGAGGAGCCCATCGCCAAGCAGTACCCTGTACATTGACAGACACCCGAATGGTAGATACCCGGATG
Unaligned ( gi|65 ): AGTCACATACATAAACCATTCTCCAGAGTGGGTCCTATGTATTACAGTACTTAGAAGAAGAGGAGA
Unaligned ( gi|67 ): ACGTGCAGTAAGTATTGTACGACAATGTTCCAGTACCTAGTACACAATTGGAAGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|69 ): ATATTACTCAAAGCGCGTCGAAGCCTTAGAGTGGCCCTGAACCTTACCAGGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|76 ): TTATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTACCAGGAAGAAGAAAGAA
Unaligned ( gi|78 ): TTTGTATTTCAAAGTGGACCCAGCACATTATCAGGAAAAAGAAGA
Unaligned ( gi|85 ): CAACAGCTGAAACAAGCAAAACAGTCCAAATACC
Alignments
lowQualScore : 111111 111 1 22222222222 111 111111 11 11111 1111 222222222222222222 111 111 222222222222222222222222222222222 3333333333333333333333333333333 111111 11111111 22222222222222222222 11111 4444444444444 1111 1 2222222222222222222222222222222222222222 1 2222222222222222222222222222222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333333333333333333333333 1111111111111111
lowQualScore : 1 4 000000 1 3 777 1 1 99 3 99 33 1 88888888888 5 33 6 000 9 000000 2 33 66 11 1 9 44444 1 2222 5 2 33 9999 222222222222222222 0 555 1 77777 9 666 3 44 4444 444 6 1 3 44 7777 3 333 555 8 6666 2 0 22 111 444 2 444 33 555 2 555555555555555555555555555555555 2 2 8888888888888888888888888888888 111111 2 5 88888 5555 44444444 66 22 66666666666666666666 7777777777777 33 33 00000 6666 3 4444444444444 3 6 1111 4 3 5 333 1 2 2 2 33 555 2 666 8888888888888888888888888888888888888888 6666 0 0 55555 2 3 222 44444 1 2 444 1 333 4444 44 7 555555 1 1 333 1 0 22 1 0 0 22 0 5 44 0 44444 66666 1 333 1 333 888888 1 1 3 9999999999999999999999999999999999999999 1 777777777 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9999999 3 3 1 666666666666666666666666666 3 44 33 22 44 1 777 222 1 1 9999999999999999 2222 777777777777 222 5 111 999999 11 77777777777777 22222 111 22222 333333 0 33
lowQualScore : . . ...... . . ... . . .. . .. .. . ........... . .. . ... . ...... . .. .. .. . . ..... . .... . . .. .... .................. . ... . ..... . ... . .. .... ... . . . .. .... . ... ... . .... . . .. ... ... . ... .. ... . ................................. . . ............................... ...... . . ..... .... ........ .. .. .................... ............. .. .. ..... .... . ............. . . .... . . . ... . . . . .. ... . ... ........................................ .... . . ..... . . ... ..... . . ... . ... .... .. . ...... . . ... . . .. . . . .. . . .. . ..... ..... . ... . ... ...... . . . ........................................ . ......... ............................................................................. ....... . . . ........................... . .. .. .. .. . ... ... . . ................ .... ............ ... . ... ...... .. .............. ..... ... ..... ...... . ..
lowQualScore : 7 1 111111 4 7 555 0 0 88 1 66 33 6 88888888888 7 99 2 888 2 888888 9 99 33 00 0 3 88888 0 2222 7 9 99 7777 999999999999999999 6 444 5 55555 2 333 1 22 3333 888 2 7 1 33 1111 0 444 000 6 1111 4 7 66 999 777 6 777 44 000 9 222222222222222222222222222222222 7 9 5555555555555555555555555555555 666666 7 2 33333 7777 33333333 11 99 33333333333333333333 4444444444444 99 99 11111 1111 1 5555555555555 1 1 2222 2 9 3 777 0 1 1 0 33 888 1 333 4444444444444444444444444444444444444444 2222 6 4 99999 4 0 999 55555 5 4 111 5 222 2222 55 6 555555 8 3 444 1 2 44 7 7 9 44 4 2 77 9 55555 33333 8 222 8 222 555555 8 7 5 9999999999999999999999999999999999999999 8 666666666 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5555555 3 3 7 111111111111111111111111111 0 11 55 00 44 4 555 555 4 4 9999999999999999 7777 777777777777 333 0 777 666666 77 99999999999999 99999 777 33333 666666 2 44
consensus : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CC--AG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTCG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGG-A-NATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTACA---GGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TCCG-AC-CA--GCA-------TC-CC-T-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-A-CC----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--A-NCT-TG---T---A-C-AT--AC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
Reference ( family-845 ) : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCNTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-ACAT-CTC-TC--AG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTNG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGG-A-NACCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTACA---GAATCGTCCATGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TCCG-AC-CA--GCN-------TC-CC-T-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-A-CC----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--A-TCT-TG---T---A-C-AT--AC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
gi|1 : AGGGAGAGGAGCCCTATC-CTC-GCAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGTCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GAG---G-ACGACG--CTC-TC--GG--GCGATCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTGG----AGTCC-A--CTATCAAGAAAGTCAACAA--------CAG-------CCTGG---CGTTC----ATAA-G-G-AGAG-TC--T--GTGTA---TTTG-TCCACAAA-A-AACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGAACC----TCGTTTGACCAACGGTCGAGTGCGCCTCCACAGCATGGGATCCAACGTAGTTC--AAC---G-TGGGGCAGCA-CG---------------------CTTC--GCCA--AGG---GA-----G--------------------ACTACTGCAC-AACTAGTAG---G-ATCTCCCAG----ATGA--------T-AAC-GGAT-------------------CTTGGTT-----G-------G--T--CA-TTTCTCCAA----CATA-G--ACG---ACAG-C-ATGCCAAGCT---GATTATGATGTATA---GGATCATCTATTGCC-ATATC-GATATCCCCG-CA---A-CACCGTA------T---CTCG-ACACA--CCA-------CC-AC-TGTAG--CGACCAGAGGTCACG-CAACCAGA-T-ACG---TT--------GTA--CCA----TTTTGCAGAATG-GACTA------TC-T-TCGTCACTCCTTCTTCCCCTTGG--CTAC-ACGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCACAGA-----ACCT--G--GT-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGCGGCATTC----------------------AAGTTG------------GGGGAGG-GGAGGGGGGACTG-G--------------------------------------TGC-A-------GTATGA--AT----A-ACCCACACTGTACAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--A-ACC-TG---C---A-C--T--ACTAGTTT------GCGCCTCACTCGGCA------------TC---ATT-C-TTGTACAGTC-A--CACA------------------------TGTA---CGACA-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACATTA
gi|10 : aagatctggacaaacgccagcaatgggaacgtgactggatgatgtccttcaaccctttaaagtgcggcgaggtcctgcgcattaccCAACATTCACAGCCAATAC-CT--GACTTTCGTCAAGA-ATGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CC--AA--A--ACCTAACCTGGAATGC---C-CATGAAG---CAG-TC-A--CAGCTAAGAAAGCCAATAA--------TTC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-G-A-AAAAACC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGG-A-CATCA--------------A---GG-TACA-GA--------TGTGAG-----------AG--------CACAGCATGGGACC---CTTA---C--ACT---G-C-------CA-CAAA-------------------CATC-AGCCAG-ACT---GA-----G--------------------GC-------C-ATCCAGCAA---TGAGCAGTGAG----AT----------T--CA-TGAA---------------------TGGC--------------G--A--C------TACAA----CC-A-GTACCAAC-CCGA-TAAC-TGATGTTCATAATGGTG-C--ACA---GAATCGTTCATGAGG-TCATA-GATATCCCCT-CA---G-TA--GTC------T---TCAG-AC-CA--GCT-------TC-AC-T-CAA--C-ACTAGAA-----G-AAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-CAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAT-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCATCCAGAGC-----ACAT--C--AC-CA---C-AG---CCGA--C-ttattagaagaa
gi|11 : ttCAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCAAG----ATGA--------C-CCA-CGAC-------------------ATTGGTT-----GAA----AG--A--CA-C---TGCAA----GA------TCGTC-ACGT-CAAC-CAAAGCTTGTGAT--TG-TGTACA---GAATTGTCCACGGGC-TGATAAGATA----CTACA---A-CA--ACC------T--------AC-CA--GCA-------TC-CC-T-CAA--C-ACTAAAG-----G-TAATTCAC-AGGTG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTTTGCACAGTT-GAC-A------TC-AAACGGCACTCCTTTTTTTCCCTGG--ATAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----CCAT--C--AC-CA---C-AG---CTGA--C-A-----------TTC----------------------T-----------------GGGCAGG-G---------CTA-G------------------------------------------A-CT----GTA-AA--GT----G-A--------GGGCAT---A---A-TGT-TT-A------T------TCCT---AA---C---------------------------C-AT--AT--G--C------ACACCTCAC----AA------------TC---A-C-C-ATATG---TC-A--TACAC-------------C------AATTGTA---CAATG-----GTGGCTCAGTGTGGG------ATTATGTACAGTAAT-GGAAGAA
gi|12 : atgatgttgttcaacccaagcaaatgcgaggtgatccacaccacacagagaaatccaattGACC---CG-A---G--ACC---G-C-------CA-C-AC-------------------CA-C-AGCCAACAT---------------------------------CAA--G-A--AAC---CGG---T-ACT--CCAA----A-GAAAG-----T-AAG-TGCA-------------------ATTCGCTTATGGGGATTACAG--AACCACT---TGCAA-------A-G--CAG-C-ATCTGCAACATG----TC---ATGGTC-TATA-----GAATCAGCCACGACC-TGATA-GACATCC----CA---G-CA--GTCATGTATC---TCC--AC-CA---------------CC-C-CAATCC-ACCA--------T-CAAC---C-TGAGGACATTT-C---T------CCAGCCTTTCTGCAGGACA-GAC-A------TT-TACATGCA------------------------CAAACGTTTTGGAACC-AG-TTGCCAATTT-----GCAT--A--GC-CG---C-TG---CCCA--G-ATCATAGAGAACTTC----------------------A-----------------GGTTCAG-A---------CTG-G-----------C------------CA----------TC--C-A-CCACTAGTC-GAC-GC----A-ATTCAT---GTGTGT---T---T-T-T-TTAA------TA--GGTTTTT---AACT-T-T--T--A--A-GCTATG---C---ATC-AT---------T------GCATCTCAC----GA------------g
gi|13 : aatatgaaaacacttccAGCAG---C-ACCTCCCGG----ATGG--------TGACAAT--C-------------------CTAGGTT-----GTC----TGCCA--CA-T-------A----GA-A-G--------GCAG-CAG-GCCAAACTGACCATGATG-TATA-----GGATCATCTTTGGTCATTATG-GACATCCCTA-CA---A-CA--CCC------T-----------------------------C-T-CAA----ACCAGAA-----G-TCACACAT-TTAAA---TACGC---TGTAC--CCA----T-CTGCTGAACG-GACTG------TC-TAT-GCCACTCCTACTTCCCCTCGG--TTACACAG-C--TGTGGAACC-AGCAAT-CAGAGT-----GCCTGGC--AC-CA---G-GG---TC----C-AACCTGGAAGCACTCAA--------------------A-----------------GGGGAcatcgtacagagtggtcttttactttagcaggaagaaaaa
gi|14 : catagct--A--ACCTATCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG-CC-A--CAGTTGAGAAGGCCAACAA--------TTC-------CTTAG---CCTTCAGACCTCA-G-AAGAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGC-A-CATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTGAATATGTGAGCACAGCATGGGACA---CATA---C--ATG---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC-------C-GTCCAGCGA---TGAGCAGCGAGAATCATGAAGGGCGATT-ACA-AGACAACAAGCAGTATACATGACCTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-----CG-CTGCAT-CAACGCGAAGCTTGCGATG--G-TGTAGA---GAATCGTCTAGGAGC-TCATA-GATATCTCCT-AA---G-CC--TTT------T---TCacagttgcagtattaatatcccacactgtacaaagtttcttttctttttaaatgtctcgcatcattctccccagagtgggccatgtacattattgaaagaagaa
gi|15 : aGCCAAGCTGACCATGATG-TATA-----GGATCACCTATGGCC-ATATC-AACATCCCCG-CA---A-CA--
gi|15 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcagCATTCCTTTTTG---TCAG--CTAC-GTGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCGGAGC-----ACCT--G--GC-CATTGC-AT---CCAA------CCTGGAGGCATTC----------------------A-----------------TAGGA-G-A---------CTG-G-----------TGCAGTATTAATAC-----------CCTAC-A-CT----GTA-------------------------CA--------G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--A-ACC-TG---C---A-C--T--AC--T--A------G---TTTGT----AAC-----------TC---A-C-------A---TC-A--TTC------------------------TTGT--------T-----ATGCCCCAGAATGGG-------CCCTGTACATTATT-GAAAGAAccgtatctccacacaacagattatcttcaccattcctttttgtcagctacgtggctgtggaaccagctaccggagcacctggccattgcatccaacctggaggcattcataggagactggtgcagtattaataccctacactgtacagttttatttctttttaaacctgcactactagtttgtaactcacatcattcttgttatgccccagaatgggccctgtacattattgaaagaagaa
gi|16 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcaggccaagctgaccatgatgtataggatcacctatggccatatcaacatccccgcaacaccgtatctccacacaacagattatcttcac-GACATCCACG-CA---A-CA--CTA------TATCTCCACAC-CA--CCA-----------C-TGTAG--CGACCAGAA-----G-TCACTCAA-TCATA---TAC-A---TTGTA--CCA----TTTTGCAGAATA-AAC-T------TT-TTTCGCCATTCCTTCTTTCCCTCGG--CTAC-ACGGC--TGTGTAACC-AG-CTACCAGAGC-----ACCT--G--GC-CA---C-AGTGTCCA-----ACCTT-GAGGCATTC----------------------A-----------------AGGGAGG-A---------CTG---------------------------------------CCAT-A-CT----GTA-------------------------CAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--A-ACC-TA---C---A---AT--ATTAGTTT------GTGCCTCAC-----A------------TC---ATT-C-TTGTACAGTC-A--CACATGTATGATCTTGTACAGTCACACTTGTA---CCACA-----ACGCCTCAGAGT-GG------ACCCGTTACATTATT-GGAAGAAgaa
gi|17 : GGTA--CCA----TTCGGCAG-----GAT-A------TCCTACCTACACTCCTTCT---CTTCAG--GTGT-CAGGC--TCTGGAA-CCAGC-TTCCAGAACACCTAGCAT--T--AA-TA-----AG---CCAA--A-TCCTTGGAGGACTTC----------------------A-----------------AGGGAGG-ga
gi|17 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacag------GCACCTCAC----AAAAGAAGACATATTC---A-C-T-TTGTA----C-A--TAAAT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCAAAGAGTGAG-------CCATGTGCAtttagcgaatatacatgcatgaatacagaactgtttttaacatcttacctgtactgttttgcacctcacaaaagaagacatattcactttgtacataaatcacattgtacaacaatgccaaagagtgagccatgtgcatcactggacgttctaagaa
gi|18 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacagggtaccattcggcaggatatcctacctacactccttctcttcaggtgtcaggctctggaaccagcttccagaacacctagcattaataagccaaatccttggaggacttcaagggaggtttagcgaatatacatgcatgaatacagaactgtttttaacatcttacctgtactgttttATGCTAAGCTTGTCATGGTC-T--ACA---GGATCAGCCACAACC-TGATA-GACACCtcactggacgttctaagaa
gi|18 : acG-G---------CTG--------------------------------------TC--C-A-CCA---GTA-G---TC----A-A--------TGTCAT---CCATG-T-T-TC-AAT----CC--G--TTTTTA-AA---T-TCTT--A--A-TCT--G---T---A-C-AT---T--GT-T------GCACCTAAC----AA------------CG---G-C-T-TTGTA---T--A--TACA--------------CA-----AAGTGTG---TTA-------ATGCTTTGGAGTAGG------tgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacatggctgtccaccagtagtcaatgtcatccatgtttcaatccgtttttaaattcttaatctgtacattgttgcacctaacaacggctttgtatatacacaaagtgtgttaatgctttggagtaggccctgcactttactaggaagaagaa
gi|19 : acatgctaagcttgtcatggtctacaggatcagccacaacctgatagacacctgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacat--CCA----TTCTGCAG-----GAC-AGGTTCTCC-TGCCTACACTCTTTTGTACCTTCAG--ATGT-CAGGC--TCTGAAC-C-AGC-TTACAGAAC-----ACCT--A--GAGCA---TTAG---CCAG--A-ATTTTAGAAGATTTC----------------------AAGTGTGTATGGAAGTGGGGGGAGG-G---------TAGCG-----------A------------G-----------TCTAC-A-T-----GTATGA--AT----ATA--------GAGC-T---G---T-T-T-TT-A------TC------TCT---AC---C-T--T--------TT-TG---T---------------------------GCTTCAC----AT------------TC---A-C-T-TTGTA----C-A--TAAGT-------------CA-----AATTGTA---TGACACTACAATGCCTCAGAGTGGG------ccctgcactttactaggaagaagaa
gi|2 : cttccatacttccactgtcactaccatagtacatgcatacacaatgAGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAT----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGCCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACG-CTC-TC--GG--ACGACCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTC----CAGTCC-A--CTACCAAGAAACCCAACAA--------CACTGAACAGCCTGG---CATTC----ATAA-G-A-GAAA-CC--T--G-TCT--AGCTG-TCCACAGG-A-AACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGACCC----TTGTTTGACCAACGCTCGAGTACGCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--ACccatgtctgtcactggaa
gi|2 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactATGCCAAGCTGACTATGATG-TATA-----GGATCATCTATGGCC-ATATC-GACATCCCCG-CAC--A-CA---TC------T---AC---ACACA--GC-------------------------CAGAG-----G-TCACACAA-TCAAA---TAC-CATTTTGTT--CCA----TTTTGCATAACG-GACTA------TC-T-TCATCACTCCTTCTTCCCCTCAGCTACAC-T--GC--TGTGGAA-C-CTGCTACCAGAGC-----ACCT--G--AC-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGAGGCATTC----------------------A---------------------AGG-A---------CTT-G-----------TG-----------CAGTATTAATAACCCAC-A-CT----GTA-------------------------------C---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--A-ACC-TG---C---A-T--T--ACTAGTTT------GCACCTCAC-----A------------TC---ATT-C-TTGTA----C-A--GTCA--------------CA-----AA-TGTA---CAACA-----ATGCCTCAGAGTGAG-------CTCTGTACATTACT-GGAAGGAacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcatgccaagctgactatgatgtataggatcatctatggccatatcgacatccccgcacacatctacacacagccagaggtcacacaatcaaataccattttgttccattttgcataacggactatcttcatcactccttcttcccctcagctacactgctgtggaacctgctaccagagcacctgaccacagcgtccaacctggaggcattcaaggacttgtgcagtattaataacccacactgtacgttttatttctttttaaacctgcattactagtttgcacctcacatcattcttgtacagtcacaaatgtacaacaatgcctcagagtgagctctgtacattactggaaggaaaa
gi|20 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactaggaagaggaaccctatcctcacaagctatcaaatccatgggcacaacctaatcatagccaagacaggacgatacctggggacaacgctctcggacgacctctcctggaagccacatgtccagtccactaccaagaaacccaacaacactgaacagcctggcattcataagagaaacctgtctagctgtccacaggaaaccaaggcccaagcatacaagacccttgtttgaccaacgctcgagtacgcctccacagtatgggatccatacacacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcGTA--CCC----TTCCGCTGAACG-GATTG------TC-T-TCGACACTC-TTCTTCCTCTAGG--CTAC-ACGGC--TGTGCAA-CCAGC-TACCAGAGC-------AT--CTGGC-CA---C-GG---C-GT--CTAACCTGGAGGCATTCGAGGGGTGGGATGGGGTGGGGGA-----------------GGGGAGGTG---------CTG-GGGCAGTAGTTATA-----------C-----------CCTAC-A-CT----GCA-------------------------CAC---A---G-T-T-GT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--A-ACC-TGCATT---A-C-AT--GT--T--T------GCGCCTCAT-----A------------TC---ATT-C-GTGTA---TA-G--T-CA--------------CA-----AA-TGCA---CGACA-----ATGACTCA-AAT-GG------ACCCTGTACA-TAAaaa
gi|21 : cagaggtcacattGATGGTG-T--ACA---GAATCGTCCATGGGC-TACTA-GATATCCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TCCG-AC-CA--GCAGGCATCTTC-CC-T-CAA--C-AGC---------T-CAAC--AT-TATAG---TTC-C---TGGTC--CCA----GTCTGCAGAGTT-GAC-A-----------------CTCCTTCTTTCCCTCGA--GCAC-CAGAT--TGGGGAA-C-ACACTCCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---T-AG---CTGA--C-ACCATAGAGGCTTTC----------------------A-----------------AAGGAGA-G---------CTG-A-----------T------------T-----------AGTGC-A-CC----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAA---T---G-TAT-TT-A------TC--G--TTTT---AAT--T-T--T--A--A-TCT-TG---T---A-C-AT--AT--G--G------GTGCCTCAC----AA------------Tt
gi|22 : atAT-T-ACCAAATCCATGGTGACAAC-CT--AGCTGTAGCCAAGA--CAA--T---GA-T--ACTT-GAG---G-AC-A-ATGTTC-TC--AG--A--AGACCTCCTGGAATCT---G-CATGTCG----AG-TCAA--CTACCAAGAGAGCCAACAG--------CAG-------TCTGG---CATTC----ATAAGG-A-GAAA--C--T--G-TTT--ATCTG-TCAATAGG-A-AACTA----AAGCCCAAGCA---GT-T--AAGATTC----TCGCTAGACCAACACATGACTACTCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--AC
gi|23 : caa-----G-CAATTCAC-TGATG---TTC-C---TGGTT--CTA----TTCTGCAGAGTT-GAC-A------TC-TACTGCCACTCCAT---TCCCTCAG--GCAC-CAAAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCTAGAGT-----GCAT--T--GC-CA---C-AG---CCGA--T-AACCTAG-GGCACTC----------------------A-----------------GTGAAAG-G---------CTC-A-----------T------------C-----------TTTGCGG-TC----ATA-CA--GT----G-A--------GGGCAT---CG--G-T-T-TT-G------TC--A--TTT---------T-T--A--A--A-TCC-TG---T---A-C-AT--AT--G--T------GCG-CTCAC----AA------------TC---C-C-C-TTGTA---TT-A--TAGAC-------------CA-----AATTGTA---AGACA-----AT------TAGCAGA------AATATGTGCATTATT-GAAAGAAacagtttgaatacagcaactagagacattccaatatagagc
gi|24 : A-CTAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----A--------------------ACCG--G-CC-AGCGAAGAG-------CAGCT-------TGA--------T-TCG-TGA
gi|24 : cctca--ACC---GGC-------CAGCGAA-------------------GAGC-AGCTTG-ATTCGTGA-----ATGGCGATT------------ACAA--A-AC-AACAATCAG---T-ATCAGCCAA----ATGA--------T-ACA-TGGC-------------------CTTTGCT-----TCA----AG--A--CA-T---GGCAT----GA-A-----CGCC-GTGT-CAACGCAAAGCTCGTGATGGTG-TATA-ATTTTAATCGTCTATGGGC-TCTTG-GACATTCCTT-CT---A-CG--ATC------T---TCCG--T-GG--GCA-------TC-C----------------AG-----G-CATGTCGT-TGAAG---TTT-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-GAT-A------TA-TACatggcgattacaaaacaacaatcagtatcagccaaatgatacatggcctttgcttcaagacatggcatgaacgccgtgtcaacgcaaagctcgtgatggtgtataattttaatcgtctatgggctcttggacattccttctacgatcttccgtgggcatccaggcatgtcgttgaagtttctggtcccattctgcagagttgatatataca
gi|25 : cctcaactaacatcagccagattgaaAGGAAGAGAAACCCAATC-CTC-ACA---CAT-G-ACCAGATCCATGGGCACAAC-AT--AGCTTTAGCCAAAATAGGA--C---GA-T--GTCT-GGA---G-AC-A-ATGCTT-TC--AG--AAGACCTCTCCTGAAA-GC---CGTATACCG----AG-TC-AATTAG-CAAGAGAGCCAACAACAGAAAAGTA----------TGG---CATTC----ATAA-G-A-GAGG-TCGTT--T-GAAGGAGTTG-TCCCCAGGTATTACCA----Aa
gi|26 : gattggatcatgtccttcaaccatttgaagtgcggagtcctctgcattatgaactAGAATTTGGC-A------TC-TGCCAGCACTC----TTTCCCTTGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAG-C-AGCCTTCCAAAAC-----ACAT--T--GC-CA---C-AG---TTGA--T-ACTTTAGAGGCATTC----------------------A-----------------GGAGAGG-A---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTTC-A-CT----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T------------------------------T-T--T--A--A-TCC-CG---T---A-A-AT--AT--G---------GCACCTCAT----AA------------TC---A-C-A--TGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AGCTGTA---CGATA-----ATGCCCCAGAATGAG------ATTTAATGTAATAAT-GGAAGAA
gi|27 : C-TATCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGA--GTAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCATGAGC-----GTAT--C--GC-CA---C-AG---CTGA--C-ACCGTAGGGGG--TC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------GTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-A-TC----GTG-GA--GC----A-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT--------------------------------T--A--A-TCT-TG---T---A-C-AT--AT--G--C------GCACCTTAC----AG------------TC---A-C-C-TTGTA---GC-A--TACAC-------------CA-----AAGTATA---CGACG-----ATGCCCCAGTGTGGA------ATTATGTGTAGTATT-GGAAGA
gi|28 : a--------------------ACAG--A-AC-AACTAGCAG---C-ACCTCCCAG----ATGG--------TGACA--GAC-------------------CTTGGTT-----GGC-----------CA-TCTCTCCAAAATAGA-A-G----G-C-A-GT-AGAT-C-AAGCTGACCATGATG-T--ACA---GGATCATCTATGGCC-ATATT-GACATCCCCT-CA---A-CA--C-CGA----T---TCTC-AA-CA--ATG-------AT-TC-T-CAA--C-ACC
gi|3 : caagggagactAAGAGGAGCCC-ATCGC----CAAGC-AG-T-ACACTTTACACGGACA-GACACTC-AATCTT-GCCCCAA-ATGG--TA--GT-T--ACCT-GGGTGTG-AC--CAT-CAA-TG--AA--A--AACTGCTGTGAGATAG---T-CATGTTG---ATG-CC-A--TCACAAATAAGGTCAGTAA--------TAT-------CATTG---CCTTC----TTGACG-A-GAAA-TT--C--A-ACC--AGTTGACCCAC-TG-A-AGTAA----AGGCCCAA--A---CT-TACAAGACAC----TGGTTCGCCCAATCCTCGAGTATGCATCTCCAGTCTAGGACC---CCCA---C--ACC---A-C-------AA-CTAA-------------------CATC-AA-CAA-ATTG--GA-----A--------------------ACAtctactgtagcgaccagaggtcatgcaatcagacac
gi|3 : aacccgcATGCTAAGCTTGTAATGGTC-T--ACA---GGATCAGCCACGACC-TGATA-GACAGTCC----A---G-CA--GTCGTGTACT---TCCA-CC-CC--ACT-------GCACCAT-TTA--C-A--AGAG-----GACATTCCACATGA-----TAC-A---TGCAG--CCT----TTCTGCCGGACG-GAC-A------AG-TACAG------CTTTTTCCCATATG--GTAC-CTGCC--TGTGGAA-CCAGC-TGCCGGATC-----GCAT--A--GC-CA---C-TG---CCCA--G-ACCAAAGAGGGCTTC----------------------A-----------------AGTCCGG-T---------CTG-G-----------T------------CGC---------CCTCC-AGTT----GT-------C----G-A--------CACCAT---CCACG-T-T-TTTA------TC--GGTTTTT---AAATTC-T--T--A--A-TCT--G---T---A-C-AT--TT--T--T------GCACGTCAA----AG------------CG---G-C-T-TTGTA---T--A--TACAC-------------CA-----A---GTG---CGTTT-----ATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTAT-CAGGAA---GAAGAAgtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaacatgctaagcttgtaatggtctacaggatcagccacgacctgatagacagtccagcagtcgtgtacttccaccccactgcaccatttacaagaggacattccacatgatacatgcagcctttctgccggacggacaagtacagctttttcccatatggtacctgcctgtggaaccagctgccggatcgcatagccactgcccagaccaaagagggcttcaagtccggtctggtcgccctccagttgtcgacaccatccacgtttttatcggtttttaaattcttaatctgtacatttttgcacgtcaaagcggctttgtatatacaccaagtgcgtttatgcctcagagtgggccctgcactttatcaggaagaagaaga
gi|30 : aacccgcaagaggagcccatcgccaagcagtacactttacacggacagacactcaatcttgccccaaatggtagttacctgggtgtgaccatcaatgaaaaactgctgtgagatagtcatgttgatgccatcacaaataaggtcagtaatatcattgccttcttgacgagaaattcaaccagttgacccactgaagtaaaggcccaaacttacaagacactggttcgcccaatcctcgagtatgcatctccagtctaggacccccacaccacaactaacatcaacaaattggaaacagtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaac---C---G-T-TATT-A------TC--G--TTTTTTAAA---T-TCTT--A--A-TCT--G---T---A-C-AT--TC--T--T------GCACCTCAC----AA------------CG---G-C-T-TTGTA---T--G--TACAT-------------CA-----A---GTG---CATTT-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACTTTACCAGGAAGAAga
gi|31 : aatggcttcaagtctggcgtggctgcccacctgtagtcaacgccatccaGGTACAC--A---GT-TACCGTCCCC----TTGTCAGGCCCATTCATGAGTATACGAGCACAGCATGGGGCC---CGTA---C--ACG---G-C-------AA-TGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GC-----G--------------------GC----G-ACGAAC-AGCGA---G-ATTAGC--G----A---------------A-TGGC----------------------GACT-----GCA----AG--A--CA------ACAA----Ggaag
gi|32 : TCA-A-A-GAAA-TG--TTCG-ATA----TTG-TCCAGAAG-A-GATAA----GGGCACA---A---GCATATACCACCC----TTGTCAGGCTCATATTTGAATATGCAGCTGCATTGTGTGATA---CCTA---CCAACA---G-C-------AA---AA-------------------CATT-AACcaataccagttgacaacagttactatcgg
gi|33 : cttattGGCTTTC----------------------A-----------------GAGGAGA-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-A-CT----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TTTA------TC--A--TTTT---AA---T-T--TT-A--A-TCT-TG---C---A-C-AT--AC--G--C------GCGCCGCAC----AA------------AT---A-C-C-TTGTA---TC-T--TACAC-------------CA-----AGTTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAATGGG------A-TTTGTGAAGTAAC-GGAAGAAatccaagataaaatgaggaacccagaattgagac
gi|35 : --C------ACACTTCAC----AT------------TC---A-C---TTAGA------A--TATGT-------------CA-----TAGTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGA------A
gi|37 : accagctcccagaagcaaagtgctttgagggcctcaatgggggtttggggagtctacatgcaggttttgaactatttgccttcacttgttc----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT--------TCTTG--TTTT---AC---T-T--TTAA--A-TCT-TG---T---A-C-AT--AC--C--C------GCGCCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---TGGCA-----ATGCCCCAGAGTGGG------AATTTGTGCAGGAGA-AGAAGAAcgtat
gi|38 : ttatacaaatgtaGGGAAG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGT-C-CC----GTA-GA--GC----A-A--------GGGCGT---T---G-T-T-T------------------------A---T-------A--A-TCC-TG---T---A-C-AT--AT--G--C------GCCACTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------T------AATTGTAAGCTGATG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTAAGGTAAGTAAT-GGAAGAAgaaga
gi|39 : AAGAAGAA-AATCCCAT------ACAGGCCACAT-ACAACATTCACGGCCAAGAC-CT--GAC
gi|4 : gaagacctggacagaattattaagtgggaaaaagacgggatgatgttattcaatcccagtaagtgcgagatgatctgcatcacaAAGAAGAGAACTCCCAT------ACAGGCCAC-TTACAACATTCTTGGCTAAAAC-CT--AACTTTCGTCAAGA-ACGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CC--AG--A--ACATATCCTGGAATGC---C-CATATAG---CAG-CC-A--CAGCTAACAAAGCCAAAAA--------TTC-------CCTAGAATTCTTT----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTA-CCCACAAT-A-CATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTTTTGAGTATGCAAGCACAGTATGAGACC---CATA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAGTCAG---T-ACCATCCAG----TTGA--------T-ACA-TGAA-------------------CTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-CCGCGT-CAACGCGAAGCTGGCGATGGTG-TGTACA---GCATCGTCCACTGGC-TCATA-GATATTCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TCCG-AC-CA--GCT-------TC-CC-G-CAA--C-ACAATAT-----G-AAACGCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCATTCCTTATTTCCCTCGG--GCTA-AAGAC--TGACGAA-C-AGCTTTTAAGAGC-----GCAT--C--GC-TA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GAAGAGA-G---------CTT-G-----------T------------C-----------CCTGC-A-CC----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-A-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---TGT--T--A--A-TCT-TG---T---A-C-AT--AC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------CC---A-C-C-TT-TA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGGAtt
gi|40 : -T-T-TT-G------T---G--TTTC---AT---T-G--T--ACAA-ACT-TG---C---A-CTAT--TT--G--TTT----GTGCCTCAC----A--------------------T-C-TTGTA----C-A--GTCAC--------------A-----AAT-GTA---TGACA-----ATGCTTCAGAGT-GG------ACCCTGCACATTATT-GGAAGAA
gi|43 : tatacaatgacctcta------------TT---A-C-A-TTGTA----C-A--TACAC-------------TA-------TTGTA---CAACA-----ATGTCCCAGGGT-GG------ACCTAGTACAAAATT-GGAAGAggagaa
gi|44 : ataatatacatatccaaactgttttcatttttacctgctcttgctttgtttcccacc---T-T--T--A--A-ACC-TGCATT---A-C-TT--GT--T--C------GCGCCTTAC----A-------------TC---A-CTC-TTGTA----C-AGTTGCAC---------------------AT-GCA---AAACA-----ATGTTCCTGAGTGGG------tgaaga
gi|45 : aaatacacatttcgagtaaacagttgcatttcttC-CT--GCA-------TC-CC-T-CAA--T-ACTAGAG-----G-CAGTTCAC-TGGTT---TTC-C---TGGTT--CCA----TTCTGGAGCATT-TAC-A------TG-TACTAACACTCCTTCTTTCCCTCGG--GTAC-CTGAC--TTTGGAA-T-AGCccctgtatattatg
gi|46 : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCGTAGCCAAGACAGGA--T---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACC-CTC-TC--AGACA--ATCTCTCCTGGAAtgacacccgagag
gi|47 : tccgcgcattaccACTCCT------CCTTGG--GCAC-CAGAC--TG--GAA-A-AGCCTTCAAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CATA--A-ACCATAAAAGTTTTC----------------------A-----------------GAGGAGA-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTG----CT----GCA-GAGTGC----A-A--------GGGCAT---C---
gi|49 : atcattttctg-T-T-TT-A------TC--G--TTTT----------T--T--A--A-CTT-TT---T---A-T-GT--GT--G--CATTAATGTATCTCAC----AA-------------C---G-C-CATTGTA----C-A--TACA---------------------AAT---A---T--CG-----ATGCCTCAGAGTGGG------
gi|5 : attcatgt--AACCTTGTCCCA-A-ATGG--AA--GA-T--ACCT-GGGTGTG-GC--CAT-CAA-CA--AA--A--AACTGCTATAGAACAG---C-CATGTTG---ATG-CC-A--TTAGAAAAGAGGCCAACAA--------CAG-------CCTCA---CCTTC----TTCACG-A-GGAA-CA--T--T-GCC--AGCTATCCCAT------CATTAGTGTAGGCCCAA--A---CC-TAGAAGACACTGGTTTGTCAA----ATCCTTGATTATGTGTCTATGTCCTGGGAGC---CCTG---C--ACC---A-CAATGTG-AA-CAAA-------------------CATCAAG--AA-ACT---GAT----G--------------------ACAtcagaaaaaaaagaaga
gi|5 : ctcATGCCAAGCTTGTCA-GG-G-TCTACA---GGATCAGCAATGACC-TAATA-GACATAC----CA---G-CA--GTCATGTATC---TCCACCC-CACTGCA--------C-CA-T-TA-----ACCACAG-----G-ACATTCCT-TAACA---TAC-A---T--TCAGCCT----TTCTACTGGACG-GAC-A------TT-TACCTGCACACTTTTTTTCCATCTG--GCAT-CCT-C--TGTAGAACC-AG-CTGCCATATC-----ACAT--A--GC-T-------G---CCTG--G-ATCATAGAGGGCTTC----------------------A-----------------GGTCCGG-A---------CTG-G-----------C------------C-----------CCAAA-A-CA----TTA-G---TC----A-A--------CGCCATTCAC---GTT-T-TT-A------TCT-GT-TTTT---AA---T-T--T--T--A-ACT-GG---T---G-C-AT--gttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatcatgccaagcttgtcagggtctacaggatcagcaatgacctaatagacataccagcagtcatgtatctccaccccactgcaccattaaccacaggacattccttaacatacattcagcctttctactggacggacatttacctgcacactttttttccatctggcatcctctgtagaaccagctgccatatcacatagctgcctggatcatagagggcttcaggtccggactggccccaaaacattagtcaacgccattcacgtttttatctgtttttaattttaactggtgcattattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|50 : ctcaaccttgtcccaaatggaagatacctgggtgtggccatcaacaaaaaactgctatagaacagccatgttgatgccattagaaaagaggccaacaacagcctcaccttcttcacgaggaacattgccagctatcccatcattagtgtaggcccaaacctagaagacactggtttgtcaaatccttgattatgtgtctatgtcctgggagccctgcaccacaatgtgaacaaacatcaagaaactgatgacagttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatc-ACAT-TTC-TC--AA--A--ACCTATCTTGGAATGC---A-TATGTAC---CCG-CC-A--CAGCAAAGAAGACCAATAA--------TTC-------TCTAG-------T----CTCA-GAA-GAAA-CC--T--G-GCA--TGTTA-ACCACTGG-tattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|51 : gaagtgt-T--T--A--ACTCT-TG---TGTTA-T-ATTAAC--G--C---------CCACGC----AA------------TAGAAA-C-A-TTACA---ACTA--TACTC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGATTGGG------ATTTGATGCAATAAC-GGAAGAA
gi|53 : g-AC-ATCAAGCAA---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAT-------------------CTTGGCT-----GGA----GG--A--CA-T---TGCAG----AA-A-----TG-TAACAT-CAACGTGAGGCTTGTGATGG
gi|55 : AAAG-ACGGGAC---GA-TTTACCT-GGG---G-AC-A----------------A--AC-TGTCCTGGAA-GC---TGTATGTCAGGTCAG-CT-A--CA---AAGAGAGCCAACAA--------CAG-------CCTGG---CATTC----ggcctatatttaa
gi|56 : CT-TG---T---A-C-AT--AC--A--C------GTGTCTCAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TTCAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAGAGTTGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAGAatag
gi|58 : CATCCATTGCCAATAG-CTGAAAC---AACCAAAA-CTGT--CCA-AA-T--ATCT-TGA---G-TC-ACTT-CTTACC--AGT-A--GCCTGTCTTGGAATGC---
gi|59 : c--G--TTTC---TG---T-T--T--A--A-ACC-TGCAGT---A-C-CT--GT--T--C------GCGCCTCGT----AT------------TT---------TTGTA---CA-A--T-CAC--------------A-----AAT-GTA---AGACA-----ATGCTCCAGAGTGGG------acgca
gi|6 : ATC-CCCTACAGGCCACAT-ACAATATTCATGGCCAAGAC-CT--AACTTTTGTCAAGA-A---------GA---------GGA---GCGC-ACAT-TTT-CA--AA--A--ACCTCTCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG--C-A--CAGCTAAGAAGGCCAATAA--------TTT-------TCTAG---CCTTC----CACA-GAA-GAAA-CC--T--G-GAA--AGTTG-CCCACAGG-A-TATCA----AGTCACAG--A---GT-TATCAGGCCC----TTGTTGGGCCCATTTTTGAGTATGCGATAACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACT---G-C-------CA-AGAA-------------------TATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC
gi|6 : aaCAA--G-AC-AACAAGTAG---T-AACAGCCAG----ATGA--------T-CAA-TGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ATG--CCA-T-G--T-CAATGCAAGGCTTGTGATGGTG-T--ACA---GAAACGTCCATGGAC-TCATA-GGTATCCCCT-CACTTATCA--TTC------T---TTCG-AT-CA---CA-------TC-C--T-CAA--C-ACTAGGG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-T---TAGTC--CCA----TTTTGCATAATT-GAC-A------TC-TACCTGCATT------TTCCCTCAA--GCAC-CAGAA--TGTGGAA-C-AGCCTTCCTGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---TCGA--C-ACTCTAGAGGtgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttcaagacaacaagtagtaacagccagatgatcaatgactttggctggaagacattgcaagaatgccatgtcaatgcaaggcttgtgatggtgtacagaaacgtccatggactcataggtatcccctcacttatcattctttcgatcacatcctcaacactaggggcaactcactgaagttcttagtcccattttgcataattgacatctacctgcattttccctcaagcaccagaatgtggaacagccttcctgagcgcatcgccacagtcgacactctagagg
gi|60 : aaatcccctacaggccacatacaatattcatggccaagacctaacttttgtcaagaagaggagcgcacattttcaaaaacctctcctggaatgcccatgtagcagcacagctaagaaggccaataattttctagccttccacagaagaaacctggaaagttgcccacaggatatcaagtcacagagttatcaggcccttgttgggcccatttttgagtatgcgataacagcatgggacccgtacactgccaagaatatcagccagattgaggctgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttCCTATC-CTG-GTAA---AT-T-ACCAAACCCATGAGCACAAC-CT--TATTTTAGCCAAGACAGGA--C---AA-T--A
gi|63 : T--AC--G--A------GTGCAATAC----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----A-----------GGG------ATTTTGTGCAGTAAC-AGAattatatgtgtacaatgct
gi|64 : tt----AA------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CT-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAAAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAA
gi|66 : GTA---CGGCG-----ATGCCCCAGTGTGGG------ATTTCGTGCAGTAAT-TGAAG
gi|68 : tgtaggtcatatagagaC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCTCTAGAGTGAG------ATTTTATGCAGTAAtaga
gi|7 : AC-T-ACAATATCCATGACCAATAG-CTG-AAACA-AGC--AAA-ACAG--TCCAAA-T--ACCT-TGG---G-GC-ACTT-CTC-ACCAAC--A--ACCTGTCCTGGAACGCATAC-AATGTCA---TGA-TC-A--CG---AAGAGGGCCAACAA--------TAC-------CACAG---TCTTC----CTCA-G-CCGCAA-CC--T--C-TCA--ACATG-CACGAGGG-G-AACTA----AAG---AG--GCCTGC-TACAAGACCT----TCGTAAGGCCCAAGGTTGAGTATGCCGCCACTGTTTGGGACC---CTCA---C--ACTCAAG-C-------C----TA-------------------TATC-AACAAA-GTA---GA-----A--------------------GCGG--T-GC-AACA--CAGAGCT-GCCAGCg
gi|70 : tcaagctcaacgcag-C-T-TTGTA---T------ATGT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGG------Atttgtctctgggattacaactgaaaattcatcgtcaccgccacgcataacacactcggctgggagggtcttcaacaacagaagaaggaggccaaggctgtcataatctattagattaccaacaaccttgatatccctaatgtgccttacatacatccacagagagtttcaaccttaggtcactcgatgaggtacttggtaccatactgcaagatgtctgtattgaaagagtcattcttcccttccatcattgtattatgga
gi|71 : -TTGTA---TT-A--TACAC-------------CA-----AAGTGTA---CGAGG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGTAAC-catatgcctcacaggaag
gi|72 : TGTA---CGACA-----ATGCTCCAGAGTGGGC-----A--CTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|73 : tata-----AATTATA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGCGCAGTAAC-AGAAGAAcaagaa
gi|74 : ATTGTA---TGACA-----ATGCCCCACAGTGAG------ATTTTATGATGTAAT-GAAAGAA
gi|75 : A-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAG
gi|77 : TGTA---CGACG-----ATACCCCAGAGTGAG------ATTTTGGGCAATAAC-GGAAGA
gi|79 : CTCTCCTGGAA-GC---CACATGTCA---AAT-CA-A--CTACCAAGAGAGCCA
gi|8 : GCACAT--A---GT-TATCAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTAAGTATGC---C-CAGCACGGGACC---CGTA---C--ACC---A-C-------AA-CGAACATAAGAAAGAACGACGAGCATC-CGCGAG-ATTCGTGAATAACG--------------------ACAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACTAGCCAG----AGGA--------T-ACA-GGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-G--T-CAACGCGA-GCTCG---TGGTGATGTACA---GAATCGTCCATGGGC-GCATA-T-TATCCCCT-CA---A-CA--TTC------T---TCCG-AC-TA--GCG-------TC-CC-T-CAA--C-ACTAGAG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-C---TAGTC--CCA----CTCTGCAGATTT-GAC-A------TA-TACACGCACCCCTTCTTTCCCTCAG--ACAC-CAGAT--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAAT-----GCAC--C--GC-CA---C-AA-----AATTT-ACTTTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------------------------CT---------------------------------------CCTGC-G-CC----GTA-GA--TCGTCGG-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-GAAAAACTC--AT-TTTT---AAT--T-T--T--A--A-TCT-TG---T---A-C-AT--AC--G--C------GCGTCTTAC----GG------------TC---A-C-C-TTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGCA---CAACG-----ATGCCACAGAATGAG------ATGTTGTGCAGTAAT-GGAAGA
gi|80 : -----ATGCCACAGAGTGGG-------CCCTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|81 : aGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGAAAC-GGAAGAgaagaa
gi|82 : tG-TGTACA---GAATTGTCCATGGTC-TCATA-GATAT-CCTT-CA---A-C
gi|83 : g---CGATG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ACTTTGTGCAGTAAT-TGAA
gi|84 : gTGTA---CGACG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAA
gi|9 : CACAG--A---GT-TACCACACTC----TTGTCAGGCCCATTATTGAGTATACAAGCACAGCATGGGACT---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-TGAA-------------------CATC-AGTCAA-ATT---GC-----GGGATTCGTGAATGGGTGACTACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TACT-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-A--T-CAACGCAAAGCTCGTAATGGTG-T--ACA---AAAACGTCCATGGGC-TCATA-GATATCCCCT-AA---T-CA--TTC------T---ACCA-AC-CA--GCT-------TC-CC-C-CAA--C-AAATGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---T-C-C---GGGTC--CCA----TTCTGCAAAGTT-GAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTCCCCTCGG--GCAC-CAAAC--TGCGGAA-A-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GAAGAGG-G---------TTG-A-----------T------------C-----------TCTGC-A-CA----ATA-GC--GC----G-A--------GGGCAT---C---GTT-T-TT-A------TT--G--CTTT---AA---TCT--T--A--A-TCT-TG---T---A-C-AT--AC--G--C------GCGTTGCAC----AA------------TG---A-C-C-GTGTA---TC-A--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGCCG-----ATGCTCTAGAGAAGG------ATTTTGTGCAGTAA
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GTCAGACTTTGGAACCAGCTTCCAGAATAACTAGCATTAGGCAGTCCTTAGAGGGCTACAAGGGGGGTTTGGTAAGACAATATCCATGAATCTAAGGCTGTTTTTAACCTTTTATATTCACATGGTTGGCACCTCATATTCCCTTTGTACATGAGTCACATTGTATGACAATGTCCAAGACGGGACCATTCACATCACTGCAA
Unaligned ( gi|34 ): CCTGGACAATGGAGCATCAGGTTTTGACACCCACCATTAGTCGACACCATTCATGTTTTATAGGCTTTAACTTATAATCTGTGCATTGATTGTTGCACATAACAACTACATTGTACATACACCCTCCGAGTGGACCCTGCATTTTATCAGGAAGA
Unaligned ( gi|36 ): TGCAGTATTAATACCCTACACAGTACAAAGTTTTATAAATTTTCTTTTTAAAACATGTAACTACTTGTTCATGCCTCATATCGTTCTTGTACAGTCACAAATGTACTACACGCCTCCAGAGTTGACCCTGTACATTACTGGAACAAG
Unaligned ( gi|41 ): ATATAACGTACCTGGTCTGTGACCCCAACACTACAACTAACAACAATTTGGAGGCAGTCCAAAGAAGGGCAGCACAGTTTGTAGATTTGTGTAGATTACAGAACTTTGAGCAGCACCAGCAACATGATGG
Unaligned ( gi|42 ): GGTGCAGTATTATCACCCCAAACTGTACAAATTTTGTCACTTTTTAACCTGCTATTACGTCATTCCTGTTCAGTAACAAATGTATGACAATGCTTCAGAGTAGACCTTGTACATCAAACGAAGAAAAA
Unaligned ( gi|48 ): AGACCTTGGTTGGCCATTTTTCTAACAAAGATGGTAGAGGACCAAGCTGACCATGATATATAGGATCATCTATGGCCATAATGACACCCAGGCAACACCCAGGTACATCG
Unaligned ( gi|52 ): TTTGGAACGTTTCGAGAACCACTAGCAATAGCAATAACCTTAAGGGCTTCAAGGGAGTGTGACGAGTCTACATGCAATATTATGCAAAATTTGTTTCACCTTA
Unaligned ( gi|54 ): TAACCTATACATTCTCATGCCTCACATGTGTACATATTCAACATAATATAATGATACTTCAGAGTTGGCCATGTACTATATTGGGAGAAGAAATA
Unaligned ( gi|57 ): ACAGCCTGGCATTCATAGGCTGTTGGGCAGCATGTTTCATCAAGGGAGAGTACGGCACAACTGGCAGCATCTCCCATATTGCCACAATCT
Unaligned ( gi|61 ): TGAATGGATAATGCCTTTTAACCCTTCGAAGTGTTTAACCACGAAGAGGACCGCTATCCTATCAAATTACCAAATCCA
Unaligned ( gi|62 ): ATAACCCGCAAGAGGAGCCCATCGCCAAGCAGTACCCTGTACATTGACAGACACCCGAATGGTAGATACCCGGATG
Unaligned ( gi|65 ): AGTCACATACATAAACCATTCTCCAGAGTGGGTCCTATGTATTACAGTACTTAGAAGAAGAGGAGA
Unaligned ( gi|67 ): ACGTGCAGTAAGTATTGTACGACAATGTTCCAGTACCTAGTACACAATTGGAAGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|69 ): ATATTACTCAAAGCGCGTCGAAGCCTTAGAGTGGCCCTGAACCTTACCAGGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|76 ): TTATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTACCAGGAAGAAGAAAGAA
Unaligned ( gi|78 ): TTTGTATTTCAAAGTGGACCCAGCACATTATCAGGAAAAAGAAGA
Unaligned ( gi|85 ): CAACAGCTGAAACAAGCAAAACAGTCCAAATACC
Alignments
lowQualScore : 111111 111 1 11 22222222222 1111111111111 11111 11111 111111 222222222222222222 111 111 222222222222222222222222222222222 3333333333333333333333333333333 111111 11111111 22222222222222222222 11111 4444444444444 1111 1 33333333333333333333333333333333333 1 2222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333333333333333333333333 2222222222222222222222 333333333333333333333333333 22222222222222
lowQualScore : 1 4 000000 1 3 777 1 1 99 3 00 66 1 88888888888 5 33 6 1111111111111 5 22222 1 9 44444 444444 5 2 33 9999 222222222222222222 1 555 1 77777 999 3 3 44 4444 444 6 1 1 7777 3 333 555 8 6666 2 0 22 111 444 2 444 33 555 2 555555555555555555555555555555555 2 2 8888888888888888888888888888888 111111 2 5 88888 5555 44444444 66 22 66666666666666666666 7777777777777 33 33 00000 6666 3 4444444444444 3 6 1111 4 3 88888 0 2 1 2 2 2 33 555 2 666 00000000000000000000000000000000000 0 4 4444 00 0 55555 2 3 222 44444 1 2 444 1 333 4444 44 7 555555 1 1 333 1 0 22 1 0 0 22 0 5 44 0 44444 66666 1 333 1 333 888888 1 1 3 9999999999999999999999999999999999999999 1 777777777 666666666666666666666666666666666666666 0 1 99999 4444444444444444444444 9999999 5 3 1 444444444444444444444444444 3 44 33 22 2 1 777 1 1 00000000000000 2222 777777777777 5 1 1 8888 11 77777777777777 22222 111 22222 333333 0 33
lowQualScore : . . ...... . . ... . . .. . .. .. . ........... . .. . ............. . ..... . . ..... ...... . . .. .... .................. . ... . ..... ... . . .. .... ... . . . .... . ... ... . .... . . .. ... ... . ... .. ... . ................................. . . ............................... ...... . . ..... .... ........ .. .. .................... ............. .. .. ..... .... . ............. . . .... . . ..... . . . . . . .. ... . ... ................................... . . .... .. . ..... . . ... ..... . . ... . ... .... .. . ...... . . ... . . .. . . . .. . . .. . ..... ..... . ... . ... ...... . . . ........................................ . ......... ....................................... . . ..... ...................... ....... . . . ........................... . .. .. .. . . ... . . .............. .... ............ . . . .... .. .............. ..... ... ..... ...... . ..
lowQualScore : 7 1 111111 4 7 555 0 0 88 1 77 77 6 88888888888 7 99 2 1111111111111 7 00000 0 3 88888 000000 7 9 99 7777 999999999999999999 2 444 5 55555 777 1 1 22 3333 888 2 7 0 7777 0 444 000 6 1111 4 7 66 999 777 6 777 44 000 9 222222222222222222222222222222222 7 9 5555555555555555555555555555555 666666 7 2 33333 7777 33333333 11 99 33333333333333333333 4444444444444 99 99 11111 1111 1 5555555555555 1 1 2222 2 9 00000 2 3 0 1 1 0 33 888 1 333 22222222222222222222222222222222222 3 7 8888 99 4 99999 4 0 999 55555 5 4 111 5 222 2222 55 6 555555 8 3 444 1 2 44 7 7 9 44 4 2 77 9 55555 33333 8 222 8 222 555555 8 7 5 9999999999999999999999999999999999999999 8 666666666 777777777777777777777777777777777777777 5 9 22222 9999999999999999999999 5555555 0 3 7 444444444444444444444444444 1 22 77 11 1 5 888 5 5 11111111111111 8888 999999999999 2 3 2 8888 77 99999999999999 99999 777 33333 666666 2 44
consensus : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTCG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCA-------TCCCT-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ACC----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
Reference ( family-845 ) : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTCG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCA-------TCCCT-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ACC----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
gi|1 : AGGGAGAGGAGCCCTATC-CTC-GCAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGTCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GAG---G-ACGACG--CTC-TCGG--GCGATCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTGG----AGTCC-A--CTATCAAGAAAGTCAACAA--------CAG-------CCTGG---CGTTC----ATAA-G-G-AGAG-TC--T--GTGTA---TTTG-TCCACAAAAAACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGAACC----TCGTTTGACCAACGGTCGAGTGCGCCTCCACAGCATGGGATCCAACGTAGTTC--AAC---G-TGGGGCAGCA-CG---------------------CTTC--GCCA--AGG---GA-----G--------------------ACTACTGCAC-AACTAGTAG---G-ATCTCCCAG----ATGA--------T-AAC-GGAT-------------------CTTGGTT-----G-------G--T--CA-TTTCTCCAA----CATA-G--ACG---ACAG-C-ATGCCAAGCT---GATTATGATGTA----TAGGATCATCTATTGCC-ATATC-GATATCCCCG-CA---A-CACCGTA------T---CT-CG-ACAC-A--CCA-------CCACTGTAG--CGACCAGAGGTCACG-CAACCAGA-T-ACG---TT--------GTA--CCA----TTTTGCAGAATG-GACTA------TC-T-TCGTCACTCCTTCTTCCCCTTGG--CTAC-ACGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCACAGA-----ACCT--G--GT-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGCGGCATTC----------------------AAGTTG------------GGGGAGG-GGAGGGGGGACTG-G--------------------------------------TGC-A------GTATGA--AT----A-ACCCACACTGTACAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-C--TACTAGTTT------GCGCCTCACTCGGCA------------TCATT-C-TTGTACAGTCA--CACA------------------------TGTA---CGACA-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACATTA
gi|10 : aagatctggacaaacgccagcaatgggaacgtgactggatgatgtccttcaaccctttaaagtgcggcgaggtcctgcgcattaccCAACATTCACAGCCAATAC-CT--GACTTTCGTCAAGA-ATGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CCAA--A--ACCTAACCTGGAATGC---C-CATGAAG---CAG-TC-A--CAGCTAAGAAAGCCAATAA--------TTC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-G-A-AAAAACC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGACATCA--------------A---GG-TACA-GA--------TGTGAG-----------AG--------CACAGCATGGGACC---CTTA---C--ACT---G-C-------CA-CAAA-------------------CATC-AGCCAG-ACT---GA-----G--------------------GC-------C-ATCCAGCAA---TGAGCAGTGAG----AT----------T--CA-TGAA---------------------TGGC--------------G--A--C------TACAA----CC-A-GTACCAAC-CCGA-TAAC-TGATGTTCATAATGGTG-C--A----CAGAATCGTTCATGAGG-TCATA-GATATCCCCT-CA---G-TA--GTC------T---TC-AG-AC-C-A--GCT-------TCACT-CAA--C-ACTAGAA-----G-AAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-CAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAT-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCATCCAGAGC-----ACAT--C--AC-CA---C-AG---CCGA--C-ttattagaagaa
gi|11 : ttCAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCAAG----ATGA--------C-CCA-CGAC-------------------ATTGGTT-----GAA----AG--A--CA-C---TGCAA----GA------TCGTC-ACGT-CAAC-CAAAGCTTGTGAT--TG-TGTA----CAGAATTGTCCACGGGC-TGATAAGATA----CTACA---A-CA--ACC------T---------AC-C-A--GCA-------TCCCT-CAA--C-ACTAAAG-----G-TAATTCAC-AGGTG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTTTGCACAGTT-GAC-A------TC-AAACGGCACTCCTTTTTTTCCCTGG--ATAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----CCAT--C--AC-CA---C-AG---CTGA--C-A-----------TTC----------------------T-----------------GGGCAGG-G---------CTA-G------------------------------------------ACT----GTA-AA--GT----G-A--------GGGCAT---A---A-TGT-TT-A------T------TCCT---AA---C-----------------------C-ATAT--G--C------ACACCTCAC----AA------------TCA-C-C-ATATG---TCA--TACAC-------------C------AATTGTA---CAATG-----GTGGCTCAGTGTGGG------ATTATGTACAGTAAT-GGAAGAA
gi|12 : atgatgttgttcaacccaagcaaatgcgaggtgatccacaccacacagagaaatccaattGACC---CG-A---G--ACC---G-C-------CA-C-AC-------------------CA-C-AGCCAACAT---------------------------------CAA--G-A--AAC---CGG---T-ACT--CCAA----A-GAAAG-----T-AAG-TGCA-------------------ATTCGCTTATGGGGATTACAG--AACCACT---TGCAA-------A-G--CAG-C-ATCTGCAACATG----TC---ATGGTC-TATA------GAATCAGCCACGACC-TGATA-GACATCC----CA---G-CA--GTCATGTATC---TC-C--AC-C-A--------------CCC-CAATCC-ACCA--------T-CAAC---C-TGAGGACATTT-C---T------CCAGCCTTTCTGCAGGACA-GAC-A------TT-TACATGCA------------------------CAAACGTTTTGGAACC-AG-TTGCCAATTT-----GCAT--A--GC-CG---C-TG---CCCA--G-ATCATAGAGAACTTC----------------------A-----------------GGTTCAG-A---------CTG-G-----------C------------CA----------TC--C-ACCACTAGTC-GAC-GC----A-ATTCAT---GTGTGT---T---T-T-T-TTAA------TA--GGTTTTT---AACT-T-T--T--A--AGCTATG---CATC-AT-------T------GCATCTCAC----GA------------g
gi|13 : aatatgaaaacacttccAGCAG---C-ACCTCCCGG----ATGG--------TGACAAT--C-------------------CTAGGTT-----GTC----TGCCA--CA-T-------A----GA-A-G--------GCAG-CAG-GCCAAACTGACCATGATG-TATA------GGATCATCTTTGGTCATTATG-GACATCCCTA-CA---A-CA--CCC------T------------------------------CT-CAA----ACCAGAA-----G-TCACACAT-TTAAA---TACGC---TGTAC--CCA----T-CTGCTGAACG-GACTG------TC-TAT-GCCACTCCTACTTCCCCTCGG--TTACACAG-C--TGTGGAACC-AGCAAT-CAGAGT-----GCCTGGC--AC-CA---G-GG---TC----C-AACCTGGAAGCACTCAA--------------------A-----------------GGGGAcatcgtacagagtggtcttttactttagcaggaagaaaaa
gi|14 : catagct--A--ACCTATCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG-CC-A--CAGTTGAGAAGGCCAACAA--------TTC-------CTTAG---CCTTCAGACCTCA-G-AAGAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGCACATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTGAATATGTGAGCACAGCATGGGACA---CATA---C--ATG---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC-------C-GTCCAGCGA---TGAGCAGCGAGAATCATGAAGGGCGATT-ACA-AGACAACAAGCAGTATACATGACCTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-----CG-CTGCAT-CAACGCGAAGCTTGCGATG--G-TGTA----GAGAATCGTCTAGGAGC-TCATA-GATATCTCCT-AA---G-CC--TTT------T---TC-acagttgcagtattaatatcccacactgtacaaagtttcttttctttttaaatgtctcgcatcattctccccagagtgggccatgtacattattgaaagaagaa
gi|15 : aGCCAAGCTGACCATGATG-TATA------GGATCACCTATGGCC-ATATC-AACATCCCCG-CA---A-CA--
gi|15 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcagCATTCCTTTTTG---TCAG--CTAC-GTGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCGGAGC-----ACCT--G--GC-CATTGC-AT---CCAA------CCTGGAGGCATTC----------------------A-----------------TAGGA-G-A---------CTG-G-----------TGCAGTATTAATAC-----------CCTAC-ACT----GTA-------------------------CA--------G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-C--TAC--T--A------G---TTTGT----AAC-----------TCA-C-------A---TCA--TTC------------------------TTGT--------T-----ATGCCCCAGAATGGG-------CCCTGTACATTATT-GAAAGAAccgtatctccacacaacagattatcttcaccattcctttttgtcagctacgtggctgtggaaccagctaccggagcacctggccattgcatccaacctggaggcattcataggagactggtgcagtattaataccctacactgtacagttttatttctttttaaacctgcactactagtttgtaactcacatcattcttgttatgccccagaatgggccctgtacattattgaaagaagaa
gi|16 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcaggccaagctgaccatgatgtataggatcacctatggccatatcaacatccccgcaacaccgtatctccacacaacagattatcttcac-GACATCCACG-CA---A-CA--CTA------TATCTC-CACAC-C-A--CCA----------CTGTAG--CGACCAGAA-----G-TCACTCAA-TCATA---TAC-A---TTGTA--CCA----TTTTGCAGAATA-AAC-T------TT-TTTCGCCATTCCTTCTTTCCCTCGG--CTAC-ACGGC--TGTGTAACC-AG-CTACCAGAGC-----ACCT--G--GC-CA---C-AGTGTCCA-----ACCTT-GAGGCATTC----------------------A-----------------AGGGAGG-A---------CTG---------------------------------------CCAT-ACT----GTA-------------------------CAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TA---CA---ATATTAGTTT------GTGCCTCAC-----A------------TCATT-C-TTGTACAGTCA--CACATGTATGATCTTGTACAGTCACACTTGTA---CCACA-----ACGCCTCAGAGT-GG------ACCCGTTACATTATT-GGAAGAAgaa
gi|17 : GGTA--CCA----TTCGGCAG-----GAT-A------TCCTACCTACACTCCTTCT---CTTCAG--GTGT-CAGGC--TCTGGAA-CCAGC-TTCCAGAACACCTAGCAT--T--AA-TA-----AG---CCAA--A-TCCTTGGAGGACTTC----------------------A-----------------AGGGAGG-ga
gi|17 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacag------GCACCTCAC----AAAAGAAGACATATTCA-C-T-TTGTA----CA--TAAAT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCAAAGAGTGAG-------CCATGTGCAtttagcgaatatacatgcatgaatacagaactgtttttaacatcttacctgtactgttttgcacctcacaaaagaagacatattcactttgtacataaatcacattgtacaacaatgccaaagagtgagccatgtgcatcactggacgttctaagaa
gi|18 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacagggtaccattcggcaggatatcctacctacactccttctcttcaggtgtcaggctctggaaccagcttccagaacacctagcattaataagccaaatccttggaggacttcaagggaggtttagcgaatatacatgcatgaatacagaactgtttttaacatcttacctgtactgttttATGCTAAGCTTGTCATGGTC-T--A----CAGGATCAGCCACAACC-TGATA-GACACCtcactggacgttctaagaa
gi|18 : acG-G---------CTG--------------------------------------TC--C-ACCA---GTA-G---TC----A-A--------TGTCAT---CCATG-T-T-TC-AAT----CC--G--TTTTTA-AA---T-TCTT--A--ATCT--G---TA-C-AT-T--GT-T------GCACCTAAC----AA------------CGG-C-T-TTGTA---T-A--TACA--------------CA-----AAGTGTG---TTA-------ATGCTTTGGAGTAGG------tgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacatggctgtccaccagtagtcaatgtcatccatgtttcaatccgtttttaaattcttaatctgtacattgttgcacctaacaacggctttgtatatacacaaagtgtgttaatgctttggagtaggccctgcactttactaggaagaagaa
gi|19 : acatgctaagcttgtcatggtctacaggatcagccacaacctgatagacacctgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacat--CCA----TTCTGCAG-----GAC-AGGTTCTCC-TGCCTACACTCTTTTGTACCTTCAG--ATGT-CAGGC--TCTGAAC-C-AGC-TTACAGAAC-----ACCT--A--GAGCA---TTAG---CCAG--A-ATTTTAGAAGATTTC----------------------AAGTGTGTATGGAAGTGGGGGGAGG-G---------TAGCG-----------A------------G-----------TCTAC-AT-----GTATGA--AT----ATA--------GAGC-T---G---T-T-T-TT-A------TC------TCT---AC---C-T--T-------TT-TG---T----------------------GCTTCAC----AT------------TCA-C-T-TTGTA----CA--TAAGT-------------CA-----AATTGTA---TGACACTACAATGCCTCAGAGTGGG------ccctgcactttactaggaagaagaa
gi|2 : cttccatacttccactgtcactaccatagtacatgcatacacaatgAGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAT----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGCCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACG-CTC-TCGG--ACGACCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTC----CAGTCC-A--CTACCAAGAAACCCAACAA--------CACTGAACAGCCTGG---CATTC----ATAA-G-A-GAAA-CC--T--G-TCT--AGCTG-TCCACAGGAAACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGACCC----TTGTTTGACCAACGCTCGAGTACGCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--ACccatgtctgtcactggaa
gi|2 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactATGCCAAGCTGACTATGATG-TATA------GGATCATCTATGGCC-ATATC-GACATCCCCG-CAC--A-CA---TC------T---AC----ACAC-A--GC-----------------------CAGAG-----G-TCACACAA-TCAAA---TAC-CATTTTGTT--CCA----TTTTGCATAACG-GACTA------TC-T-TCATCACTCCTTCTTCCCCTCAGCTACAC-T--GC--TGTGGAA-C-CTGCTACCAGAGC-----ACCT--G--AC-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGAGGCATTC----------------------A---------------------AGG-A---------CTT-G-----------TG-----------CAGTATTAATAACCCAC-ACT----GTA-------------------------------C---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-T--TACTAGTTT------GCACCTCAC-----A------------TCATT-C-TTGTA----CA--GTCA--------------CA-----AA-TGTA---CAACA-----ATGCCTCAGAGTGAG-------CTCTGTACATTACT-GGAAGGAacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcatgccaagctgactatgatgtataggatcatctatggccatatcgacatccccgcacacatctacacacagccagaggtcacacaatcaaataccattttgttccattttgcataacggactatcttcatcactccttcttcccctcagctacactgctgtggaacctgctaccagagcacctgaccacagcgtccaacctggaggcattcaaggacttgtgcagtattaataacccacactgtacgttttatttctttttaaacctgcattactagtttgcacctcacatcattcttgtacagtcacaaatgtacaacaatgcctcagagtgagctctgtacattactggaaggaaaa
gi|20 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactaggaagaggaaccctatcctcacaagctatcaaatccatgggcacaacctaatcatagccaagacaggacgatacctggggacaacgctctcggacgacctctcctggaagccacatgtccagtccactaccaagaaacccaacaacactgaacagcctggcattcataagagaaacctgtctagctgtccacaggaaaccaaggcccaagcatacaagacccttgtttgaccaacgctcgagtacgcctccacagtatgggatccatacacacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcGTA--CCC----TTCCGCTGAACG-GATTG------TC-T-TCGACACTC-TTCTTCCTCTAGG--CTAC-ACGGC--TGTGCAA-CCAGC-TACCAGAGC-------AT--CTGGC-CA---C-GG---C-GT--CTAACCTGGAGGCATTCGAGGGGTGGGATGGGGTGGGGGA-----------------GGGGAGGTG---------CTG-GGGCAGTAGTTATA-----------C-----------CCTAC-ACT----GCA-------------------------CAC---A---G-T-T-GT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TGCATTA-C-ATGT--T--T------GCGCCTCAT-----A------------TCATT-C-GTGTA---TAG--T-CA--------------CA-----AA-TGCA---CGACA-----ATGACTCA-AAT-GG------ACCCTGTACA-TAAaaa
gi|21 : cagaggtcacattGATGGTG-T--A----CAGAATCGTCCATGGGC-TACTA-GATATCCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCAGGCATCTTCCCT-CAA--C-AGC---------T-CAAC--AT-TATAG---TTC-C---TGGTC--CCA----GTCTGCAGAGTT-GAC-A-----------------CTCCTTCTTTCCCTCGA--GCAC-CAGAT--TGGGGAA-C-ACACTCCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---T-AG---CTGA--C-ACCATAGAGGCTTTC----------------------A-----------------AAGGAGA-G---------CTG-A-----------T------------T-----------AGTGC-ACC----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAA---T---G-TAT-TT-A------TC--G--TTTT---AAT--T-T--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAT--G--G------GTGCCTCAC----AA------------Tt
gi|22 : atAT-T-ACCAAATCCATGGTGACAAC-CT--AGCTGTAGCCAAGA--CAA--T---GA-T--ACTT-GAG---G-AC-A-ATGTTC-TCAG--A--AGACCTCCTGGAATCT---G-CATGTCG----AG-TCAA--CTACCAAGAGAGCCAACAG--------CAG-------TCTGG---CATTC----ATAAGG-A-GAAA--C--T--G-TTT--ATCTG-TCAATAGGAAACTA----AAGCCCAAGCA---GT-T--AAGATTC----TCGCTAGACCAACACATGACTACTCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--AC
gi|23 : caa-----G-CAATTCAC-TGATG---TTC-C---TGGTT--CTA----TTCTGCAGAGTT-GAC-A------TC-TACTGCCACTCCAT---TCCCTCAG--GCAC-CAAAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCTAGAGT-----GCAT--T--GC-CA---C-AG---CCGA--T-AACCTAG-GGCACTC----------------------A-----------------GTGAAAG-G---------CTC-A-----------T------------C-----------TTTGCGGTC----ATA-CA--GT----G-A--------GGGCAT---CG--G-T-T-TT-G------TC--A--TTT---------T-T--A--A--ATCC-TG---TA-C-ATAT--G--T------GCG-CTCAC----AA------------TCC-C-C-TTGTA---TTA--TAGAC-------------CA-----AATTGTA---AGACA-----AT------TAGCAGA------AATATGTGCATTATT-GAAAGAAacagtttgaatacagcaactagagacattccaatatagagc
gi|24 : A-CTAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----A--------------------ACCG--G-CC-AGCGAAGAG-------CAGCT-------TGA--------T-TCG-TGA
gi|24 : cctca--ACC---GGC-------CAGCGAA-------------------GAGC-AGCTTG-ATTCGTGA-----ATGGCGATT------------ACAA--A-AC-AACAATCAG---T-ATCAGCCAA----ATGA--------T-ACA-TGGC-------------------CTTTGCT-----TCA----AG--A--CA-T---GGCAT----GA-A-----CGCC-GTGT-CAACGCAAAGCTCGTGATGGTG-TATAATTTTA--ATCGTCTATGGGC-TCTTG-GACATTCCTT-CT---A-CG--ATC------T---TC-CG--T-G-G--GCA-------TCC---------------AG-----G-CATGTCGT-TGAAG---TTT-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-GAT-A------TA-TACatggcgattacaaaacaacaatcagtatcagccaaatgatacatggcctttgcttcaagacatggcatgaacgccgtgtcaacgcaaagctcgtgatggtgtataattttaatcgtctatgggctcttggacattccttctacgatcttccgtgggcatccaggcatgtcgttgaagtttctggtcccattctgcagagttgatatataca
gi|25 : cctcaactaacatcagccagattgaaAGGAAGAGAAACCCAATC-CTC-ACA---CAT-G-ACCAGATCCATGGGCACAAC-AT--AGCTTTAGCCAAAATAGGA--C---GA-T--GTCT-GGA---G-AC-A-ATGCTT-TCAG--AAGACCTCTCCTGAAA-GC---CGTATACCG----AG-TC-AATTAG-CAAGAGAGCCAACAACAGAAAAGTA----------TGG---CATTC----ATAA-G-A-GAGG-TCGTT--T-GAAGGAGTTG-TCCCCAGGa
gi|26 : gattggatcatgtccttcaaccatttgaagtgcggagtcctctgcattatgaactAGAATTTGGC-A------TC-TGCCAGCACTC----TTTCCCTTGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAG-C-AGCCTTCCAAAAC-----ACAT--T--GC-CA---C-AG---TTGA--T-ACTTTAGAGGCATTC----------------------A-----------------GGAGAGG-A---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTTC-ACT----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T------------------------------T-T--T--A--ATCC-CG---TA-A-ATAT--G---------GCACCTCAT----AA------------TCA-C-A--TGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AGCTGTA---CGATA-----ATGCCCCAGAATGAG------ATTTAATGTAATAAT-GGAAGAAtattaccaa
gi|27 : C-TATCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGA--GTAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCATGAGC-----GTAT--C--GC-CA---C-AG---CTGA--C-ACCGTAGGGGG--TC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------GTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ATC----GTG-GA--GC----A-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT--------------------------------T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAT--G--C------GCACCTTAC----AG------------TCA-C-C-TTGTA---GCA--TACAC-------------CA-----AAGTATA---CGACG-----ATGCCCCAGTGTGGA------ATTATGTGTAGTATT-GGAAGA
gi|28 : a--------------------ACAG--A-AC-AACTAGCAG---C-ACCTCCCAG----ATGG--------TGACA--GAC-------------------CTTGGTT-----GGC-----------CA-TCTCTCCAAAATAGA-A-G----G-C-A-GT-AGAT-C-AAGCTGACCATGATG-T--A----CAGGATCATCTATGGCC-ATATT-GACATCCCCT-CA---A-CA--C-CGA----T---TCTCA-AC-A-A--TGA-------T-TCT-CAA--C-ACC
gi|3 : caagggagactAAGAGGAGCCC-ATCGC----CAAGC-AG-T-ACACTTTACACGGACA-GACACTC-AATCTT-GCCCCAA-ATGG--TA--GT-T--ACCT-GGGTGTG-AC--CAT-CAA-TGAA--A--AACTGCTGTGAGATAG---T-CATGTTG---ATG-CC-A--TCACAAATAAGGTCAGTAA--------TAT-------CATTG---CCTTC----TTGACG-A-GAAA-TT--C--A-ACC--AGTTGACCCAC-TGAAGTAA----AGGCCCAA--A---CT-TACAAGACAC----TGGTTCGCCCAATCCTCGAGTATGCATCTCCAGTCTAGGACC---CCCA---C--ACC---A-C-------AA-CTAA-------------------CATC-AA-CAA-ATTG--GA-----A--------------------ACAtctactgtagcgaccagaggtcatgcaatcagacac
gi|3 : aacccgcATGCTAAGCTTGTAATGGTC-T--A----CAGGATCAGCCACGACC-TGATA-GACAGTCC----A---G-CA--GTCGTGTACT---TC-CA-CC-CCACTGCA--------CCAT-TTA--C-A--AGAG-----GACATTCCACATGA-----TAC-A---TGCAG--CCT----TTCTGCCGGACG-GAC-A------AG-TACAG------CTTTTTCCCATATG--GTAC-CTGCC--TGTGGAACC-AG-CTGCCGGATC-----GCAT--A--GC-CA---C-TG---CCCA--G-ACCAAAGAGGGCTTC----------------------A-----------------AGTCCGG-T---------CTG-G-----------TCG----------C-----------CCTCC-A------GTT-G---TC----G-A--------CACCATCCAC---GTT-T-TT-A------TC--GGTTTTT---AAATTC-T--T--A--ATC--TG---TA-C-ATTT--T--T------GCACGTCAA----AG------------CGG-C-T-TTGTA---T-A--TACAC-------------CA-----A---GTG---CGTTT-----ATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTAT-CAGGAA---GAAGAAgtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaacatgctaagcttgtaatggtctacaggatcagccacgacctgatagacagtccagcagtcgtgtacttccaccccactgcaccatttacaagaggacattccacatgatacatgcagcctttctgccggacggacaagtacagctttttcccatatggtacctgcctgtggaaccagctgccggatcgcatagccactgcccagaccaaagagggcttcaagtccggtctggtcgccctccagttgtcgacaccatccacgtttttatcggtttttaaattcttaatctgtacatttttgcacgtcaaagcggctttgtatatacaccaagtgcgtttatgcctcagagtgggccctgcactttatcaggaagaagaaga
gi|30 : aacccgcaagaggagcccatcgccaagcagtacactttacacggacagacactcaatcttgccccaaatggtagttacctgggtgtgaccatcaatgaaaaactgctgtgagatagtcatgttgatgccatcacaaataaggtcagtaatatcattgccttcttgacgagaaattcaaccagttgacccactgaagtaaaggcccaaacttacaagacactggttcgcccaatcctcgagtatgcatctccagtctaggacccccacaccacaactaacatcaacaaattggaaacagtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaac---C---G-T-TATT-A------TC--G--TTTTTTAAA---T-TCTT--A--ATCT--G---TA-C-ATTC--T--T------GCACCTCAC----AA------------CGG-C-T-TTGTA---T-G--TACAT-------------CA-----A---GTG---CATTT-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACTTTACCAGGAAGAAga
gi|31 : aatggcttcaagtctggcgtggctgcccacctgtagtcaacgccatccaGGTACAC--A---GT-TACCGTCCCC----TTGTCAGGCCCATTCATGAGTATACGAGCACAGCATGGGGCC---CGTA---C--ACG---G-C-------AA-TGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GC-----G--------------------GC----G-ACGAAC-AGCGA---G-ATTAGC--G----A---------------A-TGGC----------------------GACT-----GCA----AG--A--CA------ACAA----Ggaag
gi|32 : TCA-A-A-GAAA-TG--TTCG-ATA----TTG-TCCAGAAGAGATAA----GGGCACA---A---GCATATACCACCC----TTGTCAGGCTCATATTTGAATATGCAGCTGCATTGTGTGATA---CCTA---CCAACA---G-C-------AA---AA-------------------CATT-AACcaataccagttgacaacagttactatcgg
gi|33 : cttattGGCTTTC----------------------A-----------------GAGGAGA-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ACT----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TTTA------TC--A--TTTT---AA---T-T--TT-A--ATCT-TG---CA-C-ATAC--G--C------GCGCCGCAC----AA------------ATA-C-C-TTGTA---TCT--TACAC-------------CA-----AGTTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAATGGG------A-TTTGTGAAGTAAC-GGAAGAAatccaagataaaatgaggaacccagaattgagac
gi|35 : --C------ACACTTCAC----AT------------TCA-C---TTAGA-----A--TATGT-------------CA-----TAGTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGA------A
gi|37 : accagctcccagaagcaaagtgctttgagggcctcaatgggggtttggggagtctacatgcaggttttgaactatttgccttcacttgttc----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT--------TCTTG--TTTT---AC---T-T--TTAA--ATCT-TG---TA-C-ATAC--C--C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---TGGCA-----ATGCCCCAGAGTGGG------AATTTGTGCAGGAGA-AGAAGAAcgtat
gi|38 : ttatacaaatgtaGGGAAG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGT-CCC----GTA-GA--GC----A-A--------GGGCGT---T---G-T-T-T------------------------A---T-------A--ATCC-TG---TA-C-ATAT--G--C------GCCACTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------T------AATTGTAAGCTGATG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTAAGGTAAGTAAT-GGAAGAAgaaga
gi|39 : AAGAAGAA-AATCCCAT------ACAGGCCACAT-ACAACATTCACGGCCAAGAC-CT--GACTT
gi|4 : gaagacctggacagaattattaagtgggaaaaagacgggatgatgttattcaatcccagtaagtgcgagatgatctgcatcacaAAGAAGAGAACTCCCAT------ACAGGCCAC-TTACAACATTCTTGGCTAAAAC-CT--AACTTTCGTCAAGA-ACGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACATATCCTGGAATGC---C-CATATAG---CAG-CC-A--CAGCTAACAAAGCCAAAAA--------TTC-------CCTAGAATTCTTT----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTA-CCCACAATACATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTTTTGAGTATGCAAGCACAGTATGAGACC---CATA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAGTCAG---T-ACCATCCAG----TTGA--------T-ACA-TGAA-------------------CTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-CCGCGT-CAACGCGAAGCTGGCGATGGTG-TGTA----CAGCATCGTCCACTGGC-TCATA-GATATTCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCT-------TCCCG-CAA--C-ACAATAT-----G-AAACGCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCATTCCTTATTTCCCTCGG--GCTA-AAGAC--TGACGAA-C-AGCTTTTAAGAGC-----GCAT--C--GC-TA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GAAGAGA-G---------CTT-G-----------T------------C-----------CCTGC-ACC----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-A-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---TGT--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------CCA-C-C-TT-TA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGGA
gi|40 : -T-T-TT-G------T---G--TTTC---AT---T-G--T--ACAAACT-TG---CA-CTATTT--G--TTT----GTGCCTCAC----A-----------------T-C-TTGTA----CA--GTCAC--------------A-----AAT-GTA---TGACA-----ATGCTTCAGAGT-GG------ACCCTGCACATTATT-GGAAGAA
gi|43 : tatacaatgacctcta------------TTA-C-A-TTGTA----CA--TACAC-------------TA-------TTGTA---CAACA-----ATGTCCCAGGGT-GG------ACCTAGTACAAAATT-GGAAGAggagaa
gi|44 : ataatatacatatccaaactgttttcatttttacctgctcttgctttgtttcccacc---T-T--T--A--AACC-TGCATTA-C-TTGT--T--C------GCGCCTTAC----A-------------TCA-CTC-TTGTA----CAGTTGCAC---------------------AT-GCA---AAACA-----ATGTTCCTGAGTGGG------tgaaga
gi|45 : aaatacacatttcgagtaaacagttgcatttcttC-C-T--GCA-------TCCCT-CAA--T-ACTAGAG-----G-CAGTTCAC-TGGTT---TTC-C---TGGTT--CCA----TTCTGGAGCATT-TAC-A------TG-TACTAACACTCCTTCTTTCCCTCGG--GTAC-CTGAC--TTTGGAA-T-AGCccctgtatattatg
gi|46 : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCGTAGCCAAGACAGGA--T---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACC-CTC-TCAGACA--ATCTCTCCTGGAAtgacacccgagag
gi|47 : tccgcgcattaccACTCCT------CCTTGG--GCAC-CAGAC--TG--GAA-A-AGCCTTCAAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CATA--A-ACCATAAAAGTTTTC----------------------A-----------------GAGGAGA-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTG---CT----GCA-GAGTGC----A-A--------GGGCAT---C---
gi|49 : atcattttctg-T-T-TT-A------TC--G--TTTT----------T--T--A--ACTT-TT---TA-T-GTGT--G--CATTAATGTATCTCAC----AA-------------CG-C-CATTGTA----CA--TACA---------------------AAT---A---T--CG-----ATGCCTCAGAGTGGG------
gi|5 : attcatgt--AACCTTGTCCCA-A-ATGG--AA--GA-T--ACCT-GGGTGTG-GC--CAT-CAA-CAAA--A--AACTGCTATAGAACAG---C-CATGTTG---ATG-CC-A--TTAGAAAAGAGGCCAACAA--------CAG-------CCTCA---CCTTC----TTCACG-A-GGAA-CA--T--T-GCC--AGCTATCCCAT----CATTAGTGTAGGCCCAA--A---CC-TAGAAGACACTGGTTTGTCAA----ATCCTTGATTATGTGTCTATGTCCTGGGAGC---CCTG---C--ACC---A-CAATGTG-AA-CAAA-------------------CATCAAG--AA-ACT---GAT----G--------------------ACAtcagaaaaaaaagaaga
gi|5 : ctcATGCCAAGCTTGTCA-GG-G-TCTA----CAGGATCAGCAATGACC-TAATA-GACATACC----A---G-CA--GTCATGTATC---TC-CA-CC-CCACTGCA--------CCAT-TAA--C---CACAG-----G-ACATTCCT-TAACA---TAC-A---T--TCAGCCT----TTCTACTGGACG-GAC-A------TT-TACCTGCACACTTTTTTTCCATCTG--GCAT-CCT-C--TGTAGAA-CCAGC-TGCCATATC-----ACAT--A--GC-T-------G---CCTG--G-ATCATAGAGGGCTTC----------------------A-----------------GGTCCGG-A---------CTG-G-----------C------------C-----------CCAAA-ACA----TTA-G---TC----A-A--------CGCCATTCAC---GTT-T-TT-A------TCT-GT-TTTT---AA---T-T--T--T--AACT-GG---TG-C-ATgttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatcatgccaagcttgtcagggtctacaggatcagcaatgacctaatagacataccagcagtcatgtatctccaccccactgcaccattaaccacaggacattccttaacatacattcagcctttctactggacggacatttacctgcacactttttttccatctggcatcctctgtagaaccagctgccatatcacatagctgcctggatcatagagggcttcaggtccggactggccccaaaacattagtcaacgccattcacgtttttatctgtttttaattttaactggtgcattattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|50 : ctcaaccttgtcccaaatggaagatacctgggtgtggccatcaacaaaaaactgctatagaacagccatgttgatgccattagaaaagaggccaacaacagcctcaccttcttcacgaggaacattgccagctatcccatcattagtgtaggcccaaacctagaagacactggtttgtcaaatccttgattatgtgtctatgtcctgggagccctgcaccacaatgtgaacaaacatcaagaaactgatgacagttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatc-GT-ACAT-TTC-TCAA--A--ACCTATCTTGGAATGC---A-TATGTAC---CCG-CC-A--CAGCAAAGAAGACCAATAA--------TTC-------TCTAG-------T----CTCA-GAA-GAAA-CC--T--G-GCA--TGTTA-ACCACTGGtattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|51 : gaagtA--TACTC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGATTGGG------ATTTGATGCAATAAC-GGAAGAA
gi|53 : gttaactcttgtgttatattaacgcccacgcaatagaaacattacaact-AC-ATCAAGCAA---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAT-------------------CTTGGCT-----GGA----GG--A--CA-T---TGCAG----AA-A-----TG-TAACAT-CAACGTGAGGCTTGTGATGG
gi|55 : AAAG-ACGGGAC---GA-TTTACCT-GGG---G-AC-A--------------A--AC-TGTCCTGGAA-GC---TGTATGTCAGGTCAG-CT-A--CA---AAGAGAGCCAACAA--------CAG-------CCTGG---CATTC----ggcctatatttaa
gi|56 : CT-TG---TA-C-ATAC--A--C------GTGTCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TTCAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAGAGTTGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAGAatag
gi|58 : CATCCATTGCCAATAG-CTGAAAC---AACCAAAA-CTGT--CCA-AA-T--ATCT-TGA---G-TC-ACTT-CTTACCAGT-A--GCCTGTCTTGGAATGC---
gi|59 : c--G--TTTC---TG---T-T--T--A--AACC-TGCAGTA-C-CTGT--T--C------GCGCCTCGT----AT------------TT------TTGTA---CAA--T-CAC--------------A-----AAT-GTA---AGACA-----ATGCTCCAGAGTGGG------acgca
gi|6 : ATC-CCCTACAGGCCACAT-ACAATATTCATGGCCAAGAC-CT--AACTTTTGTCAAGA-A---------GA---------GGA---GCGC-ACAT-TTT-CAAA--A--ACCTCTCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG--C-A--CAGCTAAGAAGGCCAATAA--------TTT-------TCTAG---CCTTC----CACA-GAA-GAAA-CC--T--G-GAA--AGTTG-CCCACAGGATATCA----AGTCACAG--A---GT-TATCAGGCCC----TTGTTGGGCCCATTTTTGAGTATGCGATAACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACT---G-C-------CA-AGAA-------------------TATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC
gi|6 : aaCAA--G-AC-AACAAGTAG---T-AACAGCCAG----ATGA--------T-CAA-TGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ATG--CCA-T-G--T-CAATGCAAGGCTTGTGATGGTG-T--A----CAGAAACGTCCATGGAC-TCATA-GGTATCCCCT-CACTTATCA--TTC------T---TT-CG-AT-C-A---CA-------TCC-T-CAA--C-ACTAGGG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-T---TAGTC--CCA----TTTTGCATAATT-GAC-A------TC-TACCTGCATT------TTCCCTCAA--GCAC-CAGAA--TGTGGAA-C-AGCCTTCCTGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---TCGA--C-ACTCTAGAGGtgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttcaagacaacaagtagtaacagccagatgatcaatgactttggctggaagacattgcaagaatgccatgtcaatgcaaggcttgtgatggtgtacagaaacgtccatggactcataggtatcccctcacttatcattctttcgatcacatcctcaacactaggggcaactcactgaagttcttagtcccattttgcataattgacatctacctgcattttccctcaagcaccagaatgtggaacagccttcctgagcgcatcgccacagtcgacactctagagg
gi|60 : aaatcccctacaggccacatacaatattcatggccaagacctaacttttgtcaagaagaggagcgcacattttcaaaaacctctcctggaatgcccatgtagcagcacagctaagaaggccaataattttctagccttccacagaagaaacctggaaagttgcccacaggatatcaagtcacagagttatcaggcccttgttgggcccatttttgagtatgcgataacagcatgggacccgtacactgccaagaatatcagccagattgaggctgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttCCTATC-CTG-GTAA---AT-T-ACCAAACCCATGAGCACAAC-CT--TATTTTAGCCAAGACAGGA--C---AA-T--A
gi|63 : TAC--G--A------GTGCAATAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----A-----------GGG------ATTTTGTGCAGTAAC-AGAattatatgtgtacaatgct
gi|64 : tt----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CT-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAAAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAA
gi|66 : GTA---CGGCG-----ATGCCCCAGTGTGGG------ATTTCGTGCAGTAAT-TGAAG
gi|68 : tgtaggtcatatagagaCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCTCTAGAGTGAG------ATTTTATGCAGTAAtaga
gi|7 : AC-T-ACAATATCCATGACCAATAG-CTGAAACA--AGC--AAA-ACAG--TCCAAA-T--ACCT-TGG---G-GC-ACTT-CTCACCAAC-A--ACCTGTCCTGGAACGCATAC-AATGTCA---TGA-TC-A--CG---AAGAGGGCCAACAA--------TAC-------CACAG---TCTTC----CTCA-GCC-GCAA-CC--T--C-TCA--ACATG-CACGAGGGGAACTA----AAG---AG--GCCTGC-TACAAGACCT----TCGTAAGGCCCAAGGTTGAGTATGCCGCCACTGTTTGGGACC---CTCA---C--ACTCAAG-C-------C----TA-------------------TATC-AACAAA-GTA---GA-----A--------------------GCGG--T-GC-AACA--CAGAGCT-GCCAGCg
gi|70 : tcaagctcaacgcag-C-T-TTGTA---T-----ATGT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGG------Atttgtctctgggattacaactgaaaattcatcgtcaccgccacgcataacacactcggctgggagggtcttcaacaacagaagaaggaggccaaggctgtcataatctattagattaccaacaaccttgatatccctaatgtgccttacatacatccacagagagtttcaaccttaggtcactcgatgaggtacttggtaccatactgcaagatgtctgtattgaaagagtcattcttcccttccatcattgtattatgga
gi|71 : -TTGTA---TTA--TACAC-------------CA-----AAGTGTA---CGAGG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGTAAC-catatgcctcacaggaag
gi|72 : TGTA---CGACA-----ATGCTCCAGAGTGGGC-----A--CTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|73 : tata-----AATTATA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGCGCAGTAAC-AGAAGAAcaagaa
gi|74 : ATTGTA---TGACA-----ATGCCCCACAGTGAG------ATTTTATGATGTAAT-GAAAGAA
gi|75 : A-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAG
gi|77 : TGTA---CGACG-----ATACCCCAGAGTGAG------ATTTTGGGCAATAAC-GGAAGA
gi|79 : CTCTCCTGGAA-GC---CACATGTCA---AAT-CA-A--CTACCAAGAGAGCCA
gi|8 : GCACAT--A---GT-TATCAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTAAGTATGC---C-CAGCACGGGACC---CGTA---C--ACC---A-C-------AA-CGAACATAAGAAAGAACGACGAGCATC-CGCGAG-ATTCGTGAATAACG--------------------ACAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACTAGCCAG----AGGA--------T-ACA-GGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-G--T-CAACGCGA-GCTCG---TGGTGATGTA----CAGAATCGTCCATGGGC-GCATA-T-TATCCCCT-CA---A-CA--TTC------T---TC-CG-AC-T-A--GCG-------TCCCT-CAA--C-ACTAGAG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-C---TAGTC--CCA----CTCTGCAGATTT-GAC-A------TA-TACACGCACCCCTTCTTTCCCTCAG--ACAC-CAGAT--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAAT-----GCAC--C--GC-CA---C-AA-----AATTT-ACTTTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------------------------CT---------------------------------------CCTGC-GCC----GTA-GA--TCGTCGG-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-GAAAAACTC--AT-TTTT---AAT--T-T--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGTCTTAC----GG------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGCA---CAACG-----ATGCCACAGAATGAG------ATGTTGTGCAGTAAT-GGAAGA
gi|80 : -----ATGCCACAGAGTGGG-------CCCTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|81 : aGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGAAAC-GGAAGAgaagaa
gi|82 : tG-TGTA----CAGAATTGTCCATGGTC-TCATA-GATAT-CCTT-CA---A-C
gi|83 : g---CGATG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ACTTTGTGCAGTAAT-TGAA
gi|84 : gTGTA---CGACG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAA
gi|9 : CACAG--A---GT-TACCACACTC----TTGTCAGGCCCATTATTGAGTATACAAGCACAGCATGGGACT---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-TGAA-------------------CATC-AGTCAA-ATT---GC-----GGGATTCGTGAATGGGTGACTACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TACT-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-A--T-CAACGCAAAGCTCGTAATGGTG-T--A----CAAAAACGTCCATGGGC-TCATA-GATATCCCCT-AA---T-CA--TTC------T---AC-CA-AC-C-A--GCT-------TCCCC-CAA--C-AAATGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---T-C-C---GGGTC--CCA----TTCTGCAAAGTT-GAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTCCCCTCGG--GCAC-CAAAC--TGCGGAA-A-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GAAGAGG-G---------TTG-A-----------T------------C-----------TCTGC-ACA----ATA-GC--GC----G-A--------GGGCAT---C---GTT-T-TT-A------TT--G--CTTT---AA---TCT--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGTTGCAC----AA------------TGA-C-C-GTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGCCG-----ATGCTCTAGAGAAGG------ATTTTGTGCAGTAA
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GTCAGACTTTGGAACCAGCTTCCAGAATAACTAGCATTAGGCAGTCCTTAGAGGGCTACAAGGGGGGTTTGGTAAGACAATATCCATGAATCTAAGGCTGTTTTTAACCTTTTATATTCACATGGTTGGCACCTCATATTCCCTTTGTACATGAGTCACATTGTATGACAATGTCCAAGACGGGACCATTCACATCACTGCAA
Unaligned ( gi|34 ): CCTGGACAATGGAGCATCAGGTTTTGACACCCACCATTAGTCGACACCATTCATGTTTTATAGGCTTTAACTTATAATCTGTGCATTGATTGTTGCACATAACAACTACATTGTACATACACCCTCCGAGTGGACCCTGCATTTTATCAGGAAGA
Unaligned ( gi|36 ): TGCAGTATTAATACCCTACACAGTACAAAGTTTTATAAATTTTCTTTTTAAAACATGTAACTACTTGTTCATGCCTCATATCGTTCTTGTACAGTCACAAATGTACTACACGCCTCCAGAGTTGACCCTGTACATTACTGGAACAAG
Unaligned ( gi|41 ): ATATAACGTACCTGGTCTGTGACCCCAACACTACAACTAACAACAATTTGGAGGCAGTCCAAAGAAGGGCAGCACAGTTTGTAGATTTGTGTAGATTACAGAACTTTGAGCAGCACCAGCAACATGATGG
Unaligned ( gi|42 ): GGTGCAGTATTATCACCCCAAACTGTACAAATTTTGTCACTTTTTAACCTGCTATTACGTCATTCCTGTTCAGTAACAAATGTATGACAATGCTTCAGAGTAGACCTTGTACATCAAACGAAGAAAAA
Unaligned ( gi|48 ): AGACCTTGGTTGGCCATTTTTCTAACAAAGATGGTAGAGGACCAAGCTGACCATGATATATAGGATCATCTATGGCCATAATGACACCCAGGCAACACCCAGGTACATCG
Unaligned ( gi|52 ): TTTGGAACGTTTCGAGAACCACTAGCAATAGCAATAACCTTAAGGGCTTCAAGGGAGTGTGACGAGTCTACATGCAATATTATGCAAAATTTGTTTCACCTTA
Unaligned ( gi|54 ): TAACCTATACATTCTCATGCCTCACATGTGTACATATTCAACATAATATAATGATACTTCAGAGTTGGCCATGTACTATATTGGGAGAAGAAATA
Unaligned ( gi|57 ): ACAGCCTGGCATTCATAGGCTGTTGGGCAGCATGTTTCATCAAGGGAGAGTACGGCACAACTGGCAGCATCTCCCATATTGCCACAATCT
Unaligned ( gi|61 ): TGAATGGATAATGCCTTTTAACCCTTCGAAGTGTTTAACCACGAAGAGGACCGCTATCCTATCAAATTACCAAATCCA
Unaligned ( gi|62 ): ATAACCCGCAAGAGGAGCCCATCGCCAAGCAGTACCCTGTACATTGACAGACACCCGAATGGTAGATACCCGGATG
Unaligned ( gi|65 ): AGTCACATACATAAACCATTCTCCAGAGTGGGTCCTATGTATTACAGTACTTAGAAGAAGAGGAGA
Unaligned ( gi|67 ): ACGTGCAGTAAGTATTGTACGACAATGTTCCAGTACCTAGTACACAATTGGAAGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|69 ): ATATTACTCAAAGCGCGTCGAAGCCTTAGAGTGGCCCTGAACCTTACCAGGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|76 ): TTATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTACCAGGAAGAAGAAAGAA
Unaligned ( gi|78 ): TTTGTATTTCAAAGTGGACCCAGCACATTATCAGGAAAAAGAAGA
Unaligned ( gi|85 ): CAACAGCTGAAACAAGCAAAACAGTCCAAATACC
Alignments
lowQualScore : 111111 111 1 11 22222222222 1111111111111 11111 11111 111111 222222222222222222 111 111 222222222222222222222222222222222 3333333333333333333333333333333 111111 11111111 22222222222222222222 11111 4444444444444 1111 1 33333333333333333333333333333333333 1 2222222222222222222222222222222222222222 333333333333333333333333333333333333333 2222222222222222222222 333333333333333333333333333 22222222222222
lowQualScore : 1 4 000000 1 3 777 1 1 99 3 00 66 1 88888888888 5 33 6 1111111111111 5 22222 1 9 44444 444444 5 2 33 9999 222222222222222222 1 555 1 77777 999 3 3 44 4444 444 6 1 1 7777 3 333 555 8 6666 2 0 22 111 444 2 444 33 555 2 555555555555555555555555555555555 2 2 8888888888888888888888888888888 111111 2 5 88888 5555 44444444 66 22 66666666666666666666 7777777777777 33 33 00000 6666 3 4444444444444 3 6 1111 4 3 88888 0 2 1 2 2 2 33 555 2 666 00000000000000000000000000000000000 0 4 4444 00 0 55555 2 3 222 44444 1 2 444 1 333 4444 44 7 555555 1 1 333 1 0 22 1 0 0 22 0 5 44 0 44444 66666 1 333 1 333 888888 1 1 3 9999999999999999999999999999999999999999 1 777777777 666666666666666666666666666666666666666 0 1 99999 4444444444444444444444 9999999 5 3 1 444444444444444444444444444 3 44 33 22 2 1 777 1 1 00000000000000 2222 777777777777 5 1 1 8888 11 77777777777777 22222 111 22222 333333 0 33
lowQualScore : . . ...... . . ... . . .. . .. .. . ........... . .. . ............. . ..... . . ..... ...... . . .. .... .................. . ... . ..... ... . . .. .... ... . . . .... . ... ... . .... . . .. ... ... . ... .. ... . ................................. . . ............................... ...... . . ..... .... ........ .. .. .................... ............. .. .. ..... .... . ............. . . .... . . ..... . . . . . . .. ... . ... ................................... . . .... .. . ..... . . ... ..... . . ... . ... .... .. . ...... . . ... . . .. . . . .. . . .. . ..... ..... . ... . ... ...... . . . ........................................ . ......... ....................................... . . ..... ...................... ....... . . . ........................... . .. .. .. . . ... . . .............. .... ............ . . . .... .. .............. ..... ... ..... ...... . ..
lowQualScore : 7 1 111111 4 7 555 0 0 88 1 77 77 6 88888888888 7 99 2 1111111111111 7 00000 0 3 88888 000000 7 9 99 7777 999999999999999999 2 444 5 55555 777 1 1 22 3333 888 2 7 0 7777 0 444 000 6 1111 4 7 66 999 777 6 777 44 000 9 222222222222222222222222222222222 7 9 5555555555555555555555555555555 666666 7 2 33333 7777 33333333 11 99 33333333333333333333 4444444444444 99 99 11111 1111 1 5555555555555 1 1 2222 2 9 00000 2 3 0 1 1 0 33 888 1 333 22222222222222222222222222222222222 3 7 8888 99 4 99999 4 0 999 55555 5 4 111 5 222 2222 55 6 555555 8 3 444 1 2 44 7 7 9 44 4 2 77 9 55555 33333 8 222 8 222 555555 8 7 5 9999999999999999999999999999999999999999 8 666666666 777777777777777777777777777777777777777 5 9 22222 9999999999999999999999 5555555 0 3 7 444444444444444444444444444 1 22 77 11 1 5 888 5 5 11111111111111 8888 999999999999 2 3 2 8888 77 99999999999999 99999 777 33333 666666 2 44
consensus : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTCG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCA-------TCCCT-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ACC----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
Reference ( family-845 ) : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTCG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCA-------TCCCT-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ACC----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
gi|1 : AGGGAGAGGAGCCCTATC-CTC-GCAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGTCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GAG---G-ACGACG--CTC-TCGG--GCGATCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTGG----AGTCC-A--CTATCAAGAAAGTCAACAA--------CAG-------CCTGG---CGTTC----ATAA-G-G-AGAG-TC--T--GTGTA---TTTG-TCCACAAAAAACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGAACC----TCGTTTGACCAACGGTCGAGTGCGCCTCCACAGCATGGGATCCAACGTAGTTC--AAC---G-TGGGGCAGCA-CG---------------------CTTC--GCCA--AGG---GA-----G--------------------ACTACTGCAC-AACTAGTAG---G-ATCTCCCAG----ATGA--------T-AAC-GGAT-------------------CTTGGTT-----G-------G--T--CA-TTTCTCCAA----CATA-G--ACG---ACAG-C-ATGCCAAGCT---GATTATGATGTA----TAGGATCATCTATTGCC-ATATC-GATATCCCCG-CA---A-CACCGTA------T---CT-CG-ACAC-A--CCA-------CCACTGTAG--CGACCAGAGGTCACG-CAACCAGA-T-ACG---TT--------GTA--CCA----TTTTGCAGAATG-GACTA------TC-T-TCGTCACTCCTTCTTCCCCTTGG--CTAC-ACGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCACAGA-----ACCT--G--GT-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGCGGCATTC----------------------AAGTTG------------GGGGAGG-GGAGGGGGGACTG-G--------------------------------------TGC-A------GTATGA--AT----A-ACCCACACTGTACAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-C--TACTAGTTT------GCGCCTCACTCGGCA------------TCATT-C-TTGTACAGTCA--CACA------------------------TGTA---CGACA-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACATTA
gi|10 : aagatctggacaaacgccagcaatgggaacgtgactggatgatgtccttcaaccctttaaagtgcggcgaggtcctgcgcattaccCAACATTCACAGCCAATAC-CT--GACTTTCGTCAAGA-ATGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CCAA--A--ACCTAACCTGGAATGC---C-CATGAAG---CAG-TC-A--CAGCTAAGAAAGCCAATAA--------TTC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-G-A-AAAAACC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGACATCA--------------A---GG-TACA-GA--------TGTGAG-----------AG--------CACAGCATGGGACC---CTTA---C--ACT---G-C-------CA-CAAA-------------------CATC-AGCCAG-ACT---GA-----G--------------------GC-------C-ATCCAGCAA---TGAGCAGTGAG----AT----------T--CA-TGAA---------------------TGGC--------------G--A--C------TACAA----CC-A-GTACCAAC-CCGA-TAAC-TGATGTTCATAATGGTG-C--A----CAGAATCGTTCATGAGG-TCATA-GATATCCCCT-CA---G-TA--GTC------T---TC-AG-AC-C-A--GCT-------TCACT-CAA--C-ACTAGAA-----G-AAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-CAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAT-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCATCCAGAGC-----ACAT--C--AC-CA---C-AG---CCGA--C-ttattagaagaa
gi|11 : ttCAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCAAG----ATGA--------C-CCA-CGAC-------------------ATTGGTT-----GAA----AG--A--CA-C---TGCAA----GA------TCGTC-ACGT-CAAC-CAAAGCTTGTGAT--TG-TGTA----CAGAATTGTCCACGGGC-TGATAAGATA----CTACA---A-CA--ACC------T---------AC-C-A--GCA-------TCCCT-CAA--C-ACTAAAG-----G-TAATTCAC-AGGTG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTTTGCACAGTT-GAC-A------TC-AAACGGCACTCCTTTTTTTCCCTGG--ATAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----CCAT--C--AC-CA---C-AG---CTGA--C-A-----------TTC----------------------T-----------------GGGCAGG-G---------CTA-G------------------------------------------ACT----GTA-AA--GT----G-A--------GGGCAT---A---A-TGT-TT-A------T------TCCT---AA---C-----------------------C-ATAT--G--C------ACACCTCAC----AA------------TCA-C-C-ATATG---TCA--TACAC-------------C------AATTGTA---CAATG-----GTGGCTCAGTGTGGG------ATTATGTACAGTAAT-GGAAGAA
gi|12 : atgatgttgttcaacccaagcaaatgcgaggtgatccacaccacacagagaaatccaattGACC---CG-A---G--ACC---G-C-------CA-C-AC-------------------CA-C-AGCCAACAT---------------------------------CAA--G-A--AAC---CGG---T-ACT--CCAA----A-GAAAG-----T-AAG-TGCA-------------------ATTCGCTTATGGGGATTACAG--AACCACT---TGCAA-------A-G--CAG-C-ATCTGCAACATG----TC---ATGGTC-TATA------GAATCAGCCACGACC-TGATA-GACATCC----CA---G-CA--GTCATGTATC---TC-C--AC-C-A--------------CCC-CAATCC-ACCA--------T-CAAC---C-TGAGGACATTT-C---T------CCAGCCTTTCTGCAGGACA-GAC-A------TT-TACATGCA------------------------CAAACGTTTTGGAACC-AG-TTGCCAATTT-----GCAT--A--GC-CG---C-TG---CCCA--G-ATCATAGAGAACTTC----------------------A-----------------GGTTCAG-A---------CTG-G-----------C------------CA----------TC--C-ACCACTAGTC-GAC-GC----A-ATTCAT---GTGTGT---T---T-T-T-TTAA------TA--GGTTTTT---AACT-T-T--T--A--AGCTATG---CATC-AT-------T------GCATCTCAC----GA------------g
gi|13 : aatatgaaaacacttccAGCAG---C-ACCTCCCGG----ATGG--------TGACAAT--C-------------------CTAGGTT-----GTC----TGCCA--CA-T-------A----GA-A-G--------GCAG-CAG-GCCAAACTGACCATGATG-TATA------GGATCATCTTTGGTCATTATG-GACATCCCTA-CA---A-CA--CCC------T------------------------------CT-CAA----ACCAGAA-----G-TCACACAT-TTAAA---TACGC---TGTAC--CCA----T-CTGCTGAACG-GACTG------TC-TAT-GCCACTCCTACTTCCCCTCGG--TTACACAG-C--TGTGGAACC-AGCAAT-CAGAGT-----GCCTGGC--AC-CA---G-GG---TC----C-AACCTGGAAGCACTCAA--------------------A-----------------GGGGAcatcgtacagagtggtcttttactttagcaggaagaaaaa
gi|14 : catagct--A--ACCTATCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG-CC-A--CAGTTGAGAAGGCCAACAA--------TTC-------CTTAG---CCTTCAGACCTCA-G-AAGAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGCACATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTGAATATGTGAGCACAGCATGGGACA---CATA---C--ATG---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC-------C-GTCCAGCGA---TGAGCAGCGAGAATCATGAAGGGCGATT-ACA-AGACAACAAGCAGTATACATGACCTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-----CG-CTGCAT-CAACGCGAAGCTTGCGATG--G-TGTA----GAGAATCGTCTAGGAGC-TCATA-GATATCTCCT-AA---G-CC--TTT------T---TC-acagttgcagtattaatatcccacactgtacaaagtttcttttctttttaaatgtctcgcatcattctccccagagtgggccatgtacattattgaaagaagaa
gi|15 : aGCCAAGCTGACCATGATG-TATA------GGATCACCTATGGCC-ATATC-AACATCCCCG-CA---A-CA--
gi|15 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcagCATTCCTTTTTG---TCAG--CTAC-GTGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCGGAGC-----ACCT--G--GC-CATTGC-AT---CCAA------CCTGGAGGCATTC----------------------A-----------------TAGGA-G-A---------CTG-G-----------TGCAGTATTAATAC-----------CCTAC-ACT----GTA-------------------------CA--------G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-C--TAC--T--A------G---TTTGT----AAC-----------TCA-C-------A---TCA--TTC------------------------TTGT--------T-----ATGCCCCAGAATGGG-------CCCTGTACATTATT-GAAAGAAccgtatctccacacaacagattatcttcaccattcctttttgtcagctacgtggctgtggaaccagctaccggagcacctggccattgcatccaacctggaggcattcataggagactggtgcagtattaataccctacactgtacagttttatttctttttaaacctgcactactagtttgtaactcacatcattcttgttatgccccagaatgggccctgtacattattgaaagaagaa
gi|16 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcaggccaagctgaccatgatgtataggatcacctatggccatatcaacatccccgcaacaccgtatctccacacaacagattatcttcac-GACATCCACG-CA---A-CA--CTA------TATCTC-CACAC-C-A--CCA----------CTGTAG--CGACCAGAA-----G-TCACTCAA-TCATA---TAC-A---TTGTA--CCA----TTTTGCAGAATA-AAC-T------TT-TTTCGCCATTCCTTCTTTCCCTCGG--CTAC-ACGGC--TGTGTAACC-AG-CTACCAGAGC-----ACCT--G--GC-CA---C-AGTGTCCA-----ACCTT-GAGGCATTC----------------------A-----------------AGGGAGG-A---------CTG---------------------------------------CCAT-ACT----GTA-------------------------CAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TA---CA---ATATTAGTTT------GTGCCTCAC-----A------------TCATT-C-TTGTACAGTCA--CACATGTATGATCTTGTACAGTCACACTTGTA---CCACA-----ACGCCTCAGAGT-GG------ACCCGTTACATTATT-GGAAGAAgaa
gi|17 : GGTA--CCA----TTCGGCAG-----GAT-A------TCCTACCTACACTCCTTCT---CTTCAG--GTGT-CAGGC--TCTGGAA-CCAGC-TTCCAGAACACCTAGCAT--T--AA-TA-----AG---CCAA--A-TCCTTGGAGGACTTC----------------------A-----------------AGGGAGG-ga
gi|17 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacag------GCACCTCAC----AAAAGAAGACATATTCA-C-T-TTGTA----CA--TAAAT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCAAAGAGTGAG-------CCATGTGCAtttagcgaatatacatgcatgaatacagaactgtttttaacatcttacctgtactgttttgcacctcacaaaagaagacatattcactttgtacataaatcacattgtacaacaatgccaaagagtgagccatgtgcatcactggacgttctaagaa
gi|18 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacagggtaccattcggcaggatatcctacctacactccttctcttcaggtgtcaggctctggaaccagcttccagaacacctagcattaataagccaaatccttggaggacttcaagggaggtttagcgaatatacatgcatgaatacagaactgtttttaacatcttacctgtactgttttATGCTAAGCTTGTCATGGTC-T--A----CAGGATCAGCCACAACC-TGATA-GACACCtcactggacgttctaagaa
gi|18 : acG-G---------CTG--------------------------------------TC--C-ACCA---GTA-G---TC----A-A--------TGTCAT---CCATG-T-T-TC-AAT----CC--G--TTTTTA-AA---T-TCTT--A--ATCT--G---TA-C-AT-T--GT-T------GCACCTAAC----AA------------CGG-C-T-TTGTA---T-A--TACA--------------CA-----AAGTGTG---TTA-------ATGCTTTGGAGTAGG------tgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacatggctgtccaccagtagtcaatgtcatccatgtttcaatccgtttttaaattcttaatctgtacattgttgcacctaacaacggctttgtatatacacaaagtgtgttaatgctttggagtaggccctgcactttactaggaagaagaa
gi|19 : acatgctaagcttgtcatggtctacaggatcagccacaacctgatagacacctgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacat--CCA----TTCTGCAG-----GAC-AGGTTCTCC-TGCCTACACTCTTTTGTACCTTCAG--ATGT-CAGGC--TCTGAAC-C-AGC-TTACAGAAC-----ACCT--A--GAGCA---TTAG---CCAG--A-ATTTTAGAAGATTTC----------------------AAGTGTGTATGGAAGTGGGGGGAGG-G---------TAGCG-----------A------------G-----------TCTAC-AT-----GTATGA--AT----ATA--------GAGC-T---G---T-T-T-TT-A------TC------TCT---AC---C-T--T-------TT-TG---T----------------------GCTTCAC----AT------------TCA-C-T-TTGTA----CA--TAAGT-------------CA-----AATTGTA---TGACACTACAATGCCTCAGAGTGGG------ccctgcactttactaggaagaagaa
gi|2 : cttccatacttccactgtcactaccatagtacatgcatacacaatgAGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAT----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGCCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACG-CTC-TCGG--ACGACCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTC----CAGTCC-A--CTACCAAGAAACCCAACAA--------CACTGAACAGCCTGG---CATTC----ATAA-G-A-GAAA-CC--T--G-TCT--AGCTG-TCCACAGGAAACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGACCC----TTGTTTGACCAACGCTCGAGTACGCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--ACccatgtctgtcactggaa
gi|2 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactATGCCAAGCTGACTATGATG-TATA------GGATCATCTATGGCC-ATATC-GACATCCCCG-CAC--A-CA---TC------T---AC----ACAC-A--GC-----------------------CAGAG-----G-TCACACAA-TCAAA---TAC-CATTTTGTT--CCA----TTTTGCATAACG-GACTA------TC-T-TCATCACTCCTTCTTCCCCTCAGCTACAC-T--GC--TGTGGAA-C-CTGCTACCAGAGC-----ACCT--G--AC-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGAGGCATTC----------------------A---------------------AGG-A---------CTT-G-----------TG-----------CAGTATTAATAACCCAC-ACT----GTA-------------------------------C---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-T--TACTAGTTT------GCACCTCAC-----A------------TCATT-C-TTGTA----CA--GTCA--------------CA-----AA-TGTA---CAACA-----ATGCCTCAGAGTGAG-------CTCTGTACATTACT-GGAAGGAacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcatgccaagctgactatgatgtataggatcatctatggccatatcgacatccccgcacacatctacacacagccagaggtcacacaatcaaataccattttgttccattttgcataacggactatcttcatcactccttcttcccctcagctacactgctgtggaacctgctaccagagcacctgaccacagcgtccaacctggaggcattcaaggacttgtgcagtattaataacccacactgtacgttttatttctttttaaacctgcattactagtttgcacctcacatcattcttgtacagtcacaaatgtacaacaatgcctcagagtgagctctgtacattactggaaggaaaa
gi|20 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactaggaagaggaaccctatcctcacaagctatcaaatccatgggcacaacctaatcatagccaagacaggacgatacctggggacaacgctctcggacgacctctcctggaagccacatgtccagtccactaccaagaaacccaacaacactgaacagcctggcattcataagagaaacctgtctagctgtccacaggaaaccaaggcccaagcatacaagacccttgtttgaccaacgctcgagtacgcctccacagtatgggatccatacacacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcGTA--CCC----TTCCGCTGAACG-GATTG------TC-T-TCGACACTC-TTCTTCCTCTAGG--CTAC-ACGGC--TGTGCAA-CCAGC-TACCAGAGC-------AT--CTGGC-CA---C-GG---C-GT--CTAACCTGGAGGCATTCGAGGGGTGGGATGGGGTGGGGGA-----------------GGGGAGGTG---------CTG-GGGCAGTAGTTATA-----------C-----------CCTAC-ACT----GCA-------------------------CAC---A---G-T-T-GT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TGCATTA-C-ATGT--T--T------GCGCCTCAT-----A------------TCATT-C-GTGTA---TAG--T-CA--------------CA-----AA-TGCA---CGACA-----ATGACTCA-AAT-GG------ACCCTGTACA-TAAaaa
gi|21 : cagaggtcacattGATGGTG-T--A----CAGAATCGTCCATGGGC-TACTA-GATATCCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCAGGCATCTTCCCT-CAA--C-AGC---------T-CAAC--AT-TATAG---TTC-C---TGGTC--CCA----GTCTGCAGAGTT-GAC-A-----------------CTCCTTCTTTCCCTCGA--GCAC-CAGAT--TGGGGAA-C-ACACTCCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---T-AG---CTGA--C-ACCATAGAGGCTTTC----------------------A-----------------AAGGAGA-G---------CTG-A-----------T------------T-----------AGTGC-ACC----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAA---T---G-TAT-TT-A------TC--G--TTTT---AAT--T-T--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAT--G--G------GTGCCTCAC----AA------------Tt
gi|22 : atAT-T-ACCAAATCCATGGTGACAAC-CT--AGCTGTAGCCAAGA--CAA--T---GA-T--ACTT-GAG---G-AC-A-ATGTTC-TCAG--A--AGACCTCCTGGAATCT---G-CATGTCG----AG-TCAA--CTACCAAGAGAGCCAACAG--------CAG-------TCTGG---CATTC----ATAAGG-A-GAAA--C--T--G-TTT--ATCTG-TCAATAGGAAACTA----AAGCCCAAGCA---GT-T--AAGATTC----TCGCTAGACCAACACATGACTACTCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--AC
gi|23 : caa-----G-CAATTCAC-TGATG---TTC-C---TGGTT--CTA----TTCTGCAGAGTT-GAC-A------TC-TACTGCCACTCCAT---TCCCTCAG--GCAC-CAAAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCTAGAGT-----GCAT--T--GC-CA---C-AG---CCGA--T-AACCTAG-GGCACTC----------------------A-----------------GTGAAAG-G---------CTC-A-----------T------------C-----------TTTGCGGTC----ATA-CA--GT----G-A--------GGGCAT---CG--G-T-T-TT-G------TC--A--TTT---------T-T--A--A--ATCC-TG---TA-C-ATAT--G--T------GCG-CTCAC----AA------------TCC-C-C-TTGTA---TTA--TAGAC-------------CA-----AATTGTA---AGACA-----AT------TAGCAGA------AATATGTGCATTATT-GAAAGAAacagtttgaatacagcaactagagacattccaatatagagc
gi|24 : A-CTAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----A--------------------ACCG--G-CC-AGCGAAGAG-------CAGCT-------TGA--------T-TCG-TGA
gi|24 : cctca--ACC---GGC-------CAGCGAA-------------------GAGC-AGCTTG-ATTCGTGA-----ATGGCGATT------------ACAA--A-AC-AACAATCAG---T-ATCAGCCAA----ATGA--------T-ACA-TGGC-------------------CTTTGCT-----TCA----AG--A--CA-T---GGCAT----GA-A-----CGCC-GTGT-CAACGCAAAGCTCGTGATGGTG-TATAATTTTA--ATCGTCTATGGGC-TCTTG-GACATTCCTT-CT---A-CG--ATC------T---TC-CG--T-G-G--GCA-------TCC---------------AG-----G-CATGTCGT-TGAAG---TTT-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-GAT-A------TA-TACatggcgattacaaaacaacaatcagtatcagccaaatgatacatggcctttgcttcaagacatggcatgaacgccgtgtcaacgcaaagctcgtgatggtgtataattttaatcgtctatgggctcttggacattccttctacgatcttccgtgggcatccaggcatgtcgttgaagtttctggtcccattctgcagagttgatatataca
gi|25 : cctcaactaacatcagccagattgaaAGGAAGAGAAACCCAATC-CTC-ACA---CAT-G-ACCAGATCCATGGGCACAAC-AT--AGCTTTAGCCAAAATAGGA--C---GA-T--GTCT-GGA---G-AC-A-ATGCTT-TCAG--AAGACCTCTCCTGAAA-GC---CGTATACCG----AG-TC-AATTAG-CAAGAGAGCCAACAACAGAAAAGTA----------TGG---CATTC----ATAA-G-A-GAGG-TCGTT--T-GAAGGAGTTG-TCCCCAGGa
gi|26 : gattggatcatgtccttcaaccatttgaagtgcggagtcctctgcattatgaactAGAATTTGGC-A------TC-TGCCAGCACTC----TTTCCCTTGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAG-C-AGCCTTCCAAAAC-----ACAT--T--GC-CA---C-AG---TTGA--T-ACTTTAGAGGCATTC----------------------A-----------------GGAGAGG-A---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTTC-ACT----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T------------------------------T-T--T--A--ATCC-CG---TA-A-ATAT--G---------GCACCTCAT----AA------------TCA-C-A--TGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AGCTGTA---CGATA-----ATGCCCCAGAATGAG------ATTTAATGTAATAAT-GGAAGAAtattaccaa
gi|27 : C-TATCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGA--GTAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCATGAGC-----GTAT--C--GC-CA---C-AG---CTGA--C-ACCGTAGGGGG--TC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------GTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ATC----GTG-GA--GC----A-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT--------------------------------T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAT--G--C------GCACCTTAC----AG------------TCA-C-C-TTGTA---GCA--TACAC-------------CA-----AAGTATA---CGACG-----ATGCCCCAGTGTGGA------ATTATGTGTAGTATT-GGAAGA
gi|28 : a--------------------ACAG--A-AC-AACTAGCAG---C-ACCTCCCAG----ATGG--------TGACA--GAC-------------------CTTGGTT-----GGC-----------CA-TCTCTCCAAAATAGA-A-G----G-C-A-GT-AGAT-C-AAGCTGACCATGATG-T--A----CAGGATCATCTATGGCC-ATATT-GACATCCCCT-CA---A-CA--C-CGA----T---TCTCA-AC-A-A--TGA-------T-TCT-CAA--C-ACC
gi|3 : caagggagactAAGAGGAGCCC-ATCGC----CAAGC-AG-T-ACACTTTACACGGACA-GACACTC-AATCTT-GCCCCAA-ATGG--TA--GT-T--ACCT-GGGTGTG-AC--CAT-CAA-TGAA--A--AACTGCTGTGAGATAG---T-CATGTTG---ATG-CC-A--TCACAAATAAGGTCAGTAA--------TAT-------CATTG---CCTTC----TTGACG-A-GAAA-TT--C--A-ACC--AGTTGACCCAC-TGAAGTAA----AGGCCCAA--A---CT-TACAAGACAC----TGGTTCGCCCAATCCTCGAGTATGCATCTCCAGTCTAGGACC---CCCA---C--ACC---A-C-------AA-CTAA-------------------CATC-AA-CAA-ATTG--GA-----A--------------------ACAtctactgtagcgaccagaggtcatgcaatcagacac
gi|3 : aacccgcATGCTAAGCTTGTAATGGTC-T--A----CAGGATCAGCCACGACC-TGATA-GACAGTCC----A---G-CA--GTCGTGTACT---TC-CA-CC-CCACTGCA--------CCAT-TTA--C-A--AGAG-----GACATTCCACATGA-----TAC-A---TGCAG--CCT----TTCTGCCGGACG-GAC-A------AG-TACAG------CTTTTTCCCATATG--GTAC-CTGCC--TGTGGAACC-AG-CTGCCGGATC-----GCAT--A--GC-CA---C-TG---CCCA--G-ACCAAAGAGGGCTTC----------------------A-----------------AGTCCGG-T---------CTG-G-----------TCG----------C-----------CCTCC-A------GTT-G---TC----G-A--------CACCATCCAC---GTT-T-TT-A------TC--GGTTTTT---AAATTC-T--T--A--ATC--TG---TA-C-ATTT--T--T------GCACGTCAA----AG------------CGG-C-T-TTGTA---T-A--TACAC-------------CA-----A---GTG---CGTTT-----ATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTAT-CAGGAA---GAAGAAgtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaacatgctaagcttgtaatggtctacaggatcagccacgacctgatagacagtccagcagtcgtgtacttccaccccactgcaccatttacaagaggacattccacatgatacatgcagcctttctgccggacggacaagtacagctttttcccatatggtacctgcctgtggaaccagctgccggatcgcatagccactgcccagaccaaagagggcttcaagtccggtctggtcgccctccagttgtcgacaccatccacgtttttatcggtttttaaattcttaatctgtacatttttgcacgtcaaagcggctttgtatatacaccaagtgcgtttatgcctcagagtgggccctgcactttatcaggaagaagaaga
gi|30 : aacccgcaagaggagcccatcgccaagcagtacactttacacggacagacactcaatcttgccccaaatggtagttacctgggtgtgaccatcaatgaaaaactgctgtgagatagtcatgttgatgccatcacaaataaggtcagtaatatcattgccttcttgacgagaaattcaaccagttgacccactgaagtaaaggcccaaacttacaagacactggttcgcccaatcctcgagtatgcatctccagtctaggacccccacaccacaactaacatcaacaaattggaaacagtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaac---C---G-T-TATT-A------TC--G--TTTTTTAAA---T-TCTT--A--ATCT--G---TA-C-ATTC--T--T------GCACCTCAC----AA------------CGG-C-T-TTGTA---T-G--TACAT-------------CA-----A---GTG---CATTT-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACTTTACCAGGAAGAAga
gi|31 : aatggcttcaagtctggcgtggctgcccacctgtagtcaacgccatccaGGTACAC--A---GT-TACCGTCCCC----TTGTCAGGCCCATTCATGAGTATACGAGCACAGCATGGGGCC---CGTA---C--ACG---G-C-------AA-TGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GC-----G--------------------GC----G-ACGAAC-AGCGA---G-ATTAGC--G----A---------------A-TGGC----------------------GACT-----GCA----AG--A--CA------ACAA----Ggaag
gi|32 : TCA-A-A-GAAA-TG--TTCG-ATA----TTG-TCCAGAAGAGATAA----GGGCACA---A---GCATATACCACCC----TTGTCAGGCTCATATTTGAATATGCAGCTGCATTGTGTGATA---CCTA---CCAACA---G-C-------AA---AA-------------------CATT-AACcaataccagttgacaacagttactatcgg
gi|33 : cttattGGCTTTC----------------------A-----------------GAGGAGA-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ACT----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TTTA------TC--A--TTTT---AA---T-T--TT-A--ATCT-TG---CA-C-ATAC--G--C------GCGCCGCAC----AA------------ATA-C-C-TTGTA---TCT--TACAC-------------CA-----AGTTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAATGGG------A-TTTGTGAAGTAAC-GGAAGAAatccaagataaaatgaggaacccagaattgagac
gi|35 : --C------ACACTTCAC----AT------------TCA-C---TTAGA-----A--TATGT-------------CA-----TAGTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGA------A
gi|37 : accagctcccagaagcaaagtgctttgagggcctcaatgggggtttggggagtctacatgcaggttttgaactatttgccttcacttgttc----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT--------TCTTG--TTTT---AC---T-T--TTAA--ATCT-TG---TA-C-ATAC--C--C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---TGGCA-----ATGCCCCAGAGTGGG------AATTTGTGCAGGAGA-AGAAGAAcgtat
gi|38 : ttatacaaatgtaGGGAAG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGT-CCC----GTA-GA--GC----A-A--------GGGCGT---T---G-T-T-T------------------------A---T-------A--ATCC-TG---TA-C-ATAT--G--C------GCCACTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------T------AATTGTAAGCTGATG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTAAGGTAAGTAAT-GGAAGAAgaaga
gi|39 : AAGAAGAA-AATCCCAT------ACAGGCCACAT-ACAACATTCACGGCCAAGAC-CT--GACTT
gi|4 : gaagacctggacagaattattaagtgggaaaaagacgggatgatgttattcaatcccagtaagtgcgagatgatctgcatcacaAAGAAGAGAACTCCCAT------ACAGGCCAC-TTACAACATTCTTGGCTAAAAC-CT--AACTTTCGTCAAGA-ACGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACATATCCTGGAATGC---C-CATATAG---CAG-CC-A--CAGCTAACAAAGCCAAAAA--------TTC-------CCTAGAATTCTTT----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTA-CCCACAATACATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTTTTGAGTATGCAAGCACAGTATGAGACC---CATA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAGTCAG---T-ACCATCCAG----TTGA--------T-ACA-TGAA-------------------CTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-CCGCGT-CAACGCGAAGCTGGCGATGGTG-TGTA----CAGCATCGTCCACTGGC-TCATA-GATATTCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCT-------TCCCG-CAA--C-ACAATAT-----G-AAACGCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCATTCCTTATTTCCCTCGG--GCTA-AAGAC--TGACGAA-C-AGCTTTTAAGAGC-----GCAT--C--GC-TA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GAAGAGA-G---------CTT-G-----------T------------C-----------CCTGC-ACC----ATA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-A-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---TGT--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------CCA-C-C-TT-TA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGGA
gi|40 : -T-T-TT-G------T---G--TTTC---AT---T-G--T--ACAAACT-TG---CA-CTATTT--G--TTT----GTGCCTCAC----A-----------------T-C-TTGTA----CA--GTCAC--------------A-----AAT-GTA---TGACA-----ATGCTTCAGAGT-GG------ACCCTGCACATTATT-GGAAGAA
gi|43 : tatacaatgacctcta------------TTA-C-A-TTGTA----CA--TACAC-------------TA-------TTGTA---CAACA-----ATGTCCCAGGGT-GG------ACCTAGTACAAAATT-GGAAGAggagaa
gi|44 : ataatatacatatccaaactgttttcatttttacctgctcttgctttgtttcccacc---T-T--T--A--AACC-TGCATTA-C-TTGT--T--C------GCGCCTTAC----A-------------TCA-CTC-TTGTA----CAGTTGCAC---------------------AT-GCA---AAACA-----ATGTTCCTGAGTGGG------tgaaga
gi|45 : aaatacacatttcgagtaaacagttgcatttcttC-C-T--GCA-------TCCCT-CAA--T-ACTAGAG-----G-CAGTTCAC-TGGTT---TTC-C---TGGTT--CCA----TTCTGGAGCATT-TAC-A------TG-TACTAACACTCCTTCTTTCCCTCGG--GTAC-CTGAC--TTTGGAA-T-AGCccctgtatattatg
gi|46 : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCGTAGCCAAGACAGGA--T---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACC-CTC-TCAGACA--ATCTCTCCTGGAAtgacacccgagag
gi|47 : tccgcgcattaccACTCCT------CCTTGG--GCAC-CAGAC--TG--GAA-A-AGCCTTCAAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CATA--A-ACCATAAAAGTTTTC----------------------A-----------------GAGGAGA-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTG---CT----GCA-GAGTGC----A-A--------GGGCAT---C---
gi|49 : atcattttctg-T-T-TT-A------TC--G--TTTT----------T--T--A--ACTT-TT---TA-T-GTGT--G--CATTAATGTATCTCAC----AA-------------CG-C-CATTGTA----CA--TACA---------------------AAT---A---T--CG-----ATGCCTCAGAGTGGG------
gi|5 : attcatgt--AACCTTGTCCCA-A-ATGG--AA--GA-T--ACCT-GGGTGTG-GC--CAT-CAA-CAAA--A--AACTGCTATAGAACAG---C-CATGTTG---ATG-CC-A--TTAGAAAAGAGGCCAACAA--------CAG-------CCTCA---CCTTC----TTCACG-A-GGAA-CA--T--T-GCC--AGCTATCCCAT----CATTAGTGTAGGCCCAA--A---CC-TAGAAGACACTGGTTTGTCAA----ATCCTTGATTATGTGTCTATGTCCTGGGAGC---CCTG---C--ACC---A-CAATGTG-AA-CAAA-------------------CATCAAG--AA-ACT---GAT----G--------------------ACAtcagaaaaaaaagaaga
gi|5 : ctcATGCCAAGCTTGTCA-GG-G-TCTA----CAGGATCAGCAATGACC-TAATA-GACATACC----A---G-CA--GTCATGTATC---TC-CA-CC-CCACTGCA--------CCAT-TAA--C---CACAG-----G-ACATTCCT-TAACA---TAC-A---T--TCAGCCT----TTCTACTGGACG-GAC-A------TT-TACCTGCACACTTTTTTTCCATCTG--GCAT-CCT-C--TGTAGAA-CCAGC-TGCCATATC-----ACAT--A--GC-T-------G---CCTG--G-ATCATAGAGGGCTTC----------------------A-----------------GGTCCGG-A---------CTG-G-----------C------------C-----------CCAAA-ACA----TTA-G---TC----A-A--------CGCCATTCAC---GTT-T-TT-A------TCT-GT-TTTT---AA---T-T--T--T--AACT-GG---TG-C-ATgttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatcatgccaagcttgtcagggtctacaggatcagcaatgacctaatagacataccagcagtcatgtatctccaccccactgcaccattaaccacaggacattccttaacatacattcagcctttctactggacggacatttacctgcacactttttttccatctggcatcctctgtagaaccagctgccatatcacatagctgcctggatcatagagggcttcaggtccggactggccccaaaacattagtcaacgccattcacgtttttatctgtttttaattttaactggtgcattattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|50 : ctcaaccttgtcccaaatggaagatacctgggtgtggccatcaacaaaaaactgctatagaacagccatgttgatgccattagaaaagaggccaacaacagcctcaccttcttcacgaggaacattgccagctatcccatcattagtgtaggcccaaacctagaagacactggtttgtcaaatccttgattatgtgtctatgtcctgggagccctgcaccacaatgtgaacaaacatcaagaaactgatgacagttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatc-GT-ACAT-TTC-TCAA--A--ACCTATCTTGGAATGC---A-TATGTAC---CCG-CC-A--CAGCAAAGAAGACCAATAA--------TTC-------TCTAG-------T----CTCA-GAA-GAAA-CC--T--G-GCA--TGTTA-ACCACTGGtattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|51 : gaagtA--TACTC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGATTGGG------ATTTGATGCAATAAC-GGAAGAA
gi|53 : gttaactcttgtgttatattaacgcccacgcaatagaaacattacaact-AC-ATCAAGCAA---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAT-------------------CTTGGCT-----GGA----GG--A--CA-T---TGCAG----AA-A-----TG-TAACAT-CAACGTGAGGCTTGTGATGG
gi|55 : AAAG-ACGGGAC---GA-TTTACCT-GGG---G-AC-A--------------A--AC-TGTCCTGGAA-GC---TGTATGTCAGGTCAG-CT-A--CA---AAGAGAGCCAACAA--------CAG-------CCTGG---CATTC----ggcctatatttaa
gi|56 : CT-TG---TA-C-ATAC--A--C------GTGTCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TTCAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAGAGTTGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAGAatag
gi|58 : CATCCATTGCCAATAG-CTGAAAC---AACCAAAA-CTGT--CCA-AA-T--ATCT-TGA---G-TC-ACTT-CTTACCAGT-A--GCCTGTCTTGGAATGC---
gi|59 : c--G--TTTC---TG---T-T--T--A--AACC-TGCAGTA-C-CTGT--T--C------GCGCCTCGT----AT------------TT------TTGTA---CAA--T-CAC--------------A-----AAT-GTA---AGACA-----ATGCTCCAGAGTGGG------acgca
gi|6 : ATC-CCCTACAGGCCACAT-ACAATATTCATGGCCAAGAC-CT--AACTTTTGTCAAGA-A---------GA---------GGA---GCGC-ACAT-TTT-CAAA--A--ACCTCTCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG--C-A--CAGCTAAGAAGGCCAATAA--------TTT-------TCTAG---CCTTC----CACA-GAA-GAAA-CC--T--G-GAA--AGTTG-CCCACAGGATATCA----AGTCACAG--A---GT-TATCAGGCCC----TTGTTGGGCCCATTTTTGAGTATGCGATAACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACT---G-C-------CA-AGAA-------------------TATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC
gi|6 : aaCAA--G-AC-AACAAGTAG---T-AACAGCCAG----ATGA--------T-CAA-TGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ATG--CCA-T-G--T-CAATGCAAGGCTTGTGATGGTG-T--A----CAGAAACGTCCATGGAC-TCATA-GGTATCCCCT-CACTTATCA--TTC------T---TT-CG-AT-C-A---CA-------TCC-T-CAA--C-ACTAGGG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-T---TAGTC--CCA----TTTTGCATAATT-GAC-A------TC-TACCTGCATT------TTCCCTCAA--GCAC-CAGAA--TGTGGAA-C-AGCCTTCCTGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---TCGA--C-ACTCTAGAGGtgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttcaagacaacaagtagtaacagccagatgatcaatgactttggctggaagacattgcaagaatgccatgtcaatgcaaggcttgtgatggtgtacagaaacgtccatggactcataggtatcccctcacttatcattctttcgatcacatcctcaacactaggggcaactcactgaagttcttagtcccattttgcataattgacatctacctgcattttccctcaagcaccagaatgtggaacagccttcctgagcgcatcgccacagtcgacactctagagg
gi|60 : aaatcccctacaggccacatacaatattcatggccaagacctaacttttgtcaagaagaggagcgcacattttcaaaaacctctcctggaatgcccatgtagcagcacagctaagaaggccaataattttctagccttccacagaagaaacctggaaagttgcccacaggatatcaagtcacagagttatcaggcccttgttgggcccatttttgagtatgcgataacagcatgggacccgtacactgccaagaatatcagccagattgaggctgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttCCTATC-CTG-GTAA---AT-T-ACCAAACCCATGAGCACAAC-CT--TATTTTAGCCAAGACAGGA--C---AA-T--A
gi|63 : TAC--G--A------GTGCAATAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----A-----------GGG------ATTTTGTGCAGTAAC-AGAattatatgtgtacaatgct
gi|64 : tt----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CT-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAAAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAA
gi|66 : GTA---CGGCG-----ATGCCCCAGTGTGGG------ATTTCGTGCAGTAAT-TGAAG
gi|68 : tgtaggtcatatagagaCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCTCTAGAGTGAG------ATTTTATGCAGTAAtaga
gi|7 : AC-T-ACAATATCCATGACCAATAG-CTGAAACA--AGC--AAA-ACAG--TCCAAA-T--ACCT-TGG---G-GC-ACTT-CTCACCAAC-A--ACCTGTCCTGGAACGCATAC-AATGTCA---TGA-TC-A--CG---AAGAGGGCCAACAA--------TAC-------CACAG---TCTTC----CTCA-GCC-GCAA-CC--T--C-TCA--ACATG-CACGAGGGGAACTA----AAG---AG--GCCTGC-TACAAGACCT----TCGTAAGGCCCAAGGTTGAGTATGCCGCCACTGTTTGGGACC---CTCA---C--ACTCAAG-C-------C----TA-------------------TATC-AACAAA-GTA---GA-----A--------------------GCGG--T-GC-AACA--CAGAGCT-GCCAGCg
gi|70 : tcaagctcaacgcag-C-T-TTGTA---T-----ATGT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGG------Atttgtctctgggattacaactgaaaattcatcgtcaccgccacgcataacacactcggctgggagggtcttcaacaacagaagaaggaggccaaggctgtcataatctattagattaccaacaaccttgatatccctaatgtgccttacatacatccacagagagtttcaaccttaggtcactcgatgaggtacttggtaccatactgcaagatgtctgtattgaaagagtcattcttcccttccatcattgtattatgga
gi|71 : -TTGTA---TTA--TACAC-------------CA-----AAGTGTA---CGAGG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGTAAC-catatgcctcacaggaag
gi|72 : TGTA---CGACA-----ATGCTCCAGAGTGGGC-----A--CTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|73 : tata-----AATTATA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGCGCAGTAAC-AGAAGAAcaagaa
gi|74 : ATTGTA---TGACA-----ATGCCCCACAGTGAG------ATTTTATGATGTAAT-GAAAGAA
gi|75 : A-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAG
gi|77 : TGTA---CGACG-----ATACCCCAGAGTGAG------ATTTTGGGCAATAAC-GGAAGA
gi|79 : CTCTCCTGGAA-GC---CACATGTCA---AAT-CA-A--CTACCAAGAGAGCCA
gi|8 : GCACAT--A---GT-TATCAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTAAGTATGC---C-CAGCACGGGACC---CGTA---C--ACC---A-C-------AA-CGAACATAAGAAAGAACGACGAGCATC-CGCGAG-ATTCGTGAATAACG--------------------ACAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACTAGCCAG----AGGA--------T-ACA-GGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-G--T-CAACGCGA-GCTCG---TGGTGATGTA----CAGAATCGTCCATGGGC-GCATA-T-TATCCCCT-CA---A-CA--TTC------T---TC-CG-AC-T-A--GCG-------TCCCT-CAA--C-ACTAGAG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-C---TAGTC--CCA----CTCTGCAGATTT-GAC-A------TA-TACACGCACCCCTTCTTTCCCTCAG--ACAC-CAGAT--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAAT-----GCAC--C--GC-CA---C-AA-----AATTT-ACTTTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------------------------CT---------------------------------------CCTGC-GCC----GTA-GA--TCGTCGG-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-GAAAAACTC--AT-TTTT---AAT--T-T--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGTCTTAC----GG------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGCA---CAACG-----ATGCCACAGAATGAG------ATGTTGTGCAGTAAT-GGAAGA
gi|80 : -----ATGCCACAGAGTGGG-------CCCTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|81 : aGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGAAAC-GGAAGAgaagaa
gi|82 : tG-TGTA----CAGAATTGTCCATGGTC-TCATA-GATAT-CCTT-CA---A-C
gi|83 : g---CGATG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ACTTTGTGCAGTAAT-TGAA
gi|84 : gTGTA---CGACG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAA
gi|9 : CACAG--A---GT-TACCACACTC----TTGTCAGGCCCATTATTGAGTATACAAGCACAGCATGGGACT---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-TGAA-------------------CATC-AGTCAA-ATT---GC-----GGGATTCGTGAATGGGTGACTACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TACT-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-A--T-CAACGCAAAGCTCGTAATGGTG-T--A----CAAAAACGTCCATGGGC-TCATA-GATATCCCCT-AA---T-CA--TTC------T---AC-CA-AC-C-A--GCT-------TCCCC-CAA--C-AAATGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---T-C-C---GGGTC--CCA----TTCTGCAAAGTT-GAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTCCCCTCGG--GCAC-CAAAC--TGCGGAA-A-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GAAGAGG-G---------TTG-A-----------T------------C-----------TCTGC-ACA----ATA-GC--GC----G-A--------GGGCAT---C---GTT-T-TT-A------TT--G--CTTT---AA---TCT--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGTTGCAC----AA------------TGA-C-C-GTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGCCG-----ATGCTCTAGAGAAGG------ATTTTGTGCAGTAA
blockSeqs : G T CCCCT A T AT C C AT A GA TT C ACAGTCCA G TT T TGTGACCAT A ACG A T ATAC CAGGTC T A AT AGCT CACTGAACAG A AAT C AGACC GG A A GT TCG GGA A A C GTGT A AGC CCT A TGGT G TC GAG . T . CA CAA G AACGAACATAAGAAAGAACGACGAG A C GCGGGATTCGTGAATGGGTGACT ATG G C AGCT AATC AGGGCGAT GA AT AACAAGCAGTATACATGACC TATGGGGATTACA CC AC TCTC AATA . GTACCAACCCG G G CATA A G ATTTT T G A C A TA CTT T G GTGTACTTCCACCCCACTGCA G TCC . A T ACA GGACA T G ATT G CAG GCCT TT T GGTTCT C A TGG C CT A GT C C CC ACCTA GGC G TTG T TGT AATTT T A C GAGGGGTGGGATGGGGTGGGGGA T . GTGCAGTATTAATACC G CACTA GACGCAATTCAT CCAT T G A GAAAAACTCATTTTTAAT G CT TA CA G A CAT T T GTGCATTAAT . AAGAAGACATAT T T A CAGT GT TGTATGATCTTGTA GTCAC AGC CTACA CCCTGC CA
blockSeqs : A A CCTC A C TT A G CA . GA CA A ACGGGAC G . T TGTGGCCAT A AAG A T CA AGC . . . AGTT CAGAAAAGTA A . C C CG . . . G A T A C . C G . A . A GC CTC . G . . . . AATGTGAACAAA . . CGTGAATGGCGATT AAG . A TG . AAG GA T A GAAA . . CT . . CGCCGCCGCG . A TGTG . A C C G . G . T C . A ATGTATCTCCACCCCACTGCA . CG . . T GC AG T . . G C . T T . . A CGG T . . . C C CC . CTG . . . . GTCT A C A AAGTGTGTATGGAAGTGG . . GTGCAGTATTAATAAC . CA GATCGTCGGA CCAC T A . AATAGGTTTTTAACT C CT T . A . CAT . . ATTAGTTT . C T . . T . C . . . C T
blockSeqs : G C CCTC G C AT G T CA . C TG A CTGTCCA . . . GTGCACAT . ACA C T CG AGC . . . TACC TTC G . A A CG . . . G A . A A . C A . . . A AC CTC . A . . . . CAGCGAA . . CGTGAATAACG CGG . C TG . . C C A GTCT . . C . . TCGTCACG . G GACC . A C C C . G . A . . G TTCCGACCAGCAGGCATCTT . C . . A AC TG T . . G C . T T . . A ATG C . . . C C CA . C . . . . GAC C C A AAA . . GGGCAGTAGTTATACC . T TGAATATA TCAC T . . ATCGGTTTTTAAATT . . . . A . CAG . . ACTAGTTT . . T . . T . T . . . . T
blockSeqs : A C CCTC G C T T G CA . . TT A CAGGAC . . . GTGCACAT . TA C T TG TGA . . . TACC TTC G . A A GA . . . G A . A A . C C . . . C CC ATC . A . . . . CACAAA . . GGAA AAA . G T . . A T C GGAA . . T . . GCAGCATC . C TGCG . G G T T . T . T . . C TATCTCCACACCACCA . C . . T AT AA A . . T C . A . . . A CGC T . . . C . GC . C . . . . GAC C T A T . . GTCGCC . T GAGTGCAA CG . . . AATCCGTTTTTAAA . . . . T . . . . TTGTTT . . . . . T . T . . . . T
blockSeqs : G T CCTG A T G C A AG . . CT C TAGGAC . . . GCGCACAT . CA C T CA AGC . . . CACA CAG G . A A GA . . . G A . A A . A G . . . G TC GAG . A . . . . CACGAA . . GATG AGA . A T . . A A C TCAA . . T . . CGCTGCA . G GACC . A C G G . C . G . . T GATTCTCAACAATGAT . C . . A AA TA A . . G A . G . . . T CTA C . . . C . AC . A . . . . CAG T T C A . . GCCAT . T AAGTGA A . . . ATCGTTTTTTAAA . . . . A . . . . ATGC . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . T CGC G C T C C AA . . TT A ATGGTA . . . GACAACG . A G C C TGA . . . AGCT TAT T . C T GC . . . T A . A G . A A . . . G AT AGC . C . . . . AACTAA . . GAG AAG . T C . . T T C GCAA . . T . . CGCCGTG . C TGTC . A C T C . T . G . . C ATGTATCTCCACCA . C . . T AA AA A . . T A . A . . . A CTA C . . . . . CC . G . . . . AAA A T T A . . CGAGT . T GAGCGA T . . . ATCTGTTTTTAA . . . . A . . . . ACTA . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . . A . T C C CA . . TT G CAGGAT . . . GACAATG . A A T C ACC . . . TAGA TTC A . C C G . . . A A . A C . A G . . . G TT AAG . G . . . . AATGAA . . GAG AAG . A T . . A T C GGAA . . T . . TGTAACA . T GACT . A C C C . G . G . . T TTCAGACCAGCTT . C . . T AT AG T . . G T . G . . . G CAT T . . . . . CC . G . . . . AGA A C A A . . ATTA . T CAGTGA A . . . ATCGTTTTAAT . . . . T . . . . TGTT . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . . . T T G AT . . CG A ATGGAA . . . GACAATG . A C T G AGC . . . AGCA CAG C . C T G . . . G A . T C . C G . . . G CC GTC . C . . . . CACGAA . . GAA GGT . A C . . A T C GGAG . . T . . TGCCATG . C CGTG . G C T C . T . T . . A TTCCGACCAGCTT . C . . C AC TG T . . G A . G . . . A CGA C . . . . . CC . T . . . . TCC C C A A . . ATCT . C GAGCGA G . . . TATCATTTTAA . . . . T . . . . GTTT . . . . . G . C . . . . C
blockSeqs : . A C AG . . CT T CAGGAC . . . GACAACC . A G T T CAT . . . AGCT TTC A . A C G . . . T T . A T . A T . . . G TT GAT . A . . . . CAAGAA . . GCG ATG . A G . . A T T GGAA . . T . . CGCCGCG . A GACC . C C T G . A . T . . C TTCCGACTAGCGT . T . . G GT AG T . . G C . T . . . A TGC C . . . . . CT . A . . . . GAC A A T A . . GTCT . C GAGCAA C . . . TCTTGTTTTAC . . . . T . . . . ATGG . . . . . T . T . . . . A
blockSeqs : . T C CA . . TT A ATGGC . . . GTCACTT . A A C C CAA . . . TACC CAG G . C C G . . . G A . G A . A G . . . G GG CGC . C . . . . CATGAA . . GAG AAG . A T . . C T T GGAA . . T . . CGCCGCA . T TGTA . G C T G . C . T . . G TACCAACCAGCTT . C . . T GC AG A . . G T . T . . . G CAG C . . . . . CC . G . . . . GAT C C A A . . GTCT . T GAGCGA A . . . ATCGTTTTAA . . . . T . . . . ATGT . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . G AT . . TT A ACGGC . . . GGCACTT . A G . C CC . . . AGC TTT A . C C A . . . G A . . A . . . . G TC AAG . G . . . . CACAC . . GAG G . A T . . A T T GGAA . . T . . GGCAG . G GGCG . G C T C . T . T . . T TTCCGTGGGCAT . C . . T AC TT T . . G C . T . . . A CGG C . . . . . CC . C . . . . GAT C T A A . . GTCT . C GAGCAA T . . . ATTGCTTTAA . . . . T . . . . ATGC . . . . . T . T . . . . C
blockSeqs : . C G . . A . CAAT . . . GACA . A G . A CG . . . A TAC A . . G . . . C . . . . . . . . . TA . . T . . . . AAAA . . GAA . . A T . . A G . GGC . . . . . GGCA . C TGTC . . C C C . G . T . . G TTTCGATCACAT . C . . T CT CA T . . G G . G . . . A CGG T . . . . . CC . T . . . . GAC C G C A . . GTCT . T GAGCGA C . . . GTGTTTCAT . . . . T . . . . TTTT . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . . A . . . A C . C CG . . . G . . . . . . . . . G . . . . CTA . . . . . . T . . . T . . . . . . G TGTG . . C C G . C . T . . T TACACACAGC . C . . T AC AG A . . A C . T . . . A TAA A . . . . . CC . T . . . . CAG C A T A . . GTCC . C GCGCGA C . . . ATTCCTAA . . . . T . . . . TCTT . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : A G . . G . . . . . T . . . . A TGTG . . C T C . A . T . . T TACCAGCAT . . . . T AC AG T . . A T . T . . . A CTG C . . . . . T . C . . . . GAC C G T A . . GTCT . C GTCAA C . . . ATCTCTAC . . . . T . . . . ACGC . . . . . T . C . . . . C
blockSeqs : C . . G CGTA . . . T A . C . T . . T T . . . . . GC AG T . . G C . G . . . A CTG T . . . . . C . A . . . . TAA T A T A . . GCCC . T GTCGA C . . . ATCGTTTT . . . . T . . . . ACCC . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : A CG . . . T G . C . . . . . . . . . . C . . . . . C . T . . . A ACG C . . . . . C . C . . . . TGG C A C A . . ATCT . A GTCAA C . . . ATTTCTT . . . . T . . . . ATGC . . . . . C . C . . . . C
blockSeqs : . C . . . T T . C . . . . . C . T . . . A TGG C . . . . . C . C . . . . GAC C C T A . . G . C . T . . . ATTTCTT . . . . A . . . . ACGC . . . . . T . C . . . . C
blockSeqs : . . . T G . C . . . . . . T . . . A GC . . . . . . C . A . . . . GAC C T T A . . T . A . C . . . ATTTCTT . . . . A . . . . GTTC . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . AG . . . . . . C . C . . . . AA . G . A . . C . . . C . . . ATTTCTT . . . . C . . . . ACAC . . . . . T . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . C . . . . C . . . A . . . . . . C . . . GTCATTT . . . . A . . . . GTTC . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . . . A . C . . . A . . . . A . . . . ACGA . . . . . T . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . ACGC . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . ACGC . . . . . T . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . ATG . . . . . . . T . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : T** A**** C**** NGC*** G** G*** A** G** *** *** CACGAA*************************** AAG*** GGAA********* T**** CGCG N** TTCCGACCAGCNT********************** C*** ***** CC A*************************************** ********* GTCC*********************************** C**** GAGCGA**************** ACGC********** **** T*** C*************
originalCons : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTCG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TC-CG-AC-C-A--GCA-------TCCCT-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GGGGAGG-G---------CTG-G-----------T------------C-----------TCTGC-ACC----GTA-GA--GC----G-A--------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCT-TG---TA-C-ATAC--G--C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
finalCons : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCACT--ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAGA----ACCTNTCCTGGAATGCC----CATGTNGC---AG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCAG--A-GAAA-CC--TG---GCAA--GTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-CCACGAA---------------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAAG---AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCTGGAA---------G--A--CAT----TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CAN--TCTTCCGACCAGCNT----------------------CCCT-CAAC---ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTCA---------------------------------------GGGGAGG-G---------CTGGTCC-----------------------------------CTGC-ACC----GTAGAGCGA----------------GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCT-TG---TA-C-ATACGC----------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTAT---CA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GTCAGACTTTGGAACCAGCTTCCAGAATAACTAGCATTAGGCAGTCCTTAGAGGGCTACAAGGGGGGTTTGGTAAGACAATATCCATGAATCTAAGGCTGTTTTTAACCTTTTATATTCACATGGTTGGCACCTCATATTCCCTTTGTACATGAGTCACATTGTATGACAATGTCCAAGACGGGACCATTCACATCACTGCAA
Unaligned ( gi|34 ): CCTGGACAATGGAGCATCAGGTTTTGACACCCACCATTAGTCGACACCATTCATGTTTTATAGGCTTTAACTTATAATCTGTGCATTGATTGTTGCACATAACAACTACATTGTACATACACCCTCCGAGTGGACCCTGCATTTTATCAGGAAGA
Unaligned ( gi|36 ): TGCAGTATTAATACCCTACACAGTACAAAGTTTTATAAATTTTCTTTTTAAAACATGTAACTACTTGTTCATGCCTCATATCGTTCTTGTACAGTCACAAATGTACTACACGCCTCCAGAGTTGACCCTGTACATTACTGGAACAAG
Unaligned ( gi|41 ): ATATAACGTACCTGGTCTGTGACCCCAACACTACAACTAACAACAATTTGGAGGCAGTCCAAAGAAGGGCAGCACAGTTTGTAGATTTGTGTAGATTACAGAACTTTGAGCAGCACCAGCAACATGATGG
Unaligned ( gi|42 ): GGTGCAGTATTATCACCCCAAACTGTACAAATTTTGTCACTTTTTAACCTGCTATTACGTCATTCCTGTTCAGTAACAAATGTATGACAATGCTTCAGAGTAGACCTTGTACATCAAACGAAGAAAAA
Unaligned ( gi|48 ): AGACCTTGGTTGGCCATTTTTCTAACAAAGATGGTAGAGGACCAAGCTGACCATGATATATAGGATCATCTATGGCCATAATGACACCCAGGCAACACCCAGGTACATCG
Unaligned ( gi|52 ): TTTGGAACGTTTCGAGAACCACTAGCAATAGCAATAACCTTAAGGGCTTCAAGGGAGTGTGACGAGTCTACATGCAATATTATGCAAAATTTGTTTCACCTTA
Unaligned ( gi|54 ): TAACCTATACATTCTCATGCCTCACATGTGTACATATTCAACATAATATAATGATACTTCAGAGTTGGCCATGTACTATATTGGGAGAAGAAATA
Unaligned ( gi|57 ): ACAGCCTGGCATTCATAGGCTGTTGGGCAGCATGTTTCATCAAGGGAGAGTACGGCACAACTGGCAGCATCTCCCATATTGCCACAATCT
Unaligned ( gi|61 ): TGAATGGATAATGCCTTTTAACCCTTCGAAGTGTTTAACCACGAAGAGGACCGCTATCCTATCAAATTACCAAATCCA
Unaligned ( gi|62 ): ATAACCCGCAAGAGGAGCCCATCGCCAAGCAGTACCCTGTACATTGACAGACACCCGAATGGTAGATACCCGGATG
Unaligned ( gi|65 ): AGTCACATACATAAACCATTCTCCAGAGTGGGTCCTATGTATTACAGTACTTAGAAGAAGAGGAGA
Unaligned ( gi|67 ): ACGTGCAGTAAGTATTGTACGACAATGTTCCAGTACCTAGTACACAATTGGAAGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|69 ): ATATTACTCAAAGCGCGTCGAAGCCTTAGAGTGGCCCTGAACCTTACCAGGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|76 ): TTATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTACCAGGAAGAAGAAAGAA
Unaligned ( gi|78 ): TTTGTATTTCAAAGTGGACCCAGCACATTATCAGGAAAAAGAAGA
Unaligned ( gi|85 ): CAACAGCTGAAACAAGCAAAACAGTCCAAATACC
Alignments
lowQualScore : 111111 111 1 11 22222222222 1111111111111 11111 11111 1111 222222222222222222 111 111 222222222222222222222222222222222 3333333333333333333333333333333 111111 11111111 22222222222222222222 11111 4444444444444 1111 1 22222222222222222222222222222222222222 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222222
lowQualScore : 1 4 000000 1 3 777 1 1 99 3 00 66 1 88888888888 5 33 6 1111111111111 5 22222 1 9 44444 1 2222 5 2 33 9999 222222222222222222 1 555 1 77777 9 666 3 44 4444 444 6 1 1 7777 3 333 555 8 6666 2 0 22 111 444 2 444 33 555 2 555555555555555555555555555555555 2 2 8888888888888888888888888888888 111111 2 5 88888 5555 44444444 66 22 66666666666666666666 7777777777777 33 33 00000 6666 3 4444444444444 3 6 1111 4 3 88888 0 2 1 2 2 2 33 555 2 666 66666666666666666666666666666666666666 4444 00 0 55555 2 3 222 44444 1 2 444 1 333 4444 44 7 555555 1 1 333 1 0 22 1 0 0 22 0 5 44 0 44444 66666 1 333 1 333 888888 1 1 5 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4444 33 22 2 1 777 1 22 222222222222222 2222 777777777777 5 1 1 8888 11 77777777777777 22222 111 22222 333333 0 33
lowQualScore : . . ...... . . ... . . .. . .. .. . ........... . .. . ............. . ..... . . ..... . .... . . .. .... .................. . ... . ..... . ... . .. .... ... . . . .... . ... ... . .... . . .. ... ... . ... .. ... . ................................. . . ............................... ...... . . ..... .... ........ .. .. .................... ............. .. .. ..... .... . ............. . . .... . . ..... . . . . . . .. ... . ... ...................................... .... .. . ..... . . ... ..... . . ... . ... .... .. . ...... . . ... . . .. . . . .. . . .. . ..... ..... . ... . ... ...... . . . ......................................................................................................................................................................................... .... .. .. . . ... . .. ............... .... ............ . . . .... .. .............. ..... ... ..... ...... . ..
lowQualScore : 7 1 111111 4 7 555 0 0 88 1 77 77 6 88888888888 7 99 2 1111111111111 7 00000 0 3 88888 0 2222 7 9 99 7777 999999999999999999 2 444 5 55555 2 333 1 22 3333 888 2 7 0 7777 0 444 000 6 1111 4 7 66 999 777 6 777 44 000 9 222222222222222222222222222222222 7 9 5555555555555555555555555555555 666666 7 2 33333 7777 33333333 11 99 33333333333333333333 4444444444444 99 99 11111 1111 1 5555555555555 1 1 2222 2 9 00000 2 3 0 1 1 0 33 888 1 333 88888888888888888888888888888888888888 8888 99 4 99999 4 0 999 55555 5 4 111 5 222 2222 55 6 555555 8 3 444 1 2 44 7 7 9 44 4 2 77 9 55555 33333 8 222 8 222 555555 8 7 2 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333 55 00 6 4 555 4 66 666666666666666 8888 999999999999 2 3 2 8888 77 99999999999999 99999 777 33333 666666 2 44
consensus : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTCG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TCCG-AC-CAGCN-------TC-CC-T-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GG---GGAG-G-G---------CTGG-----------T------------C-----------CCTGC-ACC----GTA-GA--GC----G-A-----GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCC-TG---TA-C-ATAC--G---C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
Reference ( family-845 ) : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCCAC-T-ACAACATCCATGGNCACGAC-CT--AACCTTAGCCAAGA-ACGG--C---GA-T--ACCT-GGG---G-GC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACCTNTCCTGGAATGC---C-CATGTNG---CAG-CC-A--CNGCCAAGAAGGCCAACAA--------TAC-------CCTGG---CCTTC----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGANATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATNCTTGAGTATGCGNCCACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAC-------------------CTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-G--CCG-C-GCGT-CAACGCGAAGCTCGCGATGGTG-TGTA----CAGGATCGTCCACGGNC-TCATA-GACATCCCCT-CA---A-CA--NTC------T---TCCG-AC-CAGCN-------TC-CC-T-CAA--C-ACCAGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCNTAGAGGCNTTC----------------------A-----------------GG---GGAG-G-G---------CTGG-----------T------------C-----------CCTGC-ACC----GTA-GA--GC----G-A-----GGGCAT---C---G-T-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---T-T--T--A--ANCT-TG---TA-C-ATAC--G---C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGAA
gi|1 : AGGGAGAGGAGCCCTATC-CTC-GCAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGTCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GAG---G-ACGACG--CTC-TCGG--GCGATCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTGG----AGTCC-A--CTATCAAGAAAGTCAACAA--------CAG-------CCTGG---CGTTC----ATAA-G-G-AGAG-TC--T--GTGTA---TTTG-TCCACAAAAAACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGAACC----TCGTTTGACCAACGGTCGAGTGCGCCTCCACAGCATGGGATCCAACGTAGTTC--AAC---G-TGGGGCAGCA-CG---------------------CTTC--GCCA--AGG---GA-----G--------------------ACTACTGCAC-AACTAGTAG---G-ATCTCCCAG----ATGA--------T-AAC-GGAT-------------------CTTGGTT-----G-------G--T--CA-TTTCTCCAA----CATA-G--ACG---ACAG-C-ATGCCAAGCT---GATTATGATGTA----TAGGATCATCTATTGCC-ATATC-GATATCCCCG-CA---A-CACCGTA------T---CTCG-ACACACCA-------CC-AC-TGTAG--CGACCAGAGGTCACG-CAACCAGA-T-ACG---TT--------GTA--CCA----TTTTGCAGAATG-GACTA------TC-T-TCGTCACTCCTTCTTCCCCTTGG--CTAC-ACGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCACAGA-----ACCT--G--GT-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGCGGCATTC----------------------AAGTTG------------GG---GGAG-G-GGAGGGGGGACTGG-----------TG-----------CAGTATGAATAACCCAC-ACT----GTA----------------------CAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-C--TACTAGTT-T------GCGCCTCACTCGGCA------------TCATT-C-TTGTACAGTCA--CACA------------------------TGTA---CGACA-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACATTA
gi|10 : aagatctggacaaacgccagcaatgggaacgtgactggatgatgtccttcaaccctttaaagtgcggcgaggtcctgcgcattaccCAACATTCACAGCCAATAC-CT--GACTTTCGTCAAGA-ATGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CCAA--A--ACCTAACCTGGAATGC---C-CATGAAG---CAG-TC-A--CAGCTAAGAAAGCCAATAA--------TTC-------CCTAG---CCTTC----CTCA-G-A-AAAAACC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGGACATCA--------------A---GG-TACA-GA--------TGTGAG-----------AG--------CACAGCATGGGACC---CTTA---C--ACT---G-C-------CA-CAAA-------------------CATC-AGCCAG-ACT---GA-----G--------------------GC-------C-ATCCAGCAA---TGAGCAGTGAG----AT----------T--CA-TGAA---------------------TGGC--------------G--A--C------TACAA----CC-A-GTACCAAC-CCGA-TAAC-TGATGTTCATAATGGTG-C--A----CAGAATCGTTCATGAGG-TCATA-GATATCCCCT-CA---G-TA--GTC------T---TCAG-AC-CAGCT-------TC-AC-T-CAA--C-ACTAGAA-----G-AAACTCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-CAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTTCCCTCGG--GCAT-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCATCCAGAGC-----ACAT--C--AC-CA---C-AG---CCGA--C-ttattagaagaa
gi|11 : ttCAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCAAG----ATGA--------C-CCA-CGAC-------------------ATTGGTT-----GAA----AG--A--CA-C---TGCAA----GA------TCGTC-ACGT-CAAC-CAAAGCTTGTGAT--TG-TGTA----CAGAATTGTCCACGGGC-TGATAAGATA----CTACA---A-CA--ACC------T--------AC-CAGCA-------TC-CC-T-CAA--C-ACTAAAG-----G-TAATTCAC-AGGTG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTTTGCACAGTT-GAC-A------TC-AAACGGCACTCCTTTTTTTCCCTGG--ATAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAGC-----CCAT--C--AC-CA---C-AG---CTGA--C-A-----------TTC----------------------T-----------------GG---GCAG-G-G---------CTAG------------------------------------------ACT----GTA-AA--GT----G-A-----GGGCAT---A---A-TGT-TT-A------T------TCCT---AA---C-----------------------C-ATAT--G---C------ACACCTCAC----AA------------TCA-C-C-ATATG---TCA--TACAC-------------C------AATTGTA---CAATG-----GTGGCTCAGTGTGGG------ATTATGTACAGTAAT-GGAAGAA
gi|12 : atgatgttgttcaacccaagcaaatgcgaggtgatccacaccacacagagaaatccaattGACC---CG-A---G--ACC---G-C-------CA-C-AC-------------------CA-C-AGCCAACAT---------------------------------CAA--G-A--AAC---CGG---T-ACT--CCAA----A-GAAAG-----T-AAG-TGCA-------------------ATTCGCTTATGGGGATTACAG--AACCACT---TGCAA-------A-G--CAG-C-ATCTGCAACATG----TC---ATGGTC-TATA------GAATCAGCCACGACC-TGATA-GACATCC----CA---G-CA--GTCATGTATC---TCC--AC-CA-------------CC-C-CAATCC-ACCA--------T-CAAC---C-TGAGGACATTT-C---T------CCAGCCTTTCTGCAGGACA-GAC-A------TT-TACATGCA------------------------CAAACGTTTTGGAACC-AG-TTGCCAATTT-----GCAT--A--GC-CG---C-TG---CCCA--G-ATCATAGAGAACTTC----------------------A-----------------GG---TTCA-G-A---------CTGG------------------------C-----------CATCC-ACCACTAGTC-GAC-GC----A-ATTCATGTGTGT---T---T-T-T-TTAA------TA--GGTTTTT---AACT-T-T--T--A--AGCTATG---CATC-AT--------T------GCATCTCAC----GA------------g
gi|13 : aatatgaaaacacttccAGCAG---C-ACCTCCCGG----ATGG--------TGACAAT--C-------------------CTAGGTT-----GTC----TGCCA--CA-T-------A----GA-A-G--------GCAG-CAG-GCCAAACTGACCATGATG-TATA------GGATCATCTTTGGTCATTATG-GACATCCCTA-CA---A-CA--CCC------T---------------------------C-T-CAA----ACCAGAA-----G-TCACACAT-TTAAA---TACGC---TGTAC--CCA----T-CTGCTGAACG-GACTG------TC-TAT-GCCACTCCTACTTCCCCTCGG--TTACACAG-C--TGTGGAACC-AGCAAT-CAGAGT-----GCCTGGC--AC-CA---G-GG---TC----C-AACCTGGAAGCACTCAA--------------------A-----------------GG---GGAcatcgtacagagtggtcttttactttagcaggaagaaaaa
gi|14 : catagct--A--ACCTATCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG-CC-A--CAGTTGAGAAGGCCAACAA--------TTC-------CTTAG---CCTTCAGACCTCA-G-AAGAAA-CC--T--G-GCA--AGTTG-CCCACAGCACATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTGAATATGTGAGCACAGCATGGGACA---CATA---C--ATG---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC-------C-GTCCAGCGA---TGAGCAGCGAGAATCATGAAGGGCGATT-ACA-AGACAACAAGCAGTATACATGACCTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-A-----CG-CTGCAT-CAACGCGAAGCTTGCGATG--G-TGTA----GAGAATCGTCTAGGAGC-TCATA-GATATCTCCT-AA---G-CC--TTT------T---TCacagttgcagtattaatatcccacactgtacaaagtttcttttctttttaaatgtctcgcatcattctccccagagtgggccatgtacattattgaaagaagaa
gi|15 : aGCCAAGCTGACCATGATG-TATA------GGATCACCTATGGCC-ATATC-AACATCCCCG-CA---A-CA--
gi|15 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcagCATTCCTTTTTG---TCAG--CTAC-GTGGC--TGTGGAACC-AG-CTACCGGAGC-----ACCT--G--GC-CATTGC-AT---CCAA------CCTGGAGGCATTC----------------------A-----------------TA---GGA--G-A---------CTGG-----------TGCAGTATTAATAC-----------CCTAC-ACT----GTA----------------------CA--------G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-C--TAC--T---A------G---TTTGT----AAC-----------TCA-C-------A---TCA--TTC------------------------TTGT--------T-----ATGCCCCAGAATGGG-------CCCTGTACATTATT-GAAAGAAccgtatctccacacaacagattatcttcaccattcctttttgtcagctacgtggctgtggaaccagctaccggagcacctggccattgcatccaacctggaggcattcataggagactggtgcagtattaataccctacactgtacagttttatttctttttaaacctgcactactagtttgtaactcacatcattcttgttatgccccagaatgggccctgtacattattgaaagaagaa
gi|16 : acaactagtagcacctcccaaaagatgaccatctttccaacatagacgacagcaggccaagctgaccatgatgtataggatcacctatggccatatcaacatccccgcaacaccgtatctccacacaacagattatcttcac-GACATCCACG-CA---A-CA--CTA------TATCTCCACAC-CACCA-----------C-TGTAG--CGACCAGAA-----G-TCACTCAA-TCATA---TAC-A---TTGTA--CCA----TTTTGCAGAATA-AAC-T------TT-TTTCGCCATTCCTTCTTTCCCTCGG--CTAC-ACGGC--TGTGTAACC-AG-CTACCAGAGC-----ACCT--G--GC-CA---C-AGTGTCCA-----ACCTT-GAGGCATTC----------------------A-----------------AG---GGAG-G-A---------CTG-------------------------C-----------CAT---ACT----GTA----------------------CAA---A---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TA---CA---ATATTAGTT-T------GTGCCTCAC-----A------------TCATT-C-TTGTACAGTCA--CACATGTATGATCTTGTACAGTCACACTTGTA---CCACA-----ACGCCTCAGAGT-GG------ACCCGTTACATTATT-GGAAGAAgaa
gi|17 : GGTA--CCA----TTCGGCAG-----GAT-A------TCCTACCTACACTCCTTCT---CTTCAG--GTGT-CAGGC--TCTGGAA-CCAGC-TTCCAGAACACCTAGCAT--T--AA-TA-----AG---CCAA--A-TCCTTGGAGGACTTC----------------------A-----------------AG---GGAG-G-T---------TTAGCGAATA-----T------------A-----------CATGC-AT---------GA--AT----ACA-----GAAC-T---G---T-T-T-TT-A------AC--A--TCTT---A-----------------CC-TG---TA-C----T--GTTTT------GCACCTCAC----AAAAGAAGACATATTCA-C-T-TTGTA----CA--TAAAT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCAAAGAGTGAG-------CCATGTGCAga
gi|18 : gtcttccatacttcactaccagaggactgtacatgcatataagaacagATGCTAAGCTTGTCATGGTC-T--A----CAGGATCAGCCACAACC-TGATA-GACACCtcactggacgttctaagaa
gi|18 : ac-G-G---------CTG------------T------------C-----------C-----ACCA---GTA-G---TC----A-A-----TGTCAT---CCATG-T-T-TC-AAT----CC--G--TTTTTA-AA---T-TCTT--A--ATCT--G---TA-C-AT-T--GT--T------GCACCTAAC----AA------------CGG-C-T-TTGTA---T-A--TACA--------------CA-----AAGTGTG---TTA-------ATGCTTTGGAGTAGG------tgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacatggctgtccaccagtagtcaatgtcatccatgtttcaatccgtttttaaattcttaatctgtacattgttgcacctaacaacggctttgtatatacacaaagtgtgttaatgctttggagtaggccctgcactttactaggaagaagaa
gi|19 : acatgctaagcttgtcatggtctacaggatcagccacaacctgatagacacctgatagacattccagcagtcgtgtacctccaccccactgcaccattaaccacaggacattcctccaaatacatgcagccattcagctgaatgaacatttacatgcacaagtcagacat--CCA----TTCTGCAG-----GAC-AGGTTCTCC-TGCCTACACTCTTTTGTACCTTCAG--ATGT-CAGGC--TCTGAAC-C-AGC-TTACAGAAC-----ACCT--A--GAGCA---TTAG---CCAG--A-ATTTTAGAAGATTTC----------------------AAGTGTGTATGGAAGTGGGG---GGAG-G-GTAG------CGAG-----------T------------C-------------TAC-AT-----GTATGA--AT----ATA-----GAGC-T---G---T-T-T-TT-A------TC------TCT---AC---C-T--T-------TT-TG---T-----------------------GCTTCAC----AT------------TCA-C-T-TTGTA----CA--TAAGT-------------CA-----AATTGTA---TGACACTACAATGCCTCAGAGTGGG------ccctgcactttactaggaagaagaa
gi|2 : cttccatacttccactgtcactaccatagtacatgcatacacaatgAGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAT----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCATAGCCAAGACAGGA--C---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACG-CTC-TCGG--ACGACCTCTCCTGGAA-GC---CACATGTC----CAGTCC-A--CTACCAAGAAACCCAACAA--------CACTGAACAGCCTGG---CATTC----ATAA-G-A-GAAA-CC--T--G-TCT--AGCTG-TCCACAGGAAACCA----AGGCCCA---A---GCATACAAGACCC----TTGTTTGACCAACGCTCGAGTACGCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--ACccatgtctgtcactggaa
gi|2 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactATGCCAAGCTGACTATGATG-TATA------GGATCATCTATGGCC-ATATC-GACATCCCCG-CAC--A-CA---TC------T---AC---ACACAGC-------------------------CAGAG-----G-TCACACAA-TCAAA---TAC-CATTTTGTT--CCA----TTTTGCATAACG-GACTA------TC-T-TCATCACTCCTTCTTCCCCTCAGCTACAC-T--GC--TGTGGAA-C-CTGCTACCAGAGC-----ACCT--G--AC-CA---C-AG---CGTC--C-AACCTGGAGGCATTC----------------------A------------------------AG-G-A---------CTTG-----------TG-----------CAGTATTAATAACCCAC-ACT----GTA----------------------------C---G-T-T-TT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TG---CA-T--TACTAGTT-T------GCACCTCAC-----A------------TCATT-C-TTGTA----CA--GTCA--------------CA-----AA-TGTA---CAACA-----ATGCCTCAGAGTGAG-------CTCTGTACATTACT-GGAAGGAacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcatgccaagctgactatgatgtataggatcatctatggccatatcgacatccccgcacacatctacacacagccagaggtcacacaatcaaataccattttgttccattttgcataacggactatcttcatcactccttcttcccctcagctacactgctgtggaacctgctaccagagcacctgaccacagcgtccaacctggaggcattcaaggacttgtgcagtattaataacccacactgtacgttttatttctttttaaacctgcattactagtttgcacctcacatcattcttgtacagtcacaaatgtacaacaatgcctcagagtgagctctgtacattactggaaggaaaa
gi|20 : gaagacctggacaaacttcagcaatgggagcgtgactggatgatgtccttcaacccttcaaagtgcgaggtcctgcgcataactaggaagaggaaccctatcctcacaagctatcaaatccatgggcacaacctaatcatagccaagacaggacgatacctggggacaacgctctcggacgacctctcctggaagccacatgtccagtccactaccaagaaacccaacaacactgaacagcctggcattcataagagaaacctgtctagctgtccacaggaaaccaaggcccaagcatacaagacccttgtttgaccaacgctcgagtacgcctccacagtatgggatccatacacacaagtttgtgtacagcaactagaggcagttcaatgtagggcagcacacttcgtcaagggagactatcgcacaactagcaccatttttcatacatagatggcagcGTA--CCC----TTCCGCTGAACG-GATTG------TC-T-TCGACACTC-TTCTTCCTCTAGG--CTAC-ACGGC--TGTGCAA-CCAGC-TACCAGAGC-------AT--CTGGC-CA---C-GG---C-GT--CTAACCTGGAGGCATTCGAGGGGTGGGATGGGGTGGGGGA-----------------GG---GGAG-GTG---------CTGGGGCAGTAGTTATA-----------C-----------CCTAC-ACT----GCA----------------------CAC---A---G-T-T-GT-A------TT-----TCTT--------T-T--T--A--AACC-TGCATTA-C-ATGT--T---T------GCGCCTCAT-----A------------TCATT-C-GTGTA---TAG--T-CA--------------CA-----AA-TGCA---CGACA-----ATGACTCA-AAT-GG------ACCCTGTACA-TAAaaa
gi|21 : cagaggtcacattGATGGTG-T--A----CAGAATCGTCCATGGGC-TACTA-GATATCCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TCCG-AC-CAGCAGGCATCTTC-CC-T-CAA--C-AGC---------T-CAAC--AT-TATAG---TTC-C---TGGTC--CCA----GTCTGCAGAGTT-GAC-A-----------------CTCCTTCTTTCCCTCGA--GCAC-CAGAT--TGGGGAA-C-ACACTCCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---T-AG---CTGA--C-ACCATAGAGGCTTTC----------------------A-----------------AA---GGAG-A-G---------CTGA-----------T------------T-----------AGTGC-ACC----ATA-GA--GC----G-A-----GGGCAA---T---G-TAT-TT-A------TC--G--TTTT---AAT--T-T--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAT--G---G------GTGCCTCAC----AA------------Tt
gi|22 : atAT-T-ACCAAATCCATGGTGACAAC-CT--AGCTGTAGCCAAGA--CAA--T---GA-T--ACTT-GAG---G-AC-A-ATGTTC-TCAG--A--AGACCTCCTGGAATCT---G-CATGTCG----AG-TCAA--CTACCAAGAGAGCCAACAG--------CAG-------TCTGG---CATTC----ATAAGG-A-GAAA--C--T--G-TTT--ATCTG-TCAATAGGAAACTA----AAGCCCAAGCA---GT-T--AAGATTC----TCGCTAGACCAACACATGACTACTCCTCCACAGTATGGGATC---CATA---C--AC
gi|23 : caa-----G-CAATTCAC-TGATG---TTC-C---TGGTT--CTA----TTCTGCAGAGTT-GAC-A------TC-TACTGCCACTCCAT---TCCCTCAG--GCAC-CAAAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCTAGAGT-----GCAT--T--GC-CA---C-AG---CCGA--T-AACCTAG-GGCACTC----------------------A-----------------GT---GAAA-G-G---------CTCA-----------T------------C-----------TTTGCGGTC----ATA-CA--GT----G-A-----GGGCAT---CG--G-T-T-TT-G------TC--A--TTT---------T-T--A--A--ATCC-TG---TA-C-ATAT--G---T------GCG-CTCAC----AA------------TCC-C-C-TTGTA---TTA--TAGAC-------------CA-----AATTGTA---AGACA-----AT------TAGCAGA------AATATGTGCATTATT-GAAAGAAacagtttgaatacagcaactagagacattccaatatagagc
gi|24 : A-CTAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----A--------------------ACCG--G-CC-AGCGAAGAG-------CAGCT-------TGA--------T-TCG-TGA
gi|24 : cctca--ACC---GGC-------CAGCGAA-------------------GAGC-AGCTTG-ATTCGTGA-----ATGGCGATT------------ACAA--A-AC-AACAATCAG---T-ATCAGCCAA----ATGA--------T-ACA-TGGC-------------------CTTTGCT-----TCA----AG--A--CA-T---GGCAT----GA-A-----CGCC-GTGT-CAACGCAAAGCTCGTGATGGTG-TATAATTTTA--ATCGTCTATGGGC-TCTTG-GACATTCCTT-CT---A-CG--ATC------T---TCCG--T-GGGCA-------TC-C----------------AG-----G-CATGTCGT-TGAAG---TTT-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAGTT-GAT-A------TA-TACatggcgattacaaaacaacaatcagtatcagccaaatgatacatggcctttgcttcaagacatggcatgaacgccgtgtcaacgcaaagctcgtgatggtgtataattttaatcgtctatgggctcttggacattccttctacgatcttccgtgggcatccaggcatgtcgttgaagtttctggtcccattctgcagagttgatatataca
gi|25 : cctcaactaacatcagccagattgaaAGGAAGAGAAACCCAATC-CTC-ACA---CAT-G-ACCAGATCCATGGGCACAAC-AT--AGCTTTAGCCAAAATAGGA--C---GA-T--GTCT-GGA---G-AC-A-ATGCTT-TCAG--AAGACCTCTCCTGAAA-GC---CGTATACCG----AG-TC-AATTAG-CAAGAGAGCCAACAACAGAAAAGTA----------TGG---CATTC----ATAA-G-A-GAGG-TCGTT--T-GAAGGAGTTG-TCCCCAGGa
gi|26 : gattggatcatgtccttcaaccatttgaagtgcggagtcctctgcattatgaactAGAATTTGGC-A------TC-TGCCAGCACTC----TTTCCCTTGG--GCAC-CAGAC--TGTGGAG-C-AGCCTTCCAAAAC-----ACAT--T--GC-CA---C-AG---TTGA--T-ACTTTAGAGGCATTC----------------------A-----------------GG---AGAG-G-A---------CTGG-----------T------------C-----------TCTTC-ACT----GTA-GA--GC----G-A-----GGGCAT---C---G-T-T------------------------------T-T--T--A--ATCC-CG---TA-A-ATAT--G----------GCACCTCAT----AA------------TCA-C-A--TGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AGCTGTA---CGATA-----ATGCCCCAGAATGAG------ATTTAATGTAATAAT-GGAAGAAtattaccaa
gi|27 : C-TATCGGCACTCCTTCTTTCCCTCGA--GTAC-CAGAC--TGTGGAA-C-AGCCTTCATGAGC-----GTAT--C--GC-CA---C-AG---CTGA--C-ACCGTAGGGGG--TC----------------------A-----------------GG---GGAG-G-G---------GTGG-----------T------------C-----------TCTGC-ATC----GTG-GA--GC----A-A-----GGGCAT---C---G-T-T-TT--------------------------------T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAT--G---C------GCACCTTAC----AG------------TCA-C-C-TTGTA---GCA--TACAC-------------CA-----AAGTATA---CGACG-----ATGCCCCAGTGTGGA------ATTATGTGTAGTATT-GGAAGA
gi|28 : a--------------------ACAG--A-AC-AACTAGCAG---C-ACCTCCCAG----ATGG--------TGACA--GAC-------------------CTTGGTT-----GGC-----------CA-TCTCTCCAAAATAGA-A-G----G-C-A-GT-AGAT-C-AAGCTGACCATGATG-T--A----CAGGATCATCTATGGCC-ATATT-GACATCCCCT-CA---A-CA--C-CGA----T---TCTC-AA-CAATG-------AT-TC-T-CAA--C-ACC
gi|3 : caagggagactAAGAGGAGCCC-ATCGC----CAAGC-AG-T-ACACTTTACACGGACA-GACACTC-AATCTT-GCCCCAA-ATGG--TA--GT-T--ACCT-GGGTGTG-AC--CAT-CAA-TGAA--A--AACTGCTGTGAGATAG---T-CATGTTG---ATG-CC-A--TCACAAATAAGGTCAGTAA--------TAT-------CATTG---CCTTC----TTGACG-A-GAAA-TT--C--A-ACC--AGTTGACCCAC-TGAAGTAA----AGGCCCAA--A---CT-TACAAGACAC----TGGTTCGCCCAATCCTCGAGTATGCATCTCCAGTCTAGGACC---CCCA---C--ACC---A-C-------AA-CTAA-------------------CATC-AA-CAA-ATTG--GA-----A--------------------ACAtctactgtagcgaccagaggtcatgcaatcagacac
gi|3 : aacccgcATGCTAAGCTTGTAATGGTC-T--A----CAGGATCAGCCACGACC-TGATA-GACAGTCC----A---G-CA--GTCGTGTACT---TCCA-CC-CCACT-------GCACCAT-TTA--C-A--AGAG-----GACATTCCACATGA-----TAC-A---TGCAG--CCT----TTCTGCCGGACG-GAC-A------AG-TACAG------CTTTTTCCCATATG--GTAC-CTGCC--TGTGGAACC-AG-CTGCCGGATC-----GCAT--A--GC-CA---C-TG---CCCA--G-ACCAAAGAGGGCTTC----------------------A-----------------AG---TCCG-G-T---------CTGG-----------TCG----------C-----------CCTCC-A------GTT-G---TC----G-A-----CACCATCCAC---GTT-T-TT-A------TC--GGTTTTT---AAATTC-T--T--A--ATC--TG---TA-C-ATTT--T---T------GCACGTCAA----AG------------CGG-C-T-TTGTA---T-A--TACAC-------------CA-----A---GTG---CGTTT-----ATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTAT-CAGGAA---GAAGAAgtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaacatgctaagcttgtaatggtctacaggatcagccacgacctgatagacagtccagcagtcgtgtacttccaccccactgcaccatttacaagaggacattccacatgatacatgcagcctttctgccggacggacaagtacagctttttcccatatggtacctgcctgtggaaccagctgccggatcgcatagccactgcccagaccaaagagggcttcaagtccggtctggtcgccctccagttgtcgacaccatccacgtttttatcggtttttaaattcttaatctgtacatttttgcacgtcaaagcggctttgtatatacaccaagtgcgtttatgcctcagagtgggccctgcactttatcaggaagaagaaga
gi|30 : aacccgcaagaggagcccatcgccaagcagtacactttacacggacagacactcaatcttgccccaaatggtagttacctgggtgtgaccatcaatgaaaaactgctgtgagatagtcatgttgatgccatcacaaataaggtcagtaatatcattgccttcttgacgagaaattcaaccagttgacccactgaagtaaaggcccaaacttacaagacactggttcgcccaatcctcgagtatgcatctccagtctaggacccccacaccacaactaacatcaacaaattggaaacagtccaaaaaagggcagcgaaattcgcttacggagattacaggacttcaagcagcacagcaacatgatggacaaacttcagtcgccacctcttctacagagaagagaacGGC-TTC----------------------A-----------------AGTCTGGCGTG-G---------CTG-------------------------------------CC--C-ACCT---GTA-G---TC----A-A-----CGCCAT---CCACG-T-TATT-A------TC--G--TTTTTTAAA---T-TCTT--A--ATCT--G---TA-C-ATTC--T---T------GCACCTCAC----AA------------CGG-C-T-TTGTA---T-G--TACAT-------------CA-----A---GTG---CATTT-----ATGCCTCAGAGTGGG-------CCCTGTACTTTACCAGGAAGAAga
gi|31 : aatGGTACAC--A---GT-TACCGTCCCC----TTGTCAGGCCCATTCATGAGTATACGAGCACAGCATGGGGCC---CGTA---C--ACG---G-C-------AA-TGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GC-----G--------------------GC----G-ACGAAC-AGCGA---G-ATTAGC--G----A---------------A-TGGC----------------------GACT-----GCA----AG--A--CA------ACAA----Ggaag
gi|32 : TCA-A-A-GAAA-TG--TTCG-ATA----TTG-TCCAGAAGAGATAA----GGGCACA---A---GCATATACCACCC----TTGTCAGGCTCATATTTGAATATGCAGCTGCATTGTGTGATA---CCTA---CCAACA---G-C-------AA---AA-------------------CATT-AACcaataccagttgacaacagttactatcgg
gi|33 : cttattGGCTTTC----------------------A-----------------GA---GGAG-A-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTGC-ACT----ATA-GA--GC----G-A-----GGGCAT---C---G-T-T-TTTA------TC--A--TTTT---AA---T-T--TT-A--ATCT-TG---CA-C-ATAC--G---C------GCGCCGCAC----AA------------ATA-C-C-TTGTA---TCT--TACAC-------------CA-----AGTTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAATGGG------A-TTTGTGAAGTAAC-GGAAGAAatccaagataaaatgaggaacccagaattgagac
gi|35 : ---C------ACACTTCAC----AT------------TCA-C---TTAGA-----A--TATGT-------------CA-----TAGTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGA------A
gi|37 : accagctcccagaagcaaagtgctttgagggcctcaatgggggtttggggagtctacatgcaggttttgaactatttgccttcacttgttc----G-A-----GGGCAT---C---G-T-T-TT--------TCTTG--TTTT---AC---T-T--TTAA--ATCT-TG---TA-C-ATAC--C---C------GCGCCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---TGGCA-----ATGCCCCAGAGTGGG------AATTTGTGCAGGAGA-AGAAGAAcgtat
gi|38 : ttatacaaatgtaG---GGAA-G-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTGT-CCC----GTA-GA--GC----A-A-----GGGCGT---T---G-T-T-T------------------------A---T-------A--ATCC-TG---TA-C-ATAT--G---C------GCCACTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------T------AATTGTAAGCTGATG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTAAGGTAAGTAAT-GGAAGAAgaaga
gi|39 : AAGAAGAA-AATCCCAT------ACAGGCCACAT-ACAACATTCACGGCCAAGAC-CT--GACTT
gi|4 : gaagacctggacagaattattaagtgggaaaaagacgggatgatgttattcaatcccagtaagtgcgagatgatctgcatcacaAAGAAGAGAACTCCCAT------ACAGGCCAC-TTACAACATTCTTGGCTAAAAC-CT--AACTTTCGTCAAGA-ACGG--C---AAGT--ACCTTGGA---GTGC-ACAT-CTC-CCAG--A--ACATATCCTGGAATGC---C-CATATAG---CAG-CC-A--CAGCTAACAAAGCCAAAAA--------TTC-------CCTAGAATTCTTT----CTCA-G-A-GAAA-CC--T--G-GCA--AGTTA-CCCACAATACATCA----AGGCACAG--A---GT-TACAAGACCC----TTGTCAGGCCCATTTTTGAGTATGCAAGCACAGTATGAGACC---CATA---C--ACC---G-C-------CA-CGAA-------------------CATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------ACAA--G-AC-AACAGTCAG---T-ACCATCCAG----TTGA--------T-ACA-TGAA-------------------CTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-CCGCGT-CAACGCGAAGCTGGCGATGGTG-TGTA----CAGCATCGTCCACTGGC-TCATA-GATATTCCCT-CA---G-CA--TTC------T---TCCG-AC-CAGCT-------TC-CC-G-CAA--C-ACAATAT-----G-AAACGCGC-TGAAG---TTC-C---TGGTC--CCA----TTCTGCAGAATT-GAC-A------TC-TACCGGCATTCCTTATTTCCCTCGG--GCTA-AAGAC--TGACGAA-C-AGCTTTTAAGAGC-----GCAT--C--GC-TA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GA---AGAG-A-G---------CTTG-----------T------------C-----------CCTGC-ACC----ATA-GA--GC----G-A-----GGGCAT---C---G-A-T-TT-A------TC--G--TTTT---AA---TGT--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G---C------GCGCCTCAC----AA------------CCA-C-C-TT-TA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAAGGA
gi|40 : -T-T-TT-G------T---G--TTTC---AT---T-G--T--ACAAACT-TG---CA-CTATTT--G---TTT----GTGCCTCAC----A-----------------T-C-TTGTA----CA--GTCAC--------------A-----AAT-GTA---TGACA-----ATGCTTCAGAGT-GG------ACCCTGCACATTATT-GGAAGAA
gi|43 : tatacaatgacctcta------------TTA-C-A-TTGTA----CA--TACAC-------------TA-------TTGTA---CAACA-----ATGTCCCAGGGT-GG------ACCTAGTACAAAATT-GGAAGAggagaa
gi|44 : ataatatacatatccaaactgttttcatttttacctgctcttgctttgtttcccacc---T-T--T--A--AACC-TGCATTA-C-TTGT--T---C------GCGCCTTAC----A-------------TCA-CTC-TTGTA----CAGTTGCAC---------------------AT-GCA---AAACA-----ATGTTCCTGAGTGGG------tgaaga
gi|45 : aaatacacatttcgagtaaacagttgcatttcttC-CTGCA-------TC-CC-T-CAA--T-ACTAGAG-----G-CAGTTCAC-TGGTT---TTC-C---TGGTT--CCA----TTCTGGAGCATT-TAC-A------TG-TACTAACACTCCTTCTTTCCCTCGG--GTAC-CTGAC--TTTGGAA-T-AGCccctgtatattatg
gi|46 : AGGAAGAGGAACCCTATC-CTC-ACAAGCTAC----CAA-ATCCATGGGCACAAC-CT--AATCGTAGCCAAGACAGGA--T---GA-T--ACCT-GGG---G-AC-AACC-CTC-TCAGACA--ATCTCTCCTGGAAtgacacccgagag
gi|47 : tccgcgcattaccACTCCT------CCTTGG--GCAC-CAGAC--TG--GAA-A-AGCCTTCAAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CATA--A-ACCATAAAAGTTTTC----------------------A-----------------GA---GGAG-A-G---------CTGG-----------T------------C-----------TCTG---CT----GCA-GAGTGC----A-A-----GGGCAT---C---
gi|49 : atcattttctg-T-T-TT-A------TC--G--TTTT----------T--T--A--ACTT-TT---TA-T-GTGT--G---CATTAATGTATCTCAC----AA-------------CG-C-CATTGTA----CA--TACA---------------------AAT---A---T--CG-----ATGCCTCAGAGTGGG------
gi|5 : attcatgt--AACCTTGTCCCA-A-ATGG--AA--GA-T--ACCT-GGGTGTG-GC--CAT-CAA-CAAA--A--AACTGCTATAGAACAG---C-CATGTTG---ATG-CC-A--TTAGAAAAGAGGCCAACAA--------CAG-------CCTCA---CCTTC----TTCACG-A-GGAA-CA--T--T-GCC--AGCTATCCCAT----CATTAGTGTAGGCCCAA--A---CC-TAGAAGACACTGGTTTGTCAA----ATCCTTGATTATGTGTCTATGTCCTGGGAGC---CCTG---C--ACC---A-CAATGTG-AA-CAAA-------------------CATCAAG--AA-ACT---GAT----G--------------------ACAtcagaaaaaaaagaaga
gi|5 : ctcATGCCAAGCTTGTCA-GG-G-TCTA----CAGGATCAGCAATGACC-TAATA-GACATACC----A---G-CA--GTCATGTATC---TCCA-CC-CCACT-------GCACCAT-TAA--C---CACAG-----G-ACATTCCT-TAACA---TAC-A---T--TCAGCCT----TTCTACTGGACG-GAC-A------TT-TACCTGCACACTTTTTTTCCATCTG--GCAT-CCT-C--TGTAGAA-CCAGC-TGCCATATC-----ACAT--A--GC-T-------G---CCTG--G-ATCATAGAGGGCTTC----------------------A-----------------GG---TCCG-G-A---------CTGG-----------C------------C-----------CCAAA-ACA----TTA-G---TC----A-A-----CGCCATTCAC---GTT-T-TT-A------TCT-GT-TTTT---AA---T-T--T--T--AACT-GG---TG-C-ATgttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatcatgccaagcttgtcagggtctacaggatcagcaatgacctaatagacataccagcagtcatgtatctccaccccactgcaccattaaccacaggacattccttaacatacattcagcctttctactggacggacatttacctgcacactttttttccatctggcatcctctgtagaaccagctgccatatcacatagctgcctggatcatagagggcttcaggtccggactggccccaaaacattagtcaacgccattcacgtttttatctgtttttaattttaactggtgcattattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|50 : ctcaaccttgtcccaaatggaagatacctgggtgtggccatcaacaaaaaactgctatagaacagccatgttgatgccattagaaaagaggccaacaacagcctcaccttcttcacgaggaacattgccagctatcccatcattagtgtaggcccaaacctagaagacactggtttgtcaaatccttgattatgtgtctatgtcctgggagccctgcaccacaatgtgaacaaacatcaagaaactgatgacagttcaaagaatggcagcgtgattcgcgcatttagcgacatgttaaacagacttctctggccatctctacaacagagaagagatc-GT-ACAT-TTC-TCAA--A--ACCTATCTTGGAATGC---A-TATGTAC---CCG-CC-A--CAGCAAAGAAGACCAATAA--------TTC-------TCTAG-------T----CTCA-GAA-GAAA-CC--T--G-GCA--TGTTA-ACCACTGGtattgagcttcaaaaggatactgtacataatacaaatgcgttaatgtgggcgcttctctttattaagaa
gi|51 : gaagtA--TACTC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGATTGGG------ATTTGATGCAATAAC-GGAAGAA
gi|53 : gttaactcttgtgttatattaacgcccacgcaatagaaacattacaact-AC-ATCAAGCAA---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TGAT-------------------CTTGGCT-----GGA----GG--A--CA-T---TGCAG----AA-A-----TG-TAACAT-CAACGTGAGGCTTGTGATGG
gi|55 : AAAG-ACGGGAC---GA-TTTACCT-GGG---G-AC-A--------------A--AC-TGTCCTGGAA-GC---TGTATGTCAGGTCAG-CT-A--CA---AAGAGAGCCAACAA--------CAG-------CCTGG---CATTC----ggcctatatttaa
gi|56 : CT-TG---TA-C-ATAC--A---C------GTGTCTCAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TTCAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAGAGTTGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAGAatag
gi|58 : CATCCATTGCCAATAG-CTGAAAC---AACCAAAA-CTGT--CCA-AA-T--ATCT-TGA---G-TC-ACTT-CTTACCAGT-A--GCCTGTCTTGGAATGC---
gi|59 : c--G--TTTC---TG---T-T--T--A--AACC-TGCAGTA-C-CTGT--T---C------GCGCCTCGT----AT------------TT------TTGTA---CAA--T-CAC--------------A-----AAT-GTA---AGACA-----ATGCTCCAGAGTGGG------acgca
gi|6 : ATC-CCCTACAGGCCACAT-ACAATATTCATGGCCAAGAC-CT--AACTTTTGTCAAGA-A---------GA---------GGA---GCGC-ACAT-TTT-CAAA--A--ACCTCTCCTGGAATGC---C-CATGTAG---CAG--C-A--CAGCTAAGAAGGCCAATAA--------TTT-------TCTAG---CCTTC----CACA-GAA-GAAA-CC--T--G-GAA--AGTTG-CCCACAGGATATCA----AGTCACAG--A---GT-TATCAGGCCC----TTGTTGGGCCCATTTTTGAGTATGCGATAACAGCATGGGACC---CGTA---C--ACT---G-C-------CA-AGAA-------------------TATC-AGCCAG-ATT---GA-----G--------------------GC
gi|6 : aaCAA--G-AC-AACAAGTAG---T-AACAGCCAG----ATGA--------T-CAA-TGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ATG--CCA-T-G--T-CAATGCAAGGCTTGTGATGGTG-T--A----CAGAAACGTCCATGGAC-TCATA-GGTATCCCCT-CACTTATCA--TTC------T---TTCG-AT-CA-CA-------TC-C--T-CAA--C-ACTAGGG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-T---TAGTC--CCA----TTTTGCATAATT-GAC-A------TC-TACCTGCATT------TTCCCTCAA--GCAC-CAGAA--TGTGGAA-C-AGCCTTCCTGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---TCGA--C-ACTCTAGAGGtgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttcaagacaacaagtagtaacagccagatgatcaatgactttggctggaagacattgcaagaatgccatgtcaatgcaaggcttgtgatggtgtacagaaacgtccatggactcataggtatcccctcacttatcattctttcgatcacatcctcaacactaggggcaactcactgaagttcttagtcccattttgcataattgacatctacctgcattttccctcaagcaccagaatgtggaacagccttcctgagcgcatcgccacagtcgacactctagagg
gi|60 : aaatcccctacaggccacatacaatattcatggccaagacctaacttttgtcaagaagaggagcgcacattttcaaaaacctctcctggaatgcccatgtagcagcacagctaagaaggccaataattttctagccttccacagaagaaacctggaaagttgcccacaggatatcaagtcacagagttatcaggcccttgttgggcccatttttgagtatgcgataacagcatgggacccgtacactgccaagaatatcagccagattgaggctgtccagcatcgagcagcaagttttgtgaaggtcgacttCCTATC-CTG-GTAA---AT-T-ACCAAACCCATGAGCACAAC-CT--TATTTTAGCCAAGACAGGA--C---AA-T--A
gi|63 : TAC--G---A------GTGCAATAC----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CAATG-----A-----------GGG------ATTTTGTGCAGTAAC-AGAattatatgtgtacaatgct
gi|64 : tt----AA------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CT-----AATTGTA---CAATG-----ATGCCCCAAAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAC-GGAA
gi|66 : GTA---CGGCG-----ATGCCCCAGTGTGGG------ATTTCGTGCAGTAAT-TGAAG
gi|68 : tgtaggtcatatagagaCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGACG-----ATGCTCTAGAGTGAG------ATTTTATGCAGTAAtaga
gi|7 : AC-T-ACAATATCCATGACCAATAG-CTGAAACA--AGC--AAA-ACAG--TCCAAA-T--ACCT-TGG---G-GC-ACTT-CTCACCAAC-A--ACCTGTCCTGGAACGCATAC-AATGTCA---TGA-TC-A--CG---AAGAGGGCCAACAA--------TAC-------CACAG---TCTTC----CTCA-G-CCGCAA-CC--T--C-TCA--ACATG-CACGAGGGGAACTA----AAG---AG--GCCTGC-TACAAGACCT----TCGTAAGGCCCAAGGTTGAGTATGCCGCCACTGTTTGGGACC---CTCA---C--ACTCAAG-C-------C----TA-------------------TATC-AACAAA-GTA---GA-----A--------------------GCGG--T-GC-AACA--CAGAGCT-GCCAGCg
gi|70 : tcaagctcaacgcag-C-T-TTGTA---T-----ATGT-------------CA-----CATTGTA---CAACA-----ATGCCCCAGAGTGGG------Atttgtctctgggattacaactgaaaattcatcgtcaccgccacgcataacacactcggctgggagggtcttcaacaacagaagaaggaggccaaggctgtcataatctattagattaccaacaaccttgatatccctaatgtgccttacatacatccacagagagtttcaaccttaggtcactcgatgaggtacttggtaccatactgcaagatgtctgtattgaaagagtcattcttcccttccatcattgtattatgga
gi|71 : -TTGTA---TTA--TACAC-------------CA-----AAGTGTA---CGAGG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGTAAC-catatgcctcacaggaag
gi|72 : TGTA---CGACA-----ATGCTCCAGAGTGGGC-----A--CTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|73 : tata-----AATTATA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGCGCAGTAAC-AGAAGAAcaagaa
gi|74 : ATTGTA---TGACA-----ATGCCCCACAGTGAG------ATTTTATGATGTAAT-GAAAGAA
gi|75 : A-----AATTGTA---CGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAAT-GGAAG
gi|77 : TGTA---CGACG-----ATACCCCAGAGTGAG------ATTTTGGGCAATAAC-GGAAGA
gi|79 : CTCTCCTGGAA-GC---CACATGTCA---AAT-CA-A--CTACCAAGAGAGCCA
gi|8 : GCACAT--A---GT-TATCAGACCC----TTGTCAGGCCCATTCTTAAGTATGC---C-CAGCACGGGACC---CGTA---C--ACC---A-C-------AA-CGAACATAAGAAAGAACGACGAGCATC-CGCGAG-ATTCGTGAATAACG--------------------ACAT--G-AC-AACAAGCAG---T-ACTAGCCAG----AGGA--------T-ACA-GGAC-------------------TTTGGCT-----GGA----AA--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-G--T-CAACGCGA-GCTCG---TGGTGATGTA----CAGAATCGTCCATGGGC-GCATA-T-TATCCCCT-CA---A-CA--TTC------T---TCCG-AC-TAGCG-------TC-CC-T-CAA--C-ACTAGAG-----G-CAACTCAC-TGAAG---TTC-C---TAGTC--CCA----CTCTGCAGATTT-GAC-A------TA-TACACGCACCCCTTCTTTCCCTCAG--ACAC-CAGAT--TGTGGAA-C-AGCCTTCCAGAAT-----GCAC--C--GC-CA---C-AA-----AATTT-ACTTTAGAGGCTTTC----------------------A---------------------------------------CT--------------------------------------CCTGC-GCC----GTA-GA--TCGTCGG-A-----GGGCAT---C---G-T-T-TT-GAAAAACTC--AT-TTTT---AAT--T-T--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G---C------GCGTCTTAC----GG------------TCA-C-C-TTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGCA---CAACG-----ATGCCACAGAATGAG------ATGTTGTGCAGTAAT-GGAAGA
gi|80 : -----ATGCCACAGAGTGGG-------CCCTGTACATTATT-GGAAGAA
gi|81 : aGACG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ATTTTGTGTAGAAAC-GGAAGAgaagaa
gi|82 : tG-TGTA----CAGAATTGTCCATGGTC-TCATA-GATAT-CCTT-CA---A-C
gi|83 : g---CGATG-----ATGCCCCAGAGTGGG------ACTTTGTGCAGTAAT-TGAA
gi|84 : gTGTA---CGACG-----ATGACCCAGAGTGGG------ATTTTGTGCAGTAA
gi|9 : CACAG--A---GT-TACCACACTC----TTGTCAGGCCCATTATTGAGTATACAAGCACAGCATGGGACT---CGTA---C--ACC---G-C-------CA-TGAA-------------------CATC-AGTCAA-ATT---GC-----GGGATTCGTGAATGGGTGACTACAA--G-AC-AACAAGCAG---T-ACCAGCCAG----ATGA--------T-ACA-TACT-------------------TTTGGCT-----GGA----AG--A--CA-T---TGCAA----GA-ACG--CCG-C-A--T-CAACGCAAAGCTCGTAATGGTG-T--A----CAAAAACGTCCATGGGC-TCATA-GATATCCCCT-AA---T-CA--TTC------T---ACCA-AC-CAGCT-------TC-CC-C-CAA--C-AAATGAG-----G-CAACTCGC-TGAAG---T-C-C---GGGTC--CCA----TTCTGCAAAGTT-GAC-A------TC-TACTGGCACTCCTTCTTCCCCTCGG--GCAC-CAAAC--TGCGGAA-A-AGCCTTCCAGAGC-----GCAT--C--GC-CA---C-AG---CCGA--C-ACCGTAGAGGCTTTC----------------------A-----------------GA---AGAG-G-G---------TTGA-----------T------------C-----------TCTGC-ACA----ATA-GC--GC----G-A-----GGGCAT---C---GTT-T-TT-A------TT--G--CTTT---AA---TCT--T--A--ATCT-TG---TA-C-ATAC--G---C------GCGTTGCAC----AA------------TGA-C-C-GTGTA---TCA--TACAC-------------CA-----AATTGTA---CGCCG-----ATGCTCTAGAGAAGG------ATTTTGTGCAGTAA
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): GTCAGACTTTGGAACCAGCTTCCAGAATAACTAGCATTAGGCAGTCCTTAGAGGGCTACAAGGGGGGTTTGGTAAGACAATATCCATGAATCTAAGGCTGTTTTTAACCTTTTATATTCACATGGTTGGCACCTCATATTCCCTTTGTACATGAGTCACATTGTATGACAATGTCCAAGACGGGACCATTCACATCACTGCAA
Unaligned ( gi|34 ): CCTGGACAATGGAGCATCAGGTTTTGACACCCACCATTAGTCGACACCATTCATGTTTTATAGGCTTTAACTTATAATCTGTGCATTGATTGTTGCACATAACAACTACATTGTACATACACCCTCCGAGTGGACCCTGCATTTTATCAGGAAGA
Unaligned ( gi|36 ): TGCAGTATTAATACCCTACACAGTACAAAGTTTTATAAATTTTCTTTTTAAAACATGTAACTACTTGTTCATGCCTCATATCGTTCTTGTACAGTCACAAATGTACTACACGCCTCCAGAGTTGACCCTGTACATTACTGGAACAAG
Unaligned ( gi|41 ): ATATAACGTACCTGGTCTGTGACCCCAACACTACAACTAACAACAATTTGGAGGCAGTCCAAAGAAGGGCAGCACAGTTTGTAGATTTGTGTAGATTACAGAACTTTGAGCAGCACCAGCAACATGATGG
Unaligned ( gi|42 ): GGTGCAGTATTATCACCCCAAACTGTACAAATTTTGTCACTTTTTAACCTGCTATTACGTCATTCCTGTTCAGTAACAAATGTATGACAATGCTTCAGAGTAGACCTTGTACATCAAACGAAGAAAAA
Unaligned ( gi|48 ): AGACCTTGGTTGGCCATTTTTCTAACAAAGATGGTAGAGGACCAAGCTGACCATGATATATAGGATCATCTATGGCCATAATGACACCCAGGCAACACCCAGGTACATCG
Unaligned ( gi|52 ): TTTGGAACGTTTCGAGAACCACTAGCAATAGCAATAACCTTAAGGGCTTCAAGGGAGTGTGACGAGTCTACATGCAATATTATGCAAAATTTGTTTCACCTTA
Unaligned ( gi|54 ): TAACCTATACATTCTCATGCCTCACATGTGTACATATTCAACATAATATAATGATACTTCAGAGTTGGCCATGTACTATATTGGGAGAAGAAATA
Unaligned ( gi|57 ): ACAGCCTGGCATTCATAGGCTGTTGGGCAGCATGTTTCATCAAGGGAGAGTACGGCACAACTGGCAGCATCTCCCATATTGCCACAATCT
Unaligned ( gi|61 ): TGAATGGATAATGCCTTTTAACCCTTCGAAGTGTTTAACCACGAAGAGGACCGCTATCCTATCAAATTACCAAATCCA
Unaligned ( gi|62 ): ATAACCCGCAAGAGGAGCCCATCGCCAAGCAGTACCCTGTACATTGACAGACACCCGAATGGTAGATACCCGGATG
Unaligned ( gi|65 ): AGTCACATACATAAACCATTCTCCAGAGTGGGTCCTATGTATTACAGTACTTAGAAGAAGAGGAGA
Unaligned ( gi|67 ): ACGTGCAGTAAGTATTGTACGACAATGTTCCAGTACCTAGTACACAATTGGAAGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|69 ): ATATTACTCAAAGCGCGTCGAAGCCTTAGAGTGGCCCTGAACCTTACCAGGAAGAAGAAGA
Unaligned ( gi|76 ): TTATGCCTCAGAGTGGGCCCTGCACTTTACCAGGAAGAAGAAAGAA
Unaligned ( gi|78 ): TTTGTATTTCAAAGTGGACCCAGCACATTATCAGGAAAAAGAAGA
Unaligned ( gi|85 ): CAACAGCTGAAACAAGCAAAACAGTCCAAATACC