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Reference ( gi|1 ) : ACGAGGGTCATTCAATATATAATTTAACATATCACATTAATCATTTATAATGAAAATGAATGTCAATACCGTATTATTATCCTTCAAAGTAA-----TGTCCCCTGTGGTCAAAGACTGATGTCCATCGCTTCAGCAGATCTTCTATTCCCGTTGT-TAGGCAACCGCGCTCATATACC-TTCACC--TGCTCGGCCAC-GCCATCTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGCGAATCGAATTCCCC--TCA--TATTTTCTTTAAGTCTTGGGAATTAGTCATAATCACAGGGGCTAATGT-CAGAAGAATATGGAGGATGGTCCAGCTTTACCCATTCATATT----AAACAAAAAGTAAC-GTCAAACCCTGTGAAGTGCGCGTTG-T-GCC---TTATCATAAATTA-TGGTTGAAACGGCTCGCAATAGTTTTGGGCGCTATTTACGTATGACTACAT-GTAGGCA--TT-T-TTAAT-GTACTCTTTGTAGTATGTGCTGTTGACTGTTTGACCGAC--------TGGGACCTTATGACTTGTCAGAACTCCACGAATATCCTACGCGAATATCATCAGTTGCGCTATTTTTCCTTATACCCGACGGAAAA--TTGCCTGTC---CCGCTG-ATTTCGGGATGTGCCATTCGGTTGATTGTCGCTTCATCTCTGATTCGTATGATCTAATCAACATCTCGT-CTATGGCAACCATTTTTGAACGAAAGTCTCGACCATCTGCATCGAAGCACGAAAG----TATGTTGGTCGCGACTGTC---AAACGACGTTCAATTTGATTCGACGT-TA-GGCAATGGG-G-CACCCATCG-----TGCG--GAAAGTTTACGCA-----TTTCTAAACGGTTCTATATAATTGAATGAACAGACCCCACACTAATATCCAATTCCTGTGTTATTTCTTTACAATTCAATCTTCTTTCTAAACGTAAAAGTTTCA-TTACAT--TTT-CCG-CATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTTTTCAATTGTGTATCTTCTATTTTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATGAAAGAA-AACATTCACCGCAAGCTTCTTGTTATGCATTAA--A---GATTTCTGTCGCATT-CTTATTATGTCGAGACTCGAT--------------ACTG-AT-GTAACTGC---------------ACTG-T--------CAT---TTG---AC---G---T-------TGCA--CACTG------A---------TGACGTAAT--------------T------T------A------------C--------------A--------G--TT-TAC----------------AG--GATAATAAGC---AA------GTAGTT---GAT------TCA--TTAA-CATGCC--AAG---TT-GC--A--ATAATG-TACTA-TAAGCAGTTTTAGAG---ATAATCAATTTG-TT-G-GTTATA----T---ATTGAATGT
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gi|12 : gacagtgtgacaccctgtgaagtgtgcgttgtcgcgatgttataaaataagaccgattcgcaatagttcttggtgcttttaacgtatgactgatctttctgaacgtaaaagtttcatcacattttccatattgaatgtatccgttgcggtcacattttacccacttcgctagttttcttcaatcgtgtacctactattcttaaattcattaagccatctagttacttgagaatatgaaatagaacattcaccgcaagcttcttgtaatgcatttaagttttctctcgcattcttataatgtcgagactcgatattgatgtagctgggctgtttaattgacgtgaccgcgttcatACAAGGGTCATTCAATATATAATGCAACCTGTCACATAAACTTTTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCATATTATGATCCCTCAATGTAA-----TGTCTCCTGTGGTCAATGACCAATGTCCATCACTTCAGCAGGTCTTCTATTCCTGTTGC-TAGGCAACCGCACTCATATACCTTCACC--TGCTCGGCCATGGCAATTTCAA-TCTTCTCTATGTCAGCGAATGGAATTCCCCATTTATTTATTTTCTTTAAGTCTTGCGAGTAAATCA-------------TAATGT-CAGGAGAATATGAAGGATGGTCCAGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAAAGTGACGTCACACCCTGTGAAGTATGCGGTGTTGCATTGTCATGAACTATGATTGAACTGGCTTGCAAAAGTTTTGGGCGTTTTTTTTCATCTGGCTGGTTGTAtc
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gi|14 : TTCAATCACTT-TTT-TGGTGTTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCTCCCACTTTGCTTGTTGTCCTC-ATT-TGTGT-------------ATTTA-----CCA--TT-------------CTTAA-AATTCATA-AA-C-----CCTTCACCGCAAGCTTCTTGCAATGCATTAA--A---GATT--TCT--------------------T-TCACATT-CTTAT-----TACG----TCGA--AACTCGATTTGTATGTAGCT----GAACT-----------GTTCA--G--------C--------TGAC----G--------TGAT--C-------GCGT---CC-------ATGATG--CTTT-----T-----A-----G-----TG--AC--------GTTATG--TTACGT--TGCAC-GAT----GATGATG---GTATTT---AA------GATAATGTGCTCAGAGTTTGAT-GAACAGT------TAGCAAGCATG-TCAAGT---TT--CATCA-CG-----------A--TA-----CTATAAGTAGAATTAGCGTTAA-TAATAGTTTGCATTATA----TATAATTGAAa
gi|15 : ATC-CTT-TTT-----AATGAAAGT--CC----CGACC----TTCGCCAACTTTACTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAAT-------TATTTGAGAAT--ATG-AA-ATAGAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTAATGCATTAATTAAATGATT--TCT--------------------T-TTACATT-CTTAT-----TACG----TT-----ATT--ATGTTTATGTAGCT----GCGCT-----------GTTCA--A--------T--------TGAC----GTGAC----TGCGTCC-------ATGG---TGCTTTTA-GTGACG-TCATT-----agacc
gi|16 : aTT-CTTAT-----TACG----TCGA--TACTTGATGTTTATGAAGCT----GCGCT-----------GTTCA--A--------A--------TGAC----G--------TGAC--C-------GCGT---CC-------ATGATG--CTTT-----T-----A-----G-----TG--AC--------ATC--A--T----T--TG-----AT-----GT--T----G----C---AC------G----------TTG---GTGATAT--CA-TCAAAGATAA----CGTGCTCATAT---TTTGCAGAA-TA-----------AT-AA-------GCAAGTAGTTtgatgttgcacgctggtgatatcgtcgaagataacattctt
gi|16 : TCA--T--------T--------TGAT----GT-------TG----C-------ACGT---TG-------GTGATA-TCATCAAAGAT-----A-----A-----CGT-GCTCAT----A----T--T----T--TGCAG-AAT----AAT--AA---G----C---AA------G----------TAG---TTAAT-G--CA-T------AAG----CATG-TAAAGT---TT--CATCA-CA-----------AT-TA------TGTAAGTTGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCACTATA----T---ATTGAATGaatgcataagcatgtaaagtttcatcacaattatgtaagttgttttagagataattaataggttgcactatatattgaatgaccct
gi|17 : ttcttattacgtcgatacttgatgtttatgaagctgcgctgttcaaatgacgtgaccgcgtccatgatgcttttagtgaca--TT-T-TTATT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGAACGTaccct
gi|17 : tTTA--T--------T--------TGAC----GT-------TA----C-------ACGC---TG-------ATGACG-TCATT-----C-----ATGATAA-----CGT-GCTCAG----A----G--T----T--TGCAG-AAT----AAT--TA---C----C---AA------A----------TAG---TTGAT-T--CA-T------TAG----CATG-TCAAGT---TT--CATCA-CA-----------A--TA-----CTGTGAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---AGTGAATGccatgatgcttttagtgacgttatttgacgttacacgctgatgacgtcattcatgataacgtgctcagagtttgcagaataattaccaaatagttgattcattagcatgtcaagtttcatcacaatactgtgagtagttttagagataattaataggttgcattatatagtgaatgaccctcg
gi|17 : ttttttattgtactccttgtagtatgtgctgttgaacgtccatgatgcttttagtgacgCGAGGGTCATTCACTATATAATGCAACCTATTA-ATTAaccctcg
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gi|3 : tagttttagagaCCGC--AAAAAGTGAC-TATCACCCTGTAAAGTGTTCGGTGTCACGTTGTCGTGAAGTATGATTGGACCAGTTCGCAATAGCTCTGGGAG-CATTTTACGTATGGTTGGTCGTAGGCA--TT-T-TTTATTGTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTCACCATTTGACCGACAGGAACATTGTGACTTTGTGACTTGTCAGAACTCCACAAATATCATATGCAAATATTATCAAATGCTTTATTTTTCCTTGCACCCGAAGGAACTCTGACAG-ATTGGTGAGTTTAGGGTGTGCCACTCGGTCAATCGTCACTTC-----TGGTTCGTATGATCTAATCCACGTCTCAT-ATATGGCAACGATTTTTGAAAGAAAGTCCTGA--CCTTCTGCATTCAAGTGCGAAAGTAGGTTAAGCGCAACTGGCATGCGATGTTCAATAAAATCCAATGTTAGGTGATGGG-GCACCGATCA-----TGCG--GAAACTTTACGCACACACTTTTAAAAA-GGTTCCATATAATTGAATGAACAGATCCCACTCTAATGTCCAATTCCTGTGTTATTTCTTCACATGTCAATCTTCTGTCTGAATGTAAAATGCTC-ATCATTT-TAT-CA-TATTGAAAGTATCCGCTGTGGTCACATTTTGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCATTTGTGTATCTACCATTCTTAAA--------CCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTTACCACAAACTTCTTGTAATGCATTAA--A---GATTTCTCTTGCATACTATTACATCAAGAC-TCG-ATT-TTTATGTAGCTGCACTGTTCAATTGAC-CG-TGTTCATGATGCTTTTAGTGAC-----------GT-CA--T--------T--------TGTC----AT-------TA----C-------ACGC---TG-------ATGGTG-TCATT-----C-----A-----AGATAACGT-GCTC------A----GATT----T--TGCAG-AAT----AAT--TA---G----T---AA------G----------TAG---TTGAT-T--CA-T------AAG----CATG-TCATGT---TT--CATCA-CA-----------A--TA-----CTGTAGGTAGTTTTAGAGATATTTAATCGGTTGCATTATA----T---ATTGGATG
gi|4 : tttccACGAGGGTCATTAAATATATTATGCAACCAATCACATAAATCATTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCGTATTATAATCCCTCAAAGTAA-----TTTCCCCTGTAGTCAATAACCTATGTCCATCACTTCGACAGATCTTCTATTCCCGTTGC-CATGCAATCGCGCTC--------------------GGCCACAGCAATTTCAT-TCTACTCTAAGTCAGTGAAACGAATTTCTC--TTA--TATTT-----AAGTTTTGGGAATAAGTCATAATCAAAGAGGTTAATGT-CAGGAGGATATGGAGGATGGTCCAACTTTTCCAACTCATATTCCGC--AAAAAGTAACGTCACACCCTGTGAAGTGTGCGGTGTCTCGTTATCATGAAGTATGATTGGACAGGCTCGCAATAATTCTGGTCG-CTGTTTA------------CGTAGGCA--TT-T-AAAAT-GTACTCCTTGTAGCATGTGCTGTTGACCATTTGACCCACTGGAAC--------CTTGTGACTTGTCAGAACTCTATGGATACCATACGCGAATATCATCGGTTGCTTTATATTTCATTGCACCCAACGGTACTTTGGAGGTTTCGGTTAGTTCGGGGTTTGCCGTTCGGCCGAATTTCGCTTAACCTCTGGTTCGTATGCTATGATCCACGTCTCGT-CTGTGGGAACGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCATCTGCATTGAAGCGC-AAAGGAGGTTGGTCGCGACTGTCAAGCGATGGTCAATTTGATTCGACGTTAGGTGA-------------CG-----TGCG--GAAATTTTACGCA-----TTTTTAAAC-GGTTCCGTGTAACTGAATAAACAGATCCCACACTTATGTCCAATTCCTGTGTTATTTCTTTACATGTCAATTTTATATCTGAAAGTAAAA-GTTCCATCAATTGTTT-CGGTATTGAAAGTCT------------TATTTCGCCCAATTCGCTGGTTGTCTTCAATTTTGTACCTACCATTCTTATATTCGTTAACCCT--TCTaccctc
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Reference ( family-8313 ) : ACGAGGGTCATTCAATATATAATGCAACCTATCACATNAATCATTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCGTATTATAATCCCTCAAAGTAA-----TGTCCCCTGTGGTCAATGACCGATGTCCATCGCTTCGGCAGATCTTCTATTCCCGTTGC-TAGGCAACCGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTCGGCCACGGCAATTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGCGAATCGAATTCCCC--TCA--TATTTTCTTTAAGTCTTGGGAATAAGTCATAATCACAGGGGCTAATGT-CAGGAGAATATGGAGGATGGTCCAGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAAAGTGACGTCACACCCTGTGAAGTGTGCGGTGTCGCGTTGTCATGAANTATGATTGGACCGGCTCGCAATAGTTCTGGGCG-CTNTTTACGTATGGCTGGTCGTAGGCA--TT-T-TTAAT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGACCGTTTGACCGACTGGAAC--------CTTGTGACTTGTCAGAACTCCACGAATATCATACGCGAATATCATCAGTTGCTTTATTTTTCCTTGCACCCGACGGAACTTTGCCGGTCTCGGTGAGTTCGGGGTGTGCCGCTCGGCCGATTGTCGCTTCATCTCTGGTTCGTATGATCTAATCCACGTCTCGT-CTATGGCAACGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCTTCTGCATTGAAGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACTGTCAAGCGACGTTCAATTTGATCCGACGTTAGGCGATGGG-GCACCCATCG-----TGCG--GAAACTTTACGCA-----TTTTTAAAC-GGTTCCGTATAATTGAATGAACAGATCCCACACTAATGTCCAATTCCTGTGTTATTTCTTCACATGTCAATCTTCTGTCTGAACGTAAAA-GTTCCATCACTT-TTT-CGGTATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTAATGCATTAA--A---GATTTCTC-TCGCATT-CTTATTACGTCGAGACTCGATNTTTATGTAGCTGCGCT-----------GTTCA--N--------T--------TGAC----GT-------TG----C-------ACGC---TG-------A---TGACGTCAT---T-----C-----A-----A-----CG-T-----GC------------TCA-A--------G---------------T-T---TGC-----------AGAATAATTAGC---AA------GTAGTTGATT--CA-TT----AGCATGTCAAGTTTCATCACAAT-TACTGTAAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---ATTGAATG
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gi|12 : gacagtgtgacaccctgtgaagtgtgcgttgtcgcgatgttataaaataagaccgattcgcaatagttcttggtgcttttaacgtatgactgatctttctgaacgtaaaagtttcatcacattttccatattgaatgtatccgttgcggtcacattttacccacttcgctagttttcttcaatcgtgtacctactattcttaaattcattaagccatctagttacttgagaatatgaaatagaacattcaccgcaagcttcttgtaatgcatttaagttttctctcgcattcttataatgtcgagactcgatattgatgtagctgggctgtttaattgacgtgaccgcgttcatgatgcttatagtgacgtaACAAGGGTCATTCAATATATAATGCAACCTGTCACATAAACTTTTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCATATTATGATCCCTCAATGTAA-----TGTCTCCTGTGGTCAATGACCAATGTCCATCACTTCAGCAGGTCTTCTATTCCTGTTGC-TAGGCAACCGCACTCATATACCTTCACC--TGCTCGGCCATGGCAATTTCAA-TCTTCTCTATGTCAGCGAATGGAATTCCCCATTTATTTATTTTCTTTAAGTCTTGCGAGTAAATCA-------------TAATGT-CAGGAGAATATGAAGGATGGTCCAGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAAAGTGACGTCACACCCTGTGAAGTATGCGGTGTTGCATTGTCATGAACTATGATTGAACTGGCTTGCAAAAGTTTTGGGCGTTTTTTTTCATCTGGCTGGTTGTAtc
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gi|17 : --TT-T-TTATT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGAACGTaccct
gi|17 : tTTATTTGA------CGT-------------T---A----C-ACGC----T------G------ATGACGTCAT------TC-----ATGATAA-----CG-T-----GC----------------TCAGAG--------------T----T---T-G--C--------AGAAT------AA-----------T--T---ACC---A------------A------ATAGTTGATT--CA-TT----AGCATGTCAAGTTTCATCACAA--TACTGTGAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---AGTGAATGccatgatgcttttagtgacgttatttgacgttacacgctgatgacgtcattcatgataacgtgctcagagtttgcagaataattaccaaatagttgattcattagcatgtcaagtttcatcacaatactgtgagtagttttagagataattaataggttgcattatatagtgaatgaccctcg
gi|17 : ttttttattgtactccttgtagtatgtgctgttgaacgtccatgatgcttttagtgacgCGAGGGTCATTCACTATATAATGCAACCTATTA-ATTAaccctcg
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Reference ( family-8313 ) : ACGAGGGTCATTCAATATATAATGCAACCTATCACATNAATCATTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCGTATTATAATCCCTCAAAGTAA-----TGTCCCCTGTGGTCAATGACCGATGTCCATCGCTTCGGCAGATCTTCTATTCCCGTTGC-TAGGCAACCGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTCGGCCACGGCAATTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGCGAATCGAATTCCCC--TCA--TATTTTCTTTAAGTCTTGGGAATAAGTCATAATCACAGGGGCTAATGT-CAGGAGAATATGGAGGATGGTCCAGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAAAGTGACGTCACACCCTGTGAAGTGTGCGGTGTCGCGTTGTCATGAANTATGATTGGACCGGCTCGCAATAGTTCTGGGCG-CTNTTTACGTATGGCTGGTCGTAGGCA--TT-T-TTAAT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGACCGTTTGACCGACTGGAAC--------CTTGTGACTTGTCAGAACTCCACGAATATCATACGCGAATATCATCAGTTGCTTTATTTTTCCTTGCACCCGACGGAACTTTGCCGGTCTCGGTGAGTTCGGGGTGTGCCGCTCGGCCGATTGTCGCTTCATCTCTGGTTCGTATGATCTAATCCACGTCTCGT-CTATGGCAACGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCTTCTGCATTGAAGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACTGTCAAGCGACGTTCAATTTGATCCGACGTTAGGCGATGGG-GCACCCATCG-----TGCG--GAAACTTTACGCA-----TTTTTAAAC-GGTTCCGTATAATTGAATGAACAGATCCCACACTAATGTCCAATTCCTGTGTTATTTCTTCACATGTCAATCTTCTGTCTGAACGTAAAA-GTTCCATCACTT-TTT-CGGTATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTAATGCATTAA--A---GATTTCTC-TCGCATT-CTTATTACGTCGAGACTCGATTTTT---ATGTA-GC--TGCGCTGTTCANTTGA------CGT------GTCC-----AC----G------ATG-CT-------------T----TTAG-------------TGACGTCA-T------T-----T-----G-----A-----CG-T-----GC----------------TCAGAG--------------T----T---T-G--C--------AGAAT------AA-----------T--T---AGC---A------------A------GTAGTTGATT--CA-TT----AGCATGTCAAGTTTCATCACAA--TACTGTAAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---ATTGAATG
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gi|17 : --TT-T-TTATT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGAACGTaccct
gi|17 : tTGTA-GTA-TGTGCTGTTGA----A------CGT--------CC-----AT----G------ATG-CT-------------T----TTAG-------------TGACGTccatgatgcttttagtgacgttatttgacgttacacgctgatgacgtcattcatgataacgtgctcagagtttgcagaataattaccaaatagttgattcattagcatgtcaagtttcatcacaatactgtgagtagttttagagataattaataggttgcattatatagtgaatgaccctcg
gi|17 : ttttttattgtactcctTTATTTGA------CGT-------TAC-----AC----G------CTG------------------------A-------------TGACGTCA-T------TCATGAT-----A-----A-----CG-T-----GC----------------TCAGAG--------------T----T---T-G--C--------AGAAT------AA-----------T--T---ACC---A------------A------ATAGTTGATT--CA-TT----AGCATGTCAAGTTTCATCACAA--TACTGTGAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---AGTGAATGtatttgacgttacacgctgatgacgtcattcatgataacgtgctcagagtttgcagaataattaccaaatagttgattcattagcatgtcaagtttcatcacaatactgtgagtagttttagagataattaataggttgcattatatagtgaatgaccctcg
gi|17 : ttttttattgtactccttgtagtatgtgctgttgaacgtccatgatgcttttagtgacgCGAGGGTCATTCACTATATAATGCAACCTATTA-ATTAaccctcg
gi|18 : ttttttattgtactccttgtagtatgtgctgttgaacgtccatgatgcttttagtgacgttatttgacgttacacgctgatgacgtcattcatgataacgtgctcagagtttgcagaataattaccaaatagttgattcattagcatgtcaagtttcatcacaatactgtgagtagttttagagaCATT-TTTATTACGTCAATACTCGATTTT----ATGTA-GC--TGTGCTATTCA--TGA------TGC------ATTT-----------G------GTGACG-------------TCAAATTAA-------------TAACGTCA-T------TCAAGAT-----A-----A-----CG-T-----GC----------------TCAAAG--------------T----T---A-G--C--------AGAAT------AG-----------T--A---AGC---A------------A------GAAGTTCGTT--CA-TT----AGCATGTTTAGTTCCGTCACAA--TATTATAAACAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTCCATTATA----T---ATTGAAT
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gi|5 : TCCA--ATTT-TTT-CAGTATTGAAAGTATCTGTTGAGGTCACATTTGGACCACTTCGCTGGTTGTCTACAATTGTTTATTTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTCGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTCACCACAAGCTTCATGTAATGCGTTAA--A---AATTACTG-TCACATT-CTAATTACATCGAAACTTGATTTTT---ATGTA-GC--TGCACTGTTCAATTGA------CGTAACCCCGTCC-----AT----G------ATG-CTTTTAGTGATGTCAT----TTAACATTTCACCCTGATGATGTCA-T------T-----CAAGGCG-----A-----CG-T-----GC----------------TGAGAG--------------C----T---T-G--C--------AGAAT------AA-----------T--T---AGC---A------------A------GTAGTTGTTT--CA-GT----AGCATATCAAGTTTCATCACAA--TACTATAAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---ATTGAATttttcagtattgaaagtatctgttgaggtcacatttggaccacttcgctggttgtctacaattgtttatttaccattcttaaattcattaacccatctagttactcgagaatatgaaagagaacattcaccacaagcttcatgtaatgcgttaaaaattactgtcacattctaattacatcgaaacttgatttttatgtagctgcactgttcaattgacgtaaccccgtccatgatgcttttagtgatgtcatttaacatttcaccctgatgatgtcattcaaggcgacgtgctgagagcttgcagaataattagcaagtagttgtttcagtagcatatcaagtttcatcacaatactataagtagttttagagataattaataggttgcattatatattgaat
gi|6 : atataatcgttgtagtatgtgctgttggccgtttgaccgactggaaccttgtgccttgtcagaactccgcgaccatcatacgcaaatatcatcagttgctttatttttcctagcacccaacaaaactttgcttgtctaaatgagttcggggtgtgcagctcggccgattatcgcttcatctctggttcctatgatctaatccccctctcgtctatggcaaagatttttgaaagaaagtcctgtccttctgcattgaagtgcgaaagtaggttggtcgcaactgtcaagcaacattcaatttgatcagacattaggcgatgcgatccattttgtggaaactttacacatttttaaacagttgcgtatagttcaatgaacagatcccacactaatgACGAGGGTCATTCAATATATCATGCAACCTATCACATAAATCATTTATTATGAAAATCAGTGTAAATACTGTATTATAATCCCTCGAAGTAA-----TGTCCCTTGTGGTTAATGACCTATGTGTATCACTTCAACATATCTTCTATTCCTGTTGC-TAGGCAACCGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTTGGCCACAGCAATTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGTGAATCGAATTCCCC--TTA--TAATTTCTTTAAGTCATGGGAATAAGTCATAACCACTGGGGCTAAAGT-CAGGGGGATATGGAGGGTTGTCCAACTTATCCCATTTATATTCCGC--AAAAAATAACGTCACATCCGGTGAAGT-------------------------ATGACTGGACCGGCTCGCAGTAGTTCTGGGCT-CTGTTAACGTATGGCTAGTCGTAGGTA--TT-T-TTAAT-GTACTCCTTGCAGCATGTGCTGTTGACCGTTTGACCAACTGGAAC--------CTTGTGACTTATCAGAACTTAACGAATATCATACACGAATATCGTCCGTTGCTTTATATTTCATTGCACCCGACGGTACTTTGTCGATCTCGGTGAATTCAGGGTGTTCCACTCGGTCGATTGTCGCTTCATCTCTGGTTTTT-TTATCTAATCCACGTCTCGTCCTTTGG-AAAGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCTTCTGCATTAAAGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACCGTCAAACGACGTTCAA
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Reference ( family-8313 ) : ACGAGGGTCATTCAATATATAATGCAACCTATCACATNAATCATTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCGTATTATAATCCCTCAAAGTAA-----TGTCCCCTGTGGTCAATGACCGATGTCCATCGCTTCGGCAGATCTTCTATTCCCGTTGC-TAGGCAACCGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTCGGCCACGGCAATTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGCGAATCGAATTCCCC--TCA--TATTTTCTTTAAGTCTTGGGAATAAGTCATAATCACAGGGGCTAATGT-CAGGAGAATATGGAGGATGGTCCAGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAAAGTGACGTCACACCCTGTGAAGTGTGCGGTGTCGCGTTGTCATGAANTATGATTGGACCGGCTCGCAATAGTTCTGGGCG-CTNTTTACGTATGGCTGGTCGTAGGCA--TT-T-TTAAT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGACCGTTTGACCGACTGGAAC--------CTTGTGACTTGTCAGAACTCCACGAATATCATACGCGAATATCATCAGTTGCTTTATTTTTCCTTGCACCCGACGGAACTTTGCCGGTCTCGGTGAGTTCGGGGTGTGCCGCTCGGCCGATTGTCGCTTCATCTCTGGTTCGTATGATCTAATCCACGTCTCGT-CTATGGCAACGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCTTCTGCATTGAAGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACTGTCAAGCGACGTTCAATTTGATCCGACGTTAGGCGATGGG-GCACCCATCG-----TGCG--GAAACTTTACGCA-----TTTTTAAAC-GGTTCCGTATAATTGAATGAACAGATCCCACACTAATGTCCAATTCCTGTGTTATTTCTTCACATGTCAATCTTCTGTCTGAACGTAAAA-GTTCCATCACTT-TTT-CGGTATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTAATGCATTAA--A---GATTTCTC-TCGCATT-CTTATTACGTCGAGACTCGATTTTT---ATGTA-GC--TGCGCTGTTCAN-------TTGA-CGTGAC--C--G--TCC-----ACG----ATG-CTTTTAG--------------------------TGACGTCA-T------T-----T-----G-----A-----CG-T-----GC----------------TCAGAG--------------T----T---T-G--C--------AGAAT------AA-----------T--T---AGC---A------------A------GTAGTTGATT--CA-TT----AGCATGTCAAGTTTCATCACAA--TACTGTAAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---ATTGAATG
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gi|11 : acttcgccggtctcggtgcatttggtgtgtgccatttttcattttcggttggtccacgtttcatcaatatcaacaattttgaaaagaaagccaatgtcttctttatcgaaacgcgagagaaaatatgttgcgacttccaaacgatgttcctattgcaccgctatcaaacggcgagttacacaacgtgctgactctttcacgtttatgaactagttccacgcttacacgtttatatctttatctttgaatatttcttagggtaccattcttcgtttattattatttGTGACACCCTGTGAAGTGTGCGTTGTCGCGATGTTATAAAATA-----AGACCGATTCGCAATAGTTCTTGGTG-CTTTTAACGTATGACTGATCaggcatgtaatatgacgtcatt
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gi|17 : --TT-T-TTATT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGAACGTaccct
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gi|10 : ACTTCGCCGGTCTCGGTGCATTTGGTGTGTGCC---------ATT----TTTCATTTTCGGTTGGT----------CCACGTTTCAT-CAATATCAACAATTTTGAAAAGAAAG--CCAATGTCTTCTTTATCGAAACGCGAGAGAAAATATGTTGCGACTTCCAAACGATGTTCCTATTGCACCGCTATCAAACGGCGAG-TTACACAACG-----TGCT--GACTCTTT-CACG-----TTTATGAACTAGTTCCt
gi|10 : TT-TTT-CAGCATGAAAAGTGTCAGTGTCATTTATATATCGACCGTAGCGCGGGCAATCTT---TCATGTCTCTACCAT----ATATCC-TTAGTTC---TTTGAT-------TGCATATGAAT--ATACAATATAAAACACCTTCCACATACTTCTTA-----CATGGA--ACTTGATTTTCCATTGCATT-CTTAT---GGCGA---TC-ATTTTCTAAACGTATACAATGCGTTGGCCCTCTGAAG----TGACTACGTCCG-TAGTACGTAAGATGACTT--------------------------CTAG--------------------------CGACGTCACT------T-----T-----A-----A-----AG-T-----Gacgcttacacgtttatatctttatctttgaatatttcttagggtaccattcttcgtttattattattttttttcagcatgaaaagtgtcagtgtcatttatatatcgaccgtagcgcgggcaatctttcatgtctctaccatatatccttagttctttgattgcatatgaatatacaatataaaacaccttccacatacttcttacatggaacttgattttccattgcattcttatggcgatcattttctaaacgtatacaatgcgttggccctctgaagtgactacgtccgtagtacgtaagatgacttctagcgacgtcactttaaagtgaggcatgtaatatgacgtcatt
gi|11 : acttcgccggtctcggtgcatttggtgtgtgccatttttcattttcggttggtccacgtttcatcaatatcaacaattttgaaaagaaagccaatgtcttctttatcgaaacgcgagagaaaatatgttgcgacttccaaacgatgttcctattgcaccgctatcaaacggcgagttacacaacgtgctgactctttcacgtttatgaactagttccacgcttacacgtttatatctttatctttgaatatttcttagggtaccattcttcgtttattattatttGTGACACCCTGTGAAGTGTGCGTTGTCGCGATGTTATAAAATA-----AGACCGATTCGCAATAGTTCTTGGTG-CTTTTAACGTATGACTGATCaggcatgtaatatgacgtcatt
gi|11 : gacagtTCTTTCTGAACGTAAAA-GTTTCATCACAT-TTT-CCATATTGAATGTATCCGTTGCGGTCACATTTTACCCACTTCGCTAGTTTTCTTCAATCGTGTACCTACTATTCTTAAATTCATTAAGCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-ATAGAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTAATGCATTTA--A---GTTTTCTC-TCGCATT-CTTATAATGTCGAGACTCGATATTG---ATGTA-GC--TGGGCTGTTTAATTGACG----TGACCGCGTTCA-T---------GATG-CTT--------------------------ATAGTGACGTAATTTGACGTTGCACACTGATGACGTCA-T------T-----T-----A-----AGATAACG-T-----GC----------------TCAGAGT----T---T---G----------C--------AGT---------AT------AGT---TGGC---AA------GTAGTTGATT--CA-TT----Atttctgaacgtaaaagtttcatcacattttccatattgaatgtatccgttgcggtcacattttacccacttcgctagttttcttcaatcgtgtacctactattcttaaattcattaagccatctagttacttgagaatatgaaatagaacattcaccgcaagcttcttgtaatgcatttaagttttctctcgcattcttataatgtcgagactcgatattgatgtagctgggctgtttaattgacgtgaccgcgttcatgatgcttatagtgacgtaatttgacgttgcacactgatgacgtcatttaagataacgtgctcagagtttgcagtatagttggcaagtagttgattcattatc
gi|12 : gacagtgtgacaccctgtgaagtgtgcgttgtcgcgatgttataaaataagaccgattcgcaatagttcttggtgcttttaacgtatgactgaACAAGGGTCATTCAATATATAATGCAACCTGTCACATAAACTTTTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCATATTATGATCCCTCAATGTAA-----TGTCTCCTGTGGTCAATGACCAATGTCCATCACTTCAGCAGGTCTTCTATTCCTGTTGC-TAGGCAACCGCACTCATATACCTTCACC--TGCTCGGCCATGGCAATTTCAA-TCTTCTCTATGTCAGCGAATGGAATTCCCCATTTATTTATTTTCTTTAAGTCTTGCGAGTAAATCA-------------TAATGT-CAGGAGAATATGAAGGATGGTCCAGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAAAGTGACGTCACACCCTGTGAAGTATGCGGTGTTGCATTGTCATGAACTATGATTGAACTGGCTTGCAAAAGTTTTGGGCGTTTTTTTTCATCTGGCTGGTTGTAtc
gi|13 : tatCGGAGGTCATGCAATATATAAGGCAAC-------GTGAATCATTTATAAAGAAAATAAATGTAAAAACCGTATTA-------------TAA-----T---CCCT-----CAA--AGTAATGTCC--C-CTTTGGTAAGTGACCGATGTCCATCGCGTCGGCAG--------ATCTACAATTCCCAATGCTAGGCAACCGCG--TTCAAATATCCTCTAGGTCAGCGAATCGAATTTACC--T--------TTCTTTAAGCCATGGGGATAAGTCATAAGCACAGGGGCTAATGC-CACGTGAATGTGGAGGATGGTC-AGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAA-TTGACGTCACAGCCTGTGAAGCGTGCGGTGCCGCATTGTCTTGAAGTATGATTGGACCGGTTTGCAATA-----GAGCG---TTTTACGTATGGTTGGTCGTAGACATTTT-T-TTATT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGA
gi|14 : TTCAATCACTT-TTT-TGGTGTTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCTCCCACTTTGCTTGTTGTCCTC-ATT-TGTGT-------------ATTTA-----CCA--TT-------------CTTAA-AATTCATA-AA-C-----CCTTCACCGCAAGCTTCTTGCAATGCATTAA--A---GATTTCTT-TCACATT-CTTATTACGTCGAAACTCGATTTGT---ATGTA-GC--TGAACTGTTCAGCTGACG----TGATCGCGTCCA-T---------GATG-CTT--------------------------TTAG--------------------------TGACGTTA-TGTTACGT-----T-----GC----A-----CGAT-----GA----------------TGATGGT----A---T---T----------T--------AAG---------AT------AAT---GTGCTCAGA------GT--TTGATGAACAGTTAGCAAGCATGTCAAGTTTCATCACGA--TACTATAAGTAGAATTAGCGTTAA-TAATAGTTTGCATTATA----TATAATTGAAa
gi|15 : ATC-CTT-TTT-----AATGAAAGT--CC----CGACC----TTCGCCAACTTTACTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAAT-------TATTTGAGAAT--ATG-AA-ATAGAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTAATGCATTAATTAAATGATTTCTT-TTACATT-CTTATTACGTT---ATT--ATGTTT---ATGTA-GC--TGCGCTGTTCAATTGACG----TGACTGCGTCCA-T---------GGTG-CTT--------------------------TTAG--------------------------TGACGTCA-T------T-----T-----G-----A-----TG-T-----agacc
gi|16 : aTT-CTTATTACGTCGATACTTGATGTTT---ATGAA-GC--TGCGCTGTTCAAATGACG----TGACCGCGTCCA-T---------GATG-CTTTTAGTGACATCATTTGATGTTGCACGTTGG--------------------------TGATATCA-T------CAAAGAT-----A-----A-----CG-T-----GC----------------TCATATT----T---T---G----------C--------AGA---------AT------AAT---AAGC---AA------GTAGTTAATG--CA-TA----AGCATGTAAAGTTTCATCACAA--TTATGTAAGTTGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCACTATA----T---ATTGAATGtgcacgctggtgatatcgtcgaagataacattctt
gi|17 : --TT-T-TTATT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGAACGTaccct
gi|17 : tTGTA-GTA-TGTGCTGTTGAA----------------CGTCCA-T---------GATG-CTT--------------------------TTAGTGACGTTATTTGACGTTACACGCTGATGACGTCA-T------TCATGAT-----A-----A-----CG-T-----GC----------------TCAGAGT----T---T---G----------C--------AGA---------AT------AAT---TACC---AA------ATAGTTGATT--CA-TT----AGCATGTCAAGTTTCATCACAA--TACTGTGAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---AGTGAATGccatgatgcttttagtgacgttatttgacgttacacgctgatgacgtcattcatgataacgtgctcagagtttgcagaataattaccaaatagttgattcattagcatgtcaagtttcatcacaatactgtgagtagttttagagataattaataggttgcattatatagtgaatgaccctcg
gi|17 : ttttttattgtactcctCGAGGGTCATTCACTATATAATGCAACCTATTA-ATTAaccctcg
gi|18 : ttttttattgtactccttgtagtatgtgctgttgaacgtccatgatgcttttagtgacgttatttgacgttacacgctgatgacgtcattcatgataacgtgctcagagtttgcagaataattaccaaatagttgattcattagcatgtcaagtttcatcacaatactgtgagtagttttagagaCATT-TTTATTACGTCAATACTCGATTTT----ATGTA-GC--TGTGCTATTCA--TGATGCATTTGGTGACGTCAA------------AT--------------------------------TAA--------------------------TAACGTCA-T------TCAAGAT-----A-----A-----CG-T-----GC----------------TCAAAGT----T---A---G----------C--------AGA---------AT------AGT---AAGC---AA------GAAGTTCGTT--CA-TT----AGCATGTTTAGTTCCGTCACAA--TATTATAAACAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTCCATTATA----T---ATTGAAT
gi|19 : TTTCATCACTT-TTTTCGGTATTGAAAGTATCCATTGCGTTCGCATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTATTCAATTGTGAATATACCAGTCTTATATTCATTA---CAAGTCTAGT-------TACTTGAGCAT--ATG-AA-AGAGAACTTTCACAGCAAGCTTCTTGTTATGCATTAA--A---GATGTCTC-TCGCATT-TTTATCACATCGAGACTCGATTTaaccct
gi|2 : ACGAGGATAATTCAGTTAATAATGCAACCTATCACATCAATCTTTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCTTATTATAATCACTCAAA-TAAGTGTCCGTCCACTGTGATCAATGAC--A-----ATCGCTTTGGCAGATCTTCTAATCCCGTTGG-TAAGCAAACGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTCGGTCACAGCAAT-------CTCCTCTAGGTCATCGAATCGAATTCCAC--CCA--AATCTT------GTCTTGGGAATAAGTCATAATCACAGTGACTAATGT-CAAGAGAATATGGACGTTGGTCCAGCTTTTCC------------G---AAAAAATGACGTCACACCCTATAAAGTGTGCG--------TTGTCATGAATTGCTAGTGGAACGGCTCGCAATAGTTTTGGGTG-CCATTTACGCACGGCTGATCGTAGGCA--TT-TGTTAAT-GTACTCCTTGTGGTATGTGCTGTTGACCGTTTGACCGAATGGAAA--------AGTGTGACTTGTCAGAACTCAACGAATGTCATATG--AATATCA---GTTGCTTTATTTTTCCTTGCACCCGACGGAACCTTACTGATCTCGGCGAGTTCGTGGTGTGCCACTCGGCCGATTGTC-CTTCATCTCTGGTTCGTATGATCTAATCCACGTGTCGT-CTATGGCAAAGTTTTTTGAACGGAAGTCCAGA--CCTTCTGCATTGTTGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACTGTCGAGCGACATTCAATTTG------------GCGGTGGG-GCACCCGTC------TGCT--GAAACTTTATGCA-----TTTTTAAAC-GGTTTTATATAATTGAATGAACAAATCCTCCACAAATGTCCTATTCCTGTGTTATTTCTTCACATGTCATTCTTCTGTCTGAATGTAAAA-GTTCCATCATTT-TTT-CAGTATTGAAAGTATCTGTTGCGGTCACATTTCACATATTTCGCTGGTTGTTTTCATTCGTGTATCTACCATTCTTAATTTCA-TAATCGA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-ATAGAACATTTTCCGCAAGCTTCTTGTAATACATTGA--A---TATTTCTC-TCACATT-CTTATTACGTCGAGACTCGA-TTTT---ATGTA-GC--TGCGCTGTTTAATTGACG----TGACCGCGTTCA-T---------AATG-CTT--------------------------TTAA--------------------------TGACGTCA-T------T-----T-----G-----A--------T-----GC----------------T
gi|20 : tGAGGGTCATTAAATATATAATGCAATCTATCACATTAACCATTTATTATGAGAATAAATATAAATACCGTATCATAATTCCTCCAAGCAA-----TGTAGCCT-TGGTCAATGGCCGTTATTCATCACTTCGGTCGACCTTCTATTCTCGTTgcatgctgatgtcgtcattcaagataacgtgtccagatattgcagaat
gi|21 : atgtGATGGGTGCCCCCACCGCCATATGTGTCGAAAATTAACGCA-----TTTTTAAAC-GGTTGCGTATAGTTGAATGAACA
gi|22 : TAGTTTTAGAGATAATTGATAGGTTGCATTATA----T---ATTAAATG
gi|22 : CGAGGGTCATTTAATATATAATGCAACCTATCA-ATTAaccctcg
gi|3 : tagttttagagaCCGC--AAAAAGTGAC-TATCACCCTGTAAAGTGTTCGGTGTCACGTTGTCGTGAAGTATGATTGGACCAGTTCGCAATAGCTCTGGGAG-CATTTTACGTATGGTTGGTCGTAGGCA--TT-T-TTTATTGTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTCACCATTTGACCGACAGGAACATTGTGACTTTGTGACTTGTCAGAACTCCACAAATATCATATGCAAATATTATCAAATGCTTTATTTTTCCTTGCACCCGAAGGAACTCTGACAG-ATTGGTGAGTTTAGGGTGTGCCACTCGGTCAATCGTCACTTC-----TGGTTCGTATGATCTAATCCACGTCTCAT-ATATGGCAACGATTTTTGAAAGAAAGTCCTGA--CCTTCTGCATTCAAGTGCGAAAGTAGGTTAAGCGCAACTGGCATGCGATGTTCAATAAAATCCAATGTTAGGTGATGGG-GCACCGATCA-----TGCG--GAAACTTTACGCACACACTTTTAAAAA-GGTTCCATATAATTGAATGAACAGATCCCACTCTAATGTCCAATTCCTGTGTTATTTCTTCACATGTCAATCTTCTGTCTGAATGTAAAATGCT-CATCATTT-TAT-C-ATATTGAAAGTATCCGCTGTGGTCACATTTTGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCATTTGTGTATCTACCATTCTTA--------AACCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTTACCACAAACTTCTTGTAATGCATTAA--A---GATTTCTC-TTGCATA-C-TATTACATCAAGACTCGATTTTT---ATGTA-GC--TGCACTGTTCAAT---------TGACCGTGTTCA-T---------GATG-CTT--------------------------TTAG--------------------------TGACGTCA-T------T-----T-----GTCATTA-----CA-C-----GC----------------TGATGGTGTCAT---TCAAGATAACGTGCTC--------AGATTTTGCAGAAT------AAT---TAGT---AA------GTAGTTGATT--CA-TA----AGCATGTCATGTTTCATCACAA--TACTGTAGGTAGTTTTAGAGATATTTAATCGGTTGCATTATA----T---ATTGGATG
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gi|5 : tAT-ATAATCGTTGTAGTATGTGCTGTTGGCCGTTTGACCGACTGGAAC--------CTTGTGCCTTGTCAGAACTCCGCGACCATCATACGCAAATATCATCAGTTGCTTTATTTTTCCTAGCACCCAACAAAACTTTGCTTGTCTAAATGAGTTCGGGGTGTGCAGCTCGGCCGATTATCGCTTCATCTCTGGTTCCTATGATCTAATCCCCCTCTCGT-CTATGGCAAAGATTTTTGAAAGAAAGTCCTGT--CCTTCTGCATTGAAGTGCGAAAGTAGGTTGGTCGCAACTGTCAAGCAACATTCAATTTGATCAGACATTAGGCGATGCG---ATCCATTT-----TGTG--GAAACTTTACACA-----TTTTTAAAC-AGTTGCGTATAGTTCAATGAACAGATCCCACACTAATGTCCAATT
gi|5 : TCCA--ATTT-TTT-CAGTATTGAAAGTATCTGTTGAGGTCACATTTGGACCACTTCGCTGGTTGTCTACAATTGTTTATTTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTCGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTCACCACAAGCTTCATGTAATGCGTTAA--A---AATTACTG-TCACATT-CTAATTACATCGAAACTTGATTTTT---ATGTA-GC--TGCACTGTTCAATTGACG----TAACCCCGTCCA-T---------GATG-CTT--------------------------TTAGTGATGTCATTTAACATTTCACCCTGATGATGTCA-T------T-----CAAGGCG-----A-----CG-T-----GC----------------TGAGAGC----T---T---G----------C--------AGA---------AT------AAT---TAGC---AA------GTAGTTGTTT--CA-GT----AGCATATCAAGTTTCATCACAA--TACTATAAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---ATTGAATttttcagtattgaaagtatctgttgaggtcacatttggaccacttcgctggttgtctacaattgtttatttaccattcttaaattcattaacccatctagttactcgagaatatgaaagagaacattcaccacaagcttcatgtaatgcgttaaaaattactgtcacattctaattacatcgaaacttgatttttatgtagctgcactgttcaattgacgtaaccccgtccatgatgcttttagtgatgtcatttaacatttcaccctgatgatgtcattcaaggcgacgtgctgagagcttgcagaataattagcaagtagttgtttcagtagcatatcaagtttcatcacaatactataagtagttttagagataattaataggttgcattatatattgaat
gi|6 : atataatcgttgtagtatgtgctgttggccgtttgaccgactggaaccttgtgccttgtcagaactccgcgaccatcatacgcaaatatcatcagttgctttatttttcctagcacccaacaaaactttgcttgtctaaatgagttcggggtgtgcagctcggccgattatcgcttcatctctggttcctatgatctaatccccctctcgtctatggcaaagatttttgaaagaaagtcctgtccttctgcattgaagtgcgaaagtaggttggtcgcaactgtcaagcaacattcaatttgatcagacattaggcgatgcgatccattttgtggaaactttacacatttttaaacagttgcgtatagttcaatgaacagatcccacactaatgACGAGGGTCATTCAATATATCATGCAACCTATCACATAAATCATTTATTATGAAAATCAGTGTAAATACTGTATTATAATCCCTCGAAGTAA-----TGTCCCTTGTGGTTAATGACCTATGTGTATCACTTCAACATATCTTCTATTCCTGTTGC-TAGGCAACCGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTTGGCCACAGCAATTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGTGAATCGAATTCCCC--TTA--TAATTTCTTTAAGTCATGGGAATAAGTCATAACCACTGGGGCTAAAGT-CAGGGGGATATGGAGGGTTGTCCAACTTATCCCATTTATATTCCGC--AAAAAATAACGTCACATCCGGTGAAGT-------------------------ATGACTGGACCGGCTCGCAGTAGTTCTGGGCT-CTGTTAACGTATGGCTAGTCGTAGGTA--TT-T-TTAAT-GTACTCCTTGCAGCATGTGCTGTTGACCGTTTGACCAACTGGAAC--------CTTGTGACTTATCAGAACTTAACGAATATCATACACGAATATCGTCCGTTGCTTTATATTTCATTGCACCCGACGGTACTTTGTCGATCTCGGTGAATTCAGGGTGTTCCACTCGGTCGATTGTCGCTTCATCTCTGGTTTTT-TTATCTAATCCACGTCTCGTCCTTTGG-AAAGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCTTCTGCATTAAAGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACCGTCAAACGACGTTCAA
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gi|7 : AGGGTTATTCGATATATAATGCATCCTGTTAaaccct
gi|8 : tcggccgattgttgcttcatctctggtttgtatgacctgatccacgtctcgtttatggcaacgaatttgggaagaaagtaagcctaggtcggtcgtgactgtcaagcgactttcaagtttatccgacgtaaggcgatggggtactaatcgtgcggaaactttacgcatttttaaacggttccgtataatttaatgagcatatcccacactaatgtcgaattcatgtgttatttcttcacatgtcaatcttttgtatgaacgtaaaagttccatcactttttcggtatcgaaaatattcgttgtggtcacatttcgccaacttcgctggttttcttcagttgtgtatcttaattaaattcattaatccgtctagttacattgtacttgagaatatgaaagagaacattaaccgcaagctttttgtaatgcattaaggaattctctcgcattccttattacgtcgagattcgatttatatgttgctgcgctgacgtgaccgcgtccatgatgcttttagtgacatcagttgacgttgcacgctgatgacgtcattcaaaataacatgctcagagtttgcagaataatagcaagtacatgtagttgattcgttagcatgtgaagtttcatcacaatactgtaagaatttttacagatagtGAGGGTTATTCAATA----A-GCAACCTACCACATTAATCATTTATTATGAAAATAAATTTAAATACTCTATTATAATCCCTCAAAGTAA-----TGTATACTGTGGTCAATGACCGATGTCTATTGCTTCAGCAGATCTTCTATTTCCGTTGC-TTGGCAACCGTGCTCATAAGCCCTCAAC--TGCTCGGCCACGGCCATTTCAA-ATTTATCTTTGTCAGCGAATCGAGTTCTCC--TCA--TATTTTCTAAAAGTCTTTGGAATAAGTGAT-ATCACAGGGGCTAATGTAAAGGAAAATATTGTGGACGGTCCAGCTTTTCCCATTCCTATTCCGCAAAAAAAGTGACGTCACACCGTGTGAAGTGTTCGTTGTCGCGTTGTCATGAAATATGATTTGATCGGCTCGTAATAGTTCTGGGCG-CT-TTTACGTAGGGCTGGTTATAGGCA--TTGT-TTAAT-GTACGCCTTGTA
gi|8 : CTTGT----ACTCCACGAATACCATACGCGAATATCATCAGTTGCTTTATTTTTCCTTGCACCTGACAGAACTCTTCCGGTCTCGGTGCGTTC-GAGTGTGCCACTCCGCCGATTGTCGCTTCATCTCTTGTCCGTATGATATAGTCCGCGTCTCGT-ATATGACAATCCTTTTT-AATGAAAGTCCCGA--CCTTctccacgaataccatacgcgaatatcatcagttgctttatttttccttgcacctgacagaactcttccggtctcggtgcgttcgagtgtgccactccgccgattgtcgcttcatctcttgtccgtatgatatagtccgcgtctcgtatatgacaatcctttttaatgaaagtcccgacctt
gi|9 : gagggttattcaataagcaacctaccacattaatcatttattatgaaaataaatttaaatactctattataatccctcaaagtaatgtatactgtggtcaatgaccgatgtctattgcttcagcagatcttctatttccgttgcttggcaaccgtgctcataagccctcaactgctcggccacggccatttcaaatttatctttgtcagcgaatcgagttctcctcatattttctaaaagtctttggaataagtgatatcacaggggctaatgtaaaggaaaatattgtggacggtccagcttttcccattcctattccgcaaaaaaagtgacgtcacaccgtgtgaagtgttcgttgtcgcgttgtcatgaaatatgatttgatcggctcgtaatagttctgggcgcttttacgtagggctggttataggcattgtttaatgtacgcTCAATTTGATCCGACGTTAGGTGATGGT-GCACCAATCG-----TGTG--GAAACTTTACGCA-----TTTTAAAAC-GGCTCCGTGTAATTGAATGAACTGATCCCACACTAATGTCCAATTCCTGT-------CTTCACATGTCAGTCTTATGTCTGAACATAAAA-GTTCCATCACTT-TTT-CGGTATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCG--ACTAGT-------TACTTGAGAAT--ATGAAA-AAAGAACATTCACTGCAAGCTTCTTGTAATACATTAA--A---GATTGATC-TCGCATT-CTTATTACGTCGAGACTCGACTTTT---ATGTA-GC--TGCGCTGTTCAATTGACA----TGACCGCGTCCA-C---------GATG-CTT--------------------------TTTA--------------------------TGACGTCA-T------T-----T-----G-----A-----CG-TTGTACGCTGATGATGTAAT----TCAAGAT----TACAT---G----------CTCAAAGTTAGC---------AG------AATTATTAGC---AA------GAAGTTGATT--TA-TT----AGCATATCAAGTTCCATTACAA--TACTATAAGTAGTTTTAGAGATAAGTAATAGGTTTCATTATATACGT---ATTGAAT
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Reference ( family-8313 ) : ACGAGGGTCATTCAATATATAATGCAACCTATCACATNAATCATTTATTATGAAAATAAATGTAAATACCGTATTATAATCCCTCAAAGTAA-----TGTCCCCTGTGGTCAATGACCGATGTCCATCGCTTCGGCAGATCTTCTATTCCCGTTGC-TAGGCAACCGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTCGGCCACGGCAATTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGCGAATCGAATTCCCC--TCA--TATTTTCTTTAAGTCTTGGGAATAAGTCATAATCACAGGGGCTAATGT-CAGGAGAATATGGAGGATGGTCCAGCTTTTCCCATTCATATTCCGC--AAAAAGTGACGTCACACCCTGTGAAGTGTGCGGTGTCGCGTTGTCATGAANTATGATTGGACCGGCTCGCAATAGTTCTGGGCG-CTNTTTACGTATGGCTGGTCGTAGGCA--TT-T-TTAAT-GTACTCCTTGTAGTATGTGCTGTTGACCGTTTGACCGACTGGAAC--------CTTGTGACTTGTCAGAACTCCACGAATATCATACGCGAATATCATCAGTTGCTTTATTTTTCCTTGCACCCGACGGAACTTTGCCGGTCTCGGTGAGTTCGGGGTGTGCCGCTCGGCCGATTGTCGCTTCATCTCTGGTTCGTATGATCTAATCCACGTCTCGT-CTATGGCAACGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCTTCTGCATTGAAGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACTGTCAAGCGACGTTCAATTTGATCCGACGTTAGGCGATGGG-GCACCCATCG-----TGCG--GAAACTTTACGCA-----TTTTTAAAC-GGTTCCGTATAATTGAATGAACAGATCCCACACTAATGTCCAATTCCTGTGTTATTTCTTCACATGTCAATCTTCTGTCTGAACGTAAAA-GTTCCATCACTT-TTT-CGGTATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-AGAGAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTAATGCATTAA--A---GATTTCTC-TCGCATT-CTTATTACGTCGAGACTCGATTTTT---ATGTA-GC--TGCGCTGTTCAATTGACG----TGACCGCGTCCA-T---------GATG-CTT--------------------------TTAG--------------------------TGACGTCA-T------T-----T-----G-----A-----CG-T-----GC----------------TCANAGT----T---T---G----------C--------AGA---------AT------AAT---TAGC---AA------GTAGTTGATT--CA-TT----AGCATGTCAAGTTTCATCACAA--TACTGTAAGTAGTTTTAGAGATAATTAATAGGTTGCATTATA----T---ATTGAATG
gi|1 : ACGAGGGTCATTCAATATATAATTTAACATATCACATTAATCATTTATAATGAAAATGAATGTCAATACCGTATTATTATCCTTCAAAGTAA-----TGTCCCCTGTGGTCAAAGACTGATGTCCATCGCTTCAGCAGATCTTCTATTCCCGTTGT-TAGGCAACCGCGCTCATATACCTTCACC--TGCTCGGCCACGCCATCTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGCGAATCGAATTCCCC--TCA--TATTTTCTTTAAGTCTTGGGAATTAGTCATAATCACAGGGGCTAATGT-CAGAAGAATATGGAGGATGGTCCAGCTTTACCCATTCATATTAAAC--AAAAAGTAACGTCAAACCCTGTGAAGTGCGCGTTGT-GCCTTATCATAAATTATGGTTGAAACGGCTCGCAATAGTTTTGGGCG-CTATTTACGTATGACTACATGTAGGCA--TT-T-TTAAT-GTACTCTTTGTAGTATGTGCTGTTGACTGTTTGACCGACTGGGAC--------CTTATGACTTGTCAGAACTCCACGAATATCCTACGCGAATATCATCAGTTGCGCTATTTTTCCTTATACCCGACGGAAAATTGCCTGTCCCGCTGATTTCGGGATGTGCCATTCGGTTGATTGTCGCTTCATCTCTGATTCGTATGATCTAATCAACATCTCGT-CTATGGCAACCATTTTTGAACGAAAGTCTCGA--CCATCTGCATCGAAGCACGAAAGTATGTTGGTCGCGACTGTCAAACGACGTTCAATTTGATTCGACGTTAGGCAATGGG-GCACCCATCG-----TGCG--GAAAGTTTACGCA-----TTTCTAAAC-GGTTCTATATAATTGAATGAACAGACCCCACACTAATATCCAATTCCTGTGTTATTTCTTTACAATTCAATCTTCTTTCTAAACGTAAAA-GTTTCATTACAT-TTT-CCGCATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTTTTCAATTGTGTATCTTCTATTTTTAAATTCATTAACCCA--TCTAGT-------TACTTGAGAAT--ATG-AA-AGAAAACATTCACCGCAAGCTTCTTGTTATGCATTAA--A---GATTTCTG-TCGCATT-CTTATTATGTCGAGACTCGATACTG---ATGTA-AC--TGCACTG-TCATTTGACG----T---TGCA--CACT---------GA--------------------------------------------------------------TGACGTAA-T------T-----T----------------------------------------------ACAGT----T---T---A----------C--------AGG---------AT------AAT---AAGC---AA------GTAGTTGATT--CA-TT----AACATGCCAAGTTGCA--ATAATGTACTATAAGCAGTTTTAGAGATAATCAATTTGTTG-GTTATA----T---ATTGAATG
gi|10 : ACTTCGCCGGTCTCGGTGCATTTGGTGTGTGCC---------ATT----TTTCATTTTCGGTTGGT----------CCACGTTTCAT-CAATATCAACAATTTTGAAAAGAAAG--CCAATGTCTTCTTTATCGAAACGCGAGAGAAAATATGTTGCGACTTCCAAACGATGTTCCTATTGCACCGCTATCAAACGGCGAG-TTACACAACG-----TGCT--GACTCTTT-CACG-----TTTATGAACTAGTTCCt
gi|10 : TT-TTT-CAGCATGAAAAGTGTCAGTGTCATTTATATATCGACCGTAGCGCGGGCAATCTT---TCATGTCTCTACCAT----ATATCC-TTAGTTC---TTTGAT-------TGCATATGAAT--ATACAATATAAAACACCTTCCACATACTTCTTA-----CATGGA--ACTTGATTTTCCATTGCATT-CTTAT---GGCGA---TC-ATTTTCTAAACGTATACAATGCGTTGGCCCTCTGAAG----TGACTACGTCCG-TAGTACGTAAGATGACTT--------------------------CTAG--------------------------CGACGTCACT------T-----T-----A-----A-----AG-T-----Gacgcttacacgtttatatctttatctttgaatatttcttagggtaccattcttcgtttattattattttttttcagcatgaaaagtgtcagtgtcatttatatatcgaccgtagcgcgggcaatctttcatgtctctaccatatatccttagttctttgattgcatatgaatatacaatataaaacaccttccacatacttcttacatggaacttgattttccattgcattcttatggcgatcattttctaaacgtatacaatgcgttggccctctgaagtgactacgtccgtagtacgtaagatgacttctagcgacgtcactttaaagtgaggcatgtaatatgacgtcatt
gi|11 : acttcgccggtctcggtgcatttggtgtgtgccatttttcattttcggttggtccacgtttcatcaatatcaacaattttgaaaagaaagccaatgtcttctttatcgaaacgcgagagaaaatatgttgcgacttccaaacgatgttcctattgcaccgctatcaaacggcgagttacacaacgtgctgactctttcacgtttatgaactagttccacgcttacacgtttatatctttatctttgaatatttcttagggtaccattcttcgtttattattatttGTGACACCCTGTGAAGTGTGCGTTGTCGCGATGTTATAAAATA-----AGACCGATTCGCAATAGTTCTTGGTG-CTTTTAACGTATGACTGATCaggcatgtaatatgacgtcatt
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gi|6 : atataatcgttgtagtatgtgctgttggccgtttgaccgactggaaccttgtgccttgtcagaactccgcgaccatcatacgcaaatatcatcagttgctttatttttcctagcacccaacaaaactttgcttgtctaaatgagttcggggtgtgcagctcggccgattatcgcttcatctctggttcctatgatctaatccccctctcgtctatggcaaagatttttgaaagaaagtcctgtccttctgcattgaagtgcgaaagtaggttggtcgcaactgtcaagcaacattcaatttgatcagacattaggcgatgcgatccattttgtggaaactttacacatttttaaacagttgcgtatagttcaatgaacagatcccacactaatgACGAGGGTCATTCAATATATCATGCAACCTATCACATAAATCATTTATTATGAAAATCAGTGTAAATACTGTATTATAATCCCTCGAAGTAA-----TGTCCCTTGTGGTTAATGACCTATGTGTATCACTTCAACATATCTTCTATTCCTGTTGC-TAGGCAACCGCGCTCATATACCCTCACC--TGCTTGGCCACAGCAATTTCAA-TCTCCTCTAGGTCAGTGAATCGAATTCCCC--TTA--TAATTTCTTTAAGTCATGGGAATAAGTCATAACCACTGGGGCTAAAGT-CAGGGGGATATGGAGGGTTGTCCAACTTATCCCATTTATATTCCGC--AAAAAATAACGTCACATCCGGTGAAGT-------------------------ATGACTGGACCGGCTCGCAGTAGTTCTGGGCT-CTGTTAACGTATGGCTAGTCGTAGGTA--TT-T-TTAAT-GTACTCCTTGCAGCATGTGCTGTTGACCGTTTGACCAACTGGAAC--------CTTGTGACTTATCAGAACTTAACGAATATCATACACGAATATCGTCCGTTGCTTTATATTTCATTGCACCCGACGGTACTTTGTCGATCTCGGTGAATTCAGGGTGTTCCACTCGGTCGATTGTCGCTTCATCTCTGGTTTTT-TTATCTAATCCACGTCTCGTCCTTTGG-AAAGATTTTTGAAAGAAAGTCCCGA--CCTTCTGCATTAAAGCGCGAAAGTAGGTTGGTCGCGACCGTCAAACGACGTTCAA
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gi|8 : CTTGT----ACTCCACGAATACCATACGCGAATATCATCAGTTGCTTTATTTTTCCTTGCACCTGACAGAACTCTTCCGGTCTCGGTGCGTTC-GAGTGTGCCACTCCGCCGATTGTCGCTTCATCTCTTGTCCGTATGATATAGTCCGCGTCTCGT-ATATGACAATCCTTTTT-AATGAAAGTCCCGA--CCTTctccacgaataccatacgcgaatatcatcagttgctttatttttccttgcacctgacagaactcttccggtctcggtgcgttcgagtgtgccactccgccgattgtcgcttcatctcttgtccgtatgatatagtccgcgtctcgtatatgacaatcctttttaatgaaagtcccgacctt
gi|9 : gagggttattcaataagcaacctaccacattaatcatttattatgaaaataaatttaaatactctattataatccctcaaagtaatgtatactgtggtcaatgaccgatgtctattgcttcagcagatcttctatttccgttgcttggcaaccgtgctcataagccctcaactgctcggccacggccatttcaaatttatctttgtcagcgaatcgagttctcctcatattttctaaaagtctttggaataagtgatatcacaggggctaatgtaaaggaaaatattgtggacggtccagcttttcccattcctattccgcaaaaaaagtgacgtcacaccgtgtgaagtgttcgttgtcgcgttgtcatgaaatatgatttgatcggctcgtaatagttctgggcgcttttacgtagggctggttataggcattgtttaatgtacgcTCAATTTGATCCGACGTTAGGTGATGGT-GCACCAATCG-----TGTG--GAAACTTTACGCA-----TTTTAAAAC-GGCTCCGTGTAATTGAATGAACTGATCCCACACTAATGTCCAATTCCTGT-------CTTCACATGTCAGTCTTATGTCTGAACATAAAA-GTTCCATCACTT-TTT-CGGTATTGAAAGTATCCGTTGCGGTCACATTTCGCCCACTTCGCTGGTTGTCTTCAATTGTGTATCTACCATTCTTAAATTCATTAACCCG--ACTAGT-------TACTTGAGAAT--ATGAAA-AAAGAACATTCACTGCAAGCTTCTTGTAATACATTAA--A---GATTGATC-TCGCATT-CTTATTACGTCGAGACTCGACTTTT---ATGTA-GC--TGCGCTGTTCAATTGACA----TGACCGCGTCCA-C---------GATG-CTT--------------------------TTTA--------------------------TGACGTCA-T------T-----T-----G-----A-----CG-TTGTACGCTGATGATGTAAT----TCAAGAT----TACAT---G----------CTCAAAGTTAGC---------AG------AATTATTAGC---AA------GAAGTTGATT--TA-TT----AGCATATCAAGTTCCATTACAA--TACTATAAGTAGTTTTAGAGATAAGTAATAGGTTTCATTATATACGT---ATTGAAT