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Reference ( gi|2 ) : TTATC-AT---GCTGTCGTTTCAAGCA-T-ACTTTTAACTT--AAAATTTAATTTAGATATCGATATGGGGAAAACAT-T-TGAAATAACTCTTACCCAATTTAGACTAACCTCCCATAATCTCGCCGCAGAAAGGGGCAAATACGAAAACATTCAAAGAAAT-----GAAATG-GAAC-----TTTGTTACATGA-CAGTT-ATTGA-AAATTGATATCATGTCCGTCA--TGTTT-TCCCTTCCATAAAGAATTG-TGACAAAAGTATCCAAAACA-TAGCTATTGCCAATGGCCAAGTTTAAACCTA--TTCGATAT-TTTA-TGACATCTA----TA------------G---C-AAAACGAACCGTCCTTA---AATTAA--CAAAA----------T-------T------------C-----------TTCC----A-AATTGAGAAAAATCACCTAATGTATAATG--CA--TTTT-ATA-TCGAAA----A-A----AAT--AAATACCA-A--CATAAATAAAAC-----AA-------AT----T--T-T-G---T----T-CTTG-GTAAATCTGATTTTGGTTGA-TTTGATAG-GT--ATG---AC-----ATAATA-A-TAGGTTTT-ATTGTTCATATTCTCATTATAT--TCTT----ATTTTCATGT-ATTTGTGTAGGCTATAAACATGTTGA-GTG-TTTAATTTCTGAATACAGATACATGTAT
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|25 ): CTTAATCACCTTCATATTTGTTTTTATAGAAGAAG
Alignments
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Reference ( family-740 ) : TTATCGT---GCTNTCGTTTCGAGCAT-ACTTTTGACT---A-AANT-TTG-TTCAGATGTCGATATGGAGAAAAAATA-TAAAATAGCTCTTACCATATATAGATTATCCTCCCATNATCTCGCCATAGAAANCGGNNGATACGAACATNTTCNACGAAATTAAAGGAAANGTAAATTTTGTAACATGA-TANTT-ATTGAAAATGAATACCACTTC---C---T--TGTTTGTCCCTTCTATAAAGAATT-A-G-ACAAAAGTATTTAAAACATTACTGTTGCCGATGGCCAAGTTTAAAC--AAATTCGATATGNCTAATGACATCTA----TA------------G---CA-AAACGTACTGTCCTTA---ACTT--AGCGAAA------T------GT-------TT---TT-CTTTCAGA-TTAAGAAACATCACCTAATGTATA-ATG--CATTTT-ATA-TC-AAAAAAGTAAAT--AC-AA---CATAAATAAAAT-----AA-------A-----T----T--T-T-G---T----T-CTTG-GTAAATCTGATTTAGGTTGATTT-GATAG-GTA------TAAC-T------AATG-ATAGGTTTAATTGTTCATATTCTCACTATAT--TCAT----ATNTTCATGT-ATTTGTGTAGGCTATAAACATGTT-ATATG-TTTAATTGCTG-AATAAAGATATTTGTAT
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gi|10 : tttatacatatatcaccaaagttggtacgcagaaatagtttatcttgcttttgtttcgagcattgctacgagtattatttagatgttgatatggataaaaagtttaaaataccaggggtggatcttactggaattagtaaagaaaaaaaaggaaaagtcagttttgttacttgaattttatcaaaaattaatacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaCCTAATGCACG-ATG--CATGTT-ATA--C-AAAAAAGTAAAT------A---CATTAATAAAGT-----AT-------A-----C----T--G-T-GTGCT----T-CTTG-GTAAATCTGATTTAGGTTGATGT-GATAG-GTA------TTAC-T------AATACATATGTTTAATTGTTCATATTCTTAGTATAT--GCATGTCAATATTCATGG-GTTTATATAAGCTCTAAACATGTTAATATG-TATAATAACTA-AATAAAAAAATgt
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gi|10 : tttatacatatatcaccaaagttggtacgcagaaatagtttatcttgcttttgtttcgagcattgctacgagtattatttagatgttgatatggataaaaagtttaaaataccaggggtggatcttactggaattagtaaagaaaaaaaaggaaaagtcagttttgttacttgaattttatcaaaaattaatacatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaCCTAATGCACG-ATG--CATGTT-ATA--C-AAAAAAGT--AAAT--A-------CATTAATAAAGT-----AT--A-----C----TGT----GTGCTTCTT-GGTAAATCTGATTTAGGTTGATGT-GATAG-GTA------TTAC-T------AATACATATGTTTAATTGTTCATATTCTTAGTATAT--GCATGTCAATATTCATGG-GTTTATATAAGCTCTAAACATGTTAATATG-TATAATAACTA-AATAAAAAAATgt
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