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7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-841 ) : TTCACTGGCAGATC-C-AGA----G----ANGG-----G----G---A------C-A-G-GN-----AG--T--CCGGA-CC----CCTC---C--TGG----G-A----TTCCCAAA-ATAT---TGCTAAA-------T---GA-------CA-G-ATT---TTT--TC-G-G-----T-------N---------A---N---T--------------TT-----N----A---T-T--T--T-------ACT------ATC----TTGGAC--C------CC--A------C---C-C-CT----G----AA----A----T------T---N----G---A-CCC---C-ACCTGA------------CC--------AAA-AATCCTGGAT
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gi|11 : TGGCAGATC-C-AGA----C----AAGG-----G----G---G------C-A-G-GG-----AG--T--CCAGG-GC----CCTC---C--CAC----A-A-----TGCCAAA-ATAT---TGCAAAA-------T---GA-------CA-GCATT---TAC--T----G-----CAAAAA--A---------A---G---C--------------TT-----A----A---T-T--T--T-------ACT------ATC----TTGGA---T------CC--A------C---C-T-C-----A----AA----A----TGG----T---A----G---A-CCA---T-ACCTGA------------GC--------AAA-AATCTTGGATgtg
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Reference ( family-841 ) : TTCACTGGCGGATC-C-AGAG----ANGG-----GG---A------C-AG-GG-----AG--T--CC-GGA-CC----CCTC---C--TGG----G-A----TTCCCGAA-ATAT---T----GCTAAA-------T---GA-------CA----G-ATT---TT-------T-TC-GG--C----A-----A---A--------T--TT-----A----AT----T--T------T---ACT------ATC----TTGGAC--C------CC--A------C---C--C-CT----G----AA--A----T---T----G---G---A--CCC---C-ACCTGA------------CC--------AAA-AATCCTGGAT
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gi|12 : CTAACGCATA-C-AG-G----AGCG-----GG---G------C-AG-AG-----AG--T--CC-GGA-AT----TATT---------------A----TTACTGAA-ATAT---TTGTGGC-AAA-------C---AA-------CA------------------------------T----A-----A---A--------A--TG-----A----AT----T--T------T---ACT------ATA----GTGGGC--T------CC--T------C---CTGT-CT----G----AA--AATC-T---T----G---G---A--TCC---
gi|13 : -----GG---A------C-AG-GGTGTAGAG--TGTCT-TGA-CC----TCTT---T--TAG----G-A----TTCCAAAA-ATAT---T----GATTAATGCATACT---GA-------CA----GCA-----TT-------T-TC-AG--A----AAAATTA---A--------T--TC-----A----AT----T--T------C---ACT------ATC----TTGGA---T------CC--A------T---C--C-------G----AG--A----T---TGGC-G---G---AC-CCC---C-ACCTGA------------CC--------AAA-ATTTTTGAAgcctatgtacacacatgcatacatgcagaaac
gi|14 : cGATC-C-AGAG----GGGT-----GG---G------CTAA-GG-----GG--T--TC-AGA-CC----CCTT---G--TGG----A-A----CTCCCAAA-ATAT---T----GTTAAA-------T---TG-------TT----G-TTT---TT-------TGTC--G--C----A-----A---AATG-----T--TC-----A----A-----T--T------C---ACT------ATC----TTGGA---T------CT--A------C---T--G-CT----G----AA--A----TCAGT----G---G---A--CAC---C-ACCTGA------------CC--------AGA-TGTCCT
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gi|16 : TTCACTAGCAGATC-C-AGAGGGTGAGGG-----GGGCAA------C-AG-GG-----AG--T--CC-AGATCC----TCCC---C--TGG----A-A-----TCCAGAA-ATATACAT----G-TAGAT------T---AA-------CAC---C-ACTG--TT-------G-TC-GA--T----A-----A---AACAT----T--TC-----A----AT----T--T------T---ACT------ATC----TTGAAA--C------Cc
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gi|18 : caatCTGGCGGATC-C-AGAG----ACGA-----GAT--A------C-AT-AG------G--T--TC-TGA-CC----CCTA---T--TGG----T-A----TTCCCGAA--------------CTTCA-------T---AA--------A----A-AT---------------------------------A---C--------T--TT-----A----AT----T--T------T---ACTACGTTCATC----TTGGAC--C------AC--A------C---C--atgt
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gi|2 : gtggcagGCGGATA-C-AGAG-----TGG-----GG---A------C-AG-AC-----AGG-T--TC-GGA-CC----CATA---T--TGG----T-A----TT---GAA-A-----------ACTACA-----------GA-------TA----A-A-----------------C-AG--C----A----------------------------------T----T--T------T---ACT------ATC----TTGGGT--C------C---A------C---C--C-AT----A----AATTA----G---T----A---G---A--TCC---C-ACCTGA------------CC--------AAC-AATCTTGGATc
gi|20 : ttTGGTAGATC-C-AGAT----A-GG-----GG---A------C-AT-GG------T--T--AT-GGA-CC----CCAG---C--TGG----G-A----TTCCCAAA-ATAT---T------TATA-------T---GG-------AA----T-AAT---TT-------T-----A--T----A-----A----------------T-----A----TT----T--T------T---GCT-------------TTGCACCAC------CC--A------C---C--TACTA---G----AA--A----T---ccgcgtatgcatacgcatgtatattttaatataagttgccgcattagctttt
gi|21 : cctG----G-C----TTTCTAAA-ATAT---T----GCTAAA-------T---GG-------CA----G--TA---TT-------T-CC-AA--CTA--G-----A---A--------T--AT-----A----GT----T--TGAAATTT---ACT------ATC----TTGGA----------AC--A------C---C--T-TA----A----AA--A----TGG-T----G---G---A--CCC---C-ACCTGA------------CC--------ATA-GATTCTGAA
gi|22 : CCAAA-TTAT---T----GTTCAA-------T---AA-------CA----G-AAT---TC-------T-CA-GT--C----C-----A---ACTACTGGTT--TT-----T----AG----T--T------T---ACT------ATG----TTGGAC--C------CA--A------A---C--C-CT----T----AA--A----TAA-T----GACAG---G--CTG---T-ATCTGA------------CC--------AAA-AATCCT
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gi|25 : AA-ACAT---T----TCTAAA-------T---TA-------CA----G-CAT---TT-------T-TA-GA--C----A-----G---A--------TG-TTG----A----AG----T--T------T---ACT------ATC----TTGGAC--C-----------------C---C--C-CT----G----AA--A----C---T----G---ATT-AACCCC---C-ACCTGA------------TC------------AGTTCTGGATctgccaat
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gi|4 : gGATT-C-AGAG----AAAGTGGGAGG---A------C-AA-AA-----GG--T--CC-AGA-CCTCACCCCC---CAATGG----G-A----TACCTGAA-AT-T---T----GCTAAA-------T---GA-------CC----A-GTA---TT-------T-TC-AG--C----C-----AGT-A--------T--TTCG---A----AG----C--T------A---ACT------AGC----TTAGAC--C------CCTCA------C---C--C-CT----G----AA--A----T---T----GATTG---A--CCC---C-ACCTGA------------CC--------AAA-CTTCCTGTATtaactc
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gi|18 : caatCTGGCGGATC-CAGAG----ACGA-----G----AT--A------C-A-T-AGG---TTC-TGACC----C-CTA---T--TGG----T-A----TTCCCGA-------A--------------CTTCA-------T---AA--------A----A-AT---------------------------------A---C--------T--TT--A----AT-----T--T------T---ACTACGTTCA-TC----TTGGAC--C------AC--A------C---CG-A-AT----T----AAAT---TCG-TTGAA-CCAC---T-ACCatgt
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gi|8 : AG----ATGG-----GTTGTG---G------C-ATT-AGG---TTA-GGACT----C-GTC---C--TAG----ATA----TTCCAAA-------A-CTAT---T----GCTTAA-------T---GA-------CA----GTGTT---GT-------T-TCAGG--C----C-----A---A---------------A----AT-----T--T------TCAAACTAAC---A-TC----TTCGA---G------TT--A------C---A--T-TT----A----GCAT---A-A-AT-GA-CC-C---C-ACTTGA------------CC--------AAA-ctgc
gi|9 : gttggttcTTCACTGACAGATC-CAGAG----AAGG-----G----G---A------C-AGG-CAG---TCT-GAACC----C-CTC---C--AAG----G-A----TTCCCAA-------A-ATAT---T----GTTAAA-------T---GG-------CA----G-ATT---TT-------T-TT-GG--T----T-----A---T--------T--TT--T----AT-----T--T------T---GCT------A-T-----TTGGAC--C------CC--A------C---C--C-CT----G----AAAT---T----T-GA-CC-C---C-ACTTAA------------CC--------AAA-AATCTTGGATctttcttattt
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Unaligned ( gi|29 ): CCTGTAGAACTGAAAATTCTGGATCCGCCTATAAACACACATACCTATCAAATATCATCATGCAAAAGC