lowQualScore : 111 1 1111111111111 11111111 111111111111 111111 1111 1111111111 11 111111 55555555555555555555555
lowQualScore : 999 888 55 1 6666666666666 55 00000000 111111111111 111111 1 22 22 888888888 33 3 999 1 44 22 2 55 55 55555 22 22 22 2222 2222222222 55 11 222222 33333333333333333333333 4 9999 66
lowQualScore : ... ... .. . ............. .. ........ ............ ...... . .. .. ......... .. . ... . .. .. . .. .. ..... .. .. .. .... .......... .. .. ...... ....................... . .... ..
lowQualScore : 888 000 55 7 8888888888888 88 00000000 444444444444 555555 7 55 11 000000000 88 0 555 9 55 88 0 88 00 33333 99 99 88 1111 5555555555 55 00 888888 00000000000000000000000 4 4444 11
consensus : CACG--GACACACG--CA--CGCGCGCACGCAC--------G----CACGCACGCAT--ACA--------TAC--G----C----ACACACGCNCG--NA-CACA--CATAT--A--T------A--CACAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATG---AATGTA----------TGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TT-----TTTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATATTAAATTATTAGAA
Reference ( gi|4 ) : CACG--GACACACC--CA--CGCTCGCACGCAC--------G----CACGCACGCAT--ACA--------TAC--G----T----ACACACGCCCG--AA-CACA--CATAT--A--T------A--CACAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATG---GATGTA----------TGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TT-----GTTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|16 : CACGCAGACACACAAACA--CGTGTGTAAACAC--------G----TACGTGCGCAT--ACA--------TA--------T----ACACATGCATG--CA-TACAATTATAT--ACTT------A--CACACACAT--
gi|11 : gcattCACA--GGCACACA--CAAACATGTGCACGCAC--------G----CACTCACACAT--ACAAATGAACGCAC--T----C----ACACACGCTCGCAAA-CATA--CATAT--A--C------A--CAatgaatgta
gi|7 : aaatatatacagggatactcatgcaaatacacacataCACA--TACGCAAC--CA--CGCACGCATGCAC--------G----CACGCACGCAC--AGA--------TAC--A----T----GTACGTGTACG--GT-CATA--AACAC--A--T------AG-CACAtgcgtac
gi|20 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttgacacacgctcaCACA--CACACACA--CA--CGCGCGCACGCGCAG------G----CATGCACGCAC--ACA--------TCC--G----C----ATGCATGCACG--AG-CAac
gi|20 : tcacggaaaCACG--GAAACACA--CA--CACACACACGCGC--------G----CACG--CGCAG--GCA--------TGC--A----C----GCACACATCCG-----------CATGC--A--T------G--CACGAGCA
gi|1 : tACA--GATACACG--CA--CGCACACATACAC--------A----CACATCCGCATGAACG--------TAC--G----C----ACACACGCTCG--CA-CACA--TATAT--A--T------ATACACATGCAT--TCACAT-ACA--T--AC-G--TN--NNNNN-----NN--N--NN--NNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNTATTGAGGTATTG--AAACTGAAAAGCGGGAATCAAAATATTTTTATGATTCCATT-----TTT-----TTT-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATATGAAATTATTTGAA
gi|11 : gtgtactcacgcaaacacaaACACACA--TA--CACAGGCACACACAAACATGTG----CACGCACGCAC--TCA--------CAC--A----T----ACAAA----TG--AA-CGCA--C-T-----------------CACACACGC--TC-----GCA--A--AC-A--TA--CATAT-----AC--A--CA--
gi|9 : aaatatatacagggatactcatgcaaatCACACG--CA--CGAACGTACGCAC--------GCAC-CACGCACGCAT--GCA--------TGCATG----T----ACGCACACATA--AAGCACA--CA-------------------AAAAACA----CACAC-ACA--A--ACAA--TAACTATAT-----GC--G--CA--CATACATAtgcgtac
gi|19 : gaacgataaccgtgtgtaacagccacttacaatACG--CA--CGCTCGTACATAG--------G----CACGCACGCAT--ACA----------------------------CGCACG--AA-CACA--CACAC--A--C------A--CAC--ACA----CACAT---A--A--AC-C--TA--CACAA-----AC--AATCA--CACACATAatg
gi|7 : ACA--CA--CGCTCACACATAC--------GCAACCACGCACGCAT--GC----------AC--G----C----ACGCACGCACA--GA-TACA--TGTAC--G--T------G--TACGGTCATAAACACATAGCAC-A--AC-
gi|19 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttgGCACGCACGCAT--------A----CACGCACGAAC--ACA--------CAC--A----C----ACACAC--------A-CACA--CATAA--ACCT------A--CACAAACAA--TCACAC-ACA--
gi|5 : acgcacgctcgtacatagCGTACTCAC--------G----CAAACACACAT--GGA--------TAC------------ACGCACGAACG--CA-CACA--CATAT--A--T------A--CAAAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATG---AATGTA----------TGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTT-T-------TT-----ATGA-----TT-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATATTAGATTATTAGta
gi|16 : gGCATTCAC--------G----CAGACACACAA--ACACG------TGT--G----T----AAACACGTACG--TG-CGCA--TACAT--A--T------A--CACA--------TGCAT-GCA--T--AC-AATTA--TATAC-----TT--A--CA--CACACATATG---AATGTA----------
gi|15 : GTACGCAC--------G----CACGTACAC-T--A-G--------CAC--G----T----ACGGATGCT----AA-CACA--C-TAG--A---------A--CGCA--------TACAT-GCT--A--AC----TAG-CACAA-----AC--G--TA--CGCACACATG---CATGAA----------TTATAA--TATTT--A--C
gi|17 : ACGTAC--------T----AACGCACGCAC--GCA--------TAC--G----C----ACACACGCCCG--CA-CACA--CATAT--A--T------A--CACAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATAT
gi|6 : tACGCAC--------A----CAGACACGCTC--ACA--------TAC--G----T----AC-CA-ACACG--AT-CACA--CATAT--aact
gi|14 : gcacgcactcaagcacacatattcatgaCGCATGAATG--------TAC--G----C----ACACACGCTCG--CA-CACA--CATAT--A--T------A--CACAGACAT--gaatgtgtattgaaatattgaaattgaaatgtggcaaccacaatagtttataattcgaattttaaatatggaactattaga
gi|11 : atgcgtactcacgcaaacacacacggatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcAT--ATA--------TAC--AGGGAT----ACTCATGC--A--AA-TACA--CACAT--A------------CACAGGCA----CACA---CA--A--AC-ATGTG--CACGC-----AC--G--CACTCACACATACA---AATG
gi|7 : aa--ACA--------TAT--G----TGTTGACACACGCTC-------ACA--CATA----------------CGCA-AC-------CAC-GCA--C--GC-A--TG--CACGC-----AC--G--CA--CGCACAGATA---CATGTA----------CGTaacgcactcacacacgctcgcaaacatacatatacacatgcgtac
gi|3 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactc--------TAT--G----C----ACACACGCCCG--TA-CACA--CATAT--A--T------A--CACAGATAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATG---AATGTA----------TGTTGAGGTATCT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TT-----TTTGC----TT-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATGTTAAATTATTAGAAgtacggtcataaacacatagcacaac
gi|18 : tgcgtactcacgcaaaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----ACACACGCCCG--CA-CACA--CATAT--A--T------A--CACAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATGAAAAATATA----------TTTTCAGTTAc
gi|6 : acccCACGCACTCA--AG-CACA--CATATTCA--TGAACGCA--CACAGACACGCTCACAT---------AC-G--TA--CCAAC-----AC--G--AT--CACACATATG---AATGTG----------TATTGAAATATTGAAA--TTGAAATGTGGCAACCA---------CAA-------TA-----G-----------------TTTATAATTCGAATTTTAAATATGGAACTATTAGA
gi|8 : gA-CACA--CATAT--A--T------A--CACAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATG---AATGTA----------TGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGAAAATCA------TTTTAT-------TT-----TTTGCTTTTTT-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|12 : ATAT--A--T------A--CACAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATG---AATGTA----------TGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGTGAATCA------TTTTA-----------------------TTT-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATTTTa
gi|11 : acggATAT--A--T------A--CAGGGATAC--TCA--T-GCA--AATAC-A--CA--CATAC-----ACAGG--CA--CACACAtag
gi|2 : aaTAT--A--T------A--CACAGACAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--CA--CACACATATG---AATGTA----------TGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TT-----TTTGC---TTTCT----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATATTAAATTATTAGAAaacatgtgcacgcacgcactcacacatacaaatgaacgcactcacacacgctcgcaaacatacatatacacatgcgtac
gi|10 : atgcgtactcacgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT--A--T------A--CACAGATAT--TCACAT-GCA--A--AC-A--TA--CATAC-----AC--G--TA--CACACATATG---AATGTA----------TATTGAGATATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TT-----TTTGC-----C-T----TTTTTTAAATGAAA--TTAAATATTAAATTATTAGAAaa
gi|9 : ACAA--TCACAC-GCACGA--AC-G--TA--CGCACGCACCAC--G--CA--CGCATGCATG---CATGTA----------CGa
gi|13 : gaacgataaccgtgtgtaacagccactt--CATATATATG---AATGTA----------TATTGTAATATTG--AAATTGAAAATATGGAGCCA------CAATAT-------TTTAAGAATCGA---GTT-TAAGCTATTTTAAATGAAA--TGAAATATGGAATTATTAGcacacataaagcacacaaaaaacacacacacaaacaataactatatgcgcacatacataatg
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 1111111111 11 111111 1111111 2222222222222
lowQualScore : 66 66 3 44 444444444444444 1 5 4444 22 2 666666 333 1 66 999999 2 33 2 33 0000000000 55 555 00 55 111111 3333333 5555555555555 4 8888
lowQualScore : .. .. . .. ............... . . .... .. . ...... ... . .. ...... . .. . .. .......... .. ... .. .. ...... ....... ............. . ....
lowQualScore : 11 11 0 22 666666666666666 0 6 2222 99 1 111111 777 5 11 111111 4 22 4 44 9999999999 99 000 00 00 555555 0000000 1111111111111 0 5555
consensus : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGCACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
Reference ( family-783 ) : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACACACGCNCGNACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|1 : ACAGATAC--ACGCA--CGCACACATACAC--ACACATCCGCATGAA--CG--------TACGCACACACGCTCG--CACACATATATAT--A-T------ACAC---ATGCAT--TCACAT------ACA-T--AC-G--TNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNTATTGAGGTATTGAAA--CTGAAAAGCGGGAATCAAAATATTTTTATGATTCCATTT-----TT-----TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATGAAATTATTTGAA
gi|10 : gtgtactcacgcaaacacaa----AT--A-T------ACAC---AGATAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGTACACACATATG---AATGTATATTGAGATATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC-----C-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|11 : CAGGGATACTCATGCA--AATACACACATAC--ACAGGCACACAC--AAACA--------TGTGCACGCACGCACTCACACATAC----AA--A-T------GAAC---G--CAC--TCACACACGCTCGCA-A--AC-A--T----------A--CATATACACAa
gi|11 : aaatatataCACAGGCAC--ACACAAACATGTGCACGCAC--GCACTCACACAT--A--CAAATGAACGCACTCACACACGCTCGCAAACATAC----AT--A-T------ACAC---Atgcgtac
gi|12 : aaatatatacagggatactcatgcaaatacacacataAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGTGAATCA------TTTTA-----------------------TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATTTTtgcgtac
gi|13 : acggCATATATATG---AATGTATATTGTAATATTG--AAATTGAAAATATGGAGCCA------CAATAT-------TTTAAGAATCGA---GTT-TAAGCTATTTTAAATGAAATGAAATATGGAATTATTAGtag
gi|14 : CGCATGAA--TG--------TACGCACACACGCTCGCACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--
gi|15 : atgcgtactcacgcaaacacacacggatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcGTACGCAC--GCACGTACAC-T--A---G--------CACGTACGGATGCT--AACACAC-T----AG--A--------ACGC---A--------TACAT------GCT-A--AC----T----------AG-CACAAACGTACGCACACATG---CATGAATTATAA--TATTT--A--C
gi|16 : GCATTCAC--GCAGACACACAA--A--CACG------TGTGTAAACACGTACGTGCGCATAC----AT--A-T------ACAC---A--------TGCAT------GCA-T--AC-AATT----------A--TATACTTACACACACATATG---AATGTA
gi|17 : ACGTAC--TAACGCACGCAC--G--CA--------TACGCACACACGCCCGCACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATA---A
gi|18 : tACCCACACACGCCCGCACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATGAAAAATATATTTTCAGTTAct
gi|19 : --ACGCA--CGCTCGTACATAG--GCACGCACGCAT--A--CA----------CGCACGAACACACACACACACAC----AC--A-C------ACAT---AAACCT--ACACAA------ACA-ATCAC-A--C----------A--CATA
gi|2 : T----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTTCT----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|20 : atgcgtactcacgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACACACAC--ACACA--CGCGCGCACGCGCAGGCATGCACGCAC--A--CA--------TCCGCATGCATGCACGAGCAaa
gi|3 : tcacggaaa--------TATGCACACACGCCCGTACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGATAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATCT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATGTTAAATTATTAGAA
gi|4 : tgcgtactcacgcaaaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACGGACAC--ACCCA--CGCTCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGTACACACGCCCGAACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---GATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTG-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAc
gi|5 : GCGTACTCAC--GCAAACACACAT--G--GA--------TAC--ACGCACGAACGCACACACAT----AT--A-T------ACAA---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTT--T-------TTT-----ATGA----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAGATTATTAG
gi|6 : CACGCACTCAAGCACACAT----ATTCA-TGAACGCACAC---AGACACGCTCACAT-------------AC-G--T----------A--CCAACACGATCACACATATG---AATGTGTATTGAAATATTGAAA--TTGAAATGTGGCAACCA------CAATAG-------TTT-----ATAA---------------TTCGAATT---TTAAATATGGAACTATTAGA
gi|7 : gGACAC--ACGCT--CACACATACGCAA--CCACGCACGCAT--G--C----------ACGCACGCACGCACAGATACATGT----AC--G-T------GTAC---GGTCATAAACACATA-----GCACA--AC-
gi|7 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttC--ACGCA--CGCATGCACGCAC--GCACGCACAGAT--A--CA--------TGTACGTGTACGGTCATAAACACAT----A
gi|8 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttgacacacgctcacacatacgcaacACACACAT----AT--A-T------ACAC---AGACAT--TCACAT------GCA-A--AC-A--T----------A--CATACACGCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGAAAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGCTTTTTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAgcacaac
gi|9 : CAC--ACGCA--CGAACGTACGCAC--GCAC-CACGCAC--G--CA--------T--GCATGCATGTACG--CACACAT----AA--AGC------ACACAAAAAACA----CACAC------ACA-A--ACAA--T----------AACTATATGCGCACATACATAa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 11 111111 1111111 2222222222222
lowQualScore : 66 66 3 33 0 99999999999999999 1 33 4444 555555 333 1 22 666666 33 4444 9999999999 55 666666 555 00 55 111111 3333333 5555555555555 4 8888
lowQualScore : .. .. . .. . ................. . .. .... ...... ... . .. ...... .. .... .......... .. ...... ... .. .. ...... ....... ............. . ....
lowQualScore : 11 11 0 99 6 44444444444444444 0 11 0000 888888 555 5 99 444444 11 2222 7777777777 33 888888 000 00 00 555555 0000000 1111111111111 0 5555
consensus : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
Reference ( family-783 ) : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|1 : ACAGATAC--ACGCA--CGCACACATACAC--ACACATCCGCATGAA--CG--------TACGCACACACGCTCGC--ACACA--TATATATAT------ACAC---ATGCAT--TCACA------TACAT--AC-G--TNNNNNNNNNNN--NNNNNNN------NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNTATTGAGGTATTGAAA--CTGAAAAGCGGGAATCAAAATATTTTTATGATTCCATTT-----TT-----TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATGAAATTATTTGAA
gi|10 : gtgtactcacgcaaacacaa----ATAT------ACAC---AGATAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GTACACACATATG---AATGTATATTGAGATATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC-----C-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|11 : CAGGGATACTCATGCA--AATACACACATAC--ACAGGCACACAC--AAACA--------TGTGCACGCACGCACTC--ACACATAC----AAAT------GAAC-----GCAC--TCACACACGCTCGCAA--AC-A--T----------A--CATATAC------ACAa
gi|11 : aaatatataCACAGGCAC--ACACAAACATGTGCACGCAC--GCACTCACACAT--A--CAAATGAACGCACTCACACACGCTCGC--AAACATAC----ATAT------ACAC---Atgcgtac
gi|12 : aaatatatacagggatactcatgcaaatacacacataAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGTGAATCA------TTTTA-----------------------TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATTTTtgcgtac
gi|13 : acggCATATATATG---AATGTATATTGTAATATTG--AAATTGAAAATATGGAGCCA------CAATAT-------TTTAAGAATCGA---GTT-TAAGCTATTTTAAATGAAATGAAATATGGAATTATTAGtag
gi|14 : C--GTACTCACGCAA--A--CA----------CACACGGATNNNNNN--NNNNNNNN----NNNN------NNNN---NNNNNT--CCGCA------TG--A--AT-G--T----------A--CGCACACACGCTCGCACACACATAT
gi|14 : atgCGCATGAA--TG--------TACGCACACACGCTCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--atacacagacat
gi|15 : atgcgtactcacgcaaacacacacggatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcGTACGCAC--GCACGTACAC-T--A---------------GCACGTACGGATGCTAACACAC-T----AGA-------ACGC---A--------TACA------TGCTA--AC----T----------AG-CACAAAC------GTACGCACACATG---CATGAATTATAA--TATTT--A--C
gi|16 : GCATTCAC--GCAGACACACAA--A--CACG------TGTGTAAACACGTACGT--GCGCATAC----ATAT------ACAC---A--------TGCA------TGCAT--AC-AATT----------A--TATACTT------ACACACACATATG---AATGTA
gi|17 : ACGTAC--TAACGCACGCAC--G--CA--------TACGCACACACGCCCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATA---A
gi|18 : tACCCACACACGCCCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATGAAAAATATATTTTCAGTTAct
gi|19 : --ACGCA--CGCTCGTACATAG--GCACGCACGCAT--A--CA----------CGCACGAACACACAC--ACACACAC----ACAC------ACAT---AAACCT--ACACA------AACAATCAC-A--C----------A--CATA
gi|2 : T----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTTCT----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|20 : atgcgtactcacgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACACACAC--ACACA--CGCGCGCACGCGCAGGCATGCACGCAC--A--CA--------TCCGCATGCATGCACGaa
gi|3 : tcacggaaa--------TATGCACACACGCCCGT--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGATAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATCT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATGTTAAATTATTAGAAagca
gi|4 : tgcgtactcacgcaaaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACGGACAC--ACCCA--CGCTCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGTACACACGCCCGA--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---GATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTG-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAc
gi|5 : GCGTACTCAC--GCAAACACACAT--G--GA--------TAC--ACGCACGAACGC--ACACACAT----ATAT------ACAA---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTT--T-------TTT-----ATGA----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAGATTATTAG
gi|6 : GCACGCACTCAAGC--ACACATAT----TCATGAACGCACAC---AGACACGCTCACA------T------AC-G--T----------A--CCAACAC------GATCACACATATG---AATGTGTATTGAAATATTGAAA--TTGAAATGTGGCAACCA------CAATAG-------TTT-----ATAA---------------TTCGAATT---TTAAATATGGAACTATTAGA
gi|7 : GACAC--ACGCT--CACACATACGCAA--CCACGCACGCAT------------------GCACGCACGCACGC--ACAGATAC----ATGT------ACGT---GTACGG--TCA----------TAA--AC---------------A--CATA---------GCACA
gi|7 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttC--ACGCA--CGCATGCACGCAC--GCACGCACAGAT--A--CA--------TGTACGTGTACGGTCAT--AAACACAT----Aac
gi|8 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttgacacacgctcacacatacgcaac--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGAAAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGCTTTTTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAgcacaac
gi|9 : CAC--ACGCA--CGAACGTACGCAC--GCAC-CACGCAC--G--CA--------T--GCATGCATGTACGC--ACACATA-----AAGC------ACACAAAAAACA----CACA------CACAA--ACAA--T----------AACTATATGC------GCACATACATAa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 11 111111 1111111 2222222222222
lowQualScore : 66 66 3 33 0 99999999999999999 1 33 4444 555555 333 1 22 666666 33 4444 9999999999 55 666666 555 00 55 111111 3333333 5555555555555 4 8888
lowQualScore : .. .. . .. . ................. . .. .... ...... ... . .. ...... .. .... .......... .. ...... ... .. .. ...... ....... ............. . ....
lowQualScore : 11 11 0 99 6 44444444444444444 0 11 0000 888888 555 5 99 444444 11 2222 7777777777 33 888888 000 00 00 555555 0000000 1111111111111 0 5555
consensus : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
Reference ( family-783 ) : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|1 : ACAGATAC--ACGCA--CGCACACATACAC--ACACATCCGCATGAA--CG--------TACGCACACACGCTCGC--ACACA--TATATATAT------ACAC---ATGCAT--TCACA------TACAT--AC-G--TNNNNNNNNNNN--NNNNNNN------NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNTATTGAGGTATTGAAA--CTGAAAAGCGGGAATCAAAATATTTTTATGATTCCATTT-----TT-----TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATGAAATTATTTGAA
gi|10 : gtgtactcacgcaaacacaa----ATAT------ACAC---AGATAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GTACACACATATG---AATGTATATTGAGATATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC-----C-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|11 : CAGGGATACTCATGCA--AATACACACATAC--ACAGGCACACAC--AAACA--------TGTGCACGCACGCACTC--ACACATAC----AAAT------GAAC-----GCAC--TCACACACGCTCGCAA--AC-A--T----------A--CATATAC------ACAa
gi|11 : aaatatataCACAGGCAC--ACACAAACATGTGCACGCAC--GCACTCACACAT--A--CAAATGAACGCACTCACACACGCTCGC--AAACATAC----ATAT------ACAC---Atgcgtac
gi|12 : aaatatatacagggatactcatgcaaatacacacataAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGTGAATCA------TTTTA-----------------------TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATTTTtgcgtac
gi|13 : acggCATATATATG---AATGTATATTGTAATATTG--AAATTGAAAATATGGAGCCA------CAATAT-------TTTAAGAATCGA---GTT-TAAGCTATTTTAAATGAAATGAAATATGGAATTATTAGtag
gi|14 : C--GTACTCACGCAA--A--CA----------CACACGGATNNNNNN--NNNNNNNN----NNNN------NNNN---NNNNNT--CCGCA------TG--A--AT-G--T----------A--CGCACACACGCTCGCACACACATAT
gi|14 : atgCGCATGAA--TG--------TACGCACACACGCTCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--atacacagacat
gi|15 : atgcgtactcacgcaaacacacacggatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcGTACGCAC--GCACGTACAC-T--A---------------GCACGTACGGATGCTAACACAC-T----AGA-------ACGC---A--------TACA------TGCTA--AC----T----------AG-CACAAAC------GTACGCACACATG---CATGAATTATAA--TATTT--A--C
gi|16 : GCATTCAC--GCAGACACACAA--A--CACG------TGTGTAAACACGTACGT--GCGCATAC----ATAT------ACAC---A--------TGCA------TGCAT--AC-AATT----------A--TATACTT------ACACACACATATG---AATGTA
gi|17 : ACGTAC--TAACGCACGCAC--G--CA--------TACGCACACACGCCCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATA---A
gi|18 : tACCCACACACGCCCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATGAAAAATATATTTTCAGTTAct
gi|19 : --ACGCA--CGCTCGTACATAG--GCACGCACGCAT--A--CA----------CGCACGAACACACAC--ACACACAC----ACAC------ACAT---AAACCT--ACACA------AACAATCAC-A--C----------A--CATA
gi|2 : T----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTTCT----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|20 : atgcgtactcacgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACACACAC--ACACA--CGCGCGCACGCGCAGGCATGCACGCAC--A--CA--------TCCGCATGCATGCACGaa
gi|3 : tcacggaaa--------TATGCACACACGCCCGT--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGATAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATCT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATGTTAAATTATTAGAAagca
gi|4 : tgcgtactcacgcaaaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACGGACAC--ACCCA--CGCTCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGTACACACGCCCGA--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---GATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTG-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAc
gi|5 : GCGTACTCAC--GCAAACACACAT--G--GA--------TAC--ACGCACGAACGC--ACACACAT----ATAT------ACAA---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTT--T-------TTT-----ATGA----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAGATTATTAG
gi|6 : GCACGCACTCAAGC--ACACATAT----TCATGAACGCACAC---AGACACGCTCACA------T------AC-G--T----------A--CCAACAC------GATCACACATATG---AATGTGTATTGAAATATTGAAA--TTGAAATGTGGCAACCA------CAATAG-------TTT-----ATAA---------------TTCGAATT---TTAAATATGGAACTATTAGA
gi|7 : GACAC--ACGCT--CACACATACGCAA--CCACGCACGCAT------------------GCACGCACGCACGC--ACAGATAC----ATGT------ACGT---GTACGG--TCA----------TAA--AC---------------A--CATA---------GCACA
gi|7 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttC--ACGCA--CGCATGCACGCAC--GCACGCACAGAT--A--CA--------TGTACGTGTACGGTCAT--AAACACAT----Aac
gi|8 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttgacacacgctcacacatacgcaac--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGAAAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGCTTTTTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAgcacaac
gi|9 : CAC--ACGCA--CGAACGTACGCAC--GCAC-CACGCAC--G--CA--------T--GCATGCATGTACGC--ACACATA-----AAGC------ACACAAAAAACA----CACA------CACAA--ACAA--T----------AACTATATGC------GCACATACATAa
blockSeqs : TC AA A AG ACAAATGAACGCA A TA . GAACGC AAA G GC CACGCT TC AAT . AC ACGCTC AAA AA AA . . AAGAATCGAG C AAGC
blockSeqs : . . G . AAACATG T . . . . G . . . AA . G . . . . . . TTGCTTTT . .
blockSeqs : . . T . GAATGTA N . . . . N . . . A . . . . . . . . TTGCT . .
blockSeqs : . . G . ACACGTG T . . . . G . . . A . . . . . . . . TTGCT . .
blockSeqs : . . T . GCATA A . . . . G . . . A . . . . . . . . TTGC . .
blockSeqs : . . G . ACATC A . . . . G . . . G . . . . . . . . TTGC . .
blockSeqs : . . A . ACATA C . . . . A . . . A . . . . . . . . ATGA . .
blockSeqs : . . A . GGATA C . . . . G . . . A . . . . . . . . ATAA . .
blockSeqs : A . ACATG A . . . . G . . . A . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . GCAT A . . . . G . . . A . . . . . .
blockSeqs : . ACA C . . . . G . . . A . . . .
blockSeqs : . ACA C . . . . G . . . A . . . .
blockSeqs : . A A . . . . T . . . A . . . .
blockSeqs : . A . . . . G . . . G . . .
blockSeqs : A . . . . A . . . A . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ACATA************ **** ********** ** ****** ******* TTGCT********
originalCons : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
finalCons : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCATACATA------------CGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTTTTGCT--------TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 11 111111 1111111 2222222222222
lowQualScore : 66 66 3 33 0 99999999999999999 1 33 4444 555555 333 1 22 666666 33 4444 9999999999 55 666666 555 00 55 111111 3333333 5555555555555 4 8888
lowQualScore : .. .. . .. . ................. . .. .... ...... ... . .. ...... .. .... .......... .. ...... ... .. .. ...... ....... ............. . ....
lowQualScore : 11 11 0 99 6 44444444444444444 0 11 0000 888888 555 5 99 444444 11 2222 7777777777 33 888888 000 00 00 555555 0000000 1111111111111 0 5555
consensus : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
Reference ( family-783 ) : CACGGACAC--ACGCA--CGCGCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGCACGCACGCNCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|1 : ACAGATAC--ACGCA--CGCACACATACAC--ACACATCCGCATGAA--CG--------TACGCACACACGCTCGC--ACACA--TATATATAT------ACAC---ATGCAT--TCACA------TACAT--AC-G--TNNNNNNNNNNN--NNNNNNN------NNNNNNNNNNNNN---NNNNNNTATTGAGGTATTGAAA--CTGAAAAGCGGGAATCAAAATATTTTTATGATTCCATTT-----TT-----TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATGAAATTATTTGAA
gi|10 : gtgtactcacgcaaacacaa----ATAT------ACAC---AGATAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GTACACACATATG---AATGTATATTGAGATATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC-----C-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|11 : CAGGGATACTCATGCA--AATACACACATAC--ACAGGCACACAC--AAACA--------TGTGCACGCACGCACTC--ACACATAC----AAAT------GAAC-----GCAC--TCACACACGCTCGCAA--AC-A--T----------A--CATATAC------ACAa
gi|11 : aaatatataCACAGGCAC--ACACAAACATGTGCACGCAC--GCACTCACACAT--A--CAAATGAACGCACTCACACACGCTCGC--AAACATAC----ATAT------ACAC---Atgcgtac
gi|12 : aaatatatacagggatactcatgcaaatacacacataAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGTGAATCA------TTTTA-----------------------TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATTTTtgcgtac
gi|13 : acggCATATATATG---AATGTATATTGTAATATTG--AAATTGAAAATATGGAGCCA------CAATAT-------TTTAAGAATCGA---GTT-TAAGCTATTTTAAATGAAATGAAATATGGAATTATTAGtag
gi|14 : C--GTACTCACGCAA--A--CA----------CACACGGATNNNNNN--NNNNNNNN----NNNN------NNNN---NNNNNT--CCGCA------TG--A--AT-G--T----------A--CGCACACACGCTCGCACACACATAT
gi|14 : atgCGCATGAA--TG--------TACGCACACACGCTCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--atacacagacat
gi|15 : atgcgtactcacgcaaacacacacggatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcGTACGCAC--GCACGTACAC-T--A---------------GCACGTACGGATGCTAACACAC-T----AGA-------ACGC---A--------TACA------TGCTA--AC----T----------AG-CACAAAC------GTACGCACACATG---CATGAATTATAA--TATTT--A--C
gi|16 : GCATTCAC--GCAGACACACAA--A--CACG------TGTGTAAACACGTACGT--GCGCATAC----ATAT------ACAC---A--------TGCA------TGCAT--AC-AATT----------A--TATACTT------ACACACACATATG---AATGTA
gi|17 : ACGTAC--TAACGCACGCAC--G--CA--------TACGCACACACGCCCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATA---A
gi|18 : tACCCACACACGCCCGC--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATGAAAAATATATTTTCAGTTAct
gi|19 : --ACGCA--CGCTCGTACATAG--GCACGCACGCAT--A--CA----------CGCACGAACACACAC--ACACACAC----ACAC------ACAT---AAACCT--ACACA------AACAATCAC-A--C----------A--CATA
gi|2 : T----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC---TTTCT----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAA
gi|20 : atgcgtactcacgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACACACAC--ACACA--CGCGCGCACGCGCAGGCATGCACGCAC--A--CA--------TCCGCATGCATGCACGaa
gi|3 : tcacggaaa--------TATGCACACACGCCCGT--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGATAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATCT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGC----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATGTTAAATTATTAGAAagca
gi|4 : tgcgtactcacgcaaaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCACGGACAC--ACCCA--CGCTCGCACGCAC--GCACGCACGCAT--A--CA--------TACGTACACACGCCCGA--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---GATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTTTAT-------TTG-----TTGC---TTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAc
gi|5 : GCGTACTCAC--GCAAACACACAT--G--GA--------TAC--ACGCACGAACGC--ACACACAT----ATAT------ACAA---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGGGAATCA------TTT--T-------TTT-----ATGA----TT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAGATTATTAG
gi|6 : GCACGCACTCAAGC--ACACATAT----TCATGAACGCACAC---AGACACGCTCACA------T------AC-G--T----------A--CCAACAC------GATCACACATATG---AATGTGTATTGAAATATTGAAA--TTGAAATGTGGCAACCA------CAATAG-------TTT-----ATAA---------------TTCGAATT---TTAAATATGGAACTATTAGA
gi|7 : GACAC--ACGCT--CACACATACGCAA--CCACGCACGCAT------------------GCACGCACGCACGC--ACAGATAC----ATGT------ACGT---GTACGG--TCA----------TAA--AC---------------A--CATA---------GCACA
gi|7 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttC--ACGCA--CGCATGCACGCAC--GCACGCACAGAT--A--CA--------TGTACGTGTACGGTCAT--AAACACAT----Aac
gi|8 : aatttatttattattttgtcatcgttttagttttcgtttttataaataactcacatatgtgttgacacacgctcacacatacgcaac--ACACACAT----ATAT------ACAC---AGACAT--TCACA------TGCAA--AC-A--T----------A--CATACAC------GCACACACATATG---AATGTATGTTGAGGTATTT--A--CTGAAAAGCGAAAATCA------TTTTAT-------TTT-----TTGCTTTTTT-T----TTTTTTAAATGAAATTAAATATTAAATTATTAGAAgcacaac
gi|9 : CAC--ACGCA--CGAACGTACGCAC--GCAC-CACGCAC--G--CA--------T--GCATGCATGTACGC--ACACATA-----AAGC------ACACAAAAAACA----CACA------CACAA--ACAA--T----------AACTATATGC------GCACATACATAa