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gi|7 : ATTA----CA-GTCAATGTTGAGAAATCGGTGCTAATCAGGTC---ATTCCA-AATTTGATCTGGGGT-GATAAC--TTAT-CTTTTAAAATAT-TTTTTAAA-A--AAGCTTT--TGACTATATAGCGATGCATTTG-CA----TTT-ATT-TTTCCTTTCACGATTTAACAAAAGTT-ATTTTAAT-AATCT--TTTA-GGTCTAG-----AG--CCAAGATTA-GCGCCGGTGTCT---CAATTCATATTG---TATAATG--CAATA---TAGTA-TACAT------C-T-----TT--TT---CAAAAATAAT--GCATGAATAATCTGTGATAGTTGTATATATTTTAT-GTCAATATTATAGCGA--------TAG-TCTCTTGTAATTCTAATAT-T-GAATGGC-T----AT-------G-TA-CGTTG--T--ATGTGT----TACTGTATGTTTTATTTATATGTTTGTACA----TA-GATGA-GACTTAAATAAAtaa
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gi|43 : tcgatatGCATAAGTGCTTCTAT-----TGC--TTGTCAA-ATTTT-AAT-TAT--TT-----------------T-----TTAAG-TACCT--TTTA-GACGCC------AG--TTAATATTA-GCAATaa
gi|16 : -ATTTT-AAT-TAT--TT-----------------T--GTTTTAAG-TACCT--TTTA-GACGGA------AG--TCAATATTA-GCAATAGGTTTT---CAGCTTTTATCAAAATACAATG-TAAATA---ATTTG-TA-ATAACT-AA-T-----GTGATTA-GAA-----------------------------G----AAATAGTTTAT-G--AGTTGTAA----A--------TTG-TCTCTTATAATTCT--TTT-TAGAAAAGTAT----AT-------G-TGTTATTC--T--ATGTATA-TGTAC--TATGTTCTA--TGT-TGTTG-TATA----TATGATGA-GATATGAATAAATc
gi|17 : ctt--TT-----------------TT-ATTTTAAG-TACTT--TTTA-GACAGA------AG--TGAAGATTA-GTAAATGGTTTT---CAA-TTTTCTTCAAA---AATG-TAAATA---AA--G--A-AT-ATT-AC-TTATATGTGATTA-GAA----------------------------------AAATATTTTAT-G--AGTTGTGT----A--------TTG-CCTCTAATAATTCA--TTT-TAGAAAGGCATTCTCAT-------G-T--TATTT--C--ATGTAAA-TGTAC--TTTGTTCTA--TGG-TATAG-TACA----TATGATAG-GACGTGAAAAAA
gi|15 : taaACTT--TTTA-GACTGA------AA--TCAA-ATTAAGCAAAGGATTTT---CAACTTTTATTTAAAAAAGATG-TTAATA---TATTA-TA-ATAATT-ATAT-----GTGATTA-GAATAA-TATT--TTATGAGT---------TAG----AAATATTTTAT-G--ATTTGCATTATCA--------TTT-TCTCTTATAATTAT--TTT-TAGAGTGGCCT----AT-------G-T--TATTT--G--ATGTAAA-TTTGC--TATGTTTTA--TGT-TATTG-TACA----TATGATAA-GACATGAATAGAa
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gi|31 : tgAATGAGTTTT---CAACTTTTATTAGAATATAATG-TAAATA---AATTG-TA-ATAATA-AA-T-----GTGACCA-GAAGAAATATT--TTATGAAT---------TAG----AAATATTTTATGG--AGTTGTAT----A--------a
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gi|26 : gcaATATATTAATTAATACGCAATTA-AACATAATT-AA-T-----ATGAT-A-AAGCAAATATT--TTATGATT---------TAG----AAATATTTTAT-G--AGTTGTAA----T--------TTG-TCTTTAATAATTCT--GTT-TAGAGTGGCAT-----T---------T--TGCTT--G--A-----A-TGTAT--TGTGTTATA--TGT-TGTTC-TATA----T
gi|23 : tcaaagcTT-GC-T-----ATGAT------AAAATAGT--T----AAT----------------ACA-ATTTTAT-G--AGTTGTAT----AATAAATTATTG-TCTCTTATAATTTT--TTT-TAGAATAGTAT----ATATGTTCAG-T--TATTT--T--ATGTAAA-TGTAT--TTTGTATTA--TGT-CATTA-TACAACACAATTATAATGACATGAATAAAT
gi|29 : tacaggaaatcTT--TTATGAAT---------TAG----AAATATTTTTT-G--AGTTGTAT----A--------TTT-TTTCTTATAATTAT--TTT-TTGAATGGCAT----AT-------G-T--TATTTTAT--ATATATA-TGTAT--TATGTTCTA--TAT-TGTTC-TACA----TATGAATA-GACATGAATAAATaaaa
gi|36 : tttttTG-TCCTTTATAATTAT--TTT-TAGAAGGGCAT----GT-------A-T--TGTTT--TTTATG-ACAATGTAC--TATCTTCTA--TTT-TATTG-CACA----TATGATGA-GACATAGATATAT
24 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|2 ): TGCAATATAGTATACATCTTTTTCAAAAATAATGCATGAATAATCTGTGATAGTTGTATATATTTTATGTCAATATTATAGCGATAGTCTCTTGTAATTCTAATATTGAATGGCTATGTACGTTGTATGTGTTACTGTATGTTTTATTTATATGTTTGTACATAGATGAGACTTAAATAAAGATATATATATATATATAGATGAGACTTAAATAAAGATATATATATGCTGTAATCATTACAAACAACAGCTCATTGAGTCAATGTTAAATGATGTACAATAGTATTGGCAAACACGGGGGCTTAACATTAATACAAATAAAACAAAAATAATGATATTTGGAAAAGAAGACAAATTAAAGCTAATTATTATATCAACAACACTTGAATAGAAACGATAAAATCCTTCAAATATTTAGCCGTGCACTTCTTCAAAACGGCAGTTGGAATAGAACACAAACAAGAATCGCAAACATTTAACGTTTGCTAAGCATAATTTATTCTCAGTTTTTTAATAAAATCGACTTACCGTTTAAGAATAAATGCACATAGTCTTGTGGGCTCTACACTAAATTATTGTTCAGAAATATTGGGGCTAAAAAAGTGATCAAATCCATACTAAATTTTGAAGAAATAAATTGTGAACCAAAAAGTCAACAAATCTGGAAGCTTTATACGGTTGGCTGAGTCGAACACCCATACATATAGTTAGAAAAATCAATATGATTAAAGACGGGATTAAAATATTAGTTAGGTGAGCATACAGTAACCCTCGTAGTATACCGAATGCTCAAACAGGACGAAGACAATCGAAAAAACTGTAAAGGTTTCAATTGTGCCTTCCAAATTAAACAGATATTGAAAGGAATTGAAAAGTTCAACATTTGAGTCAACCAAGAATATCATACACAACTAAATATTATAGAAAGTGTCATAATTGTAACCTGAATAACGTTGAAAGTGAAAACCACTTTCTTCTTGTATGTCCGAAATGTAGGTATTTACGAATTAAATATTTAAAACCATATTTTTCGTAGATGACCAACGCT
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18 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|23 : t-AAA-TCTTGCTATG-A-TA-AAATAGTTAATACAATTTTAT-G--AGTTGTAT----AATAAATTATTG-TCTCTTATAATTTT--TTT-TAGAATAGTAT----ATATGTTCAG-T--TATTT--T--ATGTAAATGTAT--TTTGTATTAT--GT---CA-T----T--ATACAACACAATTATAAT--GACATGAATAAATgatatatatatatatatagatgagacttaaataaagatatatatatgctgtaatcattacaaacaacagctcattgagtcaatgttaaatgatgtacaatagtattggcaaacacgggggcttaacattaatacaaataaaacaaaaataatgatatttggaaaagaagacaaattaaagctaattattatatcaacaacacttgaatagaaacgataaaatccttcaaatatttagccgtgcacttcttcaaaacggcagttggaatagaacacaaacaagaatcgcaaacatttaacgtttgctaagcataatttattctcagttttttaataaaatcgacttaccgtttaagaataaatgcacatagtcttgtgggctctacactaaattattgttcagaaatattggggctaaaaaagtgatcaaatccatactaaattttgaagaaataaattgtgaaccaaaaagtcaacaaatctggaagctttatacggttggctgagtcgaacacccatacatatagttagaaaaatcaatatgattaaagacgggattaaaatattagttaggtgagcatacagtaaccctcgtagtataccgaatgctcaaacaggacgaagacaatcgaaaaaactgtaaaggtttcaattgtgccttccaaattaaacagatattgaaaggaattgaaaagttcaacatttgagtcaaccaagaatatcatacacaactaaatattatagaaagtgtcataattgtaacctgaataacgttgaaagtgaaaaccactttcttcttgtatgtccgaaatgtaggtatttacgaattaaatatttaaaaccatatttttcgtagatgaccaacgct
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gi|30 : cgTTTTATATATAAATTAAGAT--AT-C--G------ATAATT---TTTTATAATTAT-ATTGATT--TGAA-GAA-T-------------------------TA---TTTCAT-G--GTTTGTAT----A--------TTG-TCTCTTATAATTCT--TTT-TAGAAT--TAT----AA-------GAT--TATTG--T--ATAT
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gi|36 : acataTG-TCCTTTATAATTAT--TTT-TAGAAGGGCAT----GT-------A-T--TGTTT--TTTATGACAATGTAC--TATCTTCTAT--TT---TA-T----T--GCACA-------TATGATGAGACATAGATATATctt
gi|39 : GTTGTAAAT-AATTGAAG-----TTTCATGTTATGTTAAACCGCAATTTA-TAAT-GT-TGATGAACGAA---GA-GTTTTATTACTTat
gi|4 : atatttaaAATGATTCAAGAACATATCGTTGTTGTTTTTTTTTTTAAA-AA-AAAGAACAGTT-TAAAGTA-GAAACATATT-CAACTCAAATTTTACC---AATAAGACCCA-ATCGGC-TTTTAGTAAATTTTGGTATGGTGTGATGTTGCACCAATACGTACTGAAACAGG----------AATGT-----AAAATGAATGCAAATGTTCATTTTGTA--AAGT-TATAGAAAATGAAa
gi|42 : caaagtaaaataaacgtgctggacaacgtcaaaaacaagtatttctcgtaaaactgtgttttgttgttaaaaaacaagcaagactaacttgattttcaaaatcaagaaaatatagacataccaattgataaacgtagttttaatgataaaatgtttgataactttaatggagtggacatatatcattcaagttattgatgtcgtaactggaacaggaatg-GAACAATATTGCAAATCAA-TTTTACCATTAATCATACATAAATCTGCTTTTC--TAAATTCAGATGTGGCCTA-----GCACCAagcaatttgatttgtatgaggacttgagacatgctttgttaaatacttcttctgtgacttgttatgattgtttagtaatgaattaccacgacaaattagtggtg
gi|43 : GCATAAGTGCTTCTATTGC--TTGTCAA-A--TTTTAATT-------AT-T----TTTTA----AGTACCTTTT-AG-A-CGCCAGTTAATATTA-GCAATtt
gi|44 : CCTGTTTTATTATAT-TGCAAAGACGTGCATCT-CACGTTACATTAGTAAAAAATGCATTT-TT-TGTTTTc
gi|45 : CACCTAACATTGATTGGAA-AT----GTTCCAAAACCT-------TATCTGTACAACGTCTTAATTTT-TACCT---AT--ATAGATAATatatat
gi|47 : TCTTCAAGAAGATGATGGTAAATGATCGTTTGGTAATG
gi|49 : CTGATCAGAAGG-GATAATCGATACTTT---AAGATATTTTTTATAT-------TG------------CGCAATTGTGCTtcggttgatgagaatgtaaagcgtatgatt
gi|6 : ACATGTTTTAATATAT-TACAGAGACGTGCATCT-TACCT---AT--GTAACTAATACATTT--T-TATTGTT-TTATATG-TC---TAATGTT----ACAATTTCATCAACTCC---T--ATG-----TGTAT--CCTGCAAATCAGTTCGTTT-C---T-GATCTGATCAGAGGG-TATAATCGATACTTT---AAGACAGTTTTTGTAT-------TG------------CGCAATAGTGCTCTTTTCTC--TTGTCAGCG--TTTTAG-T-------AT-TTT-GTT
gi|7 : ATTA----CA-GTCAATGTTGAGAAATC--GGTGCTAATCAGGTCATTC-CAA----ATTTGATCTGGGGT-GATAACTTATCTTTT---AAAATATTTTTTAAAAAAGCTTTTGACTATATAGCGATGCATTTGCATTTATTTTTC--CTTTCAC-G--ATTTAACA-------AAAGTT-ATTTTA----ATAATCTTTT-AG-GTCTAGAGCCAAGATTA-GCGCCG-GTGTCT---CAATTCATAT---TG---TATAAT--GC-A--ATATAGTATACATCTTTTTCAAAAATAA-TGC-AT----GAA-TAA-TCTG-TGATA-G-TT-GTA-----TATA---TTTTAT-GTCAATATTAT----AGCGA----TAG-TCTCTTGTAATTCTAATAT-T-GAATGGC-T----AT-------G-TA-CGTTG--T--ATGTGT---TACTGTATGTTTTAT--TTATATGTT----T--GTACA-------TA-GATGAGACTTAAATAAAaatcttaacacactcaataattcaattagcagcattaagattattatgtcttattatgtgaatacatgtagttattttttttttttggcattgtttgatagtctcttgtaattcatatatttgaatggctatgtacataattacattgtatgatattgatgttattattattattgcgttacattacaaatagatgacactgcaa
gi|8 : TAATTGAAAAAGTCTA-TGATA-CA-T----A--T-GATAACTTTC-AGCAAT-ACACA-ATCC-TGATAAGCC-A-GTCA--TTATTTT-ACTCATCAAGGAATGATTCGAG--TA-A-GTACCAAAACCTGTTTTAATAAAT-TACAACGACGTACGTTTACATCT---GT--GT-AATAATG-ATTTGGT-TGTTTATATTATTTG-T----------T----ATA-TTTTATTC----CGTCT--ATG-----CAAAT--AGTGATAATTAGT-----C-CA----GAGTTGATATTAAA--GATAAT--ATTTTTT---AAGATA--CGCTATAA-------TG------------CTTTTTTATTCTTTTTTTTCAGTT-TAAA-A--TTTGGATTATTGCAAAT-TTT-AATTTG----AAT-CCTTTT-gata
gi|9 : aTTTATTA----CA-GC--ATA-----AAAGCCCATTGCT-------------------------GATTGAAAGT-GATAATCAATATTTT---AAAACATTTCCTAAAAA------TG------------TGCACGAGTGCTTCTCCTGC--TTGTCAA-C--TTTTTATT-------AT-TTT-GTTTTA----AGTATTTTTTAAG-A-TGGAAGTCAAGATTA-GCGATG-GGTTTT---CAACATTTTT---TAAAAGAT-AT--GT-A--A------ATAACA---TATATTA--TAT-AGCGATT--AGAAGAAA-TATT-TTATG-A---------------G---TTTTAT-G--A----------------------G-TCTGTTATAATTCT--TTT-TAGAATGGCAT----AC-------G-T--TATTT--T--ATGTAAATGTCC--TATGTTTGAT--GT---T--T----T--GTACA-------TCTGATGAAACACGAATAAATccatagctttaccatgttagttaattgtgttacctgcttggttatacatgttacctgct
18 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GGGCAAACATGTGAATAAATCCACATTAAATTTTGTCGGAAAATATTGTATACTAATACATCAACACATTTTTAATATCGAAGCTTTATATTATGAATTTGGACGAACACCGATGCATATAGTTAGGAAAATCAATATGATTAAACATTAGATTAAAATATTACAGTCAGGTGAGTACACACATTCAAAGTATACAGAATGCTCAAACAGGGCGTAGATAGTCGAAAAAACTATAACGGTTTAAATTGGGCCTTCCAAATCAAATATATATTAGACGGAATTGGAATGTCTAACATTTGGATCAACCAAGAACACTATAAACAAATAAATAATCATTTTACCAATTAAAACAGAATTATCGATATGTATAAACAAACATGGTAACCAACCATCACAAATTCACTTCTGTTACAATAATACAGATATACAAACATGAATTACACTTAGAACCATATATTTCAT
Unaligned ( gi|12 ): CAGAGATATGTTCATTTTTTATTGCTCGTATTTTCTTGTCAGAATTTTAGTATTTTAGTTTATCTTAATACACTTTTAATAAACTGTTTTGCAGCATTAAACATAGTGTTTTTATGAAAATAGTTAATTGTATTTTGCATCATGTGATGTAATTCATAGATTTAAAAGGCTACGTGTGATATTAATGTTATCATTATTAATGTGCTTCACATAGATAAGACTTAATAATGAGACATGATATACCTTTTAAAGGACCCAC
Unaligned ( gi|18 ): TTTCTGATTAGAGTTTAGTATTCTTTTTCATTCTAACAACAGGCTTAAATTATGAATCAATCTACAGCACTATACATGGTCTTAACGTATATATAGTTAATTGCGTTTTGCTTCATGTGAAAGTCTTCCATAATTCATTTATTTGAATGTTTATGTACATACAATTTAATACAATATTTTGTTTGTTAATACGCTGTACACAGAGGCGACTTAACTGAAAAT
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Unaligned ( gi|21 ): AACCTGCTATAGTACGTCAGTGTGTTAATAATTCGTCTTACTGGCACAAACGGTCTTCAATAGGTAGTACTTGGCTAACAAACGCATTCCACAATGGGCAAACAGTAAAGCAAACAGTTCTTGTAAAAATTGGTTTTATGATGTTAAAAACGTTAGATTTACTTGGTCTTCAACAGTAAAATAATATAGA
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