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gi|15 : gggcatttaatttgtcttttttattattccactaatgcaaattcatagaataaatatttctcaacaatatgataccatttttattcctctgctacaaaatttgatgaaaatgtgaccttttccatgcacaaaaatgtacacataattttaccaaattcacaatgacaaaactgttctttaattcaaatttacttagacacttgaccttcaatatttgaactaatcattcttgttttttatacaattttggaaacaagtatataaacatgtaatgatagctttgcatattaactttaaagattagattttttgcaaataaaaatgtgtaaacatgataatttcataccccacccacATGTCATATTTGTCCATCCGTTTCACATTTGTC-AATACAATG-AATAGGTATTCATGTATATCGTTTTCAATATCTTAAAGA--AAAAAATACGCCAAT-TGAAAGCAAATACATGTACTTTAAACCCA--TTAAACATTAACATCCGT-GTGTTTACATGTTGTAGATAATACGATTATTACCAATTCTAATATATTT-GGGG
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Reference ( family-728 ) : GGGGCATTTAATTTCNCTT-TTTTATTATTCCACTGATGCAAATTCATAGAATAAATATTTCTGAACAATATGATACCAT-TTTTATTCTTCTGCTACATAATTTGATGAAAATGTGGCCTTTT--CCATGCACAAAAAAAGTATACATAATTTTACCAAATTCCCAATGACAAAACTGTACTTCAATTCAAATTTACTTAGACACTTGACCTTCAATATTTGAACTAATCATTCTTGTTTT-TTTATATAATTTTGGAAACAAGTATATAAACATGTAATGATAGCTTTGCATATTAACTTTTAAGAT----TCC--TTTGCATA-AAAAAT--GTGTATACATG----ATAATTTCATACCCCACCCACTAAAATTANATGAAAA--AAGGCTAAATTGACCATTTGNTCT-AATTTCATAATAAATGTGTCGACATTTTTATAAAGANGTTGTCGAATGCATTTGATCGAA-TAAAATTA-ACAACCGAATGG-TAAATTAG-ACCATTTCGTAAAAT---T-TCATTGTCGCTTCGGTTAAAGAATTACATTGGGATTACACACTTTCCGGTAGAAAGAGAGCCTTTCGGAACATCGGT-TACCAAGAT--AG-A-AAAAATGTCATATTTATTTAGCGGTTTAATATTTCTTTAATCCAATGAAATAGGTAT------ACATCCTTTTCTATGTCTTAAATT--AAAAAATATGTGGAGATGACAG-AAAT---TATA--TCAAAATCAGTCAAGCGTGAAAATT-CATGATTTTTA---GTAGTAAAT--CACAATTATTACCAGTTCTAGNGAATTT-GGGGCACAAAACNCACCATTTTCTTGCACTACAACATTCTAGTTACAAATTATCCATCAAATGTTACATTTAAG-C-A--AA-A--AAATGTCAGACAAAATAGGGCAAAATGGAAAATATTTCCAAAA-TTATATAACTC---AAGTATTTCTTGAATGTAATATGTTTAGATT-GTGAAGTGA-TTTAGCAACATTGAAGTGCAATANATACTACCAGGCACCCATTATTGCAACTATTCAACTGGCTTTACTTATAACTGCACAATAAAAGAGGTTAAATGTGAAAAATTGCTATATA------ATATGGCATGACATGCTGGTTTTGAGTGGATAAAAATGAAAAA-AATGTCAAAAGTGGGCACATTTTCAGCACAAAATTCAAATTCAGTACCTAAGTACACATATTT--TGAG----CTTGGAATTCAAAATCAGTACTTAAACCTACTATTTCA--TGTGTATTTT--TGTTTCACAATGCAATTAAGATCATTTTTAGTGTTTTCAATGGTTCTTGAGTGTGCGATTTCAGCGGACAAGGCGCAAGTTATCGCGACAAATTGAACCTGGCATTTTAACCAAATTTTCCTAAAATGGCCTCATACGGTACCTTAAAAGAAAATAAAAAAGT-ATATTTTGTCAAAATTGAACATATCTATCATCATTCCGCTGTATTCCACTTAAATGCACTTAAAATGCTGAGTAGAACATACTGTGGGCTATTTAAAGCCATATGGCCCTTATT-TTTA--A---C-AAAAAC-CTCT-AAA--AA-------AAAA-------GAAA-AAA-TGGCGAAAATTGATCAACATGCGGAATNT--TTTTAAATTTTA-----TTGCCATTTCCCTACAAGCACCT-CAGTTGCAC-TATTTACAG-AAAAAAAGAAGTTAATGCGATGAAAATTTAG-AAAATGTTGTCGCGCTTGTT
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Reference ( family-728 ) : GGGGCATTTAATTTCTCTT-TTTTATTATTCCACTGATGCAAATTCATAGAATAAATATTTCTGAACAATATGATACCAT-TTTTATTCTTCTGCTACATAATTTGATGAAAATGTGGCCTTTT--CCATGCACAAAAAAAGTATACATAATTTTACCAAATTCCCAATGACAAAACTGTACTTCAATTCAAATTTACTTAGACACTTGACCTNCAATATTTGANCTAATCATTCTTGTTTT-TTTATATAATTTTGGAAACAAGTATATAAACATGTAATGATAGCTTTGCATATTAACTTTTAAGAT----TCC--TTTGCATA-AAAAAT--GTGTATACATG----ATAATTTCATACCCCACCCACTAAAATTAGATGAAAA--AAGGCTAAATTGACCATTTGCTCT-AATTTCATAATAAATGTGTCGATATTTTTATAAAGANGTTGTCGAATGCATTTGATCGAA-TAAAATTA-ACAACCGAATGA-TAAATTAG-ACCATTTCGTAAAAT---T-TCATTGTCGCTTCGGTTAAAGAATTACATTGGGATTACACACTTTCCGGTAGAAAGAGAGCCTTTCGGAACATCGGT-TACCAAGAT--AG-A-AAAAATGTCATATTTATTTAGCGGTTTAATATTTCTTTAATCCAATGAAATAGGTAT------ACATCCTTTTCTATGTCTTAAATT--AAAAAATATGTGGAGATGACAG-AAAT---TATA--TCAAAATCAGTCAAGCGTGAAAATT-CATGATTTTTA---GTAGTAAAT--CACAATTATTACCANTTCTAGNGAATTT-GGGGCACAAAACNCACCATTTTCTTGCACTACAACATTCTAGTTACAAATTATCCATCAAATGTTACATTTAAG-C-A--AA-A--AAATGTCAGACAAAATAGGGCAAAATGGAAAATATTTCCAAAA-TTATATAACTC---AAGTATTTCTTGAATGTAATATGTTTAGATT-GTGAAGTGA-TTTAGCAACATTGAAGTGCAATAGATACNACCAGGCACCCATTATTGCAACTATTCAACTGGCTCTACTTATAACTGCACAATAAAAGAGGTTAAATGTGAAAAATTGCTATATA------ATATGGCATGACATGCTGGTTTTGAGTGGATAAAAATGAAAAA-AATGTCAAAAGTGGGCACATTTTCAGCNCAAAATCCAAATTCAGTACCTAAGTACACATATTT--TGAG----CTTGGAATTCAAAATCAGTACTTAAACCTACTATTTCA--TGTGTATTTT--TGTTTCACAATGCAATTAAGATCATTTTTAGTGTTTTCAATGGTTCTTGAGTGTGCGATTTCAGCGGACAAGGCGCAAGTTATCGCGACAAATTGAACCTGGCATTTTAACCAAATTTTCCTAAAATGGCCTTATACGGTACCTTAAAAGAAAATAAAAAAGT-ATATTTTGTCAAAATTGAACATATCTATCATCATTCCGCTGTATTCCACTTAAATGCACTTAAAATGCTGAGTAGAACATACTGTGGGCTATTTAAAGCCATATGGCCCTTATT-TTTA--A---C-AAAAAC-CTCT-AAA--AA-------AAAA-------GAAA-AAA-TGGCGAAAATTGATCAACNTGCGGAATTT--TTTTAAATTTTA-----TTGCCATTTCCCTACAAGCACCT-CAGTTGCAC-TATTTACAG-AAAAAAAGAAGTTAATGCGATGAAAATTTAG-AAAATGTTGTCGCGCTTGTT
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blockSeqs : T . . . T T C A T . . . . . . T . . C T . . . A . . . G C . . A . . . . . . . . T A . T CCA . . . . . . T A . . T A A T . . . T G G A . TGT A G . . C . C A . . G . . . A A A . . . A . . A .
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blockSeqs : G . . . . . C T A . . . . . . A . . C T . . . A . . . C T . . A . . . . . . . . G C . A TA . . . . . . T T . . . . A . . . . . . A . CAC A G . . C . C A . . A . . . A A T . . . A . . . .
blockSeqs : T A . . . . . . G . . . T . . . A . . . G T . . G . . . . . . . . G T . A CC . . . . T T C . . A G . . T . C A . . A . . . C A T . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C . A . . . G . . T . C A . . A . . . C A A . . . C . . . .
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gi|11 : AACCTGGCATTTTAACCAAATTTCCCTAATTTAGCCTCATGAGGTACCTTAATAGAAAATAAAAAGAT-ATATTTTGTCAAAATTTACCGTATTTATCACAATTC-----TATTGCATTTA-------TTGAAATACTGAGTAGAACATACTGAGGGCTATTTAAAGCGATATGGCCCTTATT-TTTG--A---C-AAAAAA-AGAG-AAA--AA-------AGGA-------GAAA-AAA-TTGCCAAAATTAATCAACATGCAGAAAAT--TTCTAAATTTTA-----TTGCCATCTCTTTACAAGCATCT-CATTTGCAC-CATTTACAG-AACAAAAGAAGTTTATGCGATGAAAATTTAG-AAAATGTTGTCGCGCTTGTTgt
gi|12 : caAACCTGGCATTTTTACCAAATTTCCCTAATTTAGCCTCATGAGTTACCTTAATAGAAAATAAAAAGAT-ATATTTTGTCAAAATTTACCATATTTATCACAGTTC-----TATTGCATTTA-------TTGAAGTACTGAGTAGAACATACTGAAGGCAATTTAAAGCAATATTGCCCTTACT-TTTG--A---C-AAAAAC-CTCT-AAA--AA-------AATA-------GAAACAAA-TTGCCAGAATTAATCAACATGCAGAAAAT--TTCTAAATCTTA-----TTGCCATCTATTTACAAGCATCT-CAATTGCAC-TATTTACAG-AACAAAAGAAGTTTATGCGATAAAAATTTAG-AAAA---TGTCACGCTTGTTta
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gi|14 : TGAGTAGAACATACTGTGGGCTATTTAAAGCCATATGACCCTT----TTTA--AAGAC-AAAAAAACTAT-AAA--AA-------AAAAAAGAAAAGAAA-AAA-TGGCGAAAATTGATCAACACGCGG-ATTT--TTTTAAA----AAAAATTTGCCATTTACCTACAAACACCT-CAGTTGCACTTTTTTACAG-AAAAAA--AAGTTAATATGATGAAAATTTAGAAAAATGTTGTCGCGCTTGTTcaccag
gi|15 : ATGTCATATTTGTCCATCCGTTTCACATTTGTC-AATACAATGAA-TAGGTATTCATGTATATCGTTTTCAATATCTTAAAGA--AAAAAATACGCCAAT-TGAAAGCAAATACATGTACTTTAAACCCA-TTAAACATTAACATC-CGTG-TGTTTACATGTTGTAGATAATACGATTATTACCAATTCTAATATATTT-GGGGta
gi|16 : AA--TAGGTCAAATTGAATGTTTAGTCTTAATAT-ATAATAATTGGATTGACACCTCTGAAGACAGAATATCGGATAAATTTAA--GAAATTATATTG-ATAACCAAAT----AAATAAGTACT-TTTGGTAAAAT---T-TCATTGTCGCTTTGGTCACAAAATTGCaaa
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gi|18 : -----TCGCAATTTATCTACACGCATCT-CAAGTGCAC-TATTTACAG-AAAA
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