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lowQualScore : .. . . .. . . ..................................................... . . .... . . . . . ......... .. . .. . . . . . . . . . .. . . . . . . . . ...... ..... .. . . ...... . ......... . .. ..... . ............................... . . ................ . ...... . ..... . .... ... .... .......... . .. . . .. . . . ..... . . . . ..... ... . . .. .... . ....... ... .... ..... . . . .................................... . . .. . . . . . . . . .... . .. . . . . . ....... . . .. .... . .. .... . . .. .. . . ..... . . . .... .............. . .
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Reference ( gi|1 ) : ACCATTGAGCGACCACAAACTGTTCCTCGATCGAGTGCAGTCACTAGTGTGTATAT---------------------T-----------GGA----------------GTTT-TATGTTAACACTGCTATATATA----TTCGGGTGTGTGGGACGACAAGGGACCGAATC-CC--T--GAAGCATTCTATCCTATCCCCCACACCATCAGGCTGAGAAAATATCCTGGGTTAACCTTTCATTAAGCTCCACTTTCGATGAGACGCTAATAATGAACAATTGACTGTTTAGTAGGTAGACATAGAAACATGATGTTGATATGGGCTCAATAAAACAAATAGGCCAGCTGAGTTTCGCATCGGACAGTATTCATTATTGGGTAGCTAACCTACGTATGACATTTTA--AG-TTATGTAGGCCTAGTTCATTTCAGCT-AAAAAGTCCATCCACATT------A--TTTTCAAAC-CGACAA--AACGTT--TTCTGTTAGTTTCTTG--TTGTTTTTTT----------TTTAC--AAGTAAGTTGTGATATTC-------AAG-C--T-TT-TCAGC-AGA-ATGGAAACAATGCTCAATACGTTTCGACAGTG-CAGTTGTACACAA--C-TC---GAC----ATA----------AGTA--TTTTGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTATACCA-TTCCTCCGCTCTCTGTACCGAT-C-----ACATTTCGGCAT-ATTTCGCCAGTTTTAC--TA-TGTATTTTATCGTCGGAA-AATTT-AGAC---TTT-TTAA---AT----GTTTATAG----GTTATAAGTAAACATACATGT-------A-----------T---G----C----A-TTCGGGATTAAAACAACGATAGAGGCCGA-TTAAGAAGGTGAGGGAGAGCTCTTAATATCAGAATTGTCCCG-CGTCTGAACTGAAGAAAAC-TATTTTCAAAGAAACCGTAC-TTCAGATGTTTATGAGACATTGTCTACAAGTTTAAGCTT---CAGAAA-AACGGGTCGAACTATGGACT--TA-TATTTTTTAAAAACAAT-TTTGTTAATGAAAAA--CCACATA-TTT-CTTACCTACCATATGCTGTTTTTATGTCATC-----T-AACTCTGAAGCGGAAGTTGCGCGTATGGTACAGGCATCT-GTACCAGGCATCTGTACCATTAGTGCGTTTAGCAA
gi|7 : ACCATCAAGCGACCACAAACTGTTCATCGATCGAGTGCAGACACCAGTGTGTATATGGACGGATGTTTATGAGAGTCT-----------GGA----------------TTTG-TATATTAATACTGCTATATATAAATATTCGGGTGTGCGGGACGACACGGGGTCCAGCC-CC--T--GCGACATTCCTTCCTATCCCCCACGCCATCATGCTGGAAAAATATGCTGGGTTCGCCTTTCATTAATCTCCACATTCGATGAGGCGATAATAATCAACAATTGACTGTTCAGTAGGTAGACCTAAACACACGATGTTGATATGGGGCCAATAAAACAAATAGGCCAGCTGAGTTCTGCATCGGACAGTATTTATTACTGGGTAGCCA----ACGTATGACATTTTA--AG-TTAAGTAGGCCTATTTCATTTAAGCT-AAAAAGTACATCCACATT------A--TTTTTAAAC-CGACAA--AACATT--TTATGTTAGT---TTA--TTGATTTGTT----------TTTAC--GAGTATGTTGTGGTATTT-------AAA-C--T-TT-TCTGT-GGG-ATGGAAACAATGCTCAATACGTTTCGACAGT
gi|5 : ACCACCAAGCGACAAGAAGCTGTTCACCGATCGAGTGCAGACACCAGTGTGTACAC---------------------T-----------GTA----------------GT
gi|2 : TATTCCCCGGTGGAGTGCACACACTAGTGTGTATAT---------------------TGTAGTTGTATGGGAAATTATGAGAGTCTGGGTTTATATGTTAACACTGCTATATATA----TTCGGGTGAG-AAGACGACAAGAGACTGAACCACC--TTTGTGGAATTCCCTCCTATCCCCTACACCATCATGCTG-GAAAATATCCTAGGTTAACCTTTCATTAAGCTCCACTTTCTATGAGGCGCTAATAATCAACACTTGACTGTTCAAAA---AGACTTAAACACATAATATTGATATGGGCCCAATAAAATAATTAGGCCAGCTGAGATCCGCATCGGACAGTATTCATTATTGGGTAGC----CTACGAATGACATTTTA--AG-TTATGTAGGCCTATATCATTTCAGCT-AAAAAGTCCAACCACATT------A--TTTTCAAAC-CGACAA--AACGAT--TTCTGTTAGTTTATTGAGTTGTTTTT---------------AA--GAGTATGTTGTGGTATTC-------AAA-C--C-TT-TCAGT-GGG-ATGGAAACAATACCCAATACGTTTCGACAGTG-CAGTTGTACGCTA--G-TC---GAC----ATA----------AGTA--TTTTGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCATTTTTTCCGCTCTCTGTACCGAT-C-----ACATTTTGGCAT-ATTTCG--A--TTTAC--CA-TGTATTTAATCGTTGGAG-AATTG-GGAC---TTA-TTAA---AC----GTTTATAT----GTTCTATTTAAACATACATAT-------AAGTATAAAGGTT---G----A----A-TTTGGAATTAAAACGACGATAGAGGCCGA-CTTAGACGGCGAGGTAGAGCTCTTAATATCACAATCGTCTAA-TGTCTGAACAGAAGAGAAC-GATTTTCAAAGAGACCGTAC-ACCCGATGTTTATGAGACATCATATACAAGTTTAAG-TTAAAAAAAAA-AACGGGTCGAACTgtaggtaatcagatgtgccgtatcggatgtttgtgagagtcttgatttttatgttaacacagctgtatatatttggtgtttggggcgacaagggatccaaccccgtgacaatacctcctattccacacaccatcgagctggtaaaatattctggattcgcctttcattaatcttcactttcgataaggctctaataatcaacaactggctgttcagtaagtagacctagatacaagatgttgatatggaccaaataaaataaaaaggcaagtcgagttctgcatcgaaaattattcattattgggtagcctatgtatgacattttaagtgtaggcctattgtatttaaaagtccatccacattattttttcaaactgacaaaacattttctgttagtttattgatgtgttttttacaagtatgttgtggcattcaaattttttcagcgggattgaaacaatgctcaatgtgtttcgacaattttgttgtacacagctcaatgacatataattatttcatttttattttcatagaacgtg
gi|5 : GA----------------TTTT-TATGTTAACACAGCTGTATATA----TTTGG-TGTTTGGGGCGACAAGGGATCCAACC-CCG-T--GA--CAATACCTCCTATTCCACACACCATCGAGCTGGTAAAATATTCTGGATTCGCCTTTCATTAATCTTCACTTTCGATAAGGCTCTAATAATCAACAACTGGCTGTTCAGTAAGTAGACCTAGATACAAGATGTTGATATGGACCAAATAAAATAAAAAGGCAAGTCGAGTTCTGCATCGAAAATTATTCATTATTGGGTAG----CCTATGTATGACATTTTA--AG----TGTAGGCCTATTGTATTT-------AAAAGTCCATCCACATT------ATTTTTTCAAAC-TGACAA--AACATT--TTCTGTTAGTTTATTG--ATG--TGTTT----------TTTAC--AAGTATGTTGTGGCATTC-------AAATT--T-TT-TCAGC-GGG-ATTGAAACAATGCTCAATGTGTTTCGACAATT-TTGTTGTACACAG--C-TCAATGACAT--ATA----------ATTA--TTTCATTTTTATTTTCATAGAACGTG
gi|13 : accaccaagcgacaagaagctgttcaccgatcgagtgcagacaccagtgtgtacactgtagtgtaggtaatcagatgtgccgtatcggatgtttgtgagagtcttTTT-TATGTTAACACTACTTTATATA----TTTGGGTGTGTGGGATGACAAGGGACCAAAAC-CCCTT--G--GCATTCCCTCCTATCCCCCACACCATCATGCTGAAAAAATATCCTGGGTTAACCTTTCATTAAGCCCCACCTTCGATGGGGCTCTACTAGTCAACACTTCACTGTTCA--AGGTAGACTTAAACACATGATGTTGATATAGGCCCAATAAAATAAATAGGCCAGCTGAGTTCCGCATCCGACAGTATTCATTATTGGGTAG----CCTACGTATGACATTTTA--AG-TTATGTAGGCCTATTTCATCTAAGCT-AAAAAGTCCATCCACATT------A--TTTTCAAAC-CGTCAA--AAC-TT--TTC
gi|3 : gcggtCATGATGTTGATATGGGCCCAATAAAATAAATAGGCAAGCTGAGTGACGTATTGGACAGTATTCATTATTGGGTAGT----CTACGTATGAAATT---------------GGCCTATTTCATTT---------------ATCCACATT------AT-TTTTCAAAC-CGACAA--AACATT--TTCTGTTAGTTTATTG--AT-TTGTTTT----------TTTAC--GAGTATGTTGTGGTATTC-------AAA-C--T-TT-TCGGT-GAC-ATGGAAACAATGCTCAGTACATTTCG
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gi|6 : CGCATCGGGCAGTTTACATTAATGG---------CTACGTATAACATT--A--AA-TTATG-----------CATTCCAG-----AAAG-----CCAAATTCTAAAGG--TTTTCAAAAACGACAT--TATATG--TTCTGTTAGTTTATTAATTTATTTGTTT----------TTGAT----GTCGGTTGTGGTATTA-------AAA-CATTGTT-TAAGG-AGG-ATGCAAACAATGTGCAATATGTT-CGACAGTT-CGAC---ATACAA--A-TT---GAC----ATA----------ATAA--TGCCATTCTTATTTTCATAGAACGATTTCTGTACCA-CCTTCCCGATCTCTGTACCGTT-C-----ACACTTTGGC-------------------------GTATTTCGTTAACG--A-ACTTTGAG----------TAA---AT----ATGCAT--------TA-AAGTGAACACA-ATG--------G-----------T---T----C----AATTTGAGATTTAAAAAACGAAAGATAT--A-CTAAG--TGTGA--------TCTTT-TCTCAAGATTGCCTCA-CATTTGAACAGAAGGAAAC-GATTTCCAAAGAAACCGTAC--TCA----------AGCTACCGTCTACAAGTTGAAGCTT---CAG--A-AACAGGTCG-ATTATGAATT--TA-AA----TTAAAAACAGT-GATGATAATcacagatttcatttttgatttctgaaacactttcaatcacctt
gi|4 : TTTTACCAGACTATGTAGGCCTATTTAATTTAAGCTTAAAAAGTCCATCCACATT------A--TTTTCAGAC-CGACGA--AAAATTAATT---TTAGTTTATCGA-TTGTTTTTAC----------T--ACTTGAATATGTTGTGGTATTC-------AAA-C--C-TT-TCAGT-GGG-TTGGAAACAATGTTCAATACTGTTCGACAGTT-CTGCTGTACACAA--C-TC---AAC----ATA----------ATTA--TTTTGTTCTTATGTTCGTAGAACATGTTCTGTACCACTTCCTC-GCTCTCTGTACTGAT-CGATCAACATTTGGCCAT-ATTTTG----TTTTAC--CA--AT-TTTTACC----------------AC---TTA-TTAA---AT----GTTTATAT----GTTATATTGAAACATACAAGT-------AAGTATAAGGATT---G----A----A-TTCGGGATTAAAACAGCGATAATGATCAA-TTTGAAAGGCGCGGTAGAGTTCTAAATGTCAAAAT---CACATCATCTAAGCAGAAAAAAAAAGATTTTCAAAGAAACCGTAC-TCCTGATGTTTCTGAGAAATCGTCTACAAGTTAAAACTT------AAATGACGGGTCAAACTATGGATT--TA-AATTTTTAAAAAACAAT-TATGATAATGAATAA--TAACATA-TTT-CTTACCTTTCATGTGTTGTTTTTATGTCATC-----T-ATCTTTGAACCAGAAGTTGCACATATGGTACA--CATATGGTA-CAAGCGTCTGTACCATAAGTGCGTTTAGCActtattctgaaccggaagttgcgcatatgacacaggcgtctctaccacgtgcattacgcagga
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gi|14 : -ATGGAAAATATTCGCATTACGTTTCGGTAATT-TCTTTACACACAA--A-TT---GAC----ATACAGTGTATTGAGTA--TTTTATTCTTATTTTCTTAGTACGATTTCTGTACCA-TCCCCACGATCTCTGTACCGAT-T-----ACACTTTTATGT-ATTTC----GTTCTAT--CA-CGTATTTTTTCGTCGGAG-AAACT-AGAC---TTA-ATAA---ATGCCGGTTGACAT----GTT----GTAAAGATA-ACG--------G-----------T---T----CA---A-TTCGAGATTTAAACAATGACAAAGaaaaaatgaatatatactattcaattaaaaaaaataacatatatat
gi|3 : tataattttgtgttagaatataaatttcgtttgtcgaacgatctaaacTCAA-ACTTTTCG---GTGACA--TGGAAACAATGC-TC-----------------------AGTACATTTCGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCCGCTCTCTGTACCGAT-C-----ACATTTGGGCGT-ATTTCG----TTTTAT--CA-TTT-TTTTATCGTCGTAG-AATTT-AGACAC-TTA-TTAA---AC----GTTTATAATTATGTTATATGTAAACATAAAAGT-------A-----------A---G----T----A-T--AAGATTAAAACAACGATAGAGACCGT-TTTGAAAGGCGAGATAGAGCTCTAAATGTCAAAATCGCCCCA-CGTTTGAACAGGAGAAAAA-GATTTTCAAAGAAACCGTACGCTC-TATGTTTATGAGACA--GTCTACACGTTTAAGCTT---CA-AAA-AACGGGTCGAACTATGAA-T--TA-AATTTTGTAAAAACAAT-TTTGATAATAAAAAAACTCACATA-TTT-CTTACCTTTCACGTGTTGTTTTTACGTCATG-----T-AACTCTGAACCACAAGTTGTGCG-------------TCT-GTACCA--------TA-----AGTGTGTTTAGCAaacatttttgaagactatgt
gi|11 : gcatgatgttgatatgggcccaataaaataaataggcaagctgagtgacgtattggacagtattcattattgggtagtctacgtatgaaattggcctatttcatttatccacattatttttcaaaccgacaaaacattttctgttagtttattgatttgtttttttacgagtatgttgtggtatTCAACAGTT-TCATTGCACACAA--C-TC---AAC----ATA----------ATTA--TTTTGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCTGCTCTCTGTACCGAT-C-----ACATTTTGGCAT-ATTTC----GTTTTAC--CA-TGTTTTTTATCTTCGGAG-AATTT-AGAC---CTA-TTAA---AT----GTTTATAT----GTTACATGTAATCATACAAGT-------AAATATAAGGATT---G----G----A-TTCGGGA-GAAAACAACGATAGAGGCCGA-TTTAGAAGGCAAGGTAGAGCTCTTAATGTCAAAATTGTCTGG-TGTCT--ACATAAGAAATC-AATTTTCTAAGAAACTGTAC-T----ATGCTTATGAGACATCGTCTACAAGTTTAAGCTT---C--AAA-AATGGGTCGAACTATGGATT-----TAGCTTTTAAAAACAAT-TTTGCGAATGAAAAA--TCACGTA-TTT-CTTACCTTCCACGTGTTGTTTTTACGTCATC-----A-AACTCTGAATTGGAAGg
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gi|21 : tttat-TC---GACTTTTATA----------ATTA--TTTCACCCGTATTTTTATAGAACGTGTTATGTACCA-CTTCCCCGCTCTCTGTACCGAT-C-----ACATTTTGG-----TTTC----GTTTTAA--TA-TGTTTTTTATCTTCGGAG-AATTT-AGAC---TTtaagttgatttctgttgtccaagcttcaatttccgatgttagagacataatctttaagttgaggcttcaaaaaaacggaccgaactatgaatttagtttttgttgaaaatgaaaaatcacgagtttcttacgtttgac
gi|9 : acttgtcgacagttTTCGTTTTTATTCTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCAGCTCTCTGTACCGAT-C-----ACATTTTGGCGT-ATT-----------AC--CA-TGTTTTATATCTTCGTAG-AATTT-AGACCTATTTATTAA---AT----GTTTATAT----GTTACATGTAAACATACAAGT-------AAATATAAGGATT---G----A----A-TTCGGGATTAAAACAAAGATAGATGCCAA-TTTGGGAGGCGAAGTAGAGCTCTAAATGTCAAAATCGCCTCA-CATCCAAACAGAAGAAAAC-AGTTTTCTAAGAAACCCTAC-TCCTGATGTTTTTGAGACATCGTCTACAAGTTTAAGCTT---C--AAA-AACGGGTCAAACTATGGATTAAGA-TTTTTTTTAAAAACAAA-TTTAATTATAAAAAA--TCACATA-TTT-CTTACCTTTCA-----TGTTTTTACATCATC-----T-AACACTGAATCAGAAGTTGCATGTATGGTACAGG-----------AGTCA---GTACCATTAGTTCGTTTGGCAatagatttgtgcgt
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gi|16 : TTCTGTACCA-CTTCCCCGCTCTCTGTACCGAT-C-----ACAGTTTGGATT-ATTTC-----TTTAAC--CA-TTTTTTTTATCGTCGTAG-AATGT-AGA------T-TTAT---AT----GTAAACA-------TACAAGCAA--GTAAGGGT-------------------T---G----A----A-TTCGGGATTAAAGCAACGATAGAGGTCAATTTTGGAAGGTGATGTAAAGCTCTAAAGGTAAAAATCACCTCA-TGTCTGAAC------AGGC-----------GAAACCCTAT-TCCCGATGTTTATAAGATATCGTCCACAAGTTTAAGCTT---TA
gi|15 : CAACGATATAGGCCTT-TTTGAAAGGCGAGGTAGAACTCTATATGTCAAAATCGCCTCA-CGTCTGTACAGAAGAAAAC-GATTTTCTAAGAAACTTTAC-TTCTGCTGTTTATGAGACTTCGTCTACAAGTTCA-GCTT---CA--AA-AACGGGTCAAACTATGAATT--TT-GATTTTTTAAAAACAAT-TTTGATAATGAAAAA--ACACATA-TTT-CTTACCTTCCAGGTGTTGTTTTTAAGTTATC-----T-TACTCTGAACCGGAAGTTGCACGTATGGTTCAGGCGTCT--------------GTACCATTAGTGCGTTTAGCAac
gi|19 : ATTTCAAAAGAGATAAAAC-CTCCATTGTTTGTCAAACGTCGTGGTCAAGTTGAGATTT---CA--AA-AGCTATCCGAACTATGAATT--TG-AATCTGTAAAAATCAATATTTAT-AATGAAAAT--GTAGACGGTTTGCACACCTTTCACGTGTTGTTTTTATGACACA-----TGAATTATATACCGGAAGTTACACGT
gi|12 : cgAT-TTCCGATGTT-A-GAGACATAATCTTTAAGTTGAGGCTT---CAAAAA-AACGGACCGAACTATGAATT--TAGTTTTTGTTGAA-------------AATGAAAAA--TCACGAG-TTT-CTTACgcatgcgtgtgaacatgt
gi|20 : tttattacacgagcattgacataaatagtttgttcttattttcatagcacgatttctgcaccaactccccgatcccaatccccaatgctacgtgatttgttttacgttgtgtgttttcgtttggtcttaattcacgtttacatgttgtctttaaacatacagtaagcataatggttccattcaggatttaaacgaaggtaaattccgatttgaaaggttaagttgatttctgttgtccaagcttcaGATGTTTATAAGACCTCTTCTACAAGTTTAAGCTT---CA--AA-AGCGGGTCGAACTATTGATT--TA-GATTTTTTAAAAACAAT-TTTGATAATGAAAAA--TCAAATA-TTT-CTTACCTTTCACGTGTTGTATTTACGTCATC-----T-AACTCTGAACCGGCAGTTGCACGTATGGTACATGCGTCT--------------GTACCATTAGTGCGTTTAGCgtttgac
gi|22 : cAAT-TTTAATAATGAAAAA--C-ACATA-TTT-CGTACCTTTCACATGTTGTTTTTACGTCATC-----T-
gi|23 : -TCT-TTTACCTTCCATGTGTCGCTTT-AGGAC-TCGCGAAT-AA---TGTACCGGAAGTAACACGCAAGTTACA------T-GT----GACA---GTACCAATCGTACGTTTAGCAgctagtatttgtacaaactttataacatacctgtcctttggt
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|3 : g----ATTTCGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCCGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--ATTTGGGCGTATTTC----GTTTTATCAT-TTTTTTATCGTCGTAGAATTTAGACAC--TTATTAAAC----GTTTATAATTATGTTATATGTAAACATAAA----AGTAAGTAT-AA-G--------------ATTAAAACAACGATAGAGACCGT-TTTGAAAGGCGAGATA-GAGCTCTAAATGTCAAAATCGCCCCACGTTTGAACAG-GAGAAAAAGATTTTCAAAGAAACCGTACGCTCTATGTTTATGAGACA--GTCTACACGTTTAAGCTT----CA-AAAAA-CGGGTCGAACTATGAA-TTAAA--TTTTGTAAAAACAATTTTGATAATAAAAAAACTCACATA-TTT-CTTACCTTTCACGTGTTGTTTTTACGTCATG-----T-AACTCTGAACCACAAGTTGT-------------GCGTCT-GTACCA--------TA-----AGTGTGTTTAGCAttcttattttcatagaacgtgttctgtaccacttccccgctctctgtaccgatcacatttgggcgtatttcgttttatcatttttttatcgtcgtagaatttagacacttattaaacgtttataattatgttatatgtaaacataaaagtaagtataagattaaaacaacgatagagaccgttttgaaaggcgagatagagctctaaatgtcaaaatcgccccacgtttgaacaggagaaaaagattttcaaagaaaccgtacgctctatgtttatgagacagtctacacgtttaagcttcaaaaaacgggtcgaactatgaattaaattttgtaaaaacaattttgataataaaaaaactcacatatttcttacctttcacgtgttgtttttacgtcatgtaactctgaaccacaagttgtgcgtctgtaccataagtgtgtttagcag
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|23 : -TCT-TTTACCTTCCATGTGTCGCTTT-AGGAC-TCGCGAAT-AA---TGTACCGGAAGTAACACGCAAGTTACA------T-GTGACA-------GTACCAATCGTACGTTTAGCAgctagtatttgtacaaactttataacatacctgtcctttggt
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Reference ( family-817 ) : ACCATCGAGCGACCACAAACTGTTCNCCGATCGAGTGCAGACACCAGTGT-------GTA-TATNG----------G------GA---TGT-------G---------------G-----T--G--------GATTTTTATGTTAACACTGCTATATATA----TTCGGGTGTGTGGGACGACAAGGGACCGAA-CC-CCT--GTGGCATTCCCTCCTATCCCCCACACCATCATGCTGGAAAAATATCCTGGGTTAACCTTTCATTAAGCTCCACTTTCGATGAGGCGCTAATAATCAACAATTGACTGTTCAGTAGGTAGACCTAAACACATGATGTTGATATGGGCCCAATAAAATAAATAGGCCAGCTGAGTTCCGCATCGGACAGTATTCATTATTGGGTAGC----CTACGTATGACATTTTA--AG-TTATGTAGGCCTATTTCATTTAAGCT-AAAAAGTCCATCCACATT------A--TTTTCAAAC-CGACAA--AACGTT--TTCTGTTAGTTTATTGA-T-T-G-TTTTTTTTTAC--GA-GT--ATGTTGTGGTATTCAAA-C--T-TTTCAG--CG---GGATGGAAACAATGCTCAATACGTTTCGACAGTTCCGTTGCACACAA-C-TC---GAC--ATA------ATT----ATTTCGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCCGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--ATTTTGGCGTATTTC----GTTTTACCATGTNTTTTATCGTCGGAGAATTTAGAC----TTATTAAAC----GTTTATA----TGTTATATGTAAACATACA----AGTAAGTAT-AA-GG-TT-GAATTCGGGATTAAAACAACGATAGAGGCCGA-TTTGGAAGGCGAGGTA-GAGCTCTAAATGTCAAAATCGCCTCACGTCTGAACAGAAGAAAAC-GATTTTCAAAGAAACCGTACTCCCGATGTTTATGAGACATCGTCTACAAGTTTAAGCTT----CA-AAAAA-CGGGTCGAACTATGGATTTAGA--TTTTTTAAAAACAATTTTGATAATGAAAAA--TCACATA-TTT-CTTACCTTTCACGTGTTGTTTTTACGTCATC-----T-AACTCTGAACCGGAAGTTGCACGT-----------ATGGTACAGGCGTCTGTAC---------GTACCATTAGTGCGTTTAGCA
gi|1 : ACCATTGAGCGACCACAAACTGTTCCTCGATCGAGTGCAGTCACTAGTGT-------GTA-TAT--------------------------------------------------------T--G--------GAGTTTTATGTTAACACTGCTATATATA----TTCGGGTGTGTGGGACGACAAGGGACCGAA-TC-CCT--GAAGCATTCTATCCTATCCCCCACACCATCAGGCTGAGAAAATATCCTGGGTTAACCTTTCATTAAGCTCCACTTTCGATGAGACGCTAATAATGAACAATTGACTGTTTAGTAGGTAGACATAGAAACATGATGTTGATATGGGCTCAATAAAACAAATAGGCCAGCTGAGTTTCGCATCGGACAGTATTCATTATTGGGTAGCTAACCTACGTATGACATTTTA--AG-TTATGTAGGCCTAGTTCATTTCAGCT-AAAAAGTCCATCCACATT------A--TTTTCAAAC-CGACAA--AACGTT--TTCTGTTAGTTTCTTG--T-T-GTTTTTTTTTTAC--AA-GT--AAGTTGTGATATTCAAG-C--T-TTTCAG--CA---GAATGGAAACAATGCTCAATACGTTTCGACAGTGCAGTTGTACACAA-C-TC---GAC--ATA------AGT----ATTTTGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTATACCA-TTCCTCCGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--ATTTCGGCATATTTCGCCAGTTTTACTATGTATTTTATCGTCGGAAAATTTAGAC----TTTTTAAAT----GTTTATA----GGTTATAAGTAAACATACA----TGTA-------------T-GCATTCGGGATTAAAACAACGATAGAGGCCGA-TTAAGAAGGTGAGGGA-GAGCTCTTAATATCAGAATTGTCCCGCGTCTGAACTGAAGAAAAC-TATTTTCAAAGAAACCGTACTTCAGATGTTTATGAGACATTGTCTACAAGTTTAAGCTT----CAGAAAAA-CGGGTCGAACTATGGACTTATA--TTTTTTAAAAACAATTTTGTTAATGAAAAA--CCACATA-TTT-CTTACCTACCATATGCTGTTTTTATGTCATC-----T-AACTCTGAAGCGGAAGTTGCGCGT-----------ATGGTACAGGCATCTGTACCAGGCATCTGTACCATTAGTGCGTTTAGCA
gi|10 : TTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-TTTCCCCGC--TCTCTGTACAGATC-----AC--AATTTGGCATATTTC----GTTTTACCATGCATCATATCATCGGAAAATTTAGAT----TTATTAAAC----GTTTATA----TGTTATATGTAAACATACA----TATAAGTTG-AA-GGGTT-GAAATCGGGAATAAAACAACGATAGAGGCCGA-TTTAGAAGGCGAGGTA-GAGCTCTAAATATCAAAAACGTCTCGCATCTGAACTAAAGAAAAC-GATTTGTAAAGAAACCGTACTTCTGATGTTTATGATACTTCGTCTACAAATTTAAGCTT----C--AAAAA-CGGGTCAAACTATGGATTTAGA--ATTTTTAAAAACAATTTTGATAATGAAAAT--TCACATA-TTT-CTTACCTTCCACGTGCTGTCTTTACGTCATC-----T-AACTCTGAACCAGTAGTTGCATGT-----------ATGGAACAGACGTCT-------------GTACCATTAGTGCGTTTAGa
gi|11 : TCAACAGTTTCATTGCACACAA-C-TC---AAC--ATA------ATT----ATTTTGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCTGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--ATTTTGGCATATTTC----GTTTTACCATGTTTTTTATCTTCGGAGAATTTAGAC----CTATTAAAT----GTTTATA----TGTTACATGTAATCATACA----AGTAAATAT-AA-GGATT-GGATTCGGGA-GAAAACAACGATAGAGGCCGA-TTTAGAAGGCAAGGTA-GAGCTCTTAATGTCAAAATTGTCTGGTGTCT--ACATAAGAAATC-AATTTTCTAAGAAACTGTACT----ATGCTTATGAGACATCGTCTACAAGTTTAAGCTT----C--AAAAA-TGGGTCGAACTATGGATTTAG----CTTTTAAAAACAATTTTGCGAATGAAAAA--TCACGTA-TTT-CTTACCTTCCACGTGTTGTTTTTACGTCATC-----A-AACTCTGAATTGGAAG
gi|12 : gACACGAGCATT---GAC--ATA------AAT----AGTTTGTTCTTATTTTCATAGCACGATTTCTGCACCA-ACTCCCCGA--TC------CCAATC-----CCCAATGCT-ACGTGATTT----GTTTTACGTTGTGTGTTTTCG--------TTTGGTC----TTAATTCAC----GTTTACA----TGTTGTCTTTAAACATAC-----AGTAAGCAT-AATGG-TT-CCATTCAGGATTTAAACGAAGGTAAATTCCGA-TTTGAAAGGTTAAGTT-GATTTCT
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gi|16 : TTCTGTACCA-CTTCCCCGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--AGTTTGGATTATTTC-----TTTAACCATTTTTTTTATCGTCGTAGAATGTAGA-------------------TTTATA-----------TGTAAACATACA----AGCAAGTA--AG-GG-TT-GAATTCGGGATTAAAGCAACGATAGAGGTCAATTTTGGAAGGTGATGTA-AAGCTCTAAAGGTAAAAATCACCTCATGTCTGAACAG------GC-----------GAAACCCTATTCCCGATGTTTATAAGATATCGTCCACAAGTTTAAGCTT----TA-A
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gi|21 : TCGACAGTTTCG---------A-C-TT---T-T--ATA------ATT----ATTTCACCCGTATTTTTATAGAACGTGTTATGTACCA-CTTCCCCGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--ATTTTGG----TTTC----GTTTTAATATGTTTTTTATCTTCGGAGAATTTAGAC----TTAT
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gi|24 : TGTAGCTTTTACGTCATC-----A-AACTCTGAACCGAAAGTTGCACGT-----------ATTGTACAGGCGTCT-------------GTACCATAAGTGCGTTTAACAg
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gi|3 : g----ATTTCGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCCGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--ATTTGGGCGTATTTC----GTTTTATCAT-TTTTTTATCGTCGTAGAATTTAGACAC--TTATTAAAC----GTTTATAATTATGTTATATGTAAACATAAA----AGTAAGTAT-AA-G--------------ATTAAAACAACGATAGAGACCGT-TTTGAAAGGCGAGATA-GAGCTCTAAATGTCAAAATCGCCCCACGTTTGAACAGGAGAAAAA-GATTTTCAAAGAAACCGTACGCTCTATGTTTATGAGACA--GTCTACACGTTTAAGCTT----CA-AAAAA-CGGGTCGAACTATGAA-TTAAA--TTTTGTAAAAACAATTTTGATAATAAAAAAACTCACATA-TTT-CTTACCTTTCACGTGTTGTTTTTACGTCATG-----T-AACTCTGAACCACAAGTTGT------------------------GCGTCT-------------GTACCATAAGTGTGTTTAGCAttcttattttcatagaacgtgttctgtaccacttccccgctctctgtaccgatcacatttgggcgtatttcgttttatcatttttttatcgtcgtagaatttagacacttattaaacgtttataattatgttatatgtaaacataaaagtaagtataagattaaaacaacgatagagaccgttttgaaaggcgagatagagctctaaatgtcaaaatcgccccacgtttgaacaggagaaaaagattttcaaagaaaccgtacgctctatgtttatgagacagtctacacgtttaagcttcaaaaaacgggtcgaactatgaattaaattttgtaaaaacaattttgataataaaaaaactcacatatttcttacctttcacgtgttgtttttacgtcatgtaactctgaaccacaagttgtgcgtctgtaccataagtgtgtttagcag
gi|4 : gcatgatgttgatatgggcccaataaaataaataggcaagctgagtgacgtattggacagtattcattattgggtagtctacgtatgaaattggcctatttcatttatccacattatttttcaaaccgacaaaacattttctgttagtttattgatttgtttttttacgagtatgttgtggtattcaaacttttcggtgacatggaaacaatgctcagtacTTTTACCAGACTATGTAGGCCTATTTAATTTAAGCTTAAAAAGTCCATCCACATT------A--TTTTCAGAC-CGACGA--AAAATTAATT---TTAGTTTATCGA-T-T-G-TTTTTACT-ACTTGA-AT--ATGTTGTGGTATTCAAA-C--C-TTTCAG--TG---GGTTGGAAACAATGTTCAATACTGTTCGACAGTTCTGCTGTACACAA-C-TC---AAC--ATA------ATT----ATTTTGTTCTTATGTTCGTAGAACATGTTCTGTACCA-CTTCCTCGC--TCTCTGTACTGATCGATCAAC--ATTTGGCCATATTTT----GTTTTACCA-AT-TTTTACC--------------AC----TTATTAAAT----GTTTATA----TGTTATATTGAAACATACA----AGTAAGTAT-AA-GGATT-GAATTCGGGATTAAAACAGCGATAATGATCAA-TTTGAAAGGCGCGGTA-GAGTTCTAAATGTCAAAATCACATCA--TCTAAGCAGAAAAAAAAAGATTTTCAAAGAAACCGTACTCCTGATGTTTCTGAGAAATCGTCTACAAGTTAAAACTT-----A-AATGA-CGGGTCAAACTATGGATTTAAA--TTTTTAAAAAACAATTATGATAATGAATAA--TAACATA-TTT-CTTACCTTTCATGTGTTGTTTTTATGTCATC-----T-ATCTTTGAACCAGAAGTTGCACATATGGTACACATATGGTACAAGCGTCT-------------GTACCATAAGTGCGTTTAGCAg
gi|5 : ACCACCAAGCGACAAGAAGCTGTTCACCGATCGAGTGCAGACACCAGTGTGTACACTGTAGTGTAG----------GTAATCAGA---TGT-------GCCGTATCGGATGTTTG-----T--GAGAGTCTTGATTTTTATGTTAACACAGCTGTATATA----TTTGG-TGTTTGGGGCGACAAGGGATCCAA-CC-CC---GTGACAATACCTCCTATTCCACACACCATCGAGCTGGTAAAATATTCTGGATTCGCCTTTCATTAATCTTCACTTTCGATAAGGCTCTAATAATCAACAACTGGCTGTTCAGTAAGTAGACCTAGATACAAGATGTTGATATGGACCAAATAAAATAAAAAGGCAAGTCGAGTTCTGCATCGAAAATTATTCATTATTGGGTAGC----CTATGTATGACATTTTA--AG----TGTAGGCCTATTGTATTT-------AAAAGTCCATCCACATT------ATTTTTTCAAAC-TGACAA--AACATT--TTCTGTTAGTTTATTGA-TGT-G----TTTTTTAC--AA-GT--ATGTTGTGGCATTCAAATT--T-TTTCAG--CG---GGATTGAAACAATGCTCAATGTGTTTCGACAATTTTGTTGTACACAG-C-TCAATGACATATA------ATT----ATTTCATTTTTATTTTCATAGAACGTGggc
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gi|6 : cgcatcgggcagtttacattaatggctacgtataacattaaattatgcattccagaaagccaaattctaaaggttttcaaaaacgacattatatgttctgttagtttattaatttatttgtttttgatgtcggttgtggtattaaaacattgtttaaggaggatgcaaacaatgtgcaatatgttcgacagttcgacatacaaattgacataataatgccattcttattttcatagaacgatttctgtaccaccttcccgatctctgtaccgttcacactttggcgtatttcgttaacgaactttgaATC-----T-TATTCTGAACCGGAAGTTGCGCAT-----------ATGACACAGGCGTCTCTAC---------cttattctgaaccggaagttgcgcatatgacacaggcgtctctaccacgtgcattacgcagga
gi|7 : cgcatcgggcagtttacattaatggctacgtataacattaaattatgcattccagaaagccaaattctaaaggttttcaaaaacgacattatatgttctgttagtttattaatttatttgtttttgatgtcggttgtggtattaaaacattgtttaaggaggatgcaaacaatgtgcaatatgttcgacagttcgacatacaaattgacataataatgccattcttattttcatagaacgatttctgtaccaccttcccgatctctgtaccgttcacactttggcgtatttcgttaacgaactttgagtaaatatgcattaaagtgaacacaatggttcaatttgagatttaaaaaacgaaagatatactaagtgtgatcttttctcaagattgcctcacatttgaacagaaggaaacgatttccaaagaaaccgtactcaagctaccgtctacaagttgaagcttcagaaacaggtcgattatgaatttaaattaaaaacagtgatgataACCATCAAGCGACCACAAACTGTTCATCGATCGAGTGCAGACACCAGTGT-------GTA-TATGGAC--------G------GA---TGTTTATGAGA---------------G-----TCTG--------GATTTGTATATTAATACTGCTATATATAAATATTCGGGTGTGCGGGACGACACGGGGTCCAG-CC-CCT--GCGACATTCCTTCCTATCCCCCACGCCATCATGCTGGAAAAATATGCTGGGTTCGCCTTTCATTAATCTCCACATTCGATGAGGCGATAATAATCAACAATTGACTGTTCAGTAGGTAGACCTAAACACACGATGTTGATATGGGGCCAATAAAACAAATAGGCCAGCTGAGTTCTGCATCGGACAGTATTTATTACTGGGTAGC----CAACGTATGACATTTTA--AG-TTAAGTAGGCCTATTTCATTTAAGCT-AAAAAGTACATCCACATT------A--TTTTTAAAC-CGACAA--AACATT--TTATGTTAGTTTATTGA-------TTTGTTTTTAC--GA-GT--ATGTTGTGGTATTTAAA-C--T-TTTCTG--TG---GGATGGAAACAATGCTCAATACGTTTCGACAGTcacgtgcattacgcagga
gi|8 : TCGACAGTTTCATTGCACATAA-C-CC---GAC--ATA------GTT----ATTTCGTTCTTATTTTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CCTCCCCGC--TCTCTATACCGATC-----AC--ATTTTGGCGTATTTC----GTTTTACCATGT-TTTTATCGTCGGCGAATTTAGAC----CTACTAAAC----GTTTATA----TGTTACATGTAAACATACA----AGTAAATAT-AA-AG-CTGGAATTCGGGTTTAAAACAACGATAGAGGCCGA-TTTGGAAGGCAATGTA-GAGATCTAAATTTCAAAATCGCCTCACGTCTGTAAAGAAGAAAAC-GATGTTCTAAGGAACCGTACTTCCGATGTTTATGAGACTTCGTCTACAAGTTTAAGCAT----AA-AAAAA-T-GATCGAACTATGGATTTATA--TTTTTTAAAAACAACTTTGATAATGAAA
gi|8 : TTTTAAGTCATC-----T-GACTCTGAACCGGAAGTTGCACGT-----------ATGGTACAGGCGTCT-------------GTACCATAAGTGTGTTTAGCAttttaagtcatctgactctgaaccggaagttgcacgtatggtacaggcgtctgtaccataagtgtgtttagcaggc
gi|9 : tcgacagtttcattgcacataacccgacatagttatttcgttcttattttcatagaacgtgttctgtaccacctccccgctctctataccgatcacattttggcgtatttcgttttaccatgtttttatcgtcggcgaatttagacctactaaacgtttatatgttacatgtaaacatacaagtaaatataaagctggaattcgggtttaaaacaacgatagaggccgatttggaaggcaatgtagagatctaaatttcaaaatcgcctcacgtctgtaaagaagaaaacgatgttctaaggaaccgtacttccgatgtttatgagacttcgtctacaagtttaagcataaaaaaatgatcgaactatggatttatattttttaaaaacaactttgataatgaaaTTCGTTTTTATTCTCATAGAACGTGTTCTGTACCA-CTTCCCAGC--TCTCTGTACCGATC-----AC--ATTTTGGCGTATT-----------ACCATGTTTTATATCTTCGTAGAATTTAGACCTATTTATTAAAT----GTTTATA----TGTTACATGTAAACATACA----AGTAAATAT-AA-GGATT-GAATTCGGGATTAAAACAAAGATAGATGCCAA-TTTGGGAGGCGAAGTA-GAGCTCTAAATGTCAAAATCGCCTCACATCCAAACAGAAGAAAAC-AGTTTTCTAAGAAACCCTACTCCTGATGTTTTTGAGACATCGTCTACAAGTTTAAGCTT----C--AAAAA-CGGGTCAAACTATGGATTAAGATTTTTTTTAAAAACAAATTTAATTATAAAAAA--TCACATA-TTT-CTTACCTTTCA-----TGTTTTTACATCATC-----T-AACACTGAATCAGAAGTTGCATGT-----------ATGGTACAGGAGTC---A----------GTACCATTAGTTCGTTTGGCAggc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): ACACATAGTTTAACAAGTGTGTGCCAGCTCTGTGCCATACGTGCGTTTAGCAGGC
Unaligned ( gi|26 ): ATCTTTTTAAGAATTATCTTCCACAGCATTAACA
Unaligned ( gi|27 ): GTTCTCATTTTCAATGTTGGAAATTTTAAGTAC