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lowQualScore                  :      .    .     .      .   .      .. . . ..   .      ....     . .       ..   ..         .   .  ...                 .     ..  .................   .      .        ...............   . .......      .     .............       .        .      .          .      .             .   ...     .     ..    .......       . .    .      . .      .          .                            .   .   ... .   ..     .      .  .                      . .   .  .                 .         .  ..       .....................                .   .             .......       ....      .      .                                    .   .             .......       ..    .   .                                    .          .......         . .              
lowQualScore                  :      0    6     0      9   1      66 9 9 44   7      8888     2 2       55   99         9   4  000                 4     22  22222222222222222   0      4        111111111111111   4 6666666      0     8888888888888       1        2      2          2      9             2   555     2     22    6666666       1 4    4      7 9      5          8                            3   0   000 0   22     8      2  0                      0 0   2  0                 0         0  88       888888888888888888888                7   7             8888888       2222      0      5                                    0   3             5555555       88    0   0                                    5          3333333         7 0              
consensus                     :    ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTT-GATTGGCNA-A-A-NATT-AAAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGC-TTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT--------A---TTTTCTAT-ACATAA-TACTCATTGT---A------AACGCT-G-------ATAAATCTGATTAACA--TGTA---CCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTG-TATTTCAACCAAACTTCATGACTGGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAAAA-ATGC-GCAGGTAT-ATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAA-GATGGAGATCNAGACTTGATGCTCGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATAT--TTTCAAT--------ATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTAT-----TTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATANTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGNACTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAGCTAA-------TTTTGATCTTTAAAGTACGTGACAGT
Reference ( gi|1 )            :    ATAATATAGGTCTTTCTGTGGTTT-GATTGGTCA-A-A-TATT-AAAGAA----GTTATTGTAGTAAAAATAAGG-TTTATGTAGTGAATAATAATTAACCTTAATTAAAATCACCAA--AT--------A---TATTTTAT-ACATAA-TACTCATTATGATAA--GAAAATGCT-G-------ATAAATATGATTTACA--AATT---CCCATGTGTCCATAAA-CAAACCATATAATTTTG-TATTTCTACCAAACTTCATGGCTGTAGGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAAAA-ATGC-ACAGGT-T-ATGTTGATTCGACAGCTTTCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACACGGACATGTTCA-GATTAAGATCCAGACTTGATACTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CGTTTTCCGAGTATTTAAGTGCACTA-GGAAGGAAA-AT--TTTCAAT--------A--------AACAGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCAACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCTACAGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAGCTAA-------TTTTGATCTCTGAAGTACATGACAGTT
gi|10                         :    ATGATATTGGTCTATCGATGTTTT-AATTGGCAA-A-A-GATT-AAAGAAA---GGTATTCCAGTCAAACTAAGA-TTTATGTAGCGAAGAATAGTTAACCTTAATTAAAATAACTAA--AT--------A---TTTTCTAT-ACATAA-TACTCGTTGT----------AACGCT-G-------ATAAATCTGATGGACA--TGTA---CCCGTGTGTCCAAAAA-CAAATCGAATACTTTTG-TATTTCAACCAAACTTCATGACTGGAAGTGTG-TTTTG--GTAT-------ATCTTAACA-ATTCGACAG
gi|6                          :  atATGATATTGGTCTATCAGTGTTTT-GCTTGG-CATA-A-TATT-AAAAAC----GTTATTGCAGTAAAACAAAGC-TTAATGTAGCAGAGAAGCGATAACTGTAATTAACATAACT------------------TTTTCTAT-GTATAA-TGCTCATTGT----------AACGCT-G-------ATTAATCTGATTAATA--TGTA---TCCATGTGTCCATAAA--AAACCGTACACTTTTG-TAGTTCAACCGAACATCATTACTGGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAAAA-ATGC-ACAGTTAT-ATGTCGTTTCGACAGctatcgtcaagatcgcaacaat
gi|17                         :   tATGATATCGGCCTATTTGTGTTTT-GATT-GTCA-AGA-TATG-ATCGAA----GTTATAGCAGTAAAAatatcatcgaaaccgcaac
gi|22                         :      tATATTGGGTTATCTGTGTTTT-GATTGACAA-A-A-GATT-AAAGAA----GTTATTGCAGTGATAA-AAGT-TTTATATAGcaaagctgtacccatgtgtctataaacaaaccgaataattttgtttttcaaccaaacttcgtgactggatgtatgttttgatatatcttaaaaatgcataggtacaggtttttatcatcaagaccacaaca
gi|9                          :       gTATTGGTCTATCAGTGTTTT-GTTTTACAA-A-A-TATT-TAAGAA----GTTATTGCATTAAAACAAAGC-TTTATGTAGCGAAGAAAAGTTAACCTTAATAAGAATAACAAA--AT--------A---TTTTCTAT-ACATAA-TACTCATTGT----------AATGCT-G-------TTAAATCTGATGAACA--TGTA---CCCATGTACCTTTAAA-AAAATCGAATAATTTTG-TATTTCAACCAAACTTCATAACTGGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAATA-ATGC-GCAGGTAT-ATATTGTCTTGACAACTATCccaagtg
gi|2                          :               CTATCTGT--TTT-GATTAG-CA-A-G--ATT-AATGAA----ATTATTGTAGTAAAACAAAGC-TTTATGCATCAAAGAAGAGTTTATATTGATTAAAATAACCAATAAT--------AAGATATTCTAT-ACATAAATACTCATCGT--TAG--G------CT-G-------ATAAATCTGATTAACA--TGTA---CCCATGTGTCCATAA--------------TTCTG-TATTTCAACCAAACTTCATGGCGGGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAAAA-ATGC-ACAGGTAT-ATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACA-GGATAGG--CAAGATAGAGATTTAGACTTCAAGTTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTTTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATAT--TTTCAAT--------ATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCTTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGTCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTTAAAAGGAATCTTCCCTatcaatatcg
gi|8                          :      tatgaaattgtaTCTGTGTTTT-GATTGACAA-A-A-GATT-AAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGT-TTGATGTAGCGAAGAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC--------C---TTGTCTATTACAT---TACTCATTGC----------AACGCT-G-------ATAAATCTGATT---A--AATTGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTG-TACTTCAACTAAACTTCATAACTGGAATTATG-TTTTG--AAAT-------ATCTTAACA-ATTC-GCAGGTAT-ATGTTGTTTCGACAGCTATC
gi|7                          :             gtataTCTGTGTTTT-GATTGACAA-A-A-GATT-AAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGT-TTGATGTAGCGAAAAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC--------C---TTGTCTATTACAT---TACTCATTGC----------AACGCT-G-------ATAAATCTGATTTT-----ATTGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTG-TATTTCAACTAAACTTCATAACTGGAATTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAACA-GTTC-GCAGGTAT-ATGTTGTTTCGACAGCTATCatcaagatcgtaacaac
gi|5                          :               gtataTGTGTTTT-GATTGGTAA-A-A-AATT-AAAGAAATAAGTTATTGCAGTAAAACAAAGC-TTGATGTAGCGAAGAAGAGTGTACATTAATTAAGATAACCAA--ATGTATTATTA---TATTTTAC-ACATAA-TACTCATCGT--TA--------CGCT-G-------ATAAATCTGATTAACA--TGTA---CCCATGTGTCCATAAAACAAATCATAC--TTTTG-TATTTCAACCAAACTTCATGACTGGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTACAA-ATAC-ACAGGTAT-ATGTTGTTTCGACAGCTGTCTTAATTTTCAATTTGTTCAATTTACAatcaagatcgcaacaaca
gi|21                         : tatatggtatttggctgtgTGTGTTTT-GATTA-TCA-A-ACTATT-AAAGAA----GTTATTTCAGCAAAACAAAGC-TTTATGTAGCAAAGAATA------CTTAAACAAATTAACCAA--AT--------t
gi|3                          :         tatgacattggcaTGGTTTTGAATGA-CA-A-G-CATTTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACAAAGC-TTTATGTAGCGAAGAAGAGTTTACCTTAAT----A--ACCAT--AT--------A---TATTCTAT-ACATAA-TACTCATTGT--TA--------CGCT-G-------ATAGTTCTGATTAACA--TGTA---CCGATGTGTCCATAAA-CAAACTGTATAATTTTG-TATTTCAACCAAACTTCATGGCTTGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAAAA-ATGC-ACAGGAAC-ATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTCCGATAAGTTAAATTAACATGGATATGTTAA-GTTAAAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATAT--TTTCAATGTTATCTGA--------AAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTttgactatagaatgatcaaacta
gi|16                         :                tgatatTGTTTT-GGTTGGTTT-C-A-GATT-AAAGAA------TAA-GCAGTAAAA-TAAAACTTTATGCAGTGAAAAA-AGTTAACCTAAATTAGAATAAACAA--AT--------A-----------------A-TACCCATTGT----------AACGCT-G-------ATAAATCAGATTAACA--TGTA---CCCATGTGTCCATAAA-CAAATTGTTTAATTTTG-CATTTTAACAAAACTTCA----------TATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAAAATGTGC-Aggtctttaaagtatgt
gi|11                         :                         TTC-GGTTGG-CA-A-ACTATT-AAAGAA----GATATAGCAGCAAAACAAAAC-TTTATGCAGCGAAGAAGATTTAAACTAATTTAAAATAAACAA--AT--------A---TTTTCTAT-ACATAA-TACCCATTGT----------AACGCT-G-------ATGAATCTGATTAATA--TGTA---CCCAT-TTTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTG-TATTTCGCCCCAACTTCGTGACTGGAAGTATG-TTTTGATATAT-------ATCTTAAAA-ATGC-GTAGGTAT-ATGTTATTTTGACAGCTag
gi|14                         :                                   gtA-A-A-GATT-AAAGAA----GATATAGCAGTAAAAA--AGA-CCT--GCAGTTAAAACGAGTTAACCTAAATTAAAA-CAACAA-----------------------C-AAATAA-TACCCATT---------GCAAACGCTTG-------A-AAATCTGATTGACATGAA-----CCCATATATACATAAA-CAAACTGTATAATTTTG-CATTTCAACCAAACTTC----------GTATG-TTTTG--ATAT-------ATATT-AAA-ATGT-GCAGGTAT-ATGTTG-TTTGACAGCTATCataatcaagaccgtaacaaca
gi|12                         :                                         aagATT-GAATAA----GCTAAAGCAGTAAAA-TAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTGATTAAAATACCCAA--AT--------A---TATCCTAT-ACATAA-TACCCATTGT----------AACGCT-G-------ATAAATCTGATTAACA--TGTA---TCCATGTGTTCATAAA-CAAATCGTATACGATTG-TATTTCAACCAAACTTCGTGATTGAAAGTATG-TTTTT--GTAT-------ATCTTAATA-ATGC-GTAGGTAT-ATGTT--TTTGACAattaagatcgcaacaaca
gi|13                         :                                             ggcaagagA----GATATAGCAGTAAAACAAAAC-TTTATGCAGCGAAGACGAGTTAACCTTATTTAAAATAAACAA--AT--------A---TTTTCTAT-ACATAA-TACCAATTGT----------AACGCT-G-------ATAAATCTCATTAACA--TGTA---CACATGT------AAA-CAAACCGTTTAATTTTG-TATTTCAACCAAACTTCCTTAATGGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAAAA-ATGC-GCAGGTAT-ATGTTGTTTTGGCAGCTtatatcatcaataacaa
gi|15                         :                                                                                                       CCTTAAT-AAAATAACCAA--AT--------C---TTTTCAAT-ACACAG-TACTCATCA--ATACTTG-TAACGCT-G-------ATAAATCTGATGAACA--TATT---CCCATGTTTCCATAAA-CAAATCGAATAATTTTG-TACTTCAACCAAACTTCATGACTGGAAGTATG-TTTTG--ATAT-------ATCTTAACA-ATGC-GCAGGTAT-ATGTTGTTTCGATAGCTATCataatcaagactgcagcaaca
gi|4                          :                                                                                                         TTAATTAAAACAACCAA--AT--------A---TATGCTAT-ACATAA-TACACATTGT--TA--------CGCC-G-------ATGAATCTGATT------AA-----CCCATGT------------------ATAATTTTG-TATTTCAACCAAACTTTATGGCTGGAAGTATG-TTGTG--ATAT-------ATCTTAAAA--TGC-ACAGGT-TTATGTAGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGTATATGTTAA-AATGGAGATC-AGACTTGATGCTTGTATTAACGAAAGTGTAAAACATTT-CCAAGTACTTAAGTGCACTA-GTAAGGAAATAT--TTCCAAT--------ATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCGATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGACTACGATATGAAACAGTTTAAATGATATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTctcaagatcgcaacaaca
gi|20                         :                                                                                                                       CAA--AT--------A---TTTCCTAT-ACATAA-TACCCATT-CGGCAT--CGTAACGCT-G-------ATCAATCTGATTAACA--TATA---ACCATGTGTCCATAAT-CAAATCGTATAATTTTG-TATTTCAACCAAACTTCGCGATTGGAAGTATA-TTTTgatctctaaagtacgtgacagt
gi|19                         :                                                                                                                                                ataaaATAA-CATTCAT------AA--GAAGTTGTT-GCAGTAAAACAAAGCTGATTAACA--TGTA---CTCATGAGTCGATAAA-CAAACCGTATAATTTTGATAT
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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consensus                     :                           ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGCAAAANATT-A-AAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T--GT-------A----A-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAAGATGGAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGT-AAACATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGNCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGCGCTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTGTCTGAANAGGAATCTTCCCTATCANCTNATCATTTTTTTTNATCTCTGAAGNACATGACAGT
Reference ( family-79 )       :                           ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGCNAAANATT-A-AAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T--GT-------A----AACGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAAGATGGAGATCNAGACTTGATGCTCGTATTAACAAAAGTGT-AAACATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTAT-----TTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATANTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGNACTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAGCTAA-------TTTTGATCTTTAAAGTACGTGACAGT
gi|1                          :                           ATAATATAGGTCTTTCTGTGGTTTGATTGGTCAAATATT-A-AAGAA----GTTATTGTAGTAAAAATAAGGTTTATGTAGTGAATAATAATTAACCTTAATTAAAATCACCAA--AT-----A---TA---TTTTAT-ACATAA-TACTCAT-------T--ATGATAAGAA----AATGCT-GATAAATATGATTTACA-AATTCCCATGTGTCCATAAA-CAAACCATATAATTTTGTATTTCTACCAAACTTCATG-GCTGTAGGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGT-TATGTTGATTCGACAGCTTTCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACACGGACATGTTCAGATTAAGATCCAGACTTGATACTTGTATTAACAAAAGTGT-AAACGTTTTCCGAGTATTTAAGTGCACTA-GGAAGGAAA-ATTTTCAATA--------AACAGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCAACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCTACAGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAGCTAA-------TTTTGATCTCTGAAGTACATGACAGT
gi|10                         :                           ATGATATTGGTCTATCGATGTTTTAATTGGCAAAAGATT-A-AAGAAA---GGTATTCCAGTCAAACTAAGATTTATGTAGCGAAGAATAGTTAACCTTAATTAAAATAACTAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCGT-------T--GT-------A----A-CGCT-GATAAATCTGATGGACA-TGTACCCGTGTGTCCAAAAA-CAAATCGAATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTGTGTTTTG--GTATATCTTAACAATTCGACAGCTATt
gi|11                         :                                            atGTTTCGGTTGGCAAACTATT-A-AAGAA----GATATAGCAGCAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGAAGATTTAAACTAATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T--GT------------AACGCT-GATGAATCTGATTAATA-TGTACCCAT-TTTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCGCCCCAACTTCGTG-ACTGGAAGTATGTTTTGATATATATCTTAAAAATGCG-TAGGTATATGTTATTTTGACAGCTATcgtcaagatcgcaacaat
gi|12                         :                                                       GGCAAGAGATT-G-AATAA----GCTAAAGCAGTAAAATAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTGATTAAAATACCCAA--AT-----A---TA---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T--GT-------A----A-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTATCCATGTGTTCATAAA-CAAATCGTATACGATTGTATTTCAACCAAACTTCGTG-ATTGAAAGTATGTTTTT--GTATATCTTAATAATGCG-TAGGTATATGT--TTTTGACATATATCaatcaagaccgtaacaaca
gi|13                         :                                                                         A----GATATAGCAGTAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGACGAGTTAACCTTATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCAAT-------T--GT-------A----A-CGCT-GATAAATCTCATTAACA-TGTACACATGT------AAA-CAAACCGTTTAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCCTT-AATGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTTGGCAGCTATatcaataacaa
gi|14                         :                                                           AAAGATT-A-AAGAA----GATATAGCAGTAAAAAAGACCT----GCAGTTAAAACGAGTTAACCTAAATTAAAACAAC--A--AC-----A---------------A-ATAA-TACCCAT-------T--GC-------A----AACGCTTGA-AAATCTGATTGACA-TGAACCCATATATACATAAA-CAAACTGTATAATTTTGCATTTCAACCAAACTTC-----------GTATGTTTTG--ATATATATT-AAAATGTG-CAGGTATATGTTGTTT-GACAGCTATCaatcaagactgcagcaaca
gi|15                         :                                                                                                                       aagCCTTAAT-AAAATAACCAA--AT-----C---TT---TTCAAT-ACACAG-TACTCATCAATACTT--GT-------A----A-CGCT-GATAAATCTGATGAACA-TATTCCCATGTTTCCATAAA-CAAATCGAATAATTTTGTACTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAACAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGATAGCTATCattaagatcgcaacaaca
gi|16                         :                                             TGTTTTGGTTGGTTTCAGATT-A-AAGAA------TAA-GCAGTAAAATAAAACTTTATGCAGTGAA-AAAAGTTAACCTAAATTAGAATAAACAA---------------------------ATAA-TACCCAT-------T--GT------------AACGCT-GATAAATCAGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAATTGTTTAATTTTGCATTTTAACAAAACTTCA-----------TATGTTTTG--ATATATCTT-AAAATGTG-CAAGctcaagatcgcaacaaca
gi|17                         :                           ATGATATCGGCCTATTTGTGTTTTGATTGTCAAGATATG-A-TCGAA----GTTATAGCAGTAAAACAAAGCTGTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                   t-TGTACCCATGTGTCTATAAA-CAAACCGAATAATTTTGTTTTTCAACCAAACTTCGTG-ACTGGATGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-TAGGTACAGGTTTTTcccatgtgtctataaacaaaccgaataattttgtttttcaaccaaacttcgtgactggatgtatgttttgatatatcttaaaaatgcataggtacaggtttttatcatcaagaccacaaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatgatatcggcctatttgtgttttgattgtcaagatatgatcgaagttatagcagtaaaacaaagcTGTGTTAAGATGGGGATCGAAAGTTACTGTTCATATTAACAAAAGTGT-AAACATTTTTCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTCatcatcaagaccacaaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACATTTTTCAAGTAT-------TTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTC--ATCATTTCATCATTTTTTTTTATCTTTAAAGGACATGACatcatttcatcatttttttttatctttaaaggacatgac
gi|19                         :          tgtgttaagatggggatcgaaagttactgttcatattaacaaaagtgtaaAACATTCATAAGAA----GTTGTTGCAGTAAAACAAAGCT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                         tat--GT-------A----AA------ACAAAGCTGATTAACA-TGTACTCATGAGTCGATAAA-CAAACCGTATAATTTTG-AT--------------ATGTAC----AGTATCTT--------------AACAATGCA-CAGATATCTGTTGTTTTGACAGCTATCgattaacatgtactcatgagtcgataaacaaaccgtataattttgatatgtacagtatcttaacaatgcacagatatctgttgttttgacagctatcatcaaggccacatcaacat
gi|2                          : tataacattcataagaagttgttgcaATGAAATTGTACTATCTGT--TTTGATTAGC--AAGATT-A-ATGAA----ATTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGCATCAAAGAAGAGTTTATATTGATTAAAATAACCAATAAT-----AAGATA---TTCTAT-ACATAAATACTCAT-------C--GT-------T----AG-GCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAA--------------TTCTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCGGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACA-GGATAGGC-AAGATAGAGATTTAGACTTCAAGTTTGTATTAACAAAAGTGT-AAACATTTTCCAAGTTTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCTTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGTCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTTAAAAGGAATCTTCCCTatcaaggccacatcaacat
gi|20                         :                                                                                                                                    tATAAACAA--AT-----A---TT---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------TCGGC-------ATCGTAACGCT-GATCAATCTGATTAACA-TATAACCATGTGTCCATAAT-CAAATCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCGCG-ATTGGAAGTATATTTT
gi|21                         :                           ATGACATTGGC--AT--GTGTTTTGATTATCAAACTATT-A-AAGAA----GTTATTTCAGCAAAACAAAGCTTTATGTAGCAAAGAA----TA--CTTAAACAAATTAACCAA--AT---------TT---GACTAT-A
gi|22                         :                            tGATATTGGGTTATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATT-A-AAGAA----GTTATTGCAGTGATA-AAAGTTTTATATAGCCAAGgaatgatcaaacta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTATATGTTGTTTTGACAGCTATCtg
gi|3                          :    aaacacgttatacaacgaagaagaTGATATTGGT----------TTTGAATGAC-AAGCATTTA-AAGAA----GTTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTTACCTTAAT------AACCAT--AT-----A---TA---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T--GT-------T----A-CGCT-GATAGTTCTGATTAACA-TGTACCGATGTGTCCATAAA-CAAACTGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCTTGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGAACATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTCCGATAAGTTAAATTAACATGGATATGTTAAGTTAAAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGT-AAACATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTatcaagaccgcaacaaca
gi|4                          :                                                                                                                            TTAATTAAAACAACCAA--AT-----A---TA---TGCTAT-ACATAA-TACACAT-------T--GT-------T----A-CGCC-GATGAATCTGATTAAC---------------CCAT----------GTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTTATG-GCTGGAAGTATGTTGTG--ATATATCTTAAAA-TGCA-CAGGTTTATGTAGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGTATATGTTAAAATGGAGATC-AGACTTGATGCTTGTATTAACGAAAGTGTAAAACA-TTTCCAAGTACTTAAGTGCACTA-GTAAGGAAATATTTCCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCGATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGACTACGATATGAAACAGTTTAAATGATATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTggtctttaaagtatgt
gi|5                          :                           ATGGTATTTGGCTGTGTGTGTTTTGATTGGTAAAAAATT-A-AAGAAATAAGTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTGATGTAGCGAAGAAGAGTGTACATTAATTAAGATAACCAA--ATGTATTA---TTATATTTTAC-ACATAA-TACTCAT-------C--GT-------T----A-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAAACAAATC--ATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTACAAATACA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTGTCTTAATTTTCAATTTGTTCAATTTACATgatctctaaagtacgtgacagt
gi|6                          :                        tatATGATATTGGTCTATCAGTGTTTTGCTTGGCATAATATT-A-AAAAC----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTAATGTAGCAGAGAAGCGATAACTGTAATTAACATAACT---------------TT---TTCTAT-GTATAA-TGCTCAT-------T--GT-------A----A-CGCT-GATTAATCTGATTAATA-TGTATCCATGTGTCCATAAA--AAACCGTACACTTTTGTAGTTCAACCGAACATCATT-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGTTATATGTCGTTTCGACAGATATC
gi|7                          :                                   tGTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATT-A-AAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAAAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T--GC-------A----A-CGCT-GATAAATCTGATT-TTATTGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTATTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--ATATATCTTAACAGTTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcgaaaccgcaac
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gi|9                          :                               TATTGGTCTATCAGTGTTTTGTTTTACAAAATATT-T-AAGAA----GTTATTGCATTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAAAGTTAACCTTAATAAGAATAACAAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T--GT-------A----A-TGCT-GTTAAATCTGATGAACA-TGTACCCATGTACCTTTAAA-AAAATCGAATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATA-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAATAATGCG-CAGGTATATATTGTCTTGACAACTATCatcaagatcgtaacaac





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Reference ( family-79 )       :                                ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGCAAAANATT-A-AAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAAGATGGAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGNCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGCGCTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTGTCTGAANAGGAATCTTCCCTATCANCTNATCATTTTTTTTNATCTCTGAAGNACATGACAGT
gi|1                          :                                ATAATATAGGTCTTTCTGTGGTTTGATTGGTCAAATATT-A-AAGAA----GTTATTGTAGTAAAAATAAGGTTTATGTAGTGAATAATAATTAACCTTAATTAAAATCACCAA--AT-----A---TA---TTTTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------ATGATAAGAAAA-TGCT-GATAAATATGATTTACA-AATTCCCATGTGTCCATAAA-CAAACCATATAATTTTGTATTTCTACCAAACTTCATG-GCTGTAGGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGT-TATGTTGATTCGACAGCTTTCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACACGGACATGTTCAGATTAAGATCCAGACTTGATACTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CGTTTTCCGAGTATTTAAGTGCACTA-GGAAGGAAA-ATTTTCAATA--------AACAGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCAACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCTACAGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAGCTAA-------TTTTGATCTCTGAAGTACATGACAGT
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gi|17                         :                                ATGATATCGGCCTATTTGTGTTTTGATTGTCAAGATATG-A-TCGAA----GTTATAGCAGTAAAACAAAGCTGTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                          t-TGTACCCATGTGTCTATAAA-CAAACCGAATAATTTTGTTTTTCAACCAAACTTCGTG-ACTGGATGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-TAGGTACAGGTTTTTcccatgtgtctataaacaaaccgaataattttgtttttcaaccaaacttcgtgactggatgtatgttttgatatatcttaaaaatgcataggtacaggtttttatcatcaagaccacaaca
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACATTTTTCAAGTAT-------TTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTC--ATCATTTCATCATTTTTTTTTATCTTTAAAGGACATGACatcatttcatcatttttttttatctttaaaggacatgac
gi|19                         :               tgtgttaagatggggatcgaaagttactgttcatattaacaaaagtgtaaAACATTCATAAGAA----GTTGTTGCAGTAAAACAAAGCT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                        tatACAAAGCTGATTAACA-TGTACTCATGAGTCGATAAA-CAAACCGTATAATTTTG-AT--------------ATGTAC----AGTATCTT--------------AACAATGCA-CAGATATCTGTTGTTTTGACAGCTATCgattaacatgtactcatgagtcgataaacaaaccgtataattttgatatgtacagtatcttaacaatgcacagatatctgttgttttgacagctatcatcaaggccacatcaacat
gi|2                          : tataacattcataagaagttgttgcagtaaaATGAAATTGTACTATCTGT--TTTGATTAGCAA--GATT-A-ATGAA----ATTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGCATCAAAGAAGAGTTTATATTGATTAAAATAACCAATAAT-----AAGATA---TTCTAT-ACATAAATACTCAT-------C-------GT--------TA-GGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAA--------------TTCTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCGGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACA-GGATAGGC-AAGATAGAGATTTAGACTTCAAGTTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTTTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCTTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGTCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTTAAAAGGAATCTTCCCTatcaaggccacatcaacat
gi|20                         :                                                                                                                                         tATAAACAA--AT-----A---TT---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------TCGGCATCGT--------AA-CGCT-GATCAATCTGATTAACA-TATAACCATGTGTCCATAAT-CAAATCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCGCG-ATTGGAAGTATATTTT
gi|21                         :                                ATGACATTGGC--AT--GTGTTTTGATTATCAAACTATT-A-AAGAA----GTTATTTCAGCAAAACAAAGCTTTATGTAGCAAAGAA----TA--CTTAAACAAATTAACCAA--AT---------TT---GACTAT-A
gi|22                         :                                 tGATATTGGGTTATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATT-A-AAGAA----GTTATTGCAGTGATA-AAAGTTTTATATAGCCAAGgaatgatcaaacta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GTATATGTTGTTTTGACAGCTATCtg
gi|3                          :         aaacacgttatacaacgaagaagaTGATATTGGT----------TTTGAATGACAAGCATTT-A-AAGAA----GTTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTTACCTTAAT------AACCAT--AT-----A---TA---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------TA-CGCT-GATAGTTCTGATTAACA-TGTACCGATGTGTCCATAAA-CAAACTGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCTTGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGAACATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTCCGATAAGTTAAATTAACATGGATATGTTAAGTTAAAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTatcaagaccgcaacaaca
gi|4                          :                                                                                                                                 TTAATTAAAACAACCAA--AT-----A---TA---TGCTAT-ACATAA-TACACAT-------T-------GT--------TA-CGCC-GATGAATCTGATTAAC---------------CCAT----------GTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTTATG-GCTGGAAGTATGTTGTG--ATATATCTTAAAA-TGCA-CAGGTTTATGTAGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGTATATGTTAAAATGGAGATC-AGACTTGATGCTTGTATTAACGAAAGTGTAAAACATTT-CCAAGTACTTAAGTGCACTA-GTAAGGAAATATTTCCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCGATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGACTACGATATGAAACAGTTTAAATGATATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTggtctttaaagtatgt
gi|5                          :                                ATGGTATTTGGCTGTGTGTGTTTTGATTGGTAAAAAATT-A-AAGAAATAAGTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTGATGTAGCGAAGAAGAGTGTACATTAATTAAGATAACCAA--ATGTATTA---TTATATTTTAC-ACATAA-TACTCAT-------C-------GT--------TA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAAACAAATC--ATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTACAAATACA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTGTCTTAATTTTCAATTTGTTCAATTTACATgatctctaaagtacgtgacagt
gi|6                          :                             tatATGATATTGGTCTATCAGTGTTTTGCTTGGCATAATATT-A-AAAAC----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTAATGTAGCAGAGAAGCGATAACTGTAATTAACATAACT---------------TT---TTCTAT-GTATAA-TGCTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATTAATCTGATTAATA-TGTATCCATGTGTCCATAAA--AAACCGTACACTTTTGTAGTTCAACCGAACATCATT-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGTTATATGTCGTTTCGACAGATATC
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gi|8                          :                                         GTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATT-A-AAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAGAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T-------GC--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAAAT-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTACTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--AAATATCTTAACAATTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcaagatcgcaacaaca
gi|9                          :                                    TATTGGTCTATCAGTGTTTTGTTTTACAAAATATT-T-AAGAA----GTTATTGCATTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAAAGTTAACCTTAATAAGAATAACAAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-TGCT-GTTAAATCTGATGAACA-TGTACCCATGTACCTTTAAA-AAAATCGAATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATA-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAATAATGCG-CAGGTATATATTGTCTTGACAACTATCatcaagatcgtaacaac





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consensus                     :                                ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGCAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAAGATGGAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGNCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGCGCTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTGTCTGAANAGGAATCTTCCCTATCANCTNATCATTTTTTTTNATCTCTGAAGNACATGACAGT
Reference ( family-79 )       :                                ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGCAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAAGATGGAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGNCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGCGCTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTGTCTGAANAGGAATCTTCCCTATCANCTNATCATTTTTTTTNATCTCTGAAGNACATGACAGT
gi|1                          :                                ATAATATAGGTCTTTCTGTGGTTTGATTGGTCAAATATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAAATAAGGTTTATGTAGTGAATAATAATTAACCTTAATTAAAATCACCAA--AT-----A---TA---TTTTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------ATGATAAGAAAA-TGCT-GATAAATATGATTTACA-AATTCCCATGTGTCCATAAA-CAAACCATATAATTTTGTATTTCTACCAAACTTCATG-GCTGTAGGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGT-TATGTTGATTCGACAGCTTTCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACACGGACATGTTCAGATTAAGATCCAGACTTGATACTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CGTTTTCCGAGTATTTAAGTGCACTA-GGAAGGAAA-ATTTTCAATA--------AACAGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCAACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCTACAGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAGCTAA-------TTTTGATCTCTGAAGTACATGACAGT
gi|10                         :                                ATGATATTGGTCTATCGATGTTTTAATTGGCAAAAGATTAAAGAAA---GGTATTCCAGTCAAACTAAGATTTATGTAGCGAAGAATAGTTAACCTTAATTAAAATAACTAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCGT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATGGACA-TGTACCCGTGTGTCCAAAAA-CAAATCGAATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTGTGTTTTG--GTATATCTTAACAATTCGACAGCTATt
gi|11                         :                                                 atGTTTCGGTTGGCAAACTATTAAAGAA----GATATAGCAGCAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGAAGATTTAAACTAATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATGAATCTGATTAATA-TGTACCCAT-TTTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCGCCCCAACTTCGTG-ACTGGAAGTATGTTTTGATATATATCTTAAAAATGCG-TAGGTATATGTTATTTTGACAGCTATcgtcaagatcgcaacaat
gi|12                         :                                                            GGCAAGAGATTGAATAA----GCTAAAGCAGTAAAATAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTGATTAAAATACCCAA--AT-----A---TA---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTATCCATGTGTTCATAAA-CAAATCGTATACGATTGTATTTCAACCAAACTTCGTG-ATTGAAAGTATGTTTTT--GTATATCTTAATAATGCG-TAGGTATATGT--TTTTGACATATATCaatcaagaccgtaacaaca
gi|13                         :                                                                            A----GATATAGCAGTAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGACGAGTTAACCTTATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCAAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTCATTAACA-TGTACACATG------TAAA-CAAACCGTTTAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCCTT-AATGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTTGGCAGCTATatcaataacaa
gi|14                         :                                                                AAAGATTAAAGAA----GATATAGCAGTAAAAAAGACCT----GCAGTTAAAACGAGTTAACCTAAATTAAAACAAC--A--AC-----A---------------A-ATAA-TACCCAT-------T-------GC--------AAACGCTTGA-AAATCTGATTGACA-TGAACCCATATATACATAAA-CAAACTGTATAATTTTGCATTTCAACCAAACTTC-----------GTATGTTTTG--ATATATATT-AAAATGTG-CAGGTATATGTTGTTT-GACAGCTATCaatcaagactgcagcaaca
gi|15                         :                                                                                                                          aagCCTTAAT-AAAATAACCAA--AT-----C---TT---TTCAAT-ACACAG-TACTCATCAATACTT-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATGAACA-TATTCCCATGTTTCCATAAA-CAAATCGAATAATTTTGTACTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAACAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGATAGCTATCattaagatcgcaacaaca
gi|16                         :                                                  TGTTTTGGTTGGTTTCAGATTAAAGAA------TAA-GCAGTAAAATAAAACTTTATGCAGTGAA-AAAAGTTAACCTAAATTAGAATAAACAA---------------------------ATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCAGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAATTGTTTAATTTTGCATTTTAACAAAACTTCA-----------TATGTTTTG--ATATATCTT-AAAATGTG-CAAGctcaagatcgcaacaaca
gi|17                         :                                ATGATATCGGCCTATTTGTGTTTTGATTGTCAAGATATGATCGAA----GTTATAGCAGTAAAACAAAGCTGTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                        t-TGTACCCATGTGTCTATAAA-CAAACCGAATAATTTTGTTTTTCAACCAAACTTCGTG-ACTGGATGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-TAGGTACAGGTTTTTcccatgtgtctataaacaaaccgaataattttgtttttcaaccaaacttcgtgactggatgtatgttttgatatatcttaaaaatgcataggtacaggtttttatcatcaagaccacaaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatgatatcggcctatttgtgttttgattgtcaagatatgatcgaagttatagcagtaaaacaaagcTGTGTTAAGATGGGGATCGAAAGTTACTGTTCATATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTTCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTCatcatcaagaccacaaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTTTCAAGTAT-------TTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTC--ATCATTTCATCATTTTTTTTTATCTTTAAAGGACATGACatcatttcatcatttttttttatctttaaaggacatgac
gi|19                         :                      tgtgttaagatggggatcgaaagttactgttcatattaacaaaagtgtaaAAGAA----GTTGTTGCAGTAAAACAAAGCT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                             tataacattcatACAAAGCTGATTAACA-TGTACTCATGAGTCGATAAA-CAAACCGTATAATTTTG-AT--------------ATGTAC----AGTATCTT--------------AACAATGCA-CAGATATCTGTTGTTTTGACAGCTATCgattaacatgtactcatgagtcgataaacaaaccgtataattttgatatgtacagtatcttaacaatgcacagatatctgttgttttgacagctatcatcaaggccacatcaacat
gi|2                          : tataacattcataagaagttgttgcagtaaaATGAAATTGTACTATCTGT--TTTGATTAGCAA--GATTAATGAA----ATTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGCATCAAAGAAGAGTTTATATTGATTAAAATAACCAATAAT-----AAGATA---TTCTAT-ACATAAATACTCAT-------C-------GT--------TA-GGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAA--------------TTCTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCGGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACA-GGATAGGC-AAGATAGAGATTTAGACTTCAAGTTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTTTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCTTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGTCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTTAAAAGGAATCTTCCCTatcaaggccacatcaacat
gi|20                         :                                                                                                                                       tATAAACAA--AT-----A---TT---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------TCGGCATCGT--------AA-CGCT-GATCAATCTGATTAACA-TATAACCATGTGTCCATAAT-CAAATCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCGCG-ATTGGAAGTATATTTT
gi|21                         :                                ATGACATTGGC--AT--GTGTTTTGATTATCAAACTATTAAAGAA----GTTATTTCAGCAAAACAAAGCTTTATGTAGCAAAGAA----TA--CTTAAACAAATTAACCAA--AT---------TT---GACTAT-A
gi|22                         :                                 tGATATTGGGTTATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGCAGTGATA-AAAGTTTTATATAGCCAAGgaatgatcaaacta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTATATGTTGTTTTGACAGCTATCtg
gi|3                          :         aaacacgttatacaacgaagaagaTGATATTGGT----------TTTGAATGACAAGCATTTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTTACCTTAAT------AACCAT--AT-----A---TA---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------TA-CGCT-GATAGTTCTGATTAACA-TGTACCGATGTGTCCATAAA-CAAACTGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCTTGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGAACATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTCCGATAAGTTAAATTAACATGGATATGTTAAGTTAAAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTatcaagaccgcaacaaca
gi|4                          :                                                                                                                               TTAATTAAAACAACCAA--AT-----A---TA---TGCTAT-ACATAA-TACACAT-------T-------GT--------TA-CGCC-GATGAATCTGATTAAC---------------CCAT----------GTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTTATG-GCTGGAAGTATGTTGTG--ATATATCTTAAAA-TGCA-CAGGTTTATGTAGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGTATATGTTAAAATGGAGATC-AGACTTGATGCTTGTATTAACGAAAGTGTAAAACATTT-CCAAGTACTTAAGTGCACTA-GTAAGGAAATATTTCCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCGATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGACTACGATATGAAACAGTTTAAATGATATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTggtctttaaagtatgt
gi|5                          :                                ATGGTATTTGGCTGTGTGTGTTTTGATTGGTAAAAAATTAAAGAAATAAGTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTGATGTAGCGAAGAAGAGTGTACATTAATTAAGATAACCAA--ATGTATTA---TTATATTTTAC-ACATAA-TACTCAT-------C-------GT--------TA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAAACAAATC--ATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTACAAATACA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTGTCTTAATTTTCAATTTGTTCAATTTACATgatctctaaagtacgtgacagt
gi|6                          :                             tatATGATATTGGTCTATCAGTGTTTTGCTTGGCATAATATTAAAAAC----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTAATGTAGCAGAGAAGCGATAACTGTAATTAACATAACT---------------TT---TTCTAT-GTATAA-TGCTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATTAATCTGATTAATA-TGTATCCATGTGTCCATAAA--AAACCGTACACTTTTGTAGTTCAACCGAACATCATT-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGTTATATGTCGTTTCGACAGATATC
gi|7                          :                                        tGTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAAAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T-------GC--------AA-CGCT-GATAAATCTGATT-TTATTGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTATTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--ATATATCTTAACAGTTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcgaaaccgcaac
gi|8                          :                                         GTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAGAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T-------GC--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAAAT-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTACTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--AAATATCTTAACAATTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcaagatcgcaacaaca
gi|9                          :                                    TATTGGTCTATCAGTGTTTTGTTTTACAAAATATTTAAGAA----GTTATTGCATTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAAAGTTAACCTTAATAAGAATAACAAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-TGCT-GTTAAATCTGATGAACA-TGTACCCATGTACCTTTAAA-AAAATCGAATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATA-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAATAATGCG-CAGGTATATATTGTCTTGACAACTATCatcaagatcgtaacaac





Alignments
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lowQualScore                  :                                           .    .                  .         ....     .                               .                         ..  ......... ....      .      .       ...............  ........  .    .                 .                    .                                     .                 ..           .      .                                                     .        .     .      .                                .     .                    .         .          .                           .   .                            .                                                    .   .             .......       .         .                        .           ..    .  . .......    .          .          
lowQualScore                  :                                           8    3                  4         9999     9                               1                         11  888888888 8888      4      4       111111111111111  55555555  4    4                 1                    1                                     1                 11           6      2                                                     8        8     4      2                                0     8                    0         8          8                           5   2                            0                                                    0   0             5555555       5         0                        0           00    0  0 0000000    0          0          
consensus                     :                                ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGCAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAAGATGGAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGNCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGCGCTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTGTCTGAANAGGAATCTTCCCTATCANCTNATCATTTTTTTTNATCTCTGAAGNACATGACAGT
Reference ( family-79 )       :                                ATGATATTGGTCTATCTGTGTTTTGATTGGCAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTAATTAAAATAACCAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGGATATGTTAAGATGGAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGNCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTACATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGCGCTACGGAANGAAATAGTTTCAATGTTGTCTGAANAGGAATCTTCCCTATCANCTNATCATTTTTTTTNATCTCTGAAGNACATGACAGT
gi|1                          :                                ATAATATAGGTCTTTCTGTGGTTTGATTGGTCAAATATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAAATAAGGTTTATGTAGTGAATAATAATTAACCTTAATTAAAATCACCAA--AT-----A---TA---TTTTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------ATGATAAGAAAA-TGCT-GATAAATATGATTTACA-AATTCCCATGTGTCCATAAA-CAAACCATATAATTTTGTATTTCTACCAAACTTCATG-GCTGTAGGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGT-TATGTTGATTCGACAGCTTTCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACACGGACATGTTCAGATTAAGATCCAGACTTGATACTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CGTTTTCCGAGTATTTAAGTGCACTA-GGAAGGAAA-ATTTTCAATA--------AACAGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCAACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGGCTACAGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAGCTAA-------TTTTGATCTCTGAAGTACATGACAGT
gi|10                         :                                ATGATATTGGTCTATCGATGTTTTAATTGGCAAAAGATTAAAGAAA---GGTATTCCAGTCAAACTAAGATTTATGTAGCGAAGAATAGTTAACCTTAATTAAAATAACTAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCGT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATGGACA-TGTACCCGTGTGTCCAAAAA-CAAATCGAATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTGTGTTTTG--GTATATCTTAACAATTCGACAGCTATt
gi|11                         :                                                 atGTTTCGGTTGGCAAACTATTAAAGAA----GATATAGCAGCAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGAAGATTTAAACTAATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATGAATCTGATTAATA-TGTACCCAT-TTTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCGCCCCAACTTCGTG-ACTGGAAGTATGTTTTGATATATATCTTAAAAATGCG-TAGGTATATGTTATTTTGACAGCTATcgtcaagatcgcaacaat
gi|12                         :                                                            GGCAAGAGATTGAATAA----GCTAAAGCAGTAAAATAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTGATTAAAATACCCAA--AT-----A---TA---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTATCCATGTGTTCATAAA-CAAATCGTATACGATTGTATTTCAACCAAACTTCGTG-ATTGAAAGTATGTTTTT--GTATATCTTAATAATGCG-TAGGTATATGT--TTTTGACATATATCaatcaagaccgtaacaaca
gi|13                         :                                                                            A----GATATAGCAGTAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGACGAGTTAACCTTATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCAAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTCATTAACA-TGTACACATG------TAAA-CAAACCGTTTAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCCTT-AATGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTTGGCAGCTATatcaataacaa
gi|14                         :                                                                AAAGATTAAAGAA----GATATAGCAGTAAAAAAGACCT----GCAGTTAAAACGAGTTAACCTAAATTAAAACAAC--A--AC-----A---------------A-ATAA-TACCCAT-------T-------GC--------AAACGCTTGA-AAATCTGATTGACA-TGAACCCATATATACATAAA-CAAACTGTATAATTTTGCATTTCAACCAAACTTC-----------GTATGTTTTG--ATATATATT-AAAATGTG-CAGGTATATGTTGTTT-GACAGCTATCaatcaagactgcagcaaca
gi|15                         :                                                                                                                          aagCCTTAAT-AAAATAACCAA--AT-----C---TT---TTCAAT-ACACAG-TACTCATCAATACTT-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATGAACA-TATTCCCATGTTTCCATAAA-CAAATCGAATAATTTTGTACTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAACAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGATAGCTATCattaagatcgcaacaaca
gi|16                         :                                                  TGTTTTGGTTGGTTTCAGATTAAAGAA------TAA-GCAGTAAAATAAAACTTTATGCAGTGAA-AAAAGTTAACCTAAATTAGAATAAACAA---------------------------ATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCAGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAATTGTTTAATTTTGCATTTTAACAAAACTTCA-----------TATGTTTTG--ATATATCTT-AAAATGTG-CAAGctcaagatcgcaacaaca
gi|17                         :                                ATGATATCGGCCTATTTGTGTTTTGATTGTCAAGATATGATCGAA----GTTATAGCAGTAAAACAAAGCTGTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                        t-TGTACCCATGTGTCTATAAA-CAAACCGAATAATTTTGTTTTTCAACCAAACTTCGTG-ACTGGATGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-TAGGTACAGGTTTTTcccatgtgtctataaacaaaccgaataattttgtttttcaaccaaacttcgtgactggatgtatgttttgatatatcttaaaaatgcataggtacaggtttttatcatcaagaccacaaca
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTTTCAAGTAT-------TTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTC--ATCATTTCATCATTTTTTTTTATCTTTAAAGGACATGACatcatttcatcatttttttttatctttaaaggacatgac
gi|19                         :                      tgtgttaagatggggatcgaaagttactgttcatattaacaaaagtgtaaAAGAA----GTTGTTGCAGTAAAACAAAGCT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                             tataacattcatACAAAGCTGATTAACA-TGTACTCATGAGTCGATAAA-CAAACCGTATAATTTTG-AT--------------ATGTAC----AGTATCTT--------------AACAATGCA-CAGATATCTGTTGTTTTGACAGCTATCgattaacatgtactcatgagtcgataaacaaaccgtataattttgatatgtacagtatcttaacaatgcacagatatctgttgttttgacagctatcatcaaggccacatcaacat
gi|2                          : tataacattcataagaagttgttgcagtaaaATGAAATTGTACTATCTGT--TTTGATTAGCAA--GATTAATGAA----ATTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGCATCAAAGAAGAGTTTATATTGATTAAAATAACCAATAAT-----AAGATA---TTCTAT-ACATAAATACTCAT-------C-------GT--------TA-GGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAA--------------TTCTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCGGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACA-GGATAGGC-AAGATAGAGATTTAGACTTCAAGTTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTTTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCTTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGTCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTTAAAAGGAATCTTCCCTatcaaggccacatcaacat
gi|20                         :                                                                                                                                       tATAAACAA--AT-----A---TT---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------TCGGCATCGT--------AA-CGCT-GATCAATCTGATTAACA-TATAACCATGTGTCCATAAT-CAAATCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCGCG-ATTGGAAGTATATTTT
gi|21                         :                                ATGACATTGGC--AT--GTGTTTTGATTATCAAACTATTAAAGAA----GTTATTTCAGCAAAACAAAGCTTTATGTAGCAAAGAA----TA--CTTAAACAAATTAACCAA--AT---------TT---GACTAT-A
gi|22                         :                                 tGATATTGGGTTATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGCAGTGATA-AAAGTTTTATATAGCCAAGgaatgatcaaacta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTATATGTTGTTTTGACAGCTATCtg
gi|3                          :         aaacacgttatacaacgaagaagaTGATATTGGT----------TTTGAATGACAAGCATTTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTTACCTTAAT------AACCAT--AT-----A---TA---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------TA-CGCT-GATAGTTCTGATTAACA-TGTACCGATGTGTCCATAAA-CAAACTGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCTTGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGAACATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTCCGATAAGTTAAATTAACATGGATATGTTAAGTTAAAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTatcaagaccgcaacaaca
gi|4                          :                                                                                                                               TTAATTAAAACAACCAA--AT-----A---TA---TGCTAT-ACATAA-TACACAT-------T-------GT--------TA-CGCC-GATGAATCTGATTAAC---------------CCAT----------GTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTTATG-GCTGGAAGTATGTTGTG--ATATATCTTAAAA-TGCA-CAGGTTTATGTAGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGTATATGTTAAAATGGAGATC-AGACTTGATGCTTGTATTAACGAAAGTGTAAAACATTT-CCAAGTACTTAAGTGCACTA-GTAAGGAAATATTTCCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCGATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGACTACGATATGAAACAGTTTAAATGATATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTggtctttaaagtatgt
gi|5                          :                                ATGGTATTTGGCTGTGTGTGTTTTGATTGGTAAAAAATTAAAGAAATAAGTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTGATGTAGCGAAGAAGAGTGTACATTAATTAAGATAACCAA--ATGTATTA---TTATATTTTAC-ACATAA-TACTCAT-------C-------GT--------TA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAAACAAATC--ATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTACAAATACA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTGTCTTAATTTTCAATTTGTTCAATTTACATgatctctaaagtacgtgacagt
gi|6                          :                             tatATGATATTGGTCTATCAGTGTTTTGCTTGGCATAATATTAAAAAC----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTAATGTAGCAGAGAAGCGATAACTGTAATTAACATAACT---------------TT---TTCTAT-GTATAA-TGCTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATTAATCTGATTAATA-TGTATCCATGTGTCCATAAA--AAACCGTACACTTTTGTAGTTCAACCGAACATCATT-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGTTATATGTCGTTTCGACAGATATC
gi|7                          :                                        tGTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAAAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T-------GC--------AA-CGCT-GATAAATCTGATT-TTATTGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTATTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--ATATATCTTAACAGTTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcgaaaccgcaac
gi|8                          :                                         GTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAGAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T-------GC--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAAAT-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTACTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--AAATATCTTAACAATTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcaagatcgcaacaaca
gi|9                          :                                    TATTGGTCTATCAGTGTTTTGTTTTACAAAATATTTAAGAA----GTTATTGCATTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAAAGTTAACCTTAATAAGAATAACAAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-TGCT-GTTAAATCTGATGAACA-TGTACCCATGTACCTTTAAA-AAAATCGAATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATA-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAATAATGCG-CAGGTATATATTGTCTTGACAACTATCatcaagatcgtaacaac


blockSeqs                     :                                           C    G                  G         ATAA                                     T                         TA  GTATTA    TATA      T      A       CAATACTT         .         A    T                 T                    A                                     T                 AT                  A                                                     T              G      G                                A                          C                                                C   T                            T                                                    .   C             .             C         G                        T           .     T  C TCATTTT    T          G
blockSeqs                     :                                           C    T                  T         A                                        G                         .   AAGA      T         T      .       TCGGCATC         .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                     T              A      T                                .                          C                                                C   T                            A                                                        .                                                                                                            
blockSeqs                     :                                           C    T                  G         .                                        G                         .   A         T         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                     T              A      C                                .                          C                                                .   .                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                           T    T                  G         .                                        G                         .   A         A         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                     .              G      .                                .                          .                                                                                                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                           C    T                  G         .                                        G                         .   A         T         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                           C    A                  T         .                                        A                         .   A         T         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                           A    T                  G         .                                        G                         .   A         A         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                           A    T                  T         .                                        G                         .   C         T         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                           C    A                  G         .                                        G                         .   A         T         .      .       C                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                           .    .                  A         .                                        G                         .   A         A         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                           .    .                  A         .                                        T                         .   A         A         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                   T         .                                        T                         .   C         T         .      .       C                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                   G         .                                        A                         .   C         T         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                   G         .                                        .                         .   A         T         .      .       T                .         .    .                 .                    .                                     .                 .                   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
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gi|10                         :                                ATGATATTGGTCTATCGATGTTTTAATTGGCAAAAGATTAAAGAAA---GGTATTCCAGTCAAACTAAGATTTATGTAGCGAAGAATAGTTAACCTTAATTAAAATAACTAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCGT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATGGACA-TGTACCCGTGTGTCCAAAAA-CAAATCGAATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTGTGTTTTG--GTATATCTTAACAATTCGACAGCTATt
gi|11                         :                                                 atGTTTCGGTTGGCAAACTATTAAAGAA----GATATAGCAGCAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGAAGATTTAAACTAATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATGAATCTGATTAATA-TGTACCCAT-TTTCCATAAA-CAAACCGTATAATTTTGTATTTCGCCCCAACTTCGTG-ACTGGAAGTATGTTTTGATATATATCTTAAAAATGCG-TAGGTATATGTTATTTTGACAGCTATcgtcaagatcgcaacaat
gi|12                         :                                                            GGCAAGAGATTGAATAA----GCTAAAGCAGTAAAATAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTAACCTTGATTAAAATACCCAA--AT-----A---TA---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTATCCATGTGTTCATAAA-CAAATCGTATACGATTGTATTTCAACCAAACTTCGTG-ATTGAAAGTATGTTTTT--GTATATCTTAATAATGCG-TAGGTATATGT--TTTTGACATATATCaatcaagaccgtaacaaca
gi|13                         :                                                                            A----GATATAGCAGTAAAACAAAACTTTATGCAGCGAAGACGAGTTAACCTTATTTAAAATAAACAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACCAAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTCATTAACA-TGTACACATG------TAAA-CAAACCGTTTAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCCTT-AATGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTTGGCAGCTATatcaataacaa
gi|14                         :                                                                AAAGATTAAAGAA----GATATAGCAGTAAAAAAGACCT----GCAGTTAAAACGAGTTAACCTAAATTAAAACAAC--A--AC-----A---------------A-ATAA-TACCCAT-------T-------GC--------AAACGCTTGA-AAATCTGATTGACA-TGAACCCATATATACATAAA-CAAACTGTATAATTTTGCATTTCAACCAAACTTC-----------GTATGTTTTG--ATATATATT-AAAATGTG-CAGGTATATGTTGTTT-GACAGCTATCaatcaagactgcagcaaca
gi|15                         :                                                                                                                          aagCCTTAAT-AAAATAACCAA--AT-----C---TT---TTCAAT-ACACAG-TACTCATCAATACTT-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCTGATGAACA-TATTCCCATGTTTCCATAAA-CAAATCGAATAATTTTGTACTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAACAATGCG-CAGGTATATGTTGTTTCGATAGCTATCattaagatcgcaacaaca
gi|16                         :                                                  TGTTTTGGTTGGTTTCAGATTAAAGAA------TAA-GCAGTAAAATAAAACTTTATGCAGTGAA-AAAAGTTAACCTAAATTAGAATAAACAA---------------------------ATAA-TACCCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATAAATCAGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAATTGTTTAATTTTGCATTTTAACAAAACTTCA-----------TATGTTTTG--ATATATCTT-AAAATGTG-CAAGctcaagatcgcaacaaca
gi|17                         :                                ATGATATCGGCCTATTTGTGTTTTGATTGTCAAGATATGATCGAA----GTTATAGCAGTAAAACAAAGCTGTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                        t-TGTACCCATGTGTCTATAAA-CAAACCGAATAATTTTGTTTTTCAACCAAACTTCGTG-ACTGGATGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-TAGGTACAGGTTTTTcccatgtgtctataaacaaaccgaataattttgtttttcaaccaaacttcgtgactggatgtatgttttgatatatcttaaaaatgcataggtacaggtttttatcatcaagaccacaaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatgatatcggcctatttgtgttttgattgtcaagatatgatcgaagttatagcagtaaaacaaagcTGTGTTAAGATGGGGATCGAAAGTTACTGTTCATATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTTCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTCatcatcaagaccacaaca
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACATTTTTCAAGTAT-------TTAAGTGCACTACGGAAGAAAATAGTTTCAATATTGTCTGAATAGGAATTTTTC--ATCATTTCATCATTTTTTTTTATCTTTAAAGGACATGACatcatttcatcatttttttttatctttaaaggacatgac
gi|19                         :                      tgtgttaagatggggatcgaaagttactgttcatattaacaaaagtgtaaAAGAA----GTTGTTGCAGTAAAACAAAGCT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                             tataacattcatACAAAGCTGATTAACA-TGTACTCATGAGTCGATAAA-CAAACCGTATAATTTTG-AT--------------ATGTAC----AGTATCTT--------------AACAATGCA-CAGATATCTGTTGTTTTGACAGCTATCgattaacatgtactcatgagtcgataaacaaaccgtataattttgatatgtacagtatcttaacaatgcacagatatctgttgttttgacagctatcatcaaggccacatcaacat
gi|2                          : tataacattcataagaagttgttgcagtaaaATGAAATTGTACTATCTGT--TTTGATTAGCAA--GATTAATGAA----ATTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGCATCAAAGAAGAGTTTATATTGATTAAAATAACCAATAAT-----AAGATA---TTCTAT-ACATAAATACTCAT-------C-------GT--------TA-GGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAA--------------TTCTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCGGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCAATAAGTTCAATTTACA-GGATAGGC-AAGATAGAGATTTAGACTTCAAGTTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTTTTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCTTATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGTCTACGGAATGAAATAGTTTCAATGTTATCTTAAAAGGAATCTTCCCTatcaaggccacatcaacat
gi|20                         :                                                                                                                                       tATAAACAA--AT-----A---TT---TCCTAT-ACATAA-TACCCAT-------TCGGCATCGT--------AA-CGCT-GATCAATCTGATTAACA-TATAACCATGTGTCCATAAT-CAAATCGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCGCG-ATTGGAAGTATATTTT
gi|21                         :                                ATGACATTGGC--AT--GTGTTTTGATTATCAAACTATTAAAGAA----GTTATTTCAGCAAAACAAAGCTTTATGTAGCAAAGAA----TA--CTTAAACAAATTAACCAA--AT---------TT---GACTAT-A
gi|22                         :                                 tGATATTGGGTTATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGCAGTGATA-AAAGTTTTATATAGCCAAGgaatgatcaaacta
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTATATGTTGTTTTGACAGCTATCtg
gi|3                          :         aaacacgttatacaacgaagaagaTGATATTGGT----------TTTGAATGACAAGCATTTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAGAGTTTACCTTAAT------AACCAT--AT-----A---TA---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------TA-CGCT-GATAGTTCTGATTAACA-TGTACCGATGTGTCCATAAA-CAAACTGTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-GCTTGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGGAACATGTTGTTTCGACAGCTATCTGAATTTCCGATAAGTTAAATTAACATGGATATGTTAAGTTAAAGATCCAGACTTGATGCTTGTATTAACAAAAGTGTAAA-CATTTTCCAAGTATTTAAGTGCACTACGGAAGGAAATATTTTCAATGTTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTatcaagaccgcaacaaca
gi|4                          :                                                                                                                               TTAATTAAAACAACCAA--AT-----A---TA---TGCTAT-ACATAA-TACACAT-------T-------GT--------TA-CGCC-GATGAATCTGATTAAC---------------CCAT----------GTATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTTATG-GCTGGAAGTATGTTGTG--ATATATCTTAAAA-TGCA-CAGGTTTATGTAGTTTCGACAGCTATCTGAATTTTCGATAAGTTCAATTTACATGTATATGTTAAAATGGAGATC-AGACTTGATGCTTGTATTAACGAAAGTGTAAAACATTT-CCAAGTACTTAAGTGCACTA-GTAAGGAAATATTTCCAATATTATCTGAAAAGGAATCTTCCCTACCAGCCGATATTTTCCAAGTATAACCATTTTAAGTGGACTACGATATGAAACAGTTTAAATGATATCTGAAAAGGAATCTTCCCTATCAG-CTA-ATTTTggtctttaaagtatgt
gi|5                          :                                ATGGTATTTGGCTGTGTGTGTTTTGATTGGTAAAAAATTAAAGAAATAAGTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTGATGTAGCGAAGAAGAGTGTACATTAATTAAGATAACCAA--ATGTATTA---TTATATTTTAC-ACATAA-TACTCAT-------C-------GT--------TA-CGCT-GATAAATCTGATTAACA-TGTACCCATGTGTCCATAAAACAAATC--ATACTTTTGTATTTCAACCAAACTTCATG-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTACAAATACA-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTGTCTTAATTTTCAATTTGTTCAATTTACATgatctctaaagtacgtgacagt
gi|6                          :                             tatATGATATTGGTCTATCAGTGTTTTGCTTGGCATAATATTAAAAAC----GTTATTGCAGTAAAACAAAGCTTAATGTAGCAGAGAAGCGATAACTGTAATTAACATAACT---------------TT---TTCTAT-GTATAA-TGCTCAT-------T-------GT--------AA-CGCT-GATTAATCTGATTAATA-TGTATCCATGTGTCCATAAA--AAACCGTACACTTTTGTAGTTCAACCGAACATCATT-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAAAAATGCA-CAGTTATATGTCGTTTCGACAGATATC
gi|7                          :                                        tGTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAAAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T-------GC--------AA-CGCT-GATAAATCTGATT-TTATTGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTATTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--ATATATCTTAACAGTTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcgaaaccgcaac
gi|8                          :                                         GTATATCTGTGTTTTGATTGACAAAAGATTAAAGAA----GTTATTGTAGTAAAACTAAGTTTGATGTAGCGAAGAATAGTTAATCTTAATTAAAATAACCAA--AC-----C---TT---GTCTATTACAT---TACTCAT-------T-------GC--------AA-CGCT-GATAAATCTGATTAAAT-TGTACCCATGTGTCCATAAA-CAAACCGTATAAGTTTGTACTTCAACTAAACTTCATA-ACTGGAATTATGTTTTG--AAATATCTTAACAATTCG-CAGGTATATGTTGTTTCGACAGCTATCatcaagatcgcaacaaca
gi|9                          :                                    TATTGGTCTATCAGTGTTTTGTTTTACAAAATATTTAAGAA----GTTATTGCATTAAAACAAAGCTTTATGTAGCGAAGAAAAGTTAACCTTAATAAGAATAACAAA--AT-----A---TT---TTCTAT-ACATAA-TACTCAT-------T-------GT--------AA-TGCT-GTTAAATCTGATGAACA-TGTACCCATGTACCTTTAAA-AAAATCGAATAATTTTGTATTTCAACCAAACTTCATA-ACTGGAAGTATGTTTTG--ATATATCTTAATAATGCG-CAGGTATATATTGTCTTGACAACTATCatcaagatcgtaacaac