lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                          11111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
lowQualScore                  :            1        1                                                                                                                                            333                1                    4444444                           1                              1      11111     11111                                                                                                      11111                                333333      1       9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999        1111                     11111111                                                 33333333333333333333333                      2                                                                                                          1111                                 1                                                                                                                     11111111         11111111                                                            1              
lowQualScore                  :            7  3     5               55                        4   55                      9     4                                           5    77            0 000                3 2     5            5555555    5                    2 3     4      4                 5      11111     88888    7   777               66       66                                777                              22222 1      5                 3     000000      1       4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444        9999    5      0  77     66666666  6                                              00000000000000000000000                      0                                                                   1                      0               7777  8888                    4      0 3  8 2   55                  44    0     0      2                                                   2               33333333 4    2  88888888                                               0      33    3              
lowQualScore                  :            .  .     .               ..                        .   ..                      .     .                                           .    ..            . ...                . .     .            .......    .                    . .     .      .                 .      .....     .....    .   ...               ..       ..                                ...                              ..... .      .                 .     ......      .       ......................................................................        ....    .      .  ..     ........  .                                              .......................                      .                                                                   .                      .               ....  ....                    .      . .  . .   ..                  ..    .     .      .                                                   .               ........ .    .  ........                                               .      ..    .              
lowQualScore                  :            8  9     2               55                        0   55                      1     4                                           0    22            1 222                8 2     0            6666666    0                    0 7     4      4                 0      11111     66666    0   888               99       99                                888                              55555 4      0                 9     000000      4       7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777        6666    7      4  99     77777777  0                                              66666666666666666666666                      3                                                                   6                      9               0000  5555                    0      7 6  8 0   00                  66    4     2      8                                                   5               44444444 2    2  11111111                                               1      00    5              
consensus                     :   TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTAATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACC-CTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACATGT-ATTAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATT-ATAAAA-TAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCC-CN-AAATTATT---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATA---TTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTG-----TCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-T----TTTTTT-CTATTTA---------------A---------------A-----A---------------A-G---AA---T-AAA-CATTTTTT---TAGAC-TGATCACCT--TAACC----C---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGAC--C----TATCC--TA-TAAGTATTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAATGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA-AAATATAA-ACNTTTGT--GTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTCGCG--------ATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
Reference ( gi|3 )            :   TGAATAGTTGTTGAGGTAATTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGAATACGTGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACC-TTTTTCTAAATTTACATGCAATAAAACTAGGAATTAATAAAG-TTTTCTGGGGTAC------TTAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTTTAATT-ATAAAA-TAATATTAAAAGTGTAACAGCACC-----CACTCT-CA-AAATCATT---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATA---TTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTG-----TCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCATATTG------TTTTTT-CTATTTA---------------A---------------A-----A---------------A----------------CATTTTTT---AAGAC-TGATCACCT--TAACC----C---TAGCCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATC-----CTAT----TATCC-TTAATAAGTATTATTAAGTCACTGCTAAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAATGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA-AAATATTA-ACGTTTGT--GTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTCGCG--------ATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAAGGATGTATTTTATTA
gi|4                          :   TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGAATACATGTATCATAGACAGGTCGTTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCCTTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATTAGTAAAG-TTTTCTCGGGTAC------GTAA-AATTATG------------------ATT-ATAAAA-TATTATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCC-CA-AAATTATT---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCAGCACACGTTTATTCATATTTCAGCTATA---TTTCATGCCTATACAAATAAGAGGAAGTTG-----TCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCTGTATTG------TTTTTTTCTGTTTA---------------A---------------A-----AGGGTAAAATGTTAGAA----------------CATATTTT---TAGAC-TGATTACCT--TAACC----T---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATT-CCAAGGACTTATATCAGTGAC--C----TATCC---ATTAAGTATTATTTTGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCATACAAAAATACATGGTTACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAATGAT----CA----CTATGCACCAACTTCCAAGA-AAATATCA-ACTTTTGT--GTGCATTTCGCTTCAACCGTGTGTGTACATCAAATCTTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGGACAATTATTCATTACCGTAACATGTGCGCGTGACGTCAAAAT---G----TAGTTTGCA--------ATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCAT----------------GATGTATTTTATTA
gi|2                          :   TGAATAGTT-TT-AGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTAATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACC-CTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTTATCAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATT-ATAAAA-TAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCC-TC-AAATTATG---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCAACTCGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATA---TTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTG-----TATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTATTGGTTTGTTTTTTT-CTATTTA---------------A---------------A-----A---------------AGGTTAAATGTTAAAA-CATTTTTT---TAGAC-TGATCATCT--TAACC----C---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCATATTCCC---------TATT-----CAGTGACCTATCC-AT--TAAGTATTATTAAGTCACTGCATAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCATAAAAACAAAGAATGATTGATTA----CTATGCACCAACTTTCAAGA-AAATATAA-ACTTATGT--GTGTATTTCGCTTCAATC--ATGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTTGCG--------ATAATGATTTTGATGGTACACTCAGTAAATTGTTAATAGTTTCATTGTAACTAAAAAAAATGATGTATTTCAT
gi|5                          : ttTGAATAGTTTTTCAGGTACTTTTTTAATACTGTT--GTTGTAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTAATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCTTATTTAAGCAAT-AACC-CTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAGTTTTTCTGCAGTAA------TTAA-AATTATGTTTCATATAGAAAACATAATT-ATAAAA-TAATACTAAAAGTGGAAAAGGACCCTGGGCACTCC-CA-AAATTATT---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATT---TTCCATGCCTATAA----AAGAGGAAGTTG-----TCTGGGGT-AATAATATACTAGGTCCGTATTGTTT---TTTTTT-CTATTTAAAAAGGTAAAATGTTA---------------A-----A---------------A----------------CATTTTTT---TAGAC-TGATCACCT--TAACC----CTATTAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGAC--C----TATCC---AATAAGTATTATTAAGTCACTGCTTAGACTATATAGATaaaca
gi|6                          : ttTAAATAGTTTTTTAGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCATAATGTTAAA--ACAATACCCAACACAAAAAGAGTAATACACGTATCATAAACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACC-CTTTTCTAAATTTACAGTCAATCAAACTAGGAATAAGTAAAA-TTCTTTGAGGCACATGTAATCAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATT-ATAAAA-TAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCC-TC-AAATTATT---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATA---TTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTG-----TATGGGTT-AATTATATATTAGGTCCGTATTGTT----TTTTTT-CTATTTA---------------AAAAAGTCAAATGTTTA-----A---------------A----------------CATTTTTT---TAGAC-TGATCATCT--TAACG----C---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATC-----ctttattcataaacatttcaaaatatttaaatcgtaacaacaatgaatgattactatgcaccaactttcaagaaaacataaacctctgtgtgtatttcgcttcaatggtgtgtacatcaagtcttctccattataggttgttcatggtgaacaattattcatttccgtgacgtcaaaatttcgttcgcgattatgattttgatggttcacccagtaaattgttaattatttcattgtaacccaacaaaatgatgtattttatta
gi|19                         : ttTGAATATTTTTGGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--CCATTACCCAACACAAAAAGAGTAATACGCGTATCATAGATGGGTCATTGCGTGTATCagtggcctatccgttaaggtaacttattttatattatttattcataaccatttcataatatttaaatcgtaaaaacaaagaatggttattaactatgcaccaactttcaagaaaatataaacttctgtgtgtatttcgcttcgaccgtgtgtacatcaaatcttctccgttgtatgttattcacggtggacattagtcatttccgta
gi|20                         : ttTGAATAGTTTTTGAGGTATTTATTTAATATTGTT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGAATACATATAT
gi|1                          :  ttGAATAGTTTTTTAGATACTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTAATACATGTATCATAGACGGGTCATTGTGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACC-CTTTTCTAAATTTACAGCCAATAAAACTAAGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTAATCAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATT-ATAAAA-TAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCC-TC-AAATTATT---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCATTACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATA---TGTCATGCCTATAAAAA-AAGAGGAAGTTG-----TATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTGTTG------TTTTTTTCTATTTA---------------A---------------A-----A---------------AGGTCAAATGTTAAAA-CATTTTTTTTTAA--T-TGACCATCT--TAACA----C---TTACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCTCAAGGACTTATATCAGTGACC------TATCC-AT--TAAGTATTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAATCATTTCATAATATTTAAATTGTAAAAACAAAGAATGATTGATTA----CTATGCACAAACTTTCAAGA-AAACATAA-ACCGATGT--GTATATTTCGCTTCAACC--ATGTGTACAAAAAATGTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAATAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTCACG--------ATTATGATTTTGATGGTACACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATT-TAACTCAACAAAATGGTGTATTTTATCA
gi|8                          :    GAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATCGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTAATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCATGTATCCGTATTTCAGCAAT-AACC-CTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAG-AATAAATAAAG-TTTTCTGGGGTAA------TTAA-AATTACGTTTCATATAGAAATTATAATT-ATAAAA-TAATATTAAAAGTGTGAAAGCAAC-----CACTC--CACAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTA--ATACATT--CTCAGCACACATTTATTCGTATTTCAGCTATA---TTTCATCCCTATAAAAATAAGaca
gi|13                         :      ATAGTTTTTGAAGTACTTATTTAATATTCTT--TTTGCAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTAATACATGTATCATAGACGGATCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAATAAACC-TTTTTCTAAATTT---T-CAATAAAACTCGGAATAAATAAAG-TTTTATGGGATAC------TTAA-AATTATGTTTCATATATAAATTATAATT-ATAAAA-TAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCC-CC-AAATTATT---
gi|14                         :                 tGTACTTAGATAATATTTTTAATTTGTAAAAATAATATAAAATTGTAAAAGGAAAT-ACTC--CACAAAAA-ATATATACATGTATCATAGATGGACTAT-GCGTGTATCCGTATTTGAGCTGT-AGCC-CTTCCCT-------C---CGATGAAA-TAGGAATAAGTTAAG-CTTTCTGGGGTA--------TAATAGTT---TTTTTTGTAGAAA----A--T-GTAAAA-TAATATTAAAAATGTAAAGGCAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                        atTTTTAATTTGTAAAAATAATAT-AAAATTGTAAAAGGAAA-----TACTCCACA-AAA--AAT---ATAT----ACATGTATCATAGATGGACT----ATGCGTGTATCCGTATTTGAGCTGTAGCCCTTCCCTCCGAT-GAAATAGGAATAAGTTAAGCTTTCTGGGGT-Aatc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                           atgtacttagataatatATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CCCTCC-CT-CAATTATTTTTGTTTTAAAA-ATGTA--ATACATT--CTGAGCACGCGTTCAGTAGAACTTCAGCTATA---TTTCCAGCCTATGAAAATAAGAGAGAGTAG-----TTTGGGGT-CATTATATACTAGGTTCATATTG------TGTTTT-TTATATA---------------A---------------AAGAGTA---------------A----------------AATGTTAA---AAAACATGTTAAACTGATAACCGCGTT---TGACCCGTCATCATGTATGtaatagttttttttgtagaaaatgtaaaataatattaaaaatgtaaaggcacatc
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acttttatacaaacaagataaatataaaaaaaacctggtactccaggTATA---TTTCCAGCCAACACAATTAGGAGAATGTTG-----TCTGAGGTCACTTATATGCTATGTTTGTATTG------GTTTT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G------TTTTTT-CTTTTTA---------------A---------------A-----A---------------AAGGTCAAATGTTAAAACATTTTTT---TAGAC-TGATCACCT--TAACC----C---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACTAAATTCCCATGGACTTATATCAGTGACC------TATCCATTAAT---TATTATTTACTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGTAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTATTT-----TAAGTATTTCATAATATTTAATTCGTAACAACAAAGAATGAC----TA----CTATGCACCGACTTTCAAGA-AAATATAA-ACGTTTCT--GTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAAATCTTCTCCGTTATATATTGTTCACGGTGGATAATTATTCATTTCCGTAACAGagataaggaaaaaataacattaaaatacaaaaacacacaatattataggctgataaccatgtttgacccaccaccatcaggtaccgaaaatctaa
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTA-ATCAGTGAC--C----TATCC---ATTAAGTATTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATTAAAATTTATGGTAACCTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAATGAT----TA----CTAGGCACCAACGTTCAGAA-AAATATAA-ACTTCTGT------ATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAGATTTTTTCCTTTATATATTGTTCACTGTGGACAATTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACTGCT-----TATATGCATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTATCTTGCAATATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTTACAACAAAAAGTGAT----TA----ATATGCACCATTTTTCAACA-AAATATAA-ATGTTTGT--GTGCATTTCACTTCAAAC--ATGTTTACACCAAATCTCCT---TTATATATTATTCACGGTGGACAATTATTCATTTCTGTAACAGGTGAACATGACATCAAAATACATTATATTGTTTGCG--------ACTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTCTTAATAATTTCATTGTAATTCACTAAAATTATGTATTTTATTA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aATATAGATTGCAAATTCCTCACAAAAGTACACGGTAACTTATTTTCTTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGT-ACAACAAAGAATGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA-GAAT-TTA------------TACA-------TCAA----------ATAT----TCT---CCATTATATGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTCATG--------ATTATGATTTTGATGGTTCGCCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTAACTTATTTTATATTATTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAAAAACAAAGAATGGT----TATTAACTATGCACCAACTTTCAAGA-AAATATAA-ACTTCTGT--GTGTATTTCGCTTCGACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTGTATGTTATTCACGGTGGAC-ATTAGTCATTTCCGTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                          tttaaatagttttttaggttcttatttaatattgattttatagaaataatatcataatgttaaaacaatacccaacacaaaaagagtaatacacgtatcataaacgggtcattgcgtgtatccgtatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaatcaaactaggaataagtaaaattctttgaggcacatgtaatcaaaattatgtttcatatagaaattataattataaaataatattaaaagtgtaaaagcacccactcctcaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctatatttcatgcctataaaaataagaggaagttgtatgggttaattatatattaggtccgtattgttttttttctatttaaaaaagtcaaatgtttaaacatttttttagactgatcatcttaacgctaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtggcctatccgttaaTCTTTATTCATAAACATTTCAAAATATTTAAATCGTAACAACAATGAATGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA-AAACATAA-ACCTCTGT--GTGTATTTCGCTTCAATG--GTGTGTACATCAAGTCTTCTCCATTATAGGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTC-------------CGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTCGCG--------ATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATTATTTCATTGTAACCCAACAAAATGATGTATTTTATTA
gi|16                         :                                                                                                                                                                tttgaatagtttttcaggtacttttttaatactgttgttgtagaaataatatcaaaatgttaaaacattacccaacacaaaaagagtaatacatgtatcatagacaggtcattgcctgtatccttatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaataaaactaggaataagtaaagtttttctgcagtaattaaaattatgtttcatatagaaaacataattataaaataatactaaaagtggaaaaggaccctgggcactcccaaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctattttccatgcctataaaagaggaagttgtctggggtaataatatactaggtccgtattgtttttttttctatttaaaaaggtaaaatgttaaaacatttttttagactgatcaccttaaccctattaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtgacctatccaataagtattattaagtcactgcttagactatatagaTTCACAGGCAT--AATCATATTTA--------TAACAAAGAATAGT----TA----CTTAGTATCAATTTCCAATATACAAATTATATATTTTTTCGTGCATTCTATTT-AACT--GTTTTCACATCAAATCCACAATGCTACATATTGTTCATATTGGAATATTATTCATTTCTGTAGCA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agttttcacagtgttA-ACATTTAT--TT-TATTTTGCTT--ACC--ATTTTCACACCAAATCCACATTGTTTGATGA-GTTCATGGTGGAAACTTTTTCCTTGCCATAATAGGTG-ATGAAATGTCA---T---T----TTTTTC-TGTTTTGAACATTATT-TTTTGATGGATCAACCAGCAA------AATAATTTCA-TG-AATTCAACATAAAGGTTTATTTTCTTacataaagtca
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCGTTTCAACC--GTGTTCATATTAAATCCACTCTGTTTTATGTTGTTAGCGGTAGGAAAGTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGAGTGGCGTCAAAGT---T----TGGATTATG--------ACTGTAATTGTGATGGTTCACCCAATAAATTCTTAATTCTTTGACTGTAATTCACTAAAAcac





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   4444444444                                                            11111                                                                                                                                       22222      22222222222222                000000000000000000         11111111                  1111                                                                         3333                                                                                                                                                                                                                                                                                                   11111111      11111111                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             55                        1   55                        3                                                4     4                                         4            3333333333                                                            11111       1        777                                                                                     1      5                       44444 4    66666666666666           777  000000000000000000      4  66666666    66            7777       777                                                        66     0000   5   66                                                     2                              0                                  7777    7777  7777                    666    3      1                       44                                                                     1               00000000 2    66666666                                               0          0                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ..                        .   ..                        .                                                .     .                                         .            ..........                                                            .....       .        ...                                                                                     .      .                       ..... .    ..............           ...  ..................      .  ........    ..            ....       ...                                                        ..     ....   .   ..                                                     .                              .                                  ....    ....  ....                    ...    .      .                       ..                                                                     .               ........ .    ........                                               .          .                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             00                        0   00                        6                                                4     4                                         4            8888888888                                                            11111       0        888                                                                                     4      0                       44444 4    11111111111111           888  222222222222222222      4  11111111    11            2222       888                                                        99     9999   0   99                                                     0                              5                                  7777    7777  7777                    444    6      0                       66                                                                     1               99999999 7    11111111                                               8          2                   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----T-TTTT--------------TTCTATTTAAA---AAGGT-A-AA-----TGTTAAAACAT-TT--------TTTT--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCA--TTAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
Reference ( family-807 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACATGT-A-TTAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCNAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----T-TTTT--------------TTCTATTTAAA---AAG-----AA-----T----AAACAT-TT--------TTTT--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCT--ATAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAATAGTTTTTTAGATACTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGTGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGCCAATAAAACTAAGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCATTACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATGTCATGCCTATAAAAA-AAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTGTTG-----T-TTTT--------------TTCTATTTAAA---AAGGTCA-AA-----TGTTAAAACAT-TT--------TTTTTTA-ATTGACCATC----TTAACAC---TTACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCTCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCA--TTAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAATCATTTCATAATATTTAAATTGTAAAAACAAAGAATGATTGAT----TA----CTATGCACAAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCGATGTGTATATTTCGCTTCAACC--ATGTGTACAAAAAATGTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAATAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------ACGATTATGATTTTGATGGTACACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATT-TAACTCAACAAAATGGTGTATTTTATCA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTA-ATCAGTGACC--TATCCA--TTAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATTAAAATTTATGGTAACCTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTAGGCACCAACGTTCAGAA---AAAT-ATAAACTTCTGT----ATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAGATTTTTTCCTTTATATATTGTTCACTGTGGACAATTAaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CCCTCCCTCAATTATTTTTGTTTTAAAA-ATGTAATACATTCTGAGCACGCGTTCAGTAGAACTTCAGCTATATTTCCAGCCTATGAAAATAAGAGAGAGTAGTTTGGGGT-CATTATATACTAGGTTCATATTG-----TGTTTT--------------TTATAT---AA---AAG-----AG-----T----AAA-ATGTTAAAAAACATGTT--AAACTGATAACCGCG-TT--------TGACCCGTCATCATGTATG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acttttatacaaacaagataaatataaaaaaaacctggtactccaggATATAGATTGCAAATTCCTCACAAAAGTACACGGTAACTTATTTTCTTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGT-ACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---GAAT-TTATACAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATACATCAAATATTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTC--------ATGATTATGATTTTGATGGTTCGCCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTcaaatattctccattatatgttgttcatggtgaacaattattcatttccgtaacaggtgcgtgtgacgtcaaaattttgttcatgattatgattttgatggttcgcccagtaaattgttaataatttcattgtaact
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatagattgcaaattcctcacaaaagtacacggtaacttattttcttttctttattcataagcatttcataatatttaaatcgtacaacaaagaatgattactatgcaccaactttcaagagaattATAGTTTTTGAAGTACTTATTTAATATTCTT--TTTGCAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGATCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAATAAACCT-TTTTCTAAATTT----TCAATAAAACTCGGAATAAATAAAG-TTTTATGGGATAC-------TTAAAATTATGTTTCATATATAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCCCAAATTATT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTACTTAGATAATATTTTTAATTTGTAAAAATAATATAAAATTGTAAAAGGAAAT-ACTC--CACAAAAAA--TATATACATGTATCATAGATGGACTAT-GCGTGTATCCGTATTTGAGCTGT-AGCCC-TTCCCT----------CCGATGAAA-TAGGAATAAGTTAAG-CTTTCTGGGGTATA----A-T---AGTT---TTTTTTGTAGAAA--A----TGTAAAATAATATTAAAAATGTAAAGGCAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atAACATTTATTT-TATTTTGCTT--ACC--ATTTTCACACCAAATCCACATTGTTTGATGA-GTTCATGGTGGAAACTTTTTCCTTGCCATAATAGGTG-ATGAAATGTCA---T---T----TTTTTCTGTTTTGAAC-ATTATT-TTTTGATGGATCAACCAGCAA------AATAATTTCA-TG-AATTCAACATAAAGGTTTATTTTCTTatc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCACAGGCAT--AATCATATTTA--------TAACAAAGAA----TAGT----TA----CTTAGTATCAATTTCCAATATACAAATTATATATTTTTTCGTGCATTCTATTT-AACT--GTTTTCACATCAAATCCACAATGCTACATATTGTTCATATTGGAATATTATTCATTTCTGTAGCAcac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      agttttcacagtgttTCGTTTCAACC--GTGTTCATATTAAATCCACTCTGTTTTATGTTGTTAGCGGTAGGAAAGTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGAGTGGCGTCAAAGT---T----TGGATT--------ATGACTGTAATTGTGATGGTTCACCCAATAAATTCTTAATTCTTTGACTGTAATTCACTAAAAacataaagtca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATTTCCAGCCAACACAATTAGGAGAATGTTGTCTGAGGTCACTTATATGCTATGTTTGTATTG-----G-TTTTAGATAAGGAAAAAATAACATTAAAATACAAA-----AA-----C----ACACAA-TA--------TTAT--AGGCTGATAACCATGTTTGACCC----A--CCACCATCAGGTAca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATATTTTTGGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--CCATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACGCGTATCATAGATGGGTCATTGCGTGTATCccgaaaatctaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTT--AGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTTA-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCTCAAATTATG---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAACTCGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTATTGGTTTGT-TTTT--------------TTCTATTTAAA---AAGGTTA-AA-----TGTTAAAACAT-TT--------TTTT--AGACTGATCATC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCATATTCCC-------TAT-TCAGTGACC--TATCCA--TTAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCATAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCATAAAAACAAAGAA----TGATTGATTA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTATGTGTGTATTTCGCTTCAATC--ATGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTT--------GCGATAATGATTTTGATGGTACACTCAGTAAATTGTTAATAGTTTCATTGTAACTAAAAAAAATGATGTATTTCAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTTTGAGGTATTTATTTAATATTGTT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATATATaaaca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTGTTGAGGTAATTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACGTGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCT-TTTTCTAAATTTACATGCAATAAAACTAGGAATTAATAAAG-TTTTCTGGGGTAC-------TTAAAATTATGTTTCATATAGAAATTTTAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAACAGCACC-----CACTCTCAAAATCATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCATATTG-----T-TTTT--------------T-CTATTTAAA---AA---------------------CAT-TT--------TTTA--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAGCCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATC-----CTATTATCCTTAATAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTAAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATTAACGTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAAGGATGTATTTTATTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATGTATCATAGACAGGTCGTTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCCTTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATTAGTAAAG-TTTTCTCGGGTAC--GT-A----------------------AAATTATGATTATAAAATATTATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACGTTTATTCATATTTCAGCTATATTTCATGCCTATACAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCTGTATTG-----T-TTTT--------------TTCTGTTTAAA---AGGGTAA-AA-----TGTTAGAACAT-AT--------TTTT--AGACTGATTACC----TTAACCT---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATT-CCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCA--TTAA-GTA--TTATTTTGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCATACAAAAATACATGGTTACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----CA----CTATGCACCAACTTCCAAGA---AAAT-ATCAACTTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACCGTGTGTGTACATCAAATCTTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGGACAATTATTCATTACCGTAACATGTGCGCGTGACGTCAAAAT---G----TAGTTT--------GCAATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTC----------------ATGATGTATTTTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTCAGGTACTTTTTTAATACTGTT--GTTGTAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCTTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAGTTTTTCTGCAGTA------A-TTAAAATTATGTTTCATATAGAAAACATAATTATAAAATAATACTAAAAGTGGAAAAGGACCCTGGGCACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATTTTCCATGCCTATAA----AAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATAATATACTAGGTCCGTATTGTT---T-TTTT--------------TTCTATTTAAA---AAGGTAA-AA-----TGTTAAAACAT-TT--------TTTT--AGACTGATCACC----TTAACCCTATTAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCA--ATAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGACTATATAGAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttTCTTTATTCATAAACATTTCAAAATATTTAAATCGTAACAACAATGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCTCTGTGTGTATTTCGCTTCAATG--GTGTGTACATCAAGTCTTCTCCATTATAGGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTC-------------CGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATTATTTCATTGTAACCCAACAAAATGATGTATTTTATTActttattcataaacatttcaaaatatttaaatcgtaacaacaatgaatgattactatgcaccaactttcaagaaaacataaacctctgtgtgtatttcgcttcaatggtgtgtacatcaagtcttctccattataggttgttcatggtgaacaattattcatttccgtgacgtcaaaatttcgttcgcgattatgattttgatggttcacccagtaaattgttaattatttcattgtaacccaacaaaatgatgtattttatta
gi|6                          : tttgaatagtttttcaggtacttttttaatactgttgttgtagaaataatatcaaaatgttaaaacattacccaacacaaaaagagtaatacatgtatcatagacaggtcattgcctgtatccttatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaataaaactaggaataagtaaagtttttctgcagtaattaaaattatgtttcatatagaaaacataattataaaataatactaaaagtggaaaaggaccctgggcactcccaaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctattttccatgcctataaaagaggaagttgtctggggtaataatatactaggtccgtattgtttttttttctatttaaaaaggtaaaatgttaaaacatttttttagactgatcaccttaaccctattaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtgacctatccaataagtattattaagtcactgcttagactatatagaTAAATAGTTTTTTAGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCATAATGTTAAA--ACAATACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACACGTATCATAAACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATCAAACTAGGAATAAGTAAAA-TTCTTTGAGGCACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGTT-AATTATATATTAGGTCCGTATTGT----T-TTTT--------------TTCTATTTAAA---AAAGTC--AAATGTTT----AAACAT-TT--------TTTT--AGACTGATCATC----TTAACGC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGGCC--TATCCG--TTAAGGTAACTTATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttGGTAACTTATTTTATATTATTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAAAAACAAAGAA----TGGT----TATTAACTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTCTGTGTGTATTTCGCTTCGACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTGTATGTTATTCACGGTGGAC-ATTAGTCATTTCCGTAttatattatttattcataaccatttcataatatttaaatcgtaaaaacaaagaatggttattaactatgcaccaactttcaagaaaatataaacttctgtgtgtatttcgcttcgaccgtgtgtacatcaaatcttctccgttgtatgttattcacggtggacattagtcatttccgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaaatagttttttaggttcttatttaatattgattttatagaaataatatcataatgttaaaacaatacccaacacaaaaagagtaatacacgtatcataaacgggtcattgcgtgtatccgtatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaatcaaactaggaataagtaaaattctttgaggcacatgtaatcaaaattatgtttcatatagaaattataattataaaataatattaaaagtgtaaaagcacccactcctcaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctatatttcatgcctataaaaataagaggaagttgtatgggttaattatatattaggtccgtattgttttttttctatttaaaaaagtcaaatgtttaaacatttttttagactgatcatcttaacgctaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtggcctatccgttaa-TTTT--------------TTCTTTTTAAA---AAAGGTCAAA-----TGTTAAAACAT-TT--------TTTT--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACTAAATTCCCATGGACTTATATCAGTGACC--TATCCA--TTAA-TTA--TTATTTACTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGTAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTATTT-----TAAGTATTTCATAATATTTAATTCGTAACAACAAAGAA----TGAC----TA----CTATGCACCGACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACGTTTCTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAAATCTTCTCCGTTATATATTGTTCACGGTGGATAATTATTCATTTCCGTAACAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATCGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCATGTATCCGTATTTCAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTA-GAATAAATAAAG-TTTTCTGGGGTA------A-TTAAAATTACGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTGAAAGCAAC-----CACTCCACAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACATTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATCCCTATAAAAATAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACTGCTTA-----TATGCATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTATCTTGCAATATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTTACAACAAAAAG----TGAT----TA----ATATGCACCATTTTTCAACA---AAAT-ATAAATGTTTGTGTGCATTTCACTTCAAAC--ATGTTTACACCAAATCTCCT---TTATATATTATTCACGGTGGACAATTATTCATTTCTGTAACAGGTGAACATGACATCAAAATACATTATATTGTTT--------GCGACTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTCTTAATAATTTCATTGTAATTCACTAAAATTATGTATTTTATTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    444444444                                                            11111                                                                                                                                       22222                         4444444                                        1111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11111111      11111111                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             55                        1   55                        3                                                4     4                                         4             333333333                                                            11111       0        777                                                                                     1      5                       44444              777    55  5555555       66       9999      66            7777       777                                                        66       66   5   66                                                                                    0                                  7777    7777  7777                    666    3      1                       44                                                                     1               00000000 2    66666666                                               0          0                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ..                        .   ..                        .                                                .     .                                         .             .........                                                            .....       .        ...                                                                                     .      .                       .....              ...    ..  .......       ..       ....      ..            ....       ...                                                        ..       ..   .   ..                                                                                    .                                  ....    ....  ....                    ...    .      .                       ..                                                                     .               ........ .    ........                                               .          .                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             00                        0   00                        6                                                4     4                                         4             888888888                                                            11111       1        888                                                                                     4      0                       44444              888    33  6666666       11       4444      11            2222       888                                                        99       99   0   99                                                                                    5                                  7777    7777  7777                    444    6      0                       66                                                                     1               99999999 7    11111111                                               8          2                   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTA---AAAA-GGTN------AAATGTT--AAAACAT----TTTTTT--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
Reference ( family-807 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTA---AAAA-GGT-------AAATGTT--AAAACAT----TTTTTT--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAATAGTTTTTTAGATACTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGTGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGCCAATAAAACTAAGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCATTACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATGTCATGCCTATAAAAA-AAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTGTTG-----TTTTTTTCTATTTA---AAAA-GGTC------AAATGTT--AAAACAT----TTTTTTTTA-ATTGACCATC----TTAACAC---TTACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCTCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAATCATTTCATAATATTTAAATTGTAAAAACAAAGAATGATTGAT----TA----CTATGCACAAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCGATGTGTATATTTCGCTTCAACC--ATGTGTACAAAAAATGTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAATAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------ACGATTATGATTTTGATGGTACACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATT-TAACTCAACAAAATGGTGTATTTTATCA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTA-ATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATTAAAATTTATGGTAACCTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTAGGCACCAACGTTCAGAA---AAAT-ATAAACTTCTGT----ATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAGATTTTTTCCTTTATATATTGTTCACTGTGGACAATTAaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CCCTCCCTCAATTATTTTTGTTTTAAAA-ATGTAATACATTCTGAGCACGCGTTCAGTAGAACTTCAGCTATATTTCCAGCCTATGAAAATAAGAGAGAGTAGTTTGGGGT-CATTATATACTAGGTTCATATTG-----TGTTTTT-TATATA---AAAG-AGTA------AAATGTTAAAAAACA-------TGTT--AAACTGATAACCGCG-TT--------TGACCCGTCATCATGTATG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acttttatacaaacaagataaatataaaaaaaacctggtactccaggATATAGATTGCAAATTCCTCACAAAAGTACACGGTAACTTATTTTCTTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGT-ACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---GAAT-TTATACAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATACATCAAATATTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTC--------ATGATTATGATTTTGATGGTTCGCCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTcaaatattctccattatatgttgttcatggtgaacaattattcatttccgtaacaggtgcgtgtgacgtcaaaattttgttcatgattatgattttgatggttcgcccagtaaattgttaataatttcattgtaact
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatagattgcaaattcctcacaaaagtacacggtaacttattttcttttctttattcataagcatttcataatatttaaatcgtacaacaaagaatgattactatgcaccaactttcaagagaattATAGTTTTTGAAGTACTTATTTAATATTCTT--TTTGCAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGATCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAATAAACCT-TTTTCTAAATTT----TCAATAAAACTCGGAATAAATAAAG-TTTTATGGGATAC-------TTAAAATTATGTTTCATATATAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCCCAAATTATT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTACTTAGATAATATTTTTAATTTGTAAAAATAATATAAAATTGTAAAAGGAAAT-ACTC--CACAAAAAA--TATATACATGTATCATAGATGGACTAT-GCGTGTATCCGTATTTGAGCTGT-AGCCC-TTCCCT----------CCGATGAAA-TAGGAATAAGTTAAG-CTTTCTGGGGTATA-AT-------AGTT---TTTTTTGTAGAAA--A----TGTAAAATAATATTAAAAATGTAAAGGCAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atAACATTTATTT-TATTTTGCTT--ACC--ATTTTCACACCAAATCCACATTGTTTGATGA-GTTCATGGTGGAAACTTTTTCCTTGCCATAATAGGTG-ATGAAATGTCA---T---T----TTTTTCTGTTTTGAAC-ATTATT-TTTTGATGGATCAACCAGCAA------AATAATTTCA-TG-AATTCAACATAAAGGTTTATTTTCTTatc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTCACAGGCAT--AATCATATTTA--------TAACAAAGAA----TAGT----TA----CTTAGTATCAATTTCCAATATACAAATTATATATTTTTTCGTGCATTCTATTT-AACT--GTTTTCACATCAAATCCACAATGCTACATATTGTTCATATTGGAATATTATTCATTTCTGTAGCAcac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agttttcacagtgttTCGTTTCAACC--GTGTTCATATTAAATCCACTCTGTTTTATGTTGTTAGCGGTAGGAAAGTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGAGTGGCGTCAAAGT---T----TGGATT--------ATGACTGTAATTGTGATGGTTCACCCAATAAATTCTTAATTCTTTGACTGTAATTCACTAAAAacataaagtca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATTTCCAGCCAACACAATTAGGAGAATGTTGTCTGAGGTCACTTATATGCTATGTTTGTATTG-----GTTT----TAGATAAGGAAAA-AATAACATTAAAATACA--AAAACACACAATATTAT--AGGCTGATAACCATGTTTGACCC----A--CCACCATCAGGTAca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATATTTTTGGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--CCATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACGCGTATCATAGATGGGTCATTGCGTGTATCccgaaaatctaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTT--AGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTTA-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCTCAAATTATG---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAACTCGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTATTGGTTTGTTTTTTTCTATTTA---AAAA-GGTT------AAATGTT--AAAACAT----TTTTTT--AGACTGATCATC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCATATTCCC-------TAT-TCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCATAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCATAAAAACAAAGAA----TGATTGATTA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTATGTGTGTATTTCGCTTCAATC--ATGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTT--------GCGATAATGATTTTGATGGTACACTCAGTAAATTGTTAATAGTTTCATTGTAACTAAAAAAAATGATGTATTTCAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTTTGAGGTATTTATTTAATATTGTT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATATATaaaca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTGTTGAGGTAATTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACGTGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCT-TTTTCTAAATTTACATGCAATAAAACTAGGAATTAATAAAG-TTTTCTGGGGTAC-------TTAAAATTATGTTTCATATAGAAATTTTAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAACAGCACC-----CACTCTCAAAATCATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCATATTG-----TTTTTT-CTATTTA---AAAA------------------------CAT----TTTTTA--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAGCCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATC-----CTATTATCCTTAATAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTAAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATTAACGTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAAGGATGTATTTTATTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATGTATCATAGACAGGTCGTTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCCTTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATTAGTAAAG-TTTTCTCGGGTAC--GT-A----------------------AAATTATGATTATAAAATATTATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACGTTTATTCATATTTCAGCTATATTTCATGCCTATACAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCTGTATTG-----TTTTTTTCTGTTTA---AAAG-GGTA------AAATGTT--AGAACAT----ATTTTT--AGACTGATTACC----TTAACCT---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATT-CCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTTTGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCATACAAAAATACATGGTTACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----CA----CTATGCACCAACTTCCAAGA---AAAT-ATCAACTTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACCGTGTGTGTACATCAAATCTTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGGACAATTATTCATTACCGTAACATGTGCGCGTGACGTCAAAAT---G----TAGTTT--------GCAATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTC----------------ATGATGTATTTTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTCAGGTACTTTTTTAATACTGTT--GTTGTAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCTTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAGTTTTTCTG-----CA-GTAA-TTAAAATTATGTTTCATATAGAAAACATAATTATAAAATAATACTAAAAGTGGAAAAGGACCCTGGGCACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATTTTCCATGCCTATAA----AAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATAATATACTAGGTCCGTATTGTT---TTTTTTTCTATTTA---AAAA-GGTA------AAATGTT--AAAACAT----TTTTTT--AGACTGATCACC----TTAACCCTATTAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAA--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGACTATATAGAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttTCTTTATTCATAAACATTTCAAAATATTTAAATCGTAACAACAATGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCTCTGTGTGTATTTCGCTTCAATG--GTGTGTACATCAAGTCTTCTCCATTATAGGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTC-------------CGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATTATTTCATTGTAACCCAACAAAATGATGTATTTTATTActttattcataaacatttcaaaatatttaaatcgtaacaacaatgaatgattactatgcaccaactttcaagaaaacataaacctctgtgtgtatttcgcttcaatggtgtgtacatcaagtcttctccattataggttgttcatggtgaacaattattcatttccgtgacgtcaaaatttcgttcgcgattatgattttgatggttcacccagtaaattgttaattatttcattgtaacccaacaaaatgatgtattttatta
gi|6                          : tttgaatagtttttcaggtacttttttaatactgttgttgtagaaataatatcaaaatgttaaaacattacccaacacaaaaagagtaatacatgtatcatagacaggtcattgcctgtatccttatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaataaaactaggaataagtaaagtttttctgcagtaattaaaattatgtttcatatagaaaacataattataaaataatactaaaagtggaaaaggaccctgggcactcccaaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctattttccatgcctataaaagaggaagttgtctggggtaataatatactaggtccgtattgtttttttttctatttaaaaaggtaaaatgttaaaacatttttttagactgatcaccttaaccctattaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtgacctatccaataagtattattaagtcactgcttagactatatagaTAAATAGTTTTTTAGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCATAATGTTAAA--ACAATACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACACGTATCATAAACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATCAAACTAGGAATAAGTAAAA-TTCTTTGAGGCACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGTT-AATTATATATTAGGTCCGTATTGT----TTTTTTTCTATTTA---AAAA-AGTC------AAATGTT--TAAACAT----TTTTTT--AGACTGATCATC----TTAACGC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGGCC--TATCCGT--TAAGGTAACTTATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttGGTAACTTATTTTATATTATTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAAAAACAAAGAA----TGGT----TATTAACTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTCTGTGTGTATTTCGCTTCGACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTGTATGTTATTCACGGTGGAC-ATTAGTCATTTCCGTAttatattatttattcataaccatttcataatatttaaatcgtaaaaacaaagaatggttattaactatgcaccaactttcaagaaaatataaacttctgtgtgtatttcgcttcgaccgtgtgtacatcaaatcttctccgttgtatgttattcacggtggacattagtcatttccgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaaatagttttttaggttcttatttaatattgattttatagaaataatatcataatgttaaaacaatacccaacacaaaaagagtaatacacgtatcataaacgggtcattgcgtgtatccgtatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaatcaaactaggaataagtaaaattctttgaggcacatgtaatcaaaattatgtttcatatagaaattataattataaaataatattaaaagtgtaaaagcacccactcctcaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctatatttcatgcctataaaaataagaggaagttgtatgggttaattatatattaggtccgtattgttttttttctatttaaaaaagtcaaatgtttaaacatttttttagactgatcatcttaacgctaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtggcctatccgttaaTTTTTTCTTTTTA---AAAAAGGTC------AAATGTT--AAAACAT----TTTTTT--AGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACTAAATTCCCATGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-TTA--TTATTTACTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGTAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTATTT-----TAAGTATTTCATAATATTTAATTCGTAACAACAAAGAA----TGAC----TA----CTATGCACCGACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACGTTTCTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAAATCTTCTCCGTTATATATTGTTCACGGTGGATAATTATTCATTTCCGTAACAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATCGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCATGTATCCGTATTTCAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTA-GAATAAATAAAG-TTTTCTGGGGTA------A-TTAAAATTACGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTGAAAGCAAC-----CACTCCACAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACATTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATCCCTATAAAAATAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACTGCTTA-----TATGCATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTATCTTGCAATATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTTACAACAAAAAG----TGAT----TA----ATATGCACCATTTTTCAACA---AAAT-ATAAATGTTTGTGTGCATTTCACTTCAAAC--ATGTTTACACCAAATCTCCT---TTATATATTATTCACGGTGGACAATTATTCATTTCTGTAACAGGTGAACATGACATCAAAATACATTATATTGTTT--------GCGACTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTCTTAATAATTTCATTGTAATTCACTAAAATTATGTATTTTATTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    444444444                                                            11111                                                                                                                                       22222                  111111                  1111111                  1111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11111111      11111111                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             55                        1   55                        3                                                4     4                                         4             333333333                                                            11111       0        777                                                                                     1      5                       44444                  666666  2       66      3333333                  7777       777                                                        66       66   5   66                                                                                    0                                  7777    7777  7777                    666    3      1                       44                                                                     1               00000000 2    66666666                                               0          0                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ..                        .   ..                        .                                                .     .                                         .             .........                                                            .....       .        ...                                                                                     .      .                       .....                  ......  .       ..      .......                  ....       ...                                                        ..       ..   .   ..                                                                                    .                                  ....    ....  ....                    ...    .      .                       ..                                                                     .               ........ .    ........                                               .          .                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             00                        0   00                        6                                                4     4                                         4             888888888                                                            11111       1        888                                                                                     4      0                       44444                  444444  6       11      7777777                  2222       888                                                        99       99   0   99                                                                                    5                                  7777    7777  7777                    444    6      0                       66                                                                     1               99999999 7    11111111                                               8          2                   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
Reference ( family-807 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAATAGTTTTTTAGATACTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGTGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGCCAATAAAACTAAGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCATTACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATGTCATGCCTATAAAAA-AAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTGTTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTCAAATGTT--AAAACATTT----TTTTTTA-ATTGACCATC----TTAACAC---TTACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCTCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAATCATTTCATAATATTTAAATTGTAAAAACAAAGAATGATTGAT----TA----CTATGCACAAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCGATGTGTATATTTCGCTTCAACC--ATGTGTACAAAAAATGTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAATAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------ACGATTATGATTTTGATGGTACACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATT-TAACTCAACAAAATGGTGTATTTTATCA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTA-ATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATTAAAATTTATGGTAACCTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTAGGCACCAACGTTCAGAA---AAAT-ATAAACTTCTGT----ATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAGATTTTTTCCTTTATATATTGTTCACTGTGGACAATTAaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CCCTCCCTCAATTATTTTTGTTTTAAAA-ATGTAATACATTCTGAGCACGCGTTCAGTAGAACTTCAGCTATATTTCCAGCCTATGAAAATAAGAGAGAGTAGTTTGGGGT-CATTATATACTAGGTTCATATTG-----TGTTTTT-TATATAAAAG-----AGTAAAATGTTAAAAAACA---------TGTTAAACTGATAACCGCG-TT--------TGACCCGTCATCATGTATG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acttttatacaaacaagataaatataaaaaaaacctggtactccaggATATAGATTGCAAATTCCTCACAAAAGTACACGGTAACTTATTTTCTTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGT-ACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---GAAT-TTATACAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATACATCAAATATTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTC--------ATGATTATGATTTTGATGGTTCGCCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTcaaatattctccattatatgttgttcatggtgaacaattattcatttccgtaacaggtgcgtgtgacgtcaaaattttgttcatgattatgattttgatggttcgcccagtaaattgttaataatttcattgtaact
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatagattgcaaattcctcacaaaagtacacggtaacttattttcttttctttattcataagcatttcataatatttaaatcgtacaacaaagaatgattactatgcaccaactttcaagagaattATAGTTTTTGAAGTACTTATTTAATATTCTT--TTTGCAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGATCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAATAAACCT-TTTTCTAAATTT----TCAATAAAACTCGGAATAAATAAAG-TTTTATGGGATAC-------TTAAAATTATGTTTCATATATAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCCCAAATTATT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTACTTAGATAATATTTTTAATTTGTAAAAATAATATAAAATTGTAAAAGGAAAT-ACTC--CACAAAAAA--TATATACATGTATCATAGATGGACTAT-GCGTGTATCCGTATTTGAGCTGT-AGCCC-TTCCCT----------CCGATGAAA-TAGGAATAAGTTAAG-CTTTCTGGGGTATA-AT-------AGTT---TTTTTTGTAGAAA--A----TGTAAAATAATATTAAAAATGTAAAGGCAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atAACATTTATTT-TATTTTGCTT--ACC--ATTTTCACACCAAATCCACATTGTTTGATGA-GTTCATGGTGGAAACTTTTTCCTTGCCATAATAGGTG-ATGAAATGTCA---T---T----TTTTTCTGTTTTGAAC-ATTATT-TTTTGATGGATCAACCAGCAA------AATAATTTCA-TG-AATTCAACATAAAGGTTTATTTTCTTatc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCACAGGCAT--AATCATATTTA--------TAACAAAGAA----TAGT----TA----CTTAGTATCAATTTCCAATATACAAATTATATATTTTTTCGTGCATTCTATTT-AACT--GTTTTCACATCAAATCCACAATGCTACATATTGTTCATATTGGAATATTATTCATTTCTGTAGCAcac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agttttcacagtgttTCGTTTCAACC--GTGTTCATATTAAATCCACTCTGTTTTATGTTGTTAGCGGTAGGAAAGTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGAGTGGCGTCAAAGT---T----TGGATT--------ATGACTGTAATTGTGATGGTTCACCCAATAAATTCTTAATTCTTTGACTGTAATTCACTAAAAacataaagtca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATTTCCAGCCAACACAATTAGGAGAATGTTGTCTGAGGTCACTTATATGCTATGTTTGTATTG-----GTTTTAGATAAGGAAAAAATAACATTAAAATACA--AAAACA--CACAATATTATAGGCTGATAACCATGTTTGACCC----A--CCACCATCAGGTAca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATATTTTTGGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--CCATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACGCGTATCATAGATGGGTCATTGCGTGTATCccgaaaatctaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTT--AGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTTA-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCTCAAATTATG---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAACTCGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTATTGGTTTGTTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTTAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCATC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCATATTCCC-------TAT-TCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCATAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCATAAAAACAAAGAA----TGATTGATTA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTATGTGTGTATTTCGCTTCAATC--ATGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTT--------GCGATAATGATTTTGATGGTACACTCAGTAAATTGTTAATAGTTTCATTGTAACTAAAAAAAATGATGTATTTCAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTTTGAGGTATTTATTTAATATTGTT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATATATaaaca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTGTTGAGGTAATTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACGTGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCT-TTTTCTAAATTTACATGCAATAAAACTAGGAATTAATAAAG-TTTTCTGGGGTAC-------TTAAAATTATGTTTCATATAGAAATTTTAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAACAGCACC-----CACTCTCAAAATCATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCATATTG-----TTTTTT-CTATTTAAAAA----------------------CA--T----TTTTTAAGACTGATCACC----TTAACCC---TAGCCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATC-----CTATTATCCTTAATAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTAAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATTAACGTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAAGGATGTATTTTATTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATGTATCATAGACAGGTCGTTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCCTTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATTAGTAAAG-TTTTCTCGGGTAC--GT-A----------------------AAATTATGATTATAAAATATTATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACGTTTATTCATATTTCAGCTATATTTCATGCCTATACAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCTGTATTG-----TTTTTTTCTGTTTAAAAG-----GGTAAAATGTT--AGAACA--T----ATTTTTAGACTGATTACC----TTAACCT---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATT-CCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTTTGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCATACAAAAATACATGGTTACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----CA----CTATGCACCAACTTCCAAGA---AAAT-ATCAACTTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACCGTGTGTGTACATCAAATCTTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGGACAATTATTCATTACCGTAACATGTGCGCGTGACGTCAAAAT---G----TAGTTT--------GCAATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTC----------------ATGATGTATTTTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTCAGGTACTTTTTTAATACTGTT--GTTGTAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCTTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAGTTTTTCTG-----CA-GTAA-TTAAAATTATGTTTCATATAGAAAACATAATTATAAAATAATACTAAAAGTGGAAAAGGACCCTGGGCACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATTTTCCATGCCTATAA----AAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATAATATACTAGGTCCGTATTGTT---TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTAAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCCTATTAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAA--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGACTATATAGAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttTCTTTATTCATAAACATTTCAAAATATTTAAATCGTAACAACAATGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCTCTGTGTGTATTTCGCTTCAATG--GTGTGTACATCAAGTCTTCTCCATTATAGGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTC-------------CGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATTATTTCATTGTAACCCAACAAAATGATGTATTTTATTActttattcataaacatttcaaaatatttaaatcgtaacaacaatgaatgattactatgcaccaactttcaagaaaacataaacctctgtgtgtatttcgcttcaatggtgtgtacatcaagtcttctccattataggttgttcatggtgaacaattattcatttccgtgacgtcaaaatttcgttcgcgattatgattttgatggttcacccagtaaattgttaattatttcattgtaacccaacaaaatgatgtattttatta
gi|6                          : tttgaatagtttttcaggtacttttttaatactgttgttgtagaaataatatcaaaatgttaaaacattacccaacacaaaaagagtaatacatgtatcatagacaggtcattgcctgtatccttatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaataaaactaggaataagtaaagtttttctgcagtaattaaaattatgtttcatatagaaaacataattataaaataatactaaaagtggaaaaggaccctgggcactcccaaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctattttccatgcctataaaagaggaagttgtctggggtaataatatactaggtccgtattgtttttttttctatttaaaaaggtaaaatgttaaaacatttttttagactgatcaccttaaccctattaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtgacctatccaataagtattattaagtcactgcttagactatatagaTAAATAGTTTTTTAGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCATAATGTTAAA--ACAATACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACACGTATCATAAACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATCAAACTAGGAATAAGTAAAA-TTCTTTGAGGCACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGTT-AATTATATATTAGGTCCGTATTGT----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----AGTCAAATGTT--TAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCATC----TTAACGC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGGCC--TATCCGT--TAAGGTAACTTATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttGGTAACTTATTTTATATTATTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAAAAACAAAGAA----TGGT----TATTAACTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTCTGTGTGTATTTCGCTTCGACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTGTATGTTATTCACGGTGGAC-ATTAGTCATTTCCGTAttatattatttattcataaccatttcataatatttaaatcgtaaaaacaaagaatggttattaactatgcaccaactttcaagaaaatataaacttctgtgtgtatttcgcttcgaccgtgtgtacatcaaatcttctccgttgtatgttattcacggtggacattagtcatttccgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaaatagttttttaggttcttatttaatattgattttatagaaataatatcataatgttaaaacaatacccaacacaaaaagagtaatacacgtatcataaacgggtcattgcgtgtatccgtatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaatcaaactaggaataagtaaaattctttgaggcacatgtaatcaaaattatgtttcatatagaaattataattataaaataatattaaaagtgtaaaagcacccactcctcaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctatatttcatgcctataaaaataagaggaagttgtatgggttaattatatattaggtccgtattgttttttttctatttaaaaaagtcaaatgtttaaacatttttttagactgatcatcttaacgctaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtggcctatccgttaaTTTTTTCTTTTTAAAAAA----GGTCAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACTAAATTCCCATGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-TTA--TTATTTACTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGTAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTATTT-----TAAGTATTTCATAATATTTAATTCGTAACAACAAAGAA----TGAC----TA----CTATGCACCGACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACGTTTCTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAAATCTTCTCCGTTATATATTGTTCACGGTGGATAATTATTCATTTCCGTAACAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATCGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCATGTATCCGTATTTCAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTA-GAATAAATAAAG-TTTTCTGGGGTA------A-TTAAAATTACGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTGAAAGCAAC-----CACTCCACAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACATTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATCCCTATAAAAATAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTGCTTA-----TATGCATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTATCTTGCAATATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTTACAACAAAAAG----TGAT----TA----ATATGCACCATTTTTCAACA---AAAT-ATAAATGTTTGTGTGCATTTCACTTCAAAC--ATGTTTACACCAAATCTCCT---TTATATATTATTCACGGTGGACAATTATTCATTTCTGTAACAGGTGAACATGACATCAAAATACATTATATTGTTT--------GCGACTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTCTTAATAATTTCATTGTAATTCACTAAAATTATGTATTTTATTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    444444444                                                            11111                                                                                                                                       22222                  111111                  1111111                  1111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11111111      11111111                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             55                        1   55                        3                                                4     4                                         4             333333333                                                            11111       0        777                                                                                     1      5                       44444                  666666  2       66      3333333                  7777       777                                                        66       66   5   66                                                                                    0                                  7777    7777  7777                    666    3      1                       44                                                                     1               00000000 2    66666666                                               0          0                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ..                        .   ..                        .                                                .     .                                         .             .........                                                            .....       .        ...                                                                                     .      .                       .....                  ......  .       ..      .......                  ....       ...                                                        ..       ..   .   ..                                                                                    .                                  ....    ....  ....                    ...    .      .                       ..                                                                     .               ........ .    ........                                               .          .                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             00                        0   00                        6                                                4     4                                         4             888888888                                                            11111       1        888                                                                                     4      0                       44444                  444444  6       11      7777777                  2222       888                                                        99       99   0   99                                                                                    5                                  7777    7777  7777                    444    6      0                       66                                                                     1               99999999 7    11111111                                               8          2                   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
Reference ( family-807 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAATAGTTTTTTAGATACTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGTGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGCCAATAAAACTAAGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCATTACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATGTCATGCCTATAAAAA-AAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTGTTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTCAAATGTT--AAAACATTT----TTTTTTA-ATTGACCATC----TTAACAC---TTACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCTCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAATCATTTCATAATATTTAAATTGTAAAAACAAAGAATGATTGAT----TA----CTATGCACAAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCGATGTGTATATTTCGCTTCAACC--ATGTGTACAAAAAATGTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAATAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------ACGATTATGATTTTGATGGTACACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATT-TAACTCAACAAAATGGTGTATTTTATCA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTA-ATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATTAAAATTTATGGTAACCTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTAGGCACCAACGTTCAGAA---AAAT-ATAAACTTCTGT----ATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAGATTTTTTCCTTTATATATTGTTCACTGTGGACAATTAaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CCCTCCCTCAATTATTTTTGTTTTAAAA-ATGTAATACATTCTGAGCACGCGTTCAGTAGAACTTCAGCTATATTTCCAGCCTATGAAAATAAGAGAGAGTAGTTTGGGGT-CATTATATACTAGGTTCATATTG-----TGTTTTT-TATATAAAAG-----AGTAAAATGTTAAAAAACA---------TGTTAAACTGATAACCGCG-TT--------TGACCCGTCATCATGTATG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acttttatacaaacaagataaatataaaaaaaacctggtactccaggATATAGATTGCAAATTCCTCACAAAAGTACACGGTAACTTATTTTCTTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGT-ACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---GAAT-TTATACAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATACATCAAATATTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTC--------ATGATTATGATTTTGATGGTTCGCCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTcaaatattctccattatatgttgttcatggtgaacaattattcatttccgtaacaggtgcgtgtgacgtcaaaattttgttcatgattatgattttgatggttcgcccagtaaattgttaataatttcattgtaact
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatagattgcaaattcctcacaaaagtacacggtaacttattttcttttctttattcataagcatttcataatatttaaatcgtacaacaaagaatgattactatgcaccaactttcaagagaattATAGTTTTTGAAGTACTTATTTAATATTCTT--TTTGCAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGATCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAATAAACCT-TTTTCTAAATTT----TCAATAAAACTCGGAATAAATAAAG-TTTTATGGGATAC-------TTAAAATTATGTTTCATATATAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCCCAAATTATT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTACTTAGATAATATTTTTAATTTGTAAAAATAATATAAAATTGTAAAAGGAAAT-ACTC--CACAAAAAA--TATATACATGTATCATAGATGGACTAT-GCGTGTATCCGTATTTGAGCTGT-AGCCC-TTCCCT----------CCGATGAAA-TAGGAATAAGTTAAG-CTTTCTGGGGTATA-AT-------AGTT---TTTTTTGTAGAAA--A----TGTAAAATAATATTAAAAATGTAAAGGCAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atAACATTTATTT-TATTTTGCTT--ACC--ATTTTCACACCAAATCCACATTGTTTGATGA-GTTCATGGTGGAAACTTTTTCCTTGCCATAATAGGTG-ATGAAATGTCA---T---T----TTTTTCTGTTTTGAAC-ATTATT-TTTTGATGGATCAACCAGCAA------AATAATTTCA-TG-AATTCAACATAAAGGTTTATTTTCTTatc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCACAGGCAT--AATCATATTTA--------TAACAAAGAA----TAGT----TA----CTTAGTATCAATTTCCAATATACAAATTATATATTTTTTCGTGCATTCTATTT-AACT--GTTTTCACATCAAATCCACAATGCTACATATTGTTCATATTGGAATATTATTCATTTCTGTAGCAcac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agttttcacagtgttTCGTTTCAACC--GTGTTCATATTAAATCCACTCTGTTTTATGTTGTTAGCGGTAGGAAAGTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGAGTGGCGTCAAAGT---T----TGGATT--------ATGACTGTAATTGTGATGGTTCACCCAATAAATTCTTAATTCTTTGACTGTAATTCACTAAAAacataaagtca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATTTCCAGCCAACACAATTAGGAGAATGTTGTCTGAGGTCACTTATATGCTATGTTTGTATTG-----GTTTTAGATAAGGAAAAAATAACATTAAAATACA--AAAACA--CACAATATTATAGGCTGATAACCATGTTTGACCC----A--CCACCATCAGGTAca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATATTTTTGGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--CCATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACGCGTATCATAGATGGGTCATTGCGTGTATCccgaaaatctaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTT--AGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTTA-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCTCAAATTATG---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAACTCGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTATTGGTTTGTTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTTAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCATC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCATATTCCC-------TAT-TCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCATAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCATAAAAACAAAGAA----TGATTGATTA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTATGTGTGTATTTCGCTTCAATC--ATGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTT--------GCGATAATGATTTTGATGGTACACTCAGTAAATTGTTAATAGTTTCATTGTAACTAAAAAAAATGATGTATTTCAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTTTGAGGTATTTATTTAATATTGTT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATATATaaaca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTGTTGAGGTAATTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACGTGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCT-TTTTCTAAATTTACATGCAATAAAACTAGGAATTAATAAAG-TTTTCTGGGGTAC-------TTAAAATTATGTTTCATATAGAAATTTTAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAACAGCACC-----CACTCTCAAAATCATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCATATTG-----TTTTTT-CTATTTAAAAA----------------------CA--T----TTTTTAAGACTGATCACC----TTAACCC---TAGCCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATC-----CTATTATCCTTAATAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTAAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATTAACGTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAAGGATGTATTTTATTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATGTATCATAGACAGGTCGTTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCCTTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATTAGTAAAG-TTTTCTCGGGTAC--GT-A----------------------AAATTATGATTATAAAATATTATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACGTTTATTCATATTTCAGCTATATTTCATGCCTATACAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCTGTATTG-----TTTTTTTCTGTTTAAAAG-----GGTAAAATGTT--AGAACA--T----ATTTTTAGACTGATTACC----TTAACCT---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATT-CCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTTTGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCATACAAAAATACATGGTTACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----CA----CTATGCACCAACTTCCAAGA---AAAT-ATCAACTTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACCGTGTGTGTACATCAAATCTTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGGACAATTATTCATTACCGTAACATGTGCGCGTGACGTCAAAAT---G----TAGTTT--------GCAATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTC----------------ATGATGTATTTTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTCAGGTACTTTTTTAATACTGTT--GTTGTAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCTTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAGTTTTTCTG-----CA-GTAA-TTAAAATTATGTTTCATATAGAAAACATAATTATAAAATAATACTAAAAGTGGAAAAGGACCCTGGGCACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATTTTCCATGCCTATAA----AAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATAATATACTAGGTCCGTATTGTT---TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTAAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCCTATTAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAA--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGACTATATAGAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttTCTTTATTCATAAACATTTCAAAATATTTAAATCGTAACAACAATGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCTCTGTGTGTATTTCGCTTCAATG--GTGTGTACATCAAGTCTTCTCCATTATAGGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTC-------------CGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATTATTTCATTGTAACCCAACAAAATGATGTATTTTATTActttattcataaacatttcaaaatatttaaatcgtaacaacaatgaatgattactatgcaccaactttcaagaaaacataaacctctgtgtgtatttcgcttcaatggtgtgtacatcaagtcttctccattataggttgttcatggtgaacaattattcatttccgtgacgtcaaaatttcgttcgcgattatgattttgatggttcacccagtaaattgttaattatttcattgtaacccaacaaaatgatgtattttatta
gi|6                          : tttgaatagtttttcaggtacttttttaatactgttgttgtagaaataatatcaaaatgttaaaacattacccaacacaaaaagagtaatacatgtatcatagacaggtcattgcctgtatccttatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaataaaactaggaataagtaaagtttttctgcagtaattaaaattatgtttcatatagaaaacataattataaaataatactaaaagtggaaaaggaccctgggcactcccaaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctattttccatgcctataaaagaggaagttgtctggggtaataatatactaggtccgtattgtttttttttctatttaaaaaggtaaaatgttaaaacatttttttagactgatcaccttaaccctattaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtgacctatccaataagtattattaagtcactgcttagactatatagaTAAATAGTTTTTTAGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCATAATGTTAAA--ACAATACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACACGTATCATAAACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATCAAACTAGGAATAAGTAAAA-TTCTTTGAGGCACATGT-AATCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGTT-AATTATATATTAGGTCCGTATTGT----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----AGTCAAATGTT--TAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCATC----TTAACGC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGGCC--TATCCGT--TAAGGTAACTTATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttGGTAACTTATTTTATATTATTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAAAAACAAAGAA----TGGT----TATTAACTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTCTGTGTGTATTTCGCTTCGACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTGTATGTTATTCACGGTGGAC-ATTAGTCATTTCCGTAttatattatttattcataaccatttcataatatttaaatcgtaaaaacaaagaatggttattaactatgcaccaactttcaagaaaatataaacttctgtgtgtatttcgcttcgaccgtgtgtacatcaaatcttctccgttgtatgttattcacggtggacattagtcatttccgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaaatagttttttaggttcttatttaatattgattttatagaaataatatcataatgttaaaacaatacccaacacaaaaagagtaatacacgtatcataaacgggtcattgcgtgtatccgtatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaatcaaactaggaataagtaaaattctttgaggcacatgtaatcaaaattatgtttcatatagaaattataattataaaataatattaaaagtgtaaaagcacccactcctcaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctatatttcatgcctataaaaataagaggaagttgtatgggttaattatatattaggtccgtattgttttttttctatttaaaaaagtcaaatgtttaaacatttttttagactgatcatcttaacgctaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtggcctatccgttaaTTTTTTCTTTTTAAAAAA----GGTCAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACTAAATTCCCATGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-TTA--TTATTTACTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGTAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTATTT-----TAAGTATTTCATAATATTTAATTCGTAACAACAAAGAA----TGAC----TA----CTATGCACCGACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACGTTTCTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAAATCTTCTCCGTTATATATTGTTCACGGTGGATAATTATTCATTTCCGTAACAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATCGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCATGTATCCGTATTTCAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTA-GAATAAATAAAG-TTTTCTGGGGTA------A-TTAAAATTACGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTGAAAGCAAC-----CACTCCACAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACATTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATCCCTATAAAAATAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTGCTTA-----TATGCATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTATCTTGCAATATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTTACAACAAAAAG----TGAT----TA----ATATGCACCATTTTTCAACA---AAAT-ATAAATGTTTGTGTGCATTTCACTTCAAAC--ATGTTTACACCAAATCTCCT---TTATATATTATTCACGGTGGACAATTATTCATTTCTGTAACAGGTGAACATGACATCAAAATACATTATATTGTTT--------GCGACTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTCTTAATAATTTCATTGTAATTCACTAAAATTATGTATTTTATTA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AA                        T   GG                        T                                                A     T                                         T             ATGTTATC                                                             CTGGG                TTT                                                                                     T      C                       GTTTG                  ATAACA  A       AA      CACAA                    ATGT       TAT                                                        AT       AA   G   AC                                                                                                                       .       TGAT  TTAA                    TAC    T      T                       GT                                                                     C               ACATTATA T    TGTTTTGA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         A   .                         .                                                .     .                                         .             ATGTAATC                                                             .                    .                                                                                       C      .                       TT                     AG      A       .       T                        GCG        .                                                          .        .    .   .                                                                                                                        .       .     .                       .      .      A                       .                                                                      C               T        T    .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         A   .                         .                                                .     .                                         .             AGTAATT                                                              .                    .                                                                                       A      .                       T                      A       T       .       T                        .          .                                                          .        .    .   .                                                                                                                        .       .     .                       .      .      A                       .                                                                      C               T        G    .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         T   .                         .                                                .     .                                         .             AAT                                                                  .                    .                                                                                       C      .                       .                      G       A       .       T                        .          .                                                          .        .    .   .                                                                                                                        .       .     .                       .      .      T                       .                                                                      C               T        T    .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         A   .                         .                                                .     .                                         .             GTA                                                                  .                    .                                                                                       C      .                       .                      G       A       .       T                        .          .                                                          .        .    .   .                                                                                                                        .       .     .                       .      .      T                       .                                                                      C               T        C    .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         A   .                         .                                                .     .                                         .             ATT                                                                  .                    .                                                                                       C      .                       .                      G       C       .       T                        .          .                                                          .        .    .   .                                                                                                                        .       .     .                       .      .      G                       .                                                                      A               T        A    .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         A   .                         .                                                .     .                                         .             TT                                                                   .                    .                                                                                       A      .                       .                      A       C       .       T                        .          .                                                          .        .    .   .                                                                                                                        .       .     .                       .      .      T                       .                                                                      .               G        C    .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         T   .                         .                                                .     .                                         .             TT                                                                   .                    .                                                                                                                                             .       .       .       .                        .          .                                                                                                                                                                                                     .       .     .                       .      .      C                       .                                                                      .               T        T    .       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         T   .                         .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .       .     .                       .      .      T                       .                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .                         A   .                         .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        .       .     .                       .      .      G                       .                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  G                       .                                                                                                            


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATT******                                                                                                                                                                                                                                                       T******                                                                                                                                                                                                                                   ****
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACA-GT-A-TCAAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACATT------AAAATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACAT------TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   44444444                                                              11111                                                                                                                                       22222                  111111                  1111111                  1111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                11111111      11111111                                                                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             55                        1   55                        3                                                4     4                                         4            55555555   4                    2                                     11111       0        777                                                                                     1      5                       44444                  666666  2       66      3333333                  7777       777                                                        66       66   5   66                                                                                    0                                  7777    7777  7777                    666    3      1                       44                                                                     1               00000000 2    66666666                                               0          0                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ..                        .   ..                        .                                                .     .                                         .            ........   .                    .                                     .....       .        ...                                                                                     .      .                       .....                  ......  .       ..      .......                  ....       ...                                                        ..       ..   .   ..                                                                                    .                                  ....    ....  ....                    ...    .      .                       ..                                                                     .               ........ .    ........                                               .          .                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             00                        0   00                        6                                                4     4                                         4            33333333   4                    0                                     11111       1        888                                                                                     4      0                       44444                  444444  6       11      7777777                  2222       888                                                        99       99   0   99                                                                                    5                                  7777    7777  7777                    444    6      0                       66                                                                     1               99999999 7    11111111                                               8          2                   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACAT-----TAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
Reference ( family-807 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTNAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTTTCTGGGGTACAT-----TAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCGTATTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTNAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACNTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAATGATGTATTTTATTA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GAATAGTTTTTTAGATACTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGTGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGCCAATAAAACTAAGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTAATCAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCATTACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATGTCATGCCTATAAAAA-AAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTGTTG-----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTCAAATGTT--AAAACATTT----TTTTTTA-ATTGACCATC----TTAACAC---TTACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCTCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAATCATTTCATAATATTTAAATTGTAAAAACAAAGAATGATTGAT----TA----CTATGCACAAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCGATGTGTATATTTCGCTTCAACC--ATGTGTACAAAAAATGTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAATAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------ACGATTATGATTTTGATGGTACACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATT-TAACTCAACAAAATGGTGTATTTTATCA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTA-ATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATTAAAATTTATGGTAACCTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTAGGCACCAACGTTCAGAA---AAAT-ATAAACTTCTGT----ATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAGATTTTTTCCTTTATATATTGTTCACTGTGGACAATTAaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CCCTCCCTCAATTATTTTTGTTTTAAAA-ATGTAATACATTCTGAGCACGCGTTCAGTAGAACTTCAGCTATATTTCCAGCCTATGAAAATAAGAGAGAGTAGTTTGGGGT-CATTATATACTAGGTTCATATTG-----TGTTTTT-TATATAAAAG-----AGTAAAATGTTAAAAAACA---------TGTTAAACTGATAACCGCG-TT--------TGACCCGTCATCATGTATG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acttttatacaaacaagataaatataaaaaaaacctggtactccaggATATAGATTGCAAATTCCTCACAAAAGTACACGGTAACTTATTTTCTTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGT-ACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---GAAT-TTATACAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATACATCAAATATTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTC--------ATGATTATGATTTTGATGGTTCGCCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTcaaatattctccattatatgttgttcatggtgaacaattattcatttccgtaacaggtgcgtgtgacgtcaaaattttgttcatgattatgattttgatggttcgcccagtaaattgttaataatttcattgtaact
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atatagattgcaaattcctcacaaaagtacacggtaacttattttcttttctttattcataagcatttcataatatttaaatcgtacaacaaagaatgattactatgcaccaactttcaagagaattATAGTTTTTGAAGTACTTATTTAATATTCTT--TTTGCAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGATCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAATAAACCT-TTTTCTAAATTT----TCAATAAAACTCGGAATAAATAAAG-TTTTATGGGATAC-T-----TAA-AATTATGTTTCATATATAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCCCAAATTATT---
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tGTACTTAGATAATATTTTTAATTTGTAAAAATAATATAAAATTGTAAAAGGAAAT-ACTC--CACAAAAAA--TATATACATGTATCATAGATGGACTAT-GCGTGTATCCGTATTTGAGCTGT-AGCCC-TTCCCT----------CCGATGAAA-TAGGAATAAGTTAAG-CTTTCTGGGGTA--------TAATAGTT---TTTTTTGTAGAAA--A----TGTAAAATAATATTAAAAATGTAAAGGCAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atAACATTTATTT-TATTTTGCTT--ACC--ATTTTCACACCAAATCCACATTGTTTGATGA-GTTCATGGTGGAAACTTTTTCCTTGCCATAATAGGTG-ATGAAATGTCA---T---T----TTTTTCTGTTTTGAAC-ATTATT-TTTTGATGGATCAACCAGCAA------AATAATTTCA-TG-AATTCAACATAAAGGTTTATTTTCTTatc
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCACAGGCAT--AATCATATTTA--------TAACAAAGAA----TAGT----TA----CTTAGTATCAATTTCCAATATACAAATTATATATTTTTTCGTGCATTCTATTT-AACT--GTTTTCACATCAAATCCACAATGCTACATATTGTTCATATTGGAATATTATTCATTTCTGTAGCAcac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agttttcacagtgttTCGTTTCAACC--GTGTTCATATTAAATCCACTCTGTTTTATGTTGTTAGCGGTAGGAAAGTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGAGTGGCGTCAAAGT---T----TGGATT--------ATGACTGTAATTGTGATGGTTCACCCAATAAATTCTTAATTCTTTGACTGTAATTCACTAAAAacataaagtca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TATATTTCCAGCCAACACAATTAGGAGAATGTTGTCTGAGGTCACTTATATGCTATGTTTGTATTG-----GTTTTAGATAAGGAAAAAATAACATTAAAATACA--AAAACA--CACAATATTATAGGCTGATAACCATGTTTGACCC----A--CCACCATCAGGTAca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATATTTTTGGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--CCATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACGCGTATCATAGATGGGTCATTGCGTGTATCccgaaaatctaa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTT--AGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAG-TTCTTTGGGGTACATGTTATCAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CAATCCTCAAATTATG---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAACTCGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGGT-AATTATATATTAAGTCCGTATTGGTTTGTTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTTAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCATC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCATATTCCC-------TAT-TCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCATAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTATAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCATAAAAACAAAGAA----TGATTGATTA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTATGTGTGTATTTCGCTTCAATC--ATGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGTGTGACGTCAAAAT---T----TTGTTT--------GCGATAATGATTTTGATGGTACACTCAGTAAATTGTTAATAGTTTCATTGTAACTAAAAAAAATGATGTATTTCAT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTTTTGAGGTATTTATTTAATATTGTT--TTTATAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATATATaaaca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttTGAATAGTTGTTGAGGTAATTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACGTGTATCATAGACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCT-TTTTCTAAATTTACATGCAATAAAACTAGGAATTAATAAAG-TTTTCTGGGGTAC-T-----TAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTTTAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAACAGCACC-----CACTCTCAAAATCATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCCATATTG-----TTTTTT-CTATTTAAAAA----------------------CA--T----TTTTTAAGACTGATCACC----TTAACCC---TAGCCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATC-----CTATTATCCTTAATAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTAAGGCTATATAGATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTAACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATTAACGTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTATATGTTGTTCACGGTGGACAATTATTCATTTCCGTAACAGGTGCGCGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTCATTGTAACTCAACAAAAGGATGTATTTTATTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATTGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGGA-ATACATGTATCATAGACAGGTCGTTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCCTTTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATTAGTAAAG-TTTTCTCGGGTACG------TAA-AATTATG------------------ATTATAAAATATTATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACGTTTATTCATATTTCAGCTATATTTCATGCCTATACAAATAAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATTATATACTAGGTCTGTATTG-----TTTTTTTCTGTTTAAAAG-----GGTAAAATGTT--AGAACA--T----ATTTTTAGACTGATTACC----TTAACCT---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATT-CCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-GTA--TTATTTTGTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGCAAATTCCATACAAAAATACATGGTTACTTATTTTATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTAACAACAAAGAA----TGAT----CA----CTATGCACCAACTTCCAAGA---AAAT-ATCAACTTTTGTGTGCATTTCGCTTCAACCGTGTGTGTACATCAAATCTTCTCCATTATATGTTGTTCATGGTGGACAATTATTCATTACCGTAACATGTGCGCGTGACGTCAAAAT---G----TAGTTT--------GCAATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATAATTTC----------------ATGATGTATTTTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAATAGTTTTTCAGGTACTTTTTTAATACTGTT--GTTGTAGAAATAATATCAAAATGTTAAA--ACATTACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACAGGTCATTGCCTGTATCCTTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTAGGAATAAGTAAAGTTTTTCTGCAGTA-AT-----TAA-AATTATGTTTCATATAGAAAACATAATTATAAAATAATACTAAAAGTGGAAAAGGACCCTGGGCACTCCCAAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATTTTCCATGCCTATAA----AAGAGGAAGTTGTCTGGGGT-AATAATATACTAGGTCCGTATTGTT---TTTTTTTCTATTTAAAAA-----GGTAAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCCTATTAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAA--TAA-GTA--TTATTAAGTCACTGCTTAGACTATATAGAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttTCTTTATTCATAAACATTTCAAAATATTTAAATCGTAACAACAATGAA----TGAT----TA----CTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAC-ATAAACCTCTGTGTGTATTTCGCTTCAATG--GTGTGTACATCAAGTCTTCTCCATTATAGGTTGTTCATGGTGAACAATTATTCATTTC-------------CGTGACGTCAAAAT---T----TCGTTC--------GCGATTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTGTTAATTATTTCATTGTAACCCAACAAAATGATGTATTTTATTActttattcataaacatttcaaaatatttaaatcgtaacaacaatgaatgattactatgcaccaactttcaagaaaacataaacctctgtgtgtatttcgcttcaatggtgtgtacatcaagtcttctccattataggttgttcatggtgaacaattattcatttccgtgacgtcaaaatttcgttcgcgattatgattttgatggttcacccagtaaattgttaattatttcattgtaacccaacaaaatgatgtattttatta
gi|6                          : tttgaatagtttttcaggtacttttttaatactgttgttgtagaaataatatcaaaatgttaaaacattacccaacacaaaaagagtaatacatgtatcatagacaggtcattgcctgtatccttatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaataaaactaggaataagtaaagtttttctgcagtaattaaaattatgtttcatatagaaaacataattataaaataatactaaaagtggaaaaggaccctgggcactcccaaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctattttccatgcctataaaagaggaagttgtctggggtaataatatactaggtccgtattgtttttttttctatttaaaaaggtaaaatgttaaaacatttttttagactgatcaccttaaccctattaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtgacctatccaataagtattattaagtcactgcttagactatatagaTAAATAGTTTTTTAGGTTCTTATTTAATATTGAT--TTTATAGAAATAATATCATAATGTTAAA--ACAATACCCAACACAAAAAGAGTA-ATACACGTATCATAAACGGGTCATTGCGTGTATCCGTATTTAAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATCAAACTAGGAATAAGTAAAA-TTCTTTGAGGCACATGTAATCAA-AATTATGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTAAAAGCACC-----CACTCCTCAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACGCGTTTATTTGTATTTCAGCTATATTTCATGCCTATAAAAATAAGAGGAAGTTGTATGGGTT-AATTATATATTAGGTCCGTATTGT----TTTTTTTCTATTTAAAAA-----AGTCAAATGTT--TAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCATC----TTAACGC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACCAAATTCCCAAGGACTTATATCAGTGGCC--TATCCGT--TAAGGTAACTTATT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttGGTAACTTATTTTATATTATTTATTCATAACCATTTCATAATATTTAAATCGTAAAAACAAAGAA----TGGT----TATTAACTATGCACCAACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACTTCTGTGTGTATTTCGCTTCGACC--GTGTGTACATCAAATCTTCTCCGTTGTATGTTATTCACGGTGGAC-ATTAGTCATTTCCGTAttatattatttattcataaccatttcataatatttaaatcgtaaaaacaaagaatggttattaactatgcaccaactttcaagaaaatataaacttctgtgtgtatttcgcttcgaccgtgtgtacatcaaatcttctccgttgtatgttattcacggtggacattagtcatttccgta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttaaatagttttttaggttcttatttaatattgattttatagaaataatatcataatgttaaaacaatacccaacacaaaaagagtaatacacgtatcataaacgggtcattgcgtgtatccgtatttaagcaataacccttttctaaatttacagtcaatcaaactaggaataagtaaaattctttgaggcacatgtaatcaaaattatgtttcatatagaaattataattataaaataatattaaaagtgtaaaagcacccactcctcaaattattattttaaaagatgtaatacattctcagcacgcgtttatttgtatttcagctatatttcatgcctataaaaataagaggaagttgtatgggttaattatatattaggtccgtattgttttttttctatttaaaaaagtcaaatgtttaaacatttttttagactgatcatcttaacgctaacccattatcatgtatgtcaaataccaaattcccaaggacttatatcagtggcctatccgttaaTTTTTTCTTTTTAAAAAA----GGTCAAATGTT--AAAACA--T----TTTTTTAGACTGATCACC----TTAACCC---TAACCCATTATCATGTATGTCAAATACTAAATTCCCATGGACTTATATCAGTGACC--TATCCAT--TAA-TTA--TTATTTACTCACTGCTTAGGCTATATAGATTGTAAATTCCTTACAAAAATACACGGTAACTTATTTTATTTTATTT-----TAAGTATTTCATAATATTTAATTCGTAACAACAAAGAA----TGAC----TA----CTATGCACCGACTTTCAAGA---AAAT-ATAAACGTTTCTGTGCATTTCGCTTCAACC--GTGTGTACATTAAATCTTCTCCGTTATATATTGTTCACGGTGGATAATTATTCATTTCCGTAACAG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gGAATAGTTTTTGAGGTACTTATTTAATATCGTT--TTTGTAGAAATAATATCAAAATGTAAAA--ACATTATCCAACACAAAAAGAGTA-ATACATGTATCATAGACGGGTCATTGCATGTATCCGTATTTCAGCAAT-AACCC-TTTTCTAAATTTACAGTCAATAAAACTA-GAATAAATAAAG-TTTTCTGGGGTA-AT-----TAA-AATTACGTTTCATATAGAAATTATAATTATAAAATAATATTAAAAGTGTGAAAGCAAC-----CACTCCACAAATTATT---ATTTTAAAAGATGTAATACATTCTCAGCACACATTTATTCGTATTTCAGCTATATTTCATCCCTATAAAAATAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CACTGCTTA-----TATGCATTGCAAATTCCTTACAAAAATACATGGTATCTTGCAATATTTTCTTTATTCATAAGCATTTCATAATATTTAAATCGTTACAACAAAAAG----TGAT----TA----ATATGCACCATTTTTCAACA---AAAT-ATAAATGTTTGTGTGCATTTCACTTCAAAC--ATGTTTACACCAAATCTCCT---TTATATATTATTCACGGTGGACAATTATTCATTTCTGTAACAGGTGAACATGACATCAAAATACATTATATTGTTT--------GCGACTATGATTTTGATGGTTCACCCAGTAAATTCTTAATAATTTCATTGTAATTCACTAAAATTATGTATTTTATTA